Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score CTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chrX 17968342 5' + Tirant 8120 2 68.32 TACATATGTTTAAGTCCATTTCATATAAAATATGGCTAGTTAAGAATTAAGTATAGAAAAAAAAAA:1 - chrX 13557674 5' + BS3 1769 1 89.39 ATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:1 - chr3L 23839725 5' + McClintock 5965 2 65.35 AGCACCAAGCTTCTGATCCCTGTTCATCTCTTTCGCACCACAATATGCCCCCCTCTTTTCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCC:1 - chr2R 18252767 5' + Doc 459 1 58.42 CCACGATGTGAAATTTTTAATAATTTAATTTGAAATGCATGCAACTTGATGTAACTGATTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAG:1 - chr3L 17702980 5' - I-element 330 1 72.53 AGCTGGCCACATCATCGAACGGTAACATATCGCCGACACTGGTGGTCACCGAATTTTTTTCGCACGGGTACCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGA:1 - chrX 12792440 5' - Cr1a 4422 1 53.47 CCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - 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pogo 2082 1 52.48 GCCAAACTAGAGGATTCGGATCGAGATCGAAAGAGCTTGTGAGTTTTGAAAAGAAAGTCGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTT:1 + chr2R 14247148 5' - 297 468 1 59.41 CAATCGGGTGATAGATAATAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATACTTGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACAT:1 - chr2L 11453573 5' - Cr1a 4198 1 79.21 TGACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:2 - chr2L 4743187 5' + I-element 42 1 64.36 TTTCGGCATGAGTTTTGAACACCTTATAAATGTAAAAAAAATTACGAAATTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr3R 20878542 5' - 297 6955 2 54.46 TTGGGACTCTGCAGATCCCGAACACTAGGAAAAACGCACACAACTTTCGTTTTCAGTCTTAGTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAAC:1 - chr3R 12271326 5' + Tirant 8436 2 69.31 TCCTTGCCAGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr2R 16988265 5' - opus 469 2 54.46 TGGAGCACACTGCAAAGACTGTTTTGCTAGGTAAACGTTGATTAAAAGATTATAAATTCCTAGCACCCACCCAATTCGTATGTAATTATGTTAGTGATTGA:1 + chr2L 18319646 5' - 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jockey 4951 1 68.69 GGAAANAAAAAATTTCTCTTGGCGCTTCTCGTGCACTGAGAGAAAGCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 - chr2L 6601480 5' + I-element 8 1 68.32 ATCGACGACTCCCACCCACAATACCCACAATGCCCACCACAAGTCCCAAACACAACACACACACACTGTTAGCTTATTTAAGACCAAGAATAAAGACGACG:1 + chrX 1265540 5' + ZAM 8266 2 55.45 CGTTCAGCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAG:1 + chrX 15089055 5' + gypsy 7008 2 58.42 GAGGTGCTGTCCAGCTGGCTGGCAATGAAAGCTGCTATCACAATCACACACTAGCTGTGTACCGAGTATCTATTAGTCGGGAAACTAGACTATAGCATT:1 + chr2L 18995787 5' + INE-1 570 1 53.54 AATCATTGAATTCTATCTTGTTAAAGAGAGAATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr3L 682502 5' + P-element 8 2 71.29 GTTGACAGTTGAGGGATAAATTCGGAGGAGAAGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGC:1 + chr3L 7317965 5' + P-element 285 1 39.00 GAAGTGCGTGGTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr2L 12667262 5' - blood 366 2 63.37 ATGCTTTAAGTATCTAAAATGTATAAAATATAATCGAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAACTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTT:1 + chr3L 5104400 5' - jockey 4814 1 67.33 GCGCATGGATTCAATGCGATCCTTGTGTTTATCCATTTTGTCCTGACTCTATTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGC:1 - chr3R 22987295 5' - HMS-Beagle2 188 2 58.42 AAGAANTCATTTTGATGAATGGTTCATAATATTCACACACACACGGGAGCACCATACACACGCATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTC:1 - chr2L 11446509 5' + accord 7130 2 67.33 GTAATGCAATTGGTTAAAAAAATTTTGATATAGATTATATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chrX 15082388 5' - mdg1 7434 2 58.43 AAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACA:1 - chr2L 3388115 5' + F-element 335 1 72.28 AAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTA:1 - chr2L 22684574 5' + transib3 52 1 63.37 TTTATACACACAATAGGTTAAACAGGCTGGGAGCGAGATGACGAAAGCCTTCAACAAAAATGTAGCAATTTGTTGTGTTTACATCCACAAATACGACAGC:1 - chr3R 18651914 5' - G3 210 1 80.00 GATCTCTTCCGTGACTTCGCTAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2R 14675551 5' - roo 9039 1 63.16 TGAGAACCTGGTCACTCTGATCAACGAACACGAATATGTCGTCGTCTTCTCTTAAGACTGGAGTACAAAGTCCTTTTATATAACTTCGTTTTGAAACCCAT:1 - chr2R 6732599 5' + Doc3-element 4298 1 55.45 CGCCATAAAAAAGAACTGGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 + chrX 19986341 5' + Stalker2 7263 2 63.64 CAATCGCGCCACAAATATCTCCATAGCTAAGGGAAAAAGCTTTTTAGCAACTAAAATAAAAAGTAATATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAA:1 + chrX 22468969 5' + Tirant 458 1 75.25 TTCGGTCACCACAAATTTGTACTGATCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTA:1 - chr3R 21406055 5' - F-element 4494 1 70.37 GCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 7075894 5' - roo 359 2 75.25 ACGATGGCGAGTGTTTGTTTGTGTGTAAAGTGCAGCAAGAATGGTGAAAAATCACATCACACACATACACGTTCTTGTCTTTTGTTTTTACTCACACAAG:1 + chrX 21055017 5' + 1360 3245 1 61.00 GTGCCGGCTAAAATAAAGACGAAAGCCTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chr3L 22039722 5' - jockey 4943 1 73.27 CTGACTTAACCTAACCGTGCCTCTGCCTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 + chr2R 1654409 5' - Juan 4192 1 55.45 AGTAAAAGCTCTAGAACCTAAACCAGAGAGTTATATTCGACACATAGTTCTGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGAT:1 - chr3R 15598990 5' + Max-element 8162 1 68.35 TGCTAATTGGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chrX 20806842 5' - opus 493 2 74.26 TAAGTAAAATGTGTGTGTTCAAAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:2 + chr2R 7868899 5' - roo 9037 1 66.34 TGCACCGAAGTGGTGCCATTAATTATCTTTTTGCCACTCTGTCTCTCTCTATCTCTCTCTCTCCCTCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCA:1 + chrX 11520317 5' + I-element 166 1 39.60 TTGCTAAAAAAAATTATTAAATGTTTATTTTTTTTTAAGTCAGATTTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTTGG:1 + chr2R 18772506 5' + Tc1 156 1 69.31 TTTGTTTAAAAAATGAACATAAACACACCCTACACCATGAGATAGACCAAACCAAAGACACTACAATAGTTCGAAGTTCTTAGACTTTAAGTCTATATTAT:1 - chr2L 8194075 5' + 1360 243 1 77.23 TTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 3890145 5' + jockey 30 1 55.91 TTTTCTTTTCTTTCATTTGACAAATGCAAAAATTGTTCACTTAATGTGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTT:1 - chr2L 13333601 5' - flea 4624 1 60.40 CTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATT:1 - chr2L 3440506 5' + Juan 27 1 55.56 TGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCG:1 - chr3R 13582269 5' - BS 5049 1 70.00 GGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 + chr2R 4547740 5' - HMS-Beagle 7031 2 68.32 AAACAAATCAAATCAAATCTACATATAAATACCAAAGAAATAGTAATAAAATTAAAGTCAAAGACCTTTTACCGAGTGTCAACTGACGGGACATTAGTTCG:1 - chrX 9876126 5' + 297 366 2 75.25 ATCCGNACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 + chr3R 8555870 5' - 412 7492 2 79.21 GGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 + chr3R 27284017 5' + Max-element 50 2 68.32 ATAAATGGAAGGCTTCCAAGTGAACCACCCGTTCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAATTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3L 11113961 5' - 412 7505 2 65.35 AGCATTAAATTAAACTGAAATAAATGCAATATGAAACTAAGAATTGGACAATATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 + chr3L 9766331 5' + blood 21 2 59.41 ATTGCNAATGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr2L 18234160 5' + jockey 25 1 58.42 AAAAGGTCAGAAAGATTGTACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chr3L 12103755 5' - roo 409 1 79.21 GCCCATTTATTTTGTAAATAAATATATAAAAATATATAAAAAGGGAACTAAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chrX 17057931 5' - 297 372 2 61.39 GAATGACAGATTTGTGTATAGATAACAAATTAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr2L 13136743 5' + roo 43 2 71.29 TGAACTTCAGCGTCACGAACATCCAACAACAGCCGCAGCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGG:1 - chr2L 16348122 5' + F-element 296 1 62.38 AGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3L 12888218 5' - mdg1 392 2 55.45 CGCCATCAACGACACCTACGATCCCGGCATGATGTACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTC:1 - chr3R 20761797 5' + Ivk 426 1 65.35 GGTTTATTTTGCGATTTTGAATGATATGTTTTATTGAGTTTAGCGCTCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACGAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGA:1 - chr2R 4374974 5' - diver2 4662 2 59.41 AAGTGTTGGGATGAAAAAAGAAAACTTCCTCTGCCGAGCAAAAGAAAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAA:1 - chr2L 5390193 5' + I-element 412 1 54.46 AATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 - chr2R 5531189 5' + 1360 72 1 53.47 ATAACTGAGTATGACCATAGAACATACAACACCCAAAATAAAAGGTTTATGATAAGTGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAG:1 - chr3R 1267236 5' - X-element 4512 1 63.00 GCAGCTCCAAACTCCAGTCGAAAGTGAGGATCGTTGCAGTTTGAGTTTGGGCCAACTTTGTCAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCA:1 - chr2L 3889735 5' + jockey 217 1 63.37 GGTTGAGCAATCTATTCTAGACACCACCACACTCCTTAGATCTCCTTTACTCCGCTCAGCTGTCAAATCCGTATAATTTCCTCTTATTTTTTTTTTTGTTC:1 + chr3R 7181048 5' - gypsy2 399 1 60.40 ACTCCGTTCTAACGGTAAGCAGCTATATAACTAAACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCT:1 + chr3L 10350732 5' + Quasimodo 336 2 66.34 TTATGGCAATGTGTGTGGGCTTGTTCGGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAG:1 - chr2L 4125885 5' - Quasimodo 6983 2 73.27 CAATAAGTACAAAAGCCACTACTTCTTTGGATCTAAGCAAACTAAATTCAGAATTGGTTATATTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCAC:1 - chr3L 11403723 5' - copia 163 2 58.42 ACTTGTATGTATGTTAATTGTGCCCGTTGTGTGTGATAGTGTAGGTGTGAGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGCTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTG:1 - chr2R 21502545 5' - F-element 427 1 51.49 CATTTGTTCGAAAGGTGTACAATTTTATAGTCGTTGTATGCTATAAACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGCTTAAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGC:1 + chrX 21668419 5' - rooA 7541 2 60.40 GATCCAGACGGTTAAAAGGGGGTTGATTACTTATGTATATAAACTGACTTAGCTTCCGTTCAACAAAATGTATTGGATATTTTTCATAATTTTATTAGTCT:1 + chr4 1088038 5' + INE-1 403 1 69.31 GCCAGCGGACTGAAAATCGTCGGCGACTGAGCCAGACTTCAGGTAATACCAAATACCCATATACCATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chrX 17830819 5' - P-element 2876 1 69.31 AATTGAGTTTGGCTAAAATTGGTCAAAATGCGCAGCAAGCGGCCAAGACAAGAGCACCTACTCTGACCAATTCAATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chr2L 13137466 5' + Tirant 52 2 79.21 AAATAACAATAAACCGAACAAATCTTTTCATTTACAAGATATACAACAAATGCAATGGATACTTCGGATCCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCG:1 - chr3L 22791456 5' - hopper 331 1 59.41 CTTTCCCAGCTAACGAGTATCTGAAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2R 24021661 5' - pogo 2089 1 67.33 TGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:1 + chr3L 9909708 5' - Transpac 5186 2 63.37 CTTATACTTAGTCCCAAACCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr3L 11745357 5' + accord2 223 1 56.10 GTATGTCAAGTTGGACATATCCTCGGCTTTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGACCTTTTGACTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGAT:1 - chr2L 16769521 5' - G4 173 1 77.23 ACTTTGAACCCAAACCAACTCATTCATGACCCAGAGCAATCCAAAACGAACTGCTTAAAGCTAACAAAGAAAAGAGCTTCATAGCGGCCTCTGCCACAGT:1 - chr3L 11125053 5' - gypsy3 80 2 59.00 TCATCCCTCCAGGCACAAAGCTTGTAGTGAAATCCGTACTTAGAGTGGATCAGTTCCGTATTCTGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACT:1 - chr2R 2077911 5' + I-element 5137 1 68.32 AAATATGCTGACAAGCACACAAGTATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr2L 20706643 5' - mdg1 405 2 62.38 TCCGACTGATTGTTTTGGCTTATGCGGCTTTTGTGGGTTATTATTATTATTATTATTAT:1 + chr3R 6608780 5' - mdg1 38 8 64.41 ATCCACATCAGTTGGCTTGTTTTCCACACAGTCACATACATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGATCA:1 - chr3L 10082017 5' - rover 312 2 61.39 TTTCGAAAGGGGATTGCCGGTCCGTGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTCGGCCAAAGTTGGTTCTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTT:1 - chrX 13546733 5' - roo 405 1 72.28 CGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chr3R 12047400 5' - Stalker2 392 2 64.52 CCAGAATGTTTTTGTAATGAAATTCCTAGGTCTCCGTCTTGGAATTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCG:1 + chr2R 7552217 5' - springer 7511 2 69.31 AAATGTCAAAGGGTTATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGA:1 + chr2R 19183714 5' + P-element 265 1 18.81 TATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:2 + chrX 12657099 5' + blood 28 2 55.45 CATTTAACCGCAAAAATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2L 14790676 5' - roo 404 1 74.26 ATTTAGTTCTGAAGGCATATATTATATAGTGATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACA:1 - chr2L 23381787 5' + Idefix 60 2 97.03 AATCTCAACGATTTTGGTGTGCCAAAAACCCAAAAACCGCAGAGAAATAGCAACAAAGTTTATGAAAACCGCCGACATCCGCCCAAAAAGCTGACACCACA:1 - chr3L 18785326 5' + ZAM 139 2 71.29 CTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGA:1 + chrX 15089085 5' + gypsy 50 2 78.00 AACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 15955315 5' + Quasimodo 36 2 72.28 GCGTTTGTTCCGTGCACGTGTTACGTTTGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAA:1 + chr2L 20359232 5' - Tirant 8397 2 71.29 TGTGCGCCACGCATAAAGTTTGCACATAAATTTTCACACGCCGCAAGCTGAGTACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTT:1 - chr2R 21926940 5' - 1360 372 1 70.30 TTAATTTTGCCATTGTTTCTGAAAGATTATTGCAAATTCATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr3R 23591420 5' + pogo 35 1 65.35 GGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 9131782 5' - roo 9016 2 81.19 CTCCCCCCGCCCCCTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 17182064 5' + hopper 136 1 89.29 CAAACTTTTTATGAAACATCAAAAAATGCAAGCTACGCACTTTTGTTTAAACTACGCCAGTTCCGATCAACTCTACCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCT:1 + chr3L 23727227 5' - invader4 237 2 58.42 TGACATGCAAATTTGCTTCTTAAATTGAAGCACAACATCGCTGAATTCTCGTCTGTTACGAACTAACTACCGCCACGTCTTCGGTTGGAGGCATCGGACTC:1 - chr3L 27348978 5' - gypsy10 229 2 60.40 TTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 - chr2L 15947438 5' - Transpac 5181 2 70.30 GAATGTATCGTTAACAGATAAAAAATAACACTAAGTCTTTAAAAGGAATCTATGTACCTACCATCACAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGA:1 - chr3R 1220307 5' + 1360 381 1 53.54 ATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chrX 19162607 5' - pogo 2059 1 71.00 ACAAAATAAATTAAAACAAGAATGCTATAGCCGAGTCGATCTAGCAATAACCTTCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 + chrX 20460523 5' + INE-1 148 1 64.36 CCTTAGCTAATCTTTCAGCTCAAAACAACAGTAAAATTATTCAGAACCTTTAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTC:1 - chr3R 7168428 5' + flea 263 1 60.40 TTTCGCCAGATTCGCAAAAAGCAAATGAAAATGTCGCCCAAATGCAACTGCAGCTAAAAGTTATCGAGTAGTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTT:1 - chr3L 881800 5' + Cr1a 238 1 74.26 TGGAAATTGGTAAACAAAATTACTTTTATCTCAATCACCATTCTACTTCTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGATAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 - chr2L 3340026 5' + FB 28 1 51.49 GCGCAGAAAGGTGCGATTACCGTAGCACTCGATGTCGGCAACGAATCAGTGGTCGTCAGCGGCTACGCGGCGGAGAAGTTCAGATGATCGCACTTTTAGCT:1 - chrX 13782918 5' - HMS-Beagle2 116 2 67.33 AGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 16674849 5' - roo 9047 1 59.41 CCTGGAGCCTTTATTGTCCACCAGTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAT:1 - chrX 15250294 5' - I-element 228 1 55.45 CGGTTGCTTTGGGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAGATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 12949256 5' + 412 45 2 79.12 TTTTCCATTTTTTAGCTCCGCCACTTGCATCTTTCATTCTTTGTTTTCCTTTTCCTTTTTCTGCCCGCCCTTTTCACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 + chrX 13858092 5' - accord 182 2 55.56 TCTGGTGATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3R 23275257 5' - roo 9040 1 58.42 CACTAGATCACTTCTTACAACAGTTGTTATTGAAATAATTATACGGTTTTTTTTTTGGCATAAATTCAAAAAATTTTGTAAATTGTATTATGAAA:1 - chr3R 20285558 5' + transib3 45 1 48.42 TCCTGGGGTGAATTAGGCAGATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCT:1 + chr3R 14917159 5' + HMS-Beagle 3 2 74.26 TAGAAACTCTGGAATACATAAAACCTTCACTCTTAATGAATGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 - chr2L 17722838 5' - blood 343 2 59.41 ATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chrX 16995122 5' + jockey 56 1 75.25 ACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 31458439 5' + jockey 56 1 72.28 ATACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr2R 12082358 5' - mdg1 7407 2 75.25 TCCAAGAAATCGCATCCAAAGCTCGGAAAGAAACCGGAAAGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATC:1 + chrX 8388312 5' + F-element 155 1 60.40 TGAAACGCGTTCGGAAAGAGGGTCATGGCTATTTGGTTTTAGTAGTATATATATGTATGTATGTATATCTGAATTAAGTTTTTAATTTAAATTTTTAAATA:1 - chr3L 11233607 5' - 1360 3041 1 69.31 CTCTTGCTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAGTTAC:1 + chrX 13546620 5' + roo 16 2 64.36 TCGCCTTGCCAACTAGCCACTTCCGCCCAACCATCAAAGTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 1098479 5' + TAHRE 10435 1 60.78 AAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr2R 5067642 5' + F-element 47 1 70.30 GTATCGAACTGCTCTTCACATGATTTCTCGCGTAATTCAGTTGGAATTTTTCACATACAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGT:1 - chrX 8561329 5' + 1360 3186 1 68.32 CGCAACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTT:1 + chr3R 31887757 5' - HB 1559 1 70.30 ACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 22098098 5' - roo 9042 1 60.40 GGGCGTGATGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chrX 2179531 5' + Doc 47 1 71.29 ATAATATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAATACAATTGCGTCAAATGTAAAGAAATTATTCTCTAAAGCTGTCAAAAAACATGAAAATGATTTGGC:1 + chr2L 471356 5' - Transib5 2702 1 80.20 GAGAGGTACGAGGATGAGCTGCTGCTGCTCACCTTGGTGGCAGTGTTGGAGGGAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAG:1 + chr3R 14570971 5' - F-element 377 1 51.09 AAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:2 + chr3L 12103802 5' - roo 9025 2 74.26 ATCGGNAGCATCGCGCTGGCGACTTAATATGGGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTGT:1 - chr3R 27748725 5' + roo 42 2 69.31 TCACTCTCGTTGGGATCCATGGTGGGCAGTTCATTATTGGCACTGCTAGCTAATCCGCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACC:1 - chr3L 21360425 5' + G2 2957 1 61.39 TACGAGTAACGGGTATAAAATTTATGTAGTACACACTAGAAAATATTTGTAAAGTTCATACGAACAGACGGACATGGCTAGATCGATTAGGCTATTGATCC:1 - chrY 2457983 5' - INE-1 97 1 52.48 CAATCATACAGACACTTACCACACAAAATTAATACAAAGGAAGTCATTACAGCCCTGAAAAAGTATTTTAGAGCATACAACTAAGCAATCAATGTAAACCA:1 - chr3R 1832397 5' + invader3 5131 1 71.29 AAATTCAAAAATAAGCCAGTAATTTATAATTCCTTGTATAAAAGTTAGTTATTGCCTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3L 18659122 5' - pogo 2099 1 73.27 TGAAAAACCGAAATTCAGGAAGCATTTATTTGATGGCCTTTTGTGTACTTTTCGAATACCATATACATATATATGCCGTAGTTTGTTGAATATAGGCAATG:1 + chr2L 5812307 5' + 1731 4309 1 80.20 GCGAAAGTCCATCACCTCCGTCATGGCTGTCTGTCTAATGCACTTCCATTCAGATGAAAAAAGTTAACATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATC:1 + chrX 13836509 5' + Doc2-element 4555 1 53.06 GCCCCAGAGCTAGTTATAATTGCTAGTTTTGAAATGGGAAATCCACCAAATCAGTGAAAATGTATATTGTTTGGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATC:1 - chrX 10564341 5' + hobo 2512 1 76.24 AGCATATACGCTGCATTATATCTCTATCTATATATACATATTCGAATAGCACGCTCAATTCTTGATCTTATTCATTAATGTATGTAACGAAAAGATATCTG:1 - chrX 15193276 5' + gypsy12 10104 2 53.47 GGAAGTGGTCAACTTCCTATGTTACTCAGCACAGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACTTTTATTAAAAAAAA:1 + chr2R 10849787 5' + transib2 2626 1 69.31 GCCGGAGTCCTCCCTCCCAGGATGGTCAGGAATGTGTCCTTCGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr2L 3519797 5' + HMS-Beagle 32 2 58.42 CTGAAACTTAGGTTTTACCACCTTGCGCTACATTTTATTTCCAGAATCCCATGCTGCTAATAGACTCTTGGGACATGCAGCCGCCAAAACTGTGCAGTAGA:1 - chr2L 22216591 5' + diver2 15 2 89.11 TGCCATGTTTCACATCATGTTGCCGCCGCCAGCAAAAAGGTCTCCATTACTCACACAAGCAGGCAGATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTAA:1 - chr3R 31658815 5' + 1360 3287 1 54.46 TAGCCCCAGGGATTAAACTAATTGGGTAACGAGCTCTCACTTTTGTCTTTCCAGCAGGTGTTTAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTT:1 + chr3R 5134683 5' - I-element 294 1 76.24 AATAACTCCATGGGGTTTTCCGGATAAATTTATCTTGCCAGACATTATTGTTAACCTAAATTCGGCCATAGATTGCTATGAGGAGTCTTAAAACTCCCCAC:1 - chr3L 25608227 5' + gypsy8 4653 2 61.39 TGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:2 + chr3R 14917190 5' + HMS-Beagle 6830 2 62.38 TAATTAATGCCTGTATATATCATCAGTCGATTCTGGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 513734 5' - roo 9043 1 56.12 ACTAGAATTCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 + chrX 15293416 5' + Quasimodo 16 2 66.00 CAAAAATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr2L 21174282 5' - roo 9024 2 74.26 TGGTCTTGCACTGAAAATGTATAACGAACTAAAGTTTAAGGATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGT:1 + chr3R 17321686 5' - Stalker2 7645 2 72.28 GTTGAATTAAAAATAATATAAACCATAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 19450047 5' + roo 8685 2 52.48 ATAGGCAGAGAGGTTGGGATCTAAAACTCCTTTTCATTTCGCTTAACTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACAATTCAACCTACAA:1 + chr2L 14579803 5' + copia 6 2 71.29 ACCAACAGAGCAGTGCAAAAGTTAAACAAAGAAGCCAAAAGCACACACACATTTTGGAGACCAACTCCAGTCCACACACATCAATACTAATGCACACCGCA:1 - chr3R 14751372 5' - invader1 3798 2 54.46 GTTCAAGCTGGACTCAAAGGGGGAAGTGGAGGACATGCTATTCGTCGACTTCCAGAACCCCAAAGACACTAGAATTATTCCAGTGTCTTTGTTTTGGTCAT:1 - chr3R 11686725 5' - 1360 497 1 59.41 TGCACTGAGAGAAAGCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr2L 6601449 5' + I-element 39 1 58.42 GTGTGTAGCATAGTGTAAAGAACAAATTAATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 20824617 5' - pogo 2069 1 70.33 TCGAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAA:1 - chrX 16361602 5' + Tc1 33 1 88.12 AAATATTAATTATACAAGAAAATAAACAAGAAATTCCAAGTTCACACACTTTTATTACATAATTAGATCCTATT:1 - chr3L 23583098 5' + Cr1a 4281 1 71.62 ATTTACTTGTTCCCAGAAAACCGCAGCGGGTGGTGTTTCTTCTTATTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chr3L 22463228 5' - Doc2-element 244 1 77.33 TAAGATTCGTCTTACCTTTTTGGTGGATAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 7075847 5' - roo 407 1 76.24 GTATTCACTGCATCATCAACTGTCGCTCATTACGCCGGGATTTCATACATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGT:1 + chr2R 20952519 5' - rover 325 2 62.38 TCCTCGATTTTCGTGTCCGTCGAGTATTTCACATCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATAT:1 - chrX 14931020 5' - roo 55 2 67.33 CTTTTAGGGGTGGACCGTAAGGCTAATCCACTCTAATTTTAGATTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 - chrX 12290237 5' + X-element 43 1 55.45 TCGATGTCAGAAGTCTTGGCTATCAAAAGATTAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAG:1 + chr3R 11841091 5' - hobo 2561 1 68.32 CTAATAGACATTCTTCTTTTATATATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 + chr3R 12589032 5' + Max-element 55 2 79.21 CCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:2 + chr3L 19377736 5' + roo 41 2 69.31 CACTGTACATGTGTATGTATATTTGTCGCAAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTAC:1 + chrX 2293850 5' - I-element 62 1 70.30 CTGTTTTCGTATTATTTGTTCCAAGTTGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAA:1 - chr2R 1443610 5' - blood 64 2 76.00 CTATTCCGAGTATATTCAGTGTGAGTCAATGACTGGGTATTCCCCGGTGGCAGATAAGGTGCCTTCTGTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2L 19847408 5' + P-element 7 2 61.39 CCCAATTAAAGTGGTAACCTGGGGCAACGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCC:1 - chr3L 12376701 5' - F-element 244 1 71.88 GCCTGCCATACGGATGTCATCCGTTGCAGATCGTTCGAGCGCAAAATTTAACAATGACACAAACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTT:1 - chr3R 30633352 5' + 1360 3238 1 70.30 GAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chr2L 21010873 5' + opus 158 4 79.21 GCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 - chrX 3817518 5' - roo 9045 1 57.43 AATTTATTTTAAACTGCTGTATACACTTTACATAAATTAAATTAAGTTTTTAACTTAATTAATTATTAACGTTTTTCTTTATTATTGCACACAAAGAAAAT:1 - chr2R 10074717 5' - Doc3-element 150 1 69.31 GCGTAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 - chr2R 21773623 5' + Max-element 24 2 50.50 ACATCAACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 19377821 5' - roo 402 1 72.28 AATACNTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 7075902 5' - roo 9029 1 80.46 TCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chrX 20806943 5' + opus 7022 2 58.70 GCAGCATTTACAGTTGTACATTGGCCCAAAACGAAGAAAAAAAAAAACAAGGAGAAA:1 - chrX 14982213 5' + Doc2-element 228 1 87.72 TACCCACAATTTCGACACTCCATTCGCCTAGGTGGTTAACCCATCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATA:1 + chr3L 17168808 5' + mdg1 7039 2 79.21 AATGGCACTTGAATGGCAATCGCTTGACTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATTTATGTGACTCTCCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAAT:1 - chr2R 18035364 5' - Bica 4681 1 72.28 GTCTGTATCCGTGTGCGTCCCTTTTTGTATCTGTGTATCTGTAAGCGTTGTATCCGTATCTGTGCATGTCCGTTTTTGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTT:1 + chr3L 8396273 5' + pogo 284 1 65.35 ATAAGCCAGAAAGAGCAGTATCAACTAGGGAATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCT:1 + chrX 13540564 5' - roo 8775 2 69.31 TGTTAGGGTATTCGAAAGTTCTTTTTCTTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 11826509 5' - Doc2-element 234 4 54.90 TACGTACAAGAGACGAAACTCGTATTCGGAATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr2R 24628748 5' - mdg1 400 2 57.43 AGGCATGTCGGAAGGCTGGGCGGAAGGGGCAGGCGGGATCAACTCACCTTTTTAGCTGAGCAAGTGTCTCACCATCCGCCAAGTAATACAAAGAAAAAAA:1 - chr3R 16940443 5' - Chouto 113 1 72.00 CCTTGCAAAATATAAAGAAAAAAATAATATATATGAATATGACAAGCAAAGATTTAATGAGAATAAAACTAAGATTGTCATACGATCCTCGAGAGTGGAAA:1 + chr3L 24500387 5' + Idefix 132 2 74.26 TTATTATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTAGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTT:1 + chrX 21634156 5' + Cr1a 244 1 78.22 TTTTGCTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 - chr2L 17646238 5' - flea 4989 2 50.50 GCCTTTGTTTAGTCGCTGTTGGATGCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGG:1 + chr3R 17502935 5' + Quasimodo 82 2 76.24 TCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACACATACACATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr2L 21328149 5' + flea 4762 1 74.26 GGCCAAGTTTTGAGTGCTGCCAAGTCCACATCTAGTTTGTCTTCCACTGTAATATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGC:1 - chrX 19986428 5' - Stalker2 7626 2 53.47 GGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGAC:2 - chr3R 12047468 5' + Stalker2 46 2 68.32 TCTCACACTCACGCGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr2R 13644438 5' - Burdock 214 2 69.31 GAAAACTTAGCTTACTGCTTACACTTGCCTTTTTGTTTGTCTGGATCGGTTTTGCTTAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTT:1 + chr2R 1340714 5' - I-element 5079 1 75.51 TTGCAATAAGTTATGTGTATATTAACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr2L 11837973 5' + roo 8673 2 68.32 ACTGCCTAGATCAACTGCAACCCATTTGGACTCTTGACCAAAGGCTGTGCTGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr2L 9774366 5' + 412 8 2 69.31 ATGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 20744218 5' - roo 9033 1 65.35 CGAACACCAGCTGGCAGTGGCAGTGTGGAGTCACCTCTGAAGGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAG:1 + chr3L 279220 5' - Doc 354 1 58.42 TTTTGGACTCGATTACGATTTCAATTGATTTAATTGAATTTTTTGATGTGTTTTGTGTGTGAATGGTGAAAATCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTT:1 - chr3L 15535638 5' - I-element 269 1 65.35 ATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3R 19446132 5' + 297 6592 2 67.33 ACGCGAGTTAAATGACCGCTTATTGCGTAATAGCATAACTATAAAGTTGCGATTTTCTGCACGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAG:1 - chr3R 3319630 5' + Quasimodo 264 2 66.34 TTTAGCATAAATTTGAAATTGGTTTCCCTGCTGGCTGAATACAAAAGAATATGCAAAGTGTGGATCTACCCTGGCTTCAATGCATCACGCCATAAACCCAT:1 + chr2L 14191724 5' - gtwin 186 2 66.34 TTTTTTTCAATGTTGTTAATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGA:1 + chr3L 14396953 5' + BS 4997 1 66.34 ATTATTTTCAAATGACGATAGTTCAACTCGACCTAAGAAGCAAGAAGAAAGGGAAAACTACATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAA:1 - chr2L 864965 5' + micropia 5267 2 53.00 TTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 12539507 5' - roo 9027 1 71.00 AAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGT:1 - chr3R 19530693 5' + BS 45 1 71.29 CAACACAAAACACTCTTATAGAACATTGAAAACTCTTCCACATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTT:1 + chr3L 27401 5' - I-element 21 1 59.41 AAGTGTACTATTTTACAATAACCGAAATACATAATTTCAAAACGGCCATTAAGGCTCCAGCTGAAATTGGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGA:1 - chr3L 7199025 5' - Doc 306 1 67.33 GCCATTGCTGATACTTTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGACCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chrX 13640633 5' + P-element 36 1 43.56 ATTGTTTTATAAGCAGGAGCTGCTGAGTCAGGCGACATTAATCGGGGGAGGGAAGTAGGGCGCAGGGAGAAGGGTATTTATCTTGCATAACAATCCAACA:1 - chr2L 20332151 5' - Helena 429 1 61.00 GTGGCNGTCCAGCGAAAAGAGCGGGGATTTGGCTGAGCATGTGCCAATGTGCTGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTG:1 - chr3R 20468013 5' - ZAM 58 2 53.47 GGTAGCTGCCCCTCAGCGAAAAGAAGGCGATGGAGGAGGTGGTGGCAACCTACATATTTTACGTTTCCCCCTCGCTATCCATTGTAATTTATAATTTATTT:1 - chr3R 24429081 5' - copia 5122 1 58.42 GCCGAGGCATCGTATTCATCTTATTCAGCCAGCAGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATA:1 - chr3L 11663066 5' + gypsy7 40 2 68.92 CCCCAGCAGTTTCTCTGACAAAATACTATATGATTTACCCGAGATCTTGGTGTATATATTTTGTGCAAAATAGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATG:1 + chr2L 9177116 5' + copia 4815 1 71.29 TTTCCGAATCAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:1 - chr3R 11094586 5' + 3S18 19 2 58.42 GTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 - chr3L 10013650 5' - hopper 1389 1 53.47 CAACCATGAATGAGCGCATTCATGAACGGGTCAGTTATCTACACAGCTCTAAGGCACATGGATTGGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGT:1 + chr2L 21121019 5' - Bica 111 1 70.30 GGCGGCAGACAAGCCAAACATATCAAATAGACACAATTACGCACACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 18237374 5' + accord 183 4 77.94 TTTTAACAAACAAAAATTGGCCAACAAATATTTAACAAAACTACAGAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATA:1 - chr3L 7855448 5' + Stalker2 7393 6 54.46 CATGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chr2R 14713631 5' + P-element 60 1 21.78 CCATTGCCTTTCACGATTTTCCTTTGATACGAATGCGTTGCATACTTCTCAGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 - chr2L 15510469 5' - jockey 4968 1 53.47 GGAGCACATGTGCACTCTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chrX 21017777 5' - 412 459 2 57.43 AATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:2 + chrX 21668930 5' - mdg1 407 2 64.36 TACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr2R 14708968 5' + Doc 36 1 56.44 CGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 13225509 5' + hobo 43 1 67.33 GTGAATGATGCATAAATCAAACGAAGTTGAGGCATTTTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 + chr2L 17311082 5' + S-element 37 2 69.31 CGTGGCGGCACTGGGCGTGGGAAGGGAAGGCGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chr3R 12277512 5' - Tirant 8464 2 71.29 AAGCCNATTTCTAGACTAGATTTTGTTTGTTTATAATTCTCATTTGGTTTTGTTAATTCATTTTAGTAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGG:1 + chr3L 3958367 5' - I-element 231 1 66.34 TACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3L 11257423 5' + 1360 8 2 71.29 ATTTACTCCTAACGCGGTTGTAGTTTATTATATCATTATTATTCATAGTCACTGTTGGGCTGTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 + chr3L 3032211 5' - opus 7491 2 67.33 GACAGGAATGTATAAGGATACTCCAACTCGGCTGATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAA:1 + chr3R 22773400 5' + copia 5034 2 66.34 GAGGCAGAGCACCACTTCCTGCTAGGTAATGGCACGCATGAGGATACCGGTACTGGTACAAGTGTATGTATGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCCCTTTT:1 - chr3R 17929051 5' + hobo 5 1 74.26 CAGCAACAATATTTAACTAAACTTAGTGGCAATGAGTAAGCAGTAAGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAA:1 - chr2R 1771616 5' + Burdock 6080 1 81.19 CAGCTTCCAAAACTTTGGCTACCCCTTTTCTGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAA:1 + chr3L 22333282 5' - F-element 4513 1 64.29 GTTTTTGCAAAAGTCACAAATCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCGA:1 - chr2L 14677330 5' + FB 57 1 79.21 GAAGGCATAGGCAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCAT:1 - chr3R 20147570 5' - 1360 387 1 68.32 AATTGTAAATATAATTATTAAAAATACGTTCGTTTCGCGAGTGATTCTTGTGATTTGTGCAATAGTTTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTC:1 + chr3R 18717467 5' + Cr1a 180 1 83.84 ATAGGAGAAGATAAAGCTCATAAGTTGCACTAAGTGCTTATGATCCAGGATTTTTAAAGCATTTAAAGAAAGTATCCAAGTATTTTAATATTTTTAGGTGT:1 + chr2L 16163560 5' - baggins 407 1 50.50 ATGTCGGGTTAGAGGGCAGACACCGAGCAGACACCGTCAGCCGCAGCACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTA:1 - chr2L 5594079 5' + accord 288 2 63.64 ATAAATGGAAAAAGGAAATTCCTAATATACAAGATAGAAAATTTTTAAAGAGGACTTGTTGCTTCCTGCCATTTCTAGTTCTAGTTTTCTTAATAGAAGGT:1 + chr3R 19447907 5' - Q-element 350 2 74.26 GTTCTGAATCAGATTGCGAATCTGAATCTGTGCGCTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTAT:1 + chr3R 27870549 5' + hopper 338 1 62.77 GGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 + chrX 20806863 5' - opus 7476 2 61.00 ATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATA:1 + chr3L 19454676 5' + diver 46 2 71.29 CGTTTGTTGCGGCGGCCGTTGGCCAACTGGACGCCACATTGCATCCACATATGTCCTTCCAGCCGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3L 13548884 5' - hobo 2931 1 72.28 TGTAGACAGCGAAATTAAATCGAAATGTTATAATCAGATTTTACACATATTCAAAATGCTGATTTGTTGATGTTGCCACCGCCGCCGCTGTTGCTGCTGCT:1 - chrX 19524798 5' - TART-B 156 2 63.37 TGTGTCTCCGAAGATGACATGTACGCAAATATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCATCTACTTAGCCACCAAAA:1 - chr3L 23428048 5' + Porto1 4460 1 71.29 CTTGTTGATCGTCACAATTAATGAACGTCTACGCACACGGACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCC:1 + chr3L 16477138 5' + Idefix 231 2 60.40 TGGGACTGAGAGGCAGCGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTC:1 + chr3R 12047384 5' - Stalker2 7648 2 75.25 TCTCTCTGTTCTAAGAGCCCAAATCGAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAG:1 - chr3R 17888267 5' - jockey 4546 1 74.26 TCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr2R 14778502 5' - mdg1 384 2 63.37 GACAAACCGCTATACCATAATTAATGCCTGTATATATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 - chr2L 513751 5' - roo 394 1 62.38 GTAATGCCACAATTCCCTCCAAAATCGAAGTGTAGAGCAACTTGCCGGTTATTAGAAACAACCTTTGAAGGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3R 3771675 5' - roo 404 1 74.26 AGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 20744213 5' - roo 9028 1 70.30 GTATACATTATATGTATTCATAATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTAGAGATCTCAGCAACTATA:1 + chr2R 4743725 5' + INE-1 144 1 67.12 TCAACTTTGTGTCATAAACACCACTGAAATGGGGCGCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chrX 10561786 5' - hobo 2920 1 58.42 AAACTNGTGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chrX 13508672 5' + roo 15 2 63.00 GGGATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 19552061 5' + roo 8688 2 53.47 TCTCAACTTTGGTAAAGATTTAATTACCTAAGCGGTAGTGTCGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGAGGTC:1 - chr2R 5342522 5' - Doc2-element 4495 1 58.42 GTTGTCATTGTAACAATTTTATGGCTAGTACGTTTTTATTTCCACAGATTTCAGTGATTTTCATTCTACTGTTGCTGTGGCAGATAATACAATTTAGTTT:1 + chr2L 13122211 5' - S2 30 1 62.00 TATTTTGCAACTTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 10147913 5' - roo 393 1 66.34 AATGCCATTACAATAAATGATCCACTGGCACCGGAGAAAACGCAATAGGTGAGGGTTTTTTCTTTTTACAACTACTTCCATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 13279896 5' + hopper 143 7 74.26 TATTTTATTTTATTTTTTTTTTCCCCCATTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTAGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTT:1 - chr2L 8869221 5' - Porto1 198 1 67.37 GTGTTCGTCCTTTGTGACTGATTCAAGGCGCTGCAGGTGTCTTCTGCATTGTTCACCGAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAA:1 + chrX 20742407 5' - Cr1a 3973 1 62.38 CCTGAAAAGAAAAGGACGAAAAAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chrX 14323582 5' - hobo 2892 1 72.28 GTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 17843636 5' - roo 9043 1 52.48 ATTCAATTTTAAATTTGGCAACTTTAATAATAACGAGTTTTAGGCAATTTTTCAATAAAATCCAAGTTGTGATGTTGAAATATGTATGTATATTTATTAGA:1 + chrX 19428092 5' + 1731 4413 1 77.23 TTCTTCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2R 10543522 5' - P-element 2868 1 58.42 GAGCAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3L 13659896 5' + pogo 38 1 65.35 GGCCGTCCCAGTCCCAGTCTCTGTCTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCT:1 - chrX 2302527 5' + Cr1a 286 1 75.25 AAAGGGCCGGCTGGACGATGATGGCCAAGAGACAGCAGAGCGTGGCTGCCGCCGTTAGCAGATGTCTGCTATCACTGTATGCATAGAAAAGGG:1 - chr2R 13755410 5' - 1360 142 1 70.97 TCTAGGTTAGGCATTACCAAAAAAGTATCTTATAAATATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCG:1 + chr2R 23584708 5' - HMS-Beagle 246 1 74.26 TACATGATGTTCTGTATTTGGCGTAAAAATTGTGACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTGTTAGACGCCGCTGTCTGCGTTGGTAA:1 + chr3R 2833645 5' - rooA 220 2 66.00 GGGTATGCCCCAAATTGCGGCGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACT:1 + chr3R 5346217 5' - Idefix 172 2 79.21 CGTATGAACTGCCACATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr2L 3951668 5' + Transpac 4939 2 59.41 AACTAGGAAAACAAGCTCTTTACAATATTTATGCATTAATGTAATAAGAAAAAAAAAAATTTTGAAAAAAGCGAAATTTTTGATTTTCGAAAATTTTCGAA:1 - chr3L 27140733 5' - FB 143 1 57.43 CCCCATAGGCCGATAGTTCTTTTCCGAGCCTTTTAAAACATTATAGACGGTCTTACGGGATACAGGAAACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCC:1 + chr3L 14467170 5' - S-element 463 1 79.00 GACATTTGAACTTCTGACAATTTCAGGCATATCGAACTAAAATAAAACAAAAAAAA:1 - chrX 4494518 5' + F-element 4682 1 73.21 GTTTCNCACATCGATCAGCACTACGGCAAGGCGCAGCCATTATAAGAGGTAGCCGGCAATGTTATCGTCACCACACATAAACCTTCTCAAGAAGTCTGTGG:1 + chrX 11349661 5' + gypsy7 5189 1 66.34 GAAGGTTGAATATTGATTTGTGTGGAGTCTTGTTTGTGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTC:1 + chr3R 20609593 5' - F-element 237 1 65.98 CAGCGTCCCACTCCGTGGGAATGTCATTTCGTACAAAAGTTTTCAATTTTTCCTTGGTTGTTTGCCGGCTGTGCACAGGTTTATGGCCCAATGCTGGGTC:1 - chr3L 18555718 5' - Gypsy6A_LTR 65 1 66.00 ACAAGNGGGGAATATGTTGCAATTGATTTGCTTAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCA:1 - chr3R 9231975 5' - copia 58 2 67.33 CCAGCTGCATTCGCCATTGCCTTTCACGATTTTCCTTTGATACGAATGCGTTGCATACTTCTCAGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr2L 15510482 5' - jockey 4987 1 70.53 GGACCTCCCGCATGACCGAGGTTTATAAAAAAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACG:1 - chr2L 21272139 5' + copia 4883 2 62.22 TCCTCCATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 14675623 5' + roo 8686 2 57.43 CCAGCGAACTGTGTTTCGAGTTCATTTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAAACTCTCGCTTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGC:1 + chrX 11728790 5' - Porto1 215 1 74.00 TCGCTTCTCTTTTATTTTCCATTTTTCACTCTGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAGGAGTACTTTG:1 - chr3R 27533748 5' - Doc2-element 4326 1 68.32 TTAAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chr2L 2078452 5' + I-element 45 1 73.27 AGCTTAATGGTGTGTTCTCCTCCGATCTCGTTCGCAGTTAGTGGTTTTTCGAGCATGTGGTTGGTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTT:1 - chr2L 7860617 5' - gypsy7 5009 1 51.16 GATACTTTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:2 + chrX 13640642 5' + P-element 45 1 34.65 TCTTCCTCAAACCCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chrX 8682637 5' + pogo 31 1 60.40 ATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 - chr3R 6117286 5' - Tirant 8455 2 76.24 GAGGCTTAAAAACACATGCTCATGTAAGCCACGTCCGCTGCAGTGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chr3R 22800219 5' + flea 4764 1 72.28 GTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 10952276 5' - roo 9033 1 59.41 CCCTGCCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 + chr3L 9909677 5' - Transpac 302 2 70.10 AAGTATCGCAATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:2 - chrX 10672367 5' - mdg1 394 2 51.49 AGAATAACGGTCATACTTTGATTTTGCACTATGTTACTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCT:1 + chr4 852880 5' + roo 389 2 64.36 AGCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 - chr2L 6601436 5' + I-element 52 1 71.29 GCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGC:1 - chrX 22945369 5' + BS 13 1 67.33 CATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3L 10143162 5' + 297 32 2 64.36 CCGCAGAGTGATGCGCTGCATTTGCACACTGAGTGAAATTCCATGAGCACACACACACACAGACACACGAAGAGAAATACATAACCCACCAACACTACCTA:1 + chr2R 20952936 5' + I-element 4967 1 77.23 AGGGTATTTCCCAATTCGACCCTAAGTTGGCCCTTCTCATAACACATAAATATGTTTCCTTGATTTTTTGGTAGCTAAGTAGTTGATTTATGTGTTTTTTG:1 + chr3R 9913722 5' - Porto1 4446 1 73.27 GGAAATATTTCAATCCCAAATTAATTCACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 7868948 5' + roo 8713 2 76.24 AGTAATTATCTGCATTAGTAATGGCTTACGAGTGCCGTACCAAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 22903915 5' + R2-element 3585 5 62.90 TCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAG:1 - chr2R 7552300 5' + springer 41 2 74.26 TTTCCCAGGCATATTTTTATCCATTCTTTTTTTCGCAACTAACCGAATACCGCTGCACTTTGGACCATGGCGGCAGCTTGCACAAATAATTCACTGATTTA:1 + chr2R 15482191 5' - TAHRE 244 1 74.26 TTCCTTTTTTGAATGGCAGGGCACAGGGAATTTCAAGGACTTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAA:1 - chr3L 9909676 5' + Transpac 139 2 59.41 GAGATTGAGTCCTACAATGCCTTCAAGAGATTCAACGAGAACCTCGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGCATATAAGCAATGCAT:1 + chr3R 25508077 5' + invader2 306 1 51.61 GAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACATTCTTGAGCAAAATCACAACTTTTAG:1 + chr3R 31887763 5' + HB 185 1 67.33 AAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 - chr3L 14638659 5' - 1360 20 1 58.42 GGATGAGAGTATGTACTTCAATTGGAGCAGTGGGTGAGAAAAATCTCGATGAATAATCGATAGGGCCGTCAGCTGTGACACACTAAAGTGAGGTCTTACTA:1 - 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Quasimodo 208 2 73.00 AAGGCACATTGTCTAAGTATTGGCGACAGAGACACAGACGGTGCTGAGATTGGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTGCTGCCTCTGTTAATTTAAG:1 - chrX 21933028 5' + G4 3778 1 55.45 CCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr2R 4606203 5' - 1360 3370 1 60.40 TAATAGTGACAAAGTCCTTGCCATATGCTTCGAAAAAACCACATGTTATTCACGGTATTTAAACAAACAGCAACAGGGGCTGAGTAACGGGTATCTAATAG:1 + chr3L 5879004 5' + INE-1 547 1 79.21 GATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 7255796 5' - P-element 2841 1 33.66 TAGGCAACGATAAAATAGCAACGCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2R 7887272 5' + jockey 28 1 56.84 CAGATATCTGTGAAATTGAAAAACTTCTTTCCCTCAGAAGAAGCTTCAGTTGGTCAGAGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTC:1 - chr3L 18159595 5' - F-element 4345 1 63.37 ATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATA:1 + chr2R 1320684 5' - 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F-element 463 1 56.32 ATATAGTTTAAACAGAGCCTTGAAATACATTTTGATCAGGATATCCGAGTCAATCTAGCCATGTCCGACTGTTCGTTTGAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 - chr2R 5772640 5' + INE-1 142 1 75.25 TATTTTCTCCAAGCCATTGTCATCGCTTTTTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTT:1 - chr2R 13295717 5' - Tirant 8462 2 69.31 CCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 15072646 5' - pogo 2069 1 61.00 CGCCTTTTGTTTTCCCCTGCAGCTGGCAGCTGTAATTAGTTGGGCCGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTG:1 + chrX 12354439 5' - Doc 499 1 75.25 TATGCGCATTTCTAACTAAACAAGCGGCGACCTTCGGCAATCATATTTTCTGTTTTATTTAATTTCATTTATTTTCGCTTATTTTTTTGTTTTTTTTTTGT:1 + chr3R 29786870 5' - G2 3076 5 62.38 TTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chr3L 7205556 5' + Doc 58 1 73.27 AGGCTAGACAAATAAAATAACAAAAAAATATATATTAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 + chrX 991995 5' + hobo 5 1 71.29 TTTTTGATTTTTGATATATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - 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Stalker2 7619 2 54.46 CAGATACTTCAATCATCTTATGTAAATATACAATAAATGTCCCAGGGATACATTTTAAGATTTTTCCGGCATTTTATCGGAGTAACGGGTATCTGATAGCC:1 + chr3R 4694364 5' + INE-1 549 1 68.32 TTATCCTCAATATCATAACATTCGAGCTCTTCTTTTTTTCGATTATATTCCATAATACCCCTTTCTATCATGGCGATTTTGTTTTGGGCAGCCTGAATGCA:1 + chrX 22934062 5' - BS3 1355 1 62.38 GACGCTTTCGTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 23571636 5' - roo 9035 1 61.39 GGCTTTATTAAGTGCTGGACAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 27981650 5' + roo 20 2 59.41 GGGAGGTCCTTATGCGCAGGGCATTACAGCAATGGCCGGCAATTACTTGGCAGCGCTGGTCGGATGCATGAGTCG:1 - chr2R 14557803 5' + Rt1c 368 1 66.67 AAAAGTACCGCTATTCGATGTAAAATCAAGAACAAACCATATCGAAAGTACGGTATAATATATATAATAGGGTATAATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:3 + chrX 22875500 5' + INE-1 15 1 50.50 CCACAGTCACGGCGACACTTCCGCTGGTGGGTCATTTTAAAGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTGTGGGTGTGGGTATAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr3R 11343140 5' - hobo 2938 1 74.26 TGGTGATATGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr3R 4834251 5' - mdg1 393 2 55.45 TAGCGAAGGAGGTTTGGGGAAATTTATGTGGGCACGCCTGTCAAAATTGGTAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTT:1 + chr2L 15731127 5' - I-element 5188 1 54.46 TGGGAATATAAAATGAAATAAAAAAGAGTTTATGGCCAAAAAGTGGGGAGAGCACTCAGTTGAGAGGGTCCTGTTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTAGAGA:1 + chr3L 10824840 5' - mdg3 5147 1 74.26 AAACCTTTAGACTGCTCTTTTATCGGATTGTGGGTCCGAGCTTTTCCAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCGTATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGGGTT:1 - chr3L 5074304 5' - Idefix 7185 2 60.40 ATTTGAGAAATAACGTATACTTTGTTATATTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3R 3060344 5' + opus 7156 4 72.28 TAAAGAATATATAGGTAATGCAATTGGTTAACAAAATTTTGATATAGATTATATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 + chrX 15082374 5' - mdg1 398 2 55.45 TTACGAGATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 2485964 5' + jockey 30 1 37.62 GGCCTTTAGGAAAGGTGGAAAAGGTCCATAAGGCGAGTGAGATGGTGAAAGTGATGACCCTGCCTACGATCGGTCTTGACAA:1 + chr3R 19447988 5' - gypsy9 4853 1 63.41 AGTATTTTTATTTAACCTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 + chr2R 3591959 5' + Quasimodo 6 2 73.27 TTACAGTTGCTTGAACTAGTTCTGCCTCCCTCTTGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCG:1 - chr3L 10371257 5' + Doc 304 1 66.00 GAGATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr3R 11119895 5' + 297 6586 2 74.26 AGTGTGAGTTGGCCTTTTCCGATTTGTTTTGCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr2R 24239337 5' + hobo 47 1 72.28 CACCGNGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACT:1 - chr3R 12047465 5' + Stalker2 7297 2 71.29 CCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACGTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAG:1 - chr3R 15072648 5' - pogo 2070 1 59.41 CAAAACCAATATGTAAAGTAGACGAAAAAAAGATTTTAAAAAACTCCCTCAATCAAAGTAATTCAAATTCAACTTTGAACATTTTGAAGAATGAAAAAAAA:1 + chr3R 9453262 5' + Transib-N1_DM 258 1 51.49 CACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATT:1 - chr2L 22684580 5' + transib3 46 1 57.43 GCAATAAAAAATAAGTTAATTAATTGAGCGAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 - chrX 2649916 5' + Tirant 8109 2 78.35 GACGGAAAGCGAAGTCAGAGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 - chrX 2799726 5' + Tirant 2 2 78.79 CGGGAGGCACGACCAAAAGGAATCCGTGGCGGGGTAGATGAGGCATTTGTGATTATTCTGAGCATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTAGGA:1 - chr2R 9456074 5' - Porto1 4308 1 55.45 ACACTTTTTATACGTTTATACTTTTTGATACAATAATTTGTGTAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCG:1 - chr3L 1194790 5' + X-element 48 1 62.38 AAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 16458063 5' + roo 8696 2 63.92 AAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chr3L 2019703 5' - 412 439 2 81.19 CCCTCCCGCAGTTCTTTGGCTACTTCCCCCTCTTTCCCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr2L 1544943 5' + blood 7179 2 56.52 ATTTCACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3L 18500938 5' + hobo 21 1 56.44 AGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTAT:1 + chr3R 19449300 5' - roo 8609 1 64.36 GCCAGCCCGCCCTTGCTCTGTCCATTCGGAGTGGCTGGAGATGGGCATAAAGTAATGATCGGAGCAGTATATGGTATTAAAAACGGACAAGTTGGTATTGA:1 + chr3L 1735124 5' - I-element 4998 1 80.20 CCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3R 20477047 5' + 412 39 2 62.38 TCGTCTTCAGCACACGGAGACCCTTGATGCCCAAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTCATTGTCCCACATCTCATATTTCA:1 - chr2L 7780793 5' + HMS-Beagle2 21 2 73.00 GATTTCATTCTCCCTTTGTCAACTGCCGTTCTTGCACGAGCTGTCGCTGCAGAGCCTCCAACATATTGGTAGTCTGAAATCTGACATCATTTCGAGACCCA:1 - chr3R 6301210 5' + gypsy4 6389 1 77.23 GGCTCCGACTTCGAGGCGCGTCGCAGCAAGAAGGTGGACAAGGCCAAGGCCAGCAAGGCACTGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTT:1 + chr3R 5615613 5' + invader4 2784 2 70.30 GCGAAACGATGCGTATACGTAATGTGCGTATACGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chrX 8972387 5' + 1360 40 1 65.35 ATACTNATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCT:1 + chr2R 5582161 5' + Cr1a 435 1 72.28 CTACATACCTCCGCCTCAATTTTACACAACAAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chrX 3763265 5' + 297 6581 1 78.22 TGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTT:1 + chr3R 9131761 5' - roo 9037 1 60.40 AAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 15305641 5' - roo 9037 1 63.37 ACGGAAATATGTTTTGTAGGCCCGCTGCACATGGCAAGCAAACAACTTGGCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTA:1 - chr2L 18430178 5' - copia 258 1 77.78 GATGCACATTGTCCACCGAAATGAGAAGTATGGAGATATCGATGAGGCAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGAC:1 + chr3R 31259271 5' - transib2 2680 1 52.48 TGTGGCTGTTTCCTTTTTTTGTTGTTTTTTATGTGTTTGGGCCATATTGTTTTCCCCACGCGCACATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chr3R 23048414 5' + mdg1 7052 2 63.37 GTTCAGTGCATTTATTAACAACATAAAGTGCCAAATCACGACAGGTGCCAAAATCTCGTTAAAGAAAAAAAAACTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTT:1 - chr3L 4630582 5' - hopper 1143 2 70.30 TGGTTGAAAGTAAAAGTTGTTCGCTCCATTCACTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCA:1 - chr3L 9392025 5' - P-element 119 1 39.60 CACTACCACTTTTGGCTATGAATGAGCCGCGTTTGTTCGACCGTTTCTTTTATTATGGCCATGCCCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chrX 18837044 5' + P-element 9 2 73.27 TATTAAGGTATGCGTACATGATTTTGGATTTGCCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATACTTTGCTTGCTTGTGTGAGTA:1 + chrX 12773600 5' - 1360 3255 1 66.34 AAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 - chr2R 13644488 5' + Burdock 6179 2 71.29 ACCAAGGATCCAAGAATCTGCCGCAATATTTGGATTTAGCCGTCCTCTCCATTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTT:1 - chr3L 25263348 5' + Burdock 6104 1 57.43 CCAGAAGGGACGCGGCGTGGTGGTGGTCGTCACTGGATCCTTGTTGATGTAAATGCAGTTGATGATGGGCTCAACTAAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 4559810 5' + gypsy7 5004 1 71.29 TTGGAGGACTGATTGCTTGAGGATCCTTGATTACTGGATGAGCCTTGATTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTTAGGTCTTTGTGCAGGG:1 + chr3R 17157941 5' - X-element 4354 2 54.46 GCAAGTGGGTCAATAGTGACGTCAGCAGGTGGAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAATGGGG:1 - chrX 8995614 5' - hopper 139 1 84.48 ATAATCCGTAATAACAGGGAATTACAATAATGAGGGGATGAGTAATTGGGATGTGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 18571194 5' - hobo 2918 1 58.00 AGCTAAAAATGGCAGCACAAATGCCATTCACATTTGCAGCCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCT:1 - chr2L 7757642 5' - invader2 296 1 57.69 TCTCCCTATAAGAATATCTAAAACAAGGGAACAACAATTTTGGATACCAATTTTAGCCCAAGCCCACCGACAATAATGACAGACCCACCAAACATTTACAA:1 + chr3R 2136552 5' + I-element 191 1 74.26 GGATACCAAAGAAGGTTCGGTGTATCAGAGAGTCTGCTCTGTTCGAGGTTCATTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCAC:1 - chr3R 1252357 5' - Stalker4 299 4 68.32 ATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chrX 21668921 5' - mdg1 416 2 73.27 TGGAACTTATCATATCACAGCGATATTGAACTCTTTTCTTTTCTCTCTCGCTAAAATGGAGTGGGCGGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chrX 6656243 5' + P-element 9 2 45.54 ACGACTACCAACAGATGGAGCCACAAAGTTAGGTGCAAAAAAAATCTAAACATTTTTTAAAATCGTGTTAGTTTTAAAACGGACATGGCCAGATCGACTCG:1 - chrX 20996633 5' - INE-1 108 1 70.30 GCCAGAATGCAATGGGTAACAACAAACACCCAATGGCGCGCCTTAAGCGAATTTCGGTGTGGGGCTGTGTGTTGTCATGGGTTATGTTTGTGTGTCCTA:1 + chr3L 6453989 5' - I-element 4954 1 60.61 CACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTAACACT:1 - chr3R 12047465 5' + Stalker2 7297 2 67.33 TTCCGTAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chrX 4366294 5' + jockey 4686 1 63.37 ATGTGGTTATGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 29259647 5' + pogo 27 1 54.00 TGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTT:1 + chr2R 19551985 5' - roo 389 2 53.41 TTATGGTCGAAACTTCAAAGTATTTCCTAAAATATAACAGAGCAGTCATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 + chrX 11730263 5' - jockey 4962 1 54.46 TATGTATATATTTTGTATTTACGAGTTCGAACCGAACACAGTTGGTTTTTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTA:1 - chr3L 26803039 5' - Rt1a 5035 1 60.40 CTTATGGAGTTACGGGGAATTCCATTTTCCAATGTGCATCGAAGTCATCAACAACGAGCAGTTCAAAAATCGAACTATCAACAATAGATTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 13876831 5' + BS4 730 3 55.45 TGTACATACATGTATGTACATGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCTA:1 - chrX 15089112 5' - gypsy 432 2 55.45 GCATACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGCGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2L 20238664 5' - hobo 2931 1 60.76 ACCCAAATGGGAGCTGAAAAGCTGATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 + chr2L 9774293 5' - 412 440 2 77.23 TGTACAATGAAGATGTTCTGCCAAATTATACAAGCAGATAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAAC:1 + chr2R 21710006 5' - Tc3 236 2 48.51 TATGGCAAATCGGTGGACTGGTGGGCCTATGGAGTACTGCTTTATGAGATGTTAGTGGGCCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr2R 16942241 5' + 297 45 2 66.34 CGTTTGGCCAGGATCAAGGCTCGAGGAATCGAGGATTCCAGGCCGGCGACTCTACGCTCAACTCGGGCAGATTGGTAGTCTGAAATCTGACATCATTTCAA:1 - chr3L 18407546 5' + gypsy4 6383 1 70.30 GCCCCTCTGCCACTTGAGCTGCCTCATCAAATCTTGCCACGCCCACTCTTACTCCCCAAAACGGCCACGCCCACATTTTTAAAAAATTGTTGGATATTTTT:1 + chr2R 22588086 5' + INE-1 384 1 67.33 TGGGATGGTTTTCCGTTTGTGTTTCCCAGCGTTTCTCCATTTTCTG:1 - chr2R 20028266 5' - Tc1 1597 1 80.43 TGCACTGCCCTGATGACCTTTTTGAAATTCAAAACGTTGGTAACATTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAACCTAACGG:1 + chr3L 23784602 5' + Transib5 109 1 50.50 TGTACTTATTTCTCCCTTCCATCTAAGGTTCTTTCTGAAGCGTATCGAGTGCTGCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - 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chrX 18837049 5' - P-element 2883 2 78.22 GACAACAAATCAAATGCAAATGGTAAACCGACCGCAAATAGAAAGTGAAAATCAAATACAAAACGCTACCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr2R 19944004 5' + 412 9 2 71.29 ATATTTGTATATTTACACTCAATGTACAGATCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTC:1 + chr3R 9994816 5' + Max-element 109 2 74.26 TAGTTTTGTGCAGTTTTCACGTGAATTAAATTACGCTTGTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chrX 22711706 5' + transib2 2 1 77.23 TTCATAAATATACAAATTTGGTCAATGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 12103840 5' + roo 8712 2 77.23 TGAGATAGTTTAGTGCTGAAGTTAGGTAGCGTAAGTTTGCTTCCATGGCTTGATTTGGTTTATATTGCATTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCA:1 - chr3R 1136955 5' - Stalker 6812 3 74.26 GAACTATGTGCCTGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2R 10444316 5' + P-element 16 1 61.86 CATGAAGCTTGTGTATCTCGTGAATGATGTGGGCAATGGTTCAATGGTTCTACGGATAGCTAGGGAAGGTAAATTAAAAGTAGTCTACATGAAT:1 - chr2R 14500730 5' - Cr1a 3975 1 55.32 GCCTGCGTCAGCGTGAACTATTTGTTGAGTGAATCTTGCCGTTAATTTATTCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCC:1 + chr3R 2520495 5' + Idefix 7047 2 54.46 GATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 7488866 5' + roo 41 2 69.31 CGAGAAGTATGGGACATTCTGGGCCAGAGCAACAGCTTTCCAGCCACGAAAAGATTGCGCTGATGTGGATGGGGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAA:1 + chrX 19363430 5' + FB 4 1 73.27 TTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 + chr2R 4547751 5' - HMS-Beagle 224 2 57.43 CGCCAGAGCCAATAGTCAGTCATCAAGGCTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 19019044 5' - hobo 2937 1 75.25 CGTGCCCCAATCCAACGAAATAGTTAAGTGGATACGAGAGGGCACAGTGAATGGAATCCATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTA:1 - chr2L 9169719 5' + gypsy5 6975 2 61.39 CACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 - chr2R 13644484 5' + Burdock 6183 2 75.25 CAGCGAAAAATGGGGCAAAAAGATTGTAAAAGCAAATGATTTTAATTATAGAAACGCACAAGAAAAGTAGCTTAAAACTATTTCATTTTTTATAAAGTCGT:1 + chr2R 16725055 5' - Tc1-2 378 1 74.26 CCAAGTAAATGATGATTATTGAGTGCTAACGGACACGTAACGTTGGCGCTAAGCTAAAGAGAATGCAACCAGATAAAAAAAAGTAAAAAAAAAA:1 + chr2R 14129669 5' + Doc 4692 8 61.70 GTCTGGCATTTCCGTTTTGTGTTGCAAAGTGCAAATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr2R 17626583 5' - mdg1 416 2 71.43 GCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGCCCGTTTAT:1 + chr2R 23584747 5' - HMS-Beagle 213 2 55.79 GTGGGNAGGGAAGGCGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGGGTAACTGTATGAAGGTTTTTAAGTTCCAGCAG:1 + chr3R 12277528 5' - Tirant 8448 2 79.21 CCGTGCACTTTGACGATTGGGTGTGTGTATGTTTCTTTCTGGCTGCGATTTATTTCAAGTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACG:1 + chrX 17044081 5' - copia 141 2 61.22 CATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTAC:1 + chr2R 12185323 5' - accord 7361 2 54.46 TAAAAATATTTCGCAGTCTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATT:1 + chr3R 22644170 5' - hopper 1358 1 79.21 CATTTAACTATAGCTATGGGTACGGGTTAGGTTGGGGATTCTCCTTTACATACGAAGGGTATATAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCG:2 + chr3R 26842776 5' + opus 8 2 69.31 GGAAGGAGAGGAGGCGTGGCCGGGAGTTATAGACGAGGCCTATGGCAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 + chrX 2799596 5' - Tirant 397 2 77.23 AAAGCTGTCAAAGCTCACACCGTTTCTACGGAAACGCTCAAGCCCTTTCAAGACCAGAGAGCGAACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCCAAGAACAGTTCCAAA:1 - chr3L 20577480 5' + Doc4-element 143 1 80.20 ATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chr2L 7255805 5' - P-element 2850 1 42.57 CACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAATTGGAAAT:1 - chr2L 14790635 5' - roo 9026 1 67.33 TCAGATTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 + chr3L 18337648 5' - Juan 4185 1 55.45 CACATAAATAGTCGAAAATCCATTTTGTCTACACGCGCAATTATCTGCACTTTAAAATGTACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:2 + chrX 6379114 5' + hopper 10 2 70.30 CCTAGTACTTATACTCGATCCGGATGTCCTGATGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCG:1 + chr3R 2446954 5' + 1360 107 1 68.32 GAGCGGGCGTTAGGTTAAAGATTAGATTAATCTCAGGTGGCGCAAGACGTTGAAAGGTGGGTTGGGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTCGGGTTCAT:1 + chr2R 10525026 5' - Doc3-element 417 1 72.28 CCGACAACAAAGGCTTACGCGGAAAAACATAAATTTTTTCTTTACGAAAACTTTTTGGGGTTTTTTTTAAGCTTTTTCGTTTTTTTTGTTCTTTTTCTTTT:1 + chr2R 6240939 5' - Doc2-element 218 1 71.29 GTTTGNTTTCAGTTTCGCATCGAAGAATGCCTTTTGTGAGGGCAGGCAGTCTGAACCGCTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCAT:1 - chrX 5169770 5' + Cr1a 249 1 61.39 GAACCNGCATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 20744252 5' - roo 404 1 67.33 AACCCCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAA:1 - chr3R 4834321 5' + mdg1 7073 2 57.43 AACCGAGCGCGTCCACATCCTACACTGAGAAAAAAAGGACATTATTAAGAACAAATTAAAATAAAATAAAAAA:1 - chr2L 4359420 5' + F-element 4680 1 80.82 TATGCTGTTTAATTGAAAAGTTTGATATAATTTAGCGAAAAAATGGAAAGAGAACGCTGTTATTCTTGCAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGG:1 + chr4 148253 5' - I-element 5133 1 75.25 TATTACCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAA:1 - chr2L 21635341 5' + F-element 489 1 49.50 TTTGCCCACTTTGGGTAGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 - chrX 10561874 5' + hobo 23 1 56.44 GGACACACTTTCACATTTACACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:2 + chr2L 19018921 5' + hobo 5 1 71.29 CCTTCTTTTTCTTTTTTTTTTATTACTT:1 - chr3R 21657468 5' - BS 5098 2 78.57 GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGT:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 7593 2 58.42 CATTACCTATATTTCTGCGCGATTCACTGATGGTCAGCGGTGGCATCGCATCCCGAGCGGAGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAG:1 + chr3L 12488549 5' + Max-element 8351 1 67.33 CATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGTTGGAAAATGCAAATTCAATCTGAAA:1 + chrX 22398528 5' - Gypsy6A_LTR 162 1 65.35 TTTCTATCTCTCTTTTTCCCGCATTGGTATTCCCCGATAACTGTTGTAGTAATATCTTTTTTTTTTTGTGTTGGTTGCTATTAATTCAGCCCTTTCATCCG:1 + chr2L 21128591 5' - BS3 1702 1 59.41 GTAATGGAGAAATGTAACTACCTATTTGGACATAAACCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATAT:1 - chrX 20708191 5' + I-element 5268 1 72.28 CAAAGACGGTGGCCACTCAAAATAAATAAAATCCGGTTCAGATACCATAGTATCTGATGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCC:1 - chrX 17057424 5' - 297 6560 1 71.29 ATCAAGCGATAGGAAGAACGCCACTTCAAATTGGTGAATATAATTATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTT:1 + chr3R 25946500 5' - Idefix 7227 2 61.39 CTTCTTAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr3R 20878431 5' + 297 3 2 70.30 AACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTAT:1 + chr3L 11257355 5' + 1360 3375 1 51.58 AGGCAATGAGCTTTTTTATTGACTTTGAGGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 + chrX 23048286 5' - hopper 1369 1 69.31 GCCACAGCAGCTGCAGGAGCTGGAGGCACTCTTCCAGAAGACCCACTATCCCGACGTCTTCCTGCGCGAGGTCTAAACCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGT:1 - chrX 8693347 5' + F-element 4498 1 71.72 CGACCTCAAATTTAAATCCGATTTTAAAGACGACAGCATTTACAATGATATATACGACATAGTGAGGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACT:1 + chr3L 20266152 5' + P-element 2803 1 78.22 GGAAGNCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chrX 2799646 5' - Tirant 8454 2 77.23 CTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr2L 14579849 5' + copia 4921 2 79.21 AAGCTGATTTTCAACGTTAATGATAAAAGTTTTAGCGCTTTAAACTCGGTTTGTGTGGGGTAGCCGTTTAAGGCAACTCCCTGGACGCACGACGACAACCT:1 - chrX 11025240 5' + aurora-element 95 1 58.42 TTGAGGTTGAGTCTGACACAGAAATTCCAATTCCAACTCACTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATAAG:1 - chr2L 14676467 5' - P-element 2610 1 45.54 AAAAAACGGAAGTAAGAACGCGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTCACAAAATATGCCCTTCAC:1 + chr2R 399363 5' + 1360 210 1 80.00 TTGTCTTTTGATAAGACTGAGCCAGAGTGGTCGCCCCAATCGTCAATTTGCTTAAAGGTGTTAGTTAGGTTTGTTATGTATGCAACAGGCAGAAGGATGCG:1 + chr2R 5529291 5' + INE-1 30 1 27.72 GTCCACTACCATCGCGCCTTTATTGCCCAAGCCGTACTAACCTTGTCCATGAATGCTGATGATGTAGAACTTGTCATCAACCCGGCGTATTACCCGATGAG:1 + chrX 876419 5' - Chimpo 4014 1 59.41 GTAATTTTAACAAAGAAACGGCTGGTACACATGTGGTAATTGAATATAAGGAAAATTCATACCTTATATATTACTTTTCCTTACATTCTACTTTTTT:1 - chr2R 17191185 5' - Copia1_DM 4160 1 91.75 CAGGCGGCAAAAGAGCGAAACGCGAAATCAACTTAAACATATGGATTAGCATGTAATATGCCACATTCGCACACAGGTCCACAGACTGGTGAAACACATAT:1 + chrX 10577760 5' + Helena 331 1 64.36 CAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr4 1149911 5' + 297 43 2 80.20 TCAGTTTTTTTTTTGGCGGAGAGCAGCGAACTCCAAACCAGAACAATGAGAACTTGACTTCGTTTGGAATAGAGAGAGCTTGA:1 - chr3L 8167824 5' - Doc3-element 447 1 66.27 GGGAAAAACATACTGCAAACTACAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCT:1 - chr3R 7738258 5' - Doc 367 1 77.00 CTCCGNTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAAC:1 + chr2L 18279895 5' + gypsy5 31 2 51.49 CAAATAAAAACGCACTAAAGCGAATGCTCGGAAAAGATGTGACTCGCATTCTGTGGGGGTTAAACATTTGCATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chr3R 26328284 5' - blood 371 2 66.34 ACGACGGCCAGGGAAAAATGCCAAAAAACCTGGTGGAAAAGTTCCTAACCATTCTGTTGAGACGCAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGA:1 - chr2R 16333849 5' + P-element 192 1 65.35 AGTCANTAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGT:1 - chr3L 18337707 5' + Juan 4057 1 56.44 ATTGGCATCCTTTAAAATATATTTCCACCATGGATTACTAAATATATGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCAT:1 + chr3R 10240088 5' + invader4 2787 2 62.38 TAACATTAAACTAAGTACTCATAGAAACCCATGACCGCATGAAATTAAGAACAACAAACAAAAACAACAATTTCGCTAGCCCGGGCTCAAGACCTTAACCA:1 - chr2L 8818587 5' + I-element 159 1 61.39 GCGAAAACCGAACCGAAAAGCCCAGCCGCATCAGCCTATGCATAGGGTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGAAACGTAATTATGCCTTCCTCATAATTCACTTA:1 - chr3L 1977151 5' + Tom1 14 1 78.22 GAATGATTGTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr2R 24479888 5' + I-element 25 1 56.32 TATATTCTAGTTTGCCCGTCCGTTTTAACGACGAGAACTGTAAAAGCCAGAAAGTTGAGAGCTATATATATACATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGA:1 - chr3L 23123628 5' + flea 4756 1 78.22 AAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 + chrX 17968380 5' + Tirant 51 2 78.22 AAAACCAACTTCTATGTTAGGTTCTAATTTTCCCATTTTGGATAAAGCAAACAAACCGGCACTTGTCACTCTAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTT:1 - chrX 12775200 5' - Bari1 256 1 56.44 ACTAAAATAGTTGAAGTAAAAACCATTATATTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2L 10180897 5' + pogo 42 1 70.30 GAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 27981739 5' - roo 9048 2 55.45 GCTGACTCGCTTTCAACCGCCCCGTTTATTTCCGTTCTGTTCCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCC:1 + chr2R 5787796 5' + Cr1a 4399 1 71.29 ATTAATCTGCGTATAAAGTAAATATAACAAATTTGTGTTCTTCGTCTGTCTGTATATTTTTTAACATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTCC:1 + chr2L 8544905 5' - G4 3567 1 67.33 ATATGACAAGGAATGCTATATGAAAAAGAAGAAGAATCTAACTTGATAATTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTAC:1 - chr3L 24123307 5' + GATE 38 2 53.00 TTTGANCAACATAGAACCCCACCGTTTGGGCGCAAGCCAACGGGGAAGTTAATGACATGAACACAAAGACACTAGAATTATTCGAGAGAGCCTGGAGCCAC:1 + chr2R 2946464 5' - 1360 77 1 61.39 AAAAGTGTTTGTGGGTTGAGTTGGGTATGCCATGCTAGCCAGAAAACTGAACTGAAACGACAAGACTGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATA:1 - chr3L 9907975 5' + jockey 4973 1 43.56 GCAATGAAAATTAATATAATTACCATTGTAATTGCAACTAAACAAGAACACAAGTTATAAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAA:1 - chr3L 17168326 5' + mdg1 416 2 64.36 TCTTTTAGCAATAAACTGTAACTGACTTAGGCAGTTTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTCAAGACCTAAATGACACACGGGAAAAACA:1 - chr2R 8322104 5' + baggins 5095 1 77.23 CCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAAT:1 - chrX 22824234 5' - Gypsy12A_LTR 2259 1 52.48 TTATAAGGTGGCATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAGAACTTTAATATTTTGAGGTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAAT:1 + chrX 21204917 5' - mdg1 7459 2 67.00 ACTTTTACATGCTCGACACTGCACTGAGGATAGCGACATTGCAACTAATGAGCAGTGAGTGATGTGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGA:1 - chr2R 8514546 5' - McClintock 156 2 72.28 TTTTTTTTGCAGTGTATTACTAAAATATTGCAGCCTGTGGTTGCGAGTCTTGTTGTTTTTGTTTTTGTGTTTTTTATTTTCTCTTTTTGTGGTTGATATTT:1 + chr3R 27738531 5' - I-element 100 1 54.46 ATAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCC:1 - chrX 15392021 5' + 1360 28 1 56.70 ATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chrX 20806944 5' + opus 7143 4 61.39 AAGCGAAGAGGTTACGGAACAGGAGCGTCGATTTCTGAAAGCCAGCCAATGTGGCTACCGGAATGGACAAGTGCTTGATCGACTCGGCTATTGTTCCT:1 + chr3R 4308352 5' - INE-1 96 1 74.49 CAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:2 + chr3R 8458223 5' + HMS-Beagle 6831 2 59.41 TCAGTGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 10143153 5' + 297 6603 2 58.00 AAGGGAATTTCGGTAATTCGAGAAATAATCAGCAACTTTTTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chrX 20620606 5' - pogo 2069 1 62.38 AATTTTTAAAATTTAATTTGCAGTTGTCTCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGT:1 - chr3R 19530735 5' + BS 3 1 69.31 ACTCCGCCAATAATTGCGAAGGCTCGCAATAAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCC:1 + chr4 759374 5' + F-element 4523 1 69.31 GCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 9907385 5' + jockey 60 1 71.29 TGATTTTTGATATATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATGTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCT:1 - chr2L 22098118 5' - roo 9062 1 51.49 TTGAAACGCGCGTGGTCTGCGAGTGAAACATACAAATTGTCAAGTCGAGGCCGCTGATCCTAAGCTAAATCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAA:1 - chrX 9267403 5' + 1360 3003 1 71.29 GCCAGTGAATATAATCGCTCGCTAATTGACTCTGCTTAGCTGCAAGGATATCCAAAGCTATACCTCAAAGAAAAGAGAACTCTCCGAATGGGCACTCTTAA:1 + chr2R 20948748 5' + Ivk 4937 1 75.25 AGGCGTTGTAACAGGGTCTCATTTTATGGGGCGATTTTAACAAACAAATTTAATAAGCTTTAAAATTATAAAAGTCAGGTCGCGAATTTTTAAAAATTATT:1 + chrX 3675694 5' + 1360 3085 1 71.29 GACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTAC:1 - chr2R 13585525 5' - Juan 4189 1 53.47 GAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 14638597 5' + 1360 15 1 66.34 AAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACACATAAC:1 - chr3L 24208182 5' + Quasimodo 40 2 71.29 CCTCCGAAATGGCACTATGTCTATACCTGGTTGGTTGGTTGGTTGGCTTTTATTGGTCGGACTACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACA:1 - chr3R 10553183 5' + I-element 124 1 76.24 TCAGTATAAGAAGGAGTACAGCCCGCTGAAACCGATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGTACCTTTACA:1 + chr2L 18114766 5' - Tc1 153 1 64.36 TTCGTNTTCATGTCAATCTGCACTCCACTAACCATTTTAAGGCCATTGACCCACTTGACCTGCCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCA:1 - chr3R 13429843 5' - flea 4548 1 66.34 GTGGATGTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAAC:1 - chr2L 3388146 5' + F-element 304 1 55.45 CTGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGA:1 + chrX 22077200 5' - gtwin 443 2 54.00 TCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 8345509 5' - roo 9032 1 64.36 GCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:2 + chr3R 17495760 5' + Quasimodo 32 2 71.29 CAAATGACTGACTGCCTCTGAAACTGCCAACCTGGTACTGCGTTAAACCATCGAAGGGAAGGCAGCTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAAT:1 + chr3R 7882611 5' - Burdock 5955 1 78.22 CAAACCATAAAAGCCATTTAGTTGGTAATTTACACAACAAACGACACATTGAAAGGGGCAACGAAAAATCCTGGTACCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGA:1 + chr3R 21967560 5' + jockey 4616 1 75.25 AGTAGCTTCGGATACGATTTCGTTGTTTTCCTTTTTCAATTGAGGGCGGGCGAAGTTTAGAGAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAA:1 - chr3R 17654462 5' + F-element 273 1 68.32 CAATTCCTGCACTTTATGATGCATGTCCTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTAGAAAATGAAGTCCGTTTATGTTATGCATGGAGTATGTAGTAGGGATTA:1 + chrX 4014595 5' + G4 3748 1 66.34 TTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:2 + chr3L 19951174 5' + Ivk 6 1 73.27 CTTTATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCG:1 + chrX 22596367 5' - INE-1 570 1 58.42 AGTGGCAACTTGAAGAGCAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3L 13659882 5' + pogo 24 1 53.47 GGCTTGAATGGCCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chrX 18836962 5' + P-element 39 1 42.57 TTCGTTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 + chr3R 7388323 5' + HMS-Beagle 6810 2 65.35 TATGTGTATGGACGATTTTTCACGCTCGTCACCGATCATAGCCCGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTAT:1 - chr3L 23182555 5' - diver2 303 2 56.44 CACTATTATCAACTGCAGTTGTTTTAATGGCTGCACCGACGAACGAAACACATCGTCCACATCCACGAGGATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCAT:1 - chrX 11517809 5' + Tirant 8049 1 74.26 ATTTACCTCGACTATTAAATATTTTGAATACAGCTCAAGAACAAGAAGCATTTAATTTTTTAATAATATTTTTCAAAGAAAACAACATAAAAAAAAATAAA:1 + chr3R 13798066 5' + jockey 4999 1 70.30 AAGGCCAGCGTTCCACTGGACTGGCCAGTCTCTATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTGCTCCTCGCTTGGCTCTCCTTCCTTCCCGCAAGGTATTCACC:1 + chr2R 13303098 5' + Max-element 8360 1 71.29 TTCAGCAATACCATGTATGCGAACTTACAGCAAAGGACTTGAACAAAATGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr2R 1072645 5' - pogo 2076 1 55.45 GTCCGGCCGACGCTCTCAGCTTTACCAACAGATACCAGATAAGAATAAGACTACCATATGTTTCTCGAGAGTGGAAAAACCCCAACTCTAGATAAGTCACC:1 - chr2L 22181966 5' + Idefix 6973 2 76.24 AACTCTAAAACAAATTTACATTGTCGCTTGCAATTTGCAACATGAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2L 14612030 5' + roo 31 2 59.41 TTTTCTGGTTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 21174230 5' + roo 8694 2 66.33 TAAATATGCTCCAAAGCAATTTCATCCGACTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCTAACTA:1 - chr3R 9420394 5' + Ivk 5098 1 74.26 ATATACATATATATATATCAAATGGGCCAGCAATTATATAGACATGCACTTACTTATATACATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTT:1 + chr2L 10898172 5' - 17.6 7408 2 67.33 TTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chrX 20806876 5' - opus 459 2 74.26 ATTGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACTGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - chr2R 4483272 5' + Ivk 29 1 50.50 AATAACAAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3R 31101338 5' + 297 27 2 58.42 GAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 19449986 5' - roo 9036 1 61.39 CCTTTCAGTACGTCTGTGTATGTGAGTGTGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCT:1 + chr3L 20884662 5' - jockey 4691 1 71.29 GGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chrX 21668928 5' - mdg1 7447 2 66.34 TACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 19989334 5' + hobo 21 1 59.41 GCCAAGTTTAAGAGCGTTCGCTTTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCCAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 13538900 5' + hobo 4 1 75.25 CTACTATAATTATTCGTTGCGTTTAGAGATCGGAACAGTCCGCAGTAACATTCTTCTAGATTGCGAAAATATAGTAATATTATTTATTTGATTATTCTAAT:1 + chr2L 3889165 5' - jockey 4820 1 69.31 CAGTGTGACGAAGAGTTGAAAAAAAACAGGAGGGAGTTGAAATTATTAAAAAAAAAAACACGCCACAAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATG:1 + chr2R 2725095 5' - Tc1-2 1422 1 66.34 CACTTTACAAAGTTCTTTCAACTCGTCACCAAATTTGGTTTGTGTTACTTTTTACTTCCTCCAAGATGGTTCACATAGTTTCAAGTGATTTGGTCAACTTT:1 - chr2R 3141461 5' - transib1 2036 1 75.25 CAGTTGATCAACTGGTTAGAATCCACTCCCCTGGATGCTAAATCTGCTGGAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTA:1 - chr3R 19446500 5' + 297 165 2 53.47 ATAAATTTAAACACTAGTTGTTTTATTTGATATTAATACAGCACTTTAATTCATAAATAAATTCATTATGCATAATAAATTGATTATATTTTTGAGCTTTT:1 - chr2L 9420142 5' - TAHRE 19 1 69.31 CTTTTTGCGAATATTCGTCGATTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGTAGA:1 - chr2L 13320576 5' - hobo 71 1 60.38 CCATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr3L 9909682 5' - Transpac 5212 2 62.38 TATTTTTATTTATTTTATTAATAAGGCAATGATTGTTTGAGTGAACTGAATGAACAGTTTTCATTTGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCATC:1 - chr2L 21745537 5' + 1360 3283 1 63.37 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATAGAGAGACTCTCTCTCCGGCTGTTCGCTTTTTTTTCTCTCTCTTTTTT:1 + chrX 12649915 5' - transib2 2428 1 64.29 GGGAAATTCCCGTGGAGCTGGTGCATCAAGTCAAGCACGATGTCCTTCGTTGCCTGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCT:1 - chr3L 6493035 5' + Ivk 324 1 58.42 ATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3R 7522363 5' - blood 7350 2 65.35 GATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3R 23275263 5' - roo 9034 1 64.36 AAAAAAAAAATTGGAAAAGTGTGAGCTTGATAATTTAGTGTTTGTGGGCGTCAGAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATC:1 - chrX 5858216 5' + F-element 129 1 56.44 CTTATTGTTATGAAATCCCACGCAGACTTTCTTGGTAAATAGCTTGTCTTGATTTGCGTTCCGAACTTACCACGTTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCT:1 - chr3R 2465783 5' - F-element 4338 1 57.43 TAATATATCATAGTGTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 + chr3R 13582203 5' + BS 5006 1 66.34 AACCGAAACGTGCAACCAGCCAGAAGAGACAAAGAATATTGTATAACGCTTTTTTTCCCATGTACCACATTTTGTTTTCCTGCTTTGTTTTGCTCTTTTT:1 + chr2R 16728235 5' + S-element 245 1 80.00 GGACGCTGGCTGGTGGAGATACCGCCCGTTCCCAGAGGCGTTGTTGGCGAGCTTCTTGCGCAGAGCTGCGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTC:1 - chr3L 1567307 5' - G6 476 1 65.35 CCGGCATTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chr2L 20132969 5' + flea 4766 2 68.32 TGAGAGGAATGATTGTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr2R 24479882 5' + I-element 33 1 56.44 ATAAAATAATTTTTAAAAATTCACTGTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGTGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGA:1 + chr3L 14971177 5' - 1360 91 1 72.28 CCTTTAACTAGGCTAAGGTCTTAAAAAATATATAAAAATATCTATATCTCTGAATCTCTGCATGCCTAATTCCAACTTTATAGCTTTTATAGTTCCTGAAA:1 - chr3R 1193146 5' - INE-1 152 1 66.34 ACCTCTTGAATGTTCTTGTTGCATTTTTCATTTAAATACATCTGAGCTAAAGACTTTTGATTCCTTTACATTCGCATTTACACAAACAATTATCAAACCTT:1 + chr3L 17198099 5' + Porto1 305 1 78.22 TATGAACTGCCACATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTAT:1 - chr2L 3951666 5' + Transpac 22 2 57.43 CCGTCCACCGGGCGTTTAATAAAAATGCGTTTATGGAATAAGTAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCA:1 + chr2R 12239454 5' + gypsy4 477 1 57.43 GTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCA:1 - chr3L 12888266 5' + mdg1 7094 2 79.21 ATTGAAGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 16458070 5' + roo 8686 2 55.32 AACTTTGCCCGTGTAAATAACAAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3R 31101728 5' + 297 6593 2 55.45 AAATCAAATGCAAATTGATCGGGAATGCAAATCTGGAAGACAAGAAGAGAGCACGCTATGTTGGAGTTATCCGACTAACGGATACCCATTACTCAGCTAGT:1 - chr2R 9418367 5' - INE-1 542 1 62.38 TATGTGGTAGTTTAGTTTCTGCTAGTTTTCAATAGCTGTCGAGTAATAAACGTAGGCGAGTTGTGCATGCAAGCTCAATTCTTAATCTTATTCATTAATGT:1 - chr3R 5972203 5' + Gypsy12A_LTR 2126 1 74.26 AGCTAATAAGCTTTTTTTATTAGCTGTTTTTTTTGCAATTAAAAGACGAGGTTTATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTCTTATTATGTGTTGTTAT:1 - chr2R 1751002 5' - hopper 1126 1 54.46 AACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 12103803 5' - roo 360 2 75.25 TTTATAAAATAAATAAAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATATCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCACACGCCGCAAG:1 + chr2L 21745538 5' - 1360 426 1 99.01 TCTATGTAATAACCCCTGATACTAAAAACACATGAAACCAGTTTACATTTTTACTTACACTTAAGCGCATAATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTC:1 + chr2L 16179987 5' + rover 7078 2 75.25 GATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3R 19446123 5' + 297 6583 2 76.24 TATTTCATGCTTGTATGAAGAGCGATTTTAATTGAAGTTTTATTGTATTTTATTGTATTTTATTTATCTTGTTCACAGAGATAAATAAGGTTTTTAACACA:1 + chrX 14026965 5' - Porto1 129 1 66.34 CTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:2 + chr2R 7032152 5' - mdg1 371 2 75.25 CTCTGCCCGCCCACTTTTGCCCGGGCGTCGATTAAGGCGGCGGGTAATTAATTTTCCTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chr2R 21785237 5' - Doc2-element 245 2 79.73 TAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3R 20878436 5' + 297 6 2 66.67 AACATACATTGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3R 13376051 5' - 1360 3373 1 64.36 GATGCAGGGGCTTCTATTCTAAGAGGTGGAGGAGAAGGTCGCAGGACGCACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 16674952 5' + roo 5 2 74.26 ATCCCATTTTGTAGCTTTTCAGCCTAACAGCTATTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGA:1 - chr2R 13645162 5' - Burdock 6302 2 67.33 GCAAGTACTTAACTGCTTGATGTTGTCAATTTAAATTAAAACCACTGCCGGTCAAAAGCGTAGACAGAGTGTGTTGAGGCGGCTCTATGAGTGTGTTCGTT:1 - chr2L 1249822 5' + Circe 217 2 55.45 AGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCG:1 - chr2R 5924411 5' - jockey 4730 1 39.60 GTAGAGCAACTTGCCGGTTATTAGAAACAACCTTTGAAGGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 3771644 5' - roo 9036 1 59.41 CTTAACGATGAAAATCCAATTTAAGGCTGCCTCAGTTGTTCGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATG:1 + chr2L 3662184 5' + accord 28 2 61.05 AAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAATATAAGGTATTGGTATTTGTAATGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 27981748 5' - roo 395 1 61.00 ATAAATTAAATTAGCATATGTGTGCACGTTTATGTGTCCTCTTTGAACAAAGTTGCTACTAATTAAAAATGGCTGGGGGAAAATCAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chrX 2820381 5' + Doc 4698 4 88.12 ACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:2 - chr2L 16674903 5' + roo 8718 2 81.19 ATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 8555834 5' - 412 7528 2 60.40 TATTTGTGGGCAGTTTTTGGCCACTCCGTTGTTCGTGCCTCTGTCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACTGAAGGAATCTTCTTACATTTCCCTTCTTCAACA:1 - chr2R 20508708 5' - invader4 2973 2 71.29 GCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chrX 20806919 5' + opus 7168 4 79.21 CCCGAGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 - chr2L 16948754 5' + jockey 4677 1 74.26 AATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chr2R 4547748 5' - HMS-Beagle 7023 2 60.40 GTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr2L 12949219 5' - 412 7505 2 67.33 CATTCTCGATTCTGCTCAGAGCACATATATACAGCTTCACGATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGATTTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGGA:1 - chr3L 19206692 5' - Max-element 343 1 59.41 CTTAAACTTATGTATACATATATTTTAAAAGATATCTTGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCC:1 - chr2L 5393936 5' + F-element 4496 1 62.38 TTTATTTTCCGATACTCGAAACAGAAACATCATCTATACGTTTTGTTCTAAAAAATAATTTGTGAAATATATAATTTAATCATTTAAATTTTAAAATTTAT:1 + chr2L 5195652 5' - 1360 3038 1 79.21 CAAGGACGGCCCAAACAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGA:1 + chr2L 12325759 5' + jockey 4726 1 76.24 GCAGAAGACGAAAAACCTCGTTTCCAATTGGCGGGACAGGCAGCCGAAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGGAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAG:1 - chr3L 24862576 5' - diver2 4673 2 76.24 TCTTGCTGAGTCCCGCCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGCAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2L 20622765 5' + Doc 8 1 50.50 CTATTTTTAGTCTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTG:1 + chr2R 4854955 5' - opus 498 1 79.21 TATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 + chr2R 24479897 5' + I-element 48 1 71.29 GGTATATTTTGCTTACTCCATTGAATTCCTTCTTCGATAAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCAAAACCAATGTATGGCCGTT:1 + chr3L 23839986 5' + 1360 3361 1 74.26 TGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 13225513 5' + hobo 47 1 71.29 CAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACAAATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 11263455 5' + roo 8704 2 67.33 CATGTTCTGCCAAAAAGAGCGATCGATCCGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATTCGGAATGGCAAAGCTCTCTCCATTTTTTTCTTTTCTTTTTTTT:1 - chrX 2929700 5' + hopper 143 8 86.14 CATCTAAATTAGTTTTTTTTTTTATTC:1 - chrX 19173518 5' - Copia1_DM 292 1 96.30 AATTTATTTGGCAAAAACACACAGTCAGTCGGTCGATTCACTGTAATTTTGAGGAGTGTGCTCGGGTACATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCG:1 + chr3R 11453894 5' - gypsy10 31 2 71.00 CCCGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr2L 3632162 5' + P-element 51 1 31.68 GGAAAGTGTGTGTGAGCAAGCCGGGTGCCAAGTGCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGAT:1 - chr3R 28475216 5' + hopper 41 1 67.33 ATCTGTTTCTGGTGATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 23275250 5' - roo 9047 1 54.46 TAATAAACAACATTTATGATACAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chr3R 4543998 5' + flea 32 2 60.40 GTTGTCTGTTTGTCCGTGCATGCCGTCAATGCCGCCTCGCATTACGCTGACCCTTGCACATCGCTTTCGCTAAAGCGAAATGCGTTACTGGGCTGGCTCAG:1 + chr3L 19349307 5' - gypsy10 86 2 69.31 GAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 4876793 5' + roo 39 2 65.35 CACTCAACCAACTGGCCACAAGCCACATCAAATTCACACAGCCCAGAATGTCAACAAACACATACCTGTGACTACTCCTGAGGTTCCCAGCGACTCGGTGC:1 + chr3L 5727139 5' + HeT-A 5715 1 56.44 AATCCGTATGGATTGTTGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTC:1 - chr3L 18337739 5' + Juan 4025 1 78.22 ATTTGGGTATATATATATGGGGATATACATGAAGCATACACATTATATTATTAATTATTACTATTAAAAAAGATCAAGAATTGAGCGTGCTTGCGACAAAA:1 - chr3L 12187388 5' - Gypsy12A_LTR 2104 1 50.50 AAAGCTTAAAGTGTCGTAATTAAAAGCAGCCAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAA:1 - chr2R 14708523 5' + Doc 332 1 70.00 GGTTCTTCCTTTTTGGTAATAGGTGTAGAAAACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGAT:1 + chr4 395140 5' + HMS-Beagle 210 2 69.31 GTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2L 12949219 5' - 412 466 2 62.07 ACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2R 981625 5' + 1360 3 2 60.40 TCATTTCTTTTCTCTCTCTGTATCTCGGCGTATTCCCCTATTTTTGTTTCCGCCCTCTCCTTTTTAAAATTTATTTTTTCTGATAGTCGAGAAATTCGACT:1 + chr3R 6482008 5' + INE-1 562 1 62.38 AAAAATTTACAAAAAATTTTCAAAAATGGAAGCGTGGAAGTTTTCGGCGGTTTCCATAGAAATTTTCAATACGAAAATTGGCAGATGCCGCTATGAAGCTT:1 - chr2L 9693188 5' + gypsy3 85 2 73.27 GCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 12103783 5' - roo 9044 1 55.45 GTAAANAGATCTTCAGCTACATACATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr3R 8975991 5' - Bari1 1654 1 78.22 ACTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2R 9870953 5' - roo 406 1 76.24 CAAGAAAACAGAACAACAAGATAACAAAAAAAAAAGAAAAAAATAGTGCTAGTGGGAGGCAGCAGGCTGGCGGAGTGGAAAATGGGAAAGCGAAAGAGACG:1 - chrX 4985211 5' + F-element 110 1 70.30 CGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:2 - chrX 2649873 5' + Tirant 8156 2 72.28 GCACAAAAACTCCTGGCCGGCAATTTCGTGACTGGTTTTCCACTTGCACTTTGCCTGAATGTAGTGAACCATGTGACAATTGATTTGCGGTCTGGGACGTT:1 - chrX 22513167 5' - mariner2 251 1 58.42 AGATTTAAAAACAGTGTTAAAGGAATTTCACGAAGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:1 - chr2R 2311286 5' + hopper 36 1 72.34 TTGTTNATTTTCCGGTTGCGTGAAATTTTTGAACAAAAAAGAAAAACAGAAACCTAGTTATTTCTTATCAGTGTGAGTAATACATACATACATATTACAAA:1 + chr3L 7495560 5' - Dm88 4374 2 72.28 TTTCCCAATCAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:2 - chr3R 11094586 5' + 3S18 5784 2 60.40 ACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTC:1 - chr2R 7552315 5' + springer 7163 2 59.41 CAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGAT:1 + chr3R 20137279 5' + Burdock 6182 2 74.26 ATTTGAAAATGCGGCGACTGTTGCTGTAAATGGATCCTACCACTTGACGGCTGTCGCTGCAATCAAAATTATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTAC:1 - chr2R 12237871 5' - Ivk 4966 1 81.44 ACACCATAGAGCATTCAATTTTTTCAGATGTGGTAAAAAATATAATTCCAGCAAGAGTATATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCT:1 + chr2L 15883615 5' - R1A1-element 194 1 59.41 GCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGC:1 - chrX 21994001 5' + McClintock 5960 2 70.30 CACCTGAATTCCATGGCTTCCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr2R 5804510 5' - P-element 2832 1 25.74 ATACGCAGTGCTGCCAGGTAATTGTTTAGAGACTCTCCTGTCTTCTGATCACTCTGCGGCAGAGGCACGGACAGCCCCTGCAGCTGAGTGAGATCCGATCG:1 + chr3L 23593486 5' + invader4 2878 2 50.50 CGCATATAATTTCGCTTATTTTGAGTGTAGCCCAAGAAACAAGGAAAAAAGTCTCGCATTTGCCTTGGAGTATGAAGAGAAGCCTATCGAGTTCTGGTTTG:1 - chr2R 4818259 5' + Bari2 628 1 71.29 AAACAATTCCTCTGTTTTCTTTAACTGAAAGGAGTGCAATTAAAGTTACACGCGAGAGGTATATTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTGATA:1 - chr3R 4489504 5' + Tc1-2 153 1 73.27 AGATATGATTTATATATTCGTACTCGTACTTTTTGGCAGTAATATGCAGCAGCTATAAAATATAAATAATCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAT:1 + chrX 10672270 5' + mdg1 9 2 68.32 ACTGGTCTTTCTCGCGGTGTAGGCTTCTGCTTTGTTTGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGTTTGGAGAAAATTTAGTGGTGGCATTTA:1 + chr3R 30800525 5' - Bica 4445 1 67.33 TGGAGACAACTTTACTGACATGACCAAGCTGAGGGAGTTGACCAAGAAGTTCAGGGAACGCCAGTGTGTGTAGGACATTAGAGAATTTGATGAAAAAGGGA:1 + chr3R 30962032 5' + invader4 206 2 62.38 CACGCACACACACTCGCACATTCCCATAATGTTGAAAAGAGGAAAATTAAATCCTTGCGACTGAAACTGTTTACTTTGCATGGACACACACACACACACAC:1 - chr3L 14890629 5' + accord 7027 2 52.48 GCCCATCAGATGGAGTCGGTAAAACTAAAAAAAAAACC:1 + chr3R 31355878 5' - Tc1 1474 1 81.58 AAATTCCTGATCTAACAAGAAATTTGTTTCACTAAGCTAGTATAAAAAATGCACAAACTTAAGACCTATGATACTTTCCATTGAATTTGTTTTCTAATTTC:1 + chr2L 2401464 5' + S-element 1580 2 77.23 AGTTTAACAGAAGTTTAATGGAAATGAAAGCTTTGCAACAGTTGATTTTTTAATTGATAATGGCGCTTACAAAATTTAATAAATATAAAAATAAAAATATA:1 + chr3L 19323875 5' + Stalker 88 4 76.24 TCAAANATATAGAACCAATACATTGGTTTCTAAAAAAGCTTTGGTACCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 - chr2R 7032206 5' + mdg1 29 2 56.44 GCTTGNGTTTTCCCATGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 23167272 5' - Porto1 171 1 75.00 ACATCAGCTCTTTGAAGTCAGCATAAATTTTACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGA:1 - chr3R 17454458 5' + jockey 4717 1 74.26 CTTGGATTGCGTTGCGCAACATAAAACCGGAACGGAATAATGGAATGGGGCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTAT:1 + chr3R 31102354 5' + 297 395 1 53.47 TCCTGCTAGGTAATGGCACGCATGAGGATACCGGTACTGGTACAAGTGTATGTATGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 17929035 5' + hobo 21 1 58.42 CACACACAGCAATCGTCGCATGCCAGTCACGTAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCA:1 + chr3R 28240999 5' + 297 6518 1 68.00 AAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTA:1 - chr3R 20147558 5' - 1360 375 1 56.44 CATGTGTCATCAAAGAAAAAAAAAAATATATATATATAAGTTAACGCAGATTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 21010920 5' - opus 7462 2 71.43 GCGCAGACGCAGTCCGCTGTCTCTTTGCCTCTTGAGTTTGGCTTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGC:1 - chr3L 2145618 5' + copia 4771 1 57.43 TCTAAATAACTACTTTTGCTTGCCAGTTAACTGTAGCGAGCGCGCACTGTGCATTTTTGTGAATGTGTGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTAT:1 + chr3R 5686621 5' + P-element 398 1 75.25 CTACGCCATGAAATTGAGGCCAAACAACGATGCCTGTGTGGTCTGTTACTTTGGTGAGGGAGCTGCTTCCGAGGGAGGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr3R 9556636 5' - hopper 1373 2 76.24 TTAAAAAAAAATGCGAGCTCACGCACAGTTTGACATGCACTTTTAATCGATTAAAAAAAAAAAGTCAGAGTATGTAAATTATTCGTGAATATATGTTTTC:1 - chr2L 3736567 5' + transib4 298 1 60.00 AAAAGTTAGACCTAGAATGTAAAGTTGCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2L 10715318 5' - pogo 2050 1 45.54 GGCAAGAAGAACATACTTCCCCATCCTTGTGCATACGTGTGCACACATACTGTTGCCGGCTATCACTGTATGAGTAGAAAAGAGCTCTTCGCTGTAGAGCT:1 - chrX 22917419 5' - 1360 125 1 71.29 GGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 24760563 5' - pogo 2053 1 78.22 CGATCTAGTGATTACCCACATGCTTAACAATCTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGT:1 + chr3L 13047165 5' - opus 365 2 73.27 GAATTACATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCGCCGCCTAATCCAAACTTCAATCAAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCA:1 + chr3R 23020831 5' - INE-1 563 1 42.00 GCACACCGGGAGAAATTACTCCTGAAGCATTTAAAGCCTGATAATTTCTTTAGTAAATATCAAGCATTAAAACAAATTTAATTAGAATTAAAATAAAATTC:1 + chr3L 5072385 5' - Rt1b 123 1 52.48 GACCAAATGAGCAAGGCTGTTGGGTGAATGTGTGAGTGGGGTAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAG:1 + chr2L 8566572 5' + blood 481 1 58.42 ACTTGCAGCCAAAGACTAATCCTCTCACCCTTACCTTCATATACACACACCACAAATTAATAACAGTCCAACAAAAAACAATAAAAAAAAAAATAAAAAAA:1 - chrX 1309887 5' + BS 5102 4 78.22 TCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGCACAAT:1 + chr3L 6044743 5' + Tabor 36 2 55.45 AACGAATCGATGGCAAATGGGGATCGATGGAGCCGCAGTAAACGCAATTTGGAAACCCGGTGAAATTAAATTTTTTTTATCATTAATGTTTTTAAATTTTT:1 + chr2R 19521417 5' - looper1 1815 1 64.36 TGCATATAGAAGGAACTACTATCCTATTTCGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 - chr2R 9770226 5' + I-element 47 1 74.26 ACCGCTGCCACCGCTGCCGCTCGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCTTGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCAC:1 + chrX 12520449 5' - R1A1-element 4992 1 76.24 TTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2L 12324115 5' + roo 8682 2 63.37 CACATGCAAGGCCACTCAAACCAAGTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCT:1 + chr3R 20481736 5' + 412 7450 2 78.22 GAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 18950754 5' - roo 9026 1 71.29 GAGGTCCTTTCAAAAGTAGGGGGGTGGCCGAAAAAAAAAATAAAAGAAGTGGAA:1 + chrX 12247707 5' + gypsy2 404 1 85.19 TGGCAAGTTCCCACGGCGAGACACGACCACGGCTCCCATTCCTTTGGCCTGCGCTTCAAGTGGCTCAAGTGGCCCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGTG:1 + chr2L 5933732 5' - accord 7026 2 69.31 CGTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 - chr2L 6083779 5' + 3S18 5797 2 55.45 CACCCAGCTACAGATGCAAATCCACTCGCAATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCAT:1 - chr3L 451349 5' + P-element 2833 1 33.66 TACAAAATATCAGAAAATTAACCAATGAGCAAAAGGCAATATTTTTGTTTAAATGAATAAGTATTTGTTGGAAATGTTGTAGAACATATTAATAATGAACA:1 - chr3R 24344392 5' + transib3 2507 1 70.30 TTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chrX 10561844 5' + hobo 53 1 74.26 GTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 + chr2R 13078726 5' + jockey 4672 1 61.39 TCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCG:1 + chr3R 19449916 5' - roo 8681 2 77.23 CATCCGCATGCCCATCCTCAACATAACATCCTCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chrX 17042665 5' + copia 45 2 70.30 GAAAAAGTTGTACTATGCGTTTAGTTCATGTTGAATTTGCCGGTCAGTACGTAGAACTCCAAAATAGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 16245015 5' + 1360 7 2 72.28 ATATGCTCATACTCCACGGGCATAGCAAGAGAGAACGCTGTAGTTGAGTTCCTAGACTAATTCCCATATACGGTTTATGCAAAGACACTAGAATATTATTC:1 - chr2L 21929950 5' - Tc3 310 1 78.22 CGACGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 - chr3L 12888275 5' + mdg1 47 2 70.30 CTTGANCTATGCAAGGCTTTATTTTTGCGACATCAGCTCTTTGAAGTCAGCATAAATTTTACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 - chr3R 17454487 5' + jockey 4688 1 58.42 GGACTGGTCGCCGTAACTTTGATTGTTCCTGTAACCCTGTGGGGGTTGCCTGAAGCGCGAGGATACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGT:1 - chr3R 3195411 5' - Porto1 4546 1 62.38 GCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chr2R 16988243 5' - opus 447 2 76.24 ACGAAAAAACGCAGTAAGTAGCTAAACGAAATGCTCTTCATTTATGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACC:1 + chr2L 21888175 5' - accord 7066 2 55.45 TCTTTAAAAATAAGGTTCAAGATAACGTTTCTGGCGCTATAAAAAATACATTTACACTTTATGACGAGTTTCGATTAGAAAAGAAATAGAACGGAAACTCA:1 + chr2R 5783584 5' - Gypsy12A_LTR 244 1 74.26 AAATCGGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 + chr2L 17646188 5' + flea 48 2 76.24 AATGAAAGCCAGAAAAAATTGTGGGATCACTGTGTTTGGGTCAGGAACTTGCCACAAAATAGTCGAATTAATAAAGATTTATTCTTAATGTATACGCACGG:1 - chr2L 12780758 5' - accord 346 2 78.22 AACTAGACCTCCTCTATGGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTCT:1 + chrX 6510242 5' - Max-element 8232 1 76.00 CAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2R 18950757 5' - roo 9023 2 74.26 CGACAAGGTCGCAGTGGCAGCTAAAGTTTTTCTTTTTTTTTTTG:1 - chrX 7253543 5' - HMS-Beagle2 491 1 93.18 TGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 27981730 5' - roo 9039 1 59.41 CAGACGCAAGCCCTGATGTACAAAATCGCGCACCATTATTATCCTTGGCCCAGCTGTACGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAG:1 - chrX 21199833 5' - accord 7076 2 68.32 AGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr2L 13574221 5' - pogo 2052 1 78.22 CCTAGTCATACATCATATTTTTCCCATTCCCATGAATATTTCATGGGAAAAGCATAGAGAGGAAACCCCAAGGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCT:1 - chr2L 13891590 5' - flea 4889 1 71.29 GTAGGAAGTCAAAGACGGTTTCTCGTATATATATATATTTGTTTTGTTTTTTTGTTTGTTATACTTTATGGATTATACATATTTAAATATATATATATAT:1 + chr2R 24695228 5' + G3 4507 1 58.00 GCGCACTTTTGTAATTTGGCCACTAGCCAACATGACAAACAAATCGTCTAATTTTAGAGAGAGGCAGAGAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAAGTCTA:1 - chr2R 6866403 5' - Cr1a 4213 1 68.32 CAAATTAAAGGCTTCCGAAGTAGCAACTACATTGTAAGCCAATACATTTCATTAGAACCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 + chr2L 10793145 5' - I-element 5338 1 63.37 AACCTCCACACTTTTCCTTCTAAATTACCGACGGCCGACGGGATTTTTCTATTTCGACTGTTTCCTCCACTTTTCTTTTTTTGTTTTCTTTTTTTTTGT:1 + chr2L 6835696 5' - gypsy7 5005 1 75.76 TTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 - chr3R 7168649 5' - flea 4995 2 59.41 TGTATAAGCACGCCTACAAGAGCCAAAAATATAACATCTCCTTTCAATAAATGCGTTTAAAATTTGTCGTTGGCTTTGGCTACAAGTTGAAGCATTTTTTT:1 + chr2L 10686158 5' - S-element 1388 1 70.30 CGATGGTTGCAATTACTAGGTGGAAAGTGCGCCAACTGTTCCGCTTGAAATCCAAATTCAAACTGATCGTGCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr3R 11999325 5' + P-element 4 2 75.25 ATCTAACGATTTTTTCCAGAAATTAGCGATTGATGTACACATATACGGTCATCACACACAGTAACTTGTTGGTATAATTGTTGTAAATTGTCCCGCACAAG:1 + chr3R 5319451 5' + accord2 7165 1 76.24 CATCTAGCATGGCTTCTAAATACATTCAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCA:1 - chr3R 11262279 5' + roo 9039 1 73.00 ATACCGGTACTGGTACAAGTGTATGTATGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 - chr3R 17929008 5' + hobo 48 1 71.29 TAAGAACATACTTTAGAGTAGTGATCGGCACGCTCCACTAGAAGGCCTGACTCGGTTCTTTTGTCTCTTCTGCCCGCCTAAAAAGTAAGATCCTTCGCGTC:1 + chr2L 22719394 5' - Gypsy12A_LTR 479 1 68.32 TTTGGGCGTTAAAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACAAACTGTATGCTGAATCACAACCTTTTAGCTTTCATAGTTCGCGAGATTTCGACGTTCATACGG:1 + chr2R 5730441 5' - INE-1 135 1 67.33 AGACTNACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 + chr3R 17495763 5' + Quasimodo 35 2 74.26 AAGAGCAAGGCCCTGGCGTGTTTGAAAGGGTCAGTGGAGTTAGTGGACGGTCCGTCAAACCTCGGCGCCAACGTCGCCGCGAAACCTTCAGCTGCCTTCGA:1 - chr2R 3182871 5' - Osvaldo 1336 2 54.46 CCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 27748687 5' - roo 355 2 78.22 TGCATTAAAAGAAAGTTAGCTCTGAGCATTTGCATTTGTATTGCTATCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTAT:1 - chr3R 31257054 5' + transib2 28 1 62.38 AATTTATAGATAATAAACATACACAAATTATGTGTGTATATTTGTCATTAAAAACCGTTTTAATGGTTTAGCGATTTCAAATATTTATTTATTTTTATTCT:1 + chr2L 10306703 5' - mariner2 828 1 63.37 CTTTTTAATAATAACTAAAATTATCTAGATTTTATTGCGAATATAATCACATAATCTCGACAAATTCATTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:2 - chr3R 31017232 5' - Tabor 7315 2 58.42 AATAAGTTAATTAATTGAGCGAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chrX 2649907 5' + Tirant 14 2 67.00 CTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chrX 2799690 5' + Tirant 8147 2 67.33 CATAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 1625712 5' + hobo 32 1 57.43 CATTTGGGAATGTTTTTAGCGGGACCTCCCGCATGACCGAGGTTTATAAAAAAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGAAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2L 21272160 5' + copia 4 2 76.24 GGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 + chr3L 10081937 5' + rover 6975 2 58.95 ACACGAGCGCATATATAGGATGATTTTATTTAAAAAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 - chr2L 10473510 5' - flea 219 2 70.30 CCAAATTTGACAGGTCCAAAGCACGCCGCATTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCC:1 + chr3R 16354993 5' - X-element 4688 1 63.37 GACCTGGTTTAAAATCCGATTCCGTTTGGACTGTCAATTAGCCGATCCATTGAAAATTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCA:1 + chr3L 2486177 5' + jockey 4985 1 62.38 TAAAAATAAGTTTTAAAATGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2L 10746617 5' + pogo 17 1 59.41 GCACTTGGGAGCTCAATTAAATTGCACTAAAAAACGGAGCCGCTTGAAGTGTAATAAACCAATATACGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr3R 16400151 5' - blood 347 2 51.49 ATAAACAGCGGCAAACAAATGTCTACGTCTGTTGCTATTGATTTTTCCTTTGCCAAAGGTTACACACACCACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAA:1 + chr3R 18658326 5' + F-element 4475 1 75.25 AGTGCTATACTAAAGTATGTTGGGACTGAAATGCCCAATTTGAATAATATTATTATTTTTCATACTGACATTTAATTTTTATTTATATATTGATATTTATT:1 - chr3R 12881971 5' - Stalker 6935 4 89.11 AATTTGTATAAAATAAAAATTTATTGATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGATTACCCTATCTCGCACAGATCACG:1 - chr3L 25551812 5' - Chouto 81 1 74.26 CTTAGTTGCCAGGACAGGAGGGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 27775075 5' + roo 22 2 57.43 TCCACTTACCGCACTTGCAAATCGCACTTTGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGTTCTCAGCG:1 - chr2L 14332675 5' + 1360 3284 1 72.28 TATGGTACGCTGTTTTCTTTCAAGTATCTATCTATTTTGAACTAGAAAGAATATCTATCTATTTTGAACTAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACT:1 + chrX 22596370 5' - INE-1 567 1 58.42 GTTGATTCTGTATTGAATGGATTTATACGAAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 7075963 5' + roo 8679 2 62.38 GAGAGGCTTAGTTAGATCACTGAAAAATAAATTACAATATGTGGTAGGATAAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAACATACGATCA:1 - chr2R 1447799 5' + invader3 47 2 66.32 ATATTTATCACCTACAATTAAAGTGATAAGCATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chrX 17013206 5' - I-element 5313 1 74.26 AAAGATATAGTTGCGACATCGGAAAGTTTTTAAATTTAATAGGAACTATGAAAATTTATTACTTTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAAT:1 - chr2L 4144568 5' - I-element 5347 1 48.48 GGAGTGGAAAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 + chr2R 12492343 5' + hobo 7 1 70.30 GTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATAT:1 - chrY 3648876 5' - 17.6 451 2 76.24 TTCTCCACGCAAAGTGGAGCAGGATGGATTCGCTTCCTAGGATCCTAGGCACGCGCGGTCCCGATGTGTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGCAT:1 - chr3L 23794394 5' - gypsy8 332 1 54.46 CGGGAGGCGGGCACTACATACGTATAATAATGTAAAAAACCTAGTAATCAGGGGAGCCACAAAAACTCTCACGATTTGGTTTTTTTTATTTTTTTTTTTAA:1 + chr3R 23433122 5' + hopper 151 4 62.38 AAAATGTTGATTTTTTGAATTTCATTATTTGTCTTGACAAATTTTGTTCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTAT:1 + chr3L 17878702 5' - hopper2 419 1 69.31 CATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr2L 15808018 5' + I-element 53 1 72.28 TCCAAATGATATAGCCTACAGTTGTACTGGGATCCTTGGGGTTGACCCAGGTACATAAAGAGGCTTCATAGGCATTCCAACATAACGGCCAACTTCCTACT:1 - chrX 197140 5' + G7 994 1 54.46 CCGGTGGGGGCTGTAAAATTGCTGTCTATATAATTGATTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTC:1 - chr2L 8569137 5' - blood 7296 2 63.37 ACTAATTTTCAGTAGTGCATCACACACCCACCCATGCAGAGCCGAACAGGGAGTACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAA:1 + chr3R 7290296 5' + I-element 5169 1 56.44 ACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chr3R 6735275 5' + copia 4908 2 62.38 TGCTTGTTTGTAAATGTAGCGGCTGGACTGGAGCAAATCAACAGCAGAATCAACAAAACAAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACC:1 - chr2R 17326674 5' + Doc 4538 1 62.38 GGATGGGTCAGGTTCCGACCAGACACGCGCCTCATTATGTGCCACCCACCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGG:1 - chrX 20884585 5' - 297 6545 2 66.27 AAAAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:2 - chr2L 13574276 5' + pogo 32 1 57.43 CATCGCCACTCCAGGATCTCGTTTTTATCAGTTTAATGGGCGGGTCGTAATGCAATTTGCCCCACCACTCCTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTAT:1 + chrX 19075181 5' + 1360 3257 1 70.30 GGGGGCGCCATAAAAAAGAACTGGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTC:1 + chrX 19986336 5' + Stalker2 7260 2 67.33 GAACTGAGCCTGCCTTTTTCCCATATTCTTGGATTTTTTTTTACCCAATTTTTTCCCCCTTTTTTCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 8327875 5' + hopper 142 7 82.76 TTTGAATTGGCTAAGAAGCACAAGGAGCTCAGGGGGAAATGCAGGGCGGAAAGGACTGCACTCTGCTGCCCTGCTGTTCTGCCTCCGCCTGCTGCGACGCT:1 + chrX 20908127 5' + HMS-Beagle2 177 2 54.46 TTGGCGTTTATTTGTTGCCCCCCCTTTGTGCTTCGGTTTTTTGGTTCGGTTTGGTTGTTTGTTGCGATATTTTTCCATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGA:1 + chr3L 10706189 5' - Fw2 3699 1 63.37 ATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3L 10143173 5' + 297 6624 2 75.25 TTTGTTTTATTTTAATATTTTGTTCATTATTTATGTTAAACATTCTCAAATTGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTT:1 - chr3L 27992942 5' - Doc 313 1 58.43 TGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATT:2 - chr2L 8565514 5' + blood 44 2 69.31 AACTGCTAGCGTGTGAAAAATAAACGAAACGAAAAGTCGATAGGGCGGTCAGCTGTGACACACTAAAGTGAGGTCTTACTAGATGTAGCAAGAAGTAGCTA:1 - chr2L 5567034 5' + gypsy12 90 2 64.36 TGTTAATTAAGCTGTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr2R 13650090 5' - mdg1 406 2 64.36 TTCAGCCGATACCCATTGGATAAACAGCTGCGCAGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAG:1 - chrX 8571000 5' - Quasimodo 7081 2 66.34 GTACGNCAAATTGAGCTAAAAGTGCAGGAAGAAACACTGCAGGATAATGGAAAAGCTAAGAAAAGAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTA:1 + chrX 4816607 5' + invader2 4776 1 60.40 ATAGTTGAAGTAAAAACCATTATATTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2R 17261594 5' + pogo 48 1 76.24 ACAGTGGGTGGGACAGTCGGCTATATTTAAATGCTGCAAAACTCCAATTTATCCCCGGCGATGACTCCTGAGGCCTCCAACGACTCGGTGCTTTCGTCCTT:1 + chr3L 9442899 5' + TAHRE 10089 1 69.31 CCTGGCAGCACTATCCTGTGCAAATATACATTTCGTGGCCCACACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chrX 20806956 5' + opus 13 2 61.62 ATGGACCCTATATTACTATACTATATCCCGTGCATGGCAACGCAGCTGAGCTTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 - chr2L 12481657 5' + FB 24 1 54.46 CAACTCAACATATTTACACCTGATCATAGGCCTCCTTTTTTCAAACATTTCTACGCTTTATGGTCTTCGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGCACA:1 + chrX 3429447 5' - Ivk 387 1 58.42 AAATTGGCAGCTATGCGTAGCATGGGTATCGAAAGCGAATAGTGAAATAATTGCAGAGCGAGCAAGGACTGAAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTAC:1 + chr2L 22717437 5' + Rt1b 5031 1 60.40 GGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr3R 4834260 5' - mdg1 7428 2 62.11 AGACTTGGCTCTTTGTTGTGGTCTGTGTGTTTAAGGTCCCCAGTGCATATTTATATTTATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACC:1 - chr3R 7654410 5' - Stalker 47 4 52.00 CCTTATGATATGTCAGTCTCCGATTTCGTTAATAATGAAATCGACAGAATGCTAAAAGAACAAATTAGATTCACTAGAAACTATATAACCCTTATCCTAAA:1 - chr2R 1931765 5' + Cr1a 4131 1 65.35 ACCATTATGAGCAAATTGGACAGGCGGCGCAAAGGAGTTTTTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 4883557 5' + roo 23 2 49.50 TAACACAAATAAACTCTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCT:1 - chr3R 6562134 5' + hopper 1056 2 52.48 TGGGTAAAGAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chrX 19116857 5' - opus 475 2 60.40 CAACTCGATAACGCCGTTTCTGAAGGATGCCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGACTTCAAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTA:1 - chr3R 28974662 5' + transib2 2755 1 70.30 GTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTT:1 - chr3R 11094575 5' + 3S18 5795 2 51.49 ATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 992030 5' + hobo 42 1 68.32 TATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:2 + chrX 21668920 5' - mdg1 7455 2 74.26 TTATAGATTGTCATAGTAACGAATAAAACCTGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTATCCGATC:1 - chr3L 20755963 5' + X-element 4504 1 67.33 CAACTGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTAT:1 - chrY 3648897 5' - 17.6 7399 2 58.42 GTGCCTGAACAAAATGTTTGCTCACCGATAAACAACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCA:1 + chr3L 12352568 5' + G2 3021 1 66.34 TTGGTTACGTTGAAAACGTAGATATAGAAATGCAGTGGGAATGGAGTATTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGT:1 + chr3R 21167863 5' - Idefix 188 1 58.42 GACCCATGGAAAACTAGAAACGCACGAGAGCAACAGTCCAATAACAACAAAAAAAGGCAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATC:1 - chr3L 5187517 5' + 297 6524 1 62.38 GAGGATGTGGATGTGGATACGGGGTGTATTCTGCGCGTCTGCCGCATACATATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACT:1 - chr3R 13069444 5' + copia 26 2 51.00 TGCTGATTCGTAAATGAAAACATAATTGTTGCTGTTGTCGATGCTAATTGAACTCAACTGTATTCTTTCTAAAGGGAACTTGTAATTTTGCGGTCATAGCG:1 - chr3R 11398408 5' + diver 108 2 65.35 GCATACCAATTTTCCTTATCCCCTTAGAATTTAGGCCTATATACATACAGCTGTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTTGGACCTGAGAGTTTAAGATAAA:1 - chr3R 4516758 5' - HB 1597 1 68.32 AGTGCCCACCGCTATTGATGTTTTCCTGTTTCGGAGATTAACTGCTTTGAAAGAGCATCATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAAACATTTAAGTTGCA:1 - chr2R 8179681 5' + transib3 114 1 54.46 AAACACCTAATAGACATTCTTCTTTTATATATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 + chr3R 12589026 5' + Max-element 24 2 67.11 AAAAATCATGATGTCTTTTTTTACACGTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1 - chr2L 6083804 5' + 3S18 5772 2 67.33 TGGCTAGAGTGCTGTTCGAGAGTAGTTGCTAAGGGATGCGCTCAGAGATATGGCGTTCATTTTACGGAGAAGTTACTCTAGTTATGGGTCGCGGAAAGCAT:1 + chr3R 8700175 5' + Tc1 355 1 50.50 ATTCCTTGCCAGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr2R 16988267 5' - opus 7474 2 52.48 CGGGGGGAGGTGCGTTGGTGTGTTTTTTTGGTGATTATTTTATGTTGGTTTATAGTCGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTC:1 - chr2L 19611174 5' - accord 7081 2 65.35 ACAAANCCAAATAATTCATAAAATTATGGACCGAAATTAAAAATTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chr2R 7032107 5' - mdg1 7454 2 70.30 CTATACTTGTAGTACTTGACATTTTCAACATTCGCGTAATCTTTTTTAATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCCCAAAGCTGTATACCATAAGTCCACACGG:1 + chr3L 23686151 5' - G4 3424 1 58.59 AACCATATTAATGAAAACACAGGTGAGTTAACGTGTTTTGCAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGTTAGGGAGAATT:1 - chr2R 21065140 5' - jockey 4869 1 63.37 AACTTGTTGGCTTCTTTTACTCGAACCTTGGAAAGTGATCAAACCAAAACTAACATTCTTTCTTTCTCTCCCTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTC:1 + chr2R 17367516 5' + blood 7180 2 65.35 ATATTGGAAATTTGATGCCGCACTGGAAAATGTTGGGAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2L 17646146 5' + flea 4763 1 73.27 CGATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 8555832 5' - 412 7530 2 62.38 TAAATTTCGTTAATCATTGAACTGGAAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chrX 992102 5' - hobo 2925 1 64.65 GAGAGTCCCACAACCACGTGTTCAACACATTTTCAACATGTTGATCTTGCTCTCCATCCCTCTCTCTCTCTCTACACTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 + chrX 12666476 5' - mdg1 29 8 76.24 TTTGGNTCTAAATATAATAAGTTCGAAATTTTCGCCAAATGCTGCTCATAGATAAGATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGG:1 + chr3R 2913352 5' - Cr1a 4112 1 60.40 ACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2L 14790599 5' + roo 8715 2 78.22 TTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr3R 7168576 5' + flea 41 2 71.29 TGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 + chr3L 10143175 5' + 297 6626 2 77.23 TGGGAATGAGAAAATCTTTCGTTTCCATTTTTGATTAATTTTGCAGTAGCCCCTCTTGACCCCGGGACCACTAGAGCTCCGCTATGACATCAACTAACTAA:1 - chr2R 928973 5' - mariner2 44 1 64.36 AAATTGATGACTCCGACGGAAGGGAAAAACACGAAATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAA:1 - chrX 8773445 5' - BS 5027 1 63.16 TCCCAGACGAAAAATAAATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chr2L 15510375 5' + jockey 4675 1 70.30 CAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACTCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chrX 2799686 5' + Tirant 44 2 69.31 TAAATATATAAGTAGAGGAAACAATCTAGACAAAATTTAGACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAA:1 - chr2R 3592053 5' - Quasimodo 7333 2 60.40 AACACCGTTCTAATTAAGCTTCTTTCCTTATTATGCAGAGATTACTGTCGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCA:1 - chr2L 10745588 5' - pogo 1806 1 51.49 CAAATGCATCTGTGTCTGCGTCTATGCCTCCATGCTTGTGTTTTGTCATGCTTTTGTTGCTGTATGAGTGTCTATGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 4244438 5' - Quasimodo 39 2 85.86 ATTCAAGCGCACTGTTAGCTAACATTGCTGCTTAACAGGCAGTTAGCAGCGAGCTGCACGATCTTGCACTCTCAACAAAAACCAAAAAAATAAAAAAAATA:1 - chrX 12897448 5' - Tc1 1398 1 59.41 TGTTTGCTTAGCTGGCAGGAGACTTTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 4801480 5' + roo 5 2 74.26 AGGTATTAGTGGTTCCATATATATTATAATTATATATATTTGAAAAGAAAATCAGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2L 13574176 5' - pogo 2097 1 65.35 AAGTTGGGTTGGGAAAAATGGAAAAGAGGGATGGGGGCTGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTG:1 + chr2L 16536737 5' - ZAM 7990 2 59.41 ATAGGCAAAGATACATTTAAGGACAGGTAGAAGGCGCCCTTTATTACGCCACCATAATGAAGACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGA:3 - chr3R 20147564 5' - 1360 381 1 62.38 TTTTCNGTTATCATACTAATTTAAGATCCTCTCTAACTTTCATAACGACCTTTACATTAACGAAGGTTATTGATGGTTATTAATGACAAATAGAAGAAGAC:1 + chr2R 4887069 5' + gypsy7 478 1 73.27 TCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3R 7522292 5' + blood 7034 2 56.44 TTAAGAAAAACACATAGAAAACTGTTGTTTACTTTTTTTCGAATTTAATAATTTACAAATGTTCATATCTATAAATTGGTATGTTATTAAAAAAAAATAAA:1 + chr3L 14961970 5' - hopper 158 1 82.18 CAAATGCTAAAATAGGAATAATTTTATTGTTTTCTTTGAGTTTTTTTTTTTATTTCGCGAATTGTTTACACCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGA:1 - chr2R 4375223 5' - diver2 4788 2 58.00 GTTAAGAAATTTCATTGGGATCAAGATCAAGAGCGCATCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTG:1 - chrX 6429153 5' - opus 7339 2 63.37 TGTCCACAGTCACGGCGACACTTCCGCTGGTGGGTCATTTTAAAGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTGTGGGTGTGGGTATAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCC:1 + chr3R 11343137 5' + hobo 2709 1 77.23 TAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATGCGAATTCAGCATGTGCGCTTTTAGGGGTCGCACTCGACT:1 + chr2R 3262649 5' + mdg1 189 2 60.40 TCTGCGTTGGTCAGCTCTGCGAAAACCCATAAAACTGCACAACTTCAATTAATTTTCACATATGTTATGTATAGCCTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCAA:1 - chr2L 13617171 5' - Stalker 7057 4 61.39 GATTAACTGCACTATCAAGTTGAATGCATTAATTGCAGCGAAGGTGGCTGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr3L 4641142 5' + hobo 29 1 51.49 CCGTTAGGGCATGGTCATCGGTTTGGGCCACTTGGAAATCCCCCTTATATTTACATATATACATACATATTACATAT:1 - chr2R 7613876 5' - Dm88 13 2 84.42 TGTAAGGATCATTTTTTCTAGGACATTATCAAATTTCATAAGCTAGCCATGTCGCACCACCGACCACTGCGCACCACTCAGCAAGATGTCGACTGAAAGTG:1 + chr3R 5746611 5' + Tirant 498 1 54.46 AGCAGGACGTCCGGGACACTTTGGCCAGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCA:1 - chr2L 5014697 5' + Rt1b 4994 1 73.27 CCGTTCGTATTACTTACAGAGAACTGCGGGTCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTGGT:1 - chrX 16286445 5' - X-element 4399 1 72.28 TGATTTAAATGTCTTCTCGTGTTCACTAATGATAAATATAAAAAAAAAACAAGAGGGAATGCTATAGTTGACTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr4 333172 5' - INE-1 548 1 74.26 CTGCTTATGGGTGTTAGACTCTCTTTCTTTCTTTCTCTCGCTTCCTGCACACCTTTTGGCCCGCGTTGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTG:1 + chrX 19988043 5' - Stalker2 67 2 67.33 TGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3R 11846272 5' + hobo 50 1 71.29 GTAGTTTGCAATAAGTTATGTGTATATTAACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr2L 11837968 5' + roo 8668 2 73.27 TTTTTGCATTACAATTTATGTAAAGACTAATTGTACAGTCTACTACTCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTA:1 + chr3L 18090202 5' + Doc 426 1 53.47 TTAGTTGCATTAGTGGCAGCTATCAGCGGCAATGGTAGCAACACGGCTCCAGGATGCGGCGCTGGAACAAACTAACTGCAACGCCGGCCGGACCTATTTGT:1 - chrX 13691645 5' + HeT-A 5619 1 61.39 AGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTTT:2 - chr2R 5531178 5' + 1360 83 1 56.44 TTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 + chr3R 13582240 5' + BS 5043 1 71.29 TATTCAGCTGCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chr3L 17587756 5' + roo 8673 2 70.30 ATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 - chrX 21564760 5' + diver 5899 2 69.31 AACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 + chr3R 7168566 5' + flea 31 2 61.39 TCGCTNTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCCAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 13538917 5' + hobo 21 1 57.43 TTTATGAATTCATCGTGTTTCGCTCCTTGTGGAGCTGTTACCTGGCAATGGGCGAGATGATCCATTAAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATA:1 + chr2R 5950664 5' + mdg1 10 2 69.31 GCACTTAGCAAGCGTAAAGCAGTGCCAAAAATAAAAAAAAATAAGTGAAATAGCATAGAGAAACTCAAATGTATAGCACTGTTTTTTTTTTATTTCACTTT:1 + chrX 3069884 5' - F-element 4681 1 74.26 GTGTCAGAAAAACTATGATATTAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 + chr3R 19132263 5' + Ivk 23 1 56.44 TAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 2060134 5' + 412 7092 2 61.39 TGACTGCCTGCGTTTGCTCACATATTTGTAGATTTTTGCTTCGCGACTTAGAATTGTGTCTGTCGTACGCGTTATTCGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGT:1 - chrX 9446435 5' - HMS-Beagle 264 2 67.33 GATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 2074760 5' - roo 9025 2 71.29 AAAAGTAGAGCTCACCCATGATAGAGTTGGAACCA:1 - chr3L 21091806 5' + Porto1 4500 1 65.71 ATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 23456271 5' - 1360 3374 1 60.40 CAGGCCATCCCATCTAAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chr2L 11703214 5' - Tabor 472 2 65.35 ACTTTTGCAGGGTAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3L 18659013 5' + pogo 25 1 54.46 TTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTGTTGCAATTT:1 - chrX 22945329 5' + BS 53 1 72.28 ACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 7522302 5' + blood 7036 2 51.61 TAAGGAATTGGTGATATGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr3R 4834243 5' - mdg1 401 2 58.42 GCAGTCGTTGCCCTCGTAGAGGGTTAGGTATATTAACCAGTTTGCCCTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGACGAAAATTTGAGCTGCGTAAGCG:1 - chr3L 7324229 5' - Quasimodo 6959 2 55.00 TGATTTCCGCATGTGGCCGCCTCGGCCCTGTTTACACAGCGAGCATATTGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCA:1 - chr2R 20819446 5' - Quasimodo 273 2 52.48 CGCTACAAACAAACACACTTCTCTAATTTGTAATGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 513674 5' + roo 8705 2 67.33 CTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACA:1 - chr3R 19449403 5' + roo 8651 1 76.24 AAATCAACCGGCACTTAACATCTACTTACACCTCGAGGCGTTGGCGTGGTGTCCAGCGATGAGACTATAATTGACGGCGGCGACGAAAGTTGGTTACTATC:1 + chr3L 18978658 5' - TART-C 269 2 65.35 GTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCC:1 + chr2L 20360642 5' - R1A1-element 136 1 67.33 ACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 14612073 5' - roo 349 2 80.20 GGCATGCTGTCGCTCAGGTTTCGAGCGCGGCAAGCAGCAAAGTGAAAATGCCTAATGTCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCA:1 + chr2R 8000285 5' + Juan 401 1 60.40 TTTTTGATAAGCTGCCTTCGCCTTTGCGAGTTCAAGAAACTTTTGCGCCCGCACCCCCCTCCACCAAACTCCTGGCCATATCCTGTGCCAAGTTTTTGATG:1 - chr3R 30354410 5' - Penelope 384 1 52.48 AAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chr3R 11688501 5' + 1360 34 1 59.41 TACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1 + chr3R 20137264 5' + Burdock 6167 2 59.41 TGGCGTTTTTCAGTGGATGTATTCATTTGTATACACTGAAAGTCAAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAA:1 - chr3R 15183612 5' + P-element 432 1 52.48 ATGTATAATATGACAGTAAGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3R 11263445 5' + roo 10 2 63.93 GACTTTCGAGCAGGCTCACCCATTAACATGTTGTTGGGCCTTTTTGCGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAG:1 + chr2L 2280436 5' + R1A1-element 5090 1 53.47 CAGAAAAACTATGATATTAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAA:1 + chr3R 19132267 5' + Ivk 27 1 54.46 CGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAGCTAGAAG:1 + chr2R 4906451 5' + INE-1 155 1 54.46 GTTAATTAAGCTGTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr2R 13650091 5' - mdg1 7443 2 63.37 GGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chr2L 15947455 5' - Transpac 5198 2 53.47 TCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 10751697 5' - hopper 1373 2 61.39 AATGCCGTGTGAACCTGTTGCGGCTGCGAATGCGCTGATTTATGTGAGCTTCTTTCTGCGGCCAAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGG:1 - chr3L 9770269 5' - Quasimodo 216 2 69.00 GGCTGGTTGGTAACTTCATGCGTTAATCAGGTTTCCGGCCCATCTTCAAGTTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATG:1 - chr2R 20053413 5' - F-element 4451 1 52.48 CAAAAAAACATTAAAACTCATAATTTTTGCTTAGTGAATAGTAAATGAAACAGCAATAAAACAGCAACAAAACAACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGT:1 - chr3L 8439520 5' + rover 441 1 79.21 ACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3R 11688479 5' - 1360 3334 1 83.17 TTTAAGGATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTT:1 + chr3R 17321720 5' - Stalker2 7612 2 62.00 AGCTGAAGCTTTCAACTCAAGCCACAACAAATTCACCAGCAAAGTTAAAGTTCAAAGCAAGAGACAAAATAACTTAAACAAATAAAATAAACTAACTAAAT:1 - chr3R 6998432 5' + F-element 89 1 70.30 CGTGCCTCTGCCTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAA:1 + chr2R 1654424 5' - Juan 4178 1 63.00 TGTGAGTTGGCCTTTTCCGATTTGTTTTGCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr2R 24239339 5' + hobo 49 1 74.26 GTAATAAACAACATTTATGATGCAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTT:1 + chr3R 4543997 5' + flea 31 2 59.41 GAAATGTAAATATGGGAGATCTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3L 3032287 5' + opus 153 4 76.34 TGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAG:1 + chrX 22077201 5' - gtwin 7360 2 54.08 TCTCACTCTCAATTTCTGCAGTGCTTCACCGTTGTTCTCTCTCCCATGGGCCATGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2R 14713682 5' + P-element 9 2 72.28 ACTTGTCGAAAGCAAACTTTAAACAAGCAAGTTACGATGCAACAAAACGATCCGGACAGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 10147813 5' + roo 8681 2 62.38 CCAAAATTCGCATTACACCTATTCGTGCCATTTTAATTTCGTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2R 8310934 5' + pogo 9 1 68.32 GTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTCGATTC:1 + chr2R 4024225 5' - Idefix 7173 2 73.27 TGTCAAAGCGAGTAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2R 15032626 5' + hobo 23 1 56.44 TTGATTTGGCAGGGGCGTTGAAATGAAACGGGCAAATACTGGAAATAATATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCT:1 + chr3R 14070637 5' + gypsy 480 1 62.00 TTTTTTGCACACAGCACAGACGAAACGAAAGGTTGTAAAATAAAAGAAGAGAGAATGCTAGAGTCGAGTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCAA:1 + chrX 16260979 5' - INE-1 544 1 75.25 AAAGGAAGAGGAACAAATTACAGCACAAAAACCAGCGATAACGAAGAAAGCCATAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGG:1 - chr2R 8181339 5' + pogo 1725 1 75.25 AGAGCAAAGAAAAATAAATACAAAAATGTAAAATTGTTGTGTGAGTAACAAGCGCAAGCAAAAGTGCGCTCCTGTGCTGGAATAAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 4959943 5' + Osvaldo 1522 1 41.58 ATTGTTGGAAATGATTGCTATACAAGTAACATATGTTTTCAAGAATGCAATTATAACGATTTAACATTTTTTAAATATATTCTTGTATATATCTTATATAT:2 - chrX 10438199 5' - 412 7321 2 57.43 TGCCATTTTAATTTAGATTCCTATCAATCAGTAATAAGCATTGTGTCCACCCGCACAGACAGCAAAAAGAACAAAAAAAAAAAGGAAAACAGAA:1 - chr3L 2710276 5' + Doc2-element 251 1 72.34 AGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAAC:1 - chr3R 13582274 5' - BS 5053 1 65.35 ATGTTTAAAATAATGATGACAAAATAGTTTTATTCGCTTTACTTGCAAAACTAATTGGTTTATTATCTTGTGATAATACGGGGAACTCGACTATAGCATTC:1 - chr2L 15106719 5' + INE-1 571 1 59.41 ACGATTTATTTTATAGCTATACTTGGATATGCATCAAATACAAAAATACAAAACCCTCGTTTATTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAA:1 + chrX 22444444 5' + Juan 4068 1 57.43 GAGTAGCAAAAACACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr2R 8345569 5' + roo 34 2 59.41 AAACAGATTCTTTAAGTGCCAGCCACCTAGGCAAACCCAAATCGAAAACCCACCAAATAGATATACTACTCGGAGCGGAAACCCACTTTTCACCCAGATCC:1 + chr3L 14156035 5' + G6 1718 2 56.44 AATCGAAGGAACCCCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 - chr3R 4834330 5' + mdg1 7064 2 53.47 AAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chrX 13508696 5' + roo 40 2 66.34 TTATCTATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAG:1 - chr2R 5019442 5' - rooA 7586 2 50.50 GGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:2 - chr3R 10277270 5' + Doc 59 1 75.25 AGATTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCA:1 + chr3L 18337650 5' - Juan 4183 1 57.43 GCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 7861714 5' + roo 8715 2 82.18 ACAGCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCTCTG:1 + chr2L 15081445 5' - hobo 1 1 58.89 CATGCCTTTTCATTGATTACTTTTGAAAACAAGTGCATTGAGGATCTATTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr2R 9854028 5' + pogo 30 1 54.46 AATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGACCTTAAAAAGGATGTCAAAAATAAACTGAGTGAGTAAAGTTTAAGCGTGATAAACAAATATCAACCACAAAGA:1 - chrX 21555682 5' + I-element 96 1 75.25 ATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 - chr3L 18706927 5' - jockey 4947 1 64.36 TTTCCTCGAACAACCTCGTAGCACTTAAGTTTTTCATTAAATTCGCTCAGATTTTATGCATTGTACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 23773189 5' - roo 9059 1 41.58 GATTTGCCCCCGGCGAACGCCCTCGCTTCTGACATATGCCAGTCAAGTCAAGTAAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2R 16583273 5' - P-element 2870 1 64.36 ATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAGAACTTTAATATTTTGAGGTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 + chrX 21204929 5' - mdg1 7446 2 56.44 TTCAAACAAAATATTCAACTTTACCTCATTCCGAACAGCCATACTCTAATATTTTTCCTTTATTTTGTACTGGATAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTT:1 - chr3R 32035614 5' + Circe 6999 1 57.43 CAGATAAAAGAGGAGCGAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTG:1 - chr3R 28645877 5' + F-element 11 1 74.26 TTCAATCTTGGTTATGTTGTTCTCTGCCAAATCGAGCAACTGAAAAGCAGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTTC:1 - chr2R 14272460 5' - rover 6950 1 55.45 TATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2R 24021575 5' + pogo 38 1 67.33 AACGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTA:2 + chr3R 31887760 5' - HB 1556 1 67.33 TGGGATTGGGATTGGATTTGGGTTTGGATTTGGATTTGGCCTGGTATTGCTGCTGGAGGATCCTTCTTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAA:1 - chr3R 24955407 5' + P-element 2619 1 63.37 CAATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAA:1 + chr4 970227 5' + 297 6868 2 50.50 TGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr3R 16400206 5' + blood 48 2 72.28 GGCCTCGCCTAAAAGTGTGCTACACATAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2L 1625736 5' + hobo 8 1 71.29 ACCCACGGAGGGCAGCTGTACAGACTAAGGGTTAAGATTTTCAACCTTTCTCGCACTATTGACTTAATGGGGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTGCCCGACT:1 - chr2R 1892087 5' - INE-1 567 1 67.33 CCCCTCTTGGGTCTCCGCCTCTTTGTCTGTCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCACATTCACACACACACACACACATCCATAAG:1 + chr2R 18482078 5' + Quasimodo 40 2 56.04 TTGGTTGTGCGTCGCTGTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2L 16201603 5' - hobo 2936 1 79.21 ACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTA:1 - chr2L 20133056 5' - flea 4979 2 67.68 AGCCAATGTTTATTGCAAATAAATTCATTATTAGTTATTTTTATTGCCTGTTTGCATTTGTGTCTAGTTTTTCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATT:1 + chr2L 7238700 5' - Doc3-element 4482 1 59.41 TCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 2019679 5' + 412 7101 2 78.72 ATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr3L 19951178 5' + Ivk 9 1 70.00 AAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGCTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 + chr3R 13582222 5' + BS 5025 1 51.49 AAAAAGGATCAACGGAAGCTTTGCACATCTATGTATATCTAACTCTTTGACTGAGTAATGGGTATCTGATAG:1 + chr3L 22526562 5' + INE-1 547 1 76.39 GTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACATATACACAC:1 + chr3L 9183582 5' + accord 7035 2 77.97 TACCAATACTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:2 + chr2L 14790555 5' + roo 7 2 72.28 TGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chrX 18836980 5' + P-element 57 1 26.73 GCTGCGCCAGCACCACCAGCAGCTGCTGGCTGCCGCCCCGGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGA:1 - chr3R 18407771 5' + Doc2-element 490 1 60.40 TAACAAAATTAAATATAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAAATAAATCCACTCTGCATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCT:1 - chr3R 2424357 5' + 17.6 7056 2 49.50 CCCACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr3R 10277275 5' + Doc 54 1 70.30 AAAATGCGCCTTTCATAATATGAAACCTATTTCATAATTGATGATCAATATTCCTGGAGGCATGTGTAGCACATAAAAAAGAAGTCATCCAAATATCTCCA:1 - chr3L 15776552 5' - hopper 56 1 54.46 GTCATTATTAAAAATTAATGATGTCATAATTAAGTGTGTTGCTGGTGTTGTTGTTAAAGGAGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTAGTAGCTA:1 - chrX 9852832 5' - Doc3-element 483 1 54.46 ATACAATTCGATTTACTTAAGAAGATATTTTTATTACGCTTTTAGTTGAAAAGAAAACATTGCTTTGGGCTGTCATTATTAAATTGGTTGGTTGGTTGACT:1 - chr3L 16517262 5' + gypsy6 7649 2 75.25 TTTCGCTTAACTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr2L 14579839 5' + copia 42 2 69.31 AGGGAGGGCGGTGCTGCCAAAGGGAGGCCCGCAGGCAACCCAGAATAGCAGAAAAATGTTTTCCACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTG:1 + chr2L 15806144 5' + I-element 4999 1 67.33 TGGTAGCTTATATTAAAGATAGATAGACTTGGAAGATAGGAGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr2R 15374748 5' + 1360 12 1 47.52 CTGGTTTGTATGTCAATATACAACTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTT:1 - chr3L 24121680 5' + R1A1-element 29 1 80.61 ATATTNTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 21174277 5' - roo 355 2 79.21 TTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAACACGTC:1 + chrX 23280919 5' - R1A1-element 3 1 79.21 TGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGGTGAGTTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr2L 768904 5' + P-element 39 1 40.59 TTGACCATTTCGTTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTA:1 + chr3R 7388315 5' + HMS-Beagle 6802 2 73.27 ACATTTTAAGATCTGGTTTGGTATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATATTCAATACTATTTACAAAACTAGAATTACATAATAATATAG:1 + chr3R 13613087 5' + Porto1 4218 1 75.25 GTGAGTGATACCGGAATATAAAAAGAGAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTC:1 + chr3R 7067730 5' + Idefix 198 1 78.22 GGTGGCGGAGGACGCAGAAAGGGCAGGAAGGCCGGCGAGGACGACACCGAGGCAGATGAGGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGC:1 + chr3R 15959397 5' - F-element 245 1 64.00 GCAGCTGCCCGCCAGCGATTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTT:1 + chr3R 23393328 5' - I-element 145 1 82.00 GATCGAATTTTTATAGCGACAGTACGCTAATTGTTCAAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACA:1 + chr2L 7255211 5' - P-element 99 1 39.60 TGCTACCCTTTACGCTTTACTTTTTTTTTGATTGGAATGCTTTCATCACTTTGACAAGATTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGATAC:1 - chrX 5443437 5' - Doc2-element 4467 1 50.50 TTAATAACATTTTCGCAAGCTGTTCCAAAATAAACGGAATTAAGTATTAATTAATTAAGTATGACAGGAAGCGCAATTACAAAAAAAAAAACAAAA:1 - chr3L 16871436 5' + Doc 4700 1 63.54 GATTGGCAGCGATTTTTTATTGGCCCAGTGCCGGCTAAAATAAAGACGAAAGCCTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr3L 22039695 5' - jockey 4970 1 55.45 CAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3L 13659899 5' + pogo 16 1 57.89 GCACTATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chrX 20806949 5' + opus 7025 2 57.43 TTGTTGATGAAATTGTTGTTGGAGTCGTTGTTGTTGTTGTGCGGTGTTTTTATGTTGATATAGAATATGATGTTGAAGTTGTGGTCTACAGGCAGATCTCT:1 + chr3R 14830721 5' - mdg1 7323 2 78.22 CAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCGTCGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372602 5' - Doc2-element 233 1 82.29 TAGCGNTTGTAGCAAAACAAGTTTCGAAGATGCTCAATAAATTGGCTGTCATGGAATTACCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATA:1 + chr3R 17219714 5' - F-element 4249 1 57.43 GCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chrX 17968361 5' + Tirant 32 2 59.41 GTAGCTCCTGCAGACGCATCTTCAGCTCGTCGAGGTATGCCAGCTGGCGGGGTGTGAGCTGCAAGAAATTAGCTATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTTT:1 + chr2L 14548881 5' + Cr1a 5 1 57.43 CTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCACGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr2L 19019005 5' - hobo 2899 1 67.00 GCAGAGTGTAGCATAGTGTAAAGAACAAATTAATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr2L 20824614 5' - pogo 2062 1 70.30 CAACANGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGC:1 - chr2L 21657035 5' + invader1 43 2 78.00 CGTATGGATTGTTGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTT:1 - chr3L 18337735 5' + Juan 4029 1 74.26 ATCCAGTGAAAAGGAGCCACAACGTATGCTTCTCCTGGTCTGCCGATGCTCCCGCTGCTGTTTTTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 17853416 5' - roo 399 1 73.27 CGTGCAGAGTGCTGATATTGTTGTTATTCAAGAAGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTTGGTTGGGCGGGAGGTGAGGCCGTGGGACCCGAGC:1 + chr3L 4956032 5' + Cr1a 4440 1 66.34 TGCAAGAGTAGAGTAAAAGCAAAAAGAAAAAAAAA:1 - chrX 7622570 5' + Doc2-element 238 1 77.14 GGCTCGCTCTCAACGCAGTTTTGGCGTCGCTATTTCTCTTGCTCTTCTATTAGCTGTGTAAGGGGTATGTACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAA:1 + chr2R 6169120 5' - Tc1-2 1615 1 72.28 ACCCTCGCAAAAGTGCAACCCCTCTTTCACAGCCATTAACTGCGTTTGGGATTGTCGGTAAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGC:1 + chr3R 13928688 5' - F-element 245 1 59.41 GAAAACAAAACGCCACTAAAGCCACAGAGGCAAAGCAAAGCGGCATGGCATAGCGCTATCTGGAGCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGC:1 - chr2R 22824902 5' - gypsy4 6468 1 68.32 AATCTGTTTAGATTGGTTTCTATTTTTACTATAAAAGAGCTACATTTTCTAGATCATTTAAGGCACATGTCTAAAGATTTTATTTATATTTTTTTGAAGAT:1 - chr3L 13036663 5' - mariner2 785 1 69.31 CGATCTGAACGAGGGCGAGGGCGCCATAGTTGCTCTTAAGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCA:1 + chr3L 2916129 5' + R2-element 44 1 65.35 ATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTA:1 - chr3L 18706919 5' - jockey 4939 1 72.28 CCATTGAACAACTCAATATCCTTTTGGACGCAGGCCATGCACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCTACGGAACACTAA:1 + chr3L 5712378 5' - R1A1-element 81 1 60.40 ACAAATAAAAACAAACCAAATGTATACCCAAAAAGGTTAAAAATAAGAAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAA:1 + chr2R 1845364 5' + Doc3-element 128 1 56.44 GACTCAAAAACAGAAACGTAAATTCTTTATTGAGAACGTCAAAAAACGCATTATAAAGAACGCCATACGATTTTTGGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr3R 4169448 5' + 1360 48 1 75.00 GAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGA:2 - chr2L 2074793 5' - roo 9058 1 68.32 ACTTATCGTCAATGCATTAAAGCCCACAGCCACACATACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAACTAAT:1 - chr3L 11661798 5' + hopper 20 1 56.00 TGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 15305657 5' - roo 9021 2 79.21 AGTCGCCGCGTATCCGCTAGATGCGCCCGAGTGTATCGAGTATAGGTAGTAATTGACCGCTCGATGTCT:1 - chr2R 15942693 5' - F-element 305 1 75.36 TATTTTTCACTTCTTAATTGCGTATCTTTGATTTGAAACTGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTT:1 - chr2R 3116842 5' - I-element 410 1 61.00 AAGTAAACCGACGTTTAATTTTTGGAAAGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 - chr2L 4160182 5' - Tirant 8465 2 70.10 TGTTTTACACACCCAACTCATCGGCCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 - chr3R 4544094 5' - flea 250 2 75.25 ACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 19018959 5' + hobo 43 1 69.31 ACACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAGGGGTGGCACTTTTTTACCGCTCGACTCACAC:1 + chr2L 19018939 5' + hobo 23 1 53.47 AATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 - chr3R 19446228 5' - 297 6968 2 65.43 AAGTGTGAAATCAGAAAAATGCATAGGAAAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAA:1 + chr2L 19878006 5' - INE-1 87 1 71.29 CCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 14790593 5' + roo 8685 2 63.64 AAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAA:1 - chr2R 13644488 5' + Burdock 18 2 61.84 TCATTAAATCGAGTATTATTGAAACATTTACAATCGAAGGCCACAATTGAACATGCAAATCACGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr2R 10774123 5' + copia 4885 2 63.37 TTTAATTTGTTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGG:1 - chr2L 750730 5' - HeT-A 6056 2 74.26 TTTTTGGTTTACAAATCGACTTATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTGTTAATACACATGCACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCC:1 + chr3L 23867751 5' + I-element 4888 1 78.22 TGACTGACTGGCAGTTTGCATTTCCACTGCAGTCATTCACTCACTCACACACACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCA:1 - chr2L 11712165 5' - Tabor 118 2 56.44 GGGCAATTTAAGGATGACAGATTAACTAGTACTATCCGAACTGAAATCGAACTAGAACAGCTGGCTCTGTGCATGAAACATAATATCAAACTGCTGACCCA:1 + chr2R 5269045 5' + Gypsy6A_LTR 49 1 55.45 AAGGTCCTTTAGAGTGGACTCGTCAGCCATCTCTCTGGCTGTGGCTTTCAAAGAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGT:1 - chr2R 6250519 5' + Chimpo 179 1 52.48 CGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCA:1 + chr3R 32005884 5' - invader4 3047 2 64.36 TACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chr3R 31194478 5' - Transpac 5185 2 72.28 TATTATATCATTTTATTTATCTAGTTTTAAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3R 16245132 5' + 1360 7 2 70.30 TTATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATAC:2 + chr3R 22066722 5' - Stalker2 7498 2 69.31 CAGCANACGGCATTGCAGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 - chrX 8490718 5' + P-element 25 1 42.57 TATTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATGTACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr3R 7168651 5' - flea 4997 2 59.41 GGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGCTCAAGCCGACGCAAACGCAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATC:1 + chr2L 11086644 5' + jockey 4932 1 58.42 CATATCCAACGGTGGTCATGGTAACGACCGCCCACCAAAATGCATCGGGTATAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCG:1 + chrX 17945229 5' + R1A1-element 5065 1 53.47 CCAAACAAGTACTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 + chr3L 6044725 5' + Tabor 6857 2 59.41 ATTGTTCTTAGTTCTTTATTTCACTAGTGAAATTTCAATTACGATCTTATTCAACTAGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr2L 12448259 5' - transib2 2802 1 60.40 AAAAGGACAAAGTTGCAGTCGAAAACGGGCTAAAACAAAAGATTGCCAAATCAACAATCAGGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCAC:1 + chr2L 17045711 5' + Tc1 203 1 75.00 CGTACAAGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAAGCT:1 - chrY 536715 5' + Doc 29 1 50.50 AAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 20739444 5' + roo 35 2 62.38 GTTGATGTAAATATTTATTCCCGAATATATATTTTTGATAGCTAATATTTTTATAAAATTAAACGAATAAGAAACAACATAAATATAATTACATTAAATCC:1 - chr3L 10471878 5' + diver2 452 1 86.14 ACACTNATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 17928940 5' - hobo 2921 1 59.41 CAGCTTGCAAGAGGACGAGATAGTAAAGAGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTAT:1 + chrX 22809175 5' - Cr1a 4287 1 73.27 AGCGAGTAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2R 15032632 5' + hobo 29 1 56.44 ATAAACCCATTCGGGCGCATTAAATTAATCTCGGCAAAGGCATCGGCAGCATCGCGCTGGCGACTTAATATGGGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - 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P-element 2641 1 56.44 TTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chrX 13640648 5' + P-element 51 1 28.71 TATACTTGACCTATACTTTTCAAAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chrX 21564296 5' + 297 6603 2 57.43 AGTTTTGGTTTTCCAGTTTCGGCGAATTGTGTCAGCAGCTGGGTATCGCTTTATCCTGGATATAGATCTATAAATATATATGTACATATCTACATATTTTT:1 - chr3R 29384289 5' - G3 4503 1 71.29 GTGAATTTACATAAGTACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 - chrX 3305234 5' + transib2 6 1 71.29 CTCGAGGAATGCCAAAAATGTGCAAACAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTG:1 + chr3L 15318485 5' - Doc 340 1 73.27 CCAACGCCTTTAATCTAATCTAGTGCATGGCATGAAGGGTTTATAGCTCATTTCACTTGCTCTCTTTTTCTTCACACACACACACACACACAAACATATAC:1 - chrX 13843406 5' + accord 185 2 49.50 AGAAATTAATTAATTATTATTAGGTAATTATATGTACATACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTT:1 - chrX 4292925 5' + S-element 32 2 65.35 CCTCGTCGTCCTTGCCGCGATTTTCCCCATGAACGGCGGTCATGTTTTACATTGATTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGT:1 + chr2L 8612604 5' - invader3 5094 1 61.39 GTGCTGAGAAAATTTAAGCAGATTTTAAAGACCACCTAGGATTTGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGA:1 + chr2L 14677291 5' + FB 33 1 58.42 GGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 8313099 5' + 297 6634 2 84.16 GCGTGGAATTATGCAATCCATGGATGGTTTCTGTGGTTCGAGGGGGAGTTGGTTTCGGTCTCCTTTTTGTTATGGCGGCAGCTTGTCGATTTGCACAAG:1 - chr3R 10521907 5' - HeT-A 225 1 64.65 CTTTGTGTAAGGAAACACTATTTTAAGCTTGTTTGATTTGTACTTCTTAGAAATACAAATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCA:1 - chr2L 15508497 5' - jockey 4785 1 58.42 TATTGCCCCCTTCCTGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2L 12949280 5' + 412 7084 2 54.46 TTACTGATTGTCGTTGAGGAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTG:2 - chr2R 4339740 5' - G5A 2763 1 66.34 GACATNTAGTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTG:1 - chr2L 21635360 5' + F-element 470 1 69.31 CTTGTGGTAGCTTCGCATCGTGCGATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAG:1 - chr2R 12255087 5' - BS 4672 1 76.24 CTGCGACTTGCAGCCCGTTTAAAATGGCTGTGGCAAGACTCTGACCACACGCCCACATTTTCATGCCACGTGGAAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTC:1 + chr2L 11664049 5' + F-element 4442 1 79.80 AAACAAGGGCAAGCTTGAAAAGGGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr2L 20566526 5' - 1360 3337 1 80.20 TTCTGTATTGAATGGATTTATACGAAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 7075958 5' + roo 8684 2 57.43 TTGTTAATCTTTAAACTGAATGATGTCAGACTACCCCCCACTGACTGGAGTGCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr2R 5950763 5' - mdg1 7436 2 53.47 TTACTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACAT:1 + chr3L 6044733 5' + Tabor 26 2 53.47 ATCTATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAA:1 - chr2L 23400810 5' + S-element 36 2 66.34 AGAAGNTCGCAGGACGCACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2L 16674920 5' + roo 37 2 64.36 GGAGATACTCATAACCCCCTGGATATAGAGGAGGAGAATACATAACTTGGATGAGTTTTTGTACGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGACTAGAGGG:1 - chr3R 3186138 5' - I-element 5105 1 50.50 ATCTTTCGTTAGATAGGTTTTTTAAATTTGCGCTGCATCTTTATCTCTTAAATCTGTATGCTTCATCTTCTAGCTCTTATTGTTCCTGAGATCTCGACGTT:1 + chr3L 22778838 5' - INE-1 142 1 75.25 CATTGCTGAAAATTTGTCATTATTCTGTGTTTTATTTTGAAAAGAACTACATTGCTCCTCATATTCTTTAAAGCGAGTAAATGAAATAATAATTAAATAA:1 - chr3L 19112286 5' + Tc1-2 391 1 82.00 TTGATAATGCATTAAATTGTTCGGTCCATGTAACATCCATGTTGCTGGGAAAAGATCCCGCTTGAATATGACCTAAAAAAACTCATACATTCCATGAAAAA:1 + chrX 21101251 5' + S-element 1371 1 55.45 CCCATTGCAAACTGTAAGTTTCCGCTTCCCAGCTTTAATTGGTCGCATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCGCAGATCACTGCTGTTTGTCGAAAAGA:1 - chr3R 20665888 5' + Tc1 482 1 64.36 ACAAAACAGCTAAGTAAATAAATAAGTGTAGGAGCAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTA:1 - chr2R 13629835 5' + F-element 153 1 56.44 GAAATCGATTTGGTTGCAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:2 + chrX 3305142 5' - transib2 2789 1 58.42 CCATAATTTGACAACAATAAATTGCATTAGCAGCGAAACAAGTTCAACACGCAGAATAACATTTAAATTCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCAG:1 + chr3R 10685996 5' + Porto1 375 1 73.27 CCCTCTCGCCTTTCTGTGAATGGGACCCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGC:1 + chrX 20752642 5' - F-element 314 1 73.27 CCATTTTAAAAGCAACCCACTAAATTCGAATATTCACTGATTAACAAAACGCGCAAAATTGGGCTAAAATCCAATGCGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTG:1 + chr3R 15156541 5' - Quasimodo 34 2 63.00 ATGCATATAATTCGGCAGAGATTGAACACAAAAAGACCCTATTTTAGACACTTTCACAAGCTATTTTCTCCGCCATCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGG:1 - chr3R 16542025 5' - Rt1a 4662 1 66.34 ACAGCAGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr3L 12888213 5' - mdg1 397 2 54.46 GCCTTGTCTGTTGCCTTTAAGGCTGCCTGCAGTCCTGTAGTCCTGCAGTTGTGCGATTGAAATGCCGATTGTATGCGTTGGTAAATGCAGCTGCGTTTTAT:1 + chr2R 23516924 5' - rooA 7438 2 73.27 ACGTTTTAATAAAGATCATTCAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCG:1 + chrX 18835875 5' - P-element 211 1 27.96 TCCTGCTGCGACCCATTCCAAATGCATTAAAAGAAAGTTAGCTCTGAGCATTTGCATTTGTATTGCTATCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTT:1 - chr3R 31257076 5' + transib2 3 1 78.57 AGGTATACTATTTAAGATACTTATTTTCTCGCGAGTGTCTTTTCAAAGGTAAGCCTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGAC:1 + chr3R 6286600 5' + jockey 4524 1 54.46 CAAATTCGCGATGGCAAATGTTTTCATTCATGGCATCCGCAAACCACATACAAATCAAGTCTCATGCTTCCCAAATTTTCAAAAAAACAAAAAAAAAACTT:1 - chr2R 11468575 5' + HMS-Beagle2 490 1 52.48 AGAAACTAAACTACTATTATGCATTTTCTTTTTTTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTG:1 - chr2L 754134 5' - blood 493 1 76.24 AAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:1 + chr3R 13582221 5' + BS 5024 1 52.48 ACATGCACATAATAATACACATACAGTTTGTCACTGTACACACTGTGAAATAATTGGAATTTTTGACTTTAAAGGTAGAAATTAAGGGTTCTTTGCTTAAT:1 + chr3L 27262800 5' + S-element 64 1 77.23 GTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 24021588 5' + pogo 51 1 80.20 GGTTGGTTGATATTTGTTGGCTGTAGCGAGCTCGATAGTTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCT:1 - chr3R 9441820 5' - gypsy 418 2 62.38 TAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCA:1 - chr3R 28645853 5' + F-element 35 1 50.50 CTATAAATTGCTTTAACATAAACCCTTTTTTTTAAGTAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTCCGCCATCCACGA:1 + chr3R 19264047 5' + G2 2770 1 63.37 CAGGGGCAAATGCAACTCTGTGGCCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2L 16201478 5' + hobo 2 1 77.23 ATTGAAAGCATGCAGGAAGGGTAATCACAGAAAAGGTGACGGCATCGGGAAACTGCAGGAATGCATACTTCTTAGATAAATTGTAATAAACCAATATATGC:1 + chr3R 19346860 5' - blood 379 1 78.22 GTGGATGTCTCGATGCCGGATCCAGGACACCTGTAAAATACCAGAGAAACAATCGTAAATATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3L 10036654 5' - roo 331 2 64.36 ATAGTGAAACTAAGACTTTGTAATATAAGTATATTACAAAGTCTTAGTTTCACTATTTCGCATTATTTGCCTGAATTAAAATTACACTTTCATTTGATTTT:1 - chr3R 13667012 5' + 17.6 327 2 77.23 TGCAAACTAGTTAATGTATTTGGTTGTACTCTTGTTTTAGAAGTTTTTGCATGCAATTTTAATACATTTAATTTTTAAGTATTTTATTTGATTTATTTTAA:1 + chrX 20540457 5' - G7 1146 1 92.08 ATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCAGGAA:1 + chr2R 8443974 5' + INE-1 139 1 76.24 AAAAGGTGACGGCATCGGGAAACTGCAGGAATGCATACTTCTTAGATAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 + chr3R 19346890 5' - blood 349 2 54.46 GATTCACCAAGCCCGCCTAAGGGAATTTCGGTAATTCGAGAAATAATCAGCAACTTTTTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chrX 20620624 5' - pogo 2087 1 65.35 TTTTAATCAAACAAGTTGACAAAGGCGAACAGCATCATCAGTTTTGCACACGCAGTTGAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2R 14408548 5' + hobo 18 1 59.41 GAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chrX 2649887 5' + Tirant 8142 2 58.42 AGGAGCAGCAAGAGGGCATAATACCAATGATTTGCAAGGATCTGTTCACTCGCATACAGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTT:1 - chr2R 16762820 5' - 297 6627 2 59.41 GATATTCATTCAATTCGTAGAATTTACATTTTGTAAAATCCAATTTTAAATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 - chr2L 10793250 5' + I-element 2 1 75.25 GCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr2R 20739462 5' + roo 53 2 80.20 CAAAAAAAGATAAAAAGAAGGAAATAAAACAAACAACGCGTACTTCTCTT:1 + chrX 11796356 5' + Doc2-element 348 1 72.00 TTCAGTATTTATATGAGTTGCTTGATTTACAGGAATACAATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:1 - chr2R 16750709 5' + Tabor 6877 2 60.40 GATGCNCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 17587841 5' - roo 9033 1 64.36 ATGCTGTATGACACAAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 11263369 5' - roo 402 1 72.28 TTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTACTTCTG:1 - chr3R 32005961 5' + invader4 19 2 61.39 TGATGCAGATCCGCAGGCATGCATTTCATTCTTGCCTGTTGGTCAGTTCTGGACCGACCACATGAAAGTAGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCCAGAAGGT:1 - chr3L 22913170 5' + INE-1 157 1 66.34 AAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2L 18177033 5' - INE-1 552 1 63.37 TTCGTCCTCGACACTCGAGCGCATTAAAATGGTTAACACTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTAGTTCTTTTGTGGATAATAATTGAAGAATTGAA:1 - chr2R 20952708 5' - rover 414 1 71.00 GAGGCTGCCTACGAATGTCACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 + chr2R 16988177 5' + opus 17 2 62.38 GGATCGCACTCGCAACCCAAATTACCACGTCTTTCTCTCACTCACGCAATCCCAAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAGAAATTATAAGAATCTAAGA:1 + chr2L 13669463 5' + Idefix 306 2 56.44 GCTGCCATTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:2 + chrX 16995091 5' + jockey 24 1 61.39 TGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATT:1 + chr3L 15099571 5' - G4 3811 1 62.79 CGGGCAGCTGGTGGTGCAGGGGCTGTGCTGCTACGATTTGCTTGTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr2R 17857327 5' - opus 7472 2 55.45 ATAATTTCTTGCTGCTGACCAAGGAGCAGAAGAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr2L 12949185 5' - 412 486 2 69.31 AAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 14790656 5' - roo 9047 1 54.46 ACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chrX 17058219 5' + 297 13 2 61.39 GAATCNCAACCGCCTGCCACCTTATCAATAGCCAAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chrX 8684219 5' + opus 151 4 68.32 TTTGTGTCCACCCGGGGGCGCCATAAAAAAGAACTGGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCAC:1 + chrX 19986323 5' + Stalker2 7247 1 80.20 ATGGCTCGTTAGATGTTATTGACAAAGAAAAAGAGCAAACAGATCAGTGGGATAAAAGGCGAGCTTTAGAAAGAAGGGCAGAGCGAATCGGATCAT:1 + chr3L 28055219 5' + gypsy7 107 2 54.17 CCACGCAAAAACCATAGCATATTTTTTGGGGCTCGATCTCGTCAGCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3L 4641072 5' - hobo 2908 1 55.45 ATAAAAAATAAAATAAAGAGTAACCGCTATATATGCTGTTAGCAACAAATTGCCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACATTATTATTAT:1 - chr3R 7372753 5' + 1360 304 1 53.47 AAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr4 1149937 5' + 297 17 2 62.38 GAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGACGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2R 10543436 5' + P-element 49 1 30.69 CATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3R 8555847 5' - 412 7515 2 56.44 CCAGTATAAAAAGATTGCGACGATTGTATAGGTAGCGAAGAGAAAGATGACGTAGCTTTTGTTGTACGCCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCATTTT:1 + chr3L 25162528 5' - Bica 354 1 65.35 GGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 14790625 5' - roo 352 2 79.21 CCATCGTCAACCAATAAGAAATTAACGCCATTGCTGATACTTTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 13640607 5' + P-element 10 2 69.31 AGTAATATCTACGCACTAAAAACAAAGCGTATTTAACAAATAACTACTTAGCCACCAAAACACAAACTTGAGGCAAATACCGATGACAGAGTTGAAACCAA:1 + chr3L 8050378 5' + Porto1 4501 1 70.30 CCGTGTGTAATTCTTTTTTGGCGCAGTCTGCTGAAGAAGATGACTGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACC:1 - chrX 20955191 5' + Quasimodo 272 2 55.45 AAATTTTTGGTCGCGTATTGGACCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 - chr3R 27858246 5' - hopper 1363 1 77.23 GATTTNACTGACAAGTAAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 - chr3L 17168910 5' - mdg1 7429 2 56.44 ATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr2L 8565535 5' + blood 7034 2 62.38 TGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chrX 8491413 5' + P-element 41 1 40.59 ATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:2 + chrX 8682655 5' + pogo 49 1 78.22 TTATCAAAAGGAGAACATGTTTCCATTAATGCAAATAAGGCAGAGTTATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGA:1 - chrX 8943185 5' + Tirant 8329 2 53.47 CCACCCAGGCAGGTGTCCGAAAAGAGGCTCGGGGGGCCTCCCCTTTTT:1 - chr3R 17745400 5' - R1A1-element 4909 1 58.33 AAAATTTCGATATATTTGTCCGTATACAATCTTTTATCATACACAGACACAAAAAAGACCTCCCATTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGC:1 + chr3R 12048275 5' - Stalker2 7626 2 63.37 GAAATATGACAACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 + chr3L 11661706 5' - hopper 1393 1 55.45 CTAACCTTTAGATAGAAAATGAGTCGATGCATTGCTTCTATTAATTTTTTTTTCTCTGACTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTATATA:1 + chr2R 4909424 5' - invader2 250 1 77.23 CTCAAAGAGCTTGTACTTCTTAACAGCACGGGAAATTAAGTGGAGTTTAATTTACTGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 - chrX 19426459 5' - mdg3 5458 2 55.45 GGTACGCGACAAAGGTAAACGGCGCACACACTCGCCGCTCCACGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGC:1 - chrX 22386799 5' + hobo 46 1 69.70 TGTGTGTGTATTTCAGTAATTAATGTAAAAAAATATAAAAATTAAAACAAACAAAAAAAAAAACAACACAAAAATCGGTGGACTTTGCCTG:1 - chrX 5071249 5' + I-element 317 1 81.32 TCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTT:1 + chrX 15089066 5' + gypsy 7012 2 56.38 GTGGGGGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr2L 12949219 5' - 412 452 2 67.33 CTTTCGATTCTGTTCTGTTTCCTCTCAAACGGTTCTTGCACACTTTTATTTAATTTCTTATTTCACCACTCACTACTAAAATCCCCACAACCACTGCCGTC:1 + chr3L 18552412 5' + accord2 7349 1 57.43 AGCTGCAGCTTGTAAGCTTGCACACACACACCAGCAAACACGCGACTCCAATTCACTTTTAAGTCACGCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGA:1 - chr3R 19322175 5' - Bica 453 1 77.23 GTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 7550731 5' - 412 472 2 62.50 ATAAATTAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 17587783 5' + roo 36 2 64.36 TTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCA:1 - chr2R 7552301 5' + springer 39 2 73.00 TTTCCNCTTTTGTATATTTAAGCGGAAGCTAAAAGACTCTTTCAAGTTGATTTCTGCTCCATAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCT:1 + chr2L 19898902 5' - Doc2-element 389 1 69.31 ATGCAGGCAGTCTGTGTGGCTCGCAGTGATTTACCAATTTGTAGATATGCACATACTACACCTCCCCCCTTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAA:1 + chrX 8198148 5' - blood 6980 1 63.44 ACAATATACATCTAATATGTAATATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 - chr3L 25968938 5' + HMS-Beagle 6845 2 74.26 AATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3R 11119867 5' + 297 6614 2 65.35 AAAGCTTCTCTGTAAGAGACGATTAATGTATACTGCACCCGTATAAACCCATCCACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAAT:1 + chrX 8065522 5' + jockey 4818 1 58.42 TGGCTNACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 19346943 5' + blood 7063 2 77.23 TTATAAAATAAATAAAAATATGCGAGCGAAAATATAAAATCAGTTCGTTACACTGTTTATTGCAAAAGTTATATCTTGAGGCACGAAGTGC:1 + chr2L 21745539 5' - 1360 478 1 75.82 GGTTGNAGAAAAAAACAAGGGTAAGGAGGCAGCTTAAGTGTTGGCGAATTTATTTGCGCTGGTGCTTAATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCTTCGAA:1 - chr3R 4063827 5' - G4 6 1 62.38 AAAAAAAAACAAAAATATATTGTACTACCCCATCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTATATAAATGCCAGAATTTTATAGGGGTTCAGGT:1 + chr3R 2980168 5' - baggins 5324 1 83.17 GATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3R 19446131 5' + 297 6591 2 68.32 GAGACAATTACGCGCCGCCAGATCGCGATGAATGCAGTTTTTGGACTCCAGATATCGCATGCCTTGAAAAAGAAAAACATAATATTATTTACATGTTAGTT:1 + chr3R 9368766 5' - transib1 465 1 81.19 CGAGCAAAGTCGCCAGAAACAGCAGGCAGAAAGCAAACTTTAGGAAAAAACTCTCAACAATTTCCAAATCTCCGGGCCGGACTAAGGTGTTATTCGACCCG:1 + chr2R 25102954 5' + baggins 217 1 53.47 CATTATTCAAAGTGACAGGCTTCCTTTCTCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 9131813 5' + roo 8710 2 73.27 AAATTCATTAAATTTTAATATTCACTATAAAAACTTTTGCTGCCATTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGCTTCTATGTTTAAATCATTATGCATATCTTCGT:1 - chr3L 6644969 5' - Porto1 4384 1 66.34 GCTGTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr2L 16201590 5' - hobo 2923 1 66.34 TCAAATAATGGATTTAGAAATATATAAACAAGAGTTACAAATTGTTTTAGATATTTGTTTTAAAATTCTTTTTTTTTAT:1 + chr3L 13184864 5' + 1360 3094 1 88.61 TTTATTGCTTAAAAACTAATTTGATTTCTATGATTATGATTAACTATAAAAACGCTTACTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAAATT:1 - chr3R 18210395 5' + Juan 21 1 56.44 CCTGGNATGAGCAAAAACAGCAGCAACAACAATATAAAACATCACAAAATGCGATAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGATTT:1 + chr2L 7151700 5' + F-element 149 1 56.44 TTTGAATAATCAATTTAATGAAATATATTGAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 19481289 5' + roo 41 2 69.31 ACTCTAAAATAAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACA:1 - chr3R 13638702 5' + 412 262 2 58.42 TATGGCGAATGAGAAAATCATTGATGGTGTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chrX 8992143 5' - opus 7457 2 70.30 CCGGTTCGGTTAAAGCGCACAACGTGAGTGTGAGACTGTGGCTTACTTGTTTATGGGTATTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTAAG:1 - chr3L 5312652 5' - Stalker 279 4 64.36 GTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr2R 8310894 5' + pogo 49 1 75.25 CTGCTTTAGTTTGTGTCATCATTAAGATCATTATAAATATTATCACTCCTCATTTGCACCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGTGTCAGCACGGTTTT:1 + chr2R 2009407 5' + Q-element 198 2 66.34 TTCTCCACACCTGCTGGCGTGTTTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGAATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGC:1 + chr3R 7964538 5' - HMS-Beagle 6641 1 77.23 CACTTATCTAATCGAAAATTTGTATTTTGAACAGGCAGACGAAATGAACGACAGATCCAAGGAAAAAGATTTGCAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCA:1 - chr4 1083286 5' + mariner2 750 1 73.74 ATATGNATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3R 9551442 5' - P-element 2835 1 26.00 TTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 13508762 5' - roo 9045 1 56.44 ATTAAATATTTCTGTGCTATCGTGGGCAACTACGTACAAATTAAAGATTGCTTAAAAGTGCGGGCAGAGAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAAGTCTA:1 + chr2R 4886064 5' - Cr1a 4213 1 61.39 CTACTTTCGCTCTTGGCTTTGCTATTTTTTTCGCATCAAGAACAAACTACAGCTGTATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTACATA:1 + chr2R 19584990 5' - INE-1 29 1 52.48 CATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2L 11837998 5' + roo 33 2 60.00 CATTTCTTGTATCATAATCGTTTTGTTTTTCTGGTTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2L 21174204 5' + roo 7 2 70.30 GGGTTAACCCGGCATTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 + chr2L 20132961 5' + flea 4758 1 76.24 AAGTGGGTGGTGTTGTCCGCCTTTTTGGGGCGTCTTACACAATGGAATGCTGTGGGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATG:1 + chr2L 4861978 5' + P-element 2886 2 58.42 AAAGGTGCACGAAATGGCGCACTTTCCCAGATAAAACTGAAGGTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGG:1 - chr3R 11094210 5' - 3S18 18 2 62.00 TTGGGCATCCGGTCGTTCCGTTCAGCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGC:1 + chrX 15089037 5' + gypsy 6990 2 76.24 ACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 8345556 5' + roo 8711 2 72.28 ACTGACCTCCAGTAATCCAAACTACTCTCTACTCCTTTCTAGTGAAATTGTGTTTGCGGATTGCCCTACCCTACCTATGACCACTTTCCTTAATAGCAAGG:1 - chr2R 5603372 5' - Gypsy12A_LTR 1934 1 55.45 CGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chrX 13546648 5' + roo 44 2 74.26 TATGATATTTATGCTCAATTAGTGTCGCTGTTTGCCGTGCGGCGATTTAGCTGGGATACAGCCTAATCATTAATTTGATGAAGCGAGTCCGATCAGACAAG:1 - chrX 7613636 5' + Rt1b 4781 1 52.48 TTTGGTTGATAACTCCATTTGTGGCAAATGTTGCGCACGCGCGTTTTAGTTGCTCATTCCAAGTAATTGCGAGTAGTTGCACAGGAATCATAAATAAATAA:1 - chr2R 22157538 5' + G3 339 1 55.45 TCAGCGGAACCCAAAACCCTGAAGAGAGGACCTGCTGCTCTACGGGCTTCTGTCGGAGCCAGTAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGT:1 + chr2R 19375057 5' - F-element 354 1 57.43 TCTAATTAACGTTAGGTAAATATTACCTCCTTACACCTGCAAAACGGTCAACAGAACACTTAGTAACGGCAAATACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3R 4366118 5' - 1360 3378 1 75.25 TAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chrY 3648870 5' + blood 7061 2 77.23 GTATCCTGACCAACATTGCCACATCCGCATGCCCATCCTCAACATAACATCCTCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACA:1 + chrX 17042644 5' + copia 4893 2 53.47 GGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr2R 5840672 5' + Ivk 50 1 71.29 TGATAATGTAATAAACGCATTCTCCACTTAACCATCAATTCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGCACGAAAACACAAGATCAAAACATTCAAGCGAGCT:1 - chr2R 24494052 5' - Cr1a 375 1 60.40 ATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3R 20878468 5' + 297 6603 2 59.04 ATAACATTTGCGAAATGCAGGGCGAAAAACAAACGATTGGAAATTAGGAACATAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTAT:1 - chr3R 14547316 5' - invader2 4908 2 62.38 CGGAGCCAATAACCAGGAGCGGATTGCATATTCCTGGGGAAACAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCA:1 + chr2R 964470 5' + I-element 5002 1 55.67 AGGTCCCATAAACCCAGATTGCGTGCTAAATAATACATGGACGAGAAAACAGAGAGCGGCGAAAGATTAAGTGTAGCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTT:1 - chr3L 3758686 5' - Circe 17 2 72.28 GACATTAAACGTTGTGGGTGCCATTCATTTGATTGAACTTTGACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGAACGGCGCTACCAATATGCCAACTA:1 - chr2L 15456718 5' + Ivk 5098 1 58.42 TTACTGAATAGTGCCGACAGTGTGGTGGATCAGGACCAGGTAGTGGCCACGATCGGTGACTATAGGTATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCA:1 - chr3R 4405437 5' - Chouto 143 1 76.24 AGGTCGATCCCTCACTTTCTAAATTGATGCTGCCGACCCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTTTGGACTTTGAGGAGGTCAATCCA:1 - chr3L 25783635 5' - Tc1-2 1152 1 50.57 TTGAGNGTTGTGAAAAAGCATTTGCATGCTGTGGTAGGCAAATTAATTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 5277900 5' + jockey2 3406 1 72.88 GATGTGGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3L 7550725 5' - 412 449 2 67.33 ACCCAATGAATGAATGAAACGAAAGAAAAAGCGAAAAATCAACTGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGG:1 + chr3R 9224649 5' - Cr1a 318 1 61.73 GCCCTTTATTGCATTATCTTTGTTATCACACGGGCCGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGT:1 - chr3L 7979247 5' - F-element 350 1 62.38 TAAAAGGGATTCGTAGTCAATCGGAATTTAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chrX 20620544 5' + pogo 42 1 73.27 AGTAGAGAAATGCTAGGCATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:2 + chr3R 5686058 5' - 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chrX 4797163 5' + rover 221 2 68.32 CCACAGGCTGTAGCTGCAATTTTCCGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:2 + chr2L 315155 5' + Tirant 50 2 76.24 TTTTTGTATCGGTTGTGGATTTATTTTGGGCTCTACACAAGTTTTTTGTATATTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGG:1 - chr3R 19554424 5' - I-element 178 1 52.48 TTTTCTTTTTATTTATTTTTTATTTATATTATGTTTCCTTATTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGCGACTGGCAAAGCGATT:1 + chr2R 547782 5' - Ivk 222 1 52.94 CATTTNTAGCCATTTTATACTTTCAGTTCTCTGTTGATTTTTTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATC:1 - chrX 20798271 5' - I-element 5136 1 61.39 TGTTGGGTTTTTCTTTTAAATCTTCGTGTTGTTTGCACCAACTGTCTGTGCTCTGCACATGGGCGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTATCTG:1 + chrX 19400691 5' - Quasimodo 30 2 56.44 GTTAATTTTGTCAAAGCGAGTAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2R 15032618 5' + hobo 15 1 64.36 AAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGGTCA:1 - chr4 184018 5' + 1360 177 1 67.33 CCATGGCACATCCGTCGCCGTCTGTCACGGCATTATTGAAAGGTGAACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTAT:1 - chr2L 2509266 5' - invader4 2643 1 57.43 GACGGCCTGCTGATAACGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chr3R 7360386 5' + jockey 13 1 72.28 CGTTTAAGTTTTGAGGGACTTATCGCAAATACTAGTCTCGTAATTTTCATTTTCCTTTTTTGTTT:1 - chr3R 26979588 5' - Doc2-element 233 2 84.62 GCTGCTTTTTTGTTTATTATGTTTAAACTAAAAATAACAAAAGTAATAATCACATATTCCCCTTTCTTATATTTATAAATATTTATATACAAACGAAGGCG:1 + chr3L 10743515 5' - transib4 2456 1 47.52 AGTGGCGCTGTTCAGATTGTGATAAGTAAATGACTCTTAATTGTGGCAAAAGATGCGACTATAATGATGATGATAAGAAAGCTAGACAGACAATGATTTGG:1 - chr3R 26550776 5' + Tc1-2 179 1 72.28 ATGTANATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 10827406 5' - roo 9047 1 55.45 CTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chrX 18239434 5' + jockey 19 1 66.34 AGTTACGTTCATATGTACATATATTGTTGTCTCGTACCTTATAGAAAGATTTAGAAAGTACGACCGCAGAATACTTTATTTTTTTACATTATATTTATTTC:1 + chr2R 13574607 5' + Cr1a 4324 1 37.62 AAACGCCTCAATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGA:2 + chrX 21564646 5' - diver 217 1 66.34 CCGTTACTCTGCTAGTGGGAATGTGAACGCGAAATTGCATTATTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATACGCATCTTGTTATTCTAGTGTC:1 - chr3L 20853264 5' + 1360 3384 2 76.24 GTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCT:1 - chr2L 18279959 5' - gypsy5 371 2 62.38 ATGTTCGAGTCCGTGTTCTTCGTACTGCGGCAATTCTACAACTTTGTCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTC:1 + chr2L 15917262 5' + 1360 3384 2 57.43 GCCATCTGAACTATGGCAAAAATCTGAAAACAAAGGTCACGCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAAACGC:1 - chr3R 9939285 5' + Tc1 1593 1 72.28 CATTGGCCAAAAGGGATTGCACAAGTCCACATGGAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chrX 17042711 5' - copia 214 2 66.34 CCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:2 + chr3R 17896944 5' + hobo 33 1 66.34 AGTCGAGCCAATAGTCGGCAAAGGTGGTCCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATTAGTGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAAC:1 + chr2R 4986770 5' + F-element 4579 1 70.30 ATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGACCACCAACAC:1 - chr2R 2745201 5' + Stalker3T 79 1 68.32 GATAAAATATATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 21092423 5' - roo 9064 1 60.40 CTTGAACCACTCACAGGAATATATCAGGACATGCCACGCTACCTATGCGCGCACTCATGCACACACACACACACGCAT:1 + chr3R 24085694 5' + accord 181 2 55.13 ACAAACTGAATCACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr3R 4601304 5' + opus 7025 2 56.57 CTGGCCGCTCAATTTAAATTAATGAATTTATGCGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3L 4876745 5' - roo 9026 1 69.31 CCGGCTAATAACTAGCTTCGCTTGATTTATTTGATTTTTTATTATTAGGTATTTTACATTTTATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGT:1 - chr3R 31879452 5' + Cr1a 4354 1 57.43 GACAGGGGGCGCGACGGGACAGATAGAACAACAAGCAAAGATGCCACAGAATGCACTTTGATAAATTTGTCACTAATTTCCCTGGAGTTAACCAGCAAGAG:1 + chr3L 5732586 5' - Ivk 462 1 59.41 TTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 21174238 5' + roo 41 2 75.25 TTTTTTTCATTCACATTTAAATTGTGTTTGCGGTAGTTAATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTA:1 + chr2L 13333988 5' - flea 256 1 73.27 ATTGTCGCTCTCGCGTCTCGACCACGCCCACCGCCATGAGCTAGAGCCGTATTCTAAAGCGTGCACCCGCCAGAACAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTT:1 + chr2R 20919195 5' + Gypsy12A_LTR 2241 1 77.23 GCACCGCGGTGCGTATCAGCACGGTATTTATTTTTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGACT:1 - chr2R 3563447 5' - 17.6 7127 2 66.34 GTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:3 + chr3L 28063322 5' - roo 404 1 74.26 TCGAGGACAATGTCATCGTGCCGGCCACTATTTCCTTGTTAAATTGTCCAAAGGGCACCGAATTTGAGTGTATGTTGTGCGTATTGGGTTGACACGACAAA:1 + chr3L 7585240 5' - Q-element 690 2 64.36 GTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2L 14790643 5' - roo 9034 1 61.39 AACAGTGTTAAAGGAATTTCACGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGA:1 - chr2R 2311277 5' + hopper 51 1 77.00 TTGGCCATTTGATGAAACAGCTTTCAAAGGCCGAACGAACCGGCCAGGGAAAGGTTGAGCACAAAAATAAAAAAAAAAATAATAAACAATAATAACAA:1 + chrX 19403209 5' + flea 243 2 56.12 CATACTTCTTAAGCCCAGTAGTAATATTGTTAGATGAACATGCTCCACAATCCGAAAACCAAAGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTG:1 + chrX 15894580 5' - S-element 1706 1 59.41 ATTTCAATGACAAAAGGAAACTAAATAAATTAATAGTCAAAACGGCATCGCTTGCCTTGGAGCCATTTCGCCGTTTTTTGACTATTTATTTATTTAGTT:1 - chr3L 15861438 5' + copia 224 1 62.63 TTAACTATTCCACGCACCAAAGGCCAAATTAATAAAATCAAAGCAGTAGAACAAAAATTAAAACAAATTTAACATTTTCATAAACCCATTATGCTTTCACT:1 - chr3R 10449939 5' - 1731 4238 1 57.43 AATAACCCAAACTTAAAGTAAACACAGCTTCCGCTTGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAAAATTTCCTTATTACA:1 - chr3L 25337477 5' + Burdock 387 1 64.36 TATATTTTACTATTTTTCTGCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr2L 1834849 5' - gypsy7 5007 3 73.17 GACGGGAAAGTTTTGTTGGGTTTTCTGGTTTCGGTTTTAGGACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCTAGTCTTAGGGGAGAGCGTATACTAAGAAGC:1 + chr3L 13596944 5' - Fw2 3475 1 70.30 AAACATGTTTTTTTTTTCGCTGCCGTGTATCGTCCGGCTCGATTCGCGAGAAGAGATAGACGCGATATAGAAAAGAGAACAGACACGAGGAAATGAATAT:1 - chr3L 10479271 5' - Cr1a 4335 1 76.00 TCTGAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr4 1149954 5' + 297 6581 1 79.21 ATTTCAGATCAGTGAAACATTTAGCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTT:1 + chr3R 9157058 5' - Bica 415 1 76.24 TGTATAACATTGGTATCTTATTCTATCACATGCTGCCTGGATATTTGCTAGACATTGTGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTT:1 - chr3R 12394598 5' - F-element 4443 1 60.40 TTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTAGAATTT:1 + chr3L 25272565 5' + 1360 79 1 65.00 GAGCGTGCCATTAGCGAAGCCGTTGATTCGGAACGATCGCTATGGCAATCACGTCTCCTCCCCCTAAACTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCT:1 + chr3R 5676217 5' - INE-1 172 1 78.22 TTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 - chr3L 8614544 5' + opus 7052 4 81.19 GGGTGGATATGATGGATGTCTTGAGATACCATTGATCCATACAAGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2R 16980464 5' - copia 248 1 70.00 ATCGTTTGATTTTGTATACAAATATACTTGTGGTCTTTAGTTTATATTCTAAAACCTCTAAAACCTAACTTCTATTTTCGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 3579507 5' - Doc2-element 251 1 60.44 ATTTGNTTTTCATGTTGATTATCACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAA:1 - chrX 6388431 5' + jockey 309 1 77.23 TATAAATATATATACTATAATATAATATAATATATTTTATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 + chr2R 21696555 5' + I-element 38 1 68.32 TGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:2 - chr3L 23456269 5' - 1360 3372 1 58.42 AAACATTTTAAAGGTTTTTGCAAAAGTCACAAATCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGTAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr2L 14677343 5' + FB 44 1 66.34 GTACGTTTTTGTAAGACGTAAATGGAGTCTGCAACCGTGCTGGTAGTTACTAGGCTTACGAGAGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGAAGTTTGTGTGTA:1 - chr3L 14209359 5' - Doc4-element 214 1 65.35 GCCTCAAATGCACGATTACCATCAACAAAGGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 25097931 5' - P-element 2881 2 74.26 TCATTTGCCGTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr3R 7522275 5' + blood 7017 2 73.27 CAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 10952268 5' - roo 9041 1 55.45 AAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr2L 13574218 5' - pogo 2055 1 75.25 TAAAANACAGATATATCTGCATATTGATTGTATCCGCTTTTATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 10827480 5' + roo 8698 2 62.38 ATCCATCCATTGATCATTCGTGTTCGTGTTTGACTAGTGCACAAAACATTTAAACGACATAAACACTACCTAATTCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTT:1 - chr2R 14061771 5' + I-element 4996 1 70.30 TTATATTGTAGATCTAATACTTCAATTGTTATGTTATAGTAAAGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 - chr3L 5102461 5' + jockey 4702 1 56.44 GAAAATGTCAGTGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3L 10143146 5' + 297 16 2 64.36 GAAAAATTAAGTATACAAAAATCCACCCCATCAACAATACACCACCCACCCCCCACGCACACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGG:1 + chr2L 15744952 5' + Doc 463 1 66.33 TAAACCATAATTGTAATCCAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTC:1 + chr3R 19450065 5' - roo 77 2 78.65 TGGTAAGGGCAATATAATTTAATTTTAAAAACATGTTGAGTTTTAAAATTCCTTTGATATAGTGTATTTTAAATTTATTTTTTTTATTTTTTTTATTTTTT:1 + chr3R 20402774 5' + hopper 148 108 69.31 TCTTTAAAAGTTTATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3L 2019657 5' + 412 33 2 58.42 GCAGAGCAGGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 5093003 5' - roo 398 1 54.46 GATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr3R 11119893 5' + 297 7 2 72.28 TAAGTTGCACATCTTTACCTAAGCGATTGGTAATTATTCCTAGTTTTAGTAAGCGAAACTCACAGTACCTTTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCATGCCAC:1 + chr3R 30362499 5' + I-element 18 1 57.43 GCTCCGATAAACAACAACAAAGGGTATGTAAAGCAGCGGTTGTAAAGGGATGAAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGG:1 + chr2R 20862279 5' + Circe 7184 1 78.48 GTTACGAAAATCTTTCTTCTTTTTTACAATATTTTGCACTTAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGA:1 - chr2R 16916001 5' - Cr1a 4381 1 56.52 TTAAANCTGCCAACATGGCGCGTGATCACCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCCATTACGGCCACCTCTTCGGACT:1 - chrX 3047219 5' - accord2 246 1 68.00 ATCAACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 19377819 5' - roo 400 1 70.30 TCGGGGGATTATTAATGATGAATGCTCGAGATGGCAGAGCAGAGGAGCTGAATTAAAACGAAGGAATTCTGCGGATTGTTGTTATTATTGTTATTATAAT:1 - chr2L 526594 5' - mdg1 7064 4 68.00 AGCGGCCTAGTAACAGCGAATAATAAATAAATAATAATAAATTGGTGCTGCAGGGGATGAAAAAAAAGGAGATTCTTCAAATCGACACACCTGGCATCCAA:1 + chr3R 2446841 5' + HMS-Beagle2 6750 1 45.54 TGGGCGGTTCGCGCACAGGTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAG:1 - 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R2-element 3327 1 77.23 GGCAGGGGGCCGGCCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCCCGCCTCTAAA:1 + chr3R 6117220 5' + Tirant 19 2 61.39 GTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGC:1 - chr3L 24566081 5' - gypsy8 211 2 76.29 AGCAACATTTGCAAACCACAACGAAACTTCGTTCAGGAAGTGCAACTAATGAGGTGGCCAAACGCGAAACGCAACAGAAAGAGGAGAACACAATAAGACAA:1 + chr2L 7516799 5' - Dm88 4461 2 60.40 AGAAGGGGTGGGGCTATCAAAAGTTGCTAGCAGCGCTTTTGGCATAAAATAAAAGCAAAATGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTA:1 - chr3L 22495744 5' - Idefix 179 2 67.01 ATATATTAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 992022 5' + hobo 34 1 60.40 GAACTCTATAACTTAACCCAATTTTTTAATGCGACGGTGTGTATGTGTTTGGGGCTCTCGAGTGGTTTTGCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAA:1 - chr3L 19375049 5' - Quasimodo 37 2 61.70 CAACGTCGACTGTAAACAACGGTCAACATCTAAAGTTTCCAGCACACGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTT:1 - chr2L 11393777 5' - 412 260 2 54.46 AATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 17587787 5' + roo 8704 2 68.32 ATATTACATCAATGCTATTGGTCTGCTATGGTAAGCTTATTGAATTTTTCTCAATTTTATATCAATGTGGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGA:1 + chrX 15852794 5' + Cr1a 4171 1 64.36 ATAGTACGATTTTCAGCACTCGCGGCAGGCACTTAAATCCTTTTGAATTGTGGCAAGGACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - 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chr2L 12475068 5' + mdg3 5256 1 77.23 TTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCC:1 - chr2R 12185413 5' + accord 6 2 63.95 CGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 9871027 5' + roo 56 2 81.19 ACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAG:1 - chr3R 29331927 5' + G6 4 1 69.88 CTTATACGCAATGTAAGCCTTAAAAAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2L 13574298 5' - pogo 2091 1 64.36 CAATTTTACACAACAAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chrX 3763249 5' + 297 15 2 63.00 TAACGCCGTTTCCCTTTTGTTAGAATTTCAAATATTTCCCAATATTAAAGCCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2L 12662749 5' + blood 7036 2 49.50 CCAATTGTTTGGGTTTTATAATATTTGTCAGGTTGTTCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCC:1 + chr2R 645033 5' - Bica 89 1 96.04 AATGCAAAACCCTGGGGGTCAAAATACACGGGCTGAACGGGTCAAAAGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCG:1 - chr3L 12052402 5' - Doc 317 1 50.53 TCTTATACAAGTATCGCAATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATA:1 - chrX 10672375 5' - mdg1 7440 2 59.41 CAACGCTTTTCGCCCCAAAGAAATTCAAACCTTTTACACATGCAAAACTATTATATGAAAACTTTAAGCATAATTAAAAAAAAATATATATAAAAAATACA:1 + chr3L 6333970 5' - copia 4659 1 74.26 CTCACATGTAAGTCCCTCCGACACGCAAATATATAATTTTTCTCCTGGCTTACTTTCTCCTCTACGTCTTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATGGC:1 + chr2L 13685419 5' - TAHRE 274 1 43.30 CCACTCAAGTCTCGACCACTTCAACACAACCCACAACAACAACTACTCCACTTCCAACAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATC:1 - chrX 4244864 5' + Doc 303 1 62.38 GTTCTACGATTCGGGCAACCGCCCCGAAAAACAACAAAAATAACAAAAAACCGATTGAGAATTATAAGAGGGCGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATAT:1 + chr3R 24263713 5' - blood 154 2 74.26 TCAGAATCTGTTGGTTCCGCTGGCTCTTATCCAGAGATGCCCTTGGTTTAATTAGTCGCTGTCCGGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCA:1 - chr3L 22353352 5' + blood 7172 2 78.22 ATAATGAACTTTGTTTGTGGCCAACAATGCCTGAAGTCGAGCTTTGTTTAATCTGTTGCATTGTACTGTATAATATTATTGTTATTATTATTATTATTGTT:1 + chr3L 18285539 5' - mdg1 7060 5 59.41 AATAAAGATTTCACTACCGTTGTAAAAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr3R 10203592 5' + jockey 9 1 72.28 AGGCGAGTGACAATAAATTGTTAAGTGCAAAAAGTTTACAGCATTTGAGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCACAATCAGT:1 - chrX 2797825 5' - Tirant 8384 2 51.49 GCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 - chr2L 6601435 5' + I-element 53 1 72.28 TTCTAATATATAACAAAAAGGCGCACAAAAAACACACCCCTCACACACACACACACACACACACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGC:1 + chrX 5123731 5' + 1360 3276 1 57.00 CAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGA:1 - chr3L 9909742 5' + Transpac 57 2 77.23 TTTTGGCTTTAGTACGGGTATTTGTCGATTTCTGATTTGCGATAACGGTCACCGATCATACATAGGCATAAAAATAATAATAATAAAAAAAAAACAACAAA:1 - chr3R 18399338 5' + gypsy11 3929 4 58.42 TATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chrX 20806945 5' + opus 7142 4 60.40 CCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGT:1 - chr3R 29331912 5' + G6 37 1 59.41 ATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:2 - chr2R 9317028 5' - opus 463 2 66.34 CTTTCCGGCGCTTTTTCCCACATTTTTCACCTTTTTACATACCATATTTCTAATGGCTGATCTGATTTATTACGACACCGTGACGCTCAGAAACGCGGCGC:1 - chr2R 16856324 5' - Rt1a 117 1 57.43 GGATATGCATCAAATACAAAAATACAAAACCCTCGTTTATTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATA:1 + chrX 22444468 5' + Juan 4092 1 61.39 CTTTTATGTTGTACCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3L 4122465 5' - P-element 2827 1 19.80 TGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCCAATAAGACGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3R 10147874 5' - roo 9017 2 76.24 AGGCATATAGGCCCAAGACCAGGGAGCACAATCTAACCATGTTTGTCGGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAGGAACTATAAAATCTAGAAAG:1 + chr3L 25463759 5' + INE-1 156 1 70.30 ATAAATTCATAGAATTTTCATCTTCATCTGCAAAGCGAACGCTCTCTGTGCCTTCTTAAGGACTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCG:1 + chr4 941114 5' + mdg1 430 1 82.11 TTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3R 8555932 5' + 412 7080 2 51.49 CTCACACCAAATCCACCAAGCAATGCTGTTTTTAAAAATTCTTTATCTTGTATTCTTCGAGTCACATCCGGTGTCCCACAAGGGAGCTATCTTGGTCCGCT:1 + chr2R 4940428 5' + Q-element 494 2 70.30 ATTGCATTTCAGTTTTTGAGAACACTACTTTAACATAGTCTCCTTTTACGACGAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACA:1 - chr2L 11618236 5' - Rt1b 4838 1 63.37 GGGGGTTTTGCAAAATTGTGTGCAAATATTGCAGGTGAATGTGTGATTACGATTTCTCGGAAAAGCTGCTTGTGATGAAGACATTTATACATATACATATA:1 - chrX 10285170 5' - Stalker4 247 4 75.25 TTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTC:1 - chr3R 32005948 5' + invader4 32 2 62.38 GTGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATAC:1 - chr3R 12047476 5' + Stalker2 7286 2 62.38 GTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2L 18212147 5' + 412 49 2 76.24 GGTAATTCGAGAAATAATCAGCAACTTTTTGGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chrX 20620595 5' - pogo 2059 1 73.00 CGGAGGACTCTTGGCCACGGGCGGCACTTGCGGAGTCGGTGTGTAAGGACTGTAGCTGTTTTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTAT:1 - chr2L 13272301 5' + flea 4943 1 59.41 CTTCGTTGCCTTAGAACTATTATGGACTGGCTCAATGGTATCACAACAATTTACCATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 - chr3R 19138900 5' + Bari1 20 1 78.57 AATAAAATAAAAACGCCAGCCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr3R 6273607 5' + blood 8 2 72.28 GTCGGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATAAAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAAC:1 + chr3R 20137232 5' + Burdock 6135 1 76.24 AATGCATATATTTAATACAAATTAAATAATTTAACAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAAAAA:1 + chr2R 19208812 5' + jockey 4993 1 79.21 GCATGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 10952279 5' - roo 9039 1 59.78 TTTGTCTCGTCACCCCCGTCGCCTAGCCCACTGACACCTTGCTCGTCCACGTATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3R 25097809 5' + P-element 2 2 76.24 TGATCATTTGACTCCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGC:1 + chr2R 9236996 5' - INE-1 546 1 74.00 TGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chrX 16995103 5' + jockey 36 1 56.44 GGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 19446130 5' + 297 4 2 72.92 AAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 - chr3R 11094555 5' + 3S18 50 2 71.29 AGTTCTTTTAAGGGGTCAAAGGAGATGGAGTTGAAATAGTTTTATTTCAATTAACAAGAGAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCAC:1 - chrX 7400792 5' - 1360 65 1 68.75 GCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 19377778 5' - roo 9022 2 73.27 CTCCCGCTCTTTTAGCCTGGTTGGTGCTTGGCTGCCCTGTCTGGCTGCGTGCGTTTTGCCGGTTTTTGTTTTGGTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAAT:1 - chr2R 16729796 5' - F-element 4664 1 74.26 CAAAAAGCGACGTGCCTCCGCTTTGGCCCTGGCCACAGACGACAATCCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCT:1 - chrX 6113266 5' + 1360 3225 1 53.47 CCCCGCCCCCCCTTTTCCGCATTTCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAAC:1 + chrX 3621107 5' + I-element 5120 1 77.23 AAAAATAAATACTTTGAATACAAACAACTTTCGGGGAATTTCACCTCTCCCTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTG:1 - chrX 1623418 5' + blood 7178 2 87.84 TGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAA:1 - chrY 3648893 5' - 17.6 468 2 59.41 GGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTT:1 - chr2L 14612114 5' - roo 9054 2 61.39 GACATATTTCTAACTAAAAACTAAATTTCATTTGAAAATTGTGGAGATTACATTCCTTTAAATGAATCTGTGAATATGGTTATACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr2R 21710111 5' + Tc3 237 2 78.22 TTTGCAAATATTCTGAAGCTTATCAGGCAGGGTGATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 - chr2R 7775826 5' - Transpac 305 2 70.30 GAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chrX 17968368 5' + Tirant 39 2 66.34 TTCCTCTCGCATATACACGTATATGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCAC:1 + chrX 1286681 5' + roo 8816 2 76.24 CCTCGTAGAGCACGGCCAGGTTTTAGATACAAAATTTTCGTTTACCGGCCCTCCGTTTTATTTCCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 6837259 5' - Doc2-element 252 1 80.26 TGCCCCAAAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chr2L 22084451 5' - copia 249 1 70.30 TCAAGCACAAAAAAAACTGTTAAGTTTTCAGTAAACATAAAA:1 + chrX 3340800 5' - TART-C 10787 1 92.86 CTTACGTTTAACTATTAACTTTAATACAGTTGATTGAATCGCTTTTGGAACGCCTTGAGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 - chr2R 24628841 5' + mdg1 19 2 58.42 GAGATATACCGGTAAAGACCACAAGAACCGCACATATTAGGTGTGATTATGCAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTGAACTTATGGCATACAGCTCTATGGTA:1 + chr2L 21935378 5' + G4 3435 1 54.46 TTATGTCATGGTTAGCCAAACTTAAAAAGTGTTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTT:1 - chr2L 16412226 5' + Cr1a 238 1 73.27 GTATTGAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 9316964 5' + opus 7151 4 72.28 GAAAGTCGAGTTCCTGCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chr3R 5686090 5' + P-element 59 1 20.79 GAGCCNCAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTG:1 - chr3R 29331935 5' + G6 14 1 64.36 CACACAGAATACTTTTAATACATTTTAAGCCGCATTTTTTCACACGTGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAA:1 + chr2R 14959727 5' - 1360 3282 1 61.39 AAGAGTATAAAATTGATTGCCTCGGACCAAAGACACTAGAATTATTCTATTGTCTTATAAATTTTTCAAACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATA:1 - chr2R 15374794 5' - 1360 404 1 70.30 AGATTGTTCTATGTGTGGCTCCTGCCTAATCCTACTCCTGCTCACTGGCTGCTGCTGAGTTGTTCGCAGTAACTTTAGCCGAATGTAACT:1 + chr3R 18656996 5' - G-element 204 1 56.67 AAGTATATGGAATGGATATTGGATGTACATACATACATATATGTAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTATGTATATATGAGGGAATTGTGAAGATTCCAG:1 - chr2L 14949553 5' - Q-element 22 2 56.44 CTGTTGGTGTCACGTGCACAGTAGAGGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 5092943 5' + roo 8714 2 80.20 TCCAGCTCCATCTCCTTCTGTGTGTCGCTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGA:1 - chr3R 20155607 5' - 1360 3192 1 75.25 TACACTTTAAATAACAAGAGAAGAGCTTCTGCTCTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCCAAGTGTGTTTGTGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGA:1 - chrY 3648949 5' + 1360 437 1 69.31 AGACCGTGCTCCAGTTTCTCAAGATTGCGGCTGCTAAAGTTCTCTAGACTGCCGCCACATTTCTATATATATTTTTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCT:1 + chr2L 4096986 5' - P-element 2620 1 74.75 AATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chrX 10672358 5' - mdg1 385 2 60.40 TTGAGGTCTGGCTTTATTAAGTGCTGGACAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 27981641 5' + roo 3 2 74.19 CAGTTTCTGTGTTTCATTGCTGTGATTCTGTGGTTGCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 23571693 5' + roo 39 2 68.32 AAAAAAAATTGGAAAAGTGTGAGCTTGATAATTTACTGTTTGTGGGCGTCAGAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGC:1 - chrX 5858214 5' + F-element 118 1 60.23 GACGATCCCAACCAGAAACTATAGTTAGAATTTAAACAATATAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 - chr2L 22079478 5' + flea 28 2 72.28 CACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 16988195 5' + opus 148 4 62.38 CGAAGAGCTTGTCCTTTTTTTTAGAAAACTCCTTCCCTTTGTGCCACTGTAGCAGGATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGC:1 + chr2L 19018147 5' - hobo 2583 1 62.38 CTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 12633251 5' + jockey 36 1 55.45 AATCCNGTCCATATGTATTGGAGTTATCCACCTACTGAGCATGCATAGGCGAACTGATTGATATGGATTTTTAATTGCATTTACAATTTACAATTTAATTG:1 - chr3L 1802780 5' - TAHRE 10182 1 56.44 AACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 24081605 5' + 297 6619 2 72.28 ACTTTNCCTCCTGTTTTATCCGATGTTTTTCTGCAATCGACGTGTGCGGTGCGCTGTCAGCTCACCTATAATAGGCTGCTTGCAGCGCTAGCCGGACATGC:1 - chr2L 16483148 5' + TAHRE 9978 1 62.38 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATTTGTGCG:1 + chr2R 5260087 5' - 1360 3222 1 60.40 AGTAAATAGTGCGGATATTATAGTCGAACCGAAAAACAAAAAGTGTTCTACTCATACGAGAGCTAGTGCATAATATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAA:1 + chr2L 20115605 5' - FB 101 1 72.28 GCATCTAAAAATGTGTAATCCCCGGAGAAGTGTCCCCCGTTAAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 + chr2L 2078412 5' + I-element 6 1 71.29 TTCAAACTTCAATTTCAGCAGCATTTCCTTTGCCCGTTTTTGTGTAGTTGTATCGTGTTTGTTTATGTGCCTTTTTTACAGTCAACTTAACAAATGTAGCT:1 + chr2R 3157823 5' + transib1 378 1 65.35 ATCGTCTTTCTCATGCAAGTTATCCAACCCATAAACATGCGTGCACCAACACTGAACGCATCTGGATGCTCCACATTTCATAGGAGCCATCCTCCAGCTTA:1 + chr2R 3583528 5' - 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roo 395 1 65.35 TCATTTGCGTCCAGTTGCTGAGAAGCTTGAAGTGAGTTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTA:1 + chr3L 4037049 5' - Doc 153 1 64.36 AGTACAGAGACATCAAATTGCATTGAAATGCGTTCGGAGCTTGGATTTGTCTTCAACCCACTTTATTTTTCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 + chr2L 5707224 5' - jockey 4985 1 61.39 TGTTGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAG:1 + chr3R 17843622 5' - roo 9057 1 62.38 TATAATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 15305614 5' - roo 401 1 71.29 CCAACAGAGCGCTGTTACGTCCAACAGGCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 19268928 5' - P-element 2841 1 31.68 CAATTTGGGTAGTATTAACCTTAAATATTAATACGAAGCAAGAGAGAATGCTGTAGTCCAGTTCCCCGACTATCTGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAA:1 - chr4 42620 5' - INE-1 537 1 78.22 TGTGCAATTTTTCAGGCCGCACGCACACTCACACATTCGGCGACGCCCACCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAG:1 - chr2R 20707182 5' + Rt1b 4794 1 50.00 TGATTAATGTTGGGCAGTCGCTGTCGTCGAAGATGTTGCTCTTGCTGTTTTTTTTACTCTCCCTTTTTTGCGCGGTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTAGTA:1 - 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NOF 356 1 58.42 CCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGGAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 16201509 5' + hobo 33 1 56.44 GGTGTCAGTGTAGGGCCTGTGAGTTCGGGACTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAACAACAAACAGTGGAAGCGTCGGG:1 - chrX 11798997 5' + gypsy8 468 1 74.68 TTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 + chr3L 10081933 5' + rover 26 2 57.43 GCAAAACGTGAAAATGTGCGGAAATTTTATTTGCACACACACACACAGGCAGATACACATAGGCGCACGCACACGCACACTCGAACACACACACACACACA:1 + chr2R 14044263 5' + accord 7026 2 75.25 CGAGCAACCCGGCCATACGGATGAATAGCCACTTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chrX 8972464 5' + 1360 7 2 64.36 GTGGAGCAGGAAAAGCCACCGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGCCGCCTGCTGCGCC:1 + chr3L 22563974 5' + HMS-Beagle 110 2 75.58 GTGGTCGTAGCACCTCCCCCTTATATGACAATTACGGAATACTCTAATGACCAATATTCTAGTCATTTTTGAAGTAGGTTGTCAATTGATCAAAAATAATA:1 - chrX 22728559 5' - 1360 259 1 73.27 ATATCCAATCTCACAATGATTTAATTTTATTCAACTATCATTAATAGTTTGTCACCAATCCAAGAAACACATATTACAGGCTTTTGACGACTACGAGTACT:1 - chrX 14979594 5' + Helena 358 1 69.31 TAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCAATACGGTAATTATTATGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 - chr2R 19209458 5' + jockey 4785 1 53.47 GGCATCTCTTAGCGCTCAGACTCGCACCCAAGCAAATTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 - chrX 868750 5' + jockey 4801 1 67.33 ATCTTTCGTTTTTATATATGTATATATAAAGATAGCCAAGCACTATAGTAATCGACTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTG:1 - chr3R 15598739 5' - Max-element 8514 2 57.43 ATATGNACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAG:1 + chr2L 23299989 5' + invader4 353 1 64.29 AGAAGTCACGGGAAATCTCTCCGGAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACCCTTATCCATAAGCCGATCGC:1 + chr2L 8394685 5' + Stalker4 166 6 59.42 TTGAAGACCTTTATCCGACCAGGTGTTAGGAAAATCAGCATGTGAAATATCAAACAACTCAACAGCTCGGGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAA:1 + chr3R 7819651 5' + invader3 220 2 72.28 AAAAGTTTATTAAATAGCAAAGGCCACATCGATTATTCACTGAAGAGATTTTCTCACTTTTCCCTTCTTCCTCATATTCTATAATGTCTATACACACTGGC:1 + chr3L 26834373 5' - invader4 2946 2 65.35 AGAAAACAATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 13060385 5' + 412 37 2 64.36 GGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGAC:1 + chr3L 25272523 5' - 1360 3377 2 72.00 GAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chrX 8491414 5' + P-element 42 1 39.60 AAGAGAAGGCGCTAATCTGATGACGCGCATTGGATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCTGAC:1 - chr3L 24109495 5' + gypsy4 28 2 93.10 TCACTCGCACATGCACGGACACACACAACACAGAGACAGAATCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATC:1 + chrY 3631931 5' + mdg1 55 2 66.34 GCTAAAATGCCAGAGACCAGGACCGCAATGGACCGGGCCATGTCATGCTGGTTAAACTGACGAACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3R 12277594 5' + Tirant 12 2 69.31 ATGTGTGGGCGAGTGAGTGAGTTTTTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCG:1 - chr3L 12916778 5' - F-element 4376 1 68.42 ATACCCACACCTCCACTCATTTTTTTCTCAGCACACCCCACACACACACACACATGCACACA:1 - chr3L 10052989 5' + accord 7036 2 79.03 CCCTTGATTAAAAATGGAAATATGAATTGAAGAGATCGCCGCTTTCTCAAGTCGTTGAAGTTTTCTTTTACATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCT:1 - chrX 9503966 5' + Ivk 5311 1 75.25 TATCGTAAAATTCTTACGAATTTGTTTACATGCCCGTGGAATTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGTTTAACAAATTTATGCATGAAATAAAAGTAGG:1 - chr2R 2846915 5' - Tc1-2 323 1 70.30 GATCGCTCTTAAATACATTTTCCCTCTTGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAAGTAAATAATTACTGATTATTACTTGT:1 + chr3L 27387207 5' + invader4 2643 1 74.26 TGCCGNCAACATGTGTTTAACGAGGGTCTGTCACTTTTATCCTCCACTGTCAGCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTTAAACAAAT:1 + chr3L 14972155 5' - transib2 2418 1 53.47 TTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr3L 2019677 5' + 412 7106 2 78.22 AACATCAGTTGTATTGCCCTCATGGGAAAATTTTGAGGTATATGTCAAATAGTTTCCATAAAAACAGGATTCTTCACTTAATAAATATATATAAATAAACA:1 + chr2L 21860299 5' + Tc1-2 481 2 58.42 AAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr3L 8713133 5' + opus 7037 4 81.25 AATAAAAACAGTGTAACTAAGTGAAAACTAAATAAACTTAATTACAACTAATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACA:1 + chrY 285100 5' + Juan 325 1 58.42 ATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCT:1 + chr2L 18177040 5' - INE-1 545 1 68.32 CGCACGAAATAATTTCAAATTTTCACTTTGTTATTATAGGGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr3R 14917255 5' - HMS-Beagle2 7158 4 60.40 CATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 8345555 5' + roo 42 2 71.58 ACGCCATATCATGCCGGGAAAACGCCACTTGGAATTCCTGTAAATCTAGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTG:1 + chr2R 3915036 5' - diver2 120 2 52.48 AGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 + chr2R 16980507 5' - copia 204 2 81.19 TTTGAGTATTTTTATTTAACCTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATA:2 + chr2R 3591955 5' + Quasimodo 2 2 77.23 GTTGTTGTTGCTGTTGCTGTGCGTTTTCGTTTTATATGTTACATATAAACCGGCCGTGGTTTTTGTTTTTCACTCGCCTAGTGCAGTTGCACTAGGGTTTT:1 - chr2L 8984606 5' - gypsy9 488 2 62.38 AGGCGATCGCTGGTTAGAAAGGAGCCGCTGAACCGAAAATCTGCAACCACTCTAGAAAATGAAGTCCGTTTATGTTATGCATGGAGTATGTAGTAGGGATT:1 + chr3R 24616834 5' + G4 3747 1 62.38 TAGGATAGTCTCTGCAGGGTTTTAATCGATTCCACAATGTATTCCATCTGCTTATCATCCGTTTTTAATAAACAATTCTTTGGCAGCGGCACTTAGCCGTT:1 - chrX 22577493 5' + 17.6 7108 2 67.33 CTGTCGCTCATTACGCCGGGATTTCATACATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGACTAAGA:1 + chr2R 20952538 5' - rover 7266 2 68.48 CGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chr2L 4160115 5' + Tirant 24 2 57.43 TACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 22098099 5' - roo 9043 1 59.41 AACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2L 16884834 5' + pogo 48 1 77.23 GGGCANGCACGTTCATGTCACATGCTGGGGGGCGTGGGAGCGGAGACACAGCATTATCATCAATATGATGAAGCGTGTCGGATCAGACGAGATGGCCA:1 - chr2R 16940095 5' + Rt1b 4788 1 75.51 GGTAAAGGTTCTCCGTAATTCGGGAAGACAGTGGAGTGTTTCGCTAGCAACCAATTCTCAAGCTTTTCCTCTTCTTCTAGAACTGTCTCCTTTCGAATATA:1 - chr3R 4729261 5' + Gypsy12A_LTR 2040 1 65.35 TGGAGGTAGATGGTATAGACATGCAAGTTGAATTTCACGTAGTTCCTGATGAGGTTATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTA:1 + chr2R 3603337 5' - Doc2-element 369 1 63.37 AAAGACAGTTACTCGAAAATCGGACTCCAGAACTTCCTAGCTCACTCTGAAAAATGCCACACCTCCCCTCTTTTTTAAAATAACGTAAAGAAATGAAGTTA:1 - chr2L 16932223 5' - blood 6972 1 62.38 GGAAAGGACTCTCTTAGGTTACCAGAGCCCTGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2R 5804480 5' + P-element 45 1 34.65 GTATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2L 20706665 5' - mdg1 7421 2 59.41 TGGATTTATTGTCATGGAACTTGATTTCAATACAGGTTCATCGTTGTTAGCTAAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTAT:1 + chr4 460946 5' - Quasimodo 53 2 58.42 GTTGTATTTGGCTTTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2R 23580846 5' - P-element 2880 2 70.00 TTTTTTAGATGTTTTTGATATAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAAC:1 - chr2L 22081305 5' - flea 145 1 77.66 AAGGAAAATGGATTTCGTAATCAATTAGTAAACTAATATATTTCCAATAATTATATTATTAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 - chr2R 8158967 5' - pogo 2089 1 67.33 TAAGTNGTAAAAAAGATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTA:1 - chr3R 13582314 5' - Tc1-2 479 1 74.26 TAGGTGTTTTTGAGTTTAGCTATTAGCTGGCTGTTGGCAATTTGGTGATTTTGTTTTGTTTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTTTTCGCAGTGCTGT:1 + chr2L 9178963 5' + Cr1a 230 1 60.40 GTCTGCTGGTAGTGGCGTTATTCGCTATTTACGCAGCCGCGCAGTCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAA:1 - chr2L 8308017 5' - P-element 117 1 48.51 GTGAAAATCAAATACAAAACGCTACCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 - chr2R 19943960 5' + 412 7106 2 78.22 TATTTTCTAATCAAGATGCTGAGTTTATATGATACTTCACGAGTTCAGCTTTAGTATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGAGCTGCCTCCATGCTTGTT:1 - chr3R 26413926 5' - invader2 4982 2 78.22 GCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr3R 10952279 5' - roo 9030 1 65.35 AGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr2L 12949218 5' - 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G7 205 1 70.10 TAGAANGCTATTTCATTGAACTCCGCAAAAGAAGATACTATAATCATACCTACTTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAA:1 + chrX 20885961 5' + Ivk 5367 1 57.43 ATGCCCACACACACTTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr3R 17928930 5' - hobo 2931 1 70.30 TTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATA:1 + chr3L 19454678 5' + diver 5932 2 72.16 TTAATTTTAACCAATCTTGTGAATTGAATGTGGTTATGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:2 - chr3R 29259674 5' + pogo 1 1 76.24 GAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chr2L 12949216 5' - 412 7508 2 64.36 TGCGGACGTAGTGGCAACGCTTGTCGCTGGTATCGATACTTTGCCAGCAGTTTTTTTTTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCT:1 - chr3L 7912372 5' - X-element 4687 1 50.50 CGAGANCTTTACATGCTTGATACATATATGTATATGCATATGATGTACGTGTATTAATGCTTCGTGAAGTTACAAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAATTAA:2 + chrX 13590513 5' + gypsy7 5013 2 80.00 TTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 13375984 5' + 1360 48 1 75.25 TACTCGATTACCCTGTATTCATTTCAAAGATCACTTTTCATCCTATCCGGTTTCCGAGCTCATCAAATCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGT:1 - 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chr3L 19460865 5' + G2 3076 2 79.41 AAAATAAATTATTTCGTTATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCCGTGCGAAGGAA:1 + chr2L 22001227 5' + HB 18 1 71.93 AATCAATATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAA:1 + chr4 970228 5' + 297 288 2 49.50 GTGTTACAAAGTGCAAATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCAG:1 - chr2R 17626565 5' - mdg1 395 2 49.50 CGATAGTCCTTTAAATCGTTTTAAAAGTACATTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr2R 6702063 5' - pogo 2059 1 74.26 TGTGCAATGAGAGTTGCCAAAAAAAACAATATATGTACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2R 18675493 5' + opus 7038 4 71.29 ATTGTNCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:1 - chr3L 23839725 5' + McClintock 5965 2 64.36 AGGCACTGAATCCACTGCTCTTTCGCATGCCAGTTGAGTTCGAAACACATTCTTACCACCAGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chr3R 26251328 5' + jockey 4776 1 56.44 ATCTAAGCCAAACTAAGAGCATTTCAAATCAGAAGTGCATTTTTATACAACTTAGTAACTAACAACTTATTGAATGAGCTATTTAATTAAAATATTTTTTT:1 + chr3R 20544871 5' - Stalker2 7187 1 70.30 AAAAAACATTTCCATAATTGCGTGCAATTGGAGCCAATTAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chrX 20047621 5' + roo 36 2 71.29 GACAACAACCCAACCACCCACCACAGAGGCTTGCATGGGATATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGG:1 + chrX 7648631 5' - G2 2864 1 52.94 AGCTGGCGCCAAGTTTGAGATTGATTTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGCACTTATACTTTGTGC:1 - chr2L 6550940 5' - 412 7197 2 74.26 CGATTTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chrX 13761313 5' + pogo 33 1 60.40 CTTTCATTGGCATGTCGCGTAGCGCCAAACGGCCCGTAAATATGCAACTATATGGCAAACAGGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCT:1 + chr3L 4368898 5' - Idefix 186 1 66.34 CATACAGATCTCAAAGCGGGATTTCACTGTTAACAAAGACCTAAAACCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTC:1 - chrX 1221973 5' + Doc 313 1 53.47 AATTACATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCGCCGCCTAATCCAAACTTCAATCAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGAT:1 + chr3R 23020832 5' - INE-1 560 1 47.52 GTACCGATCACAGTCCTGCTCGCTCTCTTTCATACCCCTTCGGCCATACCCCTTGCCGATCTTTGCATTTATTTTTTATTTTATGTTATTAACTATTTGCT:1 - chrX 7559012 5' - Doc3-element 65 1 70.30 ACAAAAAGGGTTTTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTA:1 + chr3R 4970536 5' + diver 23 2 56.00 TTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATC:1 - chr3R 20380572 5' - P-element 404 1 21.78 AGGCTTATGCAACATAATCCTAGTTTATGACAGTTGGGGGTCCTAGCCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2L 13319669 5' + hobo 6 1 71.29 AAATGTTCTCAAATATTTGTATGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 16457971 5' - roo 404 1 75.25 TATGTTTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 8313142 5' + 297 6591 2 69.31 GTTTTNTGCGAATGTGTGTTTGATATTTTAGTGTTTTTTTTTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATTTTTTT:1 + chrX 16927952 5' + Cr1a 87 1 65.35 TTTGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr3R 17896912 5' + hobo 2 1 75.25 TAATAGCGGAGCGGTGTGTGCAATAAACCAACTCGGGGCGAGCGAGATGGCTGGATTGGGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATAGAT:1 + chr3R 10985463 5' + Bari1 1289 1 64.36 TTCGGCTGGTGCAGGAGCTGTCTAAAATCTAATTAGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGGCCTG:1 - chr2L 586084 5' - opus 31 4 59.72 TATTTNCTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr2L 16884902 5' - pogo 2081 1 56.44 AGCTGCAAAGAAAAACCCTTATTGTGTTTCGAATACAGGGTGTTTGTATTTATTATATGGCCTATAGTCTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAA:1 - chr3R 13977413 5' + micropia 5108 4 77.23 TTTTTAAACACCCTACGTGCCAAGTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACAATAATAG:1 - chr3R 22590748 5' - Tc1 1644 1 55.45 TGTAAGAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 10203612 5' + jockey 29 1 50.50 CATTGGCCCCCTTGGCGATAAGGAATTCTTTGTGAGTTTATTTGAGTGTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAAT:1 - chr2R 16831291 5' - Rt1a 5033 1 54.46 TTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr3L 12633258 5' + jockey 26 1 54.76 GAGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3L 13589442 5' + hobo 31 1 52.48 CGGTTTTTAATACATTCTTTAATAATTCTCCTCTTATGTATTTGTCTTTCTGTTTGGTGTACTCTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACC:1 - chr2R 4350357 5' + Cr1a 4119 1 68.32 ACAATGCTATTGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 + chrX 19426206 5' + mdg3 5259 1 73.27 GAACTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2R 9870951 5' - roo 408 1 78.22 GTTGACCGCTTCGTGACCGAGAAATGGACCAAATCCGGAGACTACAATGAGCTTTCTCCCAAAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 15143938 5' + BS 5094 5 65.12 ATCCTCCATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 14675624 5' + roo 8685 2 58.42 TTCAANTGCTGTGTAGGGTGTAGGCACTTCGGCTTGACGCAGCTGACATCTTTTTCTTGTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGT:1 - chrX 19401202 5' - G2 3076 1 38.61 CATAAGCACACACACACACACACACACACATACGGGCGGAGCCTCTCATTTCGACTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr2L 12617883 5' - pogo 2082 1 57.14 ATAATTATATATATTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr2L 13574201 5' - pogo 2072 1 56.44 GCCAATGTTTAAATAGTTTTTTGTTACAATGCCCCAGATTTCATGCCGCATGACACTTGTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 + chrX 6701453 5' + FB 18 1 61.39 ATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:2 + chr3R 13375937 5' + 1360 1 2 76.24 ACAACACACAACGAGATCTACAAAATCAGTTCGTTACAATTTGTTCAATCAATCAAGTCTATTGTAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGGAACT:1 + chr2L 22357753 5' - Cr1a 4173 1 54.46 TTATCAGCTTCAACCACCGATGTTTTCTGAGAATAAATGTCTTTGTGTGCTTATAAAACTGTACAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr3L 11836796 5' + 1360 13 1 66.34 AATGGAGAGGTTCATTATCATTATAATCATCAGATTATATTCATACTGCCTAGTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGTTCTACATAAT:1 + chrX 23008090 5' - transib2 2575 1 56.44 AGTTTTTGTGCTACCTTCCGATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGC:1 - chr3L 23840305 5' - McClintock 159 2 80.20 ACTTCCGCTATTTATTGCCGTTTGCAGCAACAGTTCCCATATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATC:1 + chr3R 7386613 5' + HMS-Beagle 6731 1 60.40 CGGGAAATGTGTTTTTGGCCAAGTTTTGAGTGCTGCCAAGTCCACATCTAGTTTGTCTTCCACTGTAATATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTA:2 - chrX 19986444 5' - Stalker2 7642 2 61.39 ACCAGAATGTTTTTGTAATGAAATTCCTAGGTCTCCGTCTTGGAATTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTC:1 + chr2R 7552216 5' - springer 375 2 70.30 TTCTCACCTTAGTATTGCTTTTTCAAAAATTGTTGTAAAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2R 17718222 5' - 412 7516 2 57.43 ATCCCAACAAATTAGAAGTTATAAGAAGCAACTTCGGAACCGAACCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAG:1 - chr2R 6625948 5' + F-element 4210 1 53.47 ACTCAATATCGTAAGCTTCAATGCAACCATTTAAATCAATTAAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:1 - chr3R 26530957 5' + blood 4 2 73.27 AATGGCAGGGACATAAAAATAATAATTATGATTGTACCTTTTATGATTATGGTGTGAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr2L 1233159 5' + hobo 18 1 57.00 AGAAGCTACAGAGCTGCGTCTGGATCAAAGGTTTATGATAAGTGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCT:1 - chr3R 1268367 5' - X-element 4497 1 74.26 ATGCGTTATTCATACGCCCCGTGGGATGGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGG:1 - chrX 4728475 5' - Idefix 159 2 78.22 AATGCCCCAGATTTCATGCCGCATGACACTTGTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 + chrX 6701480 5' + FB 45 1 70.30 TTTACNACTTATTTTCGACCGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 16822506 5' + hopper 142 7 90.24 TCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTAGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTT:1 - chr2L 2074789 5' - roo 391 2 62.38 GCATAACAAATTCCCACCGCCGACGCAGCAGTGGGCAATTGAAGTGTTAGATGCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTTCGCACAAGTTTATAGTG:1 + chr3R 11362978 5' + rooA 7594 2 59.00 CAACAATTAAAATTACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11947753 5' - hopper 144 103 84.21 AAAACTCGTTGCGCTCACTCATACTATCAATCATGCACACTTAAAATATACGCAAACCCTCTGTTAACCTGAGAAGGGGAATAGTACGCTAGTCAATTAAC:1 - chrX 11958932 5' + jockey2 3367 1 74.26 GAGACAGCGTTAAAAAAAATTAAAATAAATAAAAAACAACCCGAGGACGTCATCGGTAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 + chr3R 27076111 5' + jockey 4764 1 61.39 AGTGTCCCTCGATGGCCATCAGCAGATGTTTGGGGCGTGGCCATATTCGAACTCATTACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr2R 17972086 5' - 412 476 2 59.41 CTTCAGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr2R 14351874 5' + Max-element 51 2 74.00 GTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACACGATAAACACTCGGT:1 - chr2L 16201571 5' - hobo 2906 1 53.54 AATAAATGGCCTCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:2 + chr2L 6388267 5' - copia 251 1 59.41 CGAACCTTGATCTTGCCAGTGATCCAAGTCTAAATCGCTTCCGATCCGATCTCGTTTCAGTTTGCACACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAA:1 - chr3L 1936420 5' - 1360 407 1 71.43 GGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGGACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAATGCCATACATTGGATAGGCACTATGCAGC:1 + chr2L 23372628 5' - 1360 3351 1 59.00 GGAGGNTGCTGTTTCTGCTGTCAAAGTTACGCAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCAACTCGAACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr2R 24239377 5' - hobo 2896 1 63.37 TCTGTTGAATGACTCTACTTGGAGCTGAATGATTCCGGCTGGAAGCCGGCTCCATATTTAGAGTTTTCTTGATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTT:1 + chr3L 18807438 5' - 17.6 39 2 76.24 CGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 - chr3L 12888272 5' + mdg1 49 2 73.00 TCTGCTTTGTGTTTGGCCAACTATCCGTCTTGCTGGCATTTATGGCCAGCATAAATATTTGCGCTGGTGCTTGATGAATTGTCCAGGGAATTCTTTTTTCT:1 + chr3L 16518649 5' - G4 11 1 60.40 TTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 10147875 5' - roo 9020 2 78.79 ATTACCCCCCGATAAGCCAATACACTGAGACAGGTTTAGTTCCAATGGTCTAAAAATATGTAGATATAAATTCATTAGTAATTTAGTAAAAACCAGAATTT:1 - chr2R 20720294 5' + HMS-Beagle 6576 1 62.38 CTCTTGGCGCTTCTCGTGCACTGAGAGAAAGCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr2L 6601465 5' + I-element 23 1 54.46 ATAAAAAAATTAAAATATGTGTATGGTTATTTGTAATGGTTTTATATAATTGTGAATCTCCATAATCCTACTTAATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3R 5938622 5' + blood 2 2 64.36 TCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3R 9131751 5' - roo 9047 1 54.46 GAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 12539511 5' - roo 358 2 75.25 ATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr3R 7168560 5' + flea 4780 2 55.56 CTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTCCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 2074696 5' + roo 22 2 56.44 ATCTAAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 + chr2L 11703225 5' - Tabor 7300 2 54.46 CCAGTTGTTTTAAAATGCCATTACTTCTTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGC:1 + chr3L 19463705 5' - invader4 3045 2 66.34 GTTTTTCAGGCGCATATTGCGCAGCTCCACCTTCCAACTTCTCCGCTCGTTGTCCTACATCCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCTCGACGGGGC:1 - chr2L 1612313 5' - gypsy8 4511 1 71.29 CACTGATGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAA:1 + chr3L 25552479 5' + Fw3 29 1 84.16 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTATTTATAAATGCATGCAAATTAACACTATCACGTCGGGG:2 + chr2R 8981355 5' - diver2 393 1 69.31 TAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCC:1 - chr2R 21773620 5' + Max-element 27 2 52.48 GAGAACAGGCTAAGCGGCAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr2L 18212104 5' + 412 6 2 73.27 CAAATTGTTTGAATATAGATGGATAAAATATCTTTTAACATTGCTCGATAAAATACTATATTTTTATTTATGTTCTTATATTAAACAGTATTTTTTTTTTT:2 - chr3L 15754606 5' + accord2 345 1 52.48 GGAAAATATTTATGGCATATAAGCCATGTAGCTGCCCTGCAATGCCATAATTCAAATGGCAACTCTGAGATGAGAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTAC:1 - chr2L 13482901 5' + P-element 412 1 78.22 AGTCAAAAAACACCTAAATGGAAACACGTGTGCCAATAAGGACTTTAGCCATGTATTCAGGTTAGTTTACAATGATTTAAGATAGGGGGTATATAGTTTCT:1 - chr3L 25670712 5' - Cr1a 4127 1 70.30 AACCAACAGCAACATAAGCAATCTCCCACAAATCGTCTCACTATCTTCTTTCACGCACGGACTGATTTTTGATCTAACCCTTTTTAGGCCGCAGGGATC:1 + chr3L 4417946 5' - gypsy8 331 1 66.67 TTAATAGACAGGTGAGCACTGCCAACGGACAGGTGGAGAGGGGGGGGGGGTGCGTGGATTTGAAGAACCGCCTTTTTT:1 - chr3L 10050254 5' - HMS-Beagle2 6732 1 64.10 TGTAAGCTTTAAATTCTCGAATATGCGCTAATTTTGTTGGCAAACTTGTATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAAT:1 + chr2R 4907340 5' - invader2 396 1 51.49 AATATAATTAAATTAACCAACGACTTATAATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAAC:1 + chr3L 25126159 5' + Stalker 145 4 74.26 AATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTT:1 + chr2L 12474968 5' - mdg3 213 2 56.44 TATTGAATGGATTTATACGAAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 7075953 5' + roo 22 2 55.10 GAAAAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr2L 4160098 5' + Tirant 8114 2 74.26 GGCGACGGAAAGCGAAGTCAGAGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 - chrX 2799729 5' + Tirant 8108 2 80.20 GGCGANTGGGCGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 16940335 5' - 297 6936 2 72.28 AAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 27981746 5' - roo 9055 2 62.38 CTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAA:1 + chr2R 1654435 5' + Juan 3849 1 73.27 ATTCTACAAATGCCAGGTAGTCCAGTCCAAACGACGCCGCTGCTTAAAATGGGTCTTGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTG:1 + chr3R 19049873 5' - gypsy4 6359 1 66.34 CGAAACTCGAAGGACCACTTGATAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACT:1 + chr2R 20952893 5' + rover 17 2 55.00 AAAAGCAAATAAAAATTATTACTTTATTACCATCTATATGATTTTTATTATATTAACACTGAAAAAAATATACATTGTCAAAAAAACTAAAAAACTAACTA:1 - chr2R 5862260 5' + gypsy2 463 1 71.29 AGCTTNTGCCATGAGGGTTACTTTGTTTTGATTGAACGAGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTT:1 - chrX 16721050 5' - Idefix 191 1 68.32 GTGCTTAACTTTGAAAATGTAAGGGTTTGTGTGGGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTACATA:1 - chrX 16057901 5' - Transpac 412 1 66.34 TTGTATTTGGCTTTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2R 23580845 5' - P-element 2882 2 71.13 TGGTCNGAGCAGCCTCGCAGATTATGTCTCATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3R 26321712 5' + blood 3 2 74.75 TCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2R 10444280 5' + P-element 56 1 23.76 CTCAAAGATGTATGTCTAACTTTACAAGCTCAAACTGAAAATAAACAAATTCAATGCAATCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATA:1 - chr3L 23974311 5' + Idefix 89 2 63.37 AGATACTTTTCATCACCCCCCTCAATATCCACACCAGAACCCAAAACTCAAACCCAAACGCCGTGGAAAATGAAATATATATTTTTATTTTTATTATATTC:1 + chr3L 12574633 5' - mdg1 7051 2 73.27 AAATTGGAATATAAAAAAAAACTGAATAGTAATAGCCAAATCATAATATCACAAAAAAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGA:1 - chr3L 18229123 5' + 1360 396 1 71.72 CAGAAGTTTTAAAAATGAGATAAAAAATAAACAGGCCAACTTTTGCTTGCCATATTTATAGAATTGGCACAACAAAATAAAAAAGACAGAATGCTATTGTC:1 - chr2R 6646741 5' - INE-1 580 1 77.23 TTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chrX 13761309 5' + pogo 37 1 64.36 TTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTA:1 - chr3R 13582264 5' - BS 5043 1 75.25 TCTTGGCATGTGCTTAACGTTTGCATTGCTACCTGCTAATTGCATACACATCTTATTGGTGTTCTCATGGATCTGTGGCTGTTGCTATGTGGTAATGTATG:1 + chr3L 22280608 5' - Quasimodo 52 2 77.23 CCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:2 - chr3R 22824408 5' - roo 351 2 85.15 AAAAAAGAAAAATTAAATCAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAAGTAAACGCGCTTCGTCGGCA:1 - chr3R 5632029 5' + TAHRE 90 1 49.50 CTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 16458017 5' - roo 9021 2 78.22 TCTAGAATTGAGTCATCAAAATGATCTGTGCTTTAGGTAGAGATTACCAGAGTTCCAATCAAACGCTCATGAATATTTAAAGTGAATTTCTAGTTGATTTT:1 + chr3L 11433859 5' + Bari2 159 1 80.20 CATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCAATACGGTAATTATTATGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - chr2R 19209453 5' + jockey 4790 1 55.45 TTTAAATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr2L 10793206 5' + I-element 46 1 73.27 CTGGCATTTTGGGCCCTGCTAATTTGGGGCCCTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 + chr2R 16475737 5' + 412 7078 2 55.45 CTTTGACAATCCCGCCACCAAAAAGAAGCCGCCCAAGCTGAAGCCCATCCACCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAAT:1 - chr2R 9319929 5' - Tirant 190 2 53.47 GTACTGGGCGTAGTGTGCGGATGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCTT:1 - chr3R 30780442 5' - Ivk 5000 1 79.69 GCAATGGGCTTTTATCTCAAAGTTCAACTTGACTTATAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAATGTGTTAATTAGGGTCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTTG:1 + chr2L 21677438 5' - HB 1326 1 78.22 AAGCAGGAATCACGGGTCCAGGGGGCCAAAATCGCTGTACTGCCTCTGTACTGCTGAACAACCGTTCAGGGGGGCCGGTATGTTTGGGAACGAGACACCC:1 + chr3R 11093908 5' + 3S18 5764 1 76.00 AAATAAAAAATAAATTAAAATAATAAGACGCGTTACTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 + chr2R 14276353 5' + HMS-Beagle 37 2 67.33 TTTAGCGGGACCTCCCGCATGACGAGGTTTATAAAAAAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACCAAAATAACGTTA:1 - chr2L 21272146 5' + copia 4886 2 61.62 TGAAAAATATCCAAACATTTTTCTAAAATGTGGGCGTGGCAGTTACGTGTGGGAGTTAGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTA:1 + chr3L 20498687 5' - 1360 3163 1 61.39 GTTTGNTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 8345512 5' - roo 9029 1 67.33 TATGACAACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 + chr3L 11661710 5' - hopper 1390 1 52.00 GCTGCACATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3L 22831275 5' + 297 6613 2 65.35 AGACCGATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 13136780 5' - roo 355 2 80.20 TAGACAACTTTACTGCTTTCAACAATTAAATGAGAAAACAAACTCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAA:1 + chr3R 21020715 5' + I-element 104 1 56.44 CCCCACATCCTGTTCTCGTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTA:1 + chr3L 10081912 5' + rover 5 2 72.28 AGCGCACATTAAACTCTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTT:1 + chrX 21097026 5' - INE-1 166 1 64.36 ATTTTCGTAGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr3L 5489961 5' - jockey 4959 1 76.24 TCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3L 13659947 5' - pogo 2054 1 79.21 CTGATAACGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr3R 7360377 5' + jockey 22 1 63.37 CACAGTCACGGCGACACTTCCGCTGGTGGGTCATTTTAAAGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTGTGGGTGTGGGTATAGAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chr3R 11343141 5' - hobo 2937 1 73.27 GACAACAATCATTCTAGCCAATGCTAGCTATATAAAATATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3R 29353236 5' - I-element 5318 1 62.38 GAGAAACAAATGAGCTGTAAGCTGCGCTGTGTTGGTCGGCCTCCTCCAATTGCGCCGACAAGCATGGTTGGAGGAACCTATCGCTATATTAGTCGCCTCTT:1 + chr2L 22181522 5' - R1A1-element 4858 1 61.39 AGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 13375945 5' + 1360 9 2 68.32 TTTTTAGATGCCACAGTTGGGCTCTGCTGATATACACACTGGGTCGAAAAACAAATATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 6506897 5' + roo 8678 2 61.39 TATGGNTTTTCTCAGGTAAAACGTATAATTTTGATAACTTCGATTGATATAATAATACCTTTATAATAATAATAATAATAATAAAAATAATAATAATAATA:1 + chr3R 17460992 5' + mdg1 7069 2 67.33 CCATGTGTAAGTGTAAGTTCTCGATTTCGGCTAGATTTTGAAGTTCCGAGTAGATTCACTAGAAACAATAAACCCCTTACCTTAAAGCATTGTAGATCTAA:1 - chr2R 8668511 5' + Cr1a 4146 1 58.42 GGCTATAATTTTTAATGGTATCTTCGTCCTTTTATCTATTTACCTATTTTAGAGATTCCGCTTACTTGAAGCACTAAATACACACACACACACACAAATAA:1 + chrX 6082074 5' + Quasimodo 39 2 74.26 GCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2R 23580823 5' - P-element 2856 1 46.53 AAGCAGATCAGTACCACCATTGCAGGGACGACCAGAGCGACGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATA:1 - chr3L 12888312 5' + mdg1 7048 2 69.31 GTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 16201587 5' - hobo 2920 1 63.37 TACGATCACGTCCAAACGGACATATCCACTTCGTTCGCCCTACTTCAATCCTCCAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAA:1 + chr2R 9873129 5' - roo 8706 2 50.50 CATGATCAACGACATTCTGGCGGGCAGTTCGGCGGCCGCTTTCTACAAGCAGCAGCAGCATCACCAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCG:1 + chrX 17397924 5' - Quasimodo 7050 2 69.31 ATAATTTTCTGTGTCTCTTATTGTGCTGGGGTTTTTATTATCGTTATTATTATTATTATTATAGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATATTATTATGT:1 - chr3L 7261588 5' - Porto1 4226 1 69.31 GATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr2L 7255806 5' - P-element 2851 1 43.56 ATTTTGTAAATAAATATATAAAAATATATAAAAAGGGAACTAAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chrX 17057939 5' - 297 364 2 66.34 ACCTCGCCACTCCGCCGGGCACTGTGACCCTGTTTGTTCCTCCCCAGCACAAAGTTCCCTCCATAAAATTTAATTATTGTCCACAAGGACAGATTTTAAAT:1 + chr3L 7173293 5' + G2 3039 3 48.51 CGGCAAGTAAACCGACGTTTAATTTTTGGAAAGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 - chr2L 4160186 5' - Tirant 8465 2 67.33 ATACGTTTATACTTTTTGATACAATAATTTGTGTAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAA:1 - chr3L 1194781 5' + X-element 57 1 71.29 ATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2L 6888618 5' + jockey 58 1 77.23 TTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr3R 7168637 5' - flea 224 2 64.36 AAGTTCGCTGAGTTTGTAAACGCGGGTCATCAGATGCTTCAGTACCCCGCCCCAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTG:1 - chr2L 3314939 5' - jockey 4831 1 55.45 CCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAA:1 - chr2R 25051873 5' + G5A 2666 1 63.37 CACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 + chr3L 6044748 5' + Tabor 6880 2 62.38 TGTATTTGCTAACGCAGACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 + chr3R 24760523 5' - pogo 2093 1 73.27 CAGAGACCCAAATTAAGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 4876819 5' + roo 13 2 66.34 CACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr2L 16948723 5' + jockey 4708 1 59.41 TCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAAATAAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACACTTTTG:1 + chr3R 19450150 5' + roo 8687 2 50.00 GTTGCCATCTTGCAATTGATGCAAAAATCCTTCATATCTGAGCGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCAC:1 + chrX 9859718 5' - 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pogo 2082 1 46.53 CTGCGATTAAGGGTTATTTATTTTAATATCGTTAACACGTCGGTCATGCATACAGCCTTTCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTT:1 - chr3L 26640362 5' - Quasimodo 245 2 62.38 CACAGATTAGGCTGGGTCGAGATGGTTAAAGCTGCGGTCCGAAAATAAGAGCCTTTCAGAAATTACAAGTTGATTTCCAAGACCTCCCTGAAACGCAGTAC:1 + chr2R 21245299 5' + Ivk 299 1 60.40 TTAGGTTACTCGTTACGAAAGGGATTATAAATTTCGAAAGCGCTGTTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTGTTTTTTTTTTAGTTTTACTTT:1 + chr2L 11805862 5' - Doc3-element 171 1 55.00 AGTGCGGGCCATTTTTCGCCAGTTGATAAACGAGCGGAACTGCAAGGGACATTTAAAAAATCGTTGAATGTTCTGCCCAAATGGTATCTAATTCCATTAA:1 - chr2L 2698788 5' + HB 460 1 56.00 AGAAGGACGCTCCGAGTGCGTTTTCCAGCTGTTTCACTTCAACGAGAATTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGG:1 - chr2L 15810823 5' - I-element 231 1 61.00 TCTAGTCGAAGACAGGCTGGTCCAGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCTAGTAGGTTCTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACT:1 - chr2L 14103991 5' + Cr1a 4006 1 76.24 CCCAACCGAACTGAACGCTTGGCGATGATGAAAGTGATTTATGTCCGGCAAAGGCAAACACAAACTGTATAATATGGGCTATATATACATACATATAGCTA:1 - chr3R 11605761 5' - 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chr2R 4284689 5' + baggins 127 1 62.63 AATTGGATACGGGATAAACGGTGAGACAATCGGGTGAAGAGGGGTTTTGTTGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAACGGGTGA:1 + chr2R 16085898 5' - GATE 35 2 58.42 ATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2R 14341839 5' - opus 459 2 72.73 GACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2R 23580811 5' - P-element 2844 1 34.65 ATTGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTT:1 + chrX 19426214 5' + mdg3 5263 1 68.04 ACAAAGTTGCATAACGAATCAGGCGTAAAGACTGGGGTTGGCAGACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr2L 15947386 5' + Transpac 34 2 54.46 GCTGCAGATGCTCCGGGAGCACAAAAAAAAAATTTTAAAAAAAAA:1 + chr2L 2686902 5' - Tc3 77 3 64.44 TGCAGTTCCGCTGCTAACCAGCCAAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAT:1 + chr3R 16405922 5' + Quasimodo 7152 2 85.15 ACATCGACGCAAACGAGCCGTTATACTACAATTGTTAGTTGAGACAGCATTACGAATTACAATTGCTGATGTGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACAT:1 + chrX 14798156 5' + I-element 457 1 69.31 CTGATTGCCTGCGCGTGGAGCGCACCATGTAAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTA:1 - chr3L 18087131 5' - Doc 485 1 70.30 CAACCCACATAAACTCGTGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chrX 13508662 5' + roo 6 2 73.27 ATAAAAGTTAGTTATTGCCTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr3L 18659085 5' - pogo 2062 1 68.32 GGTAGTGAGCATTTCAACAGAGAGGCCGTAGTAAAATAAGTTTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCTCTAGAGGTGGCTCCGGGCTCT:1 - chr3L 25980799 5' + 1360 70 1 59.41 ATTAAATTTCCCCACTTGCTTTAATTTCAATTAAAGTTGGAACTAAAACACATAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGA:1 - chr2L 15807925 5' - I-element 5164 1 58.42 TGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3R 11119865 5' + 297 6615 2 67.00 CTCAAATGAAACGCCGACTGAGACGCCGACTGCGACTTGAGACTATGGGTATGGGTATGGGTATGGTACATGACGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chrX 17830712 5' + P-element 12 1 67.33 GACGGCCACGGATTATCAACTATTACTGGAATATGTACACGACGTGAGCAACCCCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 1715346 5' + roo 22 2 57.43 ATAACTCGGGTGCTGAGGACGAATACCGTATAACCTTGAACC:1 - chr2L 8944399 5' + Stalker3T 344 1 50.00 TTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATT:1 - chr2L 22224572 5' - Rt1c 5409 1 47.52 AAGAACACAATCGAAACAATAGGTAATATATTTATATGCTTATAAATATATATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAATT:1 + chrX 15371822 5' - Idefix 7370 2 68.32 AAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr2L 12325069 5' + jockey 4723 1 73.27 AAGTATATATCAAAGATGGGCTTACCAAATTGGCATCCTTTAAAATATATTTCCACCATGGATTACTAAATATATGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGC:1 + chr3R 10240060 5' + invader4 2759 1 80.20 GGGTATTTGCATCCACTTTGGCAGCATAACTTTTGGATTCACTAGAACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chr3L 8614482 5' - opus 479 2 59.79 CCGGTGAGAGCCAAGGAAGTGTTTCGATCGAAATCTCAGTACTTGTTCCACCCCAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGT:1 - chr2L 14873299 5' + 1360 162 1 61.39 GAAAATGCGTGGATGACACACACAATAGCAGCAATAGCAAAAGCAACAACCGAAAACCGAAGCCGTTCCCAAAATTGTCAGCATCAACCTACACACACACA:1 - 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roo 405 1 75.25 CGCGTAGCTATGCGCTGCTTGGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGGGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAAC:1 - chr2R 14799691 5' - R1A1-element 46 1 80.20 CAAGCCAAATTTGATTTGGGGCAGGGGAAAATGGAAGCGGGTGCTGATTTTCTGGTGGGAGATCTGACAAATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCA:1 - chrX 15202617 5' + McClintock 2 2 58.42 AATTAAAGCTCCGCGGCGTGCCCATTCTCGGTTATGAGCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGA:1 + chr2R 20501430 5' - F-element 254 1 68.32 ATATGCATATGTCTAGATATATGCTACATGCTAAATGTATCTGTATATGTATATGCTGTTTATGTACAATTTGAAATTAAGTAATAAATAAATAAATAAAA:1 + chrX 3119393 5' + Juan 4215 1 77.23 AGGGAATTGTACAAGGATTAAGAGAACAGGATGATAGTTTTCAGTGAATCTACTTGGAACTGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACAT:1 + chr3L 444420 5' - Cr1a 4068 1 64.36 TATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCC:1 + chr2R 8747029 5' - R1A1-element 5142 1 61.39 ATTAAGAGGGAAAAACGTAGACACCCCTACTTTGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACA:1 - chr3L 23849729 5' - R1A1-element 5306 1 68.32 GTCACATGCTAGTATTAACAGCAACTTGCAATATTTCTAAGAATTTTTCTCTAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 4551481 5' + roo 23 2 48.51 TAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2R 7032144 5' - mdg1 7418 2 67.00 GCCAAATCAATCACTGTTTTGTCGTCTATTTGAAGGGCTCTCTTCATTAAATCTAAGCTACAAACACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATAAAAA:1 + chr3R 28100284 5' + roo 8673 2 61.39 ACTTAAAAAACTGCCAGCATTTTTGAATATATAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTT:1 - chr2R 20952614 5' + rover 6960 2 62.38 TATTTCAGCTACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 15305717 5' + roo 8686 2 57.43 ATTTTACCAGCAGAGCAGGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chrX 5093012 5' - roo 407 1 63.37 GTCTTTGGTAACTCTCTTTGATGACTCTCTTGAGTGCCATAATCATTTCCATTCAAACCAAACCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr2L 9448646 5' - hobo 2904 1 69.31 ACACGTTTTTTTTTTATTTTTTTGTTA:1 + chrX 335017 5' - gypsy7 5003 16 92.59 GCACGAGAGGCAGAGATCAAGACGGAGCTGCAAAATGCTGCCAATCAGCCAACAACTTACACTGGCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTG:1 - chr3L 15504384 5' + F-element 4234 1 54.46 TTCAACTTATATATATATTATATTTTTATTTTGTTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 13992736 5' + roo 8704 2 75.25 AATCCTTCCGAAAAGTCTTACCAAGAATTTTAAAAATTACCAACAGAAGTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr2L 3339954 5' + FB 29 1 57.43 CAACATATTGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 - chr2R 4483278 5' + Ivk 23 1 56.44 TCGATCTCCCTGGTTTGTATGTCAATATACAACTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAG:1 - chr3L 24121689 5' + R1A1-element 18 1 70.83 GACTCTTCTATCATACGTTCTACAATTCTTGGTATGAATTCAGTACCATCTTTTGTGACTTTCATGTCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTAATTA:1 + chr2R 4939520 5' + Q-element 553 2 33.66 ATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGA:1 + chr3R 17321727 5' - 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roo 9029 1 74.26 AAATCCAAATAATTCATAAAATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr2R 7032109 5' - mdg1 414 2 71.29 GCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 - chr2R 7887244 5' + jockey 63 1 74.26 AAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 21092459 5' - roo 9028 1 69.31 GAGGCTTGACGTAAGCAGAAGAGTTGATATATATTTCAATACGAGTATATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 + chr2R 7775719 5' + Transpac 4939 2 59.41 CCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGT:1 + chr3L 18337664 5' - Juan 4169 1 71.29 ATTAGTCTGTTTATACACACTTTTTATGGCCACTGTGGCCTATGTTTGATCAGGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3L 2144393 5' - copia 233 1 56.44 ATCGCTCAGTTGGAAATGAGAATGACGAATTGCCCGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGA:1 - chr2L 3632200 5' + P-element 18 1 45.00 AAAGTTTTCAGGTACACACTGTATCATAGTCAATTTTAATAAAACAGCTTCTGGTTGCAATACGTTGCCATTTGAAATTCAGCACGGAGCCAGAAGTCCAG:1 + chr3L 18599055 5' - Doc 4288 1 65.35 TTCCGAAGCAGCTGGAGAAGATGGCTGGTCAGGATCAGATTCTTCAATGGATAGAAAATGGATCATCGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATCATCGCTTCCC:1 + chr2R 402143 5' - transib3 2535 1 59.41 GAACCTCAAGAACGAAAGACGTGTTTTAATAAATGCATATTTATACATACAAATTTACTTTCTACTCCCTAGCCAATGTTTATTATTTTGACTACTCCAAA:1 - chr3R 2247500 5' - invader2 4687 1 54.46 CAGTATTATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr2R 6173088 5' - pogo 2085 1 63.37 TGTAAATTACTTGTCGGTGGAAAATAATGTTCTATGATTTTAATTTTTTCTCATTTGTTTACCCAATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCAT:1 - chr2R 5319970 5' + INE-1 516 1 77.23 AGAGTTCGCTTTGATGGTCACACATTAAAATGGTATTTGTATTATGGATTAAAAATTAATTAACGAGCTACGGAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGG:1 + chr3L 5406008 5' - Doc 360 1 74.26 CGTGTACAGTGCTAATGTAAATAATTTGCTCTATTTATTTCTTTAAAAGTTTCGAAAATATAGATTAAAACAACATAATAGGCAGAAATTCTGGTGTTCAA:1 + chrX 22841848 5' - HB 1440 1 65.35 CTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 27748670 5' - roo 9043 1 58.51 TGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chr3L 19377808 5' - roo 389 2 59.41 CAGGCCAAGCCCATCAGTATTACCACAAGGGCCCCAACAACAGTGTCATCAACCACCGATGATGAAGTCTCCAGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCG:1 + chr3R 25964038 5' - Stalker 166 6 78.00 CTATCTTGTTAAAGAGAGAATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3L 682490 5' - P-element 2867 1 59.41 AAGTCNCTCTCAAAACTCAAACTGCACGCAGACTTTGATCGATGGCACTCATGATGCTGCAGGCGGCATGTCGTGGTTTTCGGTCATGACGCGCTGCCTCT:1 - chr3L 6393144 5' - Osvaldo 479 1 63.37 TGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr3R 20137276 5' + Burdock 6179 2 71.29 GGATTTTCTCAGTTGAGCCTGGATGAATAATAAGAATTTCTTTCTTAAAATATTCAACGATCATCGTAAACTATATATTATATAATATTTAAATAAATACA:1 - chr2L 14243070 5' + transib1 1935 1 27.72 ATTTCTGTCGGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2L 14612124 5' - roo 401 1 71.29 ATTTGCCCACTTTGGGTAGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 10561875 5' + hobo 13 1 63.04 TCCGCCAACCTTTTCAAAGTTTTTCGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGAAAA:1 + chr2R 13696027 5' + Doc2-element 246 5 71.15 TTTATTACCTTAAAGTTGATCTTACGGCTGCGTAATTGTTAATTGTTACTATTGAATTATCTTGGGCTATGGGTTATTGGCCGCTCGATGTCTGCGTTTGG:1 - chr3L 15831407 5' - F-element 297 1 68.32 AAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTC:1 - chr2R 5019419 5' - rooA 7578 2 68.60 CAACAGACTGGACAACTCTTGGCCTTTTGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGA:1 + chr3L 16462070 5' - F-element 62 1 72.28 AATGATGAGAGAAGAGAACGCTCGCGTTTGTTTACTAACAAAGTTGTTTTTGTTGGTGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAATA:1 - chr2R 11405460 5' - I-element 89 1 58.42 ACTTCTTGGTCTTTGGTGTAGTCGAAATTCGTAGTGGTAACAAAATAATTGGGACTTAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAAC:1 + chr3L 15729970 5' - I-element 5335 1 54.46 ACAATTCTGGCCGCGTCCTTACGCCCTACAATTTAATATAAATTCCACCTGCCAACAGGTAAATCTGTTGGTCAGTCGGTAGATCCTCGTAGTGGTCTTCG:1 + chr2R 21989998 5' - Chimpo 4132 1 70.30 GCGTGAATAAGAATGATTCTTTATTCTGTTTGAATCTATGCTTTTATATACTTAAACGGGTTTTTAGGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAAT:1 + chr3R 12778942 5' - hobo 2626 1 68.32 TTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2R 7887247 5' + jockey 59 1 71.00 TCTATTTGCTTTAATGGGTCAAACTTCAAAATCGAAATAGGATTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr2R 9770185 5' - I-element 5323 1 57.43 ATCTAATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2L 7488837 5' + roo 12 2 63.37 ATTTGTATAACGATTTAATATGAAATGATATTCTTTCGCGTCGCAATGTTTTGAATTTTTCTAAAATTTGTTTGTGTTTTTTTTTTGTTTTTAAATATTTT:1 - chr3R 18105121 5' - TART-B 10507 2 60.40 ATAATTTTTAATACAAAACTCGCAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chrX 18144324 5' - hobo 2936 1 76.00 GCCACTTTTCTGACATTCTTGCGGTTCAGAAAGGTGATGTTGCCCCAAACTGCACAGATTGATCAAGGCACACTTAAAGAAATATTTAAAATAAAAAAATA:1 + chr3R 30246182 5' + TART-B 10629 3 81.19 ATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr2R 17345921 5' + jockey 56 1 73.96 TATTTACATTGCAGCATTGCAAGCTTTTGCTTGGCCGATAATCTGCAAATACTCTGGAAAATAAAGTCCGCTTATACAAAGCTATACTAAAGCACGTGTGG:1 - 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roo 404 1 74.00 TCATATTTATAAAAAACGTAAACACAATTAGTTTATAACATATTCTAGCTTTACAAGATGACAATTGTTTATAACTGGTTGATAAAATAAAAAAAATTTAA:1 + chr2L 16256695 5' - 1360 3096 1 70.30 TCGTTATCCTTGTTCGTTTTCCTTTGAAATATTGCATTGGAGTACTGCTGACTACTTCGGTTTACAATATTAAAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCACAGT:1 + chr3L 8937308 5' - diver2 4556 2 53.47 ACTAGTTTTTGATTTTTGATATATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chr2L 22098127 5' - roo 408 1 60.40 CGGAGATATATCAACAAGTCAATGCCAAATGTTTTTTTATTTTTATTACTTTTTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAAGCCCCTTTGTG:1 - chr3L 2417278 5' - X-element 4682 1 59.41 ACTCAATTTACTTAGCAGGGCATTAAAATTAAACCTGATTTGCCCTTTGAACTTCTACGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATAC:1 + chr3L 13005683 5' - 1360 190 1 52.48 CCACACACACTTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr3R 17928934 5' - hobo 2927 1 66.34 GATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2R 4802884 5' + 412 23 2 45.54 CTACAAGCCACACACATACAGGCGTAAAATGTACACACACACACAAACATAACCCACTAACACTACCTAAATACCAATTCAATACCAACTTGTGCGTTTTG:1 - chrX 7466529 5' + I-element 4999 1 62.38 GCCATTCTTATTCCATTCTCAATTTCGAAGCCCACTCCTGAGCCCCGCGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATT:1 - chrX 12858417 5' + I-element 195 1 55.45 CCTGGCATTCAGCTACAGCCAGCAGCTTGAAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAG:1 + chr3L 3030532 5' + opus 418 2 70.30 GCAGCACGTGCAAAACATAAAATGGAATCAATTCTCAGTGCCCCAACTAAAGAAGGGGTTGGAAGCTCTTGGACGCCAGACTTCCGGCAAAAAAGCGGAAC:1 + chr2R 2264095 5' + invader3 396 1 77.23 TAAAGTACTAAAACTGACTAAAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:1 + chr3R 18210321 5' - Juan 4187 1 52.48 CAGCTGACTGGGCGGCCAGTCCCGTGACCAAATAAAAATTCAATTAAAACCTTTATTGCAACTCCTTTTTTCGACAAATTTTGAAA:1 + chrX 19697484 5' + Tc1 273 1 50.00 ATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 + chrX 16995128 5' + jockey 62 1 76.24 CCAGAAAGCCGTCAAAATACGAAAGAAGGTGACCTCGAAGAAGGCCAGCGTTGTGTCGGTTGACGACGATCTAAGTACCACTTCAACCTTCGAAGAGATAA:1 + chrX 1624263 5' + I-element 8 1 70.30 TTTTTGGCTCTATTACGTTACATTTTAATTGGGCAGGTGCAGTTTCGCTGGCAATTTAATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCCGCTTA:1 - 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flea 4985 2 67.33 GTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 - chr2L 16948735 5' + jockey 4695 1 56.00 AGATAATGCATTTTCAACTAATTACATTACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAA:1 - chrX 21448821 5' + Doc 4580 1 65.48 GACAATACACCCCACGACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTTGT:1 - chr3L 25842195 5' + 1360 84 1 58.42 TAGCCTTTGATACATTTCACTCACCCGTGTTGTACTTGTTGCGTTTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTG:1 + chr2R 5064414 5' - F-element 255 1 54.46 TTTGCATTGCGAAATGGGGAAAGAAATGAAACCAGGAAAAATAGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chrX 19162668 5' + pogo 32 1 60.40 TACAGTCTAGATCTAGAAGCAAGCGTGCTCCTTTCGAATTTATGGGTTCCTTGTATCATATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 19448516 5' - roo 335 2 69.31 CCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTG:1 + chr3L 25497423 5' - gypsy8 125 4 76.00 AGATCACTTTTCATCCTATCCGGTTTCCGAGCTCATCAAATCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - 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INE-1 548 1 59.41 ATCTTCGTCCCTAGTCATACCATAAATATACATATGTACATA:1 + chrX 2335165 5' - G3 4508 1 90.48 GCCTAAAAGTCCGAACACATACGAAGTGAACGCAACTGAATGGCATGTATTCTGAATGCTCAAATGATCTAAAAAAGTCAAAAATTTGATATTCATCGAAC:1 - chr3R 4512212 5' - Tc1-2 254 1 58.42 AACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTT:1 + chr3L 19951191 5' + Ivk 23 1 56.44 TCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 23456282 5' - 1360 3385 2 71.29 CATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCG:1 - chr3L 23839711 5' + McClintock 5979 2 57.43 AGAGATCTTGGGAGGAGACAAGTGTCAACATTAATTTGAAGATGTCTATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 12101296 5' - roo 395 1 46.53 AAATTAGCCACGCGGTCTGGATTATGATTATGCGGTGTGGCATTGTTGGCCCTGCATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTA:1 - chr2L 13573652 5' - pogo 1897 1 61.39 TTTTCTCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chr3R 4970562 5' + diver 5899 2 54.84 GTAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:2 - chr2R 21773621 5' + Max-element 8261 2 51.49 CACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chrX 13546693 5' - roo 9028 1 69.31 CGAAAAACTGGTTGGCTTGCTCAACAAGTGGGAGAGGAAAGGAGATATTGAGGGTAATATGGCGGCGCCCGTGAGGATGGATAAGTACTTTTCTTT:1 - chrX 12676685 5' - GATE 463 1 57.29 GCTGGAAACAAGTAAACCACAGTTTACATTCACTCAATTCGGTTCCGGCGAGGGTGGCGGGCTACGGCGGCGGTTTGGGCCCGCGCCAGCAATTAGCTTCA:1 + chr2R 23035121 5' - G5 454 1 72.28 GTTTGGGTGTCCTCCCCTAACTCAGCTCACTCCACTCTCCTTCGCAGTTCACACTTTCGCCGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:1 + chr2R 25059246 5' + Max-element 26 2 61.39 ATTTAGTTCGTTTTGCACATACGTTTGCCGTGAAAATTGCGGCATGCAAGCCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTC:1 + chr3R 5406747 5' + Cr1a 3987 1 63.37 CTTCTTCTTCTTACGGCTCCCATCTCCATCTGCATCTGTCTGCGTGTTTCCGGCGTGCGCGTGTGTGTGTGAGCGTATGTCATTAGGGTCTTGAATCTTTT:1 - chr2R 18010056 5' - baggins 5080 1 77.23 CGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr2R 10543488 5' - P-element 2833 1 25.74 TGGCAATAAAATAACATCACGAGGTTCCGGCTTGGAGATTATAGACAGCCCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 - chr3R 17491622 5' - Quasimodo 235 2 53.47 CCAGCAGGAGACTTTCGGCAATATGAAAAGTTGAGCAATAAACCTTCCGCCAAGCAAACACTCACACACACACACACACACATTAACAC:1 + chr3L 13827339 5' + accord 7035 2 77.53 AAAGCAGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 18104688 5' + gypsy7 5006 2 89.66 AAATAAATATTAATAAAATATTAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 12844672 5' - roo 9024 2 81.19 ATAATNGTTTTGTTTTTCTGGTTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 21174217 5' + roo 20 2 56.44 CTCCATTCGCACTAATAAATTTACAGACTGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTA:1 - chr2R 18347473 5' - blood 7321 1 72.28 TGGCAAGGCCACCTTGGAAAATATACATAAATAAAAGGATAAAAAAAAACAACAATACCGCTAAACCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAA:1 - chr2L 9284755 5' + I-element 163 1 62.22 GATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:2 - chr3L 8614556 5' + opus 7153 4 69.31 CGGGATAAAAGCGTTCAAGCGGTTCAAAGGGATTACAGGGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAA:1 - chr3R 11399971 5' - Doc 4436 1 65.35 AAAATACCCGACTAGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATA:1 - chrX 20886051 5' - Ivk 5361 1 49.50 TGTACATATGTATGTATAGGAAGAGCAACCGTAGCAACAAAGGACATCAACATTTTCAATAGATTTCCGCTAACAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTG:1 - chrX 3035907 5' + blood 357 2 76.24 CAATTGAAATCTTTCGTTTTGCTCGCAGGGTATTTAGAAGGGTTCTTTTCTCTTAACTTTGTTTTATTTTTGGTTACTTCACTTTGATCACTTCACGAATA:1 + chrX 11508998 5' + frogger 2203 1 59.41 CAAATGGATGAGGACATTGGGTAATCGCAACCACCACAACCACCCGGCCATCAACCTTCTAGACTATAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCA:1 + chrX 8045102 5' + G2 2902 1 64.44 CATTTTAGCTCGTCGCGTCTTTGCTGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCG:1 + chrX 8491389 5' + P-element 17 1 64.36 CAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 27775127 5' - roo 349 2 82.18 ATACTCAATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:1 + chr3L 19454669 5' + diver 39 2 64.36 ACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:2 + chr2L 16674865 5' - roo 9031 1 69.31 GCTTTTATTTTAATTTTCTTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTGCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCAC:1 - chrX 13263023 5' - TAHRE 10396 1 81.19 TAAAATAGCGGGACAGGCGAAGGTCATTCACGGGCGAAAGAACGAACTAAGGCAAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAA:1 + chr3R 21612567 5' - Doc 356 1 60.82 AAGTACAATTTGTTCAATTAATTATTGAAATTGAAGCGAACAGCTGAATAATTGCCAAAGGAAAAAAAAGTTAAACAATAATAATAAACAAATAAATTTAC:1 + chr3R 20465128 5' - INE-1 409 1 71.29 TAAACAAAGAATAGGCTAAAATATAGGATACACATACAGGGGGCGCATCTATGATAGAAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAAGGTCAG:1 - chr3R 15178647 5' + X-element 4522 1 63.37 AGGGAAACAACCTAAGATTTGATCCAGTACATCCCAGACAGAATAATAATACATCAAAACTAGAATTACATAATAAAATTGCAATATACAAGGCGATAATA:1 + chr2R 3515084 5' + Porto1 4238 1 68.32 TATTCNTTTGTGTGACCCAGTTGGGCTTCTGTTGCATTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTG:1 + chrX 17096575 5' - Doc 45 1 67.33 TATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr3R 28645857 5' + F-element 31 1 54.46 AGAGCATTTGCTACTTTTCACAAAGTTTCAAATACAATTTTTTCAAACAGCAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCAC:1 - chrX 3596603 5' + F-element 4335 1 55.45 TGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGA:1 + chrX 15293448 5' + Quasimodo 49 2 67.33 AGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAA:1 - chrY 3648873 5' - 17.6 448 2 79.21 CGCATCTTTTGGCCGGCACAATGGCCCACATGATTGGCCATAACATCGGCATGGGACACGACGACGGACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGC:1 - chrX 15963838 5' - Idefix 7040 2 70.30 TATAAAGTGAAAACTATACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 + chr2R 12082343 5' - mdg1 7422 2 60.40 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGGTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTA:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 8271 2 49.50 ACCAAACGATAAAAACCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAACTGGACGTGGGCAAAAGAAA:1 - chr2R 5180269 5' - FB 96 1 77.23 ATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATGTAAGATTGTTTATTATTATTG:1 + chr4 96892 5' - flea 253 2 54.46 ACCATATTAGGCAAACATGTAGCAACATATATGTATGTACATACATGTATGTACATGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCA:1 - chrX 15089147 5' - gypsy 7428 2 63.37 AAGTAAGCAACGATAAAATAGCAACGCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2R 7887275 5' + jockey 31 1 54.46 CGTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2R 1365309 5' + jockey 24 1 61.00 GTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGGCTGCGGTTATACGCACAGTGTGAAAAAGGTGGTTCACTATTGTTCAGTAGGGAGATGCCCCTTATGTTGGGATGCC:1 + chr3R 25400123 5' - G7 985 1 50.50 CAAATAATAATAATAATAAAAGTAATAACAATAATAAGAAGAAGCGAAAACGAGAAGTAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATA:1 - chrX 16580159 5' - INE-1 559 1 53.47 AAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 2649883 5' + Tirant 8146 2 62.38 TTTTCTGGTTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 21174230 5' + roo 8667 2 63.38 GCCTTATCCACTTCTGGTCAATAGGCGATGGAAATCGTTGGCCTGCGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTCATCGGGGTCCCACGCTCCGGCACAT:1 + chrX 3486844 5' - roo 8917 2 60.40 TTCATAATTCCTAGTAGCAAAAGAAATTCAAAATAAACAAAATTATCGATTTCAATAAACAAGTTACAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCGAAT:1 - chr3R 2338295 5' + Idefix 328 2 66.34 AACTTNGCGGCTTCTCCGAGCATACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2R 16940410 5' + 297 20 2 59.41 CGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGTTTGG:1 + chr2L 20132981 5' + flea 21 2 55.45 AGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3L 13589443 5' + hobo 32 1 55.45 CATAATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chrX 21852443 5' + Tirant 8136 2 53.00 TACGAACTTGTTCCTCCAATTTGGCCAAATTCTCCCTTGAGCGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGAGCGCGAGTGTCGTTCTGACTCATAGTT:1 - chr3L 8181302 5' - F-element 188 1 64.36 TAAATGTATAAGTAGAGGAAACAATCTAGACAAAATTTAGACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAA:1 - chr2R 3592053 5' - Quasimodo 7333 2 60.40 GTGTAGTGATTTGATAGGCCTGCAATAAAAAAATAGTGCATTTAGGAAAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTAC:1 - chr3R 2532795 5' - Max-element 56 2 57.43 CAATCTGGCCGACACGTCGCGGGTGCAAGTCACCAAGCTACTAATGGCAGACGTAACGCTTGCACGATTGCAGCGGCTTATTGCCGAAGTGTCAAGAGAAG:1 + chr3L 23452969 5' + rooA 7362 2 66.34 AACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTG:1 - chrX 19426287 5' - mdg3 5453 2 67.33 TCAAACTCGTTTCAATTAAAATTCTTGGCCAAGAAGCGACAACAACAGAAGTTGGCAGCAAACAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGT:1 + chr3L 10710960 5' + pogo 498 1 69.31 CACGTGTGTTTTGATTACCGATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr3R 20556109 5' + Tirant 16 2 65.35 TTGTTTATCATGCACGGAGATAAAAACAAAAAAAGATAGACAGGACAGATGGACAGTCGGACAGACAGACATGACTAGATCGATTCGGCTATTAATCCTGA:1 - chrX 22500027 5' - INE-1 94 1 58.42 CATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 + chr3R 7168554 5' + flea 19 2 60.40 TCCGTTTTCTGACTGTTTGCCTTCTCTATCCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAA:1 + chrX 22413357 5' + gypsy5 6955 2 61.39 GACATTTTTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 8555939 5' + 412 7073 2 58.42 AAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 - chr3L 9909787 5' + Transpac 4930 2 66.34 GAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3R 7522287 5' + blood 18 2 61.39 ATCTGGCTGGAAACATCTGCATTACATGCCAACCAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGT:1 - chr3L 22396262 5' + F-element 4212 1 66.34 GGGGGTGGGGGTAAGGCAGAACCCTAGCAATTCCCCAGAGCGAATTCAAAACACAAAAGCTCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACAC:1 - chr2L 13572691 5' + Doc 4396 1 65.35 TTTGTTGTTTCCTCTTTTGTGGCCGCTGCTGCCTCTTTTTGTGGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCC:1 + chr3R 6971455 5' + rover 164 2 60.40 TATTTTTAAATTAAGTGCGCCTTTTTGGAAGCACAAGGAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATAT:1 + chr3L 22900496 5' - 412 7295 2 62.38 TTTATAGGCTATTTTTTTATTCTTATTTGTACAAACAAGACAGAATGCTAAAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATATCAGCTACTCAGCTAGTGTGAATGT:1 - chrX 21506565 5' - INE-1 534 1 68.32 AAGCACTTGAAGTCACTTCAAGAGAAAGCGTCTTAGTCACACTAATACACACACAACGTGTACACCCAAATACACCCTACACTACTCCGATTGTACCCAAC:1 + chr3L 12359372 5' + Idefix 84 2 64.36 GGTAACATACAGAAATTACTTTACTTTAAATAACCGCATACCAAGGACACATGACGGTCAGGGACTTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGA:1 - chr2L 22017869 5' + INE-1 175 1 60.40 AGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAAACCCTACAATTTTGTG:1 - chrX 10561858 5' + hobo 37 1 55.56 TAAAGTGTTTGCTCTCAAGTGCGAAAATTAGGGCCGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGA:1 - chr4 852662 5' - 297 6684 2 73.27 CCAGGAAAATGCATCAAAGCTCCGAGAGTAATTGAGTGACGATTGTTGTTGCTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATTGAG:1 - chr3R 19533579 5' - BS 406 1 52.48 GGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 2074693 5' + roo 8683 2 59.41 AGATAGCCAAGCACTATAGTAATCGACTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCC:1 - chr3R 15598710 5' - Max-element 8491 2 74.74 ATCACAGTTGTTGTTGCTTATAAAATGATGTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTATGGTTC:1 + chr3L 9070067 5' - P-element 393 1 32.67 TCTATGCAACGCAGTGTTATTCGCAAAAGATCAGTGTTATTTGTTGCTATTGACTTAAACTCTCTATATATATCAGGCAGCAAGAAGCCCGCAGGACACGG:1 + chr2R 4237086 5' + gypsy8 491 1 79.21 TGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 29259638 5' + pogo 35 1 62.63 TTTTGTTTTGTTTCGTTTCGTTACTTTTAATTGAATTTATGTTTTTATTTTTTATTTTTTATATTTTCGCTTTGTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAAT:1 - chr2R 9302428 5' - gypsy4 469 1 59.41 AAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 11119889 5' + 297 10 2 69.00 CATTTGGGTGGGTATGTCTGTGTGTGTGCCTGAGTGGATGGTGTGTTTCTGTGAGAGCTCGATGAAGGCGAGAATTTCATTGGTCTTCAAGGAGGGCCCAT:1 - chr3L 21919661 5' - G5A 50 2 58.42 AAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 - chr2L 6083772 5' + 3S18 5804 2 62.38 TGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr2L 13574216 5' - pogo 2057 1 73.27 GCTGCAACTGCAGCATGAAACGATCATGAAAATTTCATGAATTTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGACAGC:1 - chr3L 4611009 5' + Doc2-element 374 1 57.29 TGAACACAAACTATTGTAAGCAAGATTGTCACTAAATTTAAGGCTGGCACTTCTGCATCCAAATTAGCTGAGTTGTATAAAATATCACG:1 + chr2R 2946521 5' + Bari2 340 1 73.03 AGGGTGGTGTAATTTGACCCTCCTCCAGGACACCGTGATCAACCTGCCGGAGTGGAGCTGTTTCCACATTTGTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAA:1 + chr3R 6743515 5' - copia 4729 1 73.27 AAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 14790647 5' - roo 9041 1 56.12 ATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGA:2 + chr2R 4547779 5' - HMS-Beagle 196 2 78.22 TGGGCGAAGCGGATGCAAAAAGGGGGAGGTGCAGCTGCTGGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCA:1 - chrX 16997622 5' - jockey 4656 1 58.57 ATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 + chr2R 5067624 5' + F-element 28 1 55.00 AAAGGATGTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 10952253 5' - roo 402 1 67.39 TGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATC:1 - chr3L 11257389 5' - 1360 21 1 47.52 AATGAAAGCGAAAATGCGAAATGGAAACACAGAAAAAAAACCAGCGCTTCAAAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGAGTGAATCTGTTGTTTCCCCCACCAG:1 + chr2L 791377 5' + rooA 491 1 77.23 TTATTAATTACTTTTTTTGAATGGATTTTTTGAACTTTCATGTTTTATGTTCAGTTGCTGTTACTTCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTT:1 + chr2L 8374320 5' - I-element 417 1 69.31 AAACAAAAATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr2L 21174285 5' - roo 9027 1 71.29 CATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTGATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chr2R 5067626 5' + F-element 31 1 54.46 AAATTCTGTGAATTTAGGAGAGCGTTAAATGTTGCTCTCTTCTAACACATTTAAGAATTCGCACATGTGTGTGTGTTGTGCTAGAAGAAGGTTTTC:1 - chr2R 17452368 5' - 1360 3199 1 77.08 TTTTCAATGTTGTTAATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1 + chr3L 14396956 5' + BS 5000 1 65.35 ACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr2L 8565504 5' + blood 54 2 79.21 TTTGTTGTGCCGTGTGGGAAAACCACAACAACAACAGAGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chrX 6657360 5' + P-element 8 2 67.42 CAGCTNCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTT:1 + chrX 15089059 5' + gypsy 7012 2 53.47 TCCCGACCCAAAATAAAAATAAAAACTGATTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 - chrX 5093201 5' - roo 408 1 38.00 AGGCGNTATGCAAGTCTCTTTCCTAACCTTTCGTTTTAGTTGAAGTAGATTAGTTATTTTGTAGGGTAGTTGTAAGCTAATGGTGTCTAAATAGTTATGTC:1 + chr3L 26710517 5' - Tc1-2 9 1 74.26 TTGTGGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr2L 7800054 5' - P-element 2856 1 48.51 CCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGCCGTCTTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGG:1 - chr3L 24566085 5' - gypsy8 4863 2 72.28 GCTTTGTGTTTGAACATAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 - chr2L 22084548 5' + copia 4898 2 52.48 AATAAAAAACATAAATAACAAGCACAGGAGAAAACTCTTTCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCT:1 - chr3L 12629212 5' + jockey 489 1 71.29 CATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3L 10143162 5' + 297 30 2 63.64 CTCCCCATGGACCCTATACCATATATGTTATTTATGATGACTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGCTTTAATTGCATGACT:1 - chr3L 5704238 5' - G6 1601 1 60.40 GCCTGCTTCGTCCTCGAAGATTTATTTGTCAGATACGCTCTTTTATTTGTTTACGAGGGCGCTGGAACTTTTTTCTCTGATGTAGATTGGAGGCGGCTTAA:1 - chr2L 17626474 5' - Fw2 204 1 58.42 ACGAACTATACCATTATTTCTTCCTACATCTCACCCTAACAACCTCCAAAACATCCTTTCCCGAAATTGGTTGCCCACCCGTTATTCAGCTAGTGTGAATG:1 + chr2R 4580496 5' - INE-1 535 1 78.22 AAGATGGACTACCTCGACTATCAGATACCCTTTTCTCCATAGAAACCAATTCCCGTTATAGATCTACCTTTTCTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTA:1 + chr2L 7256332 5' + P-element 2652 1 72.28 CGGCTGAACGTGCCGGAGCTGAGAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chrX 3817542 5' - roo 406 1 75.25 ATATTACTAATCAGTCTTGACAACAAAAATAAATACGACCGGCTATAGTAATGCTCTACCAAAAGGGCCAGATCGACTCGGCCATTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr3R 17871984 5' - INE-1 87 1 66.34 AGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2R 20744211 5' - roo 9030 1 71.13 AAAATATAATGCCATCCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGG:1 - chr2L 17444106 5' + G2 2772 1 74.75 GCATCAATATGCAAATCGTGTGTTTGTGTGAGTGCGTATGAAATGCAAACCAAAATTAGTTTATCCTGAATGTGTCATTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCA:1 - chr2L 16508187 5' - 1360 486 1 72.28 ACCCANCGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 - chr3L 23871314 5' + Doc 41 1 58.42 GGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chrX 10672338 5' - mdg1 365 2 80.20 AGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:2 + chr2L 20706676 5' - mdg1 7410 2 70.30 ATAGTGCCTGATATATCACCATAAACCACGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGT:1 + chr3L 4120952 5' - P-element 288 1 31.68 AATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr2L 12667238 5' - blood 344 2 61.62 CAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 27748688 5' - roo 354 2 78.22 CTGAAGGTATTCCAAATTGAATTACATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCGCCGCCTAATCCAAACTTCAATCAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCA:1 + chr3R 23020813 5' - INE-1 579 1 56.44 ACACACAACGAGATCTACAAAATCAGTTCGTTACAATTTGTTCAATCAATCAAGTCTATTGTAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGGAACTCAT:1 + chr2L 22357756 5' - Cr1a 4170 1 51.49 TCTCCCTTGTTTATAATTGCATTGACGAACCTGCCAACCCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCAC:1 - chr2L 16202167 5' + hobo 2659 1 61.39 TGCAANTCTGTGGCCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr2L 16201488 5' + hobo 12 1 66.34 GCTAGCAAAAAGTTCAATCGCATTAAACTTAATGATACCATTTCATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAG:1 + chrX 16132367 5' + McClintock 6129 2 56.00 AGTATAGGTGCAATGGTCGAGGGTGTAATGTTCTTACAGCTTAAAGCACTCACAGCTGATCGCCTCATGAAGTTTTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 - 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Bica 180 1 60.40 CCGTGACCCTGCCTCGCTCCCCTTTCATCATCGTGGCCATCGTGGCTACCGAGTCCATCGATGGCAAGCCCGCCAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCG:1 - chr3R 27247286 5' - R1A1-element 18 1 81.00 GTGCGCATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 19377770 5' - roo 9014 2 81.19 CTGGGGTTTCGGTTTGCTGCCACCATTGCCGCCATTGCAGCAAGAGCTCTCTGCCAAACAGCTCATTCATACAACCATTCATATTTATATTCATATTCATA:1 + chrX 5633979 5' - 1360 2956 1 57.43 TAGCGATAGTTTCATGTTTCGGCCTGTGCTGCTAAGCGGTGATTCGCCTGCGCTTTCCAACACACAGCAAATTCGCATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGC:1 - chr3L 16581302 5' + Bari1 1253 1 81.19 AGGAATGCATACTTCTTAGATAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTT:2 + chr3R 19346916 5' - blood 7335 1 80.20 TTTTACGGTGGGTGGTGAACATGATGGAAAAAAAATTAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAA:1 + chr3L 22124886 5' + I-element 5180 1 59.78 ATTTAATTAATTAATTTTTACAAAAATTTAAAAAACACCTAATAGACATTCTTCTTTTATATATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGT:1 + chr2L 15830523 5' + Max-element 8252 2 63.37 GGCACGTGCTGCCTTCTGTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3R 8277932 5' - P-element 2830 1 22.77 CCAGGAAGGCAACTTAATTTTGAGGAGAAACTTTGTTAAGGTTCGCCATGTGCTCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGA:1 - chr2L 8620600 5' + F-element 376 1 61.39 AAACANTTTTGCACTGCTTCACTAACAGCCATCAAATGGAAATTAAAACATCCACAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3R 12063854 5' + blood 7033 2 61.39 TACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 - chr3R 15151287 5' + jockey 4729 1 74.26 AGCGAATGATTTTGTGCTTTTTTCGGCTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 21092498 5' + roo 8714 2 79.21 GAATCACTTAAAGGGCTTTAATTGTGCGTGGGCCAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTAAATAA:1 + chr3R 22781947 5' - copia 240 1 61.00 TTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chr2R 12492414 5' - hobo 2887 1 74.26 CAAGATCTCAAATAAGTACAAAAGACACCTAAATTAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACT:1 - chrX 14979715 5' - BS 4997 1 63.83 GAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:3 + chrX 17968352 5' + Tirant 23 2 58.42 ATCAAGGCAGGCACAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTGTAGATTTCGTC:1 - chr2R 17970130 5' - G2 2817 1 76.36 ATAAGGAGCAAATCGAGACCGAAATAGGATAAATTTAGAGTCGTGTTACTTGAACATTTCCGTCAGAGGCCAAAAACAAAAAAAAACATCTAAATATATTT:1 + chr3R 25594528 5' + Transib5 31 1 64.36 CAAACTGCCGTCAGTTTGTTTACAATTTCTTCTTAGATCTAAGATCCAAGCCAGCATTTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGG:1 - chrX 12607246 5' - 412 7219 2 59.41 GAATATACATATGTATACATATATATGTATATATATGTATATGTATATATGTAGTAAAATAATCATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAAATTAC:1 + chr3R 12372813 5' - Tc1-2 1472 1 63.37 AATGGCAAACAGACCGCACGGCCAAGGACTTGCCACACACACACACACACACACACATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGC:1 - chrX 13006518 5' + Quasimodo 76 2 67.33 ACGCTATAATGCCCGACTCCTCTCCCCGGTTGCTTCATAAATTCAAATTTGATTTTCATGTTGATTATCACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCT:1 - chrX 6388477 5' + jockey 263 1 65.35 GCATTTTAATCCCCCGATTATGAATGCTCAAAGCATTTGTATAACTATTCTGCTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTG:1 + chr2L 9148592 5' - micropia 5290 1 52.48 TCGTGCGCTCTATGGGTAGCCCCAGCACAGTGCGCTACGTGGGCAGCTCCGAGTCGTCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTA:1 - chr2L 5580692 5' - X-element 61 1 61.39 GGTGGGGGCTCGTATAGGCTACACACTATAAATACATAACACTACACATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACC:1 - chr3L 8733417 5' + I-element 5163 1 53.47 GCATAATATCTGCCCGGCGAAAGGTTTACGGCCGCAAATAATCGCAATGCGAATGCCAATGAGTCGCACTCAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAAT:1 - chr3R 14064470 5' + gypsy4 393 1 76.24 AACTAAGTAACAAGGTGCCCGTTGAAAAGTCCAAGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr3R 6608855 5' + I-element 9 1 71.00 AAGCCTGCATAAATTTGCATTACGCATACGCTTGGGCTGGACTGTTTATGTACAAGTTAACCAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGTATGAAATACGACA:1 - chr3R 7411538 5' + gypsy2 26 2 80.20 ACATGTGCACTCTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chrX 21017782 5' - 412 7507 2 62.38 GTCAAACTGTGTACAAACAGCTTTGGCCTTAACGACATATGTGTGTGTGTGCGGGTTGTGCGGGTGTTTGTGCACGTGTGTGAGCATGTGTGTGTGTG:1 + chrX 9955472 5' - accord 190 2 50.00 ATAATATTAAACAAAACTTCATGCATAATGTACACGGTGCTGCAGCATAATTTCCTTTTTTCAGAACTCAATGAAAATGTAGGCCTCGGAAAATATTTATT:1 - chr3R 2679048 5' - mariner2 840 1 63.37 AGCAATTTATTATGGCCTGCACTTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGAT:1 - chr3R 29470833 5' + hopper 49 1 74.26 CAGTTGCCGTTGCTCAAGTTGTTATTATTATGCATTGTTAACTTGTTTACTTGCTCCCGGACAGCGAAATGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAAATTGGGGGT:1 + chrX 18396476 5' - Doc2-element 487 1 73.27 CCTTGTAAACAAGCTGTTTTCCTTGAAGTTAAGGAAGATTTTGACTTGTGTGGGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGA:1 - chr3R 2207187 5' - 1360 3210 1 59.41 GGGAAATGCTATTAACTGGTCATACCCCACGCAATCGACACAATATTCAAGCGAGTATGTGCAACAGCTTTTGCTCTCCGTTTTTTTTTATTATTTTTTTT:1 - chr2L 13565574 5' - Rt1a 5087 7 75.25 ATTTAACGGCACAACCGCAATAAATAATATTTCAACACTCCCTCTCAATGCAATATGTCAACCCTTACGGATATTTTTATCTGAATTCCAAAATCAAAATA:1 + chr2R 543969 5' - Dm88 4294 1 69.31 ATGGCGAGTTTTTGCAACAATTGCCTTTTAAATTATGCAACAACTGTTGCTATTAAACTTTCAATTCACTTAATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAA:1 - chr2R 13648106 5' - Burdock 53 2 74.26 CCCAAATCTGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 - chr3R 12047507 5' + Stalker2 7 2 72.28 GGCAGCCAGGAGCTGATCGCCACTTAGACAGAGCAACAACATCAGCACGTACAAGAAGGAAAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGT:1 + chr3R 29112206 5' - copia 4960 2 51.49 AATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 13659901 5' + pogo 43 1 70.30 AAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 + chr3R 7388330 5' + HMS-Beagle 21 2 58.42 ACAGATACGGTCGATTTTCTGTTACTTAAACTAAATTACATATATACAATTTTGTAAAATTACTTAAACATTGTTTATTACACAATAAAATAGAAAAATAA:1 + chr3L 7810213 5' - pogo 56 1 54.46 AAATATATGCGGCAAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATATATATATATAGTAGAATATGTGCCATAGTATAAGACCACAT:1 - chr2L 15955338 5' + Quasimodo 11 2 68.32 AATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 20744229 5' - roo 9044 1 57.43 ACTGATTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 - chr2L 15947465 5' - Transpac 5208 2 58.42 CAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr2L 12815039 5' - hopper 1384 1 54.46 GCAAAAATTTTAAGAGCACGCTGTGTTTAATGTGAATCTGAAATGTGAAATGATTTGTCAGAGTATATCAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 - chr3R 26551782 5' + jockey 4668 1 74.75 CCCTTGCCAGCGCCCTCTGTTTGTATTAATCCAACATACAAACTATCATGACCCTCTTTAAAATAAACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTTCCCG:1 - chrX 20345208 5' - INE-1 570 1 60.82 CAGTCTTAGTGCGTTTAACGTATTGATTTTAGGTTTATTCAGTACAACTCAGATAGTACTTCGATTACTAATTTGGTTTTTAGGTCTCTGTGTATGTCTTC:1 - chr2R 23503804 5' - Doc 4406 1 53.47 CTGCCTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 + chr2R 1654431 5' - Juan 4170 1 70.30 TGTGTNGCAGCAAAAAGTTCTCCTGGGAGTGGGTGGCCATGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 5201469 5' + 297 6603 2 59.41 CTACACATTCAAAATATTTTGACAAGTTTTTCAATAATGCAATAAAGTTGCCAACTGTGAAGCCGGAGAATAAATGTATGTATGTATGTATGTAGTATGTA:1 + chr2L 2684296 5' - 412 220 2 68.32 GAACATAACTGCACAAATATGTACATAGCAAGTCGCTCGCTGAGCCACCAAGCCCATGAACCCACCATTTCCACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGT:1 + chr3R 28552441 5' + Ivk 373 1 80.20 CCGACGTTGACACACTATTTTATTTTATTGCCACGAGCTGGCCTAAAACGAAATTTGCATGTAAGCACACACACACACACACACACACACACACAGTTTC:1 + chrX 16538925 5' + accord 185 2 82.00 TTGCATTTGTTGACAGACGAAACCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTG:1 - chr2R 9337471 5' - R1A1-element 4955 1 78.22 TGCGACTTAGGGGGCGTGGCGGCACTGGGCGTGGGAAGGGAAGGCGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGACTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 + chr3R 12277498 5' - Tirant 371 2 53.47 AATACATCATTTTCGTCTTTTCTCTTCCTCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTATGTGAGTTATTGCCATATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATT:1 + chrX 7641344 5' + HMS-Beagle2 6901 2 64.36 TTAGTGGTTCCATATATATTATAATTATATATATTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chr2L 13574181 5' - pogo 2092 1 62.38 TGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:1 - chr2L 3951650 5' + Transpac 4952 2 61.46 TGGGCGGGCAATGCGTTTCGCTGCGTTAAATTAACTCGTTTTTGCAGCGGTTCTGTACACCCGGTACATTGCGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATA:1 - chr3R 13661221 5' - accord 180 2 69.31 TGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr2L 12949230 5' - 412 7494 2 78.22 TATTCTTTTGATTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATT:1 - chr2R 2044258 5' - Tabor 470 2 63.37 AATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2L 7488856 5' + roo 8695 2 59.41 AAATGGTAATCAATTATTGTATAAAACGAGAATGGAAACGGGACTAAACTAAAATCGACAACAAAATAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAA:1 + chr3R 19438512 5' - micropia 5012 4 72.92 TTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2R 9871072 5' + roo 11 2 68.32 TTATACATTTATAAAGTTAAATACGGGAATCAAATATCAGGAACTAATAATGTTATATATAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAA:1 + chr3L 24153422 5' - Max-element 264 2 62.38 GATGAGCACGGAAAGCTGCACATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3L 22831261 5' + 297 18 2 53.47 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTGTCCGACCCATTTATAAGCGGACACAGAAAGCTGGGAAAAAAGGATAAGTTAACGTTATTTGA:1 + chrX 20783463 5' + Transib5 2515 1 54.46 ATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATTATATAAAAAAAAGAAGAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTTACTCAGC:1 + chr2L 15004798 5' - INE-1 546 1 77.23 CAATTCAATTACTAGATTTAATAAGCAAACGCAATGAAATGCAAAAGGACAGATATAATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 - chr2R 23584825 5' + HMS-Beagle 18 2 61.39 AAAGTTGCATAACGAATCAGGCGTAAAGACTGGGGTTGGCAGACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2L 15947388 5' + Transpac 4955 2 56.44 ATCCATGGCGCACCACTCTGGCACTTACCGATTAGAAGAAAGCTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAACAACACTT:1 + chrX 5252432 5' + blood 35 2 69.31 TGGAGTTGCACGGAAACCAGAAGAAAAATCACCAAAATGATGCCAAGCGCAAAGGAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr2L 8588518 5' + Doc2-element 217 2 66.20 GCATCGATTTTCGATGAAAAAATGAATTTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTACATTTTTAC:1 + chr2R 11989097 5' + rover 80 2 69.31 AAATGCATTATCATTTGTGGCAAAACTCAGTGTGGTCTAACAAATTTACACTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAAT:1 + chr3R 19513651 5' - Doc3-element 4552 1 71.29 ACCGCTTGAACCTTTTGGCTTTTGCACGTTTCGATTTTAATTCATGGGCGGCATAAAAATGTTAACCTTATGCCTTTGATTTATTCATTTATTTATTTGTT:1 + chrX 17225358 5' - Juan 4214 1 59.41 GACGAGCTCAACATTCCACTATCCCATACATACATATGTACATCCATTTACATACATATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 + chr3R 24081524 5' - 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opus 480 2 64.36 GGCAACAGCAGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 + chr3L 12888209 5' - mdg1 7439 2 58.42 CCGAAATTAGTCAGACAAAACATGTGCCAGTTTGACGAGGCTATTGATCCTGTTTAAGAATATATATACTTTATATCGTCGCTTACATCTGCCTGTTACAT:1 + chr3R 21508445 5' - INE-1 30 1 73.27 CATGCAGCTGATTGTGAATGGCAAGCGACAACTGTGCACGTTTACTGTGAATGGCAACATTGGTTGGTTTCACCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2L 8308154 5' + P-element 1 2 65.35 CATACGGATGAATAGCCACTTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chrX 8972451 5' - 1360 3369 1 51.49 ATGTTTGAAGCAGAGCTGGTAAACGGTAATGCCAGGTTTATACATTTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTAC:1 + chr2R 10957057 5' + transib2 2607 1 55.45 GCATTGGGTCAAAAGCCAAGTAAAAAAAACAAATAGAAGGAAGGGAGAACGTTATACGGCCGGACAGACGGACAGTGCCAGATCGACTGGGCTATTGATAC:1 - chrX 305997 5' - INE-1 97 1 55.45 AGAGATCTGGCTTCATTCCACGGCTCACTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCG:1 + chr2L 2063042 5' + Doc 4283 1 76.24 TTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:2 - chr3R 16400227 5' + blood 27 2 52.48 TATTTAGCGATTTGGAACGATATGTTTTTCTTCGGTTCAGCGAACGCAATCGAAAATACTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATG:1 - chr3L 23428269 5' + Porto1 4351 1 59.52 AACTATTTTGAAAAGAGATCTTTTTGAAACGTATACAAAATACGAGGTGTTCTGGCTATATCCATCGTCTATTGTTTTGTCAACGTCGAGATCTCAGTAAC:1 + chr2L 21616732 5' + INE-1 140 1 65.35 AGCGTTTGTCCGCGGAGTTTCCACTTTGCGCACTGCTAATCGACGAGGGTACAATCAATTCGGCCCTTTACAGGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCC:1 + chr2R 21773519 5' - Max-element 8531 2 71.29 TGATGGTGGTTCAGGTGGTTCAAATGGTGCGGATTGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAG:1 - chr2L 12625614 5' - Idefix 181 1 66.34 GAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCCTAAATTATAGTGTC:1 - chr2R 4339722 5' - G5A 2745 1 51.49 AACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chrX 13508742 5' - roo 361 2 73.27 CTTGCTCAACGGAATCTGTGCTATTTATTCACCCAATTTCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACG:1 - chr3R 16705389 5' - Stalker 6827 2 67.33 CAGTGNGTGAGTGTGTTCGTGTATCTGAGTGTCGTGGGTGGGCGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGG:1 + chrX 16457373 5' - Doc3-element 4534 1 57.43 GCGGGACTTGGGAACTGGGTATGGGGAAATCGAAATCGCTTGTTTATTTGCTTTCTGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAG:1 + chrX 2049416 5' + R1A1-element 5284 1 61.39 GGTCCTCAACAACAATGGATGCCACATAATTCGGTGCGAAAATATTGCCGTGACTAGTGGACTTTTTTCGTTTCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chrX 20047525 5' - roo 408 1 72.28 TAGAAAGTTTAGAGTACTTTCAAAAATGTTGAGTACGTCGTAAGAGCTTAAAGGATCCAGTATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACCGT:1 - chr3L 17860670 5' + invader4 400 1 67.33 CTCATTACTTGAAAACTTCATGCTAACTAAATATGCTCCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGGTGTTACAGCAAGTGAACATAAAAGATTAAATTT:1 + chr2R 14072177 5' + I-element 464 1 62.38 ATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr3R 8555860 5' - 412 7510 2 66.67 AACAACGTGCCACATTGTTCTCAAATTTTCTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTCATTCGCTG:1 - chrX 12122528 5' - F-element 4544 1 60.53 ACGGAGTTTTTGGGTTCAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - 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chr2R 16475839 5' - 412 488 2 65.35 CAAAGTGATTTGAGCTTTGTCTGCCCCCTTTTCCAGTGGGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTT:1 + chr3L 5193524 5' - F-element 353 1 61.39 ATTCTCCCCAATCCTGGCAGAAAGGCTTTTTGTGATTAGAGTGGTCGTTATTGTACAAATACCTTTTAGCTACAGACATTTATGAATAAGATCAAGAATTG:1 + chr3R 4721959 5' - Gypsy12A_LTR 2122 1 60.40 TTGGTGAATACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAA:1 + chr2R 4673561 5' - Quasimodo 7354 2 63.37 ATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 - chr2R 8345546 5' + roo 8721 2 82.18 TGTTAAAGCTTATCAGCTTCAACCACCGATGTTTTCTGAGAATAAATGTCTTTGTGTGCTTATAAAACTGTACAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 11836787 5' + 1360 4 2 75.25 TGTGCNGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTT:1 - chr2L 9774321 5' + 412 7101 2 72.92 GGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGA:2 - chr3R 12047469 5' + Stalker2 7293 2 69.31 CAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAA:1 - chr2L 3440479 5' + Juan 56 1 71.29 ATGTCGTTCTGAGCACTTTTGATTACTTTTTATCCGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 18950820 5' + roo 8685 2 59.41 GTAAGAAAATTGTAGAATTATTGAATGACCAACTCGCTACAAACAAACACACTTCTCTAATTTGTAATGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2L 513640 5' + roo 7 2 71.29 AATCTTTGCATGATAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chrX 15392033 5' + 1360 20 1 47.52 AGTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAGCCTAAGATT:1 - chr3L 25322747 5' - Transib5 2935 1 63.37 CGAGTTGCTGGCATTAATCTGAGCGAGATGGAAGAACACGGTTTAGAAAAAGCAGAGCACGTTAAATATGCAAGGGAACGGAGCTCTCTGGAAACCATACT:1 + chrX 15052142 5' + Rt1c 5147 1 55.45 TGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chrX 19426216 5' + mdg3 17 2 63.37 CATTTTCTAACAGTTCTTAAAGTCTGCTTCTCTGACTAATTGTTTTCCAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTG:1 - chr2L 14081441 5' + 17.6 205 2 53.47 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:1 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 AGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3L 9907353 5' + jockey 11 1 62.35 CTTGTTAAAGAGAGAATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chr3L 682486 5' - P-element 2863 1 55.45 CTGGGTTTCTCTGAGTTAAGGAAGTCAAGGCAGATATGGTAGGGAATCGCTTGAGGGGGTTGAAGGGCTTAAGCGGAGCAAAAGGGGGAGGACCACCGAGC:1 - chr2R 18304363 5' + R1A1-element 4909 1 76.24 TGTGCCCGTCTCGCTCTCACTTTGCAACATCACCTCGTTATATTGCCTTTGAATTTGCTTTTCTAAACATACCTCTCCCACCAAGGTGGCTCAATAGAAGG:1 + chrX 6804543 5' + X-element 4478 1 64.36 AAGCCCTTGACTTGTGCTTTGAGCAGGGTCTGCCGTCCACTCCTCATTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTAC:1 + chr2R 7859049 5' - Rt1b 4890 1 58.42 TGAAAACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3L 11113893 5' + 412 7077 2 55.45 GGCGCGTGGCTAGTGTTTTTTTTTCACGAAGAAAAATCTAACTATCTAACTATCTAACTATACTTTATATGATCCCAATCGCTTCCTTCTGCCTGTTCCAT:1 + chr3R 23891368 5' - INE-1 30 1 39.60 ATACTTCGATGGGAAATACACTCTATTATTTGATAGCTCTTTTTTAATTTTATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAA:1 + chr3R 14931220 5' - Tirant 447 1 56.44 ATGGAAGCACTCGGAAAATTTGTGCCTAATGGTGAAATATGCACCCACAGCCTCACCCATACCGCCAGCAGCGACAACACTACACCAGCAACAACAACAGC:1 - chr3R 22879637 5' + TART-B 149 2 65.35 TTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 21683466 5' + pogo 39 1 70.30 CTTGTNGTTCCGTCGCTGTTTGTGTTTTTGTTTCTTTTTTTTTCATCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCAC:1 + chr3R 13930207 5' - blood 498 1 76.24 ATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGA:1 - chr2R 5924406 5' - jockey 4729 1 42.27 GTTAACATTGCAGGTCACGCCCAGTGCACTAACATCCCCAAAAAGTGGACGGATCGAAAAAGCAGAGCACGTTAAATATGCAAGGGAACGGAGCTCTCTGG:1 - chr3R 11862485 5' + Rt1c 5137 1 58.42 CTGGCTAGCCGGTTACTGATTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGGAGGTTGATAG:1 - chr2L 15947479 5' - Transpac 310 1 77.66 ATTCTNTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3L 19377726 5' + roo 8695 2 59.41 TAATGCTGCGTAAATAAAGCAAACAATCTGAACAATCTGAACCATCCACGTGCTTTCTTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTT:1 + chr3R 20266397 5' + gypsy5 6982 2 60.40 GGGCGNGTGTGAGTTGGCCTTTTCCGATTTGTTTTGCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 24239332 5' + hobo 42 1 67.33 GTTGGNACGTTAAAGAATATATAGGTAATGCAATTGGTTAACAAAATTTTGATATAGATTATATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 + chrX 15082364 5' - mdg1 408 2 64.36 TTTACTTTTTTTCATTAAAGTTTTGTTTCCTGAAACCTTTTCTGATGACCAAGTTGCTCTGCGTTTTACAGTTTTTTATATATTTGGACTTAGGCTAATCC:1 - chr3L 13052420 5' - 412 330 2 68.32 TATAACTAATGGCGAGAAATTTGTTGAGTTGGATTTTTATTTGCGCAGCTAGCTCACTTGTGTTTTCAGTTTTCATTTATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7486958 5' - Porto1 171 1 78.89 CTATGGACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr2L 8565517 5' + blood 7051 2 66.00 GAGTGTTTAGACTTTGTCGAATTAGCCATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTG:1 - chrX 20381135 5' + Juan 152 1 73.27 CTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 + chr3L 17168852 5' + mdg1 45 2 69.31 TGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATAAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:1 + chr2R 17937131 5' + Quasimodo 18 2 60.40 ATCCTATGAATTATGCGTTGACCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTA:1 - chr2R 11575161 5' + INE-1 142 1 57.14 TATATTAGCATTATATATACATGTCAAAATGCACTACGACTTATGCCCTTAAACTTGAACGAAATTGAGCAACATTAAAACTCCGAATGAATCCGCTTTGC:1 - 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chr2L 12479546 5' + pogo 17 1 47.52 AAAGCAAACTTTAAACAAGCAAGTTACGATGCAACAAAACGATCCGGACAGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3R 10147821 5' + roo 8689 2 54.46 TTTACAGCCTGTCCAATTTTTACAACTCATTACAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAACAATTAATAAAAAGTTGAGTGCTTGTGACCACACTTCGTGCCTC:1 - chr2R 12236521 5' + 1360 470 1 70.30 CATCCCTGGTGCCCCTCCTCCTCCATATCCTGCTTACATTTAATTTCACCTCCAGCCACCGAATCCGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 15488011 5' - roo 405 1 67.00 TATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAGAACTACA:1 - chr3L 23871300 5' + Doc 55 1 70.30 GTGGGCGTGTCAACATGGGTCAACGAATTTGCGCTGCTTCTTTGTCTCTAGAATTTGTATGCTGAAGCTTAACCTTCTAGATTTTATAGTTCTTGAGATCT:1 - chrX 14770553 5' - INE-1 149 1 80.20 ATGGCACATTCGTGATACTGTCTTGGTCATGGCGGATCCACGGCGACTGCTGGGCGGGTGAGTGGGGATGGCAAAAAGTTTTTTTTGGCAAATCGATAGAA:1 + chr3R 15364259 5' - INE-1 312 1 59.41 GCTCCGTCGAGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3L 13589434 5' + hobo 23 1 56.44 GAGAAGACCGCAGAAAGGATGACAAACAAGGGCAAACTCAAATGCTATTTCTAGGAGCTTTTTCACAAGGTAAATTTGCTAATTTGTTATTATTATTATTA:1 - chr3L 9546182 5' - invader3 5061 1 60.40 ATATTNACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:2 + chr2L 3890132 5' + jockey 25 1 63.37 TCCCTTCAGAAAACCAAGATAAGAGTAGATGAAAATATTGTCTTTGGTCCCACAGCAAGATATGGATCCTGGGTCAATTAATATTTTAGTTTATTTATTTA:1 - chr2R 1927660 5' - G7 1148 1 59.41 GAGACACCAAAGGTGCGCGCTTCGGTGGCAGTCAGTCCGCTCAGGCTGCGGAAGCGGCAGCCGCAGTCAGTGAAGGGCCCAAGTGGACAGATCGGAAGAGC:1 + chr3R 24244200 5' - mariner2 570 1 55.45 GTCCTTTTGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 - chr2L 2074801 5' - roo 9066 1 76.24 TGAATTAAATAGGCACGTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2R 1365294 5' + jockey 10 1 75.25 TCTAAAACAAATTTACATTGTCGCTTGCAATTTGCAACATGAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 14612033 5' + roo 34 2 62.38 TTGAGATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3R 11119897 5' + 297 6584 2 76.24 CGGGGTAAGCGGGGCAGTTCCTACCCCACCACCCTCGCAGCAGCGAGTCAGTTAGATTCAAACACCTGAATTGAACTCATTAAGTGTACGCACAAGTTTAT:1 - chr3R 3621731 5' + rooA 7590 2 70.30 TATAATTTTTAATTACCTAGACGGTTGGAGAGTTGGAACTCGTAACGCTGCCTTTTCGGATCGGCACTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTGAAGGTGTAAAACT:1 + chr2R 22311680 5' - Doc2-element 204 1 78.22 CGCTTGAAATCCAAATTCAAACTGATCGTGCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3R 11999284 5' + P-element 45 1 34.65 ATATTAACCACTGTGGAGGACACAGGGGACAATAAGGTTCTTAATTTAATCATAAATCATAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 19445737 5' - roo 391 2 45.54 GTAGTCTCCAAGGAGAGAAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 9131783 5' - roo 9015 2 82.18 AAATCACTTTGTTTTAACATAAAACAGCTCAACTAATCTCATTTTCGATTGACACTTCGGCAATAGGCCGATGCAATCGTACTTATCTGTAGTTGCCACTT:1 - chrX 11436434 5' - rooA 7325 2 51.49 GGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:2 + chr2L 4160116 5' + Tirant 8132 2 56.44 AAACTCCACTTGGGAAACTTAATGTTTTGCATTTTCTTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAA:1 + chr3R 21335954 5' - invader2 450 1 64.36 GTTGCATTTGCCCCTCGATCATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAG:2 - chr3R 16400253 5' + blood 7012 2 78.22 CTCACAATTTTTGCTATCATAAAAGATATTTATGTACACTAGTTCAAATGTACCCATATGTGTAAGTTAACACATTTAACCAGCCGCAAAGAGAGGCCAAT:1 - chrX 22913200 5' + gypsy7 5251 2 62.38 CTACGATAGGTTAGGTAGCCCCCATTTTCTTTGCGTGCATGGCGAGGGGGCCATTTTCCGGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGC:1 - chrX 3031896 5' - accord 113 2 66.32 GACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 19951186 5' + Ivk 18 1 61.39 AGCAACAGAAATCACTTAAAGTGCCGTTTTTTGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2L 6454782 5' - mdg1 7416 2 68.32 GACTATGGGTATGGGTATGGGTATGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 + chr2R 9685900 5' + P-element 52 1 27.72 AAAAAGTGAAATTTCCTTGATTCTCCGATCTTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAA:1 - chr2L 2036263 5' + I-element 105 1 69.31 TTTGCACATCTCACCTATTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2R 15474789 5' + roo 28 2 55.45 CTACATACGTCTCGTTTCTCGCACTGGAATTGCGTACAAGCCACATACATATATTCTTCCCTTACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTT:2 + chr2L 6931662 5' - R2-element 449 1 69.31 CATCGTAAAATGCAAATGAAAATGAAAATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2L 12324004 5' - roo 405 1 75.25 TTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chrX 8972432 5' - 1360 3357 1 63.83 CTGTGNCATTTTGTTTGTGTAATATAAAATTATGTTTATTAGTTGATTACCGCAAACTAATAGTAAACCAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 7906523 5' - roo 402 1 61.39 TCCGCATTTACTTTCAGATTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCT:1 - chr3L 25232910 5' + GATE 8268 2 50.50 CCTGGCAGCACTATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 - chrX 20806956 5' + opus 15 2 64.36 TATGACAACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chr3L 11661710 5' - hopper 1389 1 51.49 GCCCGCAGCCGCTTTATCCCCACTGCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGTAACTTTCAGATCTCCTTCGATTACCTGGTTCGTCACGTACCAGGGG:1 - chr3R 902766 5' - G5 4482 1 78.22 AAAAAATGATATTAAAAATTCCGTGCCAATGTTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr3L 17921231 5' + 297 6581 1 78.22 TTCAAAAGAATAGTATGCTTATATCATTTTAAAACACACAACATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGA:1 - chr3L 19454726 5' - diver 188 2 66.34 CTCCGGAGCCAGTTAGCAGATGAAGACAAATAAAAGTGAAGTGGAGTCATATATAGCTAGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTAACTGCGGCCGCGTC:1 + chr2L 21011577 5' - gypsy4 6617 2 58.42 TCTCCGTGGTAAAAACAGTTTCCGGCTATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACT:1 + chr2R 5840648 5' - Ivk 5333 1 73.27 ACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2L 8565518 5' + blood 7050 2 65.00 GTTTAGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTCCGGTAGTCTCTTAACATGGGTATGTTTTTTTTTTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGA:1 + chr3R 5271891 5' - Rt1b 5114 1 57.43 ATGAGCAGGGAAAATCGCTCGAAAATCGCTTTCAAGCGAAAAACGAGTAACGGAAACAAGAGAAAATGCTAGAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATACCCG:1 + chr2L 8206279 5' - INE-1 555 1 61.39 TAAACAACCAACTACTTTCCTTTTCTAACTCTAACCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACAAATGTACATCTCAGCTTTG:1 - chr3R 19449427 5' + roo 8626 1 55.45 GGCAACCGGATGTTTCCTTTTTTAAGGCGCCAAAGGAAAGCATCAAAGCACCTTTCCCAAACAAGATGTACATTGAAATAAAAATTAAACAAAAAAAAAAT:1 - chrX 4810508 5' + Doc 4697 1 48.51 TATGTNCATTAGAAATAATTTATTATTTATTTTAAAACAACAATAATTTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 + chr3L 25968877 5' - HMS-Beagle 7022 2 56.70 AGCTCTTTAGCTCTCCAGTCTCGCATGCTCGGCAAGTTCCCCAAGTTCCGCAGTTTTCCGGGTCTTGGCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGC:1 - chrX 20075424 5' - Doc 4454 1 72.28 ATATTATAAAGATTTCTTTAAATTTTATATAAACATGACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACAC:1 + chr3L 8362998 5' - 3S18 6065 2 65.35 TTGCGACATCAGCTCTTTGAGGTCAGCATAAATTTTACTACACCGCCACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chr3R 17454463 5' + jockey 4674 1 53.97 GTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3L 13659975 5' - pogo 2082 1 60.40 CTGTTGTAATGCTTGACAAGGCGGTTCGAATGAGGAGATCACGGAGGAGAATTTTAGACTGCCTAAGTCCTGCTAGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTT:1 + chr3L 24294190 5' - baggins 5007 1 72.28 GGCTATATAAGCGACCCCATGGCCAATTCTGTAAACAGATGCACAATTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAG:1 + chr3R 13220995 5' - Porto1 254 1 53.47 GGGAAATGTGACCGATCAATGGCATCAGCGCTTCGAGGCAGAATGGCCCGCATTGATTGCGAGGATCCTCTAATTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATT:1 - chr2L 7857231 5' + invader4 184 2 36.63 ATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGA:1 - chrX 22824231 5' - Gypsy12A_LTR 2256 1 49.50 ATAAAAGTATTTTATTATACTAAATTCAATAAAAACCAACGTGACATTTGACAGACTCTTGGAGATATGGTATGCGTACATACGCATTGGCAGTGCTAGC:1 - chrX 21932799 5' + gypsy11 89 2 60.00 GGACAAGTTGATGTGCAGAAAGGGGGAATATATCCAAGTGCAATTCTGCCTATATTAAGTTTCATTATTTATTAAGTAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTT:1 + chr3L 10782827 5' - G5 4711 1 64.36 AGCTCTTTCTATTTTACTCTTTCGGATCTACACAAAGACCCTTCTACCTGCGCCCCACTTCTGTACTTTAAAGTCATATCTGGAAGAACGACAATTTAAAA:1 + chr2R 4012152 5' + Helena 496 1 67.33 ACCTGTGGACCGATTAATGAGTCGAAAAGTAATTTTATAATATTTTTTATTTAAGTTCCTTTCCATTTGCTTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAATT:1 + chr2L 10764980 5' - I-element 5176 1 77.23 CCCTTTTTCGATCGCACGTTTAGGATTTTGTTCTGGCTTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 + chrX 22574835 5' + jockey 4776 1 60.40 AAGGATCATATTTGCAAGGAATAATTTGTGAAATATCTAAATGTGGCGCTTCTGTGCTCCTCCCTTAATTTTATTTATTTAACAAAATTTAATATAGTATA:1 + chr3L 17834524 5' - Ivk 5366 1 68.32 GTGCAGCTTGGGAATTTAAAATTGAAATTTCTTCTTGTAATTCGTATATGCATGTCTGACTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTT:1 - chrX 19027974 5' - F-element 4443 1 75.00 ATAAAATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr2R 7032124 5' - mdg1 7437 2 56.44 AAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:3 + chr2R 5067622 5' + F-element 27 1 56.44 AGCGAAAAATATCGTGCCAAGTGCTGCATATTGCACGTAGATCTAAGCCTTTCTTCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3L 15256940 5' + Tirant 8133 2 67.02 AAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chrX 2799703 5' + Tirant 8134 2 54.46 TACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTA:1 - chr2R 2875210 5' - TLD2_LTR 121 1 67.33 TTACATTTTATTTTTCTTTTGCCTCTATATTTAAGGTTATTTTTTTAAGTGTACCAAGTGATTGAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 6622615 5' + P-element 8 2 71.29 TAGCTGGGAGATTGATCTACGAATTTGCAAAAGAAGTAGATACAAGATAAAATATAAATTTATTTGTTCATTCAGAGCAAAGAAATATATTCAATATAAAT:1 + chr2L 3821007 5' - Tc1-2 1598 1 54.46 CTGTTATATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr2R 9317035 5' - opus 7473 2 59.41 ATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3L 12633247 5' + jockey 32 1 51.49 CGCTGCGATGAAAGAAACCGTTGTTTGTTGAAAAAGCACACGAAGACATATTCAACAACACCAATCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACTCAATCCAGATAAC:2 - chr3L 24762350 5' + I-element 5120 1 58.42 ATAATTTTTAATACAAAACTCGCAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 18144324 5' - hobo 2935 1 75.25 GATCAAGTGCAAATTTTAATACCAATATTCTCGGCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACTAACTCTAGAGGGTTCTTAGCAAACCCAATCCTGA:1 + chr3L 11822203 5' + I-element 5116 1 66.34 ACGAGTACATCTCCAGGAGTCGTCGCTTCGAGCTGGCTCAACAATCATGCGCTGCGTTTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAAACTTCTAGCTT:1 - chr3R 26877659 5' - INE-1 167 1 67.33 TTTCTCCTTTCCCTTTTCGAATGTTTTCGTTTTTCCAACCATTTCCTCCTCCTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 + chr2R 16039339 5' + jockey 4763 1 53.47 CTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr2R 24021570 5' + pogo 33 1 62.38 CGGATTAAGTTCTTCGAACTGTTCGCACTGGTGTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACG:1 - chr3L 23452334 5' + Quasimodo 429 2 67.33 AGAACCTGTTTCTTATATCTTCTTATCCATTATTGTATGTAACGAAAAGATATCTGTACACACACAACGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCA:1 - chr2R 5398360 5' + gypsy12 10143 3 78.22 TGAAGCTGGCACACCACTTGTAGCTGCTCCCGATCCACCAGCGTAGCCTCGCTCCTCACCAGTATCCTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTG:1 - chr2L 16912945 5' - flea 4554 1 76.24 TTTGGCAGAGCGTTCACAATATGGGCGTACTGCTTGATCCGAGCCTTGGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGAGTAGAGCCTTCATGCTCGACGT:1 + chr3R 18300458 5' + R1A1-element 5034 1 53.47 CCTCAGCAGGCCGCCGTTGGCATCACAATTTTTTTTGCCCCTCACTTCACCTGCTCTGTTTTTAATGACACACACACACACACATATTCACACATACTGCG:1 - chr3L 5237067 5' + accord 7043 2 69.31 TCTCGACTTTAGCACCTCCTATGGGTAACAAATCGTTTTACAACACTATTGAGAAAAGCCTAAATATTAATATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 + chr2R 5953060 5' + pogo 1 1 78.22 AAATGGGCTGACTGTGAAAGGCCCAGGAAACAAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAACTCCTAGAAGTAACAAAAATTGCAGAT:1 + chr3R 31974837 5' + I-element 426 1 71.29 CTAGTTGCGTTAACTATAGGATCTCGTATTGTATTCCATTAAATTTCCTATCTGGTGGTGAATGAGAGGTACGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAG:1 + chr3L 16372169 5' - 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transib4 308 1 70.30 TCACTGACAGAAAAAAGTCACATGCACACTCACTCACACGACAACTGAAAACGTTCGAATTTAAACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATTGTCGGGGAACT:1 + chr3L 54164 5' + INE-1 557 1 55.45 TGAAGAAAATTATCCAGGTAAATCTAGGTTAGATCCCACCTTGAAGGTACTTTCTATTTTAAGCTTTACTTTTCGAACGATGCTTGGAACAGTCTATTTTT:1 - chr2L 21268545 5' + Cr1a 4028 1 76.24 CAATAATAATTAAAAATTCACGCCGTGAATATATTTCCGTACTTTATTATTGCAACAAAACGACTTTAACTCAATAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAG:1 + chr4 1267798 5' - 1360 226 1 73.27 TTTACACAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCA:1 - chr2L 11703278 5' + Tabor 56 2 77.23 AGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 10952270 5' - roo 9039 1 56.44 CGGATCGCAGATACTTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr2R 16334026 5' - P-element 2828 1 20.79 TGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 12949266 5' + 412 7098 2 68.32 TCTACTTTGCCCGGGAACTGGCCAAGCGGCTGGAGGGCACCAAGGTTACAGTGAATTTCCTGCATCCCGGCATGATCGACTCGGCTATTGATCTTGATCCA:1 - 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chrX 16094666 5' - S-element 1338 1 71.29 TAAAGATGCCAGATTTGAAATAAGCAAGTGTGGCACGGCCCGCGGCACAAACACAATTTCGAACGATTTTCCAAACGGGATAAGTGCATTAATTAATGCAT:1 - chrX 12624051 5' - diver2 418 1 76.24 CTTCCNAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr3R 6273576 5' + blood 39 2 63.37 GGCTGTTACCCCGGTTATCCATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGT:1 - chr2R 5019456 5' - rooA 7600 2 60.40 AGACCAGGACCGCAATGGACCGGGCCATGTCATGCTGGTTAAACTGACGAACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATC:1 - chr3R 12277581 5' + Tirant 8132 2 56.44 AAGCAGCAAGAAAAAAATATTTGTTATGTATATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:3 + chrX 10827381 5' - roo 409 1 77.23 ACTAATCATTCCAATGGACAGAATGAGACTCGAATTTAAACACGGGAGAATGCTACAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTG:1 - chr4 331582 5' - INE-1 539 1 71.29 TTTGGAACAAATTAAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAATCACCCCTATTAATTTTATTCAACAAA:1 + chr2R 4608376 5' - Tc1 235 1 82.18 TTATTTAAGCTCCCCTCTCTCGCGAGCTCATTCCTTGTTCTTTTTCGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGAGCGCTGCATTTCGACTGTCTGTCCCGCCAAT:1 + chr2R 4374837 5' + diver2 193 2 75.25 ATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 22831282 5' + 297 6620 2 72.28 AAACAGAGGAACAGAATTGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 2074675 5' + roo 1 2 75.25 TTATTCAATTATTTTTTTTATAATATTTTTATATATATAAATATAAAATATAAATATGTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAG:1 + chrX 21792820 5' - Quasimodo 7350 2 61.39 TATATAATTATAATTAATTACTAAATAATAATTATGAAAAAATTTCGGGAAATTATTGCATAATTAGATCTTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTT:1 - chr2L 17054164 5' + Cr1a 4307 1 56.44 GTTTATACACACTTTTTATGGCCACTGTGGCCTATGTTTGATCAGGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr3L 2144385 5' - copia 225 1 55.45 TTTTCNCTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 8313138 5' + 297 6595 2 64.36 ATCAGAGCCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:2 + chr3L 7205541 5' + Doc 43 1 58.42 GCACACATACATAAATACACACTGCACTGACAATGAGAGGAGACACAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGACCTCGCCCACCAAGAAG:1 - chr3R 1267706 5' + X-element 4465 2 54.46 TGTTCCCTCTGGGTGCCAGAAAATATGCGCCCAATAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTG:1 + chr2L 19413788 5' + F-element 4216 1 65.00 TAAAAGAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr2L 21272114 5' + copia 4919 2 80.20 AATCTACACTAAAATCTGCAAACAAATGACAAACAGGAGCAGCAGCCAGAGACAACTAAACAACAAAAAAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAA:1 + chr2L 17942261 5' - Gypsy12A_LTR 2071 1 66.34 GGGGACAAACAAAAGCCCAGCCAGAAACGATTATAAAAGCAATTAATATTTGTTTCGTACCGAACACACACACACACACACACACACATACACATATACAC:1 + chr2R 18951705 5' + accord 7033 2 81.19 GTGTGNTCCAGCTGGGATCTGCTGCAGGAGACAAAGAAGATGCTTTCAATTTCCGGACTCTGTTCATGGTTATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATA:1 - chr3R 15338802 5' + Quasimodo 85 2 55.45 AGATTNGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 24081612 5' + 297 31 2 65.35 TTCGCATTGCAGAATTATGAAAGCGCGCCGAATTGGCATCTAAATCTTGTCTAGAAACTGTGCGCATCCGTGGCCCTTCGATATATGCACATACTACACCT:1 - chr3R 7928685 5' - blood 7009 1 79.21 CCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:2 + chr3L 7205548 5' + Doc 50 1 65.35 GGAAAATAAATTTTTTTTTTTGTGATGACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chrX 15906231 5' + I-element 17 1 58.42 CAGAATGTGTTGGTAAAGAGTTTGCGACAGTCATAAGCGCTTAATATCGGCTATTGTAGCTGTTAATTGATTTGCTTGCAATACAAAAGCCGGTGAG:1 - chr3R 1022144 5' - Doc4-element 369 1 55.67 AAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chrX 2649863 5' + Tirant 8115 2 64.00 TGTCTTTAATGCGATAATTAATTGAATTAACTCTTACTTATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTC:1 - chr3R 31139583 5' + F-element 361 1 59.41 TCTGTTTGCTCATGTCCACTACGTGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATAT:1 + chr2L 12474941 5' - mdg3 5492 2 70.30 CTGCGAGTGTAGATATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3R 9551428 5' - P-element 2848 1 40.59 GCTCTGCAATTAATTAGGTCGCTCAATACACAAATCAACTACTTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGA:1 + chr2R 1994806 5' + Porto1 4506 1 76.24 GTTATTACAAAACTTTCGCATAAAAATTGTCTTCTCTTCTTCCTGCGACAACTCAACCGATCGAACGTCTCTTGAACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTG:1 - chr3R 835758 5' - Bica 4919 1 79.21 TGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:1 + chrX 19986367 5' + Stalker2 7291 2 70.30 CGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATTGTT:1 + chr2R 5582181 5' + Cr1a 453 1 54.55 AGTTGAAACCAAATCGATTAATCGAAGGAACCCCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 - chr3R 4834349 5' + mdg1 7 2 72.28 GACCGATTCTTTTGTGCAATGAGCCTAAGCCCCCCCAAGGATTGACCAAGAAAATTGTTTTTCACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTA:1 + chr2L 16505399 5' - transib2 2684 1 62.38 TGATTCTTGGCCTCCATCATGGCATTAAAGTCCTCGAGGGTCTTGTCGGGCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCG:1 - chr2R 21085329 5' + Ivk 5012 1 56.44 TTTCCCACCAAAGGAGCTGCGAAACCGCTCTCCCCGTCGTTAGCAACACCTCTTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCA:1 + chr2R 12181784 5' + accord 141 2 57.43 TTTCGATCAGATCAATACACAATTGCAGATCCATGCCAAAATGGCAATTCGGTTATCATTGTTGGGCATGTTAGTTTTCTATCTTGTTATGTCATAATTTA:1 - chr2L 16776410 5' - Fw2 90 1 55.45 CTATTCCCTGGAGTTTACATTTCTGTTTTTCCCCTTTGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACACTCT:1 + chr2R 9365303 5' + INE-1 576 1 72.28 ACAACATGTTTGTTGCACACTCAGTTGGCCAACAGGCTTGAGCGCGTTGGCGTAGGTCGTTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3R 8477785 5' - P-element 2870 1 58.42 ATAAACGTCAAGATCTAATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr2L 7488825 5' + roo 8664 1 75.25 GACACAAAGTTGCAGCTGTATTGTCACGTAAAACGGTGACAGATTCCAAAGACGACGATGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGA:1 + chr2L 18269721 5' + I-element 396 1 62.38 TTACCATTGGCTTTCAAAATACGATGCCAAGAAAATTGGTATAAAAAGAATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACATAACC:1 + chr2R 9518322 5' + Quasimodo 41 2 53.47 GTTTGTCGGCTAATGGGGAGCTTTTTGAGGAAACTCGCGCCAAATGGTTTTTGGTGAAACACAGGCAACTAAGGTTTATAGCGACAACCAGAGTTCCCAGT:1 - chr3R 7985270 5' + Dm88 4067 1 57.43 TAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3R 19989321 5' + hobo 34 1 54.46 GAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAG:1 + chr2L 18177038 5' - INE-1 547 1 58.42 CGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 9871061 5' + roo 8686 2 57.43 TGGGGCTTTTTTGCTAGAAACACTTTCGGTGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGAT:1 - chr3L 6044795 5' - Tabor 440 2 74.26 ATCTCCTTAACGATAGAAACTTTCAGTCATTCAGTCAATTCCTACAACTCCCGCACAAGCAACTGGGCCCTGTTACATACATACTTTTCAACGAATCTAGT:1 + chr2R 5150341 5' - INE-1 11 1 75.25 GGTTTAATCGGTGAACACATATTAAAGGTATTTTATAGAAACTTAAAAAGAAGTGAATTTTGCAACCTCTCACAGGATATGCGTGTGTGTGTGTGTGCATG:1 - chr3R 24082133 5' - accord 7026 2 65.35 ATTTGATAGTTTATGGTCCAAACAAAGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chr2R 7009829 5' + jockey 90 1 74.26 CGGAAAACAGCGACATTTTCGTAGCATGCTTTTTGGAGCGACAGTTTTCCACTTGCTCTCTCGTTTTACCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAG:1 - chr2L 315235 5' - Tirant 394 2 74.26 AAAAACAATAAATGATTTATACATAAAAAAAAAGGATAAGGAAAAATGGGGAAGCGCTGGCTAAAAAAAGGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 13581207 5' + gypsy7 5006 1 59.76 ACATTAGTGGATGTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGT:1 - chr2L 3388152 5' + F-element 297 1 62.00 TGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATAATAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 15080566 5' + hobo 29 1 59.78 AAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr2L 22084458 5' - copia 242 1 63.37 AAGTGTCCCCCGTTAAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr2L 2078440 5' + I-element 33 1 61.39 TACCAGTGCAAACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAT:1 + chr3R 32005861 5' - invader4 3070 2 62.38 TAATGGGAAATTAAAGAGTGCTTGTAATCTCTTAACCAATGTAATGTATGTTTTCAAACCTCACTCGTTGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGAT:1 - chr3L 10141334 5' + invader2 376 1 78.22 CAATTGCTGCCGCACTTAAAATTAATTGAACTTGAAACAAGTGCAGCCGCAGCCGCAGCGCCAACTCATGAGAAACTCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGT:1 + chr2R 16513360 5' - opus 241 2 77.23 CCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCAACGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3R 19132295 5' + Ivk 54 1 79.00 TGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 16458013 5' - roo 9025 2 74.26 TAGTGACGAGCTCAACATTCCACTATCCCATACATACATATGTACATCCATTTACACACATATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr3R 24081520 5' - 297 6964 2 68.32 GTTAGTTATACCGTTACTTCTACAGACAGAGACAGACACAGTGGAAAAGGAGGAGAGACGGAGGCGGCCCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGG:1 + chrX 8046690 5' - accord 255 4 58.06 CATTACACCTATTCGTGCCATTTTAATTTCGTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2R 8310924 5' + pogo 19 1 58.42 AGCATNCCAATCAAAGTGGAATCACTTAAAGGGCTTTAATTGTGCGTGGGCCAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chr3R 22781929 5' - copia 257 1 77.23 CAACAGTATTGTGTCGAACCCGAACGATTCGACGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTA:1 - chr2L 276265 5' + Ivk 387 1 67.33 ATAAAGCGCCCTGAAAAGTGTGCTACATATTTTGTGCAAACAAAACACGTATTTTGCAATCGTGTCAGGGCTACTAGTGAGGCGTTGAAAATTAAAATAAA:1 + chr3L 5309569 5' + TART-C 11088 1 68.32 GGTATCCGTTTGCTGATTATTTAAAAATTTATGAAGCCAACCAAGCGCAGCTGAAAACTCTTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAG:1 + chr2R 17943005 5' + I-element 443 1 69.31 CCCCTTTAAATAATGGACTAAATCCAACGAGCTTAAAATATTCTCTATTATCTTGAAGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 - chr2R 13106836 5' + copia 4890 2 58.42 ATCCGCTACCGCTACACCCTGGACGAGATGAAAAGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2R 9757447 5' + P-element 5 2 45.54 TTCAGGATAAGCTTCCCATTGGTCAGCGGGTTCAGCTTTTGCTGCACTGCCACTGCCTACTTTTATCCGTTCTCACCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGA:1 + chr2R 19360762 5' + jockey 4738 1 75.25 CACACACCAACAGCCAACACACACGTGGGCAAAAGGTAGAGTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCAGAATTAATAGCCGAGTCGATCTATCCA:1 + chr3R 13495912 5' + INE-1 102 1 73.27 CTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 16674873 5' - roo 359 2 77.23 TTTCCTCAATCCCAAGGTAAACCCTTTGATTAGCTCCAGTTTTTACCACCTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTG:1 + chr2R 16162569 5' - P-element 71 1 57.43 TTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:2 + chr2R 1365318 5' + jockey 33 1 52.00 TTATTCCTTAACCTTTTCAAGGAACGCAATAAAATTAAAAAAAAAAATTTAAAATAAAAAGCACTGCGAACAACGCACATAAGGGAGAATAAACAAAACA:1 - chr3L 14109702 5' - Cr1a 209 1 67.00 TTTGGGGAGCCCAGAAAACATCATTCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2L 12815134 5' - hopper 1408 2 74.26 CCCGTCGCCTAGCCCACTGACACCTTGCTCGCCCACGTATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3R 25097823 5' - P-element 2872 1 61.00 GTAAAGTTGCTCGCCATGATTTTCCAGTGCCATCAAAATCGTGGCGAGCAACTTTACGTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGT:1 + chr3R 19432908 5' - TAHRE 10435 1 48.51 AGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 4876804 5' + roo 28 2 54.46 CCGTCAGACTCTGCAGCTGACGTGACAAGACCAAGACCACCCCCACAATTCCGAATCCCGAAATACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 - chrX 5514872 5' + Doc 451 1 68.89 GCGATAATGGCTTCATTCGGACGGCTTATTCGAGTCACAGGGGCAAGGTCAGGGGCAGATCGTAAAGTTCCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGT:1 + chr3R 8254675 5' + flea 4708 1 76.00 ATTCTGCCTTTTCTGCCCCCAAGTTCCAATTCAACTGCAGTCGACGCGCAAAAGTGGAACCAGTTAACCAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGA:1 + chr2L 12618310 5' + rover 493 1 67.00 AATTATTAATCATTAGCTGTACATAATAAGATGCGTAACGACCATACATTTGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 + chr3L 23392949 5' - 1360 3318 1 77.23 TCAGTCATGAAGGTGGTTGGGGGTTTTTGGGGTATGGAAAAAAGGTGTTATAGGGGACATTTGGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCAAGTTCTC:1 - chr3L 2938082 5' + flea 144 1 37.62 GCATAGGCAGCTAACAGCTATCCACGGCCATGTCAGACAATCAACTTAACCAAGTTAGTCAACCGGAGTTGGTCATTCCAACTCTTACACGAAAATGAAAA:1 - chr2L 5495693 5' - aurora-element 4181 1 79.21 GCACGAAATAATTTCAAATTTTCACTTTGTTATTATAGGGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 - chr3R 14917254 5' - HMS-Beagle 210 2 61.39 GGGCCATGCATATTTGATGGAATCATCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGA:1 - chrX 13026037 5' + P-element 2845 1 28.71 CTGCATTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 12633251 5' + jockey 36 1 55.45 GCAATAGGACGATAAGAAGGAAGTTTTTCATCGCGGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTG:1 - chr2R 5043829 5' + invader1 3799 2 66.34 GCCGAAAACGAACAGTCGGTGCCGTGTTCCCTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr3R 13538979 5' - hobo 2892 1 72.28 TTTTTGATGTAAATTATTTAGGCAAACAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAA:1 + chr2L 6526452 5' + jockey 4911 1 74.26 TTTGAATATTTAAAGTAGGAAGTCCGTGGAATGCGCTCGACATTTGGCTCGGTAATTACTGTCGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGA:1 + chrX 10901890 5' + Max-element 349 1 69.31 GGTCGTGCCACTCGGGCGGCACGTGCTGCCTTCTGTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 8277915 5' - P-element 2847 1 39.60 GTGGGTTCTTACTCTTTGAGGGAATCTTTAACCTTTATTACTTACCTACCCACCCATACTCCCTCGGTCAACTACGTTTCGTCCATTCCT:1 - chr3R 28854912 5' + gypsy5 6883 1 57.78 ATCAATAATATTGCTCTAATTTTTATTTAAAAGCAAAATAAACTCGAAAAATTGCGCAAAGAAAACAACAAAGCAAAGCACTATGGGAAATTTACGCACTT:1 + chr2R 16585967 5' - Transib-N1_DM 492 1 70.30 AAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 - chr2R 13644497 5' + Burdock 6170 2 62.38 GATACGAATGCGTTGCATACTTCTCAGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:1 - chr2L 15510444 5' - jockey 4944 1 74.00 AGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTC:1 + chr3L 25272535 5' + 1360 25 1 59.41 AGAAAACTACCTTATATGTTTGTAAGCTCCGCACTTAATTCAAAAATTCCGTTGATCCTATTAGTTAACTCAAGCTAAATAAAATTAAAATTAAATTAAAA:1 - chr3R 13862614 5' - Rt1b 126 1 88.12 TACTGCTTTTCTTCGTGCTCTTACTCTACCACCTCCTTTCACCTCCTCATCCTCCACGTTCTCGTTATTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGG:1 - chr3R 16626290 5' - jockey 4727 1 78.22 ATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 + chr2R 13644432 5' - Burdock 220 2 63.37 TTTTGAAGACCTTTAAGGTATTTCTGTAGCTGTGCAATTTCTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 - chr3R 22097267 5' - TAHRE 10417 1 54.46 TCGCCCCGAAATCGGTTTTCCGCATTCGAGGTACTCGAATTCGAGTGCCATAATTGCTAGCATCCTCCGTAATTTGTGCCTGACATGGCCTGCTCTTGTCC:1 + chr2R 12059196 5' - Chimpo 4067 1 77.23 GATTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 - chr2R 2044249 5' - Tabor 7300 2 57.43 TGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 13508679 5' + roo 8687 2 56.44 CTGTGGCCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr2L 16201495 5' + hobo 19 1 60.40 TAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCG:1 - chrX 21564722 5' + diver 5937 2 77.23 TTACGTTTTAGAAATGGAGGTGTATGTTGTTAATTGATGGAATTCAAACTTGTGAAATGTCATATTTAAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 - chr2R 18399168 5' - S-element 1708 2 72.28 TGTTTGTTGAATTCAAAAGTACGCGTTGTTTCGTTACAATGAGAGCCGGCGATCGTCATGCTCGCGTTGTCACTGAACGCGAGTGTC:1 + chr2R 3603547 5' - Doc2-element 294 1 75.86 CTTTCTCTGGGTGGTCAACACCCAGAAACCAGTTGGATAAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTGGTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTATTCGGCTTA:1 + chr3R 31489168 5' + Cr1a 4079 1 68.32 AATTTNTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 23283050 5' + flea 4773 2 59.41 ATAACGAACGAATGAAACAACTCACTTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGACCGTAC:1 - chr2L 17460038 5' - F-element 4369 1 71.43 GGAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCCTAAATTATAGTGT:1 - chr2R 4339723 5' - G5A 2746 1 50.50 GTCCCCAAATCTGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAA:1 - chr3R 12047510 5' + Stalker2 4 2 75.25 ACTCACGCATCACCACCCAGGCTTACAAATGTCAAAAGATATCGTAATTCGCATCAACAGGAGAGATGTAGGCCATCGGCGGAAATCGCGATCAGCTGAAC:1 - chr2R 13102401 5' - gypsy12 192 3 67.33 CAATCGATTTTGAATTCCCCTTTGTGCTATGTTCCTCTCTTTCAATAGAGAGCGAGCACAGCTGTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATG:1 - chr3L 25996359 5' + 1360 264 1 75.25 TTTTTATTTTAGCAATCTGTGCCAGGATGGCAACAGGCGAAATCACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGT:1 + chrX 17017455 5' + I-element 4995 1 57.43 GTATTGACTACTTCGCATTTTTTTCTTTGATGAGGATCTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGTAGAGTAAGTAATAAAAATATGTTTTAC:1 + chr2L 22746119 5' - Gypsy6A_LTR 226 1 74.75 CACATGGATGTTTGTTTATTTTGAGCCACTATTTATGACAACCCGATCGGATCTCACTCAGCTGCAGGGGCTGTCCGTGCCTCTGCCGCAGAGCTCGACAG:1 + chr2L 6751851 5' - invader4 2842 2 74.26 GGTGCGAACCCGCATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr2R 20744257 5' - roo 409 1 73.27 ATATATGTAGAATATACATATACATATATATGTATATATATGTATATGTATATATGTAGTAAAATAATCATATGGATAACTTCATTGTTGATTTAACAAAA:1 - chr2L 18937480 5' - Tc1-2 1477 1 73.27 TTTTTTTATATCAGTATATCCCCCAACTTGGGCTGTTGTGGGACAAAAATGTGGGTGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACAAATATACGCGTTCTCG:1 - chr3L 5423825 5' + 1360 3222 1 60.40 GTGGCAGCATTTTCGGGCCCGAAAAGATTTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGTGGGG:1 - chr2R 21926022 5' - Doc 448 1 70.41 TTGTTTGTCTTCTATCGGTATACCAAAAACACTTTCGCCACACCCCTTCTTACACCAACAAATCGCCCAAAACCGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGTT:1 + chr4 990931 5' + INE-1 256 1 67.33 CATTCNCATTGAGAGGAATGATTGTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr2R 24479873 5' + I-element 24 1 52.48 ATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATGAACGGATACTTTGAGACAATTGTGACTGTATCAAAGTATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 19450033 5' + roo 8719 2 55.45 AAACTAGCGAAAAGCCCAATTCAAAAATCGCACAATAAATTGCAAAGTCCAAAGCAACATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAGAAGA:1 + chrX 11623949 5' + Tc1 482 1 64.13 AAAAATATACCTAAGAAAATTATTGTCGATATCGTAAGCAAAAAGAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAACCATGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGT:1 + chr3L 23697996 5' + Idefix 227 2 53.00 CTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 27981680 5' + roo 50 2 80.20 GCAACAGCAGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3L 12888210 5' - mdg1 400 2 57.43 ATATTTATAAATTTAAACAATTCTGCCAAGGAACTTTATCAATGTATATGTGTACAAAAATAACGGAAAAAGAACGGTATAGATGCACAACAAATCAT:1 + chr3R 2307136 5' - rover 116 2 56.12 CCAAATCCTTTGCATAAGCCAGGACAATCTAATTTTATGGCCAACGAAGGAGGAAGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGAAAGACAAAA:1 - chr2L 12250502 5' + HMS-Beagle 291 1 49.50 ATACCCTTTCCAAGTGGCTGCGTTACTTCTTCAGATGATTATCACCTTAAGAGCACTGTGAAAACCAAATTATATTTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGT:1 + chrX 10019582 5' - invader2 4773 1 73.27 ATTTTAATTGAACTTTGCATTACAAAGGCTGCGAACCCCCAAGGTATTTAGAGAAATTTTAACTGCTTAACTAAGATACAATTTCACATTCAGATATTTAT:1 + chr3L 14779068 5' - gypsy9 210 2 68.32 TTGTTCTTTCGAATTGAAACCATTCCCACAAACACAATAATTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTT:1 + chr2L 4157749 5' - Bica 433 1 60.40 GCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 + chr3L 19951196 5' + Ivk 28 1 54.46 AACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCG:1 + chr3R 32005871 5' - invader4 3060 2 54.46 GATCGCTGCTCCTGCTGATGATGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3L 7550697 5' - 412 477 2 63.37 GCTACTTGTCAAATGTCTCTGAAAACCAGGATCACAAATATATAAGGTAAAAAGTAACATTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGG:1 - chrX 15946774 5' + INE-1 537 1 45.54 TCCCTTGTTTGATGCTAGTTTTCCCTATGAGTTCCATCACATTTTTGTATTTTTTTAAAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 6572982 5' + FB 173 5 71.83 GCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 - chr3R 20137347 5' - Burdock 235 2 57.43 GGGCGTAATCAAAGGGGAGGTTCCAAACTTAGGGAGAACATAAAACTCATCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAAT:1 - chr3L 13257286 5' + G-element 3888 1 70.13 CATCCCCCAAAACCCCATCCATCGGAATTCCCGATCTTTTTTGTACACATATACTGATAAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAA:1 + chr2R 18948958 5' + rover 197 2 66.34 AATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 - chr3R 28645828 5' + F-element 60 1 73.27 GCAACTCTGTGGCCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr2L 16201489 5' + hobo 13 1 66.34 AAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:2 + chr3L 9907361 5' + jockey 35 1 49.50 GATATATAAACCAGGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 18950740 5' - roo 9043 1 56.12 TTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3R 16400228 5' + blood 7035 2 54.55 AATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGAGGAACAA:1 + chrX 15189246 5' + Doc3-element 273 1 58.59 AGAAAGTACACAAACACAGACACTCTCGTCTACCGACGATGCACTTAAGATGGCCAATCTAACGAGAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3R 22782052 5' + copia 4880 2 65.35 TACAGTCCCTCCTTATTGTTTATAGCCCCGCAAATTCTTGGAACGCACTGCATCAATGGTGGAATAAAATTTGTCGAAAAAGCTAAGTTTATTATATAA:1 + chr3R 11707381 5' + Ivk 5269 1 73.74 TTTCGGGTGGAAATCGGTGGAGGTTGTACTTGGGATATATAAACCAGGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 18950707 5' - roo 410 1 76.24 CTGGAGGGAAAAAAGACTGAAAAGAAAAGTAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 27789113 5' + F-element 4679 1 68.89 AATTTTAAACAATAAAACGATTCATAGATTTAAATATATCTTTATAGATAATGCATTTTCAACTAATTACATTACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAA:1 - chrX 21448866 5' + Doc 4552 1 72.28 ACCGCTCGCCCCTTTTTTTGGGGTGGTTCCGACTCGCAAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 285745 5' - P-element 2849 1 41.58 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATCAGCATACGTGTGCACACATATACGCGTTCTTACACGTTATACGCGTTTTTACACACACAAGCAAGCAAATTCT:1 - chr3R 4571525 5' + 1360 3257 1 53.00 AAATACCGATTCCGAGATGTTGACATTTCTGTTCACCCCAGTGACTCGTAAAGTATTTCCATTCATCTGCGTTATTATCGTCAACGGCTGCACCCGCTCA:1 + chr3L 22395363 5' + F-element 463 1 76.00 GGCCATTGAAAAGTGTGTGTGCTCTACTTGTTCCTTTATTATTATTTTCTCCAAGCCATTGTCATCGCTTTTTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 - chr2R 13295759 5' - Tirant 397 2 77.23 AAAATATGTACTCTATGTTATAGTCTAAAAAAATAGTAATCTAAATAAAAAAAAAGAGAACTAAGCTAATTACTATTATTATTATTTGTATTATTATTGTT:1 - chrX 14096836 5' - mdg1 7060 2 51.49 CATTCAAAAAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGGGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 + chr3L 9909683 5' - Transpac 5211 2 59.41 ATTTTGGCCAGTTTAAAGATTATTTGAAATGTAAATATGGGAGATCTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr3L 3032312 5' + opus 7026 2 54.46 TTACGGTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 - chr3L 13659980 5' + pogo 14 1 65.35 TTGCTTTGTAGCTCCCGATAATGTTGCCTACAAAGTATGCAATTAAAAGTCGGTCGGCTTCTCAAGGCTTTCGTGTACACCACAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3L 22039792 5' + jockey 4675 1 73.27 CAATCAGGCGGGTTGGTCGTTGCAAAAAATTCCCAAAAAAAAACTTTTTT:1 - chr3R 20787307 5' + INE-1 320 1 68.00 AATGGNCTAGGGCCGCTCCCGATTCACAAGCAACCGACATACACACACACCACACACCGCCCAATCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGA:1 + chr2R 7626842 5' - Cr1a 4393 1 61.39 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATC:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 5321 1 51.04 TCCGCCGCCCTCCTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTCAA:1 + chr2L 12815020 5' + hopper 12 2 67.33 AACAACCTTACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCC:1 + chr2L 17784612 5' + gypsy10 5660 2 57.00 TAGAGAGATTCCCAATGTCTGAGGACGGTATAAAAATTGGAGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCCATG:1 + chr2R 2110063 5' - mariner2 279 1 59.41 GATGAGTGGCACAAAAGAAAATTACTGTCTCACAAATTAATAAAAACCAAATAAAGATGCAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGA:1 - 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roo 410 1 78.22 TTATCNATCGTAAAATACCCTAACATATCGTTGAACGTATTTTTCTTGAACTATCTAAACAAATTTCATTTAAACTTTAAATCAATATTATTGTTGATCAA:1 + chr4 99761 5' + 1360 253 1 76.24 CTCTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chrX 21017791 5' - 412 7512 2 66.67 TGTAGATGAATTCTATTCATTACTAAATTATTGAAAATGCACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 + chr3R 11094509 5' - 3S18 6069 2 58.42 ACTCATGTTTCGGCGACGCTTATCAGTAGCAGTAATTTGGATCATTCATATGTAAATTATATATATGTATATACAGATTTAACAAGAGAGAATGCTATAGT:1 - chr2L 21775257 5' - INE-1 581 1 54.46 ATTTCCCTACCCATTTTAAATATTTCCATTGTATCGTACCATTATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGC:1 - chrX 17831822 5' + P-element 2818 1 52.48 TTGAGATGGGCCACGGGTCACGAAACGCTATCGTGGCGGCTACTAACTTACTAAAATGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 + chr3L 13455499 5' + jockey 4829 1 64.00 TTTTTATAATGTATTTATTTAATGGATTTTCATCATATTGCTAGTAAATTGTTATTGCTAGTCTTCTAGCACAACACGCCCACATATACGCGTTCTCGTCT:1 + chr3R 3609756 5' + 1360 3225 1 75.25 CCGCTACCAATACTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 14790551 5' + roo 8667 2 76.24 TAGCAGAAGAAATGCAGAGAGCAAGAACGGAGGAAGAAATGCGAAGAGGAGGAGAAAAAGAAAAAATGCGAAGAGGAAGAGACTTAAATATCCCATCAGT:1 + chr2R 13666884 5' + F-element 4395 1 79.00 AAAATTCGTAGTAAGCATGATATGCATTCGATTGGATTCAATTTACTGCATTTTTAGAAGGGTTGCCAGCAGTGAAGTGGACTATAGCATTCTCTCTTGTT:1 - chr2R 12418603 5' + INE-1 580 1 50.50 CGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTT:1 + chr3L 11115123 5' - R1A1-element 138 1 67.33 ACCCGCAAGGTGGACACCCACATCCATGCCGCATCGTGCATGAACCAAAAGCATCTGCTGCGCTTCATTAAAAAGACGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGC:1 - chrX 13832531 5' - invader1 41 2 78.22 AAGCGCGCGTAATTATTTAAATGAAATGGGGCACTCCCCAAGGATCCACTTCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGC:1 - chr3R 13211902 5' - invader2 4995 2 59.41 AAAAAGCTAGCGTACAGACAAATAGTGCACTTACTTTTTTTAGATTAAGTTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCATATAGTGTGCACTTAGATTACATGT:1 + chr2L 5100526 5' - roo 137 2 59.41 GGTCATCCTAGATAGGGTAAGTGCGCATAGTCATGACATCTGCGACCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATATTTATATACTATGTTGCTATTATGAACT:1 - chr2R 2540740 5' - invader2 34 2 55.45 GTGTGTGTGCTCTACTTGTTCCTTTATTATTATTTTCTCCAAGCCATTGTCATCGCTTTTTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr2R 13295747 5' - Tirant 385 2 65.35 ATTGCGTGCCCGAAAAAGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 + chr2L 12325004 5' - jockey 4987 1 71.29 ATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTT:1 + chr2R 5582167 5' + Cr1a 441 1 67.33 GTTTGGCACACGTATTGATTCTGGGCGATTCTCTTTAACGAATCAAAGGAGCTGACACTTTTGGGACTTTTGCGGAAGCAATCAAATAATAAAAAAAAAAT:1 - chr3R 10744862 5' + Rt1b 5144 1 67.33 CATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3R 13225477 5' + hobo 11 1 68.32 ACCTTCTAAACGTTAAGGTTTTAAATTAAACTTTGTTTAGAATTGGTTATGGGCCCAAATTGTGGGCGCGGCAAAAATTTTTTGGCAAATCGATAGAAAT:1 + chr3L 25256302 5' - INE-1 310 1 61.00 ACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 14675564 5' - roo 9020 2 78.22 GAACAACATGTTCAAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 11688514 5' - 1360 3369 1 60.40 GGTTTGCACAGTTTAAGCGATTTTCGTTTTGTATTTTCCATTTGCAGACTCGCTGGTCAGCCCAAACAGCACACTAACGCTGAGTATAGGGTATCTGATAG:1 + chrX 20289139 5' + INE-1 547 1 75.25 ACCTAATCAGAAATTCGCATTTTCGAAGTTAATTTAGTTGTTGCAAGTACAACTTAGTCCTAATGCAGTATTTTGTGAAATAACAATAATTATAACAATAA:1 + chrX 7711108 5' + mdg1 20 2 60.40 TCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 10143164 5' + 297 6601 2 60.92 CTTACAGCAAGCGCAAAACTTCGAATCATATCAGATCACGAACAAAAACTGTCACACCCATTTCTCATTTTATTTCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAA:1 - chr2L 1171899 5' + INE-1 498 1 62.38 TGCGACAATCGATTGAAAAATCCGAAATACAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 11263484 5' + roo 11 2 69.31 ATGTGTGTGTGAGTGGGGAACCTAAGCAAGTTATTTAAAGATGGATCGCACCGTCTTGCGATCGTTGTCGTCCGGAATCCTCCAGAGGTAAAGGGCTTCCT:1 - chr3R 20363419 5' - Gypsy6A_LTR 346 1 73.27 ACATANATCAATTAGCGGCCCTAAGCTGCCGCCACATTCCACATTTTCACATGCCACAATCGAACATTCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACAAGTGCA:1 + chrX 2382364 5' + Doc 491 1 55.45 AAGACCTACAAATAATTGGGGCAGTAACAAAATTGACTATGTATACATGATCTTCCAAAAAGCCTATATCAATAATGAATGATAAGAAGGACACAAAGGGG:1 + chrX 15355040 5' + X-element 4670 1 75.25 GGACGCGACATGTTGCTCGACAGTTACGAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAAT:1 + chr3R 6735246 5' + copia 10 2 71.29 TTGCAATAGTAAAGTACGGAAATATACGCGCAAATAGTAATTGTTAAAACATAATGGCCCATTTGAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2R 4582647 5' + 1360 9 2 71.29 AGATTAAACACTAAATCCGGCCAAGTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACACTAATA:1 + chr2R 14217697 5' - Tc1 1645 1 52.48 CAAGGTACCTTAACTTTAGATACTAAGTATGCAAAAGAAGTGAGATACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTAC:1 + chr3R 12058957 5' + Stalker2 101 2 54.46 CCTGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2R 10444306 5' + P-element 18 1 56.18 CAAAGAAAATGAATGAAATATTTAGAATGATGTCCATTTTAAATTGCTATAAATACTTAACAAAGAGTTACACAAGAATTGTAGTATATACGAACATAATA:1 - chr2R 13650207 5' + mdg1 7039 2 78.22 AGTGGGAAATGTATTTCCTTGAAAAGATTTCCGTAGAATGTTTACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATACA:1 + chr3L 3421543 5' - Gypsy12A_LTR 2058 1 58.42 CCGTTTTTCTGTTAGCCGCATGACCAAAGCCAGCTAATCCGCCCCGGCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCG:1 - chr2R 13580169 5' + Doc 4521 1 53.47 TATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2R 13650119 5' - mdg1 7415 2 68.32 TAGAACCAATACATTGGTTTCTAAAAAAGCTTTGGTACCTACTGTAGTATATACGAACATAATATCAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 - chr2R 7032197 5' + mdg1 38 2 63.37 AAAAGTACATTTTCAGTGGCCAAAACAATTAAATTGTTTTGCCTTTAACTCTCTTCTAAAATAATTTTAGAAACCAAAAGAGAGAATGCTATAGTCAAG:1 - chr2R 17557742 5' - INE-1 577 1 75.76 CTAGTNGATGATAGCATTGTCAAAAAAACCGGATTATGAAAGGAAAAATTGGGAAATAAAGAAAAAAGAGGAAAAAGAAAAA:1 - chr3R 12175649 5' + Doc2-element 234 1 81.71 TTTTTGACCATTAAACAATTTTAAAATTACTAATAAAATACCAAGTCAAAGGCCAATAAACGTACACCTAGAACGAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAAC:1 - chr3L 7777899 5' + I-element 374 1 67.33 TAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chrX 992028 5' + hobo 40 1 66.34 AGCCGGGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 + chr3R 14688499 5' + FB 39 1 63.37 TGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 7861723 5' + roo 8706 2 73.27 TTTTTCTTTGTAATAAATGCGCTGCCGCTTTAAGAATGAAACTGAATCATTGATTGATTGCAAAATTATAGAATGCAGCATTTGTTAAATTATTCAAACAC:1 + chr3R 23947547 5' - invader2 401 1 71.29 CGGTAGGAAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr2R 5067610 5' + F-element 15 1 63.37 ATATAAAGTTAGAAAAGGTCATAAGTATATTATAAAGATTTCTTTAAATTTTATATAAACATGACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATT:1 + chr3L 8362972 5' - 3S18 326 2 63.37 GTCTGTGCCTCATGTTGTGTTTGTCATTTGGCGCTGTGTTGTCTGTTCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGTGCACGGTGTTTTTC:1 + chr2L 18919026 5' - baggins 5109 1 55.79 TTCTTGGTGACACATGCCCCGGCACTACCGACTCTATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr3R 11343228 5' + hobo 41 1 65.35 TTTAAATGTTTATGGCGTATTGATTTTAATTACACACACAGTAGGCTCTGGACCTATGTTGTTGACAAATACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 23840554 5' - 1360 3374 1 72.28 AATGAGAATTTTGGGTTGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 19377707 5' + roo 8675 2 67.00 CCCACAGATTTTACAACCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr2L 6888570 5' + jockey 9 1 76.24 CCCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 20477046 5' + 412 38 2 61.39 AGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGTTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3L 7075926 5' + roo 42 2 76.92 ATGAACAAAGTCCCTATTCCAAGTACACATTATTTTGTATTATATATATTTTTTTTGTGTTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 6719699 5' + Stalker2 498 1 68.06 TGAATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAGATCTTATG:1 + chr2L 19481291 5' + roo 8707 2 69.31 AGGCAAGGCAAAAGGTAAATTTCAAGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATG:1 + chr2L 12325023 5' - jockey 4968 1 50.50 TTTGGCACACGTATTGATTCTGGGCGATTCTCTTTAACGAATCAAAGCAGCTGACACTTTTGGGACTTTTGCGGAAGCAATCAAATAATAAAAAAAAAAT:1 - chr3R 10744861 5' + Rt1b 5144 1 70.00 ATAGTGAATAGAATTCCTGACGTTCTATCAAAGTACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTG:1 - chrX 1184002 5' + Ivk 5344 1 66.34 GCAAGAACACACAGCACATAAGCATGGTTAATTGTACAATGAAGATGTTCTGCCAAATTATACAAGCAGATAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAATAA:1 + chr2R 21709974 5' - Tc3 312 1 79.21 AAATGTTTACCACCATTTTTTATAATTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 18614825 5' + Tc3 86 3 67.44 TACAAATTGGGCAACTCAAATCGAAACAACTCGCCAATTAAGGCGTTCAATCATGCTGCCCTTTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAC:1 - chr2R 16213525 5' - 1360 409 1 66.34 TTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCT:1 + chrX 15408742 5' + INE-1 527 1 84.16 TATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2L 16884902 5' - pogo 2082 1 58.00 AATCTCTCATCAAACTCAGTACATTGCTTCGTGTTAGGACCCCAGAGATACTAAATCTATTAAATGGATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 - chr2R 9854142 5' - pogo 2096 1 73.27 TGTTAGTACCGCAATATTGTCTCCCCCAGGGAAACCCCAAACCCACCATAACCAGAAACAAATATAAACAAAGTGAGGAAATGTTAAATTGCTGCAATTTT:1 + chrX 22436210 5' - Transib5 2611 1 77.23 CCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 19446146 5' + 297 19 2 56.84 CAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - chr2R 5840693 5' + Ivk 29 1 50.50 CTAACGGACAATACACCCCACGACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 - chr3L 25842201 5' + 1360 78 1 52.48 TAGATGTGCCAAATAACTTTTTGCCACTCCCAATCTTAAGCCCACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATA:1 - chr2R 5119455 5' + Quasimodo 85 2 58.42 TTTTTCGGCCGACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 12539569 5' + roo 23 2 56.57 TTACCAATCATTATAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGA:1 - chr3R 27981762 5' - roo 408 1 78.22 GGTAGGCGGGTCTCTTTCCGGAAACACTTTTTCCCTTATGTTTATTGGCAACTGAGTAATTTCCTTTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGTCGTTT:1 + chr2L 17440220 5' - hobo 470 1 75.76 ATATTTGGAATAATTTTCTCCATGAAAACATGGCAATCAAATTACGAGTGAAGCACACACTTAAAACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTC:1 - chr2L 7553295 5' - Tabor 7216 2 77.23 GCCTCTGAAAACGGTATCTGCGCCAATAAAGGGAATACTCGTTCTATGACAAAAATCCATTTCAATCACCATTACTTATTTTATTTTTAGTTATTTTTATT:1 + chr3R 26435376 5' - gypsy10 407 1 72.28 GGACAGCGAGCAAACGCACAAATTACACACTCGCACACACACACACACACACACACACCAACACGCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chrX 19989595 5' + hopper 8 2 67.33 AACGCTTATTTAAGTCTTAACTTTTGTGTTTAGCTCTCTGTCGCTGTCTCGCCCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGT:1 - chr2L 2789112 5' - accord 181 2 64.36 ACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 7488863 5' + roo 8702 2 66.34 AAGAAATATCTAACTTCGTTATAGATTCATATCACTATACCTATTGATTCCTGCATTGCAATAACAAATCAAAACACGTTTCTCGATATTGCGCATCCACT:1 + chrX 17570574 5' + Tom1 94 1 38.61 TTTAGATGCACAACAATTTGTTAGTTTAGCACGTCGGGCAAGTATAGAAAGTATAACAGACGGATGGACAGTGACAGATCGACTTGGCTATTGATCCTCAT:1 - 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chr3L 17587873 5' - roo 402 1 72.28 TGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCA:1 - chr3R 29331909 5' + G6 40 1 62.38 CCACACACACTTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 17928934 5' - hobo 2925 1 64.36 GTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTC:1 + chr2L 22092968 5' + INE-1 549 1 51.49 TGATAAAGCAAAACAATTGATAAGGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAA:1 - chr3R 27108382 5' + jockey 4812 1 81.19 CGTTTGGTTTGTTTTTCTCTCTGTCGTCGTGGTCTTTTTTATTTTCTCTTTGTGTTTGATATTTGTTTATCAAGGTTTTGCTGATAATGGTTTTGGGCTTA:1 + chr2L 7667302 5' - I-element 63 1 66.34 GGTTTGTTGAGCAGCTGCTGGTTGCAAAGGACATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr2L 13319552 5' - hobo 2938 1 76.34 AAAAAAAATTGGAAAAGTGTGAGCTTGATAATTTAGTGTTTGTGGGCGTCAGAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGC:1 - chrX 5858214 5' + F-element 131 1 54.46 TAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 + chr3R 7168570 5' + flea 35 2 65.35 GTAGANGAAACAATCTAGACAAAATTTAGACATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGA:1 - chr2R 3592042 5' - Quasimodo 7322 2 71.29 TACATTTAGGCTCCGACAAGCCGTTACGGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTT:1 - chr2L 13318631 5' - jockey 4935 1 75.25 TTTTTAAAAGCTTGTAATAATTTACTCACTGTCTTCTGTTTTTTTATTTTTATTTGTTATGTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr2R 2943108 5' - I-element 5334 1 69.31 AATACCAACCCACATAAACTCGTGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chrX 13508657 5' + roo 8665 2 78.22 TCATAATAAAATTTATAGGTAAATTGATCAGCTTGTTATATTGAATTTATGAACACAATACTGTCAAAATATATTACATTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGT:2 - chr2R 7999732 5' + Juan 1 1 78.22 TGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATAT:1 - chr2R 4802888 5' - mariner2 278 1 40.59 TTATTNTGCCCTGTTAAACCATTTTGAATTTATAATCACATAGATACGAGAAAAAAGGCAATTTCCATAGGGGTGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGAC:1 + chr2L 9172100 5' + transib2 2709 1 76.24 CTCCACTCCAAGGATCGCTCTTCACACGTACTGCTTGAGGTATCTGTACAAGCAAGACCACTACACCCAACGCCATCAGCTAGAGCCGGTCTCTAAAGCGT:1 - chr3L 24247973 5' + Gypsy12A_LTR 2202 1 64.36 CTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr4 1149917 5' + 297 6618 2 74.26 GACAATAAAGGATATGCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2L 15808057 5' + I-element 14 1 62.38 GCTCATTTAGCCATTTCGTTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 - chrX 19116932 5' + opus 141 4 60.40 GCAAAGCAGCGGTGGTCTCACTCTCATGTTCAATATCCTTTGCCTCTTCTGTAGAACTTGTTGTGCCTTCTGTGGTAGTGCTGGATTTGTTATTGTCACCA:1 - chrX 10036463 5' - Quasimodo 146 2 81.19 TATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCT:1 - chr3R 32005947 5' + invader4 33 2 63.37 CATTATAGAGATTATATACATTCATACATTATAGACTCGTTTTCGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chrX 11033899 5' - mdg1 397 2 56.44 TAAACTTTTGACTAGGTGGTCGTATCTTTTGATTGTCTCAATAGGCATAAGCCAAAGCTTCTACTTTTGGCCAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGA:1 + chr2L 10802776 5' + I-element 324 1 75.25 AATGTATTTTTTTATTGGTTGCCAAATTTATGGTTTATTGAAACTGTTGGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCT:1 - chr2L 8567654 5' - blood 485 1 51.49 TAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACCCATGGCGCTA:1 - chr3L 9909756 5' + Transpac 43 2 61.39 GAATCGGTCTCGCCGTAATAATTATGCAAAACTCTTCTATGTAATGATCATATCCTACAATATCCAGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACG:1 - chr3R 2522193 5' - 1360 314 1 75.25 AAAAAATAAATTAAAATAATAAGACGCGTTACTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 - chr3L 6463174 5' + HMS-Beagle 41 2 71.29 TTTTAATATCCATCAAATCGGATCGCTGCCTCGCTAGCAGCCTCTATACGCTGGCTGCCTTTCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCG:1 - chr3L 8711647 5' - opus 256 2 71.88 CTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTT:1 + chr3L 25272533 5' + 1360 23 1 61.39 TGATAGAAAACGTAAACACAAGTACCACCATCAAACATAAGTTTTTGGAATGCCCTCACCACATATAAATTACACACATACTCCGTTAACCATTGTAGGCA:1 - chrX 8088604 5' + Doc4-element 223 1 67.33 GGCTCAGAGCATATAAATTTGCATTTGCGTTGGCTCAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGT:1 + chr2L 15807987 5' - I-element 5317 1 64.36 CCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCT:1 + chr2L 18279883 5' + gypsy5 6958 2 60.40 TTTCTAATTAGATTTTTTGTTGTAAATTAGATGCAAAATGGCATTTAAAAATGTTTCATATATATCTTTTTTTTATTTAAATTTATTAAACGAAATTATTT:1 - chrX 15746545 5' - jockey2 3391 1 83.17 TCCGTAATAACAGGGAATTACAATAATGAGGGGATGAGTAATTGGGATGTGGAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3R 18571190 5' - hobo 2913 1 53.47 CATTCGTTACCTCGTTATTATGGTTTGTTGTGTCTGGCAATCCTGCAATTAACATATTCATGCGGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTAT:1 + chr4 516945 5' + HB 1314 1 63.37 AGAAACTAAGTAACAAGGTGCCCGTTGAAAAGTCCAAGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 - chr3R 6608858 5' + I-element 1 1 77.89 TATCTGGTAGGTGGCATCTGTGGGGGAGCTTGTTGTCGTTGTGGTGCCAGCAGCATATCCCAATAGCAGATCGCTTTTGTTGTTGTTATTGTTGTTATTAT:1 + chr3R 19466611 5' - mdg1 17 2 80.20 TTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTG:1 - chr3R 29288761 5' + BS 5032 1 57.43 TGGCCAATTTCCCTAAAAAGTGAATCAGAGCGGGTTGGAACGCGCCTAATAATTTAATTATGACTTTTTTGCCATGATCTTGAAAAAAAAGTGAAAAAAGT:1 + chr2L 7632407 5' - transib4 2477 1 74.26 TACTATATTTGATATAAAGATTCTTACATTTCCAAAAAATATATAAATTTCCCGTTTACACTTCCAGGAGAGTAACGGGTATCTGAGAGTCGGGGAACTC:1 + chr3L 23974477 5' + INE-1 558 1 71.00 TTTATAAAATAACTAAGTTATAACTAACCTCCGATTAAACAATGTTCCCCGTGGTAAATAAGATCTGATTTGATATTATTGCCATTAGAGAATATGATGAA:1 - chr3L 26011809 5' + invader4 2958 2 75.25 CGGTGATTAGAGAGGAAGTAAACTCTCCAACCTAATCTTCATAAGAAGACTGTCCCTTACATTGGTCCAACACTGACATACGCCATCCAAGTGTGGGGAAC:1 - chr2R 5043932 5' + G5A 2435 1 60.40 ACTTTCCATCAGTGCAGAAGTCCTGTAAATGTCCGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAA:1 - chr2R 23578327 5' + P-element 438 1 37.62 GTCAGCGAAAACGACGACGCCGTCGCCCCCTTCAATCAAGAATTGAGCGTGCTTGCGACAAAAGAATATAGGAGCTAGTATACAAAATCGTAGGAAGCGA:1 - chr3R 11112372 5' - Gypsy12A_LTR 2067 1 64.00 ATGAANGAGCCGCGTTTGTTCGACCGTTTCTTTTATTATGGCCATGCCCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 18837027 5' - P-element 2861 1 55.45 GAAAAGACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:2 - chr2R 11528070 5' + P-element 36 1 45.54 GACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGA:1 - chr3L 23678151 5' + Osvaldo 22 1 74.26 ACACANGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 - chr3R 11094559 5' + 3S18 5811 2 67.33 GCTCGTCGACTGAGCGCCATCGCCATTTGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr3L 13477532 5' - P-element 2879 2 69.39 AAAGCGTGAGGCAGTGGGAACTTACAGTTATGTAGGCTATACAGAGTGCCCCCGCCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTG:1 + chr2R 12725666 5' - F-element 483 1 55.45 ATATTCATATTTACTCAAGTTTATGGAGCCTTGTATTTGTCTTTCGGAATCTTCAGAGCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCATA:1 + chrX 10574130 5' - Copia1_DM 420 1 61.39 GATGGCGATGCAGCCCTGGCTGCACTGGCACTGGCAAGCCAGGGCTGCTGTGGCGGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chrX 19268862 5' + P-element 6 2 69.66 CGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:2 + chr3R 7388355 5' + HMS-Beagle 6842 2 72.28 CTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTATCCAACAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr3R 11846281 5' + hobo 34 1 57.45 TTACTAATAATGACAAATTTTCAGCAATGATATGCAAAAAGTTTTGAATACATGTTTCCGCTCTTTAATATAAATAAATAATAAATAATAAAATAATAATT:1 + chr3L 19112279 5' - INE-1 413 1 64.36 TATTGCATAAGCCGATTAACTGCACTATCAAGTTGAATGCATTAATTGCAGCGAAGGTGGCTGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr3L 4641155 5' + hobo 9 1 69.15 CAACANTAATTACCCCTTTCAGGCGTTTGTGCTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACG:1 + chr3R 16679162 5' - flea 4638 1 68.60 TATGCNGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 17896940 5' + hobo 29 1 62.38 ACATGGCACTGGCAGCTTCTTTATATACCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr2L 1625662 5' - hobo 2891 1 73.27 CGCAATGATCTAAACCTGATGTCGTTCTCTAGGCTAGCATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCACTTGC:1 - chrX 13659661 5' - G4 146 1 71.00 CTTTGCAGGGAGATAATATACTAACTGTTGGTCGCAGTGAGAACAGCGAAAGCGAGGAATGCGATAGCGGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGC:1 - chr4 1193762 5' - F-element 4486 1 76.24 TGTGCGGTATGTGTGTGCGGCATAAAAGCCCCATGTACGTATCCTGGGCTAAATGTGTGTGCGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATG:1 + chr3R 28127602 5' - Quasimodo 6 2 63.37 TCATACTTATATTTCTTGATAAAAAGTTTACGAGCAAACGAGATTTTAAAAGAAAATTTCTGGAATTAATAGTTTACGAGATCTCGACGTTTATATGGACA:1 + chrX 14756598 5' - INE-1 132 1 80.20 ACATAGAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 - chr3R 17321777 5' + Stalker2 36 2 59.41 AACTCTGTAGACTCGCCTACTTTCTAGCTCCGCGTCGCCTCCGCCTTTCCTTTCAGCAAAGCCCGCTCGGGGCAAACGATGTTATTGCGATTTAAAAAAAA:1 - chr3L 22752365 5' - FB 189 1 74.26 TCTTTCGTCTTAAAATGTCACCACTTCTCTATCTGACGCTTTTATTGTACATTACCCATGGACGTCAACAAACACGTAGTCTTAAGCGCGTCATGTGCGGG:1 + chr3R 4721676 5' + Stalker3T 236 1 71.29 TTTTTCGGCCGACTCACACTTCCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 12539569 5' + roo 8689 2 53.47 ATAACGCATAAATGAAAAGTGAAAATCGTGAGGAGGCCCTGCCTTCTGCTCGCCGTAGAAAGTTGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAAC:1 + chr2L 13078804 5' + invader2 348 1 69.31 TATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 23456267 5' - 1360 3370 1 56.44 AATGTCTAGAGCAACATTTTGGCTCTTAAGAATGAAAAGTCTCACGACTTGATCCGCATCCTCCCCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chrX 19363544 5' + FB 9 1 69.70 AAGGACACCCCCACTTAGCTGTGAAACTAACAAATTAAAGCAAATCTATAAAGGCAACTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGT:1 + chrX 6631491 5' - Doc3-element 4505 1 64.36 AGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 + chr3R 7388342 5' + HMS-Beagle 6824 2 56.70 AAATCNGTAAGTATTTGTGCATCTATACTTATTAATAACCTATGTCAAGCCGCTTAATCAAAGCTTTTCTATCCCAGGGTTCAAGTCTTGGCTAGAACCCT:1 - chr3L 23934399 5' + X-element 277 1 61.39 CTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 12324109 5' + roo 24 2 57.43 TATGGGTAAGTTTTTAATTAATAAATTTTAATTAATAGTTTTAAAAAAATGTAAAAATTTTGTGCAAAAAAAAAAATCGTATGGCGTTACGCCTCTTGTT:1 + chr3L 23126396 5' - 1360 16 1 58.00 CCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACTGTAATATAATTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr3R 15072585 5' - pogo 2094 1 46.53 TTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 14638636 5' + 1360 53 1 79.00 CATTTGCACATCTCACCTATTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2R 15474787 5' + roo 8690 2 53.47 GTCGAGATGATTGGCTCCTGTGTTAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTT:1 - chr3R 16570239 5' - Quasimodo 23 2 76.24 AGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 27981682 5' + roo 52 2 82.18 ATAGCACAAATATACCAAAAGCCACACTCGTACACACACACACACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATC:1 + chr3R 11081577 5' + accord 7152 2 68.32 TTTAACCAATCTTGTGAATTGAATGTGGTTATGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr3R 29259669 5' + pogo 6 1 73.27 TTGTGGTTATGTCTGTTGGGTTAGTTTCGATACATTTTCCTAAACCTAATCCTTAAACTAAAAATTACGTTATTTACGTTAAGGACATCTCTTATTGAGTA:1 - chr2R 964729 5' - 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chr2R 23571690 5' + roo 42 2 71.29 AGTCACCAAACCAGCTTTTCCGATTCATTCACCTGCTTATAGGATCTTCTCGTTTCAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGT:1 - chrX 17968448 5' - Tirant 384 2 63.64 AACAAACTTTGCGGAATGTCGAAGGGAGGGGGTCGGAAACTGGAACCAATCGATAAGCCAGCCACTACTACGCCGTCACATAGCCACGTAGTACATAAGAA:1 - chr2L 20143129 5' + Tom1 152 1 63.37 TTCATNTTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chr2R 4547766 5' - HMS-Beagle 7005 2 65.35 AATCTATTGGATCTGCCGCCCAAGGAGGCAGCTATGCGCGTGCCACCGGAGCCGAATCGCTCATGGGTACTGATTAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTTAGCG:1 + chrX 13955952 5' - Quasimodo 6959 2 58.42 ATATCCACCAACAAGTCCATATTCGATGCGAGCTACTCAAAGCTGAATCGGCTGATACTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCC:1 - chr2L 10768731 5' + Doc 419 1 69.70 GCTGGGTGTTTGCCACACAAAACTATTTAAAAAATAAAAGTGAAACATTTGTTGATTGTTTGAAATTAAATACATAATGA:1 + chr4 1075900 5' + HB 1528 1 76.25 TCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3L 9909763 5' + Transpac 4955 2 56.44 TCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGACAGTCCACAAAA:1 + chr3L 17878749 5' - hopper2 372 1 73.27 TTATGCGTGAACCAAACGGATACTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:2 + chr3L 15100691 5' - pogo 2049 1 78.22 TAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:1 - chr3L 9909756 5' + Transpac 43 2 63.37 TTCTAAGTTGGGTGATGACAAAGTAAGCTAAGAAAGTTAAGAATGATAAAATAAAAAAATAAAACAGGTTAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAG:1 + chr3R 15493534 5' + F-element 126 1 72.28 CAAATGCATTAAAAGAAAGTTAGCTCTGAGCATTTGCATTTGTATTGCTATCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTT:1 - chr3R 31257058 5' + transib2 24 1 66.34 GCAGGATACAGAAGAAAGGACGAGCAATACAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATA:1 + chr2L 23299828 5' + micropia 409 2 66.34 AAACAGTCAAGTTAACAACGATTTTGTCCAGTTACGTTTGTTTCGGTGCTTTAAAAATGCACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1 + chr3L 12071330 5' + Quasimodo 74 2 62.38 GCAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 19551974 5' - roo 9050 2 57.43 CATTCAACTAAAAACAACGCCGAGAACAACAGCTGGTGAAGGCTTTTCGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 6622713 5' - P-element 2865 1 58.59 ATTCCCGATGTCGCTCTAGTTCGTCTTTTTGGCTCTTGGTCAGCCTCATTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAG:1 - chr3R 19448156 5' - roo 321 2 51.49 GTCACTTCTTGTAGCACTGATTAGCCACAAAGTTGAAGTTAAGTCACACACACACATACTTTACTACATAGCAACAGCCATACACCAAATCATAGAAT:1 + chr2L 23431883 5' + Quasimodo 74 2 55.10 TAGCAACAGCAGCAACAACAATAATAAATAATGTTAGCGTAAGTGCTTGTCTACAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCTCTCG:1 + chr3R 22219539 5' - 1360 2994 1 65.98 TATTACTTCGCCGCATTGGCGTTATCAAGCCATTTTAATATTTCAAATAATTAGGTGGACATATAATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATT:1 + chr3R 15126475 5' + FB 13 1 62.38 GCATATCAAATATATTTCTTTTCTTTTAGACTTTAAAGCGAAGTGTGTTCCAATTTATTTTTTCGTTTCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTCACTCTCCC:1 - chr2R 4350439 5' + Cr1a 205 1 65.35 TATGTATTGTGAAAATATAATTATGTAAAAAGCATTGTAATATATTTTGTAATATTTTGTAATCCATAAATTGTTACAAATCATAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2R 10927217 5' + BS 5099 4 56.00 CTGGTGATTCTCCGGACCCGTGTTAGTGATACCACGAAGTGGTACCAATCGAAGTGATAACTTACATAGGGATTTATTCATAATTCCGGTCAGAGATGAAA:1 + chr3R 7252979 5' + Fw2 3689 1 57.43 TGTGTTGCAAATAACGATGGCATCTTGTCACGTTGGGCCGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTT:1 + chr2L 1265628 5' - Doc 492 1 69.31 CAAATCATTTGGAAAAAGAACATCAAGCTGTACCTGTGGGGTCAAATGTATCCGAAACTATAGCTTCAAACCACTACATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGA:1 - chr4 48871 5' + 1360 2975 1 76.24 AAAAGACAAGAGCAAAATGATACTTTCAAAACTAAACATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTGAACATTTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCC:1 + chr3R 9995332 5' - Max-element 8531 2 76.24 AAACTATTATATACTGTTCTTGCCTAAAATATATTTATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr3L 8714863 5' + opus 37 4 69.31 CTTTGGACACCCTGTGCCTGTGCGCAAAAATTAAGGCGTGTTCCACACACACACACACACACACACACACACTTATGCA:1 + chr2L 20084339 5' + accord 7032 2 88.61 GTTTATTTGTAAGAGATATCAACAATGATTCAAAGATTATTTTTTTATATACCATTTATCAGATATTTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGA:1 + chrX 16714460 5' - flea 156 1 73.00 GTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTAC:1 - chr3R 9995422 5' + Max-element 38 2 63.37 CCCGGTGAAATAGTAAAATGCTAGGGCGTTATCCACATTTAACGACCTGAGGACAGGCCAAATTCAAAGGTTGGGGACTTATCCAAAAGTCCCTAAGA:1 + chr3R 22844480 5' + Idefix 4 2 70.41 CAAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2L 21010866 5' + opus 151 4 72.28 CTGCTACTTATGATGGTGTGTGTGGGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAG:1 - chr2L 11168068 5' - accord 6999 2 71.19 GCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chrX 20806915 5' + opus 7044 4 80.23 CTCTCCTTGGATGTTGTGCAACAATCACATGCTACCGAAGCCCCAATGGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATA:1 + chr2R 18696589 5' + Ivk 393 1 52.48 ACATATAGTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGA:1 - chr2L 21635359 5' + F-element 471 1 69.31 TTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATT:1 + chr2R 1654438 5' - Juan 4163 1 77.23 ATAATCGATCTGTAGGCTTTTGAAGCGCAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 + chr3R 8458196 5' + HMS-Beagle 8 2 71.29 ACGCCCTCGCTTCTGACATATGCCAGTCAAGTCAAGTAAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr2R 16583289 5' - P-element 2854 1 48.51 GAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTT:1 + chr3R 20147885 5' + 1360 279 1 55.45 ATAAGTACATTAATAATAAATGTAAATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCA:1 - chr2R 14708647 5' + Doc 344 1 75.25 CAGACGCAGAGACCCAAATTAAGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3L 4876825 5' + roo 7 2 72.28 GAAGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACC:1 - chrX 23108343 5' + BS3 1405 1 68.32 ATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCCGA:1 + chr3R 20908117 5' - INE-1 569 1 45.54 AGGGCCGGGGAAACCCCTAATGGCCACTCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATC:1 + chr2L 15092719 5' - F-element 4223 1 72.28 GACAANCGATTGAAAAATCCGAAATACAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 11263481 5' + roo 14 2 65.35 ATGCAACATAATCCTAGTTTATGACAGTTGGGGGTCCTAGCCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr2L 13319663 5' + hobo 3 1 71.74 CGCACTCCGCAGTCTGCAGCACAAAAAGTGAAAGCTCATAAGGGATGAGTAACAAAAACACTTATTGGTTTACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCGAAAAG:1 + chrX 13948680 5' + hobo 243 1 60.40 ATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:1 - chr3R 17321770 5' + Stalker2 43 2 66.34 AAGAGCGTTCGCTTTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCCAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr3R 13538909 5' + hobo 13 1 66.34 CAACAGCCCTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr2R 4606196 5' - 1360 3377 1 67.33 TAACTGTCTATTTATGCTCGCCTTGCATATGAAGTACATTTTATTTGTTTTTATTTAGTTTTGGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCT:1 + chr2L 14975414 5' - Tc1 204 2 58.42 TGAGAACGAGAATTTCAGCAGCCACCCGTGTTGGCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 + chr2L 18430087 5' + copia 42 2 68.32 AAGAATTGGTATCATTTTTAACTTCTAACATGACTAATGAATACCATCGTCTATATTACTTCTAGGTATATTACACTATCAAATTTATTCAGGCCGCCAAG:1 - chrX 18567231 5' - gypsy10 5895 2 79.21 AACAACAACAACAACAACAATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATAC:1 + chr3R 21823855 5' + I-element 131 1 78.49 AACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 21092460 5' - roo 9027 1 70.30 ATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chrX 13508757 5' - roo 9040 1 58.42 CATCTTTTCGCTATTCGAAATACAAGAACTCAACAGAAGTTTGCAACGCCAAAATTTTGATACTGAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAGATC:1 - chr2R 7949440 5' - INE-1 150 1 57.43 ATATGNCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAG:1 + chr2R 13644413 5' - Burdock 6375 2 62.38 ACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 + chrX 20806868 5' - opus 7470 2 66.34 CTATACTATATCCCGTGCATGGCAACGCAGCTGAGCTTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTT:1 - chr2L 12481642 5' + FB 39 1 64.36 TTGACNTTTTGTGTGGCCCATAGAACCACTTATATGTATGTATGTATGTATGTACATATGTATGTATGTATGTATGTATGTACATATGTATGTATGTATGT:1 - chr3L 7844461 5' - 1731 78 2 58.42 AAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 11263383 5' - roo 9051 2 58.42 CGCAAGATCTCAAAGTTCCAAGCGGACCAGCGAGCATCGGACAACCTGGGTTTCTACCGTCAGTTGCGAGCCGGAGACAAGCAAGGTGCGATAAGGAACCC:1 + chrX 19475401 5' - G3 447 1 64.36 ACTTTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 4801501 5' + roo 26 2 53.47 AGGGAGGAAAAGTCGAGGAAAAGTGGGCAAAATAAAGATAAAAGCAAAACAAAAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAA:1 + chr2L 18248147 5' - Doc 357 1 47.52 AGCAGCCACAGCCACCACAACTGGAACAGTATATTACCGAAACGAGCACATTACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTC:1 + chr2L 5159404 5' + Doc 319 1 55.45 AATTTCATTATTTGTCTTGACAAATTTTGTTCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCAT:1 + chr3L 17878719 5' - hopper2 402 1 52.48 TTTAAATATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTT:1 + chr2R 13644408 5' - Burdock 6380 2 67.33 GCATTTTCTTACTCATTTCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCC:1 - chr3L 5655693 5' + opus 382 2 82.18 AGCGAGATAGCAAAAGGGGGCCGCGGGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3R 9551487 5' + P-element 28 1 49.48 AATTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGG:1 - chrX 21564764 5' + diver 5895 2 73.27 AAACATCCTCCCCCGTTGGAGAACACGGGCGATTATTGTTAAAACAATACACACTTTTATTTCAAAATCAATCAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCA:1 - chr3L 23753146 5' + transib2 2667 1 72.28 GCGGTTCTCGTTTTGTTCTTAATTAGCGGAATTTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr3R 14098555 5' + jockey 4798 1 67.33 GGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 16458065 5' + roo 34 2 63.37 TATGGGCTTTATCTTTTGCTTCTTTCTTGGCTTCTCCACATCAATTTCATGATTTTCATTTTTGGAAATGTTTCGAGCGCTGGACTATAAAATTTAACTTG:1 + chr3R 28442586 5' - 297 471 1 62.38 GACATCAGATATCACACACACACGGCCAACAACTTAAGGCATTCGGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGG:1 - chr3L 9262946 5' + Quasimodo 7079 2 55.45 TGATTTAGAGCGCGGCAAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2L 21010851 5' + opus 7026 2 57.43 TATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 24760558 5' - pogo 2058 1 73.27 TTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCT:1 - chr3R 7168634 5' - flea 4980 2 67.33 GTTCGGGAAACCTAGCCTTTACGTGTTACGTGTATTACTAAGGTAGAGGGACGGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 - chr2L 21335864 5' - BS 5042 1 56.44 GGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 10952282 5' - roo 9027 1 68.32 TGTATNTCGCAGAACAACAGAACAGAAAGATATAAACCCGTGTTATTCTGCAAGTCGTGTATATTGGATTGACAGGACAAAAGATCATAACTTTACGCTTG:1 - chr2R 15816953 5' - Q-element 670 2 66.34 TAATGTCTGACTGAATTCGTTTGCTGTCTGGGAGCTAGCTATACGCTGAACACCCTACATACTACCAACTATCCGGATGACAGCCAA:1 - chr3R 2821102 5' + G5A 183 1 63.22 TGCTCTGTGGCATCATGGAACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 8345477 5' - roo 401 1 72.28 CACCATAATCTATCATTAATTTTGCCATAAATTGTTTCCATCAATGCTAAACAGCCGACTCCAGTTGCATCATCTTAGTCTTATTATTTATTTTAAATTTA:1 - chr2L 4626047 5' + INE-1 422 1 56.44 CAGAATCTCCGTATCGGTCACACCTGGAGTGATGCTCTAGAAAAAACAAAAGAGAATGCTATAGTCGTCTTCCGGGACTATCAAATACCCGTTACGC:1 + chrX 22959078 5' - INE-1 549 1 57.73 CTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr2R 4606283 5' + 1360 29 1 55.10 GTGCANATTAGTGGATGTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGC:1 - chr2L 3388156 5' + F-element 294 1 64.36 CACCCACAGATTCGGCAAAAAAGCAGAAACCACACATACAGATGTCACTTTGTGCGTTGAAAAGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACA:2 + chr2L 20487768 5' - 1360 102 1 70.30 ATTCCTCATTTCACAGTCACTGCCAGCGATGCATGGTGAAAAATCAGTGGTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGCCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr2L 2060199 5' - 412 466 2 51.00 AGCTTNCCCGGCTTGACTTTTGTTGTTGTTGTTAACCAAAGCTAAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCT:1 + chr2L 19463872 5' + gypsy2 6697 2 79.21 TTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 + chr3L 14396981 5' + BS 5025 1 50.50 ATCGATAAATGGTCGCCAGCTGTTCGGCGAATGTTACGTGATTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTT:1 + chr3L 264776 5' + micropia 114 1 58.42 GCTCTTAAGTACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 19989343 5' + hobo 12 1 68.32 AGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr2L 3951644 5' + Transpac 44 2 69.31 AGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 22831284 5' + 297 6622 2 74.26 TATATGTATATATGCATATATGTATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAA:1 - chrX 9463053 5' + 17.6 44 1 90.00 GAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr3R 26842864 5' - opus 7463 2 73.27 GAACAGCCAAAAAAGCCAAAGAATGATAAATGCTTAAAACAAAGACAACAACAATTACAACATGTGTTCCATGTCCATAATTCTAAATCAGTAAGTTATAT:1 + chr3R 23264948 5' - transib3 305 1 63.37 GTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTATAATATCATTAG:1 + chr3R 31887772 5' - HB 1543 1 57.43 TGGAATATTTGCGCAGCACTCCTCGTTGCTATATCCGTTACTCGTAGAGTAAGAGGTAGAAGGACCGGCATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATC:1 - chrX 22522061 5' + INE-1 96 1 59.41 ACCAAGACTTAGATATGATTATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTT:1 - chr2R 5506357 5' - F-element 58 1 80.20 AAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 - chr3L 10013653 5' - hopper 1392 1 56.44 CCCATTAAAGACCTTTAAACAATAAACACAAATAAATATATATATGTATTTTTAATAAATTAAACAAATACTTAAACAATTTCGAAATTTAAATTAAAATT:1 - chr3L 8925548 5' + 1360 3043 1 55.45 AATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:3 + chr3L 12103788 5' - roo 9039 1 60.40 CAGTCGGCGAGGATCATTTGGATAAGTGGGTAGTATTCTTCGCCCGCCACCACGTGGGACGACTGTTTGAGCTTAGCCACCCACTCTGTTGGCC:1 + chr3R 13297439 5' - Rt1b 4805 1 70.21 AAAGCTCGCCAACAGTTTAGTGTTGTAAAGCACACTCAGTCTTGTACCTAGTAGGTTGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 + chr3L 4122414 5' + P-element 19 1 66.34 AAACTTAAATTATTTAAAACGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATT:1 - chr2L 5609090 5' + blood 225 2 80.20 CAGTGTAAGGCCGAAAAGACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chr2R 11528082 5' + P-element 24 1 57.43 ATAAAGAAACGGAAATGCGATTGCTAGCAATTTATTATGGCCTGCACTTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 - chr3R 29470858 5' + hopper 24 1 53.47 TTTATTAAGTGCTGGACAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 27981653 5' + roo 8687 2 56.44 GAAGGGCATTGAGTCTGATGTTACGCCCGAAGAGATAACGCAGGCATTAAATGATAAGGCTTTTAAGGCAAAAATCGCCTTCAACCTTCTGAACAAAGAC:1 - chr3L 23358752 5' + Fw3 285 1 65.00 AGACAGGCAGTCAGAGAAATATCAGCAGTTCATTTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 27775174 5' - roo 397 1 67.33 TCATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3R 16400235 5' + blood 19 2 60.40 TTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTA:1 - chr3L 18706914 5' - jockey 4934 1 77.23 GCCCCCCCTAAAAATAGAATATGCTAGCAAATATTTATAAAAGAAGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCG:1 - chr2R 13438078 5' - Tirant 8138 2 55.45 ACATTGATGAGGTCAGGATATTAAGCCTTAATTTATGCAACGATTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGT:1 - chrX 10675001 5' - Stalker4 425 2 51.49 ATTTAAGGCAATGCGCGCATTGCTTTAATAAATGCACGCAGCACACAAACAACACCAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 14715214 5' - Tc1 1398 2 59.46 TTATTCCATTGCTATAAAAAGAAATTTGCTAAAAAGTGAATATATATACGAATACGAGTCTTAAAACACTACTCATGCGTGAAAATTAAAAAAAAAGAAAA:1 + chr2R 17274493 5' + TART-C 11094 2 73.27 TTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 7075886 5' - roo 9031 1 67.33 CAGCGGGAAAGCGTTAAAAAAGCGAATTGTAAAACAAGCAGCAAACAAACGAGCAACATTCGCTCATGGCTAGATCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAG:1 - chr2R 16397013 5' - INE-1 89 1 64.36 AAATCCCATTTAAGTGTTTGGACAAATTGGGTATTAAAAAACTGTAAAATCAGAGAGAG:1 - chr3L 11114207 5' + 412 7409 2 74.58 ATTTCGTATCTTGAAGTTTTCTTCTTGTTATGCTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20745735 5' + HB 155 1 90.70 TATGGGTTATTTTTATTTTTCGGCACACACGGTTTGTTTTTGTTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAA:1 - chr2L 14616101 5' + roo 128 2 58.00 AAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCTACGGGGGAAGGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCT:1 + chr3L 23773902 5' + Transib5 2862 1 62.38 TAAAAATAAAGTCCAACCAACTGAGCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAA:1 - chr3R 25577438 5' - Doc 190 1 75.25 TGCTAACAAGTGTGAGATTAGAATTAAAAGTTGTTTCTTACGTTTCTCTAAATCTTTTGGTGCTTTAGCTGATGCTGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCA:1 + chr2R 14867443 5' - 1360 3121 1 80.20 ATGATTGCCCGTTGTTGCTGCTTGTCGCCTATTTTATTCTTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTTGCA:1 - chr2L 469102 5' - gypsy4 456 1 69.31 AGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr3R 31458415 5' + jockey 31 1 55.45 TCGAAATGGGAAAAGAGTAAACCGGGGGAATTTCCTGTATTGCCACCTATTGTTTGAGCAGCATTTGCAAACAAAAAAAAAAAGAAAATAAAAAAA:1 - chr2R 18319868 5' + Doc2-element 254 1 69.79 GCATTCGAAAGTTCGTTTTTATGGCTCCAAATGAGGTTTCCAGTTTATTTATTTAGTTCGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTGCACCG:1 + chr3R 11695528 5' - I-element 323 1 62.38 TTGATATATTGAATACACACTCGTATTCACTTCACCGGCAAAGGACTCAAAAAAAAAAAGAAGTGTAAAA:1 + chr3R 22823501 5' + gypsy2 406 1 90.00 AAAATGTCAGTGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3L 10143147 5' + 297 6598 2 63.37 TGAAAAAATGCTGGTAACAAAACCCGTATTCCCGCCTTAGTTGTAATCCCAGTATTTGAACTGCTTGCAATTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGA:1 - chr3R 4970637 5' - diver 217 1 71.29 AGGTGCTGCCTTAAATATTCAGGAGGCTTTAAATTTTCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTAAGTACGC:1 - chr3R 18710033 5' + Quasimodo 7184 2 64.36 TACACTTTCATTCTTGCGTTGTCCCTAGTTCTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAGCTAACCAAAAAAATGAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTAA:1 - chr3L 24011323 5' - Tc1 1374 1 70.30 CATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 14675618 5' + roo 8694 2 70.30 GGACAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 27981666 5' + roo 36 2 66.34 TAAACACCACTGAAATGGAGCGCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGT:1 + chrX 10561800 5' - hobo 2906 1 57.43 TGCAAATGTATATCAGTTTATATTACACCTTTTAGAAGACACAGTTTTATATCCGTCTGTCCATATGAACGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAA:1 - chr4 407957 5' + INE-1 154 1 67.33 CTCGTATATCTACCCACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAG:1 + chrX 3763132 5' - 297 389 2 67.33 TTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTC:1 + chrX 19426221 5' + mdg3 22 2 58.42 CAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr3R 27430072 5' + pogo 44 1 70.30 CCGGTGTAAATAACAAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3R 31101346 5' + 297 19 2 54.46 GAAACTTATCCTCATCACTCCCGTCCGACTGATTGTTTTGGCTTATGCGGCTTATGTGGGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 + chr3R 6608757 5' - I-element 5340 1 62.38 GGCGTATGCTTTGTGTTTGAACATAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 - chr2L 22084555 5' + copia 22 2 57.43 GAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr3R 6273586 5' + blood 25 2 53.61 CTCCTGTTGCCCCAAAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr2L 22084444 5' - copia 256 1 77.23 CCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 16201501 5' + hobo 25 1 54.46 AATATAGTAGTTGGCCCGCTTGGTCTCATACTCAATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTT:1 + chr3L 19454642 5' + diver 5900 2 70.30 TTTGTATAACGATTTAATATGAAATGATATTCTTTCGCGTCGCAATGTTTTGAATTTTTCTAAAATTTGTTTGTGTTTTTTTTTTGTTTTTAAATATTTT:1 - chr3R 18105120 5' - TART-B 10628 2 60.00 CGAGTCTTACCATTACCCGGCAATGACAAAGATTCCGGCTATCATCTTACGGAGCTGCTAGGCCTCTAAGGAGATTAAAAAGGAAGGGTTTCGCCAAAACA:1 + chr2R 21043881 5' + BS 4929 1 59.41 ATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2L 15510392 5' + jockey 4691 1 56.00 ACCTCAGGATTCATTTTCCAGCTTTTCAGCACAGCTGACCACAACAAACAGCCTACAATCTCCCACATGTAATGTTACATTCAAAAATGCAAATTATTGTA:1 - chr3R 7468325 5' + TAHRE 10333 1 66.34 AAGGACCTGTTAAGTTTTGTGCAAAAAATGTTAATTTTAATTAAGGCCTGCTATCGACACCCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTG:1 - chr3L 18453650 5' - flea 141 1 65.35 TTTGATATACGAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAG:1 - chr3R 29331945 5' + G6 4 1 75.25 AATGCCAATCTGCCGTTTAGCTAGCGCAACTGCCAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTAATCTTATTAATTGTTGTCTGTAA:1 + chrX 14988081 5' + gypsy12 10090 2 66.34 CTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1 + chr3R 13582219 5' + BS 5022 1 50.50 TTAGCGTATCCTTAGAAATTATCAAGACAAATCTCAATATTTTTTTAAAGTGTGTCCGCACTAGTTTCTTGACAAACTGTATATTCTTGATCAGGTTGAA:1 - chr3L 24996374 5' + INE-1 82 1 69.00 TTTTCTTAATTGGTGTTTATTGTGTGTCAAACGCACACGCACACATACACTCGCACACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr3L 13589525 5' - hobo 2926 1 65.31 GAGATAAGTCTTTCCCTCGATCGCATTTATTTGAGTTCAGGGGATGTTAGTGTCCTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCA:1 - chr3L 1072820 5' - HB 1283 1 67.33 ACGACCGGCAGATATGTGATAGGCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTC:1 + chrX 15117316 5' - opus 212 2 74.73 GGTAAGTACTTAAGTCCGTTAGACGCGCTTTACTCAAAATCAAGAAGAAGCGTTGGGGACAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATT:1 + chr3R 9545765 5' - hobo 315 1 67.33 AGCCTGTCAGGCAATCGAATCAAGCGAAATTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGT:1 - chr2R 15745908 5' - BS 4652 1 67.78 TTTTCGACCACTTGTTTGACTGCTTTGGCTTCAGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3L 11553494 5' + P-element 43 1 30.69 TATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:2 - chr2L 15808024 5' + I-element 47 1 66.34 GGTAAACAGAGCTGCGGGCTTTAACAGGCAGAAAGAAGTGTTTCCGACCAAGTCAAGAATATATGTATAGACTTTATCTGGATCACTAGCCAAGTCGATCT:1 + chr2L 5699234 5' + INE-1 97 1 67.33 AAATTAGAAAACCCATTTAAACCAACCAAAAATGTAGAACAGACAGACCCTGACCATTACAAAATCACTAATAGAAACCAAAAACGAATTACAAGCCAGAA:1 + chr2R 2127182 5' + I-element 397 1 76.24 TTCTANACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 + chr2R 13078731 5' + jockey 4677 1 66.34 AGAACTGTAAATGGCATTAATATTGAAACTTTGTTGCCTCCACAACCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr3R 27801271 5' + Burdock 6162 2 55.45 TTAGCTATTCTCCTATTCGATTTTGGATTAACTAACTTGAATGTTGAGAATGATGTTGAGAATCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAG:1 + chr2R 1984151 5' + Cr1a 4095 1 60.40 ATACTTAAAAAAAAAATAATGTGCCCGCTACACAGATTCGGATGTACCCAACAGATTCCAGATAAGAAAAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAA:1 - chr3L 23580320 5' + Idefix 6947 2 61.62 CATATATTAGCCATAGAAAAAGCGCATCTTAAGTGATTAGACATAAACTACATTTTCCGTGAGCCATCTCTAATGGACATGTCATCTCTATTAAATAAAAT:1 - chr3R 17246142 5' + invader6 4548 2 65.35 TTAGCGTAATGCAGCCAAAGTTATGCGACTATGTATGTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATAT:1 + chr2L 4301183 5' - Idefix 6 2 65.31 GGAGGCAAGCATATTAGAAACATCAGTTTTATAAACTGGGCTTTCATATATATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAG:1 + chrX 2776052 5' + 297 6588 2 67.33 TTTGCACTCAGAGAAAATTACAATAGGATGAGATTATAAAAGGATTTTATATAAAGTAATAAATAATTTTCTCATAGTTATATAAAGCGTATTTCAATTAT:1 - chr3L 9248616 5' - Copia1_DM 16 1 57.43 AGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGATGTGAGTGGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAAT:1 + chr2L 12949252 5' + 412 7455 2 72.28 AGTCTGTTTATACACACTTTTTATGGCCACTGTGGCCTATGTTTGATCAGGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr3L 2144390 5' - copia 230 1 53.47 GCAGCATTGAACGCGCATTTGAGCAAATCTCGGATACTGGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGA:1 + chr3R 22378213 5' + jockey 463 1 61.39 TATACACATTATGCACTTGAAATTATCATTAGCGCTTTCGTGGCACCCCTTATTAGTCATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAA:1 + chr3R 12371712 5' - 1360 325 1 57.43 GTGGTGTGTGGGGCGAAGTGGGGCAAAATGGATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGC:1 + chrX 13473739 5' - 297 6850 2 69.31 CTGAGAAGTTGGAACTGCTGCAGTAATTGCTCTGGCACATTGAAGTGTTCCAGTTTCGATCTTCCTCTTTGCGCACGCACCGTTACCGTTCGACCTATTTG:1 - chr2L 14705875 5' - gypsy8 4870 2 67.33 TGTTCACTGCCACGGCTCGGACTCCCTAATTGCAGTGTATTAAAACATCAAAAGTTAACAGCCAACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCG:1 - chr3R 28016900 5' + Doc 290 1 71.29 TGTAGCTTTTCAGCCTAACAGCTATTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTT:1 - chr2R 13645153 5' - Burdock 6293 2 76.24 ACCACAATCATGAAAATTTTAAATTGTTTAAGCCTAAGACATAAAATGGCCAAAACAAGCCAAAATATGCGAACAAAATTAATGAAAATGGAATGGCAAAA:1 + chr3L 15482749 5' + micropia 5251 2 57.43 AAGCCACTCAATAAATACCAGCCAACGAGCTTAAAATATTATATATTATCTTGAAGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAC:1 + chr2R 13107405 5' + copia 23 2 46.53 ATATANGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr2R 14708965 5' + Doc 33 1 53.47 TACATAGAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 17321778 5' + Stalker2 7283 2 58.42 CCCTGAAAAAAAAGGAAATAAAAAAACAAGCAAAAGTGAAGCCAGCAGCAACAACAACAACTAATGGACGGCCAGAACGTGAACCAAAGCGGAGGATGGGC:1 - chr2L 9740247 5' + TART-A 12954 2 82.18 CCTCCGTCTAACAGCTCATTGGCAGATGGAGATGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 - chr3R 14097022 5' + jockey 4708 1 67.33 TAATAATGGAAATTTGATGCCGCACTGGAAAATGTTGGGAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 + chr2L 17646144 5' + flea 4760 1 74.00 ATGTGTGTATGGCTTAGTGTTAATAATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTTAAAAATAGT:1 + chr3L 13664757 5' - pogo 1884 1 79.21 GTTGAAAGTTTATTTGCATTGTTATTGCAATTTTGTGATTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAA:1 + chr3L 2811020 5' - Tirant 5 2 56.18 TTAACAAATTCATTGCTCACAGTGCACAACTTAACCCCATTTTTATATTCAGTTTCCTAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAA:1 - chr3L 11319448 5' + flea 310 1 70.30 ACACAGCAGAGGGCAAAAAATAAGAGAGGTAGAAAGAGCTTCCAGAAGTCAATAATAATAGAGTGACCGAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAA:1 - chr3L 25256239 5' + Burdock 294 1 75.25 ATATATGTATTTCGTTAATTTCAGACGCTTTTATTTAAGATTTTAAATATATTTTCTGTTTACCATGTCTACAAAATGTATTATTATTATTTATTGTTAA:1 + chr3L 2925544 5' - flea 242 2 88.00 TGCACTATTAATTCTTTGTTGGAAATTTAAAGGATTTTGTCCTCCACCTATAATTAGTTTTTTTGTTAAAGGAGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTG:1 - chr3R 3005303 5' - Doc3-element 495 1 65.35 TACGTAGTATTGCTCTAGGTGTATACAGTGTATACATTTCCATTTGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAA:1 + chr2L 312288 5' - Tirant 191 2 53.47 TGCAGCGTTTTTAATTCCGAAAAACGTGCTAACTCATTTCTTGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCATTTCGTGTGTTGTTCGCAGTGATGTTTGG:1 + chr3L 2319545 5' + Cr1a 234 1 67.71 ATGGCTATGTAGTGGAAAATTGAAAGCGAATATGTGGTTAAAAAGTAAAGTGCGGAATTGAGCAATATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATT:1 - chr2L 15182221 5' - Stalker 6866 4 73.27 ATATATTTTAATTTTAATTTTTATATTTAATTTTAAAACAAACAAGAGAGAATGCTCTAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr2L 10705918 5' - INE-1 541 1 76.24 GCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATATTCTTAATAGTGATTAATACCCAAGTCGATCTGGCTCTGTTCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCAGGAAT:1 + chr2L 22724121 5' + INE-1 140 1 47.52 CGGAACAACATGTTCAAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3R 11688516 5' - 1360 3372 1 63.00 AACACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAG:1 + chr3R 25671929 5' - I-element 5318 1 61.39 ACCTAATACCCTCTAGTTGTGCGGTTTTGGGTCACCTTTAAAAATCCAGATTAATAGATATACTGTTCAGCCTGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAA:1 - chrX 7522850 5' - R2-element 236 1 61.39 ACTAGACTACGGTCTAAGTACATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 12639618 5' + hopper 143 7 74.42 GATAACGAATTTGTATTTACTTAAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 + chr3R 26530881 5' - blood 7336 1 75.25 CAAACAAGAATTAAATACAATAACCACCAGCCATAATGGATGAAATAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr2L 3085050 5' + copia 4899 2 56.44 GGTCAAACTTCAAAATCGAAATAGGATTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTCTAGCATTAG:1 + chr2R 9770201 5' - I-element 5307 1 69.31 GCTCTCGAGTTTCCCAATCAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1 - chr3R 11094595 5' + 3S18 7 2 71.43 GATTATATATTATATTGTAGATCTAATACTTCAATTATTATGTTATAGTAAAGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:2 - chr3L 5102470 5' + jockey 4693 1 57.43 AACTAAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGT:1 + chr3L 11257355 5' - 1360 8 2 48.51 GTGTCCCAAACCCACTCCGCTCTCCACCCTCCTCTAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTA:1 - chr3L 22039505 5' + jockey 4883 1 66.34 AGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 - chr2R 10444300 5' + P-element 23 1 48.86 AAAGGCATCGGCAGCATCGCGCTGGCGACTTAATATGGGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 27748731 5' + roo 36 2 65.35 CTCTCGGGTCTTCTTGTTTTCCCAGCGCTAAATCTTTCGGATTTTCGCGTGCCTTGTGTGGCCTTTTGTTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGC:1 - chr2L 1101972 5' - X-element 436 1 72.28 CGTATNAATGGGCCTGAAACTCGGACTGGGCGGGATCGGCGGCGGAGGAGTCGGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAG:1 - chr3R 18373276 5' - Stalker 330 4 54.17 GAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTG:1 - chr3R 29331935 5' + G6 14 1 65.35 AGGTCGCTGAGGTCAGAGGAGTGGATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 29709913 5' - accord 186 2 76.74 CTTTTCATCCTATCCGGTTTCCGAGCTCATCAAATCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCAT:1 - chr3R 26952639 5' + jockey 4800 1 67.33 TAAAAGTTTATTCTACACTCCTAAGGGATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2R 19552085 5' + roo 8664 1 75.25 GCAAGTCACTTGACAAGCTGCTGATGCAGCTCCCGCTGTTGTTGAAATGTTGACTTGCCTTTTTCCTTTGCTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTATTGTTAT:1 + chr3R 6798287 5' - mdg1 20 3 81.19 AAACGCTCACCCTTTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATAAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:1 + chr2R 17937116 5' + Quasimodo 3 2 53.47 TGTAATTCTCGTTTTTTTTCCAATTCCCGCCTGTCGACGGCTCCTCTTCACCTGGTTTCGTCGTCTGTTTCGCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATC:1 - chrX 15293258 5' - Quasimodo 6985 2 72.28 CTACATCTACTACTTTTGGGTAAGCCACCTTTCTAAAACTAAACTAAACTCTTTACAATCACGCAGTCAAAAAAAAAAGTGAAGTCAAAAGTGTAAAACC:1 - chrX 9614696 5' - Tc3 331 1 54.00 ACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 - chr3R 7388405 5' - HMS-Beagle 7004 2 64.36 GGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 15474850 5' - roo 9028 1 67.33 ACTGACGCAAGTTGTATTGGGTATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGTATGCTCA:1 - chr3L 25768163 5' - Circe 7382 1 74.26 TATTTAAAAATATATTCTATAAAAATAATACAAACATACATAGTTGAAAGTAAATATTTATATAAAAAAAATCCAGGACCTACGGATTCCAGTTTTAAAGA:1 - chr3L 23591936 5' + Doc4-element 2734 1 68.32 GTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATG:1 - chr4 184034 5' + 1360 159 1 52.53 CTAGTTGGGTAAAGAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:2 + chrX 19116852 5' - opus 480 2 65.35 TATGACACAAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 11263375 5' - roo 396 1 66.34 ACACTTTGATGGCACTCGACTGCCAAGGGCTTCAGCCCCCCCTCCTCCCCTCACAGAGACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGA:1 + chr2L 9844861 5' + accord 7127 2 69.31 ATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chrX 10827412 5' - roo 9041 1 60.40 AATATAATATAATTATAATATAATAATAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTACAAACTAC:1 - chr2R 2519724 5' + Doc 54 1 75.25 CAAGAGAATCCGAGCCGTCTTCATCATCCTTCTCCCATTTCATTACTCGGATCGATTTCTGCCAGCCTCATTTCGTGCACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAA:1 - chr2L 166138 5' - Tc1 171 1 67.33 GTATTNGCATATTTCTACAGGGTATGATTGAGCAGAAGAGCTACCCCAATTGGGTGATGAGAGATAATTGAACCAACAAGGATCGCCGCACCTCCGTGTTG:1 + chr2R 18522497 5' - G5A 202 1 57.43 TAAAGATCGGATTGATGATATACCTGAATAGGCTTCGTATATATCTAGATATTGTGGTCGCCATTTTGAATGTCATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGC:1 - chr2R 19944543 5' - 412 200 2 75.25 AAACAAGCTGCGATTCAAAGGCCCAAGCGCAGAAATCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGT:1 - chr2L 18190901 5' + F-element 4212 1 64.65 GTTTTTCTTTGCTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGATTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCG:1 + chr3L 15792807 5' - TAHRE 10403 1 74.26 TATTCATTCAACCATTTTAAAATCTTATACTAACATTCGGCACTATAATTAAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTTTTTAACTTTGCTGGTGG:1 - chrX 18688364 5' - TAHRE 10433 1 56.44 CCAACCTCGACGATGATGTTTTAGTAACTGAGCAAAGTCACGGAAACCTCGGCAATAATTCCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3R 26258982 5' + opus 142 4 63.37 AAGTGGATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr2L 12324126 5' + roo 7 2 74.26 ATATGATTTTAGAAATACGCAACATTCGACTGGTAAGGACCACATTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chr3R 12605588 5' + F-element 31 1 62.24 TGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 18500957 5' + hobo 40 1 65.35 AACAAAGGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr3R 25097908 5' + P-element 29 1 51.49 ACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 + chr2L 9163725 5' + copia 38 2 66.34 TATAAAAGTGTCCTTTTATTTATTTATTTTGCATAAAGACGACCATGGTGTGACTGTTTAATCTCCACTCAAAACTCAATTTTATAGTTGCTGAGATCTCG:1 + chr2R 5992040 5' - INE-1 147 1 68.32 CATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr2R 11528061 5' + P-element 45 1 36.63 ACATAAGTATATTGAAACGCACACATGTGTTTTCCTTTCTGCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGTT:1 - chr4 510144 5' - 1360 3350 1 57.43 GTTATNAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 29259642 5' + pogo 33 1 59.41 ATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3R 19346950 5' + blood 45 2 70.30 TTTCGNGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 - chr2R 13644514 5' + Burdock 6153 2 61.39 GACTCACTATGCTGAGCACATTTTGTGGGGGCAGCGATGATTGCAGACAACATTTACTGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACTACTGTGCACGAAAACA:1 - chr3L 10571232 5' - Cr1a 400 1 58.42 TTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 12667231 5' - blood 7347 2 69.31 ATGAAAATGAGCTACTACATAATAAGTATCATCTATAATAATATCTACTTATTCCTATATACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGA:1 + chr2L 21794109 5' - HB 82 1 52.48 CTGCAGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 17345967 5' + jockey 12 1 74.00 TGGCATAGACACAGTTACTTAGCACGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCA:1 + chr2R 16509202 5' + Stalker4 122 4 80.20 GACGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATATTTATA:1 - chr3L 12888274 5' + mdg1 7084 2 68.69 TCAGTACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 - chr2R 2427633 5' + Doc 4 1 75.25 TTTTTTGTAAAATAATTCAAATTAACAAATGTAAACATAACATACAATGTGCTAATGTTACAAGTCCATGTTACTGTC:1 + chr2L 11254920 5' + HeT-A 5860 1 89.74 GCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 - chrX 19426280 5' - mdg3 194 2 74.26 TTGGCTTTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr2R 23580839 5' - P-element 2872 1 62.38 AAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:2 + chr3L 8713087 5' - opus 7468 2 70.30 GTTGAATTGAACCGAATAAAATAACCCACTACGCTTTCCGTTCACATTTCCCGTAAAAAAAACTAAGGCGACAAAATAAGCAGAAAAAAAAACCAAAAAA:1 + chrX 13847521 5' + mdg3 5102 1 60.00 AGCATGACAGGACATACGTACAAGAGACGAAACTCGTATTCAGAATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr2R 24628734 5' - mdg1 414 2 69.31 CCGGCTGTGTGGCAGCAAAAAGTTCTCCTGGGAGTGGGTGGCCATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3L 5201464 5' + 297 6596 2 69.31 CGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 + chr2R 10543439 5' + P-element 52 1 27.72 TGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 15305687 5' + roo 52 2 78.22 TGTCTTAATTAAAATGAAATATTTTACTTGCTTTTGTTAAAGAAGTAATACCCGCGAAGACAATAGAATAACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGCTTATA:1 - chr3L 24529531 5' + Tc3 316 1 55.45 CGATATGTTTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 8313145 5' + 297 6 2 73.00 TCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2R 10543506 5' - P-element 2852 1 44.00 AAAGGTTTGTTATGTTGGTAGCATACACATTTAACTTATGTGGGCTTGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr3L 4123193 5' - P-element 2827 1 49.50 ATTTAGATAAACACTTGTCACCGAAACAGAAGAGACATCTATTTAGAGGCCTGACACTTTTAGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTG:1 + chr3R 3520695 5' - R1A1-element 288 1 66.34 AGAAAATGCGTTTTAATGAAAAATGTCAAGAGGAAAACCCGAAAAGAAATTCTTACCCCCTTTCTTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGCA:1 - chr2R 7079145 5' + Tc1 175 1 55.45 GCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr3R 13376020 5' + 1360 47 1 71.29 AATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2R 23580808 5' - P-element 2841 1 31.68 AACCCNTCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 + chr3L 17168845 5' + mdg1 7076 2 62.38 AACGAATCATAAGCAATAATAGAATGTTTTCGTTGTAAAAGAGGTAAAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAT:1 + chrX 8430604 5' + F-element 121 1 59.41 CAAACTTTAAACAAGCAAGTTACGATGCAACAAAACGATCCGGACAGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCT:1 + chr3R 10147825 5' + roo 8693 2 56.44 TTGTGAATTATTTTTAGTGGCATTATTCACGTTATTAAATTTATTCGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 17853321 5' + roo 8692 2 57.43 TCACTCCGCAGTTGTAGACGCACTTTAGCAACTGGTGGACCAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 + chr2L 20134154 5' - flea 238 2 49.50 TGTTGGCTCAAGCATTTTACGGGGGGGTTAGGTCAGCGCCCGGGTGTTGATGTCGTCGTTGTCGGCTGTCGGTTGTCGTTTGTAGGTTGTAGGTT:1 + chr2R 8333841 5' - Transpac 5148 2 65.26 TACACAAAGCCGCGTTGTTCAACTTTGCAGCCTCACTGAAAAAATAGGAGAACGAAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCA:1 - chrX 14817208 5' + I-element 4954 1 59.41 TAGGGGTGGACCGTAAGGCTAATCCACTCTAATTTTAGATTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTC:1 - chrX 12290233 5' + X-element 47 1 59.41 GAAGAAACGGTTTGTTGAGCAGCTGCTGGTTGCAAAGGACATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACT:1 + chr2L 13319544 5' - hobo 2938 1 78.22 GTTGGGACAAAGATTTGACAGCAAAAATGAAAAAAAAATAAACAAAAAAACCATGGACGAACACTATGGTTTGATTTGGCCTAAGCTAAGACGTAAACAGA:1 - chr2L 4083391 5' - transib3 357 1 65.35 GCCACTCAAGCGAGACACGCACATCTATACGGTTTTCGACCACTTGTTTGACTGCTTTGGCTTCAGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3L 11553462 5' + P-element 10 2 63.00 GGGAAATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr3R 24081625 5' + 297 6598 2 62.00 TGTTTAGTTTTATGGTTGTATGTGTTTTTATTATTTTGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTAAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAG:1 + chr3R 597411 5' - 1360 391 1 40.59 CCACAGGCTGTAGCTGCAATTTTCCGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr2L 315155 5' + Tirant 8152 2 75.00 GGCCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 6117231 5' + Tirant 8136 2 56.00 GAGAAAAGTACATAGGAAATACATAGTGTCTTAATACCACATATAAGCAATGCTGACGCGCCCCAACGGAGTTCAGCGCTCTGCGCTACGAACGGTCAGCA:1 - chr3R 771890 5' + gtwin 7010 2 72.28 GCACTAGAACAAGTGAGTGCGAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr2R 10543416 5' + P-element 28 1 49.00 TACACCTACATATATTTATGAAAAATTGTTAGACAAATCCCAAATAATACCAGTTCCCCCAACAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAA:1 - chr2R 6131698 5' - copia 145 2 70.30 CAAGAGTTTGATTGAAAAGTATGCAAGTGTGGGCGTGACCATTTTACTTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTAACGTCCCCCATTATCCATACATTGCA:1 - chr2L 22322281 5' - mariner2 744 1 57.43 ATTGGCATTTTCTTTCCCTTAGTTGCCAGGACAGGAGGGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:2 + chr3R 27775058 5' + roo 8669 2 74.26 TAGATACATACATATATATACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 27748647 5' - roo 396 1 66.34 AGGGGAGTGATGAACCCGTGGATTTGCACAGAGAAGGTCGACTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2L 19481371 5' - roo 399 1 69.31 GGGAAATGATTTCGGATGCGTTTCAGGTGAAATGGATGTGAACTGGCGGTTAATAAGTAATACTGCAGTTCTTTTTATTTTATTTTATTTTTTA:1 + chr3R 20849083 5' + transib1 1901 1 79.79 TTATGTACATAGATGGGCATGGAAGTGGAAAAACAGGGAATGGATAAAGCTAATTGAGCGAAGTGCAGATGATCGCACGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTC:1 - chr2L 18478252 5' - HMS-Beagle2 6963 2 59.41 AGCTCTCTATCAGTTGATTTTTGAGGCAGACAAAACCGCGCATTCATAACGCAGGGAAGGGAGCCGAGGCTGCCCAACGCGTTGTTCGACGAAAAGACGAC:1 - chr3R 31908858 5' + Osvaldo 1133 1 59.41 TAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 9871003 5' - roo 353 2 73.27 GAATCACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3R 4601311 5' + opus 7034 4 62.38 AATAATATCTTAAGAGATTTCCTTATACTTTTCTTTAAGTTCTTTAGACTTATAAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTT:1 - chr2R 11829168 5' - I-element 86 1 65.35 AAAAGCTTTGCAAAACTATTTTAGCTCTTCTTCGCTAATATGTAGTATTTTAACAGCTTTCTTTCAAGTGTAGCCCTTCAGTTCTTAGACTTTAAATATGT:1 - chr3L 16218101 5' + 1360 238 1 77.23 TTTACTACTATTTACTTGTACGTTTTTTATAAGTTCACTATCTTCAAACAAGCCATCTCGTTTAATTTCCTCAATTTGTTTATATTTGTTTCTGGTTATGG:1 + chrY 536715 5' + Transib5 2645 1 68.32 GCAGCTGCTCCAGTTCGTTGTGCCAGATGTGCCAGTGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGATAGGGTGGGTATAGAATAAGGC:1 + chr2R 19136968 5' + Circe 7201 1 64.00 GTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCACCTGTCTCGGTCTAGCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGT:1 + chr3L 25232774 5' - accord2 7593 2 52.48 ACAACACAATGCTATAACCAGTCAAGTGAGGCGAGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTA:1 - chr2R 15307967 5' + roo 8994 2 70.30 GAAAGTGCAAAAACCTTAGATTAAACTTAGATCGACTGCCAAAACTCAGGCAGTCCATACAGCCACCCAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGC:1 + chr3L 4557590 5' + I-element 150 1 69.31 ATTTCAGTGTTTGGGAGAGAGTAGCTTTCCAGCCCCTCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTCGCAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTC:1 - chr2R 3288605 5' + Idefix 7097 2 66.34 ACAACATGTTCAAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - 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aurora-element 4104 1 68.32 ATCGANCTGTAGGCTTTTGAAGCGCAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATC:1 + chr3R 8458199 5' + HMS-Beagle 11 2 67.33 AGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3L 7550718 5' - 412 7522 2 54.55 CATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 + chr3L 19951218 5' + Ivk 50 1 74.26 TTGGTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTA:1 - chr3L 18337690 5' + Juan 4071 1 72.45 ACAGTTTCAATATTAATAAAATCCACTCTTCCATGTTTTGCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTTACTTAAGAGACTAACATTAAGTTTTCAAATCTTATTC:1 - chrX 364512 5' - Doc3-element 4664 1 72.28 CAGTATCAGCGAGCTCTGTTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGA:1 + chr3R 25098011 5' + P-element 220 1 30.30 ACAATTCAAAATAGGCTCAATATCTAATCGTAATCGTGTTTCCATTCAACAGGCACGCCCTGCCCGTCAACCTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCG:1 + chrX 6715812 5' - jockey 4600 1 75.25 AAGCCGAAACATAAATTTCGTTAATCATTGAACTGGAAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chrX 992113 5' - hobo 2934 1 74.26 CACCCATTTATGTGCCATTCTTTTGTTCGACTAATTGTTTATGGATGGATGTTGTTGTTCCAGTTGTTTTGCATTGCCCTAACGTTATTATTAATTGAAA:1 + chr3L 22483343 5' + 1360 310 1 56.00 TCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATT:1 - chr3R 11094572 5' + 3S18 5798 2 54.46 GAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3L 13589454 5' + hobo 43 1 66.34 AAAACCTATTTAAAAAAAAAAATTTTTTTTCTTTTAACTTTTTTTTT:1 + chr2L 17879182 5' - Doc2-element 234 1 57.45 TCTAAGCACCATTGAATTATTTAAAATCCCTTCCAATGACACATCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCATCAG:1 + chrX 756658 5' + GATE 300 1 60.00 AAAAACAAAAATTATTTCCCCAATATCTATCGATATCATAATAAAATGATAAAATTTCGTGTTCGCATTCACAGTAGCTGAGCAAC:1 + chr3L 10247766 5' + INE-1 534 1 80.23 CCCAAAAATAGGAACAAAAATAATCAGATTTTTAAAAGCGAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTACACTATGCAGCCACT:1 - 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Quasimodo 290 2 78.22 TGCCCAGCTGCTGTGCGAAATTCATTGTTATGTTTTTTGTATATAACGGCGCTATCAGAAATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATG:1 - chr2R 19668919 5' - 412 241 2 67.00 GAGAGACTGTTTCCTTTGTGGCCAAGTACCGAAAAAAACGAACCACCCTTCAACCAAATATGTATTCACAGAAAACATGATGGCAGATGTTCTAACCAAGA:1 - chr3R 19433860 5' + Dm88 4211 1 67.33 ACCACCACAACCACTCGAGCGACCACCACCACCCGACCAACAACCACAACTCGTGCCACCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGC:1 - chr3L 14509702 5' + F-element 4489 1 65.35 GATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chrX 2799681 5' + Tirant 8148 2 74.19 ACGAACAATCATAAACCCAGAGTTTAACTTAGAAAGCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCT:1 - chr2L 23381897 5' + Ivk 439 1 64.36 CGACACAGCAGAAATGGCAGGCGGCGGGACCAAAACGAAAAGAAACAAAAATCTCTGGCAGCAAATAATTTCAAAATTTTTTTTAAAATTTTTTTTTT:1 + chr2L 7355864 5' + Tc3 78 3 70.41 GTTGATTTCAAATCATTCTATTAACTTTTATTTGTTTTTCCAATATACATTTATATATATGTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGA:1 - chr3L 13423402 5' - Idefix 387 2 39.60 CGGAAGTGGCTTTATGCAACATGCGTTCTACAATCAAGCGGCTGCAAGTCAAAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTA:1 - chrX 5858315 5' + invader3 5443 2 57.43 CTGCATTTCACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3L 18500934 5' + hobo 17 1 60.40 GTAGTTTCCGTTTCCCTTTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATACC:1 + chr3R 17733237 5' - INE-1 557 1 76.24 AAAGTNACTGTAAGTATGCAATGGAAAAGGAGCCGCATTTTAATGCTTAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATG:1 - chrX 14768076 5' + BS 5020 1 52.48 CAACAAGAAACACCAAGAGGAGCTCCGTATGGGATATATCCGAAATTATCCACTAACTTTACCTAAATTCAAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAA:1 + chr3R 24681995 5' + I-element 5003 1 51.49 AGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chrX 8972424 5' - 1360 3342 1 74.26 GTAAGTATGCAATGGAAAAGGAGCCGCATTTTAATGCTTAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCG:1 - chrX 14768067 5' + BS 5029 1 61.39 GAAACCATAAAGTTTATAATTACCATAAAATTTACTTGTTCGGTTCGTTTTTGTCCTGAGGTTTCTTCATGATGGGAGAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAACT:1 + chr3L 5711407 5' + HMS-Beagle2 489 1 61.39 TTTGGAAAACCTTTTTTCGAATTCTTTGGTGATCTAATTTTTTATATTAATTTGAAAGCGTATTTTTTCGCTGAATTAGCTATAAGTGGGATTTACTGGCA:1 - chr3L 10807220 5' - Porto1 4298 1 46.53 GAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr3R 7522387 5' - blood 7374 2 63.37 ATAAGGTAGTTTTATGGGATGCACCTTGGGATTTATTTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTGAAGTTTTGAGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chr2L 20929389 5' - INE-1 575 1 71.29 ATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 11119886 5' + 297 14 2 65.35 ATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATA:1 + chr2R 1320668 5' - diver2 4892 2 66.34 TGAATGAAATTATTTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCA:1 - chr3R 32005974 5' + invader4 6 2 72.28 TTATAAGGTGGCATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAGAACTTTAATATTTTGAGGTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 + chrX 21204917 5' - mdg1 7458 2 66.34 CACCGNGATAAAGTGGCAGAGATTCGCAGGAAGATAGACGCGATATAGAAAAAAAAACAGACACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGGTAGAACATAA:1 + chr2R 20191475 5' - Cr1a 4196 1 78.22 GCAATGTTTTACATGTGTTGTATGCGGAAAATAGTTGTTATATTTTTGAGTCGAACTAATATCCCGTCAGTTGGCTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAA:1 - chr4 1057884 5' - 297 338 2 80.20 TATATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGT:1 + chr2L 22092958 5' + INE-1 538 1 59.00 TTTGGAAGCACCGAAATACTATATGCTGTTTGGTGGGTCTATCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGTCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTG:1 + chr3L 6916548 5' - I-element 132 1 74.00 TCATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAA:1 + chr2R 4906443 5' + INE-1 147 1 62.38 TTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3L 12633248 5' + jockey 33 1 52.48 CATGTGTGATCGTGTTTAAAGGTTAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr2L 23390235 5' + P-element 51 1 29.70 ACCAGTGGAGTCCATAAGTTTATAAGTAATCTAATGGAGTGCTATTGATAATTATTTTCAAACTGTTAATTTATTCATATTTAATCGTATTGGATACCATT:1 + chr3R 5369350 5' - HB 461 1 77.23 GTTGGTTGGCTTACTTTCAAGACGGACTTAAACAAATTGTACTCAGGATATAGAATTTCCCGAATTTTTAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGA:1 - chr3L 21806711 5' + 1360 3107 1 67.33 AAAAGGATACCCTGGGGCGGCAGATATGTAGAATAGATCCTGTGGCGTTGGGGCACACTATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTTC:1 + chr2R 12798485 5' - diver2 363 2 56.44 CAATGNTTGTTTGCGTCTTACACCCTTTTTTTTTTAATATTTTAATTGCTCTTATTCAGTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCAT:1 - chr3L 645121 5' - I-element 357 1 64.36 TTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chrX 3305201 5' + transib2 39 1 63.37 AGGCGAAATTCCTCGTTTGCTAGCATTATTGATGTTCCCTCCGCCCGTTGTTTTTGCCACTCGCAGTGTGCGCTGCGCAAGCGTGAGGTTGTTACAATTTA:1 + chr2L 18234441 5' + jockey 239 1 71.29 GGGCCAACTCTTTGGCAATTTGTGTGCATCGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTCAT:1 - chr2L 2627372 5' + Doc3-element 4620 1 70.30 ACAGCATACATCATTCCCATTGAGATCATAAACAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAG:1 + chrX 11383124 5' + Porto1 317 1 71.29 CATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCAT:1 - chr2R 4802890 5' - mariner2 280 1 42.57 TATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACACATACACATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chr2L 21328153 5' + flea 4766 2 70.30 TGTACAATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chrX 17058227 5' + 297 4 2 70.00 AGGTTGTGCCCGAGTTAACTGTCAAACCGACAATAAAGGACCACCCTATATAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr2R 5301545 5' - 297 376 2 52.48 ATGTCAACAAAATTTAACTCGGACTAGACTAGACAGACAACCAAAACACCCACCCTTATAAGAAACATAACCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGG:1 - chr3R 3920559 5' - diver2 168 2 76.00 GAATAGGAGCTTAATACATTTACAAAATAATCCCTACGAGCACTGTCTGAAGCATACCATATAAAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCCTTG:1 + chr3L 23784870 5' - Quasimodo 7234 2 57.43 GCAATAGCCTCTCAGCCACCCGCAAAAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chrX 18239442 5' + jockey 11 1 74.26 GTTTGAGCAAACATCACGTTCTTGTATATGTAGAAGTATAAAATTGTTTTCAAGCCAATATCCAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAA:1 + chr3L 23227825 5' + opus 7382 2 68.54 AAGAACTGAATGACAATGGAGGAGGCAGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTT:1 + chr2L 14116123 5' + invader1 223 2 73.27 CCGAGCGAAAAGCGTGGACAAGAGGCAGTTTCTTACCATTTTCCTAGCTATTTTCCTCCTCACTCACTCCCACACTGCCACACACACACACACACATCATC:1 + chrX 1724141 5' + accord 185 2 68.32 AGCCTGCTCTGCTCCAAATTGCCAAAATGGTCGGAGCGCTTATTTTTTGTTTATCTTGTTTACAGAGATATATATGGTTTTTAACACAGATAAATATGTGT:1 + chr3R 23454906 5' - Porto1 116 1 55.45 TTCTACCCCGTTAGCTGATAGTCAAAGAACTTTACTACGTTTTTATTTCAAGTCACATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACAT:1 + chr2R 6253525 5' - 1360 178 1 61.39 AAAGAAAGGAAAATAAATTTTTTTTTTTGTGATGACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 - chr2L 4743218 5' + I-element 9 1 66.00 CCAAAAAAGAAGGCAAAAATTGATATAAGTCCAAGATCGACATATAGATACTGCTTGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGGTCTCAGGAACTATAAAAG:1 - chr4 141984 5' + INE-1 148 1 62.38 CGCTATATGAAGCAATTATTTCCGAAATTTAAATACTATGCGAAACCAACGACTATGTGGCCACGGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATA:1 + chr2L 21962218 5' + Tc1-2 54 1 70.97 CGGAAAATATATACATCTATTGAAATAAGATATGGTAGCAAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAA:1 - chr2R 9500077 5' + G5 4697 1 58.42 TCGCTTAAGGTGGATCAACAAAGCTGTTTGGCCATTTGAGCTATAAGTACTTCAAGTTCTTCTCTAATTGTGTTTCTTTTTATTTTTTTTTTTAACTATTT:1 - chrX 6389541 5' - TART-B 10629 3 66.34 TGTAACGAGTGCTTAGGTCACCTTAGCCAGCCGCTGGTCAATGCATTTCTGGCTACGAAGGTCGAACCAATTTCCCTCCGACGTCTAAAAAGAATACAT:1 + chr3L 11767528 5' + G5A 2676 1 74.75 GCATTATTCACGTTATTAAATTTATTCGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3R 17853340 5' + roo 47 2 76.24 TAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:1 - chr2R 21773620 5' + Max-element 8261 2 52.00 GGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr2L 18430126 5' - copia 238 1 73.27 TAGCTATGGTTTATAATAATTAAACAGTTTTCTATGCCCTTCACTCAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACT:1 - chr2L 10858304 5' + 297 6930 2 58.42 TTCAGCGTCTCGAAGTCGATCTCTATTTCATCGGGATTGGAGTCACGCAGCGATGGCTCCCGATTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGG:1 + chrX 8051430 5' + Dm88 179 1 66.34 ATATCCTATATGCCCGCCATTTAGACTGCTGTCTCAAGCTTTTCCTAGGAAGGAATTTTCCACATGTTACATACCTTAAAAACAACATACCTTGGCATTTA:1 + chr2R 4008942 5' - transib2 279 1 68.32 AAAATAAACAAAATGCCGCTGACAGACAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGC:1 - chr3R 21863351 5' + Quasimodo 6997 2 74.00 CTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTTCTACGCA:1 - chr4 184061 5' + 1360 134 1 65.35 TTCAAGATCGTTTTGCGGCCATGTTGCTACTGTATGTTTCACTCTCCCTCTCTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGCTTACTTTCTCCTCTACGTCTTTTGGCT:1 - chr2R 20907482 5' - TAHRE 295 1 52.48 AGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:2 - chr2R 14675608 5' + roo 8701 2 65.35 CGGAAAATACGATCTTTCATTAAATAGGAAGAAACAAAAATTCCTAAGAGATCAAAATAATTTCAAGAAATATATCCAACCGAAATAAAGTTATGTTATCT:2 + chr3L 2818425 5' + Chouto 149 1 64.36 GGAGATCTTTGACTTGGTCGAGGAGGTAAACCGCAACTTCTACGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAAT:1 - chrX 19179575 5' + HMS-Beagle 6672 1 58.42 TTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3R 7522315 5' + blood 7054 2 67.35 TATTCNCACAACCCTTTCGCCCATTTTTTTTTGTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCC:1 - chrX 8501425 5' - Doc3-element 123 1 76.24 TAATGTTTTTAATTTTTCCGTATCATTGCCTCATTAATTTTTCAGACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTAATTTTTGAA:1 + chr3L 18342263 5' - 1360 380 1 79.21 TTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACGA:1 - chr2L 17784673 5' - gypsy10 5930 2 74.26 GCCATGCGAGTCCTCCGCCTGTTGCTCGCTGCTCCGCCAGGACGAAGATACCTGCCTCCAGCTGGGTGCCTTCCTCATCTGCTCATATATGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 22761631 5' + Circe 422 1 68.32 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 - chr2L 17599966 5' + copia 49 2 78.22 CATCGCCAGTGTCCCTCGATGGCCATCAGCAGATGTTTGGGGCGTGGCCATATTCGAACTCATTACCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr2R 17972093 5' - 412 484 2 67.00 TTTTTGTTGGATGGCGCACGTTTGTTATTCGCTATACTTTACGGATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGGTAACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCG:1 - chr3L 25304036 5' + Cr1a 221 1 55.56 TATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAGATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGC:1 + chr3R 19449293 5' - roo 8615 1 55.45 GCAGGTAGGGGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAAT:1 + chr3R 12047403 5' - Stalker2 7629 2 54.46 GTGTGNGTTTGTAAATTGATTTTATTAGTTTTTCGTTGTTGTTGTGTGCGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAA:1 + chr2R 23580972 5' + P-element 128 1 46.53 CGATAGATAAATACTAACTGAAAAGTATAGAAAAAGAAGGAGAAAAACGCTGACAGTTTACTGGATCACTCGTGAATTCCGAAACGACACCGTGACGCTCA:1 - chr3L 18095274 5' - Rt1a 129 1 61.39 TTAAAATTACTAGTATTCAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 + chr2R 9316952 5' + opus 23 2 60.40 CAACAGAGCGCTGTTACGTCCAACAGGCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 19268927 5' - P-element 2841 1 27.00 TTTCTTGCATAACACTTTGTGAAGCAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 19551951 5' - roo 410 1 80.20 CAAATAACCTCAGCAAATAAAGTATCAAATGATAAGTCAATGATACAAAATGTTAGCTTTCAAATGCTTTACACGCTGTTAATATTAATTTTTAATTCATA:1 - chrX 6901955 5' + Tc3 264 1 70.30 ATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 + chr2R 4547749 5' - HMS-Beagle 7022 2 59.41 ATAAGAATTAATGCGTATTTGTGGTTTCGACTAAGTTTCGTTGTATGTGCGTTCCATTATGATTCTGATTATGATTATGAATTTGTATTTGAATTTGAATT:1 + chr3L 10577128 5' - Rt1a 310 2 67.33 TGTTTAGAAAGCGGCTTGTGTAGCTGCAAAAATGTTGATTCGGTTCGGTTTTTGGTTTTTGCTTTGATCGTGATTTTTGTGTTTTTGTTTCTTATGACACA:1 - 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chr3R 3706794 5' + G7 35 1 55.45 CTCCATTTAAGCAAATAAATTAACGATTGAAATTAATGCGCGTCCATAATCAAAAACAACGCGTATTTCTCGTTCGTTTCTACGGAAACGCTCAAGCCCTT:1 + chr3R 11023399 5' + Doc4-element 89 1 58.42 AATTCCGCTAATTAAACTAGTCGTCTCGGTTAACTAACGCCCGGAAAATTGTGGCTGCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGT:1 + chr2R 8156493 5' + Doc2-element 352 1 57.43 ACGCAATGGAAATTCCCAGGGAAATGGCCAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chrX 2776148 5' - 297 6935 2 68.32 TACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTG:1 + chr2R 5582162 5' + Cr1a 436 1 72.28 GAGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGG:1 - chr2R 1949151 5' - Cr1a 4419 1 79.21 CTGGGGGAAAAAATGAAATTATAAGATTAAAGATTGTTATGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 - chr3R 8458288 5' - HMS-Beagle 213 2 63.00 TTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAATTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAATCG:1 + chrX 992043 5' + hobo 52 1 76.53 CGAATCTTAACGCTTCTCATGTATACTGATCCAGATACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACC:1 + chr3R 6616375 5' + I-element 4965 1 64.36 ATTATCTGCACTTTAAAATGTACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATT:1 + chrX 6379153 5' - hopper 1366 1 78.22 AATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:2 + chr3R 19132285 5' + Ivk 45 1 71.29 GTGAGGTAGAGAAGAAAAGACAATGAACCCGAAGGACACCACTGAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCAACAGAAGCCCCG:1 - chr2R 19050768 5' + F-element 392 1 56.44 TTCGGCTGAACTTTTTGCCTCTCTGCAGCTTCGTTTGCCGGCATTAACACGTTTTTCGAGAGGGGTCTCTCTCGCTTTCTCACTCTCTCTCTCTCGCTCTT:1 - chr2R 12523287 5' + Cr1a 289 1 53.47 ATTTTATAAGCTTATATATCTTACTTGGCATATATTTTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATT:1 - chrX 16726569 5' - FB 31 1 63.37 GGATGGTGGATATGATGGATGTCTTGAGATACCATTGATCCATACAAGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chr2R 16980461 5' - copia 250 1 73.27 TTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 14612079 5' - roo 9019 2 74.26 GAAGTTGAGTTAGGAAAACACCGACACGAGCGCCACAGAAATCGCCTAGTCAAGGCACTATCCAGAGCTCGCCCACCAAGAAGGCTGCACAGGAGGCAGCC:1 - chr3L 23434659 5' + BS3 1554 1 63.37 AAACAAACCATTATTCGACAAGATTCTTAGATCATAAAAACATTTTACTCTAAAAAATTCCCCAAGAGGGGTAACTTTCAGATCTCTTTCG:1 - chr3R 5829957 5' - G5 4509 1 61.54 TGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGC:1 - chr2R 4483252 5' + Ivk 49 1 69.31 GTCGACGCCGACTGCGGCGCTGGCAGCGGATCGGCAAAAGTCAACGGCAACAACAAGTCAAAAAAAAAAGAAGAAAAAA:1 - chr3R 16034489 5' + R2-element 3584 2 74.68 AAGAAAGTTAACTTTTTGGGGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCAT:1 - chr2R 4214715 5' + rover 114 2 79.21 GATTTGTATGTGATGCAGACGGAGTTCTCGCTGTACACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAA:1 + chr2R 8727368 5' - flea 4824 1 65.35 CCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTATCTTTGTATG:1 + chrX 15089064 5' + gypsy 7017 2 55.45 TCAGCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTT:1 + chrX 15089058 5' + gypsy 24 2 55.45 TTTTCGCCTTGGCGTATGCTTTGTGTTTGAACATAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAA:1 - chr2L 22084565 5' + copia 12 2 67.33 CGATGAGAGTGATCAACTCTAAAACAAATTTACATTGTCGCTTGCAATTTGCAACATGAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 14612016 5' + roo 8681 2 64.36 AGTTGAAGTAAAAACCATTATATTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2R 17261596 5' + pogo 50 1 78.22 CATCATTTTGGCAAATGCACCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATT:1 + chr2R 15477253 5' + roo 396 1 79.21 AGTGGGCGTTTATCGGTAAACTTGGTTCCTGCGAAAAACCCACGAATCATCGAAGACATGTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTA:1 - chrX 1173555 5' - hobo 2663 1 67.33 CGTGGAGGTCGCGTTTCGATATTCGAATTGGCCATACAATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACC:1 + chrX 17941435 5' + F-element 4344 1 63.83 TAACCGATTGGAACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTA:1 - chr3L 16973446 5' + S-element 34 2 64.36 TCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chr3R 7168561 5' + flea 26 2 56.44 AAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:2 - chr2L 7488921 5' - roo 9035 1 67.33 TTCTTTTTTTTTTTGAGTTTCTTTTG:1 - chrX 11002930 5' - gypsy2 423 1 84.62 TTACTCAGCCGAATGTCGGCACTGAAAGCGAAAAACCATGCACCAATCAAGAAATATTATTGGCTTATAGGAAGAAGATCAAAGTTACCAACTTCGTCCAA:1 - chr3R 19418340 5' + G7 802 1 54.46 TGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGACGGTGAGTGAGTGTGTGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTGGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACACTGG:1 + chr3L 11247423 5' - hobo 2908 1 52.48 TGGGCGGTGCACTTAAAAAACTGCCAGCATTTTTGAATATTTAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTC:1 - chr2R 20952624 5' + rover 6950 1 70.30 TTATTAAAGGTCATGGACATCCTTGAACCGATTGTGCAACATGCGTGTCTGAGTTTCACAAACTGAGGAAAAATTCTAGAAAAATAAATTAAACTCTTTAC:1 + chr3R 22774200 5' - Tc3 374 1 85.15 TCTTGGGTTCGTGGGCCTTATAGGTGAGGTGAGGTGTGTTTCCTCACTGATTTTCTGTTTTTATTTTTTTTTTACTGTTTTTTTCTGTGTTTTTTTTT:1 - chr2R 24163541 5' + transib1 7 3 89.80 ACTGACACCTTGCTCGTCCACGTATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3R 25097838 5' - P-element 2857 1 48.00 TCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr2L 19018953 5' + hobo 37 1 63.37 CAAACAAAAAGCGGTGCAGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr2L 8565556 5' + blood 2 2 83.17 GGCGCCAAAAAGTTTGTGTTATTCTTATTCGGTGCCTTAATGAGCATTTATGCTTAACTTAACTTGTTTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCA:1 + chr3L 18710670 5' + jockey 4969 1 65.35 ACACATGAGAATGCTACTTATGTTCGAAATCGAAAGACAAAAGTATCGATTTTAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAAT:1 + chr2L 8170569 5' + Idefix 7145 2 73.27 TCGTTGTTGGAATATGATAATGCTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr2L 7850083 5' + 412 7105 2 77.23 ATAAGGTGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 13508739 5' - roo 358 2 76.24 CGAAAGCAAACTTTAAACAAGCAAGTTACGATGCAACAAAACGATCCGGACAGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 10147819 5' + roo 23 2 56.44 CAATAAAAAGGTGGGCGGCTCTCTTGTTTAAAACACGTTCTTCGTAGAGCAAAGAGGTATACAAGGTTCGTTGATAAGTATGTAACAGGTACAAGGAAGCG:1 - chr3L 27156076 5' + INE-1 30 1 71.29 AATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chr3R 15151298 5' + jockey 4718 1 63.37 TTCAATGAAAACAATAACAAACAGGCAAAGGATCAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGC:1 - chr3R 30761777 5' + I-element 5000 1 66.34 CTAAGTAACAAGGTGCCCGTTGAAAAGTCCAAGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCG:1 - chr3R 6608853 5' + I-element 12 1 68.32 TGTGTGAGCGAGGAAAACCGGTGCACCTGTATTCGTGATGTGCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTTGTATGTGTATTAGTATGTAGGCATGTG:1 + chrX 8361949 5' - Idefix 32 2 70.30 CTGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGAT:1 + chrX 22077200 5' - gtwin 7358 2 54.46 ATTCGATAACGATAACGAATTTGTATTTACTTAAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3R 26530871 5' - blood 336 2 64.65 AAGAGCGTTTACCCCACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:2 - chr3R 10277287 5' + Doc 42 1 58.42 GCGAAGTCAGAGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 2799718 5' + Tirant 12 2 69.31 AAGTGGATCGGGACGGTGGATCTTAAGTGTTCAGATGTAAACAAATATTCTAATTACCAGCCGTACGCAAAATTTATTTTGTGATGATATGTACATAGATT:1 + chr2L 2998498 5' - 1360 350 1 69.31 ACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 9383526 5' - P-element 2838 1 30.69 CAAGGGCATTGAATGCGCTTTAATATAAAGTAACTAACTTCATAATGGCGAGCTTTGAACTTTTCGCCGTTGGGTAGTGTGTCAATATGTGTGTGTGTGTT:1 - chrX 21264840 5' - accord 7034 2 55.45 AAGCCCAAGGTTTTTTTTTTGGTAGACTGAAGTTACAAATCGTATTAGTTAGAGACGGCCCTATGATTTCTTGGAGAATCTTTGCGCTTCAGTCGGCTCTG:1 - chr3L 10765358 5' - Doc2-element 4609 1 56.44 CATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACATATAAG:1 - chr3R 16400234 5' + blood 20 2 59.41 GGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:1 + chr3R 19132288 5' + Ivk 43 1 72.92 AGCATTTCCATTGTCCGTTTTTGTCGCCAGCTGGCTAACCCGATAAATAACCAAACTAAAAGTAATCACCCCTATTAATTTTATTCAGCAAATACGTGGTC:1 - chr4 1270129 5' - Tc1 226 1 68.32 AACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTT:2 - chr2L 2074787 5' - roo 389 2 62.38 TAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATCTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chrX 10827433 5' - roo 356 2 78.22 GTCGTATCTGCAGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCA:2 - chr2R 17345974 5' + jockey 6 1 80.20 GACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTAT:1 + chr3R 12047438 5' - Stalker2 346 2 76.24 AAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTATAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2R 20739443 5' + roo 8697 2 59.00 GGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chrX 17968371 5' + Tirant 42 2 69.31 CTACCGGTATAGTAAACATGACAGTTATTGCATTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCG:1 - chr2R 14296384 5' - R2-element 3330 1 72.28 TGCCTGTAAATTTGTTAGCCTGCCTGCCACCGGCATTGACAGTGCCTAAAAAGGGATGAGTGAGAAAAACACTTGTGGGAATACCGTTAAACACATGGG:1 + chr2L 15077759 5' + hobo 230 1 59.60 AAGATAGACGCATTTCTTTACCTTTTAATGTTAACATTATTTGAATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2L 19481250 5' + roo 8666 2 76.24 TGGAGCTGGATCTGAAATAGAGATTACGGCAAAGTGTTTTAGTAAATTGAATGTGGATAAGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGGACAGTGGTCTGATTTCA:1 - chr3L 14535956 5' + Cr1a 406 1 67.00 TTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACGGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2L 17722794 5' + blood 7066 2 76.24 AAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:2 + chr2L 2078454 5' + I-element 47 1 75.25 AGAGACGAACTTGAAGTGAACTTTTTGTGTAAGTGTTTGGCCTTGTGTTAGTGAGTGTCTGAGTGTGTGCCGGTATGCATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 5543799 5' - Quasimodo 39 2 67.02 AAACGGCACCAGCAGCGGCGGCAGCGTCGGAAAATGGGAAATGCCAGAGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCCAATTCTGGTGACAA:1 - chrX 8826793 5' + Quasimodo 133 2 56.00 AAGACTATTTGCACCTGCTGAAGGAAGAGAAGCGCAAGGAACGTGACCTAAAGGAACGTGAACGACATCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATC:1 + chr3R 4487087 5' - Tc1-2 171 1 70.30 GGCATTTCCGTTTTGTGTTGCAAAGTGCAAATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chr2R 17626579 5' - mdg1 409 2 65.35 CTGCACCATGTGCTGCATGTTCAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 10568119 5' + R2-element 3582 2 80.00 GGGCAAAGTGGTGAAAATTCAACCAGCCATAGAGCATTAGATCCTACTGGCATTAATATTTAATATAGGTTTTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTG:1 + chr3L 10245499 5' + Cr1a 4334 1 65.35 TTTTTTTAAATACATAATTACTATATACATAAATACATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 - chrX 12585695 5' - copia 214 2 71.29 TCAGTTGAATTTAATCCGCTGCCAATAAAGTAATTCCAACAAAAAAAAATGTGCTTACCAAAAAATCGGGCGACAAGAATACAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 13548678 5' + G2 3075 1 56.44 ATCTAGGCCGTTTTCGAATTAAGAATTGTATAATGTATTGTATTGTATAATTTTATTGTATAATTGTACCAAGGTGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGAC:1 + chr3L 19462075 5' - roo 407 1 77.23 AACACTTTTGGGCTGAGCGCGGGTTCTGGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - 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S-element 1694 1 57.43 TTTATGATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3L 2019667 5' + 412 7096 2 68.32 TGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr2R 7887245 5' + jockey 62 1 73.27 TGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:2 - chr3R 16400215 5' + blood 7050 2 63.37 TATTGATAATTCTCTTTTATCCTTTTTTATATAGCACGCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGC:1 + chr3R 1132513 5' + I-element 364 1 62.38 ACATTTGCCACGATGCCATGACGAGAGTTGACTGTCCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAA:1 + chr2L 7297869 5' - Doc 295 1 64.36 GGAGANCGTGTTAAAGAAATTAATTAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCA:1 + chr3R 20140634 5' - Burdock 6282 2 81.19 ATGCTGACAGTTGGCCATTGATTTATTAGCCGTCTTTGGCATTTTCATTCACTGTCTGCAATGCCAATTTTGTGCAGATGGCTTTGAAGTCGGCAATGCTC:1 - chr3L 18339741 5' - 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roo 397 1 67.33 GTGCTTGCCAGTGCGTGCCACTCAATCAACTCTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATA:1 + chr3R 28958585 5' + F-element 4428 1 68.32 AGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2R 17345963 5' + jockey 17 1 69.31 TTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTA:1 - chr2L 22224571 5' - Rt1c 5408 1 48.51 ATTTGCCGACACATGCCATTCCTGCGCTCCACCTATCCCAGTGGTAAGTGTTTCGATCAATCTCTTTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTATCAAGTTTT:1 + chrX 14239563 5' + Doc3-element 460 1 65.35 CTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chr2R 7887249 5' + jockey 58 1 69.31 GAAGCNTGCACTTTATTCTAATTCCTATGAACGTTTCAACTTATATATATATTATATTTTTATTTTGTTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3R 13992770 5' + roo 6 2 70.30 AAAGTATATATCAAAGATGGGCTTACCAAATTGGCATCCTTTAAAATATATTTCCACCATGGATTACTAAATATATGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCG:1 + chr3R 10240059 5' + invader4 2758 1 81.19 ATATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTC:1 - 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chr3R 18102304 5' + Doc 4690 1 81.19 GAAATTAAAAAAAAATGTAACAAGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:1 + chr2L 11775348 5' + Ivk 31 1 53.47 ATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTTTTATATTAGAAGTTTTTAAAAGACGAGGTTTATTTGTCGTTACAGTATTCAGCTTGCGACGTG:1 + chr2R 5531192 5' + 1360 415 1 74.26 CCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAGTTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr3L 18501024 5' - hobo 2917 1 52.00 ATGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2R 7861724 5' + roo 41 2 72.28 AGGGACAACTGGGGTCGGGTTGAAGAGGGGCGGAGGTATGGGAGTGGGCAAACCGCGAACACAATGACACCGGTGTTTCGCTGGCAACAAATTCTCATGCT:1 - chr3R 31813695 5' + Gypsy12A_LTR 2003 1 55.45 TCAACATTTTGGCAACTGTCAAAGCAGGAGATTCGTGGCTTTTATTTTTTTAATAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAA:1 + chr3R 30771640 5' - Ivk 244 1 66.34 CTAGGGAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 - chr2L 15947458 5' - Transpac 5201 2 50.50 ATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 + chr2L 13334030 5' - flea 4975 2 72.73 TTAAACTGCCTGTCCGCCTGGTTACAGAATTCAAATGTGTGCTGATCAATTCCATATTGTAACCGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCAAAAATAA:1 + chr2R 7318334 5' + G5 4814 1 51.49 AAACATACACTGGGGGAAAAAATGAAATTATAAGATTAAAGATTGTTATGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 - chr3R 8458297 5' - HMS-Beagle 7018 2 55.00 CGATCGCTCAGTTGGAAATGAGAATGAGTAATGCTCCAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2L 3632202 5' - P-element 2848 1 40.59 AAAAAATAAGTAAAACGAGTTGAATGCCTTAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAA:1 + chr2R 8677856 5' + accord 7068 2 70.00 CGGTCAGTGGGGTCGGGAAATGCAGGCCCAAAGCAAACGGTATCGATTTGAATGGCACCTCGGAAAGGGAGTTGCATTAGTCCAGTTTCCGACTGCGCCAG:1 + chr3L 15274260 5' - gypsy5 429 1 71.29 CCAGTNCTAGCGTTTTAAGTTGAAATTGAATTTGCATTTACCAGAATAAAGAGCGGCAGCTTGTCAACTTCGACTAAGCGGCGTAAAACATATTTTTATTA:1 - chr3L 18394104 5' + Gypsy6A_LTR 223 1 82.18 CTTGTTGGGTACCCACTCCACTTCCTTCTCCAGCTTTTATAGAACAGACAGACATGGCCAGATCGACTCGGCCATATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAT:1 + chr3R 4241739 5' + INE-1 143 1 72.28 TCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 5531196 5' + 1360 65 1 60.40 AAAAGCGAGACAAATGGGGCAAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATG:1 + chr3L 10082070 5' - rover 6971 2 75.25 TTTACAATCGAAGGCCACAATTGAACATGCAAATCACGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr2R 10774097 5' + copia 4911 2 66.34 AATCCAAAAGCTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 + chr2R 694087 5' - flea 4999 2 65.35 GAACTGACAATATAGAGTGTCCCGGGGTGAAGTGCCTGCTTCAGAAGACGGGCTACTTCATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTTAGTTTCAAAACTCATC:1 - chr2L 4842192 5' + gypsy4 6778 2 63.37 CTGTTTTTCTCTATTGCACAAAAACATGTAGATATATAATTATTCATAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 6467257 5' + roo 27 2 57.43 AAAAAACGTACAAGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chrY 536721 5' + Doc 23 1 50.50 AGGAGTATAAATTTTGCAACATTATGTGTGAATATTTAATACACTTGCTTAAGGATGTGGGCGTACTTGGACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTA:1 - chr2L 10835700 5' + Tabor 7180 2 70.30 TTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chrX 13546656 5' + roo 8716 2 82.18 TTTTATCATTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTAAACA:1 + chr3L 17048201 5' - TART-B 10632 1 74.36 GCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCA:1 + chr3L 25232769 5' - accord2 7598 2 54.46 ATTTCNCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 + chr2R 13078740 5' + jockey 4686 1 75.25 ATTCGCGAATTGTCACCTTTATGGCATTTTTACTGTTTTGACTGGAAGTGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAAT:1 - chrX 6373675 5' + X-element 39 1 50.50 GGGTTGTTTCTTCACCTATATACATTTTTACAAATTATCAGTGGGATAAGTACTTGGACAAATTATGTATTTAAATGTTATAAATTGAAA:1 + chr3R 15774843 5' - Tc1-2 1409 1 77.78 AGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2L 12324044 5' - roo 9028 1 70.30 CTAAANGTGTGCTACACATAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2L 1625728 5' + hobo 16 1 62.38 TAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:2 + chr3R 7388334 5' + HMS-Beagle 6821 2 54.46 CAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACG:1 + chrX 15089077 5' + gypsy 43 2 70.30 AAAAGGGAATCCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chr3L 18501034 5' - hobo 2926 1 63.37 ACACAAAGCTTCTAAATATATACATATGTATATGTCGCTGATAATTTAAATATAACGACATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTACTTC:1 - chr2L 22173270 5' + Cr1a 4361 1 63.37 CAGGAAGAGAGGAACAAAATCATATGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCAT:1 + chr3R 19749555 5' - Doc 286 1 75.25 GGCTGNTTGGCAGAACACCTACATTCCCAAAAGGTTGGACGAGGTATGTTTGCGCCGTGATTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCA:1 - chr3L 11646882 5' - Cr1a 71 1 66.00 CGGTAATTTGCCGAAGATTTTGTCTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTCCCTTACAGATTTTTATGTT:1 + chr3L 22539537 5' + Cr1a 4181 1 79.21 AATAATTGGGTAGATCGTGTTTAGAAAGGCGTTCAGTATTTGCTTGCGTGTGTGAATAAAAACAAGAGACGAGAA:1 + chr3R 1720878 5' - 1360 3238 1 49.33 GAACGTGCTGTCCGGTAGTGGGACGTATTTGTGCTCCTCCGTTTATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTACCTA:1 - chr2R 4132444 5' + Doc2-element 4452 1 56.44 TAACTTAACTTAACTTAACTTAAATAATAAGAATCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:3 + chr2R 7418829 5' + Doc 48 1 67.33 GGTTTATAAAAAAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr2L 21272120 5' + copia 44 2 79.21 CCGCTTACCTCGTCTTCTTCTTCTTGATGCCATTGGGATCGCCCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGA:1 - chr3R 18237406 5' - opus 261 2 58.42 GCTTTNTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - chr2R 2044233 5' - Tabor 445 2 73.27 TTTCGGGTGCTGTCCTAGGCGGTGTCGCCTCTCCTTCCATCTGATTTTTTTTTTTAATTTTTCGAGCGCTTTATTTATTAAAAATATTTTATTT:1 - chr2L 16631754 5' + 1360 3091 1 62.77 CAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr3R 28645834 5' + F-element 54 1 67.33 TCGAGCAGAGCGATGAGGTCACCGAAGCGGGTAAAAATACAAACAAATTAAACGAATAATCGGTCTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATT:1 + chr2R 20504120 5' - R2-element 3428 1 70.30 ATACAAATGTAAAATTATATAAAATATGTACAAAATGTAAGAACACCATGTACAGGTAGCTGTACCCAAAGACA:1 + chr2R 15823105 5' + Stalker2 304 2 71.62 AATGCCATATAAATATAGTATATATCGACATTTATTGTTAACATCTTTACCCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATG:1 + chr2R 21293271 5' + Cr1a 250 1 55.45 TGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 13546701 5' - roo 9036 1 61.39 TTTTTAACATGCTCTTTAATTTTTTTTTTATTTAAGTCTTGATTGCTTGCCATTTACACAAGCTTGCATGGTGATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAA:1 - chr3L 23529869 5' - Q-element 172 2 64.36 GAGAACAGGAGATGAGTTCGTGAAATGTGAAATTCTGTACCATCAATACAATATTAATATATTTGGCATTATCAAATAATAATAATAAATAATTATTTAAT:1 - chrX 18361200 5' - invader4 2638 1 72.28 TTTAATGAAATTATTATAATGACCACTTTCACAACACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAG:1 - chr2L 17139454 5' + Rt1b 5006 1 65.66 GTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2R 1365310 5' + jockey 23 1 61.22 GGATTAGTAAGTAAACCCAACATCTGGCAAAAACCAAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTG:1 - chrX 2108002 5' + F-element 4216 1 79.21 TGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATG:1 - chr3R 4834305 5' + mdg1 7089 2 73.27 TCTATAATAAAATAAAAACGCCAGCCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3R 6273612 5' + blood 7014 2 77.23 GCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 9871005 5' - roo 9019 2 78.22 CTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3R 26321672 5' + blood 7056 2 71.29 AACACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 + chr2L 16674843 5' - roo 9053 2 65.35 TAGTTGCTTAATATGACCTCCTCCTCCTTCTTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:1 - chr3L 16641790 5' + jockey 4819 1 69.31 CTGGAATCTACATCCTGAATGCTAAATACACTGAGATCTCAACTTTCAAACAAACGGACAGAATAGGTACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATA:1 + chr3L 21490163 5' - Cr1a 4318 1 71.29 TAAATTTCAATTATGGGTATAAAATATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCC:1 - chr2L 23295926 5' - micropia 5261 2 71.26 ACTTGTGGAAAATTCTTAAAGCTTCTCGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGG:1 + chr2L 11364618 5' + Rt1b 4997 1 73.27 CCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGACG:1 - chr2L 17444084 5' + G2 2796 1 51.49 ATAAATAAACAGATTTGTTCAACGACTAATTGAAGCTCAAATAAATCAAAATCTAACTAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAG:1 + chr3R 8337429 5' + invader2 4787 1 69.23 AAATGCCACCAAATTCCGCTGAGCACTGAGCACTGAAAGTCGAGTTCCTGCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3R 5686124 5' + P-element 25 1 54.46 TGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 - chr3R 12047499 5' + Stalker2 7263 2 64.36 GCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr2L 5646885 5' + jockey 4716 1 64.36 TAGTATAAAACAAGTCGAAAATGGTAATTTACTTAAATATAAGGCAATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAGA:1 - chr3L 24308439 5' + 1360 491 1 65.35 GTTCTTGCGTTAATTTGATTAAGCTTTGTTTCAATTTTGTGTCCTTTTAATTAATGATGGCCTAAATGATGAAGGACGCTGTTGGAATATACTATTCAACC:1 - chr2R 16980587 5' + copia 4870 2 78.22 CGTTTACGACACCAAATGTCACAAGAGAACTACTTTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2L 20824673 5' + pogo 38 1 65.35 AAAGCNTTGGTGGCCGGACGGAATCTCCGAGAGCCGGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCGGG:1 + chrX 5991848 5' - Chimpo 216 1 64.36 ATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:2 - chr3L 13477494 5' + P-element 49 1 29.70 TGGGTATTAGAATGGGTATGGGGATGGGCATTCAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTAATGCAACTGAGAGCC:1 + chr3R 20192107 5' - accord2 7603 2 63.37 CTGGGAGTAGTAGTAGTAGGAATATTTGCAATTCGGATTATTATTTGTTGGAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTT:1 + chrX 2663270 5' - F-element 300 1 56.44 CTTATAACAAACGCGGATCGTGTCAGTTAACCTGTTCACCGCGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAACAAATTATGCGCTTAAGTGGAAGTAAAAATGTA:1 - chrX 22093368 5' - rover 7042 2 57.43 ATAACAAACAATTATGCGGGCATTGGCCAAAAGGGATTGCACAAGTCCACATGGAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 - chrX 17042731 5' - copia 234 1 55.45 CTTACNAAATTGGCATCCTTTAAAATATATTTCCACCATGGATTACTAAATATATGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGT:1 + chr3R 10240080 5' + invader4 2779 2 59.41 GAGCGGGCACGGAGCAAACAAAAGTGGGGAACGAAGCTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2L 19482544 5' - roo 337 2 62.38 GAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3L 9383508 5' - P-element 2857 1 49.00 ATAGACGCATTTCTTTACCTTTTAATGTTAACATTATTTGAATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:2 + chr2L 19481253 5' + roo 8669 2 73.27 AAGATTGCCATATTGGTTGGAAATGCCTGACCTGATCGGCAGACATTATATTCAGCATTTGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGACGGTAGCAGG:1 - chr3L 17898243 5' - GATE 8052 1 61.39 AGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAA:2 + chr2L 6999277 5' + Ivk 53 1 75.25 TCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAA:1 + chr2L 6388278 5' - copia 240 1 70.30 ATTAACGAATGTATGGTGGGAAATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3R 24081642 5' + 297 1 2 76.24 TCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 - chr3R 7168624 5' - flea 4974 2 76.29 AAACAAGATTTAAAAACAGTGTTAAAGGAATTTCACGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATTAATACCTCCTAAACTATTGGA:1 - chr2R 2311291 5' + hopper 38 1 78.22 CTCAGTCCGCAGAATTCCCGCATGTCTCTGTCTATCTCTTTAGCTGGGTTTCATTGCCTGGTTTATTGTTGTTCTTGCTGTTTTAATTTTTGTAAACATGT:1 - chr3R 17027302 5' + 1731 4275 1 65.35 AACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 + chr3L 19951204 5' + Ivk 35 1 61.00 AAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr2R 13650126 5' - mdg1 7408 2 75.25 AGCAGGCTCTGGGAAGACTCTGTTTAGTGTCCTTGCTGTGCGTATAAGCAACATTCATTTATTTATATACACCGCCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTAC:1 - chr2L 12870696 5' + ZAM 35 2 68.32 CGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAAATTTATGTAGTACACACTAGAAAATATTTGTAAAGTTCATACGAACAGACGGACATGG:1 - chr2R 4618504 5' - INE-1 121 1 76.24 CAGTTGTGGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr2L 7800051 5' - P-element 2859 1 51.49 TAGGTGGTTTCAGTCTCTTCCTTTTAATGGTTACTACAATATTTCCATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATA:1 + chr3L 2041868 5' + Stalker2 125 2 55.45 ACGAGGGGGACGGAGAGTCAGGGGGATTGGCGGGGGGGCACAAGATGCAAAAAACATTATTATGAAATAAAAGTCAATAAATTTTTCTATATTTT:1 + chr3R 11017027 5' - transib4 2282 1 72.63 GTTCCAGTAAATCTTTCTCCGATGTCAATATTGCGCATACGCCACCGACAACGCCACGATGCACGAGTGTTTATTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGA:1 - chr3L 7205163 5' + Doc 305 1 75.25 GGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chr3R 27284017 5' + Max-element 8251 2 52.24 CAGACAGGCTTTCACCCAATCAGCTCGCTTTGTGGACGTGTCGGCAACAGGTCCTGGTCCTTGTCCACCTGACCCACCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCG:1 - chr3L 8610107 5' - opus 7281 2 75.25 GCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTTTTTATTATTATTGTTTTTTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr2L 20133066 5' - flea 228 2 54.46 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAA:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 169 2 55.45 CCAACNGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 2799687 5' + Tirant 43 2 70.30 TGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2L 18234152 5' + jockey 33 1 51.49 GGAACTGTTCCAAATAGCGCCCAAGAAGATGCTCGAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAA:1 + chrX 7080429 5' + transib2 2468 1 64.65 GTTAATAACGGCATCGACTTGGCTTGGCATAATTAAGCAACTCAAGATCTGCTGCAGGGAGTGCATTCGGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAAT:1 - chr3L 19696183 5' + F-element 4407 1 72.28 TGGGACTAAACGATGTCGAATGATGCAGCCGGCCAGCTGTTATATCTTCGTTTTCTTTCCGTTTTATAACCTGGCAAAAATTTTTATAACAGCAGACAACA:1 - chr3R 19114556 5' - Cr1a 449 1 62.38 CACCAGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGAAAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGT:1 - chr3R 9995427 5' + Max-element 8254 2 59.77 TTAATGGCTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACA:1 - chr2L 11703300 5' + Tabor 6873 2 55.45 GATTATGTCTCATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3R 26321693 5' + blood 7035 2 55.45 AATATATCTTTCGTTTTTATATATGTATATATAAAGATAGCCAAGCACTATAGTAATCGACTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGT:1 - chr3R 15598744 5' - Max-element 284 2 62.38 GGCCCGATTCCTTGCCAGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2R 16988273 5' - opus 7480 2 58.42 AGCGGGTGGGATGTGACTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 17843685 5' + roo 8719 2 80.20 ACGCAAGCCCACAAAGATATTTAAATGTGGATCGATTTGCCGGCGATGAGGAGTAAAAACAATAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 - chr2R 6858628 5' - 1360 3209 1 53.47 AAATACCTCATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTT:1 - chr3R 20137367 5' - Burdock 255 1 77.23 CCACANAGCCAAAACAAACATCGCGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGA:1 - chrX 15693557 5' + HMS-Beagle 121 2 77.23 TCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATA:1 - chr3L 18337715 5' + Juan 4049 1 54.46 CACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:1 - chr3R 11094558 5' + 3S18 42 2 66.67 GAAACTTCAGAACTGCCTTAATCTCCAGTTTAAGGTTTTGAAATGCGGTTTACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTCAAGCCCTTAACCAACAATC:1 - chr3R 12903272 5' + I-element 165 1 57.43 TTATATATTAATATATTTTACCTTTAAAAAATAAATAATAACGCATTTATCTTTAATAGTATAAGTTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATA:1 - chr2L 11336729 5' + Bica 389 2 58.42 AATCTTATTAATTATTAAACAGGAAAAGTAAAGATGAAATATCATCATCATATCATGATAACGATAAGTCTGTTGGATTATTATAATTATTATTAATACAA:1 - chr2L 13271066 5' - mdg1 48 2 45.54 AATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 15305617 5' - roo 398 1 68.32 AAAAGCGCAAAACGGGTACAAAATTGCAGCTGGCCTCAGCAGAAATTGTGAGAAGAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - chr2L 17380964 5' - BS 5048 1 60.40 TCTTAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:3 + chr3R 20878433 5' + 297 5 2 68.32 CGACCAGTGGCGTAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 - chr2R 21773632 5' + Max-element 15 2 59.41 TGTGCAATAAAAAATAAGTTAATTAATTGAGCGAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:1 - chrX 2649919 5' + Tirant 8110 2 78.22 AGTTGCTCGTCGACTGAGCGCCATCGCCATTTGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:2 - chr3L 13477536 5' + P-element 7 2 71.29 GCAAAAATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 14790667 5' - roo 396 1 66.00 ACCATCTATTATACATATTATAAACATAACTTATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTCAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTGACGGTA:1 + chr2L 5969759 5' + transib2 467 1 75.25 GCCGANTAACTGCACTATCAAGTTGAATGCATTAATTGCAGCGAAGGTGGCTGACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 - chr3L 4641145 5' + hobo 26 1 53.47 ACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2R 13295677 5' + Tirant 8159 2 75.25 TACATTGTCGCTTGCAATTTGCAACATGAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2L 14612046 5' + roo 8711 2 75.25 CTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr3R 4601394 5' - opus 7481 2 59.41 CAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCC:1 - chr2L 21403551 5' + G5 4404 1 51.49 AACTAGATGATAGACAATTTGGATGGTGAATTTAAATTTCAGTAGTTGAAGTATATGGAAGACTGTGAATTGCTTAATTTTTTTTATATATTTATTATTAG:1 + chr2L 11618486 5' - transib4 2574 1 54.46 CGACGGATGAGATTTTAGAAATATCTTTAAATAGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGA:1 + chrX 15879406 5' + Doc 238 1 67.33 ATACTTTGTTTCGATACTTAGTACGTTTTCAGTTATTCCCCTTACGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATA:1 - chr2R 16255014 5' + G2 3040 2 64.36 TTTACTTCAGTTTTTCTTTTTCTATGCCTCATGTAAATCACAACAAGAGAGGATGCTATAGTCGAGTTCTCCGACTATTAGATACCCGATACTCAACTAGT:1 - chrX 22633787 5' - INE-1 542 1 68.32 GTTTATGGCGCCATTAAGGAACAACGCCATGGCACCGAGCAAATGCAGAACTTGCAATGTTTGTGCTGAAAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2R 16475840 5' - 412 7542 2 66.34 GTGGAAAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTACCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 + chr2R 12492346 5' + hobo 10 1 65.35 ACGGTTTTCGACCACTTGTTTGACTGCTTTGGCTTCAGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr3L 11553490 5' + P-element 39 1 34.65 AATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chrX 17058215 5' + 297 4 2 65.91 ATTTAGCATCGACACTATTATCATACTTCTCCATGGTCTTAGGAGCATATGTTTATCCAAAGGTTATCCAATCCGGATTCCTGACCTTCGACGAGGGAATG:1 - chr4 514736 5' + GATE 8114 1 73.27 CCGCCCCACTGACTTTTCTTTGATGCGTTTGTATGGTCGTGCTGGTTTGTGTGTGTGTGCCTGTTTATGGGTGGAGTGTATTTCAATATCCGATTCTGAAA:1 - chr3R 28126066 5' - Bica 4547 1 79.21 CCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chr3R 6117294 5' - Tirant 8463 2 68.32 CACTCAAATATACGAGCATGAATTATTTGACAAGTACAACGTCAATGGTGTGTATGTATTGGGGTGTAATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATG:1 - chrX 5382819 5' - Idefix 32 2 60.00 CTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 + chr2L 17646192 5' + flea 4809 2 80.20 TCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACACATACACATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 + chr2L 21328149 5' + flea 4755 1 79.79 TGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3L 19377775 5' - roo 355 2 76.24 ATCGAATCGAATGGGCCTGTATAGCCCACAACCACCTCGGGCTCAGAGTCAAAGTCTATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGT:1 - chrX 13508625 5' + roo 442 1 68.69 AAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chr2L 16948726 5' + jockey 4705 1 56.44 AATGTCACAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr3L 10013669 5' + hopper 7 2 68.32 CTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 3817517 5' - roo 9044 1 58.42 TGTATTGTTACCAAAGAATTCTATTTAATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr2L 13136818 5' - roo 394 1 65.35 AAATANATAAAAATATATAAAAAGGGAACTAAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chrX 17057950 5' - 297 6941 2 73.40 TAAAATATAATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 15305609 5' - roo 406 1 76.24 TTTAAATTTCTTCTCATTTTATACCAGAACATCTAATGATATCCCAGAAAAATGATGAAATTTTGCGATCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTG:1 - chr3R 2552889 5' + INE-1 543 1 71.29 TGCCACAAAAAGCATTTCACACGCGCCACACCCGCGCACCCACAGTGGCAGCCAGAAAACCAGACCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGC:1 - chr3L 21914471 5' + R1A1-element 4937 1 62.38 AATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCG:1 + chr2R 4830331 5' + 1360 41 1 91.49 TATTTNATCATATCATATTCCCATCAAACATATCTTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGA:1 + chr3L 8717577 5' + opus 7470 2 66.34 TGCGAACATTTGATGATGCGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 - chr2R 14778529 5' - mdg1 411 2 68.32 TCTGAAAGTTATAGAAGTTTTCTTTAAAAGTTTATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr3L 2019637 5' + 412 13 2 64.36 AAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 - chr2R 4483256 5' + Ivk 45 1 65.35 TAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chrX 17058216 5' + 297 16 2 58.42 GCTTTAATACAATTTCCATGCGCTTGAGGAGATCAATAAGCAAATTAATTTTGTGCTGATGTTTACCGGACATAGGGCACCTAAGGGGCCATTGGAGCCAT:1 - chr3L 17268764 5' + Gypsy12A_LTR 1916 1 60.40 GTCTGGATCGGATTCCACCCCAACAATAACATGGATGGATAACAATAACAAGCGACGCTGAGCCAGCCCAGTAACGCATTTCGCTTTAGCGAAAGCGATGT:1 + chr3R 6473924 5' + gypsy10 108 2 62.38 GCATATTACTAATAATGTGCTACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chr3R 19346994 5' + blood 1 2 78.22 ATCAAAACAAAAAAAAAAATGCTCAGAACAATCACAAAAGC:1 - chrX 9994016 5' + Porto1 4345 1 87.80 AACTATTATTATTATTATTACTATTATTTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACATCCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAAGAA:1 + chr3R 11162683 5' - Copia1_DM 131 1 71.29 CGTTGGCCAACTGGACGCCACATTGCATCCACATATGTCCTTCCAGCCGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3L 13548868 5' - hobo 2915 1 56.44 GTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:2 + chr3L 7205553 5' + Doc 55 1 70.30 GGCCCTTGGGACTAATACTAATACTCTTCCAACATTAAAAGTACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCA:1 + chr2R 12082840 5' + mdg1 491 1 58.42 GAGAGTATGAGTGAAAATTACTTATCGTCAATGCATTAAAGCCCACAGCCACACATACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 - chr3L 11661817 5' + hopper 2 2 74.26 CAAGAAATTGTATCCATATTATATTTATTTAAATATTTTTGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chr2L 7850129 5' - 412 458 2 59.41 GAAGANCTTATTCGTATTTGTTTGAGCTAAAGCAATCCTTAAGCTGCAGAAAGAAGCGCTTCCGACTATATAAACTATATATATTCTTGATCAGGATCAAA:1 - chr3L 13596373 5' + INE-1 83 1 55.45 ATTTTGCACATTCATTGCTTATTCATTTAAAGAGTTCTATTCCATACGCCATATTGGTTTTGTTATCGCCTTGTGTATTGCTATTTTATTATGTAATTCTA:1 + chrX 19304208 5' - Porto1 4219 1 70.30 TGCTAAATCCTAACATGATTATTTTTCCATTAGTTAGCCTTGTTTAATGCATGTCTCGTCCTTGTCATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTG:1 - chr2L 20907785 5' - transib2 2493 1 69.31 CTTGTTTAGGGACCGCAGACTTATACCTTCGCCAACCAACTTAACCAAGAAGGGTTTTTTGTAAAGTTAAATAATCAGGACCTTGTTTAATTTGGCCAACA:1 - chr2R 3393391 5' - G3 421 1 49.50 GTGTAGAAATCTGCAAGAACAGCAACTAAAAAAAAGTAATCAAAAAACAAGCGCGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chr3R 32068126 5' - INE-1 553 1 57.45 GATCCATACAAGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 + chr2R 16980497 5' - copia 214 2 71.29 TACCCCGGTTATCTATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACAC:1 - chr2R 5019450 5' - rooA 359 2 56.44 TTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3R 25097888 5' + P-element 49 1 31.68 TTGACATTTTTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 8555941 5' + 412 18 2 60.40 ATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:2 + chr3L 8713095 5' - opus 457 2 78.22 GGGTGTGACAGGTTGTATGATCTCTTCCGTGACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 14675533 5' - roo 9051 2 59.41 TCATCGCTTTTGATATAATCCTAAAAAATCTTTGCATGATAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTACCAAAGACACTAGAAT:1 - chrX 15392059 5' - Tc3 317 2 62.38 GCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr3R 19446163 5' + 297 42 2 73.27 TGCTCAAATCACTTCTTTGCCAAATTATCCAACTAAAATAATTATTATTATTATTGTTGTTATTACTATTATTATTATTATTTTTATTATTATTATTATTG:1 - chr3R 28556153 5' - mdg1 36 4 53.47 ATTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAA:2 - chr2L 3440518 5' + Juan 17 1 66.34 AGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chrX 17968360 5' + Tirant 8138 2 58.42 GTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCT:2 + chrX 22077202 5' - gtwin 7356 2 56.44 CGTGTTGCATACTTTTGGGCAAAAGGGGCGGAGGTCATATAGACTATGCAGCTAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2L 3968985 5' + jockey 30 1 55.45 GTACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 12103772 5' - roo 9055 2 62.38 GCTGCCTTCTTTAAAACGCTTAGTCGTTTCGGGTGTCGTTTGGTCGGTCGCGATTTAAGCCTATTGAGCCGAGTCTTAGAGGCTGTTCCCCACACTTGGAT:1 - chr2R 2948953 5' - G5A 2440 1 61.39 GCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATGCACTTTGAAAAACAAAAAATATAAAAACACCATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3L 8395218 5' + pogo 9 1 62.38 ACGAGTACTTCGGTTACTTTAGCTTCAAATGCATCTTCTGTCTAGATGAACTTCGAGGGAAATGGCTGAATCACTT:1 - chrX 7865426 5' - Doc4-element 2415 1 75.00 AGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACCTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAAAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGT:1 + chr2R 10945341 5' - transib2 2776 1 69.31 TTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 16995123 5' + jockey 57 1 71.29 ATATATTGACTGGAAAAATGCGAAAGACTATAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATAT:1 + chrX 11681402 5' - Juan 4072 1 70.30 CTGACCTAGCAGTTCCGTCTGCACTCTCTGAGGAACACCTCAACGTAAACAACCAAGAA:1 + chr3R 2062280 5' + McClintock 6046 2 79.66 TTTGGTCAGAAATAGAGTATCGAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 - chr3R 31194518 5' + Transpac 50 2 78.22 TTAGAGAAGGTCACCAAAATTAATGTATGTCATATTTTATAGATATATCTCTGGGACTACGTAGATCGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAAGT:1 - chr3L 21531594 5' + INE-1 157 1 72.28 CGGGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3R 9551464 5' + P-element 55 1 24.75 CCAATGGGATGATCAACAAGCAAATATAAATACGTTGTAGACTAGATGGTTTTTCACTTTGCCGTGTTTCGTTCTTTTCGACAAACAGCAGTGCTTTGCGG:1 + chr2L 17083553 5' - Tc1 475 1 61.39 CAAGTCCACGAAGCGAAACGCTCTCCAAAGTTTTCCACAGCGCAAAAGGACGTACGTATGATGATAACTTCGATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTG:1 - chr3R 28100483 5' - 1360 370 1 76.24 CAAAGCTCGTAAATTATGGATGAAGCTATGGTATTTGTTTTTAACCACACGTCCACACACCACCCCCCATAATTCCGCATGAATTAAGACACTCTTCATTT:1 - chr3L 20535750 5' - Dm88 381 1 64.36 ATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3L 2019670 5' + 412 46 2 71.29 AAAAAATTTGAAATTAATTGCATTGGATTTTCCTCTTTTGTTTTCCCATTTTCTCTGTGCCATTTTCTCATTTCGCTTTTTTTGCAATAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 7355923 5' + Tc3 79 1 81.19 GGGTATTGAGTTTTAAATTTTCGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCATGCGGCTGCTTATTTACTAATATATATACA:1 + chr2L 5812533 5' - 1731 4420 1 78.22 TAGCCCTCTAGTTATCGCCGTTGTGATTGACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCC:1 - chrX 16452071 5' - transib2 2468 1 54.46 CGGCACAAGAGATCCCCTCTGCCGCCCGCCACTTTGAAATTATTCAAGTGGTCAGATGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGC:1 - chrX 7244560 5' - I-element 5059 1 63.37 ACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 + chr3R 15072571 5' + pogo 28 1 57.43 TACAATGGACTTTAAATTCCTGAAATTATTAAAATTTTTTTCTGTTT:1 - chrX 20979111 5' + Tc3 1544 1 48.94 ACATAGGTTTGAAATTTTTTTACTGTTGCCCAATTGTCTTGGCCTTGCCGTTTGAGTCGTCTCAGAGGTCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGACT:1 + chr3L 23796924 5' - Helena 1279 1 83.17 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCG:1 + chr3L 27396714 5' - gypsy6 370 4 56.44 ACACACTTTCACATTTACACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGAGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 + chr2L 19018923 5' + hobo 2 1 70.83 AATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATG:1 + chrX 15189246 5' + Doc3-element 275 1 57.43 AGTAGCCTTATCTGTTGACTCCGTTGACTCCTGTGCTTTCTGAGTTGAATTGGTTTCTGCCAAGGCCACTTGGATTGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACG:1 + chr3L 27413532 5' - Doc4-element 227 1 68.32 TATAACGAACTAAAGTTTAAGGATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGC:1 + chr3R 17321705 5' - Stalker2 378 2 53.47 CAGGCCGCCGAAAATGTCAGTGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3L 10143137 5' + 297 7 2 73.27 ACTCATGAAATGACGCATTACTCATACGCCCATTGAGAAACCGTTTGACCAGGGGAATCCAGACCGCAGATTCTGCATTAAATATATACATACATATATTT:1 - chr2R 24685621 5' - 1731 4409 1 70.30 TTTCATATTTATTATTGAATCGGAAAATGTAGATGAATTCTATTCATTACTAAATTATTGAAAATGCACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGT:1 + chr3R 11094482 5' - 3S18 331 2 67.33 GAATAAACGAAGAGTCAGTCGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTC:1 + chr3R 934471 5' - Doc 4478 1 80.20 CGTCATCGATGACATCTCGGATTCAGTGTCCCCGCGCCTGTCACTTCGTTGCTGCAGCGTAGAAGTATAGTATGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 - chr3R 18363350 5' + diver 6 2 55.45 TACCCTGCCTACCCTGTGTGGTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chrX 7665622 5' - flea 213 2 73.27 GAGAGAGCATGTCAGAGAAACCCAAACAATAGAATAGGCAATAGGCAATGCCCACATGTATGTTGAATATAGGCAATTTCCACATGTGCATATGTAATTTT:1 + chrX 6062893 5' + 1731 4360 2 79.21 ATCAGACGGGCATCCTCGTCCTCATCGCCAACCCATTCGCATCCCAAAGTCGCTGTCCTGGCCATTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGC:1 - chr3R 6614272 5' - I-element 334 1 74.26 AACAAGTCATTGTTTACAAACAAGAAAGAATAAACAAACTGACTACAGTATCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTA:1 - chr2R 2969874 5' + 297 169 2 58.00 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTAGAATAACTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCT:1 - chr2R 1982173 5' - 1360 85 1 61.39 AGCGTTGACACGAACCATTTCTACAAAATAAAAAATCGGAATGCTATCATCGCTTCCCAAATGTTTTAATGTTATTAATATGTTCTACATTTGATGCATCT:1 + chrX 11389428 5' - transib3 2493 1 58.42 GCATGCTATATATTTGGTAGAGAGAATTCTACAGTCGAGTT:1 + chr2L 10299309 5' - INE-1 575 1 90.24 AGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAGAATTAAGACTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2L 7488914 5' - roo 406 1 51.67 CGTCGCCTAGCCCACTGACACCTTGCTCGTCCACGTATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3R 25097825 5' - P-element 2870 1 61.00 CATTTTGTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTGTGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAA:1 - chr2L 6927433 5' - Stalker4 215 4 74.47 GAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGAATAA:1 + chr3R 7522320 5' + blood 7061 2 72.00 TTCCCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCCTTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 - chr3L 9907439 5' - jockey 4975 1 48.51 AATTACTAGGTGGAAAGTGCGCCAACTGTTCCGCTTGAAATCCAAATTCAAACTGATCGTGCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chr3R 11999315 5' + P-element 14 1 65.35 AGAATNAAATAAATAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATA:1 + chr4 300250 5' - Transib5 2767 1 63.37 CATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr3L 18501018 5' - hobo 2910 1 56.44 GGGTTAAAAGTCTTCTGTTTTCATTGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTC:1 - chr2L 11700454 5' - micropia 5241 2 76.24 GGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3R 23638180 5' + pogo 28 1 59.41 GTGTAAAGTGCACTTAAGCAGTCGAAAGGATTGCTTCCTGCTTTTCCCACTCCCGCCTGCCTATCTAAGGTATAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAG:1 - chr3L 18431832 5' - INE-1 577 1 62.24 ATCTTGTTTGCTTGTCGGCCTTTTTCTATTTACGCTGCAAACATGGAATATCTTTTAGAAGTTCCAACTCCGAAATAAATTAAACACTGAATAAATTCGGT:1 - chr3R 14850837 5' - McClintock 6295 2 61.39 TATACTAATGTATATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGTCAGAATGATCACACATGAACACGTATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3R 19450190 5' + roo 8681 2 90.00 AGCAAGTGGACCAAGCTGGGCGACAAGTGAAACTAAACTTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 + chr2R 18399077 5' + S-element 37 2 67.33 CTAAGATAATCTATAAAAAGCTTTTGGATCACAAATTTTGAATGCTATTTCTTTTTCCTTTTTTTTT:1 - chr2L 8433387 5' - Doc2-element 234 1 91.04 AGCATCCAGCATCCGAAATAAAGCGCAAAATAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATT:1 + chr3R 26296317 5' - 1360 3184 1 69.31 TTCTATTTACAAACTGCTAACATTCTCTTTAGGGATCACTTTATTCAATTGCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTC:1 + chr2L 7253832 5' - P-element 488 1 58.42 CGTTTTCGTTGCGCCGCCAAAGTTTTTTGATGTCTATAAATGATGGGGGCTTGCGGGGGAATCACCGAGATTGCCTGGCTTATTAAGCAATGAAATATAAA:1 + chr2L 9197393 5' + copia 240 1 62.38 AATAAATTTTATTGTGGTTAGTTTATGCGTGAACCAAACGGATACTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr3L 15100669 5' - pogo 2071 1 56.44 TTCTTTAAGGAAATCTATATCAAAAACTTAAGGTATAGAAAAACGGTGTATAAAATCAAAGTTAGTTATAGAATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chrX 15391907 5' + 1360 1 2 52.48 AGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chr3L 8713088 5' - opus 464 2 71.29 TACAAAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGG:1 - chr2L 12325073 5' - roo 193 2 57.43 CGAAAAAAAGGCAGGACAAGTAATAGAAGATGTTGAAAGAATAGGAAAGGGGTTTAAGATAAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCG:1 + chr2R 19044636 5' - Cr1a 4094 1 54.46 ATCAAAACAAAAAGGCCAAATTAATAAACGACTAGAGAGGGTGCCATTGTGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTA:1 - chr3L 18500809 5' + hobo 2469 1 54.46 CCTAAAAATGCACTTAGGTAAAAGCTTGTGTACAACAATGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCAT:1 - chr2R 16980335 5' - copia 4935 2 64.36 TTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 12324078 5' + roo 8719 2 80.20 ATTTCAATTTTTCAATTTTTCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTACCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATT:1 - chr2R 25132083 5' + FB 233 1 85.14 AGCTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 5531207 5' + 1360 54 1 71.29 TTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCT:1 + chr2L 23299997 5' + invader4 364 1 73.27 TTTAGTTTAATTTCATTTTCACAACAGCGCCTGCAACATAGACCCAGCCTAATTAAAACAACTACTTACCTGCAATGTCTCCAGAGGCTCCCAGCGACTCG:1 + chr3L 11146911 5' + HeT-A 5711 1 74.26 GNCCAAATGACTTTACGGAGAGTTCCGTTTCTAAGTCGAATTCCATCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTT:1 - chr2L 23053094 5' + diver2 139 2 52.04 AAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr3R 31101332 5' + 297 6614 2 64.36 TTTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATGCCGTATATATATATATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGG:1 + chr2L 18159038 5' + INE-1 155 1 44.55 ATTTATTTATAGAAAAAAAAAACTTTTCGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGTCGCCTAACCGGTCACTCCCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1 + chr3L 950741 5' + INE-1 553 1 69.31 CATGGGGAAGCTAACCTCTTTTTCCATTCCATCATTGACAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTT:1 - chr2L 16200990 5' + hobo 354 1 62.38 GCCGGCCACAAACATTTCCCACTAATAGCCAAGCCGGCTACTTGCTGCCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCAC:1 - chr3R 6277144 5' - blood 7020 2 52.48 CATAAATATACAAATTTGGTCAATGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:2 - chr3L 12103838 5' + roo 50 2 79.21 TTATGTATATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 10827404 5' - roo 386 2 54.46 CATGTTTGTCGGTTTCTTGAGGATTACGCAATATTGCAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCG:1 + chr3L 6172598 5' - invader4 4 2 71.13 CATATGTATGTCAACGAAACATACTTAAACATATTCAACAATGCAGACCAAAAGTATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 - chr2L 3889846 5' + jockey 4677 1 56.44 TTCTACAAGTTTAAACAATTAAAAGTGAGTGTGGAAAAAGTGATTCGAAAAAATCGTTGAAATCGGTTTCAAAACACAAATTATAAGAATCTAAGAGTACT:1 + chr2L 16602062 5' + Idefix 311 2 75.25 ATTTGCATAAAGCGACCATAAAACAAAACCCTAACAAAAATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATA:1 - chr2L 20239253 5' + jockey 4632 1 61.39 CATGAATCAGAATTTAAGCTCAGGAGAATGTGGTTATTATAAGCCATCTCAGGCACAACAAAAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAAC:1 - chr4 900427 5' - mdg1 316 2 68.32 GCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 - chr2L 18430129 5' - copia 241 1 70.30 CTTAAGACACTAAGCACTAAACACCGAATCTAACAACTTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTG:1 - chr2L 22079640 5' - gtwin 439 2 60.40 TAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 + chr3R 20878444 5' + 297 16 2 57.43 TATTATTTTCTTAATTGGTGTTTATTGTGTGTCAAACGCACACGCACACATACACTCGCACACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3L 13589530 5' - hobo 2928 1 68.32 CCGCCACTGATTTTCCAATTTGGACTGCTGAAAATTGAAAATCCCAACACAGTCGAAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCT:1 + chr3R 17204040 5' - Chimpo 225 1 55.45 AGTCACTCCAATAGAACCCGAAAGTTTAGAAACTAAGGGATTGTCTACAGATAAAAACGATAAAAACAGCCTTTTCAGTAAAAACTCATACTTTTCCTCAA:1 - chr3R 10800782 5' + I-element 5146 1 81.19 GCAGAGGAGTTGGGCAAAGAGCAGAGGAGGGGGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTAATGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAG:1 - chrX 12663379 5' - accord2 157 2 73.27 TAATGGGAATTTTGGGTTGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 19377706 5' + roo 8675 2 69.31 TATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 9316974 5' + opus 157 4 82.00 CTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3R 31194483 5' - Transpac 261 2 77.23 CCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGG:1 - chr2L 17444091 5' + G2 2789 1 58.42 CACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 13546651 5' + roo 8711 2 77.23 ATACACACTTTTTATGGCCACTGTGGCCTATGTTTGATCAGGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3L 2144381 5' - copia 221 1 59.41 ATGGTATTAAAAAACACACACAAGAATTTGCTGGGCACATTTTTAGGCACCCCTTCTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chrX 13761227 5' - pogo 2084 1 62.38 CGAAGCCTTTCTAGGGTTATAGTTGGTCAAGGTTTCAACAGGTTCCGGAGTTCATTGATGTCTAACAATTTGTTTGCCGAAAACGTAGAAATCATCAAATG:1 - chr3L 15598796 5' + hobo 2520 1 81.19 CAGGAGCTAAGCCAGAACTCTAATTCCCCACCAACGTTAAATTTGTTAGGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTTAGAATAA:1 - chr3L 3542390 5' + Doc3-element 4648 1 70.30 CTCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCT:1 - chr3R 19530708 5' + BS 30 1 57.43 CAGTCGAGTGGAATGTTTTACATGAGGCTGACTACATAATAAATCCAATAGTCCAAGGGCAGATCTGTGTTTTCGCGCAGAACGCCGTGGAGATCGCTATA:1 - chr3L 25485222 5' - mariner2 384 1 60.40 GATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 16457993 5' - roo 9045 1 54.46 TTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 - chr2R 5840680 5' + Ivk 30 1 58.43 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTATTTATTTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10417 1 64.36 ATATGGTAAAACCGACTAGCCCACTAGCCAAATTACAAAGATATAATACTATTCCCGTATATATACAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGAT:1 + chr2L 21266110 5' + F-element 4320 1 73.27 AAATATTTGCCCGTCTTATGGCGGCCATTTGTTTTTTTTTAGGTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAAATTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCCAA:1 + chrX 10698902 5' - Doc3-element 121 1 69.31 ACACCTCCTGGAGCCAACTACCAACCCAGATTCACCTCGCCATGAATGAATAATGCCCCTTAGAGATGGGTAACCTGGATTTTCAAGTTTGTCCACCAGGG:1 + chr3R 6717504 5' + GATE 302 1 71.29 AACGAGGACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3R 26842877 5' - opus 7476 2 60.40 GTTTATTCTACACTCCTAAGGGATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2R 19552080 5' + roo 5 2 72.28 ATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chr2R 5067645 5' + F-element 42 1 69.89 TTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 + chr3L 19951175 5' + Ivk 7 1 72.28 ATTAATTCCAGTTCGACCTGACCGCCTTAGACTCTTCTCGTATTCCAGTCGTCTTCGCTGTTGCTAGGCGGGGGAGTTGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCA:1 + chr2R 2494296 5' - gypsy8 4652 2 65.35 AGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGAAAGATGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2R 9317021 5' - opus 7460 2 69.00 TGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 + chrX 21668949 5' - mdg1 395 2 55.32 TTAATGTTAACATTATTTGAATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 19481274 5' + roo 26 2 54.46 CTCTAATTAATGTTAATTTACAATTTTTTCTCGCTCTTTCGCTAATATGGGGTCGGGTTATATGGTTTGGTTATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATA:1 - chr2L 8039165 5' - G4 3576 1 75.25 AATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:2 - chr3R 12047493 5' + Stalker2 7269 2 58.42 AAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 27981745 5' - roo 9054 2 61.39 CTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 + chr2R 10945346 5' - transib2 2771 1 77.23 ACATTTAAATTATCAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr3L 18706953 5' - jockey 4973 1 61.39 ATGTGCAATGTGCGATTTCTTGTTTACATTCTAACACTTTGTCTGTGTGTGTGTGTGTTGCGTGCGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 + chr2L 5306782 5' - accord 7029 3 61.80 TTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3R 12539550 5' + roo 8708 2 72.28 TTGCTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr2L 17646236 5' - flea 4987 2 52.48 TTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 - chr3R 7168617 5' - flea 4963 2 82.18 CTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACACGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGT:1 + chr2R 5582164 5' + Cr1a 438 1 70.30 CCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGCGACGCAGAGTACCGTATTGATTCGGGTAACGTCAGCGCGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGAC:1 - chr3L 23164938 5' + gypsy4 77 2 60.40 ATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCT:1 + chr2L 22092961 5' + INE-1 542 1 55.45 AGTTGTGCAAACAGCAGAACGGACCACTCGACTTGGCATCGTGTATACTGTATAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 - chr3R 27801360 5' - Burdock 236 2 60.40 AGACTTTTACACGAGTTAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 + chr2L 2060118 5' + 412 7076 2 56.44 GTAAAAAGCATCTTAATAAAAGATAAAATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 + chr2L 9163693 5' + copia 4875 2 78.22 TTTTAATAACGAATGTCTAATAAATATATATGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATAT:1 - chr3L 9687963 5' - 1360 3151 1 75.25 CAGGGAGAATGTCGCACCCCCAATGCAATAGATGTATATATATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:2 + chr2L 2308641 5' - HMS-Beagle 215 2 63.37 AGTGCGATTTAAAAAGCTTAGTACATGGTGTAATTAGAACATACTTTTCTGGATTCGCAAAAATGAATCTTAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAACTGC:1 - chr3L 24290152 5' + 1360 2980 1 75.25 CACTCACATCCCTTGCAGCACATATTGCCCCCTTCCTGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr2L 12949302 5' + 412 8 2 70.00 TATATAAAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTC:1 + chr3R 8975936 5' + Bari1 29 1 54.46 GCAAACATAAACAATTTTATACCCTTCACTCGTTTATTGTCGAACTGCATTTTCCTCGTGCCCCTCCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGAT:1 - chr3L 23231503 5' + INE-1 79 1 72.28 ATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACT:1 - chr2R 5924419 5' - jockey 4738 1 38.61 ATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2L 20706667 5' - mdg1 381 2 61.39 GGGTAATCATGTTGAATATAAACTTCGTCGAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAA:1 + chr2R 5266987 5' + Gypsy6A_LTR 152 1 76.24 TTACAATATTTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 + chr3R 31194458 5' - Transpac 286 2 54.46 TCCGCCGGCACAACATAATTGGTATTTGGGCGCTATTGGACGGCACACAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATG:1 + chr2R 4783018 5' - McClintock 6058 2 53.47 TGTCAATATCTAAATAATTTGTAGAACTCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCG:1 - chrX 3532440 5' - F-element 4467 1 72.04 TACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr2L 13334036 5' - flea 217 2 77.17 TCGGGATCGAACGAACGAACAAACAAGGCAGATAAGGATTCCCGATTGCGGAATTGACCCTATATACACACACACACACACACACACACACACATATATA:1 + chrX 2596034 5' + accord 7032 4 54.00 AAAAAGCCACAAAAGCGGGAGACACCAGAAATTGCCATAAAGGAATAAAATCAACCAACAAGCCCAATCGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGAGCACCGT:1 + chr2R 11049000 5' + Fw2 3629 1 53.47 ATTTCAAAAGAATAGTATGCTTATATCATTTTAAAACACACAACATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAA:1 - chr3L 19454728 5' - diver 6078 2 64.36 AGCGGAGCTAGCGGTGGTTGGGGAGGCGAGAAGTGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGGGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAA:1 - chr3R 23889579 5' - F-element 346 1 66.00 ATATAATATAAAAATATAAATATAAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr2R 2044193 5' + Tabor 6892 2 74.26 ACGGAAAGCTGCACATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3L 22831268 5' + 297 25 2 58.42 AGGCTGTCGGCAAAAATAAGACAACAATCATTCTAGCCAATGCTAGCTATATAAAATATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 + chr3R 29353217 5' - I-element 5337 1 67.33 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTAAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCAT:1 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 5331 1 58.00 AGAAGGGACTCTGCGAACCGAACGTAATTTGTCAATTTTGTTGGGTGGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTA:1 + chr2L 15866397 5' - Doc 485 1 61.39 CCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 15072647 5' - pogo 2069 1 60.40 TTCAGCATGACAGGACATACGTACAAGAGACGAAACTCGTATTCGGAATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 + chr2R 24628731 5' - mdg1 417 2 74.26 CTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:1 + chr2L 13319592 5' - hobo 2890 1 74.26 AAAAATAAGTTAATTAATTGAGCGAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chrX 2649910 5' + Tirant 12 2 69.31 GGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 - chr2R 2427612 5' + Doc 25 1 54.46 AAAGCTTAAGAGCAAAGAAACCCGAATTGGTTTAATTTTATTGTATTGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr3R 26254070 5' + jockey 4698 1 51.49 AGTAAAAACCAGCTAAGTGCATAGTTTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGT:1 - chr3R 22647138 5' - hopper 1010 1 74.26 TAAGGAAATCATCAGCAAAGTATGAATTTATTTTAACTCGCTCTCCAAAATTTCACACTGATCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr3L 682393 5' + P-element 12 1 67.00 GGTTACAATCTGCACAAGGGAAACTTATTTCAGAACATCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTACA:1 - chr2L 106084 5' - flea 4687 1 52.56 AGCTGCATTTGCATTTGAATTAGAGAAAGACGCAGCAGCTAGCTAAGTATGTGTGTAAAAAGAAGTTCATTAAATAAAGTAATTATTTATATGTAATATCT:1 + chr2R 15041970 5' - 1360 2936 1 83.17 CAAAANCTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 + chr2R 694091 5' - flea 236 2 60.40 CCAACNGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 + chr2L 22084483 5' - copia 217 2 60.40 TTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 - chr3R 15151301 5' + jockey 4715 1 60.40 AAGTCGCGTATGCACTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3L 8713069 5' - opus 483 2 64.36 TATATNAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 - chr3R 19346957 5' + blood 38 2 63.37 CCATATGTGTAGGCCCAGACCTTTCTAATGCTCAAAAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr3R 4834707 5' - mdg1 7409 2 66.34 TCGGTCCGTAGGAGCTCCAGCTCATCGGTGCAGAGAAACGGGTATCTGATAGTCGG:1 - chr3L 22736716 5' + INE-1 551 1 57.14 ATAATACAACTACGTTAACATACATACGAAAACTATAATGACTATACCACCGAGAATATGAAAGGCTGTATCAGAGGGAGAGACTCTGTAGACGTTGA:1 + chr2R 19945207 5' + 412 7423 2 75.51 AATTTNACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr2L 3890141 5' + jockey 34 1 54.46 GGGGTGGGGCATTGTATTGTTGCCATTGCTGTTGATAGTTTTGTCGGGGTGGAATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAA:1 + chr2L 3445384 5' - mdg1 401 2 58.42 GCATCGTTTTGGCTTGTGCAGGAAATCAAACAGAATAATTCGATTTCAATACAAGGACGCACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGC:1 + chr3R 14186310 5' + Quasimodo 54 2 78.22 TGTATATTTGTATATTTTTCAACATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chrX 7904712 5' + F-element 68 1 86.14 AACCCCTTCTTCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chr2R 10543528 5' - P-element 2875 1 66.67 CCGCCCGCGTTGAGAGTTCGTCGCGGACTGAGCAAATGTTGCGGCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr2R 14713592 5' - P-element 2856 1 51.49 TTCGTATGTTATGCTTAGCTAGGCTTAAGCTAGGTCATATTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAGGTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGGA:1 + chr2R 19568943 5' - Cr1a 4078 1 60.40 GGTGACAAATACCGCAACTCCACGGTGATACCTTACTTGGAAGCTTACCACTACGGCCCCCCTTGACGAGAACCAGGAGATGATGATATTCTCATAATTGT:1 + chr3R 13678593 5' + BS3 1618 1 56.44 AAAACTGGCAGACAAAGAGCGCAAATTGCAGAGAACGAACAAAGAGCGATCTAAAAAGGGAGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACAT:1 - chr3R 4897497 5' + Stalker2 7265 2 57.43 GTACAATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chrX 17058226 5' + 297 6 2 68.32 GTCGGAAAGAAGGGAGTTCGCGACACCGACAGCTGGATATGCAACAGCGCAGATAATTATAGTCGCTTCGGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCAT:1 + chr2R 24926243 5' + 17.6 62 1 72.28 ATCGTAAGCTTCAATGCAACCATTTAAATCAATTAAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr3R 26530950 5' + blood 11 2 66.34 CTTTGGCCCAAAAGTTGGGCGACTTCTTCATCGTGCTCACGTAGGTTGGCGACAGATATATGGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr2L 8565436 5' - blood 7378 2 66.34 ATAATAAACAAAGCAAAAAAAAACAATATAAATTGAATAATGTTAATTGAGTAAAAAAATTCTTCCCATACGAATTTTATGCATACAGAAAATGACCTGCG:1 - chr3R 19128792 5' + hobo 2727 1 50.50 GAAAGGGGATTGCCGGTCCGTGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACT:1 - chrX 13546729 5' - roo 401 1 72.28 TCCGTCCATTACATCGACTTCCATTTAAGCAGGTCCAAGTTGTCAATAGTATTTTCACATGTTTATTGCGCTTCAAAAGTATTTTCACTCAACTTAATTTA:1 - chr2L 12306843 5' - Bari1 1462 1 65.35 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAG:1 + chr3L 20988181 5' - Stalker 237 6 63.37 GCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3L 13477504 5' + P-element 34 1 41.67 GCCGACTTCGTGGGGCTGGTTTCGTTCGCCTGTGTCTTGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCT:1 - chr2R 23837096 5' - Doc 4482 1 62.38 TTTTCNGGGCTCGTGCAATGCGTTTGATTTTGACCTTGATGTCGTTTTCGTTTTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTT:1 + chr2L 1693062 5' - I-element 319 1 53.47 ACATTACCATCCATTGCAAATAATACAATTAAATAAAAAAAATCTAACTAAAAGTGCAAAACAAACTAAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCC:1 - chrX 7499907 5' + gypsy2 483 1 70.00 TAAAGTTAGAAAAGGTCATAAGTATATTATAAAGATTTCTTTAAATTTTATATAAACATGACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 + chr3L 8362975 5' - 3S18 323 2 60.40 TTCTTTCTCTCCCATTTCTCCCGCCATCGAACGAACAATTGCTCTGCGCAAATATCGTAGCATCAACTGGCCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCA:1 - chr3R 23677195 5' + Bari1 4 1 76.24 GTTGCTGCCTAAAGCGGAAGTAAAAGGATTTGAATTGCCTTTTGCTAACTGTAAAATCCCAAATTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 4801577 5' - roo 9042 1 53.47 GTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 16674852 5' - roo 9044 1 56.44 TTTTCGTTTTTGTTTGTGCATTTTTGCAGGATGTCTTTTGTGTTATTGGTGAAATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAA:1 + chr3L 18125014 5' - 17.6 7049 2 60.40 TGGATTAACCGATTGGAACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGA:1 - chr3L 16973451 5' - S-element 1687 1 59.41 AGCGGGCGATTTTCGTAGATGGTTTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAG:1 - chrX 6929465 5' + P-element 224 1 27.72 CGTAAACACGTAAAGTTAAAATTTACCATTTTAGCTTTTGATTAAGAACCTGCGACTTATGACTGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGA:1 - chrX 11730348 5' + jockey 4772 1 65.35 GTCGTTCGGCTCTTTGTTTTGTCACAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGA:1 - chr2L 11702778 5' + Tabor 7267 2 76.24 TTTCCGCCTCCTCTTTACATTCGTATTTTTGTTTACGTTCTGTGGCACGCACACGAGACCACGGCACGCACACGACTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTG:1 - chr3R 9881575 5' + Cr1a 226 1 79.21 GCTTATATTGTAAGTTTAGGGGGGGACGGTGGATGTGGCAAAAATTTTATTTTGCAAATCGATAGAAATTTACATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTA:1 + chr2R 21006391 5' + hopper 143 20 73.68 TTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGAAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 + chr3R 15598679 5' + Max-element 8274 2 73.03 ACGCCCCACCCATGAGGAATTGACCCTATATATACACACACACACACACACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAA:1 + chrX 9749540 5' + Quasimodo 65 2 60.82 TTTTAATGTTAACATTATTTGAATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2L 19481272 5' + roo 24 2 54.46 AATAAGTCCTTTTGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 - chr2L 2074806 5' - roo 9071 1 81.19 TGGTATGGAGTGTCTTTTTCAGAAAACTCATAAGTTAATGTATATTGAAGTCTTATTTAGAAAAAGATGATATTAATTATTTATCATAAAATTTACTTATT:1 - chr3R 16533704 5' + G4 3801 1 33.66 GAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAGC:1 + chr2R 24479903 5' + I-element 54 1 75.25 AGGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGT:1 - chr2L 14612116 5' - roo 393 1 62.38 TTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr3R 31194467 5' - Transpac 5196 2 61.39 AATACGCGTTCGCATCGATATTGGTATTTATTCTCGTTCCTTTATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAA:1 + chr2R 20827395 5' + hobo 2499 1 64.36 GGCAAACATGAGGAGCAGCACGAAGCGAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3L 9383482 5' + P-element 5 2 72.28 AAAGTTGAAATAGCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTA:1 - chr3L 14638666 5' - 1360 27 1 51.49 GATGCNCTACTGGCCTATGTCGTTGAATAAAATCCTTAAGCTTTCCCGATTCCCCTCTCAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGAAGAC:1 - chrX 20617986 5' + pogo 1810 1 66.34 CTGAGTTATTGTGACAATTTGAATTGTTTCACTTCTTTTTATCACTTCTCCAGCCATTTCACTTTCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAA:1 - chr2R 11801541 5' + 17.6 7279 2 60.40 ACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 + chrX 3763147 5' - 297 374 2 60.40 ATTGCTAGCAATTTATTATGGCCTGCACTTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATAT:1 - chr3R 29470839 5' + hopper 43 1 69.31 TGCTAAGAAAAATGGCAACAAATACAGACAGCCGAAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGTTAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGAT:1 + chr2L 12520984 5' - diver2 4661 2 77.23 ATATTTTAATAATATAATAAACAATTATAATAATATAACGTCGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCT:1 + chrX 16554569 5' + mdg1 7354 2 58.42 AATAATTTTCCAATCGCACAATCGCTTAAACTTCTCTCCTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGG:1 + chr2R 3591396 5' - Quasimodo 6958 2 61.39 TAATGGTATTATAAATGCTCCACTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAAT:1 - chr2R 22396971 5' - I-element 405 1 77.23 GCCTAAAGGAGACGAAGGAGTAATATGCTAGTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTT:1 + chr3L 21434727 5' + roo 344 2 69.31 TTGTAAATTGAGAACAAATTAAGAGTGCCTTAATGCGTTCGCATAGACAGTTTGCAATTAAAGACGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAA:1 + chr3L 13585073 5' - hobo 2508 1 55.45 ACAAACATCCTTCGGATGGCAGCGTGCACAGTACATACTTTCGTCTGTCTGTCTCGAACTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTTAGCATACAG:1 - chr2L 2941179 5' + INE-1 174 1 61.39 TACGGTTTTCGACCACTTGTTTGACTGCTTTGGCTTCAGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chr3L 11553489 5' + P-element 38 1 35.64 AATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3R 11119856 5' + 297 6625 2 76.24 AATAAAAGTTGAAAGCAGGGGAAAAAACGAGAAGAAACATAACAAAAA:1 - chrX 15410487 5' + Bari1 1652 1 87.50 GACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr2L 4743186 5' + I-element 43 1 65.35 TCTTTATTTAAGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTC:1 - chrX 20880678 5' + invader4 2772 2 67.33 CCCCTTTAAGATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCA:1 - chr2L 9162974 5' + copia 51 2 79.21 TTTCAAATTTTCACTTTGTTATTATAGGGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr3R 14917243 5' - HMS-Beagle 199 2 72.28 ATAATGCCATCCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCAC:1 - chr2L 17444101 5' + G2 2768 1 76.67 TGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTACGTGTGGTC:1 - chr2L 21403527 5' + G5 4428 1 70.30 GCTCCTTGTTGTTGCCGTGCGGGTGCGTTTGTTTGCTTACGAAACAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATT:1 + chr3L 4779216 5' - Porto1 4459 1 58.42 GTGGACATGCGAATTTATAGCTCCTTGACTTGTACCAAGAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chr2R 4838832 5' + HMS-Beagle2 6916 2 67.33 GGTTGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3L 19377720 5' + roo 25 2 55.45 GCTTGTGCGATTACATCTCGATGAGCCTACAGAGCCTACATTATCACAATTTCTTATTGTTGTATATAGTGCCTTAATTTGTTTTTATATCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 30213256 5' + Circe 422 4 40.59 GATATCTTCGGATCATTACGACTTTGTTATGTTTTCGGTGTTGGTTTCATTTTCGGACGAGATTTAATCCATTTCGAGATCTTCGGTTTTGTTATATTTGT:1 - chr3L 17359018 5' - G4 99 1 66.34 ATGCACGGCGCACAAAAACGCCCTGCGACCCGCAATAAGTGTATAAATTGGAGTGAAATTGCTGTAAAGTCGAGATTAGTTTTTTTTTTTGTTTTACCATG:1 + chrX 14044159 5' + Tc1 1476 1 68.32 TGTTTTTAGGGGGTCGGTCGTTAGGTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATT:1 + chr3R 31621760 5' - P-element 2724 1 28.71 CGTTTGCCCGCCAAAACTTTGGCGCTGCCTGCATTCTGCATTGAAAATATTTGCACGCAATTGCGGTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGT:1 + chrX 1626001 5' - HMS-Beagle 6708 1 72.28 CCGAAGCTTATGCAAATCAAGACATGCCGCACACATCACTTTTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCA:1 + chr3R 11120439 5' - 297 6746 2 59.41 AAGAAGAAAATATGGCGGAGAAAAAGTTTTGAATAAAACGAGCAAAATTAAAACGGAAATTAGGCGAAACAATAGCATCAGTCCATCTAAGAGTCGAAGGG:1 + chrX 22725903 5' - G5A 342 1 68.32 ACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 2799691 5' + Tirant 39 2 66.34 AATAAATTAAATTTCTCTATTTAAAAAAATTACAAAAATACCTATAATGCGTCTTTTGGATTTGTCATGGTCTTTATGGAATTTTAATTCTGATTCAGGTT:1 + chr2L 13999083 5' + Rt1b 135 1 43.56 CTCTCCTTCGACTTTGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTGTTTT:1 + chrX 9715276 5' - Doc2-element 218 7 67.50 TAATAACAATAGATCAAAGTCTCCTTCCATTAACAGGCCAATCATGGCAGCACTATTATTCAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGA:1 - chr3R 4965768 5' + diver 5953 2 68.32 AAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3R 10203620 5' + jockey 37 1 52.48 CCAACGAAACGGCGCGTTTTATAAGCTAACCTCTACAAGAGCCCCACCCACTTTCAGCCCATGCCACCATATATAGTGCCGCCGCGGTAAAATGATTGAG:1 + chr3L 5252420 5' + frogger 17 2 73.00 GTTAGAAAGTACTGATTATATATTATATTGTAGATCTAATACTTCAATTATTATGTTATAGTAAAGGTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 - chr3L 5102483 5' + jockey 4680 1 70.30 CGTTTGGCACACGTATTGATTCTGGGCGATTCTCTTTAACGAATCAAAGCAGCTGACACTTTTGGGACTTTTGCGGAAGCAATCAAATAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10744863 5' + Rt1b 5143 1 68.32 ATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATAAACATACACATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr2L 21328156 5' + flea 4769 2 65.35 GTTGCTGCTATACGGGTGTCCTGCTCCTCCTGCTCCTTCGCTGCCTGCGTGTCCTTCGTGTCAGTGTGTGTTCGGTTTCTATGTGTGTGTGTGTGTGTGCC:1 + chr3R 11271469 5' - accord 7028 2 52.48 AAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3R 20149734 5' + 1360 56 1 80.00 TGTGGGCAATAAACAAAAATTATTATGCTCAAATAAGCGTAAATGCATTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTT:1 + chr2R 20417433 5' + 1360 3270 1 56.44 ATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 6173060 5' - pogo 2058 1 80.00 TCAATNCAACATGCTGGCAACAGCAGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 + chr3L 12888194 5' - mdg1 416 2 72.28 CGACTTAAATATATAAATATAAGAATAATTTACAAATATACAAAGGTTTACATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCC:1 - chr3L 2937272 5' - roo 299 2 55.45 TTTGATGGTTTAATTTTGTGGAAAATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3R 12780604 5' + hobo 14 1 65.35 ATTTGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr2L 20133078 5' - flea 240 2 66.34 GCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:2 + chr3R 17896943 5' + hobo 32 1 65.35 ATTCATTTAACCGCAAAAATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr2L 14790679 5' - roo 407 1 77.23 GCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 19446142 5' + 297 6602 2 57.43 GCTTACATAAACATTAATTGGCAATTCATCTCATGATTGATTTTTTTTACAGACTTAATTACAAAGATATTTGGACTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTG:1 - chr2L 23232665 5' + invader4 2697 1 80.20 CGTTANTGCCTCAGTTGGACGTGTGTCTGTGTGCGGTGCGGGTGTGCGGAATTTTCGTCTTTCGACCTGGCCAATGTAGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTC:1 + chrX 11373015 5' - F-element 405 1 74.26 TTTTTAACAATGAAATACTGTTTGGGTTATCTTCTGCCAATCTCATTTGGGGCTGATTTGGAATGGCCAGCACGCTCTCCCGATCTATCCC:1 + chr2R 5180777 5' + mariner2 566 1 58.24 ATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCC:1 + chr3L 19471448 5' + INE-1 101 1 88.51 CATGCAAATCAAAGTTATTGTCAAGCCAAAAGTGCCCACCGATGCGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 27976611 5' - roo 9036 1 59.41 ACAGTTCTCGATGGCGATTACCAAATGCCAGAAAACCCGAAAAGTGGAGAATAAATGAAATGAAATACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATA:1 - chr2L 5304295 5' - Transib5 2952 1 76.24 CACAAAAATAATTTACAACATGTTTTGCTTGTTCTGTTTTGGTTGTTGTTATTCTTGGAGGGTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGG:1 - chr2L 307221 5' - Porto1 483 1 75.86 GTGGAAGAGTATCCAGTGATTCCGCGTCGCTCTTGTTCAACAATAAATCTAATTAACAGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2R 8086961 5' + 1360 13 1 66.34 ATTAAAACTATGATACAAAAAGGGTTTTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGC:1 + chr3R 4970522 5' + diver 5898 2 69.31 ATAGTGGGCTTTAACTATCATGTGTCAGAAAAACTATGATATTAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chr3R 19132242 5' + Ivk 2 1 77.23 TCGGAATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2R 24628773 5' - mdg1 7413 2 73.27 TTGCTCAATTAATTTGCGCCACTAAACGTTTCTCTGTTTTTTAAGTTCGTTTTTTTTTTACTTTTTTAATTTATGTCTGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGA:1 - chr2L 5390815 5' - F-element 4521 1 76.24 AAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chr2L 11703229 5' - Tabor 457 2 50.50 CAAATGAAAATGAAAATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 12324016 5' - roo 393 1 63.37 CTTTCCACATTGCACTCAGAAAAAAAAACCCTAACACTTTCATTACTCAAATACAAATGATTTGTAATGTCATACGGATTTTATTCATTTTATTTCTTTTG:1 + chr3R 28020687 5' - Stalker4 499 1 80.20 GTCAAAGGCGCGACATCGCCTACTGCCTCGGCGTGGAGGTTTAGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAAC:1 + chr3R 29679757 5' - gypsy5 6997 2 70.30 GCCTCCTCAAGGTCCTTCTAGCCTCCCCACCACTTACCCTCCCTTCTAGTCCTTCGCATTCTCACCTGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTC:1 - chrX 14318653 5' + INE-1 558 1 57.43 ATGAGTAGGTAAACATTTTTGAAGGGAGTGCTGACGTGAGAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATA:1 - chr3R 1852122 5' - Cr1a 4197 1 60.40 TATCCTGGGGTGAATTAGGCAGATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATT:1 + chr3R 14917157 5' + HMS-Beagle 1 2 78.22 TCTACTTTTTGGTTAGAGTGACCCTCTCTTGCCGTACAGTGCGCGCGCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTT:1 - chr2L 20104638 5' - G6 1818 1 57.43 GTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 16674852 5' - roo 9045 1 57.00 TTTGAGTGCTGCCAAGTCCACATCTAGTTTGTCTTCCACTGTAATATGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 - chrX 19986420 5' - Stalker2 370 2 61.39 CATTCTTGGAACATTAATTTTGCCATTGTTTCTGAAAGATTATTGCAAATTCATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 23591407 5' + pogo 22 1 55.45 AGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr3R 28645850 5' + F-element 38 1 51.49 TTACGACTGCAACGAGAGGAATACCAGCTACAGGAAAATAACCCAAGAGAAGCTTGCTCCCTGAGAGAGTAATAAAGTTGCCAGACAGATGATACGCAATC:1 + chr3L 8374815 5' + frogger 170 1 57.43 TCTACGAACGACTCCTGTTTTTATGGCAGCCGTGTCACAGGCGACACTCCGCCGTCGACAGTTGTCCTTTAGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGG:1 - chr3L 4921487 5' + jockey 4766 1 72.28 AAATGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 18234155 5' + jockey 30 1 54.46 TTCGTTGAAATTGAATGGCAAATTGAACGGCGGCTTTTCCAACGCGACGGCATCGGGACTGCCGTACTCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATT:1 - chr3R 25095792 5' + Quasimodo 7153 2 70.30 TTGTAGTCGTATCTCACGCTGTCTAGCATCAGTTGATGGTTCTTGTATCTTTTTTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATAT:1 + chr3L 14700044 5' - Porto1 4390 1 51.49 TGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr2R 13650110 5' - mdg1 7424 2 59.41 TGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 14675603 5' + roo 8706 2 70.30 CGCATATATAGGATGATTTTATTTAAAAAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 - chr2L 10473503 5' - flea 4971 2 77.23 GGTTTGTGTTTAATTTTTAGGTTCTGGACCGCTTTTATGGCTTTTTTTCTATTGCTTTTAGTTTTTTTTTTGGTTTTTATTT:1 - chr2R 24343582 5' - transib2 101 2 50.00 AAAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCT:1 - chr2L 9435800 5' + GATE 8268 2 46.00 TCGCCGCCATTAAAAAGGGTTCGCTGCCTTTTCACCTTGCTCCGATCCGGCCATTTCCCATTACGGCCTTCTCTTCGGACT:1 - chr2R 20731793 5' - accord2 246 1 61.73 CAAATCGTGTCGCGAAACGATGCGTATACGTAATGTGCGTATACGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chrX 8972376 5' + 1360 29 1 57.43 CGGAACCCACAAAAGAGTGCTAAGGAATTTCCATTTCTATATGGCATCCTTGATTGTCCTTGTGTGTGTAGGAGTGTAGGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 18700029 5' - accord 185 2 73.27 TATAATTTATAAATGTTTAAACTAAATTGGCTAAAATTGTGATCTATGATTAAACAGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAG:1 - chr3R 29107775 5' - F-element 4520 1 58.42 CTTTTCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2R 10543510 5' - P-element 2855 1 47.52 CGATTTTAAATTGTGCTCGCAATTAAATATTTAAATTGTATTTTATGTACCCCAGTAAACCAGTATGTAGGTGTTTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGCGTT:1 + chrX 6944704 5' - accord 7099 2 67.33 CGTGGTGCGTGCGCCTGGAAGTACATACTACAAGATACATAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCGTCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTT:1 - chr2L 3646585 5' - 1360 3325 1 71.29 ATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2L 3890132 5' + jockey 25 1 64.36 AACGTTTCAACTTATATATATATTATATTTTTATTTTGTTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 13992741 5' + roo 8699 2 70.30 GCTGCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 17587762 5' + roo 15 2 64.36 AGTCTTTTGAATGGATTCACGGGCTTTCTTTCGCCCTCGGCCGCTTTCATGATCGATTTAGCACTAAGTAGTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCAC:1 + chr2L 6264666 5' + Max-element 8362 1 74.26 CCAATACTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2L 14790557 5' + roo 5 2 73.20 TAAGAGAATATAAAAGCTAAATATACAGGACAACACTTTATCTTACGTGTAAAGAGTTTA:1 - chr2L 21138512 5' - G5A 2703 1 90.00 CGGTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3L 13659977 5' - pogo 2084 1 62.38 CTTAAAGCTTATAATTATGTACTAGTATGAAATAAATAACACCACACAAATGAAAATCAAGAGAAGTTGCTAAATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCC:1 - chr3L 22759225 5' - INE-1 556 1 62.38 TTTTTCATAATTTTATTAGTATTGTAAATGTTTATCGATTTGGCAAAAATAAACCCAAATTCTAGATAAGTCAACCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCC:1 - chr2L 9547550 5' + Idefix 183 1 51.49 ATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAGAACTA:1 - chr3L 23871302 5' + Doc 53 1 68.32 ACAATCGCATTTGGCCAACAGGAAGTCGAATATGTAATACCAACAGACAAAACAAACAGCCCACCCCAAGCCATCACTGATGATCGCCTGTCCACAATTTT:1 - chr2R 22739342 5' + invader6 431 1 66.34 CGGCGCACAGTCTTCACCGCTTGGAAGACATCGACCTCGCCGTGCTGGATGACCTGCTCGTTTGCATGCTGGCGTCGCACGAGTTACCGACCCATCGGTAC:1 + chr2L 18182166 5' + ZAM 7961 1 59.41 AGCAGAACGCAGATTAATTTGGTCGGACAGATCACGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGAC:1 + chr3L 25411930 5' + Doc 496 1 66.34 CTTGAAGTCTTATAAAATTAGCCAGAACAAATGAACAATTAACGGGTCGATTACATTAAACAATCACTCCCTTGCCATTTTAACAAATAAATAATAATTAC:1 + chr3L 7607840 5' + jockey 4827 1 80.20 GAAATGAATGTTTTATAAACGAACTGTTTTCCCACTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGTCTTTTGCTTTCCTTT:1 - 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chr2L 1625715 5' + hobo 29 1 54.46 TCATATGCACAAATCGAACTTCTTTCAATAACTTTAACTATCACTCCCCAATCTTTCAAGTCTGCTATCCTAAAGCTGAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGC:1 - chr3R 24513373 5' - Porto1 226 1 78.22 AATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGT:1 - chr3R 12047482 5' + Stalker2 32 2 54.46 TCAGAACCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3L 7205542 5' + Doc 44 1 59.41 TGTGCACACCTGTGCCATTTTGTTTGTGTAATATAAAATTATGTTTATTAGTTGATTACCGCAAACTAATAGTAAACCAAAATGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr3L 7906532 5' - roo 411 1 71.29 TATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 17587779 5' + roo 32 2 60.40 CACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 16201513 5' + hobo 32 1 59.38 CACTTNAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 14790598 5' + roo 8714 2 77.23 CCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACCACTTAGTTGCAT:1 - chr3R 6273572 5' + blood 43 2 65.35 AACAAATTTACTAAAAGAATTTTTATGTTTGGGCAAACTTAACCTAAAAATAACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGT:1 - chr3R 17495903 5' - Quasimodo 7349 2 52.48 AAGGCTGGAACTACACCCAAATTTATTCCCGAGGAAAGAGAGAGCGAGAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACC:1 - chr2L 20417806 5' + P-element 376 1 44.55 GTTTGTGATTTAGAGCGCGGCAAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 + chr2L 21010846 5' + opus 18 2 61.39 TGTAAATTCCACGAACTATTGCATTATTGATTCCTATGTTTATGTTATGTATGTATATGTTATTGCGGTGGGTTGAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGAT:1 + chrX 3448851 5' + 1360 2 2 76.24 ATAAAACTTCCACAACAGTTTTCACAGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAA:1 + chrX 2649835 5' - Tirant 8457 2 71.29 CTTAATTGGCCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr3R 6117303 5' - Tirant 366 2 59.00 CAAAATAACCAGATTTCATTCAGGGACGCAAAGTTTGGCCATCAAAAGGTTAACTTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCATTCA:1 - chr2R 10785181 5' - copia 4655 1 63.37 AAAATCCATCCATAGACAGACAGCATCAAACACACGCACACACACACACACACACACACACATGA:1 - chrX 5180333 5' + Quasimodo 39 2 56.92 CCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr3R 27748669 5' - roo 9037 1 59.41 GCTATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATAC:1 + chrX 21668918 5' - mdg1 7457 2 76.24 TAGTTTAAAAGGCATTTTTATTTCAGCTACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 15305735 5' + roo 8668 2 75.25 ATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAACG:1 + chrX 21452477 5' + INE-1 535 1 68.32 CAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2L 14790657 5' - roo 9048 2 55.45 ACCCATCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAAT:1 + chr3L 17168846 5' + mdg1 7077 2 63.37 GAAATATCTAAATGTGGCGCTTCTGTGCTCCTCCCTTAATTTTATTTATTTAACAAAATTTAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAG:1 + chr3L 17834553 5' - Ivk 5337 1 60.40 CTCTCAGTGTGCGCGCAAAGGATGGGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGGGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAAACCCAAATAAGAA:1 + chr3R 10952237 5' - roo 410 1 74.00 AGTGTTATGTGCTGTTTACGAGGCCATAAAAGATGGGAAAGCGCGTACCCTCTTCACTCGCTGTATTCCCCAGCGAAGAAGAAGAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 3634473 5' + Doc2-element 220 1 57.73 CCCCAGCCGTTTTCGTTCGACTGTCGGTTCACCTCTGAATATCTATATACCCAGCATTCAAATCAGCCATTGTATTTCGATCAAAAAAAAAAGAAAAA:1 + chrX 13022142 5' + R2-element 3580 1 45.92 GCCATCGTAAAATGCAAATGAAAATGAAAATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr2L 12324002 5' - roo 407 1 77.23 ATAAAATATGACAAGGAATGCTATATGAAAAAGAAGAAGAATCAAACTTGATAATTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTC:1 - chr3L 24123312 5' + GATE 8269 2 53.47 CTGGCCATTTGATCCGAGGATCCCAGTGACATTTTGTGATCCACTGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTG:1 - chrX 12142391 5' - hobo 31 1 55.45 GTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 13508770 5' - roo 9053 2 64.36 CACGTAAAACTTTTCCAGACTATGTGTGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGC:1 - chr3R 5915196 5' - 1360 3195 1 61.82 GCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTAC:1 + chr2R 10945343 5' - transib2 2774 1 74.26 CCGACTAGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTA:1 - chrX 20886044 5' - Ivk 5358 1 49.48 GTGGTGTTAGTGCCCCATGTCCTTTGCTGCTGGTTGCAAAGGACATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 - chr2L 13319580 5' + hobo 2708 1 57.43 TTTTCGGGTGGAAATCGGTGGAGGTTGTACTTGGGATATATAAACCAGGACCAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 + chr2R 18950706 5' - roo 411 1 75.25 ACTATATCTATAACATCATTGGAAATGGGTACAGGAACTTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGC:1 - chr2L 12162383 5' - Tirant 182 2 61.39 CTGAANTAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chrX 8491412 5' + P-element 40 1 40.59 ATTTCATCCTTCCTTCTGGGTTTTGATAAACGAGGGTTTTTATTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 - chrX 22444509 5' - Juan 4174 1 60.40 GTATTTACTTTAGGCTGTTTAGATTTCGAAAAATGCTCCAAGTCCAAAAAAGTTGTTGTAAGTTTTTCTCCTCTTTTTTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTA:1 + chrX 13985641 5' - gypsy11 3932 2 69.70 AAGATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chr3R 13582302 5' - BS 5081 1 63.37 GGGTTGCGACAATCGATTGAAAAATCCGAAATACAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 11263488 5' + roo 8671 2 73.27 CATTACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGT:1 - chr2L 17784682 5' - gypsy10 297 2 67.33 TTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr2L 15510405 5' + jockey 4705 1 59.41 GCCGATTTTTGTCCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCG:1 - chr2R 2879488 5' - Stalker 6994 4 72.28 TTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAAGCCCAAATAAGAAGACTTTCCTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 8345526 5' - roo 9017 2 76.77 CTTGANAAACATGAATGATTTTCGAATTGTCCCCACCTGTTGTGAATAACCGAATTTTTTGGCAACCTTTGCGTTAGATAGATTCCCGTTTATCGCGACTC:1 - chr3L 10081773 5' + rover 179 2 84.16 GTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 23456268 5' - 1360 3371 1 57.43 CATCCCTGTTGGCCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:2 - chr3R 20149796 5' - 1360 3377 1 67.33 CAGTGACGCTCGAATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCAGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 11846301 5' + hobo 21 1 56.44 CATATTGCCCCCTTCCTGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 12949282 5' + 412 29 2 52.48 ACAAATATTACAATATTTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr3R 31194451 5' - Transpac 293 2 61.39 ATAATAGTTGTATAAGTATATAGCGCGATTGAAGAACTTGCTCGTTCACCATTCTACTCGAAGTCCCTCCTTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAA:1 - chr2L 22237868 5' - 1360 3111 1 74.26 CACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chrX 992033 5' + hobo 45 1 71.29 TGTGACGAGCTCAACATTCCACTATCCCATACATACATATGTACATCCATTTACATACATATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chr3R 24081521 5' - 297 382 2 68.32 AGATTGACTATAACCGCATCGTGTCCGATGAATCTACAATCCCAGCGCTAACACTAGTCTCTCTCAAGCTCTCCCCATTCCAAACGGTGTCAAGTTCTTTA:1 - chr3L 9161327 5' + Doc3-element 463 1 47.52 CGTTGNGGAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCCTAAATTA:1 - chr2R 4339729 5' - G5A 2752 1 54.46 AGGTTTAATAGGTATTTGTGCGTAAACAACACCTAATGCAATCCTCATAACAGCTACCAATTTTATAACTTTAAGCAAGAGAGAATGCTATAGTCCAGTTC:1 + chr3R 948015 5' - INE-1 574 1 61.39 ATAACCTCCTCCCAACAGCCGCCGATCTTAAATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATA:1 + chrX 21581070 5' + hopper 390 1 73.27 CATGGGAGAGTCTAATAAAAGGCTTACGGGGCTTTGGAAGTTAAAGGAAGGCGGAAAAGGTAAAGCATCCATCGCACTTACACACACACACACACA:1 + chr3R 18967880 5' + Quasimodo 34 2 51.04 ACAAGTATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2L 20706661 5' - mdg1 7426 2 55.00 AGCCTCTCCTCCCAAGCGATTCTACAAGAAGACTTCCCTGACTAGCAACCTTCTAGCTTTTATCGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACGGACAGACGGAC:1 + chr2L 21261410 5' - INE-1 125 1 70.30 GTTGTAGGTAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:1 - chrX 22711668 5' + transib2 5 1 60.61 AAATTAGAACTGTAAATGGCATTAATATTGAAACTTTGTTGCCTCCACAACCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:2 + chr3R 27801266 5' + Burdock 21 2 58.42 GACGATGGTATCGTTGGGGGAGGTGGGCTGCCCTGATATGTTGACGTAGTTGCTCGGTTAGTCGGTGATCCTTGCTGAAGGCGGTTGGAGTGTGCGATTCA:1 - chr2R 16676098 5' - Chimpo 3811 1 79.21 ATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 17587773 5' + roo 8690 2 54.46 AGCCAATAGTCAGTCATCAAGGCTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr2L 19019038 5' - hobo 2931 1 69.31 CTTGTTTATCTCAGCCTTAAGCACACTATAAAACGGTTGGGGGAGGGTTTTAGAAAACTAGAATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chr3R 10734218 5' + pogo 9 1 68.32 CTCGGTCGATACATTTGACAGAGCTCATATACACGCTCGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chr2L 17311142 5' - S-element 1677 1 68.32 GTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAA:1 - chr2L 16948704 5' + jockey 4727 1 78.22 CGAAANGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 19552036 5' + roo 49 2 75.25 TTTTGGCTACCCCGTTGACGTGGCGCTGCGTCAGGGATGCGCATTGGAGCTAGCATGAAAACGAAACACATTGTTGCGATCTCATATTCGTAGC:1 + chr2R 698789 5' - gypsy2 124 2 54.26 CTTGTTGCAAATCGTAATAATGCAGCAAACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:2 + chr3R 23638079 5' - pogo 2089 1 64.36 ACCGACCGACCGACCGACCATTGGCTGGAGGGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATG:1 + chrX 16778674 5' - Stalker2 7307 2 80.20 AGTTATCCAGCCAATAATAATAAAAAAAACAGGATAACTTTGGGTAAAGTAAATTAAAGTAAAGTAAAGTAACGTAAAGTAACATAATATTTAAATTTAAA:1 + chrX 8174367 5' + TART-A 13176 1 57.43 TTTTTACGAGTATCTGGGTCCTCGAAATCATTGGCATCTCTTAGCGCTCAGACTCGCACCCAAGCAAATTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chrX 868782 5' + jockey 4769 1 69.31 CATACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAACTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTT:1 - chr3L 11661762 5' + hopper 55 1 73.27 ATTCCCCGCCGCCACTGAAAGATCTATTTACCTTTTTTACTTTATTATTCCACAAACAGAAAATTTTGTAGTACAGCATTTTAACATTGCCAATAGC:1 - chr3L 2798591 5' - Doc3-element 117 1 71.13 GAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 - chr2L 15947435 5' - Transpac 5178 2 73.27 AAAACTTTAAGCACAAATTCCTCTCCATAAGTTATTGTTTTATCAGTCTTCTATGATGTATGGTCATGTTATATTTGATTTTAAAAAATGTTGCATACTTC:1 - chrX 22446481 5' + Transib5 2806 1 67.33 AAATGATATCATAGCAATGCTCGCTGACATAATTCCTAAATGCGCGACAACAAACGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGT:1 + chr2L 4998393 5' - S-element 1698 1 61.39 ATTTATTAAATAAGTTTAATTTGTTAGTCATTTATCTTTGCTTTTATTTTATTTCAGCAATGCTGGTGGGTTTATGTGTTCTTTATAATTCTTCGTCTCCT:1 - chr2R 11783062 5' - HeT-A 260 1 83.17 TTTAAGAGCGTTCGCTTTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCAAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTA:1 + chr3R 13538906 5' + hobo 8 1 68.69 AAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3R 19446149 5' + 297 6609 2 59.41 AGAAGAAGACCCTGAGCCTTCTCCAAAAATCACGAATGGACTTATATATCAAGATACCTTCAATGAAGAATTCGACATTCTCGTTGAGCCAAAAGGCCAT:1 - chrX 18459948 5' + gtwin 7247 2 74.00 CATCAATCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 - chr2L 12815116 5' + hopper 25 1 54.46 TATCCTATATCCTTTTTGCATAACTAACACTAGAGTCGAGTGAACACGCTATAAACCCTGGAGTTCTCCAAGGCAGCGAACTTGGACCTACGCTATACGTC:1 + chr3L 23082351 5' + Fw3 2877 1 54.46 CTGCAAATCAACAGTCGAGCATAATTTTTGTTAATAAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTT:1 - chr3L 10214427 5' - X-element 4401 1 64.29 TAGTAATAATGGCCAAATCCTAAGGACTCTTAGTGCCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3R 23004927 5' + blood 7041 2 54.46 TCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 16988204 5' + opus 7047 4 71.29 TGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr2L 4743183 5' + I-element 46 1 68.32 AGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3R 8313118 5' + 297 34 2 65.35 CATAGTTTTGCGAGCCGAAAAGGCTTAATGACTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 + chr2R 17626503 5' + mdg1 7083 2 74.26 CAAGTCTTTAATGGCTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATT:1 - chr2L 11703307 5' + Tabor 6866 2 53.47 GTTTCGGTTTTTTTTTTCTTATTTTATTTTATAGTGTGTTTTTTTTTTTCTTTTATTATTT:1 - chr3L 10251665 5' - BS 5098 2 83.61 AAAAAACAGAAAAAACTAAAGACTAAAAGAACTAAAACCCCATAGAGACCGACAAAAGTTCATTCGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGA:1 - chr3L 5619591 5' + Doc3-element 4524 1 76.09 TGGGGTTCGTGATTTGCTAAACTTATGAAATTACTTTATGAATTTACGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTACACTC:1 + chr2L 5394899 5' - F-element 4378 1 52.48 TACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCA:1 + chr2L 17784620 5' + gypsy10 5669 2 48.51 CTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 + chr3L 19951180 5' + Ivk 12 1 67.33 TATATATATTTATATATAAATAACAGAAATCCGAGATTTCAGGAAAAACCATGTTTCTTTTATAGCAGCGCAGCGCGTGAAATAAAAATTAAGTAAAATTC:1 + chr2L 5442328 5' + Tc1-2 396 1 55.45 GAAAANCTATGATATTAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 + chr3R 19132269 5' + Ivk 29 1 56.44 AAAATATTTGTTATGTATATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 10827394 5' - 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invader3 5071 1 62.38 GCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 - chr2L 19684023 5' + jockey 4702 1 54.55 AAAAAAGCACTTGTCGCTGGTTGCTAAATTGACTGGTGTTATGATTAGCTGCTGCTGCTGCAAATGAGGAGTGATAACATTTTTAAAAAGTTTTGGGATAG:1 + chrX 15169011 5' - Q-element 134 2 61.39 CAATGATGCATGCAAAATCAATTCCTAGCTTAAAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTAAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCT:1 + chr3R 10279742 5' + Doc 386 1 61.11 AGGGGCAGGTAAACAGATCTTCAGCTACATACATACAGAGGGGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 - chr3R 8975999 5' - Bari1 1662 1 68.32 AAACGAATTCAGGAGAGTTTGGGCTAGACTGGAATGTACACTCGCTTAATAGAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAA:1 + chr2L 20709011 5' + mdg1 7424 2 73.27 AAAGTGAAAACTATACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2R 12082346 5' - mdg1 381 2 63.37 GGGTGACAACAAATCAAATGCAAATGGTAAACCGACCGCAAATAGAAAGTGAAAATCAAATACAAAACGCTACCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr2R 19944008 5' + 412 5 2 75.25 TGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chrX 10672351 5' - mdg1 7416 2 67.33 CAATATTCGATATCCACTAATATTTCATACCTGTTTCTCAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAGGCCATACTATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3R 3748730 5' + 1360 37 1 58.42 GAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 27981710 5' - roo 9019 2 79.21 AACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 8345495 5' - roo 9046 1 54.46 CGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2R 10543490 5' - P-element 2835 1 27.72 AATATGTTTGATTTAAAAAACATTCATTTCCATATCAGGAAGTATCATCCCTTATAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 + chr2R 14341759 5' + opus 15 2 57.43 TCTGTTCGGCTCGGATTTGTTATTTGTACTCTTCCCTTAAGGTGACACACCCTTTCTTTTTTGCCAATGATTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTT:1 - chr3L 16540443 5' - HMS-Beagle 441 1 71.29 CGTCTGTTGCCGTGCGCAGTCTAGCTGCAATCCACCAACGGACGGTATGAGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTTGAATAATAAAAAA:1 - 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Doc 346 1 55.32 TAGTAGCAAAGCATTAAACAGGAGTAGTGCCAAAGAAACCAAAACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAA:1 - chr2L 11709160 5' + R1A1-element 480 1 57.43 GGCAGCTGCGACGGGATGTGTCACCGAGTGGTCGTTCCGATGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAAGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTC:1 + chr2L 6513303 5' + opus 7090 2 57.43 CATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 + chr2R 5067626 5' + F-element 31 1 54.46 AATTTTTATGGCCAATTTCTTTCAATAAAAACATAATTGACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3L 3291645 5' + roo 37 2 67.33 GAGAAGGAGTGCACATTACCAGGTACGAGCGAATTAAACTAAGTGATCAGTAGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTG:1 + chr3L 24917441 5' + 1360 3333 1 51.49 AATTCGAAATCTCCATTTGAATGACAGGAGGCAGTGCAGTTAACTTGTTGCTTTTGCCACAAAAAGGGGGTAA:1 - chr2L 16401321 5' + Transib-N1_DM 480 1 91.78 GAATGTTTTTGTAATGAAATTCCTAGGTCTCCGTCTTGGAATTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCG:1 + chr2R 7552220 5' - springer 371 2 66.34 TACGACCAACAAAAGTGGGTGAGAAAATATGTTTTAGTAACTAATTACTAAAGACAAGCAATTAAACTTATAGCTTAACCTTTAATTTATTTATTAAGCCA:1 + chr3L 17605362 5' - X-element 4710 1 83.17 TATGAAGTAGTGTTTAAAATTGATTAAATTATGTACCACAAATTGTAAATATTTTTTTTTTTATTTTACCAA:1 + chrX 11190947 5' + Tc1 1475 1 70.83 TGTTGTTCATCTGCACCGTGGCGGCCTGTTGCTGCTGAGCTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGT:1 - chr3L 3229135 5' - Doc2-element 4370 1 61.39 TGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:2 - chr2L 20133061 5' - flea 4982 2 63.37 TTAGTAAGCCGATTTTATTTTACAGAAAAGATAACAATAACAAAATAGAGAACGGTATACTCGATTTCCCCGACTAACAGATACTTGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr3R 7757794 5' - INE-1 541 1 68.32 GGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 16884890 5' - pogo 2069 1 59.41 ATCTTTAGGAAATAAATCTTACAAATTTGAAATTGTTTTTCCAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGA:1 - chr3R 3875555 5' + accord 7067 2 58.42 GTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr3L 13060369 5' + 412 44 2 78.26 TAATAATATGCTGTACTGTGGAATTGTGTCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCAC:1 + chr3R 5020054 5' - roo 255 2 72.28 CTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 23275306 5' + roo 52 2 78.22 AACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 27981744 5' - roo 9053 2 60.40 CGATTCCACTTCTGATAGTGCGAGTCAAATTAACTTTAATGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr3L 27308 5' + I-element 36 1 60.40 TGTTTTCGTGATTCGCGTCACATATATACATGTACATCTCTCTGTTTTCATCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAA:1 + chrX 22901505 5' - Tc1 1535 1 56.44 TTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 19551996 5' - roo 9028 1 68.32 GGCCANGTCATGCTGGTTAAACTGACGAACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 - chr3R 12277559 5' + Tirant 45 2 68.69 AACTCGGTGATAATCTTGGCAAGTCGATTTTTGTTAGTAGGCGTGTTCTATGGGGTGAGGAAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3R 31212079 5' + 1360 14 1 61.39 CAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chrX 2799686 5' + Tirant 44 2 71.29 CTTTGNCCAGAGCTCGAGTTCATTTACTTCTGTCGCAGCATTATTCGTATTATTATGCTAATTAGCTCTGTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - chr3R 25672008 5' + I-element 5 1 72.00 GCGAATATTTGCCAAAATATTGACCATAAGATTTGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr3R 31256988 5' - transib2 2787 1 67.33 GTTGACATAACCGTGGTATACATCAACACGACGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAAATTTAATTTGTTATGATA:1 + chr3L 26002662 5' - 1360 362 1 73.27 GACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 + chr3R 24760539 5' - pogo 2079 1 58.59 AAAGTGAAGGCGAAACCAGGAAAATGGGCACGTCACGTGGCAGAGGAATATGGAGAGAAGGAAGCAGGATCAGGCACCTCTTTAATCTCCGAAGAAGGCCG:1 + chr2L 4790300 5' + Osvaldo 1266 1 61.39 TTATTTTGATCTCTTAGAATTGCCTAGTCTCCTTAAGTCTTAGAATTTCTTATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr2L 21008772 5' + opus 7029 4 55.45 AATTTNTAGATAATAAACATACACAAATTATGTGTGTATATTTGTCATTAAAAACCGTTTTAATGGTTTAGCGATTTCAAATATTTATTTATTTTTATTCT:1 + chr2L 10306703 5' - mariner2 828 1 62.38 TAACGAATGGATGGTGGGAAATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3R 24081640 5' + 297 6584 2 76.24 CCTTTNACGATTTTCCTTTGATACGAATGCGTTGCATACTTCTCAGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr2L 15510463 5' - jockey 4962 1 55.45 ATATTTTATTTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTT:2 + chr3L 14396971 5' + BS 5015 1 50.50 CATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 12633274 5' + jockey 60 1 78.22 ATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 6117245 5' + Tirant 8146 2 68.75 GCAAGCGCGAATGCTTTCTGAAACTCTGCGACGCAGCGGAAAGTGGCCCGTGGGGCCTACAAGATGGTAGCTGGTGCAGAACCGAGAAGCAGAAAGTCAAA:1 - chr3R 1954387 5' + G7 16 1 69.31 TTTATTGTTTCACGTAGCCATATCACTTGGCGGCACAAGGGCCGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTC:1 - chr2R 10441639 5' - 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Stalker2 394 2 69.31 TACAAAAGCAATTGGCTTTCATATAAAGAGCATGCACTATGGTAATTATGACACAGCTCTCGGTAAATAAAATTAAATTATAAAATTATTATAATTTTTTT:1 + chr3L 12956560 5' - HB 325 1 48.51 TGCGGNCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATT:1 + chr3L 10081934 5' + rover 6978 2 58.42 ATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTCATT:1 - chr2L 20133073 5' - flea 4994 2 61.39 TCAGAACTTTTTCCCTTTTGTGTCGGTGTAGAAATAAAGTTACAATCACTTGAAAGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGG:1 - chr3R 1846030 5' - Cr1a 4139 1 62.38 CGGAGATCGGGGAACCCAGAAACTCGAAGAGCTCGCTTTTTGGCGACCCCGCCACGCAATTTATATGAAGGTTACAGTTGTACAAGAGCACTGAGAG:1 + chrX 7180395 5' + Bica 418 1 64.95 GCTAGCAATTTATTATGGCCTGCACTTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 - chr3R 29470836 5' + hopper 46 1 72.28 TTCCTTATTTGTATTGATAATACCCAATGATGCAAACTGTCGGGTCTCACAGCCGCCACCAACGGCAGGAAGGGCAGGACGCAACAAGTCCTCCTT:1 - chr2R 5265173 5' + Q-element 426 2 51.04 CTGTGTAGAGTGAATAGGGCTTGGATCATATGGAGTGGCATAAGTCTTTAAGAAAGGGGAAAAGGCACAAAGGTCGCGGACAGACCAAATATCATCCTCTC:1 + chr2L 13077721 5' + Rt1b 208 1 63.37 TAAATTTCAATAGAAACATGATAGTTTCGGTATAGCCTCAAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAATGGTGTCTAAATAGCTATGCCCA:1 + chr2R 6164757 5' - Tc1-2 7 1 75.25 TTTTATTAAATATATAATTACCACGAGGGTATTTACTTTGGGTATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATT:1 + chr2L 22079574 5' + gtwin 6948 2 54.46 CTCTGAAATGAAATCTACTCAACTGCTGAGCACATGCACATACATATACAAATACAAACCCACATACTCACAGACACAGCTAAATATATATATAAAAAAAA:1 + chr2L 9816124 5' + transib4 2574 1 53.47 CGCAGATTTTCGCCGGCAGGACCTGTATAAATAAACAAAAAAGGCAAAAATAGCCGAGTCGATCAGTCTGTCTGTATGAACGTC:1 + chrX 14716503 5' + INE-1 126 1 54.76 GTCCTAGGCCGAGCGTTGCCTCGATCGTGGAATACACCCTGCCCGACGTTTCCACTGTTTGTTCTTTACCGACTTATCCGCGCGTTCTCACTCCCGAACT:1 - chr3R 1857920 5' - gypsy8 439 1 62.00 TTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCCTCTG:1 + chr2R 7552261 5' - springer 330 2 76.24 GGGGAATTGAGGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 16458075 5' + roo 24 2 56.44 ACATAGAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTTCTCTACATATATATAAGTAACGTACAT:1 - chr3R 17321777 5' + Stalker2 7284 2 57.43 CTTCAACGGGCCTTATCTGAAAATAGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 + chr3L 22043042 5' - jockey 4933 1 79.21 AGACACTAAGCACTAAACACCGAATCTAACAACTTGTATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGC:1 - chr2L 22079636 5' - gtwin 7351 2 64.36 AAGAANCAACCAAAAAATATCAATAAATATTACTCGTAATACCAAAAAGTAGTTGTCGTTGTTGATGTATTTGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCC:1 - chrX 20800320 5' - micropia 5432 2 66.34 AGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACGCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chrX 13546629 5' + roo 8689 2 55.45 GTTATGAGTGGAACCTAATGAACCCTGACAGATGAGCGTTCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGCCAATAATGACTT:1 - chr3R 26016156 5' - accord 465 2 59.74 GCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 + chrX 10561821 5' - hobo 2885 1 78.22 AACTTAATGTATTCAGTCACAGAGATCAAATTAACCTAGAAATAACAAGAGAGAATGCTATAGCCGATTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAGCTAG:1 - chr3R 4589977 5' - INE-1 543 1 72.28 CTGCATAAAAAGGGAATCCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 - chr3L 18501041 5' - hobo 2933 1 70.30 AGGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 16458066 5' + roo 33 2 62.38 CTTTTNTCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAA:1 - chr3L 19377800 5' - roo 9044 1 53.47 GCTCCTCTGCCAGCGGTAGATAAAGCGAATCCAGCAATCGAATGCTCACTGACACGGTCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCA:1 - chr3L 14110337 5' - R1A1-element 278 1 71.29 CAATTTTAATTTGTATGTATTTTAAAACAAGAGAGAATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chr4 1156243 5' + blood 40 2 72.28 TTGATGGCGGCTGCCTGAAAGTAGGCAACGATAAAATAGCAACGCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 7887293 5' + jockey 12 1 75.00 TATTTNTCTTGACAAATTTTGTTCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCC:1 + chr3L 17878727 5' - hopper2 394 1 51.49 GTTGTGTTAGATGCTTTTTCCAAAACAGCGTCTCAGGTGGCTTTAAATGAGATCCCTCGTTTGCCTTCTATTGAACCTCCATGGTGGGCGAGGTCTGTTTA:1 + chr2L 22348667 5' - X-element 4462 1 56.44 TTAATAAGTTTTAATTTTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCA:1 - chrX 15082428 5' + mdg1 7094 2 79.21 CCCCTTCCCGTCGCATTTTCCCATCTCTTGAAGGACGACCAAGAAAAACAAATACACAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACA:1 - chrX 20770258 5' + F-element 335 1 59.41 AGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 20878475 5' + 297 6628 2 73.27 ATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr2L 6388283 5' - copia 236 1 75.00 GCTGTATTCACTGCATCATCAACTGTCGCTCATTACGCCGGGATTTCATACATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGT:1 + chr2R 20952516 5' - rover 328 2 65.35 TCCTTTTGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 2074800 5' - roo 9065 1 75.25 GTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 12047479 5' + Stalker2 35 2 57.43 GAACGGAACCCAAAAGCAACATTTACCATAGCTATCTGAGTCCCTAGGCCAGAAGCCAAAAGGAAGACAGTCATCTTCCCAACATAATCAGC:1 + chr2L 8620832 5' + gypsy3 257 2 78.26 AAGTTTATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3L 2019664 5' + 412 7093 2 65.35 AGAGACATTTTTAGATAGCCCCCATCCCACACACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGAT:1 + chrX 18333334 5' + Idefix 6965 2 68.32 TTTTGGAGGCGGCGGCGTTCGCGGCGTTCACTTTCCGACTGAATTCTCACTTTCCGCCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCA:1 - chrX 16811718 5' + springer 39 2 60.40 CACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAAATAAAAAA:1 - chr2L 8627506 5' - hopper 147 108 75.76 ATGTGTCCTTTGATAAGGGTAAGGCCCCCTTTTTTTCATGACTGCCAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGT:1 - chr3R 21515608 5' - 1360 3227 1 54.46 ACTCATCCAATTTCACCCACAGCATACCCTGCTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAGAATAAGATTGTTAAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCAC:1 + chr2L 17195634 5' + Idefix 6972 2 69.31 ACTTTATACTTTGATTAATAAAAATTTGGACCCGCCCATTTTAACGCCATTTTAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTC:1 - chr4 665874 5' - INE-1 549 1 81.00 GATCGATATGAATCGAACTGAGAACGAGAACCCCAAGAAAACTCATTGAATTACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCATTACCA:1 - chr2L 2165423 5' + I-element 4985 1 57.43 CATCAAGCAACAAATTTGCTTAAAATGTAACTCTAGCTCGTAGTCATCAGTAAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAG:1 - chr2L 7195268 5' + Doc 81 1 60.40 GCGTGGTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr2L 12667257 5' - blood 363 2 59.60 AGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 18950758 5' - roo 9022 2 75.25 TATGTCCATTAGAAATAATTTATTATTTATTTTAAAACAACAATAATTTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr3L 25968877 5' - HMS-Beagle 222 2 56.44 GTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 - chr3R 17321762 5' + Stalker2 51 2 74.26 AATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chrX 17058222 5' + 297 6583 2 69.89 AGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCGCACTCGCACTAACTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTT:1 - chr3R 4947764 5' + INE-1 577 1 82.18 TCAAGGTGCGAAGTTAAAATGAAAATAATACCAGTACATTGAATGGTAAAGAATGGTATAAATTGAAAATAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr2R 17261378 5' - pogo 2097 1 67.33 TTTTGTCGGTAGTGTGCGTAGCCATAATGTTTTTGCCATCTTCAATGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATTCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCAAAATC:1 + chr4 219104 5' - Tc1-2 1255 1 54.46 GAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 + chr3R 20878454 5' + 297 25 2 52.00 AAATAATTCTTTTCTTAAGAAAATGCTGTATTTTTGTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTA:1 - chr2R 18919220 5' - Stalker2 57 2 66.34 AACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCA:1 - chr2R 21073916 5' + jockey 4721 1 77.32 TAACAACTTTTCTACTTAAGACATGGCCGGAAATTGAAAATTTGACCACCAACAAGCTCCGAAGTAAGCTTCTAAAACCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 2770284 5' - accord 185 2 62.00 ATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 + chr2L 13319584 5' - hobo 2898 1 66.34 AACAAACATGCCTTTTCATTGATTACTTTTGAAAACAAGTGCATTGAGGATCTATTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr2R 9854022 5' + pogo 24 1 57.43 AGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGG:1 - chr2L 3440489 5' + Juan 46 1 61.39 TAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 + chr3R 11263395 5' - roo 9039 1 61.39 GCAACAATAACACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2L 8627516 5' + G2 3076 1 77.78 AACCGGATCGCAGATACTTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr2R 16334029 5' - P-element 2831 1 23.76 GAAATAATTCAACGAGTGAAGGGATTTTTCTTTAAAATTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTAC:1 - chr3R 10240160 5' - invader4 292 2 67.33 CGAATAACACATACTCAGCTCAAAATAATTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTAC:1 + chr2L 18431479 5' - copia 5007 2 72.28 CCTCTAGAGTTACATAAGCGGGATTCCCACATTTTACTCCAAGCATTGAAATCACCGACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAA:1 - chr2R 1986266 5' + Idefix 7116 2 65.59 AGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr2L 3951603 5' - Transpac 261 2 77.23 CTGCTAATTTGGGGCCCTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2R 16475752 5' + 412 7093 2 66.34 CAAATATATAGAACCAATACATTGGTTTCTAAAAAAGCTTTGGTACCTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 - chr2R 7032205 5' + mdg1 30 2 57.43 CTCTGCCATCATTTACAGGTCATTCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr3R 10751720 5' - hopper 1396 1 64.36 TGTCATTTTCACCAACCCCCTTCCCCACTCTCCTTCTCATTCTCACACAGTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGC:1 - chr2R 17356166 5' + Cr1a 322 1 58.42 TAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAATGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTAACGG:1 + chr2R 4830335 5' - 1360 3334 1 75.25 CGTTTCCCTTTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCATTATTC:1 + chr3R 17733245 5' - INE-1 549 1 68.32 TTAAAAGTTTTTTTTTAATTTGTTCCAAAAGAAGACCACAAATTCTCTAGTCATGGGTCGCGGAGAGCATTGTGCCGTCGAAAAAAGAAACTTGATTAAAA:1 + chrX 12584307 5' + Tc1 386 1 72.28 ATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3R 10147897 5' - roo 9040 1 57.43 TTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 20137345 5' - Burdock 233 2 55.45 TGTACAATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chrX 17058227 5' + 297 6584 2 70.71 TTTTTTATTACTATCAATACAAAACAAATCGAATCTAATTATCGATAACAATTTTCAATCAGTGATTATACATAATCATACATAATAATATAATAATAATA:1 + chrX 16361314 5' + invader3 5050 5 63.37 AGTCCCGCCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGCAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2L 20622773 5' + Doc 11 1 44.79 CAAAGTGGAATCACTTAAAGGGCTTTAATTGTGCGTGGGCCAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr3R 22781940 5' - copia 246 1 67.33 CATTGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3R 13376045 5' - 1360 3367 1 58.42 CCTTTGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCC:2 + chr2L 3951596 5' - Transpac 5187 2 70.30 AAGGTNCGTCTATTTAAATCCATTCTCTTTGCTGCCATTATTTTGATTGAAAGGATTTCGGGTACTTGAGGATTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAAC:1 + chrX 8468717 5' - Idefix 7072 2 76.24 AAAACCAAAACCCTGAACATACCAAAGACACACACTCAAGCAAGATGAACCAGTGAGGAGATTAGGAAAACAAACAAGCTAATCTAAAGTAAACTAAAGTA:1 - 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chr2R 4707061 5' + Quasimodo 7022 2 53.47 AAAATATAACTGCAAATGATGATGGTATTAATTCTGCAGAGACTTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 - chr3R 4170424 5' - 1360 3209 1 56.44 CAATGGGTCTCAGAGCGGGAGAAAAAGGATTCAGTTGCTTCGACAGGCGCTGAAAGATATTGTTAGAGTGAGTTTTCCTCGTCAGAAAACG:1 - chr3R 29811254 5' + Gypsy12A_LTR 373 1 64.84 AATTTAGTAAGAAAATTGTAGAATTATTGAATGACCAACTCGCTACAAACAAACACACTTCTCTAATTTGTAATGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr2L 513634 5' + roo 8665 2 75.25 TGGGGTTGTCTGATCATAACTATCATAGAAATGATATGGTGTAGAAATCTCAAAAACTATAACTAACGGGTAAGAAGTAACGGGTATCTGATAGCCGAGAA:1 - chr2R 7019477 5' + INE-1 554 1 64.36 GTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTT:1 + chrX 21474406 5' + 1731 26 2 73.27 GTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGG:1 - chr2R 7552293 5' + springer 48 2 81.19 TTAATACTTTAGTGTGATGTATATAAAGGTATACTAAATTCGTTGAAAAGTATCTAACAGGCAAAATTGAACGTTTCTGTCTGTCCGTATTAACATCGAG:1 + chr2L 228904 5' + INE-1 129 1 77.00 CACTGCCCCGTTACGTTTCGGCAAACACACAAAAACAAAAACTGAAAAATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAG:1 + chr3L 21059434 5' + 297 471 1 59.41 AGTATTTCAGGTCACACAGCTGTGGTACCGTAGAACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTT:1 + chr4 907863 5' - 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INE-1 532 1 68.32 AAAATACCCATTTACACCAAACATACACCTAAACCCAGTAAAGCAAATTTAATTAGTGCATAAGTATTACCTCAAACAATCTCATCCAAATTGGACCAGAC:1 - chr3L 54083 5' + I-element 4902 1 69.31 ACCTCCCACAGCATCGACGGCATCCTCGGCGGAGGCGCTGGTTCTGTGGGAAGCGAGGATGAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATCAGAAGTGGGATCG:1 + chr2R 25063626 5' + invader1 417 1 66.34 TGGGCCATAATTGTATTGAAATTCTCAGCAACAACAACAAACCAAAACCGGGTGCGATTACCACAATCGGTATCAAAATAAAAAAAAAATCAAAAA:1 + chr2L 9495769 5' + F-element 4686 4 56.25 AAAGANTATATAGGTAATGCAATTGGTTAACAAAATTTTGATATAGATTATATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chrX 15082375 5' - mdg1 397 2 53.47 TGATGCTATGCTGGTGTTTGCTTTTACCCTTGTTAGCGTTTTTTTTTTAAT:1 - chr2R 25122038 5' + Circe 72 1 74.51 GGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 - chr3R 12047485 5' + Stalker2 7273 2 52.58 AGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr3R 31101326 5' + 297 6620 2 70.30 AGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - 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chr2L 14612100 5' - roo 9040 1 55.45 TGCAGCATGCACCCCTCGTTTGTGGCTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 23275331 5' + roo 22 2 51.04 AGCTGATTGTGAATGGCAAGCGACAACTGTGCACGTTTACTGTGAATGGCAACATTGGTTGGTTTCACCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 8308159 5' - P-element 2881 2 60.40 GCCTTGAAATATGGTTGTGTGTTTTATGTTTTTTGTGAGAAGTAAACAAGTTTAAACATTTTAATTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr2R 21463614 5' - roo 8997 2 64.36 CCCCTTTTTGATATAGTTGATATCAGCTGTGACAAAATTAATTCGATAAATTGCACCTCGTCTTGTTATTCACTGCATTTAATATGACCCTAAATTAGAA:1 + chr3R 2647423 5' - Gypsy12A_LTR 78 1 59.00 TTAGCACTTCGATGATTGAACTGGACTGTGTGGCTAATGTGTCTATGTTGTAATAATTGAAAGTTAAAAGGGCTGTGTGGGAATTCAATGTCACCTGCGGC:1 - chr3R 6298288 5' - R2-element 3154 1 79.21 CCGGTCCGTGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 13546717 5' - roo 9052 2 60.40 CGCAGAACTCCGCTTCGATGATGCAAATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAAATGCACCACCATCTGTGCTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCA:1 + chr3R 11047890 5' - G5A 411 2 71.29 ATGTGCCACTCCCAGTCGGGTGTCAACAGAACGATAAAAACAGTACAACTACACATATATTACATATATACGTTAAAAACATCATACCTTGACATTTATTT:1 - chr2L 10731307 5' - transib2 276 1 67.33 GAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATT:2 + chr3R 12539500 5' - roo 9033 1 64.36 AAACACTCATAGATTATTAGTTAAATTATGTCGATTGTGTTATCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGACGTGTAAATG:1 - chr3R 14036044 5' - Tirant 8473 2 58.42 GTAATTATGGCGCGTCATTAGTTTTCGAGCCATTGAGCCGGGGTGTATCGCGATTGGAGAATTTGGAAATAAGAAAGACGCAACTACTTAGCCACCAAAA:1 - chr2L 10912678 5' + Porto1 4460 1 59.00 TATGCTTTGCTGCTCAAATGGGAACTTTTTCTTCCGCAATATGTATCGATATACCAGAAAAATGATGAAATTTCCTGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTA:1 - chrX 6880625 5' + INE-1 532 1 77.00 TATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3R 9551441 5' - P-element 2835 1 27.72 AAAACAATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 13060383 5' + 412 36 2 65.31 GTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr2L 2074767 5' - roo 9032 1 64.36 CCATTCATTGGCTATATCTGTGTGTCCCTCTCTCTTTCGCTTTCCCACACAAAATCTAAATTTTTCAGCGTGCAGACTGTTCTCGTGCGGTTCTTTTAACA:1 + chr2L 16971558 5' + Cr1a 354 1 73.27 ATTTAAATTCAATTCGAATGTGACATTTTTGTATTTTCTTTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGG:1 + chr3R 16873597 5' - Tirant 8317 2 58.42 CAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 17968359 5' + Tirant 8128 2 56.52 ATGTGCGAACATTTGATGATGCGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr2R 14778532 5' - mdg1 414 2 71.29 TATGCNCTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGAC:1 + chr2L 23299990 5' + invader4 357 1 66.34 CACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 19018940 5' + hobo 24 1 52.48 AATAACCACCAGCCATAATGGATGAAATAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGG:1 - chr2L 3085032 5' + copia 48 2 74.26 CAGATAGAGATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chr3R 11119901 5' + 297 6580 1 78.22 TTAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr3R 20878435 5' + 297 7 2 66.34 AGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACCATGAAAAAAGGCTTCAACTTGTTGAGATCTAATTGAGTGAAATTGACTGC:1 - chrX 15019096 5' - Ivk 5160 1 72.28 TTTCCAAAATACACAGGGTCTTATTTTAGAACGATCGATTTGTTCGATGTCTATTTGTTTTTGTTTTTTTTTAGTTTTACTTTATTTTT:1 + chr4 1124611 5' - Doc3-element 165 1 76.40 AACCGGAAAAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chr2L 4160093 5' + Tirant 8109 2 79.21 CGAGCATACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2R 16940394 5' + 297 36 2 71.29 AGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 29259622 5' + pogo 1 1 59.18 GAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr3R 25097893 5' + P-element 34 1 40.66 GAAAAATGTTTCGATTTCTCTTAATTTTACTGTTTGTCTTGGCAACATGGGTGTCCATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTAA:1 + chr2R 2555702 5' - INE-1 164 1 56.44 AACGTCGAGATCTCGGGAACTAAAAAAGCTGGAAGGTTGGGGTTAAGCAACTGATTGAGAGAAGGCACGTCCCGCCAAATTATTTTTGGACGTGGTACGAT:1 - chr2L 22036461 5' + transib2 217 1 59.41 ATTAAAATTTCAGTCACATTTCAAACCGAGAAAAAAATCCAAACACACAAACAGACAGAGACAGCAGCCGAGTTTAGTATTTAAGATTTTACACATTAATT:1 - chr3L 410013 5' - Gypsy12A_LTR 1857 1 61.39 AAAAGCTTGCCACGAATTTTCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAG:1 - chr2L 18279996 5' - gypsy5 408 2 77.23 TCGCCNGCATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chr2L 5646911 5' + jockey 4690 1 59.41 ACAGACCTACTGCCCTATGACCCCACAAGGATTCCTTATCTTCTGGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTAACCTGTAGTTGCCACTTATGCT:1 - chr3L 26865649 5' - rooA 7320 2 55.45 TAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTT:1 - chr2R 4483261 5' + Ivk 40 1 60.40 TGTGCACGGACGATAAGCCGGATCAAGCAACAAAAACAAGTGCAAAACAACTAAAATAAATTCTAAAAATCTAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCA:1 + chr3L 2590317 5' + gypsy2 480 1 76.24 CAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chr3L 10143165 5' + 297 6616 2 67.33 ATAGTTTAAAAGGCATTTTTATTTCAGCTACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 15305736 5' + roo 8667 2 76.24 AAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3R 15072634 5' - pogo 2060 1 72.16 GCGTTCATGGTGTACGTGTTATTTTCTGTCAGTGCTACTGGATTTCTGAGGGTCTCTCTGTGAACATGATAACCAAAAAAAAAA:1 - chr2R 392473 5' + Porto1 157 1 71.43 TGCTGCGACCCATTCCAAATGCATTAAAAGAAAGTTAGCTCTGAGCATTTGCATTTGTATTGCTATCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGC:1 - chr3R 31257073 5' + transib2 9 1 73.27 TCAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr2R 9316968 5' + opus 152 4 76.24 AAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGC:1 - chr3L 10390410 5' - 1360 31 1 69.31 AATTTGTATGTATTTTAAAACAAGAGAGAATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr4 1156250 5' + blood 47 2 79.21 AGAATCGTGCCCGAAGGAGCAATTATTTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTACG:1 + chr3R 7954829 5' + G2 2985 1 71.88 TATCCATATTATATTTATTTAAATATTTTTGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr2L 7850119 5' - 412 448 2 69.31 CTACCACTTTTGGCTATGAATGAGCCGCGTTTGTTCGACCGTTTCTTTTATTATGGCCATGCCCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chrX 18837042 5' - P-element 2876 1 71.29 ATAAAAAGGGAATCCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3L 18501037 5' - hobo 2930 1 67.00 ATTTATAAGTAACTAGCGTTTAACTAGTTCTGTGGTGTCTTACTGATTACTAACTAATAATTAAATAAGAGATCCTGAAGCCACCTCTAGACCCACGGCGA:1 - chr3L 25637636 5' - 1360 60 1 65.35 GATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTC:1 + chr3R 20137267 5' + Burdock 6170 2 62.38 CAAACACAAGCATAGAGGTACTAAAATAAACCAATCAGACAGCTTACAACTGAAAAAAAAAGCAGCAAAAAACACACAATTCAACTACTTAGCCACCAAAA:1 - chr3L 22792491 5' + Porto1 4460 1 67.33 TCTGGGATACTCAGATGATTCTCGGAGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAA:1 - chr3L 25414408 5' - S-element 1255 1 74.26 GATATAATAACAACCACACCACCATCGCCACCCCACCACCAAAACAACGTAGGAAAACAAAATGTCTAAAGAGTTTCTTGGCAATCTCAAAAGTGTGTAAA:1 - chrX 20711276 5' - S-element 196 1 61.39 AATAGGCACGTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2R 1365301 5' + jockey 17 1 68.32 CTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTT:1 + chr2R 4547777 5' - HMS-Beagle 6994 2 76.24 GCATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 - chr2L 5646905 5' + jockey 4696 1 54.46 AACTAGATCGATAAATCTTATAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGCTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGAC:1 + chr3L 26386313 5' - diver2 4732 2 80.20 ATATCGAATTAAGTTTTTATTGTTTTGTTTTCATTGTTTTCATAAAATCGGTTATTGTAGCTGTTAATTGTTTTGCTTGCAATGCAAAAGCCGGTGAGGTC:1 + chrX 23155446 5' - Doc4-element 366 1 52.48 GACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAATTAGTTG:1 - chr3R 26321670 5' + blood 7051 2 67.74 GGCGATGTAGACTTCGTCTACCATGTAGAGATCCATATGAGGACTGGATGCACATTTTGTGCGCTTGCCCCTATATGCAGATCGCCCGCTGCACCAAGTTG:1 - chrY 1717212 5' - Rt1b 6 1 59.41 GTGCATTGACATGACTGACAGTAAAGTAAATAACAGAGTAATATAAATAAGATAACAAAACAACGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTT:1 + chr3R 4581872 5' + Tc3 1711 1 58.42 GATCCTTTGATTTTATGAACTCTTCCTCAAACCCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chrX 8682617 5' + pogo 11 1 68.32 AAGTGNAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr2L 4160101 5' + Tirant 8 2 71.72 TTCTGGTTTTGCCATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 21174232 5' + roo 35 2 69.31 CACCTTGGGCAACACAAACTATCTGCTCGAAAGACTTTAAAGGCTCCTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAAT:1 - chr3L 2280202 5' - F-element 4340 1 51.49 TAATCAAACGAATTCCAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr3R 27430087 5' + pogo 29 1 55.45 TGCCATATTATAATAGTCGGTTTTAGTCTACGCTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTAT:1 + chr2R 14246946 5' - 297 392 2 74.26 AGCGAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr3R 28645864 5' + F-element 24 1 61.39 ATAAGTCTTTAGTGGTGCTCTCAAAGCAACTGGGAGGATCCTTTGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 + chr2L 3951557 5' - Transpac 307 2 76.24 CAGACAATCAGACAAGACCAGTGGATTCTGTGGAATGAGTGGTAAAGGGGTAAAGTTCCATGGCTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 - chr2L 14579925 5' - copia 244 1 66.00 CTGTTGGGCACGGAGAAGTGCTTTCTGTAAGCTTGAATTTGTGAGACGTGCTTTGAAATCTTCCTACAGAGCCGATGTTGCGGAACAGATAGAATGCCACC:1 + chr3L 23758581 5' - invader2 85 2 67.33 AAAGTATTTTGATTGTTTTCCTCCTTTTTTTTTCTTTTTGTATCTTTGGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTTTTTGGTGTTGTTTTTTT:1 + chr3R 26923575 5' + Cr1a 246 1 76.24 TGCATTTCGTCTTTAAATCGTCTTATTTAGATGTTATTTGTTGCAACGGCCATTCTAACGCCCACAAACCGCCCAGAACTGTCACGCCCACACTTTTGAAT:1 + chr3R 8233609 5' + INE-1 250 1 76.24 GGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr2L 23372628 5' - 1360 3350 1 69.31 AGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGAT:1 - chrX 20880668 5' + invader4 23 2 57.43 CAGAACCGAGCACTCCGATCGTCGAAAGAGAACTGAGGCCAACTGAGTTTGAGTTCCAGATCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAAACTTTCAAGCGAG:1 + chr3L 19170610 5' - Cr1a 377 1 57.43 TGATAATGGATTTTTCTTACAAGTTCATAGGAGTTTTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAGCGCTGAG:1 + chr2R 14071389 5' - Ivk 237 1 64.36 AGACACAATAGATTGATACTTTTAAATTTTATTTTACACTCTGGTCTAATTTTATTGTCAGAAAGAGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATC:1 + chrX 17966591 5' - Tirant 229 2 60.87 GTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr2R 13650103 5' - mdg1 7431 2 52.48 TAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 + chr3L 19951194 5' + Ivk 26 1 53.47 AAACATATATATCTGATTTGATATAAACAAAGGCATTTGGTTTTATTTCACCTCAGAAGCTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCAC:1 - chr2L 23180749 5' + 1360 260 1 52.48 GAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 7255817 5' - P-element 2862 1 54.46 AAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTGGTGGC:1 - chr2R 4578500 5' - Chouto 408 1 56.52 TTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr3R 7388327 5' + HMS-Beagle 18 2 61.39 AAGACTGTCAAAGATTGGTCAATGGTACATAATTATGTATTCAAGCAAATTATTTACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chr3R 23364353 5' + flea 4774 2 61.39 ATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 + chr3L 10143163 5' + 297 6614 2 65.35 TTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 - chr2L 15947437 5' - Transpac 5180 2 71.29 GCAATAGGATAATGATAAAAACTATATTTACATAATAACGCCAAGCACAGTTCCAAAATCTTGGAAATCCACAATGCCGCAACCAACAACAAATTACACAC:1 + chr2R 25194862 5' + Doc4-element 199 1 61.39 ATGGGCTTACCAAATTGGCATCCTTTAAAATATATTTCCACCATGGATTACTAAATATATGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCT:1 + chr3R 10240075 5' + invader4 2774 2 65.35 ATTATTTCGGGAGCGAGATCGCCCGCTTGGGATATTGACTACTACAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTTAAGACCTTCAACATCTTTAATTAAA:1 - chr2R 5226116 5' - invader2 4634 1 66.34 AAACTNAGTTAGCGGTACCAAATAGAACAATTGAGTAAGGAACAATGGCATAAAGCCCTCGAACGAAGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAA:1 + chr3L 25492696 5' + Porto1 446 1 71.29 TCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCTC:1 + chr2L 15081432 5' - hobo 3 1 51.49 ATTTTGTCATCAGCCGTTCAGCGAGTGCTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCAGACTGTTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTC:1 - chr3L 10036991 5' + Cr1a 358 1 74.26 ATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 + chr2L 9163720 5' + copia 4900 2 60.61 AAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATT:1 + chr3R 13582223 5' + BS 5026 1 54.46 GGCTTCTATTCTAAGAGGTGGAGGAGAAGGTCGCAGGACGCACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 16674944 5' + roo 8677 2 66.34 ATGTTTATTCTATAAAAATGGTGCTCTTCGAGGCACTTTGTTCTTGAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCC:1 + chrX 1764363 5' + Stalker 129 4 58.42 CATTCACATTTAAATTGTGTTTGCGGTAGTTAATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTA:1 + chr2L 13333995 5' - flea 249 2 67.33 ATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTGCGTCTCTCGGAGCTTTCGTGTATACTATACGTGGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr2R 10444301 5' - P-element 2870 1 48.00 CAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chrX 18144346 5' - hobo 2914 1 54.00 TTATAATTTAATATAATAATAATAATATATATATGTCGTGTATTCCTTTTTAATTTCCAATTGTAACGTACATTTTATATTTGCTAGAAGCTGGGCATATT:1 - chr3L 20055876 5' + invader5 47 2 67.33 CTGTCNTGTTGCATACTTTTGGGCAAAAGGGGCGGAGGTCATATAGACTATGCAGCTAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 3968981 5' + jockey 23 1 60.20 TGCATCATTAAACCGAAAAATGCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATATGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTA:1 - chr3R 7934142 5' + 1360 338 1 78.22 CAGGTATTCAGCTGTGAGCCAAGCTGCCATGACTGCCCTAATCAGACTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCATTTACATATTTATATTTATGTTGATAA:1 + chr3R 25789423 5' - 1360 2955 1 53.47 CATCCATTATATCCCGGTTGTCTAGGTAAATCTATATGGCAGGGCCAGGACATGAAATCTTTTT:1 - chr3L 5605368 5' - G3 4456 1 54.69 AATGTACATATATGTATATAGTGACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGTATATTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAA:1 - chr3R 14473543 5' + 297 203 2 59.41 CCTCAACCATAAGCACACCTTATGTTTTTCAACCCAGACTTGTGCTTATCATAACTAAGTCAAGGAATTCTTTTGTTTTCAATTTTGCTCCTATTCCGAGA:1 + chr3L 23095724 5' + S2 249 1 59.41 TCCATCAATACGTGCACATATTCAAGTAGGGTTTCTTCTTTTTTTTAACCGTTATCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCCTC:1 - chr2R 496286 5' - Bica 482 1 62.38 CCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAGTCAGCTAATGTGAATGCGAA:1 + chrX 10445570 5' - INE-1 531 1 74.74 AAAAATAAGAACAAAACAAAATGGAAATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACA:1 + chr3R 9285783 5' + accord 172 2 74.26 CGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:2 + chr3R 19446159 5' + 297 38 2 69.31 ATATATATATATAGTAGCATTTGTGCCAGTATAGTATAAGTATAAGATATTATAAGATAAGATATTAATTATAAGTAGTATAAGACCACATATACTTACAC:1 - chr2R 8505076 5' + Quasimodo 21 2 50.50 TTTTTCCGCTTTAGTTTTCTCTTTAGTCTATAAATCCCAAGCCTTTGTTTAAGGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr3L 17917903 5' + 297 5 2 55.45 GTTAAGATTTCTTGGATTTTTCCTCTCATAATAAACTAATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 + chr3R 5633274 5' - S-element 1677 1 66.34 TTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTAC:1 - chr3L 25232904 5' + GATE 37 2 51.52 GCTGGGCGAGTGTGAGTTGGCCTTTTCCGATTTGTTTTGCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr2R 24239329 5' + hobo 39 1 64.36 GACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 4601392 5' - opus 7479 2 57.43 AGGAGCTCAAGATAGGGTTCAGTAGTCCAAAAATATTAAAAAATCAAATGTCATTAAACTATGCAAAATATAATATAAAATATATAATATGAATATAATAT:1 + chr2L 16796184 5' + transib1 1922 1 65.35 ACTCCTCCGAAGCCCGTGGACCGATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAA:1 - chr3L 18546403 5' - roo 8656 1 77.23 AATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:2 - chr3R 19446228 5' - 297 367 2 55.45 TCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 12539508 5' - roo 9026 1 72.00 AAATGCTTTGAGGGATTAGCGGGAGCGACATTTGTGGAGACCGCAGCCAGCGGTCAGAAGGCGCAAGGAGAGCCAAGCATCCGTGGCCGCAGCCAGCGG:1 + chr3R 15192476 5' + aurora-element 384 1 72.73 TTAAATTAAAAGATTAGTTTATCATTGGTTCTTAAAAAAATATAATTTTATATTTATATCATCATGAAATATCTAAATATGTATATA:1 - chr3R 14563054 5' + G3 4504 1 90.80 GTCAATGGCACGATGAAGTGAACGTCGAGTACATTACGTATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTC:1 + chr3L 20524623 5' - invader2 4820 1 63.37 GTGTTCCGCGTCTGGTTAGCAGCTTGCAGGTAAGCTACCGCCAGCTACCCCGTTATCCTCACATCCTGTCATGCGGGAATGTCAGTCAAGGTATGACTTC:1 + chrX 20398663 5' - Rt1b 4978 1 72.00 CAAATAGAAGCATGCTTAAATTCAAGGCCATTATACACTATAGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 19447672 5' - roo 9039 1 59.41 CTTACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGC:1 + chr2L 17784618 5' + gypsy10 25 2 50.50 CGAACTGGAAAGCAAATAAATGGAAGGGGAAAGTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 - chrX 16749162 5' + FB 45 1 66.34 TGTGTGTCTGTGTGACTGTGTGTGTCTATGCATTTGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGGTGAGTTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2L 16869905 5' + P-element 5 2 74.26 TAAGACAGCCTTGAAAAAAAATTCCAAAATGAACTAGTCTGATTTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAA:1 - chrY 3271643 5' + Circe 7166 1 74.26 TGTAGCTTACGAACGATAACAGTTGCAGCAGAATCTAGGAATAAAATTTACAAGTCGGACAGACTTCACCATTCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTAGCTT:1 - chrX 17176123 5' - hopper2 238 1 76.24 GTAATCAAACTTGGCTATCTTAATGTCCAGTTCAGTGGAGGAGAGTATCAGGTAGAGTATTCGTCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGT:1 + chr3R 11688822 5' + 1360 441 1 62.38 AAACTAAACATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTGAACATTTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr3R 9995360 5' - Max-element 273 2 52.08 CGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr3R 4544068 5' - flea 224 2 57.43 TTCCAATGTTGCTGTTGCTTTTGCTGTTGCACATGTGCCGTGATTCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 16318147 5' + roo 30 2 56.44 GACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAGATCTCA:1 - chr3L 12364634 5' + INE-1 135 1 76.24 GATGTATTTTTAGCATGTTTATCGACAATTAGTCACCACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTG:1 - chrX 10673557 5' + mdg1 196 2 64.36 AGGAAATTTCAGGCTTTTCAGACTTTTCTCTCTTGATAAGTTTCAGTCTTCTGGTAGAAATTCCACTCCACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGA:1 + chr2L 20133273 5' - flea 4857 1 67.33 GTATTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGGCCTGCATTCGCCGCTTATTGCACACGAAGGAGAGTATAATTTGAAATGAATAATCAATCTTTAGGTTCT:1 + chr2R 7988186 5' - hopper 1142 1 56.00 TTTTTTGTATATTTTTGGAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTATCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGA:1 - chr2R 10704757 5' - jockey 116 1 80.20 TTCCAACTACTTAAACTTAATGCAGTATTGCGTTTTTTTGGTGTATAAACACAGCCGTTGCGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCA:1 - chr2L 4416230 5' + invader1 3647 2 61.39 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chrX 21852423 5' + Tirant 8156 2 73.00 TAACAGCTGGTCAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 3817451 5' + roo 8699 2 66.34 GAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chrX 15305661 5' - roo 9031 1 80.46 GAACAGTGGTAATTGTTTTTTAAAACAAAAATTAGATACCCGTTACTAAGCTAGTGGGAATGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTTCTGGGATATCGATAG:1 + chr2R 25131806 5' - INE-1 502 1 64.36 CCGGAAGAGAAACTGCGGAACGTAAGATAGCGATTGTATTTTAGGTTAAGCCGACTAATCAAGTTGGGACTCTCAACTTCACCACGAGTAAGCTTACAAAT:1 + chr2R 2562964 5' - Cr1a 4046 1 56.44 ATTAATATTATTTTTATTTTATTATTTGTCTTTTAAATTTTTATCGATATCGACTCGTATCACCCAAGAAGCCCAGGCTTTTTTAATTGCTTCAACTAGGG:1 + chr3R 4357196 5' - Tc3 1317 1 75.25 GGTGAATGGAGTTCGTTTTTTACATTACATTTTTATAGGTGTTCCATTTTTTTTTTGTATTTTTT:1 - chrX 9299940 5' + hopper 141 1 89.23 GTGCTGCAGTTCTCTGTTGTCCAGCACAGCACTGCGTGTTGTTCCTTTTATCGTTCTCACCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCAT:1 + chr2R 2498375 5' - 1360 497 1 59.41 ACCCTTTCCAGCTCCTCCTGCCCAGCGGGTCTTCCTTCTCAAGAGGTATAATTGCTGGAGTTAGGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCCTTAG:1 + chr2R 9666602 5' - gypsy 350 2 81.19 GCATTACACCTATTTGTGCCATTTTAATTTCGTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr2R 8310925 5' + pogo 18 1 57.43 CCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 - chr3R 7168629 5' - flea 4975 2 72.28 TGCAGCACATATTGCCCCCTTCCTGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr2L 12949289 5' + 412 22 2 56.44 ACGAGCTCATTCTGTTAATGTTGTTTCAACTATTCAGTTGTGGTATTGTTTTCTGAAGTTGCTGAGAGCGGAAGTGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGT:1 - chr2L 21608226 5' - Porto1 499 1 66.34 TCCCAGCTAATGACAAAAATTTCCGGTTTCACAGCAACAGCAGGAAAAATAGGAACAACAACAAATGATAGCAATATACAAGACGATAATAAAACCAATAT:1 + chrX 18942023 5' + Porto1 4248 1 72.28 TTGTCGAAAAGATTTTACAATTGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGC:1 + chr2L 16042436 5' - 17.6 309 2 78.22 ATTGAAGGACAATAATTTGATCAAGAATTGGTTTTCATTGGAAATTGGAAATTGGATTGGAATTCTAAACAGCGACAACAGGTGTGAGAGGCAGGCCGCCC:1 + chr3L 24999089 5' + blood 494 1 63.37 ATTGACCATTTCGTTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 + chr3R 7388314 5' + HMS-Beagle 6801 2 74.26 CTGTTACATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2L 12324109 5' + roo 8688 2 55.45 CACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 992033 5' + hobo 33 1 67.42 AAGGCAAAAAGCAAAAGATGGCAAGGAAAACTTAAGAAATTGACACCGTATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCT:1 + chr2R 7346576 5' - flea 4564 1 54.46 TCAGCCTCACTTAATGGAGCACGGCCAAGAAGCAAGACGATCTCGAGGCGGGAGATTTTCTCTGCTGCTACCCATGGCATTCCA:1 - chr2R 10076619 5' - G-element 4047 1 59.52 AAAAGATTTATGATTTGGGTTTCAAGGCCTCTACGTAAAATCAGTTTCAGAACGATGTAATCGAGACCACCGACTATTCATTCCCGTTACTCAGCTAGTGG:1 + chr2R 25253146 5' - INE-1 540 1 50.50 ACATACATATATATACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 27748652 5' - roo 391 2 61.39 CAATTTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAA:1 + chr4 829440 5' - INE-1 90 1 79.21 TAAAATCTTTGTTTTTACTTCAGTTCTTTTGAATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTT:1 + chrX 20766585 5' - P-element 91 1 41.58 TTTAAACTATTTGTTGTGTACGGAATTTTTTGTAATTCAATTTTGTCCTCTATGAATAATTTTTGCAATCAGTTTTTTTTTGCAATGAGAGCCGGCGATCG:1 + chr3R 24398401 5' - Doc2-element 326 1 78.22 CCTCTGGGTGTACGCTGAATTGCATACTGTAGACCACATAAATTTTGATTTCCCACAATTCAGAAAACTGTCGCCTCAAGATCGCTTACAGGAGGCAAAAA:1 - chr2L 22228253 5' + G3 126 1 74.26 TCTAAGAAATTATGAAAAAAAAACTTAAGCGAACGTCGGAACCAAATTTACGTCTTACACAATTAAAGTATGAAT:1 - chr3L 609954 5' - Quasimodo 7279 2 88.00 CCATTCAACTTGTCAACGTGTCGCCTGCCAAAGTGGCTGTAAAATGCAACTCCCTTGTGGGACACCGGATGTGACTCGTAAAATACGAGATAAAGAATTTT:1 + chr3L 15886500 5' - Q-element 449 1 53.47 TTTTAATACAAAACTCGCAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chrX 18144329 5' - hobo 2930 1 70.30 ATAGANATAAATCATACATAAGTCTAAGTAATTGTGTGTTGTGCCATGGAGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACA:1 - chrX 14669180 5' - accord 156 2 65.35 CTAACAGGGATTTGTGCGTATTAATTATTTGCTTTAGAATCCGGCTCTAGATCGTTGGCGTTGGGTGTGGTGGTCTTACTTGTACAGATACCTTTTCGTTA:1 + chr3L 23486141 5' - Gypsy12A_LTR 2151 1 70.30 ATCCAGCTCGTGGTTTGCAATAAGTGAAGCTCTTGAACCGTTGACATCATCCTCAGTTTGCGTAGGTAGATAACAAAAAAGAACAAGGAATAAGCGCCG:1 - chr3R 4509857 5' - diver2 4668 2 67.68 TTAAAAAACACACACAAGAATTTGCTGGGCACATTTTTAGGCACCCCTTCTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chrX 13761233 5' - pogo 2078 1 56.44 TAGGGTAGGACGTATTTTACGCAAAATAAAATGAATAAGAGGAAAAAATTTGCAAGACAAATCTGTACGGGCAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCT:1 - chr2R 5789480 5' - INE-1 105 1 59.00 AATTGTTTACATTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chr3R 15151312 5' + jockey 4704 1 50.50 ATTCATAATTTTGTTAAACAGTTTAGCCCCCCCAACTCCTGTTGCTCCTTTTTCGATATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGG:1 + chr3R 12298489 5' - Quasimodo 265 2 63.37 AGTTTATGTTTGACTTTTAAAGTACTAAAACTGACTAAAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCT:2 + chr3R 18210304 5' - Juan 4204 1 65.35 CAGCCTGCATTGCCGCCCTTGTCAGCACTCATTAAGCTCTTAACCTCATTCGAGCCAACGCACACAGACCACACAGACCACTGTAGCATATTGGACTAATC:1 + chr2L 18028833 5' + Stalker4 6955 2 55.45 TGGCAGCCAAAGGACCTTGTGCTGTGCTCCACTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTA:1 + chr2L 4153652 5' + 297 456 1 68.32 TTACCACCGCTGTTGATCGATATTTTAATTTTATTAAAATCTCGACGTTCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTAATCCTGATCAA:1 + chr2R 25240193 5' - INE-1 90 1 57.43 TCAACGCATAAATTAATTGCTCGTAAAGTGGCAGAGTTATGGATATTGTATCAGTTTTTAACTCTTTTTTTTTTCTTTTTGTTT:1 + chr2L 5503122 5' - Doc2-element 219 2 89.29 TGTAATATTTTAGAGCAGAGCGGAATGGCAATGGTCAATCGTCTTTCTTAGTGGCTCAAAATCTCGGAGCAGACTTTGTGTTGTTGGCCAAAATAAACCAG:1 + chr3R 31434938 5' + G3 419 1 72.28 TATCAAATTATATTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTAT:1 - chr3R 7168661 5' - flea 248 2 69.31 AGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATAT:1 - chr3R 1977624 5' - micropia 5413 2 50.50 ATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2R 6172982 5' + pogo 14 1 65.35 ATTCGGAAATTAATAAAAAGTTTTTCACTTTTACTACTGCTTATTGTTCCGAACTTACCACGTTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTC:1 - chr3R 2465822 5' - F-element 4326 1 55.45 GGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2R 15474851 5' - roo 9029 1 66.34 TGCAGGTCATTTGGCAATTAGGTCGCCGTACTGCCTGCCGGCGTTTTCCCCTTACCGACTTTGTCCCCCCGCAAAATAAAAAAAAACTTCTTAA:1 + chr3L 9245840 5' + Transib5 24 1 45.74 CAATTGGAGCAGTCCGACTGTGTCAAAGGTCCAGCTTAAAAAAGTTCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCAGCGTTCCTTGCGG:1 - chr3R 12589478 5' + Max-element 348 1 52.48 GGCAGGTAGGGGGGCAGGTAAACGAGTTGCCACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3R 8277960 5' + P-element 45 1 34.65 CCCTGTTTGCAATTTGTGCGCCATTTTTTGATTTGTTGGTTATTGGCCGCTCGTTGTCTCGTTGAATTGAGAGCCGTAATTCGTCTTGCTCGCGCTGACGC:1 - chr2R 19978265 5' - F-element 218 1 77.23 TTTGGATGGCCCGATTCCTTGCCAGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2 - chr2R 16988280 5' - opus 484 2 65.35 ATATATATACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAATACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 27748658 5' - roo 389 2 57.73 GCCAGTGTGTGCGTGGTGCGTTGAGCAGTATCTTGAGACGGTCTACATTTTCCAGTCTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3R 29286171 5' - mdg1 402 2 52.48 CCAATAAACAACGAACTGAGCACACTCCCCGGGTGTTATATATGCGTTTCTATTTATATATGTATATATTTATATATGTATATATGTATATATGTATATAT:1 + chrX 3287112 5' + G3 4505 1 74.26 TTTTTCCTTTGGAAAAATTTCTAGGAGAATGTCTACACAGCGGTACGTTATGTCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 + chr3R 3480957 5' + 1360 27 1 67.33 AAAGAAATAAACTGCTAACAAACAGCATCCAAATCTTAAGCTCCAATATTTTTTTTTCACGCACTTAAGTTGTTTTTAAATATTTTTAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 13933713 5' - hopper 157 1 79.21 TCTTATCCCATTGGCTTTTTCTTTGTTTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTCT:1 + chr3L 25885502 5' - INE-1 163 1 72.06 ACTTAAACAAATCATTTCGCTCAGTGCACTCATGCCTAACAAATTATAGGCCAATTGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATACAAAGAGACTTAA:1 + chrX 10163608 5' + F-element 4382 1 60.40 TATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGAATGTATCATGGAGTAAGGCTGAA:1 + chr3R 7168556 5' + flea 4757 1 70.00 TGACATATTGATGCTGCCTCTTTCACGGCAGTTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTT:1 + chr3L 11148040 5' - Ivk 5012 1 68.32 ACGAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAG:1 - chr3R 29331937 5' + G6 12 1 67.33 ACTGAATCGCCCCAAGAAAATCTGCCCACCACCCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3R 29123397 5' + P-element 40 1 40.59 TAAGCCGAAACATAAATTTCGTTAATCATTGAACTGGAAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 992114 5' - hobo 2935 1 75.25 TTCATATCGAACTGCGCTGCAGGAGAATCTGTGGATGTCGCTTTAGTGAATGTTCCTGTTCTCCTGGTCAATTCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 + chr3L 18625206 5' + Tabor 6885 2 74.26 TTTGTTATTTTGTTTGTTGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 + chr3R 17843608 5' - roo 9071 1 68.32 AACATGACAACGCTTGGATTATAAAACAGTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTG:1 + chr3L 24088512 5' - F-element 4429 1 71.29 TAGCTATACCAGTTTTTACCAAGTTTTTCGGGTGCGTTCGAAATTGCAAAATGTCGCAAAAATGTGCAAAAAAAAAAATAAATAAATAAATGAAAAG:1 - chrX 18188591 5' + Doc3-element 85 1 80.41 CGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAC:1 - chr3R 7388390 5' - HMS-Beagle 193 2 77.23 ATTTTCCGCCTTAAAAGCCATGAACATGTCATTGTCAAGGACTCGCTAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCT:1 - chrX 13012196 5' + Doc2-element 446 1 54.46 CCTATGAACTCCGGATCGGGATCCAGCTGGGAATTGCTCCAAGCTTTGAACATGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTA:1 + chr3R 28927556 5' - Idefix 7022 2 63.37 ATTATTGGTTTACCCCAAACTCTCACTCCTACAATTGAAAGTTAAGCTAGAGGCCCGCAACCTCACTATACTCTGCTACGCGAAATTTCATAATTTTTCTG:1 + chr2R 5436761 5' - INE-1 514 1 72.28 AACATATGTAGAATCTATAATTCGTGGTAAACATACGTTTTGAGTAAAAAAAAAAAGGGAGTACACAAAAAGAGAAAGTTTGAATGGTAAAAAAA:1 + chrX 18839592 5' + P-element 443 1 60.00 ACTTTNTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTT:1 - chr2L 3388126 5' + F-element 323 1 61.00 AATTAAACATCTTTGAAATTTGATTGCATTCTATGAATTCAGCTGCTGGATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGTTCATACGGAC:1 + chr2R 25190028 5' - INE-1 133 1 57.43 GATTGTCGTTGAGGAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCCT:1 - chr2R 4339735 5' - G5A 2758 1 61.39 AGTGATCAACTGTTGTATGCTGTTAGCTTACTTGGCATTGACAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTAT:1 + chr2L 21634418 5' + F-element 4537 1 59.41 TCGTTCGCTTTATTTTTCAGCTAAATTGTAAGTAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTTCA:1 - chr3R 19749525 5' - hopper 1007 1 67.33 AGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:2 - chr3R 27981726 5' - roo 9035 1 63.37 AGGGTAAGCAAAAAATATTTAAAAAAAAAA:1 + chr2R 15186535 5' + TART-B 10504 2 80.00 ATTTANATTTCTTTTTGGGCATATCGACGAAAGCATTTTTGGAATTAATGAAAGCCACATATGGGAGAAAGCGCGCATGCAATTACCTCAAACAATCCCAC:1 - chr3L 25887061 5' + I-element 4886 1 78.22 ATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGT:1 + chr3L 19951173 5' + Ivk 5 1 74.26 GGATGCCCCAGCAGCCAGCGAACGCCGTGCCGAAGCCACCGCGATCCCATGGCCTCCAGTGGTCATCGAGCGCCTATCCGAAAACCATATCCGACTATAAC:1 - chrX 17689521 5' + Ivk 362 1 78.22 ACATTGGATACCGGATTTGATAGAGTGCAAAATAAAAAAAAACCATCTAAATATATTTACGCATAAAGTAACCAAATTGTCTCCAAATAGTCAAA:1 + chr3L 23784552 5' + Transib5 68 1 69.47 TGAACCATTTAAACATGGACCAATGCAATCTGTTGTCAACATTTTTTCCCACCTTCCTCGATTCAAGTGCATTCACTGTTGCATACAAGTGCTCTTAGATT:1 - chr2L 17208115 5' - Idefix 7136 2 60.40 AAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTC:1 - chr2L 3440512 5' + Juan 23 1 60.40 CATAAAATAAATATGAAGTTACGATATATAAAATGAGTAAGCATTTAGCTGGAATTAACACTACCCAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCC:1 - chr3L 17666767 5' + I-element 5001 1 60.40 TATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 12539493 5' - roo 9040 1 57.43 AATTTATAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3L 12633239 5' + jockey 24 1 59.41 GAGCTACTCGACTTGGTCGTCATTGTCGCCATCATAGCGGCGACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCGAGCGAGCGCCACGAGTTGCGCCCTCTCCTC:1 - chr2L 2925968 5' - Rt1a 4619 1 75.25 CTTGAATTAGGTCTTAATTTGATTTGTGTGTTTTTTGTAAAGAGTTTCTTAACAACCTTAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTA:1 - chrX 12942332 5' - S-element 168 2 72.00 ATGCGNAGGCGGGGTAAACAGATCTGAATGAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTC:1 + chrX 14615927 5' + 297 195 2 70.30 AACGGNGCACCATCAAAGTAAACGCTGCTAATTTTGTTTATTGTAACGCATAAAAGTCCCTTGATACGTTTAAATAGGTATAAATATACTTTTTTTTATTA:1 + chr3L 3799350 5' + Quasimodo 7341 2 70.30 GTGAGCGTAATTACCAAAGGCAACAGACATTCACTCACTTACTCACTAACTCACCACGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATAAAT:1 - chr3R 25435626 5' + HeT-A 5951 1 56.44 ATTCCGTCTGAGCCATAGTATTCATAGATGGTACTGGTACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chrX 1281675 5' - roo 9035 1 60.40 CTTGACGCTCTCCCGTCACCATATCGGATGAACTTACTAAGGCAGAGCAGCCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTGGCATTCTGCAGGTGTT:1 + chrX 19660627 5' - Doc3-element 358 1 54.00 TCTGCTCTCTCAGCCGATCGCTCAGTTGGAAATGAGAATGAGTAATGCTCCAGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 3632216 5' - P-element 2862 1 54.46 ACTTTGGGTAGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chrX 10561867 5' + hobo 30 1 51.49 ATTAAACACTTTTTTATTTTTGTCAGAAATATGATGAAACTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCCGAGTAAGGGGTATTTGATAGTCGGTGAACTCGACTAT:1 - chr2L 18791465 5' + INE-1 564 1 77.23 TTTGTCAAGCGTTACGGAAAAATCGTTCCTTAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTG:1 - chr3L 12569959 5' - HMS-Beagle 6993 2 69.31 AAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 12103807 5' - roo 356 2 79.21 ATTGAAAATCATTTGGAAATCCAATAAAATGAAAATTTTACAACAGAATCGCCGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGAGATC:1 - chr3R 23114038 5' - X-element 4441 1 57.43 TACATATATATTTATATAAAGGATGCAGCAGAAAAACTTCCTATTTTAAAGTGTGAGACATTCAGTTAGATGATGTCATAGA:1 + chr2R 10775441 5' + mariner2 43 1 79.27 CTAATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2L 7488839 5' + roo 8678 2 61.39 GGGGTTATATCCTGGGTGTTGTTTATTTTTCTCTAGGTCAAAGCCTTAATTTGCCTGCGTGTCCTTTTGCCAACATAATTATGATCAACACACGGATCAAG:1 + chr3L 2877162 5' + diver 5822 1 73.27 TGTTACAGAACTGTATCTTACAGCACACCAAAGAAATATTATATTATTTAAAAATTAAAAATTTAGGATTAGGATGGACCTAAGGATCTAGGGTGGTCCTA:1 - chr2R 959967 5' - mdg1 106 2 75.25 GCACTGCAAGAAATTACATATCAAATTGTTTATATATCAAATTGTATACGATATTGCTTACAAATAAATAATAATCATTTTGGAATT:1 + chr2L 12756515 5' + P-element 2502 1 54.02 TGCAAGCCCACCACCGAACCATTCAGCTTATCCTCGTCGTAGTTAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCCAGAACAG:1 - chr3L 17451505 5' - diver2 4643 2 60.42 GTGCCCATTTACAGTTACATTGAAGCCCACGGTGCACAGCGAGAAAAATTCGCCACCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCT:1 + chrX 6656054 5' + P-element 2852 1 60.40 CCAAAAGCTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 + chr2R 694090 5' - flea 4996 2 62.38 AGTTGTCTCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAG:1 - chr3R 19530714 5' + BS 24 1 51.49 CCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCT:1 - chr2L 18279976 5' - gypsy5 388 2 57.43 GCCTAAAGAACAAGACCCTTCGCAAAATCCGTGCCAAATTCAAGTAGGCCCCTAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGG:1 + chr3R 10280492 5' + Doc 245 1 69.00 TAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2L 2074752 5' - roo 353 2 79.21 TCTATTTCAGAGCCAGCTGCAAAGGTCTCTGGCATTGGGCAATCATTGGGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCATCAGCCGCAGCGGTTTCAT:1 - chr2L 18516758 5' - X-element 335 1 57.43 GAAAATTCATGTGTATACACTTTATGATCAGAATCGATAGGCGGAGTCGATCTGGCCATGCCCGTCTGTCCGTATGAACATCGAGATCTCAGGAACTATAA:1 - chr4 716990 5' + INE-1 145 1 76.24 ATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:2 + chr2R 5067657 5' + F-element 62 1 75.25 TACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 - chrX 3305219 5' + transib2 21 2 56.44 TGTTCCCATACGAAAAATAAATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 + chr2L 15510372 5' + jockey 4672 1 75.25 ATAGCAAATTGTGCGGGATTTCCTTACAATACAACACCTTGTGTAATGTAATGTTGCTTCCAGAATTGTTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTG:1 + chr3L 24309968 5' - Bica 295 1 70.30 AGGTATACAGAGAAAAATGTTGCATTAGAAGAAATGAAAGCGGTGGGGGCTGTGCTGGAACTGTGTCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAC:1 + chr2R 19581666 5' - Quasimodo 6951 2 66.34 CTGCAGCCAAAACAGATGCTGAAACTGTACACTATGGGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCC:1 - chr3R 1273075 5' + 17.6 7158 2 63.37 AGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chrX 20806860 5' - opus 7478 2 58.42 ATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTT:1 - chr3L 9909779 5' + Transpac 20 2 59.41 CGCTCAGATTGGTTGTGGTCAGGTTGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGC:1 - chr2R 17831159 5' + opus 334 2 75.25 CTTACCGCCATAGAAACCGGGAAACTAGACGTTGTTGATGAGGAACTTATACGAGGCAATGAATATAATGCAAAACAACAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chr2R 5351119 5' + I-element 2 1 50.50 GTGTATCAATTCATCTAGAGCTTAAGATACCCCCAGCACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chrX 18556917 5' + transib2 39 1 78.22 CCAGGACCGCAATGGACCGGGCCATGTCATGCTGGTTAAACTGACGAACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr3R 12277578 5' + Tirant 8135 2 53.47 ATATTTAATCTAGATATTTCATTCGAATGGTCACCCCAAAATGGTCGGTTGTAAGCCGTGTTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAG:1 - chrX 12130350 5' - baggins 5415 1 71.29 AACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3L 11113897 5' + 412 7081 2 55.45 TCAATNATTTCGAGTAGCTAAAATACATCTATCTCCCATGTTTTTTAAAGTACAGTATAATTCGCTGAATTCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAG:1 - chr2L 20824999 5' - pogo 13 1 51.49 CGAGCGTCAAGCTTCGTTTTATGTGCCAAAGCAATTTTTATGACTACATGGGCAAACGTAAGCAGCGCACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCACA:1 - chr2L 15020778 5' + INE-1 215 1 63.37 AACACAAATAACAATTTGTTTATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCT:1 - chr2R 21074129 5' - jockey 4738 1 79.21 TTATTTGCTCAAATGCTAAAAAAAAAAACAAAAACA:1 + chr2L 9079783 5' + G-element 4325 2 91.67 AGTGTAGATATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:2 + chr3R 9551433 5' - P-element 2843 1 35.64 GCATGCTCAAGGCCGCGAGGGTGGGCCTTGTGGGCGGTGGTGGTGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chr2R 16935252 5' - 297 6969 2 47.52 ATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr2R 4830339 5' + 1360 55 1 94.00 ATTTATACAAGTTTTATTTGTTTTCGACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 14802446 5' + roo 8753 2 74.26 CAGGCCACCTCCACACCAAGTACCGGGCAAATTCATCTGCACGTGCACTAAGAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACTCTCAACTCTCTCGCTCACA:1 - chr2L 16344749 5' + Porto1 471 1 73.27 TGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr3R 24760619 5' + pogo 32 1 68.32 AGAAGTTAAGTGCAAGAAAAAAAAACACACACACACACCAAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTG:1 - chrX 3365243 5' + Doc 4465 1 60.40 GTATTGATGACTTTAATGGACGGCTGAAATTCGGAAATAATTCAGCTTGAACTATAATTGTATTTTTTTTCTACAAATAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAA:1 + chr2L 21945978 5' + Doc2-element 246 3 78.22 GAGCAAAACAAAGTAAATACCAGTGCAAAACTTTATTTATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAA:1 - chr2R 16681804 5' + I-element 296 1 62.38 TAATTGGGCCTTCAGGCAGGGCTTTTAAAATTTTTATAATAATTGCGCACACAAATGAATCACACTTTGTGGTTTTGGCCCTTTGGTGGGAGTCGCGAATG:1 - chr3L 20317676 5' - Quasimodo 324 2 67.33 GCAGGNTGTGAGGCTGTTGTCGCTGTATTGGGCTGTGGTTTGGGTTTGCTCACTTTCGTGTTACTCTTGGCGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTC:1 - 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INE-1 569 1 49.50 CAAGTATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr2L 20706662 5' - mdg1 386 2 56.44 CAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 - chr3R 11094577 5' + 3S18 28 2 51.49 AATATATATCTAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAATATATTCGGAGGGAGACAGTTCTAGAAGAGGAGGAAAAGCTTGAGAATTTGTTGCCTGTGAAA:1 - chr3L 25255429 5' - Gypsy12A_LTR 1999 1 59.41 ATACAAATTTACAAGACTAATAAATATATTTTATTATTATTATTATTAAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTGCTACCCCTTC:1 + chr2L 9547537 5' - baggins 5391 1 74.26 TTTTCGTATATTCCGTGTACTTTTTTTGCTGCATGCGGATGAGTTGGCTGAGTGTTTGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGTACTTGTCCGATGGCT:1 - chr3R 21701566 5' - jockey2 3147 1 62.38 AACCCCCAAAGACGAAGAAAGTTTCAGCAGGAAAGGACTATGCATAATTCACATCCGTTGACCAGTGGCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAA:1 - chrX 17540355 5' + Idefix 7071 2 71.00 GTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGG:2 + chrX 15293447 5' + Quasimodo 48 2 66.34 CAATAAAGGATATGCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr2L 15808055 5' + I-element 16 1 60.40 TGAATTAAATCTGTTATATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGT:1 - chr2R 9317045 5' - opus 489 2 64.13 ATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTAT:1 + chr3R 4834271 5' - mdg1 373 2 75.25 CCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 23275277 5' - roo 356 2 78.22 TATACNTTTTGAAGGGGACTTTTAGTGCTGTTTGGAACCCCAAAGTGCTGGCGATTTGAAGGGCCTCCGTAGCTAGTACTCATCAGTAAGTGTTGATGTGT:1 + chr2L 17015197 5' - Ivk 5072 1 48.51 AATTTAGACAAGCTCATCTGCGGCGTCTTCTAATGCGATTTTAATAATACCCGCCCGTCTTTATAGTGGGGGGCATATGGTCATGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 16381851 5' - Quasimodo 42 2 71.72 AACCGATTCCGGTGCTTTTGTCTCTGTTTTCTTAATTTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAG:1 - chr3R 16034681 5' + transib2 2707 1 64.36 TGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - 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roo 388 2 58.42 GCTGTCTATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 - chrX 20880656 5' + invader4 34 2 65.00 ACTTGAACATATTTCTCCTGTTCAGTTGTGAGTTCATATTTTTCTCGAGTTTATTCTAGCACTGCCAATGCGTATGCGTATTCTGAGCACATTGTAATCTA:1 + chr2L 7537138 5' - gypsy11 41 2 54.46 CGGGATCTCAGCTATAAAATACTACAATAAAGCGACTTTGTTCTGCAAATGTGCAGAGCTTTTGCCGGCTATGCGAGGGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCA:1 + chr3L 23544656 5' - springer 7192 2 59.41 AGAACGTTTATATCGGTTTCAATTAAATTTAATTTGTATCGTGTTGTAATTAAGGTGCCGCACACACACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACTAA:1 - chr2R 22543751 5' + I-element 4958 1 69.31 GCTCATTTAAGTTGTTTGGCCGATTTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chrX 13761333 5' + pogo 13 1 67.33 CGACTGATTGTTTTGGCTTATGCGGCTTATGTGGGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chr3R 6608782 5' - I-element 5315 1 66.34 TAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:3 - chr3R 26530908 5' + blood 53 2 75.25 AAAAANGCGCCATTTTATCGAGTAGCAAAAACACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - 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hobo 482 1 74.26 GACGCNCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTAAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACA:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 5334 1 60.40 TTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACAT:1 + chr2R 3591999 5' + Quasimodo 45 2 81.00 CGAGTGGGCGTGCCCGCCCAAGTATTGACAGAGGAACAAGCTGTAACGAAGTATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 + chr2R 5811005 5' + INE-1 96 1 56.44 CGGAAAAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr2L 4160096 5' + Tirant 8112 2 76.24 GAAATAGGGACTTTACCACATTTGTATTTTTACTTTCCATTTTTATTTACACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 9880533 5' + transib2 2634 1 92.06 GCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATGCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2R 20744216 5' - roo 9031 1 65.35 ATTTGTGTTTTAATTAATATTGAAACGCGTATTGTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chr3L 10014535 5' - hopper 1379 1 59.41 TTGCCTCTATATTTAAGGTTATTTTTTTAAGTGTACCAAGTGATTGAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr3R 6622633 5' + P-element 26 1 53.47 CCCATTCATCAGCATTAATGCTTTGACCAGTCCTAGTCCAAATAAATTAAACAAAAGATGTAGCCTTGAAACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACA:1 - chr2L 22092776 5' + Doc2-element 4400 1 67.33 CTTTATACTTAAATATACATCAATACATACCAAATGGCAACTATAAATACGAAATACAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3L 17344997 5' - mdg1 405 2 60.40 ACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGA:1 - chr3R 29331927 5' + G6 22 1 57.43 TAATGTTTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2L 15080577 5' + hobo 27 1 56.44 GGCAGGGCAATACTCCGTGCCGTGGAGTCCAGAGATGGGATGCGTTTCCGATTATATAAAGTATATATATTCTCGATCAGGATCAATAGCCGAGACGATAT:1 - chrX 662277 5' + INE-1 97 1 63.37 ACCACTCAAACACAACCGTACACATCCGCACACACAGTTGTGAACATTTTTTTATATTTTCATATTTTTAAATTTATATTTTTATTATATATAGTAACATA:1 - chr3R 14991277 5' + Tc3 284 1 68.32 GCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:2 + chrX 21531018 5' - roo 9037 1 58.42 GCTAAATTTTCCCGTAAGATGATATTGCTCCGAAATGCGACTGCTGCCCCTGCTGTTGTTGCTGCTGGCGGGG:1 - chrX 9891033 5' - TART-B 149 2 65.75 TAGAACAATTTTATGGTGAGTTCTTTGCATAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 + chr2L 6083726 5' - 3S18 293 2 68.32 CATCCTTGCTCCCGATGCTGGGAACCACCACTTTGCGATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTAT:1 + chr2L 21645457 5' - Bica 408 1 69.31 TCCGGAAACTGACTGACTGCCCAAACAATCGGTACTGGGAAATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTA:1 - chr3R 13807254 5' - roo 8860 2 59.15 GACAAACGGGTTCAGCCTCTTATTGCCTCAACTTTTGTAACACCCCTCGCTCCCCCTTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 20593175 5' + hopper 140 2 58.67 ATATACAATGCAGGTGCAGGTGCATTTTGTGTGTGTTTTTTTATATTTATTTATTTGGAAATACACCGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATAT:1 + chr3R 6420569 5' - Tc1-2 435 1 72.28 ATGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr2L 20133076 5' - flea 4997 2 63.37 CAAACTTGTATGAAGAAATTTTCAGATCCTGAAAAGAAAAGGACGAAAAAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chrX 14323555 5' - hobo 2919 1 58.42 ATTTTTGCCTTCTTCGCTGGCGACGGCACATGGAAGCAACATGAAATTTTCTGCTCGGAGGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chrX 14323643 5' + hobo 12 1 54.46 ACATAAGATAAATCATAGAAAAAAACTATTCTTCTAAAATAAAATGTAATAGCCTTTCTTCAATATGGAACATAGAAATGAAAAATA:1 - chrX 15596001 5' - invader6 4513 2 63.22 AAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3R 17896953 5' + hobo 42 1 75.25 ATAGACAGTGGAGAGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGA:1 + chr2R 10945328 5' - transib2 2789 1 59.41 AATGGAAAAGTACGTTTTTAACTCTCTTGGAAATAAAAAATTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 23591489 5' - pogo 2069 1 63.37 GGATCTGTGGATCTGTTTCTGGTGATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 23275240 5' - roo 394 1 64.36 ATGCAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCGCCAGTACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chr3L 10013586 5' + hopper 37 1 62.38 CGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTG:1 - chr3R 12047462 5' + Stalker2 52 2 74.26 AAATAGTAGCAGTACTTTGACTTATACCACTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGAAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCT:1 + chr2L 18212721 5' + 412 7441 2 70.30 TTCACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3L 18500940 5' + hobo 23 1 54.46 TTTTTAGAGGTTCTGCTTTTGTCCGACTAGGGAATTGCTTTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCT:1 - chr3L 19619093 5' + P-element 200 1 51.00 CTATGTAGTACTTACATCATCAGCACGAATGCCTACCTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAG:1 + chr2L 22535602 5' - Rt1b 4988 1 70.30 GTGGAGAGTAATATTTATTTTTCCATTCCTCGAGCCTTTTCATGTCCGTATGAGCGCCAAAATTTCAGGAATTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCACCA:2 + chrX 15568398 5' + INE-1 169 1 65.35 AGATGAATTTAATGCTCGTGAGTCCGAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2R 15376539 5' + 1360 51 1 79.00 ACGAAATAATGCTATTTCTACGCCGCAACCAAAAGCAAATTACACACACACTCCGTTAACCATTAACTTCCAGCACAGCTGCCTCTCTCACAACTGCAATC:1 - chr3L 22876430 5' + Doc4-element 288 1 81.19 GCAAAGAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 18950759 5' - roo 357 2 76.24 AACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:2 + chr3L 19951191 5' + Ivk 22 1 57.00 GAGAACTGAACTGCGCACAGCAAAAGAAAAAAAAAGAACAAAACGAATAAAGGAGACGAACTAAACTAGAGGAGACACCACAAATTAAAAGCCAGGGTATT:1 - chr3R 16886561 5' + TAHRE 391 1 69.31 ACATAGTGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr2R 4483276 5' + Ivk 25 1 52.48 TTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr3L 8713145 5' + opus 7046 4 73.27 TGATTTGTTATTTCCATTTATTTAAAAATTGAAAACCTCTCAAAATCCATTTGATTACTATTTTACATTTTTAACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCC:1 - chr3R 18741065 5' + roo 293 2 81.19 ACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 13225498 5' + hobo 32 1 56.44 AGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 13640701 5' - P-element 2861 1 53.47 AAGATATCAAATCATTTTTTTGAAGATTGTACGCGGCAGATTTGGGCGATAGTGTGGGCGTCAATATAAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTT:1 + chr3L 23123498 5' - flea 251 2 76.24 TTTCTGTCGGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chr2L 14612123 5' - roo 400 1 70.30 TTTAGTATTTTTTCGATTTTTTTTACACATTCTGTGGAGAGTGTGTGTGGCCCTTTGGGTCCTTCTTTTCTATTATTTCTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCT:1 - chr3R 11337156 5' - X-element 4640 1 56.44 TGTGTGGCCTAAACTATCTGGGGGGTATGATGTTGGGTGGGTCTATCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGTCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTG:1 - chr2L 12388091 5' - I-element 135 1 69.31 GCCAGCGGTAGTAGCAGCAGTACCAGTGCCAGTGTACGGAAGCTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGACTCAAGCCCTTAACCAACAATCAT:1 + chrX 11683733 5' + I-element 167 1 58.42 CTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2R 11528050 5' + P-element 53 1 26.53 TCCGGTTCGTATTCGATGTTGTAATTGTAATGTCAGTTTCCTGTTTCTTCCTAGGACGGTCTACATTTTCCAGTCTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:1 + chr3L 6755799 5' - mdg1 420 2 66.34 AGAAGTGCGTGGTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr2L 12667263 5' - blood 367 2 64.36 AAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTA:1 - chr3L 18337693 5' + Juan 4071 1 70.30 AACAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 - chr3L 9909792 5' + Transpac 4926 2 72.28 TTCTGATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr3L 8614560 5' + opus 7149 4 65.35 AGAGTGAAGCAATGCGACACTTAAAAGTTATGGCTTACTCGAACTCAGTAGGAATACATGTGTTTGCGTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chrX 20316080 5' - accord 7031 2 64.37 CGCCTGAATGGCTTTAATTGAAAAATTTAAAACACGAATCACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGACAAGC:1 + chrX 20617866 5' + HMS-Beagle 6757 1 68.32 ATGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3R 4834258 5' - mdg1 386 2 62.38 CAAAACTTTGGCCGTCAGGAAAATAGAATAATAACGTTTACCAGCCGCATAATCTATATCCATCTCTCTTTCCGCTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAA:1 + chr2R 15433044 5' + Quasimodo 433 2 76.24 AGCGGACATAGGTATCTGATTTGCGGTTGTATTAGTTAACTGAGCATCAAAAAAGCTGGAAGCTGAAAATATTCATTTTAAAGAGGTGGGCTAAAGAAATT:1 + chr4 783630 5' - FB 453 1 60.40 CGCGTCGTAGACCAAAAACCGGACTCTCGGCCAGACGTGACTGACTGACTAACCAGTCGTATACAAACGCCACCCATCCATCTCCCTTTAAAACAGCTTTC:1 - chrX 6751914 5' + transib4 2441 1 49.50 ATAAATGCTCAATGGCTTGGACCATCGAAAATAAACAAAATCGGGGCACGAAGCCGTTAAGAGGGAACACTAAAATACACAGATACCCGTTACTCGGCTGG:1 - chr2R 20169401 5' - INE-1 543 1 65.35 CTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGAT:1 - chr3R 29331926 5' + G6 23 1 56.44 GGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chr3R 19530704 5' + BS 34 1 61.39 ATCAGCAATATTTGAGGCGCATTTGAGTGCTTAATTTGAACTTAAATCGACCGATGAGAATGTCGCCTTCTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTA:1 + chrX 17826272 5' - I-element 5304 1 74.26 AAAGAATAAATATTATTAAAAATTTTTTTTTGTTTGATGTTTTTCTTTTTCATTAGCACTCAAAACACCATGCGCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGC:1 + chr2R 5217561 5' + baggins 5128 1 61.00 TTGTGTGTTTGTCGTATTTTTCATTCTAATCTCACACAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACC:1 + chr2L 16075987 5' + I-element 4952 1 73.27 AGCACTACCGTCACTTTGCCAACCAACTCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATGTAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCACACTGCGTCT:1 + chr2L 15528399 5' + springer 467 1 76.24 CGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGTTGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGC:1 + chr3L 25232767 5' - accord2 187 1 50.57 AAACTGCCTCATTTCAGCTCTTTACAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTGGAGGCACAAAGTGCGGACACAAGCAC:1 + chr3L 27290565 5' - 1360 466 1 72.28 AAAGAATACAATTGCATTGCAAACTTTGATGGTTTTGGTGGTTGTACAGTCGTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGAAGATCTCCTCTGCTACCCATGGC:1 + chrY 1419780 5' - G-element 4053 1 73.27 TTCCATGCTAGCAAGCAGTTGAGCGTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGG:1 + chr3R 18754733 5' - Idefix 230 2 75.25 CGACACAATAAAATATAAATGCTTAATAAAAATATTTAATAAAGTTCTTTCTTCTTCTAGACCAAATAAACTCCCACAGCAGCCGATACGCCGACAGACTT:1 + chr3R 2449044 5' + G5A 2604 1 60.40 AATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 19552008 5' - roo 9016 2 80.20 ATCTGCCAGCCTTGGTCTATTACCGCCACCAGACTCCGATCATATACGAAGGTACCTCCATACAAAAGTTATATTCCACGAAACACAGCTACATTTGTTAA:1 - chr2R 6734758 5' - transib1 385 1 60.40 GTGCCCGCATTTGAGGCGAGTGGGCGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr2R 16940321 5' - 297 381 2 61.80 ACAAGATCCGGAACAACATGTTCAAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3R 11688524 5' + 1360 10 2 70.30 CTGTGGCAAGTGTATCGACAATGAGTGATTCTTACATACTTCGTTGTTGATTATATAAATTATTGCCCTATTGGTCATTGTCCAACATCTCATATTTCAAC:1 + chr3R 20422671 5' + HMS-Beagle2 23 2 79.21 TTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACGTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAG:2 + chr3R 4571526 5' + 1360 314 1 74.26 GCATGTAGATGAGCACGGAAAGCTGCACATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr3L 22831254 5' + 297 11 2 60.40 GCTCATGTCCACTACGTGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 + chr2L 12474948 5' - mdg3 233 2 63.37 TACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 21092464 5' - roo 9023 2 74.26 TATTAATGGGAATTTTGGGTTGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 19377703 5' + roo 8672 2 72.28 CGAGCAACGAACGAGCAGCAACAAAGGCACATATACATATATATATACATGGATCCAGTTAGACATATACATATGTATATGTATATGTATATGTATAAATA:1 - chrX 10101132 5' + Stalker4 7201 4 54.46 TGCCAAAGCCAAGAATAGAAAACAGAAAGAGGAAGTGCCACATTAGAGGGTGTTTCTAGGCTGTACACAATCTTTAAATAATTGGCGCTCAACTAGTGGTA:1 - chr3L 10991922 5' + gypsy6 404 2 75.25 TTAACCCATCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 + chr3L 17168843 5' + mdg1 36 2 60.40 GTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3R 8555857 5' - 412 7505 2 66.34 GATGAACCCGTGGATTTGCACAGAGAAGGTCGACTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 19481363 5' - roo 391 2 61.39 TCATTTAAATCCAATTAGGGCTCCGTTCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGG:1 - chr2L 234171 5' - X-element 4436 1 74.26 AATTGNAAATGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chr2L 18234161 5' + jockey 24 1 59.41 TTAAATTTCTCTTTGTTCTGTAAAGTGTAGCATATTTAGGGGAAGAACTTGTTTATTGTTATGGTGAGATATGCTGTTTTTGCTAGTGTCAGCACGTGGCC:1 + chr3L 27422674 5' + mdg1 7295 2 70.30 TTACANGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 - chr3R 6735334 5' - copia 221 1 58.42 CCTAGCGGCCATTACGAATGATTAAAGTTGTTTTGACCCAGAGTACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr3R 11544346 5' - hobo 2907 1 57.14 AGTATGCCAACAAACCAAAACAGAAAGCCAAACACATGCCAGGCCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATATTCGATCCGCGACATCCCCGACC:1 + chr2R 13641527 5' - aurora-element 4037 1 56.44 ATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 19377776 5' - roo 9021 2 75.00 GTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 + chr3R 14917200 5' + HMS-Beagle 6840 2 72.28 GGAAANGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr2R 12492358 5' + hobo 22 1 54.46 CAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 19446164 5' + 297 6624 2 74.26 TTATAGGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2R 4854992 5' - opus 7464 2 64.36 GACTATCTTTGTTTGGGTAAAGATGATATCATTAATATGAAGCAAAAAGATTTGTAACGAAATCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 - chr2L 4118182 5' + FB 15 1 64.36 ATGATTGACAGCTAATGGAAACAAAAGCAATTCGAATACGTGTGTGTGCATGTGTGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr3R 25096505 5' - P-element 2792 1 57.43 CAAAACGAGTAGAACATCTGGGTTATCCCATGGATTACTTTTAGGTACAGTCACAGTGCAATAGTGAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATT:1 + chr3L 14952338 5' + transib2 53 1 65.35 GTAAATAATCTTTATTTAAACACCATTGAAAAAGGAAGTTATCTTAATATTCACATCTACTTTTAATGGAACAAACATGATCTTGTAAATTGTAATTAATA:1 + chr2L 4702268 5' + transib4 2606 1 87.13 TTTATNTCGAGGCAGCCTAAGAATAATACGCCAGTAGATTCCTCATGCTTTTGTAATGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCA:1 - chr2R 12108391 5' - Stalker4 484 1 58.42 TGCCCATCAGCGTTTCCAAGAGGGGTTAGAATAAAAAAAAAACAAAAAA:1 + chrX 6710554 5' + Rt1b 5150 7 61.22 GATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 + chr2L 2078456 5' + I-element 49 1 77.23 GCAAAAGTTAATTTATGCGGGCATGTCTGTGCTATCCCCCCTCTCGTTCACTCTTCCGTGACAAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCG:1 - chr3L 14892955 5' - invader1 87 2 59.41 GCCCGACAAATAAACACAAAAGACCAAAAAATCGGCCAGAAAGTGCCGAGATACGAAAGCACAGAAATAAACGGTTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAA:1 + chr2R 19943884 5' - 412 490 2 73.00 ATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2R 24021629 5' - pogo 2058 1 74.00 CCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGATGTTTGAA:1 - chr2R 5019423 5' - rooA 332 2 69.31 ATTCCTGCCACCCCCTTTATCCATTGCAATTCACTTCCATTTTCAATTCATTTAGCTTCGTTTGTTACTGGTATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTTGT:1 - chr2L 4021310 5' - G2 3076 8 77.23 ACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr3R 19989333 5' + hobo 20 1 59.60 AATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 18659031 5' + pogo 43 1 68.32 TAGTTTATGCAGTATAAAGTGGCTTACTATCAGATACCCGTTACTGAGCTAGTATGAATGCAAAACCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAGAT:1 + chr3L 23746919 5' - INE-1 500 1 75.25 TAGCATAAACGTAGCATAAATGAAGACATTTTTCGGTCAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATATTTATCTGAAATCAGATCACTGTGCACGGAAACACAA:1 - chr3L 21784185 5' - Cr1a 397 1 62.38 CGAAAATAGAGACGAGCAACCCGGCCATACGGATGAATAGCCACTTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATA:1 - chrX 8972476 5' + Tc3 237 2 76.24 ACTTACCATTAAACAGTTTATGGCAAACATAAGCCAATTAGAAATATTCTCCATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr2L 9163794 5' - copia 230 1 51.49 AAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTGGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 16880920 5' - 1360 3381 2 79.00 ATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 27981741 5' - roo 387 2 57.43 AAAAATAAATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 + chr2L 15510384 5' + jockey 4684 1 63.37 ATATTGGTTGTAGCTATTAATATTTCCCAAGTAAGCAATTAGGATAATAAAGGGACCTTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATC:1 + chr3R 5690341 5' + P-element 446 1 62.38 ATGGTTTTATAGGGGTTGCGTCTTGGAAAAGTAATTTAAAACCTTGTTCAATTTTAAATTCTGTTAAACAGTACTATTTTATTATTATTATTATTAATATT:1 - chrX 7253108 5' - mdg1 7087 2 77.23 AGGACGAGACGTAGAGAAATGCTAGGCATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr3R 5686049 5' - P-element 2857 1 49.50 CTCAACCTTCTAGCTATTATAGTTCCAAAGATCTCAATGTTCATACAGACGAACATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 1751257 5' - roo 9051 2 59.41 AGAAACAAGCACAACCAAGGTCGTAAGTAGAGTGCCTATATAAAATCAGAAGGAAAAGACGAAATTAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACAT:1 + chr3L 24162721 5' - 1360 3153 1 65.35 CGTATGTATGTATTTTTTGGGCATTTTGTTTATGTACTTTGTATAGTAGGTAGGTAGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAGCTTGGCGCGCATTCTGCGCTC:1 - chr2R 16183954 5' - Porto1 402 1 58.42 ATGTTTCGGCATGAGTTTTGAACACCTTATAAATGTAAAAAAAATTACGAAATTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chr3R 20878545 5' - 297 6958 2 51.49 AATGGCATACTTCTGGATTATATATTACACACACACGCACACACACACACATATAAAAC:1 + chr2R 16537739 5' + Quasimodo 40 3 77.97 GTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:2 + chr3L 10081931 5' + rover 6975 2 55.45 ACGTAGAAGCTTCAGTCCACAGCAAACTAAAAAAAATCGGTTCCATGTTCTCACTAAAGTGTTGTTGTTGGTGTCAGAGTTAGAGTTGGTGGGTTATGTTT:1 + chr2L 21211377 5' - I-element 4964 1 59.41 TCCATTTTGTCTACACGCGCAATTATCTGCACTTTAAAATGTACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chrX 6379132 5' - hopper 1387 1 57.43 AAATTATTTTCGCCAAGGCAACATTTAGCACGCTCGAAGACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTTTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGA:1 - chr3R 14193309 5' + 1360 3302 1 63.37 AAAGGCCACCATCAAGCTGACGAAGGTCGCCCCATCGAAAATCATTGTAGATCTAAC:1 - chr3L 6563758 5' + Cr1a 4147 1 77.19 AGACTTCATATATTCACCAGTTTGTATTCTAGAAGCTTCGAAAATGATGATGCGAAGTAATGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCC:1 - chr3R 2937753 5' + 1360 456 1 65.35 AAGGCTGGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1 + chr2R 4547734 5' - HMS-Beagle 241 2 74.26 AACCAAGGAAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 9556636 5' + Doc 31 1 51.69 TATGAGTGAAAATTACTTATCGTCATTGCATTAAAGCCCACAGCCACACATACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr3L 11661812 5' + hopper 7 2 67.33 AATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr2R 14708951 5' + Doc 19 1 66.34 ATTTATTATTTATTTTTTATATATATATATATATATATATTTATTATTATTTATTGAATCTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCT:1 - chr3L 11558044 5' - Doc 4641 1 68.32 TTGGCAATAAAAATATATAATATGCCCGCCAGGCGCTCAGTTATCGAAACGATTCGCTGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGAC:1 - chr3L 9122314 5' - Quasimodo 373 2 64.36 TTAGCGCTGCCATTCAACTAAAAACAACGCCGAGAACAACAGCTGGTGAAGGCTTTTCGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3R 6622723 5' - P-element 2873 1 67.33 GTTTGGCACACGTATTGATTCTGGGCGATTCTCTTTAACGAATCAAAGCAGCTGACACTTTTGGGACTTTTGCGGAAGCAATCAAATAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 10744862 5' + Rt1b 5143 1 69.00 TAGGAATAGGGTTCGTCGGCACTTACATGTCACTGGGTAACGTTTCGGGACTAGAAGATCGCTCATTCCACGTGTTTCATTCATTCTTACATAGGTTCTTA:1 - chr2R 19218199 5' - rooA 273 2 73.27 CGTATACACTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chr3L 8713075 5' - opus 477 2 58.42 AGGCGCAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:1 + chr3R 8458218 5' + HMS-Beagle 30 2 54.46 ATAAAAGAGGATGAAAACCATACGGAAAATAATGATATCGAACCAAACTGAATTGAACTCAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATA:1 - chr2R 16643896 5' - micropia 4978 2 67.33 CTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 13546626 5' + roo 22 2 58.42 AAATAGATTTTGCACCAATGAGTAACTTAACTAGTCGTGTAGTTAGATTTTTTTAGTTTGTTTTCCACTTTTTTTGTGTTCGTGGCTAATGACTAACGCAC:1 + chrX 13381159 5' - gypsy2 379 1 68.32 CAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2L 18212121 5' + 412 23 2 56.44 TTATTTGCTCAGCCAGCAAAAAAAAAAGTATCTCGGTTTTGGAGAAGGATGTTGCAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCAC:1 - chr2R 23580594 5' + P-element 185 1 67.47 CCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 15072658 5' - pogo 2080 1 58.42 ATAAATTAACTTTTTTGTGTAATCGTGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr2R 10774058 5' - copia 238 1 73.27 CGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 27748677 5' - roo 9029 1 67.33 GTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAA:1 - chrX 20886037 5' - Ivk 5347 1 58.42 ATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 12539503 5' - roo 9030 1 67.33 CTATTTAATCACAGAACAGAACCATTTTGCCTTTGATTACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGA:1 - chrX 9627251 5' - HeT-A 5944 1 77.23 ATGTTTATAGAGTTCCACGGCGAGAGAGCGTTTGCATCAGCCCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:1 + chr3L 19003425 5' + Tabor 6876 2 58.42 GTTTGCTTAGCTGGCAGGAGACTTTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:2 + chr3L 4801481 5' + roo 8670 2 73.27 ACGGGAAAATCTTCGCTTTTTGTCTGTGGGCGTGTGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCCCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGATC:1 - chr3L 8743282 5' - Quasimodo 241 2 66.34 GATCGATGCAACCGCAAAGCAGCAGGAAAGGCAGGCAAATCTTATATTACCTCCTTATTTCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCCTCCCTAGGTAACC:1 - chr2L 6784251 5' + Cr1a 3998 1 69.31 GGCCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3R 6117231 5' + Tirant 8133 2 54.64 AAAATNTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531191 5' + 1360 70 1 54.46 AACTGCTAGCAAAATGCATCGGGTTGGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATA:1 + chr2L 12412290 5' + R1A1-element 5006 1 76.00 GCGAACATTTGATGATGCGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr2R 14778528 5' - mdg1 410 2 67.33 TCGGAAAATCTGTCAAAGTCTGCAAATACAATAATAAAGAAGATATAGAATTTTTGTTCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACCAAAACATCCGCGT:1 - chr2L 22391768 5' - Rt1b 5029 1 52.48 TTATCTAGTTTTAAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGGAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 16245116 5' + 1360 23 1 52.48 CGAATGGGGAAAATAAGGACGAAATTGCCGCCCACTCGCTTGGTTTGGCGGAAAATAAAATGAAGTGAAAGAAAATAAAATAAAATAAAATGATATAAAGA:1 - chr2R 15794248 5' - transib1 1890 1 69.31 GTTTCAGTTCGATTAATGGGAATTTTATAACGATTAGCACGAGAGCAGTCGGCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGTAGAGTGAAAGAGC:1 + chr2R 23177327 5' - Cr1a 305 1 62.77 TGGTTTTCAGTGGGAGGAAGTCCCTATAGGAATGCAGGCAGAATTAAACAAATTTATGAAAAACAAACGGGATTCCCTTTTTTCCTATCTACACATTCCA:1 - chrX 16875674 5' - HB 113 1 51.00 GTTTTGATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr3R 7168641 5' - flea 228 2 60.40 AGTCGTTGCCTGAGTTACTTAGATGAACAGAAGGAAGTTGCAGTTCTTGTTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGT:1 + chr4 654570 5' - Doc3-element 494 1 64.36 CCAGCTATCATAACGCCCAATATCCACGAATAGACCATGAAAAAGTTGTTATGCCAGTCTAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGC:1 - chr3L 1892595 5' + F-element 376 1 62.38 AGTGTTCCCATACGAAAAATAAATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 + chr2L 15510370 5' + jockey 4670 1 77.23 AATTATTGTTTTAATGGCCACATAAAATTCGAGTACTCCCAGATCATTTAAATTTAACGACATTTCTAGCAATTGTGTGTTTCTGCTTGGCACGCACCATG:1 - chr3R 8615349 5' + invader1 36 2 65.35 TAATACATATGCAAATGTCAACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCACGTACGTACAATTTCAAGTAAAT:1 + chrX 22906774 5' - transib3 2764 1 40.59 TGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr3R 7360344 5' + jockey 56 1 75.25 TTATGATCTGCTGCCGCATATTTCTGGTTAACTATATATGCTAGCAGTAAGAATAAAGCTATATACTATATCCCTCGGTATGTGTGAGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 7578867 5' - accord 7039 2 79.80 AAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr3R 6608819 5' + I-element 46 1 71.29 AAATCCAACTGCGACGAGCACCTGTAGCCTCTGAGATCTCAGCAACGAAACTTTGGGTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCAATTA:1 + chr3L 12966094 5' + Porto1 478 1 57.43 CGCGTACGTGAGCCGTCAGGTTTCGGCTACGAGTAGGATATCGATCTGGTGGGTCTTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGC:1 + chr3R 18369557 5' - G6 1657 1 78.31 ATTGGGATATGTTTAATTTCATGATATGTAAATATGAAAGCCGACCTAAAGAACACAAAAAACAAAAAAAAAAACAAC:1 - chr2R 6994757 5' + gypsy7 5010 1 83.33 TTACAAATGTAAATATAAATATATAATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3L 6692920 5' - 297 6941 2 85.87 ATATTAAATATTTAATATTTATTAATATATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3L 13342896 5' - copia 205 2 78.22 ATATTGTATTCTTACGCATTTTTTTAAAACCCTTTTAAGTTACTTTAAGTAGTCCTGCCAAATGGAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGAC:1 - chr2R 5066271 5' + F-element 109 1 68.32 CTGCTGCTTTAATTCGTATTTTCATGGGGGTACTTCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 18571125 5' + hobo 39 1 71.29 GGCGCCGTGGGCGAGCAGCATCCTTATTTCCTTGCGCCTACGGCACTCTTATAGAACTCACAATGTTCGTTAACCACCCAAAGCTGTGACAAAGAAACGAA:1 - chrX 12677790 5' + gypsy4 330 2 67.33 TTAAGGGACGCACTCGCAATCGGCCACTCACACCACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr2R 13295641 5' + Tirant 8123 2 63.37 AATTGNGTAGGTGTCCACTACATATGCATGTATGTATGTATGTATGTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr3L 22831342 5' - 297 6942 2 66.34 CCATCTTGAGCTCAACCCAACTCAATCTCGTTCTCGCTGATTTTTGTTTTTTGTTTTTATTTTGATTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTAGAAAT:1 + chr3R 28895210 5' - invader2 469 1 70.30 CCATGTGAAAGGTCACCAGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 - chr3R 9995440 5' + Max-element 8255 2 64.36 ATAGTTGAAAATCCATTTTGTCTACACGCGCAATTATCTGCACTTTAAAATGTACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chrX 6379121 5' - hopper 1398 1 57.43 GATTATTGATTTAGATAAAATATGAAGGGGAAGAGGGCGATTATCAGACAGTGCGCTTAGTAGAAGAGTATTATTATTTATCAAAACATCATAAAAATAAA:1 + chr3L 14602936 5' + jockey 4995 1 31.68 ATTTGTGATTAAGTTCTCACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGA:2 + chr2L 17722738 5' + blood 7011 1 76.24 AACCTGATGGTGATATGACAATCTACTCGAATCCACTCCCCACTCCCCGAACGTGTCACAATGTATTGACGCTAAGTTATACCCAATCATTTAT:1 - chr3L 19250421 5' - Stalker 6885 4 63.83 CGATGATTTTTTTTATAAAACGTTATTCGAAATTTTACTCTACACAAATACAGTGTGCGGCAGCATAACTTCCGTTTTTATGCGCTCCATTCAGTTAGTTG:1 + chrX 23042005 5' + mariner2 33 1 74.26 AACACTCAGAGTTAAGCAAACGAGGTCCCAGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCT:1 - chrX 21207366 5' - I-element 353 1 70.30 AATTGGGTGCGTTTATCAGCGGCGGTTCGTTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATTGCCGCTCGAATAAGCTACCGTTTACACATTTATATTTAT:1 + chr3L 27728793 5' - 1360 2963 1 71.29 GAGCGCTCAGCTGATGCGAGAGAGCGTTGAAGAGAGAGAGCTGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3L 11553546 5' - P-element 2852 1 35.64 CCACATCCAATTAAGATACCAACTGTGCCACAAAACAAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCAT:1 - chr2L 4152280 5' + Quasimodo 101 2 68.32 ATAATTGCGTGCAATTGGAGCCAATTAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 20047608 5' + roo 49 2 84.16 GCCAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGC:1 - chr3R 7388420 5' - HMS-Beagle 7019 2 60.40 AATAATAATAATTTAATAATAACGTTTATTTACTGCACCCCTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2L 10244565 5' - 1360 3355 1 63.37 GGAGAAATTTTTGCTGATCAGCACACATCTCATGGCCTAGTAAAGTCGTGAAAGGTTCGTGTTGTTGTAAAATTATAACCTGCGGGCGTGTAAATTTTGTT:1 + chr3L 3714465 5' + Gypsy12A_LTR 326 1 72.28 ACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTAC:1 + chr3L 19951225 5' + Ivk 57 1 81.19 CTTCGCAACAGCTTCGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAAC:1 + chr2R 4606204 5' - 1360 3372 1 61.22 CACGCCGTCACTCACACTCACTAGGCGCATAGATATGGCTAATTCATTTGTTATTTTGTTTCTTTTTTTT:1 - chr3R 27887937 5' - gypsy7 5008 3 72.86 AGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAG:1 - chrY 3648909 5' - 17.6 7411 2 70.30 CAAACACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 16674841 5' - roo 394 1 68.69 AATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:2 + chrX 21668954 5' - mdg1 383 2 63.37 ACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 18212126 5' + 412 7081 2 55.45 ATACTATTTAAGATACTTATTTTCTCGCGAGTGTCTTTTCAAAGGTAAGCCTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTA:1 + chr3R 6286604 5' + jockey 4528 1 50.50 CGCATNTCATATTATTTTTCATATGCGCCTCTCGCTCGCTCTCATCATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTT:1 + chr2L 11445804 5' - micropia 345 2 54.46 AGACCGAAGCTGTGCTGCCTCGATCGTGTTTGAATAAAGAACCACTACTGTGGAGTTAAATAAACCAAATCTTAGTATTAACTGGCGCCCGAACAGG:1 + chr3R 545321 5' + HMS-Beagle 259 1 70.10 TTTGTAAACCTGATACGTTGGCAAATCTTCTAGGATACTTACGAAAAATGTATGTATCCACTTATTTTATTTATTTATTTAACACAATTAAATATAGTATA:1 - chr3R 21265669 5' - Ivk 5366 1 69.31 CTAACCAATAGTGTCGGGGGCGAAAGAGAGATCGAGGGATAAGTTGGCCACTGAGGAGGATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCC:1 + chr2R 16604124 5' + R1A1-element 5020 1 61.39 ATGCGTACGTGCAGAGAGACACGACTAACAAACGGGCGAGGAATATACTTCTTTTTTTTTTTAAATATTT:1 + chr2L 1721756 5' - TART-B 10508 2 81.43 GCTAGATAACACCACTTTTATCAGCGTGCACTCTTATCTAATAGCCTAGTCGATCTGGGCCTGTCCGGCTATCCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGA:1 + chr2R 5698388 5' + INE-1 138 1 60.40 ATTGTNTGCCCACCTTTTACACAACTTGTTGTTTTGCGCGCTTTATGAGCTCTTCCCCGCAAGACAGGGCCAATAAAATTCCATATACATACTTATAAACA:1 + chrX 18772793 5' + ZAM 194 2 76.24 TTCTTATTTGACCTGGCTGCCTGGTTTATTGGCCTGTGGCATTTCAAGTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTTTTTAACAGAGCTACAGTTAATATCG:1 + chr2R 300064 5' + Porto1 34 1 56.57 TTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2R 9871001 5' - roo 359 2 74.26 TGAATCGGGCAGCTTGCTCAGCCGCTTGAGCCCCTTGCAGGAGGACTCCCAGGATAAGGAGAAGCCCAGCAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGAC:1 - chr3R 21556550 5' - hobo 306 1 67.33 ATGTCACTTCAACACCTTTTAGTTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGT:1 + chr2R 1996126 5' - 1360 214 1 78.22 CCCCAAATCTGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAAC:1 - chr3R 12047508 5' + Stalker2 5 2 74.00 GACTANCAAATTTAAAACAACACACCGTCAAACATCAAAAGCTTCAAAGCAGAGAAGCTGCGAAATTTAACACTGCCTAAATCCCAATCCAATACCAACTT:1 + chr3R 26162935 5' + I-element 4989 1 69.31 AGAGTGTAGCATAGTGTAAAGAACAAATTAGTAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2L 20824616 5' - pogo 2060 1 67.33 TGAGGCTGTGGTCCTAAGTACCAAATCGTGTCGCGAAACGATGCGTATACGTAATGTGCGTATACGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chrX 8972355 5' + 1360 8 2 71.29 ACGGATGCTGTTCTGTTACGTTCCGTTAGGTTCTGTTACTTCTGCTGCGCTACTGTTGTTCTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAA:1 + chrX 8367221 5' - invader2 496 1 66.34 GTAACAAGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 + chr2L 6999271 5' + Ivk 44 1 68.37 GATTTACTATATTATTCGTTTAGTAAAATATTTAAATAATTTTAAAAATACATATCCTTAAGTATTTTGCATTTTTCGTCGTTGTGTTTTGTTTACTCTCC:1 - chr2L 17564135 5' + Cr1a 204 1 61.39 CACTACCGCTGCGCCTTGAGCTATGCAAGGCTTTATTTTTGCGACATCAGCTCTTTGAAGTCAGCATAAATTTTACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chr3R 17454501 5' + jockey 4674 1 73.27 GCAGAGACTATCTATATTGCTGCCAATCGCTCTGCGCCAATCGAGTTGCTGAAGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAGT:1 + chrX 17599598 5' - Idefix 45 2 61.39 ATTATTTTATATTTTATAAGTATTTTTATTGCCTGGTTCGTAAGGAACACAACAACAAAGAGCTCAAACTAGCCACTGTCTTCGAGACAATAAACATGCAC:1 + chr2R 5145541 5' + BS3 1456 1 67.33 TGCCAATGTCACAGCGCCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3L 10013673 5' + hopper 3 2 74.26 CGACTGGTAAGGACCACATTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 12605614 5' + F-element 59 1 75.00 TTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 8555867 5' - 412 442 2 76.24 ACCTCNGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2L 16884912 5' - pogo 2091 1 66.34 TAAAAAAAAAACAATTTGCAATGTTTTCTCATTTTGTTCCCAAATATCTATCGATATACCAGAAAATCTTAAAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGA:1 - chr3L 21043313 5' + INE-1 529 1 70.30 TAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 + chr3L 19951176 5' + Ivk 8 1 71.29 CTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCACGCTACTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCT:2 + chr3R 24050054 5' - Stalker 7209 4 72.28 AACGAATACAAATGAAATAAAAAAAAACCGATTGCTCGCTTCTGCCAATATATTTAACTTTGCAGTAACATAACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGGATT:1 + chrX 5426898 5' + Doc 4345 1 71.29 TCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 19989272 5' - hobo 2900 1 69.89 ACTTGTAAAGAGAGCGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 13640717 5' + P-element 10 2 69.31 GCTCTTTATCGCTCTTAAGCGGTGATTCATCGGTGGGCGGAAATGCAGGGTAGTTTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGC:1 - chr4 181152 5' - 1360 307 1 54.55 CGCCACATTGCATCCACATATGTCCTTCCAGCCGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3L 13548853 5' - hobo 2900 1 63.37 TTGTGGCCCACACAGATACGCATATACAGATACAGATACATATGTAATGCTAGCTCGCTCAAACACAGCCACTATCACCGAAATCACCACTCACTTGTCCA:2 - chr3R 22506823 5' - diver2 482 1 65.35 CTGCACTATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTC:1 + chr2R 4854966 5' - opus 7490 2 68.32 TAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:1 - chrX 4366274 5' + jockey 4704 1 64.65 GTTTTTTCCACCTTATTATCTGGATAACTTTTGGCCCGACTTTTGCTGACTGCGAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAATAA:1 + chr3L 22166923 5' - Quasimodo 207 2 70.73 TCCAGAAATTTCGTCAATTAATTTTCTACTCGTGGCAGGGTTTTCACGTGTATGTATGTCAGCATGTCTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 - chrX 12881564 5' - accord 7029 2 59.14 ATATAATCTTTATTCAAGAACAAGAGCGAAAGAATTAAATCTAATTGTAAGTTGCAAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGACAACT:1 - chr3L 26480008 5' - Cr1a 92 1 62.38 TTACCGCACCGGCTGCTCAATGAAAAGCGTTTAATTTTAGCCGCGCTAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTT:1 - chr3R 20556196 5' - Tirant 8496 2 57.69 GACTCGTTTATCTACCCACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 + chrX 3763130 5' - 297 6972 2 71.29 GAATGTGCATGTTCTTTCCCCTATGCATTCCATATGTACGTTATCTTTCCCAGCGGACCAACGTTGGCAGATTAATCGCTCGAGAATTTTTGGCCTGCGAA:1 + chr3L 22886301 5' - gypsy12 9954 2 70.30 AAAAGAGGAGCGAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 - chr3R 28645872 5' + F-element 16 1 69.31 TCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTC:1 - chr3L 23839712 5' + McClintock 26 2 56.44 AATAGTAATTATTTGAAATGTTTTATTTGTTTTATTATGGATTTCAAAAATATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTG:1 - chr3L 11704295 5' - 1360 272 1 62.00 TAAGATGTTTGCTTAGCTGGCAGGAGACTTTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3L 4801475 5' + roo 8664 1 79.21 ATCCTTTCAATGAACTGTCTTTAAAAATATTTTTATCCAACCTTATAGTTGCTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATAAAAATCATAAAACTCAAACATAA:1 - chr3L 10477616 5' + copia 5069 2 51.49 ATGTGCAAGGTAAGCCTCACAGCAAGTGCGCAACACATGCAAAAAAGAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 946938 5' + gypsy7 5005 2 71.67 CTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTT:1 + chr4 1294988 5' - TAHRE 10406 1 73.27 ATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACAT:1 + chr2R 4260437 5' + micropia 183 2 79.21 AGAGGAAACGTTTAACTTTTGAAAATTGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATATAAGAGCACTTGTATC:1 - chr3L 16696490 5' + Idefix 317 2 72.73 CAATCTGTTTGCTCATGTCCACTACGTGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAA:1 + chr2L 12474938 5' - mdg3 243 2 73.27 CTTTCGATCCGGCCCCATCTAATTCGCATTTTTGATTAATTGGATTTGTCTCCCAAGGATATTCGATAGTTTTGGCCCGCCTTTTTTTTTTCCTTTATCCT:1 - chr3R 20089365 5' - Doc2-element 242 1 46.53 TTATAAGTGTTTTTGCCGTGTTTTGTTTTGATTTTTGCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATAGCTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTCAGTCAGAGCGTG:1 + chr2R 13991835 5' - F-element 483 1 77.23 TGACACCCAAGAAACCTCCGGCGGTGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2L 284886 5' + P-element 52 1 27.72 TTCATCGCCACAAAATGAGGGGAAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 6443174 5' + G3 4584 3 41.58 CTGCCACTCCGCTTTTGGTCGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCG:1 - chr2L 17345315 5' - F-element 4431 1 80.00 CCGGACGAAGCAGAGCCACGCACACACAGCGAATAGTTTGGGGATGGGGAAAACGGGTTGGTAGTCCCTTAAGTAAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGCAA:1 - chrX 14131446 5' + Doc3-element 4706 1 54.46 GGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTAC:1 + chrX 19986358 5' + Stalker2 7282 2 61.39 GATTGCTAACTTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGCCAAAGACACTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr2R 3919668 5' + 1360 36 1 60.40 ACCGGTACTGGTACAAGTGTATGTATGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr3R 17929006 5' + hobo 50 1 73.27 GGTGACTTTGTTTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 + chr3R 20137235 5' + Burdock 6138 2 75.25 CTCGAGTCCTGAGGCCAACACGACAAAACAATAAACCGAGCAGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGA:1 + chr3R 14673317 5' + Ivk 5072 1 58.42 TATATATTAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 992021 5' + hobo 33 1 59.41 TTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGAAAGAATGAATT:1 + chr4 1294993 5' - TAHRE 10411 1 77.89 AATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGC:1 - chrX 23108305 5' + BS3 1443 1 63.37 AATCCCGCACATAAATAAGGCAAACCCCCTCATATACACAAACGCCACACGCACCCACTTAGAGTGTAAGTCGTGCGTATTGGGTTGACACGACAAAAGG:1 + chr2L 4136961 5' - Q-element 687 2 51.00 TTTTAACAAAGTTTCGCTATAATTTAATAATAATAATTTAATAATAACGTTTATTTACTGCACCCCTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 11837174 5' + 1360 9 2 60.40 GCATCAGTCAGCATCAGAGCCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 7205529 5' + Doc 31 1 53.47 CACTCCAACCAAGCCTCAACTGTTCCGCCAGCAACTCAAATATTGAGATTCTACAACGCTACCAATCAAAAGTATTAAGACAAATTGTTAATGCTCCATTT:1 - chr2R 19879095 5' + G4 3512 1 74.26 TTTATGTGGCGGCGACTGGGCTGGCTCTTGCTCTCTGTCACTTCTTGTTTCGTATTCCCTTCTCTTTAAATTTTATCACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTT:1 + chr3R 7108007 5' + hopper 1209 1 64.36 GAATGAAAGAAATTAGTGAAATTTTTTATTGATATAAACTTCAATTTATA:1 - chr2L 3588194 5' - INE-1 434 1 40.00 AATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr2L 12667223 5' - blood 7339 1 77.23 TTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCCCCATTCGCATGGGCGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 12633257 5' + jockey 20 1 53.16 ATAGTCGATTATTTTAATTATACCTTATTATTGTAAATATACGTAGATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:2 - chrX 21017862 5' + 412 7081 2 54.46 AAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr2R 23580831 5' - P-element 2864 1 54.46 GGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3R 6117242 5' + Tirant 41 2 67.33 AAGAGAGAATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr3L 682479 5' - P-element 2856 1 48.51 CCTTTCAATTGACCAATATCTCTAGTTCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr2L 21683491 5' - pogo 2065 1 63.37 TGGCCCGCTGAAATTTCGCATAATTATGATGCCTATAAATTTGTTTTCTTTCATTAGTTAATGTTTACATTGGGGCAAGCTGGATTTGTTATTGTAACCAA:2 + chr3L 6804332 5' - Quasimodo 145 2 65.35 CCTTCGATAGCCAACCTCCATCTCCATCTCCTTATCTGAGATGCCTGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGAATTT:1 - chr3R 8196980 5' - Porto1 420 1 54.46 TGTACGAGAAGGGACGACCGTTCTCGTCCGTACCGCTCACGTAGTAGGCTCCATTGTCGCCTGCTCCATGGATCCTTGACCAGACCCCAAAGATCATCGT:1 + chrX 21156531 5' - Tc1 1221 1 67.00 GAGTTGAATAAGGGTTTCCTCCATGTCCATGCTAAATATGATCCTACTAACAGTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTG:1 + chr3R 2516748 5' + Cr1a 4334 1 61.39 GCTTGATGGCGGCTGCCTGAAAGTAGGCAACGATAAAATAGCAACGCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr2R 7887295 5' + jockey 8 1 78.57 AAATGCGCCATTTTATCGAGTAGCAAAAACACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 8345586 5' + roo 8681 2 63.37 AAAAGATAAAATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAGTGGGTTTAAATATATGGATGCTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAC:1 + chr2L 9163710 5' + copia 4892 2 59.41 TCCGTATCCATATGTAAAGTTTTTTGTGCGGCTAGACATGTGATAGGCGCGGACCATAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAG:1 + chr3R 29128059 5' + P-element 422 1 65.00 TTAATGTACATATATTCGTATATATACGTATATAAACAATTGAAAAAAGTTTATATACTATGTTGCTATACTGAACTTATGTCTGTGTACCTCTAGCTTAC:1 - chr2R 9526253 5' - invader2 5 2 55.45 TATTTTATTGGTTGTTTATCGACAATTAGCGGTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3L 13659722 5' - pogo 2091 1 42.57 TGGAGGAGAAGGTCGCAGGACGCACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 16674926 5' + roo 8695 2 58.42 AGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTAC:1 + chr3R 32005880 5' - invader4 292 2 60.40 CAGAGCCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3L 7205543 5' + Doc 45 1 60.40 CGGGGAGGGCTGGAATCTTGGCTTTTTAATTTGTATATTTGTGGTCAGTTAAGCAAGCTATTTTGTAAATATTAAGAATTATTATTAAGACAATGGATGAG:1 + chr3R 19543307 5' + BS 328 1 63.37 GGCGTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3R 7522281 5' + blood 7023 2 65.35 TCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chrX 13640668 5' - P-element 2828 1 20.79 GCGGATCTGTTCCGGCCTTCACTTAAGTTTTGATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTC:1 + chr3R 21265960 5' + X-element 47 1 72.92 CGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATT:1 + chrX 21474426 5' + 1731 4358 2 71.29 TATAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 27981751 5' - roo 397 1 67.33 GGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 4571528 5' - P-element 2881 2 73.27 TGAAAAGCGAGGATAGGAGGTTGGGAAAATCAGCTGCACGGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTT:1 - chrX 983751 5' + invader3 5424 2 56.52 ATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:1 - chr3L 25232911 5' + GATE 8267 2 53.47 AGAAAATATGTTTTCACAAAACGTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGG:1 - chr2R 13294992 5' - Tirant 210 2 73.63 TAAGAAACGGGGATGTCATCGTCACTCTATATTTTGACTACTCCAAACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAA:1 - chr3R 19447195 5' - invader2 4633 1 71.29 AGGTGNGGGAGTTCTTTTGAGGATATGAGTTGTGTAAGACCAAAACGGATGCAAGTAGGTATATAGCCTTCTGCTGGGCAATTTCAGTTTTTACAACTGGT:1 - chr2R 5139804 5' - Doc4-element 2742 1 57.43 CATATAAGTTAAAACTAGAGTTCAATTTGCGAGTTGACCATTTAACTCGGATTCAAATTGAGAACTGAACATGTAGAAAAGGAAAAATTTATCTAGTTATT:1 + chr3L 27284821 5' - G5 4708 1 71.29 TTTATTACAATGAAACTAATGCAGCCAATTTCTTCAATAGACCTTCTTATAGTCATGATACCACAATAAGCTTCTCACAACTGTTCGAACAGCTCACCCGC:1 + chr2L 13270528 5' - R1A1-element 199 1 75.25 AACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTA:1 + chr3L 11661716 5' - hopper 1383 1 57.43 GTGGGTCAAATGGCGAGACTGCTGCGCACCACCATGCATAACTTCTCAGATCATCCAGATATGCAGAGCTGCCTTCCCTTCGATGGTTTAACGCAGTACCA:1 + chr3L 13176083 5' + Burdock 6002 1 61.39 CATAAACAATGCTATTGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACC:1 + chrX 19426201 5' + mdg3 5254 1 78.22 AAATGTAAAGTGCTGCCAAGTGTCGACTGAGTCCACAACCCCCCTTTCTAAGCCCATGGTCCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACC:1 - chr2L 4144261 5' + I-element 4872 1 62.38 ATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr3L 8614555 5' + opus 151 4 70.30 TCTTGATATTCACTGTCATCTCGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTGTGTTTTGTT:1 + chrX 16468821 5' - Porto1 197 1 71.29 TCTCAAAAATAATTTCCAAAAAAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCC:1 - chr3L 12699836 5' + flea 4641 1 77.78 CTGACGCAAGTTGTATTGGGTATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGTATGCTCAG:1 - chr3L 25768162 5' - Circe 7381 1 77.23 AAAATATCTAGAGGAAAAATTTGCGGAAACCTCCAAGCCCTCCAAAGACCAGAGAGCGCACTCGTGCTTTCCGTCGTTGCCAAGCACAGTTCCAAAATCTT:1 - chr3R 1024568 5' + Doc4-element 148 1 77.23 TATATCATTATTATTCATAGTCACTGTTGGGCTGTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chr3L 3032239 5' - opus 460 2 68.32 ATGACTTTTACTGTTCCTGGTGTTTGCAAATCAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATT:1 - chr3L 16898746 5' - Doc 4450 1 68.32 TGTCTGGAGTAACTCGGTACCTTATAAAATCACAAAGTAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 + chr3L 17918379 5' - 297 363 2 66.34 GCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chrX 15293430 5' + Quasimodo 31 2 51.49 GGCTTAACCCATGAAAGCCCCACTACCCATGCCATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACC:1 - chr2L 14835819 5' + Doc 4538 1 68.82 TATTTGTATGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:2 + chr3R 16457984 5' - roo 391 2 62.38 TTAATTGAGACGTGTACAAAGTTTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTTAAGTCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAGGATCAACTCCGAAATAAATT:1 - chr3L 17953493 5' - McClintock 6315 2 77.23 TACCGTACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 - chr2R 2427629 5' + Doc 8 1 71.29 TGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTCGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGCCTCATATGGTCGCTTGACATCAA:1 + chr2R 4621662 5' - Bica 4831 1 62.38 GTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGAATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 + chr2R 3591981 5' + Quasimodo 28 2 61.39 TTTGACCGATTGTCTTGCTTTATGAGAACAAAAAAACACTAGACAACTAGAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAA:2 + chr3L 14396980 5' + BS 5024 1 49.50 TCAGAGCTTGGATACTTTCCGCACTCATGGTACATGGAGCAGTGGCTAGAAGTTACCCTGAATCAGCCGCTGCAAGCAACATATCTAGGTATCACCCTGGA:1 + chr3L 23210982 5' + Helena 899 1 53.47 TGTGTTACGGCATAATAAAACAGCGTCTTTAAGCAATATTTAAATATCCCACAAAAATTATGAACTTTCGCGTTTGCCTTTACACTAGCTGAGTAATGGGT:1 - chr2R 5967613 5' + INE-1 538 1 73.27 ACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr2R 12082360 5' - mdg1 367 2 77.23 TAAACGTGTACCAAATGGCGAGGGCTTTGATTTTGAAGGGGTGAAGAGAAAAAGCTTTGCGTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGT:1 - chr2R 19083949 5' - Idefix 7147 2 61.39 CGCCATATCCTGTCCTATACACGGCCGATAATCGAATCCGACTTTTCAACACCCAAGCGAATTATGCAGCTCACGAGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTT:1 - chr2L 4159292 5' - Tirant 131 2 77.23 AATATAGATTTTTACGAATACTAAGATGCGTGATAAACTTTAAATGAATGGACGGACCGACGGAAATGGCTAGACTAGTGATCCTGATCAAGAATATGCAC:2 + chr2R 15003594 5' - INE-1 80 1 76.24 TTTTGCAGTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 9907347 5' + jockey 21 1 58.42 CAATAAAACGATTCATAGATTTAAATATATCTTTATAGATAATGCATTTTCAACTAATTACATTACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTAT:1 - chrX 21448857 5' + Doc 4561 1 63.37 CAAACAAATTGGCGCCCATCTATACGATTGTTAACACTCTCGACCGGGGCGAAATAATAATAACAATAATAATACAAGTTTTTGCTTTGTTTTTTGTTTTC:1 + chr3R 18124699 5' - Porto1 187 1 71.29 GGAGACCATAGACGGTAGTCCAGATCCGCGTCCAGTCCAGCTAGTGCGATGCAGAAATTGATTTGCTGCTGCTCCTACCCGCGACCAGACTACGTTCGGCA:1 + chr3R 23016043 5' - invader1 110 2 73.27 GTGGGCCAAGACAAGACAGCATTTTGTTAGCAACACCAAAAATGCCGATCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGGTCTTTCTTGATT:1 + chr3L 2982010 5' - F-element 357 1 54.46 AGGACGAAGGACGAGACGTAGAGAAATGCTAGGCATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3R 5686042 5' - P-element 2864 1 56.44 ATATGACAGCACGTGTGTTTTGATTACCGATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 20556100 5' + Tirant 7 2 74.26 AAGTCAAGTCATGTGAACCACTGAGCAACAACAGCAACCACCAAGAAGGCTCAATAGAAGGCAACCGAGGGATCTCATTTCCCGATCTCCTTTGACAAGGG:1 + chr3R 934719 5' + X-element 4518 1 63.37 TTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr2L 4160144 5' + Tirant 8160 2 76.24 TAAACTCCACTGTACACTTCTACTTCAATTATTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 8932981 5' - accord 7031 2 69.31 TCTTTCTTCTCTCTTTTTTTTTTATATATTTAAAAGAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 13865150 5' + TART-B 10632 1 81.25 TGGAAAAGCATACAAAATAAAATACATGTTTATCAAAAACATTAAGAAAGTCCCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGAT:1 - chr2L 14092144 5' + Quasimodo 6966 2 55.45 TGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGTACGTGT:1 - chr3R 7360344 5' + jockey 21 1 59.70 TTAATAATATTTGAAACCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chrX 3411669 5' + blood 165 2 60.00 CAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr3R 15072569 5' + pogo 26 1 55.45 GACCACTCGACTTGGCATCGTGTATACTGTATAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 - chr3R 27801339 5' - Burdock 6351 2 69.31 TTTTTTTTTAAATTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATT:1 - chrX 20678116 5' - Porto1 4563 1 81.82 CGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:2 + chr3R 27284017 5' + Max-element 50 2 68.32 AGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2R 20744211 5' - roo 9026 1 72.28 CGAATACTTCTAGTTATTTTATGTTTGGCTAGAAAATCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3L 15100739 5' + pogo 36 1 64.36 ACTCTTGGGTAGGCCAGCATTAGAATTTTAAATTTAATTTTAGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 7080301 5' - HMS-Beagle2 489 1 87.30 TATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAA:2 - chr3L 23839700 5' + McClintock 5990 2 68.32 AGCAAGGCCGCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTT:1 - chrX 22945378 5' + BS 4 1 76.24 CTTATATCTAAAATATGCATATACATGTTTGTATTTTATTGAGTCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAG:1 - chr2L 22684934 5' + F-element 4434 1 69.07 TTTTGTGTTTATAAATGTGTGGGTTTATTTCAATTGCCTTTTTCATGTCATGATTAGTCATATACCATGGAGCACCTGTGATTGTTCTTAGCGTCATAGAC:1 - chrX 292421 5' - G3 4264 1 59.41 AATAAGTATGATTGCGTGTACAATGGTTAAAAGTAAAACTAGTAAAATAAGATTTCTACAAAGAAATTTTTATATTTAATTTTTTTTTATTTTTATAAATA:1 + chr3R 14694183 5' - HMS-Beagle2 478 3 57.43 ATTTGAAAATATATTAGAAATAGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGT:1 + chr2L 7401017 5' - 1360 3256 1 78.22 GACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1 + chr2R 3591993 5' + Quasimodo 40 2 75.25 TGTTTTAAGGTTTAAGTATTGGCAGCTTACGCATATATTTAACAACACCAACCCCCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCA:1 + chrX 19301324 5' + I-element 5133 1 66.34 GTATCTCGAAGGCGATAAGAATCGCCTTGGACACAGGATGTGCAATGAGAGTTGCCAAAAAAAACAATATATGTACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCT:1 + chr2R 18675455 5' + opus 7113 2 80.20 TAGAAGTACTTAGTCGTGCAGCGAAACAAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr3R 27430021 5' - pogo 2060 1 70.30 TATGTACGTTGTATCGGCAATATGCATGGTTATCGAACAAAAAACACAAAAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATC:1 + chr4 879564 5' + I-element 165 1 62.38 GAGCACAAATTGTCTTTCCTACTATAGGTTGACGTATGATTTATGTCAAGTTCCGGTCAGACAGGTCTTGAGGGTGGTGGCGTTTTAATCTTCTTCTCGTA:1 - chr2R 4887338 5' - jockey2 3161 1 67.33 AACATATTATTTCAACAGGCAACTCATTCAGCATATAATATTACCACCCTTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGT:1 - chr3R 20083771 5' - Quasimodo 79 2 51.49 GTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 7861676 5' - roo 9027 1 73.27 AGCTGTTGGACGTTGGTAGTGTTGGCAAACGAAGCAATGCCTAGAAATAGCCAAAGGAGAAACTGCTCCTAATTAATAGCAAACAATTATAAAAACTTACA:1 - chr3L 11064952 5' + Porto1 308 1 80.20 AACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3R 8313112 5' + 297 6621 2 71.29 TTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3R 13375940 5' - 1360 3385 2 73.27 AAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3R 12780630 5' + hobo 40 1 65.35 AATTAACTACTGCTCCTCCATCTCCACTTCCCTGCTCATGTTTTCCCACATTTCCTTCGGCTGCGTTCTCGTTTCAATTCGTTTACTATTCCTCTTTTCCC:1 + chrX 14989230 5' - Bica 352 1 80.20 CGATGATGTGAATGTGAATGGAAAGTGAAATCGATTTGGTTGCAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGC:1 + chrX 3305116 5' - transib2 2815 1 66.34 TCCTATGAGCCTGGACACGCCCTTATCTACATGCACGTGGTCGTGTCTGTGTGTGTGAGTTTGTGTGTGTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTT:1 - chr3L 7205070 5' + Doc 366 1 63.37 GTCTAAAAGGATTATATATATATAATCAAACCAAAAACAATAATTACCAGAACAAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAATT:1 - chr2R 10512173 5' - copia 4689 1 60.40 AGTTCGATAAGTAGAAAATATGGTGGAGTAACCCATGCTAACTGGTCTAGCATTTTAAAACCTGTCACTATTTTTCCGGATTGCTTTAGTGACAGGTTCCA:1 - chr2L 13421009 5' - Fw3 338 1 70.30 CCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 16201509 5' + hobo 33 1 59.41 AGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3R 19446153 5' + 297 31 2 63.00 TTTTGTAATTCGAATAAATTTGTATTGATCAAGAAAACGTTTGTATAACTAATGGGTCGCTCTCTCCTCGCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTC:1 - chr2R 10516698 5' + Doc 400 1 79.59 CACTGCAGCTGGCCCAACGAATACAGACGGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:1 + chr3R 27283989 5' + Max-element 8257 2 51.49 ACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 12103774 5' - roo 390 2 60.40 AAAGCGCCTGCGAAACCACCGAGGCTAAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTA:1 - chr2L 3889767 5' + jockey 483 1 73.27 GTGCCAATGTTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTTGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3L 17921209 5' + 297 6603 2 56.44 TCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAACGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr2R 17345961 5' + jockey 17 1 66.67 CGCAGGGGAGTCCCCTTGATGCCCAGATGCATTTCCGGGGACTTCAGCTGTTGATTCTGGCCACCTTAGTCCGCTTCTTTTTACCTTATTTAATAACGACC:1 + chr3L 10769032 5' + Q-element 520 2 61.39 CAGTGAAGCCATGTTGACATCAACGTGGGGGAAATTGTTTTGATGAATGTGTCGTTTTATTTGAATGATTTCTATGTTGCTGTCTTTGGGTACAGCTACCC:1 - chr2R 17184730 5' - Stalker2 305 2 59.41 GTGTGAGGCTATTTTGCTGTTGATGTGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCAAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTC:1 + chr3R 6452289 5' + Max-element 8321 2 76.24 CCAATGAGTGCTTTAAGATCAAATGACCTCATATTTCCGTAACATTTTCGCTAAGCTCGTTTTTGTTTTATGCTTTCTATTTCAATTTTTTTCTTTTTTAA:1 - chr4 190259 5' + FB 177 1 72.28 AACTTTTGCTGGATCGCGAAAAATCACAGATTCCATTTTTAAGTTTACCTGGATTGCATTTGAATTTGACAGTCTTGAAAATTTTTTTATTTTTTTTATTT:1 + chr2L 7535247 5' - HB 321 2 28.71 AGGATGGGACTTTTATAGGAGGCCCTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGATCTCAGTTGCA:1 - chrX 7625596 5' + accord2 168 2 73.27 TGAGGCTGCCTACGAATGTCACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACT:1 + chr2R 16988176 5' + opus 16 2 63.37 GCAATGGAAATTCCCAGGGAAATGGCCAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chrX 2776146 5' - 297 6933 2 70.30 CGTGTAGTCGAAATTCGTAGTGGTAACAAAATAATTGGGACTTAATATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 + chr3L 15729984 5' - I-element 5321 1 55.45 TAGATGATAAATGATTATTATCATGTCTTCACATTATTATGTTTTTTAATAAGTTTTAATTTTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - chrX 15082473 5' + mdg1 11 2 68.32 ATTACTAATAATGTGCTACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chr3R 19346990 5' + blood 2 2 76.53 TGAAATGATGGCTTGAAGGCTACAACTGTCACAGAAGATAAGAGATTTATTTGTCCAGAGTCATGAACTGTATGAAAACAGAGCATTTAGAGTTGTTATTA:1 + chr2L 10555242 5' + G4 374 1 75.25 TGGGCGACAGTGGTAAATGAAATGATCGCCTTTTTGACTTTCAACCATAAGCGTGGAGATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 - chrX 5129569 5' + Idefix 11 2 65.35 CTTTCCCAATGAAAACCCTTGGCAGCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATT:1 + chrX 2395717 5' - R2-element 3215 1 75.25 CGTATAGTTTGGGGACTCCAACGTGGCACGTTGCTGCTCACGTGGAAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGT:1 - chr2R 15847373 5' - Chouto 472 1 77.01 ATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chrX 21668931 5' - mdg1 7444 2 63.37 CTGAGACCGTTCGGCGGTAGAAGTCCGACGCTTCCGCCGCATGGTACACAATTCAGTTAAATTATTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGG:1 + chr2R 1276194 5' - Quasimodo 14 2 65.35 TACTCAGCATTTATGGTGGTGGTGTTGCCGTTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 - chr3L 20944421 5' - Quasimodo 244 2 69.31 AGATATTGCTGTAAGACATTGTAATCGAACTAACTTCTATTCGCACCACACCCACCCATACCGCCCATATTAGGATATAAAGTAAAGGAGTAAATTTGGCA:1 + chr2L 2962904 5' - transib3 2704 1 60.40 AGCCAGAGCGTCCGGTTAAGACTGTGGGTGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATATAGCTAGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTAACTGCGGCCGCGTC:1 - chr2L 9575060 5' - gypsy4 6617 2 71.29 TCTGCGAACTGCCTTAAAATTACTGGAATCCGTAGGTTCTGGTTGATGTTCGCGTTCCGGATGTATCAAGGCGCATCCGTTATTGTTCGCAGGATTTTTG:1 + chr2L 17363989 5' - Doc4-element 2669 1 79.00 TGTACAATACGCGTAGGCTACAACGACGACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chr3R 26842898 5' - opus 7497 2 75.25 ATATAATGGTAAAAAGTTTTTTTTCATTAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGA:1 - chr2R 8310538 5' - pogo 1946 1 72.28 AAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 + chr2L 15510408 5' + jockey 4708 1 62.38 TTGCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chrX 17968344 5' + Tirant 8122 2 64.36 AAGCCATGCTTTATTTAAGTATGCCACATATAAATTTTGTTTTTTTATTCAGAAACATTTACTTATTAATTTGAGTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCA:1 - chr2L 16070050 5' - Tc1-2 42 1 69.31 TAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTACAAGCCTAAGATTTT:1 - chr3L 25322745 5' - Transib5 2933 1 64.36 TGTCGCCCACACAAACAGGCACTTATACACACACCTACGACATTCCCATTCTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGA:1 + chr3R 19530164 5' + BS 4802 1 54.46 TTGTANTTTTGTTTGTTGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr3R 17843609 5' - roo 9070 1 74.26 AAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGATGTT:1 - chr2R 5019427 5' - rooA 336 2 65.35 TGTCATGGCTTAATGCGTGATGCAAATGAACATATTTAGTGAACTCAACTGTATTCTTTCTAAAGGGAACTTGTAATTTTGCGGTCATAGCGATAAGACG:1 - chr2R 2178105 5' + diver 116 2 61.00 TTAATTAGTTGCTGTGACGTCGATGATATAAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTAC:1 - chr2L 18464870 5' - Doc 4448 1 70.30 CATTTTCTTGAAATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr2R 14708940 5' + Doc 8 1 77.23 CCGAGAGGGTTTTTAATATAGAGCACGTTGGATGTATGCACATCGTACCTTAATAGCTCACCTACCAAGAAGGCTCTACAGGAGACAGCCGAAGGATCTCA:1 - chr2R 1892519 5' + BS3 1565 1 56.44 CTTTTCGTTGGACTTTTGGCCACTTTCTGTCACGTTGCGGTTTCATATTCGTAGCGGCCACGCAAATAAACAGTTTTTGCCGGCTACGTAACGTCATCCGG:1 - chrX 10907001 5' - gypsy2 78 2 67.33 AATAAATTTCTCAATTGCATGTTTACCCCTTGGTTTCCTATTTGTGGTTTCGGATCTCGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTT:1 - chr2R 18200921 5' - flea 459 1 60.40 GTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 31458416 5' + jockey 32 1 54.46 GCTAAGGAGCAGGAGAAAAATAGTACTTTGTATATAAGCTGTGCCAAAAGTGCTCGGTTTCCTTACCCTATCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTT:1 + chr3L 42730 5' - I-element 317 1 73.27 TGAAGTCTTATAAAATTAGCCAGAACAAATGAACAATTAACGGGTCGATTACATTAAACAATCACTCCCTTGCCATTTTAACAAATAAATAATAATTACTT:1 + chr3L 7607842 5' + jockey 4829 1 81.19 TCCCAGTGAACTCCGCTTGGTCCAGGGCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTAT:1 + chr3L 8632050 5' - gypsy 387 2 73.27 ATATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 + chr2R 23584743 5' - HMS-Beagle2 275 4 56.44 AATTGTTCTCTTTTAGTTATTAATGTGAACGTGATGGCGCCCACCCCCTTAAAAAGGTAAAGAGACGTACGATACACGGCAGCGCTCCTCGGTCGGTTGGG:1 + chr3R 3456436 5' + Cr1a 4413 1 64.36 ACCAGTGGCGTAGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGT:1 - chr2R 21773630 5' + Max-element 17 2 57.43 CCCCCTAATACCCTGCCGAACCCTTGCACCACTGTGCACGAAAACTCAAGAACAAAACTTTAAATCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAACAGTCTGCA:1 - chrX 17536225 5' - Cr1a 345 1 73.27 CGAGTTCTTGTTTGGATTCCGAGAGAGAGACTTCATAGGCATCCCAACATAACGGCCATCTCCCTACTGGACAGTACTGAACAACGCCGAAGACTGCGCAG:1 + chr2R 14402197 5' + G7 1027 1 75.25 ATCTGCAGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:2 - chr2R 17345969 5' + jockey 11 1 75.25 CGGACTTATAGCCAATCATTACATATTCATGGAAGAAGAGTATTCAGAAGAGTAGGATAGTGACTGTTCTTCGTCGTAATGATATGTCTACCCAACGATAA:1 - chr2R 1597175 5' + Fw2 3814 1 70.30 TGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGACTAGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 - chr3R 22800176 5' + flea 4782 2 65.79 GGCGCTCGTCTCCCATCGGTTTCGCTGCTCGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTGTCTTACCAATTAACTGCAAATCAAATTTATTCAGGCCGCCAAGTCT:1 + chr3L 131746 5' - gypsy10 5892 2 64.36 ATCAAACATTAATCACCAGCCGAAATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAAT:1 - chr2L 12813865 5' - hopper 1307 1 76.24 AAATCACTTAAAGTGCCGTTTTTTGTACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTGCATCTT:1 - chr2L 6454774 5' - mdg1 370 2 71.29 AACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr2L 16201511 5' + hobo 35 1 61.39 GTCGAGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3L 13589439 5' + hobo 28 1 51.49 TTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3R 11119891 5' + 297 9 2 70.30 TTAATGTGATACGTAATTATAATGACAAGAACATCTTCCAAGATTAAACTAACATAAAATGCTTTTATCAGTTGCTGATCTACCGTTTCAAGCTATTTTCT:1 - chr3R 19845310 5' + McClintock 6080 2 75.25 TCCAAGTTAATCAAGATACGGCGATATGGGAGGGGGCATGTCCTGCGTACATAAGTCTTCAAGCAGTTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTG:1 - chr3L 5704795 5' - Quasimodo 426 2 70.30 TACATAAGGAATTTCTGTAAGTTCGTGTCTTTACTTTATTTTTATTTCATCAATGAGTTTTTGCATATATTTTTACAAGCACTCGAGCAGATACCATGAC:1 - chr3R 6044107 5' + X-element 4403 1 72.00 CAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCG:1 + chr3R 32005899 5' - invader4 3032 2 79.21 GCTGTGCGTTGTCCTCGTCCTTTTCTTTTTTTTTGTGGAGGGTTGCGAACAATTGTTGTTTTCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr2L 1233250 5' - hobo 2925 1 54.00 CGGTGGCGATCCGTTGTAGTCCGTGGCCATTCCCTGGTGGACTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACTATTATTATGAAATAAAAGTC:1 + chr3R 15911004 5' - transib4 2302 1 65.35 AAGTTGTCACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2L 17722748 5' + blood 7020 2 65.00 GGGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 27775094 5' + roo 8705 2 69.31 TTTTGGCCCCGAATACAATTTCCTTTTTTTGCTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTA:1 - chr2L 17646264 5' - flea 256 1 72.28 GCTAANTGGGAAAATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 - chrX 19426302 5' - mdg3 216 2 54.46 AGGGAAATTAAGCAAATCCCAGCTAAGCAATTCCTGCAAACATGCAGCATTTATGAGCAGAAGGGAGTTGGGCACGGCATGGGATACTTAAACAATTCGAG:1 - chr2R 5837274 5' - Ivk 5209 1 80.20 TTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3L 17921200 5' + 297 32 2 63.37 AATAGCGAGAAAAACTTCGCAAATGTCAGCTGGCGATGGTCTCCCATAATTTTCCCAACCAACCCCACCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCC:1 - chrX 15291320 5' - Quasimodo 6981 2 70.30 TGGGGTCTTTGAACCACGTCAGACATCCCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGCGTTATCTGCGTGTCGAT:1 - chr3R 4127017 5' + McClintock 6099 2 72.00 GACTTNCATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 - chrX 13508782 5' - roo 9065 1 75.25 AGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCT:1 - chr2L 5646899 5' + jockey 4702 1 50.50 ACCATNGCAGCAAACAGGAGCAGGAACTACCGAATGCAAGGACCTGCTGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATA:1 - chr2R 20708435 5' + F-element 4555 1 52.48 ACAAATATTTTGATAAAAAGTGTCGAATTTAAATTAAATATATTTAAATATATGTATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chr2L 22079395 5' - flea 4992 2 62.38 CCTGAGCAAGCCCAGTATTGCTGTTAATCCAATCCATCAACCACTGGCTATAATACCACCACTACCACAGCCACCACGATACTCCCAACAGGGGGCCTACC:1 + chr3R 17664201 5' - R1A1-element 4979 1 72.28 ATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2L 6888599 5' + jockey 36 1 57.58 TTTACATGCGTTTTTATTCGATTTTTATTTATTGGTTTTCCACTTGTTTTTCTTTTTTTATGCGTTACACATGCACCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGC:1 + chr3R 14080158 5' + hopper 103 1 60.40 CAAAAATTTCTACGCTTGGACAACACGCAATGAGTTAACACGCGCAAGCCCTGCCGCTCACACAGCCGGTCAGAACCTTGCGCCCTTTTGGCGTGAACATC:1 - chr3L 15389960 5' - Max-element 8234 1 73.27 GACGGGAAGCGAAGTCAGAGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chrX 2799726 5' + Tirant 8111 2 75.25 GGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:2 + chr2R 18950753 5' - roo 9027 1 70.30 CATGGNCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 - chr2L 6601433 5' + I-element 55 1 74.26 TATGTCAGAGTATCGGAGCTTTCGGGAGAAGAGCTAAGCTTTGCTCTCTCTTTTCCTAATCTTAAGAATCAATGAGCAATGCTCTCCCGAAATACAAATAT:1 - chrX 22576512 5' + 297 212 2 62.38 GACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr2L 19684010 5' + jockey 4716 1 68.00 GGTGGATTCAAAAAATTTTTGATAATTAAAACAAAAAATATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 7902977 5' + pogo 34 1 66.34 TGTTAGGTTTTTGTCTCTTAAAAAAAAAAACCCACATTTTGCGGGTATAAGTACAATATTTGCCATCAAAAAGAGAGAGAGAAAAAAAAACAATAAAATTT:1 - chrX 7375190 5' + transib2 2645 1 78.22 CAGGCTAAGCGGCAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr2L 18212109 5' + 412 11 2 68.32 AGTATATATTTATTTTTTTTTAAGCACCGCTTTTAAGCTCCGAACTCTAGAACTTTTTGCCGGATATATAATATTGATTTGTTTTTGTATATTTATTTTTT:1 - chr3L 17393510 5' - Tc1-2 481 3 70.30 AAATCTGTTATATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:2 - chr2R 9317039 5' - opus 474 2 55.45 AATGTTCTCAAATATTTGTATGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 16457972 5' - roo 405 1 75.76 GATTCAACAGCCTGCCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTA:1 - chr2R 9388084 5' + HMS-Beagle2 7192 2 72.22 ATGCATATAGATATCCACTGTGCAAGGACACCTGCCGGCGTTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTGTCATCTGGGTGAACATGCGCT:1 - chr3R 29332244 5' - G6 1550 1 60.40 CGCCTTGGACACAGGATGTGCAATGAGAGTTGCCAAAAAAAACAATATATGTACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2R 18675477 5' + opus 7022 2 58.42 ACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTG:1 - chr2R 25051875 5' + G5A 2664 1 63.37 ATTATAATTATATATATTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 13574198 5' - pogo 2089 1 54.02 AATAGNAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAAAGATGATATCGAGTCTGAAATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTA:1 + chr3R 19444890 5' + roo 8791 2 70.30 GCCGTTCGTTGACTTTTGCCGTTGCTGTAACACCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGC:1 + chr2L 19146853 5' - I-element 384 1 79.21 CGCAATCTGTTTGCTCATGTCCACTACGTGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTT:1 + chr2L 12474936 5' - mdg3 5497 2 75.25 TATACNTAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr2L 15808022 5' + I-element 49 1 68.32 CTTGANTCCTTTTTTCCAATTATTTTCTATATATATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2L 8720485 5' + hopper 143 7 75.00 TCGCGCTTCTGCCCGTCCTCGATCTGTGTAATAACAAAATCTTTTTTCTTTTGTTATTATTTTTTTACATATTGATGAAAAAACCTATGAATAAATAGATA:1 + chr3R 18920140 5' + S2 1608 1 56.44 ATGAACATCGCCTACAAGTGTAAGTAAGAGGCTAATGGCTGTAGATTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 + chr2R 13608108 5' + jockey 4844 1 55.45 TATGTTGTTTACCTTAGCACAATAGTGATGTGTGCAAACCGATATATCGATACCGCGAGTGGTCAAAGAAGTTCTATGGTAAAGGGCATATTTTGTCAAAT:1 - chr2R 24869830 5' - 1360 209 1 59.41 AAATAAGGCTCAAAGGCATTCATTTCAAAATGAGTTCCTTAAGACTATCATATCCCTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAG:1 - chr2L 16947464 5' + jockey 4926 1 55.45 TAGATAATCGATCTGTAGGCTTTTGAAGCGCAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 + chr3R 8458193 5' + HMS-Beagle 6801 2 74.26 GCTGATCTCTTGATTTATATTTTGTTTGTTGGTTGCTTTTATGCTTTAATAGAACTGAACTGTGTACATAACTTCGTATACATGCTTCACTACTTTGAGTG:1 + chr3L 22793733 5' + frogger 101 2 62.38 ATGATGCCCAAATGTGGTTTAAAATCGCAAATGGAATTTTTCATGATAAATGTATTACGCATGCAGATTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAA:1 - chrX 22992332 5' - TAHRE 10417 1 71.29 GAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 4801512 5' + roo 37 2 62.38 ACAAATTGTGCTTAAGTCTAAAGTATGAGTGAAATGGAAGTGGCAAATGAAGGATTCCCGAAGGAAGCGCTGGGGGGTAGAGAAATAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2L 14932483 5' + Osvaldo 1519 1 71.29 ATATAAAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 + chr3R 8975937 5' + Bari1 25 1 53.12 AATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 21174278 5' - roo 9020 2 78.22 AAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chr3R 19530695 5' + BS 43 1 70.30 TGAGGCCATTCCTCATGTTCCTAGCCACTTTTCGTGGACTTTTTCAACGACAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 12457911 5' + roo 8688 2 55.45 AAAAAATATGAAAACATTTTTCAGAAGTGTGGGCGTATTAGCTTTAACCGGTTTGTTGTCGTGTTTTGGGGCCCCTTTTTCCAACCTTCTTCTTTAAGTAG:1 - chr3L 24300800 5' - S-element 1264 1 55.45 ATGAAATGTCTTTAAAAATATTTTTATCCAACCTTATAGTTGCTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTA:1 - chr3L 10477607 5' + copia 5078 2 57.43 CGACGCTGCTATTTTACTGCACACTGGCATAAAGTCCAATAATAAAGCTGAATTGGTGCACGTACGTACAATTTCAAGTAAATCGAACCAC:1 + chrX 22906792 5' - transib3 2756 1 39.56 TGTACTCAACAAAAAGAGCAGTTTATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3R 17896914 5' + hobo 4 1 73.27 GAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGAATCGAGTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGA:1 + chr3L 8558044 5' + mdg3 165 2 53.47 ATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr3R 8313103 5' + 297 49 2 80.20 GTACATAGGGATTATTAAATTCAAAGACTGTCCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr3R 7850821 5' - 1360 3345 1 72.28 TCCCTATATAAAACCCCCCCATTTCACCATTATATTTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGG:1 + chr3L 16958595 5' + Burdock 318 1 65.35 ACTTAGTCGTGCAGCGAAACAAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 27430028 5' - pogo 2053 1 77.23 TGGAGATTCCATCTAGCGAAGCAACCACCAAATAAACCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGG:1 + chrX 19605448 5' + F-element 4511 1 63.37 CTCGCAATCGGCCACTCACACCACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr2R 13295653 5' + Tirant 8135 2 53.47 GGAATGAGTAAACAAACAATCGGGCAAGTCAGGATAATTATGAGTGTGTGTTGCAGGTTGGGTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCT:1 - chr2L 21125282 5' - Idefix 7085 2 68.32 CGCTCCAGGAGAGCTGGTCACATAATTTAATCAAGCGCCAAAATGCGAGCCAAAACTAAACAAAGTGCCAGTCAAAGGGAGCTCATACACTCATACACACA:1 - chrX 21220009 5' + mdg3 80 2 77.23 TTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3R 10147875 5' - roo 9018 2 79.21 TGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr2L 6601431 5' + I-element 51 1 74.74 TCCGCAGCTCAACATAGCCCCCCAATAAATCCTTTTACTTGCCCTTTGAAAGATTCTTTGTCATAATGTCTGCTATCATCTCATTCGTAGAAGTGTACTCT:1 + chr2L 5814350 5' - 1731 4182 1 59.41 TGCTCNATTTCCTTTTCAGTTGCTCTCATTCTTGTGAATAACTTCTATTGATTTACTTCTTCCTAAGTAGTCTAAGTGTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAAT:1 + chr3L 16973355 5' + S-element 1528 1 65.35 TAGGCTACAACGACGACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 - chr3R 26842885 5' - opus 481 2 62.38 GGAACCCTGCCAGGTGTCCGAGATTAGCTCGAACAATTGCCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGA:1 - chr3R 22720269 5' + Doc 346 1 60.40 ACGAGCAAATAACGTTGGTCTTCTAATTTATTTGGGAAGTTGGCACCTGAAATCCACCCAAGTGCAGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAA:1 + chr2L 23048321 5' - McClintock 6087 2 65.35 TGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTT:1 - chrX 13546680 5' - roo 9016 2 80.00 GTAGTGGCGTTATTCGCTATTTACGCAGCCGCGCAGTCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATT:1 - chr2L 8308009 5' - P-element 109 1 40.59 GTGGGCAGGGGAAGAAGTAGCAGTTAGTCGAATGGCTCAGGCATGCAACAGGCCATGAATCTCAATCTCCGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCATATCC:1 + chr3R 31939994 5' + invader3 5238 2 74.26 GAGATCGTTGATGCCCCATCAGACGTCATGGGGCCAGCTGGTCTCGATGTGGGCATGAAAGAATGACTGAACTTATGTATATGTACCTCTAGCCTACTACA:1 - chr3R 2474428 5' - invader2 1 2 70.30 AATCAAAGCGGGACTCGCATGACACCAGTGGATTTGGGGAGTTTGAGGCCTGAGACTTGGAGGTTTGGTAGAATTTACTTTTTTTGAGGAGAAGTATGAGT:1 + chr2L 13554516 5' - I-element 5150 1 74.26 CAAGCAGGTATAGTTAAGACATGTTACAAATCCATGTTGATGATGGCTAAAAATCTATATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATAT:1 + chr3L 6488862 5' + 412 7312 2 55.45 TAATTAGTCCTTATAAAAGAAGGCGAGCACGGGAACTTGGAAAAAAAAAAATAAAAAAAAACAA:1 - chr2L 3770632 5' - hopper 147 109 78.12 GAAAGTAAGTCTTTTATGTCTGGATGCGTCGGAAGCTCGTCAAGTTGGTGATAGACGCTAAGAGAGGGTATATTTTTGATTAATTTGTCATAATCTTTTAG:1 + chrX 17945500 5' + Tc1-2 1375 1 52.48 GCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chr2R 14778507 5' - mdg1 7427 2 58.42 AAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAGGATT:1 - chr2R 4606257 5' + 1360 35 1 74.36 GTTTGCGGTAGTTAATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chr2L 13334013 5' - flea 231 2 56.44 GGCCCNCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr3R 4544072 5' - flea 228 2 53.47 CTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 + chr2L 3951606 5' - Transpac 258 2 80.20 TTCGTTGACATTCAAATATTCATATGTTTATTTTTGTTTTTCTTTTTAATGGGGGCGAGCGCAGAGAGAGAGAGACAGGATAAGACAGAGAGAGAGAGAG:1 - chr2R 21507203 5' - blood 169 2 59.00 TCAGGAAATGTTTCAGCTCATAGTTGGATAATTTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATT:1 - chr2L 1090489 5' - Tirant 449 1 67.33 GGCAGCAGATCCTCCCTTCCATGGTACTTGTAGCAGTTGATCACAATCTTGCGCTGCGTCTTTGTGTCCAGAATCTATATGCTGAATCTCAACCTTCTAGC:1 + chrX 273319 5' - INE-1 169 1 53.47 GAGAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chrX 3817522 5' - roo 386 2 55.45 ACTTTTGCGTTTTGTTTTCATTCTCTAGTTTTTTTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACTTTC:1 + chrX 122875 5' - mdg3 5024 1 69.31 AAGCTGTTGTTGTTGTGGCCCTTGATGCCGTTGTCATTCAGCGGAATCAGAAGGCTTACAGACGTAAACCAATTATCAAAATATAGTTTAAAATTTTTGTC:1 + chr3L 25910492 5' - looper1 1408 1 56.44 ACAACACAACACTCAATAAGTTCAATAAAAACAAAACTGTTGAGGCAATGAGCTTTTTTATTGACTTTGAGGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chrX 23048244 5' + hopper 4 2 72.28 AACGGTTTATCCATCTTTTCATAATATATCTAGCCTTTTACAACAACTACGATATTCTTACGAAAAGATGGATAAACCGTTTTTAAAAAAGAAAAATAATA:1 - chr3R 5092968 5' + TART-C 11040 1 81.19 GCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTT:1 + chrX 21564693 5' - diver 6058 2 81.19 CTTTTAATCTTCACCTTATATGTATGCCTTCAAAAAACTGAAAGTTTTTTTCTTTTTTATTAAATATTTAAAAATATTGTTCTTATTTTTTGAATATTTTC:2 - chr2L 18418019 5' - TART-A 13402 1 79.21 TCCGTGTCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 9131745 5' - roo 9053 2 58.42 TGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3R 20149758 5' - 1360 3339 1 77.23 GAAGCCCTAACGCACGTCGAGCAGCAATTGTTTGAATAGTTTTCAGCCTCTCCAGTTGGTGTTTGGAGGCTGTTCCCCATATTTGGATG:1 + chr3L 24120314 5' - G5A 2439 1 73.03 TGTCGATTCGGTTAGCAATAATTGTTGAATTGTTGGATTGTTATTGTTGGTTTTGTTCAGTGGCGTTTTGGTCGCACGGCTTCTAAG:1 - chr2R 19475724 5' - G4 479 1 68.97 GGCCCTAATCAATGGCATTTCACTTTCATTGCGACCGCGTTAATTGAAGCTGGCTAAATAAATTGCAAAACTCCCCCACCCCTCAAAACCTCCACG:1 - chr3L 9739980 5' + gypsy5 106 2 75.00 CATAAAGCCATTGTAGGAACGATCTACTGACTTGCGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 + chr3R 4600045 5' - HMS-Beagle 228 2 61.39 AATTGATTCTGTAGACTTACTAATAAATATTTTTGATGATGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 20200548 5' + roo 8701 2 67.33 GTAAATGATGACAAGGTAATGATTGTTGCTTTCAATATAATTTAGTGACGTCCAAAATTTCTCTCTTTCCGCTAGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTA:1 - chr3R 24699307 5' - 1360 3284 1 60.40 CTACGCGGCATAGTTTCAACTTTTCAGGCCTCTACACTGTCAGAAATTTATATTTGTTTGTGTCCTAGATATTAAAATGCATAATAAATAAATAAATCTCA:1 - chr2L 1615497 5' + G3 345 1 50.50 TTTATTATTATTTTCTCCAAGCCATTGTCATCGCTTTTTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAA:1 - chr2R 13295725 5' - Tirant 8476 2 58.95 TTTTAATTATTAAAATATTTATTTTTTTATATATTTCGTGTTCTGTTTCTTTTTCTTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTC:1 + chr2L 6080767 5' - invader2 459 1 56.44 TTCAACATGCTGGCAACAGCAGAGCATCCTGGCAATGGGCAGTTTGTATCAGCTGCAGGACTTTGTCTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3L 12888198 5' - mdg1 414 2 70.71 ACTGCCCTCGATAATGGCGGTGGCGCCTTCCTCATACCATATCTCATTGTCCTGTTCCAAGCATACTTCTACGGCTA:1 - chr2L 14848806 5' - Cr1a 4015 1 75.32 ATAAACAATAAGCACATCTAGTTACTTAGCCACCTTGTGTTCAGCACTTTCCTCACTGCGTATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTT:1 + chrX 16777237 5' - Bica 5 1 66.34 CATTCNGAATATTCAAAAGACTTTGGGTAGCAAGCTGGTGGCTTAAGAACTTGACACCATTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCTTT:1 - chr3L 24362431 5' - Doc3-element 426 1 67.33 AGATATGATATAACTTTATTAGTTGACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTATGCTTT:1 - chr3R 7523242 5' + blood 97 2 75.25 GTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 - chr3L 18706935 5' - jockey 4955 1 56.44 GACATCACCACGCCCACGACCTTCACACCGTGGTGAAAGCAAACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGC:1 - chr3L 10476019 5' - copia 4952 2 57.58 ACAAGCGAGATAGCAAAAGGGGGCCGCGGGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr3R 9551490 5' + P-element 29 1 49.50 CGTTTGTTGCTTCGCCTTCTCCAGGAAAAGTTGCATTGAACCCAAGAGACTGCAGACACATTATAGGAGTTGTACTATATAATCCCACCATAAGTCCCGTT:1 + chr2L 21589018 5' + Bari2 484 1 76.24 CAACTTTAGGGAGGAATACACCCGTTCGGTACTATGTGCACACAATTTCTTGACAGTGTTAAATCTGTGCAAACTTGGATTTAGTTGTTTTTCTCGTTCAT:1 - chr2L 17004913 5' + S2 1546 2 72.28 TAAACTTATGCAAGAGATAACGTGTTCAAGCCAACAATAAAACCATTATTTATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAA:1 - chr2L 3962979 5' + Doc 4479 1 52.48 AAGGTTGTTTTTTGAATTTAAATTTATTCTTCCTCACTTATTACTTAATGATGAAATACTTTTCTTACCATGTGTCTTATTTCTTAATATCTAGTTAAATT:1 - chr2L 5448010 5' - transib3 64 1 31.68 TCCTTTTCTATTTTGCAACTTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 10147921 5' - roo 401 1 74.26 GTTTATGCGTGAACCAAACGGATACTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:2 + chr3L 15100689 5' - pogo 2051 1 76.24 ACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGGCCGTCCGTCCGTCCATATC:1 - chr3R 1977621 5' - micropia 427 2 50.51 AACTTACATTCATGATCGTGTTGAAGTCGTTGTTGTTGCCGCCCACTATATAACGTTCACATATACACACATACATACATACACATGACCA:1 + chr3R 23075993 5' + 1731 4391 2 49.45 AGCCTGAACGCATCGCATCCAAGCCAATGACGCTGAGTCAGTTGGCAGAAGAAAAAGCCAATGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGG:1 + chr2R 8859202 5' + Stalker2 157 6 63.00 TATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATA:1 - chrX 23182896 5' + Idefix 43 2 72.28 ATTTTTTTATTTTTATTTGAGTTGCATCAAGGCTTTCAGGTGCAACCGAAAGCCTAGGTATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAG:1 - chr2R 19562126 5' - GATE 358 1 44.55 TGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAA:1 - chr3R 29331916 5' + G6 33 1 55.45 CGTATGTCAATTGGATCTGCTCTCGACATTTGGCTTATGCGTCTAATTAAAAGTACATGTAATTGTTAATATTATTTATTTATATTTTATATATATAATAT:1 - chrX 7808157 5' + transib1 1911 1 77.23 AAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chrX 3763235 5' + 297 6611 2 63.37 GGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATA:1 - chr3L 23839715 5' + McClintock 23 2 55.45 GAAAGCCGGCTGTGTGGCAGCAAAAAGTTCTCCTGGGAGTGGGTGGCCATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chr3L 5201459 5' + 297 10 2 74.26 GATGGTGGTAAAGTAGAACTCAACAGGACAGGCGATGTAAACAATGCCGAAACAAGCAAGTGAGATGGTGAAAGTGATGTCACTGCTTACGATCGGTCTTG:1 + chr3L 16932046 5' - gypsy9 4857 1 74.26 ACTCGNGGCAGGCACTTAAATCCTTTTGAATTGTGGCAAGGACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chrX 2753894 5' - roo 9038 1 58.42 TTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2R 9317026 5' - opus 461 2 68.32 TCTAGATTGTAATATGTACAGTTTAAGAAGTTGATGGACCGATGATGTGACAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTTTCGGCGTCCACAAAT:1 + chr3L 27267509 5' + invader3 280 1 56.44 GTCTGNTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATATTCGGGGAAC:1 + chr2L 22092977 5' + INE-1 556 1 59.60 TGTGATTAAGTTCTCACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2L 17722741 5' + blood 3 2 73.27 CATATAAGCACATACATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr3R 7168540 5' + flea 4762 1 74.26 AGTAAAATTATTGGACAAACAACCTTACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGG:1 + chr2L 17784595 5' + gypsy10 2 2 73.27 CGATGTAAACCTTCTGCCGGCCCAAAGAAATGATAATCGATCCAGCAAACGAAAAACCGAGAGCAGAGCAAAAAATTAAACGAAGATCGCCAATACGAACT:1 + chr2R 5043668 5' - accord2 141 2 63.37 ACCACGACGGTCAGAAGGGCCTGAAAGGCAGGTAGGGGGGCAGGTAAACGAGTTGCCACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - chr3R 8277986 5' + P-element 19 1 60.40 AAAAGCAATGACGAGAAGGTGGCTATAGGCTATGCAGCCAAATACGACCGGGTACTGTTCACCAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACAATTT:1 + chr2L 5532707 5' + HB 1397 1 66.34 TTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATT:1 - chr3R 11094566 5' + 3S18 39 2 60.40 TCTGCTCCTTTCATCCTTGTCAACTAATTTCGGGGTTGTGCGGCCGACAAAACTGTGAAGTAGACTAATCTCATACTCTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAG:1 - chr2L 21024331 5' + diver2 4584 2 56.44 CGAATGGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 16761306 5' - roo 9022 2 74.26 GGCCACGATCGCTGCTCCTGCTGATGATGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 + chr3L 7550691 5' - 412 483 2 69.31 ATACCGATTCCGAGATGTTGACATTTCTGTTCACCCCAGTGACTCGTAAAGTATTTCCATTCATCTGCGTTATTGTCGTCAACGGCTGCACCCGCTCAC:1 + chr3L 22395365 5' + F-element 464 1 74.75 CGTCCCTGCTTGACCAAATCTGCCAAGTGGGAATGGCAGATGAATAATGGAGATTGGATGCCATACGTCCAGATTGGCCTGATCGCTTTATATATGGGAAC:1 + chr2R 4932833 5' - G7 825 1 61.39 CAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTAT:1 - chr3L 18337704 5' + Juan 4060 1 59.41 TGTCCTGTCATGTCCTGTGCGTGTTTCGGTGTCTTCGCTGTTGCTCCTTGCATCCAGCATCCTTCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTC:1 - chr2L 7641570 5' - baggins 4989 1 54.46 AGCGAGGGAGTGAAATGTTTACCTTTATTATATGAATAGTCGCGTCTGTTTTGATAATCAAGGTCGTCTTTATGAAAAGCCAAAAAATTGCGATTTTGCTC:1 - chr2R 25177866 5' - HB 186 1 77.23 TTTGANAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3R 27981732 5' - roo 9041 1 57.43 TTTCTGGTTTCTGGTTGATTACTGTCCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATATTCCACTTAGAAATAAATTTGTATCCCAC:1 + chr2R 21460758 5' - Bica 173 1 74.26 TAAGGATGGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTT:1 + chr2R 4547733 5' - HMS-Beagle 7038 2 73.27 AATGATAAAATATTTATTAAAACTATGGATGCTATCAAGGCCTACAAGGAGTCACTATTAAAGGTAGAAACACTTAAAGGCGAAGCCCTCGCAGCAGCGAG:1 - chr3L 18340392 5' + rooA 7536 2 74.26 GTAATCACAGAAAAGGTGACGGCATCGGGAAACTGCAGGAATGCATACTTCTTAGATAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 + chr3R 19346880 5' - blood 359 2 58.42 AGGACTGGGGAGCAAGGACTTCTGGCTCCGCCACTTGTTGTCTTTGTCCTCCTGTTTGTGTTGTGACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAA:1 - chr2L 2075148 5' + I-element 148 1 72.28 CTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chr2R 981626 5' - Tc3 312 1 64.58 AATTTGCATGTAGATGAGCACGGAAAGCTGCACATAGACCTCATATAGATACATGTGTATGTATATGTATACATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr3L 22831249 5' + 297 6587 2 65.35 TATTTCGATTTCTTCGCATAAGTCCCGGTCTTATCCTTTAAGCGGCTTAAAGAGGTTACACCAACTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAAT:1 - chr2L 7280240 5' - blood 7143 2 72.28 ATATAATAATTATTGGTTTTGCCAGAAAATGAAGCCTTTCGCCATAATTGTATTGTACGTTTTCGAAAGTTTATTTTTTAATTATTTTTAATTAATTTAAT:1 - chr2L 15935406 5' + HeT-A 378 1 54.46 AGAACAAGTGAGTGCGAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr2R 10543421 5' + P-element 34 1 45.54 CTCAAGGTCGCTAAAAGATACCGTGCGTTCCATATCATAGGCGTCACGAAATCCAAAACAAGTGCCTGAGGCTAATCGCTGACGCTCACCCATACCATTAA:1 - chr3L 25464542 5' + G-element 4002 1 54.46 CGTATGCGTAATTATTGAATACGAAATGTGTGCGAGTGGAAAATTGATAGATTTGTATGTTTGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAA:1 - chr3R 21995061 5' + 1360 217 1 68.32 AATGATACATAATTATACAAGTAACTTACTTGGACGGATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAAT:1 - chr2R 21774330 5' - Max-element 316 1 61.46 CATTTTTAAGATAATGTTTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 - chr2L 15080588 5' + hobo 16 1 67.33 CCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr3R 6117234 5' + Tirant 33 2 59.41 AATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:2 - chrX 5092984 5' - roo 9030 1 64.36 CTGTGTACTGGGTGAATCGAACTGAATGAATGCGCACGTTTAGTCTCTTCCGACAGACTAAGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAA:1 - chr3R 9452197 5' - diver2 4723 2 60.64 TGTTGGTGTCACGTGCACAGTAGAGGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:2 + chrX 5092944 5' + roo 8715 2 81.19 CTGTTACTATATAATTGTGGAAGTGGCAACCACTGTGCCCGATCGTTGTTGAGGACCTTTGTTACTATATAAGGTCCTTTATAAGCAGCATCCAATTTATG:1 - chr2R 14059528 5' - Bica 4714 1 62.38 TAGATAATAAACATACACAAATTATGTGTGTATATTTGTCATTAAAAACCGTTTTAATGGTTTAGCGATTTCAAATATTTATTTATTTTTATTCT:1 + chr2L 10306709 5' - mariner2 828 1 61.05 ATTGGCTAATAATTCGTTTTTGGAATATGATAATGCTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2L 7850070 5' + 412 7092 2 64.36 TGGGGTCTAAAACTCCTTTTCATTTCGCTTAACTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr2L 14579817 5' + copia 4889 2 59.41 AGGTTATTCTTCTTTGTTAAGATGTTCTGTTGCTTTTGCTTACACAAGCCTTTCGTTAGTACATCTGCAACATTTTTATCAGTGGGTACATATTCAAGAAT:1 - chr2R 3009734 5' - Copia1_DM 4184 1 76.24 ATTATGTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 14612102 5' - roo 9042 1 53.47 AAGTGGAAAGGTGCATAGATGGCAGGTGGAGCGTGATTAGGCTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGA:1 + chr2R 20400674 5' + R1A1-element 235 1 58.42 TTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2L 14790586 5' + roo 8702 2 65.35 GATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACGGGTATC:1 + chr2L 22092965 5' + INE-1 541 1 54.17 AAATTGCATTGAAATGCGTTCGGAGCTTGGATTTGTCTTCAACCCACTTTATTTTTCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 + chr2L 5707238 5' - jockey 4971 1 50.50 ATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1 + chr3L 19951178 5' + Ivk 10 1 69.31 TGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATA:2 - chrY 3648877 5' - 17.6 7379 2 75.25 TTAATTTATAATTTTAAAGTTAAAAGTACAAGGAACTACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCTACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCG:1 - chr3R 12979499 5' - flea 4858 1 61.39 ACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:3 - chr3R 12047464 5' + Stalker2 7298 2 72.28 AGAATGTATTCTCTTATCAGTGAGGCTTTGCTTTCTTTTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATT:1 + chr2L 10305789 5' - G4 3522 1 73.27 CCCACNGCAATCACTCACCCCACCGAACACCCAAACATTCACTTGGCATTGCATCTCCATATACATACATATAAATATACATTTCCATATACATACATATA:1 + chr3L 10174808 5' + ZAM 190 2 53.47 CAAACGTTTAATAGACAAACAAAAAGCGAACAATAAATCAGTGAACTATTTGTGCAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAA:1 - chr2L 13809900 5' + TAHRE 281 1 83.17 CTGTTTCGTGGGATCGCGCTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGAGGGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTCGCGCTTGCAGTTTGCCTGAGTGTAGTGAC:1 - chr3L 4670191 5' - mariner2 284 1 81.19 ATTGACCAATATCTCTAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr2L 21683484 5' + pogo 21 1 58.42 CACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3L 7075879 5' - roo 9038 1 60.40 AGTGCAATTTATTTCCACCTCTCTCTATCGCATTTTGTGATGTTTTATATTGTTGTTGCTGCTGTTTTTGCTCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chr2L 7151759 5' - jockey 4943 1 74.26 AATGCCATCATAACAAATCAGCTGCCGCTGATAAGCGCAGCTTGGAGCTTTTATGTTGTACCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3L 4122512 5' - P-element 2874 1 66.34 AATCACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:2 + chr3R 4601312 5' + opus 32 4 63.37 TCGGTCCTTGAGACTAAGGCCGAAAAACCGATCTCAAAGATACCAGTAAAGACAATACCGGACAGATACCCGAAGCAAGACCGCGATCGTTTGCATTCTGC:1 - chr3L 7698276 5' - Doc3-element 365 1 61.39 TCGGATACACCGATCTATGTTGTAGCCGCAGCCTTGCTGGTTTCTTTTTAAATCAAACACACACAGCCACACACACACACACACACACATACACACAT:1 + chr3R 23988479 5' + accord 7037 2 66.33 ATTCAAATTTGATTTTCATGTTGATTATCACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAA:1 - chrX 6388437 5' + jockey 303 1 71.29 ACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 11113898 5' + 412 7082 2 56.44 GAAAACTGAGCGAATGTAAATGTAACAAAACCAGTTGTTTTAAAATGCCATTACTTCTTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTA:1 + chr3L 19463675 5' - invader4 316 2 65.35 TAAAAATTCGTTTTATAAATGATTCATTTTTTTTTTTAGAAATTGTTAGATTTAGGTTTGTCAAACGTTGTTTTTTTTTAGTTAATTAATTAAAAATTTAA:1 + chrX 3390557 5' + HeT-A 455 1 81.19 CACATCCTGTTCTCGTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGT:1 + chr3L 10081915 5' + rover 6959 2 69.31 AACCTCCGCCACAATGGGGATCTTAGATCGGGATTATCTTTACGATTATATGGCAGCTTCATACTCAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTT:1 + chr2R 1750324 5' + Ivk 4977 1 64.36 TATGCTTCATAAGTTGTTTACGCTTTAGCGCTTTTCATGTGTTTCTTGTATTTCTCATATATGTTGTTGTTGTTGTTGTCGATGCGAATGCAGTTGTGAGA:1 - chr2R 18146344 5' - Doc4-element 294 1 71.29 GAAACNTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGAATATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 - chr2R 5840668 5' + Ivk 54 1 73.27 GTTAAAACACGTGTTTCAGACCGACGTTGTACTAGCTCGAGCATGTGTGATCGTGTTTAAAGGTTAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2L 23390276 5' + P-element 9 2 71.00 GCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr3R 20149772 5' - 1360 3353 1 63.37 ATGCACTTTTGCAGGGTAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3L 18659009 5' + pogo 6 1 68.60 AAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr2R 14708986 5' + Doc 54 1 74.26 TTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 19446125 5' + 297 6585 2 74.26 CGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAATGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTG:1 + chr2R 2666334 5' + Rt1a 18 1 53.85 GGATTTTGTACAGATATCAAAAAACAAATATGTATATATATTACTCTTTCTAACACACTATTTATGAACCCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGT:1 - chr3L 414256 5' - invader4 2869 2 57.43 CCGGTGGATTTTCCTTGGATTTTCTTGGGTGTTGTTTGGGTTTTGATATAGGGATAATGATAGCCGATCTCCATGTATGTGGGTATTTCTAATCTGTTTTC:1 - chrX 5199605 5' - 1360 328 1 53.47 CCATTGACACATTTAGGGCGTGGGTGGGTGGTGGATAAGGAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGACGGCGGG:1 - chrX 2648767 5' + Rt1b 4835 1 60.40 TGATTCCTCGACAGCTGCCACGAATCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 16761326 5' - roo 9042 1 58.42 GACAATCGCTATTGATCGAAGGGTGGGGCTGGATTTGGCGAAAGGGGCCCCAAGTTGGCAATGCAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTA:1 - chr2L 3131053 5' - FB 923 3 67.33 GTGACAAAAGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCACTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 9907354 5' + jockey 28 1 52.48 CTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr2R 19551990 5' - roo 9034 1 62.38 TCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAACAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACA:1 + chr3R 19450206 5' - roo 8605 1 73.27 CGCAACTCAAATAAATTGTTCTATCTTGGCTATCACATACAATTGAAACTATTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAAC:1 - chr2R 1927757 5' + F-element 4402 1 56.44 AATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 15305634 5' - roo 9044 1 56.44 CATTTTTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr3R 8555937 5' + 412 7075 2 56.44 TTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTC:1 + chr3R 9131757 5' - roo 9041 1 56.44 ACTTATTTTTTTGTTTACGTAGACAAACTTAGTTATTCTTGCATATATTCTTATTCATTAGTCAGTAGAAATCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAT:1 + chrX 13735291 5' - G5A 2792 1 54.46 ATGTGTAATATTTTTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - chr3L 8713158 5' + opus 7032 4 60.00 GAAAGCTTTTGTCCAACCCAAAAATAACAAAAAAAACAAGCAAACAAACAAGCCAGTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGA:1 + chr3L 12452956 5' - baggins 5087 1 67.33 GATGCAAGGATTGCAAGTGTCCCTTAACTTTCGGCGTCGCTCGAGTTGCAGAATTGAGGAC:1 + chr3L 15657250 5' + diver2 4419 1 62.30 TCCGAAATTAGATCAAAAATATTGGTCTAAATATACGCTAAGGGGAGCCTTAGCGTATATATAACTGAATAAAACTGAAAATTTTCAAAATTTTTTGACTA:1 + chrX 22689324 5' - transib3 34 1 71.29 TTCGTGTCTGTGAGCCGAACGCATACGAACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chr3R 8477719 5' - P-element 2866 1 31.68 TTTTACAACACTATTGAGAAAAGCCTAAATATTAATATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:3 + chr2R 5953095 5' + pogo 36 1 68.32 ACTCTGTGTAATAGAAGTCGATTCCACTTCTGATAGTGCGAGTCAAATTAACTTTAATGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:1 - chr3L 27326 5' + I-element 18 1 62.38 CCTAGGTGGTTAACCCATCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAAT:1 + chr3L 17168834 5' + mdg1 7065 2 53.47 GTGCCATTTTGTTTGTGTAATATAAAATTATGTTTATTAGTTGATTACCGCAAACTAATAGTAAACCAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3L 7906521 5' - roo 400 1 60.40 ACAGGAGCCATTGTCTCAAAAGTATTCACGAAGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCCTTATTTT:1 + chr3R 22234698 5' + pogo 41 1 68.32 ACTTGGTGGTCTGGAAACCCACATCGCGTCCCTTGATCTTGATGGAGGCTCGCTCAATGGGCATGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAAT:1 - chrX 16709844 5' - flea 4716 1 67.33 GAGGGNTGCGACAATCGATTGAAAAATCCGAAATACAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 11263490 5' + roo 8669 2 74.26 CAAATATGCATTGATTCAATGATTTTTGGTGAATTTCTAGAAGATACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTGCCAATTTCCTAGCAATATGATA:1 + chr2R 19843803 5' - 1360 3113 1 61.39 TTATTGTGGTTATAACTCTATGTTAGGCTTTCGAAATATGGTTTTGTGTCCCTAATACATGCTCGTTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGG:1 - chr3L 27979963 5' - Doc 173 1 66.34 GCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chrX 15293433 5' + Quasimodo 34 2 52.48 AGGAAAACAAAAGCTAACTGACTGACATTATTTTGGCATGTTTTGAAGCTTATGACAAACGCCAGCAATTAGTTAGGAAATTAGATATTAACTAAATTAAG:1 - chr3L 6401370 5' + I-element 5243 1 65.35 GGCGGGACCGAGATTATTCAGTTTGCCAAGAACCTTTTGTATCTGTTTGCGACCACATAAAGAGAAAACTACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATC:1 - chr2L 19525512 5' + FB 8 1 68.32 CATGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr3R 6735331 5' - copia 5087 2 61.39 ATACTGTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2R 6173081 5' - pogo 2079 1 59.00 GGAGAAGGTCGCAGGACGCACTGCGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 16674922 5' + roo 35 2 62.38 AAATATAATTTTATTTAATATATTAAATAGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 11263396 5' - roo 9041 1 62.24 CGTATNGATTGTTGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTT:1 - chr3L 18337735 5' + Juan 4029 1 73.27 AATATTATTTCATAATTAAAATTAAATCTCATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTG:1 - chr2L 17209783 5' - jockey 4584 1 70.30 CCTTTGTATTTCTTCTGGCTGCCACTTTTTATGTATCGCTTGAATTTGTCTGTGTTGTTTAAGGGGGCCCGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACG:1 - chr2L 17721991 5' + blood 342 2 65.35 TTAATTTATTTAAATCTCACCTGTAATTCATAAGTCCAGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGAATAAGTGGAGAGCGAGC:1 - chr3L 7227041 5' - Doc 4226 1 70.30 CCTGTAAAATGTACAATTTTGCAATGAAAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACATATGGGCTTACAA:1 - chrX 5978362 5' - aurora-element 4116 1 73.27 AGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAA:1 - chr2L 3440478 5' + Juan 56 1 72.00 AATTACGTATATTGTATGTATTTGATTAGACCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAA:1 - chr2R 16628113 5' + F-element 135 1 71.29 TACCTTACTCTAATGGTCCACTAACATTTTCAGCTAGCTCTTAGTGATAGGAAATTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 - chrX 21056279 5' + FB 22 1 57.43 GGAAAGCTCATTAAACACTTGCTAAATCACACTTATGCCCCATTAGAGCACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTAT:1 + chr2L 15808214 5' + I-element 239 1 55.45 CAAAGCGCACATTAAACTCTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGC:1 + chrX 21097023 5' - INE-1 169 1 61.39 CATGCACTGAGCGAAGTATAGGTAGTGGTTTTAAGTAAACATGAAAATACGCACAAAAAAAGACAATATTGAATATTGAAGATATTAATTTTACGTAACTT:1 + chr3L 20978072 5' - Transib5 339 1 69.31 GTATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 9131742 5' - roo 393 1 63.37 AAATGCGGTGCAATAAAGCAAAAACAGAGATTAAATAAATAAGCAGAAAGAGTACAAAAAAAGGTAAACCAAACGAAAAAAAAAAACAACAAAAAAATGGG:1 - chr2L 11470510 5' - hopper 140 1 66.34 TGTCACATGTTTGGCCAAAAAGGCGCGCACGTGACGCCCCCGGAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGA:1 - chr3R 13132567 5' + Doc3-element 4536 1 57.43 AGAGCTTCATTAAGTACGCCAACTCTATGAGAACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATAATGCTGTGTCCC:1 + chr3L 8343917 5' - Rt1b 4754 1 68.32 TTCGAATCTCTGGCTTCGATTTTCCTCGCCTTTCTCTCGCATACAAATTATACATATTTCTGTCTTGTTCTGTCACAATTTATTTTTAGTTTATTACCCAT:1 - chrX 6184059 5' - Fw2 71 1 61.39 GGCAACTAAGAAAATTCTCATTCCTCACTTTCGTTTGTGGTTTTTTATTGCTTTTTATGCAGCTTTCGGCATTGAAAACTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTG:1 - chrX 9175645 5' - I-element 4963 1 79.21 GTTTGATTTAAAAAACATTCATTTCCATATCAGGAAGTATCATCCCTTATAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:2 + chr2R 14341764 5' + opus 20 2 52.48 AATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGC:1 + chr3R 14917202 5' + HMS-Beagle 46 2 74.26 ACCAAATCGATTAATCGAAGGAACCCCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 - chr3R 4834342 5' + mdg1 14 2 65.35 GCGCAAAGGATGTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 + chr3R 10952249 5' - roo 397 1 65.35 TTAGGCACATTAGCTAAAAGTTAAAGACGTCAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAG:1 - chr3L 605933 5' + I-element 328 1 76.24 ATAAGTCCTTTTGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAG:1 - chr2L 2074805 5' - roo 409 1 81.82 ACAATTTGTAATCTTTCTAACGATAACTAGCTCAAACTCGGCTTATCTGTATCCATGCGCAATCCGCTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATA:1 - chr3L 23419728 5' + Quasimodo 441 2 76.24 TCCCTTCAGCGAACCTTTCTCACATATTAAGCGCAATTAGAGCCATCCTAAGAATTTGCATTTTGTATTTGCTGGCCAATAACGATAATAATAATAATATT:1 - chr2L 17750820 5' + mdg1 33 2 71.29 GCCAATCGGTCGATCTGCGATAGTCCGTAGCACGACATTGTTATTGTTATTGTTATTGTTGGTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCA:1 - chrX 3870673 5' - gypsy10 26 2 57.43 TTTGTGGTAGGCCCAGCCAGAGCATAAAAGAAATCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCT:1 + chr2R 18088326 5' - X-element 4432 1 66.34 GAAAACACGTGGCCAGATAAACATAATATACAGAGTGGTTCGCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGT:1 + chr3L 10477545 5' - copia 222 1 57.43 TTTTTCAATGCAGTCACACATAAAATAGAATCTATGATACTTAGAAAAGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTG:1 + chr3L 5205162 5' - 297 30 2 52.48 GTAAAGATGTCGAGTGAGATCGAGATGTAGTATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chr3R 6273523 5' - blood 336 2 68.32 AGTTANATAAGGGGTATATTCAAAGTTACGTTGTTATACCCGTTACTGGTAGAGTAAAAAAGTCATTAAAATAACAAGATGCGTAACGGCCATGCATTGGT:1 + chr2R 5740135 5' - 1360 3366 1 65.35 TTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACTGTAATATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATAG:1 + chr3R 15072576 5' - pogo 2072 1 51.00 AGGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTC:1 + chr4 1301734 5' + 1731 4339 2 48.51 TGTAAAAACAAAGCGGCTATAACCATACGAAAATTACAAACAAATCAATAGATTATATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAAGCAGAGA:1 + chr3R 19357718 5' + invader2 4972 2 74.26 ATTTTGATTTACTTATGATTTTACCCACTCCGTTTCACACTGTTCACACTGTTGATTCTTGGTTACTTAGCTGTGAAAACCATTCGATCTGTTACTGATTT:1 - chr3R 18428232 5' + Tc1 1512 1 56.44 ATCTATTATGATATATTCCGATTATTCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCT:1 - chrX 1279663 5' + roo 9052 2 75.25 ATTGATGGTAAACTTTTCAACTTATCACTTTATTACAAGACACTTATTGTTATCTATACAACTCCGTCTTTAAACCTATCTGGACCTATGGCTCCGAGCTG:1 - chr2L 22943406 5' + Doc 4288 1 59.41 TTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr2L 16201586 5' - hobo 2919 1 62.38 TAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 13508686 5' + roo 30 2 56.44 ATTCCACTGCATTGTGAAATACAATTATGCTGATCAGCCGAGAACTTGATCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACGGATTCGGCAGCAGA:1 + chr3L 24360091 5' - Quasimodo 6919 2 71.29 GAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:2 - chr2L 12324093 5' + roo 40 2 65.35 TTTTTTATATGGTCGAGATCAGCGTAAAGCTTGACCGATGTATTAAAACAAAATACTATCAATAAAATACGTTTCACCAACCAATATTATTAGTTTTTAAC:1 + chr3L 24766239 5' + FB 363 1 71.29 TACATCAACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3L 19377822 5' - roo 403 1 73.27 AAAGCTCATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2R 20739432 5' + roo 23 2 57.43 AACACAACACTCAATAAGTTCAATAAAAACAAAACTGTTGAGGCAATGAGCTTTTTTATTGACTTTGAGGAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chrX 23048246 5' - hopper 1409 2 70.30 CGACGCACGGCTTTGACAGTTCAAATTAAAATGGGTGCGGCCCCCGAGCGCCGGAGAATCCAGCAGCCAGCAGCCGATGAACCATGAACTCCTTACACGTA:1 + chr3R 27755371 5' + G5A 2698 1 74.26 GAAAGTTCGCGGGTGTAGCCTGTAAAAAGCAGAATCGAGGAATACAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3L 3986521 5' + copia 33 2 57.43 TTAGACTGCGTCAATACGTGAAAACATTCTTTCCACAGCTTCCATCAAGTAGATCATCATGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATGGCCGT:1 - chr3R 20561773 5' + Tirant 8066 1 57.00 ACGTCACTACGGTGCTCAAAGAGAGCAGGAAAAATCATGTCCGATTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTA:1 + chr3R 18924387 5' - 17.6 166 2 66.34 TCCTTTTGACCACAGAGTTCATTGGCACGCGCTCTTATTTTTCCTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGATCCGTT:1 + chr3L 16761255 5' + roo 32 2 56.44 GCAAGTTAAATTTTTTTTTGAATTTT:1 + chr2R 10342485 5' + Tc3 381 1 88.46 GAAGAGCTAGTTGGGTAAAGAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chrX 19116846 5' - opus 486 2 71.29 TTTCCTCGTGTTCGCCGTTGTCCGCCTAGGGATACATTCGCCTGTCTCCAGAATCCCTCTTCCATCACTTTGAAGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTG:1 + chr2L 19823851 5' - Porto1 308 1 64.29 AACCAGCTCAACCGGTTAACCGGTTGCTAAATAGCGGCAAATTCAAATCAATCAACGACAAGGCTCCCCGCTTTTCTACTTGTTTTTTTTTTTCTTCGTTT:1 - chr2R 16047319 5' - gypsy7 5009 1 61.39 TGCGCNAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 - chr2R 16988244 5' - opus 7451 2 75.25 TCCCAGAACCGACATTTCAGGGAAAGATGACTCACATACTTGCCCAGGAGTCTATTCCTTCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGA:1 + chr3R 27390095 5' - baggins 5233 1 67.33 TAAAAGCTTAACAGCCGTCTTACCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGGCGATGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr2L 20237908 5' + jockey 35 1 53.47 GATATGATTTTATTTGTTTTGGCAACGCAGCTTGCGGCTGTGTGACCCGACGGCTGTTACCCCAGAACAACACAAACGCGAAACACAAAGGGAAGATTCAA:1 - chr2R 5019507 5' + Doc 4667 1 62.38 AGTCAACTATTCTGATCGGGATCAGACGATTTGTTTAGAATTTCCATTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 + chr2R 966151 5' - I-element 5327 1 59.41 AGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 19989279 5' - 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Transpac 451 1 65.35 ATTGCACAATACTTATATTAATTAACAGCTATTGAAACCTATGTTTTCATTTCCCATCACTCACTTATACAATTGTACATATGTGCATATATCGAGGTTTC:1 - chr2R 13338999 5' + blood 7017 2 83.17 AGGAATTCCTTGTGCCAGCCTCCTCCCATCACGGTAAGCCCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTA:1 - chr2R 13295283 5' + Tirant 445 1 60.00 AAAATGATATTAAAAATTCCGTGCCAATGTTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chr3L 17921229 5' + 297 2 2 76.24 TCGGCTGACGAACCGGATCGCAGATACTTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2R 16334039 5' - P-element 2841 1 33.66 GCGCAGTCTTGCTTCCCGCTCCTACTGATCAAACTACACAAGCAAAAGCTTCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGC:1 - chr3L 24917493 5' + Porto1 347 1 73.27 ATGGCGAATAAACGGAAAAGCGGAGTAAAGAAATAAATACAGAAATGGAATGAAGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAA:1 - chr2L 1839711 5' + 297 6960 2 57.43 AGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chrX 2649882 5' + Tirant 40 2 63.37 GACTTCTAAAAATGTCTTTAAAAAGTTTAGATTTAGTTGGGATAAAAATAAATCGATCCTGCTATAGTCGAGTTCGCCGAATATCAGATACCCGTTACCCA:1 - 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chr3L 17921190 5' + 297 6620 2 71.72 AAAGTGTGCGTGGGTTTTTAAGATTATTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTTGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACA:1 + chrX 15812526 5' + P-element 2757 1 32.67 ATTTCNTGAAAACAAGGACAGTAATCAAACGAATTCCAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3R 27430108 5' + pogo 8 1 70.30 ATTCANCTGAGCTAACGGAACTATGTGCCTGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2R 10444333 5' - P-element 2885 2 76.00 TTAAATAGGCACGTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 1365298 5' + jockey 14 1 71.29 TTTCCGCTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTAACACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chrX 17968336 5' + Tirant 7 2 74.26 CTATCAGCAAATCCTTAGCGGCATCGATGTCATCCATATGCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGA:1 + chr2L 10154898 5' + Idefix 7064 2 70.83 AAAAGGCTGAGCTTGAAGAAGCCGATTTAGGTGCATATGAATCTTCTAAAGATACCATCTATCGTCCGTAGATGGCATGCACGATTCCTAACCCTCAGTTA:1 - chr3L 2060757 5' - Rt1a 4995 1 61.39 TGGGAATTTTGGGTTGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr3L 19377709 5' + roo 14 2 66.34 GGGCGAGTGTGAGTTGGCCTTTTCCGATTTGTTTTGCGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr2R 24239332 5' + hobo 42 1 67.33 GAGTTAACATTATTGATTCAATGATTCAATCCATCAAATTAGAGCGGCAGAGAGCCAAGATTATAACATGATAACATGATAAAGTCTGTCATAGTCAGAAC:1 - chr2R 4712156 5' - Cr1a 4200 1 53.47 GGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr3R 20556138 5' + Tirant 45 2 70.30 GTTGACCCCTCCGCCTGCACACAGGACTCATAAAAATTCTGCTCATTTTCCTGCCCAACTAGAAGCTCCCTTGCTCTCACTCGCTCTCACTCGCTCGCTCT:1 - chr3R 8706265 5' + Cr1a 288 1 67.33 AATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:2 - chr2R 4483254 5' + Ivk 47 1 67.33 CCGTGGCGATAATAACCAAGACCCATAACTAGAGAACTTTTGGTCTTCTTTCGGAAAAAATTCAATTAAAACCTTTAATACAACTCCTTTTTTCAAAATTT:1 + chr2L 18114557 5' - Tc1 284 1 73.27 GTCGAAAGCAAACTTTAAACAAGCAAGTTACGATGCAACAAAACGATCCGGACAGCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3R 10147817 5' + roo 8685 2 58.42 TTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - 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chr2L 23390230 5' + P-element 56 1 24.75 TTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr3R 7168638 5' - flea 226 2 63.00 CAGTGNATATTCGTATTTATATTTGTGCTATAATCGTGTTTTTATGAATAGTTATAGTTTCCCATCTAAGGATTTTTTGAATATCCTTATATGTTTTTCCG:1 - chr4 844416 5' - HB 413 1 63.37 GATTATTTTTGATTTTGATTGTTTACCACTGCTTTTATCTCTACTTGAAAATTAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 6701988 5' + pogo 19 1 62.38 GCGGTAAATTGCTTAAAATGTGTTAAGTGAGGATCATTCAAGTATAAGACAGTTGGGAGTAAAGAAATCAAAAGAAATCAAAACATATCAATAAATATATA:1 + chr2R 11916614 5' + S2 1608 1 72.28 ACCGCTGATAAGCGCTGGTCCGTCGTTAATGATTTATAGTTGCCAAAAGGCCAATAATCAAAATCAAATGCCCGAACGAAACGCACTTCCGGTTA:1 - chr2L 4800820 5' - 3S18 386 1 58.95 AAATGACCTATTACTGGCTCGAAAATGTCAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATC:1 + chr2R 490692 5' + Stalker 164 6 71.29 CTGAAATGATAAGCAAAAAGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2L 7255840 5' + P-element 2 2 77.23 CCTCGATCATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chr3R 16400241 5' + blood 13 2 66.34 TATTATATCATTATTATTCATAGTCACTGTTGGGCTGTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr3L 3032236 5' - opus 463 2 65.35 GTATANTAAAAGAGTATCTAGTATCATTGAATCTAATATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAACCGTTCCCCATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTT:1 + chr3L 26417934 5' - Quasimodo 286 2 75.25 TTTGTGCTAATTGGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chrX 20806838 5' - opus 497 2 78.22 CCAAAGGCTCCCACTCACTTATTCTGCATTCTGTCTGTTGCGGCACCAAAGGGTATGTAAGGCAGCGGTTGTAAAAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACA:1 - chr2R 6603318 5' + Circe 7177 1 66.34 AGCAAAAAGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2L 7255829 5' - P-element 2874 1 66.34 TAAACCTTTTCGCATTTTTGCCGCTTAATTGGCCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 - chr3R 6117326 5' - Tirant 8495 2 68.32 ACTAGTACCCTTAACGCTGAAAAGCTCACACAAATTATTATTACACAGGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACA:1 + chr3L 5640099 5' - Cr1a 259 1 70.30 TGAAGTACTAAAAAACTTAGAAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGT:1 - chr3R 2914197 5' + F-element 4492 1 79.21 CGCCTCCATTCGGACTCGCCTCCCGTGGCATGTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGT:1 + chr3R 5494774 5' - F-element 354 1 69.31 CAACGGGATGTATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 9131733 5' - roo 402 1 72.28 ATTATAAAGAAAAATATTTCATATTCTGTGATTTATAAAAAAAAACAATGAAAACTTTCGCTACCGCCCAAACTAATGGGCGTGGCATACTAAAATTTTGC:1 - chr3R 30619993 5' + looper1 1778 1 50.50 AGATAATGTTTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chr2L 15080580 5' + hobo 24 1 59.41 CGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2L 12324039 5' - roo 9033 1 65.35 CGAAATTTATAGTTTCATATTTTAGTAATAATTTCCGTTGGGAACGTCTTCGTACAACTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCA:1 - chrX 3577025 5' - Bica 376 2 58.42 CTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACAT:2 - chrX 23182916 5' + Idefix 23 2 54.46 GTTGACCTTCCCGCTTCCAGCGCCTGACCTAGCAGTTTCGTCTGCTCTCTCTGAGGCTCTCCTCAACGTAAACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGT:1 - chr2L 22553409 5' + McClintock 113 2 82.18 CCTCGCTCAAATGCCGCTTGCAGCTGCAGGAAAAGAGTGGAGATTTTGGTATACGGGGTGTTCATTTCCTGGTTCCTGTTCTCTTTTGTGTATCGCGTCT:1 - chr3R 31213673 5' + Cr1a 4356 1 74.00 TTGTTTACATTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 - chr3R 15151310 5' + jockey 4706 1 51.49 AAGTGCGTGGTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr2L 12667261 5' - blood 365 2 62.38 GGGTTGGGGACTCGAGGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2R 15474866 5' - roo 9044 1 52.48 GGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 2074715 5' + roo 8705 2 69.31 TATATATTATTTATACAAAAGCTAATGAAAAAGTTGATTGGTGACCCCGACGTGATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTG:1 + chr2L 22645333 5' + invader4 2995 2 58.42 CGAAATAAAATATGACAAGGAATGCTATATGAAAAAGAAGAAGAATCTAACTTGATAATTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - 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HMS-Beagle 205 2 69.31 GTTTTGCAAATATTTTATCATCACTGGCTTTGGGCTGTTAATGAGTCAAGATATGATGCATTTGTGGGTGTGAGTGTCTGAATAAGTGTGCGTGTGTGTG:1 - chr3R 18518079 5' - accord 7032 2 69.00 ATTTATTTGTGTGTTTGTTGGGGTTGTGTGTGCGCTTTCATTTGAGTTGGATCTTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGG:1 - chr2L 9289491 5' - Doc 475 1 46.53 TTTTTAAAAATTACTAGCTGTTAAAGTGCACATTTTAGCTTATTTTTTTTTAACAGCACTGCATAGCCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAA:1 + chr2L 11922486 5' + BS 5083 1 62.38 TTCATCCGGAAAGAAATAACACGAGAGGAAAACTGCATCTTCCCACATTTGCTCGGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCAATTTTTAGATTTCTTAC:1 + chr2R 18061451 5' + 1360 3274 1 68.32 ACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGG:2 - chr3L 19377786 5' - roo 9030 1 65.35 TTTCACCAGCGAAACAAAAATCGCTAAATGGGAAAATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 - chrX 19426324 5' - mdg3 5490 2 70.30 CCAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 - chr3R 7388419 5' - HMS-Beagle 226 2 61.86 GAATGAATGAGCTAGTGACTGACTTGCGGCCACGCCCTATAATTCTGTCTGACGTCAATGATATAAGTGAAGTCAAAAGGTCATGTTGTTAGAAACATAAG:1 - chr3L 8002572 5' + G4 453 1 63.37 AAATTACGATTATTCATCACTCATTCACTGGATGGGCTGCGCGTGGGCAGACTGATGGCACAGGACTGATGGCCATGTAATAAACCAATATATGCAACCA:1 - chr2L 4861104 5' - blood 7386 2 65.00 AACATGTACTTTTTCGCACATTGTCACATATGCTTGTATGTATAGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAAGATGGAAACCG:1 - chr2R 19480593 5' + Cr1a 423 1 57.43 AGGAGNGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 27775090 5' + roo 37 2 65.35 TAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2L 1625710 5' + hobo 34 1 59.41 ATATCCCGTGAACCCTTCGCCGCCAGCGAGGTTGTCAAGGTGAGTTCATATCTGCACTGCGAGAAAATGCCACGTCTACTTATTTTGTATAACAAAATTAA:1 - chr3L 11183651 5' - Ivk 5376 1 67.33 ATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTT:2 - chr2R 19727746 5' - 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chr2L 14612129 5' - roo 406 1 76.24 AGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 - chr2L 19684007 5' + jockey 4718 1 70.71 ACTTANCTTAACTTAACTTAACTTAAATAATAAGAATCATTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2L 16434992 5' + Doc 44 1 64.00 CTATTGTTTTGGCTGGATCAATGCGACGGGTGCGTTCTGATAAGTTTTTAAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGTTTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCTGAA:1 - chr3L 8760190 5' - gypsy4 168 2 72.28 TCCTTACTCTCAAATATATATGTACATGTGGATATCCTGACAATTCACTGGCTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAA:1 + chrX 19543275 5' - accord 158 2 70.30 TGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 - chr2R 13644527 5' + Burdock 6138 2 76.77 CAGTCATTTGTTAGAATGTAACTGTGTAATACAAAAAGGGTTTGGTCAGAAATAGAGTATCGAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 - chr3R 31194557 5' + Transpac 4929 2 66.34 ATGCAGGTGTCGCAGACCAGACAGTTTTTGTAGATCTTGCTTCTTCGGAGACTGACAGGAAAAAATCAAAATCAGATATCGGCAAGCAAGGGGAAAACCCA:1 - chr3R 5442193 5' + X-element 477 1 63.37 GAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chrX 15305690 5' + roo 8713 2 75.25 ACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2L 17722756 5' + blood 7029 2 58.42 GGAATACCAAAAGTACTTCAAGTCTTTAATGGCTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 - chr2L 11703325 5' + Tabor 6848 2 71.29 AGATGTACTTTCTTCTTTGGGTGTTGTTGTACTTTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGC:1 + chr3R 4983095 5' - diver 5768 1 66.34 TTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCGACAGAAGCAAGAAGAAAGGGAAAACTACATAATGAAAAGGGAATGC:1 - chr2L 15488475 5' + micropia 5246 2 58.42 TGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr2R 16988244 5' - opus 449 2 75.00 ATTTTTGCATCGTGTACAAATGGACATGAAATTATAGGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTATCATC:1 + chr3R 18210418 5' - Juan 275 1 69.31 TTTCATCTCATTTGTTATTTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAA:1 + chr2L 6576416 5' + I-element 5168 1 81.19 CTAGAGGTAAACCTATTCTCCAAAAGTGCAGCTCGTCTAACTACTAATCACTATTTATGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTG:1 + chr3L 9142041 5' - invader4 2864 2 56.44 CCCCCACATTTTACAAAACATTTAAAAGCTCTTCAATAAATCCACAATACGTGAAACTACTCTGCAACGGAAAAGGAATCTTTAGCAATAGTATGGGCTGT:1 + chr2L 5000642 5' + Osvaldo 68 1 58.42 GAAGAGGACTTTCGGGCAGGTCGGAGGGCCTGACTTTATGACCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGG:1 + chr3L 10899900 5' - accord 7285 2 59.41 CCACTTGCTCTGTGGCATCATGGAACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:2 + chr2R 8345472 5' - roo 406 1 77.23 CAATTTGATAAATCTCATTGATGATGATGTTACATAAAATGTTAGTTAATAATATCTCTGGCATACTTTACACAAAGATTCTAAAGATTTTCTTGACACTC:1 + chrX 8985541 5' + S-element 1505 1 78.22 CAAAAAAGTGTTGCATGCAAATGCATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCAACAACCACAGCAGCTGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 12897053 5' - accord 7032 2 78.00 ACATATTCCACCATCTTTTTCGCTGTCTTTCGCCAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGT:1 + chrX 10316823 5' - accord 492 2 70.30 TTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATA:1 + chr3L 15099561 5' - G4 3806 1 62.38 AATTCTGGAAACAAATATATACTTTGAATTCATTAATTGAGTCGCTTGATTTTGTGTATGGCTGTTCTTATGTGGTTATGCATGTGTGTGTGTGTGTAAGT:1 - chr2R 9520405 5' - Quasimodo 35 2 54.46 CCAAAGGCTGTGCTGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 9774329 5' + 412 7098 2 68.32 AAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 7861673 5' - roo 9030 1 70.30 GCGAACTATACAAATGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2R 8158902 5' + pogo 4 1 78.26 GTGGATGTAGGTTCCTAGGAGTTCGCTTTCAATTAGTCCCAATCCATCTGCACGTGCACCAACAACAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTC:1 - chr3R 25360765 5' + Porto1 460 1 60.40 GCGATAAATCGGAGTTGCGCGTATTATGCGCCATATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGA:1 - chr2L 12448674 5' + transib2 2584 1 66.34 ACTCATTACCAATGCAAACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATT:1 + chr3R 32005855 5' - invader4 3076 2 70.30 CGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3R 24081596 5' + 297 6628 2 81.19 TGATGNTGCGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chr2R 14778519 5' - mdg1 401 2 57.43 CTCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACACAT:1 + chrX 6417709 5' + accord 181 6 75.25 CGCCGAGTCACCAAACCAGCTTTTCCGATTCATTCACCTGCTTATAGGATCTTCTCGTTTCAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 - chrX 17968453 5' - Tirant 8494 2 67.33 TGGAAGTTGAGAGTTAAGACTAGAAGAGCGCACATAAATCTCAAGTTTTTTGTGTCCTGCTGTCATAACTCTCCCACACGAACATACACACACACACATAC:1 + chr3L 9309863 5' + accord 183 2 58.42 GTCCAAATATTATATTTGGTTTAAAAGGAGTAAGAGGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATAATCTCCATTTATATTCTTGATCAGGATCAATTGC:1 - chr2R 1090951 5' + INE-1 86 1 61.22 TTAAAAAACACCTAATAGACATTCTTCTTTTATATATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 + chr3R 12589021 5' + Max-element 41 2 68.37 TGAAGGGGACAAAAAGAAGCCAAAGCCCACACCTATATACATTCGAGAGAAAAGCTCGAATGTTTTTGTAAACAAAATAATTGAACTTGTTGGAAAAGACA:1 + chr3L 25552485 5' + Fw3 35 1 86.14 ATGTATTTATACCGATAATCGAAGATATCTCTATTGAGTAGTTCCTGAGATCTTGATACAGACGGAAATGGCCAGATCGAATCGGCCATTGATCCTGATCA:1 - chr3L 46458 5' - INE-1 91 1 65.35 CAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 - chr2R 5531195 5' + 1360 62 1 61.86 GTGGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGA:1 + chr3L 25272521 5' + 1360 11 2 73.27 AATGGATATGGGTTGGGGACTCGAGGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 15474875 5' - roo 390 2 60.40 AAGGTTTAGCTCTTCTATGTATGTGCCTCTCAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATA:1 + chr2L 6599928 5' + I-element 5010 1 69.70 GGGCTTGGCTCGCTGCCCTTGTTGTTCTTGTTGCCATTGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTT:1 - chr3L 5847796 5' - I-element 142 1 63.37 GATGGCTTTGGTGGCGCCCCATTTGCACAAAAGAGCACTTCCTAAGTAAACTATTTGTGATTTAACAACAAAATGTACAAAGTTTCAATTCTGTAGATCAA:1 - chr3L 23749390 5' + transib2 2779 1 55.45 TTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:2 - chr3R 10147876 5' - roo 9019 2 78.22 GTAATCTATGGGCTCGCCATTTTGTTTTTCCTTCGCTGACGTTGATGTCTGTTTGGGTTTAGCCACCCACTCTGATGGCCATCTCGTCTGATCGGACTCGC:1 - chr2L 21962825 5' - Rt1b 4784 1 54.46 ACATGAACTTGGTTTAAAAAATTAAATATTATATTCACATACATATAAAATATTTACTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chr3R 10734328 5' - pogo 2084 1 62.38 TAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCA:1 - chr3L 23839727 5' + McClintock 11 2 67.33 AATTGACATGCATTTGCCGATATGTGTGGCCAGAAAACCATCGCTCCCCAAAAGTCTATGCACACGCAACCACCACACTATGGGAAATTTGACCACTTTTT:1 - chr3L 21769537 5' + Transib-N1_DM 5 1 73.27 CAGAAAACATCATTCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 - chr2L 12815123 5' + hopper 18 1 63.37 CCACTTTTCCATCTCACCACTTGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACT:1 + chrX 20806719 5' + opus 375 2 78.22 AATCCTTATTTGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr2L 20133085 5' - flea 247 2 73.27 CGGAAAAAAGGTAACATAACTTAATAGTTTATACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3L 2019743 5' - 412 479 2 58.42 ATTCTGATGTGATCAAGAATATATTTTTTTAATTTAATTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 - chr2L 13154275 5' - Juan 4171 1 73.27 TGGGANTCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2R 20744227 5' - roo 9042 1 58.42 GTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAAT:1 - chrY 3648876 5' - 17.6 453 2 75.76 CTATACTATACTATATACAAACTATACTATATACAAATCGTTACAAGTTGGCTTACAATTTCAGAACATCAATTTCATTTGGCTTTCAAAGCGAATGGTCG:1 - chr3R 14021672 5' + Cr1a 2 1 68.32 AAACTCTTGCAGTGACGCTCGAATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 11846310 5' + hobo 12 1 67.33 CGTCGACTGAGCGCCATCGCCATTTGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr3L 13477529 5' - P-element 2873 1 64.36 CAATANGCCAATGCCCAAGCAGGGCATTAGTGCTAGTGGAGAAGCTCTTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTTAGTACATAATTAGATCCTACTAACACTA:1 - chr3R 7450592 5' + Cr1a 4288 1 57.43 TCGTCGACTGAGCGCCATCGCCATTTGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr3L 13477530 5' + P-element 13 1 65.35 TATTATTATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTAGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTT:2 + chrX 21634154 5' + Cr1a 242 1 77.23 TATAAATTAATAGTTCTTAGTTTTCATTCTCGTTTCTTTAAGATCGGACATTATTGTGGATTTCTTCCGTTTTGACTTCCGTTTTGTTTCATGAATGTTGC:1 - chr3R 29599123 5' - Fw2 312 1 72.28 TGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACG:1 + chrX 3763168 5' - 297 353 2 81.19 GAGTGCCACATGAACACTTAACCTGCAACGACCGCCGAACGCAATGTCTGTGTCGACTGTCAGTCCCGGCGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAG:1 - chr3L 9171524 5' + Rt1a 4944 1 64.36 CTCAGATTTTGTAGGGCACTCTATATGCGGTGTACTTTGCTGACCGAAAAATAAAGAGAGATACAAATGTTGAGAGAGCGAGGAAGATTACAGGCGCTCCT:1 - chr2L 8739024 5' + jockey2 2981 1 75.25 GGATCTTAGTTTTACCTTTCTATTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCAAAGTGGTCTTATTTTAGATAAACATGGAAACCGAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAA:1 - chr3L 15095480 5' + Cr1a 447 1 78.22 AATGCTTAGCACCAAGAAGCTACAAAACCACACACAAATCGATCGAAAAAGTCAGAAAACATTTATACTAATTCTGGAATAGATTTTCCCAACTGGTGGTT:1 + chr3R 7270152 5' - S-element 452 1 62.38 GTGAAGTTCATGTACATCTTTGGAATGATTTTAGCATATATATACCCCTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 - chr2L 2308718 5' + HMS-Beagle 26 2 53.47 AACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chr3R 13375981 5' + 1360 45 1 72.28 ATCGTAAAATGCAAATGAAAATGAAAATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:2 + chr2L 12324005 5' - roo 404 1 74.26 CCCGCAACGGCGGGTCAGAGATCACGGGTAACATAGTTTTAAGAAGGTGTCCACGACATCACCTCACTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - chr3L 2041398 5' + jockey 4780 1 62.38 ATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTA:1 - chr2R 5924416 5' - jockey 4735 1 35.64 AGCCCAACTCATCTCATTCCACTTTCCTCCATTCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTT:1 - chr2L 6888018 5' - jockey 272 1 73.27 CTATACGATTTCTACTGTTCAATGAACAGAACAAAGTTACTGACTGAACCCAACATAACAATCCGGCTCGAAGGACCAAACAGTT:1 - chr3R 13671765 5' - GATE 269 1 67.06 CCAGTTCAGTTGAGCTCAAGTTCCAGCAGCAGCAGTTACAACAGAAATGTTCTCCTCAAATGTGCCAACGTGTAAATAAATAAATAAATCAAATAAAAAAA:1 - chr3L 5064598 5' + X-element 4717 1 77.23 CCCACTCAGAGACTCTCACGCGGGTGGGCTGGCCATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTACTG:1 - chrX 10874874 5' - gypsy4 6627 2 66.34 GCACTGAATGACTTTAAATGTATCTGTCCGGCCGGCAGACAAAACAAACGCATTATAACGAAATGTTGGCATAAAAAAAAACTAAAAAAAAA:1 + chr3L 11384783 5' + BS 5103 7 70.65 AGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGCACGCATAACATAGCACGTTTTCACATGTTTTTATGAACTCTATTAGATGCCTAAAACTAAATCTTAGGCTTCTAGC:1 - chr3R 29588499 5' + Transib5 2930 1 48.51 TTTGCATATAGAAGGAACTACTATCCTATTTCGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 - 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roo 8743 2 55.45 TATGCTTAAACTATATAACATTATTTAAGTTTTGCTACAGGGCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGTACTTAATGTTTATA:1 + chrX 14769311 5' - invader2 56 2 69.31 GCTGCCTTATTTTTATTATATTTATGTTGCTGCAACCATCCCCCCTCCACACACCTTGATATGGATTTTGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATT:1 - chr3R 20232503 5' - invader2 4637 1 54.46 TGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTG:1 - chr2L 2074794 5' - roo 9059 1 69.31 ATGAATGATTTTCGAATTGTCCCCACCTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATCG:1 - chr3L 10081763 5' + rover 7124 2 71.29 ACCCCACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 - chr3R 10277277 5' + Doc 45 1 65.96 ACACGCACAGTGGAATTCGAGATTAGAATTGGCCAGCTGAAAAATTAGCGACCTGACTTTTATAATTTTAAAGCTTATTAAATTTGTTTGTTAAAATC:1 + chr3R 21688489 5' - 1360 3002 1 58.16 CGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr2L 3632164 5' + P-element 53 1 29.70 TTCTCCCTGTGCCCGCATTTGAGGCGAGTGGGCGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr2R 16940313 5' - 297 377 2 62.38 ATTGAATTATTTTCGTTATACTCTTATGTGAAACTAATTAGGTAGAGCTGTCTGATATTTAAAGGCGCACGTTTTAGTTTTACGTGGAAAGTTTTGACCCT:1 - chrX 15292344 5' - Quasimodo 7098 2 79.21 CAGGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 18950751 5' - roo 9029 1 68.32 AACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr2L 16201516 5' + hobo 30 1 62.64 AAAATNGCATCCTGCGCCGAATCAAATGTCCTTAGGCGCATTTAAAAAAAAAATAATAAAAA:1 + chrX 6144966 5' + TART-C 11100 1 85.48 TTGCAAAGGACATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:2 + chr2L 13319573 5' - hobo 2909 1 55.45 TATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTT:1 + chr3R 21092432 5' - roo 9055 2 51.49 AATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chrX 21852440 5' + Tirant 29 2 54.64 AGTAAGGACTTTAAACAAAACACTACGGTCACCGTCCGTAGCAGACATTCCAGGGCTGGTCCACACGTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAAC:1 + chr2R 4754580 5' + Tc3 239 1 48.51 ATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 19446132 5' + 297 4 2 72.34 TTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:2 - chr3R 16458055 5' + roo 8708 2 73.27 ATGCCTTCATGTCACTGTCGCGACGCTTTTTGTTTTCTATTTCACTGGCTGTCTGGCGACCCTGAAAAAAATAAAATAAAATAAAAGAAAATAAATAAAAA:1 - chrX 20707293 5' + F-element 90 1 57.43 TGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTC:1 + chr2L 12474964 5' - mdg3 217 2 52.48 AATATAAATTTATAAAAAACTAACTTAATATATTTGCAAGATAAATTTTAAGTCGTGGATTCGCATTCGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAAC:1 - chr2R 987447 5' + I-element 381 1 72.00 AGCAGTAAGAAACAACATTTATGATACAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 + chr3R 4543993 5' + flea 4784 2 55.45 CGACTGCCTGACAATTAGCTAATAGGATGTTAAGTCCAACTTATCAAGGCGAGAGTAAAAAAAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACG:1 + chrX 9531610 5' - Doc3-element 21 2 51.49 TGTCAACGCGTGTGCGAAGGCCAATTGGTTTGCTTGTGTGGGTAAAAACCGTAGACGAGAACGTGTATATGTGTGCGTAGTTGTGCTAGAAGACTATTTTC:1 - chr2L 1141516 5' - 1360 3199 1 76.24 CTTTGATTGTCGTCTTGCAGTTGGATCTGTAACGTGGACTGGGGATGTGGAAGAGAGCCGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGT:1 + chr3L 14351303 5' - invader2 5098 2 64.36 CGTTAGTGAATTAAATCTGTTATATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr2R 9317051 5' - opus 7489 2 63.37 ATACAATAAGGTAGGAATATAAGTATATTATATATATCTTTTTTAAATATTACTTAATATTATTTGTTAGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAAC:1 + chr2L 8968367 5' + Burdock 354 1 69.31 CCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAA:1 + chr2R 13295678 5' + Tirant 53 2 76.24 GTTAGTTTGTTACACCATGTAAGTTGAGAATTTACAACAAAATCAGGTGAAATATGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAAT:1 + chr3L 13617072 5' - hobo 51 1 56.44 AGTCGTCTATTTGGTGCAATTTAAGATAGTAGAGAGAGTTAGAGAACTACTAGGTTATCAGCATCATTTATAAATAAAAAAAAGAAGAGAATGCTATAGTC:1 + chr3R 18346609 5' - INE-1 580 1 71.29 GTTGCCTACAAAGTATGCAATTAAAAGTCGGTCGGCTTCTCAAGGCTTTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr3L 22039770 5' + jockey 4697 1 54.46 ACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chr3L 11661717 5' - hopper 1382 1 58.42 TATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACCTCCACAGTTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3R 17843641 5' - roo 9038 1 57.43 ACGATTTGTTTTAAGTTATGCCTTCCGAAGAATGTTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGGGTCATATTTCGCGAATTAGTTGCAGTCGCGCTGACGTTACTGA:1 + chr3L 26367079 5' - gypsy4 56 2 72.28 CCTTCCGAAATGCAGTAATACTCAGAACCGTGTTCTCTTGATTTTATATCAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr2R 1072559 5' + pogo 25 1 57.43 ATCGTAAGCTTCAATGCAACCATTTAAATCAATTCAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr3R 26530950 5' + blood 7020 2 65.66 ATTAAAGGGATTTTCTTTGAGGGCACTAGAAGAGATGTGACACGCGAGAGCAGCGTGTGTCGCATCAACTGATTGATCCTTTGAATTTTTTGTTACTTTC:1 + chr3L 9603648 5' - invader2 5044 2 57.00 CAATCACATGAACATTCTGCCATTGTACCACCATTCTGATATATAGATATATTGTATATATATATATGATAACTACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCA:1 - chr2L 5812429 5' - 1731 312 1 60.40 TTAACAGAACATAATCAGGGTCAATTCCCTAGAAACTCGTTTATGTTAACAATCATAAAACGTATGTTTAATCATATAAAATGGTTATTTTAAAAAGAATT:1 - chr3R 13353423 5' - Tc1 1495 1 62.38 TCGATATAAATATTTATTTCTTCCTTGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 - chr2L 8308234 5' - P-element 2838 1 26.73 CAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 21092450 5' - roo 9037 1 60.40 GAGGGAACTCTATTGCTGAACTGGATGGGTTCAAGGTTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGA:1 - chr2L 16070374 5' - Doc 4377 1 62.11 GGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCACATATAAGAACTCCACCGGTAATACGCTTACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 23635041 5' - roo 398 1 68.32 AGTTGCAACATTGCAACTTCGTAGCTCTCTGGAGGATTGAAGAAATAAGAGCGAATGCTATAGTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTA:1 - chrX 7208982 5' - INE-1 539 1 61.00 AATAAATAAAGAAGAGCTAGTTGGGTAAAGAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chrX 19116836 5' - opus 7499 2 81.19 TTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 10147902 5' - roo 9045 1 55.45 GGGAGGGGGACAGGCTCCTGGGAATCCTGCTCTCGCTTATCCTGCTTGGAGTCCCTGTCAGTGTCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAG:1 + chr2R 23718890 5' + BS 4806 1 68.32 CGCACTGCAGCTGGCCCAACGAATACAGACGGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 + chr3R 27283987 5' + Max-element 20 2 53.47 GGAAAGTGAAAAATATTCAAATAATTTTCACTTTATTTATTGGAAAACAAAACATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGA:1 - chr2R 19861008 5' + accord2 144 2 56.00 GTTAGACTTATACACTGGACTTACATATTGTACCGACTTAACAATTATTGAAATCACAATCCATTCACCACACCAATACAACATACACTACTCCGGATGTA:1 + chr2R 7178318 5' + Idefix 78 2 75.25 AGACTACCCCCACTGACTGGAGTGCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr2R 5950736 5' - mdg1 370 2 76.24 GTCTCGGTGTCGGTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTTA:1 - chr2R 5627653 5' - HB 319 1 80.20 AATTTCGTTAATACTGTCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTTTAATTTTATTATTTAGTTATTATATTATTATTATCGTGTATTTTTTGTTTTTTTTTTAAT:1 + chr3L 25255890 5' + hopper 152 3 65.35 TTATGNGTATATTAACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 11837983 5' + roo 19 2 57.43 CAGCGAGAGGTTTGGATTTTATGATATATTTACATTCCAGCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGGCGCTTGAGCG:1 + chr2L 7305686 5' - invader1 3952 2 59.60 AATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - chr2L 13574265 5' + pogo 43 1 68.32 CATTCATTGCATTTGGTATTTGTAATTACATAGATGGTATTGTTGTTATTGGTTGTATTTGTTTTTGTTGTTGTCTTTCCCTTTAATAATAATAAATTTAG:1 + chrX 11960689 5' - I-element 251 1 73.27 GTGCAAGGCAACGCGTTTAACAATTGCACATGCACTTTGAAAAACAAAAAATATAAAAACACCATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr3L 8395216 5' + pogo 7 1 64.36 TTCTCTAGCGTCTCTAGCATTCGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACA:1 + chr3R 1994995 5' + accord 467 2 78.22 CATACTTATAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTC:2 + chr2R 5582160 5' + Cr1a 434 1 74.26 CAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACGACCGTTCGCTTTG:1 - chr3L 24796690 5' - Cr1a 9 1 56.18 ATCGATGCTAGCAGGCGAAATTGTAATTCATTCGGCCCTATCCACCCTTTAATGTACATTGTACACATATCTGCATAGAAGGTCCCTGCTCGGGCGCCAGT:1 - chr3R 9423132 5' - HMS-Beagle 264 3 57.43 AGGAGTTGAATGTGGGTCGTAAACAACAAATACTACACGCCCAGGAAAATAAAAGTGATCACATACAGTTGTCGGCTGTCACTGTATGCGTACAAGAGAGC:1 + chr3L 20886348 5' - 1360 141 1 78.22 ACTGAAAGTCGAGTTCCTGCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3R 5686093 5' - P-element 2843 1 23.76 TGCTGAGTAGCACCAAAGCGAGCACAAACAACCAATTCACTCGGCGAAGCGTGCAAATAAATGTTAATGAAAAATAAAGAGAAAAAAAAAAGAAAGGAAAC:1 + chr3L 5224221 5' + Doc2-element 227 1 58.42 TTTGAAATACACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 11257430 5' + 1360 1 2 78.22 CAGAGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chrX 6657326 5' + P-element 54 1 27.72 GCGTTATCCTAGAGAGAACCTATTATTAATTGTTTACATTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 - chr3R 15151339 5' + jockey 4677 1 77.23 TATGAAATATTCAAGTTGAAAACTTTTGGACCCACCAAACATTCACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTA:1 + chr3R 25672228 5' + I-element 244 1 70.30 CTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - 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P-element 2860 1 52.48 GCCTGCAGCTGTGCTGCTCGCAAGTGGAAAGTGCAAAGTGGAAAACAGATACGAAGAAATGAATATAGTTTAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGT:1 + chr3R 5163506 5' - Cr1a 4300 1 61.39 TGTTGCACAATAATGCGCCCTGGCTGCCACCGCATCAGCAGCAGCAGCAACAGGCGCCGCAGCAACATCCTACTCCACAGCATGGCTCTAGTGGCCCCTTT:1 + chrX 12597354 5' - gypsy12 9872 2 81.19 ACTTATTTTAAAAATAGACTGCAGGAATAAATTTGTATATAACTTTCCCGATATCGTTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGAA:1 - chr3R 7367593 5' + invader3 118 2 61.39 AATGCNGCAAACAATGCGATTCACGATGTACAATAAAAAAAAAAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr3R 23638097 5' - pogo 2071 1 64.36 GTCCCNGTCTGCCCTGTGCCTCATTCTTTGGCAATTAATCATTTTCCTCATCATAAACGTGATCGGTGTTAATTTCACAATTCTGGAAATCCAGTGAAGAA:1 + chr3L 14589013 5' - mdg3 487 1 61.39 CTTCAAGTACAGTGAAGCCTCCCCCAAATCGCTCCTCCTCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCT:1 + chrX 16814332 5' - roo 8962 2 62.38 TACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 14612096 5' - roo 9036 1 57.43 TCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGC:2 - chr2R 4483264 5' + Ivk 37 1 57.43 GAAGCTTATCAGGCAGGGTAATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 - chr2R 7775812 5' - Transpac 5210 2 54.46 TACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 + chr2L 11703253 5' - Tabor 433 2 74.26 AAACATTACAGAAACATGGACCAGGACTCACAAACACACACACGCACACAAAATGGTGGAGGAGAGAGTGGGTTTGAGCCAGAGAACTGCACGGGTGGCAC:1 + chr3L 13548763 5' + hobo 1 1 78.22 ATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3L 682471 5' - P-element 2848 1 40.59 GGGACATTCTGGGCCAGAGCAACAGCTTTCCAGCCACGAAAAGATTGCGCTGATGTGGATGGGGAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:2 + chrX 19363440 5' + FB 14 1 63.37 TGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGA:1 - chr3L 18706932 5' - jockey 4952 1 59.41 TTGTGTGTAAGAGATGTGCGTTTCTTGATGACAGATGATTTTTGGGTTGTATCGTTTTATTATGACAAAGTGTCACTATGTATTGACGCTAAGTTATACCC:1 + chrX 21085043 5' - Stalker 46 4 59.41 GAAAAAGCCAATAACCTGGATTATCTGCGCGAAAACGGATTACAACATATCCAGCCGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCT:1 - chr2R 5453996 5' + INE-1 572 1 56.44 AAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2L 7488928 5' - roo 9043 1 62.00 GTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTA:1 + chr3L 18337659 5' - Juan 4174 1 66.34 GCCCCAAAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr2L 22084452 5' - copia 252 1 72.16 GCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr2L 15808042 5' + I-element 29 1 48.51 CTCGTGGCATGAAACATACCAGACTGACTCCATCCATACGTATATGTAACATACATGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGAT:1 - chrX 19424771 5' - mdg3 69 2 55.45 CTTGATAAGCTTAATTAGCCCACTTAGTGCAAAGAACTACAAAAACACACCTAAGACGATACATTTTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr2L 6746941 5' + 297 55 2 63.37 GAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCA:3 + chr2L 17784624 5' + gypsy10 5673 2 52.48 TCTCTTTCAAGAATTAAATTAGCAAGAGTGCCTCGAATGCAAGTATTATTATTGGTTGCTACAGATTTTATTAATATCGAATAAAAAGTAAAAAAAAATAA:1 - chr2L 3690764 5' + Doc 4694 1 72.28 ATATCGATATGTTTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr3R 8313149 5' + 297 3 2 76.24 TACTTACAAACATAATATCAACAGTTTACACACATTTATTTGGTTATTTCAAAGGCACCCCTTCTATGGGCCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3R 11688407 5' + 1360 4 2 75.25 AATGTGCACCGAGTCATCAATCAGGTTGTTCCTCATTTTATCATTCGTTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATTATC:1 - chr3L 2712294 5' - mdg1 7081 3 53.47 TCTCGTTGCCGGTGTAAATAACAAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr3R 31101354 5' + 297 6592 2 62.38 ACGTGCAGAATGTAACTGCCGCGTCGCCGGTTGCACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACG:1 - chr2L 8102682 5' + G6 371 1 66.34 GTGTTTTTGAGGAGATTTTATTGCGGGTTTGTTGGTCAGGAAATGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAA:1 - chr2L 16595380 5' - I-element 5050 1 56.44 GGCTATTCCTGCTCCTCGAGAATCATTCGAGTTGAGTATTTCGAGTCCGCGATACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAAATCAAGATAAGTA:1 + chr2L 7439306 5' + Max-element 365 1 64.00 TGTGCCATCTTCGTGGGTCACTTGCTCTGGCCTCCCCCCCAAAAAAAAACAAAAAATAGAGAATGCTATGATCCAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTA:1 - chrX 8313197 5' - INE-1 552 1 75.25 GTTTTCGACCATATAAAGTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAG:1 + chr2L 22136609 5' + INE-1 136 1 78.22 GCGAGNTCCCACAAGTAGCTGGCGAAGTGTGTGCGAGCGAGCGAGTGAGTGAGTGACAGCAGTTGGTGACAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2R 11527983 5' + P-element 7 2 75.25 CACAAACACCCACCCACCCCCACCCATTCAATTCACATCCATCTCTAATCTTCGCGATGGTAACCTTTTCTTGCTGGTTAACTCCAG:1 - chr2R 7743783 5' + Ivk 460 1 63.22 AAATTCCGCTGAGCACTGAGCACTGAAAGTCGAGTTCCTGCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr3R 5686114 5' + P-element 33 1 45.45 GTGATGAAAGACGCATATCAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chr2L 3084982 5' - copia 255 1 54.46 AGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 - chrX 2799708 5' + Tirant 8128 2 59.41 AATCCGTGAAGCCGGGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr3R 14688490 5' + FB 30 1 54.46 GTAGCTATAGCTTAATGTGTATGCTTCTGATTACCTTAAAAATTGCAACCCAAATTGGACCAGACTCGACC:1 - chr3R 4950420 5' + I-element 4908 1 49.30 CGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAAC:1 - chr3L 23678149 5' + Osvaldo 24 1 76.24 ACTTTCTGTATCGGCTGCGTTTTTAAAGCGTTTTTGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGTGGTTTTGCTTTCGCTGACTTA:1 + chr3L 11092668 5' - F-element 494 1 69.70 CATAANATTGCATTGCATAAAAAGGAAAATCTCAGGCAAATTTGAGAATTGTATGGTAAAAAAAAAGGTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTTA:1 - chrX 13758723 5' - pogo 1963 1 55.45 CAAAANGCATTGTGCGAGATCCGCTCGATTTTTTCTCATGCTTGCCGCGTCGAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGA:1 + chr3R 7587432 5' - hobo 2599 1 59.41 CACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 - chr3R 13376039 5' - 1360 3361 1 56.44 TGCCATCACTCCGGCACCAACAAATTTTGTGGATTTGTTTAATTTAAGTACAATGTACGTGTTATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAAC:1 - chr3R 19347513 5' - blood 58 2 62.38 GGATTTCTTGTCAACCAATAGATTATCTTACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCAT:1 - chr3L 13061984 5' - 412 7178 2 70.30 ATACAAATTACACAAATTTTTTGTAAATTGAAGAGGTGCTTTGCTGGTTATCCCTTTAAATACACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACA:1 + chr3R 20701243 5' + Doc 4395 1 61.39 TTGCTTGTCTTTTTAATGGGGTTTGAGGTTCAGTTTTTTGTGCTGGGTATCGATTAAAATTATGTCTTGCCTCAAGATATGAACAAATCAAAGACACTAGA:1 - chr3R 4065920 5' + 1360 498 1 68.32 GCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:1 + chr2R 14708992 5' + Doc 60 1 80.20 TTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3R 12539515 5' - roo 354 2 79.21 CTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGATTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chr2R 1654435 5' - Juan 4180 1 67.82 TACCCTTCCTGGCACGTTGTCCCAGGCTAGCTCACACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGCACATAGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCA:1 - chr2L 21331088 5' + flea 4701 1 66.34 AAGCCCGCCTTCTTTCAAGTAGCTGTCCAAGCAAACCAATAGATAAGTTAAACCTCTTAAGCAATCGATTTTAACTTTTTATTGCATAATTAGATCTTACT:1 + chr2R 5268718 5' + Cr1a 4281 1 57.43 CCCACAAGTAGCTGGCGAAGTGTGTGCGAGCGAGCGAGGGAGTGAGTGACAGCAGTTGGTGACAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 11527990 5' - P-element 2874 1 68.00 CAATGCAAAGCCGCCCGACTTAAAGCAAAATTCTTAAGCGAAGTCGCTTACGCGAGTCTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGC:1 + chr3R 19378750 5' + Doc2-element 4624 1 63.37 GTCGTTGGCCATTGTGCATGGCAGTTTCTTCTCGAATCCAGGATATGGCTAATGACGTACCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCT:1 - chr3R 6935029 5' - Doc 426 1 68.32 AACGATGGCGGAGCTGCCGGCTATAGAGATGTCTTTGTAAACTATAAGACTTGAATTCTAAATAAATTTATATACCTTGTAATATATAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6800758 5' + BS 5094 2 83.17 GATTGAGAGGAATGATTGTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:1 + chr2R 24479879 5' + I-element 30 1 53.47 GCAAGGAGGCACTGCTTTTGGGGAGGTGCCGCCTGGCAAATTGCATTGCTTATATCCATTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATG:1 + chr2L 9311765 5' - invader2 265 1 58.42 ACATTGATATAGTCCTTGTCAGTGTGGTTTTTGTTTTTGTTGGGAATATTAAGTGGTGTACACTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chr3L 11257420 5' - 1360 3378 1 68.32 AAATTTTGACGGGGGTCATGTGGAAAACTGACTGGGAATTTTCTATTTATTTTTCCCTTCGGCGAAAAGCCTCTCCTCAATCTCACTCACATTTGAAATCA:1 - chr2R 20688812 5' + McClintock 6207 2 75.25 TTAGAGTGTCTCTTGCTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 13546611 5' + roo 7 2 73.27 CGCTGCCAGCTGCATTCGCCATTGCCTTTCACGATTTTCCTTTGATACGAATGCGTTGCATACTTCTCAGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr2L 15510487 5' - jockey 4986 1 71.29 ACAACAAAGGAGCGACGCCGCGCAGCAGACGACAAGAACTGCAGTAGTCCACTATCGAGTGGTCTGGCAATAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACG:1 - chr2R 4934017 5' - Ivk 32 1 76.24 AGCAGCAGTACTCATCTGAGTCTGAATGCCAAGCAACAACAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGT:1 - chrX 15885087 5' + F-element 4346 1 74.26 AGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGC:1 + chr3R 27284019 5' + Max-element 32 2 62.96 AAAAAGCCATTACGAAACCCAATCTCCACACTGAAATGAAATCCTAACAATAAAAAAAAAACCAACAAAATA:1 + chr2R 19309742 5' + gypsy11 3932 1 65.28 TTCATATTTTTTCACATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGAAAAAATAAATTTTTGCCACGAAGCGCAGAAAAAACACGACCGTTCGCTTTC:1 - chrX 6688963 5' - Cr1a 9 1 60.40 TTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATT:1 - chr2L 12815097 5' + hopper 44 1 64.36 TGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr3L 9909712 5' - Transpac 263 2 67.33 AAACGAACTTCCGGTTTACGCAAAATGGCGTGAAGTCTGCCACCACCATTGAATGCCTGAGTGTTGTTTGTATCTAGGTGTATATGTTGTAAGTGTATTAG:1 - chr3R 10522266 5' - Idefix 46 2 80.20 GGCGGCGGAACCAAAACGAAACGAAACGAAAGTCTCTGGCAGCAATTAATTTCAAATTTTTTTTCAAATTTTTTTTTTT:1 + chr2L 7355883 5' + FB 173 1 78.48 GGACTGTTGACCAAAGGCTGTGCTGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr2L 9774339 5' + 412 7088 2 58.42 CGAGCCATGGATTCAAAATTTCGATTCAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGA:1 - chr2R 5840719 5' + Ivk 3 1 76.24 TTTCATGGCTTAGTGTCTAGTTTTGGGTTCCAAGTTGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTT:1 - chr2L 9207103 5' - TAHRE 10391 1 64.36 TCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATGTAAATGTTTTTAAATATCGTTTTGGTGCCCCTAATGTATGCTCTTTCATAATACAATTTACAAAATTTTTTGAATTT:1 - chr2R 2146569 5' - transib3 33 1 75.25 GGTCAACTTGCCAAATTCAGTTTTATATTTTTATATAACGATATAAAAATTTTATTGTCGCTGCACATTATACAGAAGCGAGGAAATGAATATAATATAAA:1 + chr2L 22345584 5' - Cr1a 4327 1 70.30 CTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 4801509 5' + roo 34 2 59.41 TCAAGCAGATCAGTACCACCATTGCAGGGACGACCAGAGCGACGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 - chr3L 12888314 5' + mdg1 7045 2 72.00 CCGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTG:2 - chr3L 10013657 5' - hopper 1396 1 60.40 TACTCCCCTTAGCTAATCTTTCAGCTCAAAACAACAGTAAAATTATTCAGAACCTTTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 - chr3R 7168434 5' - flea 4959 2 62.38 ATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGCAAAAACTGCTATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACT:1 - chr2R 12457990 5' - roo 378 1 56.44 ACCAGNTCTTGCTATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTCCAAAACTAGACTAAC:1 - chr3R 7415208 5' - I-element 5326 1 52.48 ATGGCCACCCAATTCTCCGAATGGGATTGGCAATACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chrX 14904606 5' + Tirant 52 2 67.33 ATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2L 19481294 5' + roo 46 2 74.26 GTTACCTCGCCCCAAGACGATACACCCGGCACCATAACATCCTAAATCCGACAGACGAAGAAGTGGCA:1 - chr2L 23191532 5' - diver2 4747 2 73.53 TTCTTTTATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr3L 23456283 5' - 1360 3386 2 70.30 GAGCCCAGCTAACACGCTTGCGTTTAATGGCCGGAAATATGTTACGGGCAATCCAAAAATATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 - chr2L 2078516 5' - I-element 5340 1 63.37 CCTTCTAGCTTTTATAGTTCCAAAGATCTCAATGTTCATACAGACGAACATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 392289 5' - roo 9046 1 52.48 GATTAGCTGCTGCTGGCTGCGGGCTGCATAAACAAATAGCCTTCAAAACAAATGTCGCCAAGTTATAAAGCCTGAGGAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTGT:1 + chr3L 24051088 5' + Cr1a 498 1 62.38 TCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 19446145 5' + 297 24 2 55.45 TGGGAGAGCGACTGCTGACCGTGTGTGTGTTTTATGCTAATGCTACTGTTTGAATGTGTTGGCTTGCACACGTGTGTGCGCTCATGCATTGTAAATTCGAC:1 - chr3R 15292026 5' + 1360 194 1 60.40 TAGTAGTATAAAGTTAACCAGCTCTTGCTATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 - chr3R 7415224 5' - I-element 5342 1 63.37 GTTCGCGATGTGGCAGCTACTGATTTGGAATCGCTACCACGATTAAATCAAAATCACACGAATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chrX 11731684 5' + jockey 4788 1 65.35 AGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 - chr3R 12047472 5' + Stalker2 7290 2 64.36 GAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chr3L 8713089 5' - opus 463 2 72.28 TATAAATTATTATATTATAAGTTGTTAACTTATATACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAC:1 + chr3L 22724130 5' + 1360 3201 1 71.29 AACAAACTAGCCAAACAAACTAGAGAAAACAATTTAGGTATGAAAACATTGGATACCCTTTCCATTTCGATGAATACGTTTAAATAATTTGTTATATTTGT:2 - chr3R 21907255 5' - gtwin 34 2 73.27 CTCCTCCTGCACGCTTTGATGAAGGTGTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCG:1 + chr2R 24991202 5' - Doc 437 1 64.94 GCTGAACGTGCCGGAGCTGAGAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chrX 3817540 5' - roo 404 1 73.27 CTGGATCGATGGGCAGATGGATTGCAGGATGGATGATCGGATGGATTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCGCTGGCCTTTTGGCTCAGCGAGAATGTTCAAA:1 - chrX 12639432 5' - gtwin 7238 2 54.46 CTTGATATCTGAGGATTCTCAGATTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr3L 18337630 5' - Juan 4203 1 69.31 CACCAAAACAGTTCCGATGGGTGTGACAGGTTGTATGATCTCTTCCGTGACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:2 + chr2R 14675515 5' - roo 406 1 77.23 AATGATTGCAAAATGCTAAGCCAAATGGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTCAGTATATTCGTGGCGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAG:1 + chr2L 18288259 5' + Cr1a 4071 1 72.16 GTTCAGATATGGTAACTCGAACTGGAAAGCAAATAAATGGAAGGGGAAAGTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTT:1 - chrX 16749179 5' + FB 15 1 56.82 AATAAACAACGAACTGAGCACACTCCCCGGGTGGTATATATGCGTTTCTATTTATATATGTATATATTTATATATGTATATATGTATATATGTATATATGT:1 + chrX 3287114 5' + G3 4507 2 70.30 CCGCCNATCCAAAAATAAAACTCAAGATACGAAGCTTCATGCATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTAT:1 - chrX 15292551 5' - Quasimodo 7341 2 58.42 TACGTGAGTTTGCATGTGTGATTGAGTGGCAGTGCTCCCAGCAGAAAATAATGTAAATTCATAAGCTAAGAAAGGAAGGAAAAACATAAAGGGACATT:1 - chr2R 10255139 5' + HB 413 1 67.35 AAGTTCGTTTAATTTGTGCGAAGAGAATTAAAAAAGTTTAAAGTGTTATCATGGAAAACAGTAGCACAGGTATGTAGATTTGTAGTTCACTAACATTTTTG:1 - chr2R 7803295 5' + transib1 299 1 79.21 TACAGACTTTAATGAATAAGATCAAGAATTGTGCGTGCTTGCGACAAAAGGATATAGGAGCCAGTATACAAAAATGGAGGAAACAAATTAATATATTCGGA:1 + chr2R 5580522 5' - Gypsy12A_LTR 2052 1 82.18 TTATGGACTCTTCCTCAAACCCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chrX 8682629 5' + pogo 23 1 54.46 TCAGAAATTGTTTTGTTAGCCTGTTTACATGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 - chr3R 6735358 5' - copia 245 1 68.32 CCGTTAACCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCC:1 + chr2L 18279876 5' + gypsy5 12 2 67.33 TTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 4801504 5' + roo 29 2 54.46 CGCCTAGCCCACTGACACCTTGCTCGTCCACGTATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 + chr3R 25097828 5' - P-element 2866 1 57.43 CTTTATTCAACTCTTATATCTCTTTGTTCAACGTGGGTGTTTGCCAAATGTTTTCACTCCCGAATGCTGTATGTGGTGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCAC:1 + chr2L 18017969 5' - Rt1b 4908 1 80.20 TAATGGCAATTAGTTGCAAGTGACACGCGGCAAATCAATGAAATTTTTGGTGTAAGGTGAGAGAGCGGAGAGGTCTACATCGAACAGATCTTTTCTACGCA:1 + chr2R 18335933 5' + 1360 134 1 64.36 ACATAGACCGACCGACCCATACTTATAGACGCAGTCATAGTCACAGTACTTTCACACACCCCGAGCATGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAG:1 - chrX 18196853 5' - 1360 391 1 70.30 TAATCAAACACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 16674837 5' - roo 396 1 71.29 CCTCAGTGTTTTTATTTTCTCAATCCATTTTTGTTATTTCCGTTTGATTTTCTTTGGCTCGTGATATTGGATATATATATACTCTTAGTTAACTAAAACA:1 - chr2R 6090393 5' - invader2 229 2 57.00 TGATGTGGTTCTGTGGCTGTGGATCTGCTTTTATGCCACTCAACCGAACACATCCAGCAAAGTGTAGGACCAAATACATGTGATTTAGTAATGAAACTTAT:1 - chr2R 14448210 5' - Helitron 297 1 69.31 CAAATAACAAATTTAGGAAGGGCTTGCGGCTGCGAGAATCTACATTCACATTTGAACTACCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGCAA:1 + chr2R 4749002 5' + INE-1 555 1 63.54 CTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3R 24760551 5' - pogo 2065 1 66.34 ACCGANACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 - chr3R 12047464 5' + Stalker2 50 2 72.28 AGATTNAGGCGTGGACTGGTCGGCGGTCGCATGGGCGTGGCATAAATCTTTGGCTTGGCATAGAGGCTTTCCCTTCTAGCTTTTATAGATCCTGAGATCTC:1 - chr2L 19946140 5' - INE-1 148 1 67.33 GAAAAGTACGTTTTTAACTCTCTTGGAAATAAAAAATTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr3R 23591485 5' - pogo 2065 1 67.33 CTGTGAAATGAGAATGGGTTGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGA:1 - chr3L 3607210 5' + R1A1-element 5091 1 80.20 ATACTAATTCCATTAGAGGTGGCAACTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGA:1 + chr2L 12476256 5' + mdg3 106 2 75.25 AAAAGGCGGAAAAAAACAATGCTCGCGAAACGTAACATACGGAAAAGCTCATCCTAAAAAAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCAT:1 - chrX 3306562 5' + I-element 293 1 65.35 ATTCCATGTAGTGCGAGGAGGGTGTCCTGTAAGCTCTTCTGTAGCCGATGGTACGAAGGTAATGACGACTAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTG:1 + chr2R 18683399 5' - Bica 4643 1 65.35 TTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGAGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCAGAT:1 + chr3L 27605 5' - INE-1 560 1 51.09 TGCATACTTTTGGGCAAAAGGGGCGGAGGTCATATAGACTATGCAGCTAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 3968990 5' + jockey 35 1 50.50 TAGTGTTAAAAAAAAAAAGAAAATAAA:1 + chr2L 14774427 5' + Doc 4702 8 85.19 CACACNTACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAACTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGA:1 - chr3L 11661766 5' + hopper 51 1 69.31 GAAACGTGGGCGTGATGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chrX 2179538 5' + Doc 40 1 64.36 GGAACTCTAAACCATCGACTGGTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 + chr3R 1705082 5' + mdg3 5257 1 78.22 CGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2R 15474842 5' - roo 356 2 75.25 ATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 + chr2R 13650115 5' - mdg1 7419 2 64.36 CATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2R 14708981 5' + Doc 49 1 69.31 ATATTCCAAATCTGTATAACTTAATACAAATTAGAACGATGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACT:1 + chr3R 18902368 5' + HMS-Beagle 6872 2 61.39 AAGGTCCCCGACGACGAGTTATTTTCGGCATTTCGCTCCGATTACATGTTTTCTGTCATAGATTAGCCGCGGACCGCCTTAATTATAATGGTTGGGCAAAC:1 - chr3R 21566697 5' - FB 354 1 79.21 AAAAANTAGCGCACATTTCCGTTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTC:1 - chrX 8843002 5' + Doc 388 1 77.78 GTAAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3L 17168896 5' - mdg1 7415 2 70.30 CTTTGGAGACTGTTTTATTATTTATTTTTGTCTTCCTTTTAATAATTATAAATTTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAA:1 + chr2R 3170097 5' - I-element 207 1 75.25 CACACACACACACATTCACTTCTTGATTTTCACCACACTTTGCGCATTTTCCTGCGCCGCAACCAAAAGCAAATTACACACACACTCCGTTA:1 - chr3R 19503358 5' + Doc4-element 210 1 61.96 CACCGATGTCAACAAAATAATTGAATTTAATAAATGGCCTCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr2L 6388239 5' - copia 245 1 69.31 AAGGAGATGTGGGGGAGTCCTGGCACGGGGGGATTTACGTGGTGAAGTGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAGATAAAAGTCAA:1 + chr3R 30411285 5' - transib4 2300 1 50.50 CACCTACTTCAAGGCCACCATAAAAGCATATGCCATCGGTTTACACCCGACTTGTCAAAGCAGCAAAACAAAAAAAAAAACAATTAAA:1 - chr2L 15992701 5' + transib2 2642 2 78.41 ACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 - chr3R 24760602 5' + pogo 49 1 85.15 CTACTGGAAACCAATGGATATGGGTTGGGGACTCGAGGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTT:1 - chr2R 15474887 5' - roo 404 1 71.72 TATAAAGCATTCTTCAGGGGCTTAAGGCAAAGTATCGGAGAACTATGATCGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAA:1 - chr2L 20299228 5' + jockey 4659 1 51.49 AAAAGTGTGCTACACATAAAGAAAATAGGGGGGGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr2L 1625726 5' + hobo 18 1 59.41 CATGCGTTCGGACTCTACAACAGTTTTCCTATTTCCCCGGACTCAAGCCTCGCATATGACCTGGCAAAATTGGCCCCGAGATTTGACGGGCCGTACATGAT:1 + chr3L 26294699 5' + Osvaldo 1376 1 68.32 CATTTGTGTGAAAATTTTAAAATTAGAAATCACTAGATGGAAAGCTTACGTACCTACGCCATCAAAGTGTGGGGAACTGCCTCTAAGACTCAGCTTAATAG:1 + chr2L 38777 5' + G5A 2459 1 62.38 TTTATTTTCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2R 10543513 5' - P-element 2858 1 48.51 AAAACCGCAACCGGTTTTCCAAAAAAGTTATTACCAACTTATTCCAGTAGACTAGTTTTAATCAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGG:1 + chrX 13372374 5' + Cr1a 4014 1 72.28 TTTTANTATTTTTCTGCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTG:1 - chr2L 1834845 5' - gypsy7 5006 1 71.05 TTAGTAACAATAAGCACACACCCTTGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGAT:1 - chr4 710524 5' - roo 57 2 74.47 TTAAANTGGATAAAACATATAATATAATATAGTTAATATTCACTTTGTTAAGTTAAACAAGTGAATGAAAAATAAATTTTACATTTTCAT:1 - chr3L 18452701 5' - 1731 4258 1 50.00 AAGATTGCGGACCTGCGGAAACTGCAGAACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAAT:1 + chr3R 14919022 5' - roo 8762 2 72.28 CAATAATATTGGAAATTTGATGCCGCACTGGAAAATGTTGGGAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAG:1 + chr2L 17646141 5' + flea 4758 1 78.22 ATTAAACACTAAATCCGGCCAAGTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACAATAATA:1 + chr2R 14217699 5' - Tc1 1645 1 55.56 ATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chrX 4140462 5' + 1360 36 1 80.20 AAGGAGTGGACACCAAAATTCAACCATAAATTGATGCACTAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACC:1 + chrX 20608606 5' + F-element 305 1 59.41 CTGAGAATCCAGTTGGGGATACACCATATGCCACTTGGTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCG:1 + chr2L 10061163 5' + flea 435 1 62.38 AAAAACGAATCATATTTATTATAATTAGTTTGAATACTTATTGAAATAAGTTCTCTTATTTATATCAATGCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGA:1 + chr3L 1177801 5' - diver2 4685 2 74.26 TTCCATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 13508779 5' - roo 9062 1 73.27 CAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 10147881 5' - roo 9024 2 73.27 AGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 17587829 5' - roo 357 2 76.24 AAAGATTATTTTTTTATATACCATTTATCAGATATTTTTGTGCAAGTGGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCCTACTCCACTGCTGCCT:1 + chrX 16714491 5' - flea 4874 1 53.00 ATCTTTGCCAGAGCGGTGTTATATTTGTGTTCTATTTGCCGCTGCCTGCTGCATAAGCAAACAGGGTGAGTCAAATCGTTCGTTGCATATCTATAAAGGCA:1 - chrX 13932525 5' - Helena 387 1 73.27 GGGGTGCGGTTCAATAAATTTAAATTAGGCTGCGATCTAAGAGATTGCGTAGAGATACAAAATCTTTAAGAGAAAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 + chr3L 5537565 5' + jockey 4672 1 76.24 TTTGGCATGACTGCTTCTGTCCTACGACACACGATACTTTATATACATATAAATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACT:1 + chr2R 17937129 5' + Quasimodo 16 2 58.42 CAATAAATATGCCTAATTGAAAAACAAACAGAAGCTGCCACTAATTCGATTACTGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTC:1 + chr3R 22661064 5' - P-element 2810 1 54.46 CCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGCAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr2L 20622780 5' + Doc 23 1 39.60 TTTAAAGCTCAATAAAAAAAAAGGAAAAACAA:1 + chr2R 22522894 5' + Doc2-element 231 1 65.62 AAAGAAAATGAATGAAATATTTAGAATGATGTCCATTTTAAATTGCTATAAATACTTAACAAAGAGTTACACAAGAATTGTAGTATATACGAACATAATAA:1 - chr2R 13650206 5' + mdg1 7040 2 77.23 TTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chrX 15392015 5' + 1360 53 1 58.42 CAGCAGAGCCGCGAGCAGCGGCTAATTAAAAGCAAAGAAAAGTTAAGTGAACATTTAAGCGAGCGGACAGAGGTCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGG:1 + chrX 2502185 5' + 1360 3330 1 58.42 GTCTATATGCACTTGATTATTAGTTTAATTTAAAAATTAGCTACACGTCGTTGGGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTT:1 - chr2R 22216587 5' - invader2 4822 1 62.38 TGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTC:1 - chrY 3648882 5' - 17.6 458 2 70.00 CCAAACTTAAACTTAGTTTCTATGATAGCAACATAATACTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGC:1 + chr2R 17295770 5' - copia 5046 2 64.36 CATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:1 + chr3R 31194475 5' - Transpac 5200 2 65.17 CCTTAAGCACACTATAAAACGGTTGGGGGAGGGTTTTAGAAAACTAGAATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr3R 10734232 5' + pogo 23 1 56.44 GCAAGTGAATCCTTACAGCCAAACGACGAGGAGCATTCCATATTTTTTGTTCACTGTTTTTTTCTTTGATCGCGGAGGTATAGAAATCTTCGAAAGATACT:1 + chr3L 15792750 5' - R2-element 3552 1 67.33 TTAAATCGTTCGCTTGAATATTGTAAGTTGATCCGGGAGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAA:1 - chr4 913836 5' - invader4 204 2 62.38 TTCAAAGATCACTTTTCATCCTATCCGGTTTCCGAGCTCATCAAATCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr3R 26952650 5' + jockey 4789 1 56.44 CCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCAACCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chrX 17968378 5' + Tirant 8127 2 63.89 ATTTTNTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTGTTGC:1 - chrX 22945334 5' + BS 48 1 67.33 TTTATGGTTCCAGTGAACTGTTTTGATTGCCCATCGAGTTTTCTTCCACTTCTTTTATTTTTTTTT:1 + chrX 12226785 5' - gypsy2 403 1 60.61 GGGGCGACAATTGAAAGTTCAGGACCACCAAGTGGGCGTGGCAACATGGGTGCGCTGCGTCGTTTTCTCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAG:1 + chrX 21506960 5' - INE-1 170 1 66.34 AAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 11688501 5' - 1360 3357 1 61.00 GTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2L 14790580 5' + roo 8696 2 59.41 TCATTCATATTTTAGGACACTTCCCATTTCTTGATCTGCTTTCTTTCGTACATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATAC:1 - chr2L 12475046 5' + mdg3 5278 2 55.45 ATTGAAAAGCTGCATACGAGAAGCAAATGGCACTGGACTTTTCTTAATTGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTTTATTCAGCGTGGTTAGTTTTTACACTG:1 + chr2L 19853125 5' - GATE 8370 2 68.32 CTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGG:1 - chr2L 21403528 5' + G5 4426 1 71.00 TTGGGATTTTTGGTGGTATTTCGTCAGCTCACTATTTGTGCAAAATTGACAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGTAGAGGAGAA:1 + chr3R 7150755 5' + TAHRE 295 1 58.42 CGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGGTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chrX 17968362 5' + Tirant 29 2 56.70 CATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 - chr3R 19989309 5' + hobo 45 1 66.00 CCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 - chr3R 6273588 5' + blood 7038 2 53.47 GTTCGTCCATCGTCAACCAATAAGAAATTAACGCCATTGCTGATACTTTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chrX 13640601 5' - P-element 2883 2 75.25 TCCAGTTTCCTATCACCCAGCCAGCAAAGGACCACCCTATATAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - chr3L 5201556 5' - 297 6948 2 61.39 TTCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 - chr3R 10751698 5' - hopper 1374 2 60.40 TCTGTGGCTATCAGTCGATGAGAGTGATCAACTCTAAAACAAATTTACATTGTCGCTTGCAATTTGCAACATGAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2L 14612001 5' + roo 8666 2 79.21 CGGATCCCAGATTCCGGCCATGGGCATGAACATCAGCAATATCGCCACACACTTGAAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGATAGA:1 + chrX 9730602 5' + F-element 422 1 63.54 TATGGCAGATCTAGTGAAGGTAAATTATAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTC:1 - chr2L 5325149 5' - Cr1a 4205 1 72.28 CTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 17587851 5' - roo 9043 1 56.44 AAATCGCTTTGATTGATGCGCAAACAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGTAACTTTCAGATCTCCTTCGATTACCTGGTTCGTCACGTACCAGGGGAGCCC:1 - chr3R 31086624 5' - G5 4477 1 75.25 TCAAACTCTTGCAGTGACGCTCGAATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 11846312 5' + hobo 10 1 69.31 AAAGTTGATTTTTAGATCCGTTTATTCATAATGTGGAATCGCTTGTATTTTCACAATTTTCAGCCGAGAACTTCAGCTGCGTTAGCGGTTTTGACCCTTTG:1 - chrX 21035137 5' - Quasimodo 217 2 62.38 CACTATATTCCAGATTTCTACAATAATATCAAAAATATCTAAAGTACTTTTTGCTATCCAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTA:1 + chrX 16685936 5' + I-element 136 1 58.00 AAAACGAGAACATTTCGTTGTAGTTCATTATTTGGCAAAAATAATATAGATATAAAGTCCAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTAACA:1 - chr2L 17725421 5' - 1360 204 1 65.35 AGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3R 15072573 5' + pogo 29 1 59.00 AATGGAGGAGTTCGGAAGTTTTTGGGGGTGATAGTGGGCAAGACGAATAGTTGCAACGGTATATGTATGCATAATCTCTACCTTCTTGCTTTTATAGTTCC:1 - chrX 18575760 5' - INE-1 157 1 58.42 ACAAGAAATAAAGAATGGAGACAGAAGCGACAACCCAAAAGGAAGGAAATGCTGCAGACAATAGTGAAAATAATAATAATAATAGCAG:1 + chrX 9845546 5' + invader3 5057 1 54.55 AAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAA:1 - chr2L 3388117 5' + F-element 333 1 70.30 ACTCGTTTATCTACCCACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 + chrX 3763131 5' - 297 6971 2 70.30 GGTGGAGAATTAAAAAAAAGATCGACAAGTGCATAATATATGCATATTACATATGTAATAAATTTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATA:1 - chr3R 19132350 5' - Ivk 5361 1 62.38 GCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATATGAATGAATATTGTGCGGCTTGTGCTTAATCTGCATGCTTAATCTCACCCTTCTAGCTTTTATA:1 - chrX 23005472 5' - INE-1 162 1 60.00 GGAAGTAAAAGGATTTGAATTGCCTTTTGCTAACTGTAAAATCCCAAATTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 4801562 5' - roo 9027 1 66.34 GCGTCAGCATGAGGGCCGCCAGGCTGAGCAAGGCGCACAGTACCGTTAGAGCGGCCAGGGCGTAGCAGAAGTGTTGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGG:1 + chr3R 19655459 5' - HMS-Beagle 67 2 69.00 TGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAA:2 - chr3R 11119874 5' + 297 6607 2 58.42 CTCAAAGAAAATTCCCACCATAAATTACTCAACGGGAAGTGTTCAAGTGAATCATAAACTGTGCAAACTTGGATTTAGTTCATTTTCTCGTTCATTGTTAA:1 - chr3L 16137580 5' + S2 1552 2 63.37 AGCAATGGAAAACATTAGGCGTGGTCAGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTA:1 - chr2R 23610629 5' - jockey 4698 1 76.24 TCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTT:1 - chr2L 17784676 5' - gypsy10 5934 2 73.00 TTATGACAGTTGGGGGTCTTAGCCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGAGAGGCACTTTTT:1 - chr2L 13319645 5' + hobo 6 1 59.74 GGGGTATTTGCATCCACTTTGGCAGCATAACTTTTGGATTCACTAGAACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chr3L 8614481 5' - opus 476 2 60.40 ACTGTCCACAATCAAAGCTGTTATTCTGATTCCCATCTGACTCACATCGTTCTTTAATTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAAC:1 - chr4 1180306 5' - F-element 4415 1 62.38 ATCACGGATAGTTGGCATAGCGCATAGATATAGATACATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCA:1 + chr3R 17893210 5' - hobo 339 1 64.36 CATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 26321683 5' + blood 34 2 60.40 CGGTGCCATTCATGCATTAAATATGCAGCAATCTAATTGCTAAACCTCACCCACCCACAACCAACTAGCCAAAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACA:1 - chr3R 26855107 5' + Ivk 265 1 75.25 CTCATGGATAATTATGGGTTTACTCAGCCATTCCCCGGGCTTCAAACTCCAGATCCCAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTT:1 - chr3L 8715481 5' - opus 330 2 64.36 AATAGATTAAGCTAAAGTCAACTCTAAATATGTGCTTTCAAAATTGCTCTATAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCA:1 - chr2R 8132911 5' + F-element 4271 1 57.43 TGCTATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATA:2 + chrX 21668917 5' - mdg1 420 2 77.23 GTGACCATGGCCAGCTTCTCCAACGTTTGGAAGCAGTATCTGGAGAATCCTGCCCTTAGTTATTATCACTAGCCTTGTGGCGATAGCGATTTGATTGTAAA:1 + chrX 15088177 5' - gypsy 7295 2 56.44 TATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr2L 2074764 5' - roo 9029 1 67.33 AAATATATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTT:1 + chr3R 21092427 5' - roo 9060 1 56.44 AGCAGAAGCAGCAGCAGCCGAAGACATGGCACTGGCAGCTTCTTTATATACCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGNACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 18199327 5' - hobo 2922 1 60.22 GTGCTAATTGGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:2 + chrX 20806841 5' - opus 7497 2 75.25 AATTTNCATCTTTATTACAAAACAAACAAAAGCGAACAATTATAACTTAATTTGTGCGCTCATTAGGCACACATGTGCCACACACACACACACACACATT:1 - chr3L 1918159 5' + accord 184 2 82.00 GTTTATTGGTTTCATTATGACTCAATTACATATTTTCCCAAGCCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 19462173 5' + roo 33 2 60.40 GTCAGNAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr2L 16201571 5' - hobo 2904 1 56.44 TCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2L 19018953 5' + hobo 29 1 60.22 GTGCAACATTTGCGACTCCATTAACGGGTACACTCACTAACGCCCTTCGGTTGCATCTCCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCAC:1 + chr2R 15456368 5' + gypsy5 50 2 60.40 GCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGT:1 + chrX 15089061 5' + gypsy 7014 2 54.46 TACGTTTTACGTATATGTTTAAAATTACTAGTATTCAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2R 9316934 5' + opus 5 2 66.34 ACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGC:2 - chr3R 29331930 5' + G6 19 1 60.40 TAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 - chr2L 15947432 5' - Transpac 5175 2 76.24 ATATTATATTATTTAAAAATTAAAAATTTAGGATTAGGATGGACCTAAGGATCTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTTATATTATAATTATTATTAATAT:1 - chr2R 959932 5' - mdg1 7088 2 75.25 ATAATGGGTTTATGATCTATCTTTGCCAGTATTTAAAATAATCTATATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGT:1 + chr3R 31633474 5' - I-element 181 1 55.45 TGAATGGGTTAATAGATTCCCATAAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTAAAGCTAGTTGTTCATTGTATTTCTTCTCTTTCTTCTCTGCTATTG:1 - chr2R 18948342 5' - Doc3-element 4481 1 76.24 AACGATAACGAATTTGTATTTACTTAAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 + chr3R 26530878 5' - blood 7340 1 72.00 AGAGCTCCCGAGAGAGGGGAGCTTAGGTAAGTGCAAAGCTAATTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTTACAAATAAACGAAAAA:1 - chr2R 1247674 5' + gypsy4 333 2 72.45 ATAATTAGTTGCTGCTAAACGATCGAAGATCTTGGGGATGACTGTTAAAAAATATAAAAAAAAAAGAAAAAAAT:1 + chrX 3353980 5' + HMS-Beagle2 482 3 75.68 TACCGATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr3R 20556124 5' + Tirant 8138 2 56.44 AAAGTGGAATATAGATCATACTAGATCATTTCTTTCTTTGTTATAAATTGAAAATAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr2R 17261663 5' - pogo 2082 1 51.49 AGTGCTTGTCACGAATGTATCTTCTTAAATCCTCAAAGTCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 + chr2R 13106761 5' - copia 219 2 63.37 GATAAAATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr2L 9163714 5' + copia 27 2 57.43 GAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 13136781 5' - roo 356 2 79.21 AACAAATAGCAAGAAGCAGAACAGAACAATTCTTTCCTCTTATTTGGAAGAACAGTGCATACAAAAAGAATACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACGAAA:1 - chr3R 10101761 5' - Cr1a 227 1 56.44 TTGGTGGAACGAGCACACAACACACAACGAGATCTACAAAATCAGTTCGTTACAATTTGTTCAATCAATCAAGTCTATTGTAGTCAGAACATAATACTCTG:1 + chr2L 22357737 5' - Cr1a 4189 1 70.30 ATAAGNTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 17587856 5' - roo 385 2 54.46 CGTGGNCGGGAGTTATAGACGAGGCCTATGGCAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTA:1 + chrX 2799610 5' - Tirant 8490 2 62.38 CCAAATCTGCCAAGTGGGAATGGCAGATGAATAATGGAGATTGGAATGCCTATGAAGCCTCTTTATGTACCGATCGCTGCACTTCTTTATCTCTTCTCCGA:1 + chr2R 4932846 5' - G7 934 1 58.42 GCGGAATCCGGGGTATGGAACTGCAATTCCATCTGTTTGTCAATTAAAACGACGCAGAATATTGCACAGGAATATTTCTGGATGTCTCCCAGGCATTTGAC:1 - chr2R 10861177 5' + Fw3 2706 1 61.39 TAATAGCCATCCTGTCGGTAAATGGTACGCTTAAATTTTAGGTAAATAAATATCAGAATTGCTTGTAACAGTCTTTATGTGTAAGCTTATTCGTGGTGATG:1 + chr3L 13496493 5' + Cr1a 4049 1 65.35 GCGCTGCGGCTACAAGTTCATGTGGGAGGAGAACTTGGCCCAGCACCTTTCCACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCG:1 - chr3R 25332225 5' - Doc 437 1 55.45 AAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATT:1 - chr3R 16245104 5' + 1360 35 1 66.34 CTCCTAGAGACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 + chr2R 13585456 5' + Juan 4055 1 50.50 CATCCTGCATAAACAGAGGAAACGCACAGCGGAAATAGTATGAGTATGTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGTCAGC:1 - chr2R 11397221 5' - ZAM 149 2 64.36 GATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2L 12324121 5' + roo 8676 2 69.31 CATTAATCCGATATTCATAGAAACACAAATATCCTGTTCTGTTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAA:1 - chr3R 26979871 5' - roo 8645 1 58.42 GTCACTCATACGCCACGTACGCCAGCCATCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGTGAGTGTCTGCCTGCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3L 4633793 5' + hopper 3 2 75.51 ACAGCAGCGGTAATAAACAACATTTATGATACAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr3R 4543988 5' + flea 4779 2 55.45 AACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr2L 7255809 5' - P-element 2854 1 46.53 GGCAGTTCCTCAGCATCGCTGACCTCATTGACTTTGGCCAGTTTAGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCT:1 - chrX 23452483 5' - R1A1-element 442 1 61.39 GCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 12103777 5' - roo 387 2 57.43 ACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 21092461 5' - roo 9026 1 71.29 TGACCACATTCTCAAGAGAAGTTCATAATTTGAGAAAACAAAACAATAGAGAACACAATTGCTGTAGTCGAAAACCCGACTATCACATACCCGTTACTCAG:1 + chr3L 25844326 5' - INE-1 547 1 75.25 AAGGCTGGATACGTTGGGCTAGCTGGAACTTTCTTAAGATGATCGCACGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAA:1 + chr2R 4848882 5' - HMS-Beagle2 50 2 64.36 AAAGAAATATGATTTCTGATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:2 - chr3L 8614573 5' + opus 7023 2 60.40 AAGTTTAACACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 + chr3R 25671923 5' - I-element 5324 1 57.43 TGTTAGCCTAACCCCGTCGACTTGGCGTCTCGAACCACCTTCTGGTCTCAGCTTTGGCGTTAGCCATCTCGACGGGGCATCTTGACCCTTCACATATCCTT:1 - chr3R 2451805 5' - gypsy8 4488 1 63.37 AAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTGACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGTATATTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGG:2 - chrX 3663195 5' + 297 192 2 70.30 ACCTTCTAGCTATTATAGTTCCAAAGATCTCAATGTTCATACAGACGAACATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:2 + chrX 392288 5' - roo 9047 1 55.45 GGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr2L 19018996 5' - hobo 2889 1 78.22 CAACCAAAGAACACATTTGCCATTTGTTGCGATTAGATTAGAGTCGAAAAAAGTAACAATCTGCTCTGCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGTCATC:1 - chr3L 6479965 5' - Porto1 4503 1 57.43 CGGGTTGGCAAAGCGACTCCGTCTGAAGGACAACATTGCAACAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAA:1 + chr2L 1393481 5' - Quasimodo 7095 2 60.00 AACAGTTTCGGCCAGAACCACAATCGAAAACAAACCCCCAACCAGGCCAAATGCCAAATGCCAAATACCAAATACCTCAACGATGCCAAGAAAAACTTTTA:1 - chr2R 9741656 5' + Fw2 381 1 72.28 TTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr2L 4160144 5' + Tirant 52 2 76.00 TTGTATAACTACGGTTTTACGAAATGTTTTGTGTTTGTATATTTTTTTATCTGGCCAATTTTTATCAATATGGCATTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCA:1 + chr2R 5027927 5' - INE-1 140 1 74.26 GCTTTAGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr2R 7887250 5' + jockey 57 1 68.32 GCCAGAATGATAATAGCCCATAATATTCGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr2R 24479927 5' - I-element 5310 1 68.32 GTGTTTAGGCTAACCAAAATACCAAACATAATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 - chr2L 20706711 5' + mdg1 49 2 73.27 GGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chrX 20806850 5' - opus 485 2 66.34 AGAAATTTAATTTTTTTTTTAAAAAA:1 + chr3R 17549709 5' - NOF 3953 1 84.62 TGCAGGGACCATTCCAATCGAACAATAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCC:1 - chr2R 23454465 5' + F-element 4496 1 74.26 CAATCATTAAAAGTCACTGGCAAATTTAGGCGACTCATTTCGCACTAATTTTCGTGGAAGAGAACATGAAAAGTAATAAAAAGTAAACAAAAAAAA:1 + chr2R 6609946 5' + Doc 4694 1 61.46 GATAGGAATTTAGCTATTGAACTCGCGCTGTCAAATGTCTTCTTTCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 - chr2L 12441569 5' + transib2 30 1 56.44 CGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTG:2 + chr3R 12047400 5' - Stalker2 7632 2 59.41 GACAGATATCCTGGTGTGCCGGCAAATCCAAACCAAGCCTGATGATCGCCTTGAACTTCAATGGCTAGACCAAAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGCTT:1 + chr4 1047879 5' - Tc1 1203 1 74.26 TGAGGCCCCAAATTCACTTTGCCTTTTTCCTTGCCTTTTTCTGTGCGTGGGTGTGTGTGTGTGTTGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chrX 5256468 5' + hobo 6 1 68.82 TTATTCAGAGCTCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTG:1 - chrX 21564762 5' + diver 5897 2 71.29 ACCACGTAGAGACCAACGACAGGACAAACAACGGAGGATACAATACAGAACATCAGGAAACGCCGGAGGAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGGTAGGTG:1 + chr3L 23453408 5' - baggins 5029 1 62.38 GATAACGAATGACAAACAAAAATGCCAACACGACAAGCTGTCTCGTTTTGTGTGTATGTACATATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:2 - chr3R 14688582 5' + FB 15 1 63.37 TATCTACCAGAACCCTGGTAGCCAAATATGGTGCAGATGCTGTTCCGTAAGTGACTGTGGTTATTTTAAGCACACAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAAT:1 - chr3R 19445536 5' - BS 52 1 67.33 GGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAAT:1 - chr3R 29331915 5' + G6 34 1 56.44 CCCGAGGTATGTCCAACATCAATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTTCCGTTATTCCTGCACAAATCTACTTCCCCCGCTCCTACCAGCGACCA:1 + chr2L 23177466 5' - invader1 124 2 85.15 AGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 + chr2L 17722764 5' + blood 7037 2 50.50 CATGGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 - chr3R 7522395 5' - blood 370 2 71.29 TAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3L 12633245 5' + jockey 30 1 53.47 AGACTTTTGATAAAATGCTCGAGGGTAAGGCTAACAAAATTTCTGAGTTTCATCCAATTCTAAAGTCTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCGAGGC:1 + chr2R 13847631 5' + Idefix 7238 2 66.34 TATAGAAGTTTTCTTTAAAAGTTTATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATCCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr3L 2019646 5' + 412 22 2 55.45 ATGAACACGTGAAGGAGAAATCCTCAATACTGTAAGCGATTCCCTGAAAGCGAGAGCAAAGGCCCCAAGAGCCGTTTCTATTTTATTTTATTTTATTTTGT:1 + chr2R 10855892 5' + transib1 1900 1 63.37 GCACTCTGCCATCAGCCTTAAACTCTTTGGAACCTAAGATGTGTAGCATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAA:1 + chr3R 1838329 5' + Cr1a 3996 1 53.47 TGCTGCCATTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chrX 16995090 5' + jockey 23 1 62.38 ACAAATCGTGTGTAGTCTCGGAAAAGCAATGAAAATTGGAATGAAAATAGGAATAAATGTGTTTGGGCTTCAACTTTCATAAACATAAACATAAACATAAA:1 + chrX 13798789 5' - 412 73 2 80.20 CATTTAATCTTCTATTAAGACCACTACCAACTACATGGCAAACCGTTACAAAATCAAAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTAT:1 + chr3R 4484610 5' - BS 4882 1 65.35 ATTTATGCATCAACGTTGGTCGAATACCAATTATAGTTATAATTAGTCATATACAATCGAAAAATGTATTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:2 - chr3R 6467359 5' - roo 405 1 74.26 AAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 4876789 5' + roo 43 2 69.31 GGATGGTGTGGTATGGTGCGACTTAGGGGGCGTGGCGGCACTGGGCGTGGGAAGGGAAGGCGGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTG:1 + chr3R 12277482 5' - Tirant 387 2 65.35 CAACAGATACTTCACACTTTAGAGGAAACTGTAAATTTTCAAAGACCAGCCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACT:1 + chr2R 965511 5' + I-element 4903 1 53.47 TTTCTTTTGGGGCGTTCTAAATAATTTCTGTCACGCTTCGGCTTGCAGTGAAAATAAGTAATTTAAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr3L 19334959 5' + TART-C 11097 1 72.50 CATTGGTTGTTTCGAATGACAGATTTGTGTATAGATAACAAATTAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 13136730 5' + roo 30 2 58.42 AAAACGCAACTTCTTTTGGTCCAAATACATCTTCCGATTTAAACCCGATTGAAAACCTGTAGGGGGACATTAAACAATATGTGTCGAAGAAGTCCCCGACG:1 + chr2L 21661966 5' + HB 1191 1 73.27 TACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTC:1 - chr3R 1977613 5' - micropia 417 2 61.39 TCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACGATAAATGTTCACACATGAACACGAAGATATTTA:1 + chr2L 2074701 5' + roo 8671 2 61.73 TGCAGTTGTGGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr2L 7800049 5' - P-element 2861 1 53.47 TGGCAAGTGGGGCATTACAAATATTACAATATTTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGG:1 + chr3R 31194435 5' - Transpac 5228 2 75.25 ACACACATGTAGATGCACAGACAAGGCCAACATATTAGGAACATAGGCTGTTTTTTTTTAAATTTAAATATAGGTATATAAGTATATATAATAATATGAAA:1 + chr2L 5459916 5' + Dm88 4386 2 52.48 TGACACAAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 + chr3R 11263377 5' - roo 394 1 64.36 AATGATACTAGATTCAATGATACTAGTATCATTGAATCTAGTATCATTGAAATGTAAATAACAAAATCCATAAGGGTAAACAAAAAGCCTTTAATTTTGCA:1 - chr3L 26417955 5' - S2 58 1 51.49 TTTGGCAATTGGAACTTTTTCTTTCTGTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2L 20971443 5' - roo 359 2 75.25 CACTCGCTTTCCTCAATCCTTTTTAGCTCTTCTCCGTCATTCTCTCAATTCATTCGAGTGGTTGTCATGACAACAAAACTCAACAAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 10545488 5' + R2-element 3584 1 64.36 TATGGCTTTGCAAATATTATTTATAAGTAATACGATTTTTTAGTTCCTTTAGCAATATTCAAAACCATGGCAGGAACTTAAGAATTTTTACATTACATTCT:1 - chr3L 2894223 5' - Copia1_DM 4168 1 59.41 AGTCACTTTGTTTGCTCTAAATTCCTCGTGGATTTTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTG:1 - chr3R 11939779 5' + FB 41 1 70.30 TGATTTGATTTCGGTGTAAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTG:1 + chr2L 15512561 5' - jockey 4859 1 51.49 CTTGCGCGTTTTCTTTGTTTGCTTTCTATCTGTGCCTATGTGAATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTA:1 + chr2L 12987318 5' - accord 7058 2 60.40 AGGAGAGTTCGATTTGCTTTTAAACTGTTTATTGCAAAAGTCACATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGA:1 - chr2R 19675686 5' - 1360 483 1 79.21 CTTAAATTGGTGATATACAAGACGTTCATACGGACAGGCGGACATGGCTAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGGGTAACGGCCATACATT:1 - chr3L 27390356 5' - 1360 3369 1 57.45 GTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACG:1 + chr3L 25889017 5' + gypsy8 308 1 72.16 ATAAAAATCGAAAATATATATAAAAAGCTTGAGAATTGGTTGCTAGCGAAACACCGCTGTAGTCGTGTTCACGGATTGCCCTACCCTACCTATGACC:1 - chr3R 22343766 5' - Gypsy12A_LTR 1953 1 77.32 CATGCTTCTGAAAGTCCCAAAATCACTCTATTAGCACAATGCTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCC:1 - chr2L 12133504 5' - ZAM 8026 2 59.41 GTGGCGCTTCTGTGCTCCTCCCTTAATTTTATTTATTTAACAAAATTTAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGG:1 + chr3L 17834566 5' - Ivk 5324 1 71.29 AGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTT:1 - chr3R 19449495 5' + roo 9025 2 72.28 GAAGTTCATGTACATCTTTGGAATGATTTTAGCATATATATACCCCTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 - chr2L 2308716 5' + HMS-Beagle 28 2 54.46 CACCGACCGATGAGATGGGCTTTGGAGTGGCGGCTGCGGGTGTTTATGTCTGTTGG:1 - chr2R 21262771 5' - Quasimodo 7026 2 69.64 CAAAAATCGCTAAATGGGAAAATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chrX 19426310 5' - mdg3 224 2 56.44 CGCAAAAAATCCTTTTTTTGCATAGCGATTATTATTTGTTTTTTTCCTATAAGAATTTTGCTTAGCATACGTTTACGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATT:1 - chr2R 19551272 5' + 1731 200 1 59.41 TTCTGTTTGTTCTTGCCAAACGGTATCCGTTAGTTCGTTTTCAATTGAACATGTCATGGGTTCACATCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACA:1 - chr2R 18677408 5' + opus 417 2 73.27 CCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATCG:1 + chr2L 22699423 5' - INE-1 563 1 79.21 GCGGACATTCCGGCGGACGGACGGACAACTGTGAGCGATTCCACGAAACACAGCTACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAAACACGA:1 + chr3L 21124598 5' - transib1 350 1 63.37 AAACAATTGAAAATACTCACAAGCAATACATTGGACAATTCAATTGCGCTGCAATTTGTATATAAATACATTTTTCACTTTATTTTCAAGGATTGTTTTTG:1 + chr2L 19399572 5' + transib4 2489 1 58.42 GTGATATGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr3R 4834253 5' - mdg1 7431 2 56.57 CCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2R 20739456 5' + roo 47 2 74.26 GCAATAAATCATGAATAATAAACGGAAAAACAGCACAGAAAAAAGGCAAAAAAAAAAAGGGTACAAAAAAAAAA:1 - chr3R 21161493 5' + G2 3066 1 43.24 AGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 13546686 5' - roo 9021 2 76.24 GTTTTTTGGGGGGTAGGTGGGGGGTCAGAGGTGCTTCTTTTTACCTTACTCATTAACGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGCGTGTAATTATGTACGC:1 - chr3R 30083031 5' + Q-element 560 2 66.34 CGTCACTATATATATATTTTTTTTTCGCACTGGTCCCACGGCCACACCTGCCGCCCAATCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCG:1 - chr3R 3120438 5' - Cr1a 4394 1 85.11 GGGATAAGAACTCGCATAAGGGTTATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCATAGACCGTTGTGTC:1 + chr2L 3951608 5' - Transpac 283 2 72.97 TGAATAACGTTCTTTGCCCTTATAAAGTTTTTAATTAAATTAATATTTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTG:1 + chr2R 4828976 5' - 1360 279 1 60.40 TCATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 20739437 5' + roo 8685 2 56.38 TAAAATCTTTGTTTTTACTTCAGTTCTTTTGAATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAAACTTT:1 + chrX 20766585 5' - P-element 91 1 41.58 ACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 15305707 5' + roo 8696 2 58.42 CACAGAAGCTCATGTGAGCTGTGTTGGTGCGATGACAGCGAGGCGGAGCCGACTCATATTAGTAATGTGTTGGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGA:1 + chr3L 5054777 5' - F-element 488 1 76.24 ACCCGTTCCAAGTTCAAATCCAATGAAATCGAACGGAGATGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGA:1 + chr3R 6614395 5' - I-element 5055 1 60.40 AAAGCATGAAACAAAAAATATTTGCATTTTCCTCAAGAAATGTTTGCACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTTAACAT:1 + chr3L 5222959 5' + ZAM 8207 2 53.47 TCAAATGAGCCATTTGTCCACATCATATTGCCATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2R 7861636 5' - roo 404 1 75.25 ACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr3R 7168572 5' + flea 4780 2 59.77 AAAGTTTTTGCGGCTTTTTCAATATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTG:1 + chrX 7383265 5' - Quasimodo 42 2 77.23 CGAAAAGAACCATGAAATTAAAAAAAAATGTAACAAGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr2L 6999241 5' + Ivk 18 1 57.43 CGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTG:2 - chr2L 12815105 5' + hopper 36 1 56.44 GTCGCGGACTGAGCAAATGTTGCGGCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2R 14713611 5' - P-element 2837 1 32.67 GTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 - chrX 21852424 5' + Tirant 8156 2 72.28 AAGTTTTCAATGCTAATTTCCACTTTTATAATAATTTTATATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 + chr2R 22478067 5' + Burdock 6169 2 60.40 ATATGGTAGGCAAAAACCACAAACGGATGGGTGCAAGAGGAAATGAACACACCCAAAGTCGTTACTAAAATACCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCC:1 + chr2R 14694355 5' + HeT-A 5849 1 76.24 CCAGTCCCAACCACCCACACTTTTTGATGTGATCAGCACAAAGTTGCTCATTGTTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3L 9907436 5' - jockey 4972 1 47.52 ATCTGCTGTTCTCGTTTTTCATGCATTTTATTTTTGCTGTTCCCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 - chrX 8689949 5' + opus 7060 4 57.43 TGTTGACATTTCTGTTCACCCCAGTGACTCGTAAAGTATTTCCATTCATCTGCGTTATTATCGTCAACGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGC:1 + chr3L 22395380 5' + F-element 481 1 58.42 CTGAACTACACAGCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTC:1 + chr2L 9775400 5' + 412 7329 2 76.79 AATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGC:1 + chr2R 5260086 5' - 1360 3223 1 61.39 AAATAGTTGAAGTAAAAACCATTATATTGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr2R 17261592 5' + pogo 46 1 74.26 CGAATGTGCAATAATGCCTGAATGCCCAGAAACGCCCATATATTTATTTATTCGACTTTTCCCTTTTAGCACACGCCACCGAATGCCGCGTTTCGCGT:1 - chr3L 5659210 5' - invader3 190 2 51.02 AAATTATTATCGTCCTAGGAATAATAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGC:1 + chr2R 613048 5' + F-element 4439 1 75.25 ACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 19018941 5' + hobo 25 1 51.49 TTGGCATAACTTAGGCCTATAACAAATGGATCTATAACTAGCCATACGAACTAAGGGTTGGTTTTTATGTTTAAATAATTTTTTAAAAATCTTCTATAATT:1 - chr2L 18661196 5' + Cr1a 74 1 65.35 AAGACGGCAATTTATTATTTAGCAAAAAAAAAAACTGCAGCCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGAT:1 + chr3L 8929348 5' - X-element 4278 1 60.00 TTTAAGATTAAGAAAAGATTTAATCCAAAACAAGAGAGAATGCAATAGTCAGGTTCGCCGACTATTATAGATACCCGTTACTCAAATAGTGTGAATGCGAA:1 + chr3R 835800 5' - INE-1 531 1 73.27 TTTCGCTGCAATGTGACAGGCGGCAACAACAAAAACAACACCACATACTAAAACAAAAACCTCCGTGTGCTCTTCAGTCCTTGAACGCTCACCGGGACTGC:1 - chr3R 11062509 5' - Rt1b 4996 1 78.22 GTTTAGTGAATCATTTTTATTTTTTTTTAAAAAAAA:1 - chr3R 23167378 5' - transib2 2633 1 63.89 TAACAAAAAAATATATATTAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3L 25147220 5' + hobo 22 1 53.47 CTTGCACGTGCTGCCACAATACCTCCTTCCACGCGTCATTCAGGTTAGTAAATGTCATAGCGGCGCGCTAGTTTTACCGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAG:1 + chr2R 3068608 5' + mariner2 83 1 69.31 TTGTATCCATATTATATTTATTTAAATATTTTTGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr2L 7850122 5' - 412 451 2 66.34 GAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTAC:2 - chrX 23182902 5' + Idefix 37 2 66.34 TATGTATACAAACGATCGTAAATAAATTGAAATTGTCGTCCCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTAATTACATAATTCGATACTACTAAC:1 + chr2L 7519580 5' + Cr1a 4284 1 64.36 TGGCCACATAATCCCTTGTAATTATGCCCGCATCGATTCCTCGTAAAATAAACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCACAAGCGGTAATCAAAACCCAGC:1 + chr3R 6618958 5' + Tom1 116 1 73.27 GAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chrX 3305206 5' + transib2 34 1 58.42 GTATATTGACATAAATGGTTCGCATGTTTATGGAATCCTACTTCCTTTAATTTCCATTATAAATAAAATATACCTTAGTAATAATAACAATAATAATTATA:1 + chr2L 7588180 5' + mdg1 28 2 80.20 TGAGCACTTTTGATTACTTTTTATCCGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2R 18950811 5' + roo 8693 2 58.00 TAGAGTGTCTCTTGCTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chrX 13546612 5' + roo 8672 2 72.28 GTGTTTCATGCGTTGGTTTTGGTTTGTGGGGCATGGGACTTTACATTTCGGGCCAGCTGCTGGTATAATATGCAAATATATTTTGATTAATTTAATTTAAT:1 + chr3L 22371672 5' - Transib5 2594 1 80.20 CTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 12539557 5' + roo 8701 2 65.35 TAGAAAAACGGTGTATAAAATCAAAGTTAGTTATAGAATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 + chrX 15391942 5' - 1360 3353 1 67.33 TTTTTGGTTACGAGCATAAGAAACAAGTTGGGTAGTAAAAGTGCTTCTCTTAAAGCTATACAACATTTGCAAATGGTTTAATTTATTTAATTTTATTTTCT:1 - chr2L 9744701 5' + transib1 1900 1 73.27 GTGGGGCATTACAAATATTACAATATTTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTC:1 + chr3R 31194441 5' - Transpac 303 2 69.31 GTAAGAGATGTAATTTTTATTTTTCTACAGCCCTGATTTTTCGATACTGCTGCAATGTTCTTGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTTTGTTGTACGTCTCTAAT:1 - chrX 2766759 5' - Bica 379 2 70.30 TTAAAAAATACAAAACAACACCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTA:1 - chr3L 17525358 5' + 412 314 2 80.20 AGCTCNTCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAA:1 + chr3L 19951195 5' + Ivk 27 1 53.47 TGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr2R 20739447 5' + roo 38 2 65.35 TTCTCCACACTATTCTCTATTTTACCTAGTCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACC:1 - chrX 12340443 5' - R1A1-element 4939 1 70.30 CGTTGCTCCATCTCATCCCAACGCTTTTCATTTTGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 - chr2L 3950605 5' - Transpac 5216 2 41.58 CCCCTGCTCCTACTTCCCTCACGGAACAGGTTTCACCATCCTCTACCAGGCAGTTCACCGCGATCGTTTGCATTCTGCAGGTGCTAGGTCATTGACCGGGT:1 - chr3L 3220290 5' - Doc3-element 342 1 65.35 TCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCTGGTGAAGTCGGCAGAGAA:1 + chr2R 5039402 5' - gypsy11 4265 2 76.24 ATGAACTGCCACATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr2L 3951665 5' + Transpac 4942 2 56.44 CGGGTGCCTTCAGTCAAAAAAAAAAATAGAAAAAA:1 - chr3L 2903785 5' + R2-element 3584 1 74.29 TTATGTTCCCTCATTCGCATCAGAGAAATTCGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:2 + chrX 19162568 5' - pogo 2097 1 72.28 CTAGCCGGTTACTGATTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:2 - chr2L 15947475 5' - Transpac 5218 2 68.32 CTGTAGCTGATTTTTACAAGAATTTTCTATTCATTCGCCGGCTGCCAGCATTGCATACTTTCTGGTCCTACATATTTCCTTTTTTTTTTTATTTTT:1 + chr3L 13652976 5' - Doc2-element 245 1 66.67 GCTGGNAGGAGAGGAGGCGTGGCCGGGAGTTATAGACGAGGCCTATGGCAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGG:1 + chrX 2799593 5' - Tirant 400 1 79.21 CACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2R 8086873 5' - 1360 3361 1 61.62 TGATTGAAAACTTAGGTGAGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTTTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAG:1 + chr3R 25330085 5' - Doc 395 1 81.19 AAATGNCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 - chr3L 18706939 5' - jockey 4959 1 52.48 ATTTAAAAAACATTCATTTCCATATCAGGAAGTATCATCCCTTATAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2R 14341769 5' + opus 25 4 57.43 TACTCGTATATAACTCAGTGTGTGTGTTTCCGGCATCGGCATGTTCTCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAGAACGAAAGTATTGATTTCAATA:1 + chrX 18130908 5' + Idefix 7101 2 63.37 TTTTGAATTGTAAGTAATTTCTGATACCTCACCTCGAGATGTCCACGTGTGCGAATGGGAATAGATGGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTAAATTG:1 + chr3R 11517936 5' + aurora-element 4144 1 67.33 AATGCGATCTTAAATTATTTATTTTCTACGACAATTTTTTTATAATTGCGTTCCATGGGCGGTTTTTCTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 17724069 5' - Rt1a 5087 5 89.01 ATTTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTC:1 - chr3R 32005963 5' + invader4 17 2 63.37 AATTTAGGTTGATAAATTAACTGGGTCTTAGTGCTCACAATGAGAATAATTGAGTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATA:1 + chr2L 20865665 5' - 1360 396 1 53.47 TGGCCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAG:1 - chr3R 6117297 5' - Tirant 8466 2 65.35 AACAGTGGCGGTATCCCAAAGCACCCATATTCGCCCAGTTGGGCGCACATTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGAAAA:2 + chr3R 15598630 5' + Max-element 2 2 77.23 TTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGG:1 + chr3R 7388327 5' + HMS-Beagle 6813 2 62.00 GGCAAGCTCCTGTTGTTTTTCCCCACTTCCGTTTGCCTTCCGTATTTACTTACATGTGTTTGTTCGCGGCTATGCTGGTGAACAGGGGGGCTTGGGAGCGG:1 - chrX 11644510 5' + Rt1b 4733 1 65.35 CATATCAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCTTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAAT:1 + chr2L 3084995 5' - copia 242 1 65.35 CGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAT:1 - chr3R 29288768 5' + BS 5025 1 50.50 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGCGTATAAGTGTGC:1 + chr2R 5260087 5' - 1360 3223 1 61.00 CCCGACTTGGACAGCAACAGCAAAAACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGCCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGA:1 - chr3L 16745886 5' + F-element 4375 1 82.18 CCTGCCGCCCTTAACAGGTAATGGAATTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATG:1 + chr3R 4544997 5' - P-element 467 1 32.00 AAACCACAACAACAACAGAGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chrX 6657341 5' + P-element 39 1 42.57 CCTTTCCGCTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chrX 17968334 5' + Tirant 8112 2 76.24 GATTTATCGGCCGACAGGACGAAGGACGAGACGTAGAGAAATGCTAGGCATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 5686027 5' + P-element 8 2 71.29 TTAAAGCAAAAACATTTATAGGATAAATGTTTATTGTTAGCTTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCA:1 + chr3R 11271690 5' - Stalker4 7190 6 59.41 ATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:2 - chrX 10672341 5' - mdg1 7406 2 77.23 CCGAGGGCAAATTGAACTCGGAAGCCGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTT:1 - chrX 19986816 5' + Stalker2 397 2 72.83 AGCGGAAGTAAAAGGATTTGAATTGCCTTTTGCTAACTGTAAAATCCCAAATTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 4801565 5' - roo 9030 1 63.37 TACAGGCGTAACAGAAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 + chr2L 17210253 5' - jockey 4986 1 72.28 CTTTTTGTTGCCTATCTAAAAGGCGTTTGTAATTTACGCATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAA:1 - chr2R 22317276 5' - BS 5059 1 60.40 TTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 12324036 5' - roo 9036 1 62.38 TAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCC:1 - chr2L 14025658 5' - TAHRE 10398 1 83.17 CAATGTGAAGATATTTTGCGGCGCAACCTTGAGGTGCACAGACATAAGTTCAGTATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTATATAAACATTAAGTCATT:1 + chrX 5142523 5' + invader2 4910 2 68.32 TAAATATTAACGACGCTAATAAGAATGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTA:1 - chr2L 23390416 5' + Ivk 52 1 79.21 TGTTTGATTTGATTTATTTTGAATTTGCATTTATCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGTCAACTCCGAATAAGCGTCGTAAAACATATTCTTATTACTTACTG:1 - chrX 4511148 5' + Gypsy6A_LTR 230 1 79.21 AGACCGCCTGATCTACGGTGAATCGGCCATGACCCATGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCT:1 + chrX 8440415 5' - F-element 4394 1 64.00 GCCTGACGATTGCAACTGGCAAACTGGATTTACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAA:1 - chr2R 18673389 5' + I-element 273 1 68.75 ATGTTCAAGAATCACCGCGTCATTAAGCACCAAAAAGAGATTCTGCCCTGGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 11688507 5' - 1360 3362 1 55.45 GCGCAGTTGTTTTTGTTTCGTCTGCCATACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAAT:1 - chr3R 14650165 5' - 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chr2R 4580717 5' - Chouto 92 1 63.37 AAAGGAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 + chr3L 9909691 5' - Transpac 284 2 53.47 ATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATAT:1 - chr3L 18337710 5' + Juan 4054 1 53.47 ATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr3R 19346958 5' + blood 37 2 62.38 CCATGGCAGCATTTCAAATGCACCATCCCCACCTTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTC:1 - chr2R 16039640 5' + Doc 313 1 66.34 CAAAGGAAAAGCTAGGAAATCCCGTACATTAAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 + chr2R 3037037 5' + I-element 4944 1 69.31 CGGCACGTGCTGCCTTCTGTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3R 8277931 5' - P-element 2838 1 25.53 GCTGGCTGCGTCTCCGCTGCGTTGGCACACTCCTTGTGGAACTGCATAAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTC:1 + chr2L 13320302 5' + hobo 345 1 55.45 AAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 - 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Rt1b 5107 1 64.36 TAATTATGATTGTACCTTTTATGATTATGGTGTGAAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 1233181 5' + hobo 41 1 64.36 TTATTACCCAAAACAAAATAGAATGCGAGAAACGTAAGCTAATCTCACTTAAATAATAGCATACATCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATAC:1 - chr2L 19074761 5' + I-element 210 1 74.26 AGCAGAGCATACAGCGTATTCTTTGTTCACTAAGATCCGCCCCTTTGCAGTGGAAAAGCTGGCAATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGGA:1 + chr2R 9589266 5' - Ivk 157 1 55.45 CAATAATATTATGATGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 7861737 5' + roo 28 2 59.41 TACTTCATTAATTGTTCCTGGGATAGACAGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCCGTGGCTCTAGAGGTAGCT:1 + chr3R 2404804 5' + 1360 61 1 81.19 ATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3R 11119866 5' + 297 34 2 66.34 CAAGGAATATATGATTGCATACAGTAGTCACTCACTAAGCACACCTCCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCT:1 + chr2L 286562 5' - P-element 398 1 49.50 CAAGCAGACCAATTAAAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAAAAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCAC:1 + chr2L 22699415 5' - 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chr2R 23571924 5' - Idefix 193 1 71.29 CAAATGCTAAAAAATACACATTTGAAAGCGTTATCAATATAAGCGTGTCTCTTACTTGTGCAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCG:1 + chr3L 2079798 5' - ZAM 15 2 55.45 GTCGCATACAAAACTTGCTCGCCAGCATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chr2L 5646929 5' + jockey 4672 1 78.22 AAACAAACCGGTCTGGTCTGTCGCTCCGAAAGTACTACTGCTTGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr2L 285687 5' + P-element 34 1 45.54 CTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 + chr2R 694097 5' - flea 230 2 57.43 TTTACNATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 - chr3L 8713141 5' + opus 47 4 77.23 AATACTCAATACCCTTTGTTCCATCTATGGGTGTTCTAAAAATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTG:1 - chr2R 14341880 5' - opus 498 1 77.23 TTAAGNGATTCCACTTTGATTGGGATGCTGCTGCTGCTGCGTCACACAAAGTATCTACGAGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTT:1 - 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Tom1 80 1 58.42 TTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTC:1 + chr3L 25443680 5' - TAHRE 10410 1 58.42 TTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 - chr3R 7168649 5' - flea 243 2 63.83 TTCCTCCATTATCCTTTTTTTTTTTCTCCCCCCAGCCTAATCTAGGGGAAACAGAGAGATTTTCAAAAAAAAAAATATAAAAAA:1 - chrX 5182997 5' + R2-element 3584 2 76.19 TAGAGNAACAATTTTAATTGGCGCCTAACGTGGGGCGGTGTACTTAAAAATTCTAAAAAAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGA:1 + chr2R 1845137 5' + Doc3-element 92 1 61.39 GATCGCCATGTGAAAGGTCACCAGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 - chr3R 9995445 5' + Max-element 8250 2 69.31 TTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGC:1 + chr2R 1320676 5' - diver2 4884 2 58.42 ACTGAAAATCGTCGGCGACTGAGCCAGACTTCAGGTAATACCAAATACCCATATACCATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chrX 17830811 5' - P-element 2868 1 61.39 ATTCAGGAAAAGTGGCAACTTGAAGAGCAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr3L 13659872 5' + pogo 14 1 61.39 GTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - 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flea 221 2 65.35 AAAATTAAATGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTG:1 - chr2L 3700012 5' - gypsy2 428 1 45.54 TATGAGAAATAAAAGAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 12453617 5' + F-element 4685 12 87.10 AACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 15072560 5' + pogo 17 1 59.41 CAATTCCATAAATTTTTACTCGGAAGACAAAGCCACAAGGTGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCA:1 - chr3L 25730592 5' - Quasimodo 269 2 59.41 CACGTAAAGTTAAAATTTACCATTTTAGCTTTTGATTAAGAACCTGCGACTTATGACTGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGA:1 - chrX 11730342 5' + jockey 4778 1 61.39 TATGACTCAATTACATATTTTCCCAAGCCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 19462158 5' + roo 8712 2 75.25 TTCTTGTTAATCTTTAAACTGAATGATGTCAGACTACCCCCACTGACTGGAGTGCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr2R 5950766 5' - mdg1 400 2 57.43 GCCAAGGAGTCCACCAGGGTGAACAATGTTTTCACTATGCTTAATCTTGGAGTCGTGTTGTTCGTCATTATCGCAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAG:1 - 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X-element 400 1 72.28 AATTCCTTGTATAAAAGTTAGTTATTGCCTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 18659095 5' - pogo 2072 1 58.42 CTTACAAGTTTTCACGCCTTTTCTCTGTCGCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTC:1 + chr2L 17647292 5' - flea 4702 1 70.30 ACAGTGGGGCTCTGCTGATATACACACTGGGTCGAAAAACAAATATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 6506885 5' + roo 26 2 55.45 TCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:2 - chr2L 2074773 5' - roo 9038 1 58.42 AAATTTATGTACGCGGCGTATGAGTAATGTGCACTACTTCTACTTCTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAA:1 - chr2L 19646608 5' + Cr1a 4253 1 58.42 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chrX 21852423 5' + Tirant 8149 2 70.97 AAAATGGATACAAGTAATTATCGTGGCCGCCCTAAAATTAATGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTAATAT:1 - chr3L 25947627 5' - 1360 395 1 61.39 CCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 21092462 5' - 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mdg3 5028 1 50.50 CAATCAGTTATCGATAGAAACAGCTGACGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 6824474 5' + roo 8698 2 72.28 GGAGAGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1 + chr2R 10945337 5' - transib2 2780 1 68.32 TAAACTGCTTTTGGCGTGCATTAAGTGGTCTTAACTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTA:1 + chr2L 15953843 5' + Quasimodo 7154 2 78.22 ACACGTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 - chr2L 6083782 5' + 3S18 29 2 54.46 CTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 + chr2L 20706685 5' - mdg1 363 2 79.21 AATGTCTTTGTGTGCTTATAAAACTGTACAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr3L 11836831 5' + 1360 48 1 71.29 GGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 19018943 5' + hobo 27 1 53.47 GATTACCATCAACAAAGGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - 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roo 408 1 78.22 CCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 20477047 5' + 412 7091 2 62.00 TGAGTCCCGCCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGCAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr2L 20622771 5' + Doc 14 1 44.55 TAGCTGTTCCTCCATTCAATTAAATGGAATGCACGTGCCCGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCTACTGAGAGCCGAGCGAAAGTT:1 + chr3L 5072898 5' - accord2 7592 2 66.34 TTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 + chr2L 15510404 5' + jockey 4703 1 58.00 TAGCAAGTGCTAACTGCTTACACACACCCCTTCTACCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAG:1 + chr2L 7489436 5' + roo 9044 1 64.36 TGAATTCACAGGAACCTTAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCGAGGGTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 19449444 5' - roo 9047 1 52.48 GTCCGACGACGCTTTCGTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 23571629 5' - roo 9042 1 54.46 CTAAAGTTTCTACTCTCTCAACGTGTTCGGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAA:1 - chrX 6451387 5' - hobo 2465 1 71.29 TAAGTAAACAACACCAAGACCAGCACATGGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTCTTCGTAGATGTGTCTAAGGTCGTTACAATAAATAACTCCCTTAGAGA:1 + chr2R 18802643 5' - I-element 485 1 71.29 GATGATGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 7550713 5' - 412 7514 2 55.45 AAAACAATAAATTTGTCTCTGAAATAATACATTTTCAATTAAGTATCAACGTTGGCAATTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTC:1 + chr3R 16834015 5' + I-element 20 1 44.55 TAAGCGCCTGCTTTCCGGATTCGCATCTTTAAATTCGCTCCACTTGTAAATCTTTATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAA:1 + chr2R 9158506 5' - 1360 3283 1 57.43 AGGAACAGAATTGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATCTG:1 + chr2L 2074681 5' + roo 8671 2 71.29 TAATTAAGCGCCAAACAATTACTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCAC:1 + chr3L 6044715 5' + Tabor 6847 2 71.29 GCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 - chr3L 18706923 5' - jockey 4943 1 68.32 CTTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 10147903 5' - roo 9046 1 56.44 TTTTCTCTATTGCACAAAAACATGTAGATATATAATTATTCATAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 6467261 5' + roo 31 2 61.39 TAAAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAA:2 + chr3R 8975940 5' + Bari1 33 1 58.42 TGGCAAACACACTACAAACACGGAAGGATATACATTACGAGGGTGGGCAAACGAAATAATTTATTTTTAAAGGGTGGGCAAACGTTAAAAAT:1 + chr3L 21590314 5' - FB 983 2 57.61 TTAAAAAAAGAAATATGATTTCTGATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGA:1 - chr3L 8614579 5' + opus 14 2 66.34 CGCACNCGCATTACGTATACGCCGCATAAGCACAGGCTTCATAGTTTTTTTTTTCGATACGATTTTTCGATTTTTTAAGACATACGGGGTAGCTGAAAACC:1 + chr3L 8583911 5' - BS3 1744 1 69.31 AGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3R 19446122 5' + 297 6582 2 77.23 ACTTCTGCCACCTAAGCCCAATACACTATCCATTTATTTCGGCTTTCAGTTCAGAACTAAGTAATACGAAGAGAGAGAGCTTAAGGTTACTCTATCTCGCA:1 - chr2L 15938766 5' - Chouto 90 1 68.32 AGAGAGAACAAGCCATAAACTCACAAACAGTCACGAGCTGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAA:1 - chr3L 5718120 5' + Quasimodo 477 2 61.39 CGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 - chr2L 20133068 5' - flea 4989 2 56.44 CATTGCTGTGATTCTGTGGTTGCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTGCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 23571679 5' + roo 53 2 80.20 GGTGTCAAAACGTTGCGTATACGCAGCGTGGCATAATTTATGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAA:1 - chrX 6913608 5' - I-element 5001 1 59.41 ATCCATGTTGATTCTGTATTGAATGGATTTATACGAAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3L 7075969 5' + roo 9 2 63.37 TGCTAATTGGAGATTGCAATTCATCAATTACAAGGCATTCTGTGATTTTATTTGCCAGCGCCATTATACATCACTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGC:1 - chr2R 9236447 5' - INE-1 546 1 74.26 CGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chrX 13640703 5' - P-element 2863 1 55.45 TTTATAAAACTGAATGTTTTTTCCGTTTTGGCAGGCGAAAAGCGACACATTTTTATATACAATAACTTGTTCCACCACCAAAAACACAAGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 9831694 5' - HMS-Beagle2 498 1 79.21 ATTGAGCTTATACATTTTCCATCATTGCCCCTGCTGTGCGGCAAGTAGTGTTCTGATGAGTTTTTAAAACTAAAGACAGAAAACTTAAGTTTAATATGAAG:1 + chr2R 16962344 5' - gypsy4 184 2 53.47 ATGGATATATGCCTGGGGTATTTGCATCCACTTTGGCAGCATAACTTTTGGATTCACTAGAACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr3L 8614467 5' - opus 7493 2 65.35 GGATTCCACTGCCAGGCTACTGTTGCTCATTCCCTCCTTGATCCGGCAAGTGTCATCCCTAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGT:1 + chr2L 18672401 5' - Stalker 6979 4 51.49 AGCAGCCGGACTGCATTCCTCAGGAGTTCCTCCTCCAGCAGCAGCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCAT:1 - chrX 1220879 5' + F-element 4332 1 56.44 GTAATATAAAGTTAACCAGCTCTTGCTATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 - chr3R 7415222 5' - I-element 5340 1 63.37 ATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chrX 20806927 5' + opus 150 4 69.15 CACTTGAAAAGTCTGAAAATATCCAGGATACACGTGTGTGCGAGTTTGGCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAAC:1 - chr2R 7861414 5' - roo 8606 1 55.45 GAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3R 16400205 5' + blood 7060 2 73.27 CGGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1 + chr3R 27284016 5' + Max-element 8284 2 67.33 TACTTACTGATAATTATAGCCATTCTTATCGGATTCTTTCGCATCGACAGGCCTCCCAGGAGTCTGTTCCTGCTGGTGGAAAGCGCCATGCAGTCACATAT:1 + chrX 6679776 5' - baggins 5245 1 60.40 AAGCGGCAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 18212115 5' + 412 7070 2 62.38 GCTTGCCAGTCCACTGGGACTTCAGACAGATCGCTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATTATACGACACACATAACCTACCAACACTACCTAAATCCAAAT:1 - chrX 378891 5' + I-element 4976 1 65.35 TTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chr3R 4970548 5' + diver 36 2 58.42 TTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGGATG:1 + chr2L 23286585 5' + Tirant 416 1 60.00 TCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATC:1 - chr3R 29331919 5' + G6 24 1 52.63 AACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:3 - chr2L 16948725 5' + jockey 4706 1 57.43 TATTCAAATTGAAAACACATCTTACTTAAAGGAACCTAATACGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTG:1 + chr3L 13146118 5' - flea 4813 2 59.00 ACCCCAGAAAGCCCAGAAAGCAAAAGGCACTAGTACACTAGCACACTGCCAAATAGGCAAACTGGCAAGCTGGCCAAGTTAAGCCGAATAATCAAGTCGGG:1 + chrX 18244614 5' - Cr1a 4079 1 79.21 TTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCC:2 - chr2L 21403560 5' + G5 4395 1 60.40 GAACGCTTTGGCGCTGGCTTTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chr3L 13589595 5' - hobo 2913 1 51.49 TTGTTTATATAAAACATCTTTACTTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATGTACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTTGATTGCCT:1 - chr3L 18434926 5' - Porto1 4332 1 76.24 TTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGAT:1 - 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chr3R 7168665 5' - flea 5011 2 73.27 GAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr2L 16201525 5' + hobo 49 1 75.25 CATTCNTGGAACATTAATTTTGCCATTGTTTCTGAAAGATTATTGCAAATTCATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr3R 23591407 5' + pogo 22 1 54.46 GGGAACAATGGAAAAGTACGTTTTTAACTCTCTTGGAAATAAAAAATTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 - chr3R 23591495 5' - pogo 2082 1 57.45 GCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCA:1 - chr2L 19019003 5' - hobo 2896 1 71.29 TAGTAGCTATGGTAACTCGCGCAAGTACACCCCCGACTGTGACGTCACCTTCCAAGATGGCCTGCAGACGCACTATTAGTTCCGCTTTTGTGCCGGAAGTC:1 + chr3L 25636372 5' - invader3 395 1 60.40 GAGGAAAGTAAAAAGTGTCGAGAGGAGTTTGAGTGCTCAACTGCGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTTTGA:1 + chr3R 23037929 5' + accord2 7473 2 56.44 GCCAAAGTCTCCATTACCACCTGTGTTAATGCCGTCAAGCGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTAC:1 + chr3R 17195677 5' + ZAM 7997 2 58.42 GTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTCTTC:1 - 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Bica 4829 1 60.40 TTTTAATACGTTACGTTACGTAACAATTCGATTTGCCAGCTTGCTTTAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAATTATTATGTATGTCTTCGTTTCT:1 + chr2L 6302300 5' - Porto1 4380 1 56.44 CTGGCCCGCATTGCGTATTCGCGTTCGTATCGCAGAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCAC:1 + chr2L 7368193 5' - R1A1-element 4992 1 65.35 CTACCAAATATTATTTCTCTTTCTCTTTGCCATTTTGGGGTACATAGTTTTGCGAGCCGAAAAGGCTTAATGACTGCTGTAGTATATACGAACATAATAAC:1 + chr2R 17626461 5' + mdg1 3 2 74.26 TAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2L 12324033 5' - roo 9041 1 58.59 TTCCTAGAACAATCGTTAACGAAACTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTCTTTGTGGGGGAGCTTGAAAGAGACGCTCTCAGT:1 + chr3R 2208315 5' - Doc3-element 431 1 71.29 TTCAAAACTAAACATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTGAACATTTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr3R 9995356 5' - Max-element 273 2 53.00 TATATGTGTACACTCACAAAACAACACAACCAAAAGATCTCCAGCGAATATCTAATATATGATAATAAAAGAAAATTATTAAAAACCTCGGCTTGTTT:1 + chr2R 3931621 5' - Cr1a 61 1 69.39 AGGCCAAATAGCTGGCATCTTGATAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCC:1 + chr3L 2821669 5' + Doc 4252 1 76.24 GCAGTGGCCCCTTTTTTTTTTTGTTTTTTATTCCC:1 + chrX 11380953 5' - Osvaldo 1520 1 85.71 GGCTGTGTGGCAGCAAAAAGTTCTCCTGGGAGTGGGTGGCCATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3L 5201466 5' + 297 6598 2 67.33 CGAGTAATCAACCAGATAATAAAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTG:1 - chr2L 7496149 5' - I-element 5134 1 78.22 CATTGTAGGAACGATCTACTGACTTGCGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3R 4600053 5' - HMS-Beagle 7016 2 57.43 GTGCCTGCTGCTCGACCTTAAAATTTTGATAAATTGTTGGCGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAA:1 - chrX 7662429 5' + jockey 247 1 59.41 CCTTGCGAAAGCCAAGAACAACCAATTGCTTTGCAGATAATGGTGCAAGCCCACAACCAGTATCTATTAGTCTGGATCTCGACTATAGCATTCTCTCTTTA:1 - chr2L 22927500 5' + INE-1 579 1 54.46 ATAAATTAAATGTTGCATTTATGCACATCAGTGCGCATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGG:1 + chrX 669357 5' + hobo 2558 1 65.35 TCAGCTGCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 17587759 5' + roo 12 2 67.33 GTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr2R 14708988 5' + Doc 55 1 76.00 TTAGTTTCTAATAATAAACATCCATCAGTTTTTCACTCACAAAACTAATATAGCCAATAAATGGTCGGATTAACGAAGCTAGGGATCCTGATCAAGAATAT:1 - chr3L 20449463 5' - INE-1 84 1 64.36 CCAACNCACATAAACTCGTGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chrX 13508661 5' + roo 8669 2 73.27 CATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3R 16400234 5' + blood 20 2 59.41 GTTGAGGTCTGCCATCAGTCTGTTAATTCTTTCTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTT:1 + chr3L 5531003 5' - jockey 4893 1 68.32 GACGCNCTTGTATGCGTACGCAAAGGAAATCTCACATGGAGCATGACACGACTCTACTGCTGACTGGCCTAAAAAAAAAAACCCATTAAAA:1 + chrX 3816079 5' + HB 1556 1 86.81 CATTAAAACAATTTTAACTCGCAACACCAACAGGCGTGGAAAAAAGAAGATGCCGAAAAAACAAGGAATCTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACAC:1 + chrX 17339322 5' + F-element 4446 1 75.25 AATGTNAAATAAAAGTTAACAACTTTTTGTTGCCTATCTAAAAGGCGTTTGTAATTTACGCATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chr2R 22317298 5' - BS 5081 1 49.50 TTATTATTTATTCTTCTTCGTTTTGGTGATTTTGTATATAAAAAAATAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2L 12479561 5' - pogo 2078 1 61.39 GTGACAAGGGACTATTATGAGTTCTTTATTTGGGTCCTTAAATAGAACCTAATTTTGAATATAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAA:1 - chr3L 25628214 5' + F-element 125 1 67.33 AATTAGGTTTCAGCGGGCAGACGAGCGCAAAAATCTATCGATATGCCAAAAATTTCTCGTTCGCATTCTCACTAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGG:1 - chr2R 1732664 5' + INE-1 551 1 80.20 AATTTATTGGGCAGCACGGCTGAAATGCGAGCGCCTTTAAATCGGGTTTGGCTTCTTCTTAATGTCTTTGTCAGAATTTGGCAGATCGTCTAAATCATC:1 - chr3L 16275293 5' - Fw2 155 1 57.58 GTTATCTACCTATTTTTCTCGGTGTACGTTGGGCGGTGTGGGTGTGCTAGGTGTTACTGCAGTACCGTTTGTTGCTTGCGGTCCGTGAGCGGGTGCAGCCG:1 - chr3L 19352624 5' - F-element 469 1 58.42 GCAACACTAGCATTGGCCAAGCATCCTTCCACAGAGACCGGAAGTCGTTGGGATCCCAGTTGTCCCGATGCCTTTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCT:1 + chr2L 2204085 5' - Bica 138 1 71.29 ACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 - chr3R 11094559 5' + 3S18 41 2 65.62 GCACAAGTTGCAAAACTAATTAGCAGCAAAGTCAGTCAAGAAAATGTAGTCAGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTA:1 - chr3R 26790451 5' - Stalker2 3 2 52.48 TGTGAGTGCGTTCTCAGCCGATGAGTCGAAAAAAAAACATTTCCATAATTGCGTGCAATTGGAGCCAATTAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 20047650 5' + roo 8669 2 71.29 CGCTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACG:1 + chrX 17968340 5' + Tirant 8118 2 70.30 GTGGGGGGCCAAAACTCGAAGGGGCCAGCAGCGCCAACACCCCTCCCCCCTCCCGCGCACGCAACAAAAGTATAAATTAACTAAAAAAAAAA:1 + chr2R 12071045 5' + jockey2 3405 1 86.96 TTGTGGGCTCATTTAGCCATTTCGTTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chrX 19116938 5' + opus 7025 2 54.46 GTGGGCTGAAGTGTACGAGAGAAACGGGAATGTCTATCAGTATATGGGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCA:1 - chr2L 11914899 5' - rover 7078 2 78.57 GTCTTACCTTTTTGGTGGATAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 7075855 5' - roo 399 1 68.32 TAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chrX 21852423 5' + Tirant 40 2 70.33 TAAGGGATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 19552064 5' + roo 8685 2 56.44 AAAAAAGAAAAAAGCGGCGGCCCAAGAATCCAAAACCGAATCGGAATCACAACAAAAAAAACAAAAACAACAAAAAAA:1 + chrX 2286922 5' + gypsy11 3933 3 87.18 AACAAGGGGAATTGAGGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 16458080 5' + roo 19 2 61.39 TAATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr2R 10912578 5' - TAHRE 10431 2 67.33 GCGCCGGCGCAAGTTCTCTCTTATCCTCTCTCTCTGCGTCTCTCGGAGCTTTCGTGTATACTATACGTGGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr2R 10444213 5' + P-element 7 2 72.28 AAATCAGTTTGTTCCATCTGGCGCCCAAAACTTGTTTTTCCCGGCAGTATAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTTCACGACTATC:1 + chr2L 22699430 5' - INE-1 564 1 77.42 GTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 2074767 5' - roo 9033 1 64.00 CCCCAAATCTGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACT:1 - chr3R 12047508 5' + Stalker2 7254 2 73.27 GCAGTTCGCTCCTTGGACAAGTTGATAACAATTCGGCATGGTATTGTGTAAATTTGCCAACGGCCATTCCGTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCC:1 + chr3R 18615882 5' + McClintock 215 2 64.36 CATCAACGTTTGAATCTTCATACGTTCTACAAAAAAAGGTTCATCGTTTTCGTTAGCATTCTATTTTTAAACAACATTGATATACATACATATTGACATAT:1 - chr2L 17785710 5' - G3 4507 1 73.27 TGTGGGAAAACCACAACAACAACAGAGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 - chrX 6657348 5' + P-element 32 1 49.50 CTTTGGTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 10147877 5' - roo 356 2 77.23 TCCCTGCCAGAGGACATAGTCGTGGCTGATTCGCTCCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGCAGCCGGTCAACGGACAAGGGATTAACAATGCCCA:1 - chr3R 12173875 5' - accord2 7398 1 64.36 AACGGTGTCTGTATAATAATCTATATAAAAATAAAAAAAATAAATTTTTGTGTGAATTTTCGATATTGATAAGGGGGAACATCATAAAATTTTGCAAAAAA:1 + chrX 11822420 5' + HMS-Beagle2 393 1 63.37 ATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:1 + chr2L 15510421 5' + jockey 4721 1 75.25 CACTTTCTAGATGTCAAAAACCCCGAATAATACCCACAAGATACATACCTATAAATCTGCACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAG:1 + chr3R 23986118 5' + Porto1 326 1 61.39 AAATGCGAATTAAATTTCCTTGCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3R 15072675 5' - pogo 2097 1 75.25 TGCGGTAGTTAATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chr2L 13334016 5' - flea 4987 2 59.41 GGCCACATATACGCACTCCCATATCTTTCTCCCATCGATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACA:1 - chr3R 16190449 5' + P-element 105 1 44.55 CCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3L 18501024 5' - hobo 2916 1 53.47 CAGCAGGTTTGACATCTTTAAAGTTTGTAAATTCGTTTCATCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACG:1 - chr4 1170389 5' + 1360 3214 1 75.00 GCATTAGTGTGTCAGCCCAGTTAGCACGTACGCACTTACACGACCCGCTCTTCTTGCGAGCGTAATTAAAATGTCAAAATGAATTTACATGGTACATATTA:1 + chr2R 10397549 5' - 1360 3149 1 72.28 AAGATAATATAAATGATTGGCTTTTGGATTCAAAAAACCTTTAAACGTT:1 + chr3L 18424875 5' + HB 432 1 44.90 CATACGCCCACTTAAATGGTTAGACACGAAAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAAGCCACACAGCACGAATCATTTCATAAAATGATATTTAGTTAGTTT:1 - chr3R 11851867 5' + Doc3-element 4641 1 72.28 CACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:2 + chrX 20806867 5' - opus 7471 2 65.35 ATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGTGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGA:1 + chr2R 4260434 5' + micropia 5135 2 82.18 TAGTGTTGGTGCTGAGCTGTCGTCATTGTTCACTGATTTTATTTATTACTAGTTGAGAGCAAGGAGCATATCGGCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATA:1 + chr2L 10249185 5' - 412 87 2 76.24 GGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2L 7800058 5' - P-element 2852 1 44.55 GACTTAACCTAACCGTGCCTCTGCCTTTTGCTTCTTTCTCTGTTTTAAGTATTTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 + chr2R 1654411 5' - Juan 4190 1 53.47 AATTGGATTTGGGTGATTTGTTCTATATATAAACATATTATATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTAC:1 - chrX 15371896 5' + Idefix 21 2 72.92 CTTACATTTTATTTTTCTTTTGCCTCTATATTTAAGGTTATTTTTTTAAGTGTACCAAGTGATTGAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3R 6622614 5' + P-element 7 2 72.28 TAGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 - chr3L 5489954 5' - jockey 4953 1 83.00 GCCGAGTCCGAACGGAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 4891891 5' - Circe 434 1 79.31 TCAGACTTTGACTTCTTCGGTTTTTTCTGCTCTTTCTTTTCGCTGTATGGTGTTGTTTTTTTGCGAGCACATAAAGTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCT:1 + chr3L 15625562 5' + Cr1a 284 1 59.41 GTGGTTGGTTTGGTTCGGAAATTTCGATGGAAGTGGATTTTCTTTCGCTGACTCAGTCAGAGCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGGGCGGGCTG:1 + chrX 5202023 5' - F-element 448 1 65.35 ATTGCGTGAGAAGAGTAAGTAGCCAAGGTCGGAAACTGGGTTGGTTATTTGAATTTGTTGACTGTGATCTAGGTTCTGTAGACGAAGAGTTTTCCCCTTGT:1 - chr3L 23931008 5' - X-element 483 1 68.32 CACCAATGCGATTAATGGGGATTTCCCCTCCACATGAAGCAAAAACAAAAAAAAAAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTA:1 + chrX 7438819 5' - Tc1 1433 1 59.00 TATTCATAAGGTATCTGAAGTTAATAACTATGAGTAGTAATAAAATAATAGTCATTGAATTTTGCTCGAATAATCCTTTAGATATTTGAACTTGATTTCGT:1 - chr3L 16257986 5' + accord2 7239 1 57.43 GACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 12539559 5' + roo 8699 2 63.37 CTGCAAATACTCTATCAACAAAACAAATGATCAATCAAATAGTAGCCAAAAACTGAACCCCCAATTCTAAAAAAAAAACCCAAATTCTAGATAAGTCAACC:1 + chr3L 8636575 5' + Idefix 158 2 63.37 TCGTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 23571643 5' - roo 9028 1 68.32 CCTCTCTCACTCACCGGAATTTCAACCATGGCCACCAACCTTTGCCAGCCTCAGCATTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAGACCCTTTCAGAAATTACCAGT:1 + chr3R 18172267 5' + Ivk 268 1 77.23 GAAAGTTGACAGCAGCGGTCAGCATAATAGGTGATGCAATGCAACAAATTCTGCGATGTAATGTTCAAATATCATATAATGTTAATTATATTTTTAAAGAA:1 + chrX 9467715 5' - hobo 481 1 50.50 TTACTACATATTATGCCCTGAAACGACTTTAAAGAAACTCACAAAGAGAAAATAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACTGCTAACCCGGGCTCAA:1 - chr3R 4099192 5' + I-element 148 1 57.43 CATTCAATCTGCGTTAATACAGCACATGTATATATGTATGTTACGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCG:1 - chr2R 5581600 5' + opus 342 2 56.57 ATAAAACACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 7075873 5' - roo 9044 1 54.46 TATATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 22098108 5' - roo 389 2 50.50 AGGCCAAACTGCAGTCTTCTTCACCAATTCCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAG:1 - chr3R 19384178 5' + F-element 4469 1 71.29 AGACGAGTAGACAACAACGAAAAAATTGAAAAGAAATAATAGCAGGCGCCGAATTACATGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCAACCT:1 + chr3L 9307574 5' + G6 1826 1 61.39 GGAACATGTAAGTTATATGATAGCTTGCAGCTATGTTTTTTTATATAAAAAAAAAACAGTTCAATTAACAATCAAAACAATTAAACAATTAAATAAATTAT:1 + chr3L 15760716 5' + HeT-A 17 1 75.25 GGAAGGCTTCCAAGTGAACCACCCGTTCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAATTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:2 - chr3L 11113955 5' - 412 446 2 71.29 TGTGGAAAGTCTGGGGCGAACGAAGGAATGTTTCGCTTGAAATGTTGATTTGGCCCGAAATCGGCTTAACTTCTCGGTTCCAAGTAGATTTACTAGAAACT:1 + chr3L 22535275 5' + Cr1a 4112 1 64.36 ATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:2 - chr3R 19346956 5' + blood 7050 2 64.36 CCATATTGTGCTGATTTTTCTTTGCGTCTAAGCTTTTTTCTCACAAATTATGATCGATGTGCCCATGTCTGCCTGTCCGTCCATATGAACGTCGAGATCT:1 + chrX 173232 5' + INE-1 133 1 62.00 CGGAATTTGGCCTAGTTTGTTGTCTGCGATTTGGTGTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCA:1 - chr3L 9975617 5' - F-element 490 1 64.36 AGATACACGAGCACTATGAGCTCACCCATAACCCTATGTACATACAACCCTTGACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCT:1 - chr2L 16363634 5' - R1A1-element 5141 1 56.44 ATATGAAAAAACAAACATTCCTGCAGTTGCACTGCAGTTGAACCTCACCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACA:1 + chr3R 11888468 5' + roo 9031 1 51.49 TTCAANCACCGATGTTTTCTGAGAATAAATGTCTTTGTGTGCTTATAAAACTGTACAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr3L 11836804 5' + 1360 21 1 57.43 ACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3L 13477491 5' + P-element 52 1 26.73 GTTCTCAGCCGATGAGTCGAAAAAAAAAACATTTCCATAATTGCGTGCAATTGGAGCCAATTAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 20047641 5' + roo 8677 2 62.38 CTGGCACTGTTCTCACCAACTGACCTAGTTTCTTCCGAACTGTCTCGGTATCACCCTCGATAGACGACTTAAATATCCTAAAAAAGAGAAACCAAGCCAAC:1 - chr3L 25847242 5' + G7 740 1 67.33 CTCATGTAAGCCACGTCCGCTGCAGTGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:1 - chr3R 22800201 5' + flea 25 2 54.46 GCCACCCCCCACTTTTCCATCTCACCACTTGGCCCTCGTCTCGCATCCAAATTGAAGCGCTAAGCAAATTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAG:1 + chrX 20806711 5' + opus 459 2 71.29 GGCTTCTCCGAGGCGGATTTGCTGGAACCCGCGGGTGGCTTCTTATCGCCGACGGATCCCTTCGGTTGGCACATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTG:1 + chr3L 17241490 5' + HB 10 1 69.31 GAAGCCACTGGTGAGATCACCAGGAACTGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACGTAACGGAACCGCTAGCAGAT:1 - chr2R 14344637 5' + opus 338 2 70.30 TTCAAAATGCTGACCTTCGGACTAAAGACTCAAGCGAATTTGTTGTAAGTCCCCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 + chr3L 22641140 5' + pogo 11 1 58.42 GTGTGGCAATAAGATAATGAATCTTTTAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:3 - chr2L 7488958 5' - roo 409 1 76.24 CAGATTGATCAGGAATATGTTAAGCTTTTTCAGAACAGGGCTCGAAGGATCTACAAAAACATGATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGA:1 - chr3L 5413729 5' - 17.6 164 2 67.33 CAGGCACTCTGTGGAATCCAGAGTTTCCGAAGGCCTTCTGTTGGTGTCACGTGCACAGTAGAGGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chrX 5092906 5' + roo 8677 2 66.34 TGGGCTAATGTCTAGAGCAACATTTTGGCTCTTAAGAATGAAAAGTCTCACGACTTGATCCGCATCCTCCCCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAA:1 - chrX 19363550 5' + FB 5 1 72.28 ATGGCCTTCGGTCCCCGACTTGGCCCGATGAGTCCATACGCTACACCTGAATTCCATGGCTTCCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2R 5804553 5' - P-element 2886 2 76.67 TCGTANCTGCAGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAA:1 - chr2R 17345973 5' + jockey 7 1 78.22 GTAGCTCCCGATAATGTTGCCTACAAAGTATGCAATTAAAAGTCGGTCGGCTTCTCAAGGCTTTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 - chr3L 22039785 5' + jockey 4682 1 66.34 TGAATTAAAATTAAATTTTCCGTTTATTTCCCCGCGCGTGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 20065333 5' - pogo 2072 1 56.84 TTTGAACCAGAAGTGCATGTGGCGTGCAACTCAAAAATAAATACATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 13060323 5' - 412 461 2 63.64 CTAGGGGCAGGAAAACTTAACAAACACTTCTCCATACCCGTTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2R 20816498 5' + hobo 31 1 56.44 AATAAGTTTTATATCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2R 6172970 5' + pogo 2 1 77.23 AGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:2 + chr3R 10952281 5' - roo 9028 1 67.33 CGATAGGGTATTGTACTCAGGAAGGTTGATATCTAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCGGGGTCACCAATATAGTAACTTATGTAGTTACCGCT:1 - chr2L 14249186 5' - Chimpo 183 1 66.34 CAACCCATTTGGACTCTTGACCAAAGGCTGTGCTGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr2L 9774349 5' + 412 7078 2 52.48 GTGAGGTAAATAAAGCGTTTTTGAACACCATTGATTTCCGCTCAATGAACTCATTATATTCGCCTCTTAAAACACCATTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 2937444 5' + hopper 140 1 56.84 TATATAAATACATATATGCATGTATATATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3R 23219908 5' - 412 7499 2 73.27 TCATTNTAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 27981755 5' - roo 401 1 70.30 CTTAGATTCTGGAAGCCCATAACAAGCGATCTCCTACCCACTAGAGCGCACTCCACCCTCTTCTCCTCCTGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAAC:1 + chr3R 10754169 5' + hopper 947 1 69.31 TTATAGTTTAAAAGGCATTTTTATTTCAGCTACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATA:2 - chrX 15305738 5' + roo 1 2 78.22 TATGAGTCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3R 19346955 5' + blood 40 2 65.35 AAAGTAAACAAAACAAATAAAATGCACATAATGTTGAACATTAGTATAAATTCATTTAAAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr3L 9766428 5' - blood 7374 2 64.36 AACTTNGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 10147879 5' - roo 358 2 75.25 CCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chrX 8682649 5' + pogo 43 1 72.28 GAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr2L 15947445 5' - Transpac 5188 2 63.37 GTAACGATAACGAATTTGTATTTACTTAAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 + chr3R 26530876 5' - blood 343 2 65.52 AGTTGAAGGATCTGCAGTCCCGTTTTCCATCCGAAATTTACCTCTCACTCCATATTCTACGAGGTTATTAGTGCATCAGAATACGACTGATAACTTTTGAG:1 + chr2L 14894358 5' - gypsy9 5266 2 61.39 TATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCTT:1 - chr2L 9107913 5' - TAHRE 10396 1 66.34 ACAGAGGAACAGAATTGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr2L 2074677 5' + roo 8666 2 74.00 CACGATCGGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTACATAACATAAAAGATAATAAGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAACG:1 - chr2R 4879027 5' - Cr1a 4184 1 50.50 ATGATTTTCCAATTGGAAAATTAGTCGTGTGTGCCGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr3L 8713787 5' - opus 471 2 69.31 GTCTTGGAATTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAAAGGGGG:1 + chr2R 7552252 5' - springer 339 2 68.32 CACGCTCGAAGTCGGTAGACAAAAAGTGAGCTAGCGACAAACTCCGAAATCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTA:1 - chr3R 3820326 5' + Quasimodo 7097 2 53.47 AATTATGTTTATTAGTTGATTACCGCGAACTAATAGTAAACCAAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTT:1 - chr3L 7906496 5' - roo 9038 1 58.42 GATCTGGTCATCGACGATCCTCCATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2R 14675640 5' + roo 8669 2 74.26 AAAACTATTCGAAAATATAAACAAGTATTTATCTTCAAAAACGTAATTTTTTCAAAAAGGAACAAAAAGGAGCATATGAAACTAGTTGTATAATATTATAA:1 - chr2L 23373079 5' - transib1 476 1 82.18 TGCATTCTGTAACCCCCGCAGATATCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 19377723 5' + roo 8686 2 55.79 CGAACCAAACCGCAAAGGGGGCAGCGGTTGAAGGGGGCGGAGATATGGCCAACCGACAGACGGCGACCGCCACACACACACACACATTCACT:1 - chr2L 13602998 5' + accord 188 2 80.43 AATATGTAAGGTCTATGAAAAATGTAGTAGTAGTAGCCTCAAATATGTAAACATCCCTAATTTTTTGTACATTATTCCATTTTTTAAATAAAATATTTTTA:1 + chr2L 18603552 5' + hopper 164 1 71.29 TTCTTCTCCATGCGTCTGGCAGATGCCACACTCCATCTGGGACCCTTCGTTTTCCACTTGTTGCAGCTCGCTCGAATGCAAGTTTTTATTTTTATTTTTAT:1 - chr3L 13255190 5' - mariner2 791 1 77.23 AAAATCCGCTTAAAATCCCTTGTTCAGCACACCTGATACCCCAACTACATAAACTTGGTGAGAGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3R 10751618 5' + hopper 12 2 65.35 AACGTGGCTTTTTGCCCAAAAACGCCCACCGCAGAACGCAAACGCAAATTTCTCAAAAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGG:1 - chr3L 5412869 5' + hopper 939 1 59.41 CTCACCTTAGTATTGCTTTTTCAAAAATTGTTGTAAAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr2R 17718220 5' - 412 7514 2 59.41 TAGTGTGGCCACTGTAAAACGAATTATTCAAAGTTCCAAATACTTGAAGAGATTAAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACATTGCTATTT:1 + chr2L 22749532 5' + Tc3 1601 1 60.40 CTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3R 19446161 5' + 297 37 2 70.41 CAGTACATCAACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 19377825 5' - roo 406 1 76.24 ATTACCACGTGAATGGAGCGTAATAAATGTAATTGTGGTAGTATTGCATGT:1 + chr2R 13524160 5' + invader1 3844 2 88.24 TAAGCCATCTGTCTATGTAATTGTGCAGGCATTATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATATACGA:1 + chr3R 25565612 5' + Cr1a 4391 1 65.62 TTTTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATC:1 - chrX 23283048 5' - HMS-Beagle 229 2 56.57 AGGACNGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr4 1149930 5' + 297 6605 2 61.39 TATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr2L 22098106 5' - roo 387 2 52.48 CAATCGATTGACTGTAGTTTACTGCCCCTTTTCAACGAAGAACCACCGAAAATTCTATTTGCAATTCATTGCATCACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTT:1 - chr3R 21082049 5' - Juan 114 1 72.28 TATGCAATGGAAAAGGAGCCGCATTTTAATGCTTAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTT:1 - chrX 14768062 5' + BS 5034 1 66.34 TGCACATGGTAGTGCATGCACATACATAAGTTTCGCCAATGTCCCGTCCACTGCCCCCATCCAACTGATAGCTCCTTTTTTTTGCCATTTTACAAATTAA:1 - chrX 22550223 5' - Bari2 243 1 60.00 AATGGCCAAGAAAAATGTCTTCTTTTTCATTTGCTGGCGGACATTTCGAAATCATATTTCCATAAAAATGATAAAACGTTTAAAAGATATTAAAATTTGT:1 - chr3R 17723184 5' + Transib-N1_DM 288 1 82.00 TGCAGACGACGCTTCTCTGCGTATCTTATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAGTGCCAATCTTA:1 - chr2R 4794675 5' - baggins 5175 1 71.29 AGGGGGTATCCGAAGGGAGGGGCAGTTCCAGAGATTCTCGTCGAACAAATGAAACTTGTCATTGAGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAA:1 + chr2R 19825713 5' + Doc3-element 4493 1 62.38 CAAAATTGCAAAAAAAAAAGGAAAAAAAA:1 - chr3R 20155081 5' + Doc2-element 250 2 86.21 CGTGGGTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 1365309 5' + jockey 25 1 58.42 ATAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:2 + chr3L 12633244 5' + jockey 29 1 54.46 TAACTATTTAGTTCTCACCTTAGTATTGCTTTTTCAAAAATTGTTGTAAAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 - chr2R 17718233 5' - 412 474 2 59.41 GGGCACAAACTAATGGAGAGCAACTGCTGTCAGAGGCTTTATATAACCGTAGACATTCGTATAATGCGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACAC:1 - chr3R 20773130 5' + invader2 163 2 70.30 ACTTTTATGGTATTAAAAAACACACACAAGAATTTGCTGGGCACATTTTTAGGCACCCCTTCTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chrX 13761221 5' - pogo 2090 1 68.32 CAATTTTTTGCCTTTTATATATCTCTTTGTCTGTGCTGCTACGATTTGCTTGTCATTTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr3L 15242805 5' - opus 7480 2 58.42 CATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chrX 20806928 5' + opus 7159 4 70.30 TTGAATGATTTCATTAAAACTATAATTCCGTCTGAGCCATAGTATTCATAGATGGTACTGGTACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 1281651 5' - roo 396 1 64.36 CATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:2 - chr2R 7887243 5' + jockey 64 1 75.25 GGTGATGAAAGACGCATATCAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATA:1 + chr2L 3084981 5' - copia 256 1 53.47 AGCGANTAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr2R 15032632 5' + hobo 29 1 56.44 TGACGNGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATCTATCAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGT:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 3 1 57.43 GTGCTACATACAGTGATCACTCGTATAGAAGGCAGGAAAAGTTGACAATTGGAGATTGGATATTTTGCCGATATTAATACTTTTTTCTAGTTATTGAAAAA:1 + chrX 4616906 5' - 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Circe 480 1 68.32 CAGTTGTAGACGCACTTTAGCAACTGGTGGACCAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 + chr2L 20134162 5' - flea 230 2 56.44 ATTAAACTGTTTATTTTAAGTAGCCGATAACTGGAGAGTGGTCTAAGTGTGCGGACACAGACACAAGGAATCAACAATCGTTGCCTTATTAATATTTCACA:1 - chr3R 27425848 5' - 1360 435 1 52.48 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCTATACATTGGTTTGGCCCTATGCAACCACTTTTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTATGAAATCTAAAAAT:1 - chr2R 1982173 5' - 1360 3279 1 85.15 CTGGCGGTCATGGATCCCTCACTCTTGCGGTCGTACATTTGCAACGTCTCAATTGCTTGATGAACATCAAGATCTGAGGTACTATAAAAGCTAGAAGGTTG:1 + chr2L 21581651 5' + INE-1 159 1 64.36 AGTGAAGGGATTTTTCTTTAAAATTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCACATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAG:1 - chr3R 10240146 5' - invader4 3037 2 79.21 AGCTCTTGCTATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chr3R 7415205 5' - I-element 5324 1 57.00 GATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 19552059 5' + roo 8690 2 52.48 TTAATTTTATTACCTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr3R 4601407 5' - opus 7494 2 72.28 AAAAATCCATTAGGCCCTGTTGATGAACCTGCCCCACCTCCGGAAGGCGCTGACGTCACCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTCTGGCC:1 - chrX 18002391 5' + gypsy6 7481 2 67.33 TTCTGAAGCTTATCAGGCAGGGTGATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGA:1 - chr2R 7775816 5' - Transpac 5214 2 60.40 GACCGTCTATTTTTATAACTCCATTTTGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 19444786 5' + roo 8711 2 73.27 GGGGGAAGAGGGCGAAAAACACTAATAAAAACAAAGAAAATCCAAAACAAAAAAACTCTGAGGAAGATTACAGGCGCTCCTTGGTATATGAGGACCAGAGA:1 - chrX 12743935 5' + jockey2 3001 1 53.47 TTCTGCCACCAAAGCGAGAGCGTTGACCGAGCGGTGGATCTGGTGCGCGCCTTCTTAGAGAAAAATGCAGCCAAACCATTGGGAGACCAAATAAACTTCCA:1 + chr3R 5556428 5' + G5A 2579 1 73.27 CATAAATTCAAGTAAATTATTTTCAAACCACCCGACAACCAATTGTCTTTTGGCATATTTTCAAGTTGAACGCTCGCCTCGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2R 11265950 5' + hopper 142 7 67.33 ATGTTAGTGAAGAACAAACGGCGGAAGCGTCGAGCAGCAAGAGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTC:1 + chr3R 1363037 5' + Doc 439 1 54.84 TACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr3L 2019712 5' - 412 7535 2 58.21 ATTGTGAAAAGCCATCGAACCGTGGGTGAGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAATTGCTGTAAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGAAA:1 + chr3R 16519016 5' - Porto1 450 1 71.29 AGAGGCACTTTTGCACTAATGATCAATTTATCGTCGATGAATAAACCCCTCGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 19449089 5' - roo 409 1 49.50 GTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:2 + chr2L 4160130 5' + Tirant 39 2 62.38 ATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 15305618 5' - roo 397 1 67.33 TAAAAGCGGCACTAAATTTGTTATATCCTTTTAGTAATATTCTTATGTAACAGGTAGAAGGAAGGAAGGATTCGCATTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAAC:1 + chrX 22545295 5' + INE-1 534 1 61.39 GGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGG:1 - chr2R 7552317 5' + springer 7161 2 57.43 CCATTTGTCTGCATAAAGCAAGCGGAGCTGGCCAGAGAATGGAGAAACGGCCAGTCAAGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGAC:1 - 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chr3R 13582276 5' - BS 5055 1 63.37 CAGATNTCCGTAATATATTGTTCCGTACTCTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAAACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 19377741 5' + roo 46 2 72.28 CATTTTTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr2L 21174244 5' + roo 47 2 77.23 ATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGA:1 - chr2R 12253336 5' + BS 4645 1 60.40 TTCCGNCTTTTCCCTTTCCGGCTGCCAAGTTGCCCCCTAAACCAGGCCAAACACTTAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACT:1 + chr3L 3571530 5' + G2 2936 1 58.42 CCTAGTACGTAGGTAGCCATTAGTTGTGCCTAGAGTTAAGTTGGTGACCTTTGGCGGTGGATGGAGGAGCCCTCATGGACTACAATGAAGGAAGGGAGTGC:1 - chr3L 19694929 5' + Rt1b 4931 1 60.40 ATTTCAATAGACTTTTCGACACTTGCTGGCATCTTTTGCCATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTG:1 - chr3R 25670894 5' - I-element 4909 1 60.40 CACACACAAAGGGTCTGGGGCACATCCAATCCTCCGGCGAACCTTTTTGTCTGCCACATTTAACTTTTCTTTTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATA:1 - 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mdg1 7131 2 65.35 TATGGGAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGT:1 + chrX 2799636 5' - Tirant 357 2 67.33 GTTCCATAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3R 13225467 5' + hobo 1 1 78.22 ATGCCCGATGGCGTCGTCAATATCTCTGGTACACATCCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGTGCCAA:1 + chrY 198017 5' - G5A 395 2 77.23 TTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATAAATTAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATACTGAACTCGTCTGATGTTTCTCTGGACATA:1 + chr2R 4774809 5' + Gypsy12A_LTR 1889 1 74.26 TTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCT:2 + chr3R 31194477 5' - Transpac 5186 2 71.29 CAAAACGGAAGTTTTGCGTCTTTTTAGCTACAAACACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 2753834 5' + roo 39 2 69.31 GGAAAAATCGTTGCCTAACCCCAGGCGTTGGCCTTAATGACTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 14408470 5' - hobo 2907 1 57.58 TGGTACTTGTACATACATATTACTATCGAACTGATGGCTAGATATGCCATCATATCATATGTTATCACAAACATAACCCACTAACACTACCTAAATACCAA:1 - chr2R 5854925 5' + I-element 4975 1 73.27 AATTCGTATTTTCATGGGGGTACTTCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 18571135 5' + hobo 49 1 81.19 CGTGTGATTTCCGCTCTGGACGCTGCTTTTTATCCTTTGTGAGGGCAATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGG:1 - chr3L 13049527 5' - 412 109 2 58.42 ATTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chrX 16995097 5' + jockey 29 1 56.00 GGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr2R 10543446 5' + P-element 59 1 20.79 GAACCCGCATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr2R 20744252 5' - roo 405 1 69.00 GTTGTGAGTGAAATATTTTCGTAGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 - chr3L 5489975 5' - jockey 4973 1 62.38 ACAACATTAAAAATATTTGGCTCCGAAAAAGGAGTATTAGTATCTAAGGAATTCGACTTTGCAAAGACACTAGAATTATTCTGGTGTCTTTGTTTTGGTCA:1 + chr2R 2508329 5' - 1360 498 1 37.62 CAAACNAATAACCGAACATGAGCCGCTGCCACGCCCACAACGGCTCAGTTCAATTGCGCTGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCGAATGCTCA:1 - chr3R 12300317 5' + invader2 153 2 63.37 GAGGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr2R 15474853 5' - roo 9031 1 64.36 CCATGTATGTTTGTTATTATTCAGGTTATATTTGGAATTCTTTACTTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGG:1 + chr3R 3916369 5' - I-element 4908 1 54.46 TGGGTACATTTGGCCGAGGCGGGCGTGGCAGGAAGTCGAAGTGGGATTCTCAACTTAAACACTACTCCAAACTGCGTCTAGAATTTTAAAATATTTGGGAT:1 - chrX 21490021 5' + springer 489 1 62.38 TGTCGGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATG:1 - chr2L 14612119 5' - roo 396 1 66.34 ATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chr3L 19951173 5' + Ivk 2 1 76.53 TTAGCCTGACAAATTCGATCTGGTTCCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATC:1 - chr3L 8155829 5' + F-element 339 1 74.26 TTACTACATCTTACTGTTGTAACAGCATTTCAGGTGACTTGTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATGATATTATGGG:1 + chr4 142088 5' + hopper 341 1 69.31 GTCAGGAGAATCTTACTTATATAGCAGATCACACTGCACGAGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTT:1 - chr2L 17443661 5' - G2 2773 1 65.35 CGTCAAATATTTATATTGCATTGCTATTCCCTAACGTATTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGTGCCGTTCTGTTGTACG:1 + chr3L 10007861 5' - Bica 387 2 60.40 AAGTTTTCGTATTTTTTCCAACTTTCTACCGATATTAAAAAAAATATTGAAATTTTTCGTTGACACTTCCAGCTCAGTACGGGTATCTGATATTCGGGTA:1 - chr2L 22924456 5' + INE-1 554 1 54.00 CGTTCTTACCAAACTCAATATTCAGATCCGTCAGTTGAGATGTATAGTCGCTCTTTGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGATCGATCACCGATTTGCGGTGAG:1 + chr3R 25330321 5' - Doc 305 1 53.47 GAGCTGATTATTGGTGGAACAGCCTGAAAGTAGGCTACAAAACTCTTGTCTTCAGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAAC:1 + chr2R 14351825 5' + Max-element 8238 2 74.26 ACGGANAGACGGACATGGCTAGATTATTATCAATTGTTTATTGATCCTTATCAATAATATATACACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTT:1 - chr3R 8005046 5' - INE-1 34 1 75.00 TTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chrX 992041 5' + hobo 53 1 79.21 GAAAANTTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGAT:1 - chr2L 3440523 5' + Juan 12 1 70.30 ATTCCTCGCATCGCAAAATAGGCACATTAGTTGACCATTGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3L 24760987 5' + 1360 37 1 80.20 AGCACCTGCTTAGTAAAAAGAAAGCCTCAAAGCCTTATGCTTGAAAAGCCCCAAGCAGAAGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTC:1 - chr2R 11451380 5' + I-element 467 1 61.39 ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAA:1 - chrX 17501198 5' + Doc3-element 145 1 75.25 TAAATACTATAAGTTTGCGGTTTTCTGCAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGCCATAAAGTCTAAATTTT:1 - chrX 22711660 5' + transib2 25 1 61.54 CATTCGATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3R 8555828 5' - 412 7534 2 66.34 TTGGGGTCTAAAACTCCTTTTCATTTCGCTTAACTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr2L 14579816 5' + copia 4888 2 60.40 CTAGAATTCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTA:2 + chrX 15293417 5' + Quasimodo 18 2 64.36 TGTTCAGCACACCTGATACCCCAACTACATAAACTTGGTGAGAGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 + chr3R 10751638 5' + hopper 32 1 54.46 CCCAGCATTATTCAAAGTGACAGGCTTCCTTTCTCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 9131818 5' + roo 8705 2 68.32 GTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr3R 19446169 5' + 297 6629 2 79.21 CGACGATCCTCCATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2R 14675629 5' + roo 8680 2 63.37 CAGATATCAGATATCAGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCATGCGAACGCGAAATTGCATCATTTTCCTGGGATATTGATCCTGACCAAGAATA:1 + chr2L 8346987 5' - INE-1 85 1 61.05 ATTTCGCTGTTTATTTTCGGAGTCAGAGACTCAATATGCTGCTGATTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATG:1 + chr2R 24479678 5' - I-element 309 1 54.46 ACATTTCTCAAACAAAATGCTTGCATAACTATATTATGTGTAGACAATGGGAAGAAAGAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 + chr2L 10473430 5' + flea 15 2 62.38 GTCAACTTATATAGCTTTTGTATACTAGCATTACATTTTACAGAAAAGATGTACAACAACACTCAAAATCCTTATGAGCCGATATCAAAAGTGGGATCTGT:1 + chr2R 5499571 5' + micropia 472 1 71.29 GGATTCGCATTTGGATTCATAGTTGCATAGTCTGGTTCTTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGG:1 + chr3L 20562114 5' - jockey 4677 1 61.39 ATATTCACAGTTATTGGTTAATGTGCTGTGCAGCAATGTGCGACGGTTCCAGTAGTTAGTTGTTGGGCACAGGTGTTTTTTTTTTTATTATTATATACGAC:1 - chr3R 22480405 5' - Rt1a 5066 1 68.32 GAAAANAATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr3L 13060384 5' + 412 7091 2 65.35 TGGTATGCAATAAAAAGCGAGAATCAAGAAAAGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chr2L 19684055 5' + jockey 4672 1 73.27 GGCAGACAAAAAGTCAGCCACCCTCGCACATCCAGGAACATCCTGTGACCTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAA:1 - chr3R 14348447 5' + G6 2001 2 63.16 TATCGAGTAGCAAAAACACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 8345573 5' + roo 8694 2 55.45 TGTATTGGTGACTTAAGTGCACTAGTTACGGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTT:1 + chr3L 5436644 5' + hobo 2655 1 70.30 TGATTCGCGAATTGTCACCTTTATGGCATTTTTACTGTTTTGACTGGAAGTGAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAA:1 - chrX 6373677 5' + X-element 37 1 48.51 GCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 15072649 5' - pogo 2072 1 58.00 ATCCCGTTTTCCCCCTTTTTGCGCATGGCCCGCTCAGGTACAAGGTCCACATATTGTACCGTTAATTCACGATGCGTCCTCTTTGT:1 + chr3R 14499106 5' - gypsy8 248 2 80.23 GTTAAGGATAATGGGTCGGGGGTTCGCCGGAGGACATCCGCACTGAATAAACAAACCATGACAACGGCATATTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGC:1 + chrX 7469559 5' - R1A1-element 5284 1 72.00 ATGCCGAACTGTTTGCCGTTGCTGAAGTCCCTCTTCTTGCGCTCTTCCTC:1 + chr2R 8630685 5' + opus 10 2 92.00 GCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:2 - chrX 3763228 5' + 297 37 2 70.30 ATACACATGCACTGGCTGAAGTGTCCTTCGAACTTCGCACACACACTCACACACACATATACACACACA:1 - chrX 6212047 5' + accord 7038 2 72.46 CAAAACGGTGCACATTAGTGGATGTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGAC:1 - chr2L 3388163 5' + F-element 287 1 72.28 TATCCAGCGAAGGTAGGTTGTCACTCCAAAAGAAAAGAAACCAAACCAAACAAAAACAAAGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAA:1 - chr3R 30783156 5' + TAHRE 145 1 62.38 TGTGTGTAAGTGTGCATTTGTTTTAAAGAAAATGGTTGAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3L 10829419 5' - hobo 2902 1 64.36 ATGTGAGCCCCTACTACCGATATGCGACCTCCATCTGTTCTCCAAGCACCCGGCGCCCCTGGAATGCTCTTTTTCTAGCTAAGATCTTGACGTTCATACGG:1 - chr3L 22906955 5' - INE-1 135 1 72.28 CGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr2R 23580828 5' - P-element 2861 1 50.50 AAAGATAACGCATATTAACCCAAATTCATTTTACATTTGCTGGGCCTAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTA:1 + chr3R 25602765 5' - Stalker4 6982 4 53.47 TACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAAGATTAAGAAATTCTTATGTTGAAATTA:1 + chr2R 545174 5' + Bari1 1420 1 73.27 TTTATATTGAAATACAGCGATGTGCGTATTGTGTAAATAGGGTATTAATAGTATAATCTCTCCTCGGTACATTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAAT:1 + chrX 19676077 5' + G5A 2747 1 55.45 CTCTTNCTCTTTGTCACCTCCTTGTGAACTCTCCACTTTCATAGCTGCACGCTCTCTCCGGAATAGCCCGTAACATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chrX 7681143 5' + P-element 1 2 69.47 TCTGAAAGTTTAACACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 + chr3R 25671918 5' - I-element 5329 1 52.48 TTAAGGGATCTTTTCTGGCGTTGGTAATACTTGAGACACCCTTTATCCTTTATCGGGACTTTGGCCATAATATCGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAG:1 - chr2L 20641358 5' - Ivk 5207 1 77.23 TAAGTGCAAAATACAACCATGCCGTGGTTCCCAGACTGCTGGAAGGAACAATGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGACGCGACATAAAACAGAGAACA:1 + chr4 762513 5' - Cr1a 4354 1 57.00 ACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 10147878 5' - roo 9021 2 76.24 ATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chr2R 6173081 5' - pogo 2078 1 59.41 ACATTTTACGAATTGAGAAACTAAACGTAACAACGTAACAAATAGGATTTAAAACAAACTCATAATACTCATAAAGTTTTTCCTAAAAAAAAGTAAATTAT:1 - chr3L 12118138 5' + I-element 5160 1 59.41 CCCATTACCATTAACGTGCCCATTAGACGATATATAACTTTAATTGGATTATAATTGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTC:1 + chr2R 23027847 5' + 297 486 1 62.38 AAAAAAAGGAAGAATAAAAAAAAATTTGCACTGTCTACAGTATTGTAACTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCCCTG:1 - chr2R 19542985 5' + Circe 151 2 67.35 TTTTTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAG:1 - chrX 13786105 5' - INE-1 543 1 73.81 TTTTCCTTTTGACCACAGAGTTCATTGGCACGCGCTCTTATTTTTCCTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 16761252 5' + roo 8693 2 55.45 AAACCCACTTACGCGATACTAGACTTGGAACGCAGATTCTTGGGCGACACGCGGTTCGTAAGTGAGTGCTCCTGGAACGGA:1 - chr2R 12147493 5' + Q-element 727 1 74.07 ATCTACCAACTATTTGCTTTGGTCTTTTTGGATTTGCGGTATTTATACGCGCTTAGTTACAAGTGTTAATTTAGGAATTACATTTACGAGTGACATTTTTG:1 - chr2L 16444013 5' - TART-C 10933 1 76.24 GGATGTATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 + chr3R 9131738 5' - roo 397 1 67.33 CATACATTGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3R 13376049 5' - 1360 3372 1 63.00 TTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGC:3 - chr3L 23678159 5' + Osvaldo 14 2 68.32 CAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 13659899 5' + pogo 41 1 68.32 CCTCCTTAACCATCTACCTTATGCCATCCTGCTCTCGGGCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAA:1 - chrX 607309 5' - Tabor 96 2 61.39 AGAGAGAGCGAAAATCGATCAGTGTAAGGCCGAAAAGACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2R 11528101 5' + P-element 5 2 76.24 ATTTGTAGTATCTTTTTGTGATTTTCTGGACATCAGCTACAACAGCTAATCCATATCCAAAAGTACATACACACACTCACATATACACAC:1 - chr2R 18941897 5' + accord 7035 2 56.67 GGCTTNTTTGCCTTTTCTTGCCATTTAACATCAAGTTTCGGCGCCTAAATTGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGAAGACTACTTTTAATT:1 - chrX 18602572 5' + Cr1a 3976 1 63.37 CAGGCATTTTGCACACTGAACACTACACCATGGTGGTTACATTTAGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 14568942 5' - Rt1a 5087 5 80.60 ACAGTTAAATATTTTTGCACACATACATATATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGTGTGGACGTGTGGTTAAAAACGA:1 - chr2R 5417725 5' + Dm88 426 1 68.42 ACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 19551989 5' - roo 9036 1 61.00 GGTGTTCTAAAAATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr2R 14341851 5' - opus 469 2 61.39 GAGACATAATTGGACAGCATGGAACGTGAGCACAGCAGAGACGCATTGGATGGCAGGCAGTATGTAGGGTAAAGCCATAGACCCTGAAGTTGGACCGGGAG:1 - chr2L 5754130 5' - G5A 138 1 58.42 GGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:2 - chr2R 20744225 5' - roo 9040 1 58.42 GGCAGCGGGCAGGTAGGTGGCCCGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGA:1 + chr3R 12047395 5' - Stalker2 389 2 62.38 TACAACTAAAATTTAGTAAGCAATACATATATTTTTCTGGGGAAAAAAGAAATCGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAA:1 - chr2L 177592 5' + micropia 5036 2 58.42 GGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr2L 17722760 5' + blood 7033 2 54.46 CCCGGNTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGA:1 - chr3L 23839718 5' + McClintock 20 2 57.43 ATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chr2R 23584745 5' - HMS-Beagle 209 2 58.42 CTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATAT:1 + chr4 829449 5' - INE-1 78 1 80.00 TAAACGCAGCGCAAAGTTGTTCAGGAAGGTTGATATGCCCACTACGCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCG:1 + chr2R 5490038 5' - Tc1-2 468 1 62.38 TAGTTTTCCTTAATTACCCACTCTAGGCCACTGATTATATGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chr3R 15126553 5' + FB 38 1 62.38 AACGTAGCAGATAGTACGGGAAAAAAATAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAA:1 + chr3R 9552518 5' + P-element 439 1 36.63 CTTGGTTTTCAGTTTTCCTTTAGTACCTCAGACAACAAATTTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTTTCGAAATTTCCAACTTATAACTATT:1 - chrX 817956 5' - invader2 4797 1 60.40 AATCCTCGATCTATAAACCAAATAAATAGCTTACGCGTGATTTGTTACTCAAATCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATT:1 - chr2L 1671058 5' + 1360 273 1 58.42 AGATTATGTCTCATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 - chr3R 26321694 5' + blood 23 2 56.44 GAAGGNCGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 10147892 5' - roo 9036 1 60.40 GACAATGAACTTATATATTCACACATTCATATGTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTAAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCT:1 - chr2L 21676471 5' - HB 1372 1 67.33 AATAGTGAATAGAATTCCTGACGTTCTATCAAAGTACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATT:1 - chrX 1184003 5' + Ivk 5343 1 65.35 ACATACCTCCGCCTCAATTTTACACAACAAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chrX 3763263 5' + 297 6583 2 76.24 TATTATACTGTATCTGTTGTTTTCTTTTTAAATCAAATGTTTTTTTATTTTCTTCCTGTATATCCCTAATGTATGCTCTTTCATAATACAATTTACAAAAT:1 - chr3R 1061393 5' - transib3 44 1 71.29 TTAAGTATTTGTTTTAGTTCAAAGATGCAGGCAGGAATACCAAATCAACCAGATGCATGCAGGAATACCAAATCAATGACTTAAAATATTTGATAATTAAA:1 + chr3R 28025770 5' - Cr1a 89 1 63.37 ATTCAACATGTCTTGTCATCTTCTTTTTATTGATTAACTTAGATTTGTAATTGATTAAATTTATTGTATAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTT:1 - chr2L 2074791 5' - roo 9060 1 57.73 ACCCTGCAGATGTGGTACAGGAAGTAGAGAATATTCTTGTAACGAGTTCAGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTAAAAGTAAAGTAAAGTAAAGT:1 + chr3R 29516457 5' + TART-A 13150 1 77.23 CAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr2L 3085000 5' - copia 237 1 72.28 TTTAAATATTGACGTTTTATATAACAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 21174249 5' + roo 8716 2 82.18 TCATTAGCAAGCACAGTAGGCAGCCATTTTTCTAGACGTCGCGCAGGCATTTGACGGAGTGTGGCTGGGTAGAATTTTGTTTTAAGTAAACA:1 + chrX 4268629 5' + Tc1-2 1563 1 69.57 CGACCNTATCTAAATTATTTCGTTATTTAAATACACAACACAATAAAAACGCAGCACGAAAATTATGAGCAGTTTTCGAAAAATTCCGAGAAGGAAATAAT:1 + chr3R 14064511 5' - copia 402 1 78.22 TGAAGCTTATCAGGCAGGGTGATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr2R 7775813 5' - Transpac 292 2 57.43 GCCCACCTTGATATTTGTACATACATATGTTGGCATGTGTGCACACCAGTGGCACTTAATCAACGCCCACGCACGTATGCACACACACACACACACACA:1 + chr3L 10552306 5' + accord 7028 2 75.76 CATTAATTTTGCCATTGTTTCTGAAAGATTATTGCAAATTCATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3R 23591418 5' + pogo 33 1 63.37 TACTTCATAAATATGCCAACGTTTGAGACAGTTCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCACACAATTT:1 - chr2R 3468848 5' + 1360 36 1 74.47 TCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTA:1 - chr3R 19530707 5' + BS 31 1 58.42 CTCTCNCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGTTTGTGTCGTTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGC:1 + chrX 12649915 5' - F-element 224 1 67.33 ATGCATATAGATATCCACTGTGCAAGGACACCTGCCGGCGTTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAGCTGTGTCATCTGGGGGAACATG:1 - chr3R 29332244 5' - G6 1554 1 56.70 TGTTANATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr3R 14917190 5' + HMS-Beagle 34 2 62.38 TGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2L 21010872 5' + opus 7047 4 78.22 TGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTT:2 + chr3R 9131766 5' - roo 9032 1 65.35 TCAGTTTCTTTATTAATTAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATC:1 - chr3R 11094578 5' + 3S18 5792 2 50.50 CCCTAGTGAAGTCAAGGTTGAGTCAACTCGCAGATATTTTGTTAAACAAACATTTTTGGTGATTTGGGGGTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTG:1 + chr3R 14516902 5' - Porto1 4301 1 72.28 CTGACATGTCAAGGTTTTGCTGCGCTCGCACTGCCCACACGGATATGTTTAATAATAGACTTGGCTCTGGAGATCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAGCGGT:1 - chr3R 9953951 5' - Stalker3T 299 1 58.42 GCTCTTAGAGACCTATAAATATGTTTTAGAGACGTTAAAATAAGGAATGTCCTTGATTAATGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCAACTATAGCATTCTCT:1 + chr2L 21780188 5' + INE-1 574 1 51.49 TATGGAGCCGGAATTTTACGAAGCCACGTGTATCTCGATTCTTAGAGCTAACAAAGACTCGCAGCTGCCACGCAAATATTCTGTGTTTGCCGGCTGCGCAC:1 + chr2L 18586590 5' - Gypsy6A_LTR 89 1 64.36 CGTATACGTAATGTGCGTATACGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chrX 8972398 5' + 1360 39 1 74.16 TCCTTTTAATTAATGATGGCCTAAATGATGAAGGACGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr2R 16980546 5' + copia 42 2 66.34 TTATTGGTTTTTCATTTATTTTTCGTTTTATTGCTGTTGTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCA:1 - chr3R 8129132 5' - Doc3-element 4509 1 64.36 GACAATAGAGGATATGCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr2L 15808057 5' + I-element 14 1 60.40 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGCGAGCG:1 - chr3L 6630130 5' + 1360 3294 1 74.26 TAATTGTCATTGTTGGTTGCTGCCTTGTGATTTGACAAAATCTCTAGCAAATTAATGCAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGA:1 + chr3L 17285982 5' - 17.6 7391 2 61.39 CTTGCGTTAATTTGATTAAGCTTTGTTTCAATTTTGTGTCCTTTTAATTAATGATGGCCTAAATGATGAAGGACGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2R 16980584 5' + copia 4873 2 75.25 ACTTTTTTTCTATGTCCATTAGAAATAATTTATTATTTATTTTAAAACAACAATAATTTACATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr3L 25968867 5' - HMS-Beagle 232 2 65.35 CAACACCCCTTTGAAGAGTATTAAACTTAATTTTAGCACGAAGCCTAAGAAACTCGTACATCAACAGCACAATTACGAGCAAAAAAAGAAAAAAAGAAACA:1 - chr3R 30289058 5' + gypsy7 5008 1 77.23 GATCATTACGGACGAGTCTGATCAGAGCGACGCCGAGTTCCGTACCTGGCATAACATCTTCTTCTTCGTGGATGCTGTCCTTTTTTTGGGGTATTATGCGG:1 - chrX 9229814 5' - Fw3 61 1 74.26 ACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 - chr3R 11094559 5' + 3S18 46 2 67.33 ATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGT:1 - chr3R 29331905 5' + G6 44 1 66.34 GGTCCGTCGACTGATCGGCGATTTTCCGAATTTTTTCGACTATCGCAGCCATGAGTTGTTGTCGTGTTTTGGGGCCCCTTTTTCCAACCTTCTTCTTTAAG:1 + chr2L 15745560 5' - S-element 1267 1 66.34 AACGAATAATTATAGTAGGAAAAGTATTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATT:1 - chr2L 3889161 5' + jockey 4863 1 74.26 AATACCCTTTGTTCCATCTATGGGTGTTCTAAAAATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chr2R 14341873 5' - opus 7494 2 70.30 ACTGATTGGTAACGAATTCAGCGAAAATTGCACATATTCGGGCTAGCTGCTCTTGAGTGGATTGCCCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGG:1 - chr3R 19742628 5' - Quasimodo 7112 2 51.49 ATTTAACAATTTTTTTTTTGAAATGGGTATCTTAATGTTAAACATGAGGGTTGTGTATAACAGTTTAGGGATAATGTTTAGTTTACTGG:1 - chr3R 24797826 5' + accord2 493 1 60.67 GAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:3 - chr3R 12047461 5' + Stalker2 53 2 75.25 ATACATTTCCCCCATTGATGGCAGTGGTAAAATAATAAAAGTTGAGCTACTTTGTTATGTACTGTATTATTATTGTAAACTAGAAAAAGCTAACTATAGTT:1 - chr3R 6279373 5' + X-element 4618 1 52.48 AATGGCAGCCACAAAATATTTGCGCTAATTGAGATAAAATACAATTTAATGGGGGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 + chr2R 20816419 5' - hobo 2919 1 57.43 ATGCCATTTAAATATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCAT:1 + chr2R 13644402 5' - Burdock 250 2 74.26 TTTGGGCAAGTCGGACAGGAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCACTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCAT:1 + chr3R 6737069 5' - copia 4935 2 79.00 ACATTNTAAATTCTCCAGCTCGAGCATCTCGTTTTATTTATTTTTTTGTTTTTTTTTTTACTGGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTCACTTT:1 + chr3L 10400247 5' - gypsy4 459 1 63.37 AATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 2019672 5' + 412 48 2 73.27 CATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 + chr3L 19951218 5' + Ivk 2 1 56.60 TTATGACGCTAATTCTCAATGAGACATTTTGTTAATTAAGAGTTATCCAAACGAAACTTTTTTTTTTAAACGTATTATTTTTTATTTTATTAAATTTATTT:1 + chr3R 19891798 5' - X-element 4719 1 67.33 ACCCCCTTTTTTGCCACTTGCATACAATATGTGCATACTCATTAGTTTGGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGC:1 - chr3L 17109995 5' + Quasimodo 300 2 53.47 CAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTTTT:1 - chr2R 5531179 5' + 1360 82 1 56.44 TAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2L 14790641 5' - roo 9033 1 63.00 ATGCCACGCAGTGTAGCAACGATAGGTGAGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGG:1 - chr2R 20352510 5' - hobo 2711 1 63.64 AAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGTTAATGACAATTATGGTTTTTCTTATCCCTTGTTTTCCTTAATAAA:1 - chr3L 18337694 5' + Juan 4044 1 46.67 GAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACA:1 - chr3R 20683401 5' + 1360 177 1 63.37 CTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 9870954 5' - roo 405 1 75.25 CAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAGC:1 - chr2R 5924402 5' - jockey 4721 1 48.51 GTTTTACCCTCGTAACCACGTAAAGTTAAAATTTACCATTTTAGCTTTTGATTAAGAACCTGCGACTTATGACTGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chrX 11730358 5' + jockey 4762 1 77.23 ATAGTGACGAGCTCAACATTCCACTATCCCATACATACATATGTACATCCATTTACATACATATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 + chr3R 24081519 5' - 297 384 2 71.29 TTGTGTAGTGTAGTAGTAGACTTCATTCGCTAAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTA:1 + chr2R 5403511 5' - 1360 2964 1 72.73 GTTAGCATGACAATTCCAGTTTATATAGCTTTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATG:1 + chrX 262095 5' - accord 200 2 67.71 TAAACAAAAGAAAAGTTAAATAAAAATAATAAAACAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGT:1 - chrX 5343780 5' + TAHRE 85 1 66.67 AAAGGCACCCCTTCTATGGGCCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3R 11688457 5' + 1360 54 1 76.24 ATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 + chr2R 3591996 5' + Quasimodo 43 2 78.22 TGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 4834259 5' - mdg1 385 2 63.37 CCACTTAGCCATTCCTCATTTCACAGTCACTGCCAGCGATGCATGGTGAAAAATCAGTGGTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr2L 2060209 5' - 412 7528 2 60.40 TATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTG:3 - chr3L 23839697 5' + McClintock 5993 2 71.29 ATCACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chr3R 4601313 5' + opus 33 4 64.36 CGGACNTCTGGAGGGTGTGATCCGTCGGGATTCGCCCAAATTTGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACC:1 - chr3R 23141144 5' + I-element 4952 1 66.34 CACCTCCAATATCTCCGATTCGTAGAGCAAACAGTAACCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCGAAAAGCTCAGTTTATTATATAA:1 + chr3L 16142886 5' + Ivk 5269 1 68.32 CCTGTGCGAAAGTATCATTATAGTCATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 - chr3L 8363037 5' + 3S18 53 2 76.24 TGGTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACT:1 - chr2L 21403563 5' + G5 4392 1 63.37 TGTTCTGCTAGTTGCGAAGTGGCCAATTAGGTTCTGTTTACGGCAAAGAAAGCACAGGGAGAGGAGCTGGAAGAGAAGCCAAGCACTAGCGCAGCTCTGCG:1 - chr3R 26483334 5' + G6 497 1 60.40 AATAGGAACCATAAATTCCACCCATAAAAGTACATAAAAATGAGAATTATAGCTGAATTGAGCTCAAAGTAAAAAGAAAAAGGTTATTCGAGTGATTCTGT:1 - chr2R 1343434 5' + rooA 476 1 61.39 TAAAAGGCATTTTTATTTCAGCTACTTAGTTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 15305730 5' + roo 8673 2 70.30 GGTCGGGAATGTAGTAGCCAGTATCCAGTATTCAGTTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr2R 24287741 5' - mdg1 386 2 63.64 ATGCAGAAACGAGGATGAAGGAAAAAAGGAGCGGGGGGGATGTGACTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 17843714 5' + roo 8683 2 56.38 GATTTGTCGTTTGGGATGTTGCTTTTTGAGTTGCTGACTTTAATTGTCTTTGCATTTCTCTTGAATTCAAGTGCATTCGCTTTTGGATACAAGTGCTCTTA:1 - chr2L 22149739 5' - Idefix 323 2 77.23 GTTACCCCGGTTATCTATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTAC:2 - chr2R 5019452 5' - rooA 361 2 58.42 AGCCANAGGTTTTAAGAAACTTTAAATGCCTGCCTCTTGTTTTTTTTTCTGTATTTGTTTATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTTACTC:1 + chr2R 14808200 5' - Stalker 58 4 61.39 TTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAG:1 - chrX 23108332 5' + BS3 1415 1 60.00 AGTATGAATATTTGCATAAAACCAACCAACTTATTACTATACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGC:1 - chr2L 3069089 5' + Doc 4526 1 60.40 TCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 20806877 5' - opus 458 2 75.25 CGCTCGATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 19989247 5' - hobo 2917 1 56.44 TTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chrX 23155232 5' + blood 50 2 71.29 TAAATGGGAAAATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTT:1 - chrX 19426300 5' - mdg3 214 2 56.44 GATTTTTTCTATTAATTGCCCTATCATTGCCAGAATTTTATTATTATTATTATTAATTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTTCTA:1 + chr3R 637421 5' - baggins 5398 1 74.26 GCTACTGCCGCTGGATCTGTGGATCTGTTTCTGGTGATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr3R 23275228 5' - roo 406 1 76.24 TTGATGTCGTTGATGAGGCCTCCGAAAAGCCTTCCCGTCCTGGACAGTCCGTTCTCCTCGCGAAGACGCGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGCC:1 + chr2L 7230233 5' + Cr1a 4427 1 70.30 AACACTCCGGTCTTTTCATTATTCCTGTCTGTCTGCCCGAATGTCTATGCGTCCATATGAACGCCGAGATCTCAAAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2L 21347467 5' + INE-1 162 1 75.25 GGTGTTGCGTCCGCGACTAGATAATCTCTTCGCCTTGATCTTGGGCTTGGGACTTCGCTTCAGTGCGGAGTGTGCGCTTTTCAACTTATCTACCATACAA:1 - chrX 11455976 5' - Chouto 5891 1 76.00 ATGGTGGTGGACGAGGTGCTGCGCATGTATCCGGTGCTGCCGTTCCTGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTG:1 + chr2R 12187598 5' + accord 136 2 51.49 TCGAGGGCTTTAATGGCCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chrX 18836957 5' + P-element 33 1 50.00 CACTTAAAAGGATTTCCCGCCCATCCAAAAATAAAACTCAAGATACGAAGCTTCATGCATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAA:1 - chrX 15292567 5' - Quasimodo 7357 2 70.30 ATAAAAGGCCTCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chr2L 6388268 5' - copia 250 1 60.40 TGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3R 12539504 5' - roo 9029 1 68.32 GGTGGTGTTGCCGGAGGGTTGAAATGTGTGACTTGATAACAGGGGCGTTGCCAGATGAATAGCGGAACGTTGGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGC:1 + chr3L 20526175 5' - HMS-Beagle 6694 1 79.21 TTAGTTTCCATTCAGTTGTTGTAGGCTCCATAGGCTCACCACCCAGGAAAGAAGTATCCAGATTATCCCATATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGA:1 + chr2R 12188663 5' - accord 297 2 73.27 CGAAAGCCAAGGAGGAGTCACCACCCACCACCCACTCCACCTACACCTATACACCCATACACCCATACACACACACACACACACACACACACATACT:1 - chr3R 14002708 5' + accord 7030 2 64.95 AAGACACTAGAATTCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 + chrX 15293411 5' + Quasimodo 12 2 70.30 TCAAACTCGGCATTCAACTCAATTAAAATAGCCACTCCGATGGAACCGTAGACCAATGCTTAGAATAGTTTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGCGATGTTG:1 + chr2R 4716245 5' + Cr1a 4052 1 57.43 ATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr4 1149934 5' + 297 20 2 59.41 TCTTTGCATGATAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 - chrX 15392031 5' + 1360 22 1 49.50 TATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGC:1 + chr2R 13644414 5' - Burdock 6374 2 62.38 TGCGCCGTCCTTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTTCCCTTTTGCGGACGTCCTGCTGGGTTACGAGGTCCAGTTAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTG:1 - chr3L 24300072 5' - gypsy8 4900 2 53.47 ATCTATGTGGGTCTGCAGAACTAGACCGAGTCAATAATAATTCAAGATTCTTCGTAAGACCTGCTTCCTCCGTTTTTACCAAAGACACTAGAATATTAGAA:1 - chr2L 16834560 5' - Tc3 310 1 66.34 ATATATTTAGTATAAATGCAGTTAATTTTGTTTCGAATTCAACAAGCCTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGTTACTGTCTAAAAGCCAAGATTAC:1 - chr2L 14612879 5' + HeT-A 5876 1 60.40 AGCAGCAGCAACAACGACGACATCAGCTAAGTCAAAACAAGAATTTTCTGTTTATACAAACACACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr3R 16714390 5' - 297 383 2 68.32 ATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATAT:1 - chrX 23182895 5' + Idefix 44 2 73.27 TGCTCCTTTTGCTGACCCGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTT:1 + chr3R 6621687 5' - P-element 357 1 25.74 AGATTCCACTCACTACCGTAAGCCTTGAACTTATCATTATCGCTCGCAAAACCGCATTGAAGGTAAACAAACTCTGAACTTAATGTGTAGCTTAAAAGATA:1 + chr3R 21008720 5' - G5A 2775 1 56.44 TGTGGGGGAGTGAAAATACACTGAGGAAAATGTAAAGGAAACTTGAATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGA:1 - chr2L 4158822 5' - Tirant 310 2 54.46 TTCGATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 8555830 5' - 412 7532 2 64.36 CGCAGACAAGGCGAACTTCTAATTGAATAGCGAGTCGATCTAGCCCTGTCTGTTTGTCCGTATGAACGTCGAGATATGAGGAACTATAAATGCTAGAAGGT:1 - chr3L 6300046 5' + INE-1 157 1 72.28 TATTATGTGGGTTAAAAGCCAGCCCCCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3R 20477022 5' + 412 14 2 65.35 ATTGTTTTGTGTTATATTTTTTTGGAAGTTTTGAAGGCAATGAACAGCAGTTCCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAG:1 + chr3R 1221623 5' - F-element 481 1 54.46 GAGTAGAGGTCCATCCCGGTTCTGGATTCTTGTTTATCCTCCAGCTAGCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCA:1 + chrX 17535858 5' - F-element 76 1 57.43 AAGTAGCACAATAATAAGTTCAGTATGTCTTATAAAATTTATAAGAGTTAAATTTGTTAGATCCACTTGAGATTTTAATATGATTTTATTTTGT:1 + chr3R 22175857 5' + transib1 1890 1 85.11 ATATAGATCATACTAGATCATTTCTTTCTTTGTTATAAATTGAAAATAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr2R 17261655 5' - pogo 2074 1 59.41 GACTGCAGAATAACCTTTGGAGCTTAATTTAACCAACGAATTTAAAAAATTTTTATTTTCTCCGCGACTTAGACTTTGTCTGTCATACGCGTTATTCGCTG:1 - chr3L 6572535 5' - HMS-Beagle2 350 1 76.24 GAAAGTTATCCAAACCGTAAATATAGCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAATTTCAAACTTCAATCTCAGCAGCACCTTTGTAGATCAATCATATCACCGT:1 + chr2R 1844736 5' + Q-element 184 2 73.27 AACTCTGAGGGTATATGTCCATCAGTAGCTGCCATTGATCAAACCGCAAAAAACGCACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACA:1 + chr2L 7286405 5' + hopper 955 1 60.00 GAATTGCAGAGACACTCGTCCACTTAACATAATTCAAAGGAGCGCCTTTTGGATGGCGCCAATTGTCTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGG:1 - chr2L 13321890 5' - hobo 277 1 68.32 GGAATATGACAGCACGTGTGTTTTGATTACCGATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:2 + chr3R 20556097 5' + Tirant 8111 2 77.23 CGTATCCATCAGATAATCCCTGAAAAAGAATGAACTAGATGAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCC:1 - chrX 6306380 5' + Idefix 210 2 67.33 AGTTTTCTCCAGTTTTGTGTTTCATACATTTTGAGCATTGCTTTTGTGCCATCTTTATGTTTAATGTGTATCGCAGCTATTTTTCTTACTAGAAGGTAATG:1 + chr2L 6570656 5' - Q-element 346 2 81.19 GATGAAAGACGCATATCAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 + chr2L 3084984 5' - copia 253 1 56.44 TTACATCTCGCGGAGACCGAGCAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAG:1 + chr2L 23300003 5' + invader4 370 1 79.21 TTTTTGGCTATACCCATTATATTACGAAGTTGATCTCCCATCGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGC:1 - chr3L 24291073 5' - 1360 119 1 55.79 GTGTATCTTTTATTCACACTCAAAGTGAAATGCATTTGGAGATTAGTTGCAGAAAATATTTGCAAT:1 - chrX 2836893 5' + looper1 158 1 53.03 TTTGAACCAGAAGTGCATGTGGCGGGCAACTCAAAAATAAATACATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGT:1 + chr3L 13060323 5' - 412 7536 2 57.14 TTTCATTCACATTTAAATTGTGTTTGCGGTAGTTAATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 + chr2L 13333992 5' - flea 252 2 68.32 GACTTGAGTTGCCTAGTAATGTAGCAACTAAAGAAATAGCTCCATTTCCTCGTTATCCACCTGAGTCATGGGTAATAATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGC:1 + chr2L 13485179 5' + INE-1 567 1 79.21 CGGGGTAAGACACTAGAATTCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:2 + chrX 15293405 5' + Quasimodo 6 2 76.24 AAAAGAACTGGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:2 + chrX 19986349 5' + Stalker2 25 2 54.46 GTGGAGTGTATTGTATTTCATTCGAAAGCTGGGAAGAAAGGTTTCTTGACCCCGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTT:1 + chr3R 1328855 5' - Quasimodo 378 2 57.43 TAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGA:1 - chr2L 7488932 5' - roo 9046 1 56.44 TCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAG:1 - chr2L 3440499 5' + Juan 36 1 51.49 CACGCATGTCTCCTGTTTTCGGGTATATTTTTTTATTAATTTGTTATAATTTTTTTAGTTTAATTTTTTTTCTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTA:1 - chr2L 2062687 5' + Tc1-2 1415 1 80.20 GAAGGCGGGTGGAAAATGGGGGAGAAAACTGGCCATGGTGGGTAGGTCACAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAATGGTTTGG:1 - chrX 19131178 5' - 1360 3362 1 73.00 AAAAAAAATTGATTAATAAAAGGAACTCCTTTTTGTGTATTTTAATCAGGAAAACGGGCGTATTTTTGCACCAGTACTAAATTTAAATATACAAAAATAC:1 + chr2L 1332708 5' + Stalker 89 4 66.00 ATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3R 19346946 5' + blood 7060 2 74.26 ATGTACGTGACCTATTCATCTGTATATTATCTGTATATTATCTGTATATCAAACAAAATAGATTACCTCATTTCGAACGCTTAAATGAAAGTAAAAATG:1 - chr3R 7190391 5' - rover 7044 2 79.80 AACTCGTGTTGACTAATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 13508673 5' + roo 17 2 62.38 AGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2R 20744213 5' - roo 9032 1 69.07 GGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chrX 5092995 5' - roo 390 2 46.53 CCCATGGGTTGCATTCATTTCTTGTTTATATTTACAGTACCCAGAAAACGGAACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAG:1 - chr2L 14245958 5' + Bica 430 1 61.39 TCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3L 10143164 5' + 297 32 2 65.66 ACCCGATGCTCAACAAACATCTCCAAACTATTCACAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATA:1 - chrX 19634258 5' + I-element 5123 1 66.34 TGGGCCATGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr2R 14713636 5' - P-element 2832 1 26.73 GCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTGCGTCTCTCGGAGCTTTCGTGTATACTATACGTGGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2R 10444299 5' - P-element 2868 1 48.00 GTTAAATAGGGGTACGAATTCAAACTTTAATAAATGTACAAAGTTTTGGAGAAATGCCCAACGTACACATATTGATTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTT:1 - chr3L 19068560 5' - Juan 329 1 78.22 ATTAACTTTTGTGGCAAAAATGAACTGTAAACATTTATTTCCTTCCACCTCCTCATACCCGGATGTGTGTATCTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGG:1 - chr2L 23188630 5' - Rt1a 4732 1 72.28 TCACAGTAAAATATTAAAAGAACGCTCGTGTGATAAAAAATCACTAAATGAAGACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 7079648 5' + roo 8706 2 56.44 TCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:2 + chr2R 10945347 5' - transib2 2770 1 78.22 CTGTAGAAGTGAAGGTCACCGCCGTAGAAGGACTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTATAGATCTCGTCGTCTACCCATGGAAT:1 - chr2R 1028199 5' - G2 2802 1 67.33 CATCCGCTTGCCTCTCTGTCGCGCTCGCTGGCGGGCCGCATGTGTTTGTCTCGCTCTTACCTGTTCGATTGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCT:1 + chrX 13341803 5' - invader3 304 1 71.29 ATCAANTAATACTACAAAAAAAAAAAGAAAAAC:1 - chr2L 8750579 5' + G2 3074 1 75.76 TCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCCCTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTCCAATAATG:1 - chr2L 12815110 5' - hopper 1398 1 57.47 GCTGCTGTTTCTGCTGTCAAAGTTACGCAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2R 24239373 5' - hobo 2893 1 71.00 TCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:2 + chrX 20806885 5' - opus 450 2 83.17 TTTAAGTGGATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 12324129 5' + roo 8668 2 77.23 TTATACGTTCGTGCTAGCTAGTAATTTCAAGTGATAATTGTAGCGTTTTATTACGGATCAATAGCCGCGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGA:1 + chr4 701537 5' + INE-1 121 1 54.00 TGAAATAAAGTAAAATAATGGAAAGTAATGGCAAAATAATCGCAAGCCAAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGA:1 - chrX 5216947 5' + Doc 405 1 54.46 GAGCATCGAATATACATAAGCACGTATATTATTGTTTACACGCTATTCATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAA:1 - chrX 22901005 5' + 297 375 2 52.48 CTGATTTATGCAAGCAATGCCAATTTATTTAAATGCATTGTTAGTGCATATATAAAAGAAACCAATTAAAGTTAAACTTAAAATACACATAAAAAACCAAT:1 + chr2R 14123863 5' - transib1 4 2 71.29 CATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 7861667 5' - roo 9036 1 64.36 ACGTTAAAGAATATATAGGTAATGCAATTGGTTAACAAAATTTTGATATAGATTATATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chrX 15082370 5' - mdg1 406 2 61.86 TTACTTCTTTTAACATCAACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACC:1 + chr3L 24253234 5' + F-element 268 1 79.57 AATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 + chr2R 7032147 5' - mdg1 7414 2 70.30 TGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 2074761 5' - roo 9026 1 70.30 GTGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGCCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCAAAATAAGAAGA:1 - chr2R 20744228 5' - roo 408 1 57.53 AAAGTCAACGTGCTAAGAAAATTTAAGCAGATTTTAAAGACCACCTAGGATTTGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 + chr2L 14677282 5' + FB 24 1 56.44 TTCGAAAAGCGAAGAATTTAAGGAAATAAACGAAAAGTACATAGAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTC:1 - chr3R 17321827 5' + Stalker2 7245 1 46.00 ACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTAT:1 + chr3R 9131764 5' - roo 9034 1 63.37 CAGAGCACAGGAAAGACTAAATTATTGTTTTAAGGCCCGAAAAACAAAAGTAACGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAG:1 - chr3R 3859731 5' + Idefix 321 2 63.37 AGTGAAAATCAAATACAAAACGCTACCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr2R 19943961 5' + 412 7105 2 77.23 TCTAGAACACCTTAATACGGAAGAGTATAGCGAATTTAAAGCTGTTGTCAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrY 1710932 5' + roo 23 2 70.10 AGCCTTTTTTCGGCCGACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3R 12539574 5' + roo 8684 2 60.40 GTGGCAATAAGATAATGAATCTTTTAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:2 - chr2L 7488956 5' - roo 407 1 74.26 GTCGTCGGAGCCTTTTGTGCATTGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGT:1 - chr3L 15729250 5' - I-element 5076 1 78.22 GCCCACATCTGGCGCCGTCAGTTCCGCTCGATGCCGCTGTGGCACAAGGGAGAGAAGACCGTCCGCCCGTCTGTCGGTATGAACGTCGAGATATCAG:1 + chr3L 20496369 5' + INE-1 136 1 71.13 AAGTGAGATGTTAGGCCACGCTGTGAAAAATGACTGAGGATTAGTAGGTGACTTGGGAATGGTGCAAAGAGAGTCGGCGCTCGTCTTGCTCTTTTTGCCGC:1 + chr2L 12387506 5' - Doc3-element 247 1 62.38 TAATAAAATAAAAATTAATTATAACAATTTTAATTTGTATGTATTTTAAAACAAGAGAGAATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2L 4279422 5' + blood 16 2 67.33 CCGATGTCAACAAAATAATTGAATTTAATAAATGGCCTCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 + chr2L 6388241 5' - copia 243 1 67.33 GATTGATGACTTTGGCGCTGGGCTTGCCCATAGTGTGTGCCTGTATGTGTGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCG:1 - chr2R 21957329 5' - mdg1 187 2 57.00 AGAGCACGTTTCTTAACACTCTGCTCTATGATATTTCAACAGATTTCGCGTCTTCTGCCACTGGCTTTGAATATCCAAAACGAACTGACTATAAGCTAACA:1 + chr2L 16178865 5' - springer 138 2 68.32 AAACGNAAATATGTTTTGTAGGCCCGCTGCACATGGCAAGCAAACAACTTGGCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTA:1 - chr2L 18430180 5' - copia 258 1 77.23 AACGACAACAAATGAAACAACGGCAAATAACAATCAATAACACACAAATCACCTCTTTAGCCACCTAAACTCAAACTTGAGAGAAATACCGATGACAAAGT:1 - chrX 19894027 5' + Porto1 4492 1 62.38 AATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGC:1 - chr2R 12253302 5' + BS 4679 1 67.33 CATTCTGGGTCCTTCGGTTACCAGCTCACACTAGTCCAGCTGCTGCCTGTTGCTGCTGGTCATGTCCGTCTGTCCATATGAACGTCGAGATATCAGGAAC:1 - chr3L 16561012 5' + INE-1 140 1 66.00 CCTAACCCCAGGCGTTGGCCTTAATGACTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr2R 14408483 5' - hobo 2892 1 71.29 ATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 + chr2R 3591988 5' + Quasimodo 35 2 70.30 TTCCTTAAGGACTTGGCTCGCTATCTCGGCCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTAT:1 + chr2R 22434288 5' - flea 255 1 55.45 GCTCGAGTTCATTTACTTCTGTCGCAGCATTATTCGTATTATTATGCTAATTAGCTCTGTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 - chr3R 25671997 5' + I-element 17 1 61.39 CTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2L 7488925 5' - roo 9039 1 63.37 GATAATTAGGAGTAATGCATTGAATGGTAGAAGAAAAAATGAAATAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAA:1 - chr4 968624 5' + Tc1-2 434 1 67.33 AACGCGTAAATTAAACAGTCCGTTGCAGCCGAAGCGTAGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCG:1 - chr3L 8226434 5' - Quasimodo 6959 2 62.38 CAAATTACAAAATTTGAAAACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 11113879 5' + 412 10 2 69.31 TATTAGATTGTTGGTGAAAAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATAT:1 + chr2R 4975115 5' - INE-1 508 1 75.25 GAAAATGTCAGCAAGAAAACGGATAGATTGATCGGAAAACAAACACTGGCGCAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr3L 9689513 5' - mdg3 222 2 54.46 GGGCTGTTTCTGGATCAGCTTGTTGTGGTTCGACATGGAGCATCTTGTGGCTGGTTTCCTGGTCCAATGTTTACTGCTTGTTTTTATTTCATTTTTTTTTT:1 + chr2L 10309459 5' - Tc3 1571 1 60.40 TGGCCGCATGTTGCCAGCCGCGTCTTCGTTCTGTTCTGCACTTAATCGCGATTTCTGGTCACCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3R 11999212 5' - P-element 2874 1 62.38 CTGCTACTCCTGATTGCCAATGGATTTGAATTGCAAATTTAAATTTATGAAGCCAAGATTCTGAAGTCTGAAGCCAAGTTATTCGATTCGATCGCCGACGT:1 + chr3R 22232530 5' + F-element 8 1 64.36 GGCGAATTTAATTTGATGTCGCTGACAATTGCCGCTTGAATGCGCAGTTTTCTAGCGTCTGGAATCGTTTTCGCTTTTACTTTTTCATTTTTATTTTTTTT:1 + chr2L 3099753 5' - Doc2-element 229 1 64.36 CTATTTGTGCTGTGCCCCCTTGTGCAGCGTGTTTACTCGTTTTTCGGGGTGGCTCTAGAGGTAGCTCCCCTGGCTCTCTCGAATTTTTGTTCAAGAGCGAG:1 + chrX 1006849 5' + 1360 94 1 61.39 TTTGCATATCTAAACGAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 2398111 5' - Tc1 1398 2 79.41 CGGGGATGGAGCGGTATGAAATGGAAAAAACGTTAACGTGCACACACACACAAACACACAGACGA:1 - chr3L 7037927 5' + gypsy3 426 1 50.77 AATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chrX 992071 5' - hobo 2893 1 74.00 TACTCCTGGCCCTCGGATACTGGGAACTGGCATACTGGGATGCCGGGTGCTGGATGCTGGATGCTGGAGCTGGAATGCAGGAGTCATATT:1 - chr3R 17516819 5' - gypsy4 6661 2 78.89 CATGGATTCAAAATTTCGATTCAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 - chr2R 5840714 5' + Ivk 8 1 71.29 GAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chrX 19116865 5' - opus 7471 2 62.00 AAAACAAAACAAAACAGGGAGAAACATAGAACACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGACT:1 + chr2R 5844818 5' + I-element 145 1 70.30 AAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 + chr2R 5067618 5' + F-element 23 1 60.40 CACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:3 + chr2L 16674845 5' - roo 388 2 63.37 AATTTCGTGAAAACAAGGACAGTAATCAAACGAATTCCAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 27430109 5' + pogo 7 1 72.28 GGGCCGTGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 - chr2R 14713635 5' + P-element 56 1 23.76 TTGTGCAACCAAATAGACCAAAAATTTAATTTATCCGTAAACTTACTACTAATCGATAATAACAATTTCGAAATAAATTTGTTTACACACTTTTTTTTTG:1 - chr3L 6764198 5' + S2 223 1 70.00 AAATACGCTATTCGTCAAAAAATTTTGAACAAATGCATTAATAAGATTGGAAATTTTTTTAAAGAAATAACTAATTTATATATATGTATGTATATATATTT:1 + chr3L 15148119 5' + 1731 4411 1 88.12 CTAGGAAATCGCGGGTAAACAATGCGCCAAACACAAAAACAACAACAAAATGCCCCAAGATTTTAGCTAAGTCCAATCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACA:1 + chr2L 7969986 5' - R2-element 3320 1 67.33 TGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCTATTTTTT:1 + chr3R 15072594 5' + pogo 51 1 78.22 TTTAACAAATTAATTGGCAACAATAAATTCGCTGGCGAAAAGGTGAACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGT:1 - chr3R 11544984 5' - hobo 2710 1 54.46 ATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr3R 8313129 5' + 297 23 2 56.44 TAAATCCTTTCAATGAACTGTCTTTAAAAATATTTTTATCCAACCTTATAGTTGCTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACA:1 - chr3L 10477619 5' + copia 5066 2 54.46 CACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr3R 8313134 5' + 297 18 2 61.39 CAAGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr2R 16980505 5' - copia 207 2 79.00 AAAAGTTTTTAACCTTAATGCGGATATGTTTGTTAAATTGCCAAACAACAGTTTCGCACTTTTCGAAAATCAATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 + chr2R 15595103 5' - jockey 4987 1 52.53 TCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAA:2 - chr2L 22224570 5' - Rt1c 5407 1 49.50 ATATCTTTACGTTTTACGTATATGTTTAAAATTACTAGTATTCAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 + chr2R 9316927 5' + opus 111 3 73.27 AATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACATATACATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 13136792 5' - roo 389 2 44.55 CCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:2 + chrX 20806886 5' - opus 449 2 84.16 TGTGTNTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 28063321 5' - roo 405 1 74.26 TTCTTTGATAGTTCTTTACAAATTTTATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAA:1 + chrX 21844319 5' + Tirant 8441 2 74.26 TCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATT:1 - chrX 20886034 5' - Ivk 5344 1 61.39 TGGAAAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr2R 12492347 5' + hobo 11 1 66.34 TCATCNGTGGAAACTAGTTTTCCTTAATTACCCACTCTAGGCCACTGATTATATGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTG:1 - chr3R 15126567 5' + FB 24 1 53.47 AGGTTATGCTGCGCATTTGCCACATACAATAATAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAG:1 - chr3R 18576354 5' + hobo 2573 1 68.32 CCTTTCCCTGCGGAAATATGCGTCTGCCACACGTCCGCCAAATGACTACACTGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCGTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATA:1 + chrX 9313054 5' + Rt1b 4965 1 57.43 TTTATTATTATAAAATTATTTTATTACAACAAACTTCTTATATATTTATTGTTCACCCGCAAATTTAGAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTT:1 - chr2R 5608468 5' - Q-element 364 2 65.35 ACTATTAAGTTAGTTTCTGACCTTGGCTGCTTTGTGTGCTTAGGTGCACAAAGAGCCACAAGCCACACACATCAATACCGCACACCGAATTTTTCTGTATG:1 - chr2R 23871043 5' - invader1 3786 2 70.30 ATAATAATACCATAAATCTGGTAAAAGCTTTAGGCAGCAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAATTAGG:1 - chr2L 8344867 5' + I-element 224 1 63.37 CTCCTTTTGATCTCTCCCACTTTTCATATTCCTTGATAATTGCTTTTGTTCGCTTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGA:1 - chr2R 10686426 5' - 297 422 1 62.38 AATGCTTGGATTTAAGATTATATATATCATTCAAAACCCATCTAAAAAAGAAATTTGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGG:1 + chr3L 21442550 5' + Tc1 423 1 57.43 TGCCCGCTGAGTGACAAGAACAGAAGAGCATTTTCTAAGCGGGTTTTCTTCGGCTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAAT:1 + chrX 20881363 5' - 297 6846 2 62.63 CTACATTTGCTGTAATTAATCACATTAATTTTCATACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAT:1 - chr2L 22697539 5' - INE-1 543 1 88.71 AAGGGTGAATGCCGTGGTGGTAACTCAGTACTTGTCGAGGGGCTTCGGCTTCGGAATGTAAAGGATAACTGCTGAAGCGTTACGCTGATTATGTTGGGAAG:1 - chr2R 2050038 5' - gypsy3 261 2 81.19 CTAAAAAATGTGCAGCATGCACCCCTCGTTTGTGGCTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 23275341 5' + roo 17 2 58.42 TAAGATATAGTAGTTGTTAGTTTTGTTAATAGAGATAGTTTCAAAACTGCTGATATTCCAGAATATCTCCGCTAGCTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTA:1 - chr3L 14801257 5' - 1360 3284 1 55.45 AATTTTGTGGTCTAGCGCCTATTTTCGTTTGCCGCACAAAAGTATGCAACGCATTTCAGTATTTAGCTATGGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr2L 20287500 5' - hobo 2935 1 74.00 CATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3L 12633274 5' + jockey 59 1 78.00 AGAAACGAGGATGAAGGAAAAAAGGAGCGGGTGGGATGTGACTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 17843710 5' + roo 8694 2 55.45 CGAATCAGCGCATGGCCTTCGGTCCCCGACTTGGCCCGATGAGTCCATACGCTACACCTGAATTCCATGGCTTCCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2R 5804564 5' - P-element 2886 2 79.21 TTCAACTGCGAATCCTGCCACGCAAAGTTGTGACCTCAGCACCACACCCAACATCCCCCCCGTTGGAAGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCTCAAGGGGAAG:1 + chrX 1495994 5' - diver2 4484 1 54.00 GCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 13640700 5' - P-element 2861 1 53.00 ACGTCCTTAGTGTGAAGTTCATGTACATCTTTGGAATGATTTTAGCATATATATACCCCTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:1 - chr2L 2308729 5' + HMS-Beagle 6806 2 67.71 TTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 2799698 5' + Tirant 32 2 59.41 AGCACTGTTCGGCACAGCTGTTCAGAGTATGGGGCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 29123347 5' - P-element 2847 1 39.60 AACCAAACGAAACGAACTGCTGGAAATAAGGCAAACAAAAACTGAAAAATGTCAAAAACGAAAATGAACAACAAATTCCAAGTTTACATACTTTTGAGACT:1 - chr3R 19717682 5' - S-element 1523 1 68.32 GATGCGGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr4 1149935 5' + 297 19 2 58.42 ATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 13508734 5' - roo 353 2 81.19 TGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 16457992 5' - roo 9046 1 54.46 TATTTACTCATTTTTAAGATAATGTTTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2L 15080596 5' + hobo 8 1 75.25 CATGCAGACGTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATAT:1 - chr2R 13585531 5' - Juan 4195 1 59.41 GGCACTGCTGCATCGCGATCCGCTCCACCCGAGACCACGGCCCTACTGACCACCACTTCGGGCACACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCA:1 - chr3L 18059179 5' + I-element 212 1 68.32 TTGTTACCAAAGAATTCTATTTAATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 13136814 5' - roo 390 2 61.39 ACCTGTTTGGAATTCTAAGGATACATTAAAACTGCCGTTGCTTGTGCAGCGTTGTTTTGTTTTTTGTTTGTATTATATATTTTTGTTTGTGTGTTGCTGTT:1 + chr3L 13901683 5' - gypsy10 490 1 64.36 AACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAG:1 + chr3L 19951204 5' + Ivk 36 1 60.40 TAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3R 7388340 5' + HMS-Beagle 31 2 57.43 AAACCAGATCAACATCCAAAGCAAGGATCAGAGCAACAGCAGCGTAGAAATCATCCAACGAGCCCAATCGAAAACCCTAAGTACCATCACCGGCGCACCG:1 - chrX 18607890 5' + Fw2 3628 1 66.00 TGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3L 28063321 5' - roo 405 1 75.25 TTATANAGTAACATATCCATTCTACACCCACCACATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAG:1 - chr3R 3389439 5' + Rt1a 4766 1 67.33 ATTTTCCCATACTTAGCCCCCCATGCCGCGGTAAAATGATTGAGACAATGATATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACATAACTT:1 - chr3R 12856032 5' + frogger 2354 2 76.24 CATTACCAATGCAAACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAAAAGGAGTCTCAT:1 + chr3R 32005858 5' - invader4 3083 2 74.73 CTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCAAA:1 - chr3L 24916689 5' + Porto1 150 1 55.45 GATTGAGGGCGTTCCTCGGCAAAAATGGCAGCAGAATGTTGAAAGCTCGAACTACGGCGCACGCACTCAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTT:1 + chr2L 5421779 5' + invader3 234 2 70.30 AATCCGCTACCAATACTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr2L 14790548 5' + roo 8664 1 79.21 CAATTACTTAAATCCCTATGCGCAACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACCGAGGGATCTC:1 + chrX 9694691 5' + X-element 4493 1 79.21 GGGAGAAAACTATATTTACTCCATCTTCCAGCTGCCGACTCACATCTCCAGTTACCAATTCTAGATGCACAGAAAGAAAAAGTTAAAAAATAAACAAAAAA:1 + chr3L 6086058 5' + TAHRE 10442 1 81.19 GTTTCAGTTAACTGCAGTTCTGCGAATTAATAAAAATTTAAAAAAAAA:1 + chr2L 10483171 5' + Doc 4692 1 77.08 AGGAAGCATTCCACAGTGTTTTGTTGTTTTTTTGAAAGTTTCGCTTGAAAGTTTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATAAATATGG:1 - chrX 13387365 5' + Cr1a 417 1 78.22 CTTCTGGAGGGGCCGGGTGCTCTTGATTGTTTTGGATAGGGCTGCCTGGGGTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACG:1 - chr3L 21971124 5' - F-element 281 1 54.46 CGGGTTAACCCGGCATTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 + chr2L 20132960 5' + flea 4757 1 77.23 ACCAGGCTAAGTATGCTAAGGATGGCAAACGGTATCCTTCCGGGACCATTGTCAAAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTCAT:1 + chr2R 8644646 5' + HMS-Beagle2 6883 1 55.45 AATCAACCGATTTTAAGTTTGGTATAATTAAGTACACTCGTTTGGCGCACACTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCT:1 + chr2L 5084157 5' + Doc 365 1 57.43 GCGAATTGCGCCTGTACTTTCCACTTGCCAACTCACCGAGATAGTGGAAGTTAAGATATTTAATAATAGAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTATCAG:1 - chr2L 12628694 5' - INE-1 562 1 71.29 GTTTTAAAATATTGTAAATATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTCACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr3R 12539475 5' - roo 395 1 67.33 ATTAGGAATATTAATATGTGTATTAAACTGTATTTAAATAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCA:1 - chr2R 19549688 5' + roo 151 2 61.39 CCCGTGTGGGTTTGGTTCGGCAAGGAAAAGAGCTCGGGGTCCATGGAGTTTCTGATGTCTGCGCTAACGGGTATCCGATAGTCGAGAAACTTGACTATAG:1 - chr3L 13347685 5' + INE-1 566 1 65.00 CTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr2R 16475768 5' + 412 7106 2 81.63 AACAATAGATCGGAAAGCGACAAGAATATCAAGAAGTCTGACAAAAATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCAC:1 + chr2L 189777 5' + invader2 355 1 55.45 CGCCTCGCTCCTCTCGTTTGTGCCAACGGATTTGTCAAAGGCATTAAAACGAAATCTCGCGCAAACTGGGCATCAATCATGACTCTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 8340395 5' - accord 186 2 82.18 TGGTGGCGATGTGGAAAGTATCTTAAAGATAGCTTGGGAATACTGTGTAGAATTGTGTCTTCGTAGATGTGTCTAAGGTCGTTACAATAAATAACTCCCTT:1 + chr2R 12269459 5' - I-element 490 1 56.44 TGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 12539510 5' - roo 9023 2 74.26 CCGCATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2R 20744248 5' - roo 9048 2 50.50 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCT:1 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 77.23 AGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:2 + chr3R 13375945 5' + 1360 6 2 70.41 TCCGCCGCTGGAGCTACTTCATCTTCTACTTTGCTTTTTGCATGTTTATTCGCAATTGTTGTTGTAATTGTTTTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTTGTCGAG:1 - chrX 1591958 5' + transib2 390 1 74.26 CGCTACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr3R 31458401 5' + jockey 17 1 69.31 AAGGCGGACATCGGAGTGGGTGGCCATGCATTGGCTCAGAATATCAAGCGATTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGT:1 + chr3R 27285182 5' + Max-element 8370 1 55.45 CATGGGGTTTTTACCCCCTTGTTCACATTTAATACACAATGACACCGGTGTTTCGCTGGCAACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTGTCTT:1 + chr2L 21647972 5' + Gypsy12A_LTR 2028 1 67.33 TCGTAGGCTGCCAGCTGAGGCATGTAGATATTCTGAATGTAGACCAGCAGCTTGACGAACTGCTTGCCCTTGCTGAAGTCACTCTTCTTGCGCTCTTCCTC:1 - chr2R 8629951 5' + opus 10 2 67.33 GAAATTTTTAAAATTTAATTTGCAGTTGTCTCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCG:1 - chr3R 19530737 5' + BS 1 1 71.29 TAAACTGCTAACAAACAGCATCCAAATCTTAAGCTCCAATATTTTTTTTTCACGCACTTAAGTTGTTTTTAAATATTTTTAATAAAAAAAAAAACAAAA:1 + chrX 13933720 5' + TART-C 11100 3 73.74 AGGTGTTGATAATAATTCTTCACTTTCGGACTGAATGTTATGGTGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCA:1 - chr3R 19449606 5' + roo 147 2 60.40 ATAAAGTATATATATGTATATTCTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGATCTGGCCAAGTCCGCCTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAA:1 - chr4 156607 5' + INE-1 146 1 80.20 CTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 - chr3R 16245100 5' + 1360 39 1 70.30 AAATGCAAGCGGGAAATGCAAACTCACACACGCAGCGGAAAAAGAAAAAAAAAACAAGGAAAAATAAAAA:1 - chr2L 15171064 5' + Doc2-element 234 1 68.57 GGAAANCAGCGACATTTTCGTAGCATGCTTTTTGGAGCGACAGTTTTCCACTTGCTCTCTCGTTTTACCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGC:1 - chr2L 315234 5' - Tirant 8500 2 72.28 TTTTGGCAAGCACCTGAAAGGCCAATTCAACTTAACAAACTTGGATCTTGCAAAATCTGATTAGCATACGTGTTTGTATTTCTTCTGATGTTGTGGACGCC:1 - chr3R 20442943 5' - invader3 289 1 80.20 GGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTT:1 - chr2L 14612115 5' - roo 9055 2 62.38 AATTGCACTAAAAAACGGAGCCGCTTGAAGTGTAATAAACCAATATACGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:2 + chr3R 16400170 5' - blood 7340 1 70.30 TTTACCATTGGTTGTTTCGAATGACAGATTTGTGTATAGATAACAAATTAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 13136725 5' + roo 25 2 54.46 AGAAAGTCACGTCCCTTTGGAAATTTATGGCTTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2L 7807885 5' + P-element 49 1 32.00 CCTTTAAGCATTTTCGAAGGACGAGGAAAATTCGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATC:1 - chr3L 13372035 5' - ZAM 90 2 67.33 GAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr3R 28645861 5' + F-element 27 1 58.42 AGGGGCTGTCAACAACTACAATATGTATGATAAGCAGCCACCTTTAGATACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAAT:1 + chr3R 31131112 5' + F-element 301 1 55.45 TCCCANGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr3R 6273574 5' + blood 41 2 65.35 CCTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2R 16475767 5' + 412 54 2 81.00 TACGAACACCACTAGAGATCGCACACACACACGCAACACATAGGCATACATAGGGAGATAGAGTGAGAGAAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAG:1 + chrX 12660078 5' - F-element 348 1 68.32 TTGGAGCTTAAAACAAAACTAACACCCAAATGGGAGCTGAAAAGCTGATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2L 9774270 5' - 412 465 2 53.54 CTTCCATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 - chrX 13508780 5' - roo 9063 1 74.26 CATATTCAAGTGCATTTTGCGGTTGTTTAGCGATTCGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACA:1 - chr3L 3642116 5' + Doc 223 1 64.36 TGCGCATATATCTCTGTCTCTCAAATTTTTATACAACAAGACAAAATGATGAAATCCAGTGAATACCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAAC:1 - chr3R 25420465 5' + 412 269 2 63.37 TCTCTTTTTTACCATTATTTTTGTCTCTAGAATTTGTATTCTGAATCTTAACCTTCTAGCTTGTATAGTTACTGAGATCTCAACGTTCATACGGACAGACT:1 + chr3L 14346832 5' - INE-1 128 1 80.20 ATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCG:1 - chr2L 21657037 5' + invader1 42 2 76.24 AGACTGCAATGCTCTTGGGCATAAGCTAAGAAGAATAGTGCCGTGTTTGAGTAGTTAAGATCCGGCAGAGTCTCCATGGTCTTAGGAGCAGATGTTTATCC:1 + chr3R 22761788 5' + GATE 8071 1 76.24 TTTTGTAATTTTGTTTGTTGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAG:2 + chr3R 17843607 5' - roo 409 1 77.23 GCCGGAAAAGCACGATTATCTGTTAGGAATTCGTTTTGTAACTTAAAGTTAGTTCAAATTTCATCCATCTTCGCCACTCAATTTGGGGAATAATCGCTTTG:1 - chr2L 1535107 5' + Ivk 210 1 79.21 CTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 + chrX 19986375 5' + Stalker2 51 2 78.22 ATGTGTTTGTGATTTAGAGCGCGGCAAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGA:2 + chr2L 21010842 5' + opus 14 2 65.35 TGGGGATTGTCCTTTACATACGAAGGGTATATAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3R 26842808 5' + opus 7156 4 71.29 GGACTTAAACAAGCATTCGAGTAGTGCGACATATTACACCATCAATCCTTTTCACTCCGTTTAACTCAAAGGATTTCCAAAGTCGAATCAAGCTATACCTC:1 + chr2L 9403963 5' + Ivk 4903 1 67.33 AGAATAAGACTTTAAAATATGAATGATCAAAGAGCTTAAATATACAAATCTTAAAATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTT:1 - chr2L 16597953 5' - R1A1-element 5081 1 61.39 ATATTGAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3L 8713093 5' - opus 459 2 76.24 GTAGGGCGTGACAAACGCATGCTTGATCAAGCGACACGGGACTGTACAAATCAAGCGGATTCTGAAACTTGGCTGATATCTTTTTATTAAATTTAATAATT:1 - chr2L 18613045 5' - S-element 385 1 58.42 ATTGCCATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 7861662 5' - roo 9041 1 59.41 AGGAGTGGAAAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr2R 12492342 5' + hobo 6 1 71.29 CTAAAAAAAAGAAAACAAAAAATATACAAAAAAAAGTAACCTGATAATTTAAAGCCAAAATTTAATCTGTTTTGGGGCCCCTTTTTCCAACCTTCTTCTTT:1 + chr3R 22422845 5' - S-element 1270 1 71.29 GCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATA:1 - chr3L 9909768 5' + Transpac 4950 2 51.49 TTATGCCACTTATATACATTATCCCCACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTC:1 + chr3L 23496297 5' - 1360 464 1 73.27 AAAAAATGTGGAGAAAAACAAGTAGCAACCCGGCTCATTTTTAACTTTCCCCTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTA:1 + chr3R 12541742 5' - roo 471 1 49.50 CGGACAAAGCGTGACCTGGTGATGGAAGTTGGGTATCGGTGGGTCCGCCAAGTGGGCAAGAAGAAATACCCAAACAAAACAATATGCCCAGCTTCTAGCAA:1 - chrX 17382384 5' - invader5 3734 2 65.35 TTGTGCGTCGCTGTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr2L 16201599 5' - hobo 2932 1 75.25 ATTCCCTCCAAAATCGAAGTGTAGAGCAACTTGCCGGTTATTAGAAACAACCTTTGAAGGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 3771664 5' - roo 393 1 63.37 AAACTTTCGGTCGTGCGTAAAGTGTGGAAAGTGGTGGCGCGCGCGAGCAGGGAAATATCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATTGTAACAAAATTCAA:1 - chr3R 31887380 5' - HB 1400 1 66.34 TAGAATTAAACAAAAAAATAAAAAATAAAAACCTTTTTCAAAAGTGTGGGCGTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGCACTGACGG:1 + chr2L 5205684 5' - INE-1 127 1 64.36 CTTGGCTGCTGTCCCGTCGTCTGCCTCCGCCAGCCCTGCCACGCCCAGGTGATCAGCGCCATCAATCAGATGTACCACCAGCAGCAGCACCAGCAG:1 - chr2L 20514176 5' + TART-B 151 2 67.71 TTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGC:1 + chr3L 24272106 5' + gypsy11 4050 2 79.21 AAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3L 7075934 5' + roo 19 2 67.11 GCATAACTATAAAGTTGCGATTTTCTGCACGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCAATCCAACAGACATAAACA:1 - chr3R 3319598 5' + Quasimodo 292 2 69.07 AATATGGTACATCATATACGTATGCCAGTAATTCGAGCTGTCAGTTTGGCGGGGCGCTTATGCTGCTACTGGATTTCCCCCTGTTCACGCCAGAAGGGCGC:1 + chr3R 22431036 5' + Max-element 8234 1 80.20 GCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr4 1149932 5' + 297 22 2 59.41 TTTTTGTTTGTTTGTTTTGCATTTAATTTTCGTGTAAATCTTCTTTACTTTATGATATTCTATACGTTTCCATTTATTTTATTTGTAAGTCTCTGTGTACA:1 - chrX 578367 5' - Doc3-element 4443 1 81.19 TGTGGGCGACAGTGGTAAATGAAATGATCGCCTTTTTGACTTTCAACCATAAGCGTGGAGATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAA:2 - chrX 5129571 5' + Idefix 9 2 67.33 CGGCAGATTTGGGCGATAGTGTGGGCGTCAATATAAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAA:1 + chr3L 23123531 5' - flea 218 2 68.32 AGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 + chr2R 12185339 5' - accord 499 2 65.35 TTTTAATTTCCTATACATTTCCCAAACCTTTTTTTGTTCATAAATATACAAATTTGGTCAATGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 12103877 5' + roo 8675 2 60.00 ATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 13640692 5' - P-element 2853 1 45.00 CAATCATAAAGCCATTGTAGGAACGATCTACTGACTTGAGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACTGTTATCGATTTG:1 + chr3R 4600041 5' - HMS-Beagle 7037 2 69.57 TGGCTAAGCGTATTAGTTCAGCGTGACTTTTTAGGCCGCACTCATTTTTTTCTCTGACTCGTGATCGGCCCACTTCTGATAATGTAGGGGTACTATATATC:1 + chr2R 4907505 5' - invader2 248 1 56.44 TCGACTGGTAAGGACCACATTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 12605613 5' + F-element 59 1 74.26 GTGAAGCAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 19551969 5' - roo 392 2 62.38 TTCACATCAGCGGAAATAACCAATAGCCACGCAAAAACCATAGCATATTTTTTGGGGCTCGATCTCGTCAGCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr3L 4641046 5' - hobo 2934 1 73.27 TTATACTTTTTATTATAGATTATTAATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTCAAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAG:1 + chrX 4461004 5' - Idefix 7194 2 52.48 GTGGAAAGGTGCATAGATGGCAGGTGGAGCGTGATTAGGCTGCGGTTGTTTAGCCTAGGATCTTAATTCTGGTTCTGTTACGAACTGACTACAAATCAAAT:1 + chr2R 20400676 5' - gypsy10 270 2 67.33 GAGAAATATTACGTATATAAAATATACGTTCCAAATATATTATATAATCGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAAC:1 - chr4 978337 5' + opus 7377 2 55.45 GCTCCATTCCACTCCTCGGATCTCTGGAGCTCCATGGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGAGACATACAAATAAAACTTGTCATTAAGACAATAGCAG:1 - chr2L 16628889 5' + Doc3-element 4468 1 77.23 AAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr2R 5067617 5' + F-element 22 1 61.39 CAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACT:1 - chr3L 18706940 5' - jockey 4960 1 51.49 GTCAGNATCAGAGCCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chr3L 7205535 5' + Doc 37 1 52.48 ATAGGNGAATTTACATAAGTACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chrX 3305238 5' + transib2 2 1 74.26 GATATTATCGGTTATCATTCCATCAAATTCTCCAATTTCCATTTTTTTAGAAGCTCCTGTCATTAGCACATATTCATATTGAGAACTCAATGACTACATAT:1 - chrX 964547 5' + Stalker4 6908 2 69.31 TTTTCNGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 8345506 5' - roo 9035 1 61.39 ATATACATTCTTGGAACATTAATTTTGCCATTGTTTCTGAAAGATTATTGCAAATTCATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3R 23591402 5' + pogo 17 1 60.40 AAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGAC:1 - chrY 3648888 5' - 17.6 463 2 64.36 GACAGAGAGAGAGAGATAGAGAGAGAGAACGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTT:1 - chrX 12649918 5' - 412 7231 2 74.26 ATTACAATCAAAGGGGGCCAATAATCCACTTTTTTTCTTTATTCTTGCTTATTTCTTGCTTATTATAAAAAAAAAAAGGAAAATTAAAA:1 - chrX 5438568 5' + Doc2-element 252 1 47.19 GGATGAAATAGGATTAAAAGAATGGTCATCTTCCCTAAGATCGGCACACGATTTTTTTCGCCGTGGCTCTAGATATGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTGT:1 - chr2R 4322695 5' + 1360 82 1 56.44 GGGGTCATACGCCTTTTATAGCTTTTTATTGTTAAATTTGTTTTTATTTGTTGTATCTACTTGGTTCCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAG:1 - chr4 949253 5' - Porto1 4482 1 57.43 ATGTCAGGGGCACACAATAATTGCATCTATGTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTTAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAA:1 - chr2L 4998468 5' - S-element 1673 1 71.29 CAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 - chr3R 7388399 5' - HMS-Beagle 6998 2 70.30 ATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr2R 7032129 5' - mdg1 7432 2 52.48 TTGAGGTCCATCGTCCAACTAACACTAAATCACCAAATTGGCCAAAACTCCCCAAATACGTAAAGTCGTTTCTTCGATCAGAATTGAT:1 + chr2L 23240700 5' + 1360 3169 1 61.36 AATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 17587790 5' + roo 8707 2 71.29 TTGTGAGTGTGTGTGTATGTGTGTGGTGGTTGAGACATAAATTCATGTGAGAGTGAGTAATGAGTTCGCAAACGTGTTCGGGTGGGCGCTAAGTCTGCCGG:1 + chr3R 27376718 5' - G5A 2615 1 68.32 TGCCTTAGAACGCAAAATGAGTGTTCAGAAGAGCAGCCCATCCAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTC:1 + chr3R 10243837 5' - invader4 2624 1 57.43 ACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2R 1982173 5' + P-element 35 1 49.50 ATGATTATTATCATGTCTTCACATTATTATGTTTTTTAATAAGTTTTAATTTTGTGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAAT:1 - chrX 15082463 5' + mdg1 7059 2 58.42 GGGGTAGGAATACGAAAAGTATATATTAACAGTTAGACGGGAAATGTAATAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAG:1 + chrX 14977084 5' + invader2 4804 1 63.37 CTCAGATCAGAAGCTGAAAACTTATTTCAATTCTCAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATCAAACTACACAAACAATTATCAAAGCT:1 - chr2R 3108374 5' + Porto1 304 1 66.34 CAATANTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 14790558 5' + roo 8674 2 68.32 TGTTTTTTGAATGAGAAGCGGCTTCGAAACGTGTCGTCGCAGGCGTCGACGTCGGCGCCGCAGTCGCTGCGACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chrX 22855177 5' + P-element 3 2 76.24 TTAAGTTAAACAAATTTTATAACACCTTTTCCTTAAAAAACCAAATTATACCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAAAGCCAGCAATT:1 + chr3R 29537184 5' + I-element 5212 1 75.25 GCGGTATTATTATGCCATTTTATTTATCCAACCAACCACACCAACACCACCACCACCACAGCTACGACAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCC:1 + chrX 4822545 5' + mdg3 5331 2 48.51 GTACAAGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chrY 536714 5' + Doc 30 1 53.47 CTGTCAGTTTGGCGGGGCGCTTATGCTGCTACTGGATTTCCCCCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 + chr3R 22431073 5' + Max-element 8263 2 53.76 CACATGCAACACGACAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCTCA:1 + chr2R 21587575 5' - copia 4966 2 84.16 GAGGATTCTCAGATTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATAT:1 + chr3L 18337640 5' - Juan 4193 1 59.41 TCCAAATTGATTATTTTGACTTTATTATATATACATATACAGGAGTAATTATATACAGGAAATGGTTTCTGCATTAAATTTTTTTTTCTTTTTAAATAAAT:1 + chr3L 21372744 5' - transib2 2633 1 65.35 GTGGCTCTGCCTCGAAGGCAAAGGCAAAAGTCCAAGTCAAACGACTAAGCGGCATGTCGTCAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chr3R 26530383 5' - blood 356 2 66.34 AATTTCTTTCGCTGGTCAACCTGTGCGCTCCGGGACAAGGGACCGGTGACCCCAATCGTCCATATTGGTTTTATTAACGCCTTGTATATTGCTATTTTAAT:1 + chr3R 19287424 5' - Porto1 4230 1 58.42 TCGCAGGGCTCGCCGAAAACGAACAGTCGGTGCCGTGTTCCCTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chr3R 13538990 5' - hobo 2903 1 61.39 GAGAAGAATGACAATAGCTTTATGTATTTATTTATATACATTTTCTCCGCTCTCTGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCC:1 - chr3L 16704592 5' - 1360 67 1 57.43 TCAAAGAAAGCTTTATTTAATAGAACTTTTTACCTTCAAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAA:1 + chr3L 10599676 5' + jockey 4955 1 62.38 AAACTCGAATATAATGCAGTAAAAAAAACAACCGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAACACGTCTT:1 - chr2L 20611812 5' - Doc2-element 23 1 72.73 TTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chr2L 19018952 5' + hobo 33 1 61.22 CAGGANTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 10952280 5' - roo 9029 1 66.34 ACTGTGCCGCCCCCACCACCACCGGTATCTATAGCTGAAGTGACCAAGTGGTTTCTGAATGTGTGTTGCGGCACGTTGCTGCTCCCAACACAGTCACCTCG:1 + chr3R 1845654 5' - Chouto 323 1 72.28 ACTGAATTGTGGGATCAGACGGCAAAATCGGACTGCGTTTTAGTGGGGTTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGC:1 + chrX 11942353 5' - Idefix 223 2 55.45 AAAATACGTTATAATATACGGACCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATC:1 + chr2L 9727806 5' + Doc 4267 1 78.22 ATCACAAATATATAAGGTAAAAAGTAACATTCAGAAATAGAGTACCTTGTTCACACCAGCTGAGTAAAGGGTATCTAATAGACGGGGAACTCGACTATAG:1 - chrX 15946744 5' + INE-1 566 1 66.00 ACAAAAATAAAAATAACAATAATAAAACTATAAGTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAAC:1 - chrX 21056524 5' + F-element 242 1 82.18 ACAATCACACTTTGCGGCATGCTGCAGCATTGCAAATAATATAAATTAATATTTTTCACCGTATCGTCTACCAGTGGGTGACTTTTTTAGAATTGGGGTTT:1 + chr2L 15371449 5' - Idefix 154 2 67.33 CAGGCACTTCTGCGCTAACAGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACGGCAGACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTG:1 + chr4 946433 5' + Tirant 297 2 74.26 GAGCTAATTAAGTGGCCCCTTATTCAGCTAAAAATTTTAATTAATTTCACTTCTTGTAGTCCCTTGCTGCTTTTTAGCTGGTACGTATAAAAGTTTTTC:1 + chr2L 2802908 5' - Fw2 391 1 60.61 AATACAATTTCCTTTTTTTGCTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 - chr2L 17646253 5' - flea 245 2 61.39 TATTAACTTTAATACAGTTGATTGAATCGCTTTTGGAACGCCTTGAGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATA:1 - chr2R 24628829 5' + mdg1 31 2 53.47 GGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chr2L 4160116 5' + Tirant 8130 2 57.58 CATCATCTTAATTAATTTGACGTAAATTGCAAGCGAACTAAAACGCAAAGAGGGGGCAGATTCATGTGTGTTGTGTGTGTTACAATGTTAAAATTCTTAGA:1 + chrX 697954 5' - ZAM 250 2 76.24 TATGCAAATTCTCGCCCTGTGTGTTGGGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 - chr2L 15950742 5' - Transpac 5225 2 42.57 CCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACA:2 - chrX 23182917 5' + Idefix 22 2 55.45 TGTTCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCATGGCTTCCCATGACAGCGACAGTCCACA:1 + chr3L 17878746 5' - hopper2 375 1 70.30 GTATGCGAACTTACAGCAAAGGACTTGAACAAAATGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr2R 1072631 5' - pogo 2062 1 66.34 TCATCTTCTCTCCAAGTCCACTTCCCCTTGTTAAAGACAAAATAAAGTCAAATGTAGAGCGACATATAAGTAAACTACACGACTATGATAATGTCCTAGCA:1 + chr2R 1727403 5' + G3 4396 1 79.21 CCAAAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:1 + chr2L 22084455 5' - copia 245 1 66.34 TGAGACAGAGTAATGAATTTCTCGGAGAAAAAAAAAAGTAGATTATTTTGAAAAGCAGCGATCTGAATAAGAGTGTTTTTATTTTTTATTTTTTAATA:1 + chr2R 13379481 5' + hopper 153 1 48.98 ATCATTTGACTCCAATTCAAGATTTACGTTTTGTACCGTAAAAAATAATGGTAAACGCTATAATCAGTTCCTCGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTGG:2 + chr2R 9236998 5' - INE-1 543 1 74.26 ATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr3R 24081620 5' + 297 6604 2 57.43 TTTTCAAATTCTAGATGGGGTAGCAACTTCTGCATTCATAAGTGATCTGGAAGCGCCTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 - chr2R 3823459 5' + Max-element 21 2 57.43 CCATGTTATTTTACTTTGTATGTGGCAACCTACAACATTTACTGTTAAACATCCAGTGACATTACCCCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAA:1 - chr2R 5774850 5' + roo 349 2 68.32 TGAATCGCAGGAACGCCCTGAAAGAGCTTTTCCCATTTTCGAAAAGACGGATGCCATTGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCA:1 - chr3L 20968355 5' - Rt1b 4835 1 70.00 CGTCTTCGTCAAAATCGTTTTCCTTTACCACTGGTCCCATGGAAGTACAATTCATCGCACTTTTATCATTCACACAGCTGAGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chr2L 21363984 5' + INE-1 556 1 76.24 TTTACCTGGCCATACCTCTCCGTTCGCTCATCGATGCTGGAGTCGGGGTGTCGTCTTTTGACTCGACAGTAACGGATGCTTTGGATGATCCCATAAACAAT:1 - chr2R 25018525 5' - gypsy4 6446 1 72.28 AACGGTCATCGTGTATATATAACTCAAGGGCTAATATCAATATCAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 14247057 5' + 297 6602 2 59.41 ATCTATTATCTATTATATCTATATCTAACTGCGGTATCAGTTAGTCGGCTACAATATCCCTTTTTTTTTTACTCAAACACAAT:1 + chrX 7061478 5' - Stalker2 495 1 60.24 GAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 19552055 5' + roo 8694 2 56.44 CTTGGAGGCACTCGATTGTCTTCGCTTTCCCCCTTTTGTCTGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGC:1 - chrX 7265673 5' - accord 216 2 59.41 AAAAAAGGTAACATAACTTAATAGTTTATACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:2 - chr3L 2019740 5' - 412 476 2 55.45 TGGTTTCCAGTCTCCAATTACTCGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAAT:1 - chr3R 26213827 5' - hobo 406 1 78.22 CCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 - chr2R 13644503 5' + Burdock 6162 2 55.56 CAGGCAAGAACACAATCGAAACAATAGGTAATATATTTATATGCTTATAAATATATATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATA:1 + chrX 15371817 5' - Idefix 7375 2 63.37 GTTCTGCTGCCATTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 + chrX 16995086 5' + jockey 19 1 66.34 AAAGGGGTAATAAAAAAGCTTATTAGCTCAACATTTGGTGTCCCGACTTGATTTGTTCATAAACAATATTGTGAAAGAGCATACATAAGGAACACCAAAAC:1 + chr3R 1838593 5' + transib3 89 1 68.32 ACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3L 18500943 5' + hobo 25 1 52.00 ATTTAATTAATTAATTTTTACAAAAATTTAAAAAACACCTAATTGACATTCTTCTTTTATATATGTTCCCTCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr2L 15830523 5' + Max-element 8244 2 66.67 CCACAAGTAGCTGGCGAAGTGTGTGCGAGCGAGCGAGTGAGTGAGTGACAGCAGTTGGTGACAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr2R 11527991 5' - P-element 2872 1 68.32 ATTTTTAATTATAAAATAACTTCATAAAATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1 + chr2L 17317197 5' - Tabor 407 2 70.21 GGCTTAAGTTTATTTCTCAACTCTTCTTCTCTGTGTTGTTTTTGTTAAAGGAGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCTAGTAGCTAAAGAACTTG:1 - chr3L 3772490 5' - Doc3-element 474 1 66.34 ATGCAAAATATTTTTATGCAAAAAATTAGGAATCCAAAAATGAAAGCAGCATTAAAATATCAGTCACAAAAAAAATTACATTTATACCAAAATTTGCGGCT:1 + chrX 12767362 5' - transib4 15 2 78.22 TACATTTCTCAAACAAAATGCTTGCATAACTATATTATGTGTAGACAATGGGAAGAAAGAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr2L 10473429 5' + flea 4771 2 63.37 GTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 27775102 5' + roo 8713 2 77.23 CAATCATGAAAGTATGTGTTTCGCCAAGAAGCGTGGGCGTATTATAGACAACTTCCTGTTATTGCCGGCCCATCCCATGTCAGTTGCAATAGTAACTGTAA:1 + chr3R 25952376 5' + Fw2 3860 1 83.17 AACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr2L 7488920 5' - roo 9034 1 68.32 GCTGTGTGGCAGCAAAAAGTTCTCCTGGGAGTGGGTGGCCATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3L 5201467 5' + 297 15 2 68.37 CTGTCTACCACTGTGAATACTCTACCACCCAGGGGATATTTCAATAAGCCATATATTAAACTCATGCCCCTCCC:1 - chrX 17232643 5' + I-element 5046 1 51.35 TAAAANATTTGAAATATTTTTTTTTTTAA:1 + chr3R 22721294 5' + FB 177 1 86.21 ATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:3 - chr2R 4483253 5' + Ivk 48 1 68.32 AATTAAGCTGTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr2R 13650094 5' - mdg1 7440 2 60.40 TAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATC:1 + chr3R 4834272 5' - mdg1 7410 2 76.24 GCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACAC:1 - chrX 23182885 5' + Idefix 48 2 82.11 GGGAGGCTGCTGTTTCTGCTGTCAAAGTTACGCAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 - 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I-element 334 1 72.28 CGTCATTAGAATAAGGAAATTGCACTCCAGAGTGTCGATGGGATTACACAGAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATT:1 - chr2L 2519991 5' + jockey 4922 1 54.46 CAATTTTTAAATTTTCTCTTATTTTATTATCCCCAATATATATATATATATCCCAGAAGAAATTATGGAACTTTGCCTTAACATTCACACTAGCTGAGTAA:1 + chrX 21452475 5' + INE-1 533 1 69.31 TGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3R 20878472 5' + 297 44 2 70.30 AGCAACTGGGAGGATCCTTTGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chr2L 3951581 5' - Transpac 5202 2 55.45 TGGCANCGTTTATTCTTATTTAACTAGATTGTGTTGTGGGCGCCTTTGTTGGCACTTTGGATCTCGGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGCTTAA:1 + chr2L 13729263 5' - 17.6 255 2 68.32 TTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr2R 1365314 5' + jockey 30 1 55.45 CAAATGCCTTCCGCTCTCCACACACGTGTCTGCAAATTCCGCAAATATCCGTCTGTCCGTATGCACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTT:1 + chr3L 19679621 5' + INE-1 158 1 56.44 ATAGTTTTAATATGAACAAGCTTTTGTTCCCACCCTCAAGACCTGACTGACTGGGACTTGACTTAATTAATTATAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACA:1 + chr4 1174689 5' + jockey2 3242 1 71.29 CATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chr2L 21010870 5' + opus 155 4 76.24 CGCCGCGTCATTATTTGACATTGTTTTTCGAGGCGCCGCCGTCGGTTGCAACCACACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAAC:1 - 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Doc2-element 4297 1 63.37 ATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 8555844 5' - 412 7518 2 53.47 GTTGACAAAAGGGAAATCGTTGTAATAATGTAATACTGTGGGTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCG:1 - chr2R 21554797 5' - Transpac 192 2 58.42 AGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTG:1 + chr2R 9870972 5' - roo 9050 2 57.43 TGTCGAGACTGCAATGGTAAAGTGAAATTATGAAATTTCGCGTTTTCACTTCCACAACCAGTATCTATTAGTCTGGATCTCGACTATAGCATTCTCTCTTT:1 - chr2L 22927424 5' + INE-1 578 1 74.26 AAGCTATTTCATTGAACTCCGCAAAAGAAGATACTATAATCATACCTACTTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAA:1 + chrX 20885965 5' + Ivk 5371 1 54.46 CCCACTCTCTCCTCCACCATTTTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGT:1 - chr3L 13548813 5' + hobo 344 1 57.00 ATCTCTGATTTGATCTCTTACCAATATTTCAAAGGTAAACCAGGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACAATACATGAGTCAGTCACTTGAGATC:1 - chr2L 3722571 5' + roo 8824 2 57.43 CTCTTGTTTGCATTGCTTTAGTTGCTGCTGTTGATTTTGTTGGTGTTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCTGGA:1 + chr4 546350 5' + Max-element 8137 1 55.45 CTTATCTAGAATGGCTGATAACGCCAAACACTGATTGGTGGTGAGTGGAGCTCCCACCCACCGGCTATTTGTCGGGAAATCCGTCGCTTAAGAGAGAGAAT:1 + chr3L 12606609 5' - 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Porto1 4254 1 67.33 CATGTAAGGCGGAAACGAGGTGCTCAACTTTCTCGACTTTCCTTCTGTGCATCCTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTATGTTCCG:1 - chr3R 14419413 5' - TAHRE 10403 1 53.47 ACAATTACTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 + chr3L 6044729 5' + Tabor 22 2 57.43 TGGCCTCATGTTGCCAGCCGCGTCTTCGTTCTGTTCTGCACTTAATCGCGATTTCTGGTCACCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3R 11999212 5' - P-element 2874 1 64.36 CAGCAATAAAAGAATGGAAATTTAATAAGTTTTGCAGTCACCAAAAAAAGTAGCTGCATTGTGCAAAACCAATGCTTGTATGGCCGTTACACATCTTGGTA:1 + chr2L 7569182 5' + 1360 3374 1 74.26 ACCGTCTCATTGTGGACTCGAGTGTGCCTGTGCAACAAAAGAAGAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGTAAGCCAATTA:1 + chr3R 25210395 5' - gypsy12 10016 3 60.49 TGCAAGACCGCTCTTCAAGCAATACAGTCACGAATTGGATATGGATCAGACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTT:1 - chr2L 7481405 5' - Quasimodo 351 2 63.37 ATCTTCTTAAATCCTCAAAGTCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 + chr2R 13106779 5' - 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P-element 2860 1 52.48 GTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 10952260 5' - roo 386 2 54.46 GGAGGACGCGACATGTTGCTCGACAGTTACGAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 + chr3R 6735243 5' + copia 7 2 74.26 GATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:2 - chrX 2799681 5' + Tirant 49 2 76.24 TCAACGCCATAGTCGATTATTTTAATTATACCTTATTATTGTAAATATACGTAGATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chrX 21017870 5' + 412 7073 2 46.53 AAAATGGGTGGCAAGGTAGCGCGGTTGGGTGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCGGAGAAGTGCTGATGTCGCACTTTAACCGTTCGTTGGCGTTAATGG:1 - chr3L 3536105 5' - HMS-Beagle 58 2 68.75 CGCCACTCACGGACTCCTTTGGCCGGCGACACACTTACTAGCATCAGCAACAACAACAACAGCGGCAGCAGTTGCAGGAAATGATCTCACAGCAAAATCCA:1 + chr3L 11071055 5' + TART-A 160 2 65.35 TTTCGTTTCAATTTCCTATTTTGTTGACTTTTTTTGTGAATGCTTTTGATTACTTTTATGGTTTTTTTTATTTACATTTATTTGTTCATATGTTTTTTATC:1 + chr3R 30316917 5' + S2 111 1 65.35 CTATGTTCTGCCGCAAATCCACTCTGAAACTAAACCTTCGCCAACAATTTTGGGTATAAATCTGCACGTGCAGACAAGCACCCGGTTGTGCGCGCACCCGA:1 - 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chr2R 5531195 5' + 1360 65 1 60.00 TGGCATTTTCTTTCCCTTAGTTGCCAGGACAGGAGGGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 27775060 5' + roo 7 2 72.28 TGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chrX 5092982 5' - roo 9028 1 66.34 TATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr2R 14708964 5' + Doc 32 1 53.47 GGGAGCTGGAGAACCTCTTGGACACGGAGCGCCAGCGCCACAACCAGTACATCGCCTCCTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCA:1 - chr2R 14572151 5' - Doc 387 1 73.63 GAGAATATAATAAAAAAAAGATCGAATTGTGGTCATTTCGCTTTGTGGACGTTAGATTGGGCATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATAT:1 - chr3L 26170127 5' - diver2 55 2 66.34 AGCTTATACCTGCCGCCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGCTCAAAAACTTAAG:1 - chr2R 4673455 5' - Quasimodo 7325 2 72.28 TGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chrX 4366268 5' + jockey 4712 1 71.29 AAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTCAAAATTA:1 + chrX 20099941 5' - S-element 1669 1 74.26 AATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:2 + chr3R 19989252 5' - hobo 2912 1 52.48 TCTTGCTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 13546621 5' + roo 17 2 63.37 TTAATGGATTTTTTTCAAAAATACTATTTTATCAACATAAGTAGAGCAGAGTTGATCCATTGCATTGTACTGTATAATATTATTGTTATTATTATTATTAT:1 - chr3L 18284717 5' - mdg1 20 2 73.27 TTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chrX 16995098 5' + jockey 23 1 59.14 TAATGGAATATTCTTATTAATGCTTAACAAATGTAGCTACAAACAACCGATTGCCAATACACACATACATACATACATGCATACATACATGTATATGCTTG:1 - chrX 7113131 5' + INE-1 71 1 53.47 GCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2R 20744219 5' - roo 9047 1 53.47 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATAATTCTAGCTACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATC:1 - chr3R 4604461 5' + Ivk 47 1 67.33 GGGAATTGTGAAATTAAATAGTTATTCCAAACTTTTCCATCGGCTGGCATTTGTTTGTATCTTGCTCGACCAGGTCAAAATATTCAAAAAAAAAAAGAA:1 + chr2L 1719846 5' + TART-B 10629 2 76.77 TACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr2L 14790577 5' + roo 8693 2 56.44 CTCTCTTCACAGCCTCCCGCCCACACACGCACTTTGAGATCCTCATTATGGCACATCATCCAATCTAATTTAAGGCATGACGATATTTCCAAATAAAACCA:1 - chr2L 19821139 5' + roo 9021 2 81.19 CGTACATATGTACATAAAAATAGAACATCAATCAACGTTGATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr3R 16834079 5' - I-element 5316 1 59.41 CTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2R 13650108 5' - mdg1 388 2 57.43 TACGAAGTAAACTCTTTCACAATCGAAATAATACTGAATCGCCCCAAGAAAATCTGCCCACCACCCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr3R 29123429 5' - P-element 2879 2 70.30 TCTATTCCCAATCCTTGTGTCTCATATATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chr3L 10143227 5' - 297 6938 2 77.23 CATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 - chr2L 3951654 5' + Transpac 34 2 59.41 CGGATNATGACAAACATTTTTAATCACAAAAACGAGACGAGAAACCACCACCGCCAATTGCAGTGGCCGGGGGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCC:1 - chrX 12623976 5' + F-element 4389 1 75.25 CTAGCCGCCAATTTCAGCGATTTAATCACTCTAAGCGAGATCACAGCCATAAAGAAGAGCCAAGCCATGAGTAGCTAAAAAAAAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 16732026 5' + G-element 4325 1 41.05 TAAGCTTTATTGCTTTATTGCTCATTCGTCCTCAAACCAGAGATTTACCGAAAAACGGATTATTTAATTTAAATAATACATTGTTATTCAACGCTATGGTG:1 - chr2L 21592752 5' + BS3 325 1 58.42 AAAGTAGGAGAGATCAAAAGGAGGCAGATGCTGCAAAAATCAACAATAGCGCCGAGTACGAAATTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCAC:1 + chr2R 10686425 5' + Doc 288 1 67.33 GAGTCTACAGATCTGAACGATCATCTCCTAACTAGCCCTATAAGCACTGATCGCAACTGCTACCACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAAAGTATAAG:1 + chrX 6748202 5' - diver2 42 2 56.44 CGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 19018960 5' + hobo 43 1 70.00 TTTTTTTGTATTTCTTAGTTAACAGCTGGTCAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 3817432 5' + roo 8680 2 62.38 TATCGGACTGTTTGGTACTGAAACCACTTTAATCGGGCCGAGTCATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chr2R 10440363 5' - P-element 2816 1 45.83 TTTATAGTGTAATATCGCTAGGGATTTTAATGAATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTATATAAACGGGAATGCGCGACCTTCATCCGTCTACGCATCGG:1 - chr3R 18772956 5' + Ivk 5037 1 67.33 ACAGTAATGAAGTACTCCGCCCCCCATTCCACCCACTGGCATTTTCCGCCCACCACTCATTAAAATGACCACTTCAAAGGCCACCGATTTTTTTATGATGA:1 - chr2L 6146816 5' - I-element 308 1 79.21 CTTGCTCTGTGGCATCATGGAACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2R 8345475 5' - roo 403 1 74.26 CGGGGTAGCTTCACTTCACTTGAATAAGTACTGCTAGATGGTGCTTTTCAGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTC:1 + chr3L 23615660 5' - Bica 270 1 53.47 CAGCATAACGAACTCAAATTCAAGGTTCATGTCAGTAACCCTAAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAAA:1 + chr3R 7171577 5' + flea 204 2 56.44 CCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr2L 12815036 5' - hopper 1391 1 53.61 ATCCAAAAATAAAACTCAAGATACGAAGCTTCATGCATATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCA:1 - chrX 15292545 5' - Quasimodo 7335 2 64.36 AAGAGTTATGCATAATTTCAAGTCGGTAAACATGTCGTATGCGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGT:1 - chrX 16992326 5' + jockey 227 1 58.42 ATCCCGAATGATACCCCTGAGTGTACTAAAGAAATTTATATTTATTTTATTGTTAAAATATTATTATCAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTA:1 - chr2L 21590903 5' - INE-1 33 1 54.17 CAGCACTATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chrX 20806951 5' + opus 7022 2 60.00 AATCTCCATGAAGTAGGTCGGAAGTCGGTGAAGGGAACGATTCTACACGATGTAGGAATCTATAGATTATCGTTTGCCAAAAGGCCAATAATCAAAATCAA:1 + chr3R 24755648 5' - 3S18 414 1 71.29 ATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 + chr2R 5067624 5' + F-element 29 1 54.46 CGTATGCACTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chr3L 8713075 5' - opus 477 2 58.42 TCTATGGTAAAGTGGCCCACGTGAACAACGTACAAATGTTATAATTCGGCACAGAAATACATACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGT:1 + chr2L 21846548 5' - S-element 1707 1 70.30 CAGGAAGGGTAATCACAGAAAAGGTGACGGCATCGGGAAACTGCAGGAATGCATACTTCTTAGATAAATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chr3R 19346872 5' - blood 367 2 66.34 GGACTTGTATTTTCAAGTGTGTGGCACCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACACCATACGATTTTTTTGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTC:1 + chr3R 2973469 5' + 1360 50 1 72.28 CTTATAGTCCGTACATAAGACATCATAACCTTCTGATTGAATATAATAGAGATCTAATTGTGTGCAATCGATTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTT:1 + chr2R 2884445 5' - Ivk 5134 1 58.42 CACTGCAGCTGGCCCAACGAATACAGACGGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 + chr3R 27283989 5' + Max-element 7 2 60.47 CGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr2L 4160129 5' + Tirant 8145 2 61.39 GATTGTCCGCCGCCCTCCTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr2L 12815015 5' + hopper 7 2 72.28 GCAAAATATATGGATATAAAACTGAAATATTAATTGAAACATTAACTTTACCGTGTTTATAAATTGCCACACCACTCGAGTGAACAAATTTGAACAAATTG:1 - chrX 23048370 5' + hopper 996 2 74.26 TTCTTTGATTTAAATGGTTTAGTCCAAACAGTTTACCTTTAAAAAAGTTTTTTTTT:1 - chr3L 19127796 5' + FB 405 1 57.14 CAATACAAAATCGCCCACATTTGCGAACTGCAGTGATCAGTTATCAGCGGGAGCGGATCGACTTGCTTCAGACCATGATGAAATAAAATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2R 16583379 5' + P-element 7 2 72.28 TCTTGAAATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 + chr2R 14708945 5' + Doc 11 1 73.74 CATTTATAAAGTTAAATACGGGAATCAAATATCAGGAACTAATAATGTTATATATAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTC:1 - chr3R 943481 5' - Max-element 259 2 57.43 TATAGTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTA:1 - chr2L 21635356 5' + F-element 474 1 66.34 AATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2L 10793199 5' + I-element 36 1 76.19 GTAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTA:1 - chrX 4366290 5' + jockey 4666 1 77.92 GGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3R 20149761 5' - 1360 3343 1 74.00 GTGGGCGAATAAGCCTTTTTTCGGCCGACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:2 - chr3R 12539585 5' + roo 8673 2 71.29 TAACTATGTAATTATTTATTTTAAATCGTTTTCCCTCTCATCTTCCCACATCAAACTAATGTGTATGCTTAATCTCAACCTTATAGCTTTTATAGTTCCTG:1 - chrX 22599760 5' - INE-1 155 1 50.50 TCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1 + chr3L 19951179 5' + Ivk 10 1 69.00 TTTACATTCTGCCTGTGGCACAGGCGCACAATTTTTGCAGTCGATCTGCATTTTTTGCCGTCTTAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTC:1 - chr3L 51120 5' + 3S18 5814 2 66.34 CCTGGCTTAAATGATAAGAAATTAAGATTAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACAC:1 - chr3R 29266685 5' - Ivk 37 1 82.18 CACAGTCGGCGGTCCTGATTGCCCCTTTTGCTCATAAATTCACTTAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGCTACACTTTCTTGTCCGATTCTTAACCG:1 + chr2R 8998605 5' + Circe 48 2 55.10 GCGGGAGAGAGAGAATAAGCAAGCGAATTCAAACGAAAGGGGGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTC:1 + chr2R 16180136 5' - Max-element 62 2 61.39 GTGGGNCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2R 23580827 5' - P-element 2862 1 50.51 AATTTTTGAATTTCGTTAACTGAATGAAACGCTGTTAGAAACTAACGAACTAAATTAAAAGAAATTTTTCTAAAAATTGTTTTAATTTTTTTTTTTAATTT:1 + chr3L 18073167 5' - Doc 4699 2 65.35 ACAACTTGTTCAGGGAGAATGTCGCACCCCCAATGCAATAGATGTATATATATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 + chr2L 2308631 5' - HMS-Beagle 226 2 59.00 CAGCTGGTGAAGGCTTTTCGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3R 6622684 5' - P-element 2835 1 29.00 GTGCCCTATCAACGTGGGCCTCTTTTGACTTTCCGCTGTTGTTCAACTTGCTCTACATACTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTTTTGAGCTTTTC:1 - chr2R 21888768 5' - Idefix 7240 2 61.39 CTATGGGTAACAAATCGTTTTACAACACTATTGAGAAAAGCCTAAATATTAATATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 5953078 5' + pogo 19 1 60.40 CAGAACGGACCACTCAACTTGGCATCGTGTATACTGTATAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 - chr3R 27801346 5' - Burdock 222 2 62.38 ACAGCNCGAGAGCCACCTTTCGATAAGGTCTACAAATTGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCA:1 - chr2L 7882312 5' - Transpac 211 2 62.38 AGTGCATACAAAAAGAATGAAGAAGTTATACAATGATCATGTGTTTTACTTTGTTGCAGGTTTCAAGTTTCGAAAATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTAG:1 - chr2R 6271570 5' + GATE 397 1 71.29 ATTTTTTTTTTTAAATACATAATTACTATATACATAAATACATTGTCGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTA:1 - chrX 12585700 5' - copia 5088 2 60.40 CGAACGACGACTCACTTGAGGACCGATGGCGCAAAAGGAGCAAGGGGGAGCGTGATGCGAGGCGGGCATGTGCGCGCTGGGTGACCGTCGAAGGCATGGAA:1 - chr3R 29469865 5' + gypsy10 5812 2 57.43 GTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 21092444 5' - roo 9043 1 54.46 AAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTAT:1 + chr3R 18210341 5' - Juan 4167 1 72.28 ACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 + chr2R 5067620 5' + F-element 25 1 58.42 TTTAACTCTCTTGGAAATAAAAAATTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3R 23591473 5' - pogo 2053 1 79.21 GGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr3R 25097902 5' + P-element 35 1 45.54 AAGAAAATTCAAGCGAAATGTTTAGCACTAACTAGTCAGCATTTTATGTACACATATAAATAAATATATAAATAGATATATATATATATATATATAAGAGA:1 - chr2R 17351068 5' - blood 7193 2 88.12 AAATCNAAATTCAAACTGATCGTGCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr3R 11999278 5' + P-element 51 1 27.72 CCTAGATGTACAATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chrX 17058233 5' + 297 6580 1 75.25 CAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 + chr3L 11661736 5' - hopper 1363 1 77.23 GTCTTATTTCTTTTTCTTATTTCTTGTCCAATTTCTTTTTAAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGACACGAACAGCCTCT:1 + chr2L 22216882 5' + invader4 97 2 62.38 AGTTTTTTGTGCTCCGCTGACTCGAACCGCTAAAGTTAAATAGAGTTAAGCGACAGACAGGCAGACAGACAGACGATACCCCTTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 9907691 5' - accord2 356 1 67.37 TTACATTCAACATTAGTGTTGCCAACTTGGTGATTTTATGGAAAATACACTACGAGTATATACTCAATAGATTCGCTAGTTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chrX 1281771 5' + roo 8664 1 79.21 TGACTGATTCCTCGACAGCTGCCACGAATCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 16761330 5' - roo 9046 1 54.46 TAGGCCTTGGCACTAAAAATTAAGCTGAAGATACACAGGACGTATACGTAATGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chrX 17564528 5' + 1360 21 1 54.46 TTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTT:1 - chr3R 6117291 5' - Tirant 353 2 71.29 CTCAAATGAAACGCCGACTGAGACGCCGACTGCGACTTGAGACTATGGGTATGGGTATGGGTATGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chrX 17830712 5' + P-element 12 1 67.33 GGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTTAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAACCCATAGCCC:1 - chr2L 3388136 5' + F-element 313 1 51.00 ATCGTGGTTCCACAGTTCGCCCCTCAGCGAAACACAGAGTATGAGGGTGATTATATACATATATATATGTATATATTTATATACATATATATCACATACA:1 - chr2L 19411580 5' - Dm88 4372 2 66.00 GCCCGNGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr2L 16948755 5' + jockey 4676 1 74.26 GTGACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAAT:1 + chr3R 20147868 5' + 1360 254 1 64.52 CACTTCGAGTCCCTGCCCCACCACCACCCCCAGCAGGAACACCAGCCACAGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCACACACAGCTT:1 - chr3L 17998663 5' + Quasimodo 7074 2 54.46 TTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:3 - chr2L 15080571 5' + hobo 33 1 57.43 ATTATTAATTGTTTACATTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr3R 15151318 5' + jockey 4698 1 56.44 CCCCGAACCGATGGCTGCAATTTCCCCAAGTTTTCCAGGCGAAACCAACCGTCGCATGGCGTGCTGCGTAGCTGCGCTGCCGGATACGCCAGCGGCGGAGC:1 + chrX 5856348 5' - 412 294 2 68.32 AATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTA:2 - chr3R 20137341 5' - Burdock 229 2 59.41 TTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr3R 11119858 5' + 297 42 2 74.26 AACATGCATGCAATTTAAAACTAATATTTAAAGCAACAACAAACAAAACAACGACTGCGGCGCGGGAACAAACTAACTGCAACGCCGGCCGGACCTATTTG:1 - chr3L 17953457 5' + HeT-A 5618 1 51.49 TGGTGGCGAGGAATGGGTGGCAGCTATTTTGGGCTTGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGGCATAGGTTCAGG:1 + chr2L 13465863 5' - Fw2 3546 1 71.72 GGCCCCAATGGCATATATATATATACGTGCTCGAGGATATTTATACAAAGTGACTAGCCTGGACATGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGATA:1 - chr3R 23829108 5' - Quasimodo 411 2 56.38 TTCTTTTTTTTTTTCAACTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTA:1 - chrX 11222923 5' - Rt1b 5047 1 82.18 TTTACACAGATAATATAGACGAAATCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGT:1 - chr2L 10322433 5' - mdg1 7344 2 76.00 ACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2L 14790566 5' + roo 8682 2 61.39 GAATACGTCACTATATATATATTTTTTTTTCGCACTGGTCCCACGGCCACACCTGCCGCCCAATCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGC:1 + chr3R 2472939 5' - Cr1a 4397 1 80.21 AGTCCGCCGCTTAAGCTGAACTCTTCAATGTTGTCGAACTGCACCCTGGGTCGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACGAAATCTGGCATTCAA:1 - chr2L 18991157 5' + diver 5754 1 68.32 ATAAACTATCTTTCTTTGTAATCCAAATAGTTTCGTTGACTGTTTCTATTCTTAAATCATTATGTATATCTTCGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTG:1 + chr2R 8659221 5' - Porto1 4358 1 70.30 AATGTATTGTTACCAAAGAATTCTATTTAATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2L 13136820 5' - roo 396 1 67.33 ATACCCTCCTTTGGCACAAATAACTTTTTGTAGTAAGTCCGTTTATACAAAGCTATACTAAAGCCCGTGTAGACTTATGGCATACAGCTCTGTGGTACTGC:1 - chr2R 4785308 5' + G4 3439 1 64.36 CTGGGGTGAATTAGGCAGATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCT:1 + chr3R 14917161 5' + HMS-Beagle 6801 2 74.26 GTAGGCTACAACGACGACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chr3R 26842886 5' - opus 7485 2 63.37 GACCACCGCAAAAAAAAAACGAAAAAGAAAA:1 - chr2L 4026379 5' + Doc2-element 233 1 87.10 TGAACATCAATGTATCCCAAAAGTGGGCTCGCTTATAAATATCCCCGTTTAAATTGCTTGACGTACCAGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCACC:1 + chr2L 18084178 5' - accord2 7194 1 71.29 TTAATNCAAAACTCGCAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chrX 18144331 5' - hobo 2928 1 67.33 TACAAGCTCTACGATTTTTAGCTTACACTGGTTTGTACTGTTAAACGGGAAATTTATCTTAACGAAGATAGGAAACATTTTTAAATAATTGAAAATAGATT:1 - chr3R 29651682 5' + Transib5 258 1 75.25 TTTTAAAGCAGTATGCTTTTAAATTCCCTTCAATTCATCAAACTATAGTCTTTCTGCTTTGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGCGGATTTT:1 - chrX 12974659 5' + gypsy7 300 1 67.33 TACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chr2R 16940388 5' + 297 6623 2 77.23 TCCCATTAACGAGAGCCGTTTTTAATGTTTTACTGAAATACTGAAACAATTTATTAGACAAAAGAGACGTTTTATTTTTAACAGAATCACAAAGTTAAGTG:1 + chr2R 19381113 5' - transib3 213 1 78.22 TTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGC:1 - chrX 20806925 5' + opus 7049 4 73.27 GCCAGAGCCAATAGTCAGTCATCAAGGCTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr2L 19019043 5' - hobo 2936 1 74.26 TTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chrX 2799697 5' + Tirant 8139 2 60.00 GATGTTCATAAAAGTTAGACCTAGAATGTAAAGTTGCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 10715327 5' + pogo 37 1 62.38 ATTTTTTAAATTTTATTTAAAGACTTAGTGTTATTTTTATCTGCACACGATACTTTCCGTGGGAGGTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAAGAT:1 - chr3L 25800581 5' + 1360 155 1 70.00 TAATTAGAGTGTCTCTTGCTCAGTTTTGGTTAAGTGTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chrX 13546608 5' + roo 8668 2 76.24 TCCTATTAGGATGCGACAAGGCGCTTGACATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAATAATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTC:1 - chr3R 4152120 5' - Idefix 423 2 71.29 CAGTGTTGTTTGCCATGAAATGCCTGTTTGTTTGCCTGGGTTTTGTGTACTTCAACATGGTCGGAAAAAATACGTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGT:1 + chr2R 22501871 5' - gypsy4 439 1 59.41 GAGAGTGGCAAACCCACAGATCACCAGCCACAAAGCAACGGCTTTGACTGCATACTCAGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTT:1 + chr3R 3190407 5' - Doc 4480 1 62.38 AGTTCAAACCGATAGTGTTAGCTGTCCATTGATGGATCAGGTTTTAAATTAGACTGTATTTTCAAAAGAATTATTACTGTCATCGGAAGTGGTTTTTTCCT:1 + chr3R 16118812 5' - transib2 2448 1 73.27 GATGGCCCGATTCCTTGCCAGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr2R 16988276 5' - opus 480 2 61.39 ACCACNTTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 + chr3R 12605626 5' + F-element 52 1 83.95 ACAACTTTTGAAGGTTCTGATAGCTCACTTCGTGTACATATTCCAGTGCCCAAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTCATTGT:1 + chrX 21933230 5' + HMS-Beagle2 6886 2 61.39 TGCATAAACAATATTTGCCTACAATAATCAACAATTCTACAAAAATGCAGCTCTAGCTTTAATATTTGACTTTATGCCAGAAAAAGGGAATCTGGGCCAG:1 - chr3L 23692988 5' + transib3 2858 2 69.00 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 1982172 5' - 1360 3365 1 90.00 ACTCCACGGGAATGTTCATATTGACTTAACGGAAACTAGAGATAACTAGAGATATGCAAAAATGAACACATTATGTTTTTTTTTATTAAACGAAATTATTT:1 + chr2R 8436834 5' - jockey2 3391 1 75.25 AGCGCACTCACACACCCACCGGATCCACCGCTCTCCGGCTCATTAATTCCGCTTTATCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGT:1 + chr3R 17059853 5' - R1A1-element 5248 1 63.64 TAGTACATTTCTCAAACAAAATGCTTGCATAACTATATTATGTGTAGACAATGGGAAGAAAGAATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 10473426 5' + flea 4768 2 66.34 ATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 9316973 5' + opus 7047 4 81.19 GGAGACAAAGCTGTTTTTGATAGGTGTGTAAATGTGCCAGCGGAAATATGTGGAGTAGACCTCCAAGTCCAAGGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAA:1 - chr2L 5390635 5' - F-element 273 1 78.79 TAAGANTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3R 24081614 5' + 297 29 2 63.37 TTCTTCTGAAATAAAAAGATTTGTAATCATTTAGTGAAATAAGAATTATATTTTTTTCACTTATAAAGATTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTC:1 + chr3R 12313233 5' - Bica 134 1 74.26 AAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 17896954 5' + hobo 43 1 76.24 CATAGTTGTCTGCAAGCGAATAAAATCGATTGCCCTATAAGTCATTGTCCCACATCTCATATTTCAACCTCATATTTCTGGGTAAACACAAGCGCCCAAAA:1 + chrX 21932894 5' + HMS-Beagle2 6937 2 67.33 CTTTAAATTATTTTTTGTGTTTATTTTAGAATTAGAAAACATAGTCCGTAAGATGAAACAACATCCACCCTAAAAAAGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAA:1 + chr3R 15751846 5' + opus 7278 2 76.24 CACAAACTCTATTTTCGGGAAGGTATCGTCATCTCGATGCTGGAGTCGGGGGGTCGTCTTTTGACTC:1 - chr2R 23773838 5' - gypsy4 6483 1 80.60 ATTTGACAAATGGCTTCTGGCCTGCCAGTCCGCCGATCTGGGATTCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTATAACT:1 - chr3R 10447445 5' - invader2 4800 1 58.42 TGGCCAAAAGGGATTGCACAAGTCCACATGGAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAG:1 - chrX 17042708 5' - copia 211 2 69.31 CTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 - chr2L 16948706 5' + jockey 4725 1 76.24 ATTATTCATTTCCATTGTCAGTTCCAAGACAGGCCACAATTTTGGTATTAATGTAATTTTTATTTATTTATCTCAAGTATTATAAATCCTAATTATAAATA:1 + chrX 1011140 5' + transib4 2565 1 56.44 ATAAACGATTCTCATACACGATTTATTTTATAGCTATACTTGGATATGCATCAAATACAAAAATACAAAACCCTCGTTTATTTTCCTTAATAAATAATAAA:1 + chrX 22444427 5' + Juan 4051 1 74.26 GACGGGAAATGCACAACGTGGCCGAAAGTGTGTGCATCAGTATGTGTGCGTATGTGTATGGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAAC:1 + chr2R 16474137 5' - 412 70 2 51.49 AGTATAGCGCCCTATAAATAACTGTTGACAACATGGGTCAACGGTATATGTATGCATAATCTCTACCTTCTTGCTTTTATAGTTCCTGAGACCTCGACGTT:1 - chr2R 19426246 5' - INE-1 142 1 55.45 GATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGG:2 + chrX 15408753 5' + INE-1 537 1 84.00 TGCCATTAAGCGAAGCGTAAACCCGCAAAGGGGATGAATGCCGTACGTCCAGATTGGCTCGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCA:1 + chr3L 9924440 5' - G2 2611 1 62.38 AAGGCAGGCAGGAAACCAAAATGTTCCCGATGGAAATAATGTTAGAGAGAGACAGGCTCAGATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGG:1 - chr3L 24514852 5' - R1A1-element 5317 1 63.37 GGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGTGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr2L 17722758 5' + blood 20 2 56.44 GATTTCTGTCGGGGGCGTTGAACATTATTTACATCCGATCTTGTCTTTCCTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2L 14612125 5' - roo 403 1 73.00 CAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATC:1 + chr2L 17784622 5' + gypsy10 29 2 50.50 TAATATCTTGTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAAC:1 + chr3R 13375933 5' + Tc3 239 1 80.20 CAGTGNGTGGGACAGTCGGCTATATTTAAATGCTGCAAAACTCCAATTTATCCCCGGCGATGACTCCTGAGGCCTCCAACGACTCGGTGCTTTCGTCCTTC:1 + chr3L 9442900 5' + TAHRE 10090 1 67.33 TAGCCAGCGCCTTTGTAGCCTGTCCAAAATCATTTGGGCTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCT:1 + chr3L 4745654 5' - Bica 169 1 62.38 GAAATGTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCG:1 + chrX 16760803 5' + invader4 2743 1 41.58 GTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3R 19989299 5' + hobo 56 1 76.24 TAAAATACGTTTGTCATTTGCAACCCATTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACA:1 - chrX 5149692 5' - BS 5040 1 73.27 ATATGACTAAGCAGCTCAATTAGTTTATGGACACAATGATTTACAAGCCTGGAAAGCCTGAAAAGAACCCTGGGTCCTACCAGCCAATCAGTCTCCTGCCT:1 - chr3R 5328450 5' + BS3 436 1 65.35 CTTTTCGCATTCACTGGATCTGGAGTTGGGAAAATAAACGTGCCATAAAGGTTTTTTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCT:1 + chrX 6373631 5' - X-element 4687 1 51.49 TAAAAAAAGAAAACAAAACAACAAACATATATTTTATTATGCAAAAGGCAATTTAGGTAGCTAAGCTTTTTCTAAAATATTCACAAAAAAAGAAA:1 + chr3R 7321944 5' + TART-A 13403 1 66.32 ACATCCGTCAATGGCCATCAGGATGTTTCCCTACCCATTTATTTTCGTGTGGGTTTCGCTCAGTTGGTTTGTTGTGTTCTTAGTCGGAAAAAATACTTCA:1 - chr2R 22039122 5' - gypsy4 463 1 72.00 ACCAAGGAGCAGAAGAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTACGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2L 12949202 5' - 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F-element 330 1 74.26 CCATAAATTGCCAGCGCTCCGCTGGCCGCTCAATTTAAATTAATGAATTTATGCGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 4876724 5' - roo 9047 1 54.46 ACATATTTTTAAAGTATTTGTTTAATATCCTTAAAACAGTCGCTTTTCTACTTGTATATCTCCCTAGCATTCCTGTATCTGAGTAACGGGTATATGGTAGT:1 + chrX 364323 5' + INE-1 548 1 73.27 TATAATCTTATTAATTATTAAACAGGAAAAGTAAAGATGAAATATCATCATCATATCATGATAACGATAAGTCTGTTGGATTATTATAATTATTATTAATA:1 - chr2L 13271069 5' - mdg1 51 2 43.56 GTATTATAAAATTTATATAAAAAAATGATATAAAATACAATTTATAATTCGAATACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACAC:2 + chrY 356543 5' - Cr1a 4441 1 33.66 GTTTTTGCATAGCCTGTAAGAGCAACAACGCGTATTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCACACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGA:1 + chr3R 4708121 5' + F-element 317 1 79.21 CCGCTGAGAAAAGTACATAGGAAATACATAAACACTAAGTTACCACATATAAGCAATGCTGACGCGCCCCAACGGAGTTCAGCGCTCTGCGCTAAGAACGG:1 - chr3R 771895 5' + gtwin 7004 2 76.24 CATTTTTTTTTATGAAATTTTATGAAATTTTGAATATGAAAATCAAACTGTTCTACATGGCTTTTTAAGAACAATATATATTATATATAATAATATATAAA:1 - chr2L 13876629 5' + Tc3 288 1 49.50 ACCCTTCGCGATTGGCAGCGATTTTTTATTGGCCCAGTGCCGGCTAAAATAAAGACGAAAGCCTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr3L 22039686 5' - jockey 4979 1 64.36 TGGAANATACACTACGAGTATATACTCAATAGATTCGCTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 1281733 5' + roo 38 2 66.34 CTCGAAGCTTCAGCTCGCGCTTCAAATCCGCCACCTGGAAAGGAACACATATAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGA:1 - chr3R 9504821 5' + gypsy4 27 2 57.43 CTTACTAATCAACGAAACGGTCAATGAGTGGGAAAGAACGTCAAGAACTTCTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAAT:1 - chr2R 18949056 5' + roo 9019 2 52.00 TAGATGCCATTACTTTTGCAATTTCCTTCAGTGGTATTTTTAAAAACTTCTGTCTGTTAAGAAAAGTTTGTAATTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGA:1 - chr3L 12044701 5' - I-element 5122 1 81.19 CGATGGACTTTGGATTCTTGCAGCATAAGAAAGACAGAAAGCCGGGAAAGAATGAAAGGTAAATATAAAGACCCAACAATTGCTCTCAGCACAGGAGCGCA:1 + chr3R 19634666 5' + Porto1 387 1 73.27 AAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTATTTAAACCGAAGATATCTCCAAATAAAATCAGTTTC:1 - chr3R 19449491 5' + roo 9026 1 67.33 ATAAATGGCCTCATTATGTGAACATAAATGAGAATATATGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chr2L 6388268 5' - copia 250 1 60.40 CTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 14675565 5' - roo 9019 2 79.21 TGATACAAAAAGGGTTTTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 + chr3R 4970532 5' + diver 5908 2 59.41 CGCAAGCTGGTTGGCGTCGGTCGGAAATTTCTAGAAGCGTGCGAAAAGAAAAGAATGAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTAC:1 - chr2L 23353018 5' - rover 7111 2 62.38 ACTAAGTAAAATTATTGGACAAACAACCTTACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCA:1 + chr2L 17784591 5' + gypsy10 5640 1 77.23 AGTCAGCATCAGAGCCAGAGTTTTCGCATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3L 7205534 5' + Doc 36 1 51.49 TGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 14790660 5' - roo 388 2 58.42 CTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr3R 25097899 5' + P-element 38 1 42.57 GCCTGAACAAAATGTTTGCTCACCGATAAACAACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACT:1 + chr3L 12352570 5' + G2 3023 1 68.32 AAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACAT:1 - chr3L 9909787 5' + Transpac 4918 1 75.28 CTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 - chr2L 5646877 5' + jockey 4724 1 72.28 AGATCTTTCTAAAAACGACATGTGGGTAATGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATGAATATATGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATTT:1 + chr3R 2631243 5' - invader3 5429 2 79.21 CCCAAATCTGGTTGAATACGACGGTAATGTGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACT:1 - chr3R 12047507 5' + Stalker2 7254 2 73.00 AAGGCCATTAGCTTCTCGGTGCGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCCAAAAACCTTCAAGCTTTTATACTTCCTGAGATCTCGGCGCTCATACGGACA:1 - chr2L 7999333 5' - INE-1 132 1 62.38 GAAAAGGTTTCACGCTTAAGCCTACTGGTCTCCGGACGCTTGATGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCGCCTCGCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTC:1 + chr3R 14824017 5' - R1A1-element 161 1 57.00 TAAAAAAAGAAATATGATTTCTGATATGTAGCAGTTTTTAATAATTTAAGTGCTTATTTCATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:2 - chr3L 8614578 5' + opus 15 2 65.35 ATGGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGA:1 - chr3R 7522394 5' - blood 369 2 70.30 ACTAATCGTGCATATCAAGCATTTGTATATGGATATATATACATACACACACACACACATATATATATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTC:1 + chrX 21292568 5' - rover 343 2 76.24 TATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr3R 7415196 5' - I-element 5314 1 66.34 GAAAGAAAGGAAAATAAATTTTTTTTTTTGTGATGACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGAT:1 - chr2L 4743219 5' + I-element 6 1 68.37 ATTTTGATTGTTTACCACTGCTTTTATCTCTACTTGAAAATTAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCCGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr2R 6701999 5' + pogo 30 1 56.44 CGTGTGGTAAAATACTGTTCGCCCAACTTGGCCCAGCCCACGCCCACTTCGCCCCCTGTCAGCGTTATCCTTACATATAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 9859023 5' - accord 184 2 59.41 AAAAATCTAAACTATAGATTTTTGGACGGATTATCTCTGGAATCTTCACAATTCGCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGG:1 + chr3L 24937350 5' + Q-element 65 2 70.30 GTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3R 4601319 5' + opus 7155 4 70.30 AGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGC:1 + chr2R 14351878 5' + Max-element 56 2 78.22 GGAAAAAGCGAAATTAGAACTGTAAATGGCATTAATATTGAAACTTTGTTGCCTCCACAACCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATA:1 + chr3R 27801256 5' + Burdock 11 2 68.32 TGTGGAGTAATTGCCGAGGTCAGCCGAGGCGGCAGCGGCAAACAGCGTTGTGCATTGGATTTGCCCTTCGGCTTATCCTTCTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chr3R 28962780 5' - Doc2-element 223 1 53.06 AAATGTTTATAAAGTATATATAAATATAAAAATATATTTATATAAGTATAAAAAATAACTCTAATAATTATTAGTGTTAGTAGGATTTAATTATGTACTAA:1 + chr3L 13521987 5' - Cr1a 4280 1 49.50 AAGAACTGGCCAAACTTGCCTTCGCTCCCCCTAAGGAGCAACGTTGGGGGTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAA:1 + chrX 19986351 5' + Stalker2 25 2 53.54 CGTGGCATGACATAGAATGAAAAAAGCGCTAAAAAAAAATGGGAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAGACACTATGAGCCGGAACGATACTCGCGTTCAGCGACA:1 - chr3L 12216088 5' + Doc2-element 292 1 71.29 AATTTGGCCAACAAACAACAAAAGTTGCCCCCGGGCAGAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACC:1 - chr2R 23108718 5' + F-element 305 1 62.38 TGATTGCTGCTGCCAAACTGAAGTTAAAGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTG:1 - chr3R 9997196 5' - Max-element 8521 2 72.28 CTCGAGTTTCCCAATCAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACA:1 - chr3R 11094592 5' + 3S18 13 2 66.34 GGTGCNTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAAC:1 - chrY 3648872 5' - 17.6 7374 2 80.20 AATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTCGGTCGATAATTTTATGAATTATTTGGATTTGTTGCCTTCGAAACACCAGTGTAATCGTGTTCG:1 - chr2R 7032155 5' - Gypsy12A_LTR 1979 1 69.31 GTAGAGAAATGCTAGGCATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 5686059 5' - P-element 2847 1 39.60 TGGAGGCACTCAGCCGCCAAAGTGGAGTTTGCTCCTGTGGCAAAACCAAAAAAAAAACCAAAAAGCAAAACGCTGCCGAAAAAATAAAAAACTTGAAAAA:1 + chr2R 12113355 5' - FB 175 1 72.00 CGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTATACGAATATTAGAATTCAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTTTGCACA:1 + chr3R 4577501 5' - 1360 181 1 76.24 TACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr2R 24021634 5' - pogo 2062 1 69.31 GTGTANACGGTTACTCGTTAAGCAAGGGGGTGCCGCTGACGAAGTTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAG:1 - chrX 9974626 5' - Doc 496 1 69.31 CAGATAGAACTCATAACAAGTTGATAATTTATGTCATTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 + chr2L 4743145 5' - I-element 5322 1 60.00 TCAGTCAATCGAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2L 3951997 5' + Transpac 4955 2 61.39 CCTAAAAGCGGCACTAAATTTGTTATATCCTTTTAGTAATATTCTTATGTAACAGGTAGAAGGAAGGAAGGATTCGCATTCGCATTTCCACTAGCTGAGTA:1 + chrX 22545293 5' + INE-1 532 1 63.37 GACGAACAACCCGAGATAGTTTCCATGCCCAGCGCACGCAGATCTTAAAACACATTTCTGTTTCCATGCCTCTCATAATTTATAATTTATATTTCCTTTCA:1 - chr2L 14097938 5' - copia 246 1 74.26 GCAGGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 5092998 5' - roo 393 1 49.50 AATGCCATCCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGA:1 - chr2L 17444099 5' + G2 2781 1 66.34 AGGGTACAATCAATTCGGCCCTTTACAGGGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAAT:1 + chr2L 20924109 5' - Max-element 251 2 70.30 TGATTGAATCGCTTTTGGAACGCCTTGAGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATA:1 - chr2R 24628811 5' + mdg1 49 2 71.29 TTGATACATGTTAATACAATATTATGATAAACAGTTGTGGTAACAATAATAGCACCATAACGCATATCGTGTTTGTCCCAGCGATTCTCTATTTTCTGACA:1 - chrX 22900313 5' - Tc1 1594 1 74.26 GGATCAAGAATTGTTTCAGAGCGTACTTTTTTTTTTAAATTCTTAGACTTACGGGAGGAAAATTAAAATTTTGTACAGATACCACCTACCGTCCGTATGTG:1 + chr2L 21211681 5' - Rt1b 5092 1 69.31 AGAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2L 12949215 5' - 412 456 2 63.37 ATAGCAAATACAGCTCCTATAGATAAAACATAATGACAGTATCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr2L 21794077 5' + I-element 44 1 75.25 TTTGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATCATTTTTACGAGATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAT:1 - chr3L 2486000 5' + jockey 4671 1 69.31 CTGCCATTCTAATGTGAAACCACGAATAGAGAATGTCCTTAAACATATGCATGGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTGCTGCCTCTGTTAATTTAA:1 - chrX 2925244 5' + G4 3777 1 55.45 TCTATTTGTGGGCGCCACCAATAACACGGTAAGATATTTTTTAGTCTTATGTTTCCATGTATAAGATTTTGTTGCACTCTTTAAAAATATTTTATTTAAAA:1 - chr2L 18603713 5' - hopper 166 1 54.46 ATCTCCCAGCATTTGTTTCATTTTCTTCGTGTGGCATCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTTT:1 - chrX 7666606 5' + accord 7030 2 67.78 GTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTC:1 - chr2L 21635352 5' + F-element 478 1 62.38 GTATGCTTTGTGTTTGAACATAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr2L 22084552 5' + copia 4894 2 54.46 ACGTCCGCTGCAGTGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 - chr3R 22800189 5' + flea 37 2 65.35 TCGTGGAGTAAAACGTTATACTAGATTCGTTGAAAATATGCAACAGACAGAATGAAGCCTTTTGCGACCATACAAATTATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr3R 6388709 5' + INE-1 81 1 85.15 ACCTTAATAAATGGCCCAAACAACATAAGCCCTGTGTTCTAAACTCTCGACCAGCTCAAATTCAATGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTG:1 + chr2L 6604572 5' - I-element 302 1 62.38 TTGCCAACTTGGCAAGTACGCGTCTCTTTTAAGCTCCAGTGACCTTCAGCAAGAAAAAGAGTGCATTTTCAACAAGTGTTTGCTTTTCTTTTTCTTTTTTT:1 + chr2R 22321681 5' - gypsy7 5009 1 64.36 TAAACATGAGTGCTTTATAGAAATGTTGCAATTTAGTTGGCAACTGTAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTCTTACATCTACATCTGCAATTTTTGTTA:1 - chr3L 1120211 5' - I-element 431 1 53.47 TATTAAATATACACAAATGCTTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGT:1 - chr3R 11999878 5' - P-element 353 1 23.76 GGCCTAACGACCAGATGCCATGGAAGTCGAAAAAGCCAACGGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chr2R 16333987 5' + P-element 31 1 48.00 TAATTTATCTGCGTGTTAACAAGCCGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTG:1 - chr2R 11264933 5' - Doc 4497 1 75.00 CTCCTTTACATACGAAGGGTATATAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGAGCCC:1 + chr3R 26842816 5' + opus 161 4 77.23 ATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 - chr2R 14778500 5' - mdg1 382 2 65.35 GTGCGTTCTCGACGGCTAAGCACTCTGGGCGCTTTTGTTGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1 - chr3L 12610500 5' - Quasimodo 6980 2 62.00 ATATGTATTTCGTTAATTTCAGACGCTTTTATTTAAGATTTTAAATATATTTTCTGTTTACCATGTCTACAAAATGTATTATTATTATTTATTGTTAA:1 + chr3L 2925546 5' - flea 242 2 87.76 TAACTGATCTGGTCATCGACGATCCTCCATTCGTAGAAGTGGTGGAAAGGGAAGTGGTTGTTGAGTCCGCAAACAATGGCTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2R 14675645 5' + roo 8664 1 79.21 AGCTTTTCCGATTCATTCACCTGCTTATAGGATCTTCTCGTTTCAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTA:1 - chrX 17968436 5' - Tirant 8477 2 52.48 GGAAAGGGTTCAGAACACGCCCCCACTAACCAAGCAGCCGCGAAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - chr2L 3889606 5' + jockey 4790 1 57.43 CCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chrX 19116910 5' + opus 7166 4 82.18 TGATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 + chr2L 10746635 5' + pogo 35 1 66.34 TCTATCGATTTGCAAAAAAATATTGTTTCCACGCTCACTATAACACCCTAATACAGCCCAAAACGGCCACCCCCACCATCATTAATATGATGAAGCGTGTC:1 + chrY 3652556 5' + Rt1b 4769 1 75.25 CCTCGTTCTCCGACTCCGCGGTGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr2R 9829437 5' + transib2 50 1 75.25 TAGTTCGCAGATCAAGGACCTTGACCAAGGGAATAAACAAAAGGAGGTACAACCAAAAAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATTAGTTATACTCCACGA:1 + chr3L 26378548 5' - transib2 404 1 62.38 TGTTAAATTTTTCTCGCAGCGTATTTGTGCATGGCCTCATATATATTTTCGCATTTTGTACGTGCGTCACGGTGTCAACCGCACTCTCGCTCTCCCACACA:1 - chr3R 17910361 5' + Cr1a 304 1 80.20 TTGATTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGCTCTTTATATTACTTTTA:1 - chr2R 2044251 5' - Tabor 7302 2 56.44 GACCATAAATATAAAATATAAACAAGCTTAACAAAAAAAAGTGAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTG:1 + chr3R 18415542 5' - F-element 4425 1 57.43 AGTAGTTGGCCCGCTTGGTCTCATACTCAATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chr3L 19454647 5' + diver 17 2 65.35 GTCAAATGGCCACGTTAACAATGTGGATGATTTTTACGCTGCTGTTACTGGCGTTCCCCCATAGCTGGGAGGCATAGGTTCAGGTCGGTTTTAGGACGGAG:1 - chr2L 14963060 5' - Fw2 3529 1 77.23 CTCACCATTTCTCGTCCCACCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 14612076 5' - roo 9016 2 77.23 TTACAACCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2L 6888580 5' + jockey 17 1 67.68 TGTGGGACCCCAGCATTATTCAAAGTGACAGGCTTCCTTTCGCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 9131826 5' + roo 33 2 58.42 GCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAAT:1 - chr2R 2875186 5' - TLD2_LTR 97 1 51.49 TCATCGCCACAAAATGAGGGGAAAAAAAATAAAACGCCAAGGAAGCTACCCAAAACAAAAAAAAGAACAAAATGCAAAAATTGCAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 6443173 5' - Tc1 1476 1 40.59 AAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAA:1 + chr3R 4544020 5' + flea 4811 2 82.18 TTGTTAATCTTTAAACTGAATGATGTCAGACTACCCCCACTGACTGGAGTGCTTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chr2R 5950763 5' - mdg1 397 2 54.46 GAAAAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr2L 4160098 5' + Tirant 12 2 74.26 TTTTCATCTATGTCAATCGGCAAATACGCCTTTTAGCTATGAACGCCAATATACTTTCTATAATAAGGTAAAATTCGTGAATTGTAATTAATAAGAAAATT:1 + chr3L 18399018 5' + transib4 2614 1 76.24 CATATTGACTAATTTTACGAAATTAATTGGCCCTACATTTGACATGCAGCTCAATAAAATGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2L 3890131 5' + jockey 24 1 65.35 GAAGACTTTGGCACGCAGCTCAAAGAATCGTGACAAACAATTTGGCTGAGCAGAAAACTGAAAACCCAAAGAGCAGAAAAATAAAAAAAAGAAAGAAAAAA:1 + chrX 11516589 5' + BS 5102 7 80.20 GGCCACGATCGCTGCTCCTGCTGATGATGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr3L 7550691 5' - 412 484 2 70.00 TATGCAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCATAGATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chr2L 23400807 5' - S-element 1677 1 69.31 AGCACTATCCTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chrX 20806950 5' + opus 7024 2 58.42 GCTCTATGCTCTCCCTCTCTCGGTTTCTTTGTGCATCGGTGTGAGTGTAGATATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3R 9550847 5' + P-element 1 2 45.54 ACTCCTTCATCATCTCCCCGCAGAAGCTCTTTGGAAAGTCTGTGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTCGCTGTACTATGTCGATGT:1 - chr2L 9260304 5' - Doc3-element 4364 1 65.35 TCTGGAAGGTTCGGATACAGAGTTGCGTCTTACATTCGATAAGACGAAATACCTTGACTTGCACTCGGTTTTTTGTTCGAACTAAGTATTAAAACATGTT:1 - chr3L 24186201 5' + G4 3722 1 75.00 AATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 - chr3L 17168893 5' - mdg1 7418 2 71.58 ACCATTTAAATCAATTAAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3R 26530932 5' + blood 7040 2 51.49 CAATCCAATCGATTTGATTGGAATCAAGTTTAATTTGCTACAAATGATTTTAATTTAGTTGCAGTCATAACACAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGG:1 - chr3L 5598163 5' + transib2 2694 1 81.63 TGGATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 12324123 5' + roo 10 2 71.29 CCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2L 6888594 5' + jockey 33 1 54.46 TTTAAACACAAATAATAGCTAAAGCAACAGCCACAGCAACAATACGACAATCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGA:1 + chr3R 22517069 5' + 412 193 2 53.47 TCAATCATTGAATTCTATCTTGTTAAAGAGAGAATTTCCCTGATTCAGAGTGTATTTTAAAATTTTCCCTGATCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 682504 5' - P-element 2881 2 73.27 TAAATAAATATTAATAAAATATTAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 19214927 5' - roo 9025 2 80.20 TCCCACAACAGCGGGCAAATGTGAATGCGAAATTATTTATGAATCAATTTCGATAATAAATAAATTATGTCCGGACTCCACGGAGCAGCCAGCGAAGGAAG:1 + chrX 14479131 5' + Gypsy6A_LTR 330 1 71.29 ACGGGATGTATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 9131735 5' - roo 400 1 70.30 CAGGTGGTGCTTGAAAATAGTTGGCTGAATCCCCAAATTAGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTT:1 - chr2R 4547583 5' + Quasimodo 7306 2 67.33 GGATGCGAAAAATATATACCCATGTGTGCGTCGAGGAGACGAATGAGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTA:1 - chr3L 18326847 5' + F-element 115 2 54.46 TAGACACGAACGTAGGGATGGCAGTTTTGAAAGAAGGGAGCGGCGAGAAGCCATGTCCGTCTTTATGAACGAAAGGAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGC:1 + chr3L 24300584 5' + INE-1 168 1 52.48 GGTTTTCAGATATACAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTA:1 - chrX 6659641 5' - P-element 385 1 18.81 TACTGTCCACTATATCGTTGTTTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTTCATAGCTGTTGCGAATAATAAA:1 + chr3R 19449959 5' - diver2 4874 2 57.43 CGCCATTTAGTCCGGAAAACATGGCATTTATTCAGGGATTTAGGATTTAAATCTAATATTGACATTAACACAACTAGCACATTTATTTAAAAAAAATAA:1 + chrX 4874384 5' + transib2 2630 1 80.81 GTACATAAAATAATTTTACATGTGTAACATATTCAACTTATCAGTAATTTCACAACAGTTTTCATCAATTCTCTTAAAAGAAATCAAATTGTAATTTTTTA:1 - chr3L 23035059 5' - Ivk 275 1 63.37 TTTCGNTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chrX 19116919 5' + opus 41 4 73.27 CAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACA:1 + chrX 3305158 5' - transib2 2773 1 74.26 GGAACGAGAGATTGCGCCGGCAAGCGGGTAAAACCGGGTGAAATCGGAGGATGCAAATTAATACATTCGGAAGGGGACAGTTCTAGAACAGGAGGAAAAGC:1 - chr3L 20511694 5' - Gypsy12A_LTR 2022 1 60.40 TTATATTGAGAAATACACAATCCTAGATTGAGAAAAAAGAGAACACAAATAGAATATACGTGATTTAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGT:1 - chr3R 14668112 5' + I-element 476 1 71.29 TATCCTCATTTTCTCCAATGCATCCAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCA:1 - chr3L 18417473 5' + R1A1-element 357 1 73.40 TGGTAATTGAGACAAGTTGCAGGTCATGTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGC:1 + chr3L 9206838 5' - jockey 4696 1 78.22 TATATGTGAGGTAAATAAAGCGTTTTTGAACACCATTGATTTCCGCTCAATGAACTCATTATATTCGCCTCTTAAAACACCATTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 2937439 5' + hopper 141 1 53.47 ATGGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATC:1 - chrX 21994005 5' + McClintock 5956 2 74.26 AGCCACAGGTTGTTTACGTTGTTCGTTTTAATCTTCTTGGTTCCAACTCTGGTATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTT:1 + chr3R 13991193 5' - Porto1 4458 1 77.23 ACAAANATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2L 21174283 5' - roo 9026 1 73.00 TTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chr3R 8555842 5' - 412 467 2 52.48 CTTCGTTCTGTTCTGCACTTAATCGCGATTTCTGGTCACCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:2 + chr3R 11999235 5' - P-element 2851 1 41.58 ATATTTATATTTATGATGGTAAATATTAAAGCAGGTTAAAATAAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAA:1 + chr2L 19906346 5' + HMS-Beagle 439 1 60.40 GAAAAGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr2L 19684028 5' + jockey 4699 1 50.50 CACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTG:1 - chr3R 2533952 5' - gypsy8 4812 4 52.48 AGAATTTCAAATATTTCCCAATATTAAAGCCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chr2L 12667186 5' + blood 7057 2 70.30 AAGCTNATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 20739433 5' + roo 8688 2 55.45 GCACGGACAAACAAATGTGACATAAATCGTCTGGCTAACGGTAACGGAAGCATGCAAAGCCAAAACATTGAGAAGACACAAAGCAGGCTGCACGAAGCTGG:1 + chr2L 14291487 5' + micropia 301 1 70.30 CAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 - chr2L 16884908 5' - pogo 2087 1 63.37 GGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:2 - chr2L 12949255 5' + 412 7109 2 79.21 ATCGGCAGCATCGCGCTGGCGACTTAATATGGGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 27748725 5' + roo 42 2 71.29 GTAAGTCAACTTTTCGCCAATCGAAACCGGACTTTACTTTCGAAACTCAAATTTGATTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 12941222 5' - transib2 2645 1 80.00 TACCTAAAAGTGTATAAATAAATTTATAATCAGATAATGCCTTCTTCTTAGAACTTGATTTTATTAGATCTAACTATGAGTTGTATGACCCTTACAGAGTA:1 + chr3L 3534383 5' + Cr1a 4174 1 58.42 AAAAGTCGGATGAGGTGTATGACATATGCGCACAAAAACTTGGAAAACTTGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATT:1 + chr3R 7419515 5' - I-element 4995 1 53.47 TTAAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 15305701 5' + roo 8702 2 64.36 AGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 12539501 5' - roo 9032 1 65.35 TGCCTAATCGGGCTGATCCAGTCATTCAATGCGAATATTTGCCAAAATATTGACCATAAGATTTGCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 + chr3R 31256958 5' - transib2 2818 1 72.45 TAAAGCTCAACATCTTTTTACACATTTTGCAATTGTTGTTGTTACGCTTGGATTTGGGGTATATGAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAG:1 - chr2L 13514139 5' + Burdock 6266 2 70.30 AAGATTAGGTATGACCACTGGATTTAGCTAAAATAAATTTAATAAGCCCCCTTATTTTGGATAGTGTTGACATTCATGAGTTGGCCTAATTGTTTATGGGA:1 - chr3R 1271896 5' + gypsy4 6437 1 61.39 ATATTATTTATAAATATCAGTGACAGAAGTATATTAAATCGAAAGGTCCAACAATTATTAAAAGTGCGAGTGCCGTCTAATCATAGAACAGTTGGAAAAAT:1 - chr2L 9070653 5' + F-element 4571 1 70.30 ACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCA:1 - chr3R 1977612 5' - micropia 5401 2 62.38 ACAAGTGAGAACGGAATTTCGGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAA:1 + chrX 13873465 5' + roo 385 2 79.21 AGACAGACGGCCCACGGAAAGTCCGATCGGCCTGAAGAGTCACTGGAGGTGTTTAGGCTAACCAAAATACCAAACATAATGTAGTATATACGAACATAATA:1 - chr2L 20706759 5' + mdg1 1 2 78.22 TAAACACGTTAAATTCAAAAAGTTTTCCGAAGAATGACTGGCTTCTCAAAATAAACCAAATAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTG:1 + chr2R 2957862 5' + Dm88 356 1 59.60 CTCCGGGACGGGGAACCTGAGCTGGCGTCGTGAGTTTGATTTTAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTG:1 - chr3L 23112311 5' + R1A1-element 487 1 57.43 TTGTCGTTGCAGGAAGGATGTGTGTAGTGGAATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr3R 7389076 5' - mdg1 379 2 64.36 CCTCTCTCTCTCTCTCACACAGACACACACTAATGGGCATTAGACGAAAAAAATAAAGCGCGCCCGGCAAAATGCAATGCAAATTGCTTCACAGGCGACCG:1 - chrX 18924309 5' - accord2 7226 1 73.27 ATTACCATTAAAGTGACTGTAAGTATGCAATGGAAAAGGAGCCGCATTTTAATGCTTAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTAT:1 - chrX 14768085 5' + BS 5010 1 55.00 GTAGGTGGAAAGTGCGCCAACTGTTCCGCTTGAAATCCAAATTCAAACTGATCGTGCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr3R 11999310 5' + P-element 18 1 60.00 TCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chrX 992036 5' + hobo 48 1 74.26 TACATAAAACCTTCACTCTTAATGAATGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr2L 17722824 5' - blood 345 2 68.24 GTATGAACTGCCACATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 - chr2L 3951667 5' + Transpac 4940 2 58.42 TATGCAATAAAAAGCGAGAATCAAGAAAAGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr2L 19684052 5' + jockey 4675 1 70.30 AATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chrX 15305654 5' - roo 9024 2 76.24 AAATAAGATCGATTTGGATAAGCAAGACATGGAGTAATAAGGCGGGCAGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCCCCTTGGGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTC:1 + chrX 3710010 5' + diver2 4497 1 71.29 GATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 19377807 5' - roo 9052 2 59.00 GTAATGCGAATATGTTTCGGCATGAGTTTTGAACACCTTATAAATGTAAAAAAAATTACGAAATTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chr3R 20878556 5' - 297 6969 2 60.40 TTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGAT:2 + chr3R 4970563 5' + diver 51 2 73.27 TTTTTTAAAAATTACTAGCTGTTAAAGTGCACATTTTAGCTTATTTTTTTTTAACAGCACTGCATAGCCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:1 + chr2L 11922485 5' + BS 5082 1 63.37 CCGTCGAGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3L 13589437 5' + hobo 26 1 53.47 CGGTAAACGCATTTCAAACACTCGCCGAGATAGTTATTACAATAGTGCACAAAGCACAGCAACAACAAAAAGCTAGCTGCAACAAAAATAACAATAATAAT:1 - chr3R 8371151 5' + mdg1 7062 3 66.34 AGCGAGAATCAAGAAAAGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCA:1 - chr2L 19684040 5' + jockey 4687 1 58.42 CTGCGGGCACAAATTCAATAGAAGTACTTAGTCGTGCAGCGAAACAAAAATCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr3R 27430003 5' - pogo 2078 1 56.44 ATAAAGATTTCACTACCGTTGTAAAAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3R 10203593 5' + jockey 10 1 71.29 ATAGGCAGAGAGGTTGGGGTCTAAAACTCCTTTTCATTTCGCTTAACTTTTCACTTTTTCAACTCATTTCAAGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAA:1 + chr2L 14579803 5' + copia 6 2 73.27 AGAAATTCTGTTTCCTGATACCAGGCGAACAGAAATCTGCAGCAGGTTGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGC:1 + chr3L 2244112 5' - jockey 4964 1 52.48 AATCCTTTAATCCGCTGTGCGCGACTTCAAGGTCAGCAAGTGATCTTTACTAGTGTATACCAACCTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGA:1 - chr2L 8299051 5' - S-element 1705 1 68.32 CAGCAATCTGAACTCAAACAATTTCAAAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCTACCTCGTCATCGGCTG:1 + chr3L 9550882 5' + F-element 453 1 72.28 TTTCGAGCAGACGCCACTTACATACATTCATTTCTTCAACTTTAGGTCGTAACACTGATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr3R 2916208 5' + BS 5078 1 66.34 AACTGCTAGTATCCCCATCTTTATGGTTACATCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTT:1 - chr2R 8833409 5' - R2-element 471 1 78.22 CAGAACTTTACTGAACGACTGAATTGCATGGAAAGTCAAGAACTACGCCTAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTT:1 - chr2L 2036908 5' + invader1 302 2 73.47 ATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTTTGA:1 - chr3L 14603154 5' - jockey 4996 1 40.59 GCCAGNCAGTCAGGTGGGATGTAATAGAACAACAACAGCGATCAGCTCAGCTCAGCTTACGCATACGAAGACAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACTTAT:1 + chr2R 4676716 5' + 1360 172 1 91.09 TGTAATTTTGCTGTTTTCGTTTCTTTCTTGCTTTTTTCTCTGTTTTATTTTTTTTAATTTTT:1 + chr2L 16470616 5' - Doc 4697 1 91.94 CTTTGAGAAATCACCGCGAAAAATCTGAAACAATTGAGAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCT:1 - chrX 9132315 5' - invader1 3616 2 69.31 CCAAAACGGAAGTTTTGCGTCTTTTTAGCTACAAACACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chrX 2753833 5' + roo 8702 2 68.32 AAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 - chr3L 10013644 5' + hopper 14 1 57.83 AAAATAAGAAGACAAAAGAAAGACATGAAAACGTTGCAAACAATAAAGCATATACTTGCCATATTGATATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAA:1 + chr2L 14061323 5' + Doc3-element 106 1 70.30 CACTAACTGGATGACTCCAAAAGCCGCCACAACAGCAACAGCCAGAATGCCACAATTACTCACCTGCAATGTTTCCTGAGGCCTCCAGCGACTCGGTGCTC:1 + chr2L 13940748 5' + TAHRE 10081 1 67.33 AGCAAATCTAGTATGATTCTTACTTCATCAAAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTG:1 + chr2R 4545939 5' + HMS-Beagle 206 2 69.31 GGACGCCTCGCTTTGTTTTGTTACTGTCTGGAGTAACTCGGTACCTTATAAAATCACAAAGTAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr3L 17918355 5' - 297 6968 2 71.29 CTGTTTCGGAAAAAAGGTAACATAACTTAATAGTTTATACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr3L 2019749 5' - 412 485 2 64.36 GCCCCAACCATTTGCACATCTCACCTATTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 15474779 5' + roo 17 2 62.00 CGGCTGTTACCCCGGTTATCTATTTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTG:1 - chr2R 5019457 5' - rooA 366 1 63.37 AGTGTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr3R 13582214 5' + BS 5017 1 55.45 AATAGACTTCCATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 - chrX 13508786 5' - roo 9069 1 80.20 ATTCTNAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 - chr2R 4483266 5' + Ivk 35 1 55.45 CAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACA:1 + chr3R 14917213 5' + HMS-Beagle 6820 2 77.94 GTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATT:1 - chr2L 6083778 5' + 3S18 33 2 56.44 ATACAATCAAGTAATATAAATAGTTTGGTAATAATAATATGAAATAGCCTTTTAAATATTATTATTTCTTTGATATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGA:1 - chr2L 10239873 5' + I-element 3 1 57.43 ATGGGAAAATCGGAAAAAAGAAGCGAAAGGCAAGGGGAAGAAACTCTGGCTGGAGTCATTCTTAAAGATTCTTTTATAAATATTACTAGTATTTA:1 - chr3L 6922142 5' + Idefix 7387 2 51.58 CATAACAAATCAGCTGCCGCTGATAAGCGCAGCTTGGAGCTTTTATGTTGTACCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3L 4122504 5' - P-element 2866 1 58.42 TACACGAGTTAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2L 2060125 5' + 412 7077 2 52.63 CATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCGCATGATTAGTGAGAG:1 - chr3R 29288795 5' + BS 4998 1 70.30 ATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 + chr3R 17896941 5' + hobo 29 1 63.00 CAGGTAAACTGTTGATTCCATGTGGCGACACGATTTTTATTTCGTGTTTGTCCAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCAAATATTTTAA:1 - chr2R 18715887 5' + Cr1a 88 1 74.26 CAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr2R 5531195 5' + 1360 66 1 59.41 AACCAGGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 18950748 5' - roo 9032 1 65.35 TATAATTTATAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGT:1 + chr3L 12633236 5' + jockey 21 1 62.38 TAAAACGTTTTTAAAGCACAATCCACAGGAGCTATGCTCTCAACTGCGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACGACTGAGTAGTT:1 - chr3R 25874781 5' + accord2 39 2 53.47 ACATGGAACAAAATGGAGCTTAATTTTATGGAACTTGCGAATTCCAGTTTGTCACCTCGAAAATTAACGCAAACGTGTATGCCCACACTTTTGAAAAATGT:1 + chr3R 17472130 5' + INE-1 255 1 77.23 CAGCCCAACCGAACCGAACCCGAAATCCAAGTAACTCTGTACTCGAACCACAAGAAAGCCACCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCCTTATTTATTAACGACCTC:1 + chrX 7360586 5' + Q-element 522 2 58.42 AAAAAATAAAGAGAATCGCAACCCGATGAAAAGCCTTTTAACACGGAGACATCCAACAAACTGTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAA:1 - chr2L 9319983 5' + accord 7010 2 72.28 ATGATGTCTTTTTTTACACGTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAATAA:1 - chr2L 6083797 5' + 3S18 14 2 60.40 ACAGCNACTCTAAATTCGGTGCAAGCGGGAAGATGAGCGCAAAGAAGAATTAGCGGCAACTTCCGTTATTTCTTTTTTCTTTTTGAACATTATTATTGCTG:1 - chr3L 24211032 5' - invader2 482 1 69.31 AACCGAACTGAGCCAAGTCAGAACATGACACTTTGGAGTCTGTTCCTCTTGATGGCAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCGTAAGAAGGCTAGTCAAA:1 - chr3R 30260348 5' - baggins 5127 1 66.00 ATTAGNATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr2L 20132974 5' + flea 4771 2 62.38 CAACCCGCTGGGGCCATCATAATTTAGAATTTACATTTATCGAATATATTTCGTGCACTTAAAACCCTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGA:1 - chr2R 8347061 5' + roo 8822 2 68.32 GGGCAATCACACAAACATTAATTTGGACGAACGCACAAACTCTCTAAGCTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAA:1 - chr2L 23189101 5' + 1360 271 1 51.49 CAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 16674847 5' - roo 386 2 61.39 GGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chr3R 12047401 5' - Stalker2 392 2 64.13 TGCGCTCGCTAATTGCACATAAAGTCCAAAATCCTAAAAATGTGAAAGTAATGAAGTTCCTTATATTTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTAT:1 + chr2L 14311244 5' + hobo 2478 1 74.26 AAAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCA:1 + chr2L 4160100 5' + Tirant 8116 2 72.28 TCTCCCGTTCTCTTTCTTTTTCCTCTTCTTTAGCTTTCCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCG:1 - chr2L 190083 5' - invader2 458 1 66.34 ACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCT:1 - chr2L 17784678 5' - gypsy10 293 2 71.29 TGCAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 + chrX 3305156 5' - transib2 2775 1 72.28 TGATAATTTTTAATACAAAACTCGCAGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 + chrX 18144322 5' - hobo 2937 1 77.23 CTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr2L 4160133 5' + Tirant 42 2 65.35 AAACTTGTTATGTGCCAGGTGCTAATCAATTTTTAAGCAGCTTCAACAATCACATACAGAGCGTACATACAGTATGCTCCGACACGGCCATCCTGACCTTG:1 - chrX 8993688 5' - invader4 2743 1 53.47 GTGGAAAATAAGTGCGATAACTAATTCTTAAATTTGTGACGCTTATATATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGAGACAACAAATGGTACTTATTAT:1 + chr4 688487 5' - Tc1 101 1 55.45 GTGCGTACTTTTTTTCAGGCGGCACAAAAATTTTATTCCCTCCTCGGCATATCGGCTGCCGCGGAAGTTTATTTGGTCTCCCAATGGGACAACTTTTAAGT:1 + chr3L 27157792 5' - G5A 2561 1 55.45 TACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACCAACTACGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGC:1 - chr3R 19449463 5' - roo 8793 2 53.12 TTAATTTATAGATAATAAACATACACAAATTATGTGTGTATATTTGTCATTAAAAACCGTTTTAATGGTTTAGCGATTTCAAATATTTATTTATTTTTATT:1 + chr2L 10306701 5' - mariner2 830 1 63.37 CGTATGTACATATGGTATTATCCTGTTTACTCTACGTTATGTGGGTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATTTGACACTTTAAATAAATCAAC:1 + chr3R 21260013 5' - accord 407 2 54.17 ATTAAATGTTTATTTTTTTTTAAGTCAGATTTCTCTGAGCAAGAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACGTGCTGCAAAAG:1 + chrX 16595113 5' + Tc1 171 1 74.26 AAGAAGACAGGATCCCGGAGAATCAGAAAATAGAATGGGAAAGACGAAGATCGGCCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTA:1 + chrX 6650638 5' - Cr1a 371 1 53.47 CACAGAGTTCATTGGCACGCGCTCTTATTTTTCCTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 16761265 5' + roo 42 2 68.32 GGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:3 + chr3R 19989243 5' - hobo 2921 1 59.41 TCTTGCGGTTTAATGTCCGCTCTGGGAGGTGTGGCATATTGGACTTATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGT:1 + chr3R 30781652 5' + Stalker4 51 4 75.25 ATCAANCTACCTGGATTTTCTTTATTCATAAGTTTGTTCTAAAATTCTAAAATATTTAATAAAAATGCTCACCTTTTTTTTACTTTTTCCGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 19648360 5' - Doc2-element 232 1 89.11 GTGAACTCTGCAGCCGAATGCGGCACCTTTTCGCGAAATGAAGAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCA:1 - chr3R 29900649 5' + invader4 349 1 70.30 TAACTTTTGGATTCACTAGAACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 + chr3L 8614508 5' - opus 7452 2 86.14 AGATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 2485959 5' + jockey 35 1 42.57 AAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr2L 6888620 5' + jockey 56 1 73.20 AAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr4 1149950 5' + 297 4 2 75.25 CCATTTACAATGGCAAAACAAACGGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 20149784 5' - 1360 3365 1 55.45 TCCTTNGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr2L 3951595 5' - Transpac 5188 2 69.31 TTGAAGAAGAAAACGGACAAATGGAGATTGAGTGTGGACTTCAGGCAGACAATAGTAAAAACAAGATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGC:1 + chr2R 5266137 5' - 1360 3195 1 52.48 GGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chr2L 4160113 5' + Tirant 8129 2 59.41 GGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATT:1 - chrX 20880667 5' + invader4 24 2 56.44 AGTGTTAGTCGCAAGTTGAGAACCACTCGGCACAGAATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGAC:1 + chr3R 31048927 5' + Transpac 5093 2 64.36 GAGTTTTTTATTAATATTTTATACCTAACCTTCACCTTTACTATACGTAGACCATATGTAGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCG:1 + chr3L 23839778 5' + 1360 457 1 63.37 AGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chr3R 14688507 5' + FB 29 1 65.06 AGCGGTGCGATTAAATGTTAGTTATCGAGAATTAGTATTGGCTTGACATGCATTTAATTTGAGTTTAAGTATCTGATTATAGCTTTTTTACTTGTTTTT:1 + chr3L 16550040 5' - Bari2 924 1 65.66 GCATTATTCTTTTGATTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 - chr2R 2044262 5' - Tabor 7314 2 68.00 AACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 7522321 5' + blood 7063 2 74.26 CGAAGAGGCTAGGCAGCTGGCTCTGGAGGCCACAGAGGGCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGA:1 + chr2L 10223601 5' + Quasimodo 265 2 67.33 AATATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGAAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1 + chr2R 23584742 5' - HMS-Beagle 234 2 51.90 GCCATTGTTGATGGTTAAATGCATATTTCATGATGTCTGGCCCAGGTTGTCGTGTCCGTTGCACCATCTGTTTGTCCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTCA:1 + chr3R 27613132 5' + INE-1 135 1 67.33 AACAATAGAAAAAAACAAGAAGCGCAAAGTTTGTACAGTACTCGTGGCATATGTACACAATATACGAATACTCACGCATATGTATATGTATAAT:1 - chrX 3745040 5' + Stalker4 7199 4 67.02 TAAGTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCA:1 + chr2R 13078723 5' + jockey 4669 1 58.42 GATTATTCCAAGCGCCTTTTCCATACTAATTATCGGCGGAAAAAGTAAGAAAAAAAAGGGGGAGCAAAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGT:1 + chrX 20543140 5' - F-element 4449 1 68.32 ATCTACCCACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chrX 3763139 5' - 297 6963 2 62.38 CCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - chr3R 4544070 5' - flea 4985 2 55.45 TCAAGGTTTCACAAAAATAATATGAACATAGCCTTTGAACCAGAAGTGCATGTGGCGTGCAACTCAAAAATAAATACATGTAATGATGAACTCCCATTAAG:1 + chr3L 13060290 5' - 412 492 2 78.22 ACACATAAAGAAAATAGGGGGGGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 1625715 5' + hobo 29 1 54.46 AACAGCAACATTGAAATAATACAACGAGGACAATCAAAAATCCTCCGAACATTTACCAGGACCTACGGATTCCAGTTGTAAAAACTGAAATTGGCCAGCAG:1 + chr2L 21637281 5' + Doc4-element 2751 1 74.26 AAAAACCAGAAGAAAAACCGCAATAACAACTAACGGGAATAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTGCATTTTGGT:1 - chr3L 10536993 5' + 17.6 7034 2 60.40 TATAAAACTAACAGATGTATTCTATTGTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chrX 19768642 5' - Rt1a 5087 5 94.00 CTGCATCCGACACTTTCAGAATCCCTGAATGTTTGGAAAGGGCGCTCGAACATCTGCTCAAATGCTGATGGATATTATTAGAGTGAGTTTTCCTCGCCACA:1 + chr2R 4406895 5' + Gypsy12A_LTR 368 1 63.37 GACGTNCAGCTGTCAAAATTTGTAGACTTTAAAATCGGTATGGCGATCGGTGAAGTGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGGA:1 + chr3L 16832417 5' + Osvaldo 22 1 55.45 CTACACGATATTGACCAAGAACGTAGTTCCCAAAAGGCTGCTTACAGCAACAACAACAACAACCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAG:1 + chr2L 429613 5' - Doc 343 1 64.36 AACTACTTCTGCCATCAAAATTCCACATTCTATAAATTACTGTGGTGCCATTCGATAAATTTGAAAGAAAGAAACAGTAATGCACTTTAGTAATTTTCAAT:1 + chr2L 16707329 5' + 297 6639 2 70.30 GAAAAGGCAAGAAGGAGGGAGCAAAACCAGCTGAAAAGAGTAAGAAAGAAGTAAACGGCGACTACACGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCAT:1 - chrX 8605134 5' - micropia 86 2 53.68 TCGGAAAATATTTAGTTATTTTTATAATGTAGGTACATGTCTAAAGTTTGTTTTTGTAGGTGACGTCTCCCATTTCTGGCGTTTGTCGTGTCACTTGTTAG:1 - chr3L 4384304 5' - mariner2 707 1 54.46 GATATTGATACTGAACTTTATGAACAGGATAAAATAAAACTACATTAACTGTTAGCAAAGTACTCGATTGTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCT:1 - chr3L 26057190 5' + Cr1a 4278 1 66.33 CAGGATGCTAAAGTGAAACGTGGGCGTGATGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAA:1 - chrX 2179552 5' + Doc 26 1 54.46 CAAACATAAATTAATTTAACAAATGAACAGAACTTAACAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCGATAATTTTTTATTGCTTAGGGACATTAGTTCGACTCAAA:1 - chr2R 21923591 5' + 297 6954 2 62.38 GAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr2R 13650125 5' - mdg1 371 2 74.26 AAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2L 14790649 5' - roo 9041 1 55.00 TTGCAGCATCAGCGAAATGCTAAGAAGATAGCGATTGGGTAAGAGTTAGGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGT:1 + chr3L 5403929 5' - Chimpo 53 1 51.49 GAGAGAGAGAGCGAGAAAAGCAAAGACGATGGAGAAGAGAGCGGCAGAGAGCGGAATTGGCAATCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2L 6079189 5' - P-element 2876 1 64.36 CACTTTTGATTACTTTTTATCCGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2R 18950807 5' + roo 18 2 55.29 CCCATCTCAACCCTTTTTTGATCCACTTTTGACATACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 + chr3L 17168847 5' + mdg1 7078 2 64.36 CCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCG:1 + chr3R 32005887 5' - invader4 285 2 67.33 AATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 7488931 5' - roo 9045 1 59.41 AATATATTGTGAAGGATAGTCAGATCTGTTATGATATCATTCTTTCCATTCTTAAAAACGTGCATTTTATTAAGATATAAAATAATATCAAAATAAATAAA:1 - chr2L 19088631 5' + S-element 1450 1 23.76 GGCCCCGAATACAATTTCCTTTTTTTGCTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 - chr2L 17646260 5' - flea 252 2 68.32 ACTTTTGTAACCCAAAATAGCTAATATCCTTATTCCAGTAGACTGCTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCTTAGAACTATGCTTGGAACAGTCCT:1 - chr2L 6205883 5' + Cr1a 4023 1 74.26 GCATTCTTGGGTTAATTTATCAGATTGTTAGAAAAAGACGCACACAATAAACAAATATATTAAGAGGAACACATAATACAATCCTGAAGATTGATTATCCA:1 + chr3R 10063878 5' + hopper2 1347 1 77.23 GTTGCATAGAAATCTAAATATTTGCAGTGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTGTAGATTTCGTCGTCTACCC:1 - chr2L 14982486 5' - G2 2809 1 72.28 CAACCACCTGCGAGGTAAAACAAGAGATGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAACAATAACATCGGCGACGCTGAGCCAGCCCAGTAACGCATTT:1 - chr3L 24368230 5' + gypsy10 88 2 72.28 CGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCCTTTTTTCTTTTTTTCTT:1 + chr2R 5070930 5' - Doc2-element 226 1 26.53 ATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3R 31458418 5' + jockey 34 1 52.48 TAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 + chr2R 12492389 5' + hobo 53 1 76.24 TTAAAGAACAAGCTCAAGTCGCAAGGAGCAGTAAGACTAGAAAAAATACCAATTATAAACTCACCACGCCCAAACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAAT:1 + chr2R 9302475 5' + HeT-A 5941 1 68.32 CTCGTGACGGGAAACACGTAGTTTTATATCCTTCAAGGATCCAGAACCCACCAACACTACCCAAATCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCCAAGG:1 - chr3R 2981198 5' + I-element 5005 1 59.41 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTAATCCTATCCTAATCCTATTAATCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGT:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 3 1 49.50 TAGGCAGGTTAATTATAAATAAATAAAAGTGTGTATATTCTTCTTTTAGTTCTACATTATAAATTTCCGAATCTGAACTCGAATCGGAATCAGAATGTGAA:1 - chr3L 5975521 5' - transib2 2534 1 81.19 AAAGTACATTAAATAATTTAAAAAATACTGGAATTTGTTATGCTCTTAAAAGTATTCCATGAATTTGGTATTGTTAATATAATTAAATTTAATTTTATTTA:1 - chrX 21505837 5' - TAHRE 42 1 67.33 AGTGTGCTACACATAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:2 - chr2L 1625723 5' + hobo 21 1 58.42 TCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 20878452 5' + 297 24 2 50.50 CATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCC:1 - chr2L 15947441 5' - Transpac 5184 2 67.33 ATAGAAGTTTTAAAATATTGTAAATATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 + chr3R 12539469 5' - roo 401 1 73.27 CTCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAA:1 - chr2R 5627651 5' - TLD2_LTR 97 1 76.24 CTGGCTGCAGTGAGCCAACGCTATCTCCCATTGATCATTAGATTTCCGAATAAACTAATAATGATGCGACACGGCCTTCCTGACCAGCACACGTCCTCGTG:1 - chr3L 3398987 5' - invader6 4463 1 56.44 CAGCTCTGTTTATGGCGCCATTAAGGAACAACGCCATGGCACCGAGCAAATGCAGAACTTGCAATGTTTGTGCTGAAAGCATTGTAATGATGAACTCCAAT:1 - chr2R 16475847 5' - 412 496 1 73.27 GTGGACCGCTCGCGAGTTACTGAGTCGCTCGCTCACAGCGCAGATACATTTTGCTGCCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATA:1 + chr3L 490803 5' + F-element 309 1 61.62 ACCAGTGGATTCTGTGGAATGAGTGGTAAAGGGGTAAAGTTCCATGGCTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGT:1 - chr2L 14579909 5' - copia 227 1 55.45 CTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTGAGAATACTATTCCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTT:1 - chrX 9909333 5' - P-element 61 1 20.79 GTGACTTGAATACAACGTTTTTCTCATTATTTATTAATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCCAAAAAAGGTGCTAAATTTCCCATAGTG:1 + chrX 12636643 5' + Transib-N1_DM 493 1 71.29 CTACTGTTGGAATGTTCATAGTGGAAAGTAAATGTAAATACATTTAAAGTGTTTGTACATTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTA:1 + chr2L 17062040 5' - Stalker2 280 2 62.38 GCCTTNCATTTGCCAGCAAAGTTAGCGCCTTTGGCCGCTTCTTTGTCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAT:1 + chr2R 14778438 5' + mdg1 7070 2 55.45 GGCCATGCTAATTTTAGAAAGCTATTTCATTGAACTCCGCAAAAGAAGATACTATAATCATACCTACTTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATA:1 + chrX 20885947 5' + Ivk 5353 1 72.28 CACATGAGCATGGTTAATTGTACAATGAAGATGTTCTGCCAAATTATACAAGCAGATAACGTATAACCAAAGACACTAGAATAATAATAATAATAATATTC:1 + chr2R 21709988 5' + mdg1 7072 4 64.36 ACAATTGATATTTGAAAGCGTAAAGGGTAAAGACGTGAAAACTATTTCTCCAATAATTTTTTATTTCTTAGCGTTGTACTTAGTCAACTGACGGGACATTA:1 - chr3R 1441066 5' + 297 361 2 73.27 TATTGGCGACAGAGACACAGACGGTGCTGAGATTGGAGTTTGAAGTCCGTTTATGTTATGCATGGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTGCTGCCTC:1 - chrX 21933011 5' + G4 3766 1 54.46 AGCAGAGCGGGATCGAAGAAACCACTCCCGTTCCAACACCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGG:1 - chr3L 13423846 5' + roo 228 2 67.33 AATATTCAATTAAATAGAAATTATCTTTACATATATAAGAAAAAAAAATGTTTTAATTAATTAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTCTAAAAAGGGA:1 + chr3R 15992999 5' + Stalker2 7225 1 67.33 CCGAGGGTGTGAAATGCCAGGGCAATTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAG:1 - chrX 9129568 5' + Stalker4 7225 4 75.25 CTTTGTAGCTCCCGATAATGTTGCCTACAAAGTATGCAATTAAAAGTCGGTCGGCTTCTCAAGGCTTTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr3L 22039789 5' + jockey 4678 1 70.30 GAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCG:1 + chr2L 4160124 5' + Tirant 29 2 52.58 GAGGTCGCATCATTTTTCACACTTTATTCTCTTATCTCAATATTTCTGTCGACAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGG:1 - chrX 5819113 5' - transib4 2381 1 59.41 GTTTCNACTTATCTGTCATGTGGAGTCGGGTTAGGAAGTTCGAGAGGGGAAATGAAACTCTCGCTTCTGATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGT:1 + chr2L 19652316 5' - Porto1 203 1 53.47 GATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCG:1 + chr3R 12047432 5' - Stalker2 352 2 70.30 CTGCATACATATGTATATGTATAAATGTATGTAGCGTTACATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGT:1 - chr3L 17307313 5' - Stalker 6950 4 70.30 ACGACTCCTGTTTTTATGGCAGCCGTGTCACAGGCGACACTCCGCCGTCGACAGTTGTCCTTTAGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAC:1 - chr3L 4921480 5' + jockey 4773 1 65.35 GAGGAGCGAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr3R 28645868 5' + F-element 20 1 65.35 AGGAAAAGTGGCAACTTGAAGAGCAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 + chr3L 13659876 5' + pogo 18 1 58.42 CGCTAAAACTTAACCACCCGATAAAGTAAACACAACCTTCACTTGGAGTACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATATAGCCCGCATAAGTTAATTTAA:1 + chr2R 2053960 5' - hopper 1303 1 52.48 AACAAAAACGCCACCCAGCTGATTTACTCCACTGTGACCTGCAATCAAAGCAGAATAAAAAGTATAGAAATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGG:1 - chr4 710933 5' + 1360 2979 1 74.26 AGCTTAAATGCAATCGATTAAACTCCGCATAAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGGTCTCAGCTCTC:1 - chrX 8492964 5' + Porto1 492 1 69.31 CATTTATACCTGCCTGTTTCTTTTCACCAACAAGGGATGAGTAACAAAAACACTTATTGGTTTACCGTTAAACACATGGGTGTTTCCGAAAATACTTGGG:1 - chr2R 4709300 5' + hobo 250 1 72.00 CTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 21531019 5' - roo 9037 1 59.00 CTTATAGAATAAATATTTAAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATATCTCTGATGTAGTTAATTAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3L 18097028 5' - mdg1 7404 2 75.25 CCCTTTGGGCATGTTTTTAGTCAATTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTG:1 + chr2L 11764057 5' - Doc 211 1 74.49 AGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 - chr2L 15808040 5' + I-element 29 1 49.49 AAAAATTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATATGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATG:1 - chr2L 3440522 5' + Juan 13 1 68.32 AAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:2 - chr3R 26530916 5' + blood 7056 2 67.33 ATACATTCGCGAGCCGCTTAAGCGCAGGAAGACGAGACGGGCGACGAAATTTCTATCTCAGCGTTCTCGGCTAGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAG:1 + chr3R 18484155 5' + Rt1b 4893 1 61.39 TTATAAATATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr2R 23584737 5' - HMS-Beagle 217 2 50.50 ATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCA:2 - chrX 23108304 5' + BS3 1444 1 64.36 TATGGTGCGGCACTTTCTTTGCTCTAGGATGGCCGGTAAGTCCATTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGAGTCGCGTCAAAATCCTGGGGACTGGCG:1 + chr3R 8310360 5' - BS3 127 1 63.00 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCT:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 4990 1 54.55 GACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 15072567 5' + pogo 16 1 56.99 GCCGCCCTGGAAAGTATGCTATTAAATTGGCGCACCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGAATCG:1 + chr3L 9318760 5' + Idefix 7092 2 64.36 TTGTTAGCCTGTTTACATGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 - chr3R 6735346 5' - copia 233 1 56.44 AGCAAAACAATTTGGAAAAAAAAGAAAAGATTATAACCACATGTTATAGGATAATAATCTGGACTAATAACCAAACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGAT:1 - chr3L 5786258 5' + F-element 4542 1 76.24 TCTTTGCTGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chrX 8491406 5' + P-element 34 1 47.52 GAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTT:1 - chr2L 3440513 5' + Juan 22 1 61.39 GGCTTGCATTTAAATTATCAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chr3L 18706958 5' - jockey 4978 1 64.36 TATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 - chr4 96889 5' + flea 4764 1 54.46 TTATTGTTTATTCATCGACCGAATGGTCGCACATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGT:1 - chrX 16408811 5' + hobo 371 1 69.31 TCATTTCAAAGATCACTTTTCATCCTATCCGGTTTCCGAGCTCATCAAATCACACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 - chr3R 26952654 5' + jockey 4785 1 52.48 TGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAG:1 + chrX 21474435 5' + 1731 4367 2 76.24 TGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr2L 8565514 5' + blood 34 2 65.93 TCTTCCTTGGTTGTAGCGCAAACTGCCTCATTTCAGCTCTCTACCTCAACCAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGA:1 + chr3L 27290546 5' - 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Cr1a 4332 1 62.38 CGGGTAGGTAGTTAAAGTAGCGCAAGATCCAAAAGTGAGGAACATATACTTACATACAGACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATC:1 - chr2R 4780445 5' + Quasimodo 67 2 59.41 TGATAACCAACAGCAACAAGGGCGTGGAAAAATGGGTCAACAAACTTGTGTCTGTCTCTAGAATCTGTCTGCTGCATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTT:1 + chr2L 21329541 5' - INE-1 159 1 81.19 CAATATTTCCATTTCACCATTCAACTTTGCAATTCTACTGTGCGTTTTGTATTTATATACATATATGTTTGGTTTATTCCTTTTAGTACGCATTTTTTCAA:1 + chr3R 21173396 5' - Juan 171 1 73.27 TTAAGCATTCAAGATACTTTCTCAACTTACTAATCTGTCGTATGGTTGCTGTTTCAAAATTCTATCTACAACAATAATTTTTATATATATTATGACAAACT:1 + chrX 15598989 5' - Stalker4 76 4 58.42 CCTCGAGTTTTTTTTTTCTTTTCGTTTTTCCATCGCTATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTT:1 - chrX 21583810 5' + mariner2 63 1 72.28 GATGAAATATTATTTCATTTTCATTTACTGTGTGCGTTGTCTGTGTTTGTTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCT:1 + chr3R 17928403 5' - hobo 452 1 51.49 TTTACACAACAAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chrX 3763245 5' + 297 6601 2 58.42 GTGAGTGAAATATTTTCGTAGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 - chr3L 5489972 5' - jockey 4970 1 65.35 GATTTAGAGCGCGGCAAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2L 21010852 5' + opus 24 4 58.42 ATGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr2L 18234153 5' + jockey 32 1 52.48 ACAAANAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chrX 3763237 5' + 297 6609 2 61.39 ACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATTAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 - chr2L 22211545 5' + opus 15 2 64.36 TATTGNTATGAAAACTGAGCGAATGTAAATGTAACAAAACCAGTTGTTTTAAAATGCCATTACTTCTTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCA:1 + chr3L 19463666 5' - invader4 325 2 73.27 GAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 3817520 5' - roo 9047 1 54.46 TCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3R 10147901 5' - roo 9044 1 54.46 TTGGTGGTTCGAGGCTCAGCCCAGGATGGAAAGATGCCGTCCCTATCGAAATAGCGACTGTGATTGGAGATTGTTGTGGTTGCTGTTGATTGTTGCTGTTG:1 + chr2L 7156151 5' - gypsy7 326 1 65.35 AAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 7868920 5' - roo 352 2 87.13 ACAAATCTGTTTCTTATTTTATTTTTCTTCTTGGTTTTACCATGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTT:1 - chr2L 12948716 5' + 412 7518 2 57.43 TGTTAGTTTTTCGTTCAGTGCTGGCTAGTGTCTGTGTTTGTGGACGTGTACGTGTTCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGT:1 - chr3R 20477127 5' - 412 7525 2 56.44 CTCTTATCACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2R 8086866 5' - 1360 3366 1 56.44 TTTTGGAATATCGGTAGAAATTGGGAGAAAAAAACAATAAAAATAAATAATTCAAAATTATTGACGGACATGGTCAGATATTGAGCCTGATCAAGAATGTA:1 - chrX 15903309 5' - INE-1 83 1 80.20 CTCATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2R 20739436 5' + roo 27 2 54.46 GGAGAAGGAGCGAATTAGAACGTGCAGAGAAGGAGAAAGACAGAGAGTGAGTGTGGAAGTGTCGGGCAGTGCTCAAAAACATGTAATCTAAGTGCACACTA:1 + chr3R 2533646 5' + roo 138 2 70.30 AAAGAAACCCGAATTGGTTTAATTTTATTGTATTGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 - chr3R 26254057 5' + jockey 4711 1 64.36 ATTCGTGTTCGGCTGACGAACCGGATCGCAGATACTTCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2R 16334047 5' - P-element 2849 1 41.58 GCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 + chr3L 11661738 5' - hopper 1361 1 79.21 TGTTGGGAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 + chr2L 17646176 5' + flea 28 2 61.29 AAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTG:1 - chr2L 23295877 5' + micropia 4973 2 58.42 TATAATCCTAAAAAATCTTTGCATGATAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chrX 15392046 5' + 1360 7 2 49.50 GCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:2 + chr3R 19989248 5' - hobo 2916 1 56.44 TCATCAGTTTTGCACACGCAGTTGAGTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr2R 14408514 5' + hobo 52 1 73.27 ATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 - chr3R 4544063 5' - flea 219 2 62.38 CAATAGTCAGTCATCAAGGCTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 19019035 5' - hobo 2928 1 66.34 TACACTCCTAAGGGATTGAGTTAAAAATGAGTAAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 19552072 5' + roo 8677 2 64.36 TCATCATATTGGCTTTCAATAGCTACATGAAGTGGTGATTTGCTTTCAGCGTCAATTAAATTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 - chr3R 3866475 5' - opus 7479 2 64.36 TGCGATAAACGTCCTAACAAATCCCAAGCGCGTCAAGGCAGTAAGACCGTAACCTCATGGGAATA:1 + chr3L 11074360 5' + invader4 415 1 80.00 TTTTACGAGATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3L 2485966 5' + jockey 28 1 37.62 ATTTCATGGCTTGACAATGAACAAAGTACTGTATTTTCTGCAGTGCTGCTTTGCATATCCTGCGCCTACCCTTTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTG:1 + chr2R 23826797 5' - opus 7245 2 74.26 AAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2L 13574274 5' + pogo 34 1 59.41 GCGAGAGCGAGCGCGGAAAGGACTCTCTTAGGTTACCAGAGCCCTGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chr2R 5804466 5' + P-element 31 1 48.51 CAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCATCGACTATCTCTCTTCGAGTGAGGACGTCTGTGTATTTCCAA:1 - chr2R 5840686 5' + Ivk 27 1 47.83 CATTATTTCGCAAACTTAAAGGATTTACTTTTTATGAATGATGAAAGCTGGATTTTGGCATTTGGCTGGATGACAAATGTATAATGTTCTTTATTTTAACA:1 + chr3R 9176832 5' - Circe 473 1 59.41 GTTTCACAAAAATAATATGAACATAGCCTTTGAACCAGAAGTGCATGTGGCGTGCAACTCAAAAATAAATACATGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACAC:1 + chr3L 13060295 5' - 412 487 2 73.27 ACACAAACACAATAATATTATGATGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 7861746 5' + roo 19 2 61.39 TAAATGTTAACACAACAAATTTCAAATACTGCATACTTGAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 + chr3R 4545457 5' - flea 237 2 47.52 CGTTAAAATAACACTAGTATCTTACATAAAGAGAACAAAAATATATATTTTATATGGACGAAAACGCTTCCTTGTGATTGTTACATACTTTTCAACGAATC:1 + chr3L 23247472 5' - INE-1 15 1 68.32 GTGCGTTGTATTTGGCTTTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2R 23580850 5' - P-element 2883 2 73.27 TTTATNTTTGACTTTTAAAGTACTAAAACTGACTAAAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTA:1 + chr3R 18210306 5' - Juan 4202 1 62.38 TAAGTTTTCGTTCAAGCTTGTCAGTCAGTTTTATAGTAACATGTAACCGATGGAAGTTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGT:1 - chr2L 14838435 5' - F-element 307 1 64.36 AATTTCGCACTTAAAATTGTCTCCATGCCGGACCCTGAAATATGATGAGGCGAATTTTGGAAATATTTTGGTTTGCTTTAATTAAAAGTGATGAAGAGTGG:1 + chr2R 18262947 5' + G4 427 1 54.46 GATCGCTAAGTTGGTTAGATTAGGTTAGTTACAAAATGTGGTGCTGTAAACGTAGGAGACAAACTTTGGTTGACTACAATAATAGTAATAATAATAATAAT:1 - chr3R 22477501 5' + mdg1 27 10 74.26 AAATAGTTGTCCATTCAGACAAAGTGCTTGTCACGAATGTATCTTCTTAAATCCTCAAAGTCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2R 13106739 5' - copia 241 1 64.36 AGTGGTGGTGAACGACGAGGACGAGGGCCGGAAGGCCGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCT:1 + chr2R 24869232 5' + invader6 4534 2 71.29 AATAACAAAAATGCAAAAACCGGCATTTCGAAACGTTTCCCCACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATAT:1 + chr3R 11759384 5' + Quasimodo 86 2 59.41 TGCATATGCTAAGCGTCCAATATCTGTTTCACTTGCAGAGAAAGTACATATATAGTTGTCTTGCTCTATCTTTCTGTTCGTGCGTATGAACGTCGAGATGT:1 + chrX 19511075 5' + INE-1 133 1 60.40 ACTCGGCCAACCCGTTTTGTAGCATACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTGTATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGGTGAATTTTGTATAAATC:1 + chr3L 7193217 5' - Tc1-2 443 1 75.25 AATAAAATTTAAAAAATGAATAATTCAAAAATTTAACAAGCTATCATATTTTTGTACACATGAAATCTACGTCTTATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGT:1 - chr3L 22848762 5' - diver 106 2 54.46 ACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGT:1 + chrX 992032 5' + hobo 44 1 70.30 TATATGTTATATGTTATATGTTACATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 - chr4 96889 5' + flea 28 2 60.40 TATAAAATCCATATAATTTATAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3L 12633225 5' + jockey 10 1 73.27 ACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr2L 14790634 5' - roo 9025 2 70.30 CAGTTCAATTCGAAAACCATTTGTATTTACATTAAAAAAAAACAGCAATAAACTGAAATACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCT:1 + chr3R 23677718 5' + accord 278 2 66.34 CCAATATATGACTGTATAGTTATTTTAAGTACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 + chr2L 6454740 5' + mdg1 7086 2 70.30 TACTGCGTTGCGTTTGTTTTCTTATTGCTTAGACATGATGCAATTTGGGTTAATAATCTGGTAACTGTGCATGAAAAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTGT:1 - chr2L 22024963 5' - Ivk 4929 1 74.26 CGCAATGGACCGGGCCATGTCATGCTGGTTAAACTGACGAACACGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 - chr3R 12277571 5' + Tirant 8142 2 57.43 CTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 + chr2R 24493665 5' + flea 4757 1 70.83 CCTTCCTGCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2L 12949272 5' + 412 31 2 59.14 TGTGTGTGTATTGGCTGCGCTTCAATCTATGGAGCTGTCTGCTGTATGTTCTGCCGGATTTTCCCATTTTTTCTGTTATTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 17147415 5' - Doc2-element 232 5 67.01 TACGGGCCAAAGGACGAAGCCATGGTACAGAAGTTGGAGAGCGAGCACAGTCAAGAAGTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGAAACGAA:1 + chrX 2181983 5' + Doc 4387 1 59.41 TATGCTACACTGTACATTGGCCCAACTGGCTCCTGCCAAAAATCAACAAATACTCACCTGCAACGTCTCCTGAAGCCTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCC:1 + chr3L 996964 5' + TAHRE 10087 1 67.33 ATGTGCCACTCATACGCACTGTAGGCAGGCGTAACACAAAGTCCAGACCTCAACATAATGGAAAACCTCTGGTCATATTAAAAAAAAAAAGGAGTTCAA:1 - chr3L 7554440 5' + Tc1-2 1208 1 66.67 TTATCTGAAAGTTATAGAAGTTTTCTTTAAAAGTTTATAATATTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 + chr3L 2019634 5' + 412 10 2 67.33 TAAAGCGACATCTTTTATGTCCAATTTATGCAGAAGAACCAGTCTTAAGTTTAGTGACAATCTCGACTCGATGCCCAACTGATAGCTCCTTTGTTT:1 - chr4 896603 5' - Bari2 262 1 76.04 ATGAGTCCATACGCTACACCTGAATTCCATGGCTTCCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr2R 5804526 5' - P-element 2848 1 41.58 GAGAGTTTTGTAATAGACAGTGGAGAGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr2R 10945316 5' - transib2 2802 1 57.00 TCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAAT:1 - chr3R 13582298 5' - BS 5077 1 59.41 TATGGTTGTCGTGCCTGTCGTCGTCGTCATATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCC:1 - chr3L 7550310 5' + 412 7325 2 70.30 AGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 11119862 5' + 297 38 2 70.30 GTGGCAGAGGCAGGAAGAACTGCAGAGGACGGAAGCGAAGGACCGCGCGTCCTGAAGAAAGGTGGCCTGGCAGTGTAAAGTGATGGAAGGGAAGGGAACC:1 - chrX 21175418 5' - Gypsy12A_LTR 2239 1 76.00 CCCATTAGGAAGGTCCCGGTGACGCAAAAGCCCATCCCAACGAGCCTTGAGCCACTGCATCACTTTGCTGGCATGGTAGCTCGTGATTAATATATATATAT:1 - chr2R 23110913 5' - accord 92 2 66.34 TATTCTTGTTCGCCGAGGTTTATCCCATCACCAATTAATACTAAATACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGATTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGT:1 + chr3R 395217 5' + Stalker 438 1 53.47 ACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCC:1 + chr2L 23295816 5' - micropia 451 2 56.00 TCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 16458018 5' - roo 356 2 79.21 CACAAATCGTGTGTAGTCTCGGAAAAGCAATGAAAATTGGAATGAAAATAGGAATAAATGTGTTTGGGCTTCAACTTTCATAAACATAAACATAAACATAA:2 + chrX 13798788 5' - 412 74 2 81.19 CAAAANCTTTTCAAAAAATTATTCGAATAAATCAAAATTAACGCACGCACGCACACAAACACTCGTGAGATAATCTTAGATGTACTGGGTTAGTGGGTTGT:1 + chr2R 18116184 5' - Tom1 235 1 73.27 AGAAGACCGCATAGCGGATGATGTTGCGACGGGTATCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGA:1 - chr3L 8613787 5' - opus 207 2 64.36 TCTTATATAATTATGTACATAATATAGAATTTTATAGTTCTAAATGTCTATCGGTTACTTCAGCTTTTTATATTAAGTATGTTATTATTATTATTATTATG:1 + chrX 14853838 5' - mdg1 7054 2 76.24 CAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chrX 992065 5' - hobo 2895 1 78.26 GACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chr3R 26530906 5' + blood 53 2 76.77 AGACATGTTTATATACAATTTTCATTTAGCTTCATCTTGTTTGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTT:1 + chr3L 7204626 5' - Doc 209 1 59.41 TTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGACTGTTTTCCTACTTTGTTTTGCTCTTTTTCT:1 - chr3L 23583102 5' + S-element 247 1 82.18 AATGGCACGCATGAGGATACCGGTACTGGTACAAGTGTATGTATGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 17929024 5' + hobo 22 1 52.75 CATTGCCCGTCTCTACATTTTGGTCCTTCGTCAACTCTGTCAGGATCAATAGCCGAGTAGATCTGTTTGCATGAAGGTCGAGATCTCACGAACTTTAAAAG:1 + chr2R 4906444 5' + INE-1 148 1 61.39 AATAAATTTGTCTCTGAAATAATACATTTTCAATTAAGTATCAACGTTGGCAATTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 + chr3R 16834020 5' + I-element 25 1 48.51 AGTGTTGGGTTTTTTCTTTTATTGATCGATTGTTCCAGTGTGTCTGTGAGTGTCTATGTGTGCTTAGGTGAGTGTGTCGATGTGTGAGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 4375750 5' - accord 191 2 63.37 CCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAAC:1 + chr2L 18279883 5' + gypsy5 17 2 61.62 GAGNTGGCTATGATGGCGCCAAGTCTCCCAGGCGGATTCGACCAAAAAGGAAATCCAGTTAAAATGAGACAGATCCACAGTCAACCGCATTTTATAAAA:1 + chr3L 6670612 5' + pogo 461 1 57.58 GGGTGAATTAGGCAGATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 + chr3R 14917164 5' + HMS-Beagle 8 2 71.29 CCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 14790593 5' + roo 45 2 72.28 GGGGGCAAAGTAAGTTTCCTTCGAGCATTTTCTGCTTACTCACACGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATT:1 + chr2R 13074827 5' - jockey 4667 1 55.45 TTTCAGTAAACAAACGAAAAAAAAAGAGCGTTAGGTATTGCTCCTGATCAAGAATATATATACTTAACATGGGCAGAAACGATTCCTTCTGCCTGTTATAT:1 - chr3R 6508845 5' - INE-1 30 1 63.37 AACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 19377816 5' - roo 397 1 67.33 AAACAAAGGCGAGCATGGAGCCCAGTTAGGAATACACATACAGAATGTGAATACATTTTATAAGACTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACT:1 + chr2R 24233589 5' + Doc 468 1 68.69 CTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGC:1 - chr2R 23133732 5' + hobo 53 1 78.22 AAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAAC:1 + chr3R 8975942 5' + Bari1 35 1 60.40 GGAACTAATCAACAACATCGATGGATGAATTCCCGGACTCGCTTCTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAATCTTCACTGAA:1 + chr3L 24059368 5' - invader4 3003 2 53.12 ACGAACAAATAATAATATAACATGGATAATGATACATATTGCATTTGCAAGAAAAAACTGCTATATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2R 12458011 5' - roo 402 1 72.45 GGCCAACTGCGATTGGGACTGCGACAATTGTTGTCCGGATGAAAGGCCTCCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAACTGCCAAC:1 - chrX 11396012 5' + accord 65 2 57.43 GACTACTGATGGCTACTTTCTGATCGGGACAGACATCCGAAATGCAGCGCCCAAGCATAACGTAGGTAGAT:1 + chrX 7560012 5' - diver2 4695 2 66.20 AAGCTGATCAAACACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 16674833 5' - roo 400 1 73.27 GAACAATCGCATCGTCGTCCCTTTCCGCATAACGCACTCTCTCTTTCTCTCTCGTTTTTTTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGT:1 - chrX 1060305 5' - invader2 264 1 63.00 CTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr2L 7800066 5' - P-element 2844 1 36.63 CATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:1 + chr3L 19951199 5' + Ivk 31 1 57.43 TAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 + chr3R 19132284 5' + Ivk 44 1 70.30 TGAATTGCTAAAAATCGAAACTATGTCATGGATCGGGTTATTCTTATAGATTTCTTGGTTTTACATCTTGCTATACTTAAGTCAGTCGATTTTGGGAGTTT:1 - chr3L 25270761 5' + Burdock 6269 2 74.26 TCTCCTTTTTGGCGGCATGTTTCCTACGGCAGTGACAAAAAGCGTAGAGAAGACCAAGAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 3917309 5' - 1360 3366 1 61.39 TCATTTCGTTAACCTATATAGATTTCAAATATCCGTTTCCTATACATACAGCTGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCA:1 - chr4 126691 5' - Tc1 1415 1 68.32 TTTCANTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 8313137 5' + 297 15 2 63.37 TCCTGCTGCGACCCATTCCAAATGCATTAAAAGAAAGTTAGCTCTGAGCATTTGCATTTGTATTGCTATCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 - chr3R 31257076 5' + transib2 6 1 76.24 TGTACCTGGCCGCCAAAAATGCATCGAAGCAAGGAATTTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAA:1 + chr2L 21153720 5' + 1360 268 1 62.38 ACATATGTCCTTCCAGCCGCTCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTT:1 - chr3L 13548838 5' - hobo 2885 1 78.22 TGCGACTGCTCTCGTTACCATTCTACTCGAAGTCCCTCCTTTTTTATTTTATTATTATATACGGCAGGAAA:1 - chr3R 1329904 5' - Rt1a 5060 1 61.97 TTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAA:1 - chrX 20886036 5' - Ivk 5346 1 59.41 ACAAANCCACAAAACACTGGATGCCAGGATGCCAGGGTGGCTGGATGGATGGTGGCTTTATTGGACGACTCCATGTGCGGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTA:1 + chr3L 11361779 5' - accord 7103 2 90.10 CAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3R 19989317 5' + hobo 37 1 58.00 GATTGGAACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCT:1 - chr3L 16973441 5' - S-element 1677 1 69.31 CCGAGGAAAGCAAAACAAAACACGCATAAAAATTCTTCAGCCTCCACTGATTGTGAAGAGGAAGACGGTTATGAATTATACAATATTGAAATTAAAAATAA:1 - chr3L 1937933 5' - hopper 190 1 71.29 TATATATATTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr2L 13574206 5' - pogo 2067 1 63.37 ATCAAACACAAGCGTCTACTAGCAACACCTCCAGCTTCCTCTGAACCCAGATGAAAATATGTAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 16674839 5' - roo 394 1 69.31 CGATAACGAATTTGTATTTACTTAAAATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr3R 26530880 5' - blood 7337 1 74.26 TTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 18212135 5' + 412 7090 2 64.36 AACTANCTATAACTCTGCTTCTTGAGATACTACAAACAGAACTTGGGTGTTATTTAATTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATTGAGCTTTTCTAATATGAA:1 + chr3L 23579510 5' - Idefix 414 2 55.45 ACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 10143179 5' + 297 49 2 81.19 CAAAANTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chrX 18239420 5' + jockey 33 1 51.49 AACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr2L 7488927 5' - roo 9044 1 62.24 TTAAACCAACAAAAGGAATATGAAAAAATATGTGTAATATTTTTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCG:1 - chr3L 8713187 5' + opus 1 2 78.22 CATCTAAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:2 + chr2L 11703224 5' - Tabor 7301 2 55.45 TTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCTACCCAAAC:1 - chr3L 23839698 5' + McClintock 39 2 68.00 ATGTGCACTCTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chrX 21017784 5' - 412 7507 2 63.64 ACTGCACTATATTGCACAAGACATTTTATTTTTTTTCGCAGATTTTTTGGCACTCGATTTTTTCGCCGTAGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCACTCACGAAT:1 + chr2R 4511696 5' + 1360 77 1 60.40 AATAACAGTCGATCCAGTAAGTAAGACGTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAGGAGAGCGAATTTA:1 - chr3L 23703961 5' - G4 55 1 72.28 TTGTAGAACAACGAGATGCTCTTCCTGCCATTTTTGGTTTTCACACCCATTTGGATAATTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCT:1 + chr2R 14091442 5' - hobo 2581 1 63.37 TGCACCAACTTAAAGACTTTCCGAAGAATTTTGGCAACATGTGAGAACGAGAATTTCAGCAGCCACCCGTGTTGGCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACC:1 + chr2L 18430046 5' + copia 1 2 75.25 GCTGTCCACTGTGGTTGGATTTAGACAAATGTATAACCAGCAACTTAACGACGCCGCGTCTGCTGAAAAAAACAACAAAAAAATCGAAAAAAAAA:1 + chr2R 22548339 5' + gypsy7 5004 1 72.63 AAGCTGTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:2 + chr2R 13650098 5' - mdg1 7436 2 56.44 AAATTGCCGCAAATTTTATGTTTCTGTTCCATACCGTACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGG:1 + chr3L 13237001 5' - Rt1b 4987 1 66.34 AAACTATACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 + chr2R 12082353 5' - mdg1 7412 2 70.30 GGGAGGGCTCCATGTGAGTGATACATCAAAGCGAACGGTCTTCTTTATACCCGTTACTCATGGAGTAAAATGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAA:1 - chr4 459705 5' + INE-1 14 1 79.21 GTTTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGACACAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3R 8313139 5' + 297 6582 2 70.79 AATTTTTGTCGTTCAACAACACCTGCAGCACGTACATATAAACCCCAATACAACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGTTACCAGATAAGAAAAAGAT:1 - chr3R 10570709 5' + Idefix 106 2 67.33 CAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTA:1 - chr3L 23583084 5' - S-element 1269 1 70.30 GATTTCTGAAAGTTTAACACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3R 25671914 5' - I-element 5333 1 52.48 GTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGAT:1 + chr3L 25889017 5' + gypsy8 312 1 73.27 TTAGTNACCCTTTTTTTGTATTGTACTCGTAGTCCTGTTGATTTGTGCATCCCGTGTTTCAGATTTTGTTGGCTAACTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGTG:1 - chr3L 1525824 5' - BS3 1420 1 72.28 TTTCCCCGCCTCTACTGGTTATCCTGTCGCCTGATTAATGTGGCCACAGTTAAACTTAATACAGCGCCCATCTAAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAA:1 - chr3L 6586330 5' + copia 4662 1 79.21 TGTAACTTGCTTAAATTTCGATCAATATTAAAGGTTTATGATAAGTGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTG:1 - chr3R 1267416 5' - X-element 4500 1 75.25 GCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chr2L 4160142 5' + Tirant 8157 2 74.00 TGGAAAAGGAAAAGCAGATAAATAAAAGCTGAAATGAATAACAATTCTTAAGCTTAGAAAGGAAGGAAAAACATATAAGGACATTCAAAAAACCCTTGAAT:1 + chrX 19085558 5' + HB 429 1 70.30 GACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAAGCA:1 - chr3L 24916691 5' + Porto1 148 1 55.45 GCACGCGCTCTTATTTTTCCTCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr3L 16761279 5' + roo 56 2 81.19 TGTAAAAATACGTGAAACGAAATCCAAACCATATATTAGTGCCTAAATATTCCATTCAAGATTCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTT:1 + chr3L 24999241 5' + Cr1a 12 1 68.32 TGAGCGTGTAGCGGCGTCGTGAGTGTGTTTTTCACGTTGAGCAAGCGGAGGCAAGCTTGAATTATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGC:1 - chr3L 23111350 5' + Cr1a 4241 1 80.00 ATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 15305648 5' - roo 9030 1 70.30 TAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 13375944 5' - 1360 3382 2 70.00 GAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 10543436 5' + P-element 46 1 31.63 ATAAAGAATACAGAAGAAACGAAGAAAAACAAACTATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAATTGTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGC:1 + chr2L 22339649 5' + 1360 3114 1 65.35 AATCTTTCCTGACTCAATGTAGATTCAAAGACACAAGAATTATTGGTAGATTTGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATGGCCATACAT:1 + chr4 311196 5' - 1360 3370 1 59.41 TATTTNCTCATTTTTAAGATAATGTTTGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2L 15080596 5' + hobo 8 1 74.26 GCGGCNAACATGAAAAGGATTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr2L 21010862 5' + opus 34 4 68.32 TTAAAAAGGAAATACATTAAGATTTCCGCTTTAATAACATAGCAGGTTTAATGTTTGGATACTTATATAGTTATTTATATTTCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr3R 15768199 5' - Stalker3T 202 2 69.31 AACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 - chr3R 7388406 5' - HMS-Beagle 7005 2 63.37 TCCAGAGTAATGGGCCATAAACACAGTGTGCCGGGTCCGGCTAAAAGATTGGCATTATTTGGTTTGCCTTGTTTACTTTATTTTATTGTATTTTATTTTAT:1 + chr3R 13510719 5' + transib1 1900 1 56.44 TGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chr2L 16948719 5' + jockey 4712 1 63.37 CGGCACACTTGAAAAACATGAATGATTTTCGAATTGTCCCCACCTGTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTATC:1 - chr3L 10081780 5' + rover 7123 2 53.47 TCACATGTCCATGTTAGAGAATTAAATTAATTATTATAATTTTTTTTCAAATATCCTTTTTGATGCATTGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATA:1 - chr2L 176855 5' - I-element 5319 1 72.28 TAATTGTGCCGCGTTTGCTGCTGCTTTAATTCGTATTTTCATGGGGGTACTTCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 18571108 5' + hobo 22 1 56.44 AAGAATTATAACGCGGCTGACAAATACGAATAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTAC:1 + chr3R 12281401 5' + Tirant 436 1 69.31 AACGTCAAGATCTAATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2L 7488828 5' + roo 8667 2 72.28 GGCGAAGCCAGCGGCAACGTCATCAAAGCCATACTTTCTCCAACGTGGAATTATGCCATCCAGGTGAGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCACTAGGCT:1 + chr3R 12610748 5' + G5 4418 1 77.23 AAACGGCATCAATCTGGAAAACTTAGCAATGAGGCGGGCTCTGAACTTTATCTTTAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACC:1 + chr2R 13355483 5' + F-element 4344 1 73.49 TATCAACACACCTTACAAAACTTAAATGCATCATTGTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTT:1 + chr2L 16644092 5' - F-element 4636 1 64.36 ACTTATTCGAGAATATTCTGAAGCTGCAAAGGACATGAAGTAATCAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTA:1 + chr3R 2532815 5' + roo 8600 1 55.45 GGTTAGCTAAGCAATATATAGGAAGTCTCAAATGAACTTGATTTTATTGGTTTGTATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCACCTACAAACCAAAC:1 + chr2L 7128916 5' + I-element 5061 1 60.40 ACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 12539558 5' + roo 36 2 64.36 TGATCTTCCTCTTTAATTGTTGTACACTTACAATAATAATATAATGCAAAGTTCCTAAAGATTGTCTATCGGAAAGTGTATTGTTTTACAGTTTCAGTCGT:1 - chr3R 23456599 5' - Gypsy12A_LTR 8 1 56.44 AAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr2R 7861674 5' - roo 9029 1 71.29 AGGTACAATTTTATAATTTCGTTTCGTGTTTAATTAAAGGTGAAGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTG:1 + chr2L 11189498 5' - G6 1765 1 56.44 TGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3R 28645841 5' + F-element 47 1 60.40 TAATTGAATTTTTTCCGAAAGAAGACCAAAAGTTCTCTAGTTATGGGTCGCGGCAAACATTGTACCGTCGAAAAAAGAAATGTGATTAAAAACATGATCTC:1 - chrX 7414472 5' + Tc1 396 1 88.12 ATTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 - chr3R 7168650 5' - flea 4996 2 60.40 GAGTTTGGGTGCCTGGAGTTTTAAGTTTCGAGTTTCAAGTGTTTTAGCTGTGCTCGTGACACACGCTCTCCACTTGGACTACAAGGTGCTGTTATTCAACA:1 + chr3R 11249646 5' + Doc4-element 2560 1 61.39 GATCACTCCGATCTCGAAGCTTTCGCTTGGGCACCGCAATATAAAAATGGAAATGCAAGAAAAAAAACCCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGT:1 + chrX 22837477 5' + 412 496 1 72.28 TTCCACTCCAGTGCTTAGTCCTGAATCAGGAGGTTTTTATTGCCAACGCTGCCCCACTTAATTTACCGTCCTTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACA:1 - chr3R 28779753 5' + Cr1a 4018 1 65.35 AAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 + chr3R 7388357 5' + HMS-Beagle 6844 2 74.26 AAACAGGCTGAGGAATTGGATTAATTGAGACTTCCACGTTATAAGGAAGTCATTACAGCCCTGAAAAAGTATTTTAGAGCATACAACTAAGCAATCAATGT:1 + chr2L 19868222 5' + invader3 5125 1 58.42 TTGCTTTGTAGCTCCCGATAATGTTGCCTACAAAGTATGCAATTAAAAGTCGGTCGGCTTCTCAAGGCTTTCGTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3L 22039792 5' + jockey 4675 1 73.27 AATTATTAAGTTATTTCAAATAATAATTATTTTTTGCATCGGAATACGACTGATCACTTTTGAGCTCTGTCCAAAACTAAAGTACAATTTCATATTCAAAT:1 - chr3R 1960322 5' - gypsy9 5229 2 89.11 TCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:1 - chr2R 17345961 5' + jockey 19 1 67.33 AAATAAAATATGACAAGGAATGCTATATGAAAAAGAAGAAGAATCTAACTTGATAATTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:1 - chr3L 24123314 5' + GATE 32 2 57.43 TAATGTTAATGCTGTAAAAGGTATTGCTCACAGTAACCTGTTGAAATTTTGCACCTAATAACCAATGTCTACTCTAATTTTTAACACGTCGCAAGCTGAAT:1 + chr2L 22926607 5' - 1360 420 1 52.48 TATTGTGTGCAAACCTCCTTTGCCATCTTCTTTCACTTTTTTATTTTCGTCGTTTTCCATCCAATGCACAACAAATCATGCGCTTAAGTGTAAGCAAAAAT:1 + chr3L 13005924 5' - rover 7045 2 66.34 GGTTACTGATTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:2 - chr2L 15947469 5' - Transpac 293 2 62.38 ATGGAAAGCATGGAAAGCACAGAAGAGTCAGAAAATAGGTTAGCTAGACTAAACTTTGGATTTCCTTAAGAAGGAAAATAAAAATAAAAGGGAAAATAAAA:1 + chr2L 8443973 5' + Doc2-element 251 1 71.29 ATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATG:1 - chr2L 23295843 5' + micropia 5093 4 77.23 CTAAACTCGCTTGGCCAATGATGATATATCCACCCCGAGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTG:1 - chr2L 823945 5' + R1A1-element 5047 1 62.38 GGCGATACGATATTCAAATTCTAATTTACCATAACATATCTACGATACAGGATTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCT:1 - chrX 21059145 5' - micropia 5197 1 56.44 TCATCAAACACACACATATATAAAAAGGAAAAGGACGAAGTATGGAGGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACA:1 + chr2R 12275470 5' + Doc 4335 1 53.00 TTGAAGTCGCGCACAGCGGATTAAAGGATTAGCCCCCAAAGCGGAATATTCCCCATTTCCTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCAATG:1 + chr2L 8299043 5' - S-element 1246 1 67.33 GGCCCGGTACACTCTGCCGAGAGTCAGTCTTTGGCAGTCAGCAGCCGACAGCAGATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTA:1 - chrX 17967214 5' + Tirant 196 2 56.44 GTTGGGAGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGATGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGCCTGTTCCGAATA:1 - chrY 3648876 5' - 17.6 452 2 70.00 GAAAAGTAGTTCAGAGCGTGAAAAATACGTTATATGCTGCAAAAGTTGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATAT:1 - chr2R 18673208 5' - P-element 2782 1 52.48 TACAATTAACGACACGAATCATGATGTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCG:1 + chrX 15370779 5' + Idefix 275 2 74.26 TGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chr3R 17843625 5' - roo 9069 1 69.77 CAAGACGCTGGCCAGCAAATTTGAGCCGGTGATTAGCGCCACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAATCATTTTTGAAATTTA:1 - chr3L 8444362 5' - 1360 375 1 61.39 CTATTCGTGCCATTTTAATTTCGTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2R 8310916 5' + pogo 19 1 54.84 TGGAATCAACATATTGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGT:1 - chr2R 7174856 5' + Ivk 17 1 62.38 CATCACCCCAAATAGAAATAGTTAAATAGATTCCTTACCAGGTATATAAGGCTTTTGATTATAGGACGATTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCT:1 - chr2L 18854264 5' - Bari1 1624 1 76.24 CCAAACCGTTTACGACACCAAATGTCACAAGAGAACTACTTTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 - chr2L 20824679 5' + pogo 32 1 59.41 AGTGTATCTCTAGAGTGACGTGGGATTGCCGTGGCTGTTCGTTTCATTTGATGACCTTGATGGGCCGGGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGC:1 - 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roo 400 1 42.57 TAAGCTTCTCGTATTTCTTATGTAGTTGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCATATAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCCGCAGTCTG:1 - chr3L 26213977 5' - rooA 229 2 73.27 CAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 7488922 5' - roo 9036 1 66.34 AGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chrX 13546654 5' + roo 8714 2 80.20 AATGTAAGCCTTAAAAAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr2L 13574289 5' + pogo 19 1 55.45 GTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chr3R 19132289 5' + Ivk 46 1 74.49 AGCGCGGCAAAGTATGCAAAACAGCTTTGACTAACACCTACACACAGCACTGTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr3L 10013661 5' + hopper 15 1 62.38 GTCGGATTCAATAAGTAGAAAAGTTATGTAATGTCCTAACCACGCTGGATAAACATACGCCCGGTCGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCT:1 + chr2L 7769052 5' + GATE 187 2 65.35 ACACGCTCAGTAATACACTAAAATACATAAACGAGTATTTTATGAATAAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACACTCTTAACTAT:1 - 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roo 9048 2 56.44 TGGTGGAACAGCCTGAAAGTAGGCTACAAAACTCTTGTCTTCAGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 + chr2R 14351836 5' + Max-element 14 2 63.37 TAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chrX 19116870 5' - opus 468 2 65.26 GTGGCNTGGGTTGGAGTGCCACGTGCAAGTACACGAGTCCTTGAATGTGTGTGTGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTAT:1 + chrX 1897950 5' + micropia 137 4 56.44 TATTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTAAGGGGAGGGAAGTAGCATAATATGCTTCACATATT:1 + chr3R 29011379 5' + rover 6955 2 63.44 ATATTTATTCAATATAACAATATTTTCTGATTTCGGTTTCCATGTTTATCTAAAATAAGACCACTTTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAG:1 - chr2L 16423299 5' - Cr1a 377 1 71.29 AAAGCCAATAATGATTTGAATTTCAAATGTGGGAAACGCTGCTGCTCAGTGGGCGTGGCAATGGAGGGGCGCCAAGCGAAAAAAAGCAAAAAAAAAACAAG:1 - chrX 3421576 5' + gypsy7 5010 1 80.20 ATGGGAAGTGTGAAATGCTTTTTTGCAGCTGATGGCCACCAAATTTTTTTGTTTTGCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATAATAATAATAATAATAA:1 - chr3L 22847710 5' + mdg1 38 12 61.00 TGGTGNAGGCGGCTATCAAGCGAGTGGAGAGCGATACGGAGGACACAACTGTGGAAGGAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATT:1 - chr3L 19597600 5' - Doc 314 1 63.37 TGAGTGCAGCTCGGCAACTACAACTACAACTACAGCATCAGCAAACAATGACAAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTAG:1 + chr2R 19081235 5' - Doc 4513 1 58.42 ATCGCTGTTACCATCGCCGGTATCCATTTCATCAGTGCTGGCGGTAAACTCGTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTG:1 - chr2R 5999657 5' - Bica 4589 1 57.43 CAAACAATAACAAAATAAAAAAAAAATCATAAAA:1 - chr2L 18703041 5' + jockey 4990 1 91.18 AGTGGGCGGGCGAAAAGTTTACGGAATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 16940339 5' - 297 6936 2 75.26 TCCTGCAACAAGTTGCCAACTGTTTCGGGCCTCCATTCGCCAATCCATTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAA:1 - chr3R 26668055 5' + Quasimodo 7188 2 58.42 TGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCC:1 + chr3L 27585 5' - INE-1 571 1 66.34 TAGCTGTCAATTGCATAATCACTCAAGCGATATTGTTCGACCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACC:1 - chr3R 28214655 5' - F-element 4490 1 59.00 ATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCT:1 + chr3L 19951213 5' + Ivk 38 1 67.02 ATGAAGATCGGATAATAATGGTGCATACAACGTCCGAATATTTAATTTATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATT:1 + chr3R 19449164 5' - roo 8702 2 54.46 GACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATATTTTATATTTTTATTTTATTTCATGATGTCAATATTGCTGTTGCTG:1 + chr2R 1982172 5' - F-element 4297 1 51.49 CTCTGCGACTGCAGCATTCTTCTGTCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATT:1 - chr2R 11546200 5' - invader2 489 1 75.25 GGCCAGCAGCTCACCAAAGCTCATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr2R 20739417 5' + roo 8 2 72.28 CGCCCCAACCATTTGCACATCTCACCTATTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2R 15474778 5' + roo 17 2 62.38 TCGCATTCCGATTCTATTAAACTAAGTTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAA:1 + chr2L 20622648 5' + Doc 257 1 73.27 TGAGTGCAATTTCGGCTCACTAGGCCATTTCCAATGCTCTTGGTGTAATCTGACCCTCACAGAGTATTATGTTCTGACTGTAATAGACTTTATCCTATTAT:1 - chr3R 14811151 5' + Cr1a 4209 1 53.47 TAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCT:1 - chr2L 23295878 5' + micropia 16 2 59.41 TCAAGATGGTCTCAAATAAAGCAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTC:1 - chrX 21564751 5' + diver 20 2 60.40 ATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 19989253 5' - hobo 2915 1 54.64 GCTGCTTCCCAGCACTTGGGAGCTCAATTAAATTGCACTAAAAAACGGAGCCGCTTGAAGTGTAATAAACCAATATACGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 + chr3R 16400140 5' - blood 358 2 59.41 ATGCGTGAATAGTTTTTGCTTACACGTCACTTTGAATTTATTCATTTTTTGTTGATTTTCTGTTAAGACTCATTAATATTCAATTAGGACATGTTGAAGGC:1 - chr2L 9299843 5' - Tabor 7218 2 63.37 CATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr2R 14778501 5' - mdg1 383 2 64.36 CACGAAACAGGATGTTGGAACGTGGGGCAGAAATTTGCAAAAGAAGTTTGGTGAGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAAT:1 + chr3L 15212109 5' - F-element 252 1 60.40 CTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:2 + chr2R 8345504 5' - roo 9037 1 59.41 CATCCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATT:1 - chr2L 17444094 5' + G2 2783 1 63.27 AATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr3L 9383521 5' - P-element 2843 1 35.64 TGTAATATACTACCTTATCTTAGCTTAGTACCACATTCTCCAGGTGATACATACATATGCATACATACATACATACATACACACATACACACATACATAAA:1 + chr2R 14081652 5' + Quasimodo 40 2 71.29 AATCCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3L 18501027 5' - hobo 2919 1 56.44 AAGATNTAGATTGGAGTTGTGGAAAGCACCAGACAACGGAAATCGATGGACAGCTCGGGATAGGTGAACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGC:1 - chr2L 17746818 5' - rover 128 2 66.34 AAACTNAACTGTGATTGTTGTACAAGCAAAGACCCTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 + chr3L 11257354 5' + 1360 3380 2 48.51 AGCCCCACCACGTTTTAGCCAAGTTCCGTAGACCTTCTCCCCCTTTAGAACCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTT:1 + chr3L 9782252 5' + I-element 330 1 53.47 GGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr3R 7388343 5' + HMS-Beagle 34 2 60.40 AAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chr2L 17210267 5' - jockey 4972 1 58.42 ACACCATGTTGGTGGGGGAGGGGCGGGGAAGGCACAATGGGGGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACATTCCGCCCCCCTTGCAATC:1 + chr2L 20942334 5' - GATE 8217 1 58.42 CCTGACAATGGTGCGGTGACTTGCCCCTAATGTATGCTCTTTCATAATACAATTTACAAAATTTTTTGAATTTATGCCAAAGAAGGGAATCTGGCCCAGTG:1 + chr3L 17213253 5' - transib3 3 2 54.46 AAATATTTGTATGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 16457981 5' - roo 394 1 65.35 CCCAAGAGTGATTACCATTCGATCTGGCTTGGTTATGAATTCAATGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTT:1 + chrX 2326351 5' - mdg1 487 1 56.44 TTTCGCCTCAGAAATTGTTTTGTTAGCCTGTTTACATGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 - chr3R 6735365 5' - copia 252 1 75.25 CCTGTTGCGCTGATATAAACTTGTGTCATCTGTCTTGGCCTGTCATAATTACATTCTCCTCCGTGAATGTAACCATAAAAGATTCAAGACCTTAATGACAC:1 - chr3L 21818385 5' + baggins 5083 1 54.46 ATAGTGCCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr3R 13376035 5' - 1360 3357 1 60.40 TAATTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTA:1 + chr2R 5582168 5' + Cr1a 442 1 66.34 ATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr2R 17626549 5' - mdg1 379 2 67.33 ATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGAT:1 - chr3L 19377795 5' - roo 9039 1 56.44 GTGCAATGAAGTGCAAGTGAACTTAAAGGGACTAAAGATACTCCAAACTACCTCAGTATCACCCTCGATAGATGACTTACCTGGAAGCAGCATACC:1 + chr2R 15798471 5' + G7 716 1 59.38 GAAAATATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr4 1149951 5' + 297 3 2 76.24 AGCCANAGGAGGCGGCCTTTCAAGGTGCGTTTGACAGAAACCAAACCCTCTATCCCCAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr2R 16038434 5' + jockey 4758 1 56.44 GATAGGCAGGGGAGTGATGAACCCGTGGATTTGCACAGAGAAGGTCGACTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr2L 19481378 5' - roo 406 1 76.24 GTTGATTTTGTCCATGCGAGCAAGCGAGATAGCAAAAGGGGGCCGCGGGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 9551509 5' + P-element 10 2 69.31 TAGCCTGCCCCATGCCGCGTTCGAATTGTATGTTGCGGACTCCGTTGACGTTTTGCAAAAACGTAGCGATCCAGTCTGCATGACCGAATTCGGG:1 - chr3L 6267986 5' - Doc4-element 453 1 73.40 CTTGGCGGCTTACCATCGCTGAGAACCTTGAGTGCTGGTCAGTCGGCTTTTGGCTTTCGCAAGGTGCAGTCGCAGTAGATGTCGTGATTGCTGTACTGGTA:1 - chr3L 4167480 5' - Doc3-element 487 1 79.21 TATAGTTTATATAGCACTCTCAAATTTGACAGACACATATACACACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chr3L 9817326 5' + accord 7104 2 80.56 CTAATTGCTGTAAAGCTGCCGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGCCAAAAAATCGTACGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTG:1 - chr3L 13397144 5' - 1360 1 2 78.22 AGGAAAAATCTTTTAAATTCAACTAAGGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTG:1 - chr3R 12579883 5' + F-element 4347 1 73.27 TCACTACCGCAAAATAGTACCCTTCTAGGTATTGTTTCAGTTCGAACAATTGCCAAGCAATCCTTCGGCAAAAAGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAAC:1 + chr2R 4525946 5' + Cr1a 421 1 73.27 TATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 7488847 5' + roo 8685 2 54.00 GTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 - chrX 20806939 5' + opus 7148 4 59.41 GGTTAAACAAGATTTAAAAACAGTGTTAAAGGAATTTCACGAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAT:1 - chr2R 2311295 5' + hopper 34 1 78.22 CGTTACACTTGCAATTGGGCTGGACTGTTTATGTCCACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGTTTATATATTTTTGTTTGTGTGTTGCTGTTCACTGTTGT:1 - chr2R 3157645 5' - gypsy10 481 1 71.29 ATGTATATATATATATATATAAGAGCGA:1 - chr2R 18177425 5' - blood 180 2 96.43 ATTTAATATTGTAAATTTCCGATTCCAAAAAAAAAGCTTTTAATAAAAACGATATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 12478395 5' - hopper 150 10 61.84 ATATAGGAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCA:1 - chr3R 29331941 5' + G6 8 1 65.35 TAAGCCTAAATACTTTTTATTTTTTCTTGGTAACGAATTTTTATTTCTAATGTAATATTCGACTTTTGTGATTATTCTGAGCGTTTTTGATTGCGTTCGCT:1 + chr3L 25492545 5' - Porto1 4327 1 57.43 TGATTTCAATGCACTTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3L 17921191 5' + 297 40 2 71.29 ACGGATAAGCCGGAAGTAAATTGCTCGGCCTCAGCAAAGAATGAAATTAACATTTTCTAGGAAAAACAATCCAAAAGCAAATATATTCTCTCTCTTAAGCG:1 + chr2R 23412168 5' + G4 53 1 75.25 GGTGTAGGCACTTCGGCTTGACGCAGCTGACATCTTTTTCTTGTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 - 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chr2L 17538047 5' + G4 168 1 52.48 TTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTT:1 - chr3R 13225541 5' - hobo 2884 1 76.24 ACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCAGGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr3R 10277272 5' + Doc 55 1 71.72 TGATTNCTTCTTTTTATCTCTTTTGGCTTCGTTCGCAGCGTGCTTCACACTTTTGAACAACGTTTAAATGTTTCCGCAAATCTATCGATATCCCTTAAAAA:1 - chrX 778995 5' + INE-1 500 1 54.46 ACAAGNGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 8313121 5' + 297 6612 2 62.38 TTTGTGTTGCAAAGTGCAAATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr2R 17626568 5' - mdg1 398 2 54.46 CGCAAAGTTTTCTAATTTCCCTCAAGGAAATGGCGGCGCAAGCCTTTCGAAAACATCCAGTCATCTCAATATGCCACGCCAATCTCCCAGGTAAGACACC:1 + chr3L 2284300 5' + transib4 2358 1 65.00 AAAAAAAAAAATATAAAAAAATTTCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCTTAAGCCAATGGGGAACATACTACATACTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCC:1 + chr3L 8530167 5' + Juan 4026 1 78.22 GTAACATGGTGGGAGGATATATGCTGGAGTAGTCGTTGTGGGAGTGTGATGGCTCCAGGCTTTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGC:1 + chr3R 11292060 5' + 1360 108 1 51.49 CGTTGACCAAGTAAATATGCTATGTAATTTATTTTAACATATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGC:1 + chrX 6378718 5' + hopper 1213 1 66.34 AAATGCTTCTCGACTGCGATTGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTG:1 + chr3R 6702993 5' - F-element 216 1 79.21 GAAAATTTTATTTTTAAAGTTGGACGAGGACACACTGAAACTGGTTGAAAACAAGTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAATACACAAAGG:1 - chr2R 2050486 5' - invader2 221 2 73.27 CTCATATATAAAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATG:1 + chr3R 8975932 5' + Bari1 25 1 55.45 TATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr2L 8565530 5' + blood 28 2 57.43 GAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3R 19346971 5' + blood 7035 2 55.45 ATTTTACAACCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr2L 6888577 5' + jockey 11 1 72.92 TTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGT:1 - chr3R 19450164 5' - roo 8958 2 61.39 CGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 8345511 5' - roo 9033 1 65.31 GGTTCTGGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 23638186 5' + pogo 20 1 58.59 TTTCCCAGGGCCCTTTATGTTGGGACCTCTGTTATTTTTCGTCCTTGTGTTATGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTCGGTGTGGTT:1 + chr2R 4743297 5' + Cr1a 241 1 67.33 TTAAAGTTCTAGTTAATTTATTAAAGATTTGACTTCCTCTTTTGTTGTACTTTGTCCGTCTGTCCGAATGAGCATCTAGATCTCAGGAACTAGAAAAGTTA:1 - chr2L 17558886 5' + INE-1 151 1 58.42 TGATTTATATATTCGTACTCGTACTTTTTGGCAGTAATATGCAGCAGCTATAAAATATAAATAATCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 + chrX 10672275 5' + mdg1 14 2 63.37 TCAGTATTTATATGAGTTGCTTGATTTACAGGAATACAATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chr2R 16750708 5' + Tabor 6878 2 61.39 ATAATCTCAGGTATACAACTTGCAAAAATCGCCTGTTTACAGTATGAAAGATAATGCATACTAAATACAATAATAATAATAATAATAATAATAATATT:1 - chr3R 24682318 5' + mdg1 33 2 57.14 AACGATCGTCCGGGTAATGGTGGACCTGGTGGCCATGGGGGCGGCGCTGGAGGAGGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTC:1 + chrX 15093814 5' - F-element 337 1 63.37 ATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2L 12324085 5' + roo 8712 2 73.27 GACTACTTCTCCTCCGTCTAGGTCGTTTGTATACACTATAATTAAGGAACAGAGTCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAGGAAC:1 - chr2L 10199831 5' + G5A 2793 1 75.25 TGGGGACTCGAGGGAGTGGACGCATGTCCACATTTGCATGTCCAGAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr2R 15474862 5' - roo 9040 1 55.45 TATCATAGAAATAGTATTTATATCATCTTTATTTATCCTCTTATTGCCTTTTATTATTTAAACTATCCAGTGACTTGAAATTTTGATTTATACTAATAAAT:1 + chr2R 2557258 5' + Tc3 1495 1 58.42 TTAAAAACACATGCTCATGTAAGCCACGTCCGCTGCAGTGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 - chr3R 22800214 5' + flea 12 2 67.33 TAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 - chr2R 4483268 5' + Ivk 33 1 54.46 AATAGCTTTAAAACTCAGACCGAATTTCTGTTGAAATGTACGTTGGTCAAAACCAGACACTACTATTCTTATGAACAGCCTAAAAGTTGTGATTTTACTCA:1 - chr2L 22138748 5' - HB 185 1 69.31 GGGAGGGCAGGAGGCAGAATATCTCCGCTTTATGAATACAGAAGAAATAGCCAAACAAAACAGTAAAATGTACGTTATAATTTGAAATTAAAAAGGAATAT:1 - chrX 22697203 5' - invader5 3693 2 73.27 CTTCCGATCTAATTAGACTACTTAGGACAGGAAACTCCCCAAATTAGGACAGGAAACGAGGAAAATAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTG:1 + chr3L 15637189 5' - Cr1a 4305 1 54.46 TAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTG:1 + chr2R 14708953 5' + Doc 16 1 67.71 ATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATAC:2 - chr3L 18337702 5' + Juan 4062 1 61.39 GCTTTTGCTATATGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTA:1 - chr3L 14638654 5' - 1360 15 1 63.37 CCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr3R 6117233 5' + Tirant 8138 2 56.44 ATAAATTTTTAATAACAATAAATATTTATATATTTCTTCATTTATGTTACTTCCGCTTGATTGCCCTGCCCACAATTTTAAAAAATGTTTTAAAATTATTT:1 - chr3R 7768402 5' - transib4 108 1 81.19 TGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2L 16948748 5' + jockey 4683 1 68.32 CCGGCGAAGGCAAGTCGTGCATGCAGTGGCAGGAGAGCAGAATCAGCACTGGCTGGCCTAAAACTATGCTTAATTTTTTA:1 + chr3R 22269089 5' - Transib5 434 1 68.75 CATTACAGAAACATGGACCAGGACTCACAAACACACACACGCACACAAAATGGTGGAGGAGAGAGTGGGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 + chr3L 13548766 5' + hobo 4 1 75.25 AATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCAATACGGTAATTATTATGCACCCCCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chr2R 19209456 5' + jockey 4771 1 61.18 TGGTGGATTTGGTGTGAGGGTGTCATCGACAAAAGTTCATCGTAGATTTGGCCACATCTTTTGGTTATTGTTTTTATGTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGA:1 - chr2R 4940424 5' - Gypsy6A_LTR 250 1 54.46 TAACTNGGAATGAGATGGCTAAATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGCCAAGCAGTTATAGTCGGATATGGTTTTCGGAT:1 + chrX 20434685 5' - Ivk 358 1 78.22 CCCCATGGATTTATGTGCTTTTACCCAGGAATTATAGACGGTTGAGCTTTGGGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATTATGAAATCG:1 + chr3R 14946477 5' + accord 157 2 53.47 CTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:2 - chr2L 19481330 5' - roo 357 2 76.24 ATCTTGGCATCGCTCTGTTTGGGTTGGATTGAGAAAGTGAAGTTCTAGTTGATGTTGATCGCTTAATTGGAACTTAAACTAACTGTTAACAGGTAAGTTA:1 - chr2R 10448464 5' + Bari2 203 1 71.00 ACCTCCCCCTTATATGACAATTACGGAATACTCTAATGACCAATATTCTAGTCATTTTTGAAGTAGGTTGTCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAG:1 - 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chrX 21017884 5' + 412 6 2 46.53 GGGGCAGGTAAACGAGTTGCCACAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr3R 8277950 5' + P-element 55 1 24.75 GATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 + chr3R 14917205 5' + HMS-Beagle 6845 2 77.23 GTCGAGTCACTCCAAACGAATCCAGCCGCGCATCGTCCTGGCATGGAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGGAATTTTGCTCCATGGATCCTTG:1 + chr3R 8739058 5' - Tc1 1243 1 77.78 CAGTGATGGGTAGATGGCGTGCGAGAGAGTGGGAGAGAGAGGCGGTCTATTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAG:1 + chr2R 9711687 5' - Doc 403 1 70.51 AGATAGAAGTTTTAAAATATTGTAAATATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 12539467 5' - roo 403 1 75.25 TATACACATTAATTATTCATTTAATTTATTATACATCCTTAGTTTATAGTGTCATTGGATTTTGCAGAAATACCCCAGACCTGTATTCCGTACGGCCAGAT:1 + chr3L 27423910 5' - BS 4666 1 58.42 TGGTCTGTACAGCGGCACTGGCGATTCAGCACATAGTTGTCCAGGCCGACATCGTAGACTGCAATAAATAATTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGA:1 - chr3L 1805046 5' + pogo 215 1 76.00 GTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGGGTATCGTACGG:1 - chr2R 1949129 5' - Cr1a 4398 1 72.00 TATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3R 16458052 5' + roo 43 2 75.26 GTCACCACATTCTGTATACTTTAAAAAATTCGTGGTCTGCATTTATAAAAA:1 + chrX 16166306 5' + HMS-Beagle2 468 1 58.82 TTAGCTCATTTAAGTTGTTTGGCCGATTTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chrX 13761336 5' + pogo 10 1 70.30 TTTTGCTGGATCGCGAAAAATCACAGATTCCATTTTTAAGTTTACCTGGATTGCATTTGAATTTGACAGTCTTGAAAATTTTTTTATTTTTTTTATTTTAA:1 + chr2L 7535250 5' - F-element 4684 5 27.72 GTGGAAAATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 12780621 5' + hobo 31 1 56.44 GTAGGAGTTATTAGTCAAATTGCCACACGAATACTAAAAGGGATTCGTAGTCAATCGGAATTTAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 + chrX 20620510 5' + pogo 8 1 69.31 AGTGAAGAAACCGCTACTCCCCAAAAGAATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr3R 31458390 5' + jockey 6 1 78.22 GGGGCAGGGAAGATTGCAGCCCCCCCCCGTAAAAGTGCAAACATCTGCAAAACCATATCAATAGCAATGATGACTGATAAAATCATAACTTATGGTATAAA:1 - 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chrX 10827479 5' + roo 35 2 63.37 GGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:2 + chr2L 13319587 5' - hobo 2895 1 69.31 TCATCTTCAACTTATCTGGCAGATACAATTGCTGAGTTACTCTCTCATGGCAAAAGAAAAGCAAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCC:1 + chr2L 18360062 5' + I-element 217 1 69.31 TCTCCCGCCATCGAACGAACAATTGCTCTGCGCAAATATCGTAGCATCAACTGGCCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGT:1 - chr3R 23677179 5' + Bari1 20 1 60.40 CCCCAATAGTTGAATGAAGACAGATACTCAGATACTCAGATACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTT:1 + chrX 18492687 5' + I-element 4998 1 54.44 AATTTTTCTATTATAGATGGGTTAGGAAGAGGTGACAAAGGGGTAAACACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTATCGCGAACCGAAGCCG:1 + chr3R 9167390 5' - jockey 158 1 50.50 GCTACCAATACTAACTTCTTTCCGTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2L 14790553 5' + roo 5 2 74.26 TTTACGACTGCTTTTATCTCTACTTGAAAATTAATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCAGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr2R 6702009 5' + pogo 40 1 66.34 TTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chr3L 18337653 5' - Juan 4180 1 60.40 AAACGCGGCTCAATCAATAATTTTCGGAGTCATGAGACAAATGTTTGTCGCCAAGATTGCGAGAACACATGAAAATAACTTAGCCGTAAGTTTGGTAAATA:1 - chr3L 8325156 5' + G4 3645 1 47.52 CAGATTCATCATCGGGTAACTCGGTCATATGGCACCGAATCTGGCCGCCTTACACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTTGATGACAAGTTCTACATC:1 + chr3R 9477778 5' + Chimpo 4033 1 57.43 ATCCAGAAGCTTCGGATTGGTACGCTACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTATTCTCGACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATTAGATCT:1 - chr2L 16184833 5' + Ivk 5164 1 78.22 ATAGTTCAAGGTTGTAATATATATAGAATTATATTAAACTTTTAGGTAACTTAAAAAGTAAACTATATTTTTAATAACTTAATATAAATATATTCAGAAAA:1 - chr2L 15180865 5' - gypsy7 5059 1 80.20 ACGATAAAAACCATTTTTTAAGTGTGGGCAAACTTTTTTAATGGAAAATATTTATTTTTAAAAGATGGCCTAAAAACTGGACGTGGGCAAAAGAAACTAAT:1 - chr2R 5180264 5' - FB 91 1 79.21 AAAGGGAAAGCAAACACGGCTGGGCTCTTATCGGCTACGATCTTCATCCGCAGTTCCCACTGTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chr3R 23048518 5' - mdg1 406 2 63.37 CTTGCCAATTTTTATCTGTATACCGAAAACACTGGGCCAGATTCCCTTTTTTTGGCATAAAGTCAAATATTAAAGCTAGAGCTGCATTTTTGTAGAATTGG:1 - chr2L 22211280 5' - transib3 2807 1 72.28 ATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 + chrX 19426219 5' + mdg3 20 2 60.40 GAACTGGAAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chrX 992084 5' - hobo 2905 1 61.39 TATGCGACAAGTTTGCCGAGTTTCTTTTCATTTTTTGGGGTAGGTTGCGTTTTTATTTTGTTGTTGTTATTTTCCTTTTGTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 + chr3R 21990390 5' - Doc2-element 233 1 60.82 AGTCTAATTGTGCCCCGGTTCATAATGGCCGTATTATTGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACG:1 - chr3L 23839731 5' + McClintock 7 2 71.29 AATTTAAATTTAAATATTATGTTACTTTACGTTACTTTACTTTAAACTTAAACCGATACCTTAAACTATGGCGCGCAAAATGACTACCAAGAAATCTAA:1 + chrX 16858026 5' + TART-C 10836 1 64.65 TCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 11263389 5' - roo 9045 1 57.43 CAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGACGCCG:1 - chr2L 23390135 5' - rooA 236 2 50.50 GATTAATCGAAGGAACCCCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:2 - chr3R 4834334 5' + mdg1 7060 2 57.43 TGCCATTTCATTTCATTTTCAAAAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACA:1 - chr3R 11308862 5' + Quasimodo 282 2 77.23 TGGTCCTGACAGCAACAGCGCCGCAAAGTAAATAAAATGTTTTACGACGTTTAGTCGGAGTAAAAAGTTGACAAGCTGCCGCTCTTTATTCTGGTTAATGA:1 + chr3L 14398671 5' - Gypsy6A_LTR 177 1 74.26 TATTGAGAAATGCGTATTCTGTCAATGTCGTTTAGAAACTCTGAAGCTTAGGAAGCTTGAGCTTAGCTTTGGGATTCTAGTTTAGGGTCATATTAAATGCA:1 - chr3L 7745873 5' + Gypsy12A_LTR 83 1 69.31 GGCTGCTGCTCCCGTGTCTGCATTCGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGG:1 + chr3R 7185504 5' + baggins 5354 1 77.23 GTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr2R 4483251 5' + Ivk 50 1 70.30 ATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3R 31458443 5' + jockey 60 1 76.24 AAGCGTTCAGTTATTGAGTGGGCATCATTTTGTTCTCCAATATCTATCTATATCCCAGAAAAATTATGAATTTTCGCCTTCGCATTCACACTAGCTGAGTA:1 - chr3L 17874400 5' + INE-1 532 1 74.26 TTTTGCTTCGGAATGTTGGACGACGAGCTGAGCAGCTGGGGATTTGTTGGCGTTAGTGTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTA:1 + chr3L 4921654 5' + jockey 4826 1 66.34 AAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAAAATT:2 + chr2R 5582176 5' + Cr1a 450 1 58.42 AATTCTATTTAATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr2L 13136802 5' - roo 9041 1 58.42 TTTTTTGGCATACAAAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 - chr2L 12325083 5' + jockey 4709 1 59.41 GGACGCAAGCGCGAAGATCCACCTGCTCCTTGTCGGTTATGTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATAGTACATATTAGGGTAGTT:1 + chr3L 24497255 5' - 1360 3141 1 59.41 CAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 - chr3R 7522352 5' - blood 7339 1 76.24 AAAAAAAATTTAACGCACAAAAAATAACTTAGATATTAAGAATCGTTTAAATGGATACCGATTAGATTAAGTTGCCCAAGAAGGGTAATAGTACGCTTGTT:1 + chr2R 1654374 5' + jockey2 3360 1 79.21 AAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAA:1 + chr3R 7388352 5' + HMS-Beagle 6839 2 69.31 TTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATT:1 - chr2R 4802881 5' - mariner2 271 1 33.66 TGAATATTTTTTATTTTAATATATTTATTTTTTCATTTGAGCAAGCCCACTGTTTTGACCAATCGAAAATCCTGAGAACCATCACCGGAGCACCGTGGTAG:1 - chr3L 13308230 5' + Fw2 3634 1 64.36 GTCTCATGTATTAAATTTTCAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACA:1 + chr3R 2649166 5' + 1360 3197 1 83.00 ATCTTNTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr2L 2074774 5' - roo 9039 1 57.43 GCGGCTAACTTTCGCGCCAACCTCATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGT:1 + chr3L 22036296 5' + jockey 4892 1 76.24 GCATACAAAACTTGCTCGCCAGCATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr2L 5646926 5' + jockey 4675 1 75.25 CTTTCCCGAGATTCCTGAAATAATTTGCATTTCCAATACTCAAGGTTCTGATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATA:1 - chr3L 9501388 5' - mdg1 7356 2 61.39 ACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3R 27748666 5' - roo 9043 1 56.12 ACAAACCGCTATACCATAATTAATGCCTGTATATATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2L 513750 5' - roo 393 1 61.39 ACAAATTACAAAATTTGAAAACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr3L 11113878 5' + 412 9 2 70.30 TTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCA:1 - chr3L 28092982 5' + gypsy11 4057 2 76.00 TAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 20878436 5' + 297 8 2 65.35 CTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGT:1 + chr2L 11703252 5' - Tabor 7273 2 73.27 CAAGCATTTGTATATGGATATATATACATACACACACACACACATATATATATATATATATACTTACGTATTTTACTATTCGAGTCGAACAAATGATCCGT:1 + chrX 21292583 5' - rover 328 2 61.39 TATATGTATATATGCATATATGTATATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAA:1 - chrX 9463053 5' + 17.6 45 1 90.10 AATGCCCATCTCTTGGCGCTCTCTTACAGCCTCCGTCCTAAAACCGACCTGGACCTATGGCTCCCAGCTATGGGGGAACGCCAGTAACAGCAGCGTAGAAA:1 + chr2L 14039820 5' + Fw2 3578 1 70.30 CTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - chr2L 5646888 5' + jockey 4713 1 61.39 TATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATA:1 + chr2R 3591987 5' + Quasimodo 34 2 69.31 CGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr2R 4802883 5' + 412 22 2 44.55 AACAAACTTTTAAATCGCAGTTACAAAACTCAGACAAACTGGTGGAGCCAGAGCGATACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCAAGCAAGACGAATGCCGGCTCTC:1 - chr2L 20990006 5' + Doc2-element 319 1 56.44 GATTGCACAATTACCAACAATGGCACTCTTGTTCGGCGCGTGTGTGTGTGTGTAGGTCTCTAATATTTTGTTTGATTTTGTATTCAATAAAGAGCGCATCG:1 + chr2R 7551405 5' + springer 164 2 77.23 GCAGGNACCCAGCAAACGCTCAAAGGCCTTGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTC:1 + chr2R 9996581 5' + F-element 355 1 75.25 TCAATATCGTAAGCTTCAATGCAACCATTTAAATCAATTAAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - chr3R 26530955 5' + blood 7017 2 71.29 TGGAANTGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2L 4160104 5' + Tirant 8120 2 67.33 GTTTAATCTATTGTGTATTTTGTTATGGAAATTTGGTTATAAATTTGTAAGTTATTTGAGTAAGGTTTTATAAACATTATTTTTCTATTTTATTGTGT:1 - chr3L 7810365 5' + pogo 56 1 67.35 GCAGAAAGCGTTGCAAGGAGGTGTGGCAAATCATGGGGTGGTTGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTT:1 - chrX 4406918 5' - G-element 4212 1 63.83 TTATTTTTATTTTTTTGTTTTCACTTTGTTTTACTTATATTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCG:1 - chr2R 15073721 5' - Doc 4541 1 64.36 CAAGGTGAGTGAGTATGCCGACCCCAGTGGGCAGTGTGGTCAGTGGAATCAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATT:1 - chr3L 22406874 5' + flea 4976 2 53.47 GTGAGTGTGTGCGCGAACTGAGGTCCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTA:1 + chr3R 6562762 5' - R2-element 3356 1 76.24 ATATANTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 22098109 5' - roo 390 2 49.50 GTAAAAACCCTGCGACCGTAGCACAAAATCCAATCTGAAATCTGCGTCCCAGCAATTTGTCACGCCGCCGGGAAACTCAGCATATTTGCGTGGCCGCTATG:1 - chrX 3086739 5' + gypsy2 108 3 72.28 TAGGTTCGTGGCACACTAAAGTCCTGGACGAAACTGTGGCATACGTGGTACGTATGGGTACCGTACCCTGATCGCAACGACCCGTTCAGGAGGAGCTCCA:1 + chr3R 20319766 5' + Rt1b 422 1 39.00 AAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:2 + chr3R 20878445 5' + 297 6598 2 56.44 GTAAAAATAAATGCGTATTTATCGAATTATTTAACAATTAAACAAACCAGAGAACAATTATATGTACCCTAACAAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGA:1 - chrX 6701562 5' + FB 2 1 75.25 AAGCGAGTTGCTTGGAAAACTTTGCGGCTTCTCCGAGCATACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2R 16940427 5' + 297 3 2 75.25 AGTGACATTACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATT:1 - chr2L 17784687 5' - gypsy10 302 2 62.38 GTGGCCTTGGCTGGCTTCTGCTGCAGTATGTCGGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAGATTAAAGTCAATAAATTTTTTT:1 + chr2L 11036224 5' - transib4 2289 1 67.33 AGATACCCATAAATACGCCGATCGGAAATTGCTTTACACGGACGGTTTAAAATCTGACGCATCAACTACCGTTCCTTTTTGTACACATATACTGACTAGA:1 + chrX 22442618 5' + rover 158 2 71.00 ATGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr2L 19018941 5' + hobo 25 1 51.49 TTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr2R 11528057 5' + P-element 49 1 32.67 CAAAGGATGTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 10952252 5' - roo 394 1 62.38 TGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr3R 6735329 5' - copia 5085 2 63.37 GGGCGCACATTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGAAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:2 + chr3R 15598670 5' + Max-element 42 2 65.35 AGAATCTTTGTAGAGCTGCAGAAATGAATGGTCAGATATATTAATCCAGAGTTTACTTAATTAACAAAAAAATCTATATAAAATTAAAAAAAAAACATAAA:1 - chrX 6152139 5' + Doc 4698 1 82.18 TAAATAAAATAATGTCATCGTCGTTGCCGCCCCCGCCACGCGAACCCTCGGCCAACATACAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTA:1 - chr3L 21318803 5' + Tirant 435 1 66.34 CTTAGTAAGACGCTTTCTTCGGTACAAAAGAGGCGTGGTGGGTTCCACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 - chr2R 4606283 5' + 1360 32 1 58.42 ATGTATATATAAAGATAGCCAAGCACTATAGTAATCGACTCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATT:1 - chr3R 15598722 5' - Max-element 8497 2 64.36 AAAAATAAAAAATATAATATTTCTTAAGAGGGATATTGTTAAATTTTTGGGGATTGTTCAAGTTACGTGGTTTGGACTGTCTCCCGCTCTCCGCTCCCTCT:1 - chr2L 9435799 5' + GATE 35 2 47.52 AGAGGCGAAAGCGAAAAAGGAGGCGCGGCAAGTAAACCGACGTTTAATTTTTGGAAAGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAA:1 - chr2L 4160211 5' - Tirant 8490 2 61.39 AACTTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 10147905 5' - roo 9049 2 59.00 CATTACTCGTAGAGTAAAAGATTTGTTGAAAAGTATGTAACAGATAGAGGGAAGAGTTTCTGACCATATAAGGTATATATATACTTGATCAGGGTCAAT:1 - chrX 544106 5' + INE-1 83 1 76.77 GGTGGTGTCACGTCTACAACTTTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAACAAGTTCGGAGGGATCCGAAA:1 - chr3R 13004656 5' + R1A1-element 5326 1 81.00 AGTATGTATGTAAACTTTACATATCAAAAAACAACACTGTGCCAGGGTTGTCAGGCAACAAAATAAAAAAAAAA:1 - chrX 11648297 5' + G2 3071 1 60.81 TGGGGTAGATGATTCAGGTTTTGTTGGGTCCTCATGGACTGGTCGCCGTAACTTTGATTGTTCCTGTAACCCTGTGTGCATAAACACACACACATCATTGC:1 - chr3R 3195446 5' + G3 46 1 75.25 TAAACAAACAAAACAAAAATGCAATACACACGTGCGCATTTAAGCGACAGATGTGCACACAAACATAACCCACTAACACTACCTAAATACCAATTCAATAC:1 + chrX 9172876 5' + I-element 4983 1 64.36 GGGGTTTTGCAAAATTGTGTGCAAATATTGCAGGTGAATGTGTGATTACGATTTCTCGGAAAAGCTGCTTGTGATGAAGACATTTATACATATACATATAT:3 - chrX 10285169 5' - Stalker 7095 4 74.26 TTTTTTTGTCACTGCCTGCAATCGGCAAATAAGTATGCGAAAAAGTTACTTTCCAATATCATCACGTACCAATCTACGCGTCATCCATACCTTCGCTATAG:1 - chr3R 7894362 5' + Tirant 8062 1 63.37 CCCTGCCCTTAATGGCTTAAACTTAGGGGGGCCCTTTATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAAT:1 - chr3R 4834317 5' + mdg1 39 2 61.39 AGGGCATATAAAAAAAAGATTGCTTTCTATTAAAAAGGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTT:1 - chr2R 1532971 5' - Doc 345 1 62.63 TGGCATCATGGAACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 8345484 5' - roo 394 1 65.35 GTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCC:1 + chr3R 20137254 5' + Burdock 6157 2 56.44 TCGAGCCATGGATTCAAAATTTCGATTCAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCG:1 - chr2R 5840720 5' + Ivk 2 1 77.23 AGACACGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 - chr2R 21773619 5' + Max-element 8263 2 53.47 GCAAACATGAGGAGCAGCACGAAGCGAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3L 9383483 5' - P-element 2881 2 71.29 AAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr2L 16201527 5' + hobo 51 1 77.23 AAAAGCGGTGCAGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:2 - chr2L 8565550 5' + blood 7019 2 77.23 TTTTTGCTAGAAACACTTTCGGTGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 - chr3L 6044788 5' - Tabor 7272 2 79.21 GATTTAACTACCGTGTGCTCAATGCTATCTACAATGCTGCCTGTATAAAAAGGTCTTCATCGCAATCAGAAGTGTTCCCGACCATATAAAGTATATACGTA:1 - chr2L 22759629 5' + INE-1 57 1 71.29 GCTTATAATTAAGAATTGGGGTTTTGTCTCCGCCACTCTTCAAGGGTTTTTCCCAACGATTTAAAAAAAAAAACTTTTT:1 + chr2R 20179755 5' + INE-1 319 1 62.03 AGTACCTCATATAGTCGGGGGATGTCGCGTTCGCATTTTGAGGCACACGGCCCAAGAAACTTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGA:1 + chr3L 26722784 5' - F-element 4375 1 61.39 ACATACTAAATGTGCCGAACAAAGGCTGCAAATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTATGACACACAAAT:1 + chr3R 26824172 5' + I-element 4946 1 69.31 AGTGAAGTTTCAACTCGCAGCAAGCTGCATTTTCAGTTCTTATTGTGAGATTCAAAGTGGTTCTGCCTGTTTCTTGTATAATTTCATTTTTTTTTTTGTTT:1 + chr3L 21034712 5' - transib2 2644 2 72.28 CATTAAACATGATAGCCAGGTGATTTTTTGGTACACGATTTTTTCGCCTTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTTTCTCGAATTTTTGTTCGAAAGCGAGAG:1 - chr3R 6483000 5' + 1360 96 1 79.21 TTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 10147883 5' - roo 9026 1 71.29 GCAGCAAGCCAAGCCGCAAAATGGCATAAAATTTCGCAATAGTCCGTAATGCAAAAGCTGAACACGTGAAGTATCAAATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTG:1 - chr3L 7819029 5' + invader2 5057 2 55.45 GCCCGCGTTGAGAGTTCGTCGCGGACTGAGCAAATGTTGCGGCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 14713594 5' - P-element 2874 1 61.73 AAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATG:1 - chrX 21564719 5' + diver 52 2 80.20 GAGGAAACACCAGAAAACAATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr3L 13061310 5' + 412 7077 2 52.53 TGAATTACATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCGCCGCCTAATCCAAACTTCAATCAAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAG:1 + chr3R 23020830 5' - INE-1 562 1 47.52 AGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chrX 15305639 5' - roo 9039 1 61.39 TTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 + chrX 20806882 5' - opus 453 2 80.20 CGGGGAATCGGGAAATGGGAAATGGAAAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGATCGACGTTTGAGTTACGGTGCT:1 - chr3L 6844895 5' + R1A1-element 5049 1 71.29 AGCAATAAAAGCAATAACAACAATAAACACAACCGCAGACGCCGCAAAACTAAAATGAAGAAGAAGCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTG:1 - chr3L 7863468 5' + jockey 194 1 71.29 AGAAGGTTTCGGTTGGTAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCC:1 - chr3L 23841635 5' - 1360 3194 1 77.00 AGAGAGGAAATAGACGATCAAACTTAAACGCAAGCACGCATCCATCTTCTCTAATACCTCTGCAGCCGAGCGAAAGTTCAACGCAGATCGCCAATACGAA:1 + chr4 1109403 5' - accord2 7570 2 71.00 AAATTGGATTAAAAATAAAAAATAAAACTGAAAAACAACTGAATGAACAAAATAAAAATTTTATAAAAATAAAATCCGTTGGTTAAATTGTGCCCAAGAAA:1 + chr3L 17891766 5' + HMS-Beagle 359 1 71.29 AGAGCTTTGGGCACAGGTACTTATCACAGCCTTCGAGCGCCGCATGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATA:1 - chr2R 15041067 5' - hobo 2564 1 56.44 TCTTTACAGTACATTTTTCTAGTAATCAAATACTGGTGGCTATTTCTATTCGAGATATTTCTATTCTAAACCCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGT:1 + chr2L 9215216 5' - F-element 100 1 77.23 CTTTTACGTGGTTGCGTCAATTTATATTAAATATATGTATTTTCATACATACATATGTACGTATAAATATGTATTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTGT:1 - chrX 1569457 5' - G2 3076 4 63.92 TCGAANACGTATTTGATAACATGGCTAATCAAATTTCATCCTTCCTTCTGGGTTTTGATAAACGAGGGTTTTTATTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCC:1 - chrX 22444541 5' - Juan 4206 1 70.30 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCATACACCAACCCTCCCTCTAAACCACCATGCTTACACAAGTAGGAGAAATCGAACCGGGAAGCTTT:1 + chrX 20783463 5' + ZAM 8028 2 54.46 CTGTCATTGCAATTGAGGCTGCCTACGAATGTCACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:2 + chr2R 16988163 5' + opus 3 2 76.24 ATGCACACAATAGCACACATTTGGGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGA:1 - chr3R 31946065 5' - I-element 4991 1 76.24 TTTAATACGTTTATTGTTTTTGAGTGTCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTG:1 - chr3R 31457864 5' + jockey 135 1 74.26 CCTCGACAAACTTTTAGCTATGAGTACCATAAATTACGGTTAGTTAAAAGTTGATATAGCCGAAAGAAAAACATGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCC:1 + chr2L 12957774 5' - 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chr2L 13628303 5' - Tirant 444 1 75.25 AGCGCGGCGCAATTGCGGCCTGAAAGTATGCAGCACAATTTTTCTCTTTTCCCAACCCATGTTCCATATACCCCTACTTTCTTTTTTCCATAATTACAAAT:1 - chr2R 7852507 5' - transib4 260 1 53.47 AGACANGCAGTCAGAGAAATATCAGCAGTTCATTTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 27775174 5' - roo 397 1 66.34 CCCGCATTGTGCGCTAAGGTTTTCCTTTTCTTTTTTTTACAATTTTTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACAC:1 - chr2L 7932302 5' - baggins 4956 1 54.46 TTAAAAAAAAAAATGGAGGCATAATAACAACTTTTACCCAAACAGAATGTGTAACACACGTGCGATTACCTCAAACAATCCCACCCAA:1 - chr3L 26662609 5' + I-element 4890 1 75.00 AAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 + chrX 17968380 5' + Tirant 50 2 78.00 TATTTGAGACAATGCGTCAGCTACGTCATATGCTGTCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTG:1 + chr3R 2380327 5' + micropia 5051 2 64.36 GCAAGCCCTCCTCTTGGCTTAAGGAACTAAAAGGCCGAGCAGAAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATGAACATGGAGATCTCAGGAACAATAAAAACTAGAAG:1 - chr2R 7046302 5' + INE-1 155 1 57.43 TTTCTATATCAATGGCTAAGAACTAGGTAGAAGTAGAAATAGAGAGTTGTATACTGGTTAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGG:1 - chr2R 22285775 5' - jockey 4727 1 63.37 AGTATCGATTAGACATCGCCTGTTGTCCCAGCTCTAGTTTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCG:1 - chr3L 13486287 5' - F-element 370 1 61.39 TCTCAGTGTGCGCGCAAAGGATGTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 10952238 5' - roo 408 1 76.24 ATTTATAGAAAAAAAAAACTTTTCGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGTCGCCTAACCGGTCACTCCCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 - chrX 8408127 5' + INE-1 556 1 66.00 AAAAATGAAAAAAATCATGATGTCTTTTTTTACACGTGAATAAATATTACAAAATTTTAAATATATTTAAATGTTCTCTATGTGTTTGGGAACGAGACACC:1 - chr2L 6083813 5' + 3S18 5763 1 76.24 AATATATATTAATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 992019 5' + hobo 25 1 54.74 TTTTACACGAGTTAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr2L 2060122 5' + 412 27 2 52.48 GCAGCATCGTAATCGTTTCTTTAGTCGACGATCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGATAAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATA:1 + chr3R 11405689 5' + Porto1 276 1 74.26 ATGATGGATAAAATATATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr3R 21092417 5' - roo 9070 1 66.34 CTCACNGAACGATCGGATAGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTCACTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCCATATAACAATTGATTT:1 - chr2R 7394584 5' - mariner2 266 1 30.69 CAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3R 15072581 5' + pogo 38 1 67.33 TCATCTTTTAAACTTCTTTTTTACTCATTCTCGGCAACTAGTTCGCATACCGATACACATTCCTTGGTCGGCTGACTACCTGGTCATGAAGAGTGCCCATT:1 - chr2L 9121259 5' - Ivk 4944 1 78.22 GAGGGCGAGATCCCACAAGTAGCTGGCGAAGTGTGTGCGAGCGAGCGAGTGAGTGAGTGACAGCAGTTGGTGACAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chr2R 11527979 5' - P-element 2884 2 80.20 TTAGTAGGAATACTGTACTAGCATATGAATTAGTAACTGACCTGAATTTAAAAAAGAACTTTTAGCATGGCTTCGTTACCATAGAATAAATAAATAAATCT:1 - chr2L 16948467 5' + Doc3-element 81 1 68.32 TTAATTTAGCCTCAGATATAGACATACTTTCAGTATTTATATGAGTTGCTTGATTTACAGGAATACAATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:2 - chr2R 16750737 5' + Tabor 6849 2 59.41 CGATGCATCTTATATTCATACTAAATTTAACTATAAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTA:1 + chrX 12573952 5' + Juan 332 1 67.35 TACATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:1 + chr3R 7168552 5' + flea 4774 2 62.38 CTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACA:1 - chr2L 3440495 5' + Juan 40 1 55.45 TGCAGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2L 8565542 5' + blood 7027 2 69.31 ATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr2L 14790661 5' - roo 9052 2 59.41 GCTTCTCCGAGCATACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr2R 16940401 5' + 297 6610 2 64.36 GCGTAATAACTGCAATTCCTACATATTTCCAGTTAAACAAAGCTTTTTTGGGGTCTTTGAGCCACGTCAGACATCCCAACGTAAACATCCAAGAACATCAC:1 - chr3R 4127065 5' + McClintock 100 2 81.19 TCTGCTCCCCGACTGCTGAGCCCCTCGATTCTTCGTGGCTGCTGCCTCACTGTTGGTATAGGGGTGGCTTCCCCTCTGTTCTTCCTGGGGGAATGCTGCAT:1 + chr2R 15619965 5' - aurora-element 470 1 41.58 TAATAAAAGATAAAATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 + chr2L 9163706 5' + copia 19 2 65.35 TGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - 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roo 385 2 59.41 TACTAGGATTGGTTCTGAGTACCCTATATGCGGCACATCTTAAAACGCTTCTAACCAAGCGACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTG:1 - chr3L 9542900 5' - flea 315 1 58.42 AAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 13508772 5' - roo 392 2 66.34 GTTTATGTAACCGCCGCTAGGTGGCGGTGCAATAAAAAAAAAGTTTTTTTATCTTCATCTTAGCTTAGTAACAGGCATTTAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2L 20826459 5' - pogo 2051 1 76.24 GAAGCGTTTGCGACTATATCATCAAGTATATATCAGTATATAGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGGTCCAGCCATCTCCGTCTGCCCGTATGAACGTCGAG:1 - chr3R 4947762 5' + INE-1 129 1 68.32 GTACAAAAGCAAAAAAAGGTTACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATA:1 + chr3R 26256672 5' + Doc 4554 1 80.20 TTTAAACAACCAAAAAGTCTATGAATGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTT:1 + chr3R 11329707 5' + hobo 2671 1 74.26 AAGATGGGGCATATGTACGATAAAGAAAATAACAACAATAATAATAATAATAATAATAATAAGA:1 + chr3L 11284674 5' + mdg1 37 10 64.06 TCCTGTTCATTAACGCCATGAATGATTAAATTAAAACCACAATTACGAGCGACTGCTAAAAAAAAAACACAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 5625666 5' - hopper 145 108 80.25 GCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCATAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 13589450 5' + hobo 14 1 53.95 AGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chr2L 8565521 5' + blood 37 2 62.38 GAAAATCAGTTCGTTACACATTGTATGATTTGTTATCATATAATGGCTTAAGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATA:1 + chr3L 23602563 5' + Bica 4888 1 55.45 GTTGCTATTGCTTAAATGGCAACACTAAAATGCCACTCAAGGCATTTGGCCCTGCATCTGTGACTGTATGGGTACAGCCACCCGCACATGGCGTGCTTAAG:1 - chrX 13512369 5' - Stalker3T 237 1 72.28 TGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTTGAATC:1 + chr3R 17321731 5' - Stalker2 353 2 72.00 TTAAAGAACCAGCATAAAGAGCTAAGAAACCGATTTCTGAATTTTGTCCTGACTCTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCCATTTCTTCTTGGATGTT:1 - chr3R 3469399 5' - mariner2 668 1 74.26 CCAGCTGAAACGTCAACAACAATGCAACATTCTCGCACACATTCACACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTA:1 - chr2L 17092783 5' + Doc 129 1 54.46 GAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGT:2 - chr3R 10277269 5' + Doc 60 1 76.24 GCTCTGTTGTTTGGGGCTCAGTGCTTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGGAATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGGTAGCGGTATTGTT:1 - chr2R 5926084 5' - I-element 145 1 72.28 CACACGTGTTTGTTTCCCCCTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 17147974 5' + hopper 144 105 80.95 AATGTGCTTTCTGTACAATTGTCATCATGACCCTCATGCAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCGCCAGTACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 + chr3L 10013551 5' - hopper 1411 2 70.30 TTCGTTCGACGAGAGTGCCCCAACAAGAAATGTTGCCACATATTTGCTTTTATTTATTGAATGTTG:1 - chr3L 20714832 5' - F-element 4660 1 80.30 TGGGGTGCACGATGTCAGGCGAGGATGTGCCACGAATTCTCGGCAGGATCTGGCAGATTTTTACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACC:1 - chr3L 10081895 5' + rover 117 2 61.39 AACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3L 4801507 5' + roo 8696 2 57.43 CATCGTTTTCCTTCGGGCGGATGTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chr3L 7205560 5' + Doc 62 1 77.23 CGCAAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCG:1 + chr2L 18177030 5' - INE-1 555 1 66.34 TATGCTGCATTTCACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:2 + chr3L 18500930 5' + hobo 13 1 64.36 AGTGGCCTCCTCATCTTCCCATCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 - chr3R 22800178 5' + flea 4805 2 76.24 ACATCAGACACCAGCACAATGCTCAAGTTCGTATATTCGCTTTTTTATCTATGTTGTTCGCCTCTTGGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr2L 15416753 5' + 1360 50 1 76.24 CCATGTAATTGTGCCGCGTTTGCTGCTGCTTTAATTCGTATTTTCATGGGGGTACTTCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 18571103 5' + hobo 17 1 61.39 GCCACGTCCTGAGACCGAGGAACCAAACTAACTCACCACGCCCATACCCCAAACTCACCCCATGCAATGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTAT:1 - chrX 5833896 5' + HeT-A 5969 1 77.23 ACCTCTCCTTCAGAACACCTTATGTAACATAACCCAACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCATGAAAGAGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACAATTCAC:1 + chrX 12642496 5' + ZAM 7968 2 73.27 CAGCCCCCTGGCTCCACCACTCCTTTAGCAATGATATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCCTCGTA:1 - chr2R 23873164 5' - invader3 5223 2 69.31 TGATACTAGTATATTAGTTCTTGATGTTCCCACATTCCAAGCCCACAAGTTTTGAATTTCAATAAATAAAATCGTAAAAATCTAAGAGTGCTTGTATCCAA:1 - chr3L 23745485 5' + Idefix 7137 2 77.23 AAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 10827426 5' - roo 9027 1 73.27 CACTTAGTCCATCGAAATGGAATGAAATAAAATCGGACTGAAGGCATTAAAAGAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTA:1 + chrX 19117246 5' + opus 403 2 59.41 CGTTGATTCAAAAGGTGATTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGGGATGGGCATT:1 + chr4 148495 5' - I-element 5056 1 76.47 GCACACCCGATCGCGTCGACGATTGGTATACGTTATGCCAATAAATCAACAAAGAGCGCAAGTTACCGACCCATCGGTACCAAACACCACCCCTCCCTCTA:1 + chr2R 5395186 5' + ZAM 7982 2 49.50 TTGCAAATGAACAAGTGGAACAACTTATTTTTGGGAAAAGCGCAGAATACTCGCCTAATTCATCAGCTCGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATA:1 + chr3L 23665020 5' + Porto1 444 1 62.38 TAACAAGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:1 + chr2L 6999272 5' + Ivk 48 1 70.30 ATTTTCCGTTCAATTTGGATTCCCAAAATGGAAAAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCC:1 - chr3R 20276484 5' + Idefix 199 1 76.24 GTGAANAGGAATCGGTGAACTGGAAACTCAGGATCGATATAATGGTGTTTAATAGTTCGTCTGAATGGGTCAAGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAA:1 + chr2R 11504953 5' + I-element 99 1 72.28 AGCACGAAAATTGTGTGCGGTTTTCTTCTATAGTTACTGCCTGAATATGATTTTACGATGCAGTGGCGAATGGTTGATAAGAGATATTTGATCTAACAAGG:1 + chr3R 11599517 5' - G5A 222 1 71.29 TTAGATGCCACAGTTGGGCTCTGCTGATATACACACTGGGTCGAAAAACAAATATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 6506894 5' + roo 17 2 55.45 TATTTAGATTGTACCATCAACTGCAACAGTTATCTCTATTTCCTACTGCCGGCAAAACTACCGCTCAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2L 3968027 5' + jockey 80 1 70.30 GTTCAAAATCTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 3814648 5' + hopper 144 105 84.38 AAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 1625705 5' + hobo 29 1 60.44 ATGCACTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr3L 8713078 5' - opus 7477 2 61.39 GCTCATAAAGCTGTTTAATGGCCAAATGCCAGAATGATAATAGCCCATAATATTCGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAA:1 - chr2R 24479954 5' - I-element 5337 1 60.40 TAAAGATTGTTTTTTTTTTAAATTCGTTTATTGAACCATTAAGATTAACTTTTTAGTTATTTATAAAATAACATTATACCATTAAGGAGGGCAAATCCAGG:1 + chr3L 7361620 5' - Rt1c 5362 1 70.30 CTCCTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr2L 12815029 5' - hopper 1398 1 60.82 AAATGATTTTGACGAGTATTTTGTTGTGTTTTCAGTTGATGTTAAGCTTGATTCGCTGTTCTGACTCATAGTTTTATTATTTAAGATAACAAATCACTATA:1 + chr3L 11612537 5' - F-element 160 1 63.37 TTAAGTCGTAAATTATATGCACTTTTGCAGGGTAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr3L 18658993 5' + pogo 5 1 74.26 ACTATCATGTGTCAGAAAAACTATGATATTAATGGTCATACCACATATGTCGATATTTATTACATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCT:1 + chr3R 19132255 5' + Ivk 15 1 64.36 TCCAGTCCGACGACGCTTTCGTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 23571625 5' - roo 9046 1 53.47 CAGATTCCCTCGCACTTCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAG:1 + chr3R 12196188 5' - accord 317 2 82.18 GTGGCCACTTCCAACCACTGGTGGTTCCACCTTCGAGTTAGGTAGATTTCGTCGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTT:1 + chr2R 16629427 5' - G2 2773 1 57.73 CCACGCAGCAACACCTCCTTTGGCATTTGTCTGTGGTTGGGTTATGGTGGTGGTGGTTGAAGTGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGGTAGGGTGGGTAT:1 - chr3R 16299599 5' + Circe 7191 1 67.33 ACGAAAACGTAATTTATCCCACCAAACACTGTAAAACCCAGCAGAGATCTCACAAAAATCTGAAGAAAATACATCCCCATGAACTTCTTACACGTAAGATA:1 - chr3R 851619 5' + G5A 2703 1 65.35 ACTCAATAAGCCAGGCCACAACTTCAGCGCAAAAAAACAGGGAAAAAAATAACAGGAGAGAGAAATCGCTGCAAAAAAATATACATAAAAATT:1 - chr2R 9640330 5' + mariner2 790 1 91.40 GCCATCTCCAGCTCCTCGCAACCCTTTTGTTTTCCTATTCGCTTCATTCTATTTGTTTTGGATTTAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTAAC:1 - chr2R 9499164 5' - G5 4787 1 59.41 AGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCAGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chrX 17968369 5' + Tirant 8147 2 67.33 TACAGGACCCTTTTAAGCACACAGAGAGATAAATAACTATAGAAGAATATCTGGCACTGATATCGTTGAATGACAACTTTTTAACTACATGGCGACCGTGA:1 - chr3R 10732398 5' + mdg1 433 1 76.24 TTCAAAACGTTGGTAACATTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAACCTAACGGTTCTTTCTAAAAATAGAATTAATGTTA:1 + chr3L 23784629 5' + Transib5 136 1 69.31 TATTTTAACTCTTAAAAAAATCATTTGCTTACAGATCCTGCAGCTTCTGTAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACA:1 - chr3R 18217603 5' - Juan 20 1 65.17 GGCGCGAGTAATTTTAATTTAACTGCTGCCTGTCACTTAATGCAAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACA:1 - chr3L 14735567 5' + F-element 4367 1 56.44 ACAAGTATTCCGGTTAGTCGCAATCTAAGTGGCAATCATTTTTATAATAGTTAATTATAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr2L 20706661 5' - mdg1 387 2 55.45 GTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTCAATAACCCATAG:1 - chr2L 3388140 5' + F-element 310 1 49.50 TGCTATGAAAACTGAGCGAATGTAAATGTAACAAAACCAGTTGTTTTAAAATGCCATTACTTCTTATATATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCC:1 + chr3L 19463669 5' - invader4 322 2 71.29 AGTTTCTAACAACACTAATAACAATAAATAAAAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCCCCAATTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAAC:1 - chr2R 547170 5' - INE-1 530 1 70.30 TATAGGTTCTATATTATAGAACGCTTTAAGTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGT:1 - chr2R 18435034 5' - I-element 367 1 70.30 ATTTGTACGACCCATTCCAATAAGCCACTGCCAACAATTTATTCGAGACGAGATCATAACCGCCGCTATTTTTGTCAACGTTTCGCCTCGTGACTTCTCA:1 + chr2R 20030786 5' - gypsy9 5172 2 69.00 TTCGGCAAATCATTTCGAAACAACCCAACAAAGTTGAAACCTTAACTTTGAGAGTTACCAGCTCCAGCCCAACTATGATTAGCCAGCACTCTTAGCAGAGA:1 - chrX 19404102 5' - baggins 141 1 54.46 GTTCGCATAGAAACAAATTAACGGAAAAAAGGAAATACAACCGAAGGTAGTGACGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTAAGAATATAT:1 + chr3L 26002041 5' - INE-1 82 1 51.49 ACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCTGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chrX 20806856 5' - opus 7482 2 58.42 GGTAAGTTATGGAAACAGTCTGGCAAACCTGGAATACGATTACGAATGGAATTGGTACTATACATACATATGTATGGCATGTATGTAATATATATGTATGT:1 + chrX 12233275 5' + Dm88 12 2 67.33 TTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chr3R 8555835 5' - 412 7527 2 59.41 GATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 13508735 5' - roo 354 2 80.20 AGTCACCACCACCATAGCACCATCACAGATACACATATGTTGGCATAGACGGACGGGACGGACACACATAGTTCATGAACTCAATTTTTAATAATAATTTC:1 + chrX 7612065 5' - invader2 440 1 76.24 CAGCACGAAGCGAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 9383497 5' - P-element 2867 1 57.43 TTCTAGTGTCTTTGGTAGAGCCTGCTTCAGATGATCCTCGAGAATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCATTAATTTAAACAATTCCTTGCTT:1 - chr3R 4565322 5' + Idefix 205 2 70.30 CGAATGTTTTGAGCGAAAACAGACAATCGAAAAGGCATCACATTGATTCCAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACA:1 - 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chr2L 14057860 5' + frogger 2174 1 56.44 AATATATAAATTACACATTTAAATATCGATGAGCGAACATTCAAATGGTAATTGAGTACAATTGCTGTTGCATGCATTGCCTCATAGTTGACATCCATATC:1 - chr2L 17188307 5' - Doc4-element 2603 1 63.37 GCACTAAAGATGCGATTACAAATAAAAGTTTGAAAGCGTGAAGACTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCACACATTGGCCTCATATGGTCGC:1 - chr2L 22228185 5' - Bica 4841 1 55.67 GAATTTCATTATTTGTCTTGACAAATTTTGTTCATATGCCATTGTCACTTTAACAGCTGCTTTGTTATACAACTGCACAAATTATTGTTGACAAATATCCA:1 + chr3L 17878718 5' - hopper2 403 1 53.47 AATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATT:1 + chr2L 11703258 5' - Tabor 428 2 79.21 CCATTTAAATCAATTAAATTCGTTAGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3R 26530931 5' + blood 30 2 52.48 CCTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr2L 21683388 5' - pogo 2082 1 60.40 CTGAGTCCCGCCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGCAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr2L 20622770 5' + Doc 12 1 46.00 TTACCTGCTTTGGACGAAGGTAATGGAGACACCTATGAGGACTTGGAGACATTGGAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCAT:1 - chr3L 14672202 5' + Rt1b 4964 1 56.44 GTCTGTCCCGTGTACAACAGTGCTGGCTGCGCCAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1 + chr3R 20200109 5' - accord 7342 2 75.00 GAAAAAGCAACAATAACACGGCGGCCGAAACAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2L 8627522 5' + G2 3076 1 80.39 AACGGACAATACACCCCACGACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 - chr3L 25842199 5' + 1360 80 1 54.46 ATATGCATAGGCAAATGGCTTTATTAACATAGCCAACAGATATTGATATTTCTCTGCAACTCGTGGGAACCATGAACCACAGACCCAAAAATATTAAAATA:1 + chr3L 5031587 5' + baggins 406 1 54.46 ATAGATGCCATGAAAAGTGTGCAAATCAATCCTATGAATTATGCGTTGTCCGTTGGTCAGCTTGTCCGTCTGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAA:1 - chr2R 11575189 5' + INE-1 145 1 69.31 TTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAA:1 - chr3R 20137331 5' - Burdock 6355 2 69.31 GAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3R 27981716 5' - roo 9031 1 71.58 CTCGCTTTGTTTTGTTACTGTCTGGAGGAACTCGGTACCTTATAAAATCACAAAGTAATATATATATAGTTAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 + chr3L 17918361 5' - 297 6972 2 75.82 CTTAAAGGGTCCGATAGGAGTAACCATAAGGAACCTGGGGGTCCTGAATATAGCCAATTACCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCATTC:1 + chr2R 1322961 5' + diver2 236 2 56.44 ATAAACAACAATAAAGAGCGGACGACAGCGACGGCTTAATGAGTGACGGGCGGTCATATTAGATCAAGATCAATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGCT:1 - chrX 14157231 5' + INE-1 138 1 63.37 TCAAGTATACTTTATAACAAGCTCACACAAGTATATATATTCTTGATCAGTTTCAATCGCCGAGTCGATCTGGC:1 - chr4 651852 5' + INE-1 100 1 60.81 CGCCATTGAAAAGTGTGTGTGCTCTACTTGTTCCTTTATTATTATTTTCTCCAAGCCATTGTCATCGCTTTTTGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTG:1 - chr2R 13295759 5' - Tirant 8504 2 76.24 CCGATGTTGCCTGTTCCTCGTCATGTCGCCCATTAAAATCGTGTACACCATATGCCAGCCATATTAATTTTTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTG:1 + chr2L 2521853 5' - Doc 499 1 74.26 CGGCCCTATAAGCTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 17587863 5' - roo 9055 2 62.38 ATCGCATTTAAATGCAATTTGTGACAGTTTTCCTTTAGCGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAA:1 + chr3L 13455266 5' + jockey 4639 1 62.38 GAAATTTAATAGCCAATCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chrX 992078 5' - hobo 2899 1 67.33 CATATCGATACGGGCGCATTAAAATTTAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 1523987 5' + jockey 57 1 75.00 GCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr3R 14917188 5' + HMS-Beagle 6828 2 60.40 TACATATGCATATATACAGTACATGTATATTTATATCTGACCACTCTCTGTCTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2L 13807471 5' - P-element 2864 1 56.44 AGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 19446153 5' + 297 32 2 63.37 CAAAAAGAGACCACCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACT:1 + chr3R 32005873 5' - invader4 306 2 54.26 GCAACGAGTGCGGACGTAGTGGCAACGCTTGTCGCTGGTATCGATACTTTGCCAGCAGTTTTTTTTTTAATTTATTTATTAAGGCATACGGG:1 - chr3L 7912380 5' - X-element 4704 1 55.43 CTTGAAATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr2R 14708946 5' + Doc 14 1 71.29 AATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 13508702 5' + roo 8710 2 72.28 GAGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr2L 16948751 5' + jockey 4678 1 72.73 TTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr4 1149943 5' + 297 6592 2 68.32 ACCCAGACATGGAGGCCAAAAATGGCCACTAAACCCGACTTTAACTGAACACTAAAAAGCCAAATATTCAAACCAATATAAAAGAATATAAAAATGTATAT:1 + chr3L 14626752 5' - gtwin 7138 2 63.37 ACATTGGTCCCAGAGATGTGGCTAAAGTAGATCCAGGCTGGGATTAGGCAATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chrX 17831697 5' - P-element 2861 1 52.48 GCAAAAAGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr2L 7255828 5' - P-element 2873 1 65.35 CTTTTGGCTTTGATGTTCTCGGCTTAGGTGGCGGCAATTCCGGAGCACCCACTGTCCGTTTCCGGGAGCGACCGTGTCTCGGTCTCGAGTCTGTCTCT:1 - chr3L 9825501 5' + Stalker 419 1 67.35 TTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCCACATACTAATACACTTACAACATATA:1 - chrX 23182894 5' + Idefix 45 2 72.28 AATCCAAATCGCGTTCGCTGTTTCAGTAGCACTTCGCTGGCGGAGAGTGCACTGCCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACT:1 + chrX 5330466 5' - R2-element 3537 1 60.61 AGTGTTGCCACAAAAAAGCGTAAAACAAAAGAACCAGCCAAGCCAAAGCGAAAAGTTGTTATAGCCATCAATCAAAGTTGCGCTGTATGATTTCAATATTG:1 + chr3L 3563235 5' - Doc2-element 4404 1 77.23 AATCAAAGTGAAATGTCTCGAAATTGAAATAAAAATGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTTGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTT:1 - chrX 11229458 5' - Max-element 8256 2 65.35 AGTGAATAATTCTTTATATGTTCGTTTATTATATATCAAAAAACAATAACAACTTTAAATGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATA:1 + chr3L 26013619 5' + S-element 1608 2 59.41 CGGTTTAAATATGGTACACTATAGATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCA:1 + chrX 17947929 5' - roo 8733 2 80.20 AAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 29259635 5' + pogo 40 1 66.34 CTGTTAAAGAATACTGCATTAGGACTCTCTAATTAGGGAATATTTTAATACTTACTGCTAAAACTCGCTTTTCCTTGGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACT:1 + chr3R 6454249 5' - R1A1-element 406 1 79.21 AAAACAAAGTAAATTGAATAGTTCCCGCCACTGTCATTGGAATAAATGGAAGGCTTCCAAGTGAACCACCCGTTCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 - chr3L 11114002 5' - 412 494 1 79.00 GGGAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chr2L 17646180 5' + flea 4789 2 65.59 TTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr2L 16201585 5' - hobo 2923 1 64.58 TTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr3L 8713140 5' + opus 7051 4 78.22 AGACGCAGAGACCCAAATTAAGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3L 4876824 5' + roo 8672 2 71.29 GGCGATAAAGTACAGTTTCTGTGTTTCATTGCTGTGATTCTGTGGTTGCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 23571705 5' + roo 23 2 54.64 CGAAGACACCAGCGATCCCAAGACCAGCGTTAAACATCCAATTTGAACTACAAGAACCCAACCCAAATATCAACCCAATCCGAACAGGCTTGCGAGAGACA:1 - chr2R 12302726 5' + Fw2 3755 1 77.23 TTTAAAAAAAATTTTTTTTAGATAATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 - chr3R 7314253 5' + Max-element 55 2 77.23 TCATATTTTCTAACGATCCGGGCATAATAAATAAGGACACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATA:1 + chr3R 25076278 5' - I-element 264 1 63.37 CCTCAAGCAGGCGGGTCGTTCCATCACCCAATTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACCA:1 - chr2L 6737085 5' - Rt1a 4823 1 68.32 ATCCCGCTTCCGTCACAGGACGGATAAAAAAGCATGGTAAAAACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACT:1 - chr2R 21073957 5' + jockey 4684 1 60.40 AAAGTAAGCTGAGATACCAAAATATTTGTAAGCCAGGGGTGTGTCAACTTATAATGGAGGGGGGCTAGATATTCAGATAACAAAGTTAAAAAAATAAAAAA:1 - chr3L 10548908 5' + TAHRE 10439 1 57.43 ACAAAAACAAATACAAAGAAAACCCGAGGAGAAAAGAGAAAAAAAGAGCGGCAGCTTGTTAACTCCAACTAAGCGTGGTAAAACATATTTTTATTACTTAC:1 - chr2L 20082649 5' + Gypsy6A_LTR 228 1 64.36 AAAAATTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATG:1 - chr2L 3440522 5' + Juan 13 1 70.30 TGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 - chr4 1149942 5' + 297 6593 2 67.33 CACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:2 + chr2L 16884802 5' + pogo 16 1 52.48 GTTCATTTACTTCTGTCGCAGCATTATTCGTATTATTATGCTAATTAGCTCTGTGTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr3R 25671991 5' + I-element 23 1 55.45 TATTTATAATACTACTCTACTACTATCACTCTTATAAGCGTAACTAATGGGTCAACCAAATACAAAGTACGAAAGACAGACAGACGGACATGGCTAGATCG:1 - chrX 20805543 5' - INE-1 113 1 77.23 ATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 27981728 5' - roo 9037 1 61.39 GCCGTAACATTTCCCCACCCACACACACACACACACACACACACAGCACCTACGCTCTCCTTTTTGATCCTTTTTCCTCTGAAAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 12081322 5' - accord 186 2 76.24 GTTACNAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 + chr3R 6735268 5' + copia 28 2 53.61 TTTTGTAGTCTTTGGGCGACACATTACACACGGCACGGGATCATCATGTTAGGATCTCCAGAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTC:1 - chr2R 387581 5' + roo 391 2 66.34 CTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCTGGTGAAGTCGGCAGAGAAG:1 + chr2R 5039403 5' - gypsy11 288 2 77.23 CTTCAAGTCTTTAATGGCTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAAC:1 - chr2L 11703310 5' + Tabor 6863 2 56.44 TTTCTCGTATCCATGGGAGAAAATACCTGTAAATAATAATGTTAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGACTTGCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCT:1 - chr2R 4749226 5' - INE-1 545 1 72.28 AAGGGTAAAAAGTAGTGACGATCCCAACCAGAAACTATAGTTAGAATTTAAACAATATAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 - chr2L 22079494 5' + flea 4769 2 64.36 TTATATATTTCACTTAGGTACATATGTATACTCTATAATTAAGGAACAGAATCCATAATATCTTTTAAGCTACACATTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAT:1 + chrX 6947705 5' + G5A 2801 1 79.21 AACAATCTGTGGGAATGTTTTCGGCAATTCAATTAAAGTGACTATGGTTGATTCAATTATGTGAAATTCCTATTCCTGTTTATTATTATTATTTATTATTA:1 - chr2R 24487678 5' - flea 5002 2 53.47 AGCCCCTTCATTTCGGTCCAAGACGTCAGCAAATAAATGCATTTCCGTTGGCCGGTCAGTCCACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCA:1 + chr2R 11796120 5' + I-element 4979 1 68.32 AAGATAAATATGCCAAATTCACGCCACTGGTCTTCCTTACCAACTTTGTGTTCGCCGTGCGCAAAAGGGGAAATAACGGGATCCCCGCGGCCTATAAAGGG:1 + chr3L 847754 5' + gypsy8 331 1 55.45 GCAAAAGAACCAAAACCAGGAGCGGGTTACATGAAAATGCAGGAGCATCTCAAAACCCTGATTACTAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACACAATCTGA:1 + chr3L 4316263 5' + R2-element 265 1 71.29 CCGGTTGCTTCATAAATTCAAATTTGATTTTCATGTTGATTATCACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATT:1 - chrX 6388452 5' + jockey 287 1 56.00 ATAGCCATTACACATTACTCAAACGGACAGTTGTCGTCGTGTGGGTGTGTGAGTGTGTTTGGGGTCCACTACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr3R 13225472 5' + hobo 3 1 75.51 TATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 - chr3R 7168636 5' - flea 223 2 65.35 ACATTAGTGGATGTTCGGCCGAAGGAACTTTCTTCAAAAGCATCAAGGAATGTGAAGCTAAATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAACGAGCGGTC:2 - chr2L 3388152 5' + F-element 298 1 61.39 GATCTAAGAGATTGCGTAGAGATACAAAATCTTTAAGAGAAAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 + chr3L 5537598 5' + jockey 4705 1 57.43 GGCGACAATGAAGTAAAGCTAAAGGACAAACAAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGA:1 - chr3L 12862277 5' + mdg1 187 2 68.32 TCTATAGGCAGCGATGGGAGTGCACTTGATGTCGTTTTTGGACAGATTCCGAAGGTACACGACATTACATTTTATACATTTTATAAAAATTAGTATTTTTA:1 - chr2L 19558112 5' - Quasimodo 7342 2 48.51 CGATCACAGCATATACTATTCATTTTTTACAGACTCCAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACC:1 - chr3R 6718542 5' + F-element 305 1 64.00 TTCCTTACCTCGTCTGCAACGAAGTGGGTAAGTTTATTTTTGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTG:1 + chr3L 8017622 5' - FB 333 1 60.40 AACATGTGAGAACGAGAATTTCAGCAGCCACCCGTGTTGGCCAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr2L 18430081 5' + copia 4905 2 62.38 CCGGTTGCCTGTGTTCTGTTTTCACTTTGTTTGCTGGTTTGTTGTGTTCTTGGACGGAAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTAACAGCT:1 - chr3L 15756544 5' - gypsy4 432 2 82.18 CAAATCCAAATAATTCATAAAATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 + chr2R 7032108 5' - mdg1 415 2 72.28 GCCCTCGCTTCTGACATATGCCAGTCAAGTCAAGTAAGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:2 + chr2R 16583291 5' - P-element 2852 1 46.53 GTGGAGGGCCACTTCCTGCTGCCTACACTGATGTTTCCCAAATTTATCAGCTGAGTAACAGGTATCTCATTGTCGAAGCACTCGACTATAACATTCTCTC:1 + chr2L 15924420 5' + INE-1 575 1 61.00 GATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGC:1 + chr3R 13582248 5' + BS 5050 1 79.00 AGGGCGGGGGAAAAAGTGCAAGTTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGT:1 + chr2R 20763003 5' - F-element 265 1 76.77 ACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2L 11837997 5' + roo 33 2 59.41 GCAATCAAATTCAAATCACTTTGCATTTTTTTGATCTCAATAAAAATCTTTTCTCCTCTTCTTATTTTTTCGTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTGATTGC:1 - chrX 17760889 5' - R2-element 3580 1 51.49 AGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 - chr3R 10277267 5' + Doc 62 1 78.22 TACTTGGAAAAGTTAGACAAATCCTCATTTTACCGGTAGAACGGGGTTAGGGAGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 - chr3R 19989334 5' + hobo 21 1 57.43 AGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTA:1 - chr3R 9995423 5' + Max-element 37 2 62.38 TCCAACTTTAAGCAAACAAATTGTCTCCAAATAGTCAAAATATTTCCAGCCAAAACCAGTTTTTGCTTCAAACCTAACGGTTCTTTCTAAAAATAGAATTA:1 + chr3L 23785311 5' + Transib5 130 1 74.26 AAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:3 + chr3L 12103781 5' - roo 9046 1 53.47 AAGTGCCCCGGTGACCCATTACCAGAGGAAATTTTAACAATTTGTTGGCGTAGAGAAAGGAATACTATAATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 4541953 5' + 1360 9 2 74.26 ATTTCGTTTTATTTTATAAAATTCTTACACATCCACGACCTTGAACTGGGCGGCCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTT:1 + chr3R 25611062 5' - Quasimodo 300 2 45.36 ATCGTAATAAAATTTAAAGCTCTTCCGTCATTTTTTCCACATTTTATCTGAGAAGTGTTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAG:1 + chr2L 15510392 5' + jockey 4688 1 57.73 TGTTATTGGGGCTATTTCTGTTGTCAAGGTTACTTGCAAGTCTATTATCCGTTTGCAGGCTATGTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCG:1 + chr4 271281 5' + Porto1 465 1 72.28 GCCCGACAAATAAACACAAAAGACCAAAAAATCGGCCAGAAAGTGCCGAGATACGAAAGCACAGAAATAAACGGTTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAAC:1 + chr2R 19943884 5' - 412 7542 2 72.28 CAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTC:1 + chr3R 12047416 5' - Stalker2 368 2 54.46 ATGCCTTACGATCCATTAATAAAATATGACACACACACACTTGTCCCCTCAAACATACACGCACGCTCACACATATACACACACACACAGACATA:1 - chr3L 13711009 5' + Quasimodo 38 2 77.89 CGGTTTCTTTTCCTTTTGACCACAGAGTTCATTGGCACGCGCTCTTATTTTTCATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 16761245 5' + roo 8682 2 55.67 TACGANCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTT:1 + chr3R 20137264 5' + Burdock 31 2 59.41 TTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 - chr2L 15808038 5' + I-element 33 1 52.48 AAGAGCAAAACAAACCTGTCACGAGCGAAAGTTCTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 + chr2L 3143247 5' + FB 43 1 67.33 AAGTGTGCTACACATAAAGAAAATAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2L 1625724 5' + hobo 20 1 59.41 GTTGTGAAGCATCGTTATTTATCAATTATGTCATTTGGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACACCAGCTAGGGCCGACA:1 - chr2L 23176236 5' - diver2 270 2 54.88 AGAAATTGTATCCATATTATATTTATTTAAATATTTTTGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr2L 7850127 5' - 412 7509 2 61.39 CACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr2R 8086878 5' - 1360 3354 1 67.33 AAATTATTTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATT:1 - chr3R 32005968 5' + invader4 12 2 68.32 CACGACCGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTAT:1 - chr2R 3341945 5' - Dm88 4130 1 60.40 TTACAATTCGATCGCAAGTGAAAATCAGTTTTCAATCGGAAAAGTATTTTTATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTA:1 + chrX 5902405 5' + Stalker4 7232 4 53.47 TAACACTTTCGGAAGCACTTCGCTCGAAACTTGTCAATCAATTGTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGC:1 + chr3R 4533214 5' - P-element 70 1 61.46 TGCCAGACCACTCGATAGTGGACTACTGCAGTTCTTGTCGTCTGCAGGTGAGCGCCGGTGGCTGTGCTATAGTTGGATGCCATACGTCCAGATGGGCCTG:1 + chr2R 4933970 5' - G7 845 1 55.00 ATTAGTTAAAGGGCTTTCAGCTCCAGAGTTTGTTTGTGTGTGTGTTTGTGTG:1 - chr3R 31339949 5' - gypsy3 417 2 71.15 GAGTTTGGTGGAGCGTGACGTGGGCTGGCCAATTAGTTTGTCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCC:1 + chr2R 8223221 5' - F-element 336 1 59.41 CAACAATTTTTACCTAATTGTTTTATGCGAGTAGTTTGTTGATACCTTGTTTATTTGACATCAAAGTTCGATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATC:1 - chr2L 16819144 5' - BS 4830 1 71.29 TGGCGGCTGCCTGAAAGTAGGCAACGATAAAATAGCAACGCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2R 7887289 5' + jockey 15 1 71.72 AAGTATGCTATAAAATTGGTATACCATCAGAGTGTCCTGTATGAAATTCTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chrX 18239417 5' + jockey 36 1 50.50 CTTTATATGGCTATCATATCGTGCTTAAGCAAAAAACTGGCAAAACACGATTATTATTACAATTATTATTA:1 + chr3L 13355265 5' - mdg1 42 2 32.39 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTA:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 36 2 50.50 TAAATTGTAATGCGTTTGCAATGACGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGA:1 - chr3R 1445605 5' - Tirant 300 2 76.00 TGGCCAGGCGGGTCTGGCGATCAGTCCGGATGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGAG:1 + chrX 11376660 5' + Rt1b 5052 1 73.47 GAAGAGAGTTTTGTAATAGACAGTGGAGAGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:2 + chr2R 10945313 5' - transib2 2804 1 59.41 TTATTGATACTGCGCTTGCCGGAGTTATATTTTTATGAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATT:1 - chrX 21772530 5' - Stalker 7117 4 67.33 TTTGGCTTTGCCGTGTGTGTGGCTGAGCTCTGCCATTGGGAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGACGTCAGATGAAAAGTCCTTGCA:1 - chr3L 24059030 5' + invader4 468 1 62.89 TAAATAAACAGATGTCATTCCTAGGTTAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTAT:1 + chr2L 22098438 5' - roo 8624 1 73.27 ATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGG:1 - chr3R 4604461 5' + INE-1 156 1 54.46 ATACAAACCAAAAATGTATAATATGACAGTACGTTATTATACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 11263458 5' + roo 8700 2 66.00 TCACANACACTAGCACACACGCACACCAGCAGCACCCCGATACATTAGCAAAAGAAGCAGTCTTTTTAAGAAGACTCTAACAAGAGATGGGATGGTTCGAC:1 - chr2R 16892606 5' - frogger 477 1 54.46 GAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCACAAATAAGAACTCCACCGGTAATACGCTCACATACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chr3L 23635040 5' - roo 406 1 69.57 AATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:2 + chrX 10827416 5' - roo 9037 1 60.40 ACCATATAAGCACATACATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 + chr3R 7168538 5' + flea 4760 1 76.24 GGTGGGGTTTAGATTGATTGGTGCGCATGGAGGCTGGAGATTCTGGCCAGGGCACACTGGGCCCATTCCTCCTGAAACGCAGGTAGCTCCGTGTAGTGGA:1 + chr3R 5177975 5' - G2 487 1 71.00 TTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACGAAC:1 - chr2L 17784671 5' - gypsy10 5928 2 76.24 CATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:2 - chr2L 12324103 5' + roo 30 2 55.45 TGTTAAACATCCTACACGACTGTGAAAGCGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTC:1 + chrX 22892084 5' + 297 345 2 71.29 AAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 13546687 5' - roo 358 2 75.25 TTTTGATTGACAAACGTCTATCAAAAGAGTGAAACACTAAGCGACTAGGCGGCCACAGAGAACGTGTGCGTAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr3R 9204189 5' - blood 169 2 68.89 GTGAGTAGCGATAATGGCAAACTGGCTAGACAGCCTCCTCTAATGGTGCACCAAACAGCATCTTTTTTTTTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGG:1 + chr3L 6962878 5' - Doc3-element 386 1 68.32 CATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTC:1 + chr3R 6117237 5' + Tirant 8143 2 62.38 CGGCTCAATGGACAGTGTGCGAAACATCTTGACTGGTAAGAAATTCGCGATCAAAATAATAAAACAAGAGAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATTA:1 + chr2L 22054086 5' - INE-1 563 1 69.31 TTCCAGTTCGGCTAGAGGGGCGGGGGGAGGGGGATGCGAGAAAGTGGGCTAAGGTAGGGTAGGGCAATGCGCGAACACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGG:1 - chrX 20042814 5' + gypsy12 9940 2 59.00 CCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 + chr3L 25272553 5' + 1360 68 1 57.43 ACACACGAGGACCCATTTGTATAACTCCACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTAATCAAAAACTTAAG:1 - chr2R 17937182 5' - Quasimodo 7325 2 73.27 AGCCATTTGTCCACATCATATTGCCATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 7861643 5' - roo 397 1 68.32 CACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 + chr2R 13295674 5' + Tirant 49 2 72.28 CAATTGGCCGGCAACCGTTAAAAGTCGTCCTCCTGTGGCTCGTTGTGTGGATTAGGAAGCACTTGGAAAAAGTACTAGGAAATGAAAATAATGTAAAAAA:1 - chr3R 27209832 5' - Cr1a 4324 1 76.00 TCTGCGTTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTG:1 + chr2R 14246972 5' - 297 366 2 61.39 TATTCTAGTGTCTTTGGTTTGACCATCTCTTAAAACGAAATACTATCAATAAAAAAACGTTTAGACCGAGGTAAACTTATATTTTCTAAAGTATACATTTT:1 + chr4 311377 5' - FB 249 1 49.50 AGCGACATAAATCAAATGCTCGTGAGTGTTTGTTCTGCTCCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 + chr3L 2144322 5' + copia 4908 2 63.37 ACAACAAAGACAGTAACGCCCCCATGGAGCGCACACACACACCACGAAGCACTCACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCG:1 + chr3L 8951715 5' - 1360 135 1 59.41 AAAACATCACGCAAGGGTAAAAAGTAGTGACGATCCCAACCAGAAACTATAGTTAGAATTTAAACAATATAAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAA:1 - chr2L 22079506 5' + flea 4757 1 76.24 TGCGGATGTGTAGGCGAGTGTAGAGTGTCTGGGCGGTGGAAATTGGGGCGTGGCTAGCTATTTGTAACCATTTAGTTTACTTAATTTGGCG:1 + chr3R 26646743 5' - F-element 85 1 76.92 CCCACACACACACACACACACACACATTTTTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACT:1 + chr3R 27499989 5' + I-element 4962 1 75.00 TAATGATGAAACAGACTCAGTACGGAGAAGGGCTAAAGCTGAAAAGTGGTTGGGAGCAAAGATGAAATAAATGATGGAAGGAAAGAATAAACGCCGCCGGA:1 - chr3R 1224865 5' - Max-element 431 1 62.38 AGGATAAGTGACATTACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTC:1 - chr2L 17784693 5' - gypsy10 5950 2 56.44 CGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr3R 13375972 5' + 1360 36 1 63.37 AGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 8555856 5' - 412 7506 2 65.35 GAAGCGAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3L 9383503 5' - P-element 2861 1 53.47 TTTCTGGAATATCGATAGATATTGGGGAATACAAAAAAAATAAAACTAAAAACTTTAAAAACTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATA:1 + chr2L 9778710 5' - INE-1 29 1 74.26 GCCCAGAAAACATCATTCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAA:1 - chr2L 12815126 5' + hopper 15 1 66.34 ATGCGAACATTGTCCACATGACTACGAACAAAACCAAACAAGAAACATTCCGTTCTGGGTTTAAGTTATCTTCTTGTTTCGGCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1 + chr3L 9958451 5' - invader4 3030 2 67.33 CATAATAAGTATTTGAGAAATAACGTATACTTTGTTATATTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr3R 3060354 5' + opus 143 4 62.38 ATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr2L 17210269 5' - jockey 4970 1 56.44 TTAATAGTTTTTCTTTTTTTTATTTAGTTTTGAAAATTTCTATCGATTTCTATCGCTTGTTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGG:1 + chr3R 15251762 5' + INE-1 551 1 45.54 GAATTAAATACATAAGAAAAATAACAAGAACAGAAGTAAAAATTAGACTCAACTACAAACCCAAGTAAAACCAAACAAATAAAAAAAAAA:1 + chr3R 904321 5' - Tc1 1398 1 74.44 GCCAAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 16201500 5' + hobo 24 1 55.45 AAACCGAAAAGTTACAAGCCAAATGTATTGGTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 19552040 5' + roo 45 2 71.29 ATCAGCCTCAAGAAATAGAAATTGAACGAAATCCGTTACCCTTATTGTGACCAACAGCATCTTTTTAAGGAAAAGCAAGTAACGTAATTATGCCTTCTTCA:1 + chrY 1674224 5' + Tom1 3 1 48.51 ATTCACAAATCATAATAAGTATTTGAGAAATAACGTATACTTTGTTATATTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr3R 3060364 5' + opus 20 2 59.41 TGTATATATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - 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chr3L 17051829 5' + R1A1-element 5099 1 63.37 AATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 12780627 5' + hobo 37 1 62.38 GGCAAATCCCAAGCAATCACTCAGAACTCGGACACACACACGAGGACCCATTTGTATAACTCCACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTA:1 - chr2R 17937217 5' - Quasimodo 7360 2 73.27 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCC:3 + chr3L 25232764 5' - accord2 176 2 50.50 AAGTGACATTACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAAT:1 - chr2L 17784688 5' - gypsy10 5945 2 61.39 TGGGGGAGGGTTTTAGAAAACTAGAATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 10734255 5' + pogo 46 1 75.25 GATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCC:1 - chr2L 21403526 5' + G5 4429 1 73.27 GTCAAGTAAATAAATAAAAGCAAAAGTTTTTGGCCCACGACTCGAACTGTTACTTTTTGGACCGGCTAAATAAAAAAAAAAGAAAA:1 + chr2L 4091615 5' + G-element 4325 1 79.07 GCCCCAGCCGTTTTCGTTCGACTGTCGGTTCACCTCTGAATATCTATATACCCAGCATTCAAATCAGACATTGTATTTCGATCAAAAAAAAAGAAAAAAT:1 + chrX 13022141 5' + R2-element 3581 1 51.00 TATCATTAAGTTTATCGATTTGCCCGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGAGCAAATAAATTCGCTCTTTTAAGCGACG:1 + chr2L 16779791 5' + G4 56 1 78.22 TGACCACTCTCTGTCTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chrX 22855244 5' - P-element 2827 1 21.78 TTCACNGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr3R 19446125 5' + 297 4 2 73.27 CTTTCGCAAATTCCGAAGTGGTAACCTATTAATAAACAAAGGCATCTGTGCGCATTTCGCTTAATTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAA:1 - chr2L 16098077 5' + Doc 4660 1 73.27 AATATATGTATTTCGTTAATTTCAGACGCTTTTATTTAAGATTTTAAATATATTTTCTGTTTACCATGTCTACAAAATGTATTATTATTATTTATTGTTAA:1 + chr3L 2925543 5' - flea 242 2 88.12 TTAGTCAGATCATACATACATATATAGTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGACATACGGGGAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTCGTTT:1 - chr3L 23224285 5' - X-element 4672 1 72.16 GCACTTTTCCTTCGAGGCGCAGAGGGCTGGGCGCTACATCTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAA:1 + chr3L 22758561 5' + HMS-Beagle 421 1 61.39 AGTGAGGTCTCGCGATATAAAACTAGCTTAGCACATAATATGATTGAGCAGGGATGTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGA:1 + chrX 1028458 5' - F-element 249 1 61.39 TCTCATATATAAAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCAT:1 + chr3R 8975931 5' + Bari1 24 1 56.44 TCTCAATTTCTGCAGTGCTTCACCGTTGTTCTCTCTCCCATGGGCCATGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr2R 14713676 5' + P-element 15 1 66.34 TATGTTGAAGTGGGAGAAAGACGATAGATAATAGGTAAGCTCTATAATCAAAAAGTCATAGAACCACGCAGAAAAAAAAATCAGAAAAAAAAAACAAAAAA:1 + chrX 20037600 5' + R2-element 3583 1 67.33 GAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr3R 8458226 5' + HMS-Beagle 34 2 60.82 ATAAAAATAATTTTAGTTATTAAAAAAAAAAATAATTTAATTAGGAAAAATTACATAATCAAAAAAAAAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTG:1 + chr3L 27182014 5' + Stalker4 6888 2 64.36 CGGCCCAGAGCTACGTCGCCTTCCTGCGCAGCAAGTGGACCAAGCTGGGCGACAAGTGAAACTAAACTTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTG:1 + chr2R 18399048 5' + S-element 8 2 71.29 AGGAAAACGATTTGTTAAATGTAATTGAGAAAGAACAAACAGAAGTAAGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCT:1 + chrY 685079 5' - jockey 189 1 65.06 TTTTGGGGTGGAGGCTGGATTATGGCCCCAATAATTTGGGGTGAAGTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTAC:1 + chr2L 7000866 5' - Ivk 5196 1 54.46 CGGGAAATAGCCATTACTAGCGGGAAATATATTACCACCGTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATAT:1 + chrX 15746295 5' + jockey2 3229 1 55.00 TGGCANGGCAAGAAACCTTGACTGCTAGTCGGATTTATGGCTTGAAAATTGTTTATTTCGATTGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAAC:1 + chr3L 3740034 5' + accord 379 2 66.34 CCTTGGCCAGCACCCCTCGATCATCCCTTATGCATCCACCGAGCACAATTTTACACTAGAAACTCTATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTA:1 - chr2L 4110438 5' + Cr1a 4149 1 57.43 GCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr3R 6273568 5' + blood 42 2 69.79 TTGCCGAAGCGGAGAAGCTACTTTTCCGTAACAATATTTCCGAGCGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTACG:1 + chr3L 11076411 5' + Rt1a 4960 1 53.26 CCAATGGCCATTTGCCACCAGCTCCCCACTTACTTCCACAAATACGACAGCGATCGGCATTACAATGTCG:1 - chr3R 30558853 5' - G3 191 1 60.00 TGTGGAGAAGGGTGTGTAAAATGTTCCTCGATGTTAGCTTCCAGGGCCTGGCTTGCGACAGCCAAATTCGCCGCATTAAGGCTGCCCAAAACAAAATCGC:1 - chr3L 23629976 5' + BS3 1362 1 57.00 TTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 9870996 5' - roo 364 1 69.31 ACAGACTTTTTACATCGCGCCTTTCATGATCTTCCACAGTGGCGCCATCTTGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGCGCCTTTGCCGTTGTGGCCTACTTTTCAA:1 + chr3L 16955324 5' + mariner2 164 1 58.42 TTGTAGGTGTCAACAGGTAAATTAGGGGAATGTACGAAAAAGGAAGACAATTTAGTGACACTGAGACCCTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAACA:1 + chr3R 4359076 5' + Tc3 1330 1 77.23 ATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr2R 17345921 5' + jockey 61 1 75.25 GAAAATACACTACGAGTATATACTCAATAGATTCGCTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chrX 1281731 5' + roo 8704 2 68.32 AAAGAGTGATTATATAAATTAATAAATTAGATGAAATAGGGTTGACCGTATTACTTCTTATCGTTTTTTTTTTTCTAATTTTAAT:1 + chr3L 10583828 5' - Doc 4695 1 90.59 AAACAACCTAACTTAGCCTAAAACCCACGCAAAAAGGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCCCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGACGA:1 - chr3R 19242219 5' + G6 422 1 76.24 CTGCGGGTTGCAAAGGACATGGGGCACTAACACCACTGCACACCAGCTAGTACACACCAGAGAACTGAAGCCCGCCACTCG:1 + chr2L 13319566 5' - hobo 2936 1 67.90 AATTGTATATAAGAGTGATCTGTGCAAAAACACTTCGTGGTTATTAGAAAATAAGAAATTTCTAAAGATACCAACTACCGTGGGTGGCATGCACGATTCAG:1 - chr2R 672676 5' - Rt1b 5077 1 57.43 ATTTCGTAATTACAATGAACACCTAACTTACCATTAAACAGTTTATGGCAAACATAAGCCAATTAGAAATATTCTCCATTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2L 9163819 5' - copia 255 1 74.26 AATTAAAATGGAGCTAATGCAGGGTTTACAGTATGAAAGTAATATACACTAGTGGGCATAAGTTTTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCT:1 - chr2R 12319474 5' + Tc1-2 34 1 63.37 AATAAGCTTAAAAGCGCAGCGAAGACCAAAGGCAAACTTGACTGAAATGCATTTTCCCGAGATTTTTCCACCCCGCCACCGAAAAAGCCAGGGGGAAAAC:1 + chr3L 2521304 5' + Rt1b 290 1 50.00 CCCAAAATGGTGCACCATCGAAAGGATGGCCAACAGCCACTTGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 + chr2L 22084454 5' - copia 246 1 67.33 GTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACA:1 + chr3R 14917200 5' + HMS-Beagle 9 2 57.58 AGAAAGCTTTGAGCGCTGCGTCCTCTTATCACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2R 8086844 5' - 1360 3388 2 78.22 TTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr2R 14246984 5' - 297 6935 2 73.27 CTCTTTTCTGCATTTGAATACCCCGCGAAGCTCCCCCGGAGGTAACTCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTACTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAA:1 - chr3L 23436539 5' + F-element 402 1 60.40 AGCTGAATAAATTGATGATAGGCGAGGGGCTCGAAAACCATTGAAGCGTGCCTCTACACATTTGGCTAGCTTGGACTCTTCTAGACCAAGTACAAGGCAGT:1 + chr2R 21792712 5' + Tabor 337 2 64.36 AAAACCTATAAACAATAACTATTTATGGTCGAAACTTCAAAGTATTTTCTAAAATATAACAGAGCAGTCATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 + chrX 11730241 5' - jockey 4984 1 70.30 AATGTGGTTATGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 29259648 5' + pogo 27 1 54.46 TTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 8313137 5' + 297 15 2 64.36 TAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAGTATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3L 4801505 5' + roo 8694 2 53.47 CACGGNTGCTGGTCATGTCCGTGGAGATGGGATTGAGGCCCACCAGGGTCAGGATGCAATTCGGATTTATAGACTGGTACCTGTGTATGAAGAGTGCCCAT:1 + chr2R 22940454 5' - Ivk 4945 1 54.46 TTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr3R 16458058 5' + roo 8705 2 70.30 GCATAACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCGCC:1 + chr3R 20908115 5' - INE-1 571 1 45.54 TATCAGATAAACACTAACAAATGAGCAATAGTGTTAACATTTTGATTTGCGTACTTGGTAATATCTATACAAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:1 + chr3R 10277967 5' + Doc 92 1 73.27 CGTGCATCTTCGTTTTGAAAAGCCATTAACCAATTTATGTGAGATTTTAAAAGCAGCTGAAATAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGC:1 + chr2L 22992370 5' - Porto1 4284 1 63.37 TATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACA:1 - chrX 23182898 5' + Idefix 41 2 70.30 GACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3L 9909713 5' - Transpac 5181 2 68.32 TATAAACAAAATACTGTCTTTTTTCTTCTCTTTCAAAATTAGCAATAAAATAATTACTTGGCTTGGCTTGTTGTTATTATTATTGTTACTGTTATTGTTAT:1 - chr2L 7867007 5' - mdg1 20 2 61.39 TCATGCATCTGCGCTGATCCCCCCGGGGATGGGAGATATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTTGACCGG:1 + chr3L 11747314 5' + accord2 7408 1 63.37 TGTCGAGGTTGAGCAGAGCGCTGCAGCTTACAGATATAGATGATTTTATTACGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGCCATTACCCACGAACACA:1 + chr2R 4131063 5' + gypsy2 384 1 55.45 AACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAA:1 + chr2L 17210296 5' - jockey 4943 1 75.25 ATCCCATGCCACCAATAAATCGATAGAAAGTGACAGTTCAAAATATTATAAAGAACAAGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCATTTAC:1 - chr2R 5794425 5' - INE-1 558 1 78.35 TTGCATTTGTTTTCATTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGT:1 + chr3R 20137246 5' + Burdock 6149 2 64.36 TAAGGTATGTGTAATAAATAGGTTACGAAATAAATACGGAATCAATAGCGCTCGTTGATTGCTGTTGACCTCGCTGATCAGGACACGTCCTCGTGTGTAAT:1 - chr3L 918517 5' - invader6 4457 1 83.17 CAGTTTCCTTCGTTCTCGAGTTTGCAAACGCAGTGGTTCGAGTCAATAATAAATGTATATTTTATGCATATATTTTATGTATATATTTTAAAAAAAAAATT:1 + chr2L 4821354 5' + TART-B 10450 2 77.23 TGCGTCGCTGTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr2L 16201596 5' - hobo 2934 1 76.04 AAGGAGCGGGTGGGATGTGACTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 17843689 5' + roo 8715 2 76.24 GCTTGCCTTTGGAGGAGGCATCCATAGAAGAAGATACACAGATACATAGATAGATTATAAATACATCCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chr2L 4860989 5' + blood 6 2 72.45 TTGAAACGCCTCAAAAAAACGATATAGGATCTTTAATCATTTCGTATTACCCCAAAATCCAATTCCCAATCCCAATTAGGAGAACCTAAATTTATTATTAT:1 + chr3R 2136959 5' + I-element 245 1 55.45 TTGTTTAAGTATTTTTACCAGTATTCTATATATAGATTTGACTCACCTGTTTAGTTATAGTCAAAACGCAAAACCAATTTGTGGCCGTTACGCATCTTGTT:1 + chr2L 23162879 5' + 1360 3373 1 55.45 AGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr2L 19684024 5' + jockey 4703 1 54.46 TATGGATTGCGGCTGCTCCAACCAGCAGTCTCTTTGGATGTTTTGGTTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTGATGGTTTTCAGAATCTTTGATTGTGCTC:1 - chrX 1031390 5' - F-element 4326 1 74.26 TTAAGTGGATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2L 12324128 5' + roo 5 2 76.24 GTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chr2L 12667252 5' - blood 356 2 53.47 AAGTACCTAACTTTGAAAGTTTTTATCCTCTTGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 + chrX 16999796 5' + jockey 4784 1 68.32 AAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 17587776 5' + roo 8687 2 54.74 ATATATTTACAATACTACTGAATAAAAATTTTAAAAAATTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 21996066 5' + TART-B 10626 2 59.62 CAAGATTTTAGCGAATGATAAAGCAAAACAATTGATAAGGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGGTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAA:1 - chr3R 27108397 5' + jockey 4795 1 63.64 CGTCACAGGACGGATAAAAAAGCATGGTAAAAACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chr2R 21073947 5' + jockey 4691 1 52.04 ATATTTGTATATATTAAATACCCAAGGGCCGTGGATTATATTTGTTTTTAGTCATTTTTATTTCTTTTGTGGAGACATAATTTAATATCGTCTGCGTACAT:1 + chr2L 21663763 5' - Q-element 574 2 70.30 ATTGGCCCAGAGCCGGCTAAAATAAAGACGAAAGCCTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr3L 22039713 5' - jockey 4956 1 62.89 TTTCGAGCTTTTCCGCTCTATTTCGTTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chrX 3335077 5' + jockey 60 1 73.27 TGTGTNTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3R 15072549 5' + pogo 6 1 69.31 GTTATTTTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 9317033 5' - opus 7471 2 61.39 GGTTTTATGTTGCTTGTGCAGTGAAATGAGTTGTAACTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGAGAGAACAGCGGTTTG:1 + chr2L 22630994 5' - diver2 104 2 64.36 GGATCTGTGCCAACAAGAGGTTCTAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGCGTTTCGGTGCCTAAGTAGTTTATTTGTCTGTTTTTTGCTGCTTTT:1 - chrX 22461508 5' - Porto1 4438 1 77.23 CGTGTGATCCCTGACCGCCGACTGAGAACGTACACACCCCATATCTACATAACACTCGTCAAATCAATTCAAATTTCTTATTTTTAAGTTAGTTTAAAAAA:1 - chr3R 18482851 5' + pogo 1887 1 69.31 AATAATAATAATAATAATTATAATAATAACAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATATTCGTTTCAAGTATTTATTGTGACTGATCTAGAGT:1 - chrX 13383542 5' - Dm88 4522 2 63.37 TAATTAGGAACAAAGTAAACAAAACAAATAAAATGCACATAATGTTGAACATTAGTATAAATTCATTTAAAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAA:1 - chr3L 9766439 5' - blood 373 2 75.25 GCGCAAGTGCACATCAGCTGCATATTCATGGCAAGAGCTTTATCTTCGGAACTTTGTTACCGCCTCATTTCGCACACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACA:1 - chr3L 1694022 5' - Tc1 168 1 66.34 CTATTTGAGGTCTGGCTTTATTAAGTGCTGGACAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3R 27981637 5' + roo 8671 2 72.28 ATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 + chr2R 5067645 5' + F-element 50 1 72.28 GCGTCGCTGGGCGTCTGAATGGCGTGGCAGTTGCGTTTGTGCCTAAGCATAATCCAATTTTCAAAAGTGTGGTCGTGGCAGTTTTGGTCGGTTTTAGGG:1 - chr3R 9875169 5' - INE-1 348 1 61.62 CAACTGCATTGTAAGCCAATACATTTCATTAGAACCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTAT:1 + chr2L 10793168 5' - I-element 5315 1 69.31 GTTTTTCTCTATTGCACAAAAACATGTAGATATATAATTATTCATAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:2 + chr3R 6467259 5' + roo 29 2 59.41 CTTGGTTGTGCGTCGCTGTTTGTTAGTTAGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 16201604 5' - hobo 2937 1 80.20 GACCCTATCTAAATTATTTCGTTATTTAAATACACAACACAATAAAAACGCAGCACGAAAATTATGAGCAGTTTTCGAAAAATTCCGAGAAGGAAATAATG:2 + chr3R 14064512 5' - copia 401 1 79.21 TGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr2R 22411243 5' + Max-element 51 2 76.24 TTTTGATTAAGAACCTGCGACTTATGACTGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chrX 11730313 5' + jockey 4807 1 76.24 ACACACAAAATAACACAAAACAATCGCACCACAATCACACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATGATAATTAAA:1 + chrX 18278947 5' - Cr1a 89 1 66.34 TAATAAAATAAAAACGCCAGCCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATATGCATATATAGAGGGTA:1 - chr3R 6273608 5' + blood 7016 2 74.75 CTTCTTCGTTTTGGTGATTTTGTATATAAAAAAATAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2L 12479549 5' - pogo 2066 1 73.27 CCGCACACAAACACACACACAGGCAAACACGCACAGGTGCAATACATATGCGTTTATCCCACACCCATAGGCGATGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCA:1 - chr3R 5660884 5' + F-element 4309 1 83.17 TATGGTACTGAGCGACAATAAAGGATATGCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAA:2 - chr2L 15808070 5' + I-element 1 1 75.25 ATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 12539494 5' - roo 9039 1 58.42 AGTCGTTGCTGCCTAAAGCGGAAGTAAAAGGATTTGAATTGCCTTTTGCTAACTGTAAAATCCCAAATTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3L 4801581 5' - roo 9046 1 56.44 CCACCATTTTCGGCTTCCCCGAAAAACCCATTTTCCATGCCCAGACCAAGCAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chrX 14699354 5' + F-element 4678 6 82.86 TAATGAATGATTATTTAGAAACTCTGGAATACATAAAACCTTCACTCTTAATGAATGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 - chr2L 17722853 5' - blood 7370 2 60.40 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGT:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 4995 1 58.42 ACCCTTTAAACTTCAGCCGGGTCAAGGTTGATGGTGGAACTTTTCCAGCTGATGTCAATTAGAGGCGATTTGGAATGGCCGGCACGCTCTCCCGATCTGTC:1 + chr3R 5186901 5' + mariner2 564 1 57.43 AATAANTAAAAAAAATAAAAAAATCCCCCCGTAGAAGTATGCAACATTTTTTAAAATCAAATATAACATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAACAA:1 - chr2L 19618674 5' - Transib5 2761 1 67.00 ACTGCCAAGAAGATTCAACAACGATAATTTACACCAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGCAAGTGAACATAAAACATAAAATTTCTCTAAGG:1 - chrX 12566336 5' + I-element 472 1 63.37 CCAATACGCTGGTTTAAATCCACGCATGTGAATTATTTGTGCAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGAAGAGGAGAAAGTAAACC:1 + chr3R 10824054 5' + TAHRE 303 1 47.52 AGGATATATCACTAGACCCATTACTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGCCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGGTAAAGTCATGCAACTCATAATTAGA:1 + chr3R 19448064 5' - Cr1a 4163 1 76.24 CACCTTCACTTCCTCGTGGCCGCCATGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGG:1 + chrX 12456787 5' + I-element 4895 1 74.00 TCAATGGGCAATAAGCAAATCATTTTTATGAAATCAGAATACAGCAAGGAGATCGATTGCGTGCAGCGAGAAATCATCCAACGAACCCAATCGAAAATCCT:1 - chrX 14722304 5' + Fw2 3606 1 68.32 TGTACATATGTGCTGTTTGTTGCATGCCACATGCAACACGTGCGGAAGGCACAACACACCGATGCACACAAATATAACCCACCAACACTACCTAATTCCCA:1 - chr3R 31136825 5' + I-element 4974 1 66.34 GCATAGCAAAGTCAGTTACAAATTAAGTGTTGATCACACCGGTACGACCAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACACATTACGAATCATTTCATAA:1 + chr2R 1394419 5' + Doc3-element 4622 1 58.42 TATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr2L 11837998 5' + roo 34 2 60.40 CCAATGCGACTCTCTAATGAAATGCCAAAGTAGAAGACGCCAATCGTCCAATTATGCCACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 - chr2L 5558739 5' + Stalker2 7268 2 51.49 ATGCAGGAGGTTATGGAAATAATGGTGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTTATATATCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGTTTGCCTTCTATTGAAC:1 - chr2R 5975365 5' - X-element 4487 1 74.26 CAGTTGCCTTATTATGTCGTTCTGAGCACTTTTGATTACTTTTTATACGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2R 18950833 5' + roo 8 2 70.30 AGGTCAGTGCCCATAAATGATATTGGTATTGAATCGAAAGGGTTTAGCTGGCAGAGAAATAATCAGCAATTCTGAGTACATATTTAAGTAATTTTTACATT:1 - chr3L 14623752 5' + blood 6924 1 56.44 AATTGAAATTGGCTCACAACTTGGCAGCTAATTTAATATTTTCACTGAAGATATCTGCGCGGTTGTTGAAAACATAGATTTAAGAATGAAACTCAGCTACA:1 + chrX 14772381 5' + rooA 7432 2 71.29 TAGTTAGAAATAAGATTCGCTACGGCTAATTATTTTACCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTAT:1 - chr2L 4071234 5' - accord 462 2 63.37 CCCGCTTTAACACCTAACAACCAAAAAACAAGAACAATTCCTAGCCCACACATTTCTGACTATAAAATGTGGGTGGTGTGCATTCTGGGAAGTGTTAACTG:1 - chrX 3533149 5' - copia 4771 1 67.33 TTTCTAAGTTATATCACCCATTAATCATGACAAATCGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCTGACATT:1 + chrX 2800632 5' + Tirant 105 2 64.00 AGGGGGTAAATCGATTTAAGTTAGAAGTTTTCAATGCAGTGACGATCATATACTCCTACTCGATTCCCCGCGTTATGAGAGCTGGAGTTCCGCAGGGCAGC:1 - chr4 409394 5' + BS4 69 2 50.50 ACTGTTCCACCGCTCGCCCCTTTTTTTGGGGTGGTTCCGACTCGCAAGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2L 285753 5' - P-element 2857 1 49.50 CAAAGGAATAGAGTAACTATTTAGTTCTCACCTTAGTATTGCTTTTTCAAAAATTGTTGTAAAATAATAATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr2R 17718246 5' - 412 487 2 72.28 GCCATTCAATCGAATGACTCTTTCTTTCATCTTTCATTGCAGCCTATGACAAAATCTATATTTTACAGCCACTGAATACTGAATGTAATGAAAAATAACTA:1 - chrX 13035577 5' - Cr1a 4320 1 64.36 TTAAAACGCTACTCAGCTATCATCCAGAACGACACTAAGACGTAGGCGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGA:1 - chrX 22599615 5' - F-element 249 1 63.51 CTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACA:1 + chr2R 3591975 5' + Quasimodo 22 2 57.43 TACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAA:1 - chrX 23182911 5' + Idefix 28 2 57.43 ATCTAGTGTGTTAGGTTATAGTGATTGTGATAACATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGCCGACAATTTAGAGGTTCTTCTGTAATTGCTAGCATCCAGTTTG:1 - chr3L 24934504 5' - Q-element 90 2 77.23 TTTTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3L 8713147 5' + opus 7157 4 70.30 ATATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 10827410 5' - roo 9043 1 59.41 CGATCTTGTGCACTTTCCGGCACATTGGCGAAACTGCAATTGCAATTGGTCTGGGTCGAGGGTCTGTGTCGATGCTAATTGAACTCAACTGTATTCTTTCT:1 + chrX 7274530 5' + diver 5967 2 68.32 ACACAAAAAGCGTGCTACTCGCATTAACTTAGATTCGTTGAAAAGTGTAAAGTATAAAGTATATATATTCTTGTATAGGATTAATAGCCGAGTCGATCTGG:1 - chrX 20444908 5' + INE-1 99 1 71.29 AGATTTCACTACCGTTGTAAAAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 10203597 5' + jockey 14 1 67.33 ACGAAAATCCGGCATCTGTAGAGGCACACGAGCCAAACAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACTCACCAACACTACCTAAATCCCA:1 - chr3L 10243050 5' + I-element 4974 1 68.00 CGATGGCATTCGATTTCGATTTCGTTTCTGCTGGGAAAATCGAAAGTAGAACCCCAAAAGAACTCAGGACAACAAAAAGGGGAAAAGGCAAAAAG:1 + chr3R 12766493 5' + Rt1b 179 1 76.84 ACAAATTCTAATTAGAAAAATTACGTTTTGCACTTCCTCTCATTCTAATTAGTTAGGCTCTCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTTTGAGGTGAA:1 + chr2R 14305211 5' - GATE 72 2 59.41 ATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 12324120 5' + roo 8677 2 68.32 TCCTACCCCGATTTTTTTTTTCACAGACAAGGGTAAGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGTTGTCAATAT:1 - chrX 12941258 5' - 17.6 7048 2 62.38 AATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGC:1 + chr2R 4830331 5' + 1360 48 1 92.08 GTGGCAGTTTTGGACGGTTTGTGGGCGTGGACAAAAGAAATCCCGACATTCATACATGGACGTGGCTAGATCGACTCGGTTATTGACCCTGATCAAGAA:1 + chr3L 24159152 5' - INE-1 87 1 69.70 ATTCGCATTAGAATTAAACTGCACACGCATTTATCCATCTCTAACAAGAAAGAATGAATCTATAGCCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCTGC:1 - chr2R 5434182 5' - INE-1 546 1 61.39 ATTGGTGATTCTGTTGTATTTGCGTAAGCTGTGAAAGGAAACATGAGCAGTGTGACTAAGCGCAGTTTCTAATTTAACCAAATTCCAATTCAAATTCAAAA:1 - chr3R 24660242 5' + Rt1a 309 1 74.26 TTGGCTTTCAATGTGCAACATGCAACTTTCAACTTGATGCTTGCGATTGTGTGTAGTTTTGGTGGCTAGGTAGTTTATTTGTTTGTTTTTTGCTGCTTTTT:1 - chr2L 1332311 5' - Porto1 4437 1 53.47 CAGGTTGTGTCCAGTTTCCTATCACCCAGGCAGCAAAGGACCACCCTATATAGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 - chr3L 5201565 5' - 297 376 2 58.42 TGATGNAGTCAGCAGCACGAGGACCAGGACGAGGTTCGATTTAGGATAGTGCAGGTGCCAGGAGGTAGAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr3L 14065498 5' + 1360 7 2 71.72 GCTTGTCACGAATGTATCTTCTTAAATCCTCAAAGTCTTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr2R 13106764 5' - copia 216 2 66.34 CGACGCCGAGTCCGCTGAGTCTCTTATTTTTGAAATGAGATCGATTTATTTGCTGCTCGAACTGGTTGGGTTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAAGCCCTCA:1 - chr2R 20886002 5' + Rt1a 4976 1 58.42 CCGCANCCCCTGACAGAAACAGAAACGAAAACCGAAAGTACCGCAATCCAAAATTACCAAAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAAGAT:1 + chr2L 132127 5' + Stalker4 7002 4 62.38 AAGGGGAGGCGAAAATAAAGTCATAAAGCCAAGTGGTAAGTGCGGTGTAGCTACGATACCTGCCCTTCGGGCAACTTATTCCCCTCATCCCGCGCAAAG:1 - chr2L 15952891 5' + BS 204 1 60.61 AATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGCTTAACCAAAGACACTGGAATAACAAGATGCG:1 - chr2R 16880919 5' + 1360 5 2 77.08 TTAAATGTCAACAAAATTTAAGCATAAGACTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCA:1 + chr2R 964617 5' + I-element 5036 1 71.29 AATGATGAAAAAGACTGAGTACGGAGAAGGGCTAAAGCTGAAAATTGAGTTTCGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATT:1 + chr3R 1061428 5' - 17.6 7299 2 62.38 AGTGTAATTTCTTAAGTAAAAGGTAAACACTTGGAAAGCTGTAACTGTAAGTGTGGTTAGAGCAAAGCTCGTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr2L 16948750 5' + jockey 4681 1 70.30 TTAAAACAAAAAACTCATTTTCTGCGTTCAGAGGTTTATTTTATAAACCTAGTATAATGTAAATAAATACTTTTTTTAAATAAAATAAAACAAAATTTAAA:1 + chr3L 11626232 5' + HeT-A 324 1 87.13 GCCTTTTTCAAAAGGTTGTTCACATCCAATTGGCCAAGAACAACAATTGCACAGCTGGGCACACATAGCACACTCAGACACACACACACACACACATATAC:1 - chr2L 13713253 5' + accord 185 2 60.40 TTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGAAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr3R 15598679 5' + Max-element 51 2 74.26 GGAAGCCGGGTCCTGCGATTGATGGATGGCAGCAAGGACGAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr3R 20123251 5' - blood 7352 2 60.40 TGTAAGTATGCAATGGAAAAGGAGCCGCATTTTAATGCTTAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 - chrX 14768068 5' + BS 5028 1 60.40 CCGCTNACGTGTTTCATCGAATGGACAATGAGAAATGCATTTTAAAAAATCGATAAAAGAGCGTAGAATGCGAGTTTATATTTTTCTGGGATATCGATAGA:1 + chr2R 6085426 5' - INE-1 501 1 67.33 CGCGGCCAACTACGATTGGATCCAGCAGCAGTTGCAGTAATAAACCAATGTCGATAGCAAAAGCATTTCAAAAGCTTCCTTTTTTGTTCTTTTTTTTTTAA:1 - chrX 16706013 5' + hopper 151 4 88.12 ATAAATACTAGGAAATTATTTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 4854973 5' - opus 480 2 61.39 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTG:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 126 1 59.41 ATTTTGGTAATGGTTTCGAATTCCTTGAGCTTTAATCTTCTCTTATACAGAGAGGTAAATCCATATACAGCTAAAAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAA:1 + chr2R 14497330 5' + Doc2-element 100 2 75.51 ACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCAGTAACTTTTAGAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGC:1 - chr3R 19449414 5' + roo 8639 1 65.35 AGGATCCTTTGTCGGCTGGGATAAGAACTCGCATAAGGGAAATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:1 + chr2L 3951591 5' - Transpac 5192 2 59.41 GTTGGNCGTTTGATTTACCATGTTTTTTCGGCGCTTTTCCGCTCTATTTCGTTGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 26407378 5' + jockey 33 1 47.52 TTAATTCATTGATACATATGTATCAATATATGTACATATGTATCATTCATTGATAGCCCAGTCGATCTGGCCATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTT:1 - chr2L 21794045 5' - Burdock 6390 2 78.22 GGAGAGGAGGCGTGGCCGGGAGTTATAGACGAGGCCTATGGCAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chrX 2799600 5' - Tirant 399 1 77.89 ATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 19377812 5' - roo 393 1 63.37 GTCTAATAGTTAAAATATATACATTTTAGCTCCGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACC:1 + chrX 5376019 5' + Cr1a 3998 1 67.00 ACTTAAAATTCTTTGTTTATTTTCCTCTTTGGTTTGCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGT:1 - chr3R 10145245 5' + roo 102 2 64.36 GACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chr3R 26842871 5' - opus 467 2 66.34 GTAAGAAGTAATGCACAGAAGAGGACGGAATACTACAAAAATCGGGTTGCCATGGTGTGGGGTAACCCCCCAGTACCCCAGTACTTCAATCCGCCGATCCT:1 - chr3R 20264776 5' - FB 1048 1 78.22 TAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3L 27356104 5' + 1360 38 1 69.31 ATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 - chrX 19426289 5' - mdg3 203 2 65.35 AAGGGCTTTAATTGTGCGTGGGCCAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTAAATAAATAAATAAATA:1 + chr3R 22781957 5' - copia 229 1 50.50 AAGTATATTATAAAGATTTCTTTAAATTTTATATAAACATGACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 + chr3L 8362994 5' - 3S18 304 2 61.39 GGAAGGATTCTCCTCAGAATTTCAGCCATATGTACAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGC:1 + chr3R 14688504 5' + FB 42 1 67.68 AGTGACCCTTTTGTGGGCTCATTTAGCCATTTCGTTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 - chrX 19116948 5' + opus 12 2 64.36 CGCATTCGTATTACTATCGTACATGAGCCCACAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTG:1 - chr2R 16757076 5' - jockey 4741 1 58.02 GCAAAAAATTGGGGTAGATATAAAAAATAAATAAATGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAAATGCTGTACTACAAAATTTTCTGTTTG:1 - chr2R 19069340 5' + Doc3-element 140 1 75.00 ATAAACTTTGCTTGATAATATTTATAGAAATTGTTGATTTACGTTTTCGATTGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTA:1 + chr3R 17908834 5' + hobo 2641 1 63.64 TATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr2R 4547753 5' - HMS-Beagle 7018 2 55.45 GAACTTGTCCTAAATTCTTTGACCATAATCTAATTTTTTATTTTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAAT:1 - chr3L 25633271 5' - F-element 4641 1 92.08 TACATTTTATATATATTGGTAACAATTACCTATTGTGTACTTCTATTTTTACTTACACTTAAGCGCATAATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCG:1 + chr3L 17540232 5' + rover 129 2 56.44 GTGTTCTCTTTCTCTCAGCATCTTCGTTTTGGGCTCCGCTAACTGTAAATTTGTTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTT:1 + chr2R 15675217 5' - Doc3-element 132 1 64.36 TAGTGCCTTTGATTCTACATTACGCAGACACGATCATCTATGTATAATTCGCAGATGAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAA:1 + chr2R 2953280 5' + 1360 2959 1 54.46 ATTATTTGAAATGTAAATATGGGAGATCTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 - chr3L 3032294 5' + opus 154 4 71.29 TAAAAACGCACGAAATAATTTCAAATTTTCACTTTGTTATTATAGGGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 - chr3R 14917261 5' - HMS-Beagle 7013 2 54.46 CAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAA:1 - chrX 22945359 5' + BS 23 1 59.41 GCATGTCAAACTCTTGCAGTGACGCTCGAATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr3R 11846317 5' + hobo 5 1 74.26 TATTGCGAAAATGGCATTAAATGTTTGTTTTAATAATTTTCATAAAATTTTGGTTCCCCTTGTTAAAGACAAAATAAAGTCAAATGTAGAGCGACACATAA:1 + chrX 295360 5' + G3 4364 1 56.44 CTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chrX 20806941 5' + opus 23 2 61.70 CAATAAATTTGTCTCTGAAATAATACATTTTCAATTAAGTATCAACGTTGGCAATTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 + chr3R 16834019 5' + I-element 24 1 47.52 CGAGAATTCCTGTGCTCTGACCTCGGTAGGTGCCCATGATACATGCCCAGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCG:1 - chr2R 7010666 5' - baggins 5206 1 62.00 ACCCACACACAGACAGATTTTCCGTTGGCGAAACACTTTTCTGTATGAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGACGGTAGCAGGCCGATGGAACTGGTCAT:1 - chr2L 7033421 5' - GATE 8035 1 53.00 CTGCCCTGCAGTCCATCGTAGTGGCAGCAAAACATAAAAGAAAAAATAATTAGAAAAAAGCAAGAGAGAATGCTAAAGTAGAGTT:1 + chrX 9559498 5' - INE-1 575 1 75.29 TTATAAAAGAGAACTTAAGAACCAATGATCCTGCATTTAACTTGTATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTA:1 + chr2L 13154219 5' + Juan 15 1 60.40 TTTCAATCTTATACAAGTATCGCAATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTA:1 - chrX 10672381 5' - mdg1 409 2 66.00 ATTTTCAAATTTTAAAATCTGCGCCACGGGCGGCGCACGAGGAAATTACACTACGGATCGCTTTTTGTGTAATTTCAAAATGATTAT:1 - chr3R 30218045 5' - P-element 2507 1 93.10 TAAAACGATTTATTTATATAATTTATATTGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACA:1 + chr3L 21093337 5' - G2 237 1 54.46 AATAATTCATAAAATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 7032116 5' - mdg1 407 2 64.36 AAAAGNAAAGGACGAAAAAAAGTCCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 14323586 5' - hobo 2907 1 70.73 TTATTATGATGCGAAGACAATATTTCAGCAGGAATTGTTCAGTTCCTTTTGAACTTAACC:1 - chr3R 5990480 5' - G5A 2796 1 46.67 CTTATTAGCTCAACAAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 - chr2R 5531205 5' + 1360 56 1 69.31 AATTTATGAAGCCAAGATTCTGAAGTCTGAAGCCAAGTTATTCGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr3R 22232571 5' + F-element 48 1 58.42 TTTATTTTTAACTGAGGTCATCAGCGTAGACATCGTCTATTACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTTAAAAA:1 - chr3R 14479081 5' + FB 383 1 60.40 TATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCA:1 - chr2L 21635351 5' + F-element 479 1 61.39 TAACTCTACCTCAGTTTATAAACAAATTTCAAATTTCAATCTCGACAGCATTTCCTCGCTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAA:1 + chr2R 3282402 5' + Cr1a 4371 1 55.45 CGGCGGGATGGCGGAGGTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGACATAACGGCTGCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCAAGAGGGGGAACTT:1 - chr3R 26207422 5' - G5 4523 1 79.21 TATTTGGGAAAGATGCAGGACGGACATGACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chr4 1149946 5' + 297 8 2 71.29 GACTTGGCTTCGAGGGCTTTAATGGCCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chrX 18836948 5' + P-element 25 1 58.42 AAAATTAAAATTTATTGAAAAATAGTCAAAAATATTTAAAAAAAAATTAATTTGAAAGTGAAATTAAATGTTGATAAATGATTTTTATGATTTTTATTTTA:1 - chr3R 13548429 5' - copia 5061 2 80.20 ATATGTTTGTATGTATGTGCATACATATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - chr3R 9885486 5' + hobo 52 1 83.17 GCAAAAGTGAGCGATAACGTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGATGTCAA:1 + chr2L 9399247 5' - F-element 4311 1 81.19 ATTAATAAGGAAACCTATTGACCATCTTCATTTCATAGGCCATAGCCATCTACAATTAGCAGTGAAGCCAAGATTAGAGATAATAGGATAAAGTCTATTAT:1 + chr2L 22737551 5' - Cr1a 4209 1 65.35 ATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2L 8565529 5' + blood 7040 2 56.44 CCCTANATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAA:1 - chr3R 1977610 5' - micropia 5399 2 64.36 TTTCCNTACGTTTTTTTATGTGCCTGCCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 14790571 5' + roo 23 2 55.45 TGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 + chr3R 15072594 5' - pogo 2050 1 77.23 TCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACACATA:1 + chrX 6417710 5' + Quasimodo 38 2 74.26 GAAGTCAGAGTGCAAAATTTTTATGACTCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 - chrX 2799716 5' + Tirant 13 2 68.00 TATTAACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr2L 11837992 5' + roo 8692 2 54.46 GTGCANTAAAAAATAAGTTAATTAATTGAGCGAAAAAGCAATTTTCGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chrX 2649918 5' + Tirant 4 2 76.24 AAACGGAACCCCGGGGGCCACATAAAGTATATATTTTCTTGATCGGGATCAATAGCTGGCAAATTACCTCACGAGATTAGAAACGAGTGCCGATCAGCAAT:1 - chr3R 1438058 5' + BS 438 1 55.45 ACCCGGGTGCGGACAGGTGAATCAGGTCATCGGGGGCTCTGGGACGGGAGCCAACGCGTTGCAATGGGGCTAAATTAAAGCGATTCCGAAATGCACGCTGT:1 + chr2L 11492412 5' - mariner2 208 1 63.37 AACAGAAAACAATTTTGTTAGCATTATCATTAACACTCTTTAATGCAAATAACATAAAGTTAACCATCGCTGCTCTGAATATCCGGCTTGAAGGACCAAAT:1 - chrX 6311688 5' - 3S18 366 1 81.19 GACCACATTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr3R 12605625 5' + F-element 59 1 84.27 CTCGTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTA:2 + chr3L 10081926 5' + rover 6970 2 58.42 TCTCATAGTTTTTCAGCTCGCTGGTCAGGCTGTCGTCCGTTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCT:1 - chr3R 31256127 5' - transib2 2429 1 61.39 TCAAGTGCTGCCGGTCGGCTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTATCGCCAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTCC:1 + chr2R 21960526 5' - ZAM 64 2 70.42 ATGACCCTCATGCAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCGCCAGTACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:2 + chr3L 10013577 5' + hopper 28 1 53.47 TGTGTGCCCGATAATTGTCAACTGGCCAGGTGGACGGAAAAGACGGAGGGGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCA:1 - chr3L 12804750 5' - jockey 4713 1 48.98 GCATGGCTGTGCGGCATTTGGCGCTGCCTCTGCTCATTTCCAAGTTAATTGACTGGCCAACAAACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAAT:1 + chr3L 8255127 5' - I-element 5177 1 70.30 CGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chr3L 13589453 5' + hobo 42 1 65.35 GTGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 + chr2R 4547740 5' - HMS-Beagle 235 2 66.34 TAATAGACTTCCATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGA:1 - chrX 13508787 5' - roo 9071 1 82.00 GTTATTAACAATAAATTATTGAAAATTTTCCACCCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTAC:1 + chrX 18518461 5' - R1A1-element 5121 1 71.72 GGCAATTTTAGATCGCGCGGATTTGTTACGTTTTCGTTTTGTTTTTCTGGTAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTTGTGGTTTTGCTTTCGCTG:1 - chr2R 14414517 5' - F-element 499 1 74.47 TATTGCATTCCTTTTATATACGAATTTCATGTTACATAAGCGCTTTAGCTAAAGACAATGGTTCGTTTTTATGATCTGCTTTTTTTTTATTTTTCTTTAAT:1 + chr2L 5893905 5' + hopper 152 2 57.43 ACTTTGGCCGCACAATTCATGGCTGTGTTCACGAACGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCGAAACGCA:1 + chrX 20339321 5' + F-element 284 1 70.30 TTTTTTCGCTTTTCGGTTCGTTTCGCCGCGTTTCTTTTTTTCTTTGTTTGGTATTTGCCAAGAGCGTTAAAACTCTTAAATTTCTCTAAGGGAGTTATTTA:1 - chr3L 8263405 5' + I-element 482 1 69.31 CTCAAGATAGGGGGTAAGTGGCTTTGGATTGTTTTCGGTTTCTCTTCTACTGCTTTTTCCCCTTTTATTCCCCAATATCTATCGATTTCCCAGAAAAATG:1 + chr3R 24570081 5' + INE-1 502 1 62.00 CTGCCAATTAACAGAACAACTTCTCACTAAAACGGGCGATGCTCTCGAGTCCACCATCAAAATGGTAATATTTCGTTGAAATTAACATGAACCTACACACA:1 + chr2R 12029310 5' + accord 243 2 78.22 TCTGGCTTACATTTAAATTATCAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGATTTTATTATTTGATCAAC:1 - chr3L 18706961 5' - jockey 4983 1 70.71 CATTGTGATCATCTAGCGAAATTTGCACTAAACGACGAGAGATCTTTAATTTTTATGTAAATATATATATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCA:1 - chrX 21292696 5' + rover 6951 1 78.22 GGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 - chr2L 1625693 5' + hobo 51 1 76.24 GACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTAT:1 + chr2L 12815056 5' - hopper 1367 1 71.29 AATGCCCCACCTAAGACCAACGAAAACAAACAAAAACTGAAGATTTGAGGATGAAGGGGATCCTATGAAACGTGGAGCATCCAGATGCGTTCAGTGTTGG:1 - chr3L 21045838 5' + 1731 488 1 68.00 CCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 + chr3R 8458233 5' + HMS-Beagle 39 2 67.37 TACCCCTCATCACCCCTTCACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCC:1 - chr2R 16835078 5' - Rt1a 4887 1 81.19 CTGAANAGAACGCAATATTATTGGGTTGCTAAATATTTCACTCTTTGTATGGTGGGAGGCACATATAAGCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chr2R 24021542 5' + pogo 5 1 73.27 AAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGG:1 - chrX 992077 5' - hobo 2898 1 68.32 CCCAAGACGAAGTCAAGCACACAAACAGCCGAAAACCCAATTAAAGAGACGATCTAAACTGGAGGACACATTACAATCAAAAGCCAGGGTATTTATACCTT:1 - chr3R 13139345 5' + TAHRE 399 2 64.36 AACAGCTGGTCAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chrX 3817452 5' + roo 36 2 67.33 AATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 11263393 5' - roo 9041 1 60.40 TGCTCTTCGTTTTGTCATTTGTCTATTTATGTTTCTTTTTTTTTATAGTTCATAACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGAAAGAGACACTATTGGCA:1 - chr3L 19450256 5' + Doc3-element 105 1 57.43 ATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr3R 13582299 5' - BS 5079 1 61.00 GAGACTTAAGATCAAAGCAGTGCGTTTTTGGTGTGGTGTTTATGGGTGACGAGTGGCAGTGAGAGCGAGCGAGAACGGGAGAGAGAGAGAGCGAGAGAGTG:1 + chr3R 20552835 5' - Cr1a 296 1 58.42 AATATAGAAAATATTAAATAAATATTAATAAAATATTAAATAATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGAT:1 - chr3R 26616346 5' - roo 375 1 66.34 TTTTTTTAGCTTTTTTTATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTAACTTTCAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATC:1 - chrX 3789680 5' - TAHRE 10399 1 79.21 CCGTAACAGCTGAGTGGCATTTTTGCGGCTCCTCTTTTCGTTTATATTTTCGGTTTCTTCTTTTATACTTCCTGATGTCATGCTTATGTGCATACATAT:1 - chrX 17710561 5' - Tom1 183 1 63.64 GAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATGTTTAGATTTCGTATGTTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAA:2 - chr3L 14971177 5' + 1360 3297 1 69.31 TGGAAGCAAAGTTGTCGGCGAAATATGACAACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3L 11661687 5' + hopper 3 2 74.26 ATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTTTTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 19445153 5' + roo 72 2 66.34 GGTGAGTGGTGTCCGCATGCTGTGGTATGTATAGTATTGTATGTGTAATAAAAAAAGAGAGAATGTTATAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCGTTA:1 - chr3R 11440875 5' - INE-1 552 1 78.22 GGGAGGAGCGAGTAGGAAGTTCACATAATAATATATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATGC:1 - chr2L 9775470 5' - 412 159 2 69.79 ACAATCGAAATAATACTGAATCGCCCCAAGAAAATCTGCCCACCACCCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr3R 29123411 5' + P-element 22 1 56.70 GAGAGAACCTATTATTAATTGTTTACATTAAATATTTCTAATACAAGCAATGCTTTAGCATTCTTTACCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 - chr3R 15151328 5' + jockey 4685 1 68.37 ATATAATTTTTCTAAGTGTTCAAGTGTCACCGCCCTTCCCGGCCGCACACACACTCCCAACTTCATCAACTTATTCCAATTTATTTAGCAAACTTAAATAT:1 - chr2L 3213899 5' - Ivk 5372 1 61.39 TTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chrX 20806874 5' - opus 7464 2 72.28 AGAAAATTCAAGCGAAATGTTTAGCACTAACTAGTCAGCATTTTATGTACACATATAAATAAATATATAAATAGATATATATATATATATATATAAGAGAG:1 - chr2R 17351067 5' - blood 181 2 88.12 TACAGACTAGTTGAGATAAATCCAGGCTATCCAAAATAAGGTCGCATGACTCATCACC:1 - chr2L 15086982 5' + X-element 4304 1 63.79 ATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chrX 12657098 5' + blood 7038 2 54.46 GTTCTCGTCCTGCCAACTGAAATTGTTGCCCAACCGAACAAGGACGATCCTCATTTCGCTTTCGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACT:1 - chr2L 5392121 5' - F-element 79 1 59.41 TTATAGCTCCGTCGAGAGTTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 + chr3L 13589429 5' + hobo 11 1 65.96 TATATGTTCAAAGACCTTAACGTATATAGAAATCTCTATCCTGTCGTGGTACCGGCTGGGGTGCATGTTTATTGCCTCAAAGACAG:1 + chr3R 15064708 5' - BS3 1452 1 59.30 ACAGAATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCAT:1 + chr2L 17784621 5' + gypsy10 28 2 49.50 CCCGAAATTCGCTCGCTCCTCGCCTTGCGTGAAAACTCATTTGGATTCTGGCCAGGAGAAGGAGCACCTGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTAG:1 - chr3L 7203469 5' + Doc 275 1 72.28 TTTGAACATAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 - chr2L 22084540 5' + copia 37 2 60.40 GTGGCGCCGGCGCAAGTTCTCTCTTATCCTCTCTCTCTGCGTCTCTCGGAGCTTTCGTGTATACTATACGTGGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2R 10444210 5' + P-element 4 2 75.25 ATAAATCCACTTCTTAGCCCAGCCCTCGTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAG:1 - chr2R 24239796 5' + hobo 2703 1 72.28 CTACAGTTTTGGTACCCCAATCCCTAATTTTCAGACAGCCCCACAGCGTGACACAACATATCAGGGCAGCCCGACCTACTCCTGCAGAGCATCATGCTAAA:1 + chrX 4255738 5' + Chimpo 3895 1 62.38 GGTTTGGGGATCCCGTTCTGTGCGGAATGAGGGAGTCCTGACATGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTC:1 + chr3R 11280575 5' + F-element 371 1 55.45 CAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2R 20744240 5' - roo 392 2 56.44 GACAAAATGGGTTTCTTTGTCTTTGGCTAGCTTGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAACTTGCTATGGTATTTTTCTTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGT:1 + chr3L 3241457 5' - F-element 4418 1 65.98 TAAAATAAAAACGCCAGCCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 - chr3R 6273605 5' + blood 9 2 71.00 AACAAATCGTTTTACAACACTATTGAGAAAAGCCTAAATATTAATATATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chr2R 5953086 5' + pogo 27 1 59.41 GCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGT:1 + chr2R 5532365 5' + Doc4-element 9 1 52.53 GGAAATTTCATATGCGGGGTGCCCAATTTATGTGGTACCCCAGCATTATTCAAAGTGACAGGCTTCCTTTCTCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3R 9131856 5' + roo 8667 2 74.26 GAGACTTACATTTTATTTTTCTTTTGCCTCTATATTTAAGGTTATTTTTTTAAGTGTACCAAGTGATTGAGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr3R 6622610 5' + P-element 1 2 77.78 TGTTTTCTGTGTTTTTTTTTGTTTTTTATTATTTTTTTGACTTCAGTTACTTTTTGTGGTTTTAGTTATTGTAGAATTCGCCGTCTCTTGTTCGCTTGCAT:1 + chrX 8271424 5' - I-element 357 1 46.53 TGATTATTCCGCCTGCGAATTATCGTACAGTTTTCCTCAGCAGCCGTATCGGTTTTCCAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAA:1 - chr2R 1983711 5' + Idefix 326 2 61.39 AGCCTTAAAAAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 13574283 5' + pogo 25 1 51.49 ATTGAATTAGTGATATGTGACCCATTAAACTTACAAATTGTTAAGAACTTTAATATTTTGAGGTAATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGA:1 + chrX 21204929 5' - mdg1 413 2 59.38 TCATTGAATCTAGTATCATTGAAATGTATTTAGCAGACATAAGGAAACGTTCCCGACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTG:1 + chr3L 26417957 5' - Quasimodo 6967 2 56.44 AACTAAAAGGAATACTTGTTGAGGAAAATGCGGTGGAGACTAATCAATTTTGGACAGTTTATAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTA:1 + chr2R 5653726 5' + HMS-Beagle 6670 1 66.34 AACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chrX 2649871 5' + Tirant 51 2 74.26 ATTAGGAAATAACACGATATGACTATCCAAAAGAAGTAGATTGTTATCACTAGGTAAAGAACTTAAGGATAAACATCTGCTCCTAAGACCATGGAGACGGT:1 + chr3L 19953008 5' - GATE 8058 1 73.27 CTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 + chr2L 12815032 5' - hopper 1391 1 55.45 AAGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3L 4876805 5' + roo 27 2 53.47 ATCAACAAAAACTTCTAGGGAATGAAATGCCACTGCTCCTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAAATAGTAT:1 + chr3L 1893147 5' - I-element 5315 1 61.39 TTTATATGCCGAAGCTATTACAACTGACATTCGAATTTTAGGCGTACAAAAAATGAC:1 + chr2L 1625279 5' + hobo 2690 1 68.42 GCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 17587765 5' + roo 8682 2 61.39 TTTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTG:1 - chrX 23283046 5' + flea 4777 2 56.44 AAATTTGATTTGGCATGCTGATTTGGCCGGCGGAAAATGCGGAAAAACATAGTTGGCATAGTTTTACCCTCTCACTGACTAGAGTGAATAGCTGCTCTTTA:1 + chr3L 3639919 5' - gtwin 271 2 78.22 ATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 2074784 5' - roo 386 2 59.41 CAGATNGAAACAGTTGAATTAAACCATGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGATGTTGTACGTGCACACGATTTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTG:1 + chrX 17950898 5' - Porto1 397 1 74.26 GTCACTTGCTCTGGCCTCCCCCCCAAAAAAAAACAAAAAATAGAGAATGCTATGATCCAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTGTGAAT:1 - chrX 8313181 5' - INE-1 536 1 65.35 TTTATTTGGTTATTTCAAAGGCACCCCTTCTATGGGCCCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3R 11688441 5' + 1360 38 1 60.40 CAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATA:1 - chr2R 13644522 5' + Burdock 9 2 70.30 AATAATTTTTTAAAAATTACTAGCTGTTAAAGTGCACATTTTAGCTTATTTTTTTTTAACAGCACTGCATAGCCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATA:1 + chr2L 11922480 5' + BS 5077 1 68.32 TGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 13650113 5' - mdg1 383 2 62.38 ACACGCTCGATTGAAAGAGTATGGGAAGGCCAATCGGTGTTGTGTTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATC:1 - chr2L 9093097 5' + HB 1315 1 54.55 GGCAGACAGGCAGTCAGAGAAATATCAGCAGTTCATTTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:2 - chr3R 27775177 5' - roo 400 1 70.30 ATAGTGGTTATTGTGGGTTATTGGATTCATGTGGGCGCGAGTTGGGGTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 + chr2L 11832584 5' - F-element 4401 1 53.47 GACATGCAATCCACGAATGATTCTTATTATTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTATAAGTCTCCTCCCTTCAATTTCGAAGGTGTTTGAGAGACTGAT:1 + chr2R 3357793 5' + BS3 465 2 40.59 ATAACTGTTTAGATATGGGCCATGAATAATGACATAAATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr2L 4743188 5' + I-element 41 1 63.37 CTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 2074754 5' - roo 9019 2 77.23 CAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 4876786 5' + roo 8710 2 72.28 GTTATAAAATCCATATAATTTATAATTGCTGCACTTTCATCCCTGAATGAACATAAATATTCTACCCTCTACACTCACCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chr3L 12633223 5' + jockey 8 1 75.25 TATCATCATAACCACCATCATCGCCATCATTAGGGCTTTTTTAAATCGAGTGCCTACTGCAGCGATTGTTCCACCAACTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 - chr3L 13788584 5' + Tirant 22 2 78.22 TCAAATAGAGTTTTTTAATTTGCCGAAACAAAAATTATAATGAAGAAAAAAAATATCAATAAGATATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTC:1 - chr3L 26325023 5' + 17.6 7023 2 70.30 TTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 28063328 5' - roo 398 1 68.32 GATTCAGCTCTCCTCATCGTAAAGACTCTAGAATAACAAGATACATAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCGTCACTTTTTTGGTGACGGCCA:1 + chr3L 6549655 5' - 1360 3331 1 80.20 TATTACCTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTACCACTTGCATCAG:1 - chr3R 4601400 5' - opus 7495 2 70.97 TTTATGCGGCATCAAGTGCGCCCCCCCAACACGAGCGTTTGTATGTATGTATATAGTAAGGATGGGTGTATGAATGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTA:1 + chr3L 9171568 5' - mdg3 5315 2 63.37 TTTCGCCATAAAAATCTCGTGCGTCTGTGCGGAGATAGCGACCGTATAACCGCGAAATTTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2L 20824906 5' + pogo 15 1 65.35 AAGCATGTTATTATTTTTTTCTCAGGTAAAATGACTGCTCTAATTGACTTAAACAAATTCCTTTGGGATTTGTGCAGTATTTTAAACAAATATACAAAGTA:1 + chr3L 11554017 5' + Cr1a 167 1 61.39 CATACCACAGAGAAACCACTTAATGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAA:1 - chr2L 23382001 5' + Ivk 332 1 73.56 ATATCGCGTATCGTTTGTCAGTTTTGGAATGTGGCAAATGTGCTGGACTCACGCATTCCGCCATCCACGAGGAGCTCGGGATTCCATGGGTAGAC:1 - chr3R 25565825 5' + G2 2795 1 66.32 TGGATTTCCTGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCG:1 + chrX 22077192 5' - gtwin 7366 2 52.48 CGACGACTTACGAAAACCAATTACCGGAACCATACATATATACACATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:2 - chr3R 26842875 5' - opus 7474 2 62.38 ATGTGGACGGAGTCCCACAAGGCTCTGTCCTGGGACCGCTGCTCTCCTGCTGATGCAGTCATTTATACTCCTGGAGGAACCCCTCGAGCACGCTGAGCC:1 - chr2R 4932219 5' + G7 121 1 62.63 TGGGAATTTCACAAATATTTCTATTTTCTGAAATACCCTTAATACCACTGTAACGCCCACAAACCGCACCAAGCTACCACGCCCACACTTTTAAAGAATGT:1 - chr2R 24550180 5' + INE-1 255 1 56.44 CTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3R 27775105 5' + roo 52 2 80.20 AATTTCAAGGTTATGCAGGAGATGGAAATTAGTTTAGTTATGCAGCGATGGCAGAGGATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTA:1 + chr3L 5190238 5' - 1360 3232 1 60.40 ACCAAATGTCAAATGCAGCAAAAGCAACAAAAAAAAAATGGAATACGCACCAACAAAAATGTAGTATGTTCCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCT:1 + chr2L 17296736 5' - S-element 1394 1 55.45 AATTCGCCAAAATTCATTAGGAAACACAAGTGACCACCCATACAAATCCCCTTGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAAC:1 - chr2R 330778 5' + Doc 4534 1 68.32 GGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 - chrX 23155229 5' + blood 7064 2 74.26 ATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chr2L 3632169 5' + P-element 57 1 25.00 AGTGGGAGTCGTAAAATGTCTGACTGGCGGGCACAAATTAATGCTCATGGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGC:1 + chr3R 8919118 5' + P-element 239 1 53.47 ATAAGCAAACGCAATGAAATGCAAAAGGACAGATATAATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 - chr2R 23584805 5' + HMS-Beagle 6834 2 64.36 TCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAG:1 - chr2L 22224558 5' - Rt1c 5395 1 61.39 GGGATNCAACGCAGGGGGTAGGAAATGTGGTGAGGGGCGGGGCCAGTTTGCATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 - chr2L 20238743 5' + jockey 4668 1 55.45 TGAAATCGATTTGGTTGCAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 + chrX 3305141 5' - transib2 2790 1 57.43 AATACCAAAAAAAGGGAGTGGAATGGCTGATCTTTCCCTTTGTTATTATACTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATATGTCTTCAGTATACATCCGCCTT:1 - chr3L 20049351 5' - Bica 84 1 57.43 TACGAAAATATCAGTACGTCTAACCGTGACGCGAAAACCCATACCCATATACCCATATCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTG:1 + chr2R 14290093 5' + accord2 7570 2 61.00 TATCTGTTTAACTTTCAATTACAAATGATTTAACTGACAAGTAAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTT:1 - chr3L 17168936 5' - mdg1 417 2 75.25 TACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chr2R 24479899 5' + I-element 50 1 73.27 TTTTCAATAATTACGTACCATTTCCCTCTACTCAAAACCAAAAGTATTTCCCCTGGGAAATGTCTTAATGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCT:1 - chrX 332701 5' - mdg3 5185 1 74.26 TTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2L 13574215 5' - pogo 2059 1 72.00 CAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTC:1 - chr2L 16201569 5' - hobo 2902 1 52.48 ATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 + chr2L 9163720 5' + copia 4902 2 61.39 CGATTGTCCTCGTTTTATGCGTGTCACATAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 - chr2L 15508961 5' - jockey 4940 1 73.27 CGTGTACATCTTTGGAATGATTTTAGCATATATATACCCCTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACTTAGTCTC:1 - chr2L 2308710 5' + HMS-Beagle 6827 2 57.14 AAACAAAAATCGCTAAATGGGAAAATAACTCAAGCGAAAATCTCTTGCGTAGATTAATCCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 - chrX 19426313 5' - mdg3 5479 2 59.41 CGACCACTTGTTTGACTGCTTTGGCTTCAGCTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3L 11553498 5' + P-element 43 1 27.84 GTCTGCAGTTTGATAGGGGTCGTGAGTGTGGACATATTTGTTTATATTATATTAAGTCGATACTTGTAAGGTATAAATACCCTGGCTTTTAATTTGTAATT:1 + chrX 3744559 5' - TAHRE 387 1 52.48 CGAACATTTTAGCTCGTCGCGTCTTTGCTGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 8491385 5' - P-element 2878 2 71.13 GGCCTCATTCGATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr3R 8555823 5' - 412 486 2 71.29 GTTTACCCCACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3R 10277281 5' + Doc 48 1 64.36 GTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:2 - chr2L 1625695 5' + hobo 49 1 74.26 TTCTATCCTTTCGGAAAAATATTTATGAAAGAGTATACTGCCAACTAAAGTCCTTTTTACACCTACATTTTTACTCGAGTTACTCGACTATCAGATACC:1 - chr2L 9081766 5' - INE-1 557 1 28.28 CAGTGGCGCCGGCGCAAGTTCTCTCTTATCCTCTCTCTCTGCGTCTCTCGGAGCTTTCGTGTATACTATACGTGGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2R 10444208 5' + P-element 2 2 77.23 CTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr2R 17626537 5' - mdg1 7405 2 79.21 ACACAAACACAGACACTCTCGTCTACCGACGATGCACTTAAGATGGCCAATCTAACGAGTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3R 22782045 5' + copia 11 2 65.96 CTTCATACATATTAAACCCATGGAACGTAAATATTTAACGAATACTTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGT:1 + chrX 20353961 5' - I-element 4917 1 54.46 CCTATGATAGCGAAATAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr2L 7451951 5' + F-element 4679 1 83.87 GATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGT:1 - chr3R 17321760 5' + Stalker2 7301 2 76.24 GATTGAATTGTCTGGTCTGGGGGATTAACTTGAGCAGACAAAAACATAAAAAAAGAAAAAA:1 - chr3R 15670318 5' + gypsy7 5001 2 86.89 GTGCCGGAGCTGAGAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 3817533 5' - roo 397 1 66.34 TTTGCCATTTACCGCAAAACAACAATGAAATACAAACTGAATTATTTAAAACCTGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAAC:1 - chr3R 17999055 5' - diver2 227 2 58.42 ATGGTAGCTCATAGAAGGCGCTCATGAAATATAATAATAATCTAACAATTAGTCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAG:1 - chr2L 3069342 5' + Doc 4549 1 56.44 GGGAGATGGGAGAAGTATCTGACTGATTCCTCGACAGCTGCCACGAATCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 16761349 5' - roo 402 1 69.31 CACTAAAAGCAACGCAGACAAAATACTCGGCCCCACACAACATGCATAAACACATGAAACCAATTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTG:1 - chr2L 14546925 5' + rover 105 2 61.39 TACCATCAACAAAGGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr3R 25097915 5' - P-element 2865 1 58.42 TGAAATTAAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACA:1 + chr2R 4830296 5' - Tc3 313 1 77.23 TCTAAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTG:1 + chr2L 11703226 5' - Tabor 460 2 53.47 CTCCTCGTGATCACGGCAGAACATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGATTCTGCCGCTCTTAAGCAATCGATTTTAACTTTT:1 + chr2R 5266865 5' + Cr1a 4258 1 78.22 ATTAACTTTAATGTAATATTTTATTTTTTTATTTTTTATTTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2R 7999658 5' - Juan 4171 1 69.07 GTTAATATTTTCGTAAAATCTGTTAAAGAATGTATGGAAAATTATATAAAAAAAAGAAGAGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTTA:1 + chr2L 15004792 5' - INE-1 552 1 77.23 ATCATTATAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 27981756 5' - roo 402 1 72.28 TCGGCNCCGCACTTGAAAGCCTCCTGGAACTCGGGAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTAA:1 + chr2L 16835321 5' + Doc2-element 4759 1 65.35 TACGANATGGAGGATGTTCATCGTCGACCTCAATGCGATTGGCCTAGGGACTCAGATTGCTATGATCAAATATAAAATTAACGACAGAATGCCGGAGTTGT:1 + chr3R 32042638 5' - gypsy3 6751 2 67.33 GTTCAATTGAGCAGCAAATTGTCATGGCAAATGTTCAAAAAAAAAAGTATATATGTATATGCCAGGTGTTTATTGTTGCGTGCGTTCGAGGTTTGTGC:1 + chr3R 19961309 5' - HMS-Beagle 6641 1 61.22 GCTTTGAGACTTAATCTACTTTAACATTAACATTAACTATGTCCAACCACCAAACTCACCACATGCAA:1 + chr3R 20485615 5' + HeT-A 5935 2 75.00 TTACCATTGGTTGTTTCGAATGACAGATTTGTGTATAGATAACAAATTAGTATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr2L 13136726 5' + roo 26 2 54.46 TTGAGTATTTTTATTTAACCTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAA:1 + chr2R 3591956 5' + Quasimodo 3 2 76.24 AAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr2R 12492351 5' + hobo 15 1 62.38 AATATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTA:1 + chr2R 13644412 5' - Burdock 240 2 64.36 CGAGCAGTAGCCTGGAAAGAAGCCCAGATGTTTCCCGAACTGCCGCTAAAAGGCCGAAGTCAAGCCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACG:1 + chr2L 3270980 5' + gypsy 384 2 63.37 CGAAAATGTCAGTGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3L 10143145 5' + 297 15 2 65.35 TGCCAGCTAAATGTGGATGTGCATTGCTTTTCCCAACTCGCTTATGTGTGTGTGTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAG:1 - chr3L 12301212 5' + flea 404 1 59.41 TTAAGAATTTAAAAATTTTTAGTCTGCTATTGAGCTACTTTAAAGTTGGTTGTTAAAAGCAACATAGAATGCCATAAGCGAGATCCCCGACTATCAGATAC:1 + chr3L 22957365 5' - INE-1 558 1 72.28 AAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr3R 10147891 5' - roo 9034 1 63.37 AAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 10203638 5' + jockey 56 1 70.30 GTCCAAGTCGGAGGAATACCGCCGTAGAACTGATGACACACCCGGGCCGAATGCTCGACTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTCGGTGTGGTTTTT:1 + chr3R 5777758 5' + Cr1a 244 1 67.35 ATTTTATGGAAAATACACTACGAGTATATACTCAATAGATTCGCTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 1281739 5' + roo 8695 2 60.00 TTTGCTAATGGCAACAAGCCATATCTCTACTGACTATAAGAAATTTTCCAAACGAATGGTACCAACATGCTAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACC:1 + chr2L 7684208 5' + Ivk 5123 1 57.43 TCATTATGATAGAATTTGCATAGAGTGGAGAGTGGATTTCTATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chrX 8684300 5' - opus 485 2 61.39 ATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chrX 10827417 5' - roo 9036 1 64.36 CGAGACACGGTGCTGAAAATCAACCGTCTGGCCACCAAGAGGCATCTGCTGAAACTGGATCACACATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACACCTG:1 + chr3L 9824958 5' - G5 4399 1 57.43 AATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATTG:1 - chrX 22945338 5' + BS 44 1 63.37 GACAAATCCATGCTAGCCCAAAACTCGGAGACTCTGTGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACA:1 - chrX 5269934 5' - GATE 8268 2 77.23 TTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 28063327 5' - roo 399 1 69.31 GTAAGGACCACATTTATGAATTATGTCACTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 + chr3R 12605620 5' + F-element 66 1 81.19 CTTGTAGGAGCGATGCGCCCACAGACGATGGGCACCGGCGGTAATGCCTAGGCCAGAAATGCCGTATTGAAGCTGCAAATGGGTTGCAAGGATACCTTCAA:1 - chr3R 12446033 5' + BS4 243 1 64.36 AGAAGACGTCCCTGCTCGGATAGATCAAATGTGATTTGCGGCTCCAGGGTCTCTCCGTCCTATATGGGATTTAATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACT:1 + chrX 10834639 5' + roo 435 1 79.21 GTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATATATATAGGTACAGTGATAAGCATCGCTACGCTGCAGGGTACGCCCGCAGC:1 - chr3R 3181116 5' - 412 299 2 69.31 TAAAGTGCAGCAACTATGTAATTAGCTGCCAAATCAACAAGCGTGCAAATTATCAGTGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAA:1 + chr2L 4147730 5' + gypsy5 355 2 60.40 CGAGACGGCGACGACATGGGCTGGCCAGGCATCATTTGTCGAGGGGGAGCTATGTGCATATATATATATGTATGTATATATATGTATATATGTATATATGT:1 + chrX 20400132 5' + G3 4507 2 47.52 CCGTTTGTTTTGCGCTTTTGTTTCGAAATCCTTTTGCTGACCAGCCCATCTAGAATCTGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGC:1 + chrX 2429941 5' - Ivk 5160 1 63.00 GCCTTTTGCTCAATTATTTGCCGTTTTGCCTTTTGCTTTGCTTTAATTTATTTCACACACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTG:1 + chr3L 16647315 5' + hobo 120 1 64.36 CAGAGAAATATCAGCAGTTCATTTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 27775163 5' - roo 9049 2 56.44 TTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGT:1 + chr3L 19951181 5' + Ivk 13 1 66.34 ACACGTATATGAAACTCCATCCTATATATATATATTACGAATATGTACATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chr2L 13334152 5' + flea 16 2 64.36 TTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGG:1 + chr2R 3919679 5' + 1360 47 1 69.31 TATAGAAACTAGTTTTAATTCATTTTTGCTGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAA:1 - chr2L 4571779 5' + P-element 12 1 45.54 AAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTTTAAATTTTTATGTCA:1 - chrX 3305193 5' + transib2 32 1 63.95 AGATTTGCAAATGGGTGTGTGTGAATTCAAATGGCAAACTAATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAG:1 + chr3L 12667207 5' - I-element 5173 1 64.36 CTGACTAAATCGAATTATTTTGTTACGACTTGTTTTCCTTGCGTAGAAAGCTGATATCTAATTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCA:1 - chr2L 3136611 5' - BS 5079 1 38.61 CACAATGGGTGGAAAACACTTTTCGCTTAAATAAGCAAAAAGTGTTTTCCACCCATTGTGTGTGGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAAT:1 - chr3L 14914578 5' + 1360 199 1 43.56 TAATGTGCCTGATAAATTACCTGGACAAAGTTGCATAACGAATCAGGCGTAAAGACTGGGGTTGGCAGACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chr2L 15947362 5' + Transpac 10 2 70.30 CGTGGCCGGGAGTTATAGACGAGGCCTATGGCAAGCGGAAGTCGGCGTTAGCTTACAGCACGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGT:1 + chrX 2799610 5' - Tirant 384 2 64.00 AATAAGTATTTGAGAAATAACGTATACTTTGTTATATTTGTTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 - chr3R 3060351 5' + opus 146 4 65.35 AATGGAAATTCCCAGGGAAATGGCCAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chrX 2776144 5' - 297 350 2 72.28 GGTGGTGGTAAAACTTGTTACACAAATGCGAGCCATCAAAGCAAGTCTGTTACAATCTCTCCCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATT:1 + chr3L 20530362 5' - Burdock 6093 1 58.42 TAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGG:1 - chrX 23108306 5' + BS3 1442 1 62.38 GTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACAC:1 + chr3L 10081929 5' + rover 6973 2 55.45 CAGTCCCACATGAGGAGCAGTGTACATAGCGATCAAGATCAGAAGACTAGGAGCGGATCGGATTAGCTAGGGTATTTGCTAGTTGGTTCGGGTGGACCATA:1 - 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Stalker2 7650 2 77.23 AAATTCAGCAACAAATGGGCGTAAAATAAATCCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACC:1 - chrX 5159565 5' + I-element 179 1 77.23 CAGGTATCCCCAGAAGGATGTTTTCAATGCAGCTTAGAAAAATTCCTGTTGCCGATGCAATTGTAGCCCGTTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCATTTTTTG:1 - chr2R 4550663 5' + hobo 7 1 67.33 TACTAAGAGGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr2R 2427624 5' + Doc 13 1 66.34 ATGCACCCAAAAAAGCAATATAAAATTAGTTTAAGGAAGCTAAAGTAAATATACATAAAATAAATAAATGAATCGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCATT:1 + chr2R 8236137 5' + Doc3-element 107 1 65.35 TTGCCCGTTTCGTGGTGCACAGTAGTCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTCTCCCCCCCCTTGCGTAGGCAAAG:1 + chrX 19396877 5' - Max-element 8210 1 73.47 ACCAGATGCCATGGAAGTCGAAAAAGCCAACGGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAGGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr2R 16333996 5' + P-element 41 1 38.61 TTGCGAGACCCCAACGAGGAGCATCAGTCGCTGGAATTCGTCGCAAGACTCGAGAATCCCTCATTTGGCAATCGTTTTATTTGAATGAATCCTATGTTGC:1 - chrX 18632304 5' - 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chr2L 6454785 5' - mdg1 381 2 65.35 CGGCGATAAAAAAAAAAGAAAATAAAAA:1 - chr3L 10864235 5' + Doc2-element 252 14 78.57 ACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chr3R 26321661 5' + blood 56 2 82.18 GGCTTATGCAACATAATCCTAGTTTATGACAGTTGGGGGTCCTAGCCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:2 - chr2L 13319668 5' + hobo 7 1 70.30 TATCATACGAGTGTGTCCTCCAGTGCTACTCACATTGAGTTTCTTACTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCT:1 + chrX 8548575 5' - transib2 2439 1 53.47 CACAAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 11263380 5' - roo 391 2 61.39 ACGCTCATCTGCTTAAGCGGAAAAGTGTTGAAATTGTTTCGCGGTAGGGTAGAATGCACAGAAGAACATAATTCCCTTGAAAAAATGATTTTGAAATTGAT:2 - chr2R 22524434 5' - Stalker4 6862 1 36.63 AAATACACAATCTACAAAAATTCATCTTCATTATAATGCCTGGTGGTATAGTCATTTTAGTAAAGTTACGATGTTCAAATACTCAAGAGCAGCAAAGTGAA:1 + chr2L 17365339 5' + Stalker3T 264 1 57.43 ACTTCCGTTTTCAACTGTCGCACGCACGTAAAACTCAAACATAAACTTGTCCATTTTTCACTCAGATTCTGAGAAGGAAATAATTTCACAAGAATGTGAAA:1 + chr2L 18429147 5' - 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chr2L 21635370 5' + F-element 460 1 80.20 TACGCATTTAATCAAGTTAAACTACAAGATTACTTTTCCGGTGCATAAGCATGGGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGGATTTTTCCTTA:1 + chr2R 19020560 5' - F-element 4438 1 60.00 GCCACCCTGCGGTTGCTTTGTGTTTCGTGTGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2L 12949265 5' + 412 46 2 69.31 TGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGT:1 - chr2R 4483270 5' + Ivk 31 1 52.48 GTTGGCGATAAAGTACAGTTTCTGTGTTTCATTGCTGTGATTCTGTGGTTGCAGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAAAATTTT:1 - chr2R 23571708 5' + roo 22 2 56.57 AACGGAAATATGTTTTGTAGGCCCGCTGCACATGGCAAGCAAACAACTTGGCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTA:1 - chr2L 18430179 5' - copia 258 1 78.00 CATAATCCCCGCTCTCTTAGCACTCTCTTCGCGCTCTCTTTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTC:1 - chr2R 22402142 5' + diver2 185 2 65.35 CCACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr2L 14790597 5' + roo 8713 2 76.24 CACATTCCGGACAGGGCTTGAGTGCTGCTTGCACATAAAACAGGTGTTAAAAGTTATTTTTTTTATAGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTG:1 - 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P-element 2875 1 66.34 ATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTAACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chr2R 12492387 5' + hobo 50 1 72.00 AAGTGCAGAATCTTTGCATTGAGCATTAAAGCGGATACCGCTTTCCCACTTTGTGAAGTTGGCTCCAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTG:1 + chr2L 21314652 5' + F-element 414 1 63.37 TTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr2L 21683390 5' + pogo 20 1 59.00 CTTTCTAGGCCCGGCTCAATTCGGCTAAAGTTACTGCGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTGCTGAGGCTGG:1 - chr2L 3594984 5' + G-element 241 1 74.65 AATGTNACGGAATTTGTATTGAAAGAAGGCCGGAGGGAAAATCCATTAAGCCCATTCTCCAGGAATGGCTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCA:1 + chr3R 20147865 5' + 1360 259 1 61.39 TAAGATAAAGTATATCAATTTATATATTTTTGGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr2L 2078453 5' + I-element 46 1 74.26 TGCACTTAAAAAACTGCCAGCATTTTTGAATATATAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTAC:1 - chr2R 20952617 5' + rover 6 2 65.35 AAACGGGTTTCGGTAATTAGCATGCACATCAGTGACCGATGATCTGCATTGACGTATTTGCCGTGTTTGGCCTGTCATGTATTTATACATATGTACATA:1 + chrX 759674 5' - 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chr3R 8277954 5' + P-element 51 1 28.71 GTAACAAGTAATCGAAAATAAATTTGCATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 + chr3R 26321634 5' - blood 332 2 72.92 AGTACAACTTAAAAATGTATTGTTACCAAAGAATTCTATTTAATCCAATAGGGAGACCCATTTATTCATATTACCTATACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr2L 13136833 5' - roo 409 1 78.22 GCCTGGGGTATTTGCATCCACTTTGGCAGCATAACTTTTGGATTCACTAGCACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr3L 8614477 5' - opus 480 2 53.47 TTTTCACTTAGTTTCGCTTTTGCTGTCTGGGCTTGTTGCCGGAGAGCGCGCAATTCGCGTTGGCTCATTTTAGAACGATCGATTTGCTCGTTGTCTATTT:1 - chr2L 18225994 5' - Doc3-element 189 1 68.00 TGGGCTTCTTAGAGCTGTAAAACATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 + chr3R 20878427 5' + 297 6580 1 72.28 GGTGTGTTTCTGGGCATGTTGGATAATAGTCGCTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGCTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACGTCA:1 + chr2R 1649588 5' - Tc1-2 310 1 71.29 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTTGGTTTTGGCATGGGGCTTTTTTGCTAGAAACACTTTCGGTGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 + chr3R 9418243 5' - Tabor 7313 2 67.33 TCACACATGTTCTTAATATTCTATATTTTGTTTGTTGCGTTTGAAAGCTAAGAAACCAAACCGACACCAAAAGGTAATAAAAACAAAATTGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 16286711 5' + gypsy2 424 1 58.42 TAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:2 - chrY 311342 5' + 1360 13 1 50.50 AGCACCTAAATTCCGCCTTGAATATTCTCTAACTAAGGCTAACCCAAAATTTGGCTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 + chr3R 26137543 5' + 297 6638 2 57.43 ATCGAAAGGAACTCAAAGGACGTACACTGAATAACGCAAGAAACTCACAAAATATATGTTGTTGAAAAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGC:1 + chr3R 21335402 5' - F-element 4324 1 73.27 AACGAGATAAATTTAATTGGAGGCAATTTGTTGCAAAACATATGAGAGAAAAGTTGCCAAGAACACGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGATCGTA:1 + chr3R 28700013 5' - accord2 7224 1 69.31 GGTCCTTTCCCGGCCCACTCCCGACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACC:1 + chr2L 15330693 5' + G2 2922 1 77.23 ACAAAGAAGGAAACTCAATGAATTTTTCATAAAAAAAATCCACACTCAACTTTTACACACACGCATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCA:1 + chr2L 3752722 5' + P-element 2774 1 70.30 ACTAAAATTTGTTTTACTTATGATTTAGAGCGAAATTAACTAACCAAAAGACCATTCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATA:1 + chr3R 7191247 5' - F-element 4619 1 61.39 TGCCACAAACTGAATCACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr3R 4601300 5' + opus 20 2 59.41 GCCATCCGCGATAGACTTGTTTACATTCTTTGGCCTTAAACAAAAGCATCTATCCAAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACAATAAACAAAAGAAAAAT:1 - chr3L 13168813 5' + Porto1 189 1 54.46 GGTATAACAGACTATACTAGTATAAATAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCA:1 + chr3R 19460778 5' - accord 182 2 73.27 TGTTTNTACCATTAAGATGAACAAGAAGATGAAGAGAAAACAAAACAATAGAGAATACAATATTCGACTTCCCCGACTATTGGATACCCGTTACTCAGCTA:1 + chr2L 9293144 5' - INE-1 544 1 67.33 AAACAAAAAGCGGTGCAGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr2L 8565555 5' + blood 7014 2 82.18 CAAAATGTTTTCTGCATATCGATAAAAATGGACAAAACAGCTACAATAATTTAATCCAAAAAACGCACGGACGGTCAGACCAAAGACACTAGAATAAGAAT:1 + chr2L 17361822 5' - Tc3 311 1 76.24 AATTTTAATGAAAAAGCTCGACCACCTGGAAGAGGAAACGGAGAACCTGAAGGACTGTTTAAAATCGTCTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAA:1 + chr3L 8141754 5' + P-element 2584 1 72.28 CTCTGGCATTTCCCAGCCAAACCTCCAATTTCCACCCCCATCAAAGATACAAAAGAATCTTTTATGTTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 17844111 5' - roo 8984 2 38.61 ATTAATTCTTTCAACTTGCAGTCTGAATGAAGAGAATGCATTTAGACACTTTGCAAATTCATTTCGCTAGCCTGTTCCTTTCCATAACAAAATAAATTTCA:1 - chr2L 794774 5' + 1360 362 1 76.24 TGTGCTGGTGTGTGTGTGTGTTGGGTGCATGCAACGCTGTTTTAGTCCTGGCAATTCCCGCTTATGCTGTCCAGTGACATGTTAATTGCAGCCCATAAATA:1 + chr2L 19702741 5' - rooA 52 2 60.40 CAAACGAATTCCAAGAAAATTAGGCCTAGGAATTTGCTGTACGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 27430083 5' + pogo 33 1 59.41 CCATTTATTTTGTAAATAAATATATAAAAATATATAAAAAGGGAACTAAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 + chrX 17057933 5' - 297 370 2 60.40 CAGAAACTTTTCTAATAGCCACAAAAACTTAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAAAAGATTCAAACGCAGAACTCCAACAGAATTAA:1 + chr2R 12251178 5' + Porto1 4534 1 77.23 TGGAAGCTCTGGATATCCTGCCTCTCTCTGCTTTGGCCAGGCTGAATCTCCATCCAATTCCTCCAACTCTTCTGCTGCTGATCCGTTATTTGGCGGTGAAT:1 - chr3R 29702459 5' - invader3 460 1 77.23 TGCCCGTGAATAAATCGCAATGGAATAAGTTTAAGAAATTGCGATAAACAGCAACAAAAGCGACTCAGTGTGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATGC:1 + chr3R 26967052 5' - accord 179 2 58.42 AACCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 6888584 5' + jockey 23 1 62.38 AAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 7488928 5' - roo 9042 1 62.38 TCTCCGAAAAATGTTCGATTCCAAAACGGAAGTTTTGCGTCTTTTTAGCTACAAACACATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 2753813 5' + roo 18 2 61.39 TTATACGCAATGTAAGCCTTAAAAAAATTGCAAATAACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr2L 13574297 5' + pogo 7 1 65.98 CCATACTTAAAGTAAACACAACTTCCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAG:1 + chr2R 3116749 5' - Tirant 444 1 75.25 TGTATATATGCCTGGGGTATTTGCATCCACTTTGGCAGCATAACTTTTGGATTCAATAGAACTGTTATATAAGTTAACGCAAGTTCCAGTTGCATC:1 + chr3L 8614468 5' - opus 7497 2 63.54 ATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:2 + chr3R 14917179 5' + HMS-Beagle 6819 2 56.44 TGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAG:1 - chr3L 18337686 5' + Juan 4078 1 77.23 CCTCTTACAGGGAATTTCGAATGCCCACAAACCCCCAAAAGCTGCCACGCGCACACTTTTAAAAAGTTTTTGAGATTTTTTTTTATTTTATAGATCGGAAG:1 - chr3L 13698167 5' - HMS-Beagle2 288 2 71.29 TTTTATTACATCACTTTTTGTGAACATTTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAAT:1 + chr3R 9995377 5' - Max-element 251 2 70.30 TTTGGGAATTGTCTTCCTATTTTTTATAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCG:1 - chr3R 19446234 5' - 297 6954 2 58.42 GTTTCTGCCACTTTTACCAAACTTATTAGAAGGATTAAATCGTTAAATAAAACTCCAACCAGGGAGAACGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chr2R 5201623 5' - INE-1 557 1 65.35 ACTTTTGAAAACAAGTGCATTGAGGATCTATTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr2R 9854046 5' + pogo 48 1 72.28 CGTTGNGGTTGAGGCGTTCAGGCTGTCTGGCTGTCCGCCTGTCTGGTTTCTCCGGCAGATGGCGTGCCCCACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGGCTT:1 - chr2R 22244138 5' - G-element 3902 1 66.34 AACTTTACCTGGCACTTTAACTTTACCCCCTGGCAGATTAGTCCCAACATAAACTGGCCACCAGATTTGGTTACACCATAATTAAGGAACAGAACCCATAA:1 - chr3R 23227207 5' + G5A 2753 1 77.23 TTAAGCGAAATGCGTAATGATGCGTGGCGCGGGAGACTTACAAACAAAACTTGTCATCGAGACAATATCAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCA:1 + chr2R 544317 5' + Doc3-element 4503 1 61.39 AAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCC:1 - chr2L 18279944 5' - gypsy5 357 2 77.00 AATTTAAGTTTGTTGTGTTGTTCACTTATTAATTTAATTCACTTATAATGTTTGTTATTCACTTAGTTATAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTT:1 + chrX 8823734 5' - I-element 270 1 77.23 TCTCTNTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2R 10444286 5' + P-element 50 1 28.71 GCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTT:1 + chr3R 9131762 5' - roo 9036 1 61.39 AAAGAAATTTTTTGTTTCTTTAAATTAAGTGCCGTAAACGAAATTATTTAATTGACCAGCGTACTTCTTAGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTAAA:1 - chr4 625877 5' - jockey2 3326 1 75.25 ATACAACGTAAATATAAATTTACATATCAAATTGAAAAGAAAAAAATCGACTAAAAAATTATAACTTAATAAGAAATTTACCCTCCCTTAGCGTGTATCAC:1 - chr2R 5526138 5' - Tc1-2 1343 1 70.30 TCCTTTGTGTGACCAAAAAAAAGAAAATAAATAAAATAACAAGGCGGCATCGACTTTCCCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGCAAAATCGAATTTT:1 + chrX 16749098 5' + FB 15 1 62.50 TCAATCGCATTAGTAACTAATTAATTTATACATATATTCTTAATAGTGATTAATACCCAAGTCGATCTGGCTCTGTTCGTCCGTATGAACGTTGAGATCTC:1 + chr2L 22724115 5' + INE-1 134 1 53.47 ACAGGTTGTATGATCTCTTCCGTGACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 14675540 5' - roo 9044 1 56.44 AAAGTACACAAACACAGACACTCTCGTCTACCGACGATGCACTTAAGATGGCCAATCTAACGAGTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAAC:1 - chr3R 22782050 5' + copia 13 2 66.34 GCTGGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATT:1 + chr2R 4547737 5' - HMS-Beagle 7034 2 71.29 AAAGGTCAGAAAGATTGTACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3L 12103756 5' - roo 408 1 78.22 ACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTT:1 - chr3R 2533957 5' - gypsy8 4817 2 57.43 CACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3R 24081600 5' + 297 43 2 77.23 TCTCTCGTTGCCCGTGTAAATAGCAGGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 31101356 5' + 297 6591 2 55.45 ACGGAAGCATTGAAATTGATTTCGCTATGTCTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTTGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAG:1 + chr2L 5120759 5' + invader4 2712 1 65.56 CATCGGCCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 - chr3R 4544076 5' - flea 232 2 57.43 AGTTCTCACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr2L 17722749 5' + blood 10 2 66.00 TTTATGCAAGCATTTCAATTATATACGAATACTTCTAGTTATTTTATGTTTGGCTAGAAAATCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3L 15100764 5' + pogo 11 1 67.33 TGCTCGACAGTTACGAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAAC:1 + chr3R 6735259 5' + copia 23 2 58.42 TATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 19377782 5' - roo 9026 1 69.31 GGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCAC:1 - chrX 21994003 5' + McClintock 6 2 72.28 GTCTCTTGATGCATTTCGAAGATATGATATTTGAGCAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 - chr3L 23953534 5' + 1360 3261 1 65.35 TATGTTTTGTAGGCCCGCTGCACATGGCAAGCAAACAACTTGGCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 - chr2L 18430171 5' - copia 249 1 69.31 GGATGGGAGGATTCTTAAAACTCCACAAACCTGGTTGCGGGGAAGCGGCCTAGTAACAGCGAAGACGGCTGGAATGCAATCGCGAGCGGCACGACGTGCAT:1 + chr3R 2446798 5' + G5A 2497 1 78.22 AAAGANACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr2R 11528068 5' + P-element 38 1 42.57 CTGATGTTGGGAATTAAAATGTTGGCTGATATTAGCAAGGTCGAAGCTAGAGCATCGCTGGGTGATGAGTCATGCGACCTTATTTTGGATAGCCTGGATCC:1 - chr3L 23823235 5' - X-element 4285 1 72.28 GCCATGAAGTTAGTAAGCACTTTATTGCATTTAATAATAATTTCTGTTTTTTGATATTGTTGAGCTGTAATTGTTTTACAAAATGTAACAGGTATAGATGT:1 + chr2L 9523880 5' - Stalker4 396 1 60.40 TTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 23456283 5' + 1360 1 2 73.74 TTTGGGCTTACCTTTAACTATTAACTTTAATACAGTTGATTGAATCGCTTTTGGAACGCCTTGAGGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATA:1 - chr2R 24628847 5' + mdg1 7051 2 66.34 CATCCCGGCATCCCCGGCCTCAGCAATGACTCCTCAGCCTCACCGGCATCAGATTTCCCAACTATGGTTGCGCCCATCTAAACAAAACAAAAAAAAAAAG:1 + chrX 15277073 5' + Porto1 164 1 59.00 TACAAAAATTTAAAAAACACCTAATAGACATTCTTCTTTTATATATGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTG:1 + chr3R 12589012 5' + Max-element 8270 2 61.39 GTGAANGGCAACATTGGTTGGTTTCACCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr2L 8308200 5' + P-element 47 1 22.77 ATATTTCAACGTTTGCCCATGTGTTTATAATCTTCCTATTCATATTTTAGCAAAGCCCAAAGCAAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCC:1 + chr2L 18814527 5' + springer 7305 4 64.36 GCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCGTTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr2L 12815099 5' + hopper 35 1 57.45 ATAAAGTGAAAACTATACGAGCAAATCAATTTCCTATAAGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 12082344 5' - mdg1 7421 2 61.39 CCAGGTAGTCGTACTCCTCCTCGCACAAAATCTGAGCTCACACACACACGGACAATCAATGAAGCGCAAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAATCCTAGGG:1 - chr3L 18985564 5' + Doc2-element 4639 1 64.36 AAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCT:1 - chrX 706056 5' - Juan 14 1 79.21 CGTGCAGATGAAAACAAAAAATAAAGCAAATTCATCAATTATTTCAGTAAAGAAGAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAAT:1 + chr3R 19446714 5' - Juan 46 1 53.47 AAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr3L 7075934 5' + roo 8708 2 75.25 GGCAGGAGACTTTAAACTTGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 4801493 5' + roo 18 2 61.39 AAAGGCAACAACTGCTATTACAACTGACTAGATCTGTGTGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGG:2 + chr3L 12997757 5' + F-element 4339 1 61.39 GCGAGATCGAGAGCTCGGCAGGTAGGTCAGTTTTGGCTGCTCGAAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAAACCTTCAACATCTTTAATTAAAA:1 + chr3R 8171526 5' - invader2 4633 1 56.44 GGCAACTGCTTTTTTTTTTGTTTTTACTTTACTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTA:1 - chr3R 9228467 5' - F-element 4646 1 84.62 ACTCTTTTTGGTTTCCTGCAATTGACAAAGCAGGTGTGCAGAATAAATCTAAAATTAAACAGTTTGTATATTCGATAAATTTTTCTTTTTTCTTTTAATTT:1 - chrX 8984331 5' - Doc 4699 1 50.50 ATAAACGATTCTAAGAATACAAAACAAAAATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:2 - chr2L 21174306 5' - roo 9048 2 56.44 GATCGNTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2R 4802884 5' + 412 23 2 45.54 ACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTATTTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGT:1 - chr4 1294992 5' + TAHRE 85 1 48.51 AATTATCCAATAAAACTTGCGAGGCAAGACCACACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGCCTTGCTCTACA:1 - chr2L 7105702 5' + F-element 4223 1 64.65 TTATCAGGCAGGGTGATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:2 - chr2R 7775807 5' - Transpac 5205 2 54.46 AGGCTAAGCGGCAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr2L 18212110 5' + 412 12 2 67.33 TAGCACAGGGGATTGCAAAATATATTGCTGCACAGAGCATTGTATAAGAGTGATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTA:1 + chr3L 25960714 5' - Cr1a 4320 1 51.49 TTGTACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 + chr3R 20137261 5' + Burdock 28 2 56.44 CGAAATTCATGTTTTGTGTAAGCCATCGATTTCCGTCTGTCCGTCAGTCCGTATGAACGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATTCA:1 + chr3L 22962116 5' + INE-1 166 1 70.30 CTTTGTCTTCTTCTATTTCGTTATGGCCGCCAATTGAATTTGGTTTTATTGCATTTATTTTATTTGTTACTTTATTTTTGCTATGCTGGTGGATTTAGCTT:1 + chr3R 6504296 5' - HeT-A 286 1 58.42 AATAGAGCCTTTTTTCTTGTTTTTACATGGTGCCAATTGATCAACAATAATATTGATTTAAAGTTTAAATGAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCA:1 - chr4 103164 5' - 1360 183 1 79.21 TTACCCAAAGGCAAAATATTGAATTACATTCAATAATATAAAAAAATGGAATTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:2 - chrX 23283045 5' - HMS-Beagle 224 2 54.46 AATAAGTAAAATGTGTGTGTTCAAAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2R 7868897 5' - roo 9039 1 64.36 CAGGAAGGCCGTGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGT:1 - chrY 996322 5' + invader1 101 2 72.28 CGTTTTCTGACTGTTTGCCTTCTCTATCCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTAC:1 + chrX 22413359 5' + gypsy5 6939 1 72.29 AATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 12324030 5' - roo 9042 1 56.44 TTAGAACCATTCTCTTACATATTTTATGTTGATTACATTTCTCGCAGTGCCCGTATGTAGATGATTAGTTCACTAACATTTTTGTGTATGTTATATGTTTT:1 + chr3L 15229698 5' + transib1 316 1 67.33 TGCAACAAAGCTGATGTTCCCGAGGATCGTCTCAGCTGCAATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAA:1 - chr2R 21826801 5' - Quasimodo 6976 2 60.40 GTTTCTCTGGGTTTTGCCCCGAGTTCGTTCCCTTATAGGCAGGCTCCTTTCTCGATATCTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 + chr2L 18251006 5' - I-element 5336 1 50.00 ATCGGATTGCGGCCCAGGGTAGCCTATTCATGCCCCGCTCAACAACCGAACAACAAATATTTTACATTATATTATTTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCT:1 + chr3L 14142709 5' + Cr1a 4345 1 55.00 CAAATATATTTAATCCACAATCATTTTCTTTAAATTAAAAAAAATTAAGGTGTCAATCTTTTTTTGTTAAAGGTTTTTTTTTTTATTTTTACTTTAATCTT:1 + chr3L 11409942 5' + TART-C 10786 1 81.19 TCATTTGTGAACTCTGTTAGTTTTTCGTTCAGTGCTGGCTAGTGTCTGTGTTTGTGGACGTGTACGTGTTCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3R 20477141 5' - 412 7539 2 68.32 AAAGCTCTTTCAGCATAATAAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTCGCTCGGCTCTTA:1 - chr2R 20147813 5' + accord2 162 2 75.56 CCAAAGAACATTAAAAATTTAAAAATCTACCCAGCTAATGGTAGTTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTG:1 + chr2L 19525422 5' + FB 31 1 58.42 CTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 21092463 5' - roo 9024 2 73.27 ATATTTTTTTTTTTGGCATACAAAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chrX 19330913 5' + jockey 4701 1 51.49 TTAAGTTGTTTGGCCGATTTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chrX 13761327 5' + pogo 19 1 61.39 CACTGATGTCATAATAACAATAATAACAAGAACAACAACAAGGCAAATGAAAACAGAAGTAACCAAAATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATT:1 - chr3R 20998476 5' + flea 318 1 69.31 ATCGACTCAACTACTAGCTCATTCATTAGCATTGATAACGATTGCTTACCAACCCGTGCAATAGCTGATTTTAACATCTGATTTCTTTGCCGTGGCGCCAT:1 - chrX 22795972 5' + Transib-N1_DM 363 1 47.52 AAGTAAACTCATTACCAATGCAAACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATC:1 + chr3R 32005849 5' - invader4 323 2 76.24 GTTATCAACCAAGAAAAGTTTAAATGAAATTAGGATTCGGCTGCACAAAGTCCGCCAGAGGAGGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGA:1 + chr2R 5805724 5' - P-element 2815 1 68.32 GCGGCAGGCAGACAATCAGACAAGACCAGTGGATTCTGTGGAATGAGTGGTAAAGGGGTAAAGTTCCATGGCTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTT:1 - chr2L 14579933 5' - copia 253 1 73.74 GGGCATATTACTAATAATGTGCTACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCG:1 - chr3R 19346996 5' + blood 7010 1 80.20 GAGCGGCAACAACAAGTGGCTTCCATGAAGAAGTTCCGCCGATTTTGGTCTTTGTATATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 + chr2L 18212115 5' + 412 7070 2 61.39 CGATATGTTTTCACTTATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr3R 8313145 5' + 297 7 2 72.28 ATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr2L 4160122 5' + Tirant 8138 2 54.46 TAAATTTCAAGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chr2L 12325038 5' - jockey 4953 1 65.35 ATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 7522318 5' + blood 7060 2 71.29 GAAACGAACCACCTTCATCCTAACGCTCTTCGGACCCCCATCATTTTGATTATGTTCACTTTAATTGCTTTGCTGGGTAAACGCAAGTGCCCAAAATGCTG:1 + chr3L 18547250 5' + HMS-Beagle2 6942 2 76.24 TATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGAAAG:1 - chr2R 8505075 5' + Idefix 6913 2 67.33 TTTCGGTGCAAGAGCAATTAGAGAAGTGGTCCACCAATGGAAAAATCAAAGGAGCCCACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAA:1 + chr3L 513524 5' + Doc 4426 1 63.37 AAAAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 10203615 5' + jockey 32 1 49.50 ACCGAAGGTCTCAAACGCGACATTATTTGCATGCCAACAGGCAAAAATTCGGGGAGAGAATGGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGG:1 - chr3R 16290267 5' - I-element 5077 1 63.37 GGGTGGGGCATTGTATTGTTGCCATTGCTGTTGATAGTTTTGTCGGGGTGGAATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAA:1 + chr2L 3445385 5' - mdg1 400 2 57.43 AAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1 - chr3L 18706921 5' - jockey 4941 1 70.30 GGTTAATTTTATTACCTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 - chr3R 4601409 5' - opus 7496 2 74.26 TATTTTTATGGCTTGGCTTTGTTTCAGACACTGGCGCAGACTGCCACGCCCTTGTGCGTGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCTAAACCCCCACGCCTAC:1 - chr2R 18031899 5' + Tirant 16 2 59.41 TAAAANTTCCAACCATACCCCTTCTTGGTGGTCTGTTTTAGCTATGCGGCGCGATCCATACGATACAATATACGATTCGATTAAGTTAAAAAGGCTGTTAT:1 - chrX 16195779 5' - pogo 123 1 80.20 ACGGGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTGTTTGGGTGTCTGTGTGTGTCTATGCGAGAGTGTGCCACTTTGTGCTGCCTGCCTTTCTTTTATTTTATTTTTTATA:1 - chr3R 6144912 5' + transib1 1903 1 77.23 AACGGCTCATCCAAACGTAGACACAGTATTTTATATAGCTTTGTGAGGAGTTTTAAGACTCTCCACAAATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCG:2 + chr2L 23332208 5' + gypsy8 37 2 89.11 ATTGAACTGAGGCTGTGTAATATTTGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAA:1 + chr2R 2943227 5' + 1360 3324 1 75.25 GATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 15305623 5' - roo 9055 2 62.38 TGTTGTTTCCTCACGGCGCCTGTGCGCTCGGAGGTGGCCGGTGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCCC:1 + chr3L 25783551 5' + accord2 217 1 60.42 AGAGCTAGTTGGGTAAAGAGTTTAACAACTCGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 + chrX 19116848 5' - opus 484 2 69.31 CGGCCATTTATCCTTGTCTATTCACTCATCGCCGAACCGCTATGAAAACTACTCCGCAAAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2R 4877787 5' - roo 336 2 74.16 AAACCAAAAGAGAAGTGGTTCGAATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAATAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3R 20149729 5' + 1360 52 1 75.25 CTTTTTTGGCTACCTTAATGTGATTGACATACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGACCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGAT:1 - chrX 8310245 5' + Stalker2 129 2 70.30 TTACTGCGAATCGAAATTGGCCAAAAGTAAAACCGACAGTGGGAAAATAGATACGGTCTGCAGAAAAATCAATGGAATTAAATAAATTAAAATAAATAAAA:1 + chrX 10322143 5' + F-element 89 1 51.49 TCACACCGTGGCCACTCCCCCTCCTGGGGTGGTGGCGAAAGGGGTGGTGGTGTCGACGAGAGGAGGACGGAGAAGGGTATGTGAAGGGTCAAGATGCCCCG:1 + chr2R 1010475 5' + gypsy8 4495 1 54.46 ATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 - chr2L 10793201 5' + I-element 51 1 78.22 AAAACAAAATATAATGCCATCCCAGCTCCGGGGAGGCCAGTCTGCGAGGCGATCTATGTATATGTATCGATATATATACCACGAAAATTCCGCCATCCACG:1 - chr2L 17444111 5' + G2 2769 1 78.22 GCGGGGCGCTTATGCTGCTACTGGATTTCCCCCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 + chr3R 22431084 5' + Max-element 39 2 65.59 CTACTTTTTTCTGTATCCTAACTTTTTGTTTGTATCTCTATCTATCTCTATCTTTGCGATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACGAGTCA:1 - chr2R 18103926 5' + ZAM 105 2 58.51 TGTGCTTGCAAATAAACTACGGAAAAGTCATTTTTCCCTATTTCAAAAAAGGTTAAGCTAATCGCTGGCGAGCCTCGTGCAGTAATATTGTACTCTAGATC:1 - chr2L 20389599 5' + Dm88 4510 2 74.26 ATGGCAGTAACTATATGCAACTAACAGTGAAGTGCAGCGCAGAAGACATGCGCAGAAAAAAACGAATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTTTTACTGGCTTT:1 - chr3R 17666340 5' + Doc4-element 2509 1 60.40 CGACGCTCCATTTATTCCGATGCTGCAGGCCGGCGTTGTGTCATTGGACCAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTA:1 - chr2R 3586620 5' - Quasimodo 6963 2 50.50 TGGATACAGGCTGGTCGAGGTCTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACTTTATAGCTTTTATAGTTCCTGCTGTCTCGACGTTCATACAGACAG:1 + chr3R 20749876 5' - INE-1 131 1 78.00 AGCAAAGCGACCAGAAAAGTATAACCAGCAAAGATGGACCCATGGAGAACGGATGCGAATCGAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCG:1 + chrX 13560144 5' - GATE 8275 2 72.63 CGCGAGCGAGATGGGGACACTCCACGATACAGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr2R 10543433 5' + P-element 46 1 32.67 TTCCATGCCGGACCAACTCACATGTGTGCAGACACTCATGGTTTCGAGGGGACTAACACTAGGCCTACTAGATAACACCAGCAACCGAAGGCGCCTAAGAA:1 - chr3L 16588957 5' + G3 4439 1 48.51 GCTTTGCAAAAGTGCATTGTGTAAACTTGATTTGGTTTTAGAGTGTTTTGTTGGAATGCCTATGAAGCCTCTTTATGTACCGATCGCTGCACTTCTTTATC:1 + chrX 5921061 5' - G7 944 1 58.42 ATTGGGCGAAAACACGTGGCCAGATAAACATAATATACAGAGTGGTTCGCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:2 + chr3L 10477538 5' - copia 229 1 53.47 ACAATTTTAATTTGTATGTATTTTAAAACAAGAGAGAATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr4 1156242 5' + blood 7050 2 71.29 GTCAATATGTTCAATGCTTGCTTACCTCATTCAAACCTCCCTTTTTCAGCTTAGGTGACAGTCGACAACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAA:1 - chr2L 74576 5' + 1360 196 1 57.43 ATTGTGGTTATGAAAAGTATTATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 - chr3R 29259648 5' + pogo 27 1 53.47 TTGTCTGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chrX 16995098 5' + jockey 31 1 54.46 TATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATA:1 + chr3R 4970558 5' + diver 46 2 68.32 GAATACAAAACAAAAATATTGTAAGCTAAAATTATGAATTGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:2 - chr2L 21174292 5' - roo 9034 1 64.36 CCTAGCCCACTGACACCTTGCTCGTCCACGCATAGATGATATAGACGCGAATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr3R 25097830 5' - P-element 2871 1 57.45 GGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:2 + chrX 17968370 5' + Tirant 8148 2 68.32 TACCATAAAAACTGTAAAAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGGCCGCTGTAGCTGTTTACGTGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGA:1 - chr2R 4578517 5' - Chouto 492 1 79.21 TTAAAGCTAAGAAATTTACACGATCAGTTGGTAAAAAAATCATTTGAACTTCAACCCCGACGGACGTGTTTTTATCAGAGCTCCAGTTATTATCGAAGTTT:1 + chr2L 14818454 5' + Porto1 40 1 68.32 ACTGACCCAGTCAATATGCCACGGCACTTGTGCAGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATA:1 - chr2L 14303750 5' + I-element 209 1 66.34 CGAAATTTGCACTAAACGACGAGAGATCTTTAATTTTTATGTAAATATATATATGTATATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATAC:1 - chrX 21292680 5' + rover 6967 2 62.38 ACAACTCTTCCCTCTCTCAAAGGCAATCCATTATTGGCCAACGAACCTGTTGCATTATCAGCTTTAGTTAACTGATAAGGCCACGTGCATTGGTTAACGTA:1 + chr3R 31196632 5' - Transpac 440 1 78.22 GCACCCACGCCAGTCGCCCCTTTGGTACTCCATAGCCAGTAACACTCAAAAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACCCACTGTAATCAAAGGCAAAA:1 + chrX 18147314 5' + HeT-A 5999 1 60.40 TTATGGCTCCTGCCTGATATATATAGAGAGTTTAAGTCGATCCAAATGTCCTCTACAAGCAACAACTCAACTCTCTCGTCACTTATTGGCTG:1 - chr2R 4237153 5' + Fw3 3007 1 67.39 GCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGC:1 - chr3R 13582271 5' - BS 5050 1 68.32 CTCTCTACACTTACGGATTAATGGGTATTCACGATGAATGATATGAGTTTGTGTGGCCCTAATAATTATCGTCGGGTTGGCATATCATTACGACGAAGT:1 + chrX 11971029 5' - Fw2 3802 1 61.62 GAAGTCCATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGAAG:1 - chr3R 3320513 5' - 1360 3352 1 77.78 GTTGAACAAAAGCTATGCGAAACCGACAACGCGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCT:1 + chr3L 13240649 5' + Doc2-element 365 1 77.23 CGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chr2R 14778511 5' - mdg1 393 2 54.46 TGAAATGAGCCAGCTGGGATTTTCTTATATAAATTTAAAATGTTGTCTAAAGAAGAAATAGCAAAACATATTAAAAAATATATAGACAGACTAAGAACACA:1 + chr2R 4426797 5' + G4 3613 1 53.47 AAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATCTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 - chr3R 7388398 5' - HMS-Beagle 6999 2 68.69 CGGTTACTGCCAGGCCCTTCCAACCACCCACTCACCTATCGCCTGGTTTCTGGTGAAGAGATAGTCGCTTATACTTTCGCCTCTTTAAATTTATT:1 + chr3R 16315572 5' + hopper 327 1 58.95 TTTCCAGCATTTCCCATTTACACATCGCACACAACAATGGCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGTCCCCATG:1 - chr2R 9184040 5' - flea 274 1 71.29 TAAATTCATTGCCTAACGACACTCCTATTTTATGCTCTTGAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGAT:1 + chr3R 1227090 5' - Cr1a 4264 1 60.40 AAAGTTTTCAATGCTAATTTCCACTTTTATAATAATTTTATATATGCAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 + chr2R 22478066 5' + Burdock 32 2 59.41 GGGCATATTATTGCTAAGGTGATTTAAGCACATTTTAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCAAACAAATTTGACAAAATATGCCCTTCAGCTTAG:1 + chrX 3423519 5' + 1360 215 1 61.62 ATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2L 7488857 5' + roo 32 2 60.40 GTTGAAATGCCACCAAATTCCGCTGAGCACTGAGCACTGAAAGTCGAGTTCCTGCCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chr3R 5686128 5' + P-element 20 1 59.00 TGGGCACATTTTTAGGCACCCCTTCTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chrX 13761258 5' - pogo 2061 1 73.12 TGTATGTCTGCCGGACATCTGCCGGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACT:1 - chr2R 7552340 5' + gypsy3 1 4 78.22 CACTTATTTATTTACTTAGCTGTTTTGTCCTGCTGCTTTTTTCTACGCTTTCGCCGCACTTCGATTAACGCTTTTTGTTGTTGGCCAAATGCCGACACCGC:1 + chr2R 13629829 5' - BS 124 1 60.40 AGCTTTGGCATTTAATTGAAAGTCAACATACTTATGCAAATCCCAGCGGCTGACCACCTAACGAGCCACCTCGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAAT:1 + chr2L 12577860 5' + F-element 4273 1 71.29 CTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr2L 12815032 5' - hopper 1398 1 59.57 GAGTANGCAAAGAAACCGAAAACGAAACGAGAGCAATCGAAACAGGTGCAGCGAAAACTCTCCCAAGACCAGAGAGCGCACTCTTGCTCTCCGTCGTTGCC:1 + chr3L 25952846 5' + Doc4-element 128 1 55.45 ACACATTTAAATATTCGTAATGCTGCGAAGAAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 8345558 5' + roo 8709 2 70.30 TAAATGTTTACTTCCTTTTCTTCCCCTCTTTTATTTTCATTATTTTTTATTTATGCTTTCGAGATTATTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr3L 6700300 5' + 1360 62 1 77.66 TCTAATATAGGAACATGATAATATATGTATACTCTTCTTGCTTTCAACTCTGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTGATT:1 - chr2R 163412 5' - Porto1 4459 1 67.33 GAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCC:1 + chr3R 7388356 5' + HMS-Beagle 6843 2 73.27 AACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr3L 11113902 5' + 412 33 2 60.40 GCACCAAAATTCAAATTGTGTTTGAAAATTTCTTATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAT:1 - chr2R 23481698 5' - jockey 4941 1 72.28 GAGTGGCATCCATGAAAAGGAGAAACTGAAGCCTGAACCTTAGGAGACAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCTACGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCA:1 - chr2L 15999882 5' + Doc 269 1 51.49 CGATTCAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 - chr2R 5840698 5' + Ivk 24 1 55.45 CGACAAATCTCCGGACCGGGCCACTTGCTAAGCGCAATCCCCGCAAGGTTACGTGGACCGTGCTGTACCGCCGGAAGCACCGCAAGGGAATCGAGGAGGAG:1 + chr2L 13391657 5' + aurora-element 3884 1 71.29 GCTCATTTCCGGCTTGACAGGCTTGAGGAGATTGAGTGAACCTCATCGTCAGAAAATAGGTGGTCGGACGTGGACATATTTGTTTATATTATATTAAGTCG:1 - chr2L 17586062 5' - TAHRE 429 1 52.48 TACATTTGGCCATTCCTGCCCTGGATAGCCATGAATTATCGTTTTCCCTTACGTATCACGTTGGGTGTGGTCTGGCTTGTACAAATACCTTTTCGCTACAG:1 - chr2L 21739393 5' - Gypsy12A_LTR 2148 1 64.36 ATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chrX 17058188 5' + 297 6625 2 80.20 CAGTAATAAACAACATTTATGATACAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTG:1 + chr3R 4543995 5' + flea 29 2 57.43 TCATGTTTGTTCTTTTGGGACCTCGTAACTTCGATTTGGACTACCATGAAGTGGGTCGTTCTATCTCCACGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGACACGCTG:1 + chr3L 9782977 5' - flea 141 1 73.27 AAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 - chr3L 17168882 5' - mdg1 363 2 81.19 TTTGTATACAAATATACTTGTGGTCTTTAGTTTATATTCTAAAACCTCTAAAACCTAACTTCTATTTTCGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 3579497 5' - Doc2-element 251 1 55.56 ATAAACACAAAAGACCAAAAAATCGGCCAGAAAGTGCCGAGATACGAAAGCACAGAAATAAACGGTTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCG:2 + chr2R 19943893 5' - 412 480 2 63.37 CAATATATGCCACTGCTTTTAAAATATTTATTTAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 9316969 5' + opus 7043 4 77.23 CCCGGAAAGCTCACTCTTCGAGCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCCAATG:1 + chr3L 17421559 5' + Max-element 8388 2 68.32 TTTCCACTTCCGTTTCCTTCGCCCAGAAGTGTCGGCCATGCAATGTTAAACCTATAAATTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACATACTGTAATCAAAG:1 - chr3R 18348955 5' + HeT-A 5993 1 65.35 TAATAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 + chr3R 7388337 5' + HMS-Beagle 6823 2 54.00 CAATTCGACAGGTGTTGCAACCATGAAAGATAGAAAAAGCGTATTTATGTCGTCATGTACTTTGCTACAAACTTGCTACGTAACAGGTATCTGATAGTCGA:1 - chr2L 9173190 5' + INE-1 551 1 58.42 TAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr3L 2019707 5' - 412 7496 2 77.23 CATATCAAAAACCCATAGTGGAGAAAATTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr2R 18685862 5' + opus 168 4 76.24 GTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chrX 16995104 5' + jockey 33 1 55.67 AGAGCCGCTTTATCCGCACTACCCAGCTGGCCTAGCAGTTCCAGCAGCACGTTCCGTGTGTACGGCTTGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATT:1 - chr3R 27287275 5' - Max-element 8533 2 69.31 CTTTCAAACTATTTTAAAACTACTTGTTTGCGATCGTGAATGAATTATATAACATATATAAGTACATACATACATGTACATATACATATACATATGTATGT:1 - chrX 17125188 5' - Stalker2 7498 2 54.46 CATAATTGCGTGCAATTGGAGCCAATTAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 20047609 5' + roo 48 2 83.17 TTTCGGAGGAAGGTCACAACAATATGCTCGTTAAACCAAAGTTAAAGTTGAGTAAGAAAAGTCGGCTGTTGCGAGCATATACCACGTGGCTGCTTTGCGC:1 - chr3R 23001263 5' - hopper 1233 1 62.00 CCCATGCATCGCAAAGGGTCAATTTATGGCAAGGACCAAGTTTGGGGCTAAAATGTGGTGGAAAGGGGATAGGGTCCACAAGATCATTCGCCAACGTGTTC:1 + chrX 22725101 5' - G5A 2637 1 67.33 ATTACCGGCTATCCTTCGACCTCAAAGCATATCCAAATCCTTTACTGTGGCAGCTTTGCCGGCACTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGGTTTTGAAGTGAT:1 + chr2L 10024824 5' - I-element 214 1 67.33 GTGTTTCATTGCTGTGATTCTGGAGTTGCAGCCTGTTCACACATGACCACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 23571685 5' + roo 20 2 64.86 GGAAAGTTATTCACTACTTAGTGTCCGAAACATTTGCATATAGAAGGAACTACTATCCTATTTCGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr2R 9770260 5' + I-element 13 1 62.38 AGAATGTTTACGGTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 - chr3L 13659987 5' - pogo 2094 1 72.28 ATATTTATAATATAATATAAAAATATAAATATCAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 + chr2R 2044184 5' + Tabor 44 2 65.35 AGGACNGATAAAAAAGCATGGTAAAAACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATG:1 - chr2R 21073941 5' + jockey 4700 1 55.45 CAGTTACTTAAAACGACCATCCTATGCTATCGAGTTGGTACGATTGTTAGTATTTATTGAAAATATATTGAAAATAAAAGCCAAGGTATGTTGTTTTTAAC:1 - chr2L 23007653 5' + transib2 284 1 65.35 AGAAGGTGATAAAGCAGAGCGCTGAATGTAATATAAAAACAAGTTCCCACTATCAGATGCCTGTTACTTACCTAGTGTAAATGCGAAATTTCATAATTTTT:1 - chrX 694473 5' - INE-1 517 1 89.11 AGAAANGGATACACGAACGAAGAGAGTGAAAAGGTAGATCAACTTGCAATATCCGTAGGAAAAATTTAATTCTTAAGCTAAGAAAGGACGGAAAAACATAT:1 + chr2L 17310032 5' + HB 404 1 70.30 ATCGCATTTGCTCCACACGCCGTTGATTTATGCCTGTGTGTGTTACGAAAGAAGTTAGCTTCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCTTCGTTTCATAAAACCG:1 + chr3R 17822451 5' - Q-element 213 2 63.37 ACCCATTATTTGCTGAGCTGTATTTTGTTTATACCTTGCACACGTTACACATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTAATAATAATTTCAATTGATT:1 - chr3R 19447152 5' - invader2 432 1 80.20 AGTACACAAATGTTTATAAACAAAAGATGAAGCAAAAAATTCGGTGATATGAGAGCAAGCATGATGGATGGAGAAACTAAATTAAATAAAACAAAA:1 + chr3L 10841732 5' + X-element 4719 1 57.29 TTCATTAGGGTTCGTGTTTATTGGTTTCATTATGACTCAATTACATATTTTCCCAAGCCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3L 19462188 5' + roo 8682 2 61.39 CATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 19447228 5' - roo 390 2 51.04 TTTGTAAAATTTTATTAAAAGACTTAGTGTTATTTCTTATCTGCTCACGATACTTTCCGTGGGAGTTCTTTCTTCACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATT:1 - chr2R 612028 5' - F-element 293 1 76.24 GTTTAAACAGACAGAATATTTATAGATATTGAAAGCAAAATATATTTATATTCATTACTTCTATGTGAGTAAAAAGAATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTT:1 + chr2R 9924460 5' + INE-1 32 1 71.29 TTTATGTGCCCGTTAATTTTGTCAAAGCGAGGAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr2R 15032607 5' + hobo 3 1 74.00 TGGCACATGTCCTGGCATTTTGGGCCCTGCTAATTTGGGGCCCTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr2R 16475726 5' + 412 14 2 66.34 ATGAGAGAATTGATATCAAGGATCGGTTCATAATTAAGGGGTGTCTGAGTTTGGCTTTTTGCTTTGTGCTGCTTTTGCCTTTTGATTTTGTTTATTTTTTT:1 - chrX 12679513 5' - transib4 2538 1 55.45 ATCATTTGCCGTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3R 7522274 5' + blood 5 2 74.26 CTCCCTTTATGTCAATGTAATTGTGTGATTGCATTTTTGTGTCGTTGACAGTGTTCGCACCCTTTTACAATGTAAGAAGACGATTTTCTGGCCGAAATTAA:1 + chr2R 5531903 5' - 1360 3186 1 70.30 GTGTGTCGTGTGCCTTTGCCTATTGTTAAGTCATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGT:1 - chr2L 14980558 5' - G2 2896 1 74.26 CAAAAGGAGAAAAATGCAGTAGCGAAGAAATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCACAACG:1 - chr3R 7597513 5' + Bari1 238 1 73.27 GTCCGCCGGCACCACCTTCTTCAGCAGTATGCCATTGAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTTGTGGCT:1 - chr3L 5134843 5' - Ivk 5001 1 54.55 CAGTACCCGATCATTTTGTAAATGCTGTTCATGTTCGACTCCGGCTCTAGCTCTTTGGCGTTGTGGGGTGGTGGTCTATGCTTGCGACAAAAGAATATAGG:1 + chrX 21294208 5' - Gypsy12A_LTR 2095 1 61.39 ATCTACCAACTATTTGCTTTGGTCTTTTTGGGTCATTTTGGGTGTTTAATGCGGCTAGTTACAAGTGTTAATTTAGGAATTACATTTACGAGTGACATTTT:1 - chr2L 16444013 5' - TART-C 10935 1 59.41 CTTCTGCCCTGCCTCTTTTCTTCCGCCCCCACCCTCTACACACCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCG:1 - chr3L 10726667 5' - flea 4753 1 57.43 AATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 7488841 5' + roo 16 2 59.41 CCCCTGTAGGGTTCTGATCTAAAAAATGATTATCATCAAATGTATTCATTTCTCATTCCTTTCTGGGGTGGTTGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGC:1 + chr3L 26548103 5' - mdg3 5317 2 54.46 GGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTG:1 - chr3R 12047470 5' + Stalker2 7292 2 66.34 ATAGACTATATATATTCTTGATAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACA:1 + chr2L 13154264 5' + Juan 40 1 60.40 GCATAACATAAAAGTTACTTTTGCTCAGCTTTTGTCGTCATTATTTTTGTAAAGTGTAGGTATACCCATTCGTGTAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATAT:1 - chrX 17041806 5' + copia 433 1 80.20 TTTTAAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3R 16245108 5' + 1360 31 1 62.38 TGGACCACCACATCCTGCCCCTTCGTGTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr2L 22084495 5' - copia 5074 2 72.28 TTATGNGGTACCCCAGCATTATTCAAAGTGACAGGCTTCCTTTCTCTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3R 9131829 5' + roo 30 2 57.43 TTGTGCCATTATCTGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTAGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGCCTCATATGGT:1 + chr2R 4621649 5' - Bica 4844 1 73.27 GGGGCGTTCATTTCGGCACGGATAGTACACAGATACCGCCGGCTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTTTCACCGACAACCCCAAACGC:1 - chr3R 23171434 5' + F-element 283 1 64.36 CTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCT:1 + chr3L 19951189 5' + Ivk 21 1 58.42 CTTACACATGAAACGTTCACACGAGCGCATATATAGGATGATTTTATTTAAAAAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr2L 10473528 5' - flea 238 2 52.00 CACTGCCCGTCAACCGGGCAACCCGCATACAAAGTGCCCTGATCAGCCCATCGCCCATGATATCACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATAC:1 + chr3R 21021643 5' - R1A1-element 5238 1 69.31 CAAATCGACTTACGCGTTCTCCGTGGTAAAAACAGTTTCCGGCTATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAT:1 + chr2R 5840631 5' - Ivk 5350 1 56.44 AAACCGACAGACGAGACGAACTCAACTAAGCTAGATACAGATGCATATGCATTCACCGTCGTGTCTGACGCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACCCTGTCAA:1 + chr3R 11401574 5' + Doc3-element 330 1 60.40 TGTTGCTCGACAGTTACGAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chr3R 6735256 5' + copia 4889 2 61.39 AGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTT:1 + chr2L 23295813 5' - micropia 404 2 73.27 CAAGTAAATTAAACGCTAGCCCGCTCTCTTTCACTCCACGCTAGCACCCTCTCTTTCCACAGCTGGCAGGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTC:1 - chrX 7621261 5' - P-element 48 1 73.27 TGATTAAGCTTTGTTTCAATTTTGTGTCCTTTTAATTAATGATGGCCTAAATGATGAAGGACGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chr2R 16980572 5' + copia 4884 2 64.00 CATATGAAAAAATACAAGTATTTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGC:1 - chr3L 23635037 5' - roo 124 2 78.00 ATAAACCGGATTTGAAACTGTAGCAGTACATAAAAAACACATATAATAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCTTTGTCAAAGGAGATCG:1 + chr2L 62446 5' - X-element 4521 1 73.27 CACTTGAGTAATTAAATTCAGCATCGGCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2L 14790598 5' + roo 50 2 77.23 TCATTGATTGCAAAACATATTCAAATGGTTAACATTATTGATTCCACTGAGAAGTAGCAAAATATTATCACCCTTAACACCTACACACACACAAACACACG:1 + chr2L 11752423 5' + accord 255 2 77.23 CCTGTCTTTTGGTTCCGCGCAATTTTTACATGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAG:1 - chr3L 19018023 5' + 1360 3380 2 76.24 ATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chr3L 17168887 5' - mdg1 7406 2 76.24 AACTGACAAGTAAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 - chr3L 17168905 5' - mdg1 7424 2 61.39 TAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCT:1 - chr2L 3440504 5' + Juan 31 1 52.48 TGCCACTCGAGGAATAGCGAAAGAGCCAACCAGGACACAAGCATCGTTCTACAGTTAGCTAGGAATGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGG:1 - chr2L 17884974 5' - Cr1a 3971 1 63.37 CGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAGTCGAG:1 + chr2R 5206898 5' + Doc4-element 21 1 60.61 TAAGTTGGCGCTCACAGGAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 21253795 5' + Doc2-element 240 2 88.57 CACTCACACCACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr2R 13295665 5' + Tirant 8147 2 63.37 TTTCTAAGCCTAACATGTTCAATATGCAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAG:1 - chr3L 4898703 5' + jockey 4891 1 73.27 CGGACATCTGCCGGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCA:2 - chr2R 7552329 5' + springer 7149 2 67.33 AGCTGACTGTTGGCTTCCAAAAGCCCCTAGGCCACGACGGTCTAAACCCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCG:1 + chr3L 22220592 5' + R1A1-element 5163 1 50.52 AATGCCAGGGAACGAACGCGCCGAGCAGAAGAAATGGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTC:1 + chr2L 5456400 5' + Bica 4659 1 79.00 GTAACTTGCGCCCGTTCTCTTCTCATATATCTTCGTGCACGTATGGCCCACCGCGTGTACTAACTTACTGGTCCAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGT:1 + chr3L 25255091 5' - 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HeT-A 6050 2 72.28 TCGGTCTCGCCAAATCCTCGAGAGAGTTTTTTTTGTCAAATCAATAGAAATTTACATGACTAATAAAAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTG:1 - chr2L 7300474 5' - INE-1 261 1 76.24 GATCCCCCGATTTGGAATTTTCAATCAGTTCCAATTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATT:1 + chr2R 14783498 5' - F-element 201 1 65.66 TTAAAGCGTGGACAAGTTACAGTGGAACGAAATAAATTGATAGAAGGCAAGGGGACCTGTACTGGCGGG:1 + chr2L 17541566 5' - Gypsy12A_LTR 2227 1 59.42 TGTTAAAGTAAATAGCGACTTTGCATATATTTATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGC:3 - chr3L 23839694 5' + McClintock 44 2 74.26 GCCGTGGGCCAACTGGACGCCACATTGCATCCACATATGTCCTTCCAGCCGCTCAAACCAGAGAACAGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr3L 13548870 5' - hobo 2917 1 56.44 GAGAGTCAAAAATCAGTAGGAAAGGGGATTTGCGCGTTCAAAACAATAGTTGAAGCTGAAATTTTGCTCTATTTCTTTAAACCCATGTAAGAATGAATAAA:1 - chr3L 398672 5' + rooA 277 2 78.22 AAAAATAAGCCAGTAATTTATAATTCCTTGTATAAAAGTTAGTTATTGCCTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr3L 18659116 5' - pogo 2093 1 67.33 CTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr2L 19019016 5' - hobo 2909 1 58.42 ATAAATTTGTCTCTGAAATAATACATTTTCAATTAAGTATCAACGTTGGCAATTAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3R 16834021 5' + I-element 7 1 53.66 TGGCGGGGGAAACGAGAATAACAAGCGTGTGGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTGAAACTTA:1 - chr2R 6518900 5' + Tc3 94 1 57.81 CACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr2R 17345960 5' + jockey 20 1 66.34 CTCAGTACCTTGTTGAAGTTTTTAAATTAATTTCGGCCCGAAAAAATAAAAAAAATAATTCAACAAATGGATTATATCTTATGAACTATGTTTAAAGAATC:1 + chr2R 4719066 5' - Tc1 1355 1 58.42 GCATATGCAAGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 6417846 5' - Quasimodo 37 2 80.20 TCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 16761302 5' - roo 9021 2 79.59 GTTGTGTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2R 1365313 5' + jockey 29 1 54.46 TCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 23275274 5' - roo 359 2 75.25 CTCCAAACTGGCCGCAGTGTTAATGATTGCCGCTTATCTGTTTCTCGAAACAGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAAT:1 + chr2R 16477832 5' + 412 7252 2 50.50 TCGAAGGAAGTCTGGTATCCTCTGTTCACTTGAGAAGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAACGAGAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATT:1 - chr3L 9086680 5' - Max-element 395 1 72.28 CGACAACATCATTATCAGCGGCGGCAGCGTCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATCCC:1 + chr3L 6084343 5' + 297 6526 1 71.29 GGCGTGATGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chrX 2179530 5' + Doc 48 1 72.28 TTTAAGCCAAATAAATCAAGACAATACACTTACCTGTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTA:1 - chr2R 12625103 5' - invader2 4838 1 57.97 ATTCATTGATACATATGTATCAATATATGTACATATGTATCATTCATTGATAGCCCAGTCGATCTGGCCATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCA:1 - chr2L 21794042 5' - Burdock 6387 2 75.25 TCTATTAGGTGTTCCTGGATTGATTTTTTTTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chrX 2173483 5' - pogo 2060 1 69.31 TGTATATTAATTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTTCTTATTTTTT:1 - chr3L 4489960 5' - gypsy7 5007 3 85.71 ATTAAACAAACCAGAGAACAATTATATGTACCCTAACAAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGT:1 - chrX 6701526 5' + FB 38 1 63.37 TAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 - chr3R 9995412 5' + Max-element 48 2 71.29 AGCGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 + chr3R 12047398 5' - Stalker2 386 2 61.39 GTCTCNGGTCGTGTGACGATTTAATTTAAACACTTCTCGACTCATAAGCATGGAAACATAAACGAGTGTGAGTACAGAAAATAAATAAATTAAGTAAAATA:1 - chr2L 963401 5' + X-element 4716 1 71.29 CTCCTTTCACCACAAAGAAAAAAAAAAAGAAGAA:1 + chr3L 5650088 5' + mdg3 5087 1 82.35 TGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 12539499 5' - roo 9034 1 61.39 AGTTGGCCGTGTTGCACACGCGCCAAACGCGGACCAAACCAAACAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGAGCCAACGCGAATTGCGCGCCCAGCG:1 + chrX 3832397 5' + Doc3-element 228 1 58.59 GAGAATTAATAATTCTCTTTCATTTTTATGTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 11100263 5' + hopper 147 103 61.82 CTGAGCGCGCTTAGTGAAGCGTGCACCTTTGGTTTGGGCCGAAGTATTTATTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAAT:1 + chr3R 7383278 5' - rover 6974 2 58.42 CTGTGAATTCTAAAGTGTTTTAGAATAATTGAAAATAGATTGTTTTCTTTTTAATCGCTTAGAGAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATTAC:1 - chr3L 12979003 5' + transib2 396 1 69.31 CATTAAAAATTTCCAAATCCCCCGAAATTGTCTGAGTTTAAGCAACGCGAATGATTTTGTGCTTTTTTCGGCTTGTGTTTACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 21092549 5' + roo 8669 2 72.28 TGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chrX 23155231 5' + blood 7062 2 72.28 TCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAAT:1 + chr3L 6044743 5' + Tabor 36 2 57.43 AGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2R 16988200 5' + opus 40 4 67.33 ACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTT:1 - chr3R 7522371 5' - blood 346 2 57.43 TTTGGGATCGCCATGTGAAAGGTCACCAGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 - chr3R 9995450 5' + Max-element 10 2 74.26 TTATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 + chrX 15148857 5' + micropia 4962 2 73.27 CTGCGGCCATCCACTTCCTCCTTTGACAACAGTTCCGGCATCGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGT:1 - chr2L 17747555 5' - hobo 69 1 58.42 ATATTCAAAACATCTGTTCACCCGATAGTGATTGCTATATTCGTTGTTAATCCCATCTCCCTTCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCAGCGATCTCCGTAC:1 + chr2L 8257237 5' + G5 4649 1 53.47 CCGGAAAAGTTGAAGCCACACTTTCCATGGGCGGCTGAATTGAAGTGAGAACATAGAATGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCA:1 - chr3L 2974367 5' - Cr1a 160 1 44.55 TAAAGAGAGCGAGCGCTCCCATTTTCCGAATGTATGCGAAGCACTCCCGAAGCGATACGACAAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chrX 13640712 5' - P-element 2872 1 64.36 TTTGCCCAAAAAAAAAAATAACTGAAAACACAGGCCGAAAGGAAATAAGAAATACTTCGAGGAATATCTCCCAAGGTTGTGAAGTGAAGAAATAACGAT:1 - chr3L 9040574 5' - McClintock 6119 2 65.66 ATGTATGTGTCAGAGTTGCGCTTAGCTCGTTTTTGGTCCGCTTTTGGGAAGCTTAAACAACTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGCTTAC:1 + chr3L 10831088 5' + transib2 199 1 56.44 AAAGGNATCGGCAGCATCGCGCTGGCGACTTAATATGGGGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr3R 27748731 5' + roo 8700 2 65.35 ATTCATAATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chrX 21852446 5' + Tirant 27 2 52.48 AAACGAAAACTTCACATGTTTTTCTTTCTTCTTCCCTCTCTCAACTTCCTTTTTCAGGACTTCCGCTCTTTTATATCTGTATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 10932196 5' - Quasimodo 38 2 80.41 ATTTCGCAAGCAGTTTGCTGGAAGTAATTGTATGCATTGAAAACGTATTCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTG:1 - chr3L 17218697 5' + 1360 225 1 62.38 AACAACAATTTGCATTTTTAAATATTCTCCCAAAACAATTTGTAATCATCTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTC:1 - chr3R 4965885 5' + F-element 4219 1 56.44 CACAGGACGGATAAAAAAGCATGGTAAAAACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr2R 21073944 5' + jockey 4697 1 52.48 TAAAAGTTTTACTAATTCAATAAGGAATTCTGTTTTTACTCCAGCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTT:1 + chr3L 18499043 5' - hobo 449 1 56.44 CCCCTNCCCCAGGCCAATTGGCAAGGGGGAGAAATTGTTGGGGCCTGTCAACGAGGCTTCTTGTGGTGATCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGAC:1 + chr2L 21327549 5' - flea 151 1 71.00 ATCCACACACAGCCAAACACAATAGGCGCCATAATTCAACATAAAATATAACGAAAAGATGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAG:1 - chr2L 14825513 5' + Doc 4505 1 52.48 TTTGCCATTTTGGGGTACATAGTTTTGCGAGCCGAAAAGGCTTAATGACTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATA:1 + chr2R 17626486 5' + mdg1 7066 2 57.43 AATGATTTTCCAAAGAATCAACACCGTTAGAATTCTGAAAATTAAAAAGTGCCGCGATTCATTTGGACTAACTTGAAAAATCCAGGATATCCGGCTCGAAG:1 + chr3R 28284351 5' - GATE 281 1 74.26 GGTAATTGGAAACTAAAATCGAGGAGTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTG:1 + chr2L 9124147 5' + Ivk 298 1 74.26 GAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATATTCTTGATCATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTTGAAGGTTGAGATTCA:1 + chr4 836650 5' + INE-1 166 1 91.09 AGTCAAATTTTAAAAATCTAACTTCGTTTACTTTTTTATATCGATATAAATATTTATTTCTTCCTTGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr2L 8308274 5' + P-element 9 2 66.34 ATGTAGAATTCAATCACCCCAATCCAAACCATAGATTTAATGTCCTTGAGCTTGAAGTTCACTTACCGAGTTAACACTCAAAACTAGAATTACATAATGAA:1 + chrX 8213627 5' + Porto1 4214 1 73.27 CGTTGTTCTCTCTCCCATGGGCCATGTTTTCATTGCCTGCCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr2R 14713653 5' + P-element 25 1 50.00 ATGTCGAGTCACAAAAACCCATACAATATATTTTCGTGTATCCCTTATCGAGTTTGCCTTCCAACTTCTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTG:1 - chr2L 2531364 5' - Quasimodo 214 2 70.30 ATGTCATCTCCCAAAGATGCTCCGAATATCTTTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAACCTGATAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAAACT:1 + chr2L 1758576 5' - I-element 42 1 69.31 TGTTATCGCGACCTTCTTCTGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAATGTCTACAGAGTCTCTCCCTGATTTTACAGTTTTTAATATATTTGGACTTA:1 + chrX 21021138 5' - 412 7392 2 82.18 TCACACTTCGTTCCAGGTTCACGCTTTTCTTGTGGGATATTTTCAAGATATCCCTGGTCACCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCT:1 + chr3R 9995751 5' + Max-element 87 2 66.34 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCT:1 + chrX 15019092 5' + invader1 45 2 91.09 AGCTATTCATTTCTATTTGCTTTAATGGGTCAAACTTCAAAATCGAAATAGGATTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 + chr2R 9770174 5' - I-element 5334 1 51.49 CTTGCAAAATATAAAGAAAAAAATAATATATATGAATATGACAAGCAAAGATTTAATGAGAATAAAACTAAGATTGTCATACGATCCTCGAGAGTGGAAAA:1 + chr3L 24500388 5' + Idefix 6949 2 73.27 TTTTTAATAAATAATAATATTTAAGTGCTGTGCACACAGTGCAAAGTGTAGACTTTATTAGACAATGTTATTAAACAATTAGAAAATGAAAATAATACTAA:1 + chrX 9918079 5' - invader6 14 2 62.38 CGGGTTTGCCAGACTGACAGTCCTTGTCGACATATACTCGTATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 + chr3R 17495753 5' + Quasimodo 25 2 64.36 AATGGCTGATGAGGCCAACTTAATTATACCGTTGCAATATTTCTAAGAATTTTTCTCTAACTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAA:1 - chr3L 480712 5' + roo 8680 2 41.00 CTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAA:3 - chr2L 2074780 5' - roo 9045 1 55.45 ACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCAT:1 + chrX 21474418 5' + 1731 38 2 71.29 TACTTTTACTTTTTTTTGCCTTCTAGAAAAAGGTTTGTGTCTAACAATTCGGACCTGAGAAAGTGGATAAAGTGAAATTAGCTTTCGCGGTAATAAACTT:1 - chr2L 14662854 5' + X-element 61 1 64.00 GAAATTCCGTAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 - chrX 4366298 5' + jockey 4682 1 67.33 GCCGGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCAC:1 - chr2R 7552320 5' + springer 21 2 58.42 GCCAACGTCCTTAGTGTGAAGTTCATGTACATCTTTGGAATGATTTTAGCATATATATACCCCTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATC:1 - chr2L 2308733 5' + HMS-Beagle 11 2 68.32 GGCCTTTCCGCTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAA:2 + chrX 17968332 5' + Tirant 3 2 78.22 CATTTAAATATGTCATAATTTCATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATAT:1 + chr2R 13644406 5' - Burdock 246 2 70.30 TCATTTCTTTTGTGCTCCAGCACAGACAGATAGAACTCATAACAAGTTGATAATTTATGTCATTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAAT:1 + chr2L 4743119 5' - I-element 5347 1 66.34 TATTAGTCAAATTGCCACACGAATACTAAAAGGGATTCGTAGTCAATCGGAATTTAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chrX 20620518 5' + pogo 16 1 63.37 TTGCTGAAATAAAAAGGGGAAGTAAGAGGTAAAGCATACAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chrX 8491409 5' + P-element 37 1 44.55 TTTCACAATATTTCCGCAAAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGCCCATCAAAGAGCAAAGAC:1 - chr3L 13548941 5' + hobo 2592 1 78.79 TGTGCGTATTCGCAGTGTTCAACTTTTTCGTCGTCTTGTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTA:1 - chr2L 13474561 5' - Stalker4 51 4 66.34 TTGGCATGGGGCTTTTTTGCTAGAAACACTTTCGGTGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAG:1 - chr3L 6044801 5' - Tabor 446 2 68.32 GTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTG:1 - chr3R 1465944 5' + gypsy5 44 2 70.53 GCGTATCCTGACCAACATTGCCACATCCGCATGCCCATCCTCAACATAACATCCTCTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chrX 17042642 5' + copia 22 2 55.45 TTTTTTAAAAATTACTAGCTGTTAAAGTGCACATTTTAGCTTATTTTTTTTTAACAGCACTGCATAGCCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr2L 11922485 5' + BS 5078 1 65.98 TGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 19377773 5' - roo 353 2 78.22 CGCCTATTGGCAACTAAAACCGACACGGACGACAAAAAAGGCAAAAATACACACACACACACACACACACACACAGATACACAC:1 + chrX 6496429 5' + accord 189 2 44.05 TTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:1 - chr2R 4483258 5' + Ivk 43 1 63.37 TTGAANATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTACGTTT:1 + chr3R 17321730 5' - Stalker2 7606 2 69.79 CTTTGCGCGATGGCGCGTTCCAAGAGGGCAATTTTAGCCGTCGCCAAAGAAAGTGCCAAACCCATATATGGCCGTAACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTT:1 - chr3L 23288951 5' - 1360 3 2 78.22 TGCTACTCCTGATTGCCAATGGATTTGAATTGCAAATTTAAATTTATGAAGCCAAGATTCTGAAGTCTGAAGCCAAGTTATTCGATTCGATCGCCGACGTG:1 + chr3R 22232531 5' + F-element 9 1 63.37 CCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 - chr2R 21773610 5' + Max-element 36 2 62.00 TCATGGAACATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2R 8345489 5' - roo 9052 2 60.40 CAGCTACCGCCACAGAGCACCAGCTAAAGCAACAGTTCACTGTGTCTCTGCGCGCCAAAATCGTGTGCACGTACAACATCTTCCGCTATACCAATACACAC:1 - chr2R 7768139 5' + Porto1 449 1 56.44 TGGACCCATCAAATTAACCATAACAAACAGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTCTTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATAC:1 - chr3L 19951269 5' - Ivk 5360 1 54.74 CCGATTGGAACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAG:1 - chr3L 16973443 5' - S-element 1679 2 67.33 TTTTCTCTGCATCAAACAAACAAAATTAATTATCAAACTATTTTCGGCGCACGATTTTTTCGCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCAAATTTTT:1 + chr2L 2609326 5' + 1360 81 1 60.40 CTACAAGCGACTAATTTTGAATGCAGGGACTGGACACGAAACAGAAAAAGGAGCATTTTACAAGTTGGTAATGACTTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGT:1 + chr2R 5953486 5' - I-element 4971 1 62.38 TTTGAAAATTGCATTTTCATTTCATTAATTGTTTCTAATTTTATTGATATAAAAGAATTTTGAAGTTTTTCAGGTGTAATCCCACTAGCTGAGTAACGGG:1 + chr2L 4068865 5' + INE-1 537 1 25.00 CAGTAGCAAATATCAAGATAAATTCAATTATAAACTAACCCTGATACATTCCTTTGGTCAATATATTCTTATACAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTG:1 - chrX 13774271 5' - pogo 1789 1 82.18 CATTTATGTGCTCTCACACTCACACGCAAAAGTCAGACATGTCATGTACAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 + chr2R 13644427 5' - Burdock 6361 2 58.42 ACATAAATTTCGTTAATCATTGAACTGGAAATTTAATAGCCAAGCGAAACGCACACATACTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGT:1 - chrX 992105 5' - hobo 2926 1 66.34 TTGGCAACAAAAATTTTCGATTTAGCAACGGGTCTACATGTACTCTGATAAAAAGCAATACAAAACAAGCGAAAATAATATAGTCGAGTTCCCCGACTATC:1 + chr2L 22753884 5' - INE-1 564 1 63.37 AAGTTGGCATCGCAGTACAGGAGACTGCAATCATATGAGGTACATGTATTCTTGATTTATAAAAACGACCGTGACAGGACCGTTATAAGTTGTAGCAGAAG:1 + chr3R 4838239 5' + mdg1 462 1 71.29 TATTGCCACCGCCTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCTCTGGAGCGGTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGA:1 + chr3L 5556220 5' - 1360 93 1 80.00 GTATACGTATACCACAAGCCGCCCAAAACTGTTACACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCC:1 - chr2L 21710240 5' + FB 982 2 66.34 GTTGTATGATCTCTTCCGTGACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr2R 14675544 5' - roo 9040 1 58.42 ACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 - chr3R 27981721 5' - roo 9030 1 68.32 AAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr2L 17722767 5' + blood 29 2 52.48 ATCCTCATCACTCCCGTCCGACTGATTGTTTTGGCTTATGCGGCTTATGTGGGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr3R 6608764 5' - I-element 5333 1 55.45 AATGCGGCAGCGGTTGAAATCAATTCAATGTCGCAGAGTGTGGAGTGCATAATGGATGGAAACAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCG:1 - 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INE-1 561 1 91.09 GAGCAGTCGGAGAACAACTTTGTTGAGGAAAAATGGATATAAGCAATGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACG:1 - chr2R 20622203 5' + invader2 356 1 72.28 GATTCCAACTTCTTGCTCCATTTGCCGCACATTCGCACGCGCCCCCGATTTATTTTCTGATACGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTC:1 + chr3L 10083383 5' + invader1 102 2 52.48 CCCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3R 20477046 5' + 412 7088 2 60.20 ATAAACACCACTGAAATGGAGCGCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 10561799 5' - hobo 2907 1 56.44 CCATTACAATTACAATTACAATTAAAATTACACAAGCAATAACAATTGACAGAATCGAGATACTACTTTAATCATAAACAGCAATATTGACATCATTCAGC:1 - chr3R 5925679 5' + F-element 4304 1 76.24 AAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3L 17168894 5' - mdg1 7413 2 70.30 ATCGGTTCAGGGGAGATGGTCATTGTGGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr3R 8478202 5' - 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chr3L 27980420 5' + Doc 322 1 82.18 TACAATTGGTGGTTGTTTCGGTTTTCGGGGGGTTTAGATTAATTGATGTAAGTCGATTGAACTATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGG:1 + chr3L 5544602 5' - I-element 4993 1 64.36 AATCAACGAGCTGGGGACAGCTCTCAGCAAACAAATTTAAAAAACTTTCAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAAAAAATTTTATTTTATCATA:1 + chr2L 12845923 5' + 1360 3098 1 73.27 CCAGGAACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr2R 18950750 5' - roo 9030 1 67.33 ACTGACCTGCGCAGGTGAATTTGGCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGACTTGGACTAGGACACACAGACATAACCCACCAACACTA:1 - chr3L 16109397 5' + I-element 4963 1 76.24 CCCTGCAGTTTGAATGAATTTCCACCCGCGCTTCCATACCAATCCACTTTTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCC:1 + chrX 6212688 5' - Ivk 217 1 56.44 AATATGAATTTATCCATTGAATGGGAGAAGATTAAGCATATAGATTCTAGAGACGAAGACGCAGCTCAACTTCCACGCCCACACTTATGAAAAACGTGTTG:1 + chr3L 25932678 5' + INE-1 259 1 71.29 TTGTGCTAATTGGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chrX 20806839 5' - opus 7499 2 77.23 CATGCAGCAATCGAGGACCAAGTTGAGGCAGCGCATCAGTGAGCTGGAGGATGAGCTGAAGAAGGCCAAGGTATGTCGTTTTTAACGTATGTAGTTAATAT:1 - chr3L 7930498 5' + transib2 299 1 70.30 GTGGGCTGCCTAAAAAATGTGCAGCATGCACCCCTCGTTTGTGGCTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 23275350 5' + roo 8 2 67.33 TACGTTTTTAACTCTCTTGGAAATAAAAAATTTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr3R 23591479 5' + pogo 42 1 69.31 GCGGCAGCGGTGGAAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTA:1 + chr3L 19782216 5' - R1A1-element 145 1 70.30 TACCCCAAATTATTTCAAATCTATGCCTCAATCGCAAAACAAAACACGTATGTAACTCTTTCGGCAGGATACCGCGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCT:1 - chr2R 10828297 5' + 1360 3227 1 78.22 GTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTT:1 + chr2R 14217721 5' - Tc1 1621 1 78.22 ATCTAGTTGCGATCAAACGTACTCAGTACTCATAAATTAAACCGACCAAATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCAT:1 + chr2R 4975024 5' + INE-1 103 1 59.41 TATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:2 + chr3R 17896938 5' + hobo 27 1 60.40 CAATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTT:1 - chrX 21564730 5' + diver 41 2 69.31 GTACANGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTA:1 - chrY 536714 5' + Doc 30 1 53.47 CACGCTAAACGTATGCAAATCATTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCC:1 + chr2R 9342266 5' - opus 264 2 78.22 GGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTACACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTT:1 - chr3R 4571528 5' + 1360 3261 1 59.41 GAGAGAGGCGAAAGCGAAAAAGGAGGCGCGGCAAGTAAACCGACGTTTAATTTTTGGAAAGCGCGAGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGT:1 - chr2L 4160214 5' - Tirant 8493 2 64.36 TTATAGATAATGCATTTTCAACTAATTACATTACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCAC:1 - chrX 21448825 5' + Doc 4592 1 67.00 AGAATGCTTAAAATGCGCAAACGAAAAACATGCTCGAAATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr2R 16988257 5' - opus 461 2 62.38 TGCTAAGACACAAGAAATAACGATTTTCAAATAAATGCTAACAAAAAAAAAAATTAGAAAGAGTGCCAGCCCGGTTATTTTTTTTATTTTTTGTTTTATTT:1 + chrX 9502925 5' - F-element 4687 2 73.27 GGGGAGCGGGGTGGCTGGATGCTTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCAACGGGGGGAGGATGTTGGGTCATGCAGCCACCCAAAC:1 - chr3L 19829706 5' + diver2 4 2 74.74 CTCTTTGGCTGTGTGATACAGCCTCGGAGCCAATTGCGGACAGTCCTGCACCCTCTCCCTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAA:1 + chr2R 1451919 5' - Stalker4 7262 4 58.42 AATTAGGAACAAAGTAAACAAAACAAATAAAATGCACATAATGTTGAACATTAGTATAAATTCATTTAAAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 - chr3L 9766438 5' - blood 372 2 74.26 GGCTTNCAACCGAATTGAATGGCCATTTATCATTCCGCCAGCGAAGTGGATGTCTGCCACTCTGCCAAGCCGCACTCAGGGAGAATTATAATAGTTGATAT:1 + chr2R 23489260 5' - jockey 4855 1 76.24 CAATTTAATTATAATAGAGCTAAATAATAATAAAAGGAAATATTTAAAAAAAAAAACAAAA:1 + chr3R 16304551 5' + TART-B 10631 1 62.30 CAGATTTTTCTTTAACCTTCATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAG:1 - chr3L 6377915 5' + 1360 98 1 80.20 CACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGGAG:1 - chr3L 2485950 5' + jockey 4675 1 41.82 GAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr3R 17896952 5' + hobo 41 1 74.26 TTAAGATACTTATTTTCTCGCGAGTGTCTTTTCAAAGGTAAGCCTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAA:1 + chr3R 6286611 5' + jockey 4535 1 55.45 TCTCTTCTGCTCTTGTTTTCAAGCAGGCAACAGTTTCGTTTGCCAATTTGCTGGCAGTCCCGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACGCGGAGGTTTTT:1 + chrX 12815668 5' + Rt1b 5021 1 57.00 ACATATAAAAAACGTACAAGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 - chrY 536727 5' + Doc 17 1 54.46 GAACTTATAAAAAACGTACAAGTAAATAGTAGTAAATTATGTGAGGCGTGTATTAACGGCATGTATCAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 - chrY 536729 5' + Doc 14 1 59.00 GTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATT:1 - chr3R 7168621 5' - flea 4967 2 80.20 ATAATCCTTATTTGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATT:1 - chr2L 20133087 5' - flea 5013 2 79.17 TGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3L 18500947 5' + hobo 30 1 55.45 TGTTTCTCGTCACATGCCGAATAATTGTACTTAAAACTACAAAACACAATCCAACCCAACCACATATCGCTCTTTCTCCTGTTCTAGAACTGTCCTCTTCC:1 + chr3R 16634252 5' + Gypsy12A_LTR 2033 1 71.29 GAATGTCACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr2R 16988189 5' + opus 142 4 56.44 AGAACGAATGCAGAACGATAGAGATCGATCAGAAAGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2L 7255822 5' - P-element 2867 1 59.41 CACGAAGCGAGACAAGGGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3L 9383500 5' - P-element 2864 1 55.45 AAAATCACATATATATATTTGTCAGATCTCCCACAAGTTAAGCAAAATTACTCAATAAGAGATTTCCTTAACGTAAACAACGTAATTTTTAGTTTAAGGAT:1 - chr2L 11505445 5' + Circe 7035 1 62.38 GCCCCTCTTTTGGCGCCAAACATGTTTTACACCGCCTCTTTATATATTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAA:1 - chrX 7560076 5' + Doc 4517 1 53.47 GTTACAGGCGTAACAGAAATTGTTGCCTACTTTTGTGGGCCGCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chr2L 17210251 5' - jockey 4988 1 74.26 CTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3R 19446161 5' + 297 23 2 65.48 TGGTGATATGGCGATATTTGATAACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTGGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr3R 4834251 5' - mdg1 393 2 53.47 CAATTGGATTTGGGATCGGGGAGCACAGTGGGCGGGGGGGTGTGGGTAGTTAACCATAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGTATGAAATACGACAAGATCGG:1 + chr3R 29623115 5' + gypsy2 6521 2 69.31 AAATTTTCACGTCGGGTGCGTTTGGAGGCAGAGTGTAGCATAGTGTAAAGAACAAATTAATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 20824587 5' - pogo 2089 1 67.33 GGGCGGAGGTCATATAGACTATGCAGCTAATCATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr2L 3969010 5' + jockey 56 1 68.32 GCTATAGATCACCCAGAGGGAGAAAGGTCTTGAGAAACGAAAACCGAAATGATACTGGAAGAGACTAAACTAGTGCATTCGATATAGCTCTTTGTCGTCCC:1 - chr3L 16452900 5' + diver2 4789 2 68.32 TGGACTTTTGCCGGGCATGTCGGCACTTCAGGGATATTTGTCATGGAGATGGGGTCTACAGGCAGATCTCTTGTGACAGCCAAGTGCTGACACTCGCAAAT:1 + chr2R 14737832 5' - mdg1 7293 2 51.49 GTCAGTGGCCAACCAAGGTGGTCCGAGGCCGAGCGTTGCCTCGCCCGTGGACGATACACCCTTCACATATCCTTCTCCGTGCTCCTCTGTCCTCGCGG:1 - chr3R 3380079 5' - gypsy8 4464 1 63.27 GATGCATTTAAAATTATAAGTTAATGAATATATAAACTATTTTAATTAGTTAATAATATAAATTTTATAATTTGTTGCTGTTACTTTACTTTACTTTTACT:1 - chr3L 18681987 5' - TART-A 13148 1 67.33 TTCTGTTGTGAAAAATTGTCGTTTCCCATTTTTTCTAGCTCAAGATCAGAACCTGTCCGTATAAACGTCGAGATCTCAGGA:1 + chr3L 10094691 5' + INE-1 138 1 56.79 AGCACATAAGAAAAACAATTATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTAT:1 - chrX 22000029 5' + Quasimodo 6917 2 80.20 CACTTAATTCCGTACATATGTACATAAAAATAGAACATCAATCAACGTTGATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3R 16834089 5' - I-element 5326 1 57.43 ACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr2R 13644481 5' + Burdock 50 2 78.22 TCGCTATATATTGACATTTTTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:1 - chr3R 8555951 5' + 412 8 2 70.30 AGCTGCAACAACAATAGCAACAAGCAGCGGACACAGAAAGCTGAGGAAAAAGGATAGGTCAGCGTTATTTGAGTCTGTATATGTCTTACTAGAGGAGGGAT:1 + chrX 9298469 5' + Transib5 2544 1 67.33 CCGTTCGACTGGTTCTCGATTTTTATGTGCATCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAA:1 + chr2R 13766774 5' + flea 212 2 69.31 TTAAATTAAACTGAAATAAATGCAATATGAAACTAAGAATTGGACAATATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3L 9766335 5' + blood 7036 2 55.45 CATGGGCGAGGGGGTTGTGAGGGGGGGTGTAGAAGGGGCTATCCCCACGTTGTTTTGTATCTGTGCTGCTCATTTGCAATATGCATGTCCGGCTAGCGCTG:1 - chr2L 11182894 5' - TAHRE 9981 1 72.28 TAATTGGCCGCACTTAGGGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTCGCATCAGGG:1 + chrX 20806845 5' - opus 490 2 69.31 CAGCATACTTTTGGGGGCAGTCTGCTAGCATATCTCACACTGTGTCTATAGATCTCGTCGTCTACCCATGGAATACCGAGCTCCTCGTG:1 - chr3L 18500915 5' - G2 2787 1 78.65 GGTTGGGGGCGTGTCAACGCAGTTGGAAAAAAAAGACACTATGATCCGGAACGACACTCGCGTTCAGCGACAACGC:1 + chr2L 6540892 5' + Doc2-element 296 1 64.47 GTCGGCCATTGTACTTCATTTTCCAACGGCCAACACTGTCGTCTCTTTCGCCGCGGCTCTACCCATCTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATT:1 - chr2L 4154873 5' - Tirant 8428 2 68.00 CTTACCTTTTTGGTGGATAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 7075857 5' - roo 397 1 66.34 TTTCACAGTCACTGCCAGCGATGCATGGTGAAAAATCAGTGGTGTAATGATGAGCTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr2L 2060191 5' - 412 457 2 55.45 ATCACGCTAAACCTTAATGCATACAACAAACAAACCAAAAACTAACTATCTTTAATAAATAAATCTTCTAGTTGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 18577730 5' + hobo 25 1 80.20 TAGATATACATTCATATAGTTACTTTTTAAAGATAAAAACCATTCGGCTTTTGTGATTATTCTGAGCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGT:1 + chr4 419057 5' - Porto1 4312 1 64.36 TCCCTTTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCATTATTCAGCT:1 + chr3R 17733249 5' - INE-1 545 1 64.36 TGAAACGGCGGTTACTCATTGTAGCTAACGTTATCGCTGTCATATAATCGTTATCATTGCTCCATTCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCAT:1 + chrX 15096398 5' + Rt1b 5109 1 69.31 TAGTGTGCTGCAACGGCGAGCAATTTTTAAATCACAACAAAAAAAAATTATGTAATTTTTTTTTTTCAACTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTT:1 - chrX 9992535 5' - blood 7297 2 72.00 TAAAATGAAACAAACTTGAATCTTAAAAAATCGCATTTACTAAGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATG:1 + chrX 7828461 5' + G2 2972 1 58.42 ACCCGACTAGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAA:1 - chrX 20886046 5' - Ivk 5356 1 49.50 AAGTAGACCAAGTCAAGGGAAGCCAGCAGTCCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACG:1 + chrX 11398825 5' + Doc 485 1 70.30 GGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTA:1 + chr3L 10081937 5' + rover 30 2 61.39 ATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr2R 14246983 5' - 297 355 2 72.28 CTGTTGTTAAGCCCCTCCTTTCACCACTAAGATAGAGAATAACAAATTTCCATAATAACTGGCCATGTCCGTCTGTCAGTCTGCCCGTATGAACGTCGAGA:1 - chr2R 5045065 5' + INE-1 130 1 75.25 TTTAATTAATTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGATGAGAGTATACATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTAGTG:1 - chr2L 17599966 5' + 1360 453 1 62.38 TGGTATCTTGTAGCATATCTAAGGAAACCAAGTACCAGTGATCATTAACTTGTGTTCAATTTTAGTTACAGTTAAAATTACCCAGTCGGATCTATTGTACT:1 + chr3R 26102660 5' - baggins 5399 1 76.24 GCAAAGTGTCAAGAACTAGAGTCTTACAACTTTCGAGCTCAATTACCGAATGGTACCTGAGGAACACAACCCTGCACAAAGATCTCAAACTAGCCACTGTC:1 + chr2R 3205823 5' + BS3 1435 1 59.41 AAGTGTGGCAATAAGATAATGAATCTTTTAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr2L 7488960 5' - roo 411 1 76.24 CCACANCGAACACACATATGTGATAAGTATCCGCCCACTTACACCCACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAA:1 + chr3L 12874094 5' + Quasimodo 65 2 68.09 GCTTTATAAGTTTTTTGTTTGTTAAATATAGATTTTTATTTATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCGAGCTG:1 - chr2L 23024600 5' + Cr1a 4379 1 73.27 TCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTT:1 - chr3R 12047463 5' + Stalker2 51 2 73.27 AGGGGTGCACAATACTATTGGTTAAAGTGTGGAAGTGAATAAAAACATTGATTAAAAGCAAATAAATTATTCTTTTTATTTTTATTTTCTTGAA:1 + chrX 14839162 5' - mariner2 788 1 47.87 TTCTGGGTTTTGATAAACGAGGGTTTTTATTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAG:1 - chrX 22444496 5' - Juan 4161 1 73.27 TAATGCCACCAACCAGGCGATATCTTAACGGTCATTATTTGTAAGCTTATTTGTGGGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAATTCTCGGTTCCAAGTAGA:1 - chrX 8977372 5' + Cr1a 4099 1 66.34 TGGAGCGTGCCGGGGGCGGTCTTTGAAAGTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTG:1 + chr2R 7538158 5' - Porto1 365 1 72.28 ATACATTATCGAAAACGGTTATATCCCACCCAGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGG:1 - chr2R 4938893 5' + X-element 4431 1 65.59 CTTTCACATTTACACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr2L 19018928 5' + hobo 12 1 64.36 CATGCACAAAGAGGACGCACCTTGAACTAACGGTACAATATTTGTGCCTTGTACCCGAGCGGGCCGTGCGCAAAAGGGGAAATAAGGGGATTCCTGCGGCC:1 + chr3L 25889031 5' + gypsy8 322 1 92.08 GTCGCCACAAGCGGGTTATATTGTTGTATACTCTGCCTGATGTTGTGGTAGCAGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAG:1 - chrX 615909 5' - Doc 488 1 63.37 AAATTTAAATACAAATAATTTTTAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAAAACTACCCTAATATATACAATGTAAATTCATTTC:1 - chr3L 15643705 5' + 1360 3153 1 81.19 ATTGTAAGACGGAATTTCCGAGGGCAGGCGATCGAAAACAAAATCTCACTTTTCACCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTT:1 + chr2L 4114272 5' - FB 265 1 65.48 TCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCC:1 - chr3L 25232910 5' + GATE 32 2 53.00 AAAGGNTTTTTTATTCGTTCTCAGATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr2L 21010875 5' + opus 7044 4 80.00 TATGGATAGGCCAAATTGATATGCCTCAGTTGGTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 - chr3R 4834643 5' - mdg1 7378 2 67.33 AGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTG:1 - chrX 23108315 5' + BS3 1433 1 53.47 ACAAGTCGTGTGAGGGTGACTAATAACAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAG:1 + chr3L 14776566 5' - accord 311 2 74.26 TTTGCACCAACTTAAAGACTTTCCGAAGAATTTTGGCAACATGTGAGAACGAGAATTTCAGCAGCCACCCGTGTTGGCCAGTGTTGGAATATACTATTCAA:1 + chr2L 18430044 5' + copia 4868 1 77.23 ACTTGTCAGGAGCAGCCGCCAGTTCGTTCCGTTCGCCCATCTCCATAAAGTTATTTCAACTGCAACACC:1 - 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hobo 2918 1 58.42 GATCTACTGACTTGCGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 + chr3R 4600065 5' - HMS-Beagle 208 2 69.31 AACAATAGCATTCATAATGGCAACAAGCTTGGCCCTGTTTTTGGTTCGTTTTCACTGAGAGTTGGCCTTTTTTTCTGGTTTTGTTTTTTTTTTCTTTTTT:1 - chr2R 7746598 5' - BS 5117 106 72.00 AATTTGGGGCCCTAAGATTTTGTACTTTTATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr2R 16475757 5' + 412 45 2 71.29 AAGGCATCCCTTGCATTTCCCTTTCGAATTGACCTCCTCATTCATGTAGACTACTTTTAATTTACCTTCCCTAGCTATCCGTAGAACTATGCTTAGAACAG:1 - chrX 12996595 5' + Cr1a 4019 1 69.31 GTTGCGGTTATGATGGCCCACGGGCCTTGATGTGCAAACGCACCGAAAGCCGGCTAATTTGTACGCGAAGTCAGCGTTTGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTT:1 - chr2L 4779947 5' - Tirant 73 2 55.45 CTTCCGATTTCCACTCTCTTTTTACCACTAATTTTTTGCTGGCCAACTTACGCAGTTGAAAATCTATAAGCTTTGCCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTG:1 - chr3R 23668107 5' - micropia 5339 2 72.28 AGCAGTTCATTTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 27775151 5' - roo 9037 1 59.41 CATATTTATTATTGAATCGGAAAATGTAGATGAATTCTATTCATTACTAAATTATTGAAAATGCACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAA:1 + chr3R 11094485 5' - 3S18 6093 2 64.36 AAGATACATATTCATTGGGAATTTATACGCACATACATGTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 - chr2R 24021638 5' - pogo 2066 1 65.35 GTTATATATAGGATGTTGGCTATGTCTGGTGACTATGGTATGTATATACATACGTATAAGTCATGATGATTCGAATTCGCATTTAAACTAGCTGAGTAACG:1 + chr2L 22092954 5' + INE-1 535 1 62.38 AGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chr3R 24081616 5' + 297 27 2 61.39 CCAGATCCAGAACAAGTCCTGCAACTGGAGTCAACTCGCACCACTTCAGTGCCACCCCGATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - chr2L 12868147 5' + jockey 4790 1 62.38 TGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGAC:1 + chr2R 4860117 5' - micropia 32 2 66.34 ATCGAGGAAATGACAGGTACCCACAAAATAGGACTGGGGAAATTAAGGCGAAAAATAAACGTTGGCATTCGAAACACATAATAATAATAATATAATAATAT:1 + chr2R 23206190 5' + invader3 5048 4 76.24 TTGTTGTTTGCTGTTTCCATGCTTGATTTTTTGTTTAGTAAAAAATTACACAAAATAATATTATGTACAAATCAGTTAATTTACAATAAAAAAAAAACAAT:1 - chrX 3703191 5' + transib2 2638 2 65.35 GACCACTCGACTTGGCATCGTGTATACTGTATAATGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGG:1 - chr3R 27801339 5' - Burdock 6351 2 70.30 AACGAACAGTCGGTGCCGTGTTCCCTTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chr3R 13538973 5' - hobo 2886 1 78.22 ACAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTA:1 - chr3L 9909791 5' + Transpac 8 2 71.29 ATGTTTTGTAGGCCCGCTGCACATGGCAAGCAAACAACTTGGCCGGCCGGGAAACTCGAGGGGAAAACTGGCTGTTGTAATTTTTAATTTATATTTCCTTT:1 - chr2L 18430170 5' - copia 248 1 68.32 TTTGAAAAAATTTAATCTGTTGTGTAAGCTGGAATATAAACGAGAGAATTGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAACAACACCAAACAGCACTGC:1 - chr3R 1513122 5' - Cr1a 242 1 58.42 CAACTCCCCAGACAATGGGCAATAATCATTGATTTATGGCTGTCATTTTGGTTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTA:1 + chr2R 13077778 5' - jockey 4780 1 55.45 TTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 - chr2L 15947439 5' - Transpac 263 2 69.31 TCTTTAGAAATATTGTACAAAAATCAACCAACTAAATTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 7906425 5' + roo 8703 2 67.33 CGAGTAAATTTAAAAGGAAAAATATTTATGAAAGAGTATACTGCCAACTAAAGTCCTTTTTACACCTACATTTTTACTCGAGTTACTCGACTATCAGATAC:1 + chr2L 9085791 5' - INE-1 558 1 47.52 AAATAGCAAGCTCTTGGCTCAGTCCCTCTGTCTCTCTGTGTGCAGGTTGAATATAACTGGTTACAAATGCTTACAATCAGATGCCACCTTCACCAACATCA:1 - chr2R 5877867 5' + Chouto 6178 1 52.48 GCTGGNAATAGAATAAAGGATGAGGCATAAGTAGCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTA:1 - chr3L 22683764 5' - F-element 4221 1 66.34 TGTATATATGTTTAGGTCGTTTGTGAGTGGCTGGCTGGCCGCTGGCTCCTGTTGTTGTAAAATTATAACC:1 + chrX 13635040 5' + Gypsy12A_LTR 305 1 82.86 CCAGGTGCGAACCCGCATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAG:2 - chr2R 20744260 5' - roo 412 1 76.24 TATGTTTGCAGAGCAGCTTATTTAATATCACACACCATAACTATTTTCTTTCCATCCCTTTGGCTCTAAACCCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACC:1 - chr2L 3182569 5' - Cr1a 254 1 71.29 CCAGAGCCAATAGTCAGTCATCAAGGCTGTTTGCGGTCTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr2L 19019042 5' - hobo 2935 1 73.27 AATATAGATTTTTACGAATACTAAGATGCGTGATAAACTTTAAATGAATGGACGGACCGACGGAAATGGCTAGACTAGTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chr2R 15003594 5' - INE-1 85 1 79.17 CGCTTGACAATTGCTTGCTAATGAGACCCAGCTTATAATGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chrX 19162598 5' - pogo 2068 1 62.00 CGGGAAGATACTGCTGGATGGTGCCCGGCATGCAAAGCATTGTCAAGTGGGGAGCAGGCCAAGTGCTACACAAAAACCGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAAT:1 - chr3L 20950523 5' - McClintock 9 2 80.20 GTGCGATAATAAACTTCTCAACAAAGAGATTTGAAATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAA:1 - chr2R 4907732 5' + invader2 433 1 74.47 AATGTATTGAAAATAATTCTGTTATACTTTTTGCCTTGCGGCGCCTAAATGGGGATGCAAACCGTATATTACCTCCTTATTCAAGTAGACTACTTTTAATT:1 - chrX 16527012 5' + Cr1a 3976 1 80.20 GCACCGGCTATATCTACTACGGCTATGTGGCTATATGAGTATGGGGTGTGGGGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCA:1 + chrX 838436 5' - accord2 194 1 52.48 CGACGCCATCATCTACTTTAAAAGCATTTGTTGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTC:1 + chr2L 13345649 5' - flea 315 1 67.33 GAGTTAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2L 2060130 5' + 412 35 2 57.43 GTTGTGCACGGCCAAAATGTCCTCAATTCTCACTCACATTTGTAATTAGTCTTAAGTTGAAAGTTAGACCGTAAAGTTCAATAAGTCTTAAACCGATATT:1 + chr3L 23840050 5' + McClintock 307 2 81.00 TCAAAAAAAAAAAGTGTGTCACTTTACCAAATGGGATCTTCAATAACGATCCCTAACTGTTCAGAGACTTCACTTTACTTCAATACTTTACTTTACTTTAT:1 + chr2L 3507551 5' - TART-A 13110 1 79.21 AAATTTATGGTTTAGAAAAATGTTGCCAAAAAACTAGACCGGAATGGTGGGTGGTCGTCGTAGCTGGAGGTTGCGGGCGGCATGTACGGATTATGAGCGGA:1 - chr3L 9243722 5' + diver 5886 1 74.26 CGAGTAACGGGTATAAAAATGAGTTTAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 - chr2R 1523396 5' + 297 6626 2 79.21 AAGACGCTAGAATTCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 + chrX 15293411 5' + Quasimodo 12 2 64.36 AGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 - chr3R 6608822 5' + I-element 43 1 68.32 GCATTCTTTCCTTCAAGACAGAACATTCGAACAAATTGCTCTGCACACATTAGGAAGATTTCGAATGGCTTTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAA:1 + chr2L 14536865 5' + Doc 449 1 85.15 TTTTCGGTTTCATATTTGTTTACTTTTGCTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAAAAACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACC:1 + chr3R 13225158 5' - hobo 356 1 72.28 CAGATAATTTAGTTGGCGGCGGATAGTTTTGCAACAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTC:1 - chr2L 9031000 5' + I-element 266 1 66.34 CACCCAAATGGGAGCTGAAAAGCTGATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr2L 9774292 5' - 412 441 2 76.24 AGAATGAAACTGAAAAAACTTTTTTATTTACTTTTTAAAACACAAAGTTTGTTCCAAAATAATTATATTTCATCAAATAGCGTGTGAAAAATTAATAAGGC:1 + chr2L 23174568 5' + 1360 432 1 76.24 TAAAGAGCGAAAAATGTTTGCATACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr2L 20238645 5' - hobo 2928 1 66.34 AAGGTAACATAACTTAATAGTTTATACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCATGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3L 2019736 5' - 412 7525 2 53.47 TTGAAATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr2R 14708947 5' + Doc 15 1 70.30 GTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGGACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr2L 12325067 5' + jockey 4716 1 70.65 CCCGCCGCCGTTACTGGTGAGTCATCAAATCCAACTGTAATCTCTGGATTGGACAAGTTTTTGCAGGTCATATTCAAACGGGATCTTTTCACACTCTTCGA:1 - chr3R 26257219 5' - S-element 1329 1 56.44 CAATCNGTGGCAGGGGAAAAACACAAAAGTATGGGCAAAACGAAAGCAAAAGTTCAAGTCGGAGAAAAAGACAGGACGACGGCTCTCAATTCAACGCAACA:1 - chr3L 7752065 5' + F-element 243 1 79.21 CTACGCGTAAATGCTGATGTGAGTAAGCAAAGAAACCGAAAACGAAACGAGAGCAATCGAAACAAATTACACACAAACTCCGTTAACCATTGTAGGCAAGC:1 + chr3L 25952826 5' + Doc4-element 226 1 63.37 TTTCGATCGCACGTTTAGGATTTTGTTCTGGCTTTTTATCATCAATATTCAGTCACCCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chrX 22574840 5' + jockey 4758 1 55.45 GACACCTCCCGAATAATCGCTAAACAAAAACAAAGTTCTTTGCCACACACATTAAAAACAAATTACAAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATAC:1 + chr3L 19430653 5' + Stalker 6895 4 67.00 CTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3R 20149759 5' - 1360 3340 1 76.24 AAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr2L 13574219 5' - pogo 2054 1 76.24 TTCATGAAGAACACCTGTACATATTCGTTAAGTAGTAATTTAAGTAAAAACAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATTAGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACT:1 - chr2R 3339402 5' - diver2 4632 2 51.49 AAAACAGTAACAAAACTACCAAAACTACGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTA:1 - chr2R 13403996 5' + BS 44 1 73.27 TTAGTTTAACATTGAAAAAATTTGATTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 11052309 5' - transib2 2645 1 89.74 CTGTGAAGCTTAATGTTTCGTGTTGATGTGACTTTTTTCCACTGTTTTTTTCCGGCTTCTTCGCTCGGTATTTTTACAGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTT:1 + chr2L 16136698 5' - gypsy4 485 1 81.19 GTCCGGCGGTAAGTCACATTTAAATCTGAGCTCCGCCATTCCAAGCGCAAGTCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGT:1 - chr2L 22015618 5' + Quasimodo 7180 2 57.43 CACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTTCAGAGGGACCTTTTCCCAGGGCCCTTTATGTTTACTCTCCCTTTTGTACGTTGTTCGCAGTGCTGTTCGGTGT:1 - chr2R 3341945 5' + Cr1a 237 1 59.41 ATGGGCATGGTAAAAAATGAAGCGCCACCGATCCCGATTAAATGAGAAATCAATTGTGGAAAGATATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTCCAATA:1 - chr2R 15506251 5' - R2-element 234 1 65.35 AGTATTTTCAGTGAAAAGTGGGCCGACCTATGATCTTCCATTTGCAGTAATAAAGATAGCAGTTTGGGACACATAAAATACAAAGTATTATTATTGATCAA:1 + chr2R 21757828 5' - Quasimodo 7334 2 50.50 ATTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGGTCACGCCAGAAGGGCGAAA:1 + chr3R 15598678 5' + Max-element 1 2 57.69 TAATAATATATCATAGTGTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTG:1 + chr3R 13582200 5' + BS 5003 1 69.31 CGATACGGGCGCATTAAAATTTAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAGGTAATTGTGATC:1 + chrX 1523992 5' + jockey 62 1 78.00 GGACTGAGCAAATGTTGCGGCAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2R 14713616 5' - 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Doc 313 1 62.38 TAACAAATATTCGATTTCATTTAAACTTTTGAAAAAATTCAAAAAAAAAA:1 - chr2R 21856611 5' + TART-A 13400 1 60.00 CTGCTTTTCGGGGCGCTGTCTGGCTGTATGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr2L 19019005 5' - hobo 2914 1 63.53 CCTTCGCGATTGGCAGCGATTTTTTATTGGCCCAGTGCCGGCTAAAATAAAGACGAAAGCCTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chr3L 22039688 5' - jockey 4977 1 62.38 ATTTGGCCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 - chr3R 6117300 5' - Tirant 8469 2 62.38 CTTAACTTAACTTAACTTAACTTAAATATATATCCGAAATACTTTTTCAATTTCTAGATTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr2L 16434991 5' + Doc 29 1 79.21 CTTAGNACCGAAGATGACTTTGAAGATAACACAGTAACGATTAAAACAAAGTTCCGAAAAATGGAAAATGTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACAC:1 + chr3R 2471356 5' - Cr1a 4441 1 89.11 CAAGCGGTCATAAATAATTTCGTTCTTGTAAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAG:1 + chr3L 979487 5' + 297 185 2 80.20 GGCCTGAAGTTATTTTTATTGTCCAACTAACGGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATA:1 - 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roo 404 1 71.29 TTAGGAAGAAAAATACTGATGGAAAATAACGGCTTAATAGACTACTTTCGGAAGGAAACAATAATTACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 - chr2L 22919511 5' + I-element 230 1 66.34 TAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTGGAATAACAAGATGC:1 - chr2R 16880921 5' + 1360 4 2 77.32 AAAGTNATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 - chr3R 24760611 5' + pogo 40 1 76.24 AAGCCATATACAGGTGCGAATAAGTAAGTAATAAGTAAGTATTAAGTAATTAATAACTAGAAATATTCTTTTTTTCCTTTTCTACTTAATAATTAAGAAAC:1 - chr2R 9500038 5' + G5 4731 1 60.40 CACATAATGGCAACAATAAGGAAATCGCATGTGCAGAGGCCACAGGCATCTAGATTGAGATAAGGCGCTCTGGAAAGTATTCCCTCAAAACAGCCATCGAT:1 - chrX 22791272 5' - mariner2 496 1 64.36 TATGGTGGTGGGACGCTTTTTGCTTGTCGATATTATCCTTTACTGCGTGAATGCCGATATCCCAGTGAATGTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCAT:1 + chr2R 4706141 5' - INE-1 139 1 75.25 TAGTCGATTATTTTAATTATACCTTATTATTGTAAATATACGTAGATATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chrX 21017861 5' + 412 7082 2 55.45 ACTCATTATATTCGCCTCTTAAAACACCATTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 2937516 5' + hopper 141 1 62.50 GCGGGGCGAGAACAAAACCGCTCGCCTGCCGGCTGCCAAAGTCAATTGCACTCAATTAGATCTCAATTATTTGGTACACATAGTCTTTCGAATTGTTTAAG:1 + chr2R 7205510 5' + Ivk 5202 1 67.33 AGGCTTACAACTACTAAAGTTTGCAACCCTCAAATTTAGAAGCCGCCATTGAGCCACCCAAAAAACCAGAGCTCCACCCAAAAATTAAAAAAAAATAAAAC:1 - chr2L 16470750 5' + Doc 4697 1 46.53 GATGAAAGATTGCTCCCTATTTCCCTGATACTTTGCAAAGCTTTTAATAAAAACAGGCAAAATGCCAACGCATTATGTTTTGAATTTTAATATAATTTTAA:1 + chr2L 21085257 5' + Rt1b 121 1 65.35 AAAGCCATTGTAGGAACGATCTACTGACTTGCGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAA:1 + chr3R 4600048 5' - HMS-Beagle 225 2 58.42 GTTCAGCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGC:1 + chrX 15089056 5' + gypsy 7009 2 57.43 TAGCAGCAAGTGCGAGGCTAAATCGAAATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTA:1 - chr2R 9382287 5' - Bica 4886 1 73.27 AGCCACTTTGCGACGGGCACGAACCTGAAAAAAAAAAGCAACACCAAACAGCCCTGCAAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAAAACAAAGACGAAA:1 + chr2R 17649801 5' - Cr1a 198 1 64.36 ACAATTTGCCAAGCATTAAATCCCTAACTTCTTTAGGCCTTAGCCTCGGGGGCGGGCTTGAAGCTCTCGCGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 - chr2R 19698439 5' + jockey 4746 1 68.32 TGGATNGTTGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTT:1 - chr3L 18337731 5' + Juan 4033 1 69.31 AAAATCTCGGGTTAAAATCAGCTGATCAGAGTCAGATTAGCGAAGAAACTAAAAAACGCTTGAGAGAAGATTACAGGCGCTCCTTGGTATATGAGGACCAG:1 - chr2L 6715969 5' + jockey2 2998 1 44.55 GGCATATTACTAATAATGTGCTACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGA:2 - chr3R 19346995 5' + blood 7011 1 79.21 ATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGC:1 - chrX 3305191 5' + transib2 49 1 73.27 CAAAAATTGTGTTCCAATATGTTTGAATTAGGAACATGTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chr3L 16218197 5' - roo 9035 1 61.39 GCAGAAAAATTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 - chr2L 3440526 5' + Juan 9 1 74.26 CGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr2R 20744215 5' - roo 9030 1 68.32 GTGCATATATCTTTATACTTAAATATACATCAATACATACCAAATGGCAACTATAAATACGAAATACAAATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3L 17345007 5' - mdg1 415 2 70.30 GTATGCTAATTTGCAAATGATGCCGCCGTACAGCAGCACGCACACGCAACAAATAATAAATAAATAAATTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGT:1 - chr2R 7911857 5' - S-element 1707 1 68.32 ATGATTATAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTCGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr3R 27981756 5' - roo 402 1 68.32 AAAAAAAAACAGAGAGAAGGAATACTGACTACAAGGCTGCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGTTATTAGCGCGTTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAG:1 + chr3R 13451674 5' + rooA 7415 2 61.39 GTATCTAAAACAATTAGTGTCGTTGCATTCTGCTTTCAGTTTGAATTTGCATTAACCATATTAAGAAGCGGCAGCTTGTCAACTCCGACTAAGCGTTGTAA:1 + chr3L 23149471 5' + Gypsy6A_LTR 208 1 67.33 GCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr2R 10543487 5' - P-element 2832 1 24.75 ACCACGAGGGTATTTACTTTGGGTATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAA:1 + chr2L 22079593 5' + gtwin 8 2 53.45 AGATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 11119894 5' + 297 6 2 73.27 AAGCGAGATAGCAAAAGGGGGCCGCGGGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chr3R 9551488 5' + P-element 31 1 48.51 TTTAACCGCAAAAATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 - chr2L 14790674 5' - roo 402 1 72.28 AAGCGAAATTCTCTTTGTTTTGTTTGGACTGTATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chrX 8491456 5' - P-element 2841 1 33.66 AGAGGCAGCGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:2 + chr3R 12047392 5' - Stalker2 7640 2 67.33 GGTATTTCTATTACTAAACGTGTTAGATAGGTGTGTATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTCCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAAT:1 + chr2L 1380401 5' - 1360 3166 1 64.36 ATTTATTAAAAAGATAAATTATTAATGTCAAATCTTATGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTA:1 - chrX 21564728 5' + diver 42 2 71.00 AAACAGAATCAAGTGAGGCTTGACGTAAGCAGAAGAGTTGATATATATTTCAATACGAGTATATATACATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCT:1 + chr2R 7775705 5' + Transpac 4925 2 73.27 GCACATTGTTGTCTGCTTACTAGGGCTTCTGTTGTTGCAGTTGTTATGGCAGTTATTGTTGCTAAATGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTGCT:1 + chr3R 9187553 5' - Doc3-element 491 1 68.32 ATTATCAAAAATGCTAAAGGGTGCTTTCACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGAC:1 - chrX 13482529 5' - Stalker4 81 4 72.28 ATATATAATTACCACGAGGGTATTTACTTTGGGTATATAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATATAAAC:2 + chr2L 22079583 5' + gtwin 41 2 63.37 ATGAAGCAGCTGATTACTAGACAACGACGATAAGAAGAAGAGCAAAGACTCCAATTAAAAAAAAGGCATGCTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAG:1 - chr3L 24208479 5' + INE-1 21 1 55.45 CACTCGTAAAAGCCCACCGAAATAGAATAGAAAGGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2R 7861485 5' - roo 9055 2 42.57 CTCTCTCTCTCTATTTGTTTGTCTACCTCCTGGCACCTGCACTATCCTAAATCGAACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCG:1 + chr3L 14065430 5' + Doc 401 1 54.46 TACAAGTATCGCAATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chrX 10672370 5' - mdg1 397 2 54.46 AGTTTTAGGATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 + chr3R 17321718 5' - Stalker2 365 2 60.40 AAGATGAACGGATTCTTCACTTAATAAATATAAAATACAAAAAAATTTAATTTCGCGTTTCCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1 + chr2R 2959896 5' + INE-1 549 1 59.79 GCGGGGCAAATGCAATAAAGTGATAAATATGGCAAATCAATGGTTTTTTCCAATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTG:1 - chr2L 3197110 5' - F-element 4504 1 61.00 TTTAAAGGATAGCTGAGTCCACCTGTGAACGATTGGATAATCTTCTCAATAAAGGTTTTTATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAA:1 + chr3R 4078479 5' + S2 150 2 72.28 GTTTGGTTAGTTCACATGGCTGATAAAGGCCAAAAGGAACAGGAACAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACT:1 + chr2R 22273108 5' + 1360 371 1 55.45 CAGTCTCAGTATTATACTTTTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr2R 6173094 5' - pogo 2091 1 69.31 AAATACGAATGCAAACAAACACAAGTCCCTGTCCTTGTGTGTGTCTCCGTATTTGTATCTGTCTCTGTGTCTGTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATT:1 - chrX 20547311 5' - accord 7026 2 55.45 TTGTGCCATTATCTGAGAATATTTTCTTCGGTGTTGCTCGTCGAGACATTAAGTTAGTAAGACACATCGCACAAGATGTGCACACATTGGCCTCATATG:1 + chr2R 4621649 5' - Bica 4846 1 76.77 AGACTGATAAGGCTGTGCTCATTGTGGATTTATACATTAAAACAGGGAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAG:1 - chr3R 6773040 5' + Burdock 326 1 57.43 TCTGCCATCATTTACAGGTCATTCAGCACACCTGATACCCCAACTACATAAACTTGGTGAGAGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 - chr3R 10751719 5' + hopper 13 1 45.54 TTTTGTTTATTTTAACTTTGCTGGTTTTTCTTTGCTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGATTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr2L 13641813 5' - HeT-A 6057 2 60.40 AGTTCCCACGCTCTTTAGCCGCTTTAGGCTGCATTCCAAACGCTTCGATTGTTGGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTC:1 - chr2R 23622552 5' - jockey 4920 1 63.37 GCTGACCAAGGAGCAGAAGAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr2L 12949198 5' - 412 7526 2 56.44 GGATAAAATATATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 21092422 5' - roo 9065 1 61.39 ACGCAGCCACTCGGCCTGAGTACAAATAATAAAAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATC:1 + chr3L 6099530 5' + mdg1 7139 2 76.24 AATAGTACGATTTTCAGCACTCGCGGCAGGCACTTAAATCCTTTTGAATTGTGGCAAGGACATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chrX 2753912 5' - roo 393 1 66.34 GCACATAAGCAAATACAATTAAATATTTTATCACCGAAACCAAAATAAATTAACTTTTTTGTGTAATCGTGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2R 10774014 5' - copia 248 1 70.30 CTCAGTTGCCTTATTATGTCGTTCTGAGCACTTTTGATTACTTTTTATCCGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 18950835 5' + roo 8670 2 74.26 GTTTTAAAGAAAATGGTTGAAAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 - chr3R 17896984 5' - hobo 2900 1 79.76 TATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr4 96889 5' + Doc 5 1 54.46 CAAAGCTTCGCCTTGACCGTGCCCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTCTTTAGAATTAGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTG:1 + chrX 19174024 5' + accord2 7396 1 79.21 GTTTAGTCCAAACAGTTTACCTTTAAAAAAGTTTTTTTTT:1 - chr3L 19127780 5' + FB 405 1 52.50 AATTACTTTTATCTCAATCACCATTCTACTTCTGTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCA:1 - chr2L 3340009 5' + FB 45 1 69.31 AACCTCACACCCACCAGACTTCATTTTTAGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCT:1 + chr3R 18693643 5' + jockey 4549 1 71.29 CAGAGCAACAGCTTCCCATCCTCTTCCATGCCCCCGATCCACCACTTCCCCAGCTCCCTTCTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAA:1 - chr3R 7416862 5' + I-element 4920 1 64.36 AGGATCTTCACTGTGGCTCCCGCAGCTGAAGTGCGGGCACTAACTAAGAATAATTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAAT:1 + chr3R 22801055 5' + flea 4984 2 56.57 AGATTTTCTATTGGGCCTAGTTGTTCTCACCTTATGGGGATGTCGTCTCTTTCGTTCGCTTTGAGTAGCCGCTGGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCT:1 + chr3R 19384096 5' - F-element 229 1 73.27 TATATATGTTATAAGTTATACAAGTTCTTAAACCTACTGCATTTTCCCACAAAATATAACCAAGCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAG:1 + chr3R 21092430 5' - roo 9057 1 53.47 AGCCGAGACGCAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr3R 6273590 5' + blood 24 2 56.00 TATAATCATATTTAAAAAAAAAAGGGTTTTTTATCTATAGCCAGCAAGTGTATTTTCCTTTTTTTTTGTTTT:1 + chrX 12571552 5' - Doc2-element 248 1 66.67 TTAAATTATTTCTGCGTGTTTCAAAAGTTTTCTAACAGTCCATTTAATAATGCAAATAAAAGTTTGGTCATTGGATGAAATTTGCTTTATTTCATTTTATT:1 + chr2L 16646658 5' - TAHRE 30 1 92.08 CACACACTTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 17928937 5' - hobo 2924 1 63.37 ATTAAATTATTTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGA:1 - chr3R 32005971 5' + invader4 8 2 72.00 AAATTCATTTAACCGCAAAAATGTCAAGCCGCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr2L 14790681 5' - roo 409 1 79.21 TTTCCCCAATATCTATCGATATCCCAGAAAAATAATCATGTTTCGCGTTCGCATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATTG:1 - chr3R 24175228 5' + INE-1 566 1 82.18 GGTTTAAACAGGGATCTTTAGATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAAC:2 - chr2R 4547809 5' + HMS-Beagle 54 2 79.21 GACGACGCTTTCGTAATTGGTTCAAGAGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr2R 23571633 5' - roo 9038 1 58.42 ATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr2L 5646903 5' + jockey 4698 1 52.48 CGGCGCGACCTTGAACTCCTCGAACTCAACTCCAATGCTGTTACGCGTAATGAAAATGTAATTTTGATTGGGTGAAAATGAATTAAAGTTGTGCACACGTT:1 - chr2R 20843935 5' + Transib5 146 1 81.19 ATTGACATTTTTAAAAGCCAATATTTCTCTGACTTGCAGTTTCCTTTTCGCGCAAAAGTACGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chr3R 8555942 5' + 412 7070 2 61.39 CCTCAATTGAAACCTCTCACGATTGCTGTATACAAAAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCA:1 + chrX 21564651 5' - diver 212 1 61.39 CATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:2 + chrX 15305629 5' - roo 386 2 56.44 ATGCATAACGAATGGCGTTCCCGAGGAGTCTGAATGCGATGCCCCCGGCTAAGTTTGGCTTTCTTTATGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGC:1 - chr2R 11171066 5' - 1360 3195 1 77.00 TTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr2L 8565508 5' + blood 7061 2 75.25 TGTAATTATAAACTTATCTATTTGCCATTAAGAATGGAGTACAATGTATGAATGCCATGTATAAAGTCATAATATCTACAAAGTAAAAAAATTAAAAAAAA:1 + chr3L 10480250 5' + HB 320 1 74.26 ACTAGATGTATGTATGTATCTATTCTGAGTTTACCTTTTCAATTTTCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGGTGACAAAAG:1 - chr4 970910 5' + Tc1-2 192 1 70.41 TTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 - chr2L 15947460 5' - Transpac 284 2 53.47 TACCGATTGTCCGCCGCCCTCCTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr2L 12815011 5' - hopper 1412 2 76.24 AAGAACAAATTAATAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 + chr2L 20824634 5' - pogo 2086 1 82.46 ACAGATGGCGTCATTCGTTTGCATTGAATGTGGTCAGGAATTTTAGTATTTTTTCCTCAGACCATTTGCCTGAAGAACCCGAATTTTATTCAGGTGCGTTT:1 + chr3L 21381434 5' - jockey2 2938 1 68.32 AAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 + chr3R 8555855 5' - 412 7507 2 64.36 AGAAAATAAATATAAAAATCAGGATAGATACAAGAATAAAGAGGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATG:1 - chr2L 19260868 5' + F-element 122 1 57.43 AGTCTTACCTTCATCAAACACTATAAGCAGGATGTGTCCGATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGTTCATACGGACAGAAG:1 + chr3L 9001346 5' - INE-1 128 1 59.79 GACAAAAGAGTCTGCAGAGGAGTCCTTGGCATAGCTCCACTCTTCATTTCCCTCGACATTCTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTAC:1 - chr2R 13295542 5' + Tirant 8304 2 66.34 CACTTNGTGAAGCAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAATTTACTCGT:1 + chr2R 19551963 5' - roo 398 1 67.33 TTGTTAATTAAGCTGTAAACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr2R 13650089 5' - mdg1 7445 2 65.35 TCACATTCGTTTTTATCTTCTCTCATTTAAAATATTTTTTTAGCAATATTTTTATTT:1 - chr3R 14489572 5' - HMS-Beagle 330 1 82.46 GGTAAGGGGGGCAACGACAAGGGACATCTTGGTCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCAT:1 + chr2R 7469300 5' - F-element 4272 1 68.32 GTCAAATTTTAAAAATCTAACTTCGTTTACTTTTTTATATCGATATAAATATTTATTTCTTCCTTGGGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2L 8308273 5' - P-element 2877 2 65.35 AACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 4876776 5' + roo 56 2 82.18 ATGGANTTGGAACTAGAAAGTCACGACTTATCGATATGCCAAAAAGAATATAGAACTTTCTCGTTCGTATTCCCACTAGTTCAGTAACGGGTATCTGATAG:1 - chr4 601172 5' + INE-1 547 1 73.27 TAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 17587846 5' - roo 9038 1 59.41 TGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATA:1 + chr2R 1320688 5' - diver2 4872 2 46.53 AACCAATGCAAACAAAAAGAGACCGCCCAGAAACTGAACAAAAAGAAAGTAAAAATATTTACATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAT:1 + chr3R 32005861 5' - invader4 311 2 63.37 AGCCCAGCTGCCATACCAGATCCCACCTACCAGCTTACATTTACCAGTTCTCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATA:1 + chr3R 12778792 5' - hobo 429 1 53.47 AAAAGGGATTCGTAGTCAATCGGAATTTAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chrX 20620545 5' + pogo 43 1 74.26 AAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACATA:1 - chr2L 15955325 5' + Quasimodo 24 2 59.41 TGCGAAAAATGTTTGCATACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:2 + chr2L 20238650 5' - hobo 2923 1 63.37 CCCGTTCATGGGCCTCTTTTTCGCTTATTTTTTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTT:1 + chr3R 19543118 5' - BS 4704 1 68.32 TCTCTCGTTGCCGGTGTAAATAACAAAGCCAGCAGAGCGATAAGTAGGATTGAAATAATATACATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3R 31101356 5' + 297 6590 2 64.36 AATACTGTCAAAATATATTACATTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGA:1 - chr2R 7999669 5' + Juan 37 1 61.39 CGTGGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACAACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chrX 4413257 5' + hobo 37 1 62.89 CGGCAACGCAAGGGGCAGATGGCAGTCTTATGTGGTACATACGGGCATGTATTTAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 + chr3R 9549546 5' + P-element 75 1 62.38 ATATGAGCCGCAAGAAAAAGAATCATTTAAATTTTACACATTGATTGGATATTTTTATTGATGTATGGTTTTTTTTTTTGTGTTTTTGTTTCTTTTT:1 + chrX 21061856 5' + pogo 302 2 60.82 TAAAAATCGCATGCGAGAAAAATGAAATCAAGTCAAAATTATGCGCATAAGTTGTTGGTTGGGCAGGTGAAGTTGGCCGTAAAAAGGCGCTGCTGTGCATC:1 + chr3R 21703380 5' + Rt1a 4842 1 72.28 AGAAAATAGTTAGATGAGCGCAAATACAACAGAACGAAGCTGGCTACAATCAAGGAAATGGAATGTTTATGCAGATTTTAATTTAGTAGGATTTATGTCAA:1 - chr2R 8426879 5' - jockey2 3213 1 62.38 TACATNTATTAGACCAAGCCCTTCTAGATCCGAGATTTCTGTACATTGTATGTTTATAACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 - chr2L 21327504 5' - flea 4995 2 58.42 CAGCCAATATAAGTACATAAACAACTGAGGGAAGGATGTAAGGCAAGCCTTACTTACTGATGAGAACGGCGCTACCAATATGCCAACTATGC:1 + chr2L 9061448 5' + Ivk 5101 1 55.43 TTCTTGCACTTTTTCCTCGTCTTTAGCTGTTGCTGTTGTTGTTGTTCTGGATGCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGTCTCCGACGCTACAGCTCC:1 - chrX 20537541 5' + gypsy2 6699 2 54.46 GACTGTCACAATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr4 1149919 5' + 297 6615 2 72.00 CACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr3R 13225549 5' - hobo 2893 1 68.00 AGAAGTGGAGGCAACTAAAAGCTTATTCCTTTTAATCAAATATTTCAACCACATAGAATCCAATTTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATC:1 + chr2R 17927306 5' + R1A1-element 5221 1 72.28 GTCCACTACGTGACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTT:1 + chr2L 12474954 5' - mdg3 227 2 57.43 CACGCATATGCAAGTCGATAAATGTCTCTGTGTGCTGGCCTGCATATAGAATTTATATAATATTTTTGTTAACAGATATACTATGTATGTGTGTGTGTGTG:2 - chrX 6417849 5' - Quasimodo 40 2 83.17 CCGCGCCGATTGTTTCGCTTATTGTCATGCTCGATTTAACCGCTTAGAGTTGCGGCAGTACGGAAAAATACTTCACTTTGCACTTTTTCGTTTATTTGTCA:1 + chr3L 2418096 5' - gypsy4 337 2 70.30 AGTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 20878455 5' + 297 6608 2 53.47 GATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 7861722 5' + roo 43 2 74.26 GTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3R 7522284 5' + blood 7026 2 64.36 ATAATNTTTTCTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr3L 2019670 5' + 412 7099 2 71.29 ATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTCCTCCTATTTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCT:1 + chr3L 24039755 5' - Transpac 4951 2 63.37 ATTTAAATTATTTTACAAAAAACATTGAAATTTAGGACTAATATTGTTTAATTTCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCTGGAAGCCTCT:1 - chr2L 11254920 5' - TAHRE 10078 2 54.17 TGTGTTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3R 15072549 5' + pogo 6 1 70.30 GCACATACATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAA:1 + chr3R 7168547 5' + flea 12 2 67.33 TGAGATTAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr3R 11119896 5' + 297 4 2 75.25 AGAGACGTGCGGGAGCGTAAAGCCATTTGTTGGCGGGTTCCGCTGAAACACCTTTTGTAGATGAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCT:1 - chr2R 3073479 5' + 1360 3279 1 72.73 CCCCGAAAAGTGTGCTACGCTTTTTTCGTTTTAAAAATATTTCGCAGTCTTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chr3R 22644139 5' - hopper 1389 1 53.47 GACACCAAATTCTGGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr3L 10143176 5' + 297 46 2 78.22 ATTACTTTATTGCGTCTAGATCAAAATTAATATAATGACATAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAACAGCAAAAAACACACAAATAA:1 + chr3R 27172120 5' + Porto1 4442 1 68.69 CTTGGACACAGGATGTGCAATGAGAGTTGCCAAAAAAAACAATATATGTACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2R 18675480 5' + opus 22 2 58.42 AAAACGTTACGCCGACGCGGTAGAGAGTGATGCCGAGTATAAAAGTAATTCAGATCCAACATATACCATATATTTTTTCGGGGGCCAGTTATTAATTACAG:1 - chr2L 22490471 5' - HMS-Beagle 252 1 72.28 ACGAGNGGGGGCCACTGTATCCAGGGCGCAGAACAAAAGAGCTCCAGTGCCTTGGCTAGGTGATTCCTGTGGTGCTCTAGCCTGTCGTGTTACCGGCTGG:1 - chr3L 20710913 5' - BS3 1479 1 61.00 GGGGGCCGGCCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 + chr3R 6117224 5' + Tirant 8127 2 57.14 GTCAGAAAGATTGTACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGCTGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAAAA:1 + chr3L 12103760 5' - roo 410 1 76.84 TACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGT:1 - chr3R 29288793 5' + BS 5000 1 68.32 GGTATAACTACCCATGGCATAAAGGTTTGTAGGCGTTATAGAGGGTGTGGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 27291131 5' + 1360 29 1 77.23 CAACATATATGTATGTACATACATGTATGTACATGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGTTATGTTATT:1 - chrX 15089125 5' - gypsy 7432 2 55.45 CATCGAGAAATTCGAACATCTTATCGCTATCTTCGCACTCTTGAGAAGAAGGGGTATTCTAAACTCCCAAAATCGACTGACTTAAGTATAGCAAGCGTTCT:1 - chr3L 17813280 5' - Burdock 114 2 63.37 TCCCAACGGATGTTTTGATACGTTTTTATGAGACGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chrX 2799689 5' + Tirant 8148 2 68.32 ATTTTCTAAAAAAAACAGATGAGGTTAGTAAGATGTACACTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCAGGCTATGCTTTTCAT:1 + chr4 346604 5' + Tc1-2 40 1 65.31 GACAAAAAGATTAGGGCTTATAGTGCTATTATATTAGACTTACTCCTCGTTTTCGCTTTCCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTC:1 - chr3R 25336073 5' - 1360 122 1 67.33 TGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 + chr2L 11703241 5' - Tabor 445 2 62.38 ACATATGTACATAAAAATAGAACATCAATCAACGTTGATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:2 - chr3R 16834076 5' - I-element 5313 1 62.38 TACCTAAAACGAAAACCCTTAATGAAAAGGTAAAGCCTACCATATGAAGTATATATTTTCTTGAACAGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCG:1 + chr3L 21324163 5' - R1A1-element 5064 1 78.22 ACATAAGTACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAA:1 - chrX 3305226 5' + transib2 14 1 63.37 TGAAGNAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 19551970 5' - roo 9054 2 60.40 TTATTTATCTAGTTTTAAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr3R 16245120 5' + 1360 19 1 58.42 ACGTGTGTTTTGATTACCGATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3R 20556110 5' + Tirant 17 2 64.36 CAGTAATATTATGATGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2R 7861737 5' + roo 28 2 59.41 TCAGTGGCTAAACTTTAACCCGCAGACAGGTCTTTTTTTTTTCGATGGAGAAAGAGAAACGAGGAGGGGGCGTGACGGGAATAAGAAATGAAGGGAAAAAG:1 - chrX 2506075 5' - hobo 2643 1 73.27 CTTAAGTTGTAAAAAAGATCTTATGTAAAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATT:1 - chr3R 13582316 5' - Tc1-2 481 3 77.23 CGGTAAGCTCTAACAACCCCTAAGCAGCACGTTTTATGGTTCCTGAGATTTCGGCGTTCATACGGATAAGGCTAGATCGACTCGGTTTTTGATCCTGATCA:1 + chr4 253284 5' - INE-1 91 1 70.30 ATAGGTGAATTTACATAAGTACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chrX 3305238 5' + transib2 2 1 75.25 GCACTCCTCACCACCCCCCGCATTTAATGTAATGAATCGACAGTCCAAGAAGTTTCGGCTCAGTTCGAATGGGCAACGGGACTTAGCTCTGTCGTGATGAG:1 + chrX 3796191 5' - diver 422 1 73.27 ACTACCGCTGCGCCTTGAGCTATGCAAGGCTTTATTTTTGCGACATCAGCTCTTTGAAGTCAGCATAAATTTTACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3R 17454500 5' + jockey 4675 1 72.28 ATATGTGAGGTAAATAAAGCGTTTTTGAACACCATTGATTTCCGCTCAATGAACTCATTATATTCGCCTCTTAAAACACCATTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 2937440 5' + hopper 140 1 54.55 GTTATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCAC:1 - chr3R 1465944 5' + gypsy5 50 2 72.28 GATGTTGAGGGGACTCCGCAACTTCGAGTCATTTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCAC:1 + chr3L 23181930 5' + 1360 460 1 71.29 CATATAGAAGGAACTACTATCCTATTTCGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr2R 9770224 5' + I-element 49 1 76.24 TTACTTCCGGTTATTCAGCTGCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGA:1 + chr3L 17587745 5' + roo 8662 1 81.19 TTGAATGTTAATTTGTTTTTGGAAGAGATAACGATGCGAGACAAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCT:1 + chrX 13793433 5' + I-element 4966 1 57.43 AACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr2L 8565519 5' + blood 7050 2 64.36 CGTTAACCAAGACACACACTCCGCTTTCTGGAACACTTTTTATGGACAATGTAATTTGGTTGGCGCTAGTTACCACATCTACATCTACTTC:1 + chr2L 18279877 5' + gypsy5 6942 2 73.63 ATGCCATGACTACACGTATATGAAACTCCATCCTATATATATATATTACGAATATGTACATATATATATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 - chr2L 13334163 5' + flea 4760 1 68.32 AAGGTATACTATTTAAGATACTTATTTTCTCGCGAGTGTCTTTTCAAAGGTAAGCCTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGA:1 + chr3R 6286599 5' + jockey 4523 1 55.45 ACTCATTCACTGGATGGGCTGCGCGTGGGCAGACTGATGGCACAGGACTGATGGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr2L 4861086 5' - blood 355 2 48.51 GATTTTTTTGGGGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr3R 20556128 5' + Tirant 8140 2 59.60 GGAACCGGACTTGCGATATTTGCTATTTAGTGGAATTCATTTTCATTTGTTTAAAGTTGTGTGCGGAAGAAACTTGCTTGACATGGGTGCATGGATCAAAA:1 + chr2R 14512507 5' + roo 8779 2 57.43 ATATAATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 15305613 5' - roo 402 1 72.28 ATGTTTGTTTGCTTTTAAGCGACCTAGGCTCTTTTTGTTAACCTAAATTCGGCCATAGATTGCTATGAGGAGTCTTAAAACTCCCCACAAATC:1 - chr3L 25608398 5' + gypsy8 4658 2 63.44 GTGTCTGTGTGCGTATGTGCTGGTATGAGCTGGTGTGAGCGGATTTCCGTAGCCGTATCTGAAATGAAAATCAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 24477849 5' - copia 205 2 81.19 TGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAA:1 + chr3L 6044740 5' + Tabor 6871 2 54.00 CCCCATCTTATACGATTAGATTGAACTCATAACTAGAAAGGCACTCTGGGGTGTAAAAAACAAATTTGGTTGGTACAGCATTACATATGTACATACATATG:1 - chrX 21188049 5' + 412 7278 3 87.13 TCTGGTTTTTTCGATTCCGTCGCCTGTTTATGGCTAAATCACGTAATTTAATCCGTGTTTGTTTGCCCTAAGTTCAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAG:1 + chr3R 29766223 5' + gypsy6 7585 2 67.33 TTAACCTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATGAGACCACATATACTT:1 + chr2R 3591970 5' + Quasimodo 17 2 62.38 TTAGGGGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2L 1625702 5' + hobo 42 1 67.33 TTAGCCATTTCGTTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chrX 19116926 5' + opus 147 4 66.34 AAAGTGATGGGGAATCGCTGCAAGCCCCACTCTCTCTCTGATTAGTGTTTTGTGCAATTGCTGCCTCGTTTTGCCCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:1 - chr2R 22250358 5' + jockey 4799 1 73.27 CAACCGGAAGAGTGGAAATGGGGCGGGGAAATGAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr2L 4160092 5' + Tirant 8108 2 78.22 CCTCGTTTGTGGCTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACCCATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 23275318 5' + roo 33 2 61.70 CAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3L 7075927 5' + roo 8715 2 82.18 TACTTTTATGTGGCGCAGTAACAACCGAACTAGCTGCTGTTACCTAATTACGAGCAATTTATATTTATTAAGACAAAGGGTCACAATGTATTGACGTTAAG:1 + chr2L 9671054 5' - Stalker 6903 4 62.38 AATAATCAATTTAATGAAATATATTCAAATAACGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 19481293 5' + roo 45 2 73.27 GTCAGTGGAGTCAGTAGCCAGCCAAGGTGGTCCCAGACCGAGCGTTGCCTTCTGTTGAGCCTCCTTGGTGGGCGTGGTCTGTTAATAGCGCTGGCCAGCCG:1 - chr2L 22646374 5' - X-element 4446 1 57.43 TACTGACGCAAGTTGTATTGGGTATTATAACTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGTATGCTC:2 - chr3L 25768164 5' - Circe 7383 1 74.26 GCGTCCCTTCCCTGGCTACGATTATATAAGCCTAAAAACTTGTACATGGCATTGGGGATTTTCTATGTTTTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTGAGAGAGGC:1 - chr2L 1620841 5' - Doc4-element 289 1 79.21 AAAATAGTTCTTCCACTAGAAACAAAAATACATTCATAGGTATTATGCTTTTTTTAAATGTAGGAGTTTATAACCGTGCCAATTCTAAATATAAACAAAAG:1 - chrX 15259921 5' + transib3 2420 1 87.13 ACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGAGTATTCATCTTGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAATGCTTGTGTCCGCACTTCGT:1 + chr4 158192 5' + 1360 465 1 67.33 CTGGGNGTTTGGGATTGTGTCTGCATCTGTGTCTGGGAAGGAGCGGGTGGGAGGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGC:1 - chrX 4070167 5' + invader1 177 2 62.38 GATGTCGTGATTGAAGAAGTTAGAATTGTTGAAGATGTTGTAAAAGTTTTTGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 - chr3R 4542545 5' + flea 44 2 55.45 ATGTCTTTCTCCTAGAGACTATCTCTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAA:1 + chr2R 13585448 5' + Juan 4047 1 55.45 TTTGCCTTCTTCGCTGGCGACGGCACATGGAAGCAACATGAAATTTTCTGCTCGGAGGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chrX 14323640 5' + hobo 15 1 51.49 AAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 17587776 5' + roo 8693 2 57.43 GTTGCGCGACAGTTACGAACTTTTCTAGCAGTTCATTACGCCTAATTAACACTTGATACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACA:1 + chr3R 6735257 5' + copia 21 2 58.42 AACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGG:1 - chr3R 29331928 5' + G6 21 1 58.42 ACGTATTTGATAACATGGCTAATCAAATTTCATCCTTCCTTCTGGGTTTTGATAAACGAGGGTTTTTATTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCT:1 - chrX 22444535 5' - Juan 4204 1 68.04 GTTCAGGCTTATTCCGGTGCCAATTCGAAATGAAGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTA:1 + chr3R 19449135 5' + F-element 4418 1 64.36 TGGAGGCGGAATGCTTTCAAGTTATTTCTCAGCGCTGTCTTCTTATTGGGATTGAGTACCATTGGTTAACACTTTCCACTTAGCACGACGCGACTGCGTTA:1 - chr2R 19336843 5' - rover 446 1 54.46 CGGTCCCTAGCTGCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCT:1 - chr2R 21773614 5' + Max-element 33 2 58.42 GGGGCTGGCCACAGCCACAGAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr3R 9551462 5' + P-element 57 1 22.77 GTTCATTTATTTTGCAACTAATAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATG:1 - chr3R 19450123 5' - roo 8824 2 70.42 TTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAA:1 - chr3R 13582263 5' - BS 5042 1 76.24 ACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGATGGCTGGAAACAACCCGGTTGGCAGAGCTGTTGAGCAG:1 + chr3R 7168572 5' + flea 37 2 61.39 CCTTGAATCGTGTCAAAAACACCGGCGAGTAGTAAAGAGGACAGAAACGAGGAAATGAATATAATATAAAATAACTCTAATAAATATTAGTGTTAGTAGGA:1 + chr3L 23941505 5' - Cr1a 4296 1 61.39 AGTCATCGTTAATTTATCGAAAAGAACCATGAAATTAAAAAAAAATGTAACAAGAGATTAACCAATTTAAGTTGTTAGTCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:2 + chr2L 6999224 5' + Ivk 1 1 72.28 AAGGTCAGAAAGATTGTACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3L 12103757 5' - roo 407 1 77.23 ATGAAGCATCCTCCCATCCTGGCCGCGTTGAAAGGTGCACGAAATGGCGCACTTTCCCAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCC:1 - chr3R 11094240 5' - 3S18 7 2 64.36 AGTTTTGCCAAGCTGCAGGCAAAATTAACTGTGAAAAGGACTCCAATAACCCAAGAGACGTGACGAACAACCGTCTAATACAGGCACTATCAGACGATTCC:1 - chr2L 22240160 5' + Bica 4524 1 54.46 ACCCACCATATCATTTATATTCTATTGCGTTGTACGGTACATATGTACATATGTGTACCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 + chrX 3763143 5' - 297 378 2 58.42 TACAATGCTCACGAGATGCTGGACAGGAGGAGCAGGAGAGGCTGGTGGAGCCGGAGGAGAAGGATGATATTTGGTCTGTCCGCGACCTTTGTGCCTTTTCC:1 + chrX 18398156 5' - Rt1b 186 1 61.39 TAAAACATAATAATTTCTGGCTGTGAATGCACCCTTTACTTCCTGGGAAACTATATTAATGAATTAATTCAAGTACAGTTGCGGTTAAAATAATAACACT:1 + chr2R 14217543 5' + Tc1 6 1 67.00 TGAATAGTTCCCGCCACTGTCATTGGAATAAATGGAAGGCTTCCAAGTGAACCACCCGTTCGTTGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 - chr3L 11113988 5' - 412 7532 2 64.36 TTATTCTTTTGATTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATAT:1 - chr2R 2044259 5' - Tabor 7310 2 64.36 TAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTGTATT:1 - chrX 22945339 5' + BS 43 1 59.41 TGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCA:1 + chr3R 9131758 5' - roo 9040 1 57.43 TACGGATCTTAGGCGGTTGAATGGAGGAGAGGGTGCCGGAGGATTTGAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGC:1 + chr2L 9041586 5' - jockey 4612 1 53.47 AAACATATACAACATATCATAAATAACAAACAATTATGCGGGCATTGGCCAAAAGGGATTGCACAAGTCCACATGGAGAGTGTTGTAATTTATAATTTATA:1 - chrX 17042753 5' - copia 256 1 77.23 GAACGATGAGCAAAATACAAAATCGTTTGGGAGGGGGCTCACGGGATCATCGTCACCGTGATGAAGCGTGTCCGTAA:1 + chr3R 9961296 5' + Rt1a 4732 1 71.43 AAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chr2R 10543485 5' - P-element 2830 1 22.77 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:2 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 20 1 72.28 GAATCTTTAATAACTTTTGTATTCTTCCGGTGCCTGCAGCTTGCCGTAGGATGGCTATGGCTATGGCAACCCCAGTGATTGCAAGGGGGGCGGAATGTTCG:1 - chrX 2490960 5' + GATE 8220 1 75.25 CTCTGATTTTATTTTGATTGCAAATATTGACCGATCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTA:1 + chr2R 13585472 5' + Juan 4071 1 66.34 ATCCGTATGGCTATCTAAGTGCTCCGGTCGCTGGGAGCAGCAAAAATCACACTTTCCGCTAATTTAGTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTA:1 - chr2R 12674595 5' - I-element 5138 1 60.40 GGTGGGTATTTTTTCTCTTTGAGAAGCGTCGGTGTGAGTAAGAGCAGCTATGTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCAATTTCC:1 + chr4 1301735 5' + 1731 4340 2 49.50 TCATATAAACCAACCAAATCAAATATTGAAGTCAAAAGGTTTGGGATAGTTTGGAGATAAAGAGCTTGGTTAAAAAGTAGTCTACTGGAATAGG:1 + chr2R 5602273 5' - Cr1a 3972 1 77.66 GTGCCGGAGCTGAGAGCTCAAAGCAAGCATCTCTTCCATGGCAAACCATATATATGCATATATGTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 3817533 5' - roo 398 1 67.00 CGCCAAAGGAAAGCATCAAAGCACCTTTCCCAAACAAGATGTACATTGAAATAAAAATTAAACAAAAAAAAAAT:1 - chrX 4810481 5' + Doc 4697 1 59.46 ATGCGTGACCGATGCTTTTTTATGGGGACTAGTGTTGTAGATTAAATGTTTATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGAT:1 - chr3R 24678523 5' - gypsy 427 2 56.44 GTCGAGTGCATTCAAGCAGCGCCACAATAAAAATCGTTGTAATTTTGCATGGCTCTCGTATCACTGAAATGTTGTCTGCTTTTATAAAAATTGTTGCCAGG:1 - chr2R 22749488 5' + Cr1a 459 1 71.29 GGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 - chrX 10672337 5' - mdg1 7402 2 81.19 ACAGCAAACAAAAGCAAAATGCTGTGAGCTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr2R 18950756 5' - roo 9024 2 73.27 GGCAGAAATATGAAGTCAGCGTGTGCATTTCGGTAAAAGCGGTGATTACACACACACACACACACACACACACATT:1 - chr2R 23015452 5' + accord 184 2 78.95 TAGGTGTTGCTTCAAAGAAAATCCAGTTAACTAGGCAGAAAAATACCAAATACCTAATTAAAGGAACTTTCAAGAAATGAAGACAACGTAACTGATT:1 - chrX 15418330 5' + G4 134 1 83.51 AACTGATGACTAAATAATTTCACCTTGTGCCTGAACAAAATGTTTGCTCACCGATAAACAACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTTAATGTTTC:1 + chr3L 12352542 5' + G2 2995 1 58.42 TGCATTGCCATTTTGCAGACGAAAAACAATTTGATAGCTCATGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTG:1 + chr3R 19488241 5' - Quasimodo 260 2 59.41 TTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATA:2 + chr2R 3591999 5' + Quasimodo 46 2 81.19 CATGTGGTCCTACGCAGTGCAGGCAATGGGCCGGCTTATTGTTGTTTTTGGCACAAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATTTTG:1 + chr2R 401168 5' - transib3 379 1 57.43 GACTAGAAAGAGTCTATATAAAGTTGCTAAATTGTCTAGCACAGTATTAAACAAGCTCGACCGATTTGCTTTTGATTCAACAAATAAATAAATAAATTGAA:1 + chr3L 14464604 5' + Juan 4215 1 90.10 TCCGGGCCGCTCAATTAGCAATTAGTTTTATTTCAATTCAGTTTACTTAAGTACGAGATCCCCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 19989240 5' - hobo 2924 1 62.38 AAAATTCTCCCGTTCTCCTTTTTCGCGCCCGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACT:1 + chr3L 6551293 5' + diver2 200 2 70.30 AACGATCTAAGTGTATACAATTTTAAATTCTGAATGTAAACTTTACGATACTCTACATTACGTTTTTATTCAACGCCATGGTGAGGCTGCAACACTTCCCT:1 + chr3L 6123755 5' + BS3 343 1 55.45 CGTATCTACATCTGCAGAAAGAGCTTCCTCCATATCATGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTGAACATTGGATAGGGAGTAGAAAATGAATTTGTATAATT:1 + chr3L 22457922 5' + invader2 4724 1 72.28 GCCTCCGTAAAAAGATTCAAAGTTGATTCCTTCGCCATTTTATGCACACATATACGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTT:1 + chrX 1419895 5' + 1360 3261 1 56.44 ATTTGTAATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAAAAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTAT:1 - chrX 23280948 5' - R2-element 3260 1 53.76 TGGTATCCTCCATTTGTTTGATACGATGATTGATTGGGTTGGTGTTTGGTACCGATGGGTCGGTAACTTGCGCTCTTTGTTGATTTGTTGGTATAAGAAGG:1 - chr3L 9086413 5' - F-element 341 1 44.55 AAACTAATAATTAACGATTTAGAGCTCTGTGTGTTTCCACACCTATATATGTAGGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr3L 4712472 5' - flea 4983 2 55.45 ATCCTTTTCGGGTCTCTCCTTCCAACGGCATTATATATTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chr2R 18675558 5' - opus 465 2 67.00 TTAGTCTGTCATATTCCACTCGATTTCGCTACTCTCTGTAAATTGCCTTGTCCATCAAGTCCTGGCACCGTTTTTGAGGAATTTTGCTCCATGAATCCTTG:1 + chr3R 23562925 5' - Tc1 1243 1 54.46 TACATTATTGTTTTAAAAATAATCACCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCA:1 + chr3L 10596451 5' - transib2 2485 1 60.40 TGAGGGAATTTGCATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3L 4801511 5' + roo 36 2 61.39 GCTTTACAATAACTTTAAAAAAGATTTTGCAAAGGTACTTTAGTTTTATTTCAACAATAAATCAAAAATTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chr2R 23453706 5' - F-element 4413 1 73.00 CTGTTTGATTTTGTTTAAGGCGGCCTCCAGGCTGTTGCTTGTGCTGTTGTTATTGTTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATTGTTGTTGT:1 - chr2R 13003590 5' - mdg1 7067 3 81.19 CAGCCGGCGACTGAGTCTGGATTGGATGGGGGGAACCACTGTATAGGGGGATATATATGGTGTATATCTGCGGAGAGGGTGTGTAAGCATTGTTTTTTTAT:1 + chr2R 12732535 5' - looper1 1700 1 79.21 TATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTC:1 + chr3L 19951182 5' + Ivk 1 1 75.00 GAACGTTTCAACTTATATATATATTATATTTTTATTTTGTTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 13992742 5' + roo 8698 2 69.31 TTCTGATACTTGCTATCTTACCCGATATCGATACACATTGGAGACACTTGTGGCACTTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGACGACTTCACAGCCATT:1 - chr3R 12087971 5' + baggins 5149 1 59.41 CGTGCATATATACCTCACCACCTACTGAGACTAAATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTT:1 + chr2L 10473127 5' - flea 441 1 73.27 TAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGATGTTTGAATCT:2 - chr2R 5019420 5' - rooA 329 2 72.28 TAGGGGGTCCGGTATATTTCGTCACAAGACACCCTGTTTTCCACTCTACTATACTAACTACTAATTACAAAAGGTAGATGAATGGGTGGCGAAGCAGG:1 - chr2R 5458657 5' - transib4 2422 1 75.51 TCTTTGTACCCCACAGATAGAACTGATGACGCTGCACTGATTGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCC:1 + chr2R 19537164 5' + jockey 4758 1 59.41 CCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTATTTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTC:1 - chr4 1294991 5' + TAHRE 86 1 49.50 TGAAATCAATAACTGATATTCGTTCGAAATCGATACATAAAACTCGTATTTTCATTGCGCAAAAATAGCAAAAAATACACAAATCAACTACTTAGCCACCA:1 + chr2R 1994887 5' + Porto1 4457 1 68.32 AAAAACACACACAAGAATTTGCTGGGCACATTTTTAGGCACCCCTTCTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chrX 13761236 5' - pogo 2075 1 53.47 TGAGTATTTCTGAATTTTTTGGGGCGTTAGAGTGGGTGTGGCAAAAATTTTATTTTGCAAATCGATAGAAATTTACATTTTTTTTTCTTTTTTTTTTAATC:1 + chr3L 5859387 5' + hopper 153 5 78.22 AGTGTGCGTTGTATTTGGCTTTAAATGTGGGCCAAAAGTAATGACAATAGCGGCAATTGTACTTTAACTTGGGCTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2R 23580853 5' + P-element 1 2 76.24 CACTTTAATTGGCATTTAAGCGACGCACTCGCAATCGGCCACTCACACCACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr2R 13295626 5' + Tirant 8108 2 80.20 CTTCCGACTGGGGACCCTCTCCACATCTACACTTGGCTTCACTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACTTTGCTGTTCTTGGGTACATCCG:1 + chr2R 17032637 5' - Stalker3T 258 1 62.38 ACGATTAAGGCTCAAATGGGCACCATTCTGCGCAGTTCAAAATTGGTCCATTAAATCGCTGTGTTGTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGG:1 - chrX 16990554 5' + jockey 223 1 61.00 CTCCGTCAAAGGGTTTCGACGGTGGGCGTTTCCCTTATTTGATAAATTGGTCAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTA:1 + chr3L 6116500 5' - I-element 260 1 59.41 AATTAAAATATAATTTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 + chrX 15305606 5' - roo 409 1 79.21 ACGGGAATTAAAACTATGATACAAAAAGGGTTTTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACC:1 + chr3R 4970516 5' + diver 5892 2 75.25 CTTTCACGGGCACGCCCGTAATGCCATTTTTCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCC:1 - chr2L 11882273 5' - Bica 269 1 77.00 ATGTTAAATTACAAAAAAAATGTATCACAATTAGAATTATTTTCGTTTCTTCCTTTTGTCGCGAAGGCATAAGAAAAATACGCGTTGTTACGTTGAATTGA:1 + chrX 6771472 5' - F-element 249 1 61.39 TGCTACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3R 19346977 5' + blood 18 2 61.39 TAATAATCATCACAGATTTGGAAAATATAGTAATGGGCCTAACCCTGGCAAAACTAAATATTGTAAACCCAACATTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTC:1 + chr2L 21556159 5' - invader6 351 2 73.00 TAGTTCGCCCGCACTTAAGCTTGCTTTTCCATCATCAATGCCCAGGACGTTTTCAATAAATGTTCCCCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCTTTTTTT:1 - chr2R 23841121 5' - S-element 1388 1 63.37 GTTTTCTTTTCTGTTTACTTACAATGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTATTTTTATTCTTGTTTTCGCTTTGTTTGCTGTGTTCTTGGTCGGAAAAAATACTTC:1 + chrX 18252445 5' - gypsy4 464 1 61.39 GGCTTGGTTAGACTTTTATTTTCATTTTATTAGTATTTTGTGTGGGAGAGCGGAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAA:1 + chr2L 5043733 5' - Cr1a 261 1 69.31 ACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 + chr2R 5067649 5' + F-element 53 1 72.00 GGCAATTTTTTCTAGCAGCTCGACATCACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTC:1 - chr3L 10476040 5' - copia 4969 2 74.26 TTTTTGTTGTTTTTTATGTGTTTGGGCCATATTGTTTTCCCCACGCGCACATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAA:1 + chr3R 23048429 5' + mdg1 29 2 55.45 TTTGCGATTTTGACACTTGGCATTGCTTCTCCCAATATAACTGTAACTGGCTAGCTTTTATCGCCTCACATACACACACACACACATACG:1 - chr3L 21319526 5' + Quasimodo 36 2 74.44 GGGGCAACCCAACCTTGGGGATATTTTAAATGGCCAACTGCAATTGTTAGATAAACGGACGAAAATATTTACATAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAA:1 - chr3R 5444102 5' - G4 3357 1 77.23 AAAAGCTTAAGAGCAAAGAAACCCGAATTGGTTTAATTTTATTGTATTGTTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:2 - chr3R 26254071 5' + jockey 4697 1 50.50 AATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 13060378 5' + 412 7096 2 71.00 CTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTT:1 - chr3R 7522346 5' - blood 7333 1 82.18 AAATCTAGGCCGTTTTCGAATTAAGAATTGTATAATGTATTGTATTGTATAATTTTATTGTATAATTGTACCAAGGTGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAG:1 + chr3L 19462073 5' - roo 409 1 79.21 TAGTTAGCAACGTTCGGCCTGCGTCAGCGTGAACTATTTGTTGAGTGAATCTTGCCGTTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 + chr3R 2520479 5' - copia 229 1 65.35 TAATTGGCCGCACTTAGTGGCCCACCCACTTTTCCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:2 + chrX 20806845 5' - opus 490 2 71.29 TAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr3L 7075874 5' - roo 9043 1 55.45 AAACATTACAGAAACATGGACCAGGACTCACAAACACACACACGCACACAAAATGGTGGAGGAGAGAGTGGGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 + chr3L 13548763 5' + hobo 1 1 78.22 AGATAAACAATTATTAGAACCCCAACTTCATGGTGACAATAACAAATTCGTCCGATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGG:1 - chrX 22000021 5' + Quasimodo 6929 2 68.32 GTCACCTACCTGTGGACTTTTCCAATTGCTGGATTCGACAAAAGGGGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCT:1 + chr3R 22720070 5' + R1A1-element 391 1 73.47 TGGGGGAAATTCAAGGAGGCAACTGCACTTGATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTT:1 - chr3R 28124320 5' - Stalker2 344 2 69.31 GTGAGCCTTTTTAATTTTATTGAGCCAATTATCCAATAATTTCATTCTTAATGATAAGTAAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGTGAATTGATTAAAA:1 - chr3R 15076108 5' - pogo 1912 1 65.35 ATTAAAACGTCAGTAAGCGAAATACAACACAGCAGAAGATGCTTAACTAACTGGCATGGGATATTTGTTTATTTAAGTGTACGTACAAGTTTATAGTGTGA:2 + chr2R 5685170 5' + rooA 7597 2 52.48 ACTTAGGTAATAAGAGTTTTAAAGCCCCATTACACGATTATCCAATTAGAGAACGAGTCCTAAGTCCGCGACTTAATATCAAAATTTTGTAAAAAAAAATT:1 - chr3R 9611651 5' + HMS-Beagle2 398 1 57.43 ATAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTT:1 + chr3R 19446775 5' - I-element 4964 1 63.37 GGATATGGATGGCATTGCATCGGGTATTTGCACTTGTCTGCGATTTGTTCGGACGCTTTTGTGATTTGTTTTTCCCGCTTTTTTCTCTTTTTTTTTCTTTT:1 - chr3R 23877596 5' - Doc2-element 246 3 52.48 ATAAGTAAAATGTGTGTGTTCAAAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr2R 7868898 5' - roo 9038 1 65.35 TGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTT:1 + chr2R 12185350 5' - accord 7337 2 73.47 CCATGTTCTTGTCGAGTGTGTGTGTTGGTGTCTTTTTTGTATTTTTTAGTAACTCCATTTGCCCAACTGCCCCCGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGT:1 - chr3R 8928409 5' - accord 7037 2 77.23 GGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 - chr2L 1625694 5' + hobo 50 1 75.25 GGCTGGCATTACGCAATGGTTACATAAGACTCAGGGCTCAGGGCGAGGGCAAATCAGAATTCTTACATTGTGCGAATTGTTCAAAAATAATATAGTTTTAA:1 - chrX 17977279 5' - 1360 250 1 53.47 TCATATTTGCAAGGAATAATTTGTGAAATATCTAAATGTGGCGCTTCTGTGCTCCTCCCTTAATTTTATTTATTTAACAAAATTTAATATAGTATA:1 + chr3L 17834529 5' - Ivk 5366 1 66.67 GACTGACAAGTAGATAGCATAAATAATTATACCCTTTGCTCGTAGAGTAGAGTAGAGTATGTAACAGGCATTCACACTAGCTGAGTAGCGGGTATCTGATA:1 + chr2L 5120244 5' + INE-1 546 1 48.51 ACAAGGGGAATTGAGGAAAGCTTGTTGTATGTATATATAGCATCCAAAAATCATACACCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 - chr3R 16458079 5' + roo 20 2 60.40 GGGGGAAAAAATGAAATTATAAGATTAAAGATTGTTATGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr3R 8458286 5' - HMS-Beagle 211 4 65.00 CGGTAAATTGCTTAAAATGTGTTAAGTGAGGATCATTCAAGTATAAGACAGTTGGGAGTAAAGAAATCAAAAGAAATCAAAACATATCAATAAATATATAT:1 + chr2R 11916615 5' + S2 1609 1 71.29 TTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 12539519 5' - roo 9014 2 83.17 TTTAAGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTG:1 - chrX 20880672 5' + invader4 19 2 61.39 CGTGCTATGAAACAAATTTGTAAGAATACAAATGGTCATATCAAAATAATCCTATAATTCCTGAGTAACGTATTATTTTTTACATTATTTTCATTTCCTAG:1 - chr3R 27206838 5' + Cr1a 4328 1 85.15 ACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chr2L 8565511 5' + blood 7057 2 72.00 CCGTATGGATTGTTGACATCATCATTATTAGTCAATAGAGAAAAAATTGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCT:1 - chr3L 18337736 5' + Juan 4028 1 75.25 CGACTATTAGATACCCCTTACTCAGCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGCACAACGAATCACCAAAGTTAAAGTTGTATGTTTTTAACAAATA:1 + chrX 19278515 5' + transib4 452 1 68.32 CAAACCCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chrX 8682644 5' + pogo 38 1 67.33 AAAAAAAATTGGAAAAGTGTGAGCTTGATAATTTAGTGTTTGTGGGCGTCAGAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGAT:1 - chrX 5858214 5' + F-element 121 1 60.44 AAATGTTTGCCCAACTGCTGAGCTGTGTCCCTTGTCTATCGCTTTCGCTAAAGCGAAATGCTGACTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGGCACATCCGGTC:1 + chr3R 23900583 5' - gypsy10 5696 2 72.28 GGTTTTGGAATCGCATTGGAATTGCAATCGCTTATTATTTGTCAAGTGGCCAAGTGCAAGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGAGCCGTT:1 - chrX 3977775 5' + F-element 4547 1 67.33 CTGTCAGACTCTGCAGCTGACGTGACAAGACCAAGACCACCCCCACAATTCCGAATCCCGAAATACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGG:1 - chrX 5514872 5' + Doc 462 1 63.37 AGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:2 - chr2L 8565539 5' + blood 19 2 66.34 TTTCGGCATGAGTTTTGAACACCTTATAAATGTAAAAAAAATTACGAAATTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr3R 20878542 5' - 297 375 2 54.00 CAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGC:1 + chr3L 6044755 5' + Tabor 47 2 69.00 AATCANTATCCCAAGCGGGAGATCTCGTTCCCGAAATAATGTAAACAAAAGGGCAGTACAAATACGATTTGTTTGTCTTAAGCTAAGATCAAAAGAATAAA:1 + chr4 970228 5' + 297 288 2 48.51 ATCCAAAATCCAGTTCGTGCTGTGTTATTTTCGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCT:1 - chr3L 15761667 5' + invader1 3698 2 71.29 CAATATTAATAGTGGTATTGAAAGACACCTCGCAGAGGGAGACGGAAAGCGAGTGAGGGAGAAGGCACAAGAGCCCAGCTCTGATCAGTATATGGCTGCG:1 - chr2L 16484659 5' + invader4 382 1 50.00 CATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACG:1 + chr3R 6117250 5' + Tirant 49 2 75.25 ATCGCGAATTGGAGAAGCGGCAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3R 5686076 5' - P-element 2830 1 22.77 GGACGGTTAACAGATCCTACCGACTGCGCCAATTAAAAAATTGCAATACTAATATATAATTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 - chr2R 2427616 5' + Doc 21 1 58.42 TTTCTTGTTTGTGCTATAAACAGTAGTCAATAATTTTATATGGCATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2R 6173075 5' - pogo 2072 1 65.35 ATCTGGGTGCTGCTCTTTCCCTTCTTTGCTGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTG:1 + chr2R 15945556 5' - F-element 4465 1 71.00 AATTCCGATTCGATTTTAATTGAAATCCAATAGAAACTCCTCTTTTATCTCGCTCTCACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCATTCGATTTTAACTTTTTTATTA:1 + chr3R 19463351 5' + Cr1a 4264 1 64.36 AAACTAATCCAACGACATCTAACTACTGTGACAGTGATCGTGGAAAAACCTAATGAAAATTACTCTAATCCCCAAGAGGGGTAACTTTCAGATCTCTTTCG:1 + chr2R 3273085 5' - G5 4509 1 60.40 GTTTGATCGTGGTCACCCTGAAAGTATGCAATCATTTTTACGAGATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGCTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 - chr3L 2486001 5' + jockey 4670 1 68.32 TGATATACGAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTG:1 - chr3R 29331943 5' + G6 6 1 73.27 ATTTTATTTTATCATATTGCTACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTCAAAAAT:1 - chr2L 5307481 5' - 1360 3091 1 79.00 CATGACAGTCGGAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:2 - chr2R 20744245 5' - roo 397 1 61.39 CATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3R 19446155 5' + 297 6610 2 63.54 AAACATAAAAAATCATCACGCACCGCAGCAGCAGAGGAAATAAAAATAATACAAATAGCAATGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAAC:1 + chr3R 27860518 5' - hopper 1335 1 70.30 AGTTCGCCTCTACATCATAGAAAAGAATCCCAATGCCATCCGCACCCTCTCCAACATGGTTAAAACGCTATTGGCACTGTTAAATTGCTATACTACAAAAT:1 + chr2R 16265994 5' + Doc3-element 130 1 71.29 CTCAATTTTACACAACAAAAAGTGCCATAAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 3763251 5' + 297 14 2 64.36 AAACGAAAATTAAGCAACACAATTAATGGACACGCTTTATGTTATGCATGGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGATAACTGCTGCCTCTGTTAATTTAAGAT:1 + chr2L 11489965 5' + G4 3780 1 61.39 GACGATGAAACACGCTACTCCGGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTG:1 - 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P-element 2845 1 35.00 TAGTTGAAACCCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 15305704 5' + roo 35 2 61.39 AGTTCCGGGCATGCCGGGTCAAGGGTTTCCAAAAAGCAATGCTTTTCGTCCTGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGAC:1 + chr2L 16370411 5' - Tirant 8086 1 57.43 AATACAATTTTAACTTTTAATTGTTCAACTTGAAAGGCGAATTTAATTAAATTTGCGCGTGAGAGTTTTTTGCCGACGAAGCGCGTTTAATTTTATTAAAT:1 + chr2R 8557308 5' - TAHRE 81 1 72.28 CATTTATTGTCCTCCGATGTTGTTGACACTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTA:1 + chr3L 10013482 5' - hopper2 1561 1 69.31 ATCCGGCCAAGTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACA:1 + chr2R 14217711 5' - Tc1 1631 1 68.32 CACCAAACAATCCCCAGCCCAAAAAGCATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAAT:1 + chr3L 20741522 5' + I-element 255 1 77.78 AAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATATATATATATAGTAGCCTATGTGCCATAGTATAAAACCACATATACTTACA:1 - chr2L 15955316 5' + Quasimodo 20 2 61.36 CCATCAACAAAGGACTAACGGAGTTTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - 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chr3L 8614559 5' + opus 7037 4 66.34 ACGAGTTAGTTAGGGACATTTTAAAACATTAATAAAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAA:1 + chr2L 20617886 5' + 297 479 1 65.35 CCGTTACTCATAGAGTGAAAGTGTTTCACTGGCAGGAGGGAGCGTTTCCGACCATATAAATAATATAAATTCTTGATCAGGAACAATAGCCGAGTGGATCT:1 + chr3R 31045712 5' + INE-1 97 1 72.28 CCGCTTCTTGATCGTACCCATGTCCATGGGTTGTTTGATGATCTTGTGGTAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAAC:1 + chrX 8055161 5' - Quasimodo 206 2 51.49 GATCAGTTATCAGCGGGAGCGGATCGACTTGCTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2R 16583345 5' + P-element 41 1 38.61 CTTGTCTTCAGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTC:1 + chr2R 14351869 5' + Max-element 47 2 69.31 CTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2L 13574260 5' + pogo 25 1 65.38 AATAAAACGATTCATAGATTTAAATATATCTTTATAGATAATGCATTTTCAACTAATTACATTACACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATT:1 - chrX 21448856 5' + Doc 4562 1 62.38 CTTAACCCGTTCCATCTTTTGCCCGAACGGACCTGAACTGAACAATCACCTCATAATGGCGTTAATCAAAAAGTTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAAC:1 + chr2L 8569445 5' + blood 463 1 76.24 TTTTTGTTTGTTTTTTGAGTGATTGGGTGGGTGATTGGTTTTGGGTGGGTATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTG:1 - chrX 2796367 5' - Tirant 329 2 51.49 TCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTT:1 - chr2L 2074789 5' - roo 391 2 64.36 ATTGAGTACTTAATCCGTGCGGAAGTGTCTCATTTCGAAACTTGTTTCGATTTCAGTTTTTTAATAAAAAAAAAAATAATTTAAAAAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 12014804 5' + TART-C 11097 1 70.41 TGGCCAGCAGCTCACCAAAGCTCATCCAAAATGCAGCTTGCCAATTGCCCGGTCCACTTAATCTAATTATAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 20739416 5' + roo 8671 2 73.27 CCACGGAAGTTAATTTAAATTGGAGACTGTTCGTGGATTGCATGTCATCGGCACCTGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr3R 10277274 5' + Doc 55 1 71.29 CAGGAGGACTCTGACCTGCTCTTCACGCTTTTCGACGGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCGCCCAAGGCTCTG:1 + chr3R 23793017 5' - P-element 243 1 41.58 ATTACACCTATTCGTGCCATTTTAATTTCGTTGCCCTCTGCTGGCTTTCGCATGCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 8310923 5' + pogo 20 1 57.43 AGTTTATGGCAAACATAAGCCAATTAGAAATATTCTCCATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:2 - 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Tabor 473 2 66.00 CGGTAAGAGAAACAAATGAATTTCGAATTTCCTTCGCAGCTGTCTTGCTCGTTTGGTAATACGTTTTCGCTTGCTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACA:1 - chrX 9025567 5' + blood 171 2 67.33 CGGCCNGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGT:1 - chr3R 4544073 5' - flea 229 2 53.47 AAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGG:1 - chr3R 23020989 5' + INE-1 551 1 44.55 GCACAGCACGTAGCCTAAACATACACTGGGGGAAAAAATGAAATTATAAGATTAAAGATTGTTATGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 - chr3R 8458313 5' - HMS-Beagle 237 2 70.30 AAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr2L 4160125 5' + Tirant 8141 2 57.43 TACGGCAACAGAAGGAGAAGGGGCAATTGCAATCCGATTTCCAATTAAGACAAACACAAACAAATGCCTGTTAAACAATAATAACAATAATAGCAATAATA:1 + chr2R 16094718 5' + mdg1 7069 2 53.47 CAGCCTTCCCAAGCTGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 6273580 5' + blood 7045 2 59.00 AATTCGAGCTGTCAGTTTGGCGGGGAGCTTATGCTGCTACTGGATTTCCCCCTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 + chr3R 22431065 5' + Max-element 5 2 64.10 GCGATCTGCTGCAATCGGCGAGCATAGCACATATATTTGGCTGCATGAGTGGCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAACAC:1 + chr2L 17980103 5' + 1360 429 1 71.25 CGCAGAAAAATTCAGAAATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGC:1 - chr2L 3440527 5' + Juan 8 1 75.25 CAACACCACAAAAGCCACCGCTTCACTCCCACGCCACTGAAAAGGAATGGAAAGGGGATGGGAACGAGGCAGTTCCCTAGAGTTATATTCCATACGTCCAT:1 - chr3L 18326230 5' - Porto1 4268 1 63.37 CTCATAACCCATTAGAAATTCATGTGTAGAATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3L 2019680 5' + 412 7096 2 76.14 ATGAACCCGTGGATTTGCACAGAGAAGGTCGACTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 19481362 5' - roo 390 2 60.40 ATTCAAGCTTTGGGGTTTTCTGTATTGAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr3R 29259627 5' + pogo 48 1 74.26 CATTTAAGCGACGCACTCGCAATCGGCCACTCACACCACACCGTGCCACACAACGCCACACGTTGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr2R 13295638 5' + Tirant 8120 2 68.32 ATCACGTCTGACAATGAAAACCAATTCAAGTCCGTGGTTTTCAATTCTTTGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTATTTTGCTGCTTTT:1 + chr2L 23041073 5' - Porto1 4438 1 55.45 CAGCGCCGAATGCAAAGCGAAAAAACGAAGAATAATGGTAAAATGTAGTTCAAAGGCAAAATAAATAGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGT:1 - chr3L 19324802 5' + TAHRE 10407 1 54.00 TTAGTTTTTCGTTCAGTGCTGGCTAGTGTCTGTGTTTGTGGACGTGTACGTGTTCGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTG:1 - chr3R 20477125 5' - 412 470 2 54.46 AAAATAATTAAATATTTTTTTTGTGGTTTTTTTTTTTGTTTTGAGGTTGATCAGACCTTTTCTTAAGTGAAATGAAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chr2L 7452684 5' + F-element 87 1 78.22 CATATTGTAATTCTTAATTAAAATGTAATGCTGTTATGAAACAAATTTTAAAGACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 - chr2R 4483275 5' + Ivk 26 1 53.47 AACAATGCTATTGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCT:1 + chrX 19426205 5' + mdg3 5258 1 74.26 TGCCAACCCGAACATAACACAAAAATCACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAA:1 - chr3R 6627878 5' + P-element 2688 1 35.64 CATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 19377777 5' - roo 357 2 74.26 CCAGTACTCCAGCTGGCGCTTCGACAATAACTTGGCTTTTATTAAAAACCAACGAACTATTGATAAAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAG:1 - chr2R 22986014 5' + Bari1 1267 1 67.33 TTGACATTGTAAAGGTTCGGTAAAGTTGTACATTTTCGATTGAAATTTACAAAACTAACAAGAGAGAATGCGAGAATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 + chr2L 21347336 5' - INE-1 560 1 59.41 GCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTCGGATGTTTGA:1 - chr2R 5019424 5' - rooA 333 2 68.32 TATTTAATTCGAAGAACTCGTTCGGCCAACGAATCAATTTCATTCGGCCATTTAGGCAATACTTTTGTGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGAAAAATG:1 + chr3R 20370095 5' - invader3 281 1 69.31 AAGGCCGCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTG:1 - chrX 22945375 5' + BS 7 1 73.27 GTTTTCTCCTTACATTTTCCGAACCCCTTTTTTCTCCATCTTCTGGCTTTACATATTGACCACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTA:1 + chrX 15140992 5' - Copia1_DM 397 1 65.35 TGGCGAGACATAACCACGTCCCCTAAATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATATCAGCAAAGACATTACATCCATCTCTAAT:1 + chr2R 2650281 5' + Ivk 422 1 74.26 GCAACTGCAATATTGCAACAATTGCCTATTGGCGACGACTATCTGGCATCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chr3L 6307036 5' + jockey 4809 1 54.46 CAACAAGAAAACAATCAAAATGTGAAATATTTTTATAAACTATATGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 - chr3L 13060390 5' + 412 32 2 59.41 TCTATGAAAGCAGCCAGAAGAATGAATTTAAGTGTTAAATCTAGCCTTTCTTTTCTCTCTAGCCTTACCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACA:1 - chr3L 13119677 5' + I-element 5076 1 71.29 GTAATCTAGAGTATTAGTATAGAGCTAGTATGTATACACATTGTACCTAAGTAAGTCAACATTGTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATT:1 - chr2R 3549944 5' + invader4 12 2 73.27 TATATAAGGTGTTGATAATAATTCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTA:1 - chr3R 19449612 5' - roo 8699 2 77.23 AAATAGCCATTACTAGCGGGAAATATATTACCACCGTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACTG:1 + chrX 15746299 5' + jockey2 3234 1 57.43 TTGGCTTTAAATTATTTCATCCGTTTAAGTTAAATAAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCG:1 + chrX 16992576 5' - jockey 99 1 64.36 GTTTGCTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGA:1 - chr2L 21403566 5' + G5A 2433 1 64.36 ACACTTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTCATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 17928940 5' - hobo 2921 1 60.40 ATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGC:1 - chr2R 1949144 5' - Cr1a 4412 1 72.28 ACTGCNTTATTTTGTTTGTCAAAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAAAGTCCATTT:1 - chr2R 17261491 5' + pogo 1757 1 78.22 GGGGTATGTACTTGCAAATAAATGGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTA:1 + chr3L 15636316 5' - P-element 2763 1 26.73 GAGTAATGGGTATAAAAACGGCGAATTCCCTGAATTCCCTCTGTCTTCGGTATACCGATTGAAATTGTCAAGACGAACTAGTCGACTTTCCCGACTATCA:1 + chr2R 13839768 5' - INE-1 563 1 78.00 CACTCGTTTTCAGCACAAAGCAGAGAATTTCTGAGAGTGAAATTAAAGAAAACGTAAAACCATGGCGTTCTATTCCATACGTCCATATTGGTTTTATTATC:1 - chr3R 10170539 5' - Porto1 4253 1 70.30 ATCTANAATGCATAATCTGAGCCATAATAACAACAATAATAGTAATAATAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACT:1 + chrX 13645611 5' + 297 6497 1 54.46 TAAACNTACATTGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3R 13376053 5' - 1360 3375 1 65.35 TCCTTNCTGCGCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - 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chr3R 27775159 5' - roo 9045 1 52.48 GGTGCNCTTAAAAAACTGCCAGCATTTTTGAATATATAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATT:1 - chr2R 20952619 5' + rover 4 2 66.34 CCATTCCGACTTCCCTCGCACCCCCTCTTGACGCGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGTTTGGAGAAAATTTAGTGGTGGCATTT:1 + chr3L 6496759 5' - Bica 4446 1 66.34 CGAGAACAACAGCTGGTGAAGGCTTTTCGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3R 6622693 5' - P-element 2843 1 37.62 GTGGGTTAAAAGCCAGCCCCCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr3R 20477028 5' + 412 20 2 59.41 CATTCCTCATGTTCCTAGCCACTTTTCGTGGTATTTTTCAACGACAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 12457917 5' + roo 8685 2 53.26 TTCGCTTTTCATTTATTATTGCTGTTTTATGTTTCCATTCGATTCAAAGTCAAAGTGTGGCATCAAAGTTTAATACCAAAGACACTAGAATATCAAGATGC:1 + chr3R 801876 5' + 1360 4 2 55.45 ATAACAAAGCCACTAACACCTGGGTTAGACCTACCCCATATGTCATACTGCAGCTTGGCTTGTCCGATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCC:1 - chr2L 12918417 5' + Chouto 5944 1 74.26 ATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr2R 14708963 5' + Doc 31 1 54.46 TTAAAAACAATTTCGACAACCAAAAAAAAAACACTAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGC:1 - 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1360 3348 1 62.38 GTCTGNCGGACATCTGCCGGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCG:1 - chr2R 7552335 5' + springer 7143 4 72.28 TAGAGTTTACAATCATTTAAATTTAATAACTAGCTAAAAGCAATCATTCTTTCTCATTGAATACATGCACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAAT:1 + chr3R 6609679 5' + I-element 220 1 70.30 TGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chrX 20806938 5' + opus 143 4 66.33 GCCGCAGTCGCTGCGACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chrX 22855233 5' + P-element 59 1 20.79 AATTAGTTCGCTACTACTTCAACTTCAAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTCCAGTAGATACATACATATATAGTGGCGTATTTGGGTGGTCCAAACCGGCC:1 + chrX 22738555 5' + 297 9 2 67.33 GATTACAATTATCGATCCGCGACATTAGTTAAAAACAAGAAAAATGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCG:1 - chr3L 24402219 5' - INE-1 533 1 61.39 TGACCTGGTTTTTCCATCCGTAGTCCAGAGTTAAAAAAGAGAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 11700225 5' + TART-C 11101 4 65.38 AATAAAATCCGATTTGAACATAATCTCTTTTAACAAAAAATTTTAACCATTCACCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTGTATTATTTTTGATCAATTGG:1 + chr3R 6894998 5' + 1360 257 1 57.43 TTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCT:1 - chr3R 22476328 5' + hobo 351 1 74.42 CTTTTGATGGCATTGGTCCACCCCATTTGCCACTTAACACATCCCGGCATCCCAGTACGTGAACAGCTCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTG:1 + chr2R 16992395 5' - X-element 4424 1 67.33 TAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chrX 4366289 5' + jockey 4691 1 58.42 GTTCTAATAGCTATGCTTTAAATTCAGACAGATGAATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2L 7488836 5' + roo 11 2 62.38 AAATGAGCTACTTGCGATCGATAGGTACATATACAATAAGTTTATGGACAAGGGCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAAAGTCCGGCTC:1 + chr3L 14626871 5' - Gypsy12A_LTR 2205 1 66.34 AAAAAAATATTACGTGCACGTAAAATATATACAATTTTCTGAGTAATCAAAGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3R 10203616 5' + jockey 33 1 48.51 CCAATAAGAAATTAACGCCATTGCTGATACTTTTATAGTTGTTGGCACGATCGCTTGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGTCGAAG:1 + chrX 13640617 5' + P-element 20 1 59.41 AAATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr2L 10793203 5' + I-element 49 1 76.24 TCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chr3R 19346949 5' + blood 46 2 71.29 CGTCACTGGCGCAGTGCGTTCTGCCGTGGGTGTCCATTTACAGTACCCGCAAATTCCGCCGATTTATCATAGTAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGCAT:1 - chr3L 224497 5' - gypsy9 5049 2 77.23 AGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATACCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr2L 8565539 5' + blood 19 2 60.40 CGTATGCCAGTTCTCTCTGATTAGAGACCAGAGATTAGAGATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTT:1 + chr3R 23677099 5' - Bari1 1670 1 60.40 AATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGAGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chr3L 9909741 5' + Transpac 58 2 76.24 TTAATAATTGACGGTGTTATCGTTGCCGCTTTCGAAATGCTGGAATGTGTTTATCCTTGTCACACACACACACGCCCACACTTTTGAAAAATGTGCTGAT:1 + chrX 22741164 5' + INE-1 261 1 70.00 GCATTTTCATTTTGTAAATTTGTTTTTCTTGTTCCGTTTGGCTTCATTTCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAG:1 + chr3R 10488930 5' - McClintock 29 2 54.46 ATTCGAACACGCCGTTTTGCGCGTGTGTTGCCGCAGTACACCCCAACAGCCTAGCAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3L 2485957 5' + jockey 37 1 44.55 CCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 + chr3R 6117234 5' + Tirant 32 2 59.00 CATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:1 - chr3R 19346947 5' + blood 7059 2 73.27 CCAACACTTTGAAAGCGCGCCAAAAGTTGGTTTGTTTTCGAATTTCTGGCTGGGCACGTCCGTTGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTT:1 - chrX 21093891 5' + Doc 275 1 67.33 ATATTGATGCGGTTTTTTATTAGTCTGTTTATACACACTTTTTATGGCCACTGTGGCCTATGTTTGATCAGGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 - chr3L 2144411 5' - copia 251 1 74.26 CCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2L 6888586 5' + jockey 15 1 67.03 GAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2R 10444293 5' + P-element 27 1 41.18 GTAGCATAGTGTAAAGAACAAATTAATAATAATACAGTATAATTCGCTGAATTCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTA:1 + chr2L 20824621 5' - pogo 15 1 41.98 ATGCCTTCTAACTTTCTTAATTTTTTATCCCTGCTGTAGCTTGCTGGAACCATCCAGTGGAAATGCAAACGCGTAGTTCCATAATTTTTCAGGGATATCGA:1 + chr4 819269 5' - INE-1 505 1 55.45 GTGAAGGTGTCACTTGCTCAAGGTATAGTTTCCTTTCTAGGATATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATG:1 - chrX 18833803 5' - Stalker4 279 4 57.43 TATTCATAATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:2 - chrX 21852447 5' + Tirant 8133 2 53.47 TTTAAATTTGTGGGAGGCACATTAAATCTAGTTGAAAATAAAGTTATTATTTATAAAATAAATAAAACAAGACAGAATGCTATAGTCTAGTTCCCCGACTA:1 + chr4 103076 5' - INE-1 566 1 62.38 CCAGGAAGTTGGCTTGGTCAGGCAGTCAGTGAGAATGGATAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTTGTCGGAGAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTA:1 - chr3L 25255065 5' - GATE 416 1 72.28 TTTAATTAATATAATTTAATTAATTATTTACTTATAAAAAAATCTTATTGCCTAGTAATAAACATCATATTTCCTATGAAATATTATTATTATTGTTTGAT:1 + chrX 8703013 5' - invader3 5041 1 66.34 TTAAATGCAGGTCAACGGCAGCGAACACGTGCGAATTGTTAACTGCTTTTCTGAGAGCAGTTAAAACGGGGCTAATCTTAAGATTTCTTTCTTTGTATTAC:1 - chr3L 21326070 5' + Chouto 109 1 74.26 AGTCANATAGGGTTAGAACTTTTTATATGCGCTATACATCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACT:1 + chrX 5383123 5' + Doc 4250 1 62.38 GAATCGCCTTGGACACAGGATGTGCAATGAGAGTTGCCAAAAAAAACAATATATGTACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 + chr2R 18675473 5' + opus 15 2 62.38 TACGCTTCAGAATGCGAAATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr2L 16889133 5' - pogo 2058 1 71.29 AGGTACACTTAAATAAAATTGCTAGTGTCGATGCGTTTTAATTTTTGCTAAAGTCAAACGACTTAAAGTGGTATCATATCGCTAAAGCGAACAGGTCTTTT:1 - chr4 184068 5' + 1360 127 1 72.28 GAAAANCACCCCTTAACCCCCCATTGCCCGACAGCCGAACAATGCCAAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACT:1 - chrX 20708857 5' - I-element 5325 1 54.46 TGCCTAACCCCAGGCGTTGGCCTTAATGACTCAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr2R 14408481 5' - hobo 2894 1 69.31 ATGCTATTGAATTTCAAATGTAATATAGTCTTTTGTCACAAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 + chrX 19426209 5' + mdg3 5262 1 70.30 ATTCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chr2L 12815112 5' + hopper 28 1 53.00 GAGATTCCCAATGTCTGAGGACGGTATAAAAATTGGAGAGGGACTCCAGCTCTTCGCTTTGTCGCACTTGCAGTTCGCCTGAATGTAGTGACCCATGTAAC:1 + chr2R 2110067 5' - mariner2 275 1 63.37 ATTGTACGCGGCAGATTTGGGCGATAGTGTGGGCGTCAATATAAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr3L 23123523 5' - flea 4985 2 60.40 ACGATCTTTTGTGTCAATGCAATATAGCCATTTGGTCTGGCATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTT:1 + chr3R 20137265 5' + Burdock 6168 2 60.40 CAGAGCAGGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 5093002 5' - roo 397 1 53.47 GGGAATCCACCACATGTGCTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3L 18501030 5' - hobo 2922 1 59.41 ATGAATTAAATAGGCACGTGGTTGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 + chr2R 1365293 5' + jockey 9 1 76.24 GCATTGAAGCAATGCATTAGTTAAATAAGCGTTCTTTATCATTAATTACTTAATACCAACCTTCTGCATCTCCTGTAGACTTTGCTCAGCTAGTGTGAATG:1 + chrX 15936017 5' - INE-1 535 1 47.52 CATACAAATTATAAAAAAAAAAATTTAAAA:1 + chr3L 15617916 5' - FB 177 1 90.00 AAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTA:1 - chr3L 9907378 5' + jockey 178 1 63.37 ACATACAGCATAATAATCATAAAATTCTCATGTAACAGTTTTTGCGACCCGATTTTTATTTCGTGTTTGTCCAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTT:1 + chr4 245117 5' + Cr1a 69 1 62.38 AGGAAAACAAATCATTTTTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGGGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTT:1 + chr2R 5067614 5' + F-element 19 1 60.40 GCTTCCCAGCACTTGGGAGCTCAATTAAATTGCACTAAAAAACGGAGCCGCTTGAAGTGTAATAAACCAATATACGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 + chr3R 16400143 5' - 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BS3 140 1 61.39 AATACATAATTTTATTTCAAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 17058222 5' + 297 6591 2 64.36 TTTTCATATTTATGTCCCTTCGGCTCGCTCAATTTATATAAATACATATATGCATGTATATATATTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCG:2 - chr2L 18212217 5' - 412 480 2 62.38 TTGGCCAGCGCTTCGTGTTTACCATCAAAGTGGCGTGTGGCGGCGGTGGCGGTGATGCCAAGTGCAACAATAACAACAACAATAATAACAACAATAACAAT:1 + chr2R 11053822 5' + mdg1 24 2 67.33 AGTAGGCAAGGCAAAATGTAAATTTCAAGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 + chr2L 12325020 5' - jockey 4972 1 56.00 GTGGCCAAAACGATGTCAACTCAAAAATGGGGAAAAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGG:1 + chr2L 2083855 5' - I-element 4973 1 65.35 ATTTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCG:1 - chr3R 15021691 5' + invader4 2743 1 42.86 TCCAGCGCACTCAAAAACTACTGGATTCAAGTAAATATATAATATACAAAAAAGCATTTTCGTATATAAGGTGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chr3L 21145728 5' - INE-1 563 1 68.37 TAGGTTTCCTTTTTTTTTGTTTTTGGTTTTTTTTT:1 - chr3L 22757333 5' - transib2 101 2 94.29 GTTCTTCCTGTACTACATGAGAGTCTTTGGATTGCACAGGACGCCGAGGGCTCTTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAA:1 + chr3L 898535 5' + flea 311 1 56.44 GAAGTCGCGTATGCACTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2 + chr3L 8713068 5' - opus 7487 2 65.35 GGTTGCAGTTTGCGTTTGAAATGACTCGTTTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCGCAACACAAAATCCACGCCCATTTTCCCTGAGCATACCGGTAA:1 - chr3L 2206294 5' + Circe 7375 1 64.29 CTAGCTGGCTACGTGTGCATTTTACCCAAGTGCCTCTGAGTGTTTAAACAAATTTTGCGAAAGACTCAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAA:1 + chr2L 20138226 5' + flea 4605 1 65.35 CAAGGGAGCTAAACTAACAGACCACCTACCTCCCCCAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCA:1 - chrX 2641038 5' + Tirant 377 2 63.37 AGAATTGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2L 2074687 5' + roo 13 2 65.35 GCAATGTGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:2 - 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chr2L 19684050 5' + jockey 4677 1 68.32 GACGANGCTTTCGTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr2R 23571633 5' - roo 9038 1 58.42 TTTGGCACCTTTATGGCCATCGGCACGGGGATTCGCTGCTGATCCTGCTGGCTTTTGACGACTGCGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATGCAACAA:1 + chr3L 15162324 5' + Helena 387 1 56.44 AATATATGTGTTTATATTCGGCATATTTGGGGAGTTTTATTAGCTGTTTTTAAATTTTTTTCGCTTGATTTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTAT:1 - chrX 14342593 5' - hobo 2730 1 67.33 GGCCTTTCCGCTTTCCAGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAA:1 + chrX 17968332 5' + Tirant 8109 2 79.00 CGGAGAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 12047478 5' + Stalker2 7283 2 58.00 GGACGGATTATATTCGGTTTTTAGTTTATGCTTAATCTCAACCTTACTTTATAGTTCCTGAGATATCAACGTTCATACGG:1 - chr3R 31045874 5' - INE-1 135 1 90.00 AACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 + chr3R 7168571 5' + flea 34 2 65.66 TTTCANATTTCATTCATATTTTTTGAATTGAAATAAGCAATATAAATATTATAGATTTTCCACTTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACA:1 + chrX 23282942 5' + HMS-Beagle 6805 2 69.31 TATATATATATTAATTTAATTCTCTGCGAATTATTCCCTTGTTTTTTGCGTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCA:1 + chr3R 16700425 5' + 297 6952 2 55.45 GAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCT:1 - chr2R 1949146 5' - Cr1a 4414 1 74.26 GAAAAAATGAAATTATAAGATTAAAGATTGTTATGATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATT:1 - chr3R 8458282 5' - HMS-Beagle 206 2 69.31 TCTCCACAATAGCCTATATAAATTAAACGAAACGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAG:1 + chr2R 3663844 5' + invader2 4826 1 67.33 AAGATAAAAGCTGTCTACCTCTATTCTATTTCTTCGCGCACTTAAATTGTACCATTTTATCATATAGCCAACAAGTCATTTTTGGCTGCTCAGGTTTTATA:1 - chr2R 1878748 5' - Cr1a 482 1 65.35 TTTGCAGTTGTGGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2L 7800047 5' - P-element 2864 1 56.00 AAATGGTGGAGGAGAGAGTGGGTTTGAGCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chr3L 13548813 5' + hobo 51 1 70.30 TACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGGAACCTTAATAGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 19450169 5' + roo 8687 2 49.50 ATGAGTGCCGAGTGTCATCGGCGCTCGAGTTACCGCATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATC:1 - chr3R 1465941 5' + gypsy5 6992 2 73.27 AGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:3 + chr2L 12325047 5' - jockey 4944 1 74.26 AACAAACCAAGAATGCACTCGCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCG:1 + chr3L 1730570 5' + F-element 350 1 79.21 TGTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 + chr2R 24479895 5' + I-element 46 1 69.31 CAGGGGCGCTGGCAAAAACAGGATAATTGGGGGTCTAGCATTCTGTACATCTGATATTTCTTTCGTTTTCAACTCTGATAATTATTCTGATTTGATTGACG:1 - chrX 6584078 5' - Idefix 448 2 74.26 AAGAAGTAAAAGAAAGGACCCCATATGGTGCCGACGGCTCAAGTGATTAAGTGCACGACGAGATCAGATATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGAACGC:1 - chr3R 23043088 5' + mdg1 7365 2 65.66 TATACACACTGGGTCGAAAAACAAATATATATTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 6506867 5' + roo 43 2 73.00 GTTTCTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 20878456 5' + 297 6605 2 52.58 ATCGTCGATGAATAAACCCCTGACTGTTAACAGTGTATACACTTCCTTAAGCTCCGTACCTGACCGTTTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCA:1 - chr3R 19449060 5' + roo 9039 1 72.28 CAACTTGAAGAGCAAATATCAATATGGTTAAGGATGTAGTGGGAGCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chr3L 13659887 5' + pogo 29 1 57.43 TAAAGAAAAATAGTACGAAAACGTAAAGCTAATAAAAAGTTTGAAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAACTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAA:1 + chr3R 18977690 5' + HeT-A 6052 2 59.41 AGTCGAAAGCTCAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chrX 17968348 5' + Tirant 15 2 64.95 TGCGAGTAGATGCCGGCTAAGTGTCCTGCCGGCTAAAAGGAGTGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:2 + chr2R 15032632 5' + hobo 29 1 56.44 AAATGAACATTTTTATTGCCTACTTATAAGAGGCAAAAAAAAAATGCAGGACATTAATTATGAGCGCACCTAAAGAGTCACCACCCTCATGACCTCCCTA:1 + chrX 7045575 5' + jockey 4760 1 73.00 AGGCGTCTTACGGAATTTCCCTTCTATTTTTCTATTTTTTTTTTTAAA:1 - chr2R 16550259 5' - TART-C 11100 1 77.08 CGGTCGAAGCTGTTTGCTGCGCTTTTTCGTGCGATTTTCGATATGTCAATGCAAGTTAGCACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAAC:1 - chr2R 2923166 5' + Gypsy6A_LTR 27 1 60.40 CACCCCACATCCTGTTCTCGTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAATCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAAAATAATATGCTTCTCATAT:1 + chr3L 10081910 5' + rover 3 2 72.28 CCAGCCAGTGGAAGAGAAATGCCACGTTGAATTTCACCAGAGTCAGGCGAAGTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTGCTT:1 + chr3L 17188994 5' - Chimpo 224 1 78.12 CTGAAAGTTTAACACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTA:1 + chr3R 25671919 5' - I-element 5328 1 53.47 TGGGAATCGCAAAGTTGAAAATTGTTATACTACAGTTACAGAATCAGGAAAGAAAATACACAAAAGTTACATCCAAAATAATAAAATTTATTTTATTTTTT:1 + chr3L 25192060 5' - HB 326 1 74.26 AAGTGACCCTTTTGTGGGCTCATTTAGCCATTTCGTTTTCCCACACCCTCGTTCACTTATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCA:1 - chrX 19116949 5' + opus 11 2 65.35 ACAACAAAAGATACACTCGTCTTCTTTTTTAAGATACCAGATACTATTTAGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCGG:1 + chr3L 15710228 5' - invader4 2893 2 52.48 AGGTGTTTCAACAACATTTCGTGCATGCCATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACAC:1 - chr2R 13644530 5' + Burdock 6137 2 78.22 CGTGTACGTGTTTTGAATACAAACGACGCATTTCGTACTCCAAAGTACGAATTTTTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACG:1 + chr3L 11553436 5' - P-element 495 1 25.74 CGGTTNTTCAGCTGCACTGCGATAAAGTATCATAAAATAATAACATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 17587752 5' + roo 5 2 73.27 TTATGATGATATATGGCCTCATTTGAAAAATAGATAATGAAACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 - chr2R 7861729 5' + roo 36 2 67.33 AATGTAAACAAAAAAACATACATAGTGGTATATAGTATGGTAAATATTCGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chrX 8682721 5' - pogo 2080 1 59.41 GGTGCACTTAAAAAACTGCCAGCATTTTTGAATATATAAGTATATAAGTATATAAGTATATATGTAAGTGATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATT:2 - chr2R 20952619 5' + rover 4 2 67.33 TTGTGCTTGAGAAAACGGTGCGCAAAAGTGTATACTGATATTAGAGAACACATTGGTTGGGTTTTTCTGTTTCTTGTATAATTTCATTTTTTTTTTTGTTT:2 - chr3L 3288226 5' - transib2 2644 2 74.26 ATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2R 20744228 5' - roo 9043 1 57.43 GTATACCGAATTTCAATTTAATTACGAATATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCC:1 + chr2R 24479896 5' + I-element 47 1 70.30 CGCCTCGTCGTGGGCTGCCTAAAAAATGTGCAGCATGCACCCCTCGTTTGTGGCTGCTTCTGCTGTTGCTTGCACTACCACTGTTCACACATGAACACGAA:1 - chr3R 23275359 5' + roo 8663 1 76.24 TTATTGTGGTTAGTTTATGCGTGAACCAAACGGATACTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr3L 15100677 5' - pogo 2063 1 64.36 CCAAACGACAACAAGGCACGCAAACAGATAAAAATTATGGAGCAGGGGTTAAAGGAACAGGAATTCGGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTGTT:1 - chr2L 10579582 5' - Doc2-element 437 1 73.27 ACTAAAAAAAAAAATAGTTAAAAGTTCAACTTTGAATAGTTTTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCT:1 - chr2R 1091290 5' + 1360 51 1 58.00 ATAGCAATTTAAATTATGGAAAAAGAAAAACGAATCAAAAAATCCATGAAACAATGCGCATGAAATTCCCCGGAAGGAGTGCCTCCGTACTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 11018079 5' - Rt1b 5038 1 72.28 CTTTAATGGCCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chrX 18836964 5' + P-element 41 1 42.57 AAAACGTTACAATTTGAATTGGATGGCCCGTTCACAATGGTGTTTTGTAAACGGCGCATGTGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTC:1 - chr3L 13435557 5' + Stalker3T 271 1 62.38 TCGTAGTCCGCCTTTTCCCAAACATTTTCGCCGACTCATCGAGATCGAGAATTAATAATTCTCTTTCATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 11100217 5' + hopper 149 103 81.19 AGGTAGTTCAGGTATTCTGTCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAA:1 + chr2L 15081413 5' - hobo 23 1 50.50 ATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAG:1 - chr3R 29331920 5' + G6 29 1 51.49 CCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chrX 13508754 5' - roo 9037 1 61.39 TGTGGCCTTTGTAAGTGGGCGAGATTGTAAAATATTTATTTTGTTTGATATTAGTTTAGGACCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTT:1 - chr3L 15727042 5' - I-element 5074 1 66.34 TCTTGNATAAATTACTCGTATATGAGGTAGATGGGGTAATGAGATCCTTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTG:1 - chr3L 10211252 5' - X-element 4454 1 70.30 AATAAACGAAATTATATGATTAACCACAAATTGTTTACTTAATTTGAGTATTTTCGTTGCATTCATTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTAC:1 + chr2R 10285854 5' - Bica 422 1 70.30 AAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACGACCGTTCGCTTTGA:1 - chr3L 24796701 5' - Cr1a 8 1 50.50 ACCCCTGTCCTCCTGCTGCTGCGCCCTTAAAATTTTCAATTGAAATATGACTGCAGCGCACACAGGCACAGCCACAAACGAGCAGAAGAAATGGAAAATTA:1 + chr3R 15409913 5' + Bica 4603 1 79.21 TTTGCATACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr2L 20238661 5' - hobo 2912 1 53.47 AATTAAAAATTAATAAATAAAAAATAAATTAAAATAATAAGACGCGTTACTTATGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 - chr2R 10873638 5' + HMS-Beagle 23 2 56.44 AGTTAGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr2L 16201576 5' - hobo 2909 1 52.48 TCTTGCTATCCCCAAATCAATATCTCTCATTTTGTAAGTAATGTTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGAT:1 - chr3R 7415202 5' - I-element 5320 1 60.40 TAAGCGAAAAGACCCACGACGTGAACTAGTCTGATTTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTC:1 + chr2L 5052748 5' + Circe 7174 1 75.25 TTCAATAAAAAAATAAATTCAAAGCAGTCAACACAATCGAGTTATGAATCAGGAATAGACCAGGAATGTACACAGGCTGAATAAAAACCAAATAAAGATAA:1 + chr3R 3073825 5' + mdg1 355 2 60.40 TTCTGCGATACATATATGTACTTAGGTCGTTTTATTGTACTGGAATATCTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACC:1 - chr3L 15978427 5' - Quasimodo 372 2 52.00 GACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGAACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGT:1 - chr2R 2994306 5' + gypsy8 118 2 45.54 TACACAAGAATGTCAATGGTTGCATTTTACTTGATGAATATATAATAATAATGATGAGGCACCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCA:1 - chrX 365124 5' + I-element 4899 1 64.36 AGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 + chr3R 15072573 5' + pogo 30 1 59.41 CGTGGAATATAGATCATACTAGATCATTTCTTTCTTTGTTATAAATTGAAAATAAGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr2R 17261661 5' - pogo 2080 1 53.47 AATTTTTGCTTTGATGCTACCAAATTCTTTTTAGGTACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCA:1 + chr3R 28028611 5' - HeT-A 5734 1 61.67 AAATATTGACTAGTTGTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGCTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATT:1 + chr3R 24567114 5' - micropia 5252 2 82.00 TGATCTGCGGGACACAGATCTTGTGATGTGAAGTAGAGAGTCCCGACTTGGTAAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTTACTAGAAACAATATA:1 - chr3R 1715235 5' + Cr1a 4117 1 73.27 ATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 2074722 5' + roo 48 2 76.24 TGTAACGGGGCGAGATGAGTTTGTTGAAACCTGCTAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAATGACTTAATGTTTATATACTATGTTGCTATTATGAACTGA:1 - chr3L 9070117 5' - invader2 4890 2 65.35 AGGGTAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:2 + chr3L 18659021 5' + pogo 33 1 58.42 CATCAGAAACCCAACGTAATATTATACAATACAAGCAGCCATCAGGAAGGAATCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3L 23871322 5' + Doc 33 1 50.50 TTTAGTCACGGTGCGGCAATATATTAATAACATTGGGTGTTTAATATTTACGACAAGTCCAGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTCCT:1 - chr3R 22453564 5' + F-element 258 1 67.00 AGTAGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGG:1 - chr2R 1949150 5' - Cr1a 4418 1 78.22 AACGAAACTTATTTGCCACTTTATTTCAGCGGACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAG:1 - chr2R 13278178 5' + Quasimodo 7011 2 68.32 AAGGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - chrX 3763223 5' + 297 42 2 74.26 AAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTC:1 - chrX 3305195 5' + transib2 45 1 69.31 TGTATATGAAATTTAATGGAAAATAATAACAATATTAATCTTAATATAGATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chrX 10827407 5' - roo 9047 1 56.00 CCTTANTGGATAATGATTCCGAGAGTCTTATGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAG:1 - chrX 12495705 5' - Quasimodo 6901 2 76.24 CACACNCAACTCATCGGCCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:2 - chr3R 4544087 5' - flea 5002 2 67.33 TAACATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chrX 15392020 5' - 1360 3356 1 59.41 AAAGAGGAGCGAAATATGTAAAGGCAAAAATGCTAACCAACTGAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACG:2 - chr3R 28645871 5' + F-element 17 1 68.32 ATTATACTCCTTACCTAAACGAGCGTGGTGTCAATATCAAGAATCGCTGCATGACACTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTACCCTATTA:1 - chr2L 14258924 5' + Cr1a 4208 1 54.46 TTTTCTCACAATTAGCATTTTTCACCATTTTCTCCCGTAAAGTCACACATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3R 27975317 5' - roo 9032 1 58.33 GCCATCATTTACAGGTCATTCATCACAGCACCACGAAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 - chr3R 10751716 5' - hopper 1392 1 60.40 AAAGACGCATATCAAGGGATTTATGGCATGGATTTTTTAAGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chr2L 3084988 5' - copia 249 1 60.40 TACCTTTTTGGTGGATAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:2 + chr3L 7075859 5' - roo 395 1 64.36 CGACCCTGAAAAATGGCTACGAGAGTGCTAAGGTTCGACCAAAGACACTAGAATAGCAAGATGCCTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAATTTTTCG:1 + chr2R 4638829 5' + 1360 41 1 63.37 TGGAAGGGGAAGCTAGAGGAAGGAGGAAAGGATTGCTCGCCTGCTACGAGACCGTTTCTGGAGGAGGTGGGTCATGGAGTACCTGCCTACGCTTGTGCGC:1 + chr3L 3980191 5' + aurora-element 3776 1 77.00 CTTTCGGGTATTTTCGGTATTCCATATTGGTTATTTCGTTTTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGATGATGTCTCCCATTCTCCATACATT:1 + chrX 6515599 5' - mariner2 747 1 63.37 AATATGAAACTAAGAATTGGACAATATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCAT:2 + chr3L 9766358 5' + blood 48 2 74.26 TAATAGAATTAAAGGTACAATATAAAAACAGTAACAAAACTACCAAAACTACGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCA:1 - chr2R 13404020 5' + BS 20 1 53.47 GATTAAAATAGTCGAAATTACAATTCGTTTAATCACCTGTCAGCTGAACACTTTAAATGTACATTTATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACA:1 - chr3L 9229097 5' + HMS-Beagle 9 2 68.32 ACTGAAAATACAAATGAGGGGGGCGCGAAACGATTGTATTGGGGGTTGAATGGATCTCGGGAGCAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCC:1 - chr2R 21737322 5' + X-element 4416 1 64.00 AAGTAAACTCTTTCACAATCGAAATAATACTGAATCGCCCCAAGAAAATCTGCCCACCACCCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr3R 29123425 5' + P-element 12 1 66.34 TTAACCTATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 + chr2R 3591970 5' + Quasimodo 17 2 62.38 TGAGGAGGGCATAAAACGAGAGCAAACGACTAAAAGGCTCTGGCTGTCGTCGAAGCCAGATAAGATTAAAAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAAC:1 - chr2L 7294915 5' + I-element 5106 1 71.29 AAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGC:1 - chr2R 5840685 5' + Ivk 37 1 58.42 CCACGACTGCTTGCTCCTCAACAAATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAAC:1 + chr3R 3510355 5' - micropia 163 2 76.24 GTTGTTTACCCAAATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGC:1 - chr2L 21403561 5' + G5 4394 1 61.39 TCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chr3R 4544055 5' - flea 4970 2 70.30 TTGAAGTTTTTCGCGGGTCCCGACGATGTTTATGGACGGCGTAAAACCATTTCGTTCAGGTGCATTTGCTCTTGGATGCAAGTGCTCTTAGATTCTTATA:1 + chr3L 20831767 5' - Idefix 313 2 58.00 GGCATTGTCCTATCAAAGTAGAGGCGCAGTTATTATCTAACAAATCGCAAGGATGATCGTTATAGCCGGTAGTCGTCGTTGTTGTGTGTGTGCGTGTGTGT:1 - chr3R 14081321 5' + Stalker 442 1 60.40 TTAACTAATTATAATCCTTTTCTTTTGCGTAATAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTATA:1 + chrX 16455503 5' + S-element 1582 2 67.35 AGAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACAT:1 - chr3R 17321773 5' + Stalker2 7288 2 63.37 GAAGGCGTGCTTGCCTTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 + chr2L 4160124 5' + Tirant 33 2 56.44 CAGCATGCAGCAGTTGACTCTTGCCCGGCCCTCTTCCACCAGTTTCCCAACAATTTCCCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:2 - chr2L 5646907 5' + jockey 4694 1 56.44 TTCAAGTCCTTTTGAATGCAAATGAAAGGGTTAGACCGACCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACAGACTCGAGACCGAGTCACGGTCGCCATGTA:1 - chr2R 22772779 5' - Stalker 404 1 60.40 ATATATGTATATGACAGTGAATGTTTGGAAATTCGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGA:1 + chr3R 19961358 5' - Doc 384 1 66.34 GGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr2L 6888596 5' + jockey 35 1 55.45 CGTGAAATTCCTTAATTTTGTGTGATTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAG:1 - chr2L 13154995 5' - mdg1 7374 2 77.23 ATAAAAACGAACATCATAAATGGATGAATTAGTACAGATATGGCAAGCAACAAGAACAACAACGACAAAAACGTGCATACTTCACCGTCGTGTCAGACGCC:1 - chr2R 21502962 5' + Doc3-element 301 1 77.23 GAATAAATGGGAATCGCTGCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:3 - chr2R 20744234 5' - roo 386 2 52.48 TTTAGCTCATGGCATACATGCATGTCGAATTTGTGATCTATGTACTTTTTTTTTCGATTTTTCCGTGTTACTTTTTGCAATTTTTTTGTTTTTATTATTTG:1 - chrX 6070796 5' - Rt1b 5147 1 54.46 AAATGNAAATGGTAAACCGACCGCAAATAGAAAGTGAAAATCAAATACAAAACGCTACCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr2R 19943993 5' + 412 20 2 59.41 AATGTAAGCGGTGTGCCGGCGGTGGATCTAAGTGGTTCCACCTCGGTAACGAGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGGGGTTTGTTCGAAACACCACCC:1 + chrX 4084125 5' + X-element 4335 1 57.43 CACGTAATTTGTTTGTTCATTGAGCACGCATTATGCGTTTCGTTCAATTGTTGCTTTCTGAGCATTTTCGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAGTGG:1 - chrX 10210377 5' - Porto1 4310 1 67.68 AGGGGGAAAGAGTAAGTCCAGCCGCAATTGTTGGTGCTTTTTTGGGCGCAAAATGGGCCAAAGAGCACCACCTGTCAAAGGCAGCCGGAGGTTTCGCGGCA:1 + chr3R 16673879 5' + Osvaldo 1341 1 57.43 TAATTATATATATTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2L 13574202 5' - pogo 2071 1 59.41 AATCCAATTTTAAATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:2 - chr2L 10793214 5' + I-element 38 1 65.35 GCTTTCGATTTGTTGATTTTAACTATTTTTATACCCGTTACCCGTACATGTAAAGGGCATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGT:1 + chrX 22794411 5' + INE-1 12 1 87.95 AGTGGAAAAAGGAGGAAAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr2R 12492345 5' + hobo 9 1 68.32 GCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr2L 16201520 5' + hobo 40 1 69.07 CGCATCGCAGCCCATAACAATAACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCC:1 + chr2L 20625970 5' + F-element 4523 1 78.22 TTTCAACTAACATTTTCTAGTGCTCGTTTTTGTAATATAACTTAATTTGTTAAACGTAAACAAACTTTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTG:1 + chr2R 11058057 5' + HeT-A 5858 1 74.26 GTTTTGGCATGGGGCTTTTTTGCTAGAAACACTTTCGGTGTTGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATT:1 - chr3L 6044804 5' - Tabor 449 2 65.35 TTTGTTGTGCTACTTTGTTCGCTTTGTTGTTCAATTCTTTAAGTTCTGCAACAGTTTCGATTAAAATTTAACTTATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTT:1 + chr2L 14918123 5' - 297 445 1 68.32 ATATTTCTAGTCCGATTCGAAACTACATGTGACATTGGACGGGTTGATGGTGATAGTGGCGATGATGAAGATGGTTTGTTTGGCTTGTAGGAGGGATGGGC:1 - chrX 7708311 5' - I-element 5059 1 77.23 CTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr3L 28063320 5' - roo 406 1 76.24 TACTTAACAAAATTAAATATATTGTAGTATACAATAGGCTACGGAGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTTAATTACTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGA:2 + chr2L 3813588 5' - Ivk 5265 1 57.43 CAGTTAGTTAATCAGCTAGTAGTTTGGTATTTTTATGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTC:1 + chr3R 14096090 5' - jockey 4540 1 64.36 GTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACA:1 + chr2R 3133791 5' - micropia 5138 2 79.21 GGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACA:1 + chr3L 25272523 5' + 1360 13 1 71.29 CGCATATATAGGATGATTTTATTTAAAAAAAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chr2L 10473503 5' - flea 4972 2 77.00 TGTTGAGAGGCACACGGTTATTTATGCCGAAAAATGGAAAAATGTTTTTTTTTCGCACGGGTCCTACGGCCACACCTCCCGCCCA:1 - chr3R 2912750 5' - Cr1a 4431 1 69.41 CATATATCTACATCATATACCAGCCACTTTATATATAACCACATAGGAACAGCCATACACTAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATA:1 - chrX 22068069 5' + Quasimodo 94 2 61.29 GGGGAGGGTTTTAGAAAACTAGAATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 + chr3R 10734257 5' + pogo 48 1 77.23 ATGTGAAGTGAGTTTGAGTAGATAAGTTATATATATCTTATATATCTAGGCTTATCGATAGGTCGAACTATGCACTTATGTATTATGCATTTGGTCGGCGT:1 + chr3L 12274958 5' - 412 208 2 74.26 GCCCCAACCATTTGCACATCTCACCTATTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr2R 15474779 5' + roo 8682 2 61.39 AGATTCTTATAATTTCATCCAAAAATATTAGCCAGCAAAAACCTTTATTATTGGCATTGTTTTTAGACTTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCAT:1 - chr2R 6091710 5' + Idefix 7214 2 67.33 ATTTCAAAGTTATGAGAGGGTGCTCAATCAAACATAATACAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCACATTTTGTCAAATTTACAATGCATG:1 + chr3L 21591117 5' - 1360 197 1 72.28 TTCCTNCTCTAATGCTCCTTTGCTCCATTGCCATTCCCTGCTCGCTCTGAATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATAGTTATAAGTCTTCAG:1 - chrX 20022966 5' - Bica 98 1 54.46 GGCCGCATCATTTCCAGAATTTTTACTGACACGATAATAATTTTTTTCGGTAAAGACGAAATCTGTTTGAAAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:2 - chrX 22945373 5' + BS 9 1 71.29 GGTTATAAAAGAGTTCACTTCCTTAGTTGATACTCGTTACTCAGCTAAAAATGCGACGTACATATGTATACTTATACATAGGTGATGTTGAGAGTCCCGAC:1 + chrX 22959152 5' + Cr1a 4063 1 59.41 ATATACTTAATATATACACTGTATAAAGTGCAATTGACTGCAAGCGTCGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATATTGGTAGCG:1 + chr3R 17431262 5' - Ivk 5100 1 74.26 ATAGCATTAAGTAATAATAACAAAAAACACAAATGTATTGAAGACGGTCTTAGAAACGCACTGTCAAATACCACTGGTTGGGCGCCAATTAGAAAAAGGGT:1 + chr3R 28522421 5' - gypsy2 339 1 58.42 GTTAGNCAGCTTACACAATATATAATTAAAAAAAAAA:1 + chrX 18365729 5' - hopper 161 1 72.97 GGCAAACATGTAGCAACATATATGTATGTACATACATGTATGTACATGCAAATTATATAAATTCCAATGGATCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCA:1 - chrX 15089138 5' - gypsy 432 2 54.46 TCGATTTCCTTTTCTATTTTGCAACTTCTCATCGAGAAGGACGCTTCAAACTTTGCTGAATAACTTCTTGTTGGTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 10147927 5' - roo 407 1 80.20 AATTCGCATTAAAATCAAATGAAAATGTCAGTCTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 7488870 5' + roo 8709 2 73.27 TGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr2L 12324108 5' + roo 8689 2 56.44 GTACTAACTTACTGGTCACATGGTTATTTCTCTCTTTTGCGACCCGCTCGAATTCAAGGCTCAACAATGTTCCTTCGAGCCGGATCACCTGGATTTTCAAG:1 + chr3L 25255147 5' + GATE 288 1 69.31 TTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTG:1 - chr3L 10849151 5' + Cr1a 261 1 68.32 TACAGCCGAAGCAGTAATGGGAAAATTCAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 12103773 5' - roo 9054 2 61.39 GGAAGAGCAGCATCAATTGCCCTGGAACACAAAACAACAAAGAAGGAAAAGACAGCACACATTAGCGATCTGAAGCCGGGAAGCGCGGACGCCGGCG:1 + chr2L 2392454 5' + Osvaldo 1483 1 75.26 GTACGTTTAAGAATCAGAATAACAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 9871030 5' + roo 8717 2 78.22 TTCTCATTGCCTGCACCAAGTTTCGAAATCCATACTTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATA:1 + chr3R 4365990 5' + 412 260 2 68.13 CACCCAATTCGAGGGTATGGGATAAATCTTCAAGATGATGGCGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATA:1 + chr2R 13105621 5' + copia 5048 2 59.41 GTGCGTGGGCCAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTAAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 + chr3R 22781970 5' - copia 216 2 63.37 AGTACTAAAACTGACTAAAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 + chr3R 18210324 5' - Juan 4184 1 55.45 ACAAAAATGAGAAATGAAGAATGACAACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTAT:1 - chrX 2803586 5' + Tirant 426 1 70.30 AGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 - chr3L 5489953 5' - jockey 4957 1 83.16 GTCTAGAGCAACATTTTGGCTCTTAAGAATGAAAAGTCTCACGACTTGATCCGCATCCTCCCCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTT:1 - chrX 19363541 5' + FB 14 1 65.35 ATTTTATTTTGTTAGCGAATTTCCATACTAGGGTAACGGCTTCTTCCCTCTATTTCAAAATAATAAATAAAAATTATTGTTTTTCTTTAATAATACATTTT:1 - chrX 21185263 5' + hopper 162 1 76.24 GCACAAATAATTAAAAGTAAAATAGTGAAAATTTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTCGTGTCCGCAATTCGTGCCTCAAGATATGAACAAAGCAAAG:1 - chr3L 27287370 5' + 1360 490 1 76.00 CAAGTTCTTCCAAGAGAAGGACATCCTAATCCAGACATACGAGGATGTGCACGCATTCGACGATGTCGCCATCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGT:1 + chrX 18067860 5' - F-element 262 1 78.22 AATTCTGCACACTTTCTTCTCGCCAGTTTCATCCATATAATTATATTGCTCATGAACAAAGTTAAGTCAGAAGGCATTTTGTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr2R 17679102 5' + hopper 142 2 63.54 CCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACAC:1 - chr3R 12047466 5' + Stalker2 48 2 70.30 AAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3R 24081613 5' + 297 6610 2 64.00 GGTCGAGTTTGGATTTTGTTTAGGGAAATTAAACGTCTGCTCGTTTTGCTTTCGATTAGATTAGATTAGATTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACA:1 + chr3L 27391750 5' + S-element 1502 1 55.45 AAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr2L 16201503 5' + hobo 14 1 60.23 AATGCACTTGAACACTTTTCATTTGAGAGTGACGTGACCGGACTGAGGCGGCTCTATTTATACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr3R 21296631 5' - P-element 2871 1 65.35 CATTTCAAATGAGCCATTTGTCCACATCATATTGCCATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:2 + chr2R 7861632 5' - roo 408 1 79.21 CTCGAATACATATGTTTACATACAGGCCTTCTATATACAGATCGCAGGTGTTTGTTTGTGTTTTTGGTTTCGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTC:1 + chrX 6106077 5' + F-element 462 1 69.31 AAGAATGGCTGTTTGGTATTTGGCGATAACTATGAGTATAATGTTCCAATTATTAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCCTCAAGA:1 + chr3L 23529647 5' + 1360 474 1 52.48 GATAGAAGTTTTAAAATATTGTAAATATAAATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 12539468 5' - roo 402 1 74.26 GTGTATTATTTGATTGTTTTATTTAGTTTGTTATTAATTAATTATTTTGTTTATACAGCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATT:1 - chr3L 10364166 5' - TAHRE 10411 1 50.50 AGTTTGGCCGGTTTTTGCAACTTGCATATTTGGCATTGGCGCACACTAAATTATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTA:1 + chr3R 5019433 5' + 1360 3374 1 56.44 ATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 + chr3L 11661722 5' - hopper 1377 1 63.37 ACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2R 11528053 5' + P-element 53 1 28.71 TAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chrX 13546688 5' - roo 9023 2 74.26 ATCATGAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 513716 5' - roo 358 2 75.25 GCTCGCTGCTGGCTGGTTGCGTCACGAAATGTTTTATTCATGCGTTTCAATCCATCAATCAACTTAAATGTAATCTATCAATCCGCGGACACGATTACACC:1 - chr2R 22541427 5' + Gypsy12A_LTR 1973 1 81.19 CATCATGACCCTCATGCAAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCGCCAGTACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCT:1 + chr3L 10013573 5' + hopper 24 1 49.50 AGTCAGATTTTCCAATGGTGGAAAATGATGAATCTGTTGATTCTAGAAATCAAGGTCTTGCAATCGGGTTTTCTTTGAAAACACTTCGGACTCGCGCGCTG:1 - chr2R 4285812 5' + gypsy10 455 1 59.41 AGAGTGAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGGGTTGAATATAG:1 + chrX 21474399 5' + 1731 19 2 80.20 CAACCGATTAAATGAGCTTCATAAAAAATAAGAGCTAAATAACAAAACAAACTAAATAAAAAA:1 + chr3R 26930386 5' + F-element 91 1 77.78 AAAACTCGCTTGAAACCCTATGTTTTCACTTAGAACACACGGATTAGCTTATATTGCAAACTGTAGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3R 13225584 5' - hobo 2927 1 67.33 GTGACATTACTCATTTTGAATAAAAAAATTAAAAGTCTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGC:1 - chr2L 17784686 5' - gypsy10 5952 2 59.78 AGCTAAGGCTTAGCTAAAGGCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 7255788 5' - P-element 2835 1 26.26 AATTATTTATAACTGTTTTTTATGTCGCTTCGCAGCAAATAGTTTTGGTGGCAGATGAATATGTATGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTC:1 - chr3R 32005967 5' + invader4 13 2 67.33 TGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chrX 2179523 5' + Doc 55 1 79.21 CAGGCGAGGCGGTAATGGAAATGGAAAGTTCGCCCCGCTTGTCCTTGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGC:1 - chr2L 13320023 5' - hobo 413 1 59.41 GACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTTGTTAAAGAACGAGAGAG:2 - chr3L 25842180 5' + 1360 98 1 73.27 TTTATAATATATTAGAAATAATATTTTGAAAGCAAATAATTTAATTTTACTCAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAAAAT:1 + chr3L 24542327 5' - 1360 202 1 55.45 GGTGCGCACGGAAATGCTGGCCAGGATTCGCGGAGCAAAATCCGTTAAACTCGCATAACGGAACACAGCGAACAGCGATCAAAAAGAAACGAAGACAAGA:1 - chrX 1239543 5' - invader6 92 2 68.00 CTGGTGAGCTTACAAATTTTGGGAAAATTGGTTTTAAGGTTACTCGGGACAGCAATCCAAAAATACTTTATCAATGTACAACAACAAATTACAAAAAAAC:1 + chr2L 7768417 5' + Doc4-element 203 1 75.00 ACTACCGACCGGTTGCATTCAATGGCCAAATTTGGTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGAC:1 + chr3L 7545642 5' + I-element 4938 1 65.35 AGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr3R 7522294 5' + blood 7036 2 54.46 CGTCCAAAGATTTTTCATCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2L 16674899 5' + roo 58 2 85.15 AAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr3R 4511651 5' + 1360 29 1 73.27 ACTGNTCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chrX 21531022 5' - roo 9034 1 62.00 CATTTGCTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 13477509 5' + P-element 26 1 48.39 TTATGCAGCTCATATCCGACAATGACACACACACACACACACACAGTAATACTCATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3R 17928944 5' - hobo 2920 1 56.12 ATTTTCTCGACTGTGCGCTAGACAGAGAGGCAGACACAGCCAGGCAGTATAAACAATTGAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTG:1 + chr2R 9427923 5' + copia 322 1 59.34 TGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAA:1 + chr3R 6117246 5' + Tirant 8152 2 71.29 CTTCTAACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3L 13477503 5' + P-element 28 1 43.82 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATACAATTTACCAGTTAGACAGACATCACCATGCAAGAA:1 + chrX 3538814 5' - hopper2 260 1 64.36 AACAGACGAATTAGTGAAGATTTTCACATGAAAAGCGGCGCGTAAATTGCGCGCAGACCGCCAGAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGT:1 - chr2R 19606507 5' - baggins 5307 1 63.37 AAACANAATTTTGATGGCCCACATGGCGTATGCTTAACCACATCCGACTACACAGCCATTTGCACAAGATTGACATTGCAGAAAGTGAACTCTGTCGCTTC:1 + chr2L 17063142 5' + baggins 5190 1 55.45 TGCATGCCACCATCGAAGCCGGGAGTCCAGTTCAGATCCACACCCGTATCACTCACATTGCCCACCCTTTAGAATTTTGNAAAAATTTAT:1 - chr2R 15039626 5' + FB 236 1 75.56 TTGTGTAAGAAAAAACTTGTAATCTAATCAGCCTATATGGCAGGTCAAAAGGTAATGGGATTTGATACAGATCTTCTAATGTGCGATTCTCATGTCACCTA:1 + chr3L 25844129 5' + roo 326 2 52.48 AAACTATTTTTTCACCGTGCAATCCTTAGTGGGAGCTTCAGCTTCAGCCTCGTTCGCATCCATTCCCACTCGACCCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chr3R 5891863 5' + I-element 80 1 76.24 TCTCGAAAGAAAATAAAATAAATCGCTTGAAATCGCCATCATAAAAATCTTCTTCTATTTTTCCAAATGGTGATTATAAAAAATCAGTTGAACTACTTCAA:1 - chr3L 23235107 5' - S2 425 1 60.40 CGTGTGTAGTCTCGGAAAAGCAATGAAAATTGGAATGAAAATAGGAATAAATGTGTTTGGGCTTCAACTTTCATAAACATAAACATAAACATAAACATATA:1 + chrX 13798795 5' - 412 7126 2 74.26 AAAATTAATATTATGCAGCATGTTGCGCGATGCAAAGATAGACGCGATATAGTAAAGAGAACAGAAACGAGGAAAGAGAGAGTCAAGATTACTGATAATAG:1 - chr3L 1083027 5' - Cr1a 4224 1 66.34 AACACCCAAATGGGAGCTGAAAAGCTGATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACATAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2L 9774290 5' - 412 7518 2 64.56 TTGCAGAGAGCCAGCCAACAGCAACAACATAGCCACAGCAAAGATGATGGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGCGCTC:1 - chrX 701972 5' + I-element 146 1 57.43 ATTCAAATAAACAAACAAACAGACGCCGCAACATCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAA:1 - chr3R 19507974 5' + Idefix 296 2 66.00 GAATCTAAGTTTGTTATTACCTTGTGTTCTTGTCCATCTCTAATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTT:1 - chr2L 16726277 5' + Ivk 479 1 68.32 ACGATATGGAATATTTTTTAAAAATGTTAAAAAAAAAGGAAAATAATAAAAA:1 + chr2L 17177902 5' + Doc2-element 255 1 86.54 AGAGCCTTTTTCTAATGGTAGCAAAAATACCTGTGTATCCCATCACCCCCATTCATTCCAACAAAACAGACTTGCCACGCCCCAAACTCACCCCATGCAAT:1 + chr2R 25247756 5' + HeT-A 5936 1 81.19 AAACTTTTTCTTTCACCGTGTCTCGGGCGATTTCTGCCAGTTGCCAGTTTTTTTTTTATTTTTTT:1 + chrX 12778291 5' + hopper 141 1 80.00 CATAATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chrX 21852443 5' + Tirant 8137 2 53.47 GTGCTTTGTCGCTTGCTGACCGTCATGCCGCACAAACACACACACACACAC:1 - chr2L 895758 5' + accord 179 2 72.55 GGTTCAGATTCCGACCCTCCATCTACAGTTCCCAATCCTTCGAGCCGGATCCTTCGAGTCCGCGATACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGG:1 - chr2L 4648252 5' + Max-element 348 1 63.54 TATATACTTGTGGTCTTGACTGTCGCTAGACTGATTTGCTCTTTCGAAAGAGCTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCACCTAATTGTG:1 - chr3L 5611808 5' - I-element 236 1 59.41 CTAGTTATTTGCAGTTGTGGATTTTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2L 7800040 5' - P-element 2870 1 62.38 GATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 - chr3L 9909750 5' + Transpac 49 2 69.31 TCTCATTCTTTATAAATTTCAGTGCATTTGGGGACGGCAGATGGTAATGGAACGCGTGCCAGCGGCTCAAAATAATAAAATAAAAAAAAAA:1 - chr3R 17215867 5' + Rt1b 5148 2 78.02 TATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 19377796 5' - roo 395 1 57.83 TTTAATTTGCAGTTGTCTCCGGAGACTGAAAAAGTTGATTCAATTTCACTTGATTAAGCAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCG:1 - chr3R 19530724 5' + BS 14 1 58.42 CAACCCGGCCATACGGATGAATAGCCACTTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chrX 8972460 5' - 1360 3378 1 60.40 TAAACAACCAACTACTTTTCTTTTCTAACTCTACCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAG:1 - chr3R 19449427 5' + roo 358 2 66.34 TGCGTATCTCAAGGATATGTTTCGTTGGGTTGACCTTTTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTCCGAACATTATTATTGCTGCTTCCGTCGAAATCTTCTTCCTCG:1 + chr2L 12821949 5' - invader2 458 1 65.35 CATTCAGAGATCTCAGAGGGAGATAGAGCAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAAGAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCA:1 + chr3R 17904864 5' - Cr1a 232 1 79.21 TTGGCAATTTTTTCTAGCAGCTCGACATCACCACGCCCACGACCTTCACACCGTGGTGAAAGCAAACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTC:1 - chr3L 10476042 5' - copia 104 2 68.32 GATTGGCAGACCGCAGCCAAGTAATTTCTTCACGCACCCCAAACACCGAAAGAAAAAACCCATGTATTAATATTGGATTAAAAATTGTTTTAAAAATTATG:1 - chr3L 20062856 5' - Juan 3779 1 67.33 CAGTTGAAATCTAATTGAAACTTAATCTGCAATTTTTGTTACTTCTAGGAGTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCA:1 + chrX 14596400 5' - I-element 358 1 76.24 GAACTTGCAATGTTTGTGCTGAAAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 - chr2R 16475793 5' - 412 7495 2 74.26 TTAGCGCCTTTGGCCGCTTCTTTGTCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 + chr2R 14778459 5' + mdg1 7090 2 76.00 TTTTAATGTTTAATGAAAGAAGAGCTTAGCTTCTGCTTTGTTCGAGGTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGATGTAGTGTATCTACCCTTAATATG:1 - chr3R 210311 5' + Stalker3T 3 1 74.26 TTTTANTATATATTTGGTTCTGTTTTCCCAATCATATCGATTACTTCATCCTGTTGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTA:1 + chr3R 7505947 5' - mdg1 405 2 60.40 CTGGGGCACCTCCAGCAAAACCACCCCGAATTCACTTTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGACGTGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATC:1 - chr3L 10176875 5' - Stalker3T 215 1 73.27 CCATGGAAATTGAAAATTGCAAATGGCTGAAGGCCTTGGGCCCACCCACCCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2L 18234175 5' + jockey 10 1 74.26 AGTTTCCCAATCAGTTTCTTTATTAATAAACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGT:1 - chr3R 11094588 5' + 3S18 5781 2 63.00 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCCGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 134 1 62.37 GGCCTAACGACCAGATGCCATGGAAGTCGAAAAAGCCAACGGCCGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr2R 16333987 5' + P-element 32 1 47.52 TCGGTGTCGCTTATCACCTCTACAATTTTGAGGCAAAATTAAAGGGTGTTTCGTGCCTCTAACGCGTTCGGACATTTTATTTTAATTATTTTAATTGAAAA:1 - chr2R 5627650 5' - TLD2_LTR 96 1 75.25 CATGTTTACAAAATATTAAAAACGGGCGAAAGAAATTAAAACGAAAATGTATGTAACAGGCAAAAGGAAGCGTTTCTCAATTTTTGATCAGGATCAATAGC:1 - chrX 695516 5' + INE-1 86 1 59.41 AGAAAAATCCAGATGCGAACTCTTTGTAAAAGTATTCGTTTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTT:2 + chrX 7190619 5' - invader2 204 2 73.27 TCCAGGGCACTCAAAAACTACTGGATTCAAGTAAATATATAATATACAAAAAAGCATTTTCGTATATAAGGTGCTACAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGAT:1 - chr3L 21145728 5' - INE-1 560 1 64.36 CAAAGTACAAATACGAAACTGATACTTCATTTACAGGTTCTTACTGACTGCATGCACAGCTGAAGTGCAAATAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGCGAG:1 + chr3R 3636402 5' + Cr1a 121 1 65.35 TATTGATAAAATTCCTCATTAATTCGGAGCTGTCTCTAAACTTAAGACTTGTACTTCTGCATCCAAATTAGCTGTGTTGTACAAAATATCACGTAAAACTG:1 - chr3R 10279725 5' + Bari2 348 1 65.35 AGCAAAGGCTAATCCACAAAGGGTCCACTTGAGTTTTGGTTAGAGTGAGAAAGCGACATAATGAAAAGGGAATGCCAAAATTGAGAAGAGAAAAAGCAGCC:1 + chr3L 8256668 5' + micropia 288 2 70.30 GTCCGCCGCCCTCCTCACCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCGTTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 12815019 5' + hopper 10 2 69.00 GCATACAAAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chr2L 12325076 5' + jockey 4690 1 54.67 AGCCTCCCATTTCAGCCGTGACACCAATCCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACA:1 + chr2R 16729572 5' + accord 168 2 72.28 GCAAGTCGAATGTTAACGATCGTAAACGATGTTTTTGTAAGTCTCTGTGTATATTCTCGTTCCGAAGATAGGAGCTCCAGTAATGATTCTCAGAATCCAAT:1 + chr3L 25322543 5' - Doc3-element 4391 1 65.35 CATTTATAGTATATTTTAAAGTCACTCCAGATTGCATAGTGTCTTTTCGAGCTCTATAAAAACTGCAAGCTCCAATTTACCGTCCGTAGCTAGCCGTAGAA:1 - chr3L 6582518 5' + Cr1a 4004 1 72.28 AATATGTGTAATATTTTTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3L 8713161 5' + opus 140 4 62.38 TTTGAAAAGAAAATCCGCATGCACGAATTTAATAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 + chr2L 13574214 5' - pogo 2059 1 71.29 CTTAAGGCCTAGTTGCACGCAAGGGAAGGAAAAAGTGAAGCCCAGTGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCA:1 + chr2R 15219827 5' + flea 4642 1 55.45 CACCGCCATAGCCGCCAGTGTAACCGCCGCCATATCCTCCACCATAACTTCCGCCATATCCTCCTCCGATTCCACCTCCTGGCAACGTTTGGGAGGAATTT:1 - chrX 17203501 5' - HB 1256 1 81.19 CTACTACTTTAGACAATCGCAGATACCTTCATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAATTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTC:1 + chr3L 19028741 5' - invader2 187 2 70.30 ATTTTAATGACTGAACATCAGATATTGGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 17587796 5' + roo 49 2 77.23 GTTACAGTCCAAGGTCACAGGACACGCCACCCCCCCCCCCACACACACACACACACACTAGCTCGCCCGCCCCACAACACTATGGGGCATTTGGCTTGTTT:1 - chr3R 22644241 5' - hopper 1412 2 66.34 TCTACACCCATAGAAAAGGTTTTGATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGATGATGTCTCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTT:1 + chr2R 2118575 5' - mariner2 724 1 76.24 GGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGT:1 - chr3R 12047471 5' + Stalker2 43 2 65.35 TTTACGATTTTGGTTGTACGAATAACTGTAGCTTGTATATTGGATGCACTTCATTTTTCCGGATGGCTTTAGTGTCAGGTTCCAGCTCAACTTTGAAGAGT:1 - chr2L 5162818 5' - Fw3 321 1 77.23 TCTTGCATCGACTCAATAGAGGTTCCCAGAATGCACACCACCCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTT:1 - chr3L 2145216 5' + copia 4838 1 78.22 GTGAACAACAAGGTTTTCTTCTCCCGAGCTTCGCTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTATAAT:1 + chr2R 17624909 5' - mdg1 427 1 64.36 CCAAAGCAGCCAAAAATCAACAACTAGTGGGTTTCAATTAAATTAGTGCAGATATCTTATAAATTTATGCTTAAAACCTTTTTTCATTCAAAAAATTACTT:1 - chr2R 15602913 5' - S2 1369 1 78.22 AATGANTTGGAAATGCGCACAAGCAGGCAGCAGAGCAGACCACCAGCAACATGGCCACAACGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGG:1 + chr3L 15391662 5' + flea 4726 1 64.36 TGGTAATGGACATATAGTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGTTAAGAAAATTCGTCATCGGCTGCACCCGCTC:2 - chr2L 21635368 5' + F-element 462 1 78.22 TTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 2060138 5' + 412 7094 2 64.65 TGATATTAATCTAAAATTGGGTATTCAAAGGATTTGGCGATAGATATCTACGGTGCACTGATTTAGATGTACATATATATATATACATATATATAGTTTAT:1 + chr3L 18737802 5' - 1731 4406 1 68.32 CCATTTTCCATAGTTTTTGGGTGATCACAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2L 18234126 5' + jockey 60 1 77.23 TTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr3L 8713144 5' + opus 7160 4 74.26 TCTCAGATTTTTAGTTTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACAT:1 + chr3L 18337646 5' - Juan 4187 1 53.47 AGAGAGTGCCGAAATAGCTTTAACTACGATAGTCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAA:1 - chr3L 26721021 5' + Tc1-2 1575 1 80.22 CATCCTGTTCTCGTGTTTGCGGTCACCAAATTCGCGTTGTAAGCCAGGATATATACATATGTATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTT:1 + chr3L 10081917 5' + rover 6961 2 67.33 CGCTTTTGGCCTTTTTGTTATATTAGTTTTTAATTGGATTTCGTTTGTGGCTTTAACATGATGCAATTCGGATTTAT:1 - chrX 19740310 5' - Ivk 4976 1 54.55 TTTGTTGTTGTCAGCAGTTTTTATGAGTTTTCTTCAGGCATGAACTTCCACAATTCCCAATAAGTACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTG:1 + chr3R 17843620 5' - roo 9059 1 64.36 GTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 + chr3R 4834277 5' - mdg1 367 2 81.19 CTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCT:2 - chr2L 3440506 5' + Juan 29 1 54.46 AATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGGGTGAAAAAAATAAGGGAATGGGATTTGTAAAGGCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 27981737 5' - roo 9046 1 48.51 GTAACACTTGTTAAATAGTTTCAACAAAAACACATTCAAATATGTCTGATAAGCCAAAAGGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAG:1 + chr2R 21715427 5' + HMS-Beagle2 6979 2 58.42 TTTATNAGGTTCTTTATTCAACTGTTCAAAGTTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAAT:1 - chrY 3648915 5' - 17.6 490 2 75.25 TTCACCCACATTTGCCCACTTTGGGTAGTCGTGTTTTTGATTTGTTGTGGCCCGCCGGCGTTTTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 10561884 5' + hobo 13 1 66.34 TATATTGATATACAGTTCGGTCAAGCCTACAAACCGCCAATAAGAAGTGATAACATATTCAAAAATCTTAGGGATAGCCGACAATTAAGAGATTCCTCTGT:1 + chr2R 5152581 5' - Q-element 110 2 72.28 TCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2L 12324095 5' + roo 8702 2 63.37 ATCTACTATTTCTAATTTAACTCGGACTACTAGACAGACAACCAAAATACCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACT:1 + chr2R 964650 5' + I-element 4933 1 54.46 CTTTGGGACTGAGAGGCAGCGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAG:1 + chr3R 12047381 5' - Stalker2 403 2 78.22 ATATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3R 9551440 5' - P-element 2836 1 28.71 AACTTTGCGGCTTCTCCGAGCATACAATTTTTTCACTTGCCCCCGCATACATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 - chr2R 16940410 5' + 297 6601 2 60.40 AAGAAACAAATTTGAGGAGGTGTTAAATTGCTGCAATTTTTATTCATTTAAATTAATGATAATAAACAATATGATAATAATTATTATCCCTCCTCTAGTAA:1 + chr3L 6442453 5' - Transib5 2550 1 79.21 GGATGNATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 9131738 5' - roo 397 1 66.34 TTGGGCTCTGGGGATAATTGCTGCCAAACGACGTGACATTTCTCCCTGACAATCCTTGTTAAATCAAATATCTCTCATAAACCATTCGCCACTCTATCGCA:1 - chr2R 20838417 5' + G5A 248 1 56.44 ATTTTTGCCTTCTTCGCTGGCGACGGCACATGGAAGCAACATGAAATTTTCTGCTCGGAGGTGTGGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTGTTTACC:1 - chrX 14323643 5' + hobo 10 1 55.56 AGCGGTTGTTATTGATTGAGTAATTTGACTAATTAATTCGAACTTAAATGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAG:1 + chr3L 12221763 5' + invader4 2746 1 52.48 TCCTCCATCATTGAGCTAAAAGTTTATTAAATAGCAAAGGCCACATCGATTATTCACTGAAGAGATTTTCTCACTTTTCCCTTCTTCCTCATATTCTATAA:1 + chr3L 26834356 5' - invader4 2963 2 63.37 CCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr3L 6044760 5' + Tabor 6892 2 74.26 CTGCCACGAATCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAATACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 16761312 5' - roo 9045 1 64.29 TTTTTATTTATTTCTCCTCCAATATCGGTTCGAAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACA:1 + chr3L 26763199 5' + Tabor 407 2 67.00 TTTAATGCATTTTTAGATGCCACAGTTGGGCTCTGCTGATATACACACTGGGTCGAAAAACAAATATATATTATGTGTTCACACATGAACACGACTATATT:1 - chr3L 6506906 5' + roo 8669 2 65.35 TGATCTGGCTGAATAAAGATACACAAAGGAACTTCACTGGCAAACTTAACCCAAAAATAACAAAAATGGGCGTTTTATATTACAAGCACAACCACAAGT:1 - chr2R 5017146 5' - Transib5 488 1 79.80 TGCAGTCACTGAACTCCTCCTAAAAGTATGCAGCGCCAAATAGCCATGCGAATGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr2R 17345966 5' + jockey 12 1 73.74 TGGGAAAACCACAACAACAACAGAGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chrX 6657346 5' - P-element 2853 1 47.52 CCCAGGCACCTCGACATCGTTGTGGGACGTCGGAGGGAGAAACGATGGGGCATGTTGTTTACATGTCTCACAAAACTTATGGAAAAATATCATAGCAAGCT:1 + chr2R 5374068 5' + F-element 4440 1 72.28 CATTACAAATATTACAATATTTTTAAATCATTACTCCTTTGCAATCGGTGAGTAATTCCACATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCA:1 + chr3R 31194447 5' - Transpac 5216 2 65.35 ACATAGTCGCGAAACCGGCTCTTAAGTATTTTATTTATTTTTTTTTTTAGTTATTTTACTT:1 + chrX 9972687 5' - F-element 4682 1 77.05 CGAATCGTTTACCTGGTAATTTTTGTTTTTTTGCTTTAGCTGTTGCCTTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTCGTATAATTTGGTTTTTTTGAGAAA:1 - chr3L 537105 5' - I-element 5160 1 61.70 GCTCAACGTGGAAAATACAAACAAACAAATAACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:1 + chr2L 17210292 5' - jockey 4947 1 71.29 GTCATTTTCGTTTATGGTAAAGAATTCCCAATGCTTTTCATACAGTGACTGGGATATATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 - chr3R 11111520 5' - 297 350 2 58.42 ATAATATAACGCATTCATCCTTATAAGAAACGATAAGATAAGACATCTATTTAAACGACTCATTAAGCATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAA:1 - chr3L 3301468 5' - micropia 149 4 66.34 ATAGTTCGAATGAAGATGGTAGTGGCTGCACTTTTTCGTTTATTTGTTACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAG:1 + chr3L 12931780 5' - gypsy4 307 1 65.82 TAAGGGTCCCGACTTTAAGAGCCCAAAAAGAAGAGGAGAAGAAATTCGATGACACCACAGGAGCGCAGAATGCTCGCCAAATTCATCTGCGCGTACACCAA:1 - chr3R 13140126 5' + Porto1 421 1 56.44 TGCGGAAAGAAGTTTGGCCGACGCGACCACTTAAAGAAGCACATGAAGACGCACATGCCGCAGGAGCGCCAGCTGGCTAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTA:1 - chr3R 4345646 5' + gypsy8 4778 2 75.25 CTGAGCCAGACTTCAGGTAATACCAAATACCCATATACCATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chrX 17830793 5' - P-element 2850 1 43.56 GCATTCCCTAAATATCTGCAGTGGCTCGGCAAATATTAATAAGTAAAAGGTAGCTAATT:1 - chrX 22436096 5' + 1360 2972 1 89.83 TTTCGGAAAAAAGGTAACATAACTTAATAGTTTATACTATAGAAAAAAAGGTTTCGATATCTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr3L 2019746 5' - 412 7542 2 59.41 TACGAATATAGTTCCCATATATGAATCCATCTGGCTGACTAAATCACATGCTTTTATTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr3R 19346974 5' + blood 21 2 58.42 CACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTG:1 - chr3R 11094558 5' + 3S18 47 2 68.32 CACCGACACTAAGCATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 + chr3R 25671931 5' - I-element 5316 1 63.37 AGTCAGCAAATTAAATTCACAAATGTTGCACTACCAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAAT:1 + chr2L 6388736 5' + copia 471 1 65.00 TCGAGTGAGAGAACGCACACACACACAGCAGACCCGGTTTGAATTAGATTTAGTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGC:1 - chr2L 1976499 5' - X-element 4267 1 55.45 AAAAGCCGAAGAAAACCCGCTTAGAAAATGCTCTTCTGTTCTTGTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACC:1 - chrX 20881399 5' - invader4 74 2 56.44 AAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chrX 15305641 5' - roo 397 1 57.69 ATATGTACATAAAAATAGAACATCAATCAACGTTGATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - chr3R 16834074 5' - I-element 5311 1 64.36 AGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAA:1 - chr2L 12325068 5' + jockey 4723 1 74.00 ATTAACGGAACAGTTGAGGTCCTTTAACAGCAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAAC:1 - chrX 18161717 5' + R2-element 433 1 80.90 CCGCTCCCGCCTGACGTTTCAGACTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTT:1 + chr2L 7848796 5' - 412 7093 2 77.23 ATATAGCATGAAAATAGGAAATAAATTCAAATACCAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTCT:1 - chr3L 15234878 5' + Doc3-element 283 1 40.59 AAGTAAGTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTA:1 + chr2R 13078720 5' + jockey 4666 1 55.45 TTCGATGACACAAAGTCTTCAATCACGATCGATAGGAAATTAATCGGCCGCTTTTTTAAAATAGTTTCGTTAACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATCTAT:1 + chr3R 10052892 5' - Porto1 4392 1 59.41 GATATGCAGTTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:2 - chr2L 15808047 5' + I-element 24 1 52.48 TTCTAGCCGTGCATGTTTGGAGCCGGGATCCTCCTGGGGCAGCACTTTCGCTGGGTTTTGTTCCGCACTGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGC:1 + chr3L 5475759 5' - opus 7205 2 68.32 ATACACACACACACACACGCGCGCGCGCAGAATACAACCCGATCAAAACCCAGAAAACAGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2L 4869052 5' - P-element 2874 1 64.95 TTACAGCTTCCAGTGCCATTCCTTTTGTCTTTTGAAACTCGCTGCCTATGCTTCTTGTGCTTGCGTAGGCTCTGACTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGT:1 + chr2L 23488915 5' - G-element 416 1 73.27 AGCTGCGGAAATTGTGAGGAAATGAAAATGGTTTAACTTTTCTTTCTTGTGTGCTCTCCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATT:1 - chr2R 10008593 5' - invader2 486 1 69.31 TGTGGNAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3R 10952275 5' - roo 9034 1 61.39 AAAGANAAAGTGAAAAAGGTGCAGATAACTTAGGAAATGAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTATTAGGATCTAATTATGTAATAAAA:1 + chr3L 4771151 5' - Cr1a 4278 1 69.31 TGTAGGAACGATCTACTGACTTGCGTCCTTTTAATGTTTTTTGAATATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr3R 4600056 5' - HMS-Beagle 7013 2 60.40 ATAGGCAAAAGAATATATGTATGTATATCCCAATATACCCAATGTTCTGGGAGGTCGAAGAATATAGCAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATCGCAAAC:1 - chr3L 3957050 5' + Bica 457 1 66.34 CTCACTTTTGGCAAGCCTCTAATGCCCGTGGCTATTAATGCCGTCTAGACGGATCCGAACTCGACCACCTATTTTCTGACGATGAGGTTCACTCAATCTCC:1 + chr3L 744604 5' + TAHRE 482 1 65.35 ATGAGATGGTTCTGAATTTGCTTTACAGCTACTTCTTACTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTCTTGTAAGAAACTGATTTTA:2 + chr3R 12539498 5' - roo 9035 1 62.38 GAATGCCACAAGGAATATGAATCAAATTGAGGTGTGAATGTATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTT:1 + chr3R 9113205 5' + accord2 7576 2 74.26 ATGGGGGGTTGGATTTTATTAACCGGATGTTATTACACCCTCAATAGTCATCTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGT:1 - chr3L 10214937 5' - X-element 4553 1 49.50 CTGATAAATTACCTGGACAAAGTTGCATAACGAATCAGGCGTAAAGACTGGGGTTGGCAGACAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 + chr2L 15947370 5' + Transpac 18 2 62.38 ACTGGAATCGAAACGCGGCGGATGGCCTGCTGGTTGCGCTGGTTGGATCTCGAAGGGAGGATGGCTGGAGGGGATCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:1 + chr3L 6312627 5' - INE-1 85 1 78.00 TGTCTAATGGGCTCTAGGGCCAAATTAAAAAATAGGGGCTTGGGATTGGGATCGGTAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGAGATCTGTGG:1 - chr3R 9446719 5' - HMS-Beagle2 6796 1 63.00 TTTTCTTTGTAATAAATGCGCTGCCGCTTTAAGAATGAAACTGAATCATTGATTGATTGCAAAATTATAGAATGCAGCATTTGTTAAATTATTCAAACACA:1 + chr3R 23947548 5' - invader2 400 1 72.28 CATCACAATCACGTGCCCGCCTCATCGCATCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTC:1 + chr2L 3863797 5' + I-element 270 1 71.29 ATTTGATAACATGGCTAATCAAATTTCATCCTTCCTTCTGGGTTTTGATAAACGAGGGTTTTTATTTTTTTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chrX 22444531 5' - Juan 4196 1 61.39 ATCTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 8345498 5' - roo 9043 1 54.46 TCAAAACTATTTTAAGTTTCATTTAAAACAGTATCAGCGAGAGATTGAGATTAGGACTCTCTTTTAGGACCCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTAC:1 - chrX 15077489 5' + S-element 2 2 68.32 CCCTCATGCAACCTCCACATGTTTGCCAAAGCCAAAAGTAAAAGTGTGTATTGTATGTGTGTAGTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAG:1 + chr2L 14828936 5' - transib2 2586 1 62.38 GTATAATCATACATCTTTTATACCCGAAATCGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATAAAGTATAAAGTATATTCTTGATCAGGATCAAT:1 + chr3R 4132384 5' + INE-1 83 1 69.31 CCCATNTATGAGAATTTACCACAACAAGGGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCTACCTATCCCCCATCAGGTACCCGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAA:1 + chr3R 32028282 5' - INE-1 531 1 68.32 TACCCGTACTAGATCCAACACTTGTTATAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGGATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGC:1 + chr2R 11540416 5' + Doc 4367 1 72.28 CATTCGAGTTTCTATTCTTATTTTGAAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 20878449 5' + 297 6602 2 50.50 CGGTCCTGAACGTGAAATGGGCCCATGAAAATACTCACAAAAAAAAAA:1 - chrX 3450838 5' + TART-A 13402 1 91.67 ATGGTTTTCCTTTTTTTTTTTCCTTTTTT:1 - chr2R 5931540 5' - Doc2-element 256 2 86.21 GCTATTTACGCAGCCGCGCAGTCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACC:1 - chr2L 8307994 5' - P-element 94 1 25.74 GGTCACTTGCTCTGGCCTCCCCCCCAAAAAAAAACAAAAAATAGAGAATGCTATGATCCAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTAATCAGCTAGTGTGAA:1 - 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INE-1 345 1 68.32 ATATTAAAACAAATATAAAAAAATATCTTAATATTCACTTTATTGTACCCTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 4750330 5' - 1360 3365 1 55.45 GTGTTAATGGTTGGCCACAATTTTTAGTGGACCATGGTCCGTTGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCT:1 + chr3L 7820848 5' - 17.6 6961 2 58.42 TATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr2L 513717 5' - roo 359 2 74.26 ATAATAATATATCATAGTGTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTT:1 + chr3R 13582199 5' + BS 5002 1 70.30 TAGATACATACATATATATACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3R 27748647 5' - roo 404 1 72.04 TGACTNATCAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chrX 13508682 5' + roo 8690 2 52.48 GGCCGACTCACACTTTCATAAGCCTGATTTTTCGATTTTATAATAGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 12539563 5' + roo 8695 2 59.41 AGTTTGGTCTTGCACTGAAAATGTATAACGAACTAAAGTTTAAGGATATTGAAGATGCTTTAAGCCTAACTTTATTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCT:2 + chr3R 17321682 5' - Stalker2 401 2 76.24 GCTAAGGATGTGTAAAGTTTAGCTGAGAGTGCTATAAACAAGTTCCCTGACTATTAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATG:1 + chr3R 3624043 5' - INE-1 535 1 71.43 GAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACC:1 + chr2L 17784629 5' + gypsy10 36 2 57.43 GTGGACGGCACAGTTCGTGTTTTATATTACGAAAAACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chrX 13546643 5' + roo 8703 2 69.31 TCGACTGTTCTCCTCTTTCCCGTTTTCCGTCCCTCCCCGCCTTTCTTCCCCGTCATTTTTTGTGTTCTTATTTCCGTTTTTGTTTTTTTCGTTTTTTTTTT:1 + chr2L 12995379 5' - Bari2 910 3 71.29 GTCCCNACAGATTTTACAACCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr2L 6888567 5' + jockey 6 1 78.22 GAAACACAAAAAAAAAGGCAAAAAAAA:1 + chr2R 13799839 5' + gypsy7 5005 1 85.19 CCTAGCTTCTGTATCTATTAAATGCGAATTTCTTTCTTTCCTACTCTATTCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCAC:1 + chr3L 23848073 5' - R1A1-element 5287 1 60.40 GATTGTACGCGGCAGATTTGGGCGATAGTGTGGGCGTCAATATAAATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 + chr3L 23123522 5' - flea 227 2 59.41 CATTTTCCATGTGTCCATGAGGCCATTCCTCATGTTCCTAGCCACTTTTCGTGGACTTTTTCAACGACAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 12457894 5' + roo 7 2 72.28 GTTGTAATTTGTAATCGAGTGTTTACACTCTGTCTGCTTTAAACCGGGACATCAAAGGCATATTATCCAACGCAACAACAAAATGGACGGCCATAATGGAG:1 + chr3R 21607185 5' + TART-C 203 2 74.26 AATCACGGCTTGAGATAAGTTTAAGACCATGTACTGCTGTGTTCATAAAAATAACAGTGCGAGGGAAACTATGTAATACAAAGGTATTTTTGAATGTC:1 + chr3R 4223217 5' + HB 49 1 68.37 TTTAATCCGTGTCATTTTGCCGGATTGATTGTGGGGAGTGGGAGTGCGGAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAA:1 - chr3R 5904964 5' + R1A1-element 132 1 53.61 CACAACGCTCCGGAAATCCGGCAGTTAAACCCATTGACAGTGGAAAGTTGTGTAATCACGGCTAAGAGCATAAAGGGGAATCAAAAAATAAAAAAAAAAGA:1 + chr3R 22323048 5' + R2-element 3583 2 64.36 CAGGGTAAACTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chr3L 18659020 5' + pogo 32 1 57.43 TACAAATGTGTGTGTGTGGGTGCGTTTTGTCTGCCTGAATTACAGCTGGTGAATAGATTTAAACATGAAAAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACA:1 + chr2L 17470325 5' + Dm88 4266 1 56.44 TCTCCCAAGCGGAGGGTCAGGCCCAGGCGACCACCTGGAGCATATCGTTCATGGAGACTTTGAGGTGAAGAGCGGTAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCG:1 + chr3R 9786586 5' - 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blood 7341 2 74.26 TCGATCATGAAATAAAGTTAAACGGAATTAACAAAGACACAAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAA:1 + chrY 676891 5' + Doc 4654 1 60.40 TAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 + chr2R 5067655 5' + F-element 59 1 73.00 AGAAACGGAAATGCGATTGCTAGCAATTTATTATGGCCTGCACTTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chr3R 29470854 5' + hopper 28 1 54.46 CTCTACAGACAGATTATTGTAAGTTACAGTACCTTCGAAAACTGTTTGGTAGTTAGTTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGG:1 + chr2L 1009422 5' - I-element 196 1 66.34 AGATCGGTTTGATGACCTCCATTTACCTTATTGGAAATTGCATTTTCTAATGGATTTGCGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTAT:1 + chr2L 12522676 5' - Stalker3T 295 1 65.35 CTTCTCATCTTGCTGCTATTTTTATTTGCATATTTACTTAAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTA:1 - chr3R 26501047 5' - Quasimodo 308 2 60.40 AAAATGTGAGCTCAGTCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 5531191 5' + 1360 70 1 55.45 ACACAGAGGCACTTGTTCAAGCTGCTCGCATATACATACATAGCAAGAAATGTTTATCTTATATTACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGC:1 + chrX 22580212 5' + Doc 391 1 69.31 GGTCTCGAACAGATCGAGTTTGATGCGGATGCACTTGGCAGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTAC:1 + chr3R 29122016 5' + hobo 389 1 60.40 AGACGCCCACGCACACTTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - 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roo 9047 1 53.47 TAAGTTATGTGTATATTAACATGTTGACTATTGTATCCGAAATGTTACAATAAAATTACTACCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 11837979 5' + roo 8679 2 62.38 ATGGGCCTCATTCGATTTATATTTATACACTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 + chr3R 8555820 5' - 412 489 2 72.28 TTCCGATTCATTCACCTGCTTATAGGATCTTCTCGTTTCAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTGGATATGATGTGTAAATG:1 - chrX 17968431 5' - Tirant 366 2 55.00 TCTATGAAATTGTTTCATGAAATCATTTCAATTTCAAAATGAAATGTTTGTATTATTTGTTCAAGCTAATAATTATGATAATAATATTATTAATAATTATA:1 + chr3L 24820201 5' + mdg1 7084 2 69.31 TACACTGTCTTTTAGGGGTGGACCGTAAGGCTAATCCACTCTAATTTTAGATTAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTG:1 - chrX 12290245 5' + X-element 35 1 52.48 GTTGACGGTATCTCAATTCTATTTTTTACTGGCACTCTTCCATGTAGAAGTTCAAGGACTTCTTCGTCTGAGGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATT:1 - chr3R 805020 5' + blood 449 1 77.23 CTGTACAATAATCTGTGGTATACCATTTATGATCCGATGCTCTAAGAGCGGCAGAGAGTTAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAAC:1 - chr2R 5520004 5' - Cr1a 4200 1 72.28 GATTAGTTGTTGCCTTTAGTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 8912984 5' - gypsy7 5018 4 86.11 CTCAATATATTTAAAAAGGTTTTACAACGGATACATATACATTATATTACATACATACACATACACATATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 + chr2L 21328148 5' + flea 4761 1 75.25 AGCCGGAACTTTACGTTGGACAAGAGAGGTACTGTTTTTCAGGCTGATATTTTATCGACTTTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTTACCCTTTGGTGGGAATAA:1 - chr3L 381715 5' - Quasimodo 207 2 67.33 CCCAACTTGTAAATTAAGCAAATAATAATATACAAGTTGATATTAGAAACGCTAGTAACGGATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCT:1 + chrX 19430668 5' + mdg3 17 2 42.57 ATGTGTTCTGATTGCGGCAACTTTTAAGAATTAAACGAATTAAGAAATATTAATATTAAATGGATATGGGTGAGTCAGCAAAAAAAATCATATTAATATGT:1 + chrX 14836269 5' - transib1 1887 1 39.60 TTGGCTCGAAAGTATGCTCCATCTCGCTCTATCGCCGTGTGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr3L 13589447 5' + hobo 36 1 59.41 AATGTGGTTGTATGTACTTATTAAGAATATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr4 1149910 5' + 297 6625 2 81.19 ACAGCTTGTAGTTGTAGTTGTTACTTTAAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAAGTTTCAAGAGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAAC:1 + chr3R 10967702 5' - Cr1a 353 1 74.26 TGACCAATTGGAACGCAAGGACGAAGGAGCAGCGTCCGTAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCTTCGAAGGAATGGTCGAAAGGATGATGGAG:1 + chr2L 10440202 5' + G2 189 1 64.36 GATCTNACGCGTTTTTTTTTCCACAATGCACCTGGCTGATCGACGACGTCAGAGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTC:1 - chr3L 8382768 5' - F-element 4433 1 57.43 TGAATGGAAAGTGAAATCGATTTGGTTGCAAAGCACAAGAAGTAAAGAGCGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 + chrX 3305130 5' - transib2 2801 1 53.47 TAAATAAAATAATTAATTTATTAAATAAGTTTAATTTGTTTGTCATTTATATTTGCTTTTATTTTATTT:1 - chr3L 6934830 5' - HeT-A 322 1 82.61 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGTGAGACGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chrX 17971835 5' + jockey 28 1 43.56 ACCAGACACAAGACACCGAAAGTAACTTTATGGCTTGCCATTATGCGTTTTAGTTTTTTTCCTTTTTTGTTTCTTGCCAAAAGTTTTTTATTTTTTTGTTT:1 - chr3R 6249226 5' - HMS-Beagle2 491 1 63.37 GGGAACAACCGACTTATAGAGAAAGTTCCAACCGACCCAAACGATCGCATCGGCCTCTCAATGCGGACTGCTCTCTTGCGGTTCTTTTAACAGCTCTCCTG:1 - chr2L 10457707 5' + Cr1a 363 1 72.28 TCTATGGCTAATTAAATCCTGTGCAAATTAAAAAGATAAAAAAAAAA:1 - chr2R 13521934 5' + Doc 4700 1 78.72 CTGTCTTTAAAAATATTTTTATCCAACCTTATAGTTGCTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTAT:1 - chr3L 10477602 5' + copia 5083 2 62.38 GGTTGTATGATCTCTTCCGTGACTTCGATAACCTCAGTGACTTGGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr2R 14675543 5' - roo 9041 1 58.42 CTGGCCTTTTGTTTAGATTATTTCTGGAGCGAGATCGGCCGCGTCGGATATTGATTGTATACTGCTAGTGGATGTGGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAG:1 + chr3R 2472681 5' + rooA 7350 2 81.00 GTGCACTCTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chrX 21017786 5' - 412 7503 2 66.34 CTGAGAGGCAGCGGGCAGGTAGGTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGT:1 + chr3R 12047389 5' - Stalker2 7643 2 70.30 CATTAAATTAAACTGAAATAAATGCAATATGAAACTAAGAATTGGACAATATAATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr3L 9766333 5' + blood 23 2 57.43 ATGATGCGTAGCTTTTCATTAAATGAAAATTTCGCGTTGCTGGCAAAACAAAAGGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr2R 14778517 5' - mdg1 7437 2 56.44 CTGCTCTCCTCAGTTGCTTCTCTGTTTTTGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGGATAAT:1 + chr2R 7598634 5' - Doc 4340 1 78.22 AGCTTGGCGTCTGCAAGAAAGAAGAACAAGCGGTTCTTAATTAATTACCGTGACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAAT:1 - chr3R 25189874 5' + roo 179 2 58.42 CTATGCCTCCCGGGACTTTTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTACT:1 + chr3R 4853348 5' - gypsy4 58 2 75.90 GTTTGGCCGATTTACTATGTTAAATATGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chrX 13761320 5' + pogo 26 1 54.46 GTAATTGTGCCGCGTTTGCTGCTGCTTTAATTCGTATTTTCATGGGGGTACTTCCACATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 18571107 5' + hobo 21 1 57.43 TATTCATTTGAAATGAATGTCACTTTAAAACACTTCGATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCT:1 - chr2R 23503024 5' - jockey 4755 1 63.00 TAGCTGCCATGTGTGCTAGTATGCGAGTGTGCGAGTGGGGCTGTTAGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 - chr3R 17700334 5' - F-element 4413 1 54.46 AAATTAATTAGAATTTTTCAACTGCGAAAAAGTATGGCAATATATTGAAAAGAAATCTGTGTTCTGCGTGCTCTATTTTGTTTTTTTTTTTCTTT:1 - chrX 18530168 5' - gypsy7 5013 5 75.79 CTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr2L 2074769 5' - roo 9034 1 62.38 GGTTAATTATCAGTCATAATTACTTTGGCTTCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCC:1 + chr3L 24354989 5' - micropia 5260 2 78.22 AGCCCAGAAAACATCATTCAATCGAGGGGCTTCGGGCTGCCCCGACCGGGCTAAGCCAAGCCAAGCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAA:1 - chr2L 12815127 5' + hopper 14 1 67.33 ACTATGCTCTAATCCAAAAAATTGTTGTTGTTATTATTGTTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAAT:1 + chr3R 6679234 5' - G4 3516 1 59.41 CGTGTCCATCAGGGAGATAAGAGTCCTGCGCAGTCTTCGGCGTTGTTCACTATTGTCCAGTAGGAAGTTGGCCGTTATGTTGGAATGCCTATGAAGCCTCT:1 + chr2R 4932552 5' - G7 973 1 76.24 AATCGCTGTAACATGAATTTATGATTTCGCTGGCCGTACACTATCCCCAGATTCAAACACCCGAATTGAACTCATTAAATGTACGCACAAGTTTATA:1 - chr3L 2895855 5' + rooA 7591 2 70.10 TACAAAGAGGCCCTGCCTTGTTGGTCTTAAATCTTCTTCTCGTTCTTGTCCGATGGCTCTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCT:1 - chr2R 13645120 5' - jockey2 3119 1 66.28 ATCAAGTTGTCTCTTCCAATGCCAAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:3 - chrX 13508775 5' - roo 9058 1 69.31 AAACACTTAATTCCGTACATATGTACATAAAAATAGAACATCAATCAACGTTGATTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 - chr3R 16834092 5' - I-element 5329 1 60.40 AGCAGCCTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chr2L 21683383 5' - pogo 2094 1 70.21 ATTTTCGCTTTTATAGATTCCGGTGGCGCGGACCATGCTCGCATATCGATACGGGCGCATTAAAATTTAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chrX 1523946 5' + jockey 15 1 71.00 GTGTTTTGGTGAATACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTAT:2 + chr2R 4673556 5' - Quasimodo 7359 2 68.32 AAGGAGAGAGTTATAGATAGGAAAAAATGTATAAAAGGACAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCG:1 + chrX 16287541 5' + Doc 244 1 61.62 AATGTGGCTCTTCGCTTTTCACTTCAACACTGTGTGTATGTGTTTGGGTGTATGTGTGCTGTTTAAATTTAGCCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTT:1 - chr2R 10945424 5' + transib2 2 1 75.25 GGTGCTTACTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chrX 21531015 5' - roo 9040 1 55.45 TTTTGCTACACCGATAAAAAAAAACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAA:1 + chr3L 11605299 5' + I-element 5237 1 84.00 TTTACCAATCATTATAAAAAACATGAAATATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGTATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 27981763 5' - roo 409 1 79.21 GAAAATCGATCAGTGTAAGGCCGAAAAGACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:2 - chr2R 11528092 5' + P-element 14 1 67.33 TGAATTTACATAAGTACAAAGCACGAAGAAAGTTACTTAAAAATATATGAATATTTATTTCTTTCTGCCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 - chrX 3305233 5' + transib2 7 1 70.30 ATACACGATTTATTTTATAGCTATACTTGGATATGCATCAAATACAAAAATACAAAACCCTCGTTTATTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1 + chrX 22444440 5' + Juan 4064 1 61.39 TATTACCTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:2 - chr3R 4601400 5' - opus 484 2 65.35 AAAAGAGACTAAGTAAGTGCACAATAAGCGAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTG:1 - chr2L 16541298 5' + blood 401 1 70.30 CAGTAATAAACAACATTTATGATACAAGGGTGGTTCTGCGTTTATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGACGGCTGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr3R 4543995 5' + flea 4779 2 54.26 GTTGAAAAGTCCAAGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGC:2 - chr3R 6608835 5' + I-element 30 1 55.45 GGTACACCGCCCCACAGCATTCACAGTTATTTATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTAATT:1 - chr3L 2616102 5' + copia 4866 1 65.35 TTACCAGATTGCTCTGTTTTTTTATCCTTCTTAGAAGGGTTTTCATTTGAAAAATTTTTTTTGTTTACAGATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCAT:1 + chr2R 14613865 5' + 1360 3336 1 50.50 GTATGGACTGCCACATATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 - chr2L 3951667 5' + Transpac 4940 2 56.44 GGCTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCAC:1 - chr2L 11703295 5' + Tabor 39 2 60.40 CCTCCAGTCATTTCGATTGTTTTGATACGCTTCGCTGTGAATAACAAAAAATAACTTAAATAAAATATAAACCCTACTACCAGATACCCGTTACTCA:1 + chr2L 16339161 5' - INE-1 548 1 76.29 TTTGGATCTTGAAATCGATCTCTTGTTACCATCAAGTGATTTGGTCAACTTTCATATAGCTGCCATATGAACGATCTGGCCGATATGCCATAAAAATATTT:1 + chr2R 3141939 5' - transib1 1987 1 69.31 GGAAATCTATATCAAAAACTTAAGGTATAGAAAAACGGTGTATAAAATCAAAGTTAGTTATAGAATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chrX 15391915 5' + 1360 9 2 44.55 ATCAACAAATTATAAATATAAAACGATGAAAAGCCCAAAAATAGAACACAAAAACGAAATTTCATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCAAGAATTCTGAG:1 - chr2R 24695641 5' + Doc 4350 1 66.34 AGGCATAATACACGGTAAACTGGTGTATTTTCTGTGTGATATTCATTAACTCTATGCTCACCGTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATT:1 + chr3R 13227028 5' - hobo 2738 1 78.22 GAATCTTTTAATAAACTTCAAACAGGAGGATTTATTTGCATATCAAAACAGAAAATTAAGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2L 7488940 5' - roo 391 2 58.42 CTGTTGTTCGTGTTGCTGTTGCAGCCGTTGCTGCCGCTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGCATCGTCTGAT:1 + chr2L 13617935 5' - Bica 4533 1 58.00 AGTTTATGACAGTTGGGGGTCCTAGCCTTGTGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr2L 13319648 5' + hobo 27 1 52.48 GACCGACAACTTGGGTTATAAAACTTCCACAACAGTTTTCACAGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAAT:1 + chrX 2649818 5' - Tirant 367 2 57.43 TGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 13546709 5' - roo 9044 1 55.45 TTTCGTTTAACTATTTCTGGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGT:1 - chrX 3388050 5' - I-element 4927 1 81.19 ACATAATCTCCCGTTCCGATTAGAGTTGTTGTCACAGTACGAGTCACCGTAGGTAAGCGTAAAGAAATTTCGCATGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGA:1 + chr3L 9125634 5' - Doc2-element 480 1 74.26 GGCTCATAAAGCTGTTTAATGGCCAAATGCCAGAATGATAATAGCCCATAATATTCGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAA:1 - chr2R 24479955 5' - I-element 5338 1 61.39 ATCGCAACACAAAATCCACGCCCATTTTACCTGAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAG:1 + chr2R 6433280 5' + Circe 7388 2 86.44 ACCTATCCTGCGAAACAACTTTAAACAACCTTTTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAG:1 - chrX 2353927 5' + Bica 118 1 42.27 ATTTTACTCTGCGAGTGCGGGTAATATCTAGGACATCCATCACAGTATCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGAC:1 - chr2L 22343339 5' + F-element 382 1 53.47 ATGAATTGCAGAAAGTTGGATTCAACTTAAGGAAATGGATTTCCAACAATTCCAAAATATTAACCACTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGC:1 + chr3R 19445681 5' - roo 8853 2 71.29 ACTCTNAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTAGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTG:1 + chrX 21097038 5' - INE-1 155 1 74.00 ATGTTAGATTGAAATTAAAGCATACCTATCAGGGTTTTGGGTATATTAAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACA:1 - chr2L 15080575 5' + hobo 29 1 53.47 CTTTCAGAACTGCCCCATCCCATTCAGCCTCCCTATCGCCATGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAA:1 + chr3R 20367171 5' - Stalker 6893 4 60.40 CTCGGAAGCATTCGACTTTCTACTCGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATACATT:1 + chrX 21017793 5' - 412 443 2 71.29 CTAATATTGCAAAGTGTATGTTCTTGCAAAATCAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 + chr3L 18659029 5' + pogo 41 1 66.34 TGGAATAAATATGTGATATTATGATTTCTCTCCTCAGCTGATGGTTAGATGAATATGAACTCTTTCATAAACAACAATTAAAATTACAAAAAAAAAACAAA:1 - chrX 11947817 5' + Doc 4698 1 77.23 TGGTTGTATGTGTATAATTCTTTCTATTCTTGTTTCTCTATTTTATACTCGTTACTCGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTT:1 + chr3R 597423 5' - Bica 348 1 56.44 TTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 + chr3R 14917192 5' + HMS-Beagle 36 2 64.36 GTATTNATTATTCATTGTGGGCTTTAGTTAATATGATGTCAATTTTGAGATATTCAGCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTA:1 - chr3L 21793670 5' - Doc 4425 1 61.39 AGCCGACAATAAATTCGCTTGCACAAAAAGGGAAAATAAGAGAAAAACCATTAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACT:1 + chr2R 16700921 5' + HMS-Beagle 7028 2 56.44 TCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAGTTAAATAAAAATAATAAAACAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACAATTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGC:1 - chr4 1294989 5' + TAHRE 78 1 58.42 CTATAATGCCCGACTCCTCTCCCCGGTTGCTTCATAAATTCAAATTTGATTTTCATGTTGATTATCACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTAT:1 - chrX 6388474 5' + jockey 266 1 64.36 AGAAAATTGTAGAATTATTGAATGACCAACTCGCTACAAACAAACACACTTCTCTAATTTGTAATGTGCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 513643 5' + roo 8674 2 68.32 ACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 20238668 5' - hobo 2905 1 60.40 ATTTCATTTATAATAAGTAAAATGTGTGTGTTCAAAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 7868886 5' - roo 388 2 58.00 CATAACAGTATATAGCTCTTAAGTAATGTAATTTATTTTGTTTGTTGTGGAAACCCCGATCATTTTCCATTCTCCTCAACTTAAGAATCCAAGAGCAATGC:1 - chr3R 11659281 5' + 17.6 7181 2 74.26 GATTGCCGGTCCGTGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 13546722 5' - roo 395 1 66.00 ACAAGGTGCCCGTTGAAAAGTCCAAGGAAATGAGCCAAATCAGCAAACTAACCCACATAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCT:1 - chr3R 6608846 5' + I-element 19 1 61.39 TAGGTTCCTGTGAACACAACTGTATCAACATAAATATTCTCAACACGATCTGAAATCTCTGACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATAT:1 - chrX 22889818 5' + 297 6515 1 66.34 CACGTTGTTTTAATGAAACTAAGTGAGCGGCAAAATGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chrX 5133515 5' - P-element 2825 1 40.59 TGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACTATAAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 2074692 5' + roo 17 2 61.00 TTAAGGACCATTTAAAAGTAAGTGCAAGTAAGTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAAAG:1 + chr2R 13078695 5' + jockey 4641 1 69.31 GGGCACTTTACATGCATGCAACTACCACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chrX 3763221 5' + 297 44 2 75.25 TCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACACATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGA:1 + chr3R 19446221 5' + roo 9043 1 63.37 ATTAAAAAAGAATCGAAGGGCAGACCGAGGCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAG:1 - chr2L 19320042 5' - Cr1a 4185 1 65.52 ACCAGGTTTTTTGGCATTTTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTA:1 + chr2R 16333837 5' - P-element 475 1 29.41 GGATATGAAATTCCGGCTTAAAATACTTTTTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCT:1 + chr3R 12844441 5' - mdg1 7323 2 73.27 ATGGAGCTACATGGATTCTGCGATGCATCAACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTGAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTT:1 - chr2L 10004349 5' + invader2 378 1 76.00 GTGGCCAGATAAACATAATATACAGAGTGGTTCGCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTT:1 + chr3L 10477553 5' - copia 5083 2 65.35 TGGATTACTTTCCACTGTTGCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2L 12324123 5' + roo 8670 2 74.23 GTGTTAATCCAAAAGCTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr2R 694082 5' - flea 5004 2 70.30 AAACTGATGGGTTTGATCTCTAGTAAGACTACAGGAAGTAGAAAACAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTC:1 - chr2L 7086267 5' + F-element 256 1 55.45 TAACTTTTTAACTTTTTTTTCTTTGCTTTTATCTTTGCTGGTGGATTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAGTTCTGTTCCGCATC:1 - chr2L 15160338 5' - TAHRE 10399 1 85.15 GTAATCAATTAGTAAACTAATATATTTCCAATAATTATATTATTAAATTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr2R 8158951 5' - pogo 2073 1 60.40 TGAGATATATTTTGATGGTTATCTGTGTAGAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACC:1 - chr3R 5164437 5' + Tc1 1636 1 66.67 GGCATACAAAGTTTTACTGATTCTATAAATTTGGCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 - chr2L 12325077 5' + jockey 4715 1 65.35 CAATCCCCACAGAATTATCTGAAAGATACTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTAAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr3R 22781980 5' - copia 5075 2 73.27 GTAGGGTTGACTCTACTTTTGCTAGCTATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAG:1 - chr3R 19446209 5' - 297 6929 2 74.26 TTGAACATTGTTTTGCTTTGATTAAATTGAGTTTTTGACTATATAATGTTTATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTC:1 - chr3R 16566398 5' + INE-1 110 1 60.40 GGAAATTCCGTAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chrX 4366299 5' + jockey 4681 1 68.32 AATTTAGGCTTTATTTTTTGATTATTGTGCTCCCAGTTATCTATATATTATCCCCTAAGTACCATAGAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTA:1 + chr2R 8747723 5' - G4 3415 1 65.35 TAATGGCCAAATGCCAGAATGATAATAGCCCATAATATTCGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr2R 24479939 5' - I-element 5322 1 57.43 TCGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:1 + chrX 15293424 5' + Quasimodo 23 2 58.59 GTTTCAAACTTTTCACTTTCTGTGTGCGCTTATTTCTAAGAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTGA:1 - chr3L 4633280 5' - hopper 1030 1 78.22 TCAGTTTAGTTAAAAGTTACGTAAAGACCGAGAAACGCCACCCAATGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTCTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTACTCCCT:1 + chrX 20909867 5' + gypsy12 10165 2 62.38 TGGCCATTCGCGCATTAGCTGCCAAAAGTGAAGTTAAAAGTGCGTGTTTTTTTGAAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGCTTGAAGCGGTTTATT:1 + chr3L 17251799 5' - Stalker3T 294 1 52.48 ATCAGGCAGGGTGATTGTACAAGCACATATGGGTTTGCACATACATATTGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTT:1 - chr2R 7775805 5' - Transpac 288 2 54.64 AGGATGTGCGACCCAAGGAGTGTGGCAGGAGTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 10952255 5' - roo 391 2 59.41 TGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr2R 10444304 5' + P-element 28 1 49.48 TTAACGGACGACAAAAGGGCAAATTGTTGCTCTTTTACATACACGAAATTACATAAGTTTTTAAGAGAGAGAGAGTAAACAAAACACAAAGACAAAAATTG:1 - chr3L 17059405 5' - Cr1a 194 1 74.26 GAATCGCCCCAAGAAAATCTGCCCACCACCCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3R 29123394 5' + P-element 15 1 52.05 GATTCAATTTCCAAGTGTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr2R 5840697 5' + Ivk 25 1 54.46 AAAAGNCAGCCCCCTCCCATCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 20477035 5' + 412 7080 2 51.49 CAGGGACTTTTGGAATATCTTGTTTGCTGTTTTTTGTTTGTACATTATACCAGTTGCCATTTTTGGCACTTTTTTTTTTGTTTTTTTT:1 + chrX 12071650 5' + hopper 142 3 35.23 CGACATTCCAGGAGGTGGAGCGCAGCTGATAAAGTCAGCGTGGAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 + chr2R 4606218 5' + 1360 34 1 64.36 CAACGACAAATGATTTTCATTAGGATTTGCAGATAGTTGTTGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAA:1 - chrX 9762346 5' - Tirant 272 2 70.30 TTCCTCATGTTCCTAGCCACTTTTCGTGGACTTTTTCAACGACAATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 12457919 5' + roo 8696 2 57.43 GCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr2R 12492382 5' + hobo 46 1 69.31 GGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAG:1 - chr3R 12047468 5' + Stalker2 26 2 62.96 CCAGAATCAGCAGCGTTGGGGCAGCAGCTCGGTGATCACCACCACCTGCCAGCAGCGCCAGCAGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTT:1 - chr3L 17954163 5' + Max-element 422 1 73.27 CTGGGTGGGGAGGTAGTGTGGTGCACGTGCAGGTGGATTTGGCGCACATTCTGCGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTTCAATGCTGGAGAGC:1 - chr2R 20177229 5' - Porto1 359 1 80.20 ATTTTGCTGACTGTTGATGATGATAATGGGCCTTCCCAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAAT:1 - chr2L 1624776 5' + hobo 139 1 64.36 CCTCANAAATTGTTTTGTTAGCCTGTTTACATGAACATGAAGGGGAAGCAATAAAACTTCCGTTCAGTATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 - chr3R 6735360 5' - copia 247 1 69.31 CGTTCTCAGCTGCTCTTAATTAAAAGTCATATCAAAGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACT:1 - chr2L 22114851 5' - 1360 417 1 67.71 TACATGTTCAATTTACAAATGCTATGAATACGTTTTTTTTTTTAAAGAACATCCACTTTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAA:1 - chr2R 21952681 5' + I-element 5128 1 59.00 TGAATGGCTGTCCTAAAAGCAAGCCCTCACCCCAAAGCTCGGACTCGCATCCCGAAAAACAAAAGTGTTGATTTCAATAAACAAATTACAAGAATCTAAG:1 - chrX 22936634 5' + Idefix 305 2 80.00 TGACCAGGAGATGGGAGAAGTATCTGACTGATTCCTCGACAGCTGCCACGAATCGAAAGGAGAAACTATATAAATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3L 16761354 5' - roo 407 1 75.25 ATTCCAAAAAAATCCGATGCGAATCAAATAAGGCTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAA:1 - chr2L 10015612 5' + F-element 147 1 71.29 AGAGGTACCATGTACATTTCGATCTTTGATTTTCTATTGATATGAGGATTTTTTTCAATGTAATAGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAG:1 + chr3L 11550109 5' + invader2 4809 1 45.26 CGGGGGCAGAACCATGCATAAATGTACGTTGGCATATACAATATACATATGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chrX 18144346 5' - hobo 2913 1 52.48 TGTGGCATACTTTTAGGCAATTTGCATATTTCGTTAAGCAGCAGGAGCGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chrX 16995103 5' + jockey 29 1 53.19 AGCGACGAGCAGTGTATGTTGGCCAGGAAGTGCAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTAT:1 - chr3L 12888277 5' + mdg1 7083 2 68.32 ATTGTTAAAAGAACAGAGACAAATAAATTTTTCACTTCCGTGAAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGCTTCTGCCGGTACGTGTGTATATGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 11982689 5' - accord 7034 2 54.46 GTCTGCCGGACATCTGCCGGACATATTTCGCTCTTTCCAGTAGTCCAATCAGAAAGCGAGGTGTGTAGTATATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCG:1 - chr2R 7552335 5' + springer 6 4 73.27 AGTAAACGTAATAATTCCCAGAACAAAACACCCGACAGAATCTCAAAAAAGAAAAAAAACAAATAGACAACGAGCGCCAACTCTCTTTGCAGCGGAACA:1 - chr3L 23937156 5' + Doc3-element 272 1 59.60 GCAAATTATATTTTTAGATTTCATACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAACTTTGGCCGTGGCTCTAAAAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1 + chr3R 20683401 5' + 1360 77 1 63.37 CTTTTTGAATTACGAGTGAAGGACGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGT:1 - chr2R 12842880 5' - jockey 4602 1 76.24 GAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2L 12324090 5' + roo 8707 2 68.32 TCAGTACCCTAATGCAAAAAGCATGAAACCTCAGGCCAGCTGTCAACACAACAAGCAAATTGCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAAC:1 + chr3R 6600776 5' + Quasimodo 332 2 65.35 CAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr3R 11119863 5' + 297 37 2 69.31 CCGGTTGCTCCCAACTTAAGGCATTTCATTAAACTTGCCTATATAAAATGTAATTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGAGAAAAATATATTACTTTACCGTCA:1 + chrX 23009424 5' - transib2 481 1 69.31 GTTGTCTTTTGTCGTTGTCTTCTTCTTGTTCGCTTTACTTGTCTGGTTGTCGCATTAAATTAGAAAGGAGAACGGTATGGCGGCGCCCGTGAGAATGGATA:1 - chr3R 24508895 5' - GATE 476 1 64.36 ATGGGGAAAAAAGCACAGACAATAGATACAAGAGCTGGCTGGTTGGTCGTTCCAGTGCAGTCGACTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAG:1 - chr3L 14352966 5' - Doc3-element 4535 1 64.36 AGCTATGAATACCATTATTTAAGCGTAAACATAACAAAGACAATGCTTATGTTCGAAAATATAGTAACTGAAGACAATCACTGGGGTTGCAAAACAGCCAT:1 + chrX 15391665 5' - GATE 8195 1 68.32 GGTTGACAACAATGCTGATGCACCACCCATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGA:1 - chrX 3750451 5' + hobo 2732 1 76.00 CGGAGAAAACTATATTTACTCCATCTTCCAGCTGCCGACTCACATCTCCAGTTACCAATTCTAGATGCACAGAAAGAAAAAGTTAAAAAATAAACAAAAAA:1 + chr3L 6086058 5' + TAHRE 10442 1 82.18 CAGTTACGTTCATATGTACATATATTGTTGTCTCGTACCTTATAGAAAGATTTAGAAAGTACGACCGCAGAATACTTTATTTTTTTACATTATATTTATTT:1 + chr2R 13574606 5' + Cr1a 4323 1 38.61 CGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCC:1 - chr2R 25051859 5' + G5A 2680 1 63.37 GTATACCAATCGTCGACGCGATCGGGTGTGCGCGCACTCTTTGTGTAATCCGAAACCGATTTTGTGATTCAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTTTAC:1 - chr2R 5395195 5' + Doc2-element 110 2 71.72 CTCCCNTCCGCCATCGTGCTGTGTGCGCTTCGAGAGGCAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 20477048 5' + 412 40 2 63.37 GGCCAATAAAGTATCGTTCTAAAAATGTAATAAGATAATCGGAACAAAATTTTGTTCTGTTAATACTTGTGAATTTTATTAGTTAAAAAAAAATATTTTAA:1 + chr3L 391899 5' + transib1 35 1 73.27 TAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chr3R 16400218 5' + blood 36 2 60.40 GAATATACGAACTGAGGATGGGGGATATGGTTTTTTGATGAGACAACTAAATATCTCGGATTCTTGTACTGCGTTTCAGGGAGGTCTTGGAAATCAACTTG:1 - chr2R 3461341 5' - Ivk 285 1 78.22 GCCGTCAAGGAAATCGAGTACCAAATAATAAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 17244473 5' - accord 184 2 70.83 CGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2L 12324094 5' + roo 39 2 64.36 GGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 + chr3R 18210349 5' - Juan 4159 1 80.20 GCTTTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCCAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr3R 13538919 5' + hobo 23 1 56.44 GAAGCCAACATTTCCAAATTCAATTTTACGAGACGTTATCTTTCTTCGTCTATTCTCCGATGGCTTTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGACTATT:1 + chr4 624055 5' - jockey2 3111 1 53.47 ACAGAATTAAGCGCATAAATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAAGACATCCCAA:1 + chr2L 12475594 5' + mdg3 398 1 78.05 AGCGCAGTCAGCTGCTGAGCATCAACACATGAGCGCTCAGCTGATGCGAGAGAGCGTTGAAGAGAGAGAGCTGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 11553576 5' + P-element 5 2 63.37 ATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTCAAGACGATGCAACAGCACACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 4802885 5' + 412 7077 2 46.53 GGGATGTATCCGTATCTAAATTGTTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:3 + chr3R 9131737 5' - roo 398 1 68.32 GCCATGGCTGCTGAAAATTCTGGACTCCCTATCAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGTGCGCGAGT:1 - chr3L 25332043 5' - F-element 207 1 65.35 TTGTGTCATAAACATATCGCATACGTTTGTGCTATAAAAATTCTTCGACTATGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCTAATTCCCAATTCAATACC:1 - chr2L 6998941 5' + I-element 4984 1 64.36 ATACCATAATTAATGCCTGTATATATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr2L 513740 5' - roo 9046 1 53.47 GTAATAATAATATATCATAGTGTCTAAAAGAATGCAACAATTTATTATTTCAGATTATTGTTTTATTTAATAGCATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 + chr3R 13582196 5' + BS 4999 1 73.27 CCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGA:1 - chr3R 29331918 5' + G6 26 1 51.04 TGCTGTATGACACAAGGCATCACAATAAATATAATTTTATTTAATATATTAAATCGTTTTTTATTTAAGTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 11263370 5' - roo 401 1 71.29 TGTAAAAAAATAGCTGTATTGGAAGTATTGAAGAAATTTAAGTAGGCCGCTGTAGCTGTTTACGTGGTACAGAGTGTGGATCAGGACCAGGTGGTGGCCAC:1 - chr2R 4578505 5' - Chouto 405 1 67.33 ATTACTTAGGATCTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTA:1 - chr2L 3440510 5' + Juan 25 1 58.42 GTGCCATTGTACTTTATGTAAGTCTGTTGACTCCAGTTATATTAACTTGGGTAAGGAGTACAGGTCTTAAAAGGAAACAAAAAAACAAACAACAAAAAAAT:1 + chr2L 7060703 5' + gypsy11 3934 1 80.20 GGTCAGTACGTAGAACTCCAAAATAGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr3R 16245056 5' - 1360 3341 1 79.21 TGCTTTGTAAGGAAGTGTTCTCGCAGTGTATCACTCTAAGGAAAGACAACAACTCCTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAGAGAAATCGGTGGACTTT:1 + chr3L 22277458 5' + I-element 312 1 63.37 CTACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATT:1 - chr2L 3440498 5' + Juan 27 1 51.65 ACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr2R 11528064 5' + P-element 42 1 39.60 CAACTGGTTGTTAAAGAATTCACTTATTGTTGGTTCATACCGCCCACAAAATTGTCGGGTGTGAGTCGAGTGACAAAAAATGCCACCTTTGCAGTTC:1 + chr3R 4554096 5' - hobo 5 1 59.79 TGTTTTCCTTTTATGTCTCTTTATTGTAAGAACAACTGCACACTCTCGCTTTCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr2R 1365315 5' + jockey 31 1 54.46 ATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGC:1 + chr3R 7168557 5' + flea 4779 2 57.43 CCCGGCTGTCGGGCATGACCCATGAACGAGCAGGAATCGCTGGCCTGCTCAAGAGCCTGAAATAGACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCT:1 + chr3R 23363216 5' - flea 468 1 71.29 GTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAG:1 + chr2R 1320689 5' - diver2 4871 2 47.52 AGAACGGAACAATTTTACTGCACAAATGGCGTTGAATTTTTTGAGCTGTTCAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3L 11113895 5' + 412 26 2 53.47 TTGTCTTGAATACCAATACTTATTAGTTAAGGAACTAGTAAGGATATTAATTAGAATACTTTTTGACTATAATGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTC:1 + chr3L 15423066 5' + McClintock 10 2 75.25 TTTTGGAACAAATTAAAAAAAAACCTTTAATGAAACTAATTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAAAACCAAAGCAATCACCCCTATTAATTTTATTCAACAA:1 + chr2R 4608375 5' - Tc1 236 1 77.23 GTTCACTGCACAGTTTGGTGCATGTAAACATGTCGAGTGAGATCGAGATGTAGTATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 + chr3R 6273500 5' - blood 7377 2 64.21 AAATAGCTGCCTTCTATTCTATTCCCAATCCTTGTGTCTCATATATATATATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3L 10143244 5' - 297 391 2 72.62 TCCTCTTCGCAAGTCCAAGTGAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCC:1 - chr2L 18279977 5' - gypsy5 7328 2 58.42 AGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 15305622 5' - roo 393 1 63.37 CCCTTTCGTTACCACCTTTAATGCATTCATAAATCCCACGCAGATCAAAAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGC:1 + chr2R 2948763 5' + G5A 2594 1 71.95 GTGGAACAGCCTGAAAGTAGGCTACAAAACTCTTGTCTTCAGTACTCTTTATCGTGATTCCCACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chr2R 14351838 5' + Max-element 16 2 61.39 TGCAANGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2R 12492432 5' - hobo 2905 1 56.44 AGAACAGGCTGGAAAAGTGCGCTGACCACTATCAAATCGACGTGGGCGATGTCAAAAATTGACGTGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCA:1 + chr3R 23679520 5' + HMS-Beagle2 6792 1 63.54 AAAACTACTTCTGACTTCACTCATTCGCGCTCCATTGAAACCCACACACTTTTACCGACAACTCATCCAAATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATG:1 + chrX 7532756 5' + Doc 4509 1 68.32 TATTAATCACTTCTATTAGTGCTATTTTTAGTAAAAGATATTACTACCCCCAAGTGTGCAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:2 - chr2R 22478148 5' - Burdock 235 2 60.40 GATTGCCGTAAACTGGGTGCAGTGCCATTACCACTACCTTCTCCTTCTGTTGACCTGGTCCTTCTGGTCTCAGCCTGTCGTTAGGCATCTCGACGGGGTAT:1 + chr3R 10663763 5' - gypsy8 4509 1 65.35 AACTGGGATCAGTTAATCCATCATCATTATGATTTTCTTTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATT:1 - chr3R 5416736 5' - Idefix 7119 2 67.33 CCCACCACTCCAGTGCACTCCCCCTCGGGGACCCTTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGA:1 + chr3R 20137000 5' - Burdock 6328 2 66.34 TCGTTCTGAGCACTTTTGATTACTTTTTATCCGCTTTCGGCCGCGGGTTTCATAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr2R 18950817 5' + roo 24 2 56.44 TAACAGCAACACAAGCTTCTCCACGAACAACAACGGCAACAAGCAGCAGCACTACAACAACAATAATAACAACAACAACCATAATAATAATATAAATAATA:1 - chrX 10617276 5' + mdg1 7078 2 48.51 TGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 19377811 5' - roo 9055 2 62.38 TGCTGGCTGGGATGTGAAAAGTGTTGCCAATTGTTGGTAGCTAAAAGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAAATTGACAC:1 - chr3R 15740192 5' - Doc3-element 470 1 71.29 TTATCTGTTTAACTTTCAATTACAAATGATTTAACTGACAAGTAAATTGTATGGAAAAACGCAAACAATAAAACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 - chr3L 17168937 5' - mdg1 418 2 76.24 TTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 + chr2R 3591989 5' + Quasimodo 36 2 71.29 ATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCTTGTAGTTCCAATATGAATAAATTTCCTCTGGGGAACCAGCCCATCGGAAAAGTTTTGCCGCTCAAATTAGCT:1 + chrX 23439048 5' - R2-element 175 1 78.22 CGTCGNAAAACGCTAAGCAATTACAGTAGGCAACAAACTCGATTTTTCAAAATCTTTTTGGTAAAGTGAAATTAAGAATAACAAGTTGCGTAACGGCCATA:1 - chr3R 10484530 5' - 1360 3373 1 75.25 GAAAAGACACATCTTCTACTCTCATCTCTTCATGTCACTGTCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2R 11528070 5' + P-element 35 1 46.00 GAATTATTTTCAAATCATTCTAGGCAATTCTATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr3R 28645829 5' + F-element 59 1 72.28 GGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 15305660 5' - roo 355 2 82.00 CATCAAATTGCATTGAAATGCGTTCGGAGCTTGGATTTGTCTTCAACCCACTTTATTTTTCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 + chr2L 5707234 5' - jockey 4975 1 51.49 TCAACGAGTGAAGGGATTTTTCTTTAAAATTATATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGC:1 - chr3R 10240152 5' - invader4 284 2 75.25 TGCGTTTGCCATTCTGTCTCAATCGAAGCACTGTGATACAAAACTGGACGCATTTTAAGAACACTTGTAGCGTTAAATAATTATATCACCGGATGAATTT:1 - chr3L 21799955 5' - G3 4549 1 64.00 GCTCTCGTTTGCGGTTCCCGTGAATATTAAGCTACAATACGTAGGCATAATTCCAATAGGGCTTATGAATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGG:1 + chr2R 20706587 5' + Rt1b 5090 1 62.63 GCTTTTGCATGCCCATCTCACTGAATGCGAATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chr2R 7887250 5' + jockey 56 1 68.00 CTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCT:1 + chr3L 19951206 5' + Ivk 38 1 62.38 CGCTCCGCCTGTCCCGCTCAGCATGGAATTTATTTGAGCAAATTTACGAATTATTCTAGTGTCTTTGTTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACA:1 + chrX 12042490 5' - 1360 473 1 63.37 TATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATC:1 + chr3R 4970560 5' + diver 48 2 70.30 CCGAGAGGAGTAGTACTCTGCAACATCCGTTTGAAATTTAATAAGCTGCATTTTGTATTTTTGTAGAATTGGTGCATTTGACATTTAAAATACGTACGTGA:1 - chr2L 22676472 5' - transib3 2778 1 57.43 TTTCCTGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGG:1 + chrX 22077196 5' - gtwin 446 2 50.50 AAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGT:1 + chr2R 5067643 5' + F-element 48 1 71.29 CAGCGGCCGCAAAAGTAAGGCGCCACCCCCCGTGAGGAAAAAAAAAAAGCAAAAAAAA:1 - chr2L 13332232 5' + Doc2-element 250 5 82.76 ATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 + chr3R 7388338 5' + HMS-Beagle 29 2 55.45 CGCTATACCATAATTAATGCCTGTATATATCATCAGTCGATTCTAGAAAGTTAGGCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr2L 513744 5' - roo 388 2 57.00 GCCACCCTCCTGCGGCTCAGCGACTATCTCTCTCCTTGCCGCCGGCCGTCCGTCTCGCTCTCTCCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGT:1 + chrX 5094568 5' + Doc 352 1 68.32 TTGTGCTGGTGTTGTATTGAGCGGGATGGGTTGGGTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAA:1 + chr2L 10099952 5' - hobo 2465 1 65.35 GTTCAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chr2L 22534018 5' + P-element 23 1 55.45 AAGGAGCAGAAGAAGTGGGAGAAACTGGGATGAGCGAGATAAAGTATAGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr2L 12949205 5' - 412 7519 2 53.47 GAAGGAGTGACCAAAGTCAGCGAATCGCACGACTGAGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCT:1 - chr2L 18279957 5' - gypsy5 369 2 64.36 CGACACTGCAGTGTGGGCCAAAATGGCGATTCGCTGCATAGCCTGTAAGAGTACCGCATAGGTGTGATTTTGCGACTCGAAGAGTGTTCGCAGATTGTCTC:1 + chrX 22706233 5' - invader5 387 1 60.40 TGTGGAAAATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 + chr3R 12780620 5' + hobo 30 1 55.45 TGGTCTCATACTCAATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGAT:1 + chr3L 19454662 5' + diver 5920 2 57.43 ACGCCGAGAACAACAGCTGGTGAAGGCTTTTCGTCTGGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 6622697 5' - P-element 2847 1 41.58 AACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:2 + chr3R 18210342 5' - Juan 4166 1 73.27 CTTGACAGTCCAGACGTCCAGCATCCTGCTCTTTCCCCTGCCCCACTTACGTCTGCATGAAGAGCCAGTGACAGGCCACGATACTCCCACCAGGGGGCCT:1 + chrX 15702459 5' - R1A1-element 4982 1 78.00 CGGCACAATCGCAGTCCCTTTCCACTCAGCAAAGTTGTCAAAGTATTTGCGGCACAAAAGTTTCGCTTTCGCTCTTATTTTAAAACTAAAAACCAAACTAA:1 - chr2R 7729467 5' + rover 6828 1 75.25 CTGGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 + chr2R 4547738 5' - HMS-Beagle 237 2 70.30 ACAAAAATAAAAATAACAATAATAAAATTATGAAATAACCGCTACTCACGAAACATCAGCAACTATAAACGTTTGGTGGGTGTCATGATTGTTGGTTAAGG:1 - chrX 21056524 5' - I-element 172 1 69.31 ATTACGCATACTTAATAATTTACAAAAATATTCATATTACGCATACGCCCCGTACAACGGAAATGAAAATAAACCCCAATTCTAGATAAGTCACCCACTGG:1 + chr3L 16538715 5' + Idefix 6979 2 74.26 AAGGCAACTGAACATAAGATGAGTGAAACGGCTCCAGTAACACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 - chrX 13508752 5' - roo 9035 1 63.37 GTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATAGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr3R 15072558 5' + pogo 6 1 65.22 GAAAGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 + chr3L 9909695 5' - Transpac 5199 2 50.50 AGCTGGTCGTGATTTCTATGACCAAAGACATAAAAAAAAAAACAAAAAGGAAAATGAA:1 + chrX 10572652 5' + Doc2-element 231 1 68.97 GTAAAAACAAACAGTCTTACCATTTGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCC:1 - chr2R 21073921 5' + jockey 4720 1 73.27 TATAGGATCTTCTCGTTTCAAGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCA:1 - chrX 17968411 5' - Tirant 345 2 77.23 CGAGAAATAAAAAAGAAAACCAGGACAAACAGCGGAGCGAAACTGAATATAAAAAATGAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATA:1 - chr3R 21435273 5' - Gypsy6A_LTR 112 1 61.00 CTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3L 13659973 5' - pogo 2090 1 64.84 AGACAGGACAGATTAATTGTGCTTTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:1 - chr3R 26530907 5' + blood 54 2 76.24 GTCGGCGCCGCAGTCGCTGCGACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chrX 22855227 5' + P-element 53 1 26.73 CTTCTGACCATTACCGTATAATTTGCTTTTGCCAACAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3L 13477503 5' + P-element 40 1 36.63 CCACTNACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr3R 26321675 5' + blood 42 2 68.32 AATGAGGGTCAGTGTGTGCAGAAGCAGCTGAACTTGAGGATTTTCCAAAGGAGCTGCCAATTACCCGATAACACCCTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTT:1 - chrX 2340530 5' - invader2 5038 2 74.26 CTGCAGCTGGCCCAACGAATACAGACGGAGGAGGATGAGGCGGCGCAGGCCGCAGGCCTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:2 + chr3R 27283991 5' + Max-element 24 2 49.50 TTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr3R 11119879 5' + 297 6581 1 73.75 CCCTTATCGCACATCACCGCCCAACACTGAACCCACCAAAGAACCGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGTGCTTTGCTTATCTCGTAATTACCAT:1 - chr3L 22897688 5' + Ivk 60 1 55.32 TCGTAATGTTTTAGGCAAGAAGAAGGAAAAAGAACAGTAAGTAAACATTTAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCTAATTTTTGAAATTTGAAAG:1 + chr3L 8017914 5' + FB 28 1 54.00 CGCTAGCTCTTAGTGATAGGAAATTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:1 - chrX 21056248 5' + FB 53 1 77.23 GTGTGATTAGTAAATGAGTTAATTTTATAAATTTGTTAGCATGTTTTGAAAATTGTATACTTGATTTCCTAGCAGATCAGACATATGAATTTGATATCGCA:1 + chr3R 21712959 5' - transib3 151 1 74.26 AATTAAGCTAAGCGGATTTAGATATCGATTACGAAATCACACACATACACACAGCGACACAATAAAGGAGGTCCTTGCTCACGAATACACACACACACACA:1 + chr2L 3401461 5' + accord 7026 2 59.41 TGCCACAACCCCTTCTTCTTCTTTCTTTTCTTCCCCTCAATTCCCGCGCAAAACGCTTTTTTCCAACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr2R 10543534 5' + P-element 8 2 71.29 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCG:3 + chr3L 25232765 5' - accord2 175 2 51.49 GTTTGNTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr3R 11119877 5' + 297 6604 2 55.45 GCGTATTTATCGAATTATTTAACAATTAAACAAACCAGAGAACAATTATATGTACCCTAACAAGTGAGCTCAAAGCAGCTGGGGTCGGAA:1 - chrX 6701550 5' + FB 3 1 71.11 CCACATAATTCGGTGCGAAAATATTGCCGTGACTAGTGGACTTTTTTCGTTTCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chrX 20047546 5' - roo 9050 2 51.49 AAACAACATTAGTTTTGGACAGTACTACCCAAAACCAATCTTACCAAACGTAGGACCGATTACCCAAAACAATCCCACGCAAATTGGACCAGACTCGACCA:1 - chr2R 1574977 5' + I-element 4909 1 63.37 GATCGAGTACGTGAAAGATAGGATCATAGGAATATAGACAGTACCAGGTATGTTTTAGTCGCAATAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCA:1 + chr3L 18428557 5' + aurora-element 4134 1 71.29 TATCANTTTGCGTTTGCAATCAGTGCGGACAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGC:1 + chrX 13641802 5' - P-element 2761 1 34.65 GAACAATCACAGAAAGCTGCCGAAATCTGGGGATGCGCAAAGAAAAATAAGTTTGAGATACATAAACAAACATAAATGGCTTCAATTGTAAAGTTATGAC:1 + chr2L 7331642 5' + Q-element 666 2 70.00 CCAATNTGCAATTAATTACAATAAAAAAATGAAAGCTTTATTTTTTTACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTAATTTCATGTGTTCTT:1 + chr2R 5539086 5' - G4 3626 1 71.29 ACCCAACTTAAACTCAAAGCCAACAACTTACACTGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCA:1 + chr3R 20953884 5' - F-element 4286 1 67.00 ATACTTTTCGGCTGTCTGTGACACTGATGAAGAGCAGGTGATGGCGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2L 20238666 5' - hobo 2907 1 58.42 ATGAGCAGTAGCTTCGGCTACCGGTCTTCGTTTTGCTTCGTTTCTCTTCGGATGACTCACACACACTTACACACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTG:1 + chr2L 3539530 5' - accord 7038 2 74.00 ACCAGACATTTCTCATTAGCCCAGTCATTAGGGTCTTGAATCTTTTATGGTTATATTCACGGAGGAAAATCTTAGACTGCCCAAGTCCTGGTAGG:1 - chrX 2880020 5' - baggins 5031 1 75.79 TTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr2L 12815052 5' - hopper 1371 1 67.33 TAGTGTGTGTGAGCTTTCTTAGAACTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGTGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTA:1 + chr2L 14155168 5' + micropia 5143 2 76.24 ACACACATGCGAGTTGGTCAGCGCATCTATCTCCCAGGGTATCTTATGTATCACGCCCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAATGC:1 - chrX 8313264 5' + jockey 4686 1 57.43 TTGCACTGGCTGCCACTTGACAGGTAGTCTCCAAGGAGAGCAACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 9131760 5' - roo 390 2 53.49 TTTACACACCCAACTCATCGGCCCGCTCATTTTATATCATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr3R 4544091 5' - flea 5006 2 72.28 AGAACCGAAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr3L 9909698 5' - Transpac 277 2 53.47 AATGCCTCGAATATTTCATACTCGGTGGTGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chr2L 1839277 5' + jockey 4807 1 71.00 TAAATAAAACTCAAAACGTATTATTTATTGCTTTACATGTCACTTTTGAGAGTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGCTCTT:1 - chr3R 13711867 5' + S-element 242 1 65.35 AACTTGATGATTATATGCTGAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr2R 13650106 5' - mdg1 390 2 55.45 TAAAATGCAAATGAAAATGAAAATTAATTGCGCAAAGAACGCTCCGTTTGGACAATTAATGAGTCATCAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 12324009 5' - roo 401 1 71.00 CGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chrX 5092988 5' - roo 9034 1 60.40 TCTGGTTGCTGAGTTCTTTCATCTGGGAGTTGTGCTATTGTTGTGTGGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTAATATTTGCTGCTGCTTGCTG:1 + chr2R 13938156 5' - Bica 4576 1 53.47 AAAAGGGTTTTCGTGTTCATATATTTTCCCTTTCATTTTGATATTTTGAATTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3R 4970539 5' + diver 27 2 52.48 TTGCGCTTTTCCGACTCTGCACTATATACTATATTTATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTAGCTGCCGCATACCT:1 + chrX 20806876 5' - opus 7467 2 70.83 TGGGAGGTTGGGCGCACACTGCGTGGAGTTGTGAGCGAGCGAGTGAGTGAGTGACAGCAGTTGGTGACAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr2L 35983 5' - P-element 2879 2 43.00 AACTTCCGCTGCGTTTTAATATCCGGCCCGAAACCAAATGCGGCCAATGACTTTGGGCTGCGATACTTAGTCGTCTAGCTAGCTTGACTATTAGGATGAGA:1 + chr3L 7199280 5' - jockey2 3102 1 54.46 TGATTGCTTTTAGTCGATGAGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGT:1 - chrX 21574229 5' - accord 213 2 78.72 CCAGTACATCAACAATGCTGATAAAACTTTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 19377826 5' - roo 409 1 78.79 GGGGTTGGGCACTTTTCCAAGTTCAACAGCTGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr3R 20556139 5' + Tirant 46 2 71.29 GCCACNGGTTAATTTTATTACCTGACAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGGTATATACGTATGCAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chr3R 4601415 5' - opus 499 1 79.21 TCTTGTCACTCAACCATTCCTGAACTTGATCATCCACAATCTTTTGTTCACACTCTGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTG:1 - chr2R 3628110 5' + Doc 489 1 63.37 CATCAGGACGGTAATGGCGGGTGGGGGTCCGATTTACTTGAAATTTCACGTACGTATTTT:1 + chr2L 15092622 5' + transib3 2771 1 68.33 ATATGCTGAAGGTCCGCTTTTACCACTGGTGTAAAGCTTACTGTAAGCTTCTCCGTCTGGTCTGCTTGCTGTCTTTTCATTTCAATATCCGATT:1 + chr3R 796966 5' - Bica 4553 1 69.15 GGGAGCTCCTCCTCCTTCGTTCCCGCCGCTGACTTCATTCTTGCTGTAGTCCATGGGGGCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTT:1 - chr3L 9889385 5' - Rt1b 4892 1 55.68 ATTAGGCAGATTTTATCCGCTGTTACATATGTAATGATATATTCAAAGTACTACACTAAAGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 + chr3R 14917170 5' + HMS-Beagle 14 2 63.37 GCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 - chr2L 3440491 5' + Juan 44 1 59.41 AACACTAAATCCGGCCAAGTTAGGTAAGATGTTTGGCTGGCCGAAACGATATCGAATATCCATGGTCGTATTGTACAGTTGCGGTAACAATAATAG:1 + chr2R 14217703 5' - Tc1 1644 1 58.33 CATATATATATACATATATATATATCAAATGGGCCAGCAATTATATAGGCATGCACTTACTTATATACATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAA:2 + chrX 4486483 5' - 17.6 488 2 76.24 AAAAAGAAAAGGGGTCGCATTCCATTCAATGGATTCAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chrX 5448655 5' + roo 81 2 65.35 AACAACATTTGGCAATTATACAATTGACACCATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chr3R 21517546 5' + jockey 70 1 69.31 GTGTAGTGCGGGTATCCGGGCTTGCAGACTCGAAGTCTGGCGGCGCCGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAA:1 + chrX 14707418 5' - Stalker 7155 4 53.47 GGTGGGAAATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 24081628 5' + 297 15 2 64.36 ATAGAACTGACAAATATTTTCGAAATTGGTGTAATTTTGTTTGTAGAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAG:1 + chr2L 17784626 5' + gypsy10 33 2 54.46 GTTGACTTTATTAGTCAACAATGTAAGCTTTTTGCCGACTTCATCATAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTT:1 - chr3R 25379468 5' + Circe 7356 2 57.43 AATCTTATACAAGTATCGCAATATTTTGTACACTCAATTGGGATTTTCGAAGCATGTTGATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCCGATGTAGTTAA:1 - chrX 10672377 5' - mdg1 404 2 61.39 AGCGAAAAATTGTTGAAAAGGCTGAAAGTAGGGGTGGCAGGGCCCACCAGGAGACCCACAGACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCC:1 + chr2L 15808271 5' + I-element 176 1 62.38 GGTTATGCACTTTATGTACTTTAAATTTACAGGCTTTTGACGACTACGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATGCAACAAGCCTTCGACAAAGTATGG:1 - chr2R 21397636 5' + Helena 405 1 74.26 GTGGCCAGCCATTCCATCAGAGATTCAGACCAGGCCAAGTAGTAGGCGTTGTAATAAGTTTTAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 + chr3R 12047411 5' - Stalker2 373 2 49.50 ATTTATTTTATTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCCACGA:1 - chrX 13905146 5' - HeT-A 6025 1 74.26 TTGCTTTCTACCCCGTAAAATATACCCTTCGAGTGGTGAACTCTACGTGTGAAATTTTCAATGACTTCATCGCAGTTTTTTTTTTTATTATTCAACTTACG:1 + chrX 3807602 5' - Rt1b 5140 2 55.45 GCAACATAAAACCTTCGTGGAGGTCGGGCACCGCAGATTGCGACACAGTGGCGTCAAAGACCCTAGAAGAACAAGAGGCGTAACG:1 - chr2L 22630985 5' + 1360 10 2 88.24 ATATTTCCAGAGTATACCCTCGTCTAGACCCATAACATGGTTTACCTAAAAACTTTTTTCCAGTGACCCAAAAATCGTACGCTCACACTTTTAAAAAATGT:1 + chr3L 55135 5' + INE-1 255 1 58.42 AAGGCAGAAGATGCTATGTCCATTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTGTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACTGTAAATAACTCCCTT:1 + chr2R 2009303 5' - I-element 490 1 78.22 AAGTGCTGTGTAGGGTGTAGGCACTTCGGCTTGACGCAGCTGACATCTTTTTCTTGTTCTTTTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTT:1 - chrX 19401199 5' - R2-element 3583 116 40.00 ACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 20678118 5' + transib2 2633 1 55.10 TTACAGATCCAGGCGAAGAGAGTTTTGTAATAGACAGTGGAGAGGCTCTCCAGTAGTCACTTCTATAGACATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTT:1 + chr2R 10945299 5' - transib2 2818 1 71.29 ATCTCTCCACGATAAGTTTTAGATTTGCAAATTTTCTTTGGCGATATGTATGTACATGTTTGAAGACAATCGAGAATGAAAAAAAATAAAAACAACAAAAT:1 + chr3L 3716430 5' + gypsy11 3931 1 78.22 CAAAACGAAGATGTCCATAAAGTGCTGTTCATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 12103800 5' - roo 9027 1 72.28 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 426 2 54.46 GGGCTCATGCTATACTGCTCATGGTACAAGCTTGTCCCATGATGCTGTGGCAGACCACCCATGCATACATATATAGTGACGGATTCACGCCAACTCATCAC:1 - chrX 21994003 5' + McClintock 5958 2 72.28 TTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCAT:1 + chr2R 4547775 5' - HMS-Beagle 200 2 74.26 TTCTTGAAATAATATAAATATATATACGTGTGGTAAACATTTAAGTCTGCTGATTAAAACATTTTCCATTTCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 + chr2R 14708944 5' + Doc 10 1 74.75 GCCATCAGGTTATATTGCATATATCCAGCTCATGTCGTCGCCCACTCATACGCCCAAAAACAAAACAAAACTACCACGCCCACACTTTTGATAAATGC:1 - chr3L 10230411 5' + INE-1 255 1 61.22 TAAATAATAAAAATAAAGAAAATGAAAAACAAGTTCAAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATA:1 + chr3L 23628598 5' - copia 4988 2 63.37 TAACAGATTAAGAAATTAAAACAAATCAACACATTAATACAATGCAACCTTGCCTCCATCTATGTCACAGGAGCGCAAGCTTCCTAAACTTTGTCCATCGG:1 - chr3R 3920757 5' - Gypsy12A_LTR 37 1 58.42 TTTAGCAGTTTGTAAGAAAAAGAAATGTTTATAATTCCACTAATCTTTTGAGTTTGCAGTGATAACCGTGTAAATTGAATTATTATTTATTAAAAAAAACA:1 - chr2R 11614926 5' - Juan 4050 1 76.24 AGACAGGGGGCCGACGGGGCACGGCGAAAACGGAGTAGTACAGCTGGTAGGTAATTTGGAGGTAAGTGTTATATTTGTTTTATTTGATTTATTTAT:1 + chr2L 21097288 5' - X-element 4717 1 55.21 AGCGGTGCAGAAATACATATGTAACCAGAACTATGTACATTGTACGCCGTATAAATATACATGCTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 - chr2L 8565547 5' + blood 7022 2 74.26 ATGTTGGCCACTCAGCTATTAAAACATTTAATTGCAACTTAATTAGTTGAAGGTCTGGTGGGGCACTTCTCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 + chr2R 20150358 5' - Quasimodo 244 2 72.28 GTCCTCCTTTCAATTGACCAATATCTCTAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2L 21683496 5' + pogo 9 1 70.30 GTGAAAAAATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 10952285 5' - roo 9024 2 71.29 AATAATTGGGAAGATCGTGTTGCGAAAGGCGTTCAGTCTTTGCTTGTTTGTGTGAATAAAAACAAG:1 + chr3R 1720878 5' - 1360 3247 1 60.61 TCAAAATGGAGGCTGTCGGAACGCTTGAGCTGAAATGCTTTGTGTTGTGCAACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTG:1 - chr2R 4672115 5' + transib2 380 1 62.38 GTAAATATTAATAGCATAATTTCGCGCGCTGTATTCTTCTAGTGTTAAAAAACCAAATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCT:1 - chrX 4366290 5' + jockey 4690 1 59.41 TTGCCNTCGCTTTTAATTTTAATGCGTGCAACACGCTCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 + chr2L 4160134 5' + Tirant 8150 2 66.34 TTGCCTTAAAGCCTTAAAACTAATCAAAGTTACATTCCGCCTCAATCTCAATGAGGGTGTTCACACTATAAACTTGTGTGTACACTTAATGAGTTCAATTC:1 - chr2R 5019434 5' - rooA 343 2 58.42 GAAATGCTGATTTTACCTACATATTGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGGTCTGTTAAGAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTAT:1 - chr3R 9757192 5' - X-element 4415 1 79.21 TTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1 + chr2R 3591997 5' + Quasimodo 44 2 79.21 CCATGTGAGCTTGGTCCTTTCCTAGTTCATTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTC:1 - chr3R 7870912 5' - mdg3 316 1 70.71 GCACTTATACACACACCTACGACATTCCCATTCTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAG:1 + chr3R 19530182 5' + BS 4817 1 71.43 TGCATATCGCTTGCTCGCCAGCCTCCTTGAATTTCCCAACCCATTTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 + chr2L 16390530 5' - opus 451 2 55.45 TTGTANAAAAACATTTGTAAGCTAAAAAATAACATACATCGTAGTGTCTCAGTGGTAGCCCTTCTCATCGGGCATGTCGTGGTTCTCGGCCATGACGCGCT:1 + chr3R 946532 5' - Osvaldo 485 1 62.38 GCAGTTGCTCTGCTCAGCCCTAAAAGGGGGCGAATAATAGAAGGCAACCGAAGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGC:1 - chr2L 18505810 5' + X-element 4535 1 65.35 GTATTTCCTGTCCTGTGTCCAGAGGGGTTATGGATATCTTTTCTTCCGTGTCTAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGG:1 + chrX 22077193 5' - gtwin 7365 2 53.47 GATTTTTATTCGCATTTCGGTGTAGAGTTTCAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCT:1 - chr2R 11832837 5' + I-element 231 1 70.30 ACCTANCGGACAATACACCCCACGACACCATAACATCCTAAGTCCCATTCGCACCCGATTTCTTCGGCGTGGCTCTAAAGCTGACTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr3L 25842203 5' + 1360 75 1 50.00 GGTTGCTGGTGTCGTTTTATTATTAGGTATTTTGGTTTGTTTTCGTTTGGTAACGTTTAACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTG:1 + chr3L 13876296 5' - Cr1a 162 1 67.33 TGTACACATTTCATATTTATTATTGAATCGGAAAATGTAGATGAATTCTATTCATTACTAAATTATTGAAAATGCACTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGT:1 + chr3R 11094474 5' - 3S18 339 2 75.25 CTATTCTTATTTTGCAGCTTCGTAAATCCTCTTTCAGTTTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 20878460 5' + 297 6613 2 58.42 GCAGAACTCAGAGTTTCATATACTTACATTTTTTCACACGTCAAAAGATGAATACTCTAATTACAAATATTCTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTT:1 + chrX 22884751 5' - 1360 372 1 69.31 AAAAGNAAAGAAAAATCAACAACAAGTGGCAGTTGCATGTGTGTGCGAGTGTGCGTGTTGTGCTTGAAGACGTTTTTCGGGCCGAAATCAATTTTGATCAA:1 - chrX 6978622 5' - 1360 3176 1 58.42 ATTATGTTTTACAGCTAATGGCGAAATGTCAAAATATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr2L 13334027 5' - flea 217 2 70.30 GATCTAGTTTTCCTTGTCTTTGCCAGGATCACAGTGTCAAGCAGGTTCTTCGTCTGTGTCAGTTCGTAGTCCAGTAAGTGGCACGACTTATCTCTTCGGAG:1 - chr3L 26386300 5' - I-element 16 1 76.24 ATAATNCATCCTTAGAGGAAGAGAAGGCTCGAAATACAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAG:1 + chr3R 2157603 5' - Rt1a 4993 1 63.37 ACGACNGATTGCAAATAATCAGGGCTTAAAAGAACCAACCACGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAACGAAAAGCGAAATC:1 + chr3R 4850710 5' + invader2 414 1 74.26 CTTATGTTGTGTTCGTTCTACGAGCTAAGAAGCCTTTGGGACCCTAAACTAGAATCCCAAAGCTAAGCTCAAGCTTAGGAAGCTTGAGCTTAGCTTTGGGA:1 - chr2R 5021846 5' + Gypsy12A_LTR 56 1 41.58 GCAGAACTTGCAATGTTTGTGCTGAAAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr2R 16475796 5' - 412 445 2 71.29 ACCAAGTCCTCTATATAAGGTTGTGTGCCTTCTATGTAATTATTAACCATTAAAATATATTTGTATTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGG:1 + chr2L 13942958 5' - Quasimodo 7142 2 71.29 TCCTTTGGGATCGCCATGTGAAAGGTCACCAGTGAGTTCCTTAAACAAAAAGTGATGTAATAAAAACACAAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr3R 9995453 5' + Max-element 8242 2 77.23 TTAATTGGCCATTTAAATTAATATAAATTTCAATTTATGCACGCGAGTTAAGTCCGAGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 - chr3R 6117302 5' - Tirant 374 2 56.04 CAGGCACTTAAATCCTTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 2753886 5' - roo 9031 1 73.00 TCTCTATAATAGGATACTATTACGCTTGACTACTGATACCGACCTCAAAAAGTGCCATAATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr2R 6172983 5' + pogo 15 1 64.36 GTGCAGCAGGTGTCAAGTGTCTTGCCTCATTCGTCAAGATGAACTCGAAGCGTAGAAAATTGTAATTTTAGTTGCCCACCATAATGAACCCCCGACCAATC:1 - chr3R 14599305 5' + G-element 4212 1 66.34 GATAAGCATTGATAGAAGCAATAGAGAAATGTAGCTCTTAAGATCGTACCTAACAAAAATTGCAGATGTGAATGTTACAGAAAGTGAACATAAAACATTAA:1 - chrX 6105987 5' + I-element 460 1 57.43 TTGGTTGTCTATTATTTTAGGACTTCTGTTACCGTCTTGCGATATTGTCGTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTG:1 + chr2R 12097362 5' - Gypsy6A_LTR 329 1 70.30 TGATATACAAACATAACTCATATTCACAGTGTGTATGAATTTCACACCATAAATCCAGTGGATTTCTAAAGAGACATATTTTCTTGAAAAAAAAAAATTAA:1 + chr3L 8041852 5' + pogo 2026 1 50.50 ATATAGTTATCAGAGAATAGCAATGAAGATCAGCTTACAACTGTTTTTCAAAAATATTTACGGCAAAATGGCAAATCGGTTATAATTGTTGGGCATGTTAG:1 - chr4 160446 5' - Fw2 117 1 66.34 CTCTCGTCTACCGACGATGCACTTAAGATGGCCAATCTAACGAGTATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3R 22782030 5' + copia 33 2 60.40 AGTGTACTCGCTCCAACCCCAATGCCGCAGACCCGAGAGACAGGCAGATTTTTCCCGAACCCAGCGGTTGGGTATAAATCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr3R 21296519 5' + P-element 1 2 78.22 TGCTGAGCATCAACACATGAGCGCTCAGCTGATGCGAGAGAGCGTTGAAGAGAGAGAGCTGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3L 11553564 5' - P-element 2870 1 51.49 AGATAAAAACGCTTTTTGCATTTCTTATTTTTTTTT:1 + chr3R 17482392 5' - gypsy2 405 1 83.33 TGGGATTAGTACCATTAAGATATACCCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTCGAGCGGCAGGGTAAGCGGCCAA:1 + chr2R 22411243 5' + Max-element 8264 2 64.56 AAGTTGTGCCTCCTCTTTAAAATTATATAAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:1 + chrX 21564686 5' - diver 6065 2 74.26 GCTGGTCAAAGTGGAAGATTCTACCAGCCAGAGGAGCAAGGAAGGATAAACCGAGAGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATA:1 + chrX 10518006 5' + Juan 322 1 57.43 TACTACGCAGATTCTTAGCAGTTCTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAA:1 - chr2L 3440497 5' + Juan 38 1 53.47 TATCACTGCACAAGTTCAATTAAAACGCCTTGGGACGGACCGCCAAGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr2R 8086870 5' - 1360 3362 1 59.41 CCAATCCCATTTTCCGGACTGTTCTTTAGCTCATTTCGCTGCTTTTCCTCTTTTTTGTACACATATACTGATAAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTT:1 - chrX 5166076 5' + rover 183 2 57.43 AAAATAATAAAAACACACAAGCATATAAGTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCTCAAACAATTTTATTTTATAGCCGACCGTGAATTTTGTTT:1 + chr3R 19109162 5' - HMS-Beagle 399 1 76.24 TGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGCTATTGTTATTGTTGTTATTATTG:1 + chr2L 16217660 5' - mdg1 24 2 29.70 GGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr3R 27775110 5' + roo 8721 2 85.15 ATAGTAGCCCATTCTCCTCCTGTCAGGTTACCCTATTTTTTGTGTTCACGTGTGTGCCTGTATTTTATTATTTATTATGACCACGGACACTTCATGCTTTT:1 + chr2L 14130480 5' - Stalker4 477 1 83.17 CCATGAGTGTATCTTAAACTTAATTCCATCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chrX 15305694 5' + roo 45 2 71.29 CACTTNTCATTTGAGAGTGACGTGACCGGACTGAGGCGGCTCTATTTATACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCGGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3R 21296619 5' - P-element 2859 1 52.48 GCAGATTATGTCTCATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr3R 26321696 5' + blood 7032 2 58.42 CGAGGGGTGAGGTGAAGCAACTTTTCTTTCTTAGAGAGCGTCGGCCTTGCAGAGCATTGTTTTTTAAATATTTTTTTATTTTTTTTTTATTTATTTTAATT:1 - chrX 3954147 5' - F-element 4682 3 78.22 AAACCGTTTACGACACCAAATGTCACAAGAGAACTACTTTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr2L 20824677 5' + pogo 34 1 61.39 TGAAATTTGATTATCAAATGGGGCAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTTGTTTTAA:1 - chr2L 22778775 5' - FB 326 1 77.01 CGTGTCAACATGGGTCAACAAACTTGCGCTTGGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTACGCTGAATCTCAACATTCTAGCTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGT:1 + chr3L 23702893 5' - INE-1 143 1 84.16 GTACTATGCGTTTAGTTCATGTTGAATTTGCCGGTCAGTACGTAGAACTCCAAAATAGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 + chr3R 16245024 5' - 1360 3373 1 63.37 TGTATTTTCTACTGAACCCAGATTCCATCATGGCAATTAGGTAATTGGGTTTTTGTTTTCCTTTTCCTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 8301661 5' - Doc2-element 230 1 63.75 TCCTAAAAATATAAAAATAGTGATATAATTTTATCTCTTGTTAGAATTTCAAATATTTCCCAATATTAAAGCCAACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGT:2 + chr2L 12667124 5' + blood 7015 2 41.58 TTTATTTTAATTAAATTTGCAATAAATCATTGTCCGAGGCTCGTTAAGGAGTCATTTCAATACGGTAATTATTATGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACC:1 - chr2R 19209480 5' + jockey 4763 1 75.25 TTTATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAACATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGA:1 - chr3L 19377798 5' - roo 9046 1 51.55 TATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAAA:1 + chr2R 5582172 5' + Cr1a 446 1 62.38 CAAAGAAACCGAAATCATTTATTTAAATTTTCGGTCTTTCTGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGC:1 + chr3L 13381605 5' - invader2 324 1 66.00 AGAACTTTTAATAGGCTCATAAACAAAATTAACACGGAACATAAATCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGACTGGACACACTAAAACTTC:1 - chr3R 15826232 5' + Chimpo 96 1 54.46 TTAGTNTACCTTTACCATTAAAATATATTACCCGATAAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAG:1 + chr3L 18337656 5' - Juan 4177 1 63.37 AAACCGAAACCGAAAAACAACTGAATCTAATATGCATTTTAAATAATATATTAAGTGAAATTACTTAGAAGACGATTTTCGGGTCGAAATCAATTCTGATC:1 - chr3L 624503 5' - 1360 3178 1 66.34 AGCCAGCGGATTATGAGGCTGGTAACTGTCACTTGCAGTTCGCCTTCGAAGGGGGCGTGACTGATTGAAGGAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGC:1 - chr3L 1928827 5' - roo 8793 2 75.25 AATTTACGAACGGAATAAAACGGAATGGAACAGCGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGG:1 - chrX 2649879 5' + Tirant 43 2 66.34 AACGCTCATCTGCTTAAGCGGAAAAGTGTTGAAATTGTTTCGCGGTAGGGTAGAATGCACAGAAGAACATAATTCCCTTGAAAAAATGATTTTGAAATTGA:1 - chr2R 22524435 5' - Stalker4 6863 1 37.62 ACCATTTAAAACGTTTAGTTTTATGCATGCATATATTTTCCGTTTCTATTGGCCCGGTCGTGAACGTGAAATGGGCCCATGAAAATACTCACAAAAAAAAA:1 + chrX 3451072 5' + TART-A 13401 1 63.37 TGTCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTC:1 + chr2L 15081430 5' - hobo 5 1 50.50 AATTAACAGTAAGCAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAAT:1 - chrX 19174502 5' - Porto1 4551 1 81.19 TTTGAACGTTGTAACTTAGTTTTGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3R 3589786 5' - 1360 3334 1 91.09 AGAGATCACAGTGGTAAAATGTGGGGGAGTGAAAATACACTGAGGAAAATGTAAAGGAAACTTTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGT:1 - chr2L 4158841 5' - Tirant 8435 2 62.38 CGCCAAATCGTGAAAGAGCTGCGCCCGGGAACCAGCAACAATTCGTTGGAACGCGGCGATGACGAATGAAATTATCAGTTCATTTTATGTTTAACATTGTT:1 + chr2L 16885540 5' + pogo 1982 1 61.39 AACAAAAAACCACAAACAACACATAATAAGCGTGAAAAAAGGCAAAATGAGAGCAAAACCAACCCAGTGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGC:1 - chr3R 16334495 5' + F-element 4435 1 72.28 GCTACAAAAGACTTATTAATAGCTATATTAAATCAGCGATAAAAGGGAGACCATTTTTTCCTTACCGTTGCAGTAGATATCGTGTTTGCTGTAATGGTAGC:1 + chr2L 21849095 5' - Doc3-element 485 1 70.30 CATGAGGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCA:1 - chrX 23108346 5' + BS3 1402 1 71.29 TTTAAGCACTCGGACGCTCAAATTCGTCCGTTTCTGTCATAAGTTAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCC:1 + chr2R 9873560 5' - roo 8784 2 55.45 TTATCTAGTTTTAAATCTACAGTTTTTTAATCCACCTTTAATGCAATACAGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 16245116 5' + 1360 23 1 54.46 TAAATTAAAATTTAAACCCGAATCCGAATTGCATCATGTCCAAGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGCC:1 + chr3R 16293659 5' + Ivk 5027 1 76.67 ATTAACGAATGGATGGTGGGAAATCCAGTAAGATTGGAACTGCACTCGTTACGTAAAATTCGCAGTGATATATCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chr3R 24081642 5' + 297 1 2 78.22 ATGTAACAGGTAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATTAATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr4 913525 5' + opus 7037 4 65.35 ATGGCAAATAACCTCAAAACAAACGAATAAAACCAAAGCGACTTAAAAGCCCCTCAAGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGG:1 - chrX 15296574 5' + Quasimodo 351 2 60.61 ATGACCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chrX 18836969 5' + P-element 45 1 36.00 GGCAAAGTGCGTGAGACTGTATATATATATATTAATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCG:1 + chr3R 8101058 5' + accord 6967 2 84.51 AATGTCACTCATACGCCACGTACGCCAGCCATCGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGCGTGTGAGTGTCTGCCTGCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3L 4633796 5' + hopper 3 2 76.24 GAATTCCTCCGTGATCGGACCAATGAAATGTTTTTGAATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 - chr3R 17321772 5' + Stalker2 7289 2 64.36 GTTACTGGATTAAAATATTAATTGGACCTGGAATCGCCAATATGAAGACGCTTTCTCTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCA:1 + chr2R 4550933 5' - roo 418 1 59.41 AGACGAGCAACCCGGCCATACGGATGAATAGCCACTTGGGCTTAGTCGAGTTGGTGTATGGAGTATGGAGTATTACCAAAGACACTAGAATA:1 - chrX 8972467 5' - Tc3 316 2 73.91 CCCAAGACAAGAACTTTTAGCCTTAAACCAGGCCCAAATCAATCAATTGTAATTGATACACTAAATAATATTAATTAAGAAAAAAGGATTAACTTAACTTC:1 + chrX 11210316 5' + gypsy7 372 1 57.43 CCAGCACTTAATTAACCCTAACTGGCTGCCAATGGACGTGTTGACAGAAGTCGCGGCTAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr3R 31454836 5' + jockey 73 1 60.87 TCGAGCCAAAAGAAATGCAATCAAAACAAACAAGCAAAACACAAATCGCGCACATACAGAACGAAATCGAGTAGAAGGATAAAAAAAAAAACAAAAAATAA:1 - chr3R 31142743 5' + TART-C 11102 14 75.25 AATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTCGACGTTCATACGGACGTACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTAATCCTGATCAAGAATAAA:1 + chr4 829447 5' - INE-1 83 1 80.20 TATGTGTGTTCCATTGTCCTTATTCATGACTATCATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAAC:1 + chr2R 4855379 5' + opus 469 2 72.28 TGCTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGGTGTTGCTGGTGTAGCTGTTGAAAGTAGGGCGGTGCTGTCCTGGAGTTTTCCAAATATGCTGAAAAGGAACACTC:1 + chr2R 13181443 5' - GATE 8451 2 60.40 TGGGTATGGGTATGGGTATGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr2L 11416522 5' + P-element 57 1 22.77 TTTATTTTGTTTTTTTTTTTCAAAAACAAAAAAAAAT:1 - chr3R 12753750 5' + gypsy7 4995 2 89.19 GATTTTATGGAAAATACACTACGAGTATATACTCAATAGATTCGCTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 1281740 5' + roo 8695 2 59.41 TGCAACTTTAAGTCCTTGTTCACGGCCATTGAAATTGAACAAGCCAAGCGAGGAAACTTGTGAAGGAAGGGGGAGATGTGGAGTCTTAAAACTCCCCACAA:1 - chr3L 20438267 5' + gypsy8 4655 2 62.38 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACG:3 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 7423 2 75.25 ATAGTTTTTATATTTTAATGCCTTTAATGAACTGATCAAAATGTGCTCGCCTTAGCTTCGGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:1 - chr3R 16400233 5' + blood 21 2 58.42 GTCACGCCAATAAGTGCAGTTATCCACAGCTTCATTCGCGACTCCCACTAGAAGGGTGAAAACTGCTCACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAG:1 - chr3L 24361326 5' + Quasimodo 370 2 79.21 AAAACGAATTGAACACTTTTCCCCCAGTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACG:1 - chr3L 15377003 5' + Doc 452 1 73.27 CAATACAAATGAAATTTGTCAGTTGAATGAGCAAGAATACAGTGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chrX 13508690 5' + roo 8698 2 60.40 CTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:3 + chr3R 19446144 5' + 297 6604 2 55.45 GCTGGCTAGCCGGTTACTGATTCTAGGCAGCTTTGGAATCATTTTGAATAATAACATCTGTCATTGGAGTGTCTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:2 - chr2L 15947480 5' - Transpac 5223 2 73.27 TTTTTGAAATTATTCTATACTTTACAACTATACAACTTGCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:1 - chr2L 19266577 5' + F-element 52 1 66.34 TCATGAGAATAAACCCAAGAAAGCTGCCACACACTAAATCCACCTCGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATA:1 + chr3R 24085829 5' + accord 7028 2 57.43 CCGTGTTGAACTGCAAAGGCACTTTAAGTACTTGGCCAAAGTTGGTTTTATTGTGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 13546712 5' - roo 9047 1 55.45 CCGTTAGCAACCCCCTCGAATTTTGGACCACGGAGATTCAACCCATCCGAAAAGGCCAAAACAAGAAAATTACGAAAATAAGAAAATAAAATAAAATAACA:1 - chr3L 16180604 5' - transib1 1901 1 64.36 TTTGAAAACAAGTGCATTGAGGATCTATTAAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 9854049 5' + pogo 51 1 75.25 TATGCAAATAGATCGACATAAATTTGGAGTTGTAAGTGTCGTATATCAACGGATAAGATTTTGAGCACGCACAACCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTA:1 + chrX 6480941 5' + Bica 4653 1 69.31 TCACACACACTAGCACACACGCACACCAGCAGCACCCCGATACATTAGCAAAAGAAGCAGTCTTTTTAAGAAGACTCTAACAAGAGATGGGATGGTTCGAC:1 - chr2R 16892606 5' - frogger 477 1 54.46 CCTTCCTGTTTTCCCCCAATATTGTTCTCGTTCAAGTGGCAAAACATATTTGCCAGACGCTATCTAAATCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGAT:1 - chrX 10132393 5' + I-element 5009 1 73.27 ATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrY 311343 5' - 1360 3384 2 64.89 GAAATTACGTTAAGAACTGGCAAAGCAACAGACGGAAGAAACAATGGTCACAACAAACAAAAACACACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTTAAAGACAAA:1 + chrX 291750 5' + G3 4336 1 72.28 GAAATCATCATGTAAGTCTGCGTTATTATCCTCCGGCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAG:1 - chr2L 852617 5' - jockey 361 1 69.31 ATTCGCACTCAAAGAGAGTGCTGATTGAACCATTAACAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTT:1 + chr2R 11821155 5' - I-element 201 1 66.34 ATTTATTACTCATGAGCTCCACTTTTATGTGGCTGTCGCCTGTTTGTGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATT:1 - chr2L 8005577 5' - mdg1 7367 2 53.47 ACACCNCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3R 27748666 5' - roo 9040 1 56.44 ATTGAGGTGGGAATGCATCAATAAATTTTATTGTGGTTAGTTTATGCGTGAACCAAACGGATACTGTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr3L 15100650 5' - pogo 2090 1 64.36 TGCAAATCGCAGATACAAGCGGCGGGCATACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3R 6273566 5' + blood 7060 2 73.27 CTCAATACCCTTTGTTCCATCTATGGGTGTTCTAAAAATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chr2R 14341876 5' - opus 494 2 73.27 GGTTGGGGATTCTCCTTTACATACGAAGGGTATATAAAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr3R 26842805 5' + opus 7034 4 66.32 ACTTGCTGCGCCTATGTTTATTCGGGTAGGTATGCATGTATTCACAAAACAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3R 24760540 5' - pogo 2076 1 56.44 TTTCTGTAACTGGCGACAACAGTTTGCCCAATCCGAGGAATTGTAAGGAGTATCGTAATGTAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr3R 15072553 5' + pogo 10 1 66.34 CACTGTGCGTTATTTTCAGCTTAAAAAGATTTATACATACATGCAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3R 4601315 5' + opus 7151 4 66.34 TGTCACTGATGGTTTGGGGATGTATCTCCAGCCGTGGAATGGGAACTGGTAAAACTTTTAAAAATTTTATAAAATAATTTAAAAATTTAGGATTAAACTTT:2 - chr2R 4659341 5' + S-element 1469 1 46.53 TATTTTATATTTCTTACTCCATTCGAAAGTTTTTCCATCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCT:1 + chr3R 4359577 5' + Doc2-element 476 1 62.38 AATGGAGCGCCAATGGGCGGCAAGAGATCTGTGTCGCCACCGCCTCTATACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGC:1 + chr3L 15110104 5' + 1360 3246 1 58.42 TAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACAC:1 + chrX 15293428 5' + Quasimodo 29 2 53.47 AAGACCCCTAAGAGAGAGCGCGAGAGCGAGCGCGGAAAGGACTCTCTTAGGTTACCAGAGCCCTGGAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr2R 5804447 5' + P-element 12 1 67.33 TTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCGGAATATG:1 - chrY 3648875 5' - 17.6 450 2 75.25 CCGCCTCTCAAAGGGAGAAAAAAAACCAAGGAAAATCGCATCGAATGCGATTTGCGCAAATGCCTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 + chr2L 20622777 5' + Doc 20 1 36.63 ATTTATATTTATACATTGGCGAAGTCATATAAATTAATCCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGT:1 + chr3R 8555834 5' - 412 7536 2 65.59 TTGTGGCCTCAAGCCGCGCGTCTATTAGGTGTTCCTGGATTGATTTTTTTTTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chrX 2173503 5' - pogo 2079 1 54.46 TTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAAT:1 - chrX 20886035 5' - Ivk 5345 1 60.40 CAGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTAC:2 - chr3L 19951242 5' - Ivk 5327 1 76.24 CCTGCCGCCCACTACATCAGTTCTACGAACATCATTAGTAGCATTGTATGGTTGGCATTTATTTTCCATATTTTGCTATAATTTATGGATGCGTATTAACC:1 + chr3L 5680454 5' - transib2 239 1 49.50 TTAATGGCCAAATGCCAGAATGATAATAGCCCATAATATTCGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chr2R 24479940 5' - I-element 5323 1 57.43 TGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCT:1 - chr2L 23295854 5' + micropia 40 4 66.34 TAAACAACAGCATACTGATCCAACACCATCCTGCCCGAGCCCTACATCTTTTACACTCTAATACTCTCTCGCTTAATAAAAACCAAATGAAGATAAAATG:1 + chr3L 21917119 5' + mdg1 7397 2 74.00 ATACAATTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chrX 20806931 5' + opus 40 4 67.33 CTAAATTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTA:1 + chr3R 19445135 5' + F-element 115 1 64.36 TTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACACTTTATATATCGATGCTAAT:1 + chr3L 19454687 5' + diver 5945 2 80.20 TTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2R 4854992 5' - opus 461 2 64.36 TGAATTTCACACACTTTTCTATAATTTTCCAAAGGGCCTGCTAAACACTTTCACTTGCACGCACACACGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 - chrX 7604053 5' + Tabor 20 2 79.21 TCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chr2R 4547773 5' - HMS-Beagle 202 2 72.28 CATAAGTATATTATAAAGATTTCTTTAAATTTTATATAAACATGACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTT:1 + chr3L 8362991 5' - 3S18 6072 2 58.42 TGCCTGAAAAATGGGAGGAGGACATTAAAATTCACCAAATGTATTTATTACGGCACCAAAACCACCGCAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTC:1 + chr2L 15414054 5' + I-element 5132 1 72.28 AATTGAAATTTATTGAATGTTTGCTATTTACAAATTTCGCCATGTGCAGCACTGGCTAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAA:1 - chr2L 16436511 5' + Dm88 4390 2 76.24 CCAGGTACGAATGCTTGGCTGTTTAAGCTTTGCATAAATCATGTCTTTTTGGTTATGAAAATGTATTTATTTTTTATAATAATAATAATAATAATAATAAT:1 + chr2L 16996067 5' + mdg1 39 8 61.39 GCATTCGGCAAAAGCCAGCGATGAAAATCGATGCCCGAAATGACAGTGACAATTTCATTTAATTGATTTCAATAAACAAATTACAAGAATCTAAGAGCAC:1 + chr3L 13746725 5' + Idefix 7127 2 65.00 TGAGTTAATGTTTGTTTAATATTTGTCATTGTTCCTGTTCTCTTTTTATATCGCTTCTATATCTTCTCGCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGG:1 - chr3L 25479032 5' + Cr1a 4404 1 70.30 GTAATTGGTTCAAGTGTCTTTGGTCTTTGGGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 23571645 5' - roo 9026 1 70.30 CTAAAAGCGGCACTAAATTTGTTATATCCTTTTAGTAATATTCTTATGTAACAGGTAGAAGGAAGGAAGGATTCGCATTCGCATTTCCACTAGCTGAGTAA:1 + chrX 22545294 5' + INE-1 533 1 62.38 ATGTCAGAGGGCCATCAAAAGGGATTGACACCAAATTCTCGCGACAGGACTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 10143150 5' + 297 6601 2 56.44 CCTAATTTTCGGCCCTATAAGCTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 17587872 5' - roo 401 1 71.29 GTGTGTGTTCAAAAATTGTCGAATTAAATAATGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 7868909 5' - roo 9027 1 76.24 CGTAAAAGGAAAACCCTGGAAAACTCAGCCTGGAACCGAGATCACGAGCTACAATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTG:1 + chr2R 2748552 5' + accord 136 2 55.43 CGCAGGAAAAGTGGATCGGGAAAGGGTGCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAAAG:1 + chr2L 13330494 5' + F-element 183 1 69.31 AACCGACTGACCATGGATATCTGCAACATTGTCGTCGGAAACAGCTCAGCAAGTCGGAGACATTCCCCAAATCTGATGGGTCAGCAGATTCG:1 - chr2L 4058353 5' + gypsy5 207 2 78.26 CGTTATAAGAGCTACCAACCCGTCCGTAATTACACACAAAGTTCCATATCGCATATACATAAATCGCAATTTTTCCTTTACATTATTTGTAATTTCAAAAT:1 - chr2R 23580400 5' - P-element 2513 1 70.30 TATGAAGCGTGCACTTTATTCTAATTCCTATGAACGTTTCAACTTATATATATATTATATTTTTATTTTGTTATATTTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr3R 13992773 5' + roo 8667 2 72.28 CATAACTATACAAATTTGGTCAATGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 12103838 5' + roo 8714 2 77.23 AAAATCCAATTTTAAATAATTTCCTACTTTAATTGGTTCTAATGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 - chr2L 10793216 5' + I-element 36 1 63.37 CTCAAATATTTGTATGATGTACTATATTTCTACTATGTACTCAACACAATCATATGCCTTATATGGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chr3R 16457978 5' - roo 407 1 75.82 CCCACTGACCGGTGAATCCACACCGGATAGCCCCAACGCAGCCTTGCAGTATCATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTT:1 + chrX 13661038 5' + P-element 2810 1 58.42 ATTGGTTGGTTGCCATTAAGCACCTACGAGCTCACCATATATTTAGCTTGCCATATGATCTTTTTCGTCGCCTTCGGTTGCTGGTGTTATCTAGTAGGCAT:1 + chr2R 22347388 5' - G3 4420 1 64.36 TATTAAGTAATAAATAGAATATTTAGAATCCGACTTATTAATTGGGTATAATCTACACCATAAACGCACTAAGCACATAGATATTAAGTATCATTATGTTC:1 + chr2R 952130 5' + Copia1_DM 4136 1 53.47 GCCGGCCCACATGTGGTATGCGCATTATATTTTGCACTGCGGCAGCATGTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr3R 6117228 5' + Tirant 8134 2 53.47 AATTGTTTTCCAAAGCTCTATGAACTGCACACCATCGATGTCTCGCACAATAACATCTCCCATCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCTTGTATCGTACGGCT:1 + chr2R 14272770 5' - Cr1a 4396 1 59.41 AGTGGCGAAGAAGAATTGGAAATTATTCGAAGTTTGTTCTTCTAATCGGTTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGAC:1 - chrX 7401019 5' + micropia 454 2 58.42 TCATTCTATTTGATGTATTATTATTCTGTCTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATATTATCGCCTTGTATATT:1 - chrY 1801352 5' - Porto1 4241 1 70.30 TACACTGAGAGAATGCTTTGCTCTTTACAAAGTTTATAGTTTTATCTGTAAAAAATGTAACCATTGCGCGATGTATACGACTTTATAAAAAATGAAATAGT:1 - chr2R 16725212 5' + Tc1-2 381 1 63.37 AATAACATGAGCAGCGAAAAGTGTTGTAAATAAAACGCATGTGCATATTCAGTTGTTTGCGAAGCCAAAGGCAGGTGGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGG:1 - chr3L 18706860 5' - accord 7101 2 73.27 ATTGTTTAAATATTTCCCAAACAAACAAGGCGCAGCTATTTTGTCTGGCTATTTATAGAGCTGAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACAAGGGCATCCTGAAG:1 - chr2R 12077446 5' + G-element 3883 1 67.33 AAATTACTTATCGTCAATGCATTAAAGCCCACAGCCACACATACACACACTTTACTCCCCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAC:1 - chr3L 11661803 5' + hopper 16 1 60.40 ACTAGGAAATTATTTATATGGCAAAACAACGTTTGGCGGGTCAACTAGTACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 + chr2R 4854979 5' - opus 7477 2 57.43 TTGCCATTTCTATACTTAGTGCAAGGCGATCGAGCCGGAGTTTATCCGCTTTAAATCAAGGCTAAGCCGAAGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGA:1 + chr3R 17427402 5' + jockey 4729 1 77.23 GGTGAACTGCCTAGATCAACTGCAACCCATTTGGACTCTTGACCAAAGGCTGTGCTGCAGCTTTAATTACAATAATCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 - chr2L 9774371 5' + 412 3 2 74.26 ACTTTAATCGCACTCACTGTATTGCATGTGTGTGCGTATGGGCGCAAACCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAA:1 - chr3L 19377801 5' - roo 9045 1 52.48 AATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr2R 24628777 5' - mdg1 371 2 77.23 CCTTTAGATCCTTTGATTTTATGAACTCTTCCTCAAACCCTAGCATTGATCTTGTACACTTCAAAAATAAGCGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chrX 8682611 5' + pogo 5 1 74.26 GAATTAAATCTGTTATATTTTTGAGTCTCAAGACTTGGCAGTAAAAAATATACGTTATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2R 9317044 5' - opus 7482 2 57.43 GTGGTTTGGTGAAATAAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAAACGTGT:1 - chr2L 12667255 5' - blood 359 2 56.44 TTTGCCTTATTTCGGCTTTTTCCTCTTTGATTGTTTTTCCTTTCTTATTGTTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGA:1 - chr2R 2044247 5' - Tabor 7298 2 59.41 AATGCACGATTACCATCAACAAAGGACTAACGGAGATTTTGGGTTCAGACTTCGGGTTCGGGCCAATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr3R 25097925 5' + P-element 12 1 66.34 ACTAGTATTATGTTTATATTTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATC:1 - chr2L 21257051 5' + F-element 4243 1 80.20 TCTCTCTGTTTGTTACTGTGACAAAGTTTCGATGTGCTTTCGCCACCCTCTTTTTGGAAATTGACAAAAAGGCAAACACAAAAAAAAAAAGGAAAATAAAA:1 + chrX 17374867 5' + Doc2-element 251 1 62.38 CAAACTTTATGATCCAACCTCAACTTCTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 - chr3L 26834436 5' + Ivk 18 1 39.60 TTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACAC:1 - chrX 23182906 5' + Idefix 33 2 62.38 GAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3L 18706930 5' - jockey 4950 1 61.39 CAACATGTTTACATAAAACAGACTAGGTTTTCAATTTTAAATTATATATATATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 + chr2L 6555678 5' - Burdock 235 2 59.41 TTGAACCGCCGTCGGTCTCCGATGGCTCCCAAGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTAAGTATGTAGTTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTGTTTTTT:1 + chr3L 2041917 5' + transib2 327 1 70.30 GGGTCAACTCATCATCATCGATTTCCGTCTTTACAATCAGGTTCTGCACATTTTTCTCCTTGTTAGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTAC:1 + chr3R 25279574 5' + Doc 255 1 74.26 CCAAATAATTCATAAAATTATGGACCGAAATTAAAATTTCTTGGTTCCCAGAACTTAAAAAATTGTAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 + chr2R 7032113 5' - mdg1 412 2 68.69 TAATTCTCTAACCATTCGCATATGTGTGTGTGTGCGAATGTGTGCGACATGTGAACGGTAGCATGTGTGAGTGCATGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTC:1 - chr3R 9725168 5' + Rt1b 5114 1 77.23 GGCATTGCATTGCCTAGTACCATGTAAAGAGTGTGCGCCAGGGGCGTATGCGTGACTCATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAA:1 + chrX 18837071 5' + P-element 2755 1 58.42 TTTTGAAAGTTTCACATGCATCTTAACATATGGCAACACAAGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 2751651 5' + roo 8714 2 68.32 CTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 + chr3L 6044736 5' + Tabor 29 2 50.50 GCAATTGTACAAAAACATTTGTAAGCTAAAAAATAACATACATCGTAGTGTCTCAGTGGTAGCCCTTCTCATCGGGCATGTCGTGGTTCTCGGCCATGACG:1 + chr3R 946528 5' - Osvaldo 489 1 58.42 TTGAGGCTTAAGTTTATTGTATTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAA:1 + chr2L 15640036 5' - roo 99 2 78.22 ATCTCTCATCAAACTCAGTACATTGCTTCGTGTTAGGACCCCAGAGATACTAAATCTATTAAATGGATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr2R 9854141 5' - pogo 2095 1 72.28 ATAGTGAAAATGTGATACTATTAAACAAATGTCTGTTGCTGCATTTTTAAAAAAAAAAGTAAAAAAA:1 + chr2R 12106886 5' + TART-C 11100 1 47.76 AAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTTCAAGTTTACACACTTTTGAGAGTGTCAAGACTGTTTTCCTACTTTGTTTTGCTCTTTT:1 + chr2L 5593128 5' + S-element 244 1 82.18 CAGTGGCGGTATCCCAAAGCACCCATATTCGCCCAGTTGGGCGCACATTTTTGGCATTTTTATGACTCATTGAGTCTGTTCACGCCAGAAGGGCGAAAACA:1 + chr3R 15598632 5' + Max-element 8239 2 75.25 CAAGANTCCTGCCGCCTTTTGACTTGGCTTCGAGGGCTTTAATGGCCACAAGTGTAGCTGATTTATGAGTCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 18836928 5' + P-element 5 2 77.23 CTGTTTCGTGGGATCGCGCTGCTTCAATGTTCTCAGGTGATCTAACGAGGGACTCCAGTTCTTCGTTTTGTCGCGCTTGCAGTTTGCCTGAATGTAGTGA:1 - chr3L 4670191 5' - mariner2 285 1 83.00 AAATTATTAAAAAATTTTACTTAATTATTATTTAATTTTGTATAAATTCGCTCAAATCCTTTTTCCCCATGTTTACAACAGATCCATGCGAACTAATTAAA:1 + chr2L 4076887 5' - Tc1-2 229 1 66.34 TAACGCAACTATGTGCCTGGATGCGCTGGAAGTGCTCTCTCTCTCGTATTCTGGTGCCGCCCACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr2R 10444321 5' + P-element 15 1 62.38 GCTGAATAATGGAATGCCGCTGGAGTTGTTGGATCTCCTTCGAGATATATGAGATCCTGCGAGATCTTCGAAAGTTAAAGGAAAGTTAAAAAAAAAAATAA:1 - chrX 4417987 5' + TAHRE 10439 1 45.54 CTATGCAATGAATATCAGCCGGCAGCGGTGGTCTTGTTTGTACAGATATCTTTTCGTTACATACAATAATGAATAAGACCAAGAAATTGAACGTGCTTACA:1 + chr2R 5262245 5' - gypsy12 10067 2 74.26 TTATGTACAAAGTACATATGTTTCTCTGTAGATAATTCCATTTGTTTTTCTATATACATACATACATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTA:1 - chr3R 29868293 5' - S-element 1706 1 45.54 AGATATTTGTCAAATATGTCTAGAAACAATATAAGAGATTGACTAAGCACACTAATAGTGTTTGACATATTCAATAATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCT:1 - chr3R 27323900 5' + hopper2 425 1 67.33 AGCTACGGCCCATCTATAACTCTTGCGGTATACCGATAGCGCTGCCAACTTGCCGCAGTGGGTGATCTTGAGGGGCTGCCAGATCAACGGTGAGATCAG:1 - chr3L 27382320 5' + Rt1b 44 1 42.42 TTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCT:1 + chr2R 3919681 5' + 1360 49 1 71.29 ATAAAAATAACCCAAAACACACAGGCACACACTCACACCAAGTATGTGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCT:1 - chr2R 13644501 5' + Burdock 6166 2 58.42 CTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr2R 15474808 5' + roo 46 2 74.00 CATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 - chrX 20880660 5' + invader4 2790 2 61.39 CCGCCAATGTCTAGCTATTCGTTGCTCTATTCCAACAACTAACCATCTCTGTCTTGCTCTTGGCAATGTTTGTTGCTAAAGATACAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 6311528 5' - Tc3 92 1 61.39 AGAGTTTGCACTACATATTTGCAGTCCCGGTGAGCATGCGAGGACTCAAGAGCTCGCGGAGCCTTTGTTTTAGTACGTAGGCATAATTCCAATAGGGTTCA:1 - chr2R 13895824 5' + Rt1b 5056 1 76.24 TAAAATGTTGCTTGTTTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chr3R 11119890 5' + 297 10 2 69.31 AAACCGTCACTCTTAAAAACTCTCTTAACCAAACCGTTTACGACACCAAATGTCACAAGAGAACTACTTTATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 20824707 5' + pogo 4 1 70.30 GTAAAGTTATGTTGTTTCGCCATGCAGAAAGCGTGCAAACAGAGATAGATAGTGGGACAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAA:1 - 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chr2L 330863 5' - Cr1a 4159 1 70.30 GTTGCTGGCATAAAACTCAACTTTGTGTCATAAACACCACTGAAATGGAGCGCCGCAACACCTGCGACTGCTAAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chrX 10561770 5' - hobo 2936 1 76.24 TAATTTTGTGGAAAATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3R 12780614 5' + hobo 9 1 65.12 TTCTACGATGACGGAACAAAGAAACGCTCTATTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 + chr2R 15474806 5' + roo 45 2 72.28 GAGTGTCTTTTCAAAGGGAAGCCTTGCGAAGAGTCACCTTAATAAGATCCGCATCTTACAGGCGAAGACCTTA:1 + chr3R 6286632 5' + jockey 4528 1 64.38 GTTGCTATAATTTATATTGAACAATGTTTCACTCCAGCAGTCATCTCTGGGATATCAAGTGATTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTAT:1 - chr2L 12532869 5' - Quasimodo 16 2 68.32 GCATGTTGTTCGAGGAGCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2L 12324104 5' + roo 8693 2 54.46 TTCCACTTCTGATAGTGCGAGTCAAATTAACTTTAATGTGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr3L 27305 5' + I-element 39 1 63.37 TGATTTTGCGCATCGTGTGCCACTCCAGATTCGGCATTACACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGGTCTAAAAACTACA:1 - 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Tirant 75 2 82.18 AAAAAGCTGAAAAGCTTGGGAAAATCAAAGTCCACAGATACAGAGGAAGAGGAAGCGGAGGAAGATTATGGAGACAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGG:2 - chrX 11973314 5' + invader2 166 2 74.26 TAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:2 - chr2L 20133064 5' - flea 226 2 60.40 TAAAGGCTTCCGAAGTAGCAACTACATTGTAAGCCAATACATTTCATTAGAACCAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 + chr2L 10793150 5' - I-element 5333 1 58.42 CAATGGTAAGAGGACAACTATTGAAATCGATACTTTTGTGTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCATTGAGCGTGGGAACGTGACGATGGGG:1 + chr3L 22430759 5' - Idefix 7052 2 77.53 TGCATGTAGAGTCGGGGGTCTTGGGTGGTCAGTGTTAGTGGGCTAGTGTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chr3R 11391737 5' - roo 9008 2 55.45 ATGAGCCATTTGTCCACATCATATTGCCATTTTAAAGTTCAATTTGTATTTTAAATGCGATTCCATATGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2R 7861640 5' - roo 400 1 71.29 GGAGGGCAGGAGTCCTGCGGGCCACCTTGCTCCATTTCCAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 27775091 5' + roo 38 2 66.34 ACGCGTGCTTGAATATCTTGTTAATAGGTATAAATGCACGAGCTGTTAAATGCCCCCCACCCAAACATTTAATTATTGTCCCCATGGACAG:1 - chr3L 12547858 5' + G-element 4281 1 57.14 ATATAGAAAATCGTAACTTTCTGCATAATACTTACTTACTTATTTGATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCA:1 + chr3R 8975937 5' + Bari1 30 1 55.45 AACACTTTGGGGACTAAAAGAAACAAAGGAGAAAATAGGGTTGAGAAGAAGAATTATCCCCAGCTCGGGCCATGGCCCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr2L 12902714 5' - accord 183 4 64.00 CTCTGCGTTGCTCCGCTTTTCACTTGCATTGATCGTCCTTGTATGTCCTCTTCGACACTCACTGGCTGTTTCCCTTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCT:1 - chr3R 2541717 5' - INE-1 149 1 39.60 CCTTGGGGCAACCTTGTCATTTACATTTATTTTTTCTTTACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACTCACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107933 5' + accord 7104 2 65.98 ACGCGACCATGGAGCGCTGGGAGAAGGTCACCCACATATCGATACTCCTGACCTTCCCCATCGAGTGCTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACT:1 - chr2R 9048268 5' - Doc2-element 4540 1 37.62 TAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 9871003 5' - roo 9021 2 76.24 TTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 8345513 5' - roo 9028 1 68.32 AAAATGTGGGCGTGGCAGTTTTAGGTGCGTCTACGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTTATCCTTTTAGATTTTATAGTTCCTGAGATCTCAACGTTCA:1 + chr3L 21609977 5' - INE-1 140 1 75.25 GGCTGTGTTTCAGGATAGAGAGGATACTCATTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3R 20149761 5' - 1360 3342 1 74.26 TTTCCCCTGAGTTGTACACTTACTGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTCCGACTTTTCTGTTATTTCTTTTTCCTTTTTGAACATTATTATTGCTGC:1 - chrX 7660892 5' - invader2 481 1 76.24 GTCCAGACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 4876781 5' + roo 48 2 76.53 TTTGGCGGTGGCGTTGGATTGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAG:1 - chr3L 7731795 5' - G2 2848 1 65.45 TTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATTATCATTATACGGAGCTCGATGATAACACATCTGTTCACTTGAA:1 + chr3R 25099124 5' - Doc3-element 7 1 34.65 GAGAGTGGCTTGTTAAAATTCCAGCAAAACGGCAGACAAAAAGACAGCCACCCTCGCGCATCCAGGAACATCCTGTGACCTGTCCACTAGGAAAGATTTTA:1 - chr3R 14348477 5' + G6 1996 2 72.28 ATATATTTGGTACTAAAACGCATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 22098109 5' - roo 9053 2 49.50 TATTATATCTTGATGGGAAATTCCCTAAAAATCTTTAGAAATATTGTACAAAAATCAACCAACTAAATTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 7906394 5' + roo 8672 2 62.38 TCAAAACCAAATGGGCACCGAAATTCGCCATCTTGGGCCGCTTCTTTTTACCTTATTCATTAACGACCTCCCCTCAGTAATAAAACATTCGCGTGTACTTA:1 + chrX 10146576 5' + Q-element 553 2 70.30 CATTGCTATTATGTTATGTTTGTTGCCTTTGTTAGTTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTCACGCCATACGATTTGTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2R 1880431 5' + 1360 38 1 64.36 GTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGA:1 - chrX 20880653 5' + invader4 38 2 68.32 TCTCCTTTTTTTTGGAGCGATCCAAGCTCTTAATATTTTAGCTGACATTAATGCCAATATTTGCTCTGCTCTTCTTTCTTAAGCTCGCCTTTGATCCCAAG:2 + chr3L 13127541 5' - gypsy7 78 2 63.37 TACATAACACTCAATAAGCAACGTCACCCCTTTCTCATCCCAAATGATGCCAGGACCTGGTGGACTCCATGCCGCGTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAAC:1 - chr3R 7138603 5' + HB 1305 1 63.37 CCAACACCATATGATAAACTAATGAATCAAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAA:1 + chr3R 15284849 5' + F-element 167 1 76.24 ATTCAAAAATAAGCCAGTAATTTATAATTCCTTGTATAAAAGTTAGTTATTGCCTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3L 18659120 5' - pogo 2097 1 71.29 GGATAACAATACAATATTAGACCCAGTACTCTGTTCTGAGATACCCCATCTTGCAAATCCTGTACCGGCGTTACCTTGGTTTTGCACCATGCAGCCA:1 + chr3R 3696910 5' - 1360 3349 1 77.32 TGGGTCATGATCATGAACTTGTCTTGTATTATATAACTATCCATCTCCTGAAACAACTTATCAATAATTACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGACACCGG:1 - chr2L 5707651 5' - Q-element 482 2 75.51 TGTTTACTTTAATTTTGGTTACTTAAGTGGAAAGTGTTGGCGACAAAGGGTAAGTAAAGCAGCGGTTGTTAAAAGGGTGGAGCCCGAATGGATTTCACAGG:1 - chr3L 26015513 5' + Circe 7179 1 61.39 TTTTTTGTGTTCTGCGGTCCTGCGAGGTGGCTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTGACCAAGTGGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAAAAAAC:1 - chrX 3100233 5' - Doc3-element 477 1 73.27 GCGAGAGGAGGTCCTGTGGAAAATTGGTTATTTAACTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2R 20744216 5' - roo 9031 1 67.33 CTGACCGTGTACTTTGTTTACGTTTCGTGCTGAATGGCTGCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATT:1 + chr3R 15348008 5' - Idefix 206 2 63.37 CTTTTTGGTAGAAACTTACAAGCTTAGCCGGAAACTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 - chr2R 5840678 5' + Ivk 44 1 65.35 TGCCTGTGGAACATCTTTTGTTCCCTATTGAAGGCCACTAGGTGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGG:1 + chr2L 21203957 5' - F-element 4471 1 55.21 TTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:2 + chr2R 3591978 5' + Quasimodo 25 2 60.40 TATGGTGCAGCAAAGGCAAACACTCTGGATATGGGATGGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr2L 3951652 5' + Transpac 4955 2 61.39 TACGGTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr3L 13659979 5' - pogo 2086 1 64.36 ACTTTTACCAATAAACTTCAAGCTGAAAAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr2L 13574261 5' + pogo 47 1 72.28 TGTTGTGATATTAATATTTATCGGGTAATGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAA:1 - chr3L 18337689 5' + Juan 4075 1 74.26 CAGCAAGCTAACCGCCGACTGTCTGTCCAACGTGACCGCCTCGACGTTCTGCAATAATAATACAATACATAACAATCACATATAACAAATAGGTTTTATGA:1 - chrX 18445372 5' - X-element 4560 1 53.47 GAAACTGGATTATACGCAATCGAAGAACCAAGGGATCTTCAGGGATTTCTTCCTTGCACTTAGGCCCATCAAGTGCCAGGCTTGGTCCGCTTCTTTTTGCC:1 + chr2R 16767999 5' + Q-element 504 2 80.20 AGATTTCCCTGCTTACCTGCACCAAACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGGCACTCTTATGCAAACTTTTGGTTATGGGTCCAGGACCTACGC:1 + chr3R 10598417 5' - frogger 2255 1 73.27 CTGCTGATGATGTTGGCGATGTTGTGTTGCCGGGGCCTATTACCATTTGGCTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 + chr3L 7550708 5' - 412 466 2 52.48 TCATCATCGTGATCATCATCGTGGTAACAAACATTGTTGTAGTTGCGTGTAAAACCTGTTCGCTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAA:1 + chr3L 14611782 5' - HMS-Beagle 33 2 66.34 AACACAAGTTGTCTTATTATCAACTGCATCAGTGCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 - chr3R 11094560 5' + 3S18 5810 2 66.34 ATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCT:1 + chr3L 19951183 5' + Ivk 15 1 64.36 TTACCTGCGAAATGCATTTCAAAACTAATTGAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 27653431 5' + Doc 4701 7 65.31 GGATTNTGCTCATCACTGACAGCAACACTTGTTAATGCCATATACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2L 7800058 5' - P-element 2852 1 43.56 AGGATCAATCAATCGATCTGCCCGTTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGG:1 + chrX 15408751 5' + INE-1 536 1 84.16 CGTAGCACCTCCCCCTTATATGACAATTACGGAATACTCTAATGACCAATATTCTAGTCATTTTTGAAGTAGGTTGTCAATTGATCAAAAATAATATAGAT:1 - chrX 22728554 5' - 1360 254 1 68.32 CTATANGCTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 17587858 5' - roo 387 2 56.44 TATTTTTCTTTGCCTTAGCTATCTTGTTGTTGTTGTTCTCTGGATCACAGAATTTCTCATCACACAAACCATAATGATTGCCAAGAAACTCTTTAGACATT:1 + chr2R 10981779 5' + S-element 215 1 77.23 ATATAACCCCCATTCTTATTTGCACAGCGGGCCAAGTTGCATCACAACTCCCTTCGCTTTCAACTTTGATGTAGTTATAAACAAAATAAACAACAAATTAC:1 - chr2R 15388552 5' + S-element 171 2 67.33 CGGTTCATACTAAACTCCCCCTTCTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACG:1 - chr2R 1949131 5' - Cr1a 4399 1 72.28 TCCGTCGCTGGCAAGGTTGGTTGGGTCAGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCG:1 + chr3R 19190862 5' + R1A1-element 397 1 72.28 TGTGTGCCATTCAAATTTCCCTGCAGCTGGGTGAGTGTGCGGGCGGGCTTTGCTTGATGTTTACTT:1 + chr2L 8031546 5' - Doc2-element 4539 1 62.12 TGTAGATATATGGATGGAAAATCGAAACTCTGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3R 9551435 5' - P-element 2842 1 34.00 ACCGAAAACCAAGCCCAATCAATGAAAGAAACTCTTGTTCATCTAGGCAGGCACATAGCTACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTATGCACATAA:1 + chr3L 20597101 5' + Tom1 177 1 58.42 GCAGGATTAGACGGACGGAGGCGGTTTGTTTGAGAGGTGGCAACATGGATGATTTTATTTTGAACCCAAACGCACACATCGAGCGGTCAATAACCC:1 - chr3L 3115908 5' + F-element 306 1 73.96 CCCAGATGCACATTTCACGAAGTTAGTCCCACGTGTTTCACAATCGGAATGATTATCCTGGGTAGGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chr3L 23243068 5' + 1360 12 1 72.28 CCCCCAGAAAAAGTTCAGCCTGCTTGACTTTGCAATTTGGAAGTGCAGCGACTCCCACTTTCGCCCCCTCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGA:1 + chr3L 15672600 5' - F-element 4342 1 71.29 GTGCAATATATATAGTTTATTAAAGTGCTACCAATATATTTCTCAGTGTTTCTCGATATTGCGCATCCACTCAAGCCGTAACCAAAACCCAGCCACTAGG:1 - chr3R 15698933 5' + Tom1 123 1 53.00 CCGCACAGCCAACTTTTGGACGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3R 8555872 5' - 412 437 2 81.19 AAGAGGAAGGACACTGGCAGTCCTGCTCGAGAATCTCCCATACTACTAAGCGACTAATAGAACTATTACAAAATTTAAAATTAAAAATTTAAAAAAATCCA:1 - chr3L 23771277 5' + frogger 239 1 54.46 TCTTAAAACCGTTTGCTGTTAAATTCAATTTCAATGCTCGTTTGTTTCCATGCGCTTCGGCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAACAGTCCAACTTC:1 - chr3L 15418229 5' - invader4 250 2 57.00 GTCGATGCCGTCAATTAAATACTGTATGAGAGCGTAGTCTTCAATTTTACCTCGAGCAGAAATATCTTTCATTCTATTTCAAGTGAACAGACGTGTTTTC:1 + chr2L 21400697 5' + Doc3-element 8 1 57.00 ATAGCATTTTAAATTATTAAAGGGATAAGATTTTAACCGATATACTCAAAATAGTTGAGTTATCTGAAAGAGAAAATTTAAAACAAAAAAAA:1 + chr3L 10760445 5' + TART-C 11094 1 50.00 AGATACCATTGATCCATACAAGTGACCCAAGAAAAAGCAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 + chr2R 16980487 5' - copia 229 1 55.21 TCATTTTAATTAATTCTTAACTATAGCCTCAAATGTTTATATACAATACAATAACAATATACTAATAAAATATAAGATGTGGGACAATAACTTATATGGCA:1 + chr3L 13305710 5' - HMS-Beagle2 7 2 55.45 ACTGCGACAACTGATGACTAAATAATTTCACCTTGTGCCTGAACAAAATGTTTGCTCACCGATAAACAACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAGTT:1 + chr3L 12352534 5' + G2 2987 1 66.34 GTTGATTTCTGGATATTAAACGTACAGGTCATCGTCAGGCAAATCGAAACTTAAATACTACAATGATTTTCAATCGAAATAAAAAAAATTAGTAACAGAT:1 - chr2R 4601454 5' - Tc1 1519 1 54.00 TTACATCCAATACTTTCCAGGCAGTCGAGGCAGTTCATTCCCATCATAAATCTCATCTTTCTAAATTTTATAGTTCCTGCGATCTAGACGTTCATACGGAC:1 - chr2R 7355857 5' - INE-1 133 1 63.37 AAACTTAAGGACCATTTAAAAGTAAGTGCAAGTAAGTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGG:1 + chr2R 13078691 5' + jockey 4637 1 73.27 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGACATTTTCCGTTCGCATTCTCGGTCCCACTTGGACCACCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 - chr2L 9778708 5' + INE-1 561 1 72.28 AGAACACCTAACAAGCTGCGAGGTCAAGGGATCGGTTCTTAAATGTATTTTCAAATTGTTTAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr3R 27156622 5' + pogo 12 1 67.33 ATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTC:1 - chrX 20880659 5' + invader4 2791 2 62.38 GTTTTCGTTTTACTTTCAGATTGTTGTACAATAATAATATTGTTAGGACCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCG:1 + chr3L 23102103 5' - flea 455 1 52.53 CAGTTTAAAGATTATTTGAAATGTAAATATGGGAGATCTATATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 - 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chr3R 10762495 5' - Porto1 4490 1 54.46 TGTGTTGCAAAGTGCAAATTTAAACTCCGCTTCGGAGTTCGCCTCAATTTGCAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 - chr2R 17626566 5' - mdg1 396 2 52.48 CTCTTTAATTCCTTCATTTCAGGCAACAAAGTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCT:1 + chr3R 14617872 5' + 1360 3191 1 69.00 TCGCTCTCTCCGTTAGCTCTCTCCTGCTCGTTCTGCCGCTCTTTTTCATTCTCTCTCTCGACTTGTTCACAGTTCCCACGAGTTGCAGAGAAATAAACGG:1 - chrX 11729943 5' - baggins 368 1 66.00 ACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTT:1 + chr2R 12185316 5' - accord 7368 2 61.39 GCTGCATTACACAGCGAACAATTGTTAGCCAAAGTTGGCCATGCGCTATTTCATTAAACTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTAC:1 + chr3L 7197884 5' + roo 9030 1 65.35 CCTATATGTATTCATAATACGCAAGCACATTGTAGCACTCTGTTGCAATGTGTATGTCGGAGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chrX 21852455 5' + Tirant 18 2 61.39 TTTACACGGGTGTTTATTCCCACACGAATGTGTGTACGTGTATAGATGTATAATCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 + chr2L 19018936 5' + hobo 20 1 56.44 GGCGATGGGGGACGAGGAGGATTGGATGATTGGAGGACGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGT:1 - 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F-element 4410 1 70.30 CGCTGGATCTGTGGATCTGTTTCTGGTGATGGTGGTGCTCTCCTCCAGCTCCAACCAAATGAAGGTGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 23275236 5' - roo 398 1 68.32 TGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 8345515 5' - roo 9026 1 70.30 CTCTTCACACTTTTCAGCAATTTATGTTTGGTATGTGGCACATTGAGGTCGCCGGCGCAAATTCTTATCCAAAAAAAGAAAATAAAAAAACAAATGAAAAC:1 - chr3L 22109553 5' + Porto1 171 1 60.40 AATATGTACTCTATGTTATAGTCTAAAAAAATAGTAATCTAAATAAAAAAAAAGAGAACTAAGCTAATTACTATTATTATTATTTGTATTATTATTGTTAT:1 - chrX 14096834 5' - mdg1 20 2 49.50 GGAGGGATTCATAGAATAAATATTTAACAATAAACTGTGGTAATATTTGGTTTACCTGTCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCT:1 + chr3R 16340767 5' + R1A1-element 5049 1 57.43 CGTATTGGTTTCAATAAGTCTGTCAATTTATTTGGCCCCACAAGCGCCACGAGCACCACCGAAAGGCGCAGAAAGTTGTCACGCCCACACTTTTGAAAAAT:1 - chr3R 4161893 5' + INE-1 253 1 66.34 TGTATTTCTTAGTTAACAGCTGGTCAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 3817438 5' + roo 22 2 56.44 ATGCGAACGTCTGGCTTACATTTAAATTATCAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTT:1 - 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Osvaldo 1430 1 64.36 ATATGAAAAAATATGTGTAATATTTTTTTTTTACAATAAAAAATAAAATGTGGATATATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 - chr3L 8713170 5' + opus 18 2 61.39 GACCGAGGTTTATAAAAAAAATATAAATATTAGTAAGATGTATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chr2L 21272126 5' + copia 17 2 66.25 GTGAAAAGTATATTTACCAAAGCTTTTAGTAGCAGTTCTTGGTCAATATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 - chr2R 13585522 5' - Juan 4186 1 55.45 AAATGATTGACAGAATAAAATTAGAGATTCCATTTGGGTGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTTTGTCCAAAAGATCGTTG:1 + chr3L 9909705 5' - Transpac 270 2 58.42 TGCACAGTGAAATAGATTTTGCGCAGCCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCT:1 - chr3R 27192166 5' + 297 475 1 78.22 GATTGGAAATTATAAATAATTTTTGAGTATTTAGAATTTAAATTGAATAGCTACCTTCCACTTCTCGCGGCGCACAAGCGTAGGCAGGTACTCCATGAGCC:1 + chr3R 13403947 5' - aurora-element 3766 1 62.38 ATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCA:1 - chr2L 21403525 5' + G5 4430 1 80.20 ATGCAACACCCTAAATATGTAAGAAACACACCAATTTCGAGATACAAGATACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1 - 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chr3L 19951270 5' - Ivk 5356 1 51.00 TATATGCTAAAATGCAGTATCAATGGCTTTACTATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr2R 13650117 5' - mdg1 7428 2 62.22 AAATGCAGCGTCCGCCCTCCCAAAACAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATAC:1 - chr3R 17695949 5' + F-element 4593 1 75.25 ACGACTGGTGGTCGGTCACCGATCTAAAGCTATATCCATTTGCACAAACTTTGGTAAGGTCAATACCAAAAAGACTTCAAGCAGTTATTGATGCCAAAGG:1 + chr3R 23677585 5' + Bari1 1358 1 63.00 ACCAGAACGGGCCGTTGTGCAGCACTGTTCGGCACAGCTGTTCAGAGTATGGGGCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3R 29123327 5' - P-element 2867 1 59.41 CAGGGAAAACAAGAATGAGAACGAGAATGAGAACGAGAAATCGATTAAAGGCCTTTCGCCTCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chrX 5092997 5' - roo 9055 2 48.51 GGGTGGTGGGTTGGCCCCTGGAGGGGTTGGTATCAGAGAACTGCAAGGATGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr2L 1625697 5' + hobo 47 1 70.30 TGTAAACAAAAAAACATACATAGTGGTATATAGTATGGTAAATATTCGTTATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - 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S-element 1460 1 81.82 CGAAAACATCAGGAAGTACATATCAAATGCAGAGCATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3L 7075936 5' + roo 42 2 73.27 CTCACTGCCCGACACTTCCACACTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3R 2533697 5' - roo 327 2 75.25 CAAATGAATCGCTCGCTGTTGGATATTAATGAATATAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 27981669 5' + roo 39 2 69.31 CATTTTGGGCCACCTTGAGAAAAAAGATTAAATATTGACACAATGAACACAAAAGCTGCCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACAC:1 - chr3R 14744595 5' + accord 7013 2 55.45 GGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATA:2 + chr3L 25889010 5' + gypsy8 305 1 77.23 TTTCATGCAGCACTAGTGCAACTAGTTTATTCTTCAGACCTAGTTAATGAGTTGGCAAACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATC:1 + chr2L 2343288 5' + I-element 215 1 62.38 GTTCAGCTCCTCCAGGTCCCCCAAAATCACTCGCACCAAACACGTTACTATATATGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGT:1 + chrX 15089056 5' + gypsy 6995 2 66.67 CTAATGTGAACATTTTTCCGCCCGCCGCCCTTTTTTCCGCCCCTCGGCCACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCC:1 - chr3L 10191857 5' + I-element 4992 1 52.48 CCATCTATGGGTGTTCTAAAAATAATGAGATACGTGAAGGTGGAATCATATTATCATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2R 14341860 5' - opus 478 2 57.43 TGTCACGTAGCTTCCCGCAGGCCAAAACTTGGCCAAAAAGAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2R 16988192 5' + opus 137 4 55.91 ATGACAAATTTTTTCGGCTAAAATAAATTAAAATAATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr2L 22098088 5' - roo 9032 1 68.32 GAAAAACTGAATGTAATGGAACAAAGCAGATAAACGTATTATACGTACAGATGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCTAAAA:1 - chrX 16361600 5' + Tc1 35 1 88.12 CCTGTGGGCACAGTGGTGCGAAAAGCACAGATAGTGGCTAAAATTTCATAAGCATCGATTCATTGGAATGTTATCAACTTTTTTATTTTTTTTTACTATTA:1 + chrX 10088405 5' - Rt1a 5074 1 86.14 TAAGGAAATCTATATCAAAAACTTAAGGTATAGAAAAACGGTGTATAAAATCAAAGTTAGTTATAGAATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chrX 15391912 5' + 1360 6 2 47.52 TATGCTCATTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGC:1 + chr2R 23584744 5' - HMS-Beagle 210 2 57.43 GAGCCACAACTCTTTATCCTGGGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGT:1 - chr3R 29331935 5' + G6 13 1 66.00 TTGCTATATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAAT:2 + chrX 21668916 5' - mdg1 7459 2 78.22 TTTTATCAGACTTCCCCCCTCTCCGCGCAGCTCGACAAAGATGGCAACGCTCAATTACAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAATTCCCATTACTCAGTTTCAAT:1 + chr2R 13714687 5' + Copia1_DM 85 1 59.41 TCTCATTTCGGGCCAATTTCCATATGCATTTCGATGCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGAT:1 - chr3L 3792605 5' - F-element 4333 1 64.36 TATTGACTTTACCTTTCAAATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr3L 18659073 5' - pogo 2050 1 80.20 ACAAGNGTTCAATGCACTTGTCCAATGAAAATACAAGCTCTGTTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3L 9383511 5' - P-element 2853 1 44.55 TAATCATACGTTAGGCCGACAACTGTAAGGCACACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:2 - chr2L 22084532 5' + copia 45 2 68.32 TTACCTGTGCACCTCAGCACGTAAACGTGTCCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 - 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chr2L 3956908 5' - I-element 372 1 65.35 TCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:2 + chr2L 2060140 5' + 412 45 2 67.33 ACTAATCTTAAGTGATAAAAAAAAAAATAGTACAAAGCGTTAAAACTAACATCCATCCATCGTGTCCTTGGAATGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAAC:1 + chrX 4770503 5' + invader4 145 2 76.77 CAAATGCGGTGCAATAAAGCAAAAACAGAGATTAAATAAATAAGCAGAAAGAGTACAAAAAAAGGTAAACCAAACGAAAAAAAAAAACAACAAAAAAATGG:1 - chr2L 11470511 5' - hopper 141 1 67.33 TTTCCCCGTTTCCCCTCCCTATTCCCACCCTATTCCGTTGCCACCCCTCCGCGCCCCTCAAGAAATATTATTGGCTTATAGGAAGAAGATCAAAGTTACCA:1 + chrX 19769929 5' + G7 791 1 58.42 TAAAAACAGTAACAAAACTACCAAAACTACGAAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 - chr2R 13403998 5' + BS 42 1 71.29 CAGAGACCCAAATTAAGCAATAAAACGAATAAACAAATGTCCAAACTCAAGTGGATCCCAATCGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3L 4876819 5' + roo 8676 2 67.00 GGCATTCTCGCATATTTCTTCAAACGTAGTCTTGCGAGAGACACGGCTATCTAGCCGCCTGACTTCGTCGTAATGATATGCCAACCCAACGATAATTATTA:1 + chr3R 5231125 5' + Fw2 3820 1 73.27 TCATATGGAAAGGAAAAGCACACGCACACACAATCTTGCACCCACTTTAACGTGTAACAAAATAAAGGGATGGAAGACTAGAGTACCTGTACTCGCGGG:1 + chr2R 19423126 5' - gypsy12 10165 2 74.75 CCAAAGGAAAGTAATAAATTTGTTGTAGATTATGCAAAAAGAACAACAATTTTGGGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATT:1 + chr2L 12395297 5' - roo 85 2 63.37 CCCGTGGTCAAAGGGATTGTTTTGAGAAACGTGCCCCCGCTACTTCCCTCCACGATTAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCAG:1 + chr3L 12321917 5' - micropia 5276 2 51.49 ACGAAGCAATGTACTGAGTTTGATGAGAGATTATTAAATTACTCATAAATCTTTTAAATCCTGGATTGACATTACAACTTACAAAGCGTGTCGTTGGACTA:1 + chr2R 9854132 5' + pogo 348 1 77.23 GATATATTAATAAAGAGATTCTATTTGAAAAGAAGTTCATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr2L 10746636 5' + pogo 36 1 67.33 AACACACCTATTTATTATTTTATTTTGTTTACTTCTTATTTGTCTTGTCATGCATACAAATGTCATCAAAAACCACGCCTGGTTTGACAAACACAAAAAAA:1 - chr3L 21695189 5' - Cr1a 45 1 75.25 TCTTTGGCCCAAAAGTTGGGCGACTTCTTCATCGTGCTCACGTAGGTTGGCGACAGATATATGGTATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chr2L 8565435 5' - blood 367 2 66.34 TCAGGAAAATCTTTGGTAACAAGTAATCGAAAATAAATTTGCATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr3R 26321619 5' - blood 342 2 59.41 TATTGATACACTCTCATTTTTATGAGTGCACGCACATACACAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 992025 5' + hobo 34 1 62.24 AATTGTTTTTAATTTTCTTTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTGCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACT:1 + chr3L 15762161 5' - HeT-A 6026 2 82.18 CCTGGATGTGATCAATATCGTAGGCGATGGTGCCGCGCAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACGGG:1 - chrX 4704726 5' - Rt1a 4792 1 64.00 CATGAATTGCAGAAAGTTGGATTCAACTTAAGGAAATGGATTTCCAACAATTCCAAAATATTAACCACAGAGTACGGGGCTTACTAAAGTCACTAGAGGAA:1 + chr3R 19445680 5' + baggins 4983 1 67.33 CAGTATTTATATGAGTTGCTTGATTTACAGGAATACAATGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACA:2 - chr2R 16750707 5' + Tabor 6879 2 62.38 GCCTGGCCCCTGCCCTTTGACCAGGTTCTTGGAGATTCCTGCGCTTAAAGCGCTAATTCTTGAAATAATAAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTTCCC:1 - chr3R 5910357 5' - INE-1 571 1 56.44 ATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATNNNCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 - chr3L 9909764 5' + Transpac 4948 2 49.47 ACCAGGTTTGTATCTGTATCTTATAGATTGCCCAGCAGCTAAGCCAAGGAAATTCATCCATTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCG:1 - chr2L 7160207 5' + I-element 226 1 65.35 TCCAAACATTTGGTCATGGTTGGGTGCGTTTCGACAGAACTCAAGTTAAATTTAACGGCTACCCTGGAATGTCGAAATCTCAGGATCTATATAAGCTA:1 + chr3L 25932741 5' + INE-1 151 1 74.49 GCTGTCCTGGTCAATGCTGTTGGCACTGCTGTCTTGGGCCAAGTTCTGGGCTCCTGCATCGCGGCTGTTGTAAGGCCACTCCCCTGCACGAGATTTGTGGG:1 + chr3R 23269776 5' - gypsy8 19 2 51.49 GAAAGAAAATCTGCTGCCCTCCCTCCCTCCACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1 + chr2L 17646182 5' + flea 4799 2 70.30 GATGTTGCTTTTTCATCTTATTTATTTTGCAATTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTAT:1 - chr3R 25721815 5' + Cr1a 244 1 78.22 CTTCAAATTACGATTATTCATCACTCATTCACTGGATGGGCTGCGCGTGGGCAGACTGATGGCACAGGACTGATGGCCATGTAATAAACCAATATATGCC:1 - chr2L 4861108 5' - blood 378 1 69.00 GTGTTTGTTTTTGTGTATAATTCGAACTGTATTGTGTGCGTGGTTTTCGAGCCTTTTCAGGTATCTCTCGCTGAGCCTGGAGATTTCATCAGCGACTTGTG:1 - chr3R 10102405 5' - G6 1763 1 61.39 ATATGCCGCCCTTGAAAGTAGGCAATAAAAGTTGTTGCAAACGCATTTTCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 17896939 5' + hobo 28 1 61.39 AGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 + chr3R 4834276 5' - 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P-element 2840 1 33.66 CACTTATTAACAATTCACAAATATCTGGTAAATTACTTCAATTATTTTAGAATTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCT:1 + chr2R 9771516 5' + I-element 316 1 64.44 TATAAACTTATTAAAAAAGCACCATATTCGAAATTTTTAAAACAACATAATAGGCATAAATTCTGGTGTTCACTGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAG:1 + chr2L 21710715 5' - HB 1413 1 68.00 GACCCCAGAGATACTAAATCTATTAAATGGATATACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr2R 9854105 5' - pogo 2059 1 74.26 TTTCTTCTTGGTGTTGAATTTTTTTTTTTGGTTATAGTTTTTGGTTTTTGGATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAATCGA:1 - chr3L 24204206 5' + INE-1 94 1 70.37 ATTTCCTGTCATGGGCTTTAGATTAAAGTTCAACAAAACCACGATCACAAACCGCAGAAAAAAAAAAACGGAAAAACAAAA:1 - chr2L 18019368 5' + Doc2-element 233 2 61.73 AATGTTTATTTAGCATTTTATGCCAAAAGAGAGAGCGCTAAAATTATTTACTTTGCTTTGCTTTGCTTTTCTTGTATTTTTTTTTCTTTTT:1 - chr2L 17086869 5' - gypsy7 5011 1 56.04 CCATTAAACCTTAAAAACTGATTTATTATCATATACTCCACATGATATAAATTCGAGATGAAAATGGAAGCTTAAGTACAAAAAAAAAAAGATTGGAAAAA:1 + chrX 8919666 5' - FB 175 1 41.58 ACCGGTAGAACGGGGTTAGGGTGGGGATCAGTGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 - 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transib2 2485 1 62.38 CATGCATCCTTAAAAGTTCTTAATACATTTATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAA:1 - chr3R 4544054 5' - flea 4969 2 71.29 AAAATCGATTTGTGTAAAATTTTTGGGGCGTTGTTTATAATAGTTGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr2L 12667240 5' - blood 344 2 60.40 TGGGGGAAAACAAGCGGAAAACCGTCTCGCACTATAAACTTGTGCGTAGATTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTTACTGACTAGCTACTGCGAG:1 - chr3L 17589463 5' - rooA 309 2 74.26 CTCTCCATGTCACTTTTAATTCGTGCAGAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACATTTTTTTACTTTTCTTATCTTTA:1 - chr3R 19185966 5' - invader2 4745 1 73.27 AAACCGCTACTCCCCAAAAGTATACTAGCTTTATTGAAGTACACAGATTAATTACAATTCTAAGCCCTAAAGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr3R 31458397 5' + jockey 11 1 74.75 AAAATAAAACTGGCTACTATTATTGGGAAGAATGGGTTTAAATATATGGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 + chr2L 9163717 5' + copia 4899 2 58.42 TGATTNTCGTTGAGGAGCTAATTGAAAGCGATTAAGTCGTCCGAGTTGCTTCATAGTACTGACCTAAAATGTAGCTTAACAGATATTATGGATTCTGTTCC:1 - chr2R 4339736 5' - G5A 2759 1 61.39 TAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 + chr3L 19951190 5' + Ivk 22 1 57.43 GGCCTTGACATTAAGGGTGCAATTAAAGTGAGCATCAAAAGTTATCAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGAAGTGCCTGCGGATCGACAGCAA:1 - chr3R 29331914 5' + G6 32 1 56.12 TACATACATATATATACACCTCCGTTCGAATGCATGCCAAATCGGGATGCGGATTATCGTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 27748651 5' - roo 394 1 63.64 TTTTGAATTTAACAGCATACAAATGTTTGGTCCTACCTATCAAAATATGAGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCA:1 + chr3L 25807319 5' + 1360 459 1 53.00 GTATTCGGAATCAGCAACAGTGGCCAAGTGTTTGCCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 + chr2R 24628769 5' - mdg1 7417 2 69.31 AATGTATCACAGAAACGTATATAATATTTTTCCATGTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGTGTAGATAGGGGAAAAAAA:1 - chrX 22841444 5' + HB 117 1 75.25 CCAAGTGGTCGGACATTTCATTCGATTTACCACAAAGCAATCAAAAATGCTCAGAAAAAGCACAAAAGTCTAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATA:1 - chr3L 5086709 5' + Porto1 4377 1 64.36 ATGCAATTATGTTATTACTATATATACATAAACAAAGTATATTGAGCCAAAATAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2L 15808044 5' + I-element 27 1 47.52 AACAGTCCACAAAGTATTTTATAAGCCATTGTAGTTAATTAGTATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 4834273 5' - mdg1 7409 2 77.23 AAGGTGCCAACACAACCGCAACGAAAAGTTTTCAGACCACTCCTGGCTGAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2L 16201503 5' + hobo 27 1 53.47 TTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAA:2 - chr3R 7168638 5' - flea 225 2 63.37 CACACTTAAAGAAATAATTAAGGATATTACAGACGTTGATATTTGTTATTTGATTTAATATCTCAAAAATAATTATTTTTATTATTAAAATTATTATTATT:1 - chr3L 10033610 5' - mdg1 7078 2 31.68 CATACATTAAGGGTGTTTTGTTATTTTGTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 4801523 5' + roo 8712 2 73.27 CGATACGGGCGCATTAAAATTTAACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chrX 1523992 5' + jockey 56 1 78.72 ATCGCACGACATCTGTTTCGGGACCTGTTGTTGCTGCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGT:1 + chr2R 14004804 5' - R2-element 276 1 68.32 GGAAANCCACTGCCAATGCCGCTTTGGCTGCAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr3L 7572747 5' + G2 3072 1 76.60 AATGAACATTTTTATTGCCTACTTATAAGAGGCAAAAAAAAAATGCAGGACATTAATTATGAGCGCACCTAAAGAGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 + chrX 7045576 5' + jockey 4762 1 71.29 CATTTGGCTTAGTGCAAGTATTTGACTGTGCACCTGTGTGGGTGCCTCTGTGGGTGTGTGTGTGTTGTT:1 + chrX 10279958 5' - gypsy3 422 1 69.57 AACACAATGAACAAAATGAATGAAGATAGAATTGTGGTTAGGGCCAGTACATGAAATCTTTTTCGTCGCCTTCGGTTGCTGGTGTTATCTAGTAGGCATAG:1 - chr2L 17457358 5' - G3 4418 1 57.43 GGATTCCACTTCGGATATCTAAAAACCAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGG:1 - chr2L 9192834 5' - opus 7072 4 61.19 AGTCAGGAGGGCCCGTTGGAGGCGTGTGGCCAGGCGCACTTTCAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2L 16201572 5' - hobo 2905 1 55.45 ACATATTTTAACTTAGAACAGTATGAACTACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATT:1 - chr3L 16973434 5' - S-element 1670 1 76.24 CCCCCAAAAGTATGCTGCATTTCACTCTGACAGTCCCTGCAGTGAAAGTTTCACTTGCATTGCAACGCTATTGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 + chr3L 18500920 5' + hobo 3 1 74.26 AAATCATTTGCCGTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:3 + chr3R 7522272 5' + blood 7014 2 76.24 GATCTGTAGGCTTTTGAAGCGCAAGAAACATCCTTTATTGAACGATTGAACGATATTCAGGCTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:1 + chr3R 8458202 5' + HMS-Beagle 6810 2 65.35 ACTTAAGGACCATTTAAAAGTAAGTGCAAGTAAGTGCATTCTATACCATTTCTCTACATCTTAATATTTTTGTCCAGAACATTGCCCAAAAATATATGGAA:1 + chr2R 13078693 5' + jockey 4639 1 71.29 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGAAAAATTAAATCAATATAATAAAATAAAGCAAATTAAATTTAAT:1 - chr4 1294994 5' + TAHRE 40 1 68.32 CAGATTCACGGATTTGCGGACGCCTCCGAAAAAGCATACGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGAAGGACCTCATATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 + chr3R 19446121 5' + 297 6581 1 78.22 CTGCAAGAAAATATTTAGTAGTGTTCCAATACTATAAGTATTATATATGTAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:2 + chr3L 8713083 5' - opus 469 2 66.34 ACCATGGCAAAAAGTAAATTTACCAAGCGATTATATCGCTTCCCATGTATGGAAATTTAAAATGAAACAAGGGAGAATGCTATAGTCGAGTTGGCCGACTA:1 + chr3R 20908120 5' - INE-1 566 1 44.55 TAAGCGGGAGACGGCCACGCGTCTTCCCTTGGTCAAGAGGTGAACGGTAGATGGCGGACCGGGACGGTGCATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTA:1 - chr3L 21276127 5' - Idefix 7027 2 77.23 CTTGGGTGAACATGCAGAAACGAGGATGAAGGAAAAAAGGAGCGGGTGGGATGTGACTTGGTACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3R 17843725 5' + roo 15 2 65.35 TTATTTCTTGTCTATTTTCCACGTATTTCAAACTTTGCCGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAG:1 + chrX 1837526 5' + Quasimodo 7173 2 83.17 ATTTCNATTATTTAATTTATTTTTGACAGCCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 - chr3L 14982325 5' + 1360 44 1 67.33 ATAAATGAATGGCCATTAAGCAACGCACAAAAGGGAGGGTAAACAAAACACTAAGAAGAAAATTGCAAAATACTTTATATATTTGTTTAAACTACTACACA:1 - chr2R 11113863 5' - Cr1a 158 1 80.20 TACTCTTATTAATTTTCTTTTGGTTTTTACATTTTGACTAATCAAGTCGGCACTCTCCACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCA:1 - chr2R 3931864 5' - Cr1a 4029 1 65.35 TTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 - chr3R 24760617 5' + pogo 34 1 70.30 GCAAAAATTAACTGAAAAAAAGGCAAGGACAAAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTC:1 + chr3R 15516773 5' - Ivk 5092 1 68.00 AAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 + chr2L 11703248 5' - Tabor 438 2 69.31 AATTAAGGGAAATGTGCACGCTGGTCCGGTGAAATAAAATAAAAATATAAAATATAAAATCTCACCGTCACCGGTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2R 4830299 5' - 1360 3388 2 77.23 ATAGCTGATAAACGGCGAGTGCACAAATTAAAGCCGAAAAAAAAAAACACGCACAAAACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAACGCCGGCTC:1 + chr3L 3430430 5' + Doc2-element 317 1 56.44 GGCAAAGAAACGCAATGGAAATTCCCAGGGAAATGGCCAGTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACT:1 - chrX 2776157 5' - 297 363 2 59.41 ACACTTTTGGGCTGAGCGCGGGTTCTGGATTGTGTTCAACATAGCAGAAAATTATGAGTTAATGGATTTTGTTTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 - chr3R 23638206 5' + pogo 2 1 77.23 AAGTGAAACCACACTTACACCCCACCATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chr3R 10751681 5' - hopper 1357 1 76.24 CTGCGCCTTGAGCTATGCAAGGCTTTATTTTTGCGACATCAGCTCTTTGAAGTCAGCATAAATTTTACTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAA:1 - chr3R 17454493 5' + jockey 4682 1 65.35 TGCCATAACGAGGCTAATAATTCAGGGAATAATTCCAGCCACCATTTTCCCTTCTCATTTCTCTTGCTGTTTGTTTGTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATG:1 + chr3L 7301535 5' - gypsy4 468 1 78.22 AATGGGGACCCAAACGATTTGCAGAACTTTTTAAAAAAGAATTTAATTAAGGCTACAACCAATGAATTGCTTAAAGCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTC:1 - chr2R 5494571 5' + 17.6 227 2 80.20 ATCCAAAAGCTCTAATTCTTCCTTTGTTGGAATTAAAAAAATCGTTTAATAATAGGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 + chr2R 694088 5' - flea 239 2 64.36 TAAAATTTGGTGGTAATGGACATATAGTATTGTTTTATATTAGCGACAATGAACAGGTTTCTAAGCGTTTTTTATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCC:1 - chr2L 21635378 5' + F-element 364 1 76.24 GAATCCAGAGTTTCCGAAGGCCTTCTGTTGGTGTCACGTGCACAGTAGAGGAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chrX 5092919 5' + roo 23 2 55.10 AGTTANTGAGTATATTAGGAGATAAGAAGTTTTGTAAGTGCTGATTGCCGGGAGATTTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCT:1 - chr3R 14973141 5' - Doc 4453 1 61.39 CCCGCTCTTCTTCACGCCAATGATGAGCGTGTCGGGCAGGTGGCGCGATGGTCGGAGCCAGTAGAGCGGGAGAGCTGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTT:1 - chrX 19249963 5' - F-element 355 1 59.60 AACTANGATTATCTAATTTTCCAGACTGCATTCAACTGCTGCAGTAATCGATGTGTTGGTGATGAGCAGAGCGGGCTAAAATGTTAGAAATGAATTTTAAA:1 + chr3L 19182396 5' - FB 973 2 56.44 CTCGTGGAGTAAAACGTTATACTAGATTCGTTGAAAATATGCAACAGACAGAATGAAGCCTTTTGCGACCATACAAATTATATATATTCTTGATCAGGATC:1 - chr3R 6388710 5' + INE-1 80 1 85.15 TTTTTGGTGGATAAAGCACACGTTTTTCATGGCCAGAAAAATACTTCTTAGAATTCGCATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 7075863 5' - roo 400 1 60.87 GGCAGGCTTTGGAACTGAGCTGTTTCTGAGGCTACATTTTAAAAAAAATTTT:1 - chr2R 8159527 5' - Penelope 339 1 63.46 CTATAAAACGGTTGGGGGAGGGTTTTAGAAAACTAGAATCTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3R 10734243 5' + pogo 34 1 63.37 TTCAATTTGTTAGCTCTTTTAGTTGTTCTTTATGACTCTTCGTCTCCGTTTTGTTATGGCGGCAGCTTGTCGATTTGCACA:1 + chrX 19173396 5' - HeT-A 227 1 75.31 AAGAGCGTTCGCTTTCGAGTTCGAAAACTCACGAAGCGAGCCAGAGTGGCTATGATTTCAAGGGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 + chr3R 13538909 5' + hobo 6 1 71.28 TTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTAATATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 - chr3R 7168625 5' - flea 4971 2 74.26 ATTAAAAAAATAATAGTAATTAAAAAAAAA:1 - chr3R 17357119 5' + Doc 4691 1 73.33 CGAAGAGCATGAAAAGTGATTTCAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACT:1 - chr2R 17933948 5' - Quasimodo 6933 2 77.00 ATGTAAATTTCAAGTGGAGCCGCAGTGATGCCAAATTTATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr2L 12325035 5' - jockey 4956 1 62.38 CTCCGTCTTGGAATTTGAATTTGCTCAGCACAATATATAAATTAATTAAATGTATGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACG:1 + chr2R 7552248 5' - springer 7480 2 64.36 GTACCAGGCAGAAGATGCTATGTCCATTACTTTTTGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTGTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACTGTAAATAACTA:1 + chr2R 2009299 5' - I-element 494 1 73.27 GAACGGAAAAGATGCGTGGATGTTGAATGAGTCCGGTAAAACTCACCACAGTGTATCTGTGTAGTGGTGTATGAATGAGAATGAGAAAGGGAAACGCTTGT:1 - chr3R 9177411 5' + invader5 3897 2 77.23 TTCTTGTTAATAATTCTTCGATGCGTAAACGAGAATTCATTCCAAAACAAATACAAAAAAAAAAGAAAAAAAAA:1 + chrX 11836296 5' + G2 3076 2 70.27 TACACAAAATATTATTTTCTTAATTGGTGTTTATTGTGTGTCAAACGCACACGCACACATACACTCGCACACTCACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3L 13589539 5' - hobo 2937 1 77.23 GTTGCNAATCAAATTCAATAAAAGGGCAAATCAAGTGCTGTTAATAGAGCCAATCATGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCT:1 - chr2L 5637606 5' + invader2 242 2 58.42 TCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTCACGCATTTGTTAATCTCTTGGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chrX 21668943 5' - mdg1 394 2 52.48 GATAATGCAGCCGCAGATTCATGTAATGTATAACATTAGAAAGCATAAAAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCATGTGTGAG:1 - chr3R 24197428 5' - 1360 3257 1 65.06 TTGTCAACTATTTAACATTTTATTTTAAATGAAATACAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTA:1 - chrX 22549614 5' + jockey 168 1 63.00 CGCAGATTATGTCTCATTTTTCCCACTGACACTGGCACACTAAGCTGGCATTTGTTATGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3R 26321697 5' + blood 7031 2 59.41 GTAGTTGGCCCGCTTGGTCTCATACTCAATTTAAGCTCATTCGTATATCAGATTAAATGTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTG:2 + chr3L 19454648 5' + diver 18 2 64.36 ATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCT:1 - chrX 13383538 5' + Doc3-element 118 1 73.27 AGTGGATTCTGTGGAATGAGTGGTAAAGGGGTAAAGTTCCATGGCTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAA:1 - chr2L 14579906 5' - copia 224 1 58.42 CCTTTGTGTTCTATGTTTCTCCCTGTTTTGTTTTGTTTTGCCTTTCTTGGCTGCTGACCTCATGCTCGGACACCATAGCCTCTGCTTAGGCCCCAGCACGG:1 - chr2R 5844835 5' - Rt1b 231 1 67.33 GCCCTATAAGCTAATTAATAGATGCTCCAAATAGGAAACTGATTAACTCAGAAAAGGTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 17587861 5' - roo 9053 2 60.40 ATCTAATTATAGCTTCAAATCGCGAAATTCTCCGCCATCACAAACAACACATATATTTGAAGATATATATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATAT:1 - chr3R 20137358 5' - Burdock 246 2 68.32 ACTCCTCGGGCACTTGCCCCTCTGGCATTTTTCTCAAATCTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTT:1 + chr3L 26481280 5' - diver2 4838 2 60.40 TGTATATTTTCGGAAATTTTTCTATTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chrX 13761294 5' + pogo 52 1 79.21 ATTATATTGGCAAAAAAAAAAGTCATACTAAGTCCGAATAGAAATGTGCTGTAAAAGTTAGACAATTTACTAATTTTTTTTTTAATTTAGAAGGAAAAT:1 - chrX 16149836 5' + S-element 1590 2 45.45 AACAATCACAGGCACACATTAATGTCTAAGTACGAAATTGAGAGTGCTTGCGAAAAAAGAATATAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGACGCAAATTAAT:1 - chr3L 25206784 5' - Gypsy12A_LTR 2061 1 75.25 GAGAGAAATTGTTATAACAGAGCACAACAGAGCTGGTTGGTCGTTCCGATGCAGTCGGCTTTGGCTGCAAACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTG:1 + chr3R 817687 5' - Doc3-element 4529 1 69.31 AAGTCAAATATTTCTAGCGCTGTTATTTAGTTAAATAATTAGCTATTAAATTTTTTATTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAG:1 - chr3R 13582289 5' - BS 5068 1 51.49 AAGGGTTTGGTCAGAAATAGAGTATCGAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 - chr3R 31194523 5' + Transpac 4964 2 73.27 ATAAAAAAAAAAGGAGCGAAGAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTCCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGC:1 + chrX 12358817 5' + jockey 207 1 77.00 ACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACAAATTGTGACTGTATCAAAGTATCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 + chr3R 19450000 5' + roo 8727 2 57.43 AGCCATTCAGCTTGCGCAGCTCCGCCAGAACGTGCTGTTTCCTCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTT:1 + chr2R 8613644 5' - jockey 4552 1 57.43 AAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTA:1 - chr2R 16660292 5' + gypsy9 5041 2 49.50 CCAAATAATCAAGCGGATCCCCATCTGCGCGCTCTCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATGGCGACCGTG:1 + chr3L 9562481 5' + Tabor 496 1 66.34 CCGTTACTCGTAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGCAAAGTATGTAAGTGGCGTTTCTGAGCATATAAAGTATATACATGTATGTTCTTGATCAGGA:1 + chr2R 2749412 5' + INE-1 78 1 74.26 AAGCTACTGCTTAATACTGATTAGATCAGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCT:1 - chrX 21393559 5' + F-element 441 1 70.83 ATAATNTAGATATTCATTTAATTAAGAAACAAAATCCCCAATAGCGGAGACAAAAATAAGCGAAGGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chrX 15305615 5' - roo 404 1 72.16 AATCACAGAAAAATATGTGGCACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 10952292 5' - roo 9017 2 78.22 AAACAAACAAAACAAAAAACAAACGCACAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTGCTGCACAAAGCACAA:1 + chr3R 28240017 5' - Cr1a 150 1 72.00 GTGGANAAGGGGGCCACCGAGACGTGAATTTGGCTTTATTGACGCTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3R 12047479 5' + Stalker2 35 2 57.43 GACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAAGTGTCTCT:1 + chr2L 12474965 5' - mdg3 5468 2 53.47 TATACTTAACGTAAAACCCTAAACCACTAAAACCACCAAAGGAAAACATCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACA:1 + chr2L 14956081 5' + G2 2965 1 52.48 CGATAGCAGCGATGGGTTTTATGTGGACAAGGTGGGCAACAGCTCCTATAGAAACATAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:3 + chrX 15293425 5' + Quasimodo 26 2 56.44 CCACATGGGATGTGGATCGGACATCTTCTTTATCGCCAAAAAGTCACCAGCTGTAACAAAACCCAATTATCGTGCTTTAATCAACGATATGTTGAAAAGAA:1 + chr3L 18808888 5' + transib2 2411 1 66.34 GCAAAAGAGTTAATGCCACGCCCAATGGCCGCAGCTTCCCCCTTTACGCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr2L 14790651 5' - roo 9042 1 54.46 GCCCGAAGATCGGGATTCGAAACACTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chr2L 3632161 5' + P-element 50 1 32.67 AAATAGCTGGCGCCTTGATTTGATTATCGTGTTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCTCCCCCCCCAGTTCGAAGTGACGGCC:1 + chr2L 315407 5' - Tirant 8082 1 69.31 TTGTTTAAAATGCAGCTTTAATAAAATCGCCTTTCCAACTCGCATTTGTATATATAGTGACGTATTTAGGTGGTCCAAACCA:1 - chr3R 11119875 5' + 297 6587 2 67.07 TATTTTGATAGCGTACGGCGAATTTGAGTGAAAAAAATAAGGTAATGGGATTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 27981735 5' - roo 9054 2 52.75 GGCTTTCGGCGATTTTCTCAGAGCCACATTGAGTAATGCCCTAACAATTAATATCTTTTAATTTGTAAATTACATGTTCTAGTTAGCTAATTGTTTAATTT:1 + chr2R 9129184 5' - HeT-A 15 1 56.44 AAAGTTACCCATTTGAATTTCATCGAGAAATAATTGTATTAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chrX 17058204 5' + 297 28 2 64.36 AAATCTACTGCATACGGTCAATAAAAGTGTAAAAACAAAAATAACTCCTACCTTTCATTCACCCACATATCAAACTACACACAAAATTATCAAAGCTTACA:1 - chr2R 1411556 5' + Porto1 308 1 69.31 TTTTTTGTATTTCTTAGTTAACAGCTGGTCAATTGAAGCCCCAAGATATATTTATATATATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 3817433 5' + roo 17 2 61.39 ATCGGCCAGAAAGTGCCGAGATACGAAAGCACAGAAATAAACGGTTGTAATGATGAACCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr2R 19943914 5' - 412 459 2 53.47 GAGTGGAAGCACGGCATCTGATTCGATCCCCTGACCTCTGTCTCCTTTTGGATGCCACTGTTGCTAGTTGCTGATAAGTATCGCGAACCGAAGCCGTCACC:1 - chr3R 9851304 5' - jockey 153 1 65.35 GACGCTCGAATGTAGGCTACATTTTTGCTGCTTCTCTTGCCTTCGGGGTCTCCAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3R 11846297 5' + hobo 25 1 54.46 TATGCCATTTACCTAAACCGATTAAAATTGATTGCTTTTCGGGATTCATTGTAAAGGCAAAATAAAAACAAAAAAATAATAAAATAATACAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 15013787 5' + Rt1a 5072 3 68.32 CTTTCGGCACATTTGCATAATCTCAGGAAAATCTTTGGTAACAAGTAATCGAAAATAAATTTGCATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACA:1 + chr3R 26321597 5' - blood 364 2 65.35 AAAAGAGGCTGGGACAGTGTTCAAATTAATTTGATTTGATTGACAACAGTTTTTCTATCAATAAAAAAATTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 20254597 5' + X-element 4716 7 88.89 CTTTGGGCCATTGATCGGTTTGTTTGCCTATAATGAAACGTTAGGTGTATCGGCATATCGAAAAATTATCACATTTTTGTAGCTGAGTAACAGGTATTTGA:1 + chr2R 4377568 5' + INE-1 544 1 51.49 TTGGTCCTGGTTCTGGTTTTGGTTGTGGGTCTGCTTTTGGTTCTGGTTATGGCTCTCCGCCTCTGCCTCCTTTACCTTGGTCTCTATTAATTCAGCCCTTG:1 + chr2L 4070969 5' - BS3 1708 1 71.29 ATGAAGAAAAAAAATATCAATAAGATATGCTAGAATATTAGAAAATCCACTACGTCCATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCCATTCTATTATGT:1 - chr3L 26324984 5' - Porto1 4226 1 53.47 CATGAATTATGGCACACAGAGCTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 + chr3R 25671944 5' - I-element 5303 1 75.25 TGTAANCGACAGCAATTGCCAACCATCAATATCAAATTAACCAATTACGCAAAGAGAGGCCAATGCAAGCCCTGAAGCTTTCACGATAAGAGTCGAGCTTT:1 + chr3L 3022356 5' + gypsy7 5288 2 57.43 AGAGAAAGCCATGGGCGACGCAAATTGCTCACACGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGC:1 - chr2L 6601442 5' + I-element 46 1 65.35 ATTTTCCTTGGAATGGCCAGCGGGTATGTGTTTTTTGTTGTTTGTATGTATAGCAGAGCAAATTGTATATTTATATTTATTATGACCAAGTGTCACAATGT:1 + chrY 2720397 5' - Stalker4 66 4 65.35 AACAGCAACAGTCGCCGCCTTTTGTGGCACAAGCACTCGACTCATTCGCACGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTG:1 - chr2L 17207876 5' + jockey 4765 1 50.50 CGCACAGGGGCAGAAGTACAGTATGTGCCAAAAGCTGCGATAACCGCATGCTGCCTTGAGCGGAGCTGTAGCGTCGGAGACAAAATCAGAACTGAATATAA:1 + chr2L 9294763 5' - gypsy2 193 2 60.40 CCACTATATCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3R 19449965 5' - roo 9039 1 64.36 GAGGANCCATTCTGATTCCATATCTTCGTCCTTCAGCTGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 12324093 5' + roo 8704 2 65.35 TCGGGTCTCTCCTTCCAACGGCATTATATATTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2R 18675551 5' - opus 7460 2 74.26 TGCTCNTTACTTTATAGATACGTGCTTATACATTTGATGGACAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAA:1 + chr2R 23584746 5' - HMS-Beagle 208 2 59.41 AATATATTAAGCCATCTAAAACTTGTTAAGGATTGAGATAGTAGAAGGGTATAAACAGCCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAA:1 - chr3R 6603073 5' + I-element 398 1 63.37 GCCCGTTAAGGTGGGTTGGGATACGGGAATTCCCAGTAATCGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGAATCCGGAGGTGTCTTTCCTGGGGGATTGG:1 - chr2L 13922513 5' - transib4 2358 1 59.41 TTCGTAGGTGAAGTTTTTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTGATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAA:1 - chr3L 5489958 5' - jockey 4984 1 71.23 GCTCGAGAAAGCTTCATATATCTAAGCTATCACTTTCACCGGGTTTTTCCCATGCCAATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTCTCCGGAGAAGCACG:1 + chr2R 5840736 5' - X-element 433 1 60.40 CTTTTNCATTAGGGTTCGTGTTTATTGGTTTCATTATGACTCAATTACATATTTTCCCAAGCCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 19462192 5' + roo 8678 2 64.36 AATAAAAAAAATAATATTAAATATAATTTAAATCATCAGACGCAAGGGCTGTGCCACCCACTAGCTTTTATAGTTCCT:1 + chr3R 5225818 5' - INE-1 156 1 88.46 CATCTNACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2R 8345497 5' - roo 9044 1 53.47 TTTCCGAATTAGTGGCGCTAGAGTTTTAGGGCGTTAAAGTGCTTAAAACAAGCGAAATATAAAAAAAATCGAACATAGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATT:1 - chr4 512734 5' - HB 1356 1 66.34 TGTGAGCGCATCCCTTTTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTCACAGAAGTCGCGGATATAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chr2R 17345914 5' + jockey 68 1 80.20 TTTTGAATTCAACATGTCTTGGCATCTTCTGTTTATTGATCAACTTAGATTCGTAATTGATTAAATTTATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCT:1 - chr2L 2074797 5' - roo 9062 1 72.28 ACTATTGCTCCAGCACTTAACAACCCCAAGTCACTTGCGATGACAGGACAACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTG:3 + chr3L 6044735 5' + Tabor 28 2 51.49 GACAATTGAACCAAACGGAATGAGTTTATATACTAAATATATACATATGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCT:1 + chr2L 12474965 5' - mdg3 5468 2 53.47 CGGGCTTGCATCCTTCCAGTGCGCGATATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 + chrX 19116878 5' - opus 454 2 75.25 AACAGAATTAAACTATCAAATTATTAATGTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTG:1 - chr2R 21020040 5' + Porto1 4624 1 83.17 AGCAGAATGTTTACGGTCTTCTGCGTGTATAGCCCAGTTTTTCTCTGCAGTTTCCGTTTCCTTTGTACCCTAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3L 13659990 5' - pogo 2097 1 75.25 AACCATATAAGCACATACATATAATCTTCAACATAACAATTTGAAATATTGTTAATCGAATGTTTATATAAAATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGG:1 + chr3R 7168537 5' + flea 4759 1 77.23 AAAACACAAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCANCGGAACAATGCAT:1 + chrX 12957334 5' + Doc3-element 278 1 47.31 CAAGAAAAGCTGTTATATTTAGACAGCGAGACACATAAACACCTTAACATATGGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTC:1 - chr2L 19684031 5' + jockey 4696 1 49.50 TTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGTTTAATTTTTAAATTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTG:1 - chr3R 545850 5' - TAHRE 10434 1 62.63 ATCCTCTGGGACAAATCCCACATGCTCAATTGTGTAGGTGTCCACTACATATGCATGTATGTATGTATGTATGTAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3L 22831369 5' - 297 391 2 76.53 ATTAAGTGTAAAAGGGTTTCGAAACACAGATATTGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chrX 15392016 5' - 1360 3352 1 63.37 TGATAGGCAGGGGAGTGATGAACCCGTGGATTTGCACAGAGAAGGTCGACTTTTGGATCTCAACAATGCCATAGCGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr2L 19481379 5' - roo 407 1 77.23 GAACTGCGACAACTGATGACTAAATAATTTCACCTTGTGCCTGAACAAAATGTTTGCTCACCGATAAACAACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTAAG:1 + chr3L 12352532 5' + G2 2985 1 68.32 TATTTTGCGACAAGTGGCAACACTGATATCGGGCGGAAAAAATTTAAAGTGAATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3R 8313130 5' + 297 6603 2 57.43 CAAAAGAAAACATTCGTTCACTGCACATCGTGAATAATCCGATACAATCAATTCCATTTTTTGCGTGCACCAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:2 - chr3L 9909790 5' + Transpac 9 2 70.30 ATGGGATGTCCAAATGCCAAGTGCCTTGAAATTGAGTCCGACGACCAACGTGGCGTATGCGTGTTGCTCTATATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTAT:1 - chr2L 945381 5' - GATE 8344 2 77.55 GTTTTTTATCTCTATTTACAAACCATCTTAAAGATACTAAAGAGCCCTGAATAGAGCGTATAGCGTAGCGGAGACTAGGCGGAAATTTTTAAATAAATAAA:1 + chr2R 17473450 5' + G7 1138 1 60.40 AAATATGACAACATCATCAACATGAAAATCAGCAGCCTGATGACATGGCCACCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3L 11661707 5' - hopper 1392 1 54.46 ATTAAGTTCACACGGGGAAAGTAAAAAAATCGTCACTATTTGAACTCTTTCAAGAACTGTTGTCGTTGAGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 17722745 5' + blood 7 2 67.33 TTTATTGAGTAATTTGAAGGTGAGTCGAGATCGCCGCGGTGGTGATGACAACGACAGTCCACAAAATATTG:1 - chr3R 16833542 5' - hopper2 367 1 66.20 TGGATTTGTTTCGCACCTTTTGGTTCCTTCCGGCGAAGTGGTCGCCACGGGGTGCATTCCTGTCTCATTGTTGTAAAAATTTAATTCTGTTGGATTTCTGC:1 + chr2R 9800444 5' - Porto1 4535 1 80.20 CTCATTTGAACTTAACTTTCTGCCGTTTGTTTTGGACCAAAAAGAGAAAGCCAACAAAACAGGAAACAAATATAACAAAAACGAATATCCCGAAATGGTA:1 + chr3R 20431800 5' + G4 112 1 59.00 TTTAATTTCCTATACATTTCCCAAACCTTTTTTTGTTCATAAATATACAAATTTGGTCAATGATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 12103876 5' + roo 13 2 58.42 AGATTGTTTTATTGTGTTTTTTTCTCTGGTATTGGGTATTGGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAA:1 + chr3R 21023821 5' - Stalker 69 4 59.41 GCTGCNCCCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 15072654 5' + pogo 25 1 56.44 CAAAGCGGAGCGAAGGGAAAAAACCCCAAAAAAAGGAACAAAGGACGGAAATGCTTCCTCGACCTATGCGATTATGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTA:1 - chr2R 7171143 5' + Stalker4 6962 4 55.45 CTAAAACTGACTAAAACTAGAGGTGTTTGTGTAAGCGTTTTTATTTTATTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTA:1 + chr3R 18210328 5' - Juan 4180 1 59.41 AACTACATAAACTTGGTGAGAGGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 + chr3R 10751660 5' + hopper 54 1 76.24 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTC:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4395 1 75.27 CTCGCAAGGTTTTTGTTACAAATTTCGGAAGATAAACATCAGGAAAATATATATATATAATTATATTCTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAAATATAAATT:1 + chrX 23182828 5' - Idefix 7369 2 58.42 TCCAGAAATATAACCGCAAATAGTAATTGTTAAAACATAATGGCCCATTTGAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 16576262 5' - 1360 3366 1 56.44 AACAGCTCGACCCATTTCTCTCAGTGCTCGGATGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTT:1 + chrX 20867077 5' - 17.6 208 2 67.33 AGTGGACCAAGCTGGGCGACAAGTGAAACTAAACTTATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAA:1 + chr2R 18399081 5' - S-element 1675 1 71.29 TATTTGTTTATTATTTTGACATTTTCAACATGGTTAATTTTTTTTTTACATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACAC:1 + chr2R 3591976 5' + Quasimodo 23 2 58.42 TTAGCAGGCCATCCCATCTAAAATGCAGAAATGTGAATAAAACTACCAAATAAATGCAAATAAAAACGGTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTT:1 + chr2L 11703210 5' - Tabor 7315 2 69.31 TGGGTGGTTAATTTTATCAATGGTATTTTCATATTCTTCTATGTCAATAATATGGATTTACATACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:1 + chr2R 4547739 5' - HMS-Beagle 236 2 69.31 CCCCGACCTCGGATTTATGAGTTCTCTTTGAGAGTTGCCGAGTGGGAGTTGATCCAGATTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCGC:1 + chr3L 14849036 5' - accord2 7432 1 66.00 GCCAAGCACTATAGTAATCGACTCTGAAATGGAGAGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGG:1 - chr3R 15598705 5' - Max-element 276 2 67.14 AGGTACAATATACATCTAATATGTAATATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:2 - chr3L 25968942 5' + HMS-Beagle 6841 2 70.30 GGTGAAAACAAGTTCAACCAACCGCCGATAACTTGCTCTATCGTCAGTCTCTCTCGCTCTGCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCG:1 - chr3R 27129694 5' + Max-element 141 2 68.32 CCCAGCATACTAGAAATTCCAAACTTCGTGCTCTGCCGAATTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3R 15072647 5' + pogo 33 1 61.39 CCGCAGGATCCTCGGATTCGGACCGAAGATGGCCGGGTTTTGGCCTGGCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr2L 12815036 5' - hopper 1387 1 51.49 ATTTGGAGGGCTCTGAGCTGAAGAATGCAGCAGCTGCCGCCGCTGCTGCCGCCCACCATGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTT:1 + chrX 593710 5' - Doc 492 1 63.37 GGTGTAACTAAGTGTTTGACAAAGTGATTACTAATTTAACTATATAATTACAAATATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 24760631 5' + pogo 20 1 59.41 GTCGCTGCTGATTTTATTGCCCGAGCAGAAAGTACAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAAT:1 - chr2R 17314500 5' + Ivk 305 1 65.35 ATGAGGAGCGGCTTCGAAACGTGTCGTCGCAGGCGTCGACGTCGGCGCCGCAGTCGCTGCGACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATA:1 + chrX 22855187 5' + P-element 13 1 64.36 CTTTGTGAAGCAGAAACGCATGATACTTGATTTGAAGCATTCTAATTCAGATTTTCCGGTCGATTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:2 + chr2R 19551965 5' - roo 396 1 66.34 CAAAAATCAATATTTTTTGCCTATCAAATGGCCCATTGAAAATAAACAAGCCCAAGGGTTTTTCTCCCTCTCTGTTGTTCACATGCTCTCTCTCTCTCTCT:2 - chr2R 14908415 5' + blood 163 2 66.34 CTGCACCCATGAAAGCAGATGGAATTCAGAATTCTTAGTGCCAATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - 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chr2R 10928444 5' - flea 220 2 51.49 ATATTCTATGTTTCATTTAACATTTGCGCTCTTATTAGCGTTTATTTATATTCTTTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGG:1 + chr2R 13447231 5' - I-element 423 1 61.39 AATGGNTCATTTAAGAGCGTTTTACGCAGGCACTTTAACTACCGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chr2L 11703298 5' + Tabor 35 2 57.00 CTCACTTTTTCCGTTTGGTGGTTTAGTTAAGAAAGTACGTTGTTAAGCTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 8345500 5' - roo 9041 1 55.45 CCACAACAGCCAAAATAATAACAACAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAA:1 + chr3L 10180314 5' + F-element 315 1 76.24 CGACAAAAATTTGCCAAGTTCAAAGGAATTCGACTTTCTTTATGCATACGTAGTGGGTTAGGTGTTTCCAGAAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCCAGTGAC:1 + chr3L 15422165 5' - baggins 4992 1 63.37 CCTGCAGACCGGCATACAAATGCCGGAGGAATATAAAATATTCAGAATGTGGAGTGTGTGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2L 6888586 5' + jockey 23 1 61.62 AGTTGCTGGCAAATTTGGCTGCGCTTTTCCCTGGGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACA:1 - 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INE-1 83 1 70.30 TAGAATGTCATACCCCATTGAACTCGCGAAAAAAAACCGAATGAATTGGAATGCCAACATATTTTTATATTTTGATCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGG:1 - chr3R 27307930 5' - jockey 4726 1 74.00 AATGGGGGTTGTGGTGAATATGATATGAGTGATGTTCAACCGATGGATCCGGATGTGTCTTCCCTGGGGGAGTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGG:1 - chrX 10346733 5' - transib4 2332 1 68.32 AAATAAGTTAAGCCGCTGCTGCGGCGCCCATATAACACTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chr3R 12780626 5' + hobo 35 1 61.00 ATTGTTGCTAGACTTTTACACGAGTTAGCTTTCAGTATATACTTATTGAATAACTGACTGTACCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr2L 2060109 5' + 412 14 2 65.35 GATGGATGTCTTGAGATACCATTGATCCATACAAGTGACCCAAGAAAAAGAAAAAGGCGTCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr2R 16980474 5' - copia 237 1 60.40 CGTGTCGGCAAAACAATTTTCCAACTATCCCCCGCAATTGCAACTCCCCATCCACCCACGAAGACAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTAT:1 + chr3L 18636082 5' + Quasimodo 390 2 70.30 TTATAAAAATCGTAGACTACAAACATATGCGTCTATAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGAGTTTTTTTTACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGGTTTTATAA:1 + chr2R 5582171 5' + Cr1a 445 1 63.37 TTGCCATTGGGTCCTTCTCTTCACTCCAACGTATATTTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr2R 14246978 5' - 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Doc 4699 1 70.30 CAACTTATAACCAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTGGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGG:1 + chr2L 23286581 5' + Tirant 413 1 56.44 AGCGCATCCTTAAGCAGGATATCAACTGGCAAAAGCGCTGAAAGGAGCTGGCTCCCGCAGATCCTTCCCCCTTGTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCAC:1 - chrX 21503932 5' + INE-1 214 1 73.74 ACGCATACATACATTGCGAATTTTGCAGATACGGTGTATTTTAAATGTGGGCAATCGAAAAAAATTTTTGTTAAAGGTTTTTTAAAGGGTGGGCAAACGAT:1 + chr2R 1072188 5' - FB 382 1 68.32 TATTGTGGCTCTGGGCTTTTTGTGCTGCGTGAGTTACGCTGCTTGTAAAGCGTTGAATTGCTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCA:1 - chrX 7182082 5' - BS 415 1 71.29 TGTTTCCACGCCCACTCTAACGCCCTAATGCCGCAATTTTTAAAATATATGGATATGATATATATCCCTATATAATATAGGGATATGATCGTATGCTTCGT:1 + chr4 71480 5' - invader3 53 2 45.54 TCTTATTGAAGCCTGGTTACAACATACGTCCAACCAAAGACACCAAAGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTGGAATTTT:1 - chr2R 5531176 5' + 1360 80 1 58.33 CTTCCAGTTAATGGCTTTGACTCTGAACCCGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2R 14676945 5' + roo 67 2 75.25 CTATCCACAGAAGCGAACGAAAACTTCTCATCACCACAAAGGCAAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 - 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INE-1 252 1 79.21 ATATTTTGTCCGTTTTTATTATACCATTTCTGTATTTACTTGACCTACTGTTTTAATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr3R 7168652 5' - flea 4999 2 63.00 ATAATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTTCTCTATGTTCCTTCTCCTATTATTCGCGTTCCTAATCATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAG:1 + chr2R 4260434 5' + micropia 176 2 79.38 AGGAACAGCCCCGCTTGCAGAACAATGACCGCAGCTGCAGTGGTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGT:1 - chr3L 23427306 5' + flea 4833 1 57.43 TAAAAATCTTTAGAAATATTGTACAAAAATCAACCAACTAAATTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 7906419 5' + roo 33 2 61.39 ATAACCATGCTGCGCTGGTTAATTTATCCCTGGCGGGGAATCACCTAAACCGCCGAGCCCTGCACCTGCAGCTCCAGAATTTATACCGT:1 + chr2L 19060791 5' + Chimpo 4205 1 53.93 TTTCTCGTCGTTTCCTTTGTTGCTTTTTTGCCCAGCCGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGAT:1 + chr3R 31718531 5' - accord 325 2 63.37 TTTTTAATTAAAAAATTAACTTAATAATAATTCTCATTATTTTGGAGACTACTAATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAC:2 + chr2R 5067631 5' + F-element 36 1 59.41 CCTCTTCATCTAGCAACAATTTTTTTTCTCTTAATTTGTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - 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mdg1 403 2 61.39 TATTTTTTGTGCAAAAAGTAAACACTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACAT:1 - chrX 19877791 5' + I-element 4948 1 74.26 AAAAAAAAAATGAAACAAAAGGTTGGCTCCGGTGCACCGAAGTTTAGATACCCTGGCAGATGATGATATTCTCATAATTGTTATAATTTTAATTGTTATAT:1 - chrX 10223848 5' + BS3 1638 1 59.41 CAGCGCACAGAGGGCGCCACCAAAAGCTCCTACTGCGGATGCTGGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTACACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 17968359 5' + Tirant 21 2 56.52 CTATGTGACAATATTGACAATATCCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATT:1 - chr2L 3440474 5' + Juan 61 1 76.24 TGGATTTTTTTCAAAAATACTATTTTATCAACATAAGTAGAGCAGAGTTGATCCATTGCATTGTACTGTATAATATTATTGTTATTATTATTATTATTGTT:1 - chr3L 18284713 5' - mdg1 22 5 69.31 ATCAAATGTCTGGAAATGTGCAAATAATTTTTCACCTTGCATAAAGGTGCAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGG:1 - chr3L 18706942 5' - jockey 4965 1 52.04 CTGTGCACATATACATTTCGTGGCCCGCACCCACATGCCGTGTACATACAAGTTAAGAACTCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chrX 20806941 5' + opus 7146 4 62.38 AACATATCATATCTTTGCTATGAAGTGTAAAGCCATTCTGCTCCACTAGTCCAGCATACCCCACTTTCTTGTGGCCATTTTGTTGTTTTTTTTTTGTTTGT:1 - 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mdg1 7421 2 65.35 TTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCAAACAACCTTCTCCTTGTTGTCCTTTTCCTTCTC:1 - chr3R 9552292 3' - P-element 146 1 29.00 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACACAGTTGACCTTGTGCCAATAACTTTGCGTGGAGAGTATTAACAATTAAATACG:1 + chr3R 15196963 3' + Tirant 364 2 59.00 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAGAAGAAAAAACACCCTTTGTCGGTCGGACGACCGGAATTCGAT:1 + chr3L 12346395 3' + I-element 340 1 62.38 TCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCCGG:1 + chr2R 9500078 3' - G5 4696 1 59.41 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACC:1 - chr3L 17918394 3' + 297 6930 2 81.00 AGAAAAAGAAATAAAACAAAAACCCAGGCGACCAAACGCCCCAAACAAATTCCAAGCACGTTGCAGACGATATTACGCAAATTATGAGCATTAGCAAATGT:1 - chr2R 14427645 3' + Doc2-element 221 1 78.22 ACATTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGAGAAGAATGTAATATGGTAATACGAAGACCTTCGCTGTACGTGACTTCGCTACTACTGCAGA:1 + chr2R 4870152 3' - rooA 341 2 59.41 GTTGAATAGTATATTCCAACAGTGTGCCTTACAGTTGTCGGCCTAACGTATGATTATGTTCAAACACAAAGCATACGCCAAGGCGAAAATGACAACAAGGG:1 + chr2L 22084577 3' - copia 4869 1 79.21 ATTTTCACAATCTTTAATTCACAATTTAATTGTTTATTAGGCATGGACTGGGCCCCAAACTATGTAATTTATACATTAATAAATGCTGCACAAACAATGGT:1 + chr2R 11774654 3' - copia 316 1 63.37 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTG:1 - chr2L 19018958 3' - hobo 42 1 68.32 GACGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGTTTTTCCTATTTAGTTGAACAGAATCAGAAAAGGGTATTGATAACATTAGTGTTTTTTTTAATCGGGAATTTG:1 - chr2L 8664900 3' + Burdock 6158 2 70.30 TTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGTAGGTGTGAAATTTACAACCTATTTGATGGCCAATCG:1 + chrX 3874395 3' + opus 3 2 63.37 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCA:1 + chr2L 20706727 3' - mdg1 7071 2 57.43 CACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATCAATAAAAGTCAAGAAAAGGGAACAACACCCCGCCAAACATA:1 + chr3L 21429091 3' + F-element 4612 1 71.29 TGGTTNGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCT:1 + chr3R 11119894 3' - 297 6 2 73.27 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGGAAGA:1 + chrX 13508764 3' + roo 9047 1 58.42 CTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTGCTTACGTCAAGCCTCAC:1 - chr2R 7775717 3' - Transpac 18 2 61.39 ATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATA:1 + chr3L 19951277 3' + Ivk 5362 1 59.41 ACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATTACGTATATCAAGTGGGCGGCAAGGGGAGCTAATGCTGATCGTTTT:1 + chr2L 8567097 3' + blood 202 2 56.44 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGATCTA:1 + chr2R 17261652 3' + pogo 2071 1 62.38 CTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGCGAAATTTCTTTACGCTTACCTACGGTTTCTTATTTATCACGCTTACCTTGTTGTGCAGTGGCATAGC:1 + chr3L 18299968 3' + Doc2-element 477 1 59.00 TTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - HeT-A 8 1 67.33 TGTTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACAATTGAATTCATATTAGTGTTTTAAAATGCACTTATCTTCCTATTATAAAACGTATTTTAAAAAT:1 - chr2R 2261848 3' + TLD2_LTR 39 1 64.36 CGTTACTCAGATAGTGTGAATAGTGGGAAATCGATAGATATTGGGGAATAAAATGAAAAAAAACCTGAATTGAACAGACAGTTAGGGTATGCAATAGACTA:1 + chrX 20260083 3' - INE-1 535 1 63.37 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTGCAAACAATACAATAAAATTAAACCAATTCGGGTTTCTTTGCTCTTA:1 + chr3R 26254064 3' - jockey 4704 1 58.42 TGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTTTCTGGGCGGTCTCTTTTTGTTTGCATTGGTAATGAGTTTACTTGG:1 - chr3R 32005847 3' + invader4 325 2 78.22 TTTAGACTTTAGGGTTCTGATGAAATGAAGAGAGGGCTTCCGGTCTACGATCTGGTTGGTCAGCCTGTCGCCTTCTCCGTTGCCAGGATGAACTAATACAA:1 + chr3R 23063228 3' - Idefix 391 2 64.36 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGTTCAAAGGCTATGTTC:1 - chr3L 13060313 3' + 412 469 2 55.45 GATATNAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAGTGGCTAGGAACAT:1 - chr2R 12457925 3' - roo 8702 2 62.38 AGCGCAGCGGCAGAGGCACGGACAGCCTCTGCAGCTGTCAGGTTCGATCGGGTTGTCCGGGGGAGCTTCGCGGGGTATTCAAATGCAGAAAAG:1 + chr3L 23436537 3' + invader4 89 2 61.29 TACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCGAGCGAGATGATGGCTATCTTGGCTCACACATTATCA:1 - chr3L 8712852 3' - opus 205 2 67.33 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCAAGAATATTTAAATAAATATAATATGGATA:1 + chr2L 7850119 3' + 412 7501 2 72.28 ATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATATTTGTCAGTTCTATTCTGTAAGGT:1 - chr2L 17784616 3' - gypsy10 23 2 52.48 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGA:1 + chr3L 12888305 3' - mdg1 7055 2 62.38 GAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTACTGTCTGGGACTGCAGAGAATGTTGCTGCTGGGGCTTGGCAGGCGATATGGG:1 - chr3R 16343108 3' - F-element 324 1 58.59 TGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGCGGTATCCTGCCGAAAGAGTTACATACGTGTTTTGTTTTGCGATTGAGGCATAGATTTGAAA:1 + chr2R 10828285 3' - 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chr2R 9575014 3' - invader4 467 1 63.37 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTCGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAA:1 + chr3R 10147876 3' + roo 9019 2 76.24 GGGCCCACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCGGTTCCTCACATACTAGGGTCGCGCATTGTAACCATGATCCAACAACATAGGTCCCGCCGATCTCCGTCT:1 - chr2R 2950513 3' - G5A 2555 1 56.44 GCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGCGGATTGGTTGTCACAGTTGTAGAACATTAAAGAAAGGGTAGTAACTACAGGCT:1 - chr3R 17533516 3' - hobo 2676 1 57.43 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCTATTAAGGTTCCTGAGATCTTATACGGGCGGACAGAGTCGAGTCGGCTATTGATCCTGATCACAAA:1 + chr2L 21738001 3' - roo 8673 2 44.55 AATTTNCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCG:1 - chr2L 12815048 3' + hopper 1375 1 62.38 GATGANGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTTGCTTGTCTGTGTGTTGGTTTCGCAGCCATTGTTTTTTGTACGCGAATGT:1 - chr2R 5800824 3' + flea 4732 1 52.48 TTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATTGCAAGCAGTTCAAATACTGGGAT:1 + chr3R 4970592 3' + diver 6078 2 73.49 ACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTCAGTATATTCGTGGCAATAGGATTCCCGGCATGATTCACACAATAATTTCCT:1 - chr2L 8338420 3' + Cr1a 4003 1 63.37 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGG:2 + chr3L 9907430 3' + jockey 4966 1 47.52 AAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCCCTTAACTTCTCGAGTTCTAAGCCGACACAATGCACAA:1 + chr3R 25442476 3' + gypsy4 451 1 56.82 TTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTTGAATTTAGGTAAAGTTAGTGGATAATTTCGGATATATCTCATACGGAGCTCCTCTTGGTGTTTCTTGTTG:1 - chr3R 24681995 3' - I-element 5003 1 53.47 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCTGGAGTCAGCGAAAGAGATGGCAG:1 + chr3R 6622499 3' + P-element 2801 1 21.78 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTG:1 + chr2L 8565522 3' - blood 36 2 61.39 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAAGTGCAGGCCATAATAAATTGCTAGCAATCGCATTTCCGTTTCTTTATACGCTTCGATTACGAT:1 + chr3R 29470874 3' + hopper 1408 2 68.00 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCC:1 - chr2L 3632145 3' - P-element 34 1 48.51 GTAAAGCGGAAAGACCGTGAACTAACGGAACCGCCCTAGTACTTATACTCGATCCGGATGTCCTGTCGTCGACCTGCGCCTCCTTGATCTCAGCCCGGCAG:1 - chr3R 2451653 3' + gypsy8 4719 2 64.36 AAATATGCTGAGTTTGCCGGCTATGTAGCGACGTCCAGCATTATGCTTACTTTGCAGAATGCCCTTGCTGTCCCCAAAATTGCTGTTGTTAGGCCTCTTTT:1 + chrX 7198778 3' - Gypsy6A_LTR 95 1 71.29 ACACACACACACACACACATATAATAATAAATAAAATGCTTATGCGAAAAAAAAAGAAATCCAAGAAGAGACCCAAAAACCAAAAAAAAAAAG:1 - chr2L 5235011 3' + accord 7029 4 78.49 GGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCACACACATGTTAGCCCACTCACTTACACCCGCTCACACATACGCCCACACACTCGCACATCTCACG:1 + chr3R 11389176 3' - Porto1 440 1 68.37 GCGTGNGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCACGCACAAGGGCGTGGCAGTCTGCGCCAGTGTCTGAAACAAAGCCAAGCCATAAAAATAAATA:1 + chr2R 18031903 3' - Tirant 8119 2 63.37 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTTTTTTTATAATTCAATATTTTTGTTTTTCTTTAAATTA:1 + chr2R 330898 3' - 1360 47 1 66.34 GTGCCAATTGATCAAACATAATATTTGCGCGGTTTAAGAGCTGGAAGTTCCTAAGTTTACCATTAACCTTTTTATTGATATTATTTTGTTTCGCTTT:1 - chr4 45680 3' - 1360 260 1 75.26 ATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACCCCCAATCTCCAAACACTTGGAATTTACTACACTTATTCGATATGCTACG:1 - chr2R 12722021 3' + Doc2-element 438 1 70.30 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGCCCCAACAGGTGCCAGGACTCGTCGTGTTGGCTTGATTGATGATGTCCTTGGGAAATGGCCAAACAGTATGAAATACA:1 - chr3L 10079256 3' - accord 7026 2 53.00 TTCAATAAATAAGCAAAACATTGAAAAAAAAACGTGGTAACATTAACATTATTACATATTATATTGAAGCATCTTACATGCGCGACTTGTGCATGTGAATA:1 + chrX 11629145 3' + Doc3-element 4712 1 73.27 TATTCCAGTTGACTACTTTTAATTAATCTCACAATAATTTTTTCTTTTTTTTTTGCTCTTGCCACTTGAGACGCACAGGTCTCGCTGCCATTTAGGGCCAT:1 + chr3L 10512605 3' + Cr1a 3974 1 62.38 GGAGGTGGTTTGATTATTATTTCATCAAGTGTGTCCTTGAATGGCAGCATTATAGGCATTATGGGCAATCAAAGTCGGCAAACTGTCATTAGTGCCGACAG:1 + chrX 7793136 3' - Juan 318 1 68.32 TACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACACACACGCACACTTATGTCGCACGTCAAAGAAAATTAGTGAGTGAAGGGAATCCTTGGGTCATATTGCTCC:1 - chr3L 10013956 3' + hopper 943 1 76.24 TTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAGGCGAACACATCGATGAATACCAGGAACAATCGTAAAAACCAACCACCCACCCAACC:1 - chr3L 16401940 3' + Juan 89 1 64.29 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAAGGTAAGCCCA:1 + chr2R 24628845 3' - mdg1 7053 2 64.36 TTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTATATTTTCCCTCTGTTTTCACTGCACTTCAAGATCCATTGCCAGCGATAAGATCAACAGGCTAACAATGGAACCCTC:1 - chr3L 14956748 3' - transib2 2431 1 72.28 TCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTTGTTTATCGGTGAGCAAACATTTT:1 - chr3L 12352578 3' - G2 3031 2 76.24 CAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACATGGGGTTCTAAGAGTTGGAGGAAGATTGCAAAATTCCAATGCAGAATTTAATGTTAAACATCCAATCATTTTAG:1 + chr3R 19446958 3' + roo 8594 1 74.26 TTATTATTATTATTATTATTATCATACTTGTTAGTTGACTTTACGGCCCGTCCGCCGGGCTCATCCGTCCGGCCCGGTTAAATAATTGTAATTTATGGCAT:1 + chrX 18989139 3' - mdg1 38 8 67.33 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAG:1 - chr2L 17210280 3' + jockey 4960 1 59.00 GTATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGTAAACATTCTACGGAAATCTTTTCAAGGAAATACATTTCCCACTA:1 - chr3L 3421542 3' + Gypsy12A_LTR 2059 3 58.42 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTATAAGGGATGATACTTCCTGATATGGAAATGAATGTTTTTT:1 - chr2R 14341773 3' - opus 7145 4 61.39 ATTGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGGGATTTTATTAAAGCTGCATTTTTAACAAACAA:1 + chr3R 11119879 3' - 297 18 2 56.12 TTCTTTTCTTCTTGCTTGTTTGCGACAAATCTCGTTGCGCTTTTACAATCAC:1 + chr2R 24133333 3' - mdg3 5092 1 84.62 GCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGTCAGGTAATAAAATTAACCGGTG:1 + chr3R 4601413 3' + opus 497 2 78.22 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATGGTATCTCAAGACATCCATCATATCCACCATC:1 - chr2R 16980462 3' + copia 249 1 72.28 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTAT:1 + chr2R 20744232 3' + roo 9047 1 54.46 CTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATTAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAA:1 + chr3L 25232869 3' - accord2 14 2 62.38 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTG:1 + chr3R 27775149 3' + roo 9037 1 60.61 TAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTAT:1 - chr3R 6769712 3' - mdg1 7082 2 56.44 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTGCATACGCG:1 - chr3L 8713073 3' + opus 7482 2 60.40 TATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAA:1 + chr3R 12047496 3' - Stalker2 7266 2 61.39 TACTGTAAATTTGAAAAAGCGGACGGTGGTTCGATTGCTTATCGAAGTGGCAGG:1 - chrX 21478596 3' + X-element 4609 1 66.67 TGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 5334 1 60.40 GTGATTTGTGGAGTAGTTTACACAAATAAACTCACTCTTATGCAATTTTTGGCACGCAATGTTTGCTTTTGTTTACTTGGCTACCCGACTTCCATCACTC:1 - chr3R 16508706 3' + Cr1a 152 1 60.00 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAAT:1 - chr3R 13225478 3' - hobo 12 1 67.33 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGTGACCAGCAGCGCAAGCAATATGATCTCCTCGAGCAGTGGCACTACCACTACAATCAGCAGCAGCACT:1 + chr3R 29100525 3' - opus 39 4 74.26 GTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTACCCAAGTTCTTTTGCCTTCTCCCAATTATTGGCATCGAAAGCAAAGAAATTCATTTTAAAT:1 + chr3R 27776626 3' - roo 8816 2 64.36 TTAAAAGTGCAAAAAATATTTAAACAAAAATAAGATACCGCGTAAAACCGACCTCCTAATACTTTCTTTTGCGCATTTTAGTATCCAATCCTGTTGGCTAG:1 - chr3R 23724716 3' + NOF 3895 1 73.27 TGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAATTTTCCTAGTGTGTCTGTGTAGTTTTGGCCCAATTCTAG:1 - chr3R 20982303 3' + invader4 2623 1 64.44 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTATTTGCGGT:2 + chr2R 19943974 3' - 412 39 2 64.36 GATTTTTCCGTTATTTTTGGCTCTTTGCGGCTGCCAAAAACAGAAAAGAGCACACACACACCCACATACAGCCAGTGCTTAATTCGAATCGTGTAATTTAT:1 + chrX 12784225 3' + S-element 281 1 82.18 ATTCAAAAATACAAAGTTAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCCTGTGTCGAAGACCTGGCCCAATCTGGGCGAAATTTCATTAAAGTTCAAGTGAAACATTCTT:1 - chrX 12175191 3' + X-element 172 1 68.32 CTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTTATCTTGTGCCCCGCAGAATGCAGTCGCATTCCGACGTTAAATATTTT:1 + chrX 12217112 3' - Stalker 6827 2 52.48 TGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGATTAGTACGTGGCCCATGTGCCGCCAATGC:1 + chr3L 4120083 3' - P-element 105 1 34.65 ATTTGTAGAAAATATTTGCAATAAACAGCACGCGTCGAAAGAAAAAGCTGCAATCAAATGCGGAAAATCTTGTTTTATACTCTGCATTGCGCGGAAATTAC:1 - chr3L 7410507 3' + looper1 158 1 74.26 CTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTG:1 + chr3R 29331895 3' - G6 50 1 75.26 AAACGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTACCAAATAAACCAAAGAGGTCAGTGATGTTGATTTATGCTACCCGGCAAAATATT:1 + chr2R 11773833 3' + invader2 146 2 67.33 TGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTGTTCTTCTACTTTGAAATCATAAATTTAAGTTAAACGAAATTAAAACACAGTCATTA:1 + chr3R 7472002 3' + X-element 4429 1 61.39 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTTCTTCTGCTCCTTGGTCAGCAGCAAGA:1 - chr2L 12949191 3' + 412 7533 2 63.37 CGAAATCAAGTTCAAATTGCTTCACAGGCGACCGTATATGTGTACATCAAACTTCAATAGATGGCAAATGAAGAAAAAAATGAAGCGAATGAAGTGGTGGG:1 + chrX 4054676 3' - accord2 7238 1 51.49 ATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGGTTTTGTTGCTACCTTAGCATTAAACATGGACTGCAGGCAGCGACGTCTTAGC:1 + chrX 10936623 3' - Doc 4561 1 56.44 GAGTATAATTTGAAATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTCCTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTGATTGATGATATTACATTTTCAACTCATG:1 + chrX 10114519 3' - hopper 1158 2 56.44 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCACACACAACCATACCGCCACCGCCACCAACGACAACCCCAACAACAACGACAACAAC:1 - chr3R 25399064 3' + hobo 2923 1 60.20 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGACTTCGCTTTCCG:1 + chrX 2799724 3' - Tirant 8113 2 75.25 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTC:2 + chr3R 17321772 3' - Stalker2 7289 2 64.36 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAAGTCAGTAGATCGTTCCTA:1 - chr3R 4600058 3' + HMS-Beagle 7011 2 62.38 ACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGCTAGTCACGTGTTTATTAAATGGGTTTATTTCTCCGAATCGGAAGGTTTTGT:1 + chr3L 7233654 3' - Ivk 5364 1 56.44 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAGTGGGAACTGCGGATGAAGATCGTAGCCGATAAGAGCCCAGCCGTGTTT:1 + chr3R 23048507 3' + mdg1 395 2 52.48 ACTATNCTACCTATCATAATAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACAGCTAAT:1 - chr2L 22121345 3' + I-element 5344 1 66.34 TAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGGGTTGGCAGGTTCGTCAATGCAATT:1 + chr2L 16202153 3' - hobo 2673 1 75.25 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCAT:1 + chr3L 17587840 3' + roo 9032 1 65.35 CGTTGGAGAAAGTATGGCATTGATTTCTATCTTGGCAGCGTTCATTTATTTGTTTTTCCGCTTCGTTTTTGAGCAGAATTTTTATGCGAATTTTATTACTT:1 + chr2R 20725779 3' - G5 4362 1 67.33 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAGTGACTG:1 + chr2R 17345964 3' - jockey 16 1 70.30 ATGCACTCTGCATACACATGTATATGTATATAATATCCCATACCCTTACCTTTAACTAACCATAAACAACCCCCAAGCCCTGTGTAAGTCCTCCCCATCAA:1 + chr2R 4580200 3' + Stalker2 7489 2 68.32 AGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTGTATCTTTTAAAATTCTCGATATTTACTACATTTAAACACCCC:1 + chr4 306434 3' - 1360 413 1 57.43 CGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCTACTGCACACGGTCAAAAAGTGTAAAAACAAATATAAAAATACAATCAACCATGGCAACCGAAGAA:1 - chr2R 4467383 3' + F-element 485 1 73.96 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAACATCATCGTAAAAAATACTCAAGGTAGCAAGCTGCATATTTCATTTTTTATATTGCTGAAGTGAAAAC:1 - chr3R 16611371 3' + jockey 4971 1 51.49 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATTCTATAACTAACTTTGATTTTATACACCGTTTTTCTATACCTTAA:1 - chrX 15391934 3' + 1360 3361 1 59.41 CTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGCGATCCATCCACTCAAGAGGGATCACTGGGAGAAATGTCTTTAAATTAAGGCCTTTTTAGTTTATGTAAG:1 + chr3R 10533306 3' + Quasimodo 6970 2 55.45 GTCCGAATGTGGAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGGCCATTGTATACCGGCTTTCTTTAGGTTCCGTTCGGAAGGTATTGAC:1 - chr2R 12247405 3' + aurora-element 4098 1 67.33 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGATGAAAT:1 + chr3R 20149800 3' + 1360 3381 2 71.29 TTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTAT:1 + chrX 22824221 3' + Gypsy12A_LTR 2246 1 47.52 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAA:1 - chr2R 7861671 3' + roo 9032 1 68.32 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTTACTCTAGTCCGAGGGGCAGCACCACCCACAGAGACAACCTACCCGCCACCAACAACCACA:1 - chr3R 15150079 3' - jockey 4751 1 53.26 CCTCCCGGACAACAGTCAAACCCTCAGACGCCTGCAGAGGAAACATCCCCTAGATCTCCCCACACAATGGAAGTGTGCTGTGATAGCAAGGCAAACCGAAG:1 + chr3L 23595209 3' + G-element 4137 1 64.36 TTTTTATAATATCATTTGGTATTTATTTTCAAACAATTCAACAAATGATTCACTTTTATTTTTTCTGTGTTTAGCCACACTGATATGCATTAAAAAATTTG:1 - chr2L 21151679 3' - HB 1539 1 60.40 TTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGACTATGTTGTTTTCTCGTCAGTTGGCATATAATTGTTTAATGGCCCTTATAATGCTACATTTAGCA:1 + chr2L 14935470 3' + Idefix 209 2 71.29 GTTATTTACGTTAAGGAAATCTCTTATTGAGTAATTTATGCCTTCTACGACATAAGGGGGTACAAGGGGTACACTTGAAAAAATAATAGCAACTTAAGTGA:1 - chr2R 10154689 3' - Circe 7015 1 67.33 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGCAAGTTGTATAGTTGTAAAGTATAGAATAATTTCAAAAATTTATCAATATTAGGA:1 + chr2L 19266593 3' - F-element 36 1 50.50 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTTTCCAC:1 + chr2R 14675604 3' - roo 41 2 69.31 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTA:1 - chr2L 2078453 3' - I-element 46 1 74.26 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTCAACTGCGTGTGCAAAACTGATGATGCTGTTCGCCTTTGTCAACTTGTTTGATTAAAAAAGGA:1 + chr2R 14408553 3' - hobo 13 1 64.36 CATTTTTTTATTTTTTTTTTTGGCAATCGTTTTTCATTG:1 - chr3R 25634649 3' + hopper 142 2 87.18 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTACCTCAAAATATTAAAGTTCTTAACAATTTGTAAGTTTAATGGGT:3 - chrX 21204948 3' + mdg1 389 2 57.43 GAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGAAACTATGCCGCGTAGG:1 + chr2L 1615498 3' - G3 344 1 51.49 AGCCTAAAAGATATTATGGATTCTCTTCCTTAATTATAGTGTATAAAAATGTACCGTGGAGAGATTATGCTATATTTCCCATCCGTTGGTTATTATTTCTT:1 - chrX 5870701 3' - G5A 2766 1 72.28 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGTTGTAAAATCTGTGGG:2 - chr2L 6888570 3' - jockey 9 1 76.24 TAATANTAATATAATAATAATATTATAATTGGAATAATATAATCCAATTGAGAATATTACACATATTTATCTTTTTTACTGAAACAGTCTCAAATTATTAA:1 + chr3R 11210020 3' + invader3 5050 5 58.42 CATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAATGAAGCAGAAAATGGCGCCCAAAACTAAATAAACGAAGCATGAAGAGATATCCAGTCGGAAGCGGCACT:1 + chr3R 27859481 3' + hopper 1381 1 74.26 ATAAGNAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACA:1 - chr2L 6999270 3' - Ivk 46 1 67.33 ACGATGTCATCCCTGCCAACCATCCATCTGGCAGAGCGCGAGGAGGAGAAGCCATGCTCACCAGAGGAGTGGCAATCCGCTCCTGCCATGGCGACTAGCAA:1 - chr3R 6678862 3' + G2 415 1 64.36 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTG:1 - chr2R 14778454 3' - mdg1 7085 2 71.00 CAGCAACATTGAAAAAATACATCACATGAAAGACTATATTCATTCGATCCTATCCTCTTAATTTAGGGCAAAAGAAATAGCAATGCAGAGCTTTAAAGAAA:1 - chr2L 21641062 3' + Doc4-element 2637 1 79.21 CTAAAGTTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATTCGAGTGTGTGTGTGTTCGTTTGTGAGCGTGTGTGTGCGGATGCGACTGCTGTTTGGGCCAAATGGC:1 + chr3L 13549084 3' - hobo 2674 1 67.33 TCTCCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACATAAAGAAAGCCAAACTTAGCCGGGGGCATCGCATTCAGACTCCTCG:1 + chr2R 11171045 3' + 1360 3173 1 55.45 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCCAAGTCGGGGACCGAAGGCCATGCGCTGA:1 + chr2R 5804560 3' - P-element 5 2 75.25 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTGGAGTTTC:1 - chr3R 10751610 3' + hopper 1413 2 74.75 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCC:1 + chrX 2776141 3' + 297 347 2 75.25 TACGAGTCCGGTCAGCCTTAAACTGCAACAAAAACCTGCACTCTAAATCTCTCTGTAAAGTGGAACGGTCGTTTGGTCAAGGGATGTCCGCTAACGGTGGC:1 - chr2R 22718434 3' + Rt1a 61 1 61.39 CTTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTATAATTCGCATCGGAACATGCAAAGATAAATAAGGTAACAAAATTGCTT:1 + chr2L 23188898 3' - 1360 3062 1 54.46 CGAATTGAACTCATTAAGTGTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCA:1 + chr2R 5019433 3' + rooA 342 2 59.41 ATTGGAAGTATTTATGGCCTCTGCTCCATACAAGCGGAACCACTGTGCAAACAGTGCCTAACTCATTAATTTTGATTT:1 + chr3L 25322744 3' + Transib5 2955 1 58.97 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACAC:1 - chr2R 14778423 3' - mdg1 7055 2 63.37 TCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGAACTGTTTTGGTGGGGGA:1 - chr2R 14675510 3' + roo 411 1 80.20 CAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCAGACATTGACTTTGATGTCTACAAGGAATTTGAGTAGGTGTCTCTCCATCTCTGATCAC:1 - chr3L 23979444 3' + F-element 304 1 58.42 TTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTG:2 - chr2L 17210255 3' + jockey 4984 1 70.30 TACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTATTCAAGTGCCAAGGGTTAAGGGGGAGGGGATGATAGGGGTCTGGGAGTA:1 - chrX 7564435 3' + I-element 4983 1 50.50 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAA:1 + chr3R 29288772 3' - BS 5021 1 49.50 TATTATTTTCATATAATACAATGATGCTTTTTTATTGTAGCCGATGTAGCTGCCAAGTCCGAAAATTTGTGTGTAACCTTATAAACCTAATTTTGTCTTGG:1 + chr2L 21215718 3' - TART-C 407 2 66.34 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTT:1 + chr3L 18337694 3' - Juan 4070 1 69.31 TAATAAAGTTGCCAAGCAAATGGATTCCAAAATACTTTTGCTAAAGGTAGTAGCACAATATTGAGAGCGATGCAAGTATATGTAA:1 + chr2R 18484700 3' + frogger 2440 1 77.65 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGTGCAACAATTTAGATACGGATACATCCCGTTGC:2 - chr3R 9131732 3' + roo 403 1 73.27 CTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTAGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGATGCAAAATAACTTTTATTATAGTTTAATTTTCAGATAATC:1 - chr3R 11031377 3' + 1360 3211 1 61.39 GTGGGTGGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAAATTTTAAGCTTAGAAAGGAAGCTGAAAAAATTAGTTCGTCGCCAGCAAAAACGTTGGT:1 - chr2R 25095313 3' + HB 351 1 66.34 ATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTTGGAGGGAAACATTTGATTTGAAGTGTTTTTCGGGCACCTGCTCAACTTGAACTTCAAT:1 + chrX 3026407 3' - G2 3042 1 53.47 CCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAATTTTGAATCCAT:1 + chr2R 5840713 3' - Ivk 9 1 70.30 ACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTTC:1 - chr2L 22084473 3' + copia 227 1 50.50 CACACACACACACACACATCCACTCCTCTGACCTCAGCGA:1 - chr3R 29709916 3' + accord 186 2 75.00 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCT:1 - chr3L 7205550 3' - Doc 52 1 67.33 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGATCAGTGTGAAATTTTGGAGAGCGAGTTAAAATAAATTCA:1 - chr3L 682415 3' - P-element 35 1 44.55 TCTCTGCTAAGAGTGCTGGCTAATCGTAGTTGGGATGTAAGAAATCCCCAACCG:1 + chr3L 24264858 3' + baggins 141 1 68.52 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGG:1 + chr3R 13225568 3' + hobo 2911 1 51.49 TTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAAAGTGATGTGTGCGGCATGTCTTGATTTGCATAAGCTTCGGCATTGCATACTCATTCCCTCTT:1 - chr3R 11120417 3' + 297 475 1 63.37 AGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTTTACATTTACATTAAGTCAAATGACTTGGGTAAAGTCACGCCGACGAACTGGCAGTGTGGAAAA:1 + chr2R 15370715 3' - 1360 3332 1 61.39 ATTTGTTTATTGAAATAGATACTTTTGTTTTTCGGGAGTTGAGCTGGAATTGTATTTACTTTTATTAATTCTCTTTTGTTTTTTAAATTTAGATTTATAAT:1 - chr2R 8675595 3' - Idefix 7108 2 72.28 TTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGAATAAAGAGCAATCGCTCATAAAGCGGAACTCGAGCCACTTATTGTACAGTAATAGA:1 + chr3L 1858668 3' + springer 131 2 68.32 GCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAATACTTAAAACAGAGAAAGAAGCAAAAGGCAGAGGCAC:1 - chr2R 1654425 3' + Juan 4176 1 64.36 CAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTCGAGAGTGTGTAGGATTCTGCGGTAAGAGTCAGGGTTCCGATGCAGAAGGTGTGACAAGCGGAAAGTTA:1 + chr2R 24483718 3' - I-element 5192 1 73.27 TATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTATCAAAATATCTTTTACTTTAGCATTACGGCGAATGGACCATTTGGAGGAAGTTGT:1 + chr3L 23278228 3' - invader2 4731 1 61.39 ATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACCGAAAGTGTTTCTAGCAAAAAAGCCCCATGCCAAAACCAAGACACACACACACACACACAC:3 - chr3R 9418244 3' + Tabor 7312 2 66.34 TATTTTTATAATGTAGGTAAATGTCCACATTTTTGCAGCTGTAAGTGATATTTGACGCTAAAGTATACCATTTTAAATTTATACATATGTATTTTGCCGAT:1 - chrX 23039456 3' - mariner2 818 1 67.33 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGTTTTGAGCTTAAGTCACCTTTTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATAT:1 - chrX 4292834 3' + S-element 1701 1 62.38 ATATTCTTGATCATGATCATTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCACCAGTTGCGCGCCCAGTCTCGTCAGCCGGAAACAGCAGCACTGGTAAATTGGAT:1 + chrX 502121 3' + INE-1 84 1 62.00 GTCGAGTGTTTGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCA:1 + chr3R 29331897 3' - G6 1 1 56.00 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTATTCATGTGAGGACTTACAACTATGTCTCATATTTCGAGGGGTACCTTAAGTGTTGGCGACAACG:1 + chr3L 25841701 3' - BS 5026 1 75.25 GTGCACTGAATTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAAC:1 - chr3R 11999239 3' - P-element 52 1 37.62 GGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGGACGTGGAACTACCGACTCCGCCAGTTATCTTTCAACGTAGGTCCGGGTGTTTGAGTAGTAAAGATTTGATCCCAAGAG:1 + chr3R 1851745 3' + Cr1a 4424 1 78.22 ATACGATAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCGGTGGAA:1 + chr2L 285749 3' + P-element 2853 1 45.54 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGAT:1 + chrX 15082454 3' - mdg1 7068 2 53.47 TAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGACAGGAGTTGGACTCTTTGATTAACTACACTTTACGAAAATGTTTATTTCCATCTTAG:1 - chr3R 30283495 3' - invader2 5101 2 66.34 CTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTAATTATTTAACTTCGCAGGCAATACGTGAATTTTAACCGCAAACATATAAACATAAAAACGCTAA:1 + chr3R 24248382 3' + copia 4694 1 68.32 GTGCAATCATCTGCACTTCTCCGCCTCTAACGGCCACTGCTTCGCTGCCGACGCCCATACTTGATTGCTAGGGACTGGGAAACGCATTAATTGCGAACAG:1 - chr3L 13877630 3' + HMS-Beagle2 124 2 46.00 TCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCCACATTGATATAAAATTGAGAAAAATTCAATAAGCTTACCATAGCAGACCAATAGCATTGATGTAATAT:1 - chrX 15852794 3' - Cr1a 4171 1 64.36 CAACTTTGGAGAAGATGGACTGGCAGACCCCCCCGCCCACAATTCCACAGTTACAAGTTCCACTCCTTTCCAATTCCCTTCTGGGCGGCAGCAGGACAACT:1 + chr3R 16774750 3' + G6 308 1 66.34 TTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAGGTCACAGGATGTTCCTGGATGTGCGAGGGTGGCTGACTTTTTGTCTGCCGTTT:1 + chr3R 14348451 3' - G2 3062 1 51.49 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGAACTTTCGCTCGTGACAGGTTTGTTTTGCTCTTGATAAATTACCTTGCCAC:1 - chr2L 3143229 3' - FB 25 1 55.45 CGCAAGCTGAGTACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTTATTTTTGAAATTTATGTGACCCGTTTGAATCGTTTCTTGTTGCGTCCAGCGTGCCGAA:1 - chr3R 2463165 3' - 1360 410 1 57.43 ACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTGCTTAGATAAAGAAAGGATTTAAGGCGAAA:1 - chr3L 18344892 3' - F-element 4471 1 70.30 GAGTGNTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTA:1 - chr3R 13225480 3' - hobo 14 1 65.35 TTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTTTATTTCGTTATAACCAAGTTTTATTTTGAATGAACTTCCTTGCTTTTGGTTGATT:1 + chr2L 21850842 3' + S-element 4 2 62.38 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCTTTCGCCTCTCTCTTCTT:1 + chr2L 4160219 3' + Tirant 391 2 69.31 TGTGGGCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGGAGTGAGTGTGAAGATAGCCGCTCGTCGTAAATTTTGTACAATTTGAACTCGAAAGTCGTTAAATGTAACA:1 - chr2L 3435434 3' - roo 8865 2 74.26 GCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACATANNNAAAGACAAAAAGAGTAAAGTTTTGATTGAAATTTTCAC:1 - chr3R 8444043 3' + F-element 373 1 56.25 AATCGTTTCTTCGCGACTCCTAGATATGTTTGCACGCCTTTTCTCTATACATATATGATCAGAGGTTTTCTGTTAGTAGTAGAGTGAATGGAGAAATTGTA:1 - chr3R 3636094 3' - Tc1-2 1237 1 66.34 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGTGATTTGATGAGCTAGGAAACCGGATAGGATAAAAAGTGATCTTTGAAATGAATACAGGG:1 + chr3R 26952662 3' - jockey 4770 1 57.45 ACGGGCTTTAGTATAGCTTTTTTTTTTATTTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGCCATTTTATGCTGTGACATTTCAGCGCTGGCTTCGCCGGCGACAAAA:1 + chr3R 27410597 3' - G4 3406 1 53.47 AAAAAAAGAAGAAAAAAAATAAACGAAAAGTAACCACCGCTAATGATCTATGAAGTGCAAGTGTCTGTACTTTTACTTATTCCAAAGGAGCAATTACCGCA:1 - chr3L 7556418 3' + gypsy7 5009 3 67.33 AAAGATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAATCCTAGGGCCGTCTCTAACTAATTAGGTAATACGGCAAACGATCCGTAATAAAAGTAATTAAGCTATCGATAACA:1 - chrX 11092315 3' + Doc2-element 4627 1 61.39 TTTTATACATATGTTTCAAATTTCAAATGATGATTAACTATTAACTTTTACATAGTGCAAATATGACTTTAAATTACTTAATATGCGCTATGCTTAATTCG:1 - chrX 5113255 3' + copia 4665 1 64.36 ATATTATCTGGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCAGGAAGGGAAAGGGAA:1 - chr3L 1695465 3' - I-element 5122 1 81.19 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACAGTATGTGTGCGTTTCGCTTGGCTATTAAATTTCCAGTTCAATGATTAACGAAATTTATGTTT:1 + chrX 992107 3' + hobo 2928 1 68.32 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATG:1 + chr3R 12539547 3' - roo 8708 2 74.49 ACTCTAATGACAAATATTCTAATATAAAGTAATTTTTGAAATGAATCTTCGTTTTTTTTTTCTTTGTATCTGCTTTAAGCTGTTAAGAATGCTTACAAGAT:1 + chr2R 17347168 3' - 1360 398 1 70.30 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTGACATTCG:1 - chr2R 16988188 3' - opus 28 4 55.45 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTTT:1 - chr3L 7075875 3' + roo 9042 1 56.44 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTGTTG:1 - chr2L 18212124 3' - 412 24 2 54.55 ATTTTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTTGTGTTCCATTATACTCTCTATGTTACTTCCTCCTTCTATTTTTTATAAGCATTTTTCAATCGCATTTCGATGCG:1 - chr2L 4021178 3' + hopper 143 16 78.22 TTCGTGTCTCAAGATATGACGATATGGCAATAAACAGTTTTCATATTTTTATCGGTATTTCGGTTAAGAGGCGAACGTGGTGCAATCATAGGGATAGGGAA:1 + chr3R 13227330 3' + 1360 482 1 56.44 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATACATATATTTAAATATATTTAATTTAAATTCGACACTTTTTATCAAAATATTTG:2 - chr2L 22079396 3' + flea 232 2 61.39 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAG:1 + chr2R 14713642 3' - P-element 49 1 32.67 CCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTATATACCCTTCGTATGTAAAGGAGAATCCCCAACCTAACCCGTACCCATAGCTATAGTT:1 - chr3R 26842781 3' - opus 13 2 64.36 GTCGANTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTATGTGTAGCACACTTTTA:1 + chr2L 1625727 3' - hobo 17 1 62.38 ATAATCAAATAAATATTAATTGTTGTAATTATAAAGAATTTGACTGGGTGTTAATTCTTTCTATGCCATTATTGAGACTTTCAATAACGTGGTTTAGAGTG:1 - chr2L 22674052 3' + jockey 4826 1 65.35 ATTAGTCTAGCATAAGACGTAAACAAGTTTCAATTAGTGCAGCAGTCTGCTGCCACATGCCCCGCAAAACTTGCAACAAATTATATTAAATGAGGAAGCCA:1 - chr2L 16627932 3' - 3S18 187 2 74.26 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAG:1 - chr2R 12457938 3' - roo 8711 2 75.26 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTATCCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTAGGCTGTCTGTGCGCGTTGGACTA:1 - chr3R 4051903 3' - 1360 51 1 69.31 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGGGGGTCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCC:1 - chr3R 19989243 3' + hobo 2925 1 57.73 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGG:1 + chr3R 4544082 3' + flea 4997 2 63.37 TAGATNACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTAAGTAA:1 + chrX 22945351 3' - BS 31 1 51.49 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTCTCGTTGACTATTAGGCTCCTGGTGTTCCTGCTGGTCCTTTCGTCTCTTCCGCCATTGAACGG:1 - chr2L 22078263 3' - flea 42 2 73.68 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAGTGGTCGGCAACTGACGGTGCCACTGTAAACGTGACGCTAGAGGGGAATTGAATTCAAGGA:1 - chr3R 28425055 3' - F-element 24 1 44.00 AGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAACACCACTCCTGTCACAAGACACCTACCAAAGACTTTTGACCTAAAGTCACTTAAAAGTGACTTAAA:1 + chr2L 22278466 3' + X-element 4314 1 68.32 AATACTAATGCACACCGCATTTTTCTGTACGCTTCCTCCTTCCAACACAAATAGTTATTTGAGACTCATACATACGTATGTACAACCACATCAACGAGACA:1 + chr2L 23173896 3' - invader1 186 2 69.31 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATGAGGCCATTTA:1 - chr2L 6388269 3' + copia 249 1 61.39 TTTTTTTTTTTGATTAAATAAATAAAAAT:1 - chr2L 4630905 3' - transib2 2634 1 82.76 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAAGTTTATTAAAAGATTCAT:1 + chr2L 7488942 3' + roo 393 1 60.40 AGTCGNGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATAA:1 - chr3L 13589429 3' - hobo 18 1 61.39 CTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGCAATTTGCTTGTTGTGTTGACAGCTGGCCTGAGGTTTCATGCTT:1 - chr3R 6600794 3' - Quasimodo 7078 2 56.44 TGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGAGTCAGTGGGCTTGCGTGCCACTGTGTGTGTGTGTGGTGTACACACTCACTCCTAGCATTAAACTGTTATACGCCTAAA:1 + chrX 12642774 3' - Quasimodo 36 2 50.50 CTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATTTGCGCACCCGACGCAGGGCGGACATAGTGGCGAAATCGAACTAATGCACACCGGAAGCGGAAATGAAA:1 + chr2L 7460593 3' + opus 7199 2 72.28 TCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCCCGTTGCCCTTCGATTCCGTTAGATTTGCCGAAATCTCCGTCGAGGGGCACTGGTCGCCTGGCAAGCA:1 + chrX 1557371 3' + diver 369 2 70.30 TGAGATAAGATAACAAACACATAGTCTTAAGCACGCCATGTGCGGGTGGCTGTACCCATACAGTCACAGATGCAGGGCCAAATGCCTTGAGTGGCATTTTA:1 + chrX 13512344 3' + Stalker3T 212 1 57.43 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGG:1 - chr3L 17168848 3' - mdg1 7079 2 65.35 GTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATACCCAAAGTAAATACCCTCGTGGTAATTATATATTTAATAAAAACAAGAGGAATCGTTA:1 - chr2L 22079558 3' - gtwin 6932 2 61.39 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGGCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTAC:1 - chr2R 23571645 3' + roo 9026 1 69.31 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTAAGAG:1 - chr2R 12082333 3' + mdg1 7432 2 52.48 TATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGTTTGTTGTCGCGCATTTAGGAATTAT:1 - chr2L 4998421 3' - TART-B 10199 1 75.25 TTATGTATTTAGTTTATTTTATTTAAATAAACTCATATGCGTTTTCCTTTCTTGAGTCAAATACAATCGATATTTCTAATCATTACTAACCAATTCACTTA:1 + chr3L 8332994 3' - F-element 91 1 60.40 CTAATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGCCATCGCCCAAATTGTTGGCTATCTAGCTTTCTTATAAGCCTCACCATAAAATGAAAGAGAGAACGACAGA:1 - chr2R 4711359 3' - Tc1-2 216 1 69.31 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAAGTGCAGGCCATAATAAATTGCTA:1 + chr3R 29470834 3' - hopper 48 1 74.26 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAATAAGCACTTAAATTATTAAAAACTGCTACATATCAGAAATCATA:1 + chr3L 8614566 3' - opus 27 4 59.41 GAGCAAAATCAAAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGTACCAAAAAAAACTCGACTCCTCTGGCAAGAAAAAAAAGGGGAGAAACGATGCACG:1 - chr3L 13949947 3' + HMS-Beagle 325 1 45.54 TTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAAGAAATAAAAGCAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACAAAGAGGCGGATGGAAAACCGAGGGGCTG:1 - chrX 10695229 3' + F-element 4633 1 66.67 ATGCANATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAACTTCTTTTCAAATAGAATCTCTTTATTAATATATCA:1 - chr2L 10746635 3' - pogo 35 1 65.35 TACTACACCCCCCCACTTTTTTTGGTGGTGGGTGGGGGAATGG:1 + chr3L 1181557 3' - blood 6997 1 65.12 ATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTAGTAAGATCTAATTATGCAATAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGCGCTCTGATTATTCTGCCCA:1 - chr2R 5271304 3' - Cr1a 4315 1 76.24 AACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCACCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGTTAGTGCGAGTGCGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTT:1 + chr2R 1461346 3' - INE-1 580 1 85.15 GCCACTTGCAACATGTATGTCCGGCCGGCGTTGCAGGTGGTTTGTTCCCGCGCCTATAAAAATCGGTGGAGCCAACAAATCACGAACATTTTTTTTCCAGG:1 + chr3L 11360972 3' - TAHRE 9992 1 49.50 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCT:1 + chrX 2799710 3' - Tirant 19 2 62.00 CTTATGTTCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCTATGTGCCTGCTTGGGCGCATCCATTTTTGACCAGGCTAACGAAAGTGTGAGTGGG:1 + chr3L 16828498 3' - Tom1 178 1 55.45 TGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATGCATATCCAAGTATAGCTATAAAATAAATCGTGTATG:1 - chrX 22444439 3' - Juan 4063 1 62.38 CGGGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGAT:1 + chr3R 11999276 3' - P-element 53 1 26.73 TTTCGTACTTATCTTATAATTTGTTCGCTGACTGGGGACAATTACCATGAAATTGCTGCCTCTTGCTCTGGCTCCCGTTGTGCTGATGTTGTGGCTG:1 + chr2L 11803815 3' - GATE 327 1 74.23 GTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTAACCTTTAAACACGATCACACATGCTCGAGCTA:1 + chr2L 23390244 3' - P-element 42 1 38.61 TGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAGAAACGTGATTGCAGCATAAAAGCGTCATTTACATGCC:1 - chr2R 24232424 3' + hobo 2566 1 60.42 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCA:1 + chr3L 12888292 3' - mdg1 30 2 53.47 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATGAGGC:1 - chr2L 6388275 3' + copia 243 1 67.33 TGATTGGGTATAACTTAGCGTCAATACATTGTGACAGGGAACGGGTGGAGAGCAAGGAGCAGAGGGTCAGACCCAAGTCCACATCCCATGCCTCACCCAAT:1 + chr3L 6080217 3' + Stalker 6890 4 73.27 TCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGTGTATTG:1 + chr3L 25842193 3' - 1360 75 1 55.56 GTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATACGCGGAGTTGAAACTCATT:1 - chr3R 25537937 3' + Bica 4826 1 81.19 TAAATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTTTTGTTTATCGAGCGGGAATGCAAAGTGCCAGTCAGCAGGCGCAACAAGTTGGCCAGTTTAGTCTT:1 + chr3R 23834196 3' - Bica 4653 1 74.26 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAAACACACATCTCACAAATGTACAACTGCAAATATAAATAATATAATTATTAATGGTGAGCTTCACAGTGTTC:1 - chr2L 1341074 3' - blood 7179 2 79.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGTGCAACAATTTAGATACGGATACATCCCGT:2 - chr3R 9131735 3' + roo 400 1 70.30 GGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATTATATGTATGT:1 - chr3R 7168549 3' - flea 14 2 65.35 ACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCG:1 + chr2R 3341943 3' + Copia1_DM 4131 1 62.38 GCCCANAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATTTGTCCAGCACTTAAT:1 - chr3R 27981656 3' - roo 26 2 55.45 CGGGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAGAA:1 + chr2L 14612122 3' + roo 399 1 69.31 ACAAGTTTATAGTGTGAACAACCAGGAATCCACATTATCAGTGTAATTTAGGGCTCTTTTAAGATAGTGAAAGTAGTGGTCATAGTGGTTATAGATTTGAT:1 + chr3R 7177690 3' + rooA 367 1 67.33 CATATAAACAAATAGATGTAATTAAAAAAATACGTTTTCTATGCCTAATAATAAATTATTGAACTTCAATTTGAGATCTGGGAGAAAAAGTTTGGTAAGCT:1 + chr3L 2724871 3' - S2 102 1 76.24 AAATAATATATTATTAAAAAAAAAAATAGGAAAAACGAACTTAGTTGGTATGCAACGTTGAATCCCATTTACACCTGTATTTCTGGAATGTACATATAAGC:1 + chr2L 19461148 3' - hopper 164 2 71.29 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACT:1 + chr3R 10277267 3' - Doc 62 1 78.22 GAGCAGCCAAAAATTACTTGTTAGCTATGTGATAGAATGGTGCATACTACGGCTACTACTTATGGCACAATAATGATTTACATTGCACAGCTAATGCGTTT:1 - chr3L 13346777 3' + Cr1a 492 1 62.38 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGAGCGGCTGGGAGGACATATGTGGATGC:1 + chr3L 13548844 3' + hobo 2923 1 59.42 AAGACCGGATGTGCCAACAACAACATCGACGACGCTGAGTCAGCATTTCGCTTTAGCGAAAGCGATAGACAAGGGACACAGCTCAGCAGTTGGGCAAACAT:1 - chr3R 23900585 3' + gypsy10 52 2 74.26 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCA:1 + chrX 13546701 3' + roo 9036 1 61.39 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTACTGAGAAGACATCTCACAAAGCTATTGAACGAATGTGCTGGTCTGCATAAGTCAATGCAAATGATAATGGG:1 - chr3L 2023048 3' - 412 7085 2 68.32 AGTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCTCTACGTGGACATTACGAAAACCAAGAATGTCGAGGGCCTGGGTCC:1 + chr3R 14126471 3' + R1A1-element 5082 1 52.48 GCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGAACACGGAACTTGTAGCCGGTTTCCGGCATTAAGCCACTAACAGTATAGCGTGTACA:1 - chr2L 16660297 3' + 1360 429 1 61.39 TTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTT:1 + chr2L 3388117 3' - F-element 333 1 70.30 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAACATGAGGTCCTACTTTAGCATAGACTACTGCAGCATATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTG:1 - chr3R 19446127 3' - 297 6587 2 74.26 AGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTACGTGCCAAAATTTATGCTTATTAAAAAAAATCAGCAGTGCGCATCGAAAAGTCAACTTGGTTGACATCGCCGGC:1 - chr3L 9183509 3' + Quasimodo 7071 2 79.21 AGGCTACACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCGCTCCAAAAAGCATGCTACGAAAATGTCGCTGTTT:1 + chr2L 315231 3' + Tirant 391 2 71.00 GAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTCTTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATTAATTAGTCACGGGAGTGGACGGTATTTGATGGTCGAGGA:1 + chr3L 24074062 3' - 1360 3270 1 60.40 ATGCACCTGAATCCAAGAGAAACGTAAAGCTTTTTCTCTTCACGATACGAATCCTAAAGTCACACGAAGAGTCAACAGAACCGAACAGATTGAGGAGCAGA:1 + chr3L 18096572 3' + Idefix 348 2 60.40 TTGAAGTGTGTGCTGTTGCACTGTCTTGTTAGAACCAAGTGTCCCACAACAATAGAAATAAAAGAGTTAGATCGCTACTGGGAAGTGGAAGAAGAAGAAAA:1 + chr3R 19444919 3' - mariner2 470 1 57.43 AATAANGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTAAAACCCTCCCCCAACCGTTT:1 - chr3R 10734248 3' - pogo 39 1 67.33 GTTTAACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGGTTGGGCGTGGTGAGTTAGTTTATAATTATCTTGGTCATTATTTATATATATTCTTGTGTCAAGCCATTTTG:1 + chr2L 16837767 3' - HeT-A 5943 1 57.43 CACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTAGCTGGCCCATAATTTCCAGTTACAAAAGGCCACAAAGGAAACGAA:1 + chr2R 17626072 3' - mdg1 481 1 54.46 TCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATATAC:1 + chr2R 5924410 3' + jockey 4729 1 40.59 CAAAGCAGCCGCGTGGTAAATGAAACCAGAGCTGGTGGCGATGGGCTTACTCTGCAGACGTGCTAAGACCAAGGGCGGCAAGTAAACGCCAAAAATTACAT:1 - chr3R 31826851 3' + hopper 1236 1 69.31 CGGGATTTCAAAAAAACCCATATAAAATCACAAGGGGATAGATCGTGAGAGCGTGCTGGCCATTCCAAATAGGCATCGGATAGGAATTTGTGCTGTTTGCA:1 + chrX 14864390 3' - mariner2 603 1 69.31 GGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTTCCTGCCCCTAGAG:1 + chr2R 20816500 3' - hobo 29 1 53.47 TTTTTAATGTTTTTTTTTTAATAATTTAATTTAATTACCGCATATAAATTAATGTTTTAATTATTTAAATCCTGCTAGTTCATGTTATGATTTCATTTTGA:1 + chr3R 28013480 3' - P-element 2691 1 29.70 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACC:1 + chrX 20620595 3' + pogo 2065 1 71.28 TTCCAACTGCAGTAGTGTTATTATTTTAACCGCAACTGTACTTGAATTAATTCTTAAATACTATTCACTTTTAGTATCCGGGAAATGTGTTAAAGGCGGAC:1 + chr2R 14209905 3' - Tc1 19 1 53.47 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGT:1 + chr2R 23584797 3' - HMS-Beagle 46 2 72.28 TTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATT:1 - chr2R 8557308 3' + TAHRE 83 1 60.61 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAA:1 + chr3R 16400227 3' - blood 7038 2 52.48 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTA:1 + chrX 3305196 3' - transib2 44 1 68.32 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCG:1 - chr2R 19943930 3' + 412 443 2 69.31 GAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATAAAGTTAGGCTTAAAGCATCTTCAATATCCTTAAACTTTAGTTCGTTA:1 - chr3R 17321707 3' + Stalker2 376 2 51.49 GTGATGTTATCGTAAGATACCTGCCGAGAATATCAACTCAAATGACCATTATTAGCGGTAAATAAACTCAACTTGCAGCCGGAAAAGCAAA:1 - chr2L 15378015 3' + Chouto 159 1 68.13 GCACGCTTCAGAATCCGGCTCTAGCTCTTTGGCGTCCCAGGGTGAGATGTCATGTGGGCTTTGCGGGGTCAACTCCTCGCCCTCCGCTGCCTGGTCATCA:1 - chrX 19813007 3' - Gypsy12A_LTR 2204 1 72.00 GAGGACACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCTTTGCCAGTTACAGCTAGGGAAGCATAAAAAACGACG:1 - chrX 970673 3' - Doc 499 1 60.87 TTATTNATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTA:1 + chr2R 12082401 3' - mdg1 7076 2 65.35 TGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGCGGCCATAGAGAAGAGCAAAACCCTGAGAGTATTAAA:1 + chr3R 30572732 3' + invader4 3039 2 63.37 TCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACACGGACCGGCAATCC:1 + chrX 13546723 3' + roo 395 1 66.34 CAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAGATTACATGTTTTTGAGCACTATATATACCCTTTTTTTTATTTTAACGCAACTATATGCATTACAGCTAAC:1 + chr3R 7517177 3' - roo 8819 2 58.42 CGAAGGTATTTGGGAGATACATACATGCAAATTGAAATGATTTCTGTAAAAGCAAAACCTGAAATTCACAAACCGAATTATAATGACAAAACCAAAAAGGT:1 - chr3R 18479768 3' - accord2 7542 2 79.21 CAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACCGACTGGCGGCTGCCGTAACAACAAACGAACAAATACTGAG:1 - chr3L 15500941 3' + I-element 135 1 58.16 TTTTTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGTTAACTAATTGCGTGGCATTCTTCGCTTACGGGATATGTCTTCATATAGAAAAAA:1 - chr2R 17334723 3' - I-element 5264 1 60.40 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCT:1 + chrX 8491455 3' + P-element 2840 1 32.67 CAATTTGTCTTAATATTTTTGATTGGTAGCGTTGAAGAATCTCAATATTTGAGTTGCAGGCATACAGCCAAAAAATTCAGCTTAAGTCAGACGCAAATCGC:1 - chrX 19356253 3' - G4 3498 1 59.41 ACAATNGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACA:1 + chr2R 4483270 3' - Ivk 31 1 51.49 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAACGAAATAGAGCGGAAAAGCTCGAAAAAATTATGCAAATCCATTTGGATTTGA:1 + chrX 3335104 3' - jockey 32 1 54.46 TCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAATTAGATATCAGCTTTCTACGCAAGGAAAACAAGTCGTAACAAAATAATTCGATTTAGTCAGTTTG:1 + chr2L 3136615 3' + BS 5083 1 35.64 TTTAAATATATTCGTGTTCATTTGTGAACAACATGTGTTTGTAGCTAAAAAGACGCAAAACTTCCGTTTTGGAATCGAACATTTTT:1 - chrX 2753819 3' - roo 9 2 65.12 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAGTGTCGAAATTGT:1 - chr3L 17168813 3' - mdg1 6 2 74.26 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTATATAGGGTGGTCCTTTGCTGGCTGGGTGATAGGAAACTGGACACAACC:2 + chr3L 5201563 3' + 297 374 2 58.42 TATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGCCTTTGAAGTGGTCATTTTAATGAGTGGTG:1 + chr2L 6146767 3' + I-element 258 1 74.26 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTAACAATACATTTTTAAGTTGTAC:1 + chr2L 13136832 3' + roo 408 1 78.22 GTAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACA:1 - chr2L 3951600 3' + Transpac 265 2 72.00 CCTGGGCAGCAACTCACTAATAAAATCCCCACAACAAGCTGCCAATGGTAGGAACAAAAAAAACCAAAAAAGAATGCGGCGCAAGACCAGAAGTAA:1 + chr2R 18320752 3' + accord 493 2 53.12 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGG:1 + chrX 13508760 3' + roo 9043 1 56.44 AAAAATTTATTTATATACAAATGAAAGCTGTTTTAAAGGGAGATGGATGGGTGGCATTGTGTCGGACAAGATTGTCGCCAAGATGGGCATTCGATCACGCG:1 + chrX 6754784 3' - transib4 2463 1 54.46 ATAAACGTCGAGATCTCAGAAACAAAAAAAAGATAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCCAGAAAAATAGACGCTGTTCTGGGCATTTGCTTTTTAAC:1 + chrX 22695639 3' + INE-1 139 1 60.40 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGCAGTTCATACGCTTAACAAGACATT:2 + chr2L 3951682 3' - Transpac 6 2 73.27 TATAATTTACTTTTTTTTAGGAAAAACTTTATGAGTATTATGAGTTTGTTTTAAATCCTATTTGTTACGTTGTTACGTTTAGTTTCTCAATTCGTAAAATG:1 + chr3L 12118137 3' - I-element 5161 1 58.42 AAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCA:1 + chr2R 2879457 3' + Stalker 6963 4 54.46 TGAATTTTCAAAATCGTTTCTTCGCGACTTTTAGATAAAGGCGCATCGCAAGTTTGTCGACCCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGACCACAAAAC:1 + chr2R 1764016 3' - Tc1-2 1248 1 66.67 GTAACGGGTATCTGATATTCGGGGAATTTTACTATAGCACTCTCTCTTGTTTTCATTATAACGCCACAAAAAATAATGAGCCGTTTATGTTTACATGAGCA:1 - chr3R 18516783 3' + INE-1 551 1 74.26 ATTATGCAAGATAAAGACCCTTCTACCTGCGCCCTACTTCTGTATTTTAAAGTCATATCTGGAAGCCCACACTTCAAAATCAATTAGCAGAAGCTTTTTTC:1 - chr3R 22146661 3' + Helena 438 1 64.36 ACAATGTAGTTAAAAAAAAGGACACTGGGAAATTTGGAAAATTAAAAGAAACCTGGGGGAAGGACGACGCTCCAGGAGATTGGCGGTGTCTTTCTGCCCTT:1 - 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chr2L 17722743 3' - blood 5 2 71.29 TCTTAAAACTAACTTAAAAATGTATCTAAAATCTTTGATAATATAACTCAAAGCGTATCTTTTGATAATTGCAAGAATATGCTGGATACCAATGCTGAGT:1 - chr3R 14387984 3' - pogo 1886 1 87.00 GGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAAGTCATCTTAGTATTAATTAACAATATATTTGAATCTGTTTTCTAATCAAATGT:1 + chr2R 7036590 3' + F-element 4368 1 54.46 TAACTGACCACAAAACAGATCAAATACGGAATTCGAGTGTGAGTTCTTTTGCAAAATGCACTTAATGGATTTCGGTGTGCTGGTCAAAAGTGGGCGTGGCC:1 - chrX 12154428 3' - BS 278 1 75.25 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTC:1 - chr2R 13650125 3' + mdg1 7409 2 74.26 TATCAGATTCCCGTTACTCAGCTAGTGTCATTGCGGTGCTAGAAATGTCGACATAAGGAGAAAATGTTTGTGGATAATTTTAAAGCGATTTTTTTACATTC:1 - chr3R 4577820 3' - INE-1 546 1 72.28 TAGTTNTGTTATTATTTTTGTAAATAAAAAATGCATAATGACGGTTAGCGGTTTATTTTATCTGCTAATTTCTTTTAAGAAGAGATAACGATTGAAAGCCG:1 - chrX 18133543 3' + S2 1574 2 64.36 AGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAACCACCAGACGCGAACTATATTGAGCTGCTCCGCTTCCGTGT:1 - chrX 22985041 3' - Doc2-element 4428 1 59.76 TTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCCTACT:1 + chr2L 19285912 3' + F-element 4639 1 64.95 TAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTGTCCAGATCAGCTGCAGTCTGCTTG:1 + chrX 2982755 3' + 17.6 256 2 75.25 AACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAAGGGCGTCCATACACACACTAAGCCTTCACAGTCGTGCAAAGGTCTTTGAGGTTAGATAAGAACTAAAAACCA:1 + chr2L 21681688 3' + Tirant 8315 2 71.29 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATGTCGCAAAAATAAAGCCTTGCATAGCTCAAGGCGCAGCGGTA:1 + chr3R 17454498 3' - jockey 4677 1 70.30 GCCTTCGCGTCAACTAATATATCACTTTTCCCGAGATTCGTTTAGTCCTGATATACGTTTTTGAGATGTGTCAAAATGTTTTTTATGTCTTGGTAAAGTTT:1 + chr3L 25968190 3' - Gypsy12A_LTR 468 1 79.21 AAGAATAATAAGAATAATATTATTTAATCTTAACCTGTAGCACACCAACTGTTAGCATATATTTTTTTCAAAAAGTCCTTTCTCCTAAAGCTCTTCTCTAC:1 + chr3L 17177268 3' + mdg1 7072 2 67.33 TGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGCTGCCACGCCCCCTTCGGCAGCCCGCCCAGCTGTCATTCGGCGATATATGTGCACAGATATATGT:2 + chr3R 28228169 3' - Doc3-element 4614 1 66.34 CCATTCAAGACGGTGTCAAGTTCTTTAGCTACTAGCACAGCAATCACGATATCTACTGCATAGCGAAAAACAAAAATAACACAAAAAATTCCCGATATACA:1 - chrX 11778647 3' + Doc3-element 458 1 59.41 CCTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATCAAAACGGAGAGAGATATTTAATTTCTGTTTTTATTTGCCATTCGACGGAGCCACTCAGCAGTACGGAGAGGCA:1 + chr3R 16534332 3' + Transib-N1_DM 20 1 57.43 ATTGTTGCCAGGTTATAAAACTTGAGCAGCCAAAAATGACTTGTTGGCTATGTGATAGAATGGTACTTCTTCTTTATTCGCTCTAAGCATTTTGTTTTATT:1 - chr3L 5890868 3' + Cr1a 469 1 63.37 AGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGAGGGTAGAAAAGAACTGAATACAAGTTAAAGGAAACGTTTGTTTATTTTCACGAGAAGATATTTAT:1 + chrX 21656246 3' + 412 44 2 71.29 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACACCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATATC:1 - chr2R 18950740 3' + roo 9040 1 57.43 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGAGTCCGCAAATCCGTGAAT:1 - chr3R 19446124 3' - 297 3 2 73.27 TGTGTGTGTGTGTATGTTCGTGTGGGAGAGTTATGACAGCAGGACACAAAAAACTTGAGATTTATGTGCGCTCTTCTAGTCTTAACTCTCAACTTCCAGCA:1 - chr3L 9309860 3' - accord 7026 2 58.42 CAGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGT:1 + chr3R 1977621 3' + micropia 425 2 51.49 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTT:1 - chr2R 8086892 3' + 1360 3340 1 81.19 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCC:1 + chr2L 16201555 3' + hobo 2900 1 68.54 GCCTGCAGAGGAGCAGAGACGAGGTGAAACACCTCCTAAAAACAGATGCCATCAACTCAACTACGGTACGGGAAACCAGAGAACTAGCGGAAGAACACCTT:1 - chr3R 6777330 3' + G2 301 1 52.48 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAATATTGTTCCAATCGACTTGGCGGACCATCAGACACTTGCTATCGTCC:1 - chr3L 14956552 3' + transib2 2769 1 53.54 AACTACTGGTATGACTGAGGATTTCGCGAAATTTCATAATACGATATGATATGATATGAGAATGATATGATATGAGAATGATATGATATGATATTATATGA:1 + chrX 17366914 3' - transib2 2673 1 76.24 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACTTCTATAACT:1 - chr3L 2019643 3' - 412 19 2 58.42 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAA:1 - chrX 21668962 3' + mdg1 375 2 71.29 GTAAGNTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTTTTGG:1 - chr2L 285678 3' - P-element 25 1 54.46 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGGAGAATTCAGTTTATAAGTCCTTCTCGACCGCAA:1 - chr2L 6083683 3' + 3S18 6101 2 73.27 TGATATTTTTTATATTTAAAATTTATATTCTGTTCATAAGAAGTTTTAAGTGTGACGGAAGTTAAATGTAGTTTAAGGACGCTTACATAATTTCCATTTCA:2 + chr2L 17104654 3' - transib4 2577 1 27.72 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGAGTCCTTTCCGCGCTCGCTCTCGCGCTCTCTCT:1 - chr2R 5804457 3' - P-element 22 1 57.43 ACAATATAATAATAATAATTAAATACTTTTAGATTAAATAGAACTTATTCATTAAAGTTTAAACTTTAATGACCTTGTAAAATTCTATATCGCTCAGTTTC:1 - chr2R 6122715 3' - Burdock 456 1 68.32 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATAGGAGGTGCTAAAG:1 - chr2R 5953066 3' - pogo 7 1 72.28 ATTTAATGTAATTATATTTATGTTGTTTCTTATTCGTTTAATTTTATAAAAATATTAGCTATCAAAAATATATATTCGGGAATAAATATTTACATCAACAT:1 + chr3L 10471880 3' - diver2 450 1 86.14 GGGATCTTTGAGTGATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCTGCACACACACACACACACACACAAGCCCGTGCGAGGTCTCTTATAAATTTTAG:1 + chr3R 9114414 3' + baggins 5375 1 56.44 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCGGCGGCGGACCAAAAACCA:1 - chr3R 13793734 3' + 1360 3328 1 63.64 CACAACCACTCTTCAAAGTTGCAGCGGTATGCAAATGAATGCCATCGAAGTGGTACTGTTTGCCCAGGACCTATTTGCGGAGTGCGGGGGGAGGAAGGAAG:1 - chr3R 31174819 3' + Fw3 314 1 79.21 CCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAAAAAGTAAGGAAAAGCGAGAGGGGAAAGTCAAGGAAG:1 + chrX 6148662 3' + accord 6984 2 63.37 CAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATA:1 + chr3L 23839697 3' - McClintock 41 2 71.29 AAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAAAATGTAAAAAAAAATCGGGTGTTACTTCAATAAAAAATGGTTAAATAAAAAACAGGTACCCGTTACT:1 - chr2L 7232144 3' - roo 9008 2 60.40 AGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATAAAGACTGTTGACAAAAATGAGGCTGACCAGGAGCCAAAAAG:1 + chr3R 19448132 3' - Juan 465 1 58.42 TAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTTGTT:3 - chrX 15355065 3' - X-element 4695 1 52.48 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACCAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAAC:1 + chr3R 10277281 3' - Doc 47 1 63.00 TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGGGTGGGGACTTAAACATTTTGGCAACTTGCAAATCATGCAATACTTTGGTATTATTCTTGGGACTTTCACA:1 - chr3L 23786221 3' + Quasimodo 256 2 70.30 AAAAGTTGAAGTCTTTAATAAGTTTCATTACTAAATCACATGTATTTGGTCCTACACTTTGCGTGGGTGGTGTGCTGGCCAAAAGTAAACGAGCTTACAAC:1 - chr3R 20741535 3' + Helitron 280 1 59.41 CTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTAAGCAAATTACTAAGGGAATGGATGAGGGGTAG:1 - chrX 13770938 3' + jockey 4685 1 70.30 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCAAGGAAGAAATAAATATTTATATCGATATAAAAAAG:1 + chr2L 8308244 3' + P-element 2848 1 36.63 TGGGCTGCTGTGGAAGTTTGTTTGGTCTCCCCGTGGGCCAACTTTTAAGTCCCTTAAGTTGTTCCTTGCCTACCCTTCTGAAAAGATC:1 + chr3L 11837971 3' - G5A 2589 1 88.64 GTGTTNATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAAT:1 - chr3R 19989253 3' + hobo 2911 1 52.48 TAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGTAATGTAATTAGTTGAAAATGCATTATCTATAAAGATATATTTAAATCTATGAATCGTTTTAT:1 + chrX 21448855 3' - Doc 4563 1 61.39 GGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGAGCATGTGGAAACCTACAGCCTTAGTCCCACTCTCCACAAG:1 - chr2L 10353302 3' + F-element 4432 1 59.41 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGATACTGTCATTATTATTATAGATTTCCCAGCTTAGTTTTCGCTTTGCAGACTGCAATTAATTTTCTCGTTGTTCTACA:1 - chrX 751482 3' - I-element 8 1 72.28 TGTTGTTATTGTTATTATTATTATTGTTGTTGTTGTTATTATTATTATT:1 - chr2L 7231302 3' - mdg1 25 2 85.71 ACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTACACACGACAAGGCTTGATCATTGACTGTTAAATCAACTGCGCCACAAATGCCT:1 - chr2R 3783833 3' - 1360 465 1 53.47 AAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTGCGGCAGAAGCGTCACCTGCAACTGGAACATCAAAGAAATGTGTCAACTCAGACATGGTCTGTC:1 + chr2L 13337618 3' + flea 488 1 67.33 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTT:1 - chr3L 12103802 3' + roo 9025 2 74.26 CCCAAGGTTGTGAAGTGAAGTAATACACGATCGACACGTAGATAACGCAGAAAATAGCCTAAAAGAAACTGATTTAAACGGTATCAAAAAGTGGCGCCAAT:1 - chr2L 121048 3' - McClintock 6127 2 66.34 CTTTTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTT:1 - chr2R 5249847 3' + Tc3 236 1 66.34 ATGGGTCGCGGAAAGCACTGTACCGTCGAAAAAAGAAAATTTATTAAAAAAAAAAA:1 - chrX 14502754 3' + Tc1 359 1 82.14 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACCATTTTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGT:1 - chr3R 22476328 3' - hobo 30 1 51.49 TCAGGAATAGATCAAGAATGTACCCATGTTTATAGAGCAAAAGGAAAATTAGAAAAGTCTAAAGAAAAGCGCACGAAAAATTATGAAAAATGAAT:1 + chr3L 7843684 3' + mdg1 7362 2 78.95 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTCTTATTATTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTA:1 - chr2R 7418829 3' - Doc 48 1 67.33 TTGTGNTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTTTACAACAATTTTTGAAAAAGCAATACTAAGGTGAGAACTAAATAGTTACTCTATTCCTT:1 + chr2R 17718244 3' + 412 485 2 70.30 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCTG:1 - chr2L 12815048 3' + hopper 1375 1 63.37 TATATAGGTACAATTATTTGATTTTTGAGAATTACTCGACAGGGGCGGAACAGATAGTGTTGAGGGGAACGAAAGGGGCCGGCCGGAGCAGGGCCCGCTTC:1 + chr2L 18567094 3' - HeT-A 5972 1 70.30 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAACTATATTCGTAGCACATTATTAGTAA:1 + chr3R 19346989 3' - blood 6 2 73.27 CATATTCTTGATCAGGATCACTAGTCTAGCCATTTCCGTCGGTCCGTCCATTCATTTAAAGTTTATCACGCATCTTAGTATTCGTAAAAATCTATATTTTG:1 - chr2R 15003591 3' + INE-1 83 1 79.21 TATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGAATTTTTGACTCAGACCGCTCTCCGTCAGCTGGAAATCCCCAGGCACAGGCATTTCTACAGAGG:1 + chrX 18684979 3' + Cr1a 4197 1 57.43 GTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACAAGAGCGTGGACAAACAGACGATAATAATAATAA:1 + chr2L 21329570 3' - flea 4951 1 66.34 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATATTGTCCAATTCTTAGTTTCATATTGCATTTATTTCAGTTTAATTTAATGCT:1 - chr3L 9766331 3' - blood 21 2 59.41 AGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAAAACTCATAAAAACTGCTGAC:1 - chr3R 17843629 3' + roo 9062 1 62.92 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTACAGCAAATTCCTAGGCCTAATTTTCTTG:1 + chr3R 27430072 3' - pogo 44 1 70.30 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACATTTTT:1 - chr2L 6999265 3' - Ivk 41 1 63.37 CCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGGCTAAAATTAAACGCTTTTCATTGAGCAGCCGGTGCGGGAAATCTTTGGGAGCAAAAACCGAGAGCGTTCATCA:1 + chr3R 20556229 3' + Tirant 399 1 79.21 AACTAATTCTGGAATAGATTTTGGGTAATAAATAGATAATCGGGTGTTAACTTAATCCAAACTCCATTAGCATCAGTTCGAAGCTGGAAAACCATTCAATG:1 - chr3L 8062001 3' - S-element 466 1 64.36 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAAT:1 + chrX 868753 3' - jockey 4796 1 63.64 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCG:1 - chr3R 17495753 3' - Quasimodo 25 2 64.36 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGT:1 + chr3R 4544079 3' + flea 235 2 60.40 AAGAAGTAAACAGCGACTACATGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:2 - chr2L 20360645 3' - micropia 4983 2 57.43 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTTACAT:1 + chr3R 28645856 3' - F-element 32 1 53.47 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATATAGC:1 - chrX 21668918 3' + mdg1 419 2 76.24 TAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACTCTCTTGGAAACCGGTTGCTTCATTTGCCAC:1 + chr2R 8293653 3' - R1A1-element 5050 1 69.00 AAGTGNATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTT:1 - chr3L 9383504 3' + P-element 2860 1 52.48 GTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGTGTCTTATGCTTTTTCTAGGGTATCCAAGTGTCGCAGTAATCAGAGAAGGCAGTCCCAGAGTGGTGCTCTCCAG:1 - chr3L 21931944 3' - hopper 1112 1 77.23 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCCAAACGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGCATCAGCATAAAATATGGTAATCTTCAA:1 - chr2L 20133005 3' - flea 44 2 68.32 TGTGTCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTAGTCTAGTGTCTTTGGCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCA:1 - chr2R 3919667 3' - 1360 30 1 57.29 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTT:1 - chrX 3305159 3' + transib2 2772 1 75.25 TGGTTCATAAAACATAATATTTTATGGTTTATCTTCAAATGATTTATATACCTAGCATACTGAAACGTTAATTAATCACTGTTCTAGTACGCTTTTTGATG:1 - chrX 12500952 3' + hopper2 1096 1 86.14 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGATATATATTTGTTTTTCGACCCAGTGTGTATATCAGCAGAGC:1 + chr3L 6506877 3' - roo 8698 2 62.38 AATAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAAAAATAGAGAACAGCGAGTCCCGTGGATAAAAGCAATATCAAAGGTTGCCATTAGAC:1 + chr3R 25240079 3' + INE-1 550 1 71.08 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATAAGTGAACGAGGGTGTGGGAAAACGAAATG:1 + chrX 19116921 3' - opus 7042 4 71.29 GACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATATTTTATATTTTTATTTTATTTCACCGGACCAGCGTGCACATTTCCC:1 - chr2R 4830305 3' - 1360 7 2 76.24 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAAAACGCCGGCGGGCCACAACAAATCAAAAACACGACTACCCAAAGTGGG:1 + chrX 10561870 3' - hobo 27 1 52.48 TACAANATGACCATACATCATAGAAGACTGATAAAATCATTGATGAGGTGAAGGGTTCCAAGATCACAGGAACCAGCAAACATCATGTTGAAGAAGTTAAA:1 + chr2L 15027757 3' - Transib5 2778 1 66.34 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAAT:1 + chr3R 29288762 3' - BS 5031 1 56.44 GGTGTGGAGTAGCCGTTTAAGGCAATTTCGAGCAAGACTAATAAAAATGTAAGTCCCTCGCTAAAAAGAACCAATGCTTCTCAATGTGCAAAATGGCAAAT:1 - chr2L 22178702 3' + aurora-element 67 1 52.48 CATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCAATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCCCCACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAAC:1 - chr4 260886 3' - INE-1 254 1 62.38 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGATAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAATTCGTGCATGCGGATTTTCTT:1 - chr2L 13574220 3' + pogo 2053 1 75.25 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGGGAGTCGGCCGAAAAAAGGCTTATTCGACCAC:1 + chr3R 12539585 3' - roo 8673 2 67.33 AAATCNTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGGTTTTGATTATTCTTTCTAGGC:1 - chr3L 25272531 3' - 1360 21 1 63.37 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAAT:2 + chrX 11730328 3' - jockey 4792 1 61.39 CCCAAAATGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGAACACCCGCATCCTATGAGATTTGCACATTGATTTCGCTCCCTTTCGATGCGAAGTGTTTAGT:1 + chr2L 10526277 3' + ZAM 8103 2 62.38 CTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGATCAAGAGCGAGAACGGAGAGCTCTACATCGAACAGCTTCCAGAAAACCGAAAAGTGCCAATAAATATGGAAACGTTT:1 - 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Doc 24 1 49.50 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACAC:1 - chrX 18944964 3' - jockey 33 1 48.51 ATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGGTGCGGGAAATTAGTTTGATTCCTTGCCTTGAACGCATGCTTCATACGAGTTCCGTGTTCTATGGATTACCAGG:1 - chr2R 5952589 3' - I-element 5150 1 77.23 ACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTTCAAGAGACGTTCGATCGGTTGAGTTGTCGCAG:1 + chr3R 835716 3' + Bica 4877 1 72.28 TAGGGATTTATTCATACTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAACAAATGGAAAAATATCGCAACAAACAACCAAACCGAACCAAAAAACCGAAGCACAAAG:1 - chr3L 10706212 3' + Fw2 3676 1 67.33 TTTTAAGGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTCTTCCGGCTCCCGTGTCTTATTTTTTTTCCTCTTGATCTTGACGGG:1 + chr3R 31215056 3' + hopper 181 1 56.12 ATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCACCATAACAAGCAGAGATAACAAAGAGCGTAATTAAATGCGAGCTCAAAAGTGTTTATATAAATAAAAG:1 + chr2R 23785344 3' + Stalker 7113 4 69.31 TCAAAATCATATGTTTGATCAGCTGTTTGTTCAAGCAAACGCCAAGCGCCTGTGAAAATATGATTTTTGTTGCCATTTCGTGTTTTGCCACTTTGGAGGTC:1 + chr2L 7357108 3' + transib3 158 1 66.34 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTGGTTGACGATGGACGA:1 - 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BS 5023 1 51.49 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATCAGAGAGATAGTCTCTAGGAGAAAGACA:1 - chr2R 13585449 3' - Juan 4048 1 54.46 AAAAATGTATAAATAAAAACTTTACATAGAAGAATTCATAAAAATGTTATAACGAATTTAAATAAATGTTTTATAATTATTTATAAAGAATTAATGGCAAG:1 + chrX 23440133 3' + mariner2 791 1 90.10 CAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAGTTTCCCTGAAGCACCTATAACCTGCAATGTTTAGACAAATTTCCCACATACTTTC:1 - chr3R 19497885 3' + 1360 3301 1 60.40 TTCTTTTTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAGACGGGTTATACTGAATGCTTATGTGCGTAAGCAAAGAAACCGAACACG:1 - chr2L 22218188 3' - G3 12 1 57.00 TGCAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCT:1 - chr3R 11841099 3' + hobo 2553 1 76.24 GTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTGATATTGATTTTTCTTATTAATTATTAGCAATGTTTAGTCAGGAATAGAATTTTGAAAGCTTTCCATTTCGCGTGAT:1 + chr2L 7352337 3' - Stalker4 6875 2 59.41 GGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCCGCATATATTTCGTT:1 + chr2L 15955342 3' - Quasimodo 7 2 72.28 TGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTATTCCCATATAATAACTTAGTTTGATCCCTGCGCATAAAATTTAATGGTGGCCACTTGTGTTTGTCGTCTGTTC:1 + chr3L 6047545 3' - Tabor 487 1 80.20 AAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCC:1 + chr3R 20147567 3' + 1360 384 1 65.35 TGCATNCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTTAAAGTGCGATCATCGGCACTCTATATTTTGGCAAGTTACCCACTATTTGCTGAGCTGTATTTTGTTTAT:1 - chr3R 19447142 3' + HMS-Beagle2 6974 2 56.57 TTGGAGTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTATGGGGGGGAGGAGTTACCATAACAGCAAAAACCTTGTCTTTCATCACGAACTCATCTCTTCTC:1 - chr2L 23372720 3' - Idefix 342 2 67.33 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGATGCTGACTG:1 - chr3L 7205533 3' - Doc 35 1 50.50 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATAAAAAT:1 - chr3L 13589425 3' - hobo 14 1 65.35 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCTCA:1 + chr3R 11119896 3' - 297 6584 2 76.00 CAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCA:3 - chr2L 19479165 3' + R1A1-element 126 1 59.41 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACAATTTC:1 + chr3R 6735355 3' + copia 242 1 65.35 AGAACAATTCTGATGAATCCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGTTCTCAATAACTGGAAAATTACAGACTTTTGAACATTTGCTGCAC:1 + chr2R 741676 3' + BS 348 1 77.23 GTTTTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCAGCCATCAAGTGCAATATGCTGATAAGGCTGGAGAACGAAAATCCAGACGGGTTTTATGGCCAAA:1 - chrX 5005968 3' - Doc2-element 222 1 80.81 ATCAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAGTGCGAT:1 + chr3L 19377795 3' + roo 9039 1 56.44 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAATAAAATAAAAACGCTTACACAAACACCTCTAGTTTTAGTCAGTTTTAGTAC:1 - chr3R 18210325 3' + Juan 4183 1 56.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTAGCTGCATAGTCTATATGACCTCCGCCCCTTTTGCCCAAAAGTATGCAACA:1 - chr2L 3968987 3' - jockey 32 1 53.47 AGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGGCTTGAAATATATATATATCAGAGATACAT:1 + chr2R 8183294 3' + hopper 954 1 70.00 TGTAANATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCTAAGGCATGTCCGGCACAAGCACCAGCACCAGCAC:1 - chr3R 14374396 3' - Cr1a 4311 1 64.36 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTCAATCACTTGGTACACTTAAAAAAATAACCTTAAATATAGAGGCAAAAGAAAAATAAAATGTAAG:1 - chr3R 6622614 3' + P-element 2881 2 73.00 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCT:2 - chr3L 10143169 3' - 297 39 2 71.29 TTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTGGAAAAGAGAAATGTTTCATTTAAAGGCGAGTATTTTAAAGTACAAAGAACTATATATACTT:1 + chrX 15589983 3' - F-element 4419 1 64.36 AAAGTTACAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCTATAAAAAAAATAACTTTTAACACCTGTTTTATGTGCAAGCAGCACTCAAGCCCTGTCCGGA:1 + chr3R 31256035 3' + transib2 2778 1 63.37 TTCACNCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGTCG:1 - chr3R 8277931 3' + P-element 2831 1 21.78 TTATTTGCGCTGGTGCTTAATGAATTGTCCAGGGAATTCTTGCATACACATAAATCATGACTGCCATGGGTATGAAGAAGGAGCCCATGGCCGAGAAGATG:1 + chr3R 17754164 3' - G4 36 1 69.31 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGACAATGTAAATTTGTTTTAGAG:1 - chr2L 14612032 3' - roo 8697 2 61.39 CGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTATTTCTATTCTTTCTTTCTTTCCTTCTACAGAGGTTTCTGAGTGGGCCCA:1 + chr2L 14219860 3' + McClintock 160 2 67.33 CGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGAAACAACAAGAAAACCAATAATAAATGGAAAGCAAAAATATAGTATTTAAAAAGCGATTTCGCCTTGT:2 + chr3R 22802945 3' + flea 4835 1 71.29 CAACCAGCCCAGCGTTAAATTTGTTAGGCCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTTTTT:1 - chr3R 19445114 3' + Doc3-element 4591 1 71.29 TAGATTCGTTGAAAAGCATGTAACTTTTACTCTTTGTTGAAAATCTCGGCAAGAAAGTGTTCCAGCAGCAAGGTCAACAGGCCGGGCAGTTTTGACGTGCC:1 + chr2R 5081931 3' + INE-1 13 1 75.25 CAACGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCATCTATTAATTAGCTTATAGGGCCGA:1 + chr3L 17587864 3' + roo 396 1 65.31 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCCAATATATTTATAGCTTAATATCCCTTAACTTTTACTTCATCTTATTTGACAAAAATATATGTATT:1 + chr4 312759 3' + 1360 3335 1 71.00 ACGAAATCAAGTTCAAATATCTAAAGGATTATTCGAGCAAAATTCAATGACTATTATTTTATTACTACTCATAGTTATTAACTTCAGATACCTTATGAATA:1 + chr3L 16257986 3' - accord2 7239 1 57.43 GAATAAATAATATGGTTGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTC:1 + chr3R 10240177 3' + invader4 309 2 62.38 ATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCTGGTGCACCTGGCGTAATATGTTGCTTATGCTGCTCCTGGAATTCGTTCTATTATTTATGTTTCTGATTTAATTG:1 + chrX 3048178 3' - Ivk 157 1 75.25 TCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTGCCTAGCCCATGTTAATGAAGTGCTATGTGGTGAACCGAAGTGTTTTT:1 + chrX 4778057 3' - I-element 96 1 55.45 TGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGTCCGCGTTGGTTTTGCAGCTCAGTCAGCAGTTGCGCTAGCAGCTGAGCTGAGCTT:1 + chrX 13696658 3' - Doc 264 1 62.38 AAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATC:1 + chr3L 15099641 3' - G4 3810 1 40.59 CGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTATCGGCCTCTTTAAAAGATCGCTCACCTTGTATGTACACAGTCTATGGGATTTCCTACG:1 + chrX 20792616 3' - roo 9042 1 65.35 GGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTAGTGGTGCGGATGCCCCAACTTTCACCTACATACTTCCCAAGGC:1 - chr2L 17014321 3' - flea 4732 1 53.76 CCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGCAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTGAACACCAGTCCCCTTCCAATGGCAAGT:1 - chr3R 27503784 3' + F-element 4390 1 72.28 TAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGAATCGAGTCGCCAGTACAGGCAGTTAACAATAAAACCTTGGAA:1 + chr2R 5109802 3' + mdg3 5190 1 57.00 ATTCGCTCTTGGATACAAGTGCTTTATGGCTCTGTAATTTTATCTGGCTTTTAGTTTTCGCTCAACTGACAGTTGTCAAGGAATTGAGCTTTCGCGG:1 - chr3R 7375564 3' - Idefix 328 2 70.10 ATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGAGGTCACTGTCTGCAATGACAATCTTGTGCAAAACGCAATGGAATTCGTAAA:1 - chr3L 24335643 3' - baggins 5222 1 74.47 AAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCGGCTGCTGAGCTGGATGGGGGATTGAGAGTGCGAGTTGGGTGGAGGTTGGGGATTTTAG:1 - chr3L 13641527 3' - F-element 4548 1 56.12 ACTGANAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAATTGCCAACGTTGATACTTAATTGAAAATGTATTATTTCAGAGACAAATTTATTGT:1 - chr3R 16834018 3' - I-element 23 1 45.54 GGCTGGTTTGGACAACCCAAATACGTCACTATATGAATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTG:1 + chrX 3763239 3' - 297 6590 2 60.71 ATGGTTTCCAGAGAGCTCCGTTCCCTTGCATATTTAACGTGCTCTGCTTTTTCGATCCGTCCACTTTTTGGGGATGTTAGTGCACTGGGCGTGACCTGCAA:1 + chr3R 11862478 3' - Rt1c 5144 1 65.35 TTTTCGCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGCCGCCTGTCTGCCAAGTGCCATTTTTGATGTAACTAGAAATATTTGCAACCATATTATAAATAACTTTGA:1 - chrX 14723182 3' - Doc2-element 246 1 62.00 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGGCTAAAATTAAACGCTTTTCATTGAGCAGCCGGTGCGGGAAATCTTTGGGAGCAAAAACC:1 + chr3R 20556215 3' + Tirant 390 2 68.75 ATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGTGTGTCTGCGTGTGTGATGTGCTACAATAAACTTGCAAAGAACATTAATTGCAACTGCTAC:1 - chr2L 20967944 3' - accord 224 2 69.31 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGAAATGCAGCATACTTTTGGG:1 - chr3L 18500922 3' - hobo 5 1 72.28 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAACGGAAATGCCAGAC:1 + chr2R 17626583 3' + mdg1 417 2 72.16 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATGATTTCGAGGACCCAGATACT:1 + chrX 868774 3' - jockey 4777 1 61.39 GATCGCGGTCTTGCTCACCAATCCTTATGACGCAAAAGGTTGACCACAGCATGAAATCGAAGGATTGAAATCGCCATTATCATTTTCATTACAAACTTAGA:1 - chr3R 834184 3' + Doc3-element 378 1 73.27 ACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATGAATGAAAGGACACTCGAACTCCAGAAGAAGTGAT:1 + chr2L 17141818 3' + F-element 4363 1 65.35 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAAACTCACCAGCTCACACACACACACACATCGATAAACAAATTGCGCGAAAGGAGACAAT:1 - chr3R 28903652 3' - P-element 16 1 40.59 GAAAAAAAGAAAGGAAAAAAAAAAATGGAGTTCGTTGATATGATGATGATGAACGTTGATGAATGCCCTGCGCTTAAGCGCACTTAGCGGTCAACCATTGG:1 + chr3L 13893561 3' + Doc2-element 250 1 78.22 AATCANAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGG:1 - chr2L 22084499 3' + copia 201 2 75.25 CGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGCTGACCTTCCGCTTCCCGATGTCCATAAACAATGGACACAAAAGAAATCCGTTACGAATCCGGCGATCATCGATC:1 + chrX 10882735 3' + R1A1-element 393 1 77.23 AATTTGATTGTTTTTTTTTTGTGTGCTCAGTTTGATGAATACCAGCTTATAAGTTATAGCCTACATATTGAGATTAACACAATCCAAATAATTTGATTTTG:1 + chrX 11052429 3' - transib2 2644 1 48.51 GGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTCAGGAGAATCTTACTTATATAGCAGATCACACTGCACGAGTCTTGGAGGCTTTATTTTCGATCGGCGT:1 - chr2L 17443613 3' - G2 2877 1 73.27 AAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCA:2 - chr3R 9131766 3' + roo 9032 1 65.35 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCGTCATCGTAGAATAG:1 - chr2R 15474803 3' - roo 42 2 69.31 AAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTAAATTTAAACAGCACACATACACCCAAACACATACACACAGTGTTGAAGTGAAAAGCGAAGAGCTACAT:1 + chr2R 10945423 3' - transib2 3 1 76.24 ACTTACATAATCTGTGTGTTCGTGTGTGTTGTTGTGGGTTTCCTTAGTGGTGCGCGGCGGCTTAGTAGTTGTTGGCTTCGGCGTGGTTGTCGTAGTGGTGG:1 - chr3R 27290865 3' - gypsy3 433 1 52.48 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTTTCCACCACTTCTACGAATGGAGGATCGTCGATGAC:1 + chr2R 14675634 3' - roo 11 2 68.32 CGCTTGTCCTCGAGCGGTCATCATAAGGATGGGATGTGTTCACCACACCCTTCGGGGGCAGCTACGTGGAGTACAAGCCGTGGGAGCACGTGGCCGACTA:1 + chr3L 12129606 3' - HMS-Beagle 6758 1 66.00 CGTGCGCATTATAACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGCCAACTCCACTATTGCTGCACTCGGAATCGGAGTGGGAGTTCGTCTCCAGTCTCATGTACGCCG:1 - chr3L 3504916 3' + baggins 5118 1 65.00 TTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTCAATGAATCTTTCCAAGTAACTTAAA:1 - chrX 21292198 3' - rover 6908 1 80.00 ATAATAATAATAATAATAATAATTTTCAAATATTATTAATATTTTTCAACACCTCAAAGATGTAATTCAGTGTGGCGCTGACTGCGCAGTCGACGTCGGCG:1 + chr3R 5217176 3' + mdg1 7067 8 70.30 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGGTGGTGGGTTGCAG:1 - chr3R 8277890 3' + P-element 2872 1 62.38 ATCCGTTTGAAAAGTATGCCTCAACGGCAGAGGCACGCTCCTCACTATTTCAACGCATGATGGCCACCGAAAAGAAACTGCGCTCCGAGATCGAGGAGCTC:1 - chr3L 5791514 3' - mariner2 170 1 63.37 AATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATAAATTTGTGTGTTTTCTTGCCCTAGTGACACAAAAAAAAATAAATATGATAGCTTT:1 - chr3R 7449587 3' + roo 19 2 64.36 AGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAAAAGTGATGTGTGCGGCATGTCTTGATTTGCATAAGCTTCGGCATTGCATACTCATTCCCTCTTTATGCATAT:1 - chr3R 11120408 3' + 297 486 1 73.00 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGATAGGGAGGACATGAGGGCGGAGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAA:1 + chr2R 19209437 3' - jockey 4789 1 50.00 TTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAG:1 - chr2L 17210277 3' + jockey 4962 1 56.44 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACAT:1 + chr2R 17345915 3' - jockey 67 1 81.19 GATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGATATCAAGAGT:1 - chr3L 18337627 3' + Juan 4207 1 73.00 GTTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCTTTTATGCAAGAACTGAGGTTATATCTTTGATGATGATTGGTTATATTAATCCACATGTAGACCA:1 - chr2L 14325825 3' - hopper 23 1 64.36 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGAT:1 + chr2L 13319653 3' - hobo 22 1 56.44 TTTTTGCCAATCGGATCAACGACATTATAAGACAAGGCAATATCTTGCCGGATCATCAATTTGGATTTCGAAAGTGACGGCTTACGGCATTTATTGCCACG:1 - chrX 1498053 3' + Helena 233 1 73.27 TATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGCAATCTTGACTCTCTATCTCGTCTACCGCCCACATAAAAACGAAGGCAATAAACTGCAAATTTC:1 - chr3L 10708081 3' + Cr1a 4197 1 55.45 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGAAAAATTTCCGAAAATATACATATTT:1 + chrX 13761299 3' - pogo 47 1 74.26 GCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCCTTCCTTGCCCTTAATTCCCATTCCCGGAACAAAGGACACATTA:1 - chr2R 6251096 3' - blood 124 2 56.44 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGNNNNATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGGCCCCCTGC:1 - chr3R 6117221 3' - Tirant 14 2 60.00 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTGGCATTGTTCGGCTGTCGGGCAATGGGGGGTTAAGGGGTGCTTT:1 + chrX 20708855 3' + I-element 5323 1 56.44 GCAAACACTTGTTCCATGTTGCTGGGTTGCGGATCTTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGCTGGGATTGTCCTTTTGGTGTCTTCTCTGTATTCTCCTCC:1 - 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chr2R 3097214 3' - accord 259 2 68.32 CGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTCTGACGCCCACAAACACTAAATTATCAAGCTCACACTTTTCCAATTTTTTTTT:1 + chrX 5858215 3' - F-element 130 1 55.45 CTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGAAGCTTACGATATTGAGTAAA:1 + chr3R 26530960 3' - blood 7012 2 76.24 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTCGGTCCATAATTTTATGAAT:1 - chr2R 7032120 3' + mdg1 403 2 60.40 CATATGAGGCCAATGTGTGCACATCTTGTGCGATGTGTCTTACTAACTTAATGTCTCGACGAGCAACACCGAAGAAAATATTCTCAGATAATGGCACAAAT:1 - chr2R 4621647 3' + Bica 4846 1 77.23 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGGCT:1 - chr2R 7861643 3' + roo 397 1 68.32 GGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCATACGGA:1 + chr3L 18337737 3' - Juan 4027 1 76.24 ATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCATTCATGCCCAAAGATAGTTCAACCTACTGCAAAGTAGTGGATCAAA:1 - chr3R 1649585 3' - Stalker 6926 4 58.00 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATG:1 - chr2L 15947395 3' - Transpac 43 2 63.37 GCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAATAAGCACTTAAATTATTAAAAACTGCTACATATCA:1 + chr3L 8614557 3' - opus 149 4 67.33 GGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTAGTTATCATATATATATATACAATATATCTATATATCAGAATGGTGGTACAATGGCAGAATGTTCATGTGATTGT:1 + chr2L 5812430 3' + 1731 313 2 61.39 GAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATAAAGTTAGGCTTAAAGCATCTTCAATATCCTTAAACTTTAGTTCGTTATACATTTTCAGTGCAAGACCAAAC:2 - chr3R 17321683 3' + Stalker2 7648 2 75.25 GAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAG:1 - chr3R 9131765 3' + roo 9041 1 61.29 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAACAGTGGAAAGTAATC:1 + chr2L 12324121 3' - roo 12 2 69.31 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGCACCGCTTTT:2 + chr2L 8565550 3' - blood 8 2 77.23 TCCCAAAACGTTTTGAAAATGTTATCATTCCTTATTTGCATACCCACCTCATGTTTCCAAGAACTCCCTTTTTTTTTAACGGAATACATAACAAACATACT:1 + chr3R 23890361 3' + Q-element 137 2 67.33 CCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTCAATAAGCTTAACTTGGAGATTTTCTCTTTCTTTGCGTTTTCTAATCTACAAGATATTTATTTTTATCTATTT:1 - chrX 14888480 3' - baggins 5398 1 70.30 ATATGTTTTTCCGTCCTTTCTTAGCTTAAGAATTAAATTTTTCCTACGGATATTGCAAGTTGATCTACCTTTTCACTCTCTTCGTTCGTGTATCCTTTTCT:1 - chr2L 17310032 3' - HB 404 1 71.29 GTTTCTCTTAGATTCAAGTGCATTTGATCTGGGATACAAGTACTCTTAGATTCTTAAAATTTGTTTGTTGATGGGGCTAAGCCTTATAATGTAATATGTTT:1 + chrX 20072328 3' - Idefix 349 2 70.30 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGGAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTTTTCCGTTCGAAAATTGCTTT:1 + chrX 2649884 3' - Tirant 38 2 57.43 CTAATATACTAATGTACATCAGCCAGCCAGGGAACAAAACCGGCGGGTTGGGCACTCAATTTAAAGACCAAACCAAGGCAACCAGCGGATATGGCCATG:1 - chr3L 19950112 3' + roo 8619 1 75.76 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTACTTATGTAAATTCACCTAT:1 + chrX 3305238 3' - transib2 2 1 75.25 AATAAAATCAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAG:1 + chr3L 19377789 3' + roo 9033 1 62.38 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTAGGTTCACAGAGTGGCAGTTGACACAATCAAAAAATAGGCAAATCAAAATTAATACTA:1 - chr3L 23152029 3' + copia 237 1 61.39 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGAATAAAGTGGCAACAACGACAAGT:1 + chrX 18238045 3' - jockey 4789 1 73.27 TTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACAATTCACCAGTCTTAGTAGTGTCCATAAAAGGTCAAAACGAAGATGGGTCCCCAAAACATCGACTAGTTATT:1 - chr3L 26507204 3' - invader2 4737 1 75.25 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCACAG:1 - chr2L 16201495 3' - hobo 18 1 61.00 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTT:1 - chr2R 12082338 3' + mdg1 7427 2 55.45 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAAACTAATTTTTGAGCATTAGAAAGGTCTGGGCCTACACATATGGA:1 + chr3R 4834708 3' + mdg1 363 2 55.45 CGCTCTACCTCGTCATCGGCTGCACCGTCGTGTTGATAATGGCTGATGACCGCCAAAACTCTTCGGGCATCCTA:1 - chr2R 5364268 3' + F-element 453 1 71.62 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGCTGGCGAGCAAGT:2 + chr2L 5646917 3' - jockey 4684 1 66.34 CGTACTTGCTGAATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGCTACTGTTGAATTCGTCTATAAAATCAGGGTGGT:1 + chrX 10673523 3' - mdg1 167 2 64.36 ATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATTCGAAATAAACGCTGGCCAGCAAACATTTTCCATTTTCCCGCAGGGTGGTTAGAGAAATTCTTAAAATAT:1 - chr2L 18496892 3' - INE-1 300 1 60.40 GCCGGCTTTGACTGCATACTAGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATGTTTCCTTATGAGCATTTTTTATTAATAAGCTTGTTAGGTGG:1 - chr3R 19446987 3' - Doc 4523 1 79.21 TTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTCACCGTTATTCCACCCAAACCCAATCCCCATTGAGCAAACATTCGCGCCGCGAGAATTTCAATTGATTGTT:1 - chr3L 3292173 3' - F-element 4426 1 75.25 AAATAACATAAGGTGGTCCCATCTGTCTGCGAAGTGCCTGGTTTGCAAAGCGCAAATATATTAATAGGGCAGTACTACACAGTTCGTTGTTGTTCTTTTAA:1 + chrX 8491694 3' + P-element 8 2 80.20 CTCTGTATGCGAGGTGCTTCCCTCGCTGCTGGAGCTGCTCTTGCGTGTTCTCAGAGCCTTTTTGCGTGGGCTAATGCAACTCAAGAGTCAAATTGCTGTGC:1 + chr2R 9429814 3' - G6 414 1 68.32 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCGG:1 + chr2R 11528072 3' - P-element 33 1 48.00 CTTTTTTTTTTGTTTCCTTTTCGTTTTTCCTCGTTTCCTATGTACGCCTTCAACTAAAGTTGGAGAAATGCGAAAAGCCCTTTCGGGGATTCAACTTTCTC:1 + chr3L 19141725 3' - Doc2-element 222 1 69.31 GTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGCTGGAGTGGAGTCGTCTCCCCACACGCAAATCCAACTAC:1 + chr2L 5750381 3' - Stalker2 7339 2 61.39 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAG:1 - chr2L 17646168 3' - flea 28 2 56.44 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGG:1 + chr2L 2060177 3' + 412 443 2 69.31 TTCGCACCATGGGCATTCATCCGCATCCTCGTGGACAAATCCACATCCGTTCCCTGATTCCTCGATTCCCCCGAAGCACCCACAATTGATATGCCGATCGT:1 - chr2R 9194114 3' - Rt1c 5064 1 75.25 ATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCCTGTGTGGGTGGCAGTTGACCAAAGGCAGACAAACAATAAATAAAGACAAAGGATGCAGCGTGGAATGTC:1 - chr3L 24041229 3' + Bica 43 1 74.26 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGTGTTTTAGTACCAAATATATCAAAAATCAA:1 + chr2L 22098119 3' + roo 400 1 50.50 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAGCAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAA:1 + chr3R 7168617 3' + flea 4963 2 80.20 CATATGCATGCATATGTATATGTTTATTCATGCCAATAAGTATTTTTTGGGGAGTTGGCGCGTCGCATTAAGTGCAAATGGATTACGGCGAATTGATTATG:1 - chr2R 15611701 3' + Stalker 7086 4 61.39 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATATTTGTTTTTCGACCCAGTGTGTATATCAGCAGAGCCCAACTGTGGCATCTAAA:1 + chr3L 6506895 3' - roo 16 2 56.44 ATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAGCGCCAAACGGAAGCGATCGACTCT:1 + chr2R 4877231 3' + Doc 147 1 75.25 AAAGANAAAGAAAAAAAAAAACAGCGAACACAAAAGGCGGTGGAACAAAAAATGCTTCAATTTAACG:1 + chrX 10062948 3' + Doc2-element 219 4 89.55 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAGAAATCA:1 + chr2L 14612126 3' + roo 403 1 73.27 TCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATAATGCGGCGAACACACGCACAAAAAGTCCTGGGCCGACCCACGT:1 + chr2L 12813344 3' + hopper 1327 1 57.43 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAAC:1 + chr2L 21683460 3' - pogo 45 1 76.24 CATCCNACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAA:1 - chr2L 23286585 3' - Tirant 416 1 59.00 TTTTCAAATAATAATAACGTTAACAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAACGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAA:1 - chr3R 4571526 3' - 1360 311 1 76.53 ACTCAGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTCTCTGTGCAAATCCACGGGTTCATCAC:1 + chr2L 19481365 3' + roo 393 1 63.37 CTTGACTGCGAGAAATGTAGCAAGACAGTTTGAGGACCATCTTCTTGACGAAGAGCGGCCTACTTCGGGTGTTAAGTTGCGCGGTATCACATTGTCGGAAT:1 + chr3R 24510226 3' + baggins 436 1 67.33 CAGAGCCATACATAATACTTGATTCTCAATCTCGTCGGCATTTCCTTTTATCTTTGTTTTTGTCATTGCCTTTGCCAGCGCTTAGCTACCCCCTAAAGTAA:1 + chrX 22055393 3' + gypsy5 237 2 73.27 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGT:1 - chr3L 7075880 3' + roo 9037 1 61.39 GCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACGTACTAAAAAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTTGGGTGAAGGAGTCCAGCTTCTTGGCCGCC:1 + chr2L 18492890 3' - Rt1a 4996 1 70.30 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCT:1 + chr3R 23638161 3' - pogo 47 1 78.22 TAGCGNCCACCTGAACACGTTGGCAAATGATCTTGTCGACACTTTTTCCCTCCGACGTCTGAAGAGGTCAAGAGGTCAGAAGCTGGCCAAGATCCCCACT:1 + chr2L 22090767 3' + G5A 2625 1 65.00 GCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTCTTTCTTCCCATTGTCTACACATAATATAGTTATGCAAGCATTTTGTTTGAGAAATGTACTAAAAT:1 - chr2L 10473422 3' - flea 4764 1 70.30 CCATTTTTTTTTTCGCTTTGGCGCAAATCTTTGAAATATTTTAATGTTTAGCATGGTACATAGCGGCAGTGAAAGGTGCACCGTTTAACCCCTTCCTTAAC:1 - chr3R 9316387 3' - invader2 291 1 62.38 AAGGTNAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAATCTGCGTTAACTTATATATATATATTTTTTTTTTTCTTTGATGACACATGCA:1 + chr2L 21010922 3' + opus 458 2 70.30 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAAAAAGTACGAGTACGAATATATAAATCATATCTGTTC:1 - chrX 10672266 3' - mdg1 5 2 72.28 CTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTAACATATCTTAAACATTCTATAATAGTTCGAGATGTTAAAAAGTTCAGTAAAATGTGGCTAGT:1 - chr3L 11663207 3' + hopper 1147 1 58.42 GTTAGAGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCTTATAAGTAGGCAATAAAAATGTTCATT:1 - chrX 7045576 3' - jockey 4762 1 71.29 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCA:1 + chr3R 20149787 3' + 1360 3368 1 58.42 AGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCATTTTCGGTCTGTTTTTTTGACCAGGCGGTGCATAAATT:1 + chr3R 7414040 3' - I-element 4966 1 61.39 ATATANATTCTTGATCAGGATCAATATCCCAGGAAAATGATGAAATTTCGCGTTCGCAAGCACACTAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGA:1 - chr2L 8346986 3' + INE-1 80 1 60.40 TATTTTCCTTTTTCTTTTGCTTCTTACGGCCATTGGTTGCGTTATCAGAAGATTTATCATCGGCGATTTTGTTTTTGGTAACACTGAGAGCCTTTGGCTCA:1 + chr3L 5498474 3' - Doc2-element 248 1 36.63 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGAACTGTTTTG:1 - chr2R 14675518 3' + roo 405 1 73.74 TTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCG:1 + chr3L 12888275 3' - mdg1 7085 2 70.30 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAATAATACTTTTC:1 + chr3R 29259637 3' - pogo 38 1 64.36 GCGTTGATCCCCTTGTGATACCTACTGGCGTGGCGGCCAGTTGGCCGATTCCTATAGGTGGATGAGTTTTTTAAATTCACGTAATCGCGGTCCTGGTTTCA:1 + chr2L 22600200 3' - baggins 17 1 69.31 TAATANATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATT:1 - chr2R 13644412 3' + Burdock 6376 2 64.36 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAAATATCGCCA:1 - chr3R 4834259 3' + mdg1 7423 2 63.37 CGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAA:1 + chr2L 15808030 3' - I-element 41 1 60.40 TCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTCATATTTAACTCATAACAGAGTTG:1 - chrX 23183158 3' - Idefix 7064 2 76.24 TGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGTGGACCTGTGTGCGAATGTGGCATATTACATGCTAATCCATATGTTTAAGTTGATTTCGCGTTTCGCTCTTTTGCCG:1 - chrX 10577764 3' - Helena 335 1 73.27 TCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAAATCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACATTATAAATACTTTGGCCGTGTGGCTCAG:1 + chr2R 22840090 3' + I-element 31 1 67.35 TTGAAATTAAATACCTAATGATATTTAAAATTATCCAAAAAAATGTATATCCGTTGTTTTGGTTCATAAATTGTTCTAATTCTTCTGAATATAGAATAAA:1 - chr4 847041 3' + HB 1529 1 73.00 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGG:1 + chrX 18837004 3' + P-element 2838 1 33.66 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATAAATTTGGCATCACTGCGGCTCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTA:1 - 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chr2L 3890163 3' - jockey 57 1 71.29 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGAACACGAATCCGTCCGGTTGTGA:1 + chr2R 16334061 3' + P-element 2863 1 55.45 ATTAGNTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGA:1 + chr3R 19446239 3' + 297 379 2 64.00 TGATAGTCGGGGAACTCGACTATGGCTTTCTTTCTTGTTTTGTTTGCTCATCCTGCCGAATCCTGCTGCAATACGCAAGCCAAGTTTGAATGCATGCACG:1 - chr3L 22846224 3' + INE-1 563 1 54.00 AATATCTCAAAAAATTCCAAATTAATTGGCNGGCACCTGGAAACACGCTCAG:1 - chr3L 972387 3' + Ivk 5240 1 90.38 TAAAAAGAAAAAGGAATGAAAACCTAAGCGAAAAACGAAAGTTCCTGAGCTCTCTATGCTTTTTG:1 - chr3R 21860047 3' + Tc1-2 1209 1 78.46 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAACGCGGCTCATTCA:1 + chrX 18837026 3' + P-element 2860 1 55.45 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGCCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTCGTATGCGTTCGGCTCAC:1 - chr3R 8477728 3' + P-element 2857 1 24.75 TAAAATTTAAATTTGAATATTAAAAATGTATTGTTTGCAAGTCAGCTTTAATCCATTTTGAATGACGATTTCATCTTGGGCTGGCCCACACATGTGACCAA:1 - chr3L 12013647 3' - TART-A 13181 1 69.31 GATTTTTTTCTTTTTTTTTGTTTTGCCAGATTTTGGATTTCGGTTTCT:1 + chr3R 23400131 3' - gypsy7 5004 1 79.17 GGTGTGGGTTCCTGGAGGTGGGTGCCAATTAATATAAGGGTGGGGTACTGC:1 + chrX 21907790 3' - springer 409 1 92.16 CGTGTGAAAAATTAATAAGGAAATGATTGTTGAGTGCATGATGGTAGAGGGGGGCGGGTTGCGGTGCGGTGTGTTGTATAATTAAAAGTTCCCTTTTGTGC:1 + chrX 13558583 3' + 1360 433 1 67.33 CAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTG:1 - chr3L 6044761 3' - Tabor 54 2 75.25 TTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTT:1 - chr3R 28240017 3' + Cr1a 149 1 72.28 AGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAAT:1 + chrX 21534510 3' - accord 7331 2 74.26 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGTAAGCCAGACG:1 + chr3L 18706963 3' + jockey 4983 1 71.29 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCACCTTATCTGCCACCGGGGAATACCCAGTCATTGACTCACACTGAATA:1 + chr2L 19847396 3' + P-element 2868 1 51.49 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAAGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCATCA:1 - chr3L 7550712 3' + 412 7515 2 54.46 TTACANAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCGGCATTT:1 - chr2L 2074720 3' - roo 8710 2 73.27 GCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTGTTGCCACCCACGAACCTTTATTACAGTTAAATTTTTGGTCACTCATGACTAAT:1 + chr3L 3537542 3' - Doc 4488 1 53.47 AAAAANAAGAGACGAGAACGCGTATAGGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCGCAAGAAGAAAGAACTCCGCGTCCGCGGGGAAAGCTATTG:1 - chr3R 4895705 3' - 1360 3234 1 58.42 TAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCACTTCCAGTCAAAACAGTAAAAATGCCATAAAGGTGACAATTCGCGAATCAAGGGAA:1 + chrX 6373683 3' - X-element 31 1 42.57 TGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGTGCCCTGCAGTTCAGG:1 - chrX 15814529 3' + P-element 266 1 31.82 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTTACTGATGACTACGAGCTAGAGTTACATTTTAAGCAAATTTGTTGCTTGATGAG:1 + chr2L 7195270 3' - Doc 79 1 60.40 AAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATGGGCTCTCCAA:1 - chr3L 4876715 3' + roo 9060 1 65.98 ATCAATTTAATAACAGGTTTGAGTAAACACTTTAGGTATTAATTTGTGTAATTTAAAGCTGGC:1 - chr4 335069 3' - transib3 466 1 58.73 TCAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCATCGCGAACTAATAGTCACGTCTTTAGCACTTTGCGCGATACAAATGAATATGCATTGCTTTTCTA:1 + chr2L 8585323 3' - invader2 420 1 72.28 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATATAATCTATATCAAAATTTTGTTAACCAATTGCATTACCTATATATTCTTTAACGTA:1 - chrX 15082369 3' + mdg1 409 2 64.21 CGTTGCTTTGCTCTTATGTACTTAACTTTGGCAGCGAGAGCGCCGCTGTCTAAGAGAGTCGCCTTTCAAGGAATTTAGATCGAGCAAACGAAATATATTTC:1 - chr2R 20621044 3' - Tabor 256 2 59.41 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTT:1 - chr3R 19446149 3' - 297 6599 2 56.04 GTCATGGACACACACACACACACACATACGTTGAATGAACTCGACACAGCCCAAATATAAAACCCAGAACAACGAAGAAATGCGAGACGCTTGAG:1 + chrX 1229461 3' + accord 178 2 86.32 GAACTTTACACCGTTTGAAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCGTTGGGGTTCATTTCATGCATTGAACGATGGCTGCGACGAGA:1 - chr2L 21969707 3' - Doc3-element 459 1 74.47 CAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGT:1 + chr3R 29288766 3' - BS 5027 1 52.48 GGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCCATCTACGCGGATGAATGAATTAACGACGGACGTGTTTTCG:1 - chr3R 2412143 3' + R1A1-element 99 1 65.35 AAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAACTAACCATAAACAAAAATTGATAAGAAGTGCAAAAAGCAAATTTGAAGAATTTCACATCTAAAAAGTGAGT:1 + chr2L 3779302 3' + gypsy7 5011 1 60.40 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATC:1 + chr3R 4834334 3' - mdg1 22 2 57.43 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATA:1 - chr2R 17626472 3' - mdg1 14 2 63.37 TAGGTGACATGAGAATCGCAGAAGTTCTTGACGTTCTTTCCCACTCATTGACCGTTTCGTTGATTAGTAAGCATGTCGACATTTCAATAAAAAAAAAATA:1 + chr2R 18949085 3' - roo 326 2 81.00 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTA:1 + chrX 2649912 3' - Tirant 8 2 72.73 AAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAATCCTAAGAATCTTTAAACACCTTTTTTATCATTTGGCAACGGAAAATTAACGATAGCACTTGTC:1 + chrY 779980 3' + 1360 3011 1 68.32 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAA:1 + chrY 3648891 3' + 17.6 466 2 61.39 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCTC:1 + chr3R 11119895 3' - 297 6586 2 74.26 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTG:1 - chr3L 18659020 3' - pogo 32 1 57.43 AAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACAATCGCTTTAGCCCCTAGGCCTCGTCTACGT:1 - chr3R 30425936 3' + P-element 268 1 31.68 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATTTCAAGCGG:1 + chr3R 11999285 3' - P-element 44 1 35.64 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGAGGTCTCTGATACACAGTATGTGGGCGGTTCGCTTGGCTATTAAATTTCCAGTTTAATGATTAACGAAA:1 + chrX 992098 3' + hobo 2925 1 56.84 CTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATATCCTTAACCCGTATAGAGGCCGTCCCCGTCCCCTTTAACC:1 + chr2L 17661846 3' - R1A1-element 340 1 60.40 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAA:1 + chrX 13546689 3' + roo 9027 1 72.45 TGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAAACTACGGCATATATATGTATATGGTATTCGAAAAGTACACAAAAGGCC:1 - chr2L 5812341 3' - 1731 4343 2 54.46 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCATCAGCAGGAGCA:1 - chr3L 7550703 3' + 412 7541 2 69.05 CTCAACAATCATTGCCTTATTAATTAAACGTCACAAGATGAATACTGTATTGTAAAGTCTATAGATTTACCTCGTGAACAGCTGCTTCCACAAAAACACAC:1 + chr2R 4324385 3' - 1360 445 1 61.39 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATATAATCTATATCAAAATTTTGTTAACCAATTGCATTA:1 - chrX 15082389 3' + mdg1 7421 2 64.36 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCCCGATTGAATGATGTTTTCTGGGCTCCCCCAA:1 + chr2L 12815134 3' - hopper 1 2 74.74 ATTATTATTATTTATTATTTATTTAACATATAATGAATAATTTGTGTTGCTTTGGCAATAAGCATGTACTGAGAATGGCAATACTTTCATTAACTTGTTAC:1 - chr2R 10190875 3' - flea 241 2 82.18 TACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACCCACACACTCTCAGTGGAAGATAGAGTCATTTGGCACTGCCATTAATG:1 + chr2L 19595755 3' + accord 7058 2 55.00 TGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAA:1 - chr3R 7750435 3' + Doc3-element 13 1 38.61 TTTAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGCTTGACTACCAGACAGTATAGCAATGTCCTTGCCCCAACCCCAACCACCTGCAGTAATCATCCCCGTTTGCGGGT:1 - chr2R 6103870 3' - baggins 4970 1 59.41 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGGCCACAACAATGGATGTCGCACAGAACAAAAGGCGCATCC:1 + chr3L 4877166 3' + roo 8981 2 60.40 GTTTTGAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATGCATATCCAAGTATAGCTATAAAA:1 - chrX 22444452 3' - Juan 4076 1 49.50 AGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGATTCCTTGTTTTTTCGGCATCTTCTTTTTTCCACGCCTGTTG:1 - chrX 17339349 3' - F-element 4473 1 61.39 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTT:1 - chr3R 13375979 3' - 1360 43 1 70.30 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAACGAAATAGAGCGGAAAAGCTCGAAA:1 + chrX 3335077 3' - jockey 60 1 73.27 ACACTAGCTGAGTACCGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCTTCTCTCTTGACTTAATTTGGACCACTGTAAAAATAAAACAAAACCAAAACT:1 + chr2R 5529372 3' + INE-1 540 1 66.34 TGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAGACATTGTTGTGTGCGTGGTGTGATAGCAAAGTGAGAGAAAGA:1 - 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chrX 16153967 3' + Circe 7029 1 67.33 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACA:2 - chr3L 28063323 3' + roo 403 1 73.27 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATG:1 + chr3L 9766402 3' + blood 336 2 74.26 GTTAATCATCACCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTCTAAACTGGAGGCGTACCTGGTATCCCGGGGCATTCCGGCCTA:1 + chr3L 19858869 3' + Q-element 340 2 63.00 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAG:1 - chr3R 19346912 3' + blood 335 2 74.19 ACAAAAAATAAAAAAAAAAACAACCAAACAAATCATTATTAGAGAAGCTTGTGTGGATCATGTTCAATT:1 + chr3R 16163697 3' + G2 3076 4 63.77 TCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAAAAAGTAAAACTAAAAAACCAAAAAAAAAAACAAAACCAGAGAGGAAACAAGCCAAGATGCA:1 - chr3L 6817733 3' + I-element 40 1 71.88 CCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGA:1 + chrY 3648890 3' + 17.6 7392 2 62.38 GTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTATTTTTAACAATCTTATTCTTATCAAGTAAAGCCAAAAGCTTGGCGGCCCGATTGTTTACCCCATTGGGGAA:1 - chr2R 22667841 3' - Idefix 6976 2 58.00 TAAATACTGAACTCGGCTGATGTTTCATCGGACATAGGGTACCAAAGGGGCCGCTAGAGCCATGCCCAAGTATACAAGACAAGCTATGAGAACGAATATAA:1 + chrX 19597826 3' + Gypsy12A_LTR 1875 1 65.35 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATAGAGTCGGTAGTGCCGGGGCATGTGTCACCAAGAACTGGCCACCTGAGCTGCAGTCTCT:1 + chr3R 11343252 3' - hobo 17 1 59.41 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAATGTACTTTTAAAACGATTTAAA:1 + chr2R 6702054 3' + pogo 2051 1 83.00 CAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGGTGTCTAAGCCCAAACAGTCGTCCCGGGAGGCAGGACAGACAAATAC:1 + chr3L 12259842 3' + Rt1b 4795 1 73.24 AGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCACACATACAGGCACACACTATGGGCAAGCCCAGCGCCAAAGTC:1 + chr2R 21957322 3' + mdg1 179 2 64.36 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAA:1 + chr3R 7168647 3' + flea 4993 2 57.43 AGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCGAGACTTCTGACATCGACCGCCCCCTGAAGGCCGAAGTCCAACGCCCAACCGCCCATCCTT:1 - chr3R 11841047 3' + hobo 2605 1 77.23 TTTTGTCAAATTTACAATGCTTGAACATATGTGTGCACACATACATTTTTTATTTGTTGGGCTTATAATTTTTTTTTATTGGGCTTATAATTTTTTTT:1 + chr3L 25310374 3' - 1360 198 1 57.14 CAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTTATCGACCAACTTATGCTAATGACACGCATTGCAACGCTGCAAAAATAAATTCATCAGAAATCT:1 + chrX 8835022 3' + HMS-Beagle2 71 2 57.43 ATATACTTACACACACACACACACATACATCCCCATCGGTCTCCAACACCAACATCATCTTCCCTCCATTTCCATCCGATTCCCATCTCGAACTTCTGGC:1 + chrX 18122753 3' + Quasimodo 31 2 74.00 TTTTCTTTTTTTTTGTATTTTATCCGTTTTGTTTTTATTGTACAAGCGTTTCCAGTGTCAACAGAAATAGAAACCATAACGAAAATCAAGC:1 + chrX 157529 3' - F-element 4685 1 62.64 TATGTAAAATAAAAGCCAAGGTATGTTGTTTTTAAAATTATCTTGATCACTTACTAGTTTCCATATCCACGTCTAAGTGACGTTGGTTTTCCACATCGAGG:1 - chr2L 3807010 3' + transib2 270 1 76.24 AAATTAAATTTAATTTAAAATTTGGTATATGTCTAACACGTATTGTGAGAGTGGTTAATGTTTCGTTGCAATAACCAAACTGAATATTGTATTGCTGCACG:1 + chr2L 12027158 3' - Rt1b 124 1 60.40 GTATTNTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTG:1 + chr2L 3951656 3' - Transpac 32 2 56.44 CCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATTACAAGATTGCGGCCTGTTACAGCATCTACA:1 + chr2L 8354774 3' + F-element 325 1 68.18 TATTGNTAGAGTGAGTTTTCCTCGTCAGAAAACGGTGCGCGGGCTACGTTTTGGGAGTGTTTGCATTTAACTTTTTCAGAAGCGTAAAAAGTGGGTAAAAT:1 - chrX 398080 3' + Gypsy12A_LTR 361 1 60.40 GATCANTACCCATGAGTGATCCACTCAATGGTAACGAGAGCAGTCGCAAGTTTTCCAATCGCGCTATATACTTATACAACTAAAGCTAAACAATTGTCATC:1 + chr3R 1329957 3' + Quasimodo 257 2 74.26 GAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTAGACTTTTAATTTTTTTTATTCAAAATGAGTAATGTCACTTATC:1 + chr2L 17784691 3' + gypsy10 308 2 57.00 AAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACA:1 - chr2R 1320702 3' + diver2 4858 2 59.41 TGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGACTACTGGAAAGAGCGAAATATGTCCGGCAGATGTC:1 + chr2R 7552327 3' - springer 14 2 65.35 ACATCCAAGAACATCACATGATTTTACCGTTTAAAGCTATTTTCTGGTTTCCTGCCTGCCTTATTAATAGAAAGCAATATTTTTTTATATGCCCCAATTTC:1 + chr2R 1532977 3' + McClintock 6057 2 55.45 AGTTTNCCGACAATCAGATACCCGTTATTGTTCAAAGGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGTGTTAATTAAAAATGCGATCTCTCGGGTGTTCATAAATCTTG:1 + chr2L 9204349 3' - INE-1 557 1 57.43 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCTGTCCGGATCGTTTTGTTGCATCGTAACTTGCTTGTTTAAAGTTTGCTTTCGACAAGTTGATAAATATT:1 - chr3R 10147802 3' - roo 8670 2 73.27 AGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCACCTAGGCGTATACGCAATGTTTAATTTTCAACTCGAGCAGCGCGATCTCTGCTCACATAAATTCCTAG:1 + chr3R 6115560 3' + Tirant 165 2 79.21 AGGCANTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAGTCT:1 - chr3R 24760538 3' + pogo 2078 1 58.42 CTTAATATGTTCAATTCGGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTACATAGGTGGCAACATAGTTGCCACTT:1 - chr3L 4352216 3' - rooA 7573 2 81.19 TGGTAGGGTAGGGCAATCCGCGAACACGATTCCATAAATAATTTTCTAAGGAAATAAATTGTAAAATATGTAAAATCAGCACACCGAAAAAAAAGCATTAA:2 - chr2L 14745466 3' + Gypsy12A_LTR 1959 1 77.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCT:2 - chr2L 7488844 3' - roo 19 2 56.44 TCCTTTTCTTTTTTTTACTTTTTCCCCAACTCGAAGAGCGGTTTTTGTGTGCGGCGGCTTGAGAGCGTTCTTGAAATATCAATTCGGTGAATAGTCAATTT:1 + chr3L 4723342 3' - Doc2-element 224 1 73.27 GATACAAGTACTCTTAGATTCTTATAATTTGTGTTTTGAAACCGATTTCAACGATTTTTTCGAATCACTTTTTCCACACTCACTTTTAATTGTTTAAACTT:1 - chr2L 16602068 3' - Idefix 317 2 69.31 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTAAATAATTTGCTTGAATACATAATTATGTACCATTGACCAATCT:1 - chr3R 23364364 3' - flea 4785 2 57.43 CCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACATTAGCACTCTCGAAAATCCACACACATACACTCACATACTCTCGAGCATTTGCATAACTCCAAGCAGGACTAG:1 + chrX 21091516 3' - Bica 66 1 68.32 AGTTTTTATTTAAATTTTTTTTTTTAATTTATGCCGATAATATGCACTTTAATTGCCACGCCGTCCATCCTGG:1 + chr3R 28852740 3' - mariner2 790 1 61.64 ATCTGCGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGGAGCTTACACTCATAGCGTAAAAAAAAAGGGAAGACATAAAGGCGCAAAGCATTTCAGTTGTTTTATCGGT:1 + chrX 22647634 3' + INE-1 545 1 51.49 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAACGAAATAGAGCGGAAAAGCTCGAAAA:1 + chrX 3335078 3' - jockey 59 1 72.28 CTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATAACATATATATTTTATCCATCATAA:1 - chr3R 21092415 3' + roo 409 1 68.32 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTTAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTATCTTTCAGATAATTCTGTGGGGATTGGC:1 - chr3R 22781978 3' + copia 5077 2 71.29 AGAGGAGGAGTTGCTTGCGAGATGCTCGGGGAAGTGAAAGTGAAAGTGCCGCTCCATGGAGAAGGCAGGCAGGCAGACAAGGGCATCTATAAGAACAGAT:1 + chrX 7552518 3' + Bica 22 1 77.00 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATGTACATACACACAAAACGAGACAGCTTGTCGTGTTGGCATTTTTGTTTGTCATTC:1 + chr3R 14688576 3' - FB 21 1 57.43 AGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCCAAATGCAGTCCTCAACTCCCCATCCCTGCACTCTACCCCATCGACCAGGCCAGCTCTGGCCTTCGCCTT:1 - chr3R 17284075 3' + R1A1-element 4928 1 76.24 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATT:2 - chr3R 12539512 3' + roo 357 2 76.24 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGAGTCATTAAGGCCAACGCCTGGGG:1 - chr2R 14408488 3' + hobo 2889 1 75.76 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAATAGTAATTGTTTGGCGCTTAA:1 - chr3L 6044718 3' - Tabor 6850 2 68.32 CTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGCGAAAGAATAGAAAAGAACATTTAGTGCTGGTGTGGGGCAAATTGTTGCTATTAAA:1 + chr3R 20400057 3' - F-element 4488 1 60.40 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCATACCCATACCCATACCCATAGTCTCAAGTCGCAGTCGGCGTCTCAGTCGGCGTTTCATTTGAGCGC:1 - chrX 17830709 3' - P-element 9 2 70.30 TATGGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATCCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCAT:1 + chr2R 4802889 3' + mariner2 279 1 41.58 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAAAACTGAGCAAGAGACA:1 - chrX 13546617 3' - roo 13 2 67.33 ATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTTGAATGTCCAGTATTTGTCTTTTTTACTATATCCGACTCTGATCT:1 - chr2R 2594231 3' - I-element 5009 1 55.45 AATTGTTCTTAAGTTAACGAATTTCAATAATTATTTTAAGTAACCGTTAGTTTTCAAATTTCCTAAAGTTGTAATATATTTATTGCATTTTGATTGCTTTG:1 - chr2L 10851157 3' + invader4 2672 1 37.62 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGAAAACAACAATTGTTCGCAACCCTCCACAAAAAAAAAGAAAAGGACGAGGACAACGCACAGCGATACT:1 + chr2L 1233256 3' + hobo 2930 1 59.41 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGC:2 + chr3R 31257036 3' - transib2 45 1 71.00 CTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAACGAGGGCTGGGCTAAGAAGTGGATTTAT:1 + chr2R 24239796 3' - hobo 2703 1 72.28 CGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACAATCCAGCATAAACAATTCCAAAACAGTAGGAGGATACCCTTAGTCATCGAAACTTCACTCTTG:1 - chrX 21632434 3' + accord 321 2 65.35 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATG:1 + chr3R 10751711 3' + hopper 1387 1 55.45 ATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTAGAAAAAAAAAAACGCCTGCCAATAAA:1 + chrX 4051536 3' + 1360 397 1 73.27 AGAACNTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTT:1 + chr3L 23871310 3' - Doc 45 1 61.39 GGTGAACTCGACTATAGCATTCTCCGGTTTGTTTCATTTTAATTTTATATATTTTGCATGTTTAATTTATAAAAGTGAACAAATATGTGTTTTTCAGATTT:1 + chrX 21636071 3' + INE-1 571 1 90.10 TCTAGACCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATG:1 + chr3R 17454457 3' - jockey 4717 1 73.00 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCTCAAT:1 + chr3R 11119898 3' - 297 2 2 77.23 GCTTCNGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGG:1 - chr2L 3632136 3' - P-element 21 1 57.73 GCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACTAGTTTAGCGAACGAGAATTGATGTACAATGATACGAAAGCGAATCAGCAGGGCGATTAGCAGAACCAATTG:1 - chr2R 4374889 3' - diver2 255 2 71.72 TGGGTCGTTTACTTGATCTGCGCGAGAGCGCTTCTTGCTTATGCTTCACTTCGCCTCGGCTTGATATGTTTCCTTTCTTCCTCCTGCTGACTGTCCTGCA:1 - chr2L 11488328 3' - Tom1 221 1 59.00 GCTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAG:1 + chr2R 14713642 3' - P-element 48 1 33.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTTATCATT:1 + chr2L 7255836 3' - P-element 6 2 73.27 GTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTATCCCTATATGCCTAACTCCCTACTCTCTTCTCTCGTCCTGCTTTGTATATTATATGGCAAAGTCATATAGTCATA:1 - chrX 9172399 3' - I-element 5124 1 80.20 CAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAATCCCCGTTATTGCAAATTAACCCCCCTCCTCTCAGCGAATGCATAAAAAAATGGATGCTG:1 - chrX 11370239 3' + Porto1 229 1 65.35 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATA:1 - chr2R 24021575 3' - pogo 38 1 67.33 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCCGTGGGC:1 + chr2L 20706750 3' - mdg1 7047 2 70.00 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCCAACCAACATAGCATAAAGTCCAGCAGTATCGCCAGTCGACCAATGAAACAGTTGTCGCCGACACGGAGTAC:1 - chr3R 7521613 3' + 1360 3384 2 61.39 ACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAACGTATATTTTTTACTGCCAAGTCTTGAGACTCAAAAATATAACAGATTTAATTCACTAACAACA:1 + chr2R 9317054 3' + opus 7492 2 67.33 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGGGGGTTATTGTATTTAATTCTTGTTTGTAGTTCATGATT:1 + chr2L 3085062 3' - copia 4887 2 59.41 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACAAAATTTAATCAAATAAAATATTTACTTTTAAAGAATATATTCTTGATATCGATCTTTTTAATATC:1 - chr2L 12988868 3' - mdg1 10 2 64.36 TTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATT:1 + chr3L 18337703 3' - Juan 4043 1 51.81 GATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATACAGCAATCGTGAGAGGTTTCAATTGAGGC:1 - chrX 21564650 3' + diver 213 1 62.38 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCG:1 + chr2L 7255807 3' + P-element 2852 1 44.55 AAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACTCAATCCACTGCGATTGCCATTGGGATTAACCAGGCGCCTCAGGGATGTGGCTAT:1 + chr2L 7805325 3' + P-element 327 1 64.36 CGTATGAACGTTGAGATCTGAGGAACTATAACATAAAGGGAAAGTAAATGATTTTTATTTATATTATTACTTTTTATACCTAATAGAGTAGAGTACAACTA:1 + chr2L 21667319 3' + INE-1 136 1 69.31 GATTCTTTGTGATTTGTGCATTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGGCTAGTTTGCGTTAGCTTGCTGTAGTTTGTTGGTGTTTGCTC:1 + chr3R 26160968 3' + Cr1a 144 1 58.42 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCAGCACATGTGGGGGATTCCCTTTTT:1 + chr3L 18501035 3' + hobo 2930 1 64.29 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTATACCCAACCGCTGGGTTCGGGAAAAATCTGCCTGTCTCTCGGGTCTGCGGCATTGG:1 - chr3R 21296537 3' - P-element 19 1 60.40 ATATGGGGTCGAAAATGAACTAATCTGATGTCTGTTGGGTTAGTTTCGGTTATGTTTCTTATAAGGGTGGGTGTTTTGGTTGTCTGTCTAGTAGTCCGAGT:1 - chr2R 964669 3' + Circe 7101 1 71.29 TTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTGAGAAATGAAAAAAGAAAAGGCAAGAAATTTCCAACGGTACATGAGCTGCTG:1 + chr3R 13816503 3' + 1360 3251 1 58.42 ATATGTATATATGTATATGTATATAATATGTATATTATAAAATACATAAAAAAACAAAGCATAATTTATTTTGCACTTTCCTGAATGGCTTTGGGAAATTT:1 + chr3L 19784674 3' + G3 4507 1 60.40 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTCGTAATTAAATTGAAATTCGGTATACAATCATTCCTCTCAATGCGAATGTT:1 - chr2R 24479871 3' - I-element 22 1 55.45 GTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACACC:1 + chr2R 13644529 3' - Burdock 6137 2 78.00 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGAAACTTTGAAATAAAATTATG:1 + chrX 17058218 3' - 297 10 2 60.82 TATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTTTGTCTTAATGGTTGGTTCGCCGCTGTTGTTGCTGCTTTTGCTTAATGCACGCCTCGTTAAAT:1 - chr2L 21060665 3' - I-element 294 1 70.30 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTG:1 - chr2L 14790598 3' - roo 8714 2 77.23 ACATTNACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCTCGGACTTAACTCGCGTGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAAATGGCCAATTAAG:1 + chr3R 6117303 3' + Tirant 365 2 58.42 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTATTAATTTGTTCTTTACACTATGCTACACTCTGCCTCCAAACG:1 - chr2L 20824605 3' + pogo 2071 1 61.39 AGGACAGATTTTAAGTAATAAATAAAAAAACTAGCTAACTAACTTGAAATGTGAATCATAATAAAAAGTAATACGGGTATAATTATTTGTGTAATAACAAA:1 + chrX 13631122 3' + G2 3045 1 70.30 TGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATTAGAACCAATTAAAGTAGGAAATTATTTAAAATTGGATTTTACAAAATGTAAATT:1 + chr2L 10793230 3' - I-element 21 1 56.00 GACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCATCACATTCGTTACCAGT:1 - chr3R 1418271 3' - BS3 208 1 46.53 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACT:1 - chr3L 25272556 3' - 1360 46 1 68.32 TAGTGAGTGGTGAAATAAAAAAAAAATTAGATAAAGCGTTATTGAAACATAATGCCGTGCAAATACAAATTACAACAACTATTCAATACAAATTT:1 + chr3L 25120153 3' - accord2 7323 1 67.37 TATATGTATGTACAATATGTATGTGCCCAACATATGTATATGTATGTATTTATCTCTAGGCAATGAAGTAAATCTTCCCATCATAGGGCATTTAAAGTGCG:1 + chrX 2906784 3' + Stalker2 7509 2 44.55 TAAAATAAACTAAATACATAATGTAACATAAATCAACCCTATAACTATGGATCAAAACCAACTTAGGCACTTATATGCACTTATAATCCTTAAGATTAGGT:1 + chr3L 8333814 3' + F-element 92 1 67.33 TGTAAACAAAAAAAAAATAAAAACGAT:1 + chr3L 13497773 3' + Penelope 738 1 92.59 TTTAAATTATAACGTAATTTCAACACTTCCTCTTAAGCTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACA:1 - chr2L 12893452 3' - Copia1_DM 4 1 66.00 ACAGTGGGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTGAGTGTTTGGGTGATTTTGATTGTGGACTGATGGGCTGATAGCTGGATGGCCGACCGGCAAG:1 + chrX 14328276 3' - HeT-A 5985 1 66.34 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCTATTGCTAATCTCCCATGCGAATGCCGATCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAAT:1 - chrX 16995122 3' - jockey 56 1 71.29 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTG:1 - chrX 20806867 3' + opus 7471 2 63.37 AAATGCATTTCTGAGTGGAAAAGTGTTTCCAGGTAATCTGAGGCCAAGTGGACAAACGACAGTGGCAAAGGCAACTTGTCAACTCGAATGACGTTTTAATA:1 - chr3L 14245225 3' + Bica 182 1 72.28 AAGCCGTGCGACCAAAACGCCACTGAACATGTTCTATGTAGATATTGAGCCTAACAACAAAAACCGAGACAATATATCAAAAGTGCATTTGCCAAGGCCCA:1 - chr3R 19006177 3' + G4 484 1 72.28 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATT:1 + chrX 3763248 3' - 297 17 2 61.39 GTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCAAAAAGGCGATCATTTCATTTACCACTGTCGCCCACACATT:1 + chrX 5129575 3' - Idefix 5 2 71.29 ACGGAGCTACCTGCGTTTCAGGAGGAATGGGCTGCGTGTGCCTGTGTGTGTGCGCCGTGTCCGTGTGCGGATGGAAACTCGG:1 - chr3R 24518477 3' + G2 495 1 64.63 CTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGC:1 - chr3L 10477556 3' + copia 211 2 68.32 AAAGAATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTTGATGAGTATGCGAGAGTTTTATGGCTGTATTGGG:1 + chr3R 28991901 3' - ZAM 8107 2 64.65 ATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACTTTTCTTCACGCATTCCTTATCGTATTTCTCTTGTGGCTTGTTGCTTGTTAGCCTGTTTGCTGTT:1 + chr2R 13319143 3' - P-element 344 1 65.00 CTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTCG:1 + chr4 158201 3' + 1360 3297 1 72.28 GCACATACATTGCTTATATCTATGTATCCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAAAAGGCATTGTCCGCACTGACAAGAAGGAAGCTGTCTTG:1 + chr2R 1530664 3' - Stalker4 281 4 71.29 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAAT:1 - chr2L 12815051 3' + hopper 1375 1 65.31 TTTTTTTATGTTTTTTAATAATTTTTTGTTGCTGTTATTATATTGTTTTTGTCCCTCTTGCTGCTGTGTTGTTGTTTCCTTCCTTTTTAACGGGATGCATG:1 - chrX 7570100 3' + hopper 155 1 76.24 GCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTAAATACTGCAACTACGCCGCGATCTCAGCTGATCTATCGTAAACTTAGCCTATAAAAGTGACTAT:1 + chr3R 7524303 3' - blood 262 2 57.43 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAAT:1 - chr3L 6044738 3' - Tabor 6870 2 52.48 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTTAATCGGCTTAT:1 + chr3L 4641149 3' - hobo 22 1 58.42 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGGGTTGGGAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTT:1 + chr3R 11119869 3' - 297 19 2 56.18 CTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGGGATAA:1 + chr3R 19447024 3' - roo 470 1 63.37 ACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTTTGGCGACGACAACAATAAAGAGCAAGACGTGGCGCGTGTGGAAGATAATTCCGTAGATAAAAA:1 + chr3L 8360950 3' + 3S18 175 2 62.38 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTTTAGTATTCGTGTGGCAATTTGAC:1 - chrX 20620523 3' - pogo 21 1 58.42 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATCAACGTTGATTGATGTTCTATTTTTATGTACATATGTACGGAATTAAGTGTTT:1 + chr3R 16834092 3' + I-element 5329 1 60.40 CCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAACAACAACAACAGCAACAGCAACAACAACAGCAATGGCAATGTCAATCACGGCGGCGGGGGAGGAGGAGC:1 - chr3L 17597639 3' + F-element 333 1 77.66 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATCAGTGTTGCCACTTGTCGCAAAATAAGTGAAAACATAT:2 + chr3R 8313143 3' - 297 9 2 70.30 CTTCAGTCGGCTCTGACTGTAGACTCGCGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGTTTGGTTTGCTTCGCTTATTATTAAACAATTTTGCTAATTTCCT:1 + chrX 8277482 3' - Doc2-element 4602 1 62.38 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGA:1 + chrX 2799712 3' - Tirant 18 2 63.37 GCACCNGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCAC:1 - chr3R 13225512 3' - hobo 46 1 69.31 GCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCAACAAATTTCAATAGAAGCGTTGCAAAAACAATTATATTCATCAGCGGTCGTTAGAAGATCATCAA:1 - chr2L 15942606 3' - S-element 355 1 64.36 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCACACTCCTTTTAGCCGGCAGGACACTT:1 - chr2R 15032650 3' - hobo 21 1 65.33 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGCTAGTAGACGC:1 - chr2L 16674850 3' + roo 9046 1 58.42 CAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAAAGGCAAACAAAACTGCGAAAGCCTAATTACTGGTTGTTATAACTATATGGGGCACAAACCTCTCCTTTT:1 + chr2L 13136367 3' + roo 489 1 70.30 TAGTCGGAGTTGACGAGCTGCAACTCTCTAGTTCGATGTTAAATGAATATAAACTGGCTTTGAATGAACTGAAAAGTAAATAGCAACTTAGAGATACAATT:1 + chr2R 23112139 3' - Gypsy6A_LTR 198 1 74.26 CGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGAAAATCAAAGGCAAAAAATGACATTGAAGCATTGAATTCGGAGATGAAGACAAATACCAAA:1 - chr2L 13293410 3' - 17.6 7294 2 53.47 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATATTTATATATATATAGCCTTTTGGAATCCTCGGCTTTCGGAAGCGGCTATGTGTGCGA:1 + chr3R 17495840 3' + Quasimodo 7361 2 66.34 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGGTTTTCGTAAGTCGTCGT:1 + chr3R 26842876 3' + opus 472 2 61.39 AGATCGTATTACTCGGACGCTGGAATGCTTATGTAGTCATTGGTGTTTTTTTTTGGGTATTTGTATACTATACGTTTACGAAAGCTTTTTCTTTTTT:1 - chr2R 16690105 3' - Stalker 142 4 80.41 CTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAAACTACGGCATATATATGTATATGGTATTCGAAAAGTACACAAAAGGCCATCAA:1 - chr2L 5812336 3' - 1731 19 2 55.32 GTAGCNCCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTTCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTAC:1 + chrX 22386798 3' - hobo 49 1 66.34 ACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTAATTTTATCGCTCGCCAAATGGTGCTGACAGGCAAACAAACTCA:1 - chr2L 11689107 3' - invader2 335 1 59.41 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTAGATCTACAATATAATATATAATCA:1 + chr3L 5102471 3' - jockey 4692 1 58.42 ACCCGCTACTCAGCTAGTGTGAATGCCTGTTACATACTCTACTCTACTCTACGAGCAAAGGGTATAATTATTTATGCTATCTACTTGTCAGTCATAACCAT:1 - chr2L 5120236 3' - INE-1 538 1 56.44 AGCCCTGTTAATGTGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTAGATTTTTAAATTTTATTTTCGGTTGGCCACCGGGGGGCTGTCAAGTCGTTTA:1 - chr3R 21992081 3' - gypsy2 497 1 63.64 GAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATGCTCCTTGTTGGCCTTCAGGGTGTTCAGCTCCTTGGTCAGGCTCTTGACCCGGTCGATCAGATCCT:1 + chr2L 3071189 3' - Doc 4486 1 73.27 CAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAA:1 - chr2R 5582165 3' - Cr1a 436 1 71.43 TTCAAAAAAAGAAAAAAAAAATAAACAGGTAATCACTAGTGCCGAAAAACGAAACCCCAAACGAAATGTTTAAGCTAACGATGCTGATGGGCCTGGCCATC:1 + chrX 19215577 3' - Tc3 89 1 61.39 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCG:1 + chrX 21852436 3' - Tirant 37 2 60.40 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTGTATTTCGTATTTATAGTTGCCATTTGGTATGTATTGATGTATA:1 + chr3L 17344984 3' + mdg1 7430 2 52.48 CAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGC:2 - chr3L 10081935 3' - rover 28 2 59.41 ATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGCAGGTTTTTGTTTGTTTTTGCTGCAACTGCACTGCCTCTTCTTCTTCTTCCCGGGCTTCTTT:1 + chr2R 19143060 3' + hobo 401 1 49.00 ACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCGCATTATACGAATGTCTACGGTTATATAAAGCCTCTGACAGCAGTTGCTCTCCATTAGTT:1 + chr3R 20773123 3' - invader2 170 2 63.37 TAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAAT:1 - chr2R 13644423 3' + Burdock 6365 2 54.46 CTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTGGACTTTTTACCGATGAGCCATTGGATTCTGCCCCAGTCACGATGGCGGATACTTTATGTACGAT:1 + chr3L 21354694 3' - G2 2621 1 59.41 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTGCGACCTTCTCCTCCACCTCTTAGAAT:2 + chr2L 16674937 3' - roo 8684 2 59.41 ATTGTCTCAATGACACGTTTTATTTGGAAATTAGATTGACAGAAGAAGTTTTACAGAAATGTTCGAAAATTATTCAATATTCTGGAGTAATATGAAACAAA:1 + chr2R 1116012 3' - Doc3-element 4463 1 76.24 GTCTGTCCGTAAGAACGTCGAGATCTCAAAACCTATAAAATCTTTTTATTGCCATCTTTGCTTAGTTCGCCCTGCCTTTGTTTTGTTTTATTATTTTTTAA:2 + chr3R 14062685 3' + INE-1 129 1 65.35 GCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGCGTAATATCTATCTACTCATTTTGCCGTCTTCCCTCCATAAGCTAATAAGCCAACAGTTTTAAGTT:1 + chr2L 4158783 3' - Tirant 142 2 66.00 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACA:1 - chr2L 17210271 3' + jockey 4968 1 54.46 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCC:1 + chr3R 23275308 3' - roo 8714 2 76.24 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCA:1 + chr2L 17646235 3' + flea 4986 2 53.47 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATA:1 - chr3R 27748663 3' + roo 9043 1 54.46 AGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACAGGAGCAGTGGGACGCCAACTAAAATTCGAGCTGAGCTCATCTTGAACACTT:1 - chr2R 13840067 3' + 412 174 2 59.41 GTGAAAACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACCACG:1 - chr2R 1365309 3' - jockey 25 1 60.40 TTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTCCTCTTTTCCCAAAGTGTAATGCGTAAGCACTGAAGGATTAACCATTAAATTTTGTTAAGTATTTTA:1 + chrX 8414706 3' - Bica 239 2 60.40 TCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTTTCTTTTGCTCGGCAGAGGAAGTTTTCTTTTTT:1 + chr2L 5390180 3' - I-element 425 1 67.33 GAATGATATGTGGGGTCTTAGCAGAATCAGTTGCGCTGTCATCATTTACCATTTCGAGATCTTCGGTTTTAGCCTACGCGTGTCCAATTTTCTCCGTATTT:1 - chrX 253234 3' - G4 158 1 67.33 AGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAGATACCCTTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAA:1 - chr2R 1949359 3' - INE-1 574 1 59.41 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATA:1 - chrX 10827405 3' + roo 385 2 54.46 TTAAAATTTTTTTTAAAATTTATGTCCTGTTTGA:1 + chr3L 10057356 3' + Penelope 337 1 58.82 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATATACATACAACAAGCTTTCCTCAATTCCCCTTGTTACCCGAATGTATTC:1 + chr3R 16458094 3' - roo 5 2 75.25 TTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGATCGTACCAATGTGAACCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCC:3 + chr2R 10572710 3' - F-element 4382 1 60.40 TCTAGCTTTTATAGTTCCTGATATCTCGACGTTCATATGGACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGGCTGGAGCGGAGTAAACAGGAGCAGGCGCAGG:1 + chr2L 21233286 3' - 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Quasimodo 53 2 72.00 GTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGGTGGGTCAGGTGGACAAGGACCAGGACCTGTTGCCGACACGTCCACAAAGCGAGCTGATTGGGTGAAAGCCT:1 + chr3L 8610102 3' + opus 273 2 70.30 TTATTACCTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATTCCACCCCGACAAAACTATCAACAGCAATGGCAACAATACAATGCCCCACCCC:1 - chr2L 3445384 3' + mdg1 401 2 58.42 TTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAAT:1 + chr2L 3440518 3' - Juan 17 1 66.34 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACGAGTGC:1 + chr3R 24081601 3' - 297 42 2 76.24 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAA:1 + chr2L 17646239 3' + flea 231 2 49.50 AGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTTAAATCTATTCACCAGCCAGCTGCGGCCACACTGTGCCAAATACATTTCGTCTGCCTCGGCTCTT:1 - chrX 15320136 3' - Dm88 4262 1 53.47 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAATATACCCAAAACCCTGATAGGTATGCTTTAATTTCAATCAAACATTATCTTAAAAATGAGTAAATATTCTTA:1 + chr2L 15080602 3' - hobo 2 1 81.19 AAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATAAGCACACTACGCATTATGCATAACCCAATACGTTTTATTGCCATAGTATAGAAGACTATATTTCTCGTTAGT:1 - chrX 22689567 3' - Copia1_DM 413 1 55.45 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAATGTACTTTTAAAACGATTTAAAG:1 + chr2R 6702055 3' + pogo 2051 1 82.18 TTTCTTAAAACTAACTTAAAAATGTATCTAAAATCTTTGATAATATAACTCAAAGCGTATCTTTTGATAATTGCAAGAATATGCTGGATACCAATGCTGAG:1 - chr3R 14387985 3' - pogo 1888 1 87.13 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCCATCAACTGTATTA:1 + chr2R 24628820 3' - mdg1 7078 2 62.38 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAGACATTTGACAGCGCGAGTTCAATAGCTAAATTCC:2 + chr2L 12441565 3' - transib2 34 1 60.40 TATACTATATACATACATATTATACATATATATCTGAAGCTGAAGCTGAAGCATTCCATTTGAATTATTCATTGCCAAGGCAGCCACATGGGATCGAAAG:1 - chrX 8219361 3' - Dm88 18 2 83.00 TAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATATTTAGTATATAAACTCATTCCGTTTGGTTCAATTGTCACGTAGTGGACATGAGCAAACAGATTGC:1 - chr2L 12474937 3' + mdg3 244 2 74.26 TGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATCATGTTTTTGTAGATCCTTCGAGC:1 + chr3L 5413690 3' + 17.6 125 2 76.24 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAG:1 - chr3L 17168825 3' - mdg1 17 2 63.00 AGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATA:1 + chr3L 23839697 3' - McClintock 40 2 71.00 AATAGCCGCGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGGCGACAACTCAGGAACTATAAAACAAGAGATTCTATTATGAATATACACGTGTGCCT:1 + chr2L 5673095 3' + INE-1 102 1 78.22 TACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAACTATATTCGTAGCACATTA:1 + chr3R 19346982 3' - blood 5 2 72.04 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGC:1 - chr2L 4160132 3' - Tirant 41 2 64.36 GCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGACAAAGTTCAAGAACTCTAGTTTATGTGTTAAACTAAATGCGCCCGGGCGGCAGTAAAATGCCCAA:1 - chr2L 4194132 3' - invader2 5014 2 73.27 TCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGAT:2 + chr2L 3440500 3' - Juan 35 1 50.50 TGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCA:1 + chr3L 23839706 3' - McClintock 5984 2 62.38 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAATGGTTGATTATAGCTGGGTGGATCGTTCGTGGATGGTG:1 - chrX 14726802 3' + jockey 4950 1 66.67 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTACAATTGTTAATTACTTTTACTTTGTGCTAAGAT:1 - chr2L 12441506 3' + transib2 2785 1 68.00 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCAGCCCACGACG:2 + chr3R 23275354 3' - roo 4 2 71.29 AAGGACACAAAGGGGCTTCAAGACTTCACCTCTGACTTTGGCTTTATTAAGAGCCACATGGCGCGCAGATAAGCGGCTTGTGG:1 + chr2L 16812946 3' + X-element 4677 1 72.29 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGTATATGGGTATTTGGTATTACCTGAAGTCTGGCTCAGTCGCCGACGATTTTCAGTC:1 + chrX 17830812 3' + P-element 2869 1 62.38 ATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACC:1 + chr2L 20133060 3' + flea 224 2 63.64 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCATCT:1 + chr3L 17587842 3' + roo 9034 1 63.37 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGC:2 + chr2R 16475809 3' + 412 7511 2 58.42 TTGGTAAAATATATACATACATCTATCCATATTTGGTTCCATCTATCATATTAATCCCATTTCGCTGCAGGCAAAGACATATTTTAGCCCCCCCTTATCAT:1 - chr3L 14299092 3' - 1731 103 1 60.40 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCAACGCG:1 + chr2R 16940424 3' - 297 6587 2 74.26 CTGTTAGCTTATTTAAGACCAAGAATAAAGACGACGAGCAGTCGAGGTTGAGCAGCAAGCACTTGTGGACGATGGAGAGTTTAAGAAAATAGACAACGAGA:1 + chr3R 11148730 3' + ZAM 8252 1 70.30 TGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTACCTGCCCCTCACAAAGGCGTTTATTTGTACACAAATATCTTCAAGAAGG:1 + chr3R 8976039 3' + Bari1 1702 1 72.28 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCT:1 - chr2L 15947406 3' - Transpac 4973 2 74.26 TGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGCAGCTGCCCTTTGAATTGGG:1 - chr3R 16400124 3' + blood 7386 2 75.25 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTC:1 + chr2L 7255817 3' + P-element 2862 1 54.46 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTCTTGATTCTCGCTTTTTATT:1 + chr2L 19684047 3' - jockey 4680 1 65.35 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAGAAAATGGAATTGATTGT:1 + chr3L 9909747 3' - Transpac 33 2 65.85 CTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAA:1 + chrX 15894652 3' + S-element 1667 1 75.25 GAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCATCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCTGCGATAAATTTTACATGGTTTCCCAAAATGTTTATGTTAGAGC:1 + chr3L 26719114 3' + F-element 4488 1 62.38 ATTTCNAATAGATTACGATGCTGCATTTCTAAAATTGTGGACAGGCGATCATCAGTGATGGCTTGGGGTGGGCTGTTTGTTTTGTCTGTTGGTATTACATA:1 + chr2R 22739312 3' - invader6 461 1 66.34 TTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTCTAAATTTTGTCTAGATTGTTTCCTCTACTTATATATTTA:1 + chr2R 3592053 3' + Quasimodo 7333 2 60.40 GAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGAT:2 + chr3L 11661794 3' - hopper 25 1 51.49 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGA:1 + chr2R 11528046 3' - P-element 60 1 21.78 ATAGTTCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTG:1 - chr4 311210 3' + 1360 3356 1 58.42 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACAGTTCTAGTGAATCCAAAAGTTATGCTGCCAAAGTGGATGCAAATACCCCAGGCATATATCCATT:1 - chr3L 8614466 3' + opus 491 2 66.34 GTTAATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGTAACTTCACGAAGCATTAATACACGTACATCATATGCATATACATATATGTATCAAGCATGTAAAGGTCTCG:1 - chrX 13590513 3' - gypsy7 5014 1 81.19 AAAATAAATTAAACAGTTAACCTTTTTACCATCAAAGTCGCCACTGTTAATTGCTTCAATCAACTGCTCAGTTATCTTTATTATTTCTTGTCGTCTAGCTG:1 + chr4 1038416 3' + HeT-A 10 1 72.28 TGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGACAATTACTGTAATTAAATTACATTTACACTCACACAAAACACCGTGGTGCT:1 + chr3R 22676731 3' + micropia 5138 2 56.44 GAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGTAATAATGTAAAAGGAGTTAGTATTTTGTACAGTTTGGTGTTTAGTTTTTGGTATTTGTTTAGGCGAGTTTAT:1 + chr3L 9158217 3' - TAHRE 10293 1 54.08 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAA:1 - chr3R 20556130 3' - 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Ivk 38 1 59.41 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTTTTTAAATAAAATAATCCTATATATGCGCT:1 + chr2L 10473505 3' + flea 218 2 78.35 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCATGTCCGTCCTGCATCTTTCCCAA:1 + chr4 1149943 3' - 297 6591 2 69.00 AGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTTCGTTTATTTCCTTAAATTCTTCGCTTTTCG:1 + chr3R 17321825 3' - Stalker2 7248 1 45.54 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATATAATCTATATCAAAATTTTGTTAACCAATTGCA:1 - chrX 15082392 3' + mdg1 7418 2 67.33 TATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTGATGGCAAATGGCAGCAGTTGAACCGCTAGAAAGCAGCCGAGCGTTACCACCTTTTGGAGCAAGTG:1 - chr3L 11554912 3' - P-element 2710 1 64.36 TATTTTTTAATAATATATTCTTTCAATGAAAATAAAAATCAAGGAAACAACCTTAGATTTACCTTTAGACAGAATAATAATACACCAAATATAATAAACAA:1 + chr3L 25801408 3' + hopper 163 1 76.24 TTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTAGTCTTGCAAATTTCCATCGATTTGCAATGCCCAATCTAACGTCCACAAAGCGAAATGACCACA:1 + chr3L 26170100 3' + diver2 4658 2 71.29 GTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTCTCAACTGAGTGCTCTCCCCACTTTTTGGCCATAAACTCTTTTTTATTTCATT:1 - chr3L 10824851 3' + mdg3 5136 1 63.37 TGGTGGCTAAGAAGTTGATTTGTGTACTAGAGACTATTACCTCACATCAGCAGGTTGGATATCTGATAGCAATTGTCAAGTATCGGTT:1 - chr2R 1995494 3' - Porto1 4457 1 81.82 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCAT:1 - chr3R 4591862 3' + opus 450 2 78.22 GCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGCTCCTGCTCTCTCATTTTGTAACGTATGTATGTGGCCCCCGTTCAT:1 - chr3L 12632614 3' + jockey 453 1 57.43 TTAAAAATAAACTTTAAAAATATATTATTAAAAAAAAAAATTGGCCTCATTTGATATCTCCTTTGGGGTTAGGAACATCCCATAATTTCAATTAAATTGAA:1 + chrX 4584951 3' - hopper 178 1 74.26 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGGTCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAA:1 - chr3R 19989270 3' + hobo 2895 1 70.00 GTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGAATGATTAAGTATGTTGAGCACGGCTATTCAGGCAGCGGTCGCTCCCCTGAGTCTTCGGATTGCGAGCGG:1 - chr3R 24936966 3' - G2 2975 1 53.47 ACAGAGACAGACTCGAGACCGAGACACGGTCGCTCCCGGAAACGGACAGTGGGTGCTCCGGAATTGCCGCCACCTAAGCCGAGAACATCAAAGCCAAAAG:1 + chr3L 9825501 3' - Stalker 421 1 66.00 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGATTTGCAGCTT:1 + chr3R 6273570 3' - blood 45 2 69.31 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGCGAATGAGGGAACATAA:1 - chrX 19162568 3' + pogo 2097 1 72.28 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAACCTACTAGGTACAAGACTGAGTGTGCTT:1 - chr3L 4122441 3' - P-element 46 1 39.60 CGACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGAGTTTCTAAA:1 + chr2L 17722840 3' + blood 345 2 55.45 TAAAGATGCAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACAAAAAACGGCACTTTAAGTGAT:1 + chr2L 6454772 3' + mdg1 368 2 74.26 TCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATTGTGTTTTTCTTTGTTTTATTTCACTTTTAATGGTTGCTGCTGTTGGTGAGTC:1 + chr3R 22058016 3' - HMS-Beagle 6714 1 62.38 ATAATTTACTTTTTTTTAGGAAAAACTTTATGAGTATTATGAGTTTGTTTTAAATCCTATTTGTTACGTTGTTACGTTTAGTTTCTCAATTCGTAAAATGT:1 + chr3L 12118138 3' - I-element 5160 1 59.41 CACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAAGCGAATAAAAAGCGGGAGAGTATTAAAAGCCAGCGCAAATCACATGCAA:1 + chr3R 29364140 3' + Doc 4415 1 55.45 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAACGAAAAAAGCGTAGCACACTTTTCGGGGCGCCCATTTTT:1 - chr3R 22644128 3' + hopper 1400 1 64.36 GAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTGGTTCTTCTTCAAAACAGAAAAACACTCGCACGTGTGCGTCGCTACCTAGCAACAACAACAGCAATTTTC:1 + chr2L 15478381 3' - Stalker 6969 4 76.84 GTTTATTGCTGCCCATAAATATAACATATTTATAGTTTGTCTAAACATATATTTTGTTTAAATTCTGGAACAAATTAACGGTATTCTTCAAGCTACAGATT:1 - chr2R 5018792 3' - rooA 51 2 56.44 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACACAATATCTGTGTTTCGAAACCCTTTTACACTTAATGTTATCATGCAAAGATT:1 + chrX 15392033 3' - 1360 20 1 47.52 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCGTTGACTCC:1 + chrX 21017874 3' - 412 16 2 42.57 TTTGGNTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATA:1 + chr3L 23839700 3' - McClintock 38 2 67.33 ACTTTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACTGCAGACTGTTTGGGTAGGTATTGTTGTTTTTGGGGCTGAGTAAACGTTGCAAAAAAGTTTTGCGTGTTAACAAC:1 + chr2L 14828863 3' - jockey 4719 1 61.39 ATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTGCAATTTCGTTTACGTTGCGTTGTGGCTTACATGTTGTTTTGGTTTTATTTTACATACTCGCACACT:1 + chr2R 19525545 3' - 297 6523 1 73.27 TCTTCTTCCACGCGCGATCTGGCTGACTGACTGAATGATTCCTACTCATCCGCCCCACGACTACTTGCGTTTCTTTATTTTTTGGCCGCCTGAAGGGTTTG:1 - chr2L 17944755 3' - gypsy8 391 1 51.49 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGGATTAATTTATATGACTTCGC:1 - chr3R 8555852 3' + 412 7511 2 61.00 GAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCAATCGGTTGGATGTATGACAAGTG:1 + chr2L 5690837 3' + TART-C 11095 1 63.37 ATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATATATTTGAGATTTCTCTAGATTTATTGAATTCACAAA:1 + chr2R 7032235 3' - mdg1 7038 1 77.23 AATACAACTCCTTTTTTCAAAATTTGTCGAAAAAAATCCCAAATCACTCCTATTAATTTTATGTTTGATGTTTTCACACTTTTTCCACAAACACTTTATGT:1 + chr3R 22393973 3' - Tc1 287 1 61.39 GAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATATATACA:1 + chr4 559327 3' - INE-1 518 1 85.00 TGGTATAGCCTTCTTTTACCTTTTCTGGTCCTGTGCTGGAAGGTCTCCTGGGTGAGGAGAAATCCCATGTAGTCATAGAACCAGAGCGTCGGCTTACAGA:1 + chr3L 681476 3' - P-element 402 1 81.00 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGAGTCCTTTCCGCGCTCGCTCTCGCGCTCTCTCTTAGGGGTCTTCG:1 - chr2R 5804445 3' + P-element 2877 2 69.31 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTT:1 - chr3L 7075876 3' + roo 9041 1 57.43 GAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAG:1 - chr2L 18279904 3' - gypsy5 40 2 60.40 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACCCTATAATAACAAAGTGAAAATTTGAAATTATTTCGTGCG:1 + chr3R 14917255 3' + HMS-Beagle2 7158 4 60.40 TTATTATTAATATTATTATTATTTTTTTTAAGTTAACTAAAATTTCATTAGAATCAGCTGTCTCCTTGCTACGACGCTCCCTGCTTGCATATCTAAATCTC:1 - chr2L 20556768 3' - mdg1 7079 2 87.13 AACTAAAATGTTTTTAAATATGTTTATAACGAATTTTACAATCCATTTAGAAAGCATGTGCGTTTGGGCGAATTCAACGTGAAAACTGAACCCGACTGCAT:2 - chr3R 30242393 3' - transib3 111 1 68.32 TCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCCTGACTGTGTCATTTATGCATTGGCGACTGATTGATTTGGCAC:1 + chr3R 12161070 3' - Doc 412 1 60.40 TGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:1 + chr3R 29534664 3' + Stalker2 7254 2 63.37 TAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACACAGATTTAGACGCCACGCCCCCCTACTC:1 + chr3R 23682138 3' + Gypsy6A_LTR 391 1 78.22 ATGGAAGACAAGCTGTTTAATTTACATATAAAGGAAGGAACACAGTAGACTTACCAGCACGC:1 + chr3R 24761376 3' + pogo 1823 1 56.45 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTG:1 + chr2L 16674911 3' - roo 8709 2 73.00 TAGACAGAAGATTAATTTGGCGTAAGCACAATGAAGCCAAGAAAACAAATGTGAGCATATCACTTCCACTTCACTTCACAAATGAATAAAACTCTTCGATA:1 - chr2R 13087176 3' + Doc4-element 2447 1 60.40 TGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCCCTAATGTAAACATTAACATCCGCAGCGAGTGGATTTAGCCGAGCTATT:1 - chr2L 1287398 3' + Quasimodo 122 2 72.28 ACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGCTATGCAATTTCAACACACTGGCCATTGTCCTTAAATGTCCTTGGCTTGTGCACCT:1 + chr3R 10194528 3' + jockey 478 1 61.39 GCTAAAAAAAGATAAAAAAAAATATATCAAAAAAGTCCCCAAAAAAAATGAGAAAAAGAGCGACTGGCCGCAAGATGGAGGCCAGCTATGTTCAGGCCACT:1 + chr3L 3690992 3' + G-element 4325 1 69.31 ATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCA:1 + chrY 3648911 3' + 17.6 486 2 72.28 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTAT:2 - chr3L 4801524 3' - roo 49 2 74.26 GAAAATTTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAAACGTATTCAGAGCAAATGAAACGAAACGAAAATCGATAATGAATTAATTTTCAGGCACCGA:1 + chrX 10167722 3' - FB 134 1 65.35 CCGGCAATTTACAATGGCCAAAAACAATGTGCCCAGACACATATGGGCTTATTGCGACTAAAACATACCTGGTACTGTCTATATTCCTATGATCCTATCTT:1 - chr3L 18428571 3' - aurora-element 4148 1 57.43 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTGGGCTATACACGCAGAAGACCG:1 + chr3L 13659977 3' + pogo 2085 1 63.00 CATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGC:1 + chrX 12290216 3' - X-element 64 1 76.24 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTA:1 + chr3R 11119857 3' - 297 6624 2 75.25 TTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGG:1 + chrX 12290223 3' - X-element 57 1 69.31 ATAAANACGCACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCTCCCACTCTCAACTTCACTCAATTGCTTTATCCTTACTTCCTTTCCACGA:1 + chr2R 3904307 3' + Porto1 463 1 61.62 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGGAAAATTGCAGCTACAGCCTGTGGCACTCTGTGTGTATGTGTGTATGTGTGAGCCGACTATAATTTCATTTGT:1 - chr2L 315106 3' - Tirant 8108 2 78.22 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4826124 3' - 1360 19 1 78.22 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTATGCAAAT:1 - chr3L 4801518 3' - roo 37 2 66.32 CACTTNACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATT:1 - chr2R 5067656 3' - F-element 61 1 73.27 GACGCACATGGCATTCAAACCATTAATGCGGTGCCCAAACCTCCACGAATCACCCACCAACCCACTCGCCACCACCTCCATCGTAATCTCCATCCACTCGA:1 - chr2R 8045613 3' + HMS-Beagle2 6754 1 47.52 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAAATGTGTAGTCCAAACGCAAATCACCTAAAATGAA:1 - chr2L 6454701 3' - mdg1 7047 2 64.36 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTGACAAAAGACTATATTACATTTG:1 - chrX 19426223 3' - mdg3 5273 2 58.16 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCAACATGCTTCGAAAATCCCAATTGAGTGTACAAAATATT:1 + chrX 10672358 3' + mdg1 385 2 60.40 CAAGCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTAATCTTGAGAAGGAAGACCTCTGGACACAGGAGAGAAATACATAACTCTGGAC:1 + chr3L 25773227 3' + gypsy 7352 2 76.77 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCTACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGGAAGTTTGGCCAGTTC:1 - chrX 19986353 3' - Stalker2 14 2 54.65 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGAGTGTGACAGCTAGCTTTTAGCCATACACGTAAAGAAAAAATAAATGTAAATGA:1 - chrX 5107949 3' - accord 255 2 65.38 GACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGCTGGCGGACAAGTACCTC:1 + chr3R 10240196 3' + invader4 328 1 79.21 AACGCTTAGCAAACCTTTGGCTGAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGCCAATCGGGCCATACTAACTGGATG:1 + chrX 15294585 3' - Quasimodo 7231 2 75.25 ACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCTATCTGGACCTATGGCTCCCGCGTTGGTTGTGCGCGCGTTATACTCTCTAGATACGAAAAACAAACT:1 - chr3L 12408578 3' + F-element 4227 1 54.46 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCA:1 - chr2R 5950693 3' - mdg1 39 2 65.35 CTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATT:1 + chr3R 10240155 3' + invader4 287 2 72.28 CTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGCCAACTCACAGGATCTGGCGCCCAACTATGCGGGCACGTTGTACGGCATCATTAAC:1 - chr2R 20248531 3' + Transpac 5158 2 58.42 TCATGCGTATTGGGTTGGCATGACAAAAGGTCATAACTTTACACTTGGAGCCCAAAATGCACGTCGCTCGTAAATCTCGCGCGTGAAAAACATCAGTTTTC:1 - chr3R 15726499 3' - Q-element 695 1 52.48 CTTCGAAATCATACTGAATCCTAACATGCTAGTAAGTGCATAGCAAAAAACAAAAAAGGCGCAATTAGCTCAATGTTTTTTTTCGGAAAGAACAAAAGGCC:1 - chr3R 8271501 3' - hobo 420 1 64.36 CGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:2 + chr3R 1977616 3' + micropia 5405 2 58.42 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAG:1 - chrX 20806890 3' + opus 448 2 87.76 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCGGCACCAGAATACGAGAGAGAGAGCACTTC:1 + chr2R 10444293 3' - P-element 43 1 36.63 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTC:1 + chr2R 24021664 3' + pogo 2092 1 70.30 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGGAGAATATTTCTAATTGGCTTATGTTTGCCATAAACTGTT:1 + chr2L 9163783 3' + copia 5088 2 62.38 AACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGGGTGAAAAGTGTTGTAATTGGCAAAGAAAACACACACACCAGAC:1 + chr2R 7687006 3' + BS3 1418 1 56.44 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACACTTTGATT:2 - chr2R 14778416 3' - mdg1 7048 2 70.30 TAATATTTAAATTTAAATTGTGGGGGTTTGGAAAACTCAAATTGTCGCTGGAATTACTACGGTCAAGGACTTTGGCCGC:1 + chr3R 20914063 3' + TART-A 13181 1 69.62 TTTTAATTTAAATTTCTTTGTTGTTGTTCCTGTTGTTGGTGGCAGTGCTGTCTATTTTGGTCATAATTTTTGTCGTCTTGTTATTGATTAAAATTTTAAAC:1 + chr3R 23429871 3' - P-element 2635 2 81.19 GGTCGGAGTTGACAAGCTGCCGCTTCTTAATATGGTTAATGCAAATAGGTATAGTTAAATTCCAATATTGTAAGGGATCTATATTTTCATCCGAAGTCTTT:1 - chr3L 23155747 3' - Gypsy6A_LTR 197 1 68.32 TAATANTTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCGCAAAC:1 - chr2L 13334013 3' + flea 4990 2 55.45 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTT:1 + chr2L 16948715 3' - jockey 4716 1 67.33 CTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATT:1 + chr3R 13582283 3' + BS 5062 1 56.44 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAA:1 + chr3R 13225541 3' + hobo 2914 1 66.20 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAA:1 + chr2L 3340002 3' - FB 51 1 76.00 TGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTTGTCCGTGGATATGTAGTGAATGGGCGGCGGAGGCAGCTTCTCCGAGTCGGAGTTGTT:1 + chr2R 14762764 3' - Quasimodo 328 2 65.66 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTT:1 + chr3R 10277268 3' - Doc 61 1 77.23 CAGCCTTACTCCATGTTACATATATTCTTTCTTCCCATTGTCTACACATAATATAGTTATGCAAGCATTTTGTTTGAGAAATGTACTAAAATCACTCGAAA:1 - chr2L 10473413 3' - flea 4755 1 79.21 AAAGAAAATGAAACAAAAAAAAAAACAAACAACAAATCAAATCTAATGGAACCTAAGTTAAGTGTAAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAACA:1 + chrX 8431467 3' + Doc2-element 219 1 55.67 AACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTGGACATGCAAATGTGGACATGCGTCCACTCCCTCGAGTCCCCAACCCATATCCATTGGTTTCC:1 + chr2R 15474882 3' + roo 397 1 65.35 TCTTTAAAAAGGGAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAAAACAATAAATGATTGGGTATAACATAAACTACACATATCCGCTAAACGACAAA:1 - chr2L 7219199 3' + Stalker4 6941 2 73.00 ATAATTATAAATAAAAAACAAAAAAATTGTAAAAAAAAATCTATTTATTTGCCCATTAAATTAGTCTACGTTGCAAATCTGAGATCGTGATTTCGCTTTCG:1 + chrX 17088926 3' + Burdock 312 1 61.39 CTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTCGAGCCTTTTCATGTAATTAGGCACCTGCTATTATTTCTTTTCAATTTTTTCGTTGTT:1 - chr3L 9307586 3' - G6 1838 1 54.46 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATGCATATAAACGAGTACAAAGTGTTACAAGAGGACGGAAACTCCATGATCCCAAA:1 - chrX 10603363 3' + I-element 5325 1 56.44 AAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATGTATATATATCCATATACAAAT:1 - chrX 21292588 3' + rover 323 2 57.43 ATAATAAATATTACAAAAAAAAGTTCTCTATGCAAACATAGCAAAGATGCATGAATATTAAATTAAATAAAAAAGAAAATCTAAACATTGGAAACTTATTT:1 - chr2R 17921314 3' + Doc 4692 1 83.17 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGCTTATTTTTGAAGTGTACAAGATCAATGCTAGGGTTTGAGGAAGAGTTCATAAA:1 - chrX 8682628 3' - pogo 22 1 57.43 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAATATTTCATGTTTTTTATAATG:1 + chr3R 27981754 3' + roo 400 1 70.30 GAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATGAATATAAGCAATGCATCGACGGCCCAATGCGAGAGAGGTGTTGAAAAAGAAAATTACAACCACTTTACCGATTTACTG:1 - chr3R 25081628 3' + invader2 289 1 59.41 TAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAA:1 + chr3R 21666971 3' + INE-1 104 1 64.36 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATTTTCAAATATTATTAATATTTTTCAACACCTCAAAGATGTAATTCAGTGTGGCGCTGACTG:1 - chr3L 1674052 3' + mdg1 39 8 70.79 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGCTTACATTGCGTATAAGTT:1 + chr2L 13574300 3' - pogo 3 1 69.79 TTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGTAACATAAAATTAATCAACAA:1 + chrX 12518124 3' + S-element 236 1 75.58 CAAAAAAAACAAAAAAAAAAACATTGAAAGTAAACAGAAAAGAAAA:1 - chrX 18252446 3' + HMS-Beagle2 488 11 93.48 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAATCCTATTTCGATTTTGAAGTTTGACCCATTAAAGCAAATAGAAATGAATAGCTTAAC:1 - chr2R 9770170 3' + I-element 5344 1 58.95 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTGCTCACACAGTGGGTTAAGAATGA:1 - chr2L 6601414 3' + I-element 5308 1 77.23 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACACGGACCGGCAATCCCCT:1 + chrX 13546726 3' + roo 398 1 69.31 GGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATTTT:1 + chr3L 24123310 3' - GATE 8270 2 54.00 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCA:1 - chr2L 22084480 3' + copia 220 1 57.43 TTAAGNGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGAGTCCTTTCCGCGC:1 - chr2R 5804476 3' - P-element 41 1 38.61 AGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGCTAAAGAAATTGACACAGTTTGCTAAGCGGAGGGTAATGGGGAATGGGCCGCGGACTGCGG:1 - chrX 18563369 3' - Doc3-element 499 1 65.62 GGATTAATAGCCTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGAACGTCGAGATTTTAATAAAATTAAAATATCGATCAACAGCGGTGGTAACGAGCTC:1 - chr2R 25240186 3' + INE-1 97 1 50.50 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTAACCTTTAAACACGATCACACATGCTCGAGCTAGTACAACGTCGGTCTGAAACACGTGTTTTAACACAG:2 + chr2L 23390280 3' + P-element 2881 2 74.26 TTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTTCGTTTAGTTCCCGAAATACGTTCCTACGGCCAGGGAGCAGAACATACCG:1 - chr2L 22003486 3' - Quasimodo 460 2 56.44 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCG:2 + chr3R 4834335 3' - mdg1 21 2 58.42 TTGTTCCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCGGCATCAAATTTC:1 - chr2L 17646152 3' - flea 12 2 67.33 ATTACAGTTACACGCGAGAGGTTTTGCGGTTTACCTTTTCAGTTAAATAAGATCGATAGCTGAACCCTTTTGAGCAAGCGATC:1 - chr2R 1577190 3' + Tc1-2 112 1 55.42 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAGAAGGGGTGCCTAAAAATGTGC:1 - chrX 13761261 3' + pogo 2052 1 77.78 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAA:1 + chrX 21564723 3' - diver 48 2 76.24 GGTAACGGGGCGTGCACAAAGGAGACGCACCGTGAACTAACGGTATCGTCCACGGGCGGGGCAACGCTCGGCCTGGGACCATCTGTACCGTCCACTG:1 + chr3R 3379926 3' + gypsy8 4796 2 56.70 CAAAAAAAAATAAAAAAAACTTTAAAAATAAATTGATCCATTTTGTTGAAAAAACTATCTACGTTAAATTATAAGTTTCAAAATAGTTCTGATACTACCG:1 + chr2R 10394110 3' + HMS-Beagle2 490 1 71.00 GGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATTTTACACAAATCGATTTTATTTCACCAAACCACGCACTTCTTGAGCGGA:1 + chr2L 12667271 3' + blood 7387 2 72.28 ACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTT:1 - chr2R 5260085 3' + 1360 3225 1 63.00 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTAT:1 + chr3R 13376054 3' + 1360 3376 1 67.33 TGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATAGCCTGGGAAGATATCACATCAAAACCGATTCGGTTGCTGTCCCAATGTGTTTCTC:1 + chrX 14426565 3' - accord 6949 2 61.80 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTG:1 + chr2L 13136788 3' + roo 9027 1 72.28 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGAGTTTCTAAATAATCATTCA:2 + chr2L 17722850 3' + blood 355 2 57.43 CAAGAACTATAAAAGCAAGAAGGTTGATATTAAGCATACAGATGGACGGGCCCAGCTGGCGCTCCTGCGGCATGTGCGTCTTCATGTGCTTCTTTAAGTGG:1 + chr3R 4345620 3' + INE-1 155 1 61.39 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATATTTGTTTTTCGACCCAGTGTGTATATCAGCAGAGCCCAACTGTGGCATCTAAAA:1 + chr3L 6506896 3' - roo 15 2 57.43 GTCTAAATAGCTATGCCCACTAGTGTACATGTATGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGC:1 + chr2R 6164610 3' - Tc1-2 4 1 43.56 TTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAG:1 - chr2L 3632140 3' - P-element 29 1 51.49 GTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGTCCAAAACCGAAGCCGAAAACAATAAAAGTTACATTTAGC:1 + chr3L 18338497 3' + Juan 4153 1 60.40 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTTAAACGAAA:1 - chr3R 7388322 3' - HMS-Beagle 6809 2 66.34 TTTAAGCAGCTCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTG:1 + chr3L 18706922 3' + jockey 4942 1 67.33 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCGAGTAAAAATTTACATAGCATCCGTTTTG:1 + chr2L 17311168 3' + S-element 1703 1 64.36 GTTGAATAGTATATTCCAACAATACTCGTTAGATTGGCCATCTTAAGTGCATCGTCGGTAGACGAGAGTGTCTGTGTTTGTGTACTTTCTTTAAAGTCTGA:2 + chr3R 22782063 3' - copia 4869 1 77.23 AAGAAAGTGTAGCTATTGAAGATGAGGCCGTCTACGTAAAGCGATACTATTAGGACTCCATTTCGCTCACGTTTCAAGTACACGCAGTTGTCGGCCGGA:1 + chr2R 6437732 3' - Circe 7242 2 81.82 ATTTGNATTTACCAGAATAAAGAGCGGCAGCTCGTTTTTATTACTTCCTCTGCTGATGTAACCTCGGAATCGGACTCTAAAAGGGTATGAATCTGTCTTCG:1 - chr2R 5269319 3' + Gypsy6A_LTR 173 1 57.43 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATT:1 + chr2L 16884875 3' + pogo 2054 1 74.26 TACGTTAAGAGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATATGGCATTAACAAGTGTTGCTGTCAGTGATGAGCAAAATCCAC:1 - chr2L 7800056 3' + P-element 2854 1 46.53 CGGCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAG:1 - chr2R 10444240 3' - P-element 10 2 59.74 ATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATCAACGTTGATTGATGTTCTATTTTTATGTACATA:1 + chr3R 16834073 3' + I-element 5310 1 65.35 CGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTTTTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAATGATGCG:1 + chrX 22945370 3' - BS 12 1 66.34 AATCCCCTAGCAAGAAAACTAATCCTAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGAACTCCCAGCCTTACCGATATATCATCGACATCCTCACGAAGT:1 + chr2L 11611605 3' + Doc 4499 1 68.32 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAACAAGTGTCATGCGGCATGAAATCTGGGGCATTGTAACAAAAAACTATTTAAACATTGGCTTCAAGGCAATTTTT:1 - chrX 6701438 3' - FB 3 1 76.24 TAGTTTCTCTCGCAGTTTGGACTTTTTACCGATGAGCCAGTGGATTTGCCAATATCTCAATGCATTTTACCCAGTTTCATTAAGGCGATCCGCAGGATCAA:1 + chrX 8653945 3' - G2 2603 1 61.39 ATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGC:1 - chr3R 20147860 3' - 1360 254 1 67.33 TAAGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGGAAAGACATAAAGCAGCCAGAGTCGAGCACTAGTTGGAAGCTG:1 - chr2L 10710342 3' + Quasimodo 66 2 57.43 CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGCGATTTTAAAAACAGAAAACGATAATCTCAACGAATGATTGGAAGAACCCTAATCAAAATTTGCTAACACTGC:1 + chr3L 28006838 3' + INE-1 12 1 74.26 GTCAGAACGACACTCGCGCTCAGCGTCAGCGCGAGAGAGAGTAAGAGAGTTGGCCGTCAATCTTCGCTCAGCATCGTGGTGCTGGTTCCCACAATACCTTA:1 - chr3R 1301373 3' + F-element 196 1 65.35 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACCCGTGTAAATGTGA:1 - chr2L 19018931 3' - hobo 15 1 61.39 CATAAACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAGCCATTTTTT:1 + chrX 13798933 3' - 412 75 2 67.33 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCC:1 + chr3R 12047477 3' - Stalker2 36 2 59.00 AATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCACTCGAGTGGTGTGGCAATTTATAAACACGGTAAAGTTAATGTTTCAATTAATATTTCAGTTTTATAT:1 + chrX 23048357 3' - hopper 1009 1 61.39 CAGTCTTAAGCTACACTCGATGAGAGTGAGATCTAAATAAAATCACAACCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGGGTCAGGCTATTTGGTTTCC:1 + chr2L 16095094 3' + gypsy5 277 2 80.20 TCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTG:1 + chr3R 7388418 3' + HMS-Beagle 221 2 58.42 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCTTTTTTATG:1 - chrX 19986344 3' - Stalker2 20 2 59.41 AATAATGAACTTTTTTTGGGAAGCGATGATAGCGAATCGCCGGCAACTTGAATCCATGCATCTTCTTGGAATAGCTGAACAGCAGTAAGTATTTGTAACGC:1 - chrX 19203810 3' + transib3 2518 1 70.30 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGGATTAATTT:2 - chr3R 8555864 3' + 412 445 2 73.27 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCA:1 + chr3R 19446202 3' + 297 6922 2 81.19 TCATGTGAGGACTTACAACTTAAGTTGGATCTTCAGTTCTCATAGGGTTCATTTGAAGAAAGGTGGACTGCTGGCATTTCCACGTGTTTGCCAGCAGATAT:1 - chrX 14766325 3' - BS 4988 1 73.27 CTCTGTAGCTGCGGTGTGGTACAGAGTGCGGATCGGGACCAGGTGGCGGCATCGATTCTGTGGTTCAAGTACCATTTGGCAAGATAAATAGAGATTTAGTA:1 - chr3L 17516993 3' - Chouto 436 1 45.54 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACTATTTTGGAGTTCTACGTACTGACCG:1 - chr3R 16245055 3' + 1360 3356 1 74.71 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGATTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATTGTAAATGTTTCAATAATA:1 + chr2R 10774110 3' - copia 4898 2 53.47 AATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAATCAAAATATAATGTAAACTTTTTT:1 + chr3R 29123177 3' + P-element 2588 1 32.67 GGGGATCTCGACTATAGCATTCTCTCTTTTTTTCTATTACCTTTCTTTTCGGAGCTTCTCTTCGTTTAACAATTATTTCTTTTTTAAGCTTTTGTTTGCAC:1 - chrX 159742 3' + INE-1 571 1 72.28 TGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAA:1 - chr2R 13585478 3' - Juan 4077 1 72.28 AGTTTTGAGCGGTTTTAGGGCTTAATGATAAACATAAATTCTCCACTGTGCTATCAAATTGAAGTTCGTCTGTGCATTGATTGGAGTGTTTAAAAGACTGG:1 - chr2R 4823735 3' - INE-1 346 1 64.36 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTGCAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGTTACCAAAGATTTTCCTGAGATTATGCAAATGTGC:1 - chr3R 26321603 3' + blood 7370 2 59.41 ATGCGNATAAGCTCTCTCTCTCTCTAACTACCCCAATGTGATTTCCTTTGCTCAGCCGGCTTTTTGCTCATCTTCCAGTTTTGGGTTTTATCTTAAACCAA:1 - chr3R 26533991 3' + blood 7169 2 75.25 TAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAGAAATCA:1 + chr2L 14612126 3' + roo 403 1 73.27 AGCATTTGACTCTATTAATCATTACCTTCTAGTAAGAAAAATTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGACTAGCCTACGTACCCTGTCGTCCTTTTTGGCCTCC:1 + chr3R 1865556 3' + Q-element 327 2 64.36 AATATACACAAAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAATGAAACCTATTCTCTTGATATTGACCAACTTGATCATGTC:1 + chr3R 2208361 3' + Doc3-element 4441 1 60.40 TTATTATTATTATTATTATTACTATCCCATTTGTGTTGTGTTTTGTTTTGTGAATTGGTTTCTTCGATTCGATTCCGGTGCGCGCTCACTTTATTATCTGC:1 - chr3L 20785135 3' - mdg1 41 8 45.54 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGG:1 - chr3R 25097845 3' + P-element 2852 1 42.86 TCTTANAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACCTTCAAAGGTTGTTTCTAATAACCGGCAAGTTGCTCTACACTTCGATTT:1 + chr3R 3771654 3' + roo 9046 1 53.47 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTCTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAAAATATTAACAACATTG:1 - chr3L 14396960 3' - BS 5004 1 61.39 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAGCATCAAATAAGGAT:1 + chr2L 20133084 3' + flea 5005 2 72.28 CGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTTTACAGTAATTTTACTACAATTACATAACAATCACATATAACAGGTAGGAACGATGCCGTTGATGGTAAATAA:1 + chr2L 14115138 3' - X-element 4623 1 68.32 TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCGTAGTTTTGGTAGTTTTGTTACTGTTTTTATATTGTACCTTTAATTCTATTA:1 + chr2R 13404020 3' - BS 20 1 53.47 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTACTTGTCAGTTAAATCATTTGTAATTGAAAGTTAA:1 + chr3L 17168929 3' + mdg1 410 2 68.32 TAGACTTTATCCTATTATCTGTTATCTTGACTCTCATTTCAATTTGAATTTTTTATTATTTAATTATAGGGCGTTGAAGGACTGCGGATTCGGATTTTCCG:1 + chr2L 2799370 3' + Cr1a 4213 1 67.33 TTGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGTATGTTGTTTCCATTGCATTGTAGTGATTTTGCTCATATTCAAGATAATTTAATTTATAGAGAATAGTAA:1 - chr2L 13444026 3' + Quasimodo 66 2 69.31 TACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGA:1 - chrX 21474425 3' - 1731 4355 2 70.71 TAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCTTCGACTCCTGTAGCCTGAACGAGATCTCCGAGTTGCCCACAACCCCAGAAGATGCCTCGGCCA:1 - chr3R 23116595 3' + Cr1a 4149 1 72.00 GTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATATATATATTTACATAAAAATTAAAGATCTCTCGTCGTTTAGTGCAAATTTCGCTAGATGATC:1 + chrX 21292690 3' - rover 6957 2 72.28 GGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGCAGCTGCCCTTTGAATTGGGC:1 - chr3R 16400123 3' + blood 375 2 76.24 TTTGGCTCAACTGAATAGGTTTGACCACTAAAACTATTTAACAAAGTATACATTTATTAGTATAAATCAAAATTGGGTATCCCGATAGCGCCTCCTACGAT:1 + chr3L 27355348 3' + Tc3 218 1 73.27 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGG:2 - chr2R 7861645 3' + roo 395 1 66.34 TCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGCCCAACAAGCAGGGGCAAAAACTCTCTTCTGCGGTTAACCAACCCGACCGCCAAGCACTTGACTGACTTTTGT:1 + chr3L 3561954 3' - mdg1 7346 2 75.25 TTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTCGATCAGAATACTCACTTCGGGCAGGGATGGTCG:1 - chr2R 24562325 3' + 1360 3111 1 77.23 AGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTA:1 + chr3R 1977616 3' + micropia 5405 2 57.43 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGCTTATTTTTGAAGTGTACAAGATCAATGCTAGGGTTTGAGGAAGAGTTCATAAAAT:1 - chrX 8682626 3' - pogo 19 1 60.00 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCAAGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGAAATACACGTGGCTGCGTCTATATGGCA:1 + chr3L 22847101 3' - INE-1 579 1 72.28 CCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACTGGTGCATACATAATCATACAGATACTTTTAT:1 + chr2L 11875287 3' + Quasimodo 14 2 74.26 ATTGATGATGATTGATGATGTTTTCCGGCACCTGTACATATTACATACAAACATATTCGCATCGTTGTATCATAAGCATCTG:1 + chr2L 9426263 3' - gypsy7 327 1 70.73 TGTGTGTATATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTTCTTGGCTCTTTGGGTCTTGGAGCGTTGTCTGCTCCATTGCAGTCGTCGTCGTTGTCATTATTACC:1 - chr2L 18415824 3' - accord 7036 2 68.32 ATGTACCTACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACTTTTCCTGAGTGTTTTTGTGTTTCCAGTAAGGAAAAAATACCTGTGTTATATTCAT:1 - chr4 649511 3' + mariner2 818 1 63.37 AAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATA:1 - chr2R 5582166 3' - Cr1a 440 1 68.32 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTTGGTGAGCTGC:2 - chr2R 20739422 3' - roo 13 2 67.33 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCT:1 - chr3R 27156642 3' - pogo 32 1 62.38 AAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACCTCACTATGTCGTATA:1 - chr3L 20266202 3' - P-element 2853 1 30.69 CACCTTATGTTATTTCATCATGTTACGGGCGATTCCGGAGAGAGCGTGCAGCTATGAAAGTGGAGAGTTCACAAGGAGGTGACAAAGAGAAAGAGTTTACG:1 + chrX 7681149 3' + P-element 2886 2 74.26 ATCGTACTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAAACAATTATAATAAATGAACATTCACGGTATATTAAAGTATCAA:1 + chr3L 2890508 3' + transib2 58 1 59.41 CAAGTTTACACACTTTTGACACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGCAATGC:1 - chr3L 16973351 3' - S-element 1524 1 68.32 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGGTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGAATCAGCAATGGCG:1 - chrX 13640632 3' - P-element 35 1 42.57 TCCAATTATACTAGTCTTTAATGTTTGTAATTTGTAATGAATCAATAAGGCACGGTCATCGCTTTAGCTGTGGCAATTTGCATATGGTGG:1 - chr2L 15842038 3' + gypsy7 5083 1 70.00 GTATAACCAAAGACACTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCATATTCACAGATTCATTTAAAGGAATGTAATCTCCACAATT:1 + chr2R 21710075 3' - Tc3 317 1 48.51 CAACGACCCGCCGAAATGTCATCCAAGACCGGATGTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTATCCA:1 - chrX 21668344 3' + gypsy10 5670 2 65.35 TTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACAATACGACCATGGATATTCGATATCGTTTCGGCCAGCCAAACATCTTACCTAACTTGGCCGGATTTAGT:1 - chr2R 14217706 3' + Tc1 1636 1 63.37 CGAAGATTTCTATACCTCCGCGATCAAAATTAAGAAAAAAGAACGCAAAAACGAACGCTCAAAAGAGACTCGCGCAAAAAGACGAAGCAAATTAACATTGG:1 - chr2L 21866828 3' + R2-element 3561 1 76.24 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGGTCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAA:1 - chr3R 19989270 3' + hobo 2896 1 69.70 CACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCACCATTAACATTGGCCTCTTCAACAACAATAACAATAA:1 + chr2R 16011170 3' + Quasimodo 278 2 63.37 CTCGANAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAAATGCTTCAAATGCTTTCAATTCAAATCTCAAATGAAGAGCCATTCAAAGATATCCCTCAGCTTTAT:1 + chr2R 10084349 3' - F-element 28 1 67.33 AGCCCNTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACATACCAATCACAACTAACTACCAAACAGTTTTCGAAGGTACT:1 - chr2L 1009449 3' + I-element 169 1 70.30 GGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACGCCCTCACTTAGCGTTTTTCGTTAGCTTACACCTTGCCGCGTTATTACGGCCTTAAAATTA:1 + chr3R 5954083 3' + F-element 4441 1 64.36 TCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTAATAAAAAAAGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAATATAAAA:1 + chr2L 21635346 3' - F-element 483 1 53.00 ATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGTTCGAAAGTTATTTTAAATGTAAATTCTTTATTACTT:1 + chrX 4007611 3' + 1360 405 1 63.37 TTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGCGTCCTTGTATTGAAATCGAATTATTCTGTTTGATTTCCT:1 - chr3R 14186329 3' - Quasimodo 73 2 59.41 GGGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTGTTCTACCTGTTGCATACTTTTCA:1 - chr2L 167982 3' - accord 124 2 64.36 GTGGACTTTGAACAATGAATCAAAACGACGTACGTTCTCCGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTATGTATCTCTCTATCACACACATGT:1 - chr3R 21789242 3' + Doc 199 1 70.30 CACTTGATTTTAGTGAAGTAAATAGTTAATAACGTAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGATCGTTCTGTCGTTTTCGCCATCGACCTAAAAATCAGTTAG:1 + chr2L 7933329 3' + Doc3-element 49 1 67.33 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGA:1 - chr2L 21683420 3' + pogo 2050 1 78.22 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCT:1 - chrX 15305657 3' + roo 357 2 79.21 CCAAAGACCCTAGAATAATAATTCTAGGGTCTTTGTGGGGTAAACAGCGCACAAGCAACGAGCGGCGACAAGGTTAAAGGTCTACAAACAGATCGGCAAGG:1 - chr2L 7877419 3' - Tc3 311 1 63.37 CACATACAGATGTCTGCTATCACTTTGTGCGATTTATGTAATTTTTGTATGATTTACCGCGTTCCAATGTTGTTTACACCCAAAAACTCCGAGCAAGTGCG:1 - chr3L 12277693 3' - 1360 161 1 73.27 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTATATAGGGTGGTCCTTTGCTGGCTGGGTGATAGGAAACTGGACACA:1 + chr3L 5201560 3' + 297 6952 2 57.43 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTT:1 - chr2R 16334010 3' - P-element 55 1 24.75 TGAATGTAACCATAATAGGTTCAAGACCATTATGACATACGGGAAAAACACAGCCGCAACAGGAATCCCAGCGTTCCATCTCCAGGAGTTTTT:1 + chr2R 1246812 3' + baggins 5067 1 54.84 GCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACGC:3 - chr3L 25232763 3' + accord2 177 2 49.50 CGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAATTCCGAAGTGGTAACCTATTAATAAACAAAGGCATCTGTGCGCATTTCGCTTAAT:1 - chr2L 16098034 3' + Doc 4467 1 61.39 TTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCAACAATGTGCAACACCCAAACATCC:1 + chr3L 13749441 3' - P-element 71 1 35.35 AGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAAAGTGCGCCAGTGGAATGAGTTGGACTTGGAAACGGGCTGCAGAAGCGGAAGTACGAGAGGTA:1 - chr3R 6282265 3' + jockey 4823 1 64.36 AGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAGTACTTAAGAGCTTAAGGTAAA:1 + chr3R 19989353 3' - hobo 2 1 78.22 AAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCAGCCGCAAATTGCCGTCATCATTCTTGGGGCGATACTACCTTTTGTCTGACTCTCTGCTCGCCTG:1 - chr3R 14907943 3' + HMS-Beagle 441 1 67.33 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATTTTACACAAATCGATTTTATTTCACCAAACCACGCACT:1 + chr2L 12667260 3' + blood 364 2 61.39 TCCGCCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACACCAGCACACACCAGTAAAAGGCGGCCGACAGGAGAATTACAAAGGCATAACCTAAGGAAGAATAACT:1 - chr3L 6535860 3' + Ivk 5043 1 70.30 TTCCGNCCCCAGCTTCTTTGAGCTACGAAATCAAGCTTGCAGAATTTTTTTCGGATTTCGTCAAGCCCTTCATACAATATTTTGAGTTCATGTTCTTTGCT:1 - chr2L 4118083 3' - FB 3 1 48.51 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTA:1 + chrX 868741 3' - jockey 4810 1 76.24 GTGTAGGTACAATTATTTGAATTTTAAGACTTCATACCTTATACTTCGTTTTGTTGATATCCGACAGTGTTTTGTGGGCGCGATTTCGAAAGGAAAAGAAC:1 + chr2L 16270180 3' - HeT-A 5971 1 80.20 TAAATAAATATAAATAAAAAAAGTGCTTGTTTACGGGCCCTGAGAACTCTTGACAGCCGGCGCCTTCAAGTATCCAAGCAAGTTTCGCAAAATACGATTTG:1 - chrX 6401376 3' + S2 1620 2 77.23 CACGCNACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGCCCACAATGCGTTACAAATAAGAGTATTATG:1 + chr3R 12827791 3' + gypsy5 7031 2 53.73 AAATTTCAATTTAAATTTTAAAATTTCATGACTATGGCTCTAAAAGTGAATCTTTGGGCAAAGAGCGTTTCAGGATTGGAACAATTTGTCTTGGTTTTAAA:1 - chr2R 16995671 3' - 1360 3044 1 78.22 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTGGGCTATACAC:1 + chr3L 13659966 3' + pogo 2073 1 60.40 TACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGACAACAGCAGCAACAACCACCCACCGACCGCAGCAGCAGCCGAGTTCCGCAGCAACCGAAGAATATG:1 - chr3L 23448742 3' + copia 5008 2 46.53 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACCACGTGCC:1 - chr2R 1365305 3' - jockey 21 1 64.36 AAGCANTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAATGTGCGCCCAACTGGGC:1 - chr3R 15598662 3' - Max-element 34 2 58.42 GAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCATATATAGTAACGTGTTTGGTGCGAGTGATTTTGGGGGACCTGGAGGAGCTGAACGGAACGACCGGATGCC:2 - chrX 15089040 3' - gypsy 6 2 73.27 ATTGAGGAGAAGACTCAGTGTTTTAACAATATTTTTTTTTTCTATGTTGACAATTTTACTATAGTTTTTTGGTAGCTT:1 + chr2R 4410896 3' - 297 6821 2 71.79 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATTTTACACAAATCGATTTTA:1 + chr2L 12667241 3' + blood 355 2 54.95 TTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCGAGTGCCGCTGGTGACTAACACGCCCGGTGCTTCCTGTCCCCCGGCAGGTTGATTGTCTCATTGATATGCC:1 + chrX 18837341 3' - P-element 2583 1 78.22 AAAATAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAATCTACAAATTTGTGAGCAAACGCAGGCAGCCATTCATTTTACACCGGTTGTTTTGCCATT:1 + chrX 9446463 3' + Doc2-element 228 5 81.61 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATCCTCCAAGTTGCTT:1 - chr2L 3951580 3' + Transpac 284 2 54.46 TCCCGTGCTTATGTGAACCGGCCAAACTGACAAAAACAATTGCATTCGAAATTCATATCCCTGGTATCAATCGATATCACCAAATAACGAAAACGTAATTT:1 - chr3R 851626 3' + mariner2 620 1 80.20 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGG:1 - chr2L 19018955 3' - hobo 39 1 65.35 GAGACTTTATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTCGGTCCATAATT:1 - 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transib2 2688 1 59.41 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGA:1 + chr2L 13136790 3' + roo 9029 1 70.30 CTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTGTAAAAGCTATAACTATAAAATCTATGTAGGTATATAGTCGTAAATACATCAGTAATTCCGATAAGATG:1 - chrX 23066675 3' + INE-1 131 1 55.45 TGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCTTGCTCACCAAACACTGTAAAACCCAGCAGAGATCTCACAAA:1 - chr3R 851585 3' + Doc3-element 329 1 69.31 AAACTCGCATAACGGAACACAGCGAACAGCGATCAAAAATAAACAAATAAAATATAGAAAAAATCATGCAGCAATAAAAGGGGGAAAGAGG:1 + chr3R 14941167 3' - invader6 124 2 62.64 TAGGGAAAACCTAAAACTCCTCCTGTACAAGGCCATCCTGAAGCCAATTTGGACTTATGGGATTCAGCTGTGGGGCACGCCATCTGCCGGAGAAACCAGAC:1 + chr2R 22244098 3' + G-element 3862 1 80.20 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATAT:1 - chr2R 18950743 3' + roo 9037 1 60.40 CTTTTTTCTTGTTTTTTTTTTTGTTTATTTTTTCATCCGTTTTTTGGTTTTTTTTT:1 - chr3R 4711458 3' - Doc2-element 229 3 73.21 TTTTGGACGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCTATTCTGTGCTTCGTGAAGTTACTCAAATTTGGCT:1 + chr3R 1513861 3' + Cr1a 227 1 69.31 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACATATGTATATTGTATATGCCAACGTACATTTATGCATGGTTCTGCCCCTGCGAGTTT:1 - chrX 18144339 3' + hobo 2920 1 60.40 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGGCCA:1 - chr3R 27283998 3' - Max-element 8266 2 49.50 ATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATAATATGTTTATATAGAGAACAAATCACCCAAATCCAATTCGAATTTTC:1 + chrX 15371905 3' - Idefix 13 2 61.86 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCG:1 + chr2L 14790652 3' + roo 9043 1 53.47 TATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATG:1 + chr3L 5650486 3' - Juan 4099 1 68.32 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATGTGCACAGGATAGTGCTGCCAGGGCGGTTGGAATTTTT:1 + chrX 20806971 3' - opus 7116 3 79.21 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATGGAATTAAGTTTAAGATACACTCATGGGTTTTA:1 + chrX 15305700 3' - roo 8703 2 65.35 TTCCACATTGAAGAGATTACAACAACGACACCCATAATTGAGCGTCATCATATGAGTGCCTGGCAGCTGTAAAACACTGTGAAAATTAATTATTCTAAACA:1 + chr2L 11478660 3' - R1A1-element 5291 1 70.30 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATT:1 + chr3R 4834330 3' - mdg1 7064 2 53.47 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACATTGTATTCCTGTAAATCAAGCAACTCATATAAATACTGAAAGTATGTCTATATC:1 + chr2R 16750723 3' - Tabor 6863 2 47.52 TTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGATGACAATACGAAAAGAATGATGTTAAGCTTTTTCCCTTTG:1 + chr3R 27984375 3' - roo 9033 1 58.76 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTGTATGTGCGTGCACTCATAAAAATGAGAGTGTATTAA:1 - chrX 992027 3' - hobo 39 1 65.35 TTATCATAATAGATTCGGACCGGATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTTTAAATT:1 + chr3R 2646772 3' - gypsy9 52 2 68.32 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAAC:1 - chr3R 22644166 3' + hopper 1378 1 72.94 CGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGAAACTTTACAAGCTCAAACTGAAAATAAACAAATTCAATGCAATCCCATCAT:1 - chr3L 23974265 3' + Quasimodo 328 2 63.37 AATATTAATTTAATTTTAATTTTAAATAGTTGGTGTTTCAATTTTAAATACCTTTCCCATGTTTGACCAACAAGACTCCTCAATAAAAGCC:1 + chr3L 9546828 3' + Rt1b 124 1 75.82 GCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCGAACAAACGGCCAGCGTCCGTGGCTGCTGACCAAAGCCGCGAACC:1 - chr2R 8303358 3' + F-element 373 1 55.91 AGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTTATCTCCATGTAAATGAGTTGCCTTCTTC:1 + chr2R 11149266 3' - P-element 484 1 30.69 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAAC:1 - chr2L 2078451 3' - I-element 44 1 72.28 GTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTATCCCGTTATCATCACGGCGATTTCATTAAAATAAAGAATAAAATAGCGAGATAAAATCCGATCATTGG:1 - chrX 22933816 3' - BS3 1411 1 55.45 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTGA:1 + chr3R 7168659 3' + flea 5005 2 67.33 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAATAGAAGGCAGCTATTT:1 + chr3L 10143244 3' + 297 374 2 60.40 AGCTCGGACCCGCAATCCCGAAAAACAAATATAAATTAAGAGAAACATAATATTTAAGCTAATATATGAACTATAGATTTCGGGAAAAGCTAA:1 + chr3L 4185901 3' + Idefix 7078 2 79.57 ATTTTTATTCTTGATCAGGATCAAAAACCGAGTCGATCTAGCCTTATCCGTATGAACGCCGAAATCTCAGGAACCATAAAACGTGCTGCTTAGGGGTTGTT:1 - chr4 253295 3' + INE-1 80 1 81.19 GTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGTTGACGATAATAACGCAGATGAATGGAAATACTTTACGAGTCACTGGGGTGAACAG:1 - chr3L 22395391 3' - F-element 492 1 50.50 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCC:2 - chr3R 10952271 3' + roo 9038 1 57.43 TTGTTGATCAGGATCAATAGCCGACTGGATATAGCCATTCTAGTCATTTTGTTCATCAATATCTATCGACATCAATTATTTTATCGTGTGGAAAATAAAAC:1 - chr3L 11887690 3' + INE-1 87 1 74.26 GATTCAGGGCTGCAATTGTTTCCTGTGGGAATACATATATGTCCAGGAGTTCAGCAGCGACGGTGTCCTCTGCGACGTGTAATGTTCTGTTTTCGTTAGTT:1 - chr3L 24258846 3' - baggins 5311 1 57.43 CTTTGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAGTAAAATACAAACATTTCAGTGGCGTAACCGGAATGTCGACCACCGTCCAAGTCCTTCGTGGAAAATT:1 + chr2R 5002394 3' + 297 6941 2 57.43 TTTGAACAGTTGTTTTATTTTTCCAACTGTTCTAAGATTAAACGGCAAGGAAGGTGAGGGGAAACGGGGGGCGTGTGGATGCGCCACCATGGAAAATGAAA:1 - chr2L 4888433 3' - F-element 4587 1 57.43 CGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTA:1 + chrX 21564722 3' - diver 5937 2 77.23 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAA:1 - chr2L 6454735 3' - mdg1 7080 2 65.00 AACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTAAGAACTATTTACAATATTTA:1 + chr4 1151216 3' + 297 403 1 80.20 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAAC:1 + chr3R 20149755 3' + 1360 3347 1 77.78 ATAGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATATTTATGTTTATGCAAGCAAACTGGGCTGACAGTGCGGAAAAAAAGCAGGGAAGGAGCAGGGAGGAGCAGGCGG:1 - chr3R 18791524 3' + 412 57 2 46.53 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTTCTCCCAT:1 + chr3L 16761344 3' + roo 397 1 65.35 TGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCATCAACGAGCAGCTGATGCGGTGCGCCATTATGCGGAAGGAGGGCATCT:1 - chrX 15381457 3' + roo 418 1 57.43 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATGAGGCCATTTATTAAATTCAATTATTTTGTTGACATCGGTGCG:1 - chr2L 6388237 3' + copia 247 1 71.29 ATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACTTCCTACCACCGTCTATCCGTGTAGTACGTGTTTAGCTTTAGCACCTCCTCGT:1 - chr2L 19597896 3' - F-element 308 1 57.43 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTAGGGAGAGCACAGTTGCGTCAACTCAGCGATTTATCCATCAAATGTTCAGTTTTAACATGCAATGCATTAACTTTTGA:1 + chrX 1235179 3' - blood 166 2 72.00 TATAGATCCTGATCAAGAATATATACACTTTATATGGTCGGAAACGATTCATTCTGCCTGTAGCATACCCTTTTACTCTAATAGTAACGGGTATAAAAATA:1 + chr3L 23210604 3' - INE-1 84 1 72.28 AGTGCNACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAGGCTGTCACATTCAAGCAATCCTTTCCTCCTTTTTCCACTCCTTACC:1 - chr2R 12492338 3' - hobo 2 1 75.25 GCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCAATACAACTTCCATCCAAGCTACAATCCGGGCAGCTGG:1 + chr2L 18700354 3' + Quasimodo 232 2 68.32 CTCGCNCTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTCAATCACTTGGTACACTTAA:1 - chr3R 6622659 3' + P-element 2835 1 27.72 AGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACACCATAAGTTTCTTAGCCTAGGTCGAGGAGCAGCGCTGCCAGCGTAGCCTGCAGCTACTGC:1 - chrX 23202000 3' - R2-element 90 1 51.49 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTG:1 + chr2L 14579913 3' + copia 231 1 53.47 TTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATAGTGGAATTGGTAAAACATAACATAAAAATTAAAGTCAATACTTTCTAAGGA:1 + chr3L 24291202 3' - 1360 309 1 60.40 ATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCGAGTTTTTAAGCTTTCTTCGCCAGTTTGCAAACCAATTGCAAATCTGAGTGTAAGTAA:1 + chr2L 205758 3' - 1360 3327 1 68.32 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACT:1 - chrX 8972371 3' - 1360 24 1 55.45 CATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGTCTCAGTCTCAATGCTTGCACAGAAACTGCTCTAAGCACTGGCACTAGGTGGCCGACAA:1 + chr3R 23989465 3' - McClintock 103 2 70.79 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATAT:1 - chr2R 24021574 3' - pogo 37 1 66.34 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAAC:1 - chr3L 18337659 3' + Juan 4174 1 66.34 ATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCCAGCAGCTGCACCTCCCCCTTTTTGCATCCGCTTC:1 + chrX 16997617 3' + jockey 4655 1 54.55 CTGAAGAGAATACATCCCCATGAACTCCCTACACGTAAGATAGCATACATTTGTTTCATTTTCGTTACTTATTTCTGAATTTATTACAT:1 + chr3R 1875787 3' + G5A 2683 1 60.67 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATT:2 + chr2L 7255816 3' + P-element 2861 1 53.47 GGATTTAATGTAATTATATTTATGTTGTTTCTTATTCGTTTAATTTTATAAAAATATTAGCTATCAAAAATATATATTCGGGAATAAATATTTACATCAAC:1 + chr3L 10471878 3' - diver2 452 1 86.14 TATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGAATTCGCATATTTAATGATGGCATCAAGTTTAAAGAGAT:1 - chr2R 13656872 3' - mdg1 218 2 75.25 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCTTAATGGTACTGTGAATTTAAAGTTCTTACTAATATTACTACAGTAT:1 + chr3R 5686576 3' + P-element 2860 1 54.00 AAGCCTATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAGTAATTCTTCTTTATGTATGTATAATATATGAACTCGAGTATCTCAGCACAA:1 - chrX 20016150 3' + Stalker 177 4 52.00 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTT:1 - chr3L 12103794 3' + roo 9036 1 65.31 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGCTAGTAGACGCTTGTGTTTGATTAGCT:1 - chr2L 16674834 3' + roo 399 1 74.26 TTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATTTATGGCCTGGTCCTGGTCCGAGGACTCGAACCTGGAGACTCCTCTCTGCGAAATGCGTGTGTCCGAA:1 - chr3R 6981335 3' - I-element 5059 1 74.26 AGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTAGTGGG:1 + chr2L 21403546 3' - G5 4409 1 53.47 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCGGAAAGG:1 - chrX 17968334 3' - Tirant 5 2 76.24 TGGAAGAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCATATTGATA:1 - chr3L 13659903 3' - pogo 45 1 70.30 TCGGTCCTAGCTGCTGTAAACAATTCGCGAAATAAACAGGCTGCTATTTACTTATTCCAATTTAAATAAATATATTAAAATATTTACATATATTTTATTGA:1 - chr3R 19152009 3' + diver2 272 2 67.33 GAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCCTAAAAACCCGTTTAAGTATATAAAAGCATAGATTCAAACAGAAT:1 - chr3R 12778964 3' + hobo 2604 1 55.45 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCAAGTTGTTTGCTTGCCATGTGCAGCGGGCCTACAAA:1 + chr2L 18430166 3' + copia 244 1 64.36 TTGACCCTTCACATACCCTTCTCCGTCCTCCTCTCGTCGACCCGCCCCTTCCTCTGTACCATCTAGTTATGACCTCCACCTCTGGATTTTCTCCTCAGTTT:1 + chrX 12249988 3' - gypsy8 4486 1 58.42 AATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATT:1 + chr2L 22224564 3' + Rt1c 5403 1 54.55 CAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGG:1 - chr3L 23909061 3' - Idefix 7130 2 55.45 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAA:1 + chr3R 10277279 3' - Doc 50 1 66.34 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGAGTACGGAACAATATATTACGGATATCTGCGGGGGTTACAGAATGCAACCCAAAATTCCCATTAAT:1 - chr3L 19377704 3' - roo 5 2 74.23 CAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGCGAGACCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGATCAAACGCGATAAACGCTGGGTGGGTTACGTGGC:1 - chrX 18530221 3' + 1360 3271 1 65.35 TAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 198 1 62.03 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAA:1 - chr2R 17626474 3' - mdg1 7054 2 61.39 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCT:1 - chr2R 14675542 3' + roo 9047 1 56.25 TAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCAATTTTAACTGCTGACGCGGTTTTGTAAGCCCCTGGCACTCCGATCTATATAAATA:1 - chr3L 19379005 3' + 1360 2958 1 57.00 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGTTCAAAACAAGTTGACATTCCTTGGCATCCCTTATCGATTTTCTGTTGTTCCGAGGCTAACCA:1 + chr3L 6013153 3' - jockey 4811 1 66.34 CCCTGTTACCTGCAACCTACGCCGTGAACCAACCAAAAGCATGCGCCCACCATGGATAGCTGTAGTCCAGATACTTAACAGGAGTCCACTGAACTATGTTA:1 - chr4 634191 3' + springer 7477 2 82.18 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATAAGTCACTATATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACGAGTGCAGTTCCAATCTTAATGGATTT:1 + chr3R 24081622 3' - 297 19 2 57.58 TTACGACGGGACCACCTTTTGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATTTCAA:1 + chr3R 11999281 3' - P-element 13 1 48.48 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAAATGTGTAGTCCAAACGCAAATCACC:1 - chr2L 6454710 3' - mdg1 17 2 56.00 CACATTAGCTGACTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAAC:1 - chrX 10445556 3' + INE-1 539 1 77.23 TATAATAACAGATTAATATAGTATGTACATATGTATAAATAAGGTAAAAGAATTCATCATACAACTTGTAGCAAGCTGTAGCCGAAACTCCGGCAACATCC:1 - chr2L 13620695 3' + invader3 5068 1 65.35 ACCAGTCCCCAGGATGTTGACGCGTATCACGACCAGCTGTCCCAAGCACTCCAAATGGATCTGCCGATCACCCCCCTTGCTCCAGAAGCCCAATCCAATAC:1 + chr2R 23877165 3' + BS3 128 1 70.30 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAA:1 - chr2R 5953095 3' - pogo 36 1 68.32 TTTTACTTTTATACTTAATAATTTGTAACCCTTAAATTTATATGGTAACTTTGGAACTATTTGCCTGTAATACGTGCAAATAAATACTTCTTGGAACGAT:1 + chr3L 19014110 3' + G5 4723 1 49.00 TAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAAC:1 + chrX 15894653 3' + S-element 1669 1 74.00 TGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACGTTTGTTGTCGCGCATTTAGGAATTATGTCAGCGAGCATTGCTATGATATCATTTGAAACACAGCTTA:1 - chr2L 4998380 3' + S-element 1711 2 74.26 AGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTC:1 + chr2L 22684575 3' - transib3 51 1 62.38 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCA:1 + chr3R 19346943 3' - blood 7063 2 77.23 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTACTTTGTTCCTAATTAA:1 + chr3L 9766440 3' + blood 374 2 76.24 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAAATATATGTATAAGCATGGGAAAGTACTATTCAATACAAAACGTGTGTACGATTC:1 + chrX 16715382 3' + flea 4999 2 65.35 TTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGACTGCGCGGCTGCGTAAATAGCGAATAACGCCACTACCAGCAG:1 + chr2L 8308015 3' + P-element 115 1 46.53 ACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCACTTCCAGTCAAAACAGTAAAAATGCCATAAAGGTGACAATTCGC:1 + chrX 6373671 3' - X-element 43 1 54.46 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTCACACCATAATCATAAAAGGTACAATCATAATT:1 - chr2L 1233182 3' - hobo 42 1 65.35 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTAG:1 + chr2R 9871030 3' - roo 53 2 78.22 GTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCACGCACAAGGGCGTGGCAGTCTGCGCCAGTGTCTGAAACAAAGCCAAGCCATAAAAATAAATATA:2 + chr2R 18031905 3' - Tirant 8117 2 65.35 CGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGCCTCTGTTTGTGTTTTGTTAAGCTTTAGTAAATACTTGAAAATTTAATGCCGTTT:1 + chrX 6190494 3' + 1360 3198 1 57.43 GAAAAAGAGCAAAACAAAGTAGGAAAACAGTCTTGACACTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAAT:1 + chr3L 23583103 3' - S-element 246 1 82.18 TAAGGCTCTTTTAATAAAAGCCATATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGTGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATA:1 + chr2R 2949141 3' + G5A 2391 1 71.11 TCTGGGGAAATGGCCTGCAGACGCACTATTAGTTCCGCTTTTGTTGCAAAAGTCAGAAATTGAATTCATGTTGATACTTTTTGCCTATGATGCAATTTTTC:1 + chr3R 19763068 3' - invader3 427 1 62.38 AAAACATCAAAAAAAAAACAAAAAAACGTATTCATAAAGGTCATAAAAAA:1 - chr2L 9819612 3' + jockey 4998 1 86.00 CCGATATTTCCCTTTTTGCGCACGGCACAACTGAAAACGTAGCGCAAACAGTGAGGAGTGGAAATTCAGCGGAGTGAGGAAGCGGAAGTGGGAGTGCGCTT:1 + chr2L 12752691 3' - gypsy8 309 1 73.27 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAATATGTATGTGCAAACCCATATGTGCTTGTACAATCACCCTGCCTGATAAGCTTCAGAATATTTGCA:1 + chr2R 7775824 3' + Transpac 5222 2 68.32 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTCAATCACTTGGTACACTTAAAAAAATAACCTTAA:1 - chr3R 6622645 3' - P-element 38 1 41.58 AATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTCAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAACGTGACATTGATGCCTGTTTTTG:1 + chr3R 29467194 3' + hopper2 1342 1 77.23 CTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACTTGTAATCATTATTATATATATATGTAACCAGATTTAAATATCTTTTTT:1 + chrX 12946470 3' + accord 147 2 61.39 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGC:1 - chr2R 3919672 3' - 1360 40 1 62.38 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAA:1 + chr2R 12082386 3' - mdg1 53 2 81.19 AAAGTGTTGGGATAGCCGAAAATTTAGAGATTCTTCTGTAATTGATAGCATCCAGTTTGAAACTTACCGGAACATCGGCCCCTTCTCGAAGACGGACTGC:1 - chrX 13069520 3' - Q-element 127 2 57.00 AAGCTGGAGGCCTCAGGAAACATTGCAGGTGAGTAATTGTGGCATTCTGGGGCCAGGAGCTCTTGGTCTTTTTCCTGGCTGCATGCGTATTTACAAGAGGA:1 - chr2L 18236569 3' - TAHRE 10071 1 54.46 CAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAGGGACAACGGTCGCTGGTTGACAAGCATTAAATAAAGAGGGCGGATCGCTTTAGAA:1 - chr2L 17644019 3' + flea 288 1 63.37 TAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCACTTACATATATACTTATATACTTATATACTTATATATTCAAAAATGCTGGCAGTTTTTTAA:1 + chr2R 20952612 3' - rover 6962 2 60.40 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATTTCATTTGTATTGATTAGTCAACACGAGTTT:1 - chrX 13508672 3' - roo 16 2 63.37 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAATTGCAAAGGACAATTGCTTAAATCGTATTTTCGCTGACGCCAAAATGTATAACCAGTATAGC:1 - chr3R 26842693 3' + opus 451 2 66.34 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACGAGTTTCGTCTCTTGTACGTATGTCCTGTCATGCTGAAT:1 - chr2R 24628730 3' + mdg1 7456 2 75.25 TTTTGTGCTTTTTCTGAGCATTTTTGATTGCGATCGCTGAATTAGCTGTAAGTGTAAGTTGAGTGGGTGGTGCGGTTGTCATTGTACGCGGCGCATAACTG:1 + chr3R 26465678 3' - Porto1 4343 1 53.47 CTACTNGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCATGTACATACATGTATGTACATACATATATGTTGCTACATGTTTGCCT:1 + chrX 15089139 3' + gypsy 7424 2 57.73 AATAATAATAATAATAATAATAATATTAATAATAATAATAATAATAATAATTAAGAAATACATAAAAATTTTAAAATTTGCACTGAAAATAAATGTAACAA:1 + chr2R 3278427 3' + mdg1 7066 10 74.26 CGTCTACCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTATATATATCGATACATATACATAGATCGCCTCGCAGACTGGCCTCCCCGG:1 + chr2L 17444084 3' - G2 2796 1 51.49 GCTGACCCAGCATTGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGTCGTCGAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGACTCGACTCCACTTTCCGTTTACCCTGGGCTGCC:1 - chr3L 13797250 3' + Gypsy6A_LTR 62 1 66.34 TTATAGATATGTAGAGTAGAGTTATAGGGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCG:1 + chr3R 12047489 3' - Stalker2 7273 2 54.46 TCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAATTTTTCT:1 + chr2L 3440524 3' - Juan 11 1 72.28 TCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCCCCCAATTCGACTATACATATCCTCAAACGAT:1 + chr3L 5849550 3' + Doc 234 1 68.32 ATACANGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAGCGATAGT:1 + chr3R 11094601 3' - 3S18 4 2 75.25 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAGACAAAATG:1 - chrX 6379134 3' + hopper 1385 1 59.41 ATAAANATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAA:1 - chrX 5129475 3' + Idefix 7365 2 60.40 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGGAACCCACCACGCCTCTTTTGTACCGAAG:1 + chr2R 4606267 3' - 1360 48 1 74.26 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGTGAGAACTTA:1 - chr2L 17722747 3' - blood 7020 2 67.33 GCCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGGTGAGATTCAGCAATCAGATTCCAGAGAAAATGACTTGGAATTCTGACAACTGCAA:1 + chr2L 5618532 3' + INE-1 133 1 66.34 ATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATGGTATCTCAAGACATCCATCATATCCACCATCCATTAC:1 - chr2R 16980456 3' + copia 255 1 78.22 ATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGATTCTTGTTTTTGTTTTGAGCTTATTTATGCGACATTTTCATTGTGTGTTTACGGTTCCGAAATGAATA:1 - chrX 2505832 3' - Stalker4 7107 4 72.28 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGC:1 + chr2L 7255787 3' + P-element 2832 1 24.75 TATATATTTATTGATATGTTTTGATTTCTTTTGATTTCTTTACTCCCAACTGTCTTATACTTGAATGATCCTCACTTAACACATTTTAAGCAATTTACCGC:1 - chr2R 11916614 3' - S2 1608 1 72.28 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGTTACCAAAGATTTTCCTGAGATTATGCAAATGTGCCGAAAGGAGGG:1 - chr3R 26321592 3' + blood 369 2 70.30 TTACTTTACTTTACTTTACTTTCACCACACACTCTTGCTTAACCCCCCGCTGGCCAACCCACTTTTGTGCATTCTCCAGCCACGCTCAGTGTTTTCAATTT:1 + chr2L 6866105 3' - TART-A 13127 10 75.25 AAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATGGAAAACAATGCAAAAAAGCAGCGGGGAAAAGCGGAAAACGTTG:1 - chr3R 17822362 3' + 297 6553 2 56.44 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTAC:1 + chr3R 1977614 3' + micropia 5403 2 60.40 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCG:1 - chr3R 178124 3' - BS 44 1 69.31 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTA:1 + chr2L 20133043 3' + flea 209 2 80.41 CTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATGTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTGCGCAAGTACAATTTTATCCCTAGTTTCTGTTTTTTTTTTAATA:1 - chr2R 18526317 3' - Stalker4 6890 2 54.46 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTC:1 + chr2R 20744224 3' + roo 9039 1 59.41 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCAACAGGACCTCCTCTC:1 + chr2R 20744214 3' + roo 9029 1 69.31 AATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCACAAACAGAGGACTAAACGAATTTT:1 + chr2L 20623653 3' - Doc 4562 1 75.25 TTAGTCTTGGACATTTCTATCGCTTTCTTAAACAAAATTTTCTAATATCTTTCGATACCCGAGAAAACGTTTAATACTCCCGATGAGTAACAGTAAGTAAA:1 - chr3L 11121412 3' + INE-1 298 1 39.60 TCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACAACTCGCCGCATGTGTCCGCCCACCAAATGTTGAGGTTTTT:2 - chr3R 23386689 3' - flea 415 1 59.41 ATCATCGTAGTCATCTTCGTCGTCATCACTTAGCTGACTTCCGTGCTCATCCCACAGTTTGCAATAATCCTATATTTGCATTGCCATCAATTGGTAATTGT:1 + chr4 108045 3' - TART-A 243 2 55.45 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTTAACCCACATAATA:1 - chr3R 20477022 3' - 412 14 2 65.35 TATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCTGCCCGGCTTTTCTCGTCGAGTTACTTATGTATGTTAATGGGCTGCCGCAGACTCGTAAATTCG:1 - chr3R 27385873 3' + gypsy3 298 2 67.33 AGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGCTATGCCACCACCGCCGCCGCCGCCGTC:1 + chrX 1647818 3' - R1A1-element 496 1 72.28 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATATACATACAACAAGCTTTCCTCAATTCCCCTTGTTACCCGAATGTATT:1 + chr3R 16458093 3' - roo 8670 2 74.26 GGGTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTTGATGAGACCAGGAGCGTAAAAAACTTACATATATATCTTCCCATA:1 - chr3L 14602328 3' - Ivk 383 1 61.39 CTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTCCGAGTTGCGGATGCATAGCTCCACCACATAAGCGTAATAGGACCAAGCTATTACCGCGGTGATAAATAGCACTGG:1 + chr2R 10032439 3' - blood 7298 2 66.34 GCCGATGTTGCGAAACAGAGAGAATGCCACCCGAAACCGAAATACACAAAACACAAAAAGTATAAAATACAAATTCAACACGCGAATGTTTCAATCGAAAG:1 - chr2L 18571479 3' - invader2 4952 2 68.32 AAACGAATTTACATTGTACATATTACGCTAGTTCTTGTCAATTTCGTAGCAATATGATAAATTAAAATTATTTTTCGCAAGATTTTCGCCCCAATCAAAAA:1 - chr3R 10663515 3' - 1360 3152 1 70.30 CTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCCGAATGCACTCCCTGCAGCAGATCTTGAGTTGCTTAATTATG:1 + chr3L 19696156 3' - F-element 4434 1 58.42 ATTTANTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAAT:1 - chrX 15355071 3' - X-element 4701 1 50.50 ACGATTACACCGGTGTTTCGCAGGCAACAAATTCTCAATCTTTTCCTCCTCTTCTAGAACTCACTTCTTGTCTATTCTTAGCTTCTGATTTACGACAAATA:1 + chr3R 26212863 3' + Gypsy12A_LTR 1984 1 66.34 AAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTCCATTCGCTGTACAAGGAGGTAGTGTGT:1 + chr2R 6724443 3' - Idefix 201 2 78.22 CGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTTCCTTAGCTGTAACACTTTGGTATTGTTC:1 - chr4 206107 3' - 1360 3364 1 70.30 AGACAATAGTTAAAGGTACAAACCGACGTTTTTAACTTTTGTCAGAAAATTTTTGCTCCCCCTCTCTAATACATAATGATATACATAAATATACAAATTAT:1 - chrX 19568611 3' - transib2 458 1 55.45 AACTTTTTAAGCGGACAGAAAGAGAGAAAAGAACCAAGTCAGGCCGTGTAGTGTAGCGTAGTCTAAATAAGACCAATCACACTAAGTCATCGGTCACAAA:1 + chr2R 16925016 3' + Gypsy12A_LTR 493 1 53.00 GTCTCTCGCAAGCCTGTTCGGATTGGGTTGATATTTGGGTTGGGTTCTTGTAGTTCAAATTGGATGTTTAACGCTGGTCTTGGGATCGCTGGTGTCTTCGA:1 + chr2R 12302727 3' - Fw2 3754 1 77.23 GAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTCTGTTAGCCAAGTTCCCCAGCAGTTAACCTGGGCG:1 - chr2R 13644244 3' - Burdock 6058 1 60.94 AAATAATTTTGATTAATAAATTATTAAAAAAAA:1 - chr3R 17476792 3' + jockey2 3391 1 78.79 GAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTATTGGATTGGGATTTAGGCAGTGTTAAATTTCGCAGCTTCTCTGCTTTGAAGCTTTTGATGTTTGACG:1 - chr3R 26162960 3' - I-element 5014 1 57.43 GAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATTATAAAACAACACCAAACAGCACAGCGAACAACGCACATAAAGACTGGGTGGCAAGGTGCGAGCAA:1 + chrX 8805362 3' - Cr1a 287 1 73.00 CCGATTGATTGGCTGGACGGCATTACCTTTAGTTGGTTTGGGAGATGCATAAAAATGCTTGCTAAAGGATCCAAGACGAAGTCCAAGTTGAATGGAATGAA:1 + chrX 14344293 3' - Bari2 739 1 68.32 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACA:1 + chr2L 14612084 3' + roo 9024 2 69.31 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCA:1 + chr2L 2060170 3' + 412 436 2 76.24 AAATCGGCTGGCCAGCGCTATTAACAGACCACGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAATACTCAAACAATTCTTCCATATGTAAAAAAAATGCCACAAAATTG:1 + chr3L 26741186 3' + X-element 4442 1 55.45 AATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATA:1 + chr3R 4104615 3' - 297 213 2 62.38 GTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGATGTTAGCCCGGTTTTTTACATATATATACACTGGCATAT:1 - chr3R 25789868 3' - Idefix 7050 2 60.40 CAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAAT:1 - chrX 23211095 3' + HMS-Beagle 197 2 81.19 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACAACGGT:1 - chr3R 10203607 3' - jockey 24 1 57.43 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTAATGAGTTCGAATATGGCCACGCCCCAAACATCTGCTGATGGCCATCGAGG:1 + chr2R 17972080 3' + 412 7523 2 53.47 AGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCCTACTGCTAACTGCGGATGCTGATGCGGATGCGAATGCGAATGCG:1 + chr3L 2871514 3' + F-element 4678 1 78.57 CCCGTAAGAAGGCCAGTCAAAATGCGGACCAACACCACAGAAGTTTTCTGCCCCTTTTCTGGCTAGGTTGTCCGCTAGCTGTATACAAACAATATCCCAAG:1 - chr2R 3124016 3' - baggins 5126 1 79.21 GGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTTTTGGCTTTTTGGGGTGAGACAAGGAGAATTCTAATTGTTACGAGCGTTTTCCTGTTGGAC:1 + chr2L 17735584 3' - F-element 356 1 63.37 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGTCTG:1 + chr2L 14579925 3' + copia 243 1 65.35 TTTGCCTTTTGCGATTCCTCGCCGTTTATCTCTTGCCTAAACTGGTATTCTTGTTGTTTCTTAATAACAACTGTTTCCGCTATTCTTATCTCCTTTACTGA:1 - chr3R 19446757 3' - Bica 463 1 76.24 AGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACAATAGTGCTCAAGACCCTAATGGAATTATACGTTAATAACCAGCCACATTTCTTAG:1 - chr3R 16189404 3' - 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Chimpo 197 1 61.39 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTAACT:1 - chr2L 2060131 3' - 412 36 2 58.42 CTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGATCTATCACTCAATCTCTATCTTCAAACTGGTTAAAGATACACTGTGCAAATGCGGAGTCTCTGTCCGATTGCGATCCA:1 - chrX 6793623 3' - P-element 390 1 78.22 ATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATGTGGCAAGGGGGCGGGGCGAAGTGACGAC:1 - chrX 18002153 3' - accord 183 4 73.02 GTTCGNTGAATTAGCTGTATGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATACGTCCATATTGTTATTCTGATTATTATTCCAATTATTATTCA:1 + chr2R 8817935 3' - Porto1 4312 1 75.25 TTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATATACTTT:1 + chr4 156605 3' - INE-1 147 1 83.00 AAAAATTACTTTCAATTAGAATAAGCATACATAAGAATAGCATACAAATTTTTAGATACATTAAATTATATCAGTAATATTTATTTGAAATGCGAAAATAA:1 + chrX 9479668 3' + 1360 383 1 54.46 TTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTATTAGAGGTAGCTGCATTAGTATCGCTTGGTCTATCATTTTATA:1 - chr4 355052 3' + Tc1-2 1559 1 56.44 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATT:1 - 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chr3L 4921654 3' - jockey 4826 1 66.34 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATGGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAGAAACCATTAGATCTTATATTAAAAGCCTGGTGAAACTTAAGGAAACAGAGTG:1 - chr2R 1779629 3' - 1360 3278 1 52.48 GACTATTACACATATTACACATAAATAATTATCAACATAAATAAAAATATGAAAACTGTTTATTGCAAAAGTCACATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGT:1 - chr3R 4604452 3' + 1360 2927 1 65.35 GCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGTTCGTTTTATAAGCTTTATATTTCTTTGGGGCCGGGCGAGCTTTTCTATACATTTGAGGAAAACAGCAACC:1 - chr3R 19132564 3' + Bari1 32 1 72.28 GATTCATTTACAGAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAA:1 - chr2R 12457940 3' - roo 53 2 76.24 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCCTTGAAATCATAGCCACTCTGGCTCGCTTCGTGAGTTTTCGAACT:1 - chr3R 13538926 3' - hobo 30 1 56.44 GAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAAATATTCAAGGATCTCCAGTGCCGGTGCCCCTTCGAGCTCTTTATTAAAA:1 + chr2R 20450235 3' + P-element 2678 1 55.45 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAAC:1 + chr2R 8310894 3' - pogo 38 1 72.22 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTTAAT:1 + chr3L 4641141 3' - hobo 27 1 52.04 ATTCTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGACCGTCCGTGCGTTTTTTGGATTAAATTATTGTAGCTGTTTTGTCCATTTTTATCGATATGCAGAAAACATTTTG:1 - chr2L 17361822 3' + Tc3 311 1 76.24 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTG:1 + chr3R 10751705 3' + hopper 1381 1 53.47 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTTAAACGAAATG:1 - chr3R 7388320 3' - HMS-Beagle 11 2 68.32 AGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGGGTGAGGAAAAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr2L 16999510 3' - 1360 3279 1 56.67 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGAAAGTCGATGCCGCCTTGTTATTTTATTTATTTTCTTTTTTTTGGTCACACAAAG:1 - chrX 16749100 3' - FB 22 1 57.43 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAGCAGAC:1 + chr2L 19019007 3' + hobo 2913 1 62.50 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATTTGGTTTC:1 + chr3R 4834345 3' - mdg1 11 2 68.32 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATT:1 + chr3L 4876792 3' - roo 8704 2 66.34 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAAAAAGTACGAGTACGAATATATAAATCATATC:1 - chrX 10672271 3' - mdg1 7047 2 68.00 ATTTAGGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGA:1 - chr2L 17722791 3' - blood 7063 2 73.27 TGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAA:1 + chr2L 16884899 3' - pogo 23 1 54.46 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCAACGCGC:1 + chr2R 16940425 3' - 297 5 2 75.25 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTCCATGATGCCACAGA:1 - chr2R 8345480 3' + roo 398 1 69.31 GCTCGCCAAATTCATCTGCGCGCACACCAACAACAACATCTTGCATGCCACAAACCATTTTACAAGCGGATCCAAATCGATTGCCCACCTACACCGCC:1 - chr3R 13103745 3' + Porto1 413 1 67.35 TAATGTTCAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGTGATAAGAGCGAGTTGTTGTTTTTTACTTCTGCCC:1 + chr3L 18790874 3' + invader2 491 1 65.35 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTGATCGAATTTATATTGAGAAAATT:1 - chr3R 26530855 3' + blood 350 2 49.50 CTCCATGGTATCTTCGGAACTAGAATATACCCACTCTATATGGCAGCTGCAATAAAAGTCTGCGTCGCAGCGAGCGGCGGTGAAGTCCGGACGTCCAAAAC:1 - chrX 4076002 3' + Doc3-element 4418 1 78.22 TTTTAATACATAATTAGATCCTACTAAGCACTAATGACTATAAACTAGTTTTTTACCGGTGAGTTAATGTTTGTTTAATATTTGTCATTGTTCCTGACTTT:1 - chr3L 25479012 3' + Cr1a 4278 1 73.27 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTA:1 + chrX 20806930 3' - opus 40 4 74.00 GAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:2 - chr3L 11115124 3' + R1A1-element 137 1 68.32 TTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAAACCACCGTCACCATAACGCACCATTAGGTGCTATTGTCCTTTTTTTTTTGCGCTTTGTGGTCCCTTT:1 + chr3L 11838647 3' + G5A 2596 1 63.37 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTATGAATAATTATATATCTACATGTTTTTGTGCCTGCCTTTGTTCTCTCTGTGTAACTTCTATATCTCCTGT:1 + chr2R 9505703 3' - roo 3 2 47.52 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGG:1 + chr2L 8565523 3' - blood 7031 2 59.30 AATTTGCTGCTTTTTACCCATAGTGCAACGTACACAATGTATTGTCCTCATGGAAACGTAAAACAATTTATATGAGTTAGAAAGTTAGTTAATCTAGCAGA:1 + chrX 22510820 3' + transib4 2632 2 86.14 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTAAAACA:1 + chr3R 4544094 3' + flea 5009 2 75.25 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCATATAGAGTAACATATTTTAAAAATATTTAAAAAAAATCATAGGTAGAATTATGATACCCCCTTCTAAAGA:1 - chr3R 29259543 3' + pogo 2098 1 66.34 GTTTAAGTAAACATGAAAAAAATTAAGTAAAAAAAGTCAATATAAACGCCATTTGAAGATCGTGAGAAGAGTAAGTAGCCAAGGTCGGAAACTGGGTTGGT:1 - chr3L 23930985 3' - Transib5 392 1 59.41 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCA:1 - chr3R 23638084 3' + pogo 2087 1 56.12 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTA:1 - chr3R 7388334 3' - HMS-Beagle 6821 2 54.46 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTAT:1 + chr3R 1977617 3' + micropia 421 2 57.43 CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACTTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGCTTTAAAGACCGAACTCTCGAATCAATTAATGCGCTCCA:1 - chr3L 3028476 3' - 1360 90 1 61.39 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACGTTGAAAGTATTCGAAATGAGTATCGATTTTATGGCTTTTTT:1 - chr3L 17344914 3' - mdg1 8 2 60.00 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATATATATTAATATAAAAGCCTGAATATATTTTCCTGTTTTATT:1 + chr2R 5953166 3' + pogo 2072 1 62.38 ATACATAATACATATATATTTTAGGAACTATATATGTACTCGTTTGTACATATGTATATCACTTAAGATGTCCTTAAAAGTCCTTACCCTTCTGTTGCTGC:2 + chrX 17676973 3' - Dm88 6 2 43.56 AAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCAAATCTTATGGTCAATATTTTGGCAAATATTCGCATTGAATGACTGGATCAGCCCGATTAGGCACAAGTTG:1 - chr3R 31256951 3' + transib2 2822 1 75.25 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAATGTAATTCAATATTTTGCCTTTGGGTA:1 + chrX 23283044 3' + HMS-Beagle 7019 2 55.45 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGTGATTTGATGAGCTCGGAAACCGGATAGGATGAAAAGTGATCTTTGAAATGAATACA:1 + chr3R 26952659 3' - jockey 4770 1 60.44 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGCCATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTC:1 - chr3L 7205545 3' - Doc 42 1 58.33 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACT:1 + chr2L 513710 3' + roo 352 2 81.19 CAAGTNGAACTTGCGTTAACTTATATAACAGTTCTAGTGAATCCAAAAGTTATGCTGCCAAAGTGGATGCAAATACCCCAGGCATATATCCATTGCGGCAT:1 - chr3L 8614459 3' + opus 498 1 73.27 AATAAGAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCATTCGGTTGG:1 + chr2L 5690823 3' + Doc 4691 1 54.35 AGTTGGAGGACTCACTGCGGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAATGGGGGCGTGGCAGTACAATACGAACGCAATCAAAGATGCACTGCAA:1 - chrX 4726156 3' + aurora-element 4199 1 57.43 TAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTTGGTTGGGATTGAGGGATACGCATACGGGTTTGGGGT:1 + chr2R 16067335 3' - F-element 395 1 63.37 GGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGGTGCTGTGGTATGAAGGTATTCGCCTTGACTCGATGATTGTGTCCTA:1 - chr2L 19056328 3' - accord 7377 2 53.47 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAG:1 - chrX 6379142 3' + hopper 1377 1 67.33 GAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTAAGATTAAGCATACAGATTCTAGAAACATAAACCCAGCGTATGTTTTGTATTTCTTGTTTTCTTTCCTC:1 - chr4 1189425 3' + INE-1 148 1 75.25 TCAACNTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTCCGAGAGTGCACATGTGCTCCACCTATCGCC:1 - chrX 21017767 3' + 412 7522 2 52.48 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTTCGGTTTACTCATTTTTAACTCAATCCCTTAGGAGTGTAGAATAAACTT:1 + chr2R 19552082 3' - roo 3 2 74.26 CAAAGTCCTGGTTGGTGTTCCCAGAAGGACAGACGTTTTCCTTCTAATTTTATTACTGCCGTTGCTTCTCCTGCGTTTTTCATAGATGTG:1 - chr3L 565413 3' - baggins 5024 1 58.89 TTTTTTTTTGTTTTTACTATTTGTGGAGTTTTAATCGCGGTTTTATTGTGCACATTTTAAAGGCTTTAAATGCTTTGTTTGATTGTCAA:1 - chr3L 510668 3' - Rt1b 5148 2 80.90 CTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGACTACTGGA:1 + chr2R 7552300 3' - springer 7178 2 74.26 ATACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTC:1 - chr3R 31887776 3' + HB 1539 1 53.47 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGCCGCAGTCGCATCGGCGTCATCTCTTTCTCCTGACCCTCGCCTATCCGCATCCAGTTAGGTTTGCT:1 - chr3L 5775562 3' - Doc 47 1 70.30 AACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTCGGGGC:1 + chr2L 17646259 3' + flea 5010 2 67.33 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTG:1 + chr3L 19462151 3' - roo 55 2 82.18 TTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGCGCATCGTCAGGATGTTGGCCTCGTCCCGGCTGCGACGTGAGGTGGCCAGCTCCTTTTCGA:1 + chr2R 20609498 3' + copia 128 2 66.34 AAAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAG:1 + chr2R 5531181 3' - 1360 80 1 55.45 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGTGTTCTGAACCCTTTCCTTCTCTCGCAT:1 + chr2L 3889617 3' - jockey 4693 1 78.22 TCCCGAAAAGCCGAGGACGACTTTAACCTAACGCGGGGAGGAGGCAGACGACCATGGGCGTGAGGTGGGCTGAAGGCCTTTTGTTCGGATACCGCTCCTGG:1 - chr2L 17081467 3' + gypsy4 6530 1 59.41 ATTTTTCGGCGTCCACAATATTAAACGTTAATCTTATAGTAAATGTACGGGCGAGCAGCTGTCACAAAAGTCTGTCCTTGGTCCTCCCATTGCCACTTCC:1 - chr3R 4608891 3' + invader3 282 1 56.00 TGATCTACAAAGGTGTTGCAAATGAGGAGTGACACCATAAATAAAACTCCATTGGCACAGCAGACATTTGGACAGACTGACAAAAGACAAATGAACTTCCA:1 + chr3R 3630683 3' - Q-element 171 2 71.29 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAA:1 + chr2L 15510447 3' + jockey 4946 1 71.29 TAGAGNACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGAGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAGCAGAC:1 + chr2L 19019007 3' + hobo 2900 1 64.36 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAG:1 - chr3R 29123364 3' + P-element 2831 1 23.00 TGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATTGAGAACTTGTAAATATTTAATGGGAAGGGCGGGGGAGAATAACCAGGACCAACAGGATGCAATTCACGCTC:1 + chr3L 6015604 3' - jockey 101 1 74.26 AACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGATCCTTTCAGCGCACATGTGTGTGTGTGTGTGAGTCCTGATGTTAGTGTTGTTTCATCCCCTGCTTGTAAAATCTCTG:1 - chr2R 7380662 3' - Doc 4230 1 78.22 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGT:1 - chr3L 19951225 3' - Ivk 57 1 81.19 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAACC:2 + chr3R 12047498 3' - Stalker2 16 2 63.37 TTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAAATATGTGCGAAGTTGCGTTTTT:1 - chrX 5129453 3' + Idefix 7387 2 73.27 ACATANCAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTGTGTGTTAGGCAAATCCGGTAATCGTACTTAAATGTGGAAACACCAAATTGCATAA:1 - chrX 16673294 3' - copia 4816 1 58.42 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAAC:1 + chr2R 13644526 3' - Burdock 4 2 75.00 GTCCGGATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCGTACAGATTCCAGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCA:1 + chr2R 5296377 3' + INE-1 133 1 83.17 TTTGANTTTCCAAAAGCGTTTCTTCGCGACTTCTAGATCAGGATTAAGAATTGGAAGATCAGTCTGAATCTGGACGAGATCAAGAACAGCTTCAAACAAAA:1 + chr2R 1579838 3' - Tc1-2 1250 1 65.35 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAGTTACTCCAGACAGTA:1 - chr3L 17918376 3' + 297 6947 2 63.37 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAACTATATT:1 + chr3R 19346970 3' - blood 7019 2 65.48 GTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCAAATGTACTTCATCAGGCACGGCGAACTTAAGTGCATTCTCAACCGTTTCCGTTTCTTTTCCGCAGC:1 - chr3R 15009796 3' - jockey 426 1 74.26 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGGTAGTTAAAGTGCCTGCGTAAAACGCTCTTAAATGAGCCATTAAAGACTTG:1 + chr2L 11703307 3' - Tabor 27 2 53.47 AGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAGAATGGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAAAATGGCCCTAAATGAAATATTCTGGGTCTCTCGTCA:1 - chr2L 11939718 3' + Porto1 4202 1 67.33 GCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACC:1 - chr3R 12047406 3' + Stalker2 378 2 53.47 TATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCATAAAAACGGAGTCATAAAATTAGAGAAACATAAAATACGCTTGTGATTTA:1 + chr3L 14821734 3' + 297 6556 2 56.44 ATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTTCTTGTTATTTCGAGCGATTAGAAAATTG:1 - chr2R 18355120 3' - McClintock 472 2 71.29 AGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGAAGCTTGATGGTGCTGGAGGCGTGGCAGCGGTACGACAAC:1 + chr3L 9944801 3' - G2 59 1 62.67 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTC:1 - chr3R 10952283 3' + roo 9026 1 69.31 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGCGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCAT:1 + chr3L 4641119 3' - hobo 52 1 71.29 CGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTCTTTCTGGCTTCAGCACTCGCAAAAATATTTTTTTGCAATTTCATCTGTTAATAAAACTATA:1 - chrX 21569916 3' - diver 6065 2 66.34 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAAC:1 - chr2L 13334023 3' + flea 4980 2 66.34 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGA:1 - chr3R 22431068 3' - Max-element 8266 2 52.48 TAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGC:1 - chrX 5129482 3' + Idefix 7358 2 68.32 GTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTGTATAGGAGCTGTTGCCC:1 - chrX 15293458 3' - Quasimodo 59 2 77.23 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAG:1 + chr2L 16948721 3' - jockey 4710 1 61.39 TCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTATGATAAATCGATTTTTAGAAACATCTCAAAATAAAATTAGTAAAGAACTA:1 - chrX 21668842 3' + F-element 4412 1 54.46 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTT:1 - chr2R 18950747 3' + roo 9033 1 64.36 TGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTTGTTTATCGGTGAGCAAACATTTTGTTCAGGCACAAGGTGAAATTATTTAGTCA:1 - chr3L 12352548 3' - G2 3001 1 52.48 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAACGTGTTTTCGGGCTCA:1 + chr3R 5686143 3' + P-element 2881 2 71.29 ATAGGAAACTTGGAATCCCACAAGTCGCTGATGAAATTGGGCGCATGGGACCTTATGCTTACAAGGGAACTCAGAGGGTGTCCTACGATAGCCCCGATATG:1 - chr2L 23005573 3' + G6 1745 1 68.32 TGGACTATAGCATTCTTTCTTTTTTTGCTGTGTTAATATTATTATCTCTAGTCTATGGGCAATGCTCGCTTGTTATCTGTTATATCATGTTTTAAGGCATA:1 - chr3L 18741116 3' + INE-1 578 1 66.34 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTC:1 + chr3R 19446229 3' + 297 368 2 54.46 CAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGC:1 - chr3L 25497422 3' + gypsy8 4776 4 76.24 CAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAGTTTTATTCACATTTCTGCATTTTAGATGGGATGGCCTGCTAAAATATTC:1 - chr2L 11703203 3' + Tabor 483 2 76.24 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTTTACAACAATTTTTGAAAAAGCAATACTAAGG:1 + chr2R 17718216 3' + 412 7516 2 61.05 ACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTTCCAGGGGTCGAGCACTAAAACTTATTCAGCGACTGCCTCGAATGCGATAA:1 - chr3R 30558488 3' + R1A1-element 4892 1 52.48 AGCTAGAAGGTTGAGATTCACCACACAGAGCGGGCCAAAAAATTGTTTGGCAAATCGAATGGAAACATAAAATAGAAGCGAACGTACGCGGTAT:1 - 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blood 7180 2 79.21 GGACCACTTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCAACTCGTTTACCTGCCCCCCTACCTGCCTTTCAGGCCCTTCTGACCGTCGTGGTGGATTTGTGAGTA:1 + chr3R 8277999 3' + P-element 2882 2 74.00 TATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGGCGCCGGGGATCAAGCCCTGCCCAGCGAGGATGCACCACTGAAATTTAATATTTTTGAGAAGAAATTCCC:1 - chrX 22828731 3' - P-element 365 1 73.27 CACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAAACTGGTACAAAAAACGAAAAAATGCACTAACAATAAGTAAAACTATCGCCGGTTTTCTTTGCCCGTGGG:1 - chr3R 29996930 3' + roo 8599 1 76.24 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCT:1 - chr3L 7205544 3' - Doc 46 1 61.39 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTTCGGTTTACTCATTTTTAACTCAATCCCTTAGGAGTGTAGAATAAACTTT:1 + chr2R 19552083 3' - roo 8666 2 75.25 TAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAA:1 + chrX 21534509 3' - accord 7332 2 75.25 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAACTA:1 + chr3R 19346966 3' - blood 23 2 53.68 GTACGNTACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAGAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCG:1 + chr2R 1949131 3' + Cr1a 4400 1 71.00 ATAACTCCAGAACGGAGTAAGATATTTGGTTTTTCTTTTTTTTTATTATTTTCTCCGGCTAAATGCGTTAACCATTTGATCATGCGAATATTAATTGGCTC:1 - chr3R 23375609 3' + Transib-N1_DM 40 1 71.29 ATTCTGCCAAAGGGCCAGCAATCCTCGATTCCCTCGCTTTTGGCTTGTCTCTGGTGCCGAGAGCGTTTT:1 + chr3L 14114513 3' - roo 8644 1 68.12 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACTAAG:2 + chrX 8972427 3' + 1360 3345 1 71.29 GTCGGTAAAAGTCGGGAAAACTGACAAGACGCTCACTGACTGTTTATTTGAAAGTCGAGGGATTCAACCATAGCGTTCTCTCTTTCTCTAAAAATGTTAAT:1 + chr2L 13335214 3' + flea 443 1 76.24 GCCTGGAGACACCTCTAAAGCCAAGCCGAAAAAAGTGGCCGCATAGTGCTAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCAA:1 - chrY 1182931 3' - 1360 67 1 72.28 AGCTTCAGTTTAAGATTCAGTTTTATTGACTGACTAAATGCGCAAAGCCCCC:1 - chr2L 16429483 3' - opus 7367 2 65.38 CGGGGAACTCGACCATAGCATTATCTTTTGTTTTTTATTTAAAGGGCGATATATTGGCACCGTTAAAAATCTAAAATCAAGGGAAAAAAAATAATAAAACT:1 - 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chr2L 22925161 3' - INE-1 136 1 57.43 CCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGAAAAGGTGCCGCAAAGAGGGTCGATCGTGTGTCATTGTTATAGAT:1 - chrX 9775786 3' - Quasimodo 7052 2 55.91 ATTGTAAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATTTCATTTGTATTGATTAGTCAACACGAG:1 - chrX 13508675 3' - roo 19 2 60.40 AGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGCAGAGCAAGTGAGTTCAATTCGCGTCGCGGGGCAGCTAAATCAACTAAAAGTT:1 - chr2L 12956135 3' + P-element 40 1 58.42 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGGAGTGCTTCGCATACATT:1 + chrX 13640684 3' + P-element 2860 1 43.53 AGTATGTGGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCAAAAAGGCGATCATTTCATT:1 + chrX 5129554 3' - Idefix 26 2 55.45 TCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGACA:1 + chr3R 32005945 3' - invader4 2794 2 65.35 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTAC:1 - chr3R 17896956 3' - 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INE-1 63 1 73.27 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAG:2 + chr2R 20744218 3' + roo 9033 1 65.35 CGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAGATTTGGAGAGGTGTCCTTGATTTGATAAAAGGCGTGGAAGAAAGTGTTTTCGAAACTGTAAGGTA:1 - chr3R 20251951 3' - roo 8999 2 63.37 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATT:1 - chr3R 13582204 3' - BS 5007 1 65.35 ATATTGAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGA:1 + chr2L 3440475 3' - Juan 60 1 73.27 TATTTAGTTGTCTTTTTTTTTTGCAGATCGGGGGGTGTGTGCACACAATAACATAAATTGCAGAATGTGACAAAGGGTTGTCCTTTGGCCCCGGCTACCCA:1 - chr2R 16376798 3' + Tc1-2 1390 1 74.26 TTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTA:1 - chr3L 19951221 3' - Ivk 53 1 77.23 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAACGTGTTTTCGGGCTCACCA:1 + chr3R 5686146 3' + P-element 2884 2 74.26 GTTACNTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTT:1 + chr3R 17321783 3' - Stalker2 7278 2 52.48 TAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGATAGAAAAAAAATTTGTTATGTAAGCGTTCCTATGATATATGTAAGAATGTATGTAAAATATACCTTTGAATAAAA:1 - chr2L 19817798 3' + G4 3835 1 53.47 CAAAAAAAAAGAAAAAACAAAAAGAAAAGAAAGAAATGCATTTATCGTTCTAAATATGCAGTAAAAATATATATATATAATTTGAATTACCGAGTGCCCTT:1 - chrX 3187288 3' + gypsy7 5006 1 66.34 GGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGATGTTTTCCTTTGGTGGTTTTAGTGGTTTAGGG:1 - chr2L 14956097 3' - G2 2981 1 66.34 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCTCAT:1 + chr3L 11553548 3' + P-element 2857 1 38.78 AGCTANCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAGGTGTT:1 - chr3R 27156624 3' - pogo 14 1 65.35 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCATG:1 - chr3L 12888203 3' + mdg1 407 2 64.36 CAAATCAATTGTAACATGAGTCACTACATTCAGGCAAACTGCAACATCCCCAAAGTACATAATTCCCATCGCTATCTCATCCTTTACACCTGCCTTTGCCG:1 + chr3L 19666791 3' + mariner2 265 1 58.42 CAGCGCAATTAACAGATAAATGATAAAACCAAACCTCGCAATTTAATTGAGTATGTTTTGCAAACCATCCAATAAATGGGTTAATTTTTTTTTTAGACTTT:1 + chr2L 4072586 3' - BS 5032 1 60.40 TGAAAATTTAAAAAAAAAAATGGTTTTGAAAGATAAGGCCTTTCTTTACACAAAAAGTAAAAATTAAATATGTTTACAAATAACGTTTTTGGTCATCATTT:1 + chr2R 10160451 3' + TART-C 11094 1 79.21 CCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCGTTTGGGATCGCAAACCAAATCGATACAATGGCTTCTCGCTTTCGCTTTCCTCGGTTTTCCATCTCTAAT:1 + chrX 1157790 3' - R1A1-element 4988 1 72.28 CTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTCGTAAACGCCACCGTTGCACTTTCGGAAGCGGTATTAAATGGACAGGTGGGCAATTG:1 + chr3R 23723648 3' - R2-element 380 1 63.37 AAGGGNTAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGATATCAAG:1 - chr3L 18337630 3' + Juan 4203 1 69.31 AACTAACATGTAAATAATATTATGTTTTTCTTTTTCAAGGCATGCGATATCTGGAGTCCAAAAACTGCATTCATCGCGATCTGG:1 - chr3R 9368783 3' + transib1 465 1 77.38 CTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCACAC:1 + chrX 2649920 3' - Tirant 2 2 79.21 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCT:1 - chr3L 22831284 3' - 297 40 2 74.00 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGCCCACGTTTCACT:1 + chrX 2179541 3' - Doc 11 1 58.67 AATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCGGTGTTTCATCAACTTTACGCCATGTTCATCTGTTTCGTTTTCCTCCTCCTTC:1 + chrX 8490207 3' - P-element 107 1 63.92 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATATATGCTAAAATCATTCCAAAGATGTACATGAACTTCACACTCGCAGAGCCATGTTGGCTACG:1 - chr2L 2310416 3' - HMS-Beagle 6797 2 57.00 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATC:1 - chr3R 23275263 3' + roo 9035 1 64.00 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACAAGCCTCCAAC:1 + chr2L 16201558 3' + hobo 2894 1 68.37 AAGAAAATGAAACAAAAAAAAAACAAACAACAAATCAAATCTAATGGAACCTAAGTTAAGTGTAAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAACAAACGAA:1 + chrX 8431473 3' + Doc2-element 220 1 53.47 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGAACTTTTGCT:2 + chr3L 9907447 3' + jockey 4983 1 58.42 CTTATTGCAAGCATAGGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGA:1 + chr2R 16334039 3' + P-element 2841 1 33.66 CATCAACAAACAAATAAAAATATAAACTTATCATCCCCCACGGGTCAGCAGAACTATGTAAATGGAAATGCTCAGAATGGAAGTACCAGCGGAAATGGAAG:1 + chr2R 17600907 3' + gypsy10 492 1 69.31 ATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACCCACATAAGCCGCATAAGCCAAAACAATCAGTCGGACGGGAGTGATGAGGATAAGTTTCGCCGTGC:1 - chr3R 6608750 3' + I-element 5347 1 64.36 AAACTCAAATAATTGTACCTATATATTGCACTACACACTACAAAATAAATAAATAAATAAACATAGTTGGTTAAACATTAGAGTGGGTTTTGGGATAAATG:1 + chr3L 4501808 3' + HeT-A 5969 1 75.25 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGAAAAATTTCCGAAAATATACATATTTAACATAGTAAATCGGCCAAACAACTTAAATGAGCT:1 + chrX 13761334 3' - pogo 12 1 68.32 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCA:1 + chr2L 16674901 3' - roo 8720 2 83.17 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTA:2 - chr3R 7522316 3' - blood 7058 2 69.31 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAACGA:1 - chr2L 7850083 3' - 412 7105 2 77.23 TTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTCTAAATTTTGTCTAGATTGTTTCCTCTACTTATATATTTATATCTTTTTTAGACACTTATT:1 + chr2R 3592074 3' + Quasimodo 7354 2 67.33 AACAATAGACAACACATATAAAACCCGCCACAAATACATGTACAATTTGAAAAAAGTAGGCAAGATAATATTACGAGATTAAGAAACAAACAACAACAG:1 + chr3L 19939498 3' + G6 1907 1 61.62 ACCTTGTACCCGAGCTGGCCGTGCGAAAAGTGGAAATAACGGGATCCCCGCCTATAAAGCTCAAGGCAGTCAGGTACAATCGATAGCCGGCATATTTATGG:1 + chr3L 3971393 3' + gypsy8 288 1 73.27 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCGGCCT:1 + chr2R 11528075 3' - P-element 31 1 50.50 ACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGAATCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATACCTTCAC:1 + chr3R 10240145 3' + invader4 3053 2 76.19 TTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGG:2 + chr3R 1977610 3' + micropia 414 2 64.36 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAA:1 + chr2R 13650186 3' - mdg1 22 2 57.43 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTAGATCTACAATATAATA:1 + chr3L 5102463 3' - jockey 4700 1 54.46 TCGAAATCATACTGAATCCTAACATGCTAGTAAGTGCATAGCAAAAAACAAAAAAATGTGCAAATACATAAATTCGGAATGAATATGCCATAATGCGTTGC:1 + chr3R 26794318 3' - hobo 418 1 65.35 TTAAANATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAACAGTGGAAAGTAATCCACT:1 + chr2L 12324125 3' - roo 8672 2 73.27 TTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCGTTGTGGCCATGTTGCTGGTGGTCTGCTCTGCTGCCT:1 - chr3L 15391686 3' - flea 4750 1 63.37 TCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATTTCTTCCGACTGGCGGCTGTGTGTAGGCGGTGTGTAAAAGTGTTCTGAAGCAGAACACACAAAACATATA:1 + chr2L 1524604 3' + roo 8717 2 54.46 AAATTTAAAAAAAATAAAAAAATTCCTTATTGACTTTTCGATTGCTGGGATTTCGTTCCTTTGTCAGCACCTGTCGCGCCGTCATTCGGCCAGTCCC:1 - chr3L 18059066 3' + TART-C 11097 1 60.82 GATGAAGCTAATTGCTGGCGCGGGCCCAAAAGAGCGTTGCAGGAGCCAGCAAGGGGAGGTGGTGGTGCTGTGCGGAGGGGAGGGGGGTGTGTGGTGTGCGT:1 + chr3L 7955249 3' + G5 452 1 75.25 CTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATATATAATTGTTTATTTTGTTTTGTTGCTACCGTTTTTTAATATAAAATGGCTTTGGGTGAAAAATTTGGC:1 - chr2L 11590633 3' - F-element 28 1 57.43 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGACAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTGATA:1 + chr3R 7168661 3' + flea 250 2 68.69 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGCTACCAGGTTTCAGGCAAGGGCAAATCCATCCGTTGAGACGTTCTCAAAGTGCTGCAGTCTACCCT:1 - chr2R 3174476 3' + 1360 3379 2 69.00 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAAATATTTCATTCATTTTC:1 + chr2R 13650203 3' - mdg1 7043 2 74.26 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAAT:1 + chr3R 4544063 3' + flea 220 2 62.00 CTGTTGGTGCTGCTGGTGGAGCCAAGATGCGGATGCGGATGTGTGGGCAGGTGAAACAAGTCAGATAGAGATAATCCGATGAACTCTGCGTCTGTAGAAT:1 + chr2R 22465151 3' - TART-B 148 2 72.00 TTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCACCATTTGGCCCGTCACTCATCATCGGCTT:1 + chr2L 12884248 3' + 1360 427 1 69.47 AGGGCGGATGTAACCTGATCGCCCACTTGAAGGCTACAAACAATACGGCCGCCGGGTGGCGAAGAGTCCTGCGCGAAGAATCCTGCCAGCCGGCACAGTGA:1 - chr3R 5895021 3' + 412 111 2 72.28 CGGGCNAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGGGATGATATGGAATTCGCCCTGCCAAAGGCTC:1 - chr3R 16837815 3' - I-element 4994 1 67.33 TGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTATAGCATACTCTCATCTTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTA:1 - chr2L 15004805 3' + INE-1 548 1 72.83 GCATTGACACTAGCTGATTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTGGATCATAGCATTCTCTATTTTTTGTTTTTTTTTGGGGGGGAGGCCAGAGCAAGTG:1 + chrX 8313179 3' + INE-1 534 1 59.41 TCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTGATTGAATTCTTTTGCAGCTCTAATAATTATTTCAA:1 - chr2R 2035006 3' + gypsy 410 2 64.36 GAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTCGGTGATTCCCTTTTACTGGCTGCTGAAGGTGAGCTTTGCATTCCTCACATATAAGAAT:1 + chr2R 14172531 3' + hobo 2592 1 59.41 GTCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGCC:1 - chr2R 4854998 3' + opus 7458 2 75.25 TCAAGTATCGGCAAACAAGGGGAAACCCCTTCGTCTACAGAACCTAGATATGGCGGCAACTCAAACCGATTCAGCAACCAATAAGAAGGATACCAGCTG:1 - chr2R 490763 3' + X-element 469 1 71.72 GGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGCTTGAGGGCCTGCATCTTGTGCTCCACCAAAGTGCTGAAGACAGCCTCGTAGGTGAGCGCTCGTTGGAG:1 + chr2R 9374074 3' + hobo 269 1 75.00 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAAT:1 + chr2L 513732 3' + roo 9038 1 59.41 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAATATACCCAAAACCCTGATAGGTATGCTTTAATTTCAATCAA:1 + chr2L 15080571 3' - hobo 33 1 57.43 TCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTGGAACAGAGAAGTTAAGCCATGTAGCTGCTGAAATCAGTTGATAAATAAAAAAAAAAACC:1 - chr2L 6788968 3' - Cr1a 4185 1 59.41 AACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGCATGTATGTATAAATCTTTTTAAGCTGAAAATAACGCA:1 - chr3R 4601320 3' - opus 7042 4 71.00 CAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGAATTTGGGTTTGTGAATCAGCAAGTTTATTCAAATTGCAAGTGGATTTTTGTTATGCCAATTCGTTAATTAGT:1 - chr3L 14742150 3' - I-element 4999 1 74.26 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGTATATGGGTATTTGGTATTACCTGAAGTCTGGCTC:2 + chrX 17830791 3' + P-element 2848 1 41.58 GTGGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAATTTATATTGAGAAAATTGTCAGGCGGTTTGAAAAAAAAA:1 - chr3R 26530832 3' + blood 7384 2 72.28 AGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGCCGCAACATTTGCTCAGTCCGCGACGAACTCTCAACGCGGGCGGTTGTGTAGAATCTGTGGC:1 - chr2R 14713574 3' + P-element 2874 1 69.31 GAATATATGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCAAAGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGACGGCTTCAATCGCTGCTAATTCAACATCGATTGACATTA:1 + chr3L 24759414 3' + 1360 401 1 60.40 TGCACAGTGGTCTGATTTAAGACAAACAAGGAAATAACAAACGTTGATGAATAGATAATAAATTATACAAAAACGCTCTGAACATATTTAATTAGTACCTA:1 - chr3R 19355030 3' + Cr1a 408 1 62.38 CTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCA:1 + chr3R 29288797 3' - BS 4996 1 72.28 AACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTGCATTTTCAATAATTTAGTAATGAATAGAATTCATCTACATTTTCCGATTCAATAATAAATATGAAATGTGT:1 - chr3R 11094477 3' + 3S18 6101 2 72.28 AGCGCATTGAGAGCAAAAGCCGAATGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTCTTCAGCTTCTGGGGTTCCTTGAAGGATATATTTAAAACAAGAAATGTATAAGT:1 + chr3R 11255354 3' - 1731 4549 1 50.50 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGATTTAAAATTGGGTAGACCCATAAACAGATCGAAAAGCGCTTATCA:1 - chr3L 3172687 3' - Tirant 8164 2 57.00 TATTGNTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGCATGACGCCCTA:1 + chr2R 12082432 3' - mdg1 7 2 72.28 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTC:1 - chr2L 17722761 3' - blood 7034 2 53.47 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCGCCTGTGACACGGCTGCCATAA:1 + chr3L 4921467 3' - jockey 4786 1 52.48 ATACTNAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTACTTTGATAGAACGTCAGGAATTCTATTCACTATT:1 + chrX 1184003 3' - Ivk 5342 1 64.00 AATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCTCCGGAGTTTGTTTTTAATTCATGGGAATAATCACCGAAAAGTGCACA:1 - chr3R 14480072 3' - flea 487 1 52.48 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAGCAGAACAAACACTCACGAGCATTTGATTTATGTCGCTTTAA:1 - chr3L 2144318 3' - copia 4904 2 59.41 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTAAAAATGT:1 + chr3R 8555938 3' - 412 7074 2 57.43 TTTGCNTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAG:1 - chrX 6379142 3' + hopper 1377 1 66.34 CCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGGAATGCAAGGAAGCTCCGTCGC:1 + chr3L 22752798 3' + FB 228 1 78.22 TGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACAGAGTGGAGCTGCCGGCCAGCATGGAGCACCTGGTGCCCAAGACGACCAAGGTGAGCCGTTGTAGAAC:1 - chr3R 26855826 3' + Tc1-2 7 1 65.35 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATC:1 - chr2L 22084478 3' + copia 222 1 55.45 TAGTCTCCGATCGTGGCCACCACCTGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACGTAAACAGCTACAGCGGCCTACTTAAATTTCTTCAATACTTCCAATACAGC:1 + chr2R 4578493 3' + Chouto 393 2 57.43 ATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTTCAGCAAAAATTTCAAAATTTCCTTTTTTTTT:1 - chr3L 5166168 3' - P-element 181 1 36.21 CAGTGAACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGTGAGAACTT:1 - chr2L 17722748 3' - blood 7021 2 66.34 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCGTTGACTCCTTTTAAACT:1 + chrX 21017883 3' - 412 7 2 45.54 TGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTGCATACGCGACTTCAAACATAAAACT:1 - chr3L 8713056 3' + opus 496 2 77.23 TGGAAACGTGCCGAGGTAGTAATGATACCTAAGCCTGGAAAACCTGAGACCAATCTCGCTTTTTATCGTCCCACAAGGCTCTGTCCTGGGACCGCTGCTCT:1 - chr2R 4932196 3' + G7 220 1 72.28 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTTGAAATGAGTTGAAAAAGTGAAAAGTTAAGCGAAATGAAAAGGAGTTTTAGACCCCAACCTCTCTGCCTATGT:1 - chr2L 14579801 3' - copia 4 2 75.25 ATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTGAGTCTTTTTTCGACTTCTATTAATCCTACTTATAATTAACATATACTGCATCACCAATTTCAGA:1 - chr3R 12075712 3' - diver 6073 2 57.43 TTAAGNGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCAAGTCGATCCGCTCCCGCTGATAACTGATC:1 + chr2R 16583345 3' - P-element 41 1 38.61 GGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATGACACTCGGCACTCATAACGGAGGATAGAGAAGGCAAACAGTCAGAAAAC:1 - chrX 22413360 3' - gypsy5 18 2 59.00 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCACTTT:1 + chrX 17042702 3' + copia 5075 2 75.00 ATATTTTAAACATAATTATTAAAGAACAGTTTTCCTGTGGGATACTCGAGTACCTGAGACAGAGAAAGAGAGAGAGACTACCTGTGGCTCACTCACTTCGA:1 + chrX 395905 3' + Cr1a 101 1 78.22 GATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCTTATTCTATACACACCCACTGGGAAACCCACCCTCACCGACCATCATTAGTCATTAATCGTTGGAGTGACTTTA:1 - chr2L 21855192 3' - Circe 12 2 66.33 GGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTG:1 - chrX 19426245 3' - mdg3 46 2 71.29 TAAATGTTTGGTGGGCCTGTCATAATTGTTGGTTAAGTTAGTAAGTCAGCGGGCGATTGGAAAAGTGCGCAGATTTTTCGTTTTCACGCTCCTCTTTTTTC:1 + chr3L 15319600 3' - I-element 188 1 75.25 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATAGATCCTCAATGCACTTGTTTTCAAAAG:1 - chr2R 9854047 3' - pogo 49 1 73.27 AATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAGGGTGAGAATTTGAGGCAGTTCGTAGAATAACACGCCTCTCTGATGGTGTTGTTACATATTT:1 - chr3L 27357749 3' + 1360 454 1 62.38 CTTCAAAATCAAATCGATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGTTTGCTTATTAAATCTAGTAATTGAATTGGCAAACTGAGAAACAC:1 + chr2R 23584841 3' + HMS-Beagle 232 2 78.00 ATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCCACAAAAGAGTTAGAAAACGGCTTAGACAATCCACCACGTACTGCATGTCGT:1 - chr2L 1687590 3' + P-element 2611 1 55.45 CTTGTATTTATTGAATCTTCTTATACAAGAACATTCAATAAATAAAAGCAAACCACAGGCTAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAGAATCAAACAGAAAAGAAAG:1 + chr2R 21453768 3' - F-element 4658 1 50.50 TCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGCTGCCTGGCATTCGGCTATTAAGTTGTTTTCGATCTTAAATACGTGGGTGCGTGG:1 + chr3R 13260473 3' + hobo 312 1 60.40 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATATTTGTTTTTCGACCCAGTGTGTATATCAGCAGAGCCCAAC:1 + chr3L 6506882 3' - roo 8693 2 58.42 AAAATGGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTG:1 - chr2L 16201510 3' - hobo 34 1 58.42 ATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTAGATAGGGAATAGGGTAGGATGAACAGACAGCACTCCAAAGTGTACGGGCATAGATAAACAGGCCCACTC:1 + chr3R 27471488 3' + HB 92 1 64.36 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTAA:1 - chr2L 17210252 3' + jockey 4987 1 73.27 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTTTACAACAATTTTTGAAAAAGCAATACTAAGGTGAGAACTA:1 + chr2R 17718225 3' + 412 466 2 54.46 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGTG:1 - chr2L 17722755 3' - blood 7028 2 59.41 AATTGNGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACTGTATTGCATTAAAGGTGGATTAAAAAACTGTAGATTT:1 + chr3R 16245104 3' - 1360 35 1 65.35 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGAGCATTACTCATTCTCATTTCCAACTGAGCG:1 + chr2L 3632198 3' + P-element 2844 1 36.63 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTA:1 - chr2R 12082337 3' + mdg1 390 2 54.46 GAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGCTGAATAACAACACATGAAAATTATATACCCAAGAAACCAAAGTGCCGCGAACAAAAACTAACTAATA:1 - chr2R 12118621 3' + I-element 494 1 66.34 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCAACTTTACATTCTAGGTCTAACTTTTA:1 + chr2L 10715319 3' - pogo 44 1 70.00 AATAAAAAGTAAAAAAAAATAATTTGATTAATCGCACTCAATTGCCTTTAATTGAATAAGCTGATTTTCAATTCTATTTATCTTGTCCTAAATTCACGTTG:1 - chr2L 3690620 3' + Doc 4694 1 80.20 TTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATTTATAGAAAAGAAAAAAAGTTAATTCTTCCTTATTATTTATTGATTAGTTAGCTGTTTGTATTTATTTTAG:1 - chr3L 24208951 3' + Cr1a 4350 1 51.49 CCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTA:1 + chr2L 13136810 3' - roo 264 2 73.27 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAG:1 - chr2L 4160133 3' - Tirant 36 2 63.16 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGC:1 - chr2R 7861665 3' + roo 9041 1 61.22 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGA:1 - chr2L 14790573 3' - roo 25 2 54.46 AGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGA:1 + chr2L 3388122 3' - F-element 328 1 65.35 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGA:1 + chr2R 13650175 3' - mdg1 33 2 57.43 GGTAANAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATAGAGTCGGTAGTGCCGGGGCATGTGTCACCAAGAACTGGCCACCTGAGCTGCAGTCTCTCCCCATC:1 + chr3R 11343259 3' - hobo 10 1 66.34 ATTCCATTAAATATAAATCGAATAAATTCCATTAAATATAATTCGATCATAAAATATTCTTACAGAAGCTATTAATTCCCTATATTTTAGATGGTTAAATT:1 + chr3R 21689955 3' + HB 472 1 67.33 CACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCAAACTTAGTACTAGGGCCCTGCTTACTCGGA:1 - chr3R 4164998 3' + Idefix 175 2 71.29 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTT:1 + chr2L 7255830 3' + P-element 2875 1 67.33 CAACAACACCCACAAACACACACACAACTAACACCAACACAAACAACAATACGATTATACTGGCCGTATCCGTGGCCGTTCTCATGTCTACGGCCCGCTTC:1 - chrX 2161030 3' + gypsy3 421 1 70.30 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAATCTGCGTTAACTTATATATATATATTTTTTTTTTTCTTTGAT:1 + chr2R 11637022 3' + opus 7461 2 76.92 TTCAGATGGTCGGCGAACGCTTTGACTTTCTGCTTCTTACGTCCTGCAGCAAGTAGCCTGGGATCTTAAAGGCCCTGAGTGACTCCAGCGTTCTTGCCCAA:1 + chr2R 4932308 3' - G7 36 1 75.25 TTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAGGGCACACGTTGTTTTTTTT:1 - chr2R 488909 3' - Bica 4903 1 81.82 TTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAAAAATGCTATTTATTTGC:1 + chr2L 17960273 3' + transib2 2558 1 88.75 ATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTGTTTTTCTTTCATATGCATATTCA:1 - chrX 871147 3' + jockey 4933 1 80.20 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTT:1 - chrX 22738549 3' - 297 3 2 69.31 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAAC:1 + chr3R 12047497 3' - Stalker2 7265 2 62.38 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTT:1 - chr3R 31458413 3' - jockey 29 1 57.43 TTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAAC:1 - chr3R 4160061 3' + invader2 237 2 66.34 GATGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAA:1 + chr2L 12667219 3' + blood 7349 2 75.86 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCATATTGATATTTGCTCTT:2 - chr3L 13659894 3' - pogo 36 1 63.37 CGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGCCCCGTAAACGATTTTGCGGGCTGCTGCATTAAAATCGATCAACGAAACGACAATGGGCGTATTGAAC:1 - chrX 2318716 3' - Doc 304 1 72.28 CTGGCTTGTTATGTACAATTGCTTGTTTTGTTTTCAGATTTTATGGAAATGGCATTTTAGCACACATTTCGACCCGCAGCCCGCAGACTTTACGTAATGGC:1 + chr2L 1301012 3' - I-element 5207 1 61.39 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCA:1 + chr3R 6622680 3' + P-element 2831 1 25.00 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATTTCATTTGTATTGATTAGTCAACACGAGTTTATGTGGGTTGGTA:2 - chrX 13508659 3' - roo 3 2 76.24 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCTTATAAGTAGGCAATAAA:1 - chrX 7045586 3' - jockey 4772 1 61.39 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATTTCATTTGTATTGATTAGTCAACACGAGTTTATGTGGGTTGGTATTC:1 - chrX 13508656 3' - roo 8664 1 79.21 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGGAGTG:1 + chrX 13640671 3' + P-element 2877 2 43.64 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAACGAAAAAAGCGTAGCACACTTTTCGGGGCGCCCATTTTTGACACT:1 - chr3R 22644122 3' + hopper 1406 2 70.30 GATGTGAATGATGTGTATTTGTCTTTTGGTTTTTGTTTTTGGTTTTTTGGTTTCTTTTCTTAGGAATGCAAAGTGTGCGGGTCGCTGACCCCGAACTACTC:1 + chr2R 10517351 3' - Stalker2 82 2 73.27 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCAATATCTGATGTTCAGTCATTAAAATGTTATTATTTTATGATACTTTATCGCAGT:1 - chr3L 17587767 3' - roo 8684 2 59.41 TTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTCTGGCCTCGCGCGAGGCGAAAGGCAGTCAGTTCACTGGGAAAAAAAGCGAGGTATTCT:1 + chrX 6902460 3' + Cr1a 4323 1 59.41 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCATTTCCACTTTTCCG:1 - chr2L 4160096 3' - Tirant 4 2 77.00 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCGGCATTTTCTCCAGATGTACCCTCGACTCAGTCCAATT:1 - chr2L 2074689 3' - roo 8679 2 63.37 CTACAGTCAGAGCCGACTGAAGCGCAAAAATTCTCCAGCCCAGCAAAGAAATCCTAGGAGAGAGAAATCGCTGCAAAAAAATATACATAAAAATTGCGAGC:1 - chr2R 9640254 3' + Doc2-element 4602 1 57.43 TTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGTATCGACGGCTTTACTGTTTTTCTGCTGACCTTTGCTGTTTTTTTTTCCTATTTATAGT:1 - chr3L 4718234 3' - F-element 4426 1 60.20 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTGGTTGACGATGGA:1 - chrX 13640606 3' + P-element 2878 2 70.30 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTCGAAATGAGAGGCTCCGCCCG:1 - chr2R 8310861 3' + pogo 2047 1 78.22 GCCGANGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTGTATAGTTCGCAGCAAAATGGCCTATTGCACCTTTTGACCTTTTTGCA:1 - chr2R 8158865 3' - pogo 22 1 57.43 CCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGAGATTGTAACAGACTTGCTTTGATGGCT:1 - chr3L 20530392 3' + Burdock 6063 1 72.28 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCAACATGCTTCGAAAATCCCA:1 + chrX 10672339 3' + mdg1 366 2 79.21 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGT:1 - chr2R 981625 3' + 1360 3386 2 60.40 TAATATAATATTAATTAATAATAATAATGTAGGTGTACATGAATTAGAGTACAATAACCTATTATTATTCAGAAATATACATCACAGTATTTTAGTAAAAT:1 - chr3R 14750459 3' - Tc3 272 1 41.58 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCT:1 + chr3R 6608814 3' - I-element 51 1 76.24 TTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTCTAACGACAAAAAAAAAAACCCAAATATTAGAGTCTGAAGAGGTTTACGAAATGC:1 + chr3R 13925414 3' - 1360 434 1 55.32 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGAAG:1 + chr2R 10543520 3' + P-element 2865 1 57.43 ACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTGATAAAAAACGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAATATAAAACAATACTATATGTCCAT:1 + chr2L 21635363 3' - F-element 467 1 73.27 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGATAATAAT:1 + chrX 15082460 3' - mdg1 7062 2 55.45 CATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCATATATAGTAACGTGTTTGGTGCGAGTGATTTTGGGGGAC:1 - chrX 15089071 3' - gypsy 37 2 64.36 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTG:1 + chrX 17968419 3' + Tirant 353 2 69.31 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGTCCTTCATCATTTAGGCCATCATTAATTAAAAGGACACA:1 + chr2R 16980550 3' - copia 4907 2 62.38 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 77 1 77.23 CGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATTAGTAGTTTTTCCAGGGGAAAGC:1 + chr3L 13661058 3' - pogo 1697 1 77.23 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAAATATTTTTTCCTTGCTG:1 - chrX 10827384 3' + roo 406 1 72.28 GGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTCTTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAA:1 - chr2L 15004799 3' + INE-1 545 1 77.23 AAATCTTATTATATAACTTATATTAATTACAATATGAAGTAATTGTCGGCGCTTAAGTGGAAGCCTTCTCCTCCTCCATCTCCTCCAGCTTTCATCATATT:1 - chr2L 5874640 3' - Doc2-element 4700 1 61.39 ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGTGTTTAATGCATGACTATTGTCAGGGCAAATTGC:1 + chr2R 20228898 3' - Stalker4 44 4 65.35 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGA:2 + chr2L 17722831 3' + blood 7348 2 66.34 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTTACTTGACTTGACTGGCATATGTCAGAAGCGAGGGCGTTCGCCGGGGGCA:1 - chr2R 16583277 3' + P-element 2866 1 60.40 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTATTGTCATTACTTTTGGCCCACATTTAAAGCC:1 + chr2R 23580837 3' + P-element 2870 1 60.40 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCACGATTACACAAAAAAGTTAATTTATTTTGGTTTCGGTG:1 - chr2R 10774045 3' + copia 251 1 60.40 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCGCGATGCTGCCGATGCCTTTGCCGAGAT:1 + chr3R 27748739 3' - roo 28 2 57.43 TCATCTACACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAAAATACCCTCAACTCTCCCGCTCTCAACACACGCTCAGCCGCAGATACGGATACAGAT:1 + chr3L 13119134 3' + Porto1 424 1 70.30 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAAAACGCGCCCGAAT:1 + chrX 19162693 3' - pogo 7 1 72.28 TTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACTTATACTCGGGTGGTCTCGTAGATAGTCGAGCCAAAGACAAG:1 + chr3R 4571459 3' + 1360 3186 1 61.18 AATATTAATAATAATAATAATAATAATAAACAGAAAATTGTATTTGGATAAATAGTCCATATTCATCGACGATAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTC:1 + chr3R 19449088 3' + mdg1 49 2 55.45 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAACAGTGGAAAGTA:1 + chr2L 12324118 3' - roo 8679 2 66.34 GATCTCAGGAACTATAAAACGTAGAGGGTGAGAACGCAACCCTTTTCGGTAGGGTTTTCTAAGGCTTTTTAATAGCTTTGCGTTAAAGTCCTTTTTTTTAG:1 + chr3R 4550180 3' + INE-1 150 1 75.25 ATTAATTTATTTAATTTATTTAATTTTCGTTTCAGCAAGACCTTGGTAACCTACAATTTTTTATAGTGTATTGTATTCTATACTTTTTGTGTTGTATACAA:1 - chr2L 8525246 3' - HeT-A 1 1 55.45 TTATTGAAATATCACCTTGGCAAAATGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGCTTCATTTTATTGTTATTATATTTACTTGTCGGATTT:1 + chr2L 16994494 3' - I-element 5019 1 63.37 ATCCGNGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAATTTTTC:1 + chr2L 3440523 3' - Juan 12 1 71.29 CACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATCTCAGCATTGCGCAGTTACCGATCCACCGGACTCGCAGTTAAAAAAAAATGCCCCGAAACAGATACGACC:1 + chr3L 10358660 3' + Doc3-element 4523 1 72.28 AGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAA:1 + chr2R 5840701 3' - Ivk 21 1 58.42 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAG:1 - chr3L 9383527 3' + P-element 2837 1 29.70 TATTTTATCATATTGCTACGGAATTGGCAAAAACTGCCCAAAAAACACTGTTCCAAATCCCAATTCGATTGCACCACCACCACAACATCCATACACTGTGC:1 + chr3R 24664868 3' + 1360 3108 1 65.35 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTG:1 - chr2R 7861679 3' + roo 360 2 76.24 AGATGTGGGACAATGACTTATAGGGCAATAACTTGTATCATCTTTTTTTTCAACACCTTTACATACATTTAATATATTTTAGGACTTGTATATACAATATT:1 + chr3R 11728208 3' - HMS-Beagle2 6895 2 68.32 ACTTTCAACTTAAGAGTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGAGCACAAACACCATCACACATTCACACACACTAACACACACACACAC:1 - chr3L 1861514 3' - McClintock 6223 2 52.63 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCTTTCG:1 + chr2L 4160206 3' + Tirant 8496 2 63.33 AAATGGAAAAATGATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAG:1 + chr2L 13574260 3' - pogo 48 1 71.29 ACAAATACATATACATACATATATATACACTATGCTACATACATGTATGTATGTGTATCGAAGCCAAAGTCAGACCCTCCGCACAGAAGTGCTTTAAAAGC:1 - chrX 5604578 3' - 1731 4413 1 53.47 ATACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTACGTGGTTACGAGG:1 + chrX 11730351 3' - jockey 4769 1 70.30 CAGTTNCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATACTATGGCTCAGACGGAATTATAGT:1 - chrX 1281669 3' + roo 9041 1 55.45 TTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGCTTTATTTGTAAACATTCAAGTGAAGTGAGCTGATTTGCCTAGAGGTGTTTTCCA:1 - chr2L 18178784 3' - 17.6 7334 2 57.43 TCCCGAGTTATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTGCAGCGAAGGGTGAGCGGGAGGCAAGTACACACGGAAAAAAAAATGTGCATCC:1 - chrX 17694230 3' + transib2 2674 1 60.40 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGC:1 + chr3R 4544051 3' + flea 4966 2 74.26 CATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAAT:1 + chr2L 23295843 3' - micropia 5093 4 77.23 TATTTTATTTTATCATATTGCTAAAAGAATGGCGCTTAAATTCGACTGGAAAGAAAATATATGAGTAGGCCGATGGCAACACAGCCAAGAG:1 - chr2L 22585526 3' + 1360 3103 1 76.92 TCCCGAGAGGCTTGGTTGCTGCTATGATGGCGGAGAAAATAGCTTGTGAAAGTGTCTAAAATAGGGTCTTTTTGTGTTCAATCTCTGCCGAATTATATGCA:1 + chr3R 16542024 3' + Rt1a 4661 1 65.35 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCCGAACAGGGACCAGGTGTCATCC:1 + chr3L 8363083 3' - 3S18 5771 2 67.00 CACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGGTGGTGTGGACTTAACAGCTCGCTCTTCGCGATCCTAGTGCAAGACACA:1 + chrX 15395185 3' + 1360 195 1 53.47 ACTTAGGCGCATGATTTGTTGTGCAACCATATCTAAAAAACCAAACCCACAAATATAGCTGGGATAGAAGCTATCAAAAAACAAATTGGAAAGGAAATGGA:1 + chr2R 1368520 3' + rover 106 2 58.42 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGAAACCCGCGGCCGAAAGCGGATAAAAAG:1 + chr2R 18950795 3' - roo 8710 2 74.26 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATATACTAAGCAACAGGGTTGCCTTGACTTACGGGGATGCCA:1 + chr2L 7800117 3' - P-element 36 1 44.55 CCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTCCTACCCCGCCCCCGCAT:1 - chr2R 15895539 3' - I-element 272 1 81.19 TGCACCCGATGATGAAATCGGCATGATCCACACGCAGGCCCTTTAGATTGCTATCGCCATATGCTCGCTGACGAGCTTTGGTTTTCTCTTGCTCGAGAATC:1 + chr2L 11986315 3' + accord 7005 2 79.21 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACTTTCAAGGGCGGC:1 - chr3R 17896943 3' - hobo 32 1 65.35 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGAAGACGCGGCTGGCAACATG:1 - chr3R 11999218 3' + P-element 2880 2 66.29 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTACAGCAAATTCCTAGGCCTAAT:1 + chr3R 27430065 3' - pogo 51 1 77.23 TTTAANGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATACATCTTACTAATATTTATATTTTTTTTATAAACCTCGGTCATGCGGGAGGTCCCGCTAA:1 + chr2L 21272145 3' - copia 19 2 61.39 GTGAGCATACGATTGCTGGATTAGACAAAAGCCAGTGAAACAGTTGCCATATTCCGCTCGACCTTTTCACTTTCCTTGCTCACTTTTCTTTATTTTGCAGC:1 - chr3L 21992198 3' + R1A1-element 328 1 75.25 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCG:1 - chr2L 12815059 3' + hopper 1364 1 74.26 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATG:2 + chr3R 7168628 3' + flea 4974 2 73.27 TATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACAGAGAAGTAAAGCCGAAGGTGTAGGTGCAAGAGTACTAGGGAGGATTGCTTAGATAACGAAGCTAAGCCCA:1 + chr2L 22178576 3' - Cr1a 4117 1 58.42 AGGGATTACAACCACGGCACCCTACGGACACCCCCAATCACCTGTGGCTGTGATCTGTTACGTAATATCGTTGTGCTTAGCTTACGTCGTTGTTCCGGCCG:1 + chr2L 1718734 3' - R1A1-element 5280 1 80.20 GGAGGAGAAGTCGAGGGATGCTAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAATAACAATAATGCAATCCAAAGGGAAGAGAACCAGAGGTACG:1 - chr3L 10746262 3' + I-element 340 1 62.00 TTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTAGCAAACTTGCAATGCGTCTATGTCTCCAGAGTCTGCATGCTTAATATCAACCTTCTTGGAGTTACTAGTAGAATTAAAG:1 + chr2L 21727603 3' - INE-1 343 1 54.46 TATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAAATATTTCATTCATTTTCTTTG:1 + chr2R 13650207 3' - mdg1 7039 2 78.22 ATAATTTTGTTGTTTTTATTTTTTTTCATTCTCGATTGTCTTCAAACATGTACATACATATCGCCAAAGAAAATTTGCAAATCTAAAACTTATCGTGGAGA:2 - chr3L 3716433 3' - gypsy11 3934 1 75.25 TTCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGTGTATTGTCCGTTAGGT:1 + chr3L 25842203 3' - 1360 76 1 50.50 GTATATTTATACATATACATATATATAATACATATATGCATATATTTATTTCAATCGCGTTGTGTGGAAATCGATTTTTCCAAGTGATATCCCAAGAAGAC:1 + chr2L 17152047 3' - Stalker 7097 4 70.30 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGTGAAACCAACCAATGTTGCCATTCACAGTAAACGTGCACAGTTGTCGCTTGCCATTCACAATCAGC:1 - chr2L 8308160 3' + P-element 2880 2 59.41 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATAAGTAACGCGTCTTATTATTTTAATTTATTTTTTATTT:1 - chr2R 14276353 3' - HMS-Beagle 6833 2 67.33 GAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGACATAA:1 + chr3R 32005948 3' - invader4 32 2 62.38 CGGAANAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGA:1 - chr3R 12047423 3' + Stalker2 361 2 60.40 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGATTTTCTAGCCAAACATAAAATAACTAGAAGTATTCGTATATAATTGAAATGCTTGAATAAAACTTAG:1 + chr3L 15100770 3' - pogo 4 1 76.00 ATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATGTTGGATAATTGAAATATGTATATTCTTAACCAAATGTTTGCTTTACTTCACTATTAACAACAAAGCACTTAA:1 - chr4 179597 3' + INE-1 151 1 77.23 GTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAAATAAAAATCACACAAAATATGA:1 - chr3R 28942149 3' - INE-1 534 1 62.38 AAATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAACACCTCTTAAATACATAAAAAAGGATATCACATATTTGTTAAAGGGCACAAATCGAATCGAAAA:1 + chrX 15534773 3' + F-element 110 1 66.34 ATTTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGTGCAGTGGGCACTCCTCGCTGCGTAATCGCATCAAGAAAGTGAAATGTCAGCTGTTTCCATCATC:1 + chr3L 5280543 3' + roo 8749 2 69.31 CCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCGCAGCCACAGAAACTCAATATTAAATAAAAAAAAATATGAAGC:1 - chrX 4953821 3' - hopper 464 1 62.38 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGCAATTCATA:1 + chr2L 3951666 3' - Transpac 4941 2 55.45 GTGGGCCTTATGAGTGTTCATTCTACCACAATCTGTTTTTGAGTTCCGGAATTAATGGTTATTTGCCTGTTGCATCATTTTTATCTGATCA:1 + chr2R 5740023 3' - invader3 9 2 75.82 AATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTTGTTACTGCCCCAATTATTTGTAGGT:1 - chrX 15355043 3' - X-element 4673 1 72.28 ATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAACTTCAGAAGGAACTGATCGATTCCTACTGACTGAAGCGCGGCGCGAACCGCCGCAGCAAACAAACGCCCAAG:1 - chrX 19667248 3' + G5A 2774 1 60.00 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGCCCAACAGTGACTATGAATAATAATGATAT:1 - chr3L 3032240 3' + opus 7462 2 69.31 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAAAGTAATTTTGTTTACCAATTTCCATTTCTGTTAGATTGTAAGAA:1 + chr2L 3340046 3' - FB 8 1 71.29 TGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGG:1 - chr2L 6083716 3' + 3S18 305 2 57.58 ATTTTTTCGACTCCAGCTTCTTTGAGCTCGTACATTATGCGCAAAATGAGAAATCTATAACATAAGAGATTCATTAGTCAATGGCGAGACTAAAATTATAC:1 + chr4 469280 3' - FB 7 1 55.45 TATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACCCTAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTCCGTCCTCTCGGGAATAGTTTTCGGGTATTAAATAATGTG:1 + chr2L 6288278 3' + 1360 3113 1 60.40 GATAATAAAAGTGTTGAGTTGAGCTGCGGAAACTTGTGGGCTGGCTAACTGGAAATGGCAAAGAAATGCAAAATACTCGACGATAACCCAGATACAAGTTG:1 - chr3R 19277261 3' + Transib5 457 1 66.34 CGGTGAGCGAGCAAGGACTGTAGAGCACTCGGAGGTTTTTGTTTTGACGCTTGCTTGAATGTCAGTTACATGTGCATAAAGTTATAAGCCGAGTCCACTTC:1 + chr3R 15561801 3' + Rt1b 5003 1 66.34 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCT:1 + chr2L 7255803 3' - P-element 39 1 40.59 TTTCGTCAAATTTACAATGCAAGAACATACTTGTGAACACATAAAGTGGAAGTACGAACACACCAACTCTCTGAGCAAGCCGGTGCAACTCATAGCGAGC:1 - chr2R 4520042 3' - 1360 198 1 61.00 AAAACTTTAAAAATAATTTCGTTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCAT:1 - chrX 9909333 3' + P-element 2700 1 24.71 TTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTT:1 - chrX 15355069 3' - X-element 4699 1 49.50 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAAATGTGTAGTCCAAACGCAAATCACCTAAAATGA:1 - chr2L 6454702 3' - mdg1 10 2 63.37 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTGATCACCCAAAAACTATGGAAAATGGGTGGGTGGGCCCAAGGCCTTCAGCCATTTGCAATTTT:2 + chr2L 18234163 3' - jockey 22 1 62.38 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGAACACGAATCCGTCCGGTT:1 + chr2R 16334057 3' + P-element 2859 1 51.49 GAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAGGTTCGCTTTAAAGTTAGGAAGACGATTTTTAACTTATTTAGTATTTAAAAATCAAGAATAATTAAG:1 + chr2R 4023334 3' + Doc2-element 318 1 71.29 GGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTTCACCTACGCGGCATGGAGTCCACATACATCTTCAATCGACTAGTTCGCTCCATCTCAACACATTAAAGTTC:1 - chr3L 17244625 3' - HB 1316 1 53.47 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATGGTATCTCAAGACATCCATCATATCCAC:1 - chr2R 16980466 3' + copia 245 1 68.32 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATTTGTCCAGCACTTAATAAAGCCAG:1 - chr3R 27981648 3' - roo 8682 2 61.39 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATT:1 + chr3R 11999277 3' - P-element 52 1 27.72 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCACATCCCAATTACTCATCCCCTCATTATTGTAATTCCCTGTTATTA:1 + chr3R 18571186 3' + hobo 2909 1 56.44 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATCAAAACTTAAGTGAAGGCCGGAACAGATCCGCACGCACCCAAATACTTGGCAGAAACTT:1 - chr3R 21265933 3' - X-element 25 1 56.44 GTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAAATGTCTGCGTCTAAAGGCGTTTTTGTTTAACTCCTTTTTGGGGGAATGTCACAAATGGTATCTG:1 - chr3L 12177249 3' - F-element 287 1 67.33 TGTTTACACACCGTGAAATAAGTAGAATTTTTGACTTTAAAGGTGGGGGTGGTGGTTAATAACAAATATGCGTAAATCGTGGGGGAATGGGGAAAATTGCA:1 - chrX 15892661 3' - S-element 1699 1 59.41 CTCAANGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTACAATGCATAAAATCTGAGCGAATTTAATGAAAAACTTAAGTGCTACGAGGTTGTTCGAGGA:1 - chr3L 23773191 3' + roo 9057 1 42.57 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCG:1 + chr2L 14612090 3' + roo 9030 1 63.37 CAATAAATAACGCAATAAGTTTCAAAAAAAAAGTGGCGCAAGGACACTTGTTGTGGTCACCAGTGTGTCATCCGCAGCCGCCCAAGAAATCGATCGTGGA:1 + chr2L 1091331 3' + Doc2-element 4758 1 76.00 CCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTAATGTGC:1 + chr2L 3388154 3' - F-element 296 1 63.37 TAATTATATAATAGAAAAGTTAATACCTACGGAAAATACGATTGAGCAGCAGCCAACCTTATTCCTGTATGGCAATACTTTCTAAAGGCTTAGCCATTGGC:1 - chr3L 13300718 3' - Cr1a 4272 1 62.38 TTTAAGTTTCATTTTCAATTTCTTCTTTTGCTTCGGCTTTGCCTGTGCATCTTTCTCATTTCAGCCCTTCTCGGCGTGGTTGTGTCCTTTGTCTATTGTCT:1 - chr3R 26846219 3' - Rt1b 90 1 68.32 ATGATATGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGTAATCA:1 - chr3R 20556120 3' - Tirant 8134 2 54.46 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCG:1 - chr2R 24628774 3' + mdg1 7412 2 74.26 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTC:1 - chr2R 16940338 3' + 297 6934 2 75.00 CTTAACCCATTGTGTGTATAAATGTATATGAGACCAAGTGGTTTCTTAGTTATTAAGTAGAAAAGGAACTCCTTTAAAGTATTTAGCATTAGTAAAATTAG:1 - chr3L 25607965 3' - G5 4771 1 67.33 TCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTACA:1 - chr3R 12539487 3' + roo 9046 1 57.43 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCAAGTTGT:1 + chr2L 18430137 3' + copia 249 1 62.38 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTATAAACTATTAAGTTATGT:1 + chr3L 2019730 3' + 412 466 2 54.46 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGA:3 + chrY 3648905 3' + 17.6 480 2 66.34 AGGCANATGAAGAGATCTTTATCAGTTGTCAGAAGTATTTGCACACGGTTTCGTCGCATCACAATTATTTTCAATATTGGGATGAGCCCCAATACAAACGC:1 + chr3L 136540 3' + Bari1 182 1 71.29 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAGTATGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATTGTC:1 - chr3L 12056168 3' + hobo 2922 1 54.43 TTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGGAAAATAATGAACGGACTGCAATTGGGGGGGATAGCGGATAAAGCTTGCCAATTTTTGTTGCTA:1 + chr3R 9997443 3' + Max-element 441 1 68.32 TAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACTCCCGGATCAACTTACAATATTCAAGCGAACGATTTAAA:1 + chr4 913837 3' + invader4 2964 2 61.39 TTCTTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTATTATCCTCTTCGCTTTCGATTAACT:1 - chr2R 16532456 3' - 1360 3061 1 75.25 CATTTTTCGTCGTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGAATCTTTGCTGTCTCGATTTGGTCTTGGTCTTGTACTTGGTTTTCTT:1 - chr3L 10780538 3' + Cr1a 194 1 53.47 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTAT:1 + chr3L 2019708 3' + 412 7498 2 76.00 TAGAAGGTTGAGATTAAGCATAACGATTCTAGACACATAGACGCAGCGCAAGTTTCTTGAGCTTAGGCCGTCAGGTGTGAAGAAGGTGGAGTTTGGACGCA:1 + chr3L 22821708 3' + INE-1 171 1 59.41 TGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTCTGCGCTCAAATCCTCTAGCAATTCTAATTCGTATTCTCGCCGCCTCGCTTTGAACTTGAACTTTAAATGCACA:1 + chr3L 3250525 3' - Doc 4515 1 78.00 GCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGTGGGATTCGAGTAAACTGAATTTTGAAACAAAAGT:1 + chrX 14442831 3' + F-element 373 1 68.32 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACTTCTATAAC:1 - chr3L 2019644 3' - 412 7073 2 57.43 ACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGACAATAACCCATACTCCAGGCAGCCCTATCCAAAACAATCAAGA:1 + chr3L 21971104 3' + F-element 262 1 67.00 ATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTTTTTTAAAGTGTTCTGAATTTGGCATTTTGAACGTGCAGGATAACTATTCAGTTTCTTCTGGCTCTCCTA:1 - chr2L 3661307 3' + I-element 5063 1 69.31 GTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGCAGCTTTTGTGTTCATTGTGTCAATATTTAATCTTTTTTCTCAAGGTGGC:1 + chr3R 14744587 3' - accord 7021 2 50.50 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTGGTTCTAATGAAATGTATTGGCTTAC:1 - chr2L 10793178 3' + I-element 5305 1 79.21 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGGCATGCGGATGTGGCAATG:1 - chrX 17042657 3' - copia 37 2 62.38 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTTCC:1 + chr2R 20816489 3' - hobo 40 1 65.35 AAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAGTCAGTGTAGAAGCCAACGATCTCAGGTCTTCACACTTTTAAAATAAAATTAATAATAAAGTTGG:1 + chr3L 8710718 3' - Q-element 333 2 56.44 AGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACACTTGCAAAAATAAATTTAATCAGCCCCCTTATACTAGACAGCATCGACATTAAAGAATTATTAAAT:1 + chr2R 3550813 3' + Tabor 477 2 70.30 CGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACATCAAATAGCACTGCGAACAACGCAACTAAGCGGGGAGTCTGTCAAAGAATACAAA:1 + chr3R 23894799 3' - Cr1a 270 1 65.93 AGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGCCTTTTTTCTTTTTTTTGGTTTT:1 + chr3L 18245447 3' - mdg1 388 2 86.27 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGCCCACGTTTCACTTTAGCATCC:1 + chrX 2179550 3' - Doc 28 1 52.48 CACTTCTGATGTCGAAGAGTCATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCTTCTCGCCCATAAATGCCAACATTTGCCATTTGAAGCTAAAATGCTAAAGTTATGA:1 - chrX 4203637 3' - invader1 411 1 67.33 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGGTGGTTATTGTATTT:1 + chr2L 3085038 3' - copia 42 2 68.32 GTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTC:1 + chrX 5129534 3' - Idefix 46 2 77.23 TCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGCGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTTTTCATTGTATTTTATTTATGTTTTATGTTTTATGTTTA:1 - chrX 19407246 3' - Doc3-element 4554 1 77.23 GTCTAGCTAAACGACTAAGTATCGCAGCCCAAGGACGAGAAGAAGTTGGTCCTTTTGTGTACATGTAAGCCAACCAGCTGCCGTATTTTGGCCATAAAT:1 - chr3L 1896687 3' + jockey2 3115 1 58.59 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCAACTTTACATTCTAGGTCTAACTTTTATGAAC:1 + chr2L 10715324 3' - pogo 40 1 65.35 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGG:1 + chr3R 4834317 3' - mdg1 39 2 61.39 TAATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGAGTATAACATCGCCTTAAGCATAACAATTTTTTATTACAAAGAAAGCATTGATTATGAATATAACTTACCGAT:1 + chr4 349463 3' + Tc1-2 231 1 74.26 CACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTATTGTTTAGCTGTATAGACCTAAATACACATCCATCAGATTCAGCTTTTTGTGGGCGTGGC:1 - chrX 18879994 3' + accord 7119 2 69.31 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGTTACCAAAG:1 - chr3R 26321629 3' + blood 7344 2 69.31 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCGAATAAATTTAATAACGTGAATAATGCCACTAAAAATAATTCACAAAAACC:1 - chr3R 17853316 3' - roo 23 2 54.46 GAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCACACA:1 + chrX 2649921 3' - Tirant 8108 2 80.20 AGCTGGGTTGGTGGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAGCGGACACATATTTCAATAAGCCGAAATAAAGAATATACATACCGATCCGATCTAGAGACAGCTTA:1 + chr3L 22284330 3' - F-element 4527 1 68.32 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGC:2 + chr2L 13574268 3' - pogo 40 1 65.35 TATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAATTTTTAAA:1 - chr2L 11922488 3' - BS 5085 1 60.40 CATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTTCTGTGCGCGTGTGTTTGCTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGGTTTACTGAAGAGATGGCGGCTGAATGGA:1 - chr3R 11121858 3' + P-element 467 1 76.24 TACAANCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGG:1 + chr2R 21773610 3' - Max-element 8272 2 61.39 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAA:1 - chr3L 7075888 3' + roo 9029 1 69.31 AAAAACTAATAAAAATTAAAAAAAATTGCTTTATTTAAATTTAAATTTGTACATGGTGTGTAATACTATTAAAAAAATCAAGCTAACAATATTTTTAAGAT:1 - chr2L 16386310 3' + Doc 4687 1 89.11 AAACTTAACCAATAAGCACTGTGCATAGTTTCTTAATATATTTATATTATATCCAATTATACTAGTCATAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTA:1 + chr2R 4887645 3' + gypsy7 5032 1 62.38 GTGTGATTATGTGTGTGTGTGTGCTTAAGAGGGTGTGTGAGTGTGTGAAAGTGTGTGTTTGTCTGTGTGTGTGTACATGCAGGCGTTATTTAATTAATTCA:1 - chr2L 2075425 3' - accord 7035 2 60.40 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTAGATCTACAATATAATATATAATCAGTACT:1 + chr3L 5102476 3' - jockey 4687 1 63.37 AGGCGGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATAAAACCATAAAAATTTCGGAGACATCGGAAACACTGTACTAAATTATACCACAGAAAGTAAATAGAAGTCGCA:1 + chr4 1169291 3' + baggins 5044 1 66.34 CCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACTCCCAAATCATCATCAAATTTGGGCTTACA:1 - chr3L 2662748 3' - micropia 5032 2 70.30 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGG:1 - chr2L 12815027 3' + hopper 1396 1 60.40 CAAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACATTCAGTAGCATTCTCTCTTGTTTTCTTTGTATATTGGTATATATGGATATTCTAATACCT:1 + chr4 499298 3' + INE-1 543 1 77.23 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCC:1 + chr3R 10277270 3' - Doc 59 1 75.25 CTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGTATATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr3R 4571526 3' - 1360 3265 1 58.42 AAGCTNCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGAAC:1 - chr2L 22534018 3' - P-element 23 1 55.45 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGCCATATAAATAATTTCCTAGTATTTATAG:1 - chr2R 4854971 3' + opus 482 2 63.37 CTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCT:1 + chrX 22945358 3' - BS 24 1 58.42 ATTTTTGATCAATTGACACCATGCGAGAAATCTTTGGCATGAATAATGGACGCGCCGCTGTGACAGATATTTTAAAGTAGTCTCAATGTCGGCTCCGGTCA:1 - chrX 1022794 3' + 1360 263 1 67.33 TGAATTACAATTAACTTAAAAAAATGCATAAATATTAAATGTCTAATGCCACTTTAGGCAGGAATTATGGCGGTATTTGTCTCACTTCTTCCACAAACACA:1 - chr3R 19533189 3' - Juan 4007 1 64.36 GAAAAAGTGCGAAGCGAACTGTGACAAACAAATTATAAGTGCAAAAATTAGGAATGATTTCTATATGGATGACCTAATGACTGAAGCTGATTCGGTAGA:1 + chr3R 19445627 3' + gypsy4 349 1 61.62 TTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCTCAA:1 + chr3R 11119897 3' - 297 3 2 76.24 ATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATAACGAATATTTACCATACTATATACCACTATGTATGTTTTTTTGTTTACATTTTATTCGACTGTTTG:1 + chrX 8682736 3' + pogo 2095 2 74.26 CTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCGCCCAATGACTCGTTTCTACAGCTGACCAACTTGAC:1 + chr2L 18065302 3' + hopper 455 1 68.32 ATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATGGGAAGTGTCCTAAAATATGAATGATA:1 + chr2L 12475048 3' - mdg3 5276 2 57.43 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATATATATACATCTATTGCATTGGGGGTGCGACATTCTCCCTGAACA:1 - 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invader1 3645 2 75.25 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATAAGTGAACGAGGGTGTGGGAAAACGAAATGGCTAAATGAGCCCACA:1 + chrX 19116937 3' - opus 7026 2 55.45 GTTACTTATATATATGTAGACTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTAC:1 + chr3R 12047484 3' - Stalker2 7278 2 52.48 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGT:1 - chr3L 18337669 3' + Juan 4177 1 72.73 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTATTGTCATTACTTTTGGCCCACATTTAAAGCCAA:2 + chr2R 23580839 3' + P-element 2872 1 62.38 AGTTCCCTAGAGTTATATTCCATACGTCCATATTAGTTTTATTAACGCCTTGTATTTTCCATGGGTTTCTCTTTCACATTATTTGAATACGGAGTGCAAAT:1 - chr3R 17357533 3' - Porto1 4277 1 57.43 CAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCGGCACTTTCTGGCCGATTTTTTGGTCTTTTGT:1 - chr2R 19943899 3' + 412 7528 2 58.00 AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATAGAGTCGGTAGTGCCGGGGCATGTGTCACCAAGAACTGGCCACCTGAGCTGCAGTCTCTCC:1 + chr3R 11343254 3' - 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Doc 36 1 52.48 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTAT:1 + chr2L 1625711 3' - hobo 33 1 58.42 TTTAATTTTTTTTTTCATTTTTCACTTTAATCGGCACATCGGCACATAAAAAACAAATAAATAATAGAGTAACATAGTTTTGGAACAATTTGTTATAGTTG:2 + chr3L 19072027 3' + INE-1 472 1 53.47 TCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAAGTCAGTAGATCGTTCCTACAATGGCTTTATGATTGAT:1 - chr3R 4600039 3' + HMS-Beagle 234 2 67.33 CACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTTGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCA:1 - chrX 9909334 3' + P-element 319 1 21.00 AAAGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTTTCTATAACTGGATCGGCATTCTTTAGACATGTGGAATTTTCACTATGTTGTACATT:1 + chr2R 4285762 3' + Ivk 4930 1 62.38 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTACCTCAAAATATTAAAGTTCTTAACAATTTGTAAGTTTAATGGGTCACATATCACTAATTCAATGCC:1 - chrX 21204926 3' + mdg1 411 2 59.41 AACACACATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGGGCGGAGATCACGAGATGCCCCACAATCTGCAGCACTTGGCAACCTTATAGGAATGAATCC:1 - chrX 2664036 3' - INE-1 260 1 59.41 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGATGCCGTCACCTTTTCTGTGATTACCCTT:1 - chr3R 19346876 3' + blood 7375 2 62.38 AACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTATAAACTATTAAGTTATGTTACCTTTTTTCC:1 + chr3L 2019742 3' + 412 478 2 57.43 ATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAA:1 + chr2R 4659349 3' - S-element 1461 1 46.53 TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTC:2 + chr3L 24916691 3' - Porto1 148 1 55.45 AGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATTCCGGCCGCAAAGTTTGAACCGCGACGATACAAACATTTAATAGACAAACAAAAAGCGAAAAAAAAA:1 - chr3R 29791057 3' + TAHRE 152 1 72.92 ATCCATGAGCGATCCACTCAAGAGGGCACACAATCCAACAGACATAAATATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCTGCCCAAGTCGGCCAGCCCCTTGAGTTC:1 + chr3R 20980081 3' + Quasimodo 264 4 70.30 AGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATTGCAAGCAGTTCAAATACTGGGATTACAACTAAGGCGGGAATACGGGTTTTGTTACCAGCATTTTTTC:1 + chr3R 4970636 3' + diver 221 1 73.96 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTC:1 + chr3R 19989328 3' - hobo 27 1 53.47 CGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAGATACTTTTTTGGTAATGCCTAACCTAGA:1 - chr2R 23584708 3' + HMS-Beagle 246 1 74.26 GTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATAAGTGGATACATACATTTTTCGTAAGTATCC:1 + chr3R 21265637 3' + Ivk 5334 1 72.28 ATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGTGGAAGCTGCAGAACGCAGAGAGTGCACGGCCGAAAGTTAAGCGCAAATTTGTACATA:1 + chr3R 11040710 3' - F-element 4230 1 64.36 TATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTTTGCTGAAAAACCAGGCCATAAAGTT:1 + chr3R 17726150 3' - Quasimodo 94 2 74.26 GGCCGCGTCCGGTCTTATCGTGGAGTTATCGATTTTGGCCCTCCGGACTAACTTGTCGCACCGCTCGAAGTGCGATTGACAAACTGTCAGGGAATGCATT:1 - chr2L 21963268 3' - gypsy4 6604 2 60.00 ATTATTATTATTACTTTTATTAATTACCATTATTAATTAATTCATTTGAATCTTAATACAATGAGTAGCCAGACCCTTTCCTGCACTATTCCGTGGGAATA:1 + chr2L 19732578 3' - mdg1 7068 2 78.22 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATGTTGTCATATTTCGCCGACAACTTTGC:1 - chr3L 11661692 3' + hopper 1407 2 69.31 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTATAAGGGATGATACTTCCTGATATGGAAATGAATGTTTTTTAAATCAAACATATTGTGTAGA:1 - chr2R 14341752 3' - opus 8 2 59.41 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATGGTGGGCAACTAGAATTTTATCGTCGGTTCTTGCCGTACAATATGGCGCAATGCTTAAAACTC:1 - chr3R 19449524 3' - 1360 30 1 68.32 AACAATACGCAGCTGAAAAAGTGGAAAAAGTGAGGGAAACTGGGAATGGAAATGGTAATGAAAATCCGGGGCAGGGGTGCAAATTAGCCGCGTTTCCGTCT:1 - chrX 8611354 3' + X-element 25 1 73.27 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCGGTGGAACAGTGTGCCCGAGCCGGA:1 + chr2L 285767 3' + P-element 2871 1 61.39 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAA:1 + chr3R 16400221 3' - blood 33 2 57.43 TTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAA:1 - chr2L 21400731 3' - Doc3-element 64 1 65.35 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACA:1 - chr3R 23591433 3' - pogo 48 1 78.22 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCTGTGGCTGTGGCCAGCCCCCGCGGCCCCCTTTTGCTATCTCGCTTGCT:1 + chr3R 9551491 3' - P-element 28 1 51.49 TAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATAGACCGTTTTTTGCCCCGATTTGAGA:1 + chr3L 4895702 3' - jockey 4889 1 74.00 TTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTAATTTATTTATTTATTATTTGTTGCGTGTGCGTGCTGCTGTACGGCGGCATCATTTGCAAATTAGC:1 + chr2R 7911853 3' + S-element 1703 1 66.34 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTA:1 + chr3R 19989304 3' - hobo 51 1 71.29 TGGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTGAATTAATTAAATACCAAAAAGGGCAATTTCATGGAAATTTTCCCAACGATTTTCAGTTTGTATTTGTG:1 + chr3L 6316248 3' - INE-1 151 1 75.25 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTAACTCGTGTAAA:1 - chr2L 2060123 3' - 412 27 2 52.00 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGTAGTAATTTTATTGTAACATTT:1 - chr2L 11838018 3' - roo 8718 2 80.20 CAACGGGTTCGGGTGGGCTCTAAGTCTGCATTTAAAGGTATTTTTGTTTGCATAAATAAGCGGACGGACGGCGGAGAACTGGCAAACGTCAAAACTTTTAA:1 - chrX 8834471 3' - G5A 2625 1 77.23 AGTAANAACAAGCGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTGCCGCACATATGCACTATGTACACTTGAATAATTGCCACATCG:1 + chr3R 20384934 3' - 1360 3237 1 56.44 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCAAGTCGATCCGCTCCCGCTGATAACTGATCACTGCAGTTCGCAAAT:1 + chr2R 16583361 3' - P-element 25 1 54.46 ATGCGGAACAGAATTCACTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAAAACTAATTAACATTTTTCGAGCGCTGCGCGGTGCGAGAGGAGAAGC:1 + chrX 16916236 3' + HeT-A 6031 1 54.46 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTTGGTTTTTTAACACTAGAAGAATACAGCGCGCGAAATTATGCTATTAATATTTACGGAATT:1 + chrX 4366296 3' - jockey 4684 1 65.35 TCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACATCATTTAAATGTGATCACCATTGCTCAGTACGAG:1 + chr3L 2484914 3' + Quasimodo 297 2 69.31 ACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCTAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAGAGTTTAATG:1 - chrX 21097032 3' + INE-1 160 1 70.30 TGTTGTGTCTTTGCTGATATACTTATGGGCTCTATGGACGGCAAAGCAGTTATAGTCGGATATGGTTTTCAAATAATTTTTGCTATAGTGCTATGCGTTAT:1 - chr3L 27267011 3' - Ivk 410 1 69.31 TGGCAATTGGCGGGACAGACAGCCGAAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTGAATCGACCATATGCTAATGCGTCGGTTGTATGTGTGCATGCACATA:1 - chr2R 8083718 3' - diver2 198 2 53.47 AAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAATTATGGGGGGTGGTGGGGGGTAGGTGCAACATCTGCAGTGGCAGGCAAGTTGGGGTTGGAAAGAAGGAAGCG:1 + chr2R 18257596 3' + Dm88 381 1 63.37 ACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAATT:1 + chr2R 5840703 3' - Ivk 19 1 60.40 TGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTATGGGTTGGATGTGGGTGTATATACAGCATGACTTCGGAGGCTCACAATATCACAGAAATATT:1 + chrX 6136202 3' + R1A1-element 5268 1 75.56 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTA:1 - chr3L 4801530 3' - roo 8719 2 80.20 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGGCAGTGTTGGGTGAGTTTTCCTGCTCTCTGTATC:1 - chrX 17879641 3' - mdg1 44 2 65.35 CTGGCNACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 458 1 50.50 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTA:2 + chr2L 8565505 3' - 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Juan 20 1 63.37 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGATTATGTTGCATAAGCCTGC:1 + chr2L 13319671 3' - hobo 4 1 73.27 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGT:1 - chr2R 8345496 3' + roo 9045 1 53.47 CTATAAAAGCTAGAAGGGTGAGATTAAGCATGCAGATTAAGCACAAGCCGCACAATATTCATTCATATTTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGC:1 + chrX 23005472 3' + INE-1 161 1 59.41 CGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGTAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGATATTGTACTTATACAAAACGGGATTTGTTGTTTACTAAATGC:1 - chr3R 2137288 3' + Quasimodo 6933 2 57.43 CGAACTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTGGGTGCGTTTATCAGCGGCGGTTCGTTTTAATCCATGGCAGCCAAATGGG:1 + chr3L 27728825 3' - I-element 4930 1 61.54 AAGAATTGTTATCAGGCTCAAATTCGCAAGCTAACATTTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTTATGTTTTTGCTGGCAAAAGAAAAGTTTGCAG:1 - chr3L 4620485 3' + hopper 254 1 76.24 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAGGTTGGTATACACTAGTAAAGATCACTTGCTGACCTTGAAGTCGCGCACAGCGGATTAAAGGATT:1 + chr2L 8299051 3' + S-element 1705 1 68.32 TGAACNCACTACAACATGGATATAAACACATACTGAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTCAATTAGTTTCTTTGTTGTTTTCGACAG:1 - chr2L 14896005 3' + hopper2 1168 2 71.29 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTTT:1 + chr2L 6601438 3' - I-element 50 1 69.31 AGCGCGCTCATTCTTGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGGTATGGGTTATTGGCCTTTCGCTTCTCAGCCTTTCAGTCTTTCTTCTGCTCCTCCTC:1 - chr2L 7356743 3' - F-element 354 1 60.40 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATT:1 + chr2L 13136792 3' + roo 9031 1 68.32 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGAAGTACCCCCATGAAAATACGAATTAAA:1 - chr3R 18571132 3' - hobo 40 1 76.84 CCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGCCTCCGCATCGGGCACACCCAATCCAGCCGTTTGGAAACCACCAACGCAGCA:1 + chrX 6580473 3' + Ivk 5003 1 72.92 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCGATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCC:1 + chr2R 20744226 3' + roo 9041 1 57.43 AAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:2 - chr2L 20360645 3' - micropia 4983 2 57.43 CTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGCAGCTTGATGGTGCAGGGCTGAATTCGATTTGAGTGGTGGTGCAGGTTTCAAGAGAATGTGGTTTGGGATGG:1 + chr2R 6734701 3' - G2 52 1 53.00 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCC:1 + chr2L 1625698 3' - hobo 46 1 71.29 CACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCTATTTTATGTTAAAATACACAAGTGTGTACACCTCTGTATGTATGTGC:1 + chr2R 5041416 3' - invader1 3783 2 52.48 CTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTACTTTTCATTATGATAGTTTAGTTCATTCTTGTACTTCGAAATGCCAGTTA:1 + chr3R 16561200 3' - I-element 5203 1 53.47 CTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACCTGCCAGCAAAACCAGAAGTCTGCTCTTTTCTGGGCATATTAATTACACTTTGCTCATT:1 + chr2L 1903298 3' + Doc 488 1 63.37 AGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAAAAAGAAACAATAATATTGCCAAAATAATTACAGATTTTAAAAACACACTAGATCAAGGAATAGA:1 + chr3R 2631130 3' + mdg1 7364 2 71.29 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCTATGTGCAGCTTTCTGTGCTCATCTACATGCAAATTTC:1 - chr3L 22831247 3' - 297 6585 2 65.35 TCGATATATGCACATACTACAGTATTATATCTCATTTAGTTTAACTTTATTTCATATTGATCACTTAATTTAGTTTTTCACGTGTCATTCTCTGTTTTATA:1 - chr3R 20249144 3' - blood 7011 1 63.37 ATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAGAACATGATGGCAGATGTTCAGGAGCTGCTCCTGCTT:1 - chr3R 12456681 3' + Dm88 4173 1 72.06 AAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCATACAGTCGCGTCCAGTTGTAAAGGGCCGAAAATTCTGGAATAGATTTCGCTTTACCT:1 - chrX 7096728 3' + BS3 1433 1 61.39 GAGAAGTCATGAAAGAGGGTCACCTTGTGTTAGAGCACATAATCATAGATCATCACCAACAGACGGAGGATGATCAATTGATCGAATACGATGATAGCGGA:1 - chr3L 14748799 3' + 1731 4151 1 68.32 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTTTCCACCACTTCTACGAATGGAGGATCGTCGATGACCAGATCA:1 + chr2R 14675641 3' - roo 4 2 75.25 CAAGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTGCTCCGTGAATATAACCATAAAAGATTTAAGACCTTAATGACCCACTCGAAAACTCCGTCGATGTTTCCGTGGAC:1 - chr2R 8437906 3' + baggins 5036 1 67.00 TTTATATTTTTTTTTATTTTACTCCCTTTTTTTTTGTACCTGGCGACGGCAGCAGTAGAAGTCGATCGCCGAACGCTTTGCATTTTATTAAACACGATCCT:1 - chr3L 12558237 3' - F-element 4684 1 53.47 TGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTATCCTACCACTACTATATGTGCCATATAAATATTCCCCACTTTCATTTCATTTTCGACT:1 + chrX 5385860 3' + 17.6 7132 2 62.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTC:1 + chr2L 14790645 3' + roo 397 1 57.14 ACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTG:1 + chr2R 21773628 3' - Max-element 19 2 55.45 ACCGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAAT:1 - chr2L 7488857 3' - roo 8696 2 58.42 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGC:1 + chr2L 513726 3' + roo 9036 1 63.92 GAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGAT:1 - chr3R 12047426 3' + Stalker2 7606 2 63.37 ATAGTNAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAACCAGATTTGGGGACAG:1 + chr3R 12047512 3' - Stalker2 7250 2 77.23 ACACACACACACACACTCATAATAAATGTCGGCTCAACTCAATATCAGGGAATGCTTATAGCTTCAATTATTTTTTTGAAATACTTTGGGTGGCAAAGGTG:1 + chr2L 11554462 3' + Quasimodo 39 2 74.26 AAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTA:1 - chr3R 20137264 3' - Burdock 6167 2 59.41 TTAAAGTCAAAAATTTAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGTATGTATATAGAAAAACAAATGGACTAGACTTTGT:1 - chr3R 29867950 3' + S-element 1681 2 66.34 AAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAACTGAGACTGTTTCCAATGGGT:1 - chr3L 8084793 3' + Doc2-element 232 4 90.91 AATAACAATAATAATAATAACAATATTTGCGTATGACATTTTATTAGTTATCGAGATATGAAAGAAGAGAGAAAGAGAAAACTAAAAAATTATCCTTTATA:1 + chr3L 10726982 3' + mdg1 7069 2 33.66 TTTTTTTTGTTTTATTTCACTTAATTATTTTGCTTATTTACCTGTCGACGAATTGGCTGTCATTTGGATGAGCAGAGCCATTTGCTGCCTCTCCGACATTG:1 - chr3L 12750680 3' - F-element 4682 1 83.17 TCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTCACTTCCAGTCAAAACAGTAAAAATGCCATAAAGGTGACAATTCGCGAATCAA:1 + chrX 6373678 3' - X-element 36 1 47.52 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATCATATAGAGTAACATATTTTAAAAATA:1 - chr3R 29259587 3' + pogo 2053 1 76.24 TAAACACACAGACACACACATAATTGGTTGGTTCCTCGGGCGTTGGCGAATCGTTGAGCATTTTCTGGTCTGTACAGCGGCACTGGCGATTCAGCACATAG:1 - chr3L 1805032 3' + accord 7028 2 82.18 AAAATTTAAAAAAAAATAATAATAGTATACCTCATCAATTTATGGAAATAAAAATACATATTATCAATTAAAAATGCCACACTTTCAAGACTATTAAAGAC:1 - chr2R 16438274 3' + TART-C 11096 1 79.21 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAA:1 - chr3R 11263405 3' + roo 9029 1 71.29 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCATG:1 + chr2R 20744245 3' + roo 399 1 62.63 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCCGGCACTGGGCCAATAAAAAATCGCT:1 - chr3L 22039702 3' + jockey 4963 1 53.47 TCAATAGAAATGTACAAGACTAATAAACAAGTGAGTTTTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAAAGTTCGGCGGCAGAGGTCGTGGCAGCTCCCAATGATGGGCTG:1 - chrX 18413591 3' - INE-1 299 1 61.39 CACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTAATGGCAAAATTAATTAGAACGCATACTAACTGGCGGCTGCTGAAAATGTACTCA:1 + chr2L 2093167 3' + 1360 279 1 58.42 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAGCAGAACAAACACTCACGAGCATTTGATTTATGTCGCTTTAATTAGCCAATTTCAATTTGTATTCAATTAG:1 - chr3L 2144289 3' - copia 6 2 73.27 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTTTATCCACCAAAAAGGTAAGACGAATCTTA:1 - chr3L 7075847 3' + roo 407 1 76.24 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGG:1 - chrX 6417715 3' - Quasimodo 37 2 70.71 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGATGTTTCTTGCGCTTCAAA:1 - chr3R 8458214 3' - HMS-Beagle 6822 2 53.47 ATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCAGGAAGGAAGTAGAGCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCCGAAGTGCGAGCGAGAGGCAGTGAG:1 - chr2R 23569999 3' - Max-element 8380 2 75.00 CAGCGCTTTAAACAGATCTCACCCACCATGGGTCTTACGTTTTTTGTTGGCATGTTGCTGCTGTACATTGTGCGTTGGCAGTTTGCTAGCTGAACTCGCTG:1 - chr2R 18096925 3' + X-element 4454 1 80.20 GTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGGGGCGGGCGAGCTAGTGTG:1 + chr3R 22644190 3' - hopper 31 1 72.37 GAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGTAAGAGCTAGTGCGTCCACAAAACAGGTGCGAAAGTCAATTATGGTCGGTTGGGCAGAGCGTCATCGTCCTCGTCGTCTT:1 - chr3L 14670221 3' - Cr1a 297 1 76.24 GGATGCCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGAA:1 + chr2R 10543519 3' + P-element 2864 1 56.44 AGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGCCACTAATGATCATCACGGGGATTTTTGGCTGCAAAAGTTTAAAGTCATCTCTG:1 + chr2R 15495796 3' + 1360 123 1 60.40 GGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTATCTGCTTTGTTCCATTACATTCAGTTTTTCGATTT:2 + chrX 16361605 3' - Tc1 30 1 88.12 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGAT:1 + chr3L 16761333 3' + roo 386 2 54.46 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGGAAAATTGCAGCTACAGCCTGTGGCA:1 - chr2L 315153 3' - Tirant 8155 2 74.26 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCGCGCACTGGAAGGATGCAAGCCCGAGTTGTTAAACTCTTTACCCAACTAGCTCTTCTTTATTTA:1 - chrX 19116838 3' + opus 494 2 79.21 GTTGCAGTTAGTTTGTTCCCGCGCCGCACTTGTTAAATTAATATTATTATTTCTTTTGATATTTTGACATTTACGTGAGCAATGTTTGCATTGGCAATGAG:1 - chr3L 588618 3' - HeT-A 5600 1 78.22 GACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCGGCACTTTCTGGCCGA:1 - chr2R 19943915 3' + 412 7511 2 54.46 GCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTC:1 + chr3L 23678162 3' - Osvaldo 11 2 65.35 AACAAGATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGAC:1 + chr3L 18337706 3' - Juan 4058 1 55.45 GACTTTCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGTGAATTCGAACGCTGCAAACGCAGTGATCGTAAAGATAGCGATGCAAACTTATCTGCAATTACTTTACGGC:1 - chr2L 20887466 3' - INE-1 549 1 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTAGGCGACGGGG:1 - chr3R 25097822 3' + P-element 2877 2 66.67 CTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTAGGGCCAATGACAATCGAATCGGACTGCAGC:1 - chr2R 21103269 3' + Stalker2 7276 2 69.31 GGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACACCACATACAGCATTCGGGAGTGAAAACATTTGGCAAACACCCACGTTGAACAAAGAGATATAAGAGTTGAATAAA:1 - chr2L 18017970 3' + Rt1b 4907 1 79.21 GGCTGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACATTTTCCATTTTTCGGAACTTTGTTTTAATCGTTACTGTGTTATCTTCAAAGTCATCTTCG:2 - chr3R 2471364 3' + Cr1a 4433 1 88.12 ACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCACTTCGCTCCACTTTCCCAGATTAAAATATTTATAAATA:1 + chr3L 22395346 3' + F-element 354 1 54.12 CCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCTACCACAAATGGCGGCATCGTCAGCCTGCCACATTCT:1 + chrX 7430171 3' + Doc 475 1 77.23 TCATTAGATGGACCAATAACCATATGTGGCGACAACATAAGTTCTCATCATATTGCGAAGAATCCAGTACACCATAAACCAGCAAATTAAAAGCTGTTGGC:1 - chr2R 15157735 3' + Copia1_DM 4043 1 78.22 AACTTCTCCTCCACAGGCAAAAACCACCGATTTTTTATGACAAATGGTGATGTTTTTTCCGATTTTGCTGGTAACAATTTGCAATTTCATTTAGGTGTTAT:1 + chrX 12571874 3' - I-element 330 1 56.44 CTGTGNACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGATTTGCAGCTTGGGAAGGCTGCGTCTCG:1 + chr3R 6273587 3' - blood 7038 2 53.00 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTAT:1 - chr2R 12082344 3' + mdg1 384 2 61.00 ATATTTGGTAAAATAAAAAAAAAAATATTTACAATTTGTGGTACATAATTGAATCAATTTTAAACACTACTTCATAGTTACCATTCACTTATTTTTAAGC:1 - chrX 11190923 3' - Tc1 1479 1 83.00 TTGAAGTTTTAAACAGCTGATTGAGAGAATGCAATTCCCGCCAAATTATTTGTTTAGTTGGCATATTGTTGTTCATTTTTCAGCTTCCCACCTTCAATTAC:1 - chr3L 14952662 3' + transib2 164 1 55.45 AGAGACCGCCTCTCCTACCCCTCTCCACATCTACACTTGGCTTCACTGCTCGGTATTCTGGGGCACTTGCGTTTGTTGTCCTTCAAATTCTCCGCCTGAC:1 + chr2R 17032711 3' + Doc 431 1 80.00 GTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCAGTAATTGCATGGTAATTGCTGTCTAGTGATCGCTTGAATGGCTTGATGGCGTTGATTAACGTCAAA:1 + chr2R 7037802 3' - F-element 4444 1 70.30 GGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGA:1 - chrX 22855200 3' - P-element 26 1 53.47 GTCCAAATATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGACACTTGCCACAAGCCCACACCCATGCAGCCAGACCCAGCCACTCACCACTCTCCAC:1 - chr2R 16474932 3' + 412 7395 2 49.00 AGAAAATAAAATAAAATAAAATGATATAAAGACCAGAAGCAGCAAATGGCGGCTATAAAACAACAGAGAACAGAACCCATGAAATATGAGCAGAA:1 + chr3L 10269941 3' - transib1 1900 1 69.47 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGG:1 + chr2L 14790630 3' + roo 9028 1 72.34 TTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACATCAGATAGCTTTTTAATGCCCTCAGTTAATT:1 + chr2R 20110978 3' - diver2 334 2 69.31 TTTGTCAAGAAACTGATTACACACTGTGACTCCAAAGCAAAACAGTATCCAGCGGGCGAGGAGGAATCCCATTCATCGGGCGAGACCGAGGAAAATCATTT:1 - chr3R 4534252 3' - S-element 1712 2 68.32 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTTAATCGGCTTATGCAAT:1 + chr3L 4641154 3' - hobo 17 1 63.37 AAAGTATTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTGAATTCAAAAGGACT:1 + chr2L 2074802 3' + roo 9067 1 77.23 ATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACAC:1 - chr3R 20137275 3' - Burdock 42 2 70.30 GAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTGCATTTTCAATAATTTAGTAATGAATAGAATTCATCTACATTTTCCGATTCAATAATAA:1 - chr3R 11094490 3' + 3S18 6088 2 59.41 AAACAATTTTATTTTATAGCCAACCGTGCGTTTTTTTTGTTAATAACT:1 - chr2R 19474653 3' - HMS-Beagle 415 1 83.33 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGCTAACTTTCTTTTAATGCATTT:1 + chr3R 31257057 3' - transib2 22 1 67.35 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTCTCTGTGCAAATCCACGGG:1 + chr2L 19481357 3' + roo 385 2 55.45 TAAAAAGTAAAAAAAAAATAAATAAAGTAAAATATACATAATTAATTAAACTTAAACTGGACAGCTAAATTAGCAACAAATTGCATTTTACAATTGAAGTC:1 - chrX 8915620 3' + Doc 4696 1 74.26 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGGTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGGGGTTCAAGCGAGTTTTCG:1 + chr3R 13225586 3' + hobo 2929 1 65.35 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGCCTCCCTTAATATATTATAAATATTATTATAAAAT:1 - chr3L 7627154 3' - Ivk 49 1 65.35 AAATTAAAATGAAATTTAAATTAAAAGTAATACACTATTTCTTTTAACTAAATAAGTTAGATAGCCGAAATGTATCGAAATATGTTTCAATTATCCTTACA:1 - chr2R 20047600 3' - Rt1b 124 1 82.18 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAATATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCAATTAGCA:1 - chrX 20806842 3' + opus 499 1 76.84 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATG:1 + chr2R 17261647 3' + pogo 2066 1 67.33 CGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGAGACAAGTTATGAAGCGGTTTACATTTTGCAGCTACTGTGGTGCGAGTGTTGATACGAGTA:1 - chr3R 19752723 3' - accord 7003 2 66.34 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTG:1 - chr3R 19989258 3' + hobo 2906 1 58.42 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATG:1 - chr2L 3890131 3' - jockey 24 1 65.35 TAATGCTGTGTCCCCGCTCCCAAGCCCCCCTGTTCACCAGCATAGCCGCGAACAAACACATGTAAGTAAATACGGAAGGCAAACGGAAGTGGGGAAAAACA:1 + chrX 11644497 3' - Rt1b 4746 1 52.48 ATACTNCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGTATCGTGGAGTGTCCCCATCTCGCTCGCACTCACTTGTTCTA:1 - chr2R 10543420 3' - P-element 33 1 46.53 CAAAATGCTGAATTACCGTTGCATTTGTCCCATTATATGCAAGGCAAAAATAGTGGGACAAATGCAACGGTAATTCAGCATTTTGCTTTGCAAAATTCATC:1 - chr2R 6236864 3' - Tc3 160 1 72.28 AATGTTAAATTGCTATACTACAAATCGGACCTGAGCGAGGCATCTTCGGGTGAGCAATGCATCTGACCCATTGTTGTTACTTGTGTTGCTGGTGTTAAATT:1 - chr2L 2024013 3' + Doc3-element 126 1 80.20 TGATCTTGTCGACCCCATTTTCCTCCGACGCCCTCATAATCAAGGAGGATCCCCTGCTCCCCAGGAATCCGAAGACGAGTCGTCTGCGCAGTCGCAGCCAA:1 - chr2L 6165682 3' + G5A 2652 1 74.26 AAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGGGTATTGTCCGT:1 + chr3L 25842198 3' - 1360 81 1 55.45 CCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGCCCTAAAACACGACAACAGCTTAATTTCTGAAATAGGTTTAATAATTATGTGC:1 - chr2L 17387388 3' + S-element 1245 1 70.30 ATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTC:1 + chr3R 20147570 3' + 1360 387 1 68.32 CGGTCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAAAAGCTGGTTTGGTGACTCG:1 + chrX 17968450 3' + Tirant 403 1 79.27 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTTATATGGGCGCCGCAGCAGCGGCTTAACTTATTTTCCACA:1 - chr3R 12780620 3' - hobo 30 1 55.45 AAGGGCGTCCTGATGACTCTCCGAAACATATGTACATATAGTTGTATAGCAATTTAATTTGTTCGCGTTATAAACGTTTTAGACAAGTCCACAGCAAAAAA:1 - chr2R 4287763 3' + invader1 4007 2 74.26 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGCTCTGTGTGCCATAATTCATGCTTAGTGTCG:1 - chr3R 25671934 3' + I-element 5313 1 65.35 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCAC:1 - chrX 16995104 3' - jockey 37 1 57.43 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCCAAACGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGCATCAGCATAAAATATGGTAATCTTCAAGT:1 - chr2L 20133003 3' - flea 42 2 66.34 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCATTTCCA:1 - chr2L 4160104 3' - Tirant 10 2 70.41 TATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAAGCAGCAAACTGCTGGAAAAACTAACAAATCAATTGTGTCAG:1 - chr2L 17647355 3' + flea 4570 1 68.32 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAATAG:1 + chr3L 10143231 3' + 297 6942 2 73.27 CTTCANATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCA:1 - chr3L 11661729 3' + hopper 1370 1 69.31 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCT:1 - chr3R 19989256 3' + hobo 2908 1 56.44 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCAC:1 + chr3R 7388422 3' + HMS-Beagle 225 2 62.38 ATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCGCCCTCTTATAATTCTCAATCGGTTTT:1 - chr3R 24263759 3' + blood 108 2 80.20 ATGTAATAAGTAATAAGTAATTGCTCTCTTTAGCCATGTTATCCACATTAAAGCGCGGCCCAAAAGTATGCAATGACTTTTGACATTCCCCTGCGTGTGCG:1 - chr3L 3793392 3' - Stalker2 404 1 68.32 TTATGTGCATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAGCGGTTCAGACTGCCTGCCCTCACAAAAGGCATTCTTCGATGCGAAACTGA:1 + chrX 5169762 3' - Cr1a 257 1 54.46 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTG:1 - chr2L 16201513 3' - hobo 37 1 63.37 CAAGGATCCATGGAGCAAAATTCCTCAATAACGGTGCCACAAGTTTTGATTTTGAGCTTAAATTTCATATAATAACTCTGTTTTTGCAGTGCATTGTTCAT:1 + chr3L 3271554 3' + Tc1 1243 1 66.34 TTTATGTACATATGTATAAGTATGTGCACGCACATACGCAGGCACTTTT:1 - chrX 19775046 3' + invader3 5087 1 87.76 GGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACAC:1 + chr2R 13644528 3' - Burdock 6139 2 76.24 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAA:1 + chr2R 9871067 3' - roo 8680 2 63.37 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTG:1 - chr3R 19989237 3' + hobo 2927 1 66.34 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCACAGAGTTGCA:1 - chr2L 16201488 3' - hobo 12 1 67.33 CAATTAAAGAATAATAATAATGCTTTGAACTGTTCAAAAATAGTCAAAAATTATGCGGCGTAATTAAAAGAAAACAGTCAACAATTAGTTGTCATTATTAT:1 - chr3L 19104835 3' + invader3 5039 1 46.53 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCCGCTGTTTCGGTTTTTGCTCTGCTGCTCTGTTCTGTTCTGTT:1 - chrX 19494395 3' - jockey 4705 1 59.41 CAATTTAAATTTAAATTTTAAAAATTAGAAAACTAATAATAATCCTTTGTGTCGTAAGACTTATTAGCTTGCATATTTAAAATAAACTACTTTTCGCTT:1 + chr3L 18237799 3' + 1360 3048 2 62.63 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCAC:1 - chr3L 13060335 3' + 412 447 2 76.24 ATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATTTTTAATTTTTAAATAATATAATATTTCTTTGGTGTGCTGTAAGATACA:1 + chr2R 959956 3' + mdg1 7133 2 75.25 AACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGCAGTTC:1 + chr2L 3951663 3' - Transpac 25 2 54.46 TCTCATACAAAATTACATATGCACATGTGGGCATTGCTTATATTCAACATACAACTCATAACACAGTCTCTCAGCTTCATCAGTTTAGCGGAGTTCGTCGT:1 + chr3L 494001 3' - 1731 56 2 61.39 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGAT:1 + chr3L 13477514 3' - P-element 29 1 49.50 ATAACAATAATAATTATAATAATAAATAGTAATTTACGCTTTAAGCAATTGATCTTAAATTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAGATTCTT:1 + chr2L 7588331 3' + mdg1 32 4 73.27 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGT:1 + chr2L 20133045 3' + flea 207 2 79.21 GCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACCCTATAATAACAAAGTGAAAATTTGAAATTATTTCGTGC:1 + chr3R 14917254 3' + HMS-Beagle 210 2 61.39 TAACAGGTAGAAGGAAGCGTGTCCGACCATATAAAGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGGCGATCTGGATTCCCGGCGACTCCTTACCAGT:1 + chrX 21319205 3' + INE-1 33 1 66.34 GTAAGATACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTAGACTTTTAATTTTTTTATTCAAAATG:2 + chr2L 17784675 3' + gypsy10 5932 2 74.26 ACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTGATGCTGACTGATGAGATTAATTAAGCAAGGCAAACAAAA:1 - chr3L 7205504 3' + Doc 210 1 60.40 ATTCGCGAAAAGATATAGACGCGATATGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGCGGTTAACATTCAAACCCAGGCGAAGGACATTGAGTTTTA:1 + chr3L 25730025 3' - Cr1a 4372 1 57.45 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTTGCGCAAATCGCATTCGATGCGATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTCCCTTTGAGAGGCG:1 - chr2L 20622778 3' - Doc 21 1 37.62 TGTAAACTATTCTACCTATCATAATAAATAAATAAATAATTATATATGATATATATACCAGGTGAGCTAAATTTCTCTCTGACAATAGGCGTATTTAACA:1 - chr2L 22121351 3' + I-element 5339 1 73.00 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCT:1 - chr3L 12888215 3' + mdg1 395 2 52.48 GAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCCAGAAATTGAGGTAATTGCGCTATTTTTTAGGAATTCGATTTTTAATTCTGGGCGCAAATATTCAAAAT:1 - chr3R 5423302 3' - Doc 437 1 76.24 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCG:1 - chr2R 15474817 3' - roo 54 2 80.81 CTATAAAGGGTAGGCGCGAGCAGGGATGCGAGGCAGTCAGCTGGACAGCAAGATAGCGCGTGGAAGGAAATAAATGTTTACAG:1 + chr2L 23188606 3' + gypsy8 343 1 81.93 TGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGCTATTGCCGTTTGCTGTTGGTGTTGCAGTTGCAGTTGAAGTTGCTATTTGAGTCGCTTGTTTGTTCCCGCCCTG:1 + chr3R 24967388 3' - I-element 184 1 79.21 TTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTGTTACAATTTTATATACATCGCCTTAATGAAAAGCTGCCGGCAAGAAGTGGAAGCCGCCTCGTCATCCCC:1 - chr3L 4922963 3' - Bica 130 1 63.00 TTACAAATATTAAAGACTATTATCTGTGGTATCCCGCTGAGATACTGCTGATCCACCCTCATAAAACGGTAATTGGCCATGTGGCAATATGCCCCATTC:1 + chr3L 1320907 3' - gypsy7 5091 1 71.72 CTGTTTGATGTTTACTTTTTTTGTATCTGTGGGCCGCTTTGCTGTGGTTGTGAGTGTCAGAGTGC:1 + chr2R 9941280 3' - Doc2-element 4534 1 70.77 GAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCTTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTATGCCGCGTGCTCAGCGTGTTGTTTGCTTAT:1 - chr3L 13286794 3' + copia 4973 2 67.33 TGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATCTGCCCGAGTTGAGCGTAGAGTCGCCGGCCTGGAATCCTCGATTCCTCGAGCCTTGATCCTGGCCAA:1 + chr3L 18407543 3' - gypsy4 6382 1 70.10 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCTCAGCTGATGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGAAATCAAAACA:1 - chr3R 20556115 3' - Tirant 8121 2 60.22 TTAACACAGCTGAAGCACCAGGAAATTCCATCAAGCAATCGAAGCGCACATGTGGCGAAGCTGAGAAGTGGAGCCAAAGGAATCCTCTTTGGCGCATAGGA:1 - chr3L 5004263 3' - diver 5912 2 66.34 GGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGATATGTGTCGCGCCCATAGTTAAAGTAACACAATCCAG:1 + chr3L 19259460 3' - Idefix 216 2 63.37 TTTTAACAGCTCGCTTGAAAGATTGAACCTTGTGTTACATGAAGATACGTTAAGCAGATACCGTTCCGGCCTTCACCAAGATGACCCCACTAGCTGAGTA:1 - chr3R 2512755 3' + Cr1a 368 1 73.00 ATTATAATAATTGATTTAACATTTAAGGGTGTAAATTTAGTGTTGTTAAAAACAGCTGACATAAAAATGACATATTTTTACATTTATCTAAATCATTTACA:1 + chr2R 17032232 3' - jockey 4850 1 65.35 CAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAATGAAAATAAAAGGAATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGCTGAC:1 - chr3R 2520501 3' + copia 5082 2 65.62 ATATGNATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGCTGGCGGA:1 + chr3R 10240186 3' + invader4 3077 2 71.29 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGAGTTTCTAAATAATCATTCAT:1 + chr2L 17722851 3' + blood 7368 2 58.42 ATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACATAATCGTTGCGTTTTAGTCCAAGCTCATTAATCTACGCGACCAGGGCCGTCCATG:1 - chr3L 7037678 3' + roo 276 2 61.39 CAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACACACACACAGGAATATTGATGCGGTTTTTTATTAGTCTGTTTATACACACTTTTTATGGC:1 - chr3L 2144385 3' + copia 4756 1 62.38 GTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGTGAACGATCTCTGGTGTCAAATCTTTCTCTCGAGTTTTGTGT:1 - chr2R 4785227 3' - I-element 4946 1 60.40 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGG:1 + chr3R 11094582 3' - 3S18 23 2 56.44 GAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTGCATACGCGACTTCA:1 - chr3L 8713067 3' + opus 485 2 66.34 CTTAATAAATAAATTAAAAAAAAAACTGCAATTTAACCAACAAAATGATCAACAATGTAAGCGAATTGCGCTCAACGGCTGCGCGTCGGAATCACAAA:1 + chr3L 7911839 3' + X-element 4713 1 72.45 TCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTTGTTGCCCCGACGACGCTACTTTGCTTCCTCTGCCGACG:1 - chrX 1947551 3' - Max-element 327 1 65.35 AAAAGGCAATTAAAGAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGCCATACCGTTCTCCTTTCTAATTTAATGCGACAACCAGACAAGTAAAGCGAACAAG:1 + chr3R 24508871 3' + GATE 452 1 62.38 TAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAGTGATCGTGCCACATTAATTTAAAATGCATGCATGTAGGTATACTTCTATTGC:1 + chr3R 2839644 3' + Juan 3981 1 61.39 GAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAAT:1 - chr3R 12047421 3' + Stalker2 7611 2 59.41 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCA:1 + chr3R 6622680 3' + P-element 2830 1 24.75 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAA:1 + chr3R 7168625 3' + flea 4971 2 76.24 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCG:1 + chr3R 6622696 3' + P-element 2846 1 40.59 TATTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGTTTTCGACATGAGAAAAATGGCATACCCTTA:1 + chr3L 11314521 3' + Tc3 316 1 40.59 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAACTTCTTTTCAAATAGAATCTCTTTATTAAT:1 - chr2L 10746641 3' - pogo 41 1 72.28 CTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCAGGCCCCAATCGGAGCACTGGAA:1 - chr2R 24945079 3' - 1360 90 1 65.31 ATCTGATAGTCGGGGAATTCGACTATAGCATTTTCTTTGGTCGTAAACATATAATTTTATTCGAGAATATCCTGCGATTTTTATCGGCTAAATAAGCCAGC:1 + chr2L 1249145 3' + INE-1 560 1 59.41 CACAAATAAACTTACAAATAAAGACTGTTATACGCCTGGTCACATAATGTGTCACATTTCATTTGTTACGCCTTGCCGACTGTGATCCCAAA:1 - chr2L 12789623 3' - Cr1a 4043 1 75.00 CTTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTGATTTAATTTTTCTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTA:1 + chr4 1294993 3' - TAHRE 71 1 46.53 ACCAGCCGATGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCTGTAGGAATTCATTGCATGAATAGTA:1 + chr3R 11751406 3' + Cr1a 63 1 70.30 TATTTATTATTATTATTATTATTAATACGTCAAAGTAGGTATCGTTAGACTTAATACATTATTTAATATGAATAAATTACGAAGACCACTTAAATAGCTCC:1 - chr3L 12871246 3' - mdg1 44 3 74.26 TTTTTAATTTTTTTCTCATTTTATTTCCCCATTATCTATTGATATCCCAGTAAAATTGTGATGAGTGCTTTGAGGCACCGTTGGGATTTCATGCTAATCTT:1 + chr2R 4330509 3' + INE-1 471 1 54.46 CTAAATAATAAAAACATAGTGGCGCAAAAGGTGCAAAAATGATTAGTTGTATCCAGTTGGATCGAGTAACAGTGCGGCAAGGACGCGTTTGCCAAATAGAT:1 - chrX 10556647 3' - hobo 2485 1 78.22 TTATTNCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCAT:1 - chr3L 9383522 3' + P-element 2842 1 34.65 GNNGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATACCCAATACAACTTGCGTCAGTATGCAGCTCTTTTTGTTCTTTTTGTTAATAAGCGTTGCC:1 - chr2R 6419889 3' + Circe 210 2 70.30 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAG:1 + chr2L 2074754 3' + roo 355 2 77.23 CAAAANTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAG:1 + chrY 3648904 3' + 17.6 479 2 65.35 GTATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGGTTCTATCTGCTTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTTCCTCTTTGCCTGTCTGTGTAATTTAT:1 - chrX 19989654 3' - Quasimodo 35 2 67.33 AGTTCTAAGCGTGCAGACTGCTCTCTTTCCGTAAATTTAACAGCTCAATTGCAAAGGTTTAAAGCTTCAATTATACCGCTGCTGATCGCCAAACAAGGAGA:1 + chr3L 24054599 3' + Cr1a 334 1 53.47 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTAA:1 - chr2L 2060133 3' - 412 38 2 60.40 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGAGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGT:1 + chr2R 13644492 3' - Burdock 38 2 65.00 CCATACGGCTCTTGCGCAGCAGGCCTCGGGTGGTTTTTTTACTCGTAACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCTCGAACTTCTTGTCGACCGGCCCAAC:1 + chr3L 15521923 3' + hobo 2777 1 74.26 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTTTCTCTTAAAGATTTTGTATCTCTACGCAATCTCTTAGATCGCAGCCTAATTTAAATTTATT:1 - chr3L 5537577 3' - jockey 4684 1 64.36 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTT:1 + chr2R 24021650 3' + pogo 2078 1 56.44 ACTCTCGAAGCGAACGCATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTACTAATAACGTGGCTTTTATTTTTACGGTGCCAGCCGGG:1 + chr3L 13723305 3' - Cr1a 122 1 66.34 ATTTGTTTTTTTTTTTATTATTTTTATATCTCTTGTTTAGTTGTGTTAAGTTTAGTCAGTTCTTGGTTATCGATTTGCTGGGCTGCTGCTGCATCTATCTG:1 - chr3L 11038104 3' - Rt1b 5149 3 66.34 ATAAAAATAAATAAATATTTGAAATCGCTAAACCATTAAAACGGTTTTTAATGACAAATATACACACATAATTTGTGTATGTTTATTATCTATAAATTAAT:1 - chr2L 10306700 3' + mariner2 831 1 64.36 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGGAGGAGTGGGTTGATCCGGGGTTGGCAGGTGGATCGACGGATGCATTGCGCAAAATAAAGTGCACTCTG:1 + chr2R 11373077 3' + 1360 3381 2 76.24 AAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGATTCCGACGATAACTACAAATATTAATTACTTCGCTCACAGAACCTGTTCCAAGTTGTACGG:1 - chr2L 21656591 3' - invader1 10 2 74.26 ACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCCCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGCTCCGACAGAAGCCCACTTCTCGCCTCCCCAACCACCGCTAGCT:1 + chr3R 23889574 3' + F-element 340 1 71.29 GAATAAATGTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTT:1 - chrX 21017798 3' + 412 438 2 76.24 GTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTG:1 + chr2R 2879475 3' + Stalker 132 4 60.40 CAGGTAGACTATCGTAGTTAATTTAATTAAAAATTACTTCCTTACGAAGCGCATAAAAAGCAGTGCAGTTAAAACGTTTTACCTGGTGAGACGGTTGTCAA:1 + chr3L 7170937 3' - Tc1-2 1524 1 59.41 TAATACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATAAATTTCCTCTATGAGTTATGGCCATAAACACATTCGTTGAAA:1 - chr3L 25481502 3' + Cr1a 4281 1 67.33 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATGCGGGCACAGGGA:1 - chr2R 16940316 3' + 297 6955 2 59.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCG:1 + chr2R 9871054 3' - roo 29 2 54.46 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAACGGGCACCTTGTTACTTAGTT:1 + chr3R 6608855 3' - I-element 10 1 70.30 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAA:1 - chrX 17968344 3' - Tirant 5 2 73.63 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAA:2 + chr2L 2074771 3' + roo 9036 1 60.40 CGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCT:1 + chr3R 7388415 3' + HMS-Beagle 7014 2 55.45 GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTT:1 + chrX 3763238 3' - 297 6596 2 58.43 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCTATTT:1 + chr3L 14638659 3' + 1360 20 1 58.42 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGGGGTTC:1 + chr3R 13225573 3' + hobo 2916 1 54.46 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATTAATGTTCCAAGAATGTATATACGCC:1 - chr3R 23591397 3' - pogo 12 1 65.35 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTATTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCATTCGAACCACTTCTCTTTTGG:1 - chr3R 20149732 3' - 1360 55 1 78.22 ATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCAACAGGATGAAGTAATCGATATGATTGGGAAAACAGAACCAAATATATAATAA:1 - chr3R 7505949 3' + mdg1 7441 2 59.41 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGAC:1 - chr3R 8277916 3' + P-element 2846 1 38.61 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAA:1 + chr2L 2074762 3' + roo 9027 1 69.31 TGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGGCCTGGGGTGCTGTGGCTGGGGGAAGGCGCGTGTCGGG:1 + chr2L 5650898 3' - gypsy3 421 4 68.33 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCGGCAACACACGCGCAAAACGGCGTGTTCGAATCTCGTAAAAA:1 + chr3L 2485967 3' - jockey 26 1 39.00 TGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGA:1 - chr3R 17495752 3' - Quasimodo 24 2 63.37 ACATAGAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTGATCGACTCGCCACTCTGCCGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGATGTTTTCATTGTTATTTGATTGCGA:1 - chr2R 23822370 3' + mdg3 108 2 68.32 CATAATTAGATCCTATTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGCAGTGTCGCTTTCTAAGTCTAACTTATTTGT:1 - chr2L 22685599 3' + Cr1a 4286 1 69.31 TTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTCGACAAAAGGGGGAAGTGGGG:1 - chrX 20099911 3' + S-element 1700 1 61.00 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAAGTTTATTAAAAGATTCATTATCTTATTGCC:1 + chr2L 7488954 3' + roo 405 1 72.28 ACAAATATAACCCACCAACACTACCTAATTCCCAATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTTCCAGGCACAATGTTATTGCCTTTGCATGTTGGAAATCATAAA:1 - chr2R 23027479 3' + I-element 4962 1 61.39 AAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTCTATAGAAGTGACTACTGGAGAGCCTCTCCACTGTCTATTACAAAACTCTCTTCGCCTGGATCTGTAAAT:1 - chr2R 10945297 3' + transib2 2820 1 73.27 AAAAAAAAAAATAAAAAACCTTTTAGTATGGGCATTAAATAAATTTTAAATCTTG:1 - chrX 17720526 3' + HMS-Beagle2 490 2 92.73 ATTGAACGAAATTGGATTTTCGAACCTTTTGCTGCAGACCGGAAATTAAAAGGAATGGAAAATGCCAGGCGGCAACAATAACAGCAGCCAAGCCAGCCAAG:1 - chr3R 16256343 3' - GATE 388 1 58.42 TATACAATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAGTAATAAATTTTCATAGTTCCTATTAAATTT:1 + chr2L 4144537 3' + I-element 5314 1 65.35 TCTGCTTGAAGATTATTTTTGAAGCCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCTAGGTCCACTGGGATTGCATCTCCTATAAGGCGCGATTTGTTATTTGGGT:1 + chr3R 2913337 3' - Q-element 281 2 54.46 CGCATNTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTGTATTT:1 + chr3L 11257426 3' - 1360 5 2 74.26 TTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCG:1 - chr2L 3951603 3' + Transpac 261 2 77.23 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTATTTTTAA:1 + chr3R 13376060 3' + 1360 3382 2 73.27 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGTTTTGAGCTTAAGTCACCTTTTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATATATTTTCGTAAT:1 - chrX 4292823 3' + S-element 1712 2 72.28 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAAA:1 - chrX 23282941 3' - HMS-Beagle 8 2 70.30 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGAACACGAATCCGTCCGGTTGTGATGACGAAGCCGCACGAAGGG:1 + chr2R 16334081 3' + P-element 2883 2 75.25 AAAAAGAAAAAAAAACATTGAATCCTTTACCTAAGGTTATAATAAAGAAATGATCAAAAAGAATAATGATTATTTGGTTTTCATTTTAATTAATAAAATAT:2 - chrX 10989681 3' + transib2 2641 1 76.24 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTT:1 - chrX 8491421 3' - P-element 49 1 32.67 CAAACAAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATTCTATAACTAACTTTGATTTTATACACCGTTTTTCTATACCTTAAGT:1 - chrX 15391932 3' + 1360 3363 1 53.47 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGGAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCGCGA:1 + chr3R 27748715 3' - roo 8713 2 78.57 TTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGTGATTTGATGAGCTCGGAAACCGGATAGGATGAAAAGTGATCTTTGAAATGAATACAGGGTAATCGAGTAGGCGTC:1 + chr3R 26952678 3' - jockey 4761 1 73.27 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCTAAACGTTTCTGATGTAATTTTACTGTTGAATTTCGAATATGAACTATGAAATTAAATTACGGATTCTATATTCCAA:1 + chr3R 6114147 3' - Tirant 8171 2 75.25 GAACGCGTATATGTGTGCTTGTGCTTTGAATGTGGTGCAATCGAATCTTAGGCTCTAATCAAATGAATTACGTCTTGTGTCACTTTCAGTCTTTTA:1 - chr3R 13379104 3' - 1360 3219 1 81.25 CCCTTAGAGAAGTTTAATATTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCAATCTATGTGTATGTAATCTATGTTGTTGTTGTCGTATATATCTATGTGTATATAT:1 - chrX 13882329 3' - I-element 473 1 62.38 ATCGCGCTCTTCCACCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTTTTTTAGATTTTTATGTATGTCACTATTGATATTTTTCGGTGCATATGATCCCGTTCGTTGATAT:1 - chr2R 981530 3' - Porto1 334 1 71.29 TGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAGGTCACAGGATGTTCCTGGATGTGCGAGGGTGGCTGACTTTTTGTCTGCCGTTTTGC:1 + chr3R 14348454 3' - G2 3059 1 54.46 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCAT:1 + chr3L 17168887 3' + mdg1 368 2 76.24 TTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTT:1 - chr2L 285682 3' - P-element 29 1 50.50 CTTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGATTGCCAATTCCGCTCTCTGCCGCTCTCTTCTCCATCGTCTTTACTTTTCTCGCTCTCTCT:1 + chr3L 4298066 3' - P-element 14 1 59.41 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAGTCATCACAAAAAAAAAAATTTATTTTCCTTTCTTTCT:1 + chr2L 4743220 3' - I-element 8 1 67.33 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTTCACTTGCTCTTTTTGTTCGGCAACCAGGTTTTTCCATTTCTATGCTGTTGGTGCATGGAAAGGCATTTTGGGGGAAA:1 - chr3R 6291144 3' - jockey 4762 1 77.23 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAG:3 + chr2L 2074772 3' + roo 9037 1 59.41 TATATAAAAAAAAAACAATGCCCAGAGGGAG:1 - chr3L 15842604 3' + looper1 1694 1 87.10 AGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGAC:1 - chr2L 15081431 3' + hobo 4 1 51.49 GCTGAGAACGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGGATAAAGTTCGGATAGCTAAACTTTGGGAAACGTACGAGTATCAGTGGCAACAGC:1 + chrX 7750020 3' - 1360 3283 1 60.40 CTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGCAATTCACTTAATATTTTGCATATTTTTATCAATCTTTTCCAGTGCACA:1 - chr3L 9908703 3' - jockey 4868 1 52.48 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCAACATGCTTCGAAAATCCCAATTG:1 + chrX 10672343 3' + mdg1 370 2 75.25 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTCAACTGCGTGTGCAAAACTGATGATGCTGT:1 + chr2R 14408520 3' - hobo 46 1 67.33 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATGCATATCCAAGTATAGCTATAAAATAAATCGTGTATGAGAATCGT:2 - chrX 22444431 3' - Juan 4055 1 70.30 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCCACGGGCCCTCCTGACTAACTAACTAACAAA:1 + chr2L 16201586 3' + hobo 2920 1 61.00 TTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAGTGTCGAAATTGTGGGTAGG:1 - chr3L 17168806 3' - mdg1 7037 1 81.19 GGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATATATTTTTTTTTATTAATTTATTGCCCTTATTAAGACTAGCAATTTAGTTAGCATACGTTAAAAACG:1 - chrX 6874008 3' - McClintock 5 2 61.39 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTCGTAATTAAATTGAAATTCGG:1 - chr2R 24479901 3' - I-element 51 1 75.00 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGCCGAAAAAAGGCTTATTCGCCCACACTGG:1 + chr3R 12539590 3' - roo 4 2 76.24 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGGAGAATATTTCTAATTGGCTTATGTTTGCCATAAACTGTTTA:1 + chr2L 9163785 3' + copia 235 1 54.02 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGAT:1 + chr3R 6273561 3' - blood 54 2 78.22 AAGCGCTCCAAATGGTCTTGCCGATGCAACCGCCAACGACCTCTGCACGATTGTGAGCAAAACAAAAACTAAACAATTTAGCTTGGCAAATTGAATTAAAT:1 - chr3L 20612387 3' + BS3 171 1 71.29 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTAGCGGTTT:1 - chr3R 31458397 3' - jockey 13 1 73.27 TATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGACGCTTGATACCCCTCACT:1 + chr3R 7521586 3' - blood 7186 2 62.79 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAA:1 + chr2L 19019001 3' + hobo 2906 1 69.66 AGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAAAATCCGAGCCACTCCAACGCCCCACAATAAAAAA:1 + chr2R 15129429 3' + F-element 4338 1 69.31 TTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGATCGTCAGATGCGCTCATATTTTAGTTTGTTTATTGTTTTCACTGTGTGTCGGTTTTGGGTGTGTCAATGTATGCGT:1 + chr3R 9172229 3' - Porto1 231 1 67.33 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACAGATCCA:2 - chr3R 23275239 3' + roo 395 1 65.35 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAAAGTT:1 - chr3R 6735274 3' - copia 37 2 61.00 CACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGGAACCATCGGAGACAATTGCTACAAGGCAAACACACTTGCCTTGGGACAGT:1 - chr2L 9629784 3' + F-element 4463 1 57.43 TTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTGTGCTCCTGTGGCGAAAGGGCTCATCCGTGCTCA:1 - chr3L 21623381 3' - R1A1-element 400 1 66.34 TATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTCAGCCAGCTACTTGCGATTTCCCCCATGACCAACAACAACAGCCCCATATGT:1 + chr2L 16479158 3' - Juan 3918 1 57.43 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGCTGGCGAGCAAGTTTTGTATG:1 + chr2L 5646925 3' - jockey 4676 1 74.26 CTGCAACCACTCTGGAAAATAAAGTCCGTTTATACAAAGCATACAGCTTTATGGTACTGCCAGCAACAAAAAGACACAACAGCAACAACAACCCCAACAGG:1 - chr2R 15460581 3' + G4 3373 1 69.31 ATAACGTTAAGGCAAAGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATCATGGTTATGGGTATAGGATGAATTTGGGTCGAAGGACCG:1 - chr3R 8492615 3' - 1360 298 1 58.42 TTTATATGTTTTGATCTGGCAACGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGAAACTTTTTTTTCGCAACCCCACTAAAGTAAGGGTTCCTAAAAAGTCAA:1 - chr2L 21929586 3' + Copia1_DM 31 1 54.46 ATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATATATTTATAAGCATATAAATATATTACCTATTGTTTCGATTGTGTTCTTGCCTGTGGACCATCTGTAT:2 - chrX 15371803 3' + Idefix 7389 2 74.26 CTGGCAACAATTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCT:1 - chr2R 5582184 3' - Cr1a 458 1 50.50 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGT:1 + chrX 3817535 3' + roo 399 1 68.32 CACCTTTTCAACAAACAACAGTAGTTATCATATATATATATACAATATATCTATATATCAGAATGGTGGTACAATGGCAGAATGTTCATGTGATTGTGAAA:1 + chr2L 5812434 3' + 1731 317 1 65.35 TAATTATCAACATAAATATAAATATTTAATTTTGCAGCGTACTTATACAAGCTCACACACACACACACAAACACGAACCACGACGAACGGCACTGAAACGC:1 - chr2R 10499779 3' + 1360 2952 1 36.63 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAAC:1 - chr2L 7850085 3' - 412 54 2 79.21 AAAAATTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAGTGCGATAAAAGTTTTATCA:1 + chr3L 19377808 3' + roo 389 2 59.41 TTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTGGTTGGCGTTAGAGTGTGCGTGGCTAATCTTTTTTGCCATATTGATAAAAATTGGCCAGATAAAA:1 - chr2R 5027971 3' - INE-1 251 1 64.36 TTGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAGTCAGTCAGTCATTCATCCAGCGATCCATGCCATATCCCATCCAATCTC:1 - chr3L 3387057 3' - Tirant 443 1 56.57 CTTAAAAACGTTTTAAAATTATTTAAATTTTTTAGATACTATTTTGAGTTTCCAAACAAGACTGTTGTTATAAATGCTTTTGATATGCAAAACCGTAAAAT:1 + chr3L 9336593 3' - transib4 110 1 34.65 CCGAAAATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATC:1 + chrX 13508735 3' + roo 354 2 78.22 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACA:1 + chr3L 17168890 3' + mdg1 371 2 73.27 GGTTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGGTGGTTCGGTGGCTCGGTGGCTCAGTGGTGGTGCAGTGGATTGGGTGGGGCAACTGTGGCCAAGAAACC:1 - chr2R 17500377 3' - ZAM 7986 2 69.00 ACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAA:1 - chr2L 23286585 3' - Tirant 417 1 60.40 GGAACTCGAACATCCACCAGGACCTACGGATTTCAGTTGTAAAAACTGAAATTGTCCAGCAAAAGGCATTTCTCTTCAGCACAATTTCTCACAAAATTTCA:1 + chr2R 13192023 3' + Doc4-element 2711 1 64.36 TATTGNTATCGATAGGCTCTAGTTAGTATTTTTGAGAAGTCCGAATGTGGAAGGATTTGATTTGATGTCTTCAATATTCAGCGATAACATTACTCAGAATT:1 - chr3L 12161943 3' + aurora-element 4060 1 57.43 GTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTACTCGATGTCAGCTGTTGAAAATATTAGA:1 + chrX 7617745 3' - Tabor 6913 2 76.24 CGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGACGACTCGGAGCTGCCCACGTAGCGCAC:1 + chr2L 5580663 3' + X-element 32 1 72.28 AGTAANATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAAT:1 - chr3R 13582239 3' - BS 5042 1 69.31 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCCTGACCCAACCTACTAGGTACAAGACTGAGTGTGCTTTA:1 - chr3L 4122439 3' - P-element 14 1 59.15 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAACAATACAATAAAATTAAACCAATTCGGGTTTCTTTGCTCTTAAGCTTTTTTATTGAA:1 + chr3R 26254079 3' - jockey 4689 1 49.50 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGTAATCAAA:1 - chr3R 20556118 3' - Tirant 25 2 56.44 AATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTGTTCTCTCTTAATTTTCTTTTTCCGACTAAATTTCTGAAAATATATGGGAAAGATGCA:1 - chr4 1149951 3' - 297 325 2 70.11 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCA:1 + chr3L 16973476 3' + S-element 1712 2 74.26 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGCGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCGTATAAGTAGGC:1 - chrX 7045592 3' - jockey 4778 1 53.47 CTTAANAAATAAATTAAAAAAAAAACTGCTGGCAAAGTATCGATACCAGCGACAAGCGTTGCCACTACGTCCGCACTTGTTGCTGTATCTTCACGCTCAC:1 + chr3L 7912397 3' + X-element 4713 1 70.00 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATTCGTTTTATTGCTTAATTTGGGTCTCTGCGTCTGGT:1 + chr3L 4876827 3' - roo 8669 2 74.26 AATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCA:1 - chrX 5129476 3' + Idefix 7364 2 62.38 TTTTTTTTTTTGTAATGTTTTTCATTTCAGCTCTGATTTTCCCCGGGTTTGTCTATTTTGGATTATTTTCTTTT:1 + chr3L 12877474 3' - jockey 4997 2 71.62 TTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTTTCTCACAATGTAATTCGCACAATTCGCGGCAGATATTCGGCCAGGTATGCTTCAGATATGCA:1 - chr3R 5270920 3' + TLD2_LTR 162 1 58.42 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATAGATCCTCAATGCACTTGTTTTCAAAAGTAATCAATGAAAAGGCATGTTTGTTCCACGCATCTCCTGTGAAATG:1 - chr2R 9854001 3' - pogo 3 1 78.22 TTTAATGGTATTGGATACCATTTTTGACAGAATATTCAGGCAGGGTGCGTTTACAAAAGGAGGTTGACGACGATGCCTGTGCTTGTGTGGATGCTGCTACT:1 - chr2L 22124813 3' - HB 461 1 68.32 ACGTGACCCTCTTTCATGACTTCTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCCTAGAGTGGTGCAATAATGAAAACAAAATGAATGAAATTAT:1 + chr2L 5815060 3' - 1731 4154 1 67.33 GTAACGGGTATCAGATAGTCGGGGCTCGACTGTATCGCTCTTGATTTATTTATCCAGCTGATTGTTCCTGCAAATAGATCAAAGCACGTAATTTAAATGAA:1 + chr2R 16861622 3' + INE-1 551 1 65.35 AGTAATAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGATCTTCATTCTGATAAATGCAAAAACCGAAGAGAACAGAACGGAAGGCCAA:1 + chr3R 24171205 3' - Gypsy6A_LTR 225 1 72.28 ATCGTNTGCCAACAAATCGTATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAACTAACAAAGGCAACAAACATAACATAATAGCAATGATGA:1 + chr2R 1880435 3' - 1360 34 1 59.41 ATTTTCGAAAAAGTGGGAAAATGAAATGTCTTCGTCAAAGTGAGGGGAGAACTTTTAAAAGTATTAAGACTGAAAAGAAGGCTGGCCTAATCTGTCAAAT:1 - chr3R 11085474 3' + FB 130 1 58.00 AAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCCTCTAAATATGGCAGGGCGGCTGAAGCCGAAAAA:1 + chr2R 17260419 3' - pogo 1729 1 63.83 CACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACAATACGACCATGGATATTCGATATCGTTTCGGCCAGCCAAACATCTTACCTAACTTG:1 - chr2R 14217718 3' + Tc1 1624 1 75.25 TCATAGCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCTCGGACTTAACTCGCGTGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAAATGGCCAATTAAGCGGCAAAAATG:1 + chr3R 6117314 3' + Tirant 376 2 56.44 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAACGACCTACGCCAACGCGCTCAAGCCTGTTGGCCAACTG:1 + chr3R 8477764 3' + P-element 2849 1 37.62 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATGTTGTCATATTT:1 - 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chr3L 7075858 3' + roo 396 1 65.35 TAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTGCAATAGAAATTGTCACAGCGGCAAAACAAAAGCATTTCAACTTAGAGGCGTA:2 + chr3L 1464278 3' + 1360 398 1 57.43 TAAAANCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAA:1 - chrX 21531020 3' + roo 9035 1 59.41 CGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGACGTGGAAATCCAATAACTGCAGAAATTGTGTGCGAATTTAAGTTTCTACTTCGTGACTGCTCCTGAAAGACT:1 - chr2L 324122 3' - Tirant 8490 2 70.30 GTTCTCACTCCCGAACTCCTTCTGTTCCGACGCACTATCTTCGTACAAATTCGATCTTGCTGTCTCACCAATACTGCTCCCAATATGACGAATTCGTACTT:1 - chr3L 24492525 3' - gypsy8 434 1 59.41 CAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAATAGAAGGC:1 + chr3L 10143236 3' + 297 366 2 68.32 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTGCTTGAA:1 + chr3L 12888315 3' - mdg1 7045 2 72.28 GATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTGTGTATTTTGTTTGTGGATTTAGGTTGACTAAA:1 + chr2L 9105866 3' - Ivk 395 1 66.67 TTTTTTTTTTCTTTTTTTGGGTCCCTAATTCTTGCGCTAGGACGCCTCCTTCACATAATTGAATTTT:1 - chr3R 25571297 3' - gypsy7 5005 3 38.81 TTTCTTATTTTATTCTTCTTAGTAGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTATATTCTTGCTTGTTTACTGCAACTATTTCATTGATCATTTTCAATA:1 - chr3R 10635163 3' - mdg3 5153 1 56.44 TTATAAGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTA:1 - chr3R 29288728 3' + BS 5035 1 76.24 ATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACCGACAAGTGTTTCTTATAAGATCCCATATGCTCCACT:1 + chr2L 15247690 3' + ZAM 13 2 63.37 AGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCTCGGCGACAGCCCAAGAAAATCAAAAGATGGACAATAACTTTAAACCAGTTCCAAATGGCGCAGCCTTG:1 - chr3R 26433679 3' + Quasimodo 284 2 75.25 TTTCGAGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTAACTGCATTTTCTTCGTCAAAATCAAATCTAAACTGTGCCTTTGCCAGTTAAAGGTC:1 + chr2R 1338203 3' - 1360 3181 1 61.39 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATAAATAGAGCCGCCTCAGTCCGGTCACGTCACTCTCAA:1 + chr3R 21296609 3' + P-element 2849 1 43.56 GCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTAT:1 - chr2R 5260087 3' + 1360 3223 1 65.35 TTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTGTGGTACTATTAAGCCTTCTGGAGAGAAGACAAGTGCTATCGTTAATTTT:1 - chrY 779980 3' + Quasimodo 234 2 51.49 TGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGATTTGGTCCGCCATTCGTTCCTTCTGTTTTTTGATTTTTTTTTTCTATTTTTGTTTT:1 - chr3L 6473989 3' - Tc1-2 1286 1 62.89 GCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGTTATTCTCGATATGGATTCGTCGATCTTGTACTCCACCTCCGGGTTGAAAATCAGCTTCATCAC:1 + chr2R 14758454 3' + micropia 388 2 69.31 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTC:1 + chr2R 20744214 3' + roo 9029 1 69.31 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTG:2 - chr3L 11661724 3' + hopper 1375 1 65.35 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCCG:1 + chr3L 8363062 3' - 3S18 28 2 51.49 AGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCTTGGCGGTCTGCAAAGGATCTTCGAAGAAGGGATCTAATTTACCGGT:1 - chr3R 27285683 3' - R1A1-element 446 1 53.47 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCAT:1 - chrX 10827412 3' + roo 9041 1 60.40 AACATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAATATAAAACAAAACCCGCTCGAACTGAACTTAAAACTGGGAAACAAGCCCATTTTGTGGGCCGAACTAAAAGCC:1 + chr2R 23796849 3' + 412 7175 2 78.22 AAGAAGATCAAAGTTACCAACTTCGTCCAAGGTTCCCATATATAAAGCGATCAGACGCCAAACAAGGCAACCAAGCTGCTTTGGTCCATACACCTGAAGGA:1 - chr2R 4932691 3' + G7 794 1 57.43 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGTCAGG:1 + chr3R 4601395 3' + opus 7482 2 60.40 GCACTTTTCCCTTTATTTTTTTGTTGCCTTTTTGTTGCGGCTCGC:1 + chr2L 3742535 3' - Tc3 140 1 88.89 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGGGCCCCAAATTAGCAGGGCCCAAA:1 - chr2R 16475744 3' - 412 7085 2 58.42 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTCAGCATATAATCATCAAGTTTACA:2 - chr2R 13650102 3' + mdg1 394 2 52.48 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTAAAACCCTCCCCCAACCGTTTTATA:1 - chr3R 10734244 3' - pogo 35 1 64.36 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCACAACGGCCCGTTCTGGTCAAAACAAAGCAGAAAT:1 - chr3R 29123310 3' + P-element 2884 2 76.24 ACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGCCCAACAGTGACTATGAATAATAATGATATAATAAACTACAACCGCGTTAGGAGTAAATA:1 - chr3L 3032210 3' + opus 489 2 68.32 CGGAGAAGTTGGAAGGAAGAGACACCGGAGCGGAGGACCGTTTCGAGCCATAAACATGTAACAGCTGCAGAGCCGAGCTCCCCTCCCAGTTTCCAACGATC:1 + chr3R 27167985 3' + gypsy8 4567 1 63.37 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTTGGTGTCGTAAACGGTTTGGTTAAGAGAGTTTTTAAGAGTGACGGT:1 + chr2L 20824705 3' - pogo 6 1 68.32 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGT:1 - chrX 23048274 3' + hopper 1381 1 57.43 CCTCGATATATACACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGCACCGCTTTTTGTTTG:1 + chr2L 8565556 3' - blood 2 2 77.23 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTCGACTCGACCAATTATAGTACTGTTAAATTTTGTG:1 - chr2R 1994502 3' + 1360 1 2 65.35 AAATCATTTCTCACTCCACAATAGACGAACACTTTGGTTAGATCTTTAAAAATCTTTTTAACAAATATTTTAGCTGTGATACATCTGGGCAGGTAATATAA:1 + chr3R 8319485 3' - transib3 404 1 59.41 GGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGAATTCGTTGCATATTTTTATTTACTTGTGCAAATGTGATTCGCCC:1 - chrX 9438929 3' - Doc 358 1 56.44 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTACACATATGTACATATGTACCGTACAACGCAATAGAATATAAATGATATGGTGGGTAGATAAACGA:1 - chrX 3763133 3' + 297 390 2 69.70 CATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACAAATTTTTCATTTTCCGCCCGTTTTTCCCGCCGCCTT:1 - chr2L 5479140 3' - 1731 5 2 74.26 AAAGGGAATATAAATTATAAATTACAACATCACGATTACACAAAAAAGTTAATTTATTTTGGTTTCGGTGATAAAATATTTAATTGTATTTGCTTATGTGC:1 - chr2R 10774014 3' + copia 248 1 70.30 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAA:1 + chrX 22945353 3' - BS 28 1 54.00 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTATAAACTATTA:2 + chr3L 2019722 3' + 412 7511 2 62.38 AACTATTGTCGGCATCGGAAAATATTTTTTTATTTATATTTTTTTGAAGATGAAATCTGATATGCCAATAAAAATTTTATAGTATGCAAGTTTCCAACCCA:1 + chr2R 2674028 3' - mariner2 848 1 78.22 GATTCNTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATTGAATTTTATGATTGATACATAATC:1 + chr3L 3336083 3' - Idefix 7118 2 74.26 TTATTGATCGGGATCAATAGCCGGTTCGATCTGTCTCAGTCTGTCTGTCTGTCCCTTTCTACACATAAAACAGTTGCGTTCATAATAATATTACTTATGAT:1 + chr2R 12536386 3' + INE-1 87 1 51.49 CCTCCAGGTAGGGAGTTCGGTGGGGTGGACCCTCTTCAGCCATCGGAGGTTGATTGGATTAGGATTAAGAATTTGGGACAAGTGCGAGAAGA:1 + chr2R 3272790 3' - G5 4656 1 56.52 ATCAACTAACTGAATGGAGCGCATAAAAACGGAAGTTATGCTGCCGCACACTGTATTTGTGTAGAGTAAAATTTCGAATAACGTTTTATAAAAAAAATCAT:1 - chrX 23042007 3' - mariner2 35 1 76.24 TACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGACTGCGCCTGTTGATAGCGAAAACACACATTTCGCAAGTTCATGCAAATAATATTCAA:1 + chr3R 20555527 3' - Tirant 449 1 55.45 GTTTGCCCACCCTTATAAAAACCTTTAACAAACATTTTGTTTTTCGATTGCCCACAAAAGTTTTGAATTCGAATTTGGAGGTGAA:1 - chr3L 22758745 3' + FB 385 1 62.35 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGGAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAA:1 + chrX 17968431 3' + Tirant 386 2 55.00 AGCTAAACAAAACAAAAATAACTCCTACCTCTCATTCACCCACATCAGTTTTTGCCTCCTTCATAGTCTGGATTATGGTACACGAAGCCGCCAACTTTCTC:1 + chr2L 17964704 3' + Porto1 252 1 67.33 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCATACCCATACCCATACCCATAGTCTCAAGTCGCAGTCGGCGTCTCAGTCG:1 - chrX 17830726 3' - P-element 26 1 53.47 AGGGAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCGTCGGATGTACAAATGTGCATGTTGGCTCGATGGGGGCTGGGGTACTCA:1 + chr3L 12275259 3' + Bica 351 1 51.49 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTAT:1 + chr2L 15510443 3' + jockey 4942 1 75.25 TTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTG:1 + chr3L 24916684 3' - Porto1 151 1 57.73 CAGTAATTTAACTACAATTACATAACAATCACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGAGAAAAAAGAACAAAAACGGAAGCAAAGCAAAGCGAAGGAA:1 + chr3R 25601066 3' - X-element 4592 1 59.41 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTT:1 + chr3L 4641138 3' - hobo 33 1 54.46 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATAT:1 + chr3R 7168652 3' + flea 4998 2 62.38 AAACACATTATTGAAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGAAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGC:1 - chr2L 12815038 3' + hopper 1393 1 52.69 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAAAAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAA:1 + chr3R 7168654 3' + flea 250 2 68.48 TTTTGTTAAATCAACAATGAAGTTATCCATATGATTATTTTACTACATATATACATATACATATATATACATATATATGTATATGTATATTCTACATATAT:1 + chr2L 18937480 3' + Tc1-2 1477 1 73.27 CTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTGCACTTAGTGTTTCTGCTGTTTTGGTTTCGCCCATGATCTTGGGTCTGATTTAAATTCATTTACTTGCGATTTGT:1 + chr3L 5798259 3' + Cr1a 292 1 80.20 CAACACACACACACACACATACAAGCGAGCGTGCCTTGGCAGGTGAGAAGAAGAAGAGGAAATGCAGTGAAAGTGAGCTGGCAGCGGAAAACGGG:1 + chr3L 16692509 3' + accord 183 3 64.21 ATCAACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCACACACTTTTAGCCCGCTTTATGGCTTGTGA:1 - chrX 7666542 3' + accord 181 3 64.94 AAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTACGATTTTTTATATATGAGAATTATA:2 - chr3R 8975925 3' - Bari1 18 1 62.38 CGCATTCACACTAACTGCGTAAAGGGTATCTGATGGTCGGTGAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTGATCAGGATTACCTTCCAAACTAGAAAATT:1 + chrX 20446197 3' + INE-1 533 1 80.20 CAAGTATCTTTCGAAGATTTCTATACCTCCGCGATCAAAGAAAAAAACAGTGAACAAAAAATATGGAATGCTCCTCGTCGTTTGGCTGTAAGGATTCACTT:1 - chr3L 15792752 3' + R2-element 3550 1 65.35 TATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTTGGAATGCATTTGTTAGATACAAAAGATTGTCTTGCATGTTAAT:1 + chr3L 17664823 3' - blood 177 2 64.36 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTATTA:1 - chr2L 7488840 3' - roo 8679 2 60.40 ATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATCTTGTTTTTACTATTGTCTGCCTGAAGTCCACACTCAATCTCCATTTGTCCGTTT:1 - chr2R 5266147 3' + 1360 3185 1 57.43 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTTGCAACCAAATCGATTTCACTTTCCATTCACATTCACATCATCGCAAT:1 - chrX 3305112 3' + transib2 2819 1 70.30 TGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTA:1 + chr3L 18337701 3' - Juan 4063 1 62.38 GGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTATGCATGTGTGTGTGTTGTTTGTGTGTGGTACATATGCTATATGCTATATGG:1 - chr2R 15812592 3' - Idefix 7074 2 63.95 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAA:1 + chr2L 2074766 3' + roo 9031 1 65.35 CACCTTATGTTATTTCATCATGACTCTGTGGCTGTGGCCAGCCCCCGCGGGCCCCTTTTGCTATCTCGCTTGCTCG:1 + chr3R 9551493 3' + P-element 2886 2 68.42 TGAGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGGTGAGTTTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCGCCCCTATTCCAAAGGGGGCGTCACATGCTTTTG:1 - chr2L 7262905 3' - accord 7032 2 44.55 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATTATTATTTTACAACAATTTTTGAAAAAGCAATACTAAGGTGA:1 + chr2R 17718219 3' + 412 460 2 60.40 TATGTAATAAACCAATATATGCCAAACAACTGTGAACGAAGAGAAATCTGCAGGTGTTTTATTGGTGTGTGGGCGTGAAACATGAAAAGGCCAAAC:1 - chr3L 16516410 3' - blood 379 1 79.17 CAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCCTCCTCCAGCGCCGCCCCCATGGCCACCAGGTCCACC:1 - chrX 15093832 3' + F-element 319 1 63.37 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCGGACAATCGGTA:1 - chr2L 12815011 3' + hopper 1412 2 76.24 CTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCACCGAATTATGTGGCATCCATTGTTGTTGAGGACCATGG:1 - chrX 20047521 3' + roo 412 1 76.24 AACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTGT:1 - chr3R 178127 3' - BS 46 1 72.00 AAAAGAAGAGAAAAAAAAAAACATGAAAACCCGAGAAAACAAAACAAAAAA:1 - chrX 10021934 3' + gypsy7 5007 3 78.43 CCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAACTGCCACTGCCACCCAACAAAATTGACAAATTACGTTCGGTTC:1 - chr2L 15866411 3' + Doc 475 1 74.23 TTCATTTTTTTTTTACTTTTTCCCAACACGTTTTTAAACCATATAATAGAAACGTCTTCTTATGGCGGG:1 - chr3L 3419271 3' - Doc2-element 244 1 53.62 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATA:1 - chr3L 13589430 3' - hobo 19 1 60.40 TAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTCGGGGCCAAAA:1 + chr2L 17646264 3' + flea 256 1 72.28 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATCAACGTTGATTGATGTTCTATTTTTATGTACATATGTACGGAATT:1 + chr3R 16834084 3' + I-element 5321 1 54.46 ATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGAACAAATAATTCAAATTCAAACAAATAATTAATTATGAAAATAAT:1 - chr2L 3676991 3' + 1360 447 1 63.27 CCAAAATTGTAAGCCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCCAAC:1 + chr2R 23571708 3' - roo 24 2 55.45 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATT:1 + chr3L 17921215 3' - 297 16 2 62.38 CCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACACTTTTTCATCATTTTACTTACTAAACTTAAATACTACAATCATTTAACTTCAAATGTCAAGATTTTGAATAGAATC:1 - chr3R 5171869 3' - Tc1 1597 1 67.33 AAAAAATAATAACAAAACTATTAACAATGAACGAGAAAAACTACTAAATCCAAGTTTGCACAGATTCGACAAACCGGCGAAAAACGGTGCGTGCTTAAGTG:1 + chr2R 2961885 3' + S2 141 2 70.30 TATTTAGCTGTTTTTTTTTTTAATTCTTTGATGAGCACGATGATGAGCAATCAAAG:1 + chr3R 21715334 3' - gypsy11 3932 1 55.36 TTTTTTCTTTTTTTCCTTTTTTGAATTTCTGTACTTCTGTTCTAGGGGGCGCGGATACAGCCCAAGTGACAGTGGCGCCCCAAGAAGTGGACGGCTGCGAT:1 - chr2L 16510104 3' - Doc2-element 237 2 53.47 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTGAGCCAACGCAAATGCAAATTTATATGCTCTGAGCCATTCAATATGCA:1 - chr2L 15807975 3' + I-element 5329 1 52.48 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGG:1 + chr2L 14790636 3' + roo 9027 1 68.32 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTA:1 + chr3L 13477485 3' - P-element 56 1 17.17 GCTTTTGTGATTATTCTGAACATTTTTGTCATAAGCATTAGATGGAATACAACGCGCTGAAACAGAAATCCTGGTAAGATACACTAGTTAGTCCGATCCCT:1 + chr3L 20727762 3' - Porto1 4345 1 73.27 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAA:1 - chr3L 28063327 3' + roo 400 1 70.00 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATT:1 + chr3L 9766399 3' + blood 7345 2 77.23 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAAAACGCCGGCGGGCCACAACAAATCA:1 + chrX 10561847 3' - hobo 50 1 71.29 CGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTAATGTGCACCGTTTTGCATTT:1 + chr2L 3388168 3' - F-element 282 1 77.23 AAAAGNCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGCTGTAAGCTAACGCCGACTTCCGCTTGCCATAGGCCTCGTCTATAACTCCCGGCCACGCCTCC:1 - chrX 2799605 3' + Tirant 388 2 68.32 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCAACCTGCTGCAGATTTCTGTTCGCCTGGTATCAGGAAACAGAATTTCTTC:2 - chr3L 2244110 3' + jockey 4966 1 50.50 GTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAAAAGCGGCAGGGAAACTGAGGAATCG:2 - chrX 13792808 3' + R1A1-element 5321 1 73.27 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAG:1 + chr2L 12949267 3' - 412 7097 2 67.33 TTATGTTATTTCCAGTAGGTCTAGAGATCTTCCTTCGTATCGCTTCGTTTCATTCGCAACGGTACTGTTTCAGTCCGAACAGAGCAGAGGAATTTCAACAC:1 + chrX 15089555 3' - gypsy 7420 2 69.31 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAA:1 - chrX 13640658 3' - P-element 61 1 18.81 GTATTAGCGTATTCTTGCACTAGGAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAA:1 - chr3R 19205511 3' + Porto1 4573 1 80.20 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTG:1 + chr3R 26530921 3' - blood 7041 2 58.24 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGTTGAATGGCAGCGCTAAGC:1 + chr3R 6622725 3' + P-element 2880 2 72.92 TTCCTGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGTACCTGAAAAGAAAGGAACTCAGGACAAGCAAAGAAACCAACAAAAGCTGCATCAGGCTACCAA:1 + chrX 13981491 3' + TAHRE 10084 1 58.42 CGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGTGTACTAAAAGGTTCAGACCCAAAACAGCATTAGGTGAAAGGCGCTCACAAGACAATAAACGTAAGTAAA:1 - chr2R 18999500 3' + Juan 151 1 63.37 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTGTCACCAACTGCTGTCACTCACTCACTCGCTCGCTCGCACACACTTCGCCAGCTACTTGTGGGATCTCGCCCT:1 - chr2R 11527980 3' - P-element 4 2 79.21 AGGATNATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGAACCAATTCTGTTGCTTTGGCGCCCTTCGAGCGCTCGTCCTTGCACCAGGCAC:1 + chr3L 26288408 3' - Idefix 120 2 61.05 GTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCGTAACCGTATCATCGTAATCGTAGCCAGGAGTACTCAACGTGGGCAACAGTTTCGA:1 + chr3R 23379878 3' + Doc 4448 1 59.41 TGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGCCATTCATAGGGTGTGAATCTGTATAATAGATATAT:1 + chr3R 20862115 3' + mdg1 264 2 64.36 CCACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGGTGAGTGTGGTGGCAGGTGAGCTCCCCTTTTTT:1 + chrX 7118921 3' + copia 4800 1 67.33 TACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTAACCGATACCTCCGCACCGACAACGACGGTAAAATCTTGAAATCCCTAAAAGCCATTAAAGAATGCGTAATT:1 - chr3L 3484414 3' + mdg1 7276 2 55.45 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTCTTCCGAATTGTTTGCACTTTGTTCTTTTTATTTTTGCGCCTCATAACGTATTCAAAA:1 + chr2L 21816215 3' + BS 5024 1 63.37 ATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAAGGTAAGCCCAAAGCATTTTAAATTA:1 + chr2R 24628860 3' - mdg1 7038 1 79.21 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGT:2 - chr2L 22084498 3' + copia 202 2 75.25 CCCAGTAATACGATCTAACGCTTATTCAATACATAAGCCGAAGAATGCGCTGATGATATTGTACAGTTTTTGCCAAAAATCTGGAGTTTTCGCTCCAATCG:1 + chr3R 8512309 3' + Stalker4 7104 4 65.35 TAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTGCATTTTCAATAATTTAGTAATGAATAGAATTC:1 - chr3R 11094516 3' + 3S18 6062 2 65.35 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGTTGAATG:1 + chr3R 6622713 3' + P-element 2863 1 57.43 TGCACATACTACACCCCCCCCCTTTTTTTTTGTTTTTTATATTTATTTGCTTGGTTTTTTTTCGGGGGTCTGTCATTTTTTT:1 - chr3L 2805284 3' - blood 7003 1 67.07 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGAT:3 + chr3R 4604461 3' - Ivk 47 1 67.33 TATATTATAAAAATAAATAAATAATCCAAAAATCAAAAATGGCTCAAGAACCAGCAATTGCAATGCCTAAAATGCGTACGTGAGTTTCGCGCAGTGATCGC:1 - chr3R 21856044 3' + mariner2 825 1 59.41 AATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCAAG:1 + chr2L 22225073 3' + G5 4782 1 78.00 GCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGAGGGAGGAAGGAGGGCAG:1 + chr3R 26845573 3' - opus 462 2 82.18 ATGATCAACAATAATAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAA:1 - chr3R 4600076 3' + flea 245 2 65.35 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTG:1 - chr2R 20739442 3' - roo 8696 2 60.00 AATAAAGACTGTTCTAAGCATAGTTCTACGGATAGCTAGGGAAGGTAAATTAAAAGTAGTCTACATGAATGAGGAGGTCAATTCGAAAGGGAAATGCAAGG:1 + chrX 12996587 3' - Cr1a 4027 1 77.23 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATTAGAACCAATTAAAGTAGGAAATTATTTAAAATTGGATTTTACAAAATGTAAA:1 + chr2L 10793228 3' - I-element 24 1 53.47 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTAGCCGTACGCTATCAAAATATTTCATGTTTTTTATA:1 + chr3R 27981751 3' + roo 397 1 65.35 TGTTAGAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTAATAGAGTTACAATCGACACTGGCCCATCAATTAAT:1 - chr2R 7030834 3' + jockey 249 1 63.37 TATAATTAATAATTATTTTTATTTGATTGGAACACAGCAGCAACATCATCACCATCAGCATCGTCATCAGGCTGCATTGTGCCCGTTTTTGTTTCTCCAAC:1 - chr3R 23310730 3' - gypsy9 5306 2 75.25 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTAACAATACATTTTTAAGTTG:1 + chr2L 13136829 3' + roo 405 1 76.24 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGG:1 + chrX 11730323 3' - jockey 4796 1 66.00 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGC:1 - chr3R 19346914 3' + blood 7337 1 78.22 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGATTAT:1 + chr2L 13319656 3' - hobo 19 1 58.42 CCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAACCTTTATGGCACGTTTATTTTCCCAACTCCAGATCCAGTGAATGCGAAAAGTAAATGAAAGAAGCCA:1 - chrX 6373615 3' + X-element 4703 1 63.37 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAAATATTTCATTCATTTTCT:1 + chr2R 13650204 3' - mdg1 7042 2 75.25 AATATATATATGTATATATATTTGTACCGTGCGAAGGGAACAAATAAGAAACCCAAAGCCGAGGTTGCATAATACTGGGGAAA:1 + chr2L 5063954 3' + 1731 4410 1 92.77 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAG:1 - chr3R 16458017 3' + roo 9023 2 77.78 TTAAAAATAAAATTAACAAAGGAAATTACTCCAGCTGTGGCTTTCAAGATTGTTACATCTACAATACCATTTATTTTTTCAGTTTATGCCGCTCAGCGCG:1 - chr3R 15067066 3' + hobo 485 1 78.00 CCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTGCATACGCGACTTCAAACAT:2 - chr3L 8713062 3' + opus 7493 2 71.29 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCA:1 + chr2R 19209463 3' - jockey 4759 1 73.75 CGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTA:1 - chr2R 1320677 3' + diver2 4883 2 57.43 TGGCATTTATTTTCCATATATTGATTGCTTTTTAATGGATATTTTGCTCTGGGATAATATTTGACATTACTACTTTTGGCAGCTATCCTTGGGGCACGTCG:1 - chr3R 19700884 3' - transib2 266 1 54.46 GCTGTGAGCGGGAGAGTTGAGTGCGTGTTTATGGGCATAGCGGATGTTGTTGTTGGTGTTGCAGCGGTTTAAAGTTCA:1 - chr3R 16399349 3' - Porto1 473 1 80.77 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTAT:1 - chr2R 23584739 3' + HMS-Beagle 7011 2 52.48 CTTCAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTCTGTGCGCTTGTTTTGGCCTTTCAAAGTCTTCAGACTGATCTTGTTTTTATTTTGCTCGGCTTCT:1 + chr3L 2644787 3' + blood 163 2 67.33 CAAGCCCTCCAACCTAATCTCCATAAACAGTGTCTAAGACATCTCCGTCATAAATTGTGGTTTGAGGTCGACTTCATATTTAGATTGCACATGCCTCTCGA:1 - chr3R 25538646 3' + gypsy 365 2 66.34 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAA:1 - chrX 23282942 3' - HMS-Beagle 9 2 70.30 ATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCTTATAAGACATCCACTAAAACATCCACAACAATAATTGAAAAGTCTCTAAAAACCATATAAATAAA:1 - chrX 3688646 3' - rooA 262 2 67.33 AAAAATAAACTTAAAAAAAAAACCTTACTCAATGCTAAATCAAGTGGGCACTAACTGAATGCATGGAAATACACTGCGTATCGAGATTGTAAAACCGAG:1 + chr3L 10520508 3' + gypsy2 423 1 75.76 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCG:1 + chrX 21017866 3' - 412 7077 2 50.50 TATCATAATAAATAAATAAATAAATTACGAATATTATGGGCTATTATCATTCTGGCATTTGGCCATTAAACAGCTTTATGAGCCTGCCAATTATTAATGCC:1 + chr2R 24479972 3' - copia 229 2 76.24 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTC:1 - chr2L 7488869 3' - roo 44 2 72.28 GTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTTGGCCACTGCACTTGCTGCCCTGCGACCAATTTAAACTAATTACGCTTCAGTCT:1 + chrX 18042354 3' + Doc 477 1 57.43 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCATTTTGCCGCTCACTTAGTTTCATTAAAACAA:1 - chrX 5133519 3' + P-element 2821 1 36.63 TTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCGTCGCATATTAATCAGCGTTGGTGCCCGGCTAGTGTTGTAGTTGTTGTTCCTTGAATCCT:1 - chrX 22464219 3' - F-element 4237 1 59.41 AAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGA:1 - chr3L 10081925 3' - rover 6969 2 59.41 GTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAACGAATTACAAGCCATAAACACACGACAGCAAACGGAA:1 + chr2R 19089927 3' + I-element 338 1 77.23 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAAGTAGCTTGAAAACTAATAAAACGAGTCACGAACACACGGTTAC:1 + chr3L 8635353 3' - 1360 306 1 63.92 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTAGGTTCACAGAGTGGCAGTTGACACAATCAAAAAATAGGCAAATCAAAATTAATACT:3 - chr3L 23152030 3' + copia 236 1 60.40 GGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTCTGCAAACAAACTTCCAAAATCGTGAGTCATACGAGAT:1 + chr3R 14653723 3' - I-element 5113 1 62.38 TTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCATCGTTCGCCTCATTTCCATCTGCCAGAGTTGCCGC:1 - chr2L 15808437 3' - I-element 359 1 61.11 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAATCGCTGGGAA:1 + chrX 19162680 3' - pogo 20 1 59.41 GCAAACATAAATAAATAAATAAATAACACATTCGAAACTAATCCGAATAATCAATGGTGATTCTTCCCGTTCATTATCTGTCGATCGTGCTACTCTGTCCA:1 + chr2R 19175272 3' + Juan 4213 1 55.45 AGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAAGAGAGACGGCACCCACACGCAAGTAGGCGCAGGGAAAATGTTTGCCAGTGGGCGG:1 - chr3L 21417652 3' + Bica 89 1 63.37 TATAAAAATAAATAAACATTTTTTTTCTTCTTCCAGTGGAAATGAAAATCGTATTGAAAGAGCGATCTTGTGGTTCTTCTCAGTGCAATAGTGCCATTACA:1 + chr3L 16710561 3' + mariner2 830 1 89.11 AGGAAACATTGCAGGTGAGTGTTTGTTGTATTCTAGCTGGGGTGAATGGTGAGTTTTATTTTCCGGGAAAATCTAAGGTGTATGGCTCTACTCCCGATTCA:1 - chr2L 20488683 3' - TAHRE 10057 1 68.32 CCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCAATATAAAATATCAAAGGGTTTAGATTTTTAGAGTGACAAGATTGCAT:1 + chr3L 4907327 3' + jockey 4676 1 52.48 AAGTTAAAAAATAAACAAAAAACATTCTTATGTAAAATTAAAGGATTATCTACTGCCTTAAAAAATTTCAATTGAAATTTTATTTAGAGGAAGAATCAAG:1 + chr3L 6086203 3' + TAHRE 10442 1 64.00 CCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTGTTGGTATACTTAGATTTTAGTGTAGTGTGCAATATTTCTAGTGTGTTAGTG:1 + chr3R 3396951 3' + accord2 261 1 57.43 TCGAAGTTTAGGTGCAAAATTCAAGCCCAAGCCCAACATGCAACTCCAGCTAACGACGCTCAAGAACTGCAGTGAGTATATATATTTGTATAAATGCGAT:1 + chr3R 4941948 3' + Porto1 53 1 70.00 ATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAATTTTTCAACTTTGAATAGAGCTACAACAATTTGTGTTTTAATTAATATTGAAACGCGTATTGT:1 + chr3L 10014548 3' - hopper 1060 2 69.31 ATATATATATATTTATATTTATTTATTATATTTATCTACCCAAGATTGACTTTTTTAGCTAACGCCTTTTTAACCGTCGCTCGGGGTTTTTCCATTTT:1 + chr2L 18586802 3' - Stalker 6936 4 48.98 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCCAACA:1 + chr2R 23571709 3' - roo 8687 2 56.44 CGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTAACAAGCACCCCAACCCCATGCTTATGCACCGGAAAAGTAATCTTGTAGTTTAACTTGATT:1 - chr2R 19020569 3' + F-element 4423 1 51.49 AGCGGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACGCATTTTTCATTCTCGGAATAACGTACATATTTACATTTTGTTT:1 + chr3L 17047849 3' - gypsy3 6579 4 73.27 AAAAATTAAAAAATAAAATCGTGGCGGAGAGTGGGCGTGTTCCCCGTCCCGCCCCCTTGGGAGAAACATCCTGCCGCCACGATTTTATTTTTTATTT:1 - chrX 6141437 3' + TAHRE 157 1 75.26 TAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGTCAGCCAGTG:1 - chr3R 9131763 3' + roo 9035 1 62.38 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATT:1 + chr2R 16988246 3' + opus 7453 2 73.27 GATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGCTAATTAGATTTATGAATAGAGACCAATGTAAGTTATCGG:1 - chr3R 21421266 3' - 297 6524 1 58.33 GTTATTTTTCCGTTCTTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCTCAATTCGAATACAGTGTCCAAAGAAACCAATTTGCACTTGGATATATACAA:1 + chr2R 16083093 3' + rover 139 2 56.44 ATAGAAAATGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTATCAGATAGCCGTTACTCAGCTAGTATGAATGCGAACGCTTAATCAACTTGTAATTACCTTGAGGTTTTC:1 - chr3R 4134379 3' - INE-1 576 1 74.26 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGCCCTCCTGAC:1 + chr2L 16201571 3' + hobo 2904 1 56.44 TTATTGTTTTCACTTGTTTTTTTTTTTGGTTATCATGTTCAACCAAGAGACAGTTTTATT:1 + chr3R 17747482 3' - Porto1 176 1 75.00 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGG:1 + chrX 2799687 3' - Tirant 8149 2 68.32 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGA:1 + chr3R 26530940 3' - blood 7032 2 58.42 TATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGAAAGTTTTCGGGCCAAACAACCTTAAAGTTGCGGCTT:1 + chr2R 6777900 3' - F-element 4433 1 68.32 CAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTTTGGTGTTATTTTTTGCTTCGTTTTCTTTTTTGCCTTACGCAACCTTGTC:1 - chr2L 12953051 3' + Cr1a 182 1 67.33 CAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGACTCATCAAGGAGTGGGTGCGATGGAAAGGCTTTAAGAGTTTATAATCTTGGGGATGAATGT:1 - chr2L 10777454 3' - R1A1-element 487 1 72.45 GCTTGNGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATAATTCCATTTTTTTATATTATTGAATGTAATTCAATATTTTGCCTTTGGGTA:1 + chrX 23283044 3' + HMS-Beagle 223 2 54.46 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCGCGCACTGGAAGGATGCAAGCCCGAGTTGT:1 - chrX 19116872 3' + opus 7477 2 64.37 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCTTTTGTCACTG:1 - chr3L 9907352 3' - jockey 26 1 53.47 AGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGTTTCTTCTCGCCAGTCTTCAGAGTCTTCG:1 - chrX 3456539 3' - F-element 4440 1 71.29 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATT:1 + chr2L 7255816 3' + P-element 2863 1 54.55 AGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGCAAGAATGCCAACTCGTTTCAGCATCGCGTATGTAAAGAACAAGTGCGCTTTTG:1 - chr2L 12566769 3' + pogo 193 1 68.32 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATTTAGTATATAAACTCATTCCGTTTGGTTCAATTGTCACGTAGTG:1 - chr2L 12474957 3' + mdg3 5474 2 55.45 ACTCGACTATAGCATCCTCTCTTGTTGTGATTTACATGAGGCATAGAAAAAGAAAAACTGAAGTAAATTGACATACATTTACTTGGTAAAGACCAATCTAG:1 + chrX 22633821 3' + INE-1 576 1 61.39 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATATAAAATCAAGAGAACACGGTTCTGAGTATTACTGCATTTCGGAAGGAGAACCGC:1 - chr2R 1072551 3' - pogo 17 1 62.38 GTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGAGTGTTTCTTTGTTCTGTCATCTTGAGCTTGTTTCGGTTC:1 - chr3L 18177480 3' - F-element 4429 1 65.35 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCGTCATCGTAGAATAGGT:1 - chr2R 15474801 3' - roo 8680 2 55.13 CTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGCCTCAGTTCTTTCTGGGCTTTTGACTTAGCATA:1 - chr3R 7171116 3' - Doc 4450 1 67.00 ATAACAAAAAAAAAAATAAAAAAGTATAATGTAGTTGGACTTTCTGTTTTTTTTTCTTCACCGTTAATGTGAAATTACGAATATGGGCAGAAAAAATCGTG:1 + chr3R 25498368 3' + gypsy7 5002 13 58.42 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGC:1 + chr3L 11553531 3' + P-element 2837 1 18.81 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCC:1 - chr2L 18212132 3' - 412 34 2 61.39 TCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACTAAAAAGAAAAGATCGCTAAAAGATACGAAAATTACAATTTTTGAAACTTTTCAGTT:1 - chrX 9745266 3' - copia 163 2 67.00 CATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGA:3 + chr3R 32005943 3' - invader4 2796 2 67.33 TTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATGACACTCGGCACTCATAACGGAGGATAGAGAAGGCAAACAGTCAGAAAACGGAA:1 - chrX 22413356 3' - gypsy5 15 2 62.38 AATCGGCTGGCCAGCGCTCTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGTCCGAAGAGGAGGAGTTCTTTTTTTCCTTTTTCTTCCGTTTGATGCTAGTCGCAATA:1 + chr2L 20106704 3' + X-element 4443 1 61.39 TTTTTTTTTATTTTTTTTTTTGTGCACAGTTTGTTTTTTTTTTGTTACAATTTTT:1 + chrX 16453509 3' - G2 3077 4 70.91 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAATTAATTAAACTCTAACTTAAGTAAACGTTATATTACATGTGCACAAACTGAAATGCGGCTAAGT:1 + chr2L 176722 3' + I-element 5341 1 55.45 GAAAGNAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTGGCCAATGCCCGCATAATTGTTTGTTATTTATGATATGTTG:1 + chrX 17042744 3' + copia 247 1 68.32 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTAAGAGCATTTAAAAGCCGGCTAGCA:1 - chr2R 12082313 3' + mdg1 414 2 72.28 CTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATATCCCAAGTACAACCTCCACCGATTTCCACCCGAAAAG:1 - chr2R 18950705 3' + roo 412 1 78.22 AAAGACAATGGCAGATATGACGTTAAAAAATCAGCAGTAAGTCCATGTACCAGGAAGTCCAAAATATTATTGAAGACCGTTTCCAGGGAACTGTCCAAAAA:1 - chr2L 20134267 3' + flea 4600 1 75.25 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGATTTTCTAGCCAAACATAAAATAAC:1 + chr3L 15100727 3' - pogo 48 1 76.24 TTTAATTTTTTTTTTTAATTTTTTACAAACAGCAGTAAATTTAAAAACTATTATATTGTGCTATTAAAACCTTACCGTTCTCGTCAATGTATCCTTTTACT:1 + chr3L 18073338 3' - Doc 4698 2 75.25 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCCTGCCCTCCTGTCCTG:1 - chr3R 27775084 3' - roo 31 2 59.41 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGC:1 - chr2L 7488875 3' - roo 8713 2 78.00 AAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGACCGGTTTTGGCTTCTTTCGTTTAGAATTAGTCGTTTTGAATGTGGCTTCACTGGGACGATTTTTGGCGCCACT:1 - chrX 23448979 3' - Chimpo 4211 1 78.22 GAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAG:1 - chr3R 18346615 3' + INE-1 574 1 65.35 TTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCAAATACGATTTGCACTATAATTTTTGTGTGTTGATTAACTTGATGTACTTTGTGAGTGAGATATCCC:1 - chr3L 6618527 3' - F-element 4573 1 71.29 AAAATTAAGAAATTTTCAAATTTCTGTGGGACTATGATTGTAAACACATTATAGAAGCGTGCAGCATAAAACATTATTTCTCTCTGTGCATCACCCAAAAA:1 + chrX 4903025 3' + 1360 3031 1 71.29 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTGGT:1 - chrX 13640616 3' - P-element 19 1 60.40 CTGGATCGCTACGTTTTTGCAAAACGTCAACGGAGTCCGCAACGTACAACAGGTAATAGAGCCAAAAATGCATCTCGTCGTAAACCAGGCGAAATACGCTG:1 - chr2R 5209745 3' + Doc4-element 478 1 67.33 CTCTTTTCCCTTTTTTTTTGTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGGGCGTTTTGTAGGTGAAAG:1 + chr2R 5119210 3' - Bica 340 1 84.16 GGATGATATAATAATGTTTTCTAATACAATTAAACAACATAATTGAAGGAAAAAATATTCTTCCATTAAAAGAATATATTATTAAAAAATACTTTGATGAA:1 - chrX 21922320 3' + TLD2_LTR 48 1 58.42 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTGCAAAAGTGCATATAATTT:1 - chr3L 18659002 3' - pogo 14 1 65.35 TATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGTGTGGTGAATGGATTGTGATTTCAATAATTGTTAAGTCGGTACAATATGTAAGTCCAGTGT:1 - chr2R 7178329 3' - Idefix 89 2 64.36 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATATCCCA:1 - chr2R 18950737 3' + roo 405 1 67.11 TATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAAATGCAAAC:1 - chr3R 20137244 3' - Burdock 11 2 66.34 AAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGATGGACGTGTCTCGGCCCAA:1 - chr2R 2944235 3' - 1360 3228 1 81.19 CTAAGCCCGCAAAATTCTTCAATGGGTAATAAACTAAAAATAAATTGTGACAGAACAAGACAGAAATATGTATAATTTGTATGCGAGAGAAAGGCGAGGAA:1 + chrX 6184038 3' + Fw2 50 1 65.35 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTCCATGATGCC:1 - chr2R 8345485 3' + roo 393 1 64.36 AAGGAAAACCTAGAGAAAAGAACCCACAACAAAAAAGGAAACCCTAAGAAACAAAAGCCAAACAAGGTGCGTTCTCTGAACCCACGAGACAGACAAATTGA:1 - chr3L 2409915 3' + invader5 3602 1 77.23 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTATTGTAATTAAAGCTGCAGCACAGCCTTTGGTCAAGAGTCCAAATGGGTTG:1 + chr2L 9774349 3' - 412 7078 2 52.48 ATTTATAACATATTGTAGACGTTTTTTTTTATCATTACATTATTTGGAAATTTATGCAGGGGGCGGCGGCCGATTCAGTGACTCATTCCCATTCCGCTCAT:1 - chr3R 8705453 3' - S2 1392 1 80.20 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCACACTTGGGGGTAGTAATATCTTTTACTAAAAATAGCACTAATAGAAGTGATTAATA:1 + chr2R 22478148 3' + Burdock 235 2 60.40 CGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTTAAAATTTTTTTTGTCAAATTTGAGGTGGTAAAAAACAAATT:1 - chr3L 24158863 3' + 1360 3001 1 71.29 TTACCCATTTTAATAACTTTGTGTCATAAGAAACAAAAAACACACACACACGGTCAAAACTGTGGCCAAAAAGCCAAAACGTGAATGTATCAAAATTTTCG:1 + chr2R 17260346 3' - pogo 326 1 68.32 GAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCAGTGTCTTATTCATTTTTTACACGCCGCAAGCGAAACAAGAATTTTTTACATATATATAGATTTAA:2 - chr3L 23334829 3' - 1360 470 1 58.42 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGA:1 - chr3L 12888224 3' + mdg1 386 2 61.39 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTTTCTCTCAG:1 + chr2L 6601445 3' - I-element 43 1 62.38 CCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 21 1 73.27 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAAAAATGAGACATAATCTGCGAGGCT:1 + chr3R 26321702 3' - blood 15 2 64.36 TAGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTGCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGAAGGAAGTTGGGCAGGTGGAAAGGAAGCTGGGCGAGTGTTTCTG:1 + chrX 18132030 3' + 1360 3357 1 74.26 TAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGTCCTTCATCATTTAGGCCATCATTAATTAAAAGGACACAAAATTGAAACAAAGCTTAATCAAATTAACGCAAGA:1 + chr2R 16980585 3' - copia 4872 2 76.24 CAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCCTGTAAAGGGCCGAATTGATTGTACCCTCGTCGATTAGCAGTGCGCAAAGTGGAAACTCCGCGGACAAA:1 - chr2R 21773523 3' + Max-element 8527 2 67.33 GCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGTAATTTAATTCACGTGAAAACTGCAC:1 + chrX 22711699 3' - transib2 9 1 70.30 GCAGACGTTTTGGTACAGACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCCTTCCATAAGGTTTGAATTTCCTGCATGGTTTTATACTCGTAAGCT:1 - chr2L 16656763 3' - Tc1-2 1316 1 76.24 ACCTAATGATATTATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTA:1 - chr3R 31887774 3' + HB 1541 1 55.45 AGGGGTGGTGAATTGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCTCTTTCATGATTTGTTGGTACAAGAAGGTTCGTTGGGTTATGTTACATAAGGTGTTCTGAAG:1 - chrX 12642503 3' - ZAM 13 2 80.20 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAG:1 + chrX 3305198 3' - transib2 42 1 66.34 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATA:1 + chr3L 19377782 3' + roo 395 1 60.87 AAATTTGAAACATATGTATAAAAAAGGATGGCATGATTTTTCTTTTGGTGCCTTAAGGACACCATGACTTGTTTCGGTTTTTGTTTATTTGTTTAATTAAT:1 + chr3R 18462277 3' - copia 4666 1 71.29 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATC:1 - chr3R 4834270 3' + mdg1 7412 2 74.26 ATTCGNGTTCATGTGTGAACAGTTTGCGAATAAATTTAATAACGTGAATAATGCCACTAAAAATAATTCACAAAAACCCAAAGAGCCGCGGCATACTGGCA:1 - chr3R 17853293 3' - roo 8664 1 77.23 AATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACATATATTTAGTAATCCATGGTGGAAATATATTTTAAAGGATGCC:1 - chr3R 10240091 3' - invader4 31 2 65.35 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGGGAGCGCTCGCTCTCTTTACAA:1 + chrX 13640715 3' + P-element 2880 2 70.83 TGTTATTTTTTTTCTTTTTTTTTTCATTTACCCAGGAAGCAGTTCACGATACTCAAAAATGCAAGGGCGCCAATTCGAAAACACGTTTTGCGAACCACTTG:1 + chr2R 23614515 3' - gypsy7 5008 1 84.16 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGTTTGTTTGTAGCGAGTTGGTCATTCGATAATTCTACAATTTTCTTACT:1 - chr2L 513639 3' - roo 6 2 70.30 CACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGG:1 + chr2R 13644503 3' - Burdock 28 2 56.44 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCA:1 + chr3R 24760615 3' - pogo 36 1 72.28 TTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTTTTTATCTTTTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGATGAGCAAGTGTATCCCTGCAGGCGACCACTGGCTGC:1 - chr2L 2915249 3' - TAHRE 10430 2 51.49 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTTTCTTTTAGCTTACCAGTCGACGTCAAAAGAATTGGGGAATATTGGGAAGCTTT:1 - chrX 22659766 3' + 412 471 2 54.46 GACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGTCGAGTTGCGGGCAAGAAAGACACAAGCTTTTTAAAGCACCGAAA:1 - chrX 21213408 3' - opus 7190 4 59.09 ATACATTCTTGATCAGGATCAATATCTGACCATGTCCGTCAATAATTTTGAATTATTTATTTTTATTGTTTTTTTCTCCCAATTTCTACCGATATTCCAAA:1 + chrX 15903308 3' + INE-1 82 1 82.18 AGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGATTGGGTTTATTTGGCTGACTGGGTCACGTGTCGCCATTTCATGCTCTAAGTAG:1 + chrX 8769182 3' - roo 392 2 58.42 TTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATG:1 - chr2R 1320698 3' + diver2 4862 2 55.45 TGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAAAATAAAAAGTTGTTAGTCGATAATTTGGGTCGGCTAAAATTTCTCCATTCCAGTTGCA:1 + chr2L 6999325 3' + Ivk 5364 1 48.96 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAG:1 + chr2L 20133044 3' + flea 209 2 79.59 CATAGCTCGGAGCCATAGGTCCATATGGGTTTTAAAACGGAGTTATATAAGAGGACTTTGTACTCTAAGCTTAGGGGATCGTTTATTGCAAGATTAGAGTT:1 + chr3R 30105402 3' - Doc3-element 4322 1 80.20 CAAAAAAATGGAAAAATAAGGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCTTCGTGAATACTTTTGAGAC:1 - chr3R 22234710 3' - pogo 53 1 80.20 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATTAATTTGGGATTGAAATATTTCCTTGGATGTGCACTTCTCTAGC:1 + chr2R 7868969 3' - roo 27 2 55.00 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGTCAG:1 + chr3R 4601394 3' + opus 7481 2 59.41 TACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAGCAGACCGCAA:1 + chr2L 19019012 3' + hobo 2905 1 62.38 GCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATAAGTGGATACATACATTTTTCGTAAGT:1 + chr3R 21265633 3' + Ivk 5330 1 76.24 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTGAAAGGCAATGGCGAATGCAGCTGGC:1 + chr2L 15510483 3' + jockey 4982 1 67.33 TATTTACTTATTTATATACATATAATATATTAAACAATTGTTGGAGGTCAAAGATATTATATCTTAAATATGTTGAGTACATTACTGGTTTGAAGACAACT:1 + chr3R 7410538 3' - 1731 4418 1 46.53 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTG:1 - chr3R 13582246 3' - BS 5049 1 77.23 AGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATGCTTACAATAACATCATTAAGAAGCGATCCATTCCGGTTCG:1 + chrX 21939118 3' - springer 7171 2 59.41 TCTTGGCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAACTTCTTTTCAAATAGAATCTCTTTATTAATATATCATTTTAAAAC:1 - chr2L 10746626 3' - pogo 26 1 55.45 CCTGTGAAATCCATTCGGACTCCACCCTTTTACAACCGCTGGTTTATTTTGGACTTTGGGGCTACCTGACAAAATATTTGCATAAAAATCCATACACACAC:1 + chr2R 19539500 3' - Circe 7179 1 63.37 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAAT:1 - chrX 16995122 3' - jockey 56 1 75.25 ATATGNGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAATAGGTTAAATAA:1 - chr2R 3591966 3' - Quasimodo 13 2 66.34 AAAATGTAAATTAAAATTTTAATAAAATTTCAAATAAAACACATTAACACATTAATTGTTTAAACAGATTTTTGATGCTTATATGATCGCTTTAAGTACAT:2 - chr2L 7579207 3' + 1360 3047 1 44.55 TTCAANTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTCTATAGAAGTGACTACTGGAGAGCCTCTCCAC:1 - chr2R 10945335 3' + transib2 2783 1 64.00 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTATGTGTAGCACACTTTTAGGCGAGGCCTTTGTC:1 + chr2L 1625742 3' - hobo 2 1 77.23 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCG:1 - chr3R 443018 3' + 1360 3341 1 78.57 ATTGTNATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAAATAT:1 + chr2R 13650190 3' - mdg1 18 2 61.39 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAGACATTTGACAGCGCGAGTTCAATAGCTAA:1 + chr2L 12441560 3' - transib2 39 1 65.35 AAGCTAAAAAAAAAAATAAAAACAAAAACAAAAACAAAGCACTCAAAACCGCAAATGAGGCA:1 - chr2R 17101835 3' + TAHRE 10442 2 75.81 GAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTC:1 - chr3L 25232771 3' + accord2 204 1 65.15 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGA:1 - chr3L 2019657 3' - 412 7086 2 58.42 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTT:1 + chr2L 14579912 3' + copia 230 1 52.48 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCC:2 - 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P-element 19 1 58.42 AAATTACCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCACCTC:1 - chr4 1301733 3' - 1731 26 2 44.55 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCATATCCTTTATTGTCGCT:1 + chr2L 15808060 3' - I-element 11 1 65.35 AAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGTCCTGTCTCTTTCTCGCGGTGGTCAGTGAACCGTTGAACGAA:1 - chr3L 16639141 3' + Doc 4279 1 58.42 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGGATTCAATTGAGTGAACTCAACCAGATTTACACTTGCCTCTGGAAATGTCGCAAAAGCCGCCAGCG:1 - chr2R 21074815 3' + jockey 4979 1 71.29 TTCAANTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGAGATTGAGGAGAGGCTTTTCGCCGAAGGGAAAAATAAATAGAAAATTCCCAGTCAGTTTTCCACATGACC:1 + chr2R 20688799 3' - McClintock 268 2 62.38 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGAGTATGTGTG:1 + chr3L 11661766 3' - hopper 39 1 67.42 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATTAAT:1 - chr3R 23591419 3' - pogo 34 1 64.36 ACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACTAATTGCACATGTTCACATGGGTAAATTGGTTTATATGTT:1 - chr2R 23581274 3' + P-element 13 1 40.59 GGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTGTAAAACAATTACAGCTCAACAACACCAAAAAATGCGGAGAAAAAACAAAGAAAATCTG:1 + chr3L 10408795 3' + Stalker4 7336 4 69.07 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACAC:1 - chr3L 10013595 3' - hopper 52 1 77.23 AGGCANGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAGTCATCACAAAAAAAAAAATTTATTTTCC:1 + chrX 15906231 3' - I-element 17 1 58.42 GTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACAATACGACCATGGATATTCGATATCGTTTCGGCCAGCCAAACATCTTACCTAACTTGGCCGGATT:1 - chr2R 14217710 3' + Tc1 1632 1 67.33 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAA:1 + chr3R 15072631 3' + pogo 2053 1 76.24 TGGTGTTACTACTAGTTGTCACTGAGCGAAGTACATTGGTTATACGGATATATTTGTGTAAGCTTTTTGCCATTTCATATATAGAACAGAACATGGCAGAA:1 - chr2R 20568486 3' - 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chr3L 7509304 3' + G3 4507 1 68.32 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGG:1 + chr3R 26321676 3' - blood 41 2 67.33 TTAGTTTATTATCTTTTATAAAATACGTTTAAATATTAAAGAAAATTGTACTTTTAGTATATAATCTCAACACTTTATAATTTAGTGAGCGCCACATACTA:1 + chr2R 18228754 3' + INE-1 418 1 77.23 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGAAAAATAAGAGCGCGTGCCAATGAACTCTGTGGTCAAAAGGAAAAGAAACCGAGTCAGATACATTTAAT:1 - chr3L 16761228 3' - roo 8666 2 74.49 ATTTAAATTTGATTTTATTTCATGAAAATTGAGTTTCGTTGCGGGGTTGTGTTTTTGTGCAAACGCTTTGGGAATTTTAATTTTGGATTTCTTTCAGGAAA:1 - chr3R 27977286 3' - HeT-A 325 1 59.41 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTCGGACGTTGTATGCACCATTATTATCCGATCTTCAT:1 - chr3R 19449164 3' + roo 9016 2 64.36 GGGTGATGTGGTCTTCGTCTGCGATCCTGCCTTGGCCTCAGCCGCAGATTTGCCACTTTTCGATTTCCTCCAACGGACCCGAGTGTTACGCATGCGAATTT:1 + chr3R 17785208 3' + aurora-element 3836 1 70.30 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTAGCAGTCGCAGGTGTTGCGGCGCTCCATTTCAGTGGTGTTTATGACACAAAGT:1 - chrX 10561789 3' + hobo 2935 1 69.88 AAGGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGAATTCGGTTCTAGCTCGTTGGCATTGAGTGTGGTGTTGCGGTTGCCCCAAAGTTGCTTAAAGTTTTGCCACT:1 + chr3L 5062983 3' - 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F-element 4284 1 58.42 TATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAGTATGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATTGTCGGATATGAGCTGCATAAGTGTGTGTGGGCATTTCTGAG:1 - chr3R 17928923 3' - hobo 2711 1 78.00 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTC:1 + chr2L 13136803 3' + roo 9042 1 57.43 AATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGGCGTTGGGAATGCCATGTGGCAGTTTGGCAAAACTTTACGGGCAAACTTGT:1 + chr2R 10772326 3' + copia 105 2 54.46 GCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGTCGCTGTCCCTTGTGTATGGATGTTGACGGCGGTAAGACGACAGCGTCG:1 - chr3L 7242630 3' - HMS-Beagle 115 2 55.45 CTTATTTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCATATCCTTTATT:1 + chr2L 15808054 3' - I-element 9 1 64.52 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAAC:1 - chr3R 19989264 3' + hobo 2900 1 64.36 CCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACACATGATAGTTAAAGC:1 - chr3R 19132249 3' - Ivk 9 1 70.30 AAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGA:1 + chr2L 18279964 3' + gypsy5 7316 2 57.00 AGTTGCCGTCTTCCCAGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAA:1 - chr2L 4160146 3' - Tirant 55 2 76.24 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAG:1 - chr3L 18337638 3' + Juan 4195 1 61.39 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTAATTACATGTCATGAGTATTAATTTTCCCACCGCAATTTCCATCGG:1 + chrX 8963298 3' + flea 5008 2 55.45 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTTACAGTTAGCAAAAGGCAATTCAAATCCTTTTACTTCCGCTTT:1 + chr3L 4801567 3' + roo 9040 1 58.06 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAGTAATTTTCACTCATACT:1 + chr3L 11661814 3' + hopper 1410 2 71.29 TAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGAATAATAAAGAAAAAGCTTTTCGCTGACTGACCCAAATTCGACGAACACACTTAGAAATTGTCTATGAGA:1 + chr3R 18443126 3' - Circe 425 17 55.79 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGAC:1 - 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Juan 4080 1 79.21 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGCTAGTAGAC:1 - chr2L 16674852 3' + roo 385 2 58.76 TAATGAAAAAAGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGTGGGACACCGGATGTGACTCAGAGTAATATAAATATAACAACCAAGAATGCAGAAAAAGCTTGT:1 - chr2L 19682840 3' - Q-element 507 2 63.00 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGCTTTTGATCTTTTTTTATGAGATCTAAGTATGGCAATTTTACTCGAAGGTGCTAAGTTGTGGATGGCGAGGA:1 - chr2L 12481556 3' - FB 5 1 66.34 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTGTATAGTTCGCAGCAAAATGGCCTATTGCACCTTTTGACCTTTTTGCACCTTCGGGCGTAAG:1 - chr2R 8158851 3' - pogo 8 1 71.29 GTAGGNTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCA:1 - chr3L 13589448 3' - hobo 28 1 55.43 ACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGT:3 - chrX 8972392 3' - 1360 45 1 70.30 TTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAA:1 + chr2R 19209426 3' - jockey 4816 1 82.00 CAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAACTAAGAAAGAGAGCGATAGAGCGAAAGGACAGAAACGAAGAGATGCGAAGGGGCTGCCGCCTGTGCGCTCAA:1 + chr2R 14720327 3' + P-element 2659 1 71.29 TTTAGTTTTACTTTATTTTTCCACACACAGAAAATTTTTTGGTATAGCAATTTAACATTGCCGCCGCGTCATCAAGGTCCTGATTTCTACTCCTGCTCTCC:1 + chrX 4767613 3' - 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chr3L 16236618 3' - Cr1a 4223 1 70.30 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATAAAAATGTCAGCA:1 - chr3L 13589418 3' - hobo 7 1 72.28 ATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGTCTGCCTGCCGTTGAC:1 + chr2L 14579937 3' + copia 255 1 77.23 CAAACGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGCATCAGCATAAAATATGGTAATCTTCAAGTTGGGTTTTAATATTCGCTCGCAT:1 - chr2L 20132980 3' - flea 20 2 57.43 AGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTA:1 + chr2R 5531200 3' - 1360 61 1 64.36 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTTCACACCATAATCATAAAAGGTACAATCATAATTATTATTTTTATGTCCCTGCCACTTATTG:1 - chr2L 1233154 3' - hobo 14 1 63.37 TGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCC:1 - chr3R 17495754 3' - Quasimodo 26 2 65.35 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCACCACCGAGTATGAAATATTCGAGGCATTTTCC:1 + chr2L 1839281 3' - 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F-element 375 1 61.39 CAAAAATAAAATAAAGGAAAAATCGCTGGCGACACAGTGAACCAATGACTCCTAACGATCGAGGGTAAACAAAAGAAATAATGAACAAAAACCCTGGGACA:1 + chrX 12213478 3' - Circe 6971 1 64.36 GCTGGCCTTTCTCTGAGGTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATTGAGAGTAGTTTTTGATGCCTCAGCA:1 + chr3R 19445253 3' - roo 482 1 72.28 GGGTATCTGATAGTCGGGGAAGTCGACTATAGCATTCTCCCTACTTAACTGAAAGTGTCAACGAGAAATTTCAATATTACTCTACGAGTAACGGGTATATA:1 - chrX 17167421 3' + INE-1 556 1 60.40 TTTGTTTTTTTTTTAATATTTGATTGTATTTTATTGATATTTTTACCTCATTGATTATTTTCTGATTCCAACTCGCTT:1 - chr3L 8576112 3' - Rt1b 5147 1 51.28 GGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGA:1 + chr3L 25232910 3' - GATE 8268 2 52.48 AAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATAGAGTGTCTTTTGTCCTTTTGTCTGCGTTTAGTGGCAGCGGGGATTATTATAATTGTGTAAGCTATTTAAGCATGATAA:1 + chr3R 28778066 3' - blood 7178 2 60.40 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATGGAAATTCTAAACAAATCGTCTGATCCCGATCAGAATAGTTGACTATTTCTATCCATGCGAT:1 - chr2R 966134 3' + I-element 5344 1 76.24 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGATTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATT:1 + chr2R 10774092 3' - 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copia 46 2 69.31 GTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAAATGAACAGAAACTTCCCCCGGAACCAGAGATCGAATTGGAGGCCAAAAA:1 + chr2L 15027984 3' + invader3 248 2 57.43 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACCACGTGCCTATTTAATTCA:2 - chr2R 1365294 3' - jockey 10 1 75.25 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGACAATTCCCAAACTCGAGCTGTGTGCAGCT:2 + chr3R 19446252 3' + 297 6972 2 76.24 GTATGAAGTTTATTGTCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGCTATGTTACTTCCTATAAAACATACCTGATAATGTTGTGATTGAGTTTACAAGTGAATC:1 - chr2R 13296086 3' - Tirant 257 2 54.46 TACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCACTAATAGGAAGCACAAGTCCTGGGCATGTACCAAGCATGAAAGATCTACTCGAACATTCAGATCCGAATCGCCA:1 + chrX 21380477 3' - baggins 5276 1 76.77 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGATGTTTCTTGCGCTTCAAAAGCC:1 - chr3R 8458210 3' - HMS-Beagle 6818 2 57.43 CAATTATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGAACCTCGTGCTTCTGTTGCTATTATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTCTTGTTGCTGGTGATTTCCACA:1 + chr2R 14714459 3' + 1360 453 1 66.34 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAAGTCAGTAGATCGTT:1 - chr3R 4600062 3' + HMS-Beagle2 275 4 66.34 AGGGTNTGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGAGTGAGAAATTAAAGGCCACAAGAGCCAAGCACTACATGGTCATAATTAATTG:1 + chr3L 12018264 3' - Transpac 4 2 58.42 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGATTGATGTA:1 + chr4 311610 3' + 1360 3381 2 71.29 GGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGAATTAATTGAGTGGGTTTTTTTTGTGTAGTGCGTGGTGTGCAAAAAGAATTTAACTGAATTGAACAGAACT:1 - chrY 1076849 3' - F-element 365 1 75.51 TTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTGACAATTTTTTCAGCTTCCTATACAAATGCTGGTGGTGGCGGGGGATTCTGGTTCCG:1 + chr3R 8885579 3' - 1360 2959 1 55.45 GGACCTTGTACCCGAGCGGGCCGTGCGCAATGTCAGCACCACACACATCAATATCGAATTAAACACCTGCCAGTGCGAATCGCTTTTAATCAATTACCCAT:1 + chr3R 20490032 3' + gypsy8 286 1 75.25 GAACACGATTACACCGGTGTTTCGCAGGCAACAAATTCTCAATCTTTTCCTTTTTCCCAATTTTACTTCTTTGTTTTGTTGTTGTTTTACCCTACATTATT:1 - chr3L 26376913 3' + Gypsy12A_LTR 1980 1 55.45 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACGAGTTTCGTCTCTTG:1 - chr2R 24628754 3' + mdg1 7432 2 54.46 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGG:1 - chr3R 16400148 3' + blood 350 2 51.49 ACATTTGGTCAATCGAGCCTTTCCAACTCTTTTCCCCCTCCCAACCCAGCGAAAAAGGAGAGGTTTGTGCCCCATATAGTTATAACAACCAGTAATTAGGC:1 - chr2L 13136340 3' + roo 427 1 78.22 AGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCAAATTATTAGATACTTGTTCCAGTATTTGATTCGTTGCGCTGGTGGCAGTCAGATAAGAAAAGTCAGC:1 - chr2L 12988322 3' + mdg1 140 2 71.29 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTATTTCAGCAAAGACGCG:1 - chrX 8491402 3' - P-element 30 1 51.49 AGACACTAGAATAACAGGAGGCGTAATGCCCATACATCGACACGGAGAGAAATCATAATCTGCCCAGAATCTGTAAGTTGCACAATCATGATGTATTTAAT:1 + chr2L 18742040 3' + 1360 4 2 56.44 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACTATTTTGGAGTTCTACGTACTGACCGGCAAATTCAACATGAACTAAACGCATAGTACAACTTTTT:2 - chr3R 16245016 3' + 1360 3381 2 71.29 TATAGTGGAGTTCCCCGACTATTGGATACCCGTTACTTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTGTAGGTGAAAGATGGGCGTGGCCACAGTGTTTTTGGTAT:1 + chr4 976486 3' - INE-1 565 1 56.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTA:1 - chr2R 9871003 3' + roo 9021 2 76.24 GGGGGGGGGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCACTACGATTTGTTTGTTGATTGCCAAACCGATTGAAACGCAAACGTGTGGAATCTGCTTGAT:1 - chr3L 15980685 3' - accord2 212 1 64.36 TTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTAATTTTT:1 + chr2L 13464907 3' - hopper 96 1 72.28 TTAACAATTAATATTGTATATTTTATAATTCTAAATAATAATCAAATGAGTAGTTATGTTTGAAGATTGAAAATATTTGACAAATGTTTACCTAATGGTCT:1 + chrX 13099263 3' - Tc3 258 1 73.27 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAA:1 + chr3R 27981731 3' + roo 9041 1 58.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAAT:1 + chr2L 12324085 3' - roo 48 2 73.27 CACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGG:1 - chr2L 12815031 3' + hopper 1396 1 58.76 CTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCCTGCGTATATCCTGATTTTTCGTGACCACGCCTTCAGCTCAGCATGGCCACCAAAAACAAAAAGTTTTTCCAG:1 + chr3L 4632813 3' + hopper 1322 1 80.20 AAAATGTATAAATATGTATATAGTTCTGTGACAGCTTAACTTATATTTTATGGTCTGTCCTATGTCCTATATGTGCGTCGCGCACTGTGCTAGAAACCTT:1 - chrX 5856027 3' + G3 4504 1 52.00 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATAT:2 + chrX 3305191 3' - transib2 49 1 73.27 ATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGTTACGCCTGGGATAAACACTCGAATTTAAGAACATCAAATAGCATTTAAATAAA:1 + chrX 7568867 3' - HMS-Beagle 6725 1 56.44 AACAACACACAATTATCGGAAAACGTGTATTTACGAATAATTTACATACTCTGACTTGTAATCAGCTTTAAAATTCCTTTCAGACCCCCAAAATTACGCTA:1 - chr2L 10768873 3' - transib4 316 1 58.42 TATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACATTTTATTATTATACTTTTCTTTAGTTTTAT:1 - chr3L 3685390 3' + Bica 94 1 74.26 CGTCCCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAGACTTAAATGTTTACCACACGTATATATATTTATATTATTTCAAG:1 - chr2R 14708946 3' - Doc 14 1 71.29 ATAGTTAAAGGTACAAACTGACGTTTTGAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAACTTTTCGCAAAAATTCATCTAAAACTGCACACACACATACACACACG:1 - chrX 568872 3' - transib2 453 1 53.47 AAATAATAAAAAAAAAGAATAAAATTCCTAATAATGAAATAGTTGATCCAATAGTTGATACAATATTTCATGTTGTGTAAGCCATCCAGGTGAAATCCTAC:1 + chr3L 18738283 3' + Rt1b 5148 2 28.71 TTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGT:1 + chr2R 2875209 3' + TLD2_LTR 120 1 67.33 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGG:1 - chr2L 21683413 3' + pogo 2057 1 71.29 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAG:1 - chrX 21668925 3' + mdg1 7450 2 69.31 CTGCGNTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCCTTTTGTTTTGCCAGCAACGCGAAATTTTCATTTAATGAAA:1 + chr2R 14778504 3' + mdg1 386 2 60.40 TTAGATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGATGTTGCGGCGTCTGTTTGTTTGTTT:1 + chr3R 19507966 3' - Idefix 304 2 74.00 CTAAAAAAAAATTATTTTGTTGAGCGTTTAGACTATAAGATACAGAGTTTCTTCTAACAGTACATTTAGTACATATACAATAGATATTGTCGCATACTTGA:1 - chrX 6154215 3' - gypsy11 3944 1 84.16 GCCACTACTTCCCCACCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTCTAGCCAGGCGACATTTGGCGAGGAATTTTATCAATG:1 - chr2R 17001705 3' + gypsy5 7034 2 63.37 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAGGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTT:1 - chr3R 27156662 3' - pogo 52 1 80.20 AAGAAGATTATTAAAAAACACGGCAGGTTTGACAAACACAAAATAAAAATCAAACGGCAAATTTAATTATTATCACTTCATAATCATCATCAATTGAAGAG:1 + chr3L 13721965 3' - Cr1a 69 1 58.42 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTTTAGTATT:2 - chrX 20620539 3' - pogo 37 1 68.32 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATA:1 - chr2R 9871009 3' + roo 351 2 80.20 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAG:1 - chr3R 23275275 3' + roo 9022 2 76.24 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAAGAATATGAAAATACCATTGATAAAA:1 - chr2R 4547750 3' + HMS-Beagle 225 2 58.42 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATCTGTCATTCGAAACAACCAATGGTAAAGAATATGTTTATAATA:1 - chr2L 13136709 3' - roo 9 2 70.30 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGGTTTTCGTAAGTCGTCG:1 + chr3R 26842875 3' + opus 471 2 62.38 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACCATTT:1 - chr3L 13548813 3' - hobo 51 1 72.28 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCCTTGAAATCATAGCCACTCTGGCTCGCTTC:1 - chr3R 13538941 3' - hobo 43 1 70.71 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATTAGAACCAATTAAAGTAGGAAATTATTTAAAATTGGATTTTACAAAATGTAAATTCTACGAATTGAAT:1 + chr2L 10793243 3' - I-element 9 1 68.32 TTATTAATATATTACAAACAAATAAATCGAAGCTCAGCGACCGTGGCTGCGGCCTGCGCGTCTTTGTGTGTGTGTTGGTGTTCATTTTTTGGATAATTGGA:1 + chr3R 9992152 3' + Doc2-element 80 1 76.24 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTG:1 - chrX 17968366 3' - Tirant 37 2 64.36 AAATCTAATTTGCAAAGCGAACGCTTAGCAAACCTTTGGCTTAATTATGTAGGAAAAATACTCTGTTGTACTATATACACTTTAAGTCGCTTGGTTGAAAT:1 - chr2R 13537603 3' - Quasimodo 7250 2 63.37 TGTGTAGGCGTGGTGGTTTAGAGGGAGGGGCGAACGACATGTAAATATAGATCCCCAGTGGAGTGGGCGGGAAATGGGGCAGAGTTGAGTTTTCCACGGAG:1 - chr3L 4343917 3' - ZAM 8000 2 72.28 GGAACNATAAAAGTTAGAAGGTTAAGATTCAGTATACAGATTCTAAGGCAAGGCGCAGCGCAAGCTTGTTGAAAGAAATATTACTCATCAACAACGCAGTA:1 + chr2R 4313059 3' + INE-1 157 1 70.30 TTCCTCTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAA:1 + chrX 18836992 3' + P-element 2826 1 21.78 AGCGAGAGAGCTGAGAGCGCTACAGCGAAAAGCTCTTTTCTACACATAAAGTGATAGCATACGTGTGCAAGTTATCCAACCCATAAAAATAGCA:1 + chr2R 611194 3' + 1360 110 1 68.09 AGTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTTGGG:1 + chr2R 10517894 3' - HMS-Beagle2 489 3 88.89 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTTTAGTTTCACTTGTCGCCCAGCTTGGTCCACTTGCTGCGCAGGAAGGCGACGTAGCTCTGGGCCGGAGCT:1 - chr2R 18399043 3' + S-element 1713 2 76.24 TGTATGGCTCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGGAGGCTGAAGTGAAATGCCTGA:1 - chrX 22903451 3' - gypsy5 7166 2 70.27 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTC:1 + chr2L 7255802 3' + P-element 2849 1 40.40 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATCAG:1 + chr2R 7861724 3' - roo 41 2 72.28 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAA:1 + chrX 11730326 3' - jockey 4794 1 63.37 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGC:1 - chr3R 23591428 3' - pogo 43 1 73.27 TTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATATTAAATCTATTTTAGTATACAAGAATATACCATATATATTTT:1 - chr3R 25830639 3' + P-element 2594 1 49.50 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTATTATAAAAATGATTGCCACTTAGATTGCGACTAAC:1 - 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Stalker2 45 2 68.32 TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAAAGTAGACA:1 - chr3R 17495733 3' - Quasimodo 5 2 75.25 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAATAAAATAAAAACGCTTACACAAACACCTCTAGTTTTAGTCAGTTTTAGTACTTTAAAAGTCAA:1 - chr3R 18210313 3' + Juan 4195 1 56.44 TTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGTTGGCATTGTGAAATCTTTAATCACAGGACTTTCCTCTTGGGCGTTGCATAC:1 - chr3L 17592063 3' + F-element 4311 1 56.44 GTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATA:1 - chr2L 18177042 3' + INE-1 543 1 68.32 AGGCACATGCACCATATGCTCACTTGTTGTTATGCTCGTGAAGACAGCCATGTGTAACTTAACTCAAGGGGAGATCTGCATTTTCTGTAGCACAATTCACC:1 - chr2L 22180498 3' + R1A1-element 5244 1 66.34 GACTAGGACACACAAACATAACCCATGACAACACACAGCCCCACACCGAAATTCGCTTAAGGCGCGCCATTGGGTGTTTGTTGTTACCCATTGCATTCTGG:1 - chr3L 6453990 3' + I-element 4951 1 59.41 GTATACACATGTATATGTATAACGTATGGACATCGGGAGGCAGGTGGTGGAGTGGCTGCTGCTTTATTTTACAGATTGTGGGCTCATCAGATAGGGC:1 - 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chr2L 19018928 3' - hobo 7 1 67.71 TTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCATATCCTTTATTGTCGCTCAGTACCATA:1 + chr2L 15808070 3' - I-element 1 1 75.25 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGCATGTATGTATAAATCTTTTTAAGCTGAAAATAACGCACAGTGATTCAGTTTGTGGCATTTTACTTTC:1 - chr3R 4601290 3' - opus 10 2 69.31 CGAATCAATACGGTGTTTTGCGTCGCGGGCGGCGGCACTAACTATATGCTACGGCCATACCATACCATATGCGGTTGCCCATAAAGGAAATGAAAAAGAGA:1 + chr2R 15901053 3' + hobo 152 1 76.24 CAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGGTGTAGAGTTAGTGTGTCACTTCGTACTATCAAAATGCAACTGACAATGCGTCGCAAAAACTTCTTTTACCTAA:1 + chr3L 27391154 3' - invader4 104 2 74.26 TAAACATGTGAAAATACTATGGCCCTGTTGTTATTGCATTTTCATTGTTTGTTATTTACTTTGGCAGCTTTGCGCAAATTGCAGTAATTTGTTGCTGTTTT:1 + chr3R 27399541 3' + Bari1 1498 1 49.50 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGTGGTTTGTAGGCGTTAGAGTCGGGCTAAAAGAAATTATATCACTGCCCGAATCCGTTTTTAGAAAT:1 + chr3L 22999129 3' - INE-1 255 1 57.43 GTAGGGACGATAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGGGGAGTGGAACATGAGCAATGCAAATCCTTTAGACAAAGAATCAATTTGCCAATTGTG:1 - 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P-element 485 1 20.79 TCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCGGCGACCCCCACCTCCAGCAAGAAATCAGTGAAGAAATCCAAG:1 + chr3R 30053395 3' - flea 4961 2 56.12 TGCCANACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGACTGCAGCGAGGGATCCCCACTGGGCGCACAATTTAGATGCG:1 - chr2R 11472059 3' + Gypsy6A_LTR 252 1 80.20 AAATAAGAAAAAATATTAAAATTGTTCAAAAGTATGGGCTGACCGGTTTGGCGGCTTTATAAAGCAGCCAGTGCTAGCCGTGATCTCTTTTTGTT:1 - chr2R 4640119 3' - INE-1 470 1 82.11 CTATGTTTATATTTATGTTTATGCAAGCAATAAGGTCCAGGGCGGCTTTGCGGTAAACACATGAAAAAACTTTCTATCCGAATCCCACACACATGAGTGGC:1 - chr3L 21766143 3' + 412 74 2 60.40 ATTGCTCAAAACCTTGTAATTTATAATACACAGCCACAAAGTGTGTTGCAAACACGTCCTGCAGAGA:1 - chr2L 2074911 3' + roo 8790 2 67.16 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGCCATATAAATAATTTCCTAGTATTTAT:1 - chr2R 4854973 3' + opus 7483 2 61.39 TTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTATCTGGGTATCTGCGTATCCTGGCGCACGCACACACACACCCACGCTCGGCCAGTGACTGACTG:1 - chr3R 24663294 3' - I-element 192 1 75.25 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCACAGAGTTGCATTT:1 - chr2L 16201485 3' - hobo 8 1 71.00 ATATTNCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTT:1 + chrX 5092978 3' + roo 360 2 69.31 GCCCCCTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATAATAATAATAATAACAATACTAACAAAAACATAAGCATCACCATCACCATCGACATC:1 - chr3R 9485790 3' - copia 4847 1 64.36 ACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAACTATATTCGTAGCACATTATTAGTAATA:1 + chr3R 19346991 3' - blood 4 2 75.25 CAAAATTATATTATTAAAAAAAAAATCATTCCTTAAAAATCCGCTTATAATTACATTAGCTATTGCTCGTAGCTGTACAAAAACAATTAACAGGGTAATGA:1 + chr2L 8992477 3' - hopper 164 1 88.12 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAA:1 + chr3R 10147883 3' + roo 9026 1 71.29 GGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACGTTTTAGCAATGCTCTTCAATCTATTTTTGTATTTTTCTATTTAAGGCTAGTTAG:1 + chr2R 15473837 3' + roo 8776 2 54.46 AATTTAAAATAATTTTAAAAAAATATTATTTTTTTAATAATTAAACAATAACAACTTTAATTGCCGCCCGGCGTTAATGATTGAAAACGGAGTCCGGGGAA:1 + chrX 9710636 3' - 1360 3092 1 65.35 ACCACNTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATTTCAAGCGGAACAGTTGGCGCACTTTCCACCTAGTAATTGCAAC:1 + chr3R 11999320 3' + P-element 2884 2 74.74 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAAT:1 + chr2R 24021625 3' + pogo 2053 1 78.22 TCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCACGGCAGGAAGGGCTCTGGGCACG:1 + chr2L 13217406 3' - opus 263 2 66.07 CTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACC:1 - chr3R 12047410 3' + Stalker2 7622 2 49.50 AAACCGGATCAAAATAATTCGCGACAAAAGAAAATAACGGTGAAATCGTTTTCTATAAACATATAAACCAAAACAACAAAAACGCAAAACAAAAAATAAAA:1 + chr2L 7508748 3' + gypsy9 365 1 47.52 TTTGACTAAAAACATGATCTCTGATGCCAAATAATACTCTTTCCCCAATATGATCAGTTTGGAATAGTTTATTGAACCCCTATTGGGTTGACAATTTCTCT:1 + chr2R 22268765 3' + Tc1 397 1 66.34 AGAGCTCTACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAATGGCAACCACACCAATGGCAATGATCACGAGACATCCATCAAGC:1 + chrX 4077991 3' - R1A1-element 282 1 58.42 GCCGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTCGTATGGGAAGAATTTTTTTACTCAATTAACATTATTCAATTTATATTGTTTTTTTTTGCTTTGTTTATT:1 + chrX 12725386 3' - hobo 2729 1 50.50 GCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCAAAGGAGATTCTTGGAGATTCACCCTAAGATTGGATTGTCCT:1 - chr3L 9359398 3' - Doc 4545 1 58.42 GTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCGGCATCAAATTTCCA:1 - chr2L 17646150 3' - flea 10 2 69.31 CTATTGAACCTAATCAAGAATAGATATACTTTCGTTGATAGTCGGAAACGATTCCATCTGCCTGTTACATACTTTTCCACGAGTCTAGTATACCCTTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' - INE-1 85 1 83.17 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACA:1 + chr3R 24760619 3' - pogo 32 1 68.32 AGTATAAGACCACATATACTTACACACACACCCACTTTGAGGCCATCAAATAAATGCATAGTCAGCGTCACTGGCATCGCCGCCCTGCGAAATAGGCT:1 - chr2R 3593551 3' + Quasimodo 18 2 72.45 TAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATAGCCGGAAACTGTTTTTACCACGGAG:1 - chr2R 5840649 3' + Ivk 5332 1 74.26 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAATTATGGTATAGCGGTTTGTCTGCTG:1 + chr2L 513756 3' + roo 399 1 67.33 GAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGACGTTAGAAGGTAACGAG:1 - chr2R 1688215 3' + Idefix 7240 2 79.31 AAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTCAAGGGTTGTATGTACATAGGGTTATGGGTGAGCTCATAGTGCTCGTGTATC:1 + chr2L 16363633 3' + R1A1-element 5140 1 57.43 GATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCTGTCATCGTAGATGGGAAATGCATAACTCACGACGGAAT:1 + chr2L 2311592 3' + HMS-Beagle 449 1 66.34 TTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTAT:4 - chr2R 5582173 3' - Cr1a 447 1 61.39 TCTGTTAATAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCAAGCCTCCTTGAATCCTCGACCTCCTGCTCAGCCCACCTGGCACCCACCAGCACTTCCGTTC:1 - chr3L 22973215 3' - X-element 4448 1 61.39 GTTCGNCTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTATATAGGGTGGTCCTTTGCTGGCTGGGTGATAGGAAACTGGACACAACCTGTTGAGCA:1 + chr3L 5201572 3' + 297 383 2 67.33 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATGAACTTCTTTTCAAATAGAATCTCTTTATTAATATATCATTTTAAAA:1 - chr2L 10746627 3' - pogo 27 1 58.42 TAACATTTTTATAGTTTGCCTACTTATCACGTCTAAACACCTATTTAGACAACAGGTTTTCCTTTTTGGAAGAGTATTTGGATTTTCCCTACAAATGTGCT:1 - chr3L 15374442 3' - rooA 30 2 74.26 GGTTTTGGTGGCTAAGTAGTTTATTTGTGTGTATTTTGCTGCTTTTTTTTTAATAGTTTCGATGCTGGCCTTAAGATTAATGTTTCCCCGTA:1 + chr2L 3006743 3' - Porto1 4462 1 67.39 GGTAANAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCACAGAGTTGCATT:1 - chr2L 16201486 3' - hobo 10 1 69.31 AATTTCAATAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTATCCAGCTTGTTCCGCCAAAATGTCGCAATGTTTGTTCTTATCATTTGTATGTGGTTA:1 - chr2R 24399912 3' + 1360 377 1 53.47 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGT:1 - chr4 1156242 3' - blood 7050 2 71.29 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATG:2 - chr2L 8565464 3' + blood 338 2 64.36 ATTTAATATAGTTATTTTACAGTAAATATTTTCCTTTTTACTCTTTCTGTGCAGCGAAATAAACTGGCCCTATATTGTGGCGCGCTCGCGTGTGCATCACC:1 - chr2R 25120209 3' + Cr1a 4312 1 53.47 GTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTTAGTTGGAGAGAGTGGGTAGATTAAAACGTTCGTTTGGTTTCGCTACGGGTTA:1 - chr3L 3988804 3' - F-element 271 1 58.42 TTTTAATTTATTTATTTAAAGATTTAGATTTTGAGATGTTTATGTACATATATCTAAGCGCTACATTAACACCAGATACATATGTATTATATTATGTATTA:2 + chr3R 21860596 3' - G7 1144 1 66.34 GTTGTNGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGT:1 + chr3R 10277272 3' - Doc 57 1 72.28 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAAC:1 - chr3R 11999239 3' + P-element 2848 1 38.00 ATATATGTATATGTATAAATGTCTTCATCACAAGCAGCTTTTCCGAGAAATCGTAATCACACATTCACCTGCAATATTTGCACACAATTTTGCAAAACCCC:1 + chrX 10285169 3' + Stalker 7095 4 74.26 TACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAACG:1 - chr2L 2078450 3' - I-element 24 1 63.41 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCTGCTTCA:1 - chr2R 19551970 3' + roo 9054 2 61.39 CACGTTAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTCCCATTTAGCGATTT:1 + chrX 19426307 3' + mdg3 5473 2 53.47 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAAGCAACGCGCT:1 + chr2R 16940426 3' - 297 6585 2 76.24 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTC:2 - chr3R 10952272 3' + roo 9037 1 57.43 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCATGC:1 + chr2R 20744246 3' + roo 398 1 62.38 ATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCGCACTCACCGCGCCGCCAAAAGTTGAACTTACGCATGAAATCCCTGAGCCTGGACTCAC:1 + chr2R 15464512 3' - copia 5054 2 69.31 TGCGGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTATCTCTAAAATCTATATGATTCTATAGCCTATGCTGCCACCGATGCCGCCTGGTGCAGCTC:1 + chr3R 26015101 3' - X-element 4524 1 66.34 GGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGAGCAGACAGCCATCGAAGTTGAATGGAAATTTTTTGGCAAAGCATTTTCAA:1 + chr2R 19694593 3' - jockey 4763 1 52.48 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCGGCACCAGAATACGAGAGAGAGAGCACTTCCAGCGCATCCAGGCACA:1 + chr2R 10444310 3' - P-element 26 1 53.47 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCA:1 - chr2R 14778448 3' - mdg1 42 2 65.35 AAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTGA:1 + chr2L 2074789 3' + roo 9054 2 64.36 AACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCAAGATAGCCCATCCCTCTGCCCTAAACCTGGA:1 - chr3R 31402196 3' + F-element 4421 1 67.68 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGC:2 + chr2L 13574282 3' - pogo 26 1 51.49 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATG:1 + chr2L 22098089 3' + roo 9033 1 67.33 AAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTC:2 + chr2L 3440513 3' - Juan 22 1 61.39 TTCTTNTTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGCGCACACTGAGAGA:1 - chr3R 10952236 3' + roo 410 1 78.22 ATTATGGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATATATTTGAGATTTCTC:1 + chr2R 7032214 3' - mdg1 21 2 58.42 AAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAAACCATTTGACTTTGACTTTGAGGATTACATGAACTAGGTGTATCCATATTAAATATCTATT:1 + chr2L 17593509 3' - Tc3 314 2 64.36 GAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCATTCTATGCACGAGCCTCCTGGCCTTACAATTTACTT:1 + chrX 356065 3' + Doc 4468 1 64.36 ATCTTATCTTATCTTATAATAAACCACTACAGCGACTAGTGGCTAGAAATTTTAAATAACGCGGTCTAAAAGTATGCAACGATTGTTTTCTATCTGACTGT:1 + chrX 18051066 3' - Stalker3T 201 1 73.27 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAAAACGCCGGCGGGCCACAACAAATCAAAAACACGACTACCCAAAGTGGGCAAATGTGGGTG:1 + chrX 10561882 3' - hobo 15 1 64.36 ATACTCCTGGAGGAACCCCTCGAGCACGCTGAGCCCGCCGGAGGAAAATGAGAAAGTACGTGACTTGGTCTTGGAATATCGACTATTTGATGTTCTCCGA:1 - chr3L 7963420 3' + G7 108 1 68.00 CTGATTAACGGGTATCTGTTAGTCGGGAAACTGGATCATAGCATTCTCTATTTTTTGTTTTTTTTTGGGGGGGAGGCCAGAGCAAGTGACCCACGAAGATG:1 + chrX 8313192 3' + INE-1 547 1 68.32 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGG:1 + chr3R 12539561 3' - roo 8697 2 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAG:2 - chr3R 23275278 3' + roo 355 2 79.21 CAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTG:1 - chr3R 10952252 3' + roo 396 1 63.64 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCATTGACCAAATTTGTATATTTATGAACAAAAAA:1 + chr3L 12103847 3' - roo 29 2 66.29 GTGTGAAATATTAATAAGGCAACGATTGTTGATTCCTTGTGTCTGTGTCCGCACACTTAGACCACTCTCCAGTTATCGGCTACTTAAAATAAACAGTTTAA:1 + chr3R 27425847 3' + 1360 434 1 53.47 GGGGGTTTAGGGGGGGGGGAGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTAT:1 + chrX 2649913 3' - Tirant 8 2 73.00 CTGTTTTTTTCGTTTTTTTTTCGAACTATTTATAAAAATCTTTAAAACAGCTGATTCATTGATTATAGGCGCCATTTTCCTTATTTTCCTAGAACTGAAG:1 - chr3L 12365000 3' - Bari2 910 1 58.00 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCATTACTGCTTCGGCTGTACAATC:1 - chr3L 12103768 3' + roo 396 1 66.34 AACTCGCTTAGAGAAGTTTAATGGGTCTATGTGGAGATACAAGAACAAATTGAATTGCCGGGCTGTACGAATATTATTTTTATTTCAAAAACTAATTAAAT:1 + chr3R 22439053 3' - I-element 477 1 71.29 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCA:1 - chr3R 15072563 3' - pogo 20 1 56.44 GGCTGNATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAA:1 - chr2R 4606223 3' + 1360 3350 1 66.34 TTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTGGCTTTTCAGTGTAATTTACTAATTTCACCATAAATGCAAATGCGCATTTTTGCTGCGTTTCTACCT:1 - chrY 391598 3' + Doc 273 1 69.31 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGA:1 + chr2L 13319652 3' - hobo 25 1 52.48 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCGAGTAAAAATTTACATAGCATCCGTTTTGGGTCC:1 + chr2L 17311173 3' + S-element 1708 2 69.31 CCCTACCAATGACCACATTCCTTAAGAGTACGGTCTAGTGGCTGCTTGGTGCCCAATGTTCGAAGAAACATAAGCCGAGGAGTTTAGCGCCATTCGACTTT:1 - chr2L 13749971 3' - Gypsy12A_LTR 1945 1 76.24 ATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCCTACTCCTACTCCCGCTCATGCGAAGCCGAAACCTAGCTCTGGTGCCAACACTGCA:1 - chr3R 22739624 3' + mdg3 48 2 59.41 CATTTCTTTTTATTTTTTTTTTGCCCCTGAAATTCTGCGCAAAACTACAGAGAAGGGGAAGAAACTACTTTACGCTATGTTTTATTTACAAATGGAGGA:1 + chr2R 12550043 3' + hopper 142 2 41.41 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCACTGCAGCGGACGTGGCTTA:1 + chr3R 22800195 3' - flea 4788 2 59.41 CATTTTCCCTGAGTATGCCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGAATTAAACACCAAAATAACGCCATATAATCAAAAACCAGATACTAAAAAACGC:1 + chr2L 11968812 3' + Circe 162 1 64.36 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGCATCAGCATAAAATATGGTAATCTTCAAGTTGGGTTTTAATATTCGCTCGCATACTA:1 - chr2L 20132976 3' - flea 4773 2 61.39 GGGACCACCTTATGTTGTTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTCGTCCGGCAGGCGGCGTAGCGAGAAAACGTGTG:1 - chr2L 3632117 3' - P-element 6 2 76.24 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTCTGGCAAGGAATCGG:1 + chr2R 16988270 3' + opus 479 2 58.33 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAG:1 + chr3R 7360352 3' - jockey 27 1 59.26 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAG:1 + chr3R 11846267 3' - hobo 54 1 76.00 CAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTTGGGATTATTTTGTAAATGTATTAAGCTCCTATTTATTTCTTTTCTCCAAGATTTTCCTGG:1 - chr3L 23784844 3' + Quasimodo 244 2 61.39 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGATGGCGCTCAG:1 + chr3L 13477523 3' - P-element 17 1 60.20 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAATTTCCTATCACTAAGAGCTAGCTGAAAATGTTAGTGGACCATTAGAGTAAGG:1 + chrX 21056277 3' - FB 23 1 56.00 CGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAAGGAGAGAATCATCCAAGTCCGCTATTTCCAATGATCA:1 + chr3L 22934700 3' + Max-element 405 1 62.38 TATATACATATTTTCAACACTCCCTCTCAATGCAATATGTCTCTCTAATATATTTATCTGACTGCTATTTTTTGTCTGTTACATAATTCGATTCCCCTCTA:1 - chr3R 4281424 3' - Dm88 4358 1 63.37 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCC:1 - chrX 7045622 3' - jockey 4764 1 53.57 AAATATATGTATGTATACATATATATTGTTAAGTGTCTAGATGACCAATCGGCTAGATGGCCACATTCACAGCACAGGCAATCAGTAGTGATGAGAC:1 - chr2R 11673165 3' + 1731 4409 1 64.95 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACA:1 - chrX 16995103 3' - jockey 36 1 56.44 GGCCCTGCGCGTGTTAACTTATACAAGACAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTAAAACAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAACTGT:1 + chr2L 10405290 3' - gypsy4 6568 1 71.29 TCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCCAAAATATTCAGCCCTGTTCCATTTGCACAGCTGCTGCTTTTCCGAGGTGC:1 + chr2L 13575773 3' + pogo 101 1 57.43 ATAAAACAAAAAATAAAAAAAATAACCGGGCTGGCACTCTTTCTAATTTTTTTTTTT:1 - chrX 9502966 3' + Rt1a 5079 7 68.42 ATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATG:1 - chr3R 20147908 3' - 1360 301 1 78.22 GCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAAAATACATAAAAATCGGGAAATAATTAACCGTAAATACGGCTG:1 + chr2R 4557610 3' + HMS-Beagle 6951 2 58.42 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTT:1 + chr3L 18706939 3' + jockey 4959 1 52.48 GCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGT:1 - chr3L 6044754 3' - Tabor 47 2 68.32 GCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGA:1 + chr3R 11094549 3' - 3S18 55 2 77.00 AACCCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCCAA:1 - chr2R 7552255 3' + springer 336 2 71.29 TTAAATATTATTTATTTGAATTTTCCATATCTATCTATATCTATACCTATCAAGCGATATGAATCAGACTACCTACGAATCGAAAATCTATATACAAACAT:1 - chr3L 2140127 3' - TLD2_LTR 101 1 70.30 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTCGAATGTTGCGTATTTCTAAAATCATATTTACCAA:1 - chr3R 12605581 3' - F-element 27 1 67.33 ACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGACCTTACTCATGATAACTGATACACTGAAAAACAAAGTTGAACTAATTATTTATCTAAATGTAAACATTTA:1 + chr2L 17064163 3' - gypsy9 27 2 52.48 ATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTAT:2 - chrX 21564680 3' + diver 6071 2 68.32 TGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCATGGAAAAGGAAGAGCAATGGGAGTGAGAGTGAGTTCCTCGATTTAGCAGCTCGT:1 + chr2R 9403966 3' + 1360 388 1 60.40 CAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACCACCTCAAGCGCCAATCGAATCCGATCCCTATGGACAGGGTCAACCGTCCTATTATG:1 + chrX 12605149 3' + Ivk 4963 1 58.42 CTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAA:1 + chr2R 4483265 3' - Ivk 36 1 56.44 TATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAAGGATCAATTGACAATATAATGGAGATCTATGCTTGGAGTGAT:1 + chr3R 19446327 3' + I-element 498 1 58.00 GAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGG:1 + chr2L 315187 3' + Tirant 346 2 77.23 TGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAG:1 + chr3R 17321766 3' - Stalker2 47 2 70.30 AAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTATTAT:1 + chr2R 12458003 3' + roo 9054 2 64.36 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATATGTATGTAAATGGATGTACATATGTATGTATGGGATAGTGGAATGTTGAGCTCGTCACTATATGTG:1 - chr3R 24081514 3' + 297 389 2 76.24 ACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGGTCAGTGAGTGCTCTGTTCGCCAGTTCAGGCGGTGACAAGCCGGAGAAACCGGAGCGAAAGTTCA:1 - chr3L 2535551 3' - blood 7241 2 70.30 TTGAATGACTTCTGGTGGAAGAGATAGTCGCTATCTGTGGTGCTGGCTGCAAGGAAACTTCACGATGCCAAGGCCGCCCTGCCGCGGCCCAACTGCCACCA:1 + chrX 13772321 3' + hopper 291 1 72.28 CAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTTATATTGTTTAAATTCTAACTATAGTTTCTGGTTGGGATCGTCACTACTTTTTACCCTTGCGTGAT:1 + chr2L 22079501 3' - flea 4762 1 71.29 CCGAGNGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTTGGCTATTGATAAGGTGGCAGGCGGTTGGGATTCGATGGGTGG:1 - chrX 8684210 3' - opus 7145 4 58.42 ATACATTGGTTTGCAACTATGCAGCCACACATATGGCTCGATATCCAATTAAATAATAAGCTATAGCGTAACAAGCAACAGCTTGACAATATTCATTTCTT:1 + chr2R 1080241 3' - 1360 3354 1 78.22 TCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTATGTGTAGCACACTTTTAG:1 + chr2L 1625728 3' - hobo 16 1 63.37 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATA:1 - chr3R 13375991 3' - 1360 55 1 82.18 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATACTTTTCACGTCTGCATGCGA:1 + chr2R 13585534 3' + Juan 4198 1 62.38 AATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAG:1 - chrX 15408744 3' - INE-1 517 1 85.39 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTTAT:1 + chr2L 7255832 3' - P-element 10 2 69.31 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCACATTGTGACAGTCA:1 + chr4 1149920 3' - 297 6615 2 71.29 AGTTTATAGTCAACATAAAAATGTGTCAAAGTCTATGAAAATGTAACCCGCCTTAAAAATAAATCACTTTCAAAGTTCCTTTCGCCATTTGAGATTAATCA:1 + chr2L 2518849 3' - TART-C 10785 1 57.43 ACTTGATTTTAGTGAAGCAAATAAAATAAATAAAGATTGTAAGAAGTGCAGTCAAATTTATATATAAGCTGGCGTGCAGGATTCCCAAAGTGCAAAGTGCA:1 + chr2L 1581727 3' + Doc3-element 50 1 78.22 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAA:1 - chr3R 20878466 3' - 297 6608 2 60.00 AATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCG:1 - chrX 21474426 3' - 1731 4358 2 71.29 CATAAACTTGACTATTTATTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGT:1 - chr3L 10477549 3' + copia 217 2 60.40 ATAACATGTTTTAATACTTAGTTCGAACAAAAAATTAGTCGCTTAACCTCAAATTTTCGTAGTAAGACGTCGATTAGGGGGTCAGATAAACGATAACCAAA:1 - chr3R 3623592 3' - G4 3724 1 55.45 TAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAATAGGTTA:1 - chr2R 3591971 3' - Quasimodo 18 2 61.39 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTAGCAGTCGCAGGTGTTGCGGCGCTCCATTTCAGTGGTGTTTATGACACAAAGTTGAGTTTTATGCCAG:1 - chrX 10561774 3' + hobo 2932 1 72.28 CAGATNCCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATTCATTTCTCTGGGATATCGATAGTTATTGGGGAAAAAATTGTTTCCAGTTTGGCGGGAAAGGAGTCCTAATA:1 - chrX 21003066 3' - INE-1 543 1 66.34 TTATGTTTACGTTAATTAAGCGCAGCTGGATTAAAGCTGGA:1 - chr3L 27392166 3' - Quasimodo 7166 2 56.10 GGATTACGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAAATTCCTGCACATAAAAGTGCTTCCACACGAGGCATTGGCATTGATTGAAGCAC:1 + chr2L 18626021 3' - Idefix 257 2 61.39 ACAACATTAACAGCAACAGTCTCTTCAACTCAAACATGTTTACAAGAGGCGACATGTATCTCCGAAAGTGCTGTGTCGGCAGTTCTGGTTTCTTTTACGAG:1 + chr3R 3187475 3' + Doc4-element 319 1 65.35 TGGGAACAAAAAGAGAATTGATTTTGCGTTTGAATAATTTAACAAGCGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATTCGTTGAAAAAGTATTTAA:1 + chr3R 19447096 3' + invader2 376 1 77.23 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTA:1 - chr3R 26530883 3' + blood 7334 1 77.23 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATGACTCATTAATTGTCCAAACGGAGCGTTCTTTGCGCAATTAATTTTCATTTTCATTTGCATTTTACGATG:1 - chr2L 12324004 3' + roo 405 1 75.25 TAAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAACCGACACCGAGAC:1 + chr2R 5627653 3' + HB 319 1 80.20 ATCAATTACGAAATAAATTAAATCATCAATCCCTTTTGTATCACCGATCACTTTCAGTTCGTAGGACATGGCAACTTTGGCTTTCTTCTGTGGTGTGAATG:1 + chr2L 20607349 3' - McClintock 6312 2 69.31 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCATTACTGCTTCGGCTGTACAATCT:1 - chr3L 12103767 3' + roo 397 1 67.33 CTGTTTATTTGGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCAGCCCGTCGAAAGTTGGAGGGCAAAAAAACTTTTTTTAATTAGTTTGCCTGCCATTTTATTGTT:1 - chr3R 25797914 3' - diver2 4821 2 67.33 ACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTCCACACAGACACTCACACACATTTGCTGGGGGAGAACAATAACAGCATCAATTTGACACGTACAGGCG:1 - chr2R 19820029 3' + hopper 941 1 71.29 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACCAGCC:1 + chr2L 20133067 3' + flea 4988 2 57.43 CTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCATCAATGTGACTGTCTGAGAGAGAACCATTGCTTCTCTCGT:1 - chr2R 3032149 3' - F-element 4326 1 59.41 TCTTCTACTCAGTTCAAATCTTGTGTCGAAATAAACCACAGCTAAGTTTTGCATTGGCGATCTTGCATTTATATCGATACTTTGTCCATCTCTTCTCTGAA:1 + chrX 15086070 3' + gypsy 228 2 59.41 TTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCACTGTCACTATGTCACTTCGTCCTGTTAACGACTGTCATCTAATGCAGTCGGCACAAATGCAATTA:1 + chr3R 31349698 3' - roo 9032 1 70.00 TTCACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTAGCACCTTATATACGAAAATGCTTTTTTGTATATTATATATTTACTTGAATCCAGTAGTTTTTGAG:1 + chr3L 21145719 3' + INE-1 551 1 57.43 ATTACAGCCAAAGCTGAAGTCAGTCACAATTTTGTATCTTTGCACCTGATTGTATTTTGCAATTATTCTTAGCACTTTTAACTTGGCACCTTGGCAATAA:1 + chr2L 6085391 3' + 3S18 220 2 71.00 TCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAGGGAACGGTTCCTTATGTCTGCTAAATACATTT:1 - chr3L 26417978 3' + Quasimodo 243 2 67.00 AAATCAAAAAAAGAAAAAAAAAAATGTTCCATGCAACTTAA:1 + chrX 8983055 3' + Doc 4699 5 73.17 AAAATNGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTCAACTGCGTGTGCAAAACTGATGATGCTGTTCG:1 + chr2R 14408523 3' - hobo 34 1 59.78 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCG:1 + chr3R 7388408 3' + HMS-Beagle2 7158 4 61.39 AAACCGGCAAAGAAAGCACAGGGAGATGGTGGCGTTGGGGGCGTGGCTATAACAATTCAATCAAAGAAAGCCCCAGCAAATCAGCAGTTGTTCCTAAGCTC:1 + chr3L 13726222 3' + G6 454 1 80.20 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTAC:1 - chr3R 6273523 3' + blood 336 2 68.32 ATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGA:2 - chr3L 18337646 3' + Juan 4187 1 53.47 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGTTACCAAAGATTTTCCTGAGATTATGCAAATGTGC:1 - chr3R 26321603 3' + blood 7370 2 59.41 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATTTGGTTTCA:1 + chr3R 4834346 3' - mdg1 8 2 70.71 GTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGCAAAAGGCAGCAGCAGCGCCAATTGAATTAGCCATCA:1 + chr3L 16440904 3' + accord 7301 2 63.37 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTG:1 + chr3L 12888304 3' - mdg1 18 2 61.39 AAACTNATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTTATATTGACGCCCACACTATCGCCCAAATCTGCCGCGTACAATC:1 - chr3L 23123522 3' + flea 227 2 58.42 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTCTTTCTTCCCATTGTCTACACATAATATAGTTATGCAAGCATTTTGTTTGAGAA:1 - chr2L 10473434 3' - flea 4776 2 58.42 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAGTGCGATAAAAGTTTTATCAGCATT:1 + chr3L 19377813 3' + roo 394 1 64.36 ACACACACACATACACACACATACACAGGCACACAGACAACGAGAGGAAAATGGAGGTTTGAGTGTCAATGACAAACAGGATATTAACTTGCACAACATTA:1 + chrX 4034025 3' + accord 7037 2 74.26 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCCATGGCATCTGGTCGTTAGGCCAGCCGTTCATTCGGCAACGA:2 - chr2R 16333967 3' + P-element 2875 1 67.33 GTGACAATAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATTAACATCCGCCACCAACTCCTGGCAAGCGACCATTGGGTACATCACCACCTTCCAACTTCTAT:1 + chr3R 19042284 3' + Quasimodo 148 2 55.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAATTATGGTAT:1 + chr2L 513740 3' + roo 9046 1 53.47 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTA:1 - chr3L 6044752 3' - Tabor 45 2 66.34 TTTTATTCATTCTTACATGGGTTTAAAGAAATAGAGCAAAATTTCAGCTTCAACTATTGTTTTGAACGCGCAAATCCCCTTTCCTACTGATTTTTGACTCT:1 + chr3L 398671 3' - rooA 278 2 77.23 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATGTTGTCATATTTCGCCGACAACTTTGCTTCCAA:1 - chr3L 11661686 3' - hopper 2 2 75.25 ATCGGTTTAAGACTTATTGAACGTTACGGGAAAACCTTCAACTTAAGACTAATTACAAATCTAAGGAGAAAGATCGGGACCGCGTGACGGACAAATCAAAG:1 + chr3R 9578764 3' - McClintock 304 2 49.50 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCGCAAACACAATTTAAATGTGA:1 - chr2L 13333998 3' + flea 246 2 64.36 TCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTTTCTCTCAGTGCACGAGAAGCGCCAAGAGAAATTTTTTGTTTCCTGTG:1 + chr2L 6601484 3' - I-element 3 1 74.00 CGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGCAGCTGCC:1 - chr3R 16400136 3' + blood 7374 2 63.37 AAGACNAATTCTTAATGCTCCATTTTATATTTCAAATGCTTCGTATCCATATAGACTTAGGAATCCCTTTATGTTCTAGTTTACGTAGCTAACATGAGAAT:1 - chr2R 4906361 3' + G4 3509 1 67.33 TATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTAGCCACGTTTATGCCCCTTTCCCCTTTCCTTTGTGG:1 + chr2R 7775027 3' - Transpac 4919 1 43.56 AAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAAGGAAAAAAAGGGGAAAATACGAGAATAAAAGCAGACAGTCGAAAAAAGAAAATAAAACTCCAAAAAACTGA:1 - chrX 3310472 3' + Doc2-element 230 4 70.53 GCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCATCA:1 - chr3L 7550712 3' + 412 462 2 54.46 ATAATTATTATTAGTAATATTAGAACAATCACATCTGAAAGTGACGTATTGGCACGTTTATTTTTCTATGGCAAATTTAGTTTTACGGTGAAGATTTTCAT:1 - chr3R 31259479 3' - mdg1 7083 2 69.31 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATA:1 + chr3L 2019709 3' + 412 7502 2 74.23 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAA:1 + chrX 2799698 3' - Tirant 8138 2 59.00 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAAC:1 + chr3R 6735344 3' + copia 231 1 54.46 CCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCTTGTAGGTAGACCGACTTTCAGTCCAGACATCGCCCCAGACGAAGAACT:1 + chr2L 19341982 3' + Doc 4302 1 55.45 ACAAGGATCGCCGCACCTCCGTGTTGACTGTCATCCGGATGGTTGGCAGTATTTTATGGATGGCTCCAGAGGTGATTCGCATGCAGGAGCTAAACCCCTAC:1 + chrX 2343005 3' - G5A 206 1 56.44 TATTAATATTATTATTATTTTTTTTAAGTTAACTAAAATTTCATTAGAATCAGCTGTCTCCTTGCTACGACGCTCCCTGCTTGCATATCTAAATCTCTGTT:1 - chr2L 20556764 3' - mdg1 37 2 87.13 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCGAAATAGGATAGTAGTTCCTTCTATATGCAAATGTTTCGGACACTAAGTAGTGAATAACTTTCCTGGA:1 + chr2R 9770264 3' - I-element 9 1 65.35 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCT:1 + chr3L 17587829 3' + roo 9021 2 76.24 GCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTTGTCAGACTTTTATTCATACATACTT:1 + chr2L 11712034 3' - P-element 395 1 32.67 CGGAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCCTGCCAGCTGTGGAAAGAGAGGGTGCTAGCGTGGAGTGAAAGAGAGCGGGC:1 + chrX 7621243 3' + P-element 30 1 55.45 TCCACAGCAGCCGATAAGCCAACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCATATATTGACAATAAATTAAATA:1 + chr2L 22706772 3' + G5A 2597 1 77.23 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCATTACTGCTTCGGCTGTA:2 - chr3L 12103773 3' + roo 391 2 61.39 ACGGAACCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATATATCTGTGTTTTAAGC:1 + chrX 10827483 3' - roo 8695 2 57.43 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAACAGA:1 + chr2L 19019006 3' + hobo 2925 1 57.33 CTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGAGACCAAGCGG:1 - chr3L 19454657 3' - diver 5915 2 55.45 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGCATTTGATATGTACTTCCTG:1 + chr3L 7075927 3' - roo 8715 2 82.18 AGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTTCAGTGCTTGGCGAATGGGTTTTCTGTTTTATTTCTTACAGTGGACATTTTACGGCTATGG:1 + chr2R 11228966 3' - Idefix 7021 2 64.36 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTGTT:1 - chr2L 18212125 3' - 412 7080 2 54.46 TTATAGTTCCTGAGATCTCGGTTTATACGGTTCATATACGCTTTCTTGTTGCATATTAATACATTTTTTTAACTGATAACAATTAGCTTGAC:1 + chr2R 5433967 3' - INE-1 145 1 51.09 AGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGATCAAATCGACAAGCAACGCGTGGCTTCCAGTGAAACAAAGTCAACTGC:1 - chrX 2649118 3' - Tirant 240 2 51.49 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATGGCCACCCACTCCCAGGAGAACTTTTTGCTGCCACACAGC:1 - chr3L 5201467 3' - 297 11 2 71.28 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGTTTGCTTATTAAATCTAGTAATTGAATNGGCAAA:1 + chr2R 23584830 3' - HMS-Beagle 13 2 65.35 TGAAAATTAAAAAAAAAAGAAAATTTATTTAGATGCTTGTTTGCTAGAAAAAAAATATCATATTTCTATTTAAATGTAATTTATTATTAACTGCTTAATAA:1 - chr2R 17272379 3' + TART-C 11094 2 79.21 AATGGAATTAAAATATTTTAACCATAATAGGAGCAAAAACAATATGCTTTTATATAATAGAATATTGTTTATTCTTTTATACCGTATATCAATTATAAAGT:1 + chr2L 9635357 3' + Juan 428 1 87.13 ACTAAACATCCGTCTCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCGTCGACGTTCTACTTGAATATTTTCACCGGCACATAATTCCTGTGG:1 + chr2L 14941127 3' + Idefix 188 1 52.58 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTA:1 - chr3L 6044752 3' - Tabor 6883 2 66.00 TCTGCCCTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAGAGTTGTGGCTC:1 + chr3R 29331935 3' - G6 10 1 68.04 GCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCCAAGACGGAGACCTAGGAATTTCATTACAAAAACATTCTGGTCAGGCAGAA:1 - chr2R 7552207 3' + springer 7521 1 79.21 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCC:1 + chr3R 17929010 3' - hobo 45 1 69.00 TGGCGGAAAAAGTTGAACAAATTGCAGCGCAATTGAATTGTTCATTTGTTTGCTTAATAAAAATATGGTAAATTTTATAGTTATTTAAAATTGTTCACGAA:1 + chr3R 23263190 3' + transib4 199 1 63.37 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAAAACTGAGCAA:1 - chrX 13546623 3' - roo 8682 2 62.00 CGGTAGCTTGATGGTGGCAACCGACTCGACGACAGCATTGTCCTGCAGGATATTTGTGAGTACTGACGGAAGTACGGAAGTGGTGCACAATTAATCCTATA:1 + chr2L 5559757 3' - Chimpo 335 1 73.27 ACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTGTACTAACACTTTTTAAACAAAAGAGAAGTGTATATTTAAATTACTAA:1 - chr3R 20941087 3' + I-element 5041 1 52.48 AATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAATTGAAATTTACAGGGGGGAGTTGG:1 - chr2L 20717712 3' + Quasimodo 7171 2 76.24 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTTGGTTTTTTAACACTAGAAGAATACAGCGCGCGAAATTATGCTAT:1 + chrX 4366280 3' - jockey 4699 1 59.00 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCTTTCGC:1 + chr2L 4160207 3' + Tirant 8486 2 57.43 TCTTTTAACAGCTCGCTTGAATGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGTACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACCACATCTTTGTGGTTAAATTGAGCATAGGTGA:1 + chr2R 4521327 3' + Cr1a 366 1 68.32 CAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTTGCAACCAAATCGA:1 - chrX 3305146 3' + transib2 2785 1 62.38 TATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAAAAAAAATGTGCATAAAATCTTATAAAAATCGAATGAAACAACAGTTTTTTTGCGGTTTGAGTGGGCATAATTCATC:1 - chr2L 21327090 3' + flea 303 1 78.22 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTG:3 + chr2R 13644522 3' - Burdock 6145 2 70.30 GTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCAGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTGTGTCACCCCGAATGCCCTTGGGTGTCCTGGTACAT:1 + chr3R 19498018 3' - gypsy5 78 2 64.36 ATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGCCAGGAAGGGATCGGGGGAGGAAGAACCTGCTCCGAGCTGCATGT:1 + chr2L 21923927 3' - Doc 481 1 54.55 AAAACACACAAAGGCAGCAGCTGCTGAATGCATCGCATAAATTATTTGTTAAATCGTACTAAAACAAATACAAAAAACAGAAATTATTATTAAATGCAATA:1 - chr2L 9523902 3' - invader2 5071 2 77.23 CCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCGAAAAAAAAGTGTATTAATGCAACTGTCTAGTAA:1 - chr3L 11554586 3' + P-element 2750 1 35.64 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCACGCACAAGGGCGTGGCAGTCTGCGCCAGTGTCTGAAACAAAGCCAAGCCATAAAAATAAATAT:3 + chr2R 18031904 3' - Tirant 11 2 64.36 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGCAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTCGAAAACCGTATAGATGTG:1 - chr3L 11553481 3' - P-element 30 1 42.57 TATATAAAATAAAATCATATTAACCAGAAGGGACAGTAAGTAGTTGCAAAGGTTGCAAGTAAATCCTTGTGCTAACAAACATATTTCTCA:1 + chr3L 8893945 3' - transib1 1893 1 68.89 GACCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGCTGGCTTTGTTATTTACACCGGCAACGAGAGACTATAATTTC:1 + chr3R 31101366 3' - 297 6580 1 72.28 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTC:1 + chr2R 16940413 3' - 297 6598 2 63.37 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCA:2 + chr3R 12047478 3' - Stalker2 7284 2 58.42 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTCCACATCCCAATTACTCATCCCCTCATTATTGTAAT:1 + chr3R 18571174 3' + hobo 2897 1 68.32 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTT:1 + chr3L 18706939 3' + jockey 4965 1 50.53 TTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAAAGTAATAAATTTTCATAGTTCCTATTAAATTTAAAAACTTTCCGATGTCGCAACTA:1 + chr2L 4144561 3' + I-element 5338 1 45.54 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTATTAG:1 - chr2L 7488839 3' - roo 8678 2 61.39 GAATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAATATTAGGGTGGAGCAATCGGTGTAAGCGCAGATTTCTGTCCCAGTGTAGCACTGCTTACGCACTGCTTACTCAACT:1 + chrX 9046712 3' - 1360 3256 1 79.21 CACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAATAAAATACACAATCAAAAGGTTATT:1 + chr3L 5102302 3' + jockey 4673 1 75.25 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAACATTTAGATAAATACAAGGATGCAAGAAAATAGATTTACGTTCTAGAAAAAGTTGAG:1 + chr3L 8017994 3' - FB 20 1 60.40 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAA:1 + chrX 868752 3' - jockey 4797 1 64.65 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCA:1 + chr2R 9871063 3' - roo 20 2 59.41 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATCTTGTTACCAGAAATAATGGTGTCGAGCCGGGCAACATGCCAAAAGCATTCAATGAGCCC:1 - chr3L 6045158 3' + Tabor 7303 2 69.70 AAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACATTATTTCGGAAGGGGAAGTCCCTGTCGTGTTATGTGGAGTTGTGCAT:1 - chr2L 22727480 3' - 297 266 2 59.41 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGCTAGTAGACGCTTGT:2 - chr2L 16674846 3' + roo 9050 2 62.38 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTGACATTCGTAGGCAGCCTCAATTGCAATG:1 - chr2R 16988167 3' - opus 7 2 72.28 GAAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAAAGTCATTGGGGAGCTAGTCTGATTTCAAATGTGCGGGATTGATCATTTATGGATA:1 + chr2L 13769551 3' - Juan 71 1 61.39 CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTATTTTTAAGCACACACAATAACATAGTGGGTAGCCGGGGCCAAAGGACAACCCTTTGTCACATTCTGCAATTTATGTTAT:1 + chr2R 16376830 3' + blood 169 2 56.44 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCAATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAGAAAAACTTCACCTACGAAAATATTT:1 + chr3L 5489965 3' + jockey 4964 1 72.00 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACC:1 - chr2R 1365312 3' - jockey 28 1 57.43 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTCCACCCCTAAAAGACAGTG:1 + chrX 12290243 3' - X-element 37 1 50.50 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAA:1 - chr3R 31458444 3' - jockey 61 1 77.23 CGTGCATGCCATCCAAGGACTTTAGATGGTATCTTTAGAGGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAATAAAAAAAAACACACACACACAGAACATG:1 - chr2L 4352076 3' + Rt1a 5013 1 78.00 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACTAGCTGGGGTGCAGTGGTGTTAGTGCCCCATGTCCTTTGCAACCAGCAGCTGCTCAACAAACC:1 - chr2L 13319552 3' + hobo 2935 1 71.88 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTAATGAGTTCGAATATGGCCACGCCCCAAACATCTGCTGATGGCCATCGAG:1 + chr2R 17972079 3' + 412 7525 2 54.08 CCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGACAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGC:1 - chr2L 22724121 3' - INE-1 137 1 48.98 ACTTAGTTATATGCAATCTGATTTAAGCGAAAAAAATGTTGTCACGCCCAATCTAACGCCAATCTTCGCGCCAGCATTTCAAACATTTTTCAGTCATTATT:1 - chr2R 2049457 3' - Tc3 1668 1 71.29 CAGATTGTAATTTAAAGAAAAATAATAAGAAAAAAAAAAACAAAACTGAAAAACAAAAGGCGCGCAATAAACGAGCTGGAAATTC:1 + chrX 13254768 3' + Porto1 4661 1 56.47 GATATATAAGATATATACAAGAATATATTTAAAAAATGTTAAATCGTTATAATTGCATTCTTGAAAACATATGTTACTTGTATAGCAATCATTTCCAACAA:1 + chrX 10438198 3' + 412 7320 2 56.44 TAAACATAAATATAAATGTGTAAACGATAGCTAATTAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAACATTAACATTAAAAGTGTTTCAAAAAAAATATTTCGCTT:1 + chr2L 2436615 3' + 1360 2958 1 67.33 TGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGC:1 + chr3R 12047467 3' - Stalker2 7295 2 69.31 TCGGCTTGCCGACTTGTGTGGGCGCGATGCATTGTATTATACTCTTTTTTGTCGCCATAGAAAATCCCCCATTTTGCTTACAGCGACGAAATCGACATGAC:1 + chrX 15087572 3' + gypsy 7152 2 66.34 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATTAATTTTCAAGTAGAGATAAAAGCAGTGGTAAACAATCAA:1 - chr2R 6702002 3' - pogo 33 1 61.39 ACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGCTG:2 + chrX 21421876 3' + INE-1 542 1 90.10 TTTGGTGGCTAAGTAGTTGATTTATGTGTTTTTTGCTGCTTTTTTTTAAATAGTTTCGTTGATTGTTTCTTTTTTCTCTGTCATTTGTTTGCTCGATACTT:1 - chr3R 10246521 3' - Porto1 4459 1 67.33 TAAAANTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCT:1 + chr3R 29331901 3' - G6 48 1 69.31 TTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGCCACTGGGAGGGTGTAGTTTCGGGGTCAACCCAAAAAAAATG:1 - chr2L 16746143 3' - Bica 4635 1 59.41 AGTGGNAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACCCGTGTAAATGTGAAA:1 - chr2L 19018929 3' - hobo 13 1 63.37 AACTCAACGGGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTATGTA:1 - chr3R 27748651 3' + roo 392 2 62.38 TTCACGGTCTCTCCGCTTTGCCGGGGTCCAAGGTCCATAGCTAAAATTCTTAGCCACCAGGTATGAAAAGCAAAAAAGAAAGACAAG:1 - chr3R 26100152 3' - gypsy8 67 2 63.22 GAGTGGCAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGAAATGCAGCA:1 - chr3L 18500932 3' - hobo 14 1 63.00 CTAATCATGTGAGGACTTACAAAATTTACGCATTACGCAAAAATTAAAAATTTTTGAATTGCTTGTTTGTTCACAGTTGTGTTAGTTGTGTTATTTCATCA:1 - chr2R 22317189 3' - BS 4992 1 69.31 CATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATAAAAATATGTATGGGGGGTTAGC:1 - chr3R 11846476 3' - hobo 2520 1 80.41 TACTCTAATGACAAATATTTTTATATAAATACCATTAAGTGGCTATTTACTTGGCTATAGTCCACGGGCTCTTGAAAGCAAAACAGCGGTTGATCCTCCTT:1 + chr3R 26078315 3' - 1360 399 1 66.34 ACTACGACCAATAAGCTTCTCACAACTGTTCGAAAAGCTCACCCGCAAGCTCCCGATTGCGATGCAAATTGCAGGCGATGGTGATCAGGGCGCGCCAGTAA:1 + chr3L 19816507 3' - R1A1-element 223 1 72.28 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTCAGCATATAATCATCAAGTTTACAGCTTAATTAAC:1 - chr2R 13650091 3' + mdg1 405 2 63.37 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAATTTTTTATTTCCAAGAGAGTTAAA:1 + chr3R 23591473 3' - pogo 43 1 56.44 AAAGACTGTTCCACGCAAAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTCGCAACTGTCGGAGGAATCACAGTTTATGAATTTA:1 + chr3L 15377664 3' - Cr1a 4024 1 65.35 AGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCTGTCACTCTCGCCGTTGTAGCAACTATTCGGGGGCAGAATGTAGTCCG:1 - chr2R 7032600 3' + mdg1 479 1 52.48 GTAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAAATATTGAAGTTCGAGTTCAGCGATCACAAGAGTCGGGGAATTGACAAATCGTTTTTAAACAATGGCTGCAA:1 - chr3R 21165406 3' + Osvaldo 1521 6 64.65 TTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGA:1 - chr3L 15099554 3' + G4 3814 1 70.00 CAACGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGAAGGTTGAGATTATACATGCAGACTCTAGAGACATAGACGAAGCGCAAGTTTGTTGACTCAT:1 + chr2R 5296378 3' + roo 396 1 67.33 GGTAAACTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGCAAGTCGATCCGCTCCCGCTGATAACTGATCACTGCAGTTCGCAAA:1 + chr2R 16583360 3' - P-element 26 1 53.47 CAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGGGCGGGCAAGGAGTGGGAAGGAGGATGCTGTGCGGATGTGGAGTGTTGAAAGCCTTGAGTGGTCAAATTCGG:1 - chr3R 13840732 3' - copia 4810 1 75.25 AAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATTACAACTGCCTTAACACTAACCGTAAAAAACAGAGCAGGCGAGCGTA:1 - chr3L 16647691 3' - Max-element 8462 2 72.28 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGT:1 + chr3L 18706953 3' + jockey 4973 1 61.39 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATGATTTCGAGGACCCAGATACTCGTAAAAAACTGCGC:1 + chrX 868789 3' - jockey 4762 1 76.24 AGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAATTCATGTATCCAATAAGAACCCGAATTCTGGTGACATCAACAAGGTTTGTATCAAATTTTTTGCAAGGGTGTGA:1 + chr3L 15459693 3' + Quasimodo 91 2 66.34 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATTCGTTTTATTGCTTAATTTGGGTCTCTGCGTC:1 + chr3L 4876823 3' - roo 9 2 70.30 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGGATATAAAGAAGCTGCCAGGGCCATGTCT:1 - chr2L 1625660 3' + hobo 2895 1 73.74 AAATCAAAGTTAGCTGCGCCATCTATGAATCATTTTTGCATATCTAAAAGATGGTGATGTTGACTCTGTTGCCATATGTCAATTGTTGCCTCAGGCCATTT:1 + chr3R 24764414 3' + pogo 186 1 51.49 TTAATATGTAAATAATTAATATTAATCAGAATCAAGGCAAACTGTGTTTTGTTGTATTTTTGTGTCTGGGCGAATAGCCAACTGGCATTTTCCGCTTTCTG:1 + chrX 16912980 3' + Stalker3T 35 1 52.48 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAAGTTAGTATTGGTA:1 - chr2L 14790555 3' - roo 8666 2 76.04 CGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCTTTTTCAGCACACTCGAATCGCAAATGTCACTCGTTTCATTGGCCACATCCTGCAGA:1 - chr2R 16531225 3' - roo 9042 1 62.38 TGTAATAAAAAAGTTGAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGCCGAGTGTTTAGTGAAATGAGTTCATAATCGGATTTGACGACTTGTGAAATGG:1 + chrX 12364639 3' - Cr1a 4266 1 62.24 AAATANATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATCTGTCATTCGAAACAACCAATGGTAAAGAATATGTTTATAATATCA:1 - chr2L 13136706 3' - roo 6 2 73.27 ATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTGGTTCCTATCATTATCAGAGAAGAACATTAAATGTACGATGACAGAACTGATGCAAACCAACCCA:1 - chr2R 5273224 3' + Cr1a 4312 1 57.43 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTGATCACCCAAAAACTATGGAAAATGGGTGGGTGGGCCCAAGGCCTTCAGCCATTTGCAATTTTCAATTTCCAT:1 + chr2L 18234173 3' - jockey 12 1 72.28 ATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCAGCAAGGGTTATAACAGATGGTTGTTAGGGAGAATTGTAAAACTAGTTTAAAGTACATGGCTAAAACT:1 + chr2L 13579060 3' + pogo 8 1 67.33 TATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCGACATGTTTATTTGTAGTTTTCAGCTATGTTTTGTAGTTTAAAAGAAAATGCGATAACTGTGC:1 + chr3L 17438276 3' - I-element 209 1 65.35 TTTATTATTTTCCTTTTTTTTTATTAATTATCCGTTTGCA:1 + chr2R 14964354 3' - Doc2-element 253 1 90.00 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTC:1 - chr3L 12103806 3' + roo 9021 2 78.22 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCCATGGCATCTGGTCGTT:1 - chr2R 16333992 3' - P-element 37 1 42.57 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAA:2 + chr2R 5840675 3' - Ivk 47 1 68.32 GGTCTCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATCGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGAGGTTGGTAATTTCTTTTGATTAGTTTT:1 + chr2R 292791 3' - Porto1 359 1 73.33 AATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCACCCACTTCTTTAGCTGTAATTCGCGAATAGAAAGAGAGTGGGGCAGTGAGAAGAGTGGGAGGAAGCGAGTCTCA:1 - chr3L 14465354 3' - Max-element 232 2 78.22 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGG:1 + chr3R 26321675 3' - blood 7053 2 68.32 TTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTTCTTGGTTGCTCTTATTTTCATGATTTTGAATTTTGATAAAACATATTAACATTTTCCTTGCTTCACGGACAG:1 + chr3L 27380690 3' + BS 5033 1 75.25 AAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTTCCAGCATGACGTGAGTGTTTTGGCTATTCTTGGCCCGGAC:1 - chr3R 16859744 3' - 1360 3310 1 61.39 ATTATCATATATTTTAAACATAATTATTAAATATCACATCGCTTCGCGAGTGATTCTTTTGTGATTTGTGCAGGGCCTTAGAATTTCCCTTTTTTGCCTCA:1 - chrX 17963542 3' + Cr1a 93 1 72.28 GCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTCATTTTGGTTACCGAATGAATTTTTTTTATATTCGACTGTTGAAAGCAGAATC:1 - chr3L 24252895 3' - F-element 131 1 54.08 GTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGACCGAAATCAATTCTGATCGAAAAAACGAATTTACATATGACAATAAAGAAATTGGTAAAAAACGATTCTATATTAC:1 + chr4 931165 3' - 1360 3199 1 60.40 AAATGAGTGTGTCAATTCAAATAGAAAAATTAGGCGACAGCCTCTCAGACCGGGTCAACAATATATTACACGCTTATATGCAAATGAGTTCAATTTCTGAC:1 + chrX 14413172 3' + Copia1_DM 327 1 72.28 AAGACTCAAGCGACACCACCCTCAAAACTTCATTAGCCAAAAAGCACGCGCCGCCAAATTGAAACGACAGAAACAACGAACGCAAAAATATCT:1 + chr2L 5648077 3' + jockey 4747 1 77.42 ATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTAATTCAAGGTAGGGTATCTTCAACTCTTTTTCGTTCAATGTTTTAATTCTCTTCCTTTTTG:1 + chr3R 30276804 3' + 1360 263 1 67.33 CACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATATTTGTCAGTTCTATTCTGTAAGGTTGTTTGTCCAATAATTT:2 - chr2L 17784599 3' - 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Juan 4024 1 79.21 ATCAGTTACGTTGTCTTCATTTCTTGAAAGTTCCTTTAATTAGGTATTTGGTATTTTTCTGCCTAGTTAACTGGATTTTCTTTGAAGCAACACCTATTCGA:2 + chrX 15418335 3' - G4 133 1 84.16 AAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGACTATATAAACGCAGCTGTCGCCAAGTTTATTTGACGTTTATTTTATTTTCGGCTG:1 - chr3L 2663811 3' + Quasimodo 6973 2 69.07 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTG:1 + chr2R 5531195 3' - 1360 66 1 59.41 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGT:1 + chr2R 24628831 3' - mdg1 7054 2 57.95 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAG:1 + chr2R 11528052 3' - P-element 53 1 28.00 GTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAAAAC:1 - chr3R 17843646 3' + roo 9043 1 58.24 TTTATGTTTTTTTTTTAATTTTATATAGATTTTTTTGTTAATTAAGTAAACTCTGGATTAATATATCTGACCATTCATTTCTGCAGCTCTACAAAGATTCT:2 + chrX 6152139 3' - Doc 4698 1 82.18 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCACCAAACTGTGCAG:1 - 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chr3R 21337027 3' - hopper 1295 1 56.44 CCGTCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTTCCATCGCTTGCCGCATTTCGTTTGGCTTAAGTACACTTAACGAAAAGTTGCGGTGCACATTAATTTTAATT:1 - chrX 8170778 3' - 1360 3333 1 77.23 ATAGCGACTAGGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGAAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGTTGTAGAAGGCGGTGACGCAGAAGGC:1 - chr2L 19005063 3' + invader2 4777 1 82.18 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTGACATTCGTAGGCAGCCTCAATTGCA:1 - chr2R 16988170 3' - opus 8 2 70.71 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAAT:1 + chr3L 19377781 3' + roo 9026 1 70.00 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTGTCCAGGTAATTTATCAGGCACATTAAA:1 - chr2L 15947360 3' - Transpac 4927 2 72.28 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGG:1 - chr3R 20477047 3' - 412 32 2 59.57 CCCGAGGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGT:1 - chr3L 13060328 3' + 412 7508 2 67.00 TGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTAAAGAATGCTAAAGCATTGCTTGTATTAGAAATATTTAATGTAAACAATTAATAATAGGTTCTC:1 + chr3R 15151326 3' - 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gypsy5 192 2 82.18 AAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATAACTGAATAATTATAAATAAATAACAAAAGGAGGACTGAAAAAGGGTCCCCGAGGGGGAG:1 - chr3R 20137017 3' + Burdock 265 1 75.25 GGCCAGATTGACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTC:1 + chrX 158236 3' - INE-1 101 1 75.25 CGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGATTTCTATTTATTGTCTGGCCGAAGAATATCCTTTCTGCGTGCTGCTCGCCCCTATGCGCTCCTTTTCTTC:1 - chr2R 8250066 3' - Cr1a 338 1 77.23 CATACGGCTGTGAACTATGGGGACACGCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACACGTAACTGTTAATTATGCTACTTGT:1 + chr3L 10689297 3' + Doc2-element 4367 1 68.75 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTACGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGTGATAAGAGGACGCAGCGCTCAAAGCTT:1 - chr2R 8086847 3' + 1360 3386 2 74.00 AAAATCTCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATATATATCTCGCCGATCGGTTGGGTACTCACCTACT:1 + chr2L 7655528 3' - micropia 201 2 66.34 AAAAAAAAATTTTTTTAATTTAGGATTTACTTTCAAATGGTAATTTTATCTCAGTGCACCAGTAGCCAGCCAGCGATAGGTGCAGTGCATCGGTGCAGCAG:1 + chrX 14149607 3' - HB 328 1 55.45 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGAGCATTACTCATTCTCATTTCC:1 + chr2L 3632189 3' + P-element 2835 1 27.72 TACTTNTATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCT:1 - chrX 19986352 3' - Stalker2 7276 2 54.46 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTG:1 + chr3L 9909742 3' - Transpac 57 2 77.23 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTC:1 - chr3R 12605615 3' - F-element 61 1 76.24 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATAAATATACGTTGGAGTGAAGAGAAGGACCCAATGGCAACGCAGACTAAAACCGACTATTA:1 - chr2R 14246956 3' + 297 6963 2 68.32 CAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCTTGAAAGCCCTGGCCACGGGATTAGTTTTGATGGTAGCCAACATCTTCACGGGCACCTTCGCCTTCAACAAC:1 + chr2L 3311096 3' + jockey 4606 1 76.24 TCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATTTCTATACTTTTTATTCTGCTTTGATTGCAGGTCACAGTGGAGTAAATCAGCTGGGTGGCGTTTTT:1 + chr4 710930 3' - 1360 2982 1 71.29 GAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTTGTTTGTTGTTCTAGATATTGATCCAGGAATACCAATGAAATAAATATTTCCAATAATAAT:1 - chr3L 24758026 3' - 1360 3280 1 60.40 GTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCCGCTTAACGGACTTTGCCTGGGAGTAATAGGCGGAAACGGAAGTGGAAGTGGGTGCGCAG:1 + chr3L 5206684 3' - 297 180 2 64.36 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATA:2 + chrX 18239398 3' - jockey 56 1 69.31 TTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACA:1 - chrX 15355079 3' - X-element 4708 1 59.00 AATATNTTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGTTTGTTTGTAGCGAGTTGGTCATTCAATAATTCTACAATTTTCTTACTA:1 - chr2L 513638 3' - roo 5 2 73.27 TAATAATAAAATAAAAAAAAAAGCAAACAAACACACAAATTAGGGACACAACAAGTTGTTTCAATAAGCCATTTTCCAT:1 + chr2R 17840956 3' + Rt1a 5074 1 82.28 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAAGTT:1 - chr2L 14790565 3' - roo 8681 2 62.38 GAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGCAACAAGTCG:1 - chr2L 12896982 3' - accord 185 2 72.22 ATTAACATTATTATTAATATTATTTCCCTTATTATCATTTACCAATGCCAAAACCATGAATACTAAAAAGTTTTTACTAGCATAAGCTGCGATTGAGCAGT:1 + chr2R 9988771 3' - mdg1 7086 2 55.45 GGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGGGACAACAAGCAAAACAAGAACTGGCGAAAAAAATCCACCCACGACAGGGAA:2 + chr3R 9132734 3' + roo 8975 2 60.40 ATCACCCACTCGAAGGCCACAAAGTAATTAGGTCATAAAAAGTAGCGTGCTGGGTTTGCTCCATAAAAAC:1 + chr2R 19706999 3' + 412 7181 2 65.71 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAAAAATAAAGTGGGTTGAAGACAAATCCAAGCTCCGAACGCATTTC:1 - chr2L 5707248 3' + jockey 4961 1 60.40 AATAATAAAATAAAAAAAAAAACACACTATAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAAACCGAAACTGAAAAAATAAAAAAACTTCACACCAGCTTCTCGGTGGGGG:1 + chr3R 17213970 3' + BS 5099 3 78.22 TTAAGNTTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTGATTTGCCTCAGCAAGGAGTTTTAAGCATTGCGCCATATTGTACGGCAAG:1 + chr3R 19449536 3' - 17.6 199 2 55.45 GGACCATGAAGTGGAGGGGGCGGAATTGTTTGGTGTTGCG:1 + chr2L 23506314 3' - Max-element 306 1 90.00 GCTTTAAGCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACAAGCAAAGTCGTCACATTTCAGATGAGAAAAAGCAACAGTTGCGGCTACAAATGCGTATTGAAAAGCGG:1 - chr2L 18611455 3' - S-element 362 1 69.31 AATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTC:1 + chr2L 17646254 3' + flea 257 1 70.00 ATACGTGTGCACACGTACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGGCTGTGCTTCGGGGTATTCCGGAGGCCTTTTTGGGTATGGCGCCAG:1 - chr3L 21180195 3' - 1360 172 1 58.42 TTCAAATATGGGCAATCGAAAAAATCGAGAAGTGAGCCAGCGAAAACAACAAAGAACAACCAGTCGACTCCAAAAATTGCCCTTTCAATCTACCTCCAAAC:1 - chrX 2269425 3' - FB 423 1 73.27 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCATACCCATACCCATACCCATAGTCTCAAGTCGCAGTCGGCGTCTCAGTCGGC:1 - 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roo 8723 2 51.49 CTTATNGTGTTATCCTCTTTAGCGTGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATTTAAATGATTGTTTTCGATTGTTTTCGATATGGCT:1 - chr2R 2953625 3' + Dm88 4465 2 64.36 CATTCCCACTAGCTGAGTAAAGATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATTGCTTTCTCTCTTGTTTTGACTTTGAAAATTTACAATTATGTAGATGACAGAA:1 + chr2R 4929327 3' + INE-1 535 1 83.17 CGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACCGATGGCTCCTCTTTCGCTGATTCCACATGCGTGTGTCAACATGC:1 + chr3L 10918008 3' + Ivk 5024 1 56.84 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAG:1 - chr3R 23275273 3' + roo 9024 2 74.26 CTCGATAACCAATGGGAGTCGAGTGCGACCCCTAAAAGCGCACATGCTGAATTCGCATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATT:1 - chr2R 19727745 3' - mdg1 205 2 57.43 ACCAGNATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTAGACTTTTAATTTTTTTATTCAAAATGAGTAATG:1 + chr2L 17784682 3' + gypsy10 297 2 66.34 AAAGCNTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTTTATTGGTTTTAAGTTCGCACAGTTTGACTTCGGAGACCGCGATGCGCG:1 + chr2R 2942059 3' - 1360 3009 1 53.47 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGCCAAATTTATAGAATCAGTAAAACTTTGTATGCCA:1 + chr2L 12325078 3' - 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chr3R 10203638 3' - jockey 56 1 70.30 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCT:1 - chr3R 10751643 3' - hopper 37 1 59.41 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATCATTTACTACTATTTACTTGTACGT:1 + chrY 536716 3' - Doc 28 1 51.49 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTAAAAATGTCAAT:1 + chr3R 8555942 3' - 412 16 2 62.00 CACATAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAGCTCATGGCAATGAAGCCGCCATTTTC:1 - chr2L 20646341 3' + Ivk 5199 1 76.24 CGTGCGAGAACAGCAGTTTGAACCATGGACATCCCAACTACTCCACTACTCTGCACTACCATATCACTTAATATTAAACATTTCGGTGTTCTCCCTTGTCT:1 - chr3L 13651607 3' - diver2 102 2 69.31 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCAC:1 - chrX 21531016 3' + roo 9039 1 56.44 GAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAAGAAATACAACAAATGTAACTCATAAAGTAAATCGAA:1 + chr2L 7537739 3' + Doc 4402 1 64.36 TATTANGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTGCTTGAAGTGGGC:1 + chr3L 12888321 3' - mdg1 7039 2 78.22 GTCAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAAGATAATATATGGCAACAAACAGTCT:1 - chr2L 12444124 3' + transib2 284 1 75.25 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGTTGCGCCCAAAGGATTCGTGGCACAAAAGTTTGTCCGCTTCATGACAATTCCTCTTCGTTTTCG:1 - chrX 5286268 3' - mdg3 28 2 69.31 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAATTTT:1 + chr2R 5840705 3' - Ivk 17 1 62.38 TCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACCTTATCAATTGTTTTGCTTTATCATTCGCTAAAATCTTGTGGCATA:1 + chr3R 27108404 3' - jockey 4772 1 59.04 CCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATTCTTGACTGCTTCCATCCAGCATTATTCACAACAAATCGGAAGTAATA:1 - chr3L 17836549 3' - Ivk 197 1 54.46 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGTATTTATGTATATAGTAATTATGTATTTAAAAAAAAA:1 + chrX 12585697 3' + copia 5085 2 69.31 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTACTCAATTACGAATCTAAG:1 + chr2L 2074754 3' + roo 355 2 79.21 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCGTTGACTCCTTTTAAA:2 + chrX 21017881 3' - 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diver2 4709 2 62.38 AAAGTNCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAACGAATTA:1 - chr2L 7850079 3' - 412 48 2 72.28 ATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTGATAATCAACATGAAAATCAAATTT:1 + chrX 6388433 3' - jockey 307 1 75.25 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGACTTTGGATT:1 + chr3R 11999277 3' - P-element 52 1 25.74 TCTCACTAACTGCCCCCCATCCGTGCTCGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGATGGAAGGTAAGAGACAGTATTA:1 - chr3L 14402553 3' - gypsy8 366 1 55.45 AAAAACTTATAACTGATGTGTTTACTCAAAACTGTTATTACAATAAATTGATGTAAGTAACGTCTTTTGCATAAATGCTCTTAACCATTTTCCACCAGGGA:1 - chr3R 1137455 3' + transib3 441 1 75.25 TAAACACACACTCAACTGTTCCGTTCAGAAACCAACACCACAACTGCAGCAACTACAGCAGCAATAACTACAAAAGCGAGGCCCAGCAACTGTATATCCAT:1 - chr2L 10576500 3' + Porto1 464 1 71.29 ATTTTATTTTATTTTTTTTACTTTTTATTACTTCAGTCTAGAGCGCTTGAGCCGCTGATGTTGGCTTACTGGTGTTTCAGTTAGCGGTTAGCGGCCATTAC:1 + chr3R 18102293 3' + transib1 1900 1 70.30 GATATNTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATA:1 + chr2L 21683475 3' - pogo 30 1 60.40 AAGTAATAAAAAAAAAAGAAAAAGAAGGCAGCAGCACATGGTAAAAACAAACACGATACGATCG:1 + chr3R 21657504 3' + Rt1b 5148 2 87.50 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGTG:1 + chr3L 11257421 3' + 1360 3379 2 69.31 TTTGAGACTTTATTAACAACATCAGAAGAATTGGAAATCTAATTAAATACATGGCGACCGTGACA:1 - chrX 21555679 3' + mdg1 392 2 89.23 TCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTCCAGTCACAGCATCAGTGACTCCCCATTCTTTAATACCTCTGCC:1 + chr3R 31189429 3' - Transpac 452 1 56.44 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGG:1 - chr3L 17168857 3' - mdg1 36 2 70.11 AGAATATTTGTTATAAGAGTATTCAGCTTGCTGCTGTGATATGACTGCTGCTGTGTTTGCCTCTGTTGTTGTTTTCCGACTTTCGGTTTTATGAT:1 - chr3L 15304525 3' + 1360 400 1 71.58 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGT:1 - chr3R 10751655 3' - hopper 49 1 71.29 TGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCAAGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCAATCAATGGAGATCCAATTTTAGCACAAGTA:1 - 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297 6586 2 74.26 TAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACGGCGCCGCCAGACTTCGAGTCTGCAAGCCCGGATACCCGCACTACACA:1 - chrX 14707417 3' + Stalker 7156 4 52.48 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAACGTGTTTTCGGGC:1 + chr3R 5686140 3' + P-element 2878 2 70.30 TAGCATGATGCGCTGCAGGAGTAGGTCGGGCCGCCCTGATTGAGGAGTGAAGTTGCTCGAGGGGACGCTAAATCCTGGCTACCGGCGCCTTCAAGCATACA:1 + chr2L 9105741 3' - Chimpo 3893 1 72.28 CTTGGTTTTGGTCATTCTTGGTGATGAAATAAAGAGGGATAGTCATGCGACGTGTCAGAAAGCGTTTCTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGACCTTGGATCG:1 - chrX 22705724 3' + invader5 228 2 67.33 ATATAAGATATACATAAGAACGCCGCACACTCGAAACAAAAGCAACTCAAGAGCCCAGAAAAGTGACAGTGATAATTCATTCTGGTTCTT:1 - chr3R 29982210 3' + 412 270 2 74.44 ATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTCATTCGTATGCCCCCGTCCAGAGAATAACAAAGAATGCGACAATTGTAGCACTGTGG:1 + chr3R 25771358 3' + Doc3-element 4474 1 73.27 AGTATATTCTTGATCGGGATCACTCCGAGCAGTCTGAGCTTAAACTGTTCGATCGTCTGAGCAACTCGGGATTATTGGCGTTCTTCCCAAACTCTCTCTTC:1 + chr3L 18087367 3' + INE-1 81 1 81.19 TTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATA:1 - chr2R 5582172 3' - Cr1a 447 1 62.38 CCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGAGTTTTTCGCATTAAAAGAGCAGGTGAAACAGATCTTAATGCTAGAATCATAACCATACTTGAATTTAT:1 + chr3R 20000794 3' + Ivk 478 1 71.29 TAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAGGTCACAGGATGTTCCTGGATGTGCGAGGGTGGCTGACTTTTTGTCTGCCGTTTTGCTGGA:1 + chr3R 14348458 3' - G2 3055 1 58.42 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGG:1 - chr3L 6044759 3' - Tabor 52 2 73.27 ACGGACACACACACATACACACACAGAGAGAGAGAGAGACGCAGCGTTTAGCCAAAAAACCCATAAAACAAATTTCTCTTTTCTTCGCCCGGGTAATGGAA:1 - chr3L 8456308 3' + accord 7100 2 74.26 CCTAATATGTACAATGCAAATAACCATTTATAGTTGACACTATATCAGAAAACAAAAAAAAAAGTGGCTTCCTTATTAGGAATAATTGATATGTGGATTAT:1 - chr2R 18468059 3' + 1360 3147 1 32.67 TATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAGCTGTTTTATACTA:2 + chr2L 21403541 3' - G5 4414 1 58.42 ATATATTTTTATTTTATTTTATTTATTTAGGAATTAGTTTGAAAAATAATTCATTGGCATACAATAACCAGATTCATTAATTCGCATCGGTTGCATTTGCC:1 + chr3L 14334947 3' + transib1 1895 1 76.24 AAGAATAAACATGAAGATCAACCTGAGAATTCAGAAGGAGCGAGAAACAGAGATAGATAGAGAAACATAGAGAGAGCGCGCGATCGGATTGGAATAAAAAA:1 + chr2L 2999971 3' + Bica 137 1 68.32 GGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAATTCCGCCCGCTGCACTTTGTTCCACCCCATCAATCTCAAT:1 + chr3R 28488624 3' + BS 4678 1 60.40 AAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGGGGGAAGGGGGGTTATTGGGGGTAAAAGCCGGTCAGACTCAA:1 - chr3L 5200577 3' + 297 394 1 58.42 TTACTAATCAAGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAATGAAAGATTAGGAGTTACTTTTAATATTTTACGCCGTTTTCCGCAAGCCGGTGGCTTCACAATAAAAT:1 + chr3R 643577 3' - gypsy2 6779 2 61.39 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAG:1 - chrX 16995092 3' - jockey 25 1 60.40 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATT:1 - chrX 10827428 3' + roo 9025 2 75.25 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAAGTTTATTAAAAGAT:2 + chr2L 7488938 3' + roo 9052 2 56.44 GAAAAGAACGAAACACGGCGAAGAAAGCCCTCAATGTCCAAAGGAGGTCAGTTCATCAAGCAAATCGAATATAACGTAGTCAGCTAAACGACAAACTCTTT:1 + chr3L 20287558 3' + Tc1 497 1 63.37 TCCGAATCTGAACTCGAATCAGAATCAGAATGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTATCTTGGCCACTTAAAAATAAAG:1 - chrX 15611180 3' - transib2 2548 1 76.60 GAGGATGGAAGCAAGAAGCTGCGTAATTTGCGAGAACATTTTCTCCATCATCCTTTTGACTTCTCACGGCCCCGCAAATTTTACCCAGCAATGGATACCCT:1 + chr3R 17508941 3' - G2 231 2 55.45 GAAGTGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGAGCATCAGGCGGCACAGCATCAGAG:1 + chr2L 6388528 3' - copia 4762 1 60.94 ATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAAAGCATGCCGATGCTTTGAACAGAGTCTTGCTCTTTTTATAACAGATACTTTGATCAATCGATTGAGA:1 + chr3L 25628079 3' + F-element 232 1 68.32 CAGAGNTCGTATTGGCGATCTGCGTTGAACTTTCGCTCGGCTGCAGAGGTATTAGAGAAGATGGATGCGTGCTTGCGTTTAAGTTTGATCGTCTATTTCCT:1 - chr4 1109407 3' + accord2 7565 2 67.33 TTTTTTATTTATTTTAATTTTTTGTGCGCGCTGCAAACCTCTGAGACGAATGCCGATGACAAAACAAACGTGAAGCGAAACGGTTCGAAATCGAAGTCGAA:1 + chr3R 27076027 3' - Doc 4697 1 83.17 TGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGCTTATCCCGCCACCCATCGAATCTCCCAGTCTCACAGTTGGCAATCCCCACT:1 - chr3L 4929680 3' - hobo 22 1 58.42 CGAATGCGGCTGCGGATGTTAATGTCTGTTGGCTTGGGTTTGATTTTTGAAGCTGTCTCGAAACCCGTTCCCTCTCGACTTCCCCTCTGGCTGACTGTCAT:1 + chrX 4080989 3' - Quasimodo 308 2 72.28 CCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAACGCGTCGTCTATATCGTCATTCTAAGGTTTTAGAAATTCAGAGCAAGTACTCGTCTAGCT:1 + chr3L 23770267 3' + Bica 46 1 63.00 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCTTTTTTATGGCGCCCCCGG:1 - 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chr3L 16544967 3' + HMS-Beagle 6581 1 77.23 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTT:1 + chr3L 9909787 3' - Transpac 12 2 67.33 TAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGCTGGCG:1 + chr3R 10240184 3' + invader4 3075 2 69.31 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTTAGGACC:1 - chrX 8972364 3' - 1360 13 1 64.95 TTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAGCAACTATAAGGTTGGATAAAAATATTTTTAAAGACAGTTCATTGAAAGGATTTATCA:1 + chr3L 10477622 3' - copia 194 2 57.43 GTTGTTTTGTTGCAATGAGAGCCGGCGATCGTCTTGCTCGCGTTGTCGCTGAACGCGAGTATCGTTCCGGCTCATAGTGTCTATTAAGTGGTCTATTAAGA:1 + chr2R 4547472 3' - Doc2-element 335 1 81.19 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGC:1 - chr3L 4876739 3' + roo 9032 1 61.39 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAACACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTGTGCTTTTGTTTGCTGTT:1 - chr2R 18950755 3' + roo 9027 1 71.72 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCT:1 + chr2L 12324089 3' - roo 44 2 69.31 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAATATAATGGTTTTTACTTCAACTATTT:1 - chr2R 17261592 3' - pogo 46 1 74.26 CTAAGGGAGTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCAACGTAAGAAAACCAACAGCAACAAAAGTAAAGAAATAAAAACAAAAAACCAACATCAAATGA:1 + chrX 4988105 3' + I-element 488 1 57.43 CGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTGAAAAAACTGAATTAGCTGTGTGCACACAGCTGGAACTCCCCGGGCAAATTGCGATGACGATGAGCGGACTCA:1 - chr3R 6116765 3' + Tirant 305 2 67.33 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTT:1 + chr2R 12457993 3' + roo 9044 1 56.44 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGAACTTTCGCTCGTGACAGGTTTGTTTTGCTCTTGAT:1 - chr2L 3143244 3' - FB 40 1 64.36 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATTATGAATACATATAGG:1 + chrX 21852455 3' - Tirant 18 2 61.39 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGA:1 - chr3R 27748671 3' + roo 9035 1 61.39 CGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATACGGATCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:1 - chr2R 1751255 3' - X-element 48 1 64.36 AGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGCGCAA:1 - chr2L 17311076 3' + S-element 1685 2 63.37 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTG:1 - chr2R 16988195 3' - opus 7038 4 62.38 AAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAGCAACTATAAGGTTGGATAAAAATATTTTTAAAGAC:1 + chr3L 10477600 3' - copia 5085 2 64.36 TACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCAAATAGATAACCGG:1 + chr2R 5019446 3' + rooA 7597 2 56.38 AGAAAATGAAACAAAAAAAAAACAAACAACAAATCAAATCTAATGGAACCTAAGTTAAGTGTAAATAAAATAGTTGTTAACAAATCACAAAACAAACGAAA:1 + chrX 8431474 3' + Doc2-element 221 1 52.48 CGGAGACTGCAGCGAGGGATCCCCCTGCAGCACCACCACATTTAATAATTTATACACTATTAAGAGACCAAATTGGAATTGGAATGGGATTTTTTCTGATC:1 + chr3R 16293915 3' + gypsy3 350 2 70.30 CCGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTCGTATGGGAAGAATTTTTTTACTCAATTAACATTATTCAATTTATATTGTTTTTTTTTGCTTTGTTTATT:1 + chrX 12725386 3' - hobo 2728 1 51.00 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAG:1 + chr3R 19346940 3' - blood 7066 2 80.20 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAGCAGAACAAACACTCACGAGCATTTGATTTATGTCGCTTTAATTAGCCAATTTCAA:2 - chr3L 2144304 3' - copia 4890 2 58.42 ACGGTNGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGG:1 + chr3R 7388413 3' + HMS-Beagle 7013 2 55.00 AAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACCCGTGTAAATGTGAAAGTGTGTC:1 - chr2L 19018922 3' - hobo 6 1 70.30 TATGTTATTAAAAAAAAATAAATGGGTGGAACTATTAAAATGTACGTATAAAAAGTAGAACGTAATTGATCTGAGCGAATTAAGTCACTTATGTTTTAAA:1 + chr3L 14962116 3' - hopper 158 1 61.00 ACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACGCCATTTAATAATTAAAATGAAGTGTCACGCATTTTTT:1 + chr3L 23847862 3' - R1A1-element 5101 1 62.38 AAAAAAAAATTCGCAAAAAGCGGGAGGAAAATCCTAAAAACATAAAAAACGTTGCCATGTAGCATAAACCAGCCAGCTGGTTGGGCTGCCTGCCCCATCGT:1 + chr2R 13330602 3' - FB 171 1 55.45 TTCACGATCAGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTAGAAACATATATATAAATGTATATTGGAAAAACAAATAAAAGTTAATAGAATGATTTGAAATCAA:1 + chr3L 13423401 3' + Idefix 7203 2 40.59 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTCGAAATGAGAGGCTCCGCCCG:1 - chr2R 8310861 3' + pogo 2048 1 80.00 CCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTATGTTTATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:2 + chr2L 9019833 3' + Quasimodo 7364 2 77.23 AATTGGCACCATGCGAACAATTCTTGTTTCCTTGGTTATAACGCTGTCCTTCCCATAAGTCATTTTAGTTTTATTTATGAGTAAAGTCATTTTCTTGTTTA:1 + chr3R 908352 3' + 1360 273 1 77.23 CTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAGATACTTTTTTGGTA:1 - chr2R 23584722 3' + HMS-Beagle 7028 2 60.40 GATGAGGCGTGTCCGATCAGACTAAAGGGTGGAAAAAAAATATTTTAAGATCTATATTTAAAAAGAACAGAATACAAACTAACTTGTTGTCTAGTTTCTAA:1 - chr2L 16252197 3' + Rt1b 4778 1 67.33 TAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTTCCTGGATGCGGTAATATCCATCTCCCATTAGAATCACGAACGCAGCGTGGTTTAAAGTTCACTCCGATT:1 - chr2L 285374 3' + P-element 457 1 75.25 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGA:1 + chr3R 5686110 3' - P-element 39 1 40.59 TTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGCTGCTGCTGTATTGTGTCGCTTTTAGATTGTTTTCCATTAGGCTAAGGACCTTCAC:1 - chrX 1077792 3' + mdg1 256 2 61.39 TGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGGCGCTCAGTCTCAGTGGAATATCTTCACATGAGTTCACTCAAACTTAAACTCAAA:1 + chr2R 17261819 3' - pogo 1754 1 52.48 TTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTGCCCATATGAGATAAGCTTTCGATTACTTTGAAAATTCTTTATTTATTATTAGATATTTACAACACTACACAACACTA:1 - chr2L 940293 3' - I-element 417 1 77.23 TTTAGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGATATTCCTGTAACCTTACAATATGGATGAACGCCTTGTGAGTCTGAATTACCGTTGCTGCTCCCAGTTGTATT:1 + chr3L 27396622 3' + S-element 1493 1 80.20 TACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAGGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTCTTTGCACATATTTTCTACACGAGTTCATCGAACCCCCGAACT:1 + chr2L 8295978 3' - S-element 1548 2 68.32 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATATTGCGTTCTTTTC:1 - chr2R 24021544 3' - pogo 7 1 72.28 AATCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAAAAGGTGAAAACTACGTGATTCGCTAGGCCTGCTTGTAGAATAGCAGGAAATAAAAGATTCCTTTACGAGTTA:1 + chr2L 23175936 3' - Tc1-2 1553 1 73.27 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCA:1 - chr3R 23275268 3' + roo 9029 1 69.31 TCTACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCTAATGGACTTGGCTATTGATCCTGGTGAGGAATATATATACTTTTGTATCGAAGTTACTTTCTTATACTAC:1 - chr2L 12489340 3' - INE-1 128 1 80.20 TAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chrX 20783463 3' + 1360 3212 1 72.28 AAGGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACCCGCCAGGACCAAACCATCCAGCCAACCAACCGA:1 - chr2L 3738123 3' + 412 140 2 74.26 GCCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAGTGTCTTAAGTCAATAAAAAATAACGTCTAGCT:1 + chr2L 22079663 3' + gtwin 7378 2 66.34 CCGAGAGCGATAAATTATATTTATTGTACGTATATACGAAGGCTTTTTCAGTGGCATTTTAGAAAGCACCAACATTGGTTCTACATTTAGCTACTAGCCGC:1 - chr2L 14790233 3' + roo 73 2 61.39 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTTCCTGCCCCTAGAGG:1 + chr2R 20816501 3' - hobo 25 1 54.08 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCTGCTTCACAAAGTGT:1 - chr2R 19551962 3' + roo 399 1 69.31 ACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCCTGATCAAACATAGGCCACAGTGGCCATAAAAAGTG:1 + chr3L 2144376 3' + copia 216 2 64.36 TTTGTCCTATTATCTGTAATCTTGACTCACTGCCGCTCTTAAAAAACTCAATTTTAATTTGTTTAACGGCGATCGACATTATAAGGTGAACAATTGAATTT:1 - chr2R 4409447 3' + Cr1a 4218 1 66.34 ACTTTTCAGTTCCCAGGCATATCTTGAGTGCTCAGCAATCTGACCACACAAGAATGCTATTCAGCCCGAGAGCAGGATGGCATAAGGTAGATGGTTAAGG:1 + chrX 607306 3' + Tabor 94 2 64.00 TCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCT:1 - chr3R 29288672 3' + Tc1-2 477 1 69.31 TATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTG:1 - chr3R 17495762 3' - Quasimodo 34 2 73.27 GTAATTTACTTTTCAAATACTTCTGTAAACTATTATCTGAAAATGTATTGTGTTGTGTGATTATTAAATGTAGTTTATGTAGGTTTTTTTGTTGTCTAGCA:1 - chr3R 24680516 3' + looper1 239 1 83.17 GCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGTTTTTGCCGCCCTCGCCATGTATTGTTTACTAGTCTCCAAATTAAGACATGCATCTCTA:1 - chr4 437318 3' + 1360 429 1 59.60 GTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTTCATTTTTCTTCTTTTTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTATTGTTCGAGTAGCGCTAAACGCTCCATCATTTTGCG:1 + chr2R 12773361 3' + Cr1a 167 1 66.34 AGCTANCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACA:1 - chr3R 15072557 3' - pogo 14 1 62.38 ATATGATTGATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGGAGTGATAAAATTTTCAAAAAGTTTTGGGATAGTTGCCAGGGTTGCCACCGCCAAGTGGAAGGCAGCG:1 + chr2L 17928705 3' - Q-element 178 2 68.32 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAGA:1 - chr2R 23584735 3' + HMS-Beagle 220 2 48.00 TTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGA:1 - chr3L 15099554 3' + G4 3813 1 69.31 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGCGGCAACACACGCGCAAAACGGCGTGTTCGAATCTCGTAAAAA:1 + chr3L 2485967 3' - jockey 27 1 38.61 TGATTTCGCCCCGAAAATCGTCTTCTAACAAAACTATGTGTGTGCTGATTTGTGTTTCAGATCCTGCTTAGAAATTCGAAATTGTCGCTTGGACGGCTTGG:1 - chr3L 7123042 3' + 1360 3187 1 69.31 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTAGATCTA:1 + chr3L 5102453 3' - jockey 4710 1 64.36 TTGTANGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTGCGACCTTCTCCTCCACCTCTTAGAATAG:1 + chr2L 16674939 3' - roo 18 2 61.39 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAAT:1 + chr2R 4483266 3' - Ivk 35 1 55.45 TCTGTGGACAGCCTTCGTCTTATGAAAAAGAAAATATAGTCGTAAGCCTTTGGTAAGCGCGGAAAGGCTGATTATGCATTTATATTTGGTGGCCGTAAATT:1 - chr2R 4729831 3' + Burdock 6105 1 56.44 AATTCCACGGGCAACGGTGTATTACCAAATAAATAAATATAAAAAAAAAACACACAACCAAAAACGTTGCGAGAGCTCCGACATCAAGGCCGCCGATTTCG:1 - chr3L 22535330 3' + Tc1-2 454 1 70.30 AAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTAAATATAGTTTG:1 - chr3L 2949027 3' - 1360 223 1 75.25 TCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGAAGCCATGGAAGCTCTACTGTAGTTGCGAGGATGGAGAAGGCAAACACCCATGCCACACGAC:1 + chr2L 9564857 3' + flea 283 1 71.00 TAACACTATCACGTCGGGGTCACCAATGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAACAGATACAATTTTATAAAGGCATTTATATTTGTC:1 - chr2L 22391169 3' - diver2 390 1 66.00 GTATAAAGGAAATGGAATGTTTAGGAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAGAGCATTGGCAATCAGCATCGATATGC:1 + chr2R 6526862 3' - jockey2 3259 1 73.27 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGGGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGC:1 - chr2L 16201520 3' - hobo 44 1 68.32 TTCCAGTAGACTACTTTTAATAAATTTATCCCCCACTGCACTCTCGACTGTATTAAAGCTCTTTTTAGTTTATTTGCACTAAAATTCTTAATCTTAAGCTG:1 + chr3R 13611040 3' + Cr1a 3976 1 76.24 CTTCGNCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACATCGATTGGGCAGAGCAATC:1 + chr2L 10378543 3' + Doc 406 1 58.82 AGAAAAAAAAAATATATATAAGAAGAATATACTTTTAGAAATCACTTTCGTGTAGATAGCTATCAATTTACATATTACTGAGTAGCCTGTATAG:1 + chr2R 18999084 3' + invader2 298 2 74.47 ACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGTGCCAATTAAAGTTTCTTCACCGGTAGGAACGCGAAATGAAATCAGCTGGCTGTT:1 + chr2R 13205328 3' - Tirant 448 1 57.43 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATC:2 + chr2L 14612089 3' + roo 9029 1 64.36 GTTTTCTTTGTTTTACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTATACATAACAATCTATCTATATATCTGAGTAAATCC:1 + chrX 11400887 3' - mdg3 5075 1 68.32 AAAGAGATCTGTACAAGCAAGACCACCACACCCATTGCCATGAGCTAGAGCCGGCCTTTACTTTGCAATACCCTTTGCATTGAGAGTACCACAAGTTAGCT:1 + chrX 19783818 3' + gypsy12 10115 2 56.44 ATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAAT:1 + chr3L 18337710 3' - Juan 4054 1 53.47 GAGCTTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTCTTAGACCTACTTGCGGATTTCTTTAGTT:1 + chr2R 4780338 3' - Quasimodo 481 2 71.29 TAGGACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGCTCAGATGTTCTCTGAGCTGCAGGCTCATTCTCCACTAAGATGAGATCGTCTTCTTTATACAAA:1 - chr2R 4878777 3' + gypsy8 4468 1 67.68 TAATATGTACCATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACCAACGCATCAGCACACCATCACACACATAC:1 - chr3R 10980153 3' + 1360 3149 1 74.26 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGCATTTGATATGTACTTCCTGATGTTTT:1 + chr3L 7075934 3' - roo 8708 2 75.25 AAGACCACTTTCCTTAAGAGCATGGCTCTTGTGGCCCCTTAACTACCCTACGTCCGGAAAAGTAGTAGTTGCTCAAAATATATTTTCAGGAG:1 + chrX 22664837 3' - Gypsy12A_LTR 1937 3 63.04 AACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAAGCTGCACGAGAAGAATCTTAACTAATACATTTGACAAATCAAATCTTTGGAATATTTGCAAACTGGC:1 - chr2L 19189645 3' + Doc 4403 1 77.00 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAA:1 - chr3R 23048438 3' - mdg1 7076 2 64.36 TTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTTCT:1 + chr2R 17937195 3' + Quasimodo 7338 2 60.40 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATGAATTTGTCGAGATTATGTGATTATATTCGCAATAAAATCTAGATAATTTTAG:1 - chr2R 16750636 3' + Tabor 462 2 48.51 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTAC:1 + chrX 11730339 3' - jockey 4781 1 58.42 AAATANATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATCATCATAATATTATTGTGTTTGTGTTTGCATTTCGAAT:1 + chr2R 7861759 3' - roo 6 2 74.26 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGA:1 + chr3R 29259625 3' - pogo 50 1 76.24 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAATGTACTTTTAAAACGATTTAAAGGACTA:1 + chr2R 6702060 3' + pogo 2056 1 77.23 CTTGCATAACAATCCAACATGCCATACTTTGTCAAAGGTCTGTTGCATATCGAAACTAGGTTGAAAACTTCAATCGAACCACATCGAGAAAAGTGACCCAA:1 - chrX 21632526 3' - Helena 426 1 55.45 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATGGCCACCCACTCCCAGGAGAACTTTTTGCTGCCACACAGCCGGCTTTCAATCA:2 - chr3L 5201454 3' - 297 6586 2 79.21 ATTTTGTGGACTGTCGCTGTCATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAACAATAATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCAGCTGTTAAAGTGACAATGGCATATG:1 - chr3L 17878750 3' + hopper2 371 1 74.26 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACAATTTCTGAGG:1 + chr3R 6735360 3' + copia 247 1 70.30 TGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGC:1 - chr3L 6044747 3' - Tabor 40 2 61.39 TTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATAATATTTGG:1 - chr2R 17626464 3' - mdg1 7037 1 76.60 GAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAG:2 + chr2L 3440506 3' - Juan 28 1 55.00 CCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTCAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTACCTGCTTCTGTCATTCGGCCATCATAAAGCATTTT:1 - chr2R 18496385 3' + Doc 336 1 73.27 TAAAATGGATTTTAAAATAGAAACCATTTTTTTTGCCATTCTATTTTGCCAGTGCTATTTTTTGAGCTGGTTTTCTGGTCGGGGCGTTGTTTTCGTCTTGG:1 - chrX 9787442 3' + Transib5 269 1 57.43 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCCAACTTTTG:1 - chr2L 8565444 3' + blood 361 2 61.22 ATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTCGGGGCCAAA:1 + chr2L 17646263 3' + flea 255 1 71.29 TATTAATTACAATTTACAAGATCATGTTTGTTCCATTAAAAGTAGATGTGAATATTAAGATAACTTCCTTTTTCAATGGTGTTTAAATAAAGATTATTTAC:1 - chr2L 4702268 3' - transib4 2606 1 87.13 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAACGAAATTAAAATGGCACGAATAGGTGTAATGCGAATTTTGGCCTGGGA:1 + chr2R 8310941 3' - pogo 2 1 75.25 TAAACATTTAATTAAATACAGAATAAATACAACACCCGATTTTTGACTATTCTAAAGCCATGATTGAACAAGCTTTTAAAGTATCACCAGAT:1 - chr3L 6874078 3' + transib1 1937 1 78.26 ACATAAAACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATGTACGGAGTGACGAAACCCAACCTGGAGAAGAAGAACAAAGAAAGGTAATAAAAAAGGTAAGA:1 + chr2L 6229317 3' + Transpac 477 1 74.26 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCT:1 - chr3R 12047417 3' + Stalker2 367 2 55.45 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTAGATCTACAATATAATATATAATCAGTACTTTCTAACTGGTTCT:1 + chr3L 5102490 3' - jockey 4673 1 77.23 ATAACGACGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCTGGAATGTAAGGAGGCACATGTGGCGTCTGTATACTGTGCAGTATGTATTTCTGCATAGAAATACA:1 - chr3R 32006427 3' + Bica 4907 1 71.43 TACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATC:1 - chr3L 18337643 3' + Juan 4190 1 56.44 TTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCACCACAATTCCCTAGTCCCCCCTTTC:1 + chr2R 5812774 3' + McClintock 192 2 68.67 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAA:1 + chr2L 16948720 3' - jockey 4711 1 62.38 GTTTCTCTTGGATTCAAGTGCATTTGCTCTTGGATACAAGTGCTCTTTATTCAACAAGAGTTTCCCGGTACGCTTTCATCAAATTGTTTTCCGGCTTTTGT:1 + chr2L 18334539 3' - Idefix 349 2 58.42 CTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTAAGTAAGGAACAA:1 - chr3L 15099550 3' + G4 3817 1 73.27 GCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGGAAAGTTCCCACACATATATACTGCTGCTGCTGCTCGAATGGCGGCGTTGATTATAAGCGCGAAAAA:1 - chr2R 9737592 3' - R2-element 3524 1 72.28 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTT:2 + chr3L 10013652 3' + hopper 1391 1 55.45 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCAGCCCACGAC:2 + chr3R 23275353 3' - roo 8669 2 70.30 AAGACTCAGCTCAATAGGCTCAATAGTAATACAATCTGCCTATATAAACCCAGACATGTCCCCATTCAGTTCTGCCTCAATCAATCGCGATAACCCTGGTA:1 - chr3L 24233790 3' + G5A 2464 1 69.31 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAG:1 - chr2L 3951597 3' + Transpac 267 2 71.29 TATGTAAATATATGTATATATGTATATGTATATATCGACACTTTTCAAGACGCGTGCCCGC:1 - chrX 13950198 3' + G3 4508 1 90.16 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTGATGACTCATTAATTGTCCAAAC:1 - chr2L 12324054 3' + roo 9018 2 80.20 AGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAACACACAGCCCAATGCAACCAGCCAGAAAAAAACCCAATACTCCCACTCCACCGACCCATTTTG:1 + chrX 10693094 3' + hobo 2581 1 63.37 TGAGCAGATAAAAACAAAAGATTGGATAGAGTGCAAAAATACTCTAATGCGCATATTGTGAACTAGAATAATAACAGTTAAACTAAGTGAAAACCAAATGA:1 + chr3R 2302007 3' - looper1 67 1 54.46 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCAACTTTACATTCTAGGTCTAACTT:1 + chr2L 10715316 3' - pogo 48 1 73.27 GAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTTCCGTCATTATGTGATAGGAATCTATCTCAAAATTATAAATTAAATATTCGGACGTTGTATGCACCATTA:1 - chr3R 19449179 3' + roo 18 2 73.27 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTTGTTTCGCTGCACGACTAAGTACTTCTATTGAATTTGTGCCCGCAGCATGTAGAT:1 - chr3R 27429994 3' + pogo 2087 1 65.35 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCAC:1 - chr3R 9418242 3' - hobo 44 1 78.65 CCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTTGATTATCACTTGTTACG:1 + chr4 303773 3' - 1360 56 1 73.27 CAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTTGGTTGGGAAAATTATGGGAGACCATCGCCAGCTGACATTTGCGAAGTTTTTCTCGCTATT:1 + chrX 15291320 3' + Quasimodo 6972 2 61.39 CGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATGTCGTTTTTACTAAGATGTTTAAAATGTAAATTTATGAATTAAAGTTT:1 - chr2R 22054595 3' - invader3 5229 2 62.38 TGGAGTTGGGTGCCATTTAATATAAGGGTGGGGTGCTGCAGGGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACT:1 + chrX 21907816 3' - springer 397 1 90.77 CATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTTCTCTCACTCTATCTCCCTATGTATGCCTATGTGTTGCGTGTGTGTGTG:1 - chrX 12660099 3' + F-element 327 1 59.41 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGGGAATCACGATAAAGAGTACTGAAGACAAGAGTTTTG:1 - chr2R 14351862 3' - Max-element 8272 2 62.24 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTCCCAT:1 + chrX 19426297 3' + mdg3 5463 2 59.41 TCATTAAGTGTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCAAATAGATAAC:1 + chr2R 5019443 3' + rooA 7587 2 49.50 CAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGCAGAGGGCTAATGCCAATCAGCAAGTTAAACCAAATCAGCACGCCGAAGCGCAAT:1 - chr2L 22809204 3' - blood 7211 2 60.00 CTGATGCGCCTTGGTACATCCGGAACTCGAACATCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGACCCACCTCGACAGCAACGCACCGCTCCACGCATAAATCCTATCC:1 + chr2L 12289264 3' + Doc4-element 2690 1 69.31 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCC:1 - chr2L 4160116 3' - Tirant 25 2 56.44 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGGGGGTTATTGTATTTTATTCTTGTTT:1 + chr2L 3085049 3' - copia 4899 2 57.00 AACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCGCTTCGGAATATATTACATAACTTTTTTTTATTGTCATTTGAAGTTTGTAGTATTATTCTTACAATATTAAAA:1 - chrX 9744690 3' + blood 166 2 76.24 ATTTTCTTTTTTTTTCTATTTTTTTCCTCAAATCTTTGCTCCATTTGGTGTTTATTTGGTGTCCACACTTGCAGACATTGGCACAGTTTCACATAGTCTTG:1 - chr2L 10053420 3' + S2 234 1 63.37 GTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGTCGTCCTGTCTTTTTCTCCGACTTGAACTTTTGCTTTCGTTTTGCCCATACTTTT:1 + chr3L 7752041 3' - F-element 267 1 56.44 GCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAAATGGTAAGACTGTTTGTTTTTACC:1 + chr2R 21073922 3' - jockey 4719 1 73.27 TGTAANTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCCTGCCCTCCTGTCCTGGCAACTAAGGGAAA:1 - chr3R 27775070 3' - roo 8681 2 62.38 GGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTAGTAGTAGTATGAGTAGTAGTGGTCTGCGGATTCGGCGAGTAGGAGGTCGAAGGGTCCTCCACAGACACGAGAG:1 + chr2L 11181830 3' - F-element 276 1 74.26 ATATATGTACATATGTACATATATGCATTACTAAGAGCCGCTTGAAGGACTCGGAAATATCTCACTTCTGTGGCACTTATTGATGGTCGATGCGAGATGTC:1 + chr2R 12532443 3' - G3 4507 1 83.17 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATATTTGTTTTACGACCCAGTGAGTATATCAGCAGAGCCCAACTGTGGCATCTAAAAATG:1 + chr3L 6506899 3' - roo 8671 2 57.29 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTAGGCGACGGGGGTGACGAGA:1 - chr3R 25097813 3' - P-element 6 2 72.28 GATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCAAGACTTATCTCTTCGGAGGGTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCT:1 + chr3R 6608805 3' - I-element 60 1 81.19 AAACCTATTGAAACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATAACATTAATTAATCAATATGTGTACGTTGGGCATTTCTCCAAAACTTT:1 + chr3L 19068521 3' + Juan 290 1 64.36 GGGGTGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGTAACCGTCGTATTGCCGTTCTTCTTCAATTGTCTGCTATGGAAGTCAGTACAGAATGCCTGTACA:1 - chr3R 12587600 3' - 1360 12 1 66.34 AGATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGT:1 - chr2L 18279922 3' - gypsy5 54 2 77.32 AAAAAAGCGTGCAAACTTATCTAGAAGTCGCGAAGAAAGGATTTGGGAAAACCTTATCGATGAGAGAAAAAGCAATTATAGCCCAGTGGCATGTGAATTCC:1 - chr2L 8269737 3' + Tc1-2 1216 1 56.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGAGTATATATATGTATGTATCTATTCT:1 - chr3R 27748643 3' + roo 400 1 68.32 TTTAATTTAATTTTAATTTTATTTAGCTTGAGTTAACTAATAGGATCAACGGAATTTTTGAATTAAGTGCGGAGCTTACAAACATATAAGGTAGTTTTCTT:1 + chr3R 13862615 3' + Rt1b 127 1 89.11 GCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCA:1 + chr3L 23182031 3' - 1360 3341 1 75.25 ATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAGACTTGGTGGTCAGAAAGAAAATGAGAGCCATCGCCATGGACTAGCTGAAGAAAAAA:1 - chr3R 15791960 3' + mdg3 5066 1 62.38 CAACGGACAAGGGATTAACAATGTCCACTACGCTTATCGTTCTAATTCTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGCAAGGATAATGACGATGCCGTCTGA:1 - chrX 15212344 3' - accord2 7403 1 73.27 AGCAAATAGTGACCCCCCAAGTCACTAACAGTGAAATAATAGTGAAACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAAAGTTAGTAATCTTGCACACTTAAATCC:1 + chr3L 17151795 3' + X-element 112 1 78.22 CTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATATATTAAAAACTGTAAAATCAGGGAGAGCCATAGAATGGGGTACAGTGGGG:1 - chrX 8091232 3' + 412 300 2 76.24 TCTTTNAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACCATATGTATGGGGTAGGTGCATGCATGTAAAGGGCCCTTATGGCAC:1 + chrX 3763230 3' - 297 28 2 60.64 TTTTTTGGTTTTTTTTTTTATATTTTGTTTAATAGCATCCGAAGTTGCTGTTGTTGTTCTTGTCGATGGTACGTGTTGGGAATGTAGGACATTGTTATGC:1 - chrX 20917907 3' - gypsy11 3930 4 76.00 CAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACGTATGTCGTTTTGCCAGTGGACAGGATAGCACCGGTTAAAA:1 - chr3R 3697640 3' + Doc 312 1 61.39 AAAGCGAACGGTCGTGTTTTTATTTTGTGTTTGTCTTCTTTAATTATTTATACACAGAAACGTGTAATTGTTACATCATTAAATATAGA:1 - chr3L 23206730 3' + Cr1a 10 1 57.30 CGCTAAAAAATATAAAAAAAAAATATTAAATCCTAAGCTGCTTGGAGAAGTCCATTGAACCCTTGGACTTGTGGGAGAGTTCTCTTAGTAGTG:1 - chrX 17227472 3' + G-element 4324 1 59.14 AAAAAATCGTGTGCCAAAAATTCGCATCTTGTTACTCCTAGAGTCTTTGGTCACCGTAATTATAAATATTTATGATAACATATAGTTACAAGTCACACTAA:1 + chr3L 6091296 3' - 1360 39 1 51.49 GGTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATCTAATTATAAATTTTACTTATACGATCGAGCATGCGGATTGTAGAGAT:1 + chr3R 5732774 3' - jockey 4987 1 58.42 TTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATAAAAAATTAACAATTTAAATATTAAATGTATCAGATC:1 + chr3L 19463757 3' - invader4 40 2 67.33 CGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCC:1 + chrX 21994002 3' - McClintock 5959 2 71.29 CTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTGGCTGCCCAATTTGTTTTCCATTTAGTGTCCAGCTGGATCAGACATCTC:1 - chr3R 22649341 3' + copia 124 2 53.47 ATCAAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTG:1 + chr2R 4659338 3' - S-element 1472 1 48.51 ATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTAGCAAAAAAAAGGGGGGATCGTTGTCTCGTCGCTCGTTCGATTGAATCAAGACC:1 - chr2L 14236653 3' - pogo 197 1 55.45 ATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCCCCACCGATTTTCCCCTTTTTTCCTGCCA:1 - chr3L 7022758 3' + McClintock 155 2 58.33 CGTTTAGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAA:1 - chrX 21668948 3' + mdg1 7427 2 55.45 TATCTTCGTTTCTAATTTACCATTCGGCTTTTGTGATTGTTCTGAGCATTTTTTTTTTTGTTTTGATTCCG:1 + chr3R 15877210 3' - Porto1 4371 1 90.14 CCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAAAGAGAAGGTGGCACCGTGGATATAATCTTGCCAGCTTT:1 - chr2R 22781250 3' + Doc 4492 1 62.38 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGACCTTGCGTTGACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAA:1 - chrX 20806882 3' + opus 457 2 75.26 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAA:1 - chr4 1156247 3' - blood 7055 2 76.24 ATATTATATATATAAAATATAAATAAATAATATTAACAATTACATGTACTTTTAATTAGACGCATAAGCCAAATGTCGAGAGCAGATCCAATTGACATACG:1 + chrX 7808157 3' - transib1 1911 1 77.23 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTATAAACTATTAAGTTATGTTACCTTTT:1 + chr3L 2019738 3' + 412 7527 2 55.45 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTACACAAATTATTGTATCAAAAAGTATAAACGTATAAAAAGTGTTT:1 + chr3L 1194792 3' - X-element 46 1 60.40 GCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCTGACTTATTTTCAAGTGTACCCCAGCTGCTGTTGTTGTTGGGCGAGTGTAAAATAGTGTTTTTGTTG:1 + chrX 20920046 3' - F-element 466 1 69.31 CTGTCTTCCGACATTTCCCGCAGTCAAGGCCTGCGGGTTTTTATCAGCATCGAATGGAATTTAATAAGAGAATATCTATATTCTTTCAA:1 - chrX 8328396 3' - baggins 442 1 57.30 CCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGAAGCTTACGATA:1 + chr3R 26530951 3' - blood 7013 2 73.12 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAATGTACTTTTAAAATGATTTAAAGGACTATCGCAAAAATCGAGTAAGTGTGTTTAGTCAAG:1 + chr2R 6702092 3' + pogo 2088 1 64.36 ATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGACCCTGTTATTAATAGATTAGTGCTTTTGATAGTTGAAAGTGCACAGAAAGTAATGAAT:1 - chr2R 16207478 3' - roo 494 1 60.40 ATAAATAATAAACAAAAATAAATTATAGCATATGTTTGGGCGGTCATTTGTGTGAAGCAAATACAGCAATAAACTTCCGAAGCTGGTGTCTCACGACCAAA:1 - chr3L 11582306 3' + BS 5096 1 83.17 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGG:1 + chr3R 27775138 3' + roo 361 2 72.00 TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATA:1 - chr3R 21092439 3' + roo 9048 2 49.50 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTTTACAGCTCTA:1 - chr3R 20878436 3' - 297 8 2 65.35 ATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGAGTTTTTAGTACTTATTCTGAAATATCGACTACTGCTAGT:1 - chr3L 23632876 3' - Doc 114 1 71.29 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGC:1 - chr2L 18279899 3' - gypsy5 24 2 50.00 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACTTT:1 - chr3R 17896953 3' - hobo 41 1 75.00 AGATAACACGCGCTACTACCATTTAATCAGTGCTTTGGATGCTGATTGATGGATTAATATTCCTCGTGTAGAACTGTAATTATAGATGCATTAATATATGT:1 - chrY 511682 3' + Chimpo 431 1 54.46 GAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGAAGCAAATCGATACAAAGTTACAAGACAAATAAATA:1 + chr2R 2529517 3' + I-element 292 1 74.26 ATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAAC:1 + chr3L 23839714 3' - McClintock 5976 2 54.46 TTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGATGTGCAAAATGAGTTAAACGAATGGCAAACGGGCGGAGCCAAGC:1 - chr3R 12582441 3' - Chimpo 153 1 56.44 TATATTATTAAATTTTATTTTTACCAGCTTCGGTCAATTTCAATTATCCATTTGGTTTTGTATTTAAGAATCTCGAAATTCCTCGAAGTATGTAAAGTTCC:1 - chr2L 17212832 3' + hopper 176 1 59.41 TTTCATTATTTTCTTTTTTTTTACTTCTTAGTGGAAAACTTGGCATTAGCTTGGTGTCATGGATAACTTCCGGCGCTGGCGTCATATATCTACCTCCAGTG:1 - chrX 19527321 3' - transib2 2642 1 67.33 TCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGCATTTAATGAATTAAACTCGCATATGACACTGATTGCCCTACTGCTGCCATTTGTCAGGCA:1 + chr2R 24478027 3' - I-element 4925 1 64.36 TTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTGTGTCCTCGAAAATGAAAGTGAGTAACACTGTTCAC:1 + chr2L 2077904 3' - I-element 273 1 64.36 ATAAGCATTGGTGAGCAAGATCGCGAACGTTTGCATTCTGTAGGTGCTAGGTCATTGATCTGATGATGACTAGCCCAAAGGCAATCCTGGCCCTTCAGCGA:1 + chr2L 18644523 3' - Doc3-element 384 1 61.39 ATAGTTCCTAAGATCTCGACGTTCATACGGACGGACGGACAGACGGCCATGGCCAGATCCTATTCAAGAATATATATACTTTATGTGGTTGGAAACGCTTC:1 - chr2L 22758837 3' - INE-1 143 1 73.27 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCTTTAGTGTAGTACTTTGAATATATCATTACATATGTAACAGCGGATAAAATCTGCCTAA:1 - chr3R 14917171 3' - HMS-Beagle 6811 2 64.36 CCCTAATAAGATTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGATGCGGTGTAATGTAATTAGTTGAAAATGCATTATCTATAAAGATATATTTAAATC:1 + chrX 21448840 3' - Doc 4566 1 52.81 CACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGA:1 + chr2R 5840688 3' - Ivk 34 1 55.45 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCA:2 - chrX 21531017 3' + roo 9038 1 57.43 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGAAAAAATAAACGCCAAAAACCATAAATTCGGCAAAGATATGCAAAACGATGAGAAATCGA:1 - chr2R 7911739 3' + S-element 1707 1 68.32 GTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCCCGGCTTTTCTCGTCGAGTTACTTATGTATGTTAATGGGCTGCC:1 - chr3R 27385890 3' - accord 439 2 56.44 AGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATATATGCTAAAATCATTCCAAAGATGTACATGAACTTCACACTAAGGACGTTGGCGCCTTT:1 + chr2L 2308739 3' - HMS-Beagle 6801 2 74.26 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTGTCCAGGTAATTTATCAG:1 - chr2L 15947370 3' - Transpac 4930 2 67.02 AAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTAAAACATGCACGCATTCCACGCATAACTCTCACTAATATT:1 + chr2R 24484112 3' - I-element 269 1 61.39 ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACACAATATCTGTGTTTCGAAACCCTTTTACACTTAATGTTATCATGCAAAGATTTTTTAGGATTATAT:1 + chrX 15392047 3' - 1360 6 2 50.50 TTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACTCGAACTGTCGCAATTTACATCCTGTCCAATGCTGA:1 + chr3R 1831834 3' + Cr1a 228 1 68.32 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCCTCTACTGTGCACGTGACACCAACAGAAGGCCTTCGGAAACTCTGGATTCCACAGAGTGCCTGGCTG:1 - chrX 5092902 3' - roo 8673 2 70.30 GGGTGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGCAGTCAACTGCGAAACGGCTAAATCGGTTACCCTTATGTCGCTTTGTCTCTGGCTTAAAATTGATT:1 - chr2R 24236902 3' + hobo 269 1 68.32 TGTATGTACATATGTATGTATATATGTATATCAGTGTATTAGAAGTGTAATATGGGAATCGCATTTG:1 + chrX 18369808 3' + invader3 5087 1 91.04 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACCCACATAAGCCGCATAAGCCAAAACAATCAGTCGGACGGGAGTG:1 - chr3R 6608772 3' + I-element 5325 1 56.44 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTCTGTGGCTGTGGCCAGCCCCCGCGGCCCCCTTTTGCTATCTCGCTTGCTC:1 + chr3R 9551492 3' - P-element 27 1 52.48 TTTTTTTTTAATTTTTATTGTTTTGACTCTATCAGAAAGTACTTAATCCCGCTCATCCATATGGGAAACATGTCCGACATGTAATGATGATGACATTATTG:1 + chr2L 17756022 3' - Doc 4691 2 89.11 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCACCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCG:1 - chr2L 12815059 3' + hopper 1379 1 67.44 CATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGA:1 + chr3R 19449409 3' - roo 8645 1 73.27 TTAATAATTATGTTTACAATATAAGATAATTGAAGATAGTAAAATTGAAGAAAATAAACCGAACAGCAACCTGCCAGAAGTGACCTCGCGATTCTTCGATA:1 - chr2L 19260117 3' - Cr1a 101 1 69.31 AGATGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTC:1 + chr2L 16884872 3' + pogo 2051 1 75.25 TGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGAAGAAGCATACGATAATGATGAGCCGACCGACCGATGAAGCTGCCGTTGATAACAATTA:1 + chr3L 15342680 3' + invader3 5197 2 55.45 TAAATATATTAGTGTTCATGTGTGAACACCCAGATTACGTAACAATATATTACGGATATCTGAGGGGGGTACAGAATGCAACCCAAAAT:1 - chr3L 19377714 3' - roo 8671 2 60.67 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAAATATATGTATAAGCATGGGAAAGTACTATTCAATACAAAACGTGTGTACG:1 + chrX 16715378 3' + flea 236 2 61.39 CAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGAGGGGTTCATAAGTAGTATTATTCCAGTCAATAC:1 - chr3L 23785088 3' + Quasimodo 6945 2 67.33 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATG:2 - chrX 16995096 3' - jockey 29 1 56.44 TGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAATGAATGTGGGTACAGTGAATACTCGAAAACAGCACAGCATGGCTACGGTTTTATACAAATTTGTAGTAAAGATACAA:1 + chr3L 18501197 3' - hobo 2662 1 80.20 AAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTTTCTGGGCGGTCTCTTT:1 - chr3R 32005876 3' + invader4 296 2 58.42 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTT:1 - chrX 8972390 3' - 1360 43 1 68.32 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTA:1 + chr3R 11263440 3' - roo 8719 2 81.19 CAATANTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTACTTTGATAGAACGTCAGGAATTCTATTCACTAT:1 + chrX 1184002 3' - Ivk 5344 1 65.35 AGTGGCGCGCACCCAGCGCCTGCAACAGGCCCCTGCCAAAAATCAACAAATATTGTTATACAACCTTAAGCTTTTGCTGAGATAAGGTGGAGAAAACTATT:1 - chrX 7683674 3' + HeT-A 5645 1 55.45 TGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATATTACAGTGGAAGACAAACTAGATGTGGACTTGGCAGCACTCAAAACTTG:1 + chrX 19986425 3' + Stalker2 7623 2 56.44 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCCAACTTTTGGGCCAAAGAC:1 - chr2L 8565434 3' + blood 368 2 67.33 CCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCACGGGAACGGTTCCTTATGTCTGCTAAATA:1 - chr3L 26417983 3' + Quasimodo 6940 2 71.29 AACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTT:1 - chr3L 10477546 3' + copia 221 1 58.42 ACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAATGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGTGCAAAGATCCCAGTCTCCGGCTG:1 + chr2R 23495741 3' + jockey 4680 1 74.26 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCG:2 - chr2L 2074726 3' - roo 8716 2 80.20 GTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGTGGGGGCTGAAAGAAGGGGGCTGATTGAAAAGGTG:1 + chrX 5858074 3' - accord 7019 2 64.37 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACCTATTATTAAACGATTTTTTTAATTCCAACAAAGGAAGAATTAGAGCTT:1 - chr2R 694094 3' + flea 4992 2 58.42 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCATGTTGA:1 - chr3L 12888199 3' + mdg1 411 2 68.32 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCTATGTGCAGCTTTCCGT:1 - chr3L 22831268 3' - 297 6606 2 56.44 CCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAATTAATTAAAAAAAAGTCCATTAGTGCAACTGGCCCTGGGAATGAAAGC:1 + chr2L 3666061 3' - Cr1a 4045 1 60.40 TGAAAGAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCTTTTGATGGCCCACTG:1 - chr3L 10143154 3' - 297 6605 2 56.44 AAGACTGCACGATATGAACCCGAACGCACTGAGAGCGTCTCTCTCAAGCCCAACCCACCTTTCAACGTCTTGCGCCACCTGAGATTAATCTAATCTTTAAC:1 - chr2R 10525039 3' + Doc3-element 404 1 59.41 GGACACGCTTCATCATATTAATGATGAAAGGTGGAGGGAATCAAAGCCGCAATAAAAGTTTAAATTCGCTTCCGTTGCCTAGGTAAAATGTAAATAATTAA:1 - chrX 12823191 3' - Rt1b 4770 1 53.47 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGGATTAATTTATATGACTTCGCCAAT:1 - chr3R 8555848 3' + 412 461 2 57.43 AACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGACCTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGG:1 + chr3R 4544082 3' + flea 5010 2 70.45 TATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGCCATGTCCGCCTGTCCGCATGAACTTCGAAATTCCGATTGCCTCTTATAATAAGCCATACTATTTAAACA:1 - chr3L 6316769 3' + INE-1 81 1 53.47 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGCTCACAAGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 + chr3R 30018056 3' - hopper 49 1 78.22 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGATCGTCAGCCGAACACGA:1 + chr2R 16334045 3' + P-element 2856 1 41.30 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAG:1 + chr2L 19684022 3' - jockey 4705 1 56.44 TCGTAAGCCTCAAGTGTTTTCCTCTTTATAGATCGAGCTTCCAGAAGTCAATAATAATAGAGTGACCGAACCCGATATATAACTTTAATACTTA:1 - chr3L 25256166 3' + Burdock 34 2 63.83 ATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTGATAATCAACATGAAAATCAAATTTGAATT:1 + chrX 6388438 3' - 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roo 8672 2 71.00 ACTTAGCCATTCATGTAAACAAATCCCAAACCCAAAGCAAATAACCAAAGCAGTTTTGCCTGCTTACTCTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 - chr2R 1982172 3' + 17.6 192 2 70.30 TACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCT:2 - chr2R 12621682 3' - hopper 48 1 66.34 CTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATCAGTTTTCCCAGCCCTCTGCCTTTTAAATTTATTTTCCCGGGTATATAGGGTCCATTTTTCG:1 - chrX 22751811 3' - F-element 4658 1 61.39 CATTTTTGAATGTAACATTACATGTGGTGAGTTTGGGGGTTGGACATAGTTAGCAATAACAACAAACAGCAAGATTGTAAACTTCTGAACCGAATTTTTTA:1 + chr2R 17188536 3' - TAHRE 10321 1 56.44 TTGGGNGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCTTATAAGTAGGCAATAAAAATGTTCATTTC:1 - chrX 7045574 3' - jockey 4760 1 73.27 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGATGAGGAAAGACAAGATC:1 + chr2L 14612089 3' + roo 9029 1 64.36 GCTGCGAGGGCTTCGCCTTTTATTCATTCTTTCATAGGTTCTTACCCCCTTTTAATCCCCCGCCCAGACGAAAGGAAAGCA:1 + chr3R 24521550 3' - rooA 7530 2 54.32 GCTAGGGAAGGTAAATTAATTAAAAGTAATCTACTGGAATGAGGAGGTAATATACAACGTGCAGTACGAAGCGGTAGAGCGGCTTGGCACAGCAGAGTTGA:1 - chr3R 1848677 3' - Cr1a 3993 1 60.40 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAAATTTCCTATCACTAAGAGCTAGCTGAAA:1 + chrX 21056252 3' - FB 49 1 73.27 GTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATCGGTTTCGATTCGCCGTGATTCACTTGCCGCTCTCTCTCTGTCGCGGTGTTTGTGATAGT:1 + chr3L 9401208 3' - F-element 4446 1 62.38 ATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGAAGCCGCTTCTCATT:1 - chrX 22855186 3' - P-element 12 1 67.33 CCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACCACCCATTTTATGCCCCATAAACCAGAAAATCCACTCCCTACAATCGTCAAAGCCTTCTGGACTTTCCCA:1 + chrX 21247769 3' + Tirant 8219 2 72.00 CTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGGCATGGACTCCGGA:1 + chr3R 29125629 3' + P-element 133 1 27.72 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGG:1 - chr3R 20477051 3' - 412 31 2 61.80 GAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTCTTGATTTCCAGGGCTTTTAGATTTTCGTATAGGCCCCGCAGGTGCGTTTTATTCGCAGCGGTTGTG:1 + chr2L 16376803 3' - baggins 5350 1 68.32 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCG:1 - chr3R 19446147 3' - 297 6607 2 57.43 ATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAGCAACTATAAGGTTGGATAAAAATATTTTTAAAGACAGTTCATTGAAAGGATTTATCATATTGAATTAATTTAG:1 + chr3L 10477638 3' - copia 178 2 73.27 GCCCTCCAACATAATCTCCATAAACAGCAACAACATCTAGAAGCGATAGCAGCAGCACCCAAGTCAAGATCAACCCCTTCAAAATAAAGAACCCACAACCA:1 - chr2R 22935776 3' + gypsy 7355 2 78.22 ACAATNAGGTCTCAAACTGAACTCTGACAATTATTCTGATTTGATTGAACGGTAAATGATGAAACCTTGTTGGGGTTGGAGCCACCACCAGTGACAATCCA:1 + chr3L 25987905 3' - Idefix 476 2 62.38 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGTATATGGGTATTTGGTATTACCTGAAGTCTGGCTCA:1 + chrX 17830792 3' + P-element 2873 1 55.84 TAATAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAGAAGATCCAATAAATAACGCAATAAGTTTATGAATTTTAACTGTGATTTCTTTAAATTGGT:1 + chr2R 2494814 3' + Doc2-element 4711 1 73.27 GATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGACGTTCGTTGTGATTCTGCCCCAACTCGTGGCCAGGACAAAAGGCTCGGGTTATCCACGAG:1 - chr2L 9853395 3' + hopper 461 1 58.42 GGGCGCATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCATTAGAAGCGTTGCAGCCCCTCACTGGCGCTCCCTTC:1 + chr3R 28129773 3' - Max-element 479 1 63.37 CTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAATGTCGACAGAGGGGTACAAGGTCAAATCCGCGATAGGGCTTTTGCTGAGCGGTTGGAGCTTAG:1 - chr2R 5864637 3' - F-element 54 1 69.00 AAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAAGTACACTGCCAAAGTATACGATTT:1 + chrX 18942314 3' - FB 51 1 77.23 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCGCGATGCTGCCGATGCCTTTGCCGAGATTAATTTAATGCGC:1 + chr3R 27748752 3' - roo 15 2 64.36 TAAGCCGCCTCCAATCTACATCAGAGAAAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAAAAGAGCGTATCTGACAAATAAATCTTCGAGGACGAAGCAGGCA:1 + chr2L 17626475 3' + Fw2 205 1 58.42 AATAAATAAGGCAAAAAGAAGTGGGGCGGCAAATTTGCAATATACAAATTTGTGGGATCCTGTTCCTGTTGCTGTGTGGTTGTTGTATGCAATTGGGTCAG:1 + chr3L 5163984 3' - Q-element 513 1 83.17 GTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATAAAACTGATTGCACTTCTTTTGAACATTGATAGCGTTGCTTGTCATTCGAAGACATTTTCT:1 - chr2L 4145182 3' + I-element 5015 1 63.83 CGTCAGCAATATCGCTGGGGGTATTAAAAACCGCAAAAGCAAGTTGCCAAAGAACAGAGTACGCGGAAAAATGCGTCTCGGAT:1 - chr3L 5229907 3' - BS3 206 1 75.90 GTATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAA:1 + chrX 23182893 3' - Idefix 46 2 75.25 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAG:1 - chrX 19986356 3' - Stalker2 7280 2 59.41 ACAATCATAATGGGAAAATCCTAATCTTCACCCAAAGTCGGAGTCTTATATTATTTCCACATTTTTCATGAAGGTATTTATTAATTCAACTATTGAAAACC:1 + chrX 22518862 3' - 1731 276 1 72.28 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGCATGACG:1 + chr2R 12082427 3' - mdg1 7050 2 67.33 AATTAAATATTTTAGAAAACTTTGCGAAAACAAATTTTATATGTGTTTTAATTGGTCTTGTGAAAATAAAAAAAA:1 + chr2L 5071863 3' + NOF 3972 1 77.33 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGT:1 + chr2R 13644483 3' - Burdock 6184 2 76.24 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAATATATAATGCCGTTGGAAGGAGAGACCCGAAAAGGATGTTTACTT:1 + chr2R 18675566 3' + opus 472 2 59.41 CAGCCAAAGCTGTAACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGCGAACAACTGAACGATAAGCTAAGGGTGTAGGTGCGAGAGTACAATGGAAAGAGCTCCCGAGA:1 - chr2R 1247683 3' + gypsy4 325 2 64.36 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAAAAAGTACGAGTACGAATATATAAATCATATCTGTTCT:2 - chrX 10672265 3' - mdg1 7042 2 73.27 GAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGATGTTTCTTGCGCTTCAAAAGCCTACAGATCGATTATCTAT:1 - chr3R 8458192 3' - HMS-Beagle 6800 2 75.25 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCGGCATCA:1 - chr2L 17646158 3' - flea 4775 2 61.39 CAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTCAACAATGATCTGTCTTTCAACGCATTGCAATCAACAAGATTCAATAGA:1 - chr3R 19341225 3' + I-element 4999 1 52.48 TGCACNTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTAGTAGGCTACGCAGATGCTGACTGGGCCGCCAACATTGACGATCGCAGATCCTTCACAGGTTTTGCTTTTT:1 - chr3L 25611871 3' + Stalker4 209 4 80.20 CGACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTTTATTCCCTAATATCCATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACA:1 + chr2R 4886003 3' + INE-1 579 1 62.38 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGAGTTTCTAA:1 + chr2L 17722839 3' + blood 7356 2 58.42 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTT:1 + chr2L 7255823 3' + P-element 2868 1 60.40 AATAATAATAAAAATAATGATAAGGTTGACCTGTTGTTAAAAGGCATTGAATGCCCTTTGGTCATGGCGTTGATTAGTCCAAAAATGAAAATGAAAAAAAA:1 + chrX 13247587 3' + mdg1 25 2 60.40 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAACACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGACTTCG:1 + chrX 2799717 3' - Tirant 8120 2 66.34 CGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGGCACATATTTCTGCGCTTGGCATTG:1 + chr3L 4774410 3' - accord 214 2 75.00 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGC:1 + chr2L 3388135 3' - F-element 315 1 52.48 ATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCATACCAGCAAGCGGCGAGAGCGAGCGCTGCGTTCTCTT:1 - chrX 16217328 3' + F-element 4411 1 62.38 AGGTTTAGTATTGTATACTATATTAAATTTTGTTAAATAAATAAAATTAAGGGAGGAGCACAGAAGCGCCACATTTAGATATTTCACACATTATTCCTT:1 - chr3L 17834539 3' + Ivk 5353 1 52.53 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTA:1 + chr3R 19446208 3' + 297 347 2 75.25 ACATTTTTCTAACGTGTGGGCGAGGTAGTTTTGGGCGGTTGAAGGTTTTTGGCAAGTCGAAAAATTGTTTTCAAATCGATAGAAACTTACAAGACTAAT:1 - chr3R 2972393 3' - INE-1 255 1 58.59 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCCAATTAAAGTGG:1 - chr2R 13295625 3' - 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Porto1 4225 1 63.37 TATGAATATCTTATATATCTAGTCTTATCGGAAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGGAATA:1 - chr3R 27230973 3' - 412 264 2 87.10 AAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGAGCGAGATAAAGCCAAAACCGCCAAAGAAACTGAAATCGAATTAGAAACGAAACAG:1 - chr3R 18241361 3' + G6 394 1 70.30 CATAAGATATGAACGGAGCGCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTTCATATGTTC:1 + chr3L 23635040 3' - roo 8707 2 69.31 AACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTA:1 + chr3R 4544089 3' + flea 251 2 74.74 TATGCATAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCAAAAAGGCGATCATTTCATTTACCACTGTCGC:1 + chrX 5129566 3' - Idefix 14 2 62.38 AGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAAAATATATATATATATACTTTATATATACGTGATTTTGTGTGTGAAAAAATGATCAGAATATGAGAGCGAGC:1 + chr2R 5745479 3' - INE-1 97 1 57.43 CGAAGGCTTATTGCATATCTATAAGAACCGCGTTGGAGTACTCGCAGTCACGACACGCTAATAACGCAAAGCCAAAACAAATACCAT:1 - chr3L 5576094 3' - Helena 394 1 52.87 ATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCG:1 + chr2L 17311136 3' + S-element 1671 1 74.26 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACA:1 - chr3L 7550718 3' + 412 456 2 60.40 TAAAAATAAATTATTAATTCCAATTGATAATATGTAACCGCTCCAATTAGAGTATTCAAAAGTCGACAAGTATGCCTCGTTTTTTAAAACACACTCTGTTT:1 - chr2L 16382704 3' - looper1 231 1 89.11 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTAATTGGCTCCAATTGCACGCAATTATGGAAAT:1 + chrX 20047614 3' - roo 8707 2 78.22 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATGTATGCAG:1 + chr3L 17307313 3' - blood 18 2 61.00 TGTATNTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTCCGAGAG:1 - chrX 21017791 3' + 412 7498 2 68.32 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTGGAATTACTCACCGATTGCAAAGGAGTAATGATTTAAAAATATTG:1 - chr3R 31194461 3' + Transpac 5202 2 55.45 AAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCACAGGGGCTGCGCAAACAACAATACTTACCTGAAACGAGGGGAAAACGTCACAATTTAATCAGC:1 + chr3R 31945635 3' + Quasimodo 159 2 67.33 AGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAATGTGATAGACGCTAATATTTTTTATTAATTTGTCATAATTTTTTAGTTGACTTGAGCGGTGGTGAACATACCATTA:1 + chr2R 12310229 3' + Tc1-2 1317 1 77.23 AAGTGATCATCGTCACCATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCAATGAAGTTGATCAGGAAAGCCGTGCCGCACACAGCCACTGGAACTGTAAAA:1 + chr3L 5602505 3' + Rt1a 4717 1 56.44 ATGCACACACACACACACACATCAATCAGCCATAATGATCTGGTACAAGATGCAGGGCACTCTTGCCACTTGAAATTCATTTTTATTGAAATTTGTTTAGG:1 - chrX 12528239 3' + accord 7027 2 55.45 AGATACCCGTTACTCAGCTAGTGAAAGAGCGTACGAGAAATTCAAACATTTAACTGTCATATCGATAGAAATAAAGCATTTTTTATATTAATCAACAG:1 - chrX 20453727 3' - INE-1 542 1 79.59 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAA:1 - chr3R 12047422 3' + Stalker2 7610 2 60.40 AAATTTAAATTAATCTTTTAAATTAAGGCACAAACAACTAGAATTGGATGTAGATGTCTGATATTCATTTGTGATGATGCAAAGGTAG:1 + chrX 20864473 3' + 1360 3048 1 77.27 TGTCTNGCGTATCCAGACACATGCCCCATATGCTCACTTGTGGGTCAAGGGGGTTGGAGCCCTGCAGCCCTGCAGCCCTGCAGCCCTCTACGTGTGCCATT:1 - chr2L 18340512 3' + R1A1-element 5230 1 50.50 CGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAGGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCCAAAGACCCTAGAATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGGC:1 + chr4 311378 3' + Tc3 235 1 59.41 TGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGTTGACGATAATAACGCAGATGAATGGAAATACTTTACGAGTCACTGGGGTGAACAGAAATGTCAACATC:1 - chr3L 22395378 3' - F-element 479 1 60.40 TAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGATATATTTCCCAAACATTAATGAAAAAATAAAACAGATA:1 - chr2L 23374385 3' - Idefix 7023 2 73.74 TATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTT:1 - chrX 15355068 3' - X-element 4698 1 49.50 CCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAAAAATGAGACATAATCTGCGAGGCTGCTCAGACCAAC:1 + chr3R 26321714 3' - blood 7014 2 76.24 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATTCGTTTTATTGCTTAATTTGGGTCTCT:1 + chr3L 4876818 3' - roo 14 2 65.35 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGGTGGTGAGTTGCAGCGGTCTCAGA:1 - chr3R 8277880 3' + P-element 2882 2 74.26 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGTTTCTCCTGTTTCAAATAAAACAAAGTATTATTCTCTAACCAAGTGAAAAATTCCACAAAGGAATA:1 - chr3R 4546163 3' - flea 4757 1 67.33 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTTA:1 - chr3R 20477034 3' - 412 17 2 58.70 TACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCGTCCAAATCTAAGACTTTATCTGCTGCTCCTACTATCTTACTCCAGACTGCTCGGAGCG:1 + chr3R 1850468 3' + Cr1a 180 1 62.38 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGC:1 + chr2L 8565541 3' - blood 17 2 68.32 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAAATAAATATTTTAAAAGCAGTGGCATATATTGAA:1 - chr2R 9316967 3' - opus 7041 4 75.25 GAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTGGGATTCAGAGGAGGGGGCTGGCCGGTTTGCTTGGATAA:1 + chrX 9101038 3' - Idefix 144 2 61.39 TTTAAACAAAAACAAAAAAAAAACAAGAGTAATGTTTGTGATCTCAAGTGTGTATCATAAAACAATTAAACCAATTTGAGTGTGTTCCATAAATAGCTTTC:2 + chr3R 23483772 3' + TART-C 11100 1 78.22 CCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACGGTCCATTGACTTTCTTCTAATCCCACGCTTTTCGTTAGCTTTCCAATTTTGATCGACTTCTCATATTGTATCGC:1 + chrX 19344023 3' + gypsy8 396 1 72.28 TGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGAGCCTTTGTGACTTTGACTTTTGATGATGTTTTGAGCGCCTCAACTTTATGTGGAAAATGA:1 + chrX 8774488 3' + 1360 23 1 67.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTC:1 + chr2L 12324090 3' - roo 43 2 68.32 ATAACACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTGGAGACCGCCGGCGGCGCCGAGCTGACCACCCACTCGTCACACTACCTGGTCCAAGGTGACAACTCCAGCG:1 - chrX 19691128 3' + Tc1 20 1 76.24 AAAATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATATGTGTTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAACTAGC:1 - chr2R 22063101 3' + G3 4504 1 61.39 GTTGATTTTTCATTTCAATTTTCTTGCCATTGCCATCCCATTCCCGATCCCAATCCCAGTTCCATTTCTATTCCCACACGCAATCCCGCCTCCTTGGCCCC:1 - chr3R 27421299 3' - P-element 2641 1 77.23 GTGCAGCCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTTGGCATTCTGCAGGTGTTAGGTCATTGGGTGGAACTCTTTTGCTCGAATTTTATACCTTTGAA:1 + chr3L 8615987 3' - Doc3-element 392 1 70.30 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCCACGATTGACTTTCTTGTTCTTACATCAAAAACTCGATGTGGTAATATATTTAAAAATAGTTATACTTTT:1 + chr2R 14351946 3' + Max-element 8528 2 57.43 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATA:1 - chr2R 12082357 3' + mdg1 7408 2 74.26 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTACAATTGTTAATTACTTTTACTTTGTGCTAAGATCAATTAAA:1 - chr2L 12441498 3' + transib2 2792 1 60.40 ATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 5331 1 57.43 AATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGAATAATAAAAACGGACAAAATATA:1 + chr3R 7168653 3' + flea 257 1 73.81 ACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTC:2 + chr3R 10277269 3' - Doc 60 1 76.24 AAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCAACATCGCCTGAAAGGATTTCAGGATGCCACTCGGTATGCTGCATGTAGAGGTCGTG:1 + chr2R 3119821 3' + 1360 3268 1 68.54 AAAAGATTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCAGGGCAGGGAAAGATCGGTGGGGCACGTCA:1 - chrX 1344994 3' - Doc 337 1 69.31 TTATTACTGCTGCTTCCGTCCAAATCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTAATTAATTTCGTAGGTACACTTAGTTCGTATAATCACGTTACAGCCATT:1 + chrX 8824520 3' - invader2 472 1 58.42 AAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTAAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTTTGTGTCATTGTTAAATTTTGCGCTCGAACG:1 + chr3R 30633321 3' - 1360 3269 1 74.26 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTGGAATTACTCACCGATTGCAAAGGAGTAATGATTTAAAAA:1 - chr3R 31194466 3' + Transpac 278 2 60.40 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATCATCATAA:1 + chr2R 7861729 3' - roo 36 2 67.33 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCCTCATGCGTGCCATTACCTAGCAGGAAGTGGTGC:1 + chr3R 17929043 3' - hobo 13 1 66.34 CTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTAATGTGCACC:1 + chr2L 3388157 3' - F-element 293 1 66.34 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCGCAAA:1 - chr2L 13334014 3' + flea 4989 2 57.43 CCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTAAATTTAAACAGCACACATACACCCAAACACATACACACAGTGTTGAAGTGAAAAGCGAAGAGC:1 + chr2R 10945418 3' - transib2 8 1 71.29 CCTTATCTATCGTTCCGATTGGCCATCTCGTCCTTTCGCACCCGCATCCGTTGGCCCATCCGCACGCCCATAGCCATCACCACGTGGGCCACCATGTGGGG:1 - chr3L 19653665 3' - Rt1a 4764 1 65.35 ATAGTTATTAAGTTATTATTAAACGAAAGTGAAGCTATGCTGGTTAATCTGTATATCTAGCCAAAAATTAAATAACTATTTCTATTATTGTATTAAAGCGA:2 + chr3R 20945046 3' - gypsy9 5322 2 57.43 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGCCATGGC:1 + chr2R 16475815 3' + 412 7517 2 52.48 TGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGG:1 - chr2L 23295817 3' + micropia 5401 2 74.12 ATATTTTTGGGCAATGTTCTGGACAAAAATATTAAGATGTAGAGAAATGGTATAGAATGCACTTACTTGCACTTACTTTTAAATGGTCCTTAAGTTTACAG:1 - chr2R 13078687 3' - jockey 4633 1 77.23 AACATATATTAACTACATACGTTAAAAACGACATACCTTGGCCTTCTTCAGCTCATCCTCCAGCTCACTGATGCGCTGCCTCAACTTGGTCCTCGATTGCT:1 + chr3L 7930493 3' - transib2 304 1 65.35 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAATTGCCAACGTTGATACTTAATTGAAAATGTATTATTTCAGAGACAAATTTATTG:1 - chr3R 16834019 3' - I-element 24 1 47.52 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGATAATAATCATTTATC:1 + chrX 15082468 3' - mdg1 16 2 63.37 AATATAAAAATAAATAAACATTTTTTTTCTTCTTCCAGTGGAAATGAAAATCGTATTGAAAGAGCGATCTTGTGGTTCTTCTCAGTGCAATAGTGCCATTA:1 + chr3L 16710559 3' + mariner2 828 1 89.11 GTGGGAGTCGTGAATGCGGCTGCGGATGTTTAGAATTTTTTGTTTAAAAAAGTATTTGTAGACATTAATTTTGAAAACGTTTGTCCATCGTAAAAATCTAG:1 + chrX 9686222 3' - Quasimodo 318 2 74.26 CACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCAGCTGGCGGCGCCTCTGAAGAACAACTTTTACGTCTGAAGTCTTTTAAATGAACCTTA:1 - chr3L 11837688 3' + 1360 3259 1 55.45 GCCCCTTATGTTGGGATGCCTATGAAGCCTCTCCACTACTCTCCACTGCTGCCCTCTCGCTCGTACTCTCTTCAGTTACTACGGCTAAGTTGAGAGTTTAT:1 + chr3R 17775649 3' - G7 983 1 71.29 TATATTCATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTGGTCGTCGTAGGGCGTGAGCTTCAGCTGGGAGGGATGGACGCTGGTGATGA:1 - chr3L 21493421 3' + Cr1a 4334 1 57.43 AGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTGTGGAAAGTTGTGGGGGAAACGGGTCTGCAAAATGGCTTTGGTTGATGTCAAAGTGGATTTAAATGTATCTGTTGT:1 + chr3R 9137380 3' - F-element 357 1 76.24 CATAGNGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCCAGGGCAGAATCTCTTTTTGGTGCTTAATGACGCGGTGATTCT:1 + chr3R 11688500 3' + 1360 3355 1 61.39 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAA:1 - chr2L 16674874 3' + roo 9022 2 78.22 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTCCATGATGCCACAGAGCA:1 - chr2R 8345477 3' + roo 401 1 72.28 TAGACATGTACCTACATTATAAAAATAAATAAATTCCGATGTAATATCCGTTAATGTCTGACAAATCGCCTTGGTTTACTAATAGAATTGACAGAAACAAG:1 + chrX 7337899 3' + mariner2 813 1 42.57 GAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGTTTGCTTATTAAATCTAGTAATTGAATTGGCAAACTGAGAAAC:1 + chr2R 23584839 3' - HMS-Beagle 6800 2 75.25 CGGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATT:2 + chr3R 29331894 3' - G6 55 1 77.23 CTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATGTTATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGAAGCCG:1 - chrX 22855195 3' - P-element 20 1 59.00 AACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGCAGTTCATACG:1 + chr2L 3951668 3' - Transpac 4939 2 59.41 TTATTGAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTTAGAATTCCCCACGCAAAACTCTTTCATGTA:1 - chr2R 17971989 3' - 412 7072 2 59.41 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACCATTTTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGAGTCCTGGTCCATGTTTCTGTAATGTT:1 - chr3L 13548764 3' - hobo 2 1 77.23 TTTTTATTTTTTTTTTCATTTTTACTATAGTTTTATCCATTTCATTTTCCGAGTGTTAATTTACATCTTTTGTAATTACCAGCCTTTGTTATCCGATTTTG:1 - chr3R 6533909 3' + INE-1 471 5 65.35 AATATTTATTTATTTATTTGTGCACTTCCTGGCTGGATTATGACTTTGTCCGGCCTTCCGATGCCGTGTCTGCTGCTCGTTGATGACTGGACTCCTTGAGC:1 + chr2L 14935299 3' - Juan 4214 1 80.20 AGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACA:1 - chr3R 19450017 3' + roo 8661 1 63.37 GTACATCGAGTGTACTTGGGTTGTTTATCGGTGAGCAAACATTTTGTTCAGGCACAAGGTGAAATTATTTAGTCATCAGTTGTCGCAGTTCCTCTGATGAG:2 - chr3L 12352522 3' - G2 2975 1 76.24 CACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTACGATTTTTTATATATGAGAATT:1 - chr3R 8975928 3' - Bari1 21 1 59.41 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGCTAACTTTCTTTTAATGCATTTGGA:1 + chr3R 31257060 3' - transib2 22 1 68.32 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAG:1 - chr2R 14708990 3' - Doc 58 1 78.22 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGA:1 - chr3L 7205542 3' - Doc 44 1 59.41 ATAGCNAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGGTATCTGTGAAACTAAATACTCGAATAAATAAGAAAAAACTTATAGCGGTG:1 + chr3L 9548049 3' - accord 289 2 61.39 TTTTTTTTGTTTTACCAATCATTTTTAAAGTATCCATTTAATCTGTTACTAATTTTTTGATTTGATTTGTTTTGTTATTCCACAGACTCTGCAAACTGTAT:1 - chr3R 18428040 3' + Tc1 1479 1 63.37 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGA:1 + chr2L 513715 3' + roo 9021 2 76.24 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATATATATATTTACATAAAAATTAAAGATCTCTC:1 + chrX 21292660 3' - rover 36 2 73.27 AAACAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAACCTAAACAAAATAAAAACTCACGAATGACGGATTGAAAGCAAAAGACGA:1 - chrX 3772693 3' + Porto1 201 1 67.33 CTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTAACTAGAACGAGGTGTAGAGCTAATTTAAGATCATGCAGCACTATACTATTCATTTGCAAATTAACTGAT:1 - chr3L 7996001 3' - Cr1a 3992 1 68.32 ATTTAATATAAATATATTTATAACTTAATTAAATTGATTGTATTTCTCAACTGCCAAGTTCTGACTGGAAGTGGAATATACGATTTTACTTAATACCTTTA:1 + chrX 14885482 3' - transib3 2622 1 86.14 GGCTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTCATGGGCCGATCACCTACCGGTTTTCTTTTGATTGTGTTCCATCTCATATCTAATTACACTGGGCAACATACATAT:1 + chr2L 10689417 3' + X-element 4426 1 81.19 GTTAANATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAACGAATTATTAGCCATTATCTTT:1 - 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Stalker3T 342 1 72.00 AAAATTATATTATTAAAAAAGATACGTAGATCCACATGTATTAATAGATGTGTTTATGCTAGCTTAATATCCCTTATATATTCCCTTTATATTTTGTAATG:1 - chr2R 9050265 3' - hopper 163 1 42.57 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATA:1 - chr2L 23295810 3' + micropia 407 2 71.29 AGACGNTAAGAGAGGGTATATTTTTTATTAATTTGTTATAATATTTTAGTTCACTTTTTCCGTTTGTTTGCATTCTAGAGATCGTAGTTATTTAGAGTCGT:1 - chr3R 3713786 3' + Tc1-2 1348 1 57.43 GGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTGCTCCGAACCCACCATTCCCCAATCAAGCACACCATAATGCCCAAGCCGGAGACTTTCCATTATAGG:1 + chr2L 15960698 3' - R1A1-element 4910 1 75.28 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGAATTACTGGCATACGTATATG:1 - chr3R 22431048 3' - Max-element 8246 2 68.32 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAG:1 + chr3R 13225556 3' + hobo 2899 1 61.39 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAAGTGCAGGCCATAATAAATTGCTAGCAATCGCATTTCCGTTTCTTTATACGCTTCGATTACGATGCGCTTT:1 + chr3R 29470881 3' + hopper 1414 2 74.26 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' + 1360 3388 2 67.33 ACGAGAATAGTGAAGAAGAAGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGATATACTTTTGTTTATCACTATAAATTTGGTACATATTAAAAAAATATTACTTAATA:1 + chr3L 26479251 3' + invader1 377 2 73.27 AATGAAAATATCTACAAATCAACATTTTCTTAAAACTCGTAAAATATGAGTTATCAAACATAAAGATATTAACATGAACAAAAAGTATGTGATGTTTAAAG:1 - chr2L 3992150 3' + gypsy10 407 1 76.24 AAGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATTAGGTTGTTAAGATGTGTGGGCGTGAAATCTTGGTACGGTTTGTGGGGAGGGAAAAAGGTTTTCAACTT:1 + chr3L 14504576 3' + INE-1 554 1 76.24 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCACCACCGAGTATGAAATATTCGAG:1 + chr2L 1839272 3' - jockey 4809 1 77.32 GTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTATTTAATAATCCCCTCACACGCCGATTACACGAGGCCTTCAAAATCATAGCTTTT:1 + chr3L 1129408 3' + Stalker2 7300 2 63.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGAGTTTTGAGCATGTCGAGGAGTGCCATTTCATCAGCTTTGACTACGCGATGTGTCGCCATCATATTTACAT:1 + chr3R 23274618 3' + roo 9053 2 73.27 CATAATTAATTAAACTTATTTAATAAACCAATTAATTTTATTTAATACAATTAATGGCCGCAAAAAAGAAGGTAGCTACTCGTTAAGCCGAACGCGGTCAA:1 - chr3R 22510619 3' + HeT-A 349 1 51.49 AGAAGGTTGAGATTCACCATACAGGTTCTAGAGTTATAGACGCAGCGCAAGTTTGATCCATGTTGCCAAAGCTAGATTTCTTTCTTGTTTTCAAACTAAAA:1 - chr4 526602 3' + INE-1 172 1 67.33 GGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGGGCAATTGATAAAAAAATAAATTATCGTAAAAGTCTTGTGTAAAATGTATTGGCGCCCAACACGGGGACTAAAG:1 - chr3L 3489853 3' + Cr1a 4433 1 52.00 CGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACAATAACACAGGCACGCACAATAACAAAAAAAAGTAATTAATTTTTTTTTTTGTTATGTTGAGATTTATT:1 - chrX 3099881 3' - Rt1a 4886 1 76.24 CAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGGAGAATTCAGTTTATAAGTCCTTCTCGACC:1 - chr2L 6083687 3' + 3S18 6097 2 69.31 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTTTGCTACTCGATAAAATGGCGCATTTTTGCTTT:1 + chr2R 8345593 3' - roo 8668 2 74.74 TGAAACTGAAACTGATACACATAAAAAGGCCAGCTTCATGCTGCACTCATTAATAAAAACAACAGCCGCAAAGTAAGCGATAAATTACTCGACCAGAGTCC:1 + chr3R 28465050 3' - 1731 154 2 64.36 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAG:1 - chr2L 285710 3' - P-element 56 1 23.00 AGTGGATGTGGGGATTTTAGTAGTGAGTGGTGAAATAAAAAATTAAATAAAACGTTATTGAAACATAATGACGTGCAGTTCTCCTTGATAATCGCTAGCA:1 - chr2R 349813 3' - accord2 7343 1 77.00 GGAGCNCGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTTACAT:1 + chr3R 28645856 3' - F-element 32 1 53.47 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAAT:1 + chr2R 12457969 3' + roo 357 2 78.22 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTG:1 - chrX 20806867 3' + opus 7471 2 65.35 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGCCCACGTTTCACTTTAGCATCCTG:1 + chrX 2179552 3' - Doc 26 1 54.46 TTAACAGTAAGTAATTGGTTGACTAGATACGAAAAATAAAAGAAGCGGCCTTTCCTAGTGCAAGAATACGCTAATACATTAATAATTTGATAGTTTAATT:1 + chr2R 21020035 3' - Porto1 4628 1 83.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGTAGTAATTTTATTGTAACATTTCGGAT:1 - chr2L 11838013 3' - roo 48 2 75.00 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCTCGAAACAGATTGAG:1 + chr2L 12873565 3' - jockey 4681 1 77.33 TTATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATA:1 - chrX 15355081 3' - X-element 4711 1 61.39 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAGTTTTATTCACATTTCTGCATTTTAGA:1 - chr2L 11703226 3' + Tabor 7299 2 53.47 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACCTTATCAATTGTTTTGCTTTATCATTCGCTAAAATCTTG:1 + chr3R 27108397 3' - jockey 4796 1 66.00 CACACACACACTCATATTTACATACAGAACGAACAAAAAAAATATATATGGAACGAAAGAAAGAGATGGAAAGGAGCGAATGAGACGGGGAGAAGTACATT:1 - chrX 19129157 3' + accord 7034 2 75.25 ATGAGTCAGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCACCAACGGAACTGGTCGCCCATTTTGCGGAAT:1 - chr2R 15558319 3' + F-element 192 1 69.31 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCG:1 - chr2R 12082361 3' + mdg1 366 2 78.22 AAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTGTGGCATTCTGTCTGCTTAGAAAAAGAGACAAGTGTGGCCCACAGGTGGCGCCAGTGGTTCTAAAT:1 - chr2R 10555220 3' + INE-1 549 1 56.44 AGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTAGCAGAAAAAATTTAACACATCGAAAAAGCAAATAACCAGCATAGCAAACGTAT:1 + chr2L 21632688 3' - F-element 4479 1 59.41 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTACACAAATTATTGTATCAAAAAGTATAAACGTATAAAAAGTGTTTATTAGAT:1 + chr3L 1194799 3' - X-element 37 1 52.53 GCTATATTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGGGCCCCAAATTAGCAGGGCCCAAAATGCCAG:1 - chr2R 16475737 3' - 412 7078 2 55.45 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCCGCTGTTTCGGTTTTTGCTCTGCTGCTCTGTTTTGTTTT:1 - chrX 18011408 3' - jockey 4705 1 61.22 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTATCTGTCTGTGCTGGAGCACAAAAGAA:1 - chr2L 4743123 3' + I-element 5343 1 62.38 GTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAAT:1 - chr2R 3591996 3' - Quasimodo 43 2 78.22 ACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAAAAGCTGGTTTGGTGACTCG:1 + chrX 17968450 3' + Tirant 8491 2 64.36 ATTTTTAGTCAGTAGATAAGAAGACCTCGATCTGTACACATCGATATGGTTTCGCACACTCACCGCACACGCATCCTGTACCAGGATCCACATACCCAATT:1 - chr3R 12574645 3' + Transpac 5008 2 64.36 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGCCAT:1 + chr2R 16475812 3' + 412 461 2 55.45 GTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTCTCTGATAGTAAAGTGTCCAAAGATTGCAAATTTTACTTTTTGGTACCATTTCTGGTACTTTTTGGC:1 + chrX 3464193 3' + hopper 1091 1 78.22 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGCGGATGGGCAGATGAGGAGGCCACTGCAGCGG:1 + chr3R 22800185 3' - flea 4787 2 64.44 TCAAAGTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAAAACATCATCGTAAAAAATACTCAAGGTAGCAAGCTGCATATTTCATTTTTT:1 - chr3R 16611390 3' + jockey 4952 1 62.38 GCATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCA:1 - chrX 10445561 3' + INE-1 534 1 72.28 GATAAGACGTCTTGCAAGAAGACTGCTCTGCCTCTTGCCGCTCTTCCGCCTTTCGATTCTTCTGCGCCTTCTTCATCTTCTTCATCATCATCATCATCTTC:1 + chr2R 20033516 3' - Helena 1281 1 77.23 AATTAATTTTAGTTTGTATGGTAGATAAGTTGAAAAGCGCACACCGACCGGATATCATACCTCGATGAAAACGGGAATGAGAGGCAAGTAAGCTTTACAGA:1 - chr2L 13488257 3' + Chouto 5878 1 71.29 TAACTAACATGTAAATAATATTATGTTTTTCTTTTTCAAGGCATGCGATATCTGGAGTCCAAAAACTGCATTCATCGCGATCTGGCGGCGCGTAATTGTCT:2 - chr3R 9368767 3' + transib1 464 1 80.20 TACAAAAAAATACAAAAAAAAAAGAAATATGAGCAGGGCAGTCAGTGAAATGGTTTCGCTTTTAATCAACCCAAAAACTGAGCTAATTCGCGCCTGTCACT:1 + chrX 12507236 3' + G2 3075 1 64.36 CTATCAGATACCCGTTACTCAGCTATTGGGAATGCAATATATTGGGGGATTACATTATATTGAAATTACAAAAACCCCGTGCTGAAAGGAAAGTGGTGTGA:1 + chr3L 19430088 3' - INE-1 547 1 55.45 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATA:1 + chr2L 17365453 3' - blood 7046 2 67.33 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCGCCATCACCTGCTCTTCATCAGTGTCACAGACAGCCGAAAAGTATGCTATAAA:1 - chrX 7369841 3' + hobo 2915 1 50.50 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACAGAGAAAGGAAGCCTGTCACTTTGAATAATGCTGGGGTACCAC:1 + chr3R 9131825 3' - roo 34 2 61.39 CTTCAAGCCAAAGAAAACAAAAGAAAAAGCAGTAAAACAGCAACAACTGGAAATAAGAGAAGCACAGCAAAGGCAACAACAGAAATCGCGTTTACAACTAA:1 + chrX 3776722 3' + Porto1 247 1 65.35 TTTGCCCACCCTTTAAAAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTTCGCATTTTGCTTTATATTATTTTCGTCTTCATTTTCGACTGCGGCGACGACCTTTTGCG:1 - chr2L 12495800 3' + FB 386 1 67.33 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAG:1 - chr3L 17168825 3' - mdg1 7044 2 70.79 TTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTAGCATGCCGAGAATGGCACTCTGTGGCGGATTGATGATGGGCGTGCCCATCAGGGATCCGAACACTCCG:1 - chr3R 11246288 3' - I-element 372 1 67.33 TAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGCTAACTTTCTTTTAATGCATTTGGAATG:2 + chr3R 31257063 3' - transib2 19 1 69.31 AGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGAAGCGACAGACATATGTACGCCTCCTCCTCTGGAAAATATGAATTATATCAAAATGCATTATTAGTACCGAATGTT:1 + chr2L 20877703 3' - baggins 5214 1 69.31 GGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCCTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCAGCCTAGAACTTGAGCTGCATGCCCACAGGGAAAGATTTAA:1 + chrX 143407 3' - Quasimodo 295 2 78.22 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTG:2 - chr2R 18950760 3' + roo 356 2 77.23 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAAGGGCATTGAAATCA:1 + chr3L 17921191 3' - 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Doc 50 1 76.14 AATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGATACAATCGCAATATTGTATTTCCCCACCTCCGTCTAAATTTCCCTTACAAGTTCAAAACATATTTGAATAG:1 - chr3R 19990614 3' - hobo 2482 1 75.25 AATTGAAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAAAAAAAGAGGCAACGCCCCCACCCTTTTTTCGCTCATCTTTGTTCCTGCTGCCTTCTCCACT:1 - chr3R 30089251 3' + P-element 2673 1 65.35 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGTTCATGAGGGTGGTGCATAATACTTACCGTATTGAAATGACTCCT:1 + chr2R 19209434 3' - jockey 4777 1 59.42 CAAGAAATAAAAGCAAAGTAAAAACAAAAAAAATGAAGCAAATAGGTTACAGATGCCAAAATCAGAGTTAGCTAAAATCTTGAAGGAAAGGAC:1 + chr2R 4139135 3' + F-element 4667 1 78.49 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGGGTACAACATAAAAGCTCCAAGCTGCGCTTATCAGCGGCAGCTGATTT:1 + chr3L 4122498 3' + P-element 2861 1 53.00 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCC:1 - chr3R 13225496 3' - hobo 28 1 53.54 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAA:1 + chr3R 25671985 3' - I-element 29 1 51.49 CTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAGACTTAAATGTTTACCACACGTATATATATTTATATTATTTCAAGAAA:1 - chr2R 14708943 3' - Doc 11 1 74.26 CAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATG:1 + chr3R 7388394 3' + HMS-Beagle 6993 2 75.25 CGAACTAAAAAAAAAAACTAATTTTGCCCTTTGGAGTGGTTCATTAGTTAAATGAATCAGTTGTTATCAACCGATCTGATATTCACTTTT:1 + chr3L 2304381 3' + Copia1_DM 290 1 90.00 AAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAAGTACACTGCCAAAGTATACGATTTTA:1 + chrX 18942316 3' - FB 49 1 75.25 GCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTACTTCACTTCACAACCTTGGGAGATATTCCGTTTTTTTTCCTTTTTTTTGTGATCGTTTCACTCATATCTCCTTT:1 + chrX 13746310 3' + McClintock 150 2 67.33 CTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCGGGATGGCAGGCGTTGAAAACTGGGTCAGCAAATAAATCGAAAAGGCTTAAAACAAG:1 + chr3L 10074739 3' + F-element 390 1 61.39 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTT:1 - chrX 8972370 3' - 1360 23 1 56.44 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAA:1 + chr3R 20149754 3' + 1360 3335 1 81.19 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATGATGCCCTGGAAGACATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCAT:1 + chr2R 5804526 3' + P-element 2864 1 47.06 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTTAGAATT:1 - chr2R 17972013 3' - 412 7096 2 69.31 GAATAGGATTTAAAGCCGTACTTATCTTGAATTTTCCACTTCTCACGCTGTCAGGAAGAGCAAATGCACCCGGCCTAATGAGCAGGTGTAGGGCATCAAAT:1 - chr3L 11307232 3' - Max-element 383 1 61.39 ATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAAAAAATAACTTATTACATGGTGCCAAATATCAAAAATTAACATTTCCCAAATACCTTATTGCTCAGAATATGCTTGC:1 - chr2L 22363239 3' - 1360 301 1 60.40 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAACCCATCGCTGCTATCGAATTCTAGTGTCTTA:3 - chrX 15293410 3' - Quasimodo 11 2 71.29 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACT:1 - chr3L 18500966 3' - hobo 49 1 74.26 GCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACAACCTTTTTCCGCTTCATAGCCAGGGCGTACTGGAAGGTGTACTCGGCCACCCGGAGCGAGGCATTCCGAGTGATC:1 - chr3L 8838068 3' - Rt1a 4844 1 75.25 TAACAATAATAATAACAATAATATCTCCCACACTTGATCAATATTTTTCCCGGTTTGAACTCGGATGCTTTGGCATTTAATGTGATTTGTGCGAAACCCGT:1 - chr2L 13157262 3' + mdg1 21 2 72.28 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCA:1 + chr3L 18337731 3' - Juan 4033 1 70.30 GGAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAAGATCAGCGAATTAAAATAGTGATTCAAAAATATTTTAGAGAGGTTATTATAATGTTAGTTGGCGCTGTCTTGCAT:1 + chr3R 4159579 3' + Idefix 371 2 66.34 AGATACCCGTTACTCAGCTTTTGGAAATGCAAACCATATCTGAATCTCAAACGAAGAAACAATCCATTTTGATAGTACACTAGTGGGCATAAGTATCTAG:1 - chr3R 3736165 3' - INE-1 542 1 76.00 CCATATATGAGGGAATTCTGAAGATTCCAGAGATAAGGTAAACAGTTTCAGTAGAGGCATGCCCAATGAGGTCCTTGTCGAGAACTTGGGACCTTGATCTA:1 - chr3R 10745706 3' - Q-element 30 2 57.43 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAACGGCA:2 - chr3R 7522280 3' - blood 7022 2 68.32 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTA:1 - chr2R 5067635 3' - F-element 40 1 63.37 GTTGTTTTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTAGTTGTACTGTTTATGTGTTGTGAACATGAAATATATGTGTATTTTATTTCCCATACATAGCTACCAA:1 - chr2L 8880511 3' + transib2 294 1 79.21 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAG:1 - chr2L 11703252 3' + Tabor 434 2 73.27 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAAAAGGACATGACTAGGCTGTTAATACTGATCAAGAAAATGTA:1 - chr3R 6286480 3' + jockey 4936 1 59.41 TACTTCGATTACTAATTTGGTTTTTAGGTCTCTGTGTATGTCTTCGTTCCTCCTTGAATGTCATCTATTTTTGAAGCTTGTTCTCTGCACACTTTTTCTGT:1 + chr3R 19584140 3' - Doc 4429 1 54.46 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGGGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCCAACCCACTCTCTCCTCCACCATT:1 - chr3L 13548814 3' - hobo 52 1 75.25 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGTATCGTGGAGTGTCCCCATCTCGCTCGCACTCACTTGTTCTAGTGCACGAACGATCTTCG:1 - chr2R 10543402 3' - P-element 15 1 62.38 TAATTGGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAACCACAGCGAATGGTAATAAACGACATTAGTACAGAGCGAGGTGTAGCAAAGACGTAGGTGTA:1 + chr2R 3503387 3' + GATE 8354 2 62.37 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATAAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCG:1 + chr2R 17626539 3' + mdg1 7412 2 73.96 AAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGTAT:1 + chr2R 14498593 3' + Doc2-element 98 2 63.37 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAACGACCTACGCCAACGCGCTCAAGCCTGTTGGCCAACTGAGTGTGCA:1 + chr3R 8477772 3' + P-element 2857 1 45.54 AGTGTCCCGACTATCATATACCCTAAAAGAGGTGGATGGGTATGGGTGGATGTGGAATGCTCGCAGGTCATTGATCAGATCTACGCGACACACATAACAAT:1 - chr2L 20129156 3' - INE-1 557 1 59.41 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACTGTATTGCATTAAAGGTGGATTAAAAAACTGTAGATTTAAAACTAGATAAATAAAATGATATAA:1 + chr3R 16245130 3' + 1360 3380 2 68.32 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATAATATTT:1 - chr2R 17626466 3' - mdg1 5 2 71.43 CATCCATACCGTTCTTTTTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTCATTCTTTTCTTTTCGCACGCTTCTA:1 + chr2L 23352987 3' + rover 7080 2 74.26 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGGGGGTTATTGTATTTAATTCTTGTTTGTAGTTCATGATTTTCACTCGGCAAAC:1 + chr2L 3085076 3' - copia 4 2 73.27 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATAT:1 + chr2R 7032200 3' - mdg1 35 2 62.38 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACAATATAATGGTTTTTACTTCAACTATTTTA:1 - chr2R 17261590 3' - pogo 44 1 72.28 CACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATGTGGAATTACTCACCGATTGCAAAGGAGTAATGATTTAAAAATATTGTA:1 - chr3R 31194459 3' + Transpac 285 2 53.47 CCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAATTTTTCTG:1 + chr2L 3440525 3' - Juan 10 1 73.27 CTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGTCGTACTC:1 + chr2R 21773637 3' - Max-element 10 2 62.38 TGTAATTTGGCTGCCTGCGTGCAGTAACATTGTACTCTAGATCAGTCACAACAAATACACAGAACATTTTATACAAGTTTTTCACACAAGCGA:1 + chr2R 4151134 3' + Dm88 4489 2 62.37 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTT:1 + chr2R 8345561 3' - roo 42 2 67.33 TTGTTATTATTATTATTATTATTGTGGTGCAGCACCATCCGCACCACCTGCCCCTGCCCCATCCCCCGCCGGCACCACCGCCGCAGCTACTCAATTTCAAT:1 - chr3R 15418734 3' - mdg1 17 2 72.28 CAGATGTCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGC:1 - chr3R 15072578 3' - pogo 32 1 61.22 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACA:1 - chr2R 13644433 3' + Burdock 6355 2 64.36 TATTTATAAAATTAAAAATTGGGGAGCACATTAATTTATTAAGTTTTAAGGAAAAATACTTTGTAGGTCTCTAATTTTTTTCACAACAATTTGTATACTCA:1 - chr2L 7749135 3' + 3S18 350 1 78.22 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTT:1 + chr3R 20137334 3' + Burdock 6358 2 66.34 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGCTATTAATTGCCCTATCATTGTCAGTCTCAGATTTCGTAAAAAAAATAAATAATCTATAGAAT:1 + chr4 295772 3' + 1360 3377 1 63.37 AGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATATTTAGTATATAAACTCATTCCGTTTGGTTCAATTGTCAC:1 - chr2L 12474963 3' + mdg3 218 2 51.49 TCCGAATAAAATCACTTGATTTAGCGAAGTAAACAGTTAATAACATAAAATATATAAACAAATTAAAAGCGAAAGAGACGCTAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chrX 9053315 3' + Doc3-element 37 1 82.18 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAATACAATTAAATCAAAAATTCATAGCGTCTATTACCTGATTTATTTAGGACAATTTTTTTTAGAATTTC:1 - chr3R 7902878 3' + pogo 2098 1 76.24 TCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 19 1 75.79 CGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCG:1 - chr2R 13295646 3' - Tirant 8128 2 60.40 CCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTTGGCTATTGATAAGGTGGCAGGCGGTTG:1 - chrX 8684225 3' - opus 44 4 74.26 TTTGGTGTTGCACTTTTGACTTGTACGCACATTAGAACGCAAAGCGCTTTTGGCTGTTTTCAAAAGTTTCATTCAACTTTGGCAAACTTTAACGTTTTGA:1 - chr2L 10823166 3' + Tc3 328 1 80.00 TCATCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAAAACTCATAAAAACTGCTGACAACAACAAACAAAATTACAAA:1 - chr3R 17843608 3' + roo 9071 1 76.24 TTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATATTTTCC:1 + chr2R 9500076 3' - G5 4698 1 57.43 TGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTTGGTTTTAAAAAAAAAA:1 - chr2L 13591103 3' + mdg1 249 2 60.47 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCTCGATTGAATGATGTT:1 + chr2L 12815118 3' - hopper 23 1 58.42 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTAATGAGTTCGAATATGGCCACGCCCCAAACATCTG:1 + chr2R 17972064 3' + 412 7507 2 65.35 CACACTAGCTGATTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTGGATCATAGCATTCTCTATTTTTTGTTTTTTTTTGGGGGGGAGGCCAGAGCAAGTGACCC:1 + chrX 8313183 3' + INE-1 539 1 65.00 GGTTGCGCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCTGGAGCGTGCACGGAATGAAGAGGAGCCATTATTGGAGG:1 + chr3R 17156609 3' + Max-element 8112 1 79.27 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGGACATTTATAGGTCTATAGCTTACAGAGCCCAACTCTTCCATCACTCTAACGTTTTGCGTTTTTTCCAA:1 + chrX 4886882 3' + jockey 4948 1 69.31 GTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATGTTGTGTGTTTTAAAATGATATAAGCA:1 + chr3L 19454711 3' + diver 175 2 80.81 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGATCAGTGTGAAATTTTGGAGAGCGAGTTAAAATAAATTCATACTTTGCTG:1 - chr3L 682405 3' - P-element 25 1 54.46 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCA:1 - chr3R 29123344 3' + P-element 2850 1 42.57 AACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGCGTGTATTAGGTATATGATTGGTTATAGGTTTTCATCGGTGGCTCCTATGTAGC:1 - chr3R 24006740 3' + Quasimodo 300 2 58.42 CGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTTCATGAAAACATTTAAGCTTACTTAACTTAAGAGATATTGTG:1 + chr2R 14540527 3' - Burdock 150 2 59.41 TGTGTGTGTGTGTATGTTCGTGGGGGAGAGTTATGACAGCAGGAAACAAAAAA:1 - chr3L 9309952 3' - accord 180 2 73.58 ACATTTAATTAAAAAAATTAAAAAAATACATTACATTTTTTTTTATGTTTTGCAAGGCCGTATCTCTAACATGTTCTACATCAATCTTTTCTTCTTCATT:1 + chr2R 1370566 3' + HB 315 1 65.00 AGATATTACATATAAATAATTACTTTATTTAATGAACTTCTTTTTACACACATACTTAGCTAGCTGCTGCGTCTTTCTCTAATTCAAATGCAAATGCAGCT:1 - chr2R 15041970 3' + 1360 2936 1 83.17 TTAGCTGCATCGATAGTTTGCTGCATCGGCAAGAAATCTTCATTATTTTTTCCTTTTTTT:1 + chrX 13262866 3' + pogo 14 1 83.33 TGTCANAATGTATTGACGCCATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTCAGAAACGTGAATTGATTGTCAAGACGACAATTCCAGAATAATTGT:1 - chr3L 23578630 3' - Stalker4 55 4 62.38 AAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTACTTATGTAAATTCACC:1 + chrX 3305235 3' - transib2 5 1 72.28 AAGTACTTCAACAAAAAAATTGTTTAAAAAGGACCCAAAATCAAAATATAATGTAACCTTTTTTATAACTTACGCGGCTCTAAAACTT:1 + chr3R 29123201 3' + P-element 2626 1 78.41 GATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGCAGCTGCCCTTTGAATT:1 - chr3R 16400127 3' + blood 7383 2 72.28 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTAAGAGCATTTAAAA:1 - chr2R 12082324 3' + mdg1 7441 2 61.39 CTAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGAAAAATTTCCGAAAATATACATATTTAACATAGTA:1 + chrX 13761308 3' - pogo 38 1 64.36 TAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCAAATACATACATACACACATGTGTGTATTTCAGAAATATAAAT:1 + chr2R 25214844 3' + mdg1 100 2 61.39 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAAC:1 + chr2R 17626570 3' + mdg1 7438 2 56.44 ATGCCTTAGGATATAAGTCATCAAATCATGTATCCAATAAGAATTTTCAAAGAGCCAAGTAAGCAAGACCAATTCATTCACATCACAGGCACCCACACAGA:1 - chr3L 21497248 3' + Quasimodo 94 2 68.32 AGTTAAAAACATTATTATTATTGTTATCCTCTAATTGTAATATTTTGTCAATGTTTTACGTATGTATACGACTAGTTGAAAAAAATGTAATGAGTTTATTT:1 + chr3R 13064883 3' + Burdock 499 1 54.46 ATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCCATAAGTGTCCCGGCCGACGTTTGCATCGCAGCAATGGTGTCAGCCGCCTGCAAAAG:1 + chr3R 12219377 3' - accord 424 2 61.39 GGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGA:1 + chr3L 25232910 3' - GATE 8267 2 53.00 GATTTCTTTAAAAATATAATTAACATTATATGATATTTGAACATTACATCGCAGAATTTGTTGCATTGCATCACCTATTATGCTGACCGCTGCTGTCAACT:1 - chrX 9467718 3' + hobo 478 1 47.52 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATAATTAATTTTTATTTTATTATAA:1 + chr3L 5426022 3' - blood 7024 2 70.30 GAAGTGTCAAGAGATATGACCATGCGGGAGGTGATTAGCGCGGTCATAGTCCTCAAACCAAGTACCGTTTCTTAAAATTCTGCTTGCTCTTCTTACTCAAA:1 - chr4 290926 3' + rooA 7368 2 57.43 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATA:1 - chr3R 4544012 3' - flea 4803 2 74.26 TAAATTAGTAAAATAAATTAAACAGACATTTTACAATTACAAATTAAACTAAAACTAAGTTATATTTGCTAGTTAAAATAAAAAAATATATTTTAATAATT:1 - chr4 1004071 3' + HeT-A 1 1 80.20 ATTTAATTGCCCCCTTCAGCGGCTTTGCGCGGGGTGAGGGGAAAAAGTTGCCCGAAGGGCAGGTATCGTAGCTACACCCCTCCCCTCTACCTTTTGTTGTA:1 - chr3R 19531586 3' - BS 226 1 70.30 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATTGTTTTGAGCTTAAGTCACCTTTTATTTGTTAGTAGTAATAGTTCACTCAACATACATATATTTTCGT:1 - chrX 4292826 3' + S-element 1709 2 70.30 AGACTNTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACA:1 + chr2R 17626566 3' + mdg1 396 2 52.48 CAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCGTAGTTTTGGTAGTTTTGTTACTGT:1 + chr2R 13403993 3' - BS 47 1 76.24 TGCACACACACACACACACACAGATACAGATACGAGTACAGACACAGATACAGATACAAATATGCCTTCGTTGCAGCGACAGGAGGTAAAGGATTAAGCGG:1 - chr2R 23579967 3' + accord 182 2 42.57 ATCTATATTTATATACAATGTTTAATACATTTTCGTGGTTTTTGTGGTGTAACTTAAATTAAATTGTACAGGTTATTTCTTAAAGAATTTTATTATTCTTG:1 - chr3L 18295886 3' - I-element 5272 1 88.12 TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAATTTTTAAAAAATTAT:1 - chr2L 11922481 3' - BS 5078 1 67.33 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAG:1 + chr2R 13585500 3' + Juan 4164 1 77.23 CAGTATCGTAAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACCACACACAAGAAGTGGTTCAATTAATTGCGAA:1 - chr2L 4895242 3' + Gypsy6A_LTR 383 1 72.00 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATAATTAATTTTTATTTTATTATAATGT:1 - chr3L 24207134 3' - blood 7021 2 73.27 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACGAGTTTCGTCTCTTGTACGTATGTCCTG:1 - chr2R 24628741 3' + mdg1 7449 2 67.01 TATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAG:1 - chrX 20885954 3' - Ivk 5353 1 70.21 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACATATGTATATTGTATATGCCAACGTACATTTATGCATGGTTCTGCCCCTGCGAGGTTTGTATTA:1 - chrX 18144332 3' + hobo 2927 1 65.35 TCCGTTTCTGTTGGATTCAAGTGCATCTGCTGCTCTCGTTGGGAGACTTTTGAACTTGGACCATTTCTCTTGGGAATGAAAATGGACTAGGCCTCGGGCC:1 - chrX 1497658 3' - Idefix 352 2 76.00 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCG:1 + chr3R 27748712 3' - roo 55 2 84.16 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAAC:1 - chr2R 8345512 3' + roo 9029 1 67.33 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTTCT:1 + chr3L 16761339 3' + roo 9055 2 60.40 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTGACCCTCCCAATTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTTGCCACGAGTTGACATTTGATT:1 + chr3R 11544423 3' - hobo 9 1 69.31 GAAGGATTTGTAAGCCCATATGTGTCTGGGCACATTGTTTTTGTCGCCGATAAATAACCAAACTTAAAGTGAACATAACTTCCACTTGGAGACTTATGATC:1 + chr2L 22306850 3' + aurora-element 4109 1 66.34 TATATTTAGATTATATTTGAGCTTGTAAGTTTATTGAATCAATGTCTGCGTGGCAACGACTTCAGCTGTGATAGCTCAAGTGAAGGTCAGCTCGACAGGCA:1 - chr2R 4886610 3' - gypsy7 5416 2 54.46 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACAGAAGTAGAATGGTGATTGAGATAAAAGTAATTTTGTTTACCAATTTC:1 + chr2L 3340024 3' - FB 30 1 54.46 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATATTTATTTCCTCGTTTCTGTT:1 - chr3L 24132055 3' + roo 354 2 81.19 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAAAAACAGCAGCGGGAGCATCGGCAGACCAGGAGAAGCATACGTTGTGGCTCCTTTTCACTGGATC:1 + chr3R 17853417 3' + roo 400 1 74.26 GAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGAAATTCAGTTATACGATTTAGATTCTGCAATAAAC:1 + chr3L 21614247 3' - Quasimodo 124 2 65.35 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAACGGGGGACACTTCTCC:2 - chr2L 2078436 3' - I-element 29 1 57.43 TTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTTCAGAGATTAGAAAGTGACGGCCCGGGTGAACGAATTGTTAGGCAATACGATATGCCG:1 + chr2R 21952430 3' - Idefix 219 2 59.14 TATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAA:1 - chrX 15355072 3' - X-element 4702 1 52.48 CAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGAT:1 - chr3R 13375976 3' - 1360 40 1 67.33 GCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACCCACATAAGCCGCATAAGCCAAAAC:1 - chr3R 6608791 3' + I-element 5306 1 75.25 TTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGGGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGT:1 - chr3R 32005893 3' + invader4 279 2 71.29 TCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAATATCCATCAAATCGGATCGCTGACTCGCTAGCAGCCTCTATAC:1 - chr3L 8711620 3' - opus 7412 2 57.43 CATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCAATAAAGCTTACTA:1 + chr2L 21592755 3' - BS3 322 1 55.45 GTTATCGTAAATAGAGTGACTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCAATGGCCTAGACCCCGGCCTGAGTTTCATCCACTTGCTCGGAATTTTAGCTA:1 - chrX 22819719 3' + Gypsy12A_LTR 181 1 71.88 TGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTCACATAATTCTTATTTTGCTGATTGGCCTGAAATAAGTCGCAAGGAATGTAGCAATCGGAGCGTTC:1 + chr2L 6555790 3' - Burdock 6140 2 69.31 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTTTCTCCAGCTGTCTTCTCACCCTTGTCTTTCTTTAAA:1 + chr2R 1449684 3' + jockey 4917 1 65.35 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACG:2 - chr3L 10477552 3' + copia 5084 2 64.36 TAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTCATGTTTATATAAAATTTAAAGAAATCT:1 - chr3L 8363007 3' + 3S18 291 2 74.26 GACGTCATCGCCAAACAAAACCACAAAAAAGCTCCAGGATCGCTGCACCACCTTTGGCGTTACCGTCGCTTGGGTTGTTGGCAGTGTAGGACTCGAATCCA:1 + chr3L 23814931 3' + BS3 224 1 67.33 TTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTATTTTTGGATTTTAGGGGTGGCATTC:1 + chr3L 15289618 3' - Doc 4654 1 78.22 GGTACCTGACAGTGTCTTTAGCTGCTCCCCCTTCATGCTCTCCCTCTCTGCGTTCTCACCCCACCGTATGCCCGCTCTCGCTCGCTCCTGAAGCAACCCAC:1 + chrX 6625306 3' - Rt1b 4673 1 76.24 AATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGGCGCAGTCCCCTTCCAGGAATAATTAATCCA:1 - chr3R 17895040 3' + hobo 405 1 71.29 TTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATAT:1 + chr2R 12457976 3' + roo 364 1 71.29 CTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGT:1 + chr3L 10013622 3' + hopper2 1555 1 76.00 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCCAACTTTT:1 - chr2L 8565445 3' + blood 7369 2 58.42 GTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGCAGGTTGGGATAACTTAAGAGAGAAGTTT:1 - chr2R 2650508 3' - Ivk 356 1 78.22 ACAACNTTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGT:1 - chr2R 5582159 3' - Cr1a 433 1 75.25 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAACAACA:1 - chr3R 23048433 3' - mdg1 7071 2 59.41 TCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAAAAGGTCACCAGGAGAGTAATAGGCAGACAGAGTTATTTC:1 - chrX 16462571 3' + Rt1b 4888 1 60.40 TGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATGTTTCAAATACTAATATTTGGTTTATTTAACTCCACAGTAGTGGTCCTAACCTTCAGGTTCTTCAAGTCCAAAA:1 - chr2R 13802119 3' - HMS-Beagle 264 2 71.00 ATGAGCATGCAAAAAACAAAACAAAAAGTGCAGAACAAAAAATGTTTATTTTCGTA:1 - chr2R 10549674 3' - Cr1a 255 1 67.86 TGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACTTTTCAACGCACAAAGTGACATCTGTATGTGTGGTTTCTGCTTTTTTGCCGAATCTGTGGGTG:1 - chr2L 20487768 3' + 1360 102 1 70.30 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAG:1 - chr2L 4160133 3' - Tirant 8148 2 65.00 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCA:2 + chr2R 5840673 3' - Ivk 49 1 70.30 CATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTTTGTGTTTTGTACAGTAGTTTAAAAAATACAAAATAATCAATACTACC:1 - chrX 22943442 3' + Cr1a 98 1 76.00 CCTTCCACCCTTTAGCCGTCTTTTACGACGAGCCGGGAACGTAAATAATTTCGCAGCCTACTTGTAAAAAGCTCTCCTAGAAATTAAAATTAAGCTATGAA:1 + chr2L 22393163 3' - Rt1b 4894 1 58.42 ACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCTACTAAT:1 + chr2L 3388150 3' - F-element 297 1 59.18 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATACTATGGCTCA:1 - chrX 1281683 3' + roo 9039 1 61.80 TATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCAAA:2 + chrX 5129537 3' - Idefix 43 2 74.26 TCTGTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGGTTGGTAGCTTCCGGTTAGGCACATTCGG:1 + chr3L 25952270 3' + baggins 5013 1 74.26 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATATGGAAGGTCAGTTATTGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTTTTTATGATGCAGTCTAGATCTA:1 + chr3R 19448509 3' + Juan 4203 1 53.00 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCATTTCCACTT:1 - chr2L 4160101 3' - Tirant 8117 2 71.29 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTTTCGCTGGCGTTTATTTTTTTATTGTGATAATTT:1 + chr3L 19134078 3' + roo 9045 1 67.33 CACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGAGAAGATTCAATAAATAATAATAAATATATATATATATATATATATAAAAAATAAATAATAAATAATAATTAA:1 - chr2L 8754582 3' + Doc 4650 1 59.41 AAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTC:1 + chrX 19426293 3' + mdg3 5459 2 62.38 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATAT:1 + chrX 10827468 3' - roo 8710 2 74.26 TTTAAGGAAAAGTATGAGTTTTTATATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTATATGTAGTGTAAAGTATATCATTCTGGTAGGGATA:1 - chr2R 3648353 3' - I-element 5147 1 63.37 CCCTCNTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAAATAAAGTCCCACGGAAATATCTCTAGCTAAATTAAAATTTAACCATACTGCAAAACTTTAA:1 - chr3L 20620112 3' + I-element 5065 1 69.31 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAG:1 - chr3L 13589435 3' - hobo 24 1 55.45 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTG:1 + chr3L 16761315 3' + roo 9036 1 65.62 TCTTCTTAAATTATCATATAATGTAAACATAGGGTGAGAAAAATACTGGCCTTCTTGAAAAGAGAAACAACGGACGCGTTCCTGGAGAAAGCTACTGCCGA:1 - chr3L 23907079 3' + Cr1a 84 1 73.27 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTATATATATAGCTCTCAACTTTCTGGCTTTTACAGTTCTCGTCGT:1 + chr3L 23123601 3' - flea 4783 2 63.37 GTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAAATGAATCTTTCGACCAGGAAGTTCTCGTTG:1 - chr2L 10793929 3' - I-element 347 1 75.00 TTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTG:1 + chr2L 22150626 3' + S-element 1675 1 78.22 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTGGCCAATGCCCGCATAATTGTTTGTTATTTACGATATG:1 + chrX 17042741 3' + copia 244 1 63.37 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGAAAAAGCCGAAATAAGG:2 + chr2R 2044243 3' + Tabor 7294 2 63.37 AAATANAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATT:1 - chr3R 11263402 3' + roo 9032 1 65.35 TTAGAGTTAATTAGCCAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTTTTTATGTTTTATAGCTTTTACATACATAAAAAAATTGTTTTTGCATA:1 + chr2L 21793633 3' - Burdock 359 1 60.40 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCAGCCCACG:1 + chr3R 23275351 3' - roo 8671 2 68.32 AGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGGCATGCGGATGTGGCAATGTTGGTCAGGATACGCGCAGGTGGAGCTGATAGATG:1 - chrX 17042622 3' - copia 2 2 75.25 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCGCCTGTGACACGGCTGCCATAAAAA:1 + chr3L 4921470 3' - jockey 4776 1 59.57 TTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGATCCTTCGATTAATCGATTTGGTTTCAACTCAAGAGA:1 + chr3R 4834356 3' - mdg1 7037 1 78.00 CNNTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAGGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGT:1 + chr3R 6622707 3' + P-element 2870 1 56.82 AAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTTTAACTTGTTTTTATTTGTTTACGCACTGTATTTGTTGTTCG:1 - chr3R 14748858 3' - Porto1 228 1 75.25 AAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAA:1 - chrX 10827401 3' + roo 9052 2 57.43 TCTAGTTTTTAGAGTTCCTGAGATTAAAATCGCTGAGAGGAACAAACGAACAATGGAATAAACAAGAAGCTTACTTTATCGTCCCCTCACATTCCGTCAAT:1 - chrX 22779753 3' - INE-1 153 1 78.22 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATGCTGCAGTTCCATTTCACAGTT:1 + chr2L 14658905 3' - roo 77 2 78.22 CGGAAGCCTTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACATTCTCTCCAGAGGTGCTCTTTCCTGTGAGCTCTGTGTGTTTCTGGTCTTGATACA:1 + chr2R 550085 3' + Gypsy6A_LTR 346 1 63.83 GTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGA:2 + chr3R 17321765 3' - Stalker2 7296 2 71.29 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAA:1 + chrX 15082446 3' - mdg1 7076 2 61.39 CCGTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGTGTTGTTGGTATACTTAGATTTTAGTGTAGTGTGCAATATTTCTA:1 + chr3R 3396940 3' + accord2 261 1 64.44 AAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGATCCAGCAGGCCTACCCCCTTCTCCTGTTAAGATTGAACCACCAACTATAAGTAAACTCCAACAGCCTTTGGTGC:1 + chr2L 194730 3' + hopper 437 1 73.00 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATG:1 - 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Cr1a 4388 1 55.67 GCAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCACCCCCCATGTGCCATATTTAATGACAAAGTTTTGCATAATTTCATGAGTTTGCTGCG:1 - chr3R 22914334 3' + F-element 4432 1 63.37 CTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGCGGGCAAATAAAGCAGACGATTTACCTGCCCCCTTAAAC:1 + chr2L 17721935 3' - blood 474 1 61.39 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAA:2 + chr3R 19446221 3' + 297 6941 2 62.38 CGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATTATTCAAAAAATTTCGAAGATCTAATTCTGCATAAAAAAAGTTTAACTGTCCGATTGTAAAAATATGGCACCT:1 + chr3L 27421880 3' - INE-1 298 1 70.30 GGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGATTAATCGAAATTAAATGATGGATTAAAAACGTAC:1 - chr3R 8553864 3' - 412 7499 2 65.35 ACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1 - chr3L 25232774 3' + accord2 7593 2 58.42 CCAGGATCTCTCGAATTTTTATTAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAGAGAGGAGAGAGAGGAGTGCGCAGAAACACGAATCACCTTGTGTGCATGAATGAAGC:1 + chr2R 24229962 3' + 1360 83 1 75.25 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAA:1 + chr2L 3440483 3' - 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F-element 465 1 75.25 TCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACAGAGCCAGATCGACTTGGGTATTAATCACTATTAAGAATATATGTATAAATTAATTAGTTACTAATGCGAT:1 - chr2L 22724118 3' - INE-1 137 1 70.30 GTACANAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCTAGTTGAATAAGATCGTAATTGAAATTTC:1 - chr2L 12448287 3' + transib2 2774 1 70.30 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTT:1 - chrX 8491428 3' - P-element 56 1 25.74 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAATTCGTGCATGCGGATTTTCT:1 - chr2L 13574221 3' + pogo 2052 1 78.22 CGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCTCTTTTTTTTGCAGGAAGGCACTGTAAATGGCAAGCAATAGAAACACAATTATGTCAA:1 - chr3R 4538646 3' - 1360 2962 1 57.43 TACAATGATGTAAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATTGAAAGCAGTTCAAATACTGGGATTACAACTAAGGCGGGAATACGGGGTTTGTTACCAG:1 + chr3R 4970627 3' + diver 207 1 57.43 TGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTG:2 - chr3L 6044745 3' - Tabor 6877 2 59.41 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATT:1 + chr3R 11263466 3' - roo 8693 2 58.42 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACAGAT:1 - chr3R 23275242 3' + roo 9055 2 62.38 GTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTTAGAATTCCCCACGCAAAACTCTTTCATGTAATGAGGGCCA:1 - chr2R 17971979 3' - 412 9 2 69.31 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTT:2 + chr3R 23275338 3' - roo 20 2 55.45 AGATTTAAACATGAAAAGTGTATCCAAGGGATGGGTTTAAACTAACAAAAATGTATTTCGATTTGTTTAGTTCTGCCTGCTTTCTATTAACCTTGTGTTT:1 + chr3L 23883500 3' + Dm88 4241 1 62.00 TATTGATCCTGATCAAGAATATATAGACTTTATATAGTCGGAAACGGTTCCTTCTTTGTATACAACTTCTCCTTTACGTTTCTTGTCGTGCTGTTTTTTAG:1 + chr3L 24335787 3' - INE-1 84 1 54.46 TAAGGTCGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTACGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTGAAACCATTTGAAAGCCGTTTGTCGAGTGCATCTC:1 + chr2L 15912554 3' + X-element 4304 1 71.29 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGA:1 - chr3R 23275276 3' + roo 9024 2 76.53 ATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCCTTTTCTTTCTTTCTCTGCAATAGGG:1 + chr2L 1232293 3' - hobo 263 1 74.26 CACACACACACACATACATACAGACAGTTGTCACCCATACATCCGCACTTATCACTG:1 - chr3R 19703500 3' + Quasimodo 40 2 92.98 TCATTATTATTATTATTATTATTTGATAATATATAGCAGCTGTTCAAATCATCAACAAGTATAAAATTGAAAATGTTAAAAATTGAAGCAGTCTTG:1 - chrX 15626675 3' - mdg1 7076 10 35.42 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGTCTGC:1 + chr2L 14579926 3' + copia 244 1 66.34 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAACCGCTAATTGTCGATAA:1 - chr3L 13659737 3' + pogo 2079 1 56.12 ATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTCATGTTTATATAAAATTTAAAGAAATCTTT:1 - chr3L 8363005 3' + 3S18 6058 2 72.28 ATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAACTCGCCTGCTGCTGCTAAAGAATTCAATATGCCCTTCGATTCGCTTGTCAACAGCAACAAT:1 - chr2R 17942817 3' + Quasimodo 121 2 60.40 CAGTTCTAGAAGAAGAGGAAAAGCTTGAGAATTGGTTGCTAGCGAAACACCGAGTGGGAATACGCATACAATATATGTATATAAGTGCCCATTATGCAAAA:1 - chr3R 4719843 3' - Gypsy12A_LTR 2024 1 51.49 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGTATCGTGGAGTGTCCCCATCTCGCTC:1 - chr2R 10543436 3' - P-element 48 1 31.00 AGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTATTATTCTCGGATATTCGGCATTCGAAATTCTCCATACTTTGGCTTATGAAGGC:1 - chr3L 6013643 3' - I-element 463 1 56.44 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCTGCCGCGAGTGCTGAAAATCGTACT:2 + chrX 2753909 3' + roo 9053 2 63.37 CATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACTTAAAAAATCCATGCCATAAATCCCTTGATATGCGTCTTTCATCACCGCCAACATCGTGGGCAGTT:1 - chr2L 3084962 3' + copia 241 1 62.38 GTGCATGGTCAGCATTCCCACGCTAACCAAATGCCGCTATGTACATAATGTGCGCACATAGCATTCTCTCCAGAAGGCTTAATAGTACCACCCTCAATTAT:1 + chr2R 4214691 3' + gypsy11 4150 2 69.31 ACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTGCACAGAATGGATGTTGAAATACCTGTTTTGGCTGGATATCTTAATGTGCCGACCCAAACTGGATTTTCGC:1 + chrX 7324631 3' + R2-element 3184 1 78.22 GGTTAGCTATGGAAGGTAAATTAATTGAAAGTAGTTTACTGGAATAATAAAGTAAAACACAAAAAAA:1 - chrX 16876075 3' - Cr1a 3998 1 70.15 AATTTTTTTTTTGGAAATCAAAAAAAAAA:1 + chr2L 16320350 3' - Tc1 42 1 79.31 AACTCTACTTTACATATTACTTACTTACATATTAACTCTACCTAAATACCGTATTACTTCTTGAACCTATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAG:1 + chrY 652807 3' - Stalker3T 48 1 62.24 TTTATGACTTATAGCCTAAGGCATTCTAATTGCGCTGACTCTTTTCCAAGGGTTCAATTGGCAGAAGCAATGCAAAACATTCCAGCGCTGGTGAAGATGAT:1 - chr3L 13317657 3' - Quasimodo 96 2 81.19 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAA:2 - chr2R 7861670 3' + roo 9033 1 67.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTC:1 + chr3L 17587827 3' + roo 355 2 78.22 TGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAAATCCAATACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCAATG:1 - chr3R 19447028 3' - roo 408 1 57.43 TAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCC:1 + chrX 13546679 3' + roo 9014 2 81.19 AACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATGGGCTCTCCA:1 - chr3L 4876716 3' + roo 9055 2 62.38 GTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCGGAGCGTACGTATGTCTTTCCAGGCGGGAATCCGGTCGTAGGTAGCGCACCTGGTGGAGGAG:1 + chr2L 9504026 3' - 1360 111 1 66.34 GCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCCCCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCTCCATCAACTTTGCACCACCCACTTTTG:1 + chrX 14745521 3' + Doc 262 1 70.30 TGAATAAATGTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCT:1 - chrX 21017799 3' + 412 437 2 77.23 ATGGATAATCAATCTTTAGGTTTTTATTATGTGTTGTAATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCATTTTCTGCTTCATTTTTTCGGACTGCGTGTACTTA:1 - chr3R 27859411 3' - hopper 1144 1 67.33 ATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGCCCCTAGCAACACTTGCGCTACCATCACCCAC:1 + chr3R 31994511 3' - HMS-Beagle2 7157 2 76.24 TCTAATTTAGAGTCATATTAAATGCAGTATTATGCATCTGGAATATAGTATACGAGATGCAACCCTTATCAGCTGCACATCTAATAATAGTGCGAAATAAA:1 - chr2L 21020258 3' + Gypsy12A_LTR 79 1 66.34 ATTAAATATTAATTAATATTAAATATCATATTTAAAACCTTAGAATCGTTTGATCCTTTAATGTCTGCTTTCTGCACACTGTGTTGATAGGTTTTCGATGT:1 - chr3L 10888536 3' + Tc3 268 1 70.30 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTG:1 + chr3R 4544081 3' + flea 4996 2 62.38 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTATATACCCTTCGTATGTAAAGGAGAATCCCCAACCTAACCCGTACCCA:1 - chr3R 26842792 3' - opus 24 4 55.45 TAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTATACAAGACAAAACAAAAGGCCAAGCCCTGGCCCCGTTGGCCATGTCCATGTGATGGCGGAGTAGGGTAAC:1 + chr2L 19368645 3' - gypsy4 8 2 62.38 GCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCAATAGTGTATATTCTTTGTTAAAAAATATTTATCAGGTAAAGGCAACATTTCCGGCACTAAAAAAATTAAATAA:1 - chr3R 3584701 3' - Tc1-2 13 1 74.26 GAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTTGTTACTGCCCCAATTA:1 - chrX 15355052 3' - X-element 4682 1 63.37 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATCTGTCATTCGAAAC:1 - chr2L 13136738 3' - roo 8696 2 64.21 CCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTTTTGTTGTGCCTGAGATGGCTTATAATAACCACATTCTCCTGAGCTTA:1 + chr4 900413 3' + mdg1 7340 2 56.44 CGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGACGTGGTTGTCGGCGGATAGTTATTGAACCGGTATATATAACCGGAGTATATG:1 - chr2R 10946925 3' + transib2 2667 1 56.44 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGG:1 - chr3R 10952266 3' + roo 9043 1 54.46 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTT:1 + chr3R 17321782 3' - Stalker2 31 2 54.46 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTTTCCTCCATTTTACAGAGATTTCTTGCCGCGCGGCTCTGGTA:1 + chrX 15894697 3' - S-element 4 2 68.32 TTTATTTATTTGGAAATACACCGATGCCCGGTGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTAACGATAAATTGATAACTGTTGCATTTATTT:1 - chr2R 11689011 3' - Tc1-2 469 1 60.87 ACACANAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTT:1 - chr2L 16201522 3' - hobo 38 1 68.82 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACAAATTAAGAGAAAAAAAATTGTTGCTAGATGAAGAGGTGCCTTTCATG:1 + chr3L 5537652 3' + jockey 4966 1 61.00 ACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCA:1 - chr3R 32005895 3' + invader4 277 2 75.25 AGTACNCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTAGGCTATACACGCAGAAGACCGTAAACAT:1 + chr3L 13659984 3' + pogo 2091 1 67.33 TATATTCAATTTTGTTATATAAAAAATTCATATTTTTATTCGTTTCATATTTTGTTGGTTCACCACTGTAATCGAAATGCCCCCACATA:1 - chr2L 13566763 3' + Ivk 5371 1 91.01 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCTCATGTGTTGATGCTCAGCAGCTGA:1 + chr3L 11553569 3' + P-element 2875 1 56.44 TATTGCAGTTTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGATGGTTTAGAGTGCGTATAACTTCGTCATAGAATCTTTAATTGAATGTAAGTGACTTGCGCG:1 + chrX 19971318 3' - Doc 482 1 61.39 TTTAGTATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATT:1 - chr2L 13334026 3' + flea 218 2 67.33 TGTCAGAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAA:1 - chrX 19986371 3' - Stalker2 47 2 72.28 TTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGCGCGAGACATCGGCGGG:1 - chr3R 27518302 3' - accord 308 2 80.68 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTG:1 - chr3L 8713081 3' + opus 7474 2 64.36 AAAATTAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGAAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGA:1 + chrX 8958624 3' + Doc 4698 1 75.82 CGCTTGCGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTTTGAGGTAATATGGAAACTTCTGAGGGCATTGTTAATTATTTTGTTTTAGAAGTAAGTAAGAACCTTA:1 - chr3R 17494612 3' + Quasimodo 231 2 72.28 CATGTTAATGTTTATGTTTATGTCTATTTATATGAATATATTACATATATTACATACATATATGCGCATTTATTTAAAACATTCCGTCAAAAACACTCATA:1 + chr3R 4327858 3' + 412 75 2 60.40 TATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTAAAACAATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATATGATAATTGTTTATTGCAAAAGTCA:1 + chr3R 22232286 3' + Stalker4 392 1 72.28 GTCATACAACTGCACAAATTATTGTTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTATTTGCTAGATTAAGAGTTATAAGAGTTTCT:1 - chr3L 17861718 3' - hopper2 419 1 75.00 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAAGGTAAG:1 + chr2R 24628841 3' - mdg1 19 2 60.40 TTTTACAAAGATTATATGATTGTATGAGTATTAAAAAATTGAATTGATGAACAAATAATTCGAGTTCCGTAGCTAAGGCTATTAAAATTCGGATTGAGCTC:1 + chr2R 3119040 3' - jockey2 3284 1 65.35 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTTAATGGATTACGGTGAACACTTCTCACAAATCG:1 + chrX 21205038 3' - mdg1 7057 2 54.46 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACCTATTATTAAACGATTTTTTTAATTCCAACAAAGGAAGAATTAGAGCTTTTGGAT:1 - chr2R 694088 3' + flea 239 2 64.36 TGAGTTTTTGTATGTTATCTTAAGTGTTTCAGTTCAGTCTAAAGCCGCATAATTGTGAAATA:1 - chrX 4293335 3' - I-element 5133 1 77.42 AGGTAAATTAATTGAAAGTAGTTTACTGGAATAAGGAGGTAATCCCAACTGCCGCCGCTTGTCGCACGTCGTCACTTAGGCAAAACTCAAAGTTTTCTCTT:1 - chr3R 10967856 3' - Cr1a 3985 1 68.32 CTTATTTTTGATTTATTTCCCACGAGTTAACGCTCCGAATTTTCGTATTTCAATGCCAAAGTCGGCTCGGTAGTTGCTGATTATTTCGTTCCGTATATAAC:1 - chr3L 8101910 3' - Fw2 72 1 56.44 ATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGTGCACGTTGCACAGTTTCCAT:1 + chr3R 13582022 3' - BS 5052 1 78.22 AGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGA:1 + chr2R 5840679 3' - Ivk 43 1 64.36 GTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGAGTTTCTCATGAGTTGGCGCTGCGGCTGCGGCTGCACTTGTTTCAAGTTCAATTAATT:1 - chr2R 16513379 3' + opus 222 2 58.42 ATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAGTTTTCTCTTTATGTGGTCGCAAACAGATACAAAAGGTTCTTGGCAAACTGAATAATCTCGGTCCCGCC:1 + chr2L 19525512 3' - FB 7 1 69.00 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTGCTTGAAG:1 + chr3L 12888316 3' - mdg1 6 2 73.27 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTATATACCCTTCGTATGTAAAGGAGAATCCCCAACCTAACCCGTACCCATA:1 - chr3R 26842790 3' - opus 7024 2 56.00 GTCTTTAGTTTAAAAACTCATAAGAACTCGCACAGTCGCATAAAAAATAACCATACACTAAAGTGTTATCTGTTAATTTACATGCCCAGGAGTCTGTTCCT:1 + chr2R 737665 3' + gypsy4 208 2 60.40 AATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATGAGGCCATTTATTAAA:1 - chr2L 6388264 3' + copia 254 1 56.44 GTTACTCAGCTAGTGGAAATGCGAATGCGAATCCTTCCTTCCTTCTACCTGTTACATAAGAATATTACTAAAAGGATATAACAAATTTAGTGCCGCTTTTA:1 - chrX 22545295 3' - INE-1 534 1 61.39 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGTACAGTTTTATAAGCACACAAAGACATTTATTCTCAGAAAACATCGGTGGTTGAAGCTG:1 - chr3L 11836800 3' - 1360 17 1 62.38 CGGGANCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGAACACGAATCCGTCCGGTTGTGATGACGAAGCCGCACGAA:1 + chr2R 16334078 3' + P-element 2880 2 72.28 TGGGGACGGATGTTTAGTCTCCCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTACGTTGCAGACCCCGTCCTA:1 - chrX 23183524 3' - Idefix 184 1 77.55 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGG:1 - chr3R 27748672 3' + roo 9039 1 60.42 AAAACATATAAGGATATTCAAAAAATCCTTAGTGTGTACTATACTATATTCAGCTGTTATACTGTTAAAATATGATACATGTAGTATGCACTATTAATTAA:1 + chr4 847254 3' + HB 417 1 71.29 TTCAACGTAACAACGCGTACTTTTCTTATGTCTTCGCGACACTTGCAAACGCAGACAACGAGCGGCCAATACGCCCACACCCCGAGGATACCCCAATACCA:1 + chr3R 3525319 3' + Doc2-element 343 2 70.30 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCAC:1 - chr3L 15100682 3' + pogo 2058 1 69.31 GTGAANAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTATATGTAGATACATAGGAAAAAAAGGTAACCTGCTATTAGATAATATTTACAAGGA:1 - chrX 18214069 3' + invader4 307 2 53.47 TGTTACATACTTTTCAACGAATATATAAAACCCTTTTACGCTAGGAGTAATGGGTATATTCACTCGGCTCAAACTCAAACACACACGAATAAGACACAACA:1 - chr2L 22045468 3' - INE-1 16 1 90.10 CATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAATCG:1 + chr3L 24402220 3' + INE-1 535 1 60.00 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTGTATAGTTCGCAGCAAAATGGCCTAT:1 - chr2R 8158887 3' - pogo 44 1 75.25 CGGCTGCACCCGCTCACGGACCGCAAGCAACAAACGGTACTGCAGTAACACCTAGCACACCCACACCGCCCAACGTACACCGAGAAAAATAGGTAGATAAC:1 + chr3L 19352624 3' + F-element 469 1 58.42 TGATTAAGTTAATTTGTATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAAAAATACGATCCCGATGAAAATTAAAAGTGAAACTTATTTTGGAACAACATTTAG:1 + chrX 8460727 3' + HB 286 1 65.35 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCATATTGATATTTGCTCTTCAAGT:1 - chr3L 13659889 3' - pogo 31 1 58.42 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGC:1 - chr3L 12888221 3' + mdg1 389 2 58.42 AAAAGATCATAACTTTACGCTTGGAAAATGACATCATCGATTTGAGCGTCTGTCCGACCACATGCGTGAGTAGCTGAAATGGATTCGATTTTCCAAACTTC:1 + chr2L 19975659 3' - Q-element 671 2 67.33 ACTCATAGTTAGATCTGCAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAAGGAGGGCCAATACCGACCGAATCGTATTGTATGGAGGCATTGAACT:1 - chr2R 20719774 3' - Cr1a 4154 1 59.41 GAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGACTTCGCTTTCCGTCGCC:1 + chrX 2799729 3' - Tirant 1 2 80.20 AACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTCTGGAACATTTTATATTATTTATGAAGTTTTGTGTATACATACGTGTTGGATTATGTATACT:1 + chr3R 20840039 3' - F-element 4625 1 64.36 AAGCAGACACAGCTTATTCACTGCCCGCATTATTACTCCAGACGCGGTCCTCACTTCTGGTAAATCCATTTTATTTAACTTTGTCTATTATTTATCTTTGT:1 + chrX 7845187 3' - diver2 4465 1 58.42 ATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAAATAGTTCACGCTGACGCAGGCCGAACGTTGCTAACTAAGGAGAAGCAAAAACATCATAAATCAAAGA:1 - chr3R 2520449 3' + Tc1-2 1460 1 73.27 AGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAGACAACCCGCTGCAGGGATCGCCCATCGCCGTAGGTGTAGTAAGTGCGGTACGTGCAGTTCACGCAGC:1 - chrX 20150144 3' - F-element 4580 1 69.31 CCGAATCCGTTATTCCCACCAAAGGGTTAAAACCGCCTGTGGGAAGCAGAATGAAATTTCTCGTAAGCAGGCAGTTGATTAAACAAACCCCCATTCCACAC:1 - chr3R 17608075 3' + Quasimodo 6926 2 69.31 AATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTA:1 - chr2R 4673569 3' + Quasimodo 7346 2 56.44 CGACTCCCACCAGAGGGTCATCGTGGATACCCGTCATCGTCATCGTCATCAGCATTTGCCAACAATTCCCATGATGATGGGGCGTTAATGGCGCTTTAATT:1 + chrX 6052610 3' + Quasimodo 7058 2 81.19 TATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTA:1 + chr2L 3388148 3' - F-element 302 1 57.43 ACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATA:1 + chrY 3648901 3' + 17.6 7403 2 62.38 ATCACNACAGAGCAGTATACGCAAACATTCGCGCTCGCTCTCATCACGACAGAGCTCCTCAGGTGATTAGAAATATGTGTTAGCCATATCAGACGGCTCGT:1 + chr2L 1219217 3' + diver 383 1 54.46 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGG:1 + chrX 17968417 3' + Tirant 351 2 71.29 TGAGTTCTGTTTAAAACTAAAGTTCAATTTCACATTCAGATATTTTATAGTGGCACACCGTTATTTCACGCTTGTCTGGGTTTCATCAAATGCTTAACTTT:1 - chr3R 32021052 3' - gypsy9 5248 2 70.30 CTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTCTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAAAATATTAACAACATTGAAAAAA:2 - chr3L 14396954 3' - BS 4998 1 65.35 TTGCAAATAAAATAAAATAAAAAAAAGGGTGTGTTTGTGAAGAGAGTGCACTAAAAATAATTTAAATATTAATGTGAAAAACAAAAACAGAAAATTTGAAA:1 - chr3R 8445673 3' - transib1 1901 1 65.35 TGGTTGGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATTGAGGCGGAGG:1 + chrX 3763258 3' - 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opus 157 4 71.29 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAAGTCAG:1 - chr3R 4600071 3' + HMS-Beagle 6999 2 75.00 TACACACACACACACATACGCAGGCACACACGTGTGTGCAGACAAACACACTCGCATAAATATGCACAACAACAGCAAACTATTAAATATAAGCACACACA:1 - chr2L 9034925 3' + Quasimodo 38 2 58.42 CTGAGCATACCGGTAAAAATAGTAGACAGAGTGTGTTGGGGTGGACAACGCTCTATGAGTGTGTTCGTTACAGTTATAATACCCAATACAACTTGCGTCAG:1 + chr3L 25768162 3' + Circe 7381 1 77.23 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTCGAATGTTGCGTATTTCTAAAATCAT:1 - chr3R 12605590 3' - F-element 36 1 58.42 CACCGGAGCGGAGGACCGTCGGGATCATTAACTTTTCAAAAATAAAGAGGTTTATAGCATTGGAATAAGTTTGACCAAACGTCCATGCCATGCCCACCTTT:1 - chr2R 4886957 3' + gypsy8 4589 1 73.27 GATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGATATCAAGAGTT:1 - chr3L 18337626 3' + Juan 4207 1 73.27 TTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTCCACCCCTAAAAGACAGTGTATTTTTATGCAGT:1 + chrX 12290257 3' - X-element 23 1 64.36 TTCACNCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACTTTGAACCCGATCTTTTCCGATTTCTTAAGCTATTGCCTAATCCCAGCCTG:1 - chrX 17831730 3' + P-element 2831 1 59.41 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGG:1 - chr2R 20739464 3' - roo 55 2 82.18 TAATATTTAAGTAGCTTTTATTTTTATATGCAAAGCAAAGCAGAGCAAAAACAAACGATAACAAAGATGGCAAGGCAACTGCTCGCGCCTCGTCATTCACA:1 + chr2L 16530214 3' + blood 6922 1 57.43 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTTTAGT:1 - chrX 20620542 3' - pogo 40 1 71.29 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCGATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATAGGAGGTGCTAAAGT:1 - chr2R 5953065 3' - pogo 6 1 71.29 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTA:1 + chr2L 20133043 3' + flea 4999 2 71.21 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTG:1 + chr2L 7255793 3' + P-element 2838 1 30.69 CAAGACCGCGATCGTTTGCACTCTGCAGGTGCTAGGTCATTGACCGGGTGGATGATTTGGCACTCGGGGAACGGAAATCAAAAATAATGAAACGATATTG:1 - chr2L 11219915 3' - Doc3-element 369 1 66.00 AAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTA:1 - chr3R 8975950 3' - Bari1 43 1 68.32 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATGTTGTCATATTTCGCCGACAACTT:1 - chr3L 11661695 3' - hopper 11 2 66.34 AAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGGCTAAATTTAAACAGCACACATACACCCAAACACATACACACAGTGTTGAAGTGAAAAGCGAAGAGCTACA:1 + chr2R 10945422 3' - transib2 4 1 75.25 GCTACCGGCTTATTCCAGTTGGTCACTTCAGCTATAGTCACCGCCAGGAGCGCCACCAGACCACTCCACACACTCACCTGCACACTAACCAGGCACGCACA:1 + chr2R 8480183 3' + Chouto 212 1 64.36 CAGTGTAGTCCATGGGGTCTCCTCCTTCCTCCCTATAGTCGCCTTTTAGTCGCTGAGGTAGAATTCTTCTCATCCTTTTCCAGTTGATCGCGAATGCGGTT:1 - chr2R 15561901 3' - Rt1b 4917 1 66.34 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGCATATATAAAATTATTATAAAAGTGGAAATTAGCATTGA:2 - chr2R 22478073 3' - Burdock 39 2 66.34 TATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATATAGCA:1 - 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chr2R 18950757 3' + roo 9023 2 74.26 TTCATATCGTGCAGTCTTAAGCATCGCTTGCATTCTGCAGTTAATTAAGTCAGCCTGCTTATTGGGATCTGATGGCCATTTGGACGGCATGCTGCTCGGCC:1 + chr2R 23372942 3' - Doc3-element 400 1 77.23 GAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAACAAGAATATATACAC:1 + chr4 559328 3' - INE-1 518 1 84.16 GGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTACAAATGTGAGAGAGGGGAGCTTAGATAACGAAGATATTGCTCCACAGCAGAGGTGAGGTGCCGCAGAGTTTAA:1 - chr2R 930526 3' - McClintock 6229 2 67.33 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCTTATAAGTAGGCAATAAAAATG:1 - chrX 7045582 3' - jockey 4768 1 65.35 CACGTGTGCATGAAGTTAACGATTATAATAAAAGCATGAAGTGTCCGTGGCCAAAGAAACAAAAACACTCGTTATCACATGGAGATTATTATGGCCACAA:1 + chr2L 828205 3' + Stalker4 448 1 65.00 TTTCGTTCGCTGAATTAGCTGTATGTGGGTGTATGTGTGTGTGTGTGTCTTTGTTCGCTACATTAAACATTTAAATGCGTTTTTAAGCAGCCCAACTTCCT:1 - chr2R 16685359 3' - Porto1 4316 1 78.22 CATGCAATCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCATGCAGCAGAAGAAACACCGACTGCAACGCTGCCTGGCTAATTGTGGCAAGGTAAAGTGTATAAATT:1 - chr3R 6268804 3' - baggins 5238 1 62.38 TACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTGGACGAAAGGCATTAGCCTGGCTGTTGCTCCCATTC:1 - chr3R 16271084 3' + I-element 4890 1 67.33 ACAAGATGCGTAACGACCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGATGGCCAAAATTACGCTCTTTGATATTGCCGAGCAGCGCCTGCAG:1 + chr2L 17135611 3' - 1360 3372 1 74.26 AACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACAGAAATGGAAAAAAAAAAACAATAAATGAAATGATGCGAATAATCAATACTAGTATTCTAGTTTACGCTAACAC:1 - chr3L 25255970 3' + Burdock 328 1 78.22 ACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAG:1 + chrY 3648894 3' + 17.6 7403 2 59.57 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACCAGACACACCCAAACCACCCACCGCATTAGAGGGTTGCCAGGCAGCGGTATTTT:1 + chrX 20044572 3' + roo 406 1 56.44 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAG:1 - chr2L 14790600 3' - roo 8715 2 79.00 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGAAAGAAGACATTTGACAGCGCGAGTTCAATAGCTAAATTCCTATCGAAAAGCGGAAGATT:1 + chr2L 12441584 3' - transib2 15 1 64.36 CACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGGAGAATTCAGTTTATAAGTCCTTCTCGACCGCAAAT:1 - chr2L 6083681 3' + 3S18 338 2 75.25 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCACACCCATTAAATTGTATTTTATCTCAATTAGCGCAAATATTTTGTGGCTGCCATTGCCCTT:1 - chr2R 20816413 3' + hobo 2931 1 67.37 AATATTTAACAAAAAAAAAATAATATTTTCAACAAGTACATTGACCAGGGCATAGCCGAGCTGGTTCCCGGAGTTCTCTTCATCGATGAAATTCACATGCT:1 + chr3R 10263298 3' + TART-B 10630 1 70.30 TCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTAGCATTAATTAAAAATTATCAAATCCGACGGGGCACACATGAAAGCTGTCAGTCGTTCGTTCTAAG:1 + chr2L 16890082 3' + pogo 1923 1 67.33 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAAATATCGCCATATCACCAATTCCTTAAA:1 - chr3R 4834241 3' + mdg1 7441 2 60.40 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACA:1 + chr3R 23638174 3' - pogo 33 1 65.00 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACTTT:1 - chr3R 17896953 3' - hobo 42 1 75.25 ATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTGATTTGATTATCATGAACCTTTACATTTTTATACCTTTTCTTTAAATGAAATTAT:1 + chrX 21575409 3' - INE-1 95 1 45.54 TATTTNCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTC:1 + chrX 5092979 3' + roo 361 2 68.32 TACGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTGGTTAACTTGTAAATAACATACAAACATACAATTATTGCTTTTGGTTTATATTTTTCTTCTCTTCTTTCTTTTT:1 - chrX 16507891 3' - gypsy2 6502 2 74.26 ATTAATAAAAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCAACACTTATATCGATAGAATTAATTGTCTTGTCTTAAGAA:1 - chr2R 1264052 3' + hopper 1122 1 60.40 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTG:1 - chr2L 15947387 3' - Transpac 34 2 55.00 CGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAGAGTTGTGGCTC:1 + chr3R 29331935 3' - G6 2 1 74.16 AGTAAAAATCGATTGCTTTAAGAGCTGTGGCAAGAACAGTATAGCGATGCTGATGAGGCATCCTCGCGGCAGGCCGCACATGGCCGACCACAGGGATGAAG:1 - chrX 10382395 3' - Cr1a 4255 1 76.24 ATCAAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACA:1 + chr3L 14603153 3' + jockey 4995 1 40.59 TCTTANTTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGCCATGGCGTTGTTCCTTAATGGCGCCATAAACAG:1 + chr2R 16475842 3' + 412 491 2 68.32 AATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACCCTATAATAACAAAGTGAAAATTTGAAATTATTTCGTGCGT:1 + chr3R 14917256 3' + HMS-Beagle 7008 4 59.41 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGG:1 - chr2L 12815024 3' + hopper 1400 1 64.00 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATTTTTTGCATACATATATGTGGGTT:1 - chr3R 11939744 3' - FB 52 1 84.16 AAGAGTATGAGATTAGTCTACTGCTGACGAAGCTCCTTGAACTGGCGTTGAACTTTTTATGGAGCAACTTTTTCACAGACGGTTATATTATTTATATTTTC:1 + chr3R 22635885 3' - diver2 31 2 81.19 AAGTCGAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATCTAGATTGAATAAAATTATCTGTTAGGCAAATTGAATCT:1 + chr2L 12999883 3' + S-element 1684 2 62.38 GGATTCTTGGGCTATGGGTTATTGCCCAGACTGCTACTGCTGCC:1 + chrX 7078882 3' - F-element 321 1 50.00 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATACATATATTTAAATATATTTAATTTAAATTCGACACTTTTTATCAAAATATTTGTTGCTCT:1 - chr2L 22079389 3' + flea 4998 2 68.32 ACGACTAGCCGGGGACGCTGAGGATGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAATTCCAGGGCCAACTTCCTTTGCATATTCTCTTATTTAGTTGCCATTT:1 - chr3R 19449271 3' - Rt1b 4870 1 79.21 AAATTCCAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGC:1 + chr2R 5531182 3' - 1360 79 1 54.46 ATATGTATATGTATAAATGTCTTCATCACAAGCAGCTTTTCCGAGAAATCGTAATCACACATTCACCTGCAATAT:1 + chrX 10285145 3' + Stalker 7097 4 68.00 GTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAA:1 - chr3R 13582244 3' - BS 5047 1 75.25 TTTTTTTTGTTTTTTATTTTGTGCTAGGCACAAACGCTTCTTCTGCTATTTTCCATGTAATTGTTGTCGTTTGTAGCTGGCGTTAAATTCTAAAGATTTGT:1 - chrX 16470130 3' - G2 3076 3 53.47 TCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTG:1 - chrX 23078690 3' - INE-1 560 1 82.18 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACGGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTG:1 + chr2L 14790650 3' + roo 9041 1 50.50 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTA:1 + chr3R 12539545 3' - roo 49 2 77.23 AAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTCCTTGGTTCTTTCGCTGTCTTTTTCATATTTCGTGTCATTTTCTTGTTTACCTTGTTGTAGAATTCTG:1 - chr2R 2881608 3' + TLD2_LTR 152 1 65.35 AATTAGTATTTTTTGTATTCTTGGCTTTTAGACTTTGTATTTTCGACATTCGGTGACGTTTCAACATACAAATTAGTAAGAGTTTTCCGCGCGAGAGGTGG:1 + chr3L 3826372 3' - HeT-A 5890 1 65.35 CTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTATCCATGCGCGTTCCAGTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACAGAGAAACATGAGGAATGCATTACCTCCACCGAATT:1 + chr2R 15318839 3' + Quasimodo 242 2 69.31 TAATAATATATTTTTAGATTTTATATTTAAATATTTTATATTGATTCTGTTTCTATTTAGTACTCTTTGTAAGGATCGGTTTCATCGAAAAACACTGCTCG:1 - chr2L 12401927 3' + hopper 170 1 62.38 CTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTCGAGTCGCCCACTTCCCTCAAGTACTCGCCGGATGGCAA:1 - chr2L 6675798 3' + R1A1-element 343 1 64.36 GCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTACATAGGAAAAGAGAGACCGACCAACTACAATTAGACCCCGCGTCATCATCGTTTTTCTGGC:1 - chr2R 9300189 3' + 1360 3303 1 66.34 TTGTTGAATAAAATTAATAGGGGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAGTTTCATTAAAGGTTTTTTTTTAATTTGTTCCAAAA:1 - chr2R 4608375 3' + Tc1 236 1 77.23 TTATTGTTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAA:1 + chr3L 12888293 3' - mdg1 29 2 50.50 CCTTCAACTTAAAACGGATTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTAATGAGTTCGAATATGGCCACGCCCCAAACATCTGCTGATGGCCATC:1 + chr2R 17972076 3' + 412 7519 2 51.49 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCT:1 - chr2L 12949224 3' + 412 7500 2 72.28 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTATTGTCATTACTTTTGGCCCACATTTAAAGCCAAATACAAC:1 + chr2R 23580846 3' + P-element 2879 2 69.31 AATAAGCAACAAATTTCAATTTTGTACAAGGTATTAGAATCTTAGAATAACTAGATCCACAAAGTCTAACAATCATCGACCTATGCCAACTGTAG:1 - chr2L 14202319 3' - S-element 1540 1 81.05 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTTGCGCAAATCGCATTCGATGCGATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTCCCTTTGAGAGG:1 - chr2L 20622780 3' - Doc 23 1 39.60 CAAAATCTAATAACTGATGTGTTTACTCAAAACTGTAATTAAATTGATGTCGCCGCCCTTATTCCTGCCTGTCTTACAGTTAGATTTGTATCTTGGCCCGG:1 - chr2R 5472005 3' + transib3 440 1 57.43 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTGAC:1 - chr2R 16988193 3' - opus 22 2 55.56 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAAC:1 - chr3R 23591434 3' - pogo 49 1 79.21 GGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATATATTTAACTAAATAAATATCGATAATTCCCTTTTTTTACGCACGCATGGCAACCCTATTGCTCAAGCCGTTGTT:1 + chr3R 17795081 3' + R1A1-element 93 1 82.18 AAGTATTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGTTCAGC:1 + chrX 3817540 3' + roo 405 1 74.00 ACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATTTCAGGGCGTGAATTTTTAATAATATATGTACATATGTCGGCTGTCATATTATTTTAATGTGTTTCCACATA:1 - chrX 16552500 3' + 1360 3013 1 54.46 ATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCCACTCGCTCGAACACTTCGATTCCGAACAGTGGCATTCAGCA:1 - chr3L 21550662 3' + P-element 2734 1 47.52 TCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTG:1 + chr2R 5840686 3' - Ivk 35 1 57.00 ACACGTTAGTATTCTCTGTTAAAATACACATAAATTGTAACAGTCAACACAAAAACAATACTACACACATACAATACACACTTTTATTAAAAAAAAAAA:1 + chrX 17787070 3' - transib2 372 1 55.56 TCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGGAAAATACAGTGGGCTGAGAATCAAAAAAATTTATAACTTAACACAATCATAATAAT:1 - chr2L 13319443 3' - hobo 96 1 61.39 AGAAAAAGAAAACAAAGAAAAAGTTATAGGGAAAAGTGGTGATGGTGGGGGGAAGGGAAAGCAAAGCAAGGAGAGGGGATAAAGAAAGTATGAAAAAAGTA:1 - chr3R 21799956 3' + Doc2-element 221 1 80.20 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGAGAGCCTTGAGAAGCCGACCGACTTTTAATTGCATACTTTGTAGGCAACATTATCGGGAGCT:1 + chr3L 22039783 3' - jockey 4684 1 62.38 GCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAACCGTCACGAACACCCCAACAAGCCCACCCCCTGGAAACTCCATTCCATTGTCT:1 + chr2L 5706493 3' + jockey 4721 1 64.77 TAATANTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGATGTGAGTGGACTC:1 + chr2L 12949307 3' - 412 4 2 74.26 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCT:1 + chr3R 27775151 3' + roo 9037 1 59.41 CCGAAAATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAG:1 - chr2R 19552006 3' + roo 354 2 76.24 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTCTAGTTGTCTAGTGTTTTTTTGTTCTCATAAAGCAAGACAATCGGTCAAAATAA:1 - chr3L 14396976 3' - BS 5020 1 45.54 CTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGTG:1 - chr3R 27499991 3' + Stalker2 454 1 70.97 GTGGCTGCTTAGTGCCAAACTAATGTATGGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCTTATCTAAAACGTCACATTGGTCACATATGT:1 - chr2L 22993607 3' + 1360 3348 1 62.38 TAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACTATTTATAAACACGGGATGTGAAGGAATATCTAGGCTTTTTAATTCAACAAAC:1 - chr2R 12655711 3' + roo 8773 2 53.00 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGA:1 - chr2L 12815044 3' + hopper 1379 1 59.41 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTCGTTTTTGGTAATGTGAAAGGGTAGACTG:1 - chr4 185768 3' - jockey 4700 1 71.29 TAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGAATGGAAATGGAAATGGATGCGAGAAGCGTGAAAAATATTTAATAAAACTGAATTA:1 - chr3R 6116823 3' + Tirant 469 1 65.93 CTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTCCAACGGCCTTTGCTTTCTTCTACGTTCCAGTCTCTTCAAATACAATCGCTCGAAAAATGT:1 + chr3R 27290025 3' - jockey 4929 1 64.36 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAGATATCGAGAAAGGAGCCTGCCTATAAGGGAACGAACTCGGGGCAAAAC:1 - chr2L 18251016 3' + I-element 5325 1 60.40 TTAGCTAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACACGCCGGTATGACATATGAGTGCCGCTGTCAAAC:1 - chrX 11191722 3' + R2-element 3351 1 67.33 GACCGGTCTCGTATATGAAGAAAATCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGCAACTAATGCCAGTGCTTTGTTTTTCGCTCCAATAGGAGC:1 - chr3R 18696968 3' - Rt1a 52 1 61.39 TTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACAGCACTATATCACCTACACAAGTGCATCCTACACACGCACACACAAGA:1 + chr3L 1178267 3' - P-element 29 1 47.52 GGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGCCAACCACAAATCAAAATGCTTATTGACTACTTTTA:1 - chr3R 23263768 3' - diver 5786 1 65.96 ATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGACCTCTGATAAATGTGGTTGTGTGCGCTCTTTTAACCGTATCAAGCTAAATGGGTACTTGTTGAAGA:1 + chr3R 4220611 3' - invader2 22 2 75.25 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCTCATGTGTTGATGC:1 + chr3L 11553558 3' + P-element 2864 1 45.54 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGC:1 + chr2R 10543487 3' + P-element 2834 1 25.25 ATTATAAATAATATTTAAGTTAACGACTTATCTTACCTTAATAATAAGAGCGACGGGCGATGTGTACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTATTAATCTTT:1 - chr2L 5942607 3' + blood 6914 1 20.79 TTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCAGCACATGTGGTG:1 + chr3L 18501023 3' + hobo 2915 1 52.48 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGATTTGCAGCTTGG:1 + chr3R 6273572 3' - blood 40 2 66.33 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATATTAAGTCCCAATTATTTTGTTACCACTACGAATTTCGACTACACCAAAGACCAAGA:1 - chr3L 15729973 3' + I-element 5332 1 54.46 GACCGTGAGCGGGTGCAGCCGTTGACGATAATAACGCAGATGAATGGAAATACTTTACGAGTCACTGGGGTGAACAGAAATGTCAACATCTCGGAATCGG:1 - chr3L 22395368 3' - F-element 468 1 71.00 GAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCAGAGCGCACATGTTTGGCATAAGGACGATCAACAGACTGCAGGAAAACCGAACGAACGTTGGT:1 + chr2L 20919367 3' - Doc 343 1 62.38 AAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAAATAAGAGGAAACAACAAAAAGGAAAGAATGAAGGTGGA:1 - chr2R 2307616 3' + copia 5062 2 73.27 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATATC:1 - chr3R 9551439 3' + P-element 2838 1 30.00 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTAACT:1 - chr2L 2060131 3' - 412 7085 2 56.70 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGA:1 + chr2R 10543503 3' + P-element 2848 1 40.59 ATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGCCTTCATTATAATGCGTTGTTGTTGTTTAAAAATAAACTCTGCTGCGCGTGGCATT:1 - chr2L 12529548 3' - F-element 4320 1 55.45 TGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTCAAGTTTTGCAAAAACTCATCATTATTGTTTTTGTTATCTCACTTCCGAAATGCTTTTT:1 - chrX 14974297 3' - pogo 1837 1 72.28 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCCAAGGAAGAAATAAATATTTATATCGATATAAAAAAGTAAACGAAGTTAGATTTTTA:1 + chr2L 8308264 3' + P-element 2868 1 56.44 TTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCAATC:1 + chr3R 11263474 3' - roo 8663 1 75.95 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAAAAATAAAGTGGGTTGAAGACAAATCCAAGCTCC:1 - chr2L 5707259 3' + jockey 4950 1 71.29 CACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTC:2 - chr3L 19951186 3' - Ivk 18 1 61.39 AAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGCCGCCGTCGAGACAAGAGATGAGAAACGCTGACGCAGCTGAGAG:1 - chrX 12252927 3' - 1360 3232 1 58.42 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCACCGAATTATGTGGCATCCATTGTTGTTGAGGACC:1 - chrX 20047525 3' + roo 408 1 72.28 GTGAGTGGACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGC:1 + chr2L 16201562 3' - hobo 2755 1 65.35 GCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCTTATCGAAGACGAACTGCACCTGGACGGCCTTATCCTTCGGCTGGCTGCA:1 + chr3R 7521447 3' - blood 7269 2 66.67 GCACTTAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGCCCGAACCCGAAGTCTGAACCCAA:1 + chr3R 25097887 3' - P-element 50 1 30.69 AGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGGC:1 - chr3R 27284000 3' - Max-element 8268 2 51.49 GAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAACGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCA:1 - chrX 15746287 3' - jockey2 3222 1 54.46 GAAAAGTATATAATGAAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCAATGAAAACAGAAGACTTTTAACCC:1 + chr2L 11700454 3' + micropia 5241 2 74.26 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATGGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGGATGCTACGCT:1 - chr3L 9907362 3' - jockey 36 1 48.51 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCAATTAGCACCAAG:1 - chrX 20806837 3' + opus 498 1 77.23 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATT:1 + chr2R 19209456 3' - jockey 4787 1 52.48 TCCTACTTTGTTTTGCTCCATTTTCTTTCCTTGGGGTTTCCATTATGCTTCCTTTTTTTTATCGTCCTCTGTGTGAGTTTGGAAATTTTTCTGTTGTGAAT:1 + chr2R 23847895 3' + S-element 244 1 56.44 AGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAATTGCAGCGATTCGCGATCGTTGCTGCAC:1 + chr3L 20695132 3' - Stalker 6888 4 71.29 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAA:1 + chrX 19162669 3' - pogo 31 1 59.41 ACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACAACAACAACAATGGCCAGGACAACAAGGACAAAGGCAACAACAATGCGTGGGCAT:1 - chr3R 29347497 3' + I-element 4927 1 57.43 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGCATGA:1 + chr2R 12082425 3' - mdg1 14 2 65.35 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATATAAGTAAGTGCATGCCTATATAATTGCTGGCCCATTTGATATATATATATGTATATATAT:2 - chrX 4486486 3' + 17.6 7412 2 73.27 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATAATTTACTACTATTTACTTGTA:1 + chrY 536713 3' - Doc 31 1 54.46 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCATGAGGGTTTTTATACGAATTGCGGCAGTCAGCATTCGTCACTTCACTTTTCCTGGTAAACGTCTATTTAAATGTGAGAA:1 + chr2R 7884264 3' - jockey 4736 1 79.21 ATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCACAAATTGCCTGTCAGCTAATTACAATCTACTATTTGCCGGCAGATCAGC:1 - chrX 8499495 3' - P-element 133 1 48.51 TGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTTCGCATATTTTTTCTCGTCGGGTGCCTTGAATCGCTGGTCGCTGTATCTTTGTATCTTTCGTGTGGAGTG:1 + chr2L 1012445 3' - Quasimodo 92 2 73.27 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCA:1 - chr3L 6044740 3' - Tabor 33 2 54.46 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGCGGCAAAAAGTATCTCAACGTGTGCGTATCTCTTACAGTGCAACAAGCAAGTGCAACTAATA:1 - chr3L 16436579 3' - accord 184 2 68.69 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGAGTACGGAACAATATATTACGGATATCTGCGGGGGTTACAGAATGCAACCCAAAAT:1 - chr3L 19377714 3' - roo 19 2 61.39 TTGCGCCTCGTGACTTCTCTCGCCACAACGTCCAGACTGCTCCTTTTGGCTCTTCGAACTTAAAATTATCTTGTGGATCAATATAAAAAAAAACAGCA:1 + chr2L 14880411 3' - gypsy9 5170 2 62.24 TACATACTTTTCAACGAATCTATTATACCCTATTATATATATTATACCGTACTTTCGATATGGTTTGTTCTTGATTTTACATCGAATAGCGGTACTTTTTT:1 - chrX 22875498 3' - INE-1 13 1 52.48 CTCAAGGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAATATTTCATGTTTTTT:1 + chr3R 27981748 3' + roo 394 1 64.36 ACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGATGGACCAGTTGAGAGAGATGAGGGATGGGATTAGCCATCATCT:1 + chr3L 7198213 3' - Doc 493 1 56.57 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGG:1 + chr3R 27775130 3' + roo 352 2 79.21 AGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGCGAGATGAATTGCCAGTCGGAGATGTTGGCGGGCGATAAGGCATA:1 + chr3L 662143 3' + P-element 34 1 49.50 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTT:2 - chr2L 16201528 3' - hobo 52 1 78.22 CGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTGGTGATGCTGCTGCTGCTTGTAGAAAGCGGCCGCCGAACTGCCCGCCAGAATGTCGTTG:1 - chrX 17397930 3' + Quasimodo 7044 2 63.37 AAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGT:1 - chr3R 6735294 3' - copia 58 2 81.19 GATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAGAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCG:1 + chr2R 1949131 3' + Cr1a 4404 1 70.83 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCCATTGCGTTTC:1 + chrX 2776151 3' + 297 6938 2 65.35 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAA:1 - chr3L 2019677 3' - 412 7106 2 78.22 GTGTACCTCTAGCCTACTACATATTGTATACAATTCTGATGGTCTGTAGGCCTTAAACTGAATCTACTGTTTCATGTTTGCTAACTCAAACCACCCATATT:1 + chr3R 2819391 3' - invader2 4858 1 84.16 AAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGTATTTAGTTGCATGTTGTCCTTTCGTACGTACATATCTA:1 + chr2R 8299526 3' - I-element 5096 1 61.39 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGAAAAAGCCGAAATAAGGCAAATCAAA:1 + chr2R 2044252 3' + Tabor 7305 2 58.59 TAGTTGACGCGAAGGCTCTAAATTTTTAGGCGGGGAGAAAGAGAGAAAAGAACGAAAGACACTAGAATATCAAGATATCCATAGAAGCTTTATTCTTAGTG:1 - chr2R 17878324 3' + Gypsy12A_LTR 474 1 75.25 GGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGTATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATTGAGGCGGAGGTATGTAG:1 + chrX 3763265 3' - 297 6581 1 76.24 TTTTTCCTTGCTGTCTAAGCTTTAAATACTAAATTCCATTGTAATGTTAATTGAACTTAAATAAAGTCTAATTGTTAGATTATTCTGAAACATTTCGATTA:1 - chr3L 10702690 3' - HB 399 1 80.20 AAGTCGTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCA:1 + chr3R 23275344 3' - roo 8678 2 61.39 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTTCTCCCATCTCCTG:1 + chr3L 16761350 3' + roo 404 1 72.00 GCCTGAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATACTGAAATTTATTTATTTATTTTTGGCCTCTGACGGAACCACTGTGGAACGGAGATATTCCATGCAAAAG:1 + chr2R 5017069 3' + Transib5 2924 1 54.46 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTGACAAAAGACTATATTACATTTGAAATTCA:1 - chrX 19426216 3' - mdg3 17 2 63.37 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTATCTGTCT:1 - chr2L 4743142 3' + I-element 5324 1 58.42 CAGCAGGATTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCCTTGAAGACGACCGGGACACTTGATTGCTCCTGGCGGTAGACTCCTG:1 + chr3R 25921523 3' - Doc4-element 2661 1 53.47 CCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATGTAACGCTATGAATCCTAACCC:1 + chr3R 11404013 3' + Ivk 204 1 78.22 AAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATATTTTATATTTTTAT:1 - chrX 4140462 3' - 1360 36 1 80.20 TTATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGATGAGGTCTTGAGTGGGTCACGCGCGTCATGAGCAAATGAAAACCACTGGGCAGTCGACCAACCAACCCACC:1 + chr2R 14337946 3' - Quasimodo 39 2 58.42 TTTTCCTTTCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTTCCTTATTTTTTTCGGCTCCGCCGAGATTTCCAATGGCACAAAACATGCAAAGACATTATCT:1 - chr3R 9173483 3' - Bica 492 1 68.32 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATAAAGTTAGGCTTAAAGCATCTTCAATATCCTTAAACTTTAGTTCGTTATACATTTTC:1 - chr3R 17321698 3' + Stalker2 7633 2 60.40 TAATTATCATATATCTGAAACATAATTATTTAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGATTTGAACCTATTAGCATTGCTTGGCATCCCTTTCTCCTAC:1 + chr2R 18035987 3' + Cr1a 91 1 64.36 AGCGCGTCATGGCCGAGAACCACGACATGCCCGATGAGAAGGGCTACCACTGAGACACTACGATGTATGTTATTTTTTAGCTTACAAATGTTTTTG:1 - chr3R 946537 3' + Osvaldo 485 1 65.62 AGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTCCCATTTAGC:1 + chrX 19426302 3' + mdg3 216 2 54.46 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATTTTTAA:1 + chr3L 17921220 3' - 297 6592 2 67.33 CTTCAGCTACCAGCACAGCAATCACGATAGCGACTGCAACTACACCTTTAGCAACAACAACTACAACAAGAACTGTCCTCAAATTCGAATAGTCCATATAA:1 + chr2L 17111870 3' + Doc3-element 480 1 72.28 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGGTGGTGAGT:1 - chr3R 8277895 3' + P-element 2868 1 60.00 ATTTATATCGATTTCCCAAAAAAAATCGCAACGCTACTCTAACGCCCACAAACCGCCGGAAACACACACGTCTGCACTCGCTGAGACGGGAAGCCTTTCAG:1 + chr3L 25951988 3' + INE-1 310 1 69.31 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCTATTTTATGGGTGTTCCATTATACAC:1 - chrX 11886582 3' - Max-element 34 2 55.45 TAAAAGCAATTTTTTTTTGAAATACATACAATATTTGGTGCTTGTGTTGAATGTGTTAATAAATTGCCACTTGCGGCTATTTTGCAGCCATGGCAAATTGG:1 + chrX 9859874 3' - S-element 1630 2 63.37 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATTTCAAGCGGAACAGTTGGCGCACTTTCCACCT:1 + chr3R 11999308 3' - P-element 21 1 58.42 CCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCAGTGATCCCCTTATTAGGACACACACACACACTTTCGCATAGGGGGACCGTTCAAGGATGCCCATA:1 + chr3R 28474947 3' + accord 6992 2 67.33 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGGTGGTTATTGTATTTAATTCTTGTTTGTAGTTCATGATTTTCACTCGGCAA:1 + chr2L 3085074 3' - copia 5 2 74.00 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAACAAGTGTCATGCGGCATGAAATCTGGGGCATTGTAACAAAAAACTATTTAAACATTGGCTTCAA:1 - chrX 6701448 3' - FB 13 1 66.34 CTTCTCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAGTTTTCATATCATTTATGACACAATATCTTTATCAAGTAATTCGAATACGAATTATTCTAGTAGCTTCGTTC:1 + chrX 8683934 3' - Doc 4661 1 74.26 TTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGCGAGAGCGAGAGAGAGATTTCTTAACGGGAAAGAATGGGACTAGCAAGGATTTGACAAAAATGCCATAATGTG:1 - chr2L 22497737 3' + invader1 106 2 74.26 CAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAAT:1 - chr2R 1320675 3' + diver2 4885 2 59.41 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTT:1 - chr2L 22084474 3' + copia 248 1 63.29 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAGGCCATTAATAAACTTGGCTTAGTTTCAAGAGCGATGG:1 + chr2R 19117127 3' + roo 9038 1 62.38 GAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTATTTTTTGCCAATTTCGGTACAAAAAGCTATCATTCGCCGCTGACTTTTCTGACTATTCTGATTAATTTGA:1 - chrX 723199 3' - 1360 3153 1 66.34 AGACTTTATCCTATTATCTGTGTCTGTTTTTGTTTTTATATCGCGTGATATCTTCCCGGCGAGATATGGTAAATTTCTGGCTCTGCTCGATGTGAATAAGC:1 + chr2L 9652041 3' + Cr1a 4214 1 58.42 AAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGC:1 - chr3R 31887758 3' + HB 1558 1 69.31 TTTAAGGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTGGTTTATCGTCGCGAGTAAAAGTAAAC:1 + chrX 12465907 3' - I-element 461 1 72.28 AGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGAGGCAAATAAAAGAGGAGCTGAAAGCAAAGACTCAATGCTGCACAAATAACAACAA:1 - chr2L 16674767 3' - roo 8607 1 57.43 CTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACCCACATAAGCCGCATAAGCCAAAACAATCAGTCGGACGGGAGTGATGAGGATAAGTTTCGCCGTGCGAA:1 - chr3R 6608747 3' + I-element 5350 1 72.28 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAATGTTGCGTTATCAGCAGGCCGTCCC:1 + chr3R 7360388 3' - jockey 11 1 74.26 ATCTANAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGT:1 + chr2R 13644485 3' - Burdock 46 2 73.27 TTAGCCACCAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGAAAGTTGTACTCGTCTTCGAAGGGAGCGTATAGCTGAGCCAGGAAGGATTTGGGTGCCCTGCA:1 - chr2R 24134160 3' + Porto1 4469 1 69.31 TTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCGTAAATTTGCTCAAATAAATTCCATGCTGAGCGGGACAGGCGGA:1 - chrX 12042493 3' + 1360 470 1 60.40 CAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCATATATAGTAACGTGTTTTGCTGCAGGTTTAATTTAA:1 + chrX 15089014 3' - gypsy 40 2 67.33 AAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTAT:1 - chr2L 23295811 3' + micropia 407 2 72.00 GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAAT:1 + chr3L 23839696 3' - McClintock 28 2 67.82 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCACCGAATTATG:1 - chrX 20047549 3' + roo 9047 1 49.50 CATCTATACCTGTTACATTTTGTAAAACAATAACAACAACAATACGTTAAACAACAATGTGAATAACAGCGAGGGAAAAGTGCCCGCCAAACAG:1 - chr3R 14330773 3' + Stalker4 397 1 71.28 ATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTTATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGTCATGCCAAAAGGGTGAGCGTTTTG:1 - chr2R 17937114 3' - Quasimodo 1 2 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTTC:1 + chr3L 16761338 3' + roo 391 2 59.41 ATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAAT:2 + chr3R 15017464 3' + Tc1-2 1613 1 65.35 TGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGT:1 - chr2L 16884803 3' + pogo 2084 1 51.49 GATTGGGTGCATTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTCATTTAACTCGCGTGAGTACTGCGCAAATCT:1 + chr3R 3319647 3' - Quasimodo 277 2 69.31 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCACAATCTAGCATAGCATTTCACGGTGGCAATCGATGTTGCAAATGTTG:1 + chr3L 11552908 3' - P-element 38 1 52.48 GCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTCTCAGATAAAATGTGGAAAAAATGACGGAAGAGCTTTAAATTTTATTACGATTTA:1 - chr2L 15510389 3' - jockey 4689 1 58.42 GGGTGNGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGAAGTACCCCCATGAAAATACGAATTAAAGCAGCAGCAAACGCGGCACAA:1 - chr3R 18571111 3' - hobo 25 1 56.44 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTATGTAAGCGTATTACCGGTGGAGTTCTTATATGTGATTAAATACTTGTATTTTTT:1 + chr3L 24039753 3' + roo 388 2 58.42 TGCAGATAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAGGT:1 - chr3R 27156627 3' - pogo 17 1 62.38 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGCGTGCCAGTCCAGCTGATATGCGCTTTATGCAGTTTATTGGCGATTACATTCACT:1 + chr2R 17342379 3' - jockey 4760 1 51.49 CTTACNAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTC:1 - chr2R 19551977 3' + roo 9047 1 54.46 ATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAACGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTA:1 - chrX 15746292 3' - jockey2 3227 1 52.48 CTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGTTTTCTTTTTTTGTGGTTAAATAGTTGGACAAGTTTATGCTGATGATGCCGTAGGTCG:1 + chr3L 10481217 3' + copia 4694 1 58.42 TGCGACACGGCCATCCTGCCCTATCACACGTCCTCCATGTTCCGAAGCATCCACTTAAGCAATAAACTTCTCTTGCAGTTTATACGTTTTTCATTAACTTA:1 - chr2L 8394490 3' - invader1 3595 1 69.31 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGC:1 - chr2L 14790592 3' - roo 44 2 71.29 ACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTTTCCTCCATTTTACAGAGATTTCTTGCC:1 + chrX 15894683 3' + S-element 1698 1 54.46 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTAC:1 + chrX 3305220 3' - transib2 20 1 57.43 GAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAA:1 - chr3R 20878469 3' - 297 14 2 52.70 GCTACTGCGAGGGCTTGGCATTTTATTCATTCTTGATAAGAGCAGCATTGCCAGATGTGTATTGAATTCAATTCTTCGCACCTTTCTGCGGATGCACTTGC:1 + chrX 4619402 3' - rooA 298 2 72.28 CCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGTGGAAGTGTCGCCACGCCTACACGGGAAATGGCAGCAACGGTTTACCAACGCCTACATAGCGTCGCAGTCGG:1 - chr2L 17383739 3' + G5A 2422 1 79.21 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAGTGGCTAGGAACATGAGGAATGGCCTCATGG:1 - chr2R 12457908 3' - roo 21 2 58.42 CAATTGATTTCGCTTTTCGTTTGTTAAATTATTCAAACGCAAAATCAATTCTCTTTTTGTAATCAATTGAGTCGTCTATTACATTAATTTCAAACATTTCC:1 + chr3R 26387054 3' - invader2 419 1 59.41 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCTATTGGGGATTTTGTTTCTTAATTAAATGAATATC:1 - chrX 15305623 3' + roo 392 2 62.38 GCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGTTTGGTTTTTTTTTTCGGCTTAAAATGCAATAACCAATAAAATAAATTGCC:1 + chr3R 13552632 3' - hobo 299 1 60.00 GTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTAAATTCCGTAATAGAAATGTTGTGTATTTATTGAATTGGAAATAGACTAATACGTG:1 - chr3L 17315752 3' + F-element 28 1 58.42 GGAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACAGTGCAGCAAGAGAAGGCTGAAAAGCGATATAAAAGAAGGCCCTAAACTCCGCTAAT:1 - chr2R 5993916 3' + Bica 361 1 63.37 GAGGCNTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAA:1 - chrX 17968344 3' - Tirant 8122 2 66.34 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATACATATATTTAAATATATTTAATTTAAATTCGACACTTTTTATCAAAATATTTGTTGCTCTCCGT:1 - chr2L 22079385 3' + flea 243 2 72.28 CTCCACAAATCACAAAGAATCACCCGCCTTTCACTCTAGTATTGTGTCCATTTCTAATTTTAATGTAAATCTGAAAAAAAACAGGAACTGCTTAAGTATTC:1 + chr3R 5546743 3' - Cr1a 143 1 75.25 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTA:1 + chr3L 4876790 3' - roo 8706 2 68.32 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAAC:2 + chr3R 11094553 3' - 3S18 52 2 73.27 TCTAGCGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCT:1 + chr2R 5531207 3' - 1360 54 1 71.29 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACACAATATCTGTGTTTCGAAACCCTTTTACACTTAATGTTATCATGCAAAGATTTTTTAGGAT:1 + chrX 15392042 3' - 1360 11 1 45.54 CACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGCCCGAACCCGAAGTCTGAACCCAAAAACTCCGTTAGTCCTTTGTTGATGGTAATCGTGCATTTGAGGCGAGAA:1 + chr3R 25097936 3' + P-element 2886 2 79.21 TTTTTTTATTATTATTTTTTTATTTTTTATTTTTTATTATTATCTCCTTTTTTTTTCGGGTAGCCCCAGAAAT:1 + chrX 4945897 3' - BS 5093 2 53.42 TTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATTTTTAATTTTTAAATAATATAATATTTCTTTGGTGTGCTGTAAGATACAGTTCTGTAAC:1 + chr2R 959966 3' + mdg1 7143 2 74.26 CAACAGCTGGAGAGGGACCGACAGCCCGCTCTACCTTGATAAAAACTGTATATGCAAATATGTAAAAAAACGACACCAACAAAACACCTGCACCCCGTGTC:1 - chr2L 7231213 3' + F-element 427 1 60.40 CACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCATATC:1 + chr2L 15808047 3' - I-element 24 1 52.48 GTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTTTGATCTACTCGTCCTGATTATACGGCTAC:1 + chr3L 9913363 3' - G2 2950 1 72.28 AGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAACCCATCCACACACACACACACACAC:1 - chr3R 8376618 3' - micropia 5179 1 80.20 CGATCACGGACTTAACTCGCGAGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCG:1 + chr2L 315197 3' + Tirant 403 1 64.81 ATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCCATCCACATCAGCGCAATCTTTTCGTGGC:1 - chrX 19363472 3' - FB 46 1 70.30 ACATTAAGATACCCATTTAAAAAAAAAATGGTAAAATCAAAATATCGTCGGAGTTCGTGGCATATACCAACAAACATATGCTGATGAAATGCAACAAAGAG:1 - chr3R 9350920 3' - accord2 362 1 72.28 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATGGAATTAAGTTTAAGATACACTCATGGGTT:1 + chrX 15305697 3' - roo 42 2 68.32 GCGACCACGCCCTCTCTTGCCTATTCATCAATTATTTCAGTAAAGGAGATAAGAATAGCGGAAACAGTTGTTATTAAGAAACAACAAGAATACCAGTTTAG:1 + chr3R 19446800 3' - transib2 2703 1 82.18 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTT:1 + chr3R 23275339 3' - roo 8683 2 56.44 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATCTGAGAACGAATAAAAAATCCTTTTCATGTTTGCAGCGCTCTAAATCAC:1 - chr2L 21010850 3' - opus 22 2 56.44 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCGGCATTTTCTCCAGATGTACCCTCGACTCAGTCCAA:1 - chr2L 2074691 3' - roo 17 2 61.39 AACGANACTCGCGTTCAGCGACAACGCGAGCAAGGCTATGCAGTTCGAACATAAGGGTTTGCTCGTCTTGCTTGTCCGAACAATTAAGACCAGCTCCGGAC:1 - chr3L 24176772 3' + Doc2-element 291 1 71.29 TTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCCATGAGGGGTATGATCATCATCATGATATGGGGCTGTTTATGAGGCTGGAGCACCGG:1 - chr3L 16974315 3' - G-element 4195 1 55.45 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCAATCGATTGTCG:1 + chr3R 11263482 3' - roo 13 2 67.33 GATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATGTAGGAGTGGAAATAAGGCAATATTTTTGGTTAAATGTATAATTATATCGAAACAATCGCCGGATTATCGCC:1 + chr3L 23703348 3' - Cr1a 4143 1 75.25 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCATTGACCAAATTTGTATATTTATGAACAAAAAAAGGTTTGGGAAATGTATAGGAAATTAAAA:1 + chr3L 12103877 3' - roo 8676 2 59.41 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACA:2 - chr3R 6273522 3' + blood 337 2 67.33 ATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATGGGAAGTGTCCTAAAATATGAAT:1 + chr2L 12475044 3' - mdg3 5280 2 53.47 GGTGTGTATGTGTGTGTGTGTGCGTATGGTTGTGCATCTGCTGATGACTTGTCTTCTATCTACATACATGTGTATCTATGCACACACTGCTTATAAAGTGG:1 + chr3R 22590710 3' - Quasimodo 40 3 56.44 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACA:1 - chrX 16995099 3' - jockey 32 1 53.47 ACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATATGAGGTAGCACCCAAAGAAGAGTTAGTTATCAATTAATTAGAGGCCTA:1 - chr3R 22639195 3' - hopper 1385 1 51.49 CATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTACCCAGACGATTTCGTGTTATCTTAACCTCTCTGCTGCCGCCTTAATTTATGTTTTGCTGGTCTTATCGCA:1 + chrX 20548355 3' - accord2 7496 2 71.29 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTTTATCCACCAAAAAGGTAAGACGAATCTTATA:2 - chr3L 7075845 3' + roo 409 1 78.22 TATAANTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACAC:1 - chr3R 23048446 3' - mdg1 46 2 71.29 TTTAANTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTG:1 - chr3R 23638108 3' + pogo 2060 1 72.28 ATATACACAAAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGATACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAAAGAAAAGAGTATATTGCATCAGTAATTGATTAAGTTGTA:1 + chrX 11969955 3' + Doc3-element 4442 1 61.39 GGTTCAAGGTTATACGGTATTTTTGAAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCTCTGTTTGAGGTGTAATATTACGAAGAATTCACTTCTAAGGCCGGAGGA:1 - chr2L 10214937 3' - Stalker3T 344 1 71.29 TGACTGAACGATTCCTTTTAAATCCAAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTTAGCTTAGAAATTTAGCAACTAAACGTGTGATTTTC:1 - chr2R 9499986 3' + G5 4804 1 50.50 TTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAATAAATAATTCCTGACGTTCTATCAAAGTCGATCTATTATATTGATTCAAATGGT:2 - chrX 1183964 3' + Ivk 5356 1 56.44 GAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGACCGTATAGACGTCAAGTTCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGAATTCGAAATTACCAATTTGATCAGCAACCACC:1 + chr2L 22257147 3' + INE-1 109 1 70.30 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTTGCGGCGC:1 + chr3L 10013660 3' - hopper 16 1 63.37 CTTATTGCAAGAATTCGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATT:1 + chr2R 10543496 3' + P-element 2841 1 33.66 AATGTTGCGATTTAGGGGGATGGCTGTCCTGGAATTCAAATTAAAGAAGCTATTAAATAGTTGATCAGTAGAGCCCATTCTTGTTGTCTAAGGCCAGCAAC:1 - chr3R 24235666 3' - GATE 253 1 69.31 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAA:1 - chr3R 23275256 3' + roo 9041 1 58.42 CATTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTGGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTTCTCTTCCT:2 + chr3L 8421237 3' + INE-1 541 1 50.50 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGATTGCCAATTCCGCTCTCTGCCGCTCTCTTCTCCATCGTCTTTGCTTTTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTG:1 + chrX 12649916 3' + P-element 2884 2 69.31 ATATAATATATACATATATGTACATGTGTACTTCTGTGTGCGTCAGTGGAAATGTATGTACGTACGCATAGATATTTGGGCACACAAAGACGCAATTATCT:1 - chr3R 24438354 3' + INE-1 63 1 49.50 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATATATACATGCATATATGTATTTATAT:3 - chr3R 23219909 3' + 412 7498 2 74.26 AGTCAAATAATAAAAAAAAAAACATGACAGCTATGGAAGCTTGGTCGGGTAAGAAACCTGGCGTATACGTAATGTGAAAATGTCTACTAATTAAAAGGAA:1 - chr3L 20609840 3' + Rt1b 5144 1 57.00 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACA:1 + chr2R 5840682 3' - Ivk 40 1 61.39 GTGCGCGCACTCGAATCAATACGATACTCTGCGTCGCGGGCGAAGGATAAAGAAGGCAAACAGTCAAAAATCTTATATTGAAAAAAGTAAGATAAGTTTC:1 - chr3R 4574876 3' + hobo 141 1 69.00 AAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAATGTGAATTAAAGAAAACGAATTCCTAGTAACAATAAATTATAAATTGAATGCAATTCACTGGGATTGTG:1 - chr2L 3353930 3' + Bica 171 1 54.46 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTT:1 - chr2R 24021572 3' - pogo 35 1 64.36 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCACGATTACACAAAAAAGTTAATTTATTTTGGTTTCGGTGATAAAATATTTAATTGTATTTGCTTATGTGCAT:1 - chr2R 10774012 3' + copia 250 1 72.28 ACGAGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTTGAGA:1 - chr3R 16457977 3' + roo 398 1 69.31 CATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACAAATTAACTAAAGATTGCTGCATGCACCTAATGGCTCCGCCTCCTTGCTCTTCTTCCTT:1 - chr3R 26849043 3' - Stalker 7127 4 58.42 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATTCGTTTTA:1 + chr3L 4876799 3' - roo 8697 2 59.41 AGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCTTAAAATTCTAGAGGCATACAAATTCATTGCGTTTTACACAATTGTCAGCGGGGCATGATAACTAAATGAAATTAAATT:1 + chr2R 5748148 3' + INE-1 168 1 60.40 CACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGAATTAGGAGCATCATGACCTCCTATAGGAATTATCTCATTTAATCCATTTCAAATTCCTTTATTAAATACA:1 + chr3R 1272096 3' + jockey 4763 1 69.31 AAATTCGAATTTTTAAAATTTGCCTAAGCGAACTCAGGACTTGCTTTTAGTTTCAGTTTCGGAAACTATGCATTTCACTAATAACTTAATTGTCAACCCCA:1 - chr2R 14214815 3' + FB 24 1 90.10 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAA:1 + chr2L 4743181 3' - I-element 48 1 70.30 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTAAAAAAAT:1 - chr2R 5067628 3' - F-element 33 1 54.46 GTCAGGAACAATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTGTTCATTACATTAGCTAATTGAATTTGTGTGGGTTAAGTGAGTACGTTCTTTAAT:1 + chr2L 6989591 3' + INE-1 153 1 62.38 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATGTGCACAGGATAGTGC:1 + chrX 20806949 3' - opus 7025 2 57.43 ATATTNCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCAC:1 - chr2R 8345517 3' + roo 360 2 71.29 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAAC:1 + chr2L 16884878 3' + pogo 2057 1 71.29 TCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGCATTACATTTTAAGCAGTATTATTTTAATTTAAAATGCTTGCCAATATGAAAAATTGTTAAGTTCTTTTCAATGTC:1 + chr2R 5509622 3' + INE-1 152 1 46.53 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATG:1 + chr3R 4544064 3' + flea 220 2 61.39 ATAGGGTCAACTAGATCATTCGCCTAATTAAACAAAAGCGGTTTGAGTTGCCGCCATGGCTAGGTTTTTTCATTAATCTTATTCATTAATCTTAAAGTCAC:1 - chr3L 27113950 3' - G5A 2648 1 40.59 TTATATTGTTGTTTTAAAAATACTCGCCTTCTTCTTCTTAGTAGGATGTACCGCTTTTTGTTCTCGTCTTGAAATCGAATTTTGAAAATATACTTCTTTGC:1 - chr2L 22090471 3' - transib2 2607 1 68.32 GAGCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTA:1 - chr2R 4673579 3' + Quasimodo 7336 2 61.39 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAG:3 + chr3R 1977620 3' + micropia 424 2 54.46 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTTGAGAACA:1 - chr3R 16457974 3' + roo 401 1 72.28 AAATCCGCAGTTGAAGTCGGTTGAACGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTATGTCAAATTCTTAGTTAAAACCAAAAAAGGTAA:1 + chr3L 15409232 3' - gypsy7 299 1 70.00 ATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGGTTCATATAGAGCAATGAATCGTGCATGCTAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 + chr2R 4253306 3' + R2-element 3443 1 77.23 AGCATTGATATATAAAATGTTTAATATCAAGTAATGGTTTGAAAACTAAAGGTACTTGGGTTATTGGGAAATATTCCTAGAATTTTTAGAAAATAAGTCCA:1 + chr2R 16260748 3' - diver 54 2 58.42 AGACACAGTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCATCAACCTTCTAGACAATAGCCATATCCATTTTCGCGACAATCAAGG:1 + chrX 5572795 3' + G2 2829 1 79.21 AATAGGGGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAATTTCATTAAAGGTTTTTTTTTAATTTGTTCCAAA:1 - chr2R 4608376 3' + Tc1 251 1 78.82 AATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAATGCAATATAAACCAAATCAAGCCATGGAAGCAAACTTACGCTACCTAACTTCAGCACTAAACTATCT:1 + chr3R 1136953 3' + Stalker2 7209 3 72.28 TTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCATTTTGTTCGACGCAAAAGTTCTAATAGAATTTCACTTCAGTGCAGTGCCAGTGGGCGTTGGG:1 - chr3R 28138649 3' + Cr1a 189 1 62.00 TAGGGNGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATAC:1 + chr2R 19209483 3' - jockey 4760 1 78.22 TACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTTCCAATTTAAAATTTTAT:1 + chr2L 21570273 3' - Dm88 4369 2 74.26 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTTTTTAAATAAAATCATCCTATATATGCGCTCGTGTGAACGTTTC:1 + chr2L 10473519 3' + flea 228 2 63.37 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGT:1 + chr3R 15072639 3' + pogo 2061 1 68.32 TAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAATTTGCTTAGCGCTTCAATTTGGATGCGA:1 - chrX 20806751 3' - opus 499 1 72.28 AAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGAAC:1 - chr3R 31887754 3' + HB 1562 1 73.27 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTTATATGGGCGCCGCAGCAGCGG:1 - chr3R 12780638 3' - hobo 48 1 73.27 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATTTGGTTTCAACTC:1 + chr3R 4834350 3' - mdg1 7044 2 73.27 AAGGGTTAATGTTTTCGAAAAAAAGGAGGTGGGAGGG:1 - chr2R 10444544 3' - P-element 114 1 59.46 TATTCAAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTGTCCA:1 - chr2L 15947383 3' - Transpac 4950 2 49.50 GAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAACCAGAT:2 + chr3R 12047502 3' - Stalker2 7260 2 67.33 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCA:1 - chr3R 11999248 3' + P-element 2838 1 28.71 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTAC:1 - chr3R 10203613 3' - jockey 30 1 51.49 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGAGTCATTAAGGCCAACGCCTGGGGTTAGGCAACGATTTTTCCTTGCTTTTT:1 - chr2R 14408461 3' + hobo 2914 1 54.46 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATATCCCA:1 - chr2R 18950737 3' + roo 9043 1 54.46 TGGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTTGTTATTTATTTAATTTAATAAATGGAATATATTAAAATTTTTTAAAGGTATTTGTTTACC:1 - chrX 21388008 3' + INE-1 544 1 55.45 ATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATTAAACAGAACCTGATGTCTGCTTCTTAGTGACCGATGTAAAAGCTAAACGTAATAAAGGATGGCCTA:1 - chr3R 7356865 3' - micropia 5140 2 72.28 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATACTCGTTAGATTGGCCATCTTAAGTGCATCGTCGGTAGACGAGAG:1 + chr3R 22782030 3' - copia 4898 2 58.76 TTTTTCTCTTTGGCTCGTGATCGGCCCACTTCTGATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACGTTATATAGTTTTATTCCAAATTG:1 + chr2L 17105181 3' - invader2 283 1 76.24 GTGTGTGTGTGTGTGTGCATACGTGCGTGGGCGTTGATTAAGTGCCACTGGTGTGCACACATGCCAACATATGTATGTACAAATATCAAGGTGGGCTTGGT:1 - chr3L 10552301 3' - accord 179 2 79.21 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGAAGCCGCTTCTCATTCAAAA:1 - chrX 22855181 3' + P-element 2880 2 72.28 GCATTCCCACTAGCTTAGTAACGGGTATCTAATATTCGGGGGTGTAGAGACTTAGATTTAATCGAAAGCTAAATCCTTTACACGAGTGTGTCCATATCCTA:1 - chr2R 25134116 3' + INE-1 534 1 63.37 TTTGTTTTTTTTTTAATTTTTTAGGGTAAACATAAAATCGCAAACGGGTCAAAATAAAATACAAAACCTTTAGAACATCAGTTGTGTATAC:1 + chr3R 22591873 3' - Doc 4696 1 76.92 GACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCACACTACTCAAATGTGATAAATCAACCTCATCAAATATGTCAGCCTGCTTCACCC:1 - chr2R 3603576 3' + Doc2-element 390 1 58.42 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCAT:1 + chr3R 7388426 3' + HMS-Beagle 7025 2 66.34 GCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGCCCGCTGCCTCTCAGTCCCAAA:1 - chr3R 12047382 3' + Stalker2 7650 2 77.23 CCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTTTTAAAAAAATTATAATTATTTTTTAGATTTTTTTGTTTGCATTGATATAACTTTGGTCTGATAT:1 + chr3L 17400999 3' - Stalker 6824 2 65.35 ATTTCATAAAATGATATTTTATTAGTGCTTAAGGGGCTACAAAAAAATATAACAAGAATATTATTAACAAGAAAATGTTACAGAAAATAGA:1 + chr2L 9300796 3' + Doc3-element 4635 1 43.96 AAAAATAAAAATAAAAAAAACTGAAAATGAAAATGGAAAAAATCTAAGCCGAAAGAGATGATTGCGTCCTTTTTTGTTTTTGGGGTGCAAAGTTTGGCGCG:2 + chr2L 9471594 3' + HMS-Beagle2 489 1 66.34 CACAAGATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCACACTCCTTTTAGCCGGCAGGACACTTAGCCGGCATC:1 - chr2R 15032640 3' - hobo 37 1 58.42 TTATTATTATTATTATTATTGCAGCTGTCGCTCATGATCGCCAAAATGCGCCATTGATGGAAGCACTGCAGCGGTGGGGAGAAATCTCAAATTTCACGAA:1 + chr3R 27842635 3' - mdg1 7061 6 61.00 GGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGCCACTTTGCTGGTGGGTGGGTCACTTCATCGATAATGTACTCATACTCCGCGGGTTTCTC:1 - chrX 10036841 3' - accord 6948 2 52.48 CGGCCAACTCTTTTTCTAATTGGCGCCCAACCAGTGGTATTTGACAGTGCGTTAGTCATTACCCACAAACAAGTCAAAGGCAAAACAACAAGCTAATACGA:1 + chr3R 14811424 3' + gypsy2 333 1 77.23 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGG:1 - chr2R 13295664 3' - Tirant 39 2 62.38 TAATAAATTCTAAAAAAAAAAATCATTTCTGGGAAGTGATTGGTGTAGCACGTTCACTACTAGGTCTACAATAACTTTTTAAAATTTAATTAAAGGCATTA:1 - chr2L 4784465 3' + BS3 1768 2 22.77 CCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACTACGGTGCGCCGGTGATGGTTCTTGAGGATCTAGGTTGGCTGCTATTAAAGGAGGGAGAATAAATGTGTTGG:1 + chr3R 3211977 3' - Fw2 3659 1 54.46 TTTGTTGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGATTTAGATAGCGTCTGGCAAATA:1 + chrX 10132347 3' - I-element 5055 1 72.28 CCTACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCAAATCGATACAAATTTTTGGCCATATGACTCTGGCCATAAATCC:1 + chr2R 4916811 3' + S-element 245 1 61.39 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCT:1 + chr2L 3951639 3' - Transpac 4968 2 74.26 GCCAAAAGGCCAATAATCAAAATCAAATGCCCGAACAAACGCACGGAAGTGTTAAATTATTAACTTACTAGCACATGATTAAGCGTATTGGTTGGAAAATC:1 - chr2L 15076199 3' - 3S18 418 1 68.32 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATAAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGA:1 - chr2L 17210294 3' + jockey 4945 1 71.29 ATGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTCGCACGGGGAAAAAGGGGAAAAGG:1 - chr3R 30642481 3' - accord 187 2 81.03 AGATAAAGTATTTTTAAGGAGGACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGG:1 + chr2R 5265150 3' - Q-element 441 2 44.32 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCC:1 + chr2L 18430126 3' + copia 238 1 73.27 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTATTTCAGCAAAGACGCGACGAGCTAAAAT:2 - chrX 8491390 3' - P-element 18 1 63.37 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATATTTTTTTGCTTTCGCCGTGCCCCCATTTTACTCAATCCGCCTGG:1 + chr3R 6062793 3' + flea 4990 2 57.43 ATTCCTCGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACAACTTCAAGGGATGAATTGACAGCA:1 - chr2L 14960651 3' + baggins 5283 1 78.22 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATATATCTGTGTTTTAAGCAG:1 + chrX 10827485 3' - roo 20 2 55.43 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTTGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTC:1 + chrX 2649887 3' - Tirant 8117 2 61.84 AAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1 + chr3R 4604452 3' - gypsy 7137 2 57.43 AACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGT:1 + chr2L 4160176 3' + Tirant 348 2 77.23 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGTTATATAAAACGTCAATATTTAAAAAATGGCAAAACCAGAAAAACAAAACGAT:1 - chr2L 21174220 3' - roo 8687 2 57.43 ATTGTCTTTGACGGTAAAGTAATATCATTTGCCCTGGGTATTGTGGTATAGGTGTGCTTTGTAGCTCTGGCTTATTTGGGTGTCTTTCGTATTTTTATTCT:1 + chr2R 360873 3' + transib2 473 1 74.26 CTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCATCTTGCGGCCAGCATGATCGCATTTTTTTTCTTTTTGTTTTTTACAAATTCATTGTTTACTCTGG:1 - chr2R 16008210 3' - flea 4573 1 59.41 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAACGGAAATGCCAGACGACTA:1 + chr2R 17626588 3' + mdg1 7456 2 72.28 AGTGGACCCTCGATATATGCAAATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGGGAATTATATTCGTAGC:1 + chr3R 19346976 3' - blood 7020 2 64.84 CACCCCTTTCAGCAAGCCCTGCACCATCAAGCGGCAATAGCACCCAAATATGAGCTACAAGCACTTGCACAAAAGTTGTTGTCAACAAGTTTACGACCGAA:1 - chr3R 20261230 3' + G2 12 1 74.26 TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCCGCATATATTTCGT:1 + chr2L 15955341 3' - Quasimodo 5 2 72.00 AAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTA:1 + chr3R 29331903 3' - G6 46 1 68.32 ACAGGTTGGAGCGCCACAGAAATCGGCGGGCTGCCAGTTCGGCCAATGGGGATACTTCTGGAAGAAGGCGAACGGAATATAGAA:1 - chrX 18871604 3' + X-element 4423 1 67.86 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCATATTGATATTTGCTCTTCAAGTTGCCACTTTT:1 - chr3L 13659879 3' - pogo 21 1 56.44 TCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGTGAGAACTTAATCACAAAT:1 - chr2L 17722738 3' - blood 7011 1 76.24 GGGTGGGCAAACGATAAAAACTAATGATAATGGTTGGGGAAACGTTTTTTATTGTTAATATTTCGCGATGTGGGCTTACGAGGGTGGTTGGTGCTTGGGGG:1 - chr3L 14623909 3' - FB 375 1 65.35 TGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTTCGTTTATTTCCTTAAATTCTTCGCTTTTCG:1 + chr3R 17321825 3' - Stalker2 7248 1 45.54 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGAAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTCGAAAACCGTATAGATGTGCGTGTCTCGCTTGACTGGCGCATTTGT:1 - chr3L 11553454 3' + P-element 2884 2 68.32 CTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCATGCAATAGAAAAAAAAATCATTTGA:1 + chr3L 18200397 3' - F-element 126 1 75.25 GAGATAGGAGTGCCTGTCTCTATCACACAGTGTTGGTATAGCTCCACTCCGAATCCATTCCGGCATCCAATCCGTATTTACAACCCCATGCCCTCTGTTCG:1 - chrX 22718185 3' + Rt1c 83 1 54.46 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTGCAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGG:1 + chr3L 17587835 3' + roo 9027 1 66.34 AGATTATAATAATAAATAAATAAATCTTTATGGTTAAAATGAAGAAGACACTGATTTAAAAATATGTAACTGAATTGAAAACAAGAGAAGTCCCTTTGTTA:1 - chrX 14123142 3' + mariner2 826 2 76.24 TCTGGGATATCGATAGATAATGTTGAATATAATAATATAAAATATAGAACGCTATAGACTATCAGATACCTGTTACTTAGCAAGAGGGCGATTTTGTTTGG:1 + chr3R 4721908 3' - INE-1 496 1 73.27 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATGTCGCAAAAATAAAG:1 + chr3R 17454471 3' - jockey 4702 1 60.61 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACT:1 - chrX 8491429 3' - P-element 52 1 26.04 CTACCCCTTCATCACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGTGGTTAATTTATATGTTTTAATTTTTTCTTTTGGAGAATTTCTCCATAAAATATAT:1 - chr3R 19445445 3' - baggins 5379 1 59.41 TTGCATGAATAATAAGTACCATATGTGGTCTCTCTGAGCAATAAATTTTTACTCTCTCAACGTATCTCTTCATCGCTGCAATGCGTTAGATTTTCCTCAAA:1 + chr3L 21440223 3' + Tc1 93 1 63.37 TACTCAGAATAATCACAAAACCGATACAAATGAAATGAAATAAATAACATAAAAAACTTGTATACCAAATTCCACACTCATTCATTAAGCTTAACGTAAAA:1 - chr2R 16993649 3' + Porto1 4345 1 52.48 AACTAGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTCGCGTACAAAGTTGCACAGCTCAGGGTAGAAAAGCACGTTTACGCGGAATCGTCGTCGAACC:1 - chr2L 142534 3' + Tirant 73 2 56.25 ATCATTGTAGATCTAACTATAAGTTGCATGACCCCAGACACAGTACCTCGAACGGACAAGTAGAACATTACCAATTATGTCCTTACCTATGAATCATATAC:1 + chr3L 23780912 3' + Cr1a 4152 1 71.29 CAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACAAACACCAATATGCAAGCTCATCGTCTTCATACGCAGAGCTCCAAGAATCTTTTT:1 + chr3L 24758115 3' + 1360 3181 1 56.44 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATAG:1 - chr2R 5953078 3' - pogo 19 1 60.40 TCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAAAATAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAG:1 + chr3R 19450106 3' - roo 95 2 77.89 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGC:1 - chr2L 12815038 3' + hopper 1387 1 52.53 ATGGCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGA:1 + chr2R 2529355 3' + 1360 3374 1 39.60 TGTTTNTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCACAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCTTTTGGAACAAATTAAAAAAAAA:1 + chr2R 4608376 3' - Tc1 389 1 77.32 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCC:1 + chr3R 4544072 3' + flea 228 2 53.47 CACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTAGACACGGAAGAAAAGATATCCATAACCCCTCTGGACACAGGACAGGAAA:1 - chrX 22077196 3' + gtwin 447 2 51.00 AGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGAATATATTATAATAAAATACTTTGATGAAAAAAA:1 + chr2R 3522062 3' - Cr1a 4087 1 67.33 CTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCACTCAACACCCTCGCACTCCCCTCCCCCCCTCCACCCATCCACTGCAGCAGCAGCCATCTCATAT:1 - chr3L 10669904 3' + I-element 4874 1 61.39 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTACTTGTCAGTTAAATCATTTGTAATTGAAAGT:1 + chr3L 17168926 3' + mdg1 7445 2 65.35 CAAATNAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTG:1 - chr3R 4834280 3' + mdg1 364 2 83.17 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATTGAGG:1 + chrX 3763252 3' - 297 6594 2 65.35 TCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAGATATTCTACATGCGTGTGAAAATCGAATCCGAAAAGTAGGCAAGAAAACATTTTGCCTGTGGAG:1 + chr2L 9628688 3' + invader4 2783 2 65.35 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCT:1 - chr3L 10477559 3' + copia 208 2 71.29 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAAC:1 + chr3R 5686128 3' - P-element 21 1 58.42 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATCAGCTTTTCAGCTCCCATTTGGGTGTTAGTTTTGTTTTAAGATCCAATGAT:1 - chr2L 9774266 3' + 412 7520 2 55.45 TTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGCGAAGCGGAAACAACTTAATGACGCGCGGCGCTAATGGT:1 + chr2L 15538528 3' + invader4 2680 1 61.39 TCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTC:1 + chr3L 23678151 3' - Osvaldo 22 1 74.26 CAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCACCATTAAAATACATCAGATAGGCATAGATCACATGCTCAGCGGGTCGTCCTGCCTGCGTGCGTGTGTGCGTG:1 + chrX 4446897 3' - hobo 327 1 67.33 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCGGA:1 - chrX 17968338 3' - Tirant 9 2 72.28 TGAAATTAACATGAACCTACACACACACACACCGGCACACTCGACCACACACACACACCAATGCGACACCAATACAGATGGCCATAGTGAAACACACACAT:1 - chrX 13344976 3' + accord 240 2 79.21 ATTCATTGCCTCCGGATATAAATGCTCGACCTTGGGGAAGATGGGTCAGGGTGGCTGGTGGTTTTTGGGGAATGGGTGCACTTACAGATTGG:1 - chr3R 22132238 3' - rooA 7178 1 73.91 TCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAAAAGCTGGTTTGGTGAC:1 + chrX 17968447 3' + Tirant 381 2 61.39 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGACACTCCAATGACAGATGTTATTATTCAAAATGATTCCAAAGCTGCCTAGAATCA:1 + chr2L 15947463 3' + Transpac 287 2 56.44 GGTTGTTTGCTGACCTTTTTGCCACTTTTTTCTTTAAATGAACTCAAACAAAGGGAGCTGGCGACTCGGGGGTGCTCCTGCAGAAAAGGACGCAGGACCTC:1 - chr2L 14126295 3' - S2 1282 1 65.35 AAATGCACTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCGCTTGAAAAGTAGACCATCACTGAATAAACGATATTCGTTAAATATTCACATTGAACATTTGCCTCCTA:1 + chr3L 11663995 3' - mariner2 199 1 58.42 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGG:1 - chr3R 8277903 3' + P-element 2859 1 51.49 GTTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGTTGTGTAAGGGTTACAAGCTACAAGTGTAAGGGTTTTAGCTACACGTGAAAGTCATCTTCTAGTTTTA:1 + chr2R 16980182 3' - transib2 2470 1 81.25 TAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAA:1 + chrX 17058186 3' - 297 46 2 80.20 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCGCATTCAGTGAGATGGGCATGCAAAAGCGTTGCTATTTTATCGTTACCTACTTTCAGGCAGCC:1 + chr2R 7887285 3' - jockey 21 1 64.36 CATTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTTTGTGCCGTTTGTGGGCGTTAGAGTTTGTGGGCGGGCAGTGGGTCTGATGATTTGATGGCCGTAAATCGGGC:1 - chr3R 24480855 3' - INE-1 254 1 62.38 CTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCACAAATATTTAATAATAGCCTGCGGGACTGGCTGGAGTGGAATGGATGGG:1 + chr2L 7198967 3' + Doc 406 1 57.14 TGGATTGTGGAGTTACGTACATACCAGGGAAAGTAGTCGCCCGGTGCCGGAGTGGAGCTCTCGAGTCGCTGCTCGTGCTTACCGCCGAAGGTGAAGGCCGG:1 + chr2L 8249865 3' - Helena 1175 1 72.28 TATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCTGTAAGAAACAAATAATCATTATATTTATATTTATTATTGTTATATGCAGTAGAAATATT:1 - chr3R 2307224 3' - 1360 3018 1 59.41 ACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCTACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCAAAAATGCTCAGAATAATCACAAATGCCTCATCTACCCCGCCACGGA:1 + chr2R 9456052 3' + Porto1 4286 1 77.23 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGT:1 + chr3L 10013626 3' - hopper 50 1 72.28 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACTTCTATAACTTTCAGA:1 - chr3L 2019637 3' - 412 13 2 64.36 GGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCACGCACAAGGGCGTGGCAGTCTGCGCCAGTGTCTGAAACAAAGCCAAGCCATAAAAATAAATATAAA:1 + chr2R 18031907 3' - Tirant 8115 2 67.33 GTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTTCGTTTATTTCCTTAAATTCTTCGCT:1 + chr3R 17321820 3' - Stalker2 7253 2 45.54 TATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCCATTGCCGAGGGTATCGCGCTAAGTGGCTCCTGCATTGGGAATGGAAACTAAATGAATGGCC:1 - chr3R 28648675 3' + rooA 7322 2 64.36 AAGCCCTGTATTACGAAAGAAGTAAGAGGTTAGCGGTTGAGATTGACGGATAGTACATCGGAACACAGGACTCAAAAAATGATTTTACATTTTTTACATAA:1 - chrX 10114742 3' - Q-element 260 2 48.51 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAGACAAAATGG:1 - chrX 6379133 3' + hopper 1386 1 58.42 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTG:1 - chr3R 11263390 3' + roo 9044 1 58.42 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCAGAATACGAGTTTCGTCT:1 - chr2R 24628758 3' + mdg1 7428 2 58.42 GATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:2 + chr3R 1977623 3' + micropia 427 2 51.49 AAAAAAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAGAAAAGAACAAGAAAAAGATGTCAGCTGCGTCAAGCCGAAGTGCC:1 + chrX 19401180 3' + gypsy7 5009 109 57.89 ACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCTACAGCTGCGTTAAATGCGTTCGCCGTTTCAAGTCGTGTGGCATCCTCTTCAACGGTGCAAAGGTAGTTCC:1 - chr3L 260091 3' + I-element 5100 1 79.21 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACACTTTCTGAGGCG:1 + chr3R 6735362 3' + copia 249 1 70.30 AAGTCAAGAACTACGCATAATTCTGATTTTGTGAAGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGATCGTTACTCGTAACAGAGCAATTACCTGTTCTGTTACAGC:1 + chr3R 435918 3' + invader1 3867 2 77.23 AAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCACATTTATGCAGTAATC:1 - chr3R 20147853 3' - 1360 247 1 74.26 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATATTTATATTTTATATTTATATATATAAAAATATTATAAAAAA:1 + chr3L 24728120 3' + Quasimodo 7337 2 74.26 TTAGTAAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAG:1 + chr3R 19446222 3' + 297 6942 2 59.41 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCTTGGCCTTGATTTTTTCAAAGTCAAGAATGGCCGAAAATTATCA:1 - chrX 8519590 3' - FB 34 1 56.44 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTTTTGGTGCCGTGAAAAATCAA:1 - chr2L 285662 3' + P-element 2881 2 72.45 CGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGATGCCGTCACCTTTTCTGTGATTACCCTTCCTGCATGCTT:1 - chr3R 19346865 3' + blood 7386 2 73.27 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATGTTGTTTATTAC:1 - chr3R 4543997 3' - flea 4788 2 59.41 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTT:2 - chrX 21564684 3' + diver 179 2 72.28 GTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCAAATAGATAACCGGGGTAAC:1 + chr2R 5019452 3' + rooA 361 2 58.42 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGGGTCCTTTCCGCGC:1 - chr2R 5804476 3' - P-element 40 1 37.00 GTGTTTTTGTTTCTTATGACACAAAGTTATTAAAATGTCTAGTAAGCTTATAAGTATACGAGTTTAGTAATTTTTAAATTTAAACATTTCTTACTTCTTGG:1 - chr3R 24765889 3' + pogo 306 1 70.30 TACATACATACATAGTGCAGAAGATAGGCCCTCTGATAGGATCGTTTTATATACCCAGTGATCGGAGGAGATGAGGAGATCGTCGGGTGGAATACTTCCAG:1 + chr2L 2783624 3' + mdg1 234 2 74.26 ATAATTTCGTTTAATAAATTTAAATAAAAAAAAGATATATATGAAACATTTTTAAATGCCATTTTGCATCTAATTTACAACAAAAAATCTAATTAGAAATA:1 + chrX 15746547 3' + jockey2 3393 1 84.16 GTTTANCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTCAAAACAACTTTAATCATTCGTAATGGCCGCTAGGTGGCGTGTCAATTACA:1 - chr3R 11544330 3' + hobo 2913 1 54.46 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTCTATACCCACACCCACACACCACCACCACTACCACCTTTAAAATGACCCACCAGCGGAAGTGTCGCCG:1 - chr3R 11343149 3' + hobo 2930 1 66.00 GTAATATCATTTGCCCATTTTTGCTCGTTTTCTTAAAATTGATTTTATATAGGCAAGTTCGAGTTCAGACATAGCATACTTTGTGGCGAAATATTTTACAC:1 - chr3R 22484468 3' + transib2 491 1 74.26 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAAATATATGTATAAGCATGGGAAAGTACTATTCAATACAAAACGTGTGTACGATTCAGCT:1 + chrX 16715386 3' + flea 5003 2 69.31 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTGAAAGG:1 + chr2L 15510463 3' + jockey 4986 1 62.34 CACCTNCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTCCGGTCTGTCGTACTGGGAGGAGACGATCTTGAAGCCACGACTGCTCACCTGAACG:1 + chr3L 22266348 3' - R2-element 3142 1 55.10 GAAAGGCCGCTTCTTTTATTTTTCGTATCTAGTCAACCAATTACTTACTGTTAATTTAAAAAAAAAAACAGATTTTAATTTAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 18329912 3' + Porto1 4596 1 76.84 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCCT:1 + chr3R 17929011 3' - hobo 45 1 68.32 AAATACCGGTACCTTGGCATTACAGTTGGCGGTTGAATGTTTTTAGGCAGTTTGTTTAATTAGAATGAATAAATAATACTTATACTTATAAAATCTATCAT:1 + chr3R 5415732 3' + R1-2 2897 1 68.32 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATC:1 + chr2L 14579902 3' + copia 220 1 62.38 CAAACCATTTCTTGACAAACTGAGTGATTATCTCTTATCCGCAATCTCTCGGTTGTACGATCTTCTTGGTTTAATTGGCCCAGTAATCACGAAGTCCAAA:1 - chr3L 23236162 3' + S2 1714 2 66.00 GTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGTCAGCTATTACTTTTACTCTAATGGGTTCCTTCTGGCGATAATAAAGTAATTCGAAATCAATTA:1 + chr3R 27111139 3' - jockey 4895 1 70.30 TTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCT:1 + chr2R 5840669 3' - Ivk 53 1 74.26 CTATATTATTTTTGATCAATTGACAACCTACTTCAAAAATGACTAGAATATTGGTCATTAGAGTATTCCGTAATTGTCATATAAGGGGGAGGTGCTACGAC:1 + chrX 22728556 3' + 1360 256 1 70.30 ATTACNGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATATACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCT:1 + chr2L 20133047 3' + flea 4968 2 74.26 TATGTNTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGAGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAGAGTGTGTGTGTGTGTCTGCATGTATGCCACTTTACGTGCCCCTTTTTGTGCTG:1 - chr3L 17332201 3' - Quasimodo 38 2 58.42 ACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACGTGTAAAAAAAGACATCATGATTTTTTTCAT:1 + chr2L 6083809 3' - 3S18 5767 2 72.28 CTGTGNACAAGATAAACAAAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACAAAACCAGACAACAATTTTGTGTGTATTTCAGTTTCCGCCCACAACCCACCCCTGATC:1 - chr3R 13637646 3' + Porto1 152 1 59.41 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAAT:1 + chrX 3763247 3' - 297 18 2 60.40 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGGATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTC:1 - chr3R 16400159 3' + blood 339 2 57.43 GGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAGAGTTGTGGC:1 + chr3R 29331933 3' - G6 16 1 63.37 GCATAAGCTCTATCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTAACTGCCCCTAGCACAACGAACACCCGCGCAACGCAAAATTGGCCCGAATAAAAAGCATTG:1 - chr3L 4375270 3' + blood 7173 2 64.89 CCCGGCTATCAGATACCCGTTACTCAGCTATTGGGAATGCAATATATTGGGGGATTACATTATATTAAACTTCAAAATCGTTCAAAAGTGTGGGC:1 + chr2R 5722313 3' - INE-1 552 1 66.32 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCATTGCATAAAGTGGAGCACTGGGTGTCGTAGCGGGTTCACAGTTCAAAACAG:1 + chr3L 6627859 3' - roo 58 2 56.44 TTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGAAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTTCTGAGTGATTGCTTGGGATT:1 + chr2R 17937213 3' + Quasimodo 7356 2 69.31 ATATCAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAA:1 + chrX 17042695 3' + copia 255 1 52.27 CGAATCGAGCCGTACGATACAAGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGATGGGAGATGTTATTGTGCGAGACATCGATGGTGTGCAGTTCATAGAGCTTTGGAA:1 - chr2R 14272777 3' + Cr1a 4389 1 52.48 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8268 2 52.00 CCAATATAATAATAATAATAATAAATCAGCACTCATCAGTGGCGCAGAGTTGGACACCGTCTATGCAAATCGAGCGCGCACCACCGCCTACGCCTACAGT:1 + chr3L 14007524 3' + mdg1 12 4 60.00 TATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATTCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGACCCTCTTTCCGAACGCGTTTCA:1 + chr3L 11233607 3' + 1360 3041 1 69.31 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAAAGTTCGTAACTGTCGAGCAAC:1 - chr3R 6735257 3' - copia 21 2 60.40 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACAATTTCT:1 + chr3R 6735356 3' + copia 243 1 66.34 TTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGATGTGAGTGGACT:1 + chr2L 12949306 3' - 412 5 2 73.27 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATT:2 - chrX 10672310 3' - mdg1 49 2 77.23 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCGGAAAG:1 - chrX 17968335 3' - Tirant 6 2 75.25 GGAGAATTATAATAGTTGATATAACTAAGAATTTATTTTTTATTT:1 - chr3R 21217337 3' - jockey 4855 1 55.56 CGCCATATCGAGTTTGCTTGAGAGGAAAAGCCAGTCCAGCTACAGTTAGGGTCAGACAGGAGAATCTGTTGCAATTGTCTGTTGCAAATTGGGAATAGACT:1 + chr3L 22170684 3' - G5A 2367 1 64.36 TATCTGATAGTCGGCGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTTTAAATTTCCATACATGGGAAGCGATATAATCGCTTGGTAAATTTACTTTTTG:1 - chr3R 20908127 3' + INE-1 559 1 57.43 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTTACAGTTAGCAAAAGGCAATTCAAATCCTTTTACTTCCGCTTTA:1 + chr3L 4801568 3' + roo 9033 1 60.40 TAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCAAAAGTCACTCAATTGTGCCCCAGAGGGTCGGCCCATCGAGCGTATGAG:2 - chr3R 23046094 3' + mdg1 81 2 52.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATC:2 + chr2R 7861722 3' - roo 43 2 74.26 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGACATTTTTGCGGTTAAATG:1 + chr2L 14790676 3' + roo 404 1 74.26 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGC:1 + chr2L 12949276 3' - 412 7088 2 58.42 TCCTCAAGATTTAGGCCGCCCTCGGCTGACTCTATTTGGGCGAGAACTTCCTTCAGTCCCGCCTGCATCAAGAGCCATTTCCTGCACACCTTCATCCTGGT:1 + chrX 13069288 3' - springer 7110 1 52.48 TGTTAACTGATCCAGCATTTGCTGCGAGGATACGGGGAAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATTCAATTACTCAAAATCGATGCCACATTAGTAATTCTTAA:1 + chr2L 18432815 3' - copia 4758 1 61.39 AAAAAAACAAAAAAAAATTGGGGACTGGAACCCAGAGCACGAAGACGAAGTTGCATGCCAAAGACGTCGGCAAATTTGTGGCC:1 - chr2L 19685775 3' - hopper 140 2 90.36 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGG:1 - chr3R 15072580 3' - pogo 37 1 66.34 CTGGGNGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTATAGTAATAAGTTGGTTGGTTT:1 + chr2L 3069071 3' - Doc 4544 1 77.23 CGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGGATGTTTTAGTTGGTCAATCGTAGCCGTGGCATTTATTCAATTTACG:1 - chr2R 8233932 3' - Doc 4447 1 59.41 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACA:1 - chr3R 23275245 3' + roo 389 2 59.41 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAACGCTCTTAGC:1 + chr3R 10277290 3' - Doc 39 1 55.45 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTT:2 - chr3R 11263383 3' + roo 9051 2 58.42 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTACGTGGTTACGAGGGTAAAACAAAA:1 + chrX 11730362 3' - jockey 4758 1 81.19 CTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTT:1 - chr3L 19951204 3' - Ivk 36 1 60.40 AAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAAAACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTT:1 + chr3R 8313094 3' - 297 22 2 73.85 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTATTTAATTCGACAATTTTTGAACACACACATTTTACTTATTATAAATGAAATTATTAAATCCTT:1 - chr2R 7868874 3' + roo 399 1 69.31 TTATTATAATTTTTATTATTATTATTGTACTTGTAGTTGTTGCTGTCGTATGCGCAATTTTTGAGCGGAATGCTTTGGCTCTCCCTTTGTGAACATTTAA:1 - chrX 16992259 3' - mdg1 26 3 57.00 AAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGTTGGTG:1 + chr3R 7388434 3' + HMS-Beagle 237 2 74.26 ACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTCAAATCGATGAAATCAGTTCAATTT:1 - 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chrX 2199546 3' + G6 132 1 59.41 TATTTNTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTAAGTGCTTGGCCAGCTTGTTAGTGGTGCTAATGGGTGCGGC:1 + chr2R 22094320 3' + 1360 404 1 66.34 AGCTACACATACACATACACACACACAATCATTCTGCCGAAAAAGTGAGTGAAAGTTAATGTGAACGCGCTTGTTTACTCTGCGGCTTCTGAGGCAATCGC:1 + chr3R 18831918 3' + accord 7100 2 78.22 ATCAAGGTGAGGTAGGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAATATGATTCCACCTTCACGTATCTCATT:1 + chr2R 14341837 3' + opus 455 2 73.27 ATCATAAAAAAACAAAAAAAAAAGTAAGCCCCGTTTTATTGGCCAAAAGATAAACAGAATAGAAAAGTTCCAAAGGGAAAAAAAAAAGTTCGAATACATA:1 + chr2R 13616836 3' + R2-element 3583 4 59.00 CTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCTAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGAAGTTTCGATCCGCTCGAGAGGTCCAAATCACTGGCGCTAT:1 + chrX 2783403 3' - X-element 4390 1 67.33 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCC:1 - chr3R 9551446 3' + P-element 2830 1 22.77 CGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCAGTTTCATAAATTTGAAATTCAAATTTGGTACTCACATTCCGCAGATTCGACT:1 - chr2R 24617005 3' + 412 7309 2 50.50 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCATGTTGAA:1 - chr3L 12888198 3' + mdg1 412 2 69.31 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAATTCAAAATATCAAAATGAAAGGGAAAATATATGAACACGAAAACCCTTTTTG:1 - chr3R 4970537 3' - diver 5913 2 54.46 TTTAACAAAAAAAAAAAGAAAATGTGAAAAATATATGAAGCAGGCAGAGTGCCCTTTGGAAGATACTGAGTGAAAGTGTGAGTACTTAGAAGAAATTATGA:1 + chr3L 7267413 3' + TART-C 11100 1 54.46 AGGCAATCCGCGAACACGATTCCACCGGTGTTTTGCAGGGTAGTAAAACAAAGTACACAATGTCGAGGGAACCAAACATATGTACTCCCCGACCTGCGTGA:1 + chr3R 3657827 3' + Gypsy12A_LTR 1969 1 65.35 CATCAGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGGCCATTTTCCCGAAGACAAACTATTGACGGCCCAGACACCCAAACTGCAAAAAAAAAGACGAAAAC:1 + chr2R 19606006 3' - invader1 391 2 72.28 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATATCTACACTCACACCGATGCACAAAGAAA:1 + chr3R 9550824 3' + P-element 2863 1 36.63 TATAGNTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAAACTATGAT:1 + chr3R 16400236 3' - blood 7029 2 61.39 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAAGAATATGAAAATACCATTGATAAAATTA:1 - chr2R 4547747 3' + HMS-Beagle 7025 2 62.00 ACGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCAGGTGAGTGAAATATCTTGAGCATGAGCTTGCCCAAATCCCAGGTAATTTGT:1 - chr3L 11554069 3' + P-element 2785 1 57.43 GGTCTGGGGAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGCTAAACATTTCGAGGCAGCAGCTGTCTGCAATTG:1 - chr2L 14949420 3' - Ivk 282 1 66.34 AACTAAGTTCGTTCTAAGTCAAGTTGAATTTTGTTACAATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGATATTTCCCTGCTCGCGCGCGCCACCACTTTCCAC:1 + chr3R 31887357 3' + HB 1377 1 64.36 TTTTTAAAAATAAAAAAAACTGATCTCTAAGTTGAATTTCATTCATAAACCAAAGATACTACTCAACACAAACATCCAAAAATATTCAACTCATATATCAA:1 + chr2R 15988285 3' + TART-B 10511 1 85.15 CATATTCCAGTAGCCTACTTTTAAATAATTTACCCTTCCTAGCTAACCGTAAAACGATGCTTGTAACAGTCTGTAAAATCAAAGTTAAGACCTATGAGAGA:1 + chr3L 22942731 3' + Cr1a 3972 1 74.26 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTATGAATAATTATATATCTACATGTTTTTGTGCAATAGAGAAAAACAGCTGTTTTATAT:1 - chr3R 6467246 3' - roo 16 2 59.41 AGATAACAAGCGGAGAACATACGGTATCAGCCTCACGCAATACTCATATAAGCTTAAGCGGGCTCCGCCCTTTAAGATGTAAATTACACGGGATGCTGGAT:1 - chr3R 2156748 3' - jockey2 211 1 67.33 CTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTCTTGATTCTCGCTTTTTATTG:1 + chr2L 19684048 3' - jockey 4679 1 66.34 ATGCATGAGCATACGTGTGCACGCACACATAGTCTGCTATCACTTTGTGCTTTGAAAAGAGCTGTCCGCTGTGGCGCGCAAATCTCCGGGTAGCGGTGCCA:1 - chrX 14833345 3' - 1360 182 1 72.28 CAAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGTGTATTGTCC:1 + chr3L 25842196 3' - 1360 83 1 57.43 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAATTTATATTGAGAAA:2 - chr3R 26530858 3' + blood 347 2 52.48 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGCTGGCGAGTAAGTTTTGTATGCGACT:1 + chr2L 5646930 3' - jockey 4671 1 77.23 TATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTGTAGTTATTATCACTATGTCATACTAAAATGTTATTTAAATATACTGATGAACTTCTA:1 - chrX 21097392 3' + Tc3 316 1 72.28 TCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCGGCACTTTCTGGCCGATTTTTTGGTCTTTTGT:1 - chr2R 19943899 3' + 412 474 2 57.43 AATTCATACGTTTGCTGCATCGCAGATAACAGCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATTTTGTTATCGCCTAAAGGATATTGTTCTTTGGATAATCCGGAAT:1 - chr3L 22392378 3' + pogo 98 1 56.44 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTATTGTAATTAAAGCTGCAGCACAGCCTTTGGTCAAGAGTCCAAATGGGTTGCAGTTGATCTAGGCA:1 + chr2L 9774364 3' - 412 10 2 67.33 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCAACCTGCTGCAGATTTCTGTTCGCCTGGTATCAGGAAACAGAATTTC:1 - chr3L 2244113 3' + jockey 4963 1 53.47 GACCAACAAGCCATAGTCCCCCTATTATATCAGAGTCCACCCCGAAAGGCCAGGAATGGCAATCAATCGCCAGTCAGAAAAAGGCGGGATTCCGACCAAAG:1 - chr3R 24584389 3' + Rt1a 408 1 72.28 CGGAGTATGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGTGGATTTCCAAGATTTCGGAACGATATGTCTATTGAGATTAGCGAACAAGAATTGAATCGATG:1 + chr2R 5531298 3' - Doc4-element 207 1 57.43 TTTGTTTTTTTTTTCTTTTTGTTGTAAAATATACGACCTTTTGCTTAAACTGATGTTATTTACAGTTAATTGCTGCTGGCGGCGAATGAATGTTAAATTA:1 - chr2R 11802365 3' - G2 3076 3 55.00 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCA:1 + chr3L 18501011 3' + hobo 2911 1 60.22 TAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTGCTTACGTCAAGCCT:1 - 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chr3R 27715799 3' - gypsy7 5232 1 75.27 CCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGTGTGTCCGTGTTAGTATCTGTGTGTGTGCGGCGGAGAGTGTGCGTTGTTCTCTGTTTGCTCGCCG:1 + chr2L 9568530 3' - Tirant 71 2 66.34 AAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATAACAT:1 - chr3R 21092435 3' + roo 389 2 48.51 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGAGACCAAGCGGGC:1 - chr3L 19454655 3' - diver 5911 2 58.59 AACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAAATATCGCCATATCACCAATTCCTTAAAGGT:1 - chr3R 4834238 3' + mdg1 7444 2 63.37 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGGGAATCACGATAAAGAGTACTGA:1 - chr2R 14351876 3' - Max-element 54 2 76.24 TTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGATCGGTCAATATTTGCAATCAAAATAAAATC:1 - chr2R 13585476 3' - Juan 4075 1 70.30 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTCTTACATAATCACCTCGCTTATTGCTCGAATTTCACAGCGAACGAATGAGAGGAATCTAATCCGAAGGAACC:1 - chr2R 23580436 3' + P-element 2871 1 76.24 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTA:1 - chr2R 17626501 3' - mdg1 7074 2 70.21 TGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGAAGGAGATGTCTGCAGAAATAACGGTGTGCATTAGTATTGATGTGTGTGGGTATTTATATATGTGGGTTTTGTGTTTA:1 - chrX 7469097 3' + invader1 3733 2 72.28 ATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATGACACTCGGCACTCATA:1 + chr3R 1465942 3' - gypsy5 6991 2 74.26 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGGCAGTGACTGGGAAATGAGGAATGGCTAA:1 + chr2L 2060205 3' + 412 479 2 59.14 TAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAG:1 - chr3R 32005894 3' + invader4 312 2 64.18 TTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATAATATTTGGTAGG:1 - chr2R 17626460 3' - mdg1 2 2 75.25 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAGCAGCAAAAATGTAGCCTACATTCGAGCGTCACTGCAAG:1 + chr3R 11846305 3' - hobo 17 1 62.38 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGGGCCCATAGAAGGGGTGCCTTTGAAATAACCAAATAAATGTGTGTAAACTGTTGATATTATGTTTGTAAGTAAT:1 - chr3R 11688405 3' + 1360 3387 2 77.23 ATATATACTCTTGATCAGGATCAATAGTCGTGTCGATCTGCCCATGCACGTATGCCCACTCTGATTTTGGGAACAATATAGGCAATAAAACCTGCCGGACT:1 + chr4 1058757 3' + INE-1 80 1 65.35 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATG:1 + chrX 20806934 3' - opus 7040 4 71.29 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAGACAAAATGGATTTTCGACTATTTATGTGG:1 - chrX 6379113 3' + hopper 1406 2 71.29 GCTTAAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTG:1 + chr2R 17937181 3' + Quasimodo 7324 2 74.26 CAAAAATGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATGGAATTAAGTTTAAGATACACTCATGGGTTTTAACTAAGTAGCTGAAA:1 + chrX 15305715 3' - roo 8687 2 56.00 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCA:1 - chrX 10827413 3' + roo 9040 1 60.40 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATAC:1 - chr3R 31458416 3' - jockey 32 1 54.46 ATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCACATCCGACTACACACTTCCGCGCATTTGGCGCTGGCCCTGAAAACCGCCACCGCTCTGGATTGCT:1 + chr2L 17063225 3' + Ivk 334 1 69.31 TAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAACGGGAATGTCATCGTCACTCTATATTTTGGCAAGTTACCCATTATT:1 - chr3R 19447164 3' + roo 8941 2 74.26 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATGCTCTGCATTTGATATGTACTTCCTGATGTT:1 + chr3L 7075932 3' - roo 8710 2 77.23 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAACAACAAAAAAAGGAAACAACCA:1 - chr3R 23048416 3' - mdg1 7054 2 63.37 TGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTCAGCTTTTTAAGGCTGAATAGTTTATGCTGGAATCATTTCAATGGCTCGAGTATTT:1 + chr2L 12120586 3' - Porto1 279 1 62.00 AAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTG:1 + chr2L 2074788 3' + roo 390 2 63.37 TCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCCGCTGTTTCGGTTTTTGCTCTGCTGCTCTGTTCTGTTCTGTTC:1 - chr3R 9393036 3' - jockey 4704 1 58.42 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTTCCTGCCCCTAGAGGTACTTTTCCAAAGAGTGGAATATGA:1 + chr2R 20816526 3' - hobo 3 1 77.23 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAGTGGGAACTGCGGATGAAGATCGTAGCCGATAAGAGCCCAGCCGTGTTTGCTTTCCCTTTATCTGG:1 + chr3R 23048524 3' + mdg1 412 2 69.31 ATTAATTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACAAATTAAGAGAAAAAAAATTGTTGCTAGATGAAGAGGT:1 + chr3L 5537642 3' + jockey 4956 1 69.00 TAAGGCTCTTTTAATAAAAGCCATATTAGGTCCAACACTGACCTACGCCATCCAAGTGTGGGGAACCCACGAGTACAACAATCACAGATACCGATGCATAG:1 + chr2R 2949152 3' + G5A 2391 1 65.35 TATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTATAAGGGGTTTTCGGGAACACCTTTTTGTTTGGATCGAGTGTACTTTATTATTTGGGTCAAAAATAGTATT:1 - chr3R 7528728 3' - HMS-Beagle2 7198 1 76.24 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACA:1 + chr2L 16884879 3' + pogo 2058 1 70.30 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGA:1 + chr3R 10147882 3' + roo 361 2 72.28 TCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGTAAGATTAAAGGCTTTTTAAATTAAAATTCG:1 + chr3L 26015034 3' + invader4 2762 2 69.31 TAAGAAATTAATTTAAAAAAAATAAATAAATAAATAACATAACATATAGCCATACTATAACATTTTTTTATCTACCATATTTTGTTCAGTGCACATAGCCC:1 - chrX 20861371 3' + jockey2 3404 1 29.70 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTAGGCGACGGGGGTGACGAGACAAA:1 - chr3R 25097809 3' + P-element 2885 2 76.24 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTCTTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTATCTGTGCAAAT:1 + chr2L 19481350 3' + roo 9042 1 54.00 TAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGC:1 + chr3L 25232907 3' - GATE 8271 2 50.50 TTTTTTTTTGTCTTTTTATTCCCCGCGTTTATGAAGAAGATCATGAAAGTTTTAAGAACATTGGCAATCAACAAACTTCTTCTACGTAATTAATTATAAAT:1 + chrX 13706772 3' - Osvaldo 1521 1 69.31 ACCGANGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATA:1 - chrX 1281693 3' + roo 353 2 77.23 CGCAGAACAGACATGCATCGCTCAACCGCCATAAAACGTTGCTCAGACAATAACGTGAATAGTGAACATATATTATGTCTTCACACTCAAAACGACCTTTA:1 - chr2L 14624624 3' + invader1 325 2 72.28 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGCAAAACAACTTTAATCATTCGTAATGGCCGCTAGG:1 - chr3R 11544346 3' + hobo 2923 1 50.67 GTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:1 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 24 1 76.24 GCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATATTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGA:1 - chr3L 19951217 3' - Ivk 49 1 74.26 CTGAAGAGGGTACATCCCACCGATTTCCCTACCCGGAGGATAGTATAAAATATAAAAGAATTTATTAATTAATTTAATGGAGGGCCAAAAGTGTTATCGTA:1 + chrX 22443526 3' + G5 4639 1 58.42 AAACTATATATATGTATATATATATATGTACATCTAAATCAGTGCACCGTAGATATCTATCGCCAAATCCTTTGAATACCCAATTTTAGATTAATATCAAA:1 - chr3L 18737800 3' + 1731 4408 1 66.34 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGGAAAATTGCAGCTACAGCCTGTGGC:1 - chr2L 315154 3' - Tirant 49 2 75.25 GGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGCTTGGTTGTCTGCTTTGTGGCGCACTGGCGATGGCATCTTCTTTTGTTTGCCTGACAG:1 + chrX 12257719 3' - F-element 4544 1 66.34 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACGAACGGGTGGTTCACTTGGAAGCCTTCCATTTATTCCAATGACAGTGGCGGGAACTATTCAATTTACTTTGTT:1 + chr3L 11114000 3' + 412 7544 2 76.24 CAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATAGATCTCCCATATTTACATTTCAAATAATCTTTAAACTGGCCAAAATTGCCATTGTACAGGCGCCTCTTTA:1 + chr3L 3032336 3' - opus 7115 2 78.22 GTTGAGATCTGAGGAACTATAACAGCTAGAAAGTTGAGATTAATCATTCTGCTACGCCCCCTATCCACTTGCCCCCACTCCCCCTTTTGCCCTCTCTTTCG:1 - chrX 8373483 3' + INE-1 145 1 61.39 GTCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATAAAAGATAGGTTGAGAAGCCCACAAACCACACAAAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAATA:1 - chr2R 12521469 3' + INE-1 125 1 47.52 AGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGGTGGATTCCCAAATGTGGGTAAGTGGGCATATTGACTGATTCATTTAATAAAAAGTAGCGTGCGATAAATAAGTGA:1 - chr2R 1578005 3' + Tc1-2 179 1 77.23 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTACT:1 + chr3L 9766426 3' + blood 360 2 62.38 GTTTTAAAGGAAATTTTTTTTTCTTTTTTTAAAATTTCTTTTAAGAGCCGACTATCCATCGAACCGTCAAGCCCCAGGTTCTGTCTGCTTTCGGAGATATT:1 + chr2L 20738342 3' - HB 1557 1 56.44 GCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTTCCACGTGGCATGAAAATGTGGGCGTGTGGTCAGAGTCTTGCCACAGCCATTTTAAACGGGCTGCAAGTC:1 - chr2L 11664053 3' - F-element 4448 1 74.26 CGTTTATATACACAACACTCATGTTTAACATTAAGATACCCATTTAAAAAAAAAATGGTAAAATCAAAATACATTCCCTTTATTCAGAATATTCTCTCACC:1 + chr2L 9309398 3' - accord2 389 1 70.30 AGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTAACAGGGAGCCGAAAATTATAA:1 - chr3R 5874634 3' - Tirant 8187 2 78.22 TAAAATAAAATAAAAAATAAAAAAATATTATATTAAATTAAAGTTAATCAAGCTATTAAACATGCTATCTCAGCTTGTAAAATCATTA:1 - chr2R 7999588 3' + F-element 4685 2 36.36 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTATTTTTTTATATACAAAATCACCAAAACGAAGAAGAATAAA:1 + chr2L 12479555 3' + pogo 2073 1 67.00 TGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTATTTTTGGGTCGTGCGCTATTTTTACGATTTATCTGCTTTATGTGTTTGACTGTCATTTTCATACATTT:2 + chr3R 17496016 3' - Quasimodo 169 2 72.28 TTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACC:1 + chr4 1149905 3' - 297 29 2 82.72 TTCTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTACGGCATAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCTAGCACAGCCTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 + chrX 14317416 3' - HB 1360 1 75.25 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTATACCCAACCGCTGGGTTCGGGAAAAATCTGCCTGTCTCTCGGGTCTGCG:1 - chr3R 21296544 3' - P-element 26 1 53.47 ACAAATATAACAAATTATTTAAACGTATTCATCGAAATGGAAAGGGTATCCAATGTTTTCATACCTAAATTGTTTTCTCTAGTTTGTTTGGCTAGTTTGTT:1 + chr3R 21907255 3' + gtwin 34 2 73.27 GCGATCATCAGTGATGGCTTGGGGCTGAGGCGATCCCACTTCTGATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCCGGTCATCAACTTGGCCACTTACGGATGTGTTTGG:1 + chr3L 16760164 3' - invader6 417 1 65.35 AACTCCTATATTCTTTTGTCGCAAGCATAGACCACCACCCCACAACGCCAAAGAGCTAGAGCCGGAGTCGAACATGAACAGCATTTACAAAATGATCG:1 - chrX 21294215 3' + Gypsy12A_LTR 2091 1 67.35 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACATTTTTTTTTAATTTCATGGTTCTTTTCGATAAATTAACG:1 - chr2L 6999230 3' - Ivk 7 1 66.34 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGG:1 + chr3L 13477496 3' - P-element 47 1 31.68 CCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTGTGTCAGGTAGCCGAAGGAAAGTTCTTTTCTTATATTCATCACACTCATCGAAAGCC:1 + chr2L 20999228 3' + micropia 79 2 70.83 GTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGCATATGCTGCAGTAGTCTATGCTAAAGTAGGACCTCATGTTAATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCT:1 + chr3R 19446207 3' - jockey 4739 1 76.24 ATTATTATATATATATATATATATATATATATATATTATATATATATTTAATAAAATTTAAAATAAAACATTGGAATAATTCGACGAGCCTTCTGTGTGG:1 - chr3L 12838567 3' - Dm88 4380 2 54.00 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGAACAGCTCAAAAAATTCAACGCCATTTGTGCAGTAAAATTGTTCCGTTT:1 - chr3L 11113896 3' - 412 27 2 54.46 TGCCGNCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTCGTATGCGTTCGGCTCACAGACACGAAGCGCCGCT:1 - chr3R 8477711 3' + P-element 2874 1 39.60 AACAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAATGTGTAATGAAGTGAAGTGAAATTTAAAGCGTGCAAAGCGAGAGAAA:1 + chrX 9013566 3' + Doc2-element 229 1 91.55 AATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAAAAAAAAAGCAAGTGTTAACATAACCACAAGAGGAATAAAAAATGTTGGTTTATTCAGTAAACTAAGAGG:1 + chr3R 26267052 3' + Porto1 232 1 67.33 AGATTTAGATTTTATTCATACTTCAATTGTAGTGGGTGTATGTGCCTATTATTACAATAACCAGTATTTGGCGGCAGGTATAAGCTGATTATAAAAGTAA:1 + chr2R 4673469 3' + Quasimodo 7266 2 75.00 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAATC:1 + chrX 8491468 3' + P-element 2853 1 45.54 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCC:1 - chr3L 12103791 3' + roo 9036 1 63.37 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAA:1 - chr3R 26530872 3' + blood 7345 2 66.34 TAAATTTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTCTGGTGGTGATGAGCTGTTGATGTTATATTTTTTATTTTCAAAT:1 - 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chr2R 16333974 3' - P-element 19 1 60.40 TTACACAAAACACTAAATCTAATCTAATCTAATCGAAATCTACTTTCTCCTATTTTATCCCCTCACATTTACAGTTACTCCTATCGCGTGCTTCTGTCTTG:1 + chrX 10070510 3' - S-element 1488 1 57.43 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAACGAAAAAAGCGTAGCACACTTTTCGGGGCGCCCATTTTTGACACTTCA:1 - chr3R 22644119 3' - hopper 6 2 73.27 ATAATAAATAATAAAATAATAATTTGTCTAAGTTTGAGTAATTATAGGTGCACCCTAACCCTCTGAGGCTGCAAAATATTTTACCTGCATATTTTTTTAAT:1 + chr3L 19112409 3' - INE-1 415 1 68.32 TTTTTATAAAACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTT:1 - chr2R 5582175 3' - Cr1a 448 1 60.00 TCTTCGTTGTCGGCTTCATCCAGAACCAGAGTGCCCGCGAAGCAGCAGATGAAGCTTATCAGCAGAAGTTGGACGACAACAGACGCGCGGCCGAGGAAA:1 - chr2R 16185508 3' + diver 320 1 79.80 ACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGTAGAACTTGTGCTGCTGTTGCTGTTGCAGAACGGCGCTGGCGAGCAGGCTTTTGTAG:1 + chr3R 7302008 3' - Doc 283 1 63.37 ACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTACATACATACATACATACATGCATATGTAGTGGACACCTACACAATTGAGCATG:1 + chr3L 22831349 3' + 297 368 2 59.41 AACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAAGTGGTCGAATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGAGGATACTGTCGGATCTTCGTAATTGAAGAAGCAT:1 - chr3R 5156694 3' + Tc1 407 1 66.34 CCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTAGACTTTTAATTTTTTTATTCA:1 + chr2L 17784670 3' + gypsy10 298 2 76.14 AAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTAGCCACAATAGTTTAGGCCTATTGTTCTCGACTCAATGCCTCCACTCGTCT:1 + chr2R 11414006 3' - Tc3 315 1 55.45 GCACACTACATGAGTCAGTCACTTGGGTATATGTAGTTTTTCTAGGATGCTTAAATTAAAGGTCTGCCGTTGTCAGTTTGTAGTAGAATTTATATACCAAT:1 - chr2L 12325460 3' + roo 152 2 68.32 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAA:1 + chr2L 8565508 3' - blood 7061 2 75.25 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAA:1 - chr3R 13225479 3' - hobo 12 1 67.00 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATTAATGTTCCAAGAA:1 - chr3R 23591409 3' - pogo 24 1 54.46 TTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGTTTTTGTTGTTGGTGTTGTTTGCAATATTCCAAGACTCACGTTCGCCTCGTCCGTGTA:1 - chr2R 23979761 3' - F-element 280 1 62.00 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTA:1 - chr2L 13334036 3' + flea 212 2 78.35 CCATTGGCTTTAGCTACAAGTTGAAGCCCTTTTTTCATGGAATGGACAAGTTTTCGCAGGCACCCCTTCCGGTTCCTGAGGCTCCTTGGCGAGCGGCACTA:1 + chr2R 14993250 3' - S-element 1401 1 57.43 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGA:2 - chrX 20806877 3' + opus 7461 2 75.25 TATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAACTCAAATTAAAAGTCGCATTAAATAAATGAGAAACGAACGAGGACTGCGACGAGCA:1 + chr2R 13770044 3' + S-element 101 2 59.41 AGCCGAGTCGATCTAGCCATTTTTTGTTGTTTATTTTTTTCTATTTTTTATTGAACGAATTCCACTCGTGCTATTAAATTATCTTTAAGTTCGTTAAAAGC:1 - chrY 382989 3' + INE-1 105 1 51.49 ATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGCCAACACGGGTGGCTGCTGAAATTCTCGTTCTCACATGTTG:1 - chr2L 18430080 3' - copia 4902 2 60.61 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCA:1 + chr3R 5686098 3' - P-element 48 1 29.59 GAATCGTGCATGCCACCCACGGTAGTTGGTATCTTTAGAAATTTCTTATTTTCTAATAACCACGAAGTGTTTTTGCACAGATCACTCTTATATACAATTAG:1 + chr2R 672678 3' + Rt1b 5079 1 58.42 ATAAATAAAAAAAAAAACTTTTCATTGAAAATAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 17209085 3' + HMS-Beagle2 492 2 93.33 AGATAGTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCTA:1 - chrX 15305656 3' + roo 358 2 72.28 GAGTCTGGTCCAGTATGGGTGGGATTGTTTGAGTTTAGTAATGCCGAACATTGAAATGTGCTCTGGGATCAGGAAGCTGGAGTTCCGTAGGCTCTCCATAC:1 - chr3R 18171183 3' - I-element 4904 1 71.29 GGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTTTCTGGGCGGTCTCTTTTTGTTTGCATTGGTAATGAGTTTACT:1 - chr3R 32005850 3' + invader4 3081 2 75.25 GGTAANCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGATGGC:1 + chr3L 13477517 3' - P-element 26 1 52.48 GGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACTATATAGGGTGGTCCTTTGCTGGCTGGGTGATAGGAAACTGGACACAACCT:1 + chr3L 5201564 3' + 297 375 2 59.41 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAG:1 - chr3R 13375983 3' - 1360 47 1 74.26 TTTTATTCTTTAATTTTTTTTTCTCTTTCTGTTTTGCCTTTGTTGGAATTTGCTCTCTGGCTATCAATTGCCGCTCTGTTCGGGCTGTCATTTATTCATTT:1 - chr3R 5976971 3' + Tc3 77 1 57.43 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCCAGGGCAGAATCTCTTTTTGGTGCTTAATGACGCGGTGAT:1 + chr3R 11688497 3' + 1360 3378 1 58.67 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCG:3 - chr3R 10952263 3' + roo 9046 1 51.49 CACAANTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTAC:1 + chr2R 4483269 3' - Ivk 32 1 52.48 AAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAATGCGAATATGAACAGCGTTGGGCAAGTGCGTCTGGTGGTGCTGATGGTGC:1 + chrX 272674 3' - INE-1 571 1 57.00 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATAGATCCTCAATGCACTTGTTTTCAAAAGTAATCAATGAAA:1 - chr2R 9854035 3' - pogo 37 1 61.39 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCA:1 - chr2R 14675532 3' + roo 9052 2 58.42 TGACATCCACAAAGACATGGAACTTCCCCTTGTTAAAGACAAAATAACTTGATGTTCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCT:1 - chrX 292007 3' + G3 4315 1 53.47 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATTTATATGTGGAGTTATACAAATGG:1 + chr2R 17937170 3' + Quasimodo 7343 2 78.87 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTT:1 + chr2R 24021638 3' + pogo 2066 1 65.35 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCA:2 + chr2R 12457972 3' + roo 9024 2 75.25 ATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACATTTTCATATGCTTCTACTCCTGCAAACGAATTGAAATTGAAAAACTCGAATCCGATCAAAA:1 + chrX 4954062 3' + 1360 3179 1 64.36 CCAGATCGCGAGTGGAAGGAGAACGTGCATCAGAACGATAACTGAAGGAAATAACAACTCTTCCATATTCCTGAAAAGTTGGCTTCGGCTTAAAGTTGACA:1 + chr3R 11867956 3' + gypsy8 391 1 54.46 CAACACACACAAACACACAGATTATGTAAGTGAGCATAGGAAAATAAAATGGCAGTTACTTAGTCGTATAAATGGCGTCAAGGAGAAGGATTGCCTCGTCT:1 - chr2L 2325380 3' + gypsy3 424 1 73.27 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAAT:2 + chr3L 23456271 3' + 1360 3374 1 60.40 GAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAATCAAATCAACGCAGAGTAAAAGACATTGTTTATGTTGTCGATTG:1 + chr2R 11668457 3' + P-element 428 1 51.49 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAG:1 + chr2R 21773608 3' - Max-element 39 2 64.36 TTTTGTTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGT:1 - chr3L 25232772 3' + accord2 168 2 52.48 TTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCA:1 + chr3R 20147575 3' + 1360 392 1 73.27 GATTCGTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTT:1 + chr2R 19552032 3' - roo 8717 2 77.23 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATAT:1 + chr3R 24760636 3' - pogo 15 1 64.36 TTCACNTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCA:1 - chr3R 12605618 3' - F-element 63 1 78.00 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTTATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGTCATGCCAAAAGG:1 - chr2R 17937126 3' - Quasimodo 13 2 55.45 CAAAAAAAAGAAAAAAAAAACTAAAATGGCCA:1 - chr2L 10074748 3' + HMS-Beagle2 489 1 81.25 AACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGCCCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTTGCCTTAGTTCGTTCTTTCGCCCGTGAATGACCTTCGCCTGTCCCGCTATTTT:1 - chr3R 21612568 3' + Doc 352 1 58.00 GTAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATGCAGCCCGAAAGCTGAAGAGGCAGCTGGAGAAGAAACTGGAGGAGGAGAATCCATGGCCGCTTGA:1 - chrX 4462359 3' - Max-element 8414 1 70.30 TCTAGCTTTTATAGTTCTTGAGATCAAGGCGCTCATTTCTTTCAATTCCGCCCTTTTTATGACCTCCACCACTGGCATCTCCTCAACTGGCTGGCTTATCT:1 + chr2L 13141124 3' - INE-1 153 1 72.28 TCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGAT:1 - chr3L 19951178 3' - Ivk 10 1 69.31 AAGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGAC:1 + chr2L 18279942 3' + gypsy5 7293 2 77.23 ATATAAACAAAAACAACAAAATTATTGATTTAAGACCATGGCTTCTTTCCAATTAGTTGGAGCAGCAACGACTCAAGGGCGAGCAGCAAAAGGTGGAACGC:1 + chr3R 18679430 3' + gypsy11 3931 1 52.48 CACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAGGAAAAGCGCAAAGCGGGAAAGCGGAAAAGCGAGGCAGCCGGGCCAA:1 + chr2R 17355919 3' + jockey 4673 1 53.00 CCCCTCTTGAACGGGACCACTAGCGCTCCGCTATGTCATCATCCACATTTACGATTGAGACTTGGAGGCTTTTGGACAGCTGCTGTACAATCAGCCAAAAA:1 - chr2R 1780239 3' - mariner2 72 1 66.34 TTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGACTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGCTTTTGAGTAGGTTGTTATTGTAGTTTCGCAGGGGAAATTG:1 + chr2L 15424882 3' - Quasimodo 140 2 61.86 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCC:1 + chr3L 12888287 3' - mdg1 7073 2 58.42 TTTCTTTTTTTTTTTGTTTTGTCAGGCTTAGTTTGCTGACCGCGCAATAAAAACTAATTGAGTGGCAG:1 + chrX 9720165 3' - G2 3076 2 91.18 TGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTCGTTTTTAGATCTGGCCTGATTTCGTTTCGGTTTTGTTTCTCCACAGCGGGGAATTAACA:1 + chr3L 400609 3' + hobo 349 1 62.38 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTT:1 - chr3R 20477035 3' - 412 7080 2 52.48 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATATTCAAAAAACATTAAAAGGACGCAAG:1 - chr3R 4600075 3' + HMS-Beagle 198 2 79.21 CAATTNCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCCGCGGAAAAACTGCAGCAAAACTCCACAAGCCGAATACAGCACCGTCAATATACC:1 + chr2L 23312818 3' + Cr1a 4340 1 65.35 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGG:1 + chr2R 19209447 3' - 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mdg3 32 2 57.43 TAAGATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAAGATCGTATTTTC:1 - chr3L 2818427 3' - Chouto 151 1 62.38 AGTAAAATAGTTTTTGATTTTAAATATAGTAAAAGCCAAATTAAATCGTGTAATTGGAAGTTTTTGAAATACACGCAACAGTTGAGCGTTAACATGGCCTA:1 + chr3R 26568225 3' - Tom1 389 1 63.37 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGGCAGTG:1 + chr2L 2060182 3' + 412 7501 2 64.36 CAGTTTATGTGCATACAAAAAAACCACATCAAAAAGCACTGCTAACAACTGCCATTGAAAGCAATACGAACCAAAAACTAATGAAACAAACAATAGC:1 - chrX 16462716 3' - Cr1a 261 1 52.58 TACACACATACAAACATACATACAGCTATTGCATATGTAGTTTCTATGCCATTTGCATGAACTATTTTTTCCAGTGCACCGGAAGTGCGGTGTAAAATGAA:1 + chrX 12197935 3' + Quasimodo 38 2 78.22 TGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGGGGGTTGGTGTTGTTATCCGAAGGCCTACAGCGGCAGGTGTGTGGGGCCTTTAGTCGACCTGAGGGGCTT:1 + chrX 14356006 3' - I-element 5109 1 60.87 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGG:1 - chr2L 21683412 3' + pogo 2058 1 70.30 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAATGTACTTTTAAAACGATTTAAAGGACTATCGCAAAAATCGAGTAAGTGTGTTTA:1 + chr2R 6702086 3' + pogo 2082 1 60.40 CACCAGGAAACGATATTTTTTCTTCACTGGATTTCCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCACGTTTATGATGAGGAAAATGATTAATTGCCAAAGAATGAG:1 - chr3L 14589032 3' + mdg3 468 1 63.37 TCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGGAGAGGAAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGTGAAGTGTGTTCAGCAGAAAGGAGAGCGTGA:1 + chr3R 21072614 3' + invader2 4940 2 72.22 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAA:1 + chrX 11730311 3' - jockey 4791 1 73.49 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACACA:1 - chr3L 28063321 3' + roo 405 1 75.25 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCGGCATTTTCTCCAGATGTACCCTCGACTCAGTC:1 - chr2L 2074694 3' - roo 8684 2 58.42 TGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGT:1 + chr2L 3951655 3' - Transpac 33 2 58.42 CTCGATTTGCGAGAATATATAGACGCGATATTAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATAAAATGGAATGTGGTAAGTTTATTAAAATGTTTTTCTGTT:1 - chr3R 6481200 3' - Cr1a 4376 1 64.36 CACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTACTACCACGTTTCAAGTTAATTTTTTTTTGCGATTCCTGAAATAGCAAAGGGACAAATACTTCATT:1 + chr4 968587 3' - Stalker4 7008 4 77.23 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTATTATAAAAATGATTGCCACTTAGATTGCGACTAACCGGAATACTTGTGTGCTT:1 - chr2L 20706655 3' + mdg1 7431 2 50.50 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCATATATTTAAACCCATTCTTCCCAATAATAGTAGCCAGTTTTATTTTATCTTTTATTAA:1 - chr2L 9163705 3' - copia 18 2 66.34 TGTCAAATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCA:1 - chr3R 4591863 3' + opus 449 2 77.23 AGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGCGCACCTCTTGCATCCTGGGTTTTCCCATTTTCCCCGCCACCCGCCACCACTTTTCCCTGCT:1 + chr3R 9836148 3' + Bica 274 1 69.31 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTCTCAGATAAAATGTGGAAAAAATGACGGAAGAGCTTTAAATTTTATTACGATTTATTTTTCGTATGGGAACAC:1 - chr2L 15510371 3' - jockey 4671 1 76.24 ATATACATACATGTATATACATATTTAACATGTAACATTCAACATTCAACATTGAACATTGAACATGCAACATTCAACATGCAACATTGAATTTGC:1 + chrX 6732140 3' + INE-1 70 1 42.71 TGTGTGTGTGTGTGTTTATGCGTGTATGTTTTCTTCTGCTTCAAAGGAGTAAAACTCTCTAGAGAAGCAGAAGAAAACAGCAGTATCAGCAAAGAACATTC:1 + chr3L 5665354 3' - accord 178 2 59.41 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTT:1 + chr2L 14790648 3' + roo 9039 1 56.44 AATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCGCAAACACAATTTAAATGTGAATGAAAAAAAA:1 - chr2L 13333987 3' + flea 257 1 74.26 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGG:1 + chr3L 12888299 3' - mdg1 22 2 57.00 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAG:1 + chr3R 20137346 3' + Burdock 234 2 56.44 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGG:1 - chr2R 16475767 3' - 412 55 2 81.19 TGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCCCGGGCACAATGTGAGATATTTTTGGCATTTTTCAAAGT:1 + chr2L 20254375 3' + roo 69 2 61.39 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTG:1 + chr3L 12888309 3' - mdg1 7051 2 66.34 TAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGCTGCCAAATCAATTTTCGTTGTTTTACGTTTGCACAAGCCG:1 - chr2R 11279805 3' - 1360 318 1 68.32 GCCTCTTAGGTGCCCTATTTCCGGAGAAACATTAGCCGAGTTCAGTATTAAATTTTTAGAGGTTTTTTTCCAAGGGGAGTCTCCGCTTATGTAGTAGCATA:1 - chr3L 15392528 3' - Gypsy12A_LTR 1904 1 63.37 TTTTTTGGGATATCGATAGATATTGGGGAATGAACTGGTTTTCTTTTTTTCTGAGAAATTAACAAAGACCTAAAAAGAAAATATAAAAGCAAAAATAGAAA:1 - chrX 22898668 3' - INE-1 499 1 70.30 TTTAANTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCGTTGACTCC:1 + chrX 21017874 3' - 412 16 2 41.58 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGTTTTTATT:1 - chrX 23048267 3' + hopper 1388 1 50.50 CTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCTTTTGCTTACTTTTCCGTTGCAGCTTAACCCTTTTTAAAGCGATATTTATAAGCATGCATAGGTTAAATGC:1 + chr3L 952328 3' - opus 296 2 48.51 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAGTTTTATTCACATTTCTGCAT:2 - chr2L 11703232 3' + Tabor 7293 2 53.47 TTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGGTGGCACTGCGAGGGTTGCTTGGTAAGTTATGAGATTTCGATTGTCAGCTGTT:1 - chr2L 1624993 3' - hobo 2667 1 57.43 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGGCAGACGAAACAAAAACAACTGCGCAGGAATACAAATACTATAATCTTATTGAACGTAGCGAAAC:1 + chr3R 14650205 3' + S-element 1712 2 79.00 CTACATGAGTCAGTCACTTAAGGGATACTGTTCAACATTCTACCATAACACCTCACACGTTGCATTTTGTCAAAAAGCTGGGTTCTACGTTTGGCATTGGA:1 - chr2R 5181426 3' + roo 8821 2 81.19 AATATACATACACACACACACACACACACACACACACCTCCACGGGAGTGGGGAACGTGGGGAATCCTCTAGGTGTGAGATTGTGGCGATGGGTTAAAGGT:1 - chr2R 6912725 3' + Quasimodo 30 2 79.21 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCT:1 - chr2L 12815040 3' + hopper 1383 1 55.45 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAA:1 + chr2L 14612085 3' + roo 361 2 68.32 GTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTTCTCCACAGCAAAGCAAA:1 - chr3L 13586787 3' - Tirant 313 2 64.71 ATATGAAATTTATTTCTTTATACATCCTAGTATTGGAGTAAGAACTATTTATTTAAGGTGAAAGAGAAATAATAATTTAAAAATTTATTTATATATTACAG:1 - chr3L 7009725 3' - looper1 1665 1 86.14 GAAAANACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGC:1 - chr3R 16400143 3' + blood 355 2 56.44 ATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAA:1 + chr2L 21657044 3' - invader1 3644 2 76.24 CGAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAGTGTCTTAAGTCAATAAAAAATAACGTCTAGCTCAAATGCATAAA:1 + chr2L 22079675 3' + gtwin 475 1 79.00 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCTGTTTTCCTTCTTCAGCCATTGCTGCTGGTTTTTAT:1 + chr2R 21446022 3' - jockey 4749 1 64.36 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCT:1 + chr4 158193 3' - Ivk 38 1 71.95 TTAAACAAAAAAAAAACAAAAAAAGAATGAAGAAACAAGAAACATACAACAAAAAATAAAGGGCAACGAACGCTGAATCCACGGGTAAAATGACCT:1 + chrX 16808746 3' - hopper 151 4 53.12 TGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACGAGCAACAACAAACACGTCGACAAATCACAGTGGAGCAACAACAACAGCACCGAGGAGCTGCCCATAAAACGCA:1 + chr3L 8267378 3' + Doc 4391 1 78.22 TTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTAC:1 - chr3R 12539488 3' + roo 9045 1 56.44 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAACAACAAAAAAAGGAAACAACCACAGAAA:1 - chr3R 23048410 3' - mdg1 7047 2 70.00 CAAAATTATATTATTAAAAAAAAAATCATTCCTTAAAAATCCGCTTATAATTACATTAGCTATTGCTCGTAGCTGTACAAAAACAATTAACAGGG:1 + chr2L 8992471 3' - hopper 164 1 87.37 ATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTGGAGAGTTCACAAGGAGGCGAAGAGAGTGAGTTTACGGTT:1 + chrX 7681461 3' + P-element 2611 1 41.58 GTGCANAAAGAGGACGCACCGTACGTACGCGAGGATAGTCGAGGAGAATCTCGGCGCG:1 + chr2L 23332587 3' + gypsy8 244 2 65.52 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCG:1 - chr2R 19551981 3' + roo 9043 1 54.46 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAAT:1 + chr3R 27981734 3' + roo 9043 1 55.45 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTC:1 - chr2L 8565456 3' + blood 7358 2 56.44 CCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGACTTTCCATTTTCAAATGTGTTTGCCAGTGTGTGTGTCTATATTTCG:1 - chr2R 22148462 3' + Tirant 8124 2 53.47 TGGTGAAGGGCATATTTTGTCACATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACCAGCAGATAAGTGCGTTATGAATTTGAGACCCTTATCAAAATGTGTCTT:1 + chr3L 23146089 3' - 1360 212 1 56.44 AACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCC:1 + chr2L 14612115 3' + roo 392 2 62.38 GTACCCCAGAGCTGTATGCCAAAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGGGCAACCTGAAGCAACACATGCTAACT:1 - chr2L 11436266 3' - G4 3436 1 75.25 TTTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGA:3 + chr2R 5627650 3' + TLD2_LTR 96 1 75.25 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGC:1 - chr2L 17311080 3' + S-element 1681 2 67.33 AATGAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCTCCGGCAACAATACCGACTACTATCTCTTCTATCGCTCGGTTCCAATAAGGGGAAATCTGTTATGGATTGAAAA:1 - chr3R 852128 3' + Doc3-element 220 1 63.00 AAATTNGTTCAGTATGTGTTTATATCCATGTTGTAGTGTGTGATGGGCTCCAGGCCGATGCGCATTCGTTTGGCGTTCATAGATTCGTTCTCGCAGGCAAT:1 - chr2L 14157888 3' - hopper2 1190 2 59.41 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGATTGCAGCCTGTTAATTTTTTCGTCGTGCTAAGGGAATCATCATTTATTAATGGAATAGTG:1 - chr2R 5793263 3' - INE-1 557 1 61.39 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAAAAATAAAGTGGGTTGAAGACAAATCCAAGCTCCGAACGCATTTCAATGCAATTTGATG:1 - chr2L 5707234 3' + jockey 4975 1 51.49 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCTCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 426 2 52.48 GCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCACCACTCACGGTCTGACTGTGTCAGCTGGTCCAAGTGCAATGCATTCTGTTTAAGAATAACCTTGCGACCAAG:1 - chrX 16898693 3' + F-element 454 1 62.11 CCGGGAAGCTTTGCAATACAAAGTTGCAACATAAACATCAACGACCCAATTAAAAGCCCCTGAACGAACCTGATATCAAACTAGACCGCAACGAAACCAAC:1 + chr3L 10862399 3' + ZAM 8038 2 65.35 ATATAATAATAAAATAATAAAATAATTTGACTGTTGATATAAGTAATGTTACCTTCGCATTTTTTCCTTCTTTTTGATTAAATTCTCAAGATTGCAATTG:1 + chr3L 18421415 3' + Rt1a 5071 1 80.00 TCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAGAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCGAAATATGCGGTATTCTACTCTTT:1 + chr2R 1949154 3' + Cr1a 4422 1 82.18 CAAACCATTTAATTATTGTCCAATCGGACAGATCCTAAATAAATAAACGCAAACAGTGAAAAAAGGTGAAATTAAATATAGGCAAAGTGAAAACAAAGCA:1 - chr3R 22309869 3' + G6 1981 1 59.00 TCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCAC:1 - chr3R 12047411 3' + Stalker2 373 2 49.50 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGG:1 - chrX 17968346 3' - Tirant 17 2 64.36 GAAGTGCGGACACAAGCAATCAACAATCATTGCCTGGTTAATTTTCACACGCCTTAAGCCGGAAAAACAACACAGCAAACAACTGGCAATGTGACAATCTT:1 + chrX 3092514 3' - 1360 463 1 52.48 GGTAAAAAGGCGGAAATTTTGGAATTAATTACAATTTTAAAATCTGATCCCAAAATATGTGTAATTTTTTAGGAGTGTTAATATAATCGAGTCGCCGTTTT:1 - chr2R 5446386 3' - transib4 2628 2 65.35 GTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGATTTTCATTGAATTATGCATTTATTCCTCTTTTTTCCCCCTTTTTTCTCGCTTTT:1 + chrX 20618411 3' - pogo 1701 1 59.41 GAGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGA:1 - chr2L 15081432 3' + hobo 3 1 51.49 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAG:1 - chrX 20806881 3' + opus 454 2 79.21 TTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 170 2 54.46 TTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGGATGCACGTTATGAGACAGTACTAATGCACAGCGAGAAATCGTACAAAAT:1 + chr3R 27725493 3' + 1731 152 2 56.44 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAACG:1 + chr3R 6608836 3' - I-element 29 1 54.46 CTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATCCTCCCAGT:1 - chr2L 3951585 3' + Transpac 310 1 70.00 CTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTTTTCCAAGTGCACATACAGTTAATCCCCGGCTCATCCTGTCAACATACGAACCCAA:1 + chr2R 18675344 3' - opus 7458 2 55.45 TCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAAGATTTCATTGGGTTGAATTATATTCTTAATTTTTTGTTGC:1 + chrX 19386005 3' - I-element 326 1 59.41 TACTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCATCCATACCGTTATTTTTCCGTTCTGTATGTGTACGACTTAAGTGTGAAATAACTTTAAAATTAGTCGTA:1 + chr2R 6225215 3' + rover 99 2 55.45 CCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCCACATATTAAACTCATGCCCATCCCTTCTACAAACCTATTTCCTATGCAAAGCGCAGCTAAATGTTGAAGC:1 - chrX 415352 3' + I-element 5013 1 65.35 ACGTTNTTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGGTTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATTGTAAATGTTTCAATAATACTCGATTTAATGAT:1 + chr2R 10774124 3' - copia 4884 2 62.38 TACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGACGTACTCCCCTTACGTTAATGTTTCCCCAAATCCGACATTCTGGAATTCGTATATTCTGCAAA:1 + chr2R 16321899 3' + G2 2954 1 67.33 AATTTTTGGACTTCGTTTGGAAAAAATTCAATAAAAACCTATAATACAACTCCGATCTGGGATTCTTAAACGCAAGCGTAACTACTAATTTTC:1 + chr3L 26291445 3' - Tc1 329 1 56.99 TCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGAAGCCGCTT:1 - chrX 22855192 3' - P-element 18 1 61.39 TGGGGAGTTTTAAAACTCCTCACAAGTTTATTCAAAGTGGTTAGAAGAACACCTGGTCCTGAAGGTAAAAGAGAAAAATGAAAAGGAAAGGAAACTAGCTG:1 - chrX 2550483 3' - gypsy8 1 2 69.31 CCATTTGCACCAAATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTACCCTTTAAAATAGCTATATAAACTTCGTCTTTTCATTGCTTTAAAATAGC:1 - chr2R 4329091 3' + baggins 5166 1 50.50 GGACGTCACCTATAAGATTTCATCTTCAAAACAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTAAATATCGAAATGAAAATTATCATTATCTTTTCTAAAAT:1 - chr4 642099 3' + mariner2 764 1 69.31 TACATAAAGACTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAAAACAATAACTAATTTTAAATCTTTTATACATTTCCATCAAATGTGCTTATTTAAACACAAGAGAA:1 + chr2L 14092321 3' + G4 3553 1 67.33 GCTTGAGTGGAAAAGCCAGTCTAGCTTTTTCAGTGATGCCCAAATTGGAGCTTGACTTTTTAGCAGCCGCTTTTCCTTGTCTTTACGCTAGTTTTGCTTAC:1 + chr2L 16509060 3' - G5A 2352 1 73.27 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCG:1 - chr2R 13295655 3' - Tirant 8131 2 54.74 ACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAA:1 + chr2R 5840689 3' - Ivk 33 1 54.46 ATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAG:1 - chr3L 10081921 3' - rover 14 2 63.37 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATA:1 + chr2L 12949280 3' - 412 31 2 54.46 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAG:1 - chr3R 13375939 3' + 1360 3386 2 74.26 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAAAAACAGCAGCGGGAGCATCGGCAGACCAGGAGAAGTATACGTTGTGGCTCCTTTTCACT:1 + chr3R 17853412 3' + roo 395 1 67.33 CATACATATGTATATATATATATATATATATATATATATATATATGGGCTTGTCGCTCGCTGTGTGTGTG:1 - chr3R 24408249 3' + Stalker2 251 2 64.29 CCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAATATAACCAATTCTGAATTTAGTTTGCTTAG:1 + chr3L 11403691 3' + copia 5000 2 70.30 TGTCGATTTGCACAAGTATTACACTAATAAATTGTTCGCTTTTCGCGTGTCACTAAATGTTTATTGTTGCCGCCGACGCCGCTCTTCAGCGCAATTGGGAT:1 + chr2R 11401216 3' - HeT-A 219 1 68.32 CAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGTAACATGTTCTTACTTCATCTGGTTGTCCAATTCCTTTTTATTTCTTACTTGCACTTTGCATATAACTTACATAAATA:1 + chr2R 4578952 3' + opus 76 4 71.29 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGACTCAACTGCGTGTGCAAAACTGATGATGCTGTTCGCCTTTGTCAACTTGTTTGATTAAAAAAG:1 + chr2R 14408551 3' - hobo 14 1 63.00 GAGTGNATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATT:1 + chr3R 11119856 3' - 297 44 2 75.25 ACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACACACGGCAATCCCACCAGCACCAACAAAACACAGGCTCACCCAAGCATTCTGCCCAC:1 - chrX 281742 3' + Doc 474 1 64.36 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGT:1 + chr3L 12888285 3' - mdg1 7075 2 60.40 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTCAGCATATAA:1 - chr2R 13650116 3' + mdg1 7418 2 65.35 TATCCCAGAAAAATTATGCAATTTCGCACTGCCACCGTTCGTTTTATACACTACAGCCCTGTGTGGCGAAATATATTGAAATACAACTAAAATTTTAATTA:1 - chr3L 25985875 3' + INE-1 509 1 75.25 TTTCTTCGATCAGAATTGATTTTGGACCGAATATCGTCTTCAAGCACACACGCATCATTTATCACG:1 - chr2L 895924 3' + 1360 3171 1 77.27 GACTGNAACTAAGTCGCAAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGAGCGATTTCTTTTGAACTGGGTTTTGGGCTCAATGTGACGCACCTA:1 - chr2R 19816277 3' + gypsy4 6642 2 57.43 TGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCAACTGGAATTGGAACACACGCGTAGCATATTGGAAACACTCGCGTC:1 + chr3R 18574170 3' - G2 2959 1 54.46 TAGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAA:1 - chr3L 3548096 3' - Tc1-2 1531 1 70.30 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTCGTCGGACTGGAAGG:1 - chr2R 23571622 3' + roo 391 2 59.38 GCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACATCAATGTCTACGTCAAAGTCTAAACCCGAATTCGAAGTGGCCGAGACAGCGCTGAGGCA:1 + chrX 5399855 3' + I-element 5059 1 61.39 TCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCTGCTGATATTCTGCAGAAATCAAGAGAGCAGGATGATTCGCACTACTTCGAGCGTGGCGATATAT:1 + chrX 12660832 3' - R1A1-element 40 1 69.31 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTGCAATTCTCTGTTAAAGA:1 + chr3R 9342326 3' - hobo 14 1 47.52 TGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATAATATTAATAACAACAACAATGGCGACTCATTCACTTAGTCAGCAGACAC:1 + chrX 5034798 3' + mdg1 7039 2 62.38 CTACTGCACAAATCACAAAAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTACTAATTATGTTTAAAAATATTCAATTCAATATTCAAATTATGTTTTATTTGG:1 - chr3R 4525997 3' - Cr1a 146 1 67.33 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTATTATAAAAATGATTGCCACTTAGATTGCGACTAACCGGAATACT:1 - chr2L 20706664 3' + mdg1 384 2 58.42 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGTCCTTCATCATTTAGGCCATCATTAATTAAAAGG:1 + chr2R 16980545 3' - copia 4912 2 67.33 ATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTCGAAATGAGAGGCTCCG:1 - chr2R 8310865 3' + pogo 2043 1 84.16 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGAGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATGATTTCGAGGACCCAGATACT:1 + chrX 868774 3' - jockey 4777 1 61.39 AAAATAAAATTAAATAAATTAAACCATTTGCAAATGTTGTATAGCTTTAAGAGAAGCACTTTTACTACCCAACTTGTTTCTTATGCTCGTAACCAAAAAGC:1 + chr2L 9744703 3' + NOF 3960 1 73.27 ACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCAACGCAAGTAAAGCAAGTTAATTTTGGGAAAAGGAAATTTGTTAGTAAAATATGTTCTAAAGGTAATT:1 - chr2L 21607925 3' - micropia 18 2 71.29 ATGTAATATATACGAAAATAATATTGCACTTATTTATTTATTTATTCCGTTTCGCTAAATGATAATCATAAACAATTTTGTCGCTTAAAGCTGATGGCAAG:3 - chr3R 15721341 3' + mdg1 7038 1 50.50 ATATAATAACAATAATAAAAAGTATTTTTAGTTCAGCAAATGGCTCTCCTTAAAATTTTGTCATTCAAACGAGACCCTGACGAAAAATCTAAAATCCGCGC:1 - chr2L 13625556 3' + mdg1 7053 2 79.21 ATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACAGTTTTGCGCGCCACGCGAGTCAAGAGCCAAAGAGCGCAGAA:1 + chr3R 16157980 3' + jockey 129 1 58.42 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATGAGTGTGCGTGTTGTGCTGTCGAGGCAATTGTTTGACCATTGTGGAGATACAACACTTAGATAG:1 - chr2L 18575254 3' - 1360 3246 1 54.46 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCC:1 - chr2R 24628775 3' + mdg1 7411 2 75.25 CCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAATAAAATAAAAACGCTTACACAAACACCT:1 - chr3R 18210348 3' + Juan 4160 1 79.21 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAACCACACTGACAAGGACTATATCAATGT:1 + chr3L 11257420 3' + 1360 3378 1 68.32 ATGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAACCCATCGCTGCTATC:1 - chrX 15293426 3' - Quasimodo 27 2 55.45 ATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTAT:1 - chr3R 12539494 3' + roo 9039 1 58.42 TGACTTATCCTTTTTTCCCAGCTTTCCACGTAATTTACTTACAATTTGGTAAAATTCCAAAAATGTACATATGTATGTAGCCCATGGTCCAAAATACCGAC:1 - chr2R 16783204 3' - Transib5 2504 1 47.52 TTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATTTGGTTTTTTAACACTAGAAGAATACAGCGCGCGAAATTATGCTATTAATATTTACGGAATTTCCGTTTATC:1 + chrX 4366306 3' - jockey 4674 1 75.25 TTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCATTTCCACTTTTCC:1 - chr2L 4160097 3' - Tirant 2 2 78.35 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGA:1 - chr3L 7205557 3' - Doc 59 1 74.26 TATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCCGTG:1 + chr2L 20706747 3' - mdg1 1 2 75.28 TTGCACTATGTGCAACGCAACTGCTACCACTGACTACTTCAGCTTACAATATTAAAGAGATAACCCCACGCTTATTAAAGCTCAAACCCAGAACTGTGCTG:1 - chr2L 22212798 3' - diver2 85 2 58.42 TTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGTCCGGAAATATGATGGAAATGTAAATCTTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCA:1 - chr3R 19449716 3' + roo 410 1 78.22 CGCGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGT:1 - chr2L 18279888 3' - gypsy5 24 2 55.45 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATT:1 - chr2R 20739458 3' - roo 49 2 76.24 CTGCGNTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTATTATAAAAATGATTGCCACTTAGATTGCGACTAACCGGAATACTTG:1 - chr2L 20706662 3' + mdg1 386 2 55.45 GTGTGTGTGAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAA:1 - chr2R 3591978 3' - Quasimodo 25 2 59.41 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCA:1 - chr3L 13659911 3' + pogo 2048 1 77.23 GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTACACAAATTATTGTATCAAAAAGTATAAACGTATAAAAAGTGTT:1 + chr3L 1194791 3' - X-element 47 1 61.39 TACGCGAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAACCTACGATTTGTGCGTGCGGGAAAATCCCAGCTGGGAA:1 + chr2L 6554141 3' + Burdock 6371 2 68.32 GGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAAGAAGATGAAACATGACTACTGATGCAACTGCTGTTGCCCTCGGAGACCACCTACGACCAAGCTGG:1 + chr2L 1697022 3' + jockey 4657 1 69.31 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCC:1 - chr3R 19346906 3' + blood 7345 2 70.30 GAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGACGCGACAAGAACTGCAAAAACAACAGCAACCAAATAAAAATAACATCAGCTAACCAGGCAGGCCG:1 - chr3L 561213 3' - Idefix 244 2 71.29 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTT:2 - chr2R 12082347 3' + mdg1 380 2 64.36 AGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCCACTTTTCAAATCGCGCCAAAGTTACTGACATATGTACATACATATTTGCA:1 - chrX 2302235 3' + blood 7178 2 88.24 AAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCCTTTTGTTTTGCCAGCAACGCGAAATTTTCATTTAATGAAAAGCTACGCATCATCAAATGTTCGCACATGAC:1 + chr2R 14778535 3' + mdg1 7455 2 74.26 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCC:1 - chr3R 27775099 3' - roo 46 2 74.26 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAAT:1 - chr3R 16400166 3' + blood 7344 2 66.34 GTGGAATTATGTGGAAACTGGCTTTTCTAATAAGGTCCATGTACAATAGATTGGTGGCAGCTGTATAGGCTAAAATTGGATCCTCGATTGCACGTG:1 + chrX 22453342 3' - Fw2 281 1 58.33 AAATGNCCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGCACTCCAGTCAGTGGGGGTAGTCTGACATC:1 + chr2R 5950742 3' + mdg1 7414 2 69.31 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGCCCAACAGTGACTATGAATAATAATGATATAATAAACTACAACCGCGTTAGGAGTAAATACTACA:1 - chr3L 3032205 3' + opus 494 2 73.27 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTGCGACCTTCTC:1 + chr2L 16674921 3' - roo 8700 2 63.37 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAACGGGCACCTTGTTACTTAGTTTCT:1 + chr3R 6608858 3' - I-element 7 1 73.27 CACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACAACTTCAACATCATATTCTATATCAACATAAAAACACCGCACAACAACAACAACGACTCCAACAACAATTTCATCA:1 - chr3R 14830725 3' + mdg1 281 2 74.26 TTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACGAGCTTCTTATGTCATATGTTTTGAACCATTTAAATACATTGTTTTTATATTCCGCATTTTGGGATATTCGTAA:1 - chr3R 7413376 3' - roo 9047 1 80.00 TATTTGTTTTTTTGTTTTACTTTTCTCCTTTCGTTTTGCCTTCAAATCGTATGGTACTCCACGTTGGGCGCCATTTGTTTTTAGCCCCTCAACATATTTAC:1 - chr2L 16661758 3' - Doc3-element 172 1 69.31 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGA:1 + chr3R 11094578 3' - 3S18 24 2 54.08 GAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAAAAATGAAAAAAAAAATGCACGACAAATTGCATGAAAACTGTGTACGCGTGCATGAGCAATAAAATA:1 + chrX 6882193 3' + TAHRE 10410 1 61.39 AAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAAGGAAAAAAAGGGGAAAATACGAGAATAAAAGCAGACAGTCGAAAAAAGAAAATAAAACTCCAAAAAACTGAAGCGGAAG:1 - chrX 3310464 3' + Doc2-element 251 5 74.26 AATGTTTGGTGGGTCTATCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGTCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGAGCTTCCGTACACTGGCACTGGTAC:1 - chrX 11683752 3' - I-element 186 1 77.23 TAATANATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAGCTATAA:1 + chr3R 20137352 3' + Burdock 240 2 62.38 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAA:1 - chrX 10827401 3' + roo 389 2 57.43 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATTTGAAAGGTAAAGGCAATAACTAACTTTTATACAAG:1 + chr3L 18659090 3' + pogo 2067 1 63.37 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTATTTTTTTATATACAAAATCACCAAAACGAAGAAGAATAAATAATAAAGTGAGGAAAAAAGTG:1 + chr2L 12479577 3' + pogo 2095 1 77.00 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGGA:1 - chr3R 13225469 3' - hobo 3 1 76.24 TAACACGAGCAAGTCAGAAGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAATCCGCGGACCCACCTCCCCACCACCCTCGTCGA:1 - chrX 6647609 3' + gypsy10 5646 2 57.83 TGAAGNCTCTACTCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACACCCACCAGGTGGACACTCTTGTGTGGCCAACTATTGTCGGTAATGTGGATAT:1 + chr2L 9648445 3' - R1A1-element 5024 1 55.45 CGGGTATCTGATAGTCGGCGAACTCCACTATAGTATTCCCTCTTGTAATATAACTTACTTCCAAGCATTTCCAGTCTTCTTCTTTAGAACACAATGAAATA:1 + chr2R 1995440 3' + INE-1 555 1 55.45 TCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACATTTCCGTAATTTAACTATT:1 + chr3R 9550609 3' + P-element 2744 1 23.00 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACGAGGGCAGTTCCAATCTTACTGGATTTTCCA:1 + chr3R 24081626 3' - 297 6598 2 58.42 TGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGGTAGTTAAAGTGCCTGCGTAAAACGCTCTTAAATGAGCCATTAA:1 + chr2L 11703300 3' - Tabor 34 2 55.45 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTAAATTTTAATGCGCCCGTATCGATATGC:1 - chrX 1523986 3' - jockey 57 1 74.26 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTAC:1 + chr2L 8565506 3' - blood 52 2 77.23 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTG:1 + chrX 17042704 3' + copia 5076 2 73.27 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTTTGCTACTCGATAAAATGGTGCATTTTTGCTTT:1 + chr2R 8345593 3' - roo 8674 2 68.32 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTTTTTCGTCCTTTTCTTTTCAGGATCTGAAAATTTCTTCATACAAGTTTGCCAC:1 - chrX 14323551 3' + hobo 2931 1 67.74 TTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAACAATTCGAAAGCCATTAAAATTCAACAATTACTTACTATAAGAGTGCAA:1 + chr3R 19248967 3' - Ivk 5248 1 62.38 AGGGTCATGCAACTCATAGTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTTGGGGGGAAGGGAATGTCCTTACTGCTGCGCTGGCGTCGTGTCATCGTCATCAGCATTA:1 - chr2L 21849991 3' - Cr1a 4165 1 58.42 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTAATGAGTTCGAATATGGCCACGCCCCAAACATCT:1 + chr2R 17972063 3' + 412 453 2 66.34 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAG:1 + chr3R 19989332 3' - hobo 23 1 57.43 TAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATA:1 - chrX 15355077 3' - X-element 4707 1 57.43 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAA:1 - chr3R 6735278 3' - copia 42 2 65.35 TGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTCGGACTGCAACAGCCGC:1 - chr2L 13078482 3' - I-element 196 1 83.17 GTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAATACGCGTTGTTGGGCCCAGTTGGGTCTATGTTGTAGGCGCCGTTCTGGTAGTGGTTGCTGTTCT:1 - chr3R 29853870 3' - F-element 287 1 58.42 TTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCTTGAATCTCTAATCACTGCCTGG:1 - chr3R 19445211 3' + roo 207 2 76.77 TGCTTGCTAGTGTGAGTAAAAACAATAAATGAGCCCGTGGGCTGAGCAGCAGCTGTTTGCCCAAAGGCCGTCATAGTCGGCTTGGCGGCTCCAAAGGCGGG:1 + chr3R 23780717 3' - 1360 3251 1 74.26 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTTGTTTCGCTGCACGACTAAGTACTT:1 - chr3R 27430024 3' + pogo 2057 1 73.27 AGCACNAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAG:1 + chr2L 22079631 3' + gtwin 434 2 67.01 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCGTCATCGTAGAATAGGTGAGATGTGCAAATGGTTGGGGCGC:1 - chr2R 15474777 3' - roo 16 2 63.37 ATGAACGTCAAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTTGAAATTTATCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCACTCTTGTCGCTAAAAATGGGCAAGAAAACTA:1 + chrX 22838686 3' + INE-1 139 1 67.33 ACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTCGGGGCC:1 + chr2L 17646260 3' + flea 252 2 68.32 TACAGACATTAATGAATAAGATCGAGAATTGAGCGTGCTTGCGACAAAAGAATAGTAAACAAAATGAGGTTACTGGAATTAAATATATTCAAAAAACATTT:1 - 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chr2L 12120469 3' + gypsy7 5004 1 76.24 AATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATC:1 + chr2R 12457981 3' + roo 369 1 66.34 TAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTTTCCTCCATTTTACAGAGATTTCTTGCCGCGCGGCTCTGGTATCG:1 + chrX 15894700 3' + S-element 1715 2 71.29 AGGCGACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACGTGTCGCAACACACTTCAGCTACCACGCGAACAGCTTATAAAACTGCCCTTGCATCACATGCATT:1 + chr3R 26367481 3' + Chouto 456 2 62.38 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTAT:1 - chr3R 23638095 3' + pogo 2073 1 62.38 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGG:1 + chr3L 8363037 3' - 3S18 5818 2 76.24 TAATTTAATTAATAATAAATAATAATAATAATTAATAAATTAATTTAATTTATTACAATTCCCTTTTATTTAAAAGTACGGCAACAGAACGCATTAACGAC:1 + chr2R 4878299 3' + flea 234 2 37.62 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCT:1 + chr2R 20744208 3' + roo 359 2 75.25 TTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTACATACCTTCAGAATTCTAAACATCCTCTTTTATTATAGTATTGTTTAGAATAAAATCTCCGTCTTGCAATT:1 + chr3L 27412468 3' + mdg1 7070 3 75.25 TGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCCCGATAATTGATATTGTGCAGCCTGGAGTTGGGTG:1 - chr2L 14733319 3' + 1731 4565 1 65.00 AAAACTCACCACAGTGTGTCTGTGTAGTGGTGTATGAAGTACTTGAAATTATAGGGGAAGTTATGATCTTGGTGATTTAGGATCTGTATTTTGTGAGAGGG:1 - chr3R 4840263 3' + invader5 169 2 65.35 CTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTATGCCAAAAAATCGTACGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTAACATTCTGACCAAACCAGAGGGAAAT:1 + chr2R 8558961 3' - 1360 55 1 77.23 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGT:1 - chr3R 7522302 3' - blood 33 2 55.45 TTTTTTTTATTATTTGGATTACCAAGCCCCTAAATGTAACCTTATAAAGACCTCAAGTTTCATG:1 - chrX 6315149 3' - Rt1b 5141 1 76.56 GGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAA:1 + chr3R 6608834 3' - I-element 31 1 56.44 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAATAATTACATAGCCACCATTGACCGCCACTCTCGTTGTTATCGAATGTTTAAAATCGAATTTAATTACTTC:1 + chr2L 15001278 3' + flea 235 2 68.32 GTGGGCTTGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTAGCGCCGTTCTCATAAGAAAGTGTTGATGCTCGATTATTGGGTGTCAAGCCCGGCTGGGATAAT:1 + chr3L 21650428 3' - Ivk 5115 1 73.20 ATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAATGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCACAATATAATCATCGTCATCACAACGCACACTCGTC:1 + chrX 18371839 3' + Quasimodo 6986 2 64.36 TGTAAGCATAATGAACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGGGACAAAGTCACATTCCGTTCGGTTTCCCGATTATAATGTTGCAGATCCAGCTT:1 + chr2L 10301673 3' - Tirant 8287 2 52.48 CCTAATAGTCTAACTAGACGACTAAGTAAAGCCATCGGACAAGTACGAGAAGAAGATCCTGAATCTGGTGCTTAATCTACGGGTATTTAGTTGCATTCTGT:1 - chr2R 10378679 3' + jockey2 3108 1 56.44 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTT:1 - chrX 19162593 3' + pogo 2072 1 57.43 GAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTAGACTTTTAATTTTTTTATTCAAAATGAGTAATGTCACTTATCCT:1 + chr2L 17784693 3' + gypsy10 5950 2 56.44 CTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATT:1 + chr3R 26530924 3' - blood 7048 2 59.41 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACAAT:1 + chr2R 4483272 3' - Ivk 26 1 52.04 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATGACGTAATTTCGCGTTCGCATTCCTATCTCGTTTTTACTCAGATCCAGAATATTCAGGTTTCGTAGCTTCCAGAAGG:1 + chr3L 4804436 3' + INE-1 500 1 60.00 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAACGCGGCTCATTCATAGCCAA:1 + chrX 18837033 3' + P-element 2867 1 62.38 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCA:1 + chr3R 19346953 3' - 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chr2L 2454411 3' + Doc 367 1 79.21 TATGTGTAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTCAAGAACAAAGTGCCTCGA:1 - chrX 1764390 3' - Stalker 156 6 82.18 TTTGTAGATTGCAAGAGACCGTTTATTATAACTGATCATTTGAAACTAAAACTAACATACAAAGTATCGTTACTTTGTTTCTAACATTTTTTCTTGTGTG:1 - chr2L 23020159 3' - HMS-Beagle2 281 2 78.00 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAA:2 + chr2R 9871072 3' - roo 8675 2 68.32 ACTATTTCATTTTTTATAAAGTCGTATACATCGCGCAATGGTTACATTTTTTACAGATAAAACTATAAACTTTGTAAAGAGCAAAGCATTCTCTCAGTGTA:1 + chr2R 16725212 3' - Tc1-2 381 1 63.37 GGCGAAAAGGTCGAAGGGTAACGGTGCATGCACAAAGAAGACGCACAGTGAACACCGTACTAGAGGAGTCAGCAGTCAGGCAGCTCTCGGTCCGCATCCAA:1 + chr3L 23343924 3' + gypsy8 129 2 52.48 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCTTTAGTGTAGTACTTTGAATATATCATTACATA:1 - chr3R 14917197 3' - HMS-Beagle 41 2 69.31 GCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGCTGTGGGAGGAGAGGCGCATGCGTTGCGACCGCTATACGCGATGG:1 - chrX 6601762 3' - Doc 339 1 55.45 AGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAGTGACTCTTGTTTCCCCCAACCCGTCCAACTGAAATCCGAAAAAAAAT:1 + chrX 15306065 3' + roo 490 1 70.00 ATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGAAAGGCAGCCAGCGTATAGAGGCTGCTAGCGAGGCAG:1 + chr3L 8711622 3' + opus 7229 2 64.36 TTTGTTGAATAAAATTAATAGGGGTGATTGCTTTGGTTTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAATTAGTTTCATTAAAGGTTTTTTTTTAATTTGTTCCAAA:1 - chr2R 4608376 3' + Tc1 235 1 82.18 AATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCACTTACATATATACTTATATACTTATATACTTATATATTCAAAAAT:1 + chr3R 5241627 3' - rover 6978 2 64.36 CGCCTGAAGCCAAACTGGTGATCAGGGATCAGTCCAGCCTCGTCCAGTACTGGCATGACTCTGCGCAAAGTCTAAACCCTTTATAAATCCAATTACCCTAT:1 + chr2L 14982442 3' - G7 364 3 66.34 ACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCTTAGTCACAGCAAAATTTATCAGGCTAATACAGACGTGGTGCCAT:1 - chr3R 7387052 3' + HMS-Beagle 401 1 58.42 CATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGACAAACAAAATGCGTATTTATTTTGCAGTTAAATGGCTTGAATTCGTGATTCTTTCGTTCACTTTT:1 - chr2L 18115374 3' + Idefix 7063 2 67.33 TAAGTAATAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAGCTACCGCCTGCAAGAGTATTTCAAACTTCCCAACCCGATTATAT:1 + chrX 13977268 3' + invader3 5043 3 59.41 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACTAAGCCCAAGTG:1 + chrX 8972435 3' + 1360 3353 1 63.37 CGACGCAGGAATGTCAGGAGAGGCCGGATGTCAAGAGGAAGAGCATGAGGGAGGAGGGGCCAGGAAGGGGATCATGGACAACGTGACGTGCCACTCATCGC:1 - chr2L 16967328 3' + Bica 4914 1 56.44 ACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATG:1 + chr2L 2074785 3' + roo 387 2 60.40 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACT:1 - chr2R 8086882 3' + 1360 3350 1 71.29 TTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATATATATACATCTATTGCATTGGGGGTGCGACATTCTCCCTGAACAAGTTGTTGTAGTTG:1 - chr2L 2308623 3' + HMS-Beagle 7029 2 66.34 TTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGCTGGCTTTGTTATTTACACCGGCAACGAGAGACTATAA:1 + chr3R 31101362 3' - 297 3 2 68.32 ATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTGACTTTGCATATTATCTAAGACTAGACTACATTGCTCTTCAAAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTTT:1 - chr3R 19448410 3' + roo 8721 2 76.53 CGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGAGTGGTCCGTTCTGCTGTTTGCACAACTT:1 + chr3R 27801361 3' + Burdock 6373 2 61.39 TTTTTTTATTTTTTTTATTTTAAATGTTTTTTAACTCACCGCGTAAACAGACTATCGATCTGTTCATCAAGACTCAGCTAATAAATTTTGCTATGAACTGA:3 + chr2L 7535397 3' - F-element 4685 1 80.20 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGAGCGGCTGGAAGGACATATGTGGATGCAA:1 + chr3L 13548846 3' + hobo 2900 1 68.09 GCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATCGATTGTGTGTTCCTCTTGTTTACATATTGCTGCTTT:1 + chr2R 24936471 3' - 17.6 7342 2 66.34 ATACCCGTTACTCAGCTAGTGGGAGTGGTGGAGCGAAATTTCAAAATTCTTTTGGCATGTCCATTAAGTATGCATATAAATGTAAGGTATATATGTACATA:1 - chr3R 4679601 3' - INE-1 540 1 60.40 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAA:1 - chr2R 13644424 3' + Burdock 6364 2 55.45 CCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAAACTATGATCGAGGGGCAAATGCA:1 + chr3R 16400251 3' - blood 3 2 76.24 CGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCCAATTAAAGTGG:1 - chr2R 13295625 3' - Tirant 8107 1 81.19 TTAAGNTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAA:1 - chr3L 15100680 3' + pogo 2061 1 66.00 TAACTGTAATTAATAACTGGCCCCCGAAAAAATATATGGTATATGTTGGATCTGAATTACTTTTATACTCGGCATCACTCTCTACCGCGTCGGCGTAACGT:1 + chr2L 22490468 3' + HMS-Beagle 249 1 69.31 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAA:1 - chrX 21564689 3' + diver 174 2 77.23 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGGAGTTGCATGCATGTAAA:1 + chrX 3763215 3' - 297 6606 2 75.00 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGC:1 - chr3R 23638112 3' + pogo 2057 1 73.00 GGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCCAATTAAAGTGGC:1 - chr2R 13295624 3' - Tirant 8105 1 83.00 CCGCGNTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTATCAAGAATATATATAGTCTATACAAGTTAAATGCAGGATCATTGGTTCTTAAGTTCTCTTTTATAAATGCC:1 - chr2L 13154214 3' - Juan 10 1 65.35 TTATGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGTGTTGATGCCCGCTAGTGGGTGATTCCGAGGGTATATTGTGTTCG:1 - chr3R 27763517 3' - rover 6940 1 68.32 TAAATNTATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTTTCCACCACTTCTACGAATGGAGGATCGTCGATGACCAGA:1 + chr2R 14675638 3' - roo 8671 2 72.28 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCC:1 - chr3L 9383515 3' + P-element 2849 1 41.58 TGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCATTTAATATCTTTGGACAATATTTCGACGATGAGAATGACGATGGCATAAGCGA:1 + chrX 15926657 3' - Doc 491 1 59.41 GTTCGNCTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATGTATGAAATCCCGGCGTAATGAGCGACAGTTGATGATGCAGTGAATACAGCGGTAATTAAA:1 - chr2R 20952506 3' + rover 7290 2 76.00 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGT:1 - chr3R 16458016 3' + roo 9022 2 77.23 AGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGTAATGTAATTAGTTGAAAATGCATTATCTATAAAGATATATTTAAATCTATGAATCGTTTTATTGTTT:1 + chrX 21448860 3' - Doc 4558 1 66.34 CACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGGTGGTGAGTTGCAGCGGTCTCAGAGAGC:1 - chr3R 8277876 3' + P-element 2886 2 78.22 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAATCCGAA:1 + chrX 8491472 3' + P-element 2857 1 49.50 CAATTAACAGAACAATATTGAAGGGACTTGGATAATTACCTCTC:1 + chr2L 2142174 3' - Doc 171 1 90.91 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATATTACAGTGGAAGACAAACTAGATGTGGACTTGGCAGCACTCAAAACTTGGCCAAAAACA:1 + chrX 19986435 3' + Stalker2 7633 2 52.48 AGGAGGAGAGCTCTCCACATATTATATGTGACTGCATGGCCCTTGCCATTAAGAGGAACAAACACAAAACAAAGCTGCCAGGCTCTTGGACGCAAACAAGT:1 + chr2L 605478 3' + baggins 5222 1 62.38 CCGTATCTCTTTTGGGCACGCGCCATCAGCAATCAGACGAACTCGAGCGGCTGCGGCACGGACATATCCGACACCACGTCCGACGAACT:1 - chr2R 6932418 3' - G5 470 1 78.65 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGCGTTGACTCCT:1 + chrX 21017875 3' - 412 15 2 41.58 TATATGATAATTAAAGAAGATCGAAAAATCGGAGCTTGTTGTACTGTTGTAATTGTTGTTGTCACTCGCATTGCGGCTGTTTAATTGTCATTTCGTGTGCA:1 + chrX 11307645 3' - Cr1a 82 1 65.35 AACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTCGCTTTTTCTATG:1 - chr3R 19450001 3' + roo 13 2 77.23 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTTAATAGATCCTCAATGCACTTGTTTTCAAAAGTAATCAATGAAAAGGCATG:1 - chr2R 9854028 3' - pogo 30 1 54.46 GAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGAGATTTAGGTATTGTTGCTGTTACGTTTGTTATCCTTTTTTGGTTATGGGTGCGCTTAC:1 - chr3R 22960857 3' - I-element 5014 1 58.42 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGT:1 - chr2L 8565457 3' + blood 345 2 57.43 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGGACTTTTTTTCGTCCTTTTCTTTT:1 - chrX 14323586 3' + hobo 2894 1 74.74 GTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCGGGCTTCCTCTTCTGCTTCTTCAGCTTTTTTCATTTTTGGACCCGAGGTTTGGGGCTTTTCCGTGTCT:1 + chr3R 30880453 3' - Doc 4470 1 74.26 AAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGCTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTTTATCATAATATTGTATTAACATGTA:1 + chrX 22900309 3' + Tc1 1590 1 75.25 ATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAACTTCCAGTCGTTCTCCGGTGGAATCAT:1 - chrX 11953678 3' + Stalker2 22 2 73.27 TGCAATCGTACTTATCTGTTGTTGCCACTTATGCTGTCCAACGACGATAGCAGTTCCACCTCCTTGATGACGCCACCAAGAGCTCCGCGCATTTCGCAGGC:1 + chr3R 4414614 3' - rooA 7333 2 64.36 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCTATTGGGGATTTTGTTTCTTAATTAAATGAATATCTAAAT:1 - chrX 15305618 3' + roo 397 1 67.33 TTGCGAGAATATATAGACGCGATATTAAAAATCGATCGATCCATCAGAAATCAAAACGCAAAATCTCATTAATTTGACAGGGCAAAAGGACTCGGATTTCG:1 + chrX 17785955 3' - Cr1a 4370 1 73.27 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAAATGGTAAGACTGTTTGTTTTTACCATGCTTTTT:1 + chr2R 21073931 3' - jockey 4710 1 65.35 TTGAGCGTCACGGTGTCGTTTCGGAATTCACAAAAGTTCTAAGATTAACTTTTGTGGCAAAAATGAACTGTAAACATTTATTTCCTTCCACCTCCT:1 - chr2L 23188599 3' + Rt1a 128 1 69.79 GATGGGCATGAGTTAAATATGTGCACATCCTTTATTTTACTCCCGTTGCCACTATAGGCTGCAATTGTTATTGAACATGACATCAGAAAATGTCGTTGAAC:1 + chr2R 5991336 3' - I-element 5044 1 75.25 AAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAACCAATCCAAGAACAAATAAATACGCAGAAATACA:1 - chr3L 16839320 3' + mdg3 5025 1 65.35 ATTCTGATTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCCAATATGGACTTTATATCTAGTAGCTGTTCACAATACGAGATTTGTTTCGAGATTTTT:1 - chr2L 15063986 3' - Idefix 7261 2 56.44 CTTCGGAAGAGGACAGTTCTAGAACAGGAGAAGAGGTTTGAGAATTTTGCCCCCTTAAAATCCCCGACTGACGGAGCATACATAATCATTAATTTATGCAT:1 + chr3R 25671439 3' - Gypsy12A_LTR 2037 3 56.44 CTACTNGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACTGCACCACGAAGAGCCCCAAAACGCCCTGGAACCCCAAACCATTCACCAT:1 - chr2L 11598209 3' - Cr1a 4098 1 60.00 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCC:1 + chr2R 16940402 3' - 297 6607 2 62.00 TACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATACCAATACCACTACCATTACCCACGACAGTACTGCCCACATTGACTCATTC:1 - chrX 21207040 3' - mdg1 455 1 55.45 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCGGCACTTTCTGGCCGATTTTTTGGTCTTTTGTGTTTAT:1 - chr2R 19943893 3' + 412 7533 2 63.37 GTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGCTCTTGGCCTGGGATCGGGATGCTGGGCACTGGCAGGGCTTCCC:1 + chr2R 13649643 3' - I-element 4942 1 54.43 CTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGG:1 + chrX 20806917 3' - opus 7057 4 81.19 TTTTATTTTTTTTTAATTTTTGGGTGGAGCTCTGGTTTTTTGGGTGGCTCAATGGCGGCTTCTAAATTTGAGGGTTGCAAACTTTAGTAGTTGTAAGCCTA:1 + chr2L 16470751 3' - Doc 4696 2 47.52 CCGTGAATATAACCATAAAAGGTTTAAGACCTTAATGACACACATCCAATGAACATCATCCACACCACATACAATCCACAACACATCTGACACCACCACGC:1 - chr2L 11800777 3' + baggins 5064 1 64.36 CATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCAATTTCACTCCATGCCTGGCCAAGCTGAGCGCCAAAGCGCGG:1 - chr2L 1730160 3' + F-element 231 1 58.42 CCGACACGGCCTTCCTGACCTATCACGAGCCAAATAAAAATATAGGAATTTTATTTGAAAAGTGTGAAAAGCTTAAGGGTATTACTCTCTATATCCAAAAC:1 + chr3L 6869916 3' - invader1 3594 2 56.44 GCCCAAGAAATTCCCGTGAGTTAATAAAAAACAAAAAAAAATCACGGTCGGCAATATAGTTGGATCCCTCCATTTCATCGATGCCAAATCGAATGATGAC:1 + chrX 20954534 3' + HMS-Beagle2 436 1 60.00 ATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACTGCGCATTTTACGAGGGTTAGGCAACACTAAAGTGTTGGA:1 - chrX 21339663 3' + copia 15 2 60.40 TCTGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCAATCAACCCTGTCGCTCTATTGTGTTCCGGGATTTTG:1 - chr3L 13137485 3' - R1A1-element 5081 1 63.37 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATTTTTAATATCAT:1 + chr3L 17921226 3' - 297 5 2 73.27 AAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCTGGGAATGCGGTTGAATCGGTAATAAATTGAATTAAAGAAATTCTTTAAAATGTTCAAAGAGT:1 - chr2R 2309711 3' + hopper 49 1 68.32 AAATAGACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCT:1 - chr2R 1320710 3' + diver2 318 2 65.35 GGTGCGAAGGGAGTCGGCGCTCGTCTTGGTATTTTTGCCGCTGAGCGCTTGTTCGTTTTTCTATTTCAGTCGAATGGTCCTTGCAGCGGGGCACTGTTCTC:1 - chr3L 17704020 3' - Doc3-element 266 1 66.34 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCGTTGGGATGCTGTGGTGGCTCAACAGAGATCTGCGGAGACGCAGGTGAATGAATGCCAATGCTAACAGTGA:1 + chr3L 15581300 3' - 1360 9 2 76.29 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTT:1 - chr2R 20739432 3' - roo 8687 2 57.43 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGACACTCCAATGACAGATGTTATTATTCAAAATGATTCCAAAGCTGCCTAGAATCAGTAACCGGCTAGCCAGC:1 + chr2L 15947480 3' + Transpac 5223 2 73.27 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGG:1 + chr3R 15072629 3' + pogo 2051 1 78.22 AAAAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGT:1 + chr2R 14498591 3' + Doc2-element 96 2 61.39 TTAGGAACAGAATCCATAATATCTGTTAAGCTACATTTTAGGTCAGTACTATGAAGCAACTCGGACGACTTAATCGCTTTCAATTAGCTCCTCAACGACAA:1 + chr2R 4339733 3' + G5A 2756 1 59.41 AATTATTATTATTATTATTATTACTTTGGGGACTCCTTAAACTTTTATCGCGCTGGTTACGTTAAAAAATTTCTATGCTTCGACTTAATTTTCATTCTTTT:1 - chr2R 17990320 3' - mdg1 7081 2 77.23 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGT:1 - chr3R 31458420 3' - jockey 36 1 53.47 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAAC:1 + chr2L 14790643 3' + roo 9034 1 61.39 TTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACA:1 - chr2R 5953781 3' - accord 445 2 68.32 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATA:1 - chr2R 5953079 3' - pogo 20 1 59.41 TCACAAAAGTCTCCACCCTCGATCTCGGACTTAACTCGCGTGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAA:1 + chr3R 6117290 3' + Tirant 384 2 56.52 ATATATTTACGCATAAAGTAACCAAATTGTCTCCAAATAATCAAACTCCAGCTGACTTTAAAAGCCAAATAGTATCTGTTGACTGCAACGCTTTCTTGAAT:1 + chr3L 23784975 3' + Transib5 45 1 66.34 AGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAA:1 - chr2R 3919681 3' - 1360 49 1 71.29 ATGCACTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCACTTTTCAGCAGCAACAAAGGGAATAACGAGAACAGCGACAGCAAGCGACCACTTTGCTATTATTTATGTT:1 - chr2L 17106487 3' - mariner2 197 1 73.27 ATGCTGTGGATGACCCCATAAAGCTCTATAAGACGATATGAAATACAGGTTATGGAGGAGAAACTAAACTCCACCAATGTGGAGGTGATGACCATGACGAA:1 + chr2R 17413618 3' - gypsy4 6450 1 56.44 AGCCAAATTGCGAATTACCGTTGCATTTGTCTTGTTGGTGTAGGCCGCCATTTTGGCAATTGAGGCCACTGCGCATGCTCACCATGACACAAAGAGAGGC:1 + chr3L 7216029 3' - Tc3 162 1 73.00 TTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCACTCTATTCTCCCCCAGTTCTTTCTAACTCTCGGCCTTTGTGGCCAATTAGCTGCTGCCA:1 + chrX 4379894 3' + Bica 115 1 68.32 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATTACCTCAAAATATTAAAGTTCTTAACAATTTGTAAGTTTAATGGG:1 - chrX 21204949 3' + mdg1 7426 2 58.42 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAATTTATATTGAGA:1 - chr3R 26530860 3' + blood 7357 2 54.46 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTCGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGA:1 - chr3L 18500941 3' - hobo 24 1 51.49 ATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTGGTTGTTAGTGGTTATTTACGAATGCATCTACACAATGCACTTTAGTTAG:1 + chr3L 12122480 3' - Quasimodo 7191 2 54.46 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACATATAGTTTATAAAAATATTTCACATTTTGATTGTTTTCT:1 + chr3L 13060385 3' - 412 7090 2 64.36 AGCACTCAACAATCATTGCCCAAATAATTTTTCACACGCCGTAAGATGAATACTCTAATGATATAAATATTCTTATATAAAGTCAATTTTTAAATTTATTT:1 - chr2R 5260085 3' - 1360 449 1 87.13 ATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTAATCGAAACTGTTGCAGAACTTAAAGAATTGAACAACAAAGCGAACAAAGTAGCACA:1 - chr2L 14918128 3' + 297 440 1 63.37 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTT:1 - chr3L 2019663 3' - 412 39 2 64.36 AAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACG:2 + chr3R 17321763 3' - Stalker2 50 2 73.27 ACTAACACACACACACACACACCCATACACGCATACGGATATATGCCGACATGCTCTAGATGGCAAGCGCGTCATACTTTACTACTTACTAAATCCATTAC:1 + chr2L 15778430 3' + Quasimodo 35 2 77.23 CGCGATATGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATATCATGCAAAAAAAAGGAAAGGAAGCAGCGGATAAAAAGAGAGGAGCTAAGAAGATCGATGTT:1 - chr3L 25725598 3' - Cr1a 4353 1 60.40 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTAGCCTC:1 - chr2R 16940333 3' + 297 6941 2 69.39 AGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATCACTGATCTTAGTGTGCTCTCCATTATTGTTGTTATTATTGTTGTTATTGTTATTGTTGCTGGCGC:1 + chrX 12498300 3' - mdg1 7370 2 51.49 AGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGTTCTGCTTCACAACATGGGCACCCTGTGGAAATATACGAGTGTATTCTCATTTATTGTCTTCTCCAAAAAGTAGA:1 - chr3L 25411862 3' - Doc 383 1 74.26 TCTTGNCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATATTTTTTGTTTTAATTATCAAAAATTTTTTGAATCCACCTCCTAATT:1 + chr3R 7902985 3' - pogo 26 1 57.43 AGCCCGAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGAAAAATAAGAGCGCGTGCCAATGAACTCTGTGGTCAAAAGGAAAAGA:1 - chr3L 16761250 3' - roo 8691 2 51.49 AACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACATTTTTCATCTTGCCCATTTGGAGGACTCCCGAAAATTGCAAATAATTATTCTGGCCACTGGTGAGCTCATC:1 + chr2L 19516341 3' - opus 231 2 73.27 TAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCGTGAGCACTGTGAAATCGAAGGTATCTCGCTTCATCAACATCATATCCAC:1 - chr3R 18382043 3' + BS 4865 1 50.50 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGG:1 + chr2L 17646243 3' + flea 4994 2 51.49 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAG:1 + chr2L 14612076 3' + roo 9016 2 77.23 AAAAAAAAAATAAATAAAACTTAATACGATATTGAATTTAATTAAAGCCGTTAATAAACTTGATCATGTTTCCCTCGGAAAAGCCCCATACAT:1 + chr3L 5270047 3' + HMS-Beagle2 490 2 75.27 ATTAGGACAAATTTAACATTTTAGATACATCCAGGATAGGGTATTCATTGAGGGATTATATGTACATATATCTTGAGATTGGACATGAGTGTTTTTCCTAA:1 - chr3L 7111509 3' - 1731 4261 1 84.16 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTTAACCCACAT:1 - chr3R 20477026 3' - 412 18 2 61.39 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAAC:1 - chr3L 17168842 3' - mdg1 34 2 59.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAAC:1 - chr3R 23275254 3' + roo 9043 1 57.43 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTCTTATTATTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTA:1 - chr2R 7418829 3' - Doc 43 1 62.38 GTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGTAGGGAGAGCACAGTTGCGTCAACTCAGCGATTTATCCATCAAATGTTCAGTTTTAACATGCAATGCATTAACTTTTG:1 + chrX 1235178 3' - blood 7179 2 70.30 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAACCTACTAGGTACAAGACTGAGTGTGCTTTACAACACTAAACTGTTGGCGAGCTTTCCTCTGTTTCGCAGC:1 - chr3L 4122399 3' + P-element 2883 2 81.19 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGCCCTCCTGACTAACTAACTAACAAACAGCGACGCAC:1 + chr2L 16201597 3' + hobo 2937 1 78.72 TATAAAAAATAAAATAAAAGAAAGGCAGGCAGCACAAAGTGGCACATCTGAGATAAACCCACTTTGTCGTCGTCGTTTCTTCCTTTCGCTCGCTCTTCGCT:1 - chrX 9331105 3' - transib1 1903 1 59.41 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACG:2 - chr2R 8345511 3' + roo 9030 1 66.34 CTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAAGGAAAAGGAAACATGGCAGCCATTGTGGAAAAA:1 - chr3R 11285484 3' + F-element 489 1 74.26 AAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTGTTAGAGGTTTGGCAATTTTTGCATAATTTCGGACAAATTTACGGTAGTAGCC:1 - chr2R 2879995 3' - TLD2_LTR 46 1 52.48 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGGCCAGCTG:1 - chr3R 27283994 3' - Max-element 8258 2 48.45 CGTATGAACGTCAAGATCTCAGGCCCTGTAAAAGCTAGAATGCATAAATATGAGGGACTATTATAAAGCCTACGCTAAATTAAATAATAAATTTTGAATTT:1 - chrX 23070543 3' + INE-1 136 1 63.37 CCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGA:1 - chr4 311209 3' + 1360 3362 1 57.29 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTATGCAAATTCCC:1 - chr3L 4801514 3' - roo 39 2 64.36 AAATATTTTAACAAAAAAAAAAAGGTACTTTCTTAAATATGAAAAGAAATTTACCTGAAATTTCCTGTTAAATGGTTTTT:1 + chr3R 11186946 3' + TART-B 10508 2 82.50 GACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATGGGAAGTGTCCTAAAATATGAATGATATG:1 + chr2L 12475050 3' - mdg3 5274 2 59.41 ATTTAAACATTTAAAAATTTTTTGCAGTATAGCTCATTGCAAAATGAAATCCAGTCATATATAAAAAACCGTCTAATAAATGTTTTAATAGCATTAAATAA:1 - chr3L 6104001 3' - Tc1 57 1 44.55 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGATGCTGA:1 - chr3L 7205536 3' - Doc 38 1 53.47 CTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTGATCTAGTGCTTTCGAAACACATGTCAATGAGCATGCATTATTTATGGGAACCCAATTGAGTGG:1 + chr3R 29354451 3' + Cr1a 356 1 64.36 AGTTGGGAAAATCTATTCTAGAATTAGTATAAATGTTTTCTGTATCCCGTAAGACCGTCTACAATGTTTTAAATCGCTATGACAAAGAAATTGTGTATTCA:1 + chr3L 23786114 3' + S-element 459 1 77.23 AATACATTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGGAGAGAAGGTGGAAGAAAATCTTGACTCGTGGCGGACCCCGAAGATTGGAGAAGCTGAGGGAATTCGTCA:1 + chr2R 21952357 3' - Max-element 8356 1 61.39 AAGTACGGCTTTAAATCCTATTCCTTCTCGTTTCCCTGCATTTTTTCGACCACCGACCTTGATTAAGCTGTTGGGCGTGTTGCCCACTGGCAGCAGCTGC:1 - chrX 5457813 3' + Max-element 382 1 78.00 GTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGCTAATTGTAAATGGAATGTAAATGAAACTTTGGAGAAGACGACAGT:1 - chr3L 21484859 3' + Cr1a 208 1 66.29 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCT:1 - chrX 22855217 3' - P-element 43 1 36.63 GTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTTGTTTTGGGTTTTTTTATATTTTGGCAAACTTCTCGGGTGTCAGGGAGGAAGTAGGTGT:1 + chr3L 13055147 3' - F-element 4459 1 65.35 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAA:1 + chr3R 19446211 3' + 297 350 2 72.28 CTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATT:1 - chr3R 7168559 3' - flea 24 2 55.45 TCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGC:1 + chr2L 12815089 3' - hopper 51 1 72.00 TTTTTGTAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTGGCTGGTCCGGACTAACGTGGCCGTAAATTTAGTTTCAGTTCTGTTTCAGGCACCGATATT:1 + chr3R 28341528 3' - accord2 7455 2 64.36 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAATCCGAAGCAA:1 + chrX 8491476 3' + P-element 2861 1 53.47 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTATACCCAACCGCTGGGTTCGGGAAAAATCT:1 - chr3R 21296564 3' - P-element 46 1 33.66 ACGCCCACACTTTTGAAAAATGTTTTAATAATGCAAAAGCCGATCTGCCACGTTTGCCCAGACCCCAATCAACGCAGCTAAAATATTTAATTTGGCCTAAC:1 + chrX 20043700 3' + INE-1 254 1 77.23 GCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGATTGGTGTAGGTATGGTAGTTTAGTAA:1 - chrX 20359086 3' - accord 317 2 79.21 AAGAAAATAAAAAAAAAAGAAAACTCCGGCTAGATGGAGTGTTAAGATAAGAAGGTAGGACTTGTTAACTGACATTACACCATTTACATTTGTAGTACTAA:1 + chr3R 13998332 3' + Doc2-element 226 2 69.31 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATTTGT:1 - chr3R 27981668 3' - roo 8702 2 68.32 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTTGCAACCAAATCGATTTCACTTTCCATTCACATTCACATCATCGCA:1 - chrX 3305114 3' + transib2 2817 1 68.32 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGCCTGTTGATCCTGATCAATAATATATATATGTCGAAGCGTCATCAGGACG:1 + chr2R 4284687 3' - 1360 16 1 66.34 TCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGGAGCCCGAAGCCC:1 + chr2L 12815101 3' - hopper 40 1 60.40 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCC:1 + chr2R 23580802 3' + P-element 2835 1 25.74 CGTCTTCTAGCACAACACGCAACACGCACATAGAGACGCAATCAAATAATTTAAGCCATGACATTGTTTTCACAACGAAGTGAACTTATGCTTAAGTAGAA:1 - chr2R 17882626 3' + 1360 3205 1 77.23 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGACAAAGAGCCTCACCCACAG:1 + chr3L 13453639 3' - jockey 4794 1 78.22 TTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATAATAAAAAAGTTTTTTAAATGAATGATTAATGTACACGCTTTTAAACTGAAATCCTTGGCAATTATTTACTT:1 - chr3R 15377974 3' + Rt1b 5126 1 69.39 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCATGCGGGTTCGCACC:1 + chr2R 20744257 3' + roo 409 1 73.27 CAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCGAAGGGAAACTCGGTGGTGAAGTTCGTGAGGAAC:1 + chr3R 11800639 3' + Quasimodo 282 2 69.31 AAGATCACCCATTTATGCTTCAAGCTAAGTCAGCATTCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGTTGGTGTAACCTCTTTAAGCCGCTTAAAGG:1 + chr2L 7280206 3' + blood 7109 2 70.30 TTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGAAATCGCTGGATCTTCCTTCTATGTGGAGTGCTTGCCCCTTTCCCTGAATCGTAAGAGTGTTATTTCGGTAG:1 - chr2L 14981950 3' - G2 2734 1 60.40 AATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATTTTTAATTTTTAAATAATATAATATTTCTTTGGTGTGCTGTAAGAT:1 + chr2R 959953 3' + mdg1 7132 2 74.75 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGGGTGTTGGCTAAGTGCTTAGCCGTGTCT:1 + chr3R 23834886 3' + roo 9022 2 73.27 GCTTCAGGATGGCCTTGTACAGGAGGAGTTTTAGGTTTTCCCTAAGTTTGGCCCCTTTTCTCCGCTTCAATTTGAGTGCGACGAAGTGTGAGATGATGAAT:1 + chr2L 14294660 3' - G-element 3884 1 55.45 TATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTTATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTAACTTTGCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 15 1 84.16 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTC:1 + chr3R 7522378 3' + blood 7370 2 57.29 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAA:1 - chr3L 12888241 3' + mdg1 7407 2 78.22 CAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTTGCAGTTTCGAAAAGGCCTTTCCACATTTGCATCCATCAGATACACCTAA:1 + chr2R 15550486 3' + Doc 4417 1 61.11 GTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCACAC:1 + chrX 2649920 3' - Tirant 2 2 79.21 TCATCTATTCATCCTCACACGAAATTAGAAGAAAAGGATCGGAATCGCAATTAAAAGCACAGAGGCATAACGAAAAAAGATATAATAATAAGAAAAAAGAA:1 - chr2L 20851869 3' - micropia 5135 2 76.24 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTAAGTTTCAGAATATTTGCAAATCTCTGTCGAGATT:1 + chr2R 7775840 3' - Transpac 34 2 73.00 GTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAGACAACATTTTAAATTTATATAAGAAAATCCCAGCTG:1 - chr2R 4426807 3' - G4 3623 1 63.37 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCA:1 - chr3R 25097866 3' + P-element 2828 1 21.78 ACGAGNAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTATTATTTGTTCG:1 + chr2R 12458010 3' + roo 398 1 71.29 GAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTCTGCGCTTCGTGGCAAAAATTTATTTTTTCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAA:1 + chrX 6688963 3' + Cr1a 9 1 60.40 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTT:1 + chr3R 10147880 3' + roo 9023 2 74.26 ATCAGNATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATTTATTGTATGCCCCCTATTATACAAATAAATTTCTATTT:1 - chr4 914118 3' - invader4 2795 2 73.27 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTGCTTAATCAAGTGAAATTGAATCAACTTTTTCAGTCTCCGGAGACAAC:1 + chr3R 19530713 3' - BS 25 1 52.48 AACACTGTCACGCCCACACTTTTGATAACAGATTTAACTTTATTTTTGTTCTTCCAAATTATTTAAGAAAAACACTTTTGGCCGTCCTTTAAATTATTTTT:1 + chr2R 5140481 3' + INE-1 245 1 63.37 AGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTG:1 - chrX 20806871 3' + opus 7467 2 69.31 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAACCCATCGCTG:2 - chrX 15293431 3' - Quasimodo 32 2 50.50 AATTAGTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGTTTAAAATTGAGTTAACAAAAAATATAATAAGTCGTTCGATATCAGGTTTCTCTTTTAGTC:1 - chr3R 24051117 3' - HeT-A 5961 1 62.38 AGTCGAGTTCCCCGACTATCAGGTACCCGTTAAGAAAATTATTTTTTGAATTGTAAAAATAAACATAAACCTAAACATCAATAACCTTAATAATCTGA:1 + chrX 17232332 3' - INE-1 562 1 57.14 TTATTNTTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGACAAGATGGG:1 - 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jockey 4759 1 76.92 GGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGC:1 - chr2L 18279875 3' - gypsy5 6949 2 69.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCAT:1 + chr2R 20744228 3' + roo 9043 1 57.43 TATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTGACCAATTTATCAAATAAGGGAAACGCCCACCGTCGAAACCCTTTGACGG:1 - chr3L 6116502 3' + I-element 258 1 57.43 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGA:1 - chr3R 13375938 3' - 1360 2 2 75.25 CTGATAGTCGGGGAACTCGACTTGTAATTTTGCTATTATAATTATGATATCCAATGCCGTCGGCGGGCCTTAGATACCAAGGATTTAATATTGTTTTGCCA:1 - chr2L 12672803 3' + INE-1 562 1 71.29 GAAATCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACATCCGCTTGATCTCCCCCTGTGCTTTAACTGCATATTTTCGTAGATGTTTATGTTACCGCAATCGAATCCCCT:1 - chr3L 14064451 3' + G-element 4153 1 60.40 TAATAGTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGT:1 + chr3L 10013618 3' + hopper2 1550 1 78.22 AATGCAACAATACAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAA:1 + chrX 22945331 3' - 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mdg1 7046 2 72.28 CAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGGTGAATGTATGTGACTGACGACATCCGACACTA:1 - chr3R 6233037 3' + Stalker 7140 4 67.33 GGCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTG:1 + chr2R 5840686 3' - Ivk 36 1 55.45 ATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTCATTTGCAAGCTCGCCGGCTAAAGTCAAGCGCTTCCAAAATACTGCAAATAGACGACATACCTAGTCGGT:1 - chr2R 3037212 3' - F-element 274 1 73.27 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCCGGCACTGGGCCAATAAAAAATCG:1 - chr3L 22039704 3' + jockey 4961 1 55.45 AAACCCACTCTTAAAATATTTAAGATTCTAAATTTCTATATTCTAAAATTAAATATTGGCCATTAAAAAAAAAGTGAAAAGCACAAGCAAATGCAGTGCG:1 - chrX 5834917 3' - NOF 215 2 76.00 GGACCTGCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCCAAGACGGAGACCTAGGAATTTCATTACAAA:1 - chr2R 7552227 3' + springer 378 2 68.97 AAATTAAAATTAAAAATCAAACTAAAAAAGGAATTTCCTTAAAGCAAAGGTTCCATGATCTTCGACTTGATTTTCCTCCCGGTGCTGGGAAAACTGCGATT:1 + chr3R 18525689 3' + P-element 2642 1 80.20 ACTCAGCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAG:1 - chrX 21531019 3' + roo 393 1 54.32 ACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCATATGCGTACTATCAGACATCTGTACTGGGATATTTTAAATTCGCTTCTTAAAAACACCAACCAACCA:1 + chrX 21021971 3' + gypsy11 63 2 67.33 AGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCA:2 - chr3R 17495744 3' - Quasimodo 16 2 64.36 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCCAACTTTTG:1 - chr2L 8565444 3' + blood 7370 2 59.41 ACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTCGTCGAAGAGTCTTGCTGGTAAAATCTTAGGACACTGATTTTGTTGC:1 + chr3L 26351671 3' - G4 3658 1 57.43 TTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATCAGCTTTTCAGCTACCATTTGGGTGTTAGTTTTGTTTTAAGATCCAATGATGAGATCCTTCAAAGTTC:1 - chr2L 9774249 3' + 412 7538 2 71.00 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGGGGACGGAGAGGGCGAGTGGGTGGGTTTGAATGGAAATGATTATGGCACTCAAGAGAGACATCAAAGAGAGTTACCA:1 - chr2L 9448651 3' + hobo 2899 1 58.42 CCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCAAAGAGCAAATCAAAACGATTTTCAAATGCAACACACACTCACCCACTAAAAAAGCAGGAAAA:1 - 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chr3L 10081934 3' - rover 27 2 58.42 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGTATATGGGTATTTGGTATTACCTGAAGTCTGGCTCAGTCGCCGACGATTTTCAGTCCGCTGGCGAACGTT:1 + chrX 17830826 3' + P-element 2883 2 76.24 TAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATGGAAATTCTAAACAAATCGTCTGATCCCGATCAGAATAGTT:1 - chr2R 966155 3' + I-element 5323 1 59.41 AATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGCTGGTTGTAAAAATGGCAGTAACTTTAGAACACACACAAATGTATTAAGTTTTAAAAGGACTGTACAAG:1 + chr3R 6782517 3' - I-element 5112 1 71.29 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAA:1 + chr2R 23580797 3' + P-element 2830 1 20.79 TTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAAT:1 + chr3R 2424350 3' - F-element 4382 1 59.41 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGGCTACATGGATAATCATCAGTTGAATAAAGCTAGCATTAGCAAATAACACGAGTCTAAGACACTCACACATCC:1 - chrX 8440289 3' - 1360 56 1 79.21 TCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTCAAATTCTGAATCCTAATCCAATCAACCTCGGCGAG:1 + chr3L 26510345 3' - mdg1 352 2 64.36 TCTTGCTTGTACAGATACGTTTTCGCTACAGACATTTCAGACGACGAAAAATGAATTTAAATGTAGATATTTTAAAAAGGCCCAGTAAGTTTCCCGCGCCA:1 + chr2L 22629713 3' - Gypsy12A_LTR 2157 1 69.31 TCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTG:1 + chrY 3648889 3' + 17.6 7391 2 63.37 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGA:1 - chr3R 20477049 3' - 412 34 2 61.70 ATCAAGTAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGTAAGCCAGACGTTCG:1 + chr3L 18706967 3' + jockey 4987 1 75.25 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAGACTTAAATGTTTACCACACGTAT:1 - chr2R 14708967 3' - Doc 35 1 55.45 CCTGAGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACCATTTCAGCCCTGAACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGATAAAAAATCGAAGGAGTGC:1 - chr3R 29381664 3' + baggins 5286 1 81.19 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAAAGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGATATTTTCCCATTTAGCGATTTTT:1 + chrX 19426309 3' + mdg3 5476 2 54.00 TAGCTTGCGAATTTGAACCTGATAAAAATTCTTCAGACACTTGCTGATTGTGTTTGATTGTTGTCTTGGCCCCGTAATTCGCTGACTTTATTATGCCGTCT:1 - chr3R 24464320 3' - hopper 265 1 64.36 TCAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTTGGTTGGCCCTGTCTGTGTATGTGCCCTGCAATTTGTTGTAACCATTTTCGTTGCCTACTTTTCCGGGCA:1 + chrX 16532040 3' - accord 7032 2 81.19 AAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTG:1 + chr3L 15099638 3' - G4 3813 1 37.62 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTCCGAGAGTGCA:1 - chrX 21017787 3' + 412 449 2 67.33 ACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCGACAATCTGCTGCTGTTCAACATCCTTGGTCTGCCC:1 + chr3R 8089256 3' + accord 7110 2 70.00 CGGTCATCATAAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATATGGGAACTGTTGCTGCAAACGGCAAT:1 - chr3R 7386626 3' - HMS-Beagle 6744 1 73.27 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGAAAT:1 - chr2R 20739459 3' - roo 49 2 77.00 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATTATCTAAAAAAAATTTTTTTTAAATAC:1 + chr3L 10972764 3' - Max-element 52 2 74.26 CAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTAAAACAAG:1 + chr3R 4544096 3' + flea 5012 2 78.00 AACAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAACAGCGCTTTCGAAATTTATAATCCCTTTCGTAACGAG:1 - chr2L 11805870 3' + Doc3-element 165 1 62.24 CGTACGTGTAGAACTCACAGTTATGTTCCTTGAGTTGGTTACAAGCTCCACCTTATACAGTTTTTTATTCGCATTTTAATTGTTTTTAATCTACTGCTAGC:1 - chr2R 7999818 3' - Juan 497 1 51.49 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAA:1 - chr2R 5950690 3' - mdg1 7074 2 62.38 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATCTCCGTTTACGACGGGAATGTAGTTGGCGTGGGAAAAGTC:1 + chr3L 4549221 3' - copia 38 2 63.37 TGTTTGCTTAATTAACGAGGAATCGATACGGCGGACAGCCGCTTAGCGGTCGATTTCGAGCAATTGAAAGGTGGCAA:1 - chr3R 30666658 3' - Tom1 71 1 53.25 GTTTTNAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCCTTTTGTTTTGCCAGCAACGCGAAATTTTCATTTAATGAAAAGCT:1 + chr2R 14778508 3' + mdg1 390 2 56.44 CTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAATTTTGCTGATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATG:1 - chr3L 16121851 3' + S-element 249 1 97.03 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTG:1 - chr2R 24628780 3' + mdg1 368 2 80.20 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCT:1 + chr3R 29288754 3' - BS 5039 1 64.36 CGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCACAATGTCTAGCAAATATCCAGGCAGCATGTGATAGA:1 + chr3R 12394577 3' + F-element 4423 1 63.00 CGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGTATTCGTATTGGTATCTTTGAATTTCGAGTGGTATTTGTTTGGGCGGGGATTCTGGTGGCTTTGCTGGATGT:1 + chr2R 22744915 3' - Doc 4530 1 72.28 TTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGCAAAAAACATTTTATAAATTAGAGCAACACTTGCCG:1 + chr3R 14505455 3' - F-element 4578 1 64.36 AGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGACAGGCTCAGATGGCGGCAGAAACACAACCAG:1 - chr3L 24514791 3' - R1A1-element 5049 1 69.31 GTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGATGTTGAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGTCGCTGGTCTATTTCCC:1 - chr2L 356785 3' - I-element 5106 1 78.21 TTGGTATGTTTTTGTAGTAATTTTGTAAATGCTTTGCGCGTCCGCTTAATTTGAAATTGATTTTGTGTAAAGCTGAAACGTAGTTTTACAATAATAACA:1 - chr3R 4091283 3' - I-element 213 1 60.61 TGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTTTCTTTTGTTTTGGAGTTCAATTGGTTGGCTCTGCAGTATCAGTTTCATTTTAAGTTTAGCTTTTGTTGTA:1 - chrX 3489663 3' - Porto1 215 1 65.35 AAGGTCGTTACAATAAATAACTTTCTTAGAGAAGTTTAATATGTTTTCACCCTGCACTATATATTCATTCTTTTTTGCTTGTAGTAGGTGCCTGCGCATGA:1 - chr2L 15739795 3' - I-element 495 1 64.36 TAAATTAGGCGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAGTTGGGGTTTATTCCACATTCTGTGCTTTCAGCTGATCCCATTTAGCTGATAA:1 - chrX 2181016 3' - Idefix 190 1 64.36 TCAGTNGCAGCAGTTGCGATGCCCATAGTGCAAACCGAAATTTTGCCGTATTTGCCCAGACAAAATGGCGACGCAGGTGTCGGTTTGCCGATTGTCAGTTG:1 + chr3R 13169498 3' + diver2 4606 2 74.26 AAATAAATAATACCAAAAAAAATAAAAAAAAGAAACCCAAATATTTGCCATAATCAAATAAGCTAGAAAAACTATAGAGCTACCATTTGCTGGAGGCAAAG:1 - chr3L 10442844 3' + BS 5094 1 80.20 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAGACAAAATGGATTTTC:1 - chrX 6379127 3' + hopper 1392 1 57.43 TTAAATTTTGTTTTATTTTATTTAAAAAAAGTATTTATTTACATTATACTAGGTTTATAAAATAAACCTCTGAACGCAGAAAATGAGTTTTTTGTTTTAAA:1 - chr3L 11626231 3' - HeT-A 323 1 87.13 AAAAGAAAAACAAAAAAAAAAATCGAAGGCCTGCTGGGGGCTGGGATTTTACG:1 + chrX 14334780 3' + Doc2-element 218 1 86.79 TTATTTGGGATTTTACATTTTGGTTTACTATTAGTTTGCGGTAATCAACTAATAAACATAATTTTATATTACACAAACAAAATGGCACAGGTGTGCACATT:1 + chr3L 7906534 3' + roo 413 1 73.27 CGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGAGAACAGTGCCAGTGAGCATCAGGAACGGCAATACGAGGTACATCACTGCAAGTGA:1 + chr3L 25847285 3' - Idefix 7092 2 58.42 ACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCCCACTTTCTATTGCTTCCAGATCGACATGTCT:1 + chr3L 3327850 3' + Quasimodo 71 2 69.31 AATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATACATATTTATATTTTATATTTATATATATAAAAATATTATAAAAAAAA:1 + chr3L 17487856 3' + Quasimodo 7340 2 72.00 ACAAAATAAGTAAGGAATTGAAGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATTTGAATATTCTAATGTCTTTGGTTAAAG:2 + chr3R 4577559 3' - Tc3 113 1 78.22 ATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAGTAGCGAGGAGGAGCTCAAGGATTGGATCACCGCCCTGCAAACGGTGGCCTTCTGTGACACCTCAC:1 + chrX 7325776 3' + hobo 2589 1 74.26 GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTCACCCAGTTGTACCAGAGTCTGGTGTGCCGTGCCGCCAAGAAGATTGGCGAGGAGATTGCTCGCTTG:1 - chr3R 27698507 3' + 1360 194 1 73.27 AACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACCCCTTCAAAATCAAAGCCCTCGCCATTTGGTACACGTTT:1 + chr2R 19083948 3' + Idefix 329 2 62.38 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAACTGTTTCTCTGTTCTGTGGCAAATGA:1 + chr3L 23255836 3' + blood 295 2 71.43 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACCGAAAGTGTTTCTAGCAAAAAAGCCC:1 + chr3L 6044793 3' + Tabor 438 2 76.24 TTCTTATTTTTTTTTTTAACTTTCCTTTAACTTTCGAAGATCTCGCAGGATCTCATATATCTCGAAGGAGATCCAACAACTCCAGCGGCATTCCATTAGTC:1 + chrX 4417984 3' - TAHRE 10442 1 44.55 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGG:1 + chrX 13640667 3' + P-element 2843 1 23.53 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCAC:1 - chr3L 17168839 3' - mdg1 32 2 56.44 GTACATACATACATGTATATGCACCAATGTATATCGACTTTTATGGCCTTTGACCCGCATAGCTGAACAAAGCTGCCATTAGTCTTTTTGAATCATTAAAA:1 - chrX 295836 3' + INE-1 68 1 71.29 TTGAATTATATTTTTATTTTTGAGCTCTTATTAAAAAAAAAGAAACTAGCAGAAAAGTAAACTGAATACCAAACCCATTTAAATAAAGTTACTTTATTACA:2 - chrX 14878640 3' + Tc1 1393 1 35.64 AAAAATAATATAGATTTAAAGTGTAAGAACTTCTAGGATGGAGCGGGGAGAGCGGGCTGGAAAAGTGTGGATGTGGGTGAGGGATTGGGTGGATTCGAGG:1 - chr3L 20306315 3' - 1360 247 1 66.00 AAATGCTGCTTTCATTTTTTTACAATTTAGAAAGATTATATAGGTTATTTGATCATAAAAACCCCGAATGGCTCAGGTGCCCATTTGATCAGTTTTCAGCC:1 - chr2L 8603555 3' + transib4 62 1 83.17 GCTTAAGTGTAAGTAAAAATGTAAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAAAATTCATTTTTTCATC:1 - chr2R 11989109 3' - rover 7043 2 81.19 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGTCTGCCTGCC:1 + chr2L 14579931 3' + copia 249 1 71.29 AATAATATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCATGTACATACATGTATGTACATACATATATGTTG:1 + chrX 15089125 3' + gypsy 7432 2 55.45 AAGAAGATCCCTTCAGTGATGTTTGACTGGCGGTTGGTGGAAGTTGAGGTTGCCTGCCTGGCTGCTGTGCAATTGGTTTTGTGGGCCATAAGGACTCCCCC:1 - chr2L 16206660 3' + invader4 233 2 78.22 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGCACACTTGGGGGTAGTAATATCTTTTACTAAAAATAGCACTAATAGAAG:1 + chr2R 22478139 3' + Burdock 6363 2 55.00 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACGT:1 + chr2L 6083780 3' - 3S18 31 2 55.45 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGAACTCG:1 + chr3R 25671994 3' - I-element 20 1 58.42 CTCGGCTATTGATCCTGATCACAAATATATATGCCTTATATGATCGGAAATGATTTCTATCTGTTACATGTTACATACTTTAAACACCTTTATGATCGATT:1 - chrX 21181494 3' - INE-1 90 1 66.34 CTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATAGAAAACAAAACTACAGTTTGACTTTGATAAGCACGATATGAAATATAAGCAC:1 + chrX 4239078 3' + copia 150 2 55.45 GACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTTTCTCTTAAAGATTTTGTATCTCTAC:1 - chr3L 5537613 3' - jockey 4720 1 72.28 AATGTAGAACATATTAATAATGAACCATTTTTGGGAAGCAATGATAGCGACACGTATGTCAAATTAAACTCAATATTATATTAAATAAATAATCATATCTT:1 - chr2L 7385002 3' + transib3 2503 1 53.47 CAAGAGGGCATCCAATCCAACAGACATAAAAATGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGGCAAAACCCACTGACACCACCCACTCCT:1 + chrX 14376020 3' + Quasimodo 7010 2 75.82 GATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCGCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTAAACCGCATTTCAAAACCTTAAACTGGAGATTAAGGCAGTTCTGAAGTTTC:1 + chr3R 12903272 3' - I-element 165 1 57.43 AATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACACACCTCACACCCAGAGCGGGGAAATCGATTCAATGTCATAAATTAGATTTGAAAT:1 + chr2L 14893502 3' + jockey 4718 1 57.43 AGTGCGGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGC:1 + chr2L 12949265 3' - 412 7099 2 67.33 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATTTTTTGCATACATATATGTGGGTTTCTGTTATAAAAATTGCTCCACTTGCGTTGAACAATCTCCTTGC:1 - chr3R 11939700 3' - FB 8 1 72.28 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTT:1 + chr2R 5531190 3' - 1360 71 1 54.46 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGAAAAAGCCGA:1 + chr2R 2044236 3' + Tabor 448 2 70.30 AAAATATCGTATGGCGTTCCGCGTCTTGTTATTATCGTGCCTTTGG:1 - chr3R 25614441 3' - 1360 24 1 80.43 CCGCACACAAAATTGTGGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTG:1 - chr2L 19018958 3' - hobo 42 1 66.34 AAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTGTCCTTTTTTTTTTGAGCGAGTGGGTGTAGGTCTTAATAGGCTTT:1 - chr3R 19987809 3' - hobo 235 1 55.45 TTTTTATTATTGTTATTATATTTTCCTTCAAAATTAAATTATAATATAAAAAAAATAAAATTATTTTCGCTTCAATAAGCTGAATAAAATAAATATGTCAT:1 + chr2L 13625679 3' - mdg1 7052 2 78.22 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATA:3 + chr2L 19684018 3' - jockey 4709 1 60.40 GGCGTGATGCATTGGAGCCAGGGTAGATCCACACTTTTCATATTCTTTTGTACTCAGTTCTAAGCTTGCACTTTAACAATCTAATTCAGTCAAATATAAAG:1 - chrX 358826 3' + gtwin 7112 2 77.23 AGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATTTTTTAGAGTGTGGTCGTGTTTGTGGGCGATAGAGG:1 - chr4 1127509 3' - Idefix 6985 2 69.31 AAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTA:2 - chr3L 19951207 3' - Ivk 39 1 61.39 TTCATAGGCATCCCAACATAAGGGGCATCTCCCTACTGAACAATAGTGAACCACCCCGAAAACTGCTCTATTTTTGGGATTGCTTCGGATCGGTTTTTAAT:1 + chr3R 15988702 3' + G7 979 1 67.33 ACAAAGTGAGAAAATGTTAAATTGTTGCAATTGTTATTTATTTAAGTTGATAGAAACTTACAAGAGTAATACAAATACGAAAATTATTAAAACATTTTCAA:1 - chr4 668724 3' - Transib5 2623 1 57.43 CTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTAGGGTGTATTTGGGTGTAAATGTTGTGTGTGTATTAGTGTGTGCATATTCAATTAGCATAAGGAGTCGA:1 - chrX 6098253 3' - Idefix 93 2 73.27 ATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTGTAAATATTTGGCACACGTGTGCGGGTGAGCACTTAAAGATTCCGTGTTCCCAAAATAGCCCCTTCCC:1 - chr3R 10145662 3' + roo 68 2 70.30 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTA:1 + chr2R 24628817 3' - mdg1 7081 2 65.35 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTATTGTAATTAAAGCTGCAGCACAGCCTTTGGTCAAGAG:1 + chr2L 9774336 3' - 412 38 2 61.39 GAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGAACCTCAAAACTGTTTTCCTGGGATATTTCCAATTGAGGTACGTA:1 + chrX 19205734 3' - Quasimodo 409 2 63.37 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCT:1 + chr2L 16948714 3' - jockey 4717 1 68.32 GCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCACACAAATTGAATATTGCG:1 - chr2R 5812444 3' - F-element 499 1 72.73 TTTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGCTGGTTGGGTCCTTTGTTGTGCC:1 + chr3R 28410890 3' - BS 4717 1 53.06 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAGTGCGATAAAAGTTTTATCAGCATTGTTGATGTA:3 + chr3L 19377822 3' + roo 403 1 73.27 CCCTAAGACTTAAGTACATGCCTACACACCAATACACAAGCATACCATATGAATGTACTCGCTAAATATTCAATAAGCGGCACTTTTTG:1 - chr3R 29335168 3' + Idefix 18 2 78.65 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAGT:1 - chr3L 17918390 3' + 297 6933 2 77.23 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGA:1 + chr2L 14612078 3' + roo 354 2 75.25 TAAGACTTAAGTACATGCCTACACACCAATACACAAGCATACCATATGAATGTACTCAAAGATATCAACGCACAAATAATAAATGAGCACTGGCGAGGAGC:1 + chrX 1426039 3' + Idefix 21 2 64.36 TATTAGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCTAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCATCCGATCCGCACAGTGGCAGAATAAACAAAAACATAGTA:1 + chr3R 26547771 3' + F-element 391 1 60.40 AGTTCAAATATTTAATTATATTCAATACATTTGCATCAACGTGCTGGCGGACATGTAAAGTGTATAATTTATAATTTATTAACAACAATCAACACACGAAT:1 - chrX 18515285 3' - G7 1154 1 58.42 AAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGAGGAGCGCTGGCAATTTATGGG:1 - chr3L 4876723 3' + roo 389 2 55.67 CTTCGGACTCGCGCGCTGCACAATAATAGTGAACAGCAACAAACTACATTAATATTGACACCGCGGACACCGAAGCCAATCAAGCCACTTCATTGA:1 - chr2L 17784382 3' + gypsy10 459 1 64.58 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTCGGTCCATAATTTTATGAATT:1 - chr2R 7032119 3' + mdg1 7443 2 62.00 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAGTAATTTTCACTCATACTCTCG:1 + chr3L 11661818 3' + hopper 1414 2 75.25 AATATNCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTCAGAATTCCCCACGCAAAAC:1 - chr2R 17972000 3' - 412 7083 2 55.45 GATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTCCTTATAAAGTTCCAGGATATCCCGTTGTTGTCTTCGGTGCTCATTTTTCGTCCTTATGCGGCACGCGTTCCCCC:1 - chr2L 15955728 3' - Quasimodo 393 2 80.00 GTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCA:1 + chrX 2649917 3' - Tirant 3 2 77.78 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATGTCGCAAAAATAAAGCCTTGCATAGCTCAAGGCGCAGCGGT:1 + chr3R 17454497 3' - jockey 4678 1 69.31 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATAGGAGGTGCTA:1 - chr2R 5953069 3' - pogo 10 1 69.31 CATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAACAAAAACGGACATGCGCGAAACACGTGATTGAATGTCCCAGGAAACAGAAAAAGATAAAA:1 + chrX 7554992 3' - pogo 302 1 57.43 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCC:1 - chr2L 8565453 3' + blood 7361 2 53.47 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGCTTATTTTTGAAGTGTACAAGATCAATGCTAGGGTTTGAGG:1 - chrX 8682641 3' - pogo 33 1 63.64 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGT:1 + chr2R 24021649 3' + pogo 2077 1 55.45 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCTCTGACTGCCTGTCTGCCCTTCTCT:1 + chr3R 27775184 3' + roo 407 1 77.23 ACCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACACCCGCAAGGACATCGGAAGGA:1 - chr2L 11634790 3' + F-element 349 1 77.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATATACATACAACAAGCTTTCCTCAATTCCCCTTGTT:1 + chr3R 16458080 3' - roo 19 2 61.39 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTGATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAA:1 - chr3R 13582237 3' - BS 5013 1 51.35 ATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTAAATCTATTCTATTCTATCTAAAATCCGAAATCAATTAATGAACTAACCAAATCGATATAAAAAC:1 + chr2L 16896761 3' + Tc1 1630 1 62.38 CAGCCTCTGCAGCAGAGTGAGCTCATCAATCTAGATGTGGGTCTGTGTCTGTCCATCAGCCTGTCATTCCGTCACTCACAGCTGAAGTGTTGGCCATCGGG:1 - chr2L 13707532 3' + invader4 111 2 60.40 GTTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCACTCAACGCAATTATCGCCTCTCAGACAATTAAATATATAAATAATTACAAGTATACGTTATAACTTATA:1 - chr2L 14778353 3' - Cr1a 413 1 71.88 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGAACTGTTTTGGT:1 - chr2R 14675516 3' + roo 405 1 74.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAGAACTTGCGCCGGCGCC:1 - chr2R 10444212 3' + P-element 2881 2 73.27 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCGGCCTTAC:1 + chr2R 11528078 3' - P-element 25 1 55.10 TTAATAAATAAATTAAAAAAAAAACTGCTGGCAAAGTATCGATACCAGCGACAAGCGTTGCCACTACGTCCGCACTTGTTGCTGTATCTTCACGCTCACGC:3 + chr3L 7912399 3' + X-element 4714 2 71.29 ATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATTAAAAATATTTTTGAGAAACGGATCTCAGCAGTTAATCCTTTTAAAAAAGT:1 + chrX 17622734 3' - 297 6953 2 63.37 ACCTGATTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCACACACACACAGCCATTCAGCAACACTCTAATAAACACAGAT:1 - chrX 12148120 3' + gypsy2 6788 2 58.42 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCGATCGCCAAAAGTGCAATGTGAA:1 - chrX 9366753 3' - jockey 4756 1 77.23 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGAAGAC:1 - chr3R 11999233 3' + P-element 2862 1 47.83 CGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATAGTTCAATCAATACGCATAAATAACTGATTGCTGTGGAATCAACCGCAGT:1 + chr3R 22469804 3' - 1360 3214 1 56.44 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTC:1 + chr3R 6608832 3' - I-element 33 1 58.42 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTTGGCTATTGATAAGGTGGCAGGCGGTTGGGATTCGATGGGTGG:1 - chrX 8684210 3' - opus 142 4 59.41 TTGGACGAAGTTGGTAACTTTGATCTTCTTCCTATAAGCCAATAATATTTCTCCTCGTGGCAAGCTTTCAGGCGAGTCTCCTAGCGCGTAGGCAGATGCTG:1 + chr2R 4933054 3' - G7 802 1 52.48 ATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAACCCCGAAAAAGCCA:1 - chr3R 17495744 3' - Quasimodo 1 2 73.26 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTATTTT:1 + chr3R 13376057 3' + 1360 3379 2 70.30 GGGTTCAAGTTTTGGCTAGAACCCTGGTGATTTGGTTTCGGCTGATTTAATTAATTTTCGACTTCATTGAATGCAAATTTCACTGGCTTTATTTCGCGCTC:1 - chr3R 8922224 3' + X-element 274 1 77.23 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCAATATCTGATGTTCAGTCATTAAAATGTTATTATTTTATGATACTTTATCGCAGTGCAGCTGAATAAC:1 - chr3L 17587754 3' - roo 7 2 72.28 TTTTTTATGTGTGTGTGTGTGTGTTTGCCTCTGCCTTTGGCCTCTGTAATATATTTCCTTGTCGTTTTGTAAATACACACGAAACTGATGCTGATAATTGG:1 - chrX 10409504 3' - Quasimodo 39 2 77.23 CATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAATAAGCTCATCAATGAACCAATAAAGTATGCTACCAAAAAAGGGCCGGCAATTGATGTTTT:1 + chr2L 15954425 3' + Quasimodo 455 2 57.43 GGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTCGACAAAAGGGGGAAGTGGGGATTATAGAG:1 - chrX 20099902 3' + S-element 1709 2 69.00 TTTTCCGTTTTTTTTTTTAATTTCAAGCAAGAACGTCATAAAAACGCTTTGATGGATGTCGTCGTG:1 + chr2R 15831307 3' - Bica 337 1 72.73 TAAAAAGAAAAACTAAGTTAGTTCCAAGTCAAGTTAAATTTTGTTAATTATGTTTTCATAGCTTTGTATTTCTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTCATTG:1 + chr3L 17245744 3' + HB 1367 1 61.39 AATATTATTATATTAGTATATATAAGTGATTATAATCATTATTGACATGTTAAGCTACCCTGCACTTCACTTTGCTTTACATATAACTGGCTCTTAAAAGC:2 + chr2L 15322937 3' - Tc3 292 1 31.68 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAGGTGT:1 - chr3R 27156625 3' - pogo 15 1 64.36 AACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTATTCACACAAGCAAGCAAAGACTGAACGACTTTCGCAACACGATCTACCCAATTATTAGA:1 - chr3R 1720875 3' + 1360 3218 1 58.16 CGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGTATGTTGAGATTTAGCATACAAATTTATAGAAAATTCTTTAGAATTATATTCGAGGTCAATTC:1 - chr4 1127278 3' + INE-1 136 1 62.38 ACCTCCTTCGCCATCCATCCATCTCCCTTTAAAACCGCTTTCATTCTGTCGTTAATTACATTTTTCAACACTTAAGTGATTTATTCCGCAATTTTATCGTT:1 - chr3R 24417695 3' + transib4 2421 1 60.40 ATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAAATATGTGCG:1 - chrX 5129466 3' + Idefix 7374 2 60.40 TGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATATATATATAATTTAAAATTGAAAACCTAGTCTGTTT:1 - chr2L 6555693 3' + Burdock 220 2 70.30 CCAAAAATGAATTACAAGCCAGATGAACTCCCTGACCAGGAATGGGTCGCATCGCTCGCTAAGAACCTCCCAGCGGCCAAACTTGGGTGGTGGCTCAGCGG:1 - chrX 809931 3' + I-element 395 1 79.21 TCTCTTGACACTTCGGCAATAAGCCGCTGCAATCGTGCAAGCGTTACGTCTGCCATTAGTAGCTTGGTGACTTGCACCCGCGACGTGTCGGCCAGATTGAG:1 - chr3L 23452967 3' - rooA 125 2 67.33 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAACAAGCGT:1 + chrX 22711674 3' - transib2 34 1 58.42 ATGTATGTATGTATGTATTATGGTAGATGTCATGTGGATCGTGGGTGTAATGTTAAAATCTATTTGTGACGTCATTAGTCGTGTGTCTCCAATTT:1 + chrX 7335224 3' - 412 7275 2 77.89 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATAACTTGGCTTCAGACTTCAGAATCTTGGCTTCATAAATTTAAATTTGCAATTCAAATCCATTGGCA:1 - chr3R 22232544 3' - F-element 22 1 50.50 GTACAGTCTGTACCAAAACGTCTGCAAAAGGTGATAGCCGATGATTTGAAAATGCAGTCAATTGACCGTCATAGCAAATTTTTTTCTTTCTCTGTACAGAC:1 + chrX 715639 3' + Tc1-2 1313 1 71.29 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTTAAGAAAT:1 + chr2L 16948744 3' - jockey 4687 1 64.36 CATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAAGGTCCATATATCATCGTTTTCCCTGACCGCCGTTGATTCTTCCTGCATCGCGGTTGTCTTCGCTGTTGC:1 - chr3L 23645159 3' - F-element 4274 1 75.25 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCA:1 + chrX 2799706 3' - Tirant 8120 2 64.44 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCTGCCGCGAGTGC:2 + chrX 2753896 3' + roo 9040 1 56.44 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACG:1 + chr2L 6083779 3' - 3S18 5797 2 55.45 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTAAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTC:1 + chr2L 7488915 3' + roo 9029 1 71.29 CATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGATTGTGGACGGTCGGGTGTTGTTGAAATTGAATCGATTTAAATTGGTTTGTTG:1 + chr3L 5164067 3' - G2 2972 1 59.18 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGTAACTTTGAAATAAAATTA:1 + chrX 17058216 3' - 297 6597 2 58.42 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGCTAACTTTCTTTTAATGCATTTGGAATGGGTCGC:1 + chr3R 31257069 3' - transib2 13 1 75.25 ATGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATTCAATAATAACATGCCACAAGCTGGGTCAGGAAGCGG:1 + chr3R 18954401 3' - gypsy6 7692 4 72.53 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGG:1 - chr3L 17168857 3' - mdg1 50 2 74.26 AAGAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATATACTCAAAAACTAGGCGTCTGTGTGAGTTCAGGAAAATCAGGTAAACTAATTTCCAAATTTTCC:1 - chrX 13862166 3' + I-element 180 1 70.30 CAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACCTCAAACTGTTCCCAAATTGCATGCGATGGACGAGTTATTACCGCTGGTTA:1 - chr2L 4148111 3' + I-element 5102 1 55.45 TTTTCCTACTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGTTTGACAAACTGTATATGTATGTAGGTAATTTCCCAGACCT:1 - chrX 22560618 3' + S-element 241 1 60.40 AGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGATCGAATCTTGTCCGGTGTGTAAGCTGGATTCCACATTCCAATTTAAAATAACTGC:1 - chr3L 24934287 3' + 1360 493 1 53.47 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACAACGGTA:1 - chr3R 10203606 3' - 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Idefix 8 2 68.32 TGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAAGAATATGAAAATACCATTGATAAAAT:1 - chr2R 4547749 3' + HMS-Beagle 7022 2 59.41 TGGAGTTCCGCAGGGCAGCGTCCTTGGCCCGCTGCTCTATTCTTTATATACTGCTGACTGACATCCATTTTGACGGAAATACTCAACGCCATGACCTGGC:1 - chr3R 4590386 3' + BS4 72 1 58.00 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCATTACTG:1 - chr3L 12103784 3' + roo 9043 1 56.44 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAGA:1 - chr2R 23584735 3' + HMS-Beagle 7015 2 48.51 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTAGGCG:1 - chr3R 25097828 3' + P-element 2878 2 65.17 TTCCGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGACCTTGTGGCGTATTGATCGCCAGCCCATCGTCTA:1 + chr2L 9350828 3' + rover 146 2 66.34 TGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAGGGGAAAGAACGCATAGCCCACCATGGGCAGGGAGCAGCCGATCAGAGCTG:1 + chr3L 8603298 3' - I-element 86 1 57.43 GTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTGCGATAAAAAAAAATTGAGAAGAAAATGCTGGCCCGTGGCAGTCGTC:1 - chr2R 22789703 3' + Cr1a 4376 1 66.33 GCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGCTCCTTTCGCCCTCGACCTCGTCCTGCGGCTGCTCCACTTTACGGTAATCCACTTGCGATGCTGGCGG:1 + chrX 17961866 3' - F-element 4543 1 62.24 AAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGGATGCGTAACGACAAACACGCATAAATTACTCAATTAGTAGGCGGGATGCGATGCGATGCGATGCG:1 + chr2R 8561944 3' + invader3 5366 2 73.27 AGAGAGAGAGAGAGAGATCTAAAGCTTTGCTTGCAGCTACGTCATTAAACAAGTTTTTACGATTACATA:1 - chr3R 13976220 3' - blood 165 2 91.30 AGTTCCTGAGATCTCGACGTTAATGCGGACAGGAAAGATGGCATACTCTTTTATGTAACTGAATCTGTATGCTTTGGGAATGAGTTTGGTTTTGTAGCCG:1 + chr3R 11258439 3' - INE-1 141 1 80.00 ATTAACAATAAATATGAACACGCATAATAGCAAAAGGAACAAACAACCTACATTTCATTGCAGCTGAGATACCTTAGCGACCAAGCGCATACACATTATTT:1 - chr2R 4260432 3' - micropia 5115 2 67.33 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATC:1 - chr2L 13136751 3' - roo 51 2 79.21 CCGGGACGGTCGTTCGGCGCTGCGAGAGCAAACCAGATTTGGCCCAGGGGCAGGAGAACAGCTCTATATTGGATTCCAAGGCAAATAGCAGGGAGCCGAG:1 - chr2L 17440408 3' - Doc 462 1 74.00 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTAT:1 + chr2R 19943967 3' - 412 7099 2 71.29 AAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCAAAAAGCGATGACAATGGCTTGGAGAAAATAATAATAAAGGAACAAGTAGAGCACACACACTTTT:1 + chr2R 13295751 3' + Tirant 8496 2 69.31 GGACAATAATTACATGTTTGGGTGGGGGGCATTAACTTAACGGATTACAAAGTTGTAAGAACGAGGATAGAGAATATATTTCGGCAAAACCAATTATGCAG:1 + chr3L 2185215 3' - G-element 4271 1 56.44 GATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCTGTCGTGGGACTTGTTTTTTCTTGTTTTTTTTTTGCCCCTGCC:1 - chr3L 1432164 3' + hopper 362 1 61.39 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTGAAAGGCAATGGCGAATG:1 + chr2L 15510475 3' + jockey 4986 1 67.42 AAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGAATTAATAGAAAAAAAGGACACAAAGGGGCTCCTCGACATAGCTGTCGCTATAGTTTAAAATT:1 - chr2L 20106815 3' + X-element 4624 1 67.01 AATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTACTCGGTTTGTTTGTTGGCTATGCTTTAATAATTTTTCTTTTAAACTT:1 + chrX 23507994 3' - R1A1-element 138 1 52.48 AAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTAAAAGGGAAAAGCCGAGGAAAAAGGAAAATAAATCTAAATGGGTGGCCAGAGTAAAATTC:1 - chr3L 20037026 3' + invader3 5367 2 55.00 TTGTAATGTGTCCTCCAGTTTAGGTCGTCTCTTTAATTGGGATTTCCTCCTTATGCTTGAATTTAATCATAATATCAGATTTAAAACCGATCATATTATGT:1 + chr3R 14478910 3' - TAHRE 373 1 56.44 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGGGGGTGGGC:1 - chrX 20806864 3' + opus 472 2 62.00 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGAAAAATTTCCGAAAATATACATATTTAACATAGTAAATCGGCCAAACAACTTAAATGAG:1 + chrX 13761332 3' - pogo 14 1 66.34 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGG:1 + chr3R 15072647 3' - pogo 32 1 63.37 GCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAA:1 - chr3L 19951175 3' - Ivk 7 1 72.28 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAA:1 - chr3R 20556131 3' - Tirant 38 2 63.37 GAAGAAGAAGAAAAAAAAAAAGAGAAAAACAGCATTCAAATGCTGCAAATTTTACAAAAATTACAAGTTGAATGTCCAAAAAAAATGTTGGATTTACCCTT:1 - chrX 3620502 3' + Doc2-element 222 1 52.48 CTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAAAAATAGCCCCAGAGAACTCAATTGAATTAATAGAGAATTCTCGATTCTCCATTCTCGATTCCGTCGT:1 - chr3L 7881647 3' - 1360 3338 1 70.00 TAACAATAAAAATAAAAATAATAATTTGCATAAATTGAGTGCTTCCTTTGAGGCCGCTGATGATGACGATGCGGATGTTGTCGCCCCAGCTCTTTGCAGTT:1 - chr3L 3565988 3' + mdg1 21 3 75.25 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACAC:1 - chr3L 10013593 3' - hopper 47 1 74.49 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCCCCAAACTGTGC:1 - chr3R 6273507 3' + blood 359 2 55.32 TAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGAGAGAATGCGCCCCAAGTGGCTTAAAATCTTCAGCGGGGCGACAGAAGAATTCTATTTTCGGACTATAAA:1 + chr2L 2732064 3' + roo 8758 2 72.28 GTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGCTCAAATATCATATCTTCGAAA:1 + chr3L 23953521 3' - 1360 3274 1 78.22 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAAAACTCATA:1 - chr3R 17843641 3' + roo 9038 1 57.43 TTATCACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGATACACGGACGCAGCAGCACCAATACATATGCAGAGCAATGCGAAATGGCAG:1 - chr3R 9488782 3' + Doc 4374 1 64.29 GTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCGTGACAGGACGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAATCGTTGCATAAATTAAGGCTTAATA:1 + chrX 10674983 3' + mdg1 7457 2 69.31 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGTCGCTTGACGACAGAGAGCTCTTGAGGATCTTGTGGGTGCGTCGCATGTGGACGCCCAGAC:1 + chr2R 7510865 3' - F-element 71 1 60.40 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCT:1 + chr3L 23678152 3' - Osvaldo 20 1 73.00 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCGGACAAT:1 - chr2L 12815016 3' + hopper 1407 2 71.29 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCAAGTTGTTTGCTTGCCATGTGCAGCGGGCCTACA:2 + chr2L 18430164 3' + copia 242 1 62.38 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGAAGACGCGGCTGGCAACATGAGGCCAGCGCAA:1 - chr3R 11999206 3' + P-element 2880 2 70.30 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTTTAGTATTCG:1 - chrX 20620537 3' - pogo 35 1 66.34 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTTCGTGCTGCTC:1 - chr3L 9383494 3' + P-element 2870 1 60.40 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACCACGTG:1 - chr2R 1365307 3' - jockey 23 1 62.38 GTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCAT:1 - chrX 20885951 3' - Ivk 5349 1 74.19 AATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTTCAGTACGCCTTTCCTAAGAGCATTCGATCTCCAGTCGACTAT:1 - chr2L 1417546 3' + 1360 13 1 57.43 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGAAGCTTACGATAT:1 + chr3R 26530952 3' - blood 9 2 68.32 GAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCACCTTCCACTTTTCCTCAGCCATCTGGCCACCGAGGGCAGTTGCATTAAACGAAGGGCAAAAATGAT:1 - chr2L 6554304 3' + G6 1806 1 72.28 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGACATTTTTGC:1 + chr2L 14790667 3' + roo 395 1 65.35 ACTTATATAATTGGCGCCCAACCAACAATCTGAACCTTAGCATTAAAGTCAATGGATTTGAGAACTGTGTAATCAAAGTGCAGAGAACGCATCTGGATAAG:1 + chr3L 4828509 3' + gypsy 471 1 74.26 AAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTCGCTGGCATTTTGTTCGCCCACCCGTTTTCTCTGCCGCCAGTCACCGCATGATTTTCAT:1 + chrX 2903174 3' + G-element 53 1 62.38 CCTTACTCCATGTTACATTCGGCCCTCCTGATCATCATCATCCGACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTCGGCTGCGTATGGCAGTTGTTTAAACAGCTG:1 - 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chr3L 19951170 3' - Ivk 2 1 77.23 CCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCGCTGATTCATGGAGATATTAAGCCGGCCAACATCCTGCTGGACCA:1 - chr3R 27251770 3' + BS 4790 1 55.45 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTC:1 + chr2R 16988256 3' + opus 460 2 63.37 TTAATTATTTGAAGTGAAAATAGAAAGAAACGTATTTGAATGGTTAAGTGCAAGATCAATTAGGGATTTGATAAGAGGTTTGAGATCACGGCAAGTGTAGT:1 - chrX 11696552 3' - TLD2_LTR 94 1 40.59 AACTANTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAACTAAACGACTGAAACCAATGCG:1 + chr2R 18044048 3' + jockey 4860 1 77.00 TCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTAT:1 + chrX 22824227 3' + Gypsy12A_LTR 2252 1 45.54 CTTCTAGCTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGTCCAAAATGT:1 - chr2R 4906458 3' - INE-1 155 1 56.38 TGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATAGTGGTCCCTTCAATTGCCTATTGCATCCAAATATGGGGTACGGGTCCGATTCTAACAAAATGAGATTGCAA:1 + chr3L 23611129 3' + Bica 54 1 73.27 TATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATATATATATTTACATAAAAATTAAAGATCTCTCGTCGTTTAGTGCAAATTTCGCTAGATGATCACA:1 + chrX 21292693 3' - rover 6953 2 76.00 AGGGAGATGGGATTAGCTAGGATATTTGCTAGTCGGTTAGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACCAAACGGGTAAATAAATAGTATTAGCAGAAATCG:1 - chr3R 19093662 3' - G5 4610 1 66.34 GCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:1 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 14 2 71.13 AATAAATCAACTGCTCGGTTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCCGGGTATGTGTGTTGGTGCGCTTGGGTGTGCGGGTCACTTGGCAGCCATCTTGCG:1 + chrX 4739896 3' - accord 7242 2 79.21 ATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCC:1 - chr3L 22039727 3' + jockey 4941 1 77.55 CCCAAGGTGGGGGACACAGTATGGGCAAAAGAGCACCACCTGTCGAAGGCAGTCGAAGGCTTTGCGGCGATTCTGTCGGAACTCGGCGCTTGGATCCTGG:1 + chr2R 8565322 3' + Osvaldo 1294 1 70.00 AATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTC:2 + chr2L 16588538 3' + Doc 4687 1 72.28 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGT:1 - chr3L 18659028 3' - pogo 35 1 63.54 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATC:1 - 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P-element 9 2 45.54 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTATGTGTAGCACACTTTTAGGC:1 + chr2L 1625730 3' - hobo 14 1 65.35 ACTAACGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAA:1 - chr2L 18279902 3' - gypsy5 38 2 56.44 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCGAATAAATTTAATAACGTGAATAATGCCACTAAAAATAATTCACAAAAACCCAAAGAGC:1 - chr3R 17853308 3' - roo 8679 2 62.38 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTGGTTGACG:1 - chrX 13640611 3' - P-element 14 1 65.35 AATAAATGTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTC:1 - chrX 21017797 3' + 412 439 2 75.25 TACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATTTCTGATAGCGCCGTTATATACAAAAAACATAACAATGAATTTCGCACAGCAGCT:1 + chr2R 19668914 3' + 412 7288 2 61.39 GAAAGCGGTTTTAAAGGGAGATGGATGGATGGCGAAGGAGGTGTGGGTGTGGGGTGTTTGGAAAGGACATGGCCAGGCGGCAGTTGGGATCATAGGGGTCA:1 + chr3L 13431708 3' - 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I-element 40 1 65.35 ATAATAACAATAATAATTATAATAATAAATAGTAATTTACGCTTTAAGCAATTGATCTTAAATTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAGATT:2 + chr2L 7588328 3' + mdg1 29 2 74.26 AACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCCTTTTTAATAGAAAGCAATCTTTTTTTTATATGCC:1 + chr2R 1532969 3' + Doc 341 1 65.35 AAATAAAGACTTTTCCAAGCATCGTTTTATGGTTAGCTAGAGAATGTAAATTAATGTCAAGTTGTCTAATTTGTTATTAAAATAAATGTGAGTGAGTGATT:1 + chr3R 17660032 3' - Cr1a 4028 1 67.33 ATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGC:1 - chr3R 12047403 3' + Stalker2 7629 2 56.44 TCCGCTTTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGAGAACGATAAAAGGAACAACACGCAGTG:1 - chr2R 2498404 3' + 1360 475 1 58.51 GCGTCATGGCCGAGAACCACGACATGCCCGATGAGAAGGGCTACCACTGAGACACTACGATGTATGTTATTTTTTAGCTTACAAATGTTTTTGTACAATTG:1 - chr3R 946529 3' + Osvaldo 488 1 59.41 AAAATAAAAAAAAAATGGGGGGAAAAAA:1 - chrX 6422230 3' - hopper 137 1 89.29 TCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCTTATGTGGTTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGCGAGAACGCCTCCGCTGGGATGATAATG:1 - 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chr3R 20942109 3' + Doc 4410 1 54.46 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCGCTCAGCC:1 + chr3R 23638197 3' - pogo 11 1 68.32 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTACGAATATTATGGGCTA:1 + chr2R 24479914 3' + I-element 5297 1 81.19 TCCGCCGACAATGTTGCAACATGAGAGTGCGACGATCTAGGAGCTCGCCTCCGGAAGGAAGTGGGGGCTATCAGATGCTCCGGAATTCGAGCGATCCGCGA:1 + chr2R 675154 3' - gypsy5 7093 2 68.32 GTCCCACTGGGAGACCAAACAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAAACCACCGTCACCATAACGCACCATTAGGTGCTATTGTCCTTTT:1 + chr3L 11838622 3' + G5A 2572 1 63.37 TTTAATTAAAATCGGGAAGAAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCACAGAAGGAAGACACTGAAAGCCGCTGTCAGCTGCCAAATAGCTACAAAC:1 + chr3R 7442288 3' + gypsy5 343 2 67.33 CTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1 - chr2R 981616 3' - 1360 55 1 68.32 TTTAAGTTACCTGCATCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAA:1 - 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chrX 15293431 3' - Quasimodo 31 2 51.00 ATATATTATTCTAGGGTCTTTGGTAGTGGACTGTTATGGTCAGTCCAGTACAATTATCCTGGTTGCCTAGCATCCGGTGTCCAAAAGCGGTAACTTCCCCT:1 + chr2R 20593708 3' - Tc3 243 1 72.28 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCTCTGACTGCCT:1 + chr3R 27775170 3' + roo 393 1 63.37 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCATCAGCAGG:1 - chr3L 7550707 3' + 412 7520 2 53.47 AATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTAGTTTATTATGAGAGGAAAAATCCAAGAAATCTTAACTGCGCACTTTTAATG:1 - chr3R 5633259 3' + S-element 1692 1 55.45 TATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACACTCCACTCGCACTCACTCCCTCTCACCTGACTGC:1 - chr2L 14612560 3' + roo 90 2 68.32 AAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTACTTATGTAAATACACCTAT:1 + chrX 3305238 3' - transib2 2 1 73.27 GGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGCTTCTTCTTCATTTTAGTTTTGCGGCGTCTGCGGTTGTGTTTATTGTTGTTATTGC:1 + chr3L 7863458 3' - jockey 204 1 61.39 TATAATAATATATATAATAATAATGAAATAAATAAAATTAGAGTAGATAACTAATCTTTATGTTTCTAGCCTATGGCCTGTCTTAAGTTGAAACACTAACA:1 + chr3L 11548651 3' - Tc3 284 1 76.24 AAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACTGCGCCTTAATTCGTATTCGTTTTTTG:1 + chrX 996923 3' - opus 108 2 73.27 TTCGTAAGATACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAATAAAAAAAAATAAGGCTGCTTCCTCATCGAGTAGTTAGCTCCCCACGGAGTTGTTCTTCG:1 - chr2L 17784235 3' + gypsy10 5929 2 65.35 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGTGTTCGTCAGTTTAACCAGCATGACATGGCCCGGTCCATTGCGG:1 + chr3R 12277572 3' - Tirant 34 2 56.44 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTC:1 + chr2L 7488915 3' + roo 9029 1 73.27 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATGTTGTTTAT:1 - chr3R 4544000 3' - flea 34 2 62.38 ATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAATTTCGTAATTTTTTTTACATTTATAAGGTGTTCAAAACTCATGCCGAAACATATTCGCATTACTTAT:1 + chr3R 20878560 3' + 297 392 2 65.35 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTAT:1 + chr3L 18706919 3' + jockey 4939 1 72.28 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCC:1 - chr3R 10952256 3' + roo 390 2 58.42 GAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGGAAGGACACCAGAAGCACATCGTGATGTTTGGCTTGCAAATTGCTTGATATG:1 + chr2R 15097133 3' - Burdock 34 2 55.45 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAAAAATGAGACATAATCTGC:1 + chr3R 26321696 3' - blood 21 2 58.42 CTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATCTATATCTTCGTTGTAGTGTTGATAATTTTGATCTGAAATTTTAAGAAGTGTCACTGCTCGCAGTTTACTAATCCAT:1 - chr3L 25844244 3' - Porto1 4398 1 72.28 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAA:1 - chr3R 15072593 3' - pogo 19 1 70.00 TTTTAAAACCAACTTTAAAATATACGGTTAAAAAACCAAAAGTTTATTCTGCACCCAATTGGTCAAATTGTTTGCGCTCAACCATAAAACGCACACA:1 - chr2L 2268256 3' - pogo 1886 1 79.38 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAACAGGGGAAAGTAATCCA:1 + chr2L 12324123 3' - roo 4 2 73.68 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATACTATGGCTCAGACGGAATTATAGTTTTAA:1 - chrX 1281664 3' + roo 9046 1 51.49 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACT:1 - chr3L 2019652 3' - 412 7081 2 53.47 CCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGATGCATGACCCTTACATAGTATTATGTTCTGACTATATCTCATATGGGTAGAATAAACTTAGGGG:1 + chr2L 22996718 3' + Cr1a 4140 1 78.00 CCAAAGCTAAGAAAGAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTAATTGTAAAAGATGAAACAAATCAGGGGAACT:1 + chr3L 19946551 3' + Ivk 250 1 66.34 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATTTGGTTT:1 + chr3R 4834344 3' - mdg1 7050 2 67.33 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTAAGCATTAAAATGCGGCTCCTTTT:1 + chrX 14768052 3' - BS 5039 1 75.00 TTAGAGTGAGTTTTTCTCGACATTATCAGTGCACTGCATTTTGAATCTTAAAAGTACGGAAATCTCTATTTGGCACTTTTATTTTATCTTTAAAATTTTAC:1 + chr2L 15348665 3' + Gypsy12A_LTR 366 1 74.26 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCG:1 + chr3R 10277271 3' - Doc 58 1 74.26 GACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACAACTTCACTGGCCCTGCTTCACACTTTAAATGTCGGCACTTCGGAA:1 - chr3R 6277069 3' + HMS-Beagle 6882 2 61.39 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAG:1 - chr3L 10013561 3' - hopper 12 2 60.40 GGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCCGCTGACGATCCATCAATCTCCGTAGCTACTGGTCTTGAATACCCCAGATTCGATTATTAATGATCCGG:1 - chr3R 16401556 3' - blood 385 1 74.26 ATTCGTTGAAATGTATGTAACAGGCAGAAGTTATCGTTTCGGACAAGATAAACTATATATATTCTTGGCAGCAGATATAAAATTATTAAGTTTGTGCTTCG:1 - chr2R 4879663 3' + INE-1 16 1 66.34 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAGG:1 + chr3R 15072658 3' + pogo 2080 1 58.42 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCTGTGAAAACTGTTGTGGAAGTTTTATAACCCAAGTTGTCG:1 - chrX 2649821 3' + Tirant 364 2 60.40 AGGGCTTGAGCCCGGGTTAGAGGTCTTTGTGTTTTCATTCGAGGGATCGGAGTTATGGTGTTCTGAACTAGTAG:1 - chr2R 9526828 3' - I-element 153 1 62.16 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTAT:1 + chr2R 12457995 3' + roo 9048 2 57.58 AATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAGCATCAAATAAGGATTATTGCCT:1 + chr2L 20133092 3' + flea 254 2 80.20 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCAGGCCAGAGTAGTTCTCGCAGAGCTCTTGTCAAATGTCGGACGGTGTCAAAGCAGCTCGCGACGTGGC:1 + chr3L 22527865 3' - jockey 4711 1 73.27 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTAAAAATGTCAATATATA:1 + chr3R 8555947 3' - 412 12 2 66.34 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGATTTGCAGCTTGGGAAGGCTGCGTCTCGGC:1 + chr3R 6273589 3' - blood 26 2 54.46 GAGGAGGACGGCAAGCTGTACTGACACATCGGGCGAGGCAATGTTCGGCCTTGGACCACCTCGGCTGGCCACTGACTCCACTGACCCTTACGACACGTCAG:1 + chr3L 26023483 3' + Osvaldo 391 1 67.33 ACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCCCGCTCCTGCACGTGCTGTGATCTCCTCCTGCTCCAC:1 - chr2L 15288744 3' + F-element 307 1 73.27 ATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGATGTTTCTTGCGCTTCAAAAGCCTACAGATCGATTATCTATTTTG:1 - chr3R 8458188 3' - HMS-Beagle 6796 1 79.21 CAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAATAAATACTAATATCAATCACATTGCAGAGCTTGAAAAAATCGAGGACGTACAAAATTAAGTTCACATCT:1 + chr2R 1000283 3' + Porto1 4185 1 73.27 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAG:1 + chr3L 16761327 3' + roo 9043 1 57.43 TTTTGCATTTCTTTTTTTTTTCTCTTTCCTTCGGAACCTTTGCCCATTT:1 - chr2L 10114408 3' - gypsy2 406 1 89.80 TAAAATAAACTAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTGGACACGCCCACAAATCTGCAGCTGCAGAAGGCGTTTTT:1 + chr2L 14629214 3' + F-element 92 1 61.39 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATTAATGTTCCA:1 - chr3R 23591413 3' + pogo 2073 1 55.45 ACAATAATGAATAAGACCAAGAAATTAAGCGTGCTTACTATTGTTGTTACTGTTTCTGTTACTGTTACTGCTGCTGTTCGTGCAGTTGCAGTTTTTACTGT:1 + chrX 17453455 3' - Gypsy12A_LTR 2126 1 66.34 CATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAATCGTGAGAATCGGCTACCAGGACCGACCCAGCCAGATCAC:1 + chr2L 15135244 3' - F-element 4253 1 59.41 AGTGTNCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCT:1 - chr2L 4160126 3' - Tirant 35 2 55.45 GCAGTGACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATC:1 - chr3R 13582248 3' - BS 5050 1 77.00 CTATAATTGATTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCGCCGCTCGTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAAAAAAAAGAAAAAAAATAT:1 - chr2R 11325018 3' + Cr1a 4207 1 77.23 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACAGTTCTAGTGAATCCAAAAGTTATGCTGCCAAAGTGGATGCAAATACCCCAGGCATATATCCATTG:1 - chr3L 8614465 3' + opus 492 2 67.33 ATTTTAAATTGAAAAAAAAAAGTGTAATAGATTAACTGCAACACAGAGGACAATACTACGAAATCAATTCTATATTTGTGGTATGTAAATGATTATTCAAT:1 + chr2L 7011407 3' - Tc1-2 1401 1 64.36 CAGAGAATGCTATAGTCAAGTTTCCCAAGAACTTACTAATTTCTGTTCTATTTACATATTTTATTTGAAGTGCGGCCTAAATGCTGATCAGTTTAACTTTA:1 + chr2L 3963517 3' - INE-1 575 1 60.40 AATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCGGGATGGGAATTGTCTGTGGACAAAAAGCGGGCACAACAATTGCAGTTCAGGG:1 + chr2L 11700428 3' - Tabor 473 2 54.00 ATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAG:1 - chr3R 9131769 3' + roo 9034 1 66.67 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCACCAAACT:1 - chr3R 6273511 3' + blood 348 2 56.44 GCATTCACACTAGCTGATTAAAGAGTATCCGATAGTCGGGGAACTCCACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAGAAAACAGCTTATCATATATGATGAACTGT:1 + chr3L 6134410 3' + INE-1 534 1 92.08 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTAT:1 + chrX 21852439 3' - Tirant 34 2 57.43 CAAAACATCCGTTACTGTCGAGTCAAAAGACGACACCCCGACTCCAGCATCGAGATGACGATATCTTCCCGAAAAGCTTAGATGATCGGAACTATTTCCAT:1 - chr3L 20699518 3' + gypsy4 6464 1 76.24 CATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAAAAGCTGGTT:1 + chrX 17968440 3' + Tirant 374 2 54.46 AAAATAAAATAAAATAAAAGTAGTGGGGAAGGGTGGGAGTTTCCGGGCTATGCTCATCGACTAAAAGATATCCTGTACTCTGTATCAGTAAAACTAGTTTT:1 - chr2L 17033148 3' - transib1 1898 1 74.26 TTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCTGGAAAAAAACAATACACTGGATGTTCACGAGATTTTTGTAAAATATGGTTTTTATTGTGGCTAGG:1 - chr3R 5023076 3' + Rt1b 5116 1 67.35 AAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAAAACTCATAAAAACTGCTGACAACAACAAAC:1 - chr3R 17843619 3' + roo 9060 1 65.35 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATGGTATCTCAAGACATCCATCATATC:1 - chr2R 16980469 3' + copia 242 1 65.35 ATTAAATAAAAGTAAAGTAAAAACAAAAAAAAAAGCAGTTGCCGACCACGTCATGGTCACGCTGCCTCTCTGAAAAGCCGCAAGAAAATAAAAATAAATAT:1 - chr3R 5754718 3' + F-element 4668 1 51.49 GGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTGGAATTGGGGTTAAGGGACAGCATATATAGATCATAAAATCCATGGGCCTGGTGGTCATCTACT:1 - chrX 10221586 3' - Idefix 182 1 55.45 AAAATAAATGTTTTTTTTTAAGAAAAAGAAACATATACTCACTGATGTTTTGGTGTAGAGCTACCATTTATGTACAAAAACAATAATTAAGAATAATTTAT:1 + chr2L 8643783 3' + NOF 3867 1 87.13 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAG:1 - chr3R 16400162 3' + blood 7348 2 62.38 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATT:1 + chrX 3305192 3' - transib2 48 1 72.28 ACTTANTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGAT:1 + chr2L 7255795 3' + P-element 2840 1 32.67 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAG:1 + chr2L 8565517 3' - blood 7052 2 66.34 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGC:1 - chr3R 23638103 3' + pogo 2065 1 70.30 GCCAACATGTGCCAAAAACTAATAACTTATGTGTTTTCTATCCCTTTAAGACCACTTGTGCTGAGCTTTTTCCTGTTTTGTT:1 + chr2R 9428735 3' + transib3 428 1 63.41 TATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCAAGTACACTTACTTATAATTGTGTTTGGT:1 + chr3L 9382757 3' - P-element 139 1 29.70 AGTAAAATACAATGAAAAACTAGTCTCACATCCCAATCCCGCCCAGCCTTCTTCTT:1 + chrX 21209962 3' + Doc3-element 4497 1 66.07 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTG:1 - chr2R 20739449 3' - roo 8704 2 67.33 ATAAATATATATTAAAAAAAAAATGCAAACACACACTGCACACCAAAGGAACACGAAATTCTTACGTTTTACTTTTGTTTCATTTTATTTTCGCGTTATCT:1 + chr3L 22280110 3' + S2 1619 3 77.23 ATGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTGGCCTGGGGTGCTGTGGCTGGGGGAAGGCGCGTGTCGGGTCAGGAGTAAGCCAGAATACGCATACGCCATGTGTGCCCT:1 + chr2L 5650938 3' - accord 7027 2 80.20 CAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTA:1 + chr3L 18337708 3' - Juan 4056 1 55.45 TTTCAAATTATAACGTACATTTTACTGTTTTGTTTGGCCATTTCCCACGGTAAAAGTCCTGCCCAGTGATGACAATTTACGTTCATTCCGGACATGTGAAC:1 + chrX 22697166 3' + invader5 3707 2 56.44 TAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTTATGCTAATCCAAGCGGAAAATACCGCTGACGACCTGGTAATGT:1 - chrX 5851128 3' - flea 206 2 56.44 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAA:2 - chr2R 1365319 3' - jockey 35 1 53.47 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGGGAATCACGATAAAGAGTACTGAAGACAAGAGTTTTGTAGCCTACTTTCAGGCTGTTCCACCAATA:1 - chr2R 14351833 3' - Max-element 11 2 66.34 ATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACA:1 - chrX 15355079 3' - X-element 4709 1 59.41 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAA:1 + chr3R 24760616 3' - pogo 35 1 71.29 GGCGCCCAACCAACAATCTGAACCGCACCAATCCAAGAAACTAAAAAAAACGAAATTGTTTCTAAGCAAACTGTGTCAACAAAAGCA:1 - chrX 15579965 3' + gypsy 483 1 67.82 GTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCAACTTTACATTCTAGGTCTAACTTTTATGAACATCTGGAAGTTAGATTTCATGTGGACAGGACTCA:1 + chr2L 10715355 3' - pogo 6 1 63.37 GGTTTTGTTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACGGTCTAACTTTCGCTTTTGACTTTGCAACCAACTGACTGACGATGATGGACTGG:1 - chr2L 21194403 3' - McClintock 324 2 58.42 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAACAATACAATGAAATTAAACCAATTCGGGTTTCTTTG:1 + chr3R 26254058 3' - jockey 4706 1 61.86 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATATGGCATTAACAAGTGTTGCTGTCAGTGATGAGCAAAATCCACAACTGCAAATA:1 - chr2L 7800045 3' + P-element 2865 1 57.43 ACAGAAATAACGGCAGGAGTGCCGCTATAAATATCTGAATGTGAAATTGTATCTTAGTTAAGCAGTTAAAATTTCTCTAAATACCTTGGGGGTTCGCAG:1 - chr3L 14779096 3' + gypsy9 5197 2 53.54 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACA:1 + chr4 96892 3' - Doc 30 1 61.39 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGT:1 + chr2R 11528062 3' - P-element 44 1 37.62 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGAAGTACCCCCATGAAAATACGAATTA:1 - chr3R 18571134 3' - hobo 21 1 72.97 GTATTTGAAAAGATTATTATATGGATGATAATATCTTTATAATCTTTTCTAACACATTTGAACAACATTACACTGATTTAATTTAAATAATTTTCAAATAT:1 - chr2L 14903577 3' - TLD2_LTR 53 1 67.33 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTATTATGTGACACGCATAAAACGAGGACAATCGCACGGCTTAACGAG:1 + chr2L 15508975 3' + jockey 4955 1 59.41 AAGGGNCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCTGGGGGGAGATTATTAAATGTACCAGTTCCGTAGGAT:1 + chr2R 3586195 3' + Quasimodo 6947 2 62.38 ATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGGGCGACCCCTAAAGGCGTACATGCTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATT:1 - chrX 21668113 3' - mdg1 208 2 49.50 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAATAAA:2 - chr3L 15100676 3' + pogo 2064 1 63.37 CAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATG:1 - chr2R 5582160 3' - Cr1a 432 1 75.76 CTTATCGCGTAATTACCATCGCCCAGCTTATCGCCGTTACATTAATCTTTATCATCATATTTCTATATGTGCTTTTCCAGTTGGCGTTGCGCTGTTCGTTC:1 + chrX 17103843 3' + Ivk 63 1 59.41 TATTGGAATTCTAATTAACTACACACAGTGGGAACTGCGGATGAAGATCGTAGCCGATAAGAGCCCAGCCGGGTTTGCTTTCCCTTTATCTGG:1 + chr3R 23048524 3' + mdg1 7458 2 73.12 AACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAA:1 - chr2R 5582165 3' - Cr1a 439 1 69.31 ACTCANCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTATGTAT:1 - chr3R 27748650 3' + roo 393 1 63.37 CGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGTTACTGCTCTTCCTATTTATTGTGATATTTGCTCTGCTGGGCATGCAAGTTTTTGGCGGTAA:1 + chr2L 16176702 3' + micropia 113 1 65.35 CGACGTCGAACACCTGGACTTTGGGTCGTTGGCTCTTTAGGACCGTCATAAGTGCAAGCACTGAACGTGAGAGGAACAGCATGCCTGGCATTCGATGCTTA:1 - chr3L 27654225 3' - R1-2 237 1 62.38 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATG:1 - chr2L 6388279 3' + copia 239 1 71.29 GAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCTGTATTAGATGATTGCCGGCTG:1 + chr2L 7859710 3' + R1A1-element 4952 1 77.23 TGAAAAAATGTATACTTTAGAAAATATAAGTTTACCTCGGTCTAAACGTTTTTTTATTGATAGTATTTCGTTTTAAGAGATGGTCAAACCAAAGACACTAG:1 + chr2R 2308259 3' + FB 245 1 52.48 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTGGGCTATAC:1 + chr3L 13659964 3' + pogo 2071 1 62.38 TTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATTATGAATACATA:1 + chrX 21852451 3' - Tirant 8129 2 57.43 AATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCACAAATCACAAAGAAGCAATCGCAAAGCGAACATACGCACAACAAAGTCTAGA:1 + chrX 1509928 3' - Cr1a 169 1 74.70 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCGGACAATC:1 - chr2L 12815015 3' + hopper 1408 2 72.28 GACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATATTTGTCAGTTCTATTCTGTAAGGTTGTTTGTCCAATAATTTTACTTAGTT:1 - chr2L 17784590 3' - gypsy10 5639 1 78.22 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTT:1 + chrX 3305195 3' - transib2 45 1 69.31 ATGATGATCTCATAATTGTTATGTAGCTAATTGTTTCTGTATCACTGTTTTTTATTGGTATTCCGCAGCTTGGATGAGTCCCTTATACGCAACTCAATAAC:1 - chr3R 4494515 3' + BS3 1621 1 53.47 TTGTGNTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAAACTTTTTTTCTATAGTATAAACTATTAAGTTATGTTACCTTTTTTCCGA:1 + chr3L 2019744 3' + 412 485 2 60.42 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCA:1 - chr3R 7522305 3' - blood 36 2 58.42 CTTCGTTGCATACGGACGTTCGCGATTGCCTAGTCTTTTTGTAGTGAAACAACTTGTTTGTTAACTTGCTTGTTAAAAATATCAAATTGGAATATAAAAAA:1 - chr3L 18229127 3' + jockey2 2 1 49.50 ATGCAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACAAAAAACGGCACTTTAAGTGATTTCTG:2 + chr2L 6454777 3' + mdg1 373 2 69.31 TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAATAAGCACTTAAATTATTAAAAACTGCTACATATCAGAAATCATATTTCTTTTTTTAAGGC:1 + chr3L 8614582 3' - opus 11 2 69.31 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGG:1 + chr2R 16475806 3' + 412 455 2 61.39 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGCACCGCTTTTTG:1 + chr2L 8565552 3' - blood 6 2 79.21 ATAATGGTTTTTGCATCTTGTGCCCTCACTTTGCTCCCACGCTAGTCCCCCAAAGAAGACAGCAGCGAAGGCGTTGGCAAATATAATAACGGAACTTAGTT:1 - chr3R 2876816 3' + transib4 2317 1 63.37 GGGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAAATATTATAAAATATGCAATATCAAA:1 + chr2R 18701512 3' + flea 128 1 76.92 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGG:1 + chr3L 4876779 3' - roo 42 2 76.67 GTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCTGCGGGAGAGTTTTCCACCTTTTCCGTTAGCTGCCAGACGTTTTACGGTTCGGTTCGTCATAGCCTGTG:1 - chr2L 17443683 3' - G2 2950 1 72.28 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTAT:1 - chrX 8491417 3' - P-element 45 1 36.63 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGATTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTAAGAG:1 - chr2R 12082333 3' + mdg1 7444 2 56.18 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCA:1 - chr3R 20477064 3' - 412 7109 2 79.21 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCA:1 - chr3L 12888205 3' + mdg1 406 2 63.00 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGAAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTCGAAAACCGTATAG:1 - chr3L 11553486 3' - P-element 35 1 38.61 ATATATGGAAAATCCACTAAAAAGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATG:1 - chr2R 13644406 3' + Burdock 246 2 70.30 GACCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTTTACA:1 - chrX 22738545 3' - 297 6580 1 69.31 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATATATC:1 + chrX 10827471 3' - roo 8696 2 67.78 GTTTAGTATTGTATACTATATTAAATTTTGTTAAATAAATAAAATTAAGGGAGGAGCACAGAAGCGCCACATTTAGATATTTCACAAATTATTCCTTGCAA:1 - chr3L 17834535 3' + Ivk 5355 1 57.43 GCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATATTACAGTGGAAGACAAGCTAGATGTGGACTTGGCAGCACTCA:1 + chrX 19986418 3' + Stalker2 7619 2 62.24 TTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTTGTATATTTATTTATTTTACATTTTTCCTCTCTCTTTTTTTTTCTGTGTTTGAATATATGTTTGAGTTTCATTTGGAG:1 + chr3L 26694924 3' - Doc 4461 1 81.19 AATTTATTTCGCTTAAATCGTAGTCCACTTTAAGGAGCTGCAACGTTTCGAAAATTGGAAAAGGTCAAACCTATTCAATTATGCGGCAGTGTAAGTTCAAA:1 - chr2L 22135250 3' + Tc3 1652 1 70.30 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATATACTAAGCAACAGGGTTGCCTTGACTTACGGGGATGCCAACTC:1 + chr2L 7800121 3' - P-element 24 1 52.69 TGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATGGCATA:1 - chr2R 13644401 3' + Burdock 251 2 75.25 ACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAGGCGAAATGGAGAAAGCAAGGCATCTTATACATACATT:1 - chr3R 19759615 3' + I-element 5150 1 61.22 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTA:1 - chr2L 4743149 3' + I-element 5317 1 63.37 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCCGGCACTGGGCCAATAAAAAAT:1 - chr3L 22039706 3' + jockey 4959 1 57.43 TTTTTTTACACTTCTTTTTTTTTTTGAGTCCTTTGCCGGTGAAGTGA:1 - chr3R 22823527 3' - gypsy2 409 1 78.72 GTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCAAATAATTATAGTATACCGCCACAGATATTAA:1 + chr3R 20650688 3' - Quasimodo 116 2 68.32 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATCTCCTGTCTGCTTGGGGGCTAATTA:1 - chr2L 8298974 3' - S-element 35 2 72.73 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTACAGAAAGCACAT:1 - chr3L 10013552 3' + hopper 1412 2 69.31 GATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGG:1 - chr3R 23048455 3' - mdg1 7093 2 81.19 CATCATATCTACACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGTGCTGTAAGCTAACGCCGACTTCCGCTTGCCATAGGCCTCGTCTATAACTC:1 - chrX 2799619 3' + Tirant 8481 2 54.46 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTTCTTCTGCTCCTTGGTCAGCAGCAAGAAATTAT:1 - chr2L 12949185 3' + 412 7539 2 69.31 ATTAATCCTGATCAAGAATTTATATACTTTATATGACCGGACACGCTACCTTTTGCCTGTTACATAATTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTATTTTAC:1 - chr2R 14480236 3' - INE-1 83 1 76.24 TAACAGATGCCCGTTACTCAGCTAGTGGGACGAAATGGGAGCCTAGGCCAGGGCGGAACAGGTCTATTGCGGTTACCATCGCCGCTTGTATGCGGAATTGT:1 - chr3L 22937403 3' - INE-1 546 1 72.28 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGT:2 + chr2L 13136809 3' + roo 9048 2 56.44 GAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACATCAAAATCAAACAGGCAGTTGGCTTGTGGCAACATTTAATTAGAAAATCGCTGGAGCAAGTG:1 + chrX 15164833 3' + Bica 362 1 69.89 AGCAGGAGAAATGGAAAATTATGTTCGACGCGAAGCACGTAAAACCAACGAAATAAATAAGGCACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTT:1 + chr2R 5617480 3' + Bica 4604 1 49.50 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCA:1 + chr2L 16884885 3' + pogo 2064 1 64.36 TTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAGGTCACAGGATGTTCCTGGATGTGCGAGGGTGGCTGACTTTTTGTCTGCCGTTTTGCTGGAATTTTA:1 + chr3R 14348464 3' - G2 3049 1 64.36 ATGTCATCTTTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTTCGTTTCTTTTTGCCCGTCGTCTTGCTGTCCTTGGTTTTTTTGCGACCTTCTGTAC:1 + chr2L 13386675 3' + invader6 4547 2 57.43 CAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCGTTGGTAGTGTGAATAATGAGAAATTTGTGGCTAC:1 - chr2R 3334242 3' + Quasimodo 217 2 65.35 AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATACTGGACAATATTCAGCATTCAGCCGAGCATAAGCATCTGATATGCATCAAATCTAACTCAATTGCTGGACC:1 + chr3R 11549236 3' + Gypsy6A_LTR 277 1 71.29 TAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGTGCAACAATTTAGATACGGATACATCCCGTTGC:1 - chr3R 9131732 3' + roo 403 1 73.27 CACCTGAAGATCCGCAACCCAGCAACATGGAACAAGTGTTTGCTCGCTTTGAAGGAATCGTCGAAAGGATAGCTCAATGGCCAGGACACTGACTTATGCTG:1 + chrX 18005173 3' + G2 134 1 67.33 GGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTATTGTTTTTACTCCTCATCGCCGGCAAATCGATCCACATTTAAATAT:1 + chr2R 6858612 3' + 1360 3194 1 66.00 CACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTACACAAAAGGCTCGCCCATCTCATTAACGCACTTAAAAAATTTA:1 - chr2R 24912125 3' + Tirant 8434 2 67.33 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTGCTTGAAG:1 + chr3L 12888316 3' - mdg1 4 2 74.75 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACACACACTTTGCATGAGGGTCATGATGACAATTGTA:1 - chr3L 10013564 3' - hopper 15 1 57.43 CGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAA:1 - chr2R 12492388 3' - hobo 52 1 75.25 GTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACTGAAGATTACTCTTATAGAGTCGTCTGTCTTCAAACATGATCTGTTGCGTATGAAATTTATTGCTCTGAT:1 + chr3R 7349438 3' - micropia 5148 2 65.35 TTTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAACCGACACCG:1 + chr2R 5627649 3' + TLD2_LTR 96 1 77.00 AATAATAATCAAACCACCTCCTTAAGTGTGTATGTGTGTGAGGCGCCATACCTTTGGCTCCATACCTTGAGTAATGCACTTCAGAATGCGAATACGAATGC:1 - chr2R 8000617 3' + Juan 319 1 75.25 TAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAGCTGGA:1 + chr3R 20147581 3' + 1360 398 1 79.21 AGAGATGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCACCGCCTTGTAATGGATTTGGACATATCGATGAGATCCAGCGACTGCCCC:1 + chrX 13091840 3' - Ivk 419 1 54.46 CTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:2 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 18 1 70.30 TCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACC:1 - chr3R 12047410 3' + Stalker2 389 2 58.14 TAGAGNGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATC:1 + chr3R 8313106 3' - 297 46 2 76.24 CTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATTGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACCGAGCAAATGTGGGAAGATGCAGTTTTCCTCTCGTGTTATTTCTTTC:1 - chr2R 18061459 3' - 1360 3282 1 60.40 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTA:1 + chr2R 8345551 3' - roo 8716 2 77.23 TTTCANTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAG:1 - chr3R 29123364 3' + P-element 2830 1 22.77 AAAAANTTTTTTTTTGGAAATCAAAAAAAAAAA:1 + chrX 7149099 3' - INE-1 319 1 75.76 GCCTTTTTAACTTAAGTGCATCATATCAGCTGTTTTTTTTGGCAGCTGCCTCAGCTCGTTTTGTTGCTACTGTTGTTGGCTTAAATTAATGCATGTCTCTC:1 + chr3L 7841104 3' + pogo 129 1 68.32 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTC:1 + chrX 22945357 3' - BS 25 1 57.43 TTTCACAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATTCAAAAAATGAAAAAATCAACACTAAGAAGGACAGAAGGAGG:1 + chr3R 904439 3' + G5 4552 1 58.42 CAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGAC:1 + chr2R 7552293 3' - springer 47 2 81.00 CAAAAAATAAACAAAATCAAAAAAAATGGCCAACGAAGGTCAAGGGATTCTGGAGTCACAGAAGGACTACGTTCCC:1 + chrX 6306462 3' + transib4 2538 1 27.63 CAGAGACCTAAAAACCAAATTAGTAATCGAAGTACTATCTGAGAAGAAAATGAAATACCTAGAAAATCTGACCACCCCTCCAGCCCTCCAGCGATTTATAT:1 - chr3R 15513398 3' + Doc 4417 1 79.21 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTTGGCTATTGATAAGGTGGCAGGCGGTTGGGATTCGATGGGTGGAAAATT:1 - chrX 8684204 3' - opus 7026 2 54.46 CTGTCCGCTTCCGAAAGTATTAATTGGCTTCCTCCGATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGGTGTCTGAAACAACCGCTTGCGACGTCCCCTTGA:1 + chr3L 21553012 3' + gypsy12 9996 2 66.34 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGC:1 + chrX 2649881 3' - Tirant 8148 2 64.36 AAAGGAGACGAAGAAACATAAAGAACAAAAGTTAAACCCACCTGCAAAGTAAAAGGCTGAGACTTGGACTGAGCCGTGGAGTCATGCCGCTTTATTTACTT:1 - chr2R 5895680 3' + HeT-A 258 1 54.46 CGGTTTGAGACGCTGGCAGTGCCCCACAGCTGAATCCCATAAGTCCAAATTGCGCAACAGCCAAAGCGTTGTTCTTGGTAACCCGCTGACCGAGGATATTG:1 + chr2L 16717245 3' - G-element 3936 1 66.34 AAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGGGGAGGAGCTTTGAGGACAAGCATTGGCCTAGAATTGGAATCATCTGCAGCACACTTACATTT:1 + chrX 11379211 3' - Max-element 8320 2 60.42 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCTTTTGT:1 - chr3L 9907357 3' - jockey 27 1 52.58 AGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGACTGTCTCACCCTTTTCGTTACCAGCATT:1 + chr2R 13105594 3' + copia 4862 1 72.28 AATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTAAA:2 + chr3R 4544091 3' + flea 5006 2 72.28 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGACGCG:1 + chr3R 10751726 3' + hopper 1402 1 70.30 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAACGAAATTAAAATGGCACGAATAGGTGTAATGCGAATTTTGGCCTGGG:1 + chr2R 8310940 3' - pogo 3 1 74.26 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAAAGTTTTCCAA:1 + chr2R 16940416 3' - 297 6595 2 66.34 ACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCATTGGAAACTCACTCTCACAGAGATACGGGCATTAAAGACGGGTTCAAGTTATAGGCTGTTGTCCAACCAAA:1 - chr3L 271733 3' + Stalker4 120 4 75.25 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAG:1 - chr3R 13582219 3' - BS 5022 1 50.50 CTATGGCTTGTTGGTCCCCAGCGCTCCGTGGGAAACAGAATTGCAGTTCTTGGATTATATTTAAAATTATGCAGTGAGTAGAGTACAGTGGAAAATACATT:1 - chr3R 2845265 3' - Rt1a 402 1 67.33 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGCTGACGGGATCGAGCCCCAAAAAATATGCTATGGTTTTT:1 - chr3L 4641078 3' + hobo 2904 1 60.61 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAACGGGGGA:1 - chr2L 2078445 3' - I-element 38 1 66.34 AGATCTCGGGAACTATAAAAGTTCACTAATGTTGTTTTCATTCTACACAAATATTTTGGCGTTGCGAGAGTTGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATT:1 + chr3R 25860451 3' + INE-1 149 1 64.36 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGATGGCGCTCAGTCGACGAGCAACTTTG:1 + chr3L 13477539 3' + P-element 2883 2 74.26 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTGGTTCTAATGAAATGTATTGGCTTACAATGTAGTT:1 - chr2L 10793169 3' + I-element 5314 1 70.30 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAATAAAAACCGTCGTTTATCAAAACCCAGAAGGAAGGATGAAATTTGATTAGCAATGTTATCAAATA:1 + chrX 22444532 3' + Juan 4198 1 48.00 ACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTAGACACGGAAGAAAAGATATCCATAACCCCTCTGGACACAGGACAGGAAATA:1 - chrX 22077194 3' + gtwin 448 2 52.48 AAGCANACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTG:1 + chr3R 6622699 3' + P-element 2849 1 43.56 ACATAAGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGTTCTTTTGAGTTCCCGAATCAGATTCGTTGGCCCGATGACTTAGTGATTGACGCCCTTGCGCTCCTGG:1 - chrX 4704743 3' - Q-element 556 2 71.29 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACG:1 - chr2R 24628768 3' + mdg1 380 2 68.32 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTTCTTCTGCTCCTTGG:1 - chr2L 12949203 3' + 412 7521 2 51.49 AGCATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGAAGTAAGGAGGTAATATACGGTTTGCACAAAAGCTTGACCTGTATTC:1 - chr2L 22999642 3' - Cr1a 4011 1 80.20 AACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAGTGTGCACTTAATTAATATTTTTCAGCATGAATTTATTAAGTTATAGAGCAACCAAAAGAGTTTAATC:1 - chr3L 23100487 3' + S-element 370 1 67.33 TTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCACTTGCCACCACGAAAGCCACACATCCCAAAGATGTCACACATCAAAACCAGAGAAGCAGAAAA:1 + chr2L 20133620 3' - flea 4580 1 66.67 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTATATACCCTTCGTATGTAAAGGAGAATCCCCAACCTAACCCGTACCCATAGCTATAGTTAAATG:1 - chr3R 26842776 3' - opus 7 2 70.00 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGG:1 + chr2L 13574281 3' - pogo 27 1 52.48 GGTTGACACGACAAAAGGTCATAACTATACATTTGTTTCCTTAATTTTCTCTATATGAATATAAAATACTTTAATCACGTACGAAATTTTGAA:1 - chr2R 2675664 3' - Q-element 683 2 65.59 ACCAGACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAA:1 - chr2R 5582165 3' - Cr1a 438 1 70.00 TGTATGATGTCAGTATTGCTGTTGCGGCTTACAATGGTCGAGGGCAGTCGTTCATTGTAACGCAGTGTTTTTGCGTGTGGGTGGGTGGGCGTAAATTGATT:1 + chr2R 13791112 3' - F-element 4302 1 48.51 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGG:1 - chr3R 27775104 3' - roo 51 2 79.21 GTGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTTCGTTTATTTCCTTAAATTCTTCGCTTTTC:1 + chr3R 17321824 3' - Stalker2 7249 2 45.54 AAGCANCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGAGACCAAGCGGGCCAACTACTATATT:1 - chr3L 19454642 3' - diver 5900 2 70.30 AAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGGTTTTCCAGC:1 - chr2L 23189406 3' - 1360 39 1 71.11 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGC:1 + chr2L 18430129 3' + copia 241 1 70.30 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAATTATGGTATAGCGG:1 + chr2L 513745 3' + roo 388 2 56.44 GTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTGCCGTCCATTAAATAAGCACGCAATTAATTGTGGCAGCCATGACAGGCGTGGCTTGCCACC:1 + chrX 20025520 3' - 1360 3207 1 73.03 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGC:1 + chr3R 23275330 3' - roo 28 2 54.46 TGTTCAAGTAAAATGATCCGCAAAGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACACGGCAAAGTGAAAAACCATCTAGTCTACAACGTATTTATATTTGCTT:1 - chr2L 17083570 3' + Tc1 458 1 57.43 TAGCTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGACCAAAATGTAGAGACGGGCA:1 - chr2R 4906447 3' - INE-1 151 1 58.42 AACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTCTGTTTGGGTCTTCCTTCAATTTTTTTTTGTATTTAACTGTTGCGCGG:1 - chr4 1151308 3' + 297 6898 2 73.97 AATCTTCACGCAAACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAGAGTAAACGCGAAATAAAAAGTAGAGGTGTCGAAGGGTTTGGAAGACAAGAATATTAGT:1 + chr2L 15785610 3' - 1731 254 1 63.37 ATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTATCTGTCTGTGCTGGAGCACAAAAGAAATGA:1 - chr2L 4743119 3' + I-element 5347 1 66.34 CACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTTATATATTTTCAACAAGTCTAATGCACACATATAATTTTCATTTACAGATTTAA:1 + chr2R 18687960 3' - Tabor 102 2 62.38 TATTANAAATAAACTTTAAAAACTAGTGATATCTTTCAAAGCTGCTCATAAAATACTGCACAAGGAAATATTGTTAAAAGATAAACATTTATTTCTCTGTG:1 - chr2R 11571096 3' - hopper 180 1 59.41 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCGGCCTTA:1 + chr2R 11528077 3' + P-element 2858 1 49.50 TAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATATTGGAGATACTTGGGATCTGTATGTTGTTGTATTTTCTGTATTTTGTGAGTGGGCCCCGGCAGGCAGCAGCA:1 + chr3L 21062133 3' - G2 67 1 62.38 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATGACTGCTCTGTTATATTTTAGAAAATACTTTGAAGTTTCGACCATAAATAGTTA:1 - chrX 11730256 3' + jockey 4969 1 55.45 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCTGGGAAAGTTCAATTGGG:1 + chr2R 24021671 3' + pogo 2099 1 77.23 AACAACGCGTATTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGCAGGTTTAAGTTGACTGTTCCTGTT:1 + chr2R 1687233 3' + F-element 261 1 75.25 CGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTCGTATGGGAAGAATTTTTTTACTCAATTAACATTATTCAATTTATATTGTTTTTTTTTGCTTTGTTTATTAT:1 + chr3R 19128792 3' - hobo 2727 1 50.50 GAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAGCTCCAGAGCCAAGTCTATTTGCATAATTACTTATTACCTTTATTATGTACATATTTTTATCTATTA:1 - chr3L 26170622 3' + Stalker3T 293 1 54.46 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACAAT:1 + chr2R 4483272 3' - Ivk 29 1 50.50 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAAAAAGTACGAGTACGAATAT:1 - chrX 10672283 3' - mdg1 22 2 55.45 GAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCATATCTTATTTCAATAGATGTATATAT:1 + chr2R 9500071 3' - G5 4703 1 52.48 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATTATATGTCCACCTAATTATTTGAAATATTAAAATGGCTTGATAACGCCAATGCGGCGAAGTAATAGTAATTTTTA:1 - chr3R 15126465 3' - FB 3 1 72.28 TTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATATGTATGTATCTACTGGAGTTTTAAATTCCCGAACGCCTTTGAAGTTGAAGTAGTAGCGAACTAATTACCTTT:1 - chrX 22738549 3' - 297 3 2 67.33 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATAATA:1 - chr2R 17626469 3' - mdg1 7049 2 66.34 AATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTTGACTTTGACAGTTGTTGTTCAAATTGGCGGCA:1 + chr3L 5125055 3' + jockey 4843 1 67.33 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACAACGGTAGTGAAAT:1 - chr3R 10203599 3' - jockey 16 1 65.35 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCTACTTAATTCTGTTCATTGCCTTAACCTTGAAGTAGTTTCAATTTTGGGATTTGGAACAAAGGTTT:1 - chr3L 22822379 3' - I-element 14 1 71.29 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATTCTTTCTTCCCATTGTCTACACATAATATAGTTATGCAAGCATTTTGTTTGAGAAATG:1 - chr2L 10473431 3' - flea 4773 2 61.39 AGAGGACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGA:1 + chr2L 18279974 3' + gypsy5 386 2 55.45 CCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCGGATTTCTCAGATGCCAATGAAATCAGCCAGGAATAGGCTATTTCCGCCCATGTCTTGTGGTTTATG:1 + chr2L 11789340 3' + F-element 215 1 73.27 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1 - chrX 12657098 3' - blood 7038 2 54.46 TAGCACCTGCAGAATGCCAACGATCGCTTTCTCTTCTCGCCACCGCTTTGCTCTCCCGTTTCGTCAAGTGAAAACATTTCGTTTGGGCTTCGTCAAGTTTT:1 + chr3L 5664856 3' + Doc3-element 357 1 76.24 TCCGGATTCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACACCTGCTTCGCCACCCATTTCATTTGCATGGCACTGCGTTTTATGTTGTCGGACTAGGTC:1 + chr2R 5453819 3' + transib4 2380 1 59.41 CAGGATCAATAACCGAGTCGATCCACCTGTCAGTCCGTAAGGGGGCTGTCACCTCGAAAACTTTAAAAGCTTTGAAGTTAAGATAATGTATGCATTTCTTT:1 + chrX 23102797 3' + INE-1 95 1 72.28 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCGAGTAAAAATTTACATAGCATCCGTTT:1 + chr2L 17311166 3' + S-element 1710 2 68.48 TAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCAGATATCGGTTATTCTGCATCCTCGTCGGCATCTGCTGTCGGCTGCT:1 + chrX 17967175 3' - Tirant 294 2 56.44 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCAT:1 + chr2L 14790627 3' + roo 9018 2 77.23 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGAC:1 + chrX 21017859 3' - 412 31 2 57.43 GAAAAACTAACTTAGTTCTAGGTCACGTCGCAATTTTTTACGTAAATTAGTTTTTGTTTATTTTTCTTTATGACATAAAGAATATTATGTTTTAATCAATA:1 + chr3R 4514642 3' + HB 1373 1 78.22 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAAT:1 + chr2R 24628828 3' - mdg1 32 2 54.46 AACTCCTTCGAAAGAACTTCACCAGAGAGAAATCGGTGGACATCGGTCGTCTCCAAGACAATAGGATCTTCTGCACATAAAAAAAAATAAATGTATAAAA:1 - chr2L 3781361 3' + I-element 283 1 65.00 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTAT:1 - chr3R 13582212 3' - BS 5015 1 57.43 AGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGGTCGGCGACTCACCTTCTT:1 + chr3R 11771138 3' - hobo 2927 1 81.19 GGTTTNGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGTGATAATTTCAGCAATTCATTTGCAAGTGCTCAGTTT:1 - chr3L 17594428 3' - Quasimodo 7061 2 61.62 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCT:2 - chr3R 12047431 3' + Stalker2 353 2 69.31 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAA:1 + chrX 18837013 3' + P-element 2847 1 42.57 CACCGNCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCACTGCCTCAGTCGCCTCTACACAACTTATAAATATTTTTCCCAAAATTAACACTTTTTA:1 + chr2R 3106800 3' + F-element 286 1 62.38 TTGTGAGAGAATACCACTTTTTTTATTCCTTTTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGAGCGATGGCCAGGACGAACAAATCCTTTGGGG:1 + chr3L 1070305 3' + copia 4965 2 62.38 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGTGA:1 - chr2L 17722754 3' - blood 7027 2 60.40 TAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATAACATATATATTTTATCCA:1 - chr3R 21092421 3' + roo 9066 1 62.38 AAAAACTATCACTAAGTGAAAGTTAATTAAGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAA:1 - chr3R 15095978 3' + Doc 4602 1 74.26 TTTTCTGAATATATTTATATTAAGTTATTAAAAATATAGTTTACTTTTTAAGTTACCTAAAAGTTTAATATAATTCTATATATATTACAACCTTGAACTAT:1 + chr2L 15180865 3' + gypsy7 5059 1 80.20 TCATATATATACATACATATATATAATATATACAAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAC:1 + chr2R 18514895 3' - 1731 4411 1 77.23 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTACACTTGCAAAAATAAATTTAATCAGCCCCCTTATACTAGACAGCATCGACATTAAAGAATTATTAAATG:1 + chr2R 3550814 3' + Tabor 478 2 71.29 ATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATA:1 - chr2L 17784640 3' - gypsy10 5682 2 65.96 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCC:1 - chr3R 19446138 3' - 297 6598 2 61.39 TTCTTGGAAATATTTCTTTTGAATTTT:1 + chr2L 12586356 3' - FB 473 1 66.67 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAAT:1 + chr3R 19989308 3' - hobo 47 1 67.33 TTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAAATGTAATTTAAGTACACACTACACAAGTCCGTCTGTTGACTTTAGAACGCAT:1 - chrX 3824011 3' + roo 8764 2 65.93 CTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTCGTAATTAAATTGAAATTCGGTATACAATCATTCCTCTCAATGCGAATGTTTCAGTTTCCATCGGCCTTTC:1 - chr2R 24479851 3' - I-element 2 1 73.27 AACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAGGTAAAATTGAAGACTACGCTCTCATACAGTATTTAATTGACGGCATCGACGAAA:1 - chr2L 21400693 3' - Doc3-element 5 1 57.43 GGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCTGTTAATTAGATTTATTGTTGAACAAG:1 + chr2R 8086930 3' - 1360 43 1 68.00 AATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTTCGATGGTGCACCATTTTGGGGCAACAGG:1 - chr2L 22084446 3' + copia 254 1 75.25 GACGTNGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAGCAGACCGCAAACAGCCTTGATGACTGACTA:1 + chr2L 19019032 3' + hobo 2925 1 63.37 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGT:1 - chr2L 12949228 3' + 412 7496 2 76.24 CCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAGTTTAGTTTTGTTTGATTAGCTGTTTGTTTTTGCATCTACACAAAGAGAAATAGA:1 - chr2L 3482960 3' + invader2 5079 2 73.27 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAAAAATAAAGTGGGTTGAAGACAAATCCAAGCTCCGAACGCAT:1 - chr2L 5707251 3' + jockey 4958 1 63.37 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAA:3 + chr3R 16400228 3' - blood 7037 2 53.47 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGCGCAATTTATCGTAAAAATTAC:1 - chr2L 17311059 3' + S-element 1702 1 66.34 AGATAGGGAAAAAAAGAAAATCCGGTCAGTTTTTGAGTCAATCTGTAAAACTTATAACTGAAAGTATTGTGTATCTGCGTAGCCACGTCTGGGAATGGGAC:1 + chr3L 22771802 3' + HB 123 1 77.23 GCCGGAATCTCTGCCAACTCAAAAACAAGACGTCAAAGAAGAACACCGATAACATACGAGCCAAATGCTAAATGAACTGGAAGCAAGGAATTTCACACATT:1 + chrX 21566856 3' + diver 471 1 59.41 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGTAGTAATTTTATTGTAACATTTCGGATACAATAGTCAACATGTTAATATACACATAA:1 - chr2L 11837983 3' - roo 19 2 58.42 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCCATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAACGCT:1 + chr3R 10277284 3' - Doc 35 1 57.14 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAGCAGAACAA:1 - chrX 16995084 3' - jockey 17 1 68.32 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACTT:2 - chr3L 2019651 3' - 412 7080 2 52.48 CGGTGNCTGCGCTGTTGCCGCGTTGAATTTCAAATGGCTCACCATTTTTGGGCAGGCAGGCGTTTACTTTTTTTATTTTCGCGCACTTTATGAATTATCAA:1 - chr3R 23458656 3' - Chimpo 294 1 82.18 CAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAATAACTAAGGGGTCGATAGAACAGCCAGATATTTCTAAAAGCTTTTCTAAGACAAACAAAAAAAAAC:1 + chr3L 15811009 3' + gypsy 7299 2 57.43 TGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAGGATGTGGGGTGCAC:1 - chr3L 10081907 3' - rover 6951 1 76.24 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCA:1 + chr2L 16201556 3' + hobo 2889 1 71.29 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATAGAGTCGGTAGTGCCGGGGCATGTGTCACCAAGAA:1 + chr3R 11343228 3' - hobo 29 1 60.67 CTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTAAGAATCCCAGCTGACTTTTCATTTATGGTTTCTCACTGTTATCAAAATTTTTCTTAAGCCCCTTCAATTTGCCTTT:1 - chr2L 7011304 3' + Ivk 4952 1 76.24 TTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACG:2 + chr3L 23678149 3' - Osvaldo 23 1 76.00 TTTTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTTTCCAAACGATTCCAAACGAATCCGAGGAAAGTTGCTAATCTGCCACCTGCACTCAGCCAGCGAAACTTTCTCGATTT:1 + chr3R 9375853 3' - Doc2-element 254 2 66.34 AACTTTCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAACGCTCT:1 + chr3R 10277286 3' - Doc 43 1 53.47 TTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATG:1 - chr3R 556453 3' + Tc1-2 1590 1 58.42 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTTGGTGTCGTAAACGGTTTGGT:1 + chr2L 20824680 3' - pogo 31 1 58.42 CGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGCTTTCAAGGGG:1 + chr2R 25051874 3' - G5A 2660 1 59.38 AACAAATTTAACGCTGAGCTGGTTGGTCGGTACAGTCGGCTTTGACTGCCTTGATTTTACTAACTACTCTGCTGATTCCCCGCAGACTTCGAATGCAACGA:1 - chr2R 6935093 3' - Doc3-element 4594 1 57.43 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGGACAATTGCCGCTATTGTCATTACTTTTGGCCCACATTTA:1 + chr2R 23580832 3' + P-element 2870 1 56.25 TTCTGGGAACACCAACCAGGACTTTGGCAGTCTAAGATTCTTCCTATGAATACCACCTTTCAGTTCAAATTTATAACTGATTTCAATACCTAATTAAAAAA:1 - chrX 13237946 3' + baggins 5020 1 64.36 AAATTAAAAAGGTAGGGTTTCGGTAGGACAGCCTTAGCAGTTGAACACCAATAGTAGGTGTCATTAAATGTTGGATTTCTTCACGACGAAGGAAAATGAG:1 + chr3R 17525030 3' + BS 4921 1 68.00 CATTAAACTTCTCTAAGAAAGTTATTTATTGTAACGACCTTAAACAGCAAATGTGAGCGTTAATTTCCAGAGAAATGTATCTGGCTTATCACATTCTAAAT:1 - chr3R 25432156 3' + I-element 476 1 59.41 ACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGAGCGAATTTTTGAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 14317418 3' + 1360 3013 1 71.29 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAAT:1 + chr2R 7032185 3' - mdg1 7088 2 77.23 TTTTTTTGGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTAAGTCCCTCGCTAAAAAGAACCAATGCTTCTCAATGTGCAAAATGGCAAA:1 - chr2L 22178703 3' - INE-1 312 1 56.84 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATT:1 - chr3R 27748690 3' + roo 9016 2 80.20 ATGTTTACTTTTTTTCATCGGAATTTCCTCATTGACAAGAATGGGCTCTGGTACCTGATTGGTGCGTATATAATCCCTATGATTCTGAAAATTAACTAATA:1 - chr2R 9019566 3' - Doc2-element 4527 1 65.35 GGCGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATCCACATTTTATTTTTTATTGTAAAAAAAAAATATTACACATATTTTTTCATA:1 + chr3L 8713169 3' - opus 10 2 66.30 GCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGATTCTCCGTCAAATAGAAATTAAATAACGAAGATGGCAACCCCCCATCATTTTATTAAAGTTCCGTCCCTGGTTGC:1 + chr3L 9383982 3' + P-element 78 1 51.49 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAGCAGCAAAAATGTAGCCTACATTCGAGCGTCACTGCAAGAGTTTGACATGCAAA:1 + chr3R 11846320 3' - hobo 2 1 77.23 GGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGT:2 - chr4 158192 3' - gypsy 153 2 60.40 AATGANAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGGAGAATTCAGTTTATAAG:1 - chr2L 6083699 3' + 3S18 320 2 57.43 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGTGTTAGTTTGAT:1 - chr3L 19951200 3' - Ivk 29 1 57.14 ATTTTATGTTATTAATTATTTACTCAAGTGATTTTATACGAAGCTTGATGAAAACACGTCTGTTCACTTGAAATAGAATGAAAGATATTTCTGCTCGAG:1 - chr2L 21400736 3' - Doc3-element 67 1 69.70 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGTTGA:1 + chr3R 6622710 3' + P-element 2861 1 55.00 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGATTATGT:1 + chr2L 13319658 3' - hobo 17 1 60.40 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATT:1 + chr3R 4834338 3' - mdg1 7056 2 61.39 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCAAGCTACTATACAAGTAGTTAGAAAAGAA:1 - chr3L 20230785 3' + hobo 2894 1 70.71 GTATGATGTGGGCGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAAAAATAGCCATAAATCTCAGCCGCAGGGATTCGCATCCGAAACTGAACCAAAAA:1 + chrX 5536533 3' - gypsy6 428 1 57.43 TTTTTTGTTTTTTACGATGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGCAGGAACAGTATGAAATTAGAGGAAAGTAGCTGGGAAA:1 + chr3R 19988814 3' + hobo 385 1 62.38 AAATTAGAAAACAAATTCAATGGAAAGTATCATAGGTCTTAAGTTTGTGCATTTTTTATACTAGCTTAGTGAAACAAATTTCTTGTTAGATCAGGAATTTC:1 - chr2L 2401463 3' - S-element 1579 2 78.22 TTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATATATTTATAAGCATATAAATATATTACCTATTGTTTCGATTGTGTTCTTGCCTGTG:2 - chrX 15371815 3' + Idefix 7377 2 64.36 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCG:1 - chr3R 7388355 3' - HMS-Beagle 6842 2 72.28 AAAAAAAATTACATTAAAACCATTTAGTCTTCAACAACTCTATTTTTACATTCGACAGTGCTTTGACTAAATTGGCTTAACTAAACTAAGCTTAAGCTGTC:1 - chr3L 17206718 3' - transib4 27 1 63.37 GATTTTATCAGTCTTGTATGATGTATGGTCATTTGATTTAAAAAATGCTGCATACTTCTACGGGGGGAAGAATATATTGTTTGCCAAAAAAATTGGGTTGG:2 - chr2L 22983957 3' + Transib5 2762 1 88.12 ATTGAACTCATTAAGTGTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCAAAT:1 + chr2R 5019436 3' + rooA 7580 2 56.44 TAACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATAGATCTCCCATATTTACATTTCAAATAATCTT:1 + chr3L 3032297 3' - opus 7154 4 66.34 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATGGAAATTCTAAACAAATCGTCTGATCCCGATCAGAATAGTTGACT:2 - chr2R 966151 3' + I-element 5327 1 59.41 ATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGGTTTCGGCCGAGCGTGGCTAATTGGTTAAGTACGGACGGGACACCACATTGCCAGGATGC:1 + chr2R 11524977 3' - X-element 4395 1 62.38 CACCACTTCTACGGAACACTAAATTAATTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAGCTAGGTTCTTCGCAATATGCCCACAAAATGACAAAAAAAGAGTAAT:1 - chr3R 26961746 3' - R1A1-element 81 1 76.24 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGATTTTTGTTTCGCTGCACGACTAAGTACTTCTATTGAATTTGTGCCCGCAGCATG:1 - chr3R 27429999 3' + pogo 2082 1 60.40 ATTTATAATTATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCCGTTCGGTCACTCTATTATTATTGACTTCTGGAAGCTCTTTCTACCTCTCTTATTTTTTG:1 + chr3L 25256226 3' - Burdock 302 1 65.62 GTGTAGATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCAATGTTCTGGACAAAAATATTAAGATGTAGAGAAATGGTATAGAATGCACTTACTTGCACTTACTTTT:1 - chr2R 13078708 3' - jockey 4654 1 56.44 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAAAAATGAGACATAA:1 + chr3R 26321691 3' - blood 7037 2 53.47 GCTGCTGTTGATCTGGCTGCTGTTGTTGTTGAGGTCTTTCTTGTTGGTGGGATAGCTGCTGCTGAGACTGTACTTTTGGTTGTTTTT:1 + chr4 777449 3' - TART-A 122 2 75.86 ATTCTTGATCAGAATCAATATCAACTGTCTGTCCTTCTGTATGAACGTCGAGATCCCAGGAACTATAAAAGCTGCAATGTTTTTTTTTGTGTGAATTTACC:1 - chr2R 17202795 3' + INE-1 86 1 74.26 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCTATGTGCAGCTTTCCGTGCTCATCTACATGCAAATTT:1 - chr3L 22831248 3' - 297 5 2 66.34 TGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTTAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTTCAAAATCGTGCTTATAAAAATTATAATCG:1 + chr3L 23777682 3' + 1360 2974 1 76.24 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGCCA:1 + chr2R 16475811 3' + 412 460 2 56.44 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGGAGGAATCA:1 - chr3R 19989227 3' + hobo 2937 1 75.25 CGTCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTCAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCGAGCCGAGTGCATCAGTATACAGGTGGAAC:1 + chr2R 17523003 3' + INE-1 144 1 68.32 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATCCATTTAATAGATTTAGTATC:1 + chr2R 9854096 3' + pogo 2051 1 83.00 AAGAGNGGTAGAGAGTCAAGATTACCCATAATAGGATAAAGTCTATTACAGTCAGAACATAATACTCTGTGAGGGTCAGATTACACCAAGAGCATTGGAAA:1 + chr3R 14811124 3' - Cr1a 4236 1 76.24 GTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATATCGTCTGTGCTCTAAATCAACACTAAAAAGTCAAACACTTCTTTCACTGCGTGTAGCTGCAATCGGC:1 + chr3R 11999415 3' + P-element 2572 1 78.95 TAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGAATGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTGAGAGCGAGATAAAAGAGGAGTTTCTATTGGATTTCAATTAAAATCGAA:1 - chr3R 19463359 3' - Cr1a 4272 1 56.44 CTCGCGGACAATTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAGCTAGTTCGTTTCCATATATAACATATTCAACTGCTCAACT:1 - chr3R 18009310 3' - 3S18 115 2 62.38 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAA:1 + chr3R 11119875 3' - 297 25 2 57.43 CAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGCCCCCACTGAGTTACGTTGCCACCCGTG:1 + chrX 12994997 3' + HMS-Beagle 6644 1 75.51 AGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACATATATTTAGTAATCCATGGTGGAAATATATTTTAAAGGATGCCAATTTGGTAAGCC:1 - chr3R 10240078 3' - invader4 18 2 62.38 CGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCAGGACTTGCCGAACTCGACATAAGTGGCAATTTATGTGGTGCTGGCTGCTGTCTCACTGTTGCTGCACTGCTCG:1 + chr3R 7184615 3' - F-element 4506 1 77.23 ACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGCAATACCTGACGAGTGTAAAACTCCTTGAA:1 + chrX 7509658 3' - 412 7267 2 74.26 AACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACC:1 - chr2R 12185347 3' + accord 7337 2 71.29 TAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAGGAT:1 - chr3L 10081918 3' - rover 6962 2 66.34 ATGGANGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACATACAGCTAATTCAGCGAACGAGGTGCAGGCAAACTAGTAACGAGGAGAACGCCG:1 + chr3L 10791828 3' + Porto1 4268 1 66.34 CCTCAGTATTTGAACAATAGTTATATTTCGGGAGAGCCCCGCTGTTGGGTTGGTTATTACAGGGAGAGTAGTTGCTTCTTAGACTGCGGTGTCTGCGTGCC:1 + chr3R 851774 3' - 297 6809 2 56.44 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATGACTGCTCTGTTATATTTTAGAAAATACTTTGAAGTTTCGACCATAAATAGTTATTGTTTATAGGTTT:1 - chrX 11730242 3' + jockey 4983 1 69.31 GGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATGATGCCGTTCTGAGTGGATTTTAATTAAATTTGGTTT:1 + chr2L 21010820 3' + opus 7283 2 61.86 ATTAATAACAATAATAATAATAATAACAATAATATTATACAGTACAATGCAATGGATCAACTCTGCTCTACTTATGTTGATAAAATAGTAT:1 + chr3L 18284697 3' + mdg1 28 2 59.34 AATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGT:1 + chrX 22945349 3' - BS 33 1 54.46 ATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTATTTGTTGTTTCGTATATTTCTATAAAAGTTTTCGAGTTTGGTTTTCCTAATTAGGTGTT:1 - chrX 9174612 3' - I-element 164 1 62.38 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGTTTGCTTATTAAATC:1 + chr2R 23584811 3' - HMS-Beagle 6828 2 58.42 AAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGCGCCGACGTCGGGGAGAGTTCACGTGAGAGCCGATTGAACTGTCACGG:1 + chr2R 11527928 3' + P-element 312 1 49.00 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGG:1 - chr2L 18212137 3' - 412 7088 2 64.95 CCATATTATTATTATTATTAATAAATATTGCCATATTTATGTATATATTTAATTAGTTTATAGTTGAAAGAAGCACAGTCGACTGTGATTATTAGCACATT:1 + chr3L 27411694 3' - mdg1 7090 2 86.14 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCCTGCCCTCCTGTCCTG:1 - chr3R 27775084 3' - roo 8693 2 58.59 TAAACNACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGACACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAG:1 - chr3L 16973366 3' - S-element 1538 1 56.00 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGG:1 + chrX 13640666 3' + P-element 2838 1 21.35 TCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGATATTCGCAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGTGTGCCAACATTATATTATGGTGGCCATGGCCACC:1 - chrX 7567705 3' + Juan 84 1 65.35 CGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGTCCTGCATTTTTTTTTTGCCTCTTATAAGTAGGCAATAAAAATGTTCATTTCC:1 - chrX 7045573 3' - jockey 4759 1 74.26 ATATAAATTATAAATTACAACACATATATTCTCATTTATGTTCACATAATGAGGCCATTTATTAAATTCAATTATTTTGTTGACATCGGTGCGGTACGAAA:1 - chr2L 6388229 3' + copia 255 1 79.21 CGATTNCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGTTGTAAAATCTGTGG:1 - chr2L 6888571 3' - jockey 10 1 75.25 ATGAAGTGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATC:1 - chr3L 18337651 3' + Juan 4182 1 56.44 TGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAAC:1 + chr3R 13582268 3' + BS 5047 1 71.29 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTTGGTGAGCTG:1 - chr2R 20739423 3' - roo 14 2 66.34 ACTTGGACAACCCTAAAGACCCCCTCGAAAATATAAGACTGTCTACTAGTGTATGGAGGGTCCATCATTCCCACAAAATAGGAATATATGAACTTTTTGTT:1 + chr2R 10568485 3' + BS 4950 1 77.23 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAGTGGCTAGGAACATGAGGAATGGCCTCATGGACACATGGAAAATGGA:1 - chr2R 12457892 3' - roo 8669 2 74.26 TAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATATTTAGTATATAAACTCATTCCGGTTGGTTCAATTGTCACGTAGTGGACATGAGCAAA:1 - chr2L 12474945 3' + mdg3 236 2 64.36 GGCAAACGAAAAAAAAAAACAGGCTGAATTTATCTACAGAGCCACGCCCCAGAATATCCGAGCTGGAATACAAGAAAAAACAGAAGCTGAATCCTGCAAAA:1 + chrX 7355096 3' - FB 885 1 62.38 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAATTTTCCACCGACTTTAGACGACAAAAATGTAATCCTGTGTGAAGTAAAAG:1 - chr2R 9678144 3' - FB 27 1 53.47 TCGACTTGTTCACGTTGACGTTGCTCACGAGTTTTGTTTTGCATTTTAATTTCACTGATTTTGTGATGTTAATTTTACATTAGTTGGAGAGCAGCACGAAA:1 - chr2R 5206895 3' - Doc4-element 20 1 58.42 GAATAAATATATGTCAGCCCGCCGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATC:1 + chr2L 2060172 3' + 412 438 2 72.28 AACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATTAAAGATAAAGATTTACTGCAAGAAGAGTCCTTTTTTTTGTTTTGGTTAACAAAGCG:1 - chrX 13018399 3' - Cr1a 4174 1 50.50 AGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAA:1 - chr3R 21092445 3' + roo 9042 1 55.45 GGGTACTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAATAAGTTTATATTTTACTTTAATATAAACGGCGATTTTAGCATCATTTGTAGTTGTGGCACTTC:1 + chr3L 21878395 3' - invader2 5098 2 62.38 AACAGATACCCGTTACTCAGTTAGTCGAGGTGTGAAAGAGATATTGCAGTAAAAATGAAGAAGAAATTAAAATGCTGGAAGTGGATTGAAACTGTGGGTAA:1 + chr3L 22016587 3' - INE-1 545 1 55.45 TTTTTATTTTTTTATTTAATAATACAAACATTCAATGTTCGGGGAAGGTCAAGAATATTTTCAACTAATTGTTGTTTCCGGTGGGATTTCGGTTATGGATC:1 + chrX 159066 3' + hopper 154 1 71.29 GAGGTTTGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAG:1 - chrX 20806873 3' + opus 463 2 69.00 CAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTACAAAAAACGGCACTTTAAGTGATTTCTGTTG:2 + chr2L 6454780 3' + mdg1 376 2 69.31 TGGTAGCTGAAGTGTGTTGCGGCGAGTTGCTGCCCACAACACAGTCACCTCGTTGCCGGCCTCCATCTGTGGTGTCAGCTTGTTTCGTAACTAATTCCC:1 - chr3R 5026120 3' - Chouto 495 1 55.56 GGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTCGCGATTTGAAGCTATAATTAGATGAGGTA:1 + chr3R 20137364 3' + Burdock 6388 2 74.26 GTTGTCTTTTCCAACAAGTTCAATTATTTTGTTTACAAAAACATTCGAGCTTTTCTCTCGAATGTATATAGGTGTGGGCTTTGGCTTCTTTTTGTCCCCTT:1 - chr3L 25552487 3' - Fw3 37 1 86.14 TTTCTTGCATGGTGATGTCTGTCTAACTGGTAAATTGTATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chrX 3538815 3' + hopper2 259 1 63.37 AAAAGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACGCATAAAATTCCATATACATACTTATCAAACAAAAACTGAGCAACTGTAACTTCTGGCTTA:1 - chrX 15245033 3' + ZAM 8107 2 69.31 AACGCAGACATCGAGCGGTCAATAAACAATAATAAAAGCGGCAGGCGGAAGACCCCCC:1 + chr3R 24509931 3' + F-element 300 1 63.79 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCTCACTTTTTGATCACCGCATTGGCAGTCGCGTCCTGGGTGAAGTGGAATATCCTCAGGCGATGGTACGA:1 + chrX 17819285 3' + P-element 2806 1 75.25 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTC:1 - chr2R 23571636 3' + roo 9036 1 61.00 ATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGTGCTAAAAGGGAAAATTAGGGTCTTACATCGGCTGTGGATGAGCAGGACAAATCCATTGACTTTAACCAAAG:1 + chr3L 20047560 3' + invader3 5374 2 64.36 ACTAACATCTGGGCCTCATCTTCAATAGCTACACTTAATCTTTCGCCGCTCTCTGTTTTCTCGTCCATGTATTATTTAGCACGCAATCTGGGTTTATGGGA:1 + chr3L 3758683 3' + Circe 14 2 69.31 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAA:1 + chr2L 12324106 3' - roo 27 2 54.46 CAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGCAGTGTGTTCAATTCTTAGCTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTGCGTTTTTTCGATGATCCTGCCTCCTGTT:1 + chrX 839934 3' - hopper2 1181 2 76.24 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGTCAAAAAAACTTTAATCATTCGTAATGGCC:1 - chr3R 11544352 3' + hobo 2919 1 57.53 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCA:1 - chr2L 23372625 3' + 1360 3353 1 66.34 AAGACACAGACGTCCGCACTCAAAGAGATATAGTCGGTGACCACAATATCAAACACAAAAACAACTTCTACACATCAATTAAATAAATAAAATAATTTCAT:1 - chr2R 7434939 3' - Ivk 22 1 60.40 AATATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACA:1 - chr2L 22092967 3' - INE-1 548 1 50.50 AAAATTAAATTTAAATTTAAATATTTATTTTTCTTTTTGTAACATTTTAGGTCACGGTGCACTTCTTGCCATTGTCGACATCACATATCACGCACGCATCC:1 + chr4 1056705 3' - Rt1b 125 1 59.41 GAGTGTTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACCTTGGCCAC:1 - chr2L 16201497 3' - hobo 14 1 62.77 TGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCAAGAAATTGGGGTTCTAATAATTGTTTATCTTATGTGCTAAGGCATTCT:1 + chrX 22000039 3' + 1360 181 1 56.44 ACACGNCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAGCAGA:1 - chrX 16995088 3' - jockey 21 1 64.36 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCTCATGTGTTG:2 + chr3L 11553554 3' + P-element 2860 1 41.58 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAATTCGTGCATGCGGATTTTCTTTTCAAATATATATAATTATAATAT:1 - chr2L 13574196 3' + pogo 2077 1 53.47 GATATNTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCA:1 - chr3R 12539510 3' + roo 359 2 73.27 CGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACCTTGGGATTCGAATATTCTCTAACAATAATAAATTTTCTTTATATTTTTCCCAATAATTTTTATCTTC:1 - chr3R 19446022 3' + P-element 174 1 76.24 TTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCCTGATCAAACATAGGCCACAGTGGCCATAAAAAGTGTGTATAAACAGACTAATAAAAAA:1 + chr3L 2144399 3' + copia 239 1 62.38 AAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATATCTTTCGTTATCTAAGCTCCCTCTCACGAAAGCTCTCTCTTGTACTCTCTTTCTCACCTAAAC:1 + chr4 909063 3' - 1360 3309 1 68.32 ACCCATTTCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACTTTTTGCGGTTAAGCTAAGTGCGCTCCGAGTAGCTAAATAAATCGCGGGATACGACTTGAGGTCTTTG:1 - chr3L 15448615 3' + R1A1-element 5021 1 71.29 GCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTATATATATAGCTCTCAACTTTCTGGCTTTTAC:1 + chr3L 23123589 3' - flea 4795 2 75.25 ATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGAAATCATACAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGACAGTTGCCATGGCTGGGGGATCTG:1 + chr3R 7020682 3' + F-element 4272 1 74.26 ACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACATCCAAAGATCTATCCCATTCGATGCG:1 - chr3L 730382 3' + Quasimodo 6957 2 74.26 ATTAAATTTAATGAAATGCCTGGAAAGAGATTGGCTTTTGAAGTTACCCAATTAATAAACTCCAAAGATGAAGAACAAAATTACAATAGTTTCAGCTCACT:1 + chr3R 613226 3' + S-element 389 1 60.40 TGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATATTGTCCAATTCTTAGTTTCATATTGCATTTATTTCAGTTTAATTTAAT:1 - chr3L 9766334 3' - blood 7035 2 56.44 TTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGAACACTAATTTAAATTTGGCATTTAGATGCAACTTTGGCACTGAATTAGCTTTTGTTAAACTTTTCGATTTCTCA:1 - chr2L 19901993 3' - G2 3044 1 73.27 AATCANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCAT:1 - chr3L 12103789 3' + roo 9038 1 60.40 CGTTTTTAATTTCAGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCCTGTAAAGGGCCGAATTGAT:1 - chr2L 20924117 3' + Max-element 8478 2 76.24 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTGGA:1 - chr3R 10751615 3' + hopper 1406 2 68.32 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGTTTGTTTGTAGCGAGTTGG:1 - chr2L 513668 3' - roo 8699 2 65.35 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAA:1 + chr3R 10147875 3' + roo 9022 2 78.35 ACTTCACCCAACCATCCTTTCAATTGCGCTCGCCGACGCTCCGTCCGCCTCTTCCCGCCTGCCACGCCCCCTTACCGCTCCCCGTTGGCCAGATCTTGCCG:1 + chr3L 16211697 3' - invader2 340 1 60.40 AGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACCTACTCAGTTTTTGTTTTTGTTTTTTAATTTTATGGCATTTTCAGGGTCTCTGC:1 + chr3R 8924397 3' - INE-1 576 1 63.37 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTGATATAAAATCAAGAGAACACGGTTCTGAGTATTACTGCATTTC:1 - chr2R 1072565 3' - pogo 31 1 63.37 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCGGTGGAACAGTGTGCCCGA:1 + chr2L 285761 3' + P-element 2865 1 57.43 CTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGTTGCAAAAGTGCGCGAAATGAGGCAACAGATGGTGCAATTAAAAAAGCCTGGACAACAATTTCAC:1 + chr2R 4723096 3' + Tc1 148 1 58.42 GATATGTGTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGCGGGGGCATTCATTGGGGGGTTAAGGGGGATCCTGCTGTTGGCCGGGGATTTCCCT:1 - chrX 2805586 3' - Quasimodo 40 5 84.09 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACTAGCTGGTGTGCAGTGGTGTTAGTGCCCCAT:1 - chr2L 13319584 3' + hobo 2898 1 66.34 TTTAAATTAAAATCTGTTTTTTTTTTTAAATTAA:1 - chr3L 25761125 3' - Porto1 4655 1 61.76 TGGAAACACTTGGACCCTTAAAATAGTATTGAAGATTATTGCTGTTCGATTTGCTCGTATAATTCGAGTCAGACTCATCACAAATGTCCGTTGAGCAGGGT:1 + chr2R 13454718 3' - Helena 93 1 65.35 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACAATT:1 + chr3R 6735353 3' + copia 240 1 63.37 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAGCATCAAA:1 + chr2L 20133077 3' + flea 4998 2 65.35 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 418 2 62.24 ATGACNAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAA:1 - chrX 21668959 3' + mdg1 7416 2 67.33 GATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAATCAGTGTCAGTGGTCTGGGATTATACCAGTCGCGTGTGG:1 - chr2R 22719849 3' - accord2 7295 1 64.36 TATATATAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAATTATATA:1 + chr3L 19951286 3' + Ivk 5371 1 68.32 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACT:1 - chrX 13546654 3' - roo 50 2 80.20 TCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAAGTTTATTAAAAGATTCATTATCTTATTGCCACACAT:1 + chr2L 7488960 3' + roo 411 1 78.22 GTTTTTTTTTGTATTTTTTTTTGTATTTTTTGTTGTATTTCTCACCACCCATCGGCCAACGCCTTTTGTGCGTGCGTGTTCTTCCGATTTGATTTTCCATT:1 - chrX 8327749 3' - HMS-Beagle2 488 10 74.26 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCGCAAACACAATTTAAATGTGAATGA:1 - chr2L 13333994 3' + flea 5009 2 67.33 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGT:1 - chr3R 7168567 3' - flea 32 2 62.38 ATTTTCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAATAGATGAGAACGTGCGTATGTGTGTGCATGTGTGCATGTGTGCATGTGTGCTGACTGCTGAGTTTTGGCATTT:1 - chr3R 27462112 3' - 1360 3254 1 56.44 GTGGGGTTTGAATTAACTCATTGAGTATTGTTTAGGCTTATACATACTCAAAGTAATCATTCAAAGCGATCGACTACGCCTAGTGATGTTAAATATGCTAA:1 + chrX 922213 3' - P-element 2733 1 74.26 GCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACTTCCCCCCCGCTCCTACCCGCGACTTTTGCGTCTCAAAATATTGCTTCTCGGTTTTTCTCAGCAGTTCCGGTCC:1 + chr3L 19627697 3' - invader1 156 2 53.47 ATGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACAGTATGTGTGCGTTTCGCTTGGCTATTAAATTTCCAGTTCAATGATTAACGAAATTTATGTTTCGG:1 + chrX 992110 3' + hobo 2931 1 71.29 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATTTTACACAAATCG:3 + chr2L 12667235 3' + blood 339 2 65.35 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCCTTTTGTTTTGCCAGCAACGCGAAATTTTCATTTAATGAAAAGCTACGCATCATCAAATGTT:2 + chr2R 14778525 3' + mdg1 7445 2 64.36 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGGTATATAAAGAAGCTGCCAGTGCCATGT:1 - chr2L 1625662 3' + hobo 2891 1 73.27 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGGGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCG:1 - chr3L 19951185 3' - Ivk 17 1 62.38 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATG:1 + chr2L 12475022 3' - mdg3 5302 2 70.30 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTTT:1 + chrX 5092992 3' + roo 387 2 45.54 ATTAATCCTGATCAAGAATATAATATATACTTTATATAGTCGAAAACGCTTCCTTTTGCTTGTTACATACTTTTCAAACAATTCAATATAAGAATTCTAGA:1 - chrX 22496969 3' - INE-1 83 1 75.25 AACTGGTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGTCGTATTCCCG:1 + chr2R 21773640 3' - Max-element 8242 2 67.33 ATATTCCAGAGATACCAGTCTATGACGCTAAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACA:1 + chrX 292404 3' + G3 4247 1 73.27 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGCATACTTT:1 + chr3L 10013653 3' + hopper 1392 1 56.44 CAGCTGTTATTATAGCAGTGCATAAATCGGAAATTTCGCAACTGTACTTCATTTTCCATACCGCTTTAACTTTACGACCATGACAATCGTAAATAAGGCCA:1 - chr3L 10675321 3' + hopper 1278 1 67.33 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAA:1 + chr3R 27981732 3' + roo 9041 1 57.43 CAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACTCAGTTTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACCCTTATCACTTAAAACTAAATTTTTGACGCAAACAAAG:1 + chr3R 21971223 3' + I-element 12 1 70.30 AAAGTNCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACACACCCACACGACGACAACTGTCCGTTTGAGTAATGTGTAATGGCTATGG:1 - chr3R 13225470 3' - hobo 4 1 75.25 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAG:1 + chrX 2753880 3' + roo 9024 2 72.28 CCGGGGGTATGATTTGGCACTCGTGAGCGTCTGACACGACGGTGAAGTATGCATTGTTCCGCTGAGCTAAATGGTTTGTTTGCTTTCCCAACTCGGCTTGG:1 + chr3R 6625338 3' - Doc3-element 326 1 61.39 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGAACGAAGATATGGAATCA:1 + chr2L 12324081 3' - roo 52 2 76.24 AGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGGC:1 - chrX 23078687 3' - INE-1 557 1 79.21 AAGAAGATTAAAACGCAGAACTCCAACAGAATTTAACAATTTTATTGTAATGGTGTCTTGAATTTGGTTAACCAATGTGGCAAACTTTCATTGTTATTAGT:1 - chr3L 9916355 3' + Porto1 4521 1 71.29 ATTGATCCTGATCAAGAATGTATATATGTTTATATGTATAGTATACCCTATTAATTTACGAGTAACGGGTATAACAATCCGAGTCGAAATCATAATTTTTA:1 - chrX 15903169 3' - INE-1 83 1 65.35 TGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGAAATG:1 - chr3L 18500937 3' - hobo 20 1 57.43 GCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACAATACGACCATGGATATTCGATATCGTTTCGGCCAGCCAAACATCTTACCTAACTTGGCCGGATTTA:1 - chr2R 14217708 3' + Tc1 1634 1 65.35 AATTTACTTGGCTTTACTTTACTTTTCTTCTCTTTAATGAAGAAAAGAGTTTACTTATGCCAATGCCTGCAGAGCCTTGCTGTATCATCAGTTTCTGGATG:1 + chr3L 12805436 3' - TART-A 13130 1 57.43 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAG:1 - chr2R 14675554 3' + roo 9030 1 68.32 ATGAAATTAAAAAGCAAAAACAACAATGCCAGCAATAAAGACAAACGGGGAGAATCTGCAAATCGCAGAAAGTG:1 - chrX 10500665 3' + P-element 2645 1 83.78 AAAGCTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGCTCGGTCCCTGACGTAATTAAACCTTAGGTCCAGGCGGAAGTTGCTAAACAAAAAGAGGAGGAACTGACAAA:1 - chr3R 25566713 3' + G2 2606 1 71.29 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAAC:1 - chr2L 17210272 3' + jockey 4967 1 53.47 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAGTTTTATTCACATTTCTGCATTTTAGATGGGATGGCC:1 - chr2L 11703216 3' + Tabor 470 2 63.37 TTGCTTGACTCCGGCTCGCAACTACACATAATCACCTCTCGTCTGGCACACACTTTGCAATTGCCCAAGGACATCGCTCAGTGAGTGCGGTGGGGTGGG:1 - chrX 11048397 3' + G3 464 1 69.70 AGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGGAGTTTGTCAAATTTTTACATTGCTGCATCGATTTTTTCGTGCCG:1 + chr3L 4102322 3' + P-element 50 1 47.52 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:2 + chr3R 1977611 3' + micropia 5400 2 63.37 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATAGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATT:1 - chr3R 15072591 3' - pogo 48 1 75.25 GGTCTCAGGAACTATAAAAGCAAGAAGGTAGAGATTATGCATACATATACCGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACTCTAACGTCCACAAA:1 + chr2R 1764014 3' + INE-1 150 1 66.67 CAAAATAAATAGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAAAAATGAAAAAAAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAATA:1 - chr2L 10673199 3' + HeT-A 6016 2 70.30 AGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACGTACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGTTGAAACA:1 + chr2R 13644527 3' - Burdock 6140 2 73.27 GCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAACCGATTAGCGTCCGAGTCC:1 - chr2L 13710434 3' - 1360 3246 1 81.19 CAGAGCTCGCCCACCAAGAAGGCTGCACAGGAGGCAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCTTGACGAGAGCCAGGCGTTGAAGAAGAAAACGGACAAATGG:1 + chr2R 5266139 3' + BS3 1537 1 67.33 CTCCAACAAAAATTCTAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAAT:1 - chr3L 25272573 3' - 1360 88 1 71.29 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAG:1 - chrX 17968357 3' - Tirant 8135 2 55.45 TGGTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATAT:1 - chr2L 17784639 3' - gypsy10 46 2 67.33 TAGGGTAGTGGCCTAGCAACAGCCGCGATGCAGGGCGGCCAGGGTAAAGCGGAGAGACCGTGAACTGCCTCCGGGCGACAAATGGCCGGACTTTGTGACAC:1 - chr3L 17840358 3' + gypsy8 4685 2 59.41 ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACA:1 - chrX 21474412 3' - 1731 32 2 67.33 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTT:1 + chr3L 9909789 3' - Transpac 10 2 69.31 CTTGACAGCAGCAATTAGTTTAGCAGTTTCGTTGTCACTGTGGTACCCCCAGCTTGGATGCGAGCTGTCTCCACCCGCTTCCTGCTT:1 + chr2R 4932052 3' - G7 173 1 71.26 TTTATGTCAAGTTCCGGTCAGGCAGGTCTTGAGGGACTGGGAAAACCACTACCCAGCTAAGATCTCGCTGTGAAAGTGAAACTCTTGTGGCATAATTTGTA:1 + chr3R 24888659 3' - jockey2 3201 1 69.31 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAAGT:1 - chr2L 14790566 3' - roo 18 2 61.39 GAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCAGACTATAAGCTACTGCACTGCGTATCAAAGGTATTGAAGGCAATCTGAAGAAACAGCAAAGAAAAGGCTTATGTG:1 - chr2R 4753736 3' - INE-1 575 1 75.25 CTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAAAATTAAAACGCATCGACACTAGCAATTTTAT:1 + chr4 184056 3' - 1360 139 1 60.40 AATTTTAAAATTAAAATGAAAAGTTATCGTAAAAGACGATTACAAAAATGGTAGTAATTCAAAATTACTACTCTTTTCAAATTTCAGGCCAAGTGTGTTCC:1 - chr3L 18137688 3' + 1360 3041 1 44.55 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAAATACTTAAAACAGAGAAAGAAGCAAAAGGCAGAGGCACGGTTA:1 - chr2R 1654420 3' + Juan 4181 1 59.41 AACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCGCGCTCCTCCATGGCGGTGCAGCGCAGGTCCAGCTGGTCCAAAATGTTCT:1 + chr2R 5798160 3' - P-element 428 1 57.43 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGG:1 - chr3L 12888225 3' + mdg1 7423 2 62.38 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAATT:1 + chr2L 513733 3' + roo 9039 1 58.42 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCC:2 + chr2R 21773624 3' - Max-element 23 2 51.49 AAATTCAAAATAAAACTTAAAATGATTCTTATAGCTAACAAAGACTCACCGCGGCCACGCGAATATGCTGTGTTTGATGATGATGGCATTTCCTTTGGTAG:1 + chr3R 6878822 3' + Rt1b 91 1 75.25 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATG:1 + chr2R 11528061 3' - P-element 45 1 36.63 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGAAAATTTTAACTTTACGTGGTTACGAGGGTAA:1 + chrX 11730355 3' - jockey 4765 1 72.28 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTCCAGCATAACTGCCAGGTCGGCCACGGCCAGACCCGTGAGTATGGCATTCGTGGGGGAGCGCATC:1 - chr3L 2342741 3' - mdg1 7056 2 73.27 AATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAATTTAACATTTGTTTTAAGAGAGAGAGAGAAAATATAATGAGAA:1 - chr2L 4989166 3' + S-element 119 2 57.43 AATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATATGGCGAATGGAACGACCATTTGTTCAGGAGGCCTCGCGGTGACGTGT:1 + chr3R 7388129 3' - Quasimodo 306 2 54.46 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAAACTTTTCGTTGCGGTTGTGTTGGCACC:1 - chr2L 16201505 3' - hobo 26 1 54.08 ATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTGCGGTTTTTTGAGAAATTTCATTCTCACACATCTTATTCTCCTC:1 - chrX 17497341 3' - hopper 959 1 79.21 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATGGAATTAAGTTTAAGATACACTCATG:1 + chrX 15305693 3' - roo 46 2 72.28 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTAAATAATCTATATCAAAATTTTGTTAACCAATTG:1 - chrX 15082394 3' + mdg1 7416 2 65.35 AGTGGTCGAATTGTCGGTTGTTCAAACAAAATGATCCACAATGCACTGCTGTTTCTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCAAC:1 + chrX 9713844 3' + Tc1 440 1 53.47 TGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCAATTCATTGATCTCCATACCAGTGCTCGTAAGTAAAGCCGCATGCCTATCATCTTCTGGTGT:1 + chr2R 4818512 3' - accord 98 2 65.35 TAATTTCTTTTGTTTTGTTTTGTTGAATCTCCTCTGTCTTCACTGGCGCGTCTTCCTCTTCAGTTTTCCGCTTTTCAGCTGCGCTGCCAAACCAAACCGTA:1 - chr2L 16601937 3' + Tc3 87 1 62.38 TTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 5327 1 54.46 GTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCACCTCATTTCGCGCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAAGAGGTTAAACTAATGTCTTAGACAAAACACCCG:1 - chr3R 5169627 3' - Tc1 210 1 69.31 CCCGACTATTGGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATGTGATCGCGAAATTTTATAATTTTTCTATGGAATCGAGCAAGAGCATAATAAAGCAGATATTA:1 - chr3R 19487598 3' - INE-1 552 1 74.26 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGT:1 - chr2R 981625 3' + 1360 3387 2 62.00 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACCCAAATGGAATCTCTAATTTTATTCTGTCAATCATTTCGGTTCTTTCCTTTTTTGAATG:1 - chr3L 9909683 3' + Transpac 5211 2 61.39 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTT:1 + chr3R 27775158 3' + roo 9044 1 52.48 GGACGGTAAATTAATTAATAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGTGCTGGACAGGCAAAATGACAATGCGGTAAC:1 - chr2R 5266782 3' - Cr1a 3988 1 79.21 GCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCTTGTCAGTTGAATTTGCATGCACATGCATTGAGGGTAATTGGATTTAAGTTGCATCTACAT:1 + chr3L 1584982 3' - Doc 368 1 59.41 TTACTGGCGCCCGAACAGGGGCAGAGAAAAATTCTAAGTTGCGTAGACAAGTGTAAACTTTTGCATTAAAAAAATTTAAAAACAAATGGCTG:1 + chr3L 27347271 3' + HMS-Beagle2 328 1 59.78 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAAGGTAAGCCCAAAGCATTTTAAA:1 + chr2R 24628857 3' - mdg1 3 2 76.24 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGA:1 + chr2L 12949294 3' - 412 7070 2 61.39 CTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAATTATGTTTCCGCTTGGCTTTGTTCCAGTACTTTGCCACAAA:1 + chr3L 9606008 3' + accord 143 2 58.42 GAGCANGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGAGTTTAAGTTGGGATACAAGCGAAAGAAGCT:1 + chr2L 13880883 3' - F-element 4219 1 81.19 TCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACAAGTTTTGGGCGCCAGATGGAACAAACTGATTTTAATTGGTCTGCTTGTTACGAG:1 - chr2L 22699408 3' + INE-1 578 1 79.21 GGAGAGCTCTACAGCGAACAGCTCGTTTACACGCATCCTCTTCTGCGCCTCCTGATAACTGCAGCAATTGTCGCACTTGAACTTGTTGTCCGAGCACAGGG:1 - chr3R 22775780 3' + 1360 121 1 75.25 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAAC:1 + chr2L 12949254 3' - 412 7110 2 80.20 TTTTAAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAA:1 - chrX 22398535 3' + Gypsy6A_LTR 155 1 58.42 GACCAATATAATTATGATAATCGTTGTCCCTTCGGAAATGCTTTTCTCGATGCTTTTCTTCTATTTCTCAACTTCACTCAATTGCTTTATCCTTGCTTCGA:1 - chr2R 4078870 3' - rooA 7155 1 78.22 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATTCTTAATAAGTACATACAACCAC:1 + chr4 1149907 3' - 297 47 2 84.16 AAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTTATTGCTTGCATTCTTTGTTGCACAGCACATTTCCGTATGAAATATATTATTAA:1 - chr3R 19449829 3' + roo 9052 2 59.41 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAACGCTCTTAGCTG:1 + chr3R 10277292 3' - Doc 37 1 53.47 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCTGCTTGA:1 + chr3L 12888314 3' - mdg1 7046 2 71.29 AAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTACGATTTTTTATATATGAGAATTATAAC:1 - chr3R 8975923 3' - Bari1 16 1 64.36 GCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCACCAGCTGCTTGTCCCGCTCCAGCTGCGCCCGCTCCAG:1 - chrX 16726313 3' - flea 4851 1 66.34 TAAATGGTTTATAATTCTCCTCAGAATCACAAATTTGATCGTCGTAATA:1 - chrX 8426073 3' + HeT-A 128 1 91.84 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAG:1 + chr2L 12949291 3' - 412 7073 2 58.42 CGGAAAGAGAGCAATTTTCGCCGTCACTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCAAAACCAGTGAATGCAACAGGAAAAATATGATCACAAAACACAGCGTGAAGA:1 - chr3L 12996649 3' + 1360 3314 1 58.42 ATATATATACATACATATATCTCCGTCTTTCGAGAGATACTCAAGTTCATGGCCAACACTATTGTGTGTTAGCAATGTGTGTTAGCAATATCATTTCAATT:1 - chr2R 7606404 3' - 1731 4409 1 52.48 GACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACATTCGCATGGCTATTTGGCGCTGCATACTTTTAGGAGGAGTTCAG:1 + chr2R 17345958 3' - jockey 22 1 64.36 TAACGTGCCAGAAAGCGTTTCGTTGAGGAAACAGAGGAAGACTCTTGTAACGAGGAGTCTACAGCAATTTGTTGTGACTACAACAGCAGCGGGAGCAGCA:1 - chrX 6179729 3' + invader5 275 2 69.00 TTCATTTACCATTTCGGGATATTCGTTTTTGTTAAATTTTTGGCTAATATTATGATAACGAATATTTAATAGCATTCATTTATATATTTATTTACATAAAC:1 + chrX 3402999 3' - G4 118 1 57.43 CTTAAGAGCATAGCTCTAGCGGCCCCTTTAGTGCCCTACGTCAGGAGAAACATCAGCCGATTGCTTTCCCTTTTTATGGATTTACCTGGTGCGTTCACTGC:1 + chr2L 11776666 3' - gypsy12 9879 2 59.41 TCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTTGCTACCTTTTTTATGAAGATCACAAAGGACTCCTTCCAGTAGCCTTGGATATCATAATTACACTGAGCTCATCCTCA:1 + chr3R 17922855 3' - Q-element 93 2 61.39 TATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAATTTTCTATGTTTGCTTTTGCTTCGTTTGCGTTTTCTTCTTGTCTCATTTGTGCAATGCAAT:1 - chr2L 16976802 3' - G2 3047 1 60.40 ATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGT:1 - chr3R 9131764 3' + roo 9034 1 63.37 GGGGGGGGGGGCATTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTT:1 + chr3R 6608830 3' - G-element 4251 1 65.35 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACAACGGTAGTGAAATCTTTATT:2 - chr3R 10203592 3' - jockey 9 1 72.28 TGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGAGACCAAGCGGGCCAACTACTATA:1 - chr3L 19454644 3' - diver 14 2 68.32 TCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAAAGAAGACA:1 - chr3R 17495733 3' - Quasimodo 5 2 73.27 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGAGCGGCTGGAAGGACATATGTGGATGCAATGTGGCGTCCAGTTGGCCAACGGCCGCCGCAACAAAC:1 + chr3L 13548883 3' + hobo 2930 1 71.29 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCC:1 + chr3L 18706931 3' + jockey 4951 1 60.40 CAGCGGTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTATTAAAAAAATAAAAGCCACGAATCTCCTGCTTTGACAGTTGCCAAAAT:1 - chr3R 30771645 3' + Ivk 239 1 61.39 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTT:1 + chr2L 20133053 3' + flea 4995 2 63.75 CGTTANGCATCTTGTTATTCTACTGGCATAAGTGAACCCACAATATGATAAACCTTGAATCTGTCGAAATTAAGGTAAATGCACTGTTGTCAAACCGCTTT:1 + chr3R 3625758 3' + 1360 3379 2 79.21 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATCTGTCATTCGAAACAACCAATGGTAAAGAATATGTTTAT:1 - chr2L 13136713 3' - roo 8677 2 66.34 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTT:1 + chr3R 13376017 3' + 1360 3345 1 76.84 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAATAGAAGGCAGCTATTTGCGGCATATTTTAC:1 + chr3L 10143258 3' + 297 388 2 74.26 CAACAACAAAAAAGAAAAAAAAACACATTCACATTTTAAATTGCGTGTACTTTTATGCGTACGCACACATAACATACACATGTACATATGAATTCG:1 + chrX 3080945 3' + gypsy7 5003 1 58.33 TTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCGTTGATATGAACAGAGTAGAGATGAG:1 - chr2R 981512 3' - Doc 4455 1 74.26 TTAAAGAAATATTCAAAGTATTTTGAATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTACCCTCCTTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTTTTGTTTGGTGTTGTTGTTTTTC:1 + chr3R 23295170 3' + Cr1a 169 1 82.18 TTTGATTGACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAAGGAAGAAAAAGTTCATTGAGATATTAA:1 + chr3R 9727089 3' - Idefix 437 2 79.21 ATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGG:2 + chr3R 1977609 3' + micropia 5398 2 65.35 AACCACTTCTTTAGTTAAGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTAGTAATTCTTTCTTGCCTGAACTGATTCTAGTTTAAGATTTAGCTATATAAGCAT:1 - chrX 14851039 3' - invader3 355 1 56.44 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAATCTTATTTTAGTA:1 + chr2L 20133057 3' + flea 219 2 67.33 TATTTTATTTATTTAAAAATACAATTTTTTGTACAAAAGCAGCTTTGAGTTGTCTAATCAAACGCGTGCAGAGTGTTGATAAAGAACTATTTACACAATGT:1 + chr3L 8856946 3' - G7 1141 1 73.27 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACCCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAA:1 - chr3L 15100691 3' + pogo 2049 1 76.24 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTCTTATTATTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTT:1 - chr2R 7418830 3' - Doc 49 1 68.32 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTACAATATTTTAAAACTTCTATCTTAA:2 - chr3R 12539464 3' + roo 406 1 78.22 TTACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCTTATCCTGTTGCAGTTTTTGCAAATTATCGCGAGATCCATATCAGATAATTTGTCTGCGAAGAAATTAATTT:1 - chr2R 4745958 3' - Doc3-element 4595 1 75.25 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGTTTGTTTGTAGCGAGTTGGTCATTCAATAATTCTACAATTTTCTTACTAAATTT:1 - chr2L 513633 3' - roo 8664 1 76.24 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCT:2 - chr3L 7075897 3' + roo 9020 2 78.22 GGTCANCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGAAAGCCTTGAGAAGCCGACCGACTTTTAATTGCATACTT:1 + chr3L 22039760 3' - jockey 4706 1 63.00 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCTTTTGATGGCCCACTGACATTTTCGGCGGCCTGT:2 - chr3L 10143136 3' - 297 6 2 74.26 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACTTTCAA:1 - chr3R 17896950 3' - hobo 32 1 70.21 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGCCGAAAAAAGGCTTATTCGCCCACAC:1 + chr3R 12539587 3' - roo 8669 2 74.75 TCACAATTAAAGAACAAAACAATGGGAGGTGTCGAATGAGGAGGAAGGAA:1 - chr3R 18210676 3' - Juan 85 1 68.00 ACTATATATAAAAAATATTTTTTGTCACATAAGTTAGATTAGTAAAGTAACCAACCAACTGAGAACAACACTTTCGTAGAGGCCAATCGAG:1 - chr3R 24673652 3' + Transib5 2724 1 61.54 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTCGAAATGAGAGGCTCCGCCCGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTATGT:1 + chr3L 3695302 3' + pogo 2080 1 56.44 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCC:1 - chr3L 12888209 3' + mdg1 401 2 58.42 GATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACACATGCTGGGCACATACATAATTGAGCACGGCACTTGGACAAC:1 - chr2L 16945011 3' + accord 166 2 52.27 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTTCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGA:1 - chr3R 19446126 3' - 297 6586 2 71.29 TGGGGGACACAGTATGGGCAAAAGAGCACCACCTTCCTCGAAACTAGTCGCATGCGGCTCATTTGATGTTCCGTGAAGATCCGATTTCGGGCCTCTAAATA:1 - chr2R 2644178 3' + Osvaldo 1301 2 69.31 AGGGAGATGGGATTAGCTAGGATGTTTGCTATTGTTGTTGTACGACGCGGCACGCCCCCACACTTTATTTTTTTTCCAACCGCCTTCATTGTGCTTTAAAG:1 - chr3R 10534774 3' - G5 4610 1 73.27 CCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCACTTACTGCCCTACGCCCAG:1 - chr2R 20916448 3' + blood 7145 2 79.21 AATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGGCTTTGTTGGTTGATGGAAACGCCTTCGAA:1 + chr2L 16542354 3' - F-element 4226 1 76.24 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAGGAACTCACTGGTGACCTTTCACA:1 + chr3R 9995437 3' - Max-element 8258 2 61.39 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATGTGC:1 + chrX 20806937 3' - opus 7150 4 68.32 TGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTGATTCGCGGAATATTTCGGAAGAATACTCGTTGATAGAAAAAAAA:1 + chr2R 6645460 3' - I-element 5114 1 55.45 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCG:1 + chr3R 23638190 3' - pogo 18 1 61.39 GCCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATAATTCACCCAAGCGATCTAAGATGATCTAGCAGTGCTATTCAATGTTTTGATTTGTGTTATAGGAC:1 - chr3R 5261621 3' + S-element 406 1 66.34 TGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGGGTTGCAAATGACAAACGTATTTTA:2 + chrX 5149692 3' + BS 5040 1 73.27 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCCGAACAGGGACCAGGTGTCATCCC:1 + chr3L 8363084 3' - 3S18 5771 2 67.33 ATATTGGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAAGTTAGTATTGGTAGCGGA:1 - chr2L 14790550 3' - roo 8666 2 77.23 GAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCGCACTTAAGCCAGCTTTAGTTTCCATCCTTTGTTGCTTTTCTTGCGGTGACTGCAAAGTGAAAGAATGT:1 - chr2R 22460049 3' + P-element 38 1 72.28 GTGATNCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACATAAAAATAAAGTCATCTAGAGTAAATCAAAAAGGCATGAAGCAAATGCCAGGCAAGAGTCATAAA:1 + chr2L 17753743 3' + Quasimodo 7000 2 78.35 CTCACACATTGACAATAAATAGGAACACACACACATGAGCGGGCATCTCGTCAGGATAGAAGTAATTAAAAGTAAATAAAGGAGGCAAGAGAAAACCAAAA:1 - chr3L 9177952 3' - micropia 5122 2 74.26 CTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATATTCCCTGTATTCCATTCATTCGCCTCGTTAATCGAGCGTTTTATCTCTCCCAGAGATTTGTAAATTTGTGAAG:1 - chr2L 15808670 3' - I-element 475 1 76.24 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTAAGCATTAAAATGCGGCTCCTTTTCCATTGCATACTTACAGTCACTTT:1 + chrX 14768076 3' - BS 5020 1 52.48 GTGTANCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTG:1 + chr3R 26530921 3' - blood 7019 2 57.97 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCATGT:1 - chr3L 12888202 3' + mdg1 408 2 65.35 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGGGGCGGGCGAGCTAGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 4345372 3' - hopper 45 1 70.30 CATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCCAGATGCCTGATCGGGAAAGTGAATTAAAGTGAAACGAAAGTTGGCGAGCAAAACATTTAGTGGCTAACAAGCGAT:1 - chrX 1136154 3' + Bica 16 1 72.00 GCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCACTGGCAGCTGCCACTGCAGCATTTCAACTAAATTACT:1 - chr2L 3756173 3' + Doc 461 1 77.55 GCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAAAAGTATCTGCCAAAATGTATTTACCATAGACGGCAAACGGTAGCATTTTGATTTCGGC:1 + chr3L 6998761 3' + blood 450 1 66.34 GAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGTACAGTTTTATAAGCACACAAAGACATTTATTCTCA:1 - chr3L 11836823 3' - 1360 40 1 64.36 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAAATAAATATTTTAAAAGCAGTGGCATATATTGAATACTAGTAATTTTAAACATATACGTAAAACGTAAA:1 - chr2R 9316932 3' - opus 3 2 68.32 GTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTTTTGG:1 - chr2L 285678 3' - P-element 25 1 54.46 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTTTCCACCACTTC:1 + chr2R 14675610 3' - roo 8699 2 63.37 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGA:1 - chr2R 14675527 3' + roo 394 1 65.35 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAACGAAATTAAAATGGCACGAATAGGT:1 + chr2R 8310918 3' - pogo 25 1 52.48 ATATTNGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATTTGTCCAGCACTTAATAAAGCCAGACCTCAAATAGAGCAG:1 - chr3R 27981632 3' - roo 2 2 77.23 CTATGATTTGGTGTATGGCTGTTGCAATGTGGTAAAGTATGTCCGTGTGTATCTGGGATACCGATAGATATTGTGGAATAAAATGAGAAAATATTTAAAAT:1 + chr2R 4703435 3' - Quasimodo 71 2 55.45 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCAAGTTG:1 + chr2L 18430136 3' + copia 248 1 63.37 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGC:1 - chr3R 20477043 3' - 412 7088 2 58.42 AAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTCCGATCAGGAGAACGCTAAGCCAAAGGTTTAGGTGAGAAAGAGAGTACAAGAGAGAGC:1 - chr4 909053 3' + 1360 3139 1 61.05 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGAGTCCTTTCCGCGCTCGCTCTCGCGCTCTCTCTTAGGGGTCTTCGCG:1 - chr2R 5804443 3' + P-element 2879 2 71.29 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCG:1 - chr3L 13589441 3' - hobo 29 1 53.00 ATTCAGTTATCGTAGGTTTTTATATCGGGTTCGGTCACTCTATTATT:1 + chr3L 25256186 3' - Burdock 292 1 57.45 CCTCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGCTGCCTGCATTTCCACTGGCCAAACCAACGCTCAGCGAAAAGCAGCGAAATCTACTT:1 - chr3R 9766300 3' - F-element 4340 1 65.35 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTAGACTGGAAAATAAATTTCATTCAGAACAGACAGACGCAAAACAATGACAAATATGCATGGAAAGACAG:1 + chrX 20485223 3' + mdg1 7452 2 65.00 TCAAGTGAACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAA:1 - chr3R 25099124 3' + Doc3-element 8 1 37.00 AGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr2L 20360641 3' - micropia 4979 2 59.41 ATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAGGAAGGATACAACAGACGAACAGAC:1 - chr2R 18642665 3' + Quasimodo 275 2 75.25 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACACAATATCTGTGTTTCGAAACCCTTTTACACTTAATG:1 + chrX 15392017 3' - 1360 51 1 56.44 TTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGAGAAGTGTGGGATGATAATTCAAAATATTTAAAGAATTTGGCGGAAAGTCAAGATATATG:1 + chr3L 9674267 3' - roo 206 2 68.32 CTAGTTGACTTATTATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTGCTGCTCACCCTTTTCTCACCCAT:1 + chr3R 22861320 3' - mdg1 7112 2 66.34 CACACTTTTAAAAAATGTTTTGATATTTTTACACATATTTATTAGTACGGTAAAATTCTATCTTTCCCATTCCCAAACAATCGGAGCAATCAAGTTAGGTA:1 + chr3R 9423657 3' + INE-1 259 1 59.41 GTGGTGAAGACCCTGCGGGAAGCACTAACCGTGATCATCAGAGGCGGCCAGCAGCGCTCCACCGATCATTGCGTATACGCTGACCTGAACCGCATTCGAAG:1 + chr3L 17432419 3' - Max-element 127 1 68.32 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTTGGTGTCGTAAACGGTTTGGTTAAG:1 + chr2L 20824684 3' - pogo 27 1 54.46 TGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCCAGGCGGAAGAACAAGGAACAGAGAG:1 + chr2L 2097753 3' + Quasimodo 6905 2 74.00 ATGTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCACATCTTGTGCGATGTGTCTTACTAACTTAATGTCTCGACGAGCAACACCGAAGAAAATATTCTCAGAT:1 - chr2R 4621659 3' + Bica 4834 1 65.35 GGGGAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCAGTTTGGTTGAACTATTGGTGTCCACATAGAG:1 - chr3R 13758881 3' + 297 6578 1 68.32 GTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATGGTCACAAGATCAAGATGGTAGTAAGTTACATAAGTTAGCTAGTTAGAGGGGCAACCAACCTTTAT:1 + chrX 15950339 3' - Cr1a 4222 1 63.37 GACTCATAGTTTTATTATTTAATATAACAATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCAATTCGTTTTCAGTTTTCGGAGAGCATT:1 + chrX 6010369 3' - F-element 177 1 70.30 TCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGACTACTGGAAAGAG:1 + chr2R 7552305 3' - springer 7173 2 69.31 GAGCGAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGACATCGACCGCCCCCTGAAGGCCGAAGTCCAACGCCCAACCGCCCATCC:1 - chr3R 11841049 3' + hobo 2604 1 78.00 GTGGAGGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTATGAGTATGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCATTGTCGGATATGAGCTGCATA:1 - chr3R 17928945 3' + hobo 2922 1 58.95 ATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCCAGCAGTTAACCTGGGCGCATGTTCATTTCTAGTTGCCGCTGCCTGTATAATTTACAATTTAG:1 - chr2R 13644199 3' - Burdock 6050 1 71.72 ATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGGTGTATTACCTCACATGCACCCCTTAATTTCCATACCCCCACCACTGCAGTTTTATGGCCAGTTTT:1 - chrX 14981576 3' + Tc1-2 435 1 62.38 ATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGAAGAGAACGGCGCTACCAACATGCCACTAGCATAGTCACTCCACGGTCGGATCCCAGCCAGCCG:1 - chr3R 5543691 3' + Ivk 5054 1 63.00 TCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTTAAGATTTTCTGGTATATCGATAGATATTTGGGAACAAAATGAGAAAACATTGCAAATTGTTTTTTTTTTA:1 + chr3L 21043313 3' - INE-1 529 1 70.30 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTG:1 + chr3L 11553539 3' + P-element 2845 1 28.71 TCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTT:1 - chr2L 17646173 3' - flea 33 2 61.39 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTTCTCCCATCTCCTGGTC:1 + chr3L 16761353 3' + roo 406 1 74.26 TAATTTAAATTACTAAAAATTAAAAGAAAAATATGATAAGCTTCACGGTTGCGCTCTTAGCAGAATCCTAGAATACCTTTCTACGCCTCTGTCCGCACGCA:1 + chr2R 10220166 3' + Transib5 2596 1 90.10 ACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGTTTTTATGATGTAAGAGCATTTAAATTGCAAATATGTATGT:1 + chr2R 18894956 3' - Quasimodo 158 2 66.34 AAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTGGTGCCACTTGGGGATTGGGGGTGGGGGAGTTGGGGATTGGGTTGGATTGGATTGTGAAAA:1 - chr3R 29123693 3' - P-element 450 1 69.31 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAGTGTCGAAATTGTGG:1 - chr3L 17168811 3' - mdg1 4 2 76.24 TGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTATCCCATTTTAAGCCCACTCACAGAAAGACACGACTTGG:1 + chr2R 17622526 3' + Cr1a 160 1 69.31 AAACCNTGATCAGGGGATCAGTTAGTCAGGATGGCCGAGTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCGATACCGCCCTCATGTTCCCATTCCATGCACAG:1 - chr3L 19328612 3' + invader3 5147 1 66.34 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGA:1 + chr3L 9909777 3' - Transpac 22 2 57.43 AGATCTCAAGAACTATAAAATCTAGAAGGTTAAGCTTCAGCATACAAATTCTAGAGACAAAGAAGCAGCGCAAATTCGTTGACCCATGTTGACACGCCCAC:1 + chrX 14770553 3' + INE-1 149 1 80.20 ATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCAAATTACAAAACATAGTGCTCAGGTGTGCGGAAGGATTGGAGTTGGGGTAAACTAAACAACAAAATGCATAA:1 + chr3R 20398715 3' - 412 7151 2 79.17 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCCTCTACTGTGCACGTGACACCAACAGAAGGCCTTCGGAAACTCTGGATTCCACAGAGTGCCTGGCTGCT:1 - chrX 5092900 3' - roo 8671 2 72.28 AATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTTTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCTCGCCTGCACTCGAAGTCTATTATTTTT:1 - chrX 10724941 3' + blood 7177 2 66.33 CAAAAATAGTCTTCAAATAGATGTCATCTGCATTGACAAATGGACTCATTGAAATAACTAACTACACCGACGCACAGACTGTGACGATTTACAACGGGATA:1 + chr3L 26386120 3' + Q-element 282 2 71.29 GTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGACATGGCGCATTGGGTAGTAGTAGTAGTCCGCTGAAAGGTACCCATTTCCCAGCCACTTAT:1 - chr2R 18213048 3' - F-element 260 1 64.36 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATAAATAGAGCCGCCTCAGT:1 + chr3R 21296590 3' + P-element 2830 1 24.75 AGCGATTTCAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCTACCACGAAAATTGAGTGCGACGCCATCAATCATGAGCATCAATCAGAAGCGGC:1 - chr3L 21363856 3' + G2 2719 1 64.36 TAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGGTGTGCGCTTTGTATAATAATTTTGTTTTGAATTAAAGTGGGCAACAGTGTAAACACTTTGTTGGCGTTAC:1 + chr2R 20874160 3' - Stalker 6 4 49.50 GAACTCTTGCTATACTTAAGTTAGTCTACTGATGTATTGTAAATGTCCAAGGAAATAAGTGGGGGCACAAGCCAGATGAAAGCAATTTACATGACGATTAT:1 + chr2L 21809233 3' + Burdock 115 2 80.20 GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTA:1 + chr2R 5531200 3' - 1360 60 1 65.00 TGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAATATATTAATAACAACATTTTTTTTTTGTGCGCAACTTTTGTAGTCGCTTATTATTAACAGTTGTGATATTTG:1 - chrX 3465911 3' + hopper 1090 1 55.45 AAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTCCCACCAGCGCAATCAAAACAAAATCCATCGAAGACTGGCCCACGTAGAAAAGAGAGTTGTAGAAAACGAAGCCAA:1 - chr3R 29299785 3' + F-element 4392 1 70.30 AGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGA:1 - chr3R 13582245 3' - BS 5048 1 76.24 TAATATGTTTTTAAATAATAATAGAAAAAACTTATTAAGTAAGATAATAAGCAACTTAACTAATTTGTGATAGAGTGTAGCTCGCAAATAAAGTCCTTCAA:1 - chr2L 15962817 3' - 1360 318 1 56.44 ATGCACATGTGGAAATTGCCTATATTCAACACACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATAT:1 - chrX 4792084 3' - 1731 4350 2 69.31 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTC:1 + chr2L 7488915 3' + roo 9032 1 72.45 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTGCTTACGTCAAGCCTCACTTGATTCTGTTT:1 - chr2R 7775705 3' - Transpac 6 2 73.27 AGACCTCTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAACAATGTTGAAACACAAGATGTAAGACAATCACTTGTGTGAGTATTCGCTTAGTTGTAT:1 + chr3L 23524107 3' - HMS-Beagle2 6953 2 78.22 AGAGTATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAGCTGGA:1 + chr3R 20147581 3' + 1360 400 1 80.81 GGTCTGCTAAGAGTGCTGGCTAATCGTTGAGTTGGGCTTGATCATCGGGTGGGTGACCTGGAGTTGACATTGGACTTATATCAGAGAATCCCTCGGAGATG:1 - chr2L 15787194 3' + baggins 141 1 62.38 GGTGAACAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCAACAGATACGCCACATTGCGTATACGCCAGGGTGACCCAGTCACAATATACA:1 - chr2R 23822485 3' - Rt1b 4956 1 53.47 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGA:1 - chr3R 16458018 3' + roo 9020 2 79.21 ATAAATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACGATATCT:1 - chr2L 14931028 3' + diver2 447 1 64.36 TCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTACTTTGTTCCTA:1 + chr3L 9766435 3' + blood 369 2 71.29 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTTAATAGCAACCTGCTGCAGATTTCTGTT:1 - chr3L 2244139 3' + jockey 4960 1 70.51 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTACAGCAAATTCCTAGGCCTAATTTTCTTGGAAT:1 + chr3R 27430076 3' - pogo 40 1 66.34 TAAAAATAACTTAAAAATAGTCAGTAATTTTTTTTTGCACTGGCCTTTGTGTTCCAATCTTTTTTTTTTGTGGCACGTTTAACAAAAAATAATTATAATAA:1 - chr2L 13573953 3' - pogo 1883 1 66.34 AACTAGGGTCCCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCCTTTTGGCCAACTTCGACCATAACAGCAATAACAACAACGATAACAACAGAATGCGGCAAGA:1 + chr2R 13766194 3' - Tc3 1303 1 62.38 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGC:1 + chr3R 12539562 3' - roo 32 2 60.40 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTTTACAGCTCTAAG:1 - chr3R 20878434 3' - 297 6587 2 67.33 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATTTGTC:1 - chr3R 27981667 3' - roo 37 2 67.33 CTTCTAGCTTTTAAAGTTCGTGAGATCTCGACCTTCATGCAAACAGATCTACTCGGCTATTGATCCTGACAGAGTTGACGAAGGACCAAAATGTAGAGACG:1 - chr2R 4906451 3' - INE-1 155 1 54.46 GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATATATAAAAGAAGAATGTCTATTAGGTGTTT:1 - chr3R 12589026 3' - Max-element 47 2 72.73 AAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAA:1 + chr2R 4483262 3' - Ivk 39 1 59.41 TATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTACGAGCTACGTTCTGTTTTCAAACAGTGTCAATCGAACTGTGTTCTGCTAGCAAATGCAAAGCTTAACTA:1 + chr2L 18115115 3' - Tc1 199 1 74.26 TTAACNAATAAAAGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTCATGTTTATATAAAATTTAAAGAAATCTTTATAATATACTTATGACC:1 - chr3L 8362988 3' + 3S18 6075 2 52.48 TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAATGTTTAAACACATTCTCGGGTCTCGATAGTCAACACCTTTTCACTACTT:1 + chr2L 4143868 3' - I-element 5145 1 56.44 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGTCAGG:1 + chr3R 4601395 3' + opus 7483 2 61.00 AATACAAAATTTGTACACGAGCTAATGGCTAAAATTAAAACTGATGATTACTTTATTAAAACCATCTCAATCGGAACCCGAATCACTGACCACTGCCAACG:1 + chr3L 8637412 3' + Juan 359 1 73.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCAT:1 - chr3R 27748680 3' + roo 9026 1 70.30 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTAT:1 - chr3R 13582202 3' - BS 5005 1 67.33 TGCATAGTGCATAACCAATGTAGGGCCATTACGCATCTTGTTATTCCAGTGTCTTTGGTTAAACCACTTCTGATGTTGTAAACGGTGCTA:1 + chr2R 2906092 3' + 1360 3353 1 86.67 GTTTCCAGAAGGAGTTCGGGAGTGAGAACGCGCTGTCAAGTCGGAAATAACTAAAAAGCCTCCAAATCGAAGGGGCAGTAAAAAAAAGGGGATACAAGCCG:1 - chr2R 11555358 3' + gypsy8 427 1 56.44 TCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTGAGCCAACGCAAATGCAAATTTATATGCTCTGAGCCATTCAATATGCATGAATTATTTTTATTATTAC:1 - chr2L 15807955 3' + I-element 5349 1 72.28 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGCCCACGTTTCACTT:1 + chrX 2179542 3' - Doc 36 1 60.40 AAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAAACTACGGCATATATATGTATATGGTATTCGAAAAGTACACAAAAGGCCATCAA:1 - chr2L 5812336 3' - 1731 4338 2 51.49 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCT:2 + chr2L 7255801 3' + P-element 2846 1 38.61 GAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGGTCATATTTTTGTTTGTTTATTGTTATTATTATTTCTTTTTTGCAACATGATGTGGTAGTAAGCAC:1 - chrX 12304743 3' - Porto1 229 1 59.41 CAGAANGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGACATAAAAAACAGTTATAA:1 + chr3R 32005961 3' - invader4 19 2 61.39 CAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCTACGAAGCACCTCCTGTTCCTCTTAACCTCTGAAAACACT:1 + chr3L 22146220 3' + invader2 4904 2 60.40 GGGGCGCTGCCTTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAGATAGGGGCGATATAGAAAAGAGAAGGGAAATGGAAAGCGTTCACAG:1 - chr2L 17933948 3' - Cr1a 4400 1 79.07 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGTTTTGAATACTT:1 + chr3L 10013652 3' + hopper 1391 1 53.47 GGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGAGGGTGGGCATTAGCGAACTTGTATCGCGGCA:1 - chr3R 7151811 3' - F-element 4460 1 69.31 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAATCACGGCACATGTGCAACAGCAAAAGCAACAGCAAC:1 + chr3L 8271760 3' - roo 8701 2 63.37 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGATTCGCATTGTTTGCTGCATT:1 - chr3R 23638097 3' + pogo 2072 1 62.00 TTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTGACCAACAAGGGTGTGCCCCAGGAGATCATCCATCTGATCGGCCAGGG:1 + chrX 13760448 3' + pogo 1900 1 54.46 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTG:1 + chr3R 29123385 3' - P-element 48 1 29.90 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCAACTCGTTTACCTGCCCCCCTACCTGCCTTTCAGGCCCTT:2 + chr3R 8277972 3' - P-element 33 1 46.53 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGGTTCATCATTACAACCGTTTATTTCTGTGCTTTCGTATCTCGGCACTTTCT:1 - chr2R 19943921 3' + 412 452 2 60.40 TCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTAGAGGAACAGAATTGGACTGAGTCGAGGGTACATCTGGAGAAAATGCCGAGCTTTGAAAACTAACTTACT:1 + chr2L 2074727 3' + roo 488 1 65.35 CACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATGTATGTACATATAATTACCTAATAATAATTAATTAATTTCTCTTCAAGCGGTTTGAAATGGAA:1 + chrX 4292947 3' + S-element 1706 1 62.38 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCC:1 + chr2L 19018996 3' + hobo 2899 1 75.82 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATACTATGGCTCAGACGGAATTATAGTTTTAATGAAA:1 - chrX 1281659 3' + roo 9051 2 56.44 ATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTC:1 + chr3R 12047474 3' - Stalker2 7288 2 62.38 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGGCCC:1 - chr3R 6117226 3' - Tirant 25 2 53.47 TATATAAGAATATTTCTCATTAGAGTATTCATCTTGGGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTACGCAACAGTGGCAAGGACAATG:1 + chr2L 17185713 3' + 1360 394 1 70.11 GAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAAAAT:1 + chr2L 18279981 3' + gypsy5 401 2 67.74 TATTTTTTATATTTCCTTTCTTTTTCGAAATTTAGCCTGCCTTCGCTTGAATATTTTCCCTTTTTTTTTCTCCTGCGAAATTTGC:1 - chrX 12782609 3' - copia 245 1 61.18 CACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGCT:1 + chrX 21421875 3' + INE-1 541 1 90.10 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGA:1 + chr3L 16761322 3' + roo 9038 1 60.40 TACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGTACATAGCTCTGACCAGCTGCTAATTTGAAATA:1 + chr2L 17685208 3' + 412 7273 2 67.33 TGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATTTTACACAAATCGATTTTATTTCACCAAACCACGCACTTCTTGAGCGGATT:1 + chr2L 12667273 3' + blood 7389 2 74.26 AATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGTCATTTTCTCTGTCAAAGTCCGGGCCATCGCGGTCCTTGAACTGATAGTCGCTGCTTGATT:1 + chr3R 25034857 3' + Stalker2 7531 2 68.32 AACCTTCTAGATTTTATAGTTCCTGAGATTTGGACGTTCATATGGACAGAGGAAAGAGTGCAATGTGAAAGAGATGGCTATCACAAAAAAGAAAGAGATGG:1 + chrX 14987717 3' - INE-1 158 1 61.39 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGGGCCCCAAATTAGCAGGGCCCAAAATGCCAGGACA:1 - chr2R 16475733 3' - 412 7070 2 61.86 AAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCATCTATTAATTAGCTTATAGGGCCGAAAATTAGGAGT:1 + chr3L 17587875 3' + roo 404 1 74.26 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGG:1 - chr3R 27284001 3' - Max-element 8269 2 52.48 TAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGA:1 - chr3L 10081939 3' - rover 5 2 62.16 CGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTAAATAAATCGTATATGTATATAGAAAGAATACGTCCTAAGCTGGCTA:1 - chr3R 14475702 3' - 1360 3222 1 54.17 GATGCAGTCATTTATACTCCTGGAGGAACCCCTCGAGCACGCTGAGCCAAATTTTTATAAAGGTATCCAAGCTTTAGATAGCTTGAATATTATTTGGGAAA:1 - chr3R 25433929 3' + G7 95 1 61.39 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTAAATTTTAATGCGCCCGTATCGATATGCGAGCATGGTCCGCGCCACCGGA:1 - chrX 1523964 3' - jockey 23 1 58.89 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTG:3 + chr2L 14790629 3' + roo 356 2 75.25 CTGTTAGTTGACGCGAAGGATCTTACTTTTTAGGCGGGCAGAAGAGACAAAAGAACCGAGTCAGGCCTTCTAGTGGAGCGTGCCGATCACTACTCTAAAG:1 - 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297 6599 2 61.39 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGC:1 - chrX 17968374 3' - Tirant 35 2 69.23 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGTGTGCGAGTAGTTTTTTGGCCATCTCTCAGCCGGCAAACGAGGCGGGAAAATGGGTGGA:1 - chrX 4881383 3' + 412 476 2 64.36 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGAACT:1 + chr3R 25671992 3' - I-element 14 1 61.29 ACAAGAGTCTTCCTCTGTTTCCTCAACGAAACGCTTTCTGGCACGTTATTTCATCTTTATCTATTTATTGTCTAATTTTAATGGTCCATCGCATCGTTCGC:1 + chr3R 28043552 3' - invader5 3987 2 59.41 ATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATGAGTCACGCATACGCCCCTGGCGCACACTCTTTACATGGTACTAGGCAATGCAA:1 - chrX 18837075 3' - P-element 2759 1 54.46 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGAAGAAGGGG:1 + chr2R 10543526 3' + P-element 2875 1 65.98 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGAGAC:1 - chr3L 19454664 3' - diver 5921 2 59.00 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGCCCAACAGTGACTATGAATAATAATGATATAATAAACTA:1 - 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Idefix 304 2 63.37 CAGCCGGTAATCGTCCTGGCGATTTTGTTTTGGGCAGCCTGAATGCGTCAAATTTATTTCTAAGAACATCGATTACATTTTACATAAGACTTAATAATACC:1 + chr3L 16058749 3' - BS3 1380 1 54.46 TGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAATTCTCTCAATTCAAACACTTTTACCTAAGCCGCACTCGCATACAAGTCCAAAACATCGGA:1 - chr3R 20479407 3' + 412 7354 2 61.39 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCG:1 + chr2R 11528071 3' - P-element 35 1 46.53 CTCAGNATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGTGTTAAGGAAATAATCATCAATCCAATTCCC:1 - chr2R 14242880 3' - 297 6808 2 68.32 GCACTCGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGGTCTTGAACCTTTTATGTTTATATTATAAAGGGTTAATCTCGCATATTTTTAATTTAAGGGCGGAGGTCC:1 + chr3L 25355435 3' - baggins 5103 1 55.45 GCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCCGTCGCATCGTTCTCTTTGCTCTCTCTCTCTTTTCGGACGGCGACTGTGCGGCGGACAGTTCTCTTAATTGCTT:1 - chr3L 18732788 3' + hobo 2724 1 73.27 ATCTGATAGTCGGCGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCATTTTAAATTTCCATACATGGGAAGCGATATAATCGCTTGGTAAATTTACTTTTTGC:1 - chr3R 20908126 3' + INE-1 560 1 56.44 ATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATTTGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGA:1 - 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chr2R 16988621 3' - opus 209 2 65.35 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGT:2 + chr2L 2074755 3' + roo 9020 2 76.24 ATATAGAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATATTATCTCTTATATTTGTATCCTTGTTGAAGTCAAGTATTAGTAGAACATTC:1 + chr3L 12339606 3' - 1360 377 1 63.37 CTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAAGGTGCGTATCCCAAAGATACGATGGGCCAAGGCCAAT:1 + chr3L 2020236 3' - 412 7174 2 63.37 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTC:3 - chr3R 13582225 3' - BS 5028 1 56.44 CGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCTCAACAATTACAGATACCGATGTATAGTCGACACTGGATCGTCAATAAACACGTTAAATTCAAA:1 + chr2R 2957859 3' + Dm88 369 1 69.31 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTG:1 - chrX 13546653 3' - roo 8713 2 79.21 TCCATNGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATATTTTTTGCCGTGGCAAATAGTTGACGAAGAAACTTAATTGCGCCGTGCGCAGATGTTGAGGG:1 + chr3L 23181919 3' + hopper 373 1 55.45 ATATTTTTATATTTATATTTATACTTCTGCAACTGTAAGTTATCAGATATTGATAAGCAATATAGTAAAAAAAATATTATATTAATTTTAGCTTCATTAAA:1 + chr3L 19514581 3' - Stalker4 7043 4 65.35 AAGCTAACTGTAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAAATAATAGAAAAGAAGGACCCAAAGGGCCACACACACTCTCCACAGAATGTGTAAAAAAAAT:1 + chr3R 11337140 3' + X-element 4625 1 65.35 TTTTTTTGTTTTGCTTTTTTTTTCCAAACGATTCCAAACGAATCCGAGGAAAGTTGCTAATCTGCCACCTGCACTCAGCCAGCGAAACTTTCTCGATTTTC:1 + chr3R 9375855 3' - Doc2-element 254 2 68.32 GTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTATATGTGTGTGTGCGGCCATGTTGCCGCTGTTCAATTTGCGTTTTTTACGCTTGGATCTCCTTT:1 + chr2L 1258375 3' - gypsy4 6585 2 63.37 TGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCCGTGTGCGGATGGAAACTCGGTGCTGGGCTAATCTCGCCCTTTGGTCAGCCGGAT:1 - chr3R 24518443 3' + 1360 3360 1 54.46 ATACCCGTTACTCAGCTAGTTTAAATGCGAATTCGAATCATCATGACTTATACGTATGTATATACATACCATAGTCACCAGACATAGCCAACATCCTATAT:1 - chr2L 22092959 3' - INE-1 540 1 57.43 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACATATAGTTTATAAAAATATTTCACAT:1 + chr3L 13060371 3' - 412 7104 2 78.22 ACACACACACACACACACATCCGTTTCCTGTGACAAGGAGCACCTACGAGCTCACCATATATTTAGCTTGCCATATGATCTTTTTGGCCTTTAGCTGATAG:1 + chr2R 22347447 3' + accord 7031 2 62.38 ACTCGNAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACATTTTTTTTTAATTTCATGGTTCTTTTCGATAAATTAACGAT:1 - 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chr2R 13259138 3' + Doc2-element 232 1 71.28 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAA:1 - chrX 19426252 3' - mdg3 5305 2 78.22 AACATNGGCTCTGTAGCAACAAGCAGAGAGGCAGATCGCAAACGGAGAGGGAGTCAGTCTCAATTAGTCAGCTCAACTATAGAGTTATTATTGCGGCTGAA:1 - chr3L 15531301 3' + invader2 107 2 57.43 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAAT:2 + chr3L 10143229 3' + 297 359 2 75.25 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAATAAAAACCCTCGTTTATCAAAACCCAGAAGGAAGGATGAAATTTGATTAGCCATGTTATCAAATACGTT:2 + chrX 22444536 3' + Juan 4201 1 66.34 AAGGCATTTGTTGATTTTTACGTTTTTTAATGTCTCAATCTAAATAATAAAAACATAGTGTCCTCCCACGCGTCCCCATTACAAAGTTGGTACACTTTGAG:1 - chr3L 4652731 3' - hobo 2524 1 57.43 TTCCACCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGCTGGTGCGTTTGTCACTTCTGCTACGAGTCAAATTGCACGTTCGCCATGTAGTCACTTTAAAGTAGGGCCG:1 + chr3R 2526016 3' - Cr1a 4418 1 74.26 GGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCTGTTGGGTACTTGAAGGAAAACATAGGACTATCTTCTAATGACAGACAGTATAAGCTGCGTGCGAGG:1 + chr3L 20394750 3' - Idefix 119 2 70.30 TTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACATATAATCAGTGGCCTAGAGTGGGTAATTAAGGAAAACTAGTTTCCACAGA:1 + chr3R 15126564 3' - FB 26 1 52.00 CATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGCGAGATTTGTTTAGGCACTCAACCTTGGCAGT:1 + chr2R 23578099 3' + roo 8718 2 68.32 CTGTCTTCATTTACCATTTCGGGCTATTAAAATTGATCATGGATCATTCGATTTGTTCGAGAAGGAATAGAAAAAGAAAGATTCATTAGTTTTCTAATTTG:1 + chr3L 17640110 3' - G4 123 1 80.20 CAATAAAGATAAAAACTGTTTTTTGTCTTACCATACCTTTATTGTATAAAGCAACAATAGCTGGCCCTGAAATATCAATGTACATATGTATATGCTTTATC:1 - chr3L 23282501 3' + looper1 1616 1 69.31 AATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAACACAAAAAATGCCAACATAAACGGCCAAGACAAAGGAAAGGATAGACTGCCACCCCCGGAG:1 + chr2L 1418198 3' + Tabor 7288 2 70.30 AAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATACATATATTTAGTAATCCATGGTGGAAATATATTTTAAAGGATGCCAATTTGGTAAGCCCA:1 - chr3R 10240076 3' - invader4 2775 2 64.36 TATGTAAAATGTTATAAACTTTTTAAACTACCAAACCTTGTGCTGTACAGGATATCACTCAGTCGAATAAGGTTATGATGATTGGTGCTACTCTGTGTTTT:1 - chr2L 2723163 3' - gypsy3 490 1 65.35 AACTACACACACACATACACACACCCAACAGTGAAAAATGGGTGTGTGAAAATAGTTGTCAGGGTGATGATGCGGAGTGGGGAGGTACTGCCAAAAATCCA:1 + chr2L 10108122 3' + accord 254 2 65.35 GGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGACATCTCGGCACAGACTGCTCGTC:1 - chr4 591406 3' - R1A1-element 490 1 78.12 ATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGTAATTTTCATCGGTTCGCTCTATTCTCTACACAGAAAGAAATGAAGTGGGATATTCAAAGTGGTAAATATAA:1 - chr2L 6819705 3' + F-element 4319 1 72.28 AAGCTAAACAAAACAAAAACAACTTATACCTCTCATTCACACACATATCAAATGTCATTCAACTTGGCAACAATGCGTGAGCTCAGATCGAAGTTAAGTCA:1 - chrX 8504627 3' + Porto1 251 1 53.47 GTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCATAGAGAGCTATAGAATGCGGAGTGTGCTAGAACTCCTAGAAAGGGAATAGTAAACAGAATT:1 + chrX 14325241 3' + hobo 484 1 69.31 TTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATGTACATACACACAAAACGAGACAGCTTGTCGTGTTGGCATTTTTGTTTG:1 + chr3R 14688570 3' - FB 27 1 51.49 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGTTTGTTTGTAGCGAGTTGGTCATTCAATAATTCTAC:1 - chr2L 513651 3' - roo 18 2 60.40 ATAAAAGTGAAACATTTGTTCAATTCCTTGAAATTAGTCACCTAATGATATTGAAATACAAAAATAAGCACTTGATCTAATTACATCGACGTAGACCCTAT:1 + chrX 22824677 3' + HB 1502 1 55.45 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGAT:2 + chr3R 4834337 3' - mdg1 19 2 60.40 TTCTACGGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAGAATGAACCCCAGAAAACTGAAAGGGTGAAAGGTGTGGTGGCTTACTGTCCAAAACAACAGCAAA:1 - chr2R 7563379 3' + invader2 471 1 65.35 GAGTTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCAGCTAGTGTGAATGAAAACGAGAAATATCATAAATTTTCTAGGATTTCGATAGATATTGGGGAATGTGGG:1 - chrX 23078688 3' - INE-1 558 1 80.20 ATTAGACAAAGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTCTTACTGATTTTACTTTTCCATATATGTATGCATGCATTACTTATGTATGCATTTTTAAA:1 - chr2R 4744411 3' - Burdock 350 1 66.34 GATTTAAATTTTCGAATATAAACTTTTGTAATTCTTCGACAGTTTTCTGCAGTGTAT:1 + chrX 21669998 3' - Tc3 393 1 89.47 ACTATATGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCGAAATTAGCACCAGATCCTTGTTGTTTAAAGCGAGACACG:1 - chr2L 4160932 3' + Tirant 336 2 58.42 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCCAAAACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTT:1 + chr3R 8313094 3' - 297 6607 2 73.91 ACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGAACTCGAGCTCTGGC:1 + chr3R 25672003 3' - I-element 10 1 68.00 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCAATCGATTGTCGCAACCCTCAA:2 + chr3R 11263492 3' - roo 8667 2 77.23 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAA:1 + chr2R 17626569 3' + mdg1 7437 2 55.45 TTCATTCAAATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTAATGAAAAAGGAGCAAAATTCTGGATTGATTTTATGTAAGCATAAAATCTTATTTACAAC:1 - chr3R 12049107 3' + Stalker2 337 2 60.61 TGGCTCCAGGATCTCTCGAATTTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAACTCTTTTAAAGAAGGGCACAACAACTTAATACTCAT:1 + chrX 718791 3' + 1360 78 1 72.28 TATTCNAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACTAAGCCCAAGTGGCTATTCATCCGTATGGCCGGGTTGCTCGTCTCTATTTTCG:1 + chrX 8972476 3' - Tc3 237 1 76.24 TAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAGGATGTAGCAGACAAATATTTTAAATAAGGGAGG:1 - chr2L 3945165 3' - Transpac 5114 2 66.34 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGAAGACGCGGCTGGCAACATGAGGCCAGCGCAATT:2 - chr3R 11999204 3' + P-element 2882 2 72.28 CGACTATAGCATTCTCTGTTGTTGTTGTATGAAAAGCACACCTGAGTTTTGCCCGAGCTCATATGATTTGGTCTAAGGAGTGGCATTATGTCGTATTTCCC:1 + chr2L 21372747 3' + INE-1 579 1 69.31 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTC:1 + chr2L 20706723 3' - mdg1 37 2 61.39 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTATCTGTCTGTGCTGGAGCACA:1 - chr2L 4743129 3' + I-element 5337 1 56.44 TCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAATATTTCATGTTTTTTATAATGATTGGTAA:1 + chr3R 27981762 3' + roo 408 1 78.22 AGGTGTACTGCGACCCAGACGGATCTATTGTACTACACCTTCATGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAATGCACTGATTTTGCTGTTGACTGGTTGCCCC:1 + chr3R 26588444 3' - baggins 5411 1 76.24 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAA:1 - chr3R 15072575 3' - pogo 32 1 61.39 CAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCACCCACTCCGATGTCCGCCTTTAGCACCTTATGAAAGTGCTTGGCCGTGTGAT:1 - chr3R 27285150 3' - Max-element 71 2 53.47 AGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAAT:1 + chr2L 14612102 3' + roo 9042 1 53.47 CAAATAAAATCAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTG:1 + chr3L 19377787 3' + roo 9031 1 64.36 GGTTCTTTCTAAAAATACAATTAAAGTTATGCACACGTGTTCATTTTATTATCATATTATTCAATATTCAATTACAAACGTGGAGGGACGGGGCTGTTGGG:1 + chr3R 10987345 3' + Transib5 129 1 73.27 AGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAG:1 + chr2L 3388121 3' - F-element 325 1 64.95 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGTAGAGGGATCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATG:1 + chrX 20806934 3' - opus 7024 2 61.18 GTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATGTGCAGTGAACGAATGTTTTCTTTTGTTAAACAA:1 + chr3L 9909798 3' - Transpac 1 2 78.22 AAAAGAAAAAAAAAAAGAAACAACAAATAGGAAAATCACGGAGTCAGGTCCGGAGTGGTGCTACTACTGCTGTTCGCTGGATCGAGCGGCTCCGGTGTTTT:1 + chr3L 9113289 3' + Doc2-element 246 3 47.52 ATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAA:1 - chrX 5129475 3' + Idefix 7365 2 61.39 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTT:1 - chr2R 4606210 3' + 1360 3371 1 58.06 ACAAGTCCTCTTTAAAAATTCTTTATCTTGTAATATACATGTAATTTTATTGTTGCTTAGCTTCGACTTCTTCTTATGTACTAAAAAGAAAATTTTAAATG:1 + chr2R 4691805 3' + Q-element 435 2 75.25 CAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTGATCATTTTGTTGGTTAAATTACTTAAGCAGGTACGCGGTATCGCTAACAAGAG:1 - chr3L 7911759 3' + X-element 4544 1 55.45 TCTTAAGCACGTCATATGCGGGTGGCTGTACCCAAGAACAGCAAAGTGAATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGGCGCCATCGCAGCACAGAAACACT:1 - chr2R 19962761 3' + Stalker3T 236 1 76.24 AGGGAAACCTAAAAGATCAAGTTTGCTTACGAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCATTTTTCTGCTTAAGCCCACGGCTGATCTTAGCCATTGGAC:1 + chr2L 18883287 3' - Q-element 366 2 59.41 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAAATAAATATTTTAAAAGCAGTGGCATATATTGAATACTAGTAATTTTAAACATATACGTAAAACGTAAAGAT:1 - chr2R 9316929 3' - opus 113 3 71.29 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAAAAATGAGACATAATCTGCGAGGCTGCTCA:1 + chr3R 26321707 3' - blood 7019 2 70.71 TTGAGNTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGACAAGGTGAGCGGTGCCACGGAGAATCAGCTGTACACCGCCGAGCAAGCTCGTATTGTGA:1 + chr3L 2344325 3' + R1A1-element 4975 1 68.32 AACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGAAAGAGGGTTTAGAATAGAAATATCTCGAATAGAAATAGCCACCAGTATTTGATTACTAGAAAAATGTACTGTAAAG:1 - chr2L 9215217 3' + F-element 99 1 76.24 AAAGAACAAAACAAAGTAGGAAAACAAAATGTGTAAAGGAAGTTTATTTATTTACAATTTGTTGTGTGTAATTTAGGCATGTGTCTTGTTTCTTTTATGT:1 - chr3L 2524521 3' - S-element 243 1 65.00 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAGCATATATTAATAAATATTATATATTTAATATAAATATTAAACTAAATCGAAATATTCTTACATACATATT:1 - chr4 623332 3' + copia 244 1 66.34 TGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTATTTCATCCATTATGGCTGG:1 + chr2L 3085024 3' - copia 4922 2 81.63 ACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTCCAGCCGCCCCGCAAATATCCTTTCTGCTCATCAGCTCGGCTGTTGCTGTTGCTATTTTAA:1 + chr3R 28645540 3' + F-element 4422 1 64.36 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCT:1 + chr2L 16948730 3' - jockey 4701 1 52.48 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGG:1 - chr3R 6117229 3' - Tirant 8135 2 54.46 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCACCGAATTATGTGG:1 - chrX 20047546 3' + roo 9050 2 51.49 TTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATG:1 + chr3L 18337717 3' - Juan 4047 1 56.44 CTTCCTTCCCGCAAGGTATTCTCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTCAGACGTAGTCATACTGAAGGATTGTCTTGTTACTGTGGCCATTAG:1 - chr2R 1862696 3' + Max-element 8358 1 83.52 CTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGGCCAGTTGATGCTACGATATTT:1 + chr3R 23677146 3' - Bari1 53 1 77.23 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGAT:1 - chr3L 7205541 3' - Doc 43 1 58.42 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATA:1 + chr3R 7168633 3' + flea 220 2 68.32 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTCCCATTT:1 + chrX 19426299 3' + mdg3 5465 2 57.43 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAATTTATATT:1 - chr3R 26530864 3' + blood 7371 2 51.81 TTTTACAGAGCAATGGATACTTCGGATCGCATAATATCATCAACAAATTCCGGCGTTAGCTTAAAGGGCGACTGTTCGAATCCTGCAAACGGCCAATTGAA:1 + chr3L 306767 3' - hopper 368 1 61.39 AAACGGAGAGGGAGTCGGTCGAATGCTAAAGCTGATGTAAAGGGGTGGCATTTTCAAGGCGCAAGGAGACTGCAATATTTAATAAAGTGGAAAGATTAGCA:1 - chr3L 23758775 3' + invader2 5004 2 70.30 TCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCACAGAGCTCCTAATGAACCAGGACCGCCATAAACACTTTGCCACCACCAGCAATCCCAACCCACCTACACATCCTAG:1 - chr2L 20226231 3' + GATE 54 3 76.24 GAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCATGAGTTCTTTGTTCCGAGTCGAACACTAACTGGTTCCTATATACGTTAATCAGGGTTTCGACATGGGACAAAT:1 - chr3R 2470771 3' - Cr1a 4182 1 72.28 CTGTCAATAATTTTTATAAAAGCTGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTACGCGAAGGGAGTTTTTTAATTGGTCATTATT:1 - chr3L 24324721 3' - Cr1a 458 1 73.27 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGC:1 + chr2L 5646905 3' - jockey 4696 1 54.46 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCA:1 - 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invader2 4880 2 53.93 CGAGTCGATCTAGCCTTATCCGTATGAACGCCGAAATCTCAGGAACCATAAAAGGATAAAAAATCGATGCCGATACAAAGTTGTTCTCAATAAAAATCTTG:1 - chr4 253087 3' + INE-1 108 1 52.48 CTTTTTCTGTTTTCCTTTTTTTTGGTTACCCTCTTTCTTCAGCTCCTCTCTTCAATGGCGTTCTTCGTGTTCTTCTGTTCGTCGTTCTTCCCCCTTCCAC:1 + chr2L 3540030 3' - Doc2-element 255 1 69.00 GTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGGGAGTGACCGGTTAGGCGACTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCGAAAAGTTTTTTTTTTCTATAAATA:1 + chrX 8408128 3' - INE-1 556 1 66.34 ATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGACTAAGTTGTACTTGCAACAACTAAATTAACTTCGAAAATGCGAATTTCTGATTAGGTT:1 - chrX 7711107 3' - mdg1 18 2 62.00 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTTG:1 - chr3R 178120 3' - BS 40 1 65.35 AATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAAGTGCATTTTCAATAATTTAGTAATGAATAGAATTCATCTACATTTTCC:1 - chr3R 11094503 3' + 3S18 316 2 49.47 TATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTTCCGACTTTTTCTCTTAATAAATCCTCCATAGCCCTTTCCCCTCGGTCCTTTGGCCACTCAACTCGACGTC:2 - chrX 16238182 3' - TLD2_LTR 36 1 65.35 TTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTGCTAGCTGGCTTGTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGGTAAACATCTCTCCACCACAATGACCATT:1 - chr3L 16434107 3' - I-element 5249 1 71.29 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAGCAGAACAAACACTCACGAGCATTTGATTTATGTCGCTTT:1 - chr3L 2144320 3' - copia 37 2 61.39 TGATGAGGATCAATAGTCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTGCGTCTATCCGTATTATTGCCGCACGTTGTTCAGTTGTTCAGCACGATAATGACGAT:1 - chrX 22804381 3' + INE-1 91 1 58.42 ATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGTCCGCCGAACTTGGAGGCGCTGGCGAG:1 + chr2R 18088245 3' - X-element 4490 1 68.60 GGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGGAGAATATTTCTAATTGGCTTATGTTTGCCATAAACTGTTTAATGGTAAGTTAGGTGTTCATTGTAATTACG:1 + chr2L 9163815 3' + copia 251 1 70.30 CAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATAACA:1 - chr3R 21092436 3' + roo 388 2 47.52 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAATTCGTGCATGCGGATTTTCTTTTCAAATATAT:1 - chr2L 13574209 3' + pogo 2064 1 66.34 AAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAATAAAAAAATTAATTAAAAATTAAAATTGTGCTTGGACCAGTGAAACAAAACTAAACCAACATAGATTTAATAA:1 - chr3R 7277427 3' - Rt1b 125 1 56.57 CACGCCCAACCCCCAAACTCACCCCATGCAATGTTAAACCTATATTTTTTTCACCCAAAAAAAGGATGTATCCATGGGGTCTTATCTGGCGACATCTCAGC:1 - chr3L 3589249 3' + HeT-A 5926 1 58.42 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGTTTTTATTGAACTTATTGAGT:1 - chrX 23048254 3' + hopper 1401 1 62.38 AATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTAGGAGTATAATTAAATGCTTTGACATGAAAGAAAA:1 - chr3R 29379555 3' + flea 4832 1 66.30 GAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTA:1 + chr3R 1977613 3' + micropia 417 2 61.39 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACTTACTTGACTTGACTGGCATATGTCAGAAGCGAGGGCGTTCGCCGGGGGCAAATCGTC:1 - chr2R 16583270 3' - P-element 14 1 67.33 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCTTTCCCTTGCCTCATATTACCGATTCGAATACGTACCATCCCGTCCTGCCCTGTCATTATTATCGTAAG:1 - chrX 2649662 3' - Tirant 8180 2 77.23 GAAGANATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAAT:1 - chr3R 12539513 3' + roo 9020 2 76.24 CAACAATCATGACAGACCCACAAAGCATTTACAAAATTACTTCAACAACAACAATAATAACAACACTAACAATAACAATAACAACTATATATGC:1 + chr4 525925 3' + I-element 179 1 53.19 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATAT:1 - chr3R 10203640 3' - jockey 58 1 72.28 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTTGTGTC:1 - chr3R 11263378 3' + roo 393 1 63.37 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGC:1 + chr2R 19209442 3' - jockey 4801 1 66.34 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACC:1 - chr2R 14675543 3' + roo 9041 1 58.42 AGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACCCCCGCCGCTGGCCTCCACAGTCGGCAGCTGAACGATCGTGGCCCCGCCCGGCGTCACAGTTGAGCC:1 + chr3R 24223994 3' + Doc2-element 4421 1 75.25 AGGGTGGAAGAAGGAGCCCCCATGGCTTCCGGAAAGGAAATAGTGCCCTGGACGCTCCTGGACGCAATTCTTATATTATTCT:1 + chr3L 20324654 3' + Rt1b 4905 1 75.61 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATG:1 - chr2R 16980493 3' + copia 5087 2 67.33 TTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATACCAAATTTTAAGAAATAAATTAATGAAAAAAAACTTTTTACCATTATATGAATTAAAAGTGTATTAGGTGA:1 + chr2R 8310560 3' + pogo 1962 1 67.33 TTTTTTTTTGTTTTTTTTTTAATTGCCAGCGGAGGTCTAATGAGTTTGTTGCCACCGAGCGAGAAACCATTGGCTATAATGAGCCTGGCCGAAGAAAAAT:1 - chr2R 10595466 3' - Doc 4702 4 68.00 AGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTGGCATGGATCGCTACATCCAAATCAAGAGAAAGCTCAGCCCTCAAAACAATAAGGCAGGTAATC:1 + chr3R 7598809 3' - Doc 4256 1 69.31 CGACGNGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATATGGCATTAACAAGTGTTGCTGTCAGTGATGAGCAAAATCCACACGTCACGATGACGCGAGTTGGC:1 - chr2L 7800135 3' + P-element 2877 2 44.55 AAAGGGAAAACTATATAATGATAAGGGAATGCCGAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTACACACTGTATTTATTTAATAAACAAAACCTGGGGTTTAAG:1 - chr3L 23696433 3' + micropia 5236 2 59.41 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTCAGTGGGAA:1 + chr3R 26321678 3' - blood 7050 2 65.35 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGA:1 - chr2L 4160140 3' - Tirant 8146 2 67.39 AAAGTNCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATTTGAAAGGTAAAGGCAATAACTAACTTTTATACAAGGAATTATAAATTACTGGCTTAT:1 + chr3L 18659112 3' + pogo 2089 1 63.37 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTTTGCTACTCGATAAAATGGCGCATTTTTGCTTTGTGT:1 + chr2R 8345597 3' - roo 6 2 74.26 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCGCGCACTGGAAGGATGCAAGCCCGAGTTGTTAAACT:1 - chrX 19116866 3' + opus 467 2 63.00 GCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTGTGGAGAGTCTTAAAACTCCTCACAAAGCTATATAAAATACTGTGTCTACGTTTGGATGAGCCGTTCGGCATGA:2 - chr2L 23332200 3' - gypsy8 4680 2 89.11 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATG:1 - chr3R 7522323 3' - blood 54 2 76.24 GGTCAGAGATGAAATAGCCAAGCAAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCCATTCCGAGTCACAGATTGTCGGCGAATATCTTTCGTTTTCTCGTG:1 + chr3R 28902843 3' + Fw2 3697 1 60.40 TTCCTTTTCTACTCAATAATTAAGAAATCCATAGACTCATATACAACAATTTTCACTAGACCTAAATAATCTGCCATACGCCCCATTAACTCAAATATGAA:1 - chr3R 21571704 3' + G5 4725 1 76.24 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGCGCACACTGAG:2 - chr3R 10952239 3' + roo 407 1 75.25 CCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGCAAGGACTCGACTCCGACTACTCTGTGGACGTGTGTATAATCTAGTTTTAATTTTCATGG:1 + chr3R 8275295 3' + P-element 2750 1 64.36 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTATATACCCTTCGTATGTAAAGGAGAATCCCCAACCTAACCCGTACCCATAGC:1 - chr3R 26842788 3' - opus 7023 2 57.43 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTT:1 - chr3R 10952254 3' + roo 9055 2 60.40 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAG:1 - chr3R 23275258 3' + roo 9039 1 59.41 AAGCATGTATACGAAGTTATGTACACAGTTCAGTTCTAATAAAGCATCGATCTATGCTTTACACGCGGCGGCTGGACTACACTCGGCGACAGAGCGAAAA:1 + chr2R 3191194 3' - frogger 87 2 57.00 GCTTATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGCTAGATTCACTAGTAACTATATACCCCTTATCTGAAATCATTGTAGATCCCAGCTCGACCCCTTCTGCCGTC:1 + chr3R 13184946 3' + Cr1a 4054 1 78.22 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAA:1 - chr2R 19551995 3' + roo 9029 1 67.33 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGAGTACGGAACAATATATTAC:2 - chr3L 19377750 3' - roo 55 2 83.17 GAAAGAGTTGTTGTCTTTCCTTTTGAGTTTTCTTAGTTCACCTAATTGCGATTGGTATGTTTTTGAAAATTTCTGTGGGATTCTGTGGATTGTGCAGTGTT:1 + chr3R 12099351 3' - I-element 270 1 70.30 ACGAGGAAATTTATATAATGTAAAAAACTAGTTTATAGTCATTAGTGCTTAGGGACGGGGGAGCCTGGGCTACAGGAACTATCGCCACATGACGGGTCACA:1 + chr3L 25479117 3' - Cr1a 4329 1 81.19 GAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCTATCTATCACTGTGTGTGTCTTTTTTCTCTTTCTTTCTCCACACACGATTGCACACTTGC:1 - chrX 4439497 3' - F-element 256 2 62.38 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGGCTCAT:1 - chr2R 7861640 3' + roo 400 1 71.29 TCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACACTGCCAGGAACAGGGAACAGAAAATGGGCAAGC:1 - chr3L 4083979 3' - micropia 5176 1 72.28 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACTTTGACATACACTATTTTGTTGAATCTCAGCAATGTTGCAATTTTATCGCTCATTTCACTCACTCAAATG:1 + chr2R 21573154 3' + 1360 3386 2 67.33 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGT:1 - chr2L 17210254 3' + jockey 4985 1 71.29 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACACCATCTTCTTAGGACCAAAAATGAAAATCAGACCGTGAGAATGAGTAACCACATTTCCGAAATATC:1 - chr3L 14638588 3' + 1360 3383 2 75.25 ATCAGCGACTTGTGGGATTCCAAGTTCCCTATGAGTGGGATCTGGGGGCCAAGAGGGCTCCTGCTGGTCACAGGTAGGAAAAATAAAAAGGGGGGCAAAAA:1 - chr3R 25805267 3' - G6 1755 1 55.45 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTTCTGAGTGATT:1 + chr2R 17937203 3' + Quasimodo 7347 2 60.00 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAAT:1 - chr3L 12103797 3' + roo 9030 1 67.33 TTAAAATTCATTTCTAACATTTTAGCCCGCTCTTACTCTTTAATGAATTTCTTGGTTCTGGCTCAACTTCTCCACTTCTCCTTTTATCCTGTCCCCGATCT:1 - chr3L 19183833 3' + FB 974 2 68.32 TATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAAAACTGAGCAAGAGACACTCTAATTACT:1 - chrX 13546606 3' - roo 1 2 79.00 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCGTCATCGTAGAATAGGTGAGATGTGCAAATGGTTGGGGCGCATAA:1 - chr2R 15474773 3' - roo 12 2 67.33 ACAGAATTAAACTATTAAATTATTAATGGTACATTAGAAACGAAGACATACATAATAATTTAAACATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAGCAAGCTGG:1 - chr2L 6302335 3' + Porto1 4546 1 63.37 CAACGNGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACACGGACCGGCAATCCC:1 + chrX 13546724 3' + roo 396 1 67.33 AATGAATTTTAAAACTAAGTCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAACGCTA:1 + chrX 11730317 3' - 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roo 49 2 78.22 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAA:1 + chr2L 7488909 3' + roo 359 2 79.21 CGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGAAATATTACCATTTTGATGGTGGACTCGAGAGCATCGCCCG:1 - chr2R 12029342 3' - accord 275 2 59.41 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCC:1 + chr2L 7488916 3' + roo 9030 1 72.28 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGTCTGGCAAACCCGAAAAAGCCAAAA:1 - chr3R 17495741 3' - Quasimodo 13 2 67.33 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCGC:1 + chr3R 27748713 3' - roo 8718 2 83.17 ATCCAACATGCCATACTTTGTCGAAGGCTTGCATATCTATAAAGACAGCGTTGGAGTACTGAGCCTTACCAACCTTAATGATCTCTTTGAGCTTATTACGG:1 - chr3L 23212940 3' - Helena 415 1 59.41 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGAATTAC:1 - chr3R 22431063 3' - Max-element 8256 2 56.25 GGCCGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATACATCACTATATATATATACATTCTGATATATATATATATATATATATATAGAG:1 - 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Ivk 34 1 55.45 AATTAGTTCGCATTGATCTGTTGTTCGAAGAATCTAAAACTTTTGACTATTAAAATGAATTAGTTTTACATCACTGTTTCAAAAACTTTTATAAGAGTGTT:1 + chr2R 3172714 3' + Tc1-2 232 1 62.38 AAGCTGCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGTGTTTCGAATCCCGATCTTCGGGCAATTCGTCATTC:1 - chr2L 3632149 3' - P-element 23 1 52.33 CGCCTCCAATCTACATCAGAGAAAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAATGGAGTGATAGACAGAGGGGTGTGAGACGAATAAAGCAGTGATGTAGA:1 + chr3R 4503762 3' + Fw2 210 1 55.45 TAAATTGTTGCAAACTATTTCTCCTAGTAATGTTAAATTTAAATGCGCGCATAATCGCAGCCAAGTTAACCAAAAAGTAAATATATATATTTACTTTTTGG:1 - chrX 4700935 3' + TART-C 10863 1 75.25 TTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCA:1 + chr3L 15099635 3' - G4 3816 1 34.65 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTT:1 + chrX 21564738 3' - diver 5921 2 61.39 TATACTTCCTGAGATCTCGGCGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGA:1 - chrX 22651470 3' - INE-1 144 1 46.53 ATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTAAATGGATGCCGACAACAATGGCTCTGTCCACATCAATAACCAAAGGAAACACATTG:1 + chr3R 14178885 3' - accord2 7193 1 61.39 CTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTCTTAGAATTAGCTCATAAATTGATAAGCGAATGGGTCACTGGTTACATAAACAGCAGACGCCCCAAACCCAG:1 - chr2L 6558318 3' - Burdock 6109 1 67.33 GTCAANCGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATGTATGAAATCCCGGCGTAATGAGCGACAGTTGATGATGCAG:1 - chr2R 20952526 3' + rover 320 2 57.58 ATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGGGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAA:1 + chr3R 15671435 3' + R2-element 3202 1 72.28 CTATTTTCAAATAATAATAACGTTAACAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAACGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAA:1 - chr3R 4571526 3' - 1360 314 1 74.26 TATTAATATATAATTAATATTAATAATATATTAATAGCATTGAATTTGAATTGAAGCTAATACACATGAATTTTAAATATAAGAATAGAACTTTTTAGCTA:1 + chrX 12940804 3' - Tc3 264 1 75.25 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAA:2 - chr2R 24021562 3' - pogo 25 1 54.46 TCATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTAATGGTTTCGATTGGATTTTCATAATAAGCAATGGGCTGACTAGGTTTAATCATTAAAATT:1 + chr4 170645 3' - I-element 428 1 65.35 TATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCTTTTTTATGGCGCCCCCGGGTGGACA:1 - chrX 19986327 3' - Stalker2 3 2 76.24 TCCAANTAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTC:1 + chr2R 20744214 3' + roo 9029 1 68.32 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGCCCTCCTGACTAACTAACTAACAAACAGCGACGC:1 + chr2L 16201595 3' + hobo 2929 1 72.00 GATATCTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATAGTCGTGTAGTTTACTTATGTTCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCC:1 - chrX 292008 3' - G3 4414 1 55.45 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAACACATTCTCAGTGCCTCAGATAAA:1 - chr3L 9516755 3' - jockey 4812 1 77.23 CATATTAAGGGTAGATACACTACATCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAACCTCGAACAAAGCAGAAGCTAAGCTCTTCTTTCATTAAACATTAAAA:1 + chr3R 210311 3' - Stalker3T 3 1 74.26 GGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGG:1 - chr2L 18279876 3' - gypsy5 6951 2 67.33 TAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCGATAACCAGGTCCCGAAGATGTACCTTCTATTAGCCACTAATCTAGGTAGCGGT:1 - chrX 1539436 3' - Cr1a 4079 1 66.34 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTAAATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACGAGTGCAGTT:1 + chr3R 24081605 3' - 297 26 2 61.80 TCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAGGAACTCACTGGTGACCTTTCACATGGCGATCCCAAAG:1 + chr3R 9995451 3' - Max-element 8244 2 75.25 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTGAGTCATAATGAAACCAATAAACACGAACCCTAA:1 + chr3L 19462184 3' - roo 8686 2 57.43 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTTTTTTTAAATAAAATCATCCTATATATGCGCTCGTGTGAACGTTTCATGTGTAAGTCCACAGATCT:1 + chr2L 10473539 3' + flea 5008 2 58.00 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTGCATATACGAGTAAGTCCGCCGCGAGTGTATGTTCGCATTAGCAATGGCCTTGAGCCGGGTCATCGACCGA:1 + chr3L 20230863 3' - hobo 5 1 74.26 TAAGAGTGCTGGATAATCGTAATTGGGCTGTTACCAGAACAGCCGTTGTAGGTCAGTGGGAAAAGTGCTTCTAAGGGAGTAGGCGTTCGTCAAAGGGAGCA:1 - chr2L 15807572 3' + baggins 148 1 73.27 CTCTGCGTGTCTGGATGATCCGAGAAGTTCGTAAATGCTGCTGATTCTCAATCATGATGTGTTCCAGTTTGTCTACCAAGTGGTTGGACTCTTTG:1 + chr3R 10781164 3' - Burdock 5969 1 56.84 CCAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGGAACTGATTATAGCGTTTACCATTATTTTTTACGGTACAAAACGTAAATCTTGAATTGGAGTCAAATGAT:1 - chr2R 9236998 3' + INE-1 543 1 74.26 AGCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAAATAAATATTTTAAAAGCAGTGGCATATATTGAAT:1 - chr2R 9316966 3' - opus 7153 4 72.28 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATGTGGAAGTACCCCCATGAAAATACGAATTAAAGCAGCAGCAAACGCGGCACAAT:1 - chr3R 18571110 3' - hobo 23 1 56.00 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGAACAGCTCAAAAAATTCAACGCCAT:1 - chr3L 11113920 3' - 412 7104 2 78.22 GATGTNAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATCTAGGCCAAAGTGCTGCACCAAACTAACGAACAGCTCTACGATTCAGCTCAATTTTCAATTT:1 - chr2L 15954710 3' - Quasimodo 171 2 74.47 AAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATATATACAGCGTTGCCAGTAGCTATGGTTGCGCTGGAACCAAGTGTAGAGCGCCACCAGTGCGGCGACCA:1 - chr2R 12186466 3' + HMS-Beagle2 7189 2 61.39 ACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAAGTGTTTATATCCATGTTGTCAGTGCTTGTACAGAGATTTTTTTTGTCATGGCCACCGGAATGCTTTAGCTTTCTG:1 + chr2R 13241755 3' - hopper 997 2 63.37 CTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGAGCGTGTAGTAACGCGCAGAGAGAATAAAAACACAAGCCAAGGGCAAAAAAAAACAAATTT:1 + chr3R 31939636 3' + gypsy4 6671 2 58.62 CATACAGTGATAGCAGACAACTGTGTGTGTGCACACGTATCCATGCATTGTAAATACAGGGAAGGCAACATGCTGCTGAATTTGCAAGCTGGATGATAATT:1 + chr4 962565 3' + 1360 154 1 50.50 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCAAAGCGTTTTGGCGTTTGTTCCAATTCTGAGAGCATGCCGCACATTAGTCTCTAGT:1 - chr3R 6118538 3' + Tirant 352 2 71.95 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAAAAAGATAAGGTTGAATTGATTGAGCTTTGAATTCAATCTTTTAGGC:1 - chr3R 27108440 3' + jockey 4982 1 48.19 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGATCTATATTC:1 + chr2R 17261657 3' + pogo 2076 1 57.43 TCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAA:2 + chr2R 4659350 3' - S-element 1460 1 47.52 GAAGAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAAACAGCATTCAAAT:1 - chrX 3619931 3' + Doc2-element 244 1 92.11 TACCTGCCCTTCGGGCAACTTATTCCCCTCACCCCGCGCAGAGCCACTGAAGGGGGCAATAAAATCCATGCCTTTTGATAACTTTCTCTCTCTGCACGATA:1 + chr2L 15373636 3' + BS 183 1 68.32 ATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTTGTCTGAAGTCCCAGCTACCCATTTCCATGCAGATCCCAACCAGTTTATCGAGCGATGTTTCCTC:1 + chr2R 2864152 3' + gypsy2 6528 2 65.00 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCCAGGGCAGAATCTCTTTTTGGTGCTTAATGACGCGGTGATTC:1 + chr3R 11688499 3' + 1360 3354 1 63.37 CGGGTGCGCACACAACGGGGTGCTTGTATTGAAAAATCAAACAAGTTATTAGAAGGTTAAAACAAAAAAAAAAAGTAATTTGACCCTTATACTAATCGGTA:1 - chrX 12862844 3' - hobo 132 1 77.23 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATGTTGTCATATTTCGCCGACAACTTTGCT:1 - chr3L 11661691 3' + hopper 1408 2 70.30 GTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTGTATGTGCGTGCACTCATAAAAATGAG:1 - chrX 992037 3' - hobo 49 1 75.25 AAAAAATCGTGTACCAAAAAATAGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCGAGTGTCTTTGGTGGGGTTGTCTCGGGCAGATACAAGTCGGGGG:1 + chr2L 22348333 3' - 1360 39 1 65.59 AACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTNGCCTGGTCTGAATC:1 - chr3R 12047432 3' + Stalker2 7607 2 68.09 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGAT:1 - chr3R 23275250 3' + roo 9047 1 54.46 CTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATGTGGAAGAGTTTTCAATGTTCTATAAGAGTGTTTTGTGTTGAATATTTAAAAGTTCATTTTCTTT:1 - chr3L 27377 3' + I-element 45 1 64.36 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAAATTTTTTATTTCCAAGAGAGTTAAAAACGTACTTTTCCGCATTGTGGTAAATCAATCGAACCCGAATGTA:1 - chr3R 23591799 3' + pogo 2098 1 48.51 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCGAATAAATTTAATAACGTGAATAATGCCACTAAAAATAATTCACAAAAACCCAAAGA:1 - chr3R 17853310 3' - roo 17 2 60.40 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAA:1 + chr3R 27775141 3' + roo 9027 1 69.31 TTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTGGTTTTTAATAATTATTTTAATATATCAATCTTGAGTGAATTTGATGACATTTATAACGTGGCAAATACAA:1 + chr3R 16310627 3' - I-element 417 1 68.32 GTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTATCCAGGTATATTTTGAATTTTACAGATTTCAACTTGTAATTAATAGACTGACATTTTTTTTTAAATTC:1 + chr3L 10563438 3' - Stalker 6794 2 69.31 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCATCAGC:2 - chr3L 7550710 3' + 412 464 2 52.48 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGTATACCAATTTTATAGCATACTTTTGCGGGTGGCTGAGAGGCTAT:1 + chrX 18239439 3' - jockey 14 1 71.29 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTGCAAAAGTGCAT:1 - chr3L 18659009 3' - pogo 21 1 58.42 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCGTCCTCTTAGTA:2 + chr2R 2427624 3' - Doc 13 1 66.34 GAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAAAATGGCTCCCTTGTGGGACACCGGATGTGATTCGGAAAATGCAAGTCGAAAATTGATTTTT:1 - chr2L 5245756 3' - Cr1a 4065 1 42.57 CGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCAATCAATCTATGTTAAATATTTAAATTTATTACATGTTAATTCATGGCTTTTCGGTCATACTGCCAA:1 - chrX 9437042 3' + Cr1a 201 1 68.32 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTTCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACC:1 + chr2R 5840672 3' - Ivk 42 1 68.82 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAGTACTTAAGAG:1 + chr3R 19989342 3' - hobo 13 1 67.33 ATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGTTTGTGATATTCAAATCCAAATTTGTACCCCTGATGCAAAATCTCTCGA:1 + chr3R 18735170 3' - 1360 3254 1 56.44 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAG:2 - chr2L 285710 3' - P-element 57 1 22.77 GTGACNCTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAATACGATCTAGTTGCAGCTTGAGGGCTCCGGCCCGCTGCAGCACT:1 - chr2R 79641 3' + Stalker 71 4 64.36 TCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAG:1 - chr3R 9131769 3' + roo 9029 1 68.32 TCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAACACTTAAACCCTCTCCTAATGGGGCCCAATGTATATATACATAT:1 + chr2L 17712628 3' + 17.6 7189 2 56.44 GGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTTTTGTAAAATGGTATTAGTTTTTAATAATTCGAAATTAGCCTTTGATACATTTCACTCACCCGTGTTGTAC:1 + chr2R 5064427 3' - F-element 331 1 73.27 AAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCATCGGATTTGGAGGTAAGTTCCTCATTGCGGTGCCCCAAGAGCTTTAATCCGCTTTTTG:1 - chr2L 6315777 3' + Doc 4469 1 66.00 AATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGCAAATTTTGAATTCCCTTCTTAA:1 + chr2R 15440502 3' + HMS-Beagle 429 1 77.23 TTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTA:2 + chr3R 13582275 3' + BS 5054 1 64.36 TGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATACATCTTACTAATATTTATATTTTTTTTATAAACCTCGGTCATGCGGGAGGTCCCGCT:1 + chr2L 21272143 3' - copia 4890 2 59.41 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAGGTGTTCTA:1 - chr3R 27156621 3' - pogo 10 1 69.00 AATGTTTTCTATAAAATCATTTCAATTGTAAATTGTAAACATACCATACAATATGATAATGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAG:1 + chr2R 4029396 3' + TAHRE 10165 1 64.36 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGCCCAACAGTGACTATGAATAATAATGATATAATAAAC:1 - chr3L 3032233 3' + opus 467 2 62.00 CGCTAGTGCTTGGCTTCTCTTCCAGCTCCTCTCCCTGTGCTTTCTTTGCCGGTTTTCGCTTTAGGAGACAATGGACGCACTGTGCATGGGTAATCATTGCT:1 - chr2L 8841641 3' - G6 487 1 62.38 GCGGGTGCAGCCGATGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGCTGTTGAAGTTGTTGGTATGTGGGCGTT:1 + chr3L 16679652 3' - F-element 460 1 60.40 TTGTGNTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGAACACGTACACGTCCACAAACACAGACACTAGCCAGCACTGAACGAAAAACTAACAGAGTTCACAAA:1 + chr3R 20477138 3' + 412 7538 2 68.69 TTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGGAAGCGTGACGGAGGAAGGATGGAGAGCAAAACGATCCGGCTTGGTGGTTAGCTGGAAAATCAAAGTACGACC:1 - chr3R 11543218 3' - hobo 2684 1 63.37 GTCTACTGCACAGTTTTGGCGGCTGCGTAATCCCCTCCGCCCTTTCGTTTAGTACGCGTTATGTAATCTTGTCGGGCCAATTCGAGGAGTTAATTATGTCA:1 + chr3L 14169405 3' - diver2 4548 2 77.23 AATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGACTTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACATGTAAAAGTCATGCCTT:1 + chr2L 4289084 3' + micropia 179 2 53.47 CAAAACAGATGTTTGAGAATAGTCTCCAACGCCCATCCCCAGCCCCAATTCCGCTTTTCCCACATTTCCTTTGATTAGGGTGCAGTGTCAAGTGAAGAGCG:1 - chr3L 9913618 3' + G2 2727 1 65.35 GTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGCCAACACGGGTGGCTGCTGAAATTCTCGTTCTCACATGTTGCCAAAATTCTTCGGAAAGTCTTTAAGTTGG:1 - chr2L 18430050 3' - copia 4873 2 72.00 CAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGC:1 - chr3R 12047418 3' + Stalker2 366 2 56.44 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGGCCCCCTGCCACGCCCCTT:1 - chr3R 6117211 3' - Tirant 8117 2 68.32 TGTTANAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACTTTTCAACGCACAAAGTGACATCTGTATGTGTGGTTTCTGCTTTTTTGCCGAATCTGTGGGTG:1 - chr2L 20487768 3' + 1360 102 1 69.31 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTGACAAAAGACTATATTACATTTGAAA:2 - chrX 19426220 3' - mdg3 21 2 59.41 AGCTCGTGATTAATATATATATATACAGCGTTGGCACTTTGCTGTTGTAGTGGCAATCAGTTCGGGGCTTGGGCGTGGCTGC:1 - chr3R 7178700 3' - accord 6940 2 51.22 TGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGATTAATTGTCGCAAGTATGGCAG:1 + chr2L 19213180 3' + 1360 408 1 66.67 GATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCTGATGTTGCTGGTAGTAATAGTCGCGGGCATAGAAGTTAA:1 + chr3R 18422519 3' - flea 80 2 60.00 GGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGCTGGTCTGTCGAAAGTCGTGCTCGGCAATTAGCCGCATTTAGGCATTTGGGTTTAGGCCGCC:1 + chr3R 6121917 3' - Tirant 92 2 64.36 CTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGCTGCGGCTGTTGTTGGATG:1 + chr2L 16348103 3' - F-element 315 1 81.19 CATTTNCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTAATTGGCTCCAATTGCACGCAATTAT:1 + chrX 20047608 3' - roo 49 2 83.17 AAAAAAAATTAAAATAAAAAAAGATTGAACAATGCACACATTCGTTGAAAGGTGAACAGTATAATTGGTGGCGTGGTAAATGAATATAATGTTCATATGC:1 - chrX 5139760 3' + Doc2-element 254 3 77.00 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAA:1 - chrX 13546633 3' - roo 8693 2 59.41 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCCTGCCCTCCTGTCCTGGCAACTAAGGGAA:1 - chr3R 27775071 3' - roo 18 2 61.39 GTATTAGTTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAG:1 + chr3L 11661797 3' - hopper 22 1 51.49 AATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAAGAATTTGTACATTTAACGAGAGGATGGTATTTTTAATTTGATTAAACTCGAGACGCTGCAAATA:1 + chr3R 27839160 3' - hopper 1107 1 51.49 AGCTCNCACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAG:1 + chr2R 4483263 3' - Ivk 38 1 57.43 ATTTANGACCAAGAATAAAGACGACGAGCAGTCGAGGTTACACCGTTTACAAGGAGGTCTGCTCCTCCTGCCACTCATTGCAGTACATGGCCTATCGCAAC:1 - chr3R 29203382 3' + ZAM 8262 2 70.30 CCCAACTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAAAGTTACAAAAGTTCCGAAAATCAAAATCAGACAGTATAGCAATGTGACTCCAAAGGCCGTTTGAG:1 + chrX 21976901 3' + FB 105 1 61.39 CGATCAAAAGGCCCTGGCAAGTTTGTTTTTAAATTTAAAAGCAACGCAGTTAATGCATATAAAGGCATGCACAACCGCAATAAATAAGGAAACTAAAAGAC:1 + chr2R 2046172 3' + Copia1_DM 493 1 74.26 AGTTCTTAGAATTAAAGTATCTGACACAGCAGAAAGTATGAGTATGTTTATAAGTATGTATATGGAATTTTATTGGCCCTGTCTTGCGGGGAAGAGCTCAT:1 - chrX 18772837 3' - ZAM 8200 2 80.20 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGG:1 + chr2L 12815082 3' - hopper 35 1 72.73 AAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCACAGGTACCACTGTAATTAGTTGAAATTGTAATTCATGGCGCTGGATTAGATAAAAATCTGCTGCCAATTAGT:1 - chr3L 6389949 3' + Q-element 142 2 78.22 TAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGACGGGACTACCCCTAAAATCGAGCACCACACGTAGGAAACAACCTGCCCATCGAAT:1 - chr3L 15848118 3' + 1360 3036 1 59.41 CTAAGGTCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGCAGCCCATCCACTTTCATTATTTGCGTTTAACTCACGCAA:1 - chr2L 6594399 3' - I-element 497 1 64.36 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAGTTA:1 - chr3L 17918388 3' + 297 6935 2 75.25 AATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTAAAACAAGCT:1 + chr3R 4544098 3' + flea 5013 2 79.21 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAATATACCCAAAACCCTGATAGGTATGCTTTAAT:1 + chr2L 15080562 3' - hobo 42 1 66.34 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAAT:1 - chr2R 23584751 3' + HMS-Beagle 203 2 64.36 AAAATNGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAA:1 - chr2R 24021586 3' - pogo 49 1 77.23 AACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAA:1 + chr3R 29331904 3' - G6 45 1 67.33 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATTATATGTATGTGCT:1 - chr3R 7168546 3' - flea 4768 2 68.32 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAG:1 + chr2L 12949291 3' - 412 16 2 60.82 GGAACAGAATTTATACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGATAAGCCTCCACCAGCAAAGTTAAACAAAATAAAATAAATTAAACAATTA:1 + chr2L 14025654 3' + TAHRE 10404 1 64.36 TGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTTGATGCGCTGCACGAGGATTAATAAATAATCGTATTGCGTGCAACA:1 - chr2R 16335784 3' + P-element 2789 1 50.50 GGAAAATTAGGTTCGACGCAAAACACGCACAGCCAACAAAACTTGAATTTAACGTCATTTGGCGATAAATCTTCGACTCAGATCGACAAAAATTGGCCAAC:1 - chrX 17501058 3' + Bica 4616 1 61.39 ATTTTNTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTCGAATGTTGCGTATTTCTAAA:1 - chr3R 12605595 3' - F-element 41 1 55.45 AGCCGCATATCCTGAAAAAGATAAACCAAGCCAACCATACCCTCCACACATTGGCCTCCTCCTTAAATAATTTTATGATTTCCGTTTGTTACATTTGTATG:1 + chrX 15887674 3' + G7 727 1 66.34 GCTAGTAAAAGTCGCCACACTTTCACTTGCCAAAACTTAATTTGATCAATTTATTATACATTTATTATTGTGTTGCCTCGTAACTTTACCTAATGTAAATC:1 - chrX 20363033 3' - G5 143 1 60.40 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACA:1 + chrX 13546709 3' + roo 9044 1 55.45 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACT:1 - chr3R 10952284 3' + roo 361 2 70.30 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACAATATG:1 + chr2R 4483275 3' - Ivk 26 1 53.47 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGGCAGTGACTGTGAA:2 + chr2L 2060190 3' + 412 456 2 56.44 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTAT:1 + chr2R 19209459 3' - jockey 4784 1 54.46 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGAACTTTCGCTCGTGACAGGTTTGTTTTGCTCTTGATAAATTACCTTGCCACTTGTCGCTCAACA:1 - chr2L 3143216 3' - FB 12 1 68.32 CTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCACCCACTCCGATGTCCGCCTTTAGCACCTTATGAAAGTGCTTGGCCGTGTGATTGATAATC:1 - chr3R 27285142 3' - Max-element 63 2 61.39 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATATTAGTATGCAGTA:1 + chr3R 24760648 3' - pogo 3 1 76.24 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTA:1 + chrX 11730325 3' - jockey 4795 1 64.36 AATAAATAAAATAAAATAAAATCTAAAAAAGTAGAAGCCTCGGGCTTTCTTTGTTCTTTGTTCGAGGTCGTCGCTAAAGCTCCGCTCGGGGTCAGTTCGCC:1 - chrX 5880833 3' - transib1 1900 2 62.38 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAGACTTAAATGTT:1 - chr2R 14708979 3' - Doc 47 1 67.33 CCTCCGGATCCGCCGGTTGAACCACAGACATAATAACACCCACACCTCCTTCGCTGTCATGCAAGGATGACAAAAAGGAGCGGATTTTGAGTGGATGA:1 + chr2L 22541507 3' + transib4 2378 1 55.10 TTATGCGGGCTATATCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCGAATAGTAGTGGGTAGTATCCACCCCTTCGAAA:1 + chr3L 12638351 3' + hopper 1313 1 64.89 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCTTAATTTGTTAAATTTTATTAAAAGACTTAGTGTT:1 - chr2R 612019 3' - F-element 62 1 72.28 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAGTTTTCTCTTTATGTGGTCGCAAACAGATACAAAAGGTTCTTGGCAAACTGAATAATCTCGG:1 + chr2L 19525505 3' - FB 15 1 61.39 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTAATGAGTTCAAATATTTTATAGAA:1 + chr3R 27979152 3' + roo 348 2 77.23 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATTTGAAAGGTAAAGGCAATAACTAACTTTTATACAAGGAA:1 + chr3L 18659093 3' + pogo 2070 1 59.41 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCA:1 + chr3R 16400215 3' - blood 39 2 63.37 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATT:1 + chr3L 18706938 3' + jockey 4958 1 53.47 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCTCTGCTGTTGCCAGCATGTT:1 - chr3L 12888201 3' + mdg1 409 2 66.34 GAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCAGATGGGCATTTCATAGCCAACGAAAGTCCCGTTTCCGATGCATAAATAGCTGCCC:1 + chr2R 17937683 3' - Quasimodo 261 2 53.47 ATTCACATTAGCTGACTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGA:1 - chrX 10445559 3' + INE-1 536 1 74.26 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAA:1 + chr3R 23638177 3' - pogo 31 1 62.38 CACCACCCCTCCCTCTAAACCACCCCGCCTACACAAGTAGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTAAAAACCCGAGATCAGACAGCCCAAACGATGGAACGATC:1 + chr3R 26039505 3' + ZAM 7987 2 67.33 ACCACACACACACACACACATTGAGGGGGCGAGAGGGGCGTGGCGGCGTGTGAGTGAGTGCATCGTGGCGCTCATAAAACTAAATTTCTAAACAATCTGCG:1 - chr3L 12227161 3' + accord 7030 2 49.50 AGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTAATAC:1 - chr3R 12539492 3' + roo 9042 1 56.00 ATTATCTGGATTGGGTTTTCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGAGTTGTTGAATATGTCTTGTTTGGTTTGCACAAGCCGCGGGCAAAGTGATTGTGATTGTG:1 + chr3R 8788930 3' - I-element 5120 1 65.35 ACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGAAGATGTAGTTGAAGTAGGTTCCAGAGTGGTAGACGAGCTTGGTTCTGTTGTGGGTGTAACTGT:1 - chr3L 12886681 3' + mdg1 7001 1 55.10 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTTATATGTT:1 - chr4 96889 3' + flea 4980 2 69.31 TTTTTATGAAAAGGCATCACAAAGGACTCCTTCCATATATGAGGGAACTGTGAAAATTCCAGAAATAAGAACCTTTTACAATCAACTTTTGTAATTGATAA:1 + chr3L 9865786 3' - Q-element 62 2 67.33 GCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAA:1 + chrX 3663199 3' - 297 6769 2 74.26 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAATAAGCACTTAAATTATTAAAAACTGCTACATATCA:1 + chr3L 8614557 3' - opus 36 4 68.32 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCAGCACATGTGGTGG:1 + chr3L 18501024 3' + hobo 2921 1 56.25 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACC:1 + chr2L 1625696 3' - hobo 48 1 73.27 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTTCCCATTTAGCGATTTTT:1 + chrX 19426309 3' + mdg3 223 2 55.45 TATTACAACGCATGATGGCGACTGAACCGTAACAAAACTATGAAATTCCGCATATGGACAAAGAGTAGGCCAAAAAATAAATATGTGCAATGT:1 + chr2R 3287667 3' - mariner2 125 1 64.52 TTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGG:1 - chr2L 12815058 3' - hopper 97 1 44.55 GTTACCTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCT:1 + chr3R 12047460 3' - Stalker2 30 2 68.83 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATG:1 - chr2R 7861667 3' + roo 9036 1 64.36 TAAATCATTCTAGATCTAACTATGAGTTACTGCCCCCCACTTCATCACATTTTGGTCAGAGTAAACTGATGACTCCAGATGATTAAATGATTGCGAGCGGC:1 - chr3L 11471749 3' + Cr1a 4149 1 74.26 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCAACTTGTTATTCTTAATTTCACTTTACCAAAAAGATTTTGAAAAATCGAGTTTGTTGCCTACTGTAATTGC:1 + chr3R 10484514 3' + 1360 3357 1 60.40 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTC:1 + chr2R 14675595 3' - roo 50 2 78.22 CCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGATAGAAGGTTGAGATTTAGCCTACAGATTCTAGAAGCAGAATGCGCACATCGAGATAAAATAAAAAGAAATAATAAT:1 + chr3R 3525629 3' + INE-1 146 1 61.39 ACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGAGTGAAAAAATCAGCGATTGCTGCAGTGC:1 - chr2L 3391953 3' + F-element 4242 1 77.23 TGTTTCCAAAAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACAC:1 - chr2L 19018967 3' + hobo 272 1 44.55 TGTTGNTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATG:1 - chr3R 4544008 3' - flea 4799 2 69.31 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGTCGTATTCCCG:1 + chr2R 21773640 3' - Max-element 7 2 67.33 AAATTGAAAAACAAATTAAATATACAACGAAATTTTCCCATTCACCTTCCATTTGGTTCGTCTAAAAGTCATTTTGGCGGAAATCCATATGTGTTTTCTTT:1 - chr2R 15295157 3' - S-element 1579 2 56.44 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTC:1 - chr3L 18500963 3' - hobo 45 1 71.00 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCTCTGACTGCCTGTCTG:1 + chr3R 27775175 3' + roo 398 1 68.32 TGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGACTCTCTGCGTCTGTGTGTGTGGGTGTAATTATGCGCGTGTATGGGTGTGTGGAAAAG:1 + chr2L 21237538 3' - 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chr3L 12352551 3' - G2 3001 1 51.02 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGTGCTCATTGTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCTTTTGTCACT:1 - chr3L 9907353 3' - jockey 27 1 52.48 TTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAGGTTAATTCAGCTAGCCAATTAATATTTTTATTTACTTTGCTGATGTCTTGT:1 - chr2L 11632812 3' + Doc 205 1 57.43 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGTTTAAAAATATTAACTGTCAATTTGTATTTGGAAATA:1 + chr2L 21328885 3' - flea 4823 1 63.37 CCATGAGGTTATGGTTTTGTGTTTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGAGCTGGGCTCTTGTGCCTTCTCCCTCACTCGCTTTCCGTCTCCCTCTGCGAGG:1 - chr2R 23021584 3' - invader4 410 1 62.38 TTTTGTTAGCCGGCGGGCCTGAAAGGGGTCACCAAGGTGACAAAGGGGTTTTCAGCCGCTCCTGATGACGATGATTGCGGCAAATGATTTCCTTCAGACT:1 + chr4 352485 3' + BS3 1687 1 56.00 ATGGTCAGCATTCACACGCCGAGTTTGATTTGGCACGTGCACAAATGCAGCTAATCGAGTGTGAAAATCGTTCTGGGCTGCCCCAAGAATTCGCTTTTTAA:1 + chr2R 16473278 3' + 412 7246 2 79.21 CCATANGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTT:1 - 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blood 7059 2 72.28 AAATANAAATTATAAATTACAACAATGGAGAATATTTCTAATTGGCTTATGTTTGCCATAAACTGTTTAATGGTAAGTTAGGTGTTCATTGTAATTACGAA:1 + chr2L 9163817 3' + copia 253 1 72.28 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCTTTTTTATGGCGC:1 - chrX 19986340 3' - Stalker2 16 2 63.37 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTAACTTTTCCAAGTA:1 + chr3R 19989334 3' - hobo 21 1 59.41 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGA:1 + chr3L 18337715 3' - Juan 4048 1 55.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAGAGTACGGAACAATATATTACGGATATCTGCGGGGGTTACAGAATGCAACC:1 - chr3L 19377720 3' - roo 14 2 62.22 GTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGCGCTCCGGCACACATACACAAGTGGCTTGCAAATGGCGGATGCGGTTCCAACAAAAAGAAAAGAAGAA:1 - chr3R 17682234 3' - hobo 2722 1 75.27 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTACTGGCGCACCCACACACACACACACACA:1 + chr3R 27499995 3' - hopper 22 1 61.54 TTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGAATTACTGGCATACGTATATGATGTACCATA:1 - chr3R 22431038 3' - Max-element 1 2 78.22 AAAACCTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACTTTTAAAATACAAGGATGCAAGAAAATAGATTTACGTTCTAGAAAAAGTTGAGCATTAAGGTAGA:1 + chr3L 8018006 3' + FB 402 1 59.41 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCACACA:2 + chrX 2649921 3' - Tirant 8107 1 81.00 ACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCAACATGCTTCGAAAATCCCAATTGAGTGTACAAAATATTGCGATACTTGTATAAGATTGAA:2 + chrX 10672380 3' + mdg1 407 2 64.36 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGTCGTATT:3 + chr2R 21773636 3' - Max-element 11 2 63.37 TAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAATCCTATTTCGATTTTGAAGTTTG:1 - chr2R 9770204 3' + I-element 5304 1 74.26 ACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCATATAGCAAAAGCTA:1 + chr3L 14638656 3' + 1360 17 1 61.39 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCAATATGTATGTGCAAACCCATATGTGCTTGTACAATCACCCTGCCTGATAAGCTT:1 + chr2R 7775811 3' + Transpac 290 2 55.45 TATATATACATATATACATATATATATATATAGTGTATATTCAATTCCAAACAGAGGGAAT:1 - chrX 19117106 3' - G3 4506 1 86.89 GCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAAAAAAAATAGATCCGTTTCCGCAGCTAAGTAAAATAAAGATGAACTTTACACTTATAAAAAACTATATATAAGCTTGG:1 + chr2L 9635220 3' + invader2 280 1 78.22 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAA:1 - chr3R 19989261 3' + hobo 2920 1 53.57 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGA:1 + chr3R 8313102 3' - 297 6631 2 81.19 TAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCATTGTCTTTTTTTTAATCTTCCATTTCGTTGGCGCTTTGCTTTTCCTCACAGCGGCTGACGCCTTG:1 + chrX 5476818 3' + Cr1a 170 1 56.44 AAATACAAAGGAATTTTTCCATGTCCCTTTTTGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTAAAATGGACGACCAGACTAAGTAATAAAAACTAAAATA:1 + chr2L 21677892 3' + HB 46 1 70.30 TCATANGGACAGACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTGTTGATCCTGATCTTTATACATTATATAGTCGGAAACTGCATTCTAGATGAGTCTATGCTTAC:1 + chr4 137982 3' - INE-1 121 1 73.27 GTAAAGCTTTTGACTCTGTTAATCATCACCTTCTATGTTCCTGTTCGCTGCTCATTTCAATATTTACTTTAGCTCCAAAGGACTCCGCTTGCACATGCCAA:1 - chr3L 19461873 3' + Q-element 323 2 55.45 AAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTGTTACAATGCCGCTGGCGGC:1 - chr3R 16239833 3' - 1360 3272 1 80.20 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAAGTACATATATATAATTGGTGTGCCTTTTTTTTATATACAAAATCACCAAA:1 + chr2L 12479540 3' - pogo 22 1 53.00 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTGAGTCATAATGAAACCAATAAACACGAACCCTAATGAAAAAGTC:1 + chr3L 19462194 3' - roo 8676 2 67.33 GTGGAGGTTTTGAGGGGTGGGGGAGTTGGCGTAGAAATTGCTATAGTTATCATAGTTATTATTGCTAGTATCATATGTATGCACATTTTTCCTTTATACAC:1 - chrX 13963562 3' - gypsy5 7044 2 43.56 TTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTTAGGGTTACTGACATGAACCTTGAATTTGAGTTCGTTATGCTGA:1 - chr3R 7171576 3' - flea 4962 2 56.44 TTTTTATTTTATTTTATTTTTTTTACTTTTTATTACTTCAGTCTAGAGCGCTTGAGCCGCTGATGTTGGCTTACTGGTGTTTCAGTTAGCGGTTAGCGGC:1 + chr3R 18102287 3' + transib1 1900 2 65.00 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAG:1 + chrX 22711654 3' - transib2 53 1 78.22 ATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATACGCCCCCTTGATGCTGCCTAATCAACTGCCGCTTATTTATTTAACTTTGGTTTCACATTCGCCG:1 - chrX 16991777 3' - jockey 4983 1 67.33 ATCTCTTGACACTTCGGCAATAGGCCGCTGCAATCGTACTTGTCTGTAGTTGCCACTTATGCTGTCATCGGCTATAAATACATATATCCGCTAAAAGTCTA:1 - chrX 22477514 3' - rooA 7361 2 63.37 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATAAAAATGTCAGCATTTGC:1 - chr3L 13589413 3' - hobo 2 1 77.23 TGGGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATGCCAGCTTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGCTTATACCGCCACCCATCGAATCTCCCAGTCTCACAGTTGGCAATCCC:1 - chr3L 4929684 3' - hobo 26 1 52.48 CCAAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGGACCTACCAACCAGACTGCAGCACATTTAATTGCGTACCTTAATGTTTATTTTCAATTAA:1 - chr3R 18702638 3' + F-element 4472 1 54.46 TGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTAAGACGTAGGAGTTGCTATTGCTGTTGCTGCCGGCGGCGGGGGGCTTTCCAC:1 - chr3R 12668861 3' - F-element 314 1 58.42 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTG:3 - chr2L 16674864 3' + roo 9032 1 68.32 CAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCGAAAGCGAAGTAGTCTATTAAAGCAACAAGTAAGTCATTTAG:1 - chr3L 24762171 3' + F-element 57 1 66.00 AATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCAGCGAAACGACTTAACTGACACATTGACATAGTTCACGCCAATGCGGGTGTGTGCGGACA:1 - chr3R 8027755 3' + P-element 2741 1 63.37 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTT:1 - chr2L 21683395 3' - pogo 26 1 54.46 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATT:1 + chr3R 5686113 3' - P-element 36 1 43.56 GAAACAGTCAACGAAACTATTTAAAAAAAAGCAGCAAAATAAAAATCAAGAAAGGACCGGGAGCTAACCGATGTCCTGTGGGACCGAGGGTAACGAAAAGA:1 - chrX 21236762 3' + Porto1 4413 1 66.34 CTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTATTAGTAGCTTCGCAGATGTCTTTTACAGACCTCTGGATCCCTCAGGGAAACCCATTCCGGT:1 + chr3L 7950402 3' - hopper 428 1 68.32 TAAGTAATGCGTATTGGGTTGGCACGACAAGTGCCAGGGAGTGGCTGAATGAATGGGTTCCTAATTGAGATAAAAGTGACGCAGGCTGCTGCCTCCAACGA:1 + chr2R 15295658 3' - Q-element 699 1 74.26 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATC:1 - chr2R 14675551 3' + roo 9033 1 65.35 TGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGAGGAGTCTCACTGCTGATTACGGTGCTCTGCACTGTCGCTGGCCTTTCATCT:1 + chrX 1807065 3' + accord2 163 2 56.44 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGG:1 - chr2L 21683421 3' - pogo 52 1 79.21 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGTCATTGGG:1 + chr2L 14790631 3' + roo 9022 2 73.27 TGCAANCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGC:1 - chr3R 29123348 3' + P-element 2846 1 38.61 CAATCTTCATTTTAAAATTTATAGCATCATAATTTGGACGAGCACCGCTATTACCGAAAGGCGCGAAGAAAGTTTTCTTTGAAGGCATACGGCTTATTTGT:1 + chr3L 15717978 3' - Transpac 4808 1 63.37 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATG:1 + chrX 868754 3' - jockey 4797 1 63.37 GAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGATACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCTACATTTCAGGCTCTTTGTGGTTTTGCGGTAAGCTGGTTTACTTTTAGAAT:1 + chr2L 9217227 3' - INE-1 571 1 56.44 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTT:2 + chr3R 5686124 3' - P-element 25 1 54.46 GGAATGTAAGTGACAAATTTATCAAAGTGCCTCCTCCTCTGGCGTTGCTTATTCAATTTCATTTGCAGGCCAGGACCATAATTCGATTGCCTCATGTCTTA:1 + chrX 7385147 3' + Ivk 481 1 75.25 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGAGCT:1 + chr3R 31257037 3' - transib2 45 1 70.30 ACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGTGAAATCGAAGGATTAGCAGCTCGGCTAAAATGGGTGGAAAACTATAAGTAAGTCAGTTCTTTGAA:1 - chrX 15375059 3' - Idefix 7246 2 76.24 GTGGTATAATTTGGTTTTTTTGAGGAAAAGAATCGTGAAGAATATATAAGCCAGATCATACGAAAACAAACACATATTACTACATACATTCATGCTCTATG:1 - chr2L 16263561 3' - I-element 5165 1 78.22 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGACAATGTAAATTTGTTTTAGAGTTGATCACTCTCATCG:1 - chr2L 14612016 3' - roo 8681 2 64.36 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGAAAGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACG:1 + chr2R 12492454 3' + hobo 2929 1 64.65 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGCCCGAACCCGAAGTCTGAACCCAAAAACTC:1 + chr3R 25097893 3' - P-element 44 1 36.63 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTT:1 - chr3L 12103803 3' + roo 360 2 75.25 GAATTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGGGAAAAGGAAAGGCGATAAAAATAGAAAGAGAGCAAAGGAAATCCTTGGCAGGATGTG:1 + chr3L 3798954 3' - accord 7031 2 68.04 ATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATGTGTCTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGCTT:1 + chr3R 8165794 3' - 17.6 7 2 79.21 GCAAAACGGATAAGTTGGTATTTATTACAAGTCTCATGCGTATTGGTATTGGTAGCACTTGCTGCGTTTCCCTCCGTATAATCTGTTTTTTGGTTGATTAC:1 + chr2R 1344761 3' - I-element 5000 1 82.18 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCACACCTCCGAGCAGAAAATTTCATGTTGCT:1 + chrX 14323619 3' - hobo 40 1 68.42 GTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGATTGATGATGAGCGAGCCGTCCTTGCGGATGGTCACCCTGGTCTCCAGGGCGGCCACTTCCCGGACGG:1 - chr2L 4307300 3' - F-element 336 1 72.28 GTACATAGTTTTGGCTATTTCTAATTCTTAAGACGTATATTAGACCCACAGAGTGCTTTAACCAACTGCGGTTCTATGACTACATCAAAAATCCATCTTAT:1 - chr2L 1409858 3' - 1360 339 1 74.26 GACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGTGAAGAGTTACATTGATATCAGTATTTATAGACAGAATCTAGTTGT:1 + chrX 6135528 3' - TAHRE 10402 1 53.47 TTTAGATGATGTGTGGGAGAGCGAAAGACCGAGATAGTGAGAGCGAGAGAATAGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCGAAAAACAACAACACCAAACAA:1 - chr3R 23295170 3' - Cr1a 313 1 82.18 TTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTCTTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCTGTGATTGGGAATTAAACGCAAGATAAATAGTTGGGTTTCCCTAC:1 - chr3R 28733676 3' + copia 4965 2 58.42 AGACACAGCTTGTTCACTGCCCGCCTTATTAATCCAGACGCGGTCCTCAATTCTGCAACTCGAGCGACGCCGAAAGTTAAGGGACACTTGCAATCCT:1 - chr3L 15657256 3' - diver2 4461 1 74.23 TGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAA:2 - chr2R 3591997 3' - Quasimodo 44 2 79.21 CACTTTTGATAAATGTGTTGATAATTTTTCACATTTTCACATAACGCCCTTCTCGACTAGTATAACACTTCTTTATTGATATTATATATACTAGGGTTCTT:1 - chrX 722401 3' + INE-1 261 1 55.45 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGAATTATTGCCGAGGTTTCCGTGACTTTGCTCAGTTACTAAAACATCATCGTCGAG:1 - chr3R 26258987 3' - opus 34 4 58.42 GATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGAACGTGGCCACTTGCGAGTTGCTATAAAAAAGAGAAAGAAAATAA:1 + chr3R 772997 3' + micropia 197 2 71.29 GAGAGAGAGATATGTATGTACGTGTGTAATACCCCACTCCAAGGTACAGTAGCCGAAATGAGTATAGATTTGTTTGTTTGTATGTCGTTAGCATTGTTTTT:1 - 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hobo 21 1 62.79 TGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGC:1 - chr3L 6044741 3' - Tabor 34 2 55.45 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACGAAGTTTTTGATTACCTAGTTTCCGATCAAGTAGATCTTTGTGAAATTAGTCATATGCCTTAA:1 - chrX 21018605 3' - 412 7139 2 67.33 ATGGGTGGTGAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAACTATTTCCCGTAATGACAGGATTTGGTCTAAGCGGATCTGGTAGATATAATTTCAAGCAA:1 + chr3R 2994716 3' - Doc 4474 1 64.36 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGGAA:1 + chrX 13508762 3' + roo 9045 1 56.44 ACATGCACACACACACACACACATATATATGCATTTATTAATTAGTTACAAACACTAACCACACACACACATGGTAGTACCTGATTGATTTATCATTTGGA:1 - chr3L 12603774 3' + accord 179 2 63.37 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTTCGTGCTGCTCCTCATGT:1 - chr3L 9383487 3' + P-element 2877 2 67.33 CCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGACGTGGCTCTAGAGATGGCGATGGAAAAGTTCTTGAATGCAAAGTC:1 + chr3L 21972316 3' + 1360 8 2 71.29 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGACAATATGTGCTGCAAGGGAT:1 + chr2L 12949295 3' - 412 7069 2 60.40 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGACATCCGCCCGAAGGAAAACGATGCGAAAACTCTGGCTCTGATGCTGAC:1 - chr3L 7205535 3' - Doc 36 1 52.00 AAGTTTACTTCCGTTTTGACTTCCGTTTTGTTTCATGAATCTTGAGCATGTCGACGTTGAATTATCCGTCAACAAAAAAACTAATAGTTTGAGATCCACAA:1 - chr3L 25839096 3' - Fw2 336 1 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCGTCCTTCTCGATGAGAAGTTGCAAAATAGAA:1 + chr3R 10147916 3' + roo 396 1 69.31 ATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGA:1 - chr3L 6044743 3' - Tabor 6875 2 57.43 AAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAGTGATGCATATGCTCACAGACACGCAGACATGCACAGCTTAGGGACACGCAATGAAACGGAAGTCGAATCGTTTATT:1 + chr2R 20903077 3' + Doc2-element 246 3 66.33 TTACATACTTTTCAACGAATCTATTATACCCTATTATATATATTATACCGTACTTTCGATATGGTTTGTTCTTGATTTTACATCGAATAGCGGTACTTTTT:2 - chrX 22875499 3' - INE-1 14 1 51.49 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACCTATTATTAAACGATTTTTTTAATTCCAACAAAGGAAGAATTAGA:1 - chr2R 694098 3' + flea 4988 2 58.42 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTCTTGATTCTCGCTTTTT:1 + chr2L 19684044 3' - jockey 4683 1 62.38 AATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCACATTTTGACCGCTTGTGGTCGGGTGAAGCTCTCTTTACTTGTGTCGAAGCCGAATTTCGT:1 - chr3R 2210685 3' - 1360 241 1 59.41 GAGTANCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCGCAAAACAAATCGGAAAAGGCCAACTCA:1 - chr2R 24239341 3' - hobo 51 1 75.25 GCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCAATTATCATGTGCACTGAAGCTCTCTCATTTTCGATCATACAACTGTGAATCGGTTGCAG:1 + chrX 7425946 3' + 17.6 187 2 63.37 ATCGACTCGGCTATTGACCCTCATCAGGAATATATAATGAAATATTTAGGACTTGCTTTGGCACTACAGATTAATGTAAAATTGGCCAATGTCTTAAAAGC:1 - chr3R 4101427 3' - INE-1 95 1 56.44 GTGTGAGTAAGAACAAAAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTTTGTCATTGCATATGTAGTAGCCGAGAGTCGCCCTATTAAAGGTTTAGCTGTAATTG:1 - chr3R 14165585 3' - 1360 3242 1 66.00 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTTCGATGGTGCACCATTTTGGGGCA:1 - chr2L 22084451 3' + copia 249 1 70.30 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCATT:1 - chr2L 4160108 3' - Tirant 8107 1 77.38 ACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCTCCCGTCGCGTGATGTCGTACACCAGCAAGGCGCCAGCAGCTCCGCGGTAATAAGAGCGT:1 - chr2R 6698058 3' + mdg1 7129 2 63.37 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTGTATAGTTCGCAGCAAAATGGCCTATTGCACCTT:1 - chr2R 8158879 3' - pogo 36 1 67.33 TATATTAAATATTAGTGTTAGTAAGATCTAATTATGCAATAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGCGCTCTGATTATTCTGCCCATCGGTATTGGTCGCA:1 - chr2R 5271289 3' - Cr1a 4300 1 61.39 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGAAGCTTACGA:1 + chr3R 26530949 3' - blood 8 2 68.04 CAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATTTATAAAACGTTGTCCTTCCTCTGAACAGCGAACTTACATTCG:1 - chr2R 16042447 3' + mdg1 478 1 53.26 AATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAATAATGCAAAGGTGTCCGCACTTGGGGCACTTGGAGTGTTTGGCAAAGTACTTCTGCAGGTGCTCTATGTGAC:1 + chr3R 29742305 3' - Doc 158 1 67.33 GGCTAATAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAAGAAATTGTTAAAATTATATAAGCGTAAGGCAATCAGAAAAACAATAAAAAGTCATACCGCTAAC:1 - chr3R 24833095 3' + Porto1 4195 1 70.30 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGATTATGTTGC:1 + chr2L 13319661 3' - hobo 14 1 63.37 CCTTAAAGGGAAATACCTTTTTAATTAAAATCGATTCGACTTGCCCGTTCGAGAGGAAGAAATTAACTGCCTGGAACCCCCTAGAGCTTCTGCCTATAAAG:1 - chr3R 12373007 3' + gypsy5 325 2 69.31 CTAAATAAATAAATATAAAATAAAAAATTTAATAGCTAATTATTTAACTAAATAACAGCGCTAGAAATATTTGACTTTACATAAGATCTTTTTTACAACTT:1 + chr3R 13582313 3' + Tc1-2 478 1 74.26 AACGAATAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGGTTTACTATTAGTTTGCGGTAATCAACTAATAAACATAATTTTATATTACACAAACAAAATGG:1 + chr3L 7906518 3' + roo 397 1 57.43 TATTTTCTAAAGTATACATTTTTTCAAAATCGAGATTTGTTTGGCTTAAACTTAGTCTATTATTATGGCGG:1 + chr3L 14115227 3' - FB 249 1 66.20 GGATAAGGTCCTTCGGCTGTCTCCTGTGGAGCTCCTGGGTGGGCGACCTCTGGTTAGTGCCTTGGCTAGGCTATTTCCCCGTTCCCCGGATCTTTATTTGT:1 + chr3L 8094974 3' - BS3 1568 1 76.24 CAGACACTGCTTTTCTTATGAACAGCCTAAAAGTTGTGATTTGAGTGCTCGTGTCTAATGTCTTTGGTTTTACTCGGCAAGTAAGGGATATAAATATATGT:1 + chr2L 22114820 3' - HB 211 1 60.40 AATGTACAAAGTTTCAATTCTGTAGATCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATAGAATTCTGGACCGCAGTGCATCCGTTAAATTCCCCTCCGATTTTA:1 - chr3R 27465478 3' + transib2 2771 1 75.25 AGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTATGTGCGTAAGCAAAGAAACCGAACACGGAACGATAGCAAGCGAAACAGCTGCAACTGCCGCTATGCGAAAA:1 - chr2L 22218144 3' - 1360 3271 1 69.31 TCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGAGAACATCATACGTCCTCACAACTTTAACTTATTTCGC:1 + chr3R 22655355 3' + Doc 304 1 67.33 TCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTAGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATT:1 + chr3L 23871295 3' - Doc 49 1 70.00 GGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTCTCGGGTTTGTCGGGTTTTTCCTTCGCGATCCTCGTGTTCCAGTCCTTGGTGAGACTAGGCTCTGTGCCTAATACGGC:1 - chr3L 23110021 3' - I-element 5085 1 78.22 TTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAGCAACTATAAGGTTGGATAAAAA:2 + chr3L 10477587 3' - copia 229 1 77.23 ACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGAGGGGGCGAAAGTGGGAGTCGCTGCACTTCCAAATTGCAAAGTCAAGCAGGCT:1 - chr3L 15672616 3' + F-element 4330 1 57.73 TGCAATTACTAGCTTGTTAGGATTCAGTATTATTTGGAAGCCAAAGGAAAAGGTCACAATATTGATTAAAGCGGCTTTTGGTGTGTCAAATTTGTTGTCAG:1 - chr2R 15032407 3' + hobo 402 1 65.35 AAAACGAAGAAAAAAAAAAACAAGTAGAAAAGCGGCGGACGAGGAAGTGGAGAAGGCTTCAGCGTCCAGCAGTAGTACGTTATTGGCCGAAAAGGATGTCC:1 - chrX 5754706 3' + gypsy7 5008 1 73.27 AGTCCGGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCCACGAAATGTATATGTGCACAGGATAGTGCTGCCAG:1 + chrX 20806955 3' - opus 16 2 63.37 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAACGGGGGACAC:1 - chr2L 2078442 3' - I-element 35 1 63.37 AATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCCAATGTTTTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGTGATAACGGGGGGAAAAG:1 - chr3R 10565915 3' - Q-element 578 2 78.22 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATAAAATGCCTCAACTTCGTTTGATTTATGCATCATTCACGCGCAATTTATCG:1 - chr2L 17311069 3' + S-element 1702 1 62.64 TCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATTAT:1 + chrX 21852442 3' - Tirant 31 2 54.46 GATCAAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAAAGATATCAGCCAAGTTTCAGAATCCGCTTGATTTGTACAGTCCCGTGTCGCTTGATCAAGC:1 + chr2L 18613025 3' + S-element 365 1 39.60 TTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATTTATTACATATGTAATATGCATATATTATGCACTTGTCGATCTTTT:1 + chr3R 19132335 3' + Ivk 5346 1 55.45 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTTTTAGTACCAAATATA:1 + chr2L 22098108 3' + roo 9052 2 50.50 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTAAGCATTAAAATGCGGCTCCTTTTCCATTGCATACTTACAGTC:1 + chrX 14768071 3' - BS 5025 1 57.43 CTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAAGCCCGTCAGCTGTGTGACCTTGTTCTTCTTGAAA:1 - chr3L 17847915 3' - Quasimodo 443 2 65.35 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGGATTAA:2 - chr3R 8555867 3' + 412 7495 2 76.24 GTGTAATTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATAT:1 - chrX 12657098 3' - blood 7036 2 53.54 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACCACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTA:1 + chr3R 12047483 3' - Stalker2 31 2 51.49 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTAACTCATCTTAT:1 + chrX 13508739 3' + roo 9036 1 72.41 ATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTTCTAGTATAATTTGCAGCATCTGCAGTGCAATAAAT:1 + chr2L 8463767 3' - accord 230 2 65.35 TTATTATTTGAAAATATATTAGAAAGCCAAAGACTCTTAGTCTCTTAGCCAAAATCTCCGCGAGACAAAGACACAAATTCGATGGCTCGAAGGATCGAGAA:1 + chr3L 16441171 3' + 1360 319 1 74.26 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATATATTTGAGATTTCTCTAGATTT:2 + chr2R 7032221 3' - mdg1 14 2 65.35 GCAGTGTGCTTCATAAGTGGGCGATCATATAACACTTACACATGTAGTATTAAGACACTATGTATTTCCTATGTACTTTTCTCAGCGGAGGTCTCGTTGTG:1 + chr3R 771908 3' - gypsy11 148 2 71.29 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATTATATGTAT:1 - chr3R 7168551 3' - flea 4773 2 63.37 TTATAGTTCCTCAGATATCGACGTTCAACGAGCGAATCGGATCATAATGTCAATGTTATTGCCGACTGTTGACAAGGACAATCGTTGGGATGATATGCTG:1 + chr2R 4878525 3' - INE-1 145 1 80.00 AAAAAGTGTCAGAAAATAGAGAATCGCTGGGACAAACACGAAATGCGTTATGGTGCTATTATTGTTACCACAACTGTTTATCATAATATTGTATTAACATG:1 + chrX 22900307 3' + Tc1 1588 1 73.27 CTGTCAAAGGCAGCCGAAGGTTTCGCGGAAAAATTGGACCCGAGATTTGACGGGCCGTACACAATAGACAAGGATAAATGGCCGCTAAGG:1 - chr2R 4877781 3' + Osvaldo 1333 2 66.67 GAGTCTTTGTTAGCTTTAAGAATCATTTTAAGTTTCAGCTTGATGGATTTATCGTTTTACACGTGGCGTTCTTATCGCACGTGGTGACCGCATTTAGGCAG:1 + chr2L 18688681 3' + Gypsy6A_LTR 130 1 56.44 TACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGCCCGCTGCCTCTC:1 - chr3R 12047391 3' + Stalker2 394 2 69.00 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAATAATACTTTTCATAACCACA:1 + chr3R 29259646 3' - pogo 29 1 55.45 CACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTAC:1 + chr2L 23295886 3' - micropia 4964 2 67.33 TATTAAAAAATAAAAAATAAAAACACTCTTATTCAGATCGCTGCTTTTCAAAATAATCTACTTTTTTTTTTCTCCGAGAAATTCATTACTCTGTCTCATCG:1 - chr2R 13379478 3' - hopper 153 1 47.52 GTGGACTCCATGCCGCGTAGGTGTAAGGCTGTGCTGGCAAACAAAGACATTATCTCCGACTGCTGTGGATAGGATTATGACACTTGTTTCCGTTTGTTTTC:1 - chr2R 18151843 3' + HB 1285 1 55.45 GTTTTGTTTTCAGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGTCGCATAAAAATGACAACAAATTAGTTTGGCTGCCGGTCGG:1 - chr2R 14815244 3' - I-element 5183 1 58.42 TAAGCACATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAAC:1 + chr2R 3341938 3' + Dm88 4123 2 67.33 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGCAGTTCATACGC:1 + chr2L 3951669 3' - Transpac 4938 2 60.40 AAATACCTTTGTATTACTTAGCTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGAACACACAGCTGTATGTATATAGGCCTCAGTGCCCTCTCTTAGT:1 - chr3R 4515207 3' - HB 40 1 67.78 CACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAACATCAATAAATTAGGACGTCAATAAAATGAATAAAAGCTTCAGGTAAAC:1 - chr3R 16457873 3' - roo 8795 2 55.45 ACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAA:1 + chr2R 5531204 3' - 1360 57 1 68.32 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCTCG:1 + chr2L 12815105 3' - hopper 35 1 56.00 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACAAGCCCACATAAGTTAAATGTGTATGCTACCAACATA:1 - chr3L 4123203 3' + P-element 2817 1 39.60 AGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATAATGGATGGGGATTGAGCGGGCCGAGACCCTATGACG:1 + chr3L 19179096 3' + I-element 345 1 62.63 CCCACTCTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGAGAGTGTCTTATGGCACAGTATATCTCCGGTGCTTTATTGACTCGATATTCAAAA:1 + chrX 463321 3' + HMS-Beagle2 7089 2 58.42 ATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGATGTTGAGAAAGTATGTATCTTTTTAGTTATAAGT:2 - chr2L 23286583 3' - Tirant 415 1 58.42 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGG:1 + chr2L 12949273 3' - 412 38 2 61.39 TGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATT:1 + chrX 21852440 3' - Tirant 33 2 56.44 CGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCCCTTCGAGTGGTTTACTCCCTGACAAACTCCCACATTC:1 - chrX 17536421 3' + Doc 437 1 62.38 AATTAAAATATTTAATATTTTAAAATGAAAAAAAGAAGCATTTTGCATTGCATTCTTTTCACATGGTTTGTTTTTTTTTTTGTCAGTGGTTTTGACCCAAT:1 - chrX 7881828 3' + TLD2_LTR 101 1 65.35 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATATATACATGCATATATGTATTTAT:2 - chr3R 23219911 3' + 412 7496 2 76.24 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCCCCATATTAAGTCGCCAGCGCGATGCTGCCGATGCCTTTGCCGAGATT:1 + chr3R 27748740 3' - roo 27 2 56.44 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGTTGGCTTTGTTATTTACACCGGCAACGAGAGACT:1 + chr3R 31101358 3' - 297 7 2 64.36 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACTCTTTAGGTGCGCTCATAATTAATGT:1 - chrX 7045624 3' - jockey 4811 1 73.27 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTAT:1 + chr2R 12082402 3' - mdg1 7075 2 65.35 GGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAAGGGCCACGGATGCGCACAGTTTCTAGACAAGATTTAGATGCCAATTCGGCGCGCTTTCATAATTCTGCAAT:1 + chr3R 7928680 3' + blood 7004 1 76.24 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGA:1 - chr2R 16980499 3' + copia 224 1 69.66 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGC:1 - chrX 21531018 3' + roo 9037 1 58.42 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACC:1 - chr3R 23275266 3' + roo 9031 1 67.33 AAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCA:1 - chr3R 9131777 3' + roo 357 2 76.24 TCAGGATCAATAGTCGAGTCGAGCTGGCCCTGTCCGACTGTCCGTCATCCCCGACGCCATCCCATGAAAACCGCTCAATGAAAAGGTACAATCGCACAAAA:1 - chr3L 13637619 3' + INE-1 94 1 56.44 TATGTGGTTATGTATGTGTGTGTTGGTTAGTATGGGCGTGTGGGTGTGTGTGTGTTGGCCTGGTCCATTGCTTGTTATAGCCAAGATTTGCATGCAGCTCG:1 - chr2L 19713298 3' - Quasimodo 46 2 80.20 TACCTACTTTGAACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCGCAAAATCGCCATTTTTCCGAACTTTTGAAATCGAAATAAGTTTGTGGACATGGG:1 + chr3L 19237939 3' + invader1 443 1 76.24 AATCGAATGCTGAATGAAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACTCGTAGATACTTTGTGTGACGCAGCAGCAGCAGCATCCCAATCA:1 + chr3R 22781920 3' + copia 4645 1 56.44 ACATCNGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCAGACATGAAAATCGCCGGTGCCC:1 - chrX 5131519 3' + Idefix 193 1 76.24 TTAAGNCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTTGT:1 - chrX 15355066 3' - X-element 4696 1 51.49 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTT:1 - chr3L 19951191 3' - Ivk 23 1 56.44 TATTGCAGAGATACCAGTCTATGATGCTTAGAACAATCACAGGTGCTCCATGGTATATGACTAATCATGACATCCACCTCATGCAACTCCTCCAACTACTC:1 - chr2L 11024372 3' + G3 4248 1 76.24 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTAGGCGACGGGGGTGACGAGAC:1 - chr3R 25097812 3' + P-element 2882 2 73.27 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCT:1 - chr2L 17210256 3' + jockey 4983 1 69.31 AGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTTGTTGCTCCTGCTGCTCCTACTTTTTGCTTGTTGCAT:1 + chr3L 13544937 3' + hobo 2581 1 61.86 GCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCA:1 + chr3L 24916692 3' - Porto1 147 1 55.45 AGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACAGTACATATTTATTAAAGCTCTATGGAAATAATGTTTTGGGGCAAGGGAGGGACTCTTAATGTCTATAC:1 - chrX 21140743 3' - blood 95 2 76.24 CTACCGGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGACAGGCTCAGATGGCGGCAGAAACACAACCAGAACGTGCGTTTGCGTTTCT:1 - chr3L 24514772 3' - R1A1-element 5016 1 59.77 GCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTATTCTGGTCACTATAATTGTTCTATTTGAACTTATGCATCCAGACACATGTGTATTTTGATATATTTTTACCA:1 + chr3L 24911964 3' - 1360 258 1 78.22 ATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAACGCCCTAATTGCCAAACGAATGAATCAGCCCGCTAAAAAAGCGTAGCAGTT:1 + chrX 13247151 3' + F-element 4427 1 54.46 CTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTGCTGAAATTATACTGAACACACAGATTTCATGTCGATGTTTTCCACTGTCATCCATAAAAACCTAATAC:1 - chr3L 25989222 3' - Stalker3T 288 1 67.33 TTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATCGGGGTGGCACTGAAGTGGTGCGAGTTGACTC:1 + chr2L 12868120 3' - jockey 4817 1 72.28 TTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTAAGTCTAGTAGTACCGATGAAGAGTGTTTGGTTTTTATTTTATACAAAATTTATTTC:1 + chrX 22443373 3' - Juan 4135 1 53.47 TTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTGACACGATCACGTTGATGCGGATGATGATGATGTTGTTGACTGCTTTTCTTTGGCTCTTTATTGGCTTTGAC:1 - chr3R 19333468 3' - F-element 4237 1 75.25 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAGTTTTCTCTTTATGTGGTCGCAAACAGATACAAAAGGTTCTTGGCAAACTGAATAATC:1 + chr2L 19525501 3' - FB 19 1 57.43 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTA:1 + chr3R 27981727 3' + roo 9037 1 62.00 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAACAAAATAAAAATATAATATATATATAAGTTGAAACGTTCATAGGAATTAGAATAAA:1 + chr3R 13992759 3' - roo 17 2 60.40 CATAACCAGAAGCAAACATAAACTCACACAAACACAGGCCAAACTGTGCCACAGACAACAGCAAAACAA:1 + chr3L 16531430 3' - Transib5 2644 1 55.07 GTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAAGCAGTTCCTTGAATCCTAGTCAGCAACTAACATTTTCATCTTTATAGAGTCGCCGATATGGAGCAGGTGGACTATG:1 + chr2R 21774437 3' + Max-element 26 2 77.23 TATGCGATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGGGCCCCAAATTAGCAGGGCCCAAAATGC:1 - chr2R 16475740 3' - 412 28 2 52.48 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTT:3 - chr3R 10952290 3' + roo 9019 2 76.24 CTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACATGTCCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCATTATAACAATGTTTCAATTATAATTGAAAAAAATGC:1 - chr2R 705581 3' - Bica 65 1 63.37 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCAT:1 - chr2L 18212139 3' - 412 41 2 68.32 TTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTC:1 - chr3R 20147874 3' - 1360 268 1 53.47 GGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTATCATTTTTTGTTTCATTCATAAAGTCAAAAAATTAGTTTAAAATTTCAATCACGTTTGCGTCAAG:1 - chr3L 417585 3' - F-element 4452 1 76.24 TCCAGTAATGATTCTCAGAATCCTAGACTGTGCTTGCTTATCTATGGTGAAAACCTTCACCGCCACCTTTACCAATGGCCTTGCCGGCATTGGTTTTTTAG:1 - chr2R 4658557 3' - Doc3-element 4395 1 63.37 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTA:1 + chrX 11730306 3' - jockey 4814 1 83.17 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAG:1 + chr3L 16761320 3' + roo 9036 1 62.38 CGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAGAAGGGGGAGTTTAGTATGAACCG:1 + chr2R 1949131 3' + Cr1a 4399 1 72.28 TGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTG:1 - chr2R 2146570 3' - I-element 166 1 55.56 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAGTTCTTCAAGCAGACACGCGACAGTGGTTGGATGGGCACACCACCCAGAG:1 + chr2L 3143305 3' - FB 28 1 54.46 ATTCATTTACATAAGATATGAAAGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCTGTCCGGATCGTTTTGTTGCATCG:1 - chr3R 10147847 3' - roo 52 2 76.24 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATCAGTGTTGCCACTTGTCGCAAAATAAGTGAAAACATATCGATATCA:1 + chr3R 8313151 3' - 297 1 2 78.22 AATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACCA:2 + chr2R 9500045 3' - G5 4724 1 53.47 GAGCCGAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTGAGTCATAATGAAACCAATAAACACGAA:1 + chr3L 19462178 3' - roo 8692 2 53.47 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTGCTTACGTCAAGCCTCACTTGATTCTGTTTGT:1 - chr2R 7775703 3' - Transpac 4 2 75.25 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTCG:1 - chr2R 23571635 3' + roo 9036 1 60.40 AGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCATATTCACAGATTCATTTAAAGGAATGAAATCTCCACAATTTTCAAATGAAATTTAGT:1 + chr2L 19824553 3' + mdg1 7070 5 57.43 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATT:1 - chrX 21668954 3' + mdg1 403 2 54.32 GATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTCTGACGCCCACAAACACTAAATTATCAAGCTCACACTTTTCCAATTTTTTTTTT:3 + chrX 5858216 3' - F-element 129 1 56.44 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATCATTGACCAAATTTGTATATTTATGAACAA:1 + chr3L 12103843 3' - roo 8709 2 74.26 GAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCC:1 - chrX 15408752 3' - INE-1 518 1 82.93 ATCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGGCGGGGAACTTGACTAAAGCATTCTCTCTTTTGTTTTGAAGTGTAAAGTATATTGTTCTTCATCA:1 + chr3R 19827523 3' + INE-1 537 1 76.29 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCCAACAACGATGAGTTGTCGAA:2 + chr2R 23571725 3' - roo 8671 2 70.30 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAATATTACGTTGGGTTTCTGATGT:1 + chr3L 23871323 3' - Doc 32 1 49.50 TAGATCAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAACCTTTATGGCACGTTTATTTTCCCAACTCCAGA:1 - chrX 6373649 3' + X-element 4669 1 67.33 AATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTAAGTACACTTACTTATAATTGTGT:1 + chr3L 9382752 3' - P-element 148 1 27.72 AAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAACAAACACTGTTGCCACTCGATATCTAGCCTCTGCCTCTGACTCAGCCGCATTGAGTCATTACAGCCCCT:1 - chrX 19500966 3' - R2-element 3316 1 71.29 TATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAACGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTT:1 - chrX 15746264 3' - jockey2 3199 1 77.23 GTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCTCTGCTCAACCTCGACATGGTTTTCGTAATAAATAATATTTAACTTTTTATTTTATA:1 - chr2R 4131023 3' - gypsy2 342 1 56.44 ACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACATTACTTACAAAATGAGAGATATTGATTTGGGGATAGCAAGAGCTGGTTAACTTTATATTACTATT:1 + chr3R 7415226 3' + I-element 5344 1 67.33 ACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGTTTGTTAGCACTCAAAAAGGGCAACGAGGACAACAGCGTCGAGGGCAAGTGGTCAGAGAAGGC:1 - chrX 8140588 3' - GATE 8352 2 68.32 TGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATT:2 + chrX 22711658 3' - transib2 50 1 74.26 GACTTTAAATCTATATTATATTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCGTGTTTTGAATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGTATATGTTTTATGTCTA:1 - chr2L 11178720 3' + 1360 246 1 79.21 AATCGGCTGGCCAGCGCTATTAACAGACCACGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGAAGGCAACGCTCGGTCTGGGACCACCTTGGCTGGCTACTGACTCCACT:1 + chr2L 22646371 3' + X-element 4443 1 60.40 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCT:1 + chr2L 7255783 3' + P-element 2828 1 20.79 CACCTTATGTTATTTCATCATGATTTATACCCAACCGCTGGGTTCGGGAAAAATCTGCCTGTCTCTCGGGTCTGCGGCATTGGGGTTGGAGCGAGTACACT:1 - chr3R 21296519 3' + P-element 2886 2 78.22 TAGGTCATATCTCTGCTAAGAGTGTTGGGTAATCGTAGTTGGGCTGGAGCTGGAACTCCAGATCACGGCGATTTCATTAAAATAAAGAATAAAATAG:1 - chrX 22933838 3' + baggins 132 1 56.70 CTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAGCTAATAAGCTT:1 + chr2R 5531208 3' - 1360 53 1 72.28 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAA:1 - chr2R 3591989 3' - Quasimodo 36 2 71.29 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTTTCTGGGCGGTCTCTTTTTGTTTGCA:1 - chr3R 32005867 3' + invader4 305 2 58.42 TGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTACACATATGTACATATGTACCGTACAACGCAATAGAATATAAATGATA:1 - chrX 3763151 3' + 297 6951 2 64.36 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCCACACCTCCGAGCAGAAAATTTCATGTTGCTTCCATGTGCCGTCGCCAGCGAAGAAGGCAAAAATGTTTAAGGCG:1 + chrX 14323653 3' - hobo 2 1 64.36 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCACGATTACACAAAAAAGTTAATTTATTTTGGTTTCGGTGAT:1 - chr2R 10774043 3' + copia 253 1 58.42 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCC:1 + chr2R 5804532 3' + P-element 2874 1 59.26 GTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATAGGGACAAGAGAAATATAACCATTAAAATTCCAGCCGAATAAAAGGGATATATAACTCTTCTGC:1 - chr2L 7242829 3' + P-element 430 1 64.36 CATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGTCAATTTCATTAGCTAATGACGCGCTCTCATTAGTCAAACATATTTCTGTCACCAATTAAAACTATTGCGAAGCT:1 - chr2R 2941310 3' - 1360 3141 1 68.32 TTAAAAATAAAACATTAAACATTAAAAACATTAAAGAAAAACACATATGAACGACCCAAAAACTAGTGACGATCGCACCTCACCACCAACACACCAGAGT:1 + chrX 15520791 3' + P-element 2692 1 73.00 AATTTGATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATACTTTTTACTATGTTTCTTCTTTAACATAAGGGAGATAACAGGCAAAGCAGCACAATAAGGAAGTGCATGAG:1 - chr2R 5549718 3' - G4 3620 1 60.40 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGTGCAACAA:1 - chr3R 9131757 3' + roo 390 2 55.06 GCGGTATGGCCGTGAAGCATTGCTTCGCGAGGACGATGAGGATTTGCCTCCGTGGTCCTGATTGCTCCTTGACACGGACGACGAGTCAGCCCGGCCGGGAT:1 + chr3L 26030131 3' - Rt1c 5333 1 57.43 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTCCCACTTGGACTGA:1 - chrX 5049246 3' - micropia 4989 2 47.52 CTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAAGCATTAACAATCCATCTACGCCCACC:1 + chrX 16714642 3' - flea 452 1 74.26 GGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTTGCTGTGGAGTAGGGGATTTAAGTGGATAGGATCTGATCTTTGTGGACTGAGACGA:1 - chr3R 21009271 3' - Burdock 2 2 60.40 AATTGCTGATCGGCACTCGTTTCTAATCTCGTGAGGTAATTTGCCAGCTATTGATCCCGATCAAGAAAATATATACTTTATGTGGCCCCCGGGGTTCCGTT:1 + chr3R 1438057 3' - BS 439 1 54.46 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAA:1 - chr3L 10477539 3' + copia 228 1 52.48 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCA:2 - chrX 20806849 3' + opus 7489 2 67.33 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATAT:2 - chr3R 9551442 3' + P-element 2834 1 26.73 CAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGAGTTTTAAACGATAAATTCGAACGGGTGCTTCGCGTGC:1 + chr2L 19508602 3' - diver2 161 2 64.36 CTATAGTCGAGTTCCCCGTCTATTAGATACCCTTTACTCAGCTGGTGTGAACAAGGTACTCTATTTCTGAATGTTACTTTTTACCTTATATATTTGTGATC:1 + chrX 15946745 3' - INE-1 566 1 65.35 TACATATGTACATATACATATGTATATGGCACACGCACTCGCGTTTAATTACGCTTGCCGATTTCCATTGGCACAGGACCTTCGGTTCGTCCCTTCTTCAT:1 - chr3R 9811468 3' - Stalker4 7203 4 70.30 GACAAAATATGCCATTCACCTTAGAATTTCTTAGACTTTAAATCTAAATTTACATAATTTCGAATTCCGATCAACGCCTGATAAAAAAGAGCATTAATGAT:1 + chr2R 16627859 3' + 1360 213 1 57.43 AGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCCTCAATGGGAAGGATATGGTAATGGGGATGGCTTACTGGGCACAGGTATAATTTGGTTCGGCTACATAGAAACAC:1 - chrX 18040494 3' + gypsy8 443 1 42.57 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCCTCATGCGTGCCATTACCTAGCAG:1 + chr3R 17929033 3' - hobo 18 1 59.38 GGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTAATTGCCAACGTTGATACTTAATTGAAAATGTATTATTTCAGAGACAA:1 - chr3R 16834027 3' - I-element 32 1 54.46 GGTTGAGATTCAGCATACAGATTTGTTGACCCACCTTGCCACGCCCACTACTCCACTTGCACACAAATCCAATAAGACAGCTGGGGGAATGGGTCAGATGG:1 - chr2R 13699191 3' + INE-1 176 1 51.49 AATATGAATTATAAATTACAACAGCTCCTGATCAAACATAGGCCACAGTGGCCATAAAAAGTG:1 + chr3L 2144376 3' + copia 254 1 63.49 TAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAAAGTTCGTAAC:1 - chr3R 6735268 3' - copia 32 2 55.45 TACTTTGTTTTGTTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTTTATTTTTTCCATTTGCACCTACGCCACCTGAAATGAGCGCTTTTGTCAGCAATG:1 - chr3R 14862046 3' + S-element 247 1 63.37 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTCTATAGAAGTGACTACTGGAGAGCCTCTCCACTGTCTATTACAAAACTCTCT:1 - chr2R 10945315 3' + transib2 2803 2 58.00 AACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTCATTACAATGTACATTTTCCTGTATAAGTTACTTCAACTACATAAATTCCCCAAAGGCGATATCCAT:1 - chr3L 8619619 3' - mdg1 7409 2 70.30 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTGTTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAG:1 - chr2R 4606204 3' + 1360 3369 1 59.41 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAATAGAAAAATTTCCGAAAATATACATATTTAACATAGTAAATCGGCCA:1 + chrX 13761317 3' - pogo 29 1 56.44 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTGAACCCTATTCATCAATTTATCAATAGAATCTAGATCACCAAAATCACA:1 - chr3L 14982266 3' + 1360 3361 1 55.45 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTAAGCCGGAGCAGGTGAAACGGCACCAAGAGCCCCAATCAATCTTAGAT:1 - chr2L 20714976 3' - mdg1 7051 2 49.50 AGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTA:1 + chr2L 3440504 3' - Juan 31 1 52.48 AAAAAAAGTAAAAAAATTTTTTTTTTCATAAAAAAAAAA:1 + chr4 1002595 3' + HB 325 1 76.92 CGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCTAGAAATCCCCTCCAGCCACCTGAGCTGGACTTCTG:1 - chr2R 6525658 3' + R2-element 201 1 64.36 AGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAG:1 - chrX 17968342 3' - Tirant 8120 2 68.32 CTTGACTATTTATTTATTTATTTAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTATCTTTCAGATAATTCTGTGGGGATTGGCCCACGCACAATTAAA:1 - chr3R 22781963 3' + copia 223 1 56.44 CCAGGAATATTTTGGAAAAGGTGGAAGAGATAGTCGCTTTTGCATTACGTTAAGTAAAAAAAAAAAGAATGGCAAACGAGAGACAACAGCAAAATGTGCAA:1 + chr2L 12285637 3' + hopper 100 1 58.42 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTGCGAGTGTATGTGTGCGTGTGCGTTTGACACACAATAAACACCAATTAAGAAAATAATATTTTG:1 + chr3L 13589535 3' + hobo 2933 1 73.27 ATCTTTTAGATATGCAAAAATGATTCATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTGGCGAATTTTCCTCTATCGATACCGCAGTACGCTT:1 + chr3R 9479563 3' - pogo 216 1 68.32 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGAAAAAGCCGAAATA:1 + chr2R 2044240 3' + Tabor 452 2 66.34 AAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACAATTGAATAGCGGTCGTTGGAACAGTACCGAGTACGATAACGATAACTCACCATTGGCGTGAATATGATTTGTGTTG:1 + chrX 14602466 3' - hopper 149 111 49.50 ATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTGTTCCCGTTGATTCCCGTTTAATCGGGGATCCGAAACACACCGG:1 + chr3R 1132727 3' + I-element 275 1 56.44 AATATATATATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTTAATATTCGCGCCACCCAAACTGAACAAAAAAAAAACCTAAGA:1 - chr3R 17703572 3' - 1731 4410 1 80.20 AGATACCCTTTACTCAGCTAGTGTGCTTGCGAACGCGAAATTTCATCATTTTCCTGGGATAAAGTTTAAGACCGCCTTTATGGTCAATAATTTTAAGTACC:1 - chr3R 18345505 3' - INE-1 542 1 52.48 CAAATACTGAGACTTCTCCTCAATCCGATTTACATTTGATCTTTAGTCTTAAGCTGATGGCGATCACCGGAGGAATCCGCTGCCAAATACTTTAATAAAGC:1 - chr3L 23933029 3' + 297 6819 2 57.43 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCAT:1 + chrX 2179524 3' - Doc 6 1 58.49 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGAT:1 - chr2L 15947403 3' - Transpac 4970 2 71.29 ATTGGGCTTGTTGGATGATTTTTACGCTGCTGTATTTGGCTAGGCAAACATATAAACATTTATGCGTATGGAGAAGTTGGGGAATAGATTTCGAAAGTCCT:1 + chr3L 15951381 3' - Fw2 3596 1 72.28 GCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGCTTTATTCATATGCTAAACTCTT:1 - chr3R 15470849 3' - Quasimodo 371 2 77.23 TTATAATGAAAATTTAAGTATGGAAATTTAAAATATGGGCAATTTGTATGTATGTACATACATATATTTACATTTTCCCAAATGTGTCTG:1 + chrX 14014208 3' - looper1 1648 1 44.44 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTC:1 + chr3R 5686090 3' - P-element 59 1 20.79 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTT:1 + chr2L 22098093 3' + roo 9037 1 63.37 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATC:1 - chr2R 19551986 3' + roo 9038 1 58.42 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCC:1 + chr2L 12815094 3' - hopper 43 1 65.98 CTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTA:1 + chrX 22824220 3' + Gypsy12A_LTR 2245 1 48.51 ACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACC:1 - chr2R 14675534 3' + roo 9050 2 58.42 TAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCAGAAGGAAGCTTTTACGACCATATAAAGTATATATATTATT:1 + chr3R 20406420 3' - 1360 3235 1 57.14 TTGGATGGCATTTCGGCGGGGCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATATTT:1 - chr2L 17784637 3' - gypsy10 32 2 58.43 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTGTATGTGCGTGCACTCATAAAAATGAGAGTGT:1 - chrX 992032 3' - hobo 44 1 70.30 GGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAGCGATAGTTTCAA:1 + chr3R 11094606 3' - 3S18 5764 1 80.20 CGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCCGACCAACCAGACAGACAAGACAGAAATCAAAAGAACA:1 - chrX 4745536 3' + Quasimodo 193 2 62.38 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACAAAATTTAATCAAATAAAATATTTACTTTTAAAGAATATATTCTTGATATCGATCTTTTTAATATCCCTAT:1 - chr2L 12988863 3' - mdg1 5 2 69.31 TACATTATAAAAATAACTAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCTATTTGGTTTTAGATGTTCTCGTTCTCAAGCGTTTCGCTGTGCCTTCAAAAGC:1 - chr2R 17369370 3' + mariner2 825 1 59.41 AATTGTATTTTGAATTTAACTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAAAAAGTATTTTACACACTTCTTATGTCATGTG:1 - chr2L 22686671 3' + transib3 52 1 68.32 TTGCAATATACAAGGCGATAATATAACAATATGGACGTAAATATAGCACTCTGCCCCAGTTGATAAACAAACTTCAAACTCCAATCTTAGCAGCATTTCCC:1 + chr2R 3514894 3' + Porto1 4237 1 65.35 TATTCTAGGGTCTTTGGTATTACTAAGTAAAAAGTTATTATCAACTACGCTACATTCGTTGTTTTTTTAAGTTTTAGAAAATATTTTGGTGAGTGTGTTAC:1 - chr2R 22080764 3' + Tc3 316 1 75.25 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGGCCAGCTGCAGTG:1 - chr3R 27283989 3' - Max-element 21 2 52.00 ATAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCCATTTTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGGGTGGACACAAGTTATTTTTTAACAGAAAGG:1 - chr3L 23571415 3' - 1360 3191 1 68.37 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTGGCCAATGCCCGCATA:1 + chrX 17042719 3' + copia 222 1 58.42 GGTTGAATAGTATATTCCAACAGCGTCCTTCATCATTTAGGCCATCATTAATTAAAAGGACACAAAATTGAAACAAAGCTT:1 + chr2R 16980567 3' - copia 4870 2 72.84 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAG:1 - chr3L 19951216 3' - Ivk 48 1 72.28 TAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTA:1 + chr3L 9909756 3' - Transpac 43 2 63.37 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAA:1 + chr3R 12539550 3' - roo 8701 2 70.21 AGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTAAATAAATATTTTAAAAGCAGTGGCATATATTGAATACTAGTAATTT:1 - chr2R 9316955 3' - opus 7142 4 63.37 ATACGGTAGATTACATAAAAAAGGATAACCAAACGTTTAAGAAGCGTACAAAAAAAAAAATACAAGGCAGCCTAAGAAAGTGCGCCTACAAAAGGCAAAAA:1 - chr3L 9153336 3' - Circe 81 1 50.50 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCACCCAAATGGAATCTCTAATTTTATTCT:1 - chr3L 9909716 3' + Transpac 259 2 71.29 ATAAACGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACAGTCAACTACAATACACCAACCGATTTTAAGTCCATCCGATGAAAATGACCAAAATCATGGAA:1 - chr3L 23433938 3' + Porto1 4380 1 55.45 ATGTAATTGTAGTTAAATTACTGTAAATTTGCCACTCGCCGCAAATTGTTTTCTCAGCTAATTTGTCAGTCTTAGCCAGGCTTGTTAGCCGCTTTCTGCCA:1 + chr2R 11531941 3' + X-element 4591 1 75.25 CCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTCTACAAACAAAATTACACCAATTTCGAAAATATTTGTCAGTTCTATTCTGTAAGGTTGTTTGTCCAATAATTTTAC:2 - chr2L 17784596 3' - gypsy10 5645 2 72.28 TTACANAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATT:1 - chrX 13508702 3' - roo 8710 2 71.29 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTTATCAT:1 + chr2L 7255835 3' + P-element 2880 2 72.28 AAACTCATACTTCTCCTCAAAACACAAAAACAAAAGGAAAGGCGACGCACACACAGGCACTGCGAAAAAAATGAGAAACCGTGTGGTCCGCTGGCTCGGCA:1 + chr2L 11491322 3' + I-element 5148 1 71.29 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCTCGGTGCCATGGCGTTGTTCCTTAATGGCGCCATAAACA:1 + chr2R 16475841 3' + 412 7543 2 67.33 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCCAACAACGATGAGTTGTCGAATCC:1 + chr2R 23571728 3' - roo 8668 2 73.27 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGA:1 + chr2L 17646244 3' + flea 236 2 52.48 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAG:1 - chrX 20806873 3' + opus 7478 2 67.05 TACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAAAGATACATGCACTCACACATGCTACCGTTCACATGTCGCACACATTCGCACACACACACATATGCGAATGGTTA:1 + chr3R 9725160 3' - Rt1b 5122 1 69.31 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTG:1 + chr2L 14579907 3' + copia 225 1 57.43 TATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATT:1 - chr3L 19454675 3' - diver 5932 2 70.00 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGACCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGCAACACACACATGATACATATGCACACAGATACACATACCCATAC:1 + chr3R 31120959 3' + hopper 1393 1 53.12 GGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCATTGAAACACTTGTAAGAGTGGGCATTGAAAAGGAA:1 + chr2R 17723863 3' - 412 7488 2 64.36 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAGCAGCAAAAATGTAGCCTACATTCGAGCGTCACTGCAA:1 + chr3R 11846304 3' - hobo 18 1 61.39 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGG:1 + chr3L 25232909 3' - GATE 8269 2 51.49 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATT:1 - chr2L 17646174 3' - flea 4789 2 61.62 ATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTCGTCCACTTAGTTGTTGTTAACTGCGCATATCTATTGTAATTATATTCATTATTATTTCAATTTGTAGG:1 + chr2L 20165675 3' - Helena 1155 1 73.20 ACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTTATCA:1 + chr2L 7255834 3' - P-element 8 2 71.29 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACCATTTGTATTTAGTCCTTTGCCAATGTTTGTGGCCAACACTACGGATACCCTGTAGATATGTTTTGGTG:1 - chr2R 23581489 3' + P-element 2792 1 73.27 TTAATTTATATTTATTTATTTAATTTAATTGTTGCAGGTGTTAAAACCAAACTCTGACCTATAGATATCCTCGTAGGTATTCTGAACTTCTCGCATGTGAC:1 - chr3L 10273496 3' + S2 98 1 65.35 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCC:1 + chr2L 16884890 3' + pogo 2072 1 58.16 TAAATNGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGG:1 - chrX 21564694 3' + diver 6057 2 81.19 TTCTGTATGCTTCTCGTTTTCGTACAGACATCTACCTCCCACCCGCTCCTACCCGCGACCAGACACTTTAGTCCTTAGGAAGGAAAACAGACAGATCGGAA:1 + chr3R 7304891 3' - invader1 3773 2 63.37 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGC:1 - chrX 16995094 3' - jockey 27 1 58.42 CGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTAAAGAATGCTAAAGCATTGCTTGTATTAGAAATATTTAATGTAA:1 + chr3R 15151306 3' - jockey 4710 1 55.45 GCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTATGTATATA:1 - chrX 21292603 3' + rover 308 2 77.23 ACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTATTATTTCCATTTTGGTACTCGTCACGTGAATAACTTGGAT:1 + chr2R 14281340 3' - Doc 4642 1 59.41 CAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAAGCATAAAGGTGGCTGTGTGTTGTACGTCAGTTTTCAGCACATGTCTTATGTGGTCCTTGGGTTATTTACCT:1 - chr2R 1749825 3' - 17.6 185 2 70.30 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGAT:1 + chr3L 16761303 3' + roo 9023 2 78.35 TGTACATAATATGTATGTATATAAGGTTACGAAACCATCCTTTGGTTTTGTAGAGGTAATATTTGCATTTGATTTTCCCAAACTCTCTTATAATAAAAATG:1 + chr3R 19936635 3' + Dm88 12 2 53.47 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTATTGTCATTACTTTTG:1 + chr2R 23580821 3' + P-element 2854 1 44.55 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGA:1 - chr3R 19346904 3' + blood 336 2 68.00 TATTGTATCATCCATATAACCATGGAAAGTTTTTCCGACTTGTTCTCTTAATATATCGTCCAATTAAAATATTTATTGCAGAAGCTCCTATTCCAACTAAA:1 - chr3L 25323671 3' - TLD2_LTR 39 1 69.31 GCACGCTGAGAAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCAAAAGAGAGAGAGAGTGAGAAGGCAGCAGAAAAGGGCAGATAGGGAAATTCCAGCACACTAAAAAG:1 - chr2L 18986933 3' - Cr1a 326 1 60.40 TCAACTTAAAACGGACTTTTGTTCTTAATTGGAGGTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTCCGAGAGAGCACATG:1 - chrX 21017783 3' + 412 469 2 51.76 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCTTTAGTGTAGTACTTTGAATATATCATTACATATGTAACAGCGGATAAAATCTGCCTAATTCACCCCAGGATA:1 - chr3R 14917157 3' - HMS-Beagle 1 2 78.22 CATACATATGTATATATATATATATAAAAGGCTTTAGCACATAGCATTCTTTATGGCTTTCATTCCAAAAGCTGTAGTAGTTCTCTTTATG:1 - chrX 5375738 3' + Stalker2 7499 2 69.23 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCC:1 - chr2R 14675533 3' + roo 9052 2 60.00 TATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGATATTAAC:2 - chr3R 13375931 3' + Tc3 316 2 82.18 AGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATATATTGTTAGTTGTTAACTTGCATATATAGTAACGTGTTTGGTGCGAGTGATTTTGGGGGACCTGGAGGAGCTGA:1 - chrX 15089058 3' - gypsy 7010 2 56.00 ATCCATTTTCAAAAAGAAATTTGATGATAAAACCTTCCAATTTCTCGCTGTGCTGCAGCCCATTCAGAAACCATTCAGCGGCAATTAATGTTAAATTTAAA:1 + chr3L 14319397 3' - G5 395 1 88.12 GGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATGGGAAGTGTCCTAAAATAT:1 + chr2L 12475040 3' - mdg3 31 2 52.00 AATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAGGATGTGGGG:2 - chr3L 10081912 3' - rover 6955 2 73.00 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATG:1 - chr3R 27748683 3' + roo 9023 2 73.27 CTGACCGGAATTATGAATAAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGATCCTTGCACCCTTCTCCAGCTTCCATCTTCTGCTGTCGACTGCTTCTCGTCACCAG:1 + chr3L 26132152 3' - Fw2 3681 1 57.43 AACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTC:1 - chr3R 32005896 3' + invader4 276 2 76.24 GAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAGGATGTGGGGTGCAC:1 - chr3L 10081907 3' - rover 6950 1 77.00 AAAGCTTGAAGTGTCCGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAAATCCGTATGACATTACAAATCATTTGTATTTGAGTAATGAAAGTGTTAGGGTTTTTTT:1 - chr3R 28020708 3' + Stalker4 478 1 59.41 TATAAATATAAAAAAAATCAATATGCTATCTTTAAAATTGTAATTAATACCAAAATTTCCGGCTCCTCCTTCGTTTCCATCTCCTTTTGCTTGGTAGTGCT:1 + chr2R 5365072 3' + transib4 2579 1 61.39 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCG:1 + chr2L 22098091 3' + roo 9035 1 65.35 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAGAACTTTCGCTCGTGACAGGTTTGTTTTGCTCTTGATAAAT:1 - chr2L 3143240 3' - FB 36 1 60.40 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGACTCATAAATCAGCTACACTTGTGGCCATTAAAGCCCTCG:1 - chrX 18836958 3' - P-element 35 1 48.51 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGAACTCGAGCTCTGGCCAA:1 + chr3R 25672006 3' - I-element 8 1 70.30 AGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGATATGATGTGTAAATGTACAAAGGTTAGAACATATATTCTCTAAAAAAATTTACACATTTGCC:1 + chr2L 5773920 3' - Tirant 398 2 57.43 GAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATCCACATTTTATTTTTTATTGTAAAAAAAAAATATTACACATATTTTTTCATATTCATTTTGTTGGTT:1 + chr3L 8713184 3' - opus 4 2 73.27 GCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGAACACATAGATATATATGTTTGGCGGGTTCCATGGTGCGAAACTTTCACACCGCGCGTTTTCCACGATGTGA:1 + chr3R 11137313 3' + 1360 3195 1 72.28 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATATATTTGAGATT:2 + chr2R 7032210 3' - mdg1 25 2 54.46 GGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCTCTTTTATCCCAGCTGCTTTTAAACACTCTTCAAATTTTTGTGGGTTGGGGGATGGGGATTGGACTTTAAAGTTTT:1 - chr3R 24414328 3' - Tirant 73 2 70.30 CCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATCAAAACTTAAGTGAAGGCCGGAACAGATCCGCA:1 - chr3R 21265959 3' - X-element 51 1 73.27 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTTAGAATTCCCCACGCAAAACTCTTTCATGTAATGA:1 - chr2R 17971985 3' - 412 7068 2 63.37 TCCTCGGACCCACTATTATCAACAAATATTGTTAAAATCTAAAGAGAGAATGTGAAGGAAATATGAAATTTGAATTGTTGT:1 - chr2L 2157346 3' + transib2 2394 1 75.31 AAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATAATGATTGCTGAATAAATACGATCTGC:1 + chr2R 23051839 3' + Stalker4 6983 4 74.26 GATTGAATGTCAGCTTAAGACTGAAACATTGGTGGCTAAATTTGGTAAACGGCTCCTAAGGGAGATAAACTGCTTCGTGGAACTATATTAAGAACCATTCA:1 + chr2R 3514735 3' - Tom1 284 1 65.35 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATC:2 + chr2L 15510455 3' + jockey 4954 1 63.37 TATCTTACGATAACATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAATCTTAAGATTAGCCCCGTTTTAACTGCTCTCAGAAA:1 + chr3L 21326023 3' - Chouto 156 1 75.25 ATATAAGAATATTTGTCATTAGAAATTTTTCCTGCGTCCGGCGAAATGGTGGGATTGAGCATGCAGATTCTAGTGAAGTTGGCTTCG:1 - chr4 856936 3' + 1360 395 1 71.26 CTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCT:1 + chrY 3648909 3' + 17.6 484 2 70.30 CCTAANGCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTCCCGCCACTTGGCTTTTCTGAAGCAGCTATT:1 + chr2L 3629816 3' - P-element 480 1 35.64 GCGGCCTGTGAAAAATTAATAAGGCAAGGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGACCTCTAGCCCCTCTTCACATGCGGCACTCCCTCA:1 - chr2L 17293229 3' + 1360 429 1 65.96 ATTGGTTTTTTATGTGTATTTTAAGTTTAACTTTAATTGGTTTCTTTTATATATGCACTAACAATGCATTTAAATAAATTGGCATTGCTTGCATAAATCAG:1 - chr2R 14123863 3' + transib1 4 2 71.29 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCTTATTGGATTAAATAGAATTCTTTG:1 + chr2L 13136807 3' + roo 9046 1 53.47 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAACGCT:1 + chr3R 10277284 3' - Doc 45 1 61.39 AAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAATAACCCACAGGATATCCGGTCGAGAAGTTCGTCTGA:1 - chr3R 22118446 3' + mdg3 5026 1 64.36 CGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAA:1 + chr2L 5646894 3' - jockey 4707 1 54.46 CCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTAT:1 + chrX 2649865 3' - Tirant 57 2 80.20 CGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTGGCCTCAAGGGTATAATTGTGGTACCGTATTTTCAATGTCTAATATTGCAGTATTTTTTTCAATAACTATTTTAAT:1 + chr3R 4159506 3' + Idefix 241 2 77.23 CAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACACAACAACAAAAACAACAAGACCTCCAACCCTCCCCTCTTTTTCCGCCATTCCGCTGAAACTGAAACCC:1 + chrX 6919191 3' + I-element 99 1 62.38 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTCACATAATTCTTATTTTGCTGAT:1 + chr2L 6555747 3' - Burdock 47 2 76.24 AACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAACAGCACAGCGGAGCGGGTAAAAATGGTCAAAAACCATTGAAGCA:1 + chr3R 17976320 3' + I-element 128 1 56.44 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTATGCAAATTCCCTCAAGTTTAAAGTCTCCTGCCAGCTAAGCAAACATCTT:1 - chr3L 4801476 3' - roo 1 2 78.22 AGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAA:1 + chr2L 14612101 3' + roo 9042 1 54.00 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCG:1 + chr2L 285743 3' + P-element 2847 1 39.60 GCCATAAAACATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGAGCCCTTTTCGACCCTTACAACTGTCATGTTCTG:1 + chr2R 16977402 3' + copia 4952 2 66.34 AAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGATTAGTCCTTATCAACAGTCGCTCACCGGGAGCACCAGGTAGTAGGACACCATGGCCTCAGAAAGGGTCC:1 - chr3R 21447952 3' - 1360 3233 1 73.27 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAA:1 - chr3R 4834268 3' + mdg1 7421 2 70.21 GATAAATATCAATGTAACGGCGCAGGAAATTCCCAACCCAATTCTAATCCCAAACTAAAAAAGGGACAAACAGAACGAAATCAAGTTCGAAACAAGAACTA:2 + chrX 11884609 3' - Ivk 94 1 75.25 TGCCACGCGATCGCACAAACAGCTGTTTGCGAGCTTAAAGCTTTCTCCCCCCGGCGAAGATGTCGTGCTCCATCATTAGTGGCGTTACTTTATGCCCTTCC:1 + chrX 6374003 3' + X-element 222 1 60.40 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCCTCATGCGTGCCATTACCTAGCAGGAAGT:1 + chr3R 17929038 3' - hobo 18 1 61.39 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCACTGCAGCGGACGTG:1 + chr3R 22800190 3' - flea 36 2 64.36 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGG:1 - chr2L 12815036 3' + hopper 1388 1 52.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACTGTATCGTGGAGTGTCCCCATCTCGCTCGCACTCACTTGTTCTAGTGCACGAACGATCTTCGGTTTTTCGAA:1 - chr2R 10543392 3' + P-element 2882 2 72.28 CTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTTTGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCAGCTCAGTTGTATCCGTTATGCCGTGTTTTGGAATAATT:1 - chr3R 817648 3' + Doc3-element 4537 1 67.35 CCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCAATAAAG:1 + chr2L 21592748 3' - BS3 328 1 62.00 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATATATCTGTG:1 + chrX 10827475 3' - roo 39 2 67.33 TAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTTCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACC:1 + chrX 22386799 3' - hobo 48 1 67.33 CTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAATGTGCGCCCAACTGGGCG:1 - chr3R 15598661 3' - Max-element 10 2 60.26 GCTCTNTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTGGTAGGTAAGTAGGTGTGACACCAGTGTCGCTCCGTCTCCGTCGCTCATACGCC:1 + chr3R 30617734 3' - F-element 349 1 55.45 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCG:1 - chr2L 12815022 3' - hopper 14 1 65.35 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGT:1 + chr2L 14790634 3' + roo 9025 2 70.30 ACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAAGCTAGAATGTTGAGATTCAGCGTACAGATTCCAGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGACACG:1 - chr3L 23702893 3' + INE-1 143 1 84.16 TTTGGGCTCCGTTCATATCTTATATTTTTGATTAACCGTGTTGTACCCAGAGTTAATCAAAAATATAAGTTGACTTTCAATAAAAATTGTTTGATAATTTC:1 + chr3L 26552194 3' + roo 41 2 67.33 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGACGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAAC:1 + chr3R 10277266 3' - Doc 55 1 75.27 TTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACAAATGTTCACAAAAAGTGATGTA:1 - chr3R 9995383 3' + Max-element 245 2 76.24 CTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTAGATTTTTGGAACAGTAACGCTCGTCGTTAGCAGCCAGCTACATGATCGCCTTTTGGCTACCCCGTTGACGTGGCG:1 + chr2R 698792 3' - gypsy2 475 1 70.00 ACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGCTTCTCCAATTCGCGATGCCTAGCATTTCTCTACGTCTCGTCCTTCGTCCTGTCGGCCGATAAATC:1 - chr3R 5686027 3' + P-element 2879 2 71.29 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATG:1 - chr3L 17168828 3' - mdg1 7059 2 59.41 TTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCGAAACATTTATTTTATCTTCTGCCTTTCAACAATAGGTTTACTCAAGGCTTGATATACAATTTGAAATGACTT:1 - chr3R 4601173 3' - HMS-Beagle 445 1 78.22 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTC:1 + chr3R 10240177 3' + invader4 309 2 62.38 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGA:1 - chr3L 12103799 3' + roo 9028 1 71.29 AGACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAACCGAGCTTGGACTTGGTCTT:1 - chr3L 20605736 3' + Tirant 8382 2 78.22 ATTACAAATTTAAAATTTTAATTTTTCCTTTTCATTACACTTAATGAAAGAACCGGGAAAATCAAGTCTGCTCTAAATTTATCTGCGGTTTTTATTGCTCC:1 + chr2L 15186421 3' - 1360 3056 1 67.33 TCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCGGCGACCCCCACCTCCAGCAAGAAATCAGTGAAGAAATCCAAGCCC:1 + chr3R 30053398 3' - flea 202 2 54.46 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCTATTGGGGATTTTGTTTCTTAATT:1 - chrX 15305634 3' + roo 9044 1 56.44 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAA:1 - chr3L 2019660 3' - 412 32 2 59.79 GTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGGATCACATCACCGGACGCACGCTTTTTCCTCTTTTTCTTTTACATTTTTGTTTTGAAATGCATAG:1 + chr3R 2926897 3' - Doc 326 1 68.32 GGTGCCAATTGATCAAAAATAACTAGATTTAAAGTCTATGAACTTGTAAAGCGAGCGCAGGAACAAAGGATCCGCCCAAATGCGAAAAGGACGAATGGACG:1 + chr3R 29700904 3' - 1360 261 1 53.47 AATGAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTACGGAAAGAAATATTGATCTAATATAACCATACTTTTATTTGTATTACT:1 + chr3R 19321494 3' - Gypsy6A_LTR 135 1 51.49 ATTATTATTATTTTTGTTAATATATGTTCAAATATATGATCTAGTCGTTAGTTTTCCTTTTTCATGGAACCATTCAAGTATGCGAATTACATATGTAGACA:1 + chr2L 10389994 3' - mdg1 7068 2 86.14 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGACATTTTTGCGGTTAAA:1 + chr2L 14790674 3' + roo 404 1 73.74 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAGCAGAACAAACAACAGC:2 - chrX 16995076 3' - jockey 9 1 76.24 CTTAGGTTTGAAACGTTGTAACTTAGTTATATGCAATCTGATTTAAGCGAAAAAAATTTGTATGTCTAAATTGTAATCTGTGCTACTGGTACAACTAAGTT:1 - chr3R 23290668 3' - Tc3 1688 1 64.36 AAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGAATCCAAAATAAATAGAATGAATGATTAAAAAAAAATGATGATAATGGTCTGCTCAAGATTCCCTGG:2 + chr2L 22225082 3' + G5 4790 1 81.19 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGC:1 - chrX 20806854 3' + opus 7488 2 64.95 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAGTGTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATGTTTCTATAGGAAACAAGTTATTAACATAAAAGA:1 - chr3R 15898565 3' - 1360 56 1 66.34 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATTTCATTAAACTATAATCGTATATGATTTTTAAGTGGACACT:1 - chr3R 4962405 3' + diver 6062 2 59.41 AATTTATAATTTAAATTTCTTTGTTAAAACATAGTATATTATCCAAACTTTTTAAAGTATATACATATATTAATCTTTGATTTAGCTTCTGTTATAACCTT:1 + chr2R 14940935 3' - copia 249 1 78.22 TTCATNCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACAAGTTAAAGATCTATCGCAGCATAA:1 + chr3R 23271721 3' - micropia 5128 2 67.95 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTTGGTGTCGTAAACGGTTTGGTTAAGAGAGTTTTT:1 + chr2L 20824693 3' - pogo 18 1 56.44 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCACTGATCCCCACCCTAACCCCGTTCTACCGGTAAAATGAGGATTTGTCTA:1 + chr3R 19989321 3' - hobo 34 1 54.46 TGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACGGATTCCCCTTTTTTCCCTCAATTTCCATTAAACCGCAATTTA:1 - chr3R 20146979 3' + 1360 3379 2 46.53 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCTA:1 - chr3R 25097832 3' + P-element 2862 1 53.47 CTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCATGGAATGCGATTGGAGCTCATGTAGCTGCCACGTCTGTGATATAGTGATATACGAAGGATTTAGCG:1 - chr2L 19894563 3' - 1360 225 1 69.31 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAA:1 + chr2L 7488910 3' + roo 9024 2 78.22 TTACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGGTATGGGCGTGGTGGTAAAGTAGGAAACCATTTGAAAGTGGCGGATTGTGGGATCTCAATAAATAACCGAAGAATA:1 + chr3L 4294350 3' - HeT-A 5940 1 65.35 CAAAAACATGTAATTTAAGTGCAACACTTTCTGCTGCCACTTGAGCAATCTCGTGCCCACTGCCCCCTGTCCGAATCATCCGAGCCTTATCTTTACGTCCA:1 - chr3L 3644234 3' + roo 8796 2 81.19 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTACAATATTTTAAAACTTCTAT:1 - chr3R 12539469 3' + roo 401 1 73.27 ACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAATACCCCGCACCTGGAATACTACCCCTTTTTTTTGCGCT:1 - chrX 12924029 3' + Stalker 53 4 66.34 CGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTCTGGCAAGGAATCGGGCCATCCAAA:1 + chr2R 16988280 3' + opus 7487 2 65.35 GAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGTCCAGATGGAATGCCGTGGACAGGTGGCCGGCGTTGTA:1 - chr2L 1130825 3' - springer 390 1 54.46 TGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATAAAACAAAGCATCTGCTCAAATATATTG:1 + chr2L 20707950 3' + mdg1 473 1 72.28 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGA:1 + chr3R 27775153 3' + roo 9039 1 57.43 GTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTTACTCCTCAGTCTTCAATTATCATAAA:1 + chr3L 20556291 3' + 17.6 7083 2 73.27 GTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTAAAAGGAAGGAGCACATATATTCATTTTTCTGTCAATATTGTATACATAAA:1 - chr3L 20895114 3' + invader3 209 2 79.21 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAATA:1 + chr3R 27981735 3' + roo 9044 1 54.46 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCC:1 + chr2L 16201555 3' + hobo 2894 1 70.53 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCATGGAAGAGAT:1 - chr2R 14675552 3' + roo 9032 1 66.34 AGAAAATTAGTCAAAACACTTAGTAATAGTTCGGAAAATAGTTCATTCCGTTCATTGCGCGGCCAAGCTTTATGATTCGTTTGGTGTTTACTTTAGGTA:1 + chrX 10385076 3' + G4 308 1 76.77 CAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGCCATATAAATAATTTCCTAGTATTTATAGTGCAGACTAAAAATAG:1 - chr2R 4854955 3' + opus 498 1 79.21 ATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTCACGACAAGCAACAGAGGACTGTGGTAGTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCA:1 - chr3L 23112570 3' - R1A1-element 4863 1 52.53 CCGGGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGACCGCCATTTTGGCCACTGGTCGCCATTTTATGCAGTTCCACAAGGAGTGTG:1 - chr2L 13320327 3' - hobo 349 1 56.44 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTTCGTGCTGCTCCTCAT:1 - chr3L 9383489 3' + P-element 2875 1 65.35 AATAAACAAATATAAAATAACAATAAATAATAAAGAGAATTGGAAAGAGCGATTCTTAGACATGCTAATCAAATTGAAGTGTATCTTTACAGAGCACTGGA:1 - chrX 13308924 3' + Tc1-2 481 1 63.37 TATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTCTTGTTGTATTCTATTTTCCTATTTTTTGTTGTGTTTGTTGTGAAATGTCTCTGCCCGTTAC:1 + chrX 16091430 3' - Juan 4049 1 69.31 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAAATTAAATTAAATTAAAAAAATATATTCTTGATCACATCAGAATAGATTAGTCCAACTAACTTTGAACCAAAATTC:1 + chr2L 13154303 3' + Juan 4203 1 41.58 CGTGGTACCGATGGGTCGGTAATTCCCCAACCCCCTCTTTTGCTTCTAAATGTAGTCTTTGCAGTGCCGAATGAGAATGTATACCC:1 + chr3R 20879871 3' - ZAM 3 2 67.44 CACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAATTT:1 + chr2R 5840704 3' - Ivk 18 1 61.39 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATA:1 - chr2L 7488847 3' - roo 8686 2 53.47 CGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGGGGCTATAGCATTCTCCCTTGTTTTTTTTCTTTGCCACTGTGCGTGGGGACACCTGTAGCAC:1 + chrX 17622358 3' + INE-1 533 1 91.09 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCT:2 + chr3L 12888289 3' - mdg1 7071 2 56.44 GAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCAATCGGTTGGATGTATGACAA:1 + chr2L 5690834 3' + TART-C 11095 1 62.24 AACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTGCTTAATCAAGTGAAATTGAATCAACTTTTTCAGTCTCCGGAGACAACTGCAAATTAAATTTTAAAAAT:2 + chr3R 19530734 3' - BS 4 1 68.32 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTGGTTCTAATGAAATGTATTGGCTTACAATGTAGTTGCTACTTCGGAAGCCTTTAATTT:1 - chr2L 10793146 3' + I-element 5337 1 62.38 AATAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGGAGCAAAACACATATAACACAAATGGCACAGACAACGGACAACAAACCGCCCATCGACA:1 + chr3R 4833205 3' + Tc1 1214 1 60.00 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTAC:3 - chr2R 5953084 3' - pogo 25 1 57.43 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCA:1 + chr2R 20744243 3' + roo 395 1 59.41 AAGTGATCCTGATCAAGAATATACTTTAAGTGTACGCAATTTACAAAATAGTCTAATATAGAAAAGGCTATTTTCATATTTTGGTTTT:1 - chr4 76153 3' - INE-1 84 1 70.45 CAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGCATGAAGCTTCGTATCTTGAGTTTTATTTTTGGATGGGCGGGAAATCCTTTTAAGTGTTTAATCA:1 + chrX 15292575 3' + Quasimodo 7365 2 78.22 ATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCCGGGCCATTAGTTAAGTGCGTCATACACAAATACACAAGCCCTAATGGAATCCATTCAAATGAGGTG:1 + chr2R 14715487 3' - roo 8982 2 70.30 AATGCACACACACACACACACACACACATGCATACCGGCACACACTCAGACACTCACTAACACAAGGCCAAACACTTACACAAAAAGTTCACTTCAAGTTC:1 + chrX 5543793 3' + accord 180 2 75.25 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAAGTGTGCGTGGGCGTCTCTGTTGTTGTTGTGGTTTTCCCACACGGCACAACAAAGCAACA:1 + chrX 6657366 3' - P-element 13 1 66.00 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATA:1 - chr3R 9551443 3' + P-element 2833 1 25.74 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTATTTAATTCGACAATTTTTGAACACACACATTTTACTTATTATAAATGAAATTATTAAATCCTTG:2 - chr2R 7868873 3' + roo 400 1 70.30 TACTACATTCTCCATGCATAACATAAACGGACTTCATTTACTACAGACTCCAACTTTTTTGTTTATCTCAAGGTTTCTCAATCAGCGATGAAGGTGAAGAA:1 + chr3L 16694914 3' - G4 3741 1 59.41 CTATGTATTCTTAATTACATTTTTACATATACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCTGCAGTAACACAGAGCGACAGGCGAGGAAAGACATAACC:1 - chr2L 8574630 3' - Stalker 7111 4 61.39 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTACGAAATCAAGCTTGCAGAATTTTTTTCGGATTTCGTCAAGCCCTTCATACAATATTTTGAGTTCATGTTCTTTGCTC:1 - chr2L 4118082 3' - FB 2 1 49.50 TAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAAATATGTGCGAAGTTGCGTTTTTCGC:1 - chrX 5129450 3' + Idefix 7390 2 76.24 TATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGTTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGATTTCATTGAACAGGAGAAGGGCACACAGCCAGCGGAAAG:1 - chr2R 13888575 3' - F-element 302 1 58.42 GTGCCAAATTTTGTGCTGAACTGCATATAGCATCTGTCCATCCAAGAGTCGGAGGGCAGTATACTAAGGCAACAACTGCGATTCGAAATGCAAACTACA:1 + chrX 7250484 3' - G5A 380 1 74.75 GGATCGATAGCCGGGTCGATCTGGCCACGTCCGTATGAACGTTTCCTTATACAGGCACTTTGCTGCGGTTGCGATATCATTGAGCAGTGGGGTAGTTATCA:1 + chr2R 9182174 3' + INE-1 97 1 58.42 CTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTAATTAAAGGCAAATTATTTGCTAAACTCTTCGTCTT:1 + chr3R 9209060 3' - I-element 223 1 64.36 GAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCATTCTCCTCGCTGCGCAACTCACAACTTCTTCTTTTAGCCCGGCCCAGACACATGCTCGTATTTGTCTTGCTCTTTTAA:1 + chr3L 17167808 3' - Doc 372 1 76.24 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGGAGCAGAACAAACACTCACGAGCATTTGATTTATGTC:1 - chr3L 2144325 3' - copia 42 2 66.34 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCCAAACGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATGCATCAGCATAAAATATGGTAA:1 - chr2L 20133012 3' - flea 51 2 75.25 CGTGTCGGAGCGCAACTCTTCGCATTCTAGGATTCTTTCTGTGAATTCACATGCTGATGAAATTGTAATATATGCGAGAACATCCGGTGGAAACGGG:1 - chr2R 16910800 3' + invader4 2758 1 78.35 AATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTTAAAACTCCTTGCTGAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTG:1 - chr3R 19449478 3' + roo 8749 2 57.43 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCTCGATTGAATGATGTTTTCTGGGCTCCC:1 + chr2L 12815130 3' - hopper 11 2 70.30 CTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACATAACCTAGGCCGATTGTCCCCTG:1 + chr3R 5576168 3' + F-element 481 1 76.24 CCGTATAAAATCACTTGATTTTAGAGAAGCAAATAGTTAATATCAGAAATAAGCAATAGCATTCCGCTGCCATCGCTAGAATTTGCCAATGACGTTGTGTG:1 - chr3L 20572220 3' + Doc3-element 38 1 63.37 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTGGGGCGATTCAGTATTATTTCGATTG:1 + chr3R 29123410 3' - P-element 26 1 54.00 ACACACACACACACACAAAACCCCCCACCCCACCGCAGAGTCCAACTGGATGGGGAAAAAAATATTCAGAGCCGTTGAGCATTTCTAACATTTAATTTTGT:1 - chr2L 7546847 3' + Quasimodo 41 2 66.34 GTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTACTTTGTTCCTAATTAATG:1 + chr3L 9766442 3' + blood 376 2 78.22 ATAAGATGTGGGACAATAACTTATAGGGCAATAACATAATGACTAAAGGTCATTGAAGAAAATGTGCTTCTCCAGCTGGTCGATTAATCAAATTACATATA:1 + chr2R 23800340 3' - HMS-Beagle2 6898 2 72.28 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTTTAGTATTCGTGTGGCAA:1 - chrX 20620529 3' - pogo 27 1 58.42 TAAAGTTGGGAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAAAGAAGACCTGTCTTCTGAGTCCATGCGAGAAAATATGC:1 + chr2L 22079762 3' + flea 400 1 59.41 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACACACACAGATGAGTCTTATTTGCGCTTAGAATTCCCCACGCAA:1 - chr2R 17972003 3' - 412 31 2 58.59 AACTATGAGTTACATGACCGTTCCAGAATTGTAAGACGAATAGATTATCCTACAAGGAAATGGAATGTGGTAATTGCTCCAAGATCGCTCGAATCTTG:1 - chr2R 4886686 3' + Cr1a 4166 1 79.59 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTAT:1 + chr3L 2019713 3' + 412 449 2 71.29 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGATAATAATCATTTATCATC:1 + chrX 15082471 3' - mdg1 13 2 66.34 AGTGGGTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGC:1 - chr3R 19446136 3' - 297 6593 2 65.31 GTTCTAAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCCAACTTTTGGGCCAAA:1 - chr2L 8565437 3' + blood 365 2 66.34 CACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTGGTCCTGCTGCTCCTCCATACTTCGTCCTTTTCCTTTTTAT:1 - chr2R 12275489 3' + Doc 334 1 55.43 CACACACACACACATACATATTGGTTTAACATTTAGCCACTTGGCGCTCTCTTTTTGCCTAGAAGAAGCCCCGTTTGCTCTCCCCCTTTTCATCGTTCCCT:1 + chrX 9049099 3' + Quasimodo 40 4 54.46 TCCGTGGGGTTTGAATTAACTCAACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCACAAGGCGGTGGAAATCGAGAGGTGGAAATC:1 - chrX 15821809 3' - P-element 2736 1 35.64 TTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTA:1 + chrX 2649900 3' - Tirant 8129 2 59.41 TGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAAT:1 + chrX 20620591 3' + pogo 2054 1 77.23 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAGTAATTTTCACTCATACTC:1 + chr3L 11661815 3' + hopper 1411 2 72.28 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGCATACGTATATACCTGTGAGGAAGAGTCATGTTGGTTGAATGTGTAAGTATCTGTCAGGTAATAAAAT:1 + chr3R 4601404 3' + opus 7491 2 69.31 TAATAGAACAATTAATTTTTTTTCATGATCATGCATTATTAATTTTAGTAATAATTACAGTATTGGTGGGATATTTAGCCATTTATATTTTTAA:1 - chr2R 12071928 3' + TAHRE 62 1 25.53 AACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTGCTCGTTTTTGGCACATAATCGACATGTATATCAAATTTATGTTTTTCTTATTTTTTTGTGGGCAC:1 - chr2L 4153701 3' - mdg1 7409 2 71.29 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATATGTATGTAAATGGATGTACATATGTATGTATGGGATAGTGGAATGTTGAGCTCG:1 - chr3R 24081526 3' + 297 6958 2 64.36 CTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGACATAAAT:1 + chr2L 18212210 3' + 412 7526 2 55.45 TTTCTTTATTTTTTTAATTTTTTTTTTTGGTTTTGTGTCCCTTTTGTGTTTATGCGTTAATGTGCTAGGTGCGCTAGGCCCGACAATGAGGAA:1 - chrX 4654441 3' - Doc 4697 1 82.80 TATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGT:1 - chr3L 10081941 3' - rover 6985 2 65.35 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTC:1 - chr2L 14790603 3' - roo 8711 2 80.65 AGATAAAATATTAAAAAAAAAATTTGATGAATATCGGAGAAAATGTTTTAAGCTATTGTAGTTAGTTAGTTCTGAAGCCATTTGGTCCAAATATCATACAT:1 - chr3L 2312770 3' + BS4 729 1 72.28 CAAAAAAAAAAATCAAAAAAAAACGCACGAGGAAAAAAACGTGTGGATGATGACGAAACCTGAAAC:1 + chrX 13980494 3' + G2 3077 5 71.21 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTGCGAGTGTATGTGTGCGTGTGCGTTTGACACACAATAAACACCAATTAAGAAAATAATATTTTGTGTACA:1 + chr3L 13589541 3' - hobo 2710 1 80.00 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACA:1 - chr3R 22431074 3' - Max-element 8271 2 58.00 GATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCTCACGAGTACCGACTTGCTTGGCATTTTGTTGGTGTACATGATATTGTGGGTTCTGACAATAAGTG:1 + chr4 953742 3' - Ivk 5023 1 74.00 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATTGCAAGCAGTTCAAATACTGGGATTACAACT:1 + chr3R 4970599 3' + diver 179 2 71.29 AACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTATCCAAAATAATGAGCACGCCTCCCAGAAATGACACAGCTTTCTTGTTATTTGT:1 + chr2R 1762527 3' + I-element 379 1 59.41 TTAGTCAACTGACGCGACATTTAGTCGACTAAAATAAATTAAAAACAACGAAAAATGAAGTGGGTGGCGAGCGGAAAAAGAAATCAAAATGGAGCACAGGA:1 - chrX 22736163 3' + 297 361 2 35.64 TATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATCAGTAATTTCATGTACTTAGCATATTCTCCCTTCACTTTACCTCGTTCGTGTAAACATTTATA:1 + chr3R 17320262 3' + Stalker2 7639 2 67.33 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAAATATCGCCATATCACCAATTCCTTAAAG:1 - chr3R 4834240 3' + mdg1 404 2 61.39 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCG:1 + chr2R 16988242 3' + opus 7449 2 77.23 CCTCTGGAGGAATCCTGACGACGACAAATCACCAGCATCGCCAACTAGACGGAAATTACCAAAAACTCCGGTATAAAACAATTTCGTTATACTCAGTTGTG:1 - 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chr3R 29288680 3' + BS 5083 1 59.41 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTATT:2 - chr2L 7488841 3' - roo 16 2 59.41 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCTGTTTTCTGGGTGTTGATCGGGTTGTATTCTGCGCGCGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr3R 9418241 3' + P-element 2881 2 63.44 ATATANATTCTTGATCAGGATCAATATCTGACCATGTCCGGCAATAATTTTGAATTATTTATTTTTATTGTTTTTTTCTCCCAATTTCTACCGATATTCCA:1 + chrX 15903306 3' + INE-1 80 1 81.19 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAACGGCAA:1 - chr3R 7522279 3' - blood 7020 2 70.00 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACC:1 + chr2L 3951649 3' - Transpac 4958 2 64.36 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCCAGGGCTCTGGTAACCTAAGAGAGTCCTTTCCGCG:1 - chr2R 5804477 3' - P-element 42 1 37.62 AGCTAGCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCATAGGAGG:1 - chr2R 5953074 3' - pogo 14 1 65.00 TTGGGTTCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGGAAAACACTTGATGGTTAGGCGTGTTGTCTGTTGCGTTCGGTGTCTTGTAATTGTGTCTTGTTAATTT:1 + chr3L 20570645 3' - Quasimodo 275 2 73.00 GCGAACAATAAATCAGTGAATTATTTGTGCAAGCTGCCGCCATGGTCCAAAGTGCAGCGGTATTCGGTTAGTTGCGAAAAAAAGAATGGATAAAAATATGC:1 - chr2R 15482199 3' + TAHRE 236 1 66.34 TATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACATCCTTGCATAGATCCCTTGTTGACCCGCTCCT:1 + chr3L 6503820 3' + roo 90 2 67.33 AAAAAAAAGAACGGAAAAAAAACTGCAAAAAGCATGGCTAAAACTCAAAAACAACTAAACGAGCACTTGGCAAAAACTGTCGCAACAATAAAAACTACCAG:1 - chr3R 10935118 3' - rover 7091 2 71.29 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACCATTTTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGAGTCCTGGTCCATGTTTCTGTAATG:1 - chr3L 13548766 3' - hobo 4 1 75.25 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAA:1 + chr2R 6173071 3' + pogo 2068 1 69.31 GCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATA:2 - chr2R 13644414 3' + Burdock 6374 2 62.38 ACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTCAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACC:1 - chr3L 11115124 3' - micropia 9 2 67.95 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTGCTCACACAGTGGGTTAAGAATGATTGG:1 - chr2L 6601410 3' + I-element 5312 1 73.27 TATACAAAATCGGAGGAATCAAATTAATATTTTCGGAAGGAGACAGTCATTTACATCCCGTCATGTACATGAGTCGAAAGACGAAGCCGTGTGGTAAAAAA:1 - chr3R 1445722 3' - Gypsy12A_LTR 2067 1 63.37 ACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGAACCTGACAGCGTCTTTAGCTGCTCTCTCTCCGCCGTGAACCTGGAGCAGTTGTTGGTTGGCTGCTTGCTTGTATTT:1 - chr2R 20705404 3' - Rt1b 4695 1 74.26 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAA:1 - chr2L 4160145 3' - Tirant 8161 2 77.23 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGGAGTGCTTCGCATACATT:1 + chrX 13640684 3' + P-element 2844 1 36.63 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTATTTGCGGTCGGT:2 + chr2R 19943978 3' - 412 35 2 60.40 AGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAGCG:1 + chr3R 11094596 3' - 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297 453 1 74.26 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGG:1 + chr2L 285735 3' + P-element 2839 1 31.68 ATTGTNAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCGG:1 - chr2L 12815021 3' + hopper 1402 1 66.34 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAACAACAAAAAAAGGAAACAACCACAGAAAGC:1 - chr3R 23048408 3' - mdg1 8 2 71.29 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATCCTTTCTACTTCGGTTGTGTGCTCATTTTACCGAACGGGTGTATTC:1 + chr2L 17004900 3' - P-element 86 1 51.49 AAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTTCTGAGTGAT:2 + chr2R 17937202 3' + Quasimodo 7345 2 58.42 AATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTTCTTCTGCTCCTTGGTCAGCAGCAAGAAATTATTCATGGCAT:1 - chr2L 12949176 3' + 412 495 1 78.22 ACAGGACAAATGCCCCATAGGGGCATACTGCTCTCAGGCTCTATCTCAGAGAGTGAGCGTTTGCCTTTTTGAGTGTTTGGGAGAGAGTGCCTCTCCAGTCC:1 - chr3L 24565355 3' + hopper 1414 2 17.82 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAAGTTTATTAAAAGATTCATTATCTTATTGCCACA:1 + chr2L 7488957 3' + roo 408 1 75.25 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTT:1 + chr2R 4483255 3' - Ivk 46 1 66.34 TTTTAAAACCCATATGGACCTATGGCTCCGCATCGCAACGCATCGTCCCCAACACGACCAAACGCTTACATAGTCCCAACACTCGTGTCCTTGAAGATCGG:1 - chr2L 23312007 3' + Doc3-element 4307 1 62.38 TTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAAATATGTGCGAAG:1 - chrX 5129463 3' + Idefix 7377 2 63.37 AATATGAAGTCATTTTTGAAATTTATTCTGTTACTAATATTCTTGTTGTCCCTAGTGAATATGCTTCTTTAACCGTATATTCTCTTCTCCTTTTTTATTGT:1 - chr3L 27992964 3' - 1360 378 1 77.23 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTAT:1 + chr2R 7032198 3' - mdg1 7074 2 64.00 TGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTTAATC:1 + chr3L 4641142 3' - hobo 29 1 51.49 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGGAGAATATTTCTAATTGGCTTATGTTTGCCATAAACTGTTTAATGGTAAGTTAGGTGTTCATTGTAATT:1 + chr2L 9163812 3' + copia 249 1 68.00 ACGCCATCCAAGTGTGGGGAACAGCCTCTTACACTCAGCTCAATAGGCTTAGAGCAACGTTAATCACATCGGCAACCCGAAACCGACTCA:1 - chr2L 3227369 3' + G5A 2435 1 60.00 TTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGCATGACGCCCTAGTTG:1 + chr2R 12082436 3' - mdg1 7040 2 77.00 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACA:3 + chr3L 18706936 3' + jockey 4956 1 55.45 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCA:1 - chr2R 24021568 3' + pogo 2070 1 58.42 TTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGCCCCTGACATGATTCATGATGAGCCAAAGATG:1 + chr3L 9115373 3' - Quasimodo 7160 2 68.32 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTC:1 - chr2L 12815056 3' + hopper 1367 1 71.29 TTGCAGACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGG:1 - chr2L 12815045 3' + hopper 1378 1 58.42 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCTCAGAT:1 - chr3L 18337636 3' + Juan 4197 1 63.37 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGAAGAAGGGGTTGTGGC:1 + chr2R 10543533 3' - P-element 9 2 70.30 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGCATACTTCGCTGCGCAAACATGACCAGCTCTTGTGAATGTATTTGTGCATGTCGTACGTTGTCAACATT:1 - chr2R 15064850 3' - accord 185 3 76.24 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCCATTGCGTTTCTTTGCCTTCTATTTGCCAACTTGTTTTGTACAT:1 + chrX 2776184 3' + 297 390 2 74.26 TTTGCNGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATAGTCGGGTATAATCGGTACTATCACCATATACAGCATGTTGTCCAGCAG:1 - chr3R 18712936 3' + copia 5015 2 52.48 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTATTTGCGGTCGGTTTACCATTTGCATTTGATT:1 + chr2R 19943997 3' - 412 16 2 64.36 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCT:1 - chr2R 20739434 3' - roo 25 2 55.45 CCGTACTTACCTTAAATTTTCCCACAAATAATCTAAAAGTAATTTCTTTTTTTGTTTTTAGCATCCAGATAGGCTATGTCTATTGACTATAATGACTATAA:1 - chrX 20776774 3' - Max-element 368 1 58.42 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTTTAGTTTCACTTGTCGCCCAGCTTGGTCCACTTGCTGCGCAGGAAGGCGACGTAGCTCT:1 - chr2R 18399054 3' + S-element 1702 1 65.35 CTTTTACTTCACTCATCCACCCTTTTAGTGGCCTTTTGTGCTGCCCCCTAACCTCCCACCTCCCACCTCTCGCCTTGGCCCACGATTTGGCTTTAACTTGC:1 - 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chr3L 19951224 3' - Ivk 56 1 80.20 ACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAACCCGGCGACAATTGCGAATAATAGAAGATGCCAGTGGCAACGACCCAAGTGAGCTGCTAATTAT:1 + chr3R 5231467 3' + I-element 284 1 67.33 ATGAGCCGACCAACAGGCTGCAAACGGTTAATTGTACCCCGTTTGTTTCTATGTTTCAGGGTTATTCCGGCTAGTTATCTTTTTATTTTATTGTATAAAAA:1 - chr3L 14342779 3' - Chouto 6016 1 66.34 CAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGT:1 + chr2L 2074786 3' + roo 9051 2 61.39 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGACATTTTTGCGGTTAAA:2 + chr2L 14790674 3' + roo 402 1 72.28 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCG:1 - chr3R 19346905 3' + blood 334 2 69.31 GAATGTGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGGTTTTCCTATGGGAAGAAGGGGGAGGTGGTTGGCTTCTTTATCGCCGCCCGTTCGCGACGGAAGCTTTCAATT:1 + chrX 13057875 3' - accord 185 2 36.00 ACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTCGATCTGTACATTGAGTGTAAATATACAAA:1 - chr3R 9994819 3' - Doc 95 1 70.30 CTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAAAGATCAGTGCCTTCGTGTAAAACTCGATGAAGCCGAAATAAAGACCTATACTGGAACCAAA:1 + chrX 16682032 3' - GATE 8297 2 67.33 CAAATGTGGTTTAAAAATAAAATATTATATACCTTCGTCTTCGATTTACATGTTTTAATCAATGAAAAATTTCCATTGATATGGATTTCCATCTGGGAATG:1 + chr3L 4971248 3' + NOF 3947 1 58.42 ACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCGCAATCTTGCCACCAGTTCCAATTTTTGCCTTATCAC:1 + chr3L 13217027 3' + I-element 5044 1 63.37 AGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTTCAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATTTCTGGTTACATAATCAAGATGA:1 + chrX 1107707 3' + Bica 248 2 75.25 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTT:1 + chr2R 20816487 3' - hobo 42 1 67.33 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATACATATATTTAAATATATTTAATTTAAATTCGACACTTTTTATCAAAATATTTGTTG:1 - chr2L 22079393 3' + flea 4999 2 67.71 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGC:1 + chr3R 23275343 3' - roo 8679 2 60.40 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAA:3 + chr2L 15808038 3' - I-element 33 1 52.48 TTTAAGTATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCAATATCTGATGTTCAGTCATTAAAATGTTATTATTTTATGATACTTTATCGCAGTGCAGCTGAATA:1 - chr3L 17587756 3' - roo 8673 2 70.30 GCTGTTAAGACAGCTGAGGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAGAC:1 + chrX 21564743 3' - diver 5916 2 54.46 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTGGATTTCAA:1 + chr3R 11999281 3' - P-element 48 1 31.68 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGG:1 - chr2R 14778430 3' - mdg1 7062 2 56.44 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTAAAAA:1 - chr2R 5067631 3' - F-element 36 1 59.41 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCA:1 - chr2L 4160110 3' - Tirant 12 2 67.02 AAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGGCAGCTGTCCCTCGATGCGGTTAATGACTTCGGGCGGTAGCTTGGAGTCC:1 - chr2L 9913380 3' + invader4 2995 2 59.41 CCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTAACAAGTGTCATGCGGCATGAAATCTGGGGCATTGTAACAAAAAACTATTTAAACATTGGCTTCAAGGCAATTTTTTA:1 - chrX 6701436 3' - FB 1 1 78.22 GCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATTCCAGCTGATCATGACGAAAAGTGATTGAAAG:1 - chr2L 5439566 3' + TAHRE 10384 1 67.00 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGC:1 + chr2L 16948713 3' - jockey 4718 1 69.31 CTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTACTGTACGTGTCTGTCATATTATTAACATGGTTTGACCCATCGTGTAGTAGACGAATCCTCGACGCTTGGAAC:1 - chr3R 15186545 3' - invader2 4882 2 65.35 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTTCCTGACGAAGATCGCCGAGTGCAAGGTGATGTCGTGTTGTGCCCATGTAAAGAGG:1 - chr2L 12017931 3' - opus 171 4 58.42 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATGACTGCTCTGTTATATTTTAGAAAATACTTTGAAGTTTCGACCATAAATAGTTATTGTTTATAGGTTTTC:1 - chrX 11730240 3' + jockey 4985 1 71.29 TCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACACATGATAGTTAAAG:1 - chr3R 19132250 3' - Ivk 10 1 69.31 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATGTTGTTTATTACTGCTGCTGTTGTTGT:1 - chr3R 4543982 3' - flea 16 2 63.37 TTATGAATTATATATTATTAAAATACTAAAAACAGCTTTGTAGAGATTTACCCAAAGCAGCTCATCCTCTGGCTTGGTGTCATCAT:1 - chr3R 13776142 3' - hopper 201 1 83.72 ACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATT:1 + chr3R 12047482 3' - Stalker2 7280 2 54.46 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGTT:1 - chr2L 6888584 3' - jockey 23 1 62.38 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCTCATCGCTGTCGTACTCGTTGCTGTACGGACAATGGCGGA:1 + chr2R 15473677 3' - roo 8681 2 44.55 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCA:1 - chr3L 8713084 3' + opus 7471 2 67.33 ATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAG:1 + chr2L 14612120 3' + roo 397 1 67.33 ATAAAATCCTACGATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTCGTCCTGTGCTTTGTTCAATGCTC:1 - chrX 19433221 3' + mdg3 5208 1 76.24 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATG:1 + chr3R 17321776 3' - Stalker2 37 2 60.40 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCGCATTCAGTGAGATGGGCATGCAAAAGCGTTGCTATTTTATCGTTGCCTA:1 + chr2R 7887272 3' - jockey 25 1 58.70 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTTTTGGTGCCGTGAAAAATCAATCG:1 - chr2L 285659 3' + P-element 2883 2 74.75 CTGAGGGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAACGGGCACCT:1 + chr3R 6608843 3' - I-element 22 1 58.42 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCC:1 + chr2R 23571705 3' - roo 8691 2 56.44 TCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACACCCTTGCCGGACTCCACCTTTTCGCGAATCATCTG:1 + chr2L 3511186 3' + Quasimodo 7004 2 52.05 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCTT:1 + chr2R 14675599 3' - roo 45 2 74.00 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGC:1 - chr3L 19951196 3' - Ivk 28 1 54.46 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGA:1 + chr3L 16761302 3' + roo 354 2 80.20 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGAACTGTTTTGG:1 - chr2R 14675517 3' + roo 404 1 73.27 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAG:1 + chr3R 11094594 3' - 3S18 11 2 68.32 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTGACAAAAGACTATATTACATTTGAAATTCAATAGCATTGTTTATG:1 - chrX 19426201 3' - mdg3 5254 1 78.22 GGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCCCAGTTTAACTTTTGGCATAACTCATAAACAATTTGTGA:1 - chr2R 14407191 3' - hobo 2622 1 61.39 TGGTGTTCACTGAAATAGCAGTGCTATGGAAAAATAATAAAATGCCATTTAGGCTTTGGCAAATCATAAATTAAAATGAGCAGACAAATTATGCAACTCGT:1 + chrX 9813351 3' - HB 1428 1 71.29 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAA:2 + chr3R 27775146 3' + roo 9032 1 64.36 CGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCAT:1 - chr3R 20137281 3' - Burdock 48 2 76.24 GACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCTGA:1 - chr3R 19446120 3' - 297 6580 1 79.21 TGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACACATAGCTGCTCTTACTCACACCGACGCTTCTCAAAGAGAAAAAATACCCACCTCAGTG:1 - chr4 1301729 3' - 1731 22 2 43.56 CAGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTAGTTTTAAGTTGACTTGTTTGAAAATTTTAGCTGACAACGACTTTCAAGACC:1 - chr4 250223 3' + INE-1 555 1 75.25 ATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAATTAGCAATTCCACAAAAGTGTCGCCTCGCCCTTAACCCTGTGTGGCCGTAGCTGTGCTGAGCCTTAACC:1 + chr3L 3885270 3' + F-element 4654 1 75.76 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGCTCTGTGTGCCATAATTCAT:1 - chr3R 25671945 3' + I-element 5302 1 76.24 CAGAAAATAGCTTGAAACGGTAGATCAGCAACTGATAAAAGCATTTTATGTTAGTTTAATCTTGGAAGATGTTCTTGTCATTATAATTACGTATCACATTA:1 + chr3R 19845309 3' - McClintock 129 2 76.24 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGG:1 - chr2L 17210290 3' + jockey 4949 1 69.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAGAAA:1 + chr2L 14612123 3' + roo 400 1 70.30 AAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATGGGCTCTCCAATCGA:1 - chr3L 4876711 3' + roo 9060 1 67.33 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGC:1 + chr3R 10240173 3' + invader4 3064 2 58.42 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACCTTATCAATTGTTTTGCTTTATCATTCGCT:1 + chr3R 27108388 3' - jockey 4806 1 75.25 ATATATATAATAATATATAATATAATATAATATAAAATAATTTAGTTACTTTTTAACAAGTACTTTTTTTAACAACATTAGAAAACTGATGATTATAAAAT:1 + chrX 7760392 3' + Dm88 28 2 64.36 TAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACTTGAGGATCCACTTGAGACGGGTCGCAAGGACTCTCTCACTTGAGACGGCTTCGTGTG:1 + chr2R 13190722 3' + INE-1 164 1 66.34 CTATTAATCCTGATCAAGAATATATAAACATTATATAGTCAAAACTAATACCCTTCCCACCACTTAACTTCTTCTTTCTCAAGCCCCCTAGCATTCATTTG:1 - chrX 20805219 3' - INE-1 85 1 63.37 ATTCGTGAGCAACGTCAGCGTGAACAAGACGATCGTGGGTAACGATATACGAAGCGATGCTTGGTCATTGGGCATCACTTTGATGGAGGTAGCGACTGGTA:1 + chr3R 1031235 3' + Doc4-element 10 1 65.35 ACCAACGCAGACTGCAGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCATGTAATATTGGTATGTGTTAAAGGAATGAGTAGCCTAAAAA:1 - chr3L 21736552 3' + rooA 7457 2 69.31 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTA:1 - chr3R 27748655 3' + roo 388 2 58.42 GGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGAATGCCATATATAGCGAAACATACCTAGATCGATCACAAGCTTTATGAATACTTACTTACTACTGTAC:1 - chr3L 20150959 3' + roo 285 2 78.26 AGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAAAATAAAAAGTTGTTAGTCGATAATTTGGGTCGGCTAAAATTTCTCCATTCCAGTTGCA:2 + chr2L 6999325 3' + Ivk 5359 1 46.53 CCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTAATACCTTTTTAACCCATTACTTATACTTATGTATATCCTGTACTGTGTTAAAGAAATCGCATGTATGTGTC:1 + chr3L 10476327 3' + copia 4978 2 77.23 ATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTGATAATCAACATGAAAATCAAATTTGAATTTATGAAGCAACCGGGGAGAG:1 + chrX 6388458 3' - jockey 282 1 50.50 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGT:1 + chr3R 4834320 3' - mdg1 7074 2 58.42 GGTGCCTAGAGCACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCAAGCTACTATACAAGTAGTTAGAAAAGAA:1 - chr3L 20230785 3' + hobo 2894 1 68.69 TAAACTGACAGCCGAAATAAAGTGATGTTATCGCATCTTTTGTTGATTTTTTGCCTACTTTTTGCATTTTCGCCAGCCATTTGATTGAGCAATCATCAATT:1 - chr2R 8637774 3' + Chouto 138 1 73.27 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACC:1 + chr2L 20133060 3' + flea 4981 2 64.36 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGT:1 + chr3R 11263452 3' - roo 43 2 72.28 GTGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGACTGTGTGAGAATGAGAAGGAGAGTGGGGAAGGGGGTTGGTGAAAATGACACACATAATTGCAGCATAATAT:1 + chr2R 17356187 3' - blood 170 2 79.21 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCG:1 + chr3R 27981717 3' + roo 9026 1 72.28 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTT:1 - chr2R 7861674 3' + roo 9029 1 71.29 AGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCATTGTTTAATATATTTATATTTACTTAGTGACCATTAAACAAAAGTTAAAATAATAGAAAA:1 + chr2L 19028333 3' + jockey 4745 1 63.37 TTCATGTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTT:1 + chr2R 19552034 3' - roo 51 2 75.25 GTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAGGAGTTGTATGACATGGACCTCGGAGGAGCACCCTATGCCTACACGCCATTCTGCGAT:1 + chr3L 18877224 3' + opus 7257 2 67.33 GTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACAC:1 - chr3L 10081929 3' - rover 22 2 55.45 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCGCGCACTGGAAGGATGCAAGCCCGAGTTGTTAAACTCTTTACCCAACT:1 - chrX 19116854 3' + opus 7481 2 63.37 AGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATTCTATGTACTTTTCGTTTATTTCCTTAAATTCTTCGCTTTT:1 + chr3R 17321823 3' - Stalker2 7248 1 46.46 TATCTACCTACGTTAAGCTTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTATACCGCCAATTGCCACTTCTTCGTTTTTCGCAATTAAAATCTGTACAGGGTATCTGAT:1 - chrX 7376294 3' + diver2 162 2 72.28 CAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAATCAGGAAAACGAAGCAACAGTTGCAGGCTTCCCAAACTGGGCATCCACAGGGT:1 + chr2R 13106196 3' - copia 162 2 55.45 CTTAAAATGGGTCTCGAAATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGGTGGCCATGGGCATCTGTGGCAAGAACACCTATCTGGCGGACTCGTGGAATCGG:1 - chrX 6138148 3' - gypsy4 6396 1 54.46 TGTTGGGTGTGAGTCGAGTGGCAACAAATGGCAAATGATAATAAAAGGCAGCAAGAATAGGAACAACTAGATGGTTTGGCCTACAAATTACACTCTAAAAA:1 - chr2R 20185134 3' - hobo 29 1 78.22 GGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATCATTCGATACTGCAAGATGCTCACAAGATTCACTTTCAAATGTAGTTAAATATAT:1 - chr3L 10320071 3' + invader3 201 2 65.35 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAA:1 - chr3L 8713096 3' + opus 456 2 79.21 CTTACNCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATCTTCAAATATATGTGTTGTTTGTGATGGCGGAGAATTTC:1 + chr3R 20137335 3' + Burdock 233 2 60.44 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAGCAGAACAAACA:1 - chrX 16995081 3' - jockey 9 1 75.00 ACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTACCTGCCCCTCACAA:1 + chr3R 8976004 3' + Bari1 1667 1 65.35 GTATANTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - P-element 35 1 49.50 GAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCGCCTGTGACACGGCTGCCATAAAAAAAGGAGTCGTTCGTAGAGTAGCA:1 + chr3L 4921493 3' - jockey 4760 1 76.24 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATATCTACACTCGC:1 - chr3R 9551430 3' + P-element 2846 1 38.61 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTTTCTCTCAGTGCACGAGAAGCGCCAAGAGAAATTTTTTGTT:1 + chr2L 6601477 3' - I-element 11 1 66.34 CTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAG:1 - chr3L 4876752 3' + roo 9047 1 71.23 CGCTGGTATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAA:1 + chr3R 1977619 3' + micropia 5408 2 53.47 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCTGC:1 - chr2R 19551974 3' + roo 387 2 57.43 CTCAATTGGAGTCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCACCCTACGTGAGCACGATGA:1 - chr2L 8565463 3' + blood 368 2 54.17 GGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCCGAACAGGG:1 + chr3L 8363069 3' - 3S18 5785 2 53.00 GTAAGACTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTATGCAAATTCCCTCAAGTTTAAAGTCTCCTGCCAG:1 - chr3L 4801491 3' - roo 16 2 63.37 TTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAATCATCTACCCGGCTACCACTCATAC:1 - chr2L 37680 3' - F-element 4666 1 73.68 CAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCTTGTATTTATCCACCTCATCGCTGGACAACTGGCGTCGTTTCAAGCGAGCTGCCGTATA:1 - chr3R 19850199 3' + Ivk 320 1 61.39 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCC:1 - chr3R 23275248 3' + roo 9050 2 57.00 ATATTNCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTG:1 + chr3L 16761308 3' + roo 9024 2 73.27 CTCGCTCTCATCACGACAGAGCTAAGTCCCGTTGCCCATTCGAACTGAGCCGAAACTTCTTGGACTGTCGATTCATTACATTAAATGCGGGGGGTGGTGAG:1 - chrX 3796197 3' + diver 416 2 67.33 ATAGGGACATTCAAAAAACCCTTGAATGTTTTCCAAAATGGTATCCAATGCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAACCGCTTGGACAAACTGCCCTCTCA:1 + chr3R 17176142 3' + HB 424 1 78.22 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGAAAAATAAGAGCGCGTGCCAATGAACTCTGTGGTCAAAAGGAAAAGAAACCGAGTCAGATACATTTAATAACTG:1 - chr3L 16761223 3' - roo 8664 1 77.23 TATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAATTTAAGAAGCAACAACAAAAAGCAGCATCAGAAGAAACCGGAACGGGAACAACAACAAACACT:1 - chr3L 18392502 3' + mdg3 5029 1 55.45 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTTGAAATGAGTTGAAAAAGTGAAAAGTTAAGCGAAATGAAAAGGAGTTTTAGACCCCAACCTC:1 - chr2L 14579812 3' - copia 4884 2 64.36 GTAACGGGTATCTGACAGTCAGGGAACACGACTATATCATTCTCGCTTGTTTTATTTATAATTTCAACACGTGATAACTTAATATTTCTAAGTAACTTATT:1 + chr2R 6017493 3' + INE-1 551 1 58.42 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGG:1 - chrX 17042675 3' - copia 4898 2 73.33 AGAGTNCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAATTGCTAATTGAGCGGCCCGGAGTGGG:1 - chr3R 19989235 3' + hobo 2930 1 69.00 AACGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGGTAATGAGCCTGAAAGTGAACCAACCTCGTCCTGCACTTATTTTTGCAA:1 - chr2R 15076805 3' - Tc1 1369 1 54.46 GGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGTTATTTCTACGGTCGTTGTCGGACCG:1 + chr2L 14161841 3' - F-element 312 1 74.00 TTTTTATATTTATTGATTTGGTAATACACAGTTGCCCGTGGAATTCGCTCAGTCTGATTCGGGAGGATTAAAAGAACGGTTTACAAATGTATCAATAGAGA:1 - chr2R 2850429 3' - Tc1-2 477 1 52.48 ATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGC:1 + chr3R 10240179 3' + invader4 3074 2 67.01 GGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGGCCGCTATGATGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCA:1 - chr3L 24039753 3' + springer 72 2 60.40 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAATTTAGTTGGTTGATTTTTGTACAATATTTCTAAAGATTTTTAGGGAATTTCCCATCAAGATATAAT:1 - chr3L 7906395 3' - roo 8673 2 61.39 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACGTTGAAAGTATTCGAAATGAGTATCGATTTTA:1 - chr3L 17344924 3' - mdg1 44 2 68.32 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTGTTTAGCTGGTTTCCTGGG:1 - chr3R 29123953 3' - P-element 37 1 24.75 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAACGTG:2 + chr3R 5686131 3' - P-element 18 1 61.39 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACACATGATAGTTAAA:1 - chr3R 19132251 3' - Ivk 11 1 68.32 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTATTATTTGTTC:1 + chr2R 12458009 3' + roo 397 1 70.30 GAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGTGGTCGTTGGACTAGCTGCACTCACTGGCGGAGAGCTAACTTTTTCTGCTGGGATGTCATGCCCTATAT:1 + chr3R 26773848 3' - F-element 4483 1 77.23 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCCTCTACTGTGCACGTGACACCAACAGAAGGCCTTCGGAAACTCTGGATTCCA:1 - chrX 5092917 3' - roo 8688 2 55.45 TTTAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTAGGAAATATACTTTTGACTTACGTGTATCCATCAAAGTCGCCACTGTTAATTGCTTCAATCAACTGCT:1 + chr4 1038383 3' - Tc1 65 1 58.42 GCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGA:1 + chr3L 8363038 3' - 3S18 52 2 75.25 TTTAGTGGATAGAGGACAGCACTGCTCCCAGCAGAAAATAATGTAAATTCATCGCTTACGAACTACACATAAAAACACGAAAAGTTCAAGGTGATGATGAA:1 - chr3R 9993502 3' + HB 347 1 54.46 TTTTTTCTTTTTTTTTGATCGAAATACAATGTCTGATTTGAATGCTGGGTATATAGATATTCAGAGGTGAACCGACAGTCGAACGAAAACGGCTGGGGCAA:1 - chrX 13022139 3' - R2-element 3580 1 50.50 ATTTTGTTTTCTTTTTTTTTTTCATTTCCAGCTCGATGTTACGTCCGTTCTTCTTCTGGCGCACATGGTTGCTGCAGGGATTTCAAGATAAATGAGATTGC:1 - chrX 8715422 3' + hopper 143 10 71.29 GTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCCCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGTTTGATACCACGCGATAAGATAACCTATCTGTACACAGAGC:1 + chr2R 12951399 3' + roo 8833 2 57.43 GGGACNTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTG:1 + chr3R 29331895 3' - G6 54 1 75.25 AATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTGCACATTGCCACTCGGTTGTTTGTTGT:1 - chr3L 13477605 3' - P-element 282 1 30.69 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAAT:1 + chrX 8491467 3' + P-element 2852 1 44.55 AACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCCCAACGTTCCGCTATTCATCTGGCAACGCCCCTGTTATCAAGTCACACATTTCAACCCTCCGG:1 - chr3L 20526185 3' + HMS-Beagle 6684 1 69.31 AATCAACTTTCCATCTGCAGTAAAGAAGTAAAAGTATATAAAGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCACAAGCACAACTCGAGTGTCCCCAAACCCAA:1 - chrX 1248431 3' - Tc1 27 1 70.30 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATATATGCTAAAATCATTCCAAAGATGTACATGA:1 + chr2L 2308711 3' - HMS-Beagle 6828 2 59.00 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAGGAACTCACTGGTGAC:2 + chr3R 9995429 3' - Max-element 31 2 55.45 AAATANTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGC:1 + chr2L 13574268 3' - pogo 40 1 64.36 ACCAGACTACGTTCGGCAGAAACTATAACGGTTCTCTGCCGAGCATCAAAGAACTGAAAAGGCTTGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGCAATTACTAGAAA:1 + chr3R 3985688 3' - invader1 3715 2 86.14 TTCTANCATTTTGTACATTTAACTCATTATTTGACCTATTAGTATATAAAATTACATACATATACATATATGTATGTATGGATAAACATATATTTTCCCTA:1 - chr2L 12584354 3' - hopper 1076 1 36.63 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCT:1 + chr3R 7522356 3' + blood 331 2 72.28 ACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCAG:1 + chr2L 21403528 3' - G5 4427 1 71.29 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTC:1 - chr2R 8345494 3' + roo 9047 1 55.45 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGCTGGCGAGCAAGTTTTGTATGCGACT:1 + chr2L 5646930 3' - jockey 4671 1 79.21 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTGAACAGCTCAAAAAATTCAACGCCATTTGTGCAGTAAAATTGTTCCGTTTTCAAATTTTG:1 - chr3L 11113886 3' - 412 7069 2 63.00 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAGACAGAGAGTGGTCAGATATAAATATACATGTACTGTATATATG:1 - chr2R 8083809 3' + P-element 2856 1 50.50 CATCTNGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAGGGGTGCAGTAAATAAACGTTATTATTAAATTATTATTATTAAATTATAGCGAAACTTTGTTAAAA:1 + chr3L 11837174 3' + 1360 3386 2 64.21 AAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACGTAAAAAACACACTTTTGCTCCCCTCTTCACGGAGCCCCA:1 + chr3R 19672630 3' + Gypsy6A_LTR 277 1 83.87 GTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATTGTATCGGATTATTCACGATG:1 + chr3L 9909765 3' - Transpac 4951 2 53.54 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGA:1 + chr3R 20149752 3' + 1360 3333 1 83.17 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTTCGGTTTAC:1 + chr2R 19552042 3' - roo 43 2 69.31 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCAAAAAGCGATGACAATGGCTTGGAGAAAATAATAATAAAGGAACAAGTAGAGCACACACACTTTTCAATG:1 + chr2R 13295756 3' + Tirant 8503 2 75.76 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGAATGTAAGGGGATACATGACTATATGCCATCCCATATCCAGAGTGTTTGCCTTTGCTGCACCATATGTGGAAGTTCATA:1 + chr2L 3951666 3' - Transpac 22 2 55.45 CTAGAAGTGAAAAATAAAAGAAGCGGCCCTTTCCAGTGCAAGGTTTAACTAATGTCGGATTTGTGGGGAGTTATAGGATTTTTCACATTTCCCCCCTGTTT:1 - chr2R 979680 3' - Porto1 4606 1 68.32 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCAATACAATTTACTTGTCAGTTAAATCATTTGTAATTGAAAGATAA:1 + chr3L 17168929 3' + mdg1 7454 2 68.42 TTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGATTGCCGTGGGCACCAATTAACAGACACTGATTTCGCTATCTTACGGATTCAATGCTTATACTGTT:1 - chr2L 10452077 3' - gypsy4 311 1 66.34 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACCGAAATTCCCTTAGGCGGGCTTGGTGAA:1 + chrX 20620622 3' + pogo 2085 1 63.37 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTA:1 - chr3L 18337662 3' + Juan 4171 1 69.31 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGT:1 + chr3L 9766391 3' + blood 7337 1 85.15 CGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAACTCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGAGGAAATGCCTGGCTC:1 - chr2R 14127972 3' - 1360 3216 1 81.25 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAGTGGCTAGGAACATGAGGAATGGCCTCATGGACAC:1 - chr2R 12457904 3' - roo 8681 2 62.38 CATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCTTGACCCGTTCCTGGATTCAGGCGACATCTGCCAGTACCGAACTCACAATTTAATGTTAAATCGA:1 + chr4 408483 3' + BS 4813 1 70.30 TTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGAACAGATAAGAAGGATGGAATGCTGGAGGAGCCAAAGAAAACTGTACTGTGCTTAACC:1 - chr3L 25255308 3' - GATE 287 1 56.44 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAAAAATACAATTAAATCAAAAATTCATAGCGTCTATTACCTGATTTATTTAGGACAATTTTTTTTAGAA:1 - chr3R 7902882 3' + pogo 2094 1 72.28 CTTGACCAGTATCAATAGCCGAGTCGGTCTGACCATGTCCGTCTGTCCGTCCGCACAAATTTCATCGTGGAACTGTGGATCGTCTTCCAGCACCTGCCGTA:1 + chr2L 21283236 3' + INE-1 89 1 62.38 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGT:1 + chr2L 21683480 3' - pogo 25 1 56.44 AAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTAGCCCAGTGAAAAAAACAACTTATGCGCACCTTA:1 + chr3L 7905706 3' + gypsy 7403 2 66.34 ACACACACACATACACATATACATATGCATGGAACTGGGTGATACGGGCTCCCTTTTAACCCATCACTGTCCATCTCCAAGGATTCATCGCTTTTGCGCGA:1 + chrX 15396593 3' + accord 7031 2 76.24 ATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTCTGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCCTGTCACCTCTTGACTTGGCCTCTGCTTGTTTGTTT:1 + chrX 21251259 3' - Doc2-element 392 1 64.36 TCGCGCTGACCCTGAGCGCGAGTGTTGTTCGTGATCATATTTTTATTATTTAAGTATATATATTATTTTAAGATAATGAATTACAATATATATTTGAGCGA:1 + chr3R 778381 3' - F-element 208 1 48.51 GACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGT:1 + chr2R 2994305 3' - gypsy8 4770 2 44.55 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGA:1 - chr2L 12815033 3' - hopper 25 1 54.46 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTC:1 - chrX 8972389 3' - 1360 42 1 67.33 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCCAATTAAA:1 - chr2R 13295629 3' - Tirant 4 2 77.23 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTAAAAATGTCAATATATAGCGAGC:1 + chr3R 8555953 3' - 412 6 2 72.28 TCAGGCAAACTGCAAGTGCGCCAAAATTGATACTATAGAAGGTGGTTTAACTTCGATGCCAAAATATCGCAA:1 + chr2R 5183871 3' + mariner2 294 1 77.78 AACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATGGG:1 - chr3L 4876723 3' + roo 9055 2 59.57 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCCG:2 - chr3L 22039726 3' + jockey 4939 1 77.23 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTTTTAGTACCAAATATATCAAAAATCAA:1 + chr2L 22098119 3' + roo 400 1 52.48 GTTTGATGTACACATATACGATCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCGTGTTCTTGGCAACTTTTCTCTCATATGTTTTGCAACAAATTGCCTCCA:1 - chr3R 28700030 3' + accord2 7208 1 53.00 AGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGAAATGAGCGAGAG:1 - chr2R 1744015 3' + gypsy11 3974 1 60.40 ATGTGCAAACGTAAGCAAATAATTTGGAATTGCCTTCTCTCAATTAACTGTTTAACACTCCGTTGTAATAGGACTTCATTCCAAGTGTTTTATAATCCTCG:1 + chr2R 5487634 3' - transib2 209 1 59.41 ATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAATAAAGCATACTAGTTGTTTTCATGATGTATGGATCATTCTTTTTGTCTATTTTTCCTTTTGTTCTCG:1 - chr3R 7916617 3' + mdg1 65 2 74.26 AAAAAAAAACGAATAAAAATTTTTCTTTTCAAAAAATGCTGAAAATAATATTAGATTCCAACATTTAAATTTGATGAAAAGCTGTAATATTTTTTCA:1 + chr2L 4247490 3' - 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chr2R 5582170 3' - Cr1a 444 1 64.36 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGCTTACATTGCG:1 + chr2L 13574292 3' - pogo 11 1 61.46 GTTATNTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGATTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATTGTAAATGTTTCAATAATACTCGATTTAATGATTT:1 + chr2R 10774126 3' - copia 4882 2 66.34 TATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGAGCGAAAAGAATGTGGTGCCAGCTGCTGTTGGGGAAAGGGAATGGGAGCTGTTGAAGGGCCCGGCTTCAAT:1 + chr3L 13584833 3' - ZAM 180 2 56.44 GCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAA:1 - chr2L 23299980 3' - invader4 347 1 56.44 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACCATTTTGTGTGCGTGTGTGTGTTTGTGAGTCCTGGTCCATGTTTCTGTAATGT:1 - chr3L 13548765 3' - hobo 3 1 76.24 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTTTTGGCTATTGATAAGGTGGCAGGCGGTTGGGATTCGATGGGGGGAA:1 - chrX 8684208 3' - opus 27 4 57.43 CATGAGACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGGTGGCGAGGTGGTTAGGGTGGTTTTTTGTGGTTCTTCTTTAATAATGGGAAAATAAAATGG:1 + chr3L 13713888 3' - G6 1860 1 64.36 GTGCTGCAGGGGGTCCCACGCTGCAGTCTCCGATGATTTGCCGGTTGGCAGATAGGCAACAAAAAAACCCAAGCGACAATGGCTAATTACGGGCAACGGAG:1 + chr3R 16454428 3' - gypsy3 6935 2 55.45 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGCTCCAAAAGTCGACCTTCTCTGTGCAAATCCACGGGTTCAT:1 + chr2L 19481362 3' + roo 391 2 59.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGACAATGT:1 - chr2L 14612047 3' - roo 8712 2 76.24 TGTCCCAGCGTTTCTCTATTTTCTGACAATTTTTCATCATATTGCAACAGTCGAGCAACAGGGTAACGTTAATTAAAATGAGATTTCTATATAATT:1 + chr4 90870 3' - Tc1 1600 1 62.50 GACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGC:1 + chr3R 29331896 3' - G6 52 1 75.00 GATCANTAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGCATGAAGCTTCGTATCTTGAGTTTTATTTTTGGATG:1 + chrX 15292546 3' + Quasimodo 7336 2 62.38 TGCACCTCAACATGAAACCGTGGTCAGTCACCGATGGCGAACGAGCTAATCTGACGCTTGAGGTTGACTGTTGTTGTTGTTACACGCC:1 - chr2R 4997865 3' + R1-2 340 1 75.00 CTTCTTCACAAAATCAGAATTATGCGTAGTTCTTGACTTTGATATAGCATTAAGTTTATCTCACTAAGGGAATACGTTATGTTTCGGTTCTTCTGCGCCAC:1 + chr2R 19221222 3' - invader1 275 2 64.36 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGGTTTACTATTAGTTTGCGGTAATCAACTAATAAACATAATTTTATATTACACAAAC:1 + chr3L 7906511 3' + roo 390 2 50.50 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATACATGTATGTGCGTATAAATTCCCAATGAATATGTATCTTCAGATACTCGTTAGCT:1 + chr2R 24021654 3' + pogo 2082 1 60.40 GCGACGAAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATTTACAAATAGAACGGCAGGGGGGGCTGCGGAATCAAATAACATTAAA:1 + chr2L 13288249 3' + G3 4450 1 59.09 TCTATAACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATATTACAGTGGAAGACAAACTAGATGTGGACTTGGCAGCACTCAAAACTTGGCCAAAAACACATT:1 + chrX 19986439 3' + Stalker2 7637 2 56.44 AATGCTGACCAGAGGTCTGCATAGTGTATGCATGCTCCAAAATATCTTCGTATTTGCGCGCTTTGGCCGGGCGCTTTATTAGTCCCACCTTTAGACGCCTC:1 - chr3L 22073314 3' + HMS-Beagle2 74 2 76.24 AGTCATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCTATGCCACTTTCAAACTACTGCTGCCCATA:1 + chr3L 8279340 3' + 1360 159 1 70.30 AAACCAAATAGAAAAACTTGATGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTGCGTAATGTAGAATCAAAGGCACTAGTGTTTTTGGT:1 - chr2R 2953269 3' + Dm88 331 1 64.36 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGG:1 + chr3R 4544070 3' + flea 4985 2 55.45 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTGGCCAATGCCCGCATAATTGTTTG:1 + chrX 17042727 3' + copia 230 1 51.49 AGCTTATGTATCAGCGTTAGATCGTATTACTTGAGCGCTGGAATACATGTGTAATTGTTGGTGGTTTTTTGGGTCCTGACCTCCCGGGAGTATTCCTCCAG:1 + chr3R 13121512 3' - Stalker2 7397 6 73.27 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTGGGCGGCACCAGAATACGAGAGAGAGAGCACTTCCAGCGCATCCAGGCACATAGTTCCGTTAGCTCA:1 + chr2R 10444326 3' - P-element 10 2 69.31 AAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGCTTGCTCGTCTTCTTCTCGCTCCTCATTTTGTTTAAGTGTAGTGATAGACTTGTTGTT:1 - chr2R 12274300 3' - Quasimodo 7089 2 64.36 GTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCACTGATAATTTGCACGCTTGTTGATTTGGCAGCTAATTACA:1 - chr2L 4147746 3' - gypsy5 7310 2 59.41 GTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAACTGAAAAGCATATACATACGTGAAAAACAATGAAGAAACTTTTCCC:1 - chr3R 8310145 3' - 297 412 1 53.47 TGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGATAATTGCCCCGTTAATAAACGCCATCAAAACGAGGAGCGGCCTTCAAAAAGGCGATCTCGTAAAGATGATGAAGT:1 + chr2R 16274416 3' + hobo 349 1 73.27 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGGCAGACGAAACAAAAACAACTGCGCAGGAATACAA:1 + chr3R 14650175 3' + S-element 1681 2 69.31 CCTACTACCAGATACCCGTTACCCAGCTAGTGGGACGGTGAACGAGAAAGAATAGAAAAAAAGAAAAAAAAAACTTCGCAATAAAAACTGAAGTGCTAGAA:1 - chrX 13550149 3' - INE-1 551 1 72.28 AAATATGTAAATGGTAGCTAATTCGAGCGGCTCACAGGGAATACATCCTAGTCAGAGGCAAACGAGTTAGGTTTACAAAACATTATAAAAATATA:1 - chr3R 13376326 3' + 1360 2971 1 69.47 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGA:1 - chr2R 23571654 3' + roo 9017 2 79.21 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGTTTTTATTGAACTTATTGAGTGTTGTGTTGTGT:1 - chrX 23048242 3' + hopper 1414 2 75.00 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATATATAAAAGAAGAATGTCTATTAGGTGTTTTTTAAATTTTTG:1 - chr3R 12589014 3' - Max-element 37 2 63.37 TGTGAGCGGGAGAGTTGAGTGTGTGTTTATTGGTATAGCGGAAGTTGTTGTTGGCAGCTAGTTAAGCAGTTTCGCGTAAACGTTTTTCCAATATGA:1 - chr3L 15211916 3' - Porto1 471 1 56.25 TCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGATTGGGAATAGAATAGAAGACAGCAACAGCGACAACAGCAGCAAA:1 - chr2L 18374055 3' + 297 6971 2 53.47 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTAAAACCCTCCCCCAACC:1 - chr3R 10734252 3' - pogo 41 1 71.72 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAAAGTTCGTAACTGTCGAGCAACAT:1 - chr3R 6735255 3' - copia 19 2 62.38 GCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACA:1 - chr2L 13334031 3' + flea 213 2 73.27 AAAATCAGTTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACGCACACACATGCAATACAGTGAGTGC:1 + chr3L 19377792 3' + roo 9036 1 59.41 CCTTCTTCTTTAAGTAGGCCCACAAATTTTCAATGGGGTTTAGATCAGGACTCTGAGAAACCAAGTCCCGATCCCTCGGACCAAGTGATTGTGGC:1 - chr3R 17275528 3' - S-element 1259 1 58.95 GAAACTGAAACCCAACTTCATCAGTCCATAAAACATCAAACCAGAACTCGATAGGCTTCTCTTCATACTCCAATGCAAAAGCTACAAAAAGTTAATAACAA:1 + chr2R 4803305 3' - Bari2 664 1 74.26 TGCTATGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGCGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCT:1 - chr3R 7522299 3' - blood 29 2 55.00 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGT:1 - chr3R 16457998 3' + roo 9041 1 59.00 ATTAATTAAAGCATGCAAATTAACACGATCACGTCGGGGTCACCAATGTCACATCGTCGTGCAGAAAGCCCTTCTCTATCAATGGATCGGCTATATTAACT:1 + chr2L 23052997 3' - diver2 410 1 60.40 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGGAA:1 + chrX 13508762 3' + roo 9046 1 57.00 ATATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCAATATGTAAAAACGAAAAATGAAAAAACCGAAAAAAACGGAAAACCAAGCAAAAAATATAAGAGCGGGAAAAA:1 - chrX 17926937 3' - S2 1609 1 72.28 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGATTCTTATTATTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGTTAAGT:2 + chr2L 16434992 3' - Doc 45 1 64.36 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATGTCGCAAAAATAAAGCCTTGCATAGCTCAAGGCGCAGCGGTA:1 + chr3R 17454498 3' - jockey 4676 1 71.00 GGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGACTTAGCTTTTCTTTCAGTGTTACTACCTGTCGTGCGGCACAAGTCGACAGTCAATAGGTCAGTTAGCTAAAGTCG:1 + chrX 7754021 3' - I-element 5046 1 74.26 AAATCGGTAACCATATCATTTTACCGTAATCGTAAATAGGCAGTCCTCGGGCTCAAATCGATCGAGATCGATCGCGGATGATTGAT:1 + chr2L 2801212 3' + Helitron 62 1 53.49 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTCGTCGGACTGG:2 - chr2R 23571626 3' + roo 9045 1 52.48 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTA:2 + chr3L 17168895 3' + mdg1 7414 2 70.30 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAATCTGAGAATCCT:1 - chr3L 18337641 3' + Juan 4192 1 58.42 GTATCTAATAGTCGGGGAACTCGAACGCACGGAAAGGGGGAAGAATCCGAGAAAAAAGGAAAGAAAAGCGGCGAGCAAGGGTTGGAGACCTTTGGCAGGGC:1 - chr3R 5729531 3' + INE-1 558 1 75.25 AATTTATACACACAATAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTAAATCCAAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTT:1 - chr2R 9500021 3' + G5 4769 1 71.29 GTTTGCCCAGTCTGCGTCGGCGAAGCCCATTACCTGTTCGCCGTACTTGTAGTTTGCATTTTCATAAATGCAGATACAATATGCGAGTGTGGCTCTTTGTA:1 + chr2L 20603920 3' - Copia1_DM 3838 1 60.40 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGGAAAGTCGATGCCGCCTTGTTATTTTATTTATTTTCTTTTTTTTGGTCACACAAAGGAAGCAC:1 - chrX 16749093 3' - FB 15 1 64.36 GAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTTGATGGAAATTGCCTTTGAGCAACTAATGA:1 - chr2L 12326621 3' + roo 18 2 70.30 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAAC:1 - chr2R 5950680 3' - mdg1 26 2 53.47 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATTTTTAATA:1 + chr3L 17921222 3' - 297 6590 2 69.31 AATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGACTGCGCGGCTGCGTAAATAGCGAATAACGCCACTACCAGCAGACCGCTGAGCAGCGTCTTGTGCAGCAG:1 + chr2L 8308042 3' + P-element 142 1 73.27 GAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATCTGAGAACGAATAAAAAATCCTTTTCATGTTTGCCGCGCTCTAAATCACAAACACATAAACCAAATT:1 - chr2L 21010832 3' - opus 4 2 75.25 TTTCTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCATTGTTTGGTTTAAGGTTTGTAGCTAAATATATTTCTTCGCCATCGTTGCCAGAATTGGTGTAATAGCT:1 + chr3L 23934644 3' + Cr1a 203 1 72.28 TATTTNCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTG:1 - chr3R 9131773 3' + roo 9025 2 71.29 AAATTCGCTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACATATTTATATTGGATATTTTTAAAAGACATCATTCACATCATTTATATGAAATCACA:1 - chr2L 18331784 3' - 1360 2999 1 59.41 TTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTCCGGCACTCAGGCGTTGTTTACTGTATCCGGATTGCTGCATGGAGTGCGAATGATT:1 + chr3R 23381181 3' - Quasimodo 469 2 61.05 GTTTGGTAATTTTATCTTCGTTGTCGGCTTCATCCAGATAAATCAACGTGCCTCCGCCAGTCTCCCCAAGCCCAACCAAGCTGTCCAGGACAATTAATTTT:1 + chr2R 23285041 3' + diver 306 1 52.48 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTT:2 - chr3R 16457981 3' + roo 394 1 65.35 AAAAGNTATTACTTTACCGTCAAAGATAATAGTTATTTGGAAGAATTTTAAATATATTTCGTGTGACATCCTTTGTGTACATATGTATGCAAAACGAATAT:1 + chrX 22560078 3' - transib2 481 1 75.25 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAATTTACGCATTACGCAAAAATTAAAAATTTTTGAATTGCTTGTTTGTTCACAGTTGTGTTAGT:1 - chr2R 22317204 3' - BS 5007 1 54.46 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAACGCG:1 + chrX 18837017 3' + P-element 2858 1 50.00 TTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTATTCACCAA:2 - chr2R 4673561 3' + Quasimodo 7354 2 63.37 TCAGAAGGACGAAAGCACCGAGTCGTTGGAGGCCTCAGGAGTCATCGCCGGGGATAAATTGGAGTTTTGCAGCATTTAAATATAGCCGACTGTCCCACCCA:1 - chr3L 9442903 3' - TAHRE 10093 1 65.35 GGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTT:1 - chr2L 2078454 3' - I-element 47 1 75.25 AGCCAAGTCTATTACATCAACTACCTATTTCACTCGGTAAGCCATCGACACCTATTCTGACCCCCTTCCTGTGCCACCGACCTCGACACTCAAGCAGCAGG:1 + chr3L 8593064 3' + Stalker3T 318 1 72.28 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATATGAGACACAAGGCTTGGGAATAGAATAGAAGGCA:1 + chr3L 10143237 3' + 297 6948 2 67.33 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGAC:1 + chr2L 14612083 3' + roo 359 2 70.30 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCT:1 - chr3R 7522294 3' - blood 25 2 54.46 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATT:1 + chr3L 13477484 3' - P-element 59 1 16.83 TTGCACTTTGCACGACGCGACTGTAAAAATCTATGATTGCATGTGCGAAATGGCCGATCTGCTT:1 - chr2R 5900118 3' - rover 452 1 81.25 ATATATATGTAGAGAAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACC:1 + chr3R 12047485 3' - Stalker2 7271 2 53.68 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTAGCTGCATAGTCTATATGACCTCCGCCCCTTTTGCCCAAAAGTATGCAA:2 - chr2L 3968989 3' - jockey 34 1 51.49 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAG:1 + chr3L 16761331 3' + roo 9047 1 53.47 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTT:1 - chr3L 18500965 3' - hobo 48 1 73.27 TGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACAACGTGCTCGGACTTGAGAAACATGAAATAAACATTTGCCAC:1 + chr3L 2015672 3' - 412 7193 2 58.42 GTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAAACAAAAAC:2 + chr3L 11257394 3' + 1360 26 1 47.52 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGACAACATGGCCCATGGGAGAGAGAACAACGGTGAAGCACTGCAGAAATTGAGAG:1 + chr2R 14713677 3' - P-element 4 2 72.53 AGTAGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTACGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCCTACCCAGGATAATCATTCCGATTGTGAAACACGT:1 - chr3L 23241878 3' + 1360 3347 1 63.37 AATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAACAGGTAGTCATCTACCTCCCCATCGTACGGCACAAAGTGCACACACGTTAGGGA:1 + chr3R 6011106 3' - G-element 4212 1 59.41 TTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTGTCGTTTTTATGTTTGCTGTCACGCCGCCTGCTAAACAAATAAAAT:1 + chr2R 19859046 3' - McClintock 6418 2 44.55 TTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATGGACACCCATGTTGCCAAGACAAACAGTAAAATTAAGAGAAATCGAAACATTTTTC:2 - chr2R 2555702 3' + INE-1 164 1 56.44 GCACTCAACAATCATTGCCTTATAAATTTCTCACACATCGCAAGCTGAAAATTCGGAAAACGTTAACGTTAACGCTGATGCAAACAATGTGACATTTTTAA:1 + chr2R 4676543 3' - 1360 448 1 55.45 GTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGCAATAATTTTTTTGGCAAATCGATTGAAATTGAGGAGACTAATAAAAACAAGAAGAAAAGTTTAAGCCGGGCCAAGAGT:1 + chr2R 15029166 3' - INE-1 214 1 69.31 AAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCATTCCCATTCACCGCAGTTGCTTTGATCAAATGCATAGGCA:1 + chr2R 12962850 3' - accord2 7319 1 59.41 TTATATGTGTTAAAAACCTTATATATATCTGTGAACAAGATAAACAAAAAAAGTGAAAACGAATGGAGATGGGCGCCTATGGCACCAGCAGTCGGTGACTT:1 - chr3L 25492911 3' + Porto1 124 1 59.41 TCATAAATAGTGTGTTAGAGAGAGATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAAGTATGCAAATAAGAATTGAGAACATGACAGAAGTTCT:1 + chr3R 19448765 3' + invader4 146 2 62.38 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCG:1 + chr3R 6622693 3' + P-element 2843 1 37.62 GCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATGCTGAAATGCGAGCTAAATATGCGGCGGCGAATTTCGTTTTCGAGGCTACATAATTCGTTCAACTC:1 - chr3R 21647373 3' - 412 271 2 69.31 GGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGCTGGCTTTGTTATTTACACCGGCAACGAGAGACTATAATTT:1 + chr3R 31101365 3' - 297 6581 1 71.29 TTTAANGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGGCATGCGGATGTGGCAATGTTGGTCAGGATACGCGCA:1 - chrX 17042639 3' - copia 4888 2 58.42 CTTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCATTTGGTCCGAGGCCAGAAGGTAGATCATTCGTTTCTACAGATTTATGGATGACGCTTGATAGAACCT:1 + chrX 20345037 3' + INE-1 89 1 69.31 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCCACAGAAGGCAGCACGTGCCGCCCGAGTGGCACGACCAATGGCAGTTGGTGG:1 - 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chrX 6709112 3' + I-element 82 1 62.38 AAAAAATAAAATAAATAAAAAAAAGGGAAAAGCGAAGAGAGAGTGGGTTCGGGCAACAACAATAACAAGGTCGGAAGACGAAGTCGAAGTTGGCGGCAGAG:1 + chrX 1594006 3' + F-element 91 7 63.37 TGAAAACAAAACAGGCAATTGTACATAAAAAGCCAAAGTTAGCAGAATCAAAAAGTTCGAGGAAAAATACAAATAAACATAGAGAAAAAACGAATCAGCTT:1 + chr3L 20266593 3' + I-element 5193 1 71.29 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCTTAACGGGGG:1 - chr2L 2078446 3' - I-element 38 1 67.00 AAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGCTTGTAGGAGGGACTTTCTGGTCAGCTGAGTAAAACGAATAGAGCGTTTGGATATTA:1 - chr3R 25464160 3' - I-element 5099 1 56.44 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAA:1 - chr3R 13582236 3' - BS 5039 1 67.33 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGC:1 - chr3R 11263386 3' + roo 9048 2 55.45 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTATTGCACACA:1 + chrX 2649921 3' - Tirant 8108 2 80.20 AAATAATCAAGATAGGAATGCAAATACTGGTATTTAAGTTTACATTATTGCTTTTGTTTGTTTGGCTTACTTCAGTTTCATTCCTTGTGACCTTGTGATCT:1 + chr3L 25346340 3' - Circe 6952 1 69.31 CCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCT:1 + chr2R 2994307 3' - gypsy8 117 2 46.53 TCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAAT:1 + chrX 22945355 3' - BS 27 1 55.45 GTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACCCTATAATAACAAAGTGAAAATTTGAAATTATTTCGTGCGTTTTTATGT:1 + chr3R 14917264 3' + HMS-Beagle 220 2 53.47 ATCGCNGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAGTTTGTCTTTCATCTGACAAAAAAGTATATTCCATGCATAGGAAATCA:1 - chr3R 19380534 3' - 1360 2983 1 71.29 TTATTTTATTTTTATGATGTTTTGATAAATAATAATACTCTTCTACTAAGCGCACTGTCTGATAATCGCCCTCTTCCCCTTCATATTTTATCTAAATCAAT:1 - chr3L 14602940 3' - jockey 4999 1 70.30 GTTAGGGAGGGCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAA:1 + chr2R 19209480 3' - jockey 4762 1 76.00 TTTTACATTATATTCATTTCCACACTCTCGTTCTTGGGATCGTACTTCTTCTTGGATGCCAATTTGGCGCGCATTT:1 - chr2R 17404693 3' + Cr1a 4326 1 76.32 AACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAAC:1 + chr2L 23295875 3' - micropia 19 2 56.44 TTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAATTAAGCGAAATGCGCACAGATGCCTTTGTTTATTAATAGGTTACCACTTCGGAATTTGCGAAAG:1 + chr2L 16098077 3' - Doc 4660 1 73.27 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGCATGACGCCCTAGT:2 + chr2R 12082434 3' - mdg1 5 2 74.26 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAAC:1 - chrX 21668950 3' + mdg1 387 2 59.41 ATCCATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTAAATTGAAATGAAATCATAATTAAGCGAAACAAAATTAATATTATTATAAACAAGAGAGAATGTCATAGTCGA:1 + chr2R 3143648 3' + Tc1 1510 1 76.24 CAGTTCTAATAAAGCATTCACCCTAATCACATCTCATTGTCTCAATCATTTTACCGCGGCGTATTAGCAATGTAATTTAACCCAAGGGCAGCCATTTCCAG:1 - chr3R 25541032 3' - frogger 57 1 60.40 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGACATTTTT:1 + chr2L 14790665 3' + roo 397 1 65.98 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGACAATGTAAATTTGTTTTAGAGTTG:1 - chr2L 14612029 3' - roo 30 2 58.42 ATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAATAGGTTAAATAAAAATACTCAAAA:1 - chr2R 3591954 3' - Quasimodo 1 2 78.22 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTGTATGTGCGTGCACTCATAAAAATGAGAGTGTATTAATATATATTTTTTTGT:1 - chr3L 25147222 3' - hobo 23 1 54.00 TAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTATATTGCTTATTTCAATTCAAAAAATATGAATGAAATATGAAA:1 - chrX 23282942 3' + flea 246 2 71.29 CAAATGAAAAGCAATTTTTATGCCGAGCAGCAAAGAGAGTGAAAATAGGTATATGAGTAACTCACTCACTATTTCTCTTGCCCAGCAATTGGAGTGTAAAA:1 - chr3R 21679030 3' + TART-C 10772 1 76.24 GAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGGGAGTGGTGAGTGGTGAGTGGGGGTTGACGCGGCTCGCGATAATTATGTATGAAGCAATTATTT:1 + chr2L 20287681 3' - hobo 2656 1 68.32 GTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAACGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATG:1 - chrX 15746306 3' - jockey2 3241 1 63.37 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCGCCTGTGA:1 + chr3L 4921453 3' - jockey 4800 1 66.34 CGAGTTGCGCCCTCTCCTCGGCGAACCTAGAGCAAGTGAAAGTGCAAAAATAATAACTGTGGCTGCGGTTGCGCCTGAGAAGCAGGGTCACTTCACTCCAG:1 - chr2L 11499621 3' - Rt1a 4616 1 70.30 ACCGAATGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTGTACTAGCTGGTGTGCAGTGGTGTTAGTGCCCCATGTCCTTTG:1 - chr2L 13319576 3' + hobo 2906 1 56.44 ACACACATCTTCCACGACGCCACATCCTCGTTGCCACGTTACCACTTTGTTAAAGTGGTAGCCCTCCAGGTCGGTGGCACGATTGGAATGTTTGGTCGAGG:1 - chrX 12064174 3' - Osvaldo 446 2 71.29 TGAGATTTATTTATTTATTATGCATTTTAATATCTAGGACACAAACAAATATAAATTTCTGACAGTGTAGAGGCCTGAAAAGTTGAAACTATGCCGCGTAG:1 + chr2L 1615497 3' - G3 345 1 50.50 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCATTTGTATAGTTCGCAGCAAAATGGCCTATTGCACCTTTTGACCTTTTTGCACCTTCGGGCGTAAGTTTCTAT:1 - chr2R 8158844 3' - pogo 1 1 78.22 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGATGCACAACGGCC:1 - chr3R 29123336 3' + P-element 2860 1 49.49 TGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCCCCCTCTCCACCACCACCCCTGCTCTTTTCCAGTGTCGGGCGCCC:1 - chr2R 24285690 3' + 17.6 7152 2 56.12 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATC:1 - chr3R 10952257 3' + roo 392 2 59.18 CTACAACGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTGTATCGTTACTACATACCCATTTGAATGGATGGACTTTCTAACCTATCTACCAA:1 + chr2L 21152174 3' + 1360 129 1 58.42 CTTCGNTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTGGGGCGATTCAGTATTATTTCGA:1 + chr3R 29123407 3' - P-element 30 1 50.50 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGG:1 - chr3R 7522312 3' - blood 7054 2 65.35 TGTTTTTTTTTTTCTTGTTTCTGTTCTCTTACTGTCTCTGTTTCGATTTTTTGGCTGGATTTTCGTTTCCATTAGCATTTCCATTTTCCATTTTCTACAC:1 + chrX 13305078 3' - gypsy7 5008 1 66.00 AAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGAAATTGTTGCGGCTCTCTACCATTTGTAGTGGGATAAGAATGGTCTACGTGGGACATTGCAGAGAAGCG:1 - chr3L 27201408 3' - Cr1a 4307 1 73.27 CGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTCTCTTAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGA:1 - chr3R 19447064 3' + roo 274 2 60.40 GGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTCCACATTGTCCATGCCAGACACGTA:1 + chr3L 511251 3' - Doc 4472 1 75.25 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCACAACGGCCCGTTCTGGTCAAAACAAAGCAGAA:1 - chr3R 29123312 3' + P-element 2882 2 74.26 CCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCCACCTGAACAAATGTGTAGGTATGAGCACATGTATAGACTTATATAGATATATGTATGTGTGTGT:1 - chr2L 16565475 3' + hobo 2642 1 65.35 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGAT:1 + chr2R 17261649 3' + pogo 2068 1 65.35 TTTCTTATACAATTTTACTTTAAAGCTAAAACTACTTCAAAAATATCCAAAAATTGTACTTGCCATAAACCACATACTCGTACACATGGCTGATAGATAAA:1 + chr3R 8448300 3' + TART-B 10187 1 37.62 ATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCTCTGGGCTTGTACATTCTCGGTGTTAATGGCATCGCTTGTGGTCTGCGCCTGCTGC:1 + chr2R 10532584 3' - I-element 5043 1 64.36 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACACGCGCGGGGAAATAAACGGAA:1 + chr3L 20065316 3' + pogo 2050 1 76.00 GAACGCTGAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGACTTAAGCATATCGTCTAACGGATCCTCC:1 + chr2R 4576197 3' - Rt1b 4858 1 71.29 CTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGCAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATGCAATCAAATTGAAATACCGCATTGTATCTGAACTAATTTGCAAATAAA:1 + chr2R 19550994 3' + Doc 4380 1 54.46 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCA:1 + chr2L 5646902 3' - jockey 4699 1 51.49 CGTTANTCAGCTAGTGTGAAAGCGAACGCGAAAATTCATCATTTTTTCTCGGATATAGATAGATATTGGGTTTACTGGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 + chrX 124083 3' - INE-1 535 1 64.36 GTCCGACTGTCCGTATGAACGTTTGATATGCACGAAAAATTATGAAATTTCGCGATCTTACTTTCACTCTCTGTGTAATACAAAACCTGGGCACGGTTTTC:1 + chr2R 14708146 3' + INE-1 125 1 63.37 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAG:1 + chr2R 11528045 3' - P-element 39 1 26.58 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATATATATAAATATATCTTGGGGCTTCAATTGACCAGCTGT:1 - chrX 3817453 3' - roo 37 2 68.32 CGTATGGCGTTACGCTTCTTGTTATTCTGGCGTCTTTGTTTTTCTGCTATGTTTTTGATGTGTGATTTGTC:1 - chr3L 25304821 3' - 1360 17 1 88.73 TTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAGTCGATTACTATAGTGCTTGGCTAT:1 + chr3R 15598708 3' + Max-element 248 2 78.22 CGTGTAGAGCTTGCTATGGTATTTTTAAGGAAATGGTTTTCATTTCGATGGGGTAAAAACGGCAGAGTTTTACCCGCAGCCCCCATTGATATGCATGTTCG:1 - chr2L 4774726 3' - F-element 4447 1 73.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCATTATCCATGTTATATTA:1 + chr2R 12457999 3' + roo 9050 2 60.40 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAG:1 - chr2R 17626483 3' - mdg1 19 2 55.79 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTT:1 - chr2L 12949226 3' + 412 458 2 70.45 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAA:1 - chr2L 14790572 3' - roo 8688 2 55.45 TGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATGTTGTTT:1 - chr3R 4544002 3' - flea 36 2 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTATTTAATTCGACAATTTTTGAACACACACATTTTACTTATTATAAATGAAATTATTAAATC:2 - chr2R 7868877 3' + roo 396 1 66.34 TTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTTAACTCCCGAATATATATATAGTATATAGTGACGTAA:1 - chr4 1183661 3' - F-element 4425 1 66.34 TGTTTTCAACACTCCCTCTCAATGCAATAGTAACCCTACACATAGAAACTCTACTCCAAAGAGGGACAGCGAACTATAAAGATCTACCAAATGGTTGAGCC:1 - chr2L 22101763 3' - Dm88 4350 1 76.24 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAGCTCTGTGTGCCATAATTCATGCTTAGTGTCGGTGTTAAACTTTCAGA:1 - chr3R 25671918 3' + I-element 5329 1 52.48 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTAC:1 + chrX 22711661 3' - transib2 47 1 71.29 AAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCCTACTGCTAACTGCGGATGCTGATGCGGATGCGAATGCGAATGCG:1 + chr3L 2871514 3' + F-element 4675 1 76.24 AAAAATAAGAAAACAATGAAATTTTCTTCAACTCCATAGTTTCTAAATGGTTGCTGATGTAATAAATATAGTAAATAGAAAAGTAAGCTCTACCTTCTTGA:1 - chr3R 25504164 3' + transib2 2643 1 54.46 CGACCCATCGGTACCAAACACCACCCCTCCCTCTAAACCACCACGCCTACACAAGTAGGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCAGCCCCCATCCCTCTTTT:1 - chr2L 16536758 3' + ZAM 7 2 76.24 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTG:1 + chr3R 4544085 3' + flea 5000 2 66.34 CCGCACTCCCTGGCATCTCGCAAGCAACTCCCCCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTATCCCTTATTCCCCTTCGATTTTCCACAAGTCCCT:1 - chr3L 11262022 3' - Bica 37 1 69.31 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCG:1 + chr3R 10147886 3' + roo 9029 1 68.32 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCGGTGGAACAGTGTGCCCGAGCCGGAGCAGGGCCGC:1 + chr2L 285777 3' + P-element 2881 2 71.29 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGC:1 - chrX 15305658 3' + roo 9020 2 80.20 AAAAAAAAAAGAACAAAATAATCGGGTTGCTATAAAAATGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGTCAATTGAAAGGAG:1 + chr2L 21683493 3' + gypsy11 3934 1 58.82 ATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTCGATACTCTATTTCTGACCAAACCCTTTTTGTATTACACAGTTACATTCTAACAAATGACTGTGACTAATACG:1 + chr3R 31194568 3' - Transpac 4918 1 77.23 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCTTTTGATGGCCCACTGACATTTTCG:1 - chr3L 10143145 3' - 297 6596 2 65.35 CTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGCGTAAACAAACAACCGACTTACATAGGCGAACTGCAGCGTTGGCAAAACTTTATCAGCGGCAGGCAGCGGGG:1 - chrX 6417715 3' - Quasimodo 39 2 69.31 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATCCACATTTTATTTTTTATTGTAAAAAAAAAATATTACACATATTTTTTCAT:1 + chr3L 8713168 3' - opus 7023 2 59.41 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCTTTAGTGTAGTACTTTGAATATATCATTACATATGTAACAG:1 - chr3R 14917189 3' - HMS-Beagle 33 2 61.39 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTGG:1 + chr3L 13659957 3' + pogo 2064 1 69.31 AGCGAGTCAGTGAAATTCAAACACCCGAATTGAACTCAAAGTAAAAAGAAAAAGGTTATTCGTGGTAGCCAGTTTGCCCTGGACAGTTTTTAGTTACCATT:1 - chr3L 22302744 3' + rooA 317 2 61.39 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCTCGAATTACTGG:1 - chr3R 22431060 3' - Max-element 8258 2 56.44 TAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAAT:1 + chr3L 23871302 3' - Doc 53 1 68.32 AGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCCATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGGCTGGAGAACCAAAACCAGACTCACAGTCATAGTCTCTT:1 + chr3L 4730280 3' - F-element 4256 1 65.35 TGCACACACACACACACACACACACATGCATACCGGCACACACTCAGACACTCACTAACACAAGGCCAAACACTTACACAAAAAGTTCACTTCAAGTTCGT:1 + chrX 5543795 3' + accord 182 2 73.27 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATC:1 + chr2L 7255800 3' + P-element 2846 1 38.00 CGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACTCCACGATAAGACCGGACGCGGCCGCAGTAACGTCACAAGCAGCACTAAGCTGTGCGTCGAGGAGCTCAAGCTGCCAC:1 - chr3L 2043725 3' + gypsy4 9 2 59.41 GNGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCATACGG:1 + chr3L 18337736 3' - Juan 4027 1 76.00 AACAAAATTACAACAACGAAAAACAAAAAATAAAAAACCATAGTGCAACTACACTAAGCGAGAGGACGACACTACAGCAACATCTCTGGCCCAAAAGAGAA:1 + chr3L 14751883 3' + gypsy9 455 1 61.39 TGGTGGCTAAGTAATTGATTTGCCTTTTTATTTGCGATTTTTTTTTTAGTTTACAACTCGTTTTGTTTGTTCCATGTTCACTGTAGCCTGGCTTGAC:1 + chrX 9876203 3' - Porto1 4457 1 78.35 TAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTGCAAAGTTGGTGTGAACTAATTGTTATAAAGATTTGCTCGTCAAGGGAGAACTTTTGAGGGGGTTG:1 - chr2R 5802689 3' + P-element 482 1 69.31 TGACTGAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCTATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGCAAAACAAAACAAATAAACAGCCAAAGAGGCGCAGACGTCGCAT:1 - chr3L 11001654 3' + F-element 490 1 67.33 TGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAAGTAATCGCATGTGTGTGAGGGATTGTATACCTAATTGATGTTAGCTTTCTTTTTTTTT:1 - chr3L 15063711 3' - I-element 4909 1 67.71 TACATTGTTAGTTGTTAACTACTCCCCCCTCAAGTTTATGACCGTCCTCGGTCATGTTGAAAGTGTCGCCGCTACTCAACTGAGTTCCCCGTTCTAGATTT:1 + chr3L 13790259 3' - gypsy 6986 1 67.33 AGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTATAAAATATGGACAAAAGCATAGGTGACACAGGTGCGCCATCTCGCGG:1 + chrX 7422741 3' - HMS-Beagle2 489 1 86.67 ACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGAAGAGCCCTCGGCGTCCTGTGCAATCCAAAGACTCTC:1 - chr3L 898553 3' - flea 329 1 69.31 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATTTGAAAGGTAAAGGCAATAACTAACTTTTAT:1 + chr3L 18659085 3' + pogo 2063 1 68.00 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTCTTGATTCTCGCTTTTTATTGCATACCAGTT:1 + chr2L 19684058 3' - jockey 4669 1 76.24 TAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGGTTTGATCAAATAATGTGGTTTAATCGGTTTCCTTTCGGCTCGTTGGCTCCCCA:1 - chr3L 18007237 3' + jockey 4958 1 71.79 CTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACTCAATTAGGAACTTAACCCACCTCCACAGATGAC:1 + chr3R 30521742 3' + F-element 461 1 66.34 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAGCATCAAAT:1 + chr2L 20133078 3' + flea 240 2 66.34 CTTCCACCAGAAGTCATTGAAATGTTAGCTGGATCCTTTCGCGAACTCGAAACTGATGTGGTGATGTGTATTATCCTTGTCAGCTAAATTGTATTACAACA:1 + chr3L 6719433 3' - hopper 290 1 76.24 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCA:1 + chrX 3763209 3' - 297 30 2 82.67 AGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCAGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCAATAAA:1 + chr2L 21592747 3' - BS3 330 1 61.39 AAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTTGTGTCCAGACTCAAAGTATTTTCTTACTAAGCAACTGCTGCCAACATTTAAGAT:1 - chr2R 2830931 3' - 1360 3234 1 61.11 GTGATTGTTATGTAATTGTACTTAAATTCGATATTGCCCGAAAGGGCATATTCTCCCCGACCGACTCGCTCCACTTTGGCCGCAATCTTCAGCTTACTCT:1 - chr2R 18294061 3' + X-element 4582 1 74.00 CAGGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTAGAACTTTTCTGCGCCGAAGGAAAGTGTATTTTATTTGTTCAACTTTATTACGTATACGTGCCGT:1 - chr2L 12815795 3' - hopper 1054 1 74.00 AACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAAT:1 - chr3R 13582242 3' - BS 5045 1 73.27 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCGTCCTTCTCGATGAGAAGTTGCAA:1 + chr3R 10147909 3' + roo 9052 2 62.38 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAAATAAGCACTTAAATTATTAAAAACTGCTACATATCAGAAATCATATTTCTTTTTTTAAGGCTGTT:1 + chr3L 8614586 3' - opus 7 2 73.27 GGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 7603 2 50.50 ATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGCGCCAACGCCGGCGAAACTGGTTGAACCCGTTGGTGTGCTGCTGTCCACGCTGTTTATCTCACTGTTGCACCTGCTGTTT:1 + chr3L 5101777 3' + R1A1-element 464 1 42.57 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGATTAGCTGCATAGTCTATATGACCTCCGCCCCTTTTGCCCAAAAGTATGCA:1 - chr2L 3968990 3' - jockey 35 1 50.50 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGGACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCT:1 - chr2L 17722798 3' - blood 44 2 76.74 TTTAAATAATAATAACATTAAGACAGTGCAAAACGAATTTATGGCCGTTACGCGTCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTTTTATTGTTTCGCTATCGCGCTC:1 + chr2R 4194234 3' - 1360 309 1 74.26 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATTCATAATTTTAGCTTACAATATTTTTGTTTTGTATTCTTAGAATCGTTTATGCCTTTTGC:1 + chr2L 21174315 3' + roo 394 1 65.35 ACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGTGGGTTTAATGAACCTTGCCCGCAGGTTAAGAACTCCAAAGC:1 - chr3L 27362090 3' + 1360 480 1 57.43 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAG:1 - chr3R 19449995 3' + roo 9027 1 70.30 TCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAAACTACCATTAGCTGGGTAGA:1 - chr2L 19525447 3' - FB 25 1 75.71 TTATTAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCAAATTGGAGTCGATGGAATACAAAATCATAACAGATATAAACTGAACCAGCGAATAG:1 - chr4 141886 3' + INE-1 91 1 58.16 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCT:1 - chr3R 27156648 3' - pogo 38 1 68.32 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCTATTTTTCCTGGTTTCATTTCTTTCCCCATTTCGCAATGCAAAAA:1 + chrX 19162670 3' - pogo 30 1 58.42 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGG:1 + chr2L 12949293 3' - 412 7069 2 61.62 TAAATAAAATTAAATTTAATTATATTAACAATACCAAATTCATGGAATACTTTTAAGAGCATAACAAATTCCAGTATTTTTTAAATTATTTAATGTACTTT:1 + chrX 21505837 3' + TAHRE 42 1 67.33 TTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGATAGCAATACAAATGCAAATGCTCAGA:1 + chr3R 31257034 3' - transib2 48 1 72.28 AACTCGAAATGTGCTTGTGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTATGTACATATGCATACATATTCATATATTTAGTATCGTATATTATGTATAATTATAA:1 + chr2R 5412764 3' + Tc1 1622 1 60.40 AAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAATTTTTAAAAAATTATTAAAATTA:1 - chr2L 11922473 3' - BS 5070 1 75.25 CATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAAAATGCATACATTATAAATACATAGTTATCAAATAGTATGATTCTTGCATCGCATGCATGGGTCTGTC:1 + chr2L 17647734 3' + invader4 2806 2 71.29 AAAAGAAGCGGGCCAAGATGACTCCCTTGCGAGTCGAGATGATGGTGGCCGGGAGACTGGTGTTGGAGAGAGGATTGTGTTGTTCAGCTCATTTCCAATAA:1 - chr2R 1317302 3' - Q-element 500 2 73.27 TGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCAACAAATCCGATGACCAGGAACTGTATAAGCAGAGAGATCCTTCCGTGACCTCGGAGTCAAAG:1 - chr3R 12076970 3' + Doc 4456 1 69.31 CGAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCACAACTTCTTTCTTCAACGAGCAAACAACAACTCTC:1 + chr2R 4023428 3' + Doc2-element 317 1 67.68 GTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAAC:1 - chr3L 10081923 3' - rover 6967 2 61.39 TCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTTAAGAAATTACACTCGGGCAAA:2 + chr2L 16948758 3' - jockey 4673 1 78.22 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCC:1 - chr2L 12815041 3' + hopper 1382 1 56.44 TTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTGTTTTATTGTTTGCACAATAAAACAAAACGCCGGCGAGAACCCACTCGAACATATAAA:1 - chr3L 9767955 3' - blood 332 2 57.43 TCGGTNAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAAGTGTGCGTGGGCGTCTCTGTTGTTGTTGTGGTTTTCCCACACGGC:1 + chrX 6657352 3' - P-element 28 1 52.48 TACCTNAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAATCCTATTTCGATTTTGAAGTTTGACCCATTAAAGCAAA:1 - chr2R 9770189 3' + I-element 5319 1 57.43 AACTTNACCTAATGTGTAGCTTAAAAGATATTATGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTACACATATGCACCGTGGACGTCTGTAGCTCGGAATCGAAG:1 - chr3R 5561220 3' - G5A 2783 1 74.75 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGGTAGTTAAAGTGCCTGCGTAAAACGCTCTT:1 + chr2L 11703286 3' - Tabor 48 2 69.31 TACGCNTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:1 + chr3L 23456279 3' + 1360 3382 2 68.32 AGATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAA:1 + chr2L 14612097 3' + roo 9037 1 53.47 AAAGCNCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTA:1 + chr2R 4483261 3' - Ivk 40 1 60.40 ATAACAAAAAGGAGACGAAGAAACATAAAGAACAAAAGTAGAGACAACCAATACTACAACATTAAAATTCCACAGTTTTACCAGTTGTGACGTCAAGCACA:1 + chr3R 16352574 3' + HeT-A 251 1 66.34 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATAGATCTCCCATATTTACATTTCAAATAATCTTTAAACTGGCCAAAATT:1 + chr3L 3032313 3' - opus 7024 2 56.00 GACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCGCCATCACCTGCTCTTCATCAGTGTCACAGACAGCCGAAAAGTATGCAAACATTTTTC:1 - chr2L 20238653 3' + hobo 2925 1 63.54 TTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCGATTCCGGGACGAGGGACGAGCAGACGTGAGTCATGGAATTTACAAAATAATTCTTGCACATCGTT:1 - chr2R 23087289 3' - jockey 4734 1 72.28 GAAGTGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAACGGTGGTAATATATTTCCC:1 - chrX 15746316 3' - jockey2 3251 1 70.30 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCT:2 + chr3R 12047460 3' - Stalker2 54 2 76.24 AAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAAGGAAAAAAAGGGGAAAATACGAGAATAAAAGCAGACAGTCGAAAAAAGAAAATAAAACTCCAAAAAACTGAAGCGGA:1 - chrX 3310466 3' + Doc2-element 230 4 72.28 CTCGATTATAGCATCCTCTCTTGTTGTGATTTACATGAGGCATAGAAAAAGAAAAACTGAAGTAAATTGACATACATTTACTTGGTAAAGACCAATCTAGG:1 + chrX 22633822 3' + INE-1 577 1 62.38 TTTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCG:1 + chr3R 10277271 3' - Doc 58 1 72.28 CGCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTACAATTATTTTCTTTTGGTTTGGTTTATTTGAATTTAATTATGAACTGTATCACTGGGAAAGACAATG:1 + chr3R 15007632 3' - HMS-Beagle 267 2 63.37 ACAGATACCAGATAAAAATAAGATTGTCATACGATCCTCGAGAGTGGAAAAACACCAACTCACACATACACACTCGCATATAAGTTCGGCAGATACGCATA:1 + chr2L 18403840 3' + Idefix 6920 2 58.42 TTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTC:1 + chrX 2799692 3' - Tirant 38 2 65.35 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGAAGTTCTTAAACTTCTCGCTATCATGGCAC:1 - chr3L 13479916 3' + P-element 2781 1 33.66 CGTTGTGAAAATAATTGTGATGCGACGAATCCAAATCCAAATCCAGAGCACAACTAACTCATAAAGCCAAGTGCAACTTTTACAGTTTTCTAACCAGGACG:1 + chr2L 17758650 3' - Bari1 238 1 75.25 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCG:1 - chrX 17968340 3' - Tirant 11 2 70.30 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTAAAACCCTCCCCCAACCGTT:1 - chr3R 10734249 3' - 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chr2L 315105 3' - Tirant 8107 1 79.21 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAAT:1 - chr2R 24628771 3' + mdg1 377 2 71.29 AAAGANACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATAATTTACTACTATTTACTTGTACGTTTTTT:1 + chrY 536721 3' - Doc 23 1 50.50 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGA:1 + chrX 2649874 3' - Tirant 8155 2 71.29 CAGACCACTGTGCACGAAAACACAAAATCATAACTTTCATAATATTTATTAAAACCCTTTTTAAATATTATTTTATGGATCGCTGTTCATTTCTACTGTGT:1 + chr3R 27400666 3' - Cr1a 400 1 72.28 CCAGATAAATAAATATAAATAAAATAAATATAAATTTAGAATTTATATGCCTCGGCATCTTTATGTCTTTGTTTTTGTTGCCAGTGCTGTTGGAATACG:1 - chr2L 14931034 3' + Tc1-2 478 1 59.60 AAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCCAACGGGACGAATTCCGTGTTTGGCCGGCTTGATTAAT:1 + chr2R 11519141 3' + P-element 17 1 42.57 GCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATTACAACTACCTTAACCCAAACCTTTTCCTTTCAGGATGAGCTCATCAAGCAT:1 + chr2R 14350907 3' - Max-element 8457 2 63.37 GGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGCATTGTTGGGCGAACTTTGAAAATGCAAAGCAAATAATTTTCACAGTGTGGCCCAGTGTTTCCCCCACTACT:1 - chr2R 9769807 3' - I-element 4984 1 76.24 TTATAAATTAAAAATTACGTAAGCCAGAACGCTTGACTGCCTTAAATTCATTTGGCAATGGGGGGAAAATATTTCTATGTAGGTGATTTCAGGCAAATTAT:1 - chrX 16773970 3' - blood 6928 1 32.67 GAACGNAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATAATATATATTTGTTTTTCGACCCAGTGTGTATATCAGCAGAGCC:1 + chr3L 6506878 3' - roo 33 2 61.39 AAAAGNCTCCACCCTCGATCTCGGACTTAACTCGCGTGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAAATGGCCAATTAAGCGGCAAAAATGCGAAAAGGTTTA:1 + chr3R 6117326 3' + Tirant 388 2 68.32 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATTTATATTGACGCCCACACTATCGCCCAAATCTGCCGCGAACAATCTTCAAAAAA:1 - chr3L 23123513 3' + flea 248 2 67.42 AATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACCCCACCTGCTCTCACCTGGGTACCCC:1 + chr3L 14284889 3' - accord 184 2 94.34 TGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGTGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCATGGGTGTCGGGGGTCGCAAGCTGCGATTT:1 - chr3L 20397913 3' - Doc 474 1 70.30 ACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATTTATTACATATGTAATATGCATATATTATGCACTTG:1 + chr3R 19132325 3' + Ivk 5336 1 65.35 TTCGTTTTTTTTTCTTCTTGTTTTTGGTCTACATCATGTTTCATGTTTTCCATTTAATTTATGTGTTTATCGGGTTCTGAGCTGCCGAGTCTGTGTATTC:1 - 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jockey 4802 1 65.35 TCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTACCAGAAAAACAAAACGAAAGTGAGTGAGATGCTGATACCCAAACTC:1 + chr3R 25560901 3' + F-element 488 1 71.29 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGA:1 + chr2L 14612092 3' + roo 9032 1 61.39 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTTGGTGTCGTAAACGGTTTGGTTAA:1 + chr2L 20824683 3' - pogo 28 1 55.45 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGGCCCCCTGCCACGCCCCTTGGCGAC:1 - chr3R 6117205 3' - Tirant 8111 2 74.26 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTGCAGAAAACCGCAAACTTATAGTATTTACCTACAA:1 + chrX 22711667 3' + transib2 2783 1 67.33 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCA:1 + chr2L 15808043 3' - I-element 28 1 48.51 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGTATGTATGCCATGTTTTTATATATGTAAAAATTATCATGTTATTAATTTTGTGATACCGAAACGTACGA:1 + chr3R 27156742 3' + pogo 2097 1 76.24 GTAAAGGGTATCTGATAGTCGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTCTTTTTTTTATATAATTTTCCATACATTCTTTAACAGATTTTACGAAAATATTAA:1 - chr2L 15004793 3' + INE-1 551 1 77.23 TATTGTGTTTGAGTAAAAAAAAAAGGGATATTGTAGCCGACTAACTGATACCGCAGTTAGATATAGATATAATAGATAATAGATATATCAAGCTGAAAAAC:1 - chrX 7061461 3' + Stalker2 494 1 50.50 AATCTCAGGAACTATAAAAGTTAAAATGATTAGATTCGACATGCAGATTCCAAAAATAGTCCTGGTATTAAAATTTAAAACTGTGTTTTAACAATTACAAA:1 + chr3R 4166522 3' + INE-1 150 1 57.43 GTTATATGGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATCCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCT:1 + chr2R 4802885 3' + mariner2 275 1 37.62 CACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAA:1 + chr2R 5840690 3' - Ivk 32 1 53.47 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGGAGACCCCGAAGGCAAGAGAAGCAGCA:1 + chr3R 11846272 3' - hobo 50 1 71.29 AACTGNGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTCAGCATATAATCAT:1 - chr2R 13650112 3' + mdg1 7422 2 60.40 CTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTACATATATAATACTTATAGTATTGGAACACTACTAAATATTTTCTTGCAGTGCATACGCGACTTCAAACATAA:1 - 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chr3R 8477680 3' + P-element 2879 2 68.32 ACCCTGGTGATTTGGTGCACACTGACATACAATGTCATCGCTCTACCATCCAATTTTCATAATTTTCCATTGTGCGCATTTAAATTCATTAAAGCTTCTGC:1 - chrX 12291482 3' + X-element 294 1 78.22 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTT:1 + chrX 13546698 3' + roo 9033 1 64.36 GGATGGGCATGAGTTTAATATGTGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGCGAAATTGTCCAAGCAAATTTATAGTTTGCTCCAGTG:1 - chr3R 23694608 3' - I-element 5045 1 63.00 TATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGACTTATGCAAATATTGGAGGAGTCATTCTGGGCGCCAACGTCAACTTCAGCGTTATAGCCA:1 + chr3R 10916004 3' - I-element 5123 1 67.33 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTT:1 - chr2R 18950762 3' + roo 354 2 79.21 AAAGTAAAGTAAAGTAAAATAAAAATAGTAAGGATCTAAAAATCAAATTAATTAATTAACAGGCAGTATAGAATGTAACACACTTA:1 + chrX 14294856 3' + TART-A 13132 1 80.23 ATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTGGCGAATTGTTTACAGCAGCAGGAAATTCGGTGAGTTTTTGTAGATATACAATCTTCAC:1 - chr3R 24140127 3' - diver2 321 2 62.38 TATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTAATTTTTCTCCTCTTGTTTTTTTGTTTTTGCAATATTTTGAATTTCTTCAAT:1 + chr2L 7862328 3' - Stalker 6914 4 54.46 CAACATTTCCCGCAGTCAAGGCCTGCGGTATTTTGATATTTTTAAGTCTATTGTTCAGATAGTTTTAGCGATTGCGACTCGTTTTTGGCACCCTGCCGAAT:1 - chr3R 23343334 3' - baggins 434 1 56.44 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTCGAATGTTGCGTATTTCTAAAATCATATTTACCAAGATGTGTTAGG:1 - chr3R 12605570 3' - F-element 16 1 78.22 TGTTTCGTTTTCATGCTAGCTCCTAAGTTTGAATTCTTGTATTTTATATTCAGTTCTGATTTTGCCAATTGAAGCGGTAAACTCAATGCAACAAGAAGTCT:1 - chrX 4079535 3' + gypsy2 150 2 63.37 AATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTTATCTTATAGTCG:1 - chr2R 5883588 3' - HeT-A 379 1 39.00 CCGTGATCTGTGCGAGATAGGGTAATCTTAAGCTTTCTTTCTTTGTATTACTTAGTTCTAAACTGACAGCCGAAATCAATAAATTTTTATTTTATACAAAT:1 + chr3L 25551811 3' + Chouto 80 1 75.25 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCG:1 + chr3L 12888284 3' - 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mdg1 7088 2 74.26 TAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATGTATATGTATGCATATATATTCGCTTTTCGCCTCAATTTATGCTCTGCAAA:1 - chrX 5129474 3' + Idefix 7366 2 60.40 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATT:1 - chr2R 24021573 3' - pogo 36 1 65.35 CATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATCCGTTACTGTCGAGTAAGCGGTCAGCAAAAGAAGAATCAGTAGAGACACTCTAGCATAT:1 - chrX 1678136 3' + gypsy4 6430 1 62.38 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCT:1 - chr3R 10952255 3' + roo 391 2 59.41 GATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACCGAAATTCCCTTAGGCGGGCTTGGT:1 + chrX 20620619 3' - pogo 19 1 60.40 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACCTTTAACTTTTGGCTGATTTCTAGTGCGGAAATCGCTCGTCGAAGGACCTCCTCCC:1 - chr2R 11042135 3' + P-element 2791 1 62.38 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAGAGAGAACAACGGTGAAGCACTGCAGAAATT:2 + chr2R 14713672 3' + P-element 2868 1 62.38 AAATTCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGTGTATTGTCCGTTA:1 + chr3L 25842200 3' - 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Burdock 48 2 77.00 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTAACTCGTGTAAAAGTCTAGCAACAATAT:1 - chr2L 2060107 3' - 412 12 2 67.33 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGAAATGCAGCATAC:1 - chr3L 18500929 3' - hobo 12 1 65.35 AGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGCGAGACAAAAGGAGAGAGTCGGCAAGTGCAAAATTTGAAGCACGACTTTTGCAAAGGGGAGCACAA:1 + chr3L 16410493 3' - blood 188 2 74.26 TATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCATATTCACAGATTCATTTAAAGGAATGTAATCTCCACAATTTTCAAATGAAATTTAGTTTTTAGTTAGAAATATGTC:1 + chr2R 21710111 3' - Tc3 237 2 78.22 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAG:1 - chr2L 7488851 3' - roo 26 2 54.46 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATAGTAAAGCCATTGATACTGCATTTCAGCATATAATCATCAAGTTTACAGCTTAATTAACAA:1 - chr2R 13650089 3' + mdg1 407 2 65.35 TATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGAGCGTGTATATGAGCTCTGTCAAATGTATCGACCGAGTAAAAATTTACATAGCATCCGTTT:1 + chr2L 17311166 3' + S-element 1701 1 62.38 TTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTTAGTTCCCTTTTTATATATTTTTATATATTTATTTACAAAATAAATGGGCGAATGTAC:1 - chrX 17057923 3' + 297 380 2 69.31 TATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCA:1 + chrX 5129535 3' - Idefix 45 2 76.24 TTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCCATATATTTAAACCCATTCTTCCCAATAATAGTAGCCAGTTTTATTTTATCTTTTATTAAGATGCTTTT:1 - chr2L 9163696 3' - copia 9 2 75.25 CCACTCGATTGCTAATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATGGCAGCAGAACAAAC:1 - chrX 16995082 3' - jockey 15 1 70.30 TTTATTTTATTTTATTTATTTATTTATTATTTTTTTTTTGTTTCTTGCGACCCTGCAGCTGACATACCAGCCCAAGTTCTAGGA:1 + chrX 2548220 3' - HeT-A 1 1 85.71 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAG:1 - chrX 20806857 3' + opus 478 2 59.41 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATAAGTGAACGAGGGTGTGGGAAAACGAAATGGCTAA:1 + chrX 19116926 3' - opus 34 4 66.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAAATAT:1 - chrX 10827397 3' + roo 393 1 61.39 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACA:1 + chr3R 20149758 3' + 1360 3382 2 60.34 CTAGTCGTCTGGAATGCGAACGGCCTGCAGAACAGCAAGGCCATAGTCGAGCACCATCTGAAGACCCACCGAACATAGAAACTCTGCGGCGGCCCAACTGT:1 + chr3R 29331248 3' + G6 1623 1 69.31 CCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAAAATCCGCCACTATGACCGAGCGATCTTCACGCACCAGGCAATTCATTGAGT:1 + chrX 12588250 3' - R2-element 3372 1 59.00 CTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAATTGACTTTCACGGCATATACACGAAAAGTTACAAAAAGTTTAAAAACTATCTTCCAGCAAGG:1 - chr2L 12750759 3' + I-element 4874 1 63.37 TTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAAT:1 - chr2L 11922495 3' - Tc1-2 478 1 53.47 CTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCACGGCCCATCTATGGTGTTAGGCAGCG:1 + chrY 472521 3' + Doc 395 1 75.25 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACG:1 + chr3R 24081596 3' - 297 6628 2 79.21 AGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTATATACCCAAAGTAAATACCCTCGTGGTAATTATATATTTAATAAAAACAAGAGGAATCGTTACAGTCAAACATTA:1 - chr2L 22079545 3' - gtwin 3 2 74.26 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCAC:1 - chr2R 4606232 3' + 1360 3346 1 75.00 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTT:1 - chr3R 13582223 3' - BS 5026 1 54.46 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACCAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTG:1 + chr3L 18501009 3' + hobo 2934 1 52.94 TTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCTCGATTGAATGATGTTTTCTGGGCTCC:1 + chr2L 12815129 3' + hopper 1403 2 69.31 CTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAA:1 - chrX 21472693 3' + P-element 391 1 20.79 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCTTTTGATGGCCCACTGAC:1 - chr3L 10143152 3' - 297 22 2 58.42 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTACTTGTCAG:1 + chr3L 17168903 3' - mdg1 8 2 42.57 CATACAAATTTTAGGCGTACAAAAAATGACCAGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAAAGGGGTTGGCTGGGCGATGGCAGAGCTCGTGCGGCACTCCCGA:1 - chrX 3271741 3' + hobo 2682 1 57.43 CCACTTGGTCACTTCAGCTATAGTCTCCGATCGTGGCCGACGGTGCCTTGCCAGCGGGAGTCGAGGAGCATCTGCAGAGG:1 + chr2R 17809634 3' + Chouto 373 2 63.75 CCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGA:1 - chr2R 13644438 3' + Burdock 6350 2 69.31 CCTTGACCACACCCCAAACTTCCTCGATGTTATTGGGTTTGGCTTCAGAAACCTTTTTTCCTCGTCCGCCCAAATGTTTTCGATAATGGTAATGACAAGGG:1 - chr4 1169922 3' - Tc1 1226 1 75.25 GTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGGAAAAAGAAATTCCAAGCTGGGCGTTTGCTAAATCGCCTCTATTCTGAGTAAAAGCAAG:1 - chr3R 4605767 3' - INE-1 561 1 53.47 ATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAGTACTAGATTCAACAAACTGCATTT:1 - chr3R 26535903 3' - blood 363 2 75.25 CATTTTTCTAAAGTGTGGGCGTCGCAGTTTTGTGGACGTTAGAGTGCGCGTGGCCGTCCAGCTCCGCTGTGCACAGTTCTTGGGGCTCACGCGACAGCTGA:1 + chr3R 4350510 3' - INE-1 254 1 53.47 TTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCATTTAGGGGTATCATGGCTAATTGTGGCTTCCACATTTTGTCATTTAACTGGGGGGGCTCAATTAGTGCTCCT:1 - chr3R 16938829 3' - F-element 4568 1 79.21 AAAGTGCTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTATTAAATTCGTGCATGCGGATTTTCTTTTCAAATATATATAATTATAATATATATGGAAC:1 - chr2L 13574187 3' + pogo 2089 1 58.16 CAATCCAACAGACATAAACATCCTTTATTGTTTACCTCTCAATTTTCTCGATCCCCCACCATCCGCAGGCATCCTCGACACCATCCTGAGTGTCCAGCCTA:1 - chr3R 9654000 3' + Quasimodo 294 2 79.21 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAG:1 - chr2L 12815046 3' + hopper 1377 1 61.39 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATA:1 + chr2R 6173082 3' + pogo 2079 1 58.42 ATAGANAGGAATTGGATAAAGCGTATTGAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACCTTTCAATAACAGTTAGATCCGTACAACTA:1 + chr2R 1265942 3' - accord2 7309 1 68.37 GTTATTATTATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGCGACCTCCTTAATAGCCGATTG:1 - chr3L 18284569 3' - mdg1 7059 4 66.34 GGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCACGCAAAAAACAAAGTTCTATTTAATAGTGAATAATTTTG:1 + chr2L 2930433 3' - Cr1a 298 1 72.28 GACTGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATAGATGGTATATGAATATATATATATATACTTCTGTATGTTCTTTTTTAAGAGGATTATGGTCTTCG:1 + chr3R 29551444 3' - Tc1-2 1299 1 75.25 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCC:1 + chr2L 16884890 3' + pogo 2069 1 59.41 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAAATGGTAAGACTGTTTGTTTTTACCAT:1 + chr2R 21073924 3' - 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mdg1 7043 2 64.36 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATATAAAAA:1 - chr2L 14790581 3' - roo 30 2 59.18 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTATATGGCATTAACAAGTGTTGCTGTCAGTGATGAGCAAAA:1 - chr2L 7800061 3' + P-element 2849 1 41.58 CGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGCGAAATTTTAAGATTTTCTGGTATATCGATAGATATTTGGGAACAAAATGAGAAAACA:1 + chrX 20806209 3' - INE-1 550 1 87.13 GAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGCCCGC:1 - chr3R 12047399 3' + Stalker2 400 2 70.93 CAGGAACTATAAAAGCAAGAAGGTAGAGATTATGCATACATATACCGTTGCAACTATTCGTCTTGCCCACTATCACCCCCAAAAACTTCCGAACTCCTCCA:1 + chrX 18575758 3' + INE-1 155 1 56.44 GAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGATACCCATGAGAACAGAAACGCCGGCGCCGGTCCATAGGCATCCATA:1 + chrX 14588079 3' + opus 345 2 57.43 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGG:1 + chr2L 14790623 3' + roo 350 2 81.19 TATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATGTAAATCTAGACGTAGGACGACTTGGCACGTCTTTAATCTCGC:1 - 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chr3L 10143622 3' + 297 6819 2 79.21 AAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCTCCACAGGATTATGCATGCAGAATTAATCTGCGCAGCAATCCCGACGAAGGAACCCAA:1 - chr3R 10273958 3' - Ivk 99 1 68.37 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGGGTTTAGGATGTTATGGGGGCAGGGTGCGAACATTCTTGTTTAGCAACTGGTGGGTCGTCATCTTGGTCGATTTTT:1 + chr2L 6770637 3' + Tc3 312 1 56.44 AATAATAAATAATAATAATAATTAATAAATTAATTTAATTTATTACAATTCCCTTTTATTTAAAATTCGTTAGAACCATAAGAGAACAAATTTAAAACAGA:1 - chr2R 4879088 3' + flea 5003 3 61.39 AGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGGAAAGTTATCCAGCCCGTAAACATAGCACTATACCCCAGTTTATAAACAAATTTGAAATACCG:1 - chr3R 1362129 3' - 1731 300 1 68.32 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAGATACTTT:1 - chr2R 23584729 3' + HMS-Beagle 7021 2 53.47 TTTTGAATGTCCCTTTATGTTTTTCCTTCCTTTCTTAGCTTATGAATTTGGGTGGAGTTTCTGCTGCCAATTCATCAAGTGGATTGTCAGCCATCCGGCAT:1 - chr2L 21671003 3' - HB 418 1 57.43 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGA:1 + chr2L 285740 3' + P-element 2844 1 36.63 CCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTTTTCCAATTTCTACTCCCTCTATATAGGCGTGGTTTCGTTTAGCACCACCCAC:1 + chr2L 3193376 3' - Transpac 454 1 70.73 GACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGG:1 + chr2R 2994304 3' - gypsy8 119 2 45.00 CCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAAACTATGATCGAGGGGCAAATGC:1 + chr3R 16400250 3' - blood 7013 2 76.77 CTGAGCTATTCAATATCTATTTCACTGAGCTATTACTTATTACTTATTTTATTTCTCTTCTTTTTTCTTTCTTTTGTACATGTTTCACCTTGCGCGCCGTG:1 - chrX 12737380 3' + Stalker2 374 2 57.43 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAG:1 + chr2L 16884903 3' + pogo 2082 1 58.42 TCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACC:1 - chr3L 25889016 3' - gypsy8 311 1 72.28 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATGGATTAACGAAATATCCGTAACAAAATGAATGTATCTTGCAAATAGATACTCGTAA:1 - chrX 7993548 3' + Juan 4194 1 60.40 GGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGTTGGTACAGAAAGGTCATTGTAAATGGATTTTCTATTATTAAACGCTAAATGCTCGGGACATATTTTCT:1 - chr2L 15963843 3' + Quasimodo 253 2 68.32 TAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAACTACCACAAACACAATTTAAATGTGAATG:1 - chr2L 13333995 3' + flea 249 2 65.35 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACCTATTATTAAACGATTTTTTTAATTCCAACAAAGGAAGAATTAGAGCTTTTGGATTAAC:1 - chr2R 694084 3' + flea 5002 2 68.32 TTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGAGTGGTCCGTT:1 + chr3R 27801343 3' + Burdock 6355 2 65.35 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCACCGAATTATGTGGCATCCATTGT:1 - chrX 20047536 3' + roo 398 1 62.00 TTTCTAGTGAATCTACTTGAAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAATTCGGGACTCTGTAGTAGCTTTAAGTTTCTGTGATTGGTTACTCATGGTAAAGA:1 + chr3L 23400248 3' - Cr1a 4110 1 57.43 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCATACATACACTTGTACCAGTACCGGTATCCTCATGCGTGCCATTACCTAGCAGGAAGTGGTGCT:1 + chr3R 17929044 3' - hobo 12 1 67.33 TTTGTTTTTTTTTATTATTTTATAATATGGCTGCAACTGTTATCGTTCG:1 + chrX 17176114 3' - Rt1a 5072 3 91.84 TCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTA:1 + chr2R 21773607 3' - Max-element 9 2 50.00 TTTCTTTTTCCTTTTTTTTTGGGGCTCTGCTTTTCCATTTCC:1 - chr3L 18965827 3' - Doc2-element 232 1 76.19 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAATAAAAACCCTCGTTTATCAAAACCCAGAAGGAAGGAT:1 + chrX 22444504 3' + Juan 4169 1 65.35 TGAATNTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCT:1 + chr3R 4604451 3' - INE-1 166 1 72.28 CATCAACTACTCTTCCAATCTTACAGTACACGAGTTACCACATCAGCAATTTCTACGCCAACTCCCCCACCCTCTGCCGTTTTTTTCGTGCTTTTGTTTTG:1 - chr3L 21013646 3' + jockey2 51 1 71.29 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAA:1 + chr2L 20133058 3' + flea 4979 2 66.34 ATAAGNCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCATTAACTCAAAAACTTTTCCGCGCTGCGTTTTAAAGGGGGCCAA:1 + chr2L 6502968 3' + Stalker4 175 4 56.44 AAAATTAAGTAAATAAAATGTATATATTAAGAAAATTCAACTCGATTCGGTGCACACTTTTGGTAAAATGTAGAAACCTTTATATGGATTTCCATTAATCC:1 - chr2L 7437074 3' - accord2 430 1 35.64 CTGAANTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGAAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTCG:1 - chr3L 11553498 3' - P-element 47 1 26.73 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAAC:1 + chr3R 7168641 3' + flea 228 2 60.40 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATT:2 - chr3R 11263397 3' + roo 9037 1 61.39 AATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCTTGAAATGAGTTGAAAAAGTGAAAAGTTAAGCGAAATGAAAA:1 - chr2L 14579833 3' - copia 36 2 63.37 ACGGCGGACCACCGCGGTCGGTTTTTTTAAATGTTTTAGTAGAAGAAGGCGGGGATAAAATTAAATTATTATCTTTAAAACTAATAAAAATAAGTGAACA:1 - chr2R 19477715 3' - Tom1 44 1 77.00 AAGGTNGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCT:1 - chr3R 19346916 3' + blood 7335 1 79.21 AGGTGAATTGAATATTTATTCCAAGTGCATGACACAAA:1 + chr3L 20921304 3' - G7 1081 1 78.95 GCCGCCAAATCCCAGCTCAATGTGTGGTCCAGTCGAGAGGTGCACGCCACGCAGCCTACGTCTTTATTTATTGTTTGTTTTTCTTTGGTCAACTGCTACCC:1 + chr3R 801969 3' + G5 4414 1 55.45 CGTTGACCGGCTGCGCCAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTGGATGGAGGGAAAGGGTTCGTCTTAAGCCAAGTGAACTGTGGGGAAATTTGC:1 - chr2R 22278158 3' + accord2 7420 1 59.41 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCC:1 + chr2L 20706744 3' - mdg1 7054 2 63.37 AGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCTAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAGAGTTT:1 - chrX 21097036 3' + INE-1 156 1 72.28 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCCAAGTCGGGGACCGAAGGC:1 + chr2R 5804550 3' + P-element 2872 1 65.35 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGCATGAAGCTTCGTATCTTGAGTTTTATTTTTGGATGGGCGGGAAATCCTTTTAAGTGTTTA:2 + chrX 15292571 3' + Quasimodo 7361 2 74.26 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTCGTCGGACTGGAAGG:1 - chr2R 23571622 3' + roo 389 2 58.16 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAAAAAAACAAAAAAAAAAATAGAAATCCACTCTCCACTCTATGCAAATTCTATCATAATGATAACTCAAATAGC:1 + chrX 8684313 3' + opus 499 1 75.00 TCATATATCGGCTCATCTATATCCAGGTTTGGAATTAAGGCAACCCCATTGGCCTGACATAGACGCAGCGCAATTTTGTTTTGTTGACCCACGTTGCCACG:1 - chr3L 23702893 3' - Bica 4883 1 62.38 CGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCCACTCAAAATAAATAAAATCCGGTTCAGATACCATAGTATCTGAT:1 - chrX 17057388 3' - 297 6643 2 55.45 CGCTTNGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGAATTCAGCGAATTATACTGTACTTTAAAAAACATGGGAGATAGATGTATTTTAGCTACTCGAAATTATT:1 + chr2L 20824997 3' + pogo 11 1 50.50 CGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAAC:2 - chr2R 3591981 3' - Quasimodo 28 2 62.38 AAATACTTCACTTTGCACTTATTACGATCGATCAGTGTAAGCCCTTTAAAGAAGTTAATATTAGAAGGACATACGAAA:1 - chr3R 25076899 3' - gypsy4 451 1 75.64 GTGGGACAATGACTTATAGGGCAATAACTTGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTTGGGCACTGGAATATGTACACGAAGTGAGCTATCAGAACCTTCAAAA:1 - chrX 21933235 3' - HMS-Beagle2 8 2 66.34 TGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCACTGCAG:1 + chr3R 22800182 3' - flea 39 2 70.83 TAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATATTGGGTAAACAAATGAGAAAAAATTAAAATCATAGAACATTATTTTCCACCGACAAGT:1 + chr2R 5319962 3' - INE-1 524 1 69.31 ATAACGTACATTTTGTATTTGCTGAAGGCTGGACATATTGATTTGGTATTTGTTGTAATGATGTTTTCTGATCGTCAAACTGTTTTGTAACTGTTTGCACC:1 + chr2R 4692842 3' + invader5 3716 2 53.47 AAAATNGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCTGTTTTTACTCACACAAGCAAAGGTTTTTCTACTCTCTTACTCACTCGCACC:1 + chrX 9443196 3' + 1360 3200 1 71.29 TTTGTTTGCTTAAATACATTTAAATTATTGAATAAAAATTAGATTTAATCATTTTCCTATTACAGTTATTAAAAGTTGACCAAAGTTTCCTCAAGGGTTAA:1 + chr3R 23674713 3' + Bari1 302 1 72.28 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATATTTAGTATATAAACTCATTCCGTTTGGTTCAATTGTCACGTAGT:1 - chr2L 12474958 3' + mdg3 223 2 53.47 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTT:1 + chrX 5092990 3' + roo 9036 1 58.42 CAGCTTTAAAATTTCAAATATTCGATCTCAGCTTCCTTAACTTACATGCATAAGCATGTACAAAAGGCCAATTAAGCTACAAATTCATT:1 - chrX 13786703 3' - FB 31 1 87.64 GCATANGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATATCTACACTCGCAGCGG:1 - chr3R 9551425 3' + P-element 2851 1 43.56 CTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTAAGCTTATGCTATTCAACCTTTTTTGTGGCTCTGCTAGAAAAAGAGACATTTCCCCATTCCTTATCCGATTGCAA:1 - chr3R 10925950 3' + INE-1 577 1 70.30 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAACCTACTAGGTACAAGACTGAGTGTGCTTTACAACACTA:1 - chr3L 4122431 3' - P-element 36 1 49.50 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTTATATTTATATTTTTATATTATATTATAAATATT:1 - chr2R 2044183 3' - Tabor 6882 2 64.36 CTATTATATCAACTTCAAAAATACCGTATAAACTGGAAGTAGCTCGACTTATTTATAAACATTTGTTGTTACCAAGCTGATCTCGATATCTATTTTGATTA:1 - chr3R 25737730 3' + Stalker3T 326 1 73.27 AATAGNTCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCGTAGTTTTGGTAGTTTTGTTACTGTTTTTATATTGTACC:1 + chr2R 13404007 3' - BS 33 1 61.39 AACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAA:1 - chr3L 25232775 3' + accord2 165 2 59.41 TCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGGCTGGTTGGTTGGTTGGCTTTCGGCTTTCACATGGTTAAAGCCAGACATGGACTGCTT:1 + chr3L 8364273 3' - roo 8662 1 58.42 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATT:1 + chr3L 18706946 3' + jockey 4966 1 54.46 GTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCGAAATTAGGCGGTAACAAACAAGCACGAATATAGAATATAGAATCAAGAACCTGGCTGAGACGCATAAAAGC:1 + chr3L 21446125 3' + Tc1 169 1 59.41 TAAAGAGGTGGGCTAACTAAATTGGGTGTATTTTAAATGCGTGCAATCTATAAACCATCTGTTGATCCATTTACCCTAAATCTGTCGGCATTATCGTTTCC:1 - chr3R 15126183 3' - FB 454 1 61.39 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAG:1 - chr2R 20739452 3' - roo 43 2 70.30 CGGAGCTACCTGGGTTTCAGGAGGAATGGGCTGCGTGTGACTGTGTGTGTGCGCCGTGTCCGTGTGCGGATGGAAACTCGGTGCTGGGCTAATCTCGCCC:1 - chr3R 24518458 3' + G2 496 1 70.00 GATCCCCTGATCATGGTTTACATTGATTGCTAGTTGTATGCTCTAAAATACTTTTTCAGATGCCCAGATCCCCATCTCCATCTCCATCTCCTCGATCTTCC:1 - chr2L 15107382 3' - invader3 5144 1 57.43 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATAACTTGGCTTCAGACTTCAGAATCTTGGCTTCATAA:1 - chr3R 22232574 3' - F-element 51 1 61.39 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAAACTATGATCGAG:1 + chr3R 16400240 3' - blood 7025 2 65.35 TGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAACATTAAATAAACAAATTTAATTAAATCCCTGTATTCACCAGCAT:1 + chr2L 22258646 3' - 1360 209 1 57.43 CGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACCCTCTGGACTGATCGTTATTATATCATG:1 - chr3L 9155208 3' - invader4 246 2 72.28 ACGGATTTTACGTTATTACGACACTTAACCAAATACGTTTGCATTATTAAATGGTTCTTTTTTTTAAGGTACAAAAACATTTAGTCCCTACGCTCCTCTA:1 + chr3R 19867161 3' - gypsy10 385 1 61.00 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCAGGCTCGGTGTCATCCGTGGGCCCATTGGGATTT:1 - chr3R 13302997 3' - 1360 65 1 75.93 ATGATCACCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGGCGAGCAGTCAAAAGTTAACTGCGGGCTTAACTGAAACGTTTTTTGGGCATCGTTCGT:1 + chr2R 17919266 3' + 412 7178 2 56.44 TAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTTATCGGGTAATATATTTTAATGGTAAAGGTAAACTAAAAA:2 - chr3L 18337653 3' + Juan 4180 1 60.40 ATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAAAATGTCACTAGATTTAAAAACCACAAGTGACTGCAGCCCCTCTAATGGCACCACCCACC:1 + chr3L 21963396 3' - roo 355 2 62.38 TTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTGGACATGCAAATGTGGACATGCGTCCACTCCCTCGAGTCCCCAACCCATATCCATTGGTTTCCAGTAGCATAGTT:1 + chr2R 15474894 3' + roo 410 1 78.00 AGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTGTAGATGGAGGGGTAATTGAATTCTTGACTGCTTCCATCCAGCATTATTCACAACA:1 - chr3L 17836563 3' - Ivk 324 1 61.39 CCAGAAAACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTATGGCGCATGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTATATTTAAATGATCTGCGACATAT:1 + chr2L 22762327 3' - invader1 3714 2 64.36 TAAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGATG:1 + chrX 8958639 3' + BS 5104 12 80.20 TCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGACAGATAAGTATTTTCATGCCTTGTACTTCTCCGAAAACCTTTTAAAAACCGGGCACTTAC:1 - chr3R 17895654 3' + hobo 39 1 60.40 ATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAGCGCCAAATCTGCAAACCAAATCCAACTTAAGTCACATCAAATTAAAATCAACAACCGGGCGAAGGTTGAA:1 - chr2L 14963177 3' - Cr1a 249 1 76.24 GTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAGATAAGTATTTAAACGAATCATGAAATCTCACATCGTATCATCACATCAT:1 - chr3L 20097818 3' + 297 421 1 59.18 ATTAAGTTTAAAAGTATTTAATTCCCTTATTGATATTTTCAATTTAATGGCCAACAAACACGGGACCAACGACGGGGGCGGGAAATGAGGGGCGTGACCAC:1 + chr2L 20632757 3' - Tc3 1526 1 59.41 TTAATNTGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAA:1 - chr3L 2019656 3' - 412 7085 2 56.44 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGAAAGCGAGAGTGTGCAGTTGTTCTTACAATAAAGAGACATAAAAGGAAAACAACCACGTGCCTATT:1 - chr2R 1365301 3' - jockey 17 1 68.32 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCAAACACATACAGCCAGACAGCGCCCCGAAAAGCAGACCGCAAACAGCCTTGATGACTGACTATTGGCTCTGGCGCCCG:1 + chr2L 19019048 3' - hobo 2709 1 79.21 TAGTTTGTTGCGATATTTTTCCATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGTATGAATAAATCCCTATGTAACCATATACTTCAGTGACATTGTTGGT:1 - chr3R 4495795 3' - Fw2 3724 1 74.26 CAAAGTGATAACAAGAATAAAAAAAAAGCTAAACCAACGGTTAAAACAACATACAAAAAATAAAAAAAAAATGAGTGGAAGAGAAATGTAAAAGAAATTGA:1 + chr3L 5468743 3' + gypsy4 496 1 63.37 AACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTCGAAGCACAGCCAACTAACTCAGCCATTATCCCCATGGGTAGTTGCCGGGCGGAAG:1 + chr3L 5088037 3' + jockey 4860 1 65.35 TGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGCTGAAGGGGTGATGAGGGGTACACCGAATGGGCGTAAATCAATTAACAGC:1 + chr2R 16835107 3' + Rt1a 4738 1 55.45 ACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCATGTGAAATGGCCTAAGCATCTAAGGATTGCACCCGAATTTTTAGAA:1 + chr3R 17494528 3' + Quasimodo 229 2 54.46 TGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAGGCAGCCAAATCACACGCTAATGAGGATAGGATAGTTGGGTTTACAATATTTAGTTTTGCCAGGGTTA:1 - chr2L 21556198 3' - Dm88 4515 2 61.39 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGG:1 - chr2R 10444237 3' + P-element 2856 1 48.51 TCCAAGTAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCT:1 + chrX 2753885 3' + roo 9029 1 65.35 AATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGGCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTT:1 - chr3R 19446149 3' - 297 6602 2 52.13 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTAGCGAATCTATTGAGTATATACTC:1 + chrX 1281718 3' - roo 8717 2 81.19 TCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGAACGTTCAGCCGTT:1 + chrX 3817544 3' + roo 408 1 75.25 CTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACCAGAATAATTCTAGTGTCTTTGAGCAGCGAATAATTAAATTCACGGAAAGCGTTCCGTTGTTGTTAAGTGAGC:1 - chr2R 2498566 3' + 1360 489 1 50.00 ATCAGGATCTATAGCCGAGTCCATCTAACTCTGTTCTTCCGTCGTCTGATCGTAAAAGCGCCGAGATAATACTATAACTAGAAATATGATTTTAAGCATGC:1 - chr3L 27331680 3' + INE-1 93 1 60.40 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACT:1 + chrX 8972424 3' + 1360 3367 1 65.79 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTACATATATTGTTTTTTTTGGCAACTCTCATTGCACATCCTGTGTCCAAGGCGATTCTTATCGCCTTCGAG:1 - chr2R 18675459 3' - opus 1 2 76.24 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAAGGGTTAACAATGCAGTAAGCTCGGAGATTGCCGGGTTAT:1 + chrX 9654810 3' - pogo 62 1 60.40 ACCCTGATGCAAGTGGAATCTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCCGGGACCAGATACCAGGGACTTGAAGCT:1 - chr2L 21010428 3' + opus 7492 2 57.89 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAAT:2 + chr2L 3440487 3' - Juan 48 1 63.37 ATTTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATATCCTATACACGCTGGCGTTCACCACATTTAGCAAACTTAAATATCTTTCTCTGTTACATTTATTAAGTTATA:1 + chr3L 23597305 3' - invader4 2968 2 62.38 ATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGGATATTTGCCAGTCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGCCGTCTGCAGAAGCAACAATCACTT:1 + chr2L 20112417 3' + Tc1-2 1604 1 66.34 TAAGTTCATGTTAAGTTCAACGAGCTTAGTGCATTTGCAGCTTTTTGAACTTGGGGGCGTTTGACATTTATCACGATCAGCTTTTTAATGAATATATATTA:1 + chr2R 18108063 3' - accord 237 2 71.29 CCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACTGAAGGAATCTTCTTGAGCATGTTGTTTGACAGGATGAGTATCTCAAGGTTTTGCAGGTTCATGATATCATCGGGCA:1 + chr3R 17397811 3' - invader4 2836 2 72.28 GAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTTTGAAAAATTTATAAGACAATAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGT:1 - chr2R 6085998 3' + 1360 401 1 93.67 AATTTTGTAGTTGACTTTTTTTTTCAATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTTGTGGCGTGTTTTTTTTTTTAATAATTTCA:1 - chr2R 2725132 3' + Tc1-2 1387 1 67.35 TGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGGTAGTTAAAGTGCCTGCGT:1 + chr2L 11703275 3' - Tabor 6854 2 64.91 CGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGAAAAGGAACCGTCAGCGGATTTTCAAAACATTG:1 - chr2L 21727984 3' - Doc 351 1 68.32 CCCTTAACCAACAATCATGACAGGGACGGTTCACCAAAGGGTTAATGCCGAATTTCAAAAGGCCTTAATGAAAAGTTCAGCTGATTTGACGTCCCACTCGA:1 - chrX 16131773 3' + I-element 171 1 83.17 TAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCAATAAAGCTTACTAAT:1 + chr2L 21592757 3' - BS3 320 1 53.47 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTTGGTGAGCTGCTGGCCA:1 - chr2R 20739416 3' - roo 7 2 73.27 TTAAGTCTTAGGGACTTATAGATATGTCACTATATATATATATATAATATGTTTATATAGAGAACAAATCACCCAAATCCAATTCGACTT:1 + chrX 15371902 3' - Idefix 9 2 61.11 ACGATTCAAACGGGACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAAT:1 - chr3R 12047433 3' + Stalker2 351 2 69.31 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTTGCGCAAATCGCATTCGATGCGATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTCCCTTTGAGAGGCGGGACTCAG:1 - chr2L 20622770 3' - Doc 7 1 48.42 AAAAACCCGAATTGAACTCATTAAGTGTATGCACAAGTTTATAGTATGAACTTAAATTGGCTAGCTGCTAAATTTGCTTTTATCTAAGACAGTATAACACA:1 + chr2L 9399440 3' + rooA 7570 2 53.47 TCAAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAACACAAAATACAAAATACAAAATGTGAGGAAAAAACACGAAATGCTGTTGTACAGGCGGCCACAGCTTGGGCTTCATT:1 + chr2R 8655539 3' + R2-element 3584 1 49.50 GTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGATAATAATCATTTATCATCTAGGTTTTAA:1 + chrX 15082481 3' - mdg1 7041 2 76.24 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTGCGACCTTCTCCTCCACCTCTTAGAATAGAAGCC:1 + chr2L 16674944 3' - roo 8677 2 66.34 TATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTAT:1 - chr2L 6083725 3' + 3S18 6059 2 67.33 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGG:1 - chr2L 12815024 3' + hopper 1399 1 63.37 ACATACTTGCCCAGGAGTCTATTCCTTCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAGAGCTCTCCACCTCGGCCTGAAGCTTTACTTTAGG:1 - chr2L 22306993 3' - baggins 5279 1 77.23 TGACTCATGTTACAATTGATTTGCAGTCTGGGGCGAAGGCCAACGGGGCTTAATTAAAGCGATTCCGAACAGCACGCTCCAATTACACAGGTTCAGCCACA:1 + chr2R 2950441 3' - mariner2 266 1 78.22 CTTTTTTCTTGCACAAAATAAGTAAGGAATTGAAGGTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATTTGAATATTCTAATGT:1 + chr3R 4577547 3' - Tc3 125 1 66.34 GTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATT:1 + chr3L 24123308 3' - GATE 38 2 52.48 GCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGGTCGATTTTTCGGTAGTTTTTATGATGGAAAT:1 - chr2R 21854031 3' - blood 398 1 68.32 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATCATCATAATATTATTGTGTTTGTGTT:1 + chr2R 7861747 3' - roo 18 2 62.38 AGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACATTTTCCATTATTCATATATAT:1 + chrX 23283839 3' - GATE 49 3 82.18 AATGACATCGTTTGCCCACGTGGCCAGACCACTGAACCATCCGCCTCTTCATCTTCTTCCTCTTCTTCAAAAACTAACATCTATATTTTTGATACTTAGAA:1 + chr3L 23646340 3' + FB 204 1 58.42 AAGTGCTCTTATATTCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTCCGGTCTTATTTATGGCTCCAAGGATTCCCAGATGGGCATTGC:1 - chr3R 15949466 3' - Idefix 7129 2 60.00 TTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCACTTTTTCCGCACCTTTCCACCCCACCAACCCCTTTTTCACCCACCCATTTGGGCCAAACCAAACTTC:1 + chr2R 21238182 3' + FB 33 1 64.36 CAAACATCCCAAATATTTTAAAATTCTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTCGACTTCCTGCCACGCCCGCCTCGGCCAAATG:1 + chrX 21490015 3' - springer 494 1 68.00 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAG:3 + chr2L 4743184 3' - I-element 45 1 67.33 TACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGACACTTAGACTACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTATTCACAAGAATGAGAGCA:1 - chr3L 16973375 3' + S-element 168 2 46.53 CATAGNGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCA:1 + chr3R 20149774 3' + 1360 3355 1 60.40 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGAAGTCGCCC:2 - chr2L 8565452 3' + blood 350 2 52.48 AATATTATTCTTATTATTCTTAAATATTAAGAATAAATAGATAAGCTTATTCAAAATGTTTAGCAAAATAAGCATATTTCTTTATCTGCATTCATCCCTTT:1 - chr3L 17177070 3' - mdg1 7071 2 60.40 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATCTTAGGGCCCCAA:1 - chr2R 16475760 3' - 412 7101 2 74.26 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTTACATATTTCGCTCCTCTTTT:1 + chr3R 28645872 3' - F-element 16 1 69.31 ATTATTATTATTATTATTATAAAAAATAAATACATTTTCATAACCAAAAAGACATGATTTATGCAAAGCTTAAACAGCCAAGCATTCGTACCTGGGACCAT:1 - chr2L 16996061 3' - mdg1 30 10 67.33 CACACACACACACATACATGTCCACGTTCGCCAGTCCAGAATGGACACCTGGGCCCAGTTTCGCAGGGCGCTGATGGAACGGTTCCGGGGTCACCAGACTT:1 - chr2R 1823704 3' + Quasimodo 40 2 81.19 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACAGAAATCATAAT:1 + chr2L 14612130 3' + roo 407 1 77.23 CTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTTGAAGCGGTAGAACAAGTAGAAGATGAATTTGTTGTTTGTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTGTTTG:1 - 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roo 3 2 77.23 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTTTCTGGGCGGTCTCTTTTTG:1 - chr3R 32005873 3' + invader4 3058 2 55.45 CGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATAGTATGGCCTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTGAGAAACAGGTATGAAATATTAGTGGATATCG:1 + chr3R 3748723 3' - 1360 44 1 64.36 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:2 + chr3L 25232906 3' - GATE 37 2 50.50 GTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACC:1 + chrY 3648872 3' + 17.6 7374 2 80.20 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGT:1 + chr2R 24628824 3' - mdg1 36 2 58.42 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATATGGAAGGTCAGTTATTGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTTTTT:1 + chr3R 19448490 3' + Juan 4183 1 56.44 CCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGG:1 + chrX 2753873 3' + roo 353 2 78.22 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCTATATAATAAAAAATAAAAAAAAAAATGCATTGAAATCAGAGTCAGA:1 + chr3L 17921199 3' - 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G6 16 1 63.37 ACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATA:2 + chr3R 1977618 3' + micropia 422 2 56.44 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGATGGCACTCAGTCGA:1 + chr3L 13477527 3' - P-element 16 1 60.40 ACTGTACAGAGTTTTTGATCGGCTCGAAGTGAGCGTTTGTCTGCATTTGAAATCGAAAGTATGAGTGCGAGTGCTGGTGACACATTTCATTTGATTACACT:1 + chr3L 10081648 3' - rover 209 2 69.31 AATATAATATTAATTAATAATAATAATGTAGGTGTACATGAATTAGAGTACAATAACCTATTATTATTCAGAAATATACATCACAGTATTTTAGTAAAATG:1 - chr3R 14750458 3' + Burdock 412 1 42.57 ATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACATAATTTGTACACCGAAATTAGAGAGAAAACGCGCGGCGATGAAGTCATGCTGGAAG:1 - chr2R 10542597 3' + P-element 15 1 61.39 CACCACAACAACGGTGACATTTAGTAGTGCCAATAACAGCACCATATATACAATGGAATAATGTTAAGTCAGAGGATAATCAAGCAGATTTAGCATCCAGG:1 + chr3R 19446471 3' + BS 499 1 53.47 GTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAAT:1 - chr3R 556454 3' + Tc1-2 1589 1 59.41 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAA:1 - chr3R 12539514 3' + roo 9019 2 78.22 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCA:1 + chr3R 11263471 3' - roo 24 2 56.44 AACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATTTTTGCTTACACTTAAGCGCATGATTTGTTGTGCGTCCCTGAAACCAAAACTTCTTGTCGAATGCTGTC:1 - chrX 21491618 3' + rover 4 2 65.35 TAAAGTTTTTTAGTTTTAAAGCTAAAAAAAAGAAAAGAAATAAAAATATAAGATCAAAAAGGCAGAATAATTTATCTAGATATTTAAATTTTCAATGTTTC:1 - chr3L 6837627 3' - 1360 3026 1 43.56 CTCGGAGTAGGGAAGGAGGGGTGGAGGGCACGGTAGGTACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCCGCCTGTACCGCGACAACTAAGCACT:1 + chrX 8827090 3' - G-element 295 1 74.26 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTGAAAGGCAATGGCGA:1 + chr2L 15510472 3' + jockey 4982 1 63.33 AATCANCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAAATATATTTTTATAAGTCTCTAATTGCTTGCATTTAGGAAGATAC:1 + chr3R 4051712 3' - Juan 386 1 56.44 ATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAGGAACTCACTGGTGACC:1 + chr3R 9995430 3' - Max-element 8265 2 55.45 AAAGATCCCGCTTGAATATGACCTACCAAAACTTATCCATTCCAAACAACGTAAACGTGTTTTGTTTAGAAATTTCTCATTTTTACAAACATTTTCGTCAA:1 - chr3L 23590288 3' + S-element 1342 1 57.43 TAAGCAGATCAAATTAAGCTGCCGCATGGGGAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATT:1 + chr3L 18706920 3' + jockey 4944 1 65.98 GTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGCCACTC:1 - chrX 20885943 3' - Ivk 5349 1 76.24 GTCTTNTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTGAATTCAAAAGGACTTAT:1 + chr2L 2074805 3' + roo 9070 1 80.20 AATAAAAAATAAAAAAAACAAAAACAAAAGATAAATAAGCAAACACATACACACGCATTCCATATTTTCTTACGAAACATAAATGAGATTGGGCAACGCAT:1 - chr3R 14921270 3' + Doc 4694 8 69.31 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTTTTAGTACCAAATATATCAAAAATCAAA:1 + chr2L 22098120 3' + roo 401 1 53.47 TACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCAAATCTTATGGTCAATATTTTGG:1 - chr3R 31256999 3' + transib2 2775 1 77.23 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGA:1 - 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chr2L 1868355 3' - P-element 354 1 56.84 TAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTTCTCCACATTACCGTCGTATTCAACCAGATTTG:1 + chr3R 12047505 3' - Stalker2 9 2 70.30 AATTTCATCATATTGCTACGAAATTGGCCAAAACTCGATCGTTTCTTCGATCAGAATACATTTCGGCCCGAAAATCGTCGTCTGGCAACGCTGACCGTTGT:1 - chr2L 14094702 3' + 1360 3108 1 78.22 ATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATAATATGTTTATATAGAGAACAAATCACCCAAATCCAATTCGAATTTTCGG:1 + chrX 15371907 3' - Idefix 15 2 61.39 GTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGAGGTTTTCGAGGTGTTGGGAAAGGGGTAGTG:1 + chr2R 12871929 3' - accord 7084 2 69.31 ATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACTCGCTGTCGCTGCAATTCCTCCGCCTGGCTGGCTTCCCTTGCATTCCCTGCAGTCCGCCAAGTGCAGAG:1 + chr3R 18852493 3' - jockey 469 1 72.00 GCAAGGATACGCTAATACATTTAGTATTGGTGGCAAGGTTTAACTAATGTCGGATTTGTGGGGAGTTATAGGATTTTTCACATTTCCCCCCTGTTTCCGGC:1 - chr2R 979675 3' - Porto1 4569 1 68.32 ATTAAACAGCTTGTCTCCCATTCATCGTCCAATTTCAAGTTTCTGTGCAATTTGCCAATTTCAATTCGAAATGAACCGAATTGAAATTGGCAAATTGCACA:1 - 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G4 137 1 66.34 CCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTTTTATAGACTAATTTCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGAAATCGAAATCCAAACAAGCGTCGCGAAATATGAGACA:1 - chr3L 6992292 3' + Cr1a 4183 1 62.38 TCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACTCACTGGTGGCCCACTAACAACCACACTCA:1 - chrX 20322941 3' + F-element 4407 1 73.27 TATTAGTTTTTATCGTTTGCCCACCCTTAAAAAAAAACCTTTAACAGGGCATTTCAAAGTGTATAAAAGAGATTAAATATTGCACCTCCAAGCCATTACC:1 - chrX 19497759 3' + FB 371 1 55.00 CTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:2 - chr3L 20988181 3' + Stalker2 245 6 63.37 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACA:1 - chr2L 19018946 3' - hobo 25 1 54.17 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCTCATGTGTTGATGCTCAGCAGCTGACTGCGCTG:1 + chr3L 11553577 3' + P-element 2883 2 64.36 TGTCATCTTTATTAAATAAAATTCGTATCGAGCTGTTCTTGTCTCCGTTTCGGACTCTTTGGATACCCCGACTCCCTGCATCTTGGATCCCCACTTCCC:1 - chr3L 19494484 3' + invader6 4548 2 52.53 ACATANGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAG:1 - chr2L 14790594 3' - roo 44 2 71.72 AAAGTTTTGAGATAATTCGGTTATCGCAAAAAGAGTGGGTTTCAGCTGATCGTGATTTCCAGGCCGTCCCTATAAGATCTATCGATCTAGTTTTCCTTGT:1 - chr3L 26386305 3' + Gypsy12A_LTR 162 1 60.00 TTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGGGGTTGGGGTGCGTGGAGAGCGTCAATTGTTTATTTATTGTTC:1 + chr2R 23454446 3' - F-element 4508 1 67.74 TAGATAGGAAAAAAATGAAAATGATCAATATTTTCTAGAAAGTGTGTCTTTGGATTAAGCCACAGCAGGTGAGTTATCAAAAGCGAACGCCGCAATACGGT:1 + chr3L 16023931 3' + HB 122 1 56.44 ACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAGAGTTGTGGCTC:1 + chr3R 29331935 3' - G6 5 1 71.74 TTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCCTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTT:1 + chr4 202880 3' - 1360 253 1 66.34 ATTGATCCTGATAAAGAATATATATACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCAAGGTTAATAGTTGAAACTGTTAGGCGATCGCTCTGGCTTGCCG:1 + chr2R 25168696 3' - INE-1 83 1 56.44 ATATCNTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTG:1 - chr3R 15072572 3' - pogo 29 1 57.43 AAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGCGAGAAAGGAGGTTGAGCTCACAGCAAATGTCACATTAAACAGGCAATATTAAAGCTGAAAAGCAGA:1 - chr3R 23474162 3' + R2-element 477 1 62.63 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAGGAGGATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAACAGGGA:1 + chr3R 20149794 3' - 1360 8 2 61.05 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATAGAGTCGGTAGTGCCGGGGCATGTGTCACCAAGAACTGGCCACCTGAGCTGCAGTCTCTCCCCATCC:1 + chr3R 11343260 3' - hobo 8 1 68.00 TAAAAAATTTGTCCAAATACTTATGTCACTGCTAATTTGTAAAAACGTAAGAGAGGTAGATATTCAAGTTATCCAACCCATAAATATATCAATCTGCTTCA:1 + chr2R 2053755 3' + Tc1-2 1426 1 61.39 GTTTGTTTATTTTAAGATACTGTTTATTTAGCGAATTGTTTACAGCAGCTTGAAAGTGAATTATGTAT:1 - chr3R 4284493 3' - diver2 4840 2 70.59 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGTTGGCAAAAGCAAATTATACGGTAATGGTTAGAAGCAAATGGCGATGGCGCTCAGTCGACG:1 + chr3L 13477529 3' + P-element 2873 1 64.36 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCG:2 + chr3R 24760632 3' - pogo 19 1 60.40 AAGTAATTGTATTAGTTAGAGACGGCCCTAGGATTTCTTTGCTGGGCTGGAGAATCTTTGCGCTTCATTGATTGTCCGTGTGTGTGTGAGCTCAGATTTTG:1 + chr3L 18985539 3' - Doc2-element 4664 1 66.34 ATTCATACTTTAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTCCAGGGCAAGTCTCCGTTCGGATGATGTGGAAAGATGAGAGGGAA:1 + chrX 22599730 3' + Quasimodo 7279 2 55.45 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCAACAAGCCGAAAAG:1 - chr3R 23638071 3' + pogo 2097 1 72.28 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCAGCACATGTGGTGGATTCCCT:1 + chr3L 18501031 3' + hobo 2923 1 60.40 TAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATATAGCAGTTTTTGCTTGCAAATGCAATATGTATCAT:1 + chr2R 12457983 3' + roo 371 1 64.36 AAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACAATATGGCCAGCTTCCAGAAAATATAAAATGTACGTTGCAATTTAAAATTAACAGTTTT:1 + chr2L 1981952 3' + I-element 369 1 68.00 GGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTCTGTAATATGCGTACTATTTATGAATAATGACCCAGTGCCAGGGGACTTATACGTATTC:1 - chr3R 10940045 3' + opus 65 4 57.43 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGCTGGCCTGCTATTTACACGGGCAAAGTTGTTCGCTT:1 - chr3R 31101720 3' - 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chr2L 3951565 3' + Transpac 5220 2 69.70 ACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCAAGTCTTTAAATAAAATTTAAAAAATTAAGAACATGATACAGAGAGTACTACAAGGAATTAGTAAGCCGA:1 + chr3L 25800625 3' - 1360 3316 1 72.28 AAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAA:1 - chr3L 13727326 3' + P-element 165 1 21.78 AACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACAG:1 - chr2L 15081429 3' + hobo 6 1 49.50 TGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATGCGTAAATTACAAACGCCTTTTAGATAGGCAACAAAAAGTTGTTAACTTTTATTTTACA:1 + chr2R 22317296 3' + BS 5079 1 48.51 CTATTGGTGTTGATGCCCGCAATCTTGGTGATGCAGTTGGATTTGCATCTTGTGATTAATTGCATGAGATGTTCTTGAATGTAATTGATTGATTGCATTGT:1 - chr3R 13651687 3' - rover 6891 1 56.44 CCGCGAGACGCGGCATTGGGTGGCGTGTGACAGGAAAAGGATGCTAAAGAGCATCAGCAGGCAAATGCGGAAAATACATTTTTCCCTCTTCGAGAGTGCAG:1 - chr3R 4608949 3' + invader3 190 2 77.23 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGT:1 + chrX 13508741 3' + roo 9024 2 74.26 CCCAGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAGTGAGCATCAGGAACGGCAATACGAGGTACATCACTGCAAGTGACGGAGCAGTGAAACGCGGATATTCA:1 + chr3L 25847310 3' + hobo 2907 1 75.25 TTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTCGAGCGGAAACTAAAACAAAAGTCTGCT:1 + chr2L 11534426 3' - I-element 5146 1 71.43 ACACTAGCTGAGTAACTGGTATCTGATGCCGTTTTTTCAACGGCGATATGGCACACTTAAGAAAATCTATTGCGACTAAAGATCTTCAACTGCTCTACAG:1 + chr4 1050555 3' + INE-1 540 1 58.00 TAATAATAAATAATAATAATAAACAGGAATAGGAATTTCACATAATTGAATCAACCATAGTCACTTTAATTGAATTGCCGAAAACATTCCCACAGATTGTT:1 + chr2R 24487678 3' + flea 243 2 53.47 TCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTCCACCCCTAAAAGACAGTGTATTTTTAT:1 + chrX 12290252 3' - X-element 28 1 59.41 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAATGAATTAAAAAGTGCACTTGGG:1 - chr3L 25272552 3' - 1360 42 1 64.36 CAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACGATTTTTATAATTATAAGTATGTG:1 - chr2R 5582158 3' - Cr1a 432 1 76.24 ATAGTATTCTGAGTGTCGCATGAATGGCTGGGGCCCCAGAGTTGGAGACACATGCTATGGCTT:1 - chr3R 4901352 3' - P-element 2805 1 77.78 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATCTCTAATCTCTGGTCTCTAATCA:2 - chr3R 23677116 3' + Bari1 1653 1 77.23 ATATATATACATATATACGTATACACCCATATATTAGGATTGTACATTATTGTCTAGCATGTTTCGACTGCAATTTAAGTTCTAGCGACTTTTGGGAGCGG:1 - chrX 6232083 3' - G3 4507 1 74.26 TTTGTTTTTTTTTTAAATTTTTTTTTTGGTGGGGGCTGGGGGGATGTAAAAATGGAGGTGTTCTGAGTGCTCTTTAGGTTACAGCTTGTCACCAGTC:1 - chr2L 9298079 3' - TART-C 11095 5 77.32 CACTGGATGGTTAAAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGCATTATTTAGGATTTGGTTCACAGCCAAGTCGATACATTTAAAGCTCATAAAGGAACTTT:1 + chr2R 4721506 3' - Tc3 1466 1 56.70 AAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACACACACACACTCAAACGGCCAGGAAAACAA:1 + chr2L 12814903 3' + hopper 1039 1 71.29 TATAGTCGAATTTCTCGACTATCAAATACCAGTAAGTCAGTATACTTTATACAGAACTCCCCTTTCAAGCAGAGAGTACAAATAAATGTATGTTTTAGTTA:1 - chr3L 20474646 3' - INE-1 565 1 67.33 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAG:1 + chr2L 13574260 3' - pogo 48 1 73.27 AGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTGAATTCAAAAGG:2 + chr2L 2074799 3' + roo 9064 1 74.26 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTA:1 + chr3R 7168631 3' + flea 218 2 70.30 AGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAAC:1 + chr3L 23678148 3' - Osvaldo 25 1 77.23 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTGTCCAGGTAATTTA:1 - chr2L 15947374 3' - Transpac 22 2 58.42 GACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTGATAAAAAACGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAATATAAAACAATACTATATGTCC:1 + chr2L 21635361 3' - F-element 468 1 72.00 GGAGTNGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATATGTTGTAAGTGTTGTTGGTTTGGATGAGGAGTGGGCTCAATCTAGGGGTGGAGAAAATACAAGTCGTACAC:1 - chr2R 21630843 3' - Idefix 71 2 60.40 GGTCANATGTGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGGATTCCATTCACTGTGCCCTCTCGTATCCACTTAAC:1 + chr2L 9169697 3' - gypsy5 58 2 63.37 CTGGGTTCGGAAAAATCTAATTTTTTAAATTTGAAAACTGGAATCTTTTGCCCACTTTCTGCACAACCATTTTCAATTATGCAAACCGTTTACTTCTAAG:1 + chr3R 20000709 3' + FB 13 1 54.00 ATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCTCCGTCTCCGTATGAATGTCGAGATCTCTCCGGATCCCAGGTGGCGGCGACTCAGCGCCGGACTAGCC:1 - chr3L 7120253 3' + INE-1 103 1 60.40 CAATTAGGTCTCAAACTGAACTCTGATAAAAATTCTGATTTGATTGACGTTTTGCGAACCACTCAATTTTAACGCTCAATTAGAGAAATGGAAATGAACGA:1 - chrX 11663534 3' - Idefix 7292 2 57.43 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTGACGACATGCCGCTTAGTCGTTTGACTTGGACTTTTGCCTTTGCCTTCG:1 + chr3R 26530371 3' + blood 7356 2 54.46 TGGTCNAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGGGACCCGCTGCCTTGTAATACAGTTAAATATAAAT:1 - chr3R 6606006 3' - I-element 4909 1 64.36 TAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCCAAGTGCTCGGGCTAAACTTTAGGTTTACATTTTTTTTACATTTGTTTAT:1 - chr2L 5813352 3' + 1731 4181 1 54.46 CTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAACCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGCTACGGCTTATTCGCTTACTACTACTACTTATTAT:1 + chr3L 16647244 3' + Doc 4244 1 65.35 AAAAATGGAATTTTTGAAATTTAAAAGCTGGAATCGTTTGCTCATTTGTTGTCTTTATTTGCCCACGTTTGGCCACTCTATGTACATGTACATATATGTCA:1 + chr4 466373 3' + FB 23 1 78.22 CGGGTGGGTAAACGATAAAAACTAATAATAATGGTTTGGCGGTTCTCGTAAACTATGAGTGCTTTGGCCTGAGTGGGCAGAATGGAAAACGGAAAACT:1 - chr3R 15032731 3' - FB 376 1 67.35 TCCGAATGGGCACTCTTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCCTGACCCTGGTGGGCCTCAATCCCATCTCCACGGACATGACCAGCAT:1 - chr2R 22940459 3' + Ivk 4940 1 53.47 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGTGAGTGTAGAGGGTAGAATATTTATGTTCATTCAGGGATGAAAGTGCAGCAATTAT:1 - chr3L 12633244 3' - jockey 29 1 54.46 TGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGTTATCGTTTTTTTTGAATCTACCGTATCACTGTCTA:1 + chr2R 6433230 3' - F-element 340 1 62.38 AAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGTGTAGCAAATGGGAAAAAATGTGAAGCACAGTAGAGCTCGCAATATGAAAGCGATTTTATTGA:1 - chr3L 10436125 3' + Bari1 1261 1 64.36 GCATAGAGCGTCTCTCTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCGAGGAAAACTAAAATAAAATACAACAAACAGCGG:1 - chr3R 14010457 3' - F-element 118 1 64.36 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCC:1 - chrX 20806863 3' + opus 7475 2 61.39 TTGGGATTTAGGCAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCACGCTTCTATTAGGGCATGCGGATAATCAGCCGGTCTAGTTTATCCCATTCCCCTGCCGAT:1 - chr3L 15944775 3' - I-element 4975 1 63.37 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGACTTCGC:3 + chrX 2799718 3' - Tirant 12 2 69.31 TATAAATGTAAGTAAGAATACTTAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAAATACCCATAAACAAGTAAGCCACAGTCTCACACTCACGTT:1 + chr3L 5312632 3' + Stalker 259 4 60.40 ATCAGCATTCATGGACAAGAGAAGGCAATATAGATCTCCTCGAGGGCTGCCTCTAAGCCGTCGGCCACGGCTGACATATACTGGGCGCCGTCCACATACCA:1 - chr2R 6251577 3' + Chimpo 4055 1 77.23 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAA:1 - chr3R 6735288 3' - copia 52 2 75.25 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTGTTGCACTCTGAAAGACAGCTTTTAAAAGAGC:1 + chr3L 9383563 3' - P-element 37 1 36.56 CTGGGAGTTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTAGGATTAGTTTTCTTGCTAGGGGATTTGGATGAGTTGTCGGTAAAAGTGTGTGGGTTTCA:1 - chrX 7532791 3' - Doc 4544 1 72.28 CATTCACACTAGCTGAGTAACGAGTATCTAATAGTCGGGGAACTCGACTATGGAATTCTTAAGACCCAATACCAATTGTAATTTGTAATTTTAGTTAGAAC:1 - chr4 515636 3' + INE-1 535 1 58.42 CTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTAGTTTTGCTAATTAAGTTCTAAAACA:1 + chr2L 5074872 3' + copia 150 2 74.26 TATGGGGCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATCCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTC:1 + chr2R 4802884 3' + mariner2 279 1 38.54 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTAGCGGTTTCTT:1 - chr3R 31458394 3' - jockey 10 1 76.24 TTTATCCAGGGTGATACCTAGATATGTCGCTTTCACGAACACCCCTCAAATCCGTACATCATATTGTAACTTAACATCTGCTAAAAATGTATAACTTTATG:1 + chrX 4508956 3' - Helena 903 1 34.65 AGTACTCATTATCTATAGTTCCGACTGACCAACTCGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATGGTGAGTGCCTCCAAGACGATTGGGG:1 + chr3R 3389585 3' - Rt1a 4770 1 78.35 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTATAAATAGAGCCGCCTCAGTCCGGTCACGTCACTCTCAAATGAAAAGTGTTCAAGTGCATTCAAAGT:1 + chr3R 21296637 3' + P-element 2877 2 71.29 GCGGCGAGGGACCTGCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCC:1 - chr2R 7552257 3' + springer 7507 2 60.00 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCCAAGTCGGGGACC:1 + chr2R 5804544 3' - P-element 4 2 71.43 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAATAAAATTTATTGATGCATTCCCACCTCAATCCTTTGCAGA:1 - chr3L 15100640 3' + pogo 2100 1 74.26 TTTGTTTTTGGGCACGTGCTGCAAAAGCGCGCGAAATGAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAA:1 + chr2L 12230640 3' + Tc1 166 1 62.38 CATAAAATTTAATTATTGTCCACAAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGGTATGGATGCTGCACTGCTGTTCAATTTATAATTCATTTTTGGGAGAA:1 + chrX 4179168 3' + G2 3021 1 54.46 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTG:1 + chr3R 26842858 3' + opus 454 2 79.21 CAAAGCTGTATGCCATAAGTCCACACGGGCTTTAGTATAGTTTTGTATAAACAGACTTTATAGCAAAAGTTCAATACAATATATTCAATATTCCTTTCTAG:1 - chr2L 19814661 3' - G4 3430 1 56.44 TAACAAGTAAAAGAAAAGCAAAACTTAATCAAAGAATATTTTTTTTAAATAGCAAAGTAAAGTTTTAAAAAAAGTTGTTTTATATAAGGAACATTTTTGCA:1 - chr2L 11199851 3' + HeT-A 318 1 75.25 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCC:1 + chrX 2776141 3' + 297 348 2 75.00 CGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTTTTTCCAAGCTTGGTTTTCCCTTTACT:1 + chr2L 18344815 3' - Stalker2 7409 6 73.27 AGGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTCGTAATTAAATTGAAATTCGG:1 - chr2R 24479901 3' - I-element 50 1 72.73 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATAT:1 - chr3R 11263415 3' + roo 355 2 81.19 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGAAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTCGAAAACCGTATAGATGTGCGTGTCTCGCTTGAGTGGCGCATT:1 - chr3L 11553457 3' - P-element 6 2 67.33 GCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACATGCAAATGGTAAAAGTGAAAGCAGTAGCTGACAGCTCCAGGCCAGATGGCTGAG:1 - chr2L 17644518 3' + flea 395 1 58.42 TAAGCCGAAGCTTACCGAAGTACTCGTTCTTGCCTGTATGCATACGGATATGGAATT:1 - chr3R 10869619 3' + P-element 32 1 68.42 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAA:1 - chr2L 14790581 3' - roo 8697 2 60.40 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATTTTAT:1 + chr3L 24123312 3' - GATE 34 2 55.45 TCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTTGATTTGTTCATAAACAACAGCGAAATAATTGAAGTTAAAGCTTTAAACAGCTTTGCAGGAT:1 - chr3R 1838671 3' - Cr1a 4108 1 48.51 AATTAAAATAAAATTAAAATTAAATGCATAATTAATGCAATGGTTTCATTTGCTCTGATAAAACTAACATTAAATTCACCTAAAATATTAATTTTTATGCT:1 + chr3L 16246267 3' - Rt1b 123 1 74.26 ACTCTAACCTAAGAAATAAAAATTTCGTGATTACATAAAATATAATATTGGAAGGGAAGGTGCCCTGTAAGCCGATGAACATTTGAGGAGCTCATAAAAAA:1 - chr2L 21793230 3' + Burdock 374 1 52.48 AGAACCTTGTTGCGAACCCATGACATGGAGAATCAGCAGCATTTACGAACTTCTCGGATCATCCAGACACGCAGACTGCGCCCCATTAACGCAGCAACCAA:1 + chrX 17753191 3' + Burdock 5915 1 77.23 TCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTTTATTATTTTGCATTAGTTGCATTCACGTTTGCCACTTTCAGCTCTCCATTTT:1 - chrX 3457285 3' - F-element 214 1 56.44 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGC:1 - chr2L 16674872 3' + roo 9025 2 76.00 AGTAATTATTTAATTGACAATTCATCTCATGACTGATTTTTCTTTAACAAAGACATCTCCTCATGAACACCATTAGTCAGCAACTTCAATCTCACAATGCT:1 + chr3L 26015576 3' - invader4 2630 1 59.41 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGACTTTGAGGATTTAAGAAGATACATTCGTGACAAGCACTTTGTCTGAATGGACAACTATTTCAT:1 - chr2R 13106736 3' + copia 244 1 67.33 TTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGAGTTCTGATATATATTGTATTATAGTTTTTTGA:1 + chrX 19430055 3' - mdg3 235 2 70.30 ATGTAACAGGCAGAAGGAAGTATTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGATCATGAGCCAGCCATACGAGCCGATCCGAGTTGTAGATAACCATATA:1 + chrX 1819433 3' + INE-1 30 1 56.44 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGAC:2 + chr3R 25671977 3' - I-element 37 1 59.41 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTTGGTTGGCCCTGTCTGTGTATGTGCCCTGCAATTTGTTGTAACCATTTTCGTTGCCTACTTTTCCGGGCACTTT:1 + chrX 16532044 3' - accord 7030 2 85.15 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTA:1 - chr2L 7488843 3' - roo 8682 2 57.43 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCAGATGGATTCATATATGG:1 + chr3R 19346960 3' - blood 31 2 58.76 GAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGACATCGACCGCCCCCTGAAGGCCGAAGTCCAACGCCCAACCGCCCATCCT:2 - chr3R 11841048 3' + hobo 2604 1 78.22 CGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGTTAAGCTTGGCATTGATATAAATAAGAGAACTTATT:1 - chr3L 1177845 3' + diver2 4641 2 74.26 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGACTCATAAATCAGTTAAACGTTGTCGCAATTTGCGCACCTCAAAGTCACCAAGCCCAGAGATTGA:1 + chr2L 7338752 3' + P-element 2877 2 53.47 TGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCCGAGATATTTAGTGGTCTCATCAAAAAACTCTCCGAAAACCGCACATGGCAAAAAGTTAAAAA:1 - chrX 6422249 3' + Ivk 290 1 78.22 TTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATATTTTATATTTTTATTTTATTTCACCGGACCAGCGTGCACATTTCCCTTAATTTC:1 - chr2R 4830297 3' + Tc3 312 1 77.23 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGACACTGTACTTTGATGTGGAAGCAAGAGGATCTAGCCTTATTCACTTGGATAGTTCTTTGTGTGAAAG:1 - chr2L 15948351 3' + Transpac 5219 2 67.33 AAAAATTAAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAAAATATTTAAAAAACATATAACAAATGGAAAAAAAATACAATAAATTACATAGGTTTGTTTGAAGCCTAA:1 - chrX 12559168 3' + Doc 4697 1 54.46 TACTANAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGT:1 + chr3R 10751684 3' + hopper 1360 1 73.27 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACCGAAATTCCCTTAGGCGGGCTT:1 + chrX 20620616 3' + pogo 2081 1 58.59 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCGCCACAGCAGCCCTGGCTTGCCAGTGCCA:1 - chrX 19268887 3' - P-element 20 1 43.59 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATG:1 + chrX 868748 3' - jockey 4803 1 69.31 CAGAGATCAGTAGATATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTAGGAGAAAGCCCTTCTGGAAGAATAGCCAGATGGGTGTTAGCATAGA:1 - chr2R 2750919 3' + R1A1-element 5099 1 54.46 CGTAGTCGTCAAAAGCCTGTAATATGTGTTTCACCAGTCTGGAGCTGTTCAACTTACCATTGCATGGCAAGCGGGCCTAGTTTCCTGGAGTTCCGAAAGTA:1 - chr2L 19114800 3' - 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Stalker2 7264 2 53.75 CACATTCGGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATAACATCGGACATCAGCGGCAGCAAGTCGTCGAGCCGCCGCCGCAAGCAAAAAT:1 - chr3L 19042402 3' - aurora-element 4087 1 58.42 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTTTCAACCATTTTCTTTTAAACAAA:1 + chr3R 17896987 3' + hobo 2908 1 74.68 AAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTA:1 - chrX 20885955 3' - Ivk 5361 1 64.36 CTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGTTGACGATAATAACGCAGATGAATGGAAATACTTTACGAGTCACTGGGG:2 - chr3L 22395398 3' - F-element 498 1 57.00 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTT:1 - chr2R 12082353 3' + mdg1 7412 2 70.30 TGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGT:1 + chr3R 29331907 3' - G6 42 1 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCTGCTTCACAAAG:1 - chr2R 19551965 3' + roo 396 1 66.34 GTAATGTGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCACTTACATATATACTTATATACTTATATACTTATATATTCAAAAATGCTGGCAGTTTTTTAAGTGCA:1 + chr2R 20952617 3' - rover 6957 2 65.35 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATA:1 + chr3R 16458046 3' - roo 8717 2 82.18 AGTAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAATAAATATTGAAGTTCGAGTTCAGCGATCACAAGAGTCGGTGAATTGACAAATCGTTTTTAAACAATGGCTGCAA:1 - chr3R 21165406 3' + Osvaldo 1520 5 66.00 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATTATGAATACA:1 + chrX 21852449 3' - Tirant 8131 2 55.45 GAATTGAACTCATTAAGTGTACACACAAGTTTATAGTGTGAACACCCTCATTGAGATTGAGGCGGAATGTAACTTTGATTAGTTTTAAGGCTTTAAGGCAA:1 + chr2R 5019434 3' + rooA 343 2 58.42 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGGGTTTCAAGCGAGTTTTCGC:1 + chr3R 13225587 3' + hobo 2930 1 70.30 TATAACATACATACATACATATTTGTAAGAATAACCCATTAATAGTTTTAAAAGCTGCAGTCTCACATTTCCCAAGCTAATCCCCTATGTTTATCAGCAGC:1 - chr2R 10546280 3' + 412 7277 2 56.44 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGATAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGAAGATTTTCTTTCCCAACAT:1 - chr2L 17646175 3' - flea 35 2 59.41 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTTG:1 - chr3R 16457980 3' + roo 395 1 66.34 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAG:1 + chr2R 17626567 3' + mdg1 397 2 52.48 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCC:1 - chr2L 4160117 3' - Tirant 19 2 59.57 CACAAAGGACCACAGAAGGCAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTT:1 + chr2L 18279956 3' + gypsy5 7322 2 56.98 ATGAGNGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGGGAGCTAAGGGGGCTAAGGCCAGAAGAGCCTTCAGTAGCAGGCTCTGGGAAGACTCTGTTTAG:1 - chr2L 12870691 3' - jockey 4750 1 63.37 CGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGCTCGAATCGCAACAGACTTGCGAAACATTTGGGAACACGCT:1 - chr2R 8004722 3' - Doc 452 1 59.41 ACAACGAGGTGACTGTGTTGTGGGCAGCAACTCGCCGCAACACACTTCAGCTACCACGTAAACAGCTACAGCGGCCTACTTAAATTTCTTCAATACTTCCA:1 + chr2R 4578486 3' + Chouto 461 2 58.42 TAAGGGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGGGGCTTTATTGATTTATGCGCCCTCGCATCACGTATACGCCTCGTGTTGCTGTTGCTCTTGCCATTGCACTAATC:1 + chrX 17978314 3' - 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chr3R 27283975 3' - Max-element 8 2 65.35 ATATTCTTGATGACGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATCATGGC:1 - chr2R 3919663 3' + INE-1 84 1 48.51 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTA:2 + chr3R 8555931 3' - 412 7081 2 50.50 GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATGCATATCCAAGTATAG:1 - chrX 22444460 3' - Juan 4084 1 53.47 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTTGCAATGGGTGGTCTCCAGTGGG:1 + chrX 2778992 3' - accord 181 2 88.89 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATGTGCGCGTGGGGAAAACAATATGGCCCAAACACATAAAAAAC:1 - chr3R 23048437 3' - mdg1 37 2 63.37 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGG:1 + chr3L 9907430 3' + jockey 4968 1 46.46 ACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAGCATCAAATAAGGATTATTGC:1 + chr2L 20133090 3' + flea 5011 2 78.22 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGTCGTCGTGCTGTATATTCTCTTATCTTAATTAGC:1 + chr2R 13644008 3' + Burdock 6369 2 50.50 TCTAGTAGACTAATTTTAATTAATTTACCTTCCCCATTCCAGGCTTAAATTTAATCGGCCAACCAACTGTGGCCCACCGACAGCTGTTGTCACCTGTCTGC:1 + chr2L 16461306 3' + Cr1a 3977 1 69.31 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACG:1 - chr3R 23638091 3' + pogo 2077 1 58.42 TATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATATTTTATATAGCTAGCATTGGCTAGAATGATTGTTGTCTTATTTTTGCCGACAGCCTGTGATTTCT:1 - chr3R 29353208 3' + I-element 5346 1 76.24 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAAT:1 - chrX 19162595 3' + pogo 2070 1 59.41 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCGTAGTTTTGGTAGTTTTGTTACTGTTTTTATATTGTACCTTTAATTCTATTAAGGTAAAAATCTT:1 + chr2R 13404033 3' - BS 6 1 67.00 GTGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATGATTTCGAGGACCCAGATACTC:1 + chrX 868775 3' - jockey 4776 1 62.38 AGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAGTCGATTACTATAGTGCTTGGCTATCTTTATATATACATATATAAAAA:2 + chr3R 15598731 3' + Max-element 8506 2 55.45 TAGTTTCTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTAGACCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAAGTTTGCCCACACTTAAAAAATGGTTTTTATCGTTT:1 + chr2R 5180266 3' + FB 93 1 77.23 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTA:2 + chr3R 6735333 3' + copia 220 1 59.41 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGCTTA:1 + chr2L 13574285 3' - pogo 23 1 51.49 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCT:1 + chrX 13508751 3' + roo 9034 1 64.36 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGCATGTAAATGTCCCATTTGTCA:1 + chr2R 14801432 3' + 412 409 2 76.24 ACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGC:2 - chr2L 11219887 3' + Doc3-element 16 1 45.54 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCC:1 + chr3R 26321664 3' - blood 53 2 79.21 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTC:1 + chrX 13508732 3' + roo 9015 2 83.17 TAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATAAAGTTAGGCTTAAAGCATCTTCAATATCCTTAAA:1 - chr3R 17321720 3' + Stalker2 363 2 61.39 AGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAATGGGGGTGCATCTGTTTGGAGCTGGGCGGAAAAGGGATGAAAATTGAGGAAAATCCACGAGAGGATGG:1 + chr2R 11000913 3' + R1A1-element 331 1 73.68 TTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGAAGGGAACCACAGTGGTAAGATGGGGTTGGTTCCAC:1 - chr3R 21728876 3' - I-element 5176 1 65.35 ATCCACTATTTATTTTGCCTTTGATTACAGTGGGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAGTTTTTGAGTGTTACATTTTTGTGATAATTTCGTAACTATA:1 + chrX 6960131 3' - HeT-A 6011 2 73.27 TGCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTT:1 + chr2L 23390133 3' + rooA 7469 2 52.48 CGTTTGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAATTCCCCAGAGGTCCATGTCCACCCCAACCCGGTTATATCCTTGAAAATAAATT:1 - chr2L 8782940 3' - Porto1 4313 1 57.14 CGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTCACGAAGTCTGCCGCAAAAAGGCGAAAAAAAAATAATAAAAATATAAAAACATTTGGGTATAGCAAGAGGAA:1 - chr2L 20908223 3' + F-element 4485 1 73.27 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCAACTCGTTTACCTGCCCCCC:1 + chr3R 8277952 3' - P-element 53 1 26.73 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAA:1 + chr2L 12667221 3' + blood 7337 1 79.21 AATAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACGTGTAAAA:1 + chr2L 6083786 3' - 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chr2L 3932589 3' - HB 320 1 51.49 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAA:1 - chr3R 20137252 3' - Burdock 6154 2 59.00 TTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTT:2 + chr2R 4659345 3' - S-element 1465 1 44.55 ATTTATAAAAATAAAAATAAAAAACACAAAACTACAAACATTTTTACAAAATACGTTTTCAATGTATGAATTGTAATTTTATCCGCCTAGAACAATTTTGC:1 + chr2L 10683491 3' + HMS-Beagle2 479 1 66.34 GTGGACTGTCGCTGTCATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAACAATAATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCAGCTGTTAAAGTGACAATGGCATATGAACAA:1 - chr3L 17878745 3' + hopper2 376 1 69.31 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGTACCACAGTGCAATGGCAAATCTTATGGTCAATATTTTGGCAAATATTCGCAT:1 - chr3R 31256986 3' + transib2 2788 1 62.38 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTATCAAAATATTT:1 + chr3R 27981738 3' + roo 9047 1 54.46 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCA:1 - chrX 16995125 3' - jockey 59 1 73.27 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACACTTTGATTTATTGAC:3 - chr2R 14778409 3' - mdg1 3 2 77.23 GAAATGCAGCATCGTAATCTATTGGAAATTGTAAATGCCGTGAGGGGCTCGCAGACTACCCTATTCAAAAAAAGGAGGATGCTGCCAGTCAATAGGGTCTT:1 - chr3L 4233390 3' + invader6 454 1 58.42 CGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAAAAAAAAAGGAAAAAGAGGAATAGTAAACGATTGGATTAGAAACGCGACAACCATACACTTTTAAAAA:1 + chr2R 18145957 3' + Bica 307 1 75.76 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGA:1 + chr2L 19481334 3' + roo 361 2 72.28 AATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAGCGCATCAGCAGCGACGCTGGC:1 - chrX 17074838 3' + mdg1 6997 1 78.22 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCT:1 + chr2R 13644479 3' - Burdock 52 2 80.20 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGG:1 + chr2L 14790653 3' + roo 9044 1 52.48 AAATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGT:1 + chr2R 14793489 3' + Dm88 7 2 77.23 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTT:1 - chr2L 17210303 3' + jockey 4943 1 80.85 AGCACCTTTTCAATAAACAACATGGGAAGGCTCTTGAATATAAGCAATGCCCACATGTGCATATGTAATTTTGTATGAGAACATACATACATACACATGAA:1 - chr2R 20670577 3' + 1731 315 1 76.24 GTGTGTGAGTCGAGTGGCAAAAAATACCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCGAGTGGCTGTCTACTTGAAAACAATCTGTGTTTCTGTATGTGTATTGCTGTAG:1 - chr3R 20100524 3' - hobo 25 1 72.28 TCACTGGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAACGACCTACGCCAACGCGCTCA:1 + chr3R 8477747 3' + P-element 2832 1 22.77 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTACGAAAGCGTCGTCGGACTGGAAGG:1 - chr2R 23571622 3' + roo 386 2 56.44 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAACGGCAAAT:1 - chr3R 7522277 3' - blood 7019 2 71.29 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAA:1 + chr2L 13319646 3' - hobo 28 1 54.00 GACATTATTCAGCGTGGACAGTCAACTTCTTCTCTATATAAATTTACGTATATACCATCTCCATTCGAACACTAAATGCATTCAATACAATGCTTTGCCCA:1 + chr2R 15453663 3' + Doc 4337 1 77.23 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCCG:1 + chr2L 20706745 3' - mdg1 15 2 64.36 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATAGTATAAAC:1 + chr3L 2019717 3' + 412 7506 2 67.33 AGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTGGGGAAGCCGTAGGAGATCTGAGGAATTCAGTGTTTTGTCTTCTTGATGGGAGGAGTGTGATCATA:1 + chr2R 23038288 3' - Quasimodo 345 2 74.26 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGAAGGGAACACGGCACCGACTGTTCGTTTT:1 + chr3R 13538975 3' + hobo 2906 1 71.08 GCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCCAAGACGGAGACCTAGGAATTTCATTA:1 - chr2R 7552231 3' + springer 360 2 55.45 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAGTCGATGGATTGCCATGGAGTTCAGACC:1 + chr2L 6525089 3' - jockey 4787 1 74.26 GAATTCTTTATTACAAATATGTATAATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGAAGTGTTTCTCAGGACATTTTGGGCGGCAGCTGAGG:1 + chr3L 13926510 3' + accord2 7517 1 65.35 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTT:1 - chr2L 12949217 3' + 412 463 2 61.96 AACAAGATGCGTAACGGCCATTCCTGGGTTTGCCACGGTTTCCCACGGTGTTTTCTGCTTACAATATGCAGTCGGACTGGAATGGAATGAAGATTAAGCTG:1 - chrX 12806117 3' - 1360 3373 1 78.22 GCAAANCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCG:1 - chr3L 19951210 3' - Ivk 42 1 63.37 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTT:1 - chr2L 17210267 3' + jockey 4972 1 58.42 TTCATTTAACAGATCGCTTGAATGTTTTGATTTTGTGTTTTCGTGCACGTGTCCGGCGAACAACGAGTGTGAGATTAACAAGCGGAGACGCAAGGCCTGCC:1 - chr3L 8184528 3' + Cr1a 365 1 55.45 AGATTTTTTGGTATAATTTGGTATTTTTGAGGAAAAATATGAGTTTTTGTATGTTATCTAGAGCAGAGATGCTGCAGTGGGTCAGTTCAGATTCACTAGGA:1 - chr3L 10215744 3' - I-element 5172 1 56.44 TTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTC:1 + chr3L 18337699 3' - Juan 4065 1 64.36 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGCTGCTGCTGCAGAGGAAAAACGGATTTTCCAGGCTTGCAAGTGTGTGTGTTCGT:1 + chr3R 5684766 3' + P-element 2867 1 61.39 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAG:2 + chrX 13508745 3' + roo 9028 1 70.30 AACGANTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCATG:1 + chr2R 20744245 3' + roo 397 1 61.39 TTATCCCGTTTATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCAATCGGTTGGACAAGTGAGTGTGTGGTGGGGTGACTCTTGGTTCCATATTGGGGTCACTGGT:1 + chr2L 13592440 3' + diver2 436 1 59.41 TGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTCCTCAATTGCCGCCCGCGATTGGAGCCTGCGATTTGCGAAACGCATAGGGTCCTCGATTGCAAATCG:1 - chrX 20576830 3' - Doc 4473 1 70.30 CTAAAGAGGTATTGAACATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGGATTTTATTAGTGAGTGGCGAAAATGACAGGGAGTTTCAAGCATTGGAGCGGAAGGCCACAA:1 + chr3R 10460711 3' - accord2 7370 1 59.41 TCCTCTACAATACCGTGCTGAAACCCATCTGGACATACGGCTGTGAACTATGGGGAGCCCCATAATTCATCCAACTTTCACAGCAAAGACGACCTGGCACT:1 + chr3R 26854342 3' + Doc2-element 4334 1 55.45 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATATTGTCCAATTCTTAGTTTCATATTGCATTTATTTCAGT:1 - chr3L 9766344 3' - blood 34 2 60.40 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAAGTGCAGGCCATAATAAATTGCTAGCAATCGCATTTCCGTTTCT:1 + chr3R 29470854 3' - hopper 28 1 54.46 ACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAAAATAAATACAATTTTCCAAAAGAAAATGCTGACAAGTTTTTAAAATATTCATAAGCACACCTAT:1 + chr2L 7274023 3' + F-element 4541 1 68.32 ACAAAAACAAAAAAAGAAAAAAAGAATTGTACGAAATTCACCGGAAACGAGGCAAGAAACTTTCACTATTCGTCTTTCAGCCAGACATGGGCCA:1 - chrX 11234891 3' + G2 3076 3 76.60 GTCCTTTCGTCGGAGATGGGAACGACTGCTGAGGTGGGTGTTAGCGCTATATTTATTCAGACGGCGTTGATTATTTTTCTAATTTATTCGCACATATTTGC:1 - chrX 16569550 3' - F-element 4513 1 62.38 TATTGTTCCTGATCAAGAATTTATATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATGAGTAACGGGTATAAAAACGAT:1 - chr3R 31045699 3' - INE-1 84 1 74.26 TGAGCTCGTTCCCGCATAGTTGGCATATTGGTAGCGCCGTTCTCATCAGTAAGTAAGGCTTGCCTTACATCCTTCCCTCAGTTGTTTATGTACTTATATTG:1 - chr2L 9061452 3' - Ivk 5114 1 54.46 ATGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCTGTTGCTGATCCGCGGACGTGAACTGGAGGA:1 - chr3R 5658637 3' + micropia 182 2 75.53 ACAAAAATTGCAGATGTGGATGTTACAGGAAGTGAACATAAAACAAAACTTCGGGTCTACTTCGAAAAAACCCAATTCCTATCAACGCAGGCAGAGTCAAC:1 - chr3L 25512908 3' + I-element 433 1 61.39 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAAGAAAAACATCAACATTTTAATTAAAAATGTCTTGTCTAACTTTATTCATT:1 - chr3R 26255844 3' + jockey 4945 1 66.34 TCTTTGAGTCATAAAAGGGTAGTACTATAGTCAATATCCCTAGTGAAATAGAACCGTTCGGGGTACAGTTTCGACTTGGCCAACTGGCGGTGAAGGAGG:1 + chr3L 2170120 3' + baggins 5379 1 70.71 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCCAGGGCAGAATCTCTTTTTGGTGCTTA:1 + chr3R 11688484 3' + 1360 3339 1 78.22 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAACGGGCACC:2 + chr3R 6608842 3' - I-element 23 1 57.43 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACATTC:1 + chr2R 17345917 3' - jockey 64 1 79.00 TGTTGGCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATAAACGCAGAACCACCCTTGTATCATAAATGTTGTTTATTACTGCTGCTGTTGTTGTTTATT:1 - chr3R 4543977 3' - flea 4768 2 68.32 TGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCTTAAACTTTGGGTCTAACTTTGTTTGATG:1 + chr2R 1370420 3' - jockey 4614 1 71.29 TATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAAACACAATGGAGCATAAAAAAGTTTGTTTGTAGG:1 - chr3L 5126194 3' + jockey 4854 1 70.30 AGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTCTCAGATAAAATGTGGAAAAAATGACGGAAGAGCTTTAAATTTTATTACGATTTATTTTTCGTATGG:1 - chr2L 15510377 3' - jockey 4677 1 70.30 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTATGTATCTA:1 - chr3R 27748647 3' + roo 396 1 66.34 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGT:1 - chr3L 12103804 3' + roo 9023 2 76.24 TACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTTCGCATAAAATTTCACACACCATTTTAGCCAAGT:1 + chr2L 12931695 3' + F-element 4448 1 66.34 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCACCAAACTGTGCAGTGAACTCTGGAGCGAAGCGGT:1 - chr3R 6273484 3' + blood 7387 2 76.24 TGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCCCAGGGAAAAGCGCAGCCAAATTTGCCAGCA:1 + chr3R 10290884 3' - 1360 112 1 68.37 ATCGANTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATACTCCACTCTGAAATAAATAAATATATTTTAATAGTCAGGGCTTATTTTTTAAAAATATTTTACAATACC:1 + chr3L 7719020 3' - INE-1 95 1 79.21 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCTTGAAACGAGAAGATCCTATAAGCAGGTGAATGAATCGGAAAAGCTGGTTTGGTGACTCGG:1 + chrX 17968451 3' + Tirant 385 2 65.35 TCGTTACAGTAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTTCGAACTGCGAACTGATCCAAGTGGCATCTGCTTATCCTGTCGCCCATTT:1 - chrX 12425310 3' - I-element 491 1 50.50 TTTCAATTAAAATAATTAAAATAAAATGTCCGAACGCGTTAGAGGCACGAAACACCCTTTAATTTTGCCTCAAAATTGTAGAGGTGATAAGCGACACCGAG:1 + chr2R 5627651 3' + TLD2_LTR 97 1 76.24 TGTTTTGGGCGGTTGTAGGGCGTTAAAGTGGTCGTGGCAAAAAGTTTTTGCCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTATGCACATACATTTTTTAAATTTAA:1 - chr2R 5119909 3' - INE-1 346 1 62.38 GCACACACACACACACATACATACTTTTGGTTTATGTTTGCATACTTTGCGGTTCTGGGACTTCCAAGAAGCCACCAGTTCCTGGTCCAGTACTCCG:1 - chr3R 14928066 3' + Quasimodo 37 2 63.92 GTTCACACTATAAACTTGTGCGAACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTGTTTGCATCTAACACTTCAATTGCCCACTGCTGCGTCGGCGGTGGGAATTTGTT:1 - chr3R 11362982 3' - rooA 7599 2 63.37 ATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAGAG:1 + chr3R 29331926 3' - G6 23 1 56.44 CCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTGATAAACAAGTGAAAACCGTTGCTCCTTGCTCTCTTTTCACCTTTCGTTGTTGCTGCGG:1 + chrX 2545914 3' - flea 387 1 64.00 ACGTGGTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGATGCCGTCACCTTTTCTGTGATTACCC:1 - chr3R 19346878 3' + blood 7373 2 60.40 CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGCATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAA:1 + chr3R 7168625 3' + flea 4972 2 74.00 GTGCTNGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAAAGCAAAAGGAAATAATTAAATACGAGTATAATAAATATTTTTTTCAAATA:1 + chrX 12772831 3' - 1360 3196 1 51.49 TTAATAAAGTACAAAAAAAAAACGGAAAAAGTAAAAAAAAGGGGAGCATTTTTATTAAATATTTTAGAATTTTAGAACAAACTTATGAATAAAGAAAATCC:1 - chr2L 19648372 3' + BS3 1767 1 87.13 TATCGNGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACAGTATGTGTGCGTTTCGCTTGGCTATTAAATTTCCAGTTCAATGATTAAC:1 + chrX 992094 3' + hobo 2916 1 56.00 CCATTCATCATAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCGATGAAGATGTTTGTATTATCATTAGCCGTTGGTACCCGTACTTATCAACGAACCCAAAATT:1 - chr3L 32844 3' + I-element 304 1 37.89 TGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGCCATTCCTGGAGAATGGGCTTAATGGATTTTCCCTCCGGCCTTCTTTCAATACAAATTCCGTCAC:1 - chr3R 20147868 3' - 1360 262 1 59.41 CATACACACACACACACATACTTTTGTATATATACACGAAAAAC:1 + chr2R 10548551 3' + Quasimodo 36 2 93.18 CATATACATACATATGTACATATATAAGGCGGGGATGTGTGGCTCTCGATGGTACGTACATATATCCGTCTTATCGGCATGCGTCATGCGAGCTTCTGGGC:1 + chr2L 19035315 3' - G3 4508 1 62.38 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTACTT:1 + chr3L 17168898 3' + mdg1 379 2 68.32 ATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACATCAACAGCTGGAGAGCAAGCCGTAGTGTGCCCGCTTCGCTCGCAACCGAGCAAAAAGCAGCCAAGCA:1 - chr2L 2784621 3' + F-element 392 1 53.47 TTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCAAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAAT:1 + chr3L 17667614 3' + P-element 2617 1 29.70 CTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTTAAGGAATCTAGTATACCCCTTTACTTTACAGTTGATTCCAGTGCGCGAGTTGGCAGCTCCGTGCGTACACAAAA:1 + chr3L 837838 3' - INE-1 28 1 58.42 GTATGGCTGTTCTTATGTGGTTATGCACTCGTTAAAGTAATGAATAGTAATGTATGGTGTCTTAACCGATAGGTGCAAGGTTTCTAAAAGCTATTTGTTTG:1 - chr3L 13968522 3' - Quasimodo 59 2 77.23 TTCTTAACCGTTTGGTTATTGTTTTGCATCTATCGTATCTCTGTCTGCGTCTGCATCTCGCAAAACTTCTGCTAACGAAATTTGCAACTTAAAAAATTTGT:1 + chrX 2917076 3' + Circe 60 2 66.34 GGTAACGGTGCGTGCACAAAGAGGACGCATCGTGAATTAACGGTACAATATGTGGACCTTGTACCTGAGCGGCCCATGCGCAAAAAGGGGGAAAACGGGAT:1 - chr3R 14499106 3' + gypsy8 145 2 82.18 TAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCACTTACATATATACTTATATACTTATATACTTATATATTCAAAAATGCTGGCAGTTTTTTAAGTGCAC:1 + chr2R 20952618 3' - rover 6956 2 66.34 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTC:1 - chr2R 24628776 3' + mdg1 384 2 73.03 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTA:1 + chr2R 23580806 3' + P-element 2839 1 29.70 ATGTGACGGCAGTGGTTGTGGGAATTTTATTAGTGAGTGGTGAAATAGAAAGGAATTGAATTGAACATTTCCGGGTGG:1 - chrX 20531490 3' - accord2 7353 1 74.36 ATAGCNTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACAATGTATAGCCACCCCCTGCCGCACCC:1 - chr3L 15288025 3' + accord 6973 2 73.27 ACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATATTGCCAAACCAAAGACACTAGAATAACTAGAATTC:1 - chr2R 6947351 3' + 1360 3262 1 47.52 GTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATTCACATGAAACCGAAAGCAGGCGAACGCATTCAATAAATTAATTACGAATTTCGAAC:1 - chr3R 22170396 3' + Quasimodo 11 2 64.36 GTTCTGACTATAATAGACTTTATCTTATTATCTTTAATCTTGTCTCTCTGCTTACTTCGCGGCATTTTCATCTGTGCGCATCCCACCTGCTCTCGGATTTC:1 - chr2R 4879506 3' + Cr1a 4200 1 58.42 TATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACATACACTTGCACACATGGCCCTCTTATCCTGGCTGCTGTTATTTGTTCAGCGTTTTATGCACTCGCTGCGGCG:1 - chrX 14421772 3' - invader2 5092 2 78.22 CCTAAATTAGAATCTCACAGCTGAGCGCAAGCTTCATAAGGTTTTATGTATGTATGTCCAGTATTGTCTTCCCTTTTGCACACATTTGAGAACGTGCAATT:1 - chr2L 21734538 3' - Gypsy12A_LTR 68 1 60.40 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTA:1 - chrX 8972373 3' - 1360 26 1 54.46 AAATCTGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAA:1 + chr2L 14612097 3' + roo 9037 1 52.48 GCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAATAGTAATTGTTTGGCGCTTAATTAGC:2 - chr3L 6044713 3' - Tabor 6 2 73.27 TACAATAAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCACATCAGCAATTGTAATTCGTAATGCTGTCTCAACTAACAAT:1 - chrX 14798186 3' - I-element 487 1 68.32 CTTTAAAGTCAAAAATTTAACTTATCTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGTATGTATGTATATAGAAAAACAAATGGACTAGACTTT:1 - chr3R 29867952 3' + S-element 1679 2 68.32 TTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTACGATTTTTTATATATGAGAATTATAACCGCTTAAA:1 - chr3R 8975915 3' - Bari1 8 1 72.28 ACACAACTGTTTGTGCGATCGCGTGGCAGCTGGGCAGCGGAGCCCCAATAGTAATTTTAATTGTTACATTTATTTTCATTGCAAATTTTAAAATTTTTATG:1 - chr2R 3262683 3' - X-element 228 1 58.42 AAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAAACGGGAGCACATGCACCCG:1 - chr3L 9006992 3' + I-element 5147 1 80.20 AAGAAGACCCCTAAGCCGCCACCAATCTATTGTACATGGACCTTATTAGAAAAGACAGTTTCCACGTCATTTTATAGGAAAGAAGACCGAAGGTGTGTAAC:1 + chrX 741039 3' + Fw2 194 1 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATGTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCG:1 - chr3R 10952250 3' + roo 396 1 62.38 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGGTTGTGGAGGCAACAAAGTTTCAATATTAATGCCATTTACAGTTCTAATTTCGC:1 - chr3R 27801263 3' - Burdock 6154 2 61.39 GAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATAAGAGTACTCAGACAGCTTAGGAATTTGTTTGATGAGAGATTGATATCGCAGTGCAAGAATTACGCATTCAG:1 + chr3L 12666525 3' + 1360 385 1 63.37 GATCAATAGCCAAGTCGATCTGGTCATATCTGCCTGTCCGTCCGCATAAACAAGATGTTAGGAGCTATAAAAGCTAGAATCAGCTTTAAATCTGTATTCTT:1 - chr4 628235 3' + INE-1 98 1 79.21 CAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATGATTTAAAGTGAAGCATAAAAAAGAATGAAGAAAAAAAATTTCAGATGCGGGCTCTTTGTTGAACCCGTCAAAATGG:1 - chrX 11260080 3' + G2 3077 4 85.15 AAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGGTTGTGGAGGCAACAAAGTTTCAATATTAATGCCATTTAC:1 - chr3R 27801277 3' - Burdock 6168 2 61.39 TATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATAC:1 - chrX 15355080 3' - X-element 4710 1 60.40 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCATC:1 + chr3L 17587841 3' + roo 9033 1 64.36 CATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGTTGTTGTTGGCTGTCGCCGAGGCT:1 - chrX 19425642 3' + mdg3 109 2 76.24 TCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAACGTCGACGTGTCGATATAAAGGCAAGTATCGAGAGTCGCAGGTGGGCGCCAGAAGGCAGAGAAGGCGG:1 - chr3R 5805700 3' + R2-element 426 1 56.25 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCCATTGCGTTTCTTTGC:1 + chrX 2776156 3' + 297 362 2 60.40 GATGANTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTC:1 - chr2L 4160119 3' - Tirant 28 2 53.47 CCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATTATA:1 - chr3R 7168556 3' - flea 21 2 58.42 TTGTTATATGTGTTTGTTATGTACTGTATTATTATTGTTAAGCTATGCATGGTTATTTTTCTATTCTTAAAGAATAGAATATAATACCCTTTAAAATAACT:1 + chr2L 19399333 3' + X-element 4573 1 69.31 TACAANAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACAT:1 + chr2L 2074784 3' + roo 9049 2 59.41 GAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTAGTGGGCGAGCGGGGAAAAGGTGGGGCAGGCTGGA:1 - chr2R 6697360 3' - F-element 4584 1 65.35 TAACANATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAAATTTACGCATTACGCAAAAATTAAAAATTTTTGAATTGCTTGTTTGT:1 - chr2R 22317220 3' - BS 5023 1 54.46 CACACACACACACATACACAACACCCTATAATTTTCGACTGGCCTCTTCTCGGCAAACTCTGCGTATTATATGTGTGAAATGGCGGCAAAGTGGAAAAGTG:1 + chrX 6498922 3' + Quasimodo 40 2 70.30 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTATAATTAACTATTATAAAAATGATTGCCACTTAGATTGCGACTAACCGGAATACTTGTG:1 - chr2L 20706660 3' + mdg1 7426 2 54.46 TTTCAACATAAGAGTTTCTTTTTGGTTTTTATTTTTTTCTTTCTCACTTTTTTCCCTGGCATTAGACACACTGTGCTTGGGAAGTGAGTTAACTTCGTCGC:1 + chrX 16765266 3' - Bari1 1417 1 80.20 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGTT:1 + chr3R 6622708 3' + P-element 2858 1 52.48 GGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGCCGCCGTTCGACCCAGAACTAAGGGCAATTCACTTTTGTTTGGAGCCGGGACCCCCATATTCCAAATAAACT:1 - chr3R 31196866 3' + Transpac 5225 2 71.29 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACTT:1 - chr3R 17896954 3' - hobo 43 1 76.24 AAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATAAGTGAACGAGGGTGTGGGAAAACGAAATGGCTAAATGAGCCCACAAAAGGGTCACTTAATGGAAAATGT:1 + chrX 19116961 3' - opus 7114 3 78.00 GACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTGTGTTTGGCCTGCGGTGATATTGC:1 - chr2L 9222867 3' - I-element 11 1 45.54 ATGTTAGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACCGAAGACCTGTCTTCTGAGTCCATGCGAGAAAA:1 + chr2L 22079757 3' - copia 198 2 65.35 ATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCT:1 + chr3R 1977624 3' + micropia 428 2 50.50 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGCCGAAAAAAGGC:1 + chr3R 12539573 3' - roo 8685 2 59.41 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATCAGTGTTGCCACTTGTCGCAAAATAAGTGAAAA:1 + chr3R 8313138 3' - 297 13 2 66.00 AAATCTATTCAAATTCTTGGTTAGAACATCTGCCATCATGTTTTCTGTGAATACATATTTGGTTGAAGGGTGGTTCGTTTTTTTCGGTACTTGGCCACAAA:1 + chr3R 19433846 3' - Dm88 4225 1 55.45 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGTCTGCCTG:1 + chr2L 14579929 3' + copia 247 1 69.31 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCA:1 + chr2R 7861716 3' - roo 8713 2 80.20 GTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACATATTAAATAATAATAAATAAATAATA:1 + chr3L 15539041 3' + invader3 5411 2 81.00 GTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTTCAAAGCACTGGTATTTTAGTGAACACCAGAAACTTATCTTTACTGATAATAATGTAAAGAAACCAGCTTTTT:1 - chr3L 23125970 3' + HB 1394 1 59.41 AGTCANACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATGTATGAAATCCCGGCGTAATGAGCGACAGTTGATGATGCAG:1 - chr2R 20952526 3' + rover 7270 2 58.00 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAGTAATTTTCACT:1 + chr3L 11661808 3' + hopper 1413 2 71.74 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTTTCAGCACAAACATTGCAAGTTCTGCATTTGCT:1 + chr2R 16475803 3' + 412 452 2 64.36 TCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTAGAATTATAGACCGTCTTTGTCTTAC:1 + chr3L 24208242 3' + 17.6 337 4 75.25 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTTTCCCTG:1 + chrX 5092997 3' + roo 9055 2 48.51 CGAATATGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTAGCGTCTTTTGTTGGGTAACGGTAACAAACATATGTTTGAGCAATATGGCTGCCC:1 + chrX 20436859 3' - accord 186 2 75.00 TATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGAAGCCTAACCCATACCCTTCCCATCGAACAGTTTCGTTACTTTGGAACTTAGATTTCGATTCAATAGGT:1 - chr2R 23579844 3' + P-element 1 2 68.32 CAATTACTTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGA:1 - chr3R 11841097 3' + hobo 2555 1 74.26 CTTGGCGGCCTTAATAAATTTGATTTGTAGTCAGTTCGTAACAGAACCAGAATTAAGATCCTAGGCTAAACAACCGCAGCCTAATCACGCTCCACCTGCCA:1 - chr2R 20400693 3' + gypsy10 5895 2 59.41 GTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACG:1 - chr3L 10081928 3' - rover 20 2 57.00 TACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATGTACGAAAGAAAGCAGATCAAGAAATGGGAAGTGTCCTAAAATATGAATGATATGCGACATCTGC:1 + chr2L 12475060 3' - mdg3 5264 1 69.31 ACAATAATTAAAATTGTTGTCTGTTAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTTGTTCAAACAAGCATTCTATATGCGGATATCGTTGGC:1 + chr2L 21635623 3' + gypsy4 254 2 68.32 ATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCAGTGTAAGGGTCATGCAACTCAAAGTTAGATCTACAGCAGTAGTCCGAATTACCAACCTCAACA:1 - chr3L 23244138 3' - Cr1a 4206 1 72.28 GTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTCCACCCCTAAAAGACAGTGTATTTTTATGCAGTGGCCATAA:1 + chrX 12290265 3' - X-element 15 1 72.28 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACAACCCCAAAAAAAGGG:1 + chr2L 285736 3' + P-element 2850 1 34.07 GTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTAACTTGAGTTGAGCTGTGGTTTATTGAGCAGCTTTTTTAGAACTAAAGTACAGACAATATT:1 - chr3L 25772983 3' - gypsy4 23 2 55.45 CGGTCGCCTGTGAAGCAATTTGTACTTGATTTTGTTTGTTTCATTTGTTTTATTTGCACTTGCACACTTACACATTTCACTTGAGATTGTGGTTATTTTTT:1 + chr3L 16431156 3' + accord2 7226 1 64.36 CAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGA:1 + chrY 3648898 3' + 17.6 479 2 63.16 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATGTCTAAATTTTGTCTAGATTGTTTCCTCTACTTATATATTTATATCTTTT:1 + chr2R 3592061 3' + Quasimodo 7341 2 54.46 TTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTTTATCCACCAAAAAGGTAAGACGAATCTTATAA:1 - chr3L 7075844 3' + roo 410 1 79.21 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATA:2 - chr2R 13644431 3' + Burdock 6357 2 62.38 CAAAAAGGAAAAAGAAATAACGGAAAAGACGGAGAGCATAAAGACGACGAAAGTGACAGCGAAGCTGGAGATAGCAACGTTAACTGTTTTGTGTGTATTTT:1 + chr3L 18708706 3' + invader2 498 1 78.22 TGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTGTCTTTTACACCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 11129747 3' + blood 167 2 76.00 CGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAAAG:1 + chr3R 29331924 3' - G6 25 1 54.46 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGGTTTTCGTAAGTCGTCGTTGTAGCCTACGCGTATTGTACATTTTA:1 + chr3R 26842903 3' + opus 499 1 78.22 GAACTATAAAAGCAAGAAGGTAGAGGTTATGCATACATATACCGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACTTAGGAAACCAACTCGATGGGCATATCGGTAAAG:1 - chr3R 15949731 3' + INE-1 158 1 45.54 CATCAGCAGAAATCATGATCAGCTGAAAGTCACTCCATTCACGAAAACCTAATTATCCCAAAAATTATCAAATAATTTAAAAAAAATTAATACATATATGT:1 - chrX 14755641 3' - Gypsy12A_LTR 207 1 60.40 CGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGA:2 - chr3R 12047423 3' + Stalker2 361 2 61.39 ATTTCTTTGTTATATTGTTTCTCAAAATGTAATTAAAACAGATCCAGATTCCACAATTCTGAGTACGTTATCAATCGCGATAACCCTGTAACTTTCAATGA:1 - chr3L 25206381 3' + TLD2_LTR 182 1 57.43 CATATTATGTTACTTCCCTCCCTTTAAAAGGGAAGCTTATGCTTCCACTCCTTCTATTGGGTTTCTTTTATACGGTTTGCTCATGTTTGTGATTTTTATT:1 + chr3R 7303976 3' - rover 6944 1 60.00 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAACGGGTATGGAGAAGTGTTTGTTAAGTTTTCCTGCCCCTAGAGGTACTTTTCCAAAGAGTGGAA:1 + chr2R 20816521 3' - hobo 8 1 72.28 AAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCAGACACACACACACGCACACAAATACACACACACAGCAAGGGCTGGCAACTTAAAGTG:1 + chr2R 22752180 3' - GATE 8271 2 51.49 AGAATTTTAAAATATTTGGGATGTTTGTGCGAGTTACATAAATAAATTAAGAACATCTAATTAGCATAAGGAAATAAGAATAGATGTGTATAGATAGATGA:1 + chr2R 7553706 3' + springer 489 1 58.42 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCGTCCTTCTCGATGAGAAGTTGCAAAATAGAAAAG:1 + chr3R 10147919 3' + roo 399 1 72.28 CTAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATGAAATGCCCTATATTGGCGAGACAGCTTTTGTGCTGTACCAATTTAATACCTCAGATGGAGAAAACAG:1 + chrX 21258883 3' + S-element 368 1 64.36 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACC:1 + chr2L 1625689 3' - hobo 55 1 80.20 GAAACNTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCG:1 + chr2L 4160174 3' + Tirant 346 2 78.22 ATATTATTGTTATTATTATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGCGACCTCCTTAATA:1 - chr3L 18284577 3' - mdg1 7061 6 58.42 AGCAGTAAAAGTGATCTGAAACCGGATCAAAATAATTCGCGACAAAAGAAAATAACGGTGAAATCGTTTTCTATAAACATATAAACCAAAACAACAAAAAC:1 - chr2R 24698953 3' + gypsy9 347 1 39.60 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAA:1 - chr3R 22431080 3' - Max-element 8278 2 64.36 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTG:1 + chr2L 8565540 3' - blood 18 2 67.33 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTTGAGAACATTT:1 - chr3R 16457971 3' + roo 404 1 75.25 AGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTCGGATCTTCGTGGTCGCAGAATGGTTA:1 - chr3L 4423522 3' - 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hopper 29 1 52.00 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCG:1 + chr3R 25671975 3' - I-element 39 1 61.39 TCTTTTTTTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTATGTTTTTCACCTTTTTTGCGAATGCCTTGCTGGCTTACTTGAATTAATGAGGGTCAAGATACTTGGGCTTTG:1 - chrX 1303884 3' - Doc2-element 224 3 80.20 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATCAGCTTTTCAGCTCCCATTTGGGTGTTAGTTTTGTTTTAAGATCCAATG:1 - chr2L 9774268 3' + 412 465 2 53.47 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTT:1 + chr3L 18706947 3' + jockey 4967 1 55.45 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTGTATTTCGTATTTATAGTTGCCATTT:1 + chr3L 17344966 3' + mdg1 374 2 70.30 GATCAGGACCAGGTGGTGGCCACGATCGGTGACACTTGAAACATCTGACTGACCTGACTGGTGATCCAATTTCGATACTCATTCTTCTGATGACCCATCAT:1 - chr3R 28606875 3' - Chouto 406 1 79.21 CTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATACGTACATACATATTTGGCCATGTACAACTTTCTTGGC:1 + chr3R 4865278 3' + 412 169 2 76.24 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGGGACTGTCAGAGTGAAATGCAGCATACTTT:1 - chr3L 18500926 3' - hobo 9 1 68.32 CAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCTCTCATAATAAAATAAAGCACAACAAATAAATTTTTGTTTGAATAT:1 + chr2R 5997576 3' - F-element 4596 1 61.39 CCTTTTTTAGCCAGCACAGCCTTACACCTACTCGTCCAGTAATGGTGTCCACTAATAGGTGATTCAATTTGGTGTCAAACGCAGCTACATTTGTAATCGTA:1 + chr4 1023262 3' - HB 1310 1 71.29 GTAAGCTTATTGGTGGTGATGTTGAGAGGCCCGACTTGATTATTCGGCTTAACTTCTCGGTTGGTGGGCAATGATGATGTTTTGGCATTCTCATTTCATCG:1 + chr2R 20738570 3' + Cr1a 4050 1 61.39 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGCCGAAAAAAGGCTTATT:1 + chr3R 12539578 3' - roo 16 2 64.36 TATAATAAAATATGGAAAATAAATGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGCATTATGATGGAACAATATCTAGTCAAATGAGAAAATAAAAATTAAAACAACAA:1 - chrX 22980736 3' + transib2 260 1 53.47 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCGAATAAATTTAATAACGTGAATAATGCCACTAAAAATAATTCACAAAAACCCAAAGAG:1 - chr3R 17853309 3' - roo 12 2 63.92 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTT:1 - chr2R 7861673 3' + roo 9030 1 70.30 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAACGAATTA:1 - 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flea 4783 2 61.39 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGT:1 + chr2L 8565511 3' - blood 7058 2 72.28 GCATTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATGGCCGCTGAGTGCGTGTGTCCTTTTATTTCATTGTTCTGATTCCAAATAAAACAATTTCCAGA:1 + chr3R 16074013 3' - Doc 260 1 69.00 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGG:1 + chr3R 26842859 3' + opus 7458 2 78.22 ACGGCCACACTTCTCGCCCAACCGACCGAGTGTGTGTGTGCGTGTGTATCCGCATGCAAGTTGAAAAATGGGACTCGCTGCGAACTGCTGCGAAAA:1 + chr2R 10234739 3' - Cr1a 4429 1 73.96 CGACTATCAGATACCCTTTACTTTGCTAGTGTGAACTTACTTTTCAACGAATCTACTCTACGAGTAACGGGTAGAAAAAGCCATTAAGTTAATCTTATTTT:1 + chr3R 23020990 3' - INE-1 550 1 45.54 TTTATTTTATTTTATTTTCTTTCTACTTCTTCACTTCGCCTGCACATTCAAACCACAGTATCCCGCAACAAAATGTTACAAAACTCGAACGGCGCTGCCGC:1 - chrX 20490842 3' + transib1 1902 1 56.44 AGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTGATAATCAACATGAAAATCAAATTTGAATTTATGAAGCAACCGGGGAGAGGAGTCGGGCATTATAGCGT:1 + chrX 6388477 3' - 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F-element 132 1 60.40 GCCGAGAACCCTGATGCAAGGGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTCTG:1 + chr2R 16988258 3' + opus 482 2 54.32 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTATATATAGTAATAACATAACTGCATATCCTTTATTGTCGCTCA:1 + chr2L 15808062 3' - I-element 9 1 67.33 AAAATAGCTGAAATATATCAAATTTCGCGTAGAACTGTCTACTACTCGTTAAACAAGTTGATAGATATAAAAGGGAATAAAAAAAGGATAACAGCAGGAG:1 + chrX 10710182 3' + Bari1 457 1 61.00 TTAAGAGCGGCAAAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAATATATGTAGGAATTCGTTAAATACTTTATCATAATCACAAGAATTTCAGACTTGTATTGA:1 + chrX 6117959 3' - Cr1a 4238 1 57.43 TTTCTTTCTTTTTATAACTTAGAGGAGGCACAGGATTTCCATGGCAGGATCTGCTACGAACCGCACGAGACTCTGGAGATTGTGGCTCACATTCGATTTCT:1 + chrX 18066976 3' + Chouto 113 1 75.25 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAG:1 - chr3L 17918391 3' + 297 6932 2 78.22 AATGGGAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCTATGTGCAGCTTTCCGTGCTCATC:1 - chr3L 22831261 3' - 297 6599 2 53.47 GATGANTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAAT:1 + chrX 2649894 3' - Tirant 28 2 53.47 AATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATCACTTACATATATACTTATATACTTATATACTTATATATTCAAAAATGCTGGCAGTTTTTTAAGTGCACC:1 + chr2R 20952619 3' - rover 6955 2 67.33 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGTGCTGTTGCATCGTCTTGAAGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAAC:1 - chr2R 4802888 3' - 412 27 2 49.50 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAGCGATA:1 + chr3R 11094599 3' - 3S18 5771 2 73.27 AGAAGCCTCAGTATTTGAACAATAGTTATATTACAGGGAGAGTAGTTGCTTCTTAGACTGCGGTGTCTGCGTGCCTTTGGAAGCCATAGAATTTCACTTCA:1 + chr3R 851800 3' - 297 233 2 72.28 CTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCACCTTTTCAAGTTAGTAAAATTAATGTTTTGACAATAAAAAAAGCGCGACGCTTTGCTCATGTTATAGGTTATTAA:1 + chr4 1077460 3' + HB 72 1 73.27 CGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGCTTTCAAATATGGCCACAGCACATATGGAGCTCAACTTTTTGGCATAG:1 - chr2R 11077559 3' + HMS-Beagle 385 1 55.45 TGTGTTTATTTATATATATTTATTAAGTGAAGAATCCTGTTTTTATGGAAACTATTTGACATATACCTCAAAATTTTCCCATGAGGGCAATACAACTTATG:1 - chr2L 21860301 3' - Tc1-2 483 1 58.42 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAAGTCCCAAAATCTCACATTTCCGCAGACCCAATAATCCTTTGCTTTATTAAGTCATATTTCAACATGAAGTTG:1 - chr2L 20718345 3' + mdg1 391 2 74.26 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCAC:1 - chr2L 4160130 3' - Tirant 8146 2 62.38 TATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTT:1 - chrX 20885964 3' - Ivk 5370 1 55.45 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATA:1 - chr3L 2019674 3' - 412 50 2 75.25 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAATAGAGCGTTTCTTTGTTCCGTCATCGTAGAATAGGTGAGATGTGCAAATGGTTGGG:1 - chr2R 15474781 3' - roo 20 2 59.41 AAAGTNTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTTGTGTCATACAGCATCT:1 - chr3R 11263367 3' + roo 404 1 74.26 ATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCATGCCCCAATCGCATTAGGAGTTCCCTCAACACATCTGCACGCTTTGCGGACAGCGAGAGAGATT:1 - chr2L 7987608 3' + 1360 3189 1 69.31 ATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATG:1 + chr2R 25051863 3' - G5A 2676 1 63.37 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTT:1 + chr3R 11263453 3' - roo 42 2 71.29 GTAGGNTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACC:1 - chr2L 19018944 3' - hobo 28 1 53.47 TTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAATAAAAACCCTCGTTTATCAAAACCCAGAAGGAAGGATGAAATTTGAT:1 + chrX 22444514 3' + Juan 4179 1 55.45 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGG:1 - chr3R 23591429 3' - pogo 43 1 74.00 AGCAGTCCGCACGCTCAGAAATTTCGATTTTGTGTGGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGCGGAAGAAATACAGGGTGTTCAGGAGCAAGTT:1 + chr2R 11233056 3' - Cr1a 334 1 69.31 AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATACATATATATATTTACATAAAAATTAAAGATCTCTCGTCGTTTAGTGCAAATTTCGCTAGAT:1 + chrX 21292686 3' - rover 10 2 68.32 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGCTAGTA:1 - chr2L 16674855 3' + roo 9041 1 59.41 GTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATAATATGTTTATATAGAGAACAAATCACCCAAATCCAATTCGAAT:1 + chrX 15371901 3' - Idefix 21 2 67.33 GTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGAGAATGTCGAGGGAAATGAAGAG:1 + chr2R 13295503 3' - Tirant 235 2 76.00 CAGATCTGGTCTCTTGTGGCGAAGGCAATCCCACTTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGGCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGGTGTAAGAG:1 - chr2L 23300000 3' - invader4 365 1 74.75 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAAGCACTCCAGTCAGTGGGGGTAGTCTGACATCATTCAGTTTAAAGATTAACAAGAA:1 + chr2R 5950766 3' + mdg1 7438 2 57.43 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTT:2 + chr2L 13574273 3' - pogo 35 1 60.40 GGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAAC:1 - chrX 15293440 3' - Quasimodo 41 2 59.41 AGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGGTTTT:1 + chr3R 26842863 3' + opus 459 2 74.26 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGGGCGGCGGACAA:1 - chr2L 12815017 3' + hopper 1406 2 70.30 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTATTGTAATTAAAGCTGCAGCACAGCCTTTGGTCAAGAGTCCAAATGGGTT:1 + chr2L 9774348 3' - 412 7079 2 51.49 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACCGCACGATCAGTTTGAATTTG:1 + chr3R 11999273 3' - P-element 54 1 24.24 TACATNAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCACTTAGCGCAGAAAAGGCGATTATTTGATTTAAATGTGTATATGAATGCATGTATGTATAT:1 + chr3L 21516705 3' + Stalker2 161 6 51.49 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAAGTTAGTA:1 - chr2L 14790561 3' - roo 8677 2 66.34 TTTAAATTTTGTTTTATTTTATTTAAAAAAAGTATTTATTTACATTATACTAGGTTTATAAAATAAACCTCTGAACGCAGAAAATGAGTTTTTTGTTTTAA:1 - chr3L 11626232 3' - HeT-A 324 1 87.13 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTTCGTGC:1 - chr3L 9383499 3' + P-element 2865 1 55.45 GTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTCCAATGATAATATAAAAGCATTTATAGCCGATATTTAC:1 + chr4 430622 3' - Stalker4 309 4 73.27 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGG:1 - chr3R 8555872 3' + 412 437 2 81.19 TGTGAGTTTGTGTGTGTGTGTGCAAGTGTGTGGGTGACCGGATGCAGCGAAAGAATGGGAAACAAACGTATCGCAATTTTATAAATTTTTAATGCATTTAG:1 + chr2R 3104562 3' - accord 188 2 67.33 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAGACACTCCAATGACAGATGTTATTATTCAAAATGATTCCAAAGCTGCCTAGA:1 + chr2L 15947459 3' + Transpac 5203 2 53.00 TGCAGCCCATAAATAGAACATATTTATAGTGTGGACATGGTCACTATCCGACAAGTCTGGTTTTTAGGCCTTTTTTAATTTGTTTATGTATGGTATTGT:1 + chr3R 3619436 3' - rooA 45 2 77.78 AGTGCNTTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTA:1 + chr3R 11119857 3' - 297 43 2 74.26 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGCCAGTGTC:1 + chr3R 26321670 3' - blood 47 2 73.27 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAATCGCATGATTT:1 - chr3L 10477525 3' + copia 242 1 66.34 TGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2R 1751256 3' + INE-1 91 1 68.32 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATC:1 - chr3R 23275249 3' + roo 9048 2 55.45 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAGTAGGCAACAATTTCTGTT:1 - chr2L 17210262 3' + jockey 4977 1 63.37 AAGTAATTTTTATTTTATAATGGGAATATAGTTGATATAGAATAACTTCATTTCTTTACGTTATTTCAAAATAGGCGAGTATATAAGAA:1 + chr2L 21758353 3' + blood 6930 1 70.79 AAAACGAAATCAAGTTCAAATATCTAAAGGATTATTCGAGCAAAATTCAATGACTATTATTTTATTACTACTCATAGTCATTAACTTCAGATACCTTATGA:1 + chr3L 16257983 3' - accord2 7242 1 52.48 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCCCATACTACAATATAGCATGGATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATG:1 + chr2L 8565532 3' - blood 7028 2 63.04 AACAGAATCACAAAGTTGACTAAAAGATTCGCGCCAATTTTGCGTTTTAATCATCACTTTTTGGGTGAGAACGCAACCCTTTTCGGTAGGGTTTTCTAAGG:1 + chr3R 4550143 3' - transib3 213 1 66.34 CGAAAGAGAGAGTAAACAAAACACAAAGACAAAAAATGCAAAAGAGTTAGTTCATTTGTTTAAAATACTGACACATTTGAGAACACACACAATGAGAATTA:1 - chr2L 21635500 3' - Cr1a 210 1 70.30 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCCA:1 - chr2R 13295635 3' - Tirant 8117 2 71.29 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAATCGCATGATTTATGGCT:1 - chr3L 10477519 3' + copia 248 1 72.28 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTT:1 + chr3L 18501001 3' + hobo 2912 1 67.07 TTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTGCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGACGATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAAGCAGACGAACAAAAGCTGTGTTA:1 + chr2R 3288711 3' - Idefix 268 2 76.04 GGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACAATATGT:1 + chr2R 4483276 3' - Ivk 25 1 54.46 AAGATAACATAACTTTATTTCGGTTGGATATATTTCTTGAAATTATTTTGATCTCTTAGGAATTTTTGTTTCTTCCTATTTAATGAAAGATCGTATTTTCC:1 - chr3L 2818426 3' - Chouto 150 1 63.37 CTTGAGTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCG:1 - chr3L 10477544 3' + copia 223 1 54.46 ATTTTTGGGCAATGTTCTGGACAAAAATATTAAGATGTAGAGAAATGGTATAGAATGCACTTACTTGCACTTACTTTTAAATGGTCCTTAAGTTTACAGAT:1 - chr2R 13078685 3' - jockey 4631 1 79.21 CCACAAACCTCGTGTAGGGGAGTGGCAGCAGTCGTGATGCACTTGCGCCGTCCCTTTATGGGCCGCGGGGATCCCGTTATTTCCTTTTTTGCGCACGGCCC:1 - chr3L 23544631 3' + gypsy8 4671 2 63.37 TGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATACATATTACAAATTGAAATTAGCCGTGCTT:1 - chrX 21514707 3' - Stalker 303 4 76.24 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACAATTCATAATTTTAGCTTACAATATTTTTGTTTTGTATTCTTAGAATCGTTTATGCCTTT:1 + chr2L 21174312 3' + roo 391 2 62.38 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCTGCCGCGAGTGCTGAAAATCGTACTATTGATAATC:1 + chrX 2753919 3' + roo 400 1 73.27 ATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAGCCAGTGCAAC:1 - chr3R 9131759 3' + roo 9039 1 58.42 TTCTGGGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCA:1 - chr2L 3890136 3' - jockey 29 1 60.40 ATCCTNTTCCGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAACCTGTGCGCGAACCGC:1 + chr2R 21774646 3' + Max-element 396 1 83.17 GGTCCGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTGGAGTTAGTAAAGTAGACACATTTTGGACGGCGTCATCGTTGTAGCTTGGTAGCGGATAA:1 - chr2R 5926479 3' - F-element 4495 1 59.41 TGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGGTCTCTGGTTCCCTTGAAATCATAGCCACTCTGGCTCGCTTCGTGAGGTTTCGAACTCG:1 - chr3R 13538924 3' - hobo 20 1 53.76 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTA:1 + chr3R 26530917 3' - blood 7055 2 66.34 ATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACA:1 + chr2L 14612119 3' + roo 397 1 67.00 AAATTTTTTTTATTTTATCATATTGCTATGGAATTGGCAAAAACTATCCAGAGATATATACCTACCTGTAATCTAAGAAACAGCTTCCCATGTCCAATATC:1 - chr2R 3173148 3' + 1360 3098 1 58.42 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCAC:1 + chr3R 17321762 3' - Stalker2 51 2 74.26 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTAATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCTACCTGTTACATACTTTTCAACGA:1 - chr3L 19471445 3' - opus 22 2 57.43 ATGGANAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 33 2 53.47 AAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTATTAAGGTGACTCTTCGCAAGGCTTACCTTTGAAAAGACACTCGCGAGAAAATAAGTATCTTAAATAGTA:1 - chr3R 6286605 3' - jockey 4527 1 50.51 CAATATGATGAAATAAAATAATAATAAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGAACTCGAACATAGCATTCTCTCTTGTTAAACCTTTACATTGACCATTTTAT:1 + chr4 730256 3' - 1360 3101 1 70.30 GTTGANGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGA:1 - chr3R 8458232 3' - HMS-Beagle 44 2 67.33 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCCAACCTACTAGGTACAAGACTGAGTGTGCTTTACAACACTAAACTGT:1 - chr3L 4122425 3' - P-element 30 1 55.45 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTT:1 - chr3L 12103795 3' + roo 9032 1 67.33 AATCANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCA:1 - chrX 21531017 3' + roo 9038 1 56.44 AATAGAGAAACGTTGAGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCCATTATTGTTACCGCAACTGTATAACTAATTGTGTCGTTTATTATAGATTTTTTAAGA:1 + chr3R 4833026 3' + Tc1 1602 1 65.35 ATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATATATATATATATATAATTTAAAATTGAAAACCTAGTCTGTTTTATGTAAACATGTTGGCGACTC:1 - chr2L 6555671 3' + Burdock 242 2 66.34 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAA:1 + chr2R 19209464 3' - jockey 4779 1 59.41 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGCCCAAGTTAAAGTACAATTGCCGCTATTGT:1 + chr2R 23580810 3' + P-element 2843 1 33.66 TTAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTGTGATTTGTGCTTTTTATTTATTGAATTATTTACTACATCTATCTGAGCGTTACGTACTGTAGACGGAA:1 - chr2L 22731781 3' + Cr1a 120 1 63.37 CAGGTNAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGATATAAAGAAAAAAAAGGGACCCCAACCCAGGCTATATTGGCGTCGATCACTTCAAGACTCCTAGG:1 - chr2R 4024105 3' - jockey 4765 1 72.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACT:1 + chr2R 20744239 3' + roo 9054 2 55.45 CATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGTTTTTATTGAACTTATTG:1 - chrX 23048257 3' + hopper 1398 1 59.41 TTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGC:1 + chr2L 14790651 3' + roo 410 1 71.43 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATAAAGTAGTTCTCTTGTGACATTT:1 + chr2L 20824660 3' - pogo 51 1 78.22 GTCCTGCGCAGTCTTCGGCGTTGTTCAGTACTGTCCAGTAGGGAGATGGCCGTTATGTTGGGATGCCTATGAAGTCTCTCTCTCGGAATCCAAACAAGAAC:1 - chr2R 14402200 3' - G7 1030 1 78.22 TTAAAGGTCAAAATTAAGGGTTTTTTGAGGGATTGAAAATCCAACATTTTCACACATGATAAACCAACTAGAAACTAGAAAAATACTGCAGATGTTACAGT:1 - chrX 15900851 3' - S-element 1663 1 74.26 ATCATAATAATAATAATAATAATTGGTTCTAATGAAATGTATTGGCTTACAATGTAGTTGCTACTTCGGAAGCCTTTAATTTGCCAGAATTTTCATGCGCT:1 - chr2L 10793127 3' + mdg1 7067 8 79.21 ATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGTACCCGCATAATAAGATGAAAATCATATGTTTGGAAACTCCAGGGCTCGAATAATGTCCCAGGCTTGA:1 + chr3R 6276167 3' + blood 7320 1 71.29 TTCCTTTTTCTTTTTTTTTTTCTGCCAATCTGAGCTCCTGTTTGGGCCGCTAAGAGCCTT:1 + chr3R 23023543 3' - Doc2-element 244 1 90.00 CTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATCCTCCCAGTTGCTTTGAGAGCACCACTAAAGACTTATGGC:2 - chr2L 3951554 3' + Transpac 310 1 79.21 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCCTTTTGTTTTGCCAGCAACGCGAAATTTTCATTTAATG:1 + chr2R 14778501 3' + mdg1 383 2 64.36 AATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATATTTGGGGAGTTTTGGGCAATTTAGAAGCAGCTTAACTGAAGGAAAAAAATACACAAAAGACTAGAATA:1 + chr3L 18130071 3' - 1360 3170 1 59.41 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCA:1 + chr2L 18430131 3' + copia 243 1 68.32 GTCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGCGAACTCCACTATAGTATTCCCTCTTGTAATGTAACTAAAGTTGAACACAATGAAATAACACTGTAATTTT:1 + chr2R 1995453 3' + INE-1 545 1 81.82 CGTCAACAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTTGTGGTGATGTGGAATAAACAGCAATG:1 + chr2R 5140672 3' + 1360 3335 1 78.22 AATAGAAGCATTGAACTGATCCACAGCTTTTTTAATTGTTTTTTGTATGCATATCATCACATTATCACTCCTTTCCTAAAAAACCACTAATACTTCTTTGT:1 - chr2L 8874648 3' + Bari2 43 2 51.49 CTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATCAAGTAGTTACCGTATTGAGTGTAATTGAATTGCCGCTGCCAGTTATCCGGAAATAAATGGTGTA:1 - chr2L 3946937 3' - Transpac 4767 1 62.38 AGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAAGAATGCAACAACGGGAAGCTATTTTTAAGTGCACTTAACAAAAAAAATAATGCTACAAAGTAATTAAGATATG:1 + chr3L 9355362 3' + Doc 4538 1 77.23 ACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATC:1 + chr2L 3440488 3' - Juan 47 1 62.38 AGTGGGCAAAAGAAACAAAAAATACAAACGCTAAATTAGATCTAGTGCCATATTGGCTTGCAAATCAATTTTTAAAAAATTAAATTACATTAAAATATAAA:1 - chr3R 30919783 3' - FB 889 1 84.16 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAATACATTTTTCGATTGTATATGACTAATTATAACTATAATTGGTATTCGACCAACGTTGATGCATAA:1 + chr3R 6467357 3' + roo 403 1 72.28 AGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGGACAAATAATGTTAAGTTTGTGACTGACAGTGATCCGTGGCCCAAAACCGAATCCGA:1 - chr2L 9810782 3' - GATE 35 2 73.00 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCC:1 + chr2L 16948718 3' - jockey 4708 1 62.50 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCACAACGGCCCGTTCTGGTCAAAACAAAGC:1 - chr3R 29123316 3' - P-element 8 2 71.00 ATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATC:1 - chr3R 6769711 3' - mdg1 39 2 59.79 ATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGTCCCGAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTC:1 - chrX 14317418 3' + 1360 3153 1 53.47 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATC:1 + chr2R 24628810 3' - mdg1 7088 2 72.28 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATACTAATTTGTTATCTATACACAAATCTGTCATTCGAAACAACCAATGGTAAAGAATA:1 - chr2L 13136720 3' - roo 20 2 59.41 TTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGTTAAACTTTCAACGCACTGCCCTCCTTGTGCGTGCTTTTTCCTTTTAATTATGTATAGATTTCGGTGGCTTGCAGCTT:1 + chrX 3392155 3' - INE-1 148 1 83.17 TTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACACTTTGATTTATTG:1 - chr2R 14778411 3' - mdg1 5 2 75.25 AAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGATATTTAGATTAACTAATTAATTACTTGCCCGATATATAAAATGATTCACGAGTC:1 - chr2L 8433466 3' - Cr1a 362 1 56.44 TTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGC:1 + chrX 2179529 3' - Doc 26 1 65.38 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTTGTTTTAATCTTTGCTTTTATGCATGTGTGTTTTATAAAAACTTTTTGCCACGCCCACTCTAACG:1 - chr3L 26710195 3' + INE-1 549 1 78.00 TAACATATGTATGCACTCTGCATACACATGTATATGTATATAATATAACAAACACATTGTCTTAAGCCTACGTTCTCATGAATTTAATTCTTCTTCTCGGT:1 - chr3R 24490995 3' + Stalker2 7479 2 66.34 ATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCAGCCAGCCAGCTCAAAAAACAATGAGTCCAACAAATGTATCGCGATCCCGAT:1 - chr3R 1707065 3' - Tabor 7207 2 48.51 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAA:1 + chr2R 24628835 3' - mdg1 22 2 56.12 GGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTT:1 + chr2L 3388115 3' - F-element 335 1 71.29 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGAT:1 - chr3R 15072583 3' - pogo 40 1 69.31 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCCCCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCG:1 + chr2L 7255818 3' + P-element 2863 1 55.45 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGGCAGTGACTGTGAAATGAGGAATGGCTAA:1 + chr2L 2060205 3' + 412 471 2 56.44 ACGGAGTTGTAGAGTAAGACCTTATATTCTAGTCTTAGGCACTGCTGACTATGCATTTTTGTAATTTTTAATTTTTTTCTCGTATTTTAGTGCCAATTGAT:1 + chr3L 25825767 3' - Fw2 3513 1 63.37 GTCCATATTAGAAAAGCTCGATACCGAGGCTTGAACGTCAATCAAATCAGAATAATTGTCAGAGTTTTTATCTTTGTTTGCGTTCTAAAACTTGTGATTTA:1 - chr2R 24343418 3' + Idefix 413 2 65.35 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTTATATGGGCGCCGCAGCAGCGGCTTAACTTATTTTCCACAAAATTAAACCATCAAAAATTTG:1 - chr3R 12780598 3' - hobo 8 1 71.29 TATTTAAATTTGCTTTTATTTTATTTGTTAATTTATTTTTGCTATGCTGGTGGATTTAAATGCGTAATTACTTTGATATGAAGCATAGTTCCGGACCGCGA:1 - chrX 393985 3' - HeT-A 326 1 57.43 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACCCGTGTAAAT:1 - chr2L 19018935 3' - hobo 19 1 57.43 TCAGCGTTCTACTGGAGTATGAGATTACTCGCTCACCTGAACCTCTCCACCCCATTCCATTCCGCCCCCAAAAGTGTGCACTCTGCAGATTCCCCACCTCC:1 + chr3L 590473 3' - Osvaldo 7 1 74.26 AGTGACCAACAAAGTGGACAAAAAGGAAATTTATGCAGTTTTAAGTAAATTTGTTAAATGCGCGCTTTAATGCTTCGTTAACGCTTCGTAAACTTTTCACA:1 - chrX 17356410 3' + pogo 402 1 76.24 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTG:1 + chr3R 7168658 3' + flea 245 2 66.34 AACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATCAGCTTTTCAGCTCCCATTTGGGTGTTAGTTTTGTTTTAAGATCCAATGATGAGA:1 - chr2L 9774262 3' + 412 7524 2 59.41 ACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGT:1 + chrX 19426286 3' + mdg3 5452 2 68.32 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGA:1 - chr3R 27156645 3' - pogo 35 1 65.35 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGAAGACGCGGCTGGCAACATGAGGCCAG:1 - chr3R 11999211 3' + P-element 2876 1 66.00 GTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATCCGCCCCAAATACGTGGATGTTCCCCGAGTTTTATGCTTTTTGAGCCGGAATGGGGCT:1 + chr2R 24479601 3' - I-element 170 1 61.39 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAACACGATGAATTCATAAATATAAA:1 - chr2R 5950658 3' - mdg1 4 2 75.25 CAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTGATATATTA:1 + chr3R 7168666 3' + flea 253 2 74.26 AGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAG:2 + chr2L 22079631 3' + gtwin 430 2 69.31 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAATAAAATTTAT:1 - chr3L 15100670 3' + pogo 2076 1 54.74 AGATGCCACTCGCTTGAAGACGTGCGTACAAGTTCTCAAGAAAATTCAGCAAAACAATTTGACAAAAAAGCGAAACGACAACAAATTCTGCCATCTTCGGC:1 - chr3R 21934384 3' - Chimpo 3958 1 71.29 TTTATTACCTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATTCCACCCCGACAAAACTATCAACAGCAATGGCAACAATACAATGCCCCACCC:1 - chr2L 3445385 3' + mdg1 400 2 57.43 CCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAAACCAAACAAGAACCAATCAACGAATGTGCCAAATTGTTAAGTG:1 - chr2L 7976403 3' + Tirant 427 1 63.64 ATAAAATAGAGAAATTCTTCTGTTGGCTAAACAACACCAACTTAATTCCTGTCCAATCTTCAATCGCAGAAGATTAAACACCAACTTCGCTTCAATATTGT:1 - chrX 4989317 3' + Bari1 1411 1 52.48 CACTTTCTCGCTCTTTCACTCTACCACACAAAATCTAAATTTCTCAGCGTGCCGACTGCTCTCGTGCTAATCGTTATAAAATTCCCATTAATCGAACTGAA:1 - chr2R 23177329 3' + Cr1a 296 1 67.33 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATTGTCGTTGAAAAAGTCCACGAAAAGTGGCTAGGAACATGAGGAATGGCCTCA:1 - chr2R 12457911 3' - roo 8682 2 58.95 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAATTTCGTAATTTTTTTTACATTTATAAGGTGTTCAAAACTCATGCCGAAA:1 + chr3R 20878542 3' + 297 374 2 54.46 ATCAACTATATTACCATTATAAAATAAAAATTACTGCTAAATATGTTTAGTTACTGCTCTTATTGAACTATTCATATGTTTAACTCTTAAAACGACCCAAT:1 + chrX 9757173 3' - blood 6944 1 71.29 CTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTG:1 + chr2R 5840686 3' - Ivk 36 1 57.43 TATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATGCA:1 - chr3R 19447031 3' + 1360 3152 1 69.31 AGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCTTCAAGATAATAGAGAATATTTTAAGCTCGTTGGATTTAGTCCATTATTTAA:1 + chr2R 13106831 3' - copia 4895 2 53.47 CTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAACAGCACTTTATGGACATCTTCGTTTTGAATTTTCCCATTACTGCTTCGGCTGTACAATCTTTCTGACCTTTT:1 - chr3L 12103755 3' + roo 409 1 79.21 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAAAAAGTACGAGTACGAATATATAAATC:2 - chrX 10672276 3' - mdg1 7053 2 62.38 CTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGAGTTTTGGGTATGGGACTAATTAGGCGGGGTTTCTCACGTGAAGGAG:1 - chr2L 193609 3' + R1A1-element 4968 1 58.59 ATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTCTTTTGAGGGAAATTGCAATTGTGTTCGCATTCGGATCGATAATCAAATCCGCTTCGACAAGTCAGTC:1 - chr2L 14842620 3' + transib1 1900 1 62.38 CGAAGCATACGATCATATCCCTATATTATATAGGGATATATATCATATCCATATATTTTAAAAATTGCGGCATTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGAAACAA:1 - chr4 71479 3' + invader3 5240 2 46.53 TTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTATGTTAGTGTGGGTCGGTGCTGGAGGTAGTTTCCCCTTGTATGTGTTGTTTGGGGGCGTTTTTTGGGCTGAGG:1 + chr2L 15562391 3' + 1731 4623 2 34.65 ACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAATTAAGTCAAATGACTTAATAAATATAGTAAATAATTAAATATGATAACTGTTTATTGCAAAAGTCATA:2 + chr3R 22232288 3' - 1360 337 1 65.35 CAGTGCAAACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTTATCTACCTACGCTAAGAGGCGTTGAATGCGATCCATA:1 - chr2R 5064741 3' + diver2 99 2 77.23 CCGAGAACCCTGATGCAGGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGG:1 - chrX 20806878 3' + opus 7486 2 65.33 TGAAGACCTTCCTCAAGGGTCGCAATTTTGCGGTGAAATTTGGTGAAGCCGTTCTAATCTCAAGCAGGAAGCGGGTGGAGACAGCTCGCATCCAAGCTGGG:1 - chr2R 4932034 3' + G7 429 1 53.47 CCTCTGCCAATGCGCAGAGCCTCTGCCAAGTTGGCACGCAGCTTCTTTCGCTTTTCTATGCGCTGCTCCAGATAATGCATTAGCTCGCGGATTTTGATCT:1 - chr3L 4244613 3' - springer 7232 2 75.00 TGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACCCTATATCAACTACAATATAATTTTGCCTAAATATTTTTTCGCGTGTGTGGTCCATGTTTGCCATCGGCA:1 + chr2R 21454701 3' - Quasimodo 119 2 73.27 CGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAAATTCAAGGGAAATGCTTTTGGTAGCTTTCTCTAACTTCACCAAATATATTGCTTTAAA:1 - chr3R 19348609 3' - blood 491 1 55.45 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTACGAATATTATGGGCTATTATCATTCTGGCATTTGGCCATTAAACAGCTTTATGAGCCTGCCAA:1 + chr2R 24479961 3' + I-element 5344 1 67.33 AACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAA:1 - chr3R 12047434 3' + Stalker2 7598 2 72.28 ACACACACACACACACACATATGCAGGTGGACGAAATCCGCTGCAGCTATGACAAATACTATACCATATACGATAGCTCATAATATGTAATCCCCTAGATT:1 + chr2R 22285537 3' + accord 7029 4 66.34 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGG:1 - chr3R 23275280 3' + roo 353 2 81.19 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGACAGCACTACAAAAAAATTAAAAAAAAA:1 - chr3L 4908080 3' - jockey 4732 1 72.28 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGA:1 + chr3R 6608826 3' - I-element 39 1 64.36 ATGATAAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCATTTGATTCTAATTGGTTACTAGTCTGTTTCTGAGTAGTGTTAATACAATTAGTTATT:1 - chr3R 6615241 3' - I-element 293 1 61.39 CAGTCCAATGCACGAACTGTCAAGAATATGGCCAAGTGGGTGGTGGGTGGCTGGCTCGGTCACCCGATAAGGCAGAATCCCAAACGGAAGTGACA:1 + chr2L 12531489 3' + Fw3 457 1 77.89 CCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAA:1 + chr3R 7168626 3' + flea 213 2 75.25 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAATAAATCCTCCTGTTTGAA:1 + chr2L 7488924 3' + roo 9038 1 64.36 AAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACCCAAAATGTAAGCCCAGCTGAGTGATTAATTAATCAGAATTTCCTGATTGATTTCCTCAAGGTGTAGGCT:1 - chr3R 10971278 3' + Doc 67 1 75.25 ACATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGGGATTAATGGAATAAAAAATGTGTCTCAGTTTGCGAAAACTTTGTCAAGCCTGTCGAGGTGGGTACTGGTA:1 - chr3L 2527565 3' + G4 3737 1 63.27 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACGTCCAAAAGTTGGCTGTGCGGATTAATTTATAT:2 - chr3R 8555860 3' + 412 7502 2 69.31 TAATTTATAAAAAAATTTATTGTTTTTATTTAAAACTTATAAATATTAATAAATTTACTTAAAACTCTCGAAATGTTTGCCACCTGAAAGTTCTATACATT:1 + chr2L 11849878 3' + transib4 2281 1 80.20 CAATATTAATATTGTCTAAAATTTCATAGTCGTCTTCCTCTTCACAATGTTTTTCCCAAAACATTCGCTGGGTGCATTTTTTTCGCTCTAACACCATATTT:1 - chr3L 17872236 3' + hopper2 32 1 52.48 CTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACAGCAACTAATTAAGTTAATGTAAGATAACTTTTTAA:1 + chr2R 20747110 3' - roo 207 2 62.50 GGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTTCGTTGATCCTAGTATAAAATAAATGCTTTTTGGCAGCAGATTGTAGATTG:1 - chr3L 2739481 3' - 17.6 7019 2 54.46 ATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCAGCTGTTAAAGTGACAATGGCATATGAACAAAATTTGTCAAGACAAATAATGAAATTCAAAAAATCAACATTTTTCA:1 - chr3L 17878699 3' + hopper2 422 1 72.28 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTGGGGCGATTCAGTAT:1 + chr3R 29123399 3' - P-element 38 1 42.57 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGACAATGTAAATTTGTT:1 - chr2L 14612038 3' - roo 8703 2 67.33 TAACAATAAAAAAAAAATAAAAAATCAAAACAAAACCCCAAAAATAAGAAAAAATTATATTGTAATAAAATATATACAAAAATGGGTTGGTTTGGATCTG:1 - chr2R 3169741 3' + Rt1a 5074 1 88.00 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAATCGCATGATT:1 - chr3L 10477526 3' + copia 241 1 65.35 AAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACATTGAGTAGAGTTCAGTCACGTCTCATCCACAATGGTAACAATAATTAGAAAAATAAGGGTATCAATATAGAATAAAA:1 + chr3L 22786922 3' + 297 434 1 67.33 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGT:1 - chr3L 17168856 3' - mdg1 7087 2 73.27 ACTCAAAGCAGTAGCGTCACCACAACTGGTCGATGAGAGAGGGGAGCTCCCACAATTTCAGCATAATTCACGCGAATTCATCCGTCTGTTGTTTTTCGATT:1 + chr2R 13404522 3' + BS 482 1 77.23 TTTGATTGCGATCGCTGAATTAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTCTATTCCATGTCCAACGTTCAGGTCGGCGGCAAGTTCAGCCGG:1 + chr3R 22479570 3' - Porto1 4321 1 70.30 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCACTGCAGCGGACGTGGCTTACATGAGCATGTGTTTTTAAG:1 + chr3R 22800215 3' - flea 4768 2 68.32 TGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAATTGTGCTGCAATAAAAGCAAGTCTGAATACAT:1 - chr3L 4121586 3' + P-element 2559 1 37.62 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTTGTTTTGCCATTGTAAATGGCCAA:1 + chr3R 20149788 3' + 1360 3369 1 59.41 GGAAGCAGCAATAATAATGTTCAAAAAGGAAAAGAGGCGATTCGGGCGAAAGGGAGAGATGGAGGCACATTGGACAAGGGACAAAAGCTCCAAGTGGAACG:1 + chr2R 11597656 3' + invader2 477 1 73.27 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGGCTCATTTG:4 - chr2R 7861637 3' + roo 403 1 74.26 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAATGGTATCTCAAGACATCCA:1 - chr2R 16980476 3' + copia 235 1 58.42 ACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTCTATAGAAGTGACTACTGGAGAGCCTCTCCACTGTCTATTACAAAACTCTCTTCGCCT:1 - chr2R 10945309 3' + transib2 2808 1 61.39 TCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTCGTAGTTTTGGTAGTTTTGTTACTGTTTTTATATTGTACCTTTAAT:1 + chr2R 13404013 3' - BS 27 1 56.44 CCCAGACCCCAAGGTTCGAGTGGAGCAGTCACAGGTTAGTGAAGATCGGGCGGAAAAGTGATAGACGCTAAGGTAGGGTATATTTTTTATTAAATTCTTAT:1 - chr3R 12143990 3' + Gypsy12A_LTR 414 1 62.38 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCA:1 + chr2L 1625694 3' - hobo 50 1 75.25 GTAATNAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGA:1 + chr3R 27801333 3' + Burdock 221 2 70.79 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCTGTGAAAACTGTTGTGGAAGTTTTATAACCCAAGTTGTCGGTCGCATC:1 - chrX 2649813 3' + Tirant 372 2 52.48 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAA:1 - chrX 16995114 3' - jockey 32 1 61.63 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTGACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGG:1 - chr2L 17210290 3' + jockey 4949 1 67.33 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAGAAGGGGTGCCTAAAAATGTGCCCAGCAAATTCTTGTGTGTGTTTTTTAATACC:1 - chrX 13761229 3' + pogo 2082 1 60.40 TTCATACATTTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCGCTCC:1 + chr2L 315201 3' + Tirant 360 2 63.37 CATTTCACTTATATCATTGACGTCAGACAGAATGATAGGTGGGGGCTTAGCAGAATCACTTGCGCTGTCTTTGATGTTTGCGAAATGTTCTTTGACAAATG:1 + chr2L 17538028 3' - G4 187 1 70.30 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCT:1 - chr3L 12888220 3' + mdg1 390 2 57.43 GATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGCCGCCAAAAATAGGAAATAGTTGTTCGGATCGTAGTAATAAATTCTTTTCAACCATT:1 - chr2L 10403199 3' - F-element 4387 1 59.41 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAG:1 - chr2R 10444228 3' + P-element 2871 1 61.05 GCCCTACCCTACCTATGACCACTTTCCTTAATAGCAAGGCTCTAGTGGCCTCTTATTATTTACTACATATGATACGCGAAAACATTAGGTAATTTAAAA:1 - chr2R 5602630 3' - Gypsy12A_LTR 1951 1 56.57 CACAACTTTACAACTTTTTAATTTTCATGCATCATGATATGCTAAAAGTATTTTGACAATGGCGGAGAAGTCGAACGCGGATGCGAAGGCATCTAAAAACA:1 - chrX 20110434 3' - flea 361 1 63.37 CCTTCCGAATGTATTAATTTGCTTCCTCCTGCATCCACTCAACCCATCCTGGATCCTTACCAGCCAGCAAGTCCTCCCCC:1 - chr2L 10923040 3' + Gypsy12A_LTR 2049 1 68.75 ATAAGNACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCCAAGTTGGACGCAGGATCACCTCAAGTTGAAAAAACTAACCGCGGATCTGGTAAATGC:1 + chr2R 7402996 3' + 412 283 2 65.00 TAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTAGTGGGGCATGTGATTTAGAAATAATCCCTCGAAGGTTTCTGCATTATCACAGCTGTATCA:1 + chrX 18237663 3' - jockey 4858 1 60.40 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACC:1 - chr3R 19132288 3' - Ivk 48 1 74.26 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATCAATAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACAGAAAAACTTCACCTACGAAAA:1 + chr3L 5489960 3' + jockey 4961 1 76.53 TGGTATGAAAAAAAAACAGTTTTTATTGTTATTGCAGCACAGATGGCCTTGAATTTAAGCATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTTGACATTTCTTCGTAA:1 - chr3R 19447644 3' - looper1 1628 1 58.42 CTCTTGAATACAAGTGCTCTTAGATTCTTATAATTTGTTTGCAGATCGCAGAGTTCGGCCAGAGCCACGTCTTCGATGAATTGCTTTCTAAATGACCCAAG:1 + chr2L 20693869 3' - Idefix 323 2 63.37 CTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTAGAAACAAATGAATTATGAGTTGCTGGCG:1 - chr4 907886 3' + 1360 3340 1 74.26 ATACCCAAGCAAATCAATATGCTGATTTTCTCAAAAGTATAGCATTTGAGTTACAACACAGTTTCCAATTAGTCCAGCTTCTGCTTCATTTTTGGACTACT:1 + chr2L 11784643 3' - invader5 3748 2 51.49 TTTTTTTTTTATTTTTCTTTTATTTCTCATAGACGTAGACACACACATACGGCGAAATATGCTGATTACGAGACGACGAAGACGCCATCTGGCGTGGG:1 + chrX 868611 3' + hopper 150 12 63.27 GGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATATCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGGAATTCCAGCCTGGTTTTTCTGCATTGCTGAGGTGG:1 - chr2R 23231288 3' - R1A1-element 5222 1 66.34 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAA:1 + chr3R 24760617 3' - pogo 34 1 70.30 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATT:1 - chr3R 23591422 3' - pogo 37 1 67.33 GGCAAGCGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACA:1 - chrX 13640656 3' - P-element 59 1 20.79 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCCATTGCGT:1 + chrX 2776148 3' + 297 354 2 68.32 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTT:1 + chrX 2649886 3' - Tirant 36 2 59.41 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCA:1 - chrX 20047559 3' + roo 9041 1 63.92 TACTATATTTAATTTTGTTAAATAAAATAAATAAAATAAAAAGTTGTTAGTCGATAATTTGGGTCGGCTAAAATTTCTCCATTCCAGTTGCATGTGTAAGC:1 + chr2L 6999334 3' + Ivk 5368 1 55.45 AAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGGATCTTTCTTTTGTCCAACCGTAGTTGCAAATG:1 - chr2R 5530006 3' + 1360 3318 1 71.29 GTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTAAGCATTAAAATGCGGCTCCTTTTCC:1 + chrX 14768054 3' - BS 5041 1 74.00 ACCCTGCTACCGGCTTATTCCAGTTGGTCACTTCAGCCAGGTGTAAATGATTAAGGCACAACCCAAACCCTCTCCCCCACCACCACCATCATAAAACCGGT:1 - chrX 3661103 3' + Chouto 207 1 52.48 ATTATTGATTTTATTTATTTAAAAGAAGTACCAATTTTTTTACTAATATAAAAATTATACTTTCAAAAACTTTTTACGATAACTTGTATATTCAAATGGTT:1 - chr2L 15819509 3' - HeT-A 38 1 56.44 CAAACTACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAGAACATAATCCCAACCTTTGGAGCTCACAGGAATATTTAATATTATTTTCCGG:1 + chr2L 8618541 3' + Porto1 299 1 54.46 CGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTCTGACGCCCACAAACACTAAATTATCAAGCTTTAGCTTTTGTTTTTGTTTTTCTGCGGGCCTCA:1 + chr2L 9684540 3' - F-element 119 1 36.63 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAAATTTTCAATTGTGAATATCAGTTATGGAGTACGAATTTCA:1 - chrX 21056208 3' - FB 36 1 61.39 AAAATATTGAAAAAAAAGAAAACCGGGCATGCAAGTGGGCCGAGGGGGATGTGTACCTGCTGTAACGCGGCGACTTACAAAGGGCATTCCCCAAATGCCAC:1 + chr3L 13395802 3' + TART-B 10628 3 77.23 GGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCT:2 - chrX 15293454 3' - Quasimodo 55 2 73.27 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTCAGCTCTCTCTCTTCAACGCTCTCTCGCATCAGCTGAGCGCT:1 + chr3L 11553545 3' + P-element 2851 1 34.65 GTGTCCGTTCGAGACTGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGTACCCCCGGTTTTTCACGGT:1 - chr3L 8711552 3' - opus 7320 2 80.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTACAATATTTTAAAACTTCTATCTT:1 - chr3R 12539466 3' + roo 404 1 76.24 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGTTAAATTTTAATGCGCCCGTATCGATATGCGAGCATGGTCCGCGCCACCGGAATCTATAAAAGCGAAAATCGCGTGTCA:1 - chrX 1523937 3' - jockey 7 1 79.21 GCAGACGTCTCATGAGGAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAAATACCCCATGATGGTACTACTTGACACAGACTCCCGGCCTCCCCTCAGATCTCTAT:1 + chr3R 20970595 3' + G6 1868 1 61.00 AACTAATTAGAATAAGCACCAGTGTCAAAACTAATTTCGCTGAATAAACAAACGCCCCCCTTCCCCAGCGCCAACCAAACTCCCGATTCCCGGCAACCATC:1 + chr2L 14905392 3' + GATE 8351 2 51.49 GCATAGTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGGTGTTAGTCAAAGCTGT:1 + chr3L 10013641 3' + hopper 1380 1 56.44 TTGGCAATGTTAAATTGCTATACTACAAAATATTCTGTGTGTGGAATGAAAAAAAAAAACATGAAGCACACATGTTTCGCTGCTGCTGCTCCCAAATTTGC:1 + chr2L 20692196 3' + Doc3-element 121 1 57.43 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACT:1 + chr3R 8555895 3' - 412 7090 2 71.43 TGTACTCTAACACAACGTGACCCTCTTTCATGACTTTTCTAATGAAATGATATCGAATGTCGATGTGCTTCGTCATATGCAGTTCGGTGTGGTAGAGCCT:1 + chr2R 13249281 3' - 1731 4168 1 74.00 AGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGCATTCGATGACGAGGCGTGGCAGTTGCACAATACATTGCTACTCAAAAACATCA:1 - chr3R 8921917 3' + flea 127 1 58.42 TGTTTCACTTTCATTTCTTGAATAGTTTCGAAAATATTGATTAAAACATAGTATTCTTTATGTCATAAAGAAAAATAAACAAAAACTAATTTACGTAAAAA:1 - chr3R 4514597 3' - HB 1494 1 66.34 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAAAAATAAATTCGAAAATGATATATGCATATGTAATATGTAATATGTA:1 + chr2R 5892923 3' - pogo 26 1 54.46 ATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGCGGAAAGAGAGATGGATATAGATTATGCGGCTGGGAAACGTTATTATTCTATTTT:1 - chr2R 15433063 3' - Quasimodo 450 2 56.57 TCAATGGGTAATAAACTAAAAATAAATTGTGACAGAACAAGACAGAAAACTAAATTGCCCGAATGTATCAAGTTAAAAGCAATTGTGAATTTTCTAACTGA:1 - chr2L 2514345 3' + Fw2 68 1 59.41 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGC:1 + chr2R 16988252 3' + opus 456 2 67.33 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGAGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCT:1 + chr3R 11119862 3' - 297 38 2 70.30 CACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGGCCTGTTGGACGTAACAGCGCTCTGTTGGCTAACAGTGGGGAAATCGATTACAGAGTAGACTGACTATCGGTC:1 + chrX 19268972 3' + P-element 2886 2 74.00 TTGTTCACTTTGACGTTGCTCACGAATTTCTATTGCCTCAATTTTGGCTTGCCATCAATTTTGAAATTGCCGAATTATTTCACAATTCGTTGTTTTTCCGT:1 - chr2L 14623413 3' - Doc4-element 15 1 75.25 CTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGAACGTCATCTGCGTTGAGTCTTCTAGATTGCTGG:1 + chrX 18836898 3' - P-element 403 1 24.14 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATATCT:2 - chr3R 9551438 3' + P-element 2838 1 30.69 AATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACC:1 - chr3R 12047406 3' + Stalker2 7633 2 57.45 AACTTTCAAAGTGTTAAAATTTAAAAAGAAGAAGAAGGCTTCGGTGTTTGTGTGCCAGGAAAATAGATGGTCGATTATGTAAGAGGTGATATGGAAAGTTT:1 + chr3L 14333546 3' - hopper 1197 1 67.33 AAAAAAAAAAACAACGAAGTTAAGGTGGGCAAAGTGCATTTTTTGTTGCCTTGACAATGATAATGAAATTGTTTCTTAGGCAGTAAATCAACTGGCAAAAT:1 + chr3R 25406770 3' + gypsy7 5017 1 48.51 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTG:1 - chr2R 18950760 3' + roo 9021 2 77.00 CGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCGCATCAAAAGAATAGAAAAGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCGAAAATAACACAGCACGAACTGG:1 + chr3L 15761658 3' - invader1 3702 2 79.17 TAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGTAATGTAATTAGTTGAAAATGCATTATCTATAAAGA:1 + chrX 21448828 3' - Doc 4588 1 63.64 TTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCTTTAAAATTTGTTTTTTTCGTTAATAATGGATAAATTAAACAAAGTTTTTATGTTTACAATGAG:1 + chrX 8523662 3' + FB 685 2 57.43 GCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCTCATTTCCTTGGACTTTTCAAC:1 + chr3R 6608835 3' - I-element 30 1 55.45 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCAC:1 - chr2L 20360642 3' - micropia 33 2 53.47 ATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCCTGTAAAGGGCCGAATTGATTGTACC:1 - chr2L 20924111 3' + Max-element 251 2 71.72 AGAAGATTATGAAAAACCACGGCTGGATTTACTGACAACAAAAAGACGTATAAATAAAGAAGACAAAAATAAAAAAA:1 - chrX 8823963 3' - Cr1a 68 1 66.23 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAGAACTTGCGCCGGCGCCAC:1 - chr2R 10444210 3' + P-element 2883 2 75.25 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATT:1 + chr2R 4483254 3' - Ivk 47 1 67.33 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGA:1 - chrX 21668945 3' + mdg1 7430 2 54.46 CATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGAGCTGCTTTACAAGTGTCACGCGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - accord 184 3 84.51 TAACTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTCCAATACTCGATTCAGGATCAGGTCCTGCTGGCCGACACCACAGGCAACGAAAGTGGCACATG:1 - chr2L 9098786 3' + gypsy 347 2 57.43 ACTACACCAAACAGCACTGCGAACACCGCGCAAAAAAGGGAGAGTAAAAAAAACAGCAAGAGCAACATCTTCGACGACAGCGACTGCCCAACATTAA:1 + chr3L 5867370 3' - Cr1a 240 1 56.70 CTACANACACACATACACACTGCGTAATCGGAGGACGCGCATGATAATGCATTTTGTGAGCGCAAATTAAAATTTGCCATTGCATACAATTATGCTGACGT:1 + chr2R 8304317 3' + accord 256 2 73.27 AAAAAAAACGAACAAAACAATTGAGGAGAAGAAAAGTCGAGCCTGAACGGCTGCCTCTATCTCTAGTCACCGCCCAGTCCCAGTTTCTCTCGACAAGTTGA:1 - chr2R 21888940 3' + Bari2 912 1 65.35 AACAGATCAAATACGGATCAGTTTTTCTGATAAGCACGATTTATTGCGGATTAAACAGAAAGAGTTCTTGTGAAAAAGCACCTTTGATGCAAGCATTATGC:1 - chr2R 16057699 3' - BS 265 1 78.22 GGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTATGA:1 + chrX 23108319 3' - BS3 1429 1 51.49 GGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGACATAAAAAACAGTTATAAATAAT:1 + chr3R 32005966 3' - invader4 2773 2 66.34 CACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCTTTTTTTTAGGATGAGCTTTTCCGTATGTTACGTTTC:1 + chrX 3306536 3' - I-element 319 1 69.31 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTA:1 - chr3R 13375985 3' - 1360 49 1 76.24 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCATACCACATGTGGGCCGGCCCCCTGCCACGCCCCT:1 - chr3R 6117212 3' - Tirant 8117 2 68.00 AGAAAAGGAAAAAGAAATAAAACTGAATATAAATAAAGAAAGTAGAAAGGGCCACCACCACCCACATGAGGTGACCTTTGCCACCCAAAACTATAAATAGT:1 - chr3R 14367317 3' + Doc2-element 237 1 77.23 TAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGAATAAGTAGTGTGCTGCCCCATTGCACCTGTTGCTTGTAACCACCTCCATG:1 + chr2L 6549947 3' - Burdock 105 2 50.50 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGCCCTCCTGACTAACTAA:1 + chr2L 16201578 3' + hobo 2911 1 54.46 GGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAGAAAAACAAGTGGAAAACCAATAAATAAAAATCG:1 - chr3R 14080176 3' - hopper 121 1 66.34 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAAT:1 - chr3R 23638115 3' + pogo 2053 1 82.18 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTTAGGACCACAGCCTC:1 - chrX 8972356 3' - 1360 9 2 70.30 TTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATACCTATTATTAAACGATTTTTTTAATTC:1 - chr2R 694117 3' + flea 4969 2 77.23 TCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCTCGTTCTCATTTATACAAGCTGAGTAACGGTATTTGATAGTCCAATGTTCTTTAAAGAGTCAAATTAATTTT:1 - chr2L 22546307 3' + INE-1 505 1 70.30 GATTTTTGATTGTGCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGTTGCATGCATTGCAGGAATTTTGATTGTTTAACTAAGTCCATTGGTGCAGGCACACAGTGC:1 - chr3R 11397236 3' - Doc4-element 2655 1 61.39 CTTCTNATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGCGCACACTGAGAG:1 - chr3R 10952237 3' + roo 409 1 77.23 AGCTGTGTTCGCAAAAATAGCACCCAGTGCCTACCAACCAATGCAAAAGAAAAGCGAATGCTGGTGGTGGGAAAATGGAATTCGAATCGAGGTCTGATTAT:1 - chrX 4150240 3' + HB 7 1 69.31 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAATAA:1 - chr3L 15100677 3' + pogo 2063 1 64.36 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTGACCCTCCCAATTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTTGCCACGAGTTGACATTTGATTA:1 + chr3R 11544424 3' - hobo 8 1 70.30 CGGTATCGAGCTTTTCTGATATGGACTTTAGACTTCAGATTCAAGGGGATGCTTTTTAAAGGACGGTTTCATAGACAGCACTCGGAGCTGCGCCGAAGAGA:1 - chr3R 4384250 3' - Idefix 417 2 72.28 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTTACAGTTAGCAAAAGGCAATTCAAATCCTTTTACTTCCGCTTTAGGCAGCAACGACTACGGCAAAAG:2 + chr3L 4801591 3' + roo 393 1 66.34 TATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACATATGTATATATTTAGTATATAAACTCATTCCGTTTGGTTCAATTGTCACGTAGTGGACATGAGCAAACAGAT:1 - chr2L 12474940 3' + mdg3 241 2 71.29 AACAAAAAAAAAATTGTTAAATATTTGTTAATAACGGATTTTATTACCACCTTGAGATTATACATTAAATCTCATTCCCGCAATCAAATGTTTACTAATT:1 - chr3L 12255179 3' - accord2 345 1 57.00 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCG:1 + chr2R 20744215 3' + roo 9032 1 67.68 CTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACAACATATTAGCAATTAAAATTTTCTTAGTTAATTACTTTAAGCAGAC:1 + chrX 5548619 3' + accord 7001 2 69.31 TTCGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAAGTCAAATGACTTAATAAATATACTAATTAATTAAA:1 + chr2L 17599966 3' - 1360 480 1 62.38 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCT:1 + chr2L 4160202 3' + Tirant 374 2 52.48 TGTCTNTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCCATCAGACAATGCCACTTATATACATGTCGGAG:1 + chr2L 23390386 3' + P-element 2867 1 42.57 TCTCCTTTTCTACTTAATAATTTAGAAACCACTTGGTCTCATATTCCTTTATACAAACATTTGTTCAACAAACATTTTAAAAATCTTAATAAAAATTG:1 + chrX 3529129 3' + G5 4724 1 56.12 CACTTNCAGTTTGCCTGAATGTAGTGACCCATGAAACAATTGATTTGCGGTCTGGGACGTGACAAATCCCTATACGTCACTCAA:1 + chr2L 21687182 3' - mariner2 290 1 72.62 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTC:1 + chr2L 19684028 3' - jockey 4699 1 50.50 CTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATATTTTGATTTCATAAGACTTTTCTTTTCGTGCACCACA:1 + chr2L 21846638 3' + S-element 1679 2 68.32 ATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGTTCAAAAGCTATGTTCATATTATTTTTGTGAAACCTTGAGAGC:1 - chr3L 13060286 3' + 412 496 1 80.20 CTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCCCAGGTTTTCAATCGGCTTTAATTTAGATAACTGTTCGTAAGCTTTTGTATTAAGCTCAGTTTTTGAATATCT:1 - chr3R 4559247 3' - HB 1290 1 54.46 AAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAAAGTTAGCAATC:1 - chr2R 3919668 3' - 1360 36 1 59.41 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCA:1 - chr2R 17626488 3' - mdg1 7064 2 57.73 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTGGGGCGATTCAGTATTATTTCGATTGTGAAAGAGTTTACTTCG:1 + chr3R 29123427 3' - P-element 10 2 68.32 GTAGTTCTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGATTCCTTCCTGATGGCTGCTTGTATTGTATAA:1 + chr3L 23871301 3' - Doc 54 1 69.31 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGGCTCATTT:1 - chr2R 7861638 3' + roo 402 1 73.27 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTAGCGAATCTATTGAGTATATACTCGTAGTGTATTTTCCATAAAATCACCAAGTTGGCAAC:1 + chrX 1281754 3' - roo 17 2 62.38 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAACTTTGTGACAAAAGACTATATTAC:1 - chrX 19426228 3' - mdg3 5281 2 54.46 CTTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAA:1 - chr3L 17168861 3' - mdg1 54 2 77.23 TGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGTAAGCCAG:1 + chr3L 18706960 3' + jockey 4980 1 68.32 GGACAAGCATTTGTTTCACTCTAACGCATCATCGATGTCGATTCAATGTAAATTATGTGCCAAACAAAAACACTATATGGGAATTGACGATCCCACTTCCA:1 - chr2R 25234908 3' - invader6 192 2 72.28 TTCTATCTATCGATATCCCAGGAAAATGATGATATTTTGCGTTTGCAATCACACTAGCTGAGTAACGGGAATCTGATA:1 + chr2L 16936423 3' + INE-1 496 1 82.05 GGAGTTTGCTTGAGTGGAAAGCCAGTCCAGCTTTATCAGTTTCCATGATTCATTTGGCAATTTGGGGTCGTCTGACATTTGATATAAATGTTGAACATTTT:1 + chr3R 22182699 3' - G5A 2359 1 56.44 CGATATCAAATTCATATGTTTGATCACCTGTTTGTTAAGGCTAAATGGACGCGAAGCTTTTTACTTCGAATCTTTGATGCTCATTTGAAATCTAAAAGACT:1 - chr2L 22686593 3' + transib3 153 1 54.46 ACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCCTTCAAAACGCGCAAATCCACGGGCACCTACAGCACACCAGCAGCAATAACCAGCTGT:1 + chr2L 14062233 3' + roo 8816 2 61.39 CCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAGGTGGCAAAAAGGGACCTAAAACACAACAACACAACTGCGAATCGACTTTCACGAAAAACTGCAAGC:1 - chr3R 13975103 3' + S-element 1245 1 65.35 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACTTGGCGGTCCGTCCCAAGGCGTTTTAATTGAACTTGTGCAGT:2 - chr2R 8086874 3' + 1360 3358 1 63.37 GCTATAGTCGAGTTTTCCGACTAGGTGAAGAAACTGACTGTGGAGAGACTGCTAAAGCCGATAAACCATTGCTGTGCTTACCTTTTCCGTACAGAATTGGA:1 - chr3R 4133900 3' - INE-1 567 1 77.23 GAGGCNTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGTGTGAGCAATTTGCGTCGCCCATGGCTTTCTCTCAGTGCACGAGAA:1 + chr2L 6601455 3' - I-element 33 1 51.49 TATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTCTTTCGCACTTGTTAAGAATTTCGGATGCGAATCGATTCCCTCTTCC:1 + chr3R 12782655 3' + hobo 2497 1 56.00 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCCAAGTCGGGGACCGAAGGCCATGCGCTGAT:1 + chr2R 5804561 3' + P-element 2883 2 76.24 AGGAGCGTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATTATATGTGCAGAGCTCTCCTCCTCCATGCAGCAGCAAGAACAGCAAGGCAAGGGAAA:1 - 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G5A 2435 2 64.36 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGATTATTGTAATTAAAGCTGCAGCACAGCCTTTGGTCAAGAGTCCAAATGGGTTGCAGTTGAT:1 + chr2L 9774357 3' - 412 17 2 60.40 ACACATCATATCTTCACAAAAGGCTACACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCGCCTTCCCTTCCCACGCCCAGTGCCGCCACGCCCCCTAAGTCGCA:1 - chr3R 12277498 3' + Tirant 8478 2 55.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAATATTTAGCAACCCAATAATAT:1 - chr2R 24021556 3' - pogo 19 1 60.40 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTACGTGG:1 + chrX 11730343 3' - jockey 4777 1 62.38 AGAGAATGCTATAGTCGACTTGCCCGATTATCATATACCCGTTGCTCTAAAAGCCTGGCTGCGGCTGCGCAGAAGTCCAAAAGCGCGTGGTTCGGGCGCAT:1 - chr3R 4823384 3' - INE-1 574 1 57.43 AATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGT:1 - chr3R 12047439 3' + Stalker2 345 2 77.23 ATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTAC:1 + chr3R 19449390 3' - roo 342 2 75.00 ATATTNTGGATTCTGTTCCTTAATTATAGTGTACACATATGTACCGTGGAGAGATTATTGTATTCTCTTCCGGAGTGTCGGATATAATAGTTACATGATTC:1 - chr3R 5557216 3' - G5A 2756 1 68.32 CAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAGACTGCATGTCTGGCGACTATGGGTTAGAGACGTAATTTAGAGACATTTGCATTT:1 - chr3R 24692166 3' + F-element 255 1 56.44 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTTTT:1 + chr2L 22098095 3' + roo 9039 1 61.39 CTTTTGCCCACGTCCAGTTTTTAGGCCATCTTTTAAAAATAAATATTTTCCATTAAAAAAGTTTGCCCACACTTAAAAAATGGTTTTTATCGTTTGGTCAG:1 + chr2R 5180272 3' + FB 99 1 77.23 GAAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATACGTGCTTTTACATTGTGACATGCGGATTCC:1 - chr3L 23402380 3' - Cr1a 4092 1 54.39 GACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGGACCCGCAGCCATTCGAATACACTGAATATCCGTGGATCGGGTGAGGAGATTATCAAATTGATTCCAATTAAC:1 + chr3R 12307788 3' - invader2 190 2 76.24 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTACACATATGTACATATGTACCGTACAACGCAATAGAA:1 - chrX 3763162 3' + 297 6940 2 75.25 AAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACA:1 + chrX 13546709 3' + roo 9054 2 58.24 GTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTTCTCGCAGTGTGGCTCAGCTCTTGCCGCTGGCGATGGCTTGCATGTGC:1 - chr2L 9737807 3' - Doc 4249 1 53.61 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACTATTATAAAATCGAAAAATCAGGCTTATGAAAGTGTGAGTCGGCCGAAAAAAGG:1 + chr3R 12539572 3' - roo 8685 2 59.00 TATATNAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATACTTTTCACGTCTGCATGCGA:1 + chr2R 13585534 3' + Juan 4198 1 62.38 AAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAATTTTGCTGACTGTCGTCGTAACTGAAATTGCCTACTGCTAACTGCGGATGCTGATGCGGATGCGAATGCGAATGCGG:1 + chr3L 2871515 3' + F-element 4676 1 77.23 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGTCGT:1 + chr2R 21773633 3' - Max-element 14 2 60.40 TTTTAGTTATTTAATTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTA:1 - chrX 17580260 3' - HeT-A 30 1 76.24 AGGTAGGGTAGGGCAATGCGCGAACACGATTCCACCTGTGTTTCGCAGGCGAAAAATTCTGAAACTTTCCTCCCAGCGCTCCCATGATGAATTCATGCCAT:1 + chr3R 17359369 3' + Gypsy12A_LTR 1959 3 72.28 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATATACAAAGACCAAAATCGGCGGAACTTCTTCATGGAAGCCACTTGTTGTTGCCGCTTAG:1 - chr2L 18212113 3' - 412 14 2 65.00 AAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGAAGTGTTGCGAAGAGCAGGTTAAAGGCTTTGAATTCTGGTTCGACTGGCTCTTTGATTTCCAGTAGACG:1 - chr2L 22257030 3' - 1360 22 1 69.31 CATAGATTTCGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAATAAGAAATAATAAAGAGTTTGCAACTATATTGAACTAAGTGAACTATATTGAACTATAA:1 + chr4 722860 3' - 1360 336 1 68.32 GTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTTTAAGTTTACCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCACACTTTT:1 - chr3R 4322609 3' + FB 254 1 67.33 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGGATGGATGGTCTGAAAAATTTGGCTCGCAGCCGATCGTCC:2 + chr2R 16687959 3' - Ivk 11 1 37.62 ATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGT:1 - chr3R 9131774 3' + roo 360 2 73.27 AAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATATATATACATCTATTGCATTGGGGGTGCGACATTCTCCCTGAACAAGTTGTTGTAGTTGCCAGGGGGA:1 - chr2L 2308614 3' + HMS-Beagle 242 2 75.25 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGA:1 - chr3L 9383531 3' + P-element 2833 1 25.74 ACATCAATAAAGGCATAAACAAATAAAGAAATGTTAAATTCAATACCAACTAAAAGATACAAAAAACCAAAGATGTAAAAAAAAGAAAAACTGATCTAGAA:1 - chr3L 8951965 3' + R2-element 3398 1 74.26 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTC:1 + chr2L 19481339 3' + roo 9030 1 65.35 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCGATTGGGATCCACTTGAGTTTGGACATTTGTTTATTCGTTTTATTGCTTAATTTGGGTCTCTGCGTCTGG:1 + chr3L 4876826 3' - roo 8664 1 77.89 TATTTTGTTATTTAACTTTGCTTTTATTTATTAAAACTTAACAATATGGTGGTACTTCTTGCTTCCGGTCTTATTTCTTGCCTTTGGACAGGACGACGCT:1 - chr3R 20945822 3' - HeT-A 334 1 47.00 GCGTATACAGGGCGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCCGAACAGGGACCAGGTGTCATC:1 + chr3L 8363082 3' - 3S18 5773 2 65.35 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTA:1 - chr2R 5953098 3' - pogo 39 1 71.29 TGTGTTTATTGGTGTAGCGGAAGTTGTTGTTGGTGTACGTGCAGATGCTACTAAATGTATTAGCTTCTAGCGTACAATGTAAATAAAACTTTGATTAACAA:1 - chr3R 18174377 3' - Porto1 450 1 58.42 GCATGTACTTATATATTTTCACTTAATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTTAAATAGGCTACAAAAATTGATAATTC:1 - chr3L 12912717 3' - Max-element 475 1 73.27 TGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTTTGTTTGTTGTGTGTGTGTATGAGCGGTGTTGTAGTGTGTGTCTGCGAAAAAGGGGGTGTGGTTTCGGTTTTT:1 - chr2R 9522094 3' - 297 6507 1 67.01 CCTGCCTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGATC:1 + chr2R 17261650 3' + pogo 2069 1 62.38 TAATTTAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGAAAAAAAAG:1 + chr2L 17646242 3' + flea 4993 2 48.51 ATGTTTTCTGCATCGCGGAGAACAATTTAAAATGTTATTAATCGCGCAAAAAACGAGGGCGATTAGATCCCGTTACTTTCGGTAGAAGACATTCGCATTG:1 - chrX 22472754 3' + S2 490 1 63.00 CCTTAATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAA:1 + chrX 15894651 3' + S-element 1666 1 76.24 ATGAATAATAAGTACCATATGTTGGGTCTCTAAGCCAGATGAGGCAGTAGCGCAACAACACAAGTCCCTAATTGCTGGAGACCTACTTGTCTTCCCCGGAC:1 - chrX 532229 3' + Tc1 97 1 78.22 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTCCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGA:1 - chr3R 23275279 3' + roo 354 2 78.22 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGTTGTA:1 - chr2L 6888581 3' - jockey 20 1 65.35 GGGGAGTTTTAAGACTCCTCCCAGCTTTTATGTTAACGAGGTCTTCTTTGTTCTGGCAGCCATAATGAATGTAAATTGAAATTGATTTTGTGCAAATTAAT:1 - chr3R 18342306 3' - gypsy8 4651 1 65.35 GTGTGTTTTTTTTTTAAATATTTTATCACCAAGGCAAAAATCTGAGAAACA:1 - chrX 2509331 3' - TART-B 10509 1 94.12 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGC:1 + chr2R 20744216 3' + roo 9031 1 67.33 TACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAGGAACTCACTGGTGACCTTTCACATGG:1 + chr3R 9995440 3' - Max-element 8255 2 64.36 ACTCGACTATAGCACTCTCTCTTGACTTAATTTGGACCACTGTAAAAATAAAACTGAAAACCAAAAATTAAAAGACCAAAATAAAAGGCAATTTAATTCAC:2 + chr2L 11467985 3' + INE-1 576 1 62.38 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGGCAGAGAAGGAATACGAGAAAGAGAGCTGGGTTCGTATATGTATATATATATATATTTATATAATATATAG:1 + chrX 20511021 3' - blood 7179 2 51.00 ATTGGCAGAGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGCCAGTGGCAGAAGACGCGAAATCTGTTGAAAT:1 - chr2L 16178897 3' + springer 7243 2 68.32 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCAT:1 + chrX 2179524 3' - Doc 54 1 78.22 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGC:1 + chr3R 5686107 3' + P-element 2874 1 52.78 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGGGGAGTAAAGTGTGTGTATGTGTGGCTGTGGGCTTTAATGCATTGACGATAAGTAATTTT:1 + chr3L 11661804 3' - hopper 15 1 61.39 TAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGCCCCATTGTGTTTCTGATCCTGATCACTGCGCTGTGCATTTT:1 - chr2L 3957417 3' - F-element 371 1 58.42 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACG:1 - chr3L 13589438 3' - hobo 27 1 52.48 AATTANATGACTACATATATTACGTCATTTCTCTAAAAAGGGAGGTGTAGGCGTTGAGGGACTTGCCGCTGGCCTTGCTGCCCAGCGGACCGGCCGCATTG:1 + chrX 13839645 3' + Stalker2 7204 1 58.42 GTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATAAGTTAAAAGAAAAAAGGATAGCTATAGTCGAACTAAACATTAAGTGC:1 - chr2L 15959519 3' + Quasimodo 2 2 53.47 AATTAGTCTCTTACATTTCTATCGATTTGACCAAAAAACATCCATAATAAATATAAGGAAGATATTTGAAGATACTTATTATAAGGCACGATGATTAACTC:1 + chr2L 21764407 3' + INE-1 296 1 76.24 AAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATATATAAGAAGTAATGGCATTTTAAAACAACTGGTTTTGTTACATTTACATTC:1 - chr3L 19463686 3' + invader4 3064 2 54.46 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACGGAAAGAA:1 - chr2L 14790568 3' - roo 20 2 59.41 TATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGCCACTCT:1 - chrX 20885942 3' - Ivk 5348 1 77.23 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAGAGAGAACAACGGTGAAGCACTGCAGAAATTGAGAGTGAGAGAG:1 + chr2R 14713685 3' + P-element 2881 2 75.25 TGTACATCCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGGGTCTTTGGTACATCCAATAGTCGCGAATATAGCAATCTCTGCGATAATAATTAACTTCGGAGAACT:1 + chr2R 6164643 3' - Tc3 318 1 54.46 GGTAANCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCAACTCGTTTACCTGCCCCCCTACCTGCCTTTCAGGCCCTTCTGACCG:1 + chr3R 8277979 3' - P-element 26 1 53.47 CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTAAAGAATGCTAAAGCATTGCTTGTATTAGAAATATTTAATGTAAACAATTAATAATAGGCTCTCTCTAGGATAACGCTA:1 + chr3R 15151341 3' - jockey 4675 1 77.23 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACCAATATCTGATGTTCAGTCATTAAAATGTTATTATTTTATGATACTTTATCGCA:1 - chr3L 17587769 3' - roo 8686 2 57.43 TGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACACTCACACAACCACCCAACACCTAACACCCACATTCCCTCATTTTCGTATCTTCATTTGTGTAGGT:1 - chr3R 30185562 3' + accord 7061 2 68.32 TATTGAAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCCTCCACCACCTCCTCCACCTGGTCCGA:1 + chr2L 10693381 3' + R1A1-element 156 1 74.26 AAAATAGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAAACTCTCCCATTTCGAGCAATCATAATTTGAGTCATTACACTAAGTACGGTTTGTGATGGATATGTTTG:1 + chr3R 8975391 3' + Bari1 1253 1 75.25 TACTGNTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTT:1 + chr3R 10277268 3' - Doc 61 1 76.24 CAACGNATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCTAAGCATAGTTCTACGGATAGCTAGGGAAGGTACTTTACCATAAGGAACTGTTACCATAATATTTGGGCA:1 + chr3R 14612276 3' - Cr1a 4044 1 62.38 AATTTGTCTTCCGGCCGCAAAGTTTTGAACCGCGACAATATAAACATTTAATTTACATAACTAACTTAATAAGTGCACGGAAATATTAATATCAGTTATTG:1 + chrX 4206331 3' + TAHRE 172 1 49.50 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTT:1 + chrX 5092991 3' + roo 9049 2 46.53 AAATATTGTTATACAAAAAACAAGAGCTCAAAGACTCCTGCGGCCTAAGCCGACTGTCCAATACGCTTCTTATTTAAATCCCGTAAATATATGGCTCACAA:1 - chr3R 24472892 3' + Juan 4070 1 78.22 TATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTATTTGAAATTCCCGCCAGCTGGTACAGTTTGAGAGCAACTAT:1 - chr3L 10463562 3' - roo 8844 2 59.41 TGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTGTAAAGTTATGGCTACGTCTACTGCATTGAAAGTTGAAAAAATCGATTGAACCCATATTAATGTAAGGCGGAACG:1 - chr2L 3409580 3' + flea 497 1 80.20 GGAGTNCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTAT:1 + chr3R 11119855 3' - 297 45 2 75.25 AAAAAAAACAACAAAATAAACACAATCAACGTCACCGTCTTGCTTCTATTTTTCTCTGGCAAGATCACGCGCCTCTATGCGATCGCTGATAAAATTCTATT:1 - chrX 15635949 3' + gypsy11 3936 1 67.33 CTTCTTAGCAAACCCAGTCCAGATAACATACAAAACTCATACTTCTCCTCAAAAAAAGTAAATTCTACCAAACCTCCAAGTCTCAGGCCTCAAACTCCCCA:1 - chr2L 13554550 3' + I-element 5115 1 67.33 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATACGAGTATATGTCGACAAGGACTGTCAGT:1 - chr3R 17495765 3' - Quasimodo 37 2 76.24 GTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGGACTGCGAACATTTGATGCCATTTAATTTGAGAGGCAAAAACTTCTGGCGGCTGCAAATA:1 - chrX 15250941 3' + Doc 319 1 65.35 CAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTTTTTTCTTTGCAAAGGTCTATTATCTTGAACACGGCTGTATGCATATACTTAGTATCTGCTTAATCCTTG:1 + chrX 8358256 3' + 1360 3362 1 75.00 TTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATATAAGTAAGTGCATGCCTATATAATTGCTGGCCCATTTGATATATATATATGTATATATATATG:1 - chrX 4486483 3' + 17.6 7418 2 78.57 CGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTTTCTCTCGAGCCCTCAACATCAAAAACACAAAGCACTTAAATAATATAACAACACACTCTACCATAAAC:1 - chr3L 25501984 3' + X-element 342 1 59.41 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCAGTCAGATACTT:1 + chr3L 16761337 3' + roo 391 2 59.00 AGTGGTTTGTTCGAAACACCACCCTGCACAGAGACCTAAAAATCAAATCAAAATAACAATAATATAAAGGCGATTAAACCACTTGCTGCTGCAAACTGAAA:1 + chrX 19372958 3' + X-element 4333 1 64.36 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCTTCAAGATAATAGAGAATATTTTAAG:1 + chr2R 13106805 3' - copia 52 2 75.25 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACCGAAATTC:1 + chrX 20620602 3' - pogo 36 1 66.34 ATTATTATTATTTTTGTTAATATATGTTCAAATATATGATCTAGTCCTTAGTTTTCCTTTTTCATGGAACCATTCAAGTATGCGAATTACATATGTAGACA:1 + chr2L 10389994 3' - mdg1 7068 2 88.12 GAAGATTTTAATTAAGTAGGATTTATTTTAAGTCACCAGTCTCGATGTACCAACAAGTGGTGGTATTATCAAAATAGCTTCTCTGTATCTTCCTCCAAATA:1 + chr2L 20119866 3' - jockey2 3222 1 73.27 TCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACATTTGCTTTAACCATTTCAAAAGCAGTCGACGATCCTAGGGTGATCCCTGCCTGATGAGGGATTGAAA:1 + chr3L 27135655 3' + FB 805 3 69.31 TTAAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATATGCTGATAAATTATTTTGAAGTTTTTTTTTCGCTTCTTAGCTGTTTTTGTTTTTCATTTA:1 - chrX 6549496 3' - Porto1 237 1 59.41 CCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATATTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGATTGGAGGTGCGATCGGATCAAG:1 - chr2L 16317287 3' - HMS-Beagle2 6859 1 79.00 GCATAATTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGA:1 - chr2L 12815044 3' + hopper 1380 1 56.44 TATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCTCCAAAATGGCACGATCCCACAGCGTCTGCGA:1 + chr3R 16601038 3' + jockey 4576 1 73.27 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTG:1 - chr3R 20556148 3' - Tirant 55 2 80.20 GCTGCAGTAACTACCAGCAGGGTCGCCTCTCTCAGAAACCCATAAAAATCGGAAGATTCGTCTGCCGGGGATTAAACGTGCCAGCTGTGGTACAGTG:1 - chr2R 18526482 3' + Doc4-element 265 1 77.32 TTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTTATGATTATATGCATTTTTTATATATACGTTTACAAGGG:1 + chrX 21098893 3' - Juan 369 1 66.34 AGTAAAAGTAAAGTAAAGTAACAGCAACAAATTATAAAATTTATATTATTAACTAATTAAAATAGTTTATATATTCATAACTTATAATTTTAAATGCATCA:1 + chr3L 18681988 3' + TART-A 13148 1 66.34 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATTGGCACTAAGAATTCTGAATTCCATCTGCTTTCATGGGTGCAGCACATGTGGTGGATTCCCTTTTTATG:1 + chr3L 18501038 3' + hobo 2930 1 67.33 GGTGCACACTTTAGAGTCCGGCTCCTTTTTGCTACATTAATGAATAAGATTAAGAATTGAGCTTGCATGCACAACTCGCCTACGTTTATTACTCGACAGCT:1 + chr3R 5972170 3' - Gypsy12A_LTR 2207 1 61.39 CTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTTGCATATGCTGCGCTCAATGCAGCTTCTGTTTGCATCGTTGGCAATTAGCATTGTCTCGATGATATTG:1 - chr3L 15646190 3' - Quasimodo 226 2 71.29 ATCCAAAAGTCCCTAAGACTTAAGAACATGCCTTCACACTAATACACCCATCTAATGGACACCCATGGACAATGCAGTGGTGCTGCTATAGTCATTTCATC:1 + chr3L 5266667 3' + Idefix 8 2 57.43 CCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAACACTTCTCCCCCTGACAACTTTTTCAATTAGAACTGTGCATATCTTAGCAGGGACATTATTTTTC:1 - chr2L 11904960 3' + I-element 5114 1 68.32 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGCTGGCGAGCAAGTTTTGTATGCGAC:1 + chr2L 5646929 3' - jockey 4672 1 78.22 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACTAAGCCCAAGTGGCT:1 + chrX 8972438 3' + 1360 3356 1 60.40 AATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGCTGG:1 + chr3R 10240182 3' + invader4 3073 2 67.33 TTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATGCGGGCACAGGGAGAAACG:1 - chr2R 16940310 3' + 297 380 2 65.35 CAGATGTATACTGAAGACATATAACTATTGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAATCATGGGACAACCATGATAACCATCCAAAAGTGACGAATATTAT:1 + chr2L 8346054 3' + Bica 88 1 59.41 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCATACAAATATTTGA:1 - chr3R 16457979 3' + roo 400 1 70.10 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTT:1 + chr3L 9766414 3' + blood 348 2 62.38 TTTTGTTTATTTTAACTTTGCTGGTTTTTCTTTGCTTTATTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGATTTTTAACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - TAHRE 10438 1 60.40 TCTCGAATGTTTTTGTAAACGAAATAATTAAACTTGTTGGAAGGACAACTTTCACATAATACCAAAAATGGCAATGGAAACCGACCGATGGAGCTGGAATC:1 - chr3L 19678655 3' + Fw3 9 1 66.34 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATATCGCGCACTGGAAGGATGCAAGCCCGAGT:1 - chrX 19116875 3' + opus 457 2 72.28 CCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTTGGACCCTCTGGCGGCCCCGGGCGGTCGAGTACTACAAGTTCGAAGCTGCCTTCATCGATTCCAGA:1 - chr4 762302 3' - F-element 415 1 66.34 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTATGTATCTATT:1 - chr3R 27748645 3' + roo 398 1 68.32 TGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGGTGAGTGTAAACATCCGCCGGAATCTTGAACCCACCTACACTCCACCACTGTGCAC:1 + chr2R 17655681 3' + Quasimodo 122 2 61.39 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACAT:1 + chrX 15082451 3' - mdg1 33 2 56.44 AAAGTTAAACACAAAGTGGAAAAATCCCTTTTGACAACAGCAATAGTCAGGTAGAGCAGCAACATTATGAATAAAACCGCAACAGCAACATATGCACAGTA:1 - chrX 3047991 3' + Doc 88 1 64.36 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTACGT:1 + chrX 11730341 3' - jockey 4779 1 60.40 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAGCTTTTAGCTTGCATTTGCATACAATAAATGTGCAATCTATATGTTGCCTTCAAATCAGC:1 + chr2R 12082421 3' - mdg1 18 2 61.39 CTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGACACGTTTCGAAGCCGCTTCTCA:1 - chrX 22855188 3' - P-element 14 1 65.35 GCACTAATCTTTAATGCTATTTTAAGAATGAAAGCCGAAGTGAACAGAAAGTGTTTGTGAAAGCACAGATAATATTTCGAAAGTGATGGAGCGATAACAGA:1 + chr3L 4839553 3' + Helena 73 1 77.23 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAAC:1 - chr3L 15100685 3' + pogo 2056 1 72.00 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGGTTGTGGAGGCAACAAAGTTTCAATATTAATGCCAT:1 - chr3R 27801281 3' - Burdock 6172 2 65.35 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGAT:1 - chr2R 24628778 3' + mdg1 370 2 78.22 GAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTTATGATTCCCTGGAGGACCACCTGTCCGTGACTG:1 - chr3R 10240322 3' + invader4 2610 1 64.58 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTACATATATTGTTTTTTTTGGCAACTCTCATTGCACATCCTGTGTCCAAGGCGATTCTTATCGCCT:1 - chr2R 18675464 3' - opus 5 2 72.00 AAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCACTACCACTCGATAATCATGGACGAGGGCAT:1 + chr2L 1368762 3' + I-element 86 1 69.31 ACACACACACATATGAACACATATAAGCACATTGTATATATATTGTATACATTGTATTGTATACACAGCAATTTTTTCAAGTGTAGTTCAATTTTATGGAC:1 + chr3L 17462179 3' + accord 7037 2 35.64 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTTGGTGAGC:1 - chr2R 20739425 3' - roo 8680 2 64.36 ATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTTCGACTTTTCCCAGCTCTTTGGCGATTTGGGCTCTTATCTAAGACCATTGCCAGCTTCTGGTAATTGTCG:1 + chrX 18154742 3' + Stalker4 43 4 74.00 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTTCGATGGTGCAC:1 - chr2L 22084463 3' + copia 237 1 58.42 GTATGNCTTAATAAATAAATTAAAAAAAAAACTGCTGGCAAAGTATCGATACCAGCGACAAGCGTTGCCACTACGTCCGCACTTGTTGCTGTATCTTCACG:1 + chr3L 7912392 3' + X-element 4707 1 64.36 GCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACT:2 + chr3R 1977615 3' + micropia 5404 2 59.41 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGA:1 - chrX 17968345 3' - Tirant 8123 2 65.35 TGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGAACTAGTAAAAGGGGACTGTGAAATTCCATTTCTGAAGGTTCGGCTATTTTGTCGATACTTTACTTTTG:1 - chr3L 25846319 3' - Idefix 288 2 51.49 TTAAAATTAAAATTAAATTAATATTAATGCAATTAAATTTAATTGCAATATTGAAACAAGATATTAAAGCAAGCAAACTAAACTAACAAAACAGTAGTTCC:1 - chr3L 9546707 3' + NOF 3957 1 63.37 AGACGACTAGGTGGAGCTTTAATTGCATGACTTGCTGTTGAGAATGGTGGCCACCAACTGTCCAGACTGGCAATTAAAACTTACGCTTCCGCCTCGGGGCG:1 - chr2R 19195387 3' - G6 1611 1 58.42 GGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGGTGCGTATGTGTAAAGCTCT:1 + chr3R 13342821 3' + jockey 4563 1 80.20 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAATTTTTAAAAAATT:1 - chr2L 11922483 3' - BS 5079 1 66.00 CTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAG:2 + chr3L 23678160 3' - Osvaldo 13 2 67.33 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCTCTGACTGCCTGTC:1 + chr3R 27775173 3' + roo 396 1 66.34 ATTTAAAAATTTAAATTAAAAACTTAATTCAGATATACATACATACATATATATACTACTAAAACCAAATAGCCATGACCCTCTTTCCGAACGCGTTTCAA:3 + chr3L 11233608 3' + 1360 3042 1 69.31 GAGCGCCGACTCTCTTTGCAGTGGAACAATGCATACTTCACCGTCTATCCAATGCCCGACTGAATGCGATAAAGGTCAGACTGGGGGCTAGGTATACGCTG:1 - chr3L 26037744 3' + Doc3-element 266 1 58.42 GTCTTGAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTATAATTAGATTAAGTGGACCGGGCAATTGGCAAGCTGCATTTTGGATGAGCTTTGGTGAGCTGC:1 - chr2R 20739422 3' - roo 12 2 68.00 CGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGCATTTTTTAGGTTTTGTTTAATAGAAAGTAACA:1 + chr2L 7007874 3' - Ivk 65 1 67.33 CCCATGAGGGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCACAGCTTCATTCGCGAAATAGGTCGCCTGCATTGCCGCCATTGCCGCTT:1 - chr3L 24361274 3' + Quasimodo 6993 2 67.33 AGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCAACAATCAAATAAATTGAATTGAATAAAAACTCACGTTTAAACTCGTGAAAGCAAAAATGCCACAAA:1 - chr3R 14966977 3' + I-element 345 1 68.32 AAGAATCGCCGCACCTCCGTGTTGGCTGTCATCCGGATAGTTGGTAGTATGTAGGGTGTTCAGCGTATAGCTAGCTCCCAGACAGCAAACGAATTCAG:1 + chr3R 2821092 3' - G5A 204 2 58.16 CCTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTAGACACGGAAGAAAAGATATCCATAACCCCTCTGGACACAGGACAGGAAATACATA:1 - chrX 22077190 3' + gtwin 7368 2 56.44 AATAATTAAATTTTATGGAGGGAAACATTATCGTAAGGGGAGTACTTGGGTAGTTAGTAGTAGAAAGAGGCAGGCAGAGCTGGTGGTAATGATTGCAAAG:1 + chr3L 21780178 3' - G2 3016 1 54.00 GGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTA:1 - chr3R 31458419 3' - jockey 35 1 51.49 TGATATTCTTAACCCGACATCAGAAGTGGGATCTGTGCCACACCCCTTTTACAACCCACTAGATGAATGCGGAGGGCTCAGACTTCACAACTGGCATGGCT:1 - chr2L 697723 3' + micropia 458 1 63.37 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGAT:1 - chr2L 3951594 3' + Transpac 5189 2 68.32 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCCTCTACTGTGCACGTGACACCAACAGAAGGCCTTCGGAAACTCTGGATTCCACAGAG:3 - chrX 5092912 3' - roo 8683 2 60.40 GTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTTAACGGCTGCATTTCGCG:1 - chr2L 18279864 3' - gypsy5 6939 1 79.21 AGCTACCAGCACAGCAATCACGATATCTACTGCAACTGCACCTTTAGCAACAAAATCTTCCAGTCCTTGTTGGACTTCCGAATCCGCTTTGAATCCAGTCG:1 - chr2L 22731670 3' + Doc3-element 484 1 54.46 ATCCATCTGCACGTGCACCAACAACAACTTTCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGCTTACAGCATATTATTTCTTATTTAGGTAACAATTG:1 - chr3L 14226687 3' + Porto1 422 1 76.24 TACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAACCCGTAGCGGAATGCGTCCGTGTGGCAGCGCGAAGCTTTCGCAACTA:1 - chr3R 31813056 3' - G-element 4224 1 61.39 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTAAATTATTGTTGTTTTAAAATAAATAATAAATTATTTCTAATGGACATAGAAAAAAAGTATTG:1 - chr3L 25968863 3' + HMS-Beagle 236 2 69.31 ATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATTAAATAAAAGTACTTGTCGCAAAAGAGAGAAATAACCATGTGACCAGTAAGTTAGTACACGCG:1 - chr3L 25255142 3' + GATE 424 1 52.48 TAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCAGAAAATATTTTTAGTAAAAGAAGGTATTTGAGAAGGCATAATATGACTTTAAAAAGTAAACAAAGTAA:1 + chr2L 64120 3' + X-element 4629 1 68.32 AAATCACTTGATTTTAGTGAAGTAAATAATTAATAACATAAAATAAATAAATTAATTGTTTTAGCGAAAGAACATTGAGGGCAGCCTGCACGGAAATGAC:1 + chr2R 11267018 3' + Doc3-element 45 1 59.00 GGATCNCAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATA:1 - chrX 16995129 3' - jockey 63 1 76.24 TCGGTAATAATCGAACATTATTGTTAAAAAAACAGCGATAAGCTATTAAGGAAGTGCCCAACCCCGGCAATAAACGTTTAAACATGTATCGAACACACTC:1 - chr3R 2938574 3' + Circe 452 1 66.00 ATAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACGTGTAAAAAAAGACATCATGATTTTTTTCAT:1 + chr2L 6083809 3' - 3S18 5767 2 72.28 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATC:2 - chr2L 3951593 3' + Transpac 5190 2 67.33 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCCATGGCATCTGGTCGTTAGGCCAGCCGTTCAT:1 - chr2R 16333977 3' - P-element 22 1 57.43 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACCAAAAATATATAAATTGATATACTTTATCT:1 - chr2L 2078455 3' - I-element 48 1 76.24 CCCTTCTAAGACGAAGGCTGTCCACAGACTTTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGGTGGCGCAGTGTGCCCTCTGTTATAAAATATATATGATTACTT:1 - chr2L 2972811 3' - Burdock 6111 1 57.43 CTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATTTAGGACTGGACGAGCGATAATTAACATTTAACATCAAG:1 - chr3L 23123154 3' - flea 337 1 77.23 ACCACATTATGTTATTTCATCATGGTATATGGCATTAACAAGTGTTGCTGTCAGTGATGAGCAAAATCCACAACTGCAAATAACTAGATACCGTATATTTT:1 - chr2L 7800026 3' + P-element 2884 2 76.24 AGTTGGCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAAAAG:1 - 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P-element 14 1 62.77 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAACACTTCTCAGATAAAATGTGGAAAAAATGACGGAAGAGCTTTAAATTTTATTACGATTTATT:1 - chr2L 15510387 3' - jockey 4687 1 60.40 ACAGATACTCACACACACACACACACACACACACTCTCCCCCATGTGCAGAGCACAGACAG:1 + chr3R 10943847 3' + Quasimodo 29 2 62.30 ATTACNGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTC:1 + chrX 12290225 3' - X-element 55 1 66.34 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTATTA:1 + chr3L 5102447 3' - jockey 4716 1 70.30 AAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGC:1 + chr3R 20147566 3' + 1360 383 1 64.36 TGATTNTTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTC:1 + chr2R 19209432 3' - jockey 4811 1 75.25 GCATAGATCAAGCTAAGCGATAAGAACTATTTCAGGCAAATCGGACAACAAAAAGAAGAACTATAACAAAAAGAAGTGCAGCACAAGTAGCAACTCAAAAG:1 - chr2R 10964060 3' + Bari1 1602 1 72.28 CGAACGCTTGCTCTCCGTCGTTGCCAAGAACAGTTCCAAAATCTTGGAAATCCACAATGCCGCACCGTCGAAATCCTATGCCTCACAATCTGCCATAAATT:1 - chr2R 5529168 3' + Doc4-element 125 1 61.39 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTCTGCTATGTTGAACACAATCCAGAACCCGCGCTCAGCCCAAAAG:1 + chr3R 23638203 3' - pogo 2 1 76.53 GTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGTAATCAAAACACA:1 - chr3R 20556113 3' - Tirant 20 2 61.39 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTACATTTTAAAGTGCAGATAATTGCGCGTGTAGACAAAATGGATTTTCGACTATTTATGTGGT:1 - chrX 6379112 3' - hopper 8 2 72.28 GAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGTTTGAGAATTTTTCGCCTGCGAAACAGTGGTGGAATCGTGTTAATAAATATTACTGCTTGTTATTAATATG:1 - chr3R 8442713 3' - gypsy12 9985 2 69.31 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGATGAAAAATCTTTGGACGCAGTGCGTCCTGCGACCTTCTCCTCCACCTC:1 + chr2L 16674930 3' - roo 8691 2 54.46 ACCCGTTACTTAGCTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATC:1 - chrX 15408753 3' - INE-1 538 1 84.16 TTCATATACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTGAATTAATTTGGGATTGAAATATTT:1 + chr2R 7868946 3' - roo 8715 2 76.24 CAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATATAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGC:1 + chr2L 2074776 3' + roo 9041 1 57.43 TTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTAAT:1 + chr2L 3388150 3' - F-element 300 1 59.41 CCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTTTAATAAATTGCTTTATTTGAG:1 + chrX 21564741 3' - diver 30 2 58.42 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTGCTTAATCAAGTGAAATTGAATCAACTTTTTCAGTCTCCGGAGACAACTGCAAATT:1 + chr3R 19530721 3' - BS 17 1 55.45 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCC:1 + chr2L 1625699 3' - hobo 43 1 69.70 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGAACTCGAGCTC:1 + chr3R 25671999 3' - I-element 14 1 64.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCCTT:1 - chr2R 9870959 3' + roo 401 1 69.00 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTATATGAGAATGTGTGTGTTCGGCTTATCCTCTGCACTTTGCACGAATGCAACAGTCCTGTTGCCACCACCCCCATGC:1 - 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chr2R 17261594 3' - pogo 48 1 76.24 AAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACAC:1 - chr3R 19132263 3' - Ivk 23 1 56.44 AAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACA:1 + chr3L 18337726 3' - Juan 4038 1 65.35 AACCTGGCAGCAATTTTTATAAAAGCAGACAATAATACGGTTTCCATGTTTATCAGCTACGACGTATGTTGCTGTCGTAAACGGATGTGTATGTGAAGTTG:1 + chr3R 19087815 3' - Cr1a 461 1 54.46 AGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGAAACCCGCGGCCGAAAGCGGATAAAAAGTAATCAA:1 + chr2R 18950802 3' - roo 39 2 66.34 GGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCATTCATTATTGATATAGGCTTTTTGGAAGATCATGTATACATAGTCAATTTTGTTACTGCCCCAA:2 - chrX 15355055 3' - X-element 4685 1 60.40 CAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATGTGGAAAATGGAAACAGAAAAATGGAAAACACGA:1 - chr2L 4746624 3' + I-element 200 1 66.34 ATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTAATTTGTCTCTCATCTCATCTGCGAATTATACATAGATGATCGTGTCTG:1 - 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chr2L 13500030 3' - McClintock 271 2 76.24 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCA:1 + chrX 5092982 3' + roo 9028 1 66.34 TCAAATCAAAAAAAAAACAAAAAAATAACCAAATGGAAAAATAGTGGCTT:1 + chrX 5377965 3' + transib4 2532 1 68.00 CAATAATAATAAACAATCTTACATGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGCCTTGTGGCTTGGATTACAAATTTCGCATATTTGATTCCCGAAATATGCAA:1 - chr3R 4554531 3' + flea 5012 2 55.00 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGTTAACCG:1 + chr2R 2427613 3' - Doc 24 1 55.45 CGCACTTCGTGCCTCAAGATATGACCAAAACAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGGTGTGTTTTTAATGACACTTCCACTCGAAACTGCAACTT:1 - chr3R 16245335 3' + 1360 477 1 60.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGGAAGAGACAACT:1 + chrX 13508771 3' + roo 9054 2 65.35 TGTTGGTTGGGCGCCAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTTCGTATTGCCAGTGGTTGTGGCCGTGGTTGCAGCCCCAGATCCACCAGTGGTTGCC:1 + chr2R 24769098 3' - gypsy 476 1 60.40 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATA:1 + chr3L 23456279 3' + 1360 3382 2 68.32 AACTCCCGCGAGTTATTAACAAACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCACAGATAGCTGAGCTGAGCTGAGC:1 - 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Stalker2 7283 2 58.42 TGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATCAAATAAGTAAGTAAGTATTATGCAGAAAGTTACGATTTTTTAT:1 - chr3R 8975939 3' - Bari1 32 1 57.43 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACACGGACCGGCAATCCC:1 + chrX 13546724 3' + roo 396 1 67.33 AGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTG:1 + chrX 22945344 3' - BS 38 1 59.41 CTATTACTCAGTTTCAATTAAACCGTCAACTATACCACTACGTTCCTGTGTTTATTTGCTCGGTCTTTGCAGAAAGGTGACCCCGAGCCAGATAGACATTA:1 - chr3L 12888609 3' + Copia1_DM 89 1 63.37 CGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCAAACAACATATAGGCATCCCTTGCC:1 + chr2R 3904606 3' - Bica 231 2 75.25 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTT:1 + chr2L 1625709 3' - hobo 23 1 55.06 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACCCTATAATAACAAAGTGAAAATTTGAAATTATTTCGTGCGTTTTTATG:1 + chr3R 14917263 3' + HMS-Beagle 7015 2 52.48 AGCTTGCGGCGTGTGAAAAAATAATAAGGATAAGTTCCTGGTGATGGCTATGGTCGCGCCAGGCGGTGAATGCGGTGGCGCCGATGTGACCGAGCTGTGG:1 + chr3L 5928877 3' + 1360 424 1 75.00 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTATTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTCATTCGAACCACTTCTCTTTTGGTTTTTTCCAAATCCA:1 - 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chr3R 23591412 3' - pogo 27 1 57.43 GGTGGTATCTTTAGAATATTTTAATTTTCCTACCGTAAGCCAATTTGCCAAATTACTTAGAGGGGCAAAAATAAAAAATAAACTGAGGGGCGCCAAGGACA:1 + chr2L 848994 3' + Rt1b 5107 1 64.36 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTTGCGTAACTTTGACAGCAGAAACAGC:1 + chr2R 24239370 3' + hobo 2889 1 74.26 CAACGCAGGCGAAAATGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGGTGTGCCTAGGAGATGATCGGGGATCAATGCTGCTCGCCATGTCGAG:1 - chr3L 23402447 3' + R1A1-element 488 1 59.41 CTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTGGGTATCGTTGAGTTTCTGTATTCACTTCTTG:1 + chr3L 23773165 3' + Transib5 2938 1 68.32 CATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAA:1 + chr3R 29288773 3' - BS 5020 1 47.52 GGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCACTCTAAGAAATGATGTTCCTCTTCCTCCTCGAACCCAAACAGATCTG:1 + chrX 17513263 3' - F-element 4388 1 53.00 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTA:1 + chr2R 4483257 3' - Ivk 41 1 63.27 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAATAGTAA:2 - chr3L 6044733 3' - Tabor 6865 2 53.47 CGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCTAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGTTTCCATTATACATAGAATAACTAAT:1 + chrX 23210560 3' + F-element 289 1 74.26 CTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACAACTCGATTAGTGCGAAGACCTCTTACTTCCCAACTTTGTATTCGAGATGCATT:1 - chrX 20881675 3' - invader4 2929 2 60.40 TCTTATTGAGTAATTTTGCTTATCCAGTACAAAATAAAGGAAAAATAATTAAGATAGGAATGCAAATTTTAGTATTTGAAACATTAACTTGTATATGCACC:1 + chr3R 442392 3' - Circe 6994 1 66.34 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACTTTAGGGCTTAGAATTGTAATTAATCTGTGTACTTCAATAAAGCTAGTATACTTTTGGGGAGTAGCGGTTTCTTC:1 - chr3R 31458393 3' - jockey 9 1 77.23 CATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGACA:1 + chr2L 14612119 3' + roo 396 1 66.34 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGTAACTTTGAAATAAAATTATGTATT:1 + chrX 17058222 3' - 297 10 2 64.36 GTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAACCTTTATGGCACGTTTATTTTCCCAACTCCAGATCCAGTGAATGCGAAAAGTAAATGAAAGAAGCCAACAC:1 - chrX 6373611 3' + X-element 4707 1 67.33 ATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGAGCGATAGT:1 + chr3R 11094601 3' - 3S18 4 2 75.25 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGATCT:1 + chr3L 12888308 3' - mdg1 14 2 65.35 TATAACCAAAGACACTAGAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCATATTCACAGATTCATTTAAAGGAATGTAATCTCC:1 + chr2R 21710069 3' - Tc3 316 1 51.06 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAGTCGAAATGAGAGGCTCCGCCC:1 - chr2R 8310862 3' + pogo 2051 1 80.21 TAGAANTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTTTGACATTTCGCCATTAGCTGTAAAACATAATTAA:1 - chr2L 13334024 3' + flea 4979 2 66.34 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGCAACTTTACATTCTAGGTCTAACTTTTATGAACATCT:1 + chr2L 10715328 3' - pogo 36 1 61.39 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAGGCACATAAAAAAACGTACG:2 - chr2L 14790575 3' - roo 27 2 54.46 ATCTGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCAGTCAGTTAGAACGCACGGAAAATGTGACGGTCAGTGAAAACAGACAGTAAGAAGGTTGG:1 - chr3L 23990510 3' + F-element 112 1 59.41 GCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTTCATAATGGACATTGTTGTCGTACAGGCAATTAAATC:1 + chr2L 2522117 3' - F-element 4481 1 63.37 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCAAAAAGCGATGACAATGGCTTGGAGAA:1 + chr2R 13295713 3' + Tirant 351 2 73.27 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCAATTAGCA:1 - chrX 20806842 3' + opus 493 2 74.26 ATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAA:1 - chr2R 3591998 3' - Quasimodo 45 2 80.20 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATAATTTACTACTATTTACTTGTAC:1 + chrY 536714 3' - Doc 30 1 53.47 AAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGGCACGACTTATCTCTTCGAAGGTTGAAGTGGTACTTAGATCGTCGTCAACCGACACAAC:1 - chrX 1624312 3' - I-element 154 1 40.59 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATA:1 + chrX 2799695 3' - Tirant 35 2 62.38 GAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTGTACATACAAAATTACATGGTCCTGCCAAAATGCGCAAGAAAAAATTTAATTCAAACGGT:1 - chr4 1030001 3' + gypsy 443 2 43.56 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATCAACGTTGATTGATGTTCTATTTTTATGTACAT:1 + chr3R 16834072 3' + I-element 5309 1 66.34 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGGTGCACGCAAAAAATGGAATTGATT:1 + chr3L 9909745 3' - Transpac 54 2 74.26 TGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGAATTTTCTTTGACCTATTTCTGGATC:1 + chr3R 28646238 3' + F-element 193 1 74.26 GTGGAGGTTTTGAGGGGTGGGGGAGTTGGCGTAGAAATTGCTGATGTGGTAACTCGTGTGTTGTTTTTACAAATTGTTATCCACTGTGTGTCGGTTTTGGG:1 + chr3R 9172212 3' - gypsy5 105 2 58.42 GTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTGCCGTGGCGCTCGAGATTCTGAGATCAAGTTCGCGAATGCAGTA:1 - chr3L 6616673 3' - Tirant 109 2 60.40 TACAATGAAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAATTCGACTAGAAAAAGGAGGACGAAAAAAATTTTTAGTGTATGAAAATAATTCCG:1 - chr2R 473494 3' + Doc3-element 4504 1 61.62 GCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:2 - chr3L 25232768 3' + accord2 7599 2 54.46 CTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAGGTGCTCGTCTTCAATATTATCAGATAGGTAATCGACCACATATAAGA:1 + chr3L 25874012 3' - 1360 88 1 54.46 CTCCTCCGTGAATATAACCATAAAAGATTCAAGACTCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCATTGACGACTTCGTATGCTTTGTATATTTACTTTGATTT:1 - chr3L 4323807 3' + baggins 5059 1 73.27 CTGCCCGTGTGGACCGCTTATTTACTCTGCAACACCCATTCAGTCTGTTTTTAATGGCCACCGCGAACTCTGACAGCGCTGCCACAAAACCAAC:1 + chr2L 2546679 3' + baggins 355 1 79.79 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATACAGTCCAAACAAAACAAAGAGAATTTCGCTTGCCAAGAGAATCCGAAGCAACATT:1 + chrX 8491480 3' + P-element 2865 1 57.43 ATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGCCACATACACAGACACTGAGGGCTTTC:1 + chr3R 28646476 3' + F-element 232 1 68.60 ATACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGCCCTTACTTATGATAACTTGTACTCAAGTATTTTGTTTTCTAAATTAGTGTATAAAATATTATTGTATT:1 + chr2R 16660291 3' - gypsy9 29 2 49.50 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATATATGCTAAAATCATTCCAAAGATGTACATGAACTTCACACT:1 + chr2L 2308721 3' - HMS-Beagle 23 2 56.44 TTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGATAGAAAAAAAATTTGTTATGTAAGCGTTCCTATGATATATGTAAGAATGTATGTAAAATATACCTTTGAATAAA:1 - chr2L 19817799 3' + G4 3834 1 52.48 TACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATTTAAATGGTTGCATTGAAGCTTACGATATTGAG:1 + chr3R 26530956 3' - blood 5 2 72.28 CAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTGGCCCGTTCTCTCGTTTTTCGTATTTTCCACATATCGTGGACATTTTCAACAGAAAGAATGACACCTTTT:1 - chrX 2911609 3' + 1360 453 1 75.25 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTCCATGATGCCACAG:1 - chr2R 8345481 3' + roo 397 1 68.32 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAAT:1 + chr2R 5840702 3' - Ivk 20 1 59.41 CACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAAGGCCATCAAAACTAGTGCCACGACTCACATCGCAATATTTCGTTTAATAAAGAAAACATAGA:1 + chr4 108663 3' - micropia 5118 2 67.00 TCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTATGATCAATTGGCCTCACGTAACTTTCGCACTTTCAATTTGTGAATTAGCACATTCATCAATTAACACATTGTAA:1 + chr3R 9382205 3' + 1360 241 1 66.34 ACATTAGGGCAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTGGGCTTCTTATGTTAAACTTGAATTTATGACTTATATCAATATATGTTCGGTGAATTCGAAG:1 - chr3L 3806534 3' - Quasimodo 158 2 76.24 AAATGAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCAGCGGCAAAAAGACCAAGATGAGCGCCGACTCTCTTTGCACCAGAACAATGCCTCAAACTTTGAGCTTAGCTTA:1 - chr2L 14553560 3' + Doc3-element 219 1 77.23 CTGTTAATGTGGCTGAGTCTGATTAACTTGTAGTTAGGTTTTAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGT:1 - chr3R 15095980 3' - gypsy2 493 1 67.33 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAATAATACTTTTCATAACCACATT:1 + chr3R 29259648 3' - pogo 27 1 54.46 TTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATGAAGCTACAAGAGAGGTACCTA:1 - chr2R 22747730 3' - HMS-Beagle 43 2 69.31 TGGGACGTTAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGCTATTCCGAAATGCACGCGGTCAAAAAGAGCATTGAATTGCTACTATAAAATTAGCCTACTAGTATACAT:1 - chr3L 18213421 3' - mariner2 238 1 50.50 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAG:1 - chr3R 17843651 3' + roo 9036 1 64.52 CAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATCCACATCAGCATCAGCGCAGCCATAGCCATAGCCACAACTTCAGTCAGGAGCCACTCATTAAGG:1 + chrX 6230436 3' + I-element 5022 1 72.28 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAGAGAGAAC:1 + chr2R 14713649 3' - P-element 39 1 40.82 TCAAAACAAAAAAAAACAAAAAAAAACAGCAAAAAGGACCCGGCAAAAAAAAAAGAAAACATCATCAAAATGGGGAAGTACGAAAACGAGCACGAAATGA:1 + chrX 6438792 3' + R2-element 3584 2 78.00 CATAACCAGAAACAAATATAAACAAAGTGAGGAAATGTTAAATTGCTACGTCACGTTTTGTTTTTAAACTGCCCAAGTAGGACAATAACCATTTGGATCAA:1 + chr3L 19648538 3' - Transib5 2644 1 60.40 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACACACACACATACACACAGCCACCGACACTAACACTAATGGCTTTAATTATTAATATTTCAGCG:1 - chrX 6421557 3' + 1360 3182 1 67.33 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACA:1 + chr2L 16948711 3' - jockey 4702 1 65.06 AGAAAAAGAAAAAGAAAAAAATAAACTAACGCCATGTGGGCACTTTGTTATTTGGGCGTTTGGCAAG:1 - chrX 13340445 3' + Doc2-element 221 1 89.55 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTT:1 + chrX 2649885 3' - Tirant 37 2 60.40 CATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTCCTTCCACAGTTGTGTCCTCCGTATCGCTCTCC:1 + chr3L 19597575 3' + Doc 289 1 67.33 CGTCTATTGTGAAGTGAGAAATGATTTGTGCCAGCTTGTGCCAAAAACTAATAACTGATGTGTTTACTCAAAACTTAATTCATTTATTTGCAGGGTATTTT:1 - chrX 17494415 3' + transib3 399 1 78.22 AACGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCA:1 + chr2L 19481326 3' + roo 353 2 78.22 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGC:1 - chr3R 19446163 3' - 297 41 2 71.00 AAGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTATTTGTCACCGACAAAAAGCTTTTGATGAATGAAAAGCTTTTTGTTTTGACTTTACCGCTAT:1 - chr3R 25969064 3' + Doc2-element 322 2 50.50 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACT:1 + chr2R 17626556 3' + mdg1 386 2 60.40 TATTATTTTATATTATTATATATAATATATTATTTATATATAATATGATACTAAATATTTAAACTAATTCAGAGTTACTCACTTTAAGGCAATCTGCTTGG:1 - chr3R 19011874 3' + Tc3 274 1 40.59 AAATANAACGAATCAAAATTTCGGGATCGATTGTGTTGTTTATTGATTAACGATTTCTTTGGCTCGTTAATCTTTATTTTCGTCTTTCTGGACAACCCTTG:1 - chr3L 730738 3' - 17.6 7321 2 54.46 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACT:1 + chr2L 13319648 3' - hobo 24 1 52.04 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGTTT:1 + chr3R 20149765 3' + 1360 3346 1 70.30 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAACTACTGCCTTTTCCCAGATTACGATTACATCGTAAGCTCTTGA:1 + chr2R 2641210 3' + Ivk 5345 1 57.43 ATAATCGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAATAATAATAAACAACAGCAGCTACAGCAGCCTCGATGACAGCAACAGAACATA:1 + chr3L 14391999 3' + HMS-Beagle2 7160 2 71.95 CGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCCATGGCATCTGGTCGTTAGGCCAGCCGTTCATTCGGC:1 - chr2R 16333972 3' - P-element 17 1 62.38 AGTTATAAGTTGGAAATTTCGACAAGATCAGGTGATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTGATCACACACACACAGACACTCACACACACA:1 + chrX 17563256 3' + invader2 4800 1 70.30 TGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACATTACTTACAAAATGAGAGATATTGATTTGGGGATAGCAAGAGCTGGTTAACTTTATATTA:1 + chr3R 7415221 3' + I-element 5339 1 62.38 TGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGAG:2 + chr2R 5531197 3' - 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hobo 57 1 78.22 TATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATGTA:1 - chr3L 15099562 3' + G4 3806 1 62.00 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAGCCATGGAACTTTACCCCTTTACCACTCATTCCACAGAATCCACTGGTCTTGTCTGATTGT:1 + chr2L 14579922 3' + copia 240 1 62.38 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAATTTTTCTGCG:1 + chr2L 3440527 3' - Juan 8 1 75.25 ATTCTAGTGTCTTTGGTTTAAACCTGTTTGCAGATATGCTCTGTAGTTATTATCACTATGTCATACTAAAATGTTATTTAAATATACTGATGAACTTCTAA:1 - chrX 21097391 3' + Tc3 317 1 66.34 TACAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAAATTGGAACGTGTAAATGGGTAGAAAGATCACCGGACGCAGTGGACTGGAATG:1 - chr2R 5111581 3' - mdg3 5062 1 59.41 CGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTTTGTTCACCCCTCTACCCCTACCCTCCTTCTCTTTCACCTACTCCACCACCGCGGAGC:1 - chr3R 8110700 3' - F-element 110 1 69.07 GTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATTCAATCGAAGTCAAAGAGACAACGCAGGAAAACGGAGGAAAAACTCGGTTACCGCCCGTTCGCGACT:1 - chr2L 18716463 3' - gypsy10 10 2 68.32 GTTTTNAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGTCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCATTGCCAGGATGCT:1 - chr3L 12888220 3' + mdg1 7428 2 56.44 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACAGATCCAGCGGCAGTA:1 - chr3R 23275230 3' + roo 404 1 74.26 AAACTTCATACTGATTTTGAGCTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGATGAACCTTTTAGCTGCGCCAGGCT:1 - chr2R 13310170 3' + Tirant 8375 2 76.24 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATAACAAATGCCAGCTTAGTGTGTCAGTGTC:1 + chr3R 26321670 3' - blood 7058 2 73.27 AGTTATTTACAGTAACGACCTTAGACACATCGACGAACACACAATTCTACAAGAACTAAAACAACAAAAAGTAATGGACATAGCATCTTCTGCCTGGTACA:1 - chr2R 2009298 3' + I-element 495 1 73.27 TTCTGATGTCGGCGAGAGAGGAGTCTCATCCATTTCGTTTGCTCGGTCTCCGCGAGATGTAAGAGAAAGTGCATATTTATATAAAATTAAAAAAAAAATTG:1 + chr2L 20596078 3' - invader4 331 1 57.43 GGCCAACCCTTTTCATAATTGGCAGTTTGTTGGCATTTGTTCGAAAGGTGTACAATTTTATAGTCGTTGTATGCTATAAACTTAGGCGCTATTGTAAAAA:1 + chrX 21668464 3' + gypsy2 334 1 78.00 TGTTAATGTTACCAGTCCACGTTACTGTCTAAAAGCTAAGACTAGAAAAAATACCAATTATAAACTCACCACGCCCCCCCCACCCTCTGAGCCGCCCCCAC:1 - chr2L 12745393 3' + HeT-A 5853 1 74.26 ATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGTAAGCGTTTTTATAGTTA:1 + chr3R 18210355 3' - Juan 41 1 65.35 CTCCGGAGACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGGCTAATTATGGGGTGCCATGTGCTTAAATCGGTGCTATA:1 - chr2L 2526052 3' + X-element 440 1 65.35 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCTTATCATTT:1 + chr2L 7255837 3' - P-element 4 2 75.00 GTGTGAGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCCTGCGTCTGGATAAAGTTTCATCAAAGAAAAGTT:1 + chrX 9955578 3' - accord 189 2 65.71 CAGGAATTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTGTCATTACCGCTATTGCAGCTCCATTGCATTTCGGTGCATTTCTGTGGAGTTTCGTTGGTACTTACAGC:1 - chrX 12386911 3' - invader2 199 2 77.23 AGTGCNAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCGCCATCACCTGCTCTTCATCAGTGTCACAGACAGCCGAAAAGTATGCAAACATTTTTCGCACTTTATAAT:1 - chr2L 20238641 3' + hobo 2932 1 72.28 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCT:1 + chr2R 21773619 3' - Max-element 8261 2 52.53 TTTGTTTTTTTTTTAAGTTTGCGCACTACTTTGTTTAACAAGTGTGGTAACTTAAGGTACTTAAATGTTGTTTGTCCTTGCCCGAGGGCGGTGGCTC:1 + chrX 10572002 3' - TAHRE 10439 1 60.82 CAAGTGAACAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCACTTGATTTGAATGAGGTAAATAATTATGCAAGTAATAATTCAAAAAAAGTTGAAAG:1 - chr3R 26072699 3' + Doc3-element 9 1 65.31 ACCTTGGCAAAACGTACAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGCGTGCGATCCTGGGAGTTTGGACTAACTGCAACGAAGGCTGCTGCA:1 + chrX 12101225 3' - I-element 5006 1 54.00 GATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTAT:1 + chrX 19426289 3' + mdg3 203 2 65.35 TTTACAATATATGATAATAAAAGAAAATTATTAAAAGCTACCACTGCTTAATCACCGGTTTTATCGGCCAACGAATCGTTTGATTTTTATTTTGGTTTC:1 - chr2R 10097006 3' - Cr1a 89 1 59.60 GAAAATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTGCCCTAGCGATAAGGCCGTGTTCTCCTGCGTTCCACGAGAATTGAGATTAGT:1 + chr2R 7745981 3' + mdg1 6994 1 57.00 AGGATGACAGAGCATTTAGAGTTGTTATTAAGAATTTGCATTTTTCCACAAATTTAGATGAAATGCAAATTTTAATAAACACCAAAAAGATAATAAAACAT:1 - chr3L 15635824 3' + G4 366 1 63.37 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCC:2 - chr3R 7388344 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.39 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGA:1 - chr3R 26530873 3' + blood 332 2 67.33 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACAC:1 - chr3L 28063324 3' + roo 402 1 72.28 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCAGCCCACGACGAGGCGA:1 + chr3R 23275360 3' - roo 8662 1 77.23 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAATGTGCGCCCAACTGGGCGAATATGGGTGCT:1 - chr3R 15598649 3' - Max-element 8256 2 58.42 TATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGTTCAAAGAAACGAACTCTCTGAGCTAGCCGTTGCAACAGGTAGCTAGC:1 - chr3L 27130364 3' - 1360 3212 1 66.34 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTTAACCCACATA:1 - chr3R 20477025 3' - 412 17 2 62.38 CGCGGGTAGGAGCGGGAGGGAAGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGCCGAGGGATGTGGCCTCGTGGACGTTGAACCGGA:1 + chr3L 11161521 3' + invader1 3737 2 66.34 TAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTTGCA:1 - chrX 3305156 3' + transib2 2793 1 66.27 CCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAAAA:1 + chr3L 11257386 3' + 1360 18 1 47.52 CTGGGGCGCTGGAGTGCCTAAGTAGTTTTTGGTGGTCTTTATGCACATATATATATATATTAATAATGAATTAAACTTGACTTTCGCTCGGC:1 - chr2L 7904405 3' - Stalker 131 4 47.83 TTGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGCCGGGGGATTGAAACGATTGAAAAGATAAGGCGAGCACTTAAGGGGTTTATTGGA:1 + chrX 18746367 3' + Stalker3T 44 1 62.38 CCACAAAATCTGAAAACAAAACAGGCAAACGTCTCGAAAAATCATCAATTAATAAAAAGTTTGAGGTGAGCTTAAAATAATGTAATACATAAATACGATC:1 - chr3L 23874213 3' + I-element 5183 1 77.00 CAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGACTACTGGAAAGAGCGAAATATGTCCGGCAGATGTCCGGCAGACATAC:1 + chr2R 7552339 3' - gypsy3 2 4 77.23 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGTAATCAA:1 - chr3R 20556119 3' - Tirant 8125 2 60.22 AAAGTCTTATTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTCTCTGTGCAAATCCACG:1 + chr2L 19481355 3' + roo 404 1 67.50 TGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAAAATTTTGAGATTCTTTGCGTGATACCACACTGCAATATTCAAGAAACCGCCCAAAAATATG:1 + chr2R 22218646 3' + Juan 20 1 63.37 TTAACAATGAACGAGAAAATGAACTAAATCCAAGTTTGCACAGTTTATGATTCACTTGAACACTTCCCGTTGAGTAATTTATGGTGGGAATTTTCTTTGAG:1 + chr3L 16137580 3' - S2 1552 2 63.37 TAATTGTACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAA:1 + chr2R 13585498 3' + Juan 4162 1 77.23 GTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGAGGGGGTATTATATTTTTTTGCCCGTGCGCCTGCCGATCGCCGTATTCGCGTCGGCGGTTTGGAGTGGTTTGGAG:1 - chrX 19527576 3' - Idefix 160 2 57.00 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACA:1 - chrX 21668949 3' + mdg1 7426 2 58.42 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAAAACTGAGCAAGAGA:1 - chrX 13546619 3' - roo 8679 2 65.35 TGTTTACAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAGCCACGTCTGGTTTGACAAACACAAAGGACCCAAGTCACCGTCCACTGATAACTTTCACCGTC:1 + chr2R 1890425 3' - Cr1a 91 1 63.37 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATAC:1 + chr3L 17168889 3' + mdg1 370 2 74.26 AAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCAGTATTAGAGTGTGTGTCCTGGGATAC:1 - chr3L 13588818 3' + hobo 2826 1 78.22 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATATATCCACATTTTATTTTTATTGTAAAAAAAAAATATTACACATATT:1 + chr3L 8713161 3' - opus 141 4 63.37 AATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACCGAAAGTGTTTCTAGCAAAAAAGCCCCATGCCAAAACCAAGACACACACACACACACA:1 + chr2R 22276364 3' + Tabor 470 2 63.37 GACGGATTATATTATTAAGTTTCTTTTATTAGATTAACTAGTTCATGCTAGTCAATATGTGGTACTCTATAGTTTGTACACATCTGCAACTATTCCTCTAT:1 - chr2R 9538546 3' - HeT-A 48 1 64.36 TATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCGGTTGTTCGACATCAGCATCTTGGCTCCGTGTTGCAACTCTCGTCGAGCAATATTTTCTCGAAGCACA:1 - chr3R 4709192 3' + Quasimodo 409 2 74.26 AGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGACATCGACCGCCCCCTGAAGGCCGAAGTCCAACGCCCAACCGCCCATCC:1 - chr3R 11841049 3' + hobo 2603 1 77.23 TGCACACACACACACACACACACAAGGACCTTCCTTCTCTCATCGCTCGCATTC:1 + chrX 17047264 3' + accord 182 2 68.52 CACGAAGCATACGATCATATCCCTATATTATATAGGGATATATATCATATCCATATATTTTAAAAATTGCGGCATTAGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGAAAC:1 - chr4 71481 3' + invader3 52 2 44.55 ACTTGTTGCGTCCTGCCATTCCTGCCGTTGGTGGCGGCTGTGAGACCCGACAGTTTGCATCATTGGGTATTATCAATACAAATAAGGAAATGCACAATTTA:1 + chr2R 5265185 3' - Q-element 419 2 60.40 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAATCGCATG:1 - chr3L 10477529 3' + copia 238 1 62.38 CAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGAGTTGGTTGGCCCTGTCTGTGTATGTGCCCTGCAATTTGTTGTAACCATTTTCGTTGCCTACTTTTCCGGGCAC:1 + chrX 16532041 3' - accord 185 2 82.18 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACTGAT:1 + chr3L 12888306 3' - mdg1 16 2 63.37 AAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTT:1 + chr2L 2074787 3' + roo 389 2 62.38 TTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTTACAAACACCAGACCCACATCCCTCTTGAGTAAACCACC:1 + chr3R 25563739 3' - Cr1a 101 1 68.32 TGGATGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGGGTGTTATGAGTGTGAGTGAGTCCCGCAGACAGACAAAGAGGCGGAGACCCAAGAGGGGCGG:1 - chr2R 18482075 3' - accord 186 2 51.11 CGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGCATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTTGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTC:1 - chr3L 25232771 3' + accord2 175 2 52.63 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAA:1 + chrX 18836995 3' + P-element 2829 1 24.75 CTTTANTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAA:1 - chrX 21668938 3' + mdg1 7437 2 56.44 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACCGATATTAGTATGCAGT:1 + chr3R 24760647 3' + pogo 2097 1 75.25 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGGCTATGCAGTGCTGTTAAAAAAAAATAAGCTAAAATGTGCACTTTAACAGCTAGTAATTTTTAAAAAAT:1 - chr2L 11922484 3' - BS 5081 1 64.36 ACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATTTGTGGATGTTGGATAATAGAAAGAAGAAAAGTGTGGCAAAATGCGAGCAAATAGTTTT:1 - chrX 20886310 3' + Ivk 5369 1 61.39 AACAAAAAAGGGGCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGTGCGACCATTCGGTCGATGAATAAACAATA:1 + chrX 16408810 3' - hobo 372 1 70.30 CAAAACTCAAACTTGAGACAAATACCGATGACAGAGTTGGACATATCAAAGAAGAGCAAACTCAGTGCAAATATAATAATTATATTATTTATTATATTATA:1 - chr3L 24473073 3' + Porto1 4477 1 65.35 TTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAGCCCCCCACTAAATAGCTTTTGATTACTCACTAACAAAGAGCTTTAACTTCGGC:1 - chrX 18240434 3' - jockey 379 1 58.42 TTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGACTTTCAAAACGATTTATTTGGCTTTTTGCAAATCATTTTCCAAATTGAAATTGGGTTAATTGA:1 - chr3L 2391996 3' - diver2 348 2 68.32 CATTTGTTCGAATCGAAAAGTAAAATACGAAAGTAAATAATATTGCAAGCA:1 + chrX 5206918 3' + rover 7285 2 88.24 AAACACGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGCAGGCAGACACTCACACGCACACACACGCACACACACACGATGGCTGGCGTACGTGGCGTATGAGTGACATT:1 + chr3L 4633796 3' + hopper 1412 2 76.24 ACTAACTGAGTAACGGGTATCTGATAGTTGAGGTATTCGACAATGCTCATAACTTACCTTTGCCATTCTTCGTGCAGACAGCCGCAGCAATTAATACCTGC:1 + chrX 1861468 3' + INE-1 542 1 56.44 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGT:1 - chr3R 21092461 3' + roo 9026 1 71.29 CTCTATGGACGGCAAAGCAGATATAGTCGGATATGGTGTGTTTGATGAACATAAATTAGGAACGATGATACCAGCAATTGTTCGATGAAGTTGACTTAGAT:1 + chr2L 16950688 3' - Ivk 381 1 64.36 ATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGCTGCTGCTTGCTGTCTTTTCATCTGATTTCAATTAAGACTAATCCCGCTTTATCAACTAACTTTTAACTAGGTTAG:1 - chr2R 19004388 3' - Bica 4601 1 54.46 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTCTCCGCATCATGTGGAAATTTACTTTCAATTTGCCCATTTTTCT:1 - chr3L 1286227 3' + P-element 2787 1 51.00 ATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATATACTTT:1 + chr4 156605 3' - INE-1 131 1 79.76 ATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAGAGCAGCTGAATATAAGCCACTTGAAGTAATTCATTTATGTAGATATTTGGTTCTTTATGCCACCCTTCTTCGTG:1 + chr2R 4784210 3' - McClintock 6169 2 79.21 TTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTATTTTGGCTCAATATACTTTGTTTATGTA:1 + chr2L 15808020 3' - I-element 51 1 70.30 TATTANGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAAATGTGTAGTCCAAACGCAAATCACCTAAAATGAAAAGCCTAT:1 - chr2L 6454693 3' - mdg1 7039 2 72.28 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTTTGACCCTCCCAATTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGTTGC:1 + chr3R 22911490 3' - hobo 14 1 58.62 AATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTGCAAGGAATCGATAAATAACG:1 + chrX 15333787 3' + P-element 142 1 29.70 GGGGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCACAATATCGGTAAGTGATCGTTTTGGGGAATTTAGGCATTAAGCGGTTAAG:1 - chrX 8804922 3' + gypsy3 6566 1 55.45 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTT:1 + chr2R 4483256 3' - Ivk 45 1 65.35 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAGAAATGGAAAATGTTTTAATCAGCAGACTTAAATGTTTACCACACG:1 - chr2R 14708970 3' - Doc 38 1 58.42 CGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGGGTGCCCTTGACATGCGAACGTCTTGGAGTGTTTTGAGTAATTTTTCTGCTTGTACAATTTGTGTGTGAAATTGTT:1 + chr3L 22189123 3' - I-element 141 1 79.21 TTGCAATTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCGTGAGAAGTGGTTTGCAACAACCAATAACACAATGACCA:1 - chr2R 14247820 3' + 297 6848 2 59.41 TAAATCCCACTTACAGCTAATTCAGCGAACGCAATCGAAAATGCTCAGAATAATCACTAGCCAGCATTATCAACTGATTTTTTCTCAGTTCAGCTGAGAAC:1 + chr2L 1194630 3' + Porto1 4304 1 56.44 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAATAA:1 - chr2R 17626471 3' - mdg1 13 2 64.36 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAAAACTATTTTGGAGTTCTACGTACTGACCGGCAAATTCAACATGAACTAAAC:1 - chr3R 16245033 3' + 1360 3364 1 56.44 CATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGAACTTGTGGTCGATGAGCTGCTCGTCGGCCAGTTTGCCGAAGGTGAGATTGTGGCGCTTC:1 - chr3R 29041337 3' - F-element 4253 1 53.47 CATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTATTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGT:1 + chr3R 19450153 3' + roo 8824 2 50.50 AGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTGTCATTGGAAGGGATTTTAAATAATTCAATGGTGCTTA:1 - chrX 756660 3' - GATE 302 1 61.00 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGTGTCAACACAGTGCTGTGTGTAGG:1 + chr3L 10013625 3' - hopper 50 1 73.00 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTACTTCTGTTGGTAATTTTTAAAATTCTTGGTAAGACTTTTCGGAAGGATTTTCTATTGTATCTTT:1 - chr2L 3339939 3' - FB 13 1 66.00 CATTGNGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCATTATAAGCTGGGTCTCATTAGCAAGCAATTGTCAAGCGAATTTCTCTGATGC:1 - chrX 19162584 3' + pogo 2081 1 56.44 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACTACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGG:1 + chrX 18837004 3' + P-element 2839 1 34.00 AATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGATGTGAGTGGACTCG:1 + chr2L 12949308 3' - 412 3 2 75.25 ATATACATATGTACATACAAAAATGTAATGTAATGTTTTAATGAAATGTTATTACAGCATTGTTCTATGTGAATTATGATATGTAACAAATCAAAATTAAT:1 - chr2R 25205831 3' - invader3 5084 1 64.36 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAGTGGTGTTGCTGCGTTAGTGTGAGTGCTGTGTCTGTGAGTGGTGCGACAAATGAATGCACATGAAAG:1 - chr3L 4633672 3' + hopper 1409 2 75.25 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCT:2 + chr2L 8565539 3' - blood 7030 2 66.34 GAGGAGTTAACATGCCTCCTCTCTCCGACCACAGGGAAACAACACCGCAGGTAGCTATGAATGCTGCTCCAGAAGGTGCCAAAAAGAATGGACACCAGTGT:1 + chr3L 6690739 3' - accord2 207 1 52.48 TGTGTATGTGTGTGTGCTGGTTATGGCACAGGGATGGGATCTCAAATTAACACTTGAAGCCTTCAAACATTCGGTTTTTGTTTGGATAAATGGGTATTTGC:1 + chrX 14348881 3' - accord 7099 2 51.49 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAATCTGCGTTAACTTATATATATATATTTTTTTTTTTCTTTGATGACACATGCATGCAGTTTCAACAGCAATCAGTCAAT:1 + chr2L 21010948 3' + opus 7487 2 65.35 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATGTATATATACTCGTATTGAAATATATATCAACTCTTCTGCTTACGTCAAGCCTCACTTG:1 - chr2R 7775714 3' - Transpac 15 2 64.36 GGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCAAAAAGCGATGACAATGGCTTGGAGAAAATAATAATAAAGGAACAAGTAGAGCACACACACTTTTCAA:1 + chr2R 13295754 3' + Tirant 8499 2 72.28 ATTACAGAGCATTTATAGTTGTAAACTTAAAATCTATTAAAAGCTTAAAATAAAAGTTTTCTCGGCGATACATCAAACTTTATGCCTCTTTATTTCACATG:1 - chr2L 17895951 3' + G4 369 1 54.46 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAGAACTTGCGCCGGC:1 - chr2R 10444215 3' + P-element 2878 2 70.30 GCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCAGTGGCGTCGCACGGGAAGCATCGTACAGTTTACAGGATCGCATCG:1 + chr3L 17641950 3' + Doc 466 1 58.42 ACACACACACACACACACATATACATATAGACACAGTGGTGGCTGCCTCCAGGCATCATTACATCAAATGTCCATCAACTGTCAGTTAGTGGACGCGAAAT:1 + chr2L 14124508 3' + accord 183 4 72.28 TTTATGTGTTTGAAATGGGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATGAGCACAAAAATTTAATCTTTTGATAGCCAAGACTTCTGACATCGAC:2 - chr3R 11841090 3' + hobo 2562 1 67.33 AGCGCGAACATCACTTGCAGTACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACCTACATGGACACAAACAACAACATTGCCATAATGATTCCGATCTTGGACA:1 - chr3R 19448177 3' - Stalker 491 1 66.34 TTGCAAAGCCAAAACGACACGAATTTGGCGGTAGGCAATAAAGGAGACGGGTTATACTGAATGCTTATGTGCGTAAGCAAAGAAACCGAACACGGAACGAT:1 - chr2L 22218181 3' - G3 6 1 56.44 AAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGATCTTCTCATTTGGAATTTTACAGTTCCATTAGCGCAGAAAGAGCCGGCGAATTCGTAGATG:1 - chr2L 19882004 3' + roo 368 1 77.23 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATATTTGTAATTATATAGTTAAATTAGTAATCACTTTGTCAAACACTTAGTTACACC:1 + chr3R 24760631 3' - pogo 20 1 59.41 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAAT:1 - chr2R 7861681 3' + roo 9022 2 78.22 AGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTTTCTCGGTTTTTTTTTGTGGCTGCCAGGACATTGCTTAATTAAGTTCAGCA:2 - chr2R 16066859 3' - accord2 71 2 55.45 ATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTATGGAGTTGACTCCTTTTAAACTCTCC:1 + chrX 21017887 3' - 412 2 2 48.00 AAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGTAAGCCAGACGTTCGCAT:1 + chr3L 18706970 3' + jockey 4990 1 78.22 GTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATTTATATGTATATAAAGTATCGTGTGTCGTAGGACAGAAGCAGT:1 - chr2R 17937138 3' - Quasimodo 25 2 67.33 TTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGTGCGGGATTTTCTGTTTACTGTCGACGTCTCATCAGCGTTTTGTTGCGGTAATTAAACTCTGAT:1 + chr3L 12968571 3' - I-element 182 1 68.32 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTGAGTCATAATGAAACCAATAAACACGAACCCTAATGAAAAAGTCTTGCTAATTACT:1 + chr3L 19462206 3' - roo 8664 1 79.21 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATATACATATATATGAAAGCCCAGTTTATAAAACTGATGTTTCTAATATGCTTGC:1 - chrX 2776056 3' - 297 13 2 61.39 TTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCACGCTTCATTTTATAATTCAATCAGTGCTCAAACACACACTGTGCCGTCCAGACAGAGACTTGGTAAT:1 + chr2R 15031618 3' + hobo 2645 1 64.89 TGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGCAAAGTTAAAAGTTAATAAAAATTAAACAAATTTAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAAT:1 + chr2L 14025656 3' + TAHRE 10420 2 84.16 AATGGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATCTCTTTTCGTTACAGGATAACAATTAAAATAAATTATGTTAGGTAATTAGCTGGCTAGCAATTTTTGGCAT:1 + chr3R 17228834 3' - Gypsy12A_LTR 2171 1 66.34 GTTTGTCGAAAAGAACGAAACGCGGCGAGGAAAGCCTTCAATGTCGAGGAAGTCAGGAGTGTTCGCTCATTCGCTGTCCACTTGCAAAAAAGGAAATCCAG:1 + chr3L 23352551 3' + Tc1 490 1 65.35 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAATTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACAACGAACGGGTGGTTCACTTGGAAGCCTTCCATTTAT:1 + chr3L 11113961 3' + 412 7505 2 65.35 ATTTTGACCTTTAAAGTCAAAAATTCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTT:1 + chrX 15894656 3' + S-element 1671 1 71.29 GGCAATTTCATCTTGGATGTTGGCTTTCAAATCTTCTAGGGTTCTTGGACTGGTCTTAACACATCGGTACTTTCTTTAACGGGTGTTCCCCATGCCATTTC:1 + chrX 16530353 3' - mariner2 667 1 56.44 GTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTT:1 - chr3L 6044756 3' - Tabor 49 2 70.30 CTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAAC:1 - chr3R 17660025 3' + micropia 5410 2 55.45 ACGATTCAAACGTAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGCTCTGTTTATTTTTGTGTTATTTTGCACATTAAAAGTAGAATCAGTAATTT:1 + chr3R 17320208 3' + Stalker2 7599 2 53.47 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACATTTTATTGAGCTGCATGTCAAATGTAGGGCCAATTAATTTCGTAAAATTAGTCAATATGCCATTC:1 - chr2L 3890125 3' - jockey 18 1 70.30 GCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTCCCCATCCACATCAGCGCAATCTTTTCGTGGCTGGA:1 - chrX 19363468 3' - FB 42 1 66.34 AAATTTGGGCCAAGTTCAAATGCGACAGACCGCACAGCGCGAACGCCTTGACGTATGCAACAATAATAATAACGGGTTGTGGTCGCCTTTTGTTATGCTTG:1 - chr3L 13661570 3' + pogo 428 1 77.23 GCTGTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGCCTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGA:1 + chr3R 29331919 3' - G6 30 1 50.50 CAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGCTGCCGATCGGAGCTAATGAGGGCCTGAAGGATACACCGCCATATAACGCAGATAGGTATAAGATCTGATTAGAA:1 - chr3R 16119068 3' - Juan 45 1 76.24 GCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACATACACATACAGGGAGAAAAGTGGCGGAGATACGGCCAAAACGAGAGGCCAGGACAGGCCAA:1 + chr3R 26751626 3' + accord 160 2 72.63 CTCAGACTCAATACGACACTCAGAATAATCTTTGACTGCATGTAATAAATCATCGTTTTAGTTGTTGTACCACAACTTTCTGGACAGTCAGGCTAAGAAAG:1 - chr3R 4540332 3' + P-element 2796 1 77.23 TCATANTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCA:1 + chrY 3648874 3' + 17.6 7376 2 77.23 CAGAGAGAATGCCACCCGAAAGCGAACAAGCCCCTGTTTTGTACCTCCATTTTTTGCCACTCATTCCCATCCCCTCATGGTTTTTCCGTATATATATATAT:1 - chrX 12180043 3' - invader2 79 2 74.26 GTGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACTATCCACACATCAACATAACAACAATGCCAACCATGACCCACGCAAATTGTTAACAACAAAAGGC:1 - chr3L 12034107 3' + G2 2836 1 68.00 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACT:2 + chrX 11730335 3' - jockey 4785 1 54.46 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTAGTGGACCCCAAACACACTCACAC:1 - chr3R 13225518 3' - hobo 51 1 76.00 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTA:1 + chrX 3763224 3' - 297 41 2 74.26 ACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGCCAAGACCCGGAAAACTGCGGA:1 + chrX 20075378 3' + Doc 4410 1 77.78 AAAAAAGAGAAAAACAAAAACATAAAAAATACATTTGTGTCGGGGGAATCAATAAATAGTACCAAAAAGTCGAAACAATATTTTAGCGCTTACATTTAAAA:1 + chr2L 20032488 3' + gypsy7 5008 2 56.44 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGG:1 + chr2L 12949273 3' - 412 37 2 61.00 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCAATAGCGTTGCAATGCAAGTGAAACTTTCACTGCAGG:1 - chr3L 18500955 3' - hobo 38 1 63.37 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGCCGTACGCTA:1 + chr3R 27981727 3' + roo 9036 1 62.38 TTGGAGACAATTTGGTTACCTTATGCGTAAATATATTTAGATGTTTTTTTTTGTTTTTGGCCTCTGACGGAAATGTTCAAGTAACACGACTCTAAATTTAT:1 - chr3R 25594556 3' - Transib5 59 1 71.29 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTTGCT:1 + chr2L 7255829 3' + P-element 2874 1 66.34 GGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAAACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTGGAAAGGTGCTGGGCCAAGTTCTCC:1 + chr3R 25332198 3' + Doc 410 1 75.25 AGCCTCGGTATCGATCTTTTCTGGTATGGACTTTAGACTTTTGGGCTCTACCTATATTTAGTTTCTGTGCGAGCTCGCTTGTTAACTTTGGATTTGGTTCA:1 + chr3L 24238811 3' - Idefix 7239 2 62.38 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTGCAATCGGTTAATCCAAGAATTTTATATGCAAGTAAGAGCAAT:1 + chr3L 16973478 3' + S-element 1714 2 74.26 TAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAACATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGTGTAAAACAA:1 + chr3R 4544095 3' + flea 256 1 78.12 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCT:1 - chr3R 20477042 3' - 412 34 2 57.43 ATTTTTATTTTTTTTTTCATTTTTACTATAGTTTTATCCATTTCATTTTCCGAGTGTTAATTTACATCTTTTGTAATTACCAGCCTTTGTTATCCGATT:1 - chr3R 6533912 3' + INE-1 470 2 63.64 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATATGTATGCACATACATACAAACATATATATATATATATTCATAAAGTTACCACACATAGTGCAGAAA:1 + chrX 18144439 3' - hobo 11 1 66.34 GCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAAATGGTAAGACTGTTTGTTTTTACCATGCTTTTTTATCCGTCCTGTGACGGAAGCGGGATTATCTTTC:1 + chr2R 21073965 3' - jockey 4676 1 68.32 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTTAGGACCACAGCCTCAG:2 - chrX 8972354 3' - 1360 7 2 72.28 CAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAGTATCAGATACCCGTTATTTAACAAGAATTATAGTAATATACAAGAAATGAAAAACATTTGTTAAAATTG:1 - chr3L 23771427 3' - INE-1 578 1 52.48 ATAAAAAAAATAAAAAAATTTTCAAGACTGTCAAATTCAAATGCAATCCAGGTAAACTTAAAAATGGAATCTGTGATTTTTCGCGATCCAGCAAAAGTTTT:1 - chr2L 7535245 3' + HB 323 1 30.69 TATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGGTTGCTTATATCTAATGACTACTTTACTCCAGTACAGCTATAAAAAATAGCACACAAAACGGGCTTTACCTT:1 + chr3R 1011457 3' - F-element 309 1 75.25 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTTTACAG:2 - chr3R 20878441 3' - 297 6594 2 60.40 TGATCNTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAATAGTAAAATACGTAAGTATATATATATGTATGAAATCCCGGCGTAATGAGCGACAGTTGATG:1 - chr2R 20952532 3' + rover 312 2 64.36 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAA:1 - chr2R 24021577 3' - pogo 40 1 69.31 CTTACATTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGAATAATGGAGTCGCCGCGACTTTCAGTTAAAAAGAAAGTCAAATGTAAATAAAATGGCTGT:1 - chrX 17953694 3' - Stalker4 249 4 68.32 GCGTGCTGTTCGGAATCGCTTTAATTAAGCCCCGTTGGCCTTCGCCCCAGACTGCTACAGTACATCGAGTCTTATGCCTTATGTGAACTGCACTGTGCACT:1 - chr2R 2947622 3' + mariner2 211 1 54.46 TGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTGCATGTACATACATGTATGTACATACATATATGTTGCTACATGTTTGCCTAATATGGT:1 + chrX 15089147 3' + gypsy 441 2 63.37 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTGGAAATGGAGCAAGGTGGCCCGCAGGACTCCTGCCCTCCTGTCCTGGCAACTAAG:1 - chr3R 27775075 3' - roo 22 2 57.43 AAAACAGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTC:1 + chr2L 16201554 3' + hobo 2887 1 67.33 AGCGCACTCGTGCTTTCCGTCGTTGCCAAGCACAGTTCCTTCCATTTAATGTTTAATGGCCAGAGTGTTTACATTAACTTTCTGTGTTGGATACCTGTAGT:1 - chrX 16460610 3' + Doc4-element 123 1 64.36 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGC:1 + chr2R 12492422 3' + hobo 2895 1 66.34 AAAAGAAAAGGAAAAAGAAATAAAACTGAATATAAATAAAGAAAGTAGAAAGGGCCACCACCACCCACATGAGGTGACCTTTGCCACCCAAAACTATAAAT:1 - chr3R 14367320 3' + Doc2-element 234 1 74.26 ACGGTCTTTCCGCTTTACCGGGGTCGAAGGTCCATTAATTACGATTCGGCCTTGACTCTTCTTCAAGTCAAATGACTTAAAAAATATACTATATAATTAAA:1 - chr3L 78642 3' - gypsy8 4715 2 62.38 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTTAGGAGATTCCAAGAAACAAGCGATAGCTCGTTACATGAATCTGGAG:1 + chr3R 19445073 3' + roo 8972 2 62.79 CGGCTNTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 175 2 51.00 CCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCG:1 - chr3L 25889015 3' - gypsy8 310 1 77.23 GCAGCGCGTCATGGCCGAGAACCACGACATGCCCGATGAGAAGGGCTACCACTGAGACACTACGATGTATGTTATTTTTTAGCTTACAAAAGTTTTTGTAC:1 - chr3R 946534 3' + Osvaldo 483 1 64.36 CTCCACCAGCAAAGTTAAAATCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAATAAAAACGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAGAAAAATTAAATCAAT:1 - chr3R 5632029 3' + HeT-A 6062 2 76.24 AGTTTTATTTAAAAAAAAAATACATAATTGAATTGGG:1 + chr3L 20604806 3' + transib2 2631 1 89.19 AAATTCATCTGCACGTACACCAACAACAACTTCCGCTATACCAATAAACACACACTCAACTCTCCCGTTGTAATTTATATAAATATAAAGCCAGATGCAAA:1 + chr3R 16302088 3' + Porto1 420 1 66.34 AAAAAAAAACAAAAAAAGAAATTTTTCTTAGAAAATTAAAAATTAAACAAAA:1 + chr3R 4692626 3' - hopper 143 9 59.62 GTTTATTTTTTTTTTTAATAATACAGTGGGTATTCCTATGTCGGAACTAAGTAATCGTGTCATTCTATCGAAGGTTTCCATATCGCCACATTAACCAGCG:1 + chr3R 6585592 3' + hopper 155 1 78.00 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTGGACATGCAAATGTGGACATGCGTCCACTCCCTCGAGTCCCC:2 + chr2R 15474861 3' + roo 9039 1 56.44 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATTGCAATCAGTAAGACAAAGCCTAATTAGTTTGTGAT:1 - chr3R 10148894 3' + roo 327 2 61.73 TTATATATTAAATTAAGCATAGTTTTAAGATGATAAAGGAACAGAAACAAAGGTGGAAGCGATAGCCAACTATCCACAACCAAAACAGGTAAAGAATTAAG:1 + chr3L 23959348 3' + Transib5 429 1 66.34 AGCAGATAAGAAAGTGAAATACATACATAAGTGAACCGGGAAAGAAAGAGATAGAACAAACTGAGAAACAATCTGATGATAAGACTGTAGTTTCTTGCGAC:1 + chr3L 6216598 3' + Doc3-element 4485 1 56.44 CGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTTACAGTTAGCAAAAGGCAATTCAAATCCTTTTACTTCCGCTTTAGGCAGCAACGACTACGGCAAAAGACAGAT:1 + chr3L 4801597 3' + roo 399 1 72.28 ATTAGCTGAGTAACGGGTACCTGATGGGGGATAGGTAGGGGAACTCGACTATAGCATCCTTTCTTGTTTTTACATTACAAAAGATTTACAAAGATCTGTGA:1 - chr2L 21335366 3' + INE-1 542 1 71.29 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGG:1 - chr3L 6044744 3' - Tabor 6876 2 58.42 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTT:1 - chr3L 10477548 3' + copia 5088 2 60.40 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGTTGTAAAATCTG:1 - chr2L 6888574 3' - jockey 9 1 75.26 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGT:1 + chr2R 6173079 3' + pogo 2076 1 61.39 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTAGCGAATCTATTGAGTATATACTCGTAGTGTA:1 + chrX 1281726 3' - roo 45 2 73.27 ATAAATAAATATAAATAAACATATTAAGTTAGCTATGTTCATGATTTAATGTGTTTACCCATTTTTAAGTCGCATAGAAAAATTCATTAAATGCTAA:1 - chrX 6898446 3' + Tc1-2 482 1 37.11 AACTACATGTTGAGACCACTTGCTAAATGTACAAATGGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAAAAGATACATATATCTAGAAAAAAACATATACTAAATTAT:1 - chr3R 2839497 3' + hopper 1054 1 62.38 GTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGGGGTTTTCCAGC:1 - chr2L 23189406 3' - 1360 31 1 74.39 CACCANAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGT:1 - chr4 311228 3' + 1360 3338 1 77.23 ACTCTGTACCACACCACAGCTACAGAGGCGACAACGAGGTCAAAGATCAACAAGAATAAACTCCCTCCAAGACTCCAACATCATACGAGTTCATCTAAGAA:1 + chr2R 4580122 3' + Chouto 431 1 69.31 ATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTAAAACAATTACATGGCGACCGTGACAGGACAGCCCAGGGCGAACAAAGCCATTAAAAAGCCAACACAACAA:1 + chrX 17614211 3' + Stalker4 389 1 56.44 ACGTCCAGACCTCAGGAACTATAAAAGTTAGAAAGTTATCAGCTAAAAGGAGGGAGGGGTGATTTCAATAAAACCTTAATCTTATTCATCAACGGTGGAT:1 + chr3R 4844086 3' + INE-1 143 1 63.00 ATTGTTTTTTTTTTTCTTCAAAAAGAATT:1 + chr2L 8967278 3' - transib2 2638 1 89.66 TTTTAAAATTGCTTCTTAAATTATACTTTCTATTTCGTAAAGAGTTTCTTAAATTATACTTTCTATTTTGTACAGAGCGATTGATTGATTTGTTGGAATTT:1 + chr2L 14405429 3' - mdg3 5065 1 74.26 TTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCCCTCTCTTCACTAGCTTTTGAAAAAAGTTCTGAAACAGCTGACA:1 + chr2L 9069337 3' - Quasimodo 474 2 62.38 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGCCTGAAGAA:1 - chr3R 17843649 3' + roo 9030 1 65.35 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACCTTCAAAGGTTGTTTCTAATAACCGGCAAGTTGCTCTACACTTCGATTTTGGAGGGAATTGTGGCAT:1 + chr3R 3771672 3' + roo 401 1 71.29 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTT:1 + chr2L 13574277 3' + pogo 2070 1 56.44 CTCACGGCCACACCTCCCACCCAACCGACCGAGGGGCGATGCCCTGCAATTACAGTAGGTTAATAGCTGCATTCGCTTATTACTAATTACTAAAGGTAAC:1 - chr3L 16849320 3' - Cr1a 4432 1 64.00 TTAATCAGACTCAGCCGCATTAACAGGGCTGTAGCAACAAAACAAGTGCTTGTGACCACTGTTGTTTGTAACAGATATATGTTAACGAGCCCATCACACCC:1 + chr3R 13753148 3' + gypsy2 489 1 74.26 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCAGACAAAGCCCTGCAGCTGATACAAACTGCCCAT:1 - chr3L 12888232 3' + mdg1 7416 2 69.31 AAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATT:1 - chrX 20885956 3' - Ivk 5362 1 63.37 TGTTCCCGTGGTTGGTTCTTTTACTTCACTCAACCATCCTTTCAATTGCGCCAGTCAATGCGATGATCGGCTAAACATATCCATATATGTATTCATTTATT:1 + chr2L 19438262 3' - invader2 362 1 58.42 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAA:1 - chr3L 2019667 3' - 412 42 2 68.00 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATAAATTTGGCATCACTGCGGCTCCACTTGAAATTTACATTTTGCCTTGCCTACTT:1 - chr2L 12325019 3' + jockey 4972 1 56.44 TGCAGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCAAT:1 + chr2L 21592744 3' - BS3 333 1 66.34 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGGCTTGGGAAAATATGTAATTGAGTCATAATGAAACCAATAAACACGAACCCTAATGAAAAAGTCTTGCTA:1 + chr3L 19462200 3' - roo 8670 2 73.27 GCCTCGGCTCCCTTCCCTGTGTGATGAATGCCGAGGAGGGCGAGCTGTCGCAAAGCAGCGACTCCAGTTCCGACTCCAGCAACGAGGATAGCAGCAGCAAC:1 + chr2R 15222355 3' - Osvaldo 1102 2 71.29 AAATACCCAAGCAAATCAATATGCTGATTTTCTCAAAAGTATAGCATTTGAGTTACAACACAGTTTCCAATTAGTCCAGCTTCTGCTTCATTTTTGGACTA:1 + chr2L 11784641 3' - invader5 64 2 49.50 TGGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGCTCTGGCAAAAACAATTTTGACACTAAAATTGGAATCGTATTTGTGCATTATAAGCATT:1 - chr2R 22779564 3' + flea 276 1 56.44 ACATAAGCATAAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGGAAACAACCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTATCTCACGAGTGTTTGTGTGCGTGCGTGC:1 - chr2R 18116226 3' + Tom1 193 1 71.29 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAAATATTTTTTTC:1 - chrX 10827390 3' + roo 400 1 68.32 GCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGCTTGCGTTGAAGTCTTTCGTTTGGCAAGAACCGAGGATTGCTGATGT:1 + chr2R 13914150 3' - 1360 164 1 54.46 CAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTC:1 + chr3R 12047459 3' - Stalker2 7303 2 77.23 ACACACATACATTACCACATAGCAACAGCCCCAGTCAAAAATGCAATACCTCTAGACCTCTGATAAATGTGGTTGTGTGCGCTCTTTTAACCGTATCAAGC:1 + chr3R 4220590 3' + Quasimodo 47 2 76.24 ACTTGGAATAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCAAGTCTCAACTTCACCACAAAAATTACCGCCAAATATTTCATATGAAGGTAAGGAAGGAGTCTATCTGCG:1 - chr3R 1953019 3' - Cr1a 4096 1 52.48 CCTTAAAGCTGTGTATGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGTCGAACTGCAGGACAAGCAGCGCCGGATTATGTTTATGTGTTTGGTAACAACTTGGCACGATTT:1 + chrX 15410429 3' - Quasimodo 351 2 65.35 ATAAAAATAAATAAACATTTTTTTTCTTCTTCCAGTGGAAATGAAAATCGTATTGAAAGAGCGATCTTGTGGTTCTTCTCAGTGCAATAGTGCCATTACAC:1 + chr3L 16710562 3' + mariner2 831 1 89.11 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGA:1 + chr3R 25671980 3' - I-element 28 1 53.68 TAGATNATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACACATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGTTCTAAGAAAGCTCACACACACTA:1 - chr2L 14155168 3' - micropia 188 2 75.25 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACTGGAGCATTACTCATTCTCATTTCCAACTGAGCGATCGGCTGAGAGAGCAGAACT:1 + chr2L 3632219 3' + P-element 2865 1 56.44 CAACAAAACGGCACGAAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATATAGCAAACCCCTTCGGCTATGAATTATGCTCGCTCGCACAAGATTGATA:1 - chr2L 20973538 3' + Bica 391 2 59.41 TTTTGTATCTGTGTGTGTGTGTTGGTGGCAAACCGGTTTGTAGAGCCTCTATTTTGTGGTACGTTTTCGAGTGTTGCCTTCCCTTGGCCACTGCATCCTG:1 + chr3R 20784702 3' - Quasimodo 39 2 54.00 TAATAATTAATTTATCAGTTAATTAATCTCTACGATCGATCTACGATACCTTGGCTTTCCTTCGCCCGAGATCAAGGTGGAGAAGAACGGAGGTCAGCTAT:1 - chr3L 2130943 3' + Transib5 315 1 59.41 AACTAGGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATGCCCGCCGCTTGTATCTGCGATTTGCAGCTTGGGAAG:1 + chr3R 6273576 3' - blood 39 2 61.39 GGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTGTAGGAAGCATAGAACTTAATTACAATGAGCATAGATGTATAAGCACTAAAATAATTTAACATA:1 + chr3R 17449396 3' - jockey 4855 1 63.37 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTT:1 + chrX 2649911 3' - Tirant 8117 2 71.00 ACAAAAGGCTCCACCCTCGATCTCGGACTTAACTCGCGTGCATAAATTGAAATTTATATTAATTTAAATGGCCAATTAAGCGGCAAAAATG:1 + chr3R 6117314 3' + Tirant 386 2 62.64 GTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAACTCGAGA:1 + chr3R 11094593 3' - 3S18 12 2 67.33 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCT:1 + chr2R 9871034 3' - roo 8713 2 74.26 ACAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCAC:1 - chr3L 13060341 3' + 412 7522 2 73.97 TTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACA:1 - chr3R 10203612 3' - jockey 7 1 67.09 TTATTCATATATATACATACATATATATAATATATACAAATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chrX 21292604 3' - 1731 4415 1 72.28 TTGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCACTTTTATCTGAAAAATCTCTCCCAAAATCTC:1 + chr2R 5426499 3' + 1360 3349 1 77.23 AAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCACTTCACCTAATACAATTTTAAACATGTTGTTTTCCCGCCCCATTTACCTGTGCCCAGTTCATCAGTTCGTT:1 + chr2L 20012442 3' - G2 2937 1 72.28 ATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACTTATATATAATTATGTAATTGGTCTTAGGAGAATTCAAGTTTTAGCTGCAAAGACCACACTCTGATGC:1 - chr3L 22010523 3' + rover 7117 2 78.22 TTATTNTTATTATTTATTATTATACTATATTGCTATAGTTGAGTATTCTATATATTTTCAAATGCAACTTCTCCTGCTTTCTATTTTGCTAAAATGTAATA:1 - chr2R 24487526 3' - flea 243 2 65.35 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAG:1 - chr2L 22084493 3' + copia 5076 2 70.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAAT:1 - chr2R 7861647 3' + roo 393 1 64.36 TGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGTCCCTAATTTATGTAAAACCCCGATGAGCGGAAGTGTAACTTGATATGATACCACA:1 - chr2R 21242088 3' - 1360 3366 1 72.84 TGAATGTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAG:1 + chr2R 11528058 3' - P-element 46 1 34.34 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATGAATACATTTTAGTCAACTGTGAAATGTTCGCTGCCGGCTGCATTTCTTCCAGAATATTTTGA:1 - chr3R 6467821 3' + roo 397 1 59.41 CACACATACATTACCACATAGCAACAGCCACATTGTTTTACTCGCTTTAAATGGCTTTTAGATGAGTTTGCGCCCGCGACGTTAACGCGGCGTATGCGCA:1 - chr3R 14401339 3' + Quasimodo 48 2 71.00 GAATAAATTCGGTTTTGGTTTTTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTTACTTTACTTCAGAGTTTGCTGTTCGACATCTAAAGCTTTTAAAATGTATTCA:1 + chr3R 13325932 3' - McClintock 6286 2 62.38 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATATTACTGCCAA:1 - chrX 10672302 3' - mdg1 41 2 69.31 TTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCT:2 - chr3R 7522299 3' - blood 30 2 52.48 TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGGAACGTTTCCTTATGTCTGCTAAATACATTTCAATGATACTAGATTCAATGATACTAGATACTCTTTTACT:1 - chr3L 26417938 3' + Quasimodo 6984 2 72.28 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGA:1 + chr2L 14612078 3' + roo 9022 2 74.23 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATG:1 - chr3R 6117250 3' - Tirant 49 2 75.25 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCAC:1 - chr3R 10952260 3' + roo 386 2 54.46 GAGAGAGCGGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGAAGTAACCCTTAAATAAAAGTCC:1 - chr3R 7301595 3' + 1360 113 1 77.23 TCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAAAAAAATAAAAACCCTCGTTTATCAAAACCCAGAAGGAAGGAT:1 + chrX 22444504 3' + Juan 4170 1 64.00 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTT:1 + chr3R 28645852 3' - F-element 36 1 49.50 TAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATTCCGTAAACTTTTCGCCCGCCCACTCGCCTCAAATG:1 - chr2R 16940328 3' + 297 6943 2 65.35 TTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGG:1 + chr2R 19209447 3' - jockey 4795 1 61.00 ATAATTATTATTGTTATTATTACTAAGGTATATTTTATTTATAATGGAAATTAAAGGAAGTAGGATTCCATAAACATGCGAACCATTTATGTCAATATACA:1 - chr2L 7588179 3' - mdg1 27 2 80.20 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCCGACATACACATTGCAACAGAGTGCTACAATGTGCTTGCGTATTA:1 + chrX 21852441 3' - Tirant 8139 2 55.45 GGCGGNGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGATCAGACCAATGGGCCCGACCCTACATATGTATTTACCACCCGACACGTAATTAACCAGATGTTAAAGCATTT:1 - chr2R 7321505 3' + blood 7238 2 79.21 TTTAGAAAATATTGAACATTGCATTAACTGCATTATTTAAATGAATTGATTGATTTTCCCAAAAAGGCTGCACTTTTTTTTATTGTGTTACATGCTTGAGG:1 - chr3R 21996080 3' - HB 255 1 89.11 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATA:1 + chr2R 6173085 3' + pogo 2082 1 60.40 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCACCAAACTGTGCAGTGAACTCTGGAGCGAAG:1 - chr3R 6273488 3' + blood 7384 2 73.00 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATGATGGAATTAAGTTTAAGATACACTCATGGGTTTTAACTAAGTAGCTGAAATAAAAATGCCTTTTAAA:1 + chrX 15305732 3' - roo 8671 2 72.28 TGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAGGTGTAAAAGGTAAGAGGGAGCGTATCTGATTCTATAAAGTACATATGTACAAATAACGCAAACTTTTAATTT:1 + chr3L 26640462 3' + Quasimodo 6984 2 72.28 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACAGCATTATCATATTCCAAAAACGAA:1 - chr2L 7850082 3' - 412 51 2 76.24 GCACAAACACACACACACACACACACTTCGCACACACGGGGCCGAACCGAGATGAAGCTATGCAGTGTGGCAGCCACACCTGTGCCATTTTCCATTTCCAT:1 - chrX 9429513 3' + accord 7025 2 70.30 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCCTTCGCTTATTTTTGTCTCCGCTATTGGGGATTTTGTTTCTTAATTAAA:2 - chrX 15305631 3' + roo 9047 1 54.46 CATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATGAATGGTGTGATGCACAAAATCCATTGCGCGACTCCTCTGACAGCGACGTA:1 + chr3R 4934187 3' - I-element 338 1 57.43 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAGTGACATAATTCATAAATGTGGTCCTTACCAGTCGAATGTTGCGT:1 - chr3R 12605604 3' - F-element 50 1 65.35 ATAACTAAATAACTAAAATAAACCACAAAACTACTTTATCATATATTTATGTATATCCTTTTTTCAGTTAAGCTAGTGTATTAAGTGTTCGTTTTCCCAAG:1 - chr2L 11609576 3' + HeT-A 34 1 77.23 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACC:1 - chrX 21531015 3' + roo 9040 1 55.45 TTGGTNCTTCGAGCCGGATATCCTGGATTTTTCAAGTTAGTCCAAATGAATCGCGGCACTTTTTAATTTTCAGAATTCTAACGGTGTTGATTCTTTGGAAA:1 - chr3R 28284357 3' + 3S18 368 1 68.32 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGA:1 + chr3R 4544077 3' + flea 4992 2 58.42 ATTTGGTTTTTTGTTTTACTTTTCTCCTTTCGTTTTGCCTTCAAATCGTATGGTACTCCACGTTGGGCGCCATTTGTTTTTAGCCCCTCAACATATTTACG:1 - chr2L 16661757 3' - Doc3-element 171 1 61.39 CTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGGAGGTGTTGTGAAGAATTATTATCAACACCTTATATAGGAGAAATTAGT:1 + chr3R 19449624 3' + roo 412 1 49.50 CCAAAAAAATGGCTGCATAGTGCGAAACCGTTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGCCTTTGGTGATGTCTTGCGGCAGGAAGCAGGATGTTATCAAGCGATTC:1 + chr2L 22350065 3' + 1360 3340 1 68.32 AATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGTCGGTGTGTACGTTGGCGAGGTGGGCGAGTACTTGGTGCTGCTCGGCGAGTAGA:1 + chrX 11563663 3' + P-element 166 1 57.43 CAGGGNTCCCGTTATTTCCCTTTTTGCGCACGGCCGTGACAAAGGTTACAAGATCATAGAGGGCTGGAATGCATATCCATACAGGTGTTTTATTGAAGGT:1 + chr3L 18321026 3' - gypsy8 317 1 67.00 GCTTCAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCACTGGTGATGCGTATTCCGACACACTCGGA:1 - chr2R 3628169 3' + Doc2-element 4393 1 74.26 CCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAATGCGTTTGCACAAATACTTTCGATTTATAGTGCATTCAAAGCTGGCCAATCAAGTGTGA:1 + chr3R 12588240 3' - Max-element 348 1 64.36 TAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAAGTTTCACATCTGATACACACAATGCTTCTTTCTATGTATA:1 + chr3L 2133529 3' - Rt1a 4955 1 62.38 CAACGCCCATCTCGCTATCCTGCCGGATGGGCTCTCGATGTTATTCAGCCATAATACCCTTCCATATGGTCAACTGTTCCGCCTCGCCACA:1 - chr3R 17767275 3' - Osvaldo 160 1 65.93 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGC:1 - chr2R 16988208 3' - opus 7164 4 75.25 AATACTGTAGACAGAGATACGATAGGTGAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAACCAGACAAGAAAGTAACGAGACTACAGTTAGAATGCAGCG:1 - chr3L 27390803 3' - Circe 97 1 68.09 TATGCNATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATCTACGTATATTTACAATAATAAGGTATAATTAAAATAATCGACTAT:1 + chrX 21017862 3' - 412 7081 2 53.47 AATGGTACATTAGGAACGAAGATATACGTAATGATTTAAACATAGAAACAATCAACAATGAAACAAAAAGAATAAAATAATTCATATGCGCGCGCAGGAAC:1 - chr3R 29039499 3' + Porto1 4369 1 62.38 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTG:1 + chr3L 9907429 3' + jockey 4965 1 48.51 CCGCTAAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGGGTATATCTTAATGGTACTAATCCCACATTGCAGCTAGGGACCGTGTCTACGCCACTGGT:1 + chr2R 21773630 3' - Max-element 8248 2 59.79 ACCCCCATACTGTAAGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAACATACAAACCCTTGACTGCGGATGAGAATATATCCTCCATTTATAGCAATACATGTGTGTG:1 + chr2R 19061396 3' + 17.6 7056 2 65.35 GCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTTTTATTTCACAAATCTACGGCCTGCTTCCGGTTAGCAATGTCCGTGCTCTGGACGTGGCGGATATCCGGTTT:1 + chr3L 4028839 3' - X-element 4407 1 79.00 CCAAAGCACTGCTATTTTTCTGAAAATAGCTGTATTGCCCCATTCAATATGTCTAGTATTATTCCCTCTGTTTGTGTGTGTAAATATTTTATGTAACTAAA:1 - chr2L 17655139 3' + HB 1617 1 55.45 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGAGTTAACTTATATAATGTGCATATATGTATGGTTCCGGTAATTGG:1 + chr3R 26842859 3' + opus 463 2 70.97 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAACACAGAAACTGTACTTTATCGCCAACAACGATGA:1 + chr2R 23571716 3' - roo 16 2 58.42 GGGCAAATCCAGGACACCCCGCGGTATGGCCCTGAAGCATTGCTTCGCGAGGACGATCAGGATTTGCTCACTCGTCATCTTCATCCTGACCACCGGCCATT:1 + chr3R 23812829 3' - Rt1c 5353 1 74.26 TACTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTACTAAAGTGCATTGAACAAGATTCATTGCCAAGCTCAGAAAAATTCCCCGATATGTAATAAAACA:2 - chr3R 11160743 3' - Q-element 339 2 68.32 ATGTTAATAATAATAATAATATGTATCATAATAATAAGACAACCAATGAGTAAACTTAGAGCCCTAAGCATAAATCTACAGTTAATAAGTTAATTAAAAGC:1 + chrX 18864915 3' + mdg1 50 2 63.37 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGTTCAGCCGT:2 + chrX 3817543 3' + roo 407 1 76.24 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGGGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGG:1 - chr3L 19951188 3' - Ivk 20 1 57.43 TATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCG:1 + chr3L 4921446 3' - jockey 4807 1 73.27 TTGGCNGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGACAGCT:1 - chr3R 22431071 3' - Max-element 29 2 52.08 ACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAACCTTTACTATAACATAATAATTGAAGTA:1 + chr3L 5102444 3' - jockey 4719 1 73.27 AACATTTATCAAAAGTGTGGGCGTGGGAGTTAAGGACGGTTTTAGGGCGTTAGAGTGGGCAATAAATTTATATGACATATAAATGTAAATAATTGAGCGGC:1 - chr3R 8526335 3' - INE-1 256 1 58.42 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCC:1 - chr2R 5950707 3' - mdg1 7091 2 79.21 TGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATCTCCACGCTTATGGTTGAAAGTCAAAAAGGCGATCATTTCATTTACCACTGTCGCCC:1 + chrX 5129568 3' - Idefix 12 2 64.36 CTCACGAGATTAGAAACGAGTGCCGATCAGCAATTCAACGCTTCCCAGAGCGTGCGTAACTCGGCAAATGAAGTGAATGAATGAGTGCATGA:1 + chr2R 13324291 3' + BS 426 1 55.43 TGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTATGA:1 - chr3L 19454667 3' - diver 37 2 62.38 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGTCTAACGAATTTAATTGATT:1 + chr3R 26530924 3' - blood 36 2 59.00 GTATATTAGAAATGAAGATATACATAATGACTTAAACATAGAAACTATTAAAAAAAAAGCAGCAGAGATGTTTAACACTTCAATTAAACATTGGTGAGAAT:1 + chr3R 9994513 3' + Porto1 4373 1 55.45 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTCGGTCCATAAT:1 - chr2R 7032129 3' + mdg1 394 2 52.48 TCACTAATCATGTGAGGACTTAGTCAAATATAATTAATTTCGAACTTAGTTCGTTTCGTGAGTTTGGTTTGAAACATAGCTGAATGGCTGTGAAATCAGTG:1 + chrX 8148760 3' - BS 4995 1 40.59 CACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTTGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCAT:1 - chrX 9909333 3' + P-element 319 1 20.79 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATGTATATTTTTAATAAGTACATACAA:1 + chr4 1149903 3' - 297 6608 2 76.62 GGAGGTACGGAGACAGAATAAGTTCTGTTCTTATCATTTTAAGGAGCACATAAAAACACACAATTTGTTGCCTACACTTTGCTGTATAAAGAAAACAACTT:1 + chr2L 11146002 3' - TAHRE 10413 1 76.24 ATATAATTTGCTTGCTTGTGTGATTATGTTTACTTATAAATTATTCAGCTTATGCGAATCAAACCGAATTTAATTGATATTAATTTATTTGAAAATACATA:1 - chr3R 18003715 3' - 1360 3259 1 53.47 ATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACATAAGATTTGACATTAATAATTTATCTTTT:1 + chrX 21564720 3' - diver 51 2 79.21 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAACGAAAAAAGCGTAGCACACTTTTCGGGGCGCCCATTTT:1 - chr3R 22644129 3' + hopper 1410 2 71.11 TAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGG:1 + chr3R 7168629 3' + flea 220 2 71.13 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCGGAAAGGCCGCA:1 - chrX 17968329 3' - Tirant 8107 1 81.19 CTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAGTGCTAACCAACGGTATTGCCTTGGCGGTTTACACCCCTTATCCGGGAAGCGATTCAAACGTGACGAATCA:1 + chr2L 16173795 3' + rover 445 1 57.43 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCGCATGCTAAAAAGTATGCAACAATAATGTCCTGGTCGACAGAGGCGTCATCCGAAGGAACACTGAA:1 - chr3R 26773877 3' + jockey 4914 1 71.29 ATTTCTTTAAAAATATAATTAACATTATATGATATTTGAACATTACATCGCAGAATTTGTTGCATTGCATCACCTATTATGCTGACCGCTGCTGTCAACTT:1 - chrX 9467717 3' + hobo 479 1 48.51 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACTACAGTTTGCAATATAAGCTAATCCGTGTGTTCTAAGTGAAAACATAGGGGTTCAAGCG:1 + chr3R 13225578 3' + hobo 2927 1 63.16 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGA:1 + chr2L 14612082 3' + roo 9022 2 71.29 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGG:1 + chr3R 10751686 3' + hopper 1362 1 72.28 ATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATAT:1 + chr2L 22224563 3' + Rt1c 5400 1 56.44 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTTTTACTTA:1 + chr2L 16948738 3' - jockey 4693 1 58.42 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACATAGAGAACATTTAAATATATTTAAAATTTTGTAATATTTATTCACGTGTAAAAAAAG:1 + chr2L 6083790 3' - 3S18 21 2 53.47 GTCAGGATTCCTCCAGAGGTGAAGGGCTTCCTTCGCTGGCTGCTCCGTGGAGTCCGGACATAATTTATTTATTATCGAAATTGATTCATAAATAATTTCGC:1 - chrX 14479157 3' - Gypsy6A_LTR 356 1 56.44 CAATAACAATTATGAGATCATCATCATCTCCTGGTTCTCGTCAAGGGCGACTTAAAATGCTTATAGAAAATTATATATCATATATATCTGTGGGAGTGGCT:1 + chr2R 5094144 3' - BS3 1623 1 54.46 ATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGATTATTTATATTTTATAGCTGCTGCATAT:1 - chrX 10672311 3' - mdg1 50 2 78.22 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTATTTGGAGCATCTAT:1 + chr3L 17587844 3' + roo 9036 1 61.39 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCCATGGCATCTGGTCGTTAGGCC:1 - chr2R 16333987 3' - P-element 32 1 47.52 TGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGGGGAG:1 + chr4 1294990 3' - HeT-A 6051 2 71.64 TATATNTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTTATTTTTATGGCATGCACGAAATGTTGT:1 + chr2R 13644520 3' - Burdock 6147 2 68.32 CCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGAGAAAAACATAAACTAAAATGACAGATCTTTCATACATCGCATCGACACATTCTTATCGACAC:1 + chr2R 3823401 3' - Max-element 8369 1 68.32 AAGCAAAGACACTAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAGGAAACGAAGGCAGATGTTTAAAGTGACGTACTTATATGAACATACAGTATGTATGTATGTA:1 - chr3L 21821410 3' - Tc3 313 1 65.35 CTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAAGAAAGTTTGATGTGTTCTGCCATAAATTCGGGAGCTCTCTCAGTTACATGACATGTTTAAGAAGGATAGCTAA:1 + chr2L 5076722 3' - accord2 7590 2 78.22 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTA:1 + chr3R 13376031 3' + 1360 3353 1 64.36 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATTATTTAATATTTTATTAATATTTATTTAATATTTTCTATATTTCTTATTATCTAAGCGCACTCT:1 - chr3R 13992667 3' + roo 397 1 52.48 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCATACGTGCGTGGGCGTTGATTAAGTGCCACTGGTGTGCACACATGCCAACATATGTATGTACAAATATCAAGGTGGGCTTGG:1 - chr3L 10552302 3' - accord 7026 2 79.21 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTC:1 + chr2L 14790645 3' + roo 9036 1 59.41 GAAATATCACCGTGGAAAAACGGACAAGTTGGTATTGAATTGGGAATTAGGTAGTGTTGGTGATTCTGCGCAACGCTCGGTTTTGGACCCTTTACACTCTC:1 + chr3L 23854250 3' - I-element 5014 1 61.39 CAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATTCAAAAACATTTCATTGGTCCGATCACGGAGGAATT:1 + chr3R 17321771 3' - Stalker2 42 2 65.35 TTTTTATAAAAGCAGACAATAATACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGAACACTGTGCACGAAAACATTTTACAAGCAATTCAACAGAAACATTCCAGG:1 + chr3R 19969376 3' - Cr1a 448 1 68.32 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGAT:1 + chr2L 7255795 3' + P-element 2840 1 32.67 AATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTTCGCTTTCGCTTGTTAATTATTGAAAACATCTACTTAAATTGAATTTTAGCATCGAAAGTTAA:1 + chr2L 2081378 3' - I-element 4893 1 53.47 AAAAAAAAACGAAAAAGAAAAAAAGAAGTTACAAAAAAATAAAAAAGCAA:1 + chr3L 7749795 3' + Doc2-element 234 1 88.00 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATTGGCCCGAACCCGAAGTCTGAACCCAAAAACTCCGTT:1 + chr3R 25097897 3' - P-element 40 1 40.59 GAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATACATTGGTTTTGCACTATGCAG:1 - chr4 872519 3' + 1360 121 1 82.18 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATTATATTGTCCAATTCTTAGTTTCATATTGCA:2 - chr3L 9766355 3' - blood 7056 2 71.29 ATTTAGTATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCAT:1 + chr3R 4544053 3' + flea 217 2 67.74 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGCCTAACTTTCTAGAATCGACTGATGATATATACAGGCATTAATTATGGTATAGCGGT:1 + chr2L 513746 3' + roo 389 2 57.43 ATATTTATAACAAAAAAAAAAACAAAAAACGGAAAAAAATAACAATTTGTGGTGGAGAACACAAAAGAAATTCTATGGAAGCGCGCAGAATGTGACTTAA:1 - chr2R 11254983 3' + TART-B 10631 1 63.00 AAATTNGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTG:1 + chrX 3817510 3' + roo 9037 1 61.39 TTTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTCAGTTTTAAGACTAGCACGAGTCCAGAAAGAAATCTTAAATAACTTAAGTAATTGTGATATATGCATGCCATA:1 - chrX 8506372 3' + gypsy4 6755 2 71.29 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGATACGCCACTGTGGTTCACTGGCCCAGCCACCAAGAATCGGACCGGAGTCCAGTGTCCAGC:1 - chr2L 12325865 3' - jockey 4813 1 64.36 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCAGGCCGATGAGTTGGGTGTG:1 + chr3R 4544087 3' + flea 244 2 67.00 TCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCG:1 + chr2L 3388133 3' - F-element 317 1 54.46 AGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTATAAATTTTATTTGCAGAAAGGTCTTCTTCCGATTATAAATTGGTTGAAACTGATTTTT:1 + chr3L 24789435 3' - 412 447 2 63.37 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATAAATTTGGCATCACTGCGG:1 - chr2L 12325054 3' + jockey 4937 1 81.19 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCC:1 + chrX 3817528 3' + roo 392 2 61.39 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAAT:1 - chrX 13508703 3' - roo 47 2 73.27 GGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAA:2 - chr3R 15598679 3' - Max-element 8286 2 74.26 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCAACCCCTCCAGGGGCCAACCCACCACCCCCTATTTTCTTTATGTGTAGCACACTTTTAGG:1 + chr2L 1625729 3' - hobo 15 1 64.36 TTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTACCTGCCCCTCACAAAGGCGTTTATT:1 + chr3R 8976015 3' + Bari1 1678 1 54.46 GATAGTCGGGGAACTCGACTATACCATTCTCCCTTGTCTATAAGTGTATAGGAGTGCAAACAGAGCTAGAAATAAGTACGGTGATCTACTGAAGTAGTAAC:1 + chr2L 22930387 3' + INE-1 564 1 58.42 GGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATCGGTAATCAAAACACACGTGCTGTCATATT:1 - chr3R 20556099 3' - Tirant 8113 2 75.25 CAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTAATCACGAGCTACAATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCCCAATCCCAAGCGCCGCCCATTCATGTC:1 + chrX 8395222 3' + accord 6921 2 68.32 CTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTCAATATGCTATCTTTTATGGGCCATTACTGCGTATTTACAACGCGGCGTATGCGCGATATTTTCGCCGCGCGA:1 - chr3R 8371673 3' + roo 295 2 72.28 TAAAAGCTCAAAAATATAATCAATTTATTATGCATAATGAATTTATTTATGAATTAAAGTGCTGTATTAATATCAAATAAAACAACTAGTGTTTAAATTT:1 + chr2L 9420140 3' + TAHRE 18 1 69.00 CTATAATTCATGGATGCGTATTATCAATCGTACCATGTGCAAACGTAAGCATATAATTCTATTACTTTTTTTTTCCATTTTTATCAACCTTTTTTATTCAT:2 + chr2R 5487469 3' - transib2 243 1 55.45 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATTCGCGTCTATATCATCTATACGTGGACGAGCAAGGTGTCAGTGGGCT:1 - chr3R 25097833 3' + P-element 2861 1 52.48 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGATTTTGCAAGAACATACACTTTGCAATATTAGTTTACCCTGCAAAAGTGCATAT:1 - chr3L 18659007 3' - pogo 19 1 60.40 ATTATTATAATTATTATTGTTATTATTACTAAGGTATATTTTATTTATAATGGAAATTAAAGGAAGTAGGATTCCATAAACATGCGAACCA:1 - chr2L 7588195 3' - mdg1 21 4 79.12 CACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGGAGGAGACCCGACTTAACCATTTTTCCACCTCCCACCTTTCCTTGCAGAGAAACTCAACGTTCTGTACGAACGC:1 - chr2R 9777181 3' + I-element 7 1 74.26 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGTGAAACCAACCAATGTTGCCATTCACAGTA:1 - chr2L 8308196 3' - P-element 43 1 27.72 GAGTTNCCACCCCACCCCCTAAACCCCCACAATTTACAGTTAGGGGTGGCATTCACAATAGCGGTGATTCGAATACCCTCGCAGACTGTGAGAACCATAAA:1 - chr3R 30880095 3' + Tirant 2 2 78.22 AATTCTATATTGAAACCTATCAATCCCAATGGCACACCACAGGGCAAACCGCCTCCAGTGCCCACTAGTCAGTCCGATTTGTTCAATATATTAGGTGCGGA:1 + chr3R 7180515 3' + F-element 4244 1 82.18 TCTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTGCTTGCTTCTTTTTTTGTGTTAGCATGTACGAGAGAAATCTAATTTAAATTAAGCAAAGAAAATACATACACAGGCAA:1 + chrX 9025341 3' - gypsy3 423 1 68.32 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAGTGTC:1 - chr3L 17168821 3' - mdg1 14 2 66.34 ACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAAATTGAGATAATCGAGTTATATTTAA:1 - chrX 7687768 3' - P-element 2770 1 31.68 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCG:1 + chr3L 16761306 3' + roo 358 2 76.24 ACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGAGCAAGTGGTGAAGGTGTATCGCTTGTGCGCATCTCGATTTGTCCATCCATATC:1 + chrX 16610857 3' + Quasimodo 7029 2 61.62 AGAAAAAAAAAATATATATAAGAAGTATATACTTTTAGAAATCACTTTCGTGTAGATAGCTATCAATTTACATATTACTGAGTAGCCTGTATAGTAGGGAT:1 + chr2R 18999091 3' + invader2 298 2 80.20 CTCCTTCTGGTAACGCTCCGACGCACTATCTCCTTCCACGCGCGATCTTGCTGTCTAACTTCATTGACCGCTTCCACTTTGCTTTGACGCTAGTTTTTAAA:1 - chrX 17999538 3' - gypsy8 419 1 62.38 TTTACGATACTGTTTACTTTGAGAATTGTTTACTAGGGCCGACAAAGAGCACGAAGTTCCGCTGGAAGTCCTACGGAGTACAGAAGTTTAGTTGAAATGCA:1 + chr3R 16482223 3' - diver2 298 2 55.45 TCGAGAGAGCCTGGAGTCAGCTTTAGAGCCACGCCGAAGAAATCGGGTGCGAATGGGACTTAGGATGTTATGGTGTCGTGGGGTGTATTGTCCGTTAGGTC:1 + chr3L 25842204 3' - 1360 75 1 50.50 CCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTCTGGCAAGGAATCGGGCCATCCAAATACCAAA:2 + chr2R 16988287 3' + opus 7494 2 72.28 CCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTAGAATGTATATAAATGTATTAGAGTAAACTCAGCAGGCCAATTTATATCCTTTCAAAGTTTCACCTTTTATTT:1 + chrX 7778164 3' - Tirant 390 2 73.27 ACGTTACTTTAGTTTACTTTAGATTAGCTTGTTTGTTTTATGTCTAATAAAAAGGGGACCAATCCACCTTGAAATCTGACGGGATTCAGATAAACATACG:1 - chrX 17946868 3' - TART-A 13150 1 67.00 CACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACAAACCTTTTCACTTCCAGTCAAAACAGTAAAAATGCCATAAAGGTGACAATTCGCGAATCAAGGGAAATTGG:1 + chrX 6373688 3' - X-element 26 1 38.61 CAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGTCGAGTTGTGACTAAAGTCGTGCGAGATGCAGCCA:1 - chr2L 16738830 3' + 297 6819 2 74.26 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTTGTCGTATCGCTTCGGGAGTGCTTCGCATACATTCGGAAAATGG:1 + chrX 13640694 3' + P-element 2866 1 52.81 TTGATGTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCACTACGAGTGGTGATGCAGCTG:1 + chr2L 17462120 3' - F-element 341 1 72.63 TTATTAGATTATTATTTATTATAAATTTAAGTTTATATCGATTTGCCGACAACATATTTTAATTTTTTTTCTCATTCATCACCTACCCATTAATATAAAAC:1 - chr4 57880 3' + INE-1 415 1 73.27 GGGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCTCATACTCGGCCAGCTTTTGCAACAGCTCACAGTTTTCGAGTTCTAGGGCATTCAAACGTGC:1 + chr2L 3529851 3' - jockey 4748 1 64.36 TGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCT:2 + chr3R 10240176 3' + invader4 308 2 61.39 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAATAAAAGCATGTGATTTAGTCAGCCA:1 + chr3R 19346943 3' - blood 7056 2 75.53 ATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATGATATTGGAAAGTAACTTTTTCGCATACTTATTTGCCGATTGCAGGCAGTGACAAAAAAAAG:1 + chr3R 7894364 3' - Tirant 8060 1 63.37 AATTCACTATGTATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTGAGCCTCGGTCGTATTTGCCTTGGTTATTTTCTCTAATAGACCTTGT:1 + chr3R 12582128 3' - F-element 149 1 55.45 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAACACGATGAATTCAT:1 - chr2R 5950667 3' - mdg1 7051 2 66.34 ATGGGNAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCGGCGAATCAGGTGCAAGTGTTGAATAGTAGCTTAATAACGGGGGCGGGTTTCGAAAGTGGATTG:1 + chrX 666924 3' - FB 949 3 73.27 CCACGCCACTCCCCCAGGGAAACAACATCGAACCATCCATCCGTGCGTCCTCACACACAAACACCCATACACCCACAATTATTTCAGGGGGAAACCACAAG:1 - chr3L 15923675 3' + transib4 2353 1 78.22 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATATATACATGCATATATGTATTTATAT:1 - chr3R 23219909 3' + 412 449 2 73.20 TTTTTTTTTCTTTTTTTTTGGTTTTTTTTCTTTGAGACCAACAGTGGGGCAATGAGGGAAAATGAAGTGCCAAAGTGTTGAAAATA:1 + chrX 5175000 3' - gypsy7 5004 2 62.79 AAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGCAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTACTTATGTAAATTCACCTATT:1 + chrX 3305239 3' - transib2 1 1 76.24 AATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATGTTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTA:1 + chr2L 3440508 3' - Juan 27 1 53.47 TGTCTNTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGCCGCAACATTTGCTCAGTCCGCGACGAACTCTCAACGCGGGCGGTTGTGTAGAAT:1 - chr2R 14713581 3' + P-element 2867 1 62.38 GGAGANCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATAAGCCAACAGACTTAGCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCAGAAGTTGTCCAGCAAGTTGGGTT:1 - chrX 12519653 3' + G5A 2581 1 75.00 CAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAATAAAGTTAGGCTTAAAGCATCTTCAATATCCTTAAACTTTAGTTCGTTATACATTTT:1 - chr3R 17321699 3' + Stalker2 7632 2 59.41 GACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAGGTACACATATGTACATATGTACCGTACAACGCAATAGAATATAAATGATATGGTGGGTAGATAAACG:1 - chrX 3763134 3' + 297 6968 2 67.33 AACATAATATGCTTCTCATATTATGCTTACATTGCATTAGTCGCTAAGTATACTATCTTGCATGGACATCAAATCGGGACTTACTCAATGTACTTGTCCTT:1 - chr2L 299902 3' + rover 4 2 63.37 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGCACCGCTTT:1 + chr2L 8565549 3' - blood 7020 2 76.24 AGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCTGGCCTCCAAGAGCTCTACTACACACAGGGCGTCTACACGAATTGTTGACACCGGCGTCC:1 + chr2R 17464223 3' + R1A1-element 400 1 49.50 CTAGAATAACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTC:1 + chr3L 11257377 3' + 1360 9 2 47.52 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGCTAAAATGGTAAATTTTAACTTTACGTGGT:1 + chrX 11730344 3' - jockey 4776 1 63.37 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGACACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTG:1 - chr3R 10952268 3' + roo 402 1 58.44 ATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATATAATATGTTTATATAGAGAACAAATCACCCAAATCCAATTCGAATTTTCGG:1 + chrX 15371907 3' - Idefix 13 2 62.63 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGTTGTTCTCGGCGTTGTTTTTAGTTGAATGGCA:1 + chr3R 6622716 3' + P-element 2868 1 61.62 CGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTGATAAAAAACGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAATATAAAACA:1 + chr2L 21635348 3' - F-element 482 1 58.42 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGA:1 - chr2L 21683418 3' + pogo 2052 1 76.24 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAACAAAATAACAAAACACCCTTAATGTATGCAAATTCCCTCAAGTTTAAAGTCTCCTGCCAGCTAAG:1 - chr3L 4801486 3' - roo 11 2 68.32 AGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGTTCGCGGGTAGGAGCGGGCGGTAAAGTAAACGTGGAAATAAAATGGGAAAACAGCAAAGAAAA:1 + chr3R 31869775 3' + invader1 91 2 54.08 CCCATGGAATCCCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTATATATATCGATACATATACATAGATCGCCTCGCAGACTGGCCTCCCCGGAGCTGG:1 + chr2L 17444090 3' - G2 2790 1 57.43 CAAAATAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGAAGAAAGAAATAAATATTCATATATTTTTAAGTAACTTTCTTCGTGCTTTGTACTTATGTAAATTCA:1 + chrX 3305233 3' - transib2 7 1 68.32 TACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACAT:1 + chr2L 2074784 3' + roo 9049 2 59.41 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTTGTGTCA:1 - chr3R 11263377 3' + roo 394 1 64.36 GTTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTTAATATACCCAAAACCCTGATAGGTATGCTTTAATTTCAATCAAAC:1 + chr2L 15080573 3' - 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chr3L 10081926 3' - rover 6970 2 58.42 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGAAGTATCTGCGATCCGGTTCGTCAGCCGAACACGAATCCGTCCGGTTG:1 + chr2R 16334058 3' + P-element 2861 1 53.00 ACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAGGTAAAAGTTAATAAATACCGCCAAGCAAATCGAATTGCAATTTGTGATAACAAAGCGAGCATGAC:1 + chr3L 2491106 3' + jockey 4733 1 77.42 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCTGCTTCACAAAGTGTTATGCA:1 - chr2R 19551956 3' + roo 405 1 75.25 GCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCAACAGAGCTTGTATTTTCATTGGACAAGTGCATTGAACCCTTGTCTCGCTTCGTGCT:1 - chr3L 9383498 3' - P-element 21 1 56.44 TCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGTCGCAAAAGAGAGAAATAACCATGTGACTAGTAAGTTAGTACACGCGGTGGGCCATACGTGCACGAAGATAT:1 - chr3L 25255117 3' - GATE 8307 2 69.31 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCATACCCATACCCATACCCATAGTCTCAAGTCGCAGTCGGCGTCTCAGTC:1 - chrX 17830727 3' - P-element 22 1 55.21 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATACACAATATCTGTGTTTCGAAACCCTTTTACACTTAATGTT:1 + chrX 15392019 3' + 1360 3380 2 48.68 TGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTTTGACCACTGTAGATTCTGTAGGTTCCATTTCAGTTAAAGAATTGT:1 + chr3L 876406 3' - 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chr2R 5067654 3' - F-element 59 1 75.25 TTTAGTTTTTTCTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAAT:1 + chr3L 18337691 3' - Juan 4073 1 70.30 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAACAAAATAAAAATATAATATATATATAAGTTGAAACGTTCATAGGAATTAGAATAA:1 + chr3R 13992758 3' - roo 8682 2 59.41 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGT:1 - chr2L 16999510 3' - P-element 27 1 52.48 AAAAAAAATAATTAAATGCTTAAGATTTAGAATTATAATAAAACGAAGCCAAATGCATCGTGTTATTATAGAAGAACATTTTCGATCTACGTTGCTGCTAA:1 + chr2L 7270476 3' + Tc1 54 1 76.24 ATATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAGTGTATGTTGTATTGGGGTGTATGTACAAGTTGGCTAGTTAGTTGGCTTGTCGCTTTCGTCACTGGAGGCGGCACC:1 + chr2R 14006186 3' - Idefix 90 2 57.43 ATGCATCGACGGCGCAATTGAAAGGATGGTTAAGTGAAGTAAAAGAACCAACCACAGGGAAAGGCACGCATCCGTGTTCAAATCTCCGCTGCCCACACGGA:1 - chr3L 11799086 3' + invader2 322 1 58.42 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTCTCCATGTGGACTTGTGCAATCCCTTTTGGCCAATGCCCGCA:1 + chrX 17042717 3' + copia 220 1 60.40 CTACCAAAGGTAAGGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGAAGATATTGAACAGAAACTCCTATTAGAGACGTAAGCTTTAGTTGAAGTAT:1 - chr3R 11264934 3' + roo 470 1 53.47 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTACTTATTGGGAATTGTGGAAGTTCATGC:1 - chr3R 17843657 3' + roo 358 2 73.27 GTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAA:1 - chr2R 3591997 3' - Quasimodo 43 2 79.00 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAGAGAGAACAACGGTGAAGCACTGCAGAAATTGAG:1 + chr2R 14713675 3' - P-element 16 1 65.35 AAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGAGTCGATTACTATAGTGCTTGGCTATCTTTATATATACATATATAAAAACGAAAGATATATTTGCGCTCGTA:1 + chr3R 15598754 3' + Max-element 8529 2 72.28 AAAGANTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACATGTTGAATTCAA:1 + chr2L 2074795 3' + roo 9060 1 70.30 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGAGTTCTGAGTGATTGCTTGGGATTTG:1 + chr2R 17937215 3' + Quasimodo 7358 2 71.29 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGG:2 + chr3R 19446219 3' + 297 358 2 64.36 GCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATCGAATTTAT:1 - chr3R 26530867 3' + blood 7352 2 60.61 ATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCCCATGTCGCCAATTGCATTGAGTGTGTGGGCCATGCGTTAGTTTTAAGGGCAATGTTAATGTCAAGCG:1 + chr3L 18862613 3' + micropia 17 2 71.29 CCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCTGCCAAAACCCCACCAACTGTGAACTA:1 - chr3R 10178115 3' + Doc 4423 1 72.45 ACAAACATAATCCACCAACACTACCTAAATCCAAGTTCAATACCAACTTGTAATCGATTCACTACTACATTTTTGTGTTCGTATTTAGTAGTTTTAACAAC:1 + chr3R 25561929 3' + I-element 4962 1 58.42 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATAACAAAATAAAAATATAATATATATATAAGTTGAAACGTTCATAGGAATTAGAATA:1 + chr3R 13992757 3' - roo 8683 2 58.42 GTCGATCCGCAGGCACTTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGATAACTTTTGATGCTCACTTTAATTGCACCCTTAATGTCAAGGCCCAGGATAA:1 + chr3R 29331922 3' - G6 27 1 52.48 AAAAAAAGACAAGAGAAAACAAGCCAAATGGCAAACAGCAAATAAATAGTAAAACAACCAGTCAGACTCAATGGGGGAGAGCCCCCATCCATCTCCATCG:1 - chrX 882625 3' + Porto1 173 1 73.00 GCCGAATGCTGACATTACACAAAAGTCGCACTGCAACTCGGCACTGTTGTCTGGCGAAACTTAAAGCGAAAATACACGGTTCGAAAAGTTATCAAAACCCA:1 - 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chr3R 12539516 3' + roo 353 2 80.20 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATAGCCTGAATATCGTTCAATCGTTCAATAAAGGATG:1 - chr3R 8458230 3' - HMS-Beagle 6838 2 66.34 GTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATCCTCCCAGTTGCTTTGAGAGC:1 - chr2L 3951573 3' + Transpac 292 2 61.00 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCACAGAGTTTCGATTTTCCATCCATATA:1 - chr3R 9551441 3' + P-element 2835 1 27.72 ATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCTCATCTATTTGATCGCACGGCGATTCAGGTATCTTAGGTGCCACCTGAGAAGG:1 + chr2R 5972161 3' + 1360 3287 1 59.41 GTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTAACACTTTAACACTGTTCCCTTCACGCTCTA:1 + chr2R 2972121 3' - 1360 210 1 75.51 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCTGG:1 - chr2L 16674869 3' + roo 9027 1 73.27 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCATACGG:1 + chr3L 18337736 3' - Juan 4028 1 75.25 TTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTTTGGGGTAGCGAATCTCCTAGATACTCGTACTC:1 + chr3R 17205412 3' - F-element 402 1 70.30 TTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTT:1 + chrX 2649886 3' - Tirant 8130 2 52.27 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGACAGTGACATGAAGAGATGAGAGTAGAAGATGTGTCTTTTCGGCCTTACACTGATCGATTTTCGCTCTCTCTTA:1 + chr2R 11528103 3' + P-element 2884 2 78.22 GTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGTTTTCACCGAGGCTGTCATCGCTCTCTAAGCTGGAGTCGTTG:1 + chr3R 16645288 3' - F-element 4446 1 58.42 AAAGTTATTTTTGAAATTTATTTTGTGATGATATGTACATAGATTTGACTATTTTTAATCTATTAAGTCAAATGACTTAAAAAATATAATAAATAAATAAA:1 - chr2R 19150912 3' - 1360 373 1 73.27 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACACATGATAGTTAAAGCCCACTAT:1 - chr3R 19132242 3' - Ivk 2 1 77.23 ATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATTTAGTCATCTAACGACCTAGCTTTTATCACACAGCATAATAAATTAATTTG:1 + chr2L 21011304 3' - opus 367 2 54.46 CTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGGAACTTTCTCTATTTTTCTATTTTATTGTGCAGATATGCGGTTTACATAAATTATTTTTGCCATAACA:1 + chrX 16990403 3' - jockey 180 1 74.26 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATCATAACAATCTTTAATCTTATAATTTCATTTTTTCCCCCAGTGTATGT:1 + chr3R 8458295 3' + HMS-Beagle 219 2 56.44 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAACAAAATTTAATCAAATAAAATATTTACTTTTAAAGAATATATTCTTGATATCGATCTTTTTAAT:1 - chr2L 12988871 3' - mdg1 13 2 61.39 TGGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGCTGAGCTTTCGACTGGAAAGCGGAAAGGCCGC:1 - chrX 17968330 3' - Tirant 8108 2 80.20 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCTGCCGCGAGTGCTGAAAATC:1 + chrX 2753904 3' + roo 9048 2 58.42 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTGTCTGCCAACCCCAGTCTTTACGCCTGATTCGTTATGCAACTTTGTCCAG:1 - chr2L 15947382 3' - Transpac 30 2 50.50 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAATAG:1 - chr3L 6044736 3' - Tabor 28 2 51.00 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACGAGTTTCGTCTCTTGTACGTATGTC:1 - chr2R 24628744 3' + mdg1 404 2 61.39 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTTGTGTCATACAGCATCT:1 - chr3R 11263367 3' + roo 404 1 74.26 GCAAGNAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGCTACCAAAGATTTTCCTGAGATTATGC:1 - chr3R 26321611 3' + blood 7362 2 50.50 TGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGTTGAATTATTTCTTTCAGTTGTGGCTCTCGCTGGCGGACAA:2 + chr3R 10240189 3' + invader4 3080 2 74.26 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGCTTACATTGCGTATA:1 + chr2L 13574296 3' - pogo 11 1 63.00 GGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAATCTCTTTCAATTTTTTCTCTCCTCTTGGGCAGCTGAACTTTTGGGCTC:1 + chrX 2780735 3' - F-element 4430 1 59.41 AACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCCGAGGAACTAAAACACGGCAAACTAAAGACCAAAATCCAAATCCAAATCCACATCGAAATCGAA:1 - chr3L 14503907 3' + Stalker4 126 4 68.32 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTACCTTTTCTGAGTTAATCAGTTTCCTA:1 + chr3L 17587830 3' + roo 9022 2 75.25 TATAAAAGCTAGATGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATAGTCGCAGCACAAACGTTTCTTTGCATTCTTGTCCGCCAAAAGTACCCCATAGG:1 + chr2R 4939358 3' + INE-1 162 1 55.45 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACCTTATCAATTGTTTTGCTTTATCATTCGC:1 + chr3R 27108387 3' - jockey 4806 1 76.00 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACATT:1 + chr2R 17345916 3' - jockey 66 1 80.20 CGTGAATTACAGTACAGTACTGGACCTTGAACTCCAGCGGGCCATGGCGGTAACATCGCTGGCTCGTCTGACAAATAAATTTAATTGG:1 + chr3R 17503230 3' + gypsy8 4734 2 55.68 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGCAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACCCCCCAAAAAAATTGGTAATCAAA:1 - chr3R 20556118 3' - Tirant 8115 2 65.48 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTCAGCCACCTTCGCTGCAATTAATGCATTCAACTTGATAGTGCAGTTAATCGGCT:1 + chr3L 4641146 3' - hobo 25 1 55.45 TATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATTTTTGAGTGAACTAATCAAATTGCCGCTCAGCAAAT:1 - chr3R 15757400 3' + transib2 291 1 64.36 AAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAACACTTTACATTCATCATAATATTTTTTTGCTGCCCGCTGCTGTTGGCATGCTTTTGGTTTTATTTTTGCT:1 - chr2L 4144359 3' + I-element 5280 1 74.26 GTCGTAAGCCTCAAGTGTTTTCCTCTTTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTATCTTGTTATGATTAGATATTGCTTTCATTGATTAACTGGCAC:1 + chr3R 8599602 3' + Burdock 33 2 67.33 AATTANCAACGCAATCACGGAAGTTAAGGAAAAATACCATATTTGGCTACCAGGGTTCTGATAGATATTGCAGATAAATGTAAAAACCAAGTTATTAGTGC:1 + chr3R 19445570 3' + F-element 4414 1 74.26 AGAAAATAAAATTAAATAAATTAAACCATTTGCAAATGTTGTATAGCTTTAAGAGAAGCACTTTTACTACCCAACTTGTTTCTTATGCTCGTAACCAAAAA:1 + chr2L 9744701 3' - transib1 1900 1 73.27 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTACACACACACACACACACCCACAAGGCTAGGACCCCCAACTGTCATAAACTAGGATTA:1 + chr2L 13319655 3' - hobo 8 1 65.17 CAATAATAATAATATAATGATAACATAATAATAAGAATACTATAATAAAAAAAATGTTAATTTGGCTTTCAAAGCGAATTGCCAGTTGTTTTTGCCGCCAA:1 + chrX 12571156 3' + invader3 5047 1 77.23 TGCTGGGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATGTTAACTAAGAGCTAGAAGCTAGATGATGTAGGAAAAACAGGTATGTATTTAAGGGTAAACCCT:1 + chr3L 13886988 3' - Circe 7366 1 62.38 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAACGCGGCTCATTCATAGCCAAA:1 + chrX 18837034 3' + P-element 2868 1 63.37 CCCTTGTGATACCTACTAGCGTGGCGGCACACTTTTACTATTACAAGACACTCTTTATTGACTATTCAGAAACATTTATTAGAACCGCAGAAGAATTCAAT:1 - chr3R 2338060 3' - baggins 8 1 59.41 GTGTATCGTACGGCTCGATTCGCGAGAAAATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACTCCGCGGGAACGACACATGGAGCTTCCCAGTGGCTGGGAATACT:1 - chr2R 16952612 3' - Cr1a 4389 1 61.00 ATACATTTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCGCTCCAAA:1 + chr2L 315204 3' + Tirant 8470 2 60.40 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTATTTGCGGTCGGTTTACCATTT:1 + chr2R 19943987 3' - 412 7079 2 54.46 AAGGAGAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGATGCCGTCACCTTTTCTG:1 - chr3R 19346887 3' + blood 7364 2 51.49 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATA:1 - chr2R 18950742 3' + roo 9038 1 59.41 TATTTAAAAAATAAAATAAAAATTACATGTTCAATAATATTTAAAAATAATAATTTTATGATTTATAATACAATTGCGTCAAATGTAAAGAAATTATTCTC:1 + chr3L 8226852 3' + TART-B 10632 1 56.44 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATATTGACCAAGAACTGCTACTAAAAGCTTTGGTAAATATACTTTTCAC:1 + chr2R 13585522 3' + Juan 4186 1 55.45 TATTGCACATACTGTAATCAAAGGCAATAAAAGGGGGAAAGAGGTTCTGCAGCAAATGCCATGACAGCCGGAATCCATAAAAAGTTATGAAAACGTGTAAA:1 + chr3R 14941224 3' + HeT-A 5992 1 77.23 TTTGGGCGGTTTAAGGGCGTTAGAGTGGGCCTGCTCCTCGTGGGTTCGCTGGTTGCAATGCTCTGAATCACTAGACTCACTTAGATTTCAGAATTCTACAA:1 - chr3L 12530713 3' - INE-1 343 1 70.30 TTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAGTTGAAGCCCAAACACATTTATTCCTATTTTCATTCCAATTTTCATTGCTTTTCCGAGACTACACACGATTTG:1 - chrX 13798790 3' + 412 7126 2 80.00 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATGCAAATTTATTTTCGATTACTTGTTACCAAAGATTTTCCTGAGATTATGCAAATGTGCCGAAA:1 - chr3R 26321598 3' + blood 365 2 65.66 CACTCACGCTCAGCGTCAGCGCGAGCAAGACGAATTACGGCTCTCAATTCAACGAGACAACGCTGGGCGGATGTTGTGAATGAATGAATTGGCATTGGAAG:1 + chrX 8648685 3' + F-element 206 1 59.41 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGTCACACCCATCGGAACTGTTTTG:1 - chr2R 14675518 3' + roo 403 1 72.28 TGAACGTCAAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTTGAAATTTATCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCACTCTTGTCGCTAAAAATGGGCAAGAAAACTAA:1 + chrX 22838687 3' + INE-1 140 1 66.34 TTAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATTTTCATCCATCGAGCCATTAAAAAAACAAGGAAACATAACGTATTAAATACTTTAAAAGCCTTCGTCTAAATTA:1 - chr2R 15030916 3' + hobo 2465 1 75.25 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTGAAAAATATACAAATATACAA:1 + chrX 7904713 3' - F-element 67 1 82.18 TGGGCCAACGAACTAATGGTTCTGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTCGAGCGCCGATGACACTCGGCACTCATAACG:1 + chr3R 1465945 3' - gypsy5 6988 2 71.29 AGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTTAAACGAAATGGTCAAT:1 - chr3R 7388314 3' - HMS-Beagle 5 2 74.26 TGGATGTAATGTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAACGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCCATTGGGGCTTCGGTAGCATGTGATTG:1 - chr2R 18696610 3' - Ivk 414 1 71.29 AGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACCCTGTAAAGGGCCGAATTGATTGTACCCTCGTCGATTAGCAGTGCGCAAAGTGGAAACTCCGCGGACAAACGC:1 - chr2R 21773520 3' + Max-element 295 2 70.30 GCTAAGCCCCCACCTATCATTCTGTCTGACGTTAATGATATAAGTGAAGTCAAAAGGTCATGTTGTTAGAAACATAATTGTTGGGGCGGACAAAGCGGCG:1 + chr3L 9233309 3' + G4 158 1 75.00 GTAATAATAACAATAATAATTATAATAATAAATAGTAATTTACGCTTTAAGCAATTGATCTTAAATTTTTTTGTTAGGAATCCCATTTTTTACTGATCGAG:1 + chr2L 7588325 3' + mdg1 7064 2 71.29 TGTGTTTTATTTAAATAAGAGGATGATATATAGTACCCCTGCATGATTAGCGGAGGAATTCGGAGCGAGTGTTGGGACATTTGTAAAATTACTTAAAGAAT:1 + chr3R 10392444 3' + invader2 5085 2 61.39 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACCTTATCAATTGTTTTGCTTTATC:1 + chr3R 27108381 3' - jockey 4813 1 82.18 CGTAGNGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCCTCCAACGGGCCCTCCTGACTAACTAACTAACAAACAGCGACG:1 + chr2L 16201594 3' + hobo 2927 1 70.30 TGTGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTATTCGATAATTACAATCAGGAGTCGGCTTTGAGGGCCAC:1 + chr3R 9178055 3' - accord 188 2 51.95 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGAGGAAAAATAAGAGCGCGTGCCAATGAACTCTGTGGTCAAAAGGAAAAGAAACCGA:1 - chr3L 16761244 3' - roo 8685 2 56.44 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCACAACGGCCCGTTCTGGTCAA:1 - chr3R 29123324 3' + P-element 2870 1 62.38 TTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCGCTCCAAAAAGCAT:1 + chr2L 315210 3' + Tirant 369 2 54.46 ATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTATCCAGAGCCTAAAATAAAGCGTTACGCCCAGTTTAGGGTTACCAAAA:1 + chr2R 7030983 3' + mdg1 41 2 53.47 CCAGATCGACTCGACTATTGATCCTTAATTAGTCTTAGCGACGGTAAGACTCACTGCTCTTATTTTTCCTCTTCTCCGTTTGCAAGTTATCCAACCAATAA:1 + chr2L 22778739 3' - INE-1 99 1 76.24 TCCTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCTAAAGAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGATGAAGAGCTCGTTGTTAATGTCCGCG:1 + chrX 8689189 3' - HMS-Beagle2 6863 1 73.00 TGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTCACATAATTCTTATTTTGCTGATTGGCCTG:1 + chr2L 6555754 3' - Burdock 6176 2 68.32 CTAAGACATGAGCACAAAAATTTTCTTGGGTATTCCTTTGATACTTACATAGTTACCTTCATTATTCATTCCATGATCGGATGTCATCAAATAAGCTGTTC:1 - chr3R 27464993 3' + hobo 2607 1 70.30 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAGAACTT:1 - chr2R 10444223 3' + P-element 2870 1 62.38 ATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAATAGGTTAAATAA:1 - chr2R 3591966 3' - Quasimodo 13 2 66.34 ATATGATGAAGAAGGGAAATGTAAGAAGTATCCTCTTCTTCTTCGTCATCCTCTGGAGCATTGCCGTCCACCGACTCCTGTGGACAGGGTGTTGATCC:1 - chr2L 5917527 3' + invader4 2970 2 75.51 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTT:1 + chr2L 7255825 3' + P-element 2876 1 66.32 ATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACACTTTGATTTATTGACAGG:1 - chr2R 14778406 3' - mdg1 7038 1 80.20 TAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCGAATAACTTGGCTTCAGACTTCAGAATCTTGGCTTCATAAATTTAAATTTGCAATTCAAATCCATTGG:1 - chr3R 22232546 3' - F-element 24 1 48.51 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATG:1 - chr3R 6273520 3' + blood 339 2 65.35 CTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTGGTAACGATAGAAAAAGTAAA:1 + chr3L 13980997 3' - Quasimodo 81 2 79.21 AAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCTTAGAGCTTACTCATTGCCACTAAGTTCCCATACTGCCAACTTGGTACTGGAGTCGGCTTGGGTAATTGC:1 - chr3R 30980320 3' - Burdock 6056 1 78.22 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTGGTGGAGGGGGCTGTGGTGTCTGCGTGTGCGTTGGAAA:1 + chr2R 19696605 3' - jockey 4777 1 62.38 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAATGGTGGTACT:1 + chr3L 12888303 3' - mdg1 19 2 60.40 TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATG:1 - chr3L 4876725 3' + roo 9048 2 54.55 TTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAACCAAATTTGGCCATTGAATGCAACCGGTC:1 - chr3L 7545648 3' - I-element 4944 1 71.29 TATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGTTCACATAATTCTTATTTTGCTGATTGGCCTGAAATAAGTCGCAAGGAATGTAGCAATCGGAG:1 + chr2L 6555785 3' - Burdock 6145 2 64.36 CATTTTGCAAAAGTGTGGTCGTGGAAGTTTTGTTCATGGCGACATGGGTCAACAAATTTGCGCTTGCGGCTGTCTATGCGGAATTCCACACACCTGTAGCT:1 + chr3R 3626797 3' - INE-1 254 1 63.37 AGGCTAGTCAACCAACCAACCAATTTAATAATGACAGCCCAAAGCAATGGTTTCTTTTCAACTAAAAGCGTAATAAAAATATCTTCTT:1 + chr3L 16517244 3' - gypsy6 7654 2 63.64 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATATATAAAAGAAGAATGTCTATTAGGT:1 - chr3R 12589030 3' - Max-element 53 2 77.23 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCGAGTTGGAAAGGCGATTTTATTAAAGCTGCATTTTAAACAAACAAGCAACATTTTAATCT:1 + chr3R 11119894 3' - 297 6 2 73.27 AAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTACTATCAACTAACTAACGCACATTTTGGGAGGGATCGCGGGA:1 + chr2R 12488377 3' - hobo 2483 1 67.68 TAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCCTCTTTGTATTCTCGCACCTTTTTTATTGCAGGGGCTTCGCTTTGTTGCTGCGCTGCGTGATGG:1 + chr2L 8174359 3' + Cr1a 165 1 66.34 AAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATACATATGTATATATCCTGGCTTACAACGCGAATTTGGTGACCGCAAACACGAGAACAGGATG:1 - chr3L 10081917 3' - rover 10 2 67.33 GAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGCCCGCTGCCTCTCAGTCCCA:1 - chr3R 12047384 3' + Stalker2 400 2 75.25 GGGTGGGTGTGGTGCGATTTACTTGAAATTGTACGTACGTGCACCAATTCAGCTTTATTATTGGACTTTATGCCAGTGTGCAGTAAAATAGCAGCGTTGAC:2 - chrX 22906790 3' + transib3 2748 1 37.62 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGC:1 + chr2L 20133066 3' + flea 4987 2 58.42 GTGTCNGAAAATAGAGAATCGCTGGGACAAACGCGGTAAATTTTTCTATTATAGATGGGTTAGGAAGAGGTGACAAAGGGGTAAACACCAGGAGTGGAAAT:1 + chr3R 9167431 3' + Tc1 1593 1 72.28 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTTATTGCCAACTGTTTT:1 + chr2R 5674752 3' + S-element 1707 1 75.25 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCTCTGACTGCCTGTCT:1 + chr3R 27775174 3' + roo 397 1 67.33 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGGTTGTGGAGGCAACAAAGTTTCAATATTAAT:1 - chr3R 27801286 3' - Burdock 6176 2 70.00 ATGTAAAATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGCCTGCGCCCGGTTCGTTGTAAGGATAACTAAATTCGCTCATTATG:1 + chr2L 18572541 3' + Juan 32 1 55.45 TAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCACGCTGAAGTCAAATTCTAAGAATGATTTCTCAATATACCAAACCCATTGCGCAGCAGC:1 + chr2R 2308223 3' + Idefix 210 2 68.32 GTCTGTTAAGTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAAGTTACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACACATATATCGACTTTCGCCAACTTGAGTGTCA:1 + chr3L 12380537 3' + gypsy4 272 1 73.27 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAG:1 + chrX 2799690 3' - Tirant 8144 2 64.29 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTTTCTCCATACATAAATACATATTGCACATCCCCTATTAAACTCCAA:1 + chr3L 25038710 3' - pogo 27 1 57.43 AAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAA:1 + chrY 3648906 3' + 17.6 481 2 67.33 TCATACATTTACACGTCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGGTAAAACGAGAGAGCAAGTGGAAAACTGTCGCTCCA:1 + chr2L 315202 3' + Tirant 361 2 62.38 ATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAAACTGGTATTTTCTTCCTTTACAGCTGGAATCATGTCTGCCACGTGCCGAGCTTCTCGCCGGA:1 + chr3L 3179961 3' - jockey 4821 1 66.34 AGGGGAAATAACGCGATCCCTGATGGCTCTCCACGTCGACGATGACATTGGCCGAGCTCTGCGAGTGACCCATGTGGTAGTGGGCGTGCTTGATGGGCTCC:1 - chr3R 20226667 3' + gypsy8 317 1 80.20 ATGCGAAATAAATCAAAAATAATTTCACAAAAACGCGACGCCAAAGAGCAGGCGGCAACTTTCAACTTGCAACTTCCAGCGAGCTTGGAGAGTTTTCATAA:1 + chr2R 22002820 3' + Fw2 71 1 58.42 AGCCACGTAGCACATAAGAATTCTTTTTAACATGTATGCACACACACATACGTATAAAGGACCTTACACACACATATACACATGTCTGGAAGCCGTCGTCT:1 + chr3L 5259544 3' + Tom1 154 1 63.37 GTGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGACTGTGTGAGAATGAGAAGGAGAGTGGGGGAGGGGGTTGGGGAAAATGACACACATAATTGCAGCATAATA:1 + chr2R 17356186 3' - blood 170 2 75.00 TTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTACATCTACTCTACTTTTCTTTGAAGAACCTACTTTCTTGCGTCGCTGCTTTGGCTTTTTCATGCGACTCGA:1 + chr2L 7256477 3' - P-element 2628 1 73.27 ACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGACAGGTAAACCAAATATTACCACAGTTTATTGTTAAATATTTATTCTATGAATCCC:1 - chr3R 16340770 3' - R1A1-element 5052 1 54.46 ATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCCGTCCTTAAATGTATCTT:1 + chr3R 20147557 3' + 1360 374 1 54.46 TGGTGGGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTCTTTTTGGCCAAGTTTTGGCCTGCGGGAAGCTACGTGACATTCGTAGGCAG:1 - chr2R 16988181 3' - opus 7024 2 58.42 TTAAGGCCGCCCTCGGCCGTCTGTAGTTCAGCTGGTCGCTAATTGTGGCTCACATCTTATAGCACAGTGACTTTCGCTTTCGTCGACGTTCTTATCAACGC:1 - chr2L 20810050 3' - gypsy6 7385 1 72.28 GGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCCCGCGCGCCTACCGACGTTCCACGCCCACTGGGCGAAAGAGCTTAATCAGC:1 - chrX 18404267 3' + F-element 4432 1 58.42 CATAGCGAAGGTATGGATGACGCGTAGATTGGTACGTGATTAAGTCGGCGGGTCAACGAATGCCTCTTCATCCGCCGGAGAGTGGA:1 + chr3R 6111144 3' - Tirant 8061 1 60.47 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCAATTAGCAC:1 - chrX 20806841 3' + opus 494 2 75.25 CTCACTACCTCCTTCCACGCGCGATCTGGTTGACTAACTCCAACTCCTCCGCCTTCAGATTATCCGACGCGCAGCAATCTCCTGGGGCAGCAGTCAGCGGG:1 + chr2R 19517791 3' - gypsy8 398 1 58.42 GTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGTGTTTACAATATCATCGATCAATAACTGTCAACACAGCGGCTC:1 + chr3L 20953269 3' - I-element 5165 1 60.40 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATG:1 - chr2R 8345497 3' + roo 9046 1 53.54 TATAACGGAAACTCAAGCCGGGGTCTAGGCCATTGGCGGAAAGAGAACTGGTCACCAGGTGCACAGGGCCATCGTGCTCCTGATCCGCTGGCCAAACAAT:1 + chrX 22828420 3' - Gypsy12A_LTR 237 1 64.00 TAATATATGTAATAATCGGTACCCAGAGAACAAAAGAGAGAAAACGAAGTAGAAACGGTGCTCGCCAATATCAATAACACTGTCATGGGAGTTTC:1 - chr3L 26132237 3' - 1360 2922 1 66.32 CTTGGNGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACC:1 - chr3L 17918394 3' + 297 348 2 80.20 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAGTCATCAC:2 + chr2L 4743191 3' - I-element 38 1 60.40 ATTATTATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGCGACCTCCTTAATAGCCGATTGCCC:1 - chr3L 18284566 3' - mdg1 7068 2 65.35 TCCAATTAGATTTGTGAAATTTAAAAATGCCTGGCAAAAGATTGATCGAGCACAACTACGAAGGTGTAAAACAACAATAGAAATCGTCGCAGCTA:1 - chrX 7737053 3' + S2 377 1 57.89 CCCGCGACGCAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACACACGAAACCCTGGGCGACACCAGCGATGGAGCCAGCGAAGAAGTGTGACGTCAGCGAATTGG:1 - chr2L 10324082 3' - hobo 159 1 68.32 TAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACA:1 - chrX 21564690 3' + diver 173 2 78.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATC:1 - chr3R 10952257 3' + roo 9052 2 57.43 ATCAGNTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTCGATCAATATTGTTCGTTTTTGTGTTGCA:1 - chrX 13506716 3' + Transpac 4790 1 70.30 ACCAGCGCAAATATATTCTCTCTCTTAAGCGACGGATTTCCCGACAAATAGCCGGTGGGTGGGAGCTCCACTCACCACCAATCAGTGTTTGGCGTTATCAG:1 - chr3L 12606623 3' + G4 44 1 59.41 TAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAGGGGCTTTGTTGGCTGTATTCT:1 - chr3R 5067630 3' + I-element 242 1 78.22 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGAC:1 - chr2R 14778425 3' - mdg1 7057 2 61.39 AGAGTATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCTAGTGGGACAGCTCAAAAAAAATTCAAGATATATGGGCGTGGGAGTTTTGT:1 + chr2L 21924930 3' - INE-1 574 1 57.43 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTACCAGTACCATCTATGAATACTATGGCTCAGACGGAATTATAGTTTTAATGAAATCATTCAAAATGGTACTTC:1 - chrX 1281640 3' + roo 407 1 75.25 TCAGTTTCAGAGATCCTTTAGCAAGAAATTTATGCATTTCCCAAAAAAACTAAAGGTTGATGGACTGACATCTAATTCATCTGTATCTGATTCATCATCAT:1 + chr4 899162 3' + Bari2 678 1 59.41 TGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCAAACATCTCCAAACACCCACCTTCACCCAAAGTGGGCAAATGTGGGTGAAGGTGGGTGTTTGGAGATGT:1 + chrX 10561903 3' + hobo 121 1 44.55 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTTTACAGCTCTAAGAAGCCC:1 - chr3R 20878428 3' - 297 6581 1 71.29 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACG:1 - chr2L 8565475 3' + blood 333 2 73.68 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATGACTGCTCTGTTATATTTTAGAAAATACTTTGAA:1 - chrX 11730276 3' + jockey 4949 1 67.33 AGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTAGGTTTAATTTTTTTAATTAATGTAGGTTTATTTTATAACATGACCTTTTCCTTATTAACA:1 - chr2R 1071062 3' - 1360 3243 1 60.40 CCGCAAATTTAAAACATAGATTAATACTTGTAAGTATGGCGCACATATCTGCGGCCAAGAAATCCGAAAATGTAATTTGCACACAACATAACAATCAAGAA:1 + chrX 5394224 3' + TART-A 13254 1 81.19 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACCGCGTCTCTATGCTAATTACTGATCGGCAGGCCGAAAAACGGTGATAAGAGG:1 - chrX 18248271 3' - jockey 67 1 60.61 TATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTGTACATGACATGTCTGACTTTTGCGTGTGAGTGTGAGAGCACATAAATGAAATTATGACATATTTAAATGG:1 - chr2R 13644405 3' + Burdock 6383 2 71.29 CTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGACTAGAATGGTTTTTAGGCCTTTGAATTTGTGCTTTCGTTCGCTCAGAGGTGTGCCAGAAAAATGCCTTGGAAAACAC:1 - chr3L 6906183 3' - I-element 5115 1 75.25 TCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTCGCCTGATTGCAGTTACTTAATGAAAGTGCATAATTCGACA:1 - chr3L 12883096 3' - I-element 425 1 59.41 CAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACAACTAAGCGCAAAAAATGCTCAACTGCGGTAAATAGCCAGCAACAGCAACAAC:1 - chr3L 10989574 3' + I-element 238 1 64.36 TTAAAATAAATCAAATAAAATACTTAAAAATTAAATGTATTAAAATTGCATGCAAAAACTTCTAAAACAAGAGTACAACCAAATACATTAACTAGTTTGCA:1 - chrX 20540457 3' + G7 1146 1 92.08 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTT:1 - chr3R 19446149 3' - 297 28 2 59.41 CGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATG:1 + chr3R 20119940 3' - S-element 72 1 82.18 AAACCCAATAATAACGATGATCTTTGGGGTCTGGTCAAGGATCCATGATGCGTCCACAATGTCAACCAAAAGACCATTTTTTTGAACTGATTGTTGAGATT:1 - chrX 10357396 3' + Tc1 1208 1 59.41 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAACAATACAATAAAATTAAACCAATTCGGGTTTCTTTGCTCTTAAGCTTTT:1 + chr3R 26254071 3' - jockey 4697 1 50.50 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTT:1 + chr2L 14790649 3' + roo 9040 1 55.45 GCATACACACACACACACACACACACTAGTCGCATACACTGTGAATAATATAGTGCCGCTAGTACTTAATTAACATGTTCCA:1 + chrX 10259663 3' + accord 7025 2 86.59 CCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGGCTCTTGTTCAACAATAAATCTAATTAACA:1 - chr2R 8086925 3' + 1360 3173 1 76.24 AGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAAGCAGTGCAGGAGGAGTGGAAACACAAAAGCCAAGTCGAATGGACATAGGA:1 - chr3R 23273009 3' - roo 212 2 58.42 GCAATCGATTTTAAATTTTTTAATACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACCGGTGAGTTAATGTTTGTTTAATATTTGTC:1 - chr3L 25479027 3' + Cr1a 4261 1 70.30 ACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAGGGTGGGGAGGGGGGGGGGTTGCTCGATGCCGCTTGCTTGGCTTTATT:1 + chrX 2650293 3' + Tirant 8384 2 51.09 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCCAAGAGATTAACAAATGCGTGACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGAT:2 - chrX 21668942 3' + mdg1 7433 2 52.48 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAACAGTATCCGTTTGGTTCACGCATAAACTAACCACAATAAAA:1 - chr3L 15100675 3' + pogo 2065 1 62.38 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATT:1 - chrX 10827431 3' + roo 358 2 78.22 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCAATCGATTGTC:1 + chr3R 11263481 3' - roo 8 2 70.53 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAAT:1 + chr2L 8565509 3' - blood 7060 2 74.26 ACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAGTTCTGTTGAATTCGGT:1 + chr3R 2944443 3' - 1360 57 1 79.21 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCAGGTGTGCTGAACAAGGGATTTTAAGCGGATTTTG:1 - chr3R 10751617 3' - hopper 11 2 66.34 TCATACAGTGGGTATGCATTCTTCCTTGGAGGCAGTGCGTTTTCATGGACGATGTTATTATTATCTGCGATCCTTTTTCTGGTGTCTCTATTGCATCCACC:1 + chr2L 17971020 3' + Copia1_DM 3878 1 56.44 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACAT:2 + chr2R 4483253 3' - Ivk 48 1 68.32 GAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTATGTAGTTATCCTTGTATGCAAAGAATAA:1 + chrX 17294988 3' - roo 9038 1 72.28 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTACAGCAAATTCCTAGGCCTAATTTTCTTGGAATTCG:1 + chr3R 27430079 3' - pogo 37 1 63.37 ATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTCTCGTCTTGTTTCACTTAAATGACACTTTGC:1 - chr3L 12599164 3' + 1360 3170 1 83.17 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACCTCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATTTGTATTTCGTATTTATAGTTGCCATTTGGTATGTATTGAT:1 + chr3L 17344979 3' + mdg1 387 2 55.45 GAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGGTAAAACAGATAAGCTAAGGGGGGTAATGGCCAAGTTACAACGCCAATTAACCATCGAGATACAGTAATAAAT:1 + chr2R 17435465 3' - I-element 4978 1 71.29 TATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGA:1 + chr2R 2044227 3' + Tabor 439 2 79.21 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTCAAACCCACTCTCTCCTCCACC:2 - chr3L 13548817 3' - hobo 55 1 76.24 ATTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTT:1 + chrX 2649911 3' - Tirant 8118 2 70.30 GAGCGCTGCGGCAGAGGCACGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGTAATAAACCAGAGAATTGGCGAACCAGCAGAGGCACACGTTCAAAGTCTTCA:1 + chr3R 16198854 3' + invader4 2847 2 56.44 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGAATCACGGCACATGTGCAACAGCAAAAGCAACAGCAACATTGGA:1 - chrX 16318148 3' - roo 31 2 57.43 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCATACCCATACCCATACCCATAGTCTCAAGTCGCAGTCGGCGTCTCAGTCGGCGTTTCATTTGAGCGCTTTGC:1 - chrX 17830704 3' - P-element 4 2 75.25 TTCTTAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGC:1 + chr2R 9500040 3' - G5 4729 1 58.42 GGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAGCCATCGTAAAGAAGCTATTTCCATTGCGCTATAGTCGCGCCTGGCAGGAAAAGCTGTTGG:1 - chr2L 15769245 3' + I-element 340 1 79.21 ACATCCACATCTGCAATTTTTGTTCGTTTTATTCGACAGCGCCGTAATTATACCCTTTACTCGAAGAGTAAAGAGTTATACTTGATTCGTTGAAAAGTATG:1 - chr2L 22211545 3' - I-element 434 1 75.25 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGTGACCAGAAATCGCGATTAAGTGCAGAACAGAACGA:1 - chr3R 11999237 3' + P-element 2849 1 39.60 ATATTAATAATATTAATATTAATATCAAAAACTCGAAATATGATTGCACACTTTTCGACCAGTGCATCTTTAAGTCGAAA:1 - chr3L 10033430 3' + mdg1 41 2 70.00 AAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATA:1 - chr2L 23295810 3' + micropia 408 2 71.00 TAACTACATCGGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAATCAACATGCTTCGAAAATCCCAATTGAGTGTACAAAATATTGCGATACTTGTATAAGAT:1 + chrX 10672376 3' + mdg1 7443 2 61.62 ACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTCGATTTGCGAACAATCCCTTGTTCTATCATTTCTTTAATTTGTTTGTTAACTTCTTGGTCA:1 + chr2L 6239543 3' - Idefix 429 2 66.34 CTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAGAATTCCCAACAAGCATTTCAAAGTAATGCATTTTAATTCATTAAGCCAGTTAGGTAATTTGCTCTTTAGGTTTTATT:1 - chr3L 16700712 3' - blood 481 1 81.19 AAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTGTGGTCCTTTGTTTTCCTTGTGGGCCTTG:1 - chr2R 18717222 3' + invader1 3794 2 71.29 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGAATCT:1 - chr3R 19446122 3' - 297 6582 2 77.23 TCTAAAAATGGAATTTGCTTGCTTGTGTGCGTAAATTTGTGTTATAAGAGTGCTGATGTGTGCGTGCATGTGCGTCACCTGCAATTAAATAAATCTG:1 - chr3R 21422459 3' - 1360 3266 1 72.16 TTACANAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAATCGACCGGAAAATCTGAATTAGAATGCTTCAAATCAAGTATCATGCGTTTCT:1 - chr2R 19551976 3' + roo 385 2 55.45 TGTACTTATGTACGCAGACGTTGTTAAATTATGCCTCCAAATGGATTGTTGCTTATCTTACTAGTAATACTTTAAAAATTTTCTAAGGGTTTCTTTTATCA:1 + chr3R 8060441 3' + Q-element 567 2 73.27 TCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACAATAAACTGGCCTTAATTATGCAGCATAGATCCTACTTTCAATCGTGTGAAATTAAAGTTAAT:1 + chr2R 24242897 3' - hobo 269 1 49.50 TTGTTTTATTTGATTTATTTATTTGCATTAATTCTTTGTTTTCTATAATTTTATTTATCCTTTACAAAACAGCATTGTTTCGTACATTTAAAGCTTCGTTA:1 + chrX 15185648 3' - X-element 4717 1 62.38 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGT:1 - chrX 13546652 3' - roo 8712 2 78.22 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGGTAGCGTTTTGTATTTGATTTTCACTTTCTATTTGCGGTCGGTTTACCATTTGCATT:1 + chr2R 19943992 3' - 412 7074 2 59.41 CAATGATTGTTGAGTGTATGTGTGCCTGCCTGATTGTGTTTGTATGCCGGTTGTGTGTGTGTGAGTGAATTGGGGGTAAATGCAAGTCTAATGGCTGCAAG:1 - chr3R 24495853 3' + 1360 453 1 49.50 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCCTTGAAATCATAGCCACTCTGGCTC:1 - chr3R 13538946 3' - hobo 50 1 76.24 AATGCACACACACACACACACACCCACACAGACACAGAGACAGATACAAATACGGAGACACACACAAGGACAGGGACTTGTGTTTGTTTGCATTCGTATTT:1 + chrX 20547311 3' + accord 180 2 55.45 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACATTTT:1 - chr2L 6999266 3' - Ivk 42 1 64.36 AAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCAGCCAAGTTTACGATGTGCTTCTGTGTTGGCCT:1 + chr2L 17204510 3' + jockey 4814 1 68.32 CTGCGCCGGCAGAGAGGCCGTCGGCAGAGACGTTGCTTTGCCTTACGAACCATAATAATAAAACAAACGATTTAGGGGATGAGAAAGAGAAGATTGAAGCG:1 + chr3L 13972033 3' - Tabor 286 2 65.35 GAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGAGAACTGCTGACCATGCAATTATGTACGTTAGCCCTCAAGTGGGTGCTCGTATTACGTATAC:1 - chr2R 4794625 3' - blood 154 2 65.35 GTCTGCAGAAGTGGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAAATGACGGATTAAAGCTAACGACTGCTCATCAGGAAGGGAAATACATATCA:1 + chrX 8979345 3' - Doc2-element 371 1 53.47 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGC:1 - chr2R 9870962 3' + roo 397 1 67.33 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACCATATAAGGCATATGATTGTGTTGAGTACATAGTAGAAATATAGTACATCAT:1 - chr3R 16457991 3' + roo 9047 1 55.45 CAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAGTGTGGAGAAGAAAAAATCC:1 - chr2L 8627483 3' + R2-element 3585 4 69.05 TAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAA:1 + chr3R 10751698 3' - hopper 33 1 60.22 TGGATGGGTGGCGAAGGATATGTGGGTGTTAATATGTCTGTGGTTCAACCGGTGGATCCGGTGGCCAAGATCCTGGGCTATCGCGGTTCGATCATGATCTT:1 + chrX 6755067 3' - transib4 2420 1 60.40 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTTACATATTTCGCTCCTCTTTTAT:1 + chr3R 28645874 3' - F-element 14 1 71.29 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCAAATCTTATGGTCAATATTTTG:1 - chr3R 31257000 3' + transib2 2774 1 78.22 GTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATTTTTTGTCTTTGCATGTTCCGTTTGTTTTAGCAGCATGTGGAATTTGGTTCATAAAATTAATTTATTTGATAA:1 + chr3R 6458869 3' + S-element 1714 2 56.44 AACACNTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCGCTCCTGCTGCTTAACGAAATATGCAAATTGCCTAAAAGTATGCCACAGACAATG:1 - chrX 16995096 3' - jockey 22 1 60.64 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTT:1 - chr3L 10477563 3' + copia 204 2 75.25 CAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGATACGGACAAGAGTTAAGAGAAAGCGGGAAGAATAAGCTGTGAGAGAC:1 + chr3L 23184718 3' - 1360 3371 1 52.48 GATCGAGTCGGGTATTGATCCTGATCGGGAATATACAGTTGCGTTAATTAAGTGACTGTCAGGCTGGCGCCGTGGAATTAAAATG:1 + chr2R 21229310 3' - INE-1 96 1 52.94 AAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATAGGACATTAATACTGGAAAACTTTTAGATTGAAGCTTCG:1 - chr3R 28267305 3' + 1360 383 1 63.37 ATTAANGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCA:1 + chr3L 18337723 3' - Juan 4041 1 62.38 TGTCAGAAATTGTCAGAAAATAAGTTATACTCGAATACGAAACACAGGGCGAGGACGCACATAAAATACTGGACTCCTGGCAGCAGTCCAAGAGCAAGAAA:1 + chr2R 12558815 3' - transib2 419 1 57.43 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATTATGGCACTTTTTGAGGTCGGTATCAGTAGTCAAGCGTAATA:1 - chr2R 6173000 3' - pogo 32 1 59.41 ATTAAATTTTTTGGAGGGAAAACTAAGCCATCTGTCTATGTAATTGTGCAGGCATTATTTCAGCCATTGTATTTTAGCGTAGTGCGGGTGCAATTTTAACA:1 + chr3R 25565668 3' - G2 3012 1 83.17 TTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTTTCCTCCATTTTACAGAGATTTCTTGCCG:1 + chrX 15894684 3' + S-element 1704 1 58.33 TTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACGTGGCGTATACGTAATTTCGTCGCGTCTGCTGTT:1 - chr2R 14556513 3' + accord 7219 2 64.58 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATCGCTGGCAGTGACTGTGAAATGAGGA:1 + chr2L 2060197 3' + 412 7516 2 49.50 CTTATATTTAATTAATTAAGCTGATAAAAATAGATAAAAATATATACCAGAAGTTGGGTTTTAGTTCGGTTCAGTTTTTTAATTACTTATTTTATTGCACT:1 - chr2L 12574696 3' + springer 7525 1 61.39 ACTTCTCTGTTCCAAGTAGATTCACTATAAACAACGAAGGAATACTAAAAATAGCAAATATATTTATAAACCAAAATATATATGTCCGATTAGATGAGCAA:1 + chr2R 4821045 3' + Cr1a 4101 1 77.23 AAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAGCACGTTTTATGCAGCAAAGTAATGAAACAACAGCAAGAGCATCTACGCGA:1 + chr2R 9367190 3' - S-element 405 1 64.36 TTATTATATTTTATTTTATTTTTTACATGGCGTTTAAATTGCGTCATTAAAAATTCCCATTATTCAACCCAATTTCCGTGTCATTTAATCCGCGACAAGCT:1 + chr3R 25857986 3' + transib1 1898 1 79.21 GCCATGGATATTTGTCAACAATAATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCAGCTGTTAAAGTGACAATGACATATGAACAAAATTTGTCAAGACAAATAATGAA:1 - chr3L 17878722 3' + hopper2 399 1 47.52 CGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATAAATAACTGGCACAAACAATATTTTATGGCGGGAAA:1 + chr3L 13306280 3' + 1360 3177 1 61.11 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGATATATCACTGCGAATTTTACGTAACGAGTGCAGTTCCAATCTTACTGGATTTCCC:1 + chr3R 24081625 3' - 297 18 2 61.39 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTT:1 + chrX 20886051 3' + Ivk 5361 1 49.50 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCGTGTGTGCGTGCAAGTGAAAGTGTTTAGCAGGCCCTTTGGAAAATTATAGAAAAGTGTGTG:1 + chrX 7604046 3' - Tabor 27 2 72.28 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGGAGCCCGAAGCCCCTCGATTGAATGATGTTTTCTGGGCTCCCCCAAAA:1 + chr2L 12815136 3' + hopper 1413 2 70.41 ACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGAGTGGTCCGTTCTGCTGTTTGCAC:1 + chr3R 27801356 3' + Burdock 6368 2 56.44 TTTTTTCTCTTTTTTTTTTAGCCAGCTACAAAGGCTGAAGGGAGTGAAAAAAAGTGTGGTAGTGGCATATAACTTTGTTTTAAT:1 + chr2R 21759002 3' - G-element 4325 1 90.48 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTG:1 + chr2L 15510458 3' + jockey 4960 1 59.18 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGCTAATAGTTAAAGG:1 + chr2R 24628837 3' - mdg1 22 2 55.00 AAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTACCTG:2 + chr3R 8975994 3' + Bari1 1657 1 75.25 GGAAGNAACAATAGAGGGAAAAGAAACACAAAGGACCGCAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTT:1 + chr2L 18279945 3' + gypsy5 7296 2 73.27 AACGCGTAAGGTCTTCTTATTTTGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCG:1 + chr3L 16761306 3' + roo 397 1 47.62 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAGTCATCACACAAAAAAA:1 + chr2L 4743200 3' - I-element 26 1 50.00 GAGAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCTGCCTCCTTCCAAATCGTACGGTTTCGAGTAATTTGGCTGAAAACC:1 - chr3R 12805652 3' - roo 8980 2 57.43 TAGGGGTGAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTCGACAAATTTTATTCCACCATTGATGCAGTGCGTTCCAAGAATTTGCGGGGCTATAAACAATA:1 - chr3R 11707394 3' - Ivk 5284 1 59.41 TGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGC:1 + chr2R 23584795 3' - HMS-Beagle 48 2 74.26 GCGCCCCACTAAGGAAACCCACAACAACACACACGAACACACAGATTATGTAAGTGAGCGCTGGAAATTTGATTTCGACTGCAGCAGCAGGACGAAGGATG:1 - chr3L 15284356 3' + gypsy3 400 1 60.40 CTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTTCGGTGTGAGTGATTTGGGACGACAGACAGGACGACGAAGGAGCTGCACACATCCCTTGCTGCTTTGA:1 + chr3L 6547803 3' - F-element 310 1 73.27 CTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGTTGTTGTTTTTGTTGATGATGTCCTTGTTGCAGTCGTAAAAAGTGCTTCACATGTGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGAGT:1 + chr2R 6544444 3' - I-element 5101 1 72.00 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAA:1 - chr3L 10477536 3' + copia 231 1 55.45 GCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTCGATACTCTATTTCTGACCAAACCCTTTTTG:1 + chr3R 31194527 3' - Transpac 4960 2 69.31 ACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTTCTTAATTAATATTATTTAGTGTATTTATATTCGATTATATATTTTAGAAAGAGTTT:1 - chr3L 26695694 3' - gypsy7 379 1 63.53 TGTTGCAAACACAAATAAACATAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACATAGAAATCATTCAAATAAAACGACACATTCATCAAAA:1 + chr2R 17184693 3' + Stalker2 7320 2 60.40 GTCTAGAGGGCTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGCCGAGTCGGAGGGCTTCCAGATCACCGAGTTGCCCATCAA:1 - chr3R 21879516 3' - I-element 5093 1 55.32 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCCTCTCACCAAGTTTATGTAGTTGGGGTATCA:1 - chr3R 10751651 3' - hopper 45 1 67.33 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAAAAGCACAATTAATCTGTCCTGT:1 + chr3R 26530905 3' - blood 7067 2 78.22 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTA:2 + chr3L 9766424 3' + blood 358 2 60.40 ACAGGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATCCTAGCTAATCCCATCTCCCATCGAAGTGCAATGAAAACGATTTTAATTGTCAGCATTTTAAGCGC:1 - chr2R 13751683 3' + G5 4574 1 59.41 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAGCGGCCCACAACAGTAGGCAACAATTTCTGTTACGCCTGTA:1 - chr2L 17210253 3' + jockey 4986 1 70.30 TAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATATCATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCTTCTAGGCAGCGAACGGCAGCGGCA:1 + chr3R 14285154 3' + accord 7264 2 75.25 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATCCGTTACTAGCGTTTCTAATATCAAC:1 - chrX 19426251 3' - mdg3 5304 2 77.23 TCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACAT:1 - chr2R 4547779 3' + HMS-Beagle 6992 2 78.22 TGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAACTAGACAACTAAGAAATAAAATCAAGTATTT:1 + chr3L 14397027 3' + BS 5047 1 69.31 TGAAATAAAATTTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATATAATTATATATATATATTTTCCTGATGTTTATCTTCCGAAATTTGTAACAAAAAC:1 - chrX 23182836 3' + Idefix 7361 2 64.36 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATCGTTCTGCATTCGTTCTTTTT:1 + chr2L 7255826 3' + P-element 2871 1 63.37 AAAAGACCGCCTCTCCTACACCGCTCCCCACACAGCAACAGCGACAACAACAACGACGGCTACTGTGACTGACTTTTACGAGTACCGAGTAGTAAAATAAA:1 - chr2L 18797765 3' + Doc 430 1 68.32 CAAATGCCGTCTTTAATTGCAATTTTAAAGCTTTAATGGTATCCGAGCTAGGGGAGCTCCACTAAATTGATGTAGGAAATATTGTGATTTTAAAGTTTACT:1 + chr2L 1620290 3' + hobo 2536 1 69.31 CCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAACTAA:1 - chr3R 19989261 3' + hobo 2907 1 59.79 AGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACATTATATCAAATTTATTGGCTTTTCTTTCTTTTTGTAGAGTTATTTCCGTTTTAGGTATT:1 - chr4 190582 3' + INE-1 172 1 62.38 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAA:1 + chrX 20620590 3' + pogo 2053 1 78.22 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGATCTATATTCCA:1 + chr2R 17261659 3' + pogo 2078 1 55.45 CAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACA:1 - chr3R 20137274 3' - Burdock 41 2 68.32 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGTTATTCTGATTCTTAAACGTAC:1 + chr2R 9871030 3' - roo 53 2 78.22 GTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACATACCCATATATCCATATACCCATACATTTGTATGTATGTATAACCGTGCCATGTCGTGAACTCGCCCC:1 - chrX 12819231 3' + roo 8596 1 74.26 ATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATT:1 + chrX 2649895 3' - Tirant 8134 2 54.46 AATTAAATTAATTAAAAATAATTAAAAAATAAACTTTCGAAAACGTACAATACAATTATGGCGAAAGGCTTCATTTTCTGGCAAAACCAATAATTATTATA:1 + chr2L 15935405 3' - HeT-A 379 1 53.47 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTATTAGATCTTGACG:1 - chr2L 7488830 3' - roo 5 2 70.30 ATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCACATTTCCAGACATTTGATAATTTAAATGTAAGCCAGACGTTCG:1 + chr3L 18706967 3' + jockey 4987 1 75.25 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGG:1 - chr2R 14778450 3' - mdg1 44 2 67.33 TTTTTACTTCACTTTTTTTTTTGATTTCATTTTT:1 + chr2R 17682451 3' + Tc1-2 1390 1 61.76 TTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTGAGCCAACGCAAATGCAAATTTATATGCTCTGAGCCATTCAATATGCATGAATTATTTTTATTATTA:1 - chr2L 15807956 3' + I-element 5348 1 71.29 ACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAAATTGCAAGCAGTTCAAATACTGGGATTACAACTAAGGCGGGAATACGGGTTTTGTTACCAGC:1 + chr3R 4970628 3' + diver 208 1 62.38 GAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATTATTGCCCTGGCTGCCTGTTGACCAGCAGGCAAACGCTGTATGCAAACAAGAAGT:1 - chr2L 1623138 3' - hobo 2638 1 58.42 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGTCTATAGAAGTGACTACTGGAGAGCCTCTCCACTGTC:2 - chr2R 10945331 3' + transib2 2786 1 61.39 GACGGNTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATT:1 + chr3L 9766399 3' + blood 333 2 76.24 AAAATAAAATTAAATAAATTAAACCATTTGCAAATGCAGAAATATATACACAAATACCAAATATAGCTACGTGTCATTAAAGAAGTTACCTCACTGATTGT:1 + chr2L 9735422 3' + NOF 3960 1 67.33 CTCTACTGAGTGTCTCATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAACGTATATAAATGTATATAAATGTTAATAAATTT:1 + chr3R 16399201 3' - blood 251 2 74.26 TCATGCTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCA:1 + chr3R 22800176 3' - flea 45 2 75.00 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAGTTTTCTCTTTATGTGGTCGCAAACAGATACAAAAGGTTCTT:1 + chr2L 19525485 3' - FB 35 1 59.41 CTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCGTGTTGCTGCTGTTGCGACGTCTGTTGCTGCGGCGCCTGCTGCATAAATGATGCGTCTGGCACCCACA:1 - chr3R 29105651 3' - gypsy4 21 2 74.26 TATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTTCAA:1 + chrX 20886056 3' + Ivk 5366 1 54.46 CAAAAGTGTGTAAACTTGAAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTGATATATTGAATTTGTTTTTTATTTCATTACGATTATTATTGAGAAATTTCTTT:1 - chrX 3471068 3' + S-element 1528 1 69.31 ACATAGATTTGACTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGACAACTGCAAAAGCAGTCAGATGCATCACATGTTTTCGAGCCAAGCCACAC:1 + chrY 3614256 3' - 1360 337 1 57.43 TTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTCGAAAGAACTTCACCATTCATCATAAAAAAATCGGTGTTAATTTAGTTGAAAAGGTCCAGAAAACGAGATCTA:1 - chr3R 8836544 3' + I-element 263 1 64.36 GTAATGATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGGTGGTTTGGGATTCACTAATCGCCGAT:1 + chr3L 16106767 3' - Juan 388 1 79.21 AAGTTTTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTG:1 + chr2R 17937185 3' + Quasimodo 7328 2 70.30 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGGGAATCACGATAAAGAGTACTGAAGACAAGAGTTTTG:1 - chr2R 14351862 3' - Max-element 40 2 63.37 TCATTGTATTTTACTTTCTTCTCTGCTATTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGGAAAATCAGTCTGTGCCGCAAGATATTCAAGATTTTAGGACATTTTTT:1 + chrX 11965230 3' - Doc3-element 4490 1 57.43 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTGGTCCAAGTGGCTGTTGGCCATCCTTTCGATGGTGCACCAT:1 - chr2L 22084460 3' + copia 240 1 61.39 GAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAGTGTCTTAAGTCAATAAAAAATAACGTCTAGCTCAAATGCATAAAAT:2 + chr2L 22079677 3' + gtwin 476 1 80.20 TCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAAACTATTTCAAGCCGCAGATGTTAAACATTTTCTTAAAAACTTACAGTTACTAGAGTAGATTCGTGTTGGCCCAGGAG:1 - chr2L 5795373 3' + McClintock 6418 2 73.27 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTAT:1 - 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chr3L 10081925 3' - rover 17 2 60.00 GGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAACGCTGGTAAGTAAGTAATGGCTAGAGCGTTAATTAGTCAGAACGCTTATAACAAATATTAAGTTAATAA:1 + chr3R 16608793 3' - jockey 4745 1 70.30 TTTTTCTGGGATATCGATAGATAGAGTTTTTCCGGTTAGTGTGCTCTATGACGGCTGAGGCGTCCGATGCGAAAAAGTACTCAACTTCCTTCTCTTCCAAG:1 - chr3R 4135297 3' - INE-1 500 1 69.31 TTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAATTAAAAGATTTT:1 - chr2R 16213965 3' - P-element 2642 1 29.87 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAAAACTTCTATAACTTTCAGATAACCAA:1 - chr3L 2019630 3' - 412 6 2 71.29 CACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTATATATAACATTATTAGTTCCTGATATTTG:1 + chr3R 12589060 3' + Max-element 234 2 70.30 CATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCAACAGCACACACACACACATACACACAGGATCAGGTGAATACCTCAGGCGCTGGCATAAATACATGCACTCGG:1 - chr2R 16476025 3' + 1360 2962 1 78.00 CACTGCACTTGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGAAACTGTTGTGGTTGCATAATGTAGGTCGCAGTGTGTTCAAGTTGGCCGGGAGTGAGCCGGGCAG:1 - chr2L 14922905 3' - 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Osvaldo 1191 1 63.37 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTG:1 + chr3R 5686094 3' - P-element 55 1 24.75 TTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATAAGTTTCCTTTACATTTTCCTCAGTGTATT:1 + chr2L 4158808 3' + Tirant 8416 2 71.29 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCAATGATTTCGAGGACCCAGATACTCGTAAAAAACTGCGCAAG:1 + chrX 868792 3' - jockey 4759 1 79.21 TTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACAAGCACTAATTAGAGAGCACTCGGCGAGGACAAAAAGTGT:1 + chrX 6401467 3' - S2 1620 2 59.41 AAAAAAAACAAAAATGTTAAATAAATGAGGCAAAATGAAACGAAAGCGAAAAAATAAATGTAAAAAGAGTGAGAAATCAACGTGGACAGAAAAAATATAAA:1 + chr3R 23302421 3' - accord2 345 1 79.21 TCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGTTCAAAGGCTATGTTCATATTATTTTTGTGAAACCTTG:1 - chr3L 13060291 3' + 412 491 2 77.23 AATAAGAAAAAATAAGAAAAAAGTGTAAAATTTGTGTTAAAATTAATGCACGACCGGTAGAGAAGGCTGCGCCTTCGGTGGGGGAGTTGTCTTTGAGTTG:1 + chr3L 13204191 3' + gypsy7 5001 1 76.00 CAACCGATTGCGATTTAATGTATTTATATTTATTTATAAATGGGATAAGTACATTAATTAAAGCATGCAAATTAACACCAATGTCACATCGTCGTGCAGAA:1 + chr2L 23052962 3' - diver2 462 1 77.23 CTAAATTTGAAGGTTTTTTTTTTTGTTTTACCAATTATTTTTAAAATATTTATTAGATCTGTTACTAATTTTTTTTTTCACTTGCATTAACAATTTACAAA:1 + chrX 5012150 3' + Tc1 1463 1 73.27 CTCCGTCTTGAGGGGGGGGGGGATAGTTAACCAAAGCCCCCTGGGGCTGCGCCTCTGGACGAACAGCTGG:1 - chrX 9909513 3' + gypsy2 6461 1 58.57 TAATATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCATATTCACAGATTCATTTAAAGGAATGTAATCTCCACAATTTTCAAATGAAATTTAGTTTTTAGTTAGAAATAT:1 + chr2R 21710108 3' + Tc3 313 1 75.25 ATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACTACGCGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCTTAATAGCAATGGCAATCGTCCTGGCATCAG:1 - chrX 12839069 3' - micropia 120 1 75.25 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAACCCATCGCTGC:2 - chrX 15293430 3' - Quasimodo 31 2 51.49 CCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTAATCAAGGACACTGAACATGAAACTGAGGCACACATTGTTCGCTACTTAGACGGAAGTCATTGATGG:1 + chr2R 17094528 3' - F-element 4211 1 74.26 TGAATGTGGGTGTGTGTGTGTGTGGATGGTTTTCCTATGGGAAGAAGGGGGTGGTGGTTGGCTTCTTTATCGCCGCCCGTTCGCGACGGAAGCTTTCAATT:1 + chrX 13057875 3' - accord 7032 2 35.64 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAATGTGCGCCCAACTGGG:1 - chr3R 15598663 3' - Max-element 35 2 60.40 TTACCTTAAAGCATTGTAGATCTAACTATGAGTTACATGACCGTTACAGAGTAGTTTTCATAGCGGTTCGGCGATGAGTGAATAGACAAGGATAAATGGCC:1 - chr2R 4877788 3' + Cr1a 4143 1 52.48 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACACAGAATGTGTGCGTTTCGCTTGGCTATTAAATTTCCA:1 + chrX 992080 3' + hobo 2901 1 65.35 GGACCGCCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGGTCGAACAAACGCGGCTCATTCATAGCCAAAAGTGGTAGTGGTAG:1 + chrX 18837048 3' + P-element 2882 2 77.23 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCC:1 + chr3R 13376021 3' + 1360 3343 1 74.26 TAGGTGCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCCGGATAAAAACCCTCGAAAGATATAAGCAACCATCGTCGTCGTTGTGCGTGATTTGATGCC:1 + chr2L 750700 3' - gypsy 444 2 61.39 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAACAAATTAAGAGAAAAAAAATTGTTGCTAGATGAA:1 + chr3L 5537637 3' + jockey 4950 1 76.24 TATTTAACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATCCTGTCTGCTTGGGGGCTAATTAATTGTCCGCTTAATCGTTCGATTTGCTGACCGA:1 - chr2L 8298941 3' + S-element 1701 1 56.44 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACTCCCACTACATCCTTAACCATATTGATATTTGCTCTTCAAGTTGCCACTTT:1 - chr3L 13659880 3' - pogo 17 1 58.33 GTAGCNAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTACGAATATTATGGGCTATTATCA:1 + chr2R 24479920 3' + I-element 5303 1 74.26 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCACATAAAACCCATCGCTGCTATCGAAT:1 - chrX 15293422 3' - Quasimodo 23 2 59.41 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACGCTATGGCATTGTTGAGATCCAAAAGTCGACCTTCTCTGTGCAAATCCACGGGTTCATCACTCCCCTGCC:1 + chr2L 19481374 3' + roo 402 1 72.28 AATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTGAGTAACAACCATGGTTCTGAAGAGACTATCATTAAAATAACATATTCGAAGCG:1 - chr3R 16241790 3' - 1360 3166 1 57.43 TTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAAATAATAAACAAATAGGTTAAATAAAAATACTCAA:3 - chr2R 3591956 3' - Quasimodo 3 2 76.24 GAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCAAAACCAATGTATGGCCGTGATTCGTTAACCTCACAGTTCTGTTAAAATTTCCCCTGTTC:1 + chr2R 8407915 3' + 1360 3183 1 59.41 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTGTATGGATCAAT:1 - chr2R 16980494 3' + copia 5086 2 68.32 ATATGTAGTTATATATATTAGTACTCAATAGTGTATGGGCATGCAGCTGTTTGGCAAGAACTACACAGGTACTTTAGGAGAACCAGAAATCCAGAGCCTCC:1 - chrX 16488954 3' + 1731 4413 1 64.36 ATATATTAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATAGTCTCCTTAATCTAACCAAAAACAAATTTTGCGTCGTATTTG:1 + chr3L 9445425 3' + hopper 1118 1 66.34 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTTCGTATGCGTTCGGCTCACAGACACGAAGCGCCGCTTAACAGTGCTCAGCTCTGTTAGCGAACGCCGAGG:1 - chr3R 8477677 3' - P-element 5 2 71.29 ACAAGCATATACATGTATGTATGCATGTATGTATGTATGTATGTACTATATGCTGCAAAACTTCTATATCATTATGCATTTTTGCTATACTTATTGTGATC:1 + chr2L 18160617 3' - INE-1 72 1 72.28 TATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGAATTCAGCGAATTATACTGTACTTTAAAAAACATGGGAGATAGATGTATTTTAGCTACTCGA:1 + chr2L 20824990 3' + pogo 4 1 43.56 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCCGTGGGCCG:1 + chr2L 20706752 3' - mdg1 7046 2 71.29 TTAGTCTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGTTTTTGCATATTTTTATCATTTTCTTAAACTTCTTCTTCTCGGCCA:1 - 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chrX 13546609 3' - roo 8669 2 73.27 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATAAAAGCGGATACAATCAATATGCAGATATATCTGTGTTTTAAGCAGTTTAGCTAG:1 + chrX 10827494 3' - roo 20 2 59.41 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTAGGGTACAAAGGAAACGGAAACTGCAGAGAAAAACTGGGCTAT:2 + chr3L 13659962 3' + pogo 2069 1 64.36 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACATGAATTTCTAATGGGTTATGAGAAAATATTATAAACTTTTAAAGAA:1 - chr3L 2019656 3' - 412 32 2 57.43 GTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTTACTTACTAACAACTTAAATTGGTTAATCTCTTGTTACATTTTTTTTT:1 - chr2L 6999261 3' - Ivk 11 1 54.67 TTAACCGTTTGGTTATTGGTTTTCACCTATCGTATTTCTGTCTAGAGT:1 - chr3R 479560 3' + Circe 63 2 81.25 TGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTAGACACGGAAGAAAAGATATCCATAACCCCTCTGGACACAGGACAGGAAATACATAAC:1 - chrX 22077188 3' + gtwin 454 2 58.42 CAGAACATCGCCTAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCATATGTTAAAATACGATGAGTGTCTTCAGTTGCATGAAGTACGCTGGACTAGCAAA:1 + chrX 19034975 3' + jockey 4634 1 58.42 TAAGTACGATTGCAGCGGCCTACTGCCGAAGGCGGTCATAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCACTGTGGGCCCAGTGATCATATCAAAAACA:1 - chr2R 4738906 3' + rooA 7341 2 72.28 TTAGACGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCACGCCTTCATTTCCCCGCCCCAT:1 - chr2L 4160109 3' - Tirant 18 2 63.37 TTTCATAAACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAGCCATTT:2 + chrX 13798930 3' - 412 7131 2 61.39 AGAGGNGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCAGAGAGTGCTACAGCGACATTAACACTAGCTGTTGCAATGCTTCGTTAGTTTA:1 + chr4 56320 3' + 1360 73 1 63.37 GAGAAGGATATGTGAAGGGTCCTGATTGCTCCTTGACACAGACGACGAGTCGACCCGGCCTGGGGCGAGGCAACGCTCGTCCTGGGACCACCTGTACTGTC:1 - chr2R 4876875 3' + gypsy8 4485 1 81.19 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCGTCCTTCTCGATGA:1 + chr3R 10147899 3' + roo 9042 1 55.45 TTAAGCATAGTTTTAAGATAATAATAAGTGTGGAGTTCATCTTGGTTTGCGGGTTGTGTCTAACGGGGGCTCGGCCGCTGGCTCCTCCAACGCGAACGCGA:1 - chrX 2601159 3' + Transib5 441 1 40.59 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACGTACTTTTGCGCGAAAAGGAAACTGCAAGTCAGAGAAATATTGGCTTTTAAAAATGTCAAT:1 + chr3R 8555942 3' - 412 17 2 61.39 ACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGTATGCCAGTAATTCGAGCTGTCAGTTTGGCGGGGCGCTTATGCTG:1 + chr3R 22431079 3' - Max-element 469 1 65.79 CAGGAGCGCAGAATGCGCGCCAAGCTCATCTGCACTAATTTACACTCTTTCCAACTCATGTATCAAATTATGCTGCACCTGTTCTTTAAGTTCTGAACTGT:1 + chr3L 25484533 3' + Porto1 399 1 65.35 ACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGGCCAGTTGATGCTACGATATT:1 + chr3R 23677145 3' - Bari1 54 1 78.22 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTGATCACCCAAAAACTATGGAAAATGGGTGG:1 + chr2L 18234130 3' - jockey 56 1 73.27 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAAGTGTGCGTGGGCGTCTCTGTTGTTGTTGTGGTTTTCCCACACGGCACAACAAAGCAACATAAACA:1 + chrX 6657372 3' + P-element 2879 2 71.29 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTG:1 - chr2L 21683422 3' + pogo 2048 1 80.20 CCCCCCGCGACCCACCAAGCTGACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAAGCAGCTACTCAAGCGATAGCAGCAACAACAACGACA:1 - chr3R 8165796 3' + G-element 336 1 83.17 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAATAATACTTTTCATAAC:1 + chr3R 29259642 3' + pogo 2068 1 58.42 AAACAGAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCTGTAAGATTCACTTTTTATATTCAGTTGATTTTTATTATTATTTATTAGCTATTCCAC:1 + chrX 11981124 3' + Gypsy6A_LTR 102 1 74.26 ATTATAATAAAATAAAATAATTTTAAAAAGTTAGCTGTCGGCTTTGAAGGTAAAGTTAATATAGAACCTAATAAGCTAAAAAAGTAATTCTGCGAGCTCTG:1 - chrX 17154717 3' - 1360 3100 1 76.24 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAATTAA:1 + chr2R 24628834 3' - mdg1 26 2 51.49 AGCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACTACTTTATTTACGTAAGTAAAGTGTCTAAATTGAAGCTATTCCTACT:1 + chr3R 3121104 3' + blood 173 2 51.49 ACATATATACATATATACATATATACATATATAAATATATACATATATAAATAGAAACGCATATATAACACCCGGGGAGTGTGCTCAGTTCGTTGTTTATT:1 - chrX 3287114 3' - G3 4507 2 72.28 CGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTACAACGTTCGTCTTGTTGTTGTCGGCTATGTGCCACATGCATAGTGCTTTTGGAGTCATCATCTCGCC:1 + chr4 601393 3' + INE-1 555 1 64.95 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACACATACTTGGTGTGAGTGTGTGCCTGTGTGTTTTGGGTT:1 + chr2R 13644493 3' - Burdock 6174 2 66.34 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGA:1 + chr3R 7168624 3' + flea 211 2 77.23 CCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATTAAAACAATATAGAATTTTAATAATACAACACAAAAATTTACAAAACAAAAAAAACAAACAA:1 - chr3R 24905577 3' - 297 354 2 72.28 ATAATAATAATAATAATAATAATACTAGTAATAATAATAATAATAATAATAAATAAAACGGATTAGTTCGGCCTTTTCTTACAATCATCCATGAAAAATGC:1 + chr3R 12638463 3' + mdg1 7067 8 64.36 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTT:1 - chr3R 27156634 3' - pogo 10 1 64.37 TGGAAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAATTACAATTAGGGGATGGGAAAAACAGCAGGGTACATTTTGAGGTAATTGTTAAAAGTTGGTGAGAA:1 - chr2L 18896051 3' - Max-element 412 1 68.32 CCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGTTAACACAGCTTAAAGGGGGCAGTAACTGAATTTTTGG:1 + chr2L 672911 3' + Quasimodo 293 2 76.24 ACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTAATTTAATTTTTAGGACGTTATAACATATAATAATATATCAAGATGTGAG:1 - chr4 269669 3' + roo 9039 1 61.39 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGGGTGAAACCAACCAATGTTGCCATTCACAGTAAACGTGC:1 - chr2L 8308189 3' - P-element 36 1 34.65 TTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTTGCAATTGCCGTTTGCTGGCTTTGCCCGTTCTAGTTGCTATTGCTGATTGCCATTGTCTGCCGAAAAAGCA:1 + chr3L 10385828 3' - I-element 395 1 73.27 GGTGTGAAATGAGAATGATAATGAATTCTTTATTACAAATATGCACAATGAATATTTATCGAGTTAGTTCTTTGTTGTTGGCGCACACACTTTTCTTTCGT:1 + chr3L 18398339 3' + accord2 64 2 57.43 TCTTTGGCTCGTGATCAGGCCACTTCTGATAAAGTAGGGGGACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' - invader2 277 1 89.09 GATTGGTCGGGGGTTCATTATGGTGGGCAACTAAAATTACAATTTTCTACGCTTCGAGTTCATCTTGACGAATGAGGCAAGACACTTGACACCTGCTGCAC:1 + chr3R 14599305 3' - G-element 4212 1 66.34 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACGTATTCACATGCATTGTAAATTTGACAAAATATG:1 + chr3R 4571525 3' + P-element 2878 2 70.30 ATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTACCTGCCCCTCA:1 + chr3R 8976001 3' + Bari1 1664 1 68.32 TGTGCTAGATGTCGACTGAAAGTGACTAGGAACAAATTTTTATAAAACAAAATTGAGTGTCACACTTTGTTTGCAGGATGATAAACACTTG:1 + chr3R 19426887 3' + Tirant 496 1 54.95 TATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAGC:1 + chr3R 20147577 3' + 1360 394 1 75.25 TAGAGATTATACTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGGAGGGAAATAGGGTCGACAGAAGTGGGGGCAGGTTGACTAA:1 - chr2R 2949290 3' - G5A 2715 1 78.22 CGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAAGTTGTAACTTCAATACTATGCGCTATAAATATTTTATTGA:1 - chr3R 24659350 3' + F-element 53 1 60.40 ATATGGACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACAC:1 - 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chr3R 4834205 3' + mdg1 478 1 55.45 TATATGTATATATATATATTATACAGATATACAACTAGTTATATATCCCATATGTATATTTAAACGAAAAGCTAAGCAATGTTAAGATCCTATGTAAAAGG:1 + chr2R 13845504 3' + 1731 4412 2 55.45 CAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAAAAAACAATTTTATAGCCAACAAAAACACGCAAATAAAGGCTTATAAGAGTATTAGTACTGGTCAGC:1 - chr2L 11206811 3' + I-element 84 1 71.29 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAACGCCGATGCTGAATTTAATTACTCAAGTGGCAG:1 - chr2L 14790594 3' - roo 8704 2 69.47 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGTGATCACCCAAAAACTATGGAAAATGGGTGGGTGGGCCCAAGGCCTTCAGCCATTTG:1 + chr2L 18234156 3' - jockey 29 1 55.45 TGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATCAGTGTTGCCACTTGTCGCAAAATAAGTGAA:1 + chr3R 8313136 3' - 297 16 2 63.37 TTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTATAAATCGCCGCTCGAAGCTGGCGAATTCACAACGAAATTTGTTAAATTTGCATATGGTCTCGGGTTGCGTTGTATT:1 + chr3R 16829042 3' - 1360 3011 1 67.33 CTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGCAATAATTAATCCAGCATGTCCGGAAATATGATGGAAATGTAAATCTTT:1 - chr3R 19449760 3' + roo 8644 1 55.45 CAATTGTTATATGGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGTGAGTGAGAGCGTCAATTTCTGTCCTTTGACTATCCGATCGTTCTGTGAGAAGA:1 + chr2R 4802880 3' + mariner2 270 1 32.67 GAGAANGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTGTAGTGAGCATTTTCGCGTTGATCACAGCTGTGTGACGAAAGCACATGTAACCGTAAAAGTAATGTAAAATCA:1 + chrX 13507196 3' + roo 491 1 73.27 TGGGGATGTTGAGAGTCCCGATTTGATTAGTCGGCTTGGGGGTTTAAGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCTCGTCGTACGTGTGTCGTGTGTGTCGCCACTT:1 + chr3R 1960566 3' + Cr1a 4063 1 79.21 AGAGTCATCAGGACGCTCTTCTTCCTCTTCACTATTCTCTTATCTTTGCTTTGTGCTCACTTAGTCTATCAAATATTACTGACAGTGCCTTCCCCAGATTT:1 - chr2L 14955253 3' - invader1 4005 2 70.30 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCATTTATATAGTTTCTCCTTTCGATTCGTGGCAGCTGTCGAGGAATCA:2 + chr3L 16761326 3' + roo 9042 1 58.42 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTACATGCAC:1 - chr3R 6273517 3' + blood 7360 2 60.00 ACTGACTTAGCATTAAGTCCAGTATCATTGACCTTACTCATGATAACTGATACACAGATAAACAAAATATATATATATATATATACATATATATATAGATA:1 + chrX 9748380 3' - gypsy9 5040 2 45.54 CCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGCGTGGCAACATTTGCAAGCAAACATGCGCAAACTTCTATTGATAACCTTATAAATCGACTTC:1 - chr3R 4277911 3' - I-element 4895 1 66.67 GTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGATCCGCTAGCCAGGTGGGTGGTGCCGCTGTCGTTGCCGCCGTGGAGGCGG:1 - chrX 16823968 3' - jockey 130 1 55.45 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTTTC:1 + chrX 5092993 3' + roo 9051 2 44.55 TGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCCAGCCACCCACCACATCGAAACACAGCATTGCACACAATTCAAAC:1 + chr2L 17246391 3' - HMS-Beagle 7017 2 55.45 TTTTTTTTTTAATTTTTATTGTTTTGACTCTATCAGAAAGTACTTAATCCCGCTCATCCATATGGGAAACATGTCCGACATGTAATGATGATGACATTATT:1 + chr2L 17756021 3' - Doc 4692 1 89.11 TTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTTCAAGTGCAGGGT:1 + chrX 20886065 3' + Ivk 5375 1 63.37 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGTAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAAC:1 - chr3L 28063326 3' + roo 400 1 70.30 TTGTANACAAAATAATTGAACTTGTTCGAAAATACAACTTCCGCATAATACCCCAAAAAAAGGACAGCATCCACGAAGAAGAAGATGTTATGCCAGGTACG:1 + chrX 9229774 3' + Fw3 21 1 75.25 AGAGTGAGTTTTCCTCTCCACAAAACGGTGGGCGGACTAAGTTTTTTCCATGAGGAAATTTGCGGAAACAATATTAGGATCTGCTATAGCTACATTAACTT:1 + chr2R 5021483 3' + Gypsy12A_LTR 368 1 72.28 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTT:1 - chr3L 19951208 3' - Ivk 40 1 64.36 AGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATTTGTGTTTTTATTACATCACTTTTTGTTTAAG:1 + chr3R 9995414 3' - Max-element 8281 2 69.31 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATTGAGGCGGAGGTATGTA:1 + chrX 3763264 3' - 297 1 2 77.23 TGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATGTAAATATTTTTACTTTCTTTTTGTTCAGTT:1 - chr3R 32005892 3' + invader4 3039 2 72.28 TCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATACCATATATCTGTCGCCAACCTACGTGAGCACGATGAAGCGTGACAAAAAAAGCAAGACTATCGA:1 - chr3R 7748906 3' + blood 7379 2 42.57 AGTCAAGAAGAGGTAGTACAATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATGTACATAGGTTTTTAATGTAAACAGAGACATATTTTGTGCCGCTTCAGCATTC:1 + chr3L 25824656 3' + baggins 5385 1 52.48 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACGAACACGTACACGTCCACAAACACAGACACTAGCCAGCACTGAACGAAAAACTAACAGAGTTCACA:1 + chr3R 20477136 3' + 412 481 2 65.35 GGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGAGTGTTTGGTTGGTTGACGAGGGCGGCAAAATGATAGAAACCACTTTACACATAATATA:1 - chrX 10789667 3' - I-element 4993 1 45.54 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAG:1 - chr2L 21683402 3' + pogo 2069 1 60.00 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAGAATAAAGTGGCAACAACGACAAGTT:1 + chrX 18238046 3' - jockey 4788 1 72.28 AAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATTTATCTAAGAAGTATGCATTCCTGCAGTTTCCCGATGCCGTCACCTTTTCTG:1 - chr3R 19346887 3' + blood 7364 2 51.49 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGA:1 - chr2L 12815033 3' + hopper 1390 1 54.46 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGCTTATATGTGCCTCCCACCATACAAAGAGTGAAAT:1 - chr2R 24021576 3' - pogo 39 1 68.32 AGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAGGAGGACGAGGATCTGGATTAATGCCGCCGCCAAGCGCTGCTGTCCAAAGACCCACTCCACGTTTCG:1 + chr3R 3064346 3' + INE-1 14 1 76.24 AGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGCCCTCCCATCATAGTCTGTGAACTTCTGAGGATGTGACTTTTTTTTGGGCATTTTCGTGATCCAGTT:1 - chr2R 5062811 3' + Doc 4453 1 70.30 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAGTCCTGTCGCCAGAATTTGGTGTCAATCCCTTTTGATGGCCCACTGACAT:1 - chr3L 10143150 3' - 297 20 2 60.40 AAATTGAAATTTGTTGCTTATTATAACTATAAAAATTACTGTTTTAAACCAAGTATTTACACATTAACATTCTAAAAACCTATTCCATTTTCCAACTATTT:1 + chr2L 14202463 3' + S-element 1540 1 40.59 TTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGTCTTTTTGCTTACGATAATTGACAATCATTTTCTTAGGTATATTTTAAAACTTATATGCTACATA:1 - chr3R 15823708 3' - Stalker2 7371 2 70.30 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATGTATATATATAGCTCTCAACTTTCTGGCTTTTACAGTTCTCGTCGTT:1 + chr3L 23123602 3' - flea 25 2 62.38 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTC:1 - chr2R 981624 3' - 1360 2 2 62.38 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTTTTATTGTTTGCGTTTTTCCATACAATTTACTTGTCAGTTAAATCATTTGTA:1 + chr3L 17168917 3' + mdg1 398 2 56.44 TTATTATGTTCGTATATACTACAGTAGGTACCAAAGCTTTTTTAGAAACCAATGTATTGGTTCTATATATTTGAGATTTCTCTAGATTTATTGAATTCACA:1 + chr2R 7032233 3' - mdg1 7040 2 76.24 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGCCCCATACTCTGAACAGCTGTGCCGAACAGTGCTGCACAACGGCCCGTTCTG:1 - chr3R 29123329 3' - P-element 22 1 57.43 CATTTNCATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTACCAAGTCACATCCCACCCGCTCCTTTT:1 + chr3R 17843691 3' - roo 49 2 73.27 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGTTCAAAGGCTATGTTCATATTA:1 - chr3L 13060307 3' + 412 475 2 61.39 GGTCGCCTGTGAAGCAATTTGAACTTGATTTCTTTTGTCCTTTTTTGTTGCCAGCACTTAGCCACCCGACAAATAACCAAACTTAAAGTAAACACAATTCA:1 - chr2R 5172317 3' + accord2 7227 1 73.27 TTCGCATTCACACCAGCTGAGCAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTATAGCATTTTTCTTGTTTTTAACTAATGTCGCGGATCGATAATTGTAA:1 + chr3L 24402217 3' + INE-1 531 1 63.37 TAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTTTCAATCGCCGCTGCTTTACCAT:1 - chr3R 19210059 3' + roo 246 2 77.23 AATTCNTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCATATCAAAGGCTGGCATAAA:1 + chr3L 5020407 3' - I-element 386 1 80.20 AATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGCTGCGTTTGTTCGTTCAAGGTCTTCGATTTATCGTTTCTGGCTCAGTTCTTGTTCTCGAGATACCT:1 + chr3L 18038227 3' + HMS-Beagle 7034 2 53.47 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATGGTGGGGTGTAAGTGTGGTTTCACTTCGTGGTGCTGTGATGAATGACCTGTAAATGATGGCAGAGGA:1 + chr3R 10751722 3' + hopper 1399 1 67.00 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTATGTATGCATTTGGCACGATGGCGATGTTGTTGGTGTCCTCGCTGGTTATTGCAGCGGAAGCG:1 + chr3L 18433169 3' - Quasimodo 64 2 71.43 AAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCTAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAGAGTTTAATGTGCGCT:1 - chrX 21097026 3' + INE-1 166 1 64.36 CGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATTTGTGACTTTTGCAAAAACA:1 + chr2L 14677331 3' - FB 56 1 79.21 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACCTTCAAAGGTTGTTTCTAATAACCGGCAAGTTGCTCTACACTTCGATTTTGGAGGGAATTGT:1 + chr3R 3771667 3' + roo 396 1 66.34 TTTAAGTTTCAGATTGAATTTGCATTTTCCAACACACATTTTTATTACTTACTCTCTTCAACATTGCACGGGTGTTTTATTCTCCAAATAACCCAACAAAG:1 - chrX 22398534 3' + Gypsy6A_LTR 156 1 59.41 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGAAGACTTTGAGGATTTAAGAAGATACATTCGTGACAAGCACTTTGTCTGAATGGACAACTATTTCATTATG:1 - chr2R 13106732 3' + copia 248 1 71.29 TTTTCATATATTTATTAGTTTTGTAAATTTCTATTGATTTGTCATAAAACTTTTGGGTGAATTAAACACTAAAGTTTCACAAGGTTTTTTCAAAAATATAA:1 + chr3L 19377016 3' + INE-1 404 1 53.47 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTCCTCAAAGTCAATAAAAAAGCTCATTGCCTCAACAGTTTTGTTTTTATTGAACTTATTGAGTGTT:1 - chrX 23048251 3' + hopper 1404 2 65.35 ACAACATTTACGTTTTCCATGTAAAAAAAACTCGACCGTTCGCTTTGAAAGCTATAGACGCATATGTTTGTAGTCTACG:1 - 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chrX 5129461 3' + Idefix 7379 2 65.35 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGAATTAAACAAAATCCATTAACTCATA:1 + chr3R 23638154 3' - pogo 32 1 78.48 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAGGCTTTCGTCTTTATTTTAGCC:1 - chr3L 22039727 3' + jockey 4938 1 78.22 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGGCATGCGGATGTG:2 - chrX 17042663 3' - copia 43 2 68.32 CCAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGCATTGGACTTCAATTGGATTAATTCGCTTACCTTCGGGTAAAGACGTTCCCCAATTTGTTGTAGGTGAACGGA:1 + chr3R 9716394 3' + baggins 5333 1 66.34 AACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAACCCAAAACAATTATTCTGCAAAAATGGTGAGTTACAAAATTG:1 - chr3R 16833752 3' + I-element 13 1 62.50 TGCAGGATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACGAGCGATCTGCCTGTAGACCACACCAAGTTGAGTTATGAGCTAAATTTTCGGCTTAGGGTATTTAT:1 - chr3R 3072821 3' + mdg1 249 2 71.29 ATAATAATAATAATAATAATACACAAACCCCAAACACTAGAACATAAATGGTGGTCGACTGTTAGCAAGACACCCTTTTTGTTGTAAAAGCCCAAAAAGGC:1 + chrX 3379289 3' + mdg1 7064 12 75.25 ATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTTTGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGCAACAGCTAGGAAATAA:1 - chr3L 3570526 3' + 412 20 2 81.19 GCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGGCGCAAAGACTGTGGAGAAGATGTAACATTTTAAGCGCGTTGCT:1 - chr2R 16940437 3' - copia 148 2 56.44 TAATAATAATAATAAAAAAAAATAATAAAAATAATAATAAAGTAACAAATAGTTCTTCTTAAATATTTTAATTTTATTTATGTATTCCAA:1 - chr3L 22540382 3' + Rt1a 5074 2 56.67 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTC:1 + chr2L 16884872 3' + pogo 2051 1 77.23 TTACCTTCCCTAGCTAACCGTAAAACGATGCTTTGAACAGTCTTTATTTGATTTACATATTTGCCCCAAAAATATTTTAATTTATTTAAAAAAAACCTAAT:1 + chr2L 21640600 3' + Cr1a 4001 1 58.42 TAAGACTGAAACAAATGGTGTGAGAAAATCTATGTGCCTGCCTAGTGTCTGAAGCTTTTCCCCGACATCTTCCTTACTTTGACTTGCTAAACTTTTGCAGT:1 - chr3L 6292283 3' - Tom1 269 1 52.48 ACATTGTAAAATTAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAACAAAAATCGAACAAAAAGTGAAAGCCCG:1 - chr2L 20239213 3' + jockey 4923 1 81.19 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAATTCAGTTGGTTAGCATTTTTGCCTTTACATATTTCGCTCCTC:1 + chr3R 28645868 3' - F-element 20 1 65.35 TTAGTTATACTCCACGAAACACAGGGGACACGTTAGAATTCATTTGTATAAGCGTTTCGAGAACAAGATTTTTGATTTCGATCTAAGAATTCTTCTACGCG:1 - chr2R 14488583 3' - transib2 399 1 63.37 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAGCTGAAGCCAAAGCAGTCAAACAAGTGGTC:1 - chr3L 11553499 3' - P-element 48 1 25.74 ACCAATCACAATTAGGTGAACCTAAATTTATAATTATCAAAAGAAAATGCTGCTGGGTGTATTGGTGGAGTGAATTGAGGGGAGAGAGTTGGATTCTGGGC:1 - chr3R 15524869 3' + I-element 230 1 59.41 AGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATAAGATTCTTTTGTATCTTTTGCTTTTTATATTT:1 - chr3L 10532420 3' - roo 9037 1 67.33 CGGCAAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTG:1 - chr4 158193 3' - gypsy 7141 2 61.39 CAAACAAGACATATTTAACAACACTAACTGTAGAGGGTTCTTAGCAAACCCAATCCAGAAATGCAAAAGGCGTGCTAACAAAGCACACACGCAAGTGAACA:1 + chrX 3289906 3' + I-element 5078 1 58.42 AGGGGCAAAAACAACACAGCTTAGAAATTGCTAGGCGCTGATAGAAATGGCTTAGATTTGTATTT:1 + chrX 22549583 3' - jockey 199 1 60.00 ATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTTGCACGTACGCGACGAGGATGTACCCCCGCAAGGCGTTAACCACTAATCGATAATCCATTAAGGGCAACCACTA:1 - chr2L 8796955 3' - Ivk 161 1 58.42 TAATAACAATAATAATAATAATAACAATAATATTATACAGTACAATGCAATGGATCAACTCTGCTCTACTTATGTTGATAAAATAGTATTTTTGAAAAAAA:1 + chr3L 18284709 3' + mdg1 30 2 65.35 TTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACTTGTATGATTCCATTATTAAATACAAAACGTTTCCTCCATTTTACAGAGATTTCTTGCCGCGCG:1 + chrX 15894688 3' + S-element 1703 1 59.41 CTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAGTTCAGAACCATCTCATTTATATTTACAATATTTTAAAACTTCTATCTTAAAGA:1 - chr3R 12539461 3' + roo 409 1 79.21 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGCCATATAAATAATTTCCTAGTATTTATAGT:1 - chr2R 4854970 3' + opus 483 2 64.36 TTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTT:1 + chr2R 2994311 3' - gypsy8 113 2 47.52 TTATTATTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGA:1 - chr2R 17626478 3' - mdg1 7058 4 57.43 CTCTCGGGCTGAAAGATGACCCAGCGAGCGCCACGAGTTGCGCCCTCTCCTCGACGAACCTGGACCAGGGGAAGTAGTAGCTCCTCGTATGGCTGCACTTG:1 + chr2L 13827280 3' - Rt1a 4648 1 63.37 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCGGCCGTTGGCTTTTTCGACTTCC:1 - chr2R 16334008 3' - P-element 53 1 26.73 GCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATATAATTTTAAAGAAAAATCCCTTCACTCGT:1 + chr3R 10240149 3' + invader4 3040 2 78.22 TATTGGTATTATGTTCGTATATACTACATTATGTTTGGTATTTTGGTTAGCCTAAACACCTCCAGTGACTCTTCAGGCCGATCGGACTTTCCGTGGGCCG:1 + chr2L 20706752 3' - mdg1 7045 2 72.00 TGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGGAACTGATTATAGCGTTTACCATTATTTTTTACGGTACAAAACGTAAATCTTGAATTGGAGTCAAATGATCATTA:2 - chr2R 9236993 3' + INE-1 548 1 74.26 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCA:1 + chr2L 20133061 3' + flea 4982 2 63.37 TGATCAGGATCAACAGCCGAGCCGATCTGGCCCTGTCCGTCCGTATAAAACTATAAAAGGTGTCCAGGAATTAAGCTGATATCCACAGGTTAAGTCCTTCA:1 - chr2R 15587466 3' + INE-1 91 1 61.39 ATAAANCTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTAACGGCAAGATTCACTCAACAAATAGTTCACGCTG:1 - chr3R 2520503 3' + copia 205 2 74.26 TGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTCAGGAAACGAACTGAAGAATTCCCGCTTGAGTCTTCTAGATTGCTGGCGATTACA:1 + chrX 18836906 3' + P-element 251 1 54.46 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCAT:2 + chr2L 22098088 3' + roo 9032 1 68.32 CCTATTCCGTCCGTGGTCGCCAGTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCTTTAAATCCCGATCCCTAAACCAAACCCAATT:1 + chr3R 25721718 3' + Max-element 398 1 66.32 GCATANGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTTGCTTAATCAAGTGAAATTGAATCAACTTTTTCAGTCTCCGGAGACAACTGCAA:1 + chr3R 19530718 3' - BS 19 1 53.00 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGCTCACAGCATTTTGCTTTTGTTTGCTGTTCCTGGTTTATATATCCCAAG:1 - chr2R 18950735 3' + roo 9045 1 52.48 TCTTTNAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATTCACTTTAAATTTTTTCCGCCCGATATCAGTGTTGCCACTTGTCGC:1 + chr3R 8313124 3' - 297 6609 2 58.42 CCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACGCATTTTTATGAAATTCAAGCACTTCGACTCCTTACTCTACACA:1 - chr3L 144927 3' + F-element 4409 1 58.42 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCACCACCGAGTATGAAATATTC:1 + chr2L 1839269 3' - jockey 4799 1 75.00 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGCGCACACTGAGA:1 - chr3R 10952238 3' + roo 408 1 76.24 AAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATTCATTTCTAAGTGGAAAATAAGACAGGATCAGAAGGACATGCGATTGGGCTA:1 - chr2L 17911391 3' + Bica 137 1 67.33 TTAGCAGAGACATGACCTAACTAAGAGCCAGTTTCCAGCCACCCTGTGGAGAGTGTAGTTGCATTTCTATGTTGCATGGCGGGGATTTGCTGCATTAACCC:1 + chr3R 22105627 3' - baggins 129 1 66.34 AGAACAAAAGAAAACCAAAAAACAACAGCGGCATGAAAAGAGGGTGCGGAAAAAACCAAATGAGAATTCCTTATCGGTAAATATGAAAAGCGTGCCCCACC:1 + chr3L 4082711 3' + mdg3 5102 1 79.21 TTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTCTTCATTATGGTGGCGTAATAAAGGGCGCCTTCTACCTGTCCTTAAATGTATCTTTGCCTATGCCTTCTGGCAG:1 + chr3R 20147576 3' + 1360 393 1 74.26 GATCGACAAATGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAAAAACATAAACATAAAAAAAAGGGAAATTAA:1 + chr2R 19628359 3' + Bica 451 1 80.81 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATATAAAAGTACAAAATATTAGGGCCCCAAATTAGCAGGG:1 - chr2R 16475750 3' - 412 7091 2 64.36 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGAT:1 - chr2R 7861657 3' + roo 9046 1 54.46 CAACANAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAATAAATAGGAAGTTACGAGGCTTCCAAATATCCAATTAAAAGTTTTTGAAGAATACAAGAAAAATAA:1 - chr2R 15059351 3' + I-element 135 1 66.34 CTGTGNCACTCTTGTTCATCTCAACACAAAACCCACGCCCATTTTCTCGTAAAAGCTAGCAATTGCAGACAGGATTTTGCTGGATTTTAAAACTGCTTTCA:1 - chr3L 26023039 3' + Circe 123 2 59.41 ACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAA:1 + chr4 184025 3' - 1360 170 1 62.38 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTAACAA:1 + chr2L 13136814 3' + roo 9053 2 61.39 GGCAAAATAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAATCTGCATGCGTAATACATTTATCATGAAAAATT:1 + chrX 22992298 3' + TAHRE 10383 1 69.31 AGTAAATATGTATAAGAAAATTTTAATATTTTTTGTTGACAACTGTTTACTTGTAAGATTTTATTTTTGTCGTACATAATCAGGTCAACAAATTTTAGGTT:1 + chr3R 31976553 3' - TART-B 10184 1 65.35 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCAAATGGTAAGACTGTTTGTTTTTACCATGCTTTT:1 + chr2R 21073930 3' - jockey 4711 1 66.34 ATATTNTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACTTGTGCACACATACAGTTTTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGTTAGTAAAGAGGGCGATATG:1 - chr2R 5832303 3' - 1360 201 1 79.21 CTTTTTGTGGCCAAAATTAATAACATATTTAGTTTCAGTTTTTATAAGGTAACAATATTAACAAGGAATAGTTCTTACTATTCCTTTTTCCCGACCTGCCT:1 + chr2R 22966590 3' + Transib-N1_DM 21 1 68.32 AAACTTTTTGAAAATGTTATCACTCCTCATTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGT:1 + chr3R 2533957 3' + Q-element 142 2 57.43 AAGGTCAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATAACGTATATTTTTTACTGCCAAGTCTTGAGACTCA:1 + chr2R 9317023 3' + opus 458 2 69.31 TTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTCAAATTGCATACGAAATTGATTGTACTCT:1 + chr3L 15099621 3' - G4 3829 1 42.57 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGAAGCTGCAGATCGGCCAGTTGGCCATAAAAGCATTTTAATTTCTTAATTTACC:1 + chr3R 23364948 3' - flea 4831 1 57.43 TAAGAAAATTTAAAAAAAAAAATTATGATTTAAATCAATTAAAAGACTCGCACTTCAACGAACTTTCTGTTGAGGAACCCAATCGGTTGGATGTATGACAA:1 + chr2L 5690834 3' + Doc 4693 1 60.40 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCCAAGAGAAAGAGAAATA:1 - chr2R 17626472 3' - mdg1 12 2 62.63 CTAATTGCTGGCTTTTTATGTACAATTGCCTGTTTTGTTTTCAGATTTTGTGGTATAATTTGGTTTTTTAAGGAAAAGTATGCATAAGCAAATACAATAGA:1 + chr3L 23840460 3' - I-element 5214 1 81.19 GCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTGTGTGCTTAACAACAACAATAAAAAGCGTAATTAAAGTACGCTCTACA:1 + chrX 12903817 3' - 1360 3250 1 57.43 CGTAGGCAAAGGTATCCCTGGCCGGCTAGACAGCTTGTTCAAACTCATAATTCCGATAAAGAAGAGAAAGAACATGGACCGGGAAAGAAGCTGCGACAGCG:1 + chrX 3620303 3' - Max-element 8199 1 68.32 TGAACGTCGAGATCTCAAGTACAAGCCAGAAAGTTGTTTAATGTTACACCCAAACTTTTGAAATATTTTTTGATTAGTTTAAACGTGATCTGTATTTTTG:1 + chr2R 8587861 3' + INE-1 140 1 72.00 CGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGTCCATCAAATGTATAAGCACGTATCTATAAAGTAATGAGCATATTTATAAG:1 - chr2R 23584736 3' + HMS-Beagle 7014 2 49.50 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGATTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATTGTAAATGTTTCA:1 + chr2R 10774104 3' - copia 4904 2 59.41 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGTTCAGCC:1 + chrX 3817541 3' + roo 405 1 74.26 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATTCGCATTCAGTGAGATGGGCA:1 + chr2R 7887241 3' - jockey 65 1 77.00 CACGAGCAACGGTGCATTACCAAATAAATAAATATATATAAACACACACAACCAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTAT:1 - chr2R 3262651 3' + Tc1-2 459 1 54.46 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCC:1 + chr2L 16884884 3' + pogo 2063 1 65.35 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTAAGTTGC:1 + chrX 13508749 3' + roo 9036 1 64.95 TTTCTTTTCGCTCTATTGTTGCACCTTTCTCATTACGAATTAATGGCATTTTCGGCCGACGAACAAAAGGTGCAACACTAGAGCGAAAAGAAAGTCACCGG:1 - chr2L 12666550 3' - gypsy5 7300 2 77.23 CGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACAATACGACCATGGATATTCGATATCGTTTCGGCCAGCCAAACATCTTACCTAACTTGGC:1 - chr2R 14217716 3' + Tc1 1626 1 73.27 ATTGCAGCCTCACCATAGCGTTGAATAACAATGTATTATTTAAATTAAATAATCCGTTTTTCGGTAAATCTCTGGTTTGAGGACGAATGAGCAATAAAGCA:1 + chr2L 21592742 3' - BS3 335 1 68.32 AAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTAAAAAAAATGATTTGTTTT:1 - chr2R 5067617 3' - F-element 22 1 61.39 AGCAACAGCAATTGGACACCCCTTATCCGGGGTACCAAGCTATGTTGCATAAATGCTGAGTCGGCTTGCCGACCATGGGGAAGCAGTGCAGCAAGCAGTGC:1 - chr3R 30284846 3' + gtwin 112 2 78.22 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAAACAATACAATAAAATTAAACCAATTCGGGTTTCTTTGCTCTTAAG:1 + chr3R 26254066 3' - jockey 4702 1 55.45 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTCAGCCAGGAGTGGTCTGAAA:1 - chr2L 16201532 3' - hobo 56 1 82.18 TAGTGTAGGTGGATTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTCTTCTAATTGCTCTCTATCATCTTCATCCATTATACCAAATAAAATATGAT:1 - chr3R 19448570 3' - I-element 4963 1 56.44 GAACCNTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACAGTTCTAGTGAATCCAAAAGTTATGCTGCCAAAGTGGATGCAAATACCCCAGGCATATATC:1 - chr3L 8614470 3' + opus 487 2 62.38 AGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGGATCGGTCTAATGTGCAAAACGGTACTGGCTATGAAATAGCTAATAAATACGAGGATTTGGCTCGTTCCTATGG:1 - chrX 21296060 3' - I-element 362 1 79.59 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAATTGAGGGGAAGAAAAGAAAGAAGAAGAAGGGGTTGTGGCAAAAG:1 + chr2R 10543538 3' - P-element 4 2 75.25 AGAATTTATTCTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAAAAGCAAAGTTAAAAGTTAATAACAATTAAACAAATTTAATAAATAAAAATTAAAAT:1 + chr2L 5558971 3' + TAHRE 10409 1 66.67 AACAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGTTACTGGAGCCGTTTCACTCATCTTATGTTCAGTTGCCTTGGCATTGGAAGAGACAACTTGA:1 + chrX 13508774 3' + roo 9057 1 68.32 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAAATT:1 + chr2L 12667223 3' + blood 7339 1 77.23 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCTCAGCTGTTGAACTTGGAAAAGTGCCCAACC:1 - chr3R 20556141 3' - Tirant 8155 2 73.27 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACA:1 + chr3L 18337726 3' - Juan 4037 1 66.00 CAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAACCAACAAGAAGTTATTCAGCAAAGTTTGAAGCGTCCTTCTCGATGAGAAGTTGCA:1 + chr3R 10147908 3' + roo 9051 2 61.39 GTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGATTGGGAAA:1 + chr3R 11094586 3' - 3S18 19 2 60.40 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAAT:1 - chr3R 20878450 3' - 297 21 2 52.00 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATGAATTTGCAATAATCTTTCAGAAACAATGGCAAAATTA:1 - chr3R 23591421 3' - pogo 36 1 66.34 TTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAATTTTTTTTTGTGCTCACTCGTT:1 + chr3R 21930330 3' + micropia 5017 4 78.22 GTATTAAAACCAATTCAAAGAACAAAATTTGAAAATTTAGTTAATTCAATTTGCATCTTATACTATACTTTAAAGTATACTGTGAAAGTAAGCTTGCCAAA:1 + chr2R 18090792 3' - transib1 1828 1 77.23 GCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGCGATTGCTCTTTTCCAGGGGTCGAAGA:1 + chr2R 17919050 3' + Quasimodo 197 2 73.27 TACATAAACACTCCAGCCAATGAAATACGATCTAACGTTATTGTAGATGGCCGGATTCACGCTGGAAAAGTGAATGCCCTGCAATTGCATCTTCAGCGAGA:1 + chr3R 17321425 3' + Stalker2 7368 2 67.33 GCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACA:1 - chr3R 20137262 3' - Burdock 6165 2 57.43 GTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATA:1 + chrX 21534511 3' - accord 484 2 73.27 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCAACATCA:1 - chr3L 7550715 3' + 412 7513 2 57.00 GTATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCGAGTAGAAAGTCGAATGCTTCCGAGAG:1 - chrX 21017791 3' + 412 7499 2 70.00 TTTTGTTTTTTGTTTTTATTTTTCGTTTTTGTTGCTGTGTGTTTTGTTAGCTTCTGCTTTTCTGTTGTTCTTTGTGTATTTTCGGTCTTTACACAAAATTA:1 - chr2L 7264169 3' - transib2 100 3 76.24 TATGTTTATGTTTATGTTTATGTTTATGAAAGTTGAAGCCCAAACACATTTATTCCTATTTTCATTCCAATTTTCATTGCTTTTCCGAGACTACACACGAT:1 - chrX 13798793 3' + 412 7128 2 76.24 CCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTACTTTGATAGAACGTCAGGAATTCTATTCACTATTCATAGAACG:1 + chrX 1184012 3' - Ivk 5334 1 56.44 TACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGACAAAAAAAAAGGGAAAAGGGTATACAAGTTGGGAAAGAGAGACCGGAAGA:1 + chr3L 25481554 3' + Bica 287 1 68.32 GTAATATTTAGAAGGTTTGAATTAAGTAGGATTTATGTCATGTTCCGGTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGGTGGCATTTTCAGGCTCAAATTTTGTTTGTAAC:1 - chr3R 10301247 3' - jockey2 3232 1 75.25 TCTACTTATTTCACGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTACTTTGGTTTTCGGATTGTGGAGCATGTTCATCTAACAATATTACTACTGGGCT:1 - chrX 15894591 3' + S-element 1695 1 48.51 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAG:1 - chr2R 8345504 3' + roo 9037 1 59.41 GAAATATAAATTATAAATTACAACTTAAAAAATCCATGCCATAAATCCCTTGATATGCGTCTTTCATCACCGCCAACATCGTGGGCAGTTTGAAGTGAGTT:1 - chr2L 3084951 3' + copia 252 1 73.27 TTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCGAGAGCGTTGCGAAAATTTTTCGGCTTTTTCATTCTTTTTTACCCCGTTTT:1 + chrX 9718761 3' - G2 3077 8 91.67 ACACACACACATATACACACACACACACTTAGTCGAGAGGGATGTCCTTGACGCCTGGGAACCTCCGAACCACTGAGCCACCGCACAAGTGTA:1 + chr3L 388702 3' + accord 7037 2 50.54 TTAGANTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGCTATTAGATTTCTACTACTTGAAATGCGTAAAATCCCTTTTAGCTTTTCCG:1 - chr3R 31728697 3' - I-element 5174 1 59.41 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCCCTCGATTGAATGATGTTTTCTGGG:1 + chr2L 12815125 3' - hopper 16 1 65.35 ACAGGACCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCAACTGCAAACTTCAATGTGGGCCAACTTTTTTGTGGACG:1 - chr2R 13649781 3' + mdg1 456 1 57.43 TAAAAAGTATCTATTAAATATAAGGAACTTCATTAAACTTTCCCTTAATGAGGGATTGAATCTTGTATTACAGTGTTTACTCAAGTCTTTACTTATTCGCT:1 + chr2R 12491623 3' - hobo 2460 1 69.31 ACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAATTATTATGATTATGAACTGCATTTTTAAAGCTTGTTCCATTCGACATACCTCACCAACCAACATCTCAA:1 + chr2R 9254649 3' + Quasimodo 157 2 80.20 GGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGGCAGGAACTCGACTTTCAGTGCTCAGTGCTCAGCGGAATTTGGTGGCATTTCAAC:1 + chr3R 5686128 3' - P-element 10 2 65.56 AGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGTTCGCTTAAATATATAACGATTTTAGCCTACACCGGGAAAAAAAACTATGTATCTTTGCGAACGCCACATGC:1 + chr2R 10095982 3' + F-element 119 1 58.42 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCAACTCTCGACGGAGCTATAAAAATGT:2 - chr3L 13589423 3' - hobo 12 1 67.33 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGATCGATCTCTATC:1 + chr2L 7255806 3' - P-element 35 1 44.00 AAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAACCAAAAACTAACCATAAACGAGAAAATCTTACAATTCTGGTGGTCGCAGATGTGACCATGCGCACACTACC:1 + chr2R 4736544 3' + Doc2-element 238 2 58.42 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCACACACTCCACATTCTGAATATTTTATATTCCTCCGGCATTTGTATGCCGGTCTGCAGGT:1 - chr2L 6888585 3' - jockey 24 1 61.39 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAACACGAGAAGAGGAAAAAAATGTGTTCGATCAGGACGTGGGAAACGCGACTCGGGAAATTTCGA:1 - chr2R 16988600 3' - opus 7158 4 76.24 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTATTTCAGCAAAGACGCGACGAGCTAAAATGTTCGAAGGCAACT:1 - chrX 8491376 3' - P-element 4 2 77.23 CGTAATATGTGAAGCATATTATGCTACTATATAGTAAAATATCCATTCCCCAGGCCGAATGCGGCATCCCAAGTAACCCTACCCTACCCTCCTATCCCAG:1 - chr4 402458 3' - rover 6958 2 58.00 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGAAAAATAAAGTGGGTTGAAGACAAATCCAAGCTCCGAACGCATTTCAATGCAATTTGATGTCTCTGT:1 - chr2L 5707227 3' + jockey 4982 1 58.42 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTTTTCAGCTTGAAGTTTATTGGTAAAAGTTATTTGCAATTTTTTTAAGGCTTACATTGCGTATAA:1 + chr2L 13574297 3' - pogo 11 1 63.37 CTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCATAACTTGCTGATTGTATAGGGTATATATCATTCTGTACGGTA:1 - chr2R 12289814 3' - F-element 348 1 55.45 GTTCTAATATGAATGAATTTCCGACTGTCAAATGCCGAAGTGAAGTGAAGGGAGTGGAATGGCAAATGGCCACTCAAATATGGTCACATATCAACATATCA:1 + chrX 2104325 3' - R2-element 221 1 67.33 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATG:2 + chr2R 5804519 3' + P-element 2841 1 34.65 GTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATATACTACACACCTCGCTTTCTGATTGGACTACTGGAAAGAGCGAAATATGTCCGGC:1 + chr2R 7552320 3' - springer 7158 2 58.42 GTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAAATAATTACATTGTTCTAT:1 + chrX 23108317 3' - BS3 1431 1 51.49 CACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAGCTAACCCCTAAGCGACCTCTGCGTTCGGAAATGGAGAAGGAAC:1 + chr3R 23800272 3' + I-element 5043 1 55.56 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGC:1 + chr3R 27775133 3' + roo 9019 2 77.23 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACATGACAGATATCGAAACCTTTTTTTCTATA:2 + chr3L 2019709 3' + 412 445 2 75.25 AAGGCTTTAAAGTCCATTTTTATGCGAAACAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTTAGGGAATTAAAGTTGAGGCAAAGGACAACAAAGGTGAAATCTAA:1 + chr3L 13657300 3' + pogo 1760 1 55.45 GTCTATTGCACAGTTTTGGCGGCTGCATGATCCAACAGGTTCTTTTGTTTTGGCTGCCGCTTTCTTGCCGCCGCTGCAGTTGTTTGTCGAAACTTAATTGT:1 + chrX 6057692 3' - diver2 16 2 59.41 TTTATCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATGTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGTTCGGATCGGGAGTTCCGAGTCAGAGTGCGACCTGTCA:1 - chr2R 10289847 3' - G5 4700 1 65.98 GCATTAAGGCTGCCCAAAACAAAATCGCCAGGACGATTACCGGCTACGAATGGTACGTAAGAAACACAGCCTGAACAAAACAAAACTGGGAATAGGAAGT:1 - chr2R 18064450 3' + BS3 1356 1 68.00 CGTCTTAAAACCTATCTGGACTTCTACTGGATTGAAACGCCCGTGGAGAAGTACGCGGAGAAGACCTTCGTCCAGCTGCTGGT:1 - chr3R 25335047 3' + Doc 4273 1 72.29 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCTGTGAAAACTGTTGTGGAAGTTTTATAACCCAAGTTGTCGGTCG:1 - chrX 2649817 3' + Tirant 8475 2 56.44 TTTTGNTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAGGAGATATTTTATAGAATACCTGTGCTAATTA:1 - chr2L 7256702 3' - P-element 2648 1 32.67 CTTACACGTAATATAGCATAATCTCTCCTCGGTACATTAACGTGTTCAATTAAACACTGCAGAATTTTTTAAATCGCGTGTTTTCAGATTAACACGTTAA:1 + chrX 19664502 3' + G5A 2710 1 62.00 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGATTTGTGACTTTTGCAAAAACCTTTAAAATGTTTGTCTGA:1 + chr2L 14677349 3' - FB 22 1 55.29 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGATTATACATCTATACACGTACACACATTCGTGTGGGAATAAACACCCGTGTAAATGTGAAAGTGTG:1 - chr2L 19018924 3' - hobo 8 1 68.32 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTGAATAATCGGGTCATTACAGCATCTATAGAGTATTACCTCTAATACCTCC:1 - chr3L 25481597 3' - 1360 54 1 50.50 GCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTGCCACTTTGTGGCAGCAGCACCGATTGACCATTTGACCATCAATTGCTTAAGTCACCCCCTATTAAAAGAG:1 + chr3L 18278748 3' - diver2 4622 2 52.48 TCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATTTAATAGCGCGCGACCTGCTCCTCCGTTTATGCATATTTAATAGTTGCTATTTTTGCTAAGTGCTCGAAATTATCG:1 - chr3R 31906346 3' - R1A1-element 342 1 78.22 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTTATATAATTTTAAAGAGGAGGCACAACTTTTGTATA:1 - chrX 21564679 3' + diver 6072 2 67.33 CTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAGTGCTTGTTTACGGGCCCTGAGAACTCTTGACAGCCGGCGCCTTCAAGTATCCAAGCAAGTTTCGCAAAATACG:1 - chrX 6401381 3' + Tc1-2 478 1 72.28 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGAGCGTGTTGCACGCATTAAAATTAAAAGCGAAGGCAAGCAC:1 - chr2L 4160130 3' - Tirant 8132 2 56.32 CAAAGNACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCCAAAAAGTTGCTGATTATTTCTCGAATTACCGAAATTCCCTTAGGCGGGCTTGGTGAATCG:1 + chrX 20620625 3' + pogo 2088 1 66.34 AGAGAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAG:1 - chr2L 15081433 3' + hobo 2 1 51.49 AATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCATTTTAATTGTGCAACTGGCAACAGACAGT:1 + chr3L 9772795 3' + 412 31 2 71.29 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACCTTCAAAGGTTGTTTCTAATAACCGGCAAGTTGCTCTACACTTCGAT:2 + chr3R 3771652 3' + roo 9044 1 51.49 CACCGCCTGGAGACCACCGGACACATCCCTTGATGCCCATTACTTTGTCGCCACGGGAATGGAGGAATACATTATTGAAAACCATTTTTGTAGATCTGTGT:1 + chr2L 4845196 3' + gtwin 7363 2 68.32 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGCTTATTTTTGAAGTGTACAAGATCAATGCTAGGGTTTGAGGAAGAGTTCAT:1 - chrX 8682631 3' - pogo 25 1 54.46 AAATATAAATTATAAATTACAACAGATACTGAACGGAAGTTTTATTGCTTCCCCTTCATGTTCATGTAAACAGGCTAACAAAACAATTTCTGAGGCGAAAT:1 + chr3R 6735366 3' + copia 253 1 76.24 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCCGGTCGGGGCAGCCCGAAGCCC:1 + chr2L 12815101 3' + hopper 1404 2 58.33 CCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGCCAGAGCAATGAACTGTTACGGACTCCACG:1 + chrX 7723905 3' - R1A1-element 5202 1 63.89 ACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAACATTACTTACAAAATGAGAGATATTGATTTGGGGATAGCA:1 + chr3R 7415199 3' + I-element 5317 1 63.37 TTTGCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGGGAGCG:1 + chr3R 28940108 3' - accord 188 2 73.91 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGAAACCCGCGGCCGAAAGCGGATA:1 + chr2R 18950790 3' - roo 51 2 79.21 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATTATTTTAATTTATTTTAGCCGAAAAAATTTGTCATGCGTTTTAGTACCAAATATATCAAAA:1 + chr2L 22098114 3' + roo 395 1 47.52 ATTTTACTGGCGCAGTCGGTGGGATACAAAGAAGTGGTCATCTGTACAGAGTGCAAGTCGTTAATCAGTTTTGGTGGAAGGCTGGTAAAAGCAAGTAAAGG:1 - chr3L 25443237 3' + 297 407 1 70.30 TGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGCACTAGCATCGACTTTGTTGACGGAGGAGGAGCGTTTGCGTCGCATGTTCTTGAGCTGATCGCGTAGCT:1 + chr3L 4694486 3' - accord 186 2 71.29 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGG:1 - chr2R 14778439 3' - mdg1 11 2 60.76 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTTGGCTTTAATATTGGGAAATATTTGAAATTCTAACAAGAGATAAAATTATATCACTATTTTTATATTT:1 - chr2L 12667130 3' - blood 7021 2 41.58 GTGGCGTATATTGGTTTATTACACTTCAAGCGGCTCCGTTTTTTAGTGCAATTTAATTGAGCTCCCAAGTGCTGGGAAGCAGCTGCCCTTTGAATTGGGCT:1 - chr3R 16400122 3' + blood 7388 2 77.23 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTCCATTAAATTTCATATACATAACAAATATTTTTTTCTTG:1 - chrX 10827387 3' + roo 403 1 71.29 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATGCTATTAAATAAAACAATAATCTGAAATAATAAATTGTTGCATTCTTTTAGACACTATGATATATTATTA:1 - chr3R 13582200 3' - BS 5003 1 69.31 TATAAATGTATAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGAGACGCTGAAGGAGACACATTTTCGTTGGGAGC:1 - chr3R 12148828 3' + 1360 2968 1 67.33 CGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGAACATCCACTAATGTGCACCGT:1 + chr2L 3388159 3' - F-element 291 1 68.32 ACCATTCATCATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTCGAGGGATGCAAACGAACAAGAGACGGCTGAAGACACAAGTATACAATTTAAA:1 - chr3R 24631259 3' + I-element 303 1 75.25 CATCTNGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTTAGGACCACAGCCTCAGTGGG:1 - chrX 8972350 3' + 1360 3386 2 76.24 CTGGAGACCACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTATACAAGTTGTTAGATTCGGTGTTTAGTGCTTAGTGTCTTAAGTCAATAAAAAATAA:1 + chr2L 22079654 3' + gtwin 453 2 57.43 TAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACAATTATCAAGTTAGATTCTTCTTCTTTTTCATATAGCATTCCTTGTCATATTT:1 + chr3L 24123309 3' - GATE 37 2 52.48 CACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCATTTGCATTAAAGTCGCTTTGATTGGACTTCCAGCAGGGATTTGGGACACTTTTAGTTCGCATCCATCCGTGTGAC:1 - chr3R 7417595 3' + I-element 5184 1 77.23 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTTTCCCTGCTCT:1 + chrX 5093001 3' + roo 396 1 52.48 CGTAAGAAATCTAAAAGTAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACAAGCCGTATAGGCGTTGATTGCTAACAACATGAACC:1 - chrX 5122466 3' - 1360 3275 1 63.33 GAAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTTGCGCAAATCGCATTCGATGCGATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTCCCTTTGAGAGGCGGGACTCAGCAAGACGGCT:1 - chr2L 20622760 3' - Doc 3 1 55.45 CCACCGTCGATCACGGACTTAACTCACGCAAAAAGCGATGACAATGGCTTGGAGAAAATAATAATAAAGGAACAAGTAGAGCACACACACTTTTCAATGGC:1 + chr2R 13295758 3' + Tirant 396 2 76.24 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGCCGAAAAAAGCACAAAATCATTCGCGTTGCTTAAACTCAGACAATTTCGGGGGATTTGGAAATTTTT:1 + chr3R 21092545 3' - roo 9 2 68.32 ATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCTTCAGCTAGAGAACAATCCTCTGACCTCGCCTCCAGCAAGCGTAAGTTTA:1 - chr2L 17374222 3' - F-element 4265 1 50.00 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAAATATATGTATAAGCATGGGAAAGTACTATTCAATACAAAACGTGTGTACGATTCAG:1 + chrX 16715384 3' + flea 242 2 67.33 AATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGAGTGGTCCGTTCTGCTGTT:1 + chr3R 27801351 3' + Burdock 6363 2 57.43 CTGTTGTTGCTGCTGGTGGAGACTGCGTCGCTGATGTTGTTGCAGCTGGTGATGCGAGGAGAGTGGTACCAACAAAGCTGAGGGATGCTCGATGAGCAGGC:1 + chrX 6693841 3' - TART-B 148 2 74.26 GTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAATCTACTTTCCACTACGCCCCTGTGTGATCGACAT:1 + chr3R 30794607 3' - F-element 4444 1 72.28 AGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCACCCCCAACGTTGCTCCTTAGGGGGAGCGAAGGCAAGTTTGGCCAGTTCTTTTTTATGGCGCCCCCG:1 - chrX 19986335 3' - Stalker2 7254 2 71.88 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCACACTCCTTTTAGCCGGCAGGACACTTAGCCGGCATCTACTCGCTTTGAC:1 - chr2R 15032627 3' - hobo 24 1 55.45 CGTGTTCCACACTAAAGGGATTACAACCATGGCAGATTCCAATTGATTAACATAATGGAAATGTTCTTATCTGTTAAGGGCGAATTCTGTGCATTCTATTT:1 + chr3R 12139524 3' - R1A1-element 5295 1 77.23 AGGGTNAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGAAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCA:1 + chr2L 5646893 3' - jockey 4708 1 55.45 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGGCCATGTCATCAGGCTGCTGATTTTCATGTTGATGATG:1 - chr3L 11661718 3' + hopper 1381 1 59.41 CCGAGCTCCTCGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTATATATATCGATACATATACATAGATCGCCTCGCAGACTGGCCTCCCCGGAGATGGGATGGCATTAT:1 + chr2L 17444101 3' - G2 2779 1 66.34 GTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCCTAAGTAATTTCTGAATTTTTCTGCGAG:1 + chr2L 3440529 3' - Juan 6 1 77.23 CTCGCGCTGACCCTGAGCGCGAGTGTTGTTCGTGATCATATTTTTATTATTTAAGTATATATATTATTTTAAGATAATGAATTACAATATATATTTGAGCG:1 + chr3R 778380 3' - F-element 209 1 47.52 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCACCACCGAGTATGAAATATTCG:1 + chr2L 1839270 3' - jockey 4815 1 78.22 ACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTATGATTTGTTTGATTGCCCAACCAAGAAGAAGACCAAGTTTCAGATTAGAGCTGCTTTATTAAAGT:1 + chr3L 23933020 3' + Cr1a 173 1 68.32 AACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTGATATAT:2 + chr3R 7168664 3' + flea 5010 2 72.28 TGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGTGTGTGTTTTTGTGTGTGTATTTGTGTGTGAG:1 + chrX 15240932 3' - accord 7036 2 54.93 GGATCCTTGAGTCATGAAGGGGTAGTACAATAGATCCGCCTGGGTTATAAGTTGGAGATTTTCTTAGATTCGGCCTTAGGTGATTCGGATGACTCCTTGTC:1 - chr2R 4309693 3' + baggins 5376 1 65.35 AAGGACACAAAGGGGGTCCAAGATTTGCCCGTATGCGTTAATAAATAAAATCGCCTACGTAGTGATAATCG:1 + chr3L 27167951 3' + X-element 4677 1 67.61 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCTCATTCTCGTTCTCATTCTTGTTTTCCCTGCTCTGCTGGTAAAATA:1 + chrX 5093013 3' + roo 408 1 64.36 CATACGGACAGACGAACATGGCTAGATCGACTTGGCTATTGACCCTGATCAAGAATATATATACCTTGTTAAGCAACGTATCCTTCGATTTAACTTTAAG:1 + chr3L 18803077 3' - INE-1 120 1 64.00 GGTGANGATAATCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCTTCCCGCCTACGTAATTGTATTATTTACATCGTTT:1 - chr2L 2953799 3' - Rt1a 4712 1 43.56 AGAGCAAGCCGAAGTGTTTGCTGTTCACCTCGCGGAGCGATTCCAGCCTTTGTATTATGGGTGAGAGTGACAACAACTTCTTCTAGGTCCCTTTCTGAGTT:1 - chr2R 5615700 3' + BS3 70 1 57.43 AGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGCCAACACGGGTGGCTGCTGAAATTCTCGTTCTCACATGTTGCCAAAA:1 - chr2L 18430074 3' - copia 4898 2 55.45 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGCTTGCGAGTCGGAACCACCCCAAAAAAAGGGGCGAGCGGTGGAACAGTGTGCCCGAGCCGGAGCAGGGCCG:1 + chr2L 285776 3' + P-element 2880 2 70.30 AACCAATATTTTGTGGACTGTCGCTGTCATGAAGATTTAATTTTCTAATGGTTTTTCCTTGGCTGATTAAAGTGGCCATAACAGGGCTGTTTTCACTGTAC:1 + chr2L 8603268 3' + hopper2 364 1 64.36 ATATGGACATATGGATGTCAACTATGGAGGCAGGCAGGCAACAACAGACCAACAAACAAACAAACAATAACAAGAGCCGCCCAGCCAAGGTC:1 - chrX 9683707 3' + Doc4-element 2596 1 71.74 AAGAGGAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTTGGTTATATTTTGTGGGAAAATGCAGTAGGTTTAAGAACTTGTATAACTTATAACATATATATTTT:1 - chr3R 21092426 3' + roo 9061 1 57.43 TAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCTTTTAAAGACCATAAAACCATGTACTGAGAAAGGCAAAATTCGGTTTTAACTGTTAAGAGCCTTGAAAAT:1 - chr2L 15081575 3' + hobo 329 1 66.34 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAACACGATGAATTCATAAATATA:1 - chr2R 5950660 3' - mdg1 6 2 73.27 TAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAACAGATATTTGCATGTGCGCAGTCTTATTTAAAAAAT:1 + chrX 20853705 3' - jockey 178 1 64.36 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAAT:1 - chr3R 11263408 3' + roo 9026 1 74.26 TCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTG:1 - chr3R 12047428 3' + Stalker2 7604 2 66.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACA:1 - chr3R 10952275 3' + roo 9034 1 61.39 TCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAATGGAAATTCTAAACAAATCGTCTGATCCCGATCAGAATAGTTGACTATTT:1 - chr2R 966147 3' + I-element 5331 1 63.37 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' + 1360 3380 2 40.40 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGC:1 + chr3R 4544067 3' + flea 223 2 58.42 GTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCAGACATAAATTAAAAAAGTAAAAAAAAAACGAACTTAAAAAACAGAGAAACGTTTAGTGGCGCAAATTAATTGAG:1 + chr2L 5390812 3' + F-element 4518 1 73.27 AACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGT:1 + chr2L 23373501 3' + Tc1-2 1581 1 66.34 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGATCATACAACCTGT:1 - chr2R 14675540 3' + roo 9044 1 56.44 TTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGCCTACTCCTTTTTTCCTGCTTTTCTTCTTTTCTTTATTTAATTTAATTTATGGAATGCCC:1 + chr3R 15676546 3' + copia 4677 1 65.35 CAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACATAAATAAATAATCGAAATGGAAAAGCGTGGCGAATGGTCCACAGCTGTGGCCAGGAAAATTCAAGG:1 + chr3L 13068203 3' - McClintock 6194 2 68.32 ATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTAAGTGGGATGCAATCGATTAAATTTTTTTAA:1 + chr2R 10443497 3' - P-element 2711 1 30.69 AGGGGCGGCCTGCCTCTCACACTTGTTGTTGTTTCGAATTCTTAAATCAAATCGGCAGTAAAGGTAAACTTGCAAAATTAATTAAAATAATATTTAAATGT:1 - chr3R 22852686 3' - blood 496 1 59.41 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCC:1 - chr2L 21683392 3' + pogo 2078 1 56.44 CGTTGGGTGTGCTGGTCTTCCTTGCACAGATATCTTTTCGTTACATACATTAATGAATAAGATCAAGAATTGAGCGTGCTCAAAATTGCAGGTGATTTTAT:1 + chr2L 6990676 3' - Gypsy12A_LTR 2172 1 79.21 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCGCTCTTTACTTCTTGTGCTTTGCAACCAAATCGATT:1 - chrX 3305144 3' + transib2 2787 1 60.40 TAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACAGATCCAGCGGCAGT:1 - chr3R 23275231 3' + roo 403 1 73.27 CGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGGGGTAGAAAACGAGCGAGAGAGATTCGTTGATATGGTTGTG:1 + chr3L 9124326 3' - I-element 216 1 59.41 TTTCAAGTTCGAAAATTAAAAGAAAATAGGAGGTAAAAGGGGGAAGATGCGAATATACACATTGGGCATGATGATGTTGTGGAAGTGTCCCTCCTTCTCGT:1 - chr3R 19760461 3' + TAHRE 147 1 61.39 TGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATAC:1 + chr3L 23456268 3' + 1360 3371 1 57.43 TATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTCACACAAAGCACACGAATATTTGCCCGCTACTTGGTTTTTT:1 + chr3R 4669979 3' + roo 8608 1 73.27 TTAAANTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAG:1 + chr2L 17646233 3' + flea 4984 2 54.46 TCTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAGCCAGGTCATCTTCAAACATCACTGCTCTTAGTCAGCCAAACAGCGACTTTCTTCTGCATTGAAAATG:1 + chr3R 1860805 3' - G4 3369 1 54.46 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGAAGCT:1 - chr2L 16674871 3' + roo 361 2 75.25 CCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTTAGCTGCCAACGCAGACTGCGGCGTTTTACAATTGCTGCCCCATTTAAGTTAATATGTACTCATAGCAAGG:1 + chr2R 433273 3' + rooA 183 2 67.68 AGAGANAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGATTTGCGGATAAATGCCACATTGGCTGG:1 + chr2R 20756559 3' + micropia 5280 2 72.00 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCTTTGGTGTCTTTGGTTGGACGTATGTTGTAACCAGGCTTCAATAAGACTGAGCTCACATTTTGTTGA:1 + chr2R 5531196 3' - 1360 65 1 60.40 TCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCAC:1 - chr2R 16980508 3' + copia 5072 2 82.18 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTGACATAGCCTCGAAAAAAAAATGTCAACCCTTTTCCACTCCTTTACGCCGGCT:1 - chr3L 4801766 3' + roo 9042 1 52.48 CAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGACTCGACTATCTTCCCTTGTTTCCTAATAAGATATGGCTGCCCATTAGAATTCTGCCGGTGGTTTGTCC:1 - chr3L 2370170 3' + INE-1 543 1 69.31 GACAAGTTTACCATTGCCAACAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTGTCTTTCATCGTTCATCTTAGTTCCCTGATCTGGTTCATTTCCCACATACAT:1 - chr2R 3600930 3' + Doc2-element 419 1 65.35 ACACAGTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATCCTGCGGTGAGGAGG:1 - chr2L 12815028 3' + hopper 1395 1 59.41 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAACATTTAATCTGATATACGAATGAGCTTAAATTGAGTA:1 - chr3L 19454670 3' - diver 40 2 65.35 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACTCCATACTCCATACACCAACTCGACTAAGCCCAAGTGGCTATTCATCCGTATGGCCGGGTTGC:1 + chrX 8972461 3' + 1360 3379 2 61.39 ATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAAGTTTAGTTTCACTTGTCGCCCAGCTTGGTCCACTTGCTGCGCAGGAAGGCG:1 - chr2R 18399064 3' + S-element 1702 1 61.54 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACTTACAATTCCACTCGCAGCCGGAGTCCATTGTGCGAGGAGGAGGC:1 - chr2L 12949783 3' - 412 39 2 58.76 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGAAAATGCGTTTGCAACAACTTTTATTGCCTACT:1 - chr3R 17896955 3' - hobo 44 1 77.23 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATTATATCTGTCCTTTTGCATTTCATTGCGTTTGCTTATTAA:1 + chr2R 23584808 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.39 TTAATTATTTGTTTAATTTATTTTATTTAATTTAATTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGCGATTCGTTTTATGGCAAACCCAATGCGG:1 + chr3L 12730815 3' - HeT-A 12 1 71.29 TAATTATTAAGTAGAAAAGGAAAAAAAGAATATTTCTAGTTATTAATTACTTAATACTTACTTATTACTTACTTATTCGCACCTGTATATGGCTTGCTACC:1 + chr2R 9500044 3' - G5 4725 1 54.46 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAGTTTCCGGCTAAGCTTGTAAGTTTCTACCAAAAAGAACACTTGGAAATTGAATCGAAATTTTGAA:1 + chr2R 5840708 3' - Ivk 14 1 65.35 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCCACGTATAGTATACACGAAAGCTCCGAGAGACGCAGAGAGAGAGGATAAGAGAGAACTTGCGC:1 - chr2R 10444219 3' + P-element 2875 1 67.00 GCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATCATCTAATTGACCATGTTTTGCCCCCATCAGATTTACGATTGGTTTCGCCGTGGCTG:1 - chr3R 24763291 3' - pogo 1660 1 59.41 AAAAAATTTTTAAATGTTTAAATCTCTATTTCAATAAATTCGTATTTTTTAGAAATATTTGGATGATATTGAAAGAGATTGACAGAAAGAAATTATAATTT:1 + chr3L 6104143 3' + Tc1 56 1 77.23 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTTGCCTTTGTGGTGATGAGAAGTTTTCGTTCGCTTCTGTGGATAGCAAAAAAAGGAAATTGTATTCGG:2 + chr2L 17646256 3' + flea 5007 2 64.36 AGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAGCTGTGCTGGAAGTTAATGGTTAACGGAGTGTGTGTGTGTCTGCATAGGTATGTGCCATCAAATCCATCAATTAGC:1 + chr2L 2958317 3' - Doc4-element 289 1 61.62 GAGCCNAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATGTACATATATTGTTTTTTTTGGCAACTCTCATTGCACATCC:1 - chr2R 18675490 3' - opus 145 4 67.33 AGCGTTATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGTAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGA:1 + chr3L 23839729 3' - McClintock 5961 2 67.33 CTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGACCTGTTCGCTTTAGCGATATGATACCACTTTAAGTCGTTTGACTTTAGCAAAAATTAAAACGCATCGACACTAG:1 + chr4 184047 3' - 1360 148 1 51.49 GGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTATTTCAGCAAAGACGCGACGA:1 - chrX 8491398 3' - P-element 26 1 55.45 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAAGCCACATGACGCCACTTATATACATGTCGGAGATGCATTCTTATTAGCGTCG:1 + chr2L 23390406 3' + P-element 2882 2 57.43 ACTCTCTCTCTCTCTCTCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCACACCTTGCATACATTATCTATTTCATTTTTTATTGGTTTCTTTT:1 + chrX 13872702 3' + blood 7179 2 49.47 GTACANGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGGGGGAAATCCAGTAGCAGCATAAGCGCCCCGCCAAACTGAC:1 - chr3R 22431075 3' - Max-element 38 2 58.42 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGGGCATGGCCATAATAAAAGAAACGG:1 + chrX 18837004 3' + P-element 2870 1 49.28 AAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTGGTAGT:1 + chr3R 2533957 3' + gypsy8 4817 2 57.43 GTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATGCTTAAATATGTAGAACATTAGCTTGTTTTTCATCTAT:1 - chrX 14768016 3' + BS 5058 1 61.39 ATGTATGTATATATAAGAATGTTATGGTTGTGTGTGTGTGCAGTTTTTTCAGCAAAAATATTTTATGCATGCAGGTGAAAATTATAATAGACGTTGAA:1 + chr2L 6302747 3' + Dm88 22 2 75.51 ATAAATAAATATAAATAAACATATTAAGTTAGCTATGTTCATGATTTAATGTGTTTACCCATTTTTAAGTCGCATAGAAAAATTCATTAAATGCTAAATAC:1 - chrX 6898442 3' + Tc1-2 482 1 39.60 CTCAGTTCCTTTGTTTTCCCCATGCTTAACAAATTTATGAATGAAATAAAAGTAGGTAGTAACACTCTAATTAATCTTGTTAAAATTAACAAAACTTTTAA:1 - chr2R 9243157 3' - Tc1-2 357 1 64.36 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGGTAAA:1 + chr3R 10277280 3' - Doc 48 1 65.00 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGTTCAGC:2 + chrX 3817540 3' + roo 404 1 73.27 CCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCACCGGCATGTGAACTCGGTCTCCCCCAAGCAGAGTTCCAAGCAGT:1 - chr3R 31560161 3' - 1731 293 2 56.44 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACCATATGTTAAGGTGTTTATGTGTCTCGCTGTCTAAATATAACAGCTTTTCTTGATTCTCG:1 + chr2L 19684038 3' - jockey 4688 1 57.00 CACAGTCACCTCGTTGTCGCCTCTGTAGGCGTTCAAGGAGTGAAAGAGTGCGGAAAAATGAGACAACTCCTAAAAGCCTTTCGTTGTACCGCTTGCTGAGC:1 - chr3L 5999652 3' - Chouto 314 2 76.24 GAGGCNTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATTTATGTCATTATTCATGGCCCATATCTAAACAGTCATCACAAAAA:1 + chr2L 4743196 3' - I-element 33 1 54.46 TTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCGCTTTCAGACTAAGTGTACATGTGTGTACGTGTGTATGTGTGTGATTAGATCAATTGGTACACCCCCC:1 + chrX 10742902 3' + Cr1a 286 1 69.31 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTT:1 + chrX 3763233 3' - 297 6613 2 65.35 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTATAATAACGTACTGTCATATTATACATTTTTGGTTTGTATTTCGGATTTTTCAATCGATTGTCGCAACCCTCA:1 + chr3R 11263491 3' - roo 4 2 76.24 ATAAAAAAAATTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTC:1 - chr3R 31887763 3' + HB 1555 1 67.68 TTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTGTTGCACTCTGAAAGACAGCTTTTAAAAGAGCGATAAGAGAAGAAAAT:1 + chr3L 9383579 3' - P-element 29 1 49.50 ATATATTAATTTGCTTCATCCGTTTTGCCTGTTCTGCCTGCGATTTCCGCTCATAAATAATTTAAGCATTTTTTGCTTGTCCGTCTCTGGTTTTTTGCACT:1 + chr2L 584750 3' + Gypsy12A_LTR 2057 1 73.27 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACATGTATTTATTTTTGAGTTGCACGCCACATGCACTTCTGGTTCAAAGGCTATGTTCATATTAT:1 - chr3L 13060306 3' + 412 476 2 62.38 AGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCCTGTGTAATAATAATTTGTGTGAGCTTTTCAGC:1 - chr3L 5640114 3' + Cr1a 244 1 61.39 TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATAAATTTAATCAATTACGAATCTAAGTTGATCAATAAACAGAAGATGCCAAGACA:1 + chr2L 2074783 3' + roo 9048 2 58.42 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGC:1 - chr3R 10952249 3' + roo 397 1 65.35 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATGTATATTATTTCAATCCTACTTATCGCTCTGCTGGCTTTGTTATTTACACCGGCAACGAGAGA:1 + chr3R 31101356 3' - 297 9 2 64.36 ACCAAAAAATTTTCTGTGTGTGGAAAAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAACAAATCGATATCCAAAAACAAAAGCCAGCGAGTAAGCGAAATTAGCCAGCTA:1 - chr3R 5078733 3' + Doc3-element 142 1 57.43 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACTTGTTAGGGTACATATAATTGTTCTCTGGTTTGTTTAATT:1 + chrX 6701527 3' - FB 37 1 62.38 GAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATGCATGGGTGGTCTGCCACAGCATCATGGGACAAGCTTGTACCATGAGCAGTATAGCATGAGCCCATATC:1 + chrX 21994008 3' - McClintock 5953 2 77.23 GTGTTGGTGGGTTCTGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCATGTGTTCAGTTGCAAAGTGCCGATAAATGCGCACTTCTCCGGT:1 - chr2L 15169309 3' - I-element 4961 1 62.38 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATCTATATTAAGATTAATATTGTTATTATTTTC:1 - chrX 10827425 3' + roo 9028 1 72.28 TATCGTGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTATCTGGCTGAAAGTGCGCCTGGCCACACGCC:1 + chr2L 16201552 3' + hobo 2916 1 58.57 TATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAGAGGATGTTATGTTGAGGATGGGCATGCGGATGTGGCAGATTTGTACAGCATTGAGAGTGGCTATTT:1 - chr3L 2926046 3' - copia 4880 2 37.62 CTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGAATAAAAAAACACAAACAAGAAAATACACAAATAAATAAAAA:1 + chr3R 3758646 3' - Cr1a 4098 1 70.30 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAATCCTATTTCGATTTTGAAGTTTGACCCATTAAAGCAAATAGAAATGAATAGCTTAACCCCTA:1 - chr2R 9770165 3' + I-element 5343 1 60.40 ATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTGCTATTCAGATAAGATAAAAATGGCATAGAC:1 + chr3L 3084538 3' - F-element 4644 1 69.31 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTAATTTGGGATTTTACAGTTAGCAAAAGGCAATTCAAATCC:1 + chr3L 4801552 3' + roo 9031 1 72.41 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGACTCATAAATCAGCTACACTTGTGGCCATTAAAGCCCTCGAAGCCAAGTCAA:1 - chrX 18836946 3' - P-element 23 1 60.40 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAATGACATAAATTATCAACTTGTTATGAGTTCTATCTG:1 - chr2L 4743145 3' + I-element 5321 1 59.41 GTTGTTGGCAAATCGATAGAAATATACAAGACTAATAATAAAACGAAAAAAATCAAGAGATCCGAAAGTCAAATTTTCCGACAAGAAGTTTCAAAATT:1 + chr2L 21682841 3' - INE-1 446 1 69.39 GACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGATGTAATAAATATCGACATATGTGGTATGACCATTAATATCATAGTTTTTCTGACACATG:1 - chr3R 19132260 3' - Ivk 20 1 59.41 GTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTATGTTTCTATAGGAGCTGTTGCCCACCTTGTCCA:1 - chrX 15293448 3' - Quasimodo 51 2 67.33 CAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGGATTAATCTACGCAAGAGATTTTCGCTTGAGTTATTTT:1 + chrX 19426292 3' + mdg3 206 2 62.38 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCAT:1 + chr2R 20744244 3' + roo 396 1 60.40 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTAAATTCCGATTGACTACGAATCCCTTT:1 - chrX 20620546 3' - pogo 44 1 75.25 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGATGGGAAGATGAGGAGGCCAC:1 + chr3R 22800177 3' - flea 49 2 77.23 AAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGCAAATCTTATGGTCAATATTTTGGCAAATATTCGCATTGAATGACTGGATCAGCCCGATTAGGCACAAGTT:1 - chr3R 31256952 3' + transib2 2821 1 74.26 TAAATTAAAATGTTAAAATTATACTTAACGAGTGCTCCCTCTACTTTTCCTGTCTTCTGCCTTTAGGTTTTGCTGCCCAGACTTGTAAATTACCCACCAAA:1 - chr3R 8929064 3' + 1360 3053 1 39.60 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGTTTTTTTTAATGACAGAATATAACA:1 - chr3L 25782394 3' - F-element 61 1 81.44 AGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACATTTGAAACAATTTGCCAACAGCAAGC:1 + chr3R 22642186 3' + hopper 1034 1 77.23 AGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAG:1 + chr2R 4483263 3' - Ivk 38 1 58.42 TAATGNAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTAAAACCCTCCCCCAACCGTTTTA:1 - chr3R 10734246 3' - pogo 37 1 65.35 GTCGTCCCCTCGTGCCGTCTGGAGTTCCATGCCTTCGACGGTCACCCAGCGCGCACATGCCCGCCTCTATTTTGGACAGCTTTGCTCGGCTTATC:1 + chr3L 8970169 3' - gypsy10 194 2 70.53 TAATAATAATAATATTAAAAATATTAACGCTACGAGTGGAAAGTGCAATGTGCAATGTGCGATGTGCGATGTGCAACCTGTGTGACCTCATTGATTAGCCA:1 + chrX 10332869 3' + mdg1 7077 2 68.32 TTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAATTATATAAAAA:1 + chr3L 19951290 3' + Ivk 5375 1 72.28 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCATATACTAAGCAACAGGGTTGCCTTG:1 + chr2L 7800101 3' - P-element 52 1 28.71 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTTATAGTAAGTTAGTTTTCAAAGCTCGGCATTTTCTCCAGATG:1 - chr2L 2074710 3' - roo 8700 2 64.36 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTAGAAAAGTTCGTAACTGTCGAGCAACATG:1 - chr3R 6735254 3' - copia 18 2 63.37 AATATAAATTATAAATTACAACAGCCAGTTTTCCCCTCGAGTTTCCCGGCCGGCCAAGTTGTTTGCTTGCCATGTGCAGCGGGCCTACAAAACATATTTCC:1 + chr2L 18430176 3' + copia 254 1 74.26 CATTGAAAAGCAGAAAATTCAATTAGGTTTCCGCGAAGTGCAAGTGGTAATGCAATTGGAATTGACTTGTGCGTTTCACCAATCGCCGCGGGGATGTGGCG:1 + chr2R 16640263 3' - S2 38 1 60.40 AAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAACGAATCTAGTATATATATCCTTATACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACATAGGAGACATTGCTTCTTCCATC:1 - chrX 5853598 3' - INE-1 577 1 78.22 GATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTGATAGGGAGTCCAGAATTTTCAGCAGCCA:1 + chr3L 25332039 3' + F-element 204 1 67.00 TGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAATGCATGTTAACTTGGAGAAATTTATTCGTTTACAAA:1 - chr3R 9284458 3' - I-element 5201 1 64.36 TAAAGGTAAGAAAAGTAAAAAAATGTAACAAATAGCGGCTAAGAACACTAGGTTTATGGCCGAATGGCCAGATATGTTTGTCCTTCGCTAACCTCCCCTAG:1 - chr2R 6002245 3' + invader2 4745 1 59.41 TATTTNGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAGTATCTTTCAGATAATTCTGTGGGGATTGGCCCACGCACAATTAAAGCCCTTTAAGTGATTCCA:1 - chr3R 22781945 3' + copia 241 1 62.38 CCTGTACATTAACGAAGGTTATTGAAGGTTATTAATGACAAAGTAGAAGAAGACGAAGTTTTAGGCTGTGAGTCGCTAGCAAGCTTGAGTGGAACTGCGAG:1 + chr3L 8740573 3' + gypsy7 447 1 63.37 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCACCTTCATTTGGTTGGAGCTGGAGGAGAGCACCACCATCACCAGAAACAGATCCACAGATCCAGCGGCAGTAG:1 - chr3R 23275229 3' + roo 405 1 75.25 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTT:1 + chr3R 23275336 3' - roo 22 2 53.47 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCACGCCCACGTTTCACTTTAGCATCCTGGA:1 + chrX 2179554 3' - Doc 24 1 56.44 AGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGTTGACGATAATAACGCAGATGAATGGAAATACTTTACGAGTCACTGGGGTGAACAGAAATGTCAACATCTCGGAA:1 - chr3L 22395372 3' - F-element 473 1 66.34 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGCTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTGGCCAACACGGGTGGCTGCTGAAATTCTCG:1 - chr2L 18430093 3' - copia 48 2 72.28 TGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCTGTAACCTTACAATATGGATGAACGCCTTGTGAGTCTGAATTACCGTT:1 + chr3L 27396604 3' - Tirant 108 2 52.48 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGT:1 + chrX 5092977 3' + roo 9023 2 71.29 AAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTGTGTAATTAAACAAAGCAATCGATCAGATTCGGAATTAGATATCATTATGTAAACAACTG:1 - chr3L 10193878 3' + 17.6 7302 2 70.30 ATAGTTTAAAATTGTCTTCAGGCTGCAAAGAAAAGCCGCGGCAACAATAAACATTTAGTGACACGCGAAAAGCGATAACTACGGCGGTGATCTGGATGCCA:1 - chrX 9104693 3' + HeT-A 131 1 74.26 TTTGCTTGTATGAGTAAAAACAAGAGCCATCGACCAGCGATTCTGCCAATAGATTGCTGGATGCCCAAAAGCAACGAATGATTAAAAGAAAAAAGAATAAG:1 + chr3L 27200566 3' - 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blood 35 2 57.43 AAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACCCACATAAGCCGCATAAGCCAAAACAATCAGTCGGACGGGAGTGATGAGGATAAGTTTCGC:1 - chr3R 6608755 3' + I-element 5342 1 64.36 TACGCTTCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCGGGACTCCTGGCAACAGCAAGACAATGCTCGCCAAGGCGGTGGCAACCGAATGCGGAACTACGTTCTT:1 - chr3R 5228733 3' + 1360 3382 2 51.49 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCCCTTATGCGAGTTCTTATCCCAGCCGACAAAGGATCCTCCCAGT:1 - chr2L 3951585 3' + Transpac 279 2 59.41 TTACATATTATTATATATACATACATATTACATACATATTTTCAACAGTTATTAAGTTGATTTTTTTCGCAATTTCTCTCAGTGTGTTTTGTGTGTAATTT:1 + chr2L 21570256 3' - Dm88 4386 2 57.43 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCT:1 - chr3R 10952255 3' + roo 396 1 62.50 GCGGGTGAAGCCGATGACGAGGGAGGGCGGGCTGCATGGGATGAGATGTGGACACGGCTCTAGTTGGGCA:1 + chr3R 16222692 3' - F-element 460 1 62.86 GTTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTGGAATACTAAATCAATAAAAGTTAAGC:1 - chr3L 5130865 3' + jockey 4667 1 73.27 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATTAGTAGTCTCCAAAATAATGAGAATTATTATTAAGTTAATTTTTTAATTAAAAAAAAT:1 - chr2R 5067627 3' - F-element 31 1 55.00 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACATATGGAATCGCATTTAAAATACAAATTGAACTTTAAAATGGCAATATGATGTGGACAAATGGCTCATTTGAAATG:1 - chr2R 7861632 3' + roo 408 1 79.21 TCCACTACTGTTATAAATGCAACGGACAGGATTGATTGGCATTTTATTCCCCCGGCAGGACCTCACTTCGGAGGGATTTGGGAAGCTGGAGTTAAGTGAAT:1 + chr3R 19447580 3' + roo 8597 1 73.27 ATGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGATTTTCCGCAACCCGCTTAATCAGATTGATGTACTTAGAAGCCCCATTGCTGTCCCT:1 - chr2R 21774258 3' - Max-element 473 1 63.37 TGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCAAAATTGGACATACCAGCTAACCAAAAATAACCAACGCCAACTGCAGCTCGGATGCGAAGTGT:1 + chr3R 20783201 3' + G2 3037 2 67.33 AAAGTGTGGGCGTGACAGTTTTGTGTGAATTGTGGGCGTGGGTCAACAAATACATACATATGAAGAAGAAAATCAATTTTAATGGTTTATTTATTTGTGCA:1 - chr3R 24400918 3' - INE-1 245 1 54.46 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGACTGACATTTTCATTTGATTTTAATGCGAATTCATCTGTCTGAATTTAAAGCATAGCTATTAGATCT:2 - chr2L 7488835 3' - roo 8674 2 65.35 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAACACAAC:1 + chr3R 21907534 3' - Tabor 6874 2 60.40 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTCCGCTGTTTCGGTTTTTGCTCTGCTGCTCTGTTCTGTTCTGTTCTGTTT:2 + chr2L 3945307 3' - jockey 4699 1 53.47 TTAGAACATCAACAAGCATCTCTTAATTACTTAACATTTCTCTTTATATCTGTGCCCACTCACCCGCAATACCTTCACTTGAGTCGTAGAAATCGTCAGAA:1 + chr3R 10015191 3' - invader5 3574 1 53.47 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCCAAGTCACTGAGGTTATCGAAGTCACGGAAGAGA:1 - chr2R 14675553 3' + roo 9031 1 67.33 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATATAGATCTCCCATATTTACATTTCAAATAATC:1 + chr3L 3032295 3' - opus 7156 4 70.30 ACAAAGTACTTAAGCTATCTTAGACTTGTGAGTAGCCAATTTTAATGGCCCACTATAAGTCTAATGATTCTAAACTAGAAATTGTTCACGTTACAGATTGA:1 - chr2R 2964313 3' - S2 1482 1 73.27 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACAACACCGAAAGTGTTTCTAGCAAAAAAGCCCCATGCCAAAA:2 + chr3L 6044803 3' + Tabor 448 2 66.34 CGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCACGTTCAAAGCTTGTTCGGCTAATTGGAGTGAGTATGTTGATCTGG:1 - chr3L 11148524 3' + Idefix 198 1 68.32 TGGCCNCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTTCGCCCTTCTGGCGTGAACAGACTCAATGAGTCATAAAAATGCCAAAAATGTGCGCCCAACTGGGCGAATAT:1 - chr3R 15598656 3' - Max-element 28 2 52.48 ATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATAATATAGGCAACACACACAGGCGCTATATATCAAGTCAGGTATATAAGCGGAATTTTTGACTCAATTTTTTTT:1 - chr3R 15177404 3' - jockey 4931 1 77.23 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCTTATTTTCAATTTATAACAAAGAAAGAAATGATCTAGTATGATCTATATTCCACTTTTGATAA:1 + chr2R 17261669 3' + pogo 2088 1 52.48 ATCTATCGATATCCCAGAAAAATGATGACATTTTCCGTTCGCATTCTCGGTCCCACTTGGACCACCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 + chr3L 23747153 3' + INE-1 500 1 72.28 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATGATTTATTGCAAATTTAATTAAAATAAATACG:2 + chr2R 19209484 3' - jockey 4759 1 79.21 ACTTGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGATTATGTTTAAGTGCAACACGTATAAGTTATGTATTCTCCTCCTCTATATCCAGGGGGTTATGAGTATCTCCTCTT:1 + chr3R 3186142 3' - I-element 4976 1 67.33 GGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACAGCAACAAGAGATACATTAGCACGAAACCAAACTCGAGGAAAAAACTTGGTAAAACAGCTTAA:1 + chr3L 22966539 3' + I-element 343 1 68.75 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGGCCAAGTACTTAAAGTGCCTTTGCAGTTCAACACGGAC:1 + chrX 13546714 3' + roo 9049 2 57.43 TGCATTGCTTATATTCATTTTTTTTTTCTCTTTGGCTAATTAGCGTAGCCCCTGGGAAATGGAAATGCCTCGGCCTCCGCCCGCAGCTCTCAAAAGTCGAG:1 - chrX 7583574 3' - invader2 305 1 70.30 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTCAAATTTTATCTTCGGTTTGTTTGGTCT:1 - chr3L 12101108 3' + jockey 4948 1 73.33 ATCAATAAAAAAAAAACAAAAAAAAACAGAAAAAACGGAGAGCGTAGCATACTTTTAGGCATGCTGCTATTTCACTTTGTCCCGCACAAATGAACACCTCC:1 + chr3R 7290488 3' + R2-element 3583 2 73.27 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGATAATATGATTCCACCTTCACGTATCTCATTATTTTTAG:1 + chr2R 14341845 3' + opus 7466 2 67.33 CTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATCGTACAATGAAAACAA:2 - chr3R 20137252 3' - Burdock 6155 2 58.42 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATAGAATTGCCTAGAATGATTTGAAAATAA:1 + chr3R 28645826 3' - F-element 62 1 75.25 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCTTATAGGAAATTGATTTGCTCGTATAGTTTTCACTTTATAGTTTTAAGAGCATTTAAAAGCCGGCTA:1 - chr2R 12082316 3' + mdg1 7449 2 69.31 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACTGCACTTCCTGGCCAACATACACTGCTCGTCGCTCTGGTCGTCCCTGCAAT:1 + chr3L 12888294 3' - mdg1 4 2 67.53 GCCTACTTTTGAAGAGGATGTTCGTTTTCCACCCAGCGCCCTTGCGGCTGTTGCATTCATCCACCCTCC:1 + chr3L 13339392 3' + mariner2 173 1 71.01 AAAGAAACTCTTATGTTGAAACTCTTAATATTGAATGCTTCAATATTAATATTTGTTTTATAAAACAGTACATATCTAAAAGTTCCTATAATTCTTGTACA:1 - chrX 16765112 3' + Bari1 1418 1 68.32 TTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAAATACCCTTAATCCTGTCCTGCGTGTGTCCCATTTTTGTGGCTCCT:1 - chr3R 13303452 3' - Tirant 461 1 60.71 TCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTGGACATGCAAATGTGGACATGCGTCCACTCCCTCGAGTCCCCAACCCATATCCATTGGTTT:1 + chr2R 15474880 3' + roo 395 1 65.35 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGCTTAACAACGTACTTTCTTAACTAAACCACCAAACGGAAAAAGTGAGATGTTCCATGATGCCACAGAGC:1 - chr2R 8345478 3' + roo 407 1 76.60 GTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGAGCGGACACCCGCACACACCTGCACGCAATTTTGGAGAGCGGGAGAGGAGCAACAGGCGCAACGTA:1 + chr2L 8300843 3' - 1360 494 1 64.36 TACAGCTGTGGTCAGAATAATAGTGGTGGGCAAAAAACGCATAAAGTGCCTAAAAAGACTTCTCATAAAGCCAATAAAAGCGTTTTAAAATATTTTTCATA:1 - chr2L 13261987 3' - HB 1629 1 69.31 AATAACAGTTTTGAGTAAACACATCAGTTATAAGTTTTTGGCACAAGAGGCACGCAGTACACAGAAGGACGAGCAGTGCAAGTGGAGATTGACCCTTGGAG:1 + chr3R 1143762 3' - transib3 458 1 58.42 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCTGGAGTGGCACACGATGCGCAAAATCATCA:1 + chrX 2179526 3' - Doc 52 1 76.24 TGAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCAAGTGCAGGCCATAATAAATTGCTAGCAATCGCATTTCCGTTTC:1 + chr3R 29470853 3' - hopper 29 1 53.47 TCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAACCGTTTTTATTTGCATTTATTTGGTAGTTTTATT:2 - chr2L 11703245 3' + Tabor 7280 2 66.34 TTAAAATCGCCCCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATAATTTCGTTAATTCTTGCTAACACCACAACATAGCAGTAATGATTTTTAACACAATTTA:1 + chr2R 1924536 3' - 1360 2988 1 64.00 AAGTAATAGAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCAGCGGGATTAGCCGATGACTGGAGTGTCGCTGGAGGTCCTGGAATGGAGACGGAGTAATGCCCT:1 + chr3L 12314263 3' - Cr1a 4267 1 65.35 GAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAATAAACACTCGTGCATCGTGGCGTTGTCGGTGGCGTATGCGCAATATTGACATCG:1 + chr3L 7205144 3' - Doc 319 1 59.38 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGACGCCTTTTTCTTTTTCTTGGGTCACTTG:1 - chr2R 16980505 3' + copia 206 2 79.21 TTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATAGGTTGGTATACACTAGTAAAGATCACTTGCTGAC:1 + chr2L 8299020 3' + S-element 1674 1 70.30 ACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACATTCATTAAGAGTGAAGGTTTTATGTATTCCAGAGTTTCTAAATA:1 + chr2L 17722842 3' + blood 7359 2 55.45 GGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCG:2 - chr3L 11115123 3' - micropia 31 2 53.47 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACAAATGCACAACTAGATTTCGCTTTTCAGAATTCAAAATTCAAATGTTTCATACTCT:1 + chr3R 7184209 3' - 297 11 2 65.62 ATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATGTAAAAAAAAAATTAACCATGTTGAAAATGTCAAA:1 - chr2R 3591990 3' - Quasimodo 37 2 72.28 CCTTTACATTAACGAAGGTTATTGATGGTTATTAAGGACAAAATCTCATTCCCATTGAGTCACTCCGAGGAGATGTACGACGAGAAGAATCCCGATGTTG:1 + chr3R 11045508 3' + gypsy7 447 1 68.00 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTTTCAAACAGATTTCGTCTTTACCGAAAAAAATTATTATCGTGTCAGTAAAAATTCTGGAAA:1 + chrX 22945363 3' - BS 17 1 62.63 CGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGAGTAGTTTAACTGTCACATGGTTTAGTTGGGGAAAAGCGTTA:1 + chr3L 18080799 3' - F-element 4447 1 58.42 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATTAATATGGTCGGAAACGCTTTCTTCTACC:1 + chr2R 2947136 3' - opus 7045 4 73.27 AATTGTTTTTTTTTATTTGTTTCTTTTTTTCCTGAAACTACGATATAAATTATTCATACTTGTGTATTTTATTGTAAAAACATCAAGATGCACCTGA:1 - chr2R 20352675 3' - Porto1 165 1 74.23 TCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCCGTGGCGATCACACCTCGGTGGATTGC:1 + chrX 13773324 3' - mdg1 352 2 73.27 GTGGGNGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTTA:1 + chrX 2649912 3' - Tirant 8117 2 71.29 TTTTGCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTGCCTTGCTTTGGTTGTTCTCATTCGATGTGTGTGCTCCTCGTTATTCGAAAAGTGTGGAATATTCAAAAATTTAAT:1 + chrX 9749099 3' + Cr1a 287 1 58.42 TATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATCAATATGACTAGAGCAATGAATATATAATCAGCCGCAGGGATTCAGAAAAATAACTTCAATAGCGATTCTGC:1 - chr2R 16981771 3' - copia 245 1 69.31 AGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTTATTTGTTTGTTTGTATTTTCCACGTTGAG:1 - chr2L 17210293 3' + jockey 4946 1 72.28 AAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCTCAATAGCCGACAGCACAACAAGTTGGGAAAGGCGTACAACAAAATTTGAGAAGTCTGCATAGCTAAATTT:1 + chr2L 17962002 3' - invader4 3076 2 79.21 TTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACCCTATAAACTCGTAATATGCTCAAAATGATGCACTTAAAAACACATTAATCACATCGACAATTATTGC:1 + chr2R 22524695 3' + mdg1 7311 2 68.32 TCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCACTCGCCTACTCACTCTTTCTCTTTTTGTGGATCCCTCTCTTT:1 - chr3R 15993422 3' + Doc 384 1 56.57 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTAC:1 - chr2R 5953084 3' - pogo 20 1 57.29 AGTTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAACATATGTTTATACATGTATTCTTTATATCAGTACCGCGAACGCAGCAAATATCCATGTGGAATGTAACA:1 + chrX 639472 3' - INE-1 97 1 56.44 CGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTCACGCTCACGATGAACACTTCTCGCGAGGATCGCGAATTGTGCACCAGTGTCGCGTACGACT:1 - chr3R 13076466 3' - Ivk 5132 1 68.32 AAAAANTTCCCATTAAAACTGTAAATCACTGCTATTTTTCTGAACACAGCTGTATACACATACTTCCAGCACACGCATGTCTAACTTTTTCCTCGTTGCGA:1 - chr3R 31887756 3' + HB 1560 1 71.29 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTTTGCTACTC:1 + chr2R 8345569 3' - roo 34 2 59.41 CACTANCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGTGCAACTCGACTTTAGCATTCTCTTATGTTTTAAAATACATTTGACATTCACAGTTCATTTTGTGACGC:1 + chrX 21421874 3' + INE-1 541 1 89.00 AAAAAAAAAAAGGTAAAACAAAATGGTATTAATAAACTAGCCAACGAAGTAAACAAGGTTCAATGTCATTTGAAAACCTCAATTTCTGTGGCAATTGGAAT:1 + chrX 7372606 3' + Doc2-element 232 1 85.15 TCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCAGAGTCTTTCGGAGAACCTAGTAATTCCAGGAAAACGGTCAGG:1 + chr3R 19449002 3' + roo 411 1 50.50 AAAATAAAAAAAAAAGAAAACTCCGGCTAGATGGAGTGTTAAGATAAGAAGGTAGGACTTGTTAACTGACATTACACCATTTACATTTGTAGTACTAAGTG:1 + chr3R 13998335 3' + HMS-Beagle2 489 2 66.34 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCGTTGGAAAAAAGCGTTTTGCGCGGGAAT:1 + chr2R 10543495 3' + P-element 2840 1 32.67 AGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTCAACGAATCTAGTATATATATCCTTATACTCTACGAGTAACGGGTATAACAACATAGGAGACATTGCTTCTTCCATCT:1 - chrX 5853597 3' - INE-1 576 1 78.22 TTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCTGCC:2 - chr3R 12047402 3' + Stalker2 382 2 57.43 TAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGGCCAAGGCAACCAGCAGCAACAACAACAA:1 - chrX 4602268 3' - roo 9029 1 66.28 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGTGATTTGATGAGCTCGGAAACCGGATAGGATGAAAAGTGATCTTTGAAATGAATACAGGGTAA:1 + chr3R 26952665 3' - jockey 4768 1 64.21 TTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACA:1 + chr3L 18337689 3' - Juan 4074 1 74.00 TATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCTATATCTATGTGTCCAACCTCATTGTGATCCTTATATTACATTTTCTGAAAAT:1 + chr3R 20840764 3' - 1360 239 1 52.48 ACAGAGACAGCGTGAGATATGCTAGCAGACATTTATTTATTTTATTTTATTTTTACTCAGTTGAATGATTGTCTAAAATTTTCCTATTTCAAAGTGTTCCT:1 - chrX 777728 3' + G2 2827 1 75.25 GTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATG:1 - chr2R 12185323 3' + accord 7361 2 54.46 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGGGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTATATATGTATGGTTCCGGTAATTGG:1 + chr3R 26842859 3' + opus 455 2 76.24 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGGCCTGTTGGACGTAACAGCGCTCTGTTGGCTAACAGTGGGGAAATCGATTACAGAG:1 + chrX 19268955 3' + P-element 2868 1 56.44 TTAATTGAACATTCTCGTTGAGCCAAAAGGCCATCGAAAGACCACGGGGCCAAAGTCACGCCCTCCATCCCACTCTTCTCAAAGACACATTCTGCAAACCT:1 - chr2L 22098789 3' + gtwin 319 2 67.33 AAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACACACGAAGGGGCAGGATGTGGTG:1 - chr2L 22084500 3' + copia 5069 2 77.23 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTG:1 - chr2L 16884800 3' - pogo 14 1 54.46 TGCACCATACATTTAATTAATTTATATATTGTGCTGAGCAAATTCAAATTCCAAGACGGAGACCTAGGAATTTCATTACAAAAACATTCTGGTCAGGCAGA:1 - chr2R 7552208 3' + springer 383 2 78.22 CTTGANCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGAAATAGGAAGTGGACAAAGCTTTGTGATCCAACGATCTTTTTTCGCAGAGTATCGTATCTCGTAGTGGGG:1 - chr2L 18562645 3' - diver 5822 1 57.43 GTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAACCGGGGCACAATTAGACTG:2 + chr3L 23839732 3' - McClintock 6 2 72.28 TCCAAGTATATTCACTAGAAACTACATACCCCTCATCTCTCGTGAGTTACCTGTAATGGCGGAGACGCCGGGTACCCATGTAAGCGTTAGTTTGGGTGTGC:1 - chr4 1180410 3' + Cr1a 4111 1 70.30 TTTATAAATATTTTTCAAAATTTTTCGTTTAAATCCAGTGCTGCAAAATCTGCAAGTTTCGGTACTAGAAATTCAAATTTAAAAGTTACTTTCAGAATACA:1 + chr2R 24269455 3' + copia 4666 1 77.23 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAGAATGGCTCCTCGAACAACATGCAACAGTGGAA:1 + chr2L 12324114 3' - roo 19 2 62.38 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTG:1 - chr3L 7075879 3' + roo 9039 1 60.00 AACCAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTCTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAAGTGTACACCACTTAATATTCCCAACAA:1 + chr3L 11257384 3' + 1360 16 1 46.53 CTTTCAGCTCTTTTATTTAGTTATTTAACTAATATTTTCGTGAGCAAACCATTAAACTTCAATCATCAAGATATCAACTTTAACTGCAGTCACCTTTTCGC:1 - chr2L 11711738 3' - F-element 99 1 67.33 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTAGCGCGGCTAAAATTAAACGCTTTTCATTGAGCAGCCGGTGCGGGAAATCTTTGGGAGC:1 + chr3R 20556208 3' + Tirant 378 2 58.42 ATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTAC:1 + chrX 22386785 3' - hobo 62 1 54.46 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAA:1 + chr2L 14612097 3' + roo 9037 1 54.46 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTAACA:1 + chr2L 13136813 3' + roo 389 2 60.40 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCGATCAAACCTTCCAAAAGATGTTGGCAAAAGCGTGGCTGCCGATAATTCAG:1 + chr3R 13359844 3' + 1360 3363 1 69.31 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAA:1 - chrX 13508705 3' - roo 48 2 75.00 TGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGGATATTCGAACGAGTGAGTTTTGTGCTGATTATGAGTTTTCAACTAAGAGGCTCATTAGGGTTTG:1 - chr2L 2084116 3' - I-element 180 1 67.00 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTATTTTTTTATATACAAAATCACCAAA:1 + chr2L 12479540 3' + pogo 2057 1 82.18 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTT:1 - chr3R 20878446 3' - 297 6599 2 55.45 GCGTTCCGGATGTACCAAGGTGCACCAGTTATTGTTCGCAGGATGTTTTATTATGCTCGTTGTATTATTTAAAACGGCTGTCGTGGCTTTTCGTAGTCTTG:1 + chr3L 9177340 3' - Doc4-element 2696 1 72.28 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTGTGATTTGATGAGCTCGGAAACCGGATAGGATGAAAAGTGATCTTTGAAATGAATACAGGGTAATCG:1 + chr3R 26952668 3' - jockey 4771 1 63.37 ATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAACAATAATTTGTGCAGTTGTATGACAAAGCAGCTGTTAAAGTGACAATGGCATATGAACAAAATTTGTCAAGACAAA:1 - chr3L 17878729 3' + hopper2 392 1 53.47 ATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCA:1 + chr3R 7388421 3' + HMS-Beagle 7026 2 65.26 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCCAGCATCCGCAGTAGGAGCTTTTGGTGGCGCCCTCTGTGCGC:1 - chrX 17968361 3' - Tirant 32 2 59.41 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACGTGCAACTCTAGATGGAGTTAAGTTTTCCCGCAGAAAAGTGTGTGTTTAGCGCTGCGAAAAGTCCCACC:1 - chr3L 17589189 3' + roo 356 2 64.36 TTTTTCACACGTCGCTAGCTGAATACTCTAAAAACAAATATTCTTATATAAAGTCAAATTCTTTTATGTACTCCATGATTTCAGCGTATATTTTTGGTGTT:1 + chr2L 173365 3' - 1360 422 1 57.43 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACATTATTTAATTCGACAATTTTTGAACACACACATTTTACT:1 - chr2R 7868901 3' + roo 9045 1 64.84 CAGGTAAGTAGTTGTGTACTTGGGATGGGGGTGTGAGAACTCTATTAAATTGATTCGTGTTTTAATGGAATTGGGATACGGCGAGCGGGGCATGTTGTCTT:1 - chr3L 12993969 3' - HeT-A 5682 1 76.24 CATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTGTGTATAATTTGTCTAGTTCATTCGAGTTCATATAGGTTT:1 + chr2R 10513285 3' - Doc 4509 1 60.40 GGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAAAGGTCTCCAGCATTCGCACCTGTAGTTGGGTGAG:1 + chr3L 17820720 3' - Ivk 5085 1 76.24 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGA:1 + chr2L 14612087 3' + roo 9027 1 66.34 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGCTAAGGCGAGCACATTTTGATCAGTTCATTAAAGGCATTAAAATATAAAAACTAT:1 + chr3R 16400233 3' - blood 7032 2 58.42 CCTCCTCACTCCTTATCAACTTTGGAGAAGTAGACTGGCAGACCCCCCCGCGCACCCACAACCTTCTCTCACCGATCCGCTGGTCCTTGGTAACGCCTTAT:1 - chr3R 31204435 3' + G6 292 1 57.43 TTTTCGTTTTCCGTTTTTTTTTGTTGCTTGTTATTTTTATTTTTATTTTTTTTCTTTGCGAGTCTCGGGCTCACTGGGGAATCCCCAGTGCGACCATCTTA:1 + chrX 12175157 3' - Doc2-element 233 1 56.44 GTACGGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGTCACAAAATTTGTTGTGTTGTTCACTTTATAGCTCAAAGACTTATTTCGGTTAGATAGTAGAGTAACTGTTCA:1 - chr3L 24870914 3' + diver2 133 2 78.22 AGACTTTGTGGTCTAGGCTGAGGGGAGGGACATCGAATAAACGCATAAATCAACAACAAAAACAAAAAAAATGATTTATTTTTCTTGGCTGCTTCTTCAG:1 - chrX 7385556 3' - F-element 4214 1 76.00 TTCTTCTCCTTTTGGTTATGGCGGCAGCTTGTCAATTTTGCACAAATAGTTCACTGATTTATTGTCCGAGTTTGTTTGTTATTGCTTATTGTTACGGCC:1 - chr3R 6243196 3' - TAHRE 274 1 54.55 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATCAGCTTTTCAGCTCCCATTTGG:1 - chr2L 9774295 3' + 412 438 2 79.21 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAACACGA:2 - chr2R 5950676 3' - mdg1 7060 2 57.43 GTATTTTTTTTTTTATTTTTTTCCCAGCTTGCAGTGAATTCTTTTTAGCTTATAACGAAATAAGCGTCGTGTTTATTGGTTAGCTGAACGAGCACCAGCTT:1 + chr3L 12865445 3' - Rt1a 5087 7 58.42 GCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACGTTTTTTGGCCACGATTTTTTGAACATTTAACATAATAAGGACCTGCGTAATCTATTCCAGTATTAAGAAAC:1 - chr3R 19447209 3' + roo 8793 2 71.29 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATCGGCATTTGAAATTAAGCAACACGACG:1 - chr3R 24420979 3' - jockey 4804 1 67.47 TTGCGGTCATAGCGATAAGACGTAGATTTCATGTGTACAAAAAAAAAGAATTTAATGATAAGTGTATGATACCATACCACCATTTCATAAAGGTGCACAT:1 - chrX 8373138 3' + diver 116 2 65.00 AGGCTCTTTGACGACTCATTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGTGTAGAGGCACGCTTCAATGGTTTTCGAGCCCCT:1 - chr2R 21792736 3' - Tabor 7200 2 64.36 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATT:1 + chr2R 17626550 3' + mdg1 7418 2 66.34 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCATTCTCTCTTGTTTTAAAATACATACAAATTAAAATTGTTATAATTAATTTTTATTTTATTATAATGTA:1 - chr3L 24207133 3' - blood 9 2 74.26 ACCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAATCAACGTTGATTGATGTTCTATTT:1 + chr3R 16834062 3' + I-element 5299 1 75.25 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTATACAGTATACACGATGCCAAGTCGAGTGGTCCGTTCTGCTGTTTGCACAACT:1 + chr3R 27801360 3' + Burdock 6372 2 60.40 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGCTGTCCGGATCGTTTTGTTGCATCGTAACTTGCTTGTTTAAAGTTTGCTTTCGACAAGTTGATAA:1 - chr3R 10147807 3' - roo 10 2 69.00 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTCTTTAAAATTTGTTTCATAACAGCATTACATTTTAATTAAGAATTACAATATGTTGATTCCA:1 + chr2R 7174856 3' - Ivk 17 1 62.38 GCGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGTGTTTATATGAAATTTTTCCACTCACGACTCC:1 + chr3L 8459719 3' + opus 7462 2 69.31 TCTGTGTTGTCGCGAATCTGCTGACCCAGCGGATTTGGGGAATGCCTCCTCTGGCGGACTTTGTGCAGCCGAATCCTAATTTCATTTAAACTTTTCTTGGT:1 - chr2R 5805731 3' - gypsy5 219 2 55.45 TGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGTGGTGAAGGTTCCTAGAAAGTAAAGGAAGATATTCGGCAAAGTTTATGGAAACATGGAAACGAACA:1 - chr3R 19258256 3' - Max-element 295 2 69.31 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGTCCCCCCCAATACGTCACTATATATATATATAAATACACACACATACATACAC:1 + chr2R 16710255 3' - 297 6616 2 73.33 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTTCAATTGCTCTTGCGTGAAATGCAACAATTTGTGGCAGCAACAACGGCCAA:1 - chrX 3818972 3' + roo 9040 1 55.45 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCTTAATTTTCTGTTTTGATATGCAAA:1 + chr2L 7488906 3' + roo 9020 2 82.18 CCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGTGACATTTTTCAAAA:1 + chr2R 4659351 3' - S-element 1459 1 48.51 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAAGCTA:1 - chr2L 2060134 3' - 412 39 2 61.39 ATTATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGACTAAGTTGTACTTGCAACAACTAAATTAACTTCGAAAATGCGAATTTCTGATTAGG:1 - chrX 7711109 3' - mdg1 21 2 59.41 AGAGAGAATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGGATATTGTCAATATTGTCACATAGAACTGCTAAGAATCTGCGTAGTAGATCC:1 + chr2L 3440502 3' - Juan 33 1 50.50 TAAGTCAGCATTCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCACGTTTTCTTTTTGTCCCACTAGGCTTCCATTCCCTATTGACGG:1 + chr2L 22942741 3' + blood 7134 2 56.44 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCTTGTGTAACTCTTTGTTAAGTATTTATAGCAATTTAAAATGGACATCATTCTAAATAT:1 + chr2R 13650190 3' - mdg1 7056 2 61.39 CTGAATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAA:1 + chr3R 7168626 3' + flea 213 2 71.29 ATATTNAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATAAATATATGCAAAGTCGCTATTTACTTTAACAATAATACGGCCATTATGAAC:1 + chr3L 23839714 3' - McClintock 5976 2 54.46 ATGACCTAACACCTGCAGAATGCCAACGATCGCGGTCTTGCTCACTTTGGGTTGTCGATAACGACTGCGTAAAGTGGTCACCTTCGAGGATAGAGTTTTTT:1 - chr3R 5066462 3' + Doc3-element 351 1 64.36 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTCCTCTACTGTGCACGTGCCACCAACAGAAGGCCTT:1 - chrX 5092935 3' - roo 8699 2 70.21 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACGGTAGTTAAAGTGCCTGCGTAAAACGCTCTTAAATGAGCCATTAAAGACTTGAAGTACTTTTGGTATTCC:1 + chr2L 11703325 3' - Tabor 6848 2 71.29 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTATAGGTAATATGAATAAATGGGTCTCCCTATTGGATTAAATAGAATTCTTTGGTAACAATACATTTTTAAG:1 + chr2L 13136826 3' + roo 402 1 73.27 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGCCACATATTTTTCTGTGATTTTTTCACTCCTGCCACACTCCTTGGGTCGCACATCCTTTGCGCGCACACTGA:1 - chr3R 10952240 3' + roo 406 1 74.26 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATGTATTTATGTATATAGTAATTATGTATTTAAAAAAAAAAAT:1 + chrX 12585700 3' + copia 5088 2 66.34 TAACAATAAAATATTTAATTATCCCAAATCCTCCAGCTAATACTACTAACAAGCAGCTTTCCGCTCCACTTTCCCCATTTCCAAGCAATTTTCATCGATG:1 + chr3L 2571429 3' + transib1 1930 1 51.00 TTTCACTTTTTTTTTGTTTTTTGAAAAGAAGACATATGAGAAATATGTATGTGAGGAAATCCATTAGAAAATACATTCTATATGAGCAAATATTGCTGATT:1 + chrX 11150386 3' - Porto1 169 1 72.28 CCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATGTGTGCATGTATTTTTTCTGCAACTCGAGCTCTGCGGCTTTCGCTAAATTTCATAAT:1 + chr3R 7358577 3' + micropia 5093 4 53.47 GTAGGAGTTGTTTTTATTTTGTTAAGCTTGTAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCTTTTCTTTCAGTAGCTGGGG:1 + chr2R 12588936 3' - Porto1 258 1 80.00 TAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAACAGTCTCCAATTTAAATTAACTTCCGTGGGG:1 + chr3R 10277276 3' - Doc 53 1 69.31 CATAACATATGTATGCCTTCTGCATACACATGTATATGTATATACAATATGTACAATATGTAAAAACTTTCACGGGTTCAATAACTTGCAAAGTAAGCGAA:1 + chr3R 9489113 3' + Stalker2 229 2 62.38 ATAAGGTTTTTAACACATACAATTATCAAAGCTTACACCCTCAAAGTGATGGAAAAGCAATCGTTCGTTGTTGCCCGAATTCCCAGGCACGCAGCAAAAGG:1 + chr2L 17024590 3' - Porto1 124 1 50.50 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCCTCAAGGCGTTCCAAAAGCGATTCAATCAACTGTATTAAAGTTAATAGTTAAAG:1 + chr2R 24628836 3' - mdg1 11 2 63.64 GGAACATGGAGAAGAAGTAAACGGCGACAAAGGCGTTCTGAGGAAAAAACAAAATATATGTGCTTTATTATGGGTATATTTATCTGCAACTTGACGAGTTA:1 + chr3L 21328699 3' - micropia 4994 4 79.21 GCTGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTCTGCCGACTCGTCTTGGTGGCGCGATGCACAGCTGTGGGAAAAATTGTTAGCAGCCTGTGTTGGGTAACGTCGCGCG:1 + chr2L 4981308 3' + gypsy 147 2 57.43 CACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGAGCTCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGGTGGCATATTTTTCATGCTCAAATAAATAATATTCAAATTTCGATTA:1 + chrX 18554237 3' + McClintock 52 2 79.21 AAATAGCTAATAACATATAATAAATATATAAATCGAAAGCGAAAGAGACGAACGCCAGTATAACGGCAATGGCAATGCCA:1 - chrX 12748190 3' + Doc3-element 68 1 62.50 TAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGT:1 + chr3L 19951243 3' + Ivk 5328 1 75.25 AGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGATCTCTGAAGTCCAGGTCGAAAGCTGGCAACGGCAACAGCTACATGATGTGCAATTACAAG:1 - chr2L 21015776 3' + opus 7247 2 65.35 TGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCATGAAGTATGAGCCAATAACGGCAGAAATCTACAGGCTTGACTATCACATACCCATTACTCCAAACGTATCAT:1 + chrX 15264524 3' + 1360 2974 1 76.24 TATTATGTTCGTATATACTACAGTACTTAAAATAACTATACAGTCATATATTGGACTAAATGTGTAGTCCAAACGCAAATCACCTAAAATGAAAAGCCTAT:1 - chr2L 6454693 3' - mdg1 7039 2 72.28 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGCAGTCATTAAGCCTTTTCGGCTCGCAAAACTATGTACCCCAAAATGGCAAAGAGAAAGAGAAA:1 - chr2R 17626474 3' - mdg1 7053 2 62.00 AAAAAAAAGAATAAAAAATACACTCCGCTGACCATAAAATATTGATGGCAAATATTTATACAAATAAAATCGAATCGGTTTGGCCCTCGACTCCG:1 - chr3L 14932571 3' + gypsy7 5008 1 81.05 CGACTNATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACACTGGCCATTTCCCTGGGAATTTCCATTGCGTTTCTTTGCCTTCTATTTGCCAACTTGTTTTGT:1 + chrX 2776180 3' + 297 6967 2 70.30 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATGGTATCGCTTGTCAATGAGTGGCCAACTGGAGCAATATTTTGAAATC:1 - chr2R 9129261 3' - hopper 29 1 55.45 AATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTATTTTCCTCGTTTCCTGTCCTAATTTGGGGAGTTTCCTGTCCTAAGTAGT:1 - chr3L 15637205 3' + Cr1a 4289 1 64.36 ATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCAATACCACCAGCATTACACCATCAGAAATTGCACAACAAACCTGCAAACCGTCCACTGTCCCAGCAACACAACCA:1 + chr2R 5926334 3' - P-element 213 1 78.22 CGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGATGGCTGTCCTGGAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACCGAACTGATGTAGGACCAGCACGCACCGGCAA:1 + chr3R 18893396 3' - GATE 264 1 69.31 TCGTATTTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATC:1 - chrX 8972394 3' - 1360 18 1 59.72 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGTTTTGTGAATACATGCATACCTACCCGAATAAACATAGGCGCAGCAAG:1 - chr3R 24760541 3' + pogo 2075 1 56.44 GTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTTAAAAGTTTTGACATGGCTAAAGATTGTAATAAGCGTGCATCTGCATTTTAAGTCAAG:1 + chr4 782828 3' + INE-1 129 1 50.50 AAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTAAGTCCCTCGCTAAAAAGAACCAATGCTTCTCAATGTGCAAAATGGCAAATGTTAACAAATA:1 - chr2L 22178691 3' - INE-1 302 1 68.04 TTTGATTAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTGGAGTTATACAAATGGGTCCTCGTGTGTGTGTCCGA:1 + chr2R 17937190 3' + Quasimodo 7333 2 65.35 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGAAGGCGACATTCTCATCGGTCGATTTAAGTTCAAATTAAGCACTCAAATGCGCC:1 - chrX 17826287 3' + I-element 5289 1 59.41 AAGAACACATGAAAATAACTTAGCCTTTAGTTTGGTAAATATTAATTACTTCTTTGTACATATTTTAATGATATT:1 - chr3L 5340104 3' + G4 3626 1 61.33 TATTTGGATGTTTTTTTTTTTACTTTGTTTTTTACCTTAGAGCGAAGCGTGCGAACAATTTGCTATATCTCAACGCCGTTGTCGTAACACTATTTTCCAGC:1 + chrX 4969727 3' + hopper 62 2 61.39 TAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGTAGCAATGGTAGCATCTTCGGTGGATCCGCCGGTGGCCTGGGAGGGGCTGGATC:1 + chr2L 16189401 3' + P-element 199 1 57.43 TTATCAACAATTTGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAACCACGTTTTGGGTTTTAAATCCTCTGGCTTATGAATAATGTCCTTTAGGATTA:1 + chr3L 14949434 3' + transib2 2409 1 54.46 AATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCACCAATTTT:1 + chr2R 5674737 3' + S-element 1692 1 60.40 GTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTTAGGAGATTCAAAGAAACAAGCGATAGCTCGTTACATGAATCTGGAGAAAAA:1 + chr3R 19445078 3' + roo 308 2 67.03 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAACTATTATAAACAACGCCCCAAAA:1 + chr2L 12667220 3' + blood 7336 1 80.20 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTG:1 - chr3R 4834275 3' + mdg1 369 2 79.21 CTAGANTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCT:1 - chr3R 20878475 3' - 297 47 2 72.28 CTTTATTCTTTTGATCTTAGCTTAAGACAAACAAATCGTATTTGTACTGCCCTTTTGTTTACATTATTTCGGGAACGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGAT:3 - chr4 970229 3' - 297 289 2 48.51 AGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCAAACAATCCACCTGCCTCGCATATCATAGGGTATGCGAATTAGAGAGCTGTGAG:1 - chr3R 1440372 3' - HB 1312 1 55.45 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAAACAAAATCCATTAACTCATAATTTTC:1 + chr3R 23638160 3' - pogo 48 1 79.21 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTATGTGGGTTAGTTTGCTGATTTGGCT:1 + chr3R 6608814 3' - I-element 49 1 75.76 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCGCCTTCCCTTCCCACGCCCAGTGCCGCCACGC:1 - chr3R 12277511 3' + Tirant 8465 2 70.30 GTTGAGTAACGGGTATCTGACATTCGGGAATGTCGACTGCAGCATGTTGAAAACTATATCGATTGGTGTTCTTATCGCCCTCAGTGGGGCCATCATTGCAG:1 - chr3R 4162150 3' + INE-1 546 1 61.39 AAGACTGTGGAATGCCGAAGGCATTTGCGCAAATCGCATTCGATGCGATTTGCCTTGGTTTTTTTTCTCCCTTTGAGAGGCGGGACTCAGCAAGACGGCTC:1 - chr2L 20622759 3' - Doc 2 1 56.44 TAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCTTCGACTCGAGACTTATGGGTACTTTGATAGAACGTCAGGAATTCTATTCACTATTCATAG:1 + chrX 1184008 3' - Ivk 5338 1 60.40 GAGCGTAAGAAATCTAAAAATTTAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAAAGCAGCAACCTGCGCGGCCAGCAAACAAAAAGCCGAATAAGAATTGAC:1 + chr2L 6324717 3' - 1360 3278 1 56.44 TACCCTGGTATGTGAGCAACCGAGTCATCGAAAGGGACTTAAAAGTTTTCCCACTGGGAGGGAGACATAGAAATTAATTAATAAAAACAGAAATAAATAAA:1 + chr3L 25878367 3' + G5A 2525 1 59.41 TAAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCTGCCACGCACACAACCACACACATTCGCAAACGTAGACAACGGCACTTGAGTCGCGGGGCCAAATGAATGGCTTTCCT:1 + chrX 18214831 3' - blood 167 2 78.22 GTTTTGAACTTTTGTCAGAAATTGTCAGAAAATAAGTTATACTCGAAATTAGGATGGAATTTTTCTACCTTAAAAAAATAAAAGCACTACTGAAACAAATT:1 - chr2R 2121667 3' - transib2 431 1 58.42 TTTGTTGTTTTTTTTTAAATTTACTTTTTCATGCTTTCAATAACAAACCTATCACTACATATGTATATTTAAATTGATCGCTTTGAATTTTGGATTTAAGT:2 - chr2L 10294384 3' - TART-C 11097 1 70.30 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGC:2 + chr2R 17626553 3' + mdg1 383 2 63.37 GACCACAGAAGGAAGACACTGGAAGGCTTCACTCGTTAATTCGCTCAGTCGTGCGATTCGCTGACTTTGGTCACTCCTTCACTTGGACTTGCGAAGAGGAA:1 + chr2L 18279978 3' + gypsy5 7329 2 59.41 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACAT:1 + chr2L 8565529 3' - blood 7040 2 56.44 TCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTC:1 + chr3L 23678154 3' - Osvaldo 19 1 71.29 TTAAAGGTCAAAATTAAAGGTTTTTTGATTTATAAGTAAAATAAATTGTCGTCTGTCAGTCCAGAAACTCCCCAATCCTCCAACCTCCAGGAGGCTCCTAG:1 - chr2L 14586348 3' - S-element 1663 1 53.47 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTC:1 + chr3R 4834322 3' - mdg1 7072 2 56.44 TAAAAAATTATGAACAAAAATAGCTTATGGGAAATCCCTTATGAACCAGATGAACCTGATTCTTCTCCCGTGAGCAATGAGATGTCAGTCTGTTATGAAAG:1 - chr3R 18788455 3' + 1360 2948 1 85.15 GTTTTTTTTCCTATTCTTTATTTCTGTAACCCATAGAGGCCCCTCCTCAATTCTCCCACTTGTATCTATTTGAAAATCAAAACAGAAATAAACACTGCATT:1 + chr3L 18384384 3' + McClintock 205 2 54.46 ATGTAAATAATAGGAGTACAGAAATTTGGTTATATTTCGTTTATTCGTTTACTTTGTGTTTTGGAATTTATATTTCGTTTTAGGTTTTGTCGTTTAGCGGA:1 + chr2L 7219193 3' - Transpac 4844 1 74.26 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACACGAAAGCCTTGAGAAGCCGACCGACTTTTAA:1 + chr3L 22039750 3' - jockey 4717 1 74.26 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAAGCTCAGCTGCGTTGCCATGCACGGGATATAGTATAGTAATATAGGGTCCATTAT:1 + chr2L 12481660 3' - FB 21 1 57.43 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGCCCAAAGACCAAAGACACTTGAACCAATTA:1 - chr2R 23571646 3' + roo 9025 2 71.29 ACTTCACTAAAAACAACCGACTTCAAACGGAATCTGCTCCCGGGGATTATCGCCACCACAGAGTCTTTGGGGACCAGTGAGGCCTGAAACGACAAAAACCT:1 + chr3R 20696988 3' - Doc2-element 52 1 78.22 GCTCTCAGCGTGAGCAAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGAAATTCCCTGTCTGGCGACTTATTTTGTTCGAAAGATTTATGCGTTGGCTGCACTTAATT:1 - chrX 11287062 3' + 1360 3296 1 69.31 TAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAATTTATTACATATGTAATATGCATATATTATGCACTTGTCGATCTTTTTTTTAATTCTCC:1 + chr3R 19132347 3' + Ivk 5358 1 59.41 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTTCTAGTATGCTGGGGCGCAGCAAG:1 + chr3R 15072657 3' + pogo 2079 1 57.43 TGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGTGTAAGGGATACTCAGTTAAAGGATCTCCACATTAAGGAATTTAA:1 - chr3L 18629209 3' + Doc 200 1 55.45 TTTTTCAAAATCGGATAAAGGTTTTTCGCGGCCCATTTTAGAAAAAGATGATAAAAGATGATTTAAATTTTAGAATATTCAGCTTGCTTTTTATTTCGTTA:1 - chr3R 6506055 3' - Tc3 452 1 76.24 TTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAATTTTCTTAACTTGATAAAAAACGCTTAGAAACCTGTTCATTGTCGCTAATATAAAACAATACTA:1 + chr2L 21635354 3' - F-element 475 1 65.00 AACGANAACCAAACGGTTAAGAATCGGACAAGAAAGTGTAGCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTAAGTGAATTTATGAGCAAAAGGGGCAATCAGGACC:1 - chr2R 8998615 3' - Circe 7271 2 65.35 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCACACGGCGATAGAGCGAGATGGAGCATACTTTCGAGCCA:1 - chr3L 13589448 3' - hobo 37 1 60.40 ATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAGATCCTTAGGTCCATCCTAATCCTAAATATATAAATAAAACCAAACCCGACATATAACCTACCTCCCAAATGGTATC:1 - chr3R 5379850 3' + mdg1 95 2 53.47 AAAAAAAAGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTCTTATGAACGAAGCTTCAGCTCAATGTGG:1 + chr2L 17884799 3' + 1360 3342 1 71.58 GCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTCTTCGCTCTTGGTTTTAAAATTCCGTTAACGTTTGAGCCGCGTTTGGGGACTTTTAAATTGACT:1 + chr2L 14180606 3' + jockey 4756 1 69.00 CTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAATAGAAGATTTCTTTTATGCTCTGGCTGGGCCTACCA:1 - chr2R 18088330 3' + X-element 4428 1 70.30 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTTCTTCGCAGCATTACGAATATTTAAATGTGTTTTTGCTACTCGATAAAATGGCGCATTTTTGCTT:1 + chr2R 8345592 3' - roo 11 2 69.31 TTCATACACAGGTACCAGTCTATAAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACATCAGCATCACCACCATCACCACCACCAGCAGCAGCAACAACAACCACA:1 + chr2L 2993388 3' + Ivk 4955 1 54.46 TTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGACAAAGAAGCGGCCAAAGGCGCTAACTTTGCTGGCAAATGGAAGGCCAAGATGGGAGACACTTTGAT:1 - chr2R 14778417 3' - mdg1 7049 2 69.31 GCTCATTTTGACTGGCCTTCTTACGGGGCACTGCCGACTTCGCAGTCATTTGCGAATACCGAATGCGTTGAGGTTACTCCTTTGGAATTCTTAAGGGCTCA:1 - chr3R 25946835 3' + baggins 5121 1 57.43 CGGGGNCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTACACGGCATGTGGGTGCGGGCC:1 + chrX 20806920 3' - opus 7053 4 77.00 GTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCATGTTAATGTTAAATGATTAAATTTTTCGCCCCCATTGTTGTTCTCGTGGTTGTTGTTGTTGTTCTTGTTG:1 + chr3R 25400123 3' - 1360 3274 1 53.47 CCTCTGCGTAGGCCGTTTACTTTAAGATGCGATTCCCAGTCATCCCAAATCATCATCGAAAAGCGCACACACCACACAAAATTGTCGAATGGCGTTGAAGT:1 - chr2L 9714213 3' + roo 8965 2 67.33 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCATAATAATTACCGTATTGAAATGACTCCTTAACGAGCCTCGGACAATG:1 + chr2R 19209453 3' - jockey 4789 1 55.00 ACAAAAAAATAAGAAAAAAAAATATTTGTCAATTTAGCTTTAGCATTTTCGGAAATGTATCTGATAGAGTTCTCGACGATTCGGTCTGTATTGTCTTTTAC:1 + chr2R 548562 3' + G2 3076 3 76.24 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGGCAGGCAATGAAAACATGGCCCATGGGAGAGAGAACAACGGTGAAGCACTGCA:1 + chr2R 14713666 3' - P-element 25 1 56.44 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTTTCATTATCTATTTTTCAAATGAGGCCATATATCATCATAATATTATTGTGTTTGTGTTTG:1 + chr2R 7861749 3' - roo 8679 2 65.00 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATT:1 + chr3R 4834307 3' - mdg1 49 2 71.29 CGCCATAACCAAAAGGAAAAGAAAATCCGTAAGACAGTTGGACAGCGTTTGTGCAGCAAGTCTGGGGAAATGGAGAAAAGAGAGCGACTTGCACTGGGAA:1 + chr2L 18234934 3' + TAHRE 273 1 71.00 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGA:1 - chr2L 285711 3' - P-element 58 1 21.78 GACATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGTGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGTGTCGTTTTTGTTAAGGTCACGTGTGTCCGCCCCTTATTTTTAGC:1 + chr3L 808966 3' - Idefix 280 2 57.43 GGGACCTTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTACTTTGTGATTTTATAAGGTACCGAGTTACTCCAGACAGTAACAAAACA:1 - chr3L 17918368 3' + 297 374 2 58.42 TGACAAAATATGCCCTTCACCTAAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGTCATTAGCATTCGAGTTTTGTTCTGGTCGATTCCATTCCACGC:1 + chrX 6508907 3' + 1360 212 1 57.43 TATTATGTTCGTATATACTACACTTTAATGGATCATCTCGCCCATTGCCAGGTAACAGCTCCACAAGGAGCGAAACACGATGAATTCATAAATATAAATAA:1 - chr2R 5950655 3' - mdg1 7039 2 78.22 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTAC:1 - chr3R 19446166 3' - 297 44 2 76.00 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTGCAAATTGAGGCGAACTCCGAAGCGGAGTTTAAATTTGCACTTTGCAACACAAAACGGAAATGCC:1 + chr2R 17626579 3' + mdg1 409 2 65.35 AGGAAGTTATGCTGCCACACCCTTTATATTATTGATCAAGATCAATAGACGAGTCGATCGTGCCAAGTCTGTCTGTCCTTGAGGCAGTTTCAGTTTTGCTT:1 - chrX 6650937 3' - mariner2 3 1 77.23 TGTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGGACAGGCCAGATCGACTGATCAAAAAAAATGTATATATATCCAACTACAGGCAACCGACAAGCGCAA:1 + chr2R 7376846 3' - INE-1 144 1 75.25 ACCTTTAAAAAAGTTTTTTTTTTATAATATTCATTGTGTTAACGGACCACGATTGCAAAATCACAGGAACATTTATAAACAAGTAGAGTGTTGTAGCAAA:1 - chr3L 19127696 3' + FB 405 1 69.00 TAGTAGAACAAGTTTTATTCTGGAAGAATTCAATGTTTCACAATTGCAACTAACTTAACTTCTCTTCTCACAGAGGTGTACTTCCATGAACATCAT:1 + chr2R 5373315 3' - aurora-element 10 1 61.46 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAATAAACGAGGGTTTTGTATTTTTGTATTTGATGCATATCCAAGTATAGCTATAAAATAAATCGTGTATGAGA:1 - chrX 22444436 3' - Juan 4060 1 65.35 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGCCGCTTCTCCAATTCGCGATGCCTAGCATTTCTCTACGTCTCGTCCTTCGTCCTGTCGGCCGATAAATCGCGA:1 - chr3R 5686023 3' + P-element 2883 2 75.25 AAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTTAGGCTTCGTATCGTATTTTAGTTAGGTTTAGTATCGATAGAAATGAGCAAAACGA:1 - chr2L 22121198 3' - Ivk 5362 1 61.39 CGACTGCGACTAGGACACACAAACATAATCCACCTACACTAACTAAATCCAAACACGAGCCAACATTTTTTACATTAATTATTTTTCTTAAACCAAAACCT:1 - chr2R 13953084 3' + I-element 4944 1 51.49 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATACTTAAATAAAAAACGATTTAATATATTAAATAAAATTATATTTATTGTGATGCCTTGTGTCATACAGCATCTTA:1 - chr3R 11263365 3' + roo 406 1 76.24 GGGGCNTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAACTAAATCTAATTCAAACCGGGTCTGCTGTGTGTGTGTGCGT:1 + chr2L 1976487 3' + X-element 4255 1 58.42 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTG:1 + chr2L 12949284 3' - 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chr3R 10203612 3' - jockey 29 1 52.48 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGATCACATCAAAAAGTGTGGGTGGTTGGGACTGGGA:1 + chr3L 9907438 3' + jockey 4974 1 49.50 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCCAGACGAAAAGCCTTCACCAGCTGT:1 + chr3R 6622685 3' + P-element 2835 1 29.70 TCGATCAATTTATTTCGTTACACGTTACTAGAGCACCACCTTTTGAATCGTCGAATGAGAGTGTCGTTTATTTATTCGGTTCTGGGTACGTATTAATGTTA:1 + chr3L 17516748 3' + Gypsy12A_LTR 2252 1 62.38 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACACTTTTACTATATATCTAAATTTCGTAATTTTTTTTACATTTATAAGGTGTTCAAAACTCATGCC:1 + chr3R 20878538 3' + 297 6952 2 56.00 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGGCAAACACTTGGCCACTGTTGCTGATTCCGAATACGAGTTTCGT:1 - chr2R 24628760 3' + mdg1 7426 2 60.40 GACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGCTGAATATCTCAAAATTGACATCATATTAACTAAAGCCCACAATGAA:1 + chr3L 21793660 3' + Doc 4415 1 52.48 TTATATTGTTCTTATACAGTTCTCTTATATAATGATATTTTTGCTGAGCCAATCTGGCCTGTTTCGCTTCCTCCTCGTCGAAGCGATTGCAACTGTACCAG:1 - 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chr2R 24021558 3' - pogo 21 1 58.42 CAAAAAAAAAGAAAAAACAATAACAGTGCTCTGAAATTGGAGACAATTCATTTTGTCGCCCAGTGTAATTGAAACTTG:1 + chrX 5212196 3' + gypsy7 5006 1 78.21 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGCTCATCATTACACCACTGATTTTTCACCATGCATC:1 + chr2L 2060172 3' + 412 438 2 74.26 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGGTACAGTCAGTTATTCAATAAGTATATACTGAAA:1 - chr2L 2060138 3' - 412 43 2 65.35 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTT:1 + chr3R 7388416 3' + HMS-Beagle 219 2 56.44 ATTTAGATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCA:1 + chr2L 12324081 3' - roo 48 2 74.23 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCTGAGAAGTATGCAACGCATTCGTATCAAAGGAAAATCGTGAAAGGCAATGGCGAA:1 + chr2L 15510473 3' + jockey 4972 1 57.43 GGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTTCAGGTGCACCCAAAATAGGTACGGACCGTTCT:1 - chr2R 21185460 3' - P-element 370 1 36.36 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGC:1 + chr2L 12949288 3' - 412 23 2 55.45 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTCAATACAGAAAACCCCAAAGCTTGAATAATACTTTTCATAACCACATTCAATTCAC:1 + chr3R 29259656 3' - pogo 19 1 60.40 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAAAAGGGATGCGCTCACATTCGCATG:1 + chr2R 17345922 3' - jockey 60 1 74.26 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACATATAGTTTATAAAAATATTTCACATTTTGATTGTTTTCTTGTTGT:1 + chr3L 13060391 3' - 412 31 2 58.42 CAAAGAAGACGCACCGTGAACTAACGGGATATTAGTTGCACCTTGTACCCGAACGGGGCGTCCTCTCGGTCTATAAAAGAACAGCAGAAGCGCAACTCGTG:1 + chr3R 2533952 3' + gypsy8 4812 4 52.48 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTAATTGGCTCCAATTGCACGCAATTATGGAAATGTTTTTTTT:1 + chrX 20047623 3' - roo 8698 2 69.31 CACCTTATGTTATTTCATCATGGTATGGTATATGGGTATTTGGTATTACCTGAAGTCAGGCTCAGTCGCCGACGATTTTCAGTCCGCTGGCGAACGTTGTT:1 + chrX 17830829 3' - P-element 1 2 77.23 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACAATTA:1 + chr3L 23456273 3' + 1360 3376 1 62.38 AAAATTTTAAAATTATTTTTATCATTATGTACCATATCAGGAACAAAATGTGAAGAACTCCTCCTTCCGGTGTTTCACAAATATGAAGGCAAGATTCTGGA:1 - chr3R 12999590 3' - transib4 104 1 63.37 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAATGAATTTGTCGAGATTATGTGATTATATTCGCAATAAAATCTAGATAATTTTAGTT:1 - chr2R 16750634 3' + Tabor 7303 2 50.50 AGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCAGGTGCTCCTTCTCCTGGCCAGAATCCAAATGAGTTTTCACGCAAGGCGAGGAGCGAGCGAATTTCGGGAG:1 + chr3L 7203471 3' - Doc 273 1 72.28 TTTTTTTTTTGTTTTTTTGGAGCGGGCGCAACGGCTGCTGGCCATCGAGAAATTATTGGGGAACACTTGGCCGG:1 - chrX 10994540 3' - G2 3074 1 78.38 CATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACACAATCAATATCCCAAGCGGGCTCCAATCTTCTATCCGCCACCGATGCCATGGG:1 - chr3R 25224417 3' + Bica 123 1 68.42 TACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAAGGCCTGCGGCCTGCGCCGCCTCATCCTCCTCCGTCTGTATTCGTTGGGCCAGCTGCAGTGCG:1 - chr3R 27283987 3' - Max-element 20 2 53.47 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATTGTTTGCGGACTCAACAACCACTTCCCT:1 + chr2R 14675598 3' - roo 47 2 75.25 ATAAACATAAACATAAACATAAACATATATCTTCGATAAATCCTTAATAACATGAAGTGTAGTTTACAGAACAGAAATCCTTAGAAAAGAGCCATTTTTT:1 + chrX 13798933 3' - 412 7127 2 68.00 CGTATTAACGTCGAGATCTCAGCAACTATTCTAGCTAGAAGGTTAAGATTCAGCATTCAGAATAGAAGACAATGCACTTGCTTTTGCCACTCGAACTGCAG:1 - chr3R 14858722 3' + INE-1 136 1 71.29 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTGAGCGCTAAGAGATGCCA:1 + chrX 868751 3' - jockey 4800 1 66.34 CGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTACCGGTTTACTTGTAAGGTAAATTGTGATAATCAACATGAAAATCAAATTTGAATTTATGA:1 + chrX 6388443 3' - jockey 297 1 65.35 CTATTTCAGTAAAAGTAATAAAGTAATATTAAATGACGAATTCAGCACGATTTGGTTTTCTGTTGCGAAACACTAATAGCTTCTTTCAAAGTTATAGCAAC:2 + chr3L 13337259 3' + Tabor 7293 2 34.65 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCGGCATCAAAT:1 - chr2L 17646155 3' - flea 4772 2 64.36 TTTTTTAATTATTTTGTTAATATTTGAAAATTTTTAGTATTTAGTATGACCCCCAACAAGTTCCTCATCAACAACGTCTAGTTTCCCGGTTTCTATGGCGG:1 - chr2R 5351123 3' - S-element 1453 1 54.46 AACTGNGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTAATTTC:1 - chr2R 7032139 3' + mdg1 384 2 61.39 GAAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTATACTGCCGGGAAAAACAAGTTTTGGGCGCCAGATGGAACAAACTGATTTTAATTGGTCTGCTTGTT:1 - chr2L 22699413 3' + INE-1 573 1 79.21 CATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACGTGATTTGCATGTTCAATTGTGGCCTTCGATTGTAA:1 + chr2R 10774096 3' - copia 4912 2 67.33 TTTTGCATTGCCTTAACGGTATTATTATTTGAAAACCAGATCGACGTGCCCCACCGACGATTATTGATTTCCCATCAGATTTTTACCCCCAGCAGTTGTGG:1 + chr3R 27781960 3' + 1360 298 1 72.28 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCACGGTGTGGTGTGAGTGGCCGATTGCGAGTGCGTCGCTTAAATGCC:1 - chr2R 13295636 3' - Tirant 11 2 70.30 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGCGTCAATAAAGCCAAATTCACGTCTCGGTGGCCCCCTT:1 + chr3R 12047473 3' - Stalker2 7289 2 63.37 GTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTTTGCGGGTATATATGTATTTATATGCGGTGGGTATACAATAGATTT:1 + chr3R 27294476 3' - Quasimodo 116 2 59.41 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGG:1 + chrX 18239394 3' - jockey 56 1 72.16 TAATTTCGTTTAATAAATTTAAATAAAAAAAAGATATATATGAAACATTTTTAAATGCCATTTTGCATCTAATTTACAACAAAAAATCTAATTAGAAATAA:2 + chrX 15746548 3' + jockey2 3394 1 84.16 TACTATAATCACCAGTTGAGAAAATCTGTTCCAGAATTAGTAGAAATGTTTTCTGTAAGACCGTCGCTCTACTGGCCGTCGACAGCAAGAGGGCGAGCTGT:1 + chr2R 324781 3' + S-element 446 1 64.36 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCGAACCACTCTGTATATTATGTTTATCTGGCCACGTGTTTTCGCCCAATAATCGCATGATTTA:1 - chr3L 10477524 3' + copia 243 1 67.33 AAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTA:1 - chr2L 23295812 3' + micropia 405 2 73.27 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTTTTTTTTTTATTGTACATCGTGAATCGCATTGTTTGCTGCATTATTACGATTTGCAAC:1 - chr3R 23638082 3' + pogo 2086 1 61.39 TTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTTGGCTTTCTCTTAATTGGAACTGGT:1 + chr2L 7250983 3' + P-element 2632 1 25.74 TAACTGCATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACACAGTGGGAACTGCGGATGAAGATCGTAGCCGATAAGAGCCCAGCCGTGTTTGCTTTCCCTT:1 + chr3R 23048517 3' + mdg1 405 2 62.38 ATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTCTTTCATATGGGATTCGCTGCTGTTGTTTTGGTTTTATGGCTTTTATTCTGTTTTATTGTTGCGTA:1 - chrX 8504961 3' - Burdock 106 2 71.29 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGTATACGCACATTACGTATACGCATCGTTTCGCGACACGATTTGGTACTTAGGACCACAGCCTCAGTGGGGC:1 - chrX 8972348 3' + 1360 3388 2 78.22 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGCCAATTAGC:1 - chrX 20806843 3' + opus 7497 2 74.75 CATAGTTCTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTTCTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCTAGTTTTGATGCAGGTTGCCTGC:1 - chrX 21233342 3' - Cr1a 4009 1 77.23 AAAGTTTTTAATTATTTTGATTTTGAAATGATGTCACATAAAAATTATGACTCACAAATAGGGTTTACCACACATAAATTTTGATCAGCCTCATATCTTCG:1 + chr2R 11190525 3' - S-element 1456 1 90.10 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCGCTGTTCCATTCCGTTTTATTCCGTTCGAAAATTGCTTTTTCGCTCAATTAATTAACTTATTTTTT:2 + chrX 2649911 3' - Tirant 11 2 70.30 GGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGCTGAATGCAGAATAATAACACTAGATATAACGGCAACAAAATGCCATA:1 + chrX 968163 3' - Porto1 4453 1 52.48 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATAAATATATGTATAAGCATGGGAAAGTACTATTCAATA:1 + chrX 16715363 3' + flea 4980 2 72.28 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCAGTCATAAGTCGCAGGTTCTTAATCAAAAGC:1 + chrX 11730315 3' - jockey 4805 1 74.26 TGTTATTCTTGATCCGTGTGTTGATCATAATTATGTTGGCAAAAGGACACGCAGGCAAATTAAGGCTTTGACCTAGAGAAAAATAAACAACACCCAGGATA:1 - chr3L 2877169 3' - diver 5829 1 64.36 CTTACAAGAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTAGTAAGAAGTAGCTGTAAAGCAAATTCAGAACCATCTCATTTATATTTACAA:1 - chr3R 12539486 3' + roo 9047 1 58.42 CCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGCACAGACACACGCACACACAACTGCAACTACTTCCTGTAATTTAGATACGAACTCAACTCGCCCGTTAAA:1 - chr2L 4478863 3' - 297 6540 2 70.30 TACTTAGCTAGTGCGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAAACGGGCAGATCGATTGATTGATCCTGAA:1 - chrX 15408748 3' - INE-1 532 1 84.00 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAAGTGGAAAATCTATAATATTTAT:1 + chrX 23211130 3' - HMS-Beagle 6846 2 77.23 TACTAATACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGCTCCTGCTCTCTTTTTTATTACAGGAACTAGATTCCTGTCCATTACCGCT:1 + chr2R 25129893 3' + Cr1a 4299 1 69.31 TGTGCAGGTGCTAGGTCATTGACCGAGTGGATGATTTTGCTTACTCGCTAGCTAACCTCACATCTCGCCTTTTGAGCATTATTATTATATATCCTTTTGCC:1 - chr3R 18282559 3' - Doc3-element 348 1 67.33 GACGCTAAGAGAGGGTATATTTTTTATTAATTTGTTATAATTTTTGCAGCCAAGGAATAATATCTTTTTTTATAAATTAAAATTTCTTGATTTTAGGTTTA:1 - chr3L 8397764 3' + Tc1-2 1349 1 51.49 AACGAAATCAAGTTCAAATATCTAAAGGATTATTCGAGCAAAATTCAATGACTATTATTTTATTACTACTCATAGTTATTAACTTCAGATACCTTATGAAT:1 + chr3L 16257985 3' - accord2 7240 1 56.44 AGGTTNAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATGGACACCCATGTTGCCAAGACAAACAGTAAAATTAAGAGAAATCGAAACATTTTTCAAATGTGTGTG:1 - chr3L 24300789 3' + INE-1 175 1 46.53 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACGCTTATTTTTGAAGTGTACAAGATCAATG:1 - chrX 8682654 3' - pogo 48 1 77.23 CTAACAAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAAACTAGTTGCTGAAGCACGAGAAACCCCTTTTGCTACTTGACCATTTCTCATTTTCAGATTGCGCCAAATTCC:1 - chrX 13581833 3' + gypsy2 398 1 66.34 CCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGAGTATTTCAAAAGGTAAACAACGCAAAGAAATTTATAAATAAACGTCGACGACA:1 - chr3R 26074468 3' + roo 313 2 54.46 TAAACGCCTTTTAAGAAGTTTCTATACTAAAAAATATTCAATTTAATGCTTTTAGGCATATTTTTGGATTACACATTAATTTTTTGGTAAACTGCTTAGCG:1 - chr3L 11368784 3' - rover 7244 2 87.13 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATTTGAAAGGTAAAGGCAATA:1 + chr3L 18659073 3' + pogo 2050 1 80.20 TGCCTAAATACTTTTGCCACCGCCCAAATCATTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCATCATCATTATAGTCGCATCTTTTGCCACAATTAAGAGTCATTTACTT:1 + chr3R 26550753 3' - Tc1-2 202 1 50.50 ATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTATCAAGTGTTAATTAGGCGTAATGAACTGCTA:1 - chr3R 6735282 3' - copia 46 2 69.31 AAAAGNGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAAACACAGCCGT:1 + chr3R 20149763 3' + 1360 3344 1 71.29 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAACACAGAGCTAATTAGCATAATAATACGAATAATGCTGCGACAGAAGTAAATGA:1 + chr3R 25671989 3' - I-element 24 1 54.00 AGCGAGAGAGTGAGAGGGCAAAATAGAGAAAGGAAACACACGGAATACTCGGAGGCTACAATTTCCACCAAGCTATAAGATAAATAAAGTAAAAAAAACAT:1 + chrX 6421797 3' - Cr1a 286 1 69.31 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCACACGAAACACAAAGCAACCGCAGGGTGGCAGGAAGGGGGCAATATGTGCTGCAAGGGAT:1 + chr2L 12949295 3' - 412 16 2 62.38 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATACTACATCTCGATCTCACTCGACATGTTTA:1 - chr3R 6273524 3' + blood 338 2 68.37 AGAAANCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTAAATTGATTTCGCTTCTTCGCTTTCAAAATGAGCCCCAGCAGAGAGAAAATCAGAAAAATTCAAAGC:1 + chr2L 4037289 3' - invader2 453 1 59.41 TAACANCTACAATAACCGATTTATGTGAGTCAAAGTGGATGCGTTTAGGGGAAGAACTAGAACTGGGAGGGTTCTTTCTCCAAGCCGCAAAGAAGGATTGG:1 + chrX 19739839 3' + Doc4-element 401 1 65.35 GGTATTAATTTTTGTAATAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGCTTGGCTTGGCTTAGCCC:1 + chr2L 12815080 3' - hopper 23 1 66.67 TGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGAATTTCTTCACACGCAGAAAG:1 - chr2R 10528470 3' - F-element 340 1 79.80 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGGACACGTTTACGTGCTGAGGTGCACAGGTAAATGAACTGCTGATATTTCT:1 + chr3R 27775160 3' + roo 9046 1 53.47 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAGCCAAATGGTAATAGGCCCCGGCAACACAACATCGCCA:1 - chr3L 7550721 3' + 412 453 2 63.37 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTCTGGACATGCAAATGTGGACATGCGTCCACT:1 + chr2R 15474848 3' + roo 9026 1 69.31 TCGAGNGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGCATGTATGTATAAATCTTTTTAAGCTGAAAATAACGCACAGT:1 - chr3R 4601316 3' - opus 149 4 65.35 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGCAGATTTTCTTGG:1 + chr3R 29123386 3' - P-element 43 1 32.26 CAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCAACGTGTGGCGTTGTGTGGCA:1 - chr2R 13295681 3' - Tirant 8163 2 79.21 GCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTAATCTAAAATTAGAGTGGATTAGCCTTACGGTCCACCCC:1 + chrX 12290231 3' - X-element 49 1 61.39 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATGTCCTTGCCACAATTCAAAAGGATTTAAGTGCCTGC:1 + chrX 2753887 3' + roo 9031 1 65.35 CTGCCCTCTTTCAACGCTACATTTCCCCAACTGTTTCTCACATCATATGGAGAGTGAGTGAAAAATAAATGCAGCCAAAATGACGCATTAGTTTGGCTA:1 - chrX 3763585 3' + 297 6749 2 79.80 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGCACCTTTATGCAAGGTGAAAAATTATTTGCAC:1 + chr3L 18706925 3' + jockey 4945 1 66.34 AATAACTAAATAACTAAAATAAACCACAAAACTACTTTATCATATATTTATGTATATCCTTTTTTCAGTTAAGCTAGTGTATTAAGTGTTCGTTTTCCCAA:1 - chr2L 11609577 3' + HeT-A 33 1 76.24 CACAAATCGATTACTTAGCCACCAAAACTCCAACACAGAATGGAATCAGATTAATTTCTTATTTAACAGAATATTTATCAGATAAGTTCCTTATTTATTTG:1 - chr3R 5333446 3' + Porto1 4455 1 75.25 TTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTAACCAAGGTGCCCGGAACTTAACTACTTAATTGTCTTGGCTGGTGAGTGTTTGTCTTTTTGGTTTGGATCCCATT:1 - chr2R 17794908 3' - Quasimodo 160 2 79.21 ATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATTCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACGATACAGAAGTGAGTGTTGCGGTGTATAT:1 + chrX 4154455 3' + Stalker 7057 4 71.29 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAAGACTGCGAAATATTTTTAAAACGAAAAAAGCGTAGCACACTTT:1 - chr3R 22644145 3' + hopper 1383 1 56.44 GATAANGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGCACTGATGCAGTTGATAATAAGACAACTTGTGTTTATTAATAAAGAAACTGA:1 + chr3R 11094578 3' - 3S18 5792 2 52.48 TCTGCTGGCCAATTTCAGTTTTTACAACTGGAATCCGTAGGTCCTGGTAAATGTTCGGAGGATTTTTGATTGTCCTCGTTGTATTATTTCAATGTTGCTGT:1 - chr2L 21637282 3' - Doc4-element 2752 1 74.26 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAATAGCTAGCAAAAGTAGAGTCAACCCTATAAAAAATAGGAAGAC:1 + chr3R 19446224 3' + 297 363 2 59.41 TAAATTCTTGATCAGGATCAAAAGCCGAGTCGACCAACGGTCCTCTTCTGGGCATAGTTGATGGGGTCCGTAATGGCCCAGTACCGGTCGAGGGCTATGGC:1 - chr3L 22062243 3' + INE-1 83 1 70.30 AGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGGGGATCTCGTACTTAAGTAAACTGAATTGAAATAAAAC:1 - chr3R 19989264 3' + hobo 2901 1 64.00 GACAGAGGAGCACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGTCTGTCGAGATGAAATGAGTTGAGCTGAGTCGAAGGTAGGTAGGTGTGCTAATTGATGTG:1 - chrX 17332220 3' + gypsy8 4471 1 56.44 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCGTCTCATAAAAACGTATCAAAACATCCGTTGGGAGTCATAAAAATTTTGCACTCTGACTTCGCTTTCCGTCGCC:1 + chrX 2799729 3' - Tirant 8107 1 81.00 TAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATACACACACACATACACATACGCGCACACTTTTCCCGCCCGTGACGTCATAATGTAAAC:1 - chr3R 11276594 3' + Idefix 21 2 61.39 CTGATCATGGTTTACATTGATTGCTTAGTTGTATGCTCTAAAATACTTTTTCAGGGCTGTAATGACTTCCTTATAACGTGGAAGTCTCAATTAATCCAATT:1 - chr2L 19868235 3' - invader3 5138 1 71.29 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTATATTCATTAATATCCAACAGCGAGCGATTCATT:1 - chr3R 27981671 3' - roo 8705 2 71.29 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGT:1 - chr2L 21683396 3' + pogo 2074 1 54.46 TTTGTNAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTATATCTGTATCTCTGTACTGCTGTATCTTG:1 + chr2R 10834029 3' - I-element 416 1 70.30 CCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTTGTTTCTGTTTGAGAATGCCAAGAATAAATGTTACAATGCGCCAAACAAAAATTCATCGCAATT:1 + chr3R 3179240 3' - G5 4564 1 70.30 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTTCTGCAGCAGGATCCTGCGGCTTTGCTGAGCCCGGAAAGCTCTCGTCTTCACTGCAAACGG:1 + chr3R 22715731 3' - F-element 4526 1 63.37 AAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCAAACAACAATGACGACGACGAGCCCATGGGTACGCTCTGTAAATGTGCCCA:1 + chr3R 19131079 3' + Ivk 258 1 50.50 ACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCAGACAACCAAGCAATTTATCTAAATCTTGATCCTCACTGCGGAATACTTCCCGATTGTAACTTAGA:1 - chr3L 3816163 3' + 1360 3225 1 62.38 TAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGAATTTACGAGATAGCAATTCATTGACTTATTCACACAGTTTTCTACCTGTGTAGCTGGCCTAAGT:1 + chr2L 18217997 3' + jockey 4974 1 68.32 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTACAATTTTTTAAGTTCTGGGAACCAAGAAATTTTA:1 - chr2R 7032144 3' + mdg1 379 2 67.33 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTTGGTTTACTATTAGTTTGCGGTAATCAACTAATAAACATAATTTTATATTACACAA:1 + chr3L 7906509 3' + roo 388 2 48.51 TCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCCCCACCTCCTGGAATGTCGAAGCTGTTGCGAAGGGCTGTTGCTGCATTTTAA:1 - chr2R 4606185 3' - 1360 1 2 74.26 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGAAACGAAAAAAGTCCACTAGTCACGGCAATATTTTCGCA:1 - chrX 20047559 3' + roo 9037 1 56.44 GTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCAGATATGACGAAAAAGAAAACCAGCAACCCCAAATGAAACAGATATCAAGGTAAACAT:1 + chr2L 14062062 3' + flea 4569 1 56.44 GGGCATAAGTATTTAGACACCATTAACGCACCTGCCCGGCCAGGTCACTAATTGAAGGCGAGGAGGAATTACTAGATAATTTTAATGTGTTACGGTAGCTC:1 + chr2L 11206022 3' + Tc1-2 8 1 70.30 GTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACGTACAGCAAATTCCTAGGCCTAATTTTCTTGGAATTCGTTTGATTACTGTCCTTGTTTTCACGAAA:1 + chr3R 27430107 3' + pogo 2092 1 70.30 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGAGGCGAAAGGCCTTTAATCGATTTCTCGTTCT:1 + chrX 5092980 3' + roo 9026 1 68.32 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTTTCTCTTAAAGATTTTGTATCTCTACGCAATCTCTTAGATCGCAGCC:1 - chr3L 5537592 3' - jockey 4699 1 51.49 GCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCGGCCGA:1 + chr2L 3388138 3' - F-element 311 1 49.00 TTCGTGTTCATGTGTGAACAAACACTGTATTCTTGCTCATTCAACTGACAAATTTCATTTGTATTGATTAGTCAACACGAGTTTATGTGGGTTGGTATTCT:1 - chrX 13508655 3' - roo 8663 1 80.20 CTTGTNATCTAAGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCAAGGAGTGTTCCTCACCAATAATTCTGAGGTTCGACAAAGTAGTGGCATCCAGTACCA:1 + chr3L 15156609 3' - F-element 4210 1 63.27 CAGTAATATTTTATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCTTCGCGGAACATTGTATTACAAATTTTCGTTTCTTTCTGTGTACTTTTACAACTGACAT:1 + chr3R 15378891 3' + Cr1a 4305 1 61.00 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTGA:1 - chr3R 19446126 3' - 297 5 2 73.27 ATTCGGAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTT:1 - chr2R 1320680 3' + diver2 348 2 54.46 AACGCAGATTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCAATGTAGGAGTCGAACAGGCAGACAAGGGGCAGAAACGCAGATATATTTACATATGCATGGGAC:1 - chr2L 21018010 3' - opus 7496 2 63.37 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCCTTGAAATCATAGCCACTCTGGCTCGCTTCGTGAGTTTTCGAACTCGAAAGC:1 - chr3R 13538919 3' - hobo 13 1 62.64 GGGGAGATGTTTCGAGCACTGGACTATAAAATTTAACTTATTTTCCCCTCTACGGCTCTTCACACTTACCTTGACTACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGA:1 - chrX 21907824 3' - 297 489 1 57.43 GGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCACTCAGGTCCGAACTCACTCACGCACCACCCACAACCCATCGACCATCAACGCCCACTTTCGCTCCTTTGGCG:1 - chrX 2887116 3' - R1A1-element 5078 1 61.22 GGGGGAGTGGCGTGGGAGCGAAGTGAGGACACAAGGTGCAAATATGCATTATTACAAATAAGATACAAATACTTATGGATACTGTCTTGAGGGCGGCGAAG:1 - chr2L 1706646 3' - transib4 2346 1 66.34 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGGTGTATGATTTTTGGATGCTATATATACATACAACAAGCTTTCCTCAATTCCCCTT:1 + chr3R 16458077 3' - roo 8686 2 58.42 CGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAACCTTTATGGCACGTTTATTTTCCCAACTCCAGATCCAGTGAATGCGAAAAGTAAATGAAAGAAGCCAACA:1 - chrX 6373612 3' + X-element 4706 1 66.34 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATACTAATTAACTACAATGGCTTATAAAATACTTTGTGGACTGTTATCAAATA:1 - chr3R 4834265 3' + mdg1 379 2 69.31 CTCGACAATAGCATTCTGTCTTTTTTATTTTGTTGTGCCATTTCTATAAATATGGCAAGCAAAAGTTGGCCTGTTTATTTTTTATCTCATTTTTAAAACTT:1 + chr2R 6646738 3' + INE-1 577 1 75.25 TCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGTAAATTATTGTTGTTTTAAAATAAATAATAAATTATTTCTAATGGACATAGAAAAAAAGTATTGCATT:1 - chr3L 25968859 3' + HMS-Beagle 240 2 73.27 CTGAACGATTCCTTTTAAATCCAAAACAAATAGAATGAAGCGAATAGGAAAACTAAAGGGTTTAGCTTAGAAATTTAGCAACTAAACGTGTGATTTTCATT:2 - chr2R 9499983 3' + G5 4807 1 53.47 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCAGAATTTCATACAGGACACTCTGATGGT:1 + chrX 18239395 3' - jockey 59 1 72.28 TATTAATACATACAAGTTTATTTTATACAAGTTTTTTGTCCTGACTGCCATGATAGTCGTAATAACAGCCATACAAACGCCACTGCTCCAATAATGATGGG:1 - chr2L 16571856 3' + Tc3 1638 1 80.20 GAAGGGAGGAGAGCGGGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGGCTGACTGATGTCCTTGTCGCGCCTACGTTGTGTCCGTCTCGGCCTGACAACATTTCGA:1 + chr3R 12154327 3' - Max-element 109 2 65.00 CATTTNTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATAATTCGGCAGAGCACGAAGTTTGGAATTT:1 + chr3R 15072634 3' + pogo 2056 1 72.28 AATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAGCAACTATAAGGTTGGATAAAAATATTTTTAAAGACAGTTC:1 + chr3L 10477605 3' - copia 211 2 59.41 AAGAAGCACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATAATTTACTACTATTTACTTGTACGTTTTTTA:1 + chrY 536722 3' - Doc 22 1 51.49 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTTAAATAACCAATTTTCCACAGGACCTCCTCTCGCAGCGATTCCCATTTATTCCGACTGTCATGCGGGTT:1 + chr2R 20744251 3' + roo 404 1 68.00 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTTCGGTTTACTCATTTTTAACTCAATCCCTTAGGAGTGTAGAATAAACTTTTA:1 + chr2R 19552085 3' - roo 8664 1 75.25 TTTGAAATCGATCTAGATCGGATTGTAAGTCTAAATGGCAAAGATCTGGAGCCATATAAGACCATAGGAAATATGGAAATTTTCGTTTTCTCCGCGGCAG:1 + chr3R 31531514 3' - Q-element 640 1 68.00 TTTGTGTTTGTCAAACCAGCCGAGGTTTTTCATTAATTCTTTTTCCTATTATTTAACAACTTGATTCGATTCCGTTTGATTTACTCTCCTTCTCCTCATAT:1 + chr3R 24694077 3' + Cr1a 49 1 66.34 GACAAACACAAAATAAAAATCAGATGGCAAAAAACCCCCACCTCTCCCGCTAGAGCTAAGAATAAATGGGTCCCGCTCAGCTGTTGGTTAATGGTCGACAA:1 - chr3R 1515128 3' - Cr1a 39 1 66.34 CCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAATCAAATGCACTGCAAATCAAATAATGTAATAGTAGTAAGTTGGTAAAATCTACTTATGGCTCAAGTTGGAAA:1 + chr3R 30659130 3' + Idefix 278 2 66.34 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAATTCAAAACGGAGATTGATTAAACTGTTATAAAACCGAATTTTCTAATTCTAATGAAATTGTTTAATTGTCATCGCAG:1 - chr3L 11116526 3' + 412 449 2 68.32 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTTTAAATGAATTTATACTAATGTTCAACATTATGTGCATTTTATTTGTTTTGTTTACTTTGTTCCT:1 + chr3L 9766434 3' + blood 368 2 70.30 AGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACATATTACAGTGGAAGACAAACTAGATGTGGACTTGGCAGCACTC:1 + chrX 19986417 3' + Stalker2 7615 2 64.36 TTTTTCTTTAATAATACATTTTGAAAACAGCTGTTTCCCAGATTTGCCACTCCAGATCGACTCTGCGAATGATAGTGATCTGATCAAGAATATATATATAT:2 - chrX 8878613 3' + hopper 162 1 34.65 TATTGTTTCAATTTATATTTTCTGTTATTGGAGTACAATTGTTCAATGGAAAATTTTTTTATCAGTCACTTTTTGATTCGGTTGGTTTTCTTCTTTTCTTT:1 + chrX 11967026 3' + HB 1465 1 61.39 AAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATA:1 + chr4 96889 3' - Doc 19 1 54.46 CTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCATTAGAACCAATTAAAGTAGGAAATTATTTAAAATTGGATTTTACAAAAT:2 + chr2L 10793223 3' - I-element 29 1 56.44 CTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCTGTTGTTGCCCATTCGATTGCTTTCGC:1 - chrX 10671811 3' + mdg1 497 1 61.43 CGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTTTTGCTTGTTATGTTATTATGTCCTACTCGAAGCCGAACACGTGAGAATCGTAAAA:1 - chr3R 2560144 3' - I-element 5109 1 74.26 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAAAACAATAAGAAAGGAAAAACAATCAAAGAGGAAAAAGCCGAAATAAG:1 + chr2R 2044242 3' + Tabor 7293 2 64.36 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATGAAGGATGAAGAAGGAAAAATAAGGGACGCAAATAGAGC:1 + chrX 5256753 3' - INE-1 19 1 78.79 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCACGATAATCCGCATCCCGATTTGGCATGCATTCGAACGGAGGTGTATATATATGTATG:1 - chr3R 27748653 3' + roo 390 2 60.40 TCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTAAGGTCATGCAGCCCGGATTCTCACAGAATTGGAATAATAGACCATACTCCGATAGCAATAATCAAGCCTATAAGACG:1 + chr2R 3100454 3' - X-element 4372 1 73.27 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATATTTTTGGATTGCCCGTAACATATTTCC:1 + chr2L 2078484 3' + I-element 5308 1 72.28 GAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGAAGCGACAGCGATTTCATCCCCTCGAGAAAGGGAACATCGCGCTG:1 + chr3R 25177848 3' + 412 287 2 55.45 GGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGGAGATGCAAGATGCAAGTTGTAAGACGCGAATAATCGACCTCCGTGTGTGGTACAAAGTGCGTGCACAGTAA:1 - chr2L 736089 3' + Transib5 2942 1 77.23 AGGAAATAGGTAGGCTATCGTAGTTAAATTAGGTATAATATATGGTAAAATATATGGATAACATCATTTTTGATTTAACAAAAATTACTTTTTTTACAAAT:1 - chr3L 3548095 3' - Tc1-2 1530 1 70.30 CTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTGGAGGGAGGGAGGGCAGCAGATTTTCTTTCCCAACATTTTCCAGTGCG:2 - chr2L 17646164 3' - flea 4781 2 55.45 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAAGAATATGAAAATACCATTGATAA:1 - chr2R 4547752 3' + HMS-Beagle 7019 2 56.44 GGTTTCCTACTTTGTTTTGCTCTTTTTCTTAGAACGAACTCGATTTTTCCGTTATTTTTGGTTTGACAAACTGTATATGTATGTAGGTAATTTCCCAGACC:1 - chrX 22560619 3' + S-element 240 1 59.41 TTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAAGGGTTGAGATGGGTTAACCACCTAGGCGAATGGAGTGTCGAAATTGTGGG:1 - chr3L 17168810 3' - mdg1 7040 2 78.00 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAG:1 + chr2L 20133044 3' + flea 4970 2 79.17 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGTAAAATTTATGCTGACTTCAAAGAGCTGATGTCGCAAAAATAAAGCCTTGCATAGCTCAAGGCGCA:1 + chr3R 17454492 3' - 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roo 8695 2 59.41 CCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGAGTTTAATTTTAAAGAATTTTATATTT:1 - chr2R 6012485 3' - I-element 334 1 73.27 GTCAAGCGACCATATGAGGCCAATGTGTGCACATCTTGTGCGATGTGTCTTACTAACTTAATGTCTCGACGAGCAACACCGAAGAAAATATTCTCAGATAA:1 - chr2R 4621657 3' + Bica 4836 1 67.33 AATGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTGTGTATGTGCGTGCACTCATAAAAATGAGAGTGTATTAATATATATT:1 - chrX 992019 3' - hobo 31 1 55.45 AAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAAATGCATACTTGCAAAGAGTGCTTATAGTTGGTTGATAAAGT:1 - chr3R 19755099 3' + 1360 384 1 61.39 CACGTACGCGTTGATAAGAAGCTCAAGAAGATGTTGAAGCGATGGAGATA:1 + chr3L 5265567 3' - Ivk 131 1 60.00 GACCANCTTATGTTATTTCATCATGGACTGTATGCTTTACCTCTTACTTCCCCTTTTTATTTCAGCAAAGACGCGACGAGCTAAAATGTTCGAAGGCAACT:1 - chrX 8491376 3' + P-element 2883 2 77.23 TGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATATGAGGTCCTTCTTTAGCATAGACTACTGCAGCGTATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCGTG:1 - chr3R 19446127 3' - 297 6 2 72.28 TTTTCTGGGATATCGATAGATATTGGGAAATAAAATGACTTAGATTGACATAACTTAATAATTTAATAAATACTTGAATATAAAAATACATACTAACATTT:1 + chrX 434914 3' - 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chr2L 17646148 3' - flea 4765 1 71.29 TATAAGGACATTCAAAAAACTCTTGAATGTGCTGCCAAAATGGTATCCAATACCATTAAATATTTCATGTTTCTAGCACCATAATTATGCGCAAATTCGAA:1 + chr2L 2693175 3' + HB 423 1 62.38 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTGTGGCAACTCGTTTACCTGCCCCCCTACCTGC:1 + chr3R 8277959 3' - P-element 46 1 33.66 AAGAANGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGTTGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAA:1 + chr2L 3388124 3' - F-element 326 1 62.38 ACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACGCATAAATTCATTAATTTAAATTGAGCGGCCAGCGGAGCGCTGGCAATTTATGGGCTCTCCAA:1 - chr3L 4876715 3' + roo 9056 1 63.37 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTAATACAATTATTTCTCGATGAAATTCAAATGGGTAACTTTGAAATAAAAT:1 + chrX 17058214 3' - 297 18 2 56.44 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATATTCGTAATTAAATTGAAATTCGGTATACAATCATTCCTCTCAATGCGAATGTTTCA:1 - chr2R 24479868 3' - I-element 19 1 58.42 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAATGTTGCGTT:1 + chr3R 7360372 3' - jockey 27 1 58.42 GGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTT:1 + chrY 3648887 3' + 17.6 7389 2 65.35 GGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGCCACTTAGGAGGGGACGAACCAGAGGCTCGCACTGATTTCC:1 - chr2R 20604007 3' - Cr1a 4378 1 66.15 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCTTTGATTACTCAGAAAATTGTATATATTTTACGTGCACGTAATATTTTTTTTACA:1 - chr3R 10203612 3' - jockey 28 1 53.00 CAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGTATGTAGCTGAAGATCTGTTTA:1 + chr3R 8975990 3' + Bari1 1653 1 79.21 GATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTCGTTGTGAGATAAAATGAATAATGAAATAAAAACAATCAGCACAAGAGTTCAACGACAG:1 + chr3R 8304112 3' - 297 6520 1 62.38 AATATGCTATTTAGTTAGTTTAGTTCGTTGGGGTCCCCATAAGCTTTGGGTTAGCGATAGAAAGGATAGTAGCCTTAGTTAAAAGTCAGGCCTAAATGACC:1 + chrX 1651088 3' + Doc3-element 4642 1 75.25 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAAGTTAAAATATGTTCCAATCGGT:1 + chr3L 16973444 3' - S-element 36 2 66.34 GTTTAGGGGGTGGGGAAGTAGATGTAGATGTGGTAACTAGCGCCAACCAAATTACATTGTCCATAAAAAGTGTTCCAGAAAGCGGAGTGTGTGTCTTGGTT:1 - chr2L 18279881 3' - gypsy5 17 2 62.38 TGTTGCTAGGCCACTCCCCTACACGAGATTTGTGGAGAGTCTTAAAACTCCTCACAAAGCTATATAAAATACTGTGTCTACGTTTGGATGAGCCGTTCGGC:2 - chr2L 23332204 3' - gypsy8 33 2 89.11 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATAAAGGGCCCCCCTAAGTTTAAGCCATTAAGGGCAGGGGGTTCCTTCGATTAATCGATTTGG:1 + chr3R 4834341 3' - mdg1 7053 2 64.36 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAGATTCTAGTTTTCTTGAAGGACATTTGCTTTGTGTAATCAC:1 + chr3R 10728401 3' + pogo 2068 1 60.40 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCTGCAACCACAGAATCACAGCAATGAAA:1 + chr2R 23571682 3' - roo 50 2 79.21 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGC:1 + chr2R 16940404 3' - 297 26 2 61.39 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTAAACAATTTGAAAATACATTTAAGAACCGATCCCTTGACCTCGCAGCTTGTTAGGTGTTCTAATTA:1 - chr3R 27156617 3' - pogo 7 1 72.28 CTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACACATACATATTCATCTGCCACCAAAACTATTTGCTGCGAAGCGACATAAAAAACAGTTATAAATAATTTAATT:1 + chr3R 32005972 3' - invader4 7 2 73.00 GTGTGATGAACTGCCTAACAATAGCATCTGTCATTCAAGTTTCCTCTTCTTTCAGGTATGTACTTATGGCAGTTCCACACCATAAACTAGAATTATGCAGA:1 + chr3L 14331998 3' - G5A 370 1 61.39 TCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATGGTGAGGAAAGACAAGATCGGATGTAAATAATGTTCAACGCCCCCGAC:1 + chr2L 14612118 3' + roo 395 1 65.35 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATGCCATATAAAATTATTGACTACTGTTTATAGCACAAACAAGAAAAAGTATAATACTG:1 + chr2R 6173088 3' + pogo 2085 1 63.37 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCATCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGTGGGACGAGAAATAGTGAGGA:1 + chr2L 14612078 3' + roo 354 2 75.25 TTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGA:1 - chr3L 10590623 3' - 1360 489 1 54.46 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTTGCTCTCCTTGGAGACTACCTGTCAAGTGGCAG:1 - chr3R 9131769 3' + roo 9036 1 65.96 AGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACACAGGTCTGAGAGTTCTCATGGGCAACCAATGGCCCTATAATGAATACTCATTAGAAACGGGAAAAAATGAACTTTAA:1 + chr3R 3400099 3' - Doc 383 1 79.21 CAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTG:1 + chr2R 1982172 3' + 1360 84 1 60.40 GACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACT:1 - chr3R 18346609 3' + INE-1 580 1 71.29 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTTTTTCGTAATATAAAACACGAACTGTGCCGTCCACACTTAACCAAAA:1 - chrX 13546631 3' - roo 8691 2 57.43 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCCACGCTGACTTTATCAGCTGCGCTCCACCTCCTGGAATGTCGA:1 - chr2R 4606217 3' + 1360 3356 1 61.39 TAATAATAATAAAAAAAAATAATAAAAATAATAATAAAGTAACAAATAGTTCTTCTTAAATATTTTAATTTTATTTATGTATTCCAACACAGTGTGACAAT:1 - chr3L 22540368 3' + Rt1a 5074 1 64.36 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAACGAAATTAAAATGGCACGA:2 + chr2R 8310912 3' - pogo 31 1 57.43 TCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGTACTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACTGAGGCAATAATAACAGTGGTATCGCCTGCTAATTTTTTTTT:1 - chr3R 9381464 3' - Tc1 206 1 58.42 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGCGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCTTTCGCCTCTCTCTTCTTGGGA:1 + chr2L 4160223 3' + Tirant 8502 2 73.27 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCAGCTGAAGGACGAAGATATGGAATCAG:1 + chr2L 12324082 3' - roo 51 2 76.24 CCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCAAGCAGTAGTACTTTCGGAGCGACAGACCAGACCGGTTTGTTTGTGTTTTGGTGCCGTGAAAAATCAATCGAGAG:1 - chr2L 285655 3' + P-element 2885 2 77.23 AGGCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCGCACACAATTGGAAAGACACAGACGGTTCTTTGGTGGGTTCAGTGTTGGGCGGTGATGTGCGATAAGGGAG:1 + chr3L 22897690 3' - Ivk 65 1 53.47 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATAAATGTATTAAGAACTTTTAAGGATGCATGATATAAAATGAGCGGGCCGATGAGTTGGGTGT:1 + chr3R 4544086 3' + flea 5001 2 67.33 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAGCTATACTTTATCTCGCTCATCCCAGTTTCTCCCACTTCTTCT:1 - chr2L 12949212 3' + 412 7512 2 60.40 CCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCTAGACATCAAACTTTAATTCAGGATTGAAAA:1 - chr2R 3919679 3' - 1360 47 1 69.31 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCTCAATCACTTGGTACACTTAAAAAAATAACCTTAAATATAGAGGCAAAAGAAAAATAAAATGTAAGTCT:1 - chr3R 6622611 3' + P-element 2883 2 75.25 ATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAAAAATGAAAGCTGAGAGAGTAGCTAACGAGCGAGCGTGAAAGAGAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649919 3' + flea 297 1 71.00 ACTAACATATTCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAATTTCACCGCCATGCCTGCGTGCCTGCCAGTGGGTTCATGTG:1 - chr2R 7637515 3' + 17.6 288 2 59.41 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAACAGTTCTAGTGAATCCAAAAGTTATGCTGCCAAAGTGGATGCAAATACCCCAGGCATAT:1 - chr3L 8614473 3' + opus 484 2 59.41 GGATGGGCATGAGTTTAATATATGGCTTATTGAAATATCACCTTGGCAAAAGTCTCACCAAAATGGTTCACAAGTCAGGAATATATCTGCTCCTGGCCACC:1 + chr3R 12739679 3' - I-element 5045 1 56.44 CTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGCATACATAGATCCCCATAAATGCGCACAACAACACATACGCTGTAGCATGCGTGTGTTTGTGTGTTGTGGGTT:1 - chrX 723435 3' + INE-1 153 1 76.24 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACAAGCACTAATTAGAGAGCACTCGGCGAGGACAAAAAGTGTTGCCTACTGTTGAGGGCCGCCC:1 + chrX 6401489 3' - BS 5075 1 64.36 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATTTTATATAAACATTCGATTAACAATATTTCAAATTGTTATGTTGAAGATTATATGTATGTG:1 - chr3R 7168548 3' - flea 4758 1 75.28 AAGTGGACAATAATTAAATGATTGTGGGCTGACATTGACATAATTTATTTTTATCATAATGAACGTTTGATTGTGCATAGTTTCATGTTTGGAAGCAGAAC:1 + chr3R 4277384 3' - G-element 4275 2 69.31 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTATGAAACCCGCGGCCGAAAGCGGATAAAAAGTAATCAAAAGTGCTCAGAACGACATAATAAGGCAAC:1 + chr2R 18950831 3' - roo 8674 2 70.30 CTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTAAAACTTATTACAACGCCTACTACTTGGCCTGGTCTGAATCTCTGATGGAATGGCTGGCCACCTACCT:1 - chr3R 12047405 3' + Stalker2 7627 2 54.46 TCACACGTCGGCGATCGAATCGAATAACTTGGCTTCAGACTTCAGAATCTTGGCTTCATAAATTTAAATTTGCAATTCAAATCCATTGGCAATCAGGAGT:1 - chr3R 22232535 3' - F-element 12 1 60.00 CTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTTGTCCTGTCATCGCAAGTGACTTGGGGTTGTTAAGTGCTGGAGCAATAGTAATTGTT:1 - chr3L 6044728 3' - Tabor 6860 2 58.42 TTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCACTTGTTAGGGTACATATAATTGTTCTCTGGTTTGTTTAATTGTTAAATAATTCGATAAATACGCATTTATTTT:1 + chrX 6701559 3' - FB 5 1 72.28 AAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATGCATGAAGCTTCGTATCTTGAGTTTTATTTTTGGATGGGCGGGA:2 + chrX 15292553 3' + Quasimodo 7343 2 56.44 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTACATATTTTCATCTGGGTTCAGAGGA:1 - chr2L 16674875 3' + roo 357 2 79.21 CCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACATCACGTCGGGGTCACCAATCAACTTTTTCATTAGCTTTTGTATAAATAATATATATTGTTCAGATAACGATG:1 - chr2L 22645316 3' - invader4 3013 2 72.28 ACCTTGACATTTATTTTCCATATTTTACTCAGCACTCTCAGCTTCCGCGACCGCCCTTCACCACCCCCAAACCCCAATCCACAAATACGACACCACCCCAC:1 - chr2L 12462614 3' - transib2 270 1 78.22 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCTCAACGACAACAGTTCTTGAAAGAGTTCAAATAGTGACGATTTTTTTACTTTCCCCGT:1 - chr2L 17722756 3' - blood 18 2 58.42 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACACAAAATTAAAACTTATTAAAAAACATAATAATGTGAAGACATGATAATAATCATTTATCAT:1 + chrX 15082470 3' - mdg1 7052 2 65.35 CTTTAGCTATCAGTACAGAAATCTACTGCAACTGCACCTTTAGCAACAACAACTGCAAAATCACTCTTCATCACCTCTAAGCAGACCAAAGCAGAGTCCCA:1 - chrX 13892481 3' + Doc3-element 480 1 57.43 ATGCCATCTGGTTGAAGATTATTTTTGAAGCCCTGTATAAAGAATAGTTAGCTAAAGACAAAATGGTTATGTTGAAAAGAAACTACTGTTATTTATGGGGT:1 - chr2R 5697600 3' - Q-element 287 2 62.38 GAAAANCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATGCCAGACCAAATGGCTATATTGCATTGACACAAAAGATC:1 - chr3R 20137267 3' - Burdock 34 2 61.39 TTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTATGCAAAGAACTCACCATAAAATTGTTCTATAAAGTCCGGAGAATTCAGTTTATAAGTCCTTCTC:1 - chr2L 6083691 3' + 3S18 6093 2 65.35 TTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAAT:1 + chr3L 24916694 3' - Porto1 145 1 55.45 AACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGTAATGTAATTAGTTGAAAATGC:1 + chrX 21448814 3' - Doc 4604 1 78.22 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGGGTATATATATGCTAAAATCATTCCAAAGATGTACATGAACT:1 + chr2L 2308714 3' - HMS-Beagle 30 2 56.44 TTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGTTTTTCTTCGGATTCCCCAATGGGGTTGGTGTGAACTTT:1 + chr2R 13105425 3' + copia 4666 1 64.36 TATCTTTGTTTCTAATTTACCATTCTGCTTTTGTGATTATTCTGACCATTTTGATAACGTTCTGTTCACATTTTCTTTCCAAGTGTATTTCGTTTTGAATT:1 - chr3L 21142566 3' - Porto1 4371 1 53.47 GTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACTTGTTGGACCTGTTGGATGAGCCTTTGGCCAGGACACTTTACTTCTCTTCACTTCAGGACGAGGGCTTAG:1 + chr2L 10791121 3' + I-element 5015 1 64.36 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAGCATGTATATTTATACGGCGTACAATGTACATAGTTCTGGTTACATATGTATTTCTGCACCGCTT:1 + chr2L 8565548 3' - blood 7021 2 75.25 ATATGTAAATATATATATATATATATATATATATAGTCTTTAGCAACATTTTTTTCTGTTTTGATTTTTGTTTA:1 + chrX 6666737 3' + G3 4507 1 75.68 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCTCGAGCTTTCCAAAAATTAAACGTCGGTTTACTTGCCGCGCCTCCTTTTTCGCTTTCG:1 + chr2L 4160206 3' + Tirant 378 2 54.46 GTGGACTTTGAACAATGAATCAAAACGACGTACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTATGTATCTCTCTATCACACACATG:1 - chr3R 21789243 3' + Doc 199 1 73.00 AAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATGACTATAATGATACTTTCGCACAGGAGTAGCAGTGTCAGAATGGCGCCC:1 + chr3L 8363061 3' - 3S18 5794 2 52.48 TAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGATAAATATCTCGAACCAATTGCAAACTTTTCTCAACAAATTTTAAATGATAAATTACATTCTTTTGTCTCTC:1 - chr3R 4538704 3' + P-element 2619 1 78.22 CGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCACAGCAAAACGAATGCCACTTAGAATGTATTTTAAATA:1 + chr3L 4641663 3' + hobo 61 1 63.37 AAACGCGAAATAAAAAGTCTTGAGCCGCGTGTCCGAACACGAAGAAAAAGGCAGAAAGTAAAAAGTAAAAGATGAATAATGAATGAGCCGCACGCGAGCAG:1 + chr2R 16973304 3' - 1731 4520 2 66.34 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATTTCGAGCATGTTTTTCGTTTGCGCATTTTAAGCATTCTGGCAAGGAATCGGGCCATCCAAATA:1 + chr2R 16988282 3' + opus 7489 2 67.33 TTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTATGTCAAAAGTGGATCAAAAAA:1 - chr3L 17168860 3' - mdg1 7091 2 77.23 CGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTCTGTTTTGTGTTTTGTTTACTTTCATTTTCTTGCGTTATAATTTTATACTTTTAACTGTATTGCATGAGTTTTGCTG:1 + chr2L 12727242 3' + INE-1 579 1 60.40 AACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAATATATATACATGCATATATGTATTTATATAAATTGAGCGAGCCGAAGGGACATAA:2 + chr2L 18212208 3' + 412 471 2 53.47 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCGTAAAGGGGGAAGCTGCGGCCATTGGGCGTGGCATTAACTCTTTTGCGGCTTGGCATTTT:1 + chr2L 14790664 3' + roo 392 2 55.45 TTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGTTAAATCTATGTACATATTATCACAAAACATTTTTCAAAAATTTGGGCATGACGGTTTTCGGCAG:1 - chr2R 5865779 3' + 1360 316 1 67.71 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTCATGTTGCAAATTGCAAGCGAC:1 - chr2L 14612052 3' - roo 8717 2 81.19 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGTAGTAATTTTATTGTAACATTTCGGATACACTAGTCAACATGTTAA:1 - chr2L 11837994 3' - roo 8694 2 56.44 AACCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATTTGAATATTCTAATGTCTTTGGTTAAAGGTCAAGCAGACTGCACCACCTAGAATCACTTTAGGTATTTCCATTT:1 + chrX 16086933 3' - Tc3 3 1 55.45 TCCATACCTTCGCTATGGCCGCTCCCACAACGGCAGTCTCTTCTACATCGACTTCAACAACAACTGAAGAAATAACTACAACTACAAGCTCAACGGCCGAG:1 - chr2L 14161667 3' + Tirant 8066 1 55.45 ACGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTATAGGGGCTTCAAAATTAGTCTTTATATCAGATTCTTTATATGGACAATGACGTTC:1 - chr3R 3610716 3' - ZAM 8027 2 61.39 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATTTTAAGTAAATACAAATTCGTTATCGTTATC:1 - chr3R 26530875 3' + blood 331 2 69.00 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTCGCAGCGACTGCGGCGCCGACGTCGACGCCTGCGACGCCACGTTTCGAAGCCGCTTCT:1 - chrX 22855190 3' + P-element 2871 1 61.39 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCCGCCTTCCCTTCCCACGCCCAGTGCCGCCACGCCCCCTAA:1 - chr3R 12277504 3' + Tirant 8485 2 57.95 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTACCAATACATTTGGCTTGTAACTTTTC:1 + chr2R 19552035 3' - roo 50 2 76.24 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGTGTTATATGGGCGCCGCAGCAGCGGCTTAACTTATTTTCCAC:1 - chr3R 12780621 3' - hobo 31 1 56.44 TATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACCAAACGGCTCGTTGGAAAAAAGTATCTTTTAACCATGGTTAACATATACTTTGATAT:1 - chr2R 12868236 3' + accord 353 2 59.00 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATGCGAATTCTAAGAAGTATTTTTCTGGCCATGAAAAACGTGTGCTTTATCCACCAAAAA:1 - chr3L 7075863 3' + roo 391 2 55.45 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTGCCTCTCGAAGCGCACACAGCACGATGGCGGATGGGAGGGGGCTGGCTTTTAACCCACATAA:1 - chr3R 20477024 3' - 412 16 2 63.37 TTTCCNAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAAATACCATTACCTTATTTTTTTCACTCAAATTCGC:1 + chr3R 27981718 3' + roo 9027 1 70.30 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTGGTAGTTGCATGCATGTAAAGTGCCCTTATGGCACTTTTTGTTGTGTAAAATTGAG:1 + chrX 3763251 3' - 297 14 2 64.36 ATATGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTACTTTAAATTAATAATTATTTTTCTCGTGTTTTTTCGATATTTTCTGCAAAAGTC:1 + chrX 10694764 3' + blood 156 2 75.00 CTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAATCTTTATTAATTCGACTATTTTGTGGCAAGTTCCTGACCCAAACACAGT:1 + chr2L 12780730 3' + accord 7181 2 60.71 AAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGTTGGTGGCTAT:1 + chr3R 7388439 3' + HMS-Beagle 7038 2 79.21 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATGTATGCGGGGGCAAGTGAAAAAATTGTATGCTCGGAGAAGCCGCAA:1 + chr2R 16940406 3' - 297 6605 2 59.41 TGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCACATGCTGCCGCAGTGCAAAATATAATGCGCAT:1 - chr3R 6117245 3' - Tirant 8115 2 56.92 TACATAACATATGCATGCCTTCTGCTTACATATGTATATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGAGTGTAAAACCTTAACGGGCAAAT:1 - chr3R 15914411 3' + Stalker2 7475 2 43.56 GATTTNTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGCTTTTGATCTTTTTTTATGAGATCTAAGTATGGCAATTTTACTCGAAGGTGCTAAGTTGTGGATGGCGA:1 - chr2L 12481559 3' - FB 8 1 63.37 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAATGAGTATCCTCTCTATCCTGAA:1 + chr3R 20149753 3' + 1360 3334 1 82.18 GATAATGATGATAAACCTATTGAGACGGACACACTTGATGAAATAATAATCAAACCACCTCCTATGAAGTGTGTATGTGTGTGCGGCGCCATACCTTTGGC:1 - chr2R 8000660 3' + Juan 278 1 62.38 TAATTATTTATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTTACGCTCGACAGCATGGATTTTTA:1 + chr3L 7185005 3' - Doc 149 1 76.24 AATGTAAATCCTAAATCGTAAAATCATGGCGAACATAACCGCCGCTCGGCGCACGGCATAAATCAATGGGCTTCAACTCAGCTAAAGCAAGCAAATAAATT:1 - chr3L 18927912 3' + TART-B 10294 1 58.42 CGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATTTTATTTTCAACGTAAATCAAATCACAACAAGTAGTTGGAATAT:1 + chr2L 8265825 3' - accord 7131 2 66.34 AACTANTCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTTGTCATTGTTTGCTGATGCTGTAGTTGTAGTTGTAGTTGCCGAGCTGCACTCAAG:1 - chr2R 19081233 3' + Doc 4515 1 59.41 TAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGTTGTGGGGCGGGCGAGCTAGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 4345372 3' - hopper 9 2 53.85 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATAAATATAGTATATAGTGCAGAGTCGGAAAAGCGGAAAAGTGGGTGGGCCACTAAGTGCGGC:1 - chrX 20806851 3' + opus 7487 2 65.35 TGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCATAAGCAAATGATTTTAGG:1 + chr3L 24254017 3' + F-element 378 1 80.00 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGGAAATTGTTGGGTAACTGGTGGAAGAGGGCCGGGCAAGAGTCAACTGCTGCATGC:1 + chr2L 5646905 3' - jockey 4696 1 52.48 GCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGAAATGCAATTCAAGAAAGAAATGAAGCTGGCTTTGTTCCGTAGGTAACAGTATCAAGTTT:1 + chr3L 25395892 3' - Stalker4 200 4 66.34 TGTCGTGCCAACCCAATACGCATGACTTACACTCTAAGTGGGTGCTCCTTGTCGACCCGCTCGTATTATGCTCCGCATATTCTAGCTGACTACCACGAG:1 - chr3R 2533968 3' + Q-element 692 2 53.54 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGGAAGCCATGGAATTCAGGTGTAGCGTATGGACTCATCGGGCCAAGTCGGGGA:1 + chr2R 5804542 3' - P-element 23 1 57.43 TTTTTTTTTTGAATATACCGAAAATCAATCACAATACAAATTGCCGCCACACTTTAACTTTCGATGGTTCGAACATGAATAAATGGTATATAG:1 - chr2L 10590620 3' + Circe 7291 1 80.65 AAATACAATTTATTTTCATTGTGCAAACCATTTCTTGAAATTTGACTATGGAGGCGCTTTTACAAAAACACTAGGACTCGCCTGGGATCCGGTGTTTGAT:1 - chr3L 23236288 3' - S2 24 2 69.00 GCGGCAACATAACTTCCCTTTTTAAAATGCTCGTATTCCGCCTCGGTGGCCTCTGCTGAGTAGTATTTAGCAGTGTCCTGGTCCTGTTCCTGGTAGCCATA:1 + chrX 4242242 3' + mariner2 7 1 71.29 TGCTTGCAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAAAGCAGCGCATCGAGGACTACTTTCAGACCAGCTGGTCACTCAGCCATGGCATCGATATATACGAGGT:1 + chr2R 17915475 3' - gypsy12 10053 2 74.75 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTGTCAGCTATTACTTCACTTAAATTTCTTTTGTTACTTGTTTTGTTTTATGGACGGGGAAATTTGT:1 + chrX 14039623 3' - Doc 4474 1 52.48 CTTCTTATTTGGGGTTTTACACTGGGTTTGCGCCCATACG:1 + chr3L 19377767 3' + roo 409 1 50.00 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCTAAAGGACAACTGTCGACGGCGGAGTGTCGCCTGTGACACGGCTGCCATAAAAACAGG:1 + chr3L 4921474 3' - jockey 4778 1 60.00 GCTTTTATCGTTCCTGAGATCTTGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTCAGACCGACTCGGCTATTGATACTGGTCAAGAATATATATACTTTATAT:1 - chr2R 8443974 3' - INE-1 149 1 84.00 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACGACGAG:1 + chr2R 12492459 3' + hobo 2932 1 70.30 CTAGTGATCCTAATCAAGAATATATTCTATTCAACCTGTTAAATAGTAAATACACTATCAACGAATATTCTTCTACTTTTAAACTTCCTTCCAGGCGTTGT:1 + chr3L 19952980 3' - INE-1 85 1 80.20 AATGGNAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATGTATACATATACATACACATGTATCTATATGAGGTCTATGTGCAGCTTTCCGTGCTCAT:1 - chr3L 22831262 3' - 297 18 2 53.00 TATGTATATCTGTATATATATGCACTATACTACGAGTATATGTGCATATATGCACCGATATCGCGTGGGGAGATCTCGGCTTGACATTGGCATCTCAACGG:1 - chrX 15543353 3' + G3 4508 1 54.46 GTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTTGTACATTAGCAACAGATTTTGTTTATTAACGCATGTGCGCTTGCTTTCGGTAATGCGATACCATTCACGC:1 - chr3R 17342127 3' - I-element 4938 1 76.24 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATTACATTACGATACTCCTTACAATTCCTCGGATTGGGCAAACTGTTGTCGCCAGTTACA:1 - chr3R 15072557 3' - pogo 14 1 62.38 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATTTTCGTAGGATTTTGTAAATATCGATTAATTGTTGTTACCATCGA:1 - chr3L 13829937 3' - mdg1 51 2 60.40 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATACATATGTATATTGTATATGCCAACGTACATTTATGCATGGTTCTGCCCCTGCGAGTTTTGTATTAAA:1 - chrX 18144330 3' + hobo 2929 1 69.31 AAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCGCCCGTCCTCCGTCCGCATTGAGTGACATCTATTAATCGTCGCA:1 + chr3L 4933043 3' + 1360 3097 1 62.65 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCTTTAGCTAAGCCTTAGCTTTCTGAT:1 + chr2L 7255795 3' + P-element 2847 1 35.11 CTTTATCATGTACGGCCCGTCAAGTCTCGATGCCCTTGAGCTTGCCGCGAACGCGATTGGCATTCTTCTTGATGTCGGCCATCAGATCCTCCAGCTCTTGC:1 + chr3R 24104198 3' - Osvaldo 1380 1 75.25 CATATTATTATATATACTTATATACCTATATTTAAATTTAAAAAAAAGACCAAGAAAAACCGCAAGCAAAACGTTGGCACTTCATAAATGGGCGAGAAAGA:1 + chr2L 5461208 3' - Dm88 4383 2 61.39 TAAATGTATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGTAGTGCAAGCAACAGCAGAAGCAGCCACAAACGAGGGGTGCATGCTGCACATTTTTTAGGCAGCCCACG:1 + chr3R 23275351 3' - roo 8671 2 68.32 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGGGTGGTGGGAAGATTTT:1 + chr3R 29123381 3' - P-element 56 1 22.77 TATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATAGGCTCTCATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCAGCTCGTGACTGTTTGTGAGTTTATGGCTT:1 + chr3L 5718111 3' - Quasimodo 476 2 67.03 ATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGCGGTTTGGTGTTGTGGT:1 + chr2R 14914476 3' - Stalker 6984 4 79.25 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATTAGTTTATTATGAGAGGAAAAATCCAAGAAATCTTAACTGCGCACTTTTAATGTATTGTGTTGTATTTT:1 - chr3R 5633243 3' + S-element 1708 2 71.29 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAAACTGAAAGAGGATTTACGAAGCTGCAAAATAAGAATAGAAACTCGAATGTTTTACAGCTCTAA:1 - chr3R 20878435 3' - 297 6588 2 66.34 GCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGGTGAGACATTTAGCTTCACATTCCTTGATGCTTTTGAAGAAAGTTCCTTCG:1 + chr2L 3388133 3' - Doc 268 1 53.47 GATTCNTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGCACATTACAAATTAGAGAAGTGTGT:1 - chr2L 513686 3' - roo 8717 2 78.22 ATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTTCTTCTTTCGCTCTCCCACACGAAGGGCGTTATTCTACCATGCAACTGTTATATCTAAATTTAGGTTAAT:1 + chrX 2124801 3' + Cr1a 275 1 58.42 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACATTACCCGATAAATATTAATATCACAACAATTTTTTCTCTATTGACTAATAATGATGATGTCAACAATCCATC:1 + chr3L 18337733 3' - Juan 4031 1 71.29 CCCCTAAACCTCCACGCCAGAACCATTAGTTCGTTGGCCCACATCTGACCACATCAGCAGAGTTGCCCGGGTAAAAGTTTAAAAGATTATTACATAAGTTT:1 + chr3R 6535812 3' + gypsy5 6969 2 59.41 ATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGCATGCGAAAGCCAGCAGAGGGCAACGAAATTAAAATGGCACGAATAGGTGTAATGCGAATTTTGGCCT:1 + chr2R 8310937 3' - pogo 6 1 71.29 ATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATTAAAACAGTAGGTCAAGTAAATACAGAAATGGTATAATAAAAACGGACAAAATATAATTTGATATATTAAA:1 + chr3R 7168668 3' + flea 255 1 76.24 TCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGGTTCAAAGAGAGCAATTGCAAATTTCAGGACAGTTTTGCCATTCTGTTTAAGTATAATTTCTCTAAAGTCGCGGT:1 - chr2R 4132256 3' - 297 6767 2 64.36 AATAAACACATGGCATTCAAATCCCTTAATCTGTATTTCAATTTCAAATAACCCAATGGTTAAGCACTTGCAACACTCGCACATTCACTGCCACAGTGCCA:1 + chr3R 20338104 3' + HMS-Beagle 6665 1 79.21 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATTGATACATGCCGTTAATACACGCCTCACATAATTTACTACTATTTACTTGTACG:1 + chrY 536715 3' - Doc 29 1 52.48 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGG:1 - chr2L 21683412 3' + pogo 2059 1 70.00 CGACAACAGAAGTGGGATCGCCTTCGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCATTGGGCGGCGCTCGTCCGCTGGAAC:1 + chrX 4547458 3' + invader1 419 3 71.88 TATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTACTAGTTGACCCGCCAAACGTTGTTTTGC:1 - chr2R 4854999 3' + opus 7457 2 77.23 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGACAAGCGATCGTGCCAACAACTATAAAAGTATCAGCAATGGCGTTAATTTCTTATTGGTTGACGATGGACGAAC:1 - chrX 13640601 3' + P-element 2884 2 76.00 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGGTCCGAATCCGAGGATC:1 - chr2L 12815042 3' + hopper 1381 1 57.43 GGGACTTAAAACTGTGAACAATTTGCTGTCGATCCGCAGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACGTTGTAGTGCAATACATCTTCAGGGGCT:1 + chr3L 5518675 3' - G6 54 1 79.21 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGCCAGGCCAAAACCCGGCCATCTTCGG:1 - chr2L 12815058 3' + hopper 1365 1 73.27 ATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTATGTAAATCCATATTATTGACATAGAA:1 - chr2R 4547775 3' + HMS-Beagle 200 2 74.26 CACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCAAACAGTTTACCTAACGCTAAGTAACTGTCTCGTTTGATTTTCTTTTCGGCAAATGGCATAC:1 + chrX 9399304 3' - P-element 119 1 63.37 TCTTCTTATTTGGGATTTTACATATACATATATGCATATATATGGTTTGCCATGGAAGAGATGCTTGCTTTGAGCTCTCAGCTCCGGCACGTTCAGCCGTT:1 + chrX 3817544 3' + roo 408 1 77.23 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGGACGAGCTTTGCTCTAACCACACTTACAGTTACAGCTTTCCAAGTGTTTACCTT:1 + chr2L 16948731 3' - jockey 4700 1 51.49 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACACAATAAAACCAACTTTGTCCAAGTACTTAAAGTGCCTT:1 + chrX 13546697 3' + roo 9032 1 65.35 CTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTCCCGGCGACAGTTACACACATGCACACAAGAAATTCA:1 + chrX 16993847 3' - jockey 162 1 63.37 GCCGAGGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATATATTAATATTTAGGCTTTTCTCAATAGTGTTGTAAAACGATTTGTTACCCA:1 - chr2R 5953081 3' - pogo 22 1 57.43 CGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGA:1 + chr3R 31959305 3' - Ivk 48 1 68.32 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATATATAAAAGAAGAATGTCTATTAGGTGTTTTTTAAATTTTTGTA:1 - chr3R 12589012 3' - Max-element 35 2 61.39 GTTATTTACTGTAACGACCTTAGACACATCGACGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTAACCGAAAGTGTCAAAGCTTATAAACGTCA:1 - chrX 21484381 3' + I-element 496 1 73.27