Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score TCTGTTGTTGCCTTTTACCACTGAGCCGTAAGTTATTTTTTTTTTACTGTTTATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 + chrX 10653547 5' - jockey 4963 1 62.38 TAAAGGCAGACATTTGAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGG:1 - chr2R 12214021 5' - Transpac 308 2 78.22 AGATTGTGCGCCACAAAAGAGCTTGCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTA:1 + chr3L 5964232 5' + BS 16 1 53.47 TCTTTAGCTGATCCACGGAAGCGGCTAGCATATTGTTCTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTA:1 + chr2R 24020452 5' - I-element 46 1 62.38 TACCTAAAACTACATAGCATGTAAAAAGGTAGAAAGATTACATTATTTTTTACAAAATGTATGTAACTATTTTCTGCGTTTTATATTAATAAAAATTACAA:1 + chr2R 13761686 5' + Transib5 2599 1 84.16 CTAGATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTC:2 + chr2R 18295595 5' + I-element 18 1 59.41 AGCGAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAAT:1 - 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P-element 2840 1 32.67 AAGCATGTTTTCTTTGGGATTATCAGTTCTTGAACCCCACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2R 4502398 5' - roo 408 1 76.24 AAATCAAAACTAAAAAAAAATTTCAACACATTTTTCAAAACTGTGGGTGTGGCAGTTTTGTGCGGCTTGCGGGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAA:1 + chr2L 22353884 5' + copia 4876 2 72.28 GTTGGCGCTAAGGAAAAAGATTTAAAAATACCCATAATTGGAACTTTAGTGTAACCTAAAGCTTGTTAGCAAAAGTACTTATCCATTCTCACGGGCGCCGC:1 + chr2L 15826589 5' + GATE 476 1 79.21 CAAGACTTTGTCATCGATTTCTATTTTCTTCCGCTATTCGAGCTTTATTAGTTTCCCCTTATTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATTATA:1 - chr2L 21149110 5' - micropia 5249 2 64.36 CAACAACCTTTAATGTGGTTAATAAATATAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2R 16744179 5' + opus 7160 4 77.00 ATCGTAATAATAATTTCCACACCTCTCCTCAATGTTACCATTTTTTACTTATTGGNNTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAAC:1 - chr2R 1885996 5' + Stalker 6882 4 72.92 GTTGATAACGAATAAGGTCACTTGGCGCCACTGATAAAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3R 19467877 5' + Transpac 4954 2 64.36 AATTGTTAATAAAATAAGGGGCTAACAAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAAACT:1 - 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Quasimodo 7100 2 61.39 CCAAATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2L 903794 5' + 1360 14 1 61.39 TCCCTTCTGGTTTCCACTCGCACGCCAGGTTTAATGTGTGTTTTCATTTTATTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATACGTTTGCTGCATCGCA:1 + chr3L 1588685 5' + pogo 100 1 57.43 AAGAATCTTTTGCAAAAAATCCGTTCGCTGCTCCTCGGGTTCTAGATCAAATTGATCCTGTAATGTACGGGTTGCATGACCCTTACAGAGTATTTTGTTCT:1 + chr2R 4711989 5' + Cr1a 4183 1 69.31 CGGAATGCGAGCTGGGTGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr2L 1828774 5' + 412 35 2 58.42 GTACCATTTATACCAACATATGTATGTTGAATACTTTAAAACAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 21708610 5' + roo 8697 2 63.37 ATAACTATAAGGAAACTAATAAAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTA:1 + chr3L 27181996 5' + F-element 259 1 57.43 CTATTGTGGGCGAAGGCTGAGCACTAAACATAATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATATCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCTATGA:1 + chr3L 12072559 5' - 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I-element 4993 1 61.39 AGCGAGGGGATTGAACGGGGGGAACTGACCAAAAATCGGACCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTG:1 + chr3L 3984381 5' + Gypsy6A_LTR 118 1 66.34 CGACCCATATCCTTTGCCAGACGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAA:1 - chr3R 25702237 5' - Tirant 8458 2 75.00 ATTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 - chr2R 21848607 5' - Juan 4171 1 72.28 AATCTATTTAATACATTCAAATCGGAGGTTACATGAGAAGAAAGTCCATTATATAAAGTGAAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATC:1 + chr2L 84578 5' - BS 5008 1 65.35 TCTTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATAAA:1 + chr3R 21988768 5' - Tirant 272 2 70.30 CATTGATGTATATATATACCATTATCATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 - chrX 20880660 5' + invader4 2790 2 55.45 TGTGCTTAGCTCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chrX 14531554 5' + 412 7091 2 67.33 TAATTATGCAATGCTGTTTAATATTTAGGATCGTGCTAAACCGACACAAGGTCAAGGTATGCTTAATATAGATATAACTTACTGATTTAGAATTATGTGT:1 - 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chrX 10286284 5' - R2-element 3343 1 58.42 GAAATTAGGGCGCTAACATTGTCAGCTTAATAATTTTATATTTTTATTAAACATTCTTTCATCAACCAGCGGTCTCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAA:1 + chrX 10088869 5' + FB 3 1 53.47 AAGCATAAAATATGCTAATTTATTGCTGTTGATTTTAATAACTTTTGCCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 + chrX 13350741 5' + jockey 4769 1 66.34 CACTGTATTGTGGGTGTGGATCGGATTGGGGCTTGGCAACGTGAGTCAGGAGCCTGCGATCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTG:1 - chr3R 21985758 5' + blood 446 1 59.41 TAAATTGAAGCAAAATGCGCTTTGATGTCCTTGTAACACGATGTCCACCCACTTGGGCCAACACTGTGTGATGGAGACAGCCACTCCTATCTCCATCAATC:1 - chrX 4010132 5' - Rt1c 75 1 55.45 GGCTGGAAAATTGTTCGTAGGGGCCGCAAATGAGGAGTGATAATATTTTCTAAAACCTTTGGTACAGCCAAAAATGTAGAGATTGCTCTGTAAATGCTTGC:1 + chr2L 17213264 5' - Q-element 100 2 78.22 ACCGAATTGTGCCAATTCTCTTCTACGGCAACAAAATGGACATGGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCA:1 + chr2R 19444685 5' - 1360 3187 1 56.00 AAGAGAGCGGAGCACGCTCTTAAATTGCAGAACTCTCTGATACAGTTCAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr2L 6252497 5' - P-element 2859 1 51.49 AGATGGAGATGGCTGCCTGGTAGCTGGTCAGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr2R 19936710 5' - roo 403 1 76.24 GGAAGTATTTTTTTTAATATTTTAATTGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTA:1 - chr3R 31103093 5' + GATE 37 2 67.95 CATCGAGGCCAAGAAGAGGACTGCCCCCAAGCCAAAGGCGAAGGCAATGGCTCCACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCC:1 - chr3L 26645846 5' + HMS-Beagle 6681 1 67.06 TTTAAGATCTCACAGAGTTATCTCAGGTCCAATGAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 32018618 5' + F-element 4680 1 66.67 ATCAAGTCATGGGAATAACTTCAGTGGGAATCGCGTGTGGAACAGGCAGAAGGAAGCGATTGCGATCATATAAAGTATATACATTCTTGATCAGGATCAAT:1 + chr3R 23894050 5' + INE-1 83 1 54.46 TGCTGNTGATAGCGCGACAACGAGGTTGAAATTCAGTTTCGTTGTTTTAGTTCTTGTAGAATTGTGTTTTCGTCGATGTGTCTAAGGTCGTTACAGTAAAT:1 + chr3R 6815591 5' - I-element 499 1 66.34 TCATTAATTTTTTTTCTCTTGGCGACATTTGCGAAACAGCTGAGACGGAAAGCATGGAAAGCCAACTAAAGTCACTGGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTTC:1 - chr2L 6112371 5' + baggins 5001 1 70.30 GACCAACTTTTGCCATTGTCTGGCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - 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Porto1 267 1 55.45 GACATAAATGGACGAAGAATAAGCAAGGATAACTGAAAAGTTTCTTCTACGGAGAGGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGG:1 - chr2L 18019018 5' - F-element 4473 1 57.43 GAGCTGCACAGATATTTGTCAGTTTGCCAGTGCAATTCGGTGCTGCAACTTACCTCACAACTGCATCCGACTGGCTCTCATTTATGCGTTGCCTCCGGATA:1 + chr3L 19373439 5' - rooA 7182 1 75.25 GGAACTTGGCTCCTTCATTTATTGATGTGTATCCCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 14041975 5' + roo 8702 2 75.00 CAGTCCCAGGCCGAAAGACAGGCGATCTATTAAGGGAAGGGAAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCAT:1 - chr3L 11153240 5' + 17.6 38 2 71.29 ACTAATAAAGGGACAGCCATGGCAGGGCAACAAACATGGATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 - chrX 15195296 5' - Transpac 5198 2 61.39 GTTGGNGCACCCGCCAATGTGGTCTCAAGCGTTCCTTACTCCCCATTTCCTTCCCACTTGTTTGGCGCTGCACAAGTAGAAGACATCGAACCGGGAAGCTT:1 - chr2R 24904196 5' + ZAM 8027 2 71.29 CCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 - chr2R 9014474 5' + blood 7053 2 65.35 AATTAATTGGTAGCAGTTATGAACTTTGAACCATAGAACCAAAAATATTAAAATACCGCAGGGCTTGACTGCGGGAAATGTCGCAAGACAGTTTGATGACT:1 + chr2L 16721866 5' + baggins 452 1 78.22 GTATGCAATTGAAATTGTGCCGTTTGATGTGAAAATACTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGAC:1 + chr2L 16933598 5' - 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roo 9040 1 55.45 TGTCCCATTTTTTGCATACCCATAAAAACTTTTATTTTTTTTTTTATCATATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATT:1 - chr3R 26167165 5' + 1360 3147 1 69.70 TCAACAGATGATTTCGCTGTTGCAGTTCCGGATTATAATTGAAATCGTTTACATATGTACATTCAATATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTA:1 + chrX 10538527 5' + accord2 127 2 74.26 ATCCGNTATTCGGGGCTTTCGCCTGGAGATGGGGTGGTTTGCCGTTGCTATTATTATTTCCTATATGCTATAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3L 21319335 5' + jockey 4679 1 71.29 TGTTAAAAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGA:1 + chrX 14525243 5' + hobo 16 1 63.37 CTCGCACGCATGAGTTAAATTTTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr2R 8378582 5' - pogo 2083 1 59.41 AAAAGGAAATACATTTAGATTTCCGCTTTAATAACATAGCAGGTTTAATGTTGGGATACTTATATAGTTATTTATATTTCTTATCTTATCTTATCTTATTT:1 + chr3R 15768202 5' - Stalker3T 199 2 62.38 TGGATATTCCAGAAAAAGAGCTGTTAAGAAGGCTGTCCTTAGACTTCTTGAGAAGGTTTATGTGTGGTGACGATAACATTGCCGGCTACCTCTTATAATGG:1 - chr2L 281218 5' - gypsy7 5146 1 73.27 AAGGACCGAGCTGCCCGCATCAAAGGAAGTATTTTTTTTAATATTTTAATTGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTT:1 - chr3R 31103117 5' + GATE 36 2 52.48 TTTTTTTTTAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCG:1 - chr4 873148 5' + 1360 2981 1 56.44 AAAGAATAATCAGCTTACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 - chr3R 4543254 5' + 3S18 5797 2 53.47 TTGCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCA:1 + chr2R 9014411 5' - blood 7361 2 52.48 CCACCAACCAACCAACAAAAAAAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr2L 14083637 5' + R2-element 3585 4 89.19 TTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 + chr2R 6984319 5' + HMS-Beagle2 27 2 52.48 TACTACCTATCTTTTCGAAGAATTAAACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 13994275 5' - P-element 2861 1 51.49 CATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3R 13715121 5' - P-element 2835 1 22.34 AGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATGTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chrX 4154901 5' + blood 20 2 57.43 AAAGAATTCAATCAGAGCATTTATACTACACAAATCGAATGTATAATTTAAGAAGCAATTGTAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAG:1 - chr3L 25827568 5' + mdg3 5099 1 68.00 ACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCT:2 + chr3R 19450170 5' + roo 8703 2 65.35 GTTATTACTTGGCCTTGGTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 17122403 5' - roo 9050 2 58.42 GTCCATTGTTGTCGGCCTCCTCCAGGGGACACTTGGTGAGTATGAAATGACCTGAAGATTGATTTTGTTTGCTGCAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTT:1 + chr3L 21212354 5' + roo 361 2 67.00 ACCGGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 + chr3R 25818817 5' - mdg1 7430 2 55.45 AAATATAAACTACAAACAAATGGAAAACAACTTGACACCAAAACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTA:1 + chrX 10396887 5' + F-element 4633 1 58.42 GGGAAATGCAGTCGCATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACA:1 + chr2L 7170354 5' + jockey 4607 1 71.43 TTTTAAGCTTATCCCCAACAAAGAAGCTTCGATTTTCTTTGTTTTTATTTATATTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 - chr3L 3279802 5' - Juan 4190 1 53.47 GAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGC:2 - chr3R 10741142 5' + 1360 3365 1 42.57 ATTGCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 18012670 5' - roo 9049 2 56.44 GCTTTCGGCCACTTATTTATTATTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTAT:1 + chrX 6405634 5' + jockey 4847 1 78.22 GACATAAAAGGCGCCAAGGTGACGCATGCGGGGCTGCTCAAGCACAACTCCGATGGAACCACCGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACT:1 - chr2R 22736808 5' - 1731 163 2 68.75 AAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACC:1 - chr2L 12074397 5' + Quasimodo 41 2 74.26 GCCCGGCATACTGGACTCCAGGACCGCATTGCGAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCA:1 + chr2R 8792785 5' - roo 8920 2 67.33 AGTTCGCAAAATTGGGTTATGTAGTGCCTTCTAAATATGGAGGACACGAGACAAAAGCTAAACACGCCAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGATACGC:1 - chr2R 22937004 5' - R1A1-element 5236 1 72.28 TGGCAATCGCCGACAGCAGGCAAAAAAAATAAAAAGGAAAAAAAAA:1 - chr3L 10948375 5' + Doc2-element 251 5 73.91 GGGAGAGTTGGCCCCAATAATCCAACGGAAACCGAAACCGCGATGAACAATTTATTTGCTGTCCAATTTGGGTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTG:1 + chr3R 4670142 5' - I-element 4878 1 61.39 CCGATGGACGAGTGCACATCTGGAATGCCGACACTGGCAATAAGGTGTCCGTACTGAATGCTGACCCATCATTGGGCCGGAAACCCGTGCGCAGCCGGCA:1 + chr2L 8375308 5' + Gypsy6A_LTR 81 1 64.00 CGCAGCGCCTTTAATCACTAGCCTTTCCAACTCGAAGTCAGTTTGCGTATAGTCCGAGCCCAGCTTCAATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGT:1 + chr3L 16462664 5' - Fw2 3691 1 62.38 AATCCCCGAGCTGCCGGGGGGGGGGCCTGCCAGTCCATCTTCTCCAAAGTTGATAAGGAGTGAGGAGGGGGGGGAAGCTGGGCACCGTAAGCC:1 + chr3R 29614631 5' - G6 267 1 80.65 TAGATAGTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3R 24152888 5' - P-element 2831 1 23.00 GGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr3L 7989746 5' + mdg3 40 2 60.40 TTTTAGGCGAAATTTATTGAATAATTCATGGGAAGTGATTAACACATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGT:1 + chr3L 4048451 5' - 3S18 308 2 57.43 ACGATTAGTTGAGTTTTCTATTGGCTTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAATGGAAAATAAGTTAAATTTTA:1 - chr3L 22801819 5' + 297 463 1 73.27 GAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 + chr2L 9389060 5' - 1360 3349 1 70.30 AAAATNCATAACTAAAGCGCAGTCTTATACTTCGCATTCATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 28095210 5' - hobo 2902 1 60.40 TTTTAATAAATAATTCAAAATTTACTATTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGA:1 + chr3L 11241789 5' + transib2 389 1 76.24 CGTTCAGCTTTGCGTATTTGGTGAGAGCTTATAGCTAACATTTTTGGTTGCACATTTTCCTATAAGTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAGA:1 - chr3R 29048334 5' - Ivk 5217 1 70.30 ATTCATACGACTGTAAAGCGCTACAAGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAGTATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAAGAACGGTATGGATGCAC:1 + chr2L 2556336 5' - rover 126 2 74.26 TAAACTTGAAAGACATAATTTTGATGATTTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr2R 4901587 5' - Transpac 264 2 75.25 AGGGATCTAACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 15638307 5' - roo 389 2 60.40 TGATAGGCCATATAATTACATAGCTTATTGTCATACGCCTATTCAGCTTATTATCCAAGGAGAAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 - chr3R 8198579 5' - Tirant 389 2 67.33 CACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAG:1 - chr3R 19609707 5' + Tabor 46 2 69.31 CACCTGCCTCTATAGATTTGTCGCTGCTTTTTTATGCGAAATTTATTGAATAATTCATGGGAAGTGATTAACACATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGT:1 + chr3L 4048422 5' - 3S18 337 2 69.31 TTTTGGGCGGAATAGCCTTTCAACTTGACCTAGAACTAACTTAGTTTTTCTTTTTAATACGTTAATTCGGGCCTAATACTTGGCTGGATAGCCTTTGTTAG:1 - chr2R 6975129 5' - HB 1322 1 82.18 CAGTTTTATTATTAATTAGAAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGA:1 - chr3R 17053803 5' + invader2 263 1 80.20 GTCCAACCACCACTCGCGACATGGAACTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACC:1 - chr2L 19767993 5' + I-element 4952 1 72.00 CAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2L 21978160 5' + roo 8699 2 64.36 CCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr2R 9014464 5' + blood 7063 2 75.25 CAATAAATCTGATAATGATCGATTACTGCTGTTAAACGGTCTGAATTAGGTGCAATAATCCGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTT:1 - chr3L 3186496 5' - I-element 4934 1 66.34 CTGAGTGCAGTTTTGTCGTTCAAGCTGGCAGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCG:1 - chr2L 15893796 5' + Max-element 8233 1 80.41 GTGCATATCCTTTTCTTTAAATATCCCCTTTTCTGGACTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGA:1 - chr3R 22249266 5' - P-element 332 1 41.58 GTGTTTTTTTTTTTGCACATAACATGAACATAAACTGCACTTTTCGCT:1 - chr2R 8602045 5' + Cr1a 272 1 93.75 ATGAGAGTCCCCAACAGGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chrX 19095737 5' + roo 8694 2 55.45 GCACCATTTCCTTCCTGCATTAGTATTTAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 + chrX 7410188 5' + jockey 4715 1 72.28 AAACCAAATTCCCTTTGACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chrX 17064845 5' + Tirant 7 2 68.32 GACTCTACCAACCTGCCTTGCATCCATATCCATCCATCTGCAACTCCAATACCCAATCTCCATCTAACAAATTATCCCCAAACTTTCCGTGTGCAGCTGA:1 - chr3R 14492363 5' - Gypsy12A_LTR 148 1 65.00 ATAGTTTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAGATGGGTAGAATCTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTAT:1 + chr3R 4322610 5' - INE-1 163 1 70.30 AATTCNCTATCCTTGACCATCCAGAACATAGTGTTTTTGTGCCCGCTTCGATTTTTAAAGATTTCAGGTGGCAGCTGGTTTTTCTTTTACATTTTTTTTTT:1 - chrX 14720054 5' - Doc2-element 233 2 70.30 GATTANTGAGGCAAGGCCCGTGATTTCAGCTCACAGGCAGTTAACAATATTCCATTCGCGATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCGTGTAATTCGTT:1 + chr2L 367349 5' - I-element 400 1 65.35 CAGCGTATAATTCCAATTTGGAAACCGTGAGGGTCTTCCCTGGTGGACTTGCGTTGGAGCGAAGTGAGGACACAAGATGCAAAAACCATTATTATGAAATA:1 - chr2L 22228031 5' - transib4 2308 1 71.29 AAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCC:1 + chr2L 15956029 5' + Max-element 8262 2 52.48 AGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCT:2 + chr2R 12213931 5' + Transpac 42 2 68.32 GTGACACATTTGGCCTTGGCCTTATTTCAATTTAAAGGTACCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGG:1 + chr2R 8260546 5' - R1A1-element 4925 1 59.41 AGGAATGTTGTTGGCCTTTGTGGCTGCGTTTCTTCCCTAACAAAGTCATGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 4386534 5' + jockey 35 1 53.47 AACCAGTCTCCTTTTTTTGCCCATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATG:1 + chr2R 23261980 5' - accord 126 2 78.22 GAATACGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAAT:1 - chrX 1018164 5' + 1360 189 1 80.20 CGGCGGATGGGTTCTGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3R 27189254 5' + roo 24 2 54.46 CACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTTGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAGCAAGTCACCCTT:1 + chr2L 514850 5' + 3S18 23 2 49.49 AGCGGNAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 9692689 5' - P-element 2841 1 32.00 TGGCGAGATTTGACTTTGATGAAGGAATTAGCTTTTTTGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAAT:1 - chr2R 14457761 5' + mdg1 36 2 62.38 GCAAACTTGTGCAGAATTATGCATCCCCAACAGTGAGACTGATTCCACTTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCATCTTAAAGTA:1 + chrX 19097011 5' - roo 8982 2 55.45 CAACAGATTGACAATGCAAACATAAACAACGGCATGCGCTATAACAACACTATTAATAACCAAATACACGACAGCGCCACTCGGTCGGTTGGGCGGGAGG:1 + chr2L 5706318 5' + Cr1a 4420 1 68.00 GAGCATCTGCGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2L 13060344 5' - P-element 2867 1 59.41 TTTGTTGCTTTCGCTGCTGCCGAGTGGATTAGACCTCGCGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACAGATCGG:1 - chr3R 13851015 5' - F-element 4408 1 62.38 ACCCAGGCCGAAAACTCAAAGGCAAAGCAAACCGCACCCGCACCACCAGGCCGAAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAACAATTTGTATATTTGTTTAAAC:1 + chr3L 20704492 5' - Cr1a 167 1 49.50 CTCAACAAATACACTTTTGGATGTGAAGGAGAAGAATATAATATATATAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTAC:1 + chr3R 9952194 5' - Ivk 5334 1 53.47 GCGGGAGAGGAGGTGGGCGGCGGGGTGGAGCAAAAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCTCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTG:1 - chr2R 20997651 5' - Stalker4 7282 4 66.34 ATCCACTGCAAACAGGAAAATAATTACACCCTCTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 - chr3L 1078971 5' + I-element 44 1 67.00 CCACAGGGTTGCCATTTAGGGTTTCCGGCCCGGTGCTGGGTCAGCACTTTAACGTTATGATATTATATTTCGTTCGTGTTAACTACTCCCCCTTCAAGATT:1 + chr2R 17816282 5' - gypsy3 6559 1 52.48 GCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAGCTCACCTTGATATGACAAC:1 - chrX 329058 5' - opus 7450 2 77.23 TTTATATTTTCCTTTTTGTGCTCGGCGTTGCATACTTTTTGGGGTGCATTTGGGGATCGGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:2 + chr2R 16366755 5' - hobo 2921 1 65.35 CCCATATTCGTGAAAAGCTCAGAACGGAGACGATGGCGCAAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 + chr2L 6255741 5' - flea 247 2 72.28 AATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 9369942 5' + roo 8707 2 72.28 AAATCAAGACAAATAATAAAATATTGTCATTGAATCCATTTTTGGACGGCAATATGGAGATGATGGAGAATTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3R 19446854 5' - mdg1 7415 2 46.53 GTTCAAGATGTAAAATCTTTGGTATATATACCCGTTGATGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGATCCTGATGTCTAGCCGGCCAGGGATACCTTTGCAG:1 - chr2L 15957599 5' + Max-element 8196 1 60.40 CTGTGATAGTATCCATGAATCGAACTGATAAGTTCCTTGAGTCCTCGTTCATGCAATGTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2L 6177255 5' + pogo 16 1 63.37 CAATCTATATTTACGGGTTTTTCTTTTACTGCGCCATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3R 25553887 5' + Ivk 18 1 48.39 CCGTCCCTTACCAACGTTTCTCTACTAAGTTCTCCAGCCCCTTTCTCACAATGCACTGAGAGTAATTCAAATACCAATTAATATTATTATTATTAATATTA:1 - chr2L 17243693 5' - mdg1 7071 4 90.10 CGGGCNGCAAGTAAGGAACAAAATGCAAGTCGTCGTTGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTCTT:1 - chr3R 19959960 5' + F-element 373 1 63.37 AAACTNTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chrX 4488879 5' - 412 7503 2 66.34 GATTTAACGGCTTAACATCGCGACCGTCCCGCCTGTTCTGTCTTCAAACTAGCCAGAGTCACAATCCCCAACAATTTCGGGACCTTACGTTGGTCACAACC:1 + chr4 516357 5' - HB 232 1 70.30 ATATATATACAGTGAGCCAGCATACTTAAACTGGGTCAATTGCCGGCGTCGCTGCTGCAGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAG:1 + chr3R 9981482 5' + jockey 4777 1 59.41 ACAATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 10445178 5' - roo 392 2 62.38 TTAAGTTTCTTTCCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAA:1 + chr3L 13364540 5' - hopper 1377 1 59.41 AAGCCTAACAATTTTATGTTGATCTGTGATAACTGAAAACAAATATGAACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTA:1 + chr2R 24886319 5' + I-element 405 1 52.48 ATAATAAATGGCATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACC:1 - chr2R 14381370 5' + hobo 10 1 68.32 GAAAGAACGATTTGGGAATTTTAAAAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 7808514 5' + jockey 12 1 62.38 CAATTGTGGGTAAAAATTTGCATGCCAATGCCGATCCCGCCGCTCCCCATTTACTCCTCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGG:1 + chr3R 24890731 5' + roo 8872 2 63.37 TCAAAAGGCAATCCCCTTCAGCCAATTCCCTTCTTTTTTTTCATCTTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCT:1 - chrX 11282549 5' - I-element 5135 1 58.42 GTCCTTTCAGTGGAAGTGGGTGGTGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chrX 12538543 5' + roo 10 2 69.31 GAGTCTAACGAAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr2L 13837955 5' + 297 13 2 65.35 GTTCTGGGCCTTTTACAGGCAGTCGCTTAATGACGTAACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3R 18934938 5' + hobo 38 1 61.39 TACCTNCAACGAACGCAATAAAAGTAGATAGAGATACAAATTAAATAAAAATAATAAAACAAAGCAAATTAAATTTAATTAATAAAACTATTAATTTTATT:1 - chr2R 13302724 5' + TAHRE 62 1 44.55 TGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 7809041 5' + roo 8698 2 60.40 AACAANAATGATGTTGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 9862210 5' - roo 9040 1 60.40 AATACTTTATACGGCAAATAAGCAAAGGACATTCTTATAAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCC:1 + chr2L 17841016 5' + Juan 4036 1 55.45 TTGGAATCTGGAACTTTGTCAGCGGGACATTTGATAGTTACTAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGA:1 + chr2R 25049561 5' + copia 4855 1 74.26 CTTCTGATGATGTCGCCATCAGCATCTTCCGCCAGCTGAGCGGACTGCTCCTCGTTTTTTGTTTATATTTAGGCTTGAAAGTAAAGGATCCGATAAATCCA:1 - chr4 907716 5' - transib3 2396 1 63.37 TAATTAATTAAGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2L 1626516 5' - roo 394 1 63.37 CAACCCGCAAAAATTACACTTTCAACTGCAGGCTGGCAGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTAAGCAGTTTAGACCCTCTGG:1 - chr2L 10941155 5' - Quasimodo 339 2 60.00 GCTTGTTTATTTCCAGCCCAAAAAAGCTCTGAGAACACGCAAGAGCAGCTCCAGCAGCGAGGGAAGCACCTCGCATACAGAGCCGGACGAGATAAAGCGAA:1 - chrX 9961063 5' + G6 433 1 80.20 CTAGCTGTTACATTGGTTGTAGATTTAAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAA:1 + chr2L 8959893 5' + Ivk 5087 1 64.36 TACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCA:1 - chr2R 6869091 5' + springer 27 2 52.48 CTTTTCCTCGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTT:1 + chr3R 4973085 5' - 1360 28 1 55.45 AAAATNAATAAAAGAAACCTACATCTGACAAACTGTTGCCAAGGATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTTATAGCCGGGGAACTCGACTATAGCATTC:1 + chr3R 9504033 5' + INE-1 571 1 58.42 AACAGCAGCAATGACAAAAGCTGGCGTCATTAAGACGTGACAGAGCCAAGTACATCGAAAATACGAAACGCAGCAAAAAAAGAAAGAATGCTATAGTCCAG:1 + chr3L 18761659 5' - INE-1 577 1 72.28 GTAGGACATCTTGTCTGCTTGGAAAGCAGAGTGTAGTTAGGGTGCTGCTCATCTCTGTTACCGTTTTTGTTACTATTATTATTTTATTTGGCGGTCACTTT:1 - chr2R 8980778 5' - F-element 77 1 57.43 TTTTTGCTTACATTATTCTTTTGGGTTTTTTGTTTAGCTACGTAATTAGGTTTTGCAATTTATAAATTAATTTCTATGCGATTTGTGCAGTAGTATAAACA:1 + chr3L 9070340 5' + Cr1a 154 1 79.21 AGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr2R 24965076 5' - P-element 2844 1 37.62 ATTGTGCAGTGGCTCATTGCACTTCAAAACTATGACTTAGGAGTTGAAAGTAATCGAAACTAATCGAAACACTACGAATAAGAAGTGTCAGCTTCCCGCTG:1 + chrX 3428634 5' - gypsy 7093 2 63.37 TTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGAC:1 + chr3R 9254923 5' + F-element 225 1 58.16 GAAAGCAACGCACATAGTCTAAGCCAACCCGCTAAAAAAAAACCCATTTATTATAAGTTTTATCTGTTTAAACATAAAAAATATACAAATATACAATAATA:1 + chrX 15379981 5' + Stalker 96 4 77.23 TTCGATTTTGATGGAACACTGGACGATCTGTTCAGGGATTACATGCCAAATTAACAAATCAGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACT:1 - chr3L 9698971 5' - transib2 2499 1 61.39 CCGCAGGAGGATGCAGCTCAGCCATCTGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:1 + chr2L 20118666 5' + Max-element 8 2 71.29 GTTCGAGTTCTGACTAAAATAATGAGCTCGTTTTTCCATCTCGCAACATTTTTATGCTTTGTACTTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAA:1 + chr2L 4734388 5' - McClintock 6339 4 77.23 GCCATNGCAGGGCAACAAACATGGATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chrX 15195281 5' - Transpac 5183 2 76.24 GAACTCGCGTAGATTTTTTACGGTTCTTCATGGGACGAAGTCGCCTTAACACACCGCACCACAGCAGTTGCTAATTTATTGTGTAATTCTAGTTTTGA:1 + chr2R 11591541 5' - Porto1 4212 1 78.57 AATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAA:1 - chrX 5443966 5' - mdg1 401 2 58.42 CTGACACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr3L 9692658 5' - P-element 2871 1 63.37 AAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:1 + chr3L 2292069 5' + Max-element 22 2 49.50 CAAATGTTACGGCAAGTCTAAGATGCACCATTTGCAACTACGGTTGGACCAAAGAAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGCCTTAACGTTATTATTA:1 + chr2R 5529978 5' + 1360 303 1 54.46 GGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 + chr2R 5849989 5' + jockey 62 1 78.22 TGCATNAATGGAGCCCGTCTTACAATAGTTGTCCGTTCCCGCTCCCTGTTGCCCGGAATCCTGCCATCAGCACCTTTTACAATTAGGTCTCAAACTGAACT:1 + chr2L 1018107 5' - Idefix 7292 2 74.26 TCAGTGTGCCAACATCGCGGTGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chrX 6458193 5' + blood 7066 2 78.22 ATTTGGAGAAGTGGATGCGAACATAAGGAAATCTCCTCCACGAAGAATGTAGTTTTTAGATGTTATTTATTACTTTGATAATAATAATATTATTATTATTA:1 + chr2L 1645978 5' - mdg1 7077 6 87.13 TACATTAAAACATTTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGC:1 - chr2L 17889382 5' + accord 45 2 67.33 TAGAGGGGAATTTTCAGAATTAATCAAAGCGTAGAGAGGCCAATTGATGGCCGCTTATCAACGACTCTCGCTCGCATGCACACACACACATATACACACAT:1 - chrX 16508413 5' + accord 191 2 60.40 CCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAGACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 + chr3R 25633340 5' + Tirant 8148 2 65.35 GGCGTGGGGCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGG:1 - chr3L 5015887 5' + I-element 4936 1 61.39 CCGGAGTTTATCAGACAGTTACATAATTTTGCTAAATCATTAATAAGAAAAATCAATATCAAAAAATTTTTCCTTTCTAAGCACAATATTAATATTGAGAA:1 + chr2L 16628228 5' + Stalker 6785 2 66.34 GCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGA:1 - chr2R 6984399 5' - HMS-Beagle2 7168 2 55.45 CATGAACCCTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGG:1 + chr2L 18028665 5' + flea 4778 2 59.41 ACGAACAGATTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2R 4788793 5' - 297 6953 2 57.43 CAGTGAGCCAGCATACTTAAACTGGGTCAATTGCCGGCGTCGCTGCTGCAGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAACGTCTTA:1 + chr3R 9981491 5' + jockey 4786 1 50.50 GCAACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 9014498 5' + blood 7029 2 61.39 GACCCAATTGAATGAAATAGAATTCGCACTTCCTTTAAATTAAAATTGAAAATTAATCGAAATCAAATACGCGCGGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTG:1 - chr2L 15955118 5' - Quasimodo 7065 2 80.20 CCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chrX 19457165 5' - roo 9020 2 79.21 GTTTCGCTTTAATTTTCATTTCTTTAATTTTCCGATTCTTACAGAAACCAATGGCCAATAATACTAAATGTTTACTGGGCCCATAACCTATTCGTTTCAAG:1 - chr2L 3297587 5' - Dm88 186 1 58.42 CGACANTTTCTTTAAAAATACGTTTAAGCTGACTTATAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCG:1 + chrX 21388479 5' + 1360 5 2 71.29 CGCATACATTTTCATTGCCTTAATGTTGGCGTTTATTTGGTTTTGTACATTTTGATTTCTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCG:1 + chr3L 7807538 5' + jockey 215 1 62.38 GTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 14910574 5' + roo 8691 2 59.14 ATTGACTGACCAACTTCCCCATTTGATTCAACAGAAAAGACGGTAACACTTATACGTGTTATATGTGTTAAAGACCTTGTATATCTCTGTGAACAAGATAA:1 - chr3L 24916694 5' + Porto1 145 1 55.45 TTTTGTGGTCGTTAAACTCTCTCCTACTTTCTTGCCCAACCTCCCCTCAATGCCCAGAATTTTGGCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3L 7792159 5' + 412 12 2 67.00 CCCACCCCTACTGTTATTATTACTTTCTTCTGATTTGTATCTTCATCTTCTTAAACACTTTGCTGTCTTCATTTAAATATAATTTGTTTCTTTTCTTACAT:1 - chr3R 22474074 5' - Tirant 474 1 73.27 TCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:2 - chrX 14531544 5' + 412 48 2 77.23 AAATATACTTTTGTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:2 + chr3R 28755934 5' + 3S18 29 2 50.50 GATCGGGTGTGAGTCTGTATCTCACCAAAGCATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - 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Doc 4332 1 66.34 AGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 326124 5' - roo 9047 1 54.46 ATCCGTCGTCCGTCCGGTGAACCAAGTGACCTCTTCATTACCTCACGGCGATAATCTCGGACATGACCAGATCGACTCGGCTATTTCTCCTGATCAAGAAT:1 - chrX 15693522 5' - INE-1 86 1 52.48 TATTACTTGGCCTTGGTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 17122405 5' - roo 9048 2 56.44 CTCTTGATGGTTATGATCATCATGCAAATTAATAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 21500915 5' - roo 9050 2 55.00 TTCTAATTATACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 - chr2R 6869100 5' + springer 18 2 61.39 GCATCNGGTCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTT:1 - chr2L 11551430 5' + Max-element 7 2 71.29 ACTGATTTGTCGTCGTGCTGTATATTCCCTTATCTTAATTAGCCAATCAGCTAACCAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGG:1 + chr2R 13643987 5' + F-element 316 1 61.39 ACCCTAAATGGATCTGCTGAATACTACAACTATCGAGAGCACTGATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - 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chr3L 7989820 5' - mdg3 5479 2 60.40 TGTCAAATTACTAGTTCGCCAATAGGTTTCAGCTTCTGCTGACCCTCGTCAAAGGAGATCGGGAAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTGTTGAGCCTCCTT:1 - chr3L 22977785 5' - X-element 4481 1 78.22 AAACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chr3L 14240908 5' - Tirant 8486 2 59.41 AAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTT:1 - chr3R 4604452 5' + gypsy 7137 2 57.43 GGCGCAAAATTGGCTCAGCTGCATTTTTTGTGAAAGTTTTTTTCGGCATTTTCTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 18009546 5' + roo 18 2 61.39 GTTTTGTCTAGGGCGCCTTTTTGGGGGCGTGACCTGCTTGTAACGCACAATTTCACGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTG:1 + chr3L 4604313 5' + jockey 213 1 67.33 TGCAATACACAACATCAATATATTGTTAATCATTTTAGAACGATCGATTTGTTCGTTGTCTATTTTTTTTTTACTTTTTTACTTTATTATTCCACAAACAG:1 - chr2L 2965729 5' - Doc3-element 155 1 77.23 TTTTGGACGAATTTAACCGCCAAATGCCTCAACACACAAAATACAGATACCAGATAAGAATAAGATTGTTATATGATCCTCGAGAATGGAAAAAACCCCAA:1 - 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Ivk 268 1 76.24 GCTGCGTATGAGTAATGCGAGAAACGGTAGCGCGCTACGTATACGCCCGGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chrX 3327004 5' - hopper 1387 1 51.49 GCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr3R 9952227 5' + Ivk 50 1 77.00 GAAGGGTATTTTTCTGAAACATTTCTCTTATGGTTTTTTTTTTTATATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr2R 16898243 5' - Max-element 273 2 51.02 ATGGCCAAAATATCAGATGGCTATACCATTGGGTCCATCGATGCGTGCCTCAAGGAGGTGATGACCTGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCG:1 + chr3R 9568622 5' + F-element 4467 1 72.28 CTATTAGACAGGCGCAGATAGCTAAGTTACTTGATGCAAGTGCTCCGCTGATTTGGTTTGGTATATCTGCTGATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAG:1 + chrX 333631 5' - opus 351 2 76.24 GTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTATTGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 19215851 5' - roo 9028 1 68.32 GTACGTGCGGCCCAGTGCCTCCTGCACCTCGTCCGCCTGCTCAAACATATCAGCCATGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGAGGAGAGCTCTGCACACATTATA:1 + chr3L 17620578 5' + baggins 5226 1 60.40 ACAATCCAACATTCATTTATTATTTAAAACAAAAAAAAA:1 - 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chr3L 7808503 5' + jockey 23 1 51.49 ACCACAAATATGCATCGATCGATCCGCCGATCCCCATCCAGAGACTCTTGGCGGCCTTTTGCGGCCTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGT:1 + chr2R 14340705 5' - R1A1-element 5312 1 73.27 TGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chr2R 8378652 5' + pogo 48 1 77.23 GTGGAAAAAATTTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 6965703 5' - HMS-Beagle2 492 2 85.19 CCCCATCCTTCTTGGGGAATCCAATGGCAATACGGGGGATTTAACTTTCGAAAGTGTCGCCGAAGAATAGAAGAGCTCACTAAGTGTCACTATATATTTT:1 - chr3R 31037994 5' + TART-A 13335 1 92.00 CAAGAAAACAAACCGATTGAAAACTGGTTTTCCCTCGAGGGCAAAAGAGTGCCAAGGAAGGCCGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATG:1 - chr3R 30570302 5' + invader6 16 2 58.42 GAGAGAGAGAGAGAGGGAGAGAGAGAGTAAGGGAGTGGGAATAGGAGGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGC:1 - chrX 12649914 5' - G-element 245 1 58.42 CTTGAGAGTTAAAGATATGTTGCTAAGTATGCCAAGCAATTTTTTGAGATCTAATATTTAAAAAATTGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 4986379 5' - roo 401 1 76.24 GTTACAGTAAGCACACATCTAACGTATACTTTGGATGTATTTAATGGTAACGAAAACCAGAGAGAATGCCTTAATCGATTTTCCCGACTATCAGATACTCG:1 - chr3R 4357461 5' - INE-1 555 1 56.44 GCCTCATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTG:1 - chr3R 9952272 5' + Ivk 6 1 72.28 ATATAGTAAATCATAATAGATGCACTTGAGATCATATCTTACGTCATATTGAAGGGCAATAACTCCTCCCCTCTTAATTGACGCTTGTCCTCGAGCGGTCA:1 + chrX 11416823 5' - HMS-Beagle 6760 1 53.47 GTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCG:1 + chrX 23291023 5' - Stalker4 7335 4 54.46 CCGGGTGGCAGGATTGGCACGGGGGACCATGGCTGTGGATGGGAATTCCGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTA:1 - chr2R 12445967 5' - jockey 4671 1 59.41 AGTTGNCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAAT:1 - chr2R 5674747 5' - S-element 1702 1 69.31 GTCTGNGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2R 21379509 5' - P-element 2837 1 28.71 TTGGTCCGAAGCCACTTGCTCCAGAATGTAGACAACAAGTAACTTGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACC:1 + chr2L 15397138 5' + 297 6762 2 55.45 GACGANAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTT:1 + chr2R 12185335 5' - accord 7349 2 61.39 GGTATTTTACATCGATTACGGCAACACGGAGGAAATAAAGCGTGACGATATCAAGGCATTAATAATCCAATGTCTTCTCTGTGTGTTTGTGTGTGTGGCTG:1 + chr2R 21188739 5' - gypsy3 421 4 57.43 GAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 + chr3R 8198505 5' + Tirant 52 2 77.23 ATGTATAAGAATTCAATTAGTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTC:1 + chr2R 22441802 5' - mdg3 5469 2 57.43 AGAACNCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr2L 107979 5' - P-element 2872 1 63.37 TATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 + chr2L 21089169 5' - flea 4973 2 71.29 GAAAGCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3R 19114203 5' + 297 6622 2 76.24 AAAGGAGCCGGATATCCTAAAACAAACAGTTATATATGTGTATGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chrX 11585554 5' + pogo 29 1 62.38 GTAGCGCTGATAAATAAAATGTGAACTATACATGTACTTATCAAAGTTTGCAAAGTCATGCCATTCGCGATTGTATTACTCTAAGCCTATTGAACTGAGTC:1 - chr2R 8449684 5' - G5A 2466 1 54.46 AACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTG:1 - chr2R 6869066 5' + springer 32 2 70.37 GGGGGTGGGCGGAAGAGGATAATTGAGCTTCTGGTTTTTATAGTTTGCACGCTGATACGATGAGAAAGCAAAGGATATTCTACACACACACACACATACAC:1 - chrX 6317802 5' + Quasimodo 37 2 78.22 CTCATTCCTTCTGATGGATGTCATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 13081011 5' + 412 7076 2 56.44 ACATGTTGACCTTTTGCGATACGGAAACTCTCACGCGTGCCCTTAATTAGTCCCCTCAATTTTGTGACTTTAATGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1 + chr2L 13882517 5' + F-element 78 1 79.21 ACGATAAGGTGCTCAACTTTTACTTCCCATCGTGCGGCAAGGTGCCGCCACCCGTGATTATGGTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAA:1 - chrX 15707779 5' - Ivk 274 1 68.32 AAACTGAAATAAAAAACAAAAACAAGAGAGTGAATTTAACAATGTCGCGCGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACC:1 - chrX 14839055 5' + Transpac 297 2 57.43 ATGCTTATCCGCGACATTCCTGCCGCCCAAAGTGTCACTGTTGTCGATCATTTTTATGTTGCATGACCCTTACACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAG:1 + chr3R 8202776 5' + Cr1a 4194 1 60.40 CTTACGCTTAAGCTTCTTTATTTAAGGTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCG:1 - chrX 20880692 5' + invader4 2758 1 79.21 TGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr2L 5974413 5' + roo 8700 2 63.37 CTGGCCAAGAGGCAAAGCTTTCTAAGCCATCCAACAATGTTAAGTTAAGTGCCACACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 - chr3R 16510922 5' + flea 15 2 64.36 GAAAACTGGCTGGCAAAAAGCAAAAAGGCAAAAAGCGCACAAAAATCACGTCTGATCGCTATGACCGCAAAATTACAAGAGCGAAAGAAAGAATACAGTTC:1 + chr3L 1810366 5' - diver 85 2 62.38 AAAGAAACAGAGAAAAATAGAGAAGGTAAAGAGACTGATTGGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTC:1 + chrX 20803106 5' - Tirant 8185 2 59.41 GCTTTTGCAGACCGGCCACAGTTTTTTGAAGAATATTTAAAATTAATATGAATCCACAATTGTCGTTTCTATTTTCCATCTATTTTTTTTCTGTCTTTCTT:1 + chr2L 16335419 5' - transib2 2428 1 63.37 ATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3L 15035147 5' - pogo 2053 1 79.21 AAAATTCATGGGGTTTTTGGTCCCCGTTTGGCCCAGATATTTATATCTGTATCAGTTTTCCCACACATATAACAAATAGGATTTAAGATAAGCGTCAGCTT:1 - chrX 6151143 5' - X-element 4547 1 70.30 GAAATGAAAAGAGGCAGCTGGAGAGGCAGGCATAAAGTGGAGAATTATATATGAGGAGAGCTGGCAAAACAGTAACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAA:1 + chr2R 11550512 5' + Bica 429 1 38.61 AAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTT:1 + chr3R 19609639 5' - Tabor 466 2 57.43 ACATGCACATAATTTAAATAGAAGGAACGAACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTA:1 + chrX 17064766 5' - Tirant 352 2 72.28 CAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chrX 329071 5' - opus 460 2 66.34 CAAAAGAGTATTCAAAGGCAATTACTACAGGGTGCAGCAGCATAATTTCCTTTTTTCAGAACTCAATGAAAACTATTGTAGGCATCGGAAAATATTTATTT:1 + chr4 647499 5' - mariner2 839 1 75.25 ATTACACTTGTCCTTTCAGTGGAAGTGGGTGGTGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chrX 12538552 5' + roo 1 2 78.22 CGTATACGATGTATGTATATAGTGTACTCGCTCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr3R 21296499 5' + P-element 42 1 38.61 TGATGGATGCATTTACTCCTACTTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGACTTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr2L 609012 5' + FB 54 1 77.23 TTTTACGGTGCGTTCATATTGTTGTTTGCATTAGTTTGCAAGCAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAACATCTTTTGGTTCAAGCTGCACG:1 - chr2R 1264884 5' - hopper 481 1 63.00 TACTCAAATAAGATAATTTTTTTAAGTTCTTGTAATTATATATTATAGTGTATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGG:1 + chr3L 26719150 5' + Tc1-2 26 1 63.37 GTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 14910574 5' + roo 8699 2 62.38 GGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3L 21841321 5' - P-element 2830 1 22.77 CGATCNGAATAGTCGAGATTTGATGAGGGATATTTTCTGGATTGCGATGTTTTCACTCCGATCGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCATTG:1 + chr2L 21000834 5' - F-element 4335 1 52.48 AAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATT:1 + chr3R 9657707 5' + BS 33 1 71.11 TTCAGCCAAAGAATCTACGGGCTCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGGGGCCAGGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCGAGCTCT:1 - chrX 2354752 5' - R1A1-element 476 1 77.23 GAGCTTGTGTAAATATTGGTATTGCATATGAAATGCGTTCTGAGCTCGGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 + chr2R 23495430 5' - 412 7521 2 53.47 AAATCAGTTACGCTGGATGTAGATTTAATGGCCCTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTG:1 + chr3R 7379744 5' - HMS-Beagle2 210 4 66.34 ATATTATGCCTGGAAGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAA:1 - chr2R 5850031 5' - jockey 4962 1 49.50 ACCGTCGCACTCACAGGACTCAATAGTGTGTATATATATTGTATGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGTGGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 + chrX 7828859 5' - 412 485 2 70.30 TAGTGATAAAAAATTGGTTTTCGATGTACACGATTTTTTCGCCTTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGC:1 - chr2R 6253060 5' + 1360 108 1 73.27 ATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 - chrX 18353541 5' + jockey 56 1 72.28 ACACATGCGTTTTTTTTTTTAATATGGCATCTTGGGACCCGAAAAAGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chrX 14199960 5' - Rt1a 5087 5 82.35 GGAAATCGTAGTGCCTTGTTGATTTGCTTTTAATTTTGCATAAATATGCGCGATTCTTGGGATGTAGGGGGATGCTGGCCTGGAATTCAAATATGCTGAAA:1 - chr3R 8847661 5' - GATE 226 2 69.31 AACAATTTTCTATAGATTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTGA:1 - chrX 20549681 5' - R2-element 3584 2 97.44 TTTTTTAACAGAATTATCGATAGTCCCGCAGCTCCAGTGGCTTAGTGCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr3R 18906590 5' + P-element 28 1 51.49 GCGAAGCAAGTTAGCAAATCAGAGCGCCATGCGAAACATGCCCTTCAAGTTCTTGGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAA:1 - chr2L 13466206 5' + 1360 270 1 67.33 AAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 + chrX 23431796 5' + Stalker2 41 2 65.35 CATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATATATA:1 + chr2L 8740899 5' + Burdock 6179 2 69.89 GAGGCTGGCCTGAGGGTACTGAAAAGGCACGTGTTGAGCAACAGAATATCGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCGGTACCATGTCTCAAAA:1 - chrX 22563460 5' - Bari2 809 1 51.49 GGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAA:1 + chr3L 18576719 5' + springer 40 2 69.00 GCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 9369952 5' + roo 53 2 83.17 GGGGTAACCGGGGAATGAAAAGTGAATTCAAAACGGAAACATTGCAAAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAGG:1 - chr2L 7547722 5' + blood 475 1 53.47 GGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3L 13586747 5' - P-element 2829 1 20.41 TTCATCATTGAAAGAGTTAAGAATATGTGCAACAATGCAATTTTTTTTGGATTGACTTCTGAATATTGGCCTTTTGGCAAACGATAATCTATAGATTCCTA:1 - chr3R 4543173 5' + 3S18 441 1 68.32 CAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:2 + chr2R 17394644 5' + jockey 59 1 72.28 TTTGCAGTGTCAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGT:1 + chrX 21668039 5' - Stalker2 7645 2 73.27 AAGTATTTTTGTAAATATTTTCCATGTCGCCGAAAAGGAAAGCAAAATGAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACAGA:1 + chr2R 20701677 5' + Doc 4459 1 54.46 ATTCCTCATTTCGCACTCGACAATGATCCATTTATTTGCACTGTCAGCGATGGTGCGGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCA:1 - chr3L 5012867 5' - I-element 5027 1 62.38 GTCAACTAGGAACGCAATATGCTAAGTTACGTACATGTAAATCAACATTTACATTTACATACATTTACGTTATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGT:2 + chrX 17247250 5' + F-element 18 1 46.53 TTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTA:1 + chr3R 20466637 5' - roo 377 1 56.44 CGGCACCTAGTCCGGGCGGTGGCGCCACGAACTCCGCTCCCGCTCCGCCTTCATTTTGGGCGGATGTCGGCGTCTGACCCGTTGTTGATGTTTATGCTGCA:1 + chr2L 18137742 5' - ZAM 8062 2 54.46 TGCATGATTGATTGCTCACACATGCCCTTAAGATATCCTGTAACTGAGCGCTCCCCAGTTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTTAG:1 + chr2R 24644905 5' - Stalker4 310 4 71.29 CAGTCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCTGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAA:1 + chrX 10445564 5' - INE-1 531 1 68.32 GGGTGGGAAATTGTGCAAAAAGCTAAAAGGATCTCTGGGAAAATCGTGCACACTCACACTCACACACATTCCCTCACACACACACACACACACACACATTA:1 + chr2L 16389766 5' + accord 185 5 49.50 TTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr2R 13144984 5' - roo 352 2 81.19 AAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTT:1 + chr2R 12185327 5' - accord 7357 2 53.47 TATGGCGTTTTATTAAATCAAATTAATTGCTATATAAGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCA:1 - chrX 8976043 5' + jockey 284 1 63.37 AGAAGGTATTACATCAATACTCCACTTATTACTGAAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr2L 9946884 5' - roo 402 1 37.62 AATAATAAAGTAAAACACAAAAAAAACAAATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAATGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGC:1 + chrX 15189246 5' + Doc3-element 276 1 56.44 GACACCCGCGGAACGAAATATATGCGGCAAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr2L 15955353 5' + Quasimodo 6 2 74.26 GTATAAATTCTGGCAACAAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 + chr3R 15998058 5' + pogo 20 1 61.39 CTTTGTTTGAAATTGGCTTAAAGCCCTAAAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chrX 8948710 5' + blood 7014 2 74.26 GGATTGCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:2 + chr2R 9014408 5' - blood 7364 2 55.45 CAGGCAAGTCGAAATATCCTTTTTCGACTCAACCCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTTCTTCTCGCAAGGTATTCACCACTCCACGGTCCCGCGGTACTTC:1 - chr3L 4678124 5' + Max-element 8383 2 66.34 AAAGTTGTCCGATCTTCATGAGTGCTACAGCATTGAAAATGTAGTCCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAA:1 + chr4 1223632 5' + I-element 253 1 54.00 TACTTCATTTTATACTTTACTTAAGATTTCTTGAAACAAATAAAACCAAATACGTTTGTATTATTAAATGGTTCTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATT:1 + chr2R 2777421 5' - gypsy10 302 2 63.37 CAGCGGATCTTTGATCGTTTTGAAGAACTCCTGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTC:1 - chr3L 9707554 5' + Doc 286 1 68.32 CAAAAGAGAGATAAACAGCGATGACAATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAA:1 - chr3L 20248375 5' + Transpac 4948 2 51.49 ATTGGGAAACAACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 20437715 5' - roo 399 1 54.46 AGAATACTCTTCGCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2L 19642947 5' - roo 401 1 70.30 GTCAGACCAGCCCGTACTTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCCTGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chr2L 11065935 5' + P-element 31 1 48.00 CAGATTGCGGAATTTTTATTTCGGTGCTAGTTGTGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTC:1 - chr3L 5477268 5' + roo 445 1 66.34 CGTCACAATTCTCGATTTTGATCGAAGGCAATTCGAATAAATCCCGCTAACCACACGGCAGTAGATAGGGACAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACT:1 + chr3R 21969823 5' - R1A1-element 5329 1 47.52 AATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 - chr2R 1375137 5' - 297 349 2 74.26 ATTAGTACACTCGTACTATTTGCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCG:2 + chr2R 22997962 5' - Transpac 5192 2 66.34 ATTGANCTTCCCTGCGTAATCTTTACTAACAAATAGGGCAATGTCCTTGTGCTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACGCGCGAATGTT:1 + chr3R 2819684 5' - Q-element 557 2 59.41 TAAAAACCGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAACGAAAA:1 - chr3R 24609550 5' + Doc2-element 246 1 83.78 GTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGA:1 - chrX 22824218 5' - Gypsy12A_LTR 2243 1 52.48 AGTTTTCGCTCAGCGAATTTCGCGCTTTTCAGCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGC:1 - chr2R 21076791 5' + Doc 444 1 68.32 ATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 - chrX 14713267 5' + flea 4766 2 61.11 CCATTNATTTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTT:1 + chr2R 12779078 5' - roo 9053 2 57.43 AAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAAGAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTATTTTATTTCATCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATT:1 - chr3R 18424918 5' + 1360 3255 1 69.31 CACCANCACCAGCACATAAACCCACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 31644128 5' - roo 9049 2 54.46 CTTAATGGTTCCTAGTTGATACTAAACGGAAAGGAGCTAGGAGAAGGATGAAGGAGACGACGAAGAGTAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 10638697 5' - roo 400 1 47.52 ATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 15638233 5' + roo 39 2 65.35 AAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 14525249 5' + hobo 9 1 68.18 TTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chrX 5018698 5' - opus 462 2 62.38 TTCCACCAAAAAGTTAAGAAAAAACGCTGAAAAAGTCCATCATTGTCCCATTCGCATTTTTCACATTTTCCATTATAATTTTTGTATTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 6822330 5' - Doc2-element 251 1 69.31 AAACAAAACTTGATACATAGTTTCGAGTGTGTTCCTTGGAAAAAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:2 - 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chr2L 13060224 5' - Tirant 8081 1 36.63 CAAATTGCTGTCGGTCTAAATTTTGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr3R 21501017 5' + roo 8 2 70.30 GTTCAAAAAAAGACTTTGTTATTTTTATATATCTCGAACTGCATTTAGGTAAGAATTTTTTCGTGAAATCCTTCCATAATTAACGATTCCAGCTTTCAAAT:1 - chr2L 15636782 5' - FB 41 1 45.54 GTATAATTTTCCTCCAGCGAAACAAATGCTCCAGGTGCTGCACGCTCACACACAAGCGGACACGAATACATAGAACCTCACACACACACACACACAGATTC:1 - chr2L 4425977 5' + accord 185 2 60.40 TTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 17122430 5' - roo 359 2 74.26 CAATATGGATACGTTCTTAAAATAAACCCCGCTAAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGC:2 - chr3R 15943362 5' + jockey 4643 1 71.29 ATGGCCTCGAAGGGGCATTTCTGGGGAATTGAAAGCACGGGTTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr3L 8974052 5' + P-element 1 2 80.20 GCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:2 + chr3L 17122424 5' - roo 9029 1 68.32 CACTCGCAAGAGGATTCGAATTTCAGAAGATTAACGATGCAGCATCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr2R 23305391 5' + I-element 7 1 69.31 GTGAATCTCGATTGAAACTAAATTCGCAGCAGCGTCAGCGCAGCGGTTCACACAAACACATCGAAAAGGCGAGAGCGCACCACACACACACACACATAGTC:1 - chrX 2643018 5' + accord 185 2 57.43 GCCCCCTAACCGAAAACAGAAAACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3L 10035627 5' + jockey 37 1 54.46 AGCTTAGGCAGCAGCCGCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chrX 12538453 5' - roo 9039 1 56.44 ATATGNACCAATATGGATACGTTCTTAAAATAAACCCCGCTAAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATAT:1 - chr3R 15943370 5' + jockey 4635 1 78.22 CCACACATTGTTCGACCTCATTTCGGGTGACAAAATTAGTTTTTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTAT:1 + chrX 13005174 5' - mdg1 7067 2 62.38 TTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr3L 9925280 5' + Doc 55 1 76.24 CGAAAAAAATCGCATATCTGCGTATGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3R 15998126 5' - pogo 2053 1 76.24 GGATTATTTTTGCATATTTTTTTTTCTTTTTTTTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTACGAGCGGCGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGA:1 - chr3R 29269796 5' - Cr1a 4222 1 65.00 GAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 25633328 5' + Tirant 8136 2 55.45 GTTGCGACGTCGACTGCGGCAGCGACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 - chr3L 9692743 5' + P-element 29 1 46.53 GAACANTTGTAGGGCCGTTCATCCGAGTGGCGTCGTCGGTGCTTCGCCAGGTTATTGTTGTCCGAAAAAGTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGA:1 - chr3R 9628495 5' + R1A1-element 5093 1 70.30 TCAGACTGAATGCAACAAAAAATTTGCAGTTAGACAATAATCTTCAAACAGATGTCATCTACACTGATTTTAATAAAGCATTTGACTCTGTCAATCATTAG:1 + chr3L 23401278 5' + Q-element 330 2 65.35 GTGTGACCAGGTGGGTCCTACTTTGCACTCTTGGATTCAAGTGCATTCGCTCTTGGATATCTAATGCTTTTGTTTTTTCGGGATTGCGAGTCCGAGCTTTG:1 - chr2L 16201708 5' - Idefix 7075 2 77.23 ACAGAGAATTAACATTCCAAATCGAATTGGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chrX 13548720 5' + blood 7014 2 70.41 GCACATAACCCAGAGAAGGCAACAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTA:1 + chr2L 2797627 5' + Juan 4142 1 77.23 CTGGGGGGCCACGCCATCGGAGATCGACATATAAATTTAAGTGATGGGGAATTGATTAAAACACTTTTTAAAACTAACTT:1 - chr3L 12071999 5' - pogo 1893 1 72.50 TGTATGGTCTTTTGTGAAAGGCTTCCCATTTCCAATGCATTTTTAATGCTTTGTTTTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3L 21735360 5' + Doc 6 1 76.24 CCACCGGCAAGAAAGGAGATGCCATTCATGCCCTTCAGCCCCTCCTATCATCCTTAATAATGGTTAATTGATTTTGATCAATGAAAATAATTT:1 - chr2L 18427907 5' + Quasimodo 7332 2 79.57 GCTGAAAATCCTCCTGGAAAATATTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGCAAATTGGATTGAGGAGAAGCCTCAGTA:1 + chr2R 9564341 5' - 297 242 2 80.20 GAAATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTCTAACATAGC:1 - chr2L 16082670 5' + Stalker 38 4 58.42 TCCCATGCCAACGAAAGTCAAAGTCACAAATAATGAGCACAAATTCCGCTGTTTATATTAATGCTCGTCACTAAAAAAGTGTCTGCATAGTGCCAAACCAA:1 - chr3L 9252698 5' + 1360 3349 1 72.28 GATAATAGCATTGAGCGTTTTGCCATTTTCTGCCACACAATTTTTTGTAATCTACCTTATCTCTGTCTACAGTATTGTAGCTGTGACACTCTTGTTCATC:1 + chr2R 11717687 5' + Circe 121 1 56.00 TTTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGA:2 + chr2R 12779085 5' - roo 9046 1 51.49 TATCGATTCAACAATTCAATGAAAAAGTCATCCTACAATATAGCATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTA:1 - chr3R 21848173 5' + rover 24 2 61.39 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chrX 14317415 5' + 1360 27 1 54.46 CTCTCNTGTGAAGCGCCCGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGA:1 + chr3R 9512368 5' + P-element 421 1 24.75 CTACGGCTGATGGTGATTAATGGGATCTGCAATTAATAGGATCAGCTTCATCCATGTAGAAAGTGATATTACCCTGTGCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAA:1 - chr2L 11192389 5' + TAHRE 10235 1 46.53 CTATTGATAATAATACTAAAAGTTATGAAAAGTATTCACCTTGTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCG:1 - chr3R 10971948 5' + BS 5029 1 59.41 CTCATTCCTTCTGATGGATGTCATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr3L 13081011 5' + 412 7072 2 58.76 TACCAAACGGCATGCCCCGCCACCGGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3R 25818796 5' - mdg1 414 2 70.00 AGTCACAAAGGCAAAATCGACCTGGTTCCAATACCTCATAAATCGAGATAAACTGGCGGCGATTTTAATTCTCAACAGCTATTGAAA:1 + chrX 10027351 5' + diver2 346 2 67.82 TATAGAAATTTTCATTTATGAATGAAACTAATTAAGGACGAATTTTTCTTTATTATAGATAAAAATAGGTGCATATTTTCTCGACTATTAGATACCCGTTA:1 + chr2L 7887657 5' - INE-1 552 1 52.48 AATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 + chrX 13548760 5' + blood 46 2 72.28 GATTTATCTTGATTCCAATGGGCCAGATACCACCAATCCTAGGTACGACGGTGGGTGGTCGCGCTCTAGTGATCAACTATTATAATTCTCCCTAACATTTT:1 + chr2L 11467578 5' + jockey 4865 1 63.37 ATCCGCAAACTGGATATGTTCTAGTAAATAGAACATTTTGGAAAAGGTCCAAACTTAGGGAAAACCTTAAACTCCTCCTGTACAAGACCATCCTGAAGCCA:1 + chrX 21284209 5' + G-element 3886 1 59.41 CTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 + chrX 21396687 5' + F-element 65 1 79.21 GGAGTTCTTCGACGCAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGA:1 - chr3R 11165707 5' - Tabor 7292 2 55.45 ATGTTCACCAAAAGCGGATGTCTACTGAAAAATTCCAATTGAATCGATTTAGAGACTCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAAT:1 - chr2L 10126594 5' + mdg1 21 2 58.42 ACTAATTTGAAAATATTTTCGGTGTGAAAAGTGTTGTGGGTTGGATAACTTGCACACATAAGTTCAAGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCT:1 + chrX 19201032 5' + 1360 212 1 64.36 CTGGAATAGTGATGCAAAATAAGCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 11435559 5' - roo 398 1 56.44 TTTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTG:1 + chr3R 17733253 5' - INE-1 541 1 80.20 ACACGCACTTAATCGACACCCTACGGATAGTTTTCTACGGCATCAAGAAACAAGTGTGCCCAGATGGCTTTTAAAACCTGAGTAGCCAAAAATGATTTGTT:1 - chr3L 25354260 5' + Cr1a 492 1 72.28 CGCACGTAATTGGGCTGAACTTTCGGTTGGTCCGATTTTATGCGATTTTCCTCGATTTTCCGCACCCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACC:1 + chr2R 22279882 5' + F-element 288 1 69.31 GCCAANCAAAGTGTATGATGGTGGTCGTGTATGTGTGTGTGAGAGTGGGCACTGAGGCCTATATACATACAGCTGTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCTTT:1 - chr2R 21597740 5' - HB 1619 1 57.43 TATGTATATTCTGTGTGGCACAGCCAGGAAAAGAGAAAGAGACCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGGAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAA:1 + chrX 10089007 5' + FB 34 1 60.40 AATCGGCAATTTCTTTAAAAATACGTTTAAGCTGACTTATAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGAT:1 + chrX 21388476 5' + 1360 2 2 74.26 TTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chrX 10251790 5' - flea 211 2 78.22 TTTGACAGGTTCTATTATGTTCTGTGAGTGTCTCAACTTTTCTCTGTACAATTGGATATGTGTACAAAAAAGAACGGAAAAATAACGGTATGGATGCACAA:1 + chr2R 9576603 5' - rover 7075 2 62.38 TATGTTTCGGCATATAAAAAATTTTCCATTTATGGTAATTATTCTAGTCGCTGCGTCTTTATCTCTAGAATATGTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTT:1 - chr2L 20530479 5' - INE-1 166 1 52.48 CAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACG:1 + chr3R 7993850 5' + Doc 14 1 61.70 AATGGAGTACACACAGTTTGAAGCCAGGGTCAGAGGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTCAGCTGCGTT:1 - chrX 21038610 5' - Quasimodo 235 2 65.00 ATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2R 13122071 5' - opus 7460 2 70.30 GATAAATGAGAGCTATAAATGTAAACGAGAAACTATAGGTTAAAGTAGAAGTATTTCAACACTTTTTTTAAACAGCTAAATGTTGACACCACTTGCTAAAT:1 + chr3L 14600127 5' + hopper2 1264 2 71.29 ACTGCAACTCGTAGACAATATAAATTCGTTTATCGTTCCAGAAGACTATGTTGAGACTTATTTGCATGACTTGCTGTTGAGGATGGAAGCAACAAGC:1 - chr2R 2932369 5' - G2 234 2 65.98 CGTGTTGAGCAACAGAATATCGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCGGTACCATGTCTCAAAATCCATAGTATCTTGAACAGCCCCAGAACA:1 - chrX 22563431 5' - Bari2 780 1 74.26 CTTTTCTCTCTAGCATAAATTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGAC:1 - chr3R 14095017 5' + Doc 13 1 72.28 ATGGTCTGTAGGTTAGGTTTATCACCGGACTTCCGATGTTCGGTGAATCATGCAGACGAACCAGTTTACTATATAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATA:1 + chr2R 17682353 5' + Doc 4454 1 73.00 CTTCACAGCCTTTTGCGAATCTTCGGCGAAGACTTGCCGTTTTTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTT:1 + chr2L 3527739 5' - F-element 89 1 57.43 TTAGTTAGGAAGATTAAGCTGAATTTAGTTTCGCGAGCTATGTGCTCTTCATTATTAAATTGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACTCAACAACGG:1 - chr3L 27366588 5' + gypsy6 254 2 58.42 GCAGATCTGTGGGCACGGAAAATGCCTTCGATGCCCGGACACACACACACACACACACACTGCCTACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3L 7314766 5' + hopper 8 2 67.33 TGGGTACTTGATAATTGGTAGTTTAAATGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 + chr2R 19461356 5' + TART-B 10199 1 77.23 ATTAAACATAAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 + chr3R 20845038 5' + 17.6 6949 1 58.42 GTTCTTACCGCCTTATTTTCTGTGTACCAATTATGGTTTAGATTATATATATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chr3L 11848399 5' - 297 371 2 58.42 AGACGGGAACACAGCAACTAGCGCTGAGAGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATGCAACCTACAAAA:1 - chr3R 6147344 5' + copia 8 2 68.69 GTTACAGCAGAGCATCTGCGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2L 13060353 5' - P-element 2876 1 68.32 CTAATATAAAATGGTATGTATTAATATAAAGTATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCG:1 + chr2R 21712740 5' + I-element 226 1 58.42 AATTGGTCACATTGCTTTTGTGCACCGCGTGAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATAAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAATCT:1 - chr2R 3918731 5' + INE-1 150 1 69.31 ACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3L 9772274 5' + 297 31 2 71.29 AACATGAGTCAGACAGGCAAGCAAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGA:1 + chr2R 9408157 5' + FB 10 1 67.33 CGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chr2R 24493662 5' + flea 26 2 54.46 ATTACATTACTTTAACATTTTCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:3 + chr3R 9479435 5' - mdg1 7435 2 49.50 GGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCG:1 + chr3L 26852646 5' + 1360 44 1 63.37 CCTGCCGCACCAGCACCAGCACATAAACCCACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 31644121 5' - roo 393 1 62.38 TCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTACTG:1 + chr2L 18177044 5' - INE-1 541 1 68.32 AATAAAATGCGCTCCACGCCCCGGGAAAAAAAGAAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAGAAAAAAAA:1 + chr3R 24606826 5' + R2-element 3585 8 53.85 CTCAGACGAAGAAGAGCTTAGGGAAAATGAGTAGCCAAAAAAAGGTTGAACTCCTCAGTTAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAA:1 - chrX 9825684 5' - Transpac 5094 2 59.41 CAACGTAATCACTTAATCATAATTAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 - chrX 12857901 5' + 297 6608 2 57.43 TGCATACATTAATGTTGAAATTGTATTTATTATTAACTACCTTGTTTATTTACACACGTACTAGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGG:1 - chr3R 16799802 5' + X-element 4637 1 45.54 TAAAAAACCATAACTTTTGTAAAACTTTATCCACTTACCGCTGGAATAATCCTTCGGTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTG:1 + chrX 19344867 5' - Tabor 126 2 58.42 TTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGT:1 + chr2R 9014418 5' - blood 7354 2 59.41 AATCTATTTATGTATTAAAATTTATTAATTTGGTCCTGTTCTTTCAGGTTAGTAAATGTCATAGCGGCGCGCTAGTTTTACCGTTCAAGAGGGGCTACTGC:1 + chrX 21668795 5' + mariner2 79 1 58.42 CTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chrX 12294743 5' + blood 7060 2 75.25 TAGTATTTTTAGATATCTTTTTATTTTGGATTTTGTATATTTACTTATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTA:1 + chr3L 16345536 5' + 297 22 2 60.40 GTATATAGTGTACTCGCTCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3R 21296513 5' + P-element 56 1 24.75 TTTTTGAATTAATTGTATTATTTGTTATTTTGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCT:1 + chr2L 15940318 5' - jockey 4608 1 69.31 GGCCCAATTAAGATGTCAAATCAACACGTTTTGTTTATTAACTGATTGCACACACACACAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTTGAGGC:1 - chr2L 4033894 5' + BS3 1443 1 57.43 TTAGCATGCAATTAGTTGCAGAAAGCAGCCAAAACGAAACGGAAAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 7808938 5' - roo 396 1 46.53 CAAAACAAAAACGGCAATTGCAACATTTTATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACTCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAA:1 + chrX 12669933 5' - 1360 3209 1 71.29 AGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 3188743 5' - 1360 3353 1 63.37 ATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATC:1 + chr3R 27080716 5' - HMS-Beagle 202 2 52.48 CCAAAGCCAAGTCAGGCATAATAAAAAATTGATTTTATCATTGCATTATTATTATTATTATTATGTTAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chr3R 16626844 5' - I-element 5322 1 63.37 CGCACTTAAGCTTGCTTTTCCATCATCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATT:1 - chr2R 23841112 5' - hobo 282 1 74.26 CAGCCTCCAGTCGATCTGTATATTAAGATATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTG:1 - chr2L 22718661 5' + 1360 453 1 78.22 GATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr2R 5849963 5' + jockey 21 1 59.77 TATGCGGCCCTTCGACTTCCGGTTGGCATGGCGGCATTTTTAGCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAAGGAGT:1 - chr2R 9739260 5' + GATE 8309 2 61.39 AAAATTTAACATTTTATTAATAGCTATTGATATAGACAAAGACGCAGGGCATAATTGTTTACCCATGTTGCCACGCCCGCTGTTGTAATTTATAATTTATA:1 - chr3L 23263707 5' - copia 256 1 79.21 CACTTCCTCCTCCTCATCCTTCTCATCGTTGCAAACTGAAGGCTCGTGCCGCAAAAGGAATCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTAAAAA:1 + chrX 9289664 5' + INE-1 146 1 57.43 CAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2L 903828 5' + 1360 48 1 74.26 TTAAACAAGTACGTATTAAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 12136355 5' - roo 9054 2 61.39 GGCCAGTTAGGTGCGATTTTTCCGGCACGTGCCTGTTGACTTGCTCCTGGAATACCTTTTTGCCGATATTTTCAACGGCAAGCATGTACCCGAATTGCTAC:1 + chr3L 6437214 5' + R1A1-element 5161 1 74.26 ATGTAAGGTCTATGAAAAATGTAGTAGTAGTAGCCTCAAATATGTAAACATCCCTAATTTTTTGTACATTATTCCATTTTTTAAATAAAATATTTTTAAAG:1 + chr2L 18603555 5' + hopper 167 1 71.29 CGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGAGCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGG:1 - chr3L 23678155 5' + Osvaldo 16 2 69.70 CTTCCCATTTCCAATGCATTTTTAATGCTTTGTTTTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 21735381 5' + Doc 8 1 68.29 TAAGTAGGCAATATAAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chrX 10251712 5' + flea 9 2 70.00 GCTATTCGGGGCTTTCGCCTGGAGATGGGGTGGTTTGCCGTTGCTATTATTATTTCCTATATGCTATAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr3L 21319331 5' + jockey 4678 1 71.88 CGCACACACACTTTCGCAGGAGTTCGTGGCATATACCAACAACACGCTGCCTAATCACCTTGCTCCAATCCGGCCATTTCCCATTACGGC:1 + chr3R 25137640 5' - accord2 260 1 77.78 AATGCTTTATTTTGTTCCCATAAAAATGAGATAATCTTAACCTCGGACTTGCAACACTTTTTTTCGACTTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCT:1 + chr3R 31369280 5' - Transpac 5224 2 77.23 AAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 14910579 5' + roo 8704 2 67.33 ATAGGGCTGCATGTAAATAGTAATCCTGTCCGGGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTC:1 + chr3L 18576687 5' + gypsy3 8 4 71.00 AAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:2 - chr3R 28728346 5' + jockey 32 1 53.47 TCGTGTAAGTCAGGATTTAAAGTACTACGAATATATTAACTTCATCTTATTTGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTT:1 - chr3R 22530853 5' + Juan 3975 1 53.47 GGTAGCGTTCCATTCGCGATTGTTTTCTATTCCTTTTCACTTGTTCACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr2R 21114692 5' + jockey 37 1 55.45 TCATTCATGTTATTAAATTTGAAAATAAATATATCGAAAAAATTGTTAACTTAATTTTTTGTTTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 + chr2R 16744099 5' - opus 490 2 59.41 ATGTAATGGGACATGGGATGCAGCTTTCGTTCCTCCTCGATCTTCTCCTTCTTAATGCTAATGGGAAATGGCCGGATCGGAGCAAGGTGATTAGGCGGCGT:1 - chr3L 17434031 5' + accord2 285 1 64.36 GAAACGTTCGTTTTCCTCGTTCTCCTGCTCCGCGCACATATACATATTTTTCTCATTTGTTTATTTTTATTTGTATTTGTACTTAAGTCTTATTTCATTTT:1 + chr2L 20390623 5' - Tc1-2 390 1 53.47 CGTAANTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 - chr3R 26469490 5' + hobo 47 1 74.26 CTTATGGGCTGTACAATAAATTTGGTATGAAATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAA:1 - chr3R 19114286 5' - 297 6965 2 69.31 CGAAAACTTTGGGTGGTACTGTTACCGTTTATTTTGGGTACTTGATAATTGGTAGTTTAAATGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 + chr2R 19461322 5' - S-element 1704 1 68.32 GAAAATTATCTGAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTC:1 - chr3L 4048534 5' + 3S18 5782 2 63.37 AGCACCGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr2L 487138 5' - P-element 2854 1 45.54 TTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCG:1 + chr2L 20928065 5' + Chimpo 2 1 64.56 ATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 + chr3L 2800136 5' - blood 344 2 59.41 TTAATGTAAGTTTTATGATAAAATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAATAA:1 - chr2L 17459754 5' + Doc 4585 1 78.22 ATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAA:1 - chr3R 21695492 5' - 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chr3R 24574246 5' - Tc1 5 1 83.17 GAAATACAAGTTAAATATTTGAGCAGCCCAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chr3L 2800232 5' + blood 7014 2 76.00 ATAACGCCTAGTCATTTATTGTTTGCTGTGTCACCCCAAATCGCTAATGGCAAAGTAATTGAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCACAGCTGTGACAA:1 + chrX 4361679 5' + gypsy4 421 2 64.36 AAAGGCTATCGCCGTGCCCTTTTGCACACACACACACACACACA:1 - chr2R 16469385 5' + accord 182 2 77.27 TATAAACGCATATAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGGATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 18881492 5' + roo 8686 2 54.08 TAGAAACAATAACAATTTTTGCAAGCATACCATACAATATGATAATGTTACCTGTCCTAATTACTGTCAAAAGCCTAAGTTTACAAAATACTAACTACTTT:1 - chr3R 18461138 5' + TAHRE 10258 1 73.27 TAATTTCCGAATGTCCTCCGTTCTTCTTCTTATAAATTTTATCTTACTTTGACCACTGTCTACGAGACACCCAAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTA:1 - chr3R 19446411 5' - hobo 240 1 54.46 GACGAGACAACCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 9370017 5' - roo 398 1 68.04 ATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATA:1 + chr2R 1320684 5' - diver2 344 2 50.50 CGTTATGATGGCCTCATTGTCATTGTGGTAGAAGTGAAGGTGGAAGTGCTGGAGAAAGTGATGATGGAAAGTAATCAAAATTTAACAAAATTAAAAATATT:1 - chr3R 13311479 5' - Ivk 5369 1 58.42 CAAATATGTGGAAGAAATAGAATACAATCAGTGATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTAT:1 + chrX 17204074 5' - Tabor 462 2 59.41 TCTGAAGAATGTTGATTTTTCGATTTTTTTAAGATTATAGCCTCATATTTTTAAAGTTTATTTTTAATTTAAATATTGTATAATTCATAACCGTCTTCCTC:1 + chrX 10930028 5' + hopper 212 1 67.33 GAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 - chr3R 7522355 5' - blood 7342 2 73.27 AAGTGGCATATGGACAAGTCGATTTCCTCGAGGGTTGACTTCGGGAATTATCCGAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATA:1 - chr2L 16386137 5' + P-element 462 1 60.40 GGTATTAGTATAATAGTAGAATAGAGTTGTCCAATCTTCTACAGAAAAGGAAGACTTAAATATATTGAGCAATGAATAAATCTAAGTAATAAAAACATAAT:1 - chrX 19882609 5' - hobo 2487 1 81.19 GCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2R 16366826 5' + hobo 41 1 62.38 AAATCTACATGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCT:1 + chrX 329008 5' + opus 7149 4 64.36 TTTAAATTGAAAGTTGCAGAGGAATTTCTTGTACGAATTATATTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chrX 22676355 5' + 297 6604 2 58.70 AGAAATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTG:1 - 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ZAM 454 1 77.53 GAAATCTGTGAAAATAAATTTATCAAAACGACAAAAAAAGATTCAGATGGGCGATACATTGTGTCAATTCCATCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCAA:1 + chr3R 19444957 5' - R1A1-element 134 1 72.28 GCACAGCTGTGGTACCGTTGAACAAAAGACACTAGAATAACAAAATGCGTAA:1 - chr4 908994 5' - 1360 3381 2 88.46 CTGACATGCAAAAAATGTTTGAATGAAAAGTAATTTTTGAAAATTATTTTGTGATAATATGTACATAGATTCGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATA:1 - chr3R 9150937 5' - 1360 320 1 74.26 CCGCTTCTGTTGCCATATGCCGCATCGTTTTGATCTTGTGTTTTCGTGCACAGTGGTCTGATTTTAGATAAACATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTT:1 + chr3R 14186289 5' + Cr1a 441 1 74.26 ACTAANATACATAACTGTTCTTTAAGGGGCTCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chr3L 5975569 5' + hobo 9 1 70.30 AACAACAAGAAATTAATAATAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chrX 12546526 5' - P-element 2882 2 74.26 GGGTAACGGGCATAATTAAAGATGAAAGGATATCTTTAAAACTACATATCTTGAGGCGTATTATATATTCATACAATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTA:1 - chr3L 10116136 5' + I-element 232 1 49.50 CAACTTATAACTAAAAAGATACATACTTTCTCAACATCGGAATCATCATCTGATCACAAGCTTCCCCCTTCGACACGCTGATAACTGGCGCAGCCGGTAGG:1 + chr2L 23286581 5' + Tirant 413 1 54.46 TAGGTGCAGGTTTTTGTTGTTAGAGACTTATCGCTGATTCGGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCA:1 - chr3R 31813429 5' - roo 8826 2 59.41 ATCCACGCCGCCTGGCAGGCTTTAGTCCGTGTCGATGTGATTTGGTAGGACACGCCGGTGGCCACCAGTGAGGAGGGTTCCTTTGCCGTTGAGGCCTACTT:1 - chr3R 25483465 5' + mariner2 159 1 72.28 TCACTCACCGTTCGAGATATAGGAGTTGGAAAAAAGGCGAAGAATATCCGAGGAAACAGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGA:1 - chr3R 17230168 5' + X-element 4526 1 59.41 GCGATCCGCACGCCGCCGCTTCTTTTGGTGCTCCTCGACCAGCTCCGAGGTGCGAATCTTGTTGCCCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAG:1 + chrX 10384337 5' + F-element 476 1 70.30 AGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2R 9014492 5' + blood 16 2 60.22 CGTGGGAGGACAGAAAGACAATGTTTTACTAGACGTAGTGCGAAAAACAAAAAGAACCGTTATATTGAGAGAGTAAAAATTTCTTGCTCAGAGAGACAACA:1 - chr4 685458 5' - Tc1 116 1 59.41 TTTTGTTCCCAACGTAATTGCTCAATTAAAGTCAGCAAGAGTAATTGCCTACTGTAGCTCGTAGATACTCGTACTTTTGTGCCTTTGCAGTTTGCTTTTGC:1 + chr3R 7516754 5' - Transib5 211 1 54.46 ACTGATGCTGACGCTGACCAATTCTTATAAGAAAAGCCCCGGAAAAGTGGGGAAAACCGGGAAGCAGAACACACAGCTCCAAATAAGAAAAAAAAATAAAA:1 - chrX 8661618 5' + Rt1b 5147 1 63.37 ATTTTCTTGGGAAAAGTTTCGAAACATTGAACTTCCAGTGCAAACTTGGAAACTTAGTTGTTTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTGTTATTATTTTTTT:1 - chr2R 12397347 5' + S2 1573 2 63.37 AATTATTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATC:1 - chr2R 10863953 5' - mdg3 5455 2 71.29 TACTATTTATATATGCTATAATATGAGAGAAAAAACCAACAGATGAATTTTAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGTACTTCGTGCTTC:1 + chr3L 9907039 5' + 1360 470 1 59.14 AATTGAAATTGTGCCGTTTGATGTGAAAATACTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAA:1 + chr2L 16933604 5' - 3S18 6061 2 67.33 GAAGGGGCAGGTAGCAGTAGTCAAATATTCACATATTCCCGAATATCAACCCTCTACTATTTTTTTTGTGATTGATATTTTAAAGCTGCTTTCATTTTTTA:1 - chrX 4968342 5' + transib4 61 1 62.38 ACTAAGTGGCTGCCTAGAACTTTTTGGCCTAGCAACAAACTTTATTGTCACCCAATACCTCGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 + chr2R 7255779 5' - 297 6964 2 61.39 AGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCCTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr3R 14094983 5' + Doc 47 1 70.30 AGGCAAATAAAATCAAGCTGAATAACACAGAAGAGTCAATCAATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAA:1 - chr2L 18028764 5' - flea 5001 2 70.30 GCTGTGCTAATTTTTTGTAAATAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTAATGATATGACTATCATATTTGCTGAGGAGACCCTTCGCTATT:1 - chr3R 13884054 5' - R2-element 3231 1 78.22 ACAGCAGCAGTAGCACCACCGAAGAAAATGAATACACCACCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCAC:1 + chr3L 9609448 5' - R1A1-element 32 1 65.35 TGCATAGTCGGCTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAAT:1 - chr3L 6129875 5' + jockey 4699 1 54.46 TAATGAAAACTAAAATTATATTACGCCTGTCATGTTCACAGGCCAATAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTG:1 - chr3R 9904472 5' - roo 8594 1 54.00 AAAGATATAATGCAATTTAAGGAGATTCAAGCCCAATTTAAATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAG:1 - chr3R 24282046 5' + Max-element 5 2 75.25 TTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCAT:1 + chr2L 8740886 5' + Burdock 38 2 64.36 AAGCTGTTTTGGTTTTATAAATTTATGGGAATTTAATAACTAAAAAATCAAAAAAATTTTTTTTT:1 - chrX 3818130 5' + HB 328 1 72.31 CTGATGGATGTCATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3L 13081001 5' + 412 7086 2 58.42 AGAGTCCTTATACCCTTGTGAGCGTTAGTTTAGTGTGCCGTAGATCTCCCAGTTCCATGATGGTGTTGGTAACATTGGTGTTACTACTAGTTGTCAACTTC:1 - chr4 1180237 5' - jockey2 244 1 67.33 AAGCGAACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr3R 27080696 5' - HMS-Beagle 7018 2 72.28 AATTTTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr2R 8378599 5' - pogo 2066 1 65.35 TGCCACACCAGCTGTGTTGTGGCAGCATTCTCATGCAAATAAAAACGCCTTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAG:1 - chrX 15849094 5' + 297 191 2 58.59 TGAAAGTTGGGCAGTAAAAAGATCGTCAAGCTGAAAGTTGTCGTGTCCGGAGTAAGGTAGTCGCCGTATGTCCAGATGGGTTTCAGCACGGTATTGTAGAG:1 - chr2L 23349290 5' - Doc2-element 4336 1 62.38 ATTTTAAATCTCATTACCAATTTAAGGGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCTCAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAA:1 + chrX 3620479 5' - copia 4986 2 75.25 ATTATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACAC:1 - 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BS 5072 1 66.34 AATATGTTTCATATATTTCTGTGATGCCTTAATTTCTTCTCATGGTCGGATACCTTAATGCAATGACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATAT:1 + chr3R 16626763 5' + I-element 5268 1 66.34 ACACACAGATACGCGGTACGACCAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGG:1 + chr2R 18357018 5' - blood 105 2 76.77 ATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:2 - chrX 3649736 5' + jockey 37 1 56.44 CATGTATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACA:1 - chr3L 19881825 5' + Idefix 32 2 70.30 GAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr2L 2437728 5' + roo 8716 2 79.21 AAAAAGTGAGTATGAAAACAAATAGTCTACAGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3L 9858321 5' - pogo 2060 1 68.32 CCGGTGCTACCGGATCCGTGACGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGT:1 + chr2R 9426418 5' - P-element 2879 2 73.27 CCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 - chr2L 19679759 5' + Doc 69 1 73.27 ATTACTTCTTAAAAAATCTATAATAAACGACACAATTAGTTATACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTATTGCAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTC:1 - chr3R 4833032 5' - Tc1 1438 1 74.26 GAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:3 - chr2R 18503545 5' - roo 9031 1 66.34 AGGCGACATTCATAGTGATTTGGTTTGGCAGTTTTGTGTCATTTGTTGGATCAACCGATGGTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACC:1 + chr3R 28094599 5' - Rt1b 5110 1 62.38 GATCCTGCAACTTTATAGAGAATGTTTTACGGAATCGCTCGTTGACTTGTTCGTTTAGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACAT:1 + chrX 11943486 5' - Doc 197 1 60.40 TTTGTTCTGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTT:1 - chrY 3648884 5' - 17.6 7386 2 68.32 AACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr4 311565 5' + 1360 53 1 77.23 TCATTTTGCTCAGAGAGAAAAGAGTGGCTTACGAACAAGGTGATGGCGACTTCTGGATACCCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATA:1 + chrX 1235394 5' + P-element 13 1 64.36 CCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCCAGT:1 - 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chr3R 17121682 5' - mdg1 370 2 76.00 TCCGGAGAATGCGACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:2 + chr3R 14639341 5' + roo 8696 2 57.43 AGATGTACGTAAAGCTACACCTCTCCGCGAATTTACAATATTATGTTTTTGCGTACGGATACATATACATATGCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCT:1 + chr3R 14644506 5' - Stalker4 219 4 69.31 CACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 + chrX 21087571 5' + mdg3 5267 2 61.00 TGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:2 - chr2R 14381334 5' + hobo 46 1 72.28 GAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 9692688 5' - P-element 2841 1 33.66 GCGTCAGTGATGCGGCACTTCATCTGCCTGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACA:1 + chr2R 9750425 5' - Doc 246 1 71.29 AATTTATTGTAAGCCAATTGATTAGATCACATGTCCTTTCCATCAAAACTGGCTTACGTTGCATAGGCAGGATGTGAGGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTC:1 + chr2L 12765210 5' - Rt1b 4938 1 67.33 GTTTATGGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 - chr3L 8924625 5' + Stalker2 7289 2 62.38 CTCAGNATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr3R 14094986 5' + Doc 44 1 69.31 CAAAATTTTCTAGATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chr2R 18295586 5' + I-element 9 1 68.32 AAAAATAATGTTGATGTTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chrX 12294787 5' + blood 5 2 74.26 TCCCGTACTCGGTCCCGTACTGGTCCCCTACTCGGTCCTGTACTGGTCCGGTACTCGGCACCGTACCTCCTGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTA:1 + chr3L 16047627 5' - Cr1a 4406 1 55.45 AGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTAT:1 + chr3R 19449300 5' - roo 8609 1 64.36 TTGAGTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2L 13739988 5' + 412 7082 2 57.43 ATGGGGGAGGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2L 21978181 5' + roo 14 2 65.35 CTATTATGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr2R 9375182 5' - HMS-Beagle 203 2 73.27 GTAATTGAAACAATTGATTCCCAGCTATAGAATCACTTTTCAAATGCAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA:1 - chrX 11365364 5' + mdg1 7067 8 78.35 TTTGGTGGAGGAAATGCGGAAGACGCTGTTCGAGTTCATCGACCAGGCCATCAGCGGAAATCACGATCAGCTGAAAGTCAATCTATTTACGATAACCAAAT:1 - chr3L 23768492 5' - Gypsy12A_LTR 176 1 56.44 CATTCACAAGCAACTATAATGCCATATTGGCTTACAAACTAATTTATACTTAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTA:1 - chr2R 13605622 5' + I-element 26 1 51.49 ATACATGACAAATATATTTAATCCACAATCATTTTCTTTAAATTAAAAAAAATTAAGGTGTCAATCTTTTTTTGTTAAAGGTTTTTTTTTTTATTTT:1 + chr3L 11409934 5' + Tc1 1470 1 79.38 TTAAAAAGCGACCCATATCCTTTGCCAGACGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 - chr3R 25702245 5' - Tirant 8465 2 67.33 ATATTACATTACTTTAACATTTTCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3R 9479433 5' - mdg1 7437 2 50.50 GGTCTGGAAAGCGTTTTGCACTCAAGTACTTTATGCACTCAGTGCCTCTCTGGGTTAAAAGCTAAAGTGTAATATAATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAG:2 + chr3L 8924545 5' - Stalker2 7638 2 70.30 GTTGCAACCGCCAGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3R 29660243 5' - mdg1 7418 2 67.33 AGTCCATATATATGACCACCAGACATTATAATAATAAGCAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2L 13245017 5' + P-element 7 2 68.32 TTCCGTGGCGAAAGAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCT:1 - chr3R 1868236 5' + G-element 18 1 60.40 AAAAAAATTTCATCTTATTTGGTGAGAGTCCGAGTTATATACTGGGAACACGCAAACTTCTAACTCCCTTCTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAG:1 - chr3R 4626911 5' + 3S18 181 2 63.37 CACGAGGAACTGAGCTCATTTATGCAACTACGTACATACATATAGCCATGCATATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1 + chrX 15195210 5' + Transpac 15 2 63.37 CAATCCAATTTAAGGAATGTTGTTGGCCTTTGTGGCTGCGTTTCTTCCCTAACAAAGTCATGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 4386546 5' + jockey 12 1 73.33 CATCTCGTGCTTTGCATATTCTAGAAGGCCCGAGGAAGGAAGCCAAACTTACGGCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTTTTTACT:1 - chr3R 5444391 5' - G4 3603 1 58.00 AATAGTTTTTTATTGTTATCACCATAAATCACAAACATTTTATTATATTATTAGTAATTGTATTGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCC:1 + chr2L 12241964 5' - invader3 263 2 55.45 AAGTAGCCAACGAGGAAGGCAACCAACAGGCGCCACAGGTTCCTTCCGAGAACAATAACATACCAAAACACGACAACAACTCATGGCTGGGATAGTCGAAG:1 - chr3L 21316695 5' + S-element 1313 1 71.29 ACCAGGCGTTACTTTCGTCACCCTCCGAGCGCGGAGCTGGTTCTCAAGGGCTGTTTTTATGTGAGATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTTC:1 + chr2L 1436093 5' - I-element 5340 1 57.43 ATCTCAACATAACAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3L 19215885 5' - roo 399 1 71.29 CAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 - chr2R 8378645 5' - pogo 2041 1 49.50 TTTTTGTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 + chrX 5018645 5' + opus 45 4 77.23 TTCCTTCCTACTTTATTTAAGATGGCTTAAACAATTCAGCAGAACGTAAGCTTATAACTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr3L 11654515 5' + pogo 17 1 57.43 GGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 12894107 5' + blood 7049 2 61.39 GGGGATCTGTAGCGAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGC:1 - 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chr2L 13837925 5' + 297 43 2 73.27 ACCAAATGCCATTATGGTCGCATATAAAACATGTATGGATGGCAAAAAGACTGAAAAGAAACACTCGAATAAAAGCGAACACTATACTTTTCGTAATTGCG:1 + chr3L 5785106 5' - GATE 181 2 60.40 ATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCT:1 - chr2L 21403537 5' + G5 4418 1 62.38 GTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATC:1 + chr2R 6984318 5' + HMS-Beagle2 26 2 53.47 AAATGTTGCGAACGAAGGATGAATGTTAGAAGTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2L 4189463 5' + 1360 4 2 74.75 AGTTGGCACCTGAAATCCACCCAAGTGCAGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTT:1 + chr2L 23048358 5' - McClintock 6050 2 71.29 GTGGACGGAAGCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAG:1 + chr2L 19075651 5' + Transpac 27 2 53.47 CTCTGCTCCTTAAGCGGCAATTAGCGCTCACAATGCACGATTCATAACCCTCAGCTGAGGGCTTATGCCTACATACTAAACAAAAACCTCCGCTCTCTCTC:1 - chr2L 4102626 5' - Rt1a 4952 1 68.32 CCCCACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2R 4502432 5' - roo 9037 1 58.42 GCAAGAGGCTATATACACTAGAGACAACAAATAAACTTCCACAGCAGCGGATATGCCGACAGACTTATCGCCCACCCGAACACGTTGGCGAATGATCTTGT:1 - chr2L 20984441 5' + G5A 2639 1 76.24 AGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGG:1 - chr3L 11826426 5' - INE-1 127 1 66.34 CATACCTAAGTTGGTCCTAAGCTGAGGCACAAAAAGGATAATCCTTTGGCGGGCTGGTAAAAAAAAACTGAAAAAATCAGAGAGAGACTCTGTAGACGTTG:1 + chr3R 7821172 5' + 412 369 2 71.29 TTCAGNGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 19679787 5' + Doc 34 1 53.47 CTCTTTTAGTTTTTGGCCTGTATTTTCGTGGCATGACGCTTTCGGTCAATTTTGTTTTTGGTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTG:1 - chr3R 29901959 5' - transib2 70 1 63.37 TCCGAGTTGTTATAATGTAATGGCTAAGACAAGAATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTT:1 - chr3R 6431101 5' + 3S18 5789 2 56.44 ATATGTTGCTAAGTATGCCAAGCAATTTTTTGAGATCTAATATTTAAAAAATTGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 4986365 5' - roo 9050 2 62.38 TACTATTGTTTTTATTCACTATTCATTGCGTACCACCACCTCCCTTTTTAAAGAAATTACGTAATATATCTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTG:1 - chr2L 8319342 5' - Stalker4 6894 2 64.36 GTGCAAGTGAGAGGGAGACGGACAGCGAAGGAGACAGGAACAGAGACATCTACCGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGA:1 + chr3L 960085 5' + Rt1a 28 1 47.52 TCCGTTTTGCTCCTGCGGCGCTCCTCCTTTCTGCCCCTCCTCAATGGAGCAGATGGAGTGGGGATGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 23551923 5' + roo 8724 2 64.36 ATGTTATATACATTCTCCCAGTAGTCGAGCGTGATTAGCTGGAATGTCGTCAGCATGGACCACATAAACCTTCTCAAGAAGTCTGTGGACAGCCTTCTTCT:1 - chr2R 24905167 5' + Burdock 6103 1 67.33 ATTTACGAAAGGGAATGAGCCGAAACTGTTTTGATGATACTGATACTATTTGTGGCCGTAAACTTCTGACCGACGAATACAATCATTTTCATTGAGTTCTG:1 - chr3R 25812548 5' + mariner2 862 1 64.36 ATTTCACGCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTAGAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGAT:1 - 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mdg3 5068 1 73.27 TAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCA:1 - chr2R 6984379 5' - HMS-Beagle2 7148 2 75.25 TAGATTCAGTTCGAACATAAGAAATAAATGTGTTTTCAGATTGTATAGACTTCAGACTTATCCCTTCAAGCTCACGCCA:1 - chr3L 20895039 5' - invader3 5396 2 59.49 AGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCA:2 - chr3R 1868205 5' + G-element 49 1 68.32 GCTAGAAACGCAAATTAATTATAATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 9369915 5' + roo 15 2 64.00 GCATCGTAATAGGGAATGTGAAGCATGTGTGTCAGACCAGCCCGTACTTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr2L 11065965 5' + P-element 2 2 77.23 AACTCACTTAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAATTATTGCCCTGCAATTGTTTCTCTAA:1 - chr3R 27080798 5' + HMS-Beagle 6803 2 39.60 ACAAATATTTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 13347274 5' - 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chr3R 27189316 5' - roo 9025 2 70.30 ACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 + chr3R 7522308 5' + blood 39 2 61.39 ATCCTTAAACAGTTTGCCACAAAGCGAAATTTATGTGGGAAGCCGTAAATCAGAATCAGAATGTGAGTCCAATATTTTGTCTGATGGATCAGGTTTAAGAC:1 + chrX 3643397 5' - transib2 2500 1 56.44 ATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACA:1 + chrX 16798209 5' + diver 5925 2 59.41 AAAAGTCAAGCTCAACAAATACACTTTTGGATGTGAAGGAGAAGAATATAATATATATAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATT:1 + chr3R 9952184 5' - Ivk 5344 1 47.52 CGAAAATTATCTGAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAA:1 - chr3L 4048535 5' + 3S18 5779 2 65.66 CACAGAAGAGTCAATCAATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 - chr2L 18028739 5' - flea 4976 2 65.35 CAAACATGGATGAAGATCCTTTGGATTACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 + chrX 21396659 5' + F-element 37 1 51.49 TATAAGTACTATAAGGGTTGCATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTAC:1 - chr2L 9389094 5' - 1360 3324 1 65.35 TTGAGAACATCAAATAGTACGCATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACT:1 + chrX 16517327 5' + hobo 50 1 78.22 CAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2L 108022 5' - P-element 2829 1 21.78 ATTAAAACTAAACTATTTTTGTACCACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTG:1 + chr2L 514826 5' + 3S18 5766 2 73.27 TATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr2L 8740884 5' + Burdock 6172 2 62.38 CCCGTTCCGCCTCCGTAATCGCAAGTGCTTGTTGTGTCCTGCCATTCAGACAGCTTGAAATCCCATTTAGAAGATCAATAGGGAAACCTAAAAGATCAAGT:1 + chr2R 10125116 5' - Q-element 366 2 73.27 AAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 + chr2L 18112500 5' - transib2 2800 1 53.47 ATAACATACGATTTTGTAAAAGTGAGATAGCAAGCTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr2L 18694182 5' - P-element 2873 1 65.35 AACATTTTCTGACTTAAAATCCCTTTTCAAAGAGATTTATTTAAGGTTTCAATTCAGGCATTCGAGTCATACACAATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 10698615 5' + roo 4 2 63.37 AAATAACTCATCAATATCTGAGTGGCATTTTTCTTGTACAAATATTTACCAATGGTCCTACAAACGAAATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACT:1 - chr3R 5261144 5' + S-element 7 2 64.36 GGTCGTTCCTTTCATTTCCTCCGAATTATACATAATTATTATTTTCTTAAATACTTTAAGAAAATCTTTTACTTTTCTGTCTTTATGTTTTGTTTACTCTC:1 + chr3L 24791907 5' + Cr1a 203 1 60.40 TGTATGTGTATGTTAGACATGTCAAAGTAACATTTAACGGCTTTGATTTGCACGTACGCGTTGATAAGAAGATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATG:1 - chr3R 9957951 5' - Ivk 102 1 59.41 GGCGGGTTAGCAATGCAAATTCCCTGAACAAACAGCCGTGGAAAACGAGAGGGAGCCATCATTGAAATAGCGGAGATTTGGTCCAAATTGACATTAGAATT:1 + chr2R 8045704 5' + Bari1 1298 1 60.40 TAACGGCATATTTTAATGCCTGATTTTTAACGTCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAA:1 - chr2L 17053036 5' + F-element 4520 1 65.98 CTTAAGCAGCAACTTTGCCTCTACCGATGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3R 1228348 5' + 412 48 2 73.27 GCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 20466654 5' - roo 9024 2 73.27 GCCAGCTTGAGAAACTTTCCATTGTGCTGAAAGCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3R 19114175 5' + 297 6594 2 67.33 ACACGATAAAATACAACAAAGAGGCAAACTAAAAAAAATTATAAAAAAAAA:1 - chr3L 13902084 5' + Doc 4693 4 90.20 AGCTGACTTCGCTTCGTCCTTGCCAGCAATTCGCCTGTGGTTGCCGCCTGGGTGTGAGAGTGGTCACAGTGTGTGTGCATGTGTGCATGTGTGTGTGTGTG:1 - chr3L 1139235 5' - accord 7036 2 55.45 TCTTAGGCTTGAGAATTTCTCCATAACAACCCTGCACGAGGAGCTTTGCTATCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTT:1 + chr3R 4359423 5' - Tc3 1623 1 55.45 ATTGCTTCTTTTCTTTGTTCTCTGTAATCTCAAATGAGTATATATAGTATTTTGTACTTCCTATTTTTGTGTTCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTC:1 + chr3R 9156895 5' - G5 4797 1 74.26 TAAGTGGCTTGTATCTGTTTTCACAATGGTTTTAGTTACATTTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGT:1 - chr3R 14793435 5' - 412 289 2 59.41 CCACCTCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 19457131 5' - roo 9054 2 62.38 GATGTTGCCGCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:2 + chr3R 11993278 5' - P-element 2868 1 60.40 CCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chrX 18193726 5' - hopper 1382 1 60.40 CTGATTGTGTTCGTCTAAGTAAAAGACATGTTTGTACTAATAGAAAACCTGTGATCATATATAAAAAAATGTATGTGCAAACTTATCTAGAAGTCACGTAG:1 + chr2R 6722014 5' + Tc1-2 1229 1 61.39 CCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chrX 4890047 5' + 297 41 2 73.27 GCCGAAATGAAACTTCAAAGGCCAAATGCAAATGTTCTAAGTGAATTTGTGGACCTTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGC:1 - chr2L 754866 5' - Idefix 7089 2 61.39 ACATCAAAATACCCACACGGTCGCAGCAATGGCAGCAACATCTGAAACAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chrX 4796944 5' - copia 228 1 53.47 TTTGATTTACAGAACCAAGAAACCTAAATTGCACTTAAATGCTTTCCAATAAGACTTTATTAAGGCATACTGGGTAGCTTTGTCACCTTGGGCGCTAATAA:1 - chr3R 18943190 5' - BS3 1719 1 50.50 TGAGGAAAAGCGCCTTTAACTTCAAAACTTTTTCATTAGAATGCTTAATACAACAGGAATAACAACAACAAATACCGATGACAGAGTTGGAACCAAGAAG:1 - chr2L 17022616 5' + Porto1 4505 1 77.00 GACGTGGAACCAAAAGACCCATAATGATTTAACTCGCTCGGGGATCTGTCCGGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - 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I-element 346 1 54.46 AAGGAATCGCAACCAGCAGACGCAGCAAACAATGCAGGATACAAATCTGAGACCCCATGTTTACAACAGATCCATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAA:1 - chr2R 4704279 5' - Tc1-2 217 1 48.51 GTTTCTGTTCCACTTCTCTTTTAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCCCCTGATATTCTTAACC:1 + chr3R 8455642 5' + micropia 5435 2 78.22 TATGTTTGGTGGATTTACTTAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTT:1 + chr3R 19609619 5' - Tabor 486 1 77.23 GGCTGTAGTACGTGGTGGGCGAGACAGGCGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACACAGGAACGTAGTGGTGTAGTTGACGGTTT:1 + chr2R 15658642 5' - Copia1_DM 108 1 71.29 CGATGACTCAAGTACATAGCAGAGGGTGTCGGTTGGGAAGGGGGGGAGGGGGTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTG:1 + chr2R 8241702 5' - gypsy3 419 2 78.00 AGATCGAAATGCTGATGCCAATGTGCAGTGGAGTGAATCCATTCAAAGCCCTTGCATTGGCATCAGCATTTCGATCTAGTAAAAGCTTACAAATAAAGACT:1 - chr3L 7709771 5' - Cr1a 4039 1 68.32 CACTAGAAATATTGCACACTACACTAAAATCTAAGTATACCAAGCACATTCCCTTCATAATAACACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 - chr3R 3396943 5' + Doc 89 1 67.33 TGATTGTCGAGATCAACATGATGGCCGCCGGATTAGAAAACGGCGTTATCTTATCTACATGAGTTGGTCAGTCGGAACTATAGATAATGAGTACTCCCGTA:1 - 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opus 459 2 65.35 ACTCGGACTATTTGCCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chr2R 22997970 5' - Transpac 266 2 73.27 CATATCTGAAACCACATTGAGTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr2L 13740004 5' + 412 12 2 66.00 GATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3R 14094991 5' + Doc 39 1 64.36 ATTTCAAATGCTGCCTAACACTGGCACTAGAACAAAAGCTTTGGCGAAAGCTGCGCTGGCAGCTCGTCCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 11070473 5' + P-element 7 2 72.28 AACGCAGTTTTGAAAAGTTCTAGTTCCCAGTTTGTAAGGTTAGATATAAAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr3R 19657550 5' + roo 8664 1 79.21 AGATGAGTTGAGAAAAAAGTGAGTATGAAAACAAATAGTCTACAGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3L 9858334 5' - pogo 2073 1 55.45 GATGAGTTGAGAAAAAAGTGAGTATGAAAACAAATAGTCTACAGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3L 9858333 5' - pogo 2072 1 56.44 AATAGGCTAACTAGTGGATTTATTATAAAATATAAATATAAAAACTAAAAAAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAA:1 + chr3L 3279741 5' + Juan 4093 1 48.48 TGCAGAATAATCACATCGCAAATACGGCGAAGGCAGGAAAAATTGAAAAGAATTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCT:1 + chrX 14955891 5' + Bari1 1705 1 57.43 GAGCCATAGTTATATCATATGCGTTTTGTATTCTAAAATATAAAACCAAATAAGATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATG:1 + chr3R 22530776 5' - Juan 4192 1 55.45 TTTAAGTTGAGTGGCCGTCTGTAAAAATATTGTTTATCAAATTGACCTTTATAATTTAAAATTTCAGCAAACAATTTCTGATTCACTTGATTGCTAGGGAC:1 + chr3R 895719 5' + HMS-Beagle 6938 2 80.20 ACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGAC:1 + chr2L 20928081 5' + Chimpo 41 1 67.33 ACAAAGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 + chr3R 779374 5' + F-element 15 1 54.79 ACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 19215865 5' - roo 9042 1 56.44 AGGGTATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTT:1 - 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G-element 4165 1 67.33 AATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATC:1 + chr2R 12185303 5' - accord 7381 2 72.28 GGAAACGGCAACCAGAGTCCAACGAAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chr2L 13837969 5' + 297 6580 1 79.21 TCATATTTTATCTACATATCAACAAATAAGCGCGTGGCTGACTAGACCCCGAAATAAAGAAATAACTAAAAACCGAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3R 24611883 5' + Doc2-element 217 1 58.33 CTGCTCTGCTGGTAGACATGCATGCATACGTTTGATCCTACGTGGTCTTGAGTTTTCTTGAGTGAAGATCGCGAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 - chr3R 25633435 5' - Tirant 399 1 77.23 GATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCATGCAGAGTTTGTCTACTGATGTTGCCACCGACTAAAATTGTAACGCCCACACTTTTGAAA:1 - chrX 23148658 5' + INE-1 250 1 62.38 GAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCT:1 + chr2R 9387330 5' - Stalker2 7615 2 59.00 ATAAATAAATAAATCGAAAGCGATCGTTCTAAAATGAGCACTCTTTGCAGTGGAACAATGCATACTTCACCGTCGATGTCTGACGCCCGCGAGTGCCAAAT:1 - chr2L 11219886 5' + Doc3-element 315 1 60.40 TTTCTCGCCGTGAATAATGCATGCGATTCCTTAGTCGACATTCGTGTTGGTCTGCTTGGGCTGGGTTTTGGTTAGTATTGTTATTATTATTATTATTATTG:1 - chr3R 9483098 5' - mdg1 36 8 72.28 CAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAAC:1 - chr3R 1206455 5' - I-element 5326 1 57.43 AGGTTAAGGTTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTT:1 + chr2R 6779749 5' - 17.6 7409 2 68.32 GAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAG:1 - chr2R 12214006 5' - Transpac 294 2 64.00 TCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCA:1 + chr3L 23933554 5' - Cr1a 246 1 62.38 CCCGCTTCCTTTCACTCATTGTTGTTCGTGCAACTGTGGCGGTGTCAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCT:1 + chr3R 22801618 5' - micropia 5328 2 54.46 CATTTTTCCGATGGTTTTATGACATATCAAATATCCGGCCACCAAAAATCGCCCATCGAGGCAGGCCTTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAGAAAG:1 + chr3R 21927671 5' - Stalker4 6885 2 74.26 GTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGAACAAG:1 + chr2R 5532371 5' + Doc4-element 16 1 59.00 GTCATGTAGGCCGCCTGCCCATCAGTCTACAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr2L 17210103 5' + jockey 4718 1 70.30 AAGCAAGGCCAAACATCATCTTTTGCCTTCCAGCGCTGTTTGAAAACGTATAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCA:1 - chr3L 679319 5' + G2 2878 1 57.43 TAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 - chr2R 16898294 5' + Max-element 8285 2 74.26 AAAACTTTTTCGCTCAGTGCCCGCATCGAGAAATTACTGAGCAATGTTTTCGCGGCTTATTATTGACTCACATCCAACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACCC:1 + chrX 3041343 5' + hobo 51 1 62.38 CGGACTTGCAACACTTTTTTTCGACTTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAAAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chr3R 31369323 5' - Transpac 5181 2 71.29 AGAAGCATGTTTTCTTTGGGATTANNNNNTCTTGAACCCNACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 4502396 5' - roo 410 1 74.26 GACATCGATCTTGGGCAGGTCTCTGCGGCGATAGCTGCTCAATTAAAATCCATGGCTAGCTGACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTG:1 + chr2L 12612134 5' - Gypsy6A_LTR 101 1 64.36 TCCAAAATTTAAAGGAAAAGTTGCTCGTGTTGCAGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCGTTATCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAA:1 + chr3L 25628325 5' + 1360 3244 1 67.33 TCCCGAACCCACCATGCAGCAGGTGATGGCCGCCGTGGTGTCGGGACGCAAGAGATGAACTCGTAAGGGCGCAGAATCACAACGAATATCTTTTGGTTCAA:1 + chr3R 25021302 5' - hopper 489 1 59.41 GTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - chr3L 7989792 5' - mdg3 199 2 73.27 AGAAGAGGCAGCTGTTCCTGCCTGAAGCGACGAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGGGACGTAG:1 - chrX 10380629 5' - F-element 278 1 66.34 CGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAA:1 - chr2R 9375224 5' + HMS-Beagle 6845 2 81.19 ATAACCCACACAAACACTGGCCAAAAAAAAAAATAAATAAATAATAACAAAAAAAAA:1 + chrX 4811880 5' + BS 5095 1 73.68 GGAAAGTATAAAAAGAAGACTTCAATTAAAACAATAAATACAATACAATTACATTGGAAGTATTCTGATTGCCAAGGAAAAACATTTGTTAAATTTTTTCA:1 - chr3L 16581523 5' + HB 1511 1 71.29 TTTTAAACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAA:1 - chr3L 14240912 5' - Tirant 8490 2 63.37 ATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3R 22620200 5' + 297 36 2 66.34 AAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 108012 5' - P-element 2839 1 31.68 TAAGATTTGTTTTGTTTCACCATTCTTGATGTGTTCTTATTTTTATAACTGAAACTTAGCGTGGCCTGCAGGCCGATCGCTCGTGACAGCAAAGTGCTGAC:1 - chr3R 28748427 5' - mdg1 7303 2 84.16 ATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 - chr3R 7522363 5' - blood 7350 2 65.35 CATAACATACGATTTTGTAAAAGTGAGATAGCAAGCTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr2L 18694183 5' - P-element 2874 1 66.34 ACAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr3R 9837577 5' - 412 459 2 61.39 ACAACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chrX 20437707 5' - roo 9054 2 46.53 AGCAAACAAAGAAGTTTTTGCTGTCTGGCTTTTGGCTTGTTTAAGAAAAAAATATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3R 19622900 5' - pogo 2080 1 58.42 ACTTTGTCCTTTTTGTTTCCTACATATTTTTATCTATTTGTGTATCTATATGGCAGGTCCAGTACATGAAATCTTTT:1 + chr3R 19563153 5' - G3 4457 1 74.03 CTAAGTGAATTGACTTCCAATTGAGATCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAAC:1 - chrX 16521455 5' - opus 7061 4 71.58 GAATAAATATGAATCTGCAGTGACAGTTTGATTTCCATCCGTTATTTGCCCCCCCTCAAAAATGTATTTTCTCTCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr3R 19191578 5' + Doc 5 1 73.27 TTTTATATGTATAAAATTACATAAATTCAATGCAATTGTGATTTTTATATAGCATTTGTGATTCATTTGCGTCATTTGTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTAC:1 + chrX 19700016 5' - mdg1 7381 2 68.32 CTTGTGCACGGCAGCCAGAAAAGGGCAATTGGGCGTTTGTATAATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCAC:1 - chr3R 20768590 5' - 3S18 5638 1 77.23 AATATTTGAGGGATTTCATATTATGCAAATAGTGCCGTGTTGCCACTGACAACGTTCTGTTTCGTGAACTACTTAATAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr3R 11516725 5' - roo 411 1 49.50 ATTGGAATGCGTTTTGTTATTAACTTGTTACACTTTTAAGTATTTAAGTACTCAATGCGCTGCATTTTTAAATTGTTCGCTGTGTAGTATGTGCATATATC:1 - chrX 8352275 5' + blood 7009 1 69.31 GTTGACATGCTTAGCGATGTGTTTGACTGGCAAAGGTTATAGCCAGGTGCTTACATTCGGTAGCTAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGC:1 - chr3L 25585656 5' + roo 8925 2 64.36 CGTGGNTCGCAGCTACCATCAAGAGCCAATGAGAAATGCTGCTTTTATATGTTTTTTTTCTATCAGTTCGGTAATAATCGAACATTATTGTTAAAAAAAGA:1 - chrX 22482466 5' + Circe 464 1 64.36 GGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - 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copia 440 1 69.31 TAATGGCCTATATAAAAGCCTAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 18881561 5' - roo 9033 1 62.38 CCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chrX 2050868 5' - 412 444 2 69.31 GCATAGCTATTCTGTTTGAAATAACTTAGCTAAATGATCGTCGAAAGTGCATTTGCGTAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr2R 5784411 5' - 297 6962 2 65.35 GAAAAACACGTGGGAGTTCTTCGACGCAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 11165719 5' - Tabor 465 2 61.39 ATTTATGAAATTTATGAAATTTATAAATTTATATGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 7255530 5' + roo 8706 2 74.26 TGGGGAAATACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 10736463 5' - 412 7503 2 68.32 AGGGTATGCATGCACATGTGTATGTTGCTCTCTGTATATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTA:1 - chr2L 23049923 5' + McClintock 6423 2 64.36 GAGCAACAACAAGTGCGCGAGAGAGAGGTTTAAGTAGTGCCGCTACCCCGCTAAATAGGGCGGAAGAATGAATATTCTATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTC:1 + chrX 7891658 5' + Cr1a 335 1 78.22 ATACTATAAACTTATTGGCTAGGAATAGAAACTAATTTCCTCACTTGCAACTCGGTTACATTGAAGTACTGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 19643064 5' + roo 1 2 64.89 GTGCAGACATGCTGTTTTTCTTATTATTATTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 - chr3L 10562827 5' - Juan 4166 1 73.27 AGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:2 - chr2L 19679784 5' + Doc 37 1 51.49 CAATGAAATTGTTTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 20466625 5' - roo 389 2 60.40 ATGAATTGAAGTCCAGCGCTTATATATGCACATACTGTACTGGTGTACAGTGGTTCTTAGACTTTAAATCTATATCATTTTTGATCAATTGGCACCATGCG:1 - chr2R 3181813 5' + 1360 266 1 60.40 CCCTTTTTGCTATCCGTGCTCTTGTAGAAATTGTTAACAAAACTGTAGATTTATGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 21383960 5' + roo 8685 2 58.42 TTCTAATTAATTAAGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 1626513 5' - roo 397 1 66.34 CCAATCTTAAAATATCTTAAGATATTTGGTTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGAG:1 + chr3R 3282481 5' + 1360 68 1 66.34 AAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATT:1 + chr3L 24213795 5' - 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roo 9028 1 69.00 ATCGGCAAGGCGGTCGGTCAATGGAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr3R 27374844 5' - mdg1 7407 2 76.00 TGTCGACTATTGCTCTTTTATATTCCACGTTCAAGCCTCGGTATCGAGCTTTTCTAATATGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAG:1 + chrX 16794009 5' - Idefix 377 2 74.00 AATAAACTCGTTTCCGGAAATGCATTTAAATAAATATACTAAATAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACA:1 - chr3L 4681945 5' - 1360 460 1 79.21 AGGGAAATTAAGAAGTGGCAAATGAATGCAGGGAAAAAATGTAAAAACTCCCAGAGTGAAAGTATAATTTAAGAAACTCTGTACGAAATCGAAAGTATAAT:1 - chr2R 10572521 5' + mdg3 5046 1 58.42 AACTGAAATATTTATATGACCAGTTGTTTGGGAACGAGACACCC:1 - chr2L 16933636 5' + 3S18 5764 1 50.00 CTGCACTGAGAGAAACTCCAGCTATAGTTGCCAAAAAAAAAATAAATATATATAGTGACGGATTTGGGTGGTCCAACCCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3R 9169696 5' + 297 19 2 56.99 CACTACCGCCCTATCTTCAGCATTCCCTGCTCTCCCCGAAGTCTTTAAAATCTGTATGCTTAATCACAACCTCCTAGTTCTTATAGTTCCTGAGCTCTCGA:1 - chr3R 8374506 5' - INE-1 146 1 62.38 ATCAGGGGGGTGTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr2R 22395199 5' + I-element 28 1 54.46 ACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2R 981625 5' + 1360 3 2 60.40 TAAGANTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTA:1 + chr2L 8740889 5' + Burdock 41 2 67.33 GTGACATATGGACGCCCTTCTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3L 7054947 5' - accord 7031 2 93.02 TACTGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 + chr3L 15056313 5' + BS 5028 1 77.23 CCAATAAACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:2 + chr3L 2292056 5' + Max-element 9 2 60.40 CACGGCCCCAAAAAGTGTGCTTCGAAATGTGCACGCAAATGAGCGCAGTTCGCTCGTCATCAAGAGCTGCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:2 + chr3R 29384331 5' + jockey 4768 1 70.30 CAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr2R 14381283 5' - hobo 2900 1 67.33 AAATCAATAATTGTACATTTTCTAAACCGAAACCGAATAATAAATTGTAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACA:1 - chr2L 18160355 5' + I-element 127 1 53.47 TATAAATTGAAACACGAATAATTTCAGACAATATAAAGAATATATATAGTGTCATATTCACATACAAAACCACATAATGTAGAGTAAACATATTGAAAAG:1 - chrX 18918809 5' + 17.6 6959 1 73.00 GAGCGTTGTTTATAAACTAAATTGAGAGTGGTGATCATATGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr3L 11070560 5' + P-element 36 1 39.60 GAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 9692674 5' - P-element 2856 1 48.00 TTTTGGACATTATCTAGTTTGATTCCCCACCTGGCCCAGATTTGTTGGCCTTTTTTTGGCATAAAGTCACATAATAAAGCTAGAGAGCTAAATTTTTGTAG:1 + chr2R 23372075 5' - transib3 2813 1 70.30 AATATTAGTTTAACTTAAAAATACACTCACACACAAACACACACACCTACTTACAAAAACTGTGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGG:1 - chr2R 22993799 5' - opus 490 2 71.29 ATTTTGTTCACTAAAATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 13202984 5' - roo 9051 2 59.41 ATTTCAATGCACTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCAC:1 - chr3L 17921189 5' + Quasimodo 43 2 73.27 TTATAAACTAAATTGAGAGTGGTGATCATATGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3L 11070551 5' + P-element 45 1 30.69 TTCATAAGAGCCAGCGCTTTGGGTTAGTCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGAAAGTGTGGCCGTGGGACCC:1 + chr2L 2676686 5' + Cr1a 4436 1 71.13 AGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGT:1 + chrX 21668085 5' - Stalker2 351 2 70.30 ATTTTGATTTGCCTATTGTTTGATTGTGTCAACTGTCACTCTGTCGTGGATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3L 23152037 5' + Doc 34 1 55.45 ATCTATTGATAATAATACTAAAAGTTATGAAAAGTATTCACCTTGTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTG:2 - chr3R 10971950 5' + BS 5027 1 57.43 TTTGCAAATCGATAGAAATTTAAGCAACATGGGCCAAAAACTTGTCTCTTAAATCTGTGTGCTGAATCTCATCCTTCTATCATTTATAGTTCCTGAGATCT:1 + chr2R 5667270 5' - INE-1 149 1 77.23 TTGAGGGAGGGATGAAAAACCCACAGATGGTACATATCCTGTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTGCGTTCCAGTCACCTGCCGCAAGGAACTTTGGGCCA:1 - chr3R 28660776 5' - G5A 396 2 73.27 TATTAGTCTTGTGTTTTTACATCCGTTACTCGTAGGTTAACAGGGTATGCTGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCT:1 + chr3R 5505218 5' - mdg1 396 2 52.48 CTCACAGCAACACAACAACAAAATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 + chr3R 7100969 5' - pogo 2091 1 65.35 GACTGCCAGAAGCTGGCTATCTCTCTTGTTTATGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 21708669 5' - roo 9031 1 67.33 AAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:2 + chr3R 7522298 5' + blood 7040 2 51.49 GGAAAATGGCCGGGCGGCAGGTCATTTGGGCGCTCTATGCGACCGGCTATTAAATAAACATGCAAATTATTGCGCAATTTTGGGCGTCACCAAAAAAGTGG:1 - chr2L 16028170 5' + 1360 3330 1 80.20 TTTGCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 3671283 5' - roo 9044 1 55.45 CCAATTTAAGAATCAAATTCATTCTTTTTCTGCATCATAGGAAAAATGAAATAAAAACTCTTTCATTAAATCATAACAAATAAATAAATAAATCTGTTCAA:1 - chr2L 16187118 5' + G3 349 1 73.27 TCATCTAATATAACTCTCTCTCTAATATAGAGACTATTATTTTCAACAACCAGAGACATTGTTTCTATTGAAATATAATAAAATAAGTAAATATGTATGTA:1 + chrX 12890507 5' + G3 4504 1 60.40 CCATCAAGAAAAAGTTCCCCCAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr2L 14490411 5' + P-element 55 1 24.75 GCGAACCAAACAAATCAAAAGTAATTTTTTCAATGAAAAAAACGCCTATAATATGTTATTAATGCTAAGGGTATGCATACAAAGTATTAGAATTACCTCAA:1 - chr2R 11913493 5' + S2 1430 1 82.18 GATCTTTGACATTTTCAATTAATCGAAAAAAAGGGTCTGGGGTTTTAGACTGAAAATGAATAAAAAAAATTAAAAA:1 - chr3L 14326296 5' + HB 317 2 67.11 GGACCACGCCCCCGAATCATACCATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATA:1 - chr3L 11908231 5' + Tabor 7291 2 77.23 AGATTTAGGTAAATTGGTTTTTCCCGAGTAACCACAAAGCCTAGTTACCACTCAAATGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3L 11654618 5' - pogo 2085 1 59.41 CCTTACGTGTTATATATCAAGAGTTGGAGAATTGGTAGAGCTCTTAATAAATTTATTGATGAAAAAGGGTTGTGTTCCTTACGTACCATTCGCAGCC:1 - chr2R 5608195 5' - BS3 1397 1 76.29 TTCTACATTATGTGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 - chrX 1235450 5' - P-element 2826 1 18.81 TTTGTTATATTTATTTTAGCTTTGTTATTAAAAAAGAATTGTTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 - chrX 10251831 5' - flea 252 2 75.25 ATCACAGCGTTCAAACTTGTTTTATACTTTTTAACAAGTCCAGTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGA:1 + chr3L 21501148 5' + 1360 18 1 74.71 TAAGACAACAGAGTAACATTAGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chr3R 19609742 5' + Tabor 10 2 67.00 CGAGTTTTTCCCTAGGCTTACATTTCTTATCCTTTGAATGGGTTTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATAT:1 + chr2R 10912064 5' + 412 2 2 74.00 CCCAGCTGGATGCTGTGGCATCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 26469525 5' + hobo 12 1 67.33 TTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCAT:1 + chr3R 15157595 5' + invader3 5214 2 52.00 ATCCATGATGGTCTTCTCCTTGGCGTTCTGCTCCTCCTGCGACATTTGTACCATTAGTTCACGGTGCGATCTCTGTGTGCACGCACCGTTACCGATCAACC:1 - chr2R 9536910 5' - gypsy8 225 4 55.45 CAAGCGATCGACGAGCCGTTCACATAATTGGTGTCAATTTCGAGTGCAATAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAA:1 + chr2L 12074483 5' + Juan 4043 1 58.42 ACCATCTGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 7809047 5' + roo 8692 2 54.46 TGTTAACTTTCGATTTCCTCCTCCTTTTTTTTTTGGCTTTTGTTTTTTTTTT:1 - chr2R 18645805 5' - transib4 2539 2 65.38 AGTTAGCAAGTTTTTTGAATGAGCAAACATTCTTGTAAGTTTAAAATAAAAATCAGTATAAAATGCTGAACGCTTATGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 12136244 5' + roo 4 2 75.25 AGTGGCAGCCCCGCCCCTCTTGGGTCTCCGCCTCTTTGTCTGTCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCACATTCACACACACACATATACATACA:1 + chr2R 18482065 5' + accord 7036 2 50.00 AACTCCTTTCCGTCATAATTAGCCATGTCAGGACGACGTCTGTTTGGGTTTAGCCACCCACTCTGATGGCCATCTCGTCTGATCGGACTCGCTTCATCATA:1 - chr4 942964 5' - Rt1b 4775 1 72.28 TATTCNTTTTGGTGCACTTTATTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACCGACAGACGGACATTTCCATATCGTCTCGGCTATTGATCCTGATCGAG:1 - chr3L 18661141 5' - INE-1 89 1 77.23 ACCGCAACAGGCGTGGGGCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACT:1 - chr3L 5015896 5' + I-element 4927 1 70.30 TTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAA:1 - chrX 23108299 5' + BS3 1449 1 69.31 AGCCGGTATTTCAGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chr3R 17121694 5' - mdg1 7419 2 64.36 GCCGGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr2R 19857415 5' + 297 15 2 53.47 AGTGCNTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 7101054 5' + pogo 41 1 73.27 AAAATTGAAGAAGATGAGTTTATTGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr3R 446031 5' + pogo 50 1 76.24 CATTTTTATAATTGCATTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCAC:1 + chrX 16798175 5' + diver 5891 2 76.24 AGCGAACACTTACGTCAAGCGGCTTCTTGAGTACAATCCAACCGGGGTTCCTGAAAATTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGG:1 + chr2L 17717830 5' + Max-element 8125 1 65.35 AACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 - chr2L 16933636 5' + 3S18 56 2 77.23 CCAAAACGGTCATTGACTGACAGGCTGGAATTTGACGTTGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCG:1 - chr3L 6832755 5' + Bica 315 1 61.39 TGTTGNTTTGAAAATTGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACC:1 - chrX 3790355 5' + 3S18 20 2 44.55 GGCAGCGTATTTTGACAATTTGATTTGAATCGGAGCATTGCCGGCTTCACAGCCATTGGCATTGCAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGGA:1 + chr3R 19803944 5' + baggins 5204 1 70.30 CCACGCATAGATTCCAAGGTTCTAGATCTTTTTTGTCTCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGTCAGGGCAACCAGTTTCGCCTGCG:1 + chr2R 4027125 5' - R1A1-element 491 1 62.38 GACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chrX 10730665 5' - P-element 2826 1 21.78 TTCTACAGTCGGCGTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 19205715 5' + hopper 149 105 67.50 CCGGGNAGGGGGGCACTCAATGGAGAGGCGTGTATGTCTAAAAGTAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATTACTGATTATTACTTGTTGTCATTAA:1 + chrX 18544843 5' + invader4 2652 1 55.45 ATTATTTTCATAAATATCTCTTCTAGAGCATCAAGCATTCGGTGAGCTGTCACTGCTGTCCTCTTTCTATCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTT:1 - chr2R 10745386 5' + 3S18 29 2 74.26 ATAACGAAGATATTGCTCCACAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGGAAGCTCATGCATAGCCGGCAGAAGCTCTGCGCATTGGCAGAGGC:1 - chr2R 930553 5' + springer 96 2 80.20 TCGGAAAAGTCTGTTTAAGTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:2 - chr2R 22605996 5' + Juan 4046 1 57.43 TGCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 18012672 5' - roo 9049 2 55.56 TAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 12779099 5' - roo 9032 1 63.37 ACTCANGCAAAATTCCTGAGCTCTGAATACCCGGTATATGCGCACAATCACGAAAAGCAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGC:1 + chr3L 19375917 5' + Idefix 308 2 56.44 GTAAGTACTTATGTACATATGTATTTCAACCGGAAAACAAAATAATGGAATAAACAAAATAAGGGAAACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:2 - chr3R 25285161 5' + roo 8670 2 72.28 AAGCAGCGAAAGCGATGTGTAAGTATTGTGGAATAAAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCCCTCTTTGTCGATCG:1 - 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chr3R 10971971 5' + BS 5004 1 68.69 TTTCATTTAAATTTGTTTGCCAATCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 14910544 5' + roo 5 2 74.26 TCACGCTTTTCTTTTTTTTGCTGGCATCTCTGTTCACACTATCTGTTCTCCCCTCAGCACTTTGCGCGATTTTCATTTTGTGTTTTCGTCCAAAGTGGTCT:1 + chr3L 14457646 5' + Cr1a 399 1 78.22 GCTTTTCCATAGTATTGCTTATTTACATTTTTTGCGTTAATTTGTTTTTACGTTGTTTGCTTGGTTTTAATCTAAATAATAAAAACATAGTGGGCTTAAAA:1 + chr2L 2921764 5' - hobo 2477 1 68.32 TTTGGGTAAATATGCAGCTGATTTAAAATTATTTTTATGTACACGAGCGGCAGCTGATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGC:1 + chr2L 11551320 5' - Max-element 278 2 57.43 CATTACTAAGTGGCTGCCTAGAACTTTTTGGCCTAGCAACAAACTTTATTGTCACCCAATACCTCGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 + chr2R 7255775 5' - 297 387 2 65.35 GGCAGTCGATTAACACCCACACAGGCAAAAGCAGCCTGCGCTTGGGCAATATAAAGCATACGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chrX 8310168 5' + F-element 40 1 60.40 CGAACNTCGCCCGGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACG:1 - chr3R 28728360 5' + jockey 18 1 66.34 GGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 + chrX 14525276 5' + hobo 42 1 72.34 TGGGGTCGCGTTTTCCTCTCGGCTCGCAAAAATCAATATCTTGACTGTGTACAACAATTTTCAACGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 18906682 5' + P-element 10 2 69.31 TAAAGCTATCCATATCTTCTTCTTTGCTATCATGACTGAATGAAACTCATGAAGTTAATCAGTTCAGTACTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCT:1 - chr2R 13223992 5' + hopper 405 1 73.27 AGCTGTCGGGCGGCAGTTATTGAGTTGGTGAACGCAGAACGTGTAACGAAATGAAAGACTAAAGTAGCTATACTTGAGGGTGCACGCTTTAGAGACCGGCT:1 - chr3L 24240826 5' - gypsy12 10144 3 63.37 ACACTCGCTGTCCGAAAGCACACTCTTTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATTCTTCGAGTCCGCGATACATCCTGATCCTGCCAGCGCTCCTTGCGGAAAAA:1 + chr3L 6691238 5' + Max-element 353 1 73.00 AAAACAATGCATTGCAGCATAATAACCTCAAAAGACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTG:1 + chrX 2298787 5' + hopper 1414 2 69.31 CAGATCCGTGCGAATTCGCTAATTATCACGTACGGGTCCATTCATTATGATGGGTTGGGGCTTACTTCTGTTCCTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTAGATCG:1 + chr2R 22097292 5' - R2-element 3581 1 56.00 ATCCGCAAGCTGAATGTGAAAATAAGCCAGAAAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGTGGAAG:1 + chr2R 16969738 5' + R1A1-element 401 1 66.34 ATAATCGCCGGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2R 19857421 5' + 297 9 2 59.41 GCTGGTCAAAAAGAACCGCAATTAAGCAAAGTTGAATGGAAAAATAATGAAGCAATGAAATAATGAAAATAATAAAAGCAAAATTAAAATAAAATTAAATT:1 - chr3L 7031645 5' - Rt1b 125 1 78.22 TTAGACTTTTACAGCTTTTACCGTATACCCTTCATACATGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 10736516 5' + 412 7090 2 64.36 AGATAAACACATACGCATGCCTATGTATGTCTATTTTTTTTTTTACTTTTCTTATCTTTAATTATACAAATTTACTTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAAT:1 + chrX 14880183 5' - invader2 4704 1 69.31 TCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 + chr3R 25702186 5' + Tirant 35 2 62.00 ATACTGGCGAGGTGTGTGTGCGCGGATCGAATGTGTTCCATGTAACAATTGATTTGCTATCTGGGATGGGAGCCAACGGGGCTAAATTAAAGCGATTTCGA:1 - chr3L 18879823 5' - mariner2 220 1 63.37 TATCGCGCACCGATCACCGAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGGGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3R 8198487 5' + Tirant 8120 2 57.50 AGCTCTTTGAGTGCCTTTTTTTTTTTGCAATTTTATACAAACTCTTCGTTCCCGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAA:1 - chr3R 7993246 5' - Doc 383 1 59.78 GAATGGGGCATATTGCCACATGGCCAATTACCGCTTTATGAGGGTGGATCAGCAGTATCTCAGCCGGGATACTACAGATAATAGTCTTTAATATTTGTAAT:1 - chr3L 1320907 5' + gypsy7 5092 1 76.24 CATCCACCCGAAGAAGTCCCACTGTGGCTTCAGATCCAAAACAAAAACAAAACAGAAAACAGCCGATGCGCCGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3R 28326668 5' + P-element 4 2 79.21 ACTCATTATATTTCATTCAAAATTAAAACAATTGTAGATAACATTTTACAGTGTTTTTACACTGTAAAAACCAATTCGAAGTTTTTTATTGAAAACATTAA:1 - chr2L 8985798 5' + P-element 109 1 47.52 ATCAGTGGAAAAACTCTGCAAATATAAAGGGAATGCCAAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAG:1 - chrX 2325139 5' + micropia 326 2 75.25 TAAACTATAAATTACTATCAAAAAACCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 18009610 5' - roo 9022 2 78.22 AGCCCAATTACCTTTGGTGTGGTGGTTGTTGGAGTTCCGGTCTGGGCTCGTTTGTTAGTCGATCCTGGCTCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGAT:1 + chr2R 11898908 5' - G5 4614 1 70.30 GGGGCACATTAATTTTATCTTGGCACATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 - chr2L 14490472 5' - P-element 2873 1 65.35 TAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 15638231 5' + roo 37 2 63.37 AGGCAAATATTAAGTGCCATTAGAAAATGGGGAAGCGGAAACTGCAGTTGCTTTGGCTTTGCTGACGTGGATGCCGACGCTTTCGTCATCAAGTTTTTCT:1 + chr3R 31955844 5' - Dm88 340 1 76.00 AGACAGCTTAAGCTTAGTTTAGTTAAGCCAATTTAGTCAAAGCACTGTCGAATGTAAAAATAGAGTTGTTGAAGACTAAATGGTTTTAATGTAATTTTTTT:2 + chr3L 17206717 5' + transib4 26 1 64.36 ACAGCNTGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAA:1 - chr3L 9925288 5' + Doc 47 1 68.32 TTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr3L 21841315 5' - P-element 2836 1 28.71 CGGAATACCTCTTTTTTCCATGACGCTAATACACACATATATCTTAGCAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 326494 5' - roo 9037 1 52.48 GCAACGACCTTTAATGTGGTTAATAAATATAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 - chr2R 16744180 5' + opus 44 4 76.24 GAATAAAAAGTATATGTATAAATTTGTTATAAAATTGATTAATTCATCACTCGTTTGTCCATTTGTTACACATTTTCATTTGATTTCGCCTTTTGTTTGTT:1 - chr3R 30830112 5' - invader2 416 1 49.50 GTAGTATTTTGTTTTTGTTTTATTTTTTTATTTACACCTTATTAAGGCATACGGGTTAGCTGAAAACCCCTTTGTCACCTTGGTATCTATTAATTCAGCCC:1 - chr3L 23955813 5' - X-element 4657 2 79.21 CTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTG:1 - chr2R 6779846 5' + 17.6 6954 1 56.44 TATTGTTCCCGGCCTGAAAGCCATTTAATTATACAAGTAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 14910658 5' - roo 395 1 66.34 CAACCTGAGCTTCGCCTTCGTGGAGCTCTTCTACGGCATTGTGACGAACAGTTTGGGTGCGTACTGGGCCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATA:1 - chr3R 11213982 5' - opus 291 2 70.10 GTCAGTCGCAGCGTGTAGATACGAATGGAGTGTATATCAACTTGTGAAGACCCTTTAGAAGCTGATTTCAAAAATGTGACTGACTTCAGCTTTGGCTGTAA:1 + chr2L 518000 5' - 3S18 221 2 74.26 TCCTACGGTTCTTGGCCGTGTTGGTATTGCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCA:1 - chr2R 16041572 5' - hobo 59 1 71.29 GTGCACTTTCGGGTCCCAAGTACAGGCAGGTAGGTATACAAAAATCGGAGGAAGCCAATTAATACTTTCGGAAGCGGACAGTTCTAGAATGGGAGGAAAGT:1 - chr3L 14783888 5' - gypsy12 9976 2 69.31 GGACAAAGAGATAGTTGGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTC:1 + chr2L 10291511 5' + jockey 4783 1 52.48 AAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr3R 15943329 5' + jockey 4676 1 60.40 TGGCAGTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chrX 8977386 5' + jockey 37 1 55.45 ATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 20466704 5' + roo 34 2 61.39 GGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3L 13586747 5' - P-element 2828 1 19.19 GGCCCACCTACTGGATTCGCGGCATGCTGGAAAGTACCAAAAACTTCATCTAAGCCAAGTCAACTTTTTCCCAAAAACCAAAAAAAAAGAAAAAAAATCA:1 - chrX 3573029 5' + gypsy7 5006 1 76.00 GAGTATCCCCGCCCCAAAGAGAAAGACCCCACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTATAAAATATTCCACATTAAGTAATTAATAACTAGA:1 + chr2R 24892868 5' + G5 4696 1 70.33 GACTTGTAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 + chrX 21388509 5' + 1360 35 1 64.36 AGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chrX 20437693 5' - roo 9044 1 58.76 GAAATATACATATAACTTCAAATAACCTTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 10445246 5' + roo 48 2 82.18 AACCAAGTGCCACCCCTCGATAACGCCCCACCCCCCTCCAGAATTTCAGAGACTGCAGTTGTCGATCTAATCAATTGTAAGCATAATGAACATGCCGACTC:1 - chr3L 10435583 5' - Tirant 176 2 77.23 TGGGGGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 + chrX 10621692 5' - hobo 2887 1 73.27 CACGTCCAAGATAGCCTCGTTGTCCGAGGAGCTGTGCATCGGGTGCGGTATTTGCGTCAAGGTGGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3L 8974173 5' + P-element 2 2 73.68 ATTTAAAGGATATATAAGTGCAATATGAATGATATGAACTACTCGCATATTATCTTAGCATTTTATAGGACGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 17368093 5' + roo 8669 2 68.32 AAGTAGCAACTGAATTTCGAGATATTAGTGTTTCAATTTCCATATATTGTTTCCAAAACGATACATATGTATGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:2 - chrX 14043923 5' - opus 499 1 41.58 CTTGATTAGCAGGTTGCAAACGCATTAGTACACTCGTACTATTTGCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:2 + chr2R 22997939 5' - Transpac 296 2 65.35 ATCGTGCCACTTCTGCCATCTGCTTACTGCTGACTCGTGTAAGCGACTTCGCGAGAGGATTTTAGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTC:1 - chr3L 4914756 5' - Doc2-element 4533 1 67.33 CCAATTCCAGACCCCCAATCTCATTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAA:1 + chr3L 18193984 5' - roo 8704 2 80.20 AGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chrX 12294756 5' + blood 7047 2 62.38 ACAAAAAACGCCAGTTTATGTTGATGTGTGCATGCTTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTCGCTTAAGAGAGCGAAATTATTTGCGCTGGTGCTTG:1 - chrX 21264143 5' - G4 39 1 62.89 GAACGGAGACGATGGCGCAAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr2L 6255762 5' - flea 226 2 54.46 AGTTTCCTTTCCTTTTCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCCCATAAAT:1 + chrX 2550488 5' + gypsy8 6 2 64.36 CAACCGATTAATACCGATGTTTTTCACGGCGGCGTTATCTCCTCACCCATAGAAAGTTGTTGTTAAAGCAGTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3L 13994174 5' - P-element 2885 2 75.00 AAACAAAATACGAGAAAACAAGAACAACAAAATTATAATGAAATCGCATGTGTTTTTGTCGTAGTCTCATCATTGAGAATTGTTTTGGTTTTCTTTTCTTT:1 + chrX 578380 5' - mdg3 5103 1 73.27 TGGTAATATCTCTTAGTTGGTTTTATAAGTAAACAACATTGCTCAGAGCAGCTACCTTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAA:1 - chr3L 14601913 5' + jockey 4627 1 61.39 GGAGTAGGATTCAGTGTTTTGCTTCTGTATCTGTAGATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATG:1 - chrX 19460197 5' - 412 222 2 62.11 TGTGCCCCACTTGTGTGTCTGGATGATGATCTGAAGCCATTATTGTCTGCTACTGCTATTGTCTGCTATTTTGATTTTGATTCTGATTCAAATTCAGATTC:1 - chrX 14441259 5' + transib2 2545 1 52.48 TGATAATGAAACAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:1 - chr2L 12074411 5' + Quasimodo 27 2 60.40 CTCTTAGATACTAAGAATTTCCCTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATT:1 - chr3R 31458510 5' - jockey 4937 1 78.22 AGCAGCCGGAGATGTCGATAAGCAGTACGTATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2R 20411937 5' + 297 6617 2 71.29 ACTTATGTACATATGTATTTCAACCGGAAAACAAAATAATGGAATAAACAAAATAAGGGAAACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr3R 25285155 5' + roo 8676 2 66.34 GTTTAGCCGAGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 + chr2L 15333706 5' + P-element 19 1 58.42 GAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGC:1 - chr3L 22324317 5' + jockey 4686 1 53.33 TCTTTGGAATATAAAACAAGTAACAAACGTGAATCACATCTAACGCTGGACGCGAAATAGTTCATTGTGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAA:1 + chr2R 954510 5' - McClintock 6170 2 69.31 CATTTTCTACGCTTCGTTATCATTGACCTGCAATCTTCAATTTAATTACAGTTTTGAGTAAACACATCAGGTTTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAAT:1 + chr2L 12408554 5' - transib3 422 1 64.36 ATTCAGGCGTAGCGGAAAAATCTCTGTCGAAAAATCTAAGAGCTCGAAACCGAGACCGAAACCGAGCCTGAGCCCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTT:1 + chr3L 5254325 5' - 297 6761 2 74.26 ATTGGCTCAGCTGCATTTTTTGTGAAAGTTTTTTTCGGCATTTTTTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 18009554 5' + roo 8690 2 57.43 CATAGTAAAGCGCCTTTTAAGGAAAAATGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTA:1 + chr3R 21617995 5' - Doc 4425 1 73.27 GGGTAATCTCAAGGTCACCCTGGATCTCCTTCTGCACCTGTTTTGTTTTCAGATTTTTTCGTATAATTTGGTTTTTTTGAGAAAAAGTATGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 2092411 5' - I-element 5143 1 65.35 TTTCTAGGGGACAAACTTAAATTTGTACAAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 + chr2L 22966999 5' - 1360 3328 1 71.29 TATGGCGATGACGAAGGCCAACTTGAGTCTTTTGTCCGTCTTCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3R 19989868 5' - pogo 2071 1 57.43 CTTGGAAGTGCAGAAATTCAATGCGTTGGATCGAAAGTATGCAACTTTTAATTCTAACAAGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACA:1 + chr2R 23945232 5' - BS 5074 1 61.39 CTAGAATACTATAAACTTATTGGCTAGGAATAGAAACTAATTTCCTCACTTGCAACTCGGTTACATTGAAGTACTGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2L 19643069 5' + roo 8667 2 65.35 CTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 + chr3R 11165661 5' + Tabor 6884 2 75.82 AAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chr2L 13250427 5' - pogo 2058 1 71.29 TTTTTTTTTTAATATTTGGCTATCACACTAGCCCTCTTCAGTCTCTTTATACGGACAAAGGGACGGAAATGGCCAGATCGACTCGGC:1 + chr4 383714 5' - INE-1 106 1 57.47 ATTCCCATGCCAGTTACTCCTCTTTCTGAGCCTATTATCTTTGATTTGATTTTGATTATGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTTATAATAT:1 - chr3L 6717509 5' - HB 1549 1 65.98 ATGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3R 12894102 5' + blood 7043 2 56.00 ACGATTTGCCCGCGAAAGCGTTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr2R 17394601 5' + jockey 15 1 70.30 CCGAATCGAGAAAAAAAAAACACAAAATGTTCGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTT:1 - chr2L 512611 5' + 3S18 6092 2 68.32 ATGACGCAAAAACGCTACAGATGTACGACATGCAATAAAGTTCATCCGCACACCGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAAG:1 - chr3L 23091964 5' + Doc 4431 1 58.42 GTCAACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGC:1 + chr3R 9254893 5' + F-element 198 1 63.37 AACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:3 - chrX 21401908 5' + roo 50 2 78.22 TGTTTATTGATTGCCAGCGGTAATTGACTGAAATAATTCAGTGTTTTTGTCGCTCGTTCACTGTAGTGCAGTGCCCGAGTCCGAAGTGTTTTCAAAGAAAA:1 - chr2R 10759823 5' - gypsy10 444 1 59.41 CATCCNCTGGGCACATTATCCAAAACACTTTCCACCTTCTTGGCGACACTTCGACACCAGCTGCGACAGTCTACGATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2L 5640870 5' - accord 186 2 57.00 AGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 1626526 5' - roo 9047 1 53.47 GGAAATGCACACTTTTCTCAAGGGAATTTGTGTAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAA:1 - chr3L 10450630 5' + X-element 58 1 68.32 ATGCTGCCGGCCAACTTCACAAAAACAAAAAAAAAAATAAAAACTTT:1 - chr3R 27334022 5' + HMS-Beagle2 491 1 61.70 ACTGATTTTTTGGCACCCGGTTCATAAACATAGGAATCAATAGCCGAGTCGATCTACCCATGTCCGTCTGTCCGTCGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAG:1 - chr3R 8676940 5' + INE-1 136 1 78.22 CTGTAAAAATATACAGCATTTGATGACTGCGGGGGGGTGGCTAGGTGGCTGCTGGCTCGCTGGCTAGCTATACATTTCGTTTTATTTTGTAGATCGGAAGA:1 - chr3R 22876268 5' - HMS-Beagle2 7170 2 64.36 ATTTAAAATAACTCTATTAACAAGAATCCACAGAACCCTTTAATACTGACACTAATATGATTAATTCAGACTCGGCTTATGATCCTGATCAAGAATAAATA:1 + chr3R 5946689 5' - INE-1 81 1 66.34 TTTTAAACAAGTACGTATTAAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 12136357 5' - roo 9056 1 63.37 AATTANACGCTAAATTTTACAAGTGCAAAATTTTCTTATAATAATTTATCAAAAAAATAAAAATAAATTTAAAAACATTAATGATAAAACAAAATTTCACG:1 + chr3R 11329741 5' + looper1 1832 1 72.28 TACCCTTGCAAGGAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr2R 12779172 5' + roo 8684 2 62.38 AGCATAAAATATGCTAATTTATTGCTGTTGATTTTAATAACTTTTGCCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:2 + chrX 13350742 5' + jockey 4770 1 65.35 TTCAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr2L 19679787 5' + Doc 34 1 54.46 TATAATATTTGTTAAAACTCAATATTGTCATTGACAACAAGTTATTCAACTTGTCCGTTCGAGGTACTGTGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr4 299935 5' - 412 490 2 73.27 AAAAAAAAGTGTGTCACTTTACCACATGGTATCTTCAATAATGATCCCTAACTGTTCAGAGACTTCACTTTACTTCAATACTTTACTTTACTTTATTTAAT:1 + chr2L 3507556 5' - TART-A 13105 1 77.23 ATTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr3R 14094999 5' + Doc 31 1 56.44 AATAGAGTATAGTGCAGGGGAAGGATGGGAAAAAATAGGGGAGAAATATAGTAAGTAGGTGGATGTTTGGCCCAACGTTTCTATTAGCAATGCAAAGCTAT:1 + chrX 6670175 5' - Helitron 455 1 73.27 CTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAA:1 + chr2L 7170384 5' + jockey 4640 1 60.40 GCCACAAAAGAGCTTGCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCACGTATGCAAAAGT:1 + chr3L 5964241 5' + BS 25 1 48.51 CGGTGCTACCGGATCCGTGACGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2R 9426419 5' + P-element 9 2 72.28 GCAGGCTGCCTCATCATGGCCCTTTCCGCCCATTTAACGGTGGCATAAACACTAGAGACTTTCGCTTTATTTTTGGAAAGCGCTGCGGTTCAGCACATTGG:1 - chr3L 14288174 5' - X-element 387 1 58.42 CTTTTGCATATTCCTATAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 15638215 5' + roo 8685 2 56.44 TTGTGATTATTTGTCAATCCTATAATAAACTTGATACTTGATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAAT:1 - chr3L 22987111 5' + S-element 1673 1 59.41 GGCAGACAATTAACAATCGCGCACTGTTGTTGTATTTGTCACTCTACACATACGACTCAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCT:1 - chr3R 7167677 5' + 1360 333 1 60.40 AGTGACACTGTTTAATTGATTGCCTCTCAACTAAACTAGCTGGAAAAACTAATAAAGATTTATGTAGTTTTAAATTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 17288306 5' - gypsy7 5017 1 63.04 TCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chrX 12294760 5' + blood 7043 2 58.42 AAAAATCTACGCATCGATGACATGGTCGTCATCAAGGACGACAACTTGCCCTCTAATGAGTGGCGGCTACATTAGCGTCTCTGCTCGCTGCTTT:1 + chr2R 92948 5' - G-element 466 1 72.34 ACATTTCGCCTTACTTCATTAACTCCACCTTTGCTCCCTTGGAGGTATTAATGAAGTAAGGCGAAATGTAACCACGGTAGCAATTCGAGTACTT:1 + chr2L 5669616 5' - R1A1-element 5165 1 57.45 GTTTTGCACTCAAGTACTTTATGCACTCAGTGCCTCTCTGGGTTAAAAGCTAAAGTGTAATATAATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGC:2 + chr3L 8924557 5' - Stalker2 7626 2 58.42 AAAGGGTGAGTCTTGACTATACGGATCACCTTAAATTCTCCATGATTAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAA:1 + chr3R 10050375 5' + I-element 5032 1 53.47 ACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 + chr3L 27415238 5' - transib2 2801 1 59.52 CGCGTCTCTGGTGGATTCCCTTGAACTCGCCCACGGTGGCTGATCTCTCGATGGGTTTACTGGGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATGGATTCA:1 + chr2R 10839941 5' + BS 5064 1 67.33 TCTTATGGCCAAAATGTCACACTTTTCCTCCCTTTTTGCCAGTTTTACCCCCGCAAACCCTTCTCTCAAGCTTAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAA:1 + chr2L 4024946 5' + INE-1 555 1 64.00 CTTCTCCTGCTTCGGCACCCTCCTCATGTGGACGGTGGTGGTGGTCGTGAACCTTAAGCTCTGGCTCGAGTCAATGTATCTGATAGTCGGGAAAGTCGACT:1 + chrX 16413859 5' + INE-1 562 1 81.19 CCAGCGAGTGGCAGGGGACTTGGGGAGGGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr2L 11686082 5' + hopper 8 2 56.63 GGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr3R 7388344 5' + HMS-Beagle 35 2 61.39 AAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chrX 329077 5' - opus 466 2 60.40 GCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGA:1 + chr2L 18159043 5' + INE-1 162 1 41.58 CAGCACAAGTAAAAGATCTGCGAACCGAATGCGATTAGATAGTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr3R 24152853 5' - P-element 2865 1 57.43 AGGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 13347340 5' + roo 8712 2 74.26 TGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr2L 19679782 5' + Doc 39 1 49.50 GGATTCTCCAATGTTCGAAAGAACGCCGATTTTACCTAAAAGCTGCGAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2R 9426513 5' + P-element 27 1 52.48 TGCCACAAGGCGCTCATTTTTGCCAGAATTCCAGCTTTTCAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATAT:1 + chr2R 16491374 5' - P-element 2729 1 42.57 AATCGATAGTTCTATCGGAGCCTCCGCAGCCCTGACTCGGCCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr2R 24965130 5' + P-element 33 1 46.53 AACGTTATAAACTGCAGCCGTACTTTAATTATCCTGCCACGCCCCATTCCCGCCCACAAGCACCCTATGCGAAAAGCATCGTTGATGATTATTGATGGCTC:1 + chr2L 9393111 5' - Penelope 187 1 65.35 TTTTTATGTACACGAGCGGCAGCTGATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTT:1 + chr2L 11551351 5' - Max-element 8494 2 70.79 GCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 - chrX 21668937 5' - pogo 2058 1 70.30 AATAAGCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 11435576 5' - roo 9044 1 54.46 TCTACTACTTAGTTTCTATTTCGGGCTGATTCATTCTCGTCTGATTCTGATTTTGATTCCTATTACGTTCTCCGTTTTTTTTTTGTTTTTTATTATTT:1 - chr3L 1394008 5' - BS 5098 2 61.22 TCTGTATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 19215797 5' + roo 8699 2 60.40 CTTATCTCTTTGTGCATTCCGTTGACACTTCACCTATTAGGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTT:1 - chrX 3277913 5' - gypsy7 5008 2 64.06 TAGCAAAATTGATTGGCGTACTACTGTCCACAAATTTAAAAATTCCAATATATATATTTTTTTTTTAATTTTTCTT:1 - chrX 17067518 5' - Doc 4694 1 65.79 GTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAG:1 + chrX 21087575 5' + mdg3 5272 2 57.43 TAATAAATGGCATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr2R 14381369 5' + hobo 11 1 67.33 ATACAAGTAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 14910628 5' - roo 9028 1 71.29 AGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:2 + chr2L 108003 5' - P-element 2848 1 40.59 CGTCTTCCTGCTAGAAAGTGCAACCCAATTCGCGTGCCCCCTCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGATCTTCTTAGC:1 + chr3R 11595387 5' + I-element 5102 1 60.40 CCTTGGGATGAAGGTCAAAGATGGGCGGCGGCGGGGCTGTGCACTCCAGGTACTCTGTAACTGGAAAAGCGAAATCAATTGAAATTATTATTAAAAATCGA:1 - chr3R 9782578 5' + invader2 439 1 70.30 CGGTATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAG:1 + chr2R 10673403 5' - Tirant 350 2 74.26 CATTTGGATTTGGATTTTGGGCAACGCACTCACCTGAAGAGCCGCCAACTGGGGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTTCG:1 + chrX 9307302 5' - F-element 4431 1 57.43 AATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCCGAGGGTCAG:1 - chr2R 5924401 5' - jockey 4722 1 48.48 TTCTATATACCAAAGTCTGGGAAAACTTTAAGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACA:1 - chr2L 111614 5' - P-element 282 1 34.65 AAAGAAAAGTATTCTAAAACTAAAAAATTAGATAGACGAAAATTAATTTTTGAGAAATAGGCTAAAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGC:1 - chr2L 6906147 5' + Porto1 4299 1 68.32 AGAGAAACAAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 18503574 5' - roo 404 1 57.45 GATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGC:1 + chr2L 4189380 5' + 1360 42 1 66.34 TTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 20466707 5' + roo 31 2 58.42 CCCATNAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chrX 18193728 5' - hopper 1380 1 62.38 GGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr3R 25818820 5' - mdg1 389 2 58.42 TTTCTTGATAATATTCGAGGGTCGGGTAATGTTTACATTTTGTGCATTTGTGTTTCGTGTATTTTGTATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAA:1 - chr3R 24283045 5' - Max-element 449 1 66.34 CATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 7360365 5' + jockey 33 1 54.00 CCGCAGTTAGGGTATATTGGACGAAAGAATAATGCGGAATAATGATGATTTTATCAAAGACACTAGAATAGGTGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 + chr3R 8811601 5' - 1360 3359 1 79.21 CCTTTAGTCTGGCCACCAATTCGTTGTGTGTAACTGTGTGTAGTCTAGTCGTAGTTATTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTGGTAGCAGTTGCGATGC:1 - chr2R 10327477 5' + diver2 4606 2 57.43 GTTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCT:1 + chr2R 6779757 5' - 17.6 7401 2 60.40 TTAGTTTTTTCTCGTTGCATTCCCCTGCAGGGTTGTGTTCCTCAGGTACCATTCGGTAATCATCCTGGCGATTTTGTACTGGGCAGCCTGAATGCGACGA:1 - chr2R 3206244 5' - 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roo 351 2 83.17 ATCTGCTCACATTGAGAACATCAAATAGTACGCATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:2 + chrX 16517316 5' + hobo 39 1 67.33 AATCTNATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr3L 19951177 5' + Ivk 9 1 69.31 TTATTTACCAAACGGCATGCCCCGCCACCGGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chr3R 25818791 5' - mdg1 418 2 74.26 TTTCATAAACATATTAGTTTCTTGTGTCCTTTAGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 8542898 5' - P-element 2844 1 36.63 ATTTAGAAAACTGTTAAAGCTAGATGGCCAATAATATTTTTAACAATTTTTAATTTTATTCTCATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATGCCAGAAAAAT:1 - chrX 21030156 5' + INE-1 501 1 71.29 GGTTGGTGGCATTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chrX 8977380 5' + jockey 31 1 54.46 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAA:2 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 4890 1 54.46 AAGGCGAGGAAGTGAATTTGTCACCAAGATAATGGTTACTTGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATC:1 - 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Chimpo 4165 1 63.00 AAATGTGCACGCAAATGAGCGCAGTTCGCTCGTCATCAAGAGCTGCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chr3R 29384355 5' + jockey 4792 1 54.46 TTGCCAGTTTGCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 3671276 5' - roo 388 2 59.41 ATCTTTATTGATCAAAGGACTTTCTTTACTAATAGTTTCAATTAATTTTGGTCAAGTTAAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTTATTGAA:1 + chr4 510488 5' + HB 1423 1 56.44 AAATAACAACAATTTTTTTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCG:1 + chrX 15944804 5' + invader4 3081 2 63.37 GCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr3R 7388409 5' - HMS-Beagle 215 2 59.18 GTTCGGTTGCCCATTTTATTGTATTTCTTTCTGCTTGCAGCGCTTTATTTATTTAGTATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGA:1 - chr3R 6517398 5' - Juan 3851 1 69.31 GGGCAACAAAAGTCGAAAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 + chrX 4488862 5' - 412 467 2 54.46 AAAGGATACATCTACGGTGCACCTCACCAGCCTCAACCACCTCATTCCCTTTTAGCCATAACTTTAGACAACGCCTCAAGATCGCTTACAGGAGGCAAAAA:1 - chr2R 19063863 5' + G3 126 1 76.24 TGCTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAT:1 - chrX 21668145 5' + Stalker2 21 2 58.42 GTGGGCCTAAGTCAACAACAAAGAAGCGAAGCCTCAATGCCCTGGACGGCGCCTTTTGTTATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTT:2 - chr2L 21007100 5' + Idefix 7 2 72.28 GAGTACCGAGAACGCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 107971 5' + P-element 6 2 73.00 CAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAACATGTCATCTT:1 - chrX 11533973 5' + invader6 4535 2 67.33 TATGAGTAATCAAGGAAAAGCAAGCACGGCGCAAAAATTAGATTTAGAACTTTGTCAGTTGAGATAGACCCAGTCCTGTATATATTTGTATATGTATATTT:1 - chrX 10867615 5' - Stalker 89 4 67.33 ATAGGTAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr3R 12894110 5' + blood 7052 2 64.36 ACTTCTTTCATTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2L 903830 5' + 1360 50 1 76.24 AAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCC:1 - chr3L 2292139 5' - Max-element 8493 2 64.36 TGATANGCCCACAATATTTTTAGTTTCTCCCACTCAGTTTTAGTAATCCCACTCAGTAATGGGTATCTGACAGTCGAGGACTCGACTACAGCGTTCTCTCT:1 - chr2L 13558509 5' + INE-1 576 1 74.26 GACATNTGTTGCAACCGCCAGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr3R 29660236 5' - mdg1 390 2 59.18 TTTGATCCGATTCGATTGCAGCTAATTCGTTTACAGCCCGGCCTACAAGGTTGTGTGTGTGTGGCTGTTGGTTATCAGAAATTATTTTAAGTTCCAATTAA:1 + chr2L 20259627 5' - Bari2 187 1 75.25 ATCCGACGATGTTGCCGCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3R 11993271 5' - P-element 2876 1 68.00 TTAATGACAACGCTGTATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 + chr2L 13447089 5' - HMS-Beagle 231 2 64.36 TTTTGTTATTAACTTGTTACACTTTTAAGTATTTAAGTACTCAATGCGCTGCATTTTTAAATTGTTCGCTGTGTAGTATGTGCATATATCG:1 - chrX 8352264 5' + blood 7010 1 67.03 ATTCGAAACCATCTGCCCAAAGATATGCATTTATGAAATTTGTCTGGATATTTATATTCCCTTTGCCCTCTTTTCCTTTACCATTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 3974783 5' + hopper 140 1 56.44 GAGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 15333714 5' + P-element 27 1 50.50 AATGTCCACCGGTGCTAATGTGATGAATCCTCGGCGGCACTGGAGGTAAAAAAGAATGAAAACACATTAGAAATGGCCA:1 + chr3R 27789074 5' + 1360 328 1 75.95 CAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3R 9837578 5' - 412 7511 2 62.38 GCATCCGGTCATGCATGAGCTTTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATAAAATAAAGAGCCATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCT:1 + chr3L 26481589 5' + gypsy3 170 2 79.21 ATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCG:1 + chr3R 9254902 5' + F-element 207 1 54.46 TGGCCAGAAAGAACGGTATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chr2R 10673390 5' - Tirant 363 2 61.39 ATATTGATTGTATACAATCAATATCCCAAGCGAGATCTCCCGCTTGGGATATTGATTGTATACAATGATTGAATGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTA:1 - chr3L 25008254 5' - Tc1-2 1426 1 68.32 AACGAAGGATGAATGTTAGAAGTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr2L 4189453 5' - 1360 3373 1 63.37 ACCGAAAACTCCAGTCGGCCAGATACAGATATAGATATAGATACATACCGATCAGTTGACAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCT:1 + chrX 4610223 5' + F-element 4440 1 61.39 CCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTG:3 - chr3L 21841333 5' + P-element 61 1 20.79 TGTAGGCAGGTGCTCACACTAGACTTACACTTCCAAATAATACCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 - chr2L 514922 5' - 3S18 6070 2 57.43 AAATGTTGCGAACGAAGGATGAATGTTAGAAGTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr2L 4189463 5' + 1360 5 2 74.00 CTTTATTTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGC:1 + chr2R 9375158 5' - HMS-Beagle 227 2 63.37 GGCCCCATTACTATCTGTACAACTCACTTAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAA:2 - chr3R 27080818 5' + HMS-Beagle 6803 2 72.28 GGCCGGCTGTTTCGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chrX 8243289 5' - P-element 2828 1 20.79 CTGCTTAGGAACACATGAACCCTTATATTTGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chr2L 18028652 5' + flea 4765 1 70.30 TTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTC:1 + chr3R 9254922 5' + F-element 227 1 58.42 GCTGCCCTTGCGTGTGGCCTCCTGGAATTCGCCAAATTGATTCTCTTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAGCACTAACATATTCTTTAA:1 - chr3L 22239272 5' + 17.6 7210 2 58.42 GGAAAATTCGCCAGAAATTCAAAAGAAGCGAGTGCATAGAATAATTGAAATTTTCAATGCTGCAACTTGAGGATGGTGTAGTATATACGAACATAATAACA:1 - chr3R 9479540 5' + mdg1 7042 2 73.27 CCCAACGAATGGGCCAGAAACTCTATTTACCCAGAACGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCT:1 + chr2L 8884430 5' + R1A1-element 4969 1 64.36 AAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCT:1 + chr2L 19364080 5' + BS 4784 1 47.52 ACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTT:1 + chr2L 18112481 5' - transib2 2819 1 72.28 GAATGCAAAAGGCCAGAAAAAGATGCTCGGAGTTGAGGGTAAGCGTTCCAAAAAGGATAATTTCTAAAAACCTAAATACTGACTCGGCTGATGTTTCTCCG:1 + chrX 14635766 5' + gypsy12 9837 2 61.39 GTAGCAACATTAATTACTAAGCTGAATTACAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAAGGA:1 + chr3L 19938425 5' - pogo 2028 1 49.50 CGATCGACATTTAACGAGCAGTTGCACAACACACAAGGAGGTCGCCCTAATACACTCAACCGACTTTCCCCCACTCTGCATCCAACACACACACATACACA:1 + chr4 661287 5' + accord 7099 2 77.23 GACCATGCAGAGCCCTTTCCAGGCTCGGGAACAGCTCATCGGAGCGAGTGGCCAGCGGGGCTAAATTAAAGCGATTCCGAAATGCACGCTGCGTTTTAAGA:1 - chr3R 18020572 5' - mariner2 199 1 58.42 CTGTTTAAGTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 - chr2R 22605986 5' + Juan 4055 1 53.00 AGAATAAAGTTAACCGAAAAAAATCGCATATCTGCGTATGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGAACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr3R 15998140 5' - pogo 2069 1 59.60 AAGCGTTTGACCTACAGAGAAAGAAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 6024620 5' - roo 394 1 65.35 ACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATAGTGCTCCGCACAAA:1 + chrX 21396686 5' + F-element 39 1 65.79 TTCATATTCTCATCCGGTTCGGTATGAAAAGCCTTCAGTTACCATCGCAAGGCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCA:1 + chr3L 1390058 5' + flea 145 1 57.43 CAAGTGTTGATAACGAATAAGGTCACTTGGCGCCACTGATAAAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3R 19467872 5' + Transpac 4949 2 59.41 CGGCGAAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr3L 19349919 5' + 1360 4 2 71.29 GTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2L 19642977 5' - roo 9034 1 62.38 TAGATAGTCCGTATGAAAATCGTCCGAATAATAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATAT:1 + chr3R 4065768 5' + accord 6926 2 68.32 TTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3L 20248301 5' - Transpac 279 2 60.40 GAATCGTCTAAATGGGGGGAATGTAACTGCTACTCAAGTGACTGAAGGAAGTTCTCGCCCAAATAGGGTCGGCCGAGGGCGGCCTTAATCTTGGGGAGGGA:1 + chr3L 1022134 5' + springer 7114 1 56.44 TAACACAAGAAATATCTGATTTTAAGCAAAACATAAATAGAGATATTTGAGTAGAGTAAAAGGCCATGTTGTTAGAAACATAAGTAATATTAAATGCCGTG:1 + chr3R 3695976 5' + G4 470 1 62.38 ATGTGTGTGTTTCACTTAAAATAAATGTTACTCTTTAATCATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr2R 22993705 5' + opus 145 4 72.28 AATTGTGGTAAGAAATTCAAAGCTGATGAGCCAATTTCTGGCATTTATGTTAAAACCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCAAATTTTTGAAATT:1 - chr2R 12886298 5' + FB 22 1 58.42 TCGTGACATTGCCATCGCCACAAAGAAAAAAAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 16262762 5' - hopper 148 108 62.79 AGGGTGTCGGGTAGGATTCTGATTAGCTAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTA:1 - chr2R 15469506 5' + 1360 3379 2 73.27 TATATATTCGATTCGGTGTTCCTGCTAATCCACAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTTCGTTTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTG:1 - chrX 17203159 5' - 1360 3181 1 70.30 TGATAATCGCGTGCACACCCGCGCACTATGGGAAATTTACCCCCTTTTTTTTTGCCAAAACCCATTTTATGAAAGTCGGTCGATTAAGATAATATTAAATG:1 + chrX 2082629 5' - Transib-N1_DM 438 1 91.09 CACAGGGTAGAGATGGGTTCGAGATGAAAGGCAATTTGGTAACTCCCGCGAGTGCCAAATCATCCACCCGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAAC:1 - chr2R 3877675 5' + Doc3-element 356 1 73.27 ATTACCATAACTTGAAAGCCTCAGAAGGTAGAAGATTTATTTTCAATACAAATTCCTAACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTC:1 - chr2R 8735218 5' - P-element 267 1 58.42 ATAGTTGAATTATTTGGTTACAATTGATACAAAAAGCGGTAATTTCTAAAGTTAAGTTGGGAGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr2R 9364110 5' + Doc 18 1 56.44 CCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 17122432 5' - roo 9023 2 75.76 TGGCACTTGGATCATTAATATGCGGAAGGGGGCACAAAACACTCCCCACGCCACCACCCACACATATATAAACACACACACACACACA:1 + chr3R 26263442 5' + accord 180 2 85.23 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACACTGAATTAGGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCGCCCCC:1 - chr3L 4132693 5' - gypsy 7341 2 56.44 GGAGCACGCTCTTAAATTGCAGAACTCTCTGATACAGTTCAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2L 6252505 5' - P-element 2851 1 43.56 GTAGCAATAGAGGAGTGCAAATTGTTCGACTCGGTAGGCGATTAAGTTTTATTTATTTTACTGTGCTATGACACAGCGGTTTTTCCATTTGTTTCGCTTTT:1 - chr3L 13480764 5' - Fw2 3709 1 68.32 GAAAATAAATGTAAATCAACTCGCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATC:1 + chr3R 10830415 5' + jockey 481 1 72.29 GCAAAAAGTGTAAGATAATATGGGATTTTTGTGTATAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTG:1 - chrX 12729582 5' - gypsy10 299 2 73.27 TGTTGGTTGGTTTGGAAATGGAAAAACTAAAGATATGACCTACCTCTATAGGAAGTGCGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATA:1 - chr2R 12163943 5' + Doc 4475 1 56.44 AACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr2R 9014496 5' + blood 7031 2 59.41 ACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTAT:1 - chr3R 17615191 5' - Tc3 309 1 72.00 GATAGTTTTTATAATGAATATTTTATTAGTTTTTACTATTAGTCTTACTACATATCTTTGCTTAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 + chr3R 19967579 5' - pogo 2097 1 73.12 AGCTCCGACCCCCCGACGCCCTTCGAGCTCCAAAAACTCAGATTTTCCCACGCATATATATATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGT:1 + chr3R 30325190 5' - 17.6 483 2 71.29 GCAAATAAAATCAAGCTGAATAACACAGAAGAGTCAATCAATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATT:1 - chr2L 18028762 5' - flea 240 2 68.32 AAAAATACAGAAATGAATATATATCTGTATAGATAAACACGGGGAAATGGAAAACCAAACCAAACCAAATCAGATCAAAGACCCTTCTACCTGCGCCCCAC:1 - chrX 17474921 5' + Helena 453 1 79.21 AAGTTGTTCGCCGGAAACGTGCGGGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGA:1 - chr2R 1185089 5' - Doc 4610 1 76.24 ATTCTCGCATGTTTATTATTTATAATAAATATTTCTTGTCAATCTCTCGACCGACGCCCACCCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACC:1 - chr2R 5849772 5' + jockey 459 1 65.35 ACAAGAGTTGGGCGGGCCGAGCGCAACAATGACAATGTGGCACACGCCAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCC:1 - chr3R 23615817 5' + invader4 2980 2 72.28 TCGGCTGTGCATTCAAAGCAGTTGGATCTTCTGGCGTTAGGTGATTTTGTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 - chr2L 23188808 5' + 1360 75 1 58.42 ACTTACGTTATAGGGGCATGAATGATTCATGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:2 + chr3R 12894074 5' + blood 5 2 70.30 AGCTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 17957292 5' - opus 459 2 70.30 GTAGAATAAAATATCTTACTAACCGTACTCACTTACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:2 - chr3R 19914400 5' + jockey 4803 1 65.35 ATTTGCTATAAAAAAAAGTATTAAGAGGCGATGTTTTTTTACAATAAAATTTATTCAATTCTCGAGGGAATTAAAAAATATTAAAAAAATTGAAACAATTT:1 + chr3L 9758350 5' + HB 322 1 44.55 TGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2R 18503549 5' - roo 9036 1 62.00 GGCCCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr2L 11047956 5' - Juan 4203 1 65.35 ATATGAATCTGCAGTGACAGTTTGATTTCCATCCGTTATTTGCCCCCCCTCAAAAATGTATTTTCTCTCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr3R 19191572 5' + Doc 11 1 67.33 AAGTTTTCGAAATGCTGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:2 - chr3R 13715166 5' - P-element 2873 1 65.35 ATGGCAGTGGAGACGATGAAGAATCACCGCATTGAAAGTGCCCCACCAAGAAGGCTCCACAAGAGACAGCCGAAGGACCTCATCATACGGTCCCCCTTGAC:1 - chr2L 6187371 5' + BS3 1584 1 57.43 ACTTTTTGTCATAGATGGGTAAAAAGATGCCTGGAGAAATTATCAATTGGTTATTTTTCCTATCGCTCAAGGCTTTTAAACCCATATGGACCTATGGCTCC:1 + chr2R 5112314 5' + Doc3-element 4314 1 78.22 GACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 - chr2R 5084060 5' + F-element 57 1 74.00 CAATTAAAAATTTCCACCTTGCCATATTCTCAGTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAA:1 + chrX 18157232 5' - R1A1-element 15 1 67.33 AAAGCATTAACTATGATTGATCAAATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 + chr3R 23665275 5' - 297 6928 2 80.20 GCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 19642959 5' - roo 389 2 58.42 CGTCATGGATTGTTTGGACATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr3R 22620172 5' + 297 8 2 72.28 CTGCTCTCTTGTTGGATAAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 - chr2R 20444520 5' + Doc2-element 228 1 68.57 TTCGCAGCTCGGCTGGGTACGTATGTATATTAATTCCGGTGCAGCAGGAGCAAAAGCCTGCAGGTGTCCGTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr3R 25823618 5' + hopper 3 2 72.28 TAGAATATTCTAGTGTCTTTGGTTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2R 18405806 5' - roo 385 2 56.44 ATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr3R 12894121 5' + blood 7063 2 75.25 TTCCTCGAACGCACTTAGGCACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGACATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGC:1 + chr4 1167748 5' - 1360 3333 1 80.20 CCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2R 9014464 5' + blood 7060 2 74.49 GGATTTAAAGTACTACGAATATATTAACTTCATCTTATTTGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTT:1 - chr3R 22530841 5' + Juan 3987 1 60.40 GTGGCCACCCAAACCAGAAGCTTTTGGCCAGCCACTTTTACTTTCCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCG:1 + chr3R 11371200 5' + flea 425 1 55.21 ATTCAAATCAAACAGTTTCCAAAGATGCCGCCATCGGTTGAACTCAAATTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr3L 12085237 5' + pogo 23 1 54.00 AAAGAATATAATATGTTATATATAATTCTTTTGTAATATGAACACAATCAACAACAATCAGTAGTTTTTACTTAAGCATTATTTAGTATTTCG:1 + chr3L 5356481 5' - Tc3 1434 1 37.63 AGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 + chrX 6997196 5' + P-element 58 1 21.78 GGTCAAAATTGGGATTTGCGACCAAAGAATAATCAGCTTACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCG:1 - chr3R 4543277 5' + 3S18 5774 2 70.30 CACATCTTTGTGCTTAGCTCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chrX 14531562 5' + 412 30 2 59.41 AAAATGTCGATAGGCGGGAGAAGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTT:2 + chr2R 10863876 5' + mdg3 5264 1 64.36 GAAAGTTGTTGTTAAAGCAGTCGGACCATGATGAAATACCATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 13994225 5' - P-element 2880 2 44.44 CGGTACATTTTGGAAAGTATTTAAAGTTTTTATTATTTTACACATCATAAGGACAGACGGACATGGCCATCTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:1 + chr2R 25182874 5' - INE-1 86 1 52.48 ACAAAAGGCAGCAAACAACGCAGACGGAATGTTTCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTAGGTG:1 - chrX 3655092 5' - accord 7099 2 75.25 GGCTGCCAAAAAATATCTCTGGCCATCTATCTTTGGTTTTGTAAATGCTCTCGCCACCTATTCAAGCTTTACTCTAAGTCGCCTAAAACTTCGTCTTCTTC:1 - chr3L 4009113 5' - gypsy7 491 1 70.30 AAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chrX 21401913 5' + roo 45 2 73.27 TGTTATAATGTAATGGCTAAGACAAGAATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTA:2 - chr3R 6431094 5' + 3S18 5796 2 54.46 ACTTTCTGCATCTATTTATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 19192526 5' - roo 9045 1 56.44 AATGCCTTCTTAAATGACATCTATATTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTAT:1 - chr2R 617214 5' - diver 6060 2 75.25 TAGCGAATCTAATAGCAACAATATTCATAAGTTCCAAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAG:1 + chr3R 28099379 5' - Cr1a 356 1 64.36 TGCTGAATTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGAATATTTGTATTTAGCCTACCGTGATTAATATCAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3R 19448960 5' + roo 85 2 36.63 ATGTGATTTTTTTTCAGCCTTTTCGTTTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTT:1 - chr2L 8908556 5' - 412 274 2 74.26 AACAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 + chr2R 14381281 5' - hobo 2902 1 65.35 AAAATATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCT:1 - chr3L 14603327 5' - jockey 4949 1 65.35 GACTTAGCGCCTTTTCTGCCAGCCTCGATTTGGCTCAAAAAAATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGCTTGCCA:1 + chrX 11165500 5' - flea 4559 1 58.42 GTTGTCCAACATCTTTGGGCCCCGCCTTTGTTTGCCGGCGTGCGAGAGACTTAACACGGCTATCTAGCCGAATCTTCGTCGTAACGATATGCCAACCCAAC:1 - chrX 2441235 5' + Fw2 3809 1 58.42 AAATACATAATCGCAGTATGTATGTAGTTATATATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAG:1 + chr2L 4189344 5' - 1360 3384 2 75.00 GACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCTCGTTGGAGGTATAAATTCTGAATGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAG:1 + chr2L 108069 5' + P-element 366 1 55.45 GGGCGNTAAGGTAGTATTTGGTGAAGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr2R 3188767 5' - 1360 3377 1 39.60 AAAACGAACTATTTGTACAATTGCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chrX 18012651 5' - roo 405 1 73.27 CGTTCATTCATGTTATTAAATTTGAAAATAAATATATCGAAAAAATTGTTAACTTAATTTTTTGTTTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 + chr2R 16744096 5' - opus 7496 2 62.38 TCTAGATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCT:1 + chr2R 18295594 5' + I-element 17 1 60.40 CGATGGTTTGGGTGGCTCCGGGTGGTTTGAATAACAAGGGGATTCCCCATGCCGCACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTT:1 + chr3L 9803284 5' - Gypsy6A_LTR 102 1 56.44 ACTCGCTACTTCCTGATTACTTATTCATTTGCCACGCTTTTAGCGCTGACTGTGTTATGTCTTGCCCTCTGATTTTGTTTACTAGCTCCTATAT:1 + chr3L 15277820 5' + Gypsy12A_LTR 2080 1 76.60 ATTTGACATCTAGTGGCATTATATCAGCTGGTAGATCTACAATGATTTAGGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAG:1 + chr3R 20407661 5' - Cr1a 4097 1 67.33 AATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3R 10741084 5' - 1360 3368 1 59.41 TATTTTTCACTTATACATATAATAAATATTAATTTTCATATGTATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chrX 13127661 5' + HMS-Beagle 34 2 64.36 TATTTTATTTGAGTGGGGGATCGGGGGTGTCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2L 2920665 5' + hobo 46 1 69.31 CCCAANATGACAACGAGACATGCGAGCAAATGAAATCAAATCAAACCAAATGACTTGGCCGGCTCCTTCGACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCA:1 + chrX 17411197 5' + Doc 287 1 71.29 GCAGAATGCTAAAATTTGAGATAACAAATTAGAAAATAAATTTAAGTTATATTGTTATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGA:1 - chr2L 1129158 5' - HMS-Beagle 231 2 63.37 AGAAATAGAATACAATCAGTGATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGAT:1 + chrX 17204086 5' - Tabor 7289 2 56.44 TATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTC:3 + chr3L 19951182 5' + Ivk 14 1 65.35 GGGAGAGAGAGTTTGCGAAACAAGTGCATTTCTGCATGAGTGCATGTGTGCGGGGGGTAATTTTCGAGAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAAAC:1 - chr3L 10666524 5' + I-element 5178 1 68.32 AGCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr2L 14260726 5' + 297 21 2 59.41 TGGGCNTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAGATGGGTAGAATCTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTCCC:1 - chr3L 19271024 5' - INE-1 157 1 73.27 CGTTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr2R 17394619 5' + jockey 33 1 52.48 TGGACCGACAAATGTCCTGTGCCTGCCATCCCATGGCATCCTCTGCCATCCCATGCAATCCCATTCCGTGCCCATTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGC:1 - chr2L 4298841 5' - F-element 480 1 82.18 AGGGCAACGATTTGTTAGATTTTCGAGAGATCCGTCTTGATCCCCAGCTTGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGT:1 - chrX 6530662 5' + Max-element 8353 1 54.46 TCACACATATGTCCGTAACATATATCCCCTTGCTGTAAACATAGGAAGTGGACGACGGAGTGCAAAGGAGTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTG:1 + chr3L 9118658 5' + transib2 455 1 39.60 CACAGNAATCTCAGTTATATTGACTCAAGTGCCGTTTTAGACACTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTGCGAGGGTCTTTAAACGGTG:1 + chrX 4672586 5' + Stalker 462 1 57.43 TTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chr2R 4788802 5' - 297 364 2 66.00 TACCAGTTGCTACTTTGCCAGTTTGCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 3671262 5' - roo 402 1 73.27 AAAGGTTCCACGGGTATAGTGAATCAGTTCAAGCAGAAGGGCAATCAGTTCACTGTGCACATAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAGAAA:1 - chr2L 10840964 5' - Cr1a 366 1 54.46 GAATAATCGAATTTTCTTTGGTTGTGTTTTGATTTGACAAAGAATGTATGTGTATGAATGTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 + chr2R 5784301 5' + 297 11 2 68.32 TATTAATGGGGGAGGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 21978186 5' + roo 9 2 70.30 GAACGCAAAGGTTCCTATTGACTGCAGAATAGGTACACTTTCTTGTCTGGTTCTTAACCGTTTGGTTATCGTTTTTCACCTATCGTATCTCTGTCTACAGT:1 - chr2R 21661234 5' + Circe 94 1 69.31 AGAAGAATTTTGAAAAAATTACAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr2R 24965052 5' - P-element 2875 1 65.96 AGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGAC:1 - chr3R 14049412 5' - transib2 2788 1 61.39 ACATGCAGTAACAAGTACAACAATAACAGGAAAGGTACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr2R 9277522 5' + roo 8704 2 65.35 AGAAATTGTTTGTTTTCATAAAACTGCTTCCATGCATGTATACTGATAGTGGATAAATACAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAA:1 + chr2R 7540542 5' - Stalker4 392 1 76.24 GAACATCGGCGCAAAATTGGCTCAGCTGCATTTTTTGTGAAAGTTTTTTTCGGCATTTTCTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3L 18009539 5' + roo 11 2 68.32 TGGAGNGTGTATTATTATATTGCACGGCAGCGTTCTGCCGTGAGCGCTGCTTCAAAAGACGGGCTACTTTATATTAAGCTTAAGTTTTCTGTCTTCAGTTT:1 + chr3R 5099373 5' + gypsy4 6767 2 73.27 TTTGACTTATCTGCAGAGTTTACGCTGCACTGAGCAAATAGACAGGACTCGGGACCCAGCACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTG:1 - chr3R 19550697 5' + mdg1 258 2 67.33 CACTCAACGTGAAAAAAAGCAATTTAATTTTGATTCATTGCTTAAACGCAGCCATACCATTGGGAGACCAAATAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCGAC:1 + chr3R 5552842 5' + G5A 2598 1 68.32 ACCATAGAACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:2 - chr3R 10321112 5' - roo 394 1 64.36 ATTTGTGCGCACTCTCATTGTTTGTTGTTTGCTGCGGATTGTGTGAAGAACACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:2 + chrX 2050810 5' + 412 7079 2 53.47 GTTTGGGAGAACTCCCGACGAGTTATGCAACAATTTAATACTATATCCATTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3R 7877055 5' + roo 4 2 54.46 TATACCTTTCCATCTCTTCCAAAAAGGCGGCCACGACGGATCCTCTGTTGCACGAGTTAAGTCCGTGATCG:1 + chrX 1954438 5' - Tirant 403 1 70.42 GCAAAATTATCGTATTAGCCTAGTTAGTACCGCTAACGCAGCTGAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGCGCGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCAC:1 - chr3R 17443344 5' + Quasimodo 280 2 72.28 GCACTCGGCGCTCGGCTCATTACACGAAGCTGCCAAAAGAGAACGCTCTCTCAGGCGTTCCGCCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 - chr2L 15333806 5' - P-element 2876 1 64.36 ATGGATAACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr3L 9772281 5' + 297 6605 2 64.36 GAAAACGCCGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:2 - chrX 19457231 5' + roo 8679 2 63.37 ATTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - chr2R 10863949 5' - mdg3 5451 2 75.25 CCTATATATTCACATCTGTATCGCAATCGCGAGAAAGACAACTTTTAGTGCGACATTCGCTGGAAACTTTCATTTATAGTTCCTAAGATCTCGACGTTCAT:1 - chrX 845872 5' - INE-1 139 1 71.29 TGCAGACCCCATTGAGAAATAGAATGTGAACACATCACAAGTGCGTGCGGGGCTAAACATACAGCACACACCCGGGGAAATATATATACATATGTATATAT:1 - chr2R 10594164 5' - G3 4507 1 53.47 ATCCCATAAATTAGGAATGATCGTAAGGCTATATGTTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr3L 2024375 5' - copia 5085 2 67.33 ATGGAGGTCATTTATAGCGGGGCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:2 - chr2L 18914632 5' - mdg1 416 2 73.27 TATCAGCTACGTATATATTTCTAAATTTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTA:1 - chr3L 7989829 5' - mdg3 236 2 67.33 GTCCACCCAAGCGCACAAAGTCAACGCGTAGTCGAGTAGGAGTTGCATGAGCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCAAGTATCTG:1 + chr3R 28706586 5' + Cr1a 4212 1 55.45 ATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGG:1 + chr3L 19951178 5' + Ivk 9 1 70.00 GTTTTCATATTTTTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 25702157 5' + Tirant 7 2 74.26 ATATTTCATACAAACATAATTACTCTCAAGATTTGTTAAATAATCCAAATTTAAGAAATTTCTTTGCATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 + chr2R 8560087 5' + 297 5 2 75.25 TCAAACCATTTTTTCTAGATTGAATTTCATTTATAACGATAAAAGAACAATCCATATCCTCTTATCTAAATAAAACACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTG:1 + chr2L 22297105 5' - invader2 203 2 52.48 GTGCGGCGTCTCCAGCAAGCCTCAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chr3R 18507904 5' + jockey 8 1 76.24 AATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGATTGCTGTGGCT:1 + chrX 22726198 5' - Helena 1270 1 45.54 CAATGNTGCGTATACGTAATAATTTTGGTCTTCTCAATTATTTTTTGGCTTTTCAGGCTTTCCAGGTTTGTTAATCATGGAAATAATATCGAGCTTCCACT:1 + chrX 17210285 5' - BS3 369 1 54.46 GCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:2 + chr2L 14260727 5' + 297 6603 2 58.42 TAAACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chr3L 14240909 5' - Tirant 380 2 60.40 TTTTTATTCGGCTGGCATAATAAGTATTAGTTCTTTTATTTCATAATATGTTATGCATAGCCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAA:1 + chrX 23352862 5' + F-element 344 1 58.42 GCCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATG:1 + chr3R 13423282 5' - 17.6 466 2 56.44 CGATTCACAGGCAGGCCAATTAATGAACGCGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr2L 11065849 5' - P-element 2875 1 69.31 GGGGGGAAAAGAGAGAAGCTTGGGGCAGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACATATATTC:1 + chr3R 7817621 5' + invader3 260 2 73.27 GTGGGAGTGAGCGACCATTTCCCGGGTTGCCTTCTATATATTCCCTTCTATTCGCCAGTTTTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAA:1 - chr2R 16096377 5' + Max-element 459 1 42.57 CCGGTATTTCAGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr3R 17121692 5' - mdg1 7417 2 66.34 GCTGTCCAGTTTTGCACAACGTGTCATGAGGCGGGCAGAAATTCTGGTTTTCAATGAAATAGCAGTGCTATGAAAAAATAGTAACAAAATTCAACTTGACT:1 - chr3R 5364891 5' - HB 1393 1 67.33 TCAGTTGTGTGTTTGTGGTTGGTAGGGGTTGAACCATATTCCATTAACGCATTTGTTTGAAAAGCTAGCGTGGGTCTAGTTATGGTGTTGGTAACATTGGT:1 + chr2L 2864426 5' - jockey2 266 1 53.47 GTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 4502497 5' + roo 33 2 59.41 GCTGGTCTCCGGGCATTTTCTGCGGTTTTTTCCTTCCCTCTTTTTCATGATTACCAATCAGTTATGGGTCGCGGCAAACATTGTACCGTCGAAAAAAGAAA:1 - chr2L 18114624 5' + Tc1 375 1 63.37 GAGTAACTATATAAAAAACCCTACAATTGCACCGGAAAAAATGGATTTGCTTCGAAATTCATAAGTTTATTTAAATAAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAA:1 + chr2L 16548432 5' + Doc 4693 3 76.24 CAAGTGTGAGCTTTCCGTGGAATCACTCAGCTCTTCTGAGCTCGGTGGTTATCGCTGCGCCGAACCTGTTGACCGCTTGCCATTCCGCATCACCCTGCAGC:1 - chr3L 16063694 5' - Rt1c 5208 1 70.30 GCTAAGCAATTTTTGGCCAGGAGCGGGTGAATGTTGTTGTTGTTGTTGTAGCACTGACAGTTGCTAGGGAGGTCACTGCGGGGTAGGAGAGGCGGCCTCTG:1 + chr3L 7161387 5' - Doc 430 1 65.35 CGTAGGTGTACAACTTACAAGCTTCGGCAAGAAAATTTTCGGTTTTTTCAGGATCGTCGTTAGCTTTACATACCCTTTGGTGTCCAACAAGACATCAGATT:1 + chr2R 19434737 5' - Circe 7122 1 70.30 ATTGAGCACATTTTTAAAGGCCAACAGCAAACAGGCTAACAAGCAACAAGCCACAAGAGAAATACGATAAGGAATGCTGAGCATGCACTTTGTAGCTCAAG:1 - chr2R 13319165 5' + Stalker4 7161 4 72.28 CGCGGAATCTTGCCAACTGTGACTTTCTTATACAACAACAACGACAACTTTTGACTGTTTTACAGGACAAATATATGTAGAAAAAAAAAACAGGGAAAAGA:1 - chrX 18935005 5' + Bica 339 1 40.59 AATATCTTGACTGTGTACAACAATTTTCAACGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3R 18906648 5' - P-element 2843 1 35.64 CCATAGAAATTGCGTTCGTTCGATGATTTGTAGAGGTGCGCAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTT:1 - chr3L 5830579 5' + F-element 4417 1 59.41 AATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr2L 14260736 5' + 297 6612 2 61.39 TAGCTGGCTAGGGAACCAGGAGGGGACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 + chr3L 14240796 5' + Tirant 4 2 75.25 CGGCCTGCACACCTGCCACCTGCAACACTATGCCCGGCAGTTCCAAAAGATGCCCGTGAGTGGCGAATGAAATCCATTATATATATATATATTTACATTTT:1 - chr3R 27313954 5' - G3 4506 1 70.30 GTGACAGTTGGACAGGCCGAGTGACAGATTTGACCAGAAAACAATTCGTGTGGCTGAAGCTAACCGTACTCGTACTCCCAGTCCAGATGGCTCCTCCGCCT:1 - chr2L 14576917 5' - R1A1-element 451 1 54.46 CATATATGGCTTCCTCTGCCTCTTAACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAG:1 - chr3L 21448057 5' + mdg3 143 2 75.25 AAACGCATATAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 18881495 5' + roo 8692 2 54.46 CAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 19457221 5' + roo 8677 2 62.92 AGAGCGAGCATCTTATAAAATAAATGATAAGATAAAAGATAAAATTTCCTGTGAATTAACCTGTGGTTAATTTCTTTGTATAGTGTTCACACATGAACACG:1 - chrX 18012783 5' + roo 8661 1 80.20 ATGAAAATGTGGCTAGAAAGAAATAGACGCCAGACCAGTTCACCAAGTGAAATTTTCCATTCAATTTTTGGACAAAAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTA:1 + chrX 6491982 5' - blood 7176 2 55.45 TTGGCAGTGCTCTCAGAGCCTATACGACTTTTGTATAATTACAGTCAATTTTTTTTTTTAATTCTTTTATATCAATAAAGTAAAGTAAAGTAAGGT:1 + chrX 17017561 5' + TART-A 13110 1 70.83 AGTGAAGAATAAATGTAAATAGAAATAAAGAAATGTTAGAATGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 6024537 5' + roo 35 2 63.37 AACTACTGATCAACAAGTATTAATTATAATCCGTCAGATGGGTAAAAAAACATCATCAAATACTAATTATAAACTAACCCACCACGCCTAAGCCCCAAACT:1 - chr2R 23624262 5' + HeT-A 5923 1 60.40 TAAAGCTGTAGTTCGATTGCACTAGGTTGTGATCCTGCAAGGAAACAATATTTGGTCATTGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCG:1 - chr3L 3209872 5' - 412 298 2 57.43 CATTAAATACAAATCAGCTTAGGCAGCAGCCGCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 12538438 5' - roo 391 2 61.39 CTGTGCATATTAAAAATAGGTCCCCGGATGTCAATCCTACTTAAAAAAGCTTTGGTTAGCCTTTTCCCAAGTGCGATTGATTATCGCTCTCGTTTCATTTA:1 - chr3L 9371377 5' - roo 65 2 77.23 CACTTCACGTTTTTTCCAGCCCTCCGCCTTCCACCCTTTAGACGCCTCTTTCGACGAGCCGGGAACGCTGAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTCACCCAGG:1 - chr2L 3660435 5' - Rt1b 4841 1 77.23 ATGGTATCATAGTTTCATTACCGATCATTCCTGGAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2L 1156833 5' - 412 7542 2 69.31 TGCAAACAATTTTGATGCATTTCCCTCTTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 - chr2R 12009734 5' - I-element 5310 1 70.30 TGCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTT:1 - chrX 21388561 5' - 1360 3345 1 68.32 CGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 + chr2L 11047973 5' - Juan 4186 1 54.46 AAAGACCATTTGTTAAAGTTTCTTAAATCAAATCAAATAAAGCAGGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 - chrX 20974928 5' + opus 7032 4 54.46 TTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr3R 18960438 5' - hopper 1370 1 72.28 TTCACCATAATGCACACACACACAACAAGCAAACGTTCATACGGATAGGCGGACACATGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAGCAAGAAT:1 + chr2L 21681860 5' - INE-1 86 1 65.35 GGTGCCATCCCGGCAGAATTGCTTTCGACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 19936603 5' + roo 21 2 59.41 TCACTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGA:1 - chrX 1954501 5' + Tirant 8154 2 70.30 AGCTATAGCTACCGTAGTTACTTTTAAATGTGCCACTTGCAAACGAATGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3R 27412514 5' - 412 7519 2 51.49 AAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 + chr2L 13060286 5' + P-element 52 1 27.72 TAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 - chrX 12857878 5' + 297 6631 2 80.20 GTGGAGGTCATTTATAGCGGGGCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr2L 18914632 5' - mdg1 416 2 72.28 ACAAATAAATTAAATACGCAACAAATTAGTGAAAAAAAAATAAATATCAAAAATGACTTTATATTAGAATAATTGTTATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGT:1 + chrX 8450257 5' + 1360 414 1 64.36 GTTGCCTACGATTTGCCCAATGTCACCTGGGTGCTGCAGAATGCCCACGGGTGGACCACAAAGAATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAA:1 - chr3R 24389755 5' + Stalker2 7306 2 64.36 AATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 19457215 5' + roo 8695 2 58.42 GAATATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chr2L 18953017 5' - copia 241 1 64.36 GTAATATCCTGTGAACGACACGTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chr3L 13194746 5' + 297 20 2 59.41 ATGCCGCCAATTGATTACATTTTGCATACAAAACTGCCAACTGTTTTGCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 2762201 5' + roo 8692 2 55.45 AATTTGAACAACTCTTTAATCAGGAATCAGAATTTTAATCAGAAACTTATTTGCCAATAGATAACACAATATAATAATAATAATATTAAAAATAATTATAA:1 + chr3R 6769715 5' + mdg1 7085 2 53.47 ATAAACATTACATTACAATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chr3R 10445164 5' - roo 9069 1 76.24 TAAGAATACATTTAATTTACAAAATGCTTGGATTTCATTGGAACTAGTTCCATGCGCCCATGTTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTA:1 - chrX 2789987 5' + blood 7178 4 68.89 AAAGAAATTCGGCGATAAGTAGATAAAGCCCGAATTAAATCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACA:1 + chr3L 21341635 5' + I-element 5053 1 60.40 AGTAGGGAAGATTTGCTGTGTCCTATTGATAAAACTGAATTGTTTTGAGAAAATAAAAAACAAGAGAGAATGAAATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGAT:1 - chr2L 17974205 5' - INE-1 560 1 53.00 TGTGCATTTCAAGTTCTGGGTGTGGCAGCTCCAAAATGCGTTAATGGTGTGTATTTGGGTGAAGTTTGGCAACGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTAC:1 + chr3R 6432428 5' + Rt1b 4913 1 79.21 ACGTGTTTTGCATATAAATTCAAGTTGCTATCTCCAGCTTCGCTGTCACTTTCGTCGTCTTTATGCTCTTCGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTCCTTTTTG:1 + chr2R 7373087 5' - invader2 498 1 75.25 ACGTCATTATCCGACTGATTGAGGTGCTAATGTATTTATAAAGCGACTTGGTTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGACTTGGT:1 + chr3L 18483727 5' + Cr1a 4068 1 59.60 AAGTGNTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTT:1 + chr2R 6984322 5' + HMS-Beagle2 30 2 55.45 AAACTTATTCATTTATTGCTAAAACATATATATTTTATTAAGCAAAGTTTAGTTTAGACAAGAACGAAGAACGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCAC:1 - chrX 21205153 5' + 1360 135 1 54.46 CATATGGCTGAAATTCTGAGGAGAATCCTTCCCGGCTTCACGGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3R 14688514 5' - pogo 2097 1 49.50 CGCAAAGTCTGCTACGTTTTTGCTGGGTGTATTTTTCGTTTATTCCTCGACGTCTCCTGGC:1 + chr2L 19165216 5' - Osvaldo 1506 2 63.93 ACATACGATTTTGTAAAAGTGAGATAGCAAGCTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr2L 18694179 5' - P-element 2870 1 62.38 AAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 18881505 5' + roo 38 2 64.36 CTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chrX 329068 5' - opus 457 2 69.31 GACGGGAACACAGCAACTAGCGCTGAGTGTGTGCATAAGTTTTAATCTGCTTCCGTTACAATCAGCTGTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAGTA:1 - chr3R 6147343 5' + copia 4880 2 68.32 GATCGATCACACAGAGCGCTGTACTTAACACGAACACACTTGGCATGATCCTCAGCTGGCATATATTGTGAAATTTACAATGCATGAGCACACGTGTGCAC:1 + chr2L 6560051 5' - 1360 182 1 61.39 AGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCA:1 - chr3R 10741141 5' + 1360 3366 1 42.57 CACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTT:1 + chr2L 514850 5' + 3S18 5788 2 58.59 AACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chr2R 10863901 5' + mdg3 5289 2 63.37 GATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAAT:1 - chr3R 28755609 5' - 3S18 289 2 70.30 GGTTAAGTTTCTTATTTCATAAACATATTAGTTTCTTGTGTCCTTTAGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:2 - chr2L 8542912 5' - P-element 2858 1 50.50 CGGAACTTGGCTCCTTCATTTATTGATGTGTATCCCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 14041976 5' + roo 8706 2 75.25 TTTTTCAAACTAATCGAAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 - chr2R 21712794 5' - I-element 5332 1 52.48 AGTAAGCGAAATTTGTGTATGATTACCCAACAAATTATTAATTTAAGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGT:1 + chr3R 6431021 5' - 3S18 313 2 51.00 AATTATCCAAACACATTTTAAGCTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2L 17957312 5' - opus 7482 2 60.40 AGCCTCGAAACAAGCAAAGCGTTTTATACGCCGACATCGGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCC:1 - chr3L 6015141 5' + P-element 255 1 46.53 GCACTAGTGCCAGTGGAGACAGACAGCTTGGCACTGGCACTGGCACATTCACTGTTAGCTTACCGTTTTTGTTACTATTATTATTTTATTTGGCGGTCACT:1 - chr2R 8980624 5' - F-element 79 1 69.31 GTTTTTAATTTTTTGTTTTAAATAACGTTTATGGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTAC:1 - chrX 8854738 5' + Stalker2 7263 2 58.42 AAAAACCAAGCAAGCAAAAAGCCACAAAAAAAAACGAGCATTAAAATCCAAACAAAAACGAAGAACAAAAAACAAAGAAAATAATAAAAAATAAAATAAAA:1 - chr3R 19302701 5' + Rt1a 5075 5 63.37 GTATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTT:2 - chr3L 19881822 5' + Idefix 35 2 73.27 ATGAAGAAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTC:1 + chr3R 4543190 5' - 3S18 306 2 58.59 TAATAAAAAATAAAAACAAAAGCAATAAATTAATTCAAGAAATATTTTATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chrX 3674756 5' + opus 7022 2 60.40 TATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGGTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTG:1 - chr3L 20490708 5' + FB 52 1 78.22 ACATTTTTACCGAGGTCGCAAGGCGGTGGAGTGAACAAGTGTAGGCAATGATTGGGGTCAATGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCACGCTGTGTCTG:1 - chr2L 20251582 5' - G2 2828 1 67.00 CCAGCCGAATGCAGGCGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3L 8063873 5' - P-element 2828 1 20.79 GTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr2R 22395210 5' + I-element 39 1 57.43 CCCCACAAGCTGAGCAAATTGCACGCCAATCTCCCAGGTAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATATTAACACCCACATATCCTTCGCCA:1 - chr3R 9172521 5' + transib4 2412 1 79.21 GGAGTTTGGGTTTTTGGCGGGTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCT:1 - chr2L 13447196 5' + HMS-Beagle 6808 2 66.34 ACGGCGCACAATTGACATGGAGAAATAACAAAAGGGAATTTAGGGTGGAGTTGCAGATAGTAGTATCATGCCCTGGAGCTTATTTGGGGTTTTGTTTGGCG:1 - chr2R 17507418 5' - BS3 232 1 62.38 AGTGGTCCCGAAATGGAATTCCTCTAAGCCCTAAACAGGTCCAGTTTCCGACTGCGCCAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCT:1 + chrX 18910661 5' - gypsy5 7327 2 65.35 AAATCATTTTCTTAAGTTTTCCGTCAGTTTTTAAAGCTTTGCCAGTTTAAATGCGATTTATTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATA:1 - chr3R 19144474 5' - Juan 4196 1 55.45 ATTAACGATGCAGCATCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chr2R 23305420 5' + I-element 36 1 58.42 AAATAGTGCCGTGTTGCCACTGACAACGTTCTGTTTCGTGAACTACTTAATAGGATTGAAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 11516699 5' - roo 9051 2 46.94 TCGGGTTGCTTATCAAAGTACCCACATGTCCCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGC:1 - chr3L 11290244 5' + roo 8879 2 73.27 GTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 19076204 5' + roo 40 2 66.34 AGATGCAAGAGATCTAAAAAAGAGTACCCACCTCTCCGCAGCCGGGGGGAAAGAGTGAGAGGGTAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr2L 11045376 5' + P-element 10 2 68.32 AAGAATTGTTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 - chrX 10251798 5' - flea 219 2 70.30 CGATGAAAATGAGTCGAATCGATCTTTCGACCATCGCGATCTAGAATGTGTAAACACAACCGCACTAACTGCACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTA:1 + chr2L 21978068 5' - roo 9066 1 72.28 TTTTTTTTTTTGTTCATATCCAAAAAGGATAAATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTT:1 + chr3R 779353 5' + F-element 22 1 60.40 TTACACTTGTCCTTTCAGTGGAAGTGGGTGGTGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chrX 12538551 5' + roo 2 2 77.23 TGGCTATTTATTTTTATTTATTTATTTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGAGACCCTTTGCTATCAATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCC:1 - chr3R 6821599 5' - R2-element 3200 1 74.26 AAGAGCGCCAACACAGTAGCCAGCGGTGCCGGCGATCGGCACGCCTCCTCTACGCCTGCCTCGTCTTGACACCTTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCAC:1 + chr2L 6044438 5' - R1A1-element 407 1 54.46 AGGGTTTTCCCAAACCGGCAACAAAATTTATAACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:2 + chr3R 18934076 5' - hobo 2918 1 53.47 GCATTNGCCACCACCGTTAGTTGGTCTAGTTGTTCCAATTGTAATGTCTGTACATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 + chr3R 14324189 5' + 3S18 26 2 55.45 GATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTT:1 - chr3R 973197 5' + Rt1a 14 1 60.40 CGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGGATGATGAAATAACATAAGGTGATCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2R 9426447 5' - P-element 2850 1 42.57 GCCAGCATAGTTTTGGTCTCTTCTGTCACCTGTCTTCCCATCTTGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTA:1 - chr3R 12808715 5' - blood 480 1 56.44 CTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 + chrX 4154921 5' + blood 40 2 63.37 CTTCACCCAGAAGGGTGGCATTTTTGTACTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCA:1 + chrX 15109729 5' - 17.6 7109 2 71.29 CAAGAGAAGAGGCCAAAGTCGAGTTTTACGACTATAGTGGAAAGGGGGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACAGGCAGTCC:1 + chr2R 5212717 5' + Rt1b 4981 1 57.43 CGCAGCAATGGCAGCAACATCTGAAACAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chrX 4796965 5' - copia 207 2 74.26 GGGTGTCAGATTATAAAGTCTAGCACTTTTAAATGATGACAGAATTATGCTCTCTGTCTTTTCCGTTATTTCTTTTTTCTTTTTGAACATTATTATTGCTG:1 + chr2L 20406640 5' - invader2 482 1 64.36 TATTGTTGCTTCATACAATAATGGTATGGGTGGAGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATA:1 + chr3L 25911691 5' + mdg1 7075 2 74.26 CTCAAAATTATAAATTAAATTTTCGGACGTTGAATATCTAAGTGCACACTACACGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTACCCGCCTC:1 - chr3R 19449201 5' + roo 172 2 58.82 ACAACCGGCTAAAAGTGCGGCGAATTCGCTGTGATGCCGCGAGAGAGGGAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr2R 13038882 5' + P-element 22 1 55.67 CAGCCACAAACAAATGTGGTTTACCTGGGTAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAATGAAAAAAACAAACA:1 + chrX 3231811 5' + gypsy7 5008 1 82.09 TGATCATAGGACGGACGGATACGAGTATTCGCTGCCGTTTTTCAGCTCATTTATTCAATTAGGACATGTTGAAGGCTCTTTGACGACTCCTTTACGACTGC:1 - chr2L 1405363 5' - Tabor 7193 2 56.44 ACATAGTTTCGAGTGTGTTCCTTGGAAAAAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chr2R 10912149 5' - 412 7508 2 67.02 CTGCAGACCAAATACGATTTTACGATGTGCGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGC:1 - chr2R 12875554 5' - F-element 211 1 71.29 GGTTATCACAAGAAAGACATTCAGTTTAACATTACATTATGCACTGGATGAAGCGTGTCCGATCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAA:1 + chr3R 8376499 5' + Rt1b 4811 1 55.45 CCCAAACGCCCGCAACTCGCGCTTCCCATTTGGCACTATTCGTCTGCGAGAGGCTTTACTGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 13022645 5' - roo 9055 2 45.54 TTCAAAATCCCACCGACACAACTCAAAATCCAAAAACGAACTCTTCTTCTACGGCATCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATC:1 - chr3R 11254348 5' + F-element 4387 1 58.42 AAACGGTCAAGGAAGAGTTCCAGCGACACCGCAACTTCCAACCACTCCACAAGAAGAAGAGTGCAAATAGAATAGAATAAAAAAGAAGTGGAAGTAGAAGT:1 + chr2R 21057871 5' + transib4 2202 1 56.44 TAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACT:1 + chr3L 19349946 5' - 1360 3358 1 60.40 CATGGTCGTGTTCTTTTTGCTCCTCTTGCCTTTTTCCCCGCTGGGTTTTCTTGTTTTTTTTGCTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTT:1 + chr2L 16946090 5' - I-element 361 1 60.40 TCTTTTTTAGCTTCGGCCTGAGAGAGCATTTCTAAAAAACTTACAGTACGATCGGGCTTATTTTGTGCCTTTTTGTCTCTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTGT:1 - chr2L 14925927 5' - G2 3076 1 68.32 TTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTGGTTTTTTATTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTT:1 + chr2R 25286857 5' - HeT-A 6050 2 77.23 TGGATTGTTTGGACATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr3R 22620177 5' + 297 13 2 67.33 ATTTTAAAAAAAATAATTGAATAAAATAACTATGTTACGTTATTTTTTTAAAGGGAAGGAGTTATGGTATGCGTACATACGCATTGTCAGTGCTAGCATAA:1 - chrX 21792822 5' + gypsy11 93 2 87.13 CTTGTCATTTCAATGTCTTTGGCTACGATAGTGCTAAGGTTCGTCCAAAGACATTGAAATGACAAGATGCCTAACGGCCAT:1 + chr2R 2256438 5' - 1360 3374 1 77.78 GCTATGAACAAAGGCCACGATTCTGTTCCGACTCCCTCGCTCTCGCCGGGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGAT:1 + chr2R 17076287 5' - F-element 309 1 52.48 TCTGTCAGGAATACCCATTTATAACCTCCTGTTGGCTCACGAAGCTTCTCGCTGGCAAAGTTGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr2L 7548086 5' - blood 7377 2 64.36 TCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 - chrX 329053 5' - opus 475 2 76.47 GTAACTCGCGAAAAGGGAGACAATAATAACAGCTAAATATCCTTGTGCTGGAGGCATAATTTAACATCGTCTGCGTACATAAGTACACGCAAATGTTTTAT:1 + chr2L 74121 5' - Q-element 553 2 69.31 GAGCTAGAGGGCAATTGGCAAAAGTGAACTTTGATGTGTAAATATTGAGACATTCTGCACACGACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCG:1 + chrX 18571920 5' - roo 8778 2 62.38 AATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 + chrX 10251748 5' + flea 46 2 75.25 GTAGGAGTTGCAGAAGAAGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr3R 30272789 5' - P-element 2871 1 63.37 TAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATAC:1 + chr3R 15157597 5' + invader3 5216 4 51.00 GCGCACCTTTCAATTACGCACCTTGTTGATTGTATATAATGCATTAATTGTACATTGCAATACTTAAATGCCACTTAACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAA:1 + chr3L 8059039 5' - P-element 170 1 73.27 AAGTTTAAAATTTCATTAAATATGATGAGAGTCTGGTCGCCTGTGTAGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chrX 19392644 5' + F-element 56 1 57.43 GTATCCTTGGGAATGGGATGTTTGCTTCTGCTCACTCAGTCGATGGCATCTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTA:1 - chr3R 18568149 5' + opus 7192 4 62.64 ATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTATCGGCACTCGCTGCCG:1 - chrX 5018691 5' - opus 7474 2 61.18 TGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTG:1 + chr2R 9375188 5' - HMS-Beagle 6993 2 79.21 TCATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATTCATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCG:1 - chr3R 9952269 5' + Ivk 8 1 68.00 CAACTGAACGCATGTAAGCCGATTTCCAGTTTATGGCCCCTAAATTTTTGAATACATAATTAGATATTACTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTACA:1 + chr3L 21786692 5' + Cr1a 4311 1 60.40 AACACATTTTAATCGAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 + chr2L 7459557 5' + BS 5017 1 54.46 ACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr2L 11065897 5' - P-element 2827 1 21.78 GGAAAATAACATATATGTGCTGGTGCTTCCACTTTGGAAATATTATTCGGTTTTAGGCACCTATATACAATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAG:1 + chr2R 9454217 5' - opus 7495 2 73.27 AAACAAAAACCGACGAAAAAATAACTAAAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAATGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGAAAAAGTCTATTATAGTC:1 + chr3R 14718003 5' - Cr1a 4205 1 74.26 GTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGA:1 - chr2L 11551395 5' + Max-element 8277 2 65.35 TCCCTTTCATTAAAATTCAATTTTTTATTGCTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATACCCG:1 + chr3R 17733249 5' - INE-1 555 1 71.43 CAATCCCCAGTTCACTCGGGGAAGGGATGGGATGTCATGGCTGTGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCT:1 + chrX 2259997 5' - jockey 4629 1 56.44 GGTGGGAGGGAGAGGGAACGAAGGACCGCTGTCCGGCGAACAGAGAGCGGACGAGTTGAGAGTGGGAGAGCTGAGAGCGTAACTGCTGTGAGCGGG:1 - chr2R 8313808 5' - Porto1 483 1 56.25 AGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3R 7522360 5' - blood 335 2 68.32 GGGTTTTACTTTATTTTTTTGGTTTGTTTAGTTTTCCTTTAATATAGGGGCAGCACTATCCTTTGTTCAACTTTTTCTGCAAATTTCACAATTCAAAGCAC:1 - chr2L 20295720 5' - transib4 179 1 64.36 ATCCTGATTGGTAACAGGTTAAGCGATAGCAGTTAACAGATTTCTCCTGTTGATTCTGAAATGCACGTTGTGTCTTAATAACCGAACATCCGCTTGAAAAG:1 + chr2L 3939514 5' - mariner2 178 1 54.46 AGCTTTGTGTGATATAAGTGCGCCCACGTACTTGAAATGGCTTTACTGATCTTGCTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 - chr3R 22620283 5' - 297 6960 2 65.35 TCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 25918904 5' + roo 8707 2 68.32 ACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3L 10035652 5' + jockey 30 1 69.57 GTTGCCGTGCCTTTTATGCCAATTGTTATCGGCCAATTAATTATGTTGATTTTAGTGCACTTTATAAAGGCTCATAATGGGTTAATAGCTTTATATAATGA:1 - chrX 9927942 5' - Ivk 5280 1 62.38 CTATTGCCATAGTCAGAAGTTGAAGTTTCGGTATTTACACCCATTACAAGCTGGGTAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTTGGGA:1 - chr2R 18875414 5' + R1A1-element 248 1 60.40 TGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGC:1 - chr3R 9952229 5' + Ivk 49 1 75.25 ATTGATTTACTGAAACCAATTTACAAGGTATTATACCTTTAAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACA:1 + chr3L 826192 5' + P-element 2738 1 42.57 CACATTCTAAGGTCACCAAATTAGCTGATGGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 22079739 5' - pogo 2058 1 72.28 TTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr2L 8031278 5' - P-element 2828 1 21.78 CAAATGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGTGGCTTGGCAACATAGGTCAACAAACTTGTGCTGCGTCTATGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTT:1 + chr4 479193 5' - INE-1 174 1 79.21 AGAACCTTGACAAATATTGAACAAGCCCTCAAATTTAAAAAATTTTTATTTTCTCCGCGACTTAGACTTTGTCTGTCATACGCGTTATTCGCTGGTCCCTG:1 + chrX 19310820 5' - HMS-Beagle2 343 1 69.31 GTTGCCCCTTGATGTTGCACATGCAACTGCACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 + chr3L 11909926 5' + Tabor 25 2 54.46 CAGGATGGTGGTTTTGCCCGCGTTGTCCAGACCCACCATCACCAGCTTGTGCTCCTCGTTACATAAACAAACATTTCTCGATATTGCGCATCCACTCATGC:1 + chr3L 8299192 5' + Tom1 99 1 65.35 CACTCACACACAAACACACACACCTACTTACAAAAACTGTGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr3L 14003430 5' - opus 7471 2 63.00 CTATACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATT:1 - chr2R 7540609 5' + Stalker4 49 4 75.25 GTATGGTGTGGACATTGCGATTGGAATGTATACATTGTAATGGATCAAAGGATTGTTATCAATAAAAGAAGTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTAT:1 + chrX 4140832 5' + mdg3 113 2 74.26 ATGAATTGAGGAATGCTAATTTCGTTCATCAGAGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATA:1 - chr3L 1809867 5' - diver 180 2 66.34 GCCTGCTGCATCTTCATTATGTGCGACCAAATTAAACACATACACGTAATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr3L 14910806 5' + roo 27 2 57.43 ATGGCTTCTACAGTCGGCGTCTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 19205720 5' + hopper 147 105 71.11 TATATNCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 31644192 5' + roo 46 2 75.25 AATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTA:1 + chr3R 4543207 5' - 3S18 6052 2 76.24 TTTCGCTAGTGTTATATAACCAAAGCGTATCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTG:1 + chr3R 28883388 5' - HMS-Beagle 197 2 75.25 TATAATCAGCCCAAGGAATGTTTATATATATATATATATATATACATATTTATATATAT:1 + chrX 19748062 5' - G3 4505 1 61.02 AATTTCGTCGCGTTAAGCCAATTGTCAATAGTTTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCACAGTCACGTTATTGTTTACA:1 + chr3L 4641245 5' - P-element 473 1 39.60 GAACAACAACAAAACTTCGAAATGACCTTGACACTGGGAAAAGTAACTGTAAAAGAAAAATCCCAAAGAACTTTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGA:1 - chrX 3996295 5' + roo 8975 2 78.22 GTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGATTCTGACCATATTAAGTATATATACAAATTATATAAGTTCCAATGGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGT:1 + chr3L 19471447 5' - gypsy 439 2 56.44 CCATTTTAATTATAAAATTATTTTTAGTTTGCAAGATTTAAACAATACACTTGTTTTTCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATA:1 - chr3R 3750761 5' + 1360 324 1 53.47 GTGTCAACAGGCGATCCGCCATCTCTGATCACTCTAGTTGTACATTTTTTTTTCGCACAGGTCCTACGGCCACACCTCCCACCCAACCGACCGAGGGGCG:1 - chr3L 25959963 5' - Cr1a 4416 1 75.00 AAAAATCAGCAGGTTATCACTTTCGGTTTCTGAGATGTGACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACACATTAA:1 + chr3R 6994986 5' + I-element 460 1 61.39 AACGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATT:1 + chrX 868704 5' + jockey 4937 1 54.46 ATTTGAGCCCCGCCCTCAAAATAAATAGCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 + chr3L 9192562 5' + I-element 49 1 68.32 TAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 + chr3R 13375974 5' + 1360 38 1 65.35 CACGCCCACTAATAAAGGGACAGCCATGGCAGGGCAACAAACATGGATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGA:1 - chrX 15195303 5' - Transpac 300 2 65.52 AGGACAGAATGCTGCATTCTGCTCCTCACACAAAGTTCTAAAGTCTACGACTGTTTCTACAGTGCACTATGGTAAAAAGGCGGAAATTTTGGAATTAATTA:1 - chr2R 5461404 5' - transib4 2619 1 56.44 GTCAGACAGGTTATTGCCTGCCTCTTCGGTTGGGGCTGCCACACATATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGA:1 - chr2R 15283606 5' - S-element 1687 1 57.43 AGCAGATAAAATGAAAACAAAGACTGAGTGACCATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:2 - chrX 4154972 5' - blood 7347 2 67.33 GCTCCAAATTTATGATGTGCACGTACATTTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chrX 17132470 5' + pogo 42 1 71.29 AGCTTCCGTCGAATGCGGAGAACAGGATTACTGAAAGTAACTAAAGAATGGTTTCAGTTTAAAATTTAAAGCTTGTATTATTTTTAATAATTATTTCAATT:1 - chr3L 10539066 5' - invader2 436 1 66.34 CTCGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCAT:1 + chr3R 4973091 5' - 1360 22 1 49.50 CTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chrX 12538517 5' + roo 8699 2 58.00 GGCCTNTTACAGGCAGTCGCTTAATGACGTAACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3R 18934932 5' + hobo 43 1 67.00 AAACAACAAGAAATTAATAATAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chrX 12546527 5' - P-element 2883 2 75.25 CCGTTGGAAGTCCATTTGCGTTGAATATGTGACTGAGTGGGTGTTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - chr2R 23495507 5' + 412 7084 2 57.43 GAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 7993862 5' + Doc 33 1 51.49 AGAAATAATCGATATAGAATCGGAATATATAAAGACGCCCAACAAATAAATGATAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr2R 5398651 5' - 1360 3372 1 69.31 CTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3L 19349950 5' - 1360 3354 1 64.36 AATTTAATACCAACTTGTCCTAGATTGTATAGCTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3L 11461351 5' - copia 247 1 63.37 CTTTCCATAGTCTGATTCGATCCGTTTAGTCGCTTGATGGCTATTTTGGCTACACCACAAGGCTAGTCAATAAACCTAAGGGGGCGAAGTCAAGCCCTCCT:1 - chr3L 6608393 5' + gypsy 7341 2 55.45 GTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3L 17122420 5' - roo 9033 1 64.36 CTTGGGGTGCCAAGATTGTCTCTCAACTCTAAAATGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTCATCTAAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATC:1 + chr3L 27091734 5' - Cr1a 393 1 69.31 GAAAGGTTTTTATCGTATCATCGGTGGGCATCTGTCATACATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:2 - chr3R 23665358 5' + 297 4 2 74.26 ATGAACTCAAAGTAGCCCACTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr3L 543439 5' - P-element 2830 1 22.77 TTAGGGGAATTGTGTCAAATGGTCCCTGTGGACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTG:1 - chr2L 10475304 5' + accord 6915 2 69.31 TGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3R 21500994 5' + roo 8695 2 58.42 TGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr2L 19642962 5' - roo 9049 2 55.45 AGGCATTGAATTAAGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chrX 5018716 5' - opus 7483 2 61.39 TGAATNTAGTTCGAGAACAAAAGTAGTAGTAGTGCAAATAATTCATATTTAAAATTCGTAAGTATACAAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGC:1 + chr2L 17029568 5' - roo 8659 1 70.30 AGTGATCAGAAGACAGGAGAGTCTCTAAACAATTACCTGGCAGCATTGCGTATATTTGCACGGGCTTTAGTATAGCTTTGTTGCAGATTTTCGGACAAGCA:1 - chr3L 23593517 5' - G4 3358 1 61.39 AAATTGTAATTGTAATCCTAGGAATCCAAAAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGG:1 - chr3L 9925328 5' + Doc 5 1 73.27 CGTGGGGGATTTGATAAACTTTTCTATGGTTTGGTTGCTTGGAATGCAGTTATAAATACGTTGTAATTAAATAGTATTATTATTATTATTATTATTATTAT:1 + chr3R 17908901 5' - mdg1 29 8 46.53 AGGCAAAGCTTTCTAAGCCATCCAACAATGTTAAGTTAAGTGCCACACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 - chr3R 16510913 5' + flea 4781 2 55.45 TCATTATAAGTTCCAAACTGATGCTACTATTGAATGCTACTAAGTTTACTTAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAA:1 + chrX 14531479 5' - 412 474 2 59.00 TGTAACCCAATAAAATTAAAAGCCATGAACACTAGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTC:1 + chr3R 19450076 5' + F-element 363 1 80.20 AACCGATACGATTGTTAATACTAAAAAAATCTATTAACCATCAACAATTGATCAAGCCGAGTGGAACTACCGTCTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACAC:1 - chr2R 330545 5' + gtwin 2 2 77.23 TGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 3671332 5' + roo 56 2 84.16 AAAACGAATTATCTCAATTACATTACTAGTTCAATTGCAATTTGAGAATTTAGTAAGAGAGTACGCTGTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTA:1 + chr2L 18177033 5' - INE-1 552 1 63.37 TATGTTTGCTCAGAATTTGGGTCAATTTTCTTTTTTATATTTTCCTATTTCCTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chr3R 22845593 5' - jockey 4959 1 63.16 CGGTTATTCGCATAAAAGGAAGTCTCTCTTGCTTCAAAAAATCCGATTTAATACCTTTAGATCTTTAAGCCGTCAGGTACACAAATAAATAAATAATAAAA:1 + chr3L 17319568 5' + Juan 4214 1 80.20 GAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCT:1 + chr2L 7459571 5' + BS 5031 1 60.40 CCTCAAGCAAGATGCGATTTTAATATTCTTATTCTCGTGCACATGGTGTGAAGAACTTGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr2L 809300 5' + jockey 37 1 63.00 ATGATTAATGCATTGCAGAACTTGAGGCACGAAAAAAAAACATTTTGTTGAACTTTCTTGTTTGCATTCCAACTAGCTGAGTAAAGGGTATCAGATAGTCG:1 - chr2L 9500791 5' + INE-1 550 1 61.39 AAGTTTGTTACCAGTTTTACAGAAAATATAATATATAATAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 - chr3L 24131160 5' + HMS-Beagle2 6916 2 59.41 CAGGCCTCTCTTAGTTGGTCGAGGATGTAATTTATTCTGGGTGTCGAGCTGCCTACTTATCGATAGCCAACTTATCCGTTCCGCGACATCCCCTCCCCCGT:1 + chr3R 1313692 5' - aurora-element 4033 1 51.49 CTTGTACTCTACCTACTACAATGAAACCACAAAAGTAAACATGGATATTTTATTCCTCAAATGAAAGAAATGATGATGGGTGGCGAAGGATATGTGGGTGT:1 + chrX 6758574 5' - transib4 2413 1 76.24 TTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATG:1 + chr3R 6147260 5' - copia 217 2 61.39 GAGGGGACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 + chr3L 14240815 5' + Tirant 8130 2 58.42 TGCCANTCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 14910561 5' + roo 8685 2 57.00 CTCAACTGTTGTTATTGGAAAGCGATAGGCGAAGAGAGAGAGCTTAAGGTTACTCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAACT:1 - chr2L 7668873 5' - Chouto 53 1 71.29 TATCAACACTGCCAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3R 27189351 5' - roo 397 1 65.35 CTAATTAGATAGCAATTAGATAGCCACTCGATTGTTTCCGGAAAATTTATGAAACGGATTGTGATGGATCGGATCAGCTGTATTGTCTGATGCAGCTGAT:1 + chr3L 19894724 5' - Rt1a 188 1 77.00 CAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAG:3 + chr2L 15956024 5' + Max-element 22 2 57.43 GAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 21500986 5' + roo 39 2 66.34 GCAAGCGAACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAG:1 + chr3R 27080694 5' - HMS-Beagle 224 2 74.26 GAGATGAGTTGGAGAAAAGGGAGTTGGCAAGTTTTCCAGTTTGTTTGCAGTCCAATAAAATTGTAAATGCTTTTCTAGGATTTTTTTCTCTTGTTTTTTTT:1 - chrX 8508836 5' - Porto1 174 1 41.58 GAAAGCACGGGTTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chr3L 8974082 5' + P-element 31 1 50.50 AAGTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - 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chr2R 9014515 5' + blood 7012 2 78.22 AATATTTAAAAGGAGTTGGTAATGTTGATAGTTATAAAATCAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAA:1 - chr2L 18689352 5' + P-element 2694 1 38.54 TAAACACTACCCCAAATCAAATAGAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2R 12336637 5' + pogo 44 1 73.00 AATTTCGATACGATTTAATCGGCACTCCAGAGTTGACACCCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3L 958750 5' - P-element 2853 1 43.56 TGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2R 16366827 5' + hobo 40 1 61.39 AAGCTGGCAGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGC:1 - chr2L 15893775 5' + Max-element 8258 2 56.44 CCCAGCAACAGCAATAGCCATATATATATATATAGCAATGAAAATGGTAGCAACAAAAAAACTACAATCAAACGTTCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGA:1 - chrX 14976454 5' + Juan 138 1 59.41 CGAACATATCGACTGTTTAGTTGAATTGCTTATCAGTTATACACTGAAAACAAAGTTCGAGATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3L 14049965 5' + pogo 16 1 57.43 TACAAAGAGTGCAGAAACCGACAGCGCTACCTAGAGCACAAAAGTCTAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACATAATGATTTAAACATAGGAACAGTCA:1 + chr2R 291927 5' + Porto1 4401 1 66.34 AATTTAACAATGATCTTACGAAGGGCAAAGCCAATTTTCTGCGTTCTACCAAACTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chr2R 3492814 5' + 1360 82 1 52.48 CATCGAGGCTCTATTGTTTTCCCAGCATTTGCATATTTTGTCTATTATTTTGTGTCTTCGTTTATTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGCTTAATATTTTGGA:1 - chr2R 17830302 5' - invader3 4990 1 59.41 AAGTATACTGTATGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3R 26469438 5' - hobo 2908 1 65.35 GCGTACCAGTGAATTGGCTTTGCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3L 5716952 5' + copia 4894 2 55.00 GGATCCGTGACGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr2R 9426429 5' - P-element 2868 1 62.38 ACTCTTTCGTCCCATGACAAGATTCTGAAGCAGCCAGAACTCTCCGTGCTGAAGCCTCTCGAAACGGAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGC:1 + chr2L 5719597 5' - F-element 120 1 73.27 CTTAGCTAGCCCCTCTATATTTTCTTCTTCCTTTTTTTTT:1 + chr3L 3744648 5' - Doc2-element 234 1 92.50 TCCTTCGGCCGAAATAGATTCTCAAGTGTTTTCGCTTTTCATTAATTAAATTGCAGACCACCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAAAAAAG:1 - chr3R 31011967 5' + R2-element 3574 1 62.00 TAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 - chr3R 19609711 5' + Tabor 42 2 65.35 TCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACA:1 - chr2R 6779826 5' + 17.6 47 1 75.25 TGCGGGTATTTCAGCTGCTCCTTTTCCCATTGTTGCTAAGTGGCCATGCGGCTAACCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3R 14169327 5' - blood 355 2 56.44 TAATGTATTCCCACAACCAATTAATTGTTTTCAAGTTTTTGAAGAGTTATTAGTTTCGGGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCG:1 + chr2R 17890314 5' - Tirant 403 1 59.41 ATGTGTACCTCTAGCCTACTACAATTCGACCATCCTGACATTTAAGATTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACAT:1 - chr2R 1234688 5' + 1731 32 2 53.47 ATTGTTAAAACTATGTTTGCTATACATATAACCCGAAACGCAACAAAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr2L 20939596 5' - hopper 1387 1 52.48 CTTTTTTATGCGAAATTTATTGAATAATTCATGGGAAGTGATTAACACATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTA:1 + chr3L 4048448 5' - 3S18 311 2 54.46 GACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 10457291 5' - roo 357 2 76.24 ATTAAAGTATTTGTATTTGCCCACAGAGACAACGACAACTTATCAGATATTTTCCATGTCCAGGGCTTAAAAGAGAGAGTCATAAAAATATATAAAAATCA:1 - chr3L 18846392 5' + gypsy10 406 1 78.22 TACAGGCAGTCGCTTAATGACGTAACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chr3R 18934925 5' + hobo 51 1 74.26 CTACCTTTACCTTTCGGCTTTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 + chr3R 18960419 5' - hopper 1389 1 53.47 TCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr3R 26469505 5' + hobo 32 1 59.41 ATTTGNGTTGAATATGTGACTGAGTGGGTGTTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 - chr2R 23495494 5' + 412 19 2 60.53 AGCAGAGAATCCGGCAGAAGCAGCATTTTGCCAGCCATTTTGTTTGCCATTTTACTCAAGTTGTCAGTGCTATACTATTTAAGTTAGTCGGGTTTTGTAAA:1 - chr3R 27401754 5' + I-element 5323 1 66.34 GTAATTTTACTTTATTTTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 558258 5' - Doc 4596 1 66.67 TTCGCACACTTTTCTGTGTGAGCTTGTATATATATATATATTTTTTTTTGTTTATCTTGTTTACAGAGATATATATGGTTTTTAACACAGATAAATATGTG:1 - chrX 12333501 5' - Porto1 117 1 58.42 GACGCGTAATTTTGCCCGCCGTCTGTCTGGCAAAAGCAATGAGATAGACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr2L 2920955 5' - hobo 2910 1 53.47 GGCCATTTTCTTTCAGTGTGCCAACATCGCGGTGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chrX 6458181 5' + blood 7054 2 66.34 CCACCNCGGACTTTGAGTTGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 985391 5' - roo 9034 1 66.34 AGCGCCAACAACAACTACAACGCCTACAAGAGCGCCAACAGTAGCGGTCAATAACACATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCAAGAA:1 - chr2R 9829590 5' + F-element 344 1 53.68 AAGGGGCATTTCTGGGGAATTGAAAGCACGGGTTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 8974061 5' + P-element 9 2 72.00 GGTCCCCAAACACAGAATATGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr3R 10321049 5' + roo 8719 2 80.20 AAGAATGTTGTTTTCGTTTTGAAGTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCA:1 + chr2R 22565446 5' + roo 9011 2 76.24 AAGATAAGGCACATACCTAATTTATACCTCTATATTTAAGATTTTAATATTTTATAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 - chr3L 710877 5' + 17.6 6943 1 64.36 ATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3R 22620191 5' + 297 27 2 57.43 GAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACA:1 + chr3R 19450118 5' + F-element 404 1 62.00 ACAATTTACGTTAATGAGTTCCCGCTGCGCGCTTCCTAAGCAAACTTAGTCCAATAGTCGAGCGGAGACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATC:1 - chr3R 19987314 5' + P-element 446 1 72.28 TAAGTTTGTTTCTTCAAGCAGCTTTTTTTTTGGGGGGGTGAAAACCAAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTC:1 - chr2R 20702195 5' + Doc 3 1 78.22 CAGCCNAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACGTATAAGTACACAG:1 - chr3L 2800209 5' + blood 27 2 51.49 CTAAAATTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 - chr3L 7989809 5' - mdg3 5468 2 56.44 GAGCGGACAAGAGAGCTCCACGCTTAAGAGAGCGAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chr2L 13060246 5' + P-element 12 1 67.33 ATATCGAACTGAAGACGTAGGGATTTGTGCGCACTCTCATTGTTTGTTGTTTGCTGCGGATTGTGTGAAGAACACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1 + chrX 2050788 5' + 412 4 2 75.25 TTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 10653604 5' + jockey 35 1 51.49 GCTGCCTGGTAGCTGGTCAGTTGTTGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr2R 19936699 5' - roo 395 1 65.31 AAAGTTATTAAACTGAGTGCTGTCAAAAATGATTTGACTTTTAATTAAGAAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACA:1 - chr2L 7747291 5' + S-element 1688 1 66.34 GTCGATATTTTGACTGTTATCTGGCGCATTACTGTGATTATTGTCGTTTGGAAAAGGATGTAACATGATCACCCACTCGACGGCCACAAAGTATAAGTGCA:1 + chr3L 20909725 5' + 412 7193 2 55.45 GAATATCCAGGTCGCAGTATATTTATCTCACATAAGAACCAAAAGGACATTATTAATTAATTATTAATTAGTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATT:1 - chr2L 17841101 5' - Juan 4067 1 51.49 GTAACCACAAAGCCTAGTTACCACTCAAATGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:2 - chr3L 11654591 5' - pogo 2058 1 73.27 GTCGGTCGAAGGACCAAAGCAACCACCACTAAGCAGAGCATGGCAAAACATTTTTGCGGTCAATGGGACAAAAACACAACGTCGGTAAAACACTCGAGTAT:1 + chrX 14526929 5' + hobo 2836 1 74.26 CTCTATATGGTGAGAGACCCATACTTTGACCCAATGTTCCAATCGAAAAATAATGCATCATGTTCAAGCCACCAACGAACGTACATTAACGGGAATGCGCG:1 - chrX 8082605 5' + Ivk 5014 1 59.41 GTGGGNACAGCGATTGTTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2R 20411865 5' - 297 6953 2 55.45 ACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr3R 18934108 5' - hobo 2886 1 75.25 CTACTGCAATTTACTCAGTCTCGTACGCAAAATAGAAAATTCAGTTTTTTCTTCTCTGTTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTGT:1 + chr2L 20082213 5' - Doc 4412 1 54.46 TTTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAA:1 + chr3R 18960437 5' - hopper 1371 1 71.29 TAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3R 18881541 5' - roo 9013 2 82.18 ACATAAAAATAATCAAGGTAAAATCGGGGGAATTCGACTAATTAAATAAAGGAGCTAGTGTAACCCAATGCAAAAAAAAATATC:1 - chrX 5563693 5' - Transib-N1_DM 68 1 52.38 CTAGCAACATAATTTAAAGCAAGAGACGATATAATCGAGTTTACCGACTATCAGATAACCGTTACTCAGCTA:1 + chr3R 17733279 5' - INE-1 544 1 69.44 AAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAAT:1 - chrY 1076855 5' - INE-1 86 1 67.00 TGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3R 25918963 5' - roo 9040 1 60.40 CTCTCGGTGGATTTTCACAAGAGGAGTTGTAGCCCCCTAACCGAAAACAGAAAACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATCCGCATGGGAGATGAGCA:1 + chr3L 10035596 5' + jockey 6 1 79.21 TTTTGTTTGCTGTTCTGGGCCTTTTACAGGCAGTCGCTTAATGACGTAACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chr3R 18934949 5' + hobo 27 1 52.48 CTCTTAGAGATATCCTTGCATTTGTTACGCTCCTGGTGGTGATGATTATTATGATTATTATGATTATTATGATTATTAATTTTTAGTCTTAAACTGATATC:1 + chr3R 8221669 5' + 297 277 2 59.41 TCGCAGTATGTATGTAGTTATATATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATAC:1 + chr2L 4189354 5' + 1360 16 1 64.36 CCAGAAAATAAAATTGTTGAGAGTGTAAACTTGGGGTTTTTCGTCTTTTTTTTGTTTATTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCCAACAGATC:1 + chrX 11762965 5' - Cr1a 4424 1 52.48 GGGCGTGACCACTGCAGTGATGCCTTTTTTAACTTAGTTTGTGTGCGCTGATGTTTTCCTTTTATGCTTGCAGTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chrX 6405033 5' + jockey 4762 1 75.25 AAATAGAAAACTGAAATATTATCCGCATATTTTTAATAAATCCAAAAACATTAACCATGGCCCCCGGGCCACTAAATTTGGTGGATAATCGTTTTGCCAGT:1 + chr2R 9053566 5' + Ivk 215 1 63.37 TTTTTTTTGCTTCGGCCGCCTTAGAAAAGTCGAAAAGTGCGCTTTTTACATTAAATGCTAATATAAACTTGGTTAAGCTATTGTTATTATTATTATTATTA:1 + chrX 13253404 5' - mdg1 18 2 69.31 GCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3L 3671286 5' - roo 9041 1 56.44 GCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 18012673 5' - roo 9046 1 54.46 ATTCTAGGCATTCCTTGGTGCATATGGACAAGAAAAATAGATTTGATAAATACAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 - chr3R 5505300 5' + mdg1 25 2 54.46 AATGGCCTGCGGTTACCTGTGCTCCTTGAAGTTCTTAAATGGACCGCAGGATACTCGCCGGCATTCATAACGCAGGGAAGGGAGCCGAGGCTGCCCAACG:1 - chr3R 26318968 5' + Osvaldo 1111 2 55.00 AGAAAAATCAGGGGTAAGGCGACTGAGATTGGCAGGCGATTGAAAGAAGTCGGACTAAACAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGA:1 + chrX 9820745 5' + mdg1 7415 2 67.33 TCTTTNCTACCGAATTTTCCTTTTTTCCGCTGCCCTGTCCGTCTGTCCATCCGTATAAACGTCGAGATCTCATGAACTATAAAAGCTTGAAGGTTGAGAT:1 - chr3L 23020719 5' + INE-1 163 1 69.00 GCCATTCTTTCCGTACTCTTGGCCCTGCTGGGTATTTATAAGACAATTTCGGCTGCTCCTCTTCAAACAGTCAAGAGGAGCATCCGAAATAGATCGGAAGA:1 + chr3R 14396695 5' + Penelope 72 1 70.30 CCTTTTTGCTATCCGTGCTCTTGTAGAAATTGTTAACAAAACTGTAGATTTATGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3L 21383961 5' + roo 22 2 57.43 GCAGANGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAAC:1 + chr2R 5532365 5' + Doc4-element 7 1 52.58 AATCATTATAAGTTCCAAACTGATGCTACTATTGAATGCTACTAAGTTTACTTAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chrX 14531477 5' - 412 475 2 60.40 AGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:2 - chr2R 5084076 5' + F-element 42 1 58.42 CCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr3R 14169243 5' + blood 27 2 52.48 TCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCA:1 - chr3R 3985686 5' + Tirant 8159 2 77.23 ATTTAAACTACTATGTTTGTTTCTATTCTTTTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATA:1 + chr2R 22605943 5' - Juan 4166 1 70.30 AAGTGGGAAATCCTCGTTGCGCCAGCGACCTTAATTTTTGTTGTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTG:1 - chr3L 3127266 5' - Ivk 209 1 64.36 GTGTGCGGCTTCATTTAATGCCTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 + chr3L 20248279 5' - Transpac 5223 2 70.41 CCCTTTAATTTCCTTCGTTTTTTGACGAACTTAAATTCCACTTCACGCCCAAAGCAAAACATGCTGGGTTTTATTATATTTATTTTATTTTATTTTATTTT:1 - chr3L 8873695 5' + transib1 1898 1 64.36 GTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - 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chr3R 14169329 5' - blood 7369 2 58.42 TAATAAGTAACGCCGATTTACCATTGACGGTAGGAAGTTTTTTGCCGGTGGCCTGCGGGCCAATCGGGAGTATGTTCGTCGAGATCTCAGGCAATATAAAA:1 + chr4 899205 5' + INE-1 147 1 75.25 CAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3L 19215873 5' - roo 387 2 59.41 GACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chrX 14525270 5' + hobo 43 1 68.32 CACACCCCCCGCAAAAAAAAATGGGCAAAAGCCGAGCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAG:1 + chr3L 13948642 5' - P-element 42 1 39.00 AATCACTTAATCATAATTAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chrX 12857895 5' + 297 6604 2 59.34 TGGGTGGGACAGCATATAGAGACGTCTTTTGGACAACGTTCTTAACCGTTTGGTTATTGTTTTGCATCTATCGTATCTTTGTCTACAGTATTGTAGCTGTG:1 - chr3L 21562600 5' + Circe 106 1 61.39 AGGAATGTACGCTAACTTAGTATGTATTTGCCATGTTTTAAAGAAATTCTTATTTTAATTTTTTTTAATTCTTAATTTACTAAATTAAGTTGAGTGAAAAT:1 - chr3L 2575337 5' + Bari1 1461 1 31.68 TTGTTTCACGACAGTTTTATGTGTTTTCGTGCGAGGTTGGCAAGTTTTTGGGGCTGTGATTTCACTTGGGCACTTGGGGCGTGTTCACACATGAACACGAA:1 - 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pogo 2088 1 67.33 AATGGAAAATGGGGAAATACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 + chr3L 10736454 5' - 412 7512 2 59.41 TTAATACAGCTTGTAAAATGAACTCTCTTTACGCACCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGT:1 - chr2R 652656 5' - Bica 416 1 64.36 AGCCTNAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr3R 18507887 5' + jockey 25 1 58.42 CTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chrX 3649741 5' + jockey 31 1 60.00 AGCAACACTTTAGCTGCCACCACACTCAGTGCAGCCCCCTCGTTTTGGCCATCTTTACTTAAGGTTCGTACGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGA:1 - chr3R 22798580 5' - blood 7185 2 77.23 ATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:1 + chr2L 514867 5' + 3S18 42 2 65.35 CCATAATTGTATGGCACTCGAGTGACGTTCGCATTACAATTGAAGGGCAAAGTGGGCGTGGTCCGATTTACTTGAAATTTCACGTACGTATTTTA:1 - chr3R 8458925 5' + transib3 2772 1 61.05 TATGCACATTCAATTACCATATTAACCGAAACGACTAATTAACTAAAGTTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - 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I-element 4991 1 70.30 ATTGATATTTGATTAAATACACGAGTGCCATGATTCAGGCTTTGGACCCGGCTTTATTTGTGCATCCCTGTGTGTTAACATATTCAACAATTATTTAATTT:1 + chr3L 6554424 5' + frogger 330 1 74.26 TGGTANGAAATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 - chr3R 19114264 5' - 297 362 2 65.35 TAGAATATCCGAGCAGAAAAGTTATCTTTTCTAAAGCACAAAAAAAATAGTTACTAAGTAAAATAAGTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTG:1 + chr2L 19305646 5' - F-element 4413 1 74.26 TAACCAGCTTGTGCGATTACATCTCGATGAGCCTACAGAGCCTACATTATCACAATTTCTTATTGTTGTATATAGTGCCTTAATTTGTTTTTATATCTTTT:1 + chr3R 30213250 5' - Tc3 1578 1 40.59 CCGCTTTTTGATGTCTTGATTGAGTTGCCAAATTGTGGCCGACTTGTTAGCAAAGCCAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCG:1 - chrX 18268909 5' - gtwin 464 2 70.79 AAGTTATACACACATCCAAGTTGGGAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAAT:1 + chr2R 9387291 5' - Stalker2 405 1 80.20 TTCGTGTACGACTTGTATTTTCTCCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTGAGAGTCTCCAAGGAGTCTCCGCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTAAT:1 + chr2R 21630840 5' + GATE 101 2 75.25 ATAAATGCAACTAATATACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 19450176 5' - roo 9044 1 51.49 CTCTAAATATACTCGTATATAATTATTCATTCTTGACTATTATAATTTTAAAGCATTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGATTTAGCTACCGTTT:1 + chr3R 23150166 5' - 1360 2979 1 67.33 ATTTAGTACGAGTATAAAAATTGAAATAACTAATTTAATATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 + chrX 5651603 5' - flea 223 2 68.32 ATAACATCGGTTTGAGTTAAACTAAGTGATAGGTGGATCTAATTTAAAACTACCAATTGTTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCT:1 + chr3L 22978828 5' + FB 798 3 67.33 AATGCATAGTCGGCTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCA:1 - chr3L 6129877 5' + jockey 4697 1 56.44 AATCCGACGATCTTCATATACACTTTCTGTTCCCTTTTCTATATCGCGTCTATCTTCTGGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTTGG:1 + chr3R 3399996 5' + Cr1a 4408 1 77.23 GCAACACTTTTTTTCGACTTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 + chr3R 31369330 5' - Transpac 5193 2 75.61 CCAACNTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAGCATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGC:1 + chr2R 2552128 5' + HMS-Beagle2 48 2 74.26 GTGCTTCGAAATGTGCACGCAAATGAGCGCAGTTCGCTCGTCATCAAGAGCTGCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 + chr3R 29384347 5' + jockey 4784 1 54.46 TCCATTTTTAAATTCTACTTGTTTTACCAATATAACAAGAAGATCATACAATTATTGTAATATATTGTAATAAGTAATAAGTAATAGTTCAGTGTAATAGA:1 + chrX 23283141 5' - Stalker2 7637 2 62.38 ATACTAGATTCGTTGAAAATTATGTAACAGGCAAAAGGTAGCGTGTCCGGTCATATAAAGTATATAAATTCTTGATCAGGATCAATAGCCTAGTCGATCTG:1 + chr3R 28636012 5' + INE-1 98 1 82.18 ATTATGGGCTGATATTTCTTGTTATGAAAGCAGATTCTCAGATTATGGCATATGTATAAGTACTATAAGGGTTGCATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:1 - chr2L 9389148 5' + 1360 3 2 74.26 AACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr3L 8974106 5' + P-element 55 1 25.74 GCAGATGCCGTGATTTACCTGAGTTCTGCGCACCTTTTCGCCTTAAGATGTTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 20838594 5' + 1360 23 1 56.44 CTGATGGCATATGGGGTGGAAAGTGGGCGATGGGTGGTGTCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 2920890 5' + hobo 36 1 59.41 AATATGTCTAAATTTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chrX 21204996 5' - 1360 3356 1 59.18 TTTTGTTTAACTTTGCTGGTGGAGGCTTATCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGTATAAATTCTGTTCCGCATCCACGATTTATTATGC:1 + chr4 1294988 5' - HeT-A 6015 1 78.22 TTCACNCCGTTAATTCCATCGACGGATTTGATCTTACGAGCTGTGAGGAGAGCACAGTGGTCTTATTTAAGATAAACATGGAAAACGTAAATGTTGTCTGG:1 - chr3R 31131436 5' + Cr1a 437 1 53.47 AGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 27189338 5' - roo 9047 1 52.48 CTTAGCCTACATCCTCCTCTTAGGATCGACAATCAACAATATACATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr3R 5054374 5' - HMS-Beagle 217 2 58.42 TATCATAACATGTTGCATGCTTTATGGGAGGCTTTCGCATGGATTTAACCATTAAGCTGGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAA:1 + chr3R 7509106 5' - jockey 470 1 53.47 AAAATNATTAAAGACCATATGAAAAACTGAACCCTCCGCTTAACGAGGCATTCATTTATTGCAAATTGATGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr3R 12767114 5' - 412 488 2 70.30 TATATTATAAAACTAATAAAACCCAGCCACTACGCAGGCACATAGCCACTGAGCACATAAGAATTCTTTTTCATATGTAT:1 - chr3R 1221593 5' + Tom1 169 1 73.75 GGCGTTAAGGTAGTATTTGGTGAAGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr2R 3188766 5' - 1360 3376 1 40.59 CACCTACACCTACATATTTAATTTGTATTATATTTATGCATACGCGCATATGTAATGTAACCAGCAAATTTTACATCGTCTGCGTACATAATTACACGCGA:1 + chr3L 14671233 5' - Q-element 562 2 69.31 ACCTATTTTTTTCGTTTGTCATAATTGGTGCAGTTGCTACTGACTCATCGTCCGAAATGTTTTGTCCTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2R 3595829 5' + roo 10 2 69.31 GTCCGGTTAGCCCAGAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr2R 5849943 5' + jockey 14 1 72.00 AATGTCGATAGGCGGGAGAAGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTA:1 + chr2R 10863878 5' + mdg3 5265 1 63.00 AAACCAGAGAAACTAAGAAATACCTACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAACAACAGTAACATAACAGCGCAAT:1 + chr2R 15005054 5' - BS 5045 1 78.22 GAATAGTTATAGGTCGGTGACTTGTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCAC:1 + chr3R 30589826 5' - roo 122 2 76.24 TGCAGGATTTCAAGGATCATGGATTATTATTATAATAAAAAAAAAA:1 + chrX 1103520 5' - hopper 156 1 80.43 GGCGAGTAAGGTAAACGCCAAGAATGGTGGTCGGTGGTCAGCTGTAGTGAATGGTGGTCGGTCGGTTCCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGGC:1 + chr3R 19837002 5' - P-element 2875 1 68.32 TAAAANCTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTA:1 + chr3R 21695447 5' + 3S18 43 2 66.34 AGGGAGGAGTGCTGCCTGCGGGAATTGTGGGAAAAGTCAAGTGTGCAGCTTCCTCTTCAGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTT:1 + chr2R 20380067 5' + accord2 7279 1 64.36 GATCTGCAGCGAGGTATCCACCACCAGTGTCCAGACACCAGGCAAAGCTGACGAGGATCGGGAAGGATCGCGGTACCCTTGCTGAGGAGCGAGATCTACCT:1 + chrX 16949308 5' - R1A1-element 5119 1 75.25 AATCAACTAAGGATCTAGAGGAGGATTACGAGAATACTCGCTCACTAGAGCAATGAAGCGGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATG:1 - chr3L 27349115 5' - G3 4318 1 68.04 ATTGTGATGGCGGAAGCTTGTTACTGACAATCTCTGGTCTTGAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTAGAAACGAACGAGAAATACGCGTTGTTTTTGATTGAAG:1 - chr3R 25861538 5' - Doc4-element 53 1 70.30 CCCGCTTAAGTAGGCAATATAAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCT:1 + chrX 10251706 5' + flea 4761 1 75.25 TAGCGTAAGCATTCACAATAAATATATATTCGACTTTTCCCTTTAAGCACACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTATGCTCTCTGA:1 - chr3L 9965310 5' - invader3 165 2 80.20 CAGATTTATGAATTCGATTAATGCTCCCAAGTGACGGTTTTATACCCTCAACAAAAACTTAAGCTTAATATGAAGTAGCCCGTCTTCTGAAGCAGCGCTCA:1 + chr3R 7523055 5' - gypsy4 158 2 59.41 GAACGCCATTTATCCGTAGCATAAATGTGCTACATTTTATTATAACCACACAGGACACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAG:1 - chr3R 2156681 5' + mdg3 5136 1 68.69 GTAGTGTAAGCATCAACATATTTAGTAAGAATTCCCTGTTGAATTTTGTTAATAAATGAAAAAATAATTAAGTATAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATAT:1 - chr4 966772 5' + Tc1-2 417 1 64.36 CTCCCATTTCTACAGGAAGATTATAAACAAATGTATCTGTAGTTGAACTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTT:1 - chr3L 3945645 5' + jockey 4789 1 55.45 GGGGTACACTTCAAAAATAACAGGGAAAATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATG:1 + chr3L 2024329 5' + copia 47 2 73.27 CTTCCTTTTAGCTGAGTTTATGATAATTATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 19657464 5' - roo 361 2 70.30 CCATCAATTCAAGAGCAATTACAAAAGACAAACGGAGCAAGGACCCTAAACCTATACATATACACACTTACATACACACACACACACACACACACATTCAG:1 - chr2R 11051162 5' + accord 187 2 72.28 ATCAATGTATTTAACTTAATTGAGTACAAATTGTTGAATTAAAAATAATATAAACCATGATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATT:1 - chr2L 1750729 5' - roo 8663 1 53.47 AGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 5850017 5' - jockey 4948 1 63.37 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACACTATGTATATAGCGACCACGCCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGCCGGG:1 - chr2R 3262652 5' - R1A1-element 5155 1 52.69 GTCTATGCAAAATACATAACTTGCTGCCAGGAGAGCGCATAAAATTTACAAATTTCAATCTTATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr3L 7926319 5' - flea 5004 2 70.30 TTTGCCAATCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 + chr3L 14910559 5' + roo 8684 2 59.41 AATTANCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 - chr3R 26469487 5' + hobo 49 1 77.00 ATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCG:3 - chr3L 19350009 5' + 1360 3216 1 42.57 AGAAATAAATAAATAAATTCATGTATGCCATACTTATGTGACATAAATATAGAATTTATGGCATACACGAGTTGGCATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAG:1 + chr2L 8956527 5' - Ivk 5087 1 73.27 AGGTAAGGTGACTCCTCCATTTTTCTATCGCCAAATAATTACATATTTATTTGCAATTTTACTGCTGTTCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATAC:1 - chr2R 12180699 5' - accord 90 2 76.24 ACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr2R 5485087 5' + 1360 52 1 78.22 ACATTTCTTCGTGTGTAATAAACACCCCTCAATTTTTACATAAGAAAGCTGTCGACTGCGCTGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCATATATATATATG:1 - chr3R 15564547 5' - blood 191 2 62.38 ACAGGTGATCGGCGGCAGCACAACAGTGCTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCT:1 + chr3L 12547719 5' - 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chrX 5244152 5' + INE-1 538 1 31.68 GAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 + chr2L 20118702 5' + Max-element 8279 2 66.34 TCGACTGCCAGAAGCTGGCTATCTCTCTTGTTTATGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 21708671 5' - roo 9033 1 65.35 TATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTC:1 + chr3R 556456 5' - Tc1-2 1587 1 60.40 GTGGCAGTGGGCCTCGCAATTTGCGAGCTTTTCAGTTGACCCAAAGCCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr2L 1828845 5' - 412 466 2 52.48 TAACTTTTTTTTATTAAAAATCTTCAGTCTTTACCCATTTTTGAGTATAGAAAGCTTTTGAGCAGAATCAGTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTG:1 + chr4 885420 5' + INE-1 112 1 76.24 ACGCTCTCTCGGGCGTTCCGCCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2L 15333764 5' - P-element 2835 1 27.00 TTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 - 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chr2R 20922653 5' + TART-B 152 2 72.28 ACCTGTCGCGGTGCAAAAAAGAACCAGCAGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 + chr2L 7350749 5' + mdg1 7085 2 68.32 CAATAGAACCTGAGCGACTTGGAATTCAACGCAACAACGCGTATTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCACACATCGAGCGGTCAATAACCCAT:1 - chr2L 21874154 5' + F-element 308 1 78.22 ATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr2L 14260734 5' + 297 6610 2 59.41 ATAACATTTTCGAGAAAGGGAATTCTAATGACTGGGCTCGCTTTATGATTTCAATGTTGGTTTTTGAAGCGTTTCCCCATAGTTCACAGCCGTATGTCCAA:1 + chr2L 1300130 5' - Doc2-element 4362 1 68.32 AAAAACCCCTCGCAAAAAAAGGGAGCTTGCTGTTCGCCTATTCGAAAATTTCACTAAAAATTGTTGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTC:1 + chr2L 2198076 5' + P-element 253 1 64.36 TTTCATACCCTTGCAAGGAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 12779177 5' + roo 14 2 68.00 TAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 23146477 5' + 1360 22 1 57.43 CGGTGCGGGATGGCGACGTGATTTCTGTGGCGCTCTAGCCTGTCGTGGTACCGGCTC:1 - chr3L 1535852 5' - BS3 1480 1 66.67 CCATAACATTCTGCCGAAATAAGGCCAGGCAAAGTTAATGTTTTCCTACCCCCTAATTTAATCACTATTTTTTCATAGCACTGCTATTTCATTGAACACCA:1 - chr2L 10249430 5' + HB 1428 1 57.43 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCG:2 + chr3L 27396714 5' - gypsy6 7789 4 56.44 TATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTC:1 + chr3R 21695444 5' + 3S18 5805 2 63.37 AGTGTGTGTGTTAGTGCGAATGCGATTGCCATGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCACGTAC:1 + chr2L 19016749 5' - BS 4777 1 69.31 AAGTAGATTTGAACGCTTGAACAACTACCATTCAATGCAAAATTAAAGGCTTTTTGTTTACCCTTATGGATTTTGTTATTTACATTTGTTTGTTTATATGT:1 + chr3L 8049503 5' + S2 103 1 70.30 TAAAAGTCCCACAAGAGTACAAACTCCTCTGGAACTACATTATTTTATCCGTTACATGTAGAGTAAAATAAAGTATATATTGTATATTCTTGATCAGGATC:1 - chrX 132345 5' + INE-1 80 1 63.37 GGATTCTTAATTAAATTCAGCCAAGACAAGAGGTGGTTAAGAATGGTTGGGTTGGGGGGGGGGTGGAGGAGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGCCAAGC:1 - chr3L 9109863 5' - R1A1-element 4897 1 77.00 TGGTGAGGGGCAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 10457262 5' - roo 9051 2 57.00 AGAGCATCTGCGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2L 13060345 5' - P-element 2868 1 60.40 CAGATTTGCCAAAAAGTTCACTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 - chrX 1954518 5' + Tirant 8137 2 53.47 TGACTCTGCATTTGCATTTCTTAGCCAGCCTTTGGAGATCCATTGTGGCGATCGATGTTGCTGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTG:1 - chr3L 4441925 5' - Quasimodo 318 2 70.30 TGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1 - chr2L 15893749 5' + Max-element 8284 2 75.25 AATACTTACGTTATAGGGGCATGAATGATTCATGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3R 12894071 5' + blood 7013 2 73.27 TGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 - chr3R 13423347 5' + 17.6 43 1 77.23 TATGTTACTGAACAATTTTCCCCTGTGCATATACAAATATGGCCGGCTACTTACACATGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCT:1 - chr3L 7175167 5' - roo 8775 2 66.34 CACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTG:1 - chr3R 2533952 5' - gypsy8 4812 4 52.48 TCAGANCTGTAACATTCCTGTGAAATATGTAACAACTGTGGCCAACAATATTGTGAGTATCTTACCAAATATCTTAATATTTTAATTAATATTATTATATT:1 - chr2L 17761338 5' + Tc3 274 1 52.48 GAAAATAGTGAAATGTTAGGAAAAATTTTGACGGCCGGCTGTTTCGTTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chrX 8243257 5' - P-element 2860 1 52.48 CGATCGAGGTGCAGAGTTGAGATCCAGCTCTTCAGATTTTAGGCTTGTGAAGCTGCTCAGCCTCGACTGCTCGTCGTCTTTATTCTTGGTCTTAAATAAGC:1 + chr2L 8266484 5' - ZAM 8258 1 53.47 AAAGTCTGTTGACAAAAATGAGGCTGACCAAGAGCCAAAAAGACGAACTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATC:1 + chr3R 19448112 5' - 1360 21 1 57.43 CATGCAGTAACAAGTACAACAATAACAGGAAAGGTACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2R 9277523 5' + roo 41 2 66.34 AGCACAAAACAGAGGAAGTCACTAAACAGCTGAGCGCGGTGTTACCATAAACCACCACGCCTACACAAGTAGGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATA:1 - chr3L 20129191 5' + ZAM 72 2 58.42 ATTGTTTCATGGATTTTTTGATTCGTTGTCGCCTTCAAAAACCAACCAAATGAGCGCATGAAATTCCCCGGAAGGAGTGCCTCCGTACTAAAAAAAAAA:1 - chr3L 5723765 5' - Rt1b 5038 1 57.58 TCTGTTTAAGTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 - chr2R 22605987 5' + Juan 4055 1 52.48 TACGTCATGTAGGCCGCCTGCCCATCAGTCTACAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGG:1 + chr2L 17210100 5' + jockey 4711 1 65.98 CTCCTGTGTCGCTAATATTTTTAGTTGTTATTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTT:1 - chr4 1152116 5' - transib2 2821 1 74.26 ACCTTAGCCTACATCCTCCTCTTAGGATCGACAATCAACAATATACATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3R 5054372 5' - HMS-Beagle 7016 2 56.00 AATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATACTAATACGATACGAATACTAATTCCTGTTACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 7112792 5' + roo 8680 2 67.33 AAAAAATTTCAAATGCTGCCTAACACTGGCACTAGAACAAAAGCTTTGGCGAAAGCTGCGCTGGCAGCTCGTCCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3L 11070468 5' + P-element 2 2 77.23 AGAAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3L 6024599 5' - roo 9036 1 62.38 TTAAGAGGTTACATAAAAATCGGAATTGAAACTGAACCAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTT:1 - chrX 11534010 5' + invader6 4498 2 73.27 ATTGCAATATTCTTTTTTGTAAAAACTAATCTCTAGCACACCTGAAGTTTTACTTAATTAACTGAAGCTCTAAAAAGCCAACGAAAAGCGAACAATAAAAC:1 - chrX 17193598 5' + TAHRE 228 1 72.28 GTACAGTCTACCCGGATCTGTATGAGCGCCTGAAGGTCATGCCCAAGGAGGAGCTGAGCCGCAGGCTGGAGGAGAGGCCATCTGGCCTCCAAGAGCTCGGC:1 + chr2L 2870071 5' + R1A1-element 464 1 68.32 AGCATAATATGCTTCACATTTTTGCTTCCACTCCGTTTCTCGCGACTCACTTCGAGCCGATCAAAGCTCTGTACATAAGCATGGTACATACAATCTTGCAC:1 + chr2R 4122579 5' + rover 6996 2 66.34 TTCTGAACTTTGAGAGTGTTTTCTCATCTCGTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACA:1 - chr3R 15284040 5' + Doc 354 1 69.31 AGATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chrX 4180786 5' - I-element 5303 1 75.25 CCTCGNCATCCTCATCTCCCGACCTCGCCTTGGGCGTAATCTTGAAGGGGGAGTAGTTAAGATAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAA:1 + chr2R 20824706 5' + Gypsy6A_LTR 26 1 66.34 GGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTGTTAAAATTCA:2 + chr2L 10291527 5' + jockey 4799 1 63.37 TCCAACGAAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCA:1 - chr2L 13837952 5' + 297 6597 2 64.36 GCATTTGTATCGCCGTTCAAGTTCAAGTTCTCAAGTTCTGTTTGCAGATATCAAATTGTGGTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chr2R 16817731 5' - 297 6942 2 63.37 ATCGTATCATCGGTGGGCATCTGTCATACATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTTCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3R 23665347 5' + 297 6596 2 63.37 GGAAGTATCAGGCATTGAACCGTGCTCCTTGCCATTATCACGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATG:1 + chr3R 10812086 5' - R1A1-element 4973 1 60.00 TTTTTGCCCCGTTTTTGGCTTTTCGAATAAAGCGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATTTAT:1 + chr2R 22980366 5' - S-element 135 2 72.28 AATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 19642994 5' - roo 353 2 79.21 GCGTTATTTTTATCTACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr2L 3694169 5' - roo 385 2 56.44 GGGAAATGCAGTCGCATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:1 + chr2L 7170354 5' + jockey 4610 1 69.31 CACTTCCCTTTGCACTGAAACAAATTCAATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 - chrX 14713295 5' + flea 4766 2 68.00 CTCGCTGCAGTCGTATGGGTGTGAGCGAGTTACCCAGCGTCTGTGTGTGTGTGGGTGAGCGTCAGCGATTGACTCAGGCACTTGTTCTGGAAGCGCTGTA:1 - chr3R 18568996 5' - G-element 3966 1 57.00 CATTCACGCTCATTACAAAGAAGTTCGAATAAAGATTCTAGAGACGCATCGAAAGTTTGTTGACCTATGTTGGCCTCGTCCACTCTAACGCCCACAAACCG:1 + chr3L 21914978 5' + INE-1 220 1 78.22 CACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTT:1 + chr2L 7459579 5' + BS 5039 1 68.32 GTTTGCAAAACGAATATATTACATACATACATATGTATGTCGCATATCATTTAAATGTAACGACATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGT:1 + chrX 22560083 5' + invader1 43 2 65.35 CTCAAAGTATGCCCCTTCGACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr3R 18507884 5' + jockey 28 1 54.46 TAAAAAGGAAAATCTCGAGGTTAGCGGAGGCAGCGGAGCAATGAGAAAAGCAACAAACAAAAAATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2L 16686521 5' - pogo 2098 1 67.02 TGTAGCCCCCTAACCGAAAACAGAAAACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3L 10035623 5' + jockey 33 1 52.48 AGCGATGTGTGTGGTGCCAGGGTGCTAAAAATGCCAGACAGCCCTAGCCATCGACATCGCATCCTTGTCGTATTTATAGCCACGTAAGCATAAGCAAGAAG:1 - chr3R 5436270 5' + Tom1 191 1 79.21 TAAGAGGGTTGTATATAATGCACTCAGAACAATTGCCACTTGAATCTATAATGAAATATAAGAATATAATATAATTAAGAATATTTAATTATTATTATAAT:1 + chr3L 10562324 5' - mariner2 828 1 76.24 ACTATNGCTGTTATATTACAGCTGACCTTAACTCGTCTACAATCTTTTTCTGTAGATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 - chr3R 28883451 5' + HMS-Beagle 22 2 54.46 CCGATGCCGTTCTTCGGCTGAACAACGTGTCCATCTGGGAGGCGGCCATGGCCGTCAGTCCGGGTTGCTTCGATTTGTTTATCAACATCGACGTTTCCA:1 - chr2R 20246927 5' - P-element 2559 1 75.76 AATTTTATTTTAAGCTTGAGGAATCGCGTCTGAGGTGGATGAATTGCAGCCAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACA:1 - chr3L 15900463 5' - roo 8918 2 49.50 TTGTTTGTCCAAATTGTTTTTACACTTTAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTG:1 - chr2L 17890632 5' - accord 271 2 72.28 AAGTCGGAGGTGTCCCTCTGTTGCCCATAACTATTTTTGCTTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAA:1 - chr2L 22032966 5' + 1360 309 1 53.85 TCCAAATAAAAATACTTTTTATTCAAAATCTTCAAGCTGGTGAGCCCCACAAATTTGAGTTTTGTTTGAATTTATTCATTTTATTTCTTTTGGCCACGGAC:1 - chr2R 16363436 5' - Stalker4 490 1 57.43 ACGCAGGTGTCCACGTGGTTCGCCAACGCGAGAAGAAGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTT:1 + chr3L 12707526 5' - Max-element 8496 2 64.36 ATTGCTTCGTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3R 31812695 5' - P-element 2841 1 37.62 TGCAAGCTGCACATTTCGTTTGACAAGCTCGTGCGATTTTCCATGTAAACAGCCTGTGGGCCATTATTTCGATAGGGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 6910056 5' - Doc2-element 233 3 69.31 GGAGAGACCACAGATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:2 - chrX 329094 5' - opus 483 2 64.36 TTTCGTTTCGAATATATCATCATGTTCATGTATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACT:1 - chr3L 19881851 5' + Idefix 6 2 73.27 CTGCATCTATGAGTTGTTGCGCCACCACAACATCGTGACCAATAGCAGCAGCAACTCGCTTGCAGCACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATAC:1 - chr2L 10743170 5' - Stalker 458 1 62.00 CCTCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chr3R 14169229 5' + blood 13 2 62.38 GAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGT:1 - chr3R 10741147 5' + 1360 3360 1 42.57 CCTTCNTCTTAGAACAAGAGACTAAAAAACCAAGGGAGTGTGAGTTTCTGAACTCAAACCACAACTTTAAATCCCCAAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr3L 18154107 5' + I-element 1 1 73.27 CATCTGCTCAGGAAAGTAATACACGTAGTTCGCTACAGTATTTTTATCAGACATCAGACGGCAAACATCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTA:1 - chr2R 3589956 5' + flea 4942 1 76.00 CGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAA:1 + chr3R 19609647 5' - Tabor 458 2 49.50 ATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAA:1 + chr2R 18295621 5' + I-element 44 1 67.33 GAGCAGCGTATTAAATTTATGAATTTAAAAAGAGTTAAATTTTGGAAATTAGAGTTTCAGCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 9947000 5' + roo 8674 2 67.71 GGCTATATAGACATATAAAGCAATACATAACAGCTAGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chrX 6997243 5' - P-element 2862 1 54.46 ATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 + chrX 21204997 5' - 1360 3352 1 61.39 ATTCCACCCTGATTTTCTGAGTCTGACTTAGACGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr2R 3188662 5' + 1360 14 1 64.36 AAAAANAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 + chr3R 4543201 5' - 3S18 293 2 70.30 CTAAATATGGAAAACAAGAGAGCTGCCAATAATAATCGTATACTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTT:1 - chr3L 26008076 5' - micropia 345 2 60.40 TCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chrX 19306768 5' + P-element 48 1 31.68 AAGATAAAATGATGCCTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:2 + chr3L 19349924 5' + 1360 9 2 66.34 TCGAAAGGGTTGAAACTTCCTGGCCGGGTTTTTTCTTTCCTTTTTTTTTT:1 + chr2L 5347964 5' - Doc2-element 252 5 60.00 ATTAATTAATGGAATTATAAATGAAGCTTAAATTGTATGTAAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAAA:1 - chr3R 31192677 5' + 1731 314 2 58.42 TCATGATTTCAGATTTTTTCTTATTAAATCGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAAT:1 + chr2R 7483261 5' - opus 421 2 70.30 CACTTCCTTCGTGTCATGGTCGACTGTGCGCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCTCTGATCCTGCCA:1 - chr2R 20451623 5' + Max-element 335 1 70.30 TAGCTTTGCATGACTTGGAGTTTCACTTCAATTGTATAAATGATTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGC:1 - chrX 10570278 5' + R1A1-element 84 1 57.43 GAATAAACGGACACTCTCTCCCATGCTCAAACACACACAAACACACAGA:1 - chr3R 9488746 5' + gypsy3 423 2 55.10 ACTTCGGGTGTAGCCCATTGGACTCTGACAGCAGAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCT:1 - chr2R 2678798 5' + G2 117 1 69.31 AGGTGGCTGGGGAGTGGGGCTGAGACCCACCTGTCAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGTAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGT:1 + chr2R 11818527 5' - Quasimodo 170 2 63.00 GAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAG:1 - chr3L 23678154 5' + Osvaldo 18 1 71.00 TAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAA:1 - chr2R 6779824 5' + 17.6 48 1 77.00 CGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTGTTAAAATTCATTAGAATAATCA:1 + chr2L 10291539 5' + jockey 4811 1 75.25 ATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3R 23665318 5' + 297 44 2 81.19 GAACGAAAAAGATAATGCACGCAATAGAATCCAGATATTGTCTAGTAGAAATTGACCTAGACTATTAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGG:1 - chr3L 21709012 5' + jockey 139 1 72.28 AACCGAACGTCGCCCGGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 - chr3R 28728363 5' + jockey 11 1 72.16 GACCTGATGGCAGTAAGGTTTATCTTAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAACAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAAC:1 - chr3L 18155206 5' + I-element 5253 1 72.28 GGTTGCGGTATTTGCGTCAAGGTGGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3L 8974133 5' - P-element 2846 1 34.04 CTGACTCCATCGACGGAGCAAATTTTCTGTAATTCCTAATCTATTTATATATTTGTTCTTTAATTTATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTAT:1 + chr2R 7376194 5' + S-element 1614 2 61.39 CGACCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chrX 6654733 5' + P-element 57 1 22.77 GCAAAAACAAAAAAAAATAATTATAATTTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGT:1 - chr3L 14909102 5' + Stalker3T 4 1 93.07 GTGCAGTGGCTCATTGCACTTCAAAACTATGACTTAGGAGTTGAAAGTAATCGAAACTAATCGAAACACTACGAATAAGAAGTGTCAGCTTCCCGCTGCCA:1 + chrX 3428637 5' - gypsy 7090 2 60.40 AAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGC:1 + chr3L 22920390 5' + 1360 42 1 67.33 ACGCTCTTTGTGTTCGCTCCCTCTCTCTCCCACACACAACAGCACACACACGCACACGAGCACCATACTAGTGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 543507 5' - P-element 2882 2 75.25 CAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTTT:1 - chrX 21388559 5' - 1360 3343 1 71.29 ATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATAGGCTAGACTGAGATCTCCTAGGCTGTATATAAAAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCA:1 - chr2R 5953992 5' - aurora-element 4214 1 79.21 GCTTTGGCTTTGGCTTTGGCTTTAGCTTCAGCTCTGGCTTTTCCTGTGCTACTGTTTTCCATGATAACACTTTAAACTTTTTTAATTCTCTGAGGAAATAT:1 + chr2R 7252107 5' - transib1 231 1 58.42 GTAATAAAGTAGCCCAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr2R 12446396 5' + jockey 4681 1 65.35 CCTAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 18881543 5' - roo 351 2 80.20 CCGGGATCGGTGCGGGAGTTTTACGATTTCATACATTTGCTGCATCAGACCAATCTGGACAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATT:1 - chr2R 18854424 5' - opus 386 2 66.34 CGGAAATAAATATTCCGTGGAGCCAGTCTGCCGTAACCTCGCCGCCACAAGTCGGCAAGCCGACTCAGCATTTCTTGCAGCGTGAAGCAA:1 + chr2R 1394927 5' - gypsy 138 2 56.67 GTGTATCAAAAAACAGGACATTTTTATTTTAAAAAAAAA:1 - chr3R 4658191 5' + transib2 2629 1 56.41 AATCATTCAGGAAATAGCGTTTAAATATGCAAATATTAAATATGATTTCGCTAATTCGAAATTACAGAAAACAAACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCA:1 + chrX 8352148 5' - blood 377 2 78.22 CGGAGGATATGCCAGTGGTTATTGCGGTGTAATCCTCCGGACCGCCATGCTGTTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATT:1 - chrX 23082245 5' - hobo 2575 1 58.42 TGGTGGGGTCGACTTGCTGTCTAGAACGACTGCGATTACGCATATTGCTCGGTCGGTCTAGAAGCACATAACGGTTGTCCTGATCGTACGGTAAATCACTA:1 - chr2R 20619962 5' + Copia1_DM 179 1 56.44 AAAACAAAACTTGATACATAGTTTCGAGTGTGTTCCTTGGAAAAAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2R 10912164 5' - 412 463 2 54.46 TCGAAAAGAAAGAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAA:1 + chrX 14713190 5' - flea 237 2 65.35 CCACTTTTTTGTTCCCAATCACACAATATAAAGTAATTGTTACTTGTTCAAGAAGGTATGGTAAATTAAGTAAATAAAAAAAAA:1 + chr3L 16808072 5' + X-element 4719 2 63.10 ACGATAAACTGACCTATCAGCCGCAACAACTCGTCTATTTGTCCACTTTACGATTGGCCACATTAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAA:1 + chr2L 9142875 5' + Doc 4444 1 68.32 AAAATNATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 18012688 5' - roo 9031 1 67.33 GAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCACAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr2R 3188742 5' - 1360 3353 1 62.00 ATAACCGATCGCTGGAGCAACAGCATATTTTTTTTTTGTTAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTA:1 - chrX 16177236 5' - blood 491 1 67.33 GATATTTTAGAAAAGATATTACTCCACGGACTTAGTTATACACTCTTCCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 3694087 5' + roo 27 2 52.48 TAGGGAACCAGGAGGGGACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGC:1 + chr3L 14240804 5' + Tirant 12 2 69.31 TCTCCCTAAATGTACCCTTTAAAACCCACATACTGTTAGCTGATTTTATCCCTGCCACTTATCGAGTTACATGCGTATGTATTGTTATATATACTTACATA:1 + chr2R 17356876 5' - Dm88 21 2 75.25 ATTTTGCCTGTTTGCTCTTCTGGCCCTGTCTGTGGGCGAGGAATTTTGCAATTGTAAATTAGAAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGCGGCTTTTAC:1 + chr2L 11839958 5' - gypsy2 6797 2 54.46 GACGCNCATGAATGGATTAACGAGATTCCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCG:1 + chr3L 23112571 5' + R1A1-element 4906 1 71.00 TAAACTATTAAACTATAACTTTGGAAAAATTACTTTTGGATGGGCAAACGAAATAATTTAGTTTAAAAAGGTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTAAAGAG:1 + chr4 563716 5' - FB 909 3 63.37 CACACGTCGTTTGCAATTTTTCATTTTAATTTTCATTAGCGTTGGGGCTAGCGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCC:1 - chrX 1590115 5' - Ivk 194 1 67.33 GGGGATTTAAGACCCGCCAACAGCACCGCAAAATGCAGTCTCTCGCTCCATCTCCCTCGCACGCACACACTCACTGGGCGAATGAAGAAGTGGAAAAATTA:1 + chr3L 4626908 5' + Bari2 4 2 62.38 ATTTGCGACCAAAGAATAATCAGCTTACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr3R 4543264 5' + 3S18 5787 2 57.43 ACTTATGTTAAATGGTCCACTTAAGGGTGGGGAGCGTCGACATCATATCAGCTGCTGTCGCAAGAAGTTGCTATGTCCAAAGACACTAGAATATTATTATT:1 - chr3R 17615191 5' - Tc3 308 1 71.29 TAATGAACGCGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr2L 11065869 5' - P-element 2855 1 49.50 GAGAAGGAGTAGTAGAGCCATAGTGGAATTTTGTTTAAGTTTTTTGTTTCGTTTCTATTATTGAAACCAAAAATCAAGTAAACTAAACTAAAGTAAATTAA:1 + chr3R 30370908 5' + TART-A 13132 1 65.35 TTCGAATGAAGCAAAGTCCACTCATTTAGTATGTACGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAA:1 - chr2R 19461405 5' - S-element 1675 1 73.27 AGGAAGCTGTCGCCAAAGACAAAGACCCATACAAATTGCCAGGGAAGCCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAG:1 - chr3L 7569709 5' + G2 2657 1 60.64 AGCAACTGAATTTCGAGATATTAGTGTTTCAATTTCCATATATTGTTTCCAAAACGATACATATGTATGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chrX 14043919 5' - opus 7499 2 45.00 CTATAGGTTTCTTGCGCCTTAATCGAGCGTAATGTAATTAAATGCCGGGCCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGAC:1 + chr3R 29657854 5' - transib2 453 1 56.44 AACCGAAACCAGCATTTTGCTTTCATCCCTTCGATTTATTTTTGAAGTTGTACTTATGTACGCAGACGATGTTAAATTATACCTCCAGTACAAGGACACTT:1 - chr3L 12122241 5' + Q-element 598 1 55.45 TGGATGGGAAATGCAGTCGCAAATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGACCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAAT:1 + chr2L 7170349 5' + jockey 4598 1 75.53 GATATGCCATATAATTACATAGCTTATTGTCATACGCCTATTCAGCTTATTATCCAAGGAGAAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTT:1 - chr3R 8198578 5' - Tirant 388 2 68.32 TCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr2R 17394643 5' + jockey 58 1 71.29 CATAGTCGGCTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGC:1 - chr3L 6129873 5' + jockey 4701 1 52.48 TACGTGACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chrX 21401925 5' + roo 33 2 61.39 CGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTG:1 - chr3R 7388408 5' - HMS-Beagle2 275 4 61.39 AATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 17122437 5' - roo 9016 2 77.23 TCCAAAATAAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTT:1 - chr2L 16933646 5' + 3S18 5811 2 67.33 GACAACGCTGTATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCA:1 + chr2L 13447094 5' - HMS-Beagle 226 2 59.41 AACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGGCCGG:2 - chr2R 6869066 5' + springer 7189 2 76.24 AGTCGCCTTTGTGGGATATACATATAAAAAACAAGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCTGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAAC:1 + chrX 10445565 5' - INE-1 530 1 69.31 ATGGATGCTTTGAACATGACACAAATGCAAGGAATAAAGGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAA:2 - chrX 20879237 5' + 297 414 1 61.39 GGACGGCCTGCTGATAACGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3R 7360387 5' + jockey 12 1 73.27 TTTTTATGCGTTTTTAATGTGTAGCACATGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATAT:1 + chr3L 18127132 5' + BS 4833 1 72.28 GCTACGGACTCCAGTTTTAACAGCACCTTGGCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAG:1 + chr3R 24330357 5' + Max-element 8351 1 69.31 GTGGTTTCTCCAGTTGCGTATAAGCCGGCGGTGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACG:1 + chrX 17086535 5' - Doc 421 1 63.64 ATGTACATTTTACAAACAACTAAATATGTGGATCATGTCAAGATATTGATGCCATGCTCCCGTTCAAATTTCTAAATTAATTTTGTTATACAAAAA:1 + chr3L 11183519 5' + Juan 4067 1 80.21 TATCCTTTGAATGGGTTTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2R 10912091 5' + 412 30 2 54.46 AAACTGCCAGGCTGTCATATACAGACATACAGTCTAGTCTGGCTTGGAGGACCTCACTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAAATATGAGTTGCATGACCCT:1 + chr3L 3338067 5' + Cr1a 4165 1 59.41 CTGAAATTATTTATCATTAACCTCTTTAAGTGCATTTCAAAAAGTGCTTGATGTTTGATTATAATAGTCCCCATGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTAT:1 + chr3R 8858785 5' - Bari1 1621 1 77.23 CCCTTGTTGCGAAGGCTTCGGGGCACATGAACCCTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGC:1 - chr2L 18028282 5' + flea 4753 1 61.39 CCTGTCGGGCAGCTAACCGCCATCCACGACACAGACAACGGACAGAGGGCAATTTTGGCTGCATAGTGCAAAACCAATGTATGGAAGTTACGCATCTTGTT:1 - chr3R 4051828 5' + 1360 3373 1 62.38 CTACTATGTTTGTTTCTATTCTTTTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGT:1 + chr2R 22605950 5' - Juan 4159 1 77.23 GCCACCTCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chrX 19457130 5' - roo 9055 2 63.37 ATTATTATATATACATACATATTACATACATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 19112059 5' + roo 49 2 77.23 CTCTTTTCTCTCCACTGATGCCTGATTATTTACTTCTTCATATTGAGCGTACATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATG:1 + chr2L 1926641 5' - Quasimodo 415 2 75.76 ATAATNCGGTGCCCAGAAAAGAAATCATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 21233032 5' + jockey 4997 2 69.23 TAAACAAGAAAAGAAATGATGAAATGAAAACCATTTAGATAAGTTTACCCACTCGATTGGCATGCTATATCCAACTCCAGAATTTATACCGTTACCTTCAC:1 - chr2R 18458342 5' + Chimpo 4214 1 77.23 CTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCCTATGTAA:1 + chr3R 9369946 5' + roo 8710 2 75.00 CACGCAAATGAGCGCAGTTCGCTCGTCATCAAGAGCTGCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCA:2 + chr3R 29384362 5' + jockey 4799 1 61.39 AATGGCGGAAAAACTTTTGCTTTTGC:1 - chr2R 15180204 5' + Bari1 91 1 80.77 AATCGGGCATATGATTTTAAAGAGGAGCCAATTCGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 + chr2L 17889334 5' - accord 497 2 65.35 AATGGAAAATGGGGAAATACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 10736454 5' - 412 7514 2 58.59 TTAGTGAACACAACTCCCCTGTTGTTTATTTTCTATTGCAAGCTAGCGCCCGTTGCGGGCCTTTGCCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGG:1 - chrX 19666163 5' - roo 444 1 72.28 GATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTCCAAATACGGAAAACAAAGTTC:1 + chrX 23439047 5' - R1A1-element 39 1 69.31 GGTGTTGCTGAAGATGTAGGTTTAAATATACATCAATTTATAACGCTTTGAACACTTCCTAATCTTAAGAACCCAAAAATGAGGCTCTCCCGAAATACAAA:1 + chr2R 3504544 5' + 297 209 2 55.45 GTCAACTTTATTAGAGTTATATTAAAAGTTTAGGAAAATCAAAGAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chrX 17132534 5' - pogo 2071 1 59.41 TTTTATCAAACTACATTTTGTGTTCCCATAACCGTTAGATTCACGCCCATTACAGAGAACAATTTACACGCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCA:1 + chr2R 6778401 5' + 17.6 141 2 70.30 CGGAAACTCTCACATATGTACAACTTATTGATTTTGGCCGGCAAGAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAATAACACAAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 4555125 5' + G2 3076 1 73.12 TTTTCATTTAAATTTGTTTGCCAATCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 14910543 5' + roo 4 2 75.25 TCATCCACAAAGCTGGAGGACAAGCTAAGCAAATTCGATTACTACGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTC:1 - chr3R 25323697 5' - Doc 4350 1 56.44 TCGATTGAAATGCAAATATGGACACTACGATGCTGGGAAGGTGACAAGATCTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAA:1 - chr3L 9397923 5' + accord 417 2 55.45 ATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 + chr3L 25272569 5' + 1360 84 1 69.31 AATGAAGTGAAAAGTGAAATTACAACTAATCGTGAGCAAAGATCTGAAGTACATAGTATATTGAGTTTCAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATC:1 + chrX 16222646 5' + P-element 446 1 68.32 TGGACTCTCTTTTTTATTATTATGTTATCATGACTACTACTGCTTGTTTATTTATTTAAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACA:1 - chr2L 12074560 5' - Juan 4188 1 51.49 TCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 - chr2L 11551422 5' + Max-element 8250 2 64.36 AGGGAAAAAGTTATTACTCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr2R 8378687 5' + pogo 13 1 66.34 TAAGTCAAGTCTTTCTAGAAACGCATTAGTAATCAAATTTATTCAGGCCGCCAAGTCTTCGGTTGGAGGCAGCGGTCCCAGCAGAGCGCTTAGTCAGCGCC:1 + chrX 12729851 5' - gypsy10 5849 2 70.30 TCTGTAATCGGTTATTTTGTTCACTAAAATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 13202971 5' - roo 401 1 72.28 AACCGNGTGAACATTTTTCCACTCCCACGGCAAACAAATTAAGGCAAAGTTGAGAGAAGAAGAACTAACAGTTTTGGCGTGGAGGTTTTGGGGGCGGGGAA:1 - chr2L 17258661 5' - gypsy5 22 2 61.39 ATATTNTGTTTCCAATACATACATATGGTGTGTATCTAATGAAGGATTAGATCATATGGCATTTCAATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 - chr3L 9121909 5' - Transpac 306 2 75.25 TTTAACTGATAATTTTTTAAACAACAAAAGGTTTATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 12571481 5' + roo 8705 2 76.24 ACGCGGACAAAAGGCAGCAAACAACGCAGACGGAATGTTTCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTG:1 - chrX 3655098 5' - gypsy3 421 3 85.26 AGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr2R 19857396 5' + 297 34 2 72.28 AAATTAAGTATATATAATCTTTTTAACGATTTTCGGAAAAGCATGAGAATTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTCATTGTGTTCGCGGTTTGCCCTACCCT:1 - chr3R 5554969 5' - Gypsy12A_LTR 1963 1 66.34 ATTAAAAGATTTGTACTTAACATAAAACGTGAATAGTGTAGGTAGCTTTTTAATATTCCTGAAAAGCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 + chr2L 13566908 5' + FB 12 1 65.35 GGAGTGGCCAAATATGCCGAGCTCGATGCAGAAAAGATACCGCCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTT:1 + chr3L 12101148 5' + I-element 5013 1 58.42 TATTAACCACAGCATAATGCAGTATTTTTTGCATGAACTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTT:1 + chr2L 15893705 5' - Max-element 261 2 62.00 ACCCTGGCAAAGAGTCGGCGAAACGAGGACTAGCAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATT:1 - chrX 22678284 5' + I-element 480 1 70.30 ATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 - chr2L 11551385 5' + Max-element 8287 2 75.25 GGATGGCGTGCCTGAGAGCGAATAAAGTCGTGAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTT:1 - chr3R 27938065 5' + 297 6945 2 80.20 TCCACAATCTTGAACGGTACTTCTGCGTATTAAGATTAATTGTTTGGCCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAG:1 - chr2L 8739114 5' + Burdock 6217 2 52.48 CGGAAGGTCCTCTCGAGCAGGGAGTTCAGTTTTAGCGATCGCTGGTCATGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGTTGAGGACCTTTG:1 + chrX 16790781 5' - Bica 4754 1 55.45 TTGTTACGTTTTTCCGGATCTTTTTTAACTCTTCTTTGTATACTACTATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGA:1 + chrX 12729520 5' + gypsy10 5654 2 55.42 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGAGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 426 2 52.48 AAAAGGAATTATACTTGCATCGAAATTCTTTAGGTCATTGAATGTTTGCATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 + chrX 20364226 5' - opus 477 2 58.42 CGATGAGAATAATGTGAGTACGCTGATATGCTGACGTGTGACTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 + chrX 18200732 5' - opus 469 2 58.00 GGACAATGAGACAATTGATCGGAAAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTAT:1 - chrX 8499946 5' - mdg3 5296 2 76.24 GCCGGCACCTCCCCCACCCTCATCCCCACTGCATCCGCTGTCCACGGACTCATCAAGCAAAGCTCGCCGCACACGAAAATCCTCTCGCGAAGTCGCTTACG:1 - chrX 2045402 5' + Doc2-element 4575 1 55.45 TATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:2 + chr3R 19450190 5' + roo 59 2 53.47 AATTATACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACC:1 - chr2R 6869096 5' + springer 22 2 57.43 AAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:2 - chr3L 9925301 5' + Doc 34 1 55.45 GTGCCATGGCAAAAGATAACGCAGTTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCCCACGTCCAGTTT:1 - chrX 11512160 5' + FB 97 1 76.24 CAGCTTGCAAAGATTAATGATCAGTGCAGGCGCAGGACATGGCAGGATACGCCCAAAACCCATACTCTTCCACACATACACACTGGCGTGTGCCACATTGT:1 + chr2R 14538858 5' - invader4 2932 2 81.19 AAAATTTATTATTGTTAGAGAATATTCGAATCCCAAGGTGGATTAATTCAAACAGTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTATTTTTCTGA:1 + chr3R 19446053 5' + invader1 61 2 58.42 ACTAGATTAGTTGAAAAGTATGCAACAATATCAATGTTATACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCA:1 - chr2L 22211545 5' - 297 370 2 61.86 CAGGAAGACACGGAAGCAATAAAAAGTACGGGCAAAATCCGGATATAACAATTTGAATTTGTATTTATCATTATTTTACTTTGGTTTTATTTATTGAATTT:1 - chr3R 15095241 5' - F-element 4662 1 68.32 AAATTAGATATAAAAATTTTCTAAAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 11186666 5' + HMS-Beagle2 480 1 71.79 GAAAACTAGACAGTAATTGGAATTGACCCCGACTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGA:1 + chr3R 17708967 5' - jockey 4641 1 73.27 GAGTTGCATGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCAT:1 + chrX 21474404 5' + 1731 4336 2 75.25 CTTATTTCGGCACCAACTGACAATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chrX 495240 5' + 412 7081 2 50.50 AATAAGCACCATGAAGATGAATTGTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATA:1 + chr2L 7126009 5' - Doc 4580 1 68.00 AGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 + chr3R 29660255 5' - mdg1 7406 2 79.21 AAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:2 + chr3R 9369955 5' + roo 8720 2 86.14 AAAACCCAGACCCAAAACCAGAAAACCTCAACCTCAATAATGAAGTAATTGGCCGAATTTGTCTTGGGCCAACCACGAGGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGT:1 - chr2L 10794455 5' - R2-element 117 1 77.23 AAGTATGTAACAGGTAGCAGATAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTANAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGANTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 6227654 5' - roo 9043 1 54.26 CTCGATACAATTGCAATAAGTATACCAAAAACACATTATTCGCGCCCACTCTTACGCCACCAAACCGGCCAAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATT:1 + chr3L 25516809 5' + INE-1 254 1 58.42 TAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2L 19642993 5' - roo 9018 2 78.22 GATTGCATACTTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr3L 22324354 5' + jockey 4675 1 73.27 ACTATAACCAAAAATAAAAAAACCATTCATACTATAACCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chr3L 24204189 5' + Doc 44 1 64.36 GAGAACTTAATCGGAGGCACAGAGATGGAAACTTTTTAAGGGATATTAACCATAAATAAATATTATATATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTT:1 + chr3L 22231554 5' - 297 394 1 78.22 TTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAGTATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chr2R 10912107 5' + 412 46 2 68.32 GTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr3R 7993877 5' + Doc 48 1 66.34 TTTTTCCATATCATTTCTTCTTTATGATTAATGATATACCTATGTTTTTGTTGCAATAATATTCTTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr3R 19224827 5' - hobo 2928 1 68.32 CTTGACGTAGGCAACACATTTTAATCGAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGT:1 + chr2L 7459545 5' + BS 5005 1 66.34 GTCCAGAGGAAAGTAACGTTGACCCTAAATGGATCTGCTGAATACTACAACTATCGAGAGCACTGATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTC:1 - chr2R 9454341 5' + opus 4 2 75.25 GGGAATAGCGGATGTCTGCAATGGAAAATGGCACAATAAATACATAATACATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAAATAACAAAAATATCCACTCTG:1 + chr3R 10602919 5' + 17.6 7025 2 50.50 TATTTGTTGTTGCTGTTGTTGGCAAAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chr2L 7547973 5' + blood 1 2 74.47 ATTACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 7787239 5' - roo 9030 1 65.35 TCTACNTGATTCTCTTACCAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 + chr3R 7993832 5' + Doc 3 1 74.26 GCTCGCCTGCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 + chr3L 2800112 5' - blood 362 2 62.00 GACGGAAGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:2 + chr2L 15956013 5' + Max-element 11 2 68.32 ACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTT:1 + chr3L 18576724 5' + springer 46 2 74.26 AATAATTATCTGATAAGTACAACATGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 18717168 5' - roo 9029 1 73.12 GCCCTAATCAAAACATCTCACGTGACCGAAACTGCTCTAAAATGCAAATTTCTCGAGGCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 17127744 5' + roo 17 2 62.38 TTCTGGGTGCCATCCCGGCAGAATTGCTTTCGACTGACGATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2R 19936598 5' + roo 8680 2 62.38 TGCAAGTGAGAGGGAGACGGACAGCGAAGGAGACAGGAACAGAGACATCTACCGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGC:1 + chr3L 960086 5' + Rt1a 19 1 47.25 TGGATCACAAATGGTGCAACATGCAGTTTGCAGACAATGGTATGTGTTATTTAGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAA:1 + chr2L 16698310 5' - 17.6 7263 4 59.41 AAATGCGTTCTGAGCTCGGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTC:1 + chr2R 23495460 5' - 412 438 2 77.23 CATGATGTACATGGTTATATCAATTCCTTGTTTCTTAGAATGTAATAAATGCTTTCTATGCAAATAAGATGTTAATCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTG:1 + chrX 16891453 5' - F-element 4243 1 74.26 GCTAAGATGGAATCTCCGACGACGACAACAGCCTTCCATAGACCGCCGAAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGA:1 + chr2R 5621401 5' - diver2 4674 2 61.39 GAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCTTTTATCT:1 - chr3L 4048523 5' + 3S18 5793 2 52.48 GTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCA:1 - chr2R 12213977 5' - Transpac 264 2 72.28 CAAGAATCGTAATAAGCAGAAATCGATTATCGTCCGCTGATCTTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTCCGTTTCTGTTGGATTCAAGTGCATCTGCTCTTAG:1 + chr3L 21602916 5' - Idefix 7155 2 66.34 GATCGGCGGGACAGGTCGGTGGGGCAGGGGGGCGGTACTGGTCGACAGGATTCGTCGGGGGGGCACAGGTTGTAGTTTTTGAATAACAAAAAATAAATAAA:1 + chr2R 13168332 5' + Doc3-element 74 1 68.32 AACTGATAATTTTTTAAACAACAAAAGGTTTATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 12571484 5' + roo 8708 2 79.21 TTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCC:1 - chr2R 12185401 5' + accord 33 2 59.41 AACCTAAAACACCATTTCTTTCGACAATTTACCTCGTGATGTGTGTGTTGTGTGTTTGTGGAGCAATGGTTTGTTCTAGTTTTTTTTTTTATTATGAATTT:2 + chrX 953259 5' - BS 5094 1 83.17 AAAAGGACTAAATCGGTGGAGAATTGAAAAGTCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCGATCT:1 - chrX 22638578 5' + INE-1 97 1 57.43 TTTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGT:1 - chr2L 14713286 5' + Cr1a 122 1 67.33 ACGTATATATTTCTAAATTTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr3L 7989821 5' - mdg3 5480 2 61.39 AATATTGCAGGTTAATTTCGCACTATATGAACATTTTAAAAAGGAAAGGAAATCCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:1 - chr3R 12894180 5' - blood 355 2 53.47 TGGTGCGATAAGCTATCTTAGCCGGCACAAAACACCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCAACCGCTGCAAGCAACATATCTAGGTATCAC:1 - chr2R 22855228 5' + Helena 893 1 73.27 CCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGAT:2 - chr3L 7989797 5' - mdg3 204 2 68.32 GTCTGAATATCCTTTTCATATAACCCATCACAATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAACTCGGCCATCCTGACTAGC:1 + chr3L 7296215 5' - invader3 5167 1 68.32 CTTACCTCTGCTCACATTGAGAACATCAAATAGTACGCATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 16517311 5' + hobo 34 1 62.38 AGCAAATATATCATCAAAATGAAATAGTGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTC:1 - chr2R 17665386 5' + roo 9026 1 72.28 ACAATGAAATTGTTTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 20466624 5' - roo 9053 2 61.39 TAAAAGAAATTGTTTGTTTTCATAAAACTGCTTCCATGCATGTATACTGATAGTGGATAAATACAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGT:1 + chr2R 7540538 5' - Stalker4 396 1 80.20 ATTCGCAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGACGGCAGATAGCTGGCGGGGTGGGCGTGCGGAAGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATA:1 - chr3L 17956554 5' - I-element 5179 1 58.59 TATGATGATTACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chrX 4154883 5' + blood 2 2 77.23 GGAGTGGGAAAGGACCTATTTTATGTCGAAAGACCGCATATCCTGGTTGAATTGGAAATGTCCGTCTGTCGGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAA:1 + chrX 665186 5' + INE-1 145 1 54.46 ATGACNTGTTTGCTTGCAGAAGTGGCGTGTTCCTCACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCCGTA:1 - chr3R 20553311 5' - R1A1-element 5241 1 75.25 GGCAGACATTTGAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 - chr2R 12214017 5' - Transpac 5223 2 74.26 GCCACGACCGCTCCCAAGGTGCTAAAGACATCCAAGATGCAAATCATCCTGGGAGTGGACCGACTGGACTACCACCAATAAGCTTCTCACAGCTGTTCGAA:1 + chr2L 4390984 5' - R1A1-element 211 1 73.27 AAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chrX 10251726 5' + flea 4781 2 55.45 CTGAGATAGCACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 6185924 5' - 412 453 2 65.35 CAGATCCCACTTTTGATATCGGCTCATAAGGATTTTGAGTGTTGTTGTACATCTTTTCTGTAAAATGTAATCTATTTTGTATTACCAAATAAATAAATACA:1 + chr2R 5503056 5' + Tc1-2 473 1 80.20 AGATTTTAACCTTTTAAATATAGTTGTATATATATATTTTTTTTTCTTTGCTTTTCTTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAAT:1 + chr2L 8340733 5' - F-element 4629 1 74.26 GCAGANAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr3R 25702192 5' + Tirant 8149 2 68.32 GAAACGTATGCTTTTGGTTTTTTTTTATTCTGCAGAAGCTTTCTGTCTTTTTTAGAATCCTTACGCTGAATCTCACCCTTCTAGAGTTTATAGTTCCTGAG:1 + chr2R 16256079 5' - INE-1 153 1 76.24 GTTGAATTATTTGGTTACAATTGATACAAAAAGCGGTAATTTCTAAAGTTAAGTTGGGAGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr2R 9364113 5' + Doc 21 1 53.47 CATTCCCCTTTCCTTGGCTTTATGAACTCGCTAAAGGCGGTAAATTATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 9304662 5' + jockey 36 1 51.49 AATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACA:1 + chr3R 19450120 5' + F-element 407 1 64.36 ATGTATTTATATTTATTTATAAACGTTGGTGAGCCCGACCTGATAGTGTTAATTTGCATGCATTAATTAATGCACTTATCCCGTTTATAAATAAATATAA:1 - chr3L 20987236 5' + diver2 439 1 81.00 ATCAACAATTTTTTTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACA:1 + chr3R 28710018 5' + invader4 325 2 62.00 ACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3L 9692719 5' + P-element 52 1 25.00 CCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 + chr2R 24965090 5' - P-element 2830 1 23.76 CAATGTATCTTATAAAGTGTGTAAAGTAACATTACATTTAAGAGCAAAAATAAAGTAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTG:1 + chr3R 24281939 5' - Max-element 8517 2 60.61 GTGGGGGCCTTGAACAGCTGTGAACGCACACGCTGAAGAAGAAGAAGTAGAGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 + chr2L 18694087 5' + P-element 21 1 61.39 TCTGTGGCGATGACGAAGGCCAACTTGAGTCTTTTGTCCGTCTTCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3R 19989870 5' - pogo 2073 1 55.45 AAACAAAATTTCGTCAAGCCCTATTTGCTTGTTAAAGCTGCAAGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCT:1 - chrX 14796922 5' - transib2 2794 1 55.45 GCCAACAGAGCAGTCGGGCATTAAGGCATTGTTCGCTTTCGGGTGGCATGCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCTCTGTAGCAACAATCATAGAGGCAGATCG:1 - chr2L 1247163 5' + invader2 4981 2 78.22 AGTGTAGGAGTTGCAGAAGAAGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:2 + chr3R 30272786 5' - P-element 2874 1 66.34 CAAACAAAAACGTTACTTTCTAATCGAAACAGCGAATTTAAATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATCAG:1 + chr2R 5217682 5' - INE-1 562 1 64.36 GTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCC:1 - chr3R 9952253 5' + Ivk 25 1 53.47 GACCCCTAACATGCTTGAAGGCGTGCGATTGAATCCCGGAGAGACTGGCCCTGGTTACCCATACCCATTATGGATTGTCTTTCTTTTTTATTTAAATAAAA:1 + chr3R 31207683 5' - transib2 2633 1 52.48 CTTTANGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr3L 19215859 5' - roo 9036 1 60.40 TCACTCTCGTCGGAGACGTCGTTTTTCTAGCATTAAGTTCTCGATTTGCCTGTTCCAAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATTATTG:1 - chrX 23157636 5' + Cr1a 4137 1 54.46 TATAGTGAAATCACTCTGAGATCTGAGATAGCACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3R 6185902 5' - 412 7528 2 59.41 TTTGTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACAT:1 + chr3R 28755943 5' + 3S18 38 2 59.41 ATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr2R 20702145 5' + Doc 55 1 77.23 TTCTCCGGCGGAGACCGTCTCCCACATGAGCTTCGATGGTTTCGGTACCCACTACGGATTTTAAGTGATCGATACTTAATTATTTTGTTTGTTGTTCTTGT:1 - chr3L 7505650 5' - gypsy9 404 1 76.24 CGCACCAGCACCAGCACATAAACCCACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 31644126 5' - roo 9051 2 57.43 AATTAATACGATGGGGCCAGGTAAATCAAAGTTAGATCTACAATGATTTAAAATAAGGGGTGTATAGTGAATCTAGTAGAATATACTTGGAACCGAGAAGA:1 - chrX 7768094 5' - Cr1a 4101 1 74.26 TTTAATTTCCGGTCTTTATTGTTATAGTTTCTTTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATGTATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGAT:1 - chr3L 15674702 5' - I-element 5063 1 66.34 GGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:2 - chr2R 12446362 5' + jockey 4715 1 68.32 AATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1 - chr2L 12074394 5' + Quasimodo 44 2 76.24 AACACTTCTTGAGGGACTAGTTCGTGACTCGGTTGTTGACATATACATACATATACAGAATCCATAATATCTTTAAAGATACACATTAGGTTAAGTTGAGA:1 - chr3R 4200360 5' + G5A 2787 1 56.44 TGGTCGTATAAATTCTGGCAACAAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 + chr3R 15998053 5' + pogo 15 1 66.34 GGACAGTCGCTCAAACAATATACTAAATCCGGGCTTAAGGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chrX 13347377 5' + roo 8674 2 66.00 AAAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr3L 20903853 5' + F-element 62 1 73.27 GCGCCATTAATGGCCATTCTGTCACTCGTGGGACGGCAACAGAATGGCCATTAATGGCGCTATCTCGCTCCCGCCATTTGGCCCTTTGGTGGGAGTCGCGA:1 - chrX 3527857 5' - Quasimodo 7055 2 62.38 GAACGCTCTCTCGGGCGTTCCGCCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2L 15333766 5' - P-element 2843 1 30.85 ACACACACTCAAGGAGGTCTACCGCAGTTAACGACTGTCCTTCATTCTTGAGTTTTGTAATTATAATTTGATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTGGAT:1 - chr3R 17915852 5' + INE-1 95 1 68.32 TTTTTNAAAGAGCTTACAATTTAATCTCACCGCCCCTAGTACTTATCTTGAATTTTCCGCAAGGAGCGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGA:1 - chr3R 4668600 5' - Max-element 325 1 62.38 GCATAATTCTGGACACTGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGA:2 + chr2R 924413 5' + gypsy3 3 4 76.24 GTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAG:2 + chr3L 23112569 5' + R1A1-element 4892 1 56.44 ATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - 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chr2L 9635356 5' - Juan 427 1 87.13 TTGCATATTCCTATAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr3L 15638218 5' + roo 8688 2 53.47 GCAAGTACGTATTAAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 12136351 5' - roo 9050 2 56.44 AGTCGNTAGCCTAAGTTACCTAAGTTACCTACGATGCTAAATTGTTTGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGCAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATT:1 - chr3R 5459065 5' + jockey 4937 1 59.41 ATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chr3R 19609641 5' - Tabor 464 2 55.45 AAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATACATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 - chr3L 9925301 5' + Doc 34 1 63.37 GCCCGAAATGTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 21097077 5' - HMS-Beagle2 492 3 88.89 GGACTTTCGTGGGGCTGAGGTGCCGCCGCCGTGTCTACGCCGGATCAACTGGCTCCGTAATTATAAAACTATGAGGCTGAACGACACTCGCGCCCAGCGTC:1 + chr3R 14486412 5' + F-element 201 1 64.36 ATTATTATTTAGATGTTTATTTTTTTTTTT:1 - 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roo 9036 1 59.41 GCTCCCAAATGGACATGGCCAGGGACATGATATGCTCGTCGTTTGATATTGTTACACGCTTGCGATCAATGCGGATTACTATGTTATATCAACTATTATAA:1 + chr3R 13267943 5' + jockey 4849 1 64.36 GAATGTTAGTTTTGTTTAATGAAATAAAAACCCCCCATGTGGTAACTAATATATTCAGTTATTATTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTT:1 + chr2L 12802051 5' - jockey 4895 1 67.33 CGATCNTTCGCCTCACGCATGTACATACTTTTAGCACCGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr2L 487170 5' + P-element 1 2 76.24 GGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 5974413 5' + roo 8681 2 54.88 TTCAGACACCCATGGGGGCAGAAACCCTTGCCTCAGATGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACG:1 - chr3L 24363932 5' - hobo 298 1 63.37 TTTGCCGCCTGGACTGTATCGGGTTGGATTGTGCTTCCTGGTCTTGGGCCTATATGTGACTGCATGGCGCTTTCTTTCAGGAGGAACAGACTCCTGGGCAT:1 - chr3L 25463796 5' + baggins 5273 1 49.50 CTGCGTTACTGGATCAAGAAGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 - chrX 21668957 5' - pogo 2078 1 55.45 TACAGCTTTTTCCAAGGAAACGTTGTTGCTACCTTTCACAGGGTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCC:1 - chr2L 8031319 5' + P-element 16 1 57.47 AAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAAACCAGAGAAACTAAGAAATACCTACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chr2R 15004754 5' - BS 5069 1 56.44 ACTTCTTCACCTACGTAACTTGATGTTTGCTTAAAATTCACTCATTGAACTTGCTAATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3R 19467958 5' - Transpac 292 2 62.38 GAACTATTACTAACTATTTAAAAGTTTGGCTAAATAACAAAAGGAGGATCCGGAGACAAAACCAGCGGCATTGGCTAATCAACTCTAACCTAAAAAATAAA:1 - chr3L 25256094 5' + Burdock 372 1 70.30 GCGAATTAAATTCATAATATTTAGCTTTCTTCCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTAGACAGGCCCCGA:1 - chr3R 29350192 5' - opus 7200 2 69.31 ATTATCACCAAATACTGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTA:1 + chr3L 15056301 5' + BS 5016 1 77.23 GAAAAACGGTTCAGGGGTTGAAGTTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3R 24152935 5' + P-element 26 1 54.46 GGTTGNATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3L 19215852 5' - roo 9029 1 67.33 GCGGGGCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr2L 18914616 5' - mdg1 7438 2 57.43 CTCCAGCAAGCCTCAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr3R 18507895 5' + jockey 16 1 68.00 GCGAACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr3R 27080698 5' - HMS-Beagle 7016 2 70.30 GACGATGGCGCAAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr2L 6255769 5' - flea 219 2 61.39 CAATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 326118 5' - roo 9053 2 60.40 GAAATGTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTC:1 + chr3R 19450118 5' + F-element 378 1 48.65 GCAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr2R 24965072 5' - P-element 2848 1 40.59 TACATAACTTGCTGCCAGGAGAGCGCATAAAATTTACAAATTTCAATCTTATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chr3L 7926331 5' - flea 233 2 58.42 TGATATGCCCACAATATTTTTAGTTTCTCCCACTCAGTTTTAGTAATCCCACTCAGTAATGGGTATCTGACAGTCGAGGACTCGACTACAGCGTTCTCTCT:1 - chr2L 13558509 5' + INE-1 576 1 75.25 AAATGAGTCGAATCGATCTTTCGACCATCGCGATCTAGAATGTGTAAACACAACCGCACTAACTGCACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 21978074 5' - roo 9060 1 66.34 ACTGTAGATGGCCTTGGCCAAGGCATCCCGAGCATTGCTTGCCTCGTAGATCTTTAGAGGAACCCTTTATTCGATATCCTCGACTATCAGATACCCGTTTC:1 + chr3R 24257041 5' - INE-1 551 1 65.35 CTCCGATGCAAATGCTGATGACCTTGGTGGTACGAAGGTCATCAGCATTTGCATCGGAGGTCACATCGCACACACTCACACACACACACACACATCATCA:1 + chr2R 17499001 5' + accord 186 2 70.00 GGTTCACAATACTCTCTACTATTTCATATATTGCATATTGCATATTGGTTACGTTAAGGGCTTGGTCGCACGGCTTCTAAGTGCTTTGACTAATTTTCTGA:1 + chr2R 2878942 5' - G4 306 1 65.35 CTAATATACCCTTTCTGTAGTTAAGTAGATACTACTCTTAAAAGCGACTAAAGGGTGAAAGGAGGCGCACTCATGGCCTACACTGAAGGAAGAGAGTGTGA:1 + chr2L 2765967 5' + Rt1b 4933 1 59.41 TAAGAGAGCCAGGTATTGTATTCGATTGGACTTAATAAATAGATATATAGATCGAGTGTAGCCTTGCACATAGTGCAAACCGCTGTTTTCGCACGCATTTA:1 + chr2L 22215285 5' + diver2 108 2 64.36 TTCATAATTCGTTCTTAAGTTCCATTCTAATCTATAAGGCATTGCATGTTGTCGGCTCATTTCATTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAA:1 - chr3L 6738297 5' + F-element 4475 1 71.00 CCGCCAGCCGAATGCAGGCGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr3L 8063876 5' - P-element 2831 1 23.76 CTTGGNGGCACTTTTGAGACCAGGAGAGCGCAAGCCTCTTAACAGCAGCATGCATATATATTAGCAGCGGTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGATT:1 + chr2R 20467052 5' - mdg1 31 2 83.17 TAAATGCTGGCCAAAAGCATTAACTATGATTGATCAAATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3R 23665262 5' - 297 6941 2 67.33 ATTACTATTACATTTTAATATTACAGTTACACAAAAAAAATACAAAAAAAAAAAT:1 - chrX 4091534 5' - hopper 143 10 72.73 CCTCGTATCTTGACTCCTTTGCCTAACACGTGAAGAGCGAGGGAAGGGAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCACCGAAGTCATACCTTAATTGG:1 + chr2R 14582172 5' + Rt1b 4975 1 58.42 CACGANGCTTCTCGCTGGCAAAGTTGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr2L 7548049 5' - blood 7340 1 76.24 GCGCTNAGAAACAATTCGGCGGATCCGGCAATTGCAGTTACAGCGTGGCAGGCTGCCCCGCGCACCCACAAGCTTGGAACAACACCACGCAAAAAGGCTCT:1 + chr3L 16386867 5' + G6 362 1 56.44 GACTGTAGAGAAGACGGCGAAAGACCAGCAGAAAGAGCCTGCCACCAGCGGCTTAGTATGCACAATTCTAGCACATAGCCAAAAAATCATTTTTGGCTGCT:1 + chr2R 17501553 5' - Cr1a 493 1 65.35 ATGGGTATCAGATGGACTCTCTTTTTTATTATTATGTTATCATGACTACTACTGCTTGTTTATTTATTTAAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATA:1 - chr2L 12074572 5' - Juan 4200 1 63.37 TGAATGGGCCGAGTTGACATATGAGGGTTTTAATCGTCATAGAAAAATAGCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAATACCTATGATTTACAGT:1 - chr2R 24805672 5' - HB 1577 1 60.40 GGGCATCTTCATCTGCTTAAGGCTGCCACGCCTCCTATCGCCATTCTATCCAGCCTCCCGCTGCCTGCCGCTGCTTTATGTGTAAATATATTTAGATGGTT:1 + chr3R 7449302 5' - Transib5 35 1 81.19 CGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3R 13715135 5' - P-element 2842 1 34.65 CCTGGTGTTTAATTAATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 + chrX 6605481 5' - opus 464 2 61.39 GGGGTACTGCTTCAAATTAGCAAACCTGTCAACTGTCAGTGAGGAAAGTGTTTTATTAAATTTAAATTGTGGATGCGGAACAGAATTTATTCTGTCTCCG:1 - chr2R 13664593 5' + TAHRE 10406 1 41.00 AGTGCCCGGCGACTTCGGTAGCTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2L 13244946 5' - P-element 2835 1 30.00 CAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 - chr3R 7388418 5' - HMS-Beagle 7017 2 58.42 TTAAACAGAACTGGTATGCTATGAAGGGTCATATTAAATCGAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACA:1 + chr2L 17631611 5' - S-element 1534 1 66.34 TTGGATGCAGTGGAAGTTCTCTGAGGTTATCCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 - chr3L 26644791 5' - HMS-Beagle 205 2 67.33 GGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCT:1 + chrX 23291027 5' - Stalker4 7331 4 58.42 ATGATTATATTCACACACCATATAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chrX 19306758 5' + P-element 38 1 39.60 CGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chr3R 30272827 5' - P-element 2833 1 25.74 AGCCAAGTACTCCAATCCGCCAATCTCACTCAGATCGCTTTTTTCTTCATAATTGCCGCCGTCTTGGTGGATGAGCATCGAAGTTGAAAATTATCACAAGC:1 + chr2R 16488829 5' - mdg1 496 1 76.24 GCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr2R 5849986 5' + jockey 59 1 75.25 GGTCTGACACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr3L 9692655 5' - P-element 2874 1 66.34 AAACTAACTCACTGATTAGCTGAGTTTTGTTTCTCTAGTTCTATGCAGCTACAAATTTACTCATTGTTTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 + chrX 12703617 5' + FB 9 1 71.29 TTCAGCAATTTCCACCGAGCACAACGTGGCAGCTGGTGTTCATATTGAAGTGTGCACCAAATCACAAGGGTTCTAGCCAAAACTTGAACCCTGGGATAGAA:1 - chr3R 19327190 5' - X-element 264 1 63.37 TTCTTNAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chrX 21668066 5' - Stalker2 370 2 51.49 TTCCGTTTAATTTGATTTTTAATTCTGATGACGATTACGACCTGATTTTGTATATATATTTCGTCGGGTGAATCCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACT:1 + chrX 5493911 5' + R2-element 330 1 81.19 TGCCAAGTTGAAACCGGAGTCAGACGAGGATTGGCGCTAATAAAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTA:1 + chr3R 27416655 5' - 412 7292 2 57.43 CATATCAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGA:1 - chr3R 1206460 5' - I-element 5331 1 54.46 TGCTGTTGATTTTAATAACTTTTGCCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chrX 13350764 5' + jockey 4792 1 55.45 CATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTT:2 + chrX 16798213 5' + diver 5929 2 63.37 CCACCGAAAAAAAAAAACGAGAATAAA:1 - chr2L 4026377 5' + Doc2-element 250 1 96.30 ATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr3R 7100991 5' - pogo 2069 1 61.39 AACAAGACCATTCCAATCCATTCGCCCCTCTAACACACTATTCTTGACAACCCGATCGGACCTCACGCAGCTGCAGAGGTTGTTCGTGTCTCTGCCGCAGC:1 - chrX 2329652 5' - invader4 2851 2 73.27 GAATTGGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chrX 13548743 5' + blood 7040 2 55.45 ACCACNGCGATCCCATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 1156723 5' + 412 7072 2 59.41 AGTTTAGGAGCCAAGCCGAATATAAACAACAACTAATGGTGAAACACATATTACAGGCTTTTGACGACTACGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATG:1 + chr3L 18032430 5' + Helena 381 1 64.36 ATACTTGTCAGAATGCTAAAATTTGAGATAACAAATTAGAAAATAAATTTAAGTTATATTGTTATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATT:1 - chr2L 1129165 5' - HMS-Beagle 7034 2 71.29 ATTATTGGCATTAGCACCGATTTTATGACCTCGCACGCGCTCAAAAAGCTTTAAAATTAAAAAATTTTAAAATTAAAATTAAAATTTTAAAATTATAATAA:1 + chr3R 13734695 5' + 1360 3058 1 58.42 CATGATCGATTTTCTCGCCTAACTACGCCCAACGTGCTAAGTGAATCCATTTATTTGTCTATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAA:1 - chr3R 19619844 5' - Tabor 432 2 64.36 CATGAACACACACACACACATATTCTCACATA:1 + chrX 7247060 5' + accord 192 2 90.62 ATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 - chrX 21667933 5' - flea 4986 2 59.41 GATCTGAGATAGCACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3R 6185921 5' - 412 456 2 62.38 CGACTCTCCTAGGGTGTTGTAACGCATTTGAAAGCATTCGATTTTTATGGATTCCTTGACGCATCTCAGACACTTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 + chr2R 11752795 5' - roo 406 1 76.24 AACGCNGGGCTTTGGGCCGAATTGGTTTCACGAACGAGCGGCCCGCAAAAGTGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:2 - chr3R 29660309 5' + mdg1 26 2 52.48 ATAATAAAAAATAAAAACAAAAGCAATAAATTAATTCAAGAAATATTTTATACATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCA:1 + chrX 3674755 5' + opus 18 2 61.39 CTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 13144981 5' - roo 355 2 78.22 CCGCTCGCTCACACCATTACAACTTACCACTGCAGCATGTCATAATATTCTCTCGCGCAAAATTAATTAAAATCGTTCTAAGTTGACAAATTAATAGTTTA:1 + chr3R 11320626 5' + HeT-A 117 1 58.42 TCTATTTATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 19192536 5' - roo 9035 1 64.36 GAGCCGTTCACATAATTGGTGTCAATTTCGAGTGCAATAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 + chr2L 12074495 5' + Juan 4055 1 51.49 AGCTTTTAAAAAGGCTCCGACTCTGGGGCGATGATAATGATGATAAA:1 - chr3L 7039970 5' + Juan 271 1 87.23 TTTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:2 + chr2R 8378602 5' - pogo 2063 1 68.32 AGTGTGGTGTGCCTTTGTTTTGTGTTTTGCGAGACTATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr3L 21841278 5' - P-element 2873 1 65.35 GAGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr2L 15333714 5' + P-element 26 1 51.00 ATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3L 19215802 5' + roo 40 2 65.35 TGGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTGTTAAAATTC:1 + chr2L 10291526 5' + jockey 4798 1 62.38 CCGCGAAAGCGTTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2R 17394610 5' + jockey 24 1 61.39 GAAATTGAGCGAAACTATACAAGTGTCAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAG:1 + chr3R 5764486 5' + Stalker 7007 6 77.89 TCAAAGTTTAGCAATACAATTGTTATATTTAAAAGACTATATAATGAGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGC:1 + chr2L 13739914 5' - 412 7518 2 56.44 TGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr2R 19936632 5' + roo 50 2 77.23 TATATCGAGTGTGAAAGTGAGTTATATACACTAAAACATTCAAAGTATTACTGCGCTAGCGATTAAGATATGAAAAGAAAAATAAATAAAATAAAAAATAA:1 - chr3L 13436786 5' + X-element 4719 3 67.33 TTTGGAAAAATAAACATGAAATGAAATGAACTATCGTTTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTTCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATT:1 - chr3R 9192575 5' - invader3 236 2 66.34 ATTTATCTTTCTCTTATCCAATTTTCTTATTAATCAATACACACAACTTGTATTCGTTTTATCGTTTTATTGAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTCA:1 + chr2R 4287697 5' - McClintock 6252 2 59.41 ATAATAATAAGAATACATTTAATTTACAAAATGCTTGGATTTCATTGGAACTAGTTCCATGCGCCCATGCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTA:1 - chrX 2789994 5' + blood 171 2 72.28 CATAGAACTATAAAATATATAAAGACCAAATAATTATGGAACCATAAACGCAGATCAATAGAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTT:1 - chr2L 7051352 5' + blood 370 2 66.34 GAAGCNCCGCTCAGCCAGCTCATATATTTCATGACACAGAATGGTAGGGAGTCGTTCCCCATGCATAATACTGCATTTAATATGACCCTAAATAAGAATCC:1 + chr3R 11443658 5' - Gypsy12A_LTR 75 1 58.42 GAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr3R 30272814 5' - P-element 2846 1 38.61 GAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2R 5849957 5' + jockey 29 1 57.43 CAAAGCTTTCTAAGCCATCCAACAATGTTAAGTTAAGTGCCACACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 - chr3R 16510910 5' + flea 4784 2 55.45 CACTTCTCCTTTACCGCCTGCGCATACAGCTTGGGCTGTCTTTCGGCAAATAGTCCATCCTTGGTGTCCTTGGTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCC:1 + chr3R 24661028 5' - jockey 4561 1 81.19 AAATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr2L 903796 5' + 1360 16 1 61.39 TTCAAGAATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3R 12571528 5' - roo 9027 1 73.27 CTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTT:1 - chr3R 19450008 5' + roo 404 1 62.38 GAAGCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 12452140 5' + 412 7082 2 53.47 GGTGCAAAAAAGAACCAGCAGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCA:2 + chr2L 7350758 5' + mdg1 7094 2 77.23 TCAATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAAAACCCGGTTG:1 - chrX 14713270 5' + flea 20 2 61.63 CCATTTGGGTTTCCACTCTCACAGATCTTTGTATAATATTTAAATAATGTAAGTGTCAATTTTGTAAAGTTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATT:1 - chr2L 10508052 5' + 1360 302 1 70.30 GTTGANTTGCCAAAAATGGTTATCCACCAAATCCTAAGGCTTAAATTGAAATAGTCCAATAAACTAATTGTTTATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 + chr3R 12766989 5' + 412 3 2 75.25 CGGTATTTGCGCGTTTTGCGCGTCTTACTTTGCGATTTATTGCACCGCTTGGCTGCGTTTCGCAATTTCTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTA:1 - chr2L 8030846 5' - P-element 199 1 71.29 AGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATAAGTTAAGAACACTCTTCTTG:1 + chr3R 29350683 5' + opus 7115 2 78.26 TCTGCCTGTCTCTCGGGTCTGCGGCATTGGGGTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3R 21296545 5' - P-element 2845 1 38.61 CAGGGACACCCCAATAAACTGCCAAATAATATAGGATATTTGCCAGTCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTATCGGTATAACGGCTGC:1 - chr3L 19574800 5' - G5 4559 1 64.37 GGTTAGTGCACAAGGTGTTTTTTAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 - chr3R 12844576 5' - 297 6914 2 77.23 TTAAGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 5018706 5' - opus 7487 2 59.77 GGCGTGCTAACTTGGCGGGGCGTGGCTGATTCTTTCCCTTAAATCATCTTTCAACTCGTTACGAAAAGCATTCAAGATATTTTAAAAAATATAAACATAT:1 - chr3L 8528569 5' - Tc1 67 1 71.00 GAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 - chr3R 1868227 5' + G-element 26 1 54.00 GGAGCACGTATACGATGTATGTATATAGTGTACTCGCTCCAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 + chr3R 21296493 5' + P-element 36 1 44.55 AGAACAGCACACACCTAAACACCCACTTCAAACAAACCGGGGAGGCGACGATGAAGATGGAACGCCCCCAGTCAGATTCACACTAGCTGAGAAAAGG:1 + chr3L 13777445 5' + INE-1 536 1 77.32 GCACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 + chr3L 11909954 5' + Tabor 53 2 79.21 AAAGAAGTCGCCGCATTGGAAGAGCAGCTACGAAAATTGCTATGCAAATAAAGAATACGGCCTCCGCCCACAGCCGCACGCTTCATCATGGTGACGATGAT:1 - chr3L 11278677 5' - Rt1a 4722 1 80.20 GACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr3L 14240820 5' + Tirant 8135 2 53.47 ACGCAAACCACAACTTTAAATCCCCAAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAA:1 + chr3L 18154158 5' + I-element 52 1 71.29 CATACNTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAG:1 - chr3L 22324349 5' + jockey 4679 1 68.00 CCCGGAAAATAACATATATGTGCTGGTGCTTCCACTTTGGAAATATTATTCGGTTTTAGGCACCTATATACAATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCAT:1 + chr2R 9454214 5' - opus 7498 2 76.24 CAGTGGGCTTATATCCGAAAGTCATCTATCTACCTGCTCGTCCTCGATTCCGCCAAGTCCCAATTGACCATGCTTGTCGGAGCAAAAGGGG:1 - chr3L 1314102 5' + R1A1-element 4895 1 79.12 ATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTNAGAAACTGATTTTA:1 + chr2R 19192543 5' - roo 9035 1 68.09 ATATTTATTTAATGAATCGACGAAGTCTGGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATA:1 + chr3L 14741641 5' + flea 4946 1 71.29 ATAAGTGTTACCCTCAAGTCCCTCCCTTGCTTAAAATTTCGATTTTCGGATTTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGTGTTCACTTCACTCAAAACAACCG:1 + chr2R 7088405 5' - F-element 63 1 60.40 TCTAATTTTTGTTTAAATACTTTACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTAT:1 - chr2R 7540628 5' + Stalker4 6986 4 56.44 CTTTACTCGTTGGAATAGAAACGATAAAAAAGGGAAAATCTAAACAAATTTGATTAGATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 + chrX 2884813 5' + copia 4889 2 60.40 CCCGAGAATAACCACTCAACTGCGAGGTGCTGCCCCTTTGGCGGGCCGGTGAGAGAGGCAGCTGTGCTGGAAGTTAATGGTTAACGGAGGGTGTGTGTAAT:1 - chr3L 8106081 5' - Doc4-element 212 1 52.48 AGCAGCAAAGGCGAGCGATTTAATTATATTTATTTTGAGTTAATTCTTGTCGGGTGAAAATCCTGGCGTGACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCA:1 - chr3R 15310354 5' - R1A1-element 4990 1 76.24 GGCTATTAGTCTTGTGTTTTTACATCCGTTACTCGTAGGTTAACAGGGTATGCTGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 + chr3R 5505215 5' - mdg1 7437 2 55.45 TTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2R 17394642 5' + jockey 57 1 70.30 GCTGTTTAGGTTAAGGTTATTTAATAATTGAACAGTCTAAAATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATA:1 + chr2R 6779742 5' - 17.6 489 2 75.25 TGGATGGCTTGGACATGGACTCACGGATGGATGGATGGTTGGATGGTTAGATGGTTGGAAAAGTACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGG:1 + chr2L 14273889 5' - 3S18 117 2 62.77 AAGCTCATTTCTGCTTCATTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr3L 8063857 5' + P-element 55 1 24.75 CACACCTACCATCATATCGCGATGTTGCGACAGGCACCCACAAAATATAAAAACAAAACAGGCATTTGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTA:1 - chr2R 18272009 5' + I-element 5225 1 61.39 AATTTTACAAGAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr2L 9389045 5' - 1360 3364 1 55.45 AGAGANAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3L 9692679 5' - P-element 2850 1 41.58 TTTAAGCTTCAAGTAATTTAACTTAATTTTTTAGTCGATCTGGCCCTGTCCGTCCATTCGTATGGACGTCGAGATCTAAGGAACTATAAATGCTAGACGGT:1 + chr2R 25238754 5' + INE-1 157 1 55.45 GATAGTCCCGCAGCTCCAGTGGCTTAGTGCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3R 18906608 5' + P-element 46 1 33.66 GTAACGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATATAATGTATAAAGATCAGGATCAACAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1 + chrX 15903345 5' + INE-1 124 1 72.28 AGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACAC:1 + chr2L 7170398 5' + jockey 4654 1 74.26 TTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTTGAGATTCAGCATAC:1 + chr2L 18159053 5' + INE-1 172 1 41.58 GAGCGAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr2L 13060275 5' + P-element 41 1 38.61 TTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 6997185 5' + P-element 47 1 32.67 AGACGTAGGGATTTGTGCGCACTCTCATTGTTTGTTGTTTGCTGCGGATTGTGTGAAGAACACGTGTAGTATGTACCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chrX 2050800 5' + 412 7069 2 63.37 TGCAGTTGGGAAAAGGGGTGATAACTTCGACACGGATTGAACGAATAAATAAGATTGCATAAATTTTAAATTACAACAGGTTATGGGCCCAGTCCATGCAG:1 - chr3L 5440280 5' + copia 278 1 70.30 TACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chrX 4154892 5' + blood 11 2 68.32 ACCATTGAGATTTCCAGGATCGGTGCTTGCTTTCTCACCTGCGTGTTTTGTGGAAATTTAAATTTAATAATCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAAAAA:1 - chr3R 7219289 5' + INE-1 311 1 46.53 ATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 + chr2L 15333724 5' + P-element 37 1 42.57 CATGANAACGTACATAAAAATGCCCGAGGTCATGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAG:1 - chr2L 13772440 5' + R1A1-element 369 1 72.34 ATACCNTTGGAAATCAACAGCACTTCAGACAACATCAACAGATCTACCAACAGCCACATAGAAGACACAACATCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACTTT:1 + chr2R 15469687 5' + 1360 230 1 57.43 CCAGTGAATTGGCTTTGCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr3L 5716947 5' + copia 31 2 54.46 ATGGCATCAACAAAAACACCAGCAAAAAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:2 - chr3L 5975676 5' - hobo 2925 1 65.35 AACTAATCGCGTGTTATCTTCTTCCAACAGCTATACTATCCTTGACCCATTTTATCCAGAAATAATAGTACCATGAAATATTTTATTTATTTAAAAATGT:1 + chr3R 5605833 5' - G7 1141 1 77.00 GTTGGATCGAAAGTATGCAACTTTTAATTCTAACAAGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGC:1 + chr2R 23945256 5' - BS 5050 1 66.34 GAGGTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:3 + chr2L 8740873 5' + Burdock 25 2 54.46 TATAAATATGCCCACGGCCGTGACTCAAGAAGAATGAAGCGTTTTGAACGCCACTATCTTACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTC:1 - chr2L 19908468 5' + Stalker4 7076 4 65.35 GGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 5084075 5' + F-element 43 1 59.41 GCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTA:1 + chrX 21087606 5' + mdg3 5289 2 72.28 AGGGGGAACGCGTGCCGCATAAGGACGAAAAATGAGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAAAACT:1 + chr2L 15955727 5' + Quasimodo 333 2 65.35 AAATAAAATGATATTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:1 - 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chr3R 7664462 5' + P-element 217 1 76.24 GAAGAGCAGGAGTCTCTTCGCCGCAGGCCCCGGCAAGTCAAGCAGCAGTGCGAACAGCAGCCCGGAAACCAACAATGATAACCGATTTGCCATTTTGGCAA:1 - chr3L 7338688 5' + Fw2 137 1 67.33 TTAAGCTTCTAAATTGCAAGTTTCTAAGTTTTTAAACAAAAGATACATGAAATACATACATGCATACATATATCCTTTTAAACATTAAACCTTCTAGCCAG:1 + chr2L 11893904 5' - Fw3 2733 1 66.34 TTGCGGTGCTATTTGGCATTGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATAC:1 - chr3R 15157697 5' - invader3 276 2 75.00 AATACAAATATTGTTCAATTCCTGCGAACAATAACTCGACGATAACAATAACTGAAATTGTCCAGCAGAAGGCTA:1 - chrX 3666399 5' + Doc4-element 2758 1 34.67 GCTGGATAAGTTTAGCTCTAGGTATAGCTCTTATTTTCTTTTCTTCTACATGCTATTTACACTCATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGG:1 - chr3L 6056769 5' - F-element 4522 1 71.43 ATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chrX 329081 5' - opus 470 2 56.44 TTTTGGATCTAGGTTATTTATACAAAGGTTGTAGGGGGGTGCTGTCCTGGAGTTTTCCAAATATGCTGAAAAGGAACACTCGAAGAAAAGCGAACACTAG:1 + chr3L 11132474 5' - GATE 197 2 74.00 AATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr2R 14381336 5' + hobo 43 1 70.00 CTTTGGAAATATTATTCGGTTTTAGGCACCTATATACAATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 + chr2R 9454248 5' - opus 461 2 66.34 GAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:2 - chr2R 9014469 5' + blood 47 2 70.30 GTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGAT:1 + chr3L 25889017 5' + gypsy8 312 1 73.27 AGTTAACCGAAAAAAATCGCATATCTGCGTATGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr3R 15998133 5' - pogo 2060 1 69.31 ACGAGCCTGTGTGTGTATGTGACTTTACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chrX 10730615 5' - P-element 2876 1 71.29 TATATGACCACCAGACATTATAATAATAAGCAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chr2L 13245009 5' + P-element 14 1 63.37 TCCAGTGCATCTGGTCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 - chr2L 11551436 5' + Max-element 1 2 78.22 TATTACTTTCAAAGAGCGTAAAGCTACGTAACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chrX 21401949 5' + roo 8673 2 69.31 TTTACACTTTTTTTTTTGTATGATTAAAATATTTTTTATTT:1 - chr3L 9236983 5' + NOF 345 1 78.05 GCCTCACATTTGGGAACAGACAAAATTATAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chrX 7259268 5' + Rt1b 5149 5 64.44 AAAAATCGGAATTGAAACTGAACCAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCC:1 - chrX 11533996 5' + invader6 20 2 59.41 AAACAAATGACTGATCTATTCATACAAAAAAATTGTATAGAAAAAAACGCAATTGGACCAAAGAAAGAGAACAAAATGTGAGAAAGATTTTTTAAACCTAT:1 + chr3R 4577428 5' - Tc3 18 1 77.23 GTAAAAGGGTATACTAGATTCCTTGAAAATTATGAAACAGGCAAAAACAAGAGTTTCCGACCATATAATGTAATATGTTTTCTTGATCAGGATCAACAGCC:1 + chr2R 4618504 5' + INE-1 87 1 68.32 AGAGCAATCATGAAGTCTATATGTAATTAGGTAAATCTCTTTATTCGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTT:1 - chr3R 21905802 5' - invader3 180 2 67.33 GCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3R 7993871 5' + Doc 42 1 60.40 TAAAATCTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCA:1 + chr3L 11597870 5' + P-element 2665 1 26.73 AGGGAAACGACCCACAGCACCCACTTCGGTTAATCTCGCTTGGTAATTAAGGGTTCATCGCCTAATGGCAAGTTAACACAAGCCAACGAACTAGATCAGTT:1 - chr2R 13591487 5' + Gypsy6A_LTR 10 1 73.27 GTTTACTTTTCCAATTGAATTCGTGTCGCGAACGGCGCACAATTTCAATTACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTT:1 - chr3R 7387594 5' + HMS-Beagle 174 2 57.43 ATTACTCTCAAGATTTGTTAAATAATCCAAATTTAAGAAATTTCTTTGCATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr2R 8560105 5' + 297 6604 2 57.43 TATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTT:1 + chr2R 10673406 5' - Tirant 8454 2 77.23 GTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAA:1 - chr2R 22605978 5' + Juan 4064 1 61.39 TTTAATTATAAAACGTTTATAACGTATTCAAACTTTTTAAACAACAATGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCAT:1 - chrX 20115008 5' - jockey 4655 1 53.47 TGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATT:1 - chr3L 14603318 5' - jockey 4940 1 74.26 AATTAATTATAATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chr3R 9369927 5' + roo 8692 2 58.42 CACCCAGTCTGGACTCCGGAATATCGGTTGGTTGTCATGACAACTCTGCGCGTGGAGTTTGAAGCCCACTTTATCGCCATAAAACCGCCCAAAACTGCCAC:1 - chr3L 18086233 5' + INE-1 351 1 63.37 GTGTTCGAAATGAAATATTTTCTTCACATTGAAAACGAACACCCCTCTAATCCGNNNNATTCAGGGTAACTCCTTCTAGCCGGATTAGAGGGG:1 + chr3L 12585100 5' - Helena 848 1 37.63 GAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 + chr3R 14169248 5' + blood 32 2 57.43 AAGTANGCAATATAAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chrX 10251713 5' + flea 4768 2 67.33 GTTATTTTGCTTTCCCAATGTATCTTAACATATATAGTTTGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr2R 20838665 5' - 1360 3352 1 63.37 GGAGCCACTTAAGCCTCTTCCTGGCCACAAAAACTAAACCCTTTCCCCTTACCATTTCAAGCTTAGCTGCTGTAACCACCAGCACTGTTGCCTCTCTTACA:1 - chr2R 18558259 5' + Doc4-element 279 1 51.49 ATTCAAAGAAATTTTTTTGAGTATAAATATTTATTTATTTATTTTGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr3L 5015827 5' - I-element 5304 1 78.00 TTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 - chrX 8948677 5' + blood 36 2 60.40 CATTGCCTAAGGTCAAAGTGCAGCAGCGACAACAGACGCCATTCGTGTCATAAATCCCGTTCATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATA:1 + chrX 14589185 5' - micropia 5127 2 54.46 GATTGTGCGCCACAAAAGAGCTTGCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTAT:1 + chr3L 5964233 5' + BS 17 1 52.48 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATT:1 + chr3L 22065790 5' + Tc3 315 1 66.34 ACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr3R 25633330 5' + Tirant 31 2 57.43 GCCGAAAAGAGCGAAATAAAACAATATAACTCCGGCGACTTCAACACGGATCACAACACACACCACTGTACACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCG:1 + chr3L 8162101 5' - Cr1a 379 1 63.37 GTCATTTATAGCGGGGCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr2L 18914626 5' - mdg1 7448 2 67.33 CGATGAAACGGACACAGAAGTGGCAACCAAGGTCAAAAATGAAACAGGCAGAAGAAAGCGTTTCCGACCATATAAACTATATATATTCTTGATCAGGATTA:1 + chrX 10480355 5' + INE-1 81 1 60.40 CTGGTGGTGGCATGACGCAGTTCCCATCCATACTGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 19076127 5' - roo 397 1 62.89 TATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 - chr3R 15943312 5' + jockey 4693 1 77.23 TTTTTTTTTTGTAATTTATGAGCAACTTGTGTGCCATTTGGGCTCCATTTAATGTCCGCTAACACGAGGCTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAA:1 - chr2L 10194813 5' + Cr1a 4004 1 70.71 TCAAGGTGGCAGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 - chr2L 15893777 5' + Max-element 8256 2 56.44 CCATTACTAAAATTTGTCCCTTGGAAGGAATAAAGTCTTTCCTTCTGGGAACACCTACCAGGACTTAGGCAGTCTAAGATTCTCCTCCGTGAATATAACCA:1 + chr3R 19448081 5' + baggins 5057 1 64.36 GGGGTGTATAGGAATTTGAATGTCCAGCTGATGCATATTGCAGTCGAGAATCTAAATAGCACCTTACTTAAAAGTTTGATAATTTTTATTATTATTTTTTT:1 - chr2L 15319117 5' - invader6 4386 1 79.21 GAATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 12571523 5' - roo 358 2 80.20 AAATTATGGCGCGTCTCAAGTATCAATAAGCCAAATGGGCGACTTGTTGCCCCCCCAAAAAACCATCCCTCTCATGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATAT:1 + chr3L 4578318 5' - F-element 4404 1 73.27 AATTGNTCCCGACTCTAGTATACTACCTATCTTTTCGAAGAATTAAACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3L 13994295 5' + P-element 6 2 70.30 TTCGTTGTTAACAACACGCCGTGCGCAATTATAAGTTAGGGGAAAAGACGAAAAAAGGAAATAGAAAAAAAA:1 + chr2L 19432678 5' + Doc2-element 237 1 72.22 CAACACAACAACAAAATCATAAAGGAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 + chr3R 7100976 5' - pogo 2084 1 56.44 GTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689426 5' - diver2 4474 1 63.27 CTTTATACGCATTTCCCTCGGCAATTACAGAATTTTCCTATTACGTTCTCCGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTATTT:1 + chr2L 4027475 5' - F-element 4687 2 86.84 GGCTAAGTTCATAATGTTTTAGTAAAAACTGAAATAGATATGAGCCTTTCTTTCGGCATTCAACTGCGATTTGTTTGTAGAGTTTGGAAAAGTACTGGGCA:1 - chr3R 11605552 5' - 3S18 139 2 83.17 AATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGGCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGT:1 + chr3L 15056318 5' + BS 5033 1 77.23 AAGGCAGAAAACGTAAAAATGGGGCCAAATCATCTATCGTTAGGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 + chrX 12294664 5' - blood 7384 2 73.27 GTACATTGGGCGCCGATACATATATGCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 31644212 5' + roo 8687 2 55.10 CAATGGCCCCGGCTTATTGTAGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTTCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACT:1 - chr2L 15151797 5' - R1A1-element 5304 1 47.87 ACCAACCACGTATATTTTTATTGCATAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTTCAGCCTTTGCTCTCAA:1 - chr2R 20398133 5' + 1731 231 1 73.74 TCAGGTGGAGATGGTGACTAATTAAGATTGTATACATTTAATACCATGCAAGATTAACTTAGCAATGCTTAAAGGAGCTGGCCTTTCTCTGAGTCCCTTAC:1 + chrX 19079327 5' - roo 479 1 54.46 TATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTT:1 + chr2L 13447104 5' - HMS-Beagle 216 2 56.44 ACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGA:1 - chr2R 6984374 5' - HMS-Beagle2 260 2 80.20 GAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr3R 22620198 5' + 297 6615 2 64.36 AACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATT:1 - chr3R 846259 5' - Stalker 6939 4 75.25 GAATTGCATATATAAGCGGTTAAAAAGAAAGGACAAGAGCAACTTAATTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTCGAGAATATGGTCAAC:1 + chr3L 19927475 5' - Ivk 5138 1 55.10 GAGCTCCACGCTTAAGAGAGCGAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGGGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 + chr2L 13060258 5' + P-element 18 1 56.84 CCCATCATGGGGATCCCATTCCCATTCCACACAAACATTTAATTCCCCTGCAAGACAGCAACAAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTA:1 + chr2L 2439992 5' - roo 8961 2 71.29 AAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTT:1 + chr3R 4543196 5' - 3S18 298 2 65.35 TATCCCTTTTATGCGGCTTGAACAAATTCGCAGCCTTTCAAGGAGTTTTTATTGGTTCCTCTTTTAGTTTGCTGCCATCCCCCTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 + chr3L 5215770 5' + hopper 139 2 66.34 CTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chr2L 18028685 5' + flea 4797 2 73.00 TTCTGATTAAATACGTTTTCGTTTTACTTTCAGATTGTTGTACAAAAATAAGTGGAATAAAAAGTCGATTCCGAAAAAGGACATGGAAAAATACCTTTGTA:1 + chr3L 23102089 5' - HB 49 1 59.41 GTGACTTGGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2L 11686068 5' - hopper 1375 1 66.34 CCACACAAGAGTCGGCATACGTTGCGACGTCGACTGCGGCAGCGACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chr3L 9692763 5' + P-element 9 2 66.34 AATTGTGTATCTAGTAGACTTTTTTTTGATAAGCCGAGAAAAATTATAAAATTTCGAATTCACACGATATTCACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGAC:1 - chr3L 21143441 5' + INE-1 561 1 63.37 GAATCGGTGTAAGGATCATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 + chr3R 25633305 5' + Tirant 6 2 75.25 GAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chrX 14713201 5' - flea 226 2 65.35 GCTGGATGCTGTGGCATCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr3R 26469521 5' + hobo 15 1 64.00 TAATAAAAAATTGATTTTATCATTGCATTATTATTATTATTATTATGTTAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTA:1 - chr3R 16626826 5' - I-element 5304 1 81.19 GGCTGAAATACCAATTGTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:2 - chrX 8031421 5' + roo 8700 2 63.37 GAAAAGTATGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTCCCGACCATATGAAGTACATATATTCTTGACCAGGATCAATAGCCATGTACGTCTGTCCGTATGAA:1 + chr2R 25257599 5' + INE-1 122 1 84.16 CCATCCAACAATACCAACATGTCCTCATTTCTTGCCCCATGGACATACGGACTTTGTTATATCGACTCGGATGGTGATAATGATCAATATATATATAAACA:1 - chr2R 21486832 5' - accord 6935 2 60.40 ATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2L 4189377 5' + 1360 39 1 63.37 AATAAAAAAGTGAAATCAAATATACCAACCAAAATAAATCTGGGAACTGAATAATCGAAAATACTCAGAATAATCACAAAAGCCGAATGGTACATTATAAA:1 - chr3R 6999711 5' + Porto1 4363 1 62.38 GTATATCGTTAAGACTTGGCACTTATTCTAAGCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGATGAGTTT:1 + chrX 2762107 5' - roo 9054 2 56.00 ACCCTGCAGATGTGGTACAGGAAGTAGAGAATATTCTTGTAAGGAGTTCAGTAAATAAATGATACCTTGTTAAGTAAAGTAAAAGTAAAGTAAAGTAAAGT:1 + chr3R 29516457 5' + TART-A 13150 1 79.21 GCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAG:1 + chrX 21772484 5' - 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mdg3 5204 1 54.46 GCACTNCGCATAGTCCGCAGATTGTTTAATAGCCACATCACTCTTTACTTTATTATATTTCCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCC:1 + chrX 2534589 5' - R2-element 3392 1 63.37 AAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3L 5975650 5' - hobo 2915 1 60.00 CACAGATTTACGACTCAAATGACCATGAACGTGTCGGTATGGAAATGTCTATATAGACGAGTACGTATCCGGCTCAGGGGAAACTCAACCATAGCATTCTC:1 + chr3R 19823105 5' + INE-1 573 1 69.31 GCAGGCCCAGTGGTTTTGTTTTTTATTTCGATTTTAACTCATTGCAAAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCA:1 - chrX 1425699 5' - Bari1 1704 1 52.48 GCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTCGCACTATGCAG:1 + chr3L 19349952 5' - 1360 3352 1 64.36 TACATTCCGAACACCAATTTTCTTTTCCGAGATTCATAGCGGAATGTGTTTCCATTACTATAGAGCCATTGATTGGTACATTATTTTTGTTGAATGGAATG:1 - chr3R 15914101 5' + HB 98 1 68.32 GCTCGGACCCTTGTCCTTGTTTTATATAATAACATTTTAATTCCCTTAATAGTGTATAAATTATTAAATGTGGTGGTGCTGCAGGGGGTCCCTCGCTGCAG:1 - chr3L 12963626 5' - gypsy3 356 2 58.42 AAGCACTCGCAAGAGGATTCGAATTTCAGAAGATTAACGATGCAGCATCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 + chr2R 23305388 5' + I-element 4 1 72.28 TGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTG:1 + chr2L 7459583 5' + BS 5043 1 72.28 TTAATTATTATTATTATATTTTTCAATTTCAATTTTTCAATTTTTCGCAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTA:1 - chr4 269159 5' + FB 235 1 70.30 AACTTAAACTCTTTTGCCTGTGCAATTTTTCCGATTAAACGCTGCGATTTGTTGTCAGTTAACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTT:1 - chr3R 15525844 5' - P-element 177 1 70.30 CCTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 + chr2L 18028672 5' + flea 4785 2 65.35 AGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 + chr2L 18112525 5' - transib2 2775 1 74.26 TGGAGGGTATGATGAAATATTGCATAGACTGGTAACCTAAAAGTTAAGCCGACTAATAAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAA:1 - chr2R 15837520 5' - Cr1a 4044 1 65.35 AACTTATCAACACTGCCAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 27189355 5' - roo 401 1 69.31 CTCACTCGCACGCATGAGTTAAATTTTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGC:1 + chr2R 8378578 5' - pogo 2087 1 63.37 TACGTCATGTAGGCCGCCTGCCCATCAGTCTACAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTA:1 + chr2L 17210100 5' + jockey 4715 1 67.33 ACCAGCAGGCATTCAAGGAGGGTCATCCCTACATAATTAGTATTTTATTCATTTGTAGCCTTTACATATAACCAAATTTAAATAATTAAATTTAATTT:1 + chr3R 24242528 5' - TAHRE 48 1 67.35 ACCAACTATTTCGCCATTAAGTATGGATTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr3L 3951113 5' - pogo 2063 1 70.53 GGTTATTTTGTTCACTAAAATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 13202980 5' - roo 9055 2 63.37 ATAAAGCGATGCATCGAGACATCGCAACCGGATCCACAAAGAAACCTTCTTTTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGC:1 - chrX 8759123 5' + F-element 376 1 60.40 CGTTAGGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 + chrX 12294701 5' - blood 7348 2 65.00 GGGGTTGAGTCAGCTGCAAGGATTGGCCACCAGACTTTCCCTGCAGACACAGCTTGTTCACAGCCCGCATTATTACTCCAGACGCGGTCCTCAATTCTGCA:1 - chr2R 20629792 5' - diver2 4426 1 58.42 ATATAAAAATAATGTTGATGTTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAG:2 - chrX 12294791 5' + blood 7012 2 78.22 CTTTTCCACACTTGACTTCGCATTTCCCCGCGATCTTGGAACCGCGGTATTCCCACCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGA:1 + chr3R 10041224 5' - 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hopper 144 105 63.89 AGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr2L 19642967 5' - roo 9044 1 54.46 CTTAAAGCGTTTAACGGCTCATTTATTGCGAAACATAGCCTCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3L 17699384 5' + 412 7089 2 58.42 CAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCAGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAA:1 + chrX 21907811 5' - F-element 4416 1 57.43 CGGCGTTATCTCCTCACCCATAGAAAGTTGTTGTTAAAGCAGTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 + chr3L 13994203 5' + P-element 31 1 46.00 ACATAATCAAAGTTTTACCGGGAATAAGAGCCTGAAACTGAAAGTGACGAGCATAAATTATAGCAGAATTCGATCTGGCCATGCCCGTCTGTCCGTATGAA:1 - chr3L 21731645 5' + INE-1 122 1 77.23 CGCCAAGTAAAAACAGACACAAGTGGAATCTCCACAGGCAAGACATAAAATATTTCTGAATGGACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGA:1 + chr3L 13773321 5' + 1360 33 1 68.32 AGAGGAGCGACTATCAAAAGTGACAGAAACATGTGGATGCGTCTCTAGTTTCCCCGTAGAGTTGTTGGCAATGGTAAACTTGTCGGGTTATGGGTGATTGA:1 + chr2R 21859494 5' - Doc2-element 402 1 65.35 CATACTTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCGACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGG:1 - chr3L 22324349 5' + jockey 4680 1 68.32 TCAGGCATAATAAAAAATTGATTTTATCATTGCATTATTATTATTATTATTATGTTAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCA:1 - chr3R 16626833 5' - I-element 5311 1 74.26 CTCGGTTTTATCCTGGAGTAAAAAGCATTTTTGGCACGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAG:1 + chr2R 22993267 5' - opus 7425 2 63.00 GGGGGCTGTGGGGTCGCGTTTTCCTCTCGGCTCGCAAAAATCAATATCTTGACTGTGTACAACAATTTTCAACGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 - chr3R 18906690 5' - P-element 2885 2 77.23 TCCAATAAGGCCAGGTAGCAGTGAGAAGCATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2L 326228 5' + roo 4 2 74.26 AATTGCTCAGGATAATTTTCGAAGGGAAATGCACACTTTTCTCAAGGGAATTTGTGTAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGT:1 - chr3L 10450671 5' + X-element 34 1 44.55 AAAATGCCATTTATTTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTG:1 + chr2R 12779072 5' - roo 396 1 64.36 CTTTCGACGCCCTTGGACCGCCTATTAGCACATTTCGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTT:1 + chrX 2589673 5' - copia 249 1 66.34 AATTTGCGAGCTTTTCAGTTGACCCAAAGCCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAACCGTCGGGCTGACA:1 - chr2L 1828828 5' - 412 7502 2 65.35 ATCGAAGCTAGCTTTAAAATTTCGGGATATATAGGACTCAGTTTGATCGTTGTGGTGAAGAAAATCAATAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTG:1 - chr3L 23773390 5' - 1360 3215 1 71.29 GGCGACGGTGGCGAGGCTGTCACCATCGCCAGCTCGCCGTCCATGCATCTGCGAGATACATTAGACAGTTTGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAA:1 - chr2R 11609430 5' + FB 6 1 73.27 TGGCATATATTTCCAACAATTGACCTAAATTGACCGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCA:1 - chr3R 8548604 5' + 17.6 7003 2 66.34 CGCTAACGTTTTCCCTATGAAATCTACATGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGA:1 + chrX 328989 5' + opus 14 2 65.35 TAAGCATTTCTCATTTTGATGTGTAAAATTATTTACAGATTTTGTACATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 - chr2L 21089238 5' + flea 23 2 56.44 AGGATACATTTGATTGATTTCTCATCAAATTTTCGCTTGTCTGTTGATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 + chr3R 779378 5' + F-element 47 1 61.39 AAGCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3L 11435579 5' - roo 9041 1 57.43 ATGGCTCAGGCTTTCCTAAGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGATCG:1 + chr2L 21657575 5' - invader4 2894 2 81.61 TTTCATTCCACTTCTACTGCTGCTGAGAGCAAATTCATGGTCAATGTGTCAAATTCCCTCAAGCGAAGTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTA:1 - chr3L 18031635 5' - Tirant 8323 2 70.30 GGCGAGCTTTTCACTATTGATAAGAATGGCAAACGTGCAAATTGAAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chrX 14530781 5' - 412 7509 2 62.38 AGGCAGAGTACACTGAGAAAAAAACTAGCTAGAAAAGCTGAAAATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCAT:1 + chr3R 13941424 5' + HMS-Beagle 460 1 60.00 AAAAAAAAATTTTTTTTCCTTATATGTTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3R 23445643 5' - 297 347 2 81.19 ACGTGTAATTAAATTTATATATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGGTGGA:1 + chr3L 20490711 5' + FB 33 1 64.36 TACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTC:1 + chrX 21772489 5' - gypsy3 6550 1 64.36 TGTTCACACCGGGAGAAAATTCGCATTAATCTAATTAGTTATAACTACGAATGGACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCCAAAGCACTGTATAAATGCCAGATT:1 + chr3L 15676753 5' - baggins 5341 1 59.41 CTGACGTTCGTGGGGCGTCAAATGCGTCTGACCGAATCCCAGTGTTCCTCGTTGTTCGTTTTGTTTGCCTCCTTCTGTTCCCTTTTTCCTTTTTTTTTT:1 - chr2L 13177613 5' - Doc2-element 233 1 69.70 AAGACCCTAGAATAACAAGATGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGC:1 + chrX 14317416 5' + 1360 91 1 76.14 CCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 1626537 5' - roo 9036 1 58.42 ACTTGAGCTATATATTCTTATATTACACTTACGTCGGTTACTGTATGTATATTACACACATAGCAACAGCTAACACAAAATCATAGAATGCCTTAG:1 - chrX 9214759 5' + Quasimodo 81 2 60.42 GGCATCTATATGTTTGACTATCTAATGGAAATGCAGATAAGCTGATCAGAAGTACTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCC:1 + chr3R 19815088 5' - accord 7069 2 61.39 GTCAATGCGAATGATGTGCTAAAAGTGTGAATGATGTCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTA:1 + chr2R 23299864 5' - I-element 314 1 63.37 CATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr2L 19679773 5' + Doc 48 1 52.48 CTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTT:1 + chrX 1427537 5' - Bari1 1670 1 59.41 ACCCTTGCAAGGAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 - chr2R 12779171 5' + roo 8 2 70.45 TGGCCAACTTAAAGCGTTTAACGGCTCATTTATTGCGAAACATAGCCTCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 17699391 5' + 412 29 2 51.49 AAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chrX 7809032 5' + roo 43 2 69.31 AATGTCTTGAAAGCGAAAATAAATGGTTTATATTTCAAATGATTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr3R 22277219 5' - 297 6949 2 62.38 TCTCTTTTTTATTATTATGTTATCATGACTACTACTGCTTGTTTATTTATTTAAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 - chr2L 12074555 5' - Juan 4184 1 54.00 TGCGTCTCTGGCGGCGGATTGCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chr2R 9014393 5' - blood 7379 2 70.30 ATAATTACATTTTATTATATATTATCCTCCAGAAATGACTTCTATGGCTCTGCAACCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCAT:1 - chr3R 19967685 5' + pogo 18 1 61.39 TCACAGCAACACAACAACAAAATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 + chr3R 7100970 5' - pogo 2090 1 64.36 AACAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3L 19215875 5' - roo 409 1 76.54 TCATTTAATGCCTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACC:1 + chr3L 20248289 5' - Transpac 5210 2 60.40 AGTACGCTGATATGCTGACGTGTGACTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 + chrX 18200748 5' - opus 452 2 74.26 ACAACAAGGGAAGGGGCTGTGTGAACAGGGTAATATAGCTTGTTGTTTGAGCGGATAGGTATTAAGTATTAAAACATGTTATGCATAGAGTATGTAGTAGG:1 - chrX 15194380 5' + G4 3743 1 58.42 ACAAAAACACCAGCAAAAAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chr3L 5975667 5' - hobo 2916 1 56.44 GATTAAGGGGTTCCACTTCGGGGAATTTGAGCGCAGAGGGGGAATATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGATGTGCGGAAGGGGAATTTTACAG:1 - chr3L 19588172 5' + R2-element 72 1 79.21 GGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACA:2 - chr3L 8924619 5' + Stalker2 47 2 68.32 ATGTTATTACTTGGCCTTGGTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTT:1 + chr3L 17122401 5' - roo 389 2 60.40 GGTCCAAAAGAGAGATAAACAGCGATGACAATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTT:1 - chr3L 20248379 5' + Transpac 25 2 55.45 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATAGATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACC:1 + chr4 1267786 5' + Stalker 295 4 66.34 GCTATATACTATATACGACAACACGACTTTGTCACACTGTTTGTTTTACTTTGCACATGTTCGTTTTCTATCAACTATATTACCATTATAAAATAAAAATT:1 - chr3R 9549130 5' - blood 6934 1 70.30 AGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 9862232 5' - roo 9019 2 82.00 ATGGCGATGCGGGAATGGTAAGCTCCATCGATTTCATAACAACTTAAGATCATATAATATCTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACAGACTGA:1 + chr3L 6992936 5' - INE-1 126 1 66.34 GAGCAATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGGGAGGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2L 326115 5' - roo 9056 1 63.37 TGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 12538474 5' - roo 9018 2 77.23 CCGTTAAGATATCGCCTGGTTGGTGGCATTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 8977363 5' + jockey 12 1 72.73 GTTGTTCTCTTCGGGTATACTAGAAACTATATACACATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2L 4009447 5' - pogo 2065 1 66.34 TGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr2R 9014419 5' - blood 341 2 60.40 ATTTTTAAACAAGTACGTATTAAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3R 12136359 5' - roo 9058 1 65.35 AGTGCCCTTATCGATTGGAATTTGTTGCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 7101083 5' + pogo 11 1 63.00 TGATACGCTCTTTGTGTTCGCTCCCTCTCTCTCCCACACACAACAGCACACACACGCACACGAGCACCATACTAGTGGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3L 543511 5' + P-element 1 2 79.21 CAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTAC:2 - chr2L 15893760 5' + Max-element 8273 2 64.36 CACCGGGGGCTTGTCGTCATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCA:1 - chr3R 14688348 5' + pogo 1 1 66.34 CTTACTTCAATATTCTTAGACTTTTTATCTACTTAAGTATATTAACGAGTTTATTATACAAACTAGAGAGGATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGA:1 + chr3L 22969031 5' - INE-1 561 1 76.24 GATTTTAAATTTCAATCAAATACGAATGCATTTCCTGCCATTTCATTTAGTGTCACTTTGCATTCGACGTTGTCAACACACACACACACATACATACATAC:1 - chr3R 15715452 5' + Quasimodo 39 2 66.34 ACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3R 25702189 5' + Tirant 8146 2 65.35 TAGGCAAACACAAGCCTCCGGCTTCTCGCACGAAAGCGACGGGTTGCGTGTCTGTCAGTGCGTCGTCTGGTTGAGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTA:1 + chr3R 19205715 5' - accord 7028 2 74.26 CTGATACTATTTTAATGAAAATAATTATGTTTTTCTGATGTACTACACGGTTTTTTAAGTTTACATTGAATATTGAATGATCGAAATGGGAAATGAAGACA:1 + chr2L 6151622 5' + G4 122 1 67.33 TATGTGTATGTAGCTACTGCATGCAGTAAAATCTTAAACTTAAAGCAAGGAACCTCCACTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAA:1 - chrX 6041355 5' + Doc 4234 1 73.27 TTCGCCTGGAAACTTATTCGCAACAACGGAATGCGAGCTGGGTGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 + chr2L 1828748 5' + 412 9 2 70.30 GCAAAAAGGACCGAGCTGCCCGCATCAAAGGAAGTATTTTTTTTAATATTTTAATTGGTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chr3R 31103122 5' + GATE 31 2 57.43 GAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAA:1 - chrX 1018148 5' + 1360 197 1 70.97 CATGGGGGTATGTACTAATTTTTTTCTTTTCTAACCATATCTGGCCTTATCCGTATGAACGTCGAGATCTCGGGAAATACAAAAGCTAGAAGGTTGAGATT:1 - chr3L 65381 5' + INE-1 164 1 62.38 GGATTAACAAAACAAAAACTTCTTCGTGTCACGACTGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTT:1 - chr2R 16366862 5' + hobo 5 1 73.27 ACACATAATTCGTTTGGTTTCACTATTAAATCGTTTCGCCCAGACTTAGTCCGGGCGAACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTG:1 - chr3R 25306391 5' - X-element 4541 1 49.50 GCAGACCGCCACCAGCTAAGCCCGCTCCTCCAGCAGCACCAAATCCGGCGAATCCTCCTCCAAATTTTTTGACGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGACA:1 + chr2R 11233272 5' - R1A1-element 323 1 68.32 ATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chrX 8977404 5' + jockey 56 1 71.29 GGGCGGCGGGCACGCGTGTGAGTCGCGCCTATAAATACACGAAAGTAAATCAAGTATATATTGCCATGGCGCTAAAACGTAAAAAAAAAAATATTGGAAAA:1 - chr3R 24137586 5' - FB 176 1 55.45 CAGAATTGATAGTACTGCATTAGCATGTTGATTCATCTGAATATTGAGTTACATACCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACGA:1 - chrX 18717232 5' + roo 18 2 65.35 TGTCAGTGAGGTCAGTGAGCAGTACGTTCCGTATGTGGTCCTGTTTGAGTAAGTTTGTAACAAAATTCAACTTGACTTAGAGAACGAACTTGGTTTTTCTT:1 - chr3L 24253465 5' - HB 1371 1 59.41 ATTCTGCATATCAGGACTCTGCTGACTAATTGAATTGAAATGCGATTATATATATATATACTAAGTAATATATGTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTT:1 - chrX 6608550 5' + opus 111 3 69.31 CCCCAGCTGGATGCTGTGGCATCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCA:1 - chr3R 26469526 5' + hobo 11 1 68.32 AAAACAAGGGCTTTATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 19095813 5' - roo 9045 1 52.48 GAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATT:1 + chr2R 9387315 5' - Stalker2 385 2 58.76 GATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chrX 4180785 5' - I-element 5302 1 76.24 AGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCG:1 + chr3R 9254933 5' + F-element 238 1 69.31 GTTTCTCGTATATTAAGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTAAAAGGTGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCG:1 - chr2L 15957525 5' - Max-element 277 2 56.44 AATTGGTGTCAATTTCGAGTGCAATAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAA:1 + chr2L 12074508 5' + Juan 4068 1 64.36 TGTTCTTTAAGGGGCTCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3L 5975584 5' + hobo 24 1 56.44 TTTAGGAGAGCTCGATGCGGAACTGTACTGCAAAATATGCCAAGAGTCACCCATTTATCGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTT:1 + chr2R 19541073 5' - Bica 279 1 60.40 CTGGGATAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTTTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAATAACATAACAGCGCATTTA:1 - chr3R 25796059 5' - BS 5043 1 63.37 ACCGCNTCGCCTTGGCCAGACTAAGTCCAAAAAGCTGACACCACATTCTTTTCGCTCAGACAGGGCAACGCATAAAATTCCATATACATACTTATAAACAT:1 - chrX 18777409 5' + ZAM 8157 2 74.26 GTTCGAAAGAGACAGAGCGAATGGGTGGGGTGGGTTGGTGTGGTTTGTGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGC:1 - chr2L 8104130 5' - G2 65 1 63.37 ATTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 - 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chr2L 1129153 5' - HMS-Beagle 7022 2 59.41 CACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 31644150 5' - roo 9027 1 71.29 GTATGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 + chr3R 26469447 5' - hobo 2899 1 74.26 AAATTGAAAACTTTATTTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTT:1 + chr2R 9375148 5' - HMS-Beagle 7033 2 73.27 TTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr2R 8378603 5' + pogo 39 1 72.28 AAGGGAGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTAGACGTTCATA:1 - chr3L 11826437 5' - INE-1 138 1 63.37 ATTTTAATGAATACAGTTGTATTTCATATAAAGATTTTATTGAAAAAAAAAACAAAA:1 - chr3L 9640143 5' + transib2 2634 1 77.19 AAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGT:1 + chr2L 18953048 5' - copia 210 2 75.25 GATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAA:1 + chrX 17204106 5' - Tabor 430 2 76.24 TTTAAGATATAGAAATGTATCGGCAGCCGCAGATTAACGATCTAGTCAGGATTGCTATGTAAATTGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGGATGCATTGTT:1 - chr2L 6914680 5' - Doc 282 1 71.29 AATTGNAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGCTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAAT:1 - chr2L 21570262 5' + Dm88 20 2 60.40 TTTAGAGGCAGCCTAACGTTAAAGTGCTGACTATGCATAAATCATTATTTGTCGATTTATTACATGGCGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGACCTGAGG:1 + chrX 8960792 5' + blood 411 1 61.22 TTAGTGATTCAAGTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 19076216 5' + roo 8686 2 51.58 GAGCATCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr2R 7481093 5' - opus 458 2 74.26 CAAGTACACAAGAAAGAACTTTATTAACTTATGCTCACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCA:1 + chr3R 2690748 5' - diver2 88 2 64.36 GCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCT:1 + chr3R 25796003 5' + BS 5012 1 58.42 CACTTAAAAAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 + chr3R 21695432 5' + 3S18 28 2 52.48 TGTCTGGCAAAAGCAATGAGATAGACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chr2L 2920932 5' - hobo 2887 1 76.24 AAATGCACAGGGTAGAGATGGGTTCGAGATGAAAGGCAATTTGGTAACTCCCGCGAGTGCCAAATCATCAACCCG:1 - chr2R 3877680 5' + Doc3-element 325 1 52.00 AGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGA:1 + chr3R 6147274 5' - copia 5072 2 75.25 TCCTATTACCCGAAAAACAACCAACTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCG:1 - chr3L 15375796 5' + F-element 207 1 76.24 AGAGAGGGATACATTTACAGAGCTATGATTTGAGAGAGATGGCAATGTAGTGCACGCCAGTGTGTATAGACATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGT:1 + chrX 16472005 5' + invader4 211 2 65.35 ATGAGGAAATAAAGGTTTAGTCTGTTAAATACGTTCATGCTAAAAAATAATCTAAGCCAATCTATATACACCGCATCAAAGTTTTTTTTAAAATAATTTA:1 - chr2R 14921644 5' + HeT-A 5801 1 67.00 CTTTANGCGGTAATCTTTGTCTCCATTATCATAGCTTTTCTCAATGCGTCCGACAGAGATAAATGACTAATATAATTATGATAATCGTTGTCAACCCTAGT:1 - chrX 21520793 5' - rooA 7140 1 62.38 GAAGCCATAACCATATTTTCTGCTTATCCAAATCCTCTAGCCCCTGCCCTTTGTACAAGTTAACTCTAAAATCTTTATTTTTAATAAAGAGCGCATCGCGC:1 + chrX 20080547 5' + gypsy6 176 4 59.41 TTTTCATTTTCCCTTTTTTTTTTGTTCTTTCGAGCTAGAAAGGTTGGATGGGGGGGTTTTTTATTTTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 + chr2L 14123969 5' + hopper 143 6 73.81 CATACCGACGTCTGCATAATTCAGCACAAAACACGTGTCAGTGAACGCAGAGCAGAGAAGGAAAAAATAATAATAATAATATTA:1 + chr3R 24423180 5' + mdg1 34 2 57.14 CCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCACTGCAT:1 - chrX 12294744 5' + blood 48 2 72.28 AATGGCAAATTCAATCCGGATGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGG:1 - chrX 12193820 5' + Stalker 7133 4 79.21 AGTGCGCACAAAAGTATGCAATAAAAATATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr3L 14603350 5' - jockey 4972 1 58.42 TTGTGCCGCGCGCCAGAGAAATGAAACGTGTCAAAGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGGGTGTCGTTCTGACTCA:1 - chr3L 11673353 5' - F-element 193 1 63.37 CGATACGATTGTTAATACTAAAAAAATCTATTAACCATCAACAATTGATCAAGCCGAGTGGAACTACCGTCTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTAT:1 - chr2R 330542 5' + gtwin 5 2 74.26 TTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 20466703 5' + roo 35 2 62.38 CTGATTGCCACTTGAGGCGCGTAATCGAAACATCGGCAAGGCGGTCGGTCAATGGAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAG:1 - chr3R 27374875 5' - mdg1 7437 2 56.44 TAACATTAAATCGAAACTATTACCGAAATCAAGCGACCCTCCAAACCGGAAAGGGTAATCGAAGCGAGAAATCCACATTGAATCTGAATTCGAATCTGAAT:1 - chrX 9298127 5' - transib2 2545 1 63.37 CGAACAGCTGGAAAAACGCCGGGCTTTGGGCCGAATTGGTTTCACGAACGAGCGGCCCGCAAAAGTGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - chr3R 29660323 5' + mdg1 11 2 68.00 CAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 13347304 5' - roo 358 2 76.24 CTCTCTCCATCTCCCTTCCAAATAGTCGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr2L 8031243 5' - P-element 2863 1 56.44 TAAAACATTTTCGTGTGATTTTGAAAAGATGTCAACAGAATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGC:1 - chr3R 12880672 5' + blood 7159 2 61.39 ACCAACCGAAATTTCCCAAAATCAAGGCAGATATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTACATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCA:1 + chr2R 13038094 5' - P-element 317 1 46.91 TTCCAAGTTGGGGCTGTGTGTTGCAAAGGGAACTGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGC:1 - chr3R 31369368 5' + Transpac 4960 2 62.38 ATTGTAGACGAGTTAAGGTCAGCTGTAATTATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGAAAGACAAAATTCTAAGTCGCGGAGCAA:1 + chr3R 28883430 5' + HMS-Beagle 309 1 78.22 GGGTCTGACACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3L 9692654 5' - P-element 2882 2 72.34 GTTTAATAATGCCTCCCATTTACATTTGGGGTTTTGCTTTTTCCGTTTTTTCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTA:1 - chr3L 25210593 5' + FB 660 2 58.42 TGATAATAAATGGCATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2R 14381372 5' + hobo 8 1 70.30 ATACTAACGTTTTTTATCGAATCCAGATACCCGATACATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCC:1 - chr3R 20845115 5' - 17.6 7384 2 70.30 CCACTCAGCTAACGAGAAGCCAGTTCGTGTTCTGAGTCTTTTGATATGCGCCTGCAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGG:1 - chr2R 20574613 5' - R1A1-element 4921 1 68.09 CCAGCAGAACTAAAGAAATAGAACACTATTTTCTATAAAATATCACAAAAATCGTTTAGCAACAACGCGTACTTCTCCTATGTCTCACCGACAATCCCAAA:1 + chr3L 11039365 5' + F-element 280 1 60.40 ACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCCC:1 + chr3L 19349972 5' - 1360 3332 1 84.16 GCGATTGCACTTAAATATGCACGCAGTGGTTTATCGCTCGTTCTCGGCCAACTTTATGCATTATCTGAACTCTTTAGCTTCTATAGTTCCTGAGATCTCGT:1 - chr2R 929480 5' - INE-1 146 1 52.48 AAAACTGCTTCCATGCATGTATACTGATAGTGGATAAATACAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCA:1 + chr2R 7540561 5' - Stalker4 373 2 62.38 AAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 + chr3R 21695440 5' + 3S18 36 2 59.41 TTTCGGCCATCGCGATCTAGAATGTGTAAACACAACCGCACTAACTGCACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2L 21978092 5' - roo 9043 1 53.00 TTCCATCTAATTTTTGTTTAAATACTATACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTG:1 - chr2R 7540633 5' + Stalker 25 4 54.46 AATTCAGGGCCAGTGGCAGTGGGCCTCGCAATTTGCGAGCTTTTCAGTTGACCCAAAGCCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr2L 1828857 5' - 412 7531 2 64.36 GGGAATTGTACAAGGATTTAGAGAACAGGATGATAGTTTTCAGTAGAAGGAGGTCATTACGAGTTCGTTAGAATGCCGTTTGGCCGGATGCGGTGTTCCAG:1 + chr3L 444421 5' - Tirant 8182 2 45.54 CATGATGGCTGGATTGTTTTCGACTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTAATGCCCCGCCCACCCAAACATTTAATTATTGTCCACATGGACAGATTTTAAA:1 + chr2L 8863061 5' + G-element 4289 1 75.25 TATTTATTTTTGATCAGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAG:1 + chrY 104337 5' + INE-1 152 1 64.36 ATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 21500988 5' + roo 37 2 64.36 ATTAGTGCGAAACTAAAAATAGTTCCTATGTTAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 + chr2R 969175 5' - flea 4981 2 67.39 CCCCCACCTCCGCCATCCCTTGTGTCGCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAG:1 - chr2R 11051465 5' + 297 6808 2 73.27 CTTTAGATTTTTATTGCGATTCAAGTTTATTGGAAACCAGCCGCAGGGCCATATTTTATTTGGACACTCTCCATTGGCCAACTCCTCACGCCCCCCCCCCC:1 - chr3R 24509810 5' + accord2 221 1 62.38 CTGTGTCAGTTGGTTGCCATAATTTTAGCTTGCTTCGCTTTCGGCTTCATCTACATGCCAATCCCTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTTA:1 + chr3R 19722025 5' + G2 2925 1 59.41 TGCACAAACTCCTTTGGCCTTAGAAATGTTTGCTCCGTTTTTTAGGAATTCTTTCTCACTTTCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAAT:1 + chr2L 10279182 5' - roo 8755 2 58.42 CAATTNAAGTTTTAGTCTGGTATATTTTTTAACATCATATTTGCAATATTAATTTTATTTCTCTTTTGCCATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGA:1 + chr3R 16003991 5' - jockey 4988 1 63.37 TGTGCCAACCCCCAATGGGCTTTATAATCAATTCATTTAGCAAAATCCGGACAAGCAAATATATATGTAAGTTAACACGCGCAGGGCCAAAATCGCTAACT:1 + chrX 6190189 5' + gypsy4 11 2 58.42 TGAGTTCTGCGCACCTTTTCGCCTTAAGATGTTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr2R 20838613 5' + 1360 42 1 69.31 TACAATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 13682627 5' - roo 9043 1 55.45 GTAAAAAAAGGAGCCGGATATCCTAAAACAAACAGTTATATATGTGTATGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chrX 11585548 5' + pogo 23 1 56.44 TCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAAT:1 - chr3L 27264573 5' - 1360 97 1 58.42 GAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr2L 13060290 5' + P-element 56 1 23.76 GCTCTNTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2L 2909606 5' + pogo 39 1 67.33 AATTCCCTTTGACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chrX 17064839 5' + Tirant 8114 2 66.32 GCCAGGCCAAGAGCCATGAGTAATATTTGTTCAACATAGGCCGCAGCAGCAGCAGCAACAGCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCGGC:1 + chrX 18926159 5' + TART-B 155 2 75.79 GCAGCTTTGTGTGATATAAGTGCGCCCACGTACTTGAAATGGCTTTACTGATCTTGCTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:1 - chr3R 22620285 5' - 297 6968 2 71.58 TGTCGCCTATGAAAAATGTTTTGGGACAAATGGGCGTGCATAGGACAACGCAGATTTAATTAACCAATATATACATATATGTATATGTATATATGTATGTA:1 - chrX 8652865 5' + Stalker4 251 4 70.30 AAGGGGGGAGTGGGGGGAAGTTGAAAGGTTTTACCGTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTG:1 - chr3R 7170168 5' - F-element 499 1 70.00 ATTTAAGCATAGTATGCCTTCTGTTTATTTGCCGCCTTTTTTATTCCTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCACG:1 + chr3R 22046622 5' + invader1 110 2 64.36 TCTCANTAAACTATTGCAAACGGATAGGTTTAAGTTTCAAAACGTTTGTTGCTGCGTCCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGCAGCGGAT:1 - chr2R 4674262 5' - Quasimodo 190 2 62.38 TATATATCCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGCCGAACTGGTCGTGTCCGTCCGTATAAACGTCGAGATTTTAGGGACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:1 - chr4 828910 5' + INE-1 163 1 88.00 CAAACTCTGGCCAAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 7787309 5' + roo 8685 2 58.42 GGGAGAAGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chr2R 10863891 5' + mdg3 5279 2 53.47 GTATACGCCGTCATGAACGATAAGACCAGATCGTAAAAAATATTTAACTTGCCAATCNGTCGACCGCAAATTATACAAATTTACTTTCTACTCC:1 - 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chrX 8031421 5' + roo 8700 2 63.37 TAATGATATACCTATGTTTTTGTTGCAATAATATTCTTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3R 19224855 5' - hobo 2900 1 64.36 TCCCTTCAAAAGATTGAAGTTAAAAATATTATATTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTA:2 - chr3R 12877856 5' + mdg1 44 2 73.27 TAATAGCCAATAAACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAAC:1 + chr3L 2292050 5' + Max-element 8238 2 66.34 TGTACTCTTTCTGCATCTATTTATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2R 19192521 5' - roo 387 2 59.41 ATTACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chrX 4154890 5' + blood 9 2 70.30 TTTTAGTCTGGTATATTTTTTAACATCATATTTGCAATATTAATTTTATTTCTCTTTTGCCATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr3R 16004000 5' - jockey 4979 1 55.45 CTAACATAAACATATGCATACACTCTTCACACTCTTCATTCTAAACAATTAAAATTCGGCAGGCAGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCC:1 + chr3R 20836385 5' - 17.6 189 2 61.39 AACAAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3R 15998072 5' + pogo 34 1 65.35 TATAAAGTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAA:1 + chr3L 19555065 5' + INE-1 147 1 81.19 CATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAAT:1 - chr2R 6984385 5' - HMS-Beagle2 7154 2 69.31 AATTGAAAGCACGGGTTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr3L 8974078 5' + P-element 26 1 55.00 TTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 5849966 5' + jockey 36 1 54.55 CAAAANGTAAAAGAACTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr3L 833370 5' - P-element 2846 1 37.62 GCCAAAAATCTAGTGCGGATCGGGAAAAGCAGTTATATTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACAACTAAATATCTCCGATTCTTGCACTG:1 + chr3L 866517 5' - Ivk 315 1 75.00 GCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chrX 10730662 5' - P-element 2829 1 24.75 TATAATCTAATGGCTCATTAACATTATCAGCTGGCCGCATTCATAGCTTGGCGTTACATTATTATTATTATTATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGA:1 - chr3L 657887 5' + P-element 2736 1 62.38 CATTGAAAAGGACTTTGCCTCTGCATTCGACCATGAAAGAAGGGGTTTATTCAACGCCATGGTGAGGCTGCAATACTTTCCTCCACAGTGGAAGCTCGGTA:1 + chr3L 5201664 5' + BS3 362 1 55.45 AAGAAGCGTATGCATAAGTATACTATCAATTAAAGAGTCTTCGATGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCA:1 - chr3L 15127914 5' + GATE 8303 2 56.44 GGAGGAAGATTTTCGAAAGAATAGAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr3L 5363066 5' + Osvaldo 1522 1 65.00 AGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATG:1 + chr2R 6984348 5' + HMS-Beagle2 6939 2 81.19 CAAGTTGGGAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGTATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAA:1 + chr2R 9387307 5' - Stalker2 7641 2 64.95 GGCGGGAGAAGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 + chr2R 10863888 5' + mdg3 5276 2 52.48 GTGCANATATGTACACACACGGCGACAACAACTGCTGTTAACCGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chrX 2589730 5' + copia 4904 2 56.44 CGATTAAAGTGATTACTTTAGTGATTTTTATTGGAGTTGTTTCATTGCGCTGAATAAGCTGTAAGTGGGATTTACTGGCAGTTCCCCAGAGTTTTATTCCA:1 + chrX 19081419 5' - Porto1 4277 1 55.45 GCTTCCTTTTAGCTGAGTTTATGATAATTATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 19657463 5' - roo 9026 1 69.31 TCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCAA:1 + chr2R 5410969 5' - Tc1 1393 1 44.55 CTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr3L 19349953 5' - 1360 3356 1 65.62 AGCAAGGCTAAGGGCAGATTTTATACTCTCCCAACACAGCTTATGCATTAGAGTTTAACACTTTATTTGAACTTACTAATCGATTGACCAAATGTAATATC:1 + chr3R 27651975 5' - roo 421 1 75.25 GTTTTGCTAAATGTTTATAATATAATAAACAATTGTAATAATACAACGTCGTCGCAGGAGTTTTTGCAGGGCCCCTTAGTTGGTTGGGCGGGAGGTGTGGC:1 - chr2R 4938066 5' + Cr1a 4426 1 65.35 GCACTACATCATTGTTTCAAATTCAAATGCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAGAAATTTTCATATGTGCTTTT:1 - chr2R 2875214 5' - TLD2_LTR 125 1 75.25 TGCCTCCACCACACCACCCGACTAACCAATCTAACTATCTGTCTACCTAGCTTGTCTATCTATCTGTCTAACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGC:1 + chr2R 12275911 5' + F-element 359 1 73.27 TAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 21500947 5' - roo 353 2 79.21 CGGCGCCCGGTTAGCCCAGAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chr2R 5849939 5' + jockey 11 1 73.27 TCCGCATCGCCATCCACATCCCCTTTCGCATTCCCATTTCCATCCGGAGACGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCCTTTTGCTGCGCTGCGCGAATT:1 - chrX 11727120 5' + Rt1a 31 1 53.47 CTCGGGTCTGCGGCATTGGGGTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGAGCG:1 - chr3R 21296534 5' - P-element 2837 1 28.57 CACGGCTGAGTACAGTAATGACGCCCTGCAGACAGACAGAAGGAAGCGATTCCGATCATAAAACGTATTTCTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATCTG:1 - chr3R 902568 5' + INE-1 98 1 67.00 AATGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGA:1 + chr2R 6779782 5' - 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chr3L 8063878 5' - P-element 2835 1 26.26 AATAATTAAATAATAATAATTACTAAATAATTAGTAATTAATTAACATTTGAATTTGAATTTGAATTTCGCGCCCAACGAGCGCGCGGCCGAATGACGAT:1 - chr3L 16120542 5' - Rt1a 277 1 61.00 TATTACAGCTGACCTTAACTCGTCTACAATCTTTTTCTGTAGATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 - chr3R 28883438 5' + HMS-Beagle 35 2 58.42 GCCGACTGGGCTCCTATGATTGCAATTCACTTGAGTTTGTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGG:1 + chr3L 16749630 5' - Doc 4540 1 70.30 TTCTAAGAGCGGATTTAAGGACTCTAATGGCACACTGATCTTGTTGTTTCCCTAGTATTGAATTATGTTTTATTGGGATTTTTTTATATTTATAATGAGGA:1 - chr3R 18235759 5' - transib4 2572 1 71.29 CAACTGCACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 + chr3L 11909949 5' + Tabor 6887 2 74.26 TCTCTCTACAGTCTATTCAATAGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTATGATATATGTAGGTTATATATATTTGCCACT:1 - chr3L 12711429 5' - accord 421 2 78.22 CTTTTGCAACTTAAGATTTCAAAAACAAAAAAAAA:1 - chrX 7471554 5' + G3 4583 1 80.00 CAAGAAAATCGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr3R 14688248 5' - pogo 2065 1 64.36 TATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGTCGTACACTT:1 + chrX 11533926 5' - invader6 4823 2 64.65 ATGCAATTTAAGGAGATTCAAGCCCAATTTAAATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 - chr3R 24282037 5' + Max-element 14 2 66.34 TTTATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3R 20466725 5' + roo 8677 2 68.32 CATAGTCCATACATCATTTCATGTTATTGTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTG:1 + chrX 11533893 5' - invader6 362 2 68.32 AAATGCTCGCGAGTTTTGTAAATACTTTCAATTAATTCTAACGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGATTATAACTTATTGAAAACCTGATCCATCAGACAAAATA:1 + chr2L 3487828 5' + transib2 2507 1 37.62 AATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACG:1 + chr3L 27182019 5' + F-element 282 1 80.20 AGGCANGTTAAGCGAGGTTCGACTGTTTTTGGCTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACC:1 + chr2L 3199725 5' + P-element 401 1 37.62 GCTTTTGTAGCTATATTAAATAGTACTGTCTAAGATTATAATTTTGTTATAAAAAGGTAGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGAG:1 - chr3R 12870715 5' - springer 428 1 66.34 TCACAGAGAATTAACATTCCAAATCGAATTGGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chrX 13548718 5' + blood 7014 2 71.00 AAAATGTAGAAGCTCGTTATGAGAAATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTG:1 - chr3L 2292169 5' - Max-element 288 2 59.41 CTTGACTAAATTAGCCAAGTCTCATCTTTATTGAAACAAATCGGGGTTACTTTAATTTAATACTTACTACTTTAATACTTTACTTTACTTTACTTTAATAC:1 - chr2L 6296796 5' - TART-A 13147 1 50.50 ATGTAGTTAGTTAAAATAAAAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGC:1 - chr2L 10329968 5' + R1A1-element 5158 1 80.00 TTCATTAGAATGCGGTTTTGTTTGCAACCCTTTTTAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCGTCTTCGCGCACGGTCCGCACGGTTACCGTTCGACCTCTTT:1 - chr3R 21692369 5' - gypsy8 220 4 75.25 GCTGCGCACAAAAAACTGGATGACTTACAAAAGCACCTATCCACATTCGGACTTCTCAAAAATACTAACTAGAGCCTATCGATAACAATATTCGATCCGCG:1 - chr3R 5606009 5' - aurora-element 4049 1 67.33 GTTGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 9862222 5' - roo 9028 1 72.28 TCTAACTATCTCAACAAACAATCAAAAAGTTTATCCTTACGATAAATTGTATTTAGAATCACATGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTA:1 - chr3R 14324284 5' - 3S18 6094 2 67.33 TAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 - chr3R 27080790 5' + HMS-Beagle 29 2 60.00 TTTGTCGCTGCTTTTTTATGCGAAATTTATTGAATAATTCATGGGAAGTGATTAACACATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCAT:1 + chr3L 4048438 5' - 3S18 321 2 54.46 TATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACT:1 + chr3L 27356075 5' - Tc3 1687 1 63.37 TTAGTCTGGTATATTTTTTAACATCATATTTGCAATATTAATTTTATTTCTCTTTTGCCATTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr3R 16004002 5' - jockey 4979 1 54.55 CCGCCCTTGTCCCATGCAATCCTAATCATGCAATCACGAAATGCAACGGACTGCGTGGACGATGACGTCGAGGGAGAACAAACCTCCATCCGTAAAAGC:1 + chr3L 12925049 5' + Rt1b 278 1 74.75 GTAGTTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr4 311598 5' + 1360 20 1 59.41 GTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chrX 19306753 5' + P-element 33 1 46.53 GCTGTTCCAGAAATTCGAACGGCTTCTCGCCCTCAAAGTGATGGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATTACTCTCACCAGA:1 + chr3L 25493000 5' + Porto1 379 1 66.00 TTGCTGAAGTTGGTTAAGGTTTCCATTATGCTACTGGGAAATAAATAAGTCTGTAATAGAAATGATGATGAACTCCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr3L 17698165 5' - 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HMS-Beagle 7022 2 57.73 GCGGGGCTTGGTAGTCGTTGAACCCGTTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCAACATCGACGTT:1 - chr2L 6254702 5' - P-element 2563 1 33.66 AATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 + chr2R 10912110 5' + 412 7102 2 73.27 AGAAAGAACGGTATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGG:1 + chr2R 10673395 5' - Tirant 8465 2 66.34 CCGTAAAAATAATATTTCAATGCGAGCTGGATGCTTAGACGGGCGCTTGAAATAGCATTGAAACTCTTGTGTCCTCACGCCAATCCCCCAGGAAAGACACC:1 + chr2R 5462879 5' + transib4 2358 1 70.30 AGTTTTTAACTAATGATTTATTTTTTAGTACATTTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTT:1 + chr3L 23025265 5' - copia 208 2 66.34 TAATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:2 - chrX 19095801 5' - roo 9033 1 64.36 AACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chrX 329070 5' - opus 459 2 67.33 TTTATGGCGCAGAAACGTATAAACGCATATAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:2 + chr3R 18881475 5' + roo 8672 2 71.29 TTCCGCTTCCTGTCGCACCGCACGGCTCAGTTATGCATGAAGTGGATTCATCAAAAGCACTGCTGCTTGCCCGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCA:1 + chr2R 22431619 5' + accord 355 2 55.45 GTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACAGTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTAGCACTATACAG:1 + chr3R 13375973 5' - 1360 3352 1 59.41 ACCCCTTCCCCGACTTGGCATTTCCACATTGAGCTCAACTGTTGAGAGAGGGTGTAATTATTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 + chr3L 1078913 5' - I-element 5340 1 61.39 TGAAGAATGAGATCCTTAAACTGAATTTGCGTTGCAGCACGATAATATCAAACAATGTGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTTGCTCACGCTGAGAGCGTA:1 - chrX 7869086 5' - 1360 3293 1 64.36 ATTGGCAAAGCTGCCCACATAGCGGGTTATAAGCCAAATATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATAC:1 - chr3R 14923879 5' - 17.6 7067 2 61.39 CTAAAACTATATAAATCGAAAAGCACCTCAATGAACTGGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2L 8448399 5' - 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Doc2-element 4487 1 60.40 GAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2R 12779160 5' + roo 32 2 57.43 GGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 10457275 5' - roo 9037 1 60.40 ATGTGCAACAACCTTTAATGTGGTTAATAAATATAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 - chr2R 16744184 5' + opus 7029 4 67.82 CAGGCAAGCGGCAAGCAGCCAACATAATGCAATGGTAAACAGCCATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACC:1 + chr3L 10227165 5' + jockey 4754 1 56.44 CGTTAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3R 10741072 5' + 1360 9 2 71.29 GTAATAGGAGTATCTGATATATTTCCCAACAAAGATTTATGGTTTTTTAAAAACAGACAAATACAAAAAAAAAACAAACAAAAACAAAAAAAAACATCAAA:1 - chr3L 10674778 5' + Transib5 23 1 79.21 ATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr2L 2437706 5' + roo 30 2 57.43 GCCCCGCCACCGGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 + chr3R 25818809 5' - 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hopper2 1303 1 61.39 AAGAAGTTGTGCCTCATGAAGCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3L 12452123 5' + 412 12 2 63.37 ATTACGTTCGCAAGTAAAAGCTATTGTATTTCCACCATACAAATCAAATTACAAAAGTGCCTGCAATATCGCATCGAAGTGAAAGAGCTAATCTGACGCTT:1 - chrX 19782700 5' + R1-2 377 1 81.19 GACAACAATGAAATTGTTTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 20466620 5' - roo 394 1 65.35 GTCAAATATTTTCAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTC:1 - chr2L 19679797 5' + Doc 24 1 64.36 AGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGACAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCA:1 + chrX 10251738 5' + flea 4793 2 63.37 CATTGAGAAAACCAAAGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 + chr3L 14205570 5' + HMS-Beagle 6836 2 67.33 CACGTCACGTACCTTCGACGGGGCTCCACAACGTGCCGCTCCGCCGTTCAGTGATTTTTTGCGCAGCCATTCCGCGAACTTATGTATGTGTACCTCTAGCC:1 + chr2R 15877417 5' - invader2 4866 2 78.22 TACACTTGAAAAAACATATAAGCTTGTATTTAGTGAAGAATAAATGTAAATAGAAATAAAGAAATGTTAGAATGCTTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 + chr3L 6024506 5' + roo 8668 2 73.27 TAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 10912109 5' + 412 7101 2 72.28 TCCCGGCCTGAAAGCCATTTAATTATACAAGTAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 14910652 5' - roo 389 2 60.40 AAACTGAACCGAACCGAACGCAGCACGTAACTGCAGCGACTTTAGTCAAAATTAATCACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTA:1 - chr3R 6968823 5' + Doc 120 1 56.44 TATGCAAAAACCTGCAAAAATGTGACAAAAGCTGAGCCAGCAGCATTTTCGCGTCTCTTCCGTTTTCTTTTCCCCTCTATTTATTATTTTCCTTTTTTTGT:1 - chr2R 17214360 5' - Doc2-element 253 1 67.33 GCGACGCTTTTATTTTAGTCTCGTAAGGTAATTTTTAAGCATTTCGTGAAATCTTTTAAATCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTACCAAACTTAAGGCTA:1 + chr3R 6683638 5' - G4 3646 1 54.46 GAGTANTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 19936666 5' - roo 358 2 72.28 AGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3R 19657500 5' + roo 8714 2 77.23 TTTATCGGTTGGTTTTTTTTTATTACAAAAATTATGGTTAAGACATCCAAACCAGCAGTTAGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chrX 13548834 5' - blood 7375 2 63.37 GCTTTNCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 - chr3L 5716936 5' + copia 41 2 65.00 ATACTCGTAGTAGCAAACGAGGTAACCATGGCGTATACGTCATATATTTATGGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAAT:1 + chrX 14707713 5' + flea 4936 1 54.46 TGTGCTCCATGGTAGCTGTTGCAATTGCCGCAACAACAACAACAACGGAGAACATTGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 + chr3R 17121621 5' + mdg1 7061 2 53.47 GCCCAACTTGTCATCCTCTTAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGTTCTTTGAC:1 + chr3L 5620719 5' + 1360 227 1 80.20 CTTGCTGCATTTTTCAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3530891 5' + FB 172 1 78.57 ACACCCTACAATTGAGTCATGAAACCTACCTGTGAATGTCGTACAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAA:1 + chr3L 9303328 5' + jockey 4989 1 57.43 GCTTAAGTTCTGTATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3L 19215789 5' + roo 8691 2 52.48 GAAGTGATACATATCCAATAAGATGGTTAATTATGTTCATAGGCTTTTCAAGTTTGTCCATCAGCGAACAAATTATAGGATAAGTACGAAATTTCCATTC:1 - 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transib2 359 1 61.39 AAATCACTTGATGCGTTGCAATGTCGGGGCCAGCACCATCTTCTGATTTAAACCCGATTGAAAACCTGTAGGGGGACATTAAACAATATGTGTCGAAGAAG:1 - chr2L 12864925 5' + HB 1182 1 75.25 AAAATCGTTGCTGCCCATTTATGCATTTAAACTAAAAGCTTGGAAAAAAGAAAAACAAAAAAACAAAAAAAAAAATTATAGAA:1 - chr3R 9488324 5' - Tc3 82 1 57.83 GAAATCACCCTGGATGGAGGATATTTCTCAATGGTTTTCTCGGCAAACGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCAGCCGATGACGAGGCAGAGCGGGC:1 + chr3L 7497511 5' - F-element 450 1 58.42 ATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTA:2 + chr2L 19075667 5' + Transpac 43 2 69.31 ACCCAAATCCGAACCCAACCTGAAACCAACCAACCACCCACTGAAAATGTCAATTACTAAGCGTTTTTTTTTTTGTTTTCCTTTT:1 - chr3R 23895550 5' - Doc2-element 218 2 69.41 CGAAATGCACCACCAGAGAGTGGGAAATCATAAAGTGGGAGAGCACAGAGCGCCAATTGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTT:1 + chr2R 11232940 5' - Idefix 7191 2 64.36 ATGTGAAATAGTACATTTCAAAGAGTATGCATGACTTGCACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2L 2435241 5' + roo 76 2 65.35 ATGAGAAATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGC:1 - chr3L 2292151 5' - Max-element 272 2 51.52 GATTAAATTGTGGCCACTTCCCTGGCATTACCATTAATCGAATTCGAATAGAGGCAACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr3L 12452223 5' - 412 7526 2 55.45 CACAATGTGACACTGTCCAAAGCTCGGATGACCGTTACCCGATTTGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTT:1 - chr2R 10705660 5' - P-element 156 1 40.59 ACAAATGACAACCCCGAAAAACACGTGGGAGTTCTTCGACGCAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 - chr3R 11165734 5' - Tabor 7319 2 76.24 CGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 5974422 5' + roo 8709 2 72.28 TGCACCGCCTTTCAGTTGCAAACAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGACAAGCGTCAATTAAGAGGGGGGGGGTTATT:1 - chr2L 11604777 5' + HMS-Beagle 6782 1 64.71 GGAAGTTGTTAAATCTCGACGAGCAGTATTACCCACATTTGTGCTTCCGATTCATCCTTGTTTTTAATCACATAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTC:1 - chr3L 27330893 5' + 1360 3270 1 63.37 ATTTTCATTTTCACCAAAATTGTTAAAACTATGTTTGCTATACATATAACCCGAAACGCAACAAAACAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTAC:1 - 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hobo 2891 1 74.26 ATGCTATATCATCATATTCGGCATTTATCTTTTTGTAAAAGAACTACGAAATGACTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACAGAT:1 + chr2R 10792109 5' - hobo 2565 1 58.42 GCGTCGACACGATTAACAACATGATCTGTTGTTGCTGCTGTTGCTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGCTGCTGTTGTTGCTGATGTGGTTGCTGCGGCTGCTGC:1 + chr2R 22892011 5' - Max-element 8504 2 58.42 TACAAACTAATAAATTAGGAAAAATGTATTTGTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCA:1 - chr2R 13122107 5' - opus 493 2 74.26 CTGCCTTAGCACAAAGTAATGTTGGTCTACAGACATTAATGAATAAGATCGATATAATAATTGGCTTCCTCCGATTATATCGATCTTATTCATTAATGTCT:1 + chr2L 18698092 5' + Gypsy12A_LTR 2128 1 49.50 GATTGTTAATACTAAAAAAATCTATTAACCATCAACAATTGATCAAGCCGAGTGGAACTACCGTCTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAG:1 - chr2R 330536 5' + gtwin 11 2 68.32 GTTATCTCGCATTTTCGTGACATACGTAATACCGGTAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGACAATGATTATAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAATGAA:1 + chr3L 23270131 5' - Cr1a 4121 1 65.35 AGCAAGTGCAATTTTCTTCCCTTGCTGCTATTATTTCTATGTGTTGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATA:1 - chrX 4797015 5' + copia 4903 2 59.41 CTTAAAAATGGCGTGACTCGACAAACACAAGATGTGGAGAGGGAGTTTTTTCTTCCTTTACGTTCGCTCTTTCTTCCAGTTTTTTTTGTTTACTTTTTATT:1 - chr3L 11925000 5' - Doc 4694 1 72.28 GGCATCGGTGGCGTATGCGTAATGTGCTTCTTTATTTACTTATTTCGTTAATTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr2R 18602382 5' - Transpac 5226 2 56.44 AGGGCTGCAGTATTTTCGGTTCTTTTATTAGCAATATCACGTTGATGATTTTTGGTTTTGTTTTTATATTTCTGGGAGTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGA:1 + chr2L 8258749 5' - I-element 5108 1 78.22 ATGTANGTATTCAACGTAGTAACACATTCTACTTATAACAAACGTAGGATCACAGGACAACGATTATGTATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAA:1 + chr3R 21848070 5' - rover 340 2 72.28 CATCTGCATCTGGAACTCGGACTCCGTGGCAACAGTGGGCGTGCATCCCCTGAACGTCGGAGAACTTCAAATGCTAGCAGAGCAATTGAAATTATTATTAA:1 + chr2L 5400153 5' + invader2 432 1 58.42 GGTAATACGCATCAAAAATAAAGAACAACAGTCATAAACCAACCATGAAGCTCCTGTCTTTATTCCTTCTGGGTTCGTTGTTTTTGTATACAAAGTACAAA:1 - chr3L 14235681 5' - Transib5 293 1 68.32 CCCTTTTTTCGAGCTGCCTACGCGGGGTTTTTGGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 11347553 5' - accord 186 2 76.79 GAAGCAAAAGGAGCAACGGCTGGCGGGCAAAAGGGGGAGGACCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTA:1 - chrX 17628863 5' + R1A1-element 4939 1 67.50 CCAGGTAGCAGTGAGAAGCATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - 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roo 173 2 74.26 CAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTAATTATTAATTTAAT:1 - chr3R 20884941 5' - flea 4995 2 69.12 TAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGCTTTT:1 + chr3L 22920385 5' + 1360 37 1 57.43 ACGGAGAAGACAGTGCAGATGTTAAGGTAACTGTCATTGACAAACCTGCACCGCCAAACGAACTGACTATAAGCTAACAAAGGGAAAAACATCATAGCGGC:1 + chr4 759648 5' - springer 116 2 59.41 AGTTTCATTACCGATCATTCCTGGAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:2 - chr2L 1156823 5' - 412 7532 2 65.35 ATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 10445219 5' - roo 9014 2 82.18 TATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCAC:1 - chr3L 19350020 5' + 1360 3205 1 53.47 AGCCCACTACTAGCACAAAAACCAAGGTGGTGGCGCCCAAACGTGGGACAGCCCGATGCCTGATTAGGCACTTGTCGTTTGACAACCGAGCTTCCCGTTAA:1 + chr2L 10729982 5' + Circe 299 1 70.30 AGCAAGCCTCAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGGGTGGACGTGT:1 - 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roo 394 1 44.55 GGAAAAATTGTTTAGACGACATCCGATGAGCCAAGAAGATGCCAGCCACAAAAATACCTCGTGTTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTTG:1 + chr3L 16459044 5' + rover 292 2 58.42 TTTTTAGTGATTCAAGTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 19076219 5' + roo 8686 2 50.00 CATTTGAACGTTGTCTTGAACATCGGGTTTCCCACCTTTCGGCTGGATTTCCTTTACTTCTCTCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 + chr2L 11391833 5' + accord2 223 1 78.82 CGGAGGCTAAATTGCAATTTTCAAGATTTAAGCGTGAACAATAAATGTCACATAATCTGTAAGTAGCCAAATAAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGC:1 - chrX 20548631 5' + Circe 7120 1 74.26 TAGTGCTTCCAAATAGTCGTTTCTCGTATATTAAGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTAAAAGGTGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCT:1 - chr2L 15957543 5' - Max-element 295 2 74.26 ATATACAGTGAGCCAGCATACTTAAACTGGGTCAATTGCCGGCGTCGCTGCTGCAGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 + chr3R 9981486 5' + jockey 4781 1 55.45 AGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTA:1 - chr3R 25796082 5' - BS 5066 1 48.51 AAAACAATTTTCAATGCACCAATATATTTAGATACATCAAGCTGCATCTTCTTCGCTATAATGACACTTTATTTACGCCGGTTTTTTTTAAATAAATAAAA:1 + chr2L 2123998 5' + G7 1139 1 78.22 CACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 + chr3R 25633341 5' + Tirant 8149 2 68.32 ATATGTTTGGTGGATTTACTTAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATA:1 + chr3R 19609618 5' - Tabor 487 1 78.22 ATGTCGTTTTTGTAAAATTAATTCGTTTGTTTACCTTTTTCTGCTTATCAGCTTGGTAGAGATCGTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTA:1 + chr2R 1395434 5' + gypsy 9 2 68.32 AAACTAATAAAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCG:1 + chr3L 27182008 5' + F-element 269 1 68.69 AGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr2L 18914584 5' - mdg1 369 2 75.00 GCCCANATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATG:1 + chr3R 13423282 5' - 17.6 466 2 56.44 AATAANATTTTGTAGTTTTTCCACCGAATGCAGGCACAATTGCTTCGTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 31812657 5' - P-element 2879 2 74.26 GTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACA:1 - chr3L 11826431 5' - INE-1 132 1 61.39 GATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGG:1 + chr2L 20928068 5' + Chimpo 26 1 53.54 AGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 3671308 5' - roo 355 2 77.23 CGGGAAAGCCGTAGCTGCCGGGCATTACCGGGGACCACCACGATGAGGTTTTGAGTCGACTTGAGTAAAGGAGAGACTTGTGAGTTACAGAGTAAAAT:1 - chr3L 4697758 5' - R2-element 85 1 76.53 CGTTTGGCCAGAAAGAACGGTATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAT:1 + chr2R 10673386 5' - Tirant 8482 2 53.76 CGTTCNTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTG:1 + chr3L 24213783 5' - invader2 212 2 60.40 GAGACTATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:2 + chr3L 21841308 5' - P-element 2843 1 35.64 AATTTTGTTATATTAAAAACCTCACATTTGGCTGGTGCTGGAATGCAGGAGTCATATTTCGCGACTTAGTTGCAGTCGGGCTGACGTTACTGCGGCCGCGT:1 + chr3R 28641650 5' - gypsy4 48 2 74.26 AGAAATTCGACTACCAGTGCACTGAGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3R 10419947 5' + roo 72 2 75.25 TGGCGATTTTTAAACTTTCTATTCCACTTAATACTTGGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGT:1 + chr2R 13395711 5' - P-element 353 1 44.55 CAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3R 10321079 5' - roo 9024 2 71.29 CGCACTTTTACTTTTCTAGCTCACTGTACAAACAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 + chr2R 14381251 5' - hobo 2932 1 70.30 GTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 18012698 5' - roo 357 2 77.23 CGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAAT:1 + chr3L 25889009 5' + gypsy8 304 1 77.23 ATAAANATTACATTACAATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACT:1 + chr3R 10445164 5' - roo 9069 1 75.25 ACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAAATCTG:1 - chrX 22386752 5' + hobo 95 1 72.28 ATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 - chr2R 6779848 5' + 17.6 6952 1 56.44 TAGTTCGATCTCTTCTGCAATGTAGTTAAGTTTACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2R 13128072 5' - roo 390 2 47.52 ATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chrX 329019 5' + opus 7045 4 74.75 AACAGAAATAGCCACTTATTCATTCAGAAGTATAGGCACTCAGAGTGTAGTGAGAGAAATTAGGGACACTCCATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chrX 495138 5' - 412 490 2 75.25 ATCGTGGTGGATCAGCTGTCGGATCGCCTCTTCTGGATTGACGACCTGGTCGCCCATTAAAACTAGCTTCAAAAAACTTACCCATCTTGTTATTCTAAT:1 - chr3L 1505253 5' + 1360 3381 2 57.58 CAGCAACATGCAGTAACAAGTACAACAATAACAGGAAAGGTACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2R 9277517 5' + roo 8699 2 60.40 GGCTGATGCAACATTCTCGTTATGGTGAAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2R 964177 5' - 1360 3342 1 74.75 AGAAANAATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGA:1 - chr3R 21695499 5' - 3S18 6068 2 56.44 TTGGATCTTTACATTGATTACCTATTCATCTTTAAAAGGTTAATAAATTAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAG:1 - chr2R 10867694 5' + mdg3 155 2 52.48 TTGCTAGCGCATAGAATACATCAAAATACCCACACGGTCGCAGCAATGGCAGCAACATCTGAAACAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTT:2 + chrX 4796927 5' - copia 245 1 68.32 ATTGTGTTTCCAATACATACATATGGTGTGTATCTAATGAAGGATTAGATCATATGGCATTTCAATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTT:1 - chr3L 9121907 5' - Transpac 5223 2 74.26 ATGCAAATTAATGCATTTTCTCTTTTAGAAGTTGTGGTTTAAATGAAAGAAGTCATTCAATTGTTAGC:1 - chr2R 17557847 5' - hopper2 115 1 70.59 TCAAGCGCTTAATATCCAAGCATTTCACCGCCTGCAAGCCAAAAGTTACAGCGTTCACTCTCCATTTTTTTGCTCATCGCTTTCTTCAACTTTTTTTTTTT:1 - chrX 4168099 5' + FB 173 1 73.27 GGTTTCGATTGCGGTCTGTTATCAGGTAAGACCTTAATGCCCCACGAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 - chr3L 958840 5' + P-element 1 2 77.08 GAGAAGGTTTTGCTCGTTTTCAGCTTGCCACCGCGGATGGGCAGACATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGT:1 - chr2L 20362014 5' + BS 5021 1 58.42 AAAACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3L 10035646 5' + jockey 57 1 73.27 ATTTTGCGAGTTTGTGGAGCATTGTATATAATACCTCACACTCGTTTTTCCGACCAAGCAGGTAAATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAA:1 + chr3R 4764712 5' + invader3 5210 2 71.29 GTAATCATACTCTTTCAAGAATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 - chr3R 12571541 5' - roo 9040 1 60.40 GCTCGTATTACGCATACACTTGGGCTGGACTGTTTATGTACATGTCGGCCATGTACATGTCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGGCAGCGCA:2 - chr2R 4794620 5' - invader4 3042 2 41.58 CGCGAGCGTTGACAGCCCATTGCCCGTTGGCAATGCATAATAAACTATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATA:1 - chr2L 7343141 5' + mdg1 7096 2 61.00 AGTTGCTTCTTACAAGAAAATCGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 14688236 5' - pogo 2077 1 52.48 AATGAGCCCACTAGAAACAACAAACCTATAAATACCAAGAACACAAACTGTATCACGCTCTTCCATCACTTTGAAGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTG:1 + chr2L 21366252 5' - Porto1 306 1 55.45 TTCGGTTTAAAGGAACTCAAGGCATTTTAAGTTTCTTTCCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3L 13364514 5' + hopper 12 2 61.39 GGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 - chr3L 14240893 5' - Tirant 8471 2 60.40 TAATAGTAAATCCATCGTGCGGAAATCTACTTGATGGGATGTGCATTGTGAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAGAAGTTTTTAGGCTTTAAATCTA:1 - chr2R 4786531 5' + 1360 237 1 54.46 ATATACCTCCACACTTAGATCTGATTCAAAAAGAGGATCGCCATTCAATAAAAGCACTTTCCACTGTGGAGGGAAGTATTGCAGCCTTACCATAGCGTTGA:1 + chr3L 2530008 5' - BS3 333 1 61.39 AAGTCTTGGCACTTATTCTACGCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 2762117 5' - roo 9043 1 56.44 ATATAGTACAAAAAACTATCGACCAAGCCTACTTGCTAGTTTAATCGTATGGCGTGAGTACAGCCAAAGCTTAAGTTAGTCACATTTTTGATCTGCAAGAA:1 + chrX 15737529 5' + 3S18 243 2 67.33 GCATATTGATTCTAATATTAAAAATTTAGTACCTAAATTTGTATGTGTGCACGCGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAG:1 - chr3L 24291389 5' + 1360 215 1 61.39 ATTTGTTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGT:1 - chr2L 22975179 5' + Stalker4 275 4 57.00 AGCTATCCAATCAGCAAGATAATTGCTCTTTGCTAATAAATACCTAAAAAGATCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGTGCCCCAGTAATACGATCTAAC:1 + chr3R 21797587 5' + Stalker4 145 4 63.37 GGTAAGAAGAAAAACGTAACGCACTTCTAGTAAAACTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGAT:1 - chr3L 11461401 5' + copia 4909 2 65.35 TGTGTNGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr2R 19936675 5' - roo 9031 1 63.37 CTCCTTAATAAATAGCCAATTAGTCAGATAATTTAACACTTAGAAATCATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGACTGAACGATTCCTTTTGGATCCAAAATA:1 + chr2L 13804434 5' + G5 4813 1 53.47 TGTATTTACCTAAATTTATTGGTTTTCTACGATTAAATCTCAAGAGCTTTGAGTTTATGGAATAATAATCAATGTCTGCGTGGCGACGACCGACGCGTTCG:1 - chr2L 271602 5' - gypsy7 5364 2 67.33 ACAATGGTGCCAATGTAACTTTTTCTCGACAAATGAATTTTGTACTTATTTACCCAAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAG:1 - chr2L 8740966 5' - Burdock 6375 2 63.37 AGGCGTGTGAATTATATTATGCCTGGAAGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTT:1 - chr2R 5850044 5' - jockey 4975 1 62.38 ACTTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr2L 11065920 5' + P-element 41 1 32.63 ATCTTCAAATGAAACTTTTAGATGACTTTAAGTTTTAATGTGCAAGCAGTGGAAATTTGTTTTTTGTCAAAACGAGGACATTTTTATATGAAATATAATTC:1 + chr3L 16222197 5' - S-element 1622 2 40.59 AACCATTGATATAAATGAACATACAAGAAGAGCGAAAGGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAATAACACCAAACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAATC:1 - chrX 3930010 5' - Cr1a 204 1 70.30 ATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:3 + chrX 7787248 5' - roo 9021 2 74.26 TGTCGAATGAAATTTTATGCTAATTAGAAGTTGATTTTTTGGCGCCCGTCACACACAAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAG:1 + chr2R 8306159 5' - HMS-Beagle 148 4 61.39 TACACATAAAATTACATATGTATTGTGTTATGTTATGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chrX 9248379 5' - pogo 2091 1 68.32 GCTAATAACAGATCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTAT:1 + chrX 4890028 5' + 297 6601 2 59.60 GTGAAGTCCAAATTGAATACGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:2 - chr2R 9375243 5' + HMS-Beagle 6826 2 62.38 AGAAGCCTTTGTTGTTTGTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATACT:1 - chrX 21087673 5' - mdg3 5483 2 55.45 TCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATA:2 + chrX 21668056 5' - Stalker2 7628 2 56.44 TTGCTGTTGTTGGCATAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr2L 7547982 5' + blood 7028 2 62.38 AAGTACAGGTCTCCGTGGATGTCAAAGTCCCACATCTCGAAGGCAAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATATTACATAC:1 + chr3L 1533216 5' + 412 7265 2 63.37 TAAAAAGATATAATGCAATTTAAGGAGATTCAAGCCCAATTTAAATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAA:1 - chr3R 24282049 5' + Max-element 8237 2 78.22 TCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chrX 5018693 5' - opus 7468 2 64.52 TTCTTAAATATTTAAAAACACCAATTGAATTTACCCGACTTTCACTTGCTCTGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAA:1 + chr3R 19141760 5' - Juan 351 1 59.41 TATTGAGCAAAGGAAGTAACTAGGTCGCTCGTCAGTTTGCGTAGACTTGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGC:1 + chr2L 20680137 5' - opus 163 4 53.47 AGTTAACATTTGATTGTAAGCTAATGATTAAAATCGAGTCCTTCATTTTTACCTCTCTTTTCTTTCGATTTAAAAATATCTAAAAAAATATATAATAA:1 - chrX 10562388 5' + G7 1171 1 51.02 AAGTCCATCTTAGATTTCTCCATTCAAACAATGTGCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTTCGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr2L 10118895 5' - hobo 2900 1 64.00 ATACTTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr3L 22324348 5' + jockey 4681 1 67.33 ACAACAGAGTAATGTGGTGGCGTACACCAAATGTGTCAACTAAAGGTACACCCGTGGTCAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAG:1 - chr3R 17743760 5' - Tc1 184 1 55.45 TTTCGNAGAATTAAACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 13994263 5' + P-element 10 2 53.42 GGGTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:1 - chr2L 13447178 5' + HMS-Beagle 30 2 55.45 ATTAATTAGAATATAAACCCGGGAAGTAATAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAAT:1 - chr3L 2573362 5' + Stalker 7173 4 75.25 CGGAAAGTACCGCTAGCAGATGAAAAATCAATTTCGCAATGTTACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chrX 12546433 5' - P-element 2855 1 47.52 ATACCTAAGAAAATTATAATCAAGTTCAAAACTCATGCCCACCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAAACCTTCTTAGC:1 + chr3L 23698002 5' + I-element 5102 1 70.30 GGGGATGTGAAAAAGTTGGGGACCCTCTTAAAAAGCGACCCATATCCTTTGCCAGACGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 - chr3R 25702272 5' - Tirant 385 2 63.37 GAAAAGTCTCTGATGTGGTTGTTGTTATGCTCTTTCGCTGCAGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCG:1 + chr3R 18504057 5' + accord 7121 2 58.42 TCACAAAGAATGGAACGCCTTTTTTCTCGCAACCTGCATAAAATACACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACACTCTCAGCGTGA:1 + chr3L 5044743 5' + 1360 3287 1 53.54 TATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 19215801 5' + roo 39 2 64.36 TGTATGGACTAAAGGAAATCGAACGACTGAATACTGTGGAAAATACTATATAAATATAATAAAATTAAGAGTTCCCGCGAATCTTCAATACGAAAACCAAT:1 - chr3R 11184030 5' + Transpac 431 1 67.33 CCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCAGATTAAACATTAGCTACTGGGCATACGAGCCCCAACCACTATTAATTTTATTCAGCAAATACGTGGTCAGTGCTATT:1 + chr2R 1982173 5' - Tc1 217 1 65.35 AATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:2 - chr3L 19215847 5' - roo 9024 2 72.28 AACACNAACCCCTTTTGACAGGACCCATGCCGGGATATACGTGATAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTATGCGTGTGAACACACACACACACACA:1 - chrX 14544895 5' + accord 180 2 81.19 GCGAACGTTCGGATAACGCCCTGCTTCAGACCCGAATGCAACTTGGCCTTTTGTGAGTCTGCCGATTGATATAATCACTTATATAATTATATATAATAATA:1 + chr3R 22130921 5' - Tc3 284 1 62.38 AAGGTCATTGTGTTAATTGGAGCGTTAGTGATGAAGATGTGGACGATACTGAGCGTCCTACTTTTAAGGATGGGTTTGCAGCAATTAAGGCTTTAATGTCC:1 + chr3R 20437203 5' + pogo 1753 1 73.27 AATTCAATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 - chrX 14713273 5' + flea 32 2 66.34 GTTCTAAATGTTAAATTAAATGTTGTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTT:1 + chr2L 19767538 5' - I-element 5166 1 72.22 CACGAACATCGGCGCAAAATTGGCTCAGCTGCATTTTTTGTGAAAGTTTTTTTCGGCATTTTCTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAA:1 + chr3L 18009536 5' + roo 8 2 71.29 CCCAAGAACAGGCCCGTTGCGGAGAGGGCAAGGTGTTGAACGTAACGGGACGGTTAATTCACATACCAGGGTAGCCCAGATGCATGTCGTGCCGCTCGCG:1 - 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P-element 2833 1 25.74 GGCAGTCATCACAAACTGATGAAAAGATACGGCATGCGACAGCCAAATAAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGC:1 + chrX 3508552 5' + X-element 4310 1 70.00 AATGCTTGAGTCTAGAGCAAATAAACAGCTAATTTGATGATGATGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTA:1 + chr3L 481591 5' - 1360 3284 1 59.41 TGTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAAC:1 + chr2R 6779784 5' - 17.6 447 2 76.24 GCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTG:2 - chr3R 1868209 5' + G-element 45 1 64.36 AAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 - chr3R 21695489 5' - 3S18 6058 2 66.34 TTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTACATATATACATAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATTGGCAGTGC:1 - chr3L 28092979 5' + gypsy11 4061 2 72.28 AAAAATAAAATTGAATTTTTATGGCATAAAATAGATAACCTGATTGAACAGGTGAATAGTCATTTCCTTATTTCCGGCTCGAAGGACCAAATGTAAAATCC:1 - chr2L 3224322 5' - 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gypsy8 4551 1 62.38 GAGCATGAAATTTGAATTATGGTATAGCTATACCCCACTTTCATAATATTTTTAATAAAAATATTTATAATATAATAATATAATATTTTATATCTATATAC:1 + chr2L 1890625 5' - Dm88 4126 1 75.25 TGTTGATAACGAATAAGGTCACTTGGCGCCACTGATAAAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACAC:1 + chr3R 19467876 5' + Transpac 4953 2 63.37 TGCGCTCACGCTCTCGCCGGCAAAACTCTCCTGTTCTCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3R 28326787 5' + P-element 7 2 73.27 GTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 - chr2R 20702143 5' + Doc 57 1 79.21 ATTGAATAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2L 5974406 5' + roo 8687 2 53.68 AGTGTTTATAGGGCTGCATGTAATTAGTAATCCTGTCCGGGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTG:1 + chr3L 18576680 5' + gypsy3 6577 4 75.25 AATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3R 13202998 5' - roo 9037 1 61.39 AGCTTTCTGAATAAAATCGAATAAATCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chrX 2884874 5' - copia 204 2 80.20 GCTCATTTAAATTCAATGCTCATTCCTTCTGATGGATGTCATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAA:1 - chr3L 13081029 5' + 412 5 2 74.26 CAGGAAGCGACTTTAAACAGACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTTCCCGAAATTAAAAA:1 - chr3R 18551169 5' - Max-element 245 2 78.79 GCTTTTCGTTTCGAATATATCATCATGTTCATGTATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAG:1 - chr3L 19881854 5' + Idefix 3 2 76.24 TTTGGTGTTTATAGTTATGATTTTCCTTTGTTTAATCAACTCTCTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGTATAGTTTACAAAACTA:1 + chrX 5126593 5' - I-element 5333 1 57.00 CGCTGAATATATCCGCCCTGAATGCGTCCGTTTCGAGCACGCTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATA:1 - chrX 19661158 5' + R1A1-element 5006 1 59.41 GTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 - chr3R 9952243 5' + Ivk 35 1 61.39 CTCAAGATCAAGAGTGAACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCAGGCTGCAC:1 + chr3R 30255712 5' + Doc 4528 1 76.25 AATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCAC:1 + chr3R 5977765 5' + copia 52 2 75.25 ATCATTAATTTATTCGCATAATTATATTACAAATATTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTA:1 - chrX 18011761 5' - roo 309 2 65.35 CAGGGAAAAAGTTATTACTCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2R 8378688 5' + pogo 12 1 67.33 AAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chrX 4488878 5' - 412 451 2 65.35 ATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATATCACGAACTATAAAAGCTATTAGGTCCATTCACACTAATTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCCGGGAACT:1 - chr3L 23871827 5' + INE-1 557 1 63.37 CGGCGAAAGATCAAAGCAAGAACAGAGCCGAGCTAGTCAGGAATATCACCCTAATAACAATAACAATATACTAATAAAATATAAGATGTGGGACAATAACT:1 - chr2R 25068137 5' - HMS-Beagle2 16 2 64.36 ACTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 + chr2R 24493686 5' + flea 50 2 78.22 CAAAAACAATAAATATATAGAAATATAGAAAGCATAATTAATGTTATACCTTATTAAAAAAAAAATACTTAAGTTAAAAATTATAATAAAAT:1 + chrX 12031580 5' + TAHRE 21 1 47.83 GTGAAGTCTTTCGATTTTCATCCAATACTCTTAATAAATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGTCTA:1 + chrX 2457348 5' - 412 7435 2 63.37 AAGGGCAAATTTAACACAATAATTTGCACAATTTGTCAAAACAACCCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACA:1 - chrX 7828974 5' + 412 10 2 69.31 TTAAGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 1626523 5' - roo 9050 2 56.44 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGTGAATACGTGTGCACACATACAGATG:1 - chr3L 6630130 5' - 1360 171 1 53.47 CAGTTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTG:1 + chr3R 9657671 5' + BS 7 1 62.00 TCCGTCACATTTATGCAGTAATCAGTCAAGGTATGATTAATAAAGATATAACCTACTGATTTAGAATTAGGTGTTCCATCTTGTAATTGTTGTTGTCTTCG:1 - chr3R 20147854 5' + transib3 339 1 74.26 CGTCCAGGTTACTTGACATTAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTT:1 - chr3R 25440207 5' + pogo 52 1 80.20 GATGGGGGGCGGGAAGGCAGCCATTAATTCACGACTTGTAATTTCCTCACTTTCATGCATCTATTTGTCATTAATAACCTTCAATAACCTTCGTTAATGTA:1 - chr3L 13717997 5' - gypsy7 451 1 58.42 ACGAAAGGTTTTTATCGTATCATCGGTGGGCATCTGTCATACATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chr3R 23665360 5' + 297 2 2 76.24 ATATGTATATTTAAAGGATCAAAGAACATTTTAAGCAGCACCAAGTGAAACGAAACGAAAAAATCGTATGGTGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTT:1 - chrX 19767470 5' + 1360 3387 2 60.40 CATACGCGAGTCAAATATTTTCAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 - chr2L 19679806 5' + Doc 15 1 71.29 CTTATCTAAATACCCAACCTTTAAAAAGACACTCACCAGCAGGCCTTTTCTAGAGCTGTATATTAATGTGCTTCCTCCGAA:1 + chrX 2238463 5' + Gypsy12A_LTR 2059 1 61.73 TCCAAACACATTTTAAGCTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr2L 17957307 5' - opus 7477 2 55.45 CCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:2 - chrX 7828929 5' + 412 55 2 80.20 TTTATTACAAAAATTATGGTTAAGACATCCAAACCAGCAGTTAGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chrX 13548815 5' - blood 345 2 55.45 TAAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 12136339 5' - roo 9038 1 55.45 GCGCTCGTTCTCAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chrX 4041514 5' - hopper 1380 1 58.42 GCCGCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 12538466 5' - roo 9026 1 69.31 AACTTTGTAAGAACACATGTTCCCAGAAAGATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATCAAAGATTCTGAGAACCATCAC:1 + chr3R 12342311 5' + F-element 4335 1 48.51 GTGCAAAGGATACGGATAGTCTGGATGGCCAGGACCTATCCCCATGCCATCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTA:1 - chr3R 10957738 5' + hopper 28 1 54.46 TATTCTAGGCATTCCTTGGTGCATATGGACAAGAAAAATAGATTTGATAAATACAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAAT:1 - chr3R 5505301 5' + mdg1 7062 2 55.45 ATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTT:1 - chr2R 2552169 5' - HMS-Beagle2 7150 2 68.32 ATTCTAAACATAGTTTAGAATAAACAATTACATTCGTTCTTAACATAATCAACACTTTCGGAAGAATTACAGAGTCTTAAGTCTTAAGCTGAGATCAAATG:1 + chrX 15627357 5' + 297 282 2 58.42 TGAGGATTTTAGTTCGGGTAGCTAAAGTGGCGGCAGTAAAAACTACCAAAACAAAGGAGGTGAAAGTAAAAACAATTCTATAATCTAAAATCTTTAAATTA:1 + chr2R 14439066 5' + TLD2_LTR 152 1 62.38 ACAGCNAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2L 13837924 5' + 297 6625 2 74.26 TGTAGACCTGTTACTCGTAAAGTAAAGTGTGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAACC:1 + chr3L 22788036 5' + INE-1 87 1 70.30 TAACATTTTACTCTACATTTGTTATTTTTCCCCCCAATAAGAATGCCATAACATTTTTATTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chr2L 18513610 5' - jockey 4978 1 51.49 CAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 19642981 5' - roo 9030 1 66.34 TATTGACGGGTGCACAAAAGTCTTGTTTCAAGTCTTAAGAATTGTGCACATGTTTACACTGAAAGAAATAAGAAAAATTAAAACAAAAAA:1 + chrX 3558739 5' + Doc 4693 1 66.67 TTTCGACTCGGACTTAGTCGATCGCTATTTACGATCGCTCATCGCTTATCGCATGCACAATAGCGTTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGA:1 + chr2R 9414649 5' - F-element 4412 1 66.34 GGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chrX 4154934 5' + blood 53 2 76.24 CATTTGTTGCAACCGCCAGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 29660238 5' - mdg1 7423 2 62.38 ACCAATGGATTCTATGTTGACCTGAACGATACTCGCGCACAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGCAACAACGCGTACTTCTC:1 - chr2L 8466424 5' + F-element 256 2 73.27 AGCAGCAAATATGTGGAAGAAATAGAATACAATCAGTGATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chrX 17204069 5' - Tabor 7306 2 64.36 ATGCTGAGTACCATACCAATGCCTTCTACCCTTCAGGCCACATTTGGCCCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 10811216 5' - P-element 2861 1 55.45 ATCGCGCACCGATCACCGAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACT:1 + chr3R 8198488 5' + Tirant 35 2 60.40 CATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 - chr2L 2197124 5' + P-element 55 1 25.74 AAACGATGAACTCAAAGTAGCCCACTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr3L 543434 5' - P-element 2835 1 27.72 GGATGNCGGTTCCGATCTATCGATAGCTTGTCATTCATTTGGCTTGCCCTCTTTCATTTCCGTCTGCCAGCGAGCACCTGCATTGCCACAGTGGACACTGT:1 - chr2R 5152537 5' - R1-2 3179 1 72.28 TTGCAAAATCGAAATAAATATTATAACGGTTGGCATGAAACTATCTTCAATACATCATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAGGTTTTTATCGTGCTCC:1 - chr3L 27680858 5' + F-element 32 1 53.47 GATAGAGAAGGGCTTTCTGCACGACGTGATCGTGTTAATTTGCATGCTTTAATTAATGTACTTATCCCATTTATAAATAAATATAAATACATTAAATCGCA:1 - chr2L 23052976 5' + diver2 454 1 73.27 ACATTNGAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAG:1 - chr2R 12214012 5' - Transpac 299 2 68.32 ATTGGGTATCCAAAGACCAAAGTTGTAGCTCACCCATTCCGATGAGACAACAACAAAAATGCAACCGAACATGCACATTAATATTATGTATAAAAGTGAAA:1 - chr3R 29722619 5' - NOF 4001 1 55.45 AAATTTACCCATTTGACACTAAACTTTGAACGGAACTGGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCA:1 - chr3L 22325218 5' - jockey 4713 1 62.38 TTTGTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCC:1 + chrX 5018647 5' + opus 7163 4 79.21 TTCTTTGTTTGAAATTGGCTTAAAGCCCTAAAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 - chrX 8948712 5' + blood 7012 2 76.24 GTTGAAAGGTCAAAAAATCAATTTACCTGTAAGCGCCTGTGATAAATGTATATTTTAATGCTTTATGTAAGTATAATACTTTAATAATATAATAATAATAA:1 - chr3R 4543755 5' + invader3 5051 5 81.19 CTCTCATTCCGTTGATTTGCTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTG:1 + chr2L 14280113 5' + P-element 142 1 24.75 TAAGCAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr2L 13244983 5' + P-element 40 1 39.60 TCAGTTGGATGTGCCTCAAGATCGAGTTTGTCAAGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGA:1 + chr3R 6305445 5' - Quasimodo 211 2 66.34 GTACAGATACACGTAGTTTCCCAGCACACTCTGGGCATTGTTGCCCACGTTCATGTACAGACACCCTCTCGATCTTCCACAACAATAGACAACACATATAA:1 - chr2L 1747787 5' + G6 1906 1 63.37 CCGTTAATCATCACCTGTGATTTCTTCAATTTCTCAACCTCCCACTAAAGTCAGTGTAGATGACATCTGTGTGAAGATTATTTTTGAAGCCCTGTATTACG:1 - chr3R 21427217 5' - Q-element 267 2 57.43 ATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGA:1 + chr3L 19951183 5' + Ivk 3 1 73.03 TTGCTCATTGTGGGTGGCAACCACTGCTGCCGAAACCACACTTTTGAAGGACGTGTTGATATTTTTCACATTTCTATTTGTCTTGTAAATTTCTATCGATT:1 + chr2L 21902005 5' + INE-1 301 1 73.27 AAATAATAATAACGTTAAGGCAGTCAGACTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGTAC:1 - chr3L 6630130 5' - 1360 182 1 72.28 CCAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:2 - chr3L 2800205 5' + blood 7042 2 54.46 AAAACCCTGACACATTTGAATGAAAAGTACATAAGAATTCTTTTTCCATATGTGTGCACATAAGCATGAGCAAGAAGCGCTCTCGCGCAGATCAAGATAAC:1 - chr3L 16397122 5' + Tom1 215 1 75.25 GGTTGCAGATGCCGTGATTTACCTGAGTTCTGCGCACCTTTTCGCCTTAAGATGTTCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2R 20838590 5' + 1360 19 1 60.40 GTTGGGTGCCACCGATGCAGCAAAACTCGCCATACCCACCACCCTCCCAGCCACACCCACACTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACC:1 - chrX 16419676 5' + Doc 428 1 67.68 AATTTCGAATCGATTTCTTTGCTTTTTCCTTTGAAAAAATCACGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATG:1 - chr2R 11557471 5' - flea 4762 1 67.33 CAAAGTGTGATATTGATTTGCAGCAAAGTAAAGGCACAGCAGAGTGCAGAGATTATCTCAAACACAATTTCACAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGA:1 + chr3R 25573948 5' + Max-element 277 2 76.24 AAAATGGCTCCAAGAGAATGAAGAAAATCATTGCCAAAAGGGAAAATGGAGTATAAAAAGTAACCAAGACACATTGT:1 + chr3L 17815343 5' + jockey 4908 1 81.82 AAACCACTCACACTCAATGAATTTCCATTCATTGAAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTT:1 - chr2R 16846558 5' - Tirant 8315 2 64.36 ATGAGGAATTGATGATTCGATTTTTAAGTGTGACTCATAATCACTTTCTAAAAATCGAATCATCAATTCCTCATAGGTTATTTTATTTATTTATTTATTTA:1 + chr2L 14336228 5' - HeT-A 31 2 74.26 AAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCA:1 + chr3L 27356081 5' - Tc3 1681 1 65.35 GAATACTCTTCGCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2L 19642948 5' - roo 400 1 69.31 TCAGAGGCCGGATCCCACGACAGCTCGCATCACAGTGGCCAAGATGTATCGCCACACATGAAGTACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr2L 18473459 5' - 412 467 2 68.32 TTCCTCCAGTGTCAGGACATTTTCCTCCAGTGTCCCGTCTCTAGGTCTCCCGCACTGGTGTAAGGGGCGGCCTGCCTCTCACACCTGTTGTCGCTGTTTAG:1 + chr3R 7520678 5' - blood 479 1 73.27 TCAGCTGCTGGCCAAGCACGATAACTGTTATTATTGCATCCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAA:1 + chr2R 22992884 5' - copia 117 2 60.40 ATAATAAGAATAAAATTTATCACCAATAAAGATATTAAAATATGTTCAAGTTACGCTCACCCGCTGTCACCCGCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTAC:1 - chr2R 3502267 5' + GATE 38 2 80.20 AGTTGTTTTGTTTTTCAAAAGTGGGTATTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGT:1 + chr2L 2194232 5' - Porto1 329 1 70.30 CTTTTATCTTATACAACTTATTACTTATTATTAACGAAATAAGTTTATGAACAAGGCCAAGGGAGAAACCTGTACTTGCGGGTGCACGCTTTAAAGTCCGG:1 + chrX 19595901 5' - Gypsy12A_LTR 2208 3 65.35 GTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 15638279 5' - roo 360 2 78.22 CTTATTCGCAACAACGGAATGCGAGCTGGGTGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr2L 1828760 5' + 412 21 2 58.42 AGCGAAAAATAATCAAAGATACTCGAAAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTA:1 - chr2L 12258276 5' + I-element 244 1 73.27 GAGTTNGGATCCATGTTGGAGAGTGAGTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCACAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTAATTCTCCTGGCTCAACACCTGCTAC:1 - chr2R 12048671 5' - jockey 411 1 73.27 TATATAATTTATATTTTTGGACCCATCAAATTAACCATAACAAACAGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAAT:1 - chr3L 19951286 5' - Ivk 5362 1 68.32 CGCACNAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTG:1 + chr2L 22719600 5' + 1360 46 1 73.27 CTTCCAAACAAAATTTCGTCAAGCCCTATTTGCTTGTTAAAGCTGCAAGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 - chrX 14796927 5' - transib2 2799 1 54.46 GCTATAGCTACCGTAGTTACTTTTAAATGTGCCACTTGCAAACGAATGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr3R 27412513 5' - 412 466 2 52.00 TCAATNCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTT:1 + chr2R 3919682 5' + 1360 50 1 71.29 ATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chrX 21668888 5' + pogo 44 1 71.29 AATGCACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACT:1 + chrX 1427531 5' - Bari1 1676 1 53.47 CCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 + chr2L 13447115 5' - HMS-Beagle 7001 2 67.33 CTTATAGTTTCTGCAAAGGCAATCATAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 14041935 5' - roo 358 2 75.25 GGCAAATGAGCAAGCCCCCAAATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAAC:1 + chr2L 903777 5' - Tc3 314 2 78.22 AAAGAAAGAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTAT:1 + chrX 14713194 5' - flea 4992 2 61.39 GTGAGGCGTGAAAACGTCGAACAAAACTGCAGAAAAACATAAAAAAGTATGTAAAAGGCTGAAGGAATCGTTTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 - chr2L 13129738 5' + INE-1 88 1 64.36 ACTAAAATTCTAGAAAAAAAAGAATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGC:1 + chr2R 617187 5' + diver 5941 2 75.25 CGTCTCAATGTATCTTATAAAGTGTGTAAAGTAACATTACATTTAAGAGCAAAAATAAAGTAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGG:1 + chr3R 24281934 5' - Max-element 285 2 64.36 TTGCATAATTGCTGATGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3R 14688456 5' - pogo 2053 1 76.24 CTGCCTGGTAGCTGGTCAGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 19936698 5' - roo 391 2 64.36 ACGCATGTACATGTGTATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCA:1 - chr2R 18502443 5' - P-element 2676 1 25.74 AACGACCAAAGTGGTCTGGTAAGGTGCCGAAAATGTCTGGGAAGTAGATTTGTGCAGGAATAACGGAAGCGTACAGAAAAATGCGGGGTGCATTAGTATTG:1 - chr3R 28512706 5' + invader1 3796 2 56.44 CACTGTACAAACAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 14381272 5' - hobo 2911 1 56.44 ATGATGCGAGAAATAAACGGTAGAAACGAGAAAGTGGAGGAATCCATCCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAA:1 - chr3R 5092083 5' + 17.6 6946 1 53.47 TTATTAATTCACCTATAAAAGCTTTTTAATATTCGTACCTTTTGCATTTATCAACTTATTTTTGCTACCTTTAGCTGTAAGATGCTTAAAGGAGCTGGCCT:1 + chr3R 15925506 5' - roo 496 1 57.43 AGGTAGCAGATTTGCACGACTATACAAGAAGTCTCCTAAACTCGTATTTACTCCAGCCTAAGCAATAATGATGAGTTTTTGCAAAACTTGAATTCTATGGA:1 + chr2R 8382072 5' + pogo 1806 1 66.34 AAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 20466698 5' + roo 8704 2 67.33 AAATTCAACTAAATTGGGAAACAACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chrX 20437727 5' - roo 411 1 66.34 TAAATCAAAACCATAAATTGTTCAATTTGATTAGGTGTGCAAGCAGGAGAAAGAGAGTAGGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATT:1 + chr3L 9678271 5' - blood 166 2 85.00 CTTAAAAAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTT:1 + chr3R 21695434 5' + 3S18 5795 2 53.47 GCGGAAAAAGTATGGAAAGAATGGGAATCCACTATCGCATCATTCGGGCAATATTATAATGCTTTCGGGCATATCGTGAAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGT:1 + chr3R 15469381 5' + micropia 343 2 78.22 TTTAAGGGATATTAACCATAAATAAATACTATATATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr3L 22231588 5' - 297 6941 2 72.28 TATGTGTAGCTTTTCCATTCGGTTGTAGTGTTTTATTTGGCCGATTTTTATGCGTTTTTAATGTGTAGCACATGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATC:1 + chr3L 18127079 5' + BS 4789 1 70.30 AAAATGTAATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 - chr2R 16898305 5' + Max-element 39 2 63.37 ACATTGACAATGGAAGGCACGCTTATGTCATAGACCAAAAATGGACAATCCAAGTGGGTGGAGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAAT:1 + chr3R 19107179 5' + invader4 3050 2 65.35 CTGAGNATGTTCAGCCAAATAAACTCTAAATAACTTTGACTACTGTTCAACCGGTCTACTGTCTACTATTCGTCTATATACCAGAGAACTGCAGCCCGCCA:1 - chr3L 13885968 5' + hobo 2710 1 80.20 AAATAACATATATGTGCTGGTGCTTCCACTTTGGAAATATTATTCGGTTTTAGGCACCTATATACAATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr2R 9454220 5' - opus 7492 2 70.30 AATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTG:1 + chrX 23431797 5' + Stalker2 7290 2 66.34 ATGCAGAATAAATAACGCATAAATACAAATCCACGATAACAGCCAAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCC:1 - chrX 8910024 5' + 1731 4597 1 55.45 AATTATTCGAACTTCTCTCGATAGATCGTTGCTTTTATATAAATACAATACTAATATTTTGTAACACCACCTTTGGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTT:1 + chr3R 6813197 5' - Bari1 1348 1 68.32 AAGTAGCAACTAATTTTCAAGCTGATGCAACAGCAGACGACGACGACTGGTACGACAAAGGACGACAAACGGTTGGCTTTGTCGCCGGACTTTTATAGAGC:1 - chr3L 13366430 5' + BS3 53 1 73.27 TATGCGTCTTAAATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 3649759 5' + jockey 14 1 75.25 CACCTCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chrX 19457132 5' - roo 390 2 61.39 CGAGCCAGTAAGCAAGCAGTTGATGGGAACAGATAGCAAGGGGCGAACGACCGACCTTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3R 10677662 5' - 412 7528 2 60.00 GGTCAGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 - chr2R 19936685 5' - roo 9041 1 54.46 CCCCCAAATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 903791 5' + 1360 11 1 61.39 ACTCCGGGCACTGTGCTGCTAGCAATTTTATAAATAGAAAAATGCATAAAAATTGCATGAAATAGGAATGAACTAATCTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAG:1 - chr3L 3503102 5' + Circe 7127 1 71.29 TTCACGACAGTTTTATGTGTTTTCGTGCGAGGTTGGCAAGTTTTTGGGGCTGTGATTTCACTTGGGCACTTGGGGCGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2L 1626632 5' + roo 8667 2 71.29 CGCTATTCGGTTGTCAATGCCAGGTCTTTTTTTTTGCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATT:1 + chr3R 18507837 5' - jockey 4955 1 63.37 TTTTAGACTCCAGTGTTGACGGCTGTGGGCGATCTCAGGAACATCTGGACGCAGAGCCTCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCA:1 - chr3L 20629111 5' - R1A1-element 5046 1 63.37 CGCAAAAACAAATAACTGCGAGTATAGTTAATCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTAC:1 + chr2R 9426592 5' + P-element 351 1 35.64 GGGATTAATGGAAATCCATATAAAGGTTTCTACATTTTACCAAAAGTGTGCACCGAATCGAGTTGAATTTTCTTAATATATACATTTTATTTACTTAATTT:1 + chr2L 7437073 5' + accord2 429 1 36.63 TAGTACATATATCTATATCTGTATTTTACATATATATGTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 9862272 5' + roo 8703 2 73.27 ACCAGTGAATTGGCTTTGCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr3L 5716948 5' + copia 30 2 53.47 CTTTCCGTTCCGACCCATCAGGCAAGGGGTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 19306725 5' - P-element 2882 2 74.26 AAACTGTAAATGATTGGAGCCGAGTGAAAAAGTAATGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTA:1 - chr3L 22841959 5' + Stalker 7166 4 69.31 CATAATACTTTTCACTCGATTCCGCTATTCGGTTGTCAATGCCAGGTCTTTTTTTTTGCTTTCACAATTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chr3R 18507815 5' - jockey 4977 1 46.53 ATGGTGCCTACATACGAGGCCAACTATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGGTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTCAATAGAGCTAC:1 + chr3L 24149491 5' - hopper 1020 1 75.79 CTCTACATGATTCTCTTACCAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTT:1 + chr3R 7993831 5' + Doc 2 1 76.24 ACTATTATTATTATTTTTCTTTTTCCGCACGGGTACCGCGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACGGAGGGGCGCTGTCATGTATCGTACGGCTCGATTC:1 + chrX 10295828 5' - Cr1a 4390 1 75.51 CAGAGTCTTCTACTTGGCGTCCATTGAATTTGACGACTCCTTTACGACTGCCTTGTACTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTGC:1 - chr3R 19611464 5' - Tabor 7143 2 72.28 TGACAATGTGGTATACACTCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCA:1 + chr3R 2555497 5' - Bari1 1679 1 52.48 TTAGTGGAAGAATATTCCACCACAAAGAACTTGAACCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATAT:1 + chr2R 4135919 5' + 1360 240 1 64.36 GTTTAGAAACAAAAACACAACAGATATTTCTCGATTTTGGTTTTTGCGTTTTGAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAG:1 + chrX 14828596 5' - F-element 489 1 60.40 TTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGAC:1 + chr2R 924447 5' + springer 7174 2 63.37 TAGGTGATCCTTTTCGCTCAACACATCGCCTAAATTGGAATGCAAACCTTATATTACCTCCATATTCCAGTAGACTACTTTTATTTAATTTACCTTCCCTA:1 + chr3L 19863959 5' + Cr1a 3991 1 74.26 AACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 - chrX 20437688 5' - roo 9035 1 65.35 TATAGCATTTAACGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGC:1 + chrX 868694 5' + jockey 4927 1 60.40 AAAGTTCCAAAGTGAGCCGGTTGTTTTCATTGTTTTTCTGCTCTGCTCTGCTCTGTTCTGTGCTATTTTTTTTTCGTTGTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr2L 1019941 5' - gypsy9 453 2 68.09 TCAGCGAGAAGAATTTTGAAAAAATTACAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2R 24965046 5' - P-element 2874 1 67.33 CAATTGCAGCATACTTTTGGGCAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chrX 18353588 5' + jockey 8 1 75.25 TCTTCCATTATCGTTCTCTTCGGTACACTCTGTAGAAATGCGCGATTATAGCAACAACCAAATTGCTACCAAAAAAAATAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3R 18448068 5' - hopper 147 118 62.38 GCTTGATAACTAAGAAGAAGACTGAAATTTAAATATAAATTTGTTAACAAATATTATCGTTTTACAAGGATGTGATAGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTC:1 - chr2R 6810744 5' - invader4 3009 2 79.21 AATTTTGGCCACAACCAGAGGTTTTTTTTTTGGTTTTTCTTACCCTATTTATATACTTAGTATACTTATATACTACACAGAATAGGTATTCGAGCGATGGT:1 + chr3L 16514556 5' - Doc2-element 137 1 56.44 CGGAACATCCCAAATCGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chrX 4488936 5' + 412 7086 2 55.45 CCATGGGGTGGAGAATGGGGAAAAGGACTTAAATACAGACTCACTGGCCGTGGCCAGCAACACGAACACCAAACTAAGTTTACCCTCGAGCAATGCATCGC:1 + chr2L 19883436 5' - gypsy 188 2 69.31 CCATTGTGCACAAGTTCACCAAGGAGAAGTATCAGATGATCGCACTTTTAGCTGGTCGTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGC:1 + chr3L 15159572 5' - HMS-Beagle2 6951 2 74.26 AAAAATTAATTGCCAATCAGACTGACTAAGAATTGTTTACTCGCTTTTCCGACCATATAAAGAAAATATATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGATC:1 + chr4 1031202 5' + INE-1 96 1 53.47 CTTCAAATCAATTGGGAAACCAACAACCGAAGGCGCCTAAGAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATAAAAATTTACAAATAGATAAAAATATGTAAATAT:1 - chr3L 17236019 5' + G3 4497 1 80.20 CTTTCAAAGAGCGTAAAGCTACGTAACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 21401944 5' + roo 14 2 64.36 AGGCAATCGACCAAATTTTCCGAGCGTAAGAGGGAGTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGAGGGTG:1 - chr2R 6438517 5' - GATE 8271 2 66.18 GTAAGGTTAGATATAAAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3R 19657517 5' + roo 8697 2 60.40 CGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 + chr3R 19609658 5' - Tabor 7286 2 60.40 ACTTTCTTGCCCAACCTCCCCTCAATGCCCAGAATTTTGGCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 7792184 5' + 412 7091 2 59.41 GTCGGAATCGTTGCAACGTTTTCGACGAATCAGAATAAACTTCTCTATAAATGAAAGGTATGTATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGC:1 + chr2R 6868998 5' - springer 370 2 65.35 CACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr3L 3671293 5' - roo 9034 1 62.38 AATGAGTCTATTCCATTTCAAGGAAATTTATTAAAACTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGT:1 - chr2R 5952403 5' - Doc 308 1 59.04 TCATCTGAATATTGAGTTACATACCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chrX 18717200 5' + roo 50 2 75.25 CAGAAGGCAGAAAAAATTTATGCACAATCGAATTCTTTTCGACGCTTAACGTTTTGCTCAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACC:1 - chr3L 22543952 5' - INE-1 557 1 61.39 CAAGAGAGTCGAACGACCCCGTCTTCACCGCTCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 - chr2L 2909635 5' + pogo 10 1 69.31 AAAATTTGAGATAACAAATTAGAAAATAAATTTAAGTTATATTGTTATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 - chr2L 1129148 5' - HMS-Beagle 221 2 57.43 AATTTCGCTTTCTTGTTGTCTCTCTGGTCGAGGCGACGAGAGATAAAGTTCTATAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTC:1 + chrX 15446569 5' - accord 7160 2 59.41 ATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chr3R 15998084 5' + pogo 46 1 77.23 TCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 + chr3R 14169231 5' + blood 15 2 60.40 CCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chrX 19457147 5' - roo 9038 1 61.39 GCTGACTTACTTCTGTATCCTTGGACAACAATTGTCGTGGCTAATATTAAATATAAACAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGAATATCAGATACCC:1 - chr3L 12890273 5' - INE-1 556 1 58.42 ATATGGTTTTAAAGAGGAGCCAATTCGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTA:1 + chr2L 17889342 5' - accord 7335 2 70.30 GGGGCCTCCTTCGACTCCTCCACAGCTGGGCGTGGTCTTGCTTGTACAAATACCTTTTCCCTACAGGCATTAATAATTAAAATCAAGAATTGAGCGTGCTT:1 - chrX 19595308 5' - Gypsy12A_LTR 2113 1 67.33 CAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 19076163 5' - roo 9020 2 81.19 ATATACGCATACGCACACGCACGGGCCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chrX 2050893 5' - 412 469 2 54.46 GACACCAGTCTGAAAAAAGACTCCTCTGACTCCAATAGTTTACGCGTTGTCGTATTGAATAGTGGACTTCATGCCGCGTAAGTGTAAGGCTGTGCTGGCTA:1 - chr2R 5515319 5' + HB 1303 1 63.37 ACATTTCTTATCCTTTGAATGGGTTTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 + chr2R 10912083 5' + 412 22 2 56.44 CTGAAACAAATACTTGTAAATACCAACACAATAAAATTACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 7787204 5' - roo 402 1 70.30 AGGCCGGGAAATCATTTGATTGGATTAATGAAAAAACAGAAAAAACAATAGATAGAAGATAGCTCTCTCTCACTCTTTCGCTCTCCCACACAAAATCTAAA:1 + chr2R 3937169 5' + Cr1a 313 1 64.36 GTCAAGAAGCTAGAAGGAAAAGCGATCCCCGAAATACAAAGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCCACTTCTGCAGACAGCGAGCGGTCAATCACCCATAACC:1 - chr2L 16706938 5' + Doc2-element 396 1 63.37 CATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 - chrX 5018692 5' - opus 456 2 68.32 AATATTGAAACACCTCCAGCACCTGAAAATTTTCGTCAAGAAGCCTCGGACAGAGAAAAACAATAACTAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGG:1 - chr2L 23389038 5' + Ivk 5300 1 70.30 GTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 + chr2L 1129086 5' + HMS-Beagle 6831 2 69.66 CTAGCATAAATTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 - chr3R 14095008 5' + Doc 22 1 63.37 GAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 - chr2L 108073 5' + P-element 21 1 59.41 CGTGATGCCGCGAGAGAGGGAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chr2R 13038911 5' + P-element 55 1 23.76 CTGTGCCTTGTCTACAAATAGCAATTCAAGGGCCGTCAATGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chr3L 23821861 5' + HMS-Beagle2 27 2 57.43 ATTAGACCTTTTGACTGTTGGCCACGCTAATTTCTGTCTAATATTCCCTCTCCTTTTATCGCTCCATCTCACTCAAATTCATACAGCTTATTTATTTGTTT:1 + chr2L 11970457 5' - Bari2 926 1 61.39 TAATAATAAGCAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 - chr2L 13244989 5' + P-element 34 1 45.54 ATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr3R 30272832 5' - P-element 2828 1 20.79 ACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chr3R 19609708 5' + Tabor 45 2 68.32 AGTATAGGCACTCAGAGTGTAGTGAGAGAAATTAGGGACACTCCATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chrX 495166 5' - 412 7515 2 53.47 ATTTTCTGACTTAAAATCCCTTTTCAAAGAGATTTATTTAAGGTTTCAATTCAGGCATTCGAGTCATACACAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr3L 10698618 5' + roo 7 2 60.40 AGGTGNACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 13347340 5' + roo 8692 2 67.90 GAGGAAGTAATCAGTGGATTTAAGTGGGGATTTAAGGGAATCGCATTCGAATAAGTTATAGAAATTAATAATAAAGACAATAAACGAAAAATCTAT:1 - chr2R 24139392 5' + Transpac 4764 1 70.83 ATTTGCCGACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 + chr2L 21089145 5' - flea 4997 2 63.37 ACTTAAATAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chrX 20974841 5' - opus 7483 2 61.39 AAGAATTAAACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3L 13994258 5' - P-element 2844 1 34.65 TTACACTGCAAGAATATTTCATACATTTGTAAAAATAAACTTACTTTGTTTATAGAATTCACAGTTCTAGGGGGGCTAGTTTTGAAAATATATATTAACAA:1 + chr3R 25817465 5' - TART-C 11027 1 74.26 AATTGAAATATAAACTTCCTGGTGTTTAATTAATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCA:1 + chrX 6605464 5' - opus 7484 2 60.40 GTCAAGCACTTCGAAACTGTCCATATGCAAGCTCGCCGCTCAACACGTGCGGAGTGGAAAATTTCCAATAATTTATTGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGT:1 + chr2L 20546736 5' - R1A1-element 125 1 74.26 GAGCACTTCAATCATCCATGAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 + chr3R 5977744 5' + copia 4900 2 54.46 TGATGAGGGATCTAACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3L 15638312 5' - roo 394 1 64.36 ATCACCTCAGCTCCCGCGGAACGCCGACCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chrX 6654709 5' + P-element 33 1 44.55 TCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 28326751 5' - P-element 2844 1 39.60 AGTCCAAATTGAATACGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 - chr2R 9375239 5' + HMS-Beagle 6830 2 66.34 CTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 7787243 5' - roo 9026 1 69.31 GAGAATGGAGGACAGAGTGCTCAAAGACTAGGTAGATGGAACCAAACGATTCATCCTATATCCATACCCAGAAACACCTGTGCGTCTGCACGTGCTATGTA:1 + chr2R 7427816 5' - NOF 58 2 69.31 CGCTCCATACAATATCAGCAATTTCCTTCGTTAGTCATTCGTTTCCTCGCATTCTCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATGAGCGTTAGATCGTATTTCAA:1 + chr3R 25151376 5' - Stalker2 139 2 59.41 CTAACGACAATTTACCCCGAAACCCGTTTACAATTCCGTTTTAAACCCTTTACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3L 5716849 5' - copia 252 1 73.27 ATTTATATATAAATTTAATTACACGTTATAAGTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGGTGGAATCGTTTGCCCA:1 - chr3L 20490715 5' + FB 45 1 76.24 GGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr3R 14169247 5' + blood 7042 2 56.44 AAAAAATTATTATCATGTATTGATTCAGATAAAAATATTTCGCTTTTAAAAAATTGTCAGATGAGAGACAAATTAGAATTAAACATAAATATAAATGTGTA:1 + chr3L 3999206 5' + 1360 2958 1 75.25 CGGGAATTCGCAATAAAACTTTTTCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 - chr2L 7927267 5' + hobo 32 1 60.40 TATGCAACACTTTTACAGCCTTCAAAAACATGAAAAGCCTAAAAGTGTTTTAAAAATCCAAGATTTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 - chrX 13134996 5' + jockey 4785 1 60.40 AGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGC:1 + chr3L 24213775 5' - invader2 5078 2 52.48 ATCCAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATATCACGAACTATAAAAGCTATTAGGTCCATTCACACTAATTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTC:1 - chr3R 21568086 5' + INE-1 549 1 57.43 ATGGAAGAGGAGAAGATATTGGCTTCGGCTCTGGAGGCATGTACTTAACCTGCACAAGCTCAACTAAAAGAGGGTATCACAAATTTGGGAGGTTTCACCA:1 + chr3L 13998729 5' - P-element 263 1 72.00 ACCAGCTCCTTCCAGGTGCTCCTAACTGGACATAAACATGTGCAAATCAAAATGCTTGACTACCAACAAAAAAGAACAAAAAAAAAAAGAAA:1 + chr2R 12104652 5' + Doc2-element 225 2 54.35 AATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 9370002 5' - roo 9042 1 56.44 ATTTTCGACCGAACGTCGCCCGGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:2 - chr3R 28728369 5' + jockey 9 1 76.24 AGTACTTATCCCTGTGTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 5485149 5' - 1360 3372 1 60.40 GCACTNAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chr2R 8378656 5' + pogo 44 1 73.27 AACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 + chr3R 14169272 5' + blood 56 2 81.19 TCCCTACACTAAAAGAAACGAGCAGTGGAATTGGTACTTTTAGAGCAATATCCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAATT:1 - chr2R 21140700 5' + Stalker4 6981 4 52.48 CTAATAATAAAGATTTCATAATTTTTAGAAAGATCAATGAACCCTCTAAACCACCACGCCTGCACAAGTAAGAGACATCGAACCGGGAAGCTTTGCGATAC:1 - chr3R 16812345 5' + ZAM 8035 2 59.41 GACGACGGCAATTATTCGGAAAGTCATCCCCGTTGTTATTGCATCATCATGATGGAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATAC:1 + chr2L 16572372 5' + F-element 4576 1 67.33 TCAGGTTTATTGTGATATATTTAATGTTACACACACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAA:1 + chr2L 17890529 5' + accord 309 2 73.27 AAAGCGAGCAGATAAAATGAAAACAAAGACTGAGTGACCATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chrX 4154978 5' - blood 7356 2 60.20 GCTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - chr2L 17957291 5' - opus 458 2 71.29 AAAGTTTTGAGCAGTTTTTCTCCAACAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 + chr3R 9837553 5' - 412 7537 2 70.00 ACTGCCCACGATCACGATCTTTGTCTTTGCTCGCCGCTTTAAGCTCATTTCTGCTTCATTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3L 8063817 5' + P-element 2 2 73.86 TTAGACAGTGTAAAAGAAACATCCAAGCCAACGGATTCATTTCCTTACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACATGGCGACCG:1 + chr3L 21698117 5' + mdg1 430 1 54.46 ATTCGATACCCACACCACTCATACGACCCGACGGCCATGAAAGAGCGTGATCTTGCTCTCCAGCATTGAAGAGACCCAACAATTACTCTCAGCACAGGAGC:1 + chr3L 1932480 5' + Porto1 384 1 60.40 AATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAA:1 - chr2L 18028723 5' - flea 4960 2 79.21 ATAAATGTATAAATATATATATAAATATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCT:1 + chr3R 13102023 5' + opus 156 4 87.13 GCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chrX 8364634 5' + jockey 4807 1 73.27 GGTAAGAAACTGAACTACTGCAGAGTTGCTTTACGATAAACTCACAATGACACACAGACACAGACACGTAGATAACGCAGAAAATAGCTTGAAACGGTAGA:1 + chr2L 9613101 5' - McClintock 127 2 66.34 TGAAATTGGGAAGTGCATTTGCGGCGAAAAGGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAGTCGACTCAAAACCTCCTCGTGGT:1 + chr3R 16563297 5' + R2-element 125 1 70.30 CGGGGAACGGACTGCTCCATGGCAGAATAATAAATCTCAATACAAAAAATTGTTGTCTGTAAATTGGCGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCACAATATTT:1 - chr3R 5881350 5' + gypsy4 297 1 74.26 GGATAGACAATGCCATAAACAAAATGAATTTTCATCAAATCCCGCACCGACCATTAATCACACCTCCAAAAAAGAAAAAAAAAAAGGAAAAAAAAAAATAA:1 + chr3R 11601582 5' + Doc2-element 237 3 74.26 AAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350001 5' + 1360 3224 1 49.50 CGATGTTAAACGACACTTTCGGTTGTTTTTCAAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chr3R 31812764 5' + P-element 15 1 65.35 ATGTTGATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr2R 20702145 5' + Doc 55 1 77.23 AGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:2 + chr3R 25702191 5' + Tirant 41 2 67.33 TTGGTTTTGGAAGGCGTCCAGGACCTTGGTGAGCGCACCTTGCTTCACGCCCTCATCAGCACACGGATTGATGTCCCAGTGCTGAGTCGGCTTGCCGACCA:1 - chr3R 20927483 5' + gtwin 165 2 76.24 GAAATTAGAAAAGCTAACTTCCGGCCATTATTGTGACCTTTTCCTTTGGCTTCCAAATAATACTGAATCCTAACAAGCTAGTAATTGCATCGTAAACAACA:1 - chr2R 14381468 5' - hobo 390 1 72.28 ACGCATATGCCCAACAAAGGCGACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3L 3671385 5' + roo 1 2 77.78 GTATCTAAAGTTGATTTTTAGATCCGTTTATTCATAATGTGGATCGCGCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTCAGCTGCGTTAGCGGTTTTGACCCTTT:1 - chrX 21035143 5' - Quasimodo 218 2 62.38 TTTGTGAATATCAATTAATGTTAGTTCGTGAATTTTTTTTTCCACTCTTTGTTTTCGTCTATTCTCACGGCCACACCTCCCATCCAACCGACCGAGGGGCG:1 - chr3R 1845905 5' - Cr1a 4416 1 68.32 CTCAGCTCAATCTTAATTATATGTTTGCGCTGAGCTCACGACAAGCCCGATGACGACCAGTAGCAATTATTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCT:1 + chr2L 11963033 5' - Max-element 8246 2 79.21 TCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 - chr2L 11551422 5' + Max-element 14 2 65.00 ATCATGCAAATTAATAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 21500933 5' - roo 9031 1 67.33 TATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3R 12136323 5' - roo 9022 2 71.29 AAGTATGGAGTTGGTCTAAAGTTAAAAGAAATGTTTCTTGGTCGTTACAAGATAGTAAAGGTTTTAGGGCCTAGGGCTCGTCTTTTGATCCTGATCAAGAA:1 - chr3R 1443745 5' - INE-1 87 1 63.37 GGCAAACCGAGAACTTTGCCAATATTTTCGACTTGCCGTTTGCTATTTTCCACTCTTTTTTTTCCGTTACCGTTGTTTCTTGCTTTTTCCTTTCGATCAAC:1 - chrX 5477602 5' - Bica 497 1 62.38 GTGGTNTGCGGATGCCATGAATGAAAACATTTGCCATCGCGAATTTGGCCCGAAGCGTTCGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTT:1 + chr2R 11468550 5' - Quasimodo 7028 2 66.34 GGGGAAATCAATCAAATTACAGCTCCCTCGATTTGCTTAATTTATATTTATAACGTTAGCGCACACCTACAGTGGGGATGAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 5145987 5' - blood 169 2 70.30 CATCATCTCAACATAACAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3L 19215889 5' - roo 403 1 75.25 CCCTTTTGCATATTCCTATAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 15638213 5' + roo 8683 2 58.42 CTTTTTTATCTAATATAAAATGGTATGTATTAATATAAAGTATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCC:1 + chr2R 21712731 5' + I-element 217 1 67.33 TGTGCCACGTATCCTGCTTTTCGCCAGGAATCCCCATTCTTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 - chr3L 11910016 5' - Tabor 467 2 58.42 AGCCTCAGGTGCGCAGACTGCTGGGTATGGGTGTATTTTCCTTTCAGCTAGAGTTTAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 11924048 5' + TART-C 11098 1 61.64 GTCGTGGTTTCTCAGTTTCCAACTTATGCGGTTGATTTTTAGTCCCGGCTTCGCTGATCCTTTCCATTGGATTTGTAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGG:1 + chr2R 16158173 5' - mdg1 7332 2 77.23 GATTANCAGTTCTTGAACCCCACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 4502415 5' - roo 9054 2 62.38 GGGTACAAGCCAAGTCACTACGCAAGTTCGCACGGATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTC:1 - chr3R 28755643 5' - 3S18 6088 2 49.50 CTAGCTCACCGTCCTCCTTGACAATCATCACATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAAC:1 + chr3L 19883401 5' + Idefix 287 2 70.30 GTGTATGATTACCCAACAAATTATTAATTTAAGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTT:1 + chr3R 6431035 5' - 3S18 298 2 65.35 CTTGGCACTTATTCTACGCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:2 + chrX 2762121 5' - roo 9039 1 58.42 AAGCATAGCTATTCTGTTTGAAATAACTTAGCTAAATGATCGTCGAAAGTGCATTTGCGTAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr2R 5784413 5' - 297 383 2 67.33 CTTTTATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chr3R 29350805 5' - opus 494 2 73.27 GGTTGTCCAGAAATGAGATTGTGTTAACTTTTTTTTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAAC:1 + chr3L 22020046 5' - F-element 4623 1 72.28 AAATANGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr3R 12894119 5' + blood 50 2 73.27 CGGACAAAGAGATAGTTGGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACACTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAG:1 + chr2L 10291510 5' + jockey 4781 1 54.00 CATTAGCCACATTCGGAGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 - chrX 10653631 5' + jockey 8 1 78.22 AATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr3R 13203003 5' - roo 9032 1 66.34 ATGACNAGGAATATAAAAAAAAAAACGTTTT:1 + chr2L 23049988 5' + Stalker2 7178 1 70.97 GCTTAAGAGGTTACATAAAAATCGGAATTGAAACTGAACCAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTT:1 - chrX 11534012 5' + invader6 4496 2 75.25 ACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 9692663 5' - P-element 2867 1 59.00 AGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGA:1 - chr3R 19609722 5' + Tabor 31 2 54.46 CATTTATGTAATTTAGCTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTC:1 + chr3L 7989722 5' + mdg3 16 2 67.33 CCTAAAAATCACAATAAATAATATTACCCTCACCTTGGGTTTCCACGGCCGTCTTCGGAGATTATAGTGGCGTGCCTGATCCTGGACCGCCTTTTCCATAT:1 + chr2R 4352285 5' - Osvaldo 1232 1 74.26 CAACAATGTTAAGTTAAGTGCCACACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:3 - chr3R 16510891 5' + flea 4803 2 74.26 TTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chrX 19457143 5' - roo 9042 1 57.43 TTTTAAAATTTCTCTTTAAGCTTGTTCCTTCTAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2L 8542856 5' + P-element 45 1 32.67 TAGGGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCT:1 + chr3R 19450108 5' + F-element 394 1 52.00 CCCAGAGAACATTAAACTAAAATTAAAAACCAAAATTTAATCGAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2R 13145027 5' + roo 8697 2 60.00 TTGGGTAATAAATTCCCAAGACAATTTTGTGCGGCGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTTG:1 + chr3L 21909811 5' - Transpac 228 2 55.13 TCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGA:1 - chr3L 23747152 5' - INE-1 126 1 66.34 AGGCCAGATATCCACACAAATATGTTGCCTACTTATCGGCTGTCGCTAATTTATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr3R 29466277 5' - hobo 2917 1 54.46 GTCGGCGACCTTGGCTCGCTGGCAGTTTTCACCGGCTTGGTGGTTTTGGCACCGCGTCAATGGGTTGAATGCCAGGTGCGTCGATTTGAAGGACCACCTTT:1 - chrX 6554619 5' - HMS-Beagle2 6735 1 59.41 GCCTGATAAAGTTACAACGATGTTATTAACCGCGTGAATATGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCATGTTGGTAGCGTCGTTCTCATCAGTAAGTGTTG:1 - chr3R 22639261 5' - Ivk 5078 1 61.22 AAATACTCTTGTTAGAAATAATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATT:1 - chr3R 21695512 5' - 3S18 316 2 54.46 AGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTC:1 - chr2L 15893751 5' + Max-element 8282 2 73.27 AGAAAACGTAAAAATGGGGCCAAATCATCTATCGTTAGGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chrX 12294669 5' - blood 367 2 68.32 ACCTCTGACCCCGCTGCCTGCCGCTGATAAAGTTTTGCCAACGCTGCAGTTCGCCTATGTAAGTCGGTTGTTTGTTTACGCATACACACACACACACACAC:2 + chrX 6417707 5' + accord 7025 2 77.23 TTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGC:1 + chr3R 9254917 5' + F-element 221 1 53.00 TTTACTTTCGTTTGGGATTTCGGTAGTTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCCTCCACTGCACAGTGGTTTTTTATGTGTTTTTTTTGGCAGAATTTCGAAATGA:1 + chr2R 10333589 5' - transib1 2122 1 71.29 ATTAACTCCTCCTCGTCAATAAATTTATGCATTTACTTAGGCTTAAATTTATTGACGAGGAGGAGTTAATGCCTAACAATTTGTTTTTTTTTCTTTAATTT:1 - chrX 12990384 5' - Doc 4699 1 56.44 TCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chrX 4890040 5' + 297 6603 2 61.80 TATAACGGTTGGCATGAAACTATCTTCAATACATCATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGA:1 - chr3L 27680837 5' + F-element 53 1 66.34 GCCGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 19457225 5' + roo 21 2 59.41 TATAATTTAATATAATAATAATAATATATATATGTCGTGTATTCCTTTTTAATTTCCAATTGTAACGTACATTTTATATTTGCTAGAAGGTGGGCATATTG:1 - chr3L 20055875 5' + invader5 48 2 66.34 TCTAGCAAAACTAACTTTTTTGCACACCCATGTTCATGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chr2L 19075723 5' - Transpac 5194 2 60.40 TTTGTGCAAAGTTGTTCTTAGGTGCTGAGGTAGCTGTGTCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTG:1 - chr4 389054 5' - R2-element 279 1 61.39 CTTTGGTGGGTATAAATTCTTGGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAA:1 + chr3L 9926362 5' + Doc 143 1 78.00 ACTGAGAAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2R 21379494 5' - P-element 2852 1 44.55 GTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGG:1 + chr3R 15157570 5' + invader3 5190 2 74.26 ACTGAATTTCGAGATATTAGTGTTTCAATTTCCATATATTGTTTCCAAAACGATACATATGTATGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chrX 14043915 5' - opus 491 2 49.50 TACAGTTTATGCATGGCTTAGCATAGTTGGCCATTAGTGGTGCATATGAATAGATGAATTATCTATGAACGGGATTTTGCAAAAACGAGAGCGATAGAGCT:1 + chr3R 28640354 5' + micropia 5179 1 55.45 AAGTGNAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chr2L 22921284 5' + copia 55 2 82.18 ATGCCTTAATTTCTTCTCATGGTCGGATACCTTAATGCAATGACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATG:1 + chr3R 16626786 5' + I-element 5291 1 58.42 AATCGACAATTTCTTTAAAAATACGTTTAAGCTGACTTATAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGAT:1 + chrX 21388476 5' + 1360 2 2 76.24 AAATGATCTAATCAATTTGTGCTTTCTATCTGCTATTAACATAACACGAATATATTTATAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 19217357 5' + roo 50 2 59.41 CAAGGTCGAACACGCAGACCCTTTGTGGAAATACCCTTTCCAAGTTGGGGCTGTGTGTTGCAAAGGGAACTGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 - chr3R 31369405 5' + Transpac 3 2 77.00 AATTTTGTTTACTATTTACAGCTTTTTCCAAGGAAACGTTGTTGCTACCTTTCACAGGGTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAG:1 - chr2L 8031335 5' + P-element 14 1 65.35 GAGCGCAGTTCGCTCGTCATCAAGAGCTGCCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 + chr3R 29384371 5' + jockey 4808 1 70.30 GGACCGTTAGATAGATGTTGGATTGGCCCAATGAAAACCCCCATGATGAATGGTCACGTTGACTTGGTGAAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACC:1 + chr3L 13403807 5' + P-element 26 1 70.30 CAAAAGGCATTAAAATAGTTAATTGGCTTTATTTAAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCC:1 + chr2R 17825501 5' - opus 7312 2 74.26 CATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr2L 9389063 5' - 1360 3346 1 71.29 TGGTGATATACAAGACGACCATATCGGCCATTTGGTAGCTGTGTTACAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr3L 27390349 5' + 1360 30 1 81.19 CTACTATTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3L 19349939 5' - 1360 3365 1 53.47 GAGTTTATATGACAGATATGTTTCTGCTCAATGTGTGCACTATTTTTTGATCATTTGAATAAGTTTTCCATTTTTGATTTCACTTTTTGTTTGACCGCGTG:1 + chr3R 16959974 5' + Tc3 349 1 75.25 CAGCAGGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3L 9925287 5' + Doc 48 1 69.31 CAAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 - chr2L 13250433 5' + pogo 37 1 69.31 GTTGTAGTTTTTAAAAAACCTTCAATATGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTA:1 + chr3L 20410684 5' - gtwin 426 2 71.29 ATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr2L 1129077 5' + HMS-Beagle 6834 2 64.36 CGGAAGGCAGAATCAATCACCTTGAGACGTCATTCGTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAA:1 + chr3R 7363998 5' + jockey 4970 1 64.36 GGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 - chr3L 14240893 5' - Tirant 8473 2 57.58 TTGGCACATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chr2L 14490453 5' - P-element 2854 1 46.53 GTTCCCCAAAAAGGAAAGATTTCTTATCCAATTGGCTAATCCAATATTGCCAATAAGTCTCTATAAGAATGATGAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 - chr2L 10291464 5' + jockey 4837 1 78.22 TCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCC:1 - chr2L 23295856 5' + micropia 125 4 64.36 AGTCGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr2L 8031266 5' - P-element 2840 1 33.66 CCCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGC:2 - chr3R 10741150 5' + 1360 3357 1 42.57 CTTTTACGTCTCAATGTATCTTATAAAGTGTGTAAAGTAACATTACATTTAAGAGCAAAAATAAAGTAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTG:1 + chr3R 24281928 5' - Max-element 8527 2 71.00 TTTAAAGTTGTAAAATCAAAAACTGTTAATAATTGTTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAA:1 - chrX 5103873 5' + BS 5074 1 64.36 GTATGTAAATTAATAATAGTGCTTAGCAATATTTATTTATGGCTATATAAACAACCACGATTTCGACGCGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTT:1 - chr2L 21682346 5' - 297 46 2 78.22 GGAGAAGAATCAATTTGCACTAAAATTCTAGAAAAAAAAGAATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1 + chr2R 617169 5' + diver 5923 2 57.43 ACGCATATAAATTATTGTATCTCGAGCGTATTAAAAATGTACGAGTGCTCATCTTGTTATCCTGTTGTGTAAGCGGATTCGAGTTTACGATTAGCTTTATT:1 + chr3R 29352196 5' - opus 377 2 78.22 ATTTTCTGGGCATTTGAACGTTGTCTTGAACATCGGGTTTCCCACCTTTCGGCTGGATTTCCTTTACTTCTCTCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCCACC:1 + chr2L 11391823 5' + accord2 223 1 78.57 GCAATCCATAGAAAGAACTCATATAGAATGCGATCATGTAGAAAACGTCCTTCAACTGTCAGTTCATTTTACCACGTCCCAAGCTGAATAATTTAATGACA:1 + chr4 137244 5' - 1360 408 1 72.28 CGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 19457223 5' + roo 8687 2 57.43 TTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTT:1 + chr3L 27415200 5' - transib2 2822 1 77.23 GTCAGCAGTGGTCTGTCATTTTTTTTACTACTTTTGCTACTTCTAGAAATGACAGACCACTGCTGACTCTGGTGGGAGTCGTGAATGCGGCAGC:1 - chr3L 935511 5' - Quasimodo 7045 2 42.55 GATTTATATTGTAATGTAATGTTTATAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTG:1 - chr3R 10445168 5' - roo 8616 1 75.25 TTTTACAAAGGCTTAGTTAAAAACAAAACTTGATACATAGTTTCGAGTGTGTTCCTTGGAAAAAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - chr2R 10912183 5' - 412 7535 2 65.35 TCCGTTCGTTAGCAATGATGAATAAATAGTGAGTTGAATGTTGAAAAATGTCTTTGTCTTATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 - chr3R 443315 5' + flea 4755 1 71.26 GCTGGAATAGTGATGCAAAATAAGCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 11435558 5' - roo 399 1 57.43 AGAATNCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 15638245 5' + roo 8715 2 77.23 ATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAATGATAATGCATGTGAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCA:1 + chr3R 19449294 5' - roo 8614 1 57.43 AAAAAACGCTCAGTGAACGTATTTAAAATACTTGCACATTTGGGCATTGCTTATATTCAAGAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACA:1 + chr2L 18239565 5' - 1731 4274 1 66.34 AAATTTCCTTCCCATCTTAATTGTCCTCTTCATAGCAAAGCTGAATGAACATATTTCACAATGAATTTGTTGCCCAGAGCTTCAATATTTATTTATTTATT:1 + chr2L 13321332 5' + copia 223 1 84.16 AACAATAATTCGCTTCATTTTTCCCCATTATCTCGCCTTTTCTTTTATTTTCGTATTTATAACATTTAAATAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAA:1 - chr3R 8968827 5' + Tc1-2 1439 1 57.43 ACAACAGGGGCAACAAGCGCGAAAGCCGTTTAATGACTATGTTTCAGCGAAATGAAAAACTGGCGCCCAACACACACACACACACACACACACAAACATAC:1 - chrX 20336165 5' + Quasimodo 39 3 68.32 CCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGG:1 + chr3R 13423283 5' - 17.6 465 2 57.43 TATTTCGAAACGAAATCTTTAAATAAATCTCAACAACCAATTCAATGATAACAGCAGTAGCTGGAGTTGATTGAAGGCGCGATGCGCTCTTTATTAAGTA:1 + chr3L 19948967 5' - gypsy6 7593 4 67.00 CCTGCCGCTTGGCCAGCTAAAGCAATGTGGTCACAGATCACAACAGCTGAGATGGCTGATGAATAGAAGGATCACTCTTTCGCTGAGGTGCAAAAGAGCTG:1 - chrX 18886186 5' + Helena 1021 1 81.19 ACGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:2 - chr2R 9375225 5' + HMS-Beagle 48 2 80.20 GGTGGCAGTCTTCTCTTCTTTGCTTAATTTGGTAGGTGATTCTTCGTTGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGT:1 + chr3R 15069920 5' - accord 31 2 56.44 AGTGGNTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAAC:1 - chr2L 15893751 5' + Max-element 8238 2 56.14 GACCAAGATTGATGGGCCAGCGAGTGGCAGGTGACTTGGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr2L 11686098 5' - hopper 1405 2 66.34 ATATGGTATCAATTATACTTAGTGTGTTTTATATGAGTTTCGTAGAATAAAATATCTTACTAACCGTACTCACTTACCACCACCCTCATGACCTCCCTAAC:1 - chr3R 19914441 5' + jockey 4762 1 67.33 AGATGGTAATGTGTTCGTGGGAAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAG:1 + chr2L 16640489 5' - Stalker 6988 4 78.00 GTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAA:1 - chr2R 12779141 5' + roo 8715 2 76.24 GAACAGTGTCAGGGAGCTTTAATTACTTTATTACTCGAGATTCCACAATCTGAAGAATGGACAAAAACACAAAAAAAAAACAACAAAAAAA:1 - chr2R 22144808 5' + G2 3077 7 78.02 CCTGCCCAACCCGCTGTGCCCTGCGTGGGCGGAAGATACAAAATTAAACTGAAACAAAAAGAAAAGACGCTAACACATATTTATATGTGTTAAAA:1 + chr3R 22171856 5' + Porto1 117 1 64.21 CCATCGTCTTCCACACATCTACAATCAAGATGGCCAACAAAAAAAAGCAAGAGGGAATGCTATAGTCGGGTTCCCCAACTATCAAATACCCGTTAATCAG:1 + chr3L 45215 5' - INE-1 547 1 71.00 TTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAAAATACCATAAATGATTGGGTATAACATGGCGTCAATACATTGTGA:1 - chr2L 16082655 5' + Stalker 6902 4 75.25 GTGGGTGGGTGGTGGGTGTAGAAGTGGGCAACAGTTATCGGGGAATACCAATGCGGGAAAAAAAAAAAGAAAACCAAAAAAAAAAAGGAAAAGGTAAAA:1 - chr2L 21128643 5' + Doc2-element 234 1 62.63 AGACGNTTCGATGCTTATCGATGAGCGCAAATCTCGTGCCTCCCATATTCATGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 + chrX 5515716 5' + 297 6591 2 66.34 TGGTGAAGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr2R 3188749 5' - 1360 3359 1 57.43 TAAACACAAGTCAGAAATGTGAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATTGCCAAAT:1 - chr2R 4269758 5' + 1360 331 1 81.19 GCCTTTTGCCAGAGCCATAGTTATATCATATGCGTTTTGTATTCTAAAATATAAAACCAAATAAGATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTT:1 + chr3R 22530765 5' - Juan 4203 1 66.34 ACAGTTGTGTCAGAGCTACAATTCGGAGCAACACTCTGACTACATTATCTCCAATTAAGCGATCAACATCAACTAGAACTTCACTTACTCAATGCAAATCA:1 - chr4 892374 5' - Bari2 144 1 54.46 CTAAGGGCCCATAAACCCATCAGCCCGTCTTAGGGGCTTCCCGGAACAAAGCACCGCCCACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCC:1 + chr2R 20328222 5' + Doc 4502 1 68.75 AGATTTTCCCTCATGCAATCTGTGTGCAACGGAATGCAGTTTCTTTCCTTCAGGTAGGTTCCATAGTTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTA:1 + chr2R 21712326 5' - S-element 1269 1 71.29 ACCGAGTTTGACTTTGCATGCATTGAACTTGGCTTGCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGGGTTGTTTTTTGCATGC:1 + chr3R 5405125 5' + Cr1a 251 1 55.29 TTTTAAATCAGAAGGGTATTTTTCTGAAACATTTCTCTTATGGTTTTTTTTTTTATATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCA:1 + chr2R 16898233 5' - Max-element 280 2 55.45 ATATGCCATATACTGTTTCTAACATGCATACAAAGATTTAACCACAGTACAGAGCAATTACCATTCGGTTTAAGATCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTT:1 + chr2L 19178707 5' + accord2 7319 1 73.27 AATACTCTTGTTAGAAATAATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTG:1 - chr3R 21695511 5' - 3S18 6080 2 53.47 CTGTCGTTTACAAATTGCATTTAAAATGCCGCCAATTGATTACATTTTGCATACAAAACTGCCAACTGTTTTGCCATTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chrX 2762226 5' + roo 8667 2 73.27 TCAGCTTAAACGTTTGAGCCACTCAAAGTGGTTAACATTTGCGGCTAAATGTTATTAATTTGTTCCTAGTCACTTTCAGTCGACATCTTGCATATAGTTTG:1 - chrX 13250832 5' - Tirant 489 1 63.37 TCTCTGCAGTTTTTCCAGGCCACACCAGACCGACCGAAAAACACGAACAGCTGTCAGGGCATCCGTTTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCACGTGGCTGCT:1 - chr3R 11705752 5' - G-element 241 1 76.24 TGGCTGTATATGGGAATCATAATTCTACAAGAGCTTACGTTGTGCGTCCAGGTTACTTGACATTAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAG:1 - chr3R 25440251 5' + pogo 8 1 72.28 CTTAAAGTTTTTAATTTTTTGTTTTAAATAACGTTTATGGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:3 - chr2L 617348 5' + Stalker2 9 2 59.41 TTTAGGCCACCCTTTACAACAAAAGCTCCGTCGAAGTGGGCAGCCTGATATCGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCATCTGTTTT:1 - chr3R 15083463 5' - G2 339 1 57.43 GAGAACTTGTTACACCTGCCGCTGCAACTGGCAGCCCGACCTATTCCTGCAGCGCATCATGCTAAACCACCTGTTTTCATTTGTAAGGACCTGAGAACTTG:1 + chr3R 19128310 5' + Chimpo 3930 1 69.31 ATATTAATATTGGATGCACTTAAATTCACAATACATATCTATATAATCCACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGGATACTCTAATG:1 - chrX 21357851 5' - 1360 411 1 56.44 ATACCTGTAATATGAAAATAATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr2L 1129057 5' + HMS-Beagle 18 2 59.41 TTGTGAGTCTCAACAATTACTCAAGCTCACCTCAAACTTCAATGAAAAGCGTGCAGATTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAACAGCTCGCTTGAAAGTTTTG:1 + chr2L 20841874 5' + Cr1a 372 1 54.00 TTTAGATCTTTTTCACTAACTGTGGTCTTTAGTACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAACATCGGCCCTGTAGCAACAAGCACAGAGG:1 + chr3L 21881984 5' + invader2 4974 2 70.30 GGGTAGGTCAGTTATAGATTGGGTTAAATGAAAGAATGGGGAAAGTGGGTTTATGGAGGAGAGGCGGGCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCG:1 - chr2L 7198915 5' - Doc 409 1 68.09 AAACGACTAAGCGTTTTAAAGAAGGCAGCAGCCGATATGCCGACAGACTTAGAGCCCACCCGAACCCGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTC:1 + chr2R 2948946 5' + G5A 2655 1 75.25 AAGTTGTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3R 10445193 5' - roo 9040 1 56.44 TATGTATTCTTTATTACATATAGTAGCATATGTGCTATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chrY 3648860 5' - opus 496 2 73.27 TAAAAGATTAATTTCACGCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTA:1 - chr2R 2552206 5' - HMS-Beagle2 304 2 71.29 TAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 18881504 5' + roo 37 2 63.37 GAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr3L 15035219 5' + pogo 16 1 65.35 CTGGGACACACCTTTCAAACTTCCAGCTCATATACAGGGTGCGGCAGCATAACATCCTTTTTTTTAAATGCGCACCATTCCAGTTAGTTGATGTCATAGCG:1 + chrX 22689729 5' + mariner2 44 1 73.27 TTAAATGTAGTTAACTGTGTTCCCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGTCTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chrX 10160267 5' - accord 7032 2 54.55 CGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:2 + chr3R 14639364 5' + roo 8719 2 80.20 AAATATTTGTTTGCTTTCGCTGCTGTTTTCATCACTTAAACTGAGTAATGGGAATTTCACAATGACTTCTTAAGCTATAATTGAGCGTTGCCAGATCAAAA:1 - chr2L 5081790 5' - Copia1_DM 39 1 63.37 TATTCGCTGGATTATTTTTGTTCAGCCCAACTATGAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGAGCCCTTAAGTATAT:1 - chr3L 2677262 5' + Ivk 394 1 65.35 TAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3R 22620201 5' + 297 37 2 67.33 CGGAAACTACAGTTTTCCCTCCGGGGGAAACCTCCCAACAATTTTGTGTGCAGGTGCTACCCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACCGTATAA:1 - chrX 22386757 5' + hobo 90 1 67.33 GATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 + chr2R 18295598 5' + I-element 21 1 56.44 TAAATAAACTCCATGTGTTTAGAAAAGTGTTCTAATCTTTTACACACTAATTTAGGGTCATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 - chr2R 2457330 5' + 1360 17 1 63.37 CACGATCCTGGCACTGCGTTTTGTGCAACACCTGCATTTTGATATATGAATTTTCGAAAAAGTTACAAAAGTTCCGAAAATCAAAAATTTCACTTTTTT:1 - chr3R 25776820 5' + FB 158 1 61.62 TCTGCAGTGTATAAATTATGAGGTTCCAGACAGTCCAGAGGTCTTCCTTCTTATTATTGGTAGTCGGCCTATGAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACT:1 + chrX 21670008 5' - mdg1 7456 2 75.25 CGTTGTGCTGAAAGCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3R 19114194 5' + 297 6613 2 67.33 TAATGAGTAAGTCGCTGATCGTTGAGACGTAGAATGTTGTGTTGTTTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAACTCG:1 + chrX 17593175 5' - invader3 5182 1 54.46 AGTGGGCGAGTAAGGTAAACGCCAAGAATGGTGGTCGGTGGTCAGCTGTAGTGAATGGTGGTCGGTCGGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 19836998 5' + P-element 8 2 72.28 TCGATATCATTAAGTATATTGCGAAAAATGTCAAAATCATTGGAATAACTACATATATAAATTCCTTAAAAATGCATTCAAAATATTACAAGTTGATTTCC:1 + chr2R 12720639 5' + Ivk 276 1 69.31 TACCGCTAGCAGATGAAAAATCAATTTCGCAATGTTACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 12546440 5' - P-element 2848 1 40.59 AAACAAATAGCAATATTAAATGTTAAAAGAGAAAATAACAGAACGAATTGGTTTAACCTTACTAATTGTAGTTAATTAGAATTACAATACTTCTGATGTA:1 + chr3R 12877780 5' - mdg1 409 2 66.00 CTTTGCAAAAAAAAAAACGAAAAAGAAAAAA:1 - chrX 5082665 5' + Doc2-element 235 1 90.32 CATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chr2R 9014422 5' - blood 338 2 63.37 TTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAA:1 + chr2L 15956052 5' + Max-element 8264 2 67.50 ATTTTTTTCCTCGGCTTTCTTGCCCGCAGTTTTTTTTATGCTGTCGTTGTTGTTGTCAGTTTCCAGCTCAACTTTGAAGAGTGGTTGTGGGTTTCTGTCTT:1 + chr2R 10568552 5' - Fw3 302 1 60.40 GGCAAGAGGTAGCAGACACCAGAAAGACTAGAGAAGTTCACACCCCTCCGAGGTCTGAAGTCCGCGATCACCAAAAAAAAAA:1 + chr2L 3475485 5' + R2-element 3577 1 90.24 CCAAATTGAATACGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 - chr2R 9375236 5' + HMS-Beagle 37 2 69.31 ACCGAGGGCCATCAAATTGCTGCAAGGTCCCTCATAAAATGCATAACTAAAGCGCAGTCTTATACTTCGCATTCATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr3R 28095245 5' - hobo 2937 1 77.23 AAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCAAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chr2R 18295613 5' + I-element 36 1 60.40 TGTTTTAAAAGCAATCATGTTAAATTAAAACTTTTACCATTCACTATTTTCCATATTTTCCACTAAAAACAAAGTAACTATTATTAACTATTTGTACATTT:1 + chrX 19555322 5' - hopper2 1282 1 74.26 TTCATGCCCTCTCACTTCCACTCACAGCCGACTGTTTGTTGCAACTATTGTGGCATTGCCGGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACC:1 - chr2L 17106395 5' - Doc 483 1 63.37 ATGAGTCAAACAGAAGAGAAGAAAGGACCAATGGACGGTGGTGCGGGGTGCGGGGTGCGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGC:1 - chrX 8221943 5' + opus 7333 2 58.42 ATTGTTAACTCCCGGTTTTTTATTTCCGCCTCCATTTTACACACTTCACTGTACTCACTGTTTTTTCTTACATCGACACATTTGTCAAAAGTGTGGTCGTG:1 + chr3R 1851570 5' - INE-1 253 1 75.25 CTAATGAGGGTCAATTACACTTGCCCAAACATATCGGGCACATTACGCATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCA:1 + chr3R 21290917 5' - P-element 3 2 52.00 TCATAGAGAAAGTTGTTCAATTCTATGAACTTGCAACACGTGCGGCATTTTGTTGTCGTTCAAACATTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCT:1 - chr2R 8685922 5' - R2-element 3408 1 65.35 TAGTTTGGCCCGACTGCAACAACCGCCCACCCAGCATAAAGGAACCCAAAAGACAAAAAAAAACAAAAA:1 - chr3R 18109670 5' + gypsy7 5012 2 81.16 ACACTGTCACTGTCGCCATGTAAAATGTTAATTTTTATAAGACTAGAAGAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTATTAATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAG:1 + chr3R 3177921 5' - Stalker4 7276 4 82.18 TAAACAAGGCAAAACTGGAGCATAACCCCAGCCGTATGTAACGCATTGTTTACTT:1 + chr2L 7506861 5' - Tc1-2 1576 1 85.45 ATAAGCCCCGGCTCTCCAGCGATTATTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTTAAGGTAGTTGTAATTT:1 - chr3L 2292518 5' + Max-element 8412 1 80.20 ATCTAAGTTGCTTTTGTACTTTTAGTTTACGTTTAATATGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chrX 4009340 5' + 412 37 2 64.36 CAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 - chr3L 9925298 5' + Doc 36 1 58.00 GCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:2 - chrX 5443939 5' - mdg1 374 2 70.30 ATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCT:1 - chr3R 2412143 5' - R1A1-element 5279 1 54.46 CGGTGAGTCCTACCTCTGTGTATGTGTGAGTTGTGGGTGTGGGTTGAGTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr3L 4581402 5' + hobo 19 1 58.95 TGGCTCTGGATTCTCCAATGTTCGAAAGAACGCCGATTTTACCTAAAAGCTGCGAGCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAACC:1 - chr2R 9426520 5' + P-element 15 1 62.50 TTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr2L 108055 5' + P-element 39 1 41.58 GCTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 4502503 5' + roo 8691 2 53.47 CCGAGGGGGTCACATTGTTTGCGACAAGGTATGTGACCTTAGTGACAATAATGACCTCCCCTTAATAATAAAACATTCGTGTGTACTTATGAACGCA:1 - chr3R 821214 5' + Q-element 561 2 54.64 AAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 - chr3R 14049413 5' - transib2 2795 1 57.89 AGCAAGTGCAAGTGAGAGGGAGACGGACAGCGAAGGAGACAGGAACAGAGACATCTACCGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTG:1 + chr3L 960080 5' + Rt1a 23 1 48.51 GGAGTTCGAATGCCCCGAAAACACACGTACGAATGAACTGCGCACAGAACATGAATAGAAAAATAAAATATTTAAAAAAAA:1 - chrX 1830399 5' + BS4 728 1 56.79 CATTCCCGATGTCGCTCTAGTTCGTCTTTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTAGTTTTTAATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAAACATAATTATTA:1 - chr3R 19448157 5' + Cr1a 100 1 73.27 AACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 13060317 5' - P-element 2841 1 33.00 ACATAGTCCATACATCATTTCATGTTATTGTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCT:1 + chrX 11533892 5' - invader6 4855 2 69.31 AGGTGCAATACTAGCAACTCCTTTTTGTTGACCACTGGCAGAGAAAGAGAGGACTCGGTGTTCACATGCGATCTCGGCACCCAGACGAACTTGATGAAGAA:1 + chr2L 12035260 5' + R2-element 432 1 56.44 ACAGCGGAGAGGGCTTGTAATAATGCAGGGCAAACACAAGTGCCAATGAGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTT:1 + chr2L 16734404 5' - Ivk 310 1 54.46 CAAATAAGTTTAGCATTGCGGCTATTTAAGTTTTTTTTATTTTTTTTTTAATTTACATTTTCAAGCTGTCGCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCT:1 + chr3R 30816589 5' - X-element 4455 1 75.25 GCTAGAACGTGAGGGCATCTCGCCCGTATACCTTTCCATCTCTTCCAAAAAGGCGGCCACGACGGATCCTCTGTTGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chrX 1954412 5' - Tirant 399 1 75.25 TTCAAGTGGGATTATGTTATTACTTGGCCTTGGTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr3L 17122388 5' - roo 9067 1 74.75 TTTCATACTATTTTCTTTATTAAATATTTAGTTACATTTACCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chrX 13682560 5' + roo 8699 2 60.40 CGCTCTCACGTACAGTAGCAGCTTTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTTTCTCGAATTTTTGTTCGAAAGCGAGAGAGCGGAGAGAGCTACAGCGAACAGC:1 + chr2L 6324461 5' + 1360 121 1 77.23 CAATTGAAGTTGTAAATCTTGTTCTTTAGTTTTTGGATTGGCACTTCCTTTAAATTGCCAGTGAAGGCAATCAACTTGGGTTTAACCAAAGACACTAGAAT:1 - chr3L 16047740 5' + Tc3 236 2 35.64 ATGCCCAACGACGAGTCTTTGTACAGATGGTTATCAGATGTGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTT:1 - chrX 7113340 5' + P-element 2598 1 23.76 AGGCCGTAAAACGTTTAACTTTTGAATTTTAATTACTTAGCTATCTGGTGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGT:1 - chr2R 18601893 5' + Transpac 4938 2 58.33 GTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:2 + chr2L 7548015 5' + blood 7061 2 75.25 CTTGCGCGCCTACCAGTAAGTACGAGAAAACATTAAAAAAAAAAACATAAAAATTGGGGCGGAGTTGGGGCACACCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGG:1 - chr3R 31260817 5' - hopper 97 1 65.35 GGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr2L 11686061 5' - hopper 1369 1 73.00 GAGAAAAAAGTGAGTATGAAAACAAATAGTCTACAGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr3L 9858325 5' - pogo 2064 1 64.36 AGCGACAAAGTGGGCGGGGATTTTCTTGAGCAAAAAAAAAGTTAAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATTTTACA:1 + chr3R 19144118 5' - Juan 33 1 57.43 AAAATGCCCTGGCTTTTTCTGCCTTCTCCCGCGCCTCGTTGGTTTATTTGGTACTTCACGTGTTCAGCTTGAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCG:1 + chr3R 30936702 5' - invader2 143 2 68.32 CGTTCGGAGAAAAATTCAGTGGATCAGTAAGTTGTTCGCCGGAAACGTGCGGGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAA:1 - chr2R 1185117 5' - Doc 4638 1 53.47 ATCCAAATTTAAGAAATTTCTTTGCATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr2R 8560129 5' + 297 6628 2 75.25 ATGCAGCATATCCCACAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAGGCTGCACCTGC:1 + chr3R 27474554 5' + P-element 304 1 28.71 GTATAGTAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chr2R 12446372 5' + jockey 4705 1 58.42 TGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTC:1 + chrX 21668060 5' - Stalker2 376 2 52.48 CTGAGGCAAATTAAGTGGCAAATAAACAGAACCTTACTTGCCTTATTCCTTTGGTTTCGCTTGTGCTCATGCTTATTTTTAGATATAAATATTGTTATTAA:1 - chr2L 15213075 5' + gypsy12 9763 2 79.21 GATGGATAACGTTTTTGAAAGGTCTTTGGGGAGTTCAATTGCTGTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAAT:1 - chr2R 10646837 5' - F-element 4245 1 62.38 CCTTAACTGCCAGAGCTGTTTGAAGACGTTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTT:1 - chr2R 8464504 5' - 297 301 2 71.29 AGAATGAATATTCCGAAATTTCGTTGTCGCCTGCAAAACACCGGTGGAATCGTGTTCGCGAATTGCCTACCCTACCTATGACCACTTTCCTTAAGAGCATG:1 - chr3R 7557303 5' - Gypsy12A_LTR 1935 1 75.25 AGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr3L 9692679 5' - P-element 2850 1 42.57 CTGAACTCTTCAGCCAACTCCCCTGTTTTGAAACGCACCAGGAATCTCTCCAATGTAACTTGCTCATCCGCAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACT:1 - chr3R 25254483 5' + P-element 470 1 80.20 ATTCGCAATAAAACTTTTTCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr2L 7927262 5' + hobo 37 1 65.35 TGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACG:1 - chr3R 1868231 5' + G-element 21 1 58.59 TCTTTTTAACTTGAAATGGCCATTGCCTTAAGAGCAAAAAAATAAAACACAAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATA:1 - chrX 15793561 5' + Chimpo 176 1 53.47 AAGCAAACAAAGAAGTTTTTGCTGTCTGGCTTTTGGCTTGTTTAAGAAAAAAATATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr3R 19622899 5' - pogo 2082 1 60.00 GTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 19936672 5' - roo 9028 1 66.34 ATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:2 + chrX 4154905 5' + blood 7035 2 55.45 GACAGNAAGTTGCAGCCAATGCCAATACCAATGCGAATGGGAAAACATCAAAGCCCCCAGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGT:1 + chr3L 20764426 5' - F-element 4476 1 66.34 CTTTTGGCTACTGTATTTCTGCCCTCTCAACCAACTCCAAGTTAACATCATCAACAACATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGAC:1 - chr3L 14604859 5' + jockey 4739 1 67.00 GTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2L 13739984 5' + 412 33 2 61.39 GTAAAACGTTTAACTTTTGAATTTTAATTACTTAGCTATCTGGTGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAA:1 - chr2R 18601888 5' + Transpac 29 2 55.45 GTCGTGTCTATGCAAAATACATAACTTGCTGCCAGGAGAGCGCATAAAATTTACAAATTTCAATCTTATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTT:1 + chr3L 7926314 5' - flea 5009 2 75.25 CTCCTCTCTGGCAGCATGACAACAAATATTTCCATAATAGGCGGACATATGGTGCCACAATAGTTTGCTGCTCCTGCTCCGCTTCTAAGACGAAGGATGTC:1 + chr3R 25196877 5' - Burdock 6111 1 80.20 GCCTGTCTCTGTCAAAATATTTTCTTGGAACAGTCTTTGTGTGTAAGCTTATTCGCGGTGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTCG:1 - chr3L 18356584 5' + Cr1a 4071 1 77.65 ATTTGNCTTTGATGAAGGAATTAGCTTTTTTGGGTTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATT:1 - chr2R 14457754 5' + mdg1 7081 2 65.35 TTTGTACCTAATCATTTAAAGCCATTTAACAAATAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chrX 21401865 5' - roo 9032 1 68.32 AATCCCGAGTTATATTTTCGCTACCGCTGAAAGCAGCTTATATATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 - chr3R 29432823 5' - 297 6950 2 61.39 GAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr3R 14094982 5' + Doc 48 1 73.27 CTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1 - chrX 21668143 5' + Stalker2 23 2 56.44 GCGGAAATGCGATCTGAGAAATGAGAAATGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAACTTTATACTGATTTTGAACTTCAAGAAAGTCAG:1 - chr3R 25631713 5' + Tirant 8389 2 38.61 GCTTTTATTGTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:2 - chr3R 29350806 5' - opus 495 2 74.26 GGCTCAGCTGCATTTTTTGTGAAAGTTTTTTTCGGCATTTTCTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3L 18009557 5' + roo 29 2 57.43 GGGTTCCATGCCAGTGAATGATGATGTGGCCCACTAACTAGCGGCAACAATACATGTCCGTTTGGGCGTATAAACGTCAATATCTCACGAACTATAAAAGC:1 - chrX 274049 5' + INE-1 149 1 61.39 TTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chrX 13347311 5' - roo 351 2 83.17 AATAATTATTAATTTGCTTGGCTGCTCAAGCACAAATATAATATACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chr3R 8548370 5' + 17.6 6943 1 64.36 CTTATACATTTTTGGTCAGTATCACTAACCGCATACTCTCAGTTTAAACAAGCGAGAATGCTATAGCCGAGTTCCACGACTATCAGATACCTATTACTCA:1 + chr2L 21769278 5' - INE-1 548 1 55.00 TTTTCAAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr3R 31812738 5' + P-element 41 1 39.60 GGAATTTTCAAAGTTTAGCAATACAATTGTTATATTTAAAAGACTATATAATGAGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr2L 13739907 5' - 412 7525 2 55.45 GATGGGGGTGGGTTCGGCCGTTCAGTTCTGACCATGCCTCATTTACATTTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGAG:1 - chr3R 30716453 5' + opus 453 2 52.48 AGAACAATCTCAAAGAACTGGATTTTAATTAAATTGAAAAGAAAAAAAAGTCAACTAAAAAATTATAACAAATTAATAATAAATATACCCTCTCT:1 + chr3L 23554989 5' - Tc1-2 1356 1 69.47 GCCTCGAAGGGGCATTTCTGGGGAATTGAAAGCACGGGGTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr3L 8974055 5' + P-element 2 2 76.77 ATTAATTTTATCTTGGCACATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr2L 14490465 5' - P-element 2866 1 58.42 TTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr2L 11065918 5' + P-element 49 1 30.69 CAACAAATTGAATCACTGGCACGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr3L 15035228 5' + pogo 6 1 75.00 GAGGAATGCTAATTTCGTTCATCAGAGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTA:1 - chr3L 1809860 5' - diver 6061 2 73.27 GCTATATAGACATATAAAGCAATACATAACAGCTAGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chrX 6997242 5' - P-element 2861 1 53.47 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATA:1 - chrX 12649915 5' - blood 155 2 92.31 TAAAACGGTGTGACAATAATTTGAATTGGTAGCAGATTATTTTAAAAAAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 22903209 5' + TART-C 11100 1 77.42 GATCATATCTTGGATAAAAGCGGAATAACTATAAAATAGAACCACTTTAATATGTATTTATCCCGATAAAGAACTTTTAATTTGTATGCATATATAATA:1 - chr2R 10286798 5' + Dm88 18 2 33.33 AAGTTTCGCCACCTCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chrX 19457123 5' - roo 399 1 70.30 ACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 3671363 5' + roo 20 2 57.29 ATCCTGCCATGCGTGTGCATTGCACTTGAACGGCTGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTCATCGGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGAAGGTCTC:1 - chr3R 28417166 5' - Doc2-element 4493 1 65.35 GCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3L 12452143 5' + 412 7085 2 56.44 TGGCGTGATATCAGAAAATTTTGTAAATAAAGCAGATCACTTTAAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGA:1 + chr3L 93527 5' + I-element 257 1 61.39 AAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGAT:1 + chr3L 23456273 5' - gtwin 442 2 54.46 AATTCAACTAAATTGGGAAACAACAGTAATTATAGGTGATCATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 - chrX 20437726 5' - roo 410 1 63.37 AAACTTGGGGCACGGTCTTGATAGTATAGATCAATTATTTGTCAGTCGTCCGTTCGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTT:1 - chr2L 11403113 5' - 17.6 7098 2 61.39 ACGAGCCATCGATTTTTGCTCAAGTTCAGGGCGGAAAACATAATGGCGAAATAAAGCTGGAAAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCG:1 - chr2R 15718087 5' - diver2 233 2 64.00 GTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 13194767 5' + 297 41 2 71.29 GGCATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 - chr2R 6779851 5' + 17.6 6949 1 59.41 TGGAAGAGATAATTGCTCTAGCTACATTTCATATTTTGACTAAAAGTATTAAATCGCTGGTTTGTATCACGCCATTAATTATTAATAAATAAAATAAAATA:2 + chr2R 13540154 5' + G7 1146 2 25.74 TGTAATTTTGGGGCAAGCATTTCCCTTGTGACTTTGTATGCCTCTTAGACCCTCCGATTTGTAGCCAATGCTATTTGACGTGCAAAAAATGACCAGAGAAC:1 + chr2L 10119058 5' + hobo 2698 1 68.32 ACCCATATAAGAAAACAACGATGTTGTACAGAAGATATTGATTTAAAGTCCAGAGAGCCAGATCGGCACGGCTATTGATCCT:1 + chr2L 5608540 5' - INE-1 96 1 65.85 AAAAAGCAGACAACATTTATTATTTCCATTTGGAGCGCTTGGGACAGCTGGTCGTGAGTCGCGTCAACATCCTGGGGACTGGCGAGGTTCAAAGGCTGGAA:1 - chr3R 18686037 5' - BS3 110 1 75.25 ATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATATACATTTCCATATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chrY 2720339 5' + opus 21 2 75.25 CGGAGAGAAAGCGAGAGCTAAAGTTGAAAGTTAAATTGAATTGAGGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chr3L 10811141 5' + P-element 29 1 52.48 TTAATTAACAACAACAATTGCAATTGTGCTGCCCCGCCCCCTCCATCAGATAGAAATAAGCGTTCCGTCCCTTTAAAATATATTCTTGATCAGGATCACTT:1 - chr3L 17095559 5' + INE-1 84 1 56.44 AAATCAAACACTTCAACAACTCAGCAACGAAACGAGACGAAATTCTTCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATC:1 - chr2R 15786365 5' - G2 213 1 56.44 GGTGAAGACAAATAAATGCTGCCAGCAGCCGGAGATGTCGATAAGCAGTACGTATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCAC:1 - chr2R 20411960 5' + 297 11 2 68.32 AACGTTGGACATGGTATTGAACACGGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATT:1 - chr3R 22479546 5' + R1A1-element 145 1 77.23 GCCCTTGGACCGCCTATTAGCACATTTCGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATA:1 + chrX 2589681 5' - copia 241 1 74.26 TAATCATTTGCTAACCTGAAACCTGATTACATATATTTGTTGTTTTTAAAATTTTTTGGTCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chrX 14796833 5' + transib2 13 1 66.00 GAGATATTATATCGATTCACTAAAAAACCTAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACAC:1 - chr3L 17118684 5' + roo 134 2 70.30 TTTTTNGCCACAGGCTTTATTTAGTATGCGGCATTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATT:1 - chr3L 10324102 5' - jockey 4932 1 67.33 GGTAAAGGTATTCAACATTTTTATATTTATTTATAAATTTATAAATAAATTGATTTGATAATCAAACTTAATATTATTATAGGTTTTTTACATTATATTCA:1 + chr3L 19561337 5' + Cr1a 4320 1 80.20 AAACAAAAGAGTATATGTATAAAAATCTATTCATCTACTGTAAGTAATATTATATAATAAAATAACTTGATATTTCACTAATATATTTTTGAACTTTCAAA:1 - chr3R 26303239 5' - TAHRE 16 1 80.20 TGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 21978153 5' + roo 42 2 71.29 AGCCGCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chrX 12538465 5' - roo 9027 1 68.32 TAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chrX 5018685 5' - opus 449 2 75.25 AGAGCAATTAAATACCACAGAACATGTTTTCTTCATATAATTATTAAGTTGGTTAATATGTGCACGATGCATGGTAAAAAATTCCTCCCAAACGTTGCCAG:1 - chr3R 7141887 5' + HB 1257 1 61.39 ATTTATTGCGAAACATAGCCTCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr3L 17699364 5' + 412 56 2 78.22 GGCAAAGGGTACCGAAAGGAATAATGGTTTCTGTTAGGCCCATATATATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAA:1 - chrX 20391117 5' + rover 6976 2 58.42 TATAAGGATATTTTGGAGCCCTCACTTCTTCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr2L 11062460 5' - P-element 2794 1 34.65 CACTTNCTAAGAGCCAACAAACGACCGACCTTAAACTGCACCCCCGCAAACATCGAGCCCCCAAGAATACCAATTCAATACCAACTTGTGCGTTTTGCCAA:1 + chr3L 9056463 5' + I-element 5003 1 69.31 ATATAATCGTTCGTATTTCCTGTTAGTATCTGATACTCTGGAAATTGGACTGTCGCGTGCTCTCTTGTTATTATAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGT:1 + chrX 22601887 5' + INE-1 31 1 75.25 ATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chrX 13682623 5' - roo 9039 1 59.41 TCCACACAAATATGTTGCCTACTTATCGGCTGTCGCTAATTTATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr3R 29466287 5' - hobo 2914 1 55.32 GCATACAGTGACAGCACACGTATTGTTCATGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATC:1 + chrX 3464225 5' + hopper 42 1 69.31 GACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:2 + chr2R 19936629 5' + roo 46 2 74.00 AATATTTTATTAGTTTTTACTATTAGTCTTACTACATATCTTTGCTTAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 19967595 5' - pogo 2077 1 54.64 TCATACCCTTGCAAGGAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr2R 12779175 5' + roo 8681 2 65.35 AGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr3L 9692683 5' - P-element 2846 1 38.61 ACTTTGGCCATAACTACTGTTCCACGGACTTTTGACTTGTGTGGGCATAGTTTGTGGTGCATAGCTATTCCAATTTGTAATAAAATTAAATTTATTAATTT:1 + chr3L 10111011 5' + NOF 3963 1 74.26 GTCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr2R 9014461 5' + blood 55 2 78.22 GACTCCGGCAGTCTCCCTCCTTCACTTTGCTTACATTTGAATGGATTGGTCGGGCTTCGAGTTGGTTTGGTCTGGGATCATGGGGTATTGGAGAGCAGAGG:1 + chr2R 23145549 5' + R2-element 10 1 75.25 CAACATTTTACAATATTTCGTACCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCG:1 - chr2L 11044817 5' - P-element 351 1 27.72 TCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCCATCTTTATGGTTCAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 + chrX 12649914 5' + P-element 38 1 37.62 CGGCANGGTTTACAAAACACTCGCCCAACAAATGGCAAATTAAGTTTGGGAAATGGTTTCCACTTACGGACATGGCTAGATCGACTCGGGTATTGATCCTG:1 - chr3L 20055163 5' - INE-1 95 1 74.26 CAACAAAAAGGGGCAAGGGGTGGTTGATAAGTACGTCGCGAAGGCTGACATGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCTCAATGGGACAACTTTTAAGTCCCTTT:1 - chr3R 4199762 5' - G5A 2555 1 55.45 TTCATGTTCGTCAACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTC:1 + chr3R 9254884 5' + F-element 189 1 72.28 GTATATACTTTATAACGTAATTAATACTTTATAAATATTGAACAAGTACAGGCAGAGAGTAAAGATTACAGATAATAGGATTACGTCTATTATAGTCAGAA:1 + chr4 1179570 5' - Cr1a 4201 1 55.45 GAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCC:1 + chr3R 19450118 5' + F-element 390 1 55.81 AGCTATTGCGGAGAACAAGCTGGGCGGGAAGAAAGAGCCAGAGAGGCCGGGTGTCAAGAGGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGG:1 - chrX 15302530 5' + Bica 29 1 60.40 GGCCGCAAATTCTCAATTTCTCCATATCTCCACTTCTACTCCCTATCCAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAAT:1 - chr2L 8115608 5' - invader2 4661 1 67.33 ATTCAATGTCCGTTGGAAGTCCATTTGCGTTGAATATGTGACTGAGTGGGTGTTCCTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chr2R 23495516 5' + 412 22 2 57.43 TTCCTTCTGATGGATGTCATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3L 13081007 5' + 412 27 2 52.48 GATCGGTCTCCCAAGTGATTCCGTGGGCGAATCGCAAGGACAAAGATGCACTTCACGACATGGGACTTTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chr3L 13080907 5' - 412 7540 2 72.28 ACGGACAGCGAAGGAGACAGGAACAGAGACATCTACCGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAG:1 + chr3L 960102 5' + Rt1a 45 1 64.36 CCCACCTCTCCGCAGCCGGGGGGAAAGAGTGAGAGGGTAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr2L 11045350 5' + P-element 35 1 43.00 TTCTCGTTAAAGTCAACCGGAAAAAAGAACAAGGCGCGTGAAGTTGGCTGCGGTTAATAGTGCTGGGCCTGTTGAGAGTTAAAAAAGAAAAAATTTTAAAA:1 - chrX 16637904 5' - FB 176 1 70.30 ATAATGGTTTCTGTTAGGCCCATATATATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCAC:1 - chrX 20391097 5' + rover 6996 2 78.22 ACAATNAATTTGGTATGAAATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr3R 19114274 5' - 297 372 2 57.43 AGTCAACAGGACGACACCGGCAAGTATCCTTTGTCTGCTGAGTCAGCTGAAAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGTGA:1 - chr3L 20903902 5' + F-element 12 1 71.00 TGTTTGACTTTTGCAGTACAGGCAGGTACACAGAGAATAACGTTTGGTTTTTTTTGTCGACTTCCACTTCTTTCATATATATTTTAATATGATTTTATTTT:1 + chr2L 4086691 5' + transib1 1888 1 73.27 AAACTATTAAGTCAATATTTACTCAGCATTAGGAGTGCATTTGCCATTGTATATATGGTGCTGTTATTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGAC:1 + chr3L 5964051 5' - BS 497 1 64.36 TTTAAGTAAACGCTTACTTTTATATGTATATATATTCGTCGATTTAAACTACTATGTTTGTTTCTATTCTTTTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 + chr2R 22605902 5' - Juan 4207 1 76.24 AGAGTTAAATTTTGGAAATTAGAGTTTCAGCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 9946970 5' + roo 8709 2 74.26 TTTCACTTTTTTATTCGTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAGCACCATAAGCACATT:1 + chr2R 5466825 5' - Tc1 1629 1 40.59 TAGGTNGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTT:1 + chrX 21668084 5' - Stalker2 7607 2 67.02 TTAGAATTTGCACTTTTGGCTCTGCACCGCTGAAGAAGCCGTTGAGTGAAGACGCGTTGAGCGGGAAGACCATTGATCAGACACACACACACATTCACAC:1 - chr3L 7431746 5' + accord 189 2 57.00 AAAGATGTTTAGTAATGTTTAATCTTGGTAAGATTGTGGGAATTGATGATTAATGGAATTTTAGACGACAGACGTACAACCTTACTTTACTTTACTTTATT:1 - chrX 17017698 5' - TART-A 13109 2 73.27 GTCTCACTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr3R 29350797 5' - opus 7489 2 65.35 AAAATAATTGAAGGCCCGCCGGTTCCTTGAATTCACAGAAAGGTCCATATATATCTTAAATATAAGTTATAAGCATTCACTGGAAACTATATACCCCTTAT:1 - chr3L 14865006 5' + Cr1a 4125 1 68.32 AGTACGAGTATAAAAATTGAAATAACTAATTTAATATATATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chrX 5651607 5' - flea 4978 2 72.28 AAAATAAATTTAAAAATTGACTTTATATAAGAATATTTATATCATTAGAGTATTCATCTTACGGCGTGTGAAAAATTATTTGGGCAATGATTGTTGAGTGC:1 + chr2R 5260084 5' + 1360 448 1 87.13 AAAAGAGGGAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACATGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAG:1 + chr2L 8740869 5' + Burdock 6148 2 59.78 GGGAGGGCAAGAAAAACGGCAACATTTTTAAACAACCCCATAGACGTAAATAAATAAAAATACAATTTAAAAAAATTTATAAATATTATTATTATATTATT:1 - chr3L 18445315 5' - invader3 5054 1 70.30 TATGCAATTTTATGAATATGAATGGTTTATGTGCAGGTGAGGGTTTATTCTGTTCTTTTGATGAGCGGCAGAGAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGT:1 + chr3L 15364044 5' + invader1 101 2 53.47 CATTTGCTGATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:2 - chrX 14979306 5' - accord 180 2 28.71 ATGGCTTATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:1 - chr3R 9952230 5' + Ivk 48 1 74.26 AAACGACACTTTCGGTTGTTTTTCAAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr3R 31812757 5' + P-element 22 1 58.42 CGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3L 10035650 5' + jockey 61 1 77.23 ATACANAACTGTTCTTTAAGGGGCTCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 5975575 5' + hobo 15 1 64.36 GCGACTTTTGACTGATACACCTACTTAAAAACAACAACGAAAATCCAGAAAAGCGGAGAAATCGAGTTCGTTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAGTAGGAA:1 - chr3R 18310333 5' - S-element 243 1 60.40 AAGCTACAAATTGCGCCAAGCGCGGCCTCCGGCGAAAACAACTTTCGATTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTTCATCGGAGCTTATCAGCGGAATCAATGT:1 - chr3R 4457983 5' + 3S18 5850 2 56.44 ATGCCGCGAGAGAGGGAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr2R 13038915 5' + P-element 59 1 20.79 ACAGTTGGCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAA:1 - chr2R 5674749 5' - S-element 1704 1 72.28 TAAGAGAAAATTTAGGTAATAAGACTACCAAAATCACTTAAGTGCGCTATTTCCATTTCGCCTTCACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTG:1 - chr3R 2555595 5' + Bari1 11 1 69.31 TCTTTATAAACATTTTGATTAGTTTTATTATTGATTGATTATTGATTATTGATTAGTTTATTTTTACTATTACTAACGGGTATCTGATAGTCGAGAAAATC:1 + chr3L 15172631 5' + INE-1 558 1 32.67 CTCCCCCGCTTAGATTATCGCGCACCGATCACCGAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAA:1 + chr3R 8198472 5' + Tirant 19 2 62.38 CATCCCATCCCCCACTTTCAAATCCCATCCATTGCTTGCACTTTTTACATTTTCGTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCC:1 + chrX 9248448 5' - jockey 4700 1 59.41 GGCCTGCAACTGCAGGGGAGTCAGGAGCACCAGGACAAAGAACAGAACTGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAAC:1 + chr2R 9454889 5' + opus 380 2 54.46 ACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chrX 19306774 5' + P-element 54 1 25.74 GTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAA:1 + chr2L 7170403 5' + jockey 4659 1 79.21 TGCAGTGTCAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGT:1 + chrX 21668041 5' - Stalker2 7643 2 71.29 TCTGCTTCTCCATCTTCGCCTCTCGCGCGCACATCAATATTTTTACATTTGTTTGGCTATTTCATCTCTGACCGGAAGTATGAATAAATCCCTAT:1 - chr3L 1167449 5' - Fw2 3675 1 60.00 AATAAAGTAGCCCAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 - chr2R 12446394 5' + jockey 4683 1 63.37 AAATGGTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2L 4189428 5' - 1360 3348 1 67.33 GGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr3R 7522392 5' - blood 7379 2 68.32 CATTATATGTTAAAAAGTATACTGTATGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3R 26469424 5' - hobo 2922 1 62.38 ACAAACAAATTCGCAACGGGAGCCAGTGTAGCTGCGAAATGTTAAATGTTGAATGCTATGTGTGCACATTGTGTACAAAGCGGCATTTGGTTAGCGTGGGA:1 + chr3R 7319744 5' - gypsy11 4165 2 57.43 TGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 13682620 5' - roo 9036 1 62.38 TTTTATAATTTGTTAATAAAAATGTTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCGCG:1 - chr3R 15021689 5' + invader4 2748 1 45.54 GCATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCA:1 - chr2R 14381360 5' + hobo 20 1 58.42 GCAGTGCATTTTATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr3R 20466734 5' + roo 4 2 77.23 CGGCTGCTGTTGTACCAAAGGCAGTTGTTGCTGTTGCACCAAGGGCTGTTGCTGCTGTTGGCTCATGGCCTGTTGCGCGTTGCGGACTCCGTTTACGTTTT:1 + chr3L 21549467 5' - Doc4-element 498 1 74.26 GAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:2 + chr3R 14169271 5' + blood 55 2 80.20 AGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGACCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3R 10321100 5' - roo 9045 1 50.50 GGATGAATGTTAGAAGTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2L 4189447 5' - 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I-element 4929 1 58.00 ATTATTATTACACCAGCCTGTTAACACAATTATTCATTCCATCTGATAGCGTCGATCTTCAGCTTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCA:1 - chrX 3438532 5' - Ivk 5236 1 73.27 AGGTTGCAAACGCATTAGTACACTCGTACTATTTGCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTG:1 + chr2R 22997949 5' - Transpac 287 2 56.00 CCCCTGGATGCTAAATCTGCTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTAATTGTAA:1 - chr3R 19446473 5' + Cr1a 4032 1 84.16 CAAAANTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr2R 20702152 5' + Doc 48 1 70.30 TTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTA:1 + chr3L 21735415 5' + Doc 61 1 81.19 AAATCGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chrX 4488925 5' + 412 42 2 65.66 TTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 13347282 5' - roo 9044 1 54.46 AAGTGGCCAGACCAGCGCTGCCAGTTTTTTCTGGCGTTTTTTATTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - 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chr2L 7153757 5' - F-element 350 1 60.40 ACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTC:1 + chr3R 9254897 5' + F-element 201 1 60.00 ACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCTTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 - chr3L 4048507 5' + 3S18 5809 2 62.38 GTGGTGGCTGGAAAAACCAATACCGACGACGTGCTCAAGTTGTTAAAAACTCCAAACAAAAGCAGGCAGAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 29469143 5' - hobo 2934 1 73.74 AAATTGGTATATCTTTTACGATTTTATTCGTAGCTTAAAAAAAGATGAGTTTGAGAAAAAAAAATTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATGTT:1 - chrX 22490470 5' + FB 49 1 61.39 AGGATATATAAGTGCAATATGAATGATATGAACTACTCGCATATTATCTTAGCATTTTATAGGACGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 17368087 5' + roo 8675 2 62.38 ACACTGCGTCAAAAGGAATTATACTTGCATCGAAATTCTTTAGGTCATTGAATGTTTGCATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:2 + chrX 20364216 5' - opus 487 2 68.32 AGCATTATAACTGTACATTCTTAAATGCGAACATTCACCATTTAAAGGCTTTTGTAAATAACTTAGATATTGAGATTCGTTTAAATTGATACCGAT:1 + chr4 628261 5' + jockey2 3321 1 66.67 GATGCAGCTCAGCCATCTGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGG:1 + chr2L 20118675 5' + Max-element 8231 1 78.75 ACACTNTCTGCATCTATTTATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 19192524 5' - roo 9047 1 57.43 ATTTAATTTTGTACAAAATTCTACTTCATTATTGGTTTTTCTAGTTCTGGCCGTTTTTGTTTGGTTACAAATGTGACATGTTTATTGCAGCCCATAAATAA:1 - chr3L 27901451 5' - rooA 51 2 71.29 TCGCAGCAGCCGGCACTCAAAGTGTCATCGAATGGATTCTTTATTTTATCTGCTGCGTTTCTTTTTGCTTCTTTCCATGTTTTCTTAAATAATAAAACTAT:1 + chr3R 18995036 5' + F-element 172 1 48.51 GGGTCTAATTGTATGTTTGGTTTGCGAAAATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTA:1 + chr2L 9278142 5' - jockey 4780 1 71.29 ACAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACTCGATAAACACTCGGTACTCT:1 + chr2R 14381282 5' - hobo 2901 1 64.36 CGTAGGTTAACAGGGTATGCTGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 5505248 5' - mdg1 366 2 78.22 GGGCAGTAAGTATGTAAGCAAGCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr2L 14260706 5' + 297 1 2 77.23 ATATAGGGTAGCATTATATAGCACATTTTGGGCATTAATCTTTTCCCAAATAGCTAGTAAGTCAGAATTCGTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 - chr2L 18867637 5' + transib2 30 1 74.26 AGCAAAATATTTCAATTTTACAAGAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2L 9389032 5' + 1360 9 2 69.39 CAGCGATGGCACGATAACAGAAAGCAGGGTAATAGATAATAACGATATATTTACTTCTAACTTAATATTAATAATGAAAATTAAA:1 + chr2L 14811586 5' - hopper2 23 1 65.88 TTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTCCAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1 - chr3R 13423366 5' + 17.6 6951 1 58.42 TTATGGTTTAAAAGTATGAAGTATTTTCTCTTAACATGTGATTACCTCCTTATTCCAGTAGACTAGTTTTAATTAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGA:1 - chrX 6500266 5' + Cr1a 4003 1 60.40 TCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 + chr3L 12452154 5' + 412 7096 2 67.33 CGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCT:1 + chr3R 4973093 5' - 1360 20 1 47.52 CCATTCGCACCGTAAAAAGTATTAAAGTATAAAGTTTCAGGGACACCCGCGAAATGAAGTGAAGCCCCCATTAAATAATCCGCAACGCACTGCTGTTTGTC:1 + chr2L 20705630 5' + Tc1 475 1 77.23 GACCTTCCCTCCATCTACAATACAAGCAAACTCAAGATCGTTCTACACTCCTTTTTTTCGCATGGTGCAAATGGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCT:1 - chr2L 15099725 5' - 1360 245 1 53.47 AAACAGTTTCCAAAGATGCCGCCATCGGTTGAACTCAAATTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:2 - chr3L 12085228 5' + pogo 33 1 60.40 ATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATA:1 - chrX 16798258 5' - diver 178 2 69.31 CAATGATCTTACGAAGGGCAAAGCCAATTTTCTGCGTTCTACCAAACTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGA:1 + chr2R 3492821 5' + 1360 89 1 58.42 CACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 326151 5' - roo 9020 2 74.26 TGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3R 19450181 5' + roo 50 2 54.46 GGAAGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:1 + chr2L 15956016 5' + Max-element 8249 2 65.35 CAAACCAATTTCAGTTTACCTAACCATGAACTTTGCTCTCACTAACATTACTAGCTCCTATATTCTTTTGTTGCAAGCACGTTCAATTATTGATCTTATTC:1 - chrX 15117507 5' + Gypsy12A_LTR 2118 1 57.43 ATAATAACGAAATTGAAGAACTGAACATCAAGTTATTTTTCGATAACAATGCCTTGAAAGTTGAAAATAAAGTCAAATGTAGAGCGACACATAAGTAAACT:1 + chrX 292029 5' + G3 4371 1 70.30 AGTGACAGTTTGATTTCCATCCGTTATTTGCCCCCCCTCAAAAATGTATTTTCTCTCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr3R 19191560 5' + Doc 23 1 55.45 AAGAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGC:1 - chr2R 12253302 5' + BS 4679 1 67.33 GTGGGGCTAAGTTTTATTTTATTTGGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 1100788 5' - roo 9028 1 69.31 TATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3L 21841352 5' - P-element 2845 1 35.64 GTTGTCCCCTCACCCCGAAGTTAACCCAAAATTGTGTTCACTTTGCTTTGTGTTGTCGTCAGTTTTGTGCTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAA:1 - chr3R 11593251 5' + GATE 8363 2 74.26 ATGTCCTCCGGACGAAACACAATGCAAGCGGCAACCGGAAATGAGTAAACAAGCGTCAAATAGTGAAAACGAAAATGGCGACCACGGACGGAATAGGATTT:1 + chr2L 15955506 5' - Max-element 394 1 69.31 TTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 - chr3R 14094998 5' + Doc 31 1 57.00 AGTGGGGCCAAATGTGCGGACTATCTGATACCGCTCTGATGAGTTTTTAATGTTGATGATGATGTCAGATTTCAGACTACCAATATGTTGGAGGTTCTGCA:1 + chr2L 4737838 5' - gypsy4 6357 1 42.57 ATTTTGATTTTTCAAACTAATCGAAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 - chr2R 21712801 5' - I-element 5339 1 57.43 TACATCAAAATACCCACACGGTCGCAGCAATGGCAGCAACATCTGAAACAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATA:1 + chrX 4796943 5' - copia 229 1 52.48 GCAACTCCTCTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATAGTTTAAATACTTCCAGCCAAAACTAGTTT:1 + chrX 22575251 5' + Transib5 91 1 62.38 GATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:3 - chr2R 19936677 5' - roo 9033 1 61.39 AAGCAAATTAAAATATAAACTTGGGGATTGTTAACAAACTCAATGACGTCGAAAAGTTATGAGCTGTAGGTGATAGCTAAGTAACGGGTATCTGTTAGTCG:1 - chr2L 14381523 5' + INE-1 550 1 87.13 CGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTAACAGGTATCTGATAGTCGGGGAAC:1 + chrX 23078686 5' + INE-1 556 1 78.22 GATCGCTGCTGAACCTAACACGCCTACCCGTCTTGATCGCATTGGATTTACATAAGGCATTAAGTCGGAAAAATCCGTTAGATTTGACAATAAATCTTACA:1 - chr3L 14158117 5' - GATE 414 1 69.31 CAATAAACTAAATCCGGGCTTAAGGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chrX 13347362 5' + roo 8686 2 50.52 TATAGTTTTTGACCCTTGCTCTTCACTGATTGCCTCCATTGCGCCATTATCATTTTAGTGAACCAATTGTACTTATTATTAAATTTATAATAAATATTCAA:1 + chr3R 25652908 5' - INE-1 422 1 50.50 GACTCCTTCACGGGAATTTACGCTTAATTCCTTTATTTATTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAG:1 + chr2L 2931596 5' + pogo 2088 1 60.40 ATTTCCGACTCTTATCAGATAAACCTGTTCTAATTTGTGTAACAGATATTCAACATGAGGAGCTAGCAATGAGTTTTTATTAAATTTTTTTTTTAATTTAT:1 - chr3L 11385574 5' + S-element 1581 2 64.36 TAACCAACTATTTCGCCATTAAGTATGGATTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAA:1 - chr3L 3951115 5' - pogo 2059 1 70.30 ATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:2 + chr2L 326120 5' - roo 388 2 58.42 CGAAGGGTTTTCCCAAACCGGCAACAAAATTTATAACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:2 + chr3R 18934073 5' - hobo 2921 1 56.44 GAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr3L 958795 5' + P-element 47 1 29.90 TCGCGGTGCAAAAAAGAACCAGCAGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGA:1 + chr2L 7350754 5' + mdg1 7090 2 73.27 CACAAAGCGCATGCACGCAGAGCATCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr2R 7481112 5' - opus 7480 2 58.42 ACTAATAAATTAGGAAAAATGTATTTGTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTT:1 - chr2R 13122102 5' - opus 488 2 69.31 ATTCAGAAGTATAGGCACTCAGAGTGTAGTGAGAGAAATTAGGGACACTCCATGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chrX 495159 5' - 412 7522 2 54.46 GGTTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chrX 17204133 5' + Tabor 51 2 72.28 ACCAANGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 - chr3L 9772271 5' + 297 34 2 74.26 GAGTTATGCCAGCTGTCGCAAAAATCCCGAGTTATATTTTCGCTACCGCTGAAAGCAGCTTATATATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3R 29432845 5' - 297 6972 2 75.25 TAAAGNATGGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACC:1 - chr3R 7522400 5' - blood 375 2 75.25 AGCGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr3L 9692687 5' - P-element 2842 1 32.67 TCTTTAAATCTGCATCTATGCCCGAGAGTATGCCACGTGTCCTTTGAAGAAAAAGAATATGCCTTAAAGTAGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACA:1 + chr3L 968305 5' - P-element 182 1 75.25 GAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 - chr2L 1156800 5' - 412 7509 2 68.32 GTGACNTTACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chrX 10730633 5' - P-element 2858 1 52.48 TAATTATAGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGA:1 - chr2R 5924421 5' - jockey 4740 1 40.59 CAGAAATGACTTCTATGGCTCTGCAACCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 19967656 5' + pogo 47 1 72.28 AAGAGACTAAAAAACCAAGGGAGTGTGAGTTTCTGAACTCAAACCACAACTTTAAATCCCCAAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 + chr3L 18154122 5' + I-element 16 1 59.41 CTGGACTTGTATCGGTATTTGTTTTCGTATTATTCATTGAGCTGGCCGCCACTCCCCTTTTTTTTTTATTTTTTTTTAAA:1 + chr3R 11584894 5' - TART-C 11100 1 47.50 TAGCCAGATTTATGGACTTCGGGTCCGAGTTTTGGCCGACCTTCACTTACTTGGGCAATTTTTGTCGTTCCTTTTGCATGCAGTGGCCCATAGTTGACATC:1 + chr3R 17333532 5' - Doc4-element 2609 1 61.39 CGCTTTAATTATTTTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 + chrX 6997150 5' + P-element 12 1 67.33 ATATGTGAACGTCTAATTATAAACACAAAACACGACTGTGGCTGGCATACCTGAGAACTCAAAAATAATATATTATTAAAAAAAAAA:1 - chr3L 9819590 5' - hopper 161 1 65.52 AAATTTATGTGATTTCTTAAAAAAAAAAATAACATGGCTTAGATACCGGCTGTTTTGCTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAA:1 - chr2R 23939855 5' - I-element 5159 1 47.42 GTTAAACTCTCTCCTACTTTCTTGCCCAACCTCCCCTCAATGCCCAGAATTTTGGCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3L 7792169 5' + 412 7076 2 56.44 ATGAGTGGTTTTAACTTATGCGGGCGACCGTAGCAACAGCACAGCACTGACGGTTATTTATGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2L 17686403 5' - mdg3 5419 2 63.37 TATATAAAAGCCTAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3R 18881553 5' - roo 9025 2 70.30 AGGAATGTGCATCGGTATGCGAACTAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGAC:1 + chr2L 9121217 5' + Bica 84 1 75.25 ATAATAGCTCCTTACTTTTTTAGTCTAGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTA:1 + chr2R 12213905 5' + Transpac 16 2 64.36 TGATAAGAAAACCGAATCACGCACATAGAAGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTG:1 - chr2R 13935806 5' - I-element 221 1 70.30 ATTAAGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chrX 5018707 5' - opus 471 2 53.47 CAAAGNCAAGAGAGTCGAACGACCCCGTCTTCACCGCTCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2L 2909641 5' + pogo 4 1 74.26 ATCTCGTGCAATGCACTTCGGGAATGGGAGTAAGTTAGATGGAATATATAGCGAATGGATAAACCACTGTATAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTG:1 + chr3R 18060602 5' - 1360 3325 1 60.40 CCCTTGTTGCGAAGGCTTCGGGGCACATAAAAATGTCATATGTCAACTACAGGTTGCCTTGTCAGCAGTGGAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAG:1 - chr2L 18028282 5' + flea 134 2 67.00 AGTTAATAATTGTGGGCTTTTTGGAGAGTGCATACGGACAGACGGACATG:1 + chr2R 8639477 5' - INE-1 122 1 80.00 ACACACAGATTTCTCGCAGTGCATTGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTTCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCC:1 + chr2R 10976972 5' - Rt1a 4887 1 75.25 TATGATATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGCTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr3R 19114261 5' - 297 6956 2 65.88 AATTGGTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 - chrX 10251795 5' - flea 216 2 73.27 AATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr2L 903797 5' + 1360 17 1 60.40 GGATCTCAAACCAGGCACCAAGTACCGTCTCCGGCGAAAGGACGTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTCTAATCATAGAACAGTTGGAAAAAT:1 + chr3R 7182455 5' + F-element 4571 1 74.26 GTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCGTTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 + chr2L 21936092 5' + INE-1 10 1 49.00 GTGCCGCGAAATATTTGCGGCTAGTAAAATTAAGTTAATAATTTTTTTTTTTGCGATTTTTGGCGTTCCCTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGC:1 - chr3L 6273911 5' - F-element 49 1 58.42 GAAACAGCAGCAGAAACCAAATGAGGAACAGCAAAAGGGCGTTGCTGCCAAGAGCATAACGAGAACTTGTGCACAGGTGGAATCGTGTTCGCGTATTGCCC:1 + chr3L 15915653 5' - gypsy12 9923 3 79.21 GGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 - chr3L 6024583 5' - roo 9020 2 78.22 CGCGAACACAAACACATGCACAATAGCACTCACACCTATACACAAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3L 15035207 5' + pogo 28 1 59.41 CGATTCGTGTTACCGCCGGGTCCCGCAAAAAGTAACAAACGTCTAGATGGCAAGCGGGTATTTAGGTCCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGACAATGGCA:1 + chr4 1104617 5' + flea 4591 1 56.44 AGCGACAGAAAGTCGCAAATGAAAACGAAAGTGAAATACATGCACATAATTTAAATAGAAGGAACGAACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 + chrX 17064729 5' - Tirant 8496 2 64.36 AGCGATTGTTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGAC:1 + chr2R 20411873 5' - 297 364 2 61.39 GGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 - chr3L 19215853 5' - roo 9030 1 66.34 CACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGGCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGCATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAAC:1 + chrX 1427535 5' - Bari1 1683 1 50.00 ATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr2R 12779106 5' - roo 361 2 70.30 TTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2L 326139 5' - roo 9032 1 62.38 TTGCCGCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3R 11993282 5' - P-element 2864 1 56.44 ACAACAATGAAATTGTTTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 20466621 5' - roo 393 1 64.36 ACAATTAACGAACACACACAAAAACGAAAGCATAAGACAAA:1 - chr2R 16790102 5' - S-element 296 1 97.56 GACACCCCGCTTTCGGATGGGGCGGTGGTGCAGTTCAGTGGAGCTCAGCTCATTTCTGCAGCCATTGTGCATTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCC:1 - chr3L 18970905 5' - 297 6956 2 71.29 CATGAAAAGAAACCGTAGTATTGAATAACTTGTATAAATATATTTCTATTGTTATTTTTAAAAAAATCAAAAAACACATAATTTAAATCACATAATAATTT:1 - chr2L 8900619 5' + HeT-A 338 1 49.50 AGGGGTGGTTGTGGAATTTGGGCACAACTTGGAATGCCAACAACAAAAGTAACTGCCATTTGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAAGTA:1 - chr3L 19210516 5' - Quasimodo 34 2 78.35 TTCCACTTAAAGGGTATCTGAAGTTCGCTAACCGATATCTTGGTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTTTATGATG:1 + chr3R 27699482 5' - I-element 309 1 61.39 ACGTCACCACTTGAAGCCAGAGAGCAGAGAGAATTGAAGATTGAGAGGGAAACACCGCTGTAGTCGTGTTCACGGCTTGCCCTACCCTACCTATGACCGCT:1 - chr2R 8725557 5' - Gypsy12A_LTR 1950 1 56.44 AAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAATATCCCAAATAAGATGACTTTACTCGTGGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 25918943 5' - roo 9020 2 74.26 CGTTAATTCTCGACTTGCCTCTTAGCTTCTTCACACTCACTTCATCTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAC:1 + chrX 10755745 5' - accord 7198 2 55.45 TTTAGCTCAATAGTGATTTTTTTATCTTTAGTTAATCCTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTT:1 - chrX 21396717 5' - F-element 4636 1 73.27 GCCACAAAAGAGCTTGCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGT:1 + chr3L 5964241 5' + BS 25 1 50.50 CCCCCCAAATTAATATTTAAATTAACTATATTCTCAGTCCACACAAATTTCAACTCTCTCCATTCCATCCACACACACACATATACACAC:1 - chrX 11982861 5' + accord 7035 2 53.33 TGTGGTGTGCCTTTGTTTTGTGTTTTGCGAGACTATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3L 21841280 5' + P-element 6 2 70.33 ATATTTGAGCAGCCCAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3L 2800218 5' + blood 18 2 61.39 CTAACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 - chr3L 15638301 5' - roo 9046 1 56.44 CTCTTATCACGGTATTTCTTTATCGTACCAGTCTATGACTTCTGCAGACCCCATTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATATTTTGTTAGCCTTAAGTTCAGT:1 + chr3L 8699663 5' + gypsy6 143 2 54.46 CTTAAGAGAGCGAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr2L 13060268 5' + P-element 34 1 45.54 CTTCATTTAATGCCTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGA:1 + chr3L 20248287 5' - Transpac 293 2 62.38 TATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr2R 18295600 5' + I-element 23 1 54.46 AATAGTAATCCTGTCCGGGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGG:1 + chr3L 18576702 5' + springer 7161 2 55.45 AGCCAGCAACAATGCGTGCCAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1 - chr3R 7388437 5' - HMS-Beagle 241 2 76.00 GATGCTGAATGGTGCCGAAAATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACAATGAAAATAAATTGTATTTAATTACAAAATTAAGGGCTCTTTGTTTACCT:1 - chr2L 21396590 5' + S2 64 1 79.21 CTGCANCGAAATTGTGAGGATTCTTATCATGATTTGGATTTTGACTTCCATAACTTGTAGAGTAAATTGGTGTGACCAAATATTATAAACAAAAAACGTTT:1 + chr3L 22752536 5' + FB 336 1 76.24 GGGTAAGAGGAAAGTTTGTGCCACTTTTCTTTTTCTTAGTATTGCTGCTGTCGCTTTTCCGCCTATATGTATGTATATATATA:1 - chr2L 9109959 5' + 1731 4410 1 78.31 GTACCGCCTAGAGCCGCCGTTCGGCATTTAGCCGGAGGAACCGCGAACACGTCTGAAGTCCGGAGAAACATCAGCCAGGTGTAGGCCATCGGCGGAAAT:1 + chr2R 914774 5' - gypsy12 207 2 67.68 AACATTAGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACA:1 - chr3R 19609728 5' + Tabor 25 2 52.48 CATTCTGGGAAATCGCAACCTTGGTCCTGTGCGGCAATCAATTTTCCTGAGGCTTCCAGCGACTCGGTGCTTCCGTCCTTCTGGCGGGGGGACCTGAAAAG:1 - chr2R 17194916 5' + HeT-A 5746 1 59.41 ACAGCGGTATTAAAAATATAATACATCACCGAGGTTTTAATTTTTATACCCGTTACTCGTGGAGAAAATCAATATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAAC:1 - chr2R 2947234 5' + INE-1 15 1 61.39 CACTCATCGTTTATTCACCCAGCGAATGCACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAAC:1 + chrX 1427507 5' - Bari1 1700 1 72.28 GGTACAAGCCAAGTCACTACGCAAGTTCGCACGGATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCA:1 - chr3R 28755642 5' - 3S18 6087 2 48.51 GTCAGCGGCAACCTCAACACTTTGGCCGTTTTCTATCTGTGTCGGCGGCTTCCTTAGC:1 - chr3L 2920666 5' - G-element 484 1 89.66 ATATTTATCAAAATTAAAGTATAGTATTAGTGTACTTATGTATGCAGACGATGTTAAATTATGCCTCCAGTACAAGGACACTTCGTGCCATTTAGACTTAT:1 - chr4 827697 5' + Q-element 616 1 68.32 GATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTGTGGTCC:1 - chr2L 21403526 5' + G5 4429 1 73.27 AGGACTTGTACTACTTCCTGATTTCATCCACAAAGCTGGAGGACAAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCC:1 - chr3R 25323720 5' - Doc 4401 1 58.42 AATAAAAGTATTCATCACACACCAAACCACACTGACTACTTCGGCTTACAATATTAAAGAGTATGAGATAAGTCTACTGCACAGTTTAGGCGGCTGTATGA:1 - chr3R 3920623 5' - diver2 4540 2 71.29 AAAACCAAATTGTGTAATTGGTTGAAATTTAATAAAAACCGCAAACACAAAGACGAAAAATGCAAAATACTTTGTATATTATTTGTTTAAACTACTGCACA:1 + chr3L 13348305 5' - Cr1a 158 1 58.42 ATATGTCTGTGCGAAGAACTCCTACACATTTCGCAATCACTTTTGATATGTAACAAATTTGGGTTTTTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGAGCC:1 - chr3R 13150915 5' - 1360 3194 1 74.26 ATCAAAAGTGAAATCTATGCTACTTTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACAACACACACACTGTTAGCTTATTCAAGACCAAGAATAAAGA:1 + chr3L 14075605 5' + ZAM 8261 1 75.25 TATATTTCTAAACCAGGATCGCAGTTCGGTTTTCGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTAG:1 + chr2R 7409190 5' - mdg3 315 1 72.28 TAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:1 + chr3R 7388334 5' + HMS-Beagle 25 2 54.46 GCCCCNAAAATGTGTCGCAATCGATGATAAACTGAAGGAAGGGAGTGAGACCTGGCCTCACATCCTGCTCATCGAAGTCATACCTTGACTGCCAGTCCCGG:1 + chr3R 27134295 5' + Rt1a 4913 2 71.29 GATTTCCGCAATATTTCCGCCAGCCCAGGATGGCCGGGGCAGAAATGGCAATGGAGGCAGCGGCGGCAAAAGGGAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTAC:1 - chr2R 8176829 5' + copia 4 2 75.25 CTCCACCTCTTCCTCAAAGTACAGCCAGCGGACAAAATGACATGCAAGTTTATTATAAATAACAAAATAAAAAATACAATACCTTCCACTTTAAAATCCAT:1 + chr3L 9707742 5' - Transib5 273 1 71.29 GTTGCAAAATAAATGAACGTATATCACATAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCT:1 + chr3R 19450127 5' + F-element 413 1 71.00 AAGTGACGCATGTGCAGCAGGAGCACGGCAGTTGCGGCTGCTGTTGCTGCTGCTTTTGTTGCTGCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTG:1 + chr2R 24273643 5' + HMS-Beagle2 198 2 40.82 CAGTGAGAAGCATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - 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diver2 357 2 63.37 TGGAGCGGATAATTTGTAAGGATTAATTGATACATTCTCTTGTTGGATTGGGTTCCCTCTTGAGTGGATCGCTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTG:1 + chr2R 7716228 5' - Quasimodo 244 2 63.00 TAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr2R 18295605 5' + I-element 28 1 51.49 TCGACAAATGAATTTTGTACTTATTTACCCAAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 - chr2L 8740941 5' - Burdock 6350 2 71.29 CAGTAGTAGCTAAGGAAAGGGGGCAGAAATAAATATAATAAAAAAGCTAAATAAAATCATAATCAGAAGAAGGGGAGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAAC:1 + chr3L 10941964 5' + blood 339 2 81.19 CGAAAGTTCCAATGGTGAAGTGCTTCTAATGGTCCCTGGATTTTTCGGCATCTGTTCTGTCTTCCGTCTTAGATAATGGCTTTTTAATGACAATTTCAATT:1 + chr2L 22732110 5' - invader2 436 1 75.25 AAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAA:1 + chr3L 27182017 5' + F-element 280 1 78.22 GTTGCTTTCAGTGTAGGAGTTGCAGAAGAAGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3R 30272777 5' - P-element 2883 2 75.25 ATGGAGAGACGCGTAATTGTAAATGGAAAGCTCTTGCCCAATTTCGTGTTCATGCTCAAGCAAGGGGCAATCTTTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAA:1 + chr3R 23632195 5' - R2-element 3316 1 78.22 TCATCCGTGTCCATTTCAAAACGCGTTCTGCTCTCGACTAAAGAGTGATTGCTTTGGGTTTTTTTCGACAAATTTTGAAAAAAGGAGTTGTATTAAAGGTT:1 - chr2L 18114675 5' + Tc1 294 1 58.42 CACAAGAGTTTCTACCAATATACATATGAAGACATTTTAACATTTTATAGGCATCGCGTTAGAGCTTAGCAAAGAACAAAAGAGAAGGCTATAGTCGAGTT:1 + chr3L 25107311 5' - INE-1 575 1 72.28 CACTATGCAATAATGTGGTGCTTTTAATACAATACATCTCTAGATATAAGAACAGATCACGGCGCAGAAGAGTTCCTCGACTAACAGATACCCGTTACTTA:1 + chr2L 14381366 5' - INE-1 548 1 49.50 ACCGGCCGGCGGATGGGTTCTGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3R 27189248 5' + roo 8682 2 60.40 AAAGTAATATTTTTCATTTATAGCTATTTTTAGAAACCGTACATTTGTAAAGCACAAAACAAGAGAGAATGATGTAGATGAGCTCCCCGACTATCAGATAC:1 - chr4 50474 5' - INE-1 558 1 54.46 CCAGCTGCACATTTCGTTTGACAAGCTCGTGCGATTTTCCATGTAAACAGCCTGTGGGCCATTATTTCGATAGGGTGTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 6910054 5' - Doc2-element 233 3 66.67 AAGAGATATAAAAATGGAGAATGAAAAAGAGAGAAAAAATAGGAAAAAAACACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAAC:1 + chr3R 22224846 5' + transib2 2487 1 81.19 CTCTTCACTTAACGACTTACCTAGTGTAAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGAGATGTGGTTAGATACTGGGAAGCAAAATGAGAAAAAACTTTAAAA:1 + chrX 694681 5' - INE-1 471 1 64.65 TCGGACGATTTATCCCAAAAAGTAGGCAATATGGAGGGAGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTT:1 + chr3R 19960041 5' - jockey 4702 1 65.35 AGTCGTTTCTCGTATATTAAGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTAAAAGGTGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGC:1 - chr2L 15957529 5' - Max-element 281 2 60.40 GCCGACAATTAGTGACCGTCGTCAAACGGACACAAATTCGCTGACACGGCACCTTGTAGTATATACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAAT:1 - chrX 21947725 5' + mdg1 30 2 54.17 TATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 21841313 5' - P-element 2838 1 30.69 CGCCGGTATTTCAGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGT:1 - chr3R 17121694 5' - mdg1 381 2 64.36 ATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr2R 19857389 5' + 297 41 2 79.21 GTCCCATTCCCTATCTGGAATGACTGGACACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr2R 19857343 5' - 297 6935 2 72.00 AGAAGTCCCACTGTGGCTTCAGATCCAAAACAAAAACAAAACAGAAAACAGCCGATGCGCCGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chr3R 28326679 5' + P-element 15 1 68.32 AACTCTACCTGCCGTTTCACTATCGTATATTATCTGCCCCTAAAACTTTCTAACTTTTTCTACATTCTCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAAC:1 + chr2L 16761792 5' + Porto1 252 1 72.28 CATCANTCAAAGACGATCAATCAAATTGTTGTCAACATCGGCGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCTCACAAGCAAGCAAATTCTATT:1 - chr2R 19543820 5' + 1360 3260 1 62.38 CAGTGGCAGTGGGCCTCGCAATTTGCGAGCTTTTCAGTTGACCCAAAGCCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr2L 1828847 5' - 412 7521 2 54.46 GACCAGCTCAAAGTCTGGAATACAATGAAATATTTAGAATAGAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATT:1 + chr3R 14518023 5' + transib2 2526 1 58.42 AGGGACAGCCATGGCAGGGCAACAAACATGGATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTT:1 - chrX 15195288 5' - Transpac 5190 2 69.31 ATACATCATTTCATGTTATTGTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCG:1 + chrX 11533901 5' - invader6 4846 2 60.40 GATATGACCGCACATGTGTATGTGTATGTTTGCTCATTTGCGACGCTATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chr2L 7994513 5' + jockey 4769 1 67.33 ATGGAAAATGGGAGAGACCACAGATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:3 - chrX 329104 5' - opus 493 2 74.26 GAAAAACCCATTAGGTATAACAATTTCCTGTGTGATGGAAATGGAAGGCAACGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAAT:1 - chr3L 13786432 5' - R2-element 3438 1 53.47 ACAGTTCGCTGTTCGCAGCAATTTCAATATGCAAACGGGTGTACATAACACTTAACCCATGATACCCCACCTGAATACTGTAGTATATACGAACATAATAA:1 - chr3R 25818919 5' + mdg1 2 2 77.23 GGTTTGTATACACGAAAAACACAAACTTTCTACCACTTCAATCCATATGCCCTGCCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGTTGTAGCGCTCTTC:1 + chr3L 798821 5' - 1360 121 1 56.44 CCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTT:1 + chr3L 5964262 5' + BS 46 1 71.29 AAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 + chrX 21844338 5' + pogo 9 1 68.32 TAATTGATTGAAATGGTTGCAATTTGTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 + chrX 7705193 5' - jockey 4917 1 74.26 CCATGATTACATAATTAAGTTGAAACTGTCACGTTGTCGTTGCGAAAACACAAATACACACGTAAACTGGTACACTCATCACAACCACACACACACACACA:1 - chr3R 18006850 5' + gypsy3 419 1 55.45 TTTTCTTTTTGTGCTTAAGTTAGATAACAATTAACAATATAACAATTATGAGATCATCATCATCTCGTCAAGGGGGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTG:1 - chr2R 7250574 5' - BS3 1571 1 75.25 CCACAGCAGGGGTCGAAACAATAGGTCGCAATCTATGAATAATCGAGCATGACTTTACAACAAGTAATTTTGGATTTATAAATAATAATAATAATTATGTA:1 + chr2R 9738328 5' + invader6 4390 1 38.61 GGCAGCTGGAAAAGCGCCACATGTGTGGACCGAAAGCTTCTGCTTGGGAAAGGAGGGGAGGAGGGCACGGTAGGAACCGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAG:1 - chr2R 22364726 5' - G-element 253 1 57.43 TACCTGAAACTTTACTTTTTCATGTTTTTTTTTTTATA:1 - chr2L 3555818 5' - gypsy11 3930 1 78.95 GTGTCAGGTTTGTCACCATTGGCGATCCTTTATTAATTGCATTATTAATGTTTCTTATTCATTAAGTTTAAGCTTAATAAATAACAAAAGGAGGATCCGGA:1 + chr2R 7023868 5' + Burdock 325 1 75.25 CGGGAGACGGATAATCTCTACAATTCGGAAGAGCTACGCATGCTGGAATCGCGTTTGAATATGAACTACAAAAACTTGTCCATTCCATGAAAAAAAGGCTT:1 - chr2L 7388061 5' + S-element 1378 1 59.41 TTTCTCCATTTTCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCACATAAATATCG:1 - chrX 15434336 5' + gypsy8 10 2 54.46 GCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 + chr3R 19609662 5' - Tabor 7282 2 64.36 TGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGG:1 + chr3L 23112570 5' + R1A1-element 4893 1 57.43 GGTCACTGTAATATAAGTGCGGGAAATGAAGTAGAACATTAATAATCTTTCAATTATGTGCACTTCAAGTTAAAGCACATATTATTAAATATAATTAAACA:1 - chr3L 286581 5' + S-element 98 2 43.56 AGTATATTTTCTGAAATGTTTATGGGGGACATCTGAAAACCAGCGCCAGGTACGACAATTTCAATTTATTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGC:1 - chr2L 7519648 5' - P-element 415 1 76.24 GAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 + chr2L 13060279 5' + P-element 45 1 34.65 GCAGAAACGTATAAACGCATATAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 18881483 5' + roo 16 2 63.37 AACTGATAATGAAACAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 - chr2L 12074414 5' + Quasimodo 24 2 59.41 TGAATAATCGAATTTTCTTTGGTTGTGTTTTGATTTGACAAAGAATGTATGTGTATGAATGTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr2R 5784300 5' + 297 6590 2 70.00 GTCAACATGTTTCGTGGTGATTTGTGGGCCAGATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr3L 22920462 5' - 1360 3372 1 62.38 CTTAAAAAATACTTAAAGGGAACTCAATTATTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr2R 10863978 5' - mdg3 5480 2 58.42 GTTGAATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAG:1 + chr3R 15157570 5' + invader3 5189 2 75.00 GGGGGGGGGCTATTATTATTAGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTA:1 + chr2R 21894903 5' - F-element 4401 1 80.20 TAAATNGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 10445184 5' - roo 9049 2 55.45 CTTTGNTGGCGTGGAGCCTCAGATCTTTGTGACCTCGCCATCGGGGGACAATGAGCACTGTCAGTTGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTT:1 - chr2R 22720846 5' - Quasimodo 6946 2 67.33 CCTGTTTAATGTCCACGACTGCCTAAAGCAATTTCCGGTTGGAAATACGCCCAGAATAAATGGGTTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTCTG:1 - chr3R 26108543 5' - gypsy10 294 2 65.35 GAACCCCACAGACACACTTCATTAGAAGCCCACACCACTTTTAACCATTTAATTGAAGGGGAATTTTACTCTGTAACTCACAAGTCTCTCCTTTACTCAAG:1 - chr3R 14546713 5' + R2-element 102 1 57.43 ACCTGCAGGCGGCCCAATTGATGGACGAGTTGCCTGATATGAGGATCGGCCTTTCGCCGCCCAGCGACCAACTTATAGGATAAGTACGAAATCTCCATACC:1 - chr3R 11753105 5' + GATE 337 1 66.34 CACAAAGGATGTTATTAAAAATATCTAGTATGTGTATTAAATTCATACTACTTTTAAACATTAGTTAGGAATGCCACACTAAATAAATAAAATTGATTAAA:1 + chr3L 11668655 5' + HeT-A 1 1 66.34 ATTTCACCGACCGACTTTTAAGTTCCTCTAGCTCATGGCGTTTGGTGTGGTGGTCTTGCTTGTACAGATACCTTTTCGCTACAGACATTAATGAATAAGAT:1 - chr3R 14070216 5' - Gypsy12A_LTR 2131 1 73.27 CAGGAAATAAAATATATAATACACTTTATTATGGAATCTGAAAATATTTTGTTATTTGTTTTCAACTGTTTTACATATATTAAGTAATTTCTATTTTAAAA:1 - chr3L 15888037 5' + blood 6928 1 79.21 CACAAAAGTATGCAATAAAAATATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 - chr3L 14603344 5' - jockey 4979 1 60.23 ATGAACCAATGCTTGGATGCAGTGGAAGTTCTCTGAGGTTATCCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 - chr3L 26644803 5' - HMS-Beagle 217 2 55.45 CTCGACCGGGGTCTTGGATAGTGTTCTGTGTTGTCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGCTC:1 + chr3R 4484122 5' - invader1 369 2 61.19 CGATAAGCAAACTGTGGAAATCAATTTTGCTGCGTTGTTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAA:1 + chr2R 11741001 5' - roo 8756 2 62.38 TTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3R 14688324 5' + pogo 25 1 53.47 TCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 - chr3R 13423343 5' + 17.6 43 1 80.41 TAATATTTGTAGTTATCGTCGGAATCTTGTATATGTCGAAGAGTGACTTTCAGCTGATCGTTATTTTCGCCGATGGTCTTGAGTTTCCGTTTTATTTATTT:1 + chr2L 21656628 5' + Gypsy12A_LTR 244 1 71.29 TGATGATTCTGGTCCGAGGAGAACCGAAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATTATTGACTATAGTAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTC:1 - chrX 12635940 5' + Doc 152 1 73.27 AAGAACTCCAGACAGACAAATGTTTTTTAACGATCGTTGGCGTCAAGCAATTTACAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 + chr2L 17447611 5' + FB 23 1 61.39 GCGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr2L 13060336 5' - P-element 2859 1 51.49 TTAAGAATCTGGCCATATCAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGT:1 - chr3R 1206473 5' - I-element 5344 1 67.33 CTCAAAGTAGCCCACTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAAT:1 + chr3L 543444 5' - P-element 2825 1 17.82 TTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACG:2 + chrX 23431786 5' + Stalker2 31 2 55.45 GTGGAAAGTGGGCGATGGGTGGTGTCTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:2 + chr2L 2920905 5' + hobo 51 1 74.26 GTTATCATGACTACTACTGCTTGTTTATTTATTTAAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAA:1 - chr2L 12074537 5' - Juan 4165 1 72.28 GCTGGGAATTAGAATGGATTGGAGTGAGAAGGATAAGTCGGTAAAGAACAAACAGTGGAAGCGTCGG:1 - chr3L 10014944 5' + gypsy8 467 1 68.66 CTTTCACTTTTCCCCCTTGCAGACTCTTCGGTTCGCTGCCGAAATACACACAGCATCTTCCGATCGTAGGATTTTATAACAATTAACGTTTCTTAAAGCTA:1 + chr3L 15600394 5' - mdg3 5184 1 55.45 TACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chr2L 13250360 5' + pogo 26 1 57.43 CGCGGGAAAAGGATGAGCTATTAAACGATCAAGCTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACT:1 - chr3L 12861901 5' + I-element 198 1 67.33 CACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chrX 14525254 5' + hobo 27 1 54.46 GATACTGTTGTCCAAAACTTAATGCATTCTGAGAATTATCACTGGAGCGCCGTGGAACCT:1 + chr2R 3090900 5' + Doc 4377 1 55.00 CCGCAACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 - chr2R 9014500 5' + blood 7027 2 63.37 TAAATGTCATTGAAAACATATTTTAATTAAGAAATAGTTGGCGATCATGAAATATGCTCTTTTCTTTGTTAGCTTTAAGCAGTTCGTTTTGGACACTCATA:1 - chr3R 19549003 5' + gypsy3 127 2 63.37 GTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCT:1 - chr3R 29350786 5' - opus 7478 2 54.46 TAATATGCTTTCTAAAAAGTATGCTAAATATTTGATTAGTAGCAGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr3R 31884206 5' - 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chr2L 10128698 5' - INE-1 146 1 61.00 ATTCTATTCAGTAGTTCAAGTTTATTAGTTCTCCCGTTCACCTTTATACCAAAGCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAG:1 + chr2L 17889567 5' + accord 497 2 55.45 TTCGAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGT:1 + chr2R 6984295 5' + HMS-Beagle2 3 2 76.24 TTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr3R 6147271 5' - copia 5075 2 72.28 ATTAATTAGCAGAAAAGCCAAAAGGAGAAAGAAAAAAAAAA:1 + chrX 15523873 5' + Doc2-element 239 1 60.98 AGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTA:1 + chr2R 22395214 5' + I-element 43 1 61.39 AAACAGGAAAATAATTACACCCTCTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACT:1 - chr3L 1078962 5' + I-element 54 1 76.24 CTGCGCTCACGCTCTCGCCGGCAAAACTCTCCTGTTCTCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chr3R 28326788 5' + P-element 6 2 74.26 ATATCAACATAAGACACATACACAATCACATTTTGGCATTGATCTAAGTTCTTTTTTTTATTCCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTA:1 - 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roo 9054 2 59.41 ATATATGTATATATATAAACTTTTTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 + chr3R 15191221 5' + opus 7033 4 67.33 GACTCGTGATCTAAGTTGCTTTTGTACTTTTAGTTTACGTTTAATATGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chrX 4009348 5' + 412 29 2 56.44 AAATGTTCCTCAAAACGAAAACCGAAATACAAGCACAAAGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATATATAGTCTTGATCAGGATCAATAGCAGAGTCGATC:1 - chr3L 3759365 5' + INE-1 96 1 68.32 TATTAGAATACTACCTAAAATACATTTTTAATGCTATTATGTTATACATTCTGTTGTTTGATCTTTAATAATAATAATAATTAATTAATAATTAATAATTT:1 - chr3R 18808235 5' - Tc3 263 1 68.32 GCAAAATTAAGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATAAACAGCGTGGACAGCAGCACACCAACAGGTTCAACCAGTTTCGCCTGCGTTGGCGCCGA:1 + chr3R 17635641 5' - R1A1-element 481 1 41.58 GCCATCATCATCAACAGCAAAATAAAAATAAAGAAAATGAAAAACAAGTTCAAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTAC:1 + chr3L 1001863 5' - copia 5007 2 46.39 GGAAACTTTGCCACCGGATACCTTTGGAGCCGCTTACGTAAAGTTTCTGAAAGATAATGTAAGTAGTTCAAAGTTGTTTGTGAGCAACCGTGGGTATTCGT:1 - chr3L 17429891 5' + looper1 379 1 72.28 GCAGATAAAGCTGTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr2L 2437686 5' + roo 8674 2 67.33 TTTTAGAAAAGATATTACTCCACGGACTTAGTTATACACTCTTCCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2L 3694091 5' + roo 8695 2 56.44 GGACTNAATATCTCATTCGTGAGCTTCTTTTGGCAGTGTGCCCCAAAGTATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 + chr3R 23617974 5' + jockey 4787 1 51.49 CATGGTCGGATACCTTAATGCAATGACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTA:1 + chr3R 16626803 5' + I-element 5308 1 75.25 TTAATTTGCATATGGGGAGGATTGCGGGAGGGCGGCGATGAAAAATTATTCAATGGGTAATAAATCAAAAATAAATTGTGACATAAGAAGACAGAAAACTA:1 - 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chr2R 24965103 5' + P-element 60 1 19.80 TTGATGTTTTTTTAGTTTTCAGGTTATCTATTTCATACGTATTTTATTTAAAGTGCTTTACCTAAACCTTAATAAATATATTAGTTGCATTTATAACAGTA:1 - chr2L 16552130 5' - roo 8602 1 81.19 GGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3R 28728348 5' + jockey 30 1 55.45 ACTTAGTTATACACTCTTCCTTGGGGGTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 3694116 5' + roo 8689 2 68.57 GTTAGCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr3R 13375942 5' + 1360 6 2 71.29 AACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 17394623 5' + jockey 36 1 51.00 CAGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGC:1 + chrX 14317409 5' + 1360 97 1 71.29 AATCGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chrX 4488924 5' + 412 7094 2 65.98 TACGTGGTCTTGAGTTTTCTTGAGTGAAGATCGCGAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 - 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P-element 431 1 49.50 CACAGCCATAAAGTATATTAATAACTCAAGAACCAAACCCGATAAGATCATAATTTTTAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTT:1 - chr3L 2820234 5' + Juan 3810 1 59.41 AGGGGGCGTGTTCAAGCTGCTCGGGGCGGCTTTTTATGCACACCCAGGACACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTC:1 - chr3R 18960500 5' + hopper 25 1 55.00 AATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3L 14910590 5' + roo 8715 2 77.23 CTGCAGATGGAATCGAGTGCAAGCCGAATAGTCGAACGCGTGATACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 - chr3R 12091832 5' + HMS-Beagle 26 2 52.48 TAAATTGCAGAACTCTCTGATACAGTTCAAGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chr2L 6252517 5' - P-element 2839 1 31.68 GTCATTGAGGCCTAACAATGTTAACAAAACAAAATAACATACGTTAGAACGAATTCGAATTTTTTTGTTCGTTTTTTTTCATTTTTTTTTTATTTTTTTTT:1 + chrX 3236737 5' + hopper 142 2 87.13 TAAACATAAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1 + chr3R 20845040 5' + 17.6 6951 1 59.41 AATATTAAAAGAAAAACGGTTCAGGGGTTGAAGTTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:2 - 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HB 1279 1 56.44 AATGTTCTGACTCTGATTTCAATGCACTTTTTTTTTACTTTTTATTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACA:1 - chr3L 17921204 5' + Quasimodo 28 2 59.41 TTTGCCGGCTAATACTTGAGTAATTTGTGTGTGTATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 - chrX 16517363 5' - hobo 2895 1 72.28 GAGTTGGGTTTTTGAGTTGAAGTGTAAAAAACACGAGCGAATGCTATCGTCGAGTTTCCCTGCTATCAGATACCAGTTACTCAGCTAGTGTGAATTCGAAC:1 - chr2R 4580906 5' - INE-1 530 1 79.21 CGCGAAATGAATAATAAATATTATCTGTATGAATATGCGAAAATAAATTCGCTCGGAAAATTTACTAAAATGATAATTGGCGCCCAAACGGATATAAAAAC:1 - chr3R 20238977 5' + Burdock 277 1 62.38 GTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATA:1 - chr2L 17957287 5' - opus 7457 2 75.25 AAAAGGAAATTCCTAATATAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAATGAATAAATTGTAAAATAACTATATTAAATATTAGT:1 + chr3R 19447916 5' - Cr1a 4306 1 81.00 GCTACCAGTTGCTACTTTGCCAGTTTGCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3L 3671260 5' - roo 404 1 75.25 GCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr3L 11435581 5' - roo 9039 1 59.41 ATGCANTAGGAGTTTATTGCTCCTCATAATGGTTGATAGTAAACTGTGATCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAA:1 + chr2R 7840459 5' - jockey 4871 1 54.46 CGAAAGCGAAAGTGCTGCATGCGAATGAAAATTGGTATTAAGTGCTGAAAGAGCGCTATATTCCAGTTAATCGACTATAAGATACCCGTTACGCAGCTAGT:1 - chr3R 7432783 5' - INE-1 542 1 54.46 AGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGT:1 + chr2L 15956019 5' + Max-element 17 2 62.38 GGGCTTTGCATTGACAGAAAATTAGATTTAATGTTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chrX 2997033 5' + Ivk 45 1 69.31 GCGGGAGACTTATGCCCTTTTAGGGCATTTTTGATAGTGACTGATTTAGAGCAAGCCGAACCATGATTCATAAACCTGGGAAGCCTGAAAAGAACCCTGGT:1 + chr2L 11308150 5' + BS3 409 1 66.34 TTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGG:1 + chr3L 2292072 5' + Max-element 25 2 52.48 GCACATACCTAATTTATACCTCTATATTTAAGATTTTAATATTTTATAATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1 - 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F-element 4328 1 71.29 ATTAATTGCTAGCGCATAGAATACATCAAAATACCCACACGGTCGCAGCAATGGCAGCAACATCTGAAACAACATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chrX 4796922 5' - copia 250 1 73.27 TGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3R 14639358 5' + roo 49 2 74.26 GAAATTTGTGTATGATTACCCAACAAATTATTAATTTAAGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 + chr3R 6431028 5' - 3S18 305 2 58.42 AAAGTTTCTGTCTATTCTATTCTGGCTCCTAATGAAGGCATCAAATCCGAAGGCGACAAAATGTTTACCACCATTTTTTATAATTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 13234896 5' + Tc3 86 3 78.22 AAGACTGCCAAGGCTTCTGGTTATTCAAACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTT:1 - chr3L 2612800 5' + G2 2719 1 72.28 CATTACACGCCGCCCGCGCAACTTACAAAAACAATAACATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCG:1 + chr2R 3563736 5' + 17.6 367 2 75.00 CGGAAAATGACTGCCGACGGTGAGGCAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr3R 20884966 5' - flea 228 2 56.44 ACAATAAAATTACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chrX 7787231 5' - 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chrX 12857881 5' + 297 47 2 77.23 ATACCCTACCTTTCGTTTAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAAC:1 + chr3R 19176356 5' + P-element 464 1 24.75 GTCTCNCTCGTGTGATAAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr3R 29350797 5' - opus 7489 2 64.36 GGTCACTTGGCGCCACTGATAAAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTT:1 + chr3R 19467892 5' + Transpac 50 2 79.21 CATTTGACTCATAGATTAATGCAGATGCCGAAAAGGGGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCA:1 - chr3R 21386160 5' - 412 7442 2 63.37 AGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3R 10457273 5' - roo 9039 1 58.42 CAGAGCCTCAATGAGCTGGGCTGTCTTCGAACCTGGCGGCCACGGTTCTGATAAGATTCGAGCGCCGCCGCGCTGTTTATTATTTACCGTTTGAAAGCCAG:1 + chrX 4112934 5' + gypsy10 5570 1 73.27 ACTGGTTGGGCTCGGCGATCTGTCCTCCAGCAATCGTATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGCTCCACCTATTGGTAGCGTGCACTAA:1 + chr3L 6062722 5' - R1A1-element 274 1 75.25 TGAAGCTATTTCCCAGCATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAATCTACAA:1 + chr2L 22921235 5' + copia 6 2 77.23 TGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCT:1 + chr3L 15056316 5' + BS 5031 1 77.23 GTAGCCAGTGGTGGTAATGGTGGTGTCCGTGTTGGTTTCACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATA:1 - chrX 19871286 5' + I-element 4913 1 46.53 TTTTTAAATATTTTCTCTTCGCTGCATTCTTTTTCATAATTACATGGCGACCGTGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCGTGTATGTG:1 + chr3L 15698619 5' + Stalker 443 1 63.37 TTTTAGTTTACGTTTAATATGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chrX 4009321 5' + 412 7109 2 83.17 ACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCT:2 - chr3R 9952263 5' + Ivk 15 1 63.37 CCATTGTGGGTCAATGCCTTTGTCAACTGCAATTTCTGTGTGCAGAAAGAGTGGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGGTAATAAAGTCTCAAAA:1 - chr3L 1813232 5' - mdg1 391 2 55.45 AAGGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTA:1 + chr3R 25796000 5' + BS 5009 1 61.39 GTAAAAGTGAGATAGCAAGCTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr2L 18694167 5' - P-element 2858 1 50.50 AAATACTTAAAGGGAACTCAATTATTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr2R 10863972 5' - mdg3 5474 2 54.46 CAACTAGGAACGCAATATGCTAAGTTACGTACATGTAAATCAACATTTACATTTACATACATTTACGTTATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 + chrX 17247252 5' + F-element 20 1 44.55 TACCCATTTGCCTTTTTCATCGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2R 24493642 5' + flea 4763 1 71.29 AATAACAGAAACGCCAGCAACAGCATTTGATAAAGTTTTGATAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 16980912 5' - roo 9036 1 63.37 TCAGTGTCCCTTTTCTTCAGCCTATTTGGCTTCTTTTGTTACTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr3R 10818451 5' + 412 18 2 56.44 AAGTTAATTAAATAAATAATAAATTAAATATTTTTTAAAATATGTATACATATTTCTTCAAAACATTTCGTCTTTAGATACATAATTATTATTATTATTTA:1 - chr2R 12991619 5' - invader6 4389 1 52.48 AGTGGCCTTATCGATTGGAATTTGTTGCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 7101083 5' + pogo 12 1 67.33 TTATAGTCGACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 + chr3R 9657674 5' + BS 11 1 58.42 AACTTATGGAAATGCTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTA:1 - chrX 21668157 5' + Stalker2 9 2 70.30 AAAACCTGAAATACCCCTATTGTAACTGAAGCGTAGCCGATAAGAAGGTGGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAA:1 + chrX 10731261 5' + P-element 2590 1 52.48 AGCATTCCATTGCATAAGATGAGTTTCTTTATTTGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATT:1 - chr3L 27412241 5' - Stalker4 7231 4 81.19 CACAAACACACAAACACACACACACACAACCGCAACTCACGAACAGGTATGGGATACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCG:1 + chr3L 5132044 5' + F-element 33 1 49.50 GATCTTAAATACTCTTATTTCGGCACCAACTGACAATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chrX 495253 5' + 412 15 2 62.38 AACCCTGCACTTGAAAAAATACCCGACTAGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAA:1 - chrX 20886066 5' - Ivk 5376 1 64.36 TAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chrX 12546507 5' - P-element 2863 1 55.45 CTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTT:1 + chr3R 20466648 5' - roo 373 1 60.64 ATAGAACTTAGAGGGGTTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATC:2 - chrX 17204147 5' + Tabor 6876 2 58.42 CTAAATTTTGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 21501002 5' + roo 23 2 57.43 GGATATGTAGAAAGAATGCCAGGCGGTGTGAAGACTTTTAATGTGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAA:1 + chr3L 8743195 5' - 1360 145 1 57.43 ACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 7787250 5' - roo 355 2 76.24 ACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTCCTGATGGAAAGCGCTCCTCCTCCATGCAGCAAAAGCGACAGAGTTCACTGTCTGCAATGCCAATCTTGTGCAAATGGC:1 + chr2R 737665 5' - baggins 5165 1 64.36 TTAAGAAGTTTGTTCGCACCCAAAAAGTTGAAAGCAAAAATATGAGCGCATCCGACGCTTAAAATCAGAAGCGAGAGTTTCATTCACCCACATATCAAACT:1 + chr3L 11919918 5' + Porto1 283 1 66.34 CCTTGCCGGTACGTTCCAACCACGTGGATCCGCCATTTCTGAATTTTGTCCTGACTCTTGTTAGCATAGCAGGTGTTATGTTGGCCATTTCTTCTTGGATG:1 + chr2L 10585491 5' - mariner2 670 1 66.34 AACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 12452145 5' + 412 34 2 58.42 ACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAAATCCCAGCTCAATAGGCTCCGTG:1 - chr2L 21403532 5' + G5 4423 1 67.33 CGATTTGCCCATAAATTCAAGTATCGAAGAAGACGTCGACGACTCTTGCAACGACTCAGCAAGAGCCTTGAAAAGTACATGTCGAAGAGTCATCAGGATGC:1 - chr2R 19403824 5' - invader1 4011 2 75.25 GGATACGTTCTTAAAATAAACCCCGCTAAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATG:1 - chr3R 15943356 5' + jockey 4649 1 65.35 GCCCAGAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr2R 5849952 5' + jockey 10 1 72.41 TTTATTTAATATGCCCGTATATTCCGTATTTCCCAACATTGATGGATTCGAAAGAGCGCAAGCATCCGTAACAAGTTGGCTAACACACACACACACACACA:1 - chr2R 13669645 5' + Quasimodo 36 2 66.34 AAGGGGGGTGTGCAACCCCCAAGCAAAGTGCAGAGCACACAAAAACCCCATACACACACCCACTCTCTCTCTCTTTCTCTCT:1 - chr2L 1663375 5' + Cr1a 296 1 75.61 TCGGCTGGGTACGTATGTATATTAATTCCGGTGCAGCAGGAGCAAAAGCCTGCAGGTGTCCGTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3R 25823626 5' + hopper 11 2 64.36 TTACACTCAAAACATACACTCCACTGAGAAAATTTTGATAAAAGCTAAGAGAGTCTTCTATACAGATTATTAAGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 10444297 5' - roo 9050 2 74.26 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGCAATTTATGTTTTAAATATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATAT:1 + chrX 12649915 5' - blood 7165 2 43.33 GTGCTTAACTGTAACATTTCAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCC:1 - chr3R 13447073 5' - P-element 89 1 32.67 CTTCAGCTCAAGCAACCACTTCAAGCTTCCATTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACA:1 - chr3L 3208561 5' - R1A1-element 5011 1 69.31 TGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGA:1 + chrX 10251736 5' + flea 33 2 63.00 AGGAAGGAGTTACCGCCTCAGCCCTCGGCGGCCCCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTTTTTGTTTTAAATAAAAG:1 - chr3L 27414764 5' - transib2 2632 1 65.35 GCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 - chr3R 27080785 5' + HMS-Beagle 6836 2 67.33 CGGTCAGCGGCTGTTGGGAAAACTCATCTGCATTACTCGCTATCATATGGTCAATTGTGGGTGTCGTTGTTGTAATCTCTTCAATGTGGAACACGCCACGT:1 + chr2R 19404345 5' + R1A1-element 5301 1 57.43 ATTAACTCTTTTAATATTCGTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAT:1 - chr3R 28090255 5' - Stalker4 55 4 80.20 ATTATACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCG:1 - chr2R 6869095 5' + springer 7160 2 56.44 ATAATTATTTCTGAATCTAGCATATATTTTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAC:1 - chr3L 17932681 5' + 1360 3199 1 71.29 AAAATCAAGACTCTGGGACTCATTTTGTGACTTTGGAGAAGTAAAAACTGTCTCTGAAGATTTAACAATATATTTTTAAAGCTTATTTTTAATTTCAATAT:1 + chr3R 6849070 5' + hopper 187 1 68.32 TATTGNTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGC:1 + chr3L 21841313 5' - P-element 2838 1 29.70 TTTAGCTCAGTCTTTAAACGAATGTTATTTTGCTTTCCCAATGTATCTTAACATATATAGTTTGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 20838688 5' - 1360 3375 1 65.35 CAAAAAAAACAGTCAGCACGCTTTTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGC:1 - chr2L 13566972 5' + FB 53 1 79.21 AATGCCCCACGAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 - chr3L 958805 5' + P-element 41 1 38.61 ATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATT:1 + chr3R 27080712 5' - HMS-Beagle 7002 2 56.44 CCCGCTTACTAAATGGAGAAGAATCAATTTGCACTAAAATTCTAGAAAAAAAAGAATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCT:1 + chr2R 617155 5' + diver 21 2 58.42 TATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 + chrX 19306754 5' + P-element 33 1 46.00 CGCTTCGGTTTTTGCCTTCGAAATCTACATATTATACACAAGTCACCCTTTATCTTTGTTTACATTATCATTTGTCTGCAGCTTCAGCGGAGCTTATCAGC:1 - chr3L 17695780 5' + 3S18 5839 2 63.37 AGCTGACCTAATTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 - chr2R 21848617 5' - Juan 4181 1 62.38 GTAACAAGATAGTTGCTGCTCATGGTTAATTGTTTCTGTAGTTTGATATGTGGGTGAATGAGAGGTAGGAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCT:1 + chr2R 20093445 5' - Porto1 243 1 74.26 TGGAAAACCGCCAGGGAATTAGAAGTTGGGTGTGCCCTTTTCGCAAAGAGTACTTTCCTGCGCCAAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAG:1 - chrX 4409714 5' - 297 6872 2 65.35 CTACGTAACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:2 - chrX 21401926 5' + roo 8696 2 60.40 ACACACAGGCAGGCACACAAACACACGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAA:1 + chr3L 8825270 5' - flea 4969 2 73.27 GCACCTTCTTATGCATCTGCATCGAATTAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 7304419 5' + Doc 4701 2 87.23 GGCCANATAACTGAGCGGCAATCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTAGAT:1 - chrX 2365117 5' - Stalker4 7177 4 56.44 TAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 20466706 5' + roo 8696 2 59.41 TGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 - chr3R 13715151 5' - P-element 2858 1 50.50 TGGGTGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 1828786 5' + 412 7100 2 70.30 AAACCCATTTAACTGCGCCCTTGGCTAGCCACCCCCCTCACTTTCGACGCCCTTGGACCGCCTATTAGCACATTTCGGTTGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chrX 2589633 5' - copia 255 1 79.21 GTAACCCACAAAAAGGTAACCAAAACCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 - chr3L 21203051 5' - pogo 2053 1 72.28 ACCTGCCGGCTGGAATGGGTTTAGGATGTTATGGGGCATCGTCCCCGGATTCAATGGTCTTAGATGGTTGTTGACGTTTGGCTTTCAGACGGTAGACAAGA:1 + chr3R 1450232 5' - gypsy10 5568 1 62.38 AACGGATTCGCTGGAATAGTGATGCAAAATAAGCTCTAATTTTTACAAAGTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:2 + chr3L 11435549 5' - roo 409 1 67.00 CATTATCATTAGCTTGCGTTTTTATTTGTTACGTTTTTCCGGATCTTTTTTAACTCTTCTTTGTATACTACTATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGG:1 + chrX 12729495 5' + gypsy10 4 2 71.00 GGCGCNAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:1 + chr2L 6255775 5' - flea 4972 2 67.33 GTTATAAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chrX 14525244 5' + hobo 17 1 64.36 TATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chrX 5443943 5' - mdg1 7416 2 68.32 ATCGTTTTCTTAACATCCAGCAAAATATCAAACTTCGCACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGAACAAATATTGTGAGTTCTATAAGAGTG:1 + chr3R 6437016 5' - gypsy4 294 1 69.31 CTCCTCGCCCTCAGTTTTTCAATCCCCTCCCCCCTAAACCTCCACGCTGAGCCGCTAGTTCGTTGTCCCCTCATGTTGCAACAGTGTAGGCGGAAACAGCT:1 - chrX 12852442 5' + gypsy5 161 2 75.25 CAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 19857409 5' + 297 6602 2 59.41 CTGGCNCACTGCGTCAAAAGGAATTATACTTGCATCGAAATTCTTTAGGTCATTGAATGTTTGCATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 + chrX 20364211 5' - opus 492 2 72.28 TAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr3R 26469452 5' - hobo 2894 1 79.21 ACATCAATACTCCACTTATTACTGAAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 9946894 5' - roo 9055 2 47.52 CTCTCTCCATCTCCCTTCCAAATAGTCGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr2L 8031243 5' - P-element 2865 1 57.58 GCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 3671336 5' + roo 52 2 80.20 TCGAAAAGTAATTTATAGCATTTAACGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATA:1 + chrX 868681 5' + jockey 4914 1 73.27 GGCAAAATGAAACAAAAAGAGAAACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTA:1 - chr2L 9549001 5' + I-element 5018 1 77.23 AACTTTACCCGCTGTGGACGGATCGACGTCCCCGTGGGTGTGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCA:1 - chr2L 22181452 5' - Rt1a 4858 1 59.41 AATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 + chr3R 11516611 5' + roo 44 2 72.28 CTTTCATAAAATCGGAATCCTCATTACTCATTTACCATTATGTTTCGAGGAAGAAAATAATGAGAAATTTGTTGCTAGCGAAACACCGGTGTAATTGTGTT:1 + chr3R 2744723 5' - Gypsy12A_LTR 1981 1 54.46 AAATGGGGCCAAATCATCTATCGTTAGGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 + chrX 12294680 5' - blood 356 2 57.43 ATATGTCGTTGTGAAGTAGTTCTTAGGCTGGGATGCAGCTCAGTCACGCCATGATCTCTTCACAGAAAAATCTTTAAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTA:1 + chr3R 1864886 5' - G4 3665 1 70.30 TCACATAATTGGTGTCAATTTCGAGTGCAATAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATAC:1 + chr2L 12074502 5' + Juan 4062 1 58.42 AAACTGATGCTACTATTGAATGCTACTAAGTTTACTTAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 + chrX 14531493 5' - 412 7516 2 57.73 AAACATTTAATATTAGCAATAAAAGCAAAAATTTGTCTTCGTCTCCTCCGTTTGAATATGAAATAATGAAATGAAAATAAAATAAATATTGTTTAATTCAA:1 - chr3L 18545078 5' + S-element 1608 2 53.47 AAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGT:1 + chr2R 1320673 5' - diver2 4887 2 61.39 ATATGATAAGTACATTTTAAAGCTAATCATCCAGATTTTTGGATTTCTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCG:1 - chr2R 17927486 5' - R1A1-element 5029 1 52.22 CGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 - chr3R 9952260 5' + Ivk 18 1 60.40 CAAAATAAAAAAAAACTGAGACTGCAAACAACATTGCGATTTGTTTGCCGATATATGAATTCATACATACATACATACTATATATGTATGTATATATATTC:1 - chrX 11541562 5' + 1731 4411 1 74.26 TAATTTTACAGCTCCAGTGGCGGGGGCTTTTAGCAAGGGGAGCCCCGCTAAAAAAAAGATAAAAAAA:1 - chr2R 13378265 5' + G-element 4324 1 86.57 CATTTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCA:1 - chr2L 17889372 5' + accord 55 2 77.23 TAAAACTAACTATTTGTACAATTGCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:2 + chrX 18012650 5' - roo 406 1 76.24 TCAGGAGCTACATTTTCGAATATCAAGCAGCATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATT:1 + chr3R 2555515 5' - Bari1 1661 1 70.30 ATAATCGAATTTTCTTTGGTTGTGTTTTGATTTGACAAAGAATGTATGTGTATGAATGTATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 + chr2R 5784303 5' + 297 6594 2 66.34 ACTTAGCGGCGCCCGCTGCCTTGAGTATGAAAAGTTTCACTTTCATCTGCCAGCCAGAGTCTTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 21111227 5' + jockey 22 1 60.40 GAAATCTAAAAAAAAAAGGCAAAAAAAAA:1 + chr3R 18725356 5' + Doc2-element 233 6 89.66 CGTTGNTTATAAACTAAATTGAGAGTGGTGATCATATGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr3L 11070557 5' + P-element 38 1 36.00 ATCAATAGCAAAATACATGATAGGAAAGTGCCGAACTTCGAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGA:1 - chr3R 2207533 5' - 1360 173 1 70.30 CGACTCTTTTAATCATTTGCTAACCTGAAACCTGATTACATATATTTGTTGTTTTTAAAATTTTTTGGTCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTT:1 + chrX 14796824 5' + transib2 5 1 74.26 GGGGTTTTTCATATTCAGATTCCATTTTGGAGGCCCATGAATGAAAATTCCCCAACCTGTAATTGCCTGTTGGCAATTTGATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3R 21959715 5' + roo 8725 2 71.29 CAAAAAGGCGGCCACGACGGATCCTCTGTTGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chrX 1954457 5' - Tirant 354 2 71.29 ACAGAGAATTAACATTCCAAATCGAATTGGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 + chrX 13548720 5' + blood 6 2 68.32 AATGCNACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 19450179 5' + roo 8712 2 55.45 TCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACAT:1 + chr2L 514863 5' + 3S18 38 2 61.39 ACGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTG:1 + chr3L 17869908 5' + 1360 25 1 50.50 TTTGCGGTTGGCTTTGGCTTTGGCCGCATCAACACATTGGTAATTACGAATGTGGATCGCACCGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAA:1 + chr2L 15344116 5' + transib2 13 1 66.34 TGAGCAATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 326114 5' - roo 9058 1 65.00 AAAGCTAATCTCTTCTTGATCTTAAAATTTTACCAGAATCAATAAATTATCTTCACAGTTGTTGAAATCCATACAAATTAATATTTCTTATGTATATATTT:1 + chr3L 11012368 5' - transib3 2640 1 45.54 ACTACTCGAAGGTCCGAGAAAGAAAAGTGGCACATTCTAAGGTCACCAAATTAGCTGATGGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 + chr3R 22079709 5' - pogo 2088 1 63.37 ATTACAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 24965069 5' - P-element 2851 1 44.55 AGCATGTGTGTCAGACCAGCCCGTACTTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chr2L 11065944 5' + P-element 22 1 57.00 ATTCCGTTTTAAACCCTTTACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTT:1 + chr3L 5716881 5' - copia 220 1 65.35 AGATTAGGGCAAGTTCTACCTTTACCTTTCGGCTTTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr3R 18960404 5' + hopper 11 2 66.34 AATTTGCTCAAGATGTACGCACTCAAATTAGTTTAATAAAATTAAAGTCAATTTAAGTGAATCTCCTTAACATGCCTGAAAAAAAAAAGTTAAAGAAAAAA:1 + chr2L 17765041 5' - Tc3 78 1 74.26 TCGAAGAATTAAACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3L 13994261 5' - P-element 2848 1 38.00 TTTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 + chr2R 9375163 5' - HMS-Beagle 222 2 58.42 TTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr3R 24152912 5' + P-element 49 1 31.68 AAGTTGGGAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGAT:1 + chr2R 9387308 5' - Stalker2 388 2 63.37 GAGTTGGGTTTCAGGGTCTTGGATTCTTATTTTTTCCCTGGTGGGTTTCGAGTGGATCATCACCTCCAATTCGCTGCTGCTCTTCTTTCTTAAGCTCGCCT:1 + chrX 13843445 5' - gypsy7 89 2 61.39 TGATGGTTATGATCATCATGCAAATTAATAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAA:1 + chr3R 21500919 5' - roo 9045 1 51.49 GAGCACGAGGAACTGACCTCATTTATGCAACTACGTACATACATATAGCCATGCATATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAG:1 + chrX 15195207 5' + Transpac 12 2 68.32 TGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 29432754 5' + 297 39 2 68.00 GCGAGAGAGGGCGAGAGATGATATGAACGGCGACGGCGCATCTCTCGATTTCTTCGAGTCCAGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGA:1 - chr3L 6789751 5' - gtwin 395 2 73.20 AAAGCCGCCGGCACTTGCGGCTTTATTGTTGGCATTGTCTAACATCTTTAGCCAGTTGTCTTTTTCCTTTTTGTTTGAAGTCTCCTGGCCTGACGGCGCCC:1 + chr2L 19685869 5' - Osvaldo 1494 1 71.29 GCTTAAAGAAGAAATTCTTAATCTTAATCAGGCCATACAGTGGGCAAAAGCAAAAATTTTAATATGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTATTTGAATTAAAT:1 - chr2R 2875186 5' - TLD2_LTR 97 1 49.50 TAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr3R 19144387 5' + Juan 9 1 59.41 TCGGGTGGATAAAGTGGTTTGATTAAGGGGGATGTGGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGA:1 - chr3L 18786521 5' + I-element 383 1 64.36 CTTATCCTTTGAATGGGTTTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2R 10912089 5' + 412 28 2 52.48 AAGAAGGTGCAGAGTCGGCGGAAAAAAATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGA:1 - chr2L 18112606 5' + transib2 2548 1 75.25 TGGGCTGCGGTGCACCTTTCGTACTCTCGGACACGGACAACCACCCCCCCCCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAACGTCTTC:1 + chr3L 3980688 5' - F-element 32 1 57.73 TTCGAACTCAATATTTTATTCGAAATTCGACAACGTTCTCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2R 13038948 5' - P-element 2857 1 45.16 TTATTATGAGTCATTTGTGTTTTTCTGTTTGTTTGTGATTTGTGCAGTAGCTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATCTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTT:1 + chr2L 1766566 5' + Cr1a 197 1 73.27 GCTAACTTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 + chr2R 3919672 5' + 1360 40 1 62.38 CACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 - chr3L 22324314 5' + jockey 4707 1 65.59 TTGCAGCCAGTCGCACTCGCAGGCGCTACGGGGCAGGTTGCTTGATACGGCAGCATACGCGGCGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTT:1 - chr2R 16895638 5' - Max-element 8370 1 65.35 AACAGCAGTTAGTTGCAGTCATATGGTGGTCAGATGGTGCTCGACTATGGCCTTGCTGTTCTGCAGGCCGTTCGCATTCCAGACGACTAGGTGGAGCTTTA:1 + chr2L 20289026 5' - G6 1612 1 76.24 CCGTAAAATGTAATTATTAATAATTGAATTTTATATATGTATGCGTGTTTATACTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCT:1 - chr3L 22273583 5' - F-element 4576 1 57.43 AATGGTGGAAAGAACGATTTGGGAATTTTAAAAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGC:1 - chr3L 7808521 5' + jockey 5 1 69.31 AATATTCTGTTATTGTAATCCAAGTATACGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr3L 9772218 5' - 297 352 2 75.51 GATGACAATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 - chr3L 20248356 5' + Transpac 48 2 69.31 TTCATATTAAACATAAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chr3R 20845033 5' + 17.6 6943 1 64.00 AAATGATCGGCCTAACAGAACTTTCGCGAATTTTGGTGTCCGTCGAACCGGGGTTTATTTTCGCTTTCCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCA:1 - chr4 422137 5' + G2 2707 1 71.29 CTATCCTACGCCAATTTTATTTCGAAGAGCATGAGAGAGGGGGAGTTGCTTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAAGG:1 - chr2R 694430 5' + Bica 66 1 77.23 AGTTTACTTCATCAAGCGGATTACTTGTTAGAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 - chr2R 23945294 5' + BS 5038 1 69.31 CCTTCAGGCCACATTTGGCCCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3L 10811187 5' - P-element 2832 1 26.73 ATGAGTCACATGGAAAAAGCGAGCAGATAAAATGAAAACAAAGACTGAGTGACCATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTT:1 - chrX 4154993 5' - blood 7368 2 57.43 ATGTGTAAACACAACCGCACTAACTGCACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2L 21978113 5' - roo 357 2 73.27 ACACATGACCACACGGCAGTAGGATAATCTAGAAGAAAAAAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTT:1 - chr3L 4022827 5' - roo 148 2 60.40 ACAGTTTCTGACATGCCCCTCCGCACTGCCCCCGCCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCG:1 - chr3R 9105109 5' - Quasimodo 252 2 65.35 TAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCG:2 + chr2R 5617505 5' - invader1 3987 2 55.45 ACATTTAAAACTAGTAACACTATGTGTCTAGAAAACGTATAAAAACATTGACATTTAAGACTAACATTGCTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGCCA:1 + chr3L 3111143 5' - HeT-A 5748 1 60.40 AGGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 21978174 5' + roo 8685 2 58.42 CAATAATAATAATTTAATTTCCAGCCGCCGAAGTCGAGTCACTCAAGAAAAACACTTCTGTGGAAGTGGTGCGGAAATTTTCGCGATTCAAAAACAAGCG:1 - chr2R 23200612 5' + R1A1-element 110 1 65.00 GGTCCATAAAGTTAATAAACTATAAATTACTATCAAAAAACCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTT:1 - chr3L 18009625 5' - roo 373 1 59.41 AGCTCTAGTGGGCTTGATTCTACTTTGTGGATTATCCACTTGGGCAAGCAACTACAACTAGAAGGAAATTATAGCTTATAAAACTTTATACTGTTTTAATT:1 - chr3R 15509197 5' - transib1 245 1 71.29 TGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGT:1 - chr2R 5924414 5' - jockey 4733 1 36.63 TTTCCATTATGCTACTGGGAAATAAATAAGTCTGTAATAGAAATGATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr3L 17698184 5' - 412 456 2 56.44 ATAAATGCTGGGTACTTTATTTATTGATTTCCTTTACTTCCGTTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACAC:1 - chr2R 10412941 5' - R2-element 3538 1 58.00 CCCCTTCATCGCTTAGCGGATCTTGTTTGATCCCCCGACTAGAGCCTAAATAAAGTCGTGAAACTATT:1 - chrX 17811704 5' + 297 6883 2 76.47 TGGAAATTCCCAACAAGTCAAAGATCAGAAAAGATGTGGAGTATACCTGGGATTTAAATAGAATTTTGGGTTTTGTTTATTTTTTGATCTGACAACGCCTT:1 - 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INE-1 17 1 73.27 CCCCATTTTGTGCCACCCTCCTCCTTTAACGCCCACCCCCTTTTTTGTCCGACGCCCCTGCGGTTAGGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGCCGCGGC:1 + chr2L 6186901 5' + HMS-Beagle 6890 2 69.31 CCCGCNGTCCACTCTACTGGTCAATAGCTGCAACAGCAACCCGAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAACAACCACACCGGTAGCAATTCGAGTACTTGCTTGC:1 - chrX 19661430 5' - R1A1-element 5159 1 73.27 TGTACAGGATTAGGTTAGAAGTGTTTAGATGGCTGAGGGAGCCGACCGGATCAAGGGTCAAGGGCTGTAGGCACAATTAAGAAAATTATTCAACAAATGG:1 - chrX 21076237 5' - Tc1 1386 1 62.00 ATATGCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 31644191 5' + roo 47 2 76.24 GCTGCACGCCTTCCTTCTTCTCGGCTGCTGCAAATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGG:1 - chr2L 6775497 5' - blood 134 2 67.33 TACCGCTAAAGTTAAATTTGTTCATAAGCATTTTAGTTTGTATGGTAGATAATTTGAAAAGCGGCCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAT:1 + chr3L 24773723 5' + Chouto 5940 1 67.33 GGAGGCGCTCGCCAAGGGAATCCCCCGCTAATGTCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTG:1 + chrX 6921688 5' - I-element 106 1 66.34 GTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 8031405 5' + roo 52 2 79.21 CGCGACCCCACAAACATGAAATTGATGTATTGAAAAAGAGTGATTAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAACTCAATTTTCA:1 - chrX 6123151 5' + 17.6 7340 2 55.45 TGTTATTTTAATATGCTTTCTAAAAAGTATGCTAAATATTTGATTAGTAGCAGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACCCTACGTCCA:1 + chr3R 31884198 5' - hobo 2923 1 64.36 AGCTGCCAGAACAATTTGTCTCTCTACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 22920357 5' + 1360 9 2 70.30 AGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr2R 5084079 5' + F-element 39 1 55.45 GGTTATGATCATCATGCAAATTAATAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTG:1 + chr3R 21500923 5' - roo 9041 1 57.43 GGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATC:1 - chr2R 12213987 5' - Transpac 274 2 62.38 AATCAGATAATCAAATGCATCGCATCCTGACTATTCATATTTTATAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 + chr2L 3225576 5' - I-element 5336 1 60.44 CATGCTCAGCTGTTGCTTCTGCAATCCCAGCGCCCAACCACCTATTGCACGTGTTGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGAG:1 + chr3R 23971015 5' + R1A1-element 203 1 56.38 TCACTCGACGACGAGACAACCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 9370026 5' - roo 403 1 74.26 AAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2R 20702149 5' + Doc 51 1 73.27 TCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chr2R 21379510 5' - P-element 2836 1 28.71 TGGTGGAAGGTCAGGGGTCAGTTTAATCATGTGTTCACCCCCACCACCCACACGAATCTAAACTGACCCCTGACCTTCCACCAAAGACACTAGAATAATAT:1 - chrX 2113931 5' + Tc3 241 1 77.23 ATCGCAATGCTACCAAAGGAACTAAGGTTTCTTGATCTACGTTTCAATAACCCATAGCCCAAGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAGAGACCGCGC:1 - chr3R 7367448 5' + F-element 353 1 55.00 AAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr2R 20702150 5' + Doc 29 1 65.00 ATGGGAGCGACCACAGATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGGTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chrX 329097 5' - opus 499 1 72.73 AGCTGTTATATTACAGCTGACCTTAACTCGTCTACAATCTTTTTCTGTAGATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAG:1 - chr3R 28883446 5' + HMS-Beagle 6823 2 50.50 ACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 - chrX 8948674 5' + blood 7048 2 62.63 CGCCAAAGCCAAGTCAGGCATAATAAAAAATTGATTTTATCATTGCATTATTATTATTATTATTATGTTAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTT:1 - chr3R 16626846 5' - I-element 5324 1 61.39 GATTATTGAAATTTATTGGAGCGCTGCCACTGCACTGCGGTTTGTGAAGACTGAGTTTCTAAGTCAAGATCTTTGGCGGTAAAGTAATAGCTTTTGCCCAT:1 - chr3R 4728249 5' + transib2 487 1 76.24 AATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGC:1 + chr2L 1129076 5' + HMS-Beagle 6833 2 63.37 CATATCAATGGCAATTTTTACTACAAATTGATAATTCCATTAAGGGGGGTGTTCGTTCGGCTGAACATCCTAAAGCCTGACCTAAGCAGATTTGACTGCCC:1 + chr2L 13838707 5' + 297 6733 2 65.35 TTTTGAAATCCTTACATTCAATCATTTTTTCTGAAACATTTCTCTTATGGTTTTTTTTTTTATATGTGTAATGGAGTGGGCGGGAAGATTCCTTTGG:1 + chrX 7856560 5' - 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Max-element 159 2 63.37 CAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAAT:1 - chr2R 5084077 5' + F-element 41 1 57.43 GGAGGCCTCAGTAGTTGTGGTACTTTCGGCGTTGGCGCTCAAAATCGCAACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chr3L 11610206 5' + jockey 35 1 52.48 CACTTGGAGAAAAACATTAAGCACAAAACACAAATGTGCAAGATGAGTGAATCTCGAACTTCGCCGACCGCGAACTAACTAATTAATTGGCGCCCAACTCG:1 + chr2L 4126874 5' + springer 396 1 61.39 ATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGG:1 - chr2R 6869070 5' + springer 48 2 72.28 GAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3R 28728347 5' + jockey 31 1 54.46 ATAGGATATTTTCAATTTCCATTTGCCCGCTCGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTT:1 - chr3R 22919523 5' - I-element 5148 1 68.32 CACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAAC:2 - chr3L 5015872 5' + I-element 4951 1 55.45 CTTGGACTTCAGAATTTTAAACCATGTTCCCTGAGACATGTTCGAACTGTTTTTGTTTTGAGTCGAATAAACGATGCGTATTTGAACTAAGATCAACGC:1 + chrX 23108902 5' - Tom1 351 1 51.52 ATTTTAAAGTTGTAAAATCAAAAACTGTTAATAATTGTTCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCT:1 - chr3R 15920717 5' + BS 5072 1 62.38 TGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCG:1 + chr3L 25272577 5' + 1360 92 1 72.28 CCCTAAAGCAAAATATTTCAATTTTACAAGAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAGGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 9389026 5' + 1360 3 2 76.53 ACTATCCCACGGGAACTCTGGACTCCAAGGACATTGGCAATGGGAACGGCTGCTGGGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCT:1 - chr2L 3917122 5' - F-element 4458 1 57.43 CACTTAAAATAAAAGAAATTCTATAAATTCTATACACACTTAAAATAAAATAAATATATCATATTTATTTATAGATAGATATTTATTCATTTCTTAAGAAA:1 - chr3R 19494508 5' + copia 229 1 53.47 CATATTCAACTTATTCGGGTTTTTAAACCTTATTCTAAACTAACTAAAAATCATTTTATGAAATGATTCGTGCTGTGTGGCCTAACAAATTTAACGCTGA:1 + chr3R 15747337 5' - 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P-element 2853 1 48.51 TGTTTTTGTTTGTGCAAAGTATACTATTTTACGAGTTGCTCCAAATTTATGATGTGCACGTACATTTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGA:1 + chrX 17132433 5' + pogo 5 1 74.26 AATTGAAATTCCGTACAATTTGTATGTTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTA:1 - chrX 3193921 5' - Stalker 65 4 67.80 AGTTTTTAACAAGGAGATCTTGATTTCAATGTGTTCCTTTATGTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAG:1 - chrX 11234101 5' - Tirant 444 1 57.43 CAGACATATACGTATACCAAAAAATTCTGACCAACTCCCGCCACAATTTTTATAAAAGCAGGCAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTGAAATCAGACCA:1 + chr3R 13116317 5' - Cr1a 415 1 58.42 ATTGAGTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2L 13739989 5' + 412 7081 2 56.44 CAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chr3L 19215809 5' + roo 8711 2 72.28 GTCCGTGGACATGTTTCTTCTAAATACATTCTACATTATGTGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 - chrX 1235478 5' - P-element 2854 1 46.53 TGCTGATTAAAATAGTTTTCACTTTTTAATTACAATTTATGAGTTTCATTTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr3L 6466378 5' + I-element 60 1 56.44 CTGCGGCAGCGACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - 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P-element 2847 1 39.60 CGGCGAAAGAAAGAAAGAAATTTACAAAACAATTAAAAATGTTTAAAAATATCAACACATTTTTGGTAATGTGGGCGTGGCAGTTTTGGGCGGCTTTAGGG:1 + chr3R 15117594 5' - INE-1 348 1 59.41 GAGTGAAGCTAATGGGTAGCAGGGATGTTGGGGAGAAGAGGCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAA:1 + chr2L 1238798 5' + opus 7360 2 70.30 GGTACTTTCAATGCGATGCGATTGTGTGATGATGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 + chrX 6355944 5' - 412 7470 2 67.33 CGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 - chr3L 27415297 5' + transib2 34 1 58.42 TAATTTTAAATAAATTTACTATAGCTTTAAACCGTATTATTTTGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAAGTGGCAAATATATATAACCTACATATA:1 - chr3L 13921262 5' + accord 7273 2 59.41 TAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGCGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCG:1 + chr2R 1320677 5' - diver2 351 2 57.43 CATTAGGCCAAGAACAACAAAATCGAACAATATTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 + chr2L 2909548 5' - 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chr3L 21923444 5' - P-element 443 1 18.81 GGTATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCT:1 - chr3L 23869140 5' - gypsy 418 2 69.31 GAGCGGGAACCACCAGTTACGCACAGTGGCCAGATCGCACTGCGCCTATGTCTCTAGAATCTTTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTTTG:1 + chr2L 21345290 5' - INE-1 155 1 64.36 CGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr2L 11065878 5' - P-element 2846 1 40.59 AAAGGATATATAAGTGCAATATGAATGATATGAACTACTCGCATATTATCTTAGCATTTTATAGGACGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr3R 17368089 5' + roo 8673 2 64.36 CACATATATATTTATTGCGCCTCGTTTCAGTCAATGGTGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGGACGCCCATTTTTAATGTGATGGGGA:1 + chr2R 20087687 5' + Chouto 6310 1 62.38 TGAAATATTTACGCTTCGAAGGAAAGAAAGCTAGACAGACAATGATTTGGGCGGTGGCAAAAGTATTTAGACATCGAATTTAATTAGTTCGCATTGATCTG:1 - chr2R 16217282 5' + Tc1-2 230 1 71.29 AGCACNTACACGCACATGAATATGTACATATATATAAATGTATAAATATATATATAAATATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - 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hobo 2930 1 68.32 TACAGTTTAGAAAGTAAAATAGCGGTATGAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCCCTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACG:1 - chr3R 31458555 5' - jockey 4982 1 67.33 ACATTCAGCTGGCTCTATTAATGGATAATCACTTTTTTTTTGCAATACAGCTGAGTTTATATGTAAATTAAACAGCTTGTCTTCCATAGAATTC:1 + chrX 5014228 5' - pogo 1816 1 65.96 TGTAATTGCATTTGTGTTTGACCAGGGCAAGTGCCTCTATCGGTCGACTGCAGACACCACTATCAATTAGCCAGGAACCCACACCACTACCCTGAATCATG:1 - chr2R 23658207 5' + springer 425 1 78.22 ATTTGCCAAAAAGTTCACTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chrX 1954515 5' + Tirant 33 2 56.44 ATATAAAATGGTATGTATTAATATAAAGTATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAAC:1 + chr2R 21712743 5' + I-element 229 1 55.45 CAGTTNTCAAAAGGTTCAACAAAGCAAACAACGTCACACCTCAGTGGGTTTTTTTTTGTTTTTGTTATTTCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACC:1 - chr2R 18787730 5' + F-element 4399 1 75.25 CTGCTCTGTTCGCCGACAAAAAGTAAAAGAACTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr3L 833354 5' - P-element 2862 1 54.46 AGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr3R 7522377 5' - blood 7364 2 53.47 TATGTNAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 + chr2R 18295600 5' + I-element 23 1 53.47 TGTTGGCCTCGCAGTCAGAAGTCTGTTCCAAGCGGAGTTTTGTTGTCTCGGGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTATGTTGGGCGCCAGTTAATAGAGTTATG:1 - chr3R 13862301 5' - gypsy7 236 1 68.32 CAGAAGTCCATAAATGGGTCGTATCAGAGTGATCAGCAGCAGGCTGACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTA:1 - chr3R 24365622 5' - 17.6 7096 2 61.39 GCCAATAAACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:1 + chr3L 2292055 5' + Max-element 8 2 61.39 ATTATTTTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 + chrX 6997157 5' + P-element 19 1 60.40 TGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGC:1 - 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Cr1a 4155 1 66.34 GTTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:3 + chr3L 11435598 5' - roo 9022 2 76.24 ATTTGAAGATGGTTCGCAATAATTATTAAATTAAACATAAAATTAAAATCACAATTTTATAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTG:1 - chr2R 18958886 5' - accord 7105 2 77.23 AGCGCCACACAAGAGTCGGCATACGTTGCGACGTCGACTGCGGCAGCGACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3L 9692767 5' + P-element 5 2 70.30 GGCGCTGGTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGGCGCTGGTGGCGCTGGTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGTTGGCGCTGGTG:1 - chr3L 2805978 5' - TART-B 152 2 62.89 GTATTGTAAAATATTTTTAAAAAATAAGCCCTGACTATTAAAATATATTTATTTATTTCAGAGTGGAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGATTCGATC:1 - chr3L 7719019 5' + INE-1 96 1 46.53 TAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 10445191 5' - roo 9042 1 56.44 GCGAAGCACAAACTTAATAATTTTATATCTGTTGCCAAGAATATAACATAGCATTCTCGTACTTGGGCTGCGATACTAAGTCGTTTAGCTAGACTATTAGG:1 + chr2R 4879662 5' - jockey2 3108 1 57.43 GGTGGCTTTCAATTTAATACCAACTTGTCCTAGATTGTATAGCTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 + chr3L 11461341 5' - copia 257 1 53.47 AACTTATGACCGACATCTGCCCCCAAGTTCAGCATTATCGCATGTATTGAATGTTCTCATATGTTTTTC:1 - chr3R 16817523 5' - HB 415 1 49.28 ATATGATGTACATTTTACAAACAACTAAATATGTGGATCATGTCAAGATATTGATGCCATGCTCCCGTTCAAATTTCTAAATTAATTTTGTTATACAAAAA:1 + chr3L 11183514 5' + Juan 4067 1 81.19 CAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATA:1 - chr2L 12074400 5' + Quasimodo 38 2 71.29 TAGCTCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chrX 14531548 5' + 412 7097 2 73.27 CGAGATGGTTGGCCAGTCGATACAGGCGCTGGGGAATGCGGTCAGTCTGACAACAACAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACAAGA:1 - chr3L 19633171 5' + accord 52 2 59.41 GGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chr3L 15638296 5' - roo 9041 1 61.39 GTGGGGCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACA:1 - 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accord 186 2 75.25 GGGGGGTGTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr2R 22395203 5' + I-element 32 1 50.50 CCTGCTTCACCTTTCACCGCCCAGCCCGCCCACACAAACAAAACAAACTCAACGTTACTTTGTATTAACTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr2L 6252594 5' - P-element 2882 2 74.26 AAAGGTGGGCAAACTATCAAGTTTCTGATACCGTGGTGGAGATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGT:1 + chr2L 17986195 5' - Idefix 4 2 59.41 AAGTTGTGCCTCATGAAGCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:2 + chr3L 12452126 5' + 412 15 2 60.40 CCCCTGATCCGAGCTCAAATCGCTCACTTGGAGTGCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGATCAGAGATTTTTGTTTAGTACGTAGGCATAATTCTC:1 + chrX 2391130 5' + Rt1b 5046 1 69.31 CCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chrX 2050867 5' - 412 7496 2 70.30 ACAGTGAATAGCTTGCATTCCTATATTATTTATTTATATAATGGAGAATTCATTTGCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATG:1 + chr3R 29588984 5' + jockey 383 1 65.00 CCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3R 28326750 5' - P-element 2843 1 38.61 CAAAGCGAAAAAAAAATATTGCCATTAAATAAAAGTTGTTACTATACATACAGTATGTATAGTTGTTACTATACATACAGTATGTATGTATGTAATATGTG:1 + chrX 16139874 5' - 412 7273 2 69.31 TCGCTGGGGGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chrX 10621688 5' - hobo 2891 1 69.31 AAAAAGAAGCAGTGGCCGAGTGATTTAGTTGTCCTCAATGTCGACCGCTGCACTGAAAGATACTTTGTGAACTATAGAAATAAATAAATTAACAAATAAAT:1 - chr3L 19056745 5' + HeT-A 308 1 54.46 TATATTCATATTTCAGCTGAAGGAGATTGCATTGGGCAAATCCGCCAAAATTCGACTGCAGCGGATTCCTCTCGTTCTCTATTTTTATCAATAGTTCGTTG:1 - chrX 14963406 5' - Bari1 1237 1 63.37 GGCTATTGAAAATCCAACAACTGATAGCAGCAGTCGCTGCATACAAAGTAGCTGAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGCTTTGGG:1 - chr2L 15846709 5' + blood 453 1 57.58 ACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:2 + chr2R 22395219 5' + I-element 48 1 66.34 GGCCGATAAAAGTAATATCCTGTGAACGACACGTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:2 + chr3L 13194735 5' + 297 9 2 70.30 TTTTCGCTCGACCTCTGTCGTCACCCCTTCTATTTTTTTTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTG:1 + chr3L 11339324 5' - jockey 4953 1 68.32 ACCCTGATTTTCTGAGTCTGACTTAGACGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2R 3188667 5' + 1360 19 1 59.41 GGCATCAACAAAAACACCAGCAAAAAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3L 5975674 5' - hobo 2923 1 63.37 AGGTGAAAGTATTTTTGATCGATCTCTCGCAATTTGCAATCTTGTCCCCAGCTAGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGA:1 - chr3R 25632780 5' + Tirant 8294 2 59.41 CTACCATCTGCGGTCATTCCCATTCTCATTTGTATTCCAATTTCAATACCAAGTCCAAATCCAAGTCCAAGCTGCGTGAGAAACTAAAGATTCTCGTCTAC:1 - chr2L 11186602 5' + G2 2618 1 70.30 TATTAACAAGAGTTGGGTTTTATAACTGAATTATACAAGTTATCACTGATAGAATTTGGTAATCAAAGAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 + chrX 17133806 5' - pogo 2095 1 64.36 GCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCGTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr2R 5849978 5' + jockey 29 1 55.00 GCAGACGCGGATGCAGCCTGATTGCCACTTGAGGCGCGTAATCGAAACATCGGCAAGGCGGTCGGTCAATGGAGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:2 - chr3R 27374892 5' - mdg1 416 2 73.27 GTTTATTTTTATTTTGCCAATGCGTGTGGCATCGAGAATTATTCTGGAAAATAGGGAAACACTGCATCTTCAGGTGCAGATTTTTTATTTTTTTTTTTATT:1 + chrX 2888558 5' + hopper 143 11 62.38 AAGCACAAATATAATATACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTA:1 + chr3R 8548397 5' + 17.6 43 1 77.23 TAAACAAATATACAAAAAAAAACACCAAAAACGCCGATCGCGGAACGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATAC:1 + chr3L 6565066 5' + Stalker 7075 4 71.29 ATCCTCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3R 14169227 5' + blood 7013 2 70.65 CATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 14688303 5' + pogo 46 1 74.26 TTTGCCTCGCTCGCGGACTGAGACTGAGAGAAATTTAGCGCAATTTACTTGTTATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTT:1 - chr2L 6255847 5' + flea 19 2 61.39 AAACAGTTGGCAATAAAATTGGTGAATGTTGAAGAAGTCGATCGCCACAAGTTTTTGCCTCGGAAAAAAATATATTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTA:1 - chr2R 5674751 5' - S-element 1706 1 74.26 AAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 10741092 5' - 1360 3362 1 57.58 CATGACCTATTTTTTTCGTTTGTCATAATTGGTGCAGTTGCTACTGACTCATCGTCCGAAATGTTTTGTCCTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 3595833 5' + roo 8670 2 73.27 ATGCCTCATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 - chr3R 9952274 5' + Ivk 4 1 74.26 GTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGATCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr2R 18503551 5' - roo 9038 1 60.00 TTTTTGGGGGGGTGAAAACCAAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 - chr2R 20702171 5' + Doc 29 1 53.47 CAACTGGAAATTGGTATAATATGTGGCATCTTCCTTTAACCTATCTGAATAATGTCTATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGT:1 - chr2L 20620330 5' - Doc 4292 1 56.44 GTTTGCTCAATTTTAATTAAATTTTTAGCATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGAAG:1 - chrX 9793201 5' - HMS-Beagle 6939 2 71.29 CCGAATCGAGGGTTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCC:1 - chr3R 10741149 5' + 1360 3358 1 42.57 TGTATATGTATAGAGTATAGAACTTAGAGGGGTTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 - chrX 17204163 5' + Tabor 21 2 56.44 AGATGGACTGGACTGGCCAAATCGCAAGACCGCCGATTGACGCATTTTCCTTTGTTTTGTTTTCCATTTCTAATTCTATTTTCATTGGATTTTACTTTTTT:1 + chr2R 14490500 5' - Doc3-element 4492 1 71.29 ATTGTCATTGACAACAAGTTATTCAACTTGTCCGTTCGAGGTACTGTGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr4 299912 5' - 412 467 2 50.50 ACGCTTTATGGCGCAGAAACGTATAAACGCATATAAATTCAATATTAACATAGTCAANGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr3R 18881471 5' + roo 8664 1 77.32 GAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:2 + chr3L 2292068 5' + Max-element 8255 2 49.00 GTTCATGCATATGTAAAATCTCTAACAATTAAGGCTAAAGACTGAGAAGAAGTTTGGCTTTTTGCTTACATAAAACAAACGTTTTTTATTATCCTTTTTTT:1 + chr3L 12468673 5' - Doc2-element 255 1 65.35 GCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2R 9014491 5' + blood 7036 2 54.46 GGTGGTTGTTCACTACTGCCGCCTGAAGGCCTATTCTCGAGCCAAGACCAGCTTGAATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTA:1 - chr2R 24493752 5' - flea 4997 2 65.35 CGCAATAAAACTTTTTCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 - chr2L 7927259 5' + hobo 40 1 68.32 GGTTTGTCCCTCAACACAAAGTGCATCGAATCCAATGTTAGTGATGAAGAAGGAACAGTTTTATAAGATTTGAAAAATTATTGTTAGTCTCACAAAAAGAG:1 - chr2L 21974006 5' + Doc2-element 4730 1 67.33 CCAACTTGTCCTAGATTGTATAGCTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr3L 11461360 5' - copia 238 1 72.28 AGGCATACGATATGAAATGCCGAATAAATAAAAAAAAAAACAA:1 - chr3R 30068981 5' + Osvaldo 1522 2 90.70 TAACTCCACCGCATCTGTACTTCGCTCGGGGGATGCGATGTATCTCGCTCGCTGGAAGCTGCGAGCACATTATATAAAATTTAACGCTGGGCTGGTTGGTC:1 - chr2R 23656626 5' - Doc3-element 4588 1 82.18 TAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATCGTAAGTCTTTA:1 + chr3R 19449923 5' - roo 27 2 78.22 GTTTTNAAAGCTTTGCCAGTTTAAATGCGATTTATTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGG:1 - chr3R 19144448 5' - Juan 4170 1 70.30 CCGCGAGGATATGAAATCGTGACTCGTGATCTAAGTTGCTTTTGTACTTTTAGTTTACGTTTAATATGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chrX 4009368 5' + 412 9 2 68.32 CAAGTATCCTTTGTCTGCTGAGTCAGCTGAAAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr3L 20903882 5' + F-element 33 1 50.50 GTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 + chr2L 18112514 5' - transib2 2786 1 63.37 TTTCATTTGATATTATAAGATGAAGGCAAGGTTACATTGTATTAATGTGTTATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr3R 3920701 5' - 1360 3364 1 54.46 CTTCGTTTATCAGCTCCCTTCCTCCAGATCTTTGAACGAAAAAAAAAAAGCCACCTGAGTCATCCTCCCAATTGATGTCTTTATTAAATAACATAATAAAT:1 + chr3R 23512365 5' - transib3 2670 1 81.19 ATATGCCTCTTAAATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 3649760 5' + jockey 12 1 79.00 ACGGTAAGGTTGGATAAGGTTGAAAAAAGATGGAGAAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCGGGTGACAGCGGGTGAG:1 + chrX 9126382 5' - GATE 8249 2 69.31 GTATTGTGTTATGTTATGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chrX 9248360 5' - pogo 2072 1 58.42 GAGCCATCTCTGGTGACCTCTTAGATACTAAGAATTTCCCTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 - chr3R 31458527 5' - jockey 4954 1 61.39 AATATGAATCTGCAGTGACAGTTTGATTTCCATCCGTTATTTGCCCCCCCTCAAAAATGTATTTTCTCTCGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGA:1 - chr3R 19191573 5' + Doc 10 1 68.32 TCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAA:1 + chrY 425012 5' - 297 6926 2 78.22 GCAAACTGTTGGAGCACCTCATCTTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTCCAATGTCCAGTCTGACGATATCAGAAGGTATC:1 + chr2L 2517688 5' - Chimpo 77 1 74.26 GAAAATATTTATTTCCAGTGTTAGAGAAAAGGAGGTGCTAGAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAG:1 - chr3R 14982903 5' + 1360 3338 1 59.60 ATTGATTTTATAAAGAAATTCAATTGTCAACTAGATTTCAAACCAAGTGAAGACTGGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTA:1 - chr3R 4738281 5' - Tabor 463 2 62.38 ACTAACAACTGTTTACAAATTGACCTTTGAAATTGTGTTCGGGTGCCTTTCCTAGCTTAAGAATTAATATTCTTTCTCCTCGGAGCAGTGCTGTCCTCTAC:1 + chr2L 21687389 5' - HB 355 1 55.45 AGAGCAGAGACTCGGATCAAAAACAATAATTTACTTGATTTCACTTTCAAACCGCTTGTATTTGAATCGCGAAAATTTGGGCACCACTTCCACGGAA:1 - chr3L 2358228 5' - R1A1-element 87 1 55.67 TAAGANTTTGATGGTATATAATATTTAAAAAAAAA:1 - chr2R 5493621 5' + Rt1a 5069 1 85.71 TTAATTCATATTAAACATAAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTA:1 + chr3R 20845029 5' + 17.6 6940 1 67.33 CAGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:2 - chr2R 19936682 5' - roo 9038 1 56.44 TCTACAAAAATTACAATACAGTTAGATCAAAGTTACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGACACTTTTTTAGTGAC:1 + chr3R 3480988 5' - 1360 3336 1 74.26 CTTCCTGCAGACATTTTACCGGACGAGCAACAATAAGAACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGG:1 + chr2L 5546309 5' - Max-element 8366 1 62.38 AAAGCNGCTTTCTGCCCGTCCTTGCCCACCTCCTCTCCTAAAAAACAACGATTCTACCTGGTCTGGTCTGGTCTGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr3L 9519370 5' + Doc 32 1 72.28 GCATGGAGGATCTGCCAGCATTCCACTCAGCAAAAAATCAAAACGATTGCCAAAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCT:1 - chr3L 666826 5' + I-element 5272 1 58.42 TCCGCCGTGAAAAATCGGTGTATGGGTATGGGGATGGGCATGGCAAGTTGTCGAGCTGGAAGTTGTGACCCATGTAACAATTGATTTGCGGTCTGGGACGG:1 + chr3R 18525144 5' - mariner2 252 1 68.32 CCCCCCCCGCATTCACTTACTTCTCACACATATAAATAAAATAATCTCTACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAA:1 - chr3R 10289805 5' + Doc 4679 1 51.49 CTCGCGCTTTGTGGCTCTCCATGTCAGCAATATGTACATACATAAGCTCTGGCTACATTTGCGCCAGAGTTACCACAGTCACCACACCCCCTAAACCCCCA:2 + chr3L 19779016 5' + Tirant 8116 2 66.34 TTAAAACATAAAAGTCACTCATACGTCATGTAGGCCGCCTGCCCATCAGTCTACAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTG:1 + chr2L 17210079 5' + jockey 4693 1 52.00 CTTATAAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 + chr2L 17841049 5' + Juan 4069 1 72.28 AATGTGCAACAACCTTTAATGTGGTTAATAAATATAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 16744185 5' + opus 39 4 71.29 CACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:1 - chr3R 13423355 5' + 17.6 6962 2 69.31 TTAATCGACGAGAATATCGCTAGTGTACTTAGGCGTGAGTTCGCGCTGGAGGAACGGTGGAAATTTGAATATGGGGACTTTTTTTAATTGGTTTTTTCGTT:1 + chr3L 18865636 5' - Bari2 918 1 42.57 ACTGATACAAATACAAATAGATAGATGGTAGATACACAATTGCTTCACGATTTTTTCAGCATATTCTCATAATCATAATAATCATAATAATAATAATAATA:1 - chrX 14599231 5' + mdg1 31 11 69.31 ATACCTACATAGACTATATATATACTAAATACTGCAGTATTTAGTATATATATAGTCTATGTAGGTATACTGAGATCAACTATTTATTCATATATTATTTT:1 + chrX 9577378 5' - S2 1605 1 38.61 ATATAAATTATAAATTTAATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATAGTTCCCCGACTATAAGACACCCGTTACTCAGCATAATTTTTCTGGGATATCAATAA:1 - chr3L 23742562 5' - INE-1 502 1 76.24 TCTACNCAGCGTTTTCTTGTGGGGGCAATCTTGTACATTTTGGGGGTTGCAGTTGCGCTGACGTTACTGAGGCCGCGTACGGTCTTATCGTGGAGTTAGCG:1 - chr3L 809585 5' - gypsy4 25 2 53.47 CTTAATTCTGTTGAAATGGGCAAGACTTCCTTTGCACATATTTTTCTTGGCCAGCCTTTGTCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr3R 18551110 5' + Max-element 8244 2 69.15 CAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr2L 18112492 5' - transib2 2808 1 61.39 ACTACTACACATATTTGAAAATAATGTTTTATAAAACTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTG:1 + chrX 21397648 5' - F-element 4260 1 64.36 CATTTTCGCATCAAATGTCGGGCAAAACTGCAGTTTTATGACAAGTTGTGCCGTGTGGAAATCGTGGGAGGTTAAGCGGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCG:1 - chr3R 14166560 5' + blood 282 2 73.27 CCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTT:1 + chr3L 13364552 5' - hopper 1365 1 71.29 GTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chrX 12546473 5' + P-element 58 1 21.78 AATGANAACATATAAATAAATCAAATTCATTCTACATTCCTTTCTGATTTTCGTGCCCTATCTCGTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTT:1 + chr2L 6700624 5' - INE-1 174 1 67.33 GTATTTCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTT:1 - chrX 20880666 5' + invader4 25 2 55.45 AATTGAACAAAAACCCGACAAAAGTGCTGCTAATGGAGCAAAACTACTCAATAACGATGCCAGGACTTGGTGGACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGT:1 + chr3R 4833134 5' + Tc1 1299 1 68.32 CTGGATAAATATACTTTTGTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAAACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTT:1 + chr3R 28755928 5' + 3S18 5788 2 54.46 TTGCCAGGTATGAAATGGTACCTTTATTAAGGTAAGCGATTTCGTAATAGCTTTGTACGCACCTGTGATTGTTCTAAGCATCATAGACTGGTATCTCTGCA:1 - chr3L 27361634 5' - G3 4251 1 60.40 CTAAGATTTGTGACACTAAAAAGGGCCACCACCTTCTCTTCATCACTCCATCTTGCCTTTATATCGACACGTCGACGTTCTTCATCAAGTTCGTCTGGGTG:1 + chr3R 31961942 5' - R2-element 430 1 68.32 CAACAACAACAACAACAACAACAATGGCAACTTGTTAAATAATGACGTGCAAGTGCAAATAAAACAAAAGAAACAAACAAAATCAAGTACAAATTGCTTCA:1 - chr3R 25400123 5' - accord2 7236 1 62.38 CGCCGACCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:2 + chrX 6654730 5' + P-element 54 1 25.74 ATTTTGTATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTAATTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACAC:1 + chr3L 24996090 5' - 1360 472 1 72.28 TGCTGTGGCATCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 - chr3R 26469515 5' + hobo 22 1 57.43 TTAAAAAGGAAATACATTTAGATTTCCGCTTTAATAACATAGCAGGTTTAATGTTGGGATACTTATATAGTTATTTATATTTCTTATCTTATCTTATCTTA:1 + chr3R 15768199 5' - Stalker3T 207 2 65.35 CCTCGCCATCGGAGCTGGGCGGTTGCAATAGTGCCAATAACAATAACAATAATAACAACAACAGTAGCACTGTGCATAGTTTCTTAATATATTTATATTAT:1 + chr3L 21263290 5' + gypsy7 5060 1 68.32 TCTAGTTCCCAGTTTGTAAGGTTAGATATAAAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - 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hobo 2893 1 74.26 AGAATACACCTTAATTGTATAGATTAATAGATTATAGATTAATTATATAGATAGATTAAATGAAAGTTATAGGTACATTTTTCTTTTTTTCCTTTTTTTAT:1 - chrX 20535662 5' + HB 154 1 70.30 ACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTATTCGA:1 - chr3R 15157655 5' - invader3 5419 2 79.21 AGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTA:1 - chrX 20886038 5' - Ivk 5348 1 57.43 ATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:1 + chr2L 8740883 5' + Burdock 6171 2 61.39 TTCCCATGTTACTGCCTGGGTTGCTTCCTTGGGCTATATATGTTTTTACACACTAATTTAGGGTCATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr2R 2457421 5' + 1360 11 1 57.43 CATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:2 + chrX 19457141 5' - roo 9044 1 55.45 TTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 9946934 5' - roo 356 2 76.24 TCATACTATTTTCTTTATTAAATATTTAGTTACATTTACCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chrX 13682562 5' + roo 37 2 62.38 AAGTGACTAAAGAATAAAGTTAACCGAAAAAAATCGCATATCTGCGTATGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 15998150 5' - pogo 2077 1 55.45 ACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:2 - chrX 8948662 5' + blood 7062 2 75.25 CGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 19095755 5' + roo 8712 2 73.27 ATCGGTGTAAGGATCATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3R 25633307 5' + Tirant 8 2 73.27 AAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:2 + chr2R 12779114 5' - roo 353 2 78.22 TATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 - chr3R 1206450 5' - I-element 5321 1 62.38 TGTATGTTTTATAGGGTAAAAAATTATTTGGTATTGTGCCAGATGGAAATGAAATTATTACTTGGTCGAGCAAACTATTAATTTCATTTTATTTTGAAAC:1 - chr2R 9260206 5' - NOF 3955 1 58.00 CCTTGCCTTGCTTGAGACCGACGGCCACGGCCTGTGCGATGGTGTCCTTGGAGGACAGACGTTTTTCTTCGTCTAGTAACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTG:1 + chr2L 9574545 5' - baggins 4971 1 53.47 CAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3R 7993850 5' + Doc 21 1 57.43 ACCGATTTTTTGCAAACAAAAACCGCGCACTTGAACGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGCACATAGCCGAAAATGC:1 - chr2R 24024507 5' + flea 4688 1 64.36 ATTTTTATATAATTTATATTTTTGGACCCATCAAATTAACCATAACAAACAGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTAT:1 - chr3L 19951291 5' - Ivk 5367 1 73.27 TTTGGTTTCGGAAATTTTACTATGGCATTTGTCTTTATTTCTCATCTTTCTCTAACACACTATTTATGACAACCCGATCGGATCTCACTCAGCTGCAGGGG:1 + chr3L 23091403 5' - invader4 2873 2 62.38 AGTTTAGGAGATATTTGACTTTAAATTAAAGATAATTTTATTATACCTTTGCTTTCCTCTTCGGTTAATCATTAGATAACTTTTTGTATTAATTAATATTG:1 - chr2L 9773607 5' - gypsy7 357 1 64.36 TGATAGTCAAGCAGCCATAAAGGCGCTCAGCAAAGCTAAGATAACATCTAAGCTAGTAAATGAAGTGAGGAGGAGGAGAGCTATGCACATATTATAT:1 + chr2R 4330780 5' + baggins 5227 1 74.23 GAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCA:1 + chr3R 11165644 5' + Tabor 38 2 61.39 AAAATTTTCTAGATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:2 + chr2R 18295587 5' + I-element 10 1 67.33 AGAGCAGCAACTTAAGAGAATTTGTACACTCTTTTATCTTGCTCAATTTGAGCTTTGAAGAGAGCCGGCAACTTCTGTTTTTGGGTGGATCGTGTCCGGTG:1 + chr3R 26535709 5' + GATE 8157 1 80.20 AAATGGAAAATCAAATCGGAAGAACACGCAAGCACAAAAGGCGTTGGCCGGTGGGTGGTGAGAAATACAACAAAAAATGCAAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:2 + chrX 8327748 5' + R2-element 3585 5 80.20 GCAGATGGACTCTTTGCGATGCCTGGTGACCAGTTTGCGTTGGCAGAATGTCGCTGGTTGTTCGCTCTTCTTTTTTTTTTCGTTGTTTTTTTTTTACTTTT:1 + chr3R 8779309 5' - gypsy7 5012 1 74.26 GGTGATCAGAAGATAGATCGTATTTTGTTTCAATTGAAAGTTTATTTATTTTTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATT:1 - chr2L 20120166 5' - Juan 4186 1 52.48 CATTTGAGTATTATTTCCGGCGAATATTTAAGAGTTTTAAGAGTTTTCTGTCTTCTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAACAGGTTGCCGTGTCTTGTTCGT:1 - chr3R 22016761 5' - I-element 363 1 73.27 AATCGCTTGGCTCTGCTTCGTGTTCCTTCTATTTTTCGTCTGTCTAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGA:1 + chr2L 13700598 5' - Cr1a 4153 1 57.43 CTATCCAATCCCTGATTCGACGTGGTGGGAAATTGTCGGTGTCACTTGGACTAGCTGAGTAACGGGTATAATTAGACTGTTGTACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr3R 2210531 5' + Tc3 237 1 60.40 TAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 27189317 5' - roo 9026 1 69.31 AGTGGAATCCTGGCCAAGAGGCAAAGCTTTCTAAGCCATCCAACAATGTTAAGTTAAGTGCCACACATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 - chr3R 16510931 5' + flea 4763 1 73.27 TAGATATTAACAAGGACGGTGACAGTTTTTAAGGGAGCGAAACTGAACTTTATGTGATATTATTATATTATATACATTTTTATTCTTGATCAGGATCAAAA:1 - chr4 254393 5' + INE-1 84 1 54.46 GCTGGTGGTGGCATGACGCAGTTCCCATCCATACTGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 19076126 5' - roo 394 1 61.39 CGAGTACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAAT:1 - chr3L 16047628 5' + Gypsy6A_LTR 27 1 56.44 TATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCA:1 + chr3R 9657712 5' + BS 49 1 77.23 GTAAAAATGGGGCCAAATCATCTATCGTTAGGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chrX 12294676 5' - blood 7372 2 61.39 TTTAAAGGAAAAGATAGATGAATTGCTTAAAAATAAAAAATTCGCAGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGCACAACGAATCACCAAAGTTAAAATTGT:1 + chrX 22509284 5' + transib4 436 1 51.49 TTAGTGGCTTAATTATCTCAACAAAAAAAAAACCTATCACGAAATCAGCTGGAGTTGAATCATGCTGTAATTGTTTTAAAAAAATGTAACAGGTATAGAT:1 + chr2L 16082589 5' - Stalker4 398 1 66.00 TATCACTTACTGAACTACGAACATAATAATAACAATAATAATAATAATTATGATAATAATATTAATAATAATTATGAATAAGTAAGCTTAGGAGCACCCTA:1 + chr3L 26386239 5' + mdg1 7135 2 82.18 TGCATCGCGTGCAGAGCAACATTTATCCGGGCATTACCCTGAGTGCCAACCAGCTGTCTTATCAGTCACACAACATTGGTTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr2R 17006850 5' + roo 8663 1 70.00 ACTGAAACAAATTCAATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 - chrX 14713282 5' + flea 4773 2 58.51 CATAAGAATTGGCCACATCTTGATTAATATTTTCGGTTAATATCACAAGCAATAGACCAGGAAAAACACGAAATGAGCGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTT:1 - chr2R 11651938 5' + R1A1-element 191 1 79.21 AATGCGATGTCGCCGCTTCGAAGCGGGCAGGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTCA:1 + chr3L 6718285 5' - Tirant 8368 2 70.30 TGTTANGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chrX 9248349 5' - pogo 2061 1 69.31 AGAGTTATTTTCTTAACCATAGAACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 10321127 5' - roo 409 1 79.21 AAGCGACGTCTGATACGATGAATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3R 9837621 5' + 412 54 2 77.00 TATCATCAAATAAATTATAGTCGAAAACAAAAAATAAGTAAACATCTTGAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chrX 11585637 5' - pogo 2077 1 55.45 ACAGGCAAACTTGCGTACAATGGCATTCACTCGTCCGCAGTGCCCACTTGAGCCGCAAACCAATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 3196229 5' + roo 40 2 63.00 TATACATGTATATAAAGTATAGGATTTTTTTCCGAGTCTAAATGCTTGGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAA:1 - chrX 495963 5' - 412 86 2 54.46 AACCCTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGC:2 + chr2L 18028669 5' + flea 25 2 62.38 GACTAGGTGGAAACTCACTTGGCCATCAGCGACTCCTGGTGTTCTGTTTTAAGTTGCATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCC:1 - chr3R 11377273 5' - 297 6594 2 65.98 AAAGTCCAGCTGCGTATTGGAATTTAGGATTCACTTCTTGAGAAAGCTATCGAAAATGTATCGAAATATTATCTTTATCTTCAATTATATGGGGTCGAAAA:1 - chr2L 8496519 5' + Circe 7094 1 61.39 CTTTTTCATCGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGG:2 + chr2R 24493653 5' + flea 17 2 62.38 GTGTGTCGGTGTGTGTGCGTGTTGTTTATCTCGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:2 + chr3R 13715095 5' + P-element 45 1 34.65 CAGACTTTTGTCTGCAATATTTTGACATTTCGAAGGGCAAAAGAACGCTTGCACGATGAATTAACTAAAAGAAGACAAAATAAACACACACACACACACTT:1 - chrX 10628463 5' + accord 7027 2 58.42 AGCTAAAAAAAATTATTTTTACTATGGTAGGCCTCAAACATAGATTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGAATGCGGCGTCTTACAAGCGC:1 - 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chrX 23457220 5' + Stalker2 7272 2 51.49 GAAAAGATTTTCGGGGCGAAGAGTTGTCTACTATTTAGTATTCGCAACAACCATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGGTGACCCCGACGTGATTGTGT:1 - chr3R 6679397 5' + diver2 388 1 68.32 TAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAAT:1 + chr3R 25633323 5' + Tirant 24 2 57.43 ATAATGTGTTTGTTTAACTGGCACGGTAAGGGTTAAGCATTTCCGACCATATAAAGTATAAATACTCTTGATCAGAATCAATA:1 + chr4 406545 5' + INE-1 84 1 67.47 CGCGAGGTGGATTTTCATTCATAGCACCCTGGTTGTCCAGTCTTTTAGCGTATCTCTCGCTGAAGCGGGAGATCTCCTCTGCTACCCATGGCATTCCAAGC:1 - chr2L 12087750 5' - G-element 4044 1 71.29 AAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 - chr3R 19657502 5' + roo 48 2 75.25 GGATGCATTTACTCCTACTTACCCTCGGACAATGCTAAGTAGGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCG:1 + chr2L 609016 5' + FB 37 1 60.40 GTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:2 - chr2L 13447176 5' + HMS-Beagle 32 2 57.43 AAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 + chr3R 10741078 5' - 1360 3374 1 65.35 GTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCG:1 + chr3L 25232765 5' - accord2 175 2 51.49 GGGCTGATATTTCTTGTTATGAAAGCAGATTCTCAGATTATGGCATATGTATAAGTACTATAAGGGTTGCATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2L 9389143 5' + 1360 8 2 69.31 AATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 - chr3R 24282006 5' + Max-element 40 2 67.71 CTTCAGGCCACATTTGGCCCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 - chr3L 10811186 5' - P-element 2831 1 25.74 CATACATGTGCTCACTCGTTTCCTTGTGTGCGTAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr2L 2197160 5' + P-element 18 1 60.00 AATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAA:1 - chr3L 2292127 5' - Max-element 246 2 76.24 GTGCGGAAAACTCCACTCACTAAATTGGCATAGGCGCTGCGTCCATGTCTCTAGCATCTGAGTTCTTAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTCATGAGA:1 + chr3L 23007392 5' - INE-1 152 1 77.23 TGATGAAGAAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTC:1 + chr3R 4543188 5' - 3S18 6071 2 57.43 GCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:2 + chrX 12538469 5' - roo 9023 2 72.28 GGTTCGCTGGTAGAAAGCGGCAGCGACTGCATTGTTTGAAATATTTTGCATACAACTACACTCGTATGCCACACCATGTATGTATGTATATATAAGAATGT:1 - chr2L 2590360 5' + Dm88 22 2 69.31 CTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chrX 21087607 5' + mdg3 5290 2 73.27 TTAAGGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chrX 13347343 5' + roo 45 2 71.29 CTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr2L 18694148 5' - P-element 2839 1 31.68 AACATGTAGACATTCTACAAATATTTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chrX 13347258 5' - roo 405 1 75.25 AAGAAATTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTC:1 + chr2L 8959919 5' + Ivk 5113 1 50.50 ATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTA:1 - chr3R 13423372 5' + 17.6 6945 1 59.41 GCGGTCACCAGAATACCAGAGTTTAGTGGACGCGGGCAATGCGGGGAGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGG:1 - chrX 6930554 5' + flea 160 1 56.44 GTTCACTTATTCTTGCACTGGGCCGACCACCTACGAGAATCTAACTCATTCAGTTAAACAAGTAAAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAA:1 + chr3L 18439101 5' - F-element 4615 1 78.22 CATGCAACTGCACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGT:1 + chr3L 11909945 5' + Tabor 44 2 70.30 CAACATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGC:1 - chr2R 4677366 5' + invader3 5 2 74.26 GACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 + chr2L 13447121 5' - HMS-Beagle 6995 2 73.27 GAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGATACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr3R 25702178 5' + Tirant 8135 2 53.47 GGGCAACTACGTACAAATTAAAGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGT:1 + chr2R 4886087 5' - Cr1a 4188 1 82.18 CCCAGCCCGCCCACACAAACAAAACAAACTCAACGTTACTTTGTATTAACTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chr2L 6252575 5' + P-element 24 1 55.45 ATATTAAACATAAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAACACCACATAACGTAGAG:1 + chr3R 20845036 5' + 17.6 6943 1 62.89 TAAATACAATAAATTAGTTTAAACAGAGCATCACGACTTTAGCACCGTTTACAACATCAGAAGTGGTTTAACCAAAGACACTGGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr2R 16880921 5' + 1360 8 2 78.22 GGTCGGCGATAAAAATTGTCGCAGAAATCAAGGAAATTAACGCGTGCAAATATGTATTTCTACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGA:1 + chr3L 14273366 5' + opus 7298 2 59.41 ACAGCNGAAGTTGGCCAATACCGTAAATCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCGGCAAATCATCGGAGACT:1 - chr3L 12496241 5' + gypsy3 6911 2 79.21 AGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAATGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 5850017 5' - jockey 4948 1 61.39 TGTACACACACGGCGACAACAACTGCTGTTAACCGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chrX 2589721 5' + copia 4913 2 65.35 AAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2L 108001 5' - P-element 2850 1 42.57 ATAGATCATAACACATATCTTCCAAAATGGGGGCGGCTCATGGCCCATTGATAACAATCAAGCAAAGTCAAAAAATTTCAATAGAAGCATTGTAAAAAGCA:1 + chr3R 19770657 5' - S-element 310 1 75.25 AACACCAGCATGTTCCAGGCAACCGCCTTGTTTACATTATGCAATCTCCAAAACAATCAACTGGGTTTCACAACAATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAA:1 - chr2L 22357215 5' - Cr1a 4044 1 80.20 AGCTCCGCCATCTGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTA:1 + chr2L 20118680 5' + Max-element 8255 2 56.57 ATCATGCCCTCGATTCAATTTTTACCATGATAATTATGTTTTTTACTCTCGATGTATCTTCTTTTTTTCGTTTCGGTTTCTTTTTTTATTTTTTTTTAATT:1 - chrX 8958638 5' - Doc 4700 1 78.22 GGGCGAGTAAGGTAAACGCCAAGAATGGTGGTCGGTGGTCAGCTGTAGTGAATGGTGGTCGGTCGGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3R 19837001 5' - P-element 2876 1 69.31 CTTAGATTATCGCGCACCGATCACCGAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 + chr3R 8198480 5' + Tirant 8134 2 54.46 TATGAAATCTACATGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chrX 329004 5' + opus 29 4 60.40 CCTGTAAATCTATACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chr2L 13250348 5' + pogo 14 1 63.37 AATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATT:1 + chr2L 21362554 5' + Cr1a 126 1 67.33 ACCTCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chrX 19457133 5' - roo 389 2 60.40 CTAGCNAAAACAGCGTCAACTTCGCCCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGG:1 + chr3R 24153344 5' - P-element 367 1 27.72 CTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 19215870 5' - roo 9047 1 56.44 AATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 28728345 5' + jockey 33 1 52.48 GGCGGCTGGGTATAATTTGAGGTAATCAGATCTGTAAGACGTCTTACCGAGCAGTCGTCCTCGCAGTCAACGAGTCCACTTGCGTCTGCTTTGGCTTCTCC:1 + chr2R 24776600 5' - micropia 5326 2 67.33 GTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chr2L 18112498 5' - transib2 2802 1 55.45 CTTCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3R 25918895 5' + roo 34 2 59.41 ATCAATATCTTGACTGTGTACAACAATTTTCAACGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 - chr3R 18906651 5' - P-element 2846 1 38.61 TTTCAATTTAATACCAACTTGTCCTAGATTGTATAGCTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 + chr3L 11461347 5' - copia 251 1 59.41 CCTTCGGAACATCCCAAATCGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chrX 4488940 5' + 412 7082 2 51.49 ATTTATACCAACATATGTATGTTGAATACTTTAAAACAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 21708615 5' + roo 38 2 68.32 CTCTTGGGTGTGTGTGTTGTGTTTTCGATTTCGGAGCCGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTC:1 + chr3L 19870811 5' + Quasimodo 409 2 61.22 TAGTTGCGCCGGCAGCCAGAAATAAGACTCTTATAAGCTAAAAACTCAAATGTTCTAATTCCATTAAATATGAATGGAAGCCCGAAAACCGCGGTACCATA:1 - 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hobo 2935 1 73.00 TATATTTGATTACCACGTAGGTATGTATACTTTTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCT:1 - chr3R 12365689 5' - 17.6 7242 2 70.30 CATGGTCTTGTACTGATTAAAGTCAAGCTTCTGGCCATGACGTCGTTGCTGGTTAATTAATTTTACAACTCCAAGGTTGTCTCCACAGTTGTGAGGATTGG:1 + chr2L 17531393 5' - invader5 369 1 56.44 TGAGCNTTTCCCGGCCTGAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 + chr3R 11165627 5' + Tabor 21 2 61.39 CTTAACTTTTTATATATATGCAATCTTTTTGTAACCTTTCTCGTTGCAATCATACTTTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAAC:1 + chr3R 17310890 5' - G2 216 1 58.42 GGATTCTCGATCGACACGCGGCGATCTGCGAGATTCGAATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTTAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAA:1 - chr3L 7360720 5' - Quasimodo 6935 2 62.38 ATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chr3R 22620207 5' + 297 43 2 73.27 GATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTT:1 - chr3L 15099641 5' + G4 3810 1 40.59 TATTTATTTTATTTATTTTTTTAGTATTACGTTTTCTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCG:1 + chr3R 7963094 5' - F-element 17 1 64.65 AAGAAACCAGGAAATAGTAAAATTATAAGGTAAAACAAGCCCGATGCCAACATTTTTAGAACGCAACTTTGCTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 + chr3R 11166022 5' - Tabor 7278 2 77.23 CTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr3L 9692664 5' - P-element 2865 1 57.43 TTTTGTACTTTTAGTTTACGTTTAATATGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chrX 4009329 5' + 412 48 2 75.25 CTCGCGGACACCTGGACATCCGGTCAACGGGGCACCGTGGTACGATCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCA:1 + chr3R 22837640 5' + F-element 4409 1 70.30 GTAGGCAACACATTTTAATCGAATGATTCACATGCCCAATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTA:1 + chr2L 7459551 5' + BS 5009 1 61.62 AAGCCTGTCTATCTCGTTCTCTTGCAGGGCCCTTCAAATGTCAACTGACTCCATGAACCGAACGTTGCCATTTGTTCGTTCATTTTGTTATTGTTTTTATG:1 - chr2R 12459910 5' - BS4 450 1 70.30 CAATACCGGGTCCAAACTCGGAGTGGAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAA:1 - chr2L 21873784 5' + P-element 146 1 29.70 CACCTCCCTCACTAGCCCACAAACATCCGGTCCAAAGAGTTTCTCAACATCCTCGAAGTTCATCTAGACAGAAGATGCATTTGAAGCTAAAAGTCAGTAGG:1 + chr3R 29202123 5' + Doc4-element 2496 1 54.46 TATTAACATGAGGTTGTACCCAAACTTCGATGTTACTGATATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - 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chr2R 12779174 5' + roo 8682 2 64.36 AAGTTCTAGTTCCCAGTTTGTAAGGTTAGATATAAAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 19657536 5' + roo 14 2 65.35 AATTGAATGGAATTGACTGAAAATATAATAATATTTCTTCCTAAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGA:1 + chr2R 22199712 5' - 1360 3241 1 59.41 TTTATTAAAATATCTAGCTATATTTGCTTGTTGTTTTCATTGTTTTTCTGCTCTGCTCTGCTCTGTTCTGTGCTATTTTTTTTTCGTTGTTTTTGTTTTTT:1 - chr3R 21339080 5' - gypsy9 456 1 68.32 CGGAACGAAATATATGCGGCAAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATA:1 - chr2L 15955345 5' + Quasimodo 12 2 67.68 CTCTACGTTTTATTGCATTTATGGCGTTTTTAATGAGCGCGCCGGGTCGCCAAATACGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGTCCACGAGCGCAACGAAAA:1 - chr3L 12449488 5' - R1A1-element 9 1 53.47 TTTTCCCTCGTTGCTTTGTTGATTTGCTTTCCCATTCCGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTAT:1 - chr3L 2799578 5' - blood 7330 1 62.38 TTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - 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Stalker4 6998 4 48.51 CCACGCGCGAGTAGAACAATTCGAAGGCTGTCTTGGCCGCCAAATCGGGAAAGATTAGACGCAAAAAGCAAATAAAATAAAAAAAAAATAAAAAA:1 - chr2L 11281183 5' + F-element 4686 2 66.32 GTGAAATCACTCTGAGATCTGAGATAGCACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chr3R 6185906 5' - 412 471 2 55.45 CACAAAATATTCTGTTATTGTAATCCAAGTATACGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr3L 9772213 5' - 297 354 2 71.29 CTTTCATTTGTATATAAATAAATTTTTCACTTTATTTTCAAGGCTTGAAGAAAAATCGAAATTCTATTTAAATCCTAATTATAAATATAAAAAA:1 + chr2L 7770686 5' + transib4 2572 1 73.40 ATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chr3R 9369991 5' - roo 9031 1 65.35 CCGTCTGGGCCGTAAATCAAACTGGTCGGCTACAATGGGAAATCAATCAATCGACAGCGACATGGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACC:1 + chrX 2185396 5' + F-element 321 1 71.29 GACCCCGTCTTCACCGCTCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2L 2909621 5' + pogo 23 1 56.00 AAAAAAAAAATAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTC:1 - 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pogo 2052 1 77.23 GCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTT:1 + chr3L 5964256 5' + BS 40 1 65.35 CGTGCAACGTTTCGTATGAGTGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACACAACCTTTCCTCTCAACAAG:1 + chr3R 9118722 5' - P-element 79 1 24.75 ATACGTTGGTGGGTGGGTGGTGCCGGTGGTTGACTTATTTTATATTTAATTATCATTAAATCCTTGTTTAAACAACATAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCC:1 - chr3R 11365899 5' - INE-1 571 1 71.29 CACGGGCATTCCTTTCTCCCGATCCCTCTGAATTCCTTTTTTTTTTTCCTTTTT:1 + chrX 4020945 5' - Doc2-element 244 1 85.19 CATGCACAAAGCACCCCACCAATCTCCGTTCCGCATTCTCCGGCGCTCCTTACTTGCGTGAGATATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGC:1 - chr3L 2615254 5' + G2 2860 1 64.36 TCAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGCTTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr2L 19679786 5' + Doc 35 1 53.47 ATGAGGAAATAAAGGTTTAGTCTGTTAAATACGTTCATGCTAAAAAATAATCTAAGCCAATCTATATACACCGCATCAAAGTTTTTTTTAAAATAATTTAA:1 - chr2R 14921644 5' + HeT-A 5802 1 60.40 CCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 7787254 5' - roo 9021 2 78.95 TAATTCCCAGTCAGTATTTGCACTGGCACTTTATTTGCTTCGCAGAATTGCCCGAGTGCGCTGCACTCGATTACTTTTTCACCCGCGATATGGGTACCAAC:1 - chr2R 10657388 5' - R1A1-element 5015 1 79.21 TTACTTAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chr3R 19609633 5' - Tabor 7311 2 63.37 ACAAATTCTAGTTCATATTTTATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAG:1 - chr3L 20257140 5' + invader3 246 2 79.21 ATTAGTCGATGTTGTTGGTGAGGCGCGTTGCATTGTAGTGGTTCAAGTGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAAATGATTGGGCA:1 - chr3R 27254906 5' + Stalker 6878 4 57.00 GACTGCAGATCTGTGGGCACGGAAAATGCCTTCGATGCCCGGACACACACACACACACACACACTGCCTACCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTT:1 - chr3L 7314770 5' + hopper 4 2 71.29 ATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 + chr3R 7522318 5' + blood 7060 2 71.29 GGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr3R 14169254 5' + blood 38 2 63.37 GTCTTATCCCTGCCGTTCTTCTTCTTCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTAG:1 + chrX 13482987 5' - 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mdg1 412 2 63.37 ACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACT:1 + chr3R 25702206 5' + Tirant 55 2 82.00 ATGATTATTATGATTAATAAATAAAAGAAAGAAAAAAAAA:1 + chr2L 3945681 5' + F-element 4687 3 67.50 CAGTAGATGGACAAACCCTTTGTGGATCTGCCTTTCGCTACCGCTCAACATTGAGGCAAAGCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGAT:1 + chr3L 1456817 5' - accord2 13 2 68.37 ACTGATAATGAAACAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACAC:1 - chr2L 12074413 5' + Quasimodo 25 2 58.42 TGGAGATGGAGATGGCTGCCTGGTAGCTGGTCAGTTGATGGGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr2R 19936713 5' - roo 407 1 78.00 GTTGGGAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATAT:1 + chr2R 9387310 5' - Stalker2 7634 2 61.39 ATGGTTATGATCATCATGCAAATTAATAAATATTTATTTGTAAGTACTGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAAC:1 + chr3R 21500921 5' - roo 9043 1 55.45 TATTCTCTTTTGATACCTGTAATATGAAAATAATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTA:1 + chr2L 1129045 5' + HMS-Beagle 6802 2 71.29 CGCTTAACGAGGCATTCATTTATTGCAAATTGATGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - 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roo 9039 1 56.44 GGCTTATAGATCTGTATATGTATAGAGTATAGAACTTAGAGGGGTTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 - chrX 17204175 5' + Tabor 6848 2 68.32 AGTAACTTTAATAGATCTAGAGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 20201012 5' - roo 9017 2 82.18 GTTTCTTATATATTTCTCTTTAATATAGGGACTTAATATCTCATTCGTGAGCTTCTTTTGGCAGTGTGCCCCAAAGTATACACCACCCTCATGACCTCCCT:2 + chr3R 23617948 5' + jockey 4759 1 75.25 ACGACGTACGTATGCTGGTTTTGCATTTTTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTT:1 + chr2L 19680051 5' + Doc 23 1 36.63 ATAAAATATTTTCTCATTTTTAACGTATGCTTAAATGAACATACACCGCACATATGTACATATACTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGT:1 + chrX 457491 5' - invader4 173 2 67.33 TTCCCACCATTTTCCCCCAACCGTTCGTTTCGCTGCCGCATTTTTCCCTTCCCTGCAACAGCATCAACTTTCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAA:1 + chrX 5138478 5' + I-element 4911 1 67.33 CAGTTGTGATGATGAACTGCTCCCGTCAGAGCTTAACCGGCGACCCACTTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAAT:1 + chr3R 14093221 5' - Doc 4655 1 52.48 AGTGTCAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAAT:1 + chrX 21668044 5' - Stalker2 392 2 68.32 ATATGGAAAAAAAAGAAAAGATTATAGGATAATAATCTTGACTAATAACCAAACGAACCGCCCTCCTCCATTCGCGAAGTTTGTTTTTTTTTTAATTTTAA:1 - chr3L 5786249 5' - Doc 4696 2 74.26 TTCTGAGCTAACGGTTCTTGCTGGCTTTGGGGTGTGTAGGGTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAA:1 - chrX 279033 5' - accord 7050 2 63.74 GTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTT:1 - chr3L 2800197 5' + blood 7050 2 62.38 AATTAGGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 - chrX 5018708 5' - opus 472 2 52.48 TTAATCGACCGCTCGAAGATACTGCCCTTGGAGTCACTCGAAAAGGTCGGAGCTTTCGCCCCAACGGGCTCTATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAG:1 + chr2R 7351012 5' - micropia 43 4 78.22 ATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr2L 1156737 5' + 412 33 2 60.40 ACACACATAGATGCCAAGGCGGCGGGTGCGAGTGTGTCGGTGCGGTGGCAAGCGGTTAAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGC:2 + chr2R 5992902 5' + F-element 359 1 57.43 CCGAAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTG:1 + chr2L 19364076 5' + BS 4780 1 43.56 ATCGGCAGTCGGTCGCTTTTGCTCCCAGATCCCATTTTAGCATTAGCGGCTACGATGGGATCTGGGACAAAAGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGA:1 + chrX 3845937 5' - G2 352 1 46.53 CGGGTGTACATAACACTTAACCCATGATACCCCACCTGAATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 - chr3R 25818884 5' + mdg1 37 2 59.41 AGAAAGGCGGAAAATAGGAAAACAGAAAGGCGGACGAAGCACAGAGTCAGCGAAGGGGGAGAGCTGATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAG:1 + chr3R 31429786 5' + 1360 215 1 72.28 GTTGCAAACGAAGGATGAATGTTAGAAGTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr2L 4189459 5' - 1360 3379 2 67.33 CCAATGGGGAGCAGAACACACACACATCGTTATCTCGTTAGCGATAATTAATTTGGCCAAAAGCAAAAAACAATTAAAAAAGCTGTATGTAAATAATTTTG:1 + chrX 5344921 5' + Bari2 938 1 74.26 TGCTCTTAAGATGCTATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 + chr2R 5485048 5' + 1360 13 1 66.34 CCATATTCGTGAAAAGCTCAGAACGGAGACGATGGCGCAAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTA:1 + chr2L 6255742 5' - flea 246 2 71.29 GCAACTGAAACTGAAACTACCTGATGTCCCTATATATATGTTCATATGGACAGACGGACGTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATA:1 + chr2L 7310395 5' - INE-1 83 1 59.41 AAACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 - chr3L 9772276 5' + 297 29 2 69.31 ACAAGGAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 14910626 5' - roo 9026 1 73.27 CTCTAGCATAAATTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTC:1 - chr3R 14095010 5' + Doc 20 1 65.35 GCGAACTATTTAGCCTGGTTGTAAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATC:1 - chrX 16798265 5' - diver 6073 2 62.38 TTTTCNTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGA:1 + chr3L 24213779 5' - invader2 5074 2 56.44 GGGCGTGTCTTTGGGTGTCGCCTACTTTGCATTTCAAATGCGCCGTCGCCGTGTCGTTTGTCTCGTCTACATGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chr2R 21901424 5' + P-element 101 1 78.22 AACGTCGCCCGGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3R 28728358 5' + jockey 20 1 65.35 TGGGAATGTGCTGCCCTGTTCCGGGGCAAAAATATCTCAGCTTCTCTAAGGACATTGGGGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTT:1 + chr2L 19770226 5' - I-element 4934 1 69.00 AATGATTCTTCAATACAAAATTAAAAAATTCCAAATCCAAACATCCGCTCCGCACTATTCCTCCTCACTATTCCAACGCATGGTGGCAACTGAACCGTGTC:1 + chr3L 23072008 5' - mariner2 114 1 61.39 AGTCTAGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr2R 12213926 5' + Transpac 37 2 63.37 GTGGGGGCCTTGAACAGCTGTGAACGCACACGCTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr2L 18694087 5' - P-element 2868 1 35.64 GCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 + chr3L 2800127 5' - blood 7365 2 53.47 CGGGTTTGAGTCTGTATCTCACCAAAGCATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 14639417 5' - roo 398 1 63.22 AAGCTGGCAAAGAACATGTAACAATATTTCTAACGCTGGGGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTT:1 - chr3R 18507743 5' - jockey 4813 1 60.40 CATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 + chr3L 19951218 5' + Ivk 50 1 74.26 AACGGNTCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGT:1 - chr3L 15099645 5' + G4 3806 1 43.56 TTATCGGCAAATAAGGTAACGTAACCCACAAAAAGGTAACCAAAACCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 - chr3L 21203071 5' - pogo 2073 1 52.48 CGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGACGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 487133 5' - P-element 2849 1 40.59 TATGTGGCTTGGATGCGACTCGGGTCGCCGCAAGAGATTTGCTTTGCTTCTAGATTGTAACTTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACT:1 - chr3L 22936472 5' + 1360 228 1 61.39 GTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 - chr2R 14381344 5' + hobo 36 1 62.38 GTTTTGCTTAAGTTCATCAATTTTCCGATCCGATTGGGTTACAGTATTTGCATTGCATAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTACACACGTATGCTCAG:1 - chr2L 7261072 5' + 1360 178 1 54.46 TCGCAATTCATAAAGATGTGCGTGATTGAAAAATCAGACAGCCACTCGCCTGTCGGCCCACCCATTGTTTAATGTCGGAGGGTTTATCATCATTATCATCA:1 - chr3L 7038751 5' - Juan 274 1 66.34 ATTCTACAGATATTTGTCATTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGA:1 + chr2L 9515535 5' - 1360 91 1 79.21 TATTATAAAAATTATGGTTAAGACATCCAAACCAGCAGTTAGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGG:1 - chrX 13548813 5' - blood 343 2 57.43 ATATCCTTGGAAGGATATTCGAGGAGATTGGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAA:1 - chr3L 17307949 5' - F-element 4437 1 70.30 AATCGGTGGAGAATTGAAAAGTCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCC:1 - chrX 22638568 5' + INE-1 107 1 67.33 CTGCGCCACAAGTAAGGGAGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGAT:1 - chr3L 11826450 5' - INE-1 151 1 68.32 AAAATATGATCTTGGGTTGATTTCAAACTTGGCTAAGCGGGCAGGCATTACATTTTATTCTTCTTAGTGGAGATACTTTTGAACGGTCTTAAACATTTTTT:1 + chr2R 10866145 5' - mdg3 5119 1 49.50 TCTACAGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 - chr2L 3694157 5' - roo 9036 1 66.34 TACTAAAAGTTATGAAAAGTATTCACCTTGTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACT:1 - chr3R 10971935 5' + BS 5042 1 72.28 CTCTTTTACCAACAAGGTCTGCTGGTAATGGATTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACA:1 - chr2L 7459613 5' - BS 5052 1 68.32 GCGCAAAAAAAACCCATATATACATATTTTCCGAAGGACTCTCGCAGGACCCACAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCG:1 - chr3R 11260640 5' - HMS-Beagle2 7087 2 62.63 GTATAGCGCTTAACTCAATAGTGATGTTTAAATGCTCTTGCAGCACGTACATAACGTACATACAAATCAAAGTTTTTGATTTTGATTTGCTTGCCGGCGG:1 + chr3R 14377951 5' - TART-B 10332 1 64.00 GAGTTGCAGATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAAT:1 + chr2R 9387315 5' - Stalker2 381 2 56.44 TAAATAAACATATAGTATAGTTCTATGCAGCTACAAATTTACTCATTGTTTAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 - chrX 14090607 5' + FB 27 1 49.50 GGTTGGCTTTGGCTTTGGCCGCATCAACACATTGGTAATTACGAATGTGGATCGCACCGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATA:1 + chr2L 15344121 5' + transib2 12 1 65.26 TTAGCTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACAT:1 + chr3L 7989734 5' + mdg3 28 2 55.45 GGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 19095753 5' + roo 46 2 71.29 AATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chrX 14525250 5' + hobo 23 1 58.42 GCTTCCTTCTGCTGCAGAATTTTCCGCCAACTTTTTCAAGGGTATCTTAGTCGATAGGCATATTTTTCGCCATTTTCTTTTTTTCCA:1 - chr3L 21391673 5' + Max-element 413 1 55.17 TCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 - chr2R 7481088 5' - opus 7456 2 79.21 AGGCATCTCGCCTGCTCGCCTGCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chr3L 2800099 5' - blood 374 2 74.26 GCAGCATACGAAATCAGTTTACAAATCTTTTGTGGGCCCCTTTTTAGTCTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 14454082 5' - HMS-Beagle2 489 1 91.04 CAGCCCCATAGCTCCAAATCCACATAGCCCGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGCCACTATGCAGCCAATTTTTT:1 + chr2R 1094683 5' - 1360 3342 1 71.29 ATGGGCTGGCCGCCTTCCTCACACTGCAGTCCGATCAAGGCGAACGGGTGATCTCGCACTCCAGAAGAACGCTGAACGCAGCGGAGAGG:1 - chr3L 23678119 5' + Osvaldo 21 1 66.29 TAGCAGTACAGAGAAAGCAAAGTACTATGAACTATGGTTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:2 + chr3L 9121814 5' + Transpac 35 2 61.39 TTTAAACTTAAATAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 + chrX 20974836 5' - opus 7488 2 66.34 CACCGGTAGTTGAATCAAGGAATTACAAAAAATCCATTGGCTTCGAAAAGTGTAAGCATATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chrX 494627 5' + 412 7093 2 41.58 CGGTGNTACCGGATCCGTGACGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2R 9426419 5' - P-element 2878 2 71.29 GTGTAAAGTTCGGTAAGTTCCACATGTAGTAATGTTACAACATCTAGGAAAATTAGGTACAGTACCACATGATACTATGGTAATTTATTTCAAACAATTTA:1 - chr3L 14958252 5' - HB 1521 1 76.24 AAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 + chr3R 14169259 5' + blood 43 2 68.32 GAAAATTGTAATTGTAATCCTAGGAATCCAAAAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTC:1 - chr3L 9925330 5' + Doc 3 1 75.25 ATATGTTATCTGCCACCCCGTTGCCGCCACCAACATTTTTTGTCACAATTTTTGCTGTCTGGGCGAAAGTTTTCATGTGGTTCTTCTACGGTAATTCTACG:1 - chr3L 2337913 5' - Fw3 409 1 49.50 AAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCG:1 - chr3R 1868211 5' + G-element 43 1 62.38 ACCACACACAGTGGCAGCGTCTTCAAAGCGTTCGTCAAGTTTAATTGTATTGGGGATTGGCGGATAAGACACACGAGGACATGTGAAAGGTCAGGAAGGC:1 - chr3R 30780488 5' + invader4 2736 1 52.00 GAGCGCAAAACATTGGAGGCAATCATGGGCATGCAAATCTTATATTACCTCCTTATTTCAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCCTCCCTAGGTAACCGT:1 + chr2L 10190190 5' + Cr1a 4000 1 76.24 GCACCAGCACCAGCACATAAACCCACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 31644127 5' - roo 9050 2 56.44 CAAGGCACACACTCTCTGCCGCTCGGCTCTCTGGCTATATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAA:1 + chr2R 14928212 5' - Ivk 336 1 66.34 TGAGTCAAGAAGTTGTGCCTCATGAAGCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAG:1 + chr3L 12452117 5' + 412 6 2 69.31 ATCAATGCCGCCGGAAAATGACTGCCGACGGTGAGGCAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 - chr3R 20884977 5' - flea 239 2 64.36 GTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 18507878 5' + jockey 33 1 51.00 GGCTTAATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 19095805 5' - roo 9037 1 60.40 AGAGGGGTTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTG:1 - chrX 17204138 5' + Tabor 6882 2 66.33 TAATACCGAATAAAAATAAAATAGATGATAAATTATATGAATTACCAGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCAACGCCTGCAGTCAATTGCACTCAATT:1 - chr2L 8960403 5' + Ivk 5158 1 53.47 ATTGTTTGTTGTTTGCTGCGGATTGTGTGAAGAACACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 2050826 5' + 412 42 2 68.32 GTTCANTGACGCAGCAAACTCTGGCCAAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chrX 7787323 5' + roo 8671 2 71.29 ACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAA:1 - chrX 17064828 5' + Tirant 23 2 52.00 TATCTCTCATTCGATGTGTTTAGATGATTTGTGCACATTCTTAAATGGTTTACCGTCCTTTACGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTT:1 + chr3L 24131071 5' - HMS-Beagle2 300 2 65.35 TATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATA:1 - chr3R 13423382 5' + 17.6 8 2 69.31 GATTTGACTTTGATGAAGGAATTAGCTTTTTTGGGTTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAT:1 - chr2R 14457755 5' + mdg1 7080 2 64.36 GCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr2L 107984 5' - P-element 2867 1 59.41 AACGTATTTAACAGAACGAAAGAAAATGGCTGAAAGTTTATTTTAAAAATGGTATTTCAAGTTTTTAATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGC:1 - chr2L 4723605 5' - 412 320 2 64.36 GCAAAGTTTGGATATTTTCCGGGGGTCTTGCCGATGCCGATGAAAAAGTGTCAGAAACTGAAGAAACGCTGGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCT:1 + chrX 22637835 5' + Tc1 1624 1 56.00 GGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2L 108041 5' + P-element 53 1 27.72 CATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chrX 21668890 5' + pogo 46 1 73.27 AATGCNGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 13347300 5' - roo 9026 1 72.28 CCAGCAGCAGCACATTTAGCTTGGGCACATCCTCATCCTTTTCCCGCGCCAATAGCGCACGGAGATTGGTTACAGATCACAACAGCTGATATGGCTCATGA:1 + chrX 6244314 5' + Helena 982 1 69.31 AATAGCACCTAATGGTGCGTTGTGGTGACGGTGGTTTCTAAGTCTGTGGGCATATCGGCTGCTGTGGAAGTTTGTTTGGTCTCCCAGTGGGACAACTTTTA:1 - chr3L 11838614 5' - G5A 2564 1 71.29 AAATAACTATAAAAACATAAGTAGTAATATAATTTAATTTTTCAAACGTCAAAAGATGAATACTCTAAGTACAAATATTCTAATATAAA:1 + chrX 22884679 5' - 1360 392 1 61.80 TTACGGATAAACCGAGATCTTGCCTCTGGATTCCTTACAAGTCGGGAGTACTTATCGCCAGCAGAATCATTCCAACAGTACAACTACACACATATTAGCTA:1 + chr2L 23004833 5' - transib2 311 1 75.25 ACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2L 3694154 5' - roo 9033 1 69.31 CTTGAAACGACGCTAAAAAAAAAAATAAAAAA:1 + chr3R 6854940 5' + G-element 4324 1 68.75 TTAAGAATATCCAGGTCGCAGTATATTTATCTCACATAAGAACCAAAAGGACATTATTAATTAATTATTAATTAGTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATT:1 - chr2L 17841105 5' - Juan 4071 1 55.45 GTTTTTGAGTAGCGATGAAATGTGGAACTATAGGGTATTACAAGTAACCACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGT:1 - chr3R 8548806 5' + 17.6 6944 1 60.40 GATGACTTAACTGTCCAGTTATTACCATCCGTCTGATTCAAATCCATCAAACTTGAGATAATTATCTTAGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGC:1 - chr3L 6185634 5' - flea 4773 2 75.00 CACAANTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 12452148 5' + 412 7090 2 61.39 TAGCAATTAAATCTACCTTTCTTTTATTCGCAATTTGTTTGTTTGCTTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr2L 17430729 5' - opus 7477 2 60.40 TACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2L 326157 5' - roo 9014 2 80.20 ATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 - chr3R 11165687 5' - Tabor 433 2 75.25 GTATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTT:1 - chr3L 23869139 5' - gypsy 417 2 70.30 ATTTGGGTGGCAACGATCTTACCAATATCCCGCAGAAAGCTCTTTCCATTTTGAGCACCTTAAAGAAACTGGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTA:1 - chr2R 8011964 5' - Tabor 7264 2 79.21 TGTTATGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chrX 9248349 5' - pogo 2061 1 69.31 AGAAGGTGATAAAGCAGAGCGCTGAATGTAATATAAAAACAAGTTCCCACTATCAGATGCCTGTTACTTACCTAGTGTAAATGCGAAATTTCATAATTTTT:1 - chrX 694473 5' - INE-1 517 1 89.11 ATTGCAAAAAGTGTAAGATAATATGGGATTTTTGTGTATAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATT:1 - chrX 12729585 5' - gypsy10 5944 2 70.30 TAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTG:1 + chr3L 6620580 5' - accord 7036 2 57.33 AAAAAAATGGATGTGACTCGAAGCATTTATAGTACCTAAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCCAGAACAACTCGGCTATTGATCCAGATC:1 + chr4 616274 5' - INE-1 92 1 79.21 AACATNGCTTATATTCTTTAATTAAAATGCAAAAAGGCCAATTGCAAATGTGTTACGGCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGATTTGCTTATCGCGTAATTA:1 + chrX 17319378 5' + Ivk 56 1 59.41 AAAGCGGATATTACAGTGTGAAGATGAGGCGTGAAGTCCAAATTGAATACGTGAAATATACATAATATAAATAACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGAT:1 - chr2R 9375272 5' + HMS-Beagle 6796 1 77.23 AAAATNAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCA:1 - chr2L 12074396 5' + Quasimodo 42 2 74.26 TTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATACTAATACGATACGAATACTAATTCCTGTTACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr2L 7112794 5' + roo 17 2 66.00 CTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - chr3R 7522349 5' - blood 7336 1 79.21 TGAGCAACCGTTGACCTGACACCCCCCCCCACCCTTTAATGCATTTTCAAGGCTTTTTTCTTTTTCCTCTTTTT:1 - chrX 15862941 5' - Doc2-element 236 1 86.49 AAGAAGCTATTTCTTAAAAAATGCTTCTTACCAATGATTCTACCGATTTACCTGAATTTAGAGATATCTTTTAGATAGTCTTTTGAAATTTGAAAAAATTT:1 + chr2R 18383686 5' + FB 234 1 53.47 CTAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 18881542 5' - roo 350 2 81.19 GCCAACAAAAGAATGCTTTTCCATGTGGACGGAAGCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCC:1 + chr2L 19075627 5' + Transpac 3 2 76.24 GCCGTTGTCTTATCCTCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 + chr3R 14169216 5' + blood 7011 1 75.25 TACTGTCTTTTGCCAGTTTCATGAAAAATATATTTATATTTTTTTTAAGTCAGATTGCATGAATATTAAGTACCATATGTTGGCTCTCTGAGCAAGAAATT:1 + chr3R 5172105 5' + Tc1 118 1 68.32 GAAAAAGTCATCCTACAATATAGCATATACATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCA:1 - chr3R 21848153 5' + rover 44 2 77.23 GAGATTCGATAAAAACGAAAATACGATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3R 29432728 5' + 297 14 2 65.35 GTTAATAAACTATAAATTACTATCAAAAAACCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3L 18009615 5' - roo 405 1 61.02 CGGATCGTTCCTGTTACGTGTCCCTACACTAAAAGAAACGAGCAGTGGAATTGGTACTTTTAGAGCAATATCCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCT:1 - chr2R 21140720 5' + Stalker4 6961 4 72.28 TGATGCTTGCGTTGTGCTTACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGT:1 - chr2R 21113223 5' + jockey 184 1 87.13 GTCGGTTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACAGCAGCTGTGGTCAATGCTGAC:1 - chr3L 6129869 5' + jockey 4705 1 50.50 GATATTACACAAAGAGAAAATGTTGAAAGCTGTGACCTAAACATCACCAAGATCACAAGCCTTTTGTGTTGTTTATTGATTAACGTTCAGCTTAAGACTGA:1 + chr3R 13425467 5' - 17.6 348 2 61.39 CCCTGTGATCCCAACCGGAATTCTTGAGCTGGCATTGGATTTCGGTTGACTGTCGTGTTGGTGATGCGCACCTCGACGTGGATGTCTACGTCGTGCAGCTC:1 + chr3L 22690313 5' - G5A 91 1 64.36 ATTGCTTAAATTATTTTTGAAAAAGTTACGGTCCCCAAACACAGAATATGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:2 + chr3R 10321020 5' + roo 8690 2 53.47 AGTTCTTCGATGTCAAGGAACCTTGTATTTATGTTTCAAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr2L 13250469 5' - pogo 2100 1 75.25 CATCATCGCCAGGTAAAAGCATATTGCACACACAGATTGCAATGCATCTTAATGAGCGCTGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTAC:1 + chr2L 17680259 5' + BS 4656 1 65.35 TATCAAAGGCTCTCCTGAATTTACATCTCTAATGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTATGCGGTTTTGAC:1 + chr2R 24425513 5' - Quasimodo 223 2 66.34 GGTGGTGGTGCTGCCGGCGACTGGCAGGACTCCGAGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTT:1 + chr3R 14648224 5' - Doc 4427 1 65.35 AGTCCCTTTTGTGGATTACGATTTGATAAGGATTTGGATGTTGTATGTTTTCTGTGTCCCATAAATATAAATATTGTGACAAAGTGTCACAATGTATTGAC:1 + chr2R 21140599 5' - Stalker4 7016 4 66.34 ATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:2 - chr2L 19679772 5' + Doc 49 1 53.47 ACTATTGGCCATATCCCTGGAGGACAAAAAGCACTTCCATGAGGAGGAGAAGAACTACACTACTCCGGATGTACCCAACAGATACCAGA:1 + chr3L 3183286 5' + Idefix 94 2 67.42 TCTTACGTTTATTTTGATGTGTGGCGGCAAAAGGGCGTGAAATACGCCCGAAAAAAGGGAGACCGGAAGAGGAGGGTAAGAAGCTTTGTATGAACAATGCT:1 + chr2R 14652756 5' + gypsy 7026 2 81.19 CATGAGTTAAATTTTCGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr2R 8378590 5' - pogo 2075 1 56.44 AAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACA:2 + chr3L 24213770 5' - invader2 5083 2 54.46 TCTCCTCAACGATTTTCCTAAATATACTTATGGCTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATAT:1 + chrX 4190344 5' + I-element 5028 1 67.33 GTAGTTTATTTTGTCCTTAATTGATGAAAATCATAAACATGACGTTTTAAAGATGTTAATAAGGCCTCACATATATATTTTTTATTAAAAACAAAAAAAAA:1 + chr3L 16061998 5' + transib2 2633 2 80.20 CCAGACAGACACAAAAAGAGTTAAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr2R 10911923 5' + 412 87 2 77.23 CACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 + chr3L 5964258 5' + BS 42 1 67.33 CTTACTGGAGCATAGCTTTTGTTTTGATGCTAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCCGCAAGGTATTCACCAC:1 - chrX 15895575 5' + Max-element 8362 1 68.04 GACCATGAAATAATTACATTTTATTATATATTATCCTCCAGAAATGACTTCTATGGCTCTGCAACCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr3R 19967694 5' + pogo 9 1 70.30 GCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:3 + chr3R 27189269 5' + roo 8703 2 66.34 AACAAAAACCAGAAACAATGATCTCTTGTTGTGTTTTTATAAATATAAAAATATATATTCATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 + chr2R 6493933 5' + 17.6 6941 1 64.36 ATACACATCTTTGTGCTTAGCTCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chrX 14531565 5' + 412 7080 2 56.44 ATTTACTCGCCTGTGCAAATGAGTCACATGGAAAAAGCGAGCAGATAAAATGAAAACAAAGACTGAGTGACCATAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 - chrX 4155011 5' - blood 374 2 75.25 AAACAAAAACTTCTTCGTGTCACGACTGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr2R 16366853 5' + hobo 14 1 64.36 CAAGCGTTTGACCTACAGAGAAAGAAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chr3L 6024621 5' - roo 395 1 66.34 CAGCTNGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chrX 6997213 5' - P-element 2832 1 23.76 ATTTTTCTGGGTGCCATCCCGGCAGAATTGCTTTCGACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr2R 19936594 5' + roo 12 2 68.32 GGTCATTTATAGCGGGGCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATG:1 - chr2L 18914627 5' - mdg1 411 2 68.32 GAAATCGTTGAGGAATCATATTTTCGGGGATTCGAAAGCGTGCGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTCTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGA:1 - chrX 18424681 5' - Quasimodo 327 2 58.42 AGAAGACATCGAACCATCTGTAAGATTGAAGAATTCTTCCATTTGGGTTTTGCTTTTCACATTTCACTTGCATTTGTAACCAGTTATATTCTGCAGCATTT:1 - chr3R 22606823 5' - Chouto 6137 1 75.25 GCAATAGTCAATTTGCGCGATTATCAGGTACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTTGTT:1 - chr2R 5660177 5' + Rt1b 4696 1 61.82 AAAAAACCGGTTTTACGGACTTATGCATACCCTGCAGCATTAATGGGACTAGGTTAAACACATTCAGTCTGCTGCCAAGTACGGTTTCCAGAGAGCTCCGT:1 + chr3L 11297593 5' - Rt1c 5145 1 68.32 GGAGGAGTCACCTTACCTGCACAGCCCCTACCAGGTGGCCATTATAGCCACCGACCTGCACCACGAGGATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTA:1 + chr2R 12180703 5' + accord 7125 2 71.29 AGTCAAGCCACATTTTTTGCACCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 - chr3L 833405 5' + P-element 51 1 16.33 CGAAANAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCG:1 - chr3R 1868228 5' + G-element 26 1 53.47 TATCTTTAGAAATGTATATTTTCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCTCGAAAATCGTCTTCGA:1 - chrX 17105949 5' + 1360 3192 1 74.00 GATATTTATGGCATCGCCCGGGCAGATTATGCGGCTAAAACGTTTAGCTAATGAAATTTGCCGCAGCTCCGTTGTCAGAGCAAAAGAAAAAAAAAAACTTC:1 - chr2R 13325891 5' - FB 884 1 65.35 TCCCATTTATTTATGGCTGGCATTAACAAGTTGATGCCAACAGACACACACACTTACACACACTCACACACCCTCTTAAGCACACACACACACATAATCAC:1 - chr3R 9486071 5' + accord 7033 2 76.24 GCTTAATTGCAATTCAGGGCCAGTGGCAGTGGGCCTCGCAATTTGCGAGCTTTTCAGTTGACCCAAAGCCATTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr2L 1828867 5' - 412 488 2 74.26 AACAATTTACCCCGAAACCCGTTTACAATTCCGTTTTAAACCCTTTACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr3L 5716854 5' - copia 248 1 71.00 AATAAACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 + chr3L 2292058 5' + Max-element 11 2 58.42 GTGGAGCAGCCGAAATTGCTATTTTAAGCAATTTATAAGCATACTTTGAGGCGCCCCCACACCCTTAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3L 13652585 5' - hobo 2930 1 70.30 GTCCAATAAAATAATTGTTTATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 12767042 5' + 412 7095 2 79.31 GTTGANTTCTTTCCGTGAAAGTGAACAAAGAGCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 7792234 5' - 412 7501 2 68.32 GAACACGCAGACCCTTTGTGGAAATACCCTTTCCAAGTTGGGGCTGTGTGTTGCAAAGGGAACTGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTA:1 - chr3R 31369398 5' + Transpac 11 2 69.31 GGTGAAGACAAATAAATGCTGCCAGCAGCCGGAGATGTCGATAAGCAGTACGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr2R 20411960 5' + 297 6590 2 67.33 AAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chrX 18012700 5' - roo 355 2 79.21 CAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3R 14169244 5' + blood 7031 2 53.76 TGCGAGACTATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr3L 21841305 5' - P-element 2846 1 38.61 TAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 + chr2L 1129080 5' + HMS-Beagle 41 2 67.33 GTAACTTTTTCTCGACAAATGAATTTTGTACTTATTTACCCAAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAA:1 - chr2L 8740952 5' - Burdock 225 2 60.40 GATTCAATAGGTAGATGGCGTAGGTGAACTTGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTAT:1 + chrX 17669764 5' + Quasimodo 450 2 69.31 TTATTAATGATTTGTTTAACTTAGAAATGTTTAATGAATTGAGGAATGCTAATTTCGTTCATCAGAGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATC:1 - chr3L 1809900 5' - diver 213 1 67.33 AATTTGATCTTATCCTGGCCACAAAAGACAGGCCACCATAAAGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCAT:1 + chr3L 5977260 5' - hobo 2539 1 58.42 AGTTTCATAGCGTTTCTCTATAAAATTTTCGAATTATGATACGAGCGAAATCACATCCACATCCTTATTTAAATTATAAAGCTAGAGAGCTGCATTTTTGT:1 + chr3R 2119898 5' - transib3 2815 1 74.26 TGACGTGATTAAGAGCACTTAAACTACGCAGAGGCCTACGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCG:1 - chr3R 20966980 5' - roo 234 2 77.23 ACGTAACCATGATTTTCGCCATCTGGAGCTTTGCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAG:1 + chr3R 22531570 5' + Juan 4087 1 67.33 ACAGAGAAAGCAAAGTACTATGAACTATGGTTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr3L 9121821 5' + Transpac 38 2 67.01 ATCATTTGTCGCCGTGCGTGTTCTCCAGGGTTGCCACCACCAGCTTGACTGCAGCACTGCGTCGTCTAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTT:1 + chr2R 8319008 5' + P-element 2811 1 50.50 TTTTAAGGGCTGTACAATAAATTTGGTATGAAATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGA:1 - chr3R 19114287 5' - 297 6966 2 69.31 GGAGTAAGGGTAGATGGATGGCGCTGCTGGCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTATCGAATCCAGCAATCGTATGCTCACTGAC:1 + chr2L 12355134 5' - R1A1-element 324 1 75.25 CAATAAAACAAATTAAATATTTGGCAATCGTTTTGTGTCGATTTTTTTGATTATCGTTCCATTTGCTGTGAGCTCAACCTCCTTTCTCGCCATCATCCACT:1 - chr2L 8146150 5' - R2-element 497 1 65.35 AAAACATATTACTTTCAATTAGATGTACACATAGTGGAGTGCTAAAACCAACTTCAAGGCAGAGCAAACACAGAACAACACACACACACACACATGCAGAA:1 + chr2L 20959242 5' + Quasimodo 39 2 58.42 TAAGAGGTAAATTCAGTAAACAACGTAAACGTGTTTTGTTTAGAAATTTCTCATTTATTAAAAATTCTTGTGATGCATTTGCCTTAACGTTATTATTATTT:1 - chr3L 23590341 5' + 1360 306 1 55.45 ACGATGATGATGTTGCTTTGTTGTCCATCTGGCCAAATCGAGGACCCACATAAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr3R 25440144 5' - pogo 2080 1 58.42 CGTCGCACGAAATTAGCAGGCCTAAATTATGGCCATAACTGCTAATTGCATATTTGATTTCAATTAACAGCCGAGACACTGGACCAAAGACACAAGAACTC:1 - chr2R 14380554 5' - hobo 340 1 63.37 GCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3R 19114207 5' + 297 45 2 80.20 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTA:1 + chr3R 19450176 5' + roo 45 2 59.41 CTTAANTAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 + chrX 20974842 5' - opus 479 2 59.41 TTCAAATGCAGCTACGGCGGTATCTCAACTGGTTTTGTTTAAAGCGTTTATGGCGGACCTCCAGTCATCGCCAGCCGAAATGCTTTTTCGCACCACTATTC:1 + chrX 6137268 5' + Chimpo 3770 1 55.45 TTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2L 6227698 5' + roo 8717 2 77.23 GTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:2 + chrX 5018650 5' + opus 50 4 82.18 CTGCATGAGAAGAGAGCATCATCAAAACCGCATAAAAAATATATATATACAATAGATACCTTAATAAGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTA:1 - chrX 9011227 5' + jockey 4528 1 61.05 ATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGAC:2 - chr3R 9952267 5' + Ivk 11 1 67.33 ACTCTNTGAACGACCTGGGTAAGGTGATTAGCAACATGAGGCAGGACCAATCACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAG:1 - chrX 6089405 5' + accord 7139 2 52.48 ATTTANAGTAACCTTCCTGCGGTAAATCCTTTGTAAAACACACTTAAAATTTAAATGCATCCTTGATGTATGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATA:1 - chr3R 8548485 5' - 17.6 489 2 77.23 TGGTGCCTGCTGCCTGGCGAGTGTGGAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGC:1 - chr3R 15380987 5' - accord 7190 2 74.26 TCACGAGTCAGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 25918897 5' + roo 36 2 61.39 AAAGCTGGATAAATATACTTTTGTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCAC:1 + chr3R 28755924 5' + 3S18 19 2 59.41 AAAATAAGTTTGTTACCAGTTTTACAGAAAATATAATATATAATAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCAT:2 - chr3L 24131165 5' + HMS-Beagle2 6911 2 56.44 TGTCATTTACAAATTGCATTTAAAATGCCGCCAATTGATTACATTTTGCATACAAAACTGCCAACTGTTTTGCCATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 2762225 5' + roo 4 2 74.26 GACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 14525264 5' + hobo 37 1 62.38 TATATATATATATATATATTTTTTTTTTTATCTGTGTATCAGTTATCATGAGTAAGGTCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAAT:1 + chr3L 16725555 5' + gypsy9 40 2 58.42 ATGGGCTAGAAACGCAAATTAATTATAATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3R 9369911 5' + roo 8676 2 67.33 ATAAGCAAACAAAGAAGTTTTTGCTGTCTGGCTTTTGGCTTGTTTAAGAAAAAAATATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 + chr3R 19622897 5' - pogo 2083 1 61.39 TTACTCCACGGACTTAGTTATACACTCTTCCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATACTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr2L 3694105 5' + roo 45 2 68.32 GGAGAGCATAATTGATATGCATAATCATTATTCGGTTTTTGTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chrX 5018610 5' + opus 7 2 71.43 AAACATGAAAAGCCTAAAAGTGTTTTAAAAATCCAAGATTTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chrX 13134971 5' + jockey 4809 1 60.00 AGGTTGTGAAGTTGCGAATAAATCGTACAATACATCAAAACATTTTCTATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGAT:1 - chr3R 7723615 5' + F-element 4527 1 53.47 CTACTATAGAACTTTAAACTTAAATAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGC:1 + chrX 20974824 5' - opus 7500 2 76.24 CCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chrX 8948661 5' + blood 7063 2 76.24 CGAATAAATTCAAAGACTAACGAAACAGGAATCGGTTTACACAATGTATGGAGAATGGGGGACGTCAACTATCAGATTTAATCTTCAAAAAAATATAAATA:1 - chr2L 18031261 5' + mariner2 784 1 71.29 CACTTTTGGCTTGCAAGCAAACGCGTTACAGCCAACCTGTCGTATGAGCGATATTTATATGTTTAAGTCATTATGTATATCTTCGTTTATAATGTACCATT:1 + chrX 18369087 5' - Porto1 4369 1 64.36 TTTAGCACCACTCCAGTTTATCCGATTTTGAGCGTCGGATACGCTGATATTTTCGTTTTGTTTATTGTTTTCACTAGTTTCTTTTGTTTATCTTGTTCACA:1 + chr3R 14354979 5' - Porto1 153 1 77.23 GAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 + chr2L 20118705 5' + Max-element 8276 2 68.42 GCTCAACCGTGAGATTTGGGTCAACCAGTCGCGGGTGATTGGCGTGGAGTTCGATCAGTTCACCAACCGGGAGACTAGTATGAGATTAGTCTAATGCACAG:1 + chrX 12328162 5' - diver2 4557 2 74.26 CAGATCGACAATATTAGAATTAGAAGTGCAGCGAGATAAGTACTACTGCTTTTAATCAGAAAACTACTTGCGGAGAATAAATAAAATATAAAAAAATCTA:1 + chr2L 7029252 5' + transib4 2278 1 75.00 CATTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCT:1 + chrX 16798189 5' + diver 17 2 62.38 AAAAGCCAATGCACAAGTCAAAAGTATTTCACTTTTTAATAAGACATCAAGAAGATAAGATGATAAATATCAATGTAACGGCGATGGTAATTACGCGATAA:1 + chr2R 15376213 5' - Ivk 64 1 59.41 CTGGGTGCATACACATCCATGGAGGCCTGCGCCTCTGGCAGTTGGACCAGAATGGTGCATATATTGAGGTAGGTTCGTTGGATGATTTCTACGCTGCTGTT:1 - chr2R 15539386 5' - Fw2 3584 1 74.26 GTACTTACGAATTCATATGTACATGTGTATGTTATGTGTGCGTACGCATAAAAGTGCACGCAATTTAAAATGTGAATGTTTTTTTTCTTTTTTGTTGTTGT:1 - chrX 3080952 5' - gypsy7 5002 1 55.45 TGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCG:1 - chr2R 6984400 5' - HMS-Beagle2 7169 2 54.46 CAGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr2R 5084089 5' + F-element 29 1 49.50 TGGCCCAAGTACCAGACTCACATTTACAGTTAAGATCGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTG:1 + chr2R 23787483 5' - Quasimodo 7068 2 67.33 GTTAATGACAACGCTGTATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr2L 13447088 5' - HMS-Beagle 7028 2 65.35 GTTCCCCCACACGACAAATCTAACTAAACACACCCAATTCGCATGTCGAACGCATTGCAAGAACCTTTTGCTGCAGACCGGCAATTAAAAGGAATGGAAAT:1 + chrX 1024727 5' - GATE 348 1 64.36 AATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 - chr2L 11551386 5' + Max-element 51 2 74.26 TATATTTTCTAATTAATTAAGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:2 + chr2L 1626507 5' - roo 403 1 72.28 ATAGCCAATAAACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACA:1 + chr3L 2292052 5' + Max-element 8239 2 65.00 CCAGATGCTTCATGCCCTCTAGGATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGC:2 + chrX 18527081 5' + 412 7224 2 77.23 AGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGC:1 + chr2L 15956034 5' + Max-element 32 2 56.44 TTTCCCCCTTTTTCCGGGCTTCTTATTTCTTACGGGCTGTCGCCGCGTCTTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTT:1 - chr2R 12543347 5' - Idefix 7077 2 53.47 AATATTTTAAAAAAAATAATTGAATAAAATAACTATGTTACGTTATTTTTTTAAAGGGAAGGAGTTATGGTATGCGTACATACGCATTGTCAGTGCTA:1 - chrX 21792825 5' + gypsy11 4063 2 86.73 ATTTGCGACGCCGCCAGTTGGTGAAAAAATGAGTCATTGCAAAAAGTGTAAGATAATATGGGATTTTTGTGTATAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGA:1 - chrX 12729620 5' - gypsy10 339 2 74.26 GCCTCTAACAGATTCCAAGACCGTTCTAGGGCGTACACTTAATGAGTTCACTTCGGGTGTTTGAATCAAACTGACTCCCTACTGCGAGGGCTTCGGCTTTT:1 - chr3R 10485925 5' - rooA 7531 2 68.32 AGAAACAAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 18503572 5' - roo 396 1 52.00 GTAAATTACTTTCCCCCACACACGCCCCAGCCAAGTGGGCCGATATTTTTGCCATTTTTTTTTTGTTTTTTATTTTTT:1 - chrX 4842500 5' + hopper 147 113 66.67 TCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTCTGGGCTATGGAGTGTTACATCAGGGGAGCTCAAACAGGAATCTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCAAAGTCA:1 + chr2R 4261971 5' - invader4 2699 1 75.25 GTAAAGCATCTATAGAAGGAAAGTTGTACTATAATGCGCATAGTCGCATAATAAATAACAATACTCGAAATTGTTGTCTGTTAATTGGCGCCTACGGCACT:1 - chrX 9129866 5' + gypsy4 276 1 68.32 GTCTTTTCTCAGCACATACTCGTAGCATCGAAAAAACCAAAAAAAATATACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTA:1 - chr3R 19962769 5' - jockey 4620 1 52.48 CTACTTACAAAAACTGTGAATATACAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 - chr2R 22993753 5' - opus 445 2 82.00 TTATTGTCATTTTATAGGTCAATGTATGTATTATATATAAGTCATTACTGATGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTT:2 + chr2L 8959925 5' + Ivk 5119 1 56.44 ACATTCTTACATATATCATAGTAACGGTTACGTATCAATTTTTTTTCATTATTATTTTTTTTCCCTCTTTTTTTATTTACAATCTGTCTTAAAAAAGTATG:1 + chr2L 19817823 5' - G4 3825 1 58.42 GAAGAGAAAAACAATTTTAATCTTCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 25918874 5' + roo 13 2 65.35 CTAATCTGCCCAGTCAAACTACAATATACCCATCGTCCTTTTGAGTTGTTTTACGTGGTCGGCCACTACGCGCAACGTTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTTA:1 - chr2L 212684 5' - Tc1-2 493 1 76.24 ACTTTNTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACC:1 - chr2R 12185432 5' + accord 2 2 72.28 TCTACTTGCCCCCGAAGGTGAGCCTTCTCCTGTTGGGTTCGCTGTTTCCATTCGAGGTGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCG:1 - chr3L 22018466 5' - 412 7265 2 60.40 TTAACATTTTCTGACTTAAAATCCCTTTTCAAAGAGATTTATTTAAGGTTTCAATTCAGGCATTCGAGTCATACACAATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr3L 10698613 5' + roo 2 2 65.35 TCAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAAT:1 + chrX 21668048 5' - Stalker2 7636 2 64.36 TAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:2 + chrX 20974848 5' - opus 7476 2 62.38 ATAAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAA:1 + chr2L 17841052 5' + Juan 4072 1 75.25 CAATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 13682625 5' - roo 9041 1 57.43 AAAATCTGCCTGTCTCTCGGGTCTGCGGCATTGGGGTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3R 21296549 5' - P-element 2849 1 42.57 GTTTCGTCAGATCGGAAGGATGAATTGGGAATAACGGATAAACCCCATATCACACCTAGGGAACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr3R 19837108 5' + P-element 12 1 66.34 AAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 + chr2R 2832927 5' - 1360 3341 1 76.24 AGCAANCCTCAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chr3R 18507891 5' + jockey 21 1 62.38 CATAAACATATTAGTTTCTTGTGTCCTTTAGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr2L 8542895 5' - P-element 2841 1 33.66 CTTCAACTCCTGCTTCTGGACCTTCAAGTTGTGCGCATAGTGGCCCGAGATCGAAAAATGCAAAGATGTGCAAAAAAAAATAAAATAATAAAATAAAAAAA:1 - chr3R 5847504 5' + BS4 726 2 53.47 TCGCCCTCCACAAACGACTGCGTCATCGTCGTCATCATCGCCGTGGCCAAAATCCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTT:1 - chrX 17366036 5' + Max-element 226 2 61.39 AAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 + chrX 4890049 5' + 297 6624 2 75.25 CATCAGCACGGGGCCTTCCGAGTTCTTTATAAAAGCAGACAACATTTACTGTCTCCATGCTTATCTGAACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTT:1 + chr2L 1168266 5' - Cr1a 386 1 75.25 ATCCCCATTCTTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATAT:1 - chr3L 11909987 5' - Tabor 438 2 68.32 TGTTTACCTTTTTCTGCTTATCAGCTTGGTAGAGGTCGTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAAT:1 + chr2R 1395461 5' + gypsy 36 2 62.38 CAAACTTAAATATCTTTCTCTGTTATAGAGCGCTACAGCAGACAGCTCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAATTTTATGTGTGCACACGTATGCTC:1 + chr3L 23597286 5' + 1360 176 1 74.26 ATTTCCATGAGGCATTCAAATTACCAGCGGACACGCCCAATTGCCCACTCTAACGCCCAAAAACCGCACGAAACTGCCACGCCCACACTTTTGAAAAATGT:1 - chr3L 5534642 5' + INE-1 255 1 58.42 GGTGGNGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 12538525 5' + roo 8692 2 54.46 GCACTATAGGCAGAATGGCACACGATTTTTTCGTAGTGGCTCTAGAGCTCTATGTGTGTGTTTTTTCACAAGTATGCCAATTTGCAGTATTTTAGTATTA:1 - chr3L 17870709 5' - hopper2 1550 1 79.00 TGTTGGGTGCTTATATCTATGTATTCTTTATTACATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATA:1 - chrY 3648877 5' - 17.6 452 2 75.25 AGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACGTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAG:1 + chr3L 23112568 5' + R1A1-element 42 1 51.49 CGCCGGCAAAACTCTCCTGTTCTCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACAT:1 - chr3R 28326773 5' - P-element 2866 1 59.41 AATAACGTTTATGGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 - chr3L 8924631 5' + Stalker2 7283 2 56.44 ATGGGNGCCCTGCTGATAGTGCCTTCTCCCTCTTAGCTTTGTCAGTCGATGGAGAAGAGGTTCGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAACACAGGTGGAATCGTG:1 + chr2R 18689909 5' - gypsy12 9937 2 54.46 AGATAAGATTGCTGGCCAGTGAAAAGAGATATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAA:1 - chr3R 19121719 5' - accord 342 2 70.30 AAATGTTTTTAATAAATTAATTATTGATTGAATTTGTATATAGGAACATAGAATAATTAAACATAATTAATAAACAATAATTAAAAAATTTTACAATTAAA:1 + chr3L 6131621 5' + 1360 3034 1 56.44 CTGGCCATATCAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 - chr3R 1206465 5' - I-element 5336 1 59.41 CTTCTTGGCCAAAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAA:1 + chr3R 6147241 5' - copia 236 1 66.34 AATGGNTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chrX 19095800 5' - roo 9032 1 65.35 CGCCTTGCACGACGGTGTGTTCAGTATTAGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTAAAGATAATAAGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTC:1 + chr2R 4886569 5' - Cr1a 4191 1 71.29 ACAGCNGAAGGCAATCAAATCAATACAGTCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGAAAAT:1 + chr3L 15030975 5' + Quasimodo 475 2 70.30 TGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCTTTTATCTTTATTT:1 - chr3L 4048517 5' + 3S18 5799 2 52.48 AGGTTCCTCTGCACAAAAATTTATTATCAAGAAGATAAGATGATGAAGATCAATGTAACGGCGATAAGCTGGGCGATGGTAATTCCGCGATAAGTAAAGCG:1 - chr2R 3466092 5' - Ivk 56 1 75.25 GCCAACAATAATTTTTCATTAGGCCAAGAACAACAAAATCGAACAATATTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCT:1 + chr2L 2909532 5' - pogo 2078 1 55.45 TATGTTTTGAAGTGTTCAGCAAGAGTGTCTACTTTTTCTTTGTTTGATCTCGCCCATGTGTTGTTGTAAAATTATAACCTGCGGGCGTGTAAATTTTGTTT:1 + chr2R 1997871 5' + Gypsy12A_LTR 327 1 66.34 ATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCT:1 + chrX 21772492 5' - gypsy3 6548 1 66.34 AAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 - chr3R 7388417 5' - HMS-Beagle 7016 2 57.43 ATCGCNATGCCTGGCCATTTTCTTTCAGTGTGCCAACATCGCGGTGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chrX 6458169 5' + blood 31 2 54.46 AGGAGGTTTTGGATGGGTTCATGATTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAA:1 - chr2L 18391006 5' - roo 60 2 79.21 CGAGATCACAGCGTTCAAACTTGTTTTATACTTTTTAACAAGTCCAGTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCA:1 + chr3L 21501144 5' + 1360 28 1 68.32 CGCGGNACGCCGACCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 6654723 5' + P-element 47 1 31.68 ATTTCAGAAGATTAACGATGCAGCATCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCATCTCAGTCTA:1 + chr2R 23305410 5' + I-element 26 1 50.50 CAGAGAGACCAGCACCTGGATACCCATAAACAAAACACAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAA:1 + chr2R 12414412 5' + Porto1 248 1 71.29 TGTTTCTTTATCAATCCCCGATATATATATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTTAATATTCGCGCCACCCAAACTGG:1 - chrX 7506421 5' + McClintock 42 2 80.20 TCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3R 25633339 5' + Tirant 40 2 66.34 GCTCCCAAATATCAATTCGATCACTAAGCCTGACCTTGTCCCACTGCACCTGCAGCTCCAGAATTTATACCGTTACCTTCACCACCTGGCGAAGTCACTGG:1 - chr3R 21879150 5' + Chimpo 4233 1 57.43 TAAGCATTGGAAAGGTACATAGTTAACACCTCTGCGTAAGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chrX 4009280 5' - 412 457 2 55.45 CGTAACCCACAAAAAGGTAACCAAAACCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr3L 21203052 5' - pogo 2054 1 71.29 CTTGAGTTTGGGTTTTTGGCGGGTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:1 - chr2L 13447198 5' + HMS-Beagle 10 2 69.31 TCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chr2R 23305435 5' + I-element 51 1 73.27 ATTTAATGGAAAACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 - chr3L 9772286 5' + 297 19 2 59.41 AATCATCCTTTAAGCAGTGTTCATAATTGGGCTTCAGTCTTAAGGGAAAGGGTTCATAGTGCCACTCGAACATTCAAACCTTATGGAAAGATATTTCAATA:1 - chr3R 28772796 5' + Tc1-2 1273 1 74.26 AGCATTGGAAAGGTACATAGTTAACACCTCTGCGTAAGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 + chrX 4009282 5' - 412 455 2 57.43 GTTATGAGAAATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGG:2 - chr3L 2292154 5' - Max-element 8508 2 49.50 TGTGGGCAACAAAAGTCGAAAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 + chrX 4488859 5' - 412 7524 2 58.00 AGTTCAACACTTTAGCAATTGAATATAAAACAAGAGAGAATTCTATAGTGGGTGTGGCCAAAAGTTTTTTTGACTAGATCGACTCGGCTATTGATATTGAT:1 + chr2L 17361716 5' - INE-1 93 1 54.46 AATCTTCTTGCTGGCAGTTTCTGTTGCGGGAAAAACTAATTTGGACTGGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCC:1 - chr3R 31830982 5' - F-element 4441 1 52.48 ATATCTCTGTGGTATATCTCTGTTGCATAAGGTGCAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGCTGTACTGGTAGGTAATGAACTTGACACCGTTTGGAATGGGCT:1 - chrX 19211675 5' - Doc3-element 455 1 78.22 CAGGAATCCCCATTCTTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTAT:1 - chr3L 11909992 5' - Tabor 7282 2 63.37 AGTTCCGATAACTGACTTTGCATATTATCTAAGACTAGACTACATAGCTTTGAAGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAGA:1 - chr3R 19448468 5' - roo 8750 2 44.55 GAACGGTTGAATAAGTACGAAATTAATTGTGTGTTTTAAATCAATTTAAAATGGCTATATATCTTCTGCCACAAGAAATATAGTTTTTATATTTAAGATAA:1 + chr3R 18487067 5' - F-element 172 1 64.36 ATTTGNTAACCTGAAACCTGATTACATATATTTGTTGTTTTTAAAATTTTTTGGTCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 + chrX 14796838 5' + transib2 19 1 59.41 AACATTCTTGTAAGTTTAAAATAAAAATCAGTATAAAATGCTGAACGCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chr3R 12136269 5' + roo 29 2 53.47 TATTTTTTATTTGCCTTCAGCCAGATGCTTCAATATCATTCATATATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTT:1 + chr3R 14164076 5' + Quasimodo 17 2 67.33 TCACGGGCCACGATAAATGCAATTAAGCGGACAAAAACTAATTGAGAAATATGTGTTCAGGCGAAGACATTAGAATAACGAGATG:1 + chr2R 8414622 5' - 1360 3386 2 56.47 AATTGAAAACTTTATTTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTT:2 + chr2R 9375149 5' - HMS-Beagle 236 2 72.28 GAAAATTGGTCGGTCCAAAAGAGAGATAAACAGCGATGACAATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGAT:1 - chr3L 20248390 5' + Transpac 14 2 66.34 GTTTTGAACCACAGTGTTGTCAAATTGGAAGACAATAGCTTATACCAGCAAAGAACTTTTTTCTAAATTTAAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCA:1 + chr2L 15372843 5' + Doc 154 1 66.34 ACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chrX 10251732 5' + flea 30 2 59.41 TAGAGGATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAA:1 - chr2R 12213973 5' - Transpac 260 2 76.24 ATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAA:1 + chrX 15851241 5' + INE-1 122 1 63.37 CAGTGGTGGGCGCCAGCTGTGGTGAGTTCATTATTTGATTTTCGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTT:1 - chr3L 8071809 5' - I-element 5147 1 57.43 CTGAGAAATGGATGGAAAGCGGTTGAACATAACTCCGTTAAGTTTAATTTGTTTGTGTGGTCGAGATAAAAATAGAAAGAAAAAAAAAATGGAAAATAGAA:1 - chrX 18056850 5' + Doc2-element 251 1 68.32 ATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr2L 13837933 5' + 297 35 2 65.35 GCCAACGGAAAACAGCGAAGAGGTGACGAACACTCTTGAGAAAACCGAAAAAAAAGAAGAAATATTCGACAACTTAACTGGCTAATAGGAAAACACTCAAG:1 + chr2R 10279565 5' + Porto1 4195 1 71.29 GACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCA:1 - chr3L 5015869 5' + I-element 4954 1 58.42 ATAATTCCATTAAAAGCTAAGAAAGCGACGTCTGATACGATGAATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - 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chr3R 18507849 5' + jockey 64 1 78.22 ACAGGCCATAAATTTTACAAGACATTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGC:1 + chrX 13020812 5' - 1360 62 1 76.24 CACACACAGGCAGGCACACAAACACACGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 + chr3L 8825269 5' - flea 211 2 72.28 GCACGAGCACAAGATTCACTTGCCGCCCTCACAGCACAACAAATAGAAATGGAAGACGTTCCATTACCCCTACTATATCCATCAATCCCAGCCCAAGTATA:1 + chr3L 3332039 5' + 297 6538 2 71.29 GGTGCTGACTTCACCTGTACTTTGCATTCGTTGGGCAGGGCCAAGACCATCGCTCGTCTCTTTGGGTAGCTGAGAACCAATTCGCCAAATAAACAGTATCG:1 + chr3R 25193224 5' + diver2 4826 2 79.21 ACAATTTTGACTTACCCATTTATGGAGTGTTTTTCTTTTTTATTTTATCAAAAAACTAGAAACAACAAACTGCAAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCA:1 - chrX 23037871 5' - pogo 1723 1 72.28 TTACACTTTCCGCGACTCACGATGATTCACCTCACCATTCACGTCCTGCGTTCGTTGTCATCATGACTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCG:1 - chr2L 5778018 5' + FB 9 1 70.30 AACTTTCGCTATCGAAAACGCCGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATAT:2 - chrX 19457244 5' + roo 2 2 76.24 CATCATTTCATGTTATTGTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTC:1 + chrX 11533904 5' - invader6 4843 2 57.43 AGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGG:1 + chr3L 26852650 5' + 1360 47 1 67.00 CTCATTGCCCATGCATGACCGAACCGACCAGTGAGGCGGGCTAATGTCCTGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAA:1 + chr3R 19197522 5' + Doc 34 1 45.98 TGCTGAATCAACGGCGCACGACCAGAACATGGTGTTTAAGTTTTTTCACACCCAGGACTTCACGGTTACCATAAACGATTTTGTCCGCCATCATAGCGGCA:1 - chr2R 15524315 5' - Rt1a 4677 1 71.29 TGTATGTGACTTTACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chrX 10730628 5' - P-element 2863 1 58.42 TTCACTACTGCCGCCTGAAGGCCTATTCTCGAGCCAAGACCAGCTTGAATATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAG:1 - chr2R 24493744 5' - flea 4989 2 57.43 ATTAAATACTCTTGTTAGAAATAATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTT:1 - chr3R 21695515 5' - 3S18 6084 2 57.43 CGCATACGCACACGCACGGGCCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 - chrX 2050888 5' - 412 464 2 50.50 GGCGTAATAAAAATTTAGTATGTGTCACATTGTTGCCCCAGTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTT:1 - chrX 17040330 5' - 297 403 1 59.41 CCATCCGCTCTCACTCTCACTAGCTTCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCACTCCAACAGACA:1 - chrX 3269660 5' + Quasimodo 286 2 72.28 CGCACACTTTGTTTGTCCACTGGCACACACACACACGCGTTGGCACACGCACACCACGACAAAGAAGGAGGACAGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:2 - chrX 10621769 5' + hobo 1 1 78.22 ACGGAATTCTATTAATTCTAATTATACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTG:1 - chr2R 6869115 5' + springer 2 4 77.00 GTAACCAGCAGGTTTACAATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 13682641 5' - roo 9057 1 63.37 AGCCAAACATATCAAATAGACACAATTACGCACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 18237385 5' + Quasimodo 39 4 76.36 TGCAGCTTGCTTTTCCTTTGCTCAACTCTCCTTTTCTTTGACGCTTTCTTTTTAAACCTGACGCGGCCACTGCTTCATGAATTTTATTTGTTTTTTGTAAA:1 + chr3L 11654847 5' - pogo 474 1 70.30 CCAAATAAAGACGGACCACTGGTCCTGAATATCTTATCGTAAAAACAAACGTTTTACTTTAACTTGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTA:1 - chr2R 2879476 5' - Stalker4 133 4 61.39 AATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAAACGGCCATAATTTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3L 23146502 5' - 1360 3343 1 68.00 AGAATAGTGCTCTTAAGATGCTATAACGTATTTAGTATTCTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2R 5485041 5' + 1360 6 2 73.27 GTCGATCAGTGTCCCTTTTCTTCAGCCTATTTGGCTTCTTTTGTTACTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:2 - chr3R 10818456 5' + 412 13 2 61.39 ACTCACAAGGCGTTCATCCATATTGTAAGGTTACAGGAATATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTA:1 - chr3L 27396591 5' - S-element 1538 1 60.40 GTATCNGAGCTTTTGCTTGTGAAAAGCTTCGATGACAAGATCATTCAATGAGCACCACTCTTTTGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr2R 18503464 5' + roo 11 2 67.33 GCTGCTGTTGCCGCTTGTTTTTTATCTACTTATATTTTAGCCCTAAACTCTTTTCTTGTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCA:1 - chr2R 18718767 5' - jockey 4985 1 69.07 ATTATTTGTCAATCCTATAATAAACTTGATACTTGATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAAATTCAAC:1 - chr3L 22987106 5' - S-element 38 2 63.37 ATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2L 13739979 5' + 412 7091 2 66.34 GCTGCGCTGGCAGCTCGTCCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3L 11070522 5' - P-element 2831 1 23.76 CGCAGGCGAACCATGAGAACGCAATGTGTAATCAATTAAGTTAGGCCAGGAATAAATAGAAAACCCATTTAAACCTAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTAAA:1 - chr2L 9498743 5' + Doc 4698 2 60.40 GTGGGGGATCCTGGATGCCAGGCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chr3R 10957686 5' - hopper2 1555 1 75.25 GGAACNCCGACCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 + chrX 6654726 5' + P-element 50 1 28.71 TTTGCAGACCGACAATTGTTAGGCAATCGATTCCGTTATTTTGCAGGCACTTTGCCTCTTCACTTCACTGTTCTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 + chr2R 5262555 5' + 1360 4 2 73.27 ACATATATATGTATATATATAAACTTTTTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chrX 21503012 5' + opus 7029 4 67.33 TCACTTATGAGCTGTTTAGAAATGACCCCTTTATTTCTAATGACAACTAATTATTATAATAATATAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr2R 13643910 5' + F-element 21 1 52.48 AAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAACATAAATATAAATGTGTAAACG:1 - chr3L 6630130 5' + 1360 2962 1 77.23 GATTCCCTGACTTGTTTTATTTAATTTATTTAGAAATGACAGGCGATTTCGTTACATATTCTTTTGTATTCAGTCTTAAGCCAGAGCTTTAATAAAGAGCA:1 - chr2R 24690049 5' + gtwin 7174 2 59.41 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTAAATAAGCAGCCCCATGAAGCTGGCATTTTTATGT:1 + chr2R 5029211 5' + 1731 4448 1 74.26 TATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chrX 19306765 5' - P-element 2846 1 34.65 TTCATCAATAATGATGTTATCGGTTGCACAGGCACACACCGAAGGCAACGAGGCCAGCACACGCTGCATATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATA:1 - chr3L 13312238 5' + mdg1 7 2 72.28 GTTTGTTTCTTCAAGCAGCTTTTTTTTTGGGGGGGTGAAAACCAAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGG:2 - chr2R 20702192 5' + Doc 6 1 74.26 GTGTATAGTTTAAAACTACATGCGAAACAGCTTGTTTTTATCAGTGTACTCCAGATATTTGCGGAAGTTTTCCCCCTGTGCTTTTTGTAAAATATTAATTA:1 - chr2R 18308391 5' - TLD2_LTR 109 1 54.46 TTTTCCCGGAATTTGCTGCTCCGGAAGTTCCAGCGCCTATGTAGCCCTAGGACTGCGAATAAAAGGTTGTCGTCGTGCGTCCAGGGAGTTGCCTTAAACGT:1 - chr2R 12001144 5' - aurora-element 79 1 57.43 CTAATTTCATTTTGAGAACCGCCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTA:1 - chr2L 6875968 5' + Tirant 457 1 79.21 TTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCGAA:1 + chr3L 27356103 5' - Tc3 1659 1 78.22 ATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chrX 13219900 5' + Doc 50 1 42.00 GTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 - chr3R 25918962 5' - roo 9039 1 61.39 TGGGGGATCCTGGATGCCAGGCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGAGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGT:1 + chr3R 10957687 5' - hopper2 1554 1 75.25 CAAATATGTTGCCTACTTATCGGCTGTCGCTAATTTATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chr3R 29466293 5' - hobo 2912 1 60.00 ACTGAGAAAACTGGGAGTTGGACCATAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGTGATGTTCTTGGATGTTTACGTTGAGGAGAGCTTGGGAATCCGTTTAC:1 - chr3R 13448307 5' - McClintock 6025 2 74.26 AATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCT:1 - chr2R 16898298 5' + Max-element 46 2 70.30 GGGACNTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr2L 18028681 5' + flea 37 2 69.31 TGGCCGCCGTCCCCCATCGTTTCTTCGCGACTTCTAAATAAGTTTGCACTCCTTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATTATGTTGAGGTTTGG:1 - chrX 3412977 5' - Tc1-2 1172 1 81.19 GACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chrX 7809028 5' + roo 8711 2 73.27 CGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr3L 14910573 5' + roo 34 2 61.39 TGTAAGGAGGGTCTAATGGGGAAGTGTATGCTGCATATACATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCA:1 - chrX 1969170 5' - 3S18 5770 2 60.40 AGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 + chr2L 15956036 5' + Max-element 34 2 58.42 ATGTGGAAGAAATAGAATACAATCAGTGATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chrX 17204079 5' - Tabor 7296 2 54.46 GTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATC:1 + chrX 21668083 5' - Stalker2 353 2 68.32 CCAGGAGAGCGCATAAAATTTACAAATTTCAATCTTATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 + chr3L 7926345 5' - flea 219 2 67.33 AGAAATAGACACACTTTCAAAAAATATTGCCTAAATTAATTATAGATTTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTTAAAACAATAATGTACACACT:1 + chr3R 14344011 5' + transib2 2612 1 59.41 GAGATCACAGCGTTCAAACTTGTTTTATACTTTTTAACAAGTCCAGTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 21501145 5' + 1360 29 1 67.33 CTTATAAAGTGTGTAAAGTAACATTACATTTAAGAGCAAAAATAAAGTAGTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGC:1 + chr3R 24281947 5' - Max-element 8507 2 51.49 TCTAAGTGGGACCATCAAGACGTAGTTGTGAAGAATTGGTAGAATTGTTGTTGATGTTGTGGCAGTTGCCAGTGAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGT:1 - chr3R 4299875 5' - Doc 493 1 59.41 ATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chrX 3649747 5' + jockey 26 1 65.35 CAGCGATGACAATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAA:1 - chr3L 20248360 5' + Transpac 4963 2 65.35 ATAATGAGTAATATATATTAACAACAAAGAGATAAACCAACCAAGGACTGAATCGATACCTAACTAAACACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTA:1 - chrX 7083708 5' - accord 7164 2 67.33 ACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACA:1 + chr2R 21712776 5' + I-element 262 1 71.29 TGGTGGTATATTGAATGTAGCCGCTGCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCC:1 - chr3L 22232692 5' + R1A1-element 4942 1 74.26 CTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAA:1 + chr3L 20248300 5' - Transpac 5199 2 59.41 GCTTGCCACTCTACAAAAGAACTGCTTAAGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAA:1 + chr3L 18972919 5' - roo 8667 2 71.29 TACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTG:1 - chr2R 7540606 5' + Stalker4 7008 4 78.22 AAACAGCAAAGCCAATTTGAAACCTTTTTATTTTTCTGATGCGCGGCAGACAACCGTTAGAGTTTCTGCCGAACGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGG:1 + chr2L 6115343 5' + invader1 123 2 77.23 AATTAGAACAAGCAGGGAAAAACATCGTGACAAAAATGATAATTGTTTTTAAATTAGACGACAGAGGCGACCAATGTTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTA:1 - chr3R 4669237 5' + copia 457 1 77.23 AGCAAAACTAACTTTTTTGCACACCCATGTTCATGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 - chr2L 19075720 5' - Transpac 272 2 63.37 AATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGA:1 + chr3R 9254912 5' + F-element 217 1 48.51 AGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3L 19215872 5' - roo 386 2 58.42 TTCGTCAACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCC:1 + chr3R 9254890 5' + F-element 195 1 66.34 AAAATGGACAGCAGCTTATCGTCCTGGCCATATGTGCCACACATTTTCCCGCACATAGGAAAGGAAAGGGTACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 31884309 5' + hobo 3 1 76.24 TTGGGTTGCTGATAAATTTATTAGGGTTACTTGGCTCTACTCAGAAGATATTCACACTGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTA:1 + chr3L 19023789 5' - Tirant 415 1 65.35 AGAAAATCCTAGAGTTAGGAAAAGAGTGGTTGAAAGAGATGCACAGAGGAAAAAAATTGGTCGGTGCTAGGGGTGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAA:1 + chr2R 12010300 5' - I-element 5036 1 65.35 TCGAACACTCGCGCGTAAAAGTCCTGGCGAAGAATTTTGGTACTGAACGGTGACTTTAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGCAAACAAAACAAAAATA:1 - chr2L 8560595 5' + Penelope 735 1 80.20 GCATAGCATATTCTTGCTAATACCACCAATGACTACATAAGCATTCCAGCGTCCGAGTAATATGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGG:1 - chr2R 14660827 5' + Stalker 175 4 77.23 AATTGACAAACAAAAAGGCAGAAGCTGGACAACAGACGCCCCCAAAAACCAAGCAAAATTATGACAGACAGACAAAATGCAAATGAAATTCATGAAGCTG:1 - chr3L 14588514 5' + pogo 484 1 79.00 TATTCGGTTTTTGTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chrX 5018638 5' + opus 38 4 70.30 ATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTTAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3L 23146481 5' + 1360 26 1 51.49 AATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3L 15638232 5' + roo 8702 2 64.36 CTGTTCGCATTCCGGAGAATGCGACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 14639331 5' + roo 8686 2 57.43 AAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chrX 19457194 5' + roo 52 2 79.21 CAGGCTGGCCCAAATTGCGTTCGATGAGTTGAGAAAAAAGTGAGTATGAAAACAAATAGTCTACAGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:2 - chr3L 9858355 5' - pogo 2094 1 74.26 GCATACATACCTAGTAGATGAGTTTAATCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAATATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATT:1 - chr2L 903859 5' - 1360 331 1 46.53 AAACATCTTGGCCTATTGCCGCCAGTATTTCGTATTTCTATATATACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3R 29350781 5' - opus 7473 2 60.40 ATTATCTCAACAAAAAAAAAACCTATCACGAAATCAGCTGGAGTTGAATCATGCTGTAATTGTTTTAAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTG:1 + chr2L 16082600 5' - Stalker4 386 1 54.46 GGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGAATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3R 7522306 5' + blood 7048 2 57.43 TGGACCAACTTGGCAACCTCATGCAGCTGCCGTGGGTCCAAGGAAGTGGGCCAGCGATATGCTGGCTGGGCTTTGGGTGGCGGCCAGGTGGTTGTGGTGGT:1 + chr3L 2615104 5' - G2 2863 1 79.21 TCTTAGAACAAGAGACTAAAAAACCAAGGGAGTGTGAGTTTCTGAACTCAAACCACAACTTTAAATCCCCAAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATA:1 + chr3L 18154113 5' + I-element 7 1 68.32 GTCATTATCATTAGCTTGCGTTTTTATTTGTTACGTTTTTCCGGATCTTTTTTAACTCTTCTTTGTATACTACTATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGG:1 + chrX 12729493 5' + gypsy10 5645 2 72.28 TATATGCGGCAAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACA:1 - chr2L 15955335 5' + Quasimodo 24 2 56.44 TAAGAGGTTACATAAAAATCGGAATTGAAACTGAACCAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTA:1 - chrX 11534009 5' + invader6 7 2 72.28 ATTACTTTCTGTCTTTCATTAGTCATATTTTTAAGTATTGCCTATTTAAATGGGGCCTTAAAATGCTTGCCATAAAAATGTTATGTACACCCCAACAGCCT:1 + chr2L 18513544 5' + jockey 4665 1 30.69 GACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 487128 5' - P-element 2844 1 35.64 TTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 12779157 5' + roo 35 2 62.38 CAATGCAATGATAAGAACGAAGAGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTG:1 - chr2L 9205707 5' + roo 131 2 77.23 CCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACA:1 + chr2R 2552121 5' + HMS-Beagle2 6924 2 69.31 GATATGGAGGCTGAAACTCCCTGTATGTAAATGTCTTCGTTGTGTAATTTCCCCTTGATTGGATATCCATACGTGTGCACACATACAGTTGGCTGCTATC:1 - chr3L 20935254 5' - 1360 162 1 76.00 CACAGAGAAAGAGGGACAGCAGATCTTAAGAGAGCTGCCAAGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTT:1 + chr2L 8277980 5' - invader2 5062 2 59.41 TAATCATAATTAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chrX 12857888 5' + 297 6621 2 70.30 TTCCCTTTGCACTGAAACAAATTCAATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:2 - chrX 14713292 5' + flea 13 2 64.36 TTCTAACTGACTGCGATCTTCTAGGTTACTATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCGTACAGGGCAGACGGACAGATGGACATGGCCAGATCGACTCGGC:1 + chr3L 23969124 5' - INE-1 106 1 70.30 ACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:2 + chrX 4154893 5' + blood 7023 2 67.33 TTTCGAATATATCATCATGTTCATGTATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAG:1 - chr3L 19881846 5' + Idefix 10 2 69.00 GAAAATGAGAGGCAGTCATTATATATTCAAGCATTTAACGGGGCAATAATTTTTTTCTGATTAGCAGCAATTTGAATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAA:1 - chrX 22383084 5' + invader1 3611 2 37.62 GTACATCACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACT:1 + chr2R 6779785 5' - 17.6 446 2 77.23 ATTTGTTGTTGCTGTTGTTGGCATAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2L 7547974 5' + blood 7020 2 70.30 TTAACAAAACAAAAACTTCTTCGTGTCACGACTGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTA:1 - chr2R 16366859 5' + hobo 8 1 70.30 ATGGTCAGGAGACGAAGTTCCTTCATGACATAGCAGACGCACCTGGACTGCCTCATCTTGTTGAAGCAGATCATTGCCCATCCTATAAAATTCATTTTTAA:1 - chr2R 14376380 5' + FB 661 2 73.27 AAGAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2L 9389053 5' - 1360 3356 1 63.37 GACATTTGAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCC:1 - chr2R 12214013 5' - Transpac 5221 2 71.72 TTTGTCGCTCAAGGCAGAACACACTGGGCCTACTATAGTAGTATTCACTGATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATG:1 + chrX 19313775 5' - P-element 14 1 53.47 TCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 + chr2R 2552120 5' + HMS-Beagle2 40 2 68.32 TTTATCGGTTGGTTTTTTTTTATTACAAAAATTATGGTTAATACATCCAAACCAGCAGTTAGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chrX 13548834 5' - blood 7379 2 63.92 AATGCTGTCGAATACAAATAACATAGCATACTTTGCACCAATTCGATCACCATAACTACTTACTAGCTTAAAATCCGGATTTAACTTTTTTAAGTTATTGT:1 - chr3L 18078725 5' - HB 315 1 62.38 CGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chrX 21668882 5' + pogo 38 1 65.35 CCGAGGTCGACCTTTGTGCCAGCATCCCCCACTACTAACACAACTACGCCAACAACAACAGCGAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGC:1 + chr3R 30653551 5' + accord 93 2 65.35 AAATGTGCACCGAGAAATGTTCACCAAAAGCGGATGTCTACTGAAAAATTCCAATTGAATCGATTTAGAGACTCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAA:1 - chr2L 10126610 5' + mdg1 5 2 74.26 AATAAGTATTGTGACGAAGGCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCG:1 + chr3R 9254929 5' + F-element 199 1 46.97 GGACACTCACAGCAACACAACAACAAAATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 + chr3R 7100964 5' - pogo 2099 1 70.41 TGGCAACTTTTGGCCAAAAGTTACGCTCGAAATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAA:1 - chr2L 16082698 5' + Stalker4 6966 4 69.31 GTTAATTTGGGTTATTTTTCCCCCACAATCGTATGCAATTGAAATTGTGCCGTTTGATGTGAAAATACTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTG:1 + chr2L 16933568 5' - 3S18 332 2 77.23 ATTATGTATTTGATATTTACAAATTATATATATACACCCACAGATATATATATATATATATATATATAATTAAATACTTGCAATATTTATAAGTGAAAAAA:1 + chr3L 19881735 5' - Idefix 7378 2 67.33 AAGCTTTCATTATGCAAACGTTTCAATCTGCTCTTACGGGATACAGGATACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCCAACTGGTGGTTATAGTTTCT:1 - chr2L 2715913 5' - S-element 443 1 69.31 AGACTCTAGTTCTTGAGACTTTGCCGGTGTTTAGCGGGTGGACGTAGAGTGCCAG:1 + chr3L 25840048 5' + hobo 2918 1 56.36 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACTGGTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATGTGAAAGAATATCAACACATTTATCAAAAGTGTG:1 + chr2R 5722314 5' - INE-1 259 1 68.32 ATGCAGAAGATGGCTGGCAATTAAAGAATGCATATTTTAAGCACTTAAAAACTGTCCATGTGTTTTCACATATGAACATAAATATGAATATGTA:1 - chr3L 16875948 5' + 1360 2958 1 89.36 TAAAAGAGAAAATAACAGAACGAATTGGTTTAACCTTACTAATTGTAGTTAATTAGAATTACAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 12877803 5' - mdg1 7423 2 58.42 TTCGAGTCCCCAGAGCACAGGAAAGACTAAACTATCTGTAGCTACTTCAAAACTGTTGATCACTACTTTCAAGTCACCGAAAAAGTTTTTTTTGGAAATCG:1 - chr3R 3859741 5' - INE-1 318 1 72.28 ATACCATCTGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chrX 7809049 5' + roo 26 2 54.46 AAAGCTACGAAGCTTGTTAATTTCTTATTCTTATTGTTTCGTAATACTAGAAAAATTTGCTTTAAAATCTCGATCTGGTCTCTTGTTTTTTCTCACACAAG:1 + chr3R 26314823 5' + 1360 3245 1 66.34 AATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCG:1 + chr3R 19144389 5' + Juan 9 1 58.59 AAGTCTAGCTCGCCCGCCCTTCCTCCGGTTTTCAGTCTGCGCTCGTCGCACTTTAATTGACTTGTGATTGGGTCCTCCACATGTAGCATATTGGACTAATC:1 + chr3R 5766182 5' + Stalker4 6955 2 73.27 TTTACAAGATGACAATTGTTTATAACTGGTTGATAAAATAAAAAAAATTTAAACAAATTTTAAAAAATTCTAATGCCAACATTATTTTTAAAACTATTTTT:1 + chr2L 16256744 5' + Juan 3779 1 28.71 CTGGCGGTATATGGGAATCATAATTCTACAAGAGCTTACGTTGTGCGTCCAGGTTACTTGACATTAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3R 25440252 5' + pogo 7 1 71.29 GGTCTATTCGAAGAACTCGGACAGCGTCTTCCGCGCTTCCTCGACCAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATACATAAGCCGATCGCG:1 + chr3L 23666427 5' + Stalker4 7123 6 54.46 GCCCCCTAAGTCGACGGCGACAAATCACGTGACGGTTTTCAAACAGACATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGT:1 + chr3R 19837704 5' + P-element 263 1 54.00 ACTGAAAGGGTGTTTTATGGACGTTTTTACCCCAAATTCCTTGTTGTAGTTGTTGTTGCTAAAGGTGTAGTTGCAGTCGATATCGTGATTGCTGTGCT:1 + chr2R 15725849 5' - Doc3-element 491 1 60.20 GCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGA:1 + chr3R 13423300 5' - 17.6 7376 2 74.00 GAATTGAAACAATTTGTCACTTTTTGGCCAAGTGCCTGTGGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTA:1 - chr3R 14907396 5' - flea 4574 1 60.40 TGGTTTTTTTTTTTAAAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 9334760 5' + FB 173 5 89.66 GATAGGAGCGAAAGCGGGCTCCTTTGACAGCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAATAATCAGTAATT:1 + chr3L 23613045 5' - invader4 2645 1 70.30 ACCAAACACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGA:1 + chr3R 25633330 5' + Tirant 8138 2 57.43 TCGTGTCACGACTGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 16366839 5' + hobo 28 1 50.50 GAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr3R 7522320 5' + blood 7062 2 73.27 CAGAACTTACCTCATGCTCGTTAAATTTTAAAATTGTTTAATGCATTCTTGCTTGTTTTTTTTATTTTTTGTTTTGTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTTTT:1 - chr3R 6446061 5' - gypsy7 5009 1 69.31 GGTAGCGTATTACAATGTGCAATAGTCCCCGCAACCATTTGATGTGTGCATGTGTTGCTTTGGAGAAAGTTCAGAAAGTTGCCCGACTATCAGATACCCGT:1 - chr2R 488281 5' - INE-1 554 1 78.22 ACAAGTGCCCCTGGGAAAGTGCTTCACATAATAAACATTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTTTTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCT:1 - chr3R 20996029 5' + diver2 351 2 71.00 CATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACT:1 + chr2L 18112520 5' - transib2 2780 1 69.31 GAAAAGGATAATGCGAATAAAGTGGGTAATTATTAGCAGGGTTGCACTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAA:1 + chrX 4154759 5' - blood 391 1 59.79 TTTCANCGGATCCCAAATAATCTTCGGCTAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGGTTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAA:1 - chr3R 19449657 5' - roo 34 2 68.32 CAAATTGCGCAAAGAAACAAAACAAATAAAAAACTATTCGAGAATATTTATAAGAAACTAAGGTAAAAGTAAAAACCTAAGAGAGCTTTAGGACCCTTGCA:1 + chrX 20785518 5' + Fw3 121 1 57.43 GAAAATAACCCACACAAACACTGGCCAAAAAAAAAAATAAATAAATAATAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 4811876 5' + BS 5097 1 71.43 TTGCTGGTATAGAAGGCGTAACTCTCTTCGCAAACACATCTTAAATTATGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAG:1 + chr3R 24995645 5' + Transpac 4804 1 51.00 CCGCGATCTCCACCGCCCAACGCGAGTTACCGTTCTCCCATTTTCCGATCAACCGTTTGCGATTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCATTTGTCGATCTT:1 - chrX 20571319 5' - Bica 449 1 55.45 CGGCAGATTTGTTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGC:1 - chr2L 22975185 5' + Stalker 7119 4 62.38 TGGTGCAAATATTAGATTCTATTATTATGACTTTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGAC:1 - chr3L 8924620 5' + Stalker2 46 2 67.33 AATTTCCAGGCAATTTCTCATACCCATAATTGCATAATTTCAAAGTTGTTGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCTGACATTCCGGCCGAATGCT:1 - chr3L 14241089 5' + Tirant 8206 2 56.44 TTCATTATTTAATTTTGTTCAATGTGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGC:1 + chrX 4499891 5' + Quasimodo 6905 2 77.23 ATGGCCATTGCTTAAACGAGTGTTTGTGTGGGCGGTAGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACT:1 + chr3R 28453806 5' - Quasimodo 6999 2 54.88 TTTGGCTTTGGCCGCATCAACACATTGGTAATTACGAATGTGGATCGCACCGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTT:1 + chr2L 15344128 5' + transib2 25 1 54.46 AGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTACAATTGTGTGAGC:1 - chr3R 9952240 5' + Ivk 37 1 62.00 CGAAAGTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCAAGCACCAGCGCAAATAAATTCGCTCTCTTAAGC:1 - chr3L 23702221 5' + G4 52 1 72.28 AAGGGGGAAAACTTTGACGGCTTTTGCCTGTTTACTTGGCTACTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACAC:1 + chr3R 15160456 5' - invader3 5460 2 54.46 GCTCGCAGTGTGTGTGCCGAGTTTATAATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGTCGCTCTCCATCGGCAT:1 + chr2R 5841082 5' - R1A1-element 379 1 69.32 TCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 + chr3R 25918897 5' + roo 36 2 61.39 TACATATTTTAAATCTAAGAGTTTAGAAACATGTAATGTACATAATTTTGATATGTTTGGAAATTTGGCCAACTTCCAGTTTTTTTATTCAATAGTTTCGA:1 - chrX 10773378 5' - HB 1485 1 74.26 TACGCCATTTTTTGCGCTTCTCGTAGATCGAATGATTTAGGTTTCTTTTGCCCTATAAGTTATTGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAA:1 + chr2L 15997242 5' + HMS-Beagle2 38 2 53.47 CAACAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3R 9837575 5' - 412 7514 2 59.41 ATGTTCCAAGTGCAAAGTCCCCCATTTTTTTCTGCCTTTTTCAATTTAATGTCCAAAAGCAGAGTGCGTAAAAAAACAAAAACAAAAAAA:1 - chr2R 21492107 5' - hopper 150 13 53.33 CAGGATACAGTCTGGGAAATGGCGAACTTCATGTCTGTGTGCAGTCAAGTGGCTTTCAGTCAAACAGCAGAGAGCTAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGA:1 + chr3R 31877828 5' + FB 2 1 77.23 GGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr2R 19857412 5' + 297 6599 2 56.44 TATATTTTTCACAAAATTTATGACATCGCACGAGGCGATAAGCTGGGGTCATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:2 + chr3L 12085146 5' - pogo 2080 1 56.44 ATAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 7787284 5' + roo 46 2 73.27 GCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATT:1 + chr3R 20466640 5' - roo 374 1 56.44 ACTTCTAAGGCGTTCGGGAATTTAAAACTAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 + chrX 22738570 5' + 297 6632 2 77.23 TACACGCGCGTTGTTTACTGCGACGCTGCCGCCAGCCGAATGCAGGCGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3L 8063904 5' - P-element 2859 1 50.50 TTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTG:1 - chr3R 9952248 5' + Ivk 30 1 56.44 CCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr3L 2800187 5' + blood 7060 2 72.28 GCACCGGTAAGTACAGATTCCGGCAGCTGACAATAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCA:1 - chr2R 15777162 5' - copia 225 1 54.00 AAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr3R 31812733 5' + P-element 46 1 34.65 TTCACAACCCATTCTGCCCAACGGACTGATCCTAGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAAT:1 + chrX 18259221 5' - P-element 301 1 41.58 GAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr3R 30272807 5' - P-element 2853 1 45.54 TTTTTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2L 17957247 5' + opus 50 4 77.23 TAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr2L 2197128 5' + P-element 42 1 32.61 AGTCTGTTAATATTTTTATGCACCACAAACCGCTCACAGAAGCGTTAAAAAAATACATTGTTAATCAACGCCAATTATTTAAAGATTGATCGCACCGTTTT:1 + chr2R 3814515 5' - Gypsy6A_LTR 392 1 72.28 GCTAAATAAATAATTGCACGAAAGAAATTACCGCATTCCACTACCAGTTCCCCCAAATCCGGCATCTCACTCAATGCAACAATTTAATAAAAAATAAAAAA:1 + chr3R 25445466 5' + transib4 2273 1 84.16 GTTTAATTTGCCGAAAGACGAAAACAACTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCATGCTCAG:1 + chr2R 21624966 5' - Circe 7381 1 79.21 AAACAATCTGGAGAACCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGA:1 + chr2R 18601819 5' - Transpac 5195 2 61.62 ATTTCGTCGTTGCAGCAGCATGTGCAATTTAAGGCATCGCATATTTCGAATTATTTCTGATTTCCGACACCACGATTGGAATGCTAGAAAATCAAAAATTT:1 - chr3R 20001047 5' + FB 149 1 76.24 AGTTGGCCCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATC:1 + chr2L 11047952 5' - Juan 4207 1 67.33 TATTTCATACTATTTTCTTTATTAAATATTTAGTTACATTTACCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chrX 13682558 5' + roo 8697 2 58.42 CTTTTCTTTCCGAAGGACCAGGCACCCACACACACACACACACACACACACACACACACGCACTGCGCAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTA:1 + chr2R 7880530 5' + accord 292 2 46.53 TTGTACAGAGCACAAGGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr2L 19642961 5' - roo 9050 2 54.46 TTTTCCCCCACAATCGTATGCAATTGAAATTGTGCCGTTTGATGTGAAAATACTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTAT:1 + chr2L 16933583 5' - 3S18 6082 2 62.38 TTAAAGGGAACTCAATTATTTTGGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCT:1 - chr2R 10863966 5' - mdg3 216 2 58.42 TTTTCGCCTGACTTAATCAACGTAATCACTTAATCATAATTAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCA:1 - chrX 12857918 5' + 297 6591 2 74.26 AAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCAATTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCG:1 - chr3L 15099646 5' + G4 3805 1 45.54 TCGACNACAAAGGAAATTTTCGGGTAGTAAAAATAGATTTCTGATTAATAAATTGGCAAAATACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTG:1 + chr2L 16137160 5' - X-element 4271 1 65.35 CATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCACATATAAGAACTCCACCGGTAATACGCTTACATACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTG:1 - chr3L 23635037 5' + HMS-Beagle 16 2 63.37 AATTTCATAGGGCTGCTTTAATGTCTTGAAAGCGAAAATAAATGGTTTATATTTCAAATGATTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTC:2 - chr3R 22277238 5' - 297 6968 2 73.27 GGCATTAGATTTCTCTATAAATATTGTTTAATTTCGATTTTGTTGAGTTGGAAACTAACAAGGCATTATTATTTAGTGGGTTTGTATGTGTACTGCGACCC:1 - chr3R 9036787 5' - baggins 5417 1 56.44 TTTCGTCAAGCCCTATTTGCTTGTTAAAGCTGCAAGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:1 - chrX 14796914 5' - transib2 2786 1 63.37 TCTTCTTTATGATTAATGATATACCTATGTTTTTGTTGCAATAATATTCTTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 + chr3R 19224842 5' - hobo 2913 1 53.47 TTCTGTTGTAAAATGCCATTTATTTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr2R 12779063 5' - roo 405 1 73.27 TCCCAATGTATCTTAACATATATAGTTTGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2R 20838653 5' - 1360 3340 1 75.25 GATGAAGAAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCA:1 + chr3R 4543189 5' - 3S18 305 2 58.42 GTCCCTAATCACCGTTAATGACAACGCTGTATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGA:1 + chr2L 13447075 5' - HMS-Beagle 245 2 78.22 ATCCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGT:1 - chr2R 19386729 5' - 1360 131 1 59.09 CTTGAGCAATCAGATACTTTGACACCTGCGCTGCTTGGTTAGAAAGGGAAAACTATATAATGATAAGGGAATGCCGAAAATTGAGAAGAGACAAAGCAGGC:1 + chrX 19172022 5' + micropia 5273 2 74.26 AGGCGGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 25918973 5' - roo 387 2 54.46 AATATAACCAATAAACTAACCTTACATTTGTTGTTGCTGTCGCCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATGAAGTTTATGTTGGAGGGCGTGACTTTGCC:1 - chr2R 10049903 5' - gtwin 367 2 58.42 TACGGATATTGCACAATTTCTTTTTCATTCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGT:1 + chr3R 22162884 5' - mdg1 301 2 72.28 AAAGATATGTTGCTAAGTATGCCAAGCAATTTTTTGAGATCTAATATTTAAAAAATTGTAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 4986369 5' - roo 9054 2 66.34 CAGTCTGCGTTTCGTATTTTCGAAACACAGACCAATTGCATCGAAAATACGAAACGCAGACTGACCACCGACCTACTCAACAATAATAACAACAATAATAA:1 - chr3L 18761714 5' + mdg1 7061 2 62.38 TTAAAACATGAGAGAATGCTATCGTCGACTTTCCCGACTAT:1 + chr4 149125 5' - INE-1 565 1 87.80 ATATANCATAATAGCTCCTTACTTTTTTAGTCTAGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 + chr2R 12213898 5' + Transpac 4928 2 70.30 GTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr2L 107993 5' - P-element 2858 1 50.50 AGAACGGTATTATTTTTCACTCGGGGCTACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr2R 10673399 5' - Tirant 354 2 70.30 CGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCAGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2L 13060335 5' - P-element 2857 1 50.50 CAACAGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr2R 5084092 5' + F-element 26 1 49.50 CGGAAACTAAAACTTAATCACACACACTTAAAAAATGGCCGCCAACTACAAAAGCTGCCCGCTAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTA:1 - chr2L 15478120 5' + P-element 424 1 65.35 TAATTAATATTATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 11516577 5' + roo 10 2 70.30 TATATCATATGCGTTTTGTATTCTAAAATATAAAACCAAATAAGATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCAT:1 + chr3R 22530786 5' - 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P-element 2864 1 56.44 CCATTAATAAACCCAGCTGAAAATCTCTAGCGAATGCAATCAGGAGCACAGAGAGAAAGACACAAAAATAGACAACGATCGCAAGACGGTGCGATCCATCT:1 - chr3R 7552869 5' + Gypsy6A_LTR 389 1 70.30 ACTTCAGCCAAAATGCCAACAATAATTTTTCATTAGGCCAAGAACAACAAAATCGAACAATATTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr2L 2909518 5' - pogo 2098 1 72.63 TTGCTNATGCCACATTAAAGTTTTTGGCCCCGTCAACGTCGTCGCCATCGCCATCGCCTCTCTGTGAGTGTGAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTTCGTG:1 - chrX 14979303 5' - accord 7026 2 29.59 CAAGGCTCTTACCCCTTGAAATCATATTAGTGCAACTATAATTACATAATAAAATAGCAATATGGACGAATGGAACAGAACTCTGGGGAACTGCCAG:1 - chrX 13338069 5' + Porto1 4282 1 65.98 AAGTAATTCACCAATTGGAATCGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr2L 2437757 5' - roo 356 2 76.24 GTGAAAACCAAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr2R 20702160 5' + Doc 40 1 62.38 CGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACG:1 - chr3R 1868233 5' + G-element 21 1 59.41 GCTGCCAGTTTTTTCTGGCGTTTTTTATTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 - 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chr3L 22908066 5' - INE-1 535 1 78.22 GTATCCCAATTTTCTTACTGCTACATATTTTAATTAATGTACTGTTTATGTGTTGTGAACATGAAATATATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTC:1 - chr2L 23007334 5' + transib2 373 1 63.37 CAACCCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chrX 7828933 5' + 412 7104 2 76.24 GACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 3671309 5' - roo 9018 2 78.22 GAGATTTGACTTTGATGAAGGAATTAGCTTTTTTGGGTTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAACGTTAAGGCAATGC:1 - chr2R 14457757 5' - 1360 302 1 48.51 TCTGAGCTTTTGCTTGTGAAAAGCTTCGATGACAAGATCATTCAATGAGCACCACTCTTTTGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chr2R 18503467 5' + roo 8678 2 65.35 TTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCT:1 - chr2L 11551404 5' + Max-element 33 2 58.42 CACCATCCGTACGCATCCCATCAATCAGCTGAAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACATTCCGTCCCCCTTGCA:1 + chr3R 9999991 5' - GATE 8220 1 68.32 AGCCCACCAAAATGTCAACACGGACAAAGAGGCAAAGCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAA:1 + chr2L 14449791 5' + Bica 486 1 70.30 AGCATGTAGAATGGTAAAATAAAATTATCCTTAATAGCAGCAGCGTTGAGCACATGTATAACTCCTCCATCATCCACTTCTCTTCATCACTCCATCTTGCC:1 + chr3R 26962142 5' - R2-element 474 1 75.25 TTACATTACAATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 10445171 5' - roo 9062 1 69.31 TAGTATTGAAAGCGTACCTATTCCGGTTCATTTTTTTTCCGTTTTTTTTTTT:1 + chr2R 16056410 5' - Doc2-element 231 6 63.46 GGGCGAAGGAAACGCAAATACAAACTGATTAAATATGCACTTAAGTTAAAAAGGCTGTTATCTGCGATGCAGCAAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTC:1 - chr3R 32029347 5' - pogo 83 1 66.34 TAAGGCAGCCTTTGAAGGTCCCTTTTCCAGGTGGCGGCCGTATCCTTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTG:1 + chr3L 20949819 5' - P-element 243 1 51.49 ACAGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2R 5084090 5' + F-element 28 1 50.50 ATTACCCAACAAATTATTAATTTAAGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTA:1 + chr3R 6431042 5' - 3S18 6056 2 72.28 GTGCAAAATCAATCTAGAATACAAGTACAATTCATGCTTATTAGTATCTGTTTGGCTACGTGACCAAACTTCATTGCATGTGGATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3L 17290562 5' - accord 7033 2 56.44 GTGCAGGCGCGAGAATTGGCGGGGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr2R 22998008 5' + Transpac 51 2 75.25 TAAGCGAAAGTCCAAATGCAGCAAACAAGGTAAGAGTAAGGCTATTCGGCAGACAACCACAGTCTTTAACATTTAATTTCTCTTTAAGTCAAACGATTCAG:1 + chr2R 13136829 5' + Doc4-element 339 1 56.44 CCCCGACAAGCGCCAGCTGACTCTTACGAGTCTGGGATCGAGCGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGACTGCTATGACTCGGTAATCTGTCACTGTATCGA:1 - chr2R 23666828 5' - Helena 1248 1 63.37 TGGAANTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGA:1 - chr2R 5850021 5' - jockey 4952 1 59.41 CTCTTCATTTTTACATCTGCTCTGTTCGCCGACAAAAAGTAAAAGAACTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3L 833338 5' + P-element 5 2 71.13 CGTCAACTGTGTTAGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAA:1 - chr3L 10807931 5' + P-element 374 1 19.57 ATTTCCACGCCCACTTCTATGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCACTCCTGCTCATCAT:1 - chr3L 7915935 5' - flea 4736 1 76.53 CTCTCGTGCATTTCGAGGAAGTGGAACTAGTCTGCCTGCCACAATGTTGCACATTTAAGCCCCCTGCTTTCCACTAACATTTTTTGTTTTTTCTTTTCTTT:1 - chr2R 17250352 5' - gypsy7 5013 2 69.31 CGCTCTGCCGCTGGCCATAGCTCCGCCCGCTGCGTCTATGTGTCGAGAATCTGTATGCTTAATTTTAATGCCTTTATACAGGATGCGGCAGTATAACTTCC:1 + chr3L 3133004 5' + mariner2 2 1 35.64 GGATACACGTGTAGTAATCTACAGCCACAAAAAAACAAAAAAAAAGAAATGCTCAGAATAATCACAAAAACCGAATGGTACATTAGAAACGAAGATATACA:1 + chr3L 581001 5' + Porto1 4375 1 69.31 TCCTCTTCGGAATCTTCGATGGGAAGGGCGCTTCACTGGTGCTCCACTAGGACGGCCTGACTCGGTTCTTTTCTATCATTCTACCCGCCTAAAAAGTTAGA:1 + chrX 19597119 5' - Gypsy12A_LTR 490 1 66.34 ACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 + chr2R 24493675 5' + flea 39 2 67.33 GGATATTGCTTCGATTCGATGTTACAAAGTTGCTCGATTTTGGCGTTGGCCGCACTTGTGCTATGTACATGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATG:1 - chr3R 23464982 5' - flea 4762 1 77.23 TCGTTTATCTACGATATTATAATTAAATTACAACTGCCTCTGTTAATTTAAGATTAATATATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGT:1 + chrX 14729530 5' + G4 3826 1 66.34 AAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:3 + chr3L 19951203 5' + Ivk 35 1 60.40 GGCATGTACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCG:1 - chr3R 9952228 5' + Ivk 50 1 76.24 AGTAGCAATGCTGAGCAATCATTGCTTGCCAACTCGTTTGTTTTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGAG:1 - chr3R 7768685 5' - Quasimodo 7106 2 55.00 GTATTACATCAATACTCCACTTATTACTGAAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 9946889 5' - roo 397 1 42.57 TATCCTCCGCCATTGTTTCCATATCCTCCACCATTATTTCTATAACCTCCGACCATATAAAGTAAATATTCTTGATCAGGATCAATAGATGAGT:1 + chr2R 5975293 5' + INE-1 91 1 57.45 AAATTTGTTTGCCAATCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 14910552 5' + roo 13 2 66.34 AACACGGCTATTGTAACAAAATAAGTCGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACCACGGACGGAATAGGATTTAA:1 + chr2L 20118514 5' - Max-element 392 1 73.27 GACATTTTAGTTATGTGTATCAGTCGAGCAGGGCTCTTTACCATGAGATAATAATTACGTGATCTACATCCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr3L 480382 5' + 1360 73 1 81.25 TTTAACATTTTCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAATACGCA:1 + chr3R 9479445 5' - mdg1 7425 2 56.44 TTTCTTGCCCGCCGCTGTGCACATATGTACACACACGGCGACAACAACTGCTGTTAACCGATGATGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chrX 2589746 5' + copia 19 2 58.42 CGTAGGTTAACAGGGTATGCTGTTGTAGTTAATGAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3R 5505248 5' - mdg1 7424 2 70.37 TTTTGTGATTATTTGTCAATCCTATAATAAACTTGATACTTGATAAAAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAGAACCCTTAATTTTTAACTTTAAAGTCAAAA:2 - chr3L 22987113 5' + S-element 1671 1 57.43 TATCCCGTGAACCCTTCGCCGCCAGCGAGGTTGTCAAGGTGAGTTCATATCTGCACTGCGAGAAAATGCCACTCTACTCTACTTTTTTGTATAACAAAATT:1 - chr3L 11183650 5' - Juan 4071 1 66.34 AATCAAGGGAATTAAATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr3L 10583264 5' + accord2 343 1 66.67 AAGGATTCAATTATTCCCGCTCGTTACACAATAACAAAAAAAAAAGTATATTTTGTAACACAATATATTAACACTAAAACTTAATGACTACATGTATTACG:1 - chr3R 27974953 5' + Stalker4 6914 2 66.34 ATGTTCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTTATTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCCTCTAAAGATACCATCTAAAGTCCTTGGATGGCATGCACGATT:1 + chrX 9505809 5' - Rt1a 5010 1 77.23 GTTTCATATTTCCCCTTTAAGTTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATA:1 + chr3R 28398201 5' - Tirant 8481 2 78.22 AAATGTTAAACCGCACGGCTAGCAGATCAACACCAACAACAGCAACACCAACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGG:1 + chr2L 5001201 5' - R1A1-element 4987 1 54.55 CGCAACACATTCTTTGTTTAACTTCGCTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr2R 4502528 5' + roo 2 2 77.23 GGTAATGTAAACACAGTACGAGTAATTCAATTAACCAGAACCTCAATCAACAACAGCTGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGTCATCGGCTGCAC:1 + chrX 12380974 5' + F-element 456 1 56.44 CTATTGCTTTAGTTACAAAATCTAAAGGAAATATATAGAACAGTTAAATACAAAATAAAAAAAAACAAAAGAGAGTGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATC:1 + chrX 20894633 5' - INE-1 564 1 71.29 TGAACTTACCACAGTTTTTTAAACGCTGATATAATAAGTGGGTTATACCAAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 + chr4 612161 5' + 1360 31 1 70.41 GGATATCACCTAGTACTCCATGCTCCTCCACCTCGCTGCATGCCAAAAAAAACGTCGTATTTCTTAGTTTCTCTTGCACTGCTATTTTTTTGAACACAGCT:1 + chr3R 28999882 5' - HB 7 1 52.48 CAACGCCTACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 22719557 5' - 1360 3386 2 75.25 GGAAAGAATTACATAACCAAAATTCGTTCTCATATTACACTTACAGATTTCTCGTTTACTTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGCTGATGTGATGGGAGTCAATA:1 - chr3L 6685247 5' - accord 472 2 55.45 GCGGTGAAAGGGGGTTTCAGATCGGTTTTGGGCGGTCTCGATAGAAATTTACAACATTAATAAAAATGTAAAAAAATATCAACGCATTTTTCAAAAGTGT:1 - chrX 20856221 5' - INE-1 260 1 65.00 TCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGAGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 - chr2L 7927238 5' + hobo 41 1 76.54 TAAGTATGTAAGCAAGCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chr2L 14260712 5' + 297 7 2 71.29 CTAAGNTCGTTACATTGCAACTCAATTAGAAAATCAACTCACCGTGGACAGCTTCTCGATTTCTTCGTCGGAGGCTAACAATAAGATTTCAAATCTTATTC:1 + chr3L 6715666 5' - Doc3-element 4664 1 73.27 ATGATATAAGCGAAATTTCTACAAATTACCCTACTCGTACATAGAGACTACCTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACATA:1 + chrX 16954176 5' + hopper2 1178 2 62.38 GGGGTCTGACACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 9692653 5' - P-element 2876 1 68.32 GGCTTCCAAACAAAATTTCGTCAAGCCCTATTTGCTTGTTAAAGCTGCAAGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 - chrX 14796929 5' - transib2 2801 1 56.44 ACTCGACGACGAGACAACCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:2 - chr3R 9370024 5' - roo 401 1 72.28 TAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 9014487 5' + blood 7040 2 52.48 AGAGAGTATACTATTCCTTAAAAAGTATCGTAAAAGGTGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATT:2 - chr2L 15957510 5' - Max-element 262 2 60.40 AATGTAAGCATTCTTGAGCTATTGAACCACCTTAATGAGTTCAATTCTGGTGTTTGAATCTAACTGACTCGCTGCTTCGA:1 + chr3L 3510763 5' - rooA 7545 2 57.50 CAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGC:1 + chr3R 13375978 5' + 1360 42 1 69.31 GCAGACGTGTTTCGTGCTGCTCTCCAACTAATGTAAAATTAACATCACAAAATCAGTGAAATTAAAATGCAAAACAAAACTCGTGAGCAACGTCAACGTGA:1 + chr2R 5532365 5' + Doc4-element 11 1 53.47 CTATTTTTGTACCACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACA:1 + chr2L 514838 5' + 3S18 5778 2 69.31 AACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 20437705 5' - roo 389 2 48.51 CATTTAAATTGGAGGGGATTCTTGCATATAGTTTGTTTCGTTTCTTACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGT:1 - chr3L 15470971 5' - Tirant 442 1 76.83 TATAAATTCCCCATGAAAGGTTTAAAGATCATAATGATCTAATATAAACACTACGACATATACATTATATTGACCATTTTAAATATTATTTTTATTTTTCT:1 - chrX 6664856 5' - invader6 4386 1 50.50 TTGGCAGCTTAAAACTGAGGTGAGGTGCCCTCAAAATCTACAGCGTCACTGTGAGTGTCAAATGTCTTTTAAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTGC:1 - chrX 21421916 5' - INE-1 573 1 90.10 ATATGCTTAAATATATCATTGAAATGTAAGTTTAATTATTCATTTATATTCACTAATATTCACAAACATTTTCTAAGAAATATATCTATTTAATATATATA:1 + chr2R 15591632 5' - transib3 2630 1 38.61 CTTTTTGTGGCAAGAGTATAATTTTACAGTACATTCCTCTCGTCTAATCATTTTGATATGGATCACTTGCTAAATGTACAAATAGTTAGTAGTAGACGCAC:1 - chrX 18373824 5' + hopper2 1290 1 69.31 ACAAAAGCGTGTCCAAGCTGAATGAAAAACGGAGCAGTGGGCGTGCCTCTCACACTTGTTGTTGTTTCGAATTCTTAAATCAAATCGGCAGTATTAGCAGC:1 - chr2R 21896026 5' - blood 447 1 61.39 ATCCATCGTGCGGAAATCTACTTGATGGGATGTGCATTGTGAATTTGACAAAATATTCCCTTCACCTTAGAAGTTTTTAGGCTTTAAATCTATATTATTTT:1 - chr2R 4786522 5' + 1360 246 1 63.37 TAGGGCACAACGTGATGTACATGACACACGTCACACACACGCCTACACACACACGGGTGCCTCAGATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTA:1 + chr2R 17009710 5' - Cr1a 4165 1 54.00 GAGAGCTCCACGCTTAAGAGAGCGAAGAAGAAGCGAAGGGGAGCAGGAGCATCCGCGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 + chr2L 13060256 5' + P-element 22 1 57.43 CCTATTCCTGGCCGGACCATTCCATTCCCCTTTCCTTGGCTTTATGAACTCGCTAAAGGCGGTAAATTATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chr3L 9304684 5' + jockey 14 1 69.31 AATATGGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2L 326183 5' + roo 8713 2 78.22 ATTAATTCTAATTATACTATCAAAATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCAC:1 - chr2R 6869105 5' + springer 13 2 66.34 ATTAAATCGCTGACTTTCGCCATTGCTTTCTGCACAATCAGTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGCTAATGACAAATATTCTAATATAAATTCATT:1 - chr3R 19888471 5' - 1360 386 1 67.33 TCTGCCTGGGACCACCTTTGCTGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTT:1 - chr2R 2679665 5' - Ivk 266 1 78.22 TATTTGAGGGATTTCATATTATGCAAATAGTGCCGTGTTGCCACTGACAACGTTCTGTTTCGTGAACTACTTAATAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAG:1 - chr3R 11516723 5' - roo 409 1 47.52 GGACGGAAGCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTA:1 + chr2L 19075653 5' + Transpac 26 2 54.08 TAGTTTTTCGAATGAAGCAAAGTCCACTCATTTAGTATGTACGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAA:1 - chr2R 19461411 5' - S-element 1681 2 67.33 TTCTCAATCAATATGAACGGTTTTGAAGATTAGTCTAGTAAAGTTCTAGTTGATGTTGATCGCTTAATTGGAACTTAAACTAACTGTTAACAGTTATGTTA:1 + chr2L 21589390 5' + Bari2 203 1 78.22 AAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCC:2 + chr3L 23773903 5' - Transib5 2873 1 78.22 CAAAAGCAATAAAATTATTAAGCCACACAAAGACACACACACACACACACACACACACACACACACATATA:1 + chrX 15428584 5' + accord 7030 2 70.42 TGGAGCACGAGGAACTGACCTCATTTATGCAACTACGTACATACATATAGCCATGCATATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATT:1 + chrX 15195205 5' + Transpac 10 2 70.30 CGAAAGCCCACTGGTCATTGATACGCCGGCTCGCGCGCCGTTTTGTTCTTTTTTCCGAGCCGCGCCCCCCCTTTTTTATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3L 2805391 5' - 412 7480 2 77.08 TTTCATATTTCTGCGCCCGGCATGTCTAGATATTTATTGAAAAGGCGCAGACAAACATAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAAT:1 - chrX 20779387 5' + flea 470 1 63.37 ACAGAGTAACATTAGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAAT:1 - chr3R 19609735 5' + Tabor 18 2 59.41 AATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAAT:1 + chr2R 1320683 5' - diver2 4877 2 51.49 CAAACAGAATGGCAAGCCAGAAAAAGAACAAAGAAAAAAA:1 - chr3R 27778190 5' + Doc2-element 221 1 80.00 AACGGTTCGATTTTCAGCAAAGATGTTTGAGGAAAGTAGCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATT:1 + chr3L 4832884 5' + jockey 415 1 60.66 TCACACACACACACAAACACACACACCTTGAAGTCCTCGAGCTTCTGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2L 17081446 5' + hobo 32 1 53.47 AACGATTTTTAGAACTGATCCGGGCAAACTGGACGGAACCAATATTTAATAATCAAGAAACCCGCTTTCGGTTCGTTGTTGTTGTTTTGGTAT:1 + chr2R 9190276 5' - gypsy9 453 1 91.40 TTGGCTGAAGGGGATTGCCTTTTGAAATCGGTGACCCCGACGTGATGCGAATCAAGTGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACA:1 + chrX 11282546 5' - I-element 5339 1 66.34 TTCTGTTGAAATGGGCAAGACTTCCTTTGCACATATTTTTCTTGGCCAGCCTTTGTCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 + chr3R 18551115 5' + Max-element 21 2 59.41 GAAATNCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2R 9014469 5' + blood 7058 2 70.30 GTTCACTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGG:1 - chrX 1954503 5' + Tirant 42 2 67.35 CACTCCGCCTTGAGTGTGGGTCCCATTCCCTATCTGGAATGACTGGACACACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 + chr2R 19857324 5' - 297 6953 2 58.42 GTATTATAGTGAAATCACTCTGAGATCTGAGATAGCACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGT:1 + chr3R 6185898 5' - 412 7532 2 63.37 GCAGGAGAGCATGGCCATCACTATATCTTTATACTGAGATACAGACCATCGTGTGACGCTTACTCCCTGCTAGGCCTCTATGGAGATTAAAAAGGAAGGGT:1 - chr2R 3999296 5' + BS 4917 1 46.53 TCAGCCGTGACCTGATCTGAACTAGCCCACTAAGCAGGTTTACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTAC:1 - chr3L 7927503 5' - flea 447 1 58.16 CGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGT:1 + chr2R 5617509 5' - invader1 3983 2 59.41 TTACACCATTATCGCAATAAAAATAAAAACATCAAAAAAAA:1 + chr3L 16830609 5' + jockey 4992 1 80.49 ATGAAATTCTATGTATTTTTCTTTATGTTTCTTTTAATACCCAATATGTATATTATCACCAAACCAAAAACCACAACAGCATCTCCGCCAACAACAACAAT:1 + chr2R 5440448 5' - transib4 2501 1 73.27 GCTGGNTGTTGAAAGCAATAACAATAAATTGCTTATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 + chr2L 8620280 5' + Juan 4074 1 66.34 ATTTGTTAAATAATCCAAATTTAAGAAATTTCTTTGCATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chr2R 8560117 5' + 297 6616 2 63.37 CCTCCAAACTAAAGCAGACAGATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAG:1 - chrX 4180805 5' - I-element 5322 1 58.42 TTGGTGTTCCATTGCCGGCGGCGATACCTGTTTGTTTATGCGGCCTATATGAGTTACGAATAAAAATGGCTGCCAGTGACATGTGTGTGTGTGTGTGTTCG:1 + chr3L 2851567 5' - accord 7028 2 64.36 AACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGA:1 + chr3L 19951204 5' + Ivk 35 1 61.00 TAAGCGTAACTCAGTCGCAATTTGACATACTGACGTGTTTATAAAGTTAAGTTGGGAGGCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 - chr3L 6817998 5' + Doc 1 1 60.76 TTTCGCCTGGAGATGGGGTGGTTTGCCGTTGCTATTATTATTTCCTATATGCTATAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 - chr3L 21319319 5' + jockey 4694 1 57.00 AGTGCTATGCCTGCGAATCCGTCTACGAGGCTAGTGTTTCATTGTATTTTACATTTTTCTCTGCTTTGTCTCAATGACAAGTTTTATTTGTAAGTCTTTGT:1 + chr2L 20868363 5' - Doc3-element 4448 1 74.26 AATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chrX 495219 5' + 412 7102 2 71.29 AACCAAGCCCACCTTGATATTTGTACATATGTTGGCATGTGTGCACACCAGTGGCACTTAATCAACGCCCACGCACGTATGCACACACACACACACACACA:2 + chr3L 10552300 5' + accord 7028 2 75.25 TGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAA:1 - chrX 1018117 5' + 1360 233 1 67.33 GGGATATTAACCATAAATAAATACTATATATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAA:1 + chr3L 22231593 5' - 297 355 2 77.23 ATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chr3R 19609702 5' + Tabor 6890 2 74.26 TGAAATTATGCAACACTTTTACAGCCTTCAAAAACATGAAAAGCCTAAAAGTGTTTTAAAAATCCAAGATTTGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAA:1 - chrX 13135002 5' + jockey 4779 1 66.34 CGTGGCCACAGTGTTTTTGGTATACATATACAAATTGGCAAGACATACAAAGAAAAGTCTACGAAGAAAAGTCTAAAGATTTTTCAAAAGAGTGTGCGTGA:1 + chr4 976485 5' - INE-1 252 1 68.32 TATTATTATTATTATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTC:1 + chr2R 11367667 5' + P-element 2795 1 20.79 CACATTAGCCACATTCGGAGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chrX 10653633 5' + jockey 6 1 80.20 ATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGAT:1 - chr2R 12253314 5' + BS 4667 1 55.45 GAAGGGTTTTCCCAAACCGGCAACAAAATTTATAGCTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 + chr3R 18934074 5' - hobo 2920 1 53.47 GTCGCGATGGAGCAAGTTTCCAAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTCGTGAGCCATCTTAGCTGTTGTGATCTGTGATCACATTTCTTTACTGTGTTTTTGA:1 - chrX 4155981 5' - Helena 947 1 78.22 CCGCTCACAATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 - chrX 5443974 5' - mdg1 7447 2 66.34 GGTCAGGCATCCGGCGCAACAGCGTTGTCACCTAACATAACATAACAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTT:1 - chr2R 4879020 5' + G-element 36 1 57.43 TTTCATAAAACTGCTTCCATGCATGTATACTGATAGTGGATAAATACAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCG:1 + chr2R 7540555 5' - Stalker4 379 2 63.37 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAA:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 169 2 55.45 CCTTCTATTTTACATAGTCATCGATTTCTATCTTTCTTGCGGACTGTAATTTTTCCACAATACAAGGTATTTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTTTTG:1 + chr3L 23090860 5' + 1360 248 1 70.30 CAACTAAATTGGGAAACAACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACT:1 - chrX 20437722 5' - roo 406 1 61.39 ATGAATTCCTAACAAGAAGAAATTCAGATTGCTCATACGCCGCGTCAGCCGTCGTGCGGTGTATAATTTTAGACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAAC:1 + chr2R 19636321 5' + F-element 4456 1 76.24 CGAGTTCGAGGCGAGTGCGAGTAATCCCCACACCCCACACAATAGACGAGGTATTGTGCGTCTCTCCGCCCAGACCATTGAAATTGTTTATTGAAATCGAT:1 + chr3R 21678310 5' - Idefix 293 2 80.20 ATTGGACTTATGAAACCGCTTCAAAGAAAAAAATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 - chrX 14713267 5' + flea 4795 2 72.28 TAGTATTTATTTATATTTTATATAAAATCTACGAAGAAACTTCTTCATCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCT:1 - chrX 14992207 5' - Stalker 7039 4 52.48 GTGCAGAGTCGGCGGAAAAAAATATGAGAAAACTCGCAGTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTA:1 - chr2L 18112600 5' + transib2 2554 1 71.29 ATCCGGTAAGCAAACTTATAACTTGACAAACTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAC:1 - chr2L 15760193 5' + jockey 4956 1 70.30 TATGTCTGGTGTCTTTTATTTGAGCCCCGCCCTCAAAATAAATAGCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 + chr3L 9192545 5' + I-element 32 1 51.49 TAAAGCAATCAAATCGAATTCAGTAGCCATTGGGTGAACTTGAGCTACTCCTTTTTTTACAGGCGTAAAACCCAACGAACCTTCTTGTACCAACAAATCA:1 + chr3R 9104618 5' + F-element 340 1 72.00 TTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chrX 8948667 5' + blood 7057 2 70.30 CTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATAT:1 + chr3R 19450168 5' + roo 37 2 67.33 CTCGCNGGGGGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chrX 10621687 5' - hobo 2892 1 68.32 CAAAGCGATCTGCCAAAACACATAAAAATACCAACACTTACATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCG:1 + chr2L 438940 5' + Stalker2 7409 6 75.25 ACTAATTGTGCAAACGCAAAAAAAAAAAGTTGTCGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTT:1 + chrX 17874305 5' + Bari1 18 1 56.92 TCGGGGTGGTGGGCCAAGGGAATAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTCCACAGGTAGGG:1 - chrX 9120400 5' + Circe 7184 1 69.86 GCCAAAGTTTGGCAATAAAATTCAAACACCAAATGATCAGCAGACATCTGGTGTGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGACTC:1 - chr3R 7514574 5' + Tirant 225 2 68.09 TTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAAAGAGACACCCTGCATACGCGAAAAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTG:1 + chr3R 28755954 5' + 3S18 5812 2 63.64 GTCTATATGGACTATATACAAATTAAAATCGAAAAGTAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTT:1 - chr2L 9995335 5' - 297 45 2 67.33 GACGAGGAATGGAAGGGAAGAAAGAGGATGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGC:1 - chr3L 20917439 5' - Quasimodo 323 2 72.28 ACTTTTGGCCAAAAGTTACGCTCGAAATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAA:1 - chr2L 16082693 5' + Stalker 6864 4 64.36 CGCGGCTAGTGCAGTTAAAAATATTCATTTTAACTAAAATGTACCATCAGATCCCGTAATAAAAAAGGTTTGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 + chr3L 22564792 5' + blood 5 2 72.28 AATGCTGTATCTGGTGGAAAGTTTGGCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGC:1 - chr3R 10328817 5' + R1A1-element 378 1 74.00 AACTGAGGTGAGGTGCCCTCAAAATCTACAGCGTCACTGTGAGTGTCAAATGTCTTTTAAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTGCACGACTATCAGA:1 - chrX 21421904 5' - INE-1 561 1 89.11 TTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 + chr2R 20411881 5' - 297 356 2 69.31 GCCCCAGCTGGATGCTGTGGCATCTCATATAGGTACGCGTAATTATCATCAAATTGTCGGTTCTATACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACC:1 - chr3R 26469527 5' + hobo 10 1 69.31 CTTTCGCTATCGAAAACGCCGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 19457242 5' + roo 4 2 74.26 GGTATAAGCGCGTGTATTCTTCATGTGGTCAGATATAAAATCAACATAGTTTTCCTTTTGAATACGTTAATTAGGGCCTAATACTTGGTTGGATAGCCTTT:1 - chr2L 21935198 5' - HB 1327 1 58.42 GTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAG:1 + chr2L 8740876 5' + Burdock 26 2 53.54 AACATTACATTACAATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTT:1 + chr3R 10445167 5' - roo 9067 1 74.00 GGCGACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3L 3671367 5' + roo 21 2 58.42 GATGGCACTATAGTCACCATTCGAGCCGGAAACTATGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTAAATTTGAAGGTTAAAATAATAGCACTACTGCATGT:1 + chrX 20541912 5' + Tc1 15 1 46.53 CTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCCATCTTTATGGTTCAACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chrX 12649915 5' + P-element 25 1 34.02 ACGATATCAAAACGGCGCTTCTTTCAAAATTCCACGCACACCGACCGGATATCACACCTCGATGAAAACAAATGAATGCAAGGCCGAAGTAGAAGCGTTGC:1 + chrX 14477252 5' + Chouto 5960 1 66.34 TAAGTNAACGCTTACTTTTATATGTATATATATTCGTCGATTTAAACTACTATGTTTGTTTCTATTCTTTTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCC:1 + chr2R 22605904 5' - Juan 4205 1 73.27 TTTATGTTCTCTTATTTTTTTTTTAACATCTTTTTCCAGTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 13398248 5' - Doc2-element 230 1 68.00 CGCACTTAAAAAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTAT:1 + chr3R 21695430 5' + 3S18 26 2 54.46 GTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTT:1 - chr2R 1247765 5' + Doc3-element 110 1 65.35 TCTCCTGAAAATTCCAGTATACCCTATCAATTATGTCAATCAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTG:1 - chr3R 13886053 5' + accord 69 2 62.63 TATGCGGCCCTTCGACTTCCGGTTGGCATGGCGGCATTTTTAGCCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCCAA:1 - chr2R 9739260 5' + GATE 69 2 59.38 CCCCACTGGAAAACAAAAATGAGAGTCCCCAACAGGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chrX 19095719 5' + roo 8671 2 66.67 AATTTTAGTTTAAAAAACTTTAATTTTAAGCCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATA:1 - chr2L 19768425 5' - I-element 5314 1 64.36 AATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr3R 25633333 5' + Tirant 8141 2 60.40 CATAGTTGGGCGTATAAATAGTTCATGGGTTTGCCGACCTCTCATATTGTTCAAAACGTATGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chrX 7832547 5' + roo 8681 2 41.58 GAATTAAATTTGGAACACACCGGTTCACTCAGCCTCTTATCCTTTCACTTTCAGAGACCCACTCCAGTCCACACACATCAATACTAATGCACACCGCATTT:1 + chr3L 19391773 5' - invader1 3795 2 56.44 TGAGACTATAACCTTATCGACAAATATGTAAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAACAAGACATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAG:1 - chr2L 10552924 5' + I-element 5101 1 75.25 ACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAAGAAGCATACGATCA:1 + chr3R 15157601 5' + invader3 5233 2 55.45 GGGGAAAACAACAACTTGAAATTACCGCCGCCAATTTAATAGTCACACTTGTTGTTGTTTCGAATTCTTAAATCAAATCGGCAGTATTAGCAGCATTTCCT:1 - chr3R 14458406 5' - blood 440 1 58.42 ATTGACAACAAGTTATTCAACTTGTCCGTTCGAGGTACTGTGTCTGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr4 299906 5' - 412 7514 2 54.46 TAGAGCAGGCCGAGTATTGTCTCAACGAGATAAAGACAACCCTGAATGGAGAGAAGCGCCAGTGAGGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAA:1 - chr2L 19043663 5' - roo 8704 2 74.26 TAGTTGAATTGCTTATCAGTTATACACTGAAAACAAAGTTCGAGATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 + chr3L 14049982 5' + pogo 33 1 54.46 ATATTNTTATTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 - chr3R 1868246 5' + G-element 8 1 71.29 GATATGGGAAAATAGCGAATGGAAAGTAAAATAAATAAATCCGCTTAGTTGACTTCTGGCCCCTCGGGAAAACCCGCTCAGGTACATGAACTGTTTAAAAC:1 + chr3L 11024927 5' - R2-element 3305 1 69.31 ATATTAATTCCGGTGCAGCAGGAGCAAAAGCCTGCAGGTGTCCGTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAA:1 + chr3R 25823644 5' - hopper 1386 1 56.44 CCTTTGTAAGAGCCTAAAAATAACCCTTTTCGACCATTGGTTGCCATGCTGTCTCGGAAACTAAGGCACCGGGATCGCTTGTGCGGGACAATTTACAACA:1 + chr3L 15824481 5' - accord2 7164 1 68.00 ACTGAAGCAAAATTTAGTTTGCTTGTGCAAAAGTCATAGTGCGGACAGAAGCAATTAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTG:1 + chr2L 133776 5' - 1360 423 1 74.23 GCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2R 9014413 5' - blood 7359 2 54.46 ATCGAAGGTCTGTTAGCTACTAACCAAGCGCACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATG:1 - chr2R 15252654 5' + 1360 3275 1 71.29 GAGCCCATGTGATGCCAGTTCGTTAAATCTGTTTGGAGATTATTTTTGAAACCCTGTATTACGAAAGAAGTTAGCTCCAAGAGGTTAGTGGTTGTTGATCT:1 - chr2L 21152034 5' - Q-element 229 2 76.24 CCAGCTTGTGCGATTACATCTCGATGAGCCTACAGAGCCTACATTATCACAATTTCTTATTGTTGTATATAGTGCCTTAATTTGTTTTTATATCTTTTTTT:1 + chr3R 30213253 5' - Tc3 1575 1 40.59 GGAAAAAACGCTGAGAACACTGAGAAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr2R 21379476 5' - P-element 2870 1 62.38 TCAGTTCTGTATTCGCCAGCAGCGAGAGAAGCAGCACGGGCAGCAACTGGTGTCAGTGCAAATCTCCGGAGAATCCAATTAATCACAAGCGTACAAAACAC:1 + chr3R 29723451 5' - frogger 393 1 72.28 TGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chrX 8977406 5' + jockey 57 1 75.00 ACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chrX 7787246 5' - roo 9023 2 72.28 TATGTGATTGCATACTTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 - chr3L 22324359 5' + jockey 4670 1 78.22 CCTTTNGCATATTCCTATAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3L 15638214 5' + roo 8684 2 56.44 GGGGTTATCGGGTGCTCTCTGACACAGTGCTCAGCTCAAACACTGAGTTCCAATTGCTCACTGCTGATTGTTTGTTAATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGC:1 - chr3R 28883575 5' - HMS-Beagle 371 1 69.31 CCTTCNCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCG:1 + chr2R 1320692 5' - diver2 4868 2 50.50 CTTTNTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr2L 17957246 5' + opus 7151 4 72.41 CCGTTAGTTGTCCGTGGACATGTTTCTTCTAAATACATTCTACATTATGTGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 - chrX 1235487 5' - P-element 2863 1 55.45 AAGATATAGCACCAAGATATTCTATAGACAAAATAAAAAAATTTTTAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTGAATTTGTTTGTTAAA:1 + chr3R 19448234 5' - 1360 3005 1 68.32 GATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGT:1 - chr2L 19679757 5' + Doc 71 1 75.25 CGCACNGATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAAT:1 - chr3R 28755615 5' - 3S18 295 2 64.36 TTCCCGATTGGATTTTATTTATAACGATAAAAGACCAATCCATATTCTCGAATCAGAAAAAGCATACCTTGACCTTTATATTCCATTTTATTTGAAAATGT:1 + chrY 1739813 5' - transib3 256 1 67.33 ACATTATTATTATTATTATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGAC:1 + chr2R 11367663 5' + P-element 2791 1 23.76 AATCCGGGCGTAAGTTTCTTTTTTGCTTTTCTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGTCAGTTTTCCTA:1 + chr3R 5533340 5' - R2-element 3517 1 77.23 GCGAAAGCGTTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATATTACATACGTAGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr2R 17394612 5' + jockey 26 1 59.41 TAATCAATACCGCCAAATGTAGGCGCAGAGCTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chrX 1523699 5' + jockey 59 1 72.28 TTTCAGAAGATTAACGATGCAGCATCAATGAATGAGAATCATAACGAGGTGCTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr2R 23305411 5' + I-element 27 1 49.50 AATATATAACTTATGCAAAAAAAAAAATTAAAAAAATTTTCAGAAGTGTACAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTG:1 + chr2R 330442 5' - gtwin 447 2 56.44 AGTTACGAGCTGCTGTTTTTGAGCTCTGAATTCCGAGAACTGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGA:1 - 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Stalker2 393 2 68.32 GAAGTGGGCGGATAAATAGATGTGTATATAGACATACATCCGCACATATGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAA:1 - chr2R 8848434 5' - I-element 5016 1 52.48 CTTTTTTTGGATTTTCACCTGCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19136549 5' - Porto1 170 1 81.82 GTTGTAGATGTTGCGACTGTCATTCGATGGCTGCAGGTTGTATTGGTTCTGCTGCTGCTGCTGGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGA:1 + chr3L 22583247 5' + flea 485 1 64.36 AAGAATCAATTTGCACTAAAATTCTAGAAAAAAAAGAATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATT:1 + chr2R 617173 5' + diver 5927 2 61.39 GCGTCTCTGGCGGCGGATTGCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 + chr2R 9014394 5' - blood 366 2 69.31 ATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGA:1 - chrX 22824231 5' - Gypsy12A_LTR 2256 1 49.50 AGCTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATAC:1 + chr3L 7989736 5' + mdg3 5282 2 53.47 GATGGGCCAGCGAGTGGCAGGTGACTTGGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 - 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Doc4-element 2679 1 66.34 ACGCTATTTGGAATTGCATTTTCATGGCGTGGATTTTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTT:1 - chr3R 21254888 5' + F-element 21 1 51.43 CTTCGACGCAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCA:1 - chr3R 11165701 5' - Tabor 7286 2 61.39 GTTGCTGTAGTTGTTGCCGGTATTTCAGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr3R 17121708 5' - mdg1 7433 2 52.48 ACTGCATGATAACGTTCGACCAGAATGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTA:1 + chr3R 7790737 5' - I-element 95 1 75.25 TCAATAAGTAAGATGTCTTTTGGTGCTACAACCACTTTCTCAGTCCACTTATCAGCAAAAAAACTAATCCGAGTATGCATTGTTAGTCTCTTAAAACAAAG:1 - chr2L 22942372 5' + Doc 4656 1 61.39 ACTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATG:1 + chr2L 22921274 5' + copia 4912 2 70.71 TCTGAGTTCCCAAGTACAGTTGTGTTTAAGCTAATTTCGTTATACTTCATTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGT:1 + chrX 12530737 5' - Doc 4416 1 64.36 CTAGTNGCCAATTTAGGAAAAGAGCATCTTCCTTTTAGCTGAGTTTATGATAATTATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 19657437 5' - 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chr2R 9454311 5' + opus 7037 4 65.35 CCCATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr2L 1156734 5' + 412 30 2 57.43 TTTTTTACTTTGCGACAAGATTATAGAATGTAGTGAACGCCAGCGTGTATAGGACATTAGAGAATATGTTGAAGAAGGGAAATGTAAGAAAATCCCTTCAG:1 - chr2R 8184070 5' + invader4 227 2 70.30 CTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTAT:1 + chr3L 15099560 5' - G4 3807 1 63.37 TTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAAC:1 - chrX 23108298 5' + BS3 1450 1 70.30 ACGCTACACTTTCGGTAGACGAACTAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTAC:1 - chr2L 8250894 5' - 1360 26 1 79.21 ACTCGATATTGCTAACACTAATTTCATTATTAGCCTTTTTTGAGGCCTTTGTAGCCATGTCCTTCTGTCCCAATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAA:1 - chr3L 9629459 5' + INE-1 146 1 61.39 TCGAATTTCGAAAAAACTGCTTTCTGCACCCACAAACCTACCAAAACTATTACTTTTTTTCGTTTTATTATTTTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTAC:1 + chr2R 5788280 5' - 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Quasimodo 302 2 70.30 CTAAGACTTCCTCTTGGCAATAATTAAATATGTATATATATTTATTAAAACTCGCAATCATTTTTCTTACTTTTCCTACTTTAGCCTAAGTCCAAATATAT:1 + chr3R 20872029 5' + 412 332 2 70.30 AGTGTGTATGTGTTGGCTTATTTATCTTTCGTTTCTTTTTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATAATAAACATTGGC:1 + chr3R 2239380 5' + invader2 4695 1 61.39 GAAGTTCATTGACGCAGCAAACTCTGGCCAAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 7787326 5' + roo 4 2 75.25 CAAAGGAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chr3R 5977768 5' + copia 55 2 78.22 CCTTCGTTCAAGAAGTTAAATGAAATGTCCAATATGATTTCTCCGCTCTTTAATAGCTATAATGTTTGTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCT:1 + chrX 1685839 5' - mdg3 5332 2 62.38 AGTATGTCAGGGCAAATATTAGTATTCTTGTATTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATTTGGCCCTTTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAG:1 - chr2R 16030303 5' + INE-1 148 1 68.32 ATAGGCCCGACCACATTCGTGACACTCCAGCCGCGCTCGCGCCTACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTCCCTTTTTGCG:1 + chr2R 19283087 5' - gypsy8 311 1 59.77 GGGGAAATGGGGGGTTAAGGAAATGAATGAATCTTACAGCTAACAAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTC:1 + chr3R 9916680 5' - 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chr3L 2800223 5' + blood 7024 2 66.34 GGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chrX 10621696 5' - hobo 2893 1 74.73 GGCAGCGGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGATTTTAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACT:1 + chr2L 20360644 5' + micropia 23 2 55.45 TGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAATGCCAAACCAAT:1 - chr2R 5424275 5' + 1360 3350 1 71.28 CCACAGTAAACTGCGCCCATATCGTTCAAATTAATATACCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAACGATTCTTATTATTTAAGTTATT:1 - chr2L 19821192 5' - jockey2 3303 1 64.36 TCAAACATTTGCCTTCACGCCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 19457136 5' - roo 9049 2 57.43 CCCTANAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chrX 8948687 5' + blood 26 2 52.48 TAAATTGGGTATATCATATGAAAGTCAAAAGTGTTTGCGCCCCCTGATCTTTCCTTTGATAGCTCCCACTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACG:1 + chrX 9737798 5' - F-element 4365 1 75.25 TGGAACACTGCTATCGCTAGTAAAGTTTTCCACGCATCGGGTTTTTGGCCATTGTAAATTACCGGGAAAATTTAGCTTTTCATTGTCGTGTAAGAGTTGGA:1 + chr2R 12593500 5' + aurora-element 4184 1 60.40 TCAGCATGTAATTAGATGTTACATTCGTTATAAAATCTTACGATCGGGAG:1 + chr3L 4324237 5' + mdg3 5207 1 62.00 AAGGCGGTACACACACAATATAAACATCCAAATAACAGCCTGTAAGCCCTTAGAAAATTCCCATAAAAAAAGGTAGCAAACTGGATGCAAGCAATTACAGA:1 + chr3R 25983011 5' + Q-element 93 2 71.29 CTTCTACATAGAAAAAGCAAAACTGTAGATTTATGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 19449995 5' + roo 41 2 65.35 ACAATCAAAAAGTTTATCCTTACGATAAATTGTATTTAGAATCACATGTACTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTT:2 - chr3R 14324267 5' - 3S18 312 2 51.49 CCGTTTGCCGTCCAACCGGCGATTATCTGCGGTTCATTGTACTTATTAGCAGACCTAAATGTGTGTTAATAAAATAACAGAAAAAAAAAACAACAAAACAA:1 + chr2L 8128525 5' + gypsy11 3933 2 52.48 GCAATTTATAAGCATACTTTGAGGCGCCCCCACACCCTTAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 + chr3L 13652612 5' - hobo 2903 1 61.39 GTTTACAATATTTGTTAAAAATGTTTAAATATTCAAGTAGTAGTACTAAGTAGTAAGTAGTACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTAC:1 - chr2R 9198801 5' + Tc3 317 1 62.38 TGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATGGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCG:1 - chr2R 4886003 5' - INE-1 579 1 62.38 AAAAAAAAAATTTTTTTGCAGCTGAATATATATATATACTCAGTAGTTCTTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTA:1 + chr3R 5911853 5' - Stalker 6914 4 56.44 AAAACAATGACCACGCCCAGGCTTTTCAATTGAATAGCCCACACGTAGCGTTTATTCCTATTTGATCAACGCACTGTTACACATGCGGCAACTTAATTT:1 - chrX 8364759 5' - jockey 4954 1 62.63 TCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGC:1 + chr3R 9657700 5' + BS 37 1 67.33 AAGTGTTATTTGATTAGAAATTATTGTTAGAAATCATCGTATTTTCATGCTATTCTTGATTGCCATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTAC:1 - chr3L 4345052 5' + mdg3 5266 1 44.55 CATCTCTATAATCCCCACTTCCCCCTTTTGTCGACAATGTACAAATAAATAAGTATATCTCAGCTTACATACATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACA:1 + chrX 20099899 5' + S-element 5 2 71.29 AGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:2 + chr3L 9692687 5' - P-element 2842 1 34.65 CTTTGNTGGCCAAATGCGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2R 11556072 5' + jockey 17 1 50.50 CGGAGACCTCGACCATCGAAATCCATCAACAATTCGAGTGCATAAAAAGTGGTTATGACCCAGCGTTCGCATCCACCATCCGAGTAACAGGTATCTGATAG:1 - chrX 3235758 5' + INE-1 547 1 68.32 TCCAGCTAAAATAAGAAATATACTACTACGTTTGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCC:2 + chr2R 6778889 5' + 17.6 243 2 67.33 AAAATAATTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCA:1 + chr3L 27182017 5' + F-element 278 1 77.78 CTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCT:1 + chr3L 7989738 5' + mdg3 32 2 52.48 CTCCTAGTCATTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAA:1 + chr2R 1571530 5' - 1731 311 1 75.25 CTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr3L 833385 5' - P-element 2831 1 23.76 ACTTCTCATTTGTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 + chr2L 22719565 5' + 1360 11 1 67.33 GCTCGTATTACGCATACACTTGGGCTGGACTGTTTATGTACATGTCGGCCATGTACATGTCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGGCAGCGC:1 - chr2R 4794620 5' - invader4 284 2 42.00 ACCTACTTCTTTTCTTCATCGGCTTGCCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCT:1 + chr2R 17293545 5' - Max-element 64 2 74.26 TGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAGATGGGTAGAATCTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTCCC:1 - chr3L 19271024 5' - INE-1 157 1 73.27 AAAATGGTAAAAAAAAAAATTTAAGAGATAGAGACGCTCTATGCGATGAAAGATCGCTTAAATACATAGTGAATTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAG:1 - chr3R 13647691 5' + F-element 175 1 72.28 GCCCGATTCCCATTCCACCCGCCCACTCGACTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAG:1 - chrX 5529226 5' - 17.6 117 2 70.30 AAACAAGTTTTCGAAATGCTGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3R 13715170 5' + P-element 7 2 71.43 AACACATTTTTGATCTCTTTCGCAGTAGGGTTGGAGTGGGTCTCCAAAATGTGTTGGCAATGCGTGTAGAGTTAAGAACTACGCGTAATTCGGATTTTGTG:1 - 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chrX 7536834 5' + Rt1a 19 1 58.42 CACCGAAAAAGTTGCTCCATCCATCGGATTGTTTGCTGCCACTATCAGCTGAACAACACTTTTCTCCGATAACCGAATTACACCAAACTTATCGGGTGCA:1 - chr3R 12120291 5' - gypsy12 145 2 60.00 AAGCTTACATTAAGCCACCCAATTGCATTCATCAAAGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTGT:1 + chr3L 11364110 5' - mdg1 7320 2 64.36 ACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chrX 14525255 5' + hobo 28 1 53.47 CAAGCCCCGACAATCAGTATCGGGTTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGG:1 - chr3R 31098220 5' - R1A1-element 4988 1 75.25 CAAACTCGCACAGAGCAATGCATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTAC:1 + chr3L 13452116 5' - F-element 4369 1 79.21 GACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGC:1 - chr2L 11551381 5' + Max-element 56 2 79.21 GGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr2L 21089158 5' - flea 4985 2 60.00 ATCTTACCAATAACTACACCAACGTAGTGGCTATATGCCCCCCCACCCAAACATGTAATTATTGTCCAGATGGACAGATTTTAAATTAATAAATAGATCGA:1 + chr3L 25515780 5' + G-element 4305 1 61.39 ATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 5974431 5' + roo 54 2 81.19 ATAAGACTAGAAAACTTGTAATACTAAGAATTCCGTGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTCACTCCTC:1 + chr3R 25313241 5' - Burdock 6133 1 61.86 TAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGA:1 + chr3R 9254903 5' + F-element 208 1 53.47 ATAGCCAAAAAATCGCTCTAAACGGGGGAAGTGGCCTGCATTCCATGGAATTGTGGACAAAGTTTTCGTATTGTTCCACCTTCTACTCCACGCCGATAAAG:1 - chr3L 6682854 5' - BS4 266 1 69.31 CAATATGTCATTAAGTCACAGCGAATAAACAACAACAATAAGTTGAAGGCGACTCACAAAGTTGAAACTAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAC:1 - chrX 8276276 5' + blood 168 2 61.70 ATTGATGGGTGTGGGCTGGCAAAAGCAATGAGATAGACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAG:1 - chr3L 22612025 5' - hobo 2899 1 64.36 TAAAAAATGTAATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTG:1 - chr2R 16898308 5' + Max-element 8270 2 60.00 TTCAGTGTAGGAGTTGCAGAAGAAGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr3R 30272783 5' + P-element 10 2 69.31 TAGAAGGGACGGCCTGCTGATAACGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCA:1 - chr3R 7360393 5' + jockey 6 1 79.21 GACGCAGCAAACTCTGGCCAAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chrX 7787316 5' + roo 8677 2 66.00 AAAACCAATACTTAAATGGTTCTATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAA:1 - chr3L 21713442 5' + roo 9034 1 77.00 CGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTT:1 + chr3L 24213803 5' - invader2 5050 2 80.20 GCTCCGTGTGCTGTCAACATGTTTCGTGGTGATTTGTGGGCCAGATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr3L 22920474 5' + 1360 5 2 74.26 ATACATTTTTATCGGCACCCAAATTAGGAGGATTGAACGAATTCCGCCTTGCCCCGGCGAGAGTGGTGCAAAGGCATCGTGGAGGAAGTCTACAGCGGAGC:1 - 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Doc 4645 1 60.40 TAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:2 + chr3R 10445213 5' - roo 9020 2 76.24 ACGGACAGTTGCATTCTTAAGCAGCTCGCTTCTGCGTCAGCTTAACTAAATTTGAAATAATCCACTGACATGACGACCGTGAGGCAGGAGCCTGCGATCT:1 + chr3L 2800874 5' + blood 407 1 70.00 AAACAACATTATCAGGATCAGGATATTAAGGATTTGAAAGCGAATGCCAGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCA:1 - chrX 12295446 5' - blood 428 1 52.48 TCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr2R 3188728 5' - 1360 3338 1 77.23 CTGAAACATATAATACTTTTCAGTAGTTCAAGAAGTATATATATAACATATTTAAATGCAACACATTTTGAATATCGGGTGGCATTCTCTCTGTTTCGCAA:1 - chrX 14746403 5' + invader2 4945 2 73.27 CAGATCGGAAGGATGAATTGGGAATAACGGATAAACCCCATATCACACCTAGGGAACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - chr3R 19837101 5' + P-element 19 1 59.41 CAAAATGAAGGAAAATCTTGACTTGCGACAGCACGAGCTAACCATGTGCGAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACATAATATCAAA:1 - chr2R 14850058 5' + Gypsy6A_LTR 38 1 70.11 TGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2R 19936678 5' - roo 9034 1 60.40 TTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:2 + chr3L 22920384 5' + 1360 36 1 61.39 ACGCATTGGCAAAAACACTGCTGCCTAATTTACTTGCTCTTCTTACACACGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGG:1 + chrX 4610978 5' + accord 7046 2 69.89 CAAGGAAACGTTGTTGCTACCTTTCACAGGGTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 - chr2L 8031307 5' + P-element 42 1 37.62 TTAAGTAGGCAATATAAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chrX 10251711 5' + flea 4766 2 70.30 AAGGCGGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGGAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 25918974 5' - roo 9051 2 53.47 AGCTCCTTGGAATATTTATTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATT:1 + chr2R 2552098 5' + HMS-Beagle2 18 2 61.39 TATACTGTATGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr3R 26469441 5' - hobo 2905 1 68.32 AATTTCTTTAAAAATACGTTTAAGCTGACTTATAGCTTCTTCTTTCGGAGATCCTATTTATAAGGTTTCACCAAAGACCTTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chrX 21388483 5' + 1360 9 2 68.32 GTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr3R 29350694 5' + opus 10 2 66.30 AGAGTTGCAATTTTTGTTAATGATCTGCTTTGGTGAAAGTGGATATAAAAGTATAATCAAAAATCGTCTTAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTA:1 + chrX 20974752 5' + opus 391 2 70.30 TGTAGCAGCGCTTTTCATCGTCAGTTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAG:1 - chrX 13602498 5' + copia 475 1 76.24 CTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGG:1 - chrX 1954498 5' + Tirant 8157 2 73.27 AGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAT:1 + chr3L 7989755 5' + mdg3 5301 2 69.31 AATAGTTGGCGTTGGCCATTTCCTGGGGATTAGCGGGCATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCT:1 + chrX 10997249 5' - F-element 4327 1 62.38 CCATTGATTTTTATTAGAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3R 11038636 5' - hopper 153 1 63.64 GATTGATGGGCCAGCGAGTGGCAGGGGACTTGGGGAGGGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr2L 11686092 5' + hopper 9 2 60.64 AATTTTGTTTCAAAAGGCATTGAATTAAGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chrX 5018730 5' - opus 7497 2 75.25 ACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr3R 14639363 5' + roo 8718 2 79.21 AATCTTTATGAGCAGTATAATATAATACTATTTGAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATACGATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTGATTTGTTAT:1 - chr3R 18823266 5' + F-element 154 1 64.36 TATAGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCA:1 - chr2R 5424284 5' + 1360 3348 1 66.34 TTTCCTTCCTGCATTAGTATTTAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCA:2 + chrX 7410194 5' + jockey 4721 1 78.22 CTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAAGGATTCA:1 + chr2R 5410968 5' - Tc1 1394 1 43.56 TTTGAGCAGTTTTTCTCCAACAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:2 + chr3R 9837558 5' - 412 478 2 64.36 GCTGTCGATGCTGTTGCTCTGGATGTCGTTCTCGTAGATGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGG:1 - chrX 15180945 5' - 1360 8 2 64.36 TATAAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCAATTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 14525246 5' + hobo 18 1 63.00 GAATTGATAGTACTGCATTAGCATGTTGATTCATCTGAATATTGAGTTACATACCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACGATT:1 - chrX 18717230 5' + roo 8684 2 63.37 AAGCGAGTTTTTAGAAGAAAAGAAAAACACTGTTGAACAATTTGAGAAACTAGTGACGCTCGCACCTTTGACATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACC:1 - chr2R 6868916 5' + 1360 261 1 77.23 TTTGCGCTTATTTTTTATTCGCCTTCATTCTTTTTACCTTCTTTTGCTTTTCTCTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGT:1 + chrX 13285166 5' - 297 401 1 61.39 TTTGATTTTCCAAAAGCGTACCAGTGAATTGGCTTTGCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3L 5716967 5' + copia 11 2 69.31 AATAAAAACCTTTAAAAACCCAAACGGATAGCACTTTTCCATCAATAAAGACAGAAATATATCTTGGTTACCGAAAACTGTGAACTAACGGTACCGCGCTG:1 + chr3R 24840468 5' + gypsy8 4827 2 65.35 GACTTATGATTCCAAAAAGAACAAATGCGTTATTTTTATCTACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGA:1 - chr2L 3694195 5' - roo 411 1 76.24 CCAGTGGATGCCAATGTCGCTTGTCGTGGGTGTGATTCTATGCAGTGCTCACTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAA:1 + chr2L 4224000 5' - Doc 4633 1 55.45 AAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAATTCCCTGGACAATTCATCA:1 - chr3L 23702254 5' + G4 19 1 56.44 GTATATAGGTACTCAATGAAACAAATTGTTGTCTATATATATTTTTTGTACTCACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCA:1 + chr4 651295 5' + mariner2 852 1 59.41 AAAATTGTAGCCTACTTAGCGGCGCCCGCTGCCTTGAGTATGAAAAGTTTCACTTTCATCTGCCAGCCAGAGTCTTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chr2R 21111240 5' + jockey 9 1 73.27 AACTTGATAAATTTGAACAACTCTTTAATCAGGAATCAGAATTTTAATCAGAAACTTATTTGCCAATAGATAACACAATATAATAATAATAATATTAAAAA:1 + chr3R 6769706 5' + mdg1 38 2 62.38 AATACAATAAATGACTGGGTATAACTTAGTATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACTAAGCACTCCAGAGCCCCAGTAATACGATCTAAAGCTTATAC:1 + chr2R 545172 5' + Stalker4 7109 4 71.29 GGTCTAGTTGTTCCAATTGTAATGTCTGTACATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGT:1 + chr3R 14324211 5' + 3S18 5813 2 69.31 CAGTTCTGGTAGAATAATAGTAGAGGGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAAACAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTC:1 - chr3R 22059527 5' + 1360 3377 1 79.21 AACTCTCTTGGCACTACGCCCCTGTCATTTATCCCATTTGCTTTATTCATTTGCATTCATATTTATCATTTTCATATTATTATTATTATTGTTATTATTAT:1 + chr3L 19656252 5' - mdg1 7064 2 74.26 AGGTAGCAGTGAGAAGCATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCAAACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr2L 326216 5' + roo 8680 2 64.36 TGAATAGGCTGAAATACCAATTGTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCG:1 - chrX 8031427 5' + roo 30 2 57.43 TTTTCACTCCATCGAATTTTGCATCCCCCGCTAAGTCCTGAAAATCGAAAAACAAGGTAAAACCGCAAACGAGCCAACAATTTATACAAAAATAAAAAAAA:1 + chr2R 8228997 5' + HMS-Beagle2 479 1 79.21 AAAGCGAAATATTTTTTTTGAAACACTTCTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGACTTAATGATGAACAAAGACTCGCAGCGGCCACGCAAAT:1 - chr2L 2436616 5' - Gypsy6A_LTR 113 1 68.32 CCATCAGTCTCGGGATCTCGAGGGGGGGGACAGTAGGAAGCTGTCAAAAGGCGTGTATGAAGCCAGGTTCAGTGATCGGCGATGTAAACA:1 + chr2R 18572991 5' - gypsy9 4915 1 87.78 GTAATCAAAATGCTTTTTAGAATATTTACTCTACAGTATTTTTATGTTACCTATTTTAACAACGATAGCCTACCTATTTACTAAAATTATTAAACAATTTT:1 + chr2R 6160464 5' + Tc1-2 1549 1 60.40 GATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAA:2 + chr2L 1129082 5' + HMS-Beagle 6839 2 69.31 AGCAGACTGATTAAATTAGGAAGTACTTGTACGTAAATAGAGGGAGAGAGAAAGTGAAGAGTGGACGGAGCTACTAGAAATATTTAAATGGAAATTCTAC:1 + chr2R 21421337 5' + TART-A 13182 1 48.00 GTAAGTATGTAAGCAAGCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 + chr2L 14260711 5' + 297 6587 2 72.28 AATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:2 + chrX 6605495 5' - opus 450 2 75.25 CTCGAAAGACAAAATGAGATGGCGAAACACAACTTTAATGGGAAAGGATAATGAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTA:1 + chrX 12554820 5' - roo 8973 2 58.42 GAAGACGACGGCAGTTGGGGGATCCTGGATGCCAGGCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 10957672 5' - hopper 1376 1 62.38 AGGTGNACCACTCCGTTTCGTAGGCTGCGGTGGCCACGGCCAAATTCTGTTCCCTTAACTCAATGAAACCTATTTTAGGCATCGGAAAATATTTATTTATT:1 - chr2R 12844247 5' - mariner2 836 1 56.44 AGCTTATCGTCCTGGCCATATGTGCCACACATTTTCCCGCACATAGGAAAGGAAAGGGTACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 - chr3R 31884297 5' + hobo 15 1 64.36 ATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2R 19936637 5' + roo 55 2 82.18 CTGCGAGGCAAATAAAATCAAGCTGAATAACACAGAAGAGTCAATCAATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATT:1 - chr2L 18028769 5' - flea 247 2 75.25 CGTTCCATTCGCGATTGTTTTCTATTCCTTTTCACTTGTTCACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr2R 21114697 5' + jockey 23 1 53.66 GGTCAAGCGCAGGCACAGCATTAATACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACA:1 + chr4 713639 5' - flea 419 1 75.25 ACACAGCAAGTGTTGTCAGCATCAACTTCACAAACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGA:1 - chr3L 11977310 5' - R1A1-element 5241 1 67.33 GACGTACATAGAACTTCATTTGATAAAAGCAACCTAAAAACCCAAATGGAAAATTGCCAAAAAGTGCTCACAAAACAAACACAAAAAAAAAAGAAAAAAA:1 + chrX 3627539 5' + G2 3076 2 69.00 AAAAAGAACAAATGCGTTATTTTTATCTACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr2L 3694182 5' - roo 398 1 65.35 CACCACCACTCCAATTTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAGACCGCTTGTTTTTGAATCGCAAAAATTTGCGCACAACTTCCACGGAACACTAAA:1 + chr2R 20532533 5' - R1A1-element 80 1 80.00 GTCAGTATAGCCGCTTAAAACCGATCTAATTAAAAATATACACATATATTCTAGCCTAAGTCTTCTATATGGTTAATCATTTCATTGTTTATTGTTTTTTT:1 - chr2R 7633455 5' - transib2 2642 1 65.35 GAGTCGAGCACTTTCCACTTTCCGCAGAAACATTAATGCAAGTTTTGCGTACTGTAAGGAATGTAATTATTGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTTTTAA:1 + chr3L 7289995 5' + Cr1a 352 1 68.32 CGCACACCCGCTAACGTTTTCCCTATGAAATCTACATGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 + chrX 328981 5' + opus 6 2 73.27 CAAAGATTTCTGTATAAAGGTTTAGACAATCATTTTCAAGATATTTTTTATAGGCACCAACCAAAGACACTAGAATTCTATTATTATTCTAGTGTCATTG:1 - chr2R 11728624 5' + Tc3 310 1 58.00 TCTCAACATAACAGCTGTCCCGAAACTTTATGGGGTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 19215884 5' - roo 404 1 70.53 TAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACT:1 + chr3R 19609638 5' - Tabor 467 2 58.42 TGAGTGCGCACAAAAGTATGCAATAAAAATATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr3L 14603352 5' - jockey 4974 1 60.40 GCCAGTACTCAAGTGAATGAGGTTATATCTAGGAGATCCCCTATGTTTTCATCAAATACACTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTC:1 - chrX 21085842 5' + mdg3 71 2 65.35 GATGCTTTAATCCAAAATAAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:1 - chr2L 16933656 5' + 3S18 5801 2 57.43 TACAAGGTACACAGAAAATTTGTTTTAGAGACACAACATTGAAATCATAAAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAACTATCACTGGGGCACCATGGTAC:1 + chr3L 15378520 5' + Doc2-element 4449 1 67.00 TTTTATACTTTTTAACAAGTCCAGTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 21501167 5' + 1360 51 1 77.23 CATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 + chr2L 14260751 5' + 297 6627 2 76.24 AGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1 + chr2L 1129081 5' + HMS-Beagle 6838 2 68.32 TGATTCAAAATATTATCAATGACTGTGGTTTATTTGATACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGC:1 + chr3L 10823508 5' - invader2 129 2 75.25 GTAAAATGTTTCGAGATCTGTTTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCAACAGA:1 + chr2R 15802847 5' + X-element 4475 1 77.78 GAGATTAATTAGTATGCCGTTTGCGTATGGCAAAGCGTTTTGTTTGCACTAAATTCTCAATAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGA:1 - chr2R 21848026 5' + Juan 4113 1 63.37 ATTGCCAGTCGAAATGCAGACTCTGTCCCCGGGCTCCATTAAAGAAATCAGATGCCGGCAACAGCTGACAAAATCGATGTATAGTATATATATGCATGTAT:1 - chrX 14973057 5' + INE-1 64 1 78.22 CCCATAATGATTTAACTCGCTCGGGGATCTGTCCGGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3L 13194826 5' - 297 6941 2 63.37 TTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr2R 19192544 5' - roo 9027 1 72.28 TGACCGCTCACAATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:2 - chrX 5443977 5' - mdg1 412 2 69.31 ATCTATACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 + chr2L 13250355 5' + pogo 21 1 56.44 ATATACTAGTAATTATTAAGACCACAAACAACAAAAGAAGAAAGATGAAAAAAAAAATTGACTAAAAAAAGCCCAGTACTCTGTGGTGACCAACACCACA:1 - chr3L 19888872 5' - baggins 4954 1 67.00 GCCAGCATACTTAAACTGGGTCAATTGCCGGCGTCGCTGCTGCAGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTA:1 + chr3R 9981497 5' + jockey 4792 1 55.45 ATTTAACCCATTTATTAATATGCTTAATAAATTATTACTATTGACTATAAATAAAATGAAAATACATTAAGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCG:1 + chr2L 6363049 5' + Doc 241 1 74.26 AACGTAACCCACAAAAAGGTAACCAAAACCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr3L 21203054 5' - pogo 2056 1 69.31 GCTGTTGCTGTTGTGTCTGTGGGTACAGCGATTGTTGCTATATCCATTGTTGTTGGATCTTTGGCAATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGA:1 + chr2R 20411847 5' - 297 6971 2 74.26 ACCGATGAGAAGCTACTGCGCCAAGTTGAGAACCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCC:1 + chr3R 31586858 5' + R1A1-element 4967 1 67.33 AGGTTTCACTTTATCTCTTCATGATCTTTCACATTTAGTATTCAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATGTTTAACATTGTTATAAAGAAATAAATTGTTT:1 + chr3L 21836949 5' + pogo 2001 1 55.45 AATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTT:1 + chr3R 13375975 5' + 1360 39 1 66.34 GAACCGAATGCGATTAGATAGTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3R 24152874 5' - P-element 2876 1 53.62 GTAATCCAACAGAGTAATTGCGATGAACTGGACATTGCCTACAAAGAGCTGTTAAGTGAGCAGTTCCACGTAGGTTCACTAGAAACTACATACCCCTAAT:1 - chr3R 14271394 5' + Cr1a 4125 1 67.00 ATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTA:2 - chr3L 14603322 5' - jockey 4944 1 70.30 GGCCGAAAAGGGGGGATGAACTCTCCCTGCGAATTTCTATGGAATTTCACATGCAGCGGCAACTGCAGCAAACAAACTACACAAACAATTATCA:1 + chrX 19149677 5' + Porto1 299 1 76.60 CATTCNTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTA:1 - chr3L 11909982 5' - Tabor 433 2 73.27 GCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chrX 18012682 5' - roo 9037 1 56.44 GAAATGCCGTCATAAAACTTCACAAGCATCTGGAAAGTAAAACTTTATAACATGCATTAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGA:1 + chr2L 20020823 5' + jockey 4729 1 67.33 GCAGANCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 - chr3R 9369999 5' - roo 9039 1 57.43 ATTCCGGAGAATGCGACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAATGATCACACATGAACACGAATAGATTTAAAGACTTA:1 + chr3R 14639339 5' + roo 15 2 58.14 AGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr2L 11065915 5' + P-element 52 1 27.72 GCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTA:1 - chr2L 18914590 5' - mdg1 7412 2 69.31 CAGTGGCCTCCAATCTGCATGCTTGATGGGTTATGGGTGATTGACCGCAGAAGTCGCGGAGACGTAAGAGAAGTACGCGTTGTTTCGTTGCAATGAGAGC:1 + chr2L 2664034 5' - Doc2-element 335 1 73.00 CGTCGCGTCATATTGCGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTT:1 - chrX 10730674 5' + P-element 60 1 20.79 GTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 - chr2R 20702147 5' + Doc 48 1 73.96 GAATTGATGGTTGACAATTAGCAAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACT:1 - chr2L 12075738 5' + Juan 4070 1 66.34 CTTTTCAATCGACTTTCAACAGCTTATGACACCCAGCCTTATTATGACCGTCATGGCTGTCAAGATGATGTATAGTACGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2L 6250176 5' - accord 184 2 66.34 GGACACTTCGTTTCGCCTGCTCATCTCTAACTGAGTAATAACCAGGATGTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAATTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTCTTTA:1 + chr3R 13080381 5' + diver2 33 2 56.44 GGTGTAAGGATCATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACG:1 + chr3R 25633310 5' + Tirant 8118 2 70.30 TGTTGACAGGGAATAAAAAAACAGGAAAAAGTATAGCCTGGCACAAAAAATGAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 20957641 5' + gypsy7 5006 1 84.13 GTACTTTCCAGGGACTGAAATGAAAAATAAGTTTGTTACCAGTTTTACAGAAAATATAATATATAATAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCC:1 - chr3L 24131188 5' + HMS-Beagle2 6888 2 74.26 CGGGGAGCGATAAATAAATGTAAAAGTACGAGGGGAAAATTCAATGAAATATGTGAGCTTTTAAATTTCCAGTTATTCAAGAAACAAATTAAAACATATTA:1 - chr2L 12275321 5' + HeT-A 5766 1 57.43 TATCGCCCATCTGAATCTTTTTTTGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTAAA:1 - chr3R 19444991 5' - Doc 151 1 77.23 ACGACTGGGCGCGGGACACGGCAGACTCTGCGCTGGCCAATGAAGTGGACGACCACCGTGATTGGCTCAGCCGGCGAACCTTACGGTATCGCTACCACTAC:1 - chr3R 5824186 5' + G-element 147 1 61.39 GAGGTGACTTTACCCATAGCCAGGTTCTCATTTTCAATTTTCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3R 11496885 5' + Doc 40 1 59.41 ATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTT:1 - chr3R 9952234 5' + Ivk 44 1 70.30 ATGCAAATTTTAATAAACACCAAAAAGATAATAAAACATACATACATACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTA:1 - chr3L 15635841 5' + roo 8852 2 61.39 TTGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCA:1 - chr2L 11551385 5' + Max-element 52 2 75.25 TAGTGGAAGTCCTTTTTTCCACCACTGCTGTTTCTTGGCATCCTTGTACTGTTTTTGAGGAATTTTGCTTCCTGAATCCTTGACCACACCCCAAAATTCCT:1 - chr2L 20619252 5' - Tc1 1224 1 53.47 AGATCTTTCCTATTCAGGTGCAGCTCGGTGGAGGAGTCAACCTGTTCCATAGTATTGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAG:1 - chr3L 19818563 5' - R2-element 3355 1 64.36 AACTATAAAGGTACAATAATAGTTCTAAATGGATTTTTGCACATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATAC:1 + chr3L 14241258 5' - Tirant 306 2 58.42 TTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 - 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chr2L 19679795 5' + Doc 26 1 62.38 TAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACAC:1 + chr2R 2492932 5' - invader2 5086 2 57.43 TGCTAACTTTTTCAATCCTGAATTAAAGTTTGATGTCTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2R 3919671 5' + 1360 39 1 62.38 TACAANATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 10445177 5' - roo 9056 1 62.38 AGTTTTTTTCGGCATTTTCTTCGATGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 18009580 5' + roo 52 2 80.20 ATTTTNGGGTGGCTCAAGACATATCACCTGTCGCGGTGCAAAAAAGAACCAGCAGTTCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATA:1 + chr2L 7350724 5' + mdg1 22 2 52.48 ATCGAATAAATAGATGTTCATCTGAGTATAATGAAAGCAGATTGATGATATTTTTTTTTTTCCAAACATTGTTTCGGAGAAAATTAAAATAAAAAGAAAAA:1 + chr2L 10604216 5' + Doc 4698 1 62.38 TCCACGAAGCTCCATCAAAAAGTCCTGCTTAAAAATGCAATAACAGGAAATGGCAACGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATACAACGAGCACAATCAAA:1 - chr3L 19347303 5' + Doc4-element 2651 1 49.50 CAGCGAAGGAGACAGGAACAGAGACATCTACCGGTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTGCTGCGCTGCGCGAATTTCGTCATATACGAG:1 + chr3L 960107 5' + Rt1a 45 1 67.71 TCTGCTCGTTCTAAAACAGATTGTGTTAGGAAAAAGAAAAAAATTTCTATACACGAGGACCAGGTATACCAGGCGGTAACAATAATAGCACTGCTTCTCGT:1 + chr3R 25343241 5' - Tc1 1434 1 73.27 ACCGTTAAGATATCGCCTGGTTGGTGGCATTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chrX 8977362 5' + jockey 12 1 73.00 CCAAAACAAAAACAAAACAGAAAACAGCCGATGCGCCGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3R 28326703 5' + P-element 25 1 49.43 TTTCGCCCTAGCTACTTTTCGTTTATCGCAAGCATTTTCGCATAGCGGCAGTTGCGTTGCACATAGTGCAAACCGCTGTTTTCGCACGCATTTATCTGTAC:1 + chr2L 22218110 5' + diver2 4647 2 54.46 TAAGCACGTAAATTGAGCAATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGAC:1 + chr2L 326101 5' - roo 9070 1 81.19 ACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 14525271 5' + hobo 37 1 67.02 AAACCCCAGCCACTCGAGATGTATGTCATTACTTTAGACTGCTGGGACTTGATCAGAAGACTACGCGATGTATGATAAAACAAGAGAGAATGCTATGGTCG:1 + chr2L 22318199 5' - INE-1 579 1 59.41 GTTTCCTTGTGTGCGTAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACA:1 - chr2L 2197143 5' + P-element 36 1 44.55 ATCCCCAGAGGTTACAAAATGTACTCCGTGTCCTCCCAATTAAAAAAAATTAAAAAAAAA:1 + chr4 615058 5' - hopper 152 3 71.67 CCCTGCACGCAAACAACAAATCGATGAAAATGTTCATGATTATTTTTCTCTGTGTGCATGCTCCCACCCCCAATTTGAATATCTGGCGCCCAACCAGTGGT:1 - chr3R 22311393 5' + gypsy2 349 1 67.33 TCATAAACATATTAGTTTCTTGTTCCTTCTAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr2L 8542896 5' + P-element 47 1 26.73 GGCAGTTCTCTTCAGTGTATACGTAAACTTTATTTACATTAAAACATTTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAAC:1 - chr2L 17889416 5' + accord 11 2 68.32 TGAGGCGTTACGGGTGCTCCAACATAATACCACCCAAAAAAAAAAACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGC:1 - chr3L 16030365 5' + accord 7055 2 49.44 TTTGGAAGGCGTCCAGGACCTTGGTGAGCGCACCTTGCTTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGTAGCAGCCAG:1 - chr3R 20927478 5' + gtwin 414 2 61.39 AAAAATGGATTATAGATCCGTAAAATAGAGAGGCACCTTATGCGTTTCCTGTGCAAAGATATGAATGGAATGAAAAGTGTGTAACAGACAGAAGGAAGCGT:1 + chr3L 15027804 5' + INE-1 31 1 63.37 AACCGGAATGGATCGCTTCTTAATGATGTTATTGTAAGCATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGA:1 - chrX 21939116 5' + springer 7173 2 61.39 GGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chr3R 4973101 5' - 1360 13 1 40.00 AATTGCATCTTGAGCCGGAAATTTCTTTCATTTTTTATTTCCTCTTCGCTGTTTGCAACTCCTGGCCTTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTC:1 - chrX 5726674 5' - blood 7327 1 63.37 GCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 17122428 5' - roo 9025 2 72.28 ATTTTTAGATCATCCTTGGGAGTACATTCTACTCCAAATCCCAAGCTCAAGCATTTTATCAGCGTGACAGAGTCTGTTGCCTTTTTCCTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 5932246 5' - Doc2-element 230 1 58.42 GCATGGAAACAAAGGAAAAGAAATACGTAAAGCTTTCAAAGAGAACGGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTT:1 - chr3L 21483925 5' + Cr1a 56 1 82.18 CTTTTGCTCAGTATATGTAGTATTCAATTTTCAATTTTCCGAAAATGGTATTACAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 4986274 5' + roo 8684 2 59.41 ATAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 - chr3L 20248349 5' + Transpac 4974 2 76.24 ATTATGCGATGTTAGGGGCACATTCTAAGGTCACCAAATTAGCTGATGGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr3R 22079095 5' - pogo 2076 1 54.46 ACGACTGCGACGATGTCTACGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 - chr3L 13312588 5' - mdg1 350 2 77.23 TTGAGCCCGAGGAGCAGCAACTGGATTACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chrX 21396288 5' + F-element 33 1 49.48 ATTTTCTGCGCTTTTCCTCTTTGTTTCACTGCTAATCGCTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCA:1 + chr3R 8704710 5' + jockey 217 1 62.38 CTTTCATTAGTCATATTTTTAAGTATTGCCTATTTAAATGGGGCCTTAAAATGCTTGCCATAAAAATGTTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCT:1 + chr2L 18513556 5' + jockey 4677 1 30.69 GCGCAAGCTCACTGCATGTTTGATGGCCTGGCATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGT:1 + chr2L 6255776 5' - flea 4971 2 68.32 CGTTGTCTTATCCTCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGTGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chr3R 14169218 5' + blood 7013 2 73.27 AAACCTTTTTAAACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTT:1 - chr3L 14240918 5' - Tirant 389 2 69.31 CCTGTGAATTAACCTGTGGTTAATTTCTTTGTATAGTGTACACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chrX 18012736 5' + roo 8708 2 69.31 GTAAAATGAATTTCAAGTGTTTTTTAAATGGACAAATGGTTACACACACATGCTTAATCTCCACTTTCTAGCTTTTATATTGTAGTTCCTGAGATCTCAAC:1 - chrX 18033521 5' - INE-1 145 1 52.48 AGGTCNGGAGTTCTATTGTAGGCAGGTGCTCACACTAGACTTACACTTCCAAATAATACCTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCAT:1 - chr2L 514938 5' - 3S18 6086 2 55.45 ATTTGGGACCAAAGAATAATCAGCTTACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCT:1 - chr3R 4543264 5' + 3S18 5787 2 55.45 TCTCAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chrX 4041522 5' - hopper 1372 1 66.34 CGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:2 + chr2R 5849988 5' + jockey 61 1 77.23 AGAGCGGGAGCGAGAGAGAGAGTGGGAAAATCATCGGGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACAT:1 + chr2R 15676674 5' + roo 8783 2 66.34 ACAAGGAGACGGAGGCAACTGGGGACTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCA:1 + chr2R 7965131 5' - opus 7249 2 80.41 ATTCTCGTTGGCGTAGTCGTGCCCGTTCTACTTCCTGTTGTCGTTTGGCTGCTGTTTTCACGTTATGAGCTACTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGATGG:1 - chr3R 27766412 5' - F-element 399 1 78.22 TATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chrX 4154918 5' + blood 37 2 60.40 CACCGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr2L 487136 5' - P-element 2852 1 43.56 ATTTATTGCGAAACATAGCCTCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAATTTGTTGCTAT:1 - chr3L 17699364 5' + 412 56 2 76.24 TATTCGTCTGCGAGAGGCTTTACTGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 9277562 5' - roo 9019 2 79.21 TTCTGCTTGTGTGGCCTCTTTAGACCCGAAAAAATAATACTACAAAAACACCATGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGG:1 - chr2L 3538493 5' - I-element 335 1 53.47 AGAAACTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATG:1 - chr2R 5424281 5' + 1360 3351 1 69.31 ACACTGATAGCTTGTTGAATACGTGTTCTCACTCCCATTCTTTTGAACAATTTTATTGATCCAAAATAAAATAGATTTGAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTG:1 - chr2R 399420 5' - 1360 229 1 72.28 TTAATTAAGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2L 1626519 5' - roo 391 2 60.40 AGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAA:1 + chr3L 23933548 5' - Cr1a 252 1 56.44 TTTGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 21500996 5' + roo 8693 2 56.44 AAATGCAGAACCGAGACCCTCAAGAAACTGACACATCGACGCGGCCCCAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAA:1 + chr3L 8885007 5' + I-element 5105 1 53.47 CGCGTTGCCGGAAATCGGGCGACAATTGGAAGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCAGTCTCAGCGCTAGCCCCAAAGCTAAGAAAA:1 - chr3R 14080258 5' + Ivk 243 1 69.31 AGGCACAATTGCTTCGTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3R 31812688 5' - P-element 2848 1 44.55 GGATTGCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chrX 21388565 5' - 1360 3349 1 66.34 GCGCAACACATGCTGTTTTCAAGGAGATGCACTCTGGAACTCGCCGCTCGAACTCGAAGCTCCGGCATTCCGACATTCCGACAACGTGCCCAACACCAGCG:1 + chrX 20063395 5' + G-element 499 1 79.21 GCGAATTAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGG:1 - chr3R 1868229 5' + G-element 22 1 55.10 TCATCAATTTCCCATTTATCACGACAACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGAGCAATATGAACCAAACGCAGCGGCTACTCTATCTAGGGTTCCCTGCAC:1 - chr3R 23864424 5' + R2-element 350 1 72.28 GATGACTCAAGTACATAGCAGAGGGTGTCGGTTGGGAAGGGGGTGAGGGGGTAGGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGTGTGTG:2 + chr2R 8241703 5' - gypsy3 417 2 78.22 GTTGGGGCTGTGTGTTGCAAAGGGAACTGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCT:2 - chr3R 31369362 5' + Transpac 47 2 68.32 TAAAGGATGAGAATTGTCATCCTGCAAGATGGCCTTTAGGAAAGGTGGAAAAGGTGCATAAGGGGAATGATGATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:1 + chr3R 19447958 5' + mdg1 90 2 76.24 ATTAGCCACATTCGGAGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chrX 10653630 5' + jockey 9 1 77.23 TGCCGTACTTAGGAAGCCGTCAGCTGAGCAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAA:1 - chr3R 8461613 5' + P-element 442 1 45.54 GATGATTCAAACAGACGGGACTCTGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAGAAAAGTTAAA:1 + chr4 763151 5' - Cr1a 4270 1 76.24 CAGTTTCGTCAGATCGGAAGGATGAATTGGGAATAACGGATAAACCCCATATCACACCTAGGGAACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3R 19837110 5' - P-element 2877 2 68.32 CAATGCAAAATTGTCGAGCTTAGTATTAACCACAGCATAATGCAATATTTTTTGCATGAACTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTT:1 + chr2L 15893682 5' - Max-element 283 2 62.38 ATTTGGGTTATTTTTCCCCCACAATCGTATGCAATTGAAATTGTGCCGTTTGATGTGAAAATACTGTTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAA:1 + chr2L 16933572 5' - 3S18 328 2 73.27 GGAGGNGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chr2L 108041 5' + P-element 53 1 26.73 GGGCTGTGTGTTGCAAAGGGAACTGCATTAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTT:1 - chr3R 31369358 5' + Transpac 51 2 72.28 ATGAACATTTTAAAAAGGAAAGGATATCCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3R 12894154 5' - blood 7341 2 72.28 CATACGAAAGTGTTCGATAACGGTGCACACCAACACCACCTTCGCACGCACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACAGAAAACAAAGTTCTTCG:1 - chrX 19796336 5' - R1A1-element 35 1 51.49 AGTGTATATGTATTTTATATGTATTTATATATATATGTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 1787718 5' + roo 39 2 67.33 GATTTATTCGAAACTCCCGACTATGATTTTCTGCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGATAATTCTCAGAATTCTTGACTGTGCTCGCTGAATAATGTCTAT:1 + chr3R 16297235 5' - Doc 4334 1 67.33 ATACACATCTTTGTGCTTAGCTCTAATGCCACTTGATTTTTAACAAGTTCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAAT:1 - chrX 14531565 5' + 412 22 2 56.25 CACAATCATGCTTATGGCTTATGTAAATTTTTTGACTGGAAATCGAAGAGCGAGTCCCCAGTTACCAAGTTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 9610397 5' - roo 329 2 77.00 AAAGGAGCCGGATATCCTAAAACAAACAGTTATATATGTGTATGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chrX 11585554 5' + pogo 16 1 57.95 CACATCTTCGGAATCCTTTTTGGACATGCTATTATGTTGTTTTATTCTATATTTTCGAAACTATTGAAGAAATAAAAGTGAACCATTTGTTAAATTGTTTG:1 + chr2L 21671364 5' + HB 1510 1 72.28 CGACCAAAGTATGTAACAGGTAGCAGATAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTAAAATCCCAAGTAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2L 6227648 5' - roo 9042 1 51.49 TTTTTCGTGCTTTTGTTTTGAGTTGCGAGGCAGCGGAAGATTTTCGAGCTTCGCTTTGGTCTTTTTATGCTTTGACAACTTGATTGCTTCTATTAAAATTC:1 - chr3L 21013644 5' - HMS-Beagle 6592 1 73.27 TTCATCGACGATAAATTGATCATTAGTGCAAAAGTGCCTCTGTTTAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCT:1 + chr3R 19449070 5' - roo 8740 2 59.41 ATAATCAAATAGTAACCAACTATTTCGCCATTAAGTATGGATTTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTACCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr3L 3951127 5' - pogo 2071 1 56.44 ACGTTGAAAACAAGTTTTCGAAATGCTGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr3R 13715177 5' - P-element 2884 2 76.24 ACAAGAATGATGTTGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2R 9862211 5' - roo 9039 1 61.39 GCCCGAAGATCACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTG:1 + chr2L 11047957 5' - Juan 3867 1 60.40 CCATCCACTTCAAATGTAATTTCAACGCCAATTTGGCTGTGTAAAATTTATGCAAAAAATTCGCGATCTCTCTTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTT:1 - chr3R 17243450 5' + blood 166 2 57.14 CCGCTCTTTGGTGACTATTACTCAATAGTCGGAGCTCGGCTGGGCTCGCTCCGTGCCGTACCGCTCGCCAGTCGGTTGGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATA:1 - chr2R 9013628 5' - blood 197 2 81.19 AAACAAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:2 - chr2R 18503570 5' - roo 393 1 51.49 ATGACGTTTGGTTTGGGCTGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGACACATGCACCAAATGCTCACTT:1 + chr2R 5532140 5' + R1A1-element 5247 1 77.66 CTGGCAAGGGGTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chrX 19306743 5' + P-element 23 1 54.46 ATAAGCTGAAAACAAATGACAACATGAACTTAAATTGTTAAATGTGGGGCAATAGAAGTGTTTTTTATTTCTTTATTAATTAGAAGCGATAAATCCATACA:1 + chrX 20266165 5' - BS 5074 1 64.36 AGTTGAATTGCTTATCAGTTATACACTGAAAACAAAGTTCGAGATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chr3L 14049983 5' + pogo 34 1 55.45 CCATATATTTTCCGCTGTCCGTCTGACTGTCCGTCTGTCCGTCTGTCCGTTTGGAGATGTGCAAAAAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAA:1 - chrX 20485161 5' + R1A1-element 87 1 53.47 TTAGGAAAAATGTATTTGTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2R 13122093 5' - opus 479 2 60.40 AATGTGATTTATTTAATGGAAAACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3L 9772296 5' + 297 6590 2 67.33 GTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2L 2437698 5' + roo 8686 2 55.45 GCTCCATTTGACGCCTCCCATTAACTGCCAATGAATATACCCCTTTTCCCAGTAAGTAATCGGTATAAAAACGAAGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGG:1 - chr3R 22864444 5' - jockey 4778 1 81.19 TTAAAACATGGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCAC:1 - chr3R 7522401 5' - blood 376 2 71.29 TTCAGTCGTCAATTATTTATATATCGCTAATTTTTTTATTTGTGATATAGAATGCTGAGCTTAGCTTGCTTTGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCA:1 - chr2R 4402686 5' - 1360 498 1 64.36 TGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTT:1 + chr2L 22719593 5' + 1360 39 1 66.34 AACGATGAACTCAAAGTAGCCCACTAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGT:1 + chr3L 543435 5' - P-element 2834 1 26.73 AGCGGAAGAGAGAGAGGGAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAG:1 - chrX 18276928 5' + P-element 287 1 23.76 AGCAAGAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 - chr3L 5975640 5' - hobo 2889 1 76.24 ATGTAATTGTGGTGTAAACAGAAATGTGTCTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTAGATAGGGA:1 + chr2R 25183067 5' + HB 110 1 77.23 CATTGGAAAGGTACATAGTTAACACCTCTGCGTAAGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chrX 4009284 5' - 412 7506 2 59.41 TTTGAGGTCGTTGAGTTCTTTCCGTGAAAGTGAACAAAGAGCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3L 7792243 5' - 412 7510 2 59.41 GCTCCTTGGAATATTTATTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTT:3 + chr2R 2552099 5' + HMS-Beagle2 6902 2 60.40 TCAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chr3R 1206456 5' - I-element 5327 1 56.44 TTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 + chr3R 25702169 5' + Tirant 18 2 63.00 TGGTTACATCAGTAATTTTTTTATCTTCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGCAGATCTCTTTCACAGAGCAATGGATACTTCGGAGCCCATAATA:1 - chr3L 17861435 5' - hopper2 192 2 71.29 GCCGCCGTTTGTATGCAAACCATATGCAACGAGTTAATAAATGGGAAACACAGGCTTGGGGATTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3L 18154218 5' - I-element 5343 1 65.35 ATACTNATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chr3L 19951213 5' + Ivk 45 1 69.31 CCCAATTACTTGACGTTTTGCGAACCACTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTAT:1 - chrX 11663579 5' - P-element 2576 1 35.64 AACTCTTTTCAAAAAGGAAAAGAAGTAAAAGATTTCTATTCAAAGGGATATGTAGGTGGATAGATAGATGTATAGATAGATGTACAAATTATCTAAAAAAG:1 - chr2L 1401225 5' - Tc1-2 278 1 69.31 GTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 - chrX 8948680 5' + blood 7044 2 57.43 GTGGAGAGAAAGGGTAATGGGAGTGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTCAGCAGTACAGAGGCAGTACAGCGAT:1 - chrX 14664000 5' - 3S18 5719 1 76.24 AGAAAGTAATAAAGTAGCCCAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGC:1 - chr2R 12446401 5' + jockey 4676 1 70.30 AACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTCTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chrX 19457167 5' - roo 9018 2 79.21 TTAATNCCCCACGAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr3L 958807 5' + P-element 39 1 39.60 GTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAG:1 - chrX 23108307 5' + BS3 1441 1 61.39 GGTTGCACTTTGGAACCGATTTGGAACCAGGCGCCGCCAGAATAGGAATCATTTCACTTGAGGCTCGATTGAGCAATGGGGGCGATAAATTTGAGAAAA:1 + chr3L 4068667 5' + jockey 381 1 71.72 CTCTAGCTGGCTAGGGAACCAGGAGGGGACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTA:1 + chr3L 14240793 5' + Tirant 1 2 78.22 CTGTGCGTATGCAATAGAAAATATTTAAAGTGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGA:1 - chrX 8364669 5' + jockey 4772 1 63.37 TAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr2L 13739968 5' + 412 49 2 77.23 GTGCCAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAA:1 - chr3R 7388422 5' - HMS-Beagle 225 2 62.38 GGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGC:1 - chr2L 15893766 5' + Max-element 8267 2 58.42 TATGGCCCGCGCCTGAAAGTATGCCGCACATTCACCTAGGATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCA:1 + chr3R 14135108 5' + Tabor 440 2 60.40 TGCACGTATGTACACACACGGCGACAACAACTGCTGTTAACCGATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 - chrX 2589729 5' + copia 36 2 57.43 GTCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGGTGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCT:1 + chr2L 15081431 5' - hobo 4 1 51.49 TAATGAGCAACTTTTTAGATTCAGTTCGAACATAAGAAATAAATGTGTTTTCAGATTGTATAGACTTCAGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATG:1 - chr3L 20895054 5' - invader3 5389 2 61.39 TCGCTTGGCTACTGGAGTGACTATTGGTGTTGTTGCTATAGTTGCTGCAGTTGCGGAAGAGTTCAGAGTGGGAGAGCTGAGACCGTAACTGCTGTGAGCGG:1 - chr3R 31367311 5' - Porto1 484 1 73.27 GTTTCGATTGCGGTCTGTTATCAGGTAAGACCTTAATGCCCCACGAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr3L 958839 5' + P-element 7 2 72.28 ACTGTTATACAATGGTGCCAATGTAACTTTTTCTCGACAAATGAATTTTGTACTTATTTACCCAAGTGTATAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATA:1 - chr2L 8740974 5' - Burdock 6383 2 71.29 CGTAGCGACTGACAAGATATTCGAACTCAATATTTTATTCGAAATTCGACAACGTTCTCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2R 13038967 5' - P-element 2868 1 60.40 CTGCGTCTCGTCTAGCGAAACTTTTCATTATGCACTTGGAGGCACAAAACCGTAACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCG:1 - chr2L 14085943 5' + invader4 448 1 65.35 AAGGGACGGACAGACGGACGTGGGACAACCTACAACCTACAACCTACAAACGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAGGAACAAGGACTGAG:1 + chr2R 8334888 5' - diver2 141 2 53.47 CAGACAAATCCTTCAGTGTCACAACATTATGATAAAGTAGAACATTGGGTAGTTTTTGGAGAAAGAAGACGTTGCAGACTGTGCAAAACTGCAACGCCGAT:1 + chr3L 26696870 5' + looper1 1558 1 88.12 AATGCAATTAAATGCTGGCCAAAAGCATTAACTATGATTGATCAAATGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 + chr3R 23665254 5' - 297 368 2 59.41 CCCTGCACTTATTACTCGAAATGTAAACCAAGCATATGCACCCGGCGGAAGCCGAAGCAAATGTTGGGATGTTGGGTCATACAGCCGCCTAAACTGTG:1 - chr3L 16890525 5' + diver2 8 2 67.35 GCCAGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 29660252 5' - mdg1 7409 2 76.24 ACTTAAGTGAAAAAAATTAAATGAATATCTGAAAGCATCATGAAAATATTACGAAATTATTATTTTGACCGCAACGACACGAAGTTCAAAGAAAAAAGAAT:1 - chr3L 23702272 5' + G4 1 1 74.26 GTGGCCAGACCAGCGCTGCCAGTTTTTTCTGGCGTTTTTTATTTTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 - chr2L 16686612 5' + pogo 29 1 62.38 AATGTTTTTGAAAAGTAATATAAACAATTTTATGGTGCGCAGACAGCAGAAAATAGAAAATAGAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACC:1 - chrX 8409026 5' + pogo 2049 1 53.47 AAAAATGAGATAATCTTAACCTCGGACTTGCAACACTTTTTTTCGACTTTAATGAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGT:1 + chr3R 31369301 5' - Transpac 284 2 56.44 GGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGA:1 + chr3L 25889016 5' + gypsy8 311 1 72.28 AACTGCAGCCGCGCTCAGAATATCTAAGCAGCCGCAGACACATCTAGGTAGTTCCCAGTTGCAGGGCTGGCAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTG:1 + chr3R 21698522 5' - 3S18 33 2 77.23 GCTGAGGGGGATTGCCTTTTGAAATCGGTGACCCCGACGTGATGCGAATCAAGTGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 + chrX 11282549 5' - I-element 5336 1 61.39 TTCAAAATAAAAAAAAAAGGGAAAAAAAAA:1 - chr2L 15777467 5' + Doc2-element 233 7 90.00 GCAAAATTGTATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chr3L 21841361 5' + P-element 33 1 48.51 CCGCCNCCGGAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 + chr3R 25818812 5' - mdg1 7435 2 52.48 AATACACATATATTTCAAAAAGAATTATGCAATTATGCAAAATTACATAATATACATAAAAGGAGCACAATGTCGCTAAGAGCCAAAAGAGCAGTATACGT:1 - chr3R 4583506 5' + BS4 533 1 60.40 CTTGCGCCGTCCTTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTTCCCTTTTGCGGACGTCCTGCTGGGTTACGAGGTCCAGTTAGTTCACGGTGCGTCGTCTT:1 - chr3L 24300074 5' - gypsy8 4902 2 55.45 CAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chrX 329078 5' - opus 467 2 59.41 GAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTTTTTACTTAAAGCAAAATTGGTTAATAATTTTTTTAATAATAAATTATGACAAATTAATAAAAAATA:1 + chr2L 14099896 5' - Tc1-2 1366 1 63.37 CGGAAAAGTATAACATATCCGAATGTAATTTTATAAAATGAAAGGTTTTCGCTAGTGTTATATAACCAAAGCGTATCAGTTAATAATTACAGTTATCGATT:1 + chr3R 28883342 5' - HMS-Beagle 7039 2 74.26 CCAGGTCGCAGTATATTTATCTCACATAAGAACCAAAAGGACATTATTAATTAATTATTAATTAGTTATTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTAT:1 - chr2L 17841095 5' - Juan 4061 1 45.54 CCTTTTGAATATGTTTCATATATTTCTGTGATGCCTTAATTTCTTCTCATGGTCGGATACCTTAATGCAATGACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAA:1 + chr3R 16626756 5' + I-element 5261 1 73.27 ACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACTTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 + chrX 19306774 5' - P-element 2836 1 26.53 TAGCGGTGTGGTCCAGATATGTTGCTAAGTATGCCAAGCAATTTTTTGAGATCTAATATTTAAAAAATTGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr3R 4989559 5' - roo 403 1 64.36 TCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:3 - chr3R 9369994 5' - roo 9034 1 62.38 CCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCT:1 - chr2R 19386727 5' - 1360 118 1 49.49 AGCAGCGGCGTAAGGAATTTTTATTTGGCTTTTTTCTGGCCAAAGAGCAAATGCACTTGAATACAAGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCACGATCAAAA:1 + chr2L 21008466 5' + Idefix 7194 2 55.45 CTTATTGTTAACTCATATTTACTCGTTTCATATGAGAGTTCCTACCATAAGTTTTTTTGTTTTAGGCAATGCAAAAGAATTTTTCGGATGGTGCCAATTGA:1 + chr4 681162 5' - 1360 271 1 66.34 CTCTTATACGAAAAACACAACCCAGCCCTCCCAAAAAGGACCTGCCACCCAACACCACCCACCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGT:1 + chr3R 13240872 5' + Quasimodo 6970 2 64.36 AGTTTTGCACTCTTGATTAGCAGGTTGCAAACGCATTAGTACACTCGTACTATTTGCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 + chr2R 22997928 5' - Transpac 5226 2 76.24 AAACAAAAGAGTATATGTATAAAAATCTATTCATCTACTGTAAGTAATATTATATAATAAAATAACTCGATATTTCACTAATATATTTTTGAACTTTCAAA:1 - chr3R 26303239 5' - TAHRE 16 1 78.22 GTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 - chr3L 22324338 5' + jockey 4691 1 57.43 TTCAATGTCAACTTTATTAGAGTTATATTAAAAGTTTAGGAAAATCAAAGAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chrX 17132540 5' - pogo 2077 1 55.45 GTGAGGGGCAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 10457264 5' - roo 385 2 55.45 CAAGCTGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr2L 18694152 5' - P-element 2843 1 35.64 GTGCCATCCCGGCAGAATTGCTTTCGACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr2R 19936604 5' + roo 22 2 58.42 AAAACATTGCTTAAACCCAAAATAAAATCAAAGGCATTCTCCACGCGCGTTTCCTGGTGGAGCATTTTTCCGTTGGGATGTCTTGCAGCCTCGCGATTAAT:1 + chr3L 7838153 5' - mdg3 391 1 53.47 CGAACAACACTAATATAGTCGGTTTAGCCACCAGAGGTAATGAGCTACTGAACACAGATTCTGATCCCCAAAAGTCAAAAATTTGATATTCATCGAACAAC:1 - chr4 802846 5' - Tc1-2 251 1 71.29 CAAAATAAAACTTTTTAAGGCCGGGTATGCATTGCAAGCTCTAAAGAGAGAAGCTGAGTAGTGGTACAGCAAAAACATATTAAAAAAAAAGAAAATAAAAA:1 - chr3R 10608697 5' + TART-C 11101 4 44.55 CATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCT:1 + chrX 21772491 5' - gypsy3 6548 1 66.34 GTTGTCCGTGGACATGTTTCTTCTAAATACATTCTACATTATGTGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chrX 1235481 5' - P-element 2857 1 49.50 TCCCAAATCCCCTACCCCCCCCTGTCACACCCTTGCCCACATTACCATTTCCCATTTTCCGACCCTATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTATATGCC:1 + chr2R 10979633 5' - accord 7024 2 62.38 CTCACAATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 - chrX 5443971 5' - mdg1 7444 2 63.37 CGTTTATTTTTATTAGGGTTTTGGTGTTTTTTTTATCCATTTTGCATGCACATAAACTGCACCTTTCGCTCTCACTCTCTCGCTCTTTCGCTCTCCCACAC:1 - chr3R 16948884 5' + Cr1a 303 1 70.30 GATTTTAAAGCTGATCCTCTTTTCCAAGAAAGAACATTTCTTCCACTTAATGCTCAATCCATATTTAGCTGACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAA:1 + chr2R 5080986 5' - mdg1 7012 2 78.22 CTGTGCCAGTGTGTGTGTGAATCTTATTTGAATAGGTATCCGTATCCATTTCATTAGGATCTATAGCCGAGTAGATCTAGCCATTTCCGTCTGTCCGTATG:1 - chr3R 27245577 5' + INE-1 120 1 54.46 ACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 + chr3L 10736472 5' - 412 7494 2 77.23 AATGGGGCTAGCGCTATCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGCCCGTGCGTGTGTGGGTGGATGGGTGGGCGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGCCG:2 + chrX 22461681 5' - accord 177 2 79.21 GGGCAAGATGGGGGAAATTTTAAATTCGCAACGAAGTGCATGGCAAGGGAAGCAGGGCAATCTCAAACCAGATCGTTCAGTTTACTTATTTATTTGAGTGC:1 + chr3L 8855831 5' - Tc1-2 65 1 53.47 AAAAAGAATATTGCAGGTTAATTTCGCACTATATGAACATTTTAAAAAGGAAAGGATATCCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACG:1 - chr3R 12894186 5' - blood 7374 2 60.00 AATGTATGGAAAATGATAAAAAAAAAAACAAGAGAGTCGAGTTCTCCGACTATCAGATACCCTTCTAGCTTTTATCTCTACCTTCCAGCTTTAATAGTTCC:1 + chr2L 15004820 5' - INE-1 157 1 52.48 CACCACCGTTAGTTGGTCTAGTTGTTCCAATTGTAACGTCTGTACATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTT:1 + chr3R 14324197 5' + 3S18 34 2 55.45 ACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chrX 7787246 5' - roo 9032 1 69.57 AGCGTTTCCCTTCAAAAGATTGAAGTTAAAAATATTATATTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAA:1 - chr3R 12877862 5' + mdg1 7076 2 67.33 GAAATGAGTAATAAGGGAAATTAGTGGACGGAACTCAGCACGCAATCCGCAGGGGCTCAAGAGAAGTAAGCGTCTGGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTA:1 - chr4 406736 5' - BS 4865 1 68.32 AAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1 - chr2L 16933638 5' + 3S18 5819 2 75.25 ATTCATCTGAACGTGTAATTCCTGTTGTTTTGTTTCGTGGTTTTTTGATATTTCATATCCTTTTATCCCTGGTAGCAGCCAGCACCAGATCTCCACCGCCT:1 + chr3R 12021730 5' + gtwin 433 2 65.35 TTAGCGATTATTGCATTTCCCCTTAGCAGAGCTTATTTCCCTATTTAACCTTTTACCATTCGTTACTTTGTTATTTTTTATATTTTTTTTTGTTTTTGGCC:1 + chr2L 8256570 5' - Transib5 19 1 76.24 ATACTTGCCGCACATTTTTCGCTATTTTTACCATTTATATAGTGGGATAAATATAATATATATAAACATAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCT:1 + chr3R 25510305 5' + opus 3 2 63.37 TATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 - chr2L 487110 5' - P-element 2826 1 16.83 GTGTACATAACACTTAACCCATGATACCCCACCTGAATACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATA:1 - chr3R 25818881 5' + mdg1 7078 2 62.38 ACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAAC:1 - chrX 17064801 5' + Tirant 54 2 76.24 TTTAGCATACTCTTCGCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr2L 19642944 5' - roo 404 1 71.29 TCGTTNTCATATTTTTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr3R 25702155 5' + Tirant 5 2 75.25 AGAACTATTAAAGCCCCTGCTTCCTCTAATAACTCTTCAACTAGAAGTTAAGGAGGATTTGCACTTCTGGCTGGAAGACAAAAATCTAAATTTCTCAGCGT:1 + chr2R 22487767 5' + Cr1a 324 1 79.21 CCCTAGAATCGTAGCAGTACAGAGAAAGCAAAGTACTATGAACTATGGTTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr3L 9121803 5' + Transpac 24 2 50.50 CTTTAAACTTATTCATTTATTGCTAAAACATATATATTTTATTAAGCAAAGTTTAGTTTAGACAAGAACGAAGAACGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAAC:1 - chrX 21205157 5' + 1360 131 1 58.42 GCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr2L 13739981 5' + 412 36 2 64.36 TACATTGGGCGCCGATACATATATGCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 31644211 5' + roo 23 2 54.64 GCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 + chr3L 20248305 5' - Transpac 275 2 70.30 CTTTGTTTAACTTCGCTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2R 4502517 5' + roo 13 2 66.34 GTTTTTCCACCGAATGCAGGCACAATTGCTTCGTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr3R 31812671 5' - P-element 2865 1 61.39 CGGTGTGGGGTGATGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTT:1 + chr3L 13161701 5' - 297 6603 2 81.18 GCTGTGTCTTTTGTGCACTTTTGTCTCGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 - chr2R 9426656 5' - P-element 2884 2 52.48 GTCTGCGCATGTCTGGGCATGTCCCGCACATTAAAGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGGAGGCGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATG:1 - chrX 15089441 5' - Ivk 5018 1 64.65 TCCGACAAAAGTTGAGCAGTCCCACAAACAGGAAAAGTCGAATAAAGGCATTGTGAAATTATTTAAAGGATTGAGTACATATATTCTTTTTTCGGCGTCCA:1 - chr3L 20038773 5' + invader3 275 2 70.30 AAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGC:1 - chr2L 23295889 5' + micropia 5 2 70.30 CCTCACAGGTTGTTGCAGTCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAA:1 + chr3L 4215532 5' - P-element 234 1 22.77 TAGGGATTAAGACATATCTGAATATTATTTGAGTATTATATTTAACAGATTTAATCTTTTATAATCCTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 - chr3L 12298657 5' + pogo 7 1 65.35 TAATGNAATAAACAAAATAAGGGAAACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3R 25285119 5' + roo 8712 2 81.19 TTAACTTTCTTAGAAGAATATATATATATATTTTTTTTTTTGGGTTTTCTTTTATTTTTTTTGGTTGATCAGACCTTTTCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGG:1 - chr3R 3953119 5' - Porto1 380 1 58.42 AGTTTCTTGTGTCCTTTAGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:2 - chr2L 8542883 5' - P-element 2829 1 21.78 CTCTTGTTAGAAATAATTAAATAGTTACTAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTA:1 - chr3R 21695507 5' - 3S18 6076 2 49.50 CCGGCCCAGCTATCAATTATTTTGTCCTTAAGACAGATTAGTTCATTTTGATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTCCTAAACCTAATCCTTAA:1 + chr3R 2914322 5' - Circe 7049 1 67.00 CAATGCACTCGGTCCATAAAGTTAATAAACTATAAATTACTATCAAAAAACCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:2 - chr3L 18009635 5' - roo 9046 1 57.43 TTGGGGGCACTTTTGAGACCAGGAGAGCGCAAGCCTCTTAACAGCAGCATGCATATATATTAGCAGCGGTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGATTA:1 + chr2R 20467053 5' - mdg1 30 2 83.17 GTGATCCTTACGATCACAAGCCGACCAAAACTGCCACACCCACATTTTTGAACCATTTTTAGATATTTCATAATTTTATTAGTCTTGTAAATTTCTATCGA:1 + chr3L 23771384 5' + INE-1 299 1 74.26 AACTGCGTCAAGTTTAAAATTTCATTAAATATGATGAGAGTCTGGTCGCCTGTGTAGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGAACAAAATCGGTTG:1 + chrX 19392635 5' + F-element 47 1 48.51 GGAGATGGCTGCCTGGTAGCTGGTCAGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr2R 19936706 5' - roo 399 1 72.28 GTTTCCTGGCCCCTTCCCACCACTAACTCCACCACTCTCCTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGACAAAT:1 + chr2R 22749935 5' - 1360 405 1 61.39 CAATATTTGCTCTAAATTAAACTATACATTTTCGATGCTTTAATCCAAAATAAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCT:1 - chr2L 16933689 5' + 3S18 5765 1 77.55 ATAAAGGGACAGCCATGGCAGGGCAACAAACATGGATATATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 - chrX 15195292 5' - Transpac 275 2 65.35 CTGTTCCAGAAACTTGGTCAAATCGCTGCCGTAGCGCGGCATGACTATAAATCGATGCCTTCTATTGAACCTCCATGGTGGGCGAGGTCTGTTTAGAGCG:1 + chr3R 26866019 5' - X-element 4457 1 58.00 CGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3R 7101002 5' - pogo 2058 1 72.28 GGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chrX 19457200 5' + roo 8710 2 73.27 AACTTGGCTACTTTAAATGTCTATAGCTCTCATTTATTTACATAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTA:1 + chr3R 25285065 5' - roo 9041 1 54.46 CAATCAAGAATTTAAGGATGCTGTAAAAAAAACATGTGTGGTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTCGTTCGACGCGAAGGACGAAAAAG:1 - chr2R 2955042 5' + Dm88 476 1 65.35 TTTAAAGGAAATTTTAATTTTTTTTAAAAAAGGAAATGGAAAAAAAA:1 - chr3R 29856590 5' + Doc2-element 237 1 61.70 ATGATTCAGTTTGTTCTTTAACATACATGTATAATATTTACAATGTTTTTCAACGCTAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTTTGTTGGAGTTCTGCG:1 - chr3R 15124018 5' - Porto1 4534 1 54.46 TCGCACGGATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTA:1 - chr3R 28755616 5' - 3S18 6062 2 63.00 AAAAAGAAGTTTGTTACCAGTTTTACAGAAAATATAATATATAATAATATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chr3L 24131166 5' + HMS-Beagle2 6910 2 55.45 TCTTCACCGCTCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr2L 2909614 5' + pogo 28 1 58.16 CTGATAGCTCCAACTCCCAGTTCCAGGTTGCGCAATCCGAGCGAGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAA:1 + chr2R 11936170 5' + P-element 175 1 52.48 AAAATTAACTATGTGATGCATGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCA:1 - chr2R 7925925 5' + F-element 299 1 79.21 CAAACCATTGGGGTCCGGTTCCTTTGCTTTCGTTCCGTTTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGG:1 + chr2R 20726913 5' - P-element 2750 1 46.53 CAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGC:1 - chr3L 23730763 5' + Stalker 7154 4 71.29 TGTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTCCTAATGTATTGTAATTGTTTTAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCC:1 + chrX 23291022 5' - Stalker 7229 4 53.47 CTCCCNTTGTATGTTAAGTTATTTTTTTATTATATTGGTTTTCTTCTGAATGGTTAAGCCTCTCTTATTGTGCACTCGAGAGACATAAGGTTTTTAACACA:1 + chrX 6016506 5' - Porto1 129 1 78.22 GCGCATAAAATTTACAAATTTCAATCTTATTATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 + chr3L 7926353 5' - flea 4970 2 75.25 GATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGA:1 + chrX 15851240 5' + INE-1 121 1 63.37 ACATTGTAGTTTATTAACTGCGCTTCCCATTTGGCACTATTCGTCTGCGAGAGGCTTTACTGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 9277599 5' - roo 393 1 61.39 TGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAACC:1 + chrX 21087562 5' + mdg3 5255 1 71.13 AATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCG:1 + chr3L 26822246 5' + 1360 107 1 49.50 GACTAGAGAACCATTTAAATGGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGG:2 + chr3L 4345005 5' - mdg3 5440 2 80.20 ACGTTATAGGGGCATGAATGATTCATGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr3R 12894078 5' + blood 9 2 66.34 CCTCAATGCCCTGGACGGCGCCTTTTGTTATATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACA:2 - 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INE-1 541 1 66.34 CAGGATTTAAAGTACTACGAATATATTAACTTCATCTTATTTGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAG:1 - chr3R 22530843 5' + Juan 3985 1 58.42 CCCCGTTTTCATTGTCTTTTTTGATAGCGATGGTGGAAGGGCACCATTTCCTTCCTGCATTAGTATTTAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 + chrX 7410148 5' + jockey 4675 1 71.29 TATACNAGTATCTCATTAAAGATGCTAAGTGCCACACATGTTTTTTTATTTCTTTTAACTTATCTTACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTA:1 + chr2L 15954160 5' + Quasimodo 149 2 72.28 AAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATACTAATACGATACGAATACTAATTCCTGTTACATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2L 7112791 5' + roo 15 2 68.32 ATAGGGGTGCAGAATTATGAAAAATGTTTACTATATATAGGGGGGAAAGTCACCAGAAATTGTTGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGT:1 - chr3R 11498790 5' - Doc 353 1 70.30 GGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCCCTTCACCTTAGAAGAAGTTCTTAGACTTTAAAT:2 - chrX 1018116 5' + 1360 234 1 68.32 CTGGAGGAGCTGAGGAAGGCCAGTATGAACGTTTGATATGCACGAAAAATTATGAAATTTCGCGATCTTACTTTCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATA:1 + chr3R 17027637 5' + INE-1 546 1 73.27 ACACGCTGGCTTATCTGGGCTATATAGACATATAAAGCAATACATAACAGCTAGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - 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INE-1 552 1 66.34 AATTGTATTCACTTGATTCATGGAAACAAAAGTGGCAACAAAAGGGCTAAGAGCATGCAATTTTGCAATTTATGCCTATGTATATAGATATAAAATATTAT:1 - chr2L 1890756 5' + Dm88 4126 1 75.25 TTATAGGGGCATGAATGATTCATGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCTGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3R 12894081 5' + blood 12 2 56.44 CAATAATACTACCAACCTCCGGCAAAAAGAGAAAAAAAAACGAAA:1 - chr3L 21914773 5' + Doc2-element 245 1 91.11 GATTCCTCAGGCTGAAGGGGAAGGCCCCGAAGCAAGGCAGCCACTGCCTCCATGCAGGCTTGGTCTAGAAGAGTCCAAGCTAGCCAAATGCAATCCGTCTG:1 - chr3R 25987338 5' - Tabor 305 2 68.32 ACCACGGCGATCCCATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr2L 1156723 5' + 412 19 2 60.40 GATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chrX 13682610 5' - roo 9026 1 72.28 TTCCCTCTCACCGCAATTCAACAATAATATAAAGCTGGTCTAAAAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAAC:1 + chr2R 9427107 5' + P-element 458 1 53.47 TGTTAATACTGGCACACTGGTTCGGTTGTTTCTATTTTTTAATTATTTGTTGAATCTTTCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTAAAATCTTATT:1 - 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chr3R 9952227 5' + Ivk 51 1 77.23 GAATCAATTAAGAGATTGTTGTTCTCTTCGGGTATACTAGAAACTATATACACATGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAT:1 + chr2L 4009430 5' - pogo 2082 1 60.40 TCTATCTACAACGTGACAAATTACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTATACCTTACAAGTATCGACTTAATATAATATAAATAAATATGTCCACGTCCGACCA:1 + chrX 15552153 5' + TAHRE 448 1 56.44 TCGTGGATGGGAAATGCAGTCGCATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGG:1 + chr2L 7170346 5' + jockey 4602 1 77.23 TGGATCATCAAAGTAAATAGAAGACTATTTTTATTTCAAGTTACAACGTCTGATTGGCCGGCATTTAAGTTAATAACAGCAGATCTATGGAAAGTCGTTTG:1 - chr3R 16288402 5' + Copia1_DM 414 1 73.27 TGATGGCCCACAGCTATTAAATTGTATTCCCAACTAAAAATCGAAAATAGCTCAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3L 4744435 5' - opus 7476 2 58.42 AGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGA:1 + chrX 21772501 5' - gypsy3 6541 1 74.00 CATCTTCAGTTCAGATGTGGCCAATTTCGTATCAATTAGGTGCAGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAG:1 - chr2R 4677363 5' + invader3 3 2 76.04 CGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr2R 4502495 5' + roo 35 2 61.39 AATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTTGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr2L 14260736 5' + 297 31 2 59.41 GTGGCCGTGGCCAAATGGCGAACATCGCGCTCGCCGCACGCCCAGGGCTTTATCGAGGTCGACCAGGTGGGTTTCTGATACCAGTAGTACATCGATGGCAT:1 + chrX 575285 5' - G2 346 1 70.30 CTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 + chr3L 19951180 5' + Ivk 12 1 67.33 CCTTCGTTCATATATATGCGAATATATATAGTATAAGCATATATGGTGAGAGCGAAACGAGAGCTCAGTCACGCAAAACGATATCAAGTGGTTCAGTTACC:1 - chr3L 4682556 5' + R1-2 447 1 79.21 TAATGGTGCAAATGGCATTTCTATTGCCTGCGAAATTGAGTTGCAATAAATATTTATGCAGTGGCATACGTATATAGACAAATTATTTAAATGGCATAAAT:1 + chr2L 20231882 5' - Tc1-2 1414 1 61.39 ATGATGATTACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 + chrX 4154884 5' + blood 7013 2 77.00 CGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTT:1 - chr3R 9952238 5' + Ivk 40 1 66.34 TGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chrX 13347283 5' - roo 9043 1 55.45 AGTTCTGCTGCGCCTGCTGGTGCTGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTACTAGGCACTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCC:1 - chr2R 24884657 5' - G-element 329 1 77.23 AATGATCTTGGGATATCTGATTTTTACAATGCATTTTTCATGTCCGTATGAGCGCCAAAATTTCAGGAATTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCACCATA:1 + chrX 15572279 5' + INE-1 171 1 66.34 TCTGTAGCGAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATA:1 - chrX 16798271 5' - diver 191 2 56.44 TATATTGCTTAGTTGATTAATTTCAATTGCTTAAATTATTTTTGAAAAAGTTACGGTCCCCAAACACAGAATATGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATA:1 + chr3R 10320995 5' + roo 1 2 78.22 AAATTGCTATTTTAAGCAATTTATAAGCATACTTTGAGGCGCCCCCACACCCTTAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACATCCACC:1 + chr3L 13652597 5' - hobo 2921 1 60.20 ATATTTTCGGTTTAAAGGAACTCAAGGCATTTTAAGTTTCTTTCCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chr3L 13364509 5' - hopper 1408 2 65.35 GCAAAATATTTCAATTTTACAAGAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chr2L 9389033 5' - 1360 3376 1 66.34 CTTTGTTTGGGGCCAATTTTGTGTTTAACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAAGAAAGAAAGCTTAAGA:1 - chr3R 31036385 5' - Chouto 105 1 67.47 AGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 4502475 5' + roo 55 2 81.19 ACTAGTCAACAGGACGACACCGGCAAGTATCCTTTGTCTGCTGAGTCAGCTGAAAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr3L 20903905 5' + F-element 10 1 73.27 TCAGTACCGGCCGGCGGATGGGTTCTGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 + chr3R 27189243 5' + roo 11 2 64.65 CATTTTCGCAGCTCAAATTCATCAGGGGGGTGTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAA:1 + chr2R 22395179 5' + I-element 8 1 74.26 TAAAGTCATACGGTAAAATCTCAAAAAAGTTATTGGATTGCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrX 21388630 5' + 1360 5 2 46.00 TAGACTCTTTTACCAACAAGGTCTGCTGGCAATGGATTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACA:1 - chr2L 7459617 5' - BS 5057 1 68.00 TTCAAAGTCAATGAAAAAGTTCATTGCCTAAACATTCTTTTTTTGCATTGCCTTAACGGTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGT:1 - chr3L 25412883 5' + 1360 337 1 67.33 AGCAACAATAGGAAGCAAAGTTAGATGCGTCGAAAAACAACCAAAAGTACAGTCTCAGCAGCAGCTATCACACAAACAATTATCAAAGCTTACACCTTCAA:1 - chr4 777481 5' + Porto1 315 1 76.24 GAGCGAATTTCCTACAATGTTTACTCACACACACACACTGCCAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGTTCAAATACTGAG:1 - chr2R 16474817 5' + 297 6808 2 58.42 TGGATGGTTGGATAGAAAAATGAAGATGTACAGATTGGAACAGGCGCCCAGATACACGAAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATA:1 + chr3R 26542013 5' + INE-1 565 1 62.38 TTCGACGCCCTTGGACCGCCTATTAGCACATTTCGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chrX 2589675 5' - copia 247 1 68.32 TTGCTTCAAATTTTCAACCACGGTTGGTGTTCTAAAAGGGCATTCTGTGTCTCCTATGCGTTCTACTTTATACCGAAAAAATAGAATTCTGGACCGCAGTG:1 - chr3L 23746667 5' + transib2 2823 1 74.26 GTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACAT:1 - chr3L 24208179 5' + Quasimodo 45 2 77.23 TGACACATTTTTCATGAGCACAAACAGGGGCGTCGTTAGGTGATTTTTTTTTTGGGAAATTAATTCTGAAATTAACATGAACCTACACATACACATACACA:1 + chr2R 18413723 5' + accord 253 2 63.37 CCGACCCGCAAGTAGGGGGCCCCAGTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTTGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTC:1 - chr3R 11771124 5' + R1A1-element 5023 1 73.27 TAGTCGATCAAATTGCTGTCGGTCTAAATTTTGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr3R 21501025 5' + roo 8664 1 78.22 TAGAACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3R 10321108 5' - roo 390 2 60.40 GGCATAACAATGACAACAAACTAAAAGAAAAATGCATTCCCCAAAGGGAAAAAAAACAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCA:1 - chr3L 1806770 5' - Cr1a 339 1 61.39 AAAGTATACTGTATGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 26469437 5' - hobo 2909 1 64.36 TGAGTGACACTAGAATAACAATATTTTGGATCATTTACATACAAGTTAACAACTAACAATGTACTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATG:1 - chr3L 24491089 5' + gypsy 37 2 57.43 CATTTGACCGCTCACAATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chrX 5443981 5' - mdg1 7454 2 73.27 GTTGCAAGATAAAATGATAACCACCAAAAGAAGCTGAAGAAAAAAACGAGAAACGAGGTCTCACCGACCTCGTTTACAATATGAAAAAAAAAATAACAAAA:1 + chrX 13591085 5' + gypsy11 3930 1 51.49 GCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAA:1 - chr2R 12185421 5' + accord 13 2 62.38 CCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 + chr2R 18601834 5' - Transpac 259 2 77.23 TATGTTTTCGGGTAACTATGATCTCAACTCACCCCATATTGCAGTATTGACTCATCGTCTTGTTGTCCCCAATCATTTATTGTATTATTAGGGTAGATTAG:1 + chr3L 8896095 5' - Stalker 15 4 70.30 ATGTATCCTGCTTTTCGCCAGGAATCCCCATTCTTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATT:1 - chr3L 11910010 5' - Tabor 7300 2 54.46 GCCTTTGCTTGGTTGCGTCGCTTGATGTGCCGCGGATTGTTGCACTGCGTTTCAGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTTTGAAAGGGTCTTTTTTT:1 + chr2L 3704438 5' - Ivk 261 1 66.34 TTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2R 12779086 5' - roo 9045 1 50.50 GCTTTGGGCTTACCCAGACATTGAGCTGTTTTCACACCAATAACAAATCTTCGTGACACAAGGAATAGCAATAGTCGAAATTCTCGACTATCAGATACCCG:1 - chr4 708574 5' - INE-1 555 1 65.35 AAGCCGTCCGAATGCCAAACGGAGTCGGGCCAGAAACAATTCAATTACGTTCCAAAATGGCTGCGCCCATGTATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGG:1 + chr3R 28009341 5' - accord 7100 2 71.72 AATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2L 22719607 5' + 1360 53 1 80.20 CATTATCATTAGCTTGCGTTTTTATTTGTTACGTTTTTCCGGATCTTTTTTAACTCTTCTTTGTATACTACTATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGG:1 + chrX 12729495 5' + gypsy10 2 2 72.45 CGACATGGAGTACGGCCAAGTGAGGGGTATCAAGCGTCTATCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCTGTCGACGGCGGCGCAG:1 - chr3R 7521604 5' + blood 215 2 60.40 GTGTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTT:1 + chr2R 22395208 5' + I-element 37 1 55.45 CCCAGCAGCAGCTTTGTGTGATATAAGTGCGCCCACGTACTTGAAATGGCTTTACTGATCTTGCTTGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGT:1 - chr3R 22620292 5' - 297 6969 2 74.26 AAATAAACATTCAAGTGGAATTATTGCAACGAAATTCAAAGGATTACGACAAAAACTTCTTTGGCAAATCGATAGAAATTTAAAAATAAAATGTTAAAAAT:1 + chr3L 13691691 5' + P-element 2692 1 53.47 CTTGTGTGCGTAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 - chr2L 2197138 5' + P-element 8 2 58.82 GACATACATTGTTATCCTTAAATTTTACACGGATTGCTCCTTATACTAAATATGCGAATTCAGCATGTACGCCTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGG:1 + chr3R 12880718 5' + mdg1 197 2 58.42 CGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCT:1 + chr3R 9837585 5' - 412 453 2 68.69 CTATAATAAAATCTTAAAAGCCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATA:1 + chr3R 13423263 5' - 17.6 7412 2 73.27 CAATTCTTTTACCACTCCTGTTGTTGTGAAGTCTGTAGGAAATGTTATTTGATTTGTTTGTATATTTTAGTAAATAATTACTATAGTCAATAATTGTTAGT:1 - chr2L 16550312 5' - Doc 124 1 38.61 CATCTTCGCATTTGCCTCGCTCGCGGACTGAGACTGAGAGAAATTTAGCGCAATTTACTTGTTATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 - chr2L 6255857 5' + flea 4765 1 72.00 ACTGTAATGGAAAAGTTAGCTTATGACCTATTAACCCCTGTAAAACTAAACTATATGTAAAGTGAGCCATCCGCTGGCGCCCGCGCAATTACGAAAAGTCT:1 + chrX 9246157 5' + GATE 177 2 77.23 TTTGCATACGCTTGTAATGCGCTCGAAGTTGAACTGTAGTTAATTTGAATACCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr2L 7350790 5' - mdg1 376 2 65.35 CACCTAAAAATTTAATAAATAGTTTAATATATTAAAGCTTAACAAGCAAACAAATTCTATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGACAGA:1 + chr3R 3622322 5' + 1360 3300 1 59.41 AAGTGCAATCATATTGAAGAATTAGACTAAAAAACAAGGCCAAGTAGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCCCGTTCATAGA:1 + chr2R 20148034 5' - micropia 206 2 58.42 ACAGCTGCTCTTCCTTTTTTACCGAGTCCTGCAGGACATTTCATAGTAATTGAAGTGCCAGTCCCGATTCTTTTTTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACG:1 + chr2R 8245345 5' - mdg1 463 1 79.21 AACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGT:1 + chr3R 27080701 5' - HMS-Beagle 217 2 67.33 TTTAAAAAAAAAAACTAGACTACTTTTAATTAATTTACTATCCCTAGCTAACCGTAGAAATATGCTTGGAGCAGTCCTTATTTATAAGCTTATTCGTGGTG:1 - chr2R 8648386 5' + Cr1a 4046 1 73.27 AATTGTAATCCTAGGAATCCAAAAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAG:1 - chr3L 9925321 5' + Doc 11 1 67.00 CTGACGTAAATGTACCCAATGGTAACTCGATCGAAAGCGATGCCAAGATTACTGGCCTAAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACT:1 + chrX 12857806 5' - 297 382 2 66.34 GAATATATTAACTTCATCTTATTTGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAA:2 - chr3R 22530825 5' + Juan 4003 1 76.24 CAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 - chrX 8364632 5' + jockey 4809 1 75.25 ATACAAAATATTGGTTATTGTTACTTTCTGTTTAAAAAACCAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11307991 5' + TART-C 11100 1 78.85 CAGCTCAGCCATCTGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAA:1 + chr2L 20118679 5' + Max-element 21 2 58.42 GGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAA:1 - chr3L 14240889 5' - Tirant 8467 2 64.36 TGTTGATTTTGCGGTGGTGCAGACGAAAAAATTCAATTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCCTAAACCTA:1 - chr3R 31151084 5' - Circe 7057 1 63.00 TATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAG:1 + chr3L 19951172 5' + Ivk 4 1 75.25 GCATCTACTTGCGAGTGGAACGCATCTAACCTCCATATTCGTTGCTCCCATGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACAT:1 - chr2R 6779850 5' + 17.6 6950 1 58.42 CAAATGGTTATGAGCTGGAGATTTTGTCAGTTTTCTGCCAGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGA:1 + chrX 18769047 5' - flea 129 1 61.39 CCGTACCGACTGAAAACAGCTGCGAAAGCCTCGCTTTTGCATATGCGGAAGTGCAGGCGCGAGAATTGGCGGGGGATATAGTCATGTATACCCTTACATAC:1 - chr2R 22998058 5' + Transpac 1 2 79.21 TTACAAGTTTTACAAAAGCGACATATGGTTTAAAAATCCCATAAATTAGGAATGATCGTAAGGCTATATGTTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCC:1 - chr3L 2024410 5' - copia 251 1 71.29 AAACATCTGCATGACCGTCTATTCATCAGACTCCGATTCCGATTCGGACTCTTCTTCATCGTCATCATCGTCGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATCCG:1 + chrX 12017433 5' - R2-element 265 1 80.20 AATGTTCGTCTACAATTCATCATAATCGAATGGAATCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGT:1 - chr2R 15182928 5' - R2-element 3416 1 65.35 GAGAACGCAGAACGCAGATTCATCCACCGAGGTGGCGGAAGGCGGAAGGGCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 + chr3L 7314674 5' - hopper 1393 1 52.48 GTGTGTGGTTAGGGAGTTGTGGGCGTAGAAAGAGTGGGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTACATACAAAAACAACTCCAAACAGCACTGC:1 + chr3R 1267956 5' - Cr1a 242 1 73.27 GATCAATAACAGCGTGTGATATTCACACATGAGAAGACAGCCATGCTCAAAAACATGACGGTCCATGGTAAAGATGTACTAAAAAAGAGGGAATGCTATAG:1 - chr3L 22954501 5' - INE-1 582 1 62.38 TCAAGCACAAATATAATATACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACG:1 + chr3R 8548395 5' + 17.6 6968 2 73.27 GTAGATGGATTGTTAATGCTTAAATTAATTACATTTCTCTTTTGCTATCTCACTCACTCACAAGCCGCCCAAAACTGCCACGCCCACACATTTGAAAAATG:1 - chrX 16714635 5' + INE-1 254 1 69.31 AAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:2 - chr2R 18503566 5' - roo 9052 2 47.52 AGAGAATTAACATTCCAAATCGAATTGGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chrX 13548722 5' + blood 7019 2 66.34 TCAATGTTGAACCAATGCCTGTAATTGGTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTAGTTTCC:1 - chr2L 21741425 5' - Stalker4 7336 2 68.57 ATCAANTGACTAAAGAATAAAGTTAACCGAAAAAAATCGCATATCTGCGTATGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 15998153 5' - pogo 2080 1 57.43 GCGCGGCTAATTGCATCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTC:1 - chr2R 16920746 5' - gypsy8 4547 1 40.59 GGGTCNATGGTCAAGAATAGTTTCAATTTACGCCTTATGAGCAAACATTTATCAAATCTATTTTAGAAAATATTGATCATTTCGGGACTTTACGTTGGTCA:1 - chr2R 25179685 5' - HB 237 1 67.33 CCTCTCCATGGCTTTTCCTACCATATTCCCCTAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGACCACAAGATCTTGCTCTA:1 - chr2R 17986259 5' + F-element 4221 1 64.36 ACAATAGAGATACGATTCGGTTAACCGATTCCATTTGGCCAACTGATCGACGTCGAGTGGACCGGCATCTAGAATATAAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3R 22119906 5' + 1360 20 1 72.28 CCCTGGCCAATATCATTACTAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACT:1 + chr3L 20901995 5' + F-element 4336 1 76.74 ATTATGTAATTGCATACTTCCAGGTGCCTGGCCAAAATGCCAAAGAACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGC:1 - chr3L 22324361 5' + jockey 4668 1 78.22 CCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr3R 7522390 5' - blood 365 2 66.34 GTTGGCGTTGCAAACTGGGCAGCTATAGCTACCGTAGTTACTTTTAAATGTGCCACTTGCAAACGAATGGAATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr3R 27412534 5' - 412 486 2 61.39 CACCTCTCCGCAGCCGGGGGGAAAGAGTGAGAGGGTAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACT:1 - chr2L 11045348 5' + P-element 38 1 40.59 GGAACAACTAATGTCGTAGCCGACGCATTATCTCGAATAAAAATAATATACAAAAATACAAGGAAAGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCAT:1 - chr3L 27881861 5' - 1360 198 1 54.00 ATGCACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTT:2 + chrX 1427532 5' - Bari1 1675 1 54.46 GGCCTTATTTAATTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTA:1 - chr2R 10863944 5' - mdg3 194 2 80.20 AGCTGGGTGGCGCCGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATCGCATATTAACTTAT:1 + chr2L 1828783 5' + 412 37 2 62.77 CTATATGCGGTGTACTTTGCTGACCGAAAAAAAGAGAGATACAAATGTTGAGAATGCGAATGGGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCAATAG:1 - chr2L 8739004 5' - INE-1 502 1 62.38 AAACACACACACACACAACCGCAACTCACGAACAGGTATGGGATACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCC:1 + chr2L 2511479 5' + F-element 32 1 47.19 TTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCGGTTTGTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAGATGGGTAGAATCTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTCC:2 - chr3L 19271025 5' - INE-1 158 1 73.27 AAAGAATTCAACTGAATTGAACAGAACTTAACAGTATACAAGCAAGCACGGCGTCAAGCGTCGCGCCGCGTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATA:1 - chrY 1076855 5' - INE-1 85 1 66.34 TTTTTATAATAGCGCCTAAGTTTATAGCATACAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGC:1 - chrX 21668464 5' - I-element 170 1 66.34 AGCCTTTCCCGGCCTGAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAA:1 + chr3R 11165629 5' + Tabor 23 2 60.40 AACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 + chr3R 7388353 5' + HMS-Beagle 6840 2 70.30 ATAATTTAATATAATAATAATAATATATATATGTCGTGTATTCCTTTTTAATTTCCAATTGTAACGTACATTTTATATTTGCTAGAAGGTGGGCATATTGT:1 - chr3L 20055874 5' + invader5 3735 2 67.33 AATGCGCTGCATTTTTAAATTGTTCGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chrX 8352230 5' + blood 7062 2 74.26 ATTTATAATCGCCGGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACC:1 - chr2R 19857425 5' + 297 5 2 63.37 CCAGCAAAGGTCACCATGATGATGTAACGGCCTTCCTTGGTGGGCGAGGTCTGTTTAGAGCGTTAGCCCGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAACCTGTCATGG:1 + chr3R 17107956 5' - X-element 4418 1 67.33 TGAAGAACAAAAAATAACAAAGTGAACAGTTACAATACTGTAGACAGTGATACGGTAGATTCAAAAAAACGATAGCCAAACGGTTAAGAAGCG:1 - chr3R 15896070 5' - Circe 7267 2 63.44 GGGGGAGGTTGATTTTCCTGGGGGTGGGGCTTATAGTTTCTGCAAAGGCAATCATAGGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chrX 14041906 5' - roo 388 2 58.42 CAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 - chr3R 9952258 5' + Ivk 20 1 58.42 TTTCTTCCGACTGTATGCGCGTTGTCACTATCGACCCTATGACTGTGGGCGTTGTCACTTACTGGCCTGGTATGTGGAGTCCGGGGAGCAGAATATTATTA:1 - chr3L 25847214 5' - Gypsy6A_LTR 304 1 72.28 AGGAANACTCTGCTCTTTGTGTCGATATTTTTCACATGCGTTTGTTGGCACTTGCCTTTGTCGTTTGTTTTGTGTAGAGTTTCTTGATAGTCTCAAAAGTG:1 + chr2L 7156726 5' + S-element 1514 1 71.29 AACCANGAGGGGACAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3L 14240809 5' + Tirant 17 2 63.37 GAATAATTATTAATTTGCTTGGCTGCTCAAGCACAAATATAATATACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGA:1 + chr3R 8548369 5' + 17.6 6942 1 65.35 TGTCGTCATATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr3R 14688337 5' + pogo 12 1 57.43 ACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:1 + chr3L 19951192 5' + Ivk 24 1 55.45 GAATTGCTGACATCGGTACCCTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATA:1 + chr2R 11830483 5' - Doc 4608 1 79.21 ATTTTACAGGGGAAGAATGGGACAACGACGGTAAAATCTTGAAATCCCTAAAAGCCATTAAAGAATGCGTAATTCTTTTCTCTAAATATATATGTACATAT:1 - chr3L 3484490 5' - gypsy11 7 2 76.24 GCAGCCCAAATGCGTAATCGTTCTATCACATAAAAGTCATAAATTCAAGTATCCCATAAGAACAACCCCAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTGCC:1 + chr2R 17511832 5' + Quasimodo 151 2 67.33 TATCCACCAAATCCTAAGGCTTAAATTGAAATAGTCCAATAAACTAATTGTTTATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 + chr3R 12767009 5' + 412 23 2 56.44 CCAAAGCTCAGTCAAGTGCAATGGCAAATAGGCCCAGATGCTCTTCTATCTCGGCTAAAATTATAAACAGATGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATC:1 - chr2L 15952337 5' - Quasimodo 7002 2 77.23 CATATAAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3R 18881500 5' + roo 8697 2 59.41 ACGTTACTTTGCAGTTTTTTTCTATAACAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTACTTTTCCAACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTG:1 - chr2R 10657748 5' - F-element 4544 1 77.23 GTGCAACGTCTTAGACGATGATGATGTTGCTTTGTTGTCCATCTGGCCAAATCGAGGACCCACATAAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGA:1 + chr3R 25440130 5' - pogo 2096 1 73.74 CTGCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTC:2 - chr3L 3747685 5' - blood 355 2 53.47 TGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCT:1 + chr3R 27080732 5' - HMS-Beagle 186 2 64.36 TAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 + chr2L 108000 5' - P-element 2852 1 44.00 TCCGAAAACTAAACTAAAACTAAATAAATGCCAAAACAAACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTTTC:1 - chr3R 30674628 5' + I-element 270 1 66.34 TTTCTGTCTTTCATTAGTCATATTTTTAAGTATTGCCTATTTAAATGGGGCCTTAAAATGCTTGCCATAAAAATGTTATGTACACCCCAACAGCCTAGCAA:1 + chr2L 18513549 5' + jockey 4670 1 25.74 ATTAAATTGTGGCCACTTCCCTGGCATTACCATTAATCGAATTCGAATAGAGGCAACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 - chr3L 12452222 5' - 412 472 2 54.46 AGAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 8031378 5' - roo 9022 2 78.12 ATGCACATTCAATTACCATATTAACCGAAACGACTAATTAACTAAAGTTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 10698716 5' - roo 9044 1 56.44 CAATAAAATGACAGTTTATAAATAGGCAATCTTTTGCAAATGGGGGGAAATAAAAACAACACCAAACAGCAC:1 - chr2R 7516977 5' - Cr1a 245 1 77.78 CATAAGGTATCTGAAGTTAATAACTATGAGTAGTAATAAAATAATAGTCATTGAATTTTGCTCGAATAATCCTTATGATATTTGAACTTGATTTCGTTTTG:1 - chr3L 16257982 5' + accord2 7243 1 53.47 AATACAAAAGGGGGGCAAACAAGTTGGCAAGGTAAGCAAACAAGCCGGCGGAAAAGGAAACAAACAAAGAGATACGGGAGCAAATAAAAAAGAGCTGGCAA:1 + chrX 15635564 5' + G5 494 1 70.30 ATGATCTAGAAAATTACACGTAATTAAGAACTCGAAGAATTTCTAATTCTCGGTTGACCAGTGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATAGGT:1 - chr3L 2416797 5' - F-element 4258 1 70.30 AATATGGCAGACATGCAGGCGAGGGGCCGCCCACGTCCACGCCCACTTTATCGCCCCTCCCCAAGAGGAGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAAT:1 + chr3L 2583637 5' + F-element 92 1 83.17 AAATAGAATACAATCAGTGATTTTGTCTGCCCAAAAGTGTGCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTC:1 + chrX 17204088 5' - Tabor 7287 2 58.42 CAATATGAATGATATGAACTACTCGCATATTATCTTAGCATTTTATAGGACGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 17368073 5' + roo 8689 2 54.46 TCGATNGGAATTTGTTGCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3R 7101073 5' + pogo 22 1 56.44 TTGTGTGAAAACAAATTACATTTCTTCTCGCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCA:1 + chr3R 26065354 5' + Doc 442 1 70.30 TACTGACATTTTAACACATTTCAGGAGGGGAAATAAAGTCATGCCATTGAGGCCTACTTTTGTTCGGCTGTTCGGTTATCAAAACACAGCGTGTATTTCGG:1 + chr2R 17636353 5' + mariner2 202 1 55.45 GTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGGTCCTCTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGTCGTACA:2 + chrX 11533921 5' - invader6 334 2 60.40 AACCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 9370009 5' - roo 9049 2 57.43 ATCCATTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:2 - chr2L 6227703 5' + roo 8712 2 72.28 TATGTTCTGTATATCACATAAGATCTGACCTATCCTGACATAAATCTTGAAGCCGACAGTCATCATCGCGAAAATTTGCACACCACTTCCACGGAACACTA:1 - chr2L 15613102 5' - R1A1-element 82 1 68.32 TGTAACCGGGGCTTTGTTTCGGCTAAACACGTCTGACTGCTTCCAGGTTGTCCACGCTGTCAGGTACCCTGTTCAGCCCTAGTGGCTC:1 - chr2L 23006620 5' + Rt1b 4693 1 64.77 TTATTTTCTTAACCATAGAACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 10321123 5' - roo 405 1 75.25 GTTCACTTGAGTTTAAGTGCATTTTTGCATCTTTATTTGCACTCTGGTATTTGGTATTTGCTTCACTAATCAAGTGATTTTATACGGAGCTCGATGAAAAC:1 - chr3L 2813395 5' - Doc2-element 30 2 59.41 TTAAGACATCCAAACCAGCAGTTAGCCCTGTAATAAACCAATATATGCAACCAATTGAGAACACGTGTATTCCTTGCAGTTGGG:1 - chrX 13548796 5' - blood 7355 2 64.29 GTTTAATTAATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 6605487 5' - opus 7461 2 65.35 AACGATCGTTGGCGTCAAGCAATTTACAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chr2L 17447639 5' + FB 51 1 80.20 CATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 + chr3R 25633321 5' + Tirant 16 2 63.16 TTGGCGTTGCTACGACGTTTGATTATTATGGCCCCGTTTTTAGATTTCTCTTGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGCCGTTATGCCGACAGGCTTATGG:1 - chr2R 7401302 5' + G5 4564 1 53.47 CAAAGTGGTAGCTCCCCCGAGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 + chr3R 25818830 5' - mdg1 387 2 65.59 CCAGGAGAATCGGGCATGCGAAAAGCGAGTCCAGATATTTAGTATTCACCGCACACAACCTCTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTAT:1 - chr3R 16717352 5' - P-element 53 1 51.49 TATGTCGTTTTTGTAAAATTAATTCGTTTGTTTACCTTTTTCTGCTTATCAGCTTGGTAGAGATCGTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTT:1 + chr2R 1395433 5' + gypsy 6992 2 71.43 CCGTTGAGAACTGAGAATTGCGAGGAGAAGGGGCTCAACTTAATGGAGGAACAGATTCCTGGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTGCAGCCCTGA:1 + chr3L 18028348 5' + baggins 5308 1 56.44 CGCCGCGTGCGCTTTGATTTTATTAAGCCAAAATACACCCAACGAACATAGCCCACATGTCAGCAATATTTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCT:1 + chr2L 15317486 5' + 1360 469 1 48.51 AGAGCGTAAAGCTACGTAACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chrX 21401937 5' + roo 21 2 57.43 CACCAAATACTGAATGAGCTATTGAGATTTTATATATATCCAGTATTGTCTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGT:1 + chr3L 15056306 5' + BS 5021 1 77.23 CATGTAAATAGTAATCCTGTCCGGGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAG:1 + chr3L 18576696 5' + springer 7155 2 61.39 ATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chr2L 2197121 5' + P-element 58 1 22.77 TCCATCTAATTTTTGTTTAAATACTATACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGG:2 - chr2R 7540632 5' + Stalker4 26 4 53.47 AAAATAATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr2L 1129071 5' + HMS-Beagle 32 2 58.42 ATAGGCATACATACCTAGTAGATGAGTTTAATCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAATATTTTTGTGATATTATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATC:1 - chr2L 903863 5' - 1360 335 1 42.57 ATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chr3R 1206442 5' - I-element 5313 1 70.30 AGGCAATATAAATTCACTTTGAGTGCAACCAAATTCGTGGATTGAATCATAAGCAGAAATAGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 + chrX 10251717 5' + flea 15 2 64.36 CAGTGCTAGTCTAAGCATTTCTTCACTTTTGCCTTCACCTCAATGTCCTCAAAAGGCAAGCACCAACAACTCCAGTTCCAATAACAACAATAATAACAGTA:1 - chr2R 25207597 5' + mdg1 7057 2 64.36 AAGAAAACGTCGGTTTCGTTTTCTGCATACTATTTTTCCTAGCATACTTCTTGGGGCCTCCACATAAATCTTGTCAATGAGGAAATTCAGATGAAAAAAAG:1 - chr2R 14579430 5' + Doc2-element 4520 1 59.41 TCGCTATCAAAAAGTTCTAGTTCAGACAAATCGGCAAAGTCCTCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTAC:1 + chr3R 31040181 5' + HMS-Beagle 161 2 51.69 CAATTAGACGTGGAACCAAAAGACCCATAATGATTTAACTCGCTCGGGGATCTGTCCGGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr3L 13194849 5' - 297 6964 2 68.32 CTTGGGTGTTATTTAATTGATTGATAATGTATTATTCAGCAAAGGACCTATTGACCTAATCCGTTGGATCTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTA:1 + chr3L 23579551 5' - Bica 365 2 67.33 GAAATACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAAACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 + chr3L 10736467 5' - 412 451 2 68.75 AGTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACA:1 - chr2R 22605979 5' + Juan 4063 1 60.40 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACACTGAATTAGGAAGATTACGTTGGAGGGCTTGACTTCG:1 + chr2R 11367657 5' - gypsy 359 2 61.39 AAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2L 13739971 5' + 412 46 2 74.26 CAGAGCCAGCTAATTAATGGACGCTAATTTCTGATGGCACAGGAAAGGAAAGGAAATGAAAGTGGGAGGGGAAGAGGTTTTTGTTTAAGTACGTAGGCATA:1 + chr2L 792635 5' + Rt1b 5040 1 69.31 CCACATTGAGTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr2L 13739993 5' + 412 7077 2 56.44 GCAGTGAGAAGCATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2L 326211 5' + roo 21 2 59.41 CTACCCCAAGTTTAGACCAATACCCGCATATTTTCGGCTTAGAGCCCTGGTACTATACGAATCCTAAAGTCTAAAGTCCATATTGGAAAAGCTCAATACCG:1 - chr3R 5377988 5' + Idefix 417 2 61.39 GGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 21978173 5' + roo 8686 2 57.43 GCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGCTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAATAAAGTCAATGCACTGTGTCTCCCTCTTTTG:1 - chr2L 21570225 5' + Dm88 57 2 80.20 AGCTGCCCAATGGATCGGGTTTGAGTCTGTATCTCACCAAAGCATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 14639432 5' - roo 399 1 69.31 TTTTGTTTAAATACTATACATTTTTAAAACTATATTAAAACTGTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATA:1 - chr2R 7540622 5' + Stalker 36 4 62.38 TATATATTCGTCGATTTAAACTACTATGTTTGTTTCTATTCTTTTAATTTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:1 + chr2R 22605930 5' - Juan 4179 1 57.43 CGATAATATAAATGGTATTTTAATGATTGTGTCTTTTTACATTTTAGCTAATATTAAACTAAATCATGATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGG:1 + chr2R 23870075 5' + R2-element 246 1 72.28 TTAGGAATCTTTCCCTTAAGTCAGCTTGAATTTTCTGCGAAGTAATGGCTTCTGAGTAATAGCAGAGTCGATCTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACG:1 - chrX 159315 5' + INE-1 124 1 65.35 AAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:2 + chr2R 21379500 5' - P-element 2846 1 38.61 CTGCGNCGCTGCCGCCAGCCGAATGCAGGCGGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3L 8063887 5' - P-element 2842 1 33.66 ATTATTATTTCACTGGTTGCACCATGGGCCAAAGTGACCGGAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATT:1 + chrX 13141386 5' + Tabor 42 2 59.41 GACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAA:1 + chr3R 27080728 5' - HMS-Beagle 6986 2 60.40 ACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chrX 6997167 5' + P-element 29 1 50.50 AGTTATTGGTCATTTGCTTTGTTCTTGGCATCTGTTGGTCATTATGGCTTGCTTTTCCTGTGTATTATTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chrX 550034 5' - Doc2-element 233 9 71.59 GAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACC:1 + chr2L 7170399 5' + jockey 4655 1 75.25 ACATAAAAATTGCCGACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTAT:1 + chr2L 21089138 5' - flea 245 2 68.32 ATCTAAAGGGAATATTAGAATGAAGAAAAAAAGCCAGAGAAACAGAGTGAAAAGCTAGGGAAGCAGCAGCGAAGTACAAAAACAAAAAAAAAAACAA:1 - chr3L 7828579 5' + gypsy7 5009 2 65.98 TACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 13144979 5' - roo 9021 2 76.24 TAAGCCAGAGAAGAGAAAAGGTGTCGCACAGGTAAAGATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTT:1 + chr2R 9406601 5' + FB 659 2 63.37 TCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr2L 7548016 5' + blood 51 2 76.24 CCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCG:1 - chr2R 2994304 5' + gypsy8 4771 2 45.54 GTCGACTGCCAGAAGCTGGCTATCTCTCTTGTTTATGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr3L 21708672 5' - roo 9034 1 64.36 GGTTTNGCAAAGGCGGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 25918983 5' - roo 399 1 64.65 ATTATGCCTACGTTTAGCTGAAGTTCAAGGCTAAATGATTGGTTACTTTCGGTCTCCAATGTGCAATTGGGCCCTTATGTCTAAATCCGTAAGATATATCT:1 - chr2R 10970761 5' - transib3 303 1 49.50 TACATNGGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3R 13376047 5' - 1360 3369 1 59.41 GCGTTTTCCTCTCGGCTCGCAAAAATCAATATCTTGACTGTGTACAACAATTTTCAACGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3R 18906675 5' - P-element 2870 1 62.38 CAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr2R 5485124 5' - 1360 3347 1 68.32 CAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGC:1 - chr2L 15893752 5' + Max-element 45 2 72.00 TTTGCCTACGGAAATATAGAACGTGTGTCATAGCTGCCAAGCTGACCTAATTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATAATTTAATTTAATAAAATTAT:1 - chr2R 21848656 5' + TAHRE 74 1 81.19 TTTTAAACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chrX 8948668 5' + blood 7056 2 69.31 CTTAAGCCTGCAGATCGGTTGTATGGGGTAGAACTTGGCCGTTGCCTTGTCGTAGCATACATTTTAGGGC:1 + chr3R 18171785 5' + Rt1c 477 1 88.57 TTTGATGCTTCTGCTTGGGTTCGATTTGTTTGGAGATCGCTCTTCCCTATCTCGCACAGATCACGGCCGCCGACCAGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTG:1 + chr2R 25013525 5' - Chouto 46 1 56.00 AACTCATTAGCGTGCATTTTAGTGGCAAGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAA:1 - chr3L 18457367 5' - roo 8706 2 72.28 AGGCGAAGGAGGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATAC:1 + chr3L 17869899 5' + 1360 16 1 41.58 AAAAATCATTCCATTTGTTTGGAACTTTGTTGAGTGTTGTGTGCATCAGAAAATAAATTTAAATGTGTGAAAAAATATCAACACGTTTTTCAAAAGTGTGG:1 + chr3R 30464387 5' - INE-1 258 1 67.33 GCGAAAAATACTGGAAAACGGTAAAATTTTAATTCATAAATCTTTAGAAAATATAAGATATGAATTTGATATCGCATAAAAAATTCAGTGTTGCAACTTAA:1 + chr2L 22686718 5' - transib3 126 1 65.35 CCATCCTCCTCCTTTTGTGCACCATGGTAGCTGTTGCAATTGCCGCAACAACAACAACAACGGAGAACATTGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 + chr3R 17121606 5' + mdg1 8 2 70.30 CAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:2 + chrX 4154894 5' + blood 7024 2 66.34 AAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:2 - chr3L 6024597 5' - roo 9034 1 64.36 TTTTTGAAACCCCCATGTGAACCCTCAAATAAATTTAAATTGAATAACAACGTAATGCTTATAATCAGTAATCTGCCACTGTATCGACTTGTATGTCTCCA:1 - chr4 636684 5' - Helena 1234 1 71.29 ATCAAGCTACACCACTCTAAGGAGTTCACGCCGCGCGTACTTAGTCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCT:1 + chr2R 12030329 5' + Doc 29 1 51.49 TTCATAAAATGTTTTACTTATACCAGCACCATTGGAAATGAGTGCCAATAGTTACACCAAAGAAACTAGAATAACAATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTA:1 - chr4 871851 5' - Tc3 239 3 65.35 TACATATGGCTGAAATTCTGAGGAGAATCCTTCCCGGCTTCACGGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCT:1 - chr3R 14688516 5' - pogo 2099 1 51.49 TCTTTCGGCAATCGTCGAGAATCGGGTTTTTGTTTCATATTCTGTTTTTCAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCAC:1 + chrX 9038634 5' + F-element 4310 1 53.47 AAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAATA:1 + chr2L 17841054 5' + Juan 4074 1 75.25 GCGGCCTCGTCACCAGGTAATAATACATTAAAATTATATACATTAGTGGGCATAAGTATTTAGACACCATTAGCTTGCAACTGCCGGGCTATGCTTTTCAT:1 - chr3L 26720738 5' + Tc1-2 40 1 64.36 TGTGAATTATATTATGCCTGGAAGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 - chr2R 5850039 5' - jockey 4970 1 57.43 GGAGCCGGTTTTATGGTTGCCTCCCTTTTGGGTTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTA:1 + chrX 21946803 5' - Doc 4449 1 67.33 GAGATGGAGAATATGTGGAAGCCCTTAATTATTCTAAACAATCAACTTAAGTCTTAGACAGCAGTGATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAC:1 + chr3R 10402680 5' + mdg1 7065 8 56.44 CCCCCAGAAAATAATTTCCAGGCTCTCTGAATTATACACAGTAATTTTCTAAGGCCTACAATGAATTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 6794508 5' + roo 8712 2 64.36 ACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 + chr3L 11909956 5' + Tabor 55 2 81.19 GAAAGCGATGCCAAGATTACTGGCCTAAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chrX 12857838 5' - 297 6931 2 72.28 GGTCAAGACCCATCGTGTTTGTTGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGAGAGCAAGAACGCGCTCTTTCTTGAGTTATTGGCAATGGTAAACTTGTCGAGTTATG:1 + chr2L 3584471 5' - Doc2-element 411 1 82.18 GGCTTTTAGTCCGAAAGACCTCGATTACCCGAATTTTTGTGTATTCAACTACTTAGTCATTCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCT:1 + chr2L 20772111 5' - P-element 388 1 64.36 TAACATATATTAACAGATTTTCATTAGGCAACCATCACAGTAAGAAGTACACGTATAAACGTCGATGTGACGACAATGTTCATATTTTTGTTTTGTTTATT:1 + chr3R 18639963 5' - Porto1 193 1 76.24 TCTTGCATGTGCAGCTGGAGCTCTCAAGTTGGAACTCGGAATTATTGGCCATGGTTCTACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCG:1 - chr3L 4347078 5' - mdg3 5387 2 65.98 TGATGACGTACAAAGTTATCATAAGGTTTTTTTAGCAGAGCTGTAGAATTTGAAATATTGATGACGGCAGTGGCCATGAACACAAAATCTGCTCCGAGATT:1 - chr2L 17122084 5' - G3 399 1 58.42 TTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2R 19192545 5' - roo 9026 1 73.27 CACCTATCAGTCGATCAGTGTCCCTTTTCTTCAGCCTATTTGGCTTCTTTTGTTACTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTA:1 - chr3R 10818465 5' + 412 4 2 70.30 ATTTTTGTTGTACATTTTTAACATTTACTTAATATTTAACTGCATTAAATGTAATCGATGGCCCCCGGGCCACTCAATTTGGGGGATAATCGCTTTGCCA:1 - chr2L 20633785 5' + Ivk 213 1 58.00 CATGGCATTGATAATGAATACAATGAATACTAGGAATAATTCACTTAATACATTTTAGGGCAGAATTGAGCACAGTTGCTTATGAAACAGCGAGGAAGAAG:1 - chr2R 21113595 5' + invader2 447 1 47.52 AAATGTAATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 - chr2R 16898304 5' + Max-element 39 2 64.00 GCTAGCATTGTATCGTATTAAGGCAGGAATGGATGATATAGTGTATGGTTTAAAACGATAATAATAGCATGATTACGATATTTATTTACAATGTTATTATA:1 - chrX 16290020 5' - I-element 5266 1 68.32 CGAGANCGCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chr2L 107977 5' - P-element 2874 1 65.35 TATATATTCCACATGAGGAGCATCTGAAAAGTAAAATTGTAAATAAACTTAGCTTTTTGGACTAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGAT:1 - chr2L 15628964 5' - Ivk 5225 1 57.43 ATCGATGGCATGTTCAGCACAAGTAAAAGATCTGCGAACCGAATGCGATTAGATAGTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3R 24152839 5' + P-element 8 2 71.29 AGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr3L 9692689 5' - P-element 2841 1 33.00 CGGGCCATGCAAAAACGCAACGCTAAAGCAGGTGCAGCAGCCTGCAACTTCCGCAGCGAATGCGAATGAATGTGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTA:1 + chr3R 8165817 5' - 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roo 9023 2 72.28 CAAATTGCTGGTAGCAAGATTAATGCCTGCATTATCTTTCCTCATTTGTCGATTGTCAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGT:1 + chr2R 15793959 5' + Doc 299 1 62.38 ATGTGTTTATTTTAAATCTTAGGCCTTTGTTGTTGCTGAATACTATGATGAGGAGATAAGTATAGATTTTTGGGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAG:1 - chr3R 19603074 5' - Tabor 7293 2 73.27 CGTATGTGTTTTTAATCTCAATCGTATAGGATAAAGTCTTTTATAGTCAGAACATAAAACTCTATAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGAT:1 - chr3L 12760111 5' - Cr1a 4152 1 75.25 TTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 + chrX 6997163 5' + P-element 25 1 54.46 AACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr3R 10321105 5' - roo 387 2 56.44 AGGTAAAAACATAATCAAAAATAAGTAAAACGTAAAAAAAATCCATTAAGGTAAACAAAAGTGTTGATTTCAATAAACAAATTACAAGAATCTAAGAGCAC:1 + chr2L 16124844 5' + Idefix 310 2 53.47 AAGGCGAGGGAAAGTGCATAAGATTTCGATTTTTGAGTAGATGATTATAAGCCGCGAAAAAATTAAAAGGCAAGTAAGCAAAAATCATTTTCACAAAGTGC:1 - chrX 9832460 5' + Bari1 12 1 57.43 CCCTCGGGGGGAAGGACGCAGGTCCCAGGAGACAACTTTAAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAG:1 + chr3L 22534187 5' + Cr1a 4033 1 72.28 TATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 11516587 5' + roo 20 2 60.40 ATTTGCATTTTAATTCAATTAATTCCCTTTTCATGAGGCCACACTGTGATTCATATCCCACTCGTTGTCCCGGAGTAGGGAAGGAGGGGAGGAGGGCACGA:1 - chr3R 8853233 5' - G-element 284 1 68.32 GAATAAAATCAGAGATTCGATAAAAACGAAAATACGATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 + chr3R 29432717 5' + 297 3 2 76.24 TCGTGNGCTTCTTTTGGCAGTGTGCCCCAAAGTATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 + chr3R 23617990 5' + jockey 4803 1 67.33 CATATATGTATTTTTCATATATACACTAGTGGGCATAAGTACTTAGACACCATTGTTAACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTATTAAATAGGTAGGC:1 - chr3R 3510055 5' - Tc1-2 1537 1 53.47 TTTCCGCCGGCAAATGAATTTTCCCATTTGACGACGTCGACGTTGTTTTGTGTGCTAATTTAACGTCTTTTTTTCACTCGCCGCAAGATGAATACTCTAAT:1 + chr2L 10904149 5' - 1360 412 1 79.21 ACAACGAAACGGCAGAAATACCGACTCGAAAATCGGATCTAGCGGGAAGATGAGCGCAAAGACAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACTTATGCTCATGCA:1 - chr2R 4676466 5' + 1360 181 1 61.39 CCTCTACATCGTGAATTTTCCCTCTGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATG:1 - chr2L 7623888 5' - 17.6 134 2 73.68 GGTGTTTTTTTCTTCTAGCTCGTGTTTTCACTGCTCTTTTTGTTTTTTTTGATTGGTAGCGTTGTAAAATCTCAATATTTGTTGCTGGCTGTACCCCAGAG:1 + chr2L 3303302 5' - G4 3447 1 58.42 AGGAATACGGACCAAATAATCGTTAACATCCTGCACG:1 + chr3R 14637027 5' - Stalker4 452 1 48.65 TGGCATAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2L 7547992 5' + blood 7038 2 52.48 GATCCGTTTGTTTATTCGTTCGATTGCACTTCAGTTGCTTGCTTATGTAGTTGTTGGCGGTCTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGT:1 + chrX 11380878 5' - Stalker 6925 4 65.35 AACACAGAATTGATAGTACTGCATTAGCATGTTGATTCATCTGAATATTGAGTTACATACCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 18717236 5' + roo 14 2 69.31 AAGGGGAGGCTGGCCTGAGGGTACTGAAAAGGCACGTGTTGAGCAACAGAATATCGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCGGTACCATG:1 - chrX 22563465 5' - Bari2 817 1 58.16 AGAGTGTCACAGCCAATTGACAATGACATCTCTCATTTGGGGCCCCTTTTTTGCTGCCCCCCCAAAACAATAACAAAACAATAACAAAACAATTGACAATG:1 + chr3R 9155620 5' + S2 148 2 71.29 AAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCC:1 + chr2R 12185341 5' - accord 497 2 67.33 GCATAAATGGAACTGCCAAGGAAAAACAACTTGGGAAAGTGGTCACTTCCATGGGCTGACAGCAACGCTTCTACTTCGGCCTTGCATTCATTTGTTTTCAT:1 - chr3R 7617591 5' - Chouto 5942 1 54.46 GTATATGTTTATAATATGAATACACATAAAAGCGCAGCATTATCGAGGATCATATAACAACCTTATTCTTATCTGATATCTGTTGGGTACATCCGGAGTAG:1 - chr2R 17720343 5' - Idefix 86 2 63.37 CGTGANTTGAATAACTTTGATTTAGTGTCATCTCATTTTGCGTGCCGCACAGAGCACATGCGATGGGGAACAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAAC:1 + chrX 20274029 5' - 1360 239 1 68.32 GTAGTAACTGCAAAATATTCAAAACTAATTGGCTCTTAGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 13203059 5' + roo 8701 2 66.34 CTTCTGCTGCGTGGTGAATGGGAGGTGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCG:1 + chrX 916154 5' - roo 8778 2 78.22 CGTTTNCTCCTTTTGATTTTGCTTGCCACTTAAACGCTACAGGTAATTGTATAATTTAAATCTAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTC:1 + chr3R 21548706 5' + roo 9038 1 67.33 AACGGACAATACACAGTGCCCCATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGG:1 - chr3L 25513169 5' - jockey 4778 1 78.22 GAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - 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Doc 332 1 53.47 TGGCAGCCCCGCCCCTCTTGGGTCTCCGCCTCTTTGTCTGTCTGCGGGACTCACTCACACTCATAACACCCACATTCACACACACACATATACATACATAA:1 + chr2R 18482067 5' + Quasimodo 39 2 47.52 TTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTC:1 - chr3L 25232913 5' + GATE 30 2 55.45 CCCGAAGTATCCTCCACGAACATTATGTGCGAAATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAA:1 + chr3R 11624179 5' + 17.6 7120 2 67.33 TATCAATTGCCTTAGTGATTTTTAAACATTTTTTAGGAGCGGCCGTATGTTATGGTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGCTCTTAGATGC:1 + chr4 1131157 5' - 17.6 259 2 62.38 ATATATGCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr3R 31644193 5' + roo 45 2 74.26 GAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 19936666 5' - roo 9022 2 72.28 AGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chrX 6997208 5' - P-element 2836 1 21.74 GACTGGGAGAAATTTAGCGCAATTTACTTGTTATATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 - 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chr3R 19447701 5' - Quasimodo 7083 2 64.36 AAAACATCTCACGTGACCGAAACTGCTCTAAAATGCAAATTTCTCGAGGCTAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 17127735 5' + roo 8690 2 53.47 TAGCAGTTGGCAATTTCATAAATATGTAGTTTTCAATCGAAATAAAAAAATTAATAACACATGTAATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAA:1 - chr3R 4833113 5' - Tc1 1480 1 69.31 GTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 25918903 5' + roo 42 2 67.33 ATTTTAGTTTATGACCCGTAATTATTTTAACAAATTTGCGCTGCATCTTTATCTCTTAAATCTGTATGCTTCATCTTCTAGCTCTTATTGTTCCTGAGATC:1 - chrX 453611 5' - INE-1 150 1 72.28 CAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3R 27189339 5' - roo 385 2 53.47 AAAGTTGCCGGGCAAGTTGCACTGCGCTCTTCTGTTTCTGCTTCCTCTTCGGTCTTCAAGTAGATGCTCTAGAGAAATGTACACACACACACACACATATC:1 + chr3L 5249157 5' + accord 7030 2 63.37 TCTTTNGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 - chr2L 15893745 5' + Max-element 8288 2 79.21 ATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 - chr2R 12446364 5' + jockey 4713 1 66.34 TTGAGCAGTTTTTCTCCAACAGATTTCGATCTTTACCGCGTTTATGTTACTCGTTGGCCAAATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chr3R 9837559 5' - 412 7530 2 63.37 TGAAGAAGAAGTGCACAAAGGCCACAAGCTGTAAGATATATGTAGAAGCAAAACTGAAAAATGGCAGAGACTCTGTAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTT:1 + chrX 13126187 5' + 412 7439 2 50.50 TATTAAATTTGAAAATAAATATATCGAAAAAATTGTTAACTTAATTTTTTGTTTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 + chr2R 16744109 5' - opus 7483 2 53.47 CGCATATTTTTTTTGTTTGTAAACGCTACTGGCCACGTTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCTACACGGTTCAGTCGCCAACATGCG:1 - chr2R 7394698 5' + mariner2 117 1 78.49 TGTGAGCGACACGTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chr3L 13194755 5' + 297 6610 2 59.41 CCAATGGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTA:1 + chr2L 7459586 5' + BS 5046 1 75.25 AATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3R 7993883 5' + Doc 54 1 72.28 TTAGAAAAAAACGAGATCCACCGGCTAATCGGCTGCTGTGGAAGTTTATTTGGTCTCCTAATGGGACCACTTTTAAGTCCCTTTCAATAACTCGGTTCCTC:1 - chr3R 31122673 5' - G5A 2538 1 73.27 TCGGGNAAACGGTTGAGCTAAGCTAAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAAT:1 - chr2L 19674283 5' - jockey 4870 1 75.25 CACGTTTTTCTTTCCAGCTGCAACTCACTCAGCAAAAATAGAAATAATCAATGAAGAAATAACTGAAAAATTCAACATCACCCAACCACCTAGCGCGAGGT:1 + chr2R 16217878 5' + F-element 4471 1 62.38 TCCCTTTGACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCT:1 - chrX 17064836 5' + Tirant 8123 2 59.41 TTCACNATTCTTTTCCTTTAACTATGAACGTATGGAATAGAACTCTGGGGAACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAAGGCAATCAAAAAT:1 + chr2L 16263623 5' + Porto1 4324 1 78.22 CTGCAGCCGCAGTCAAGGATAAACTAAGGCCGACACCCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACG:1 - chr2R 6152285 5' + micropia 5408 2 63.37 TATAGGTGATGGATATTATCCTTAAGGATACGTATGTATCTGTAATACCACATGCCCAACAGTTATGGATACAAATCACTTAATATTATTATTATTGTTAT:1 + chrX 4284443 5' - mdg1 7070 8 66.34 GATTTTCATTTTCAATTCTCAACATTTTATTTGTTGCTGGTTTCGCTCTGCCTTTTTTCCCCTTTTTTTTTTT:1 + chr3L 14457713 5' - Bica 340 1 78.08 GATGACGAAGGCCAACTTGAGTCTTTTGTCCGTCTTCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:2 - chr3R 19989862 5' - pogo 2065 1 63.37 GAAGGNTTAGTTTCAAAAATAAGTTCTTAAAAATGTTTTAAAAATGTATAGTAATTATACTCGATTGCCAATAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCC:1 - chr2R 5325752 5' + Q-element 364 2 75.25 AGGTCGCTCAAAGAGTTGTGTGAGTTGTTATACTTGATATACTAAAGACACTAGAATAATTAATAACAATAATAATAAATTAATATTCTAGTGTCTTTGGT:1 + chr3L 18284585 5' + Tc3 312 1 67.33 ACAAAGATTTCTGTATAAAGGTTTAGACAATCATTTTCAAGATATTTTTTATAGGCACCAACCAAAGACACTAGAATTCTATTATTATTCTAGTGTCATTG:1 - chr2R 11728625 5' + Tc3 310 1 58.42 CAAATGCTTTGGTTTTTATACAACATTCACTATTTTTTTGTTGCTAGCTGATTTTATCTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chr2L 16497299 5' - roo 326 2 56.44 CTAACTATTTGTACAATTGCACGTACTGCATTAAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chrX 18012655 5' - roo 401 1 71.29 GCTGGGAACGGGGCTTTTGGGGCGATACGATCAACCAGGAATTGTTTCGCTGATATGCAGATGAGCGTTAGATGGATAGGATATATGTATGTACATATGTA:1 - chr3L 401183 5' - 412 227 3 72.28 TGTGTGTGTTTTCTTTTTTTTGTTTTTTGGTTAAAAAAAAATTTTTTTTCCTTATATGTTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAAT:1 + chrX 14342130 5' - 297 6960 2 65.35 AATGATGGCTCTTACTATGTATTATTTATTGCATTCATATAGCAACTTTATCTTTAAAAATTAGATATTAGGTAGAAAAAATGTAATATTCAAAAATGCAA:1 - chr2R 20379286 5' + TAHRE 10324 1 58.42 TCAGTGCCTCTCTGGGTTAAAAGCTAAAGTGTAATATAATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCG:1 + chr3L 8924583 5' - Stalker2 352 2 65.35 CGTCTTGATAACTTGTCGCCAGCTGGAAATCTGCGGAGCATACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGAT:1 + chr3L 14375969 5' + Doc 4514 1 57.43 TAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAA:1 + chrX 14713209 5' - flea 4977 2 73.27 TCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr2L 14490431 5' - P-element 2832 1 24.75 AACGCGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 + chr2L 11065874 5' - P-element 2850 1 44.55 TTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATT:1 - chr3L 7989803 5' - mdg3 210 2 62.38 GATATTGTGTTTCCAATACATACATATGGTGTGTATCTAATGAAGGATTAGATCATATGGCATTTCAATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - chr3L 9121910 5' - Transpac 5226 2 77.23 CGAAANTCTAAGTGCAAATAAGCGGTTAGAGTTTTCTATTTGGCAACAACAAAAAGTGTAAGAAGAAGAAAAAAAAAACGCACATAGAGACTACATGATAT:1 + chr2L 5295754 5' + hopper2 1135 1 74.26 TGTATTTGTAATTTAGTTTTTATTGATAGCCATCCATACTGCCTGTCCAACTACTGTCGCTTTGTTTTTCCTGATTTCGGCATTTGTTGATTTTTACGTTT:1 - chr2L 2919388 5' - hobo 2521 1 65.35 AAACCCGGTGATTCAGCATATCATCGAATCGGGTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACC:1 + chr3R 13422840 5' + 17.6 57 1 67.33 TCCAGCTTCTCGGCGTCACCATTACTTCTCGAGATATATATATAACTATACAACATCGACATAGTACAGCGAGCACAGTCTAGGATTCTGAGAATCATTAC:1 + chr3R 2999768 5' + Doc3-element 4391 1 54.46 CCCATCAGGCAAGGGGTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 + chrX 19306738 5' + P-element 18 1 61.39 AAATACTATTTCACGGTATTTTCAGTATATCAAGTGCCAGCTTTGGTGCACAAAATTTTACACTTAATTCTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGA:1 + chrX 6654294 5' - P-element 2590 1 69.31 CACACTCACAATCGCACTCACACGCAGACACATCTACAGACCCTATTCAGACTTATTCATTTTACACATTCATCTCTCTATAGTGTATATACATATGTATA:1 - chr2L 4059949 5' + invader3 5083 1 70.30 CTTATCAGTGAATAATGCGAATTATCTCTTATATGAATTATGCAGATAATATTTTGAATAAAAATATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGC:1 + chr2L 19813681 5' - 412 249 2 63.37 CTTATCAACACTGCCAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTC:1 - chr3R 27189353 5' - roo 400 1 68.00 GAAGTAAAAACCCGTCTCGCTATATTCGTCGACCGTGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTG:1 - chr3L 12081704 5' - I-element 221 1 64.36 CTGGCAAACGTCAATTTCAGCTGGGTCAGAAGAAATTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGTGTTTTTGGGAGAGCATTGC:1 + chr2L 12372039 5' - 17.6 269 2 67.33 CGGACNAAGTGCCCGTTTATATATAGATCTAAGGGTGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAA:1 + chrX 2164449 5' - blood 7128 2 73.27 CGTGATACCTGTTAGTAACAGGCTGTTACTCAGCTAGCCGCAGGTAGACATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCACCATAAGCACATTTCGTGTTTGTC:1 + chr3R 5167528 5' - Tc1 1618 1 54.46 GATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 6024589 5' - roo 9026 1 72.28 AGGTTNCAAAAAAGTTACTTGCAGTAAAAGGCAATAGTTAAAGATAAAAACGGACTTTTTAACTTTGGTCAGAAAATTAGTTATACTCGACGAAACACAGG:1 + chr2L 9114825 5' - transib2 396 1 72.28 AAAATCTTTGTGTGGGATAACAAAAGTAACAATATTTTGAGTCCAGACCTTGACCTATGAAGTATATTTATTATTAATTAGGATCAATAGCAGGGTCGATC:1 + chrX 12965317 5' + INE-1 96 1 57.43 ATTCCCCTTTCCTTGGCTTTATGAACTCGCTAAAGGCGGTAAATTATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 - chr3L 9304661 5' + jockey 37 1 52.48 AAAAAAGGGGTTCAGTTCACTGGTATTGCGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGA:1 - chr2L 1652112 5' - jockey 4593 1 71.29 ACACTGCCAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3R 27189346 5' - roo 392 2 60.40 GAAAGTAATTCACCAATTGGAATCGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2L 2437759 5' - roo 9022 2 71.29 GGAATTCGCAATAAAACTTTTTCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:2 - chr2L 7927265 5' + hobo 34 1 62.38 AGAGCTAAAGTTGAAAGTTAAATTGAATTGAGGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chr3L 10811154 5' + P-element 42 1 39.60 AAATCCGCAGAGCCAAAACGTTTACGTGGTCAATCAGACACAACAGCAACTTGTGCAGCAACAATTAACCGGTGGCAGCCTGTTGGTCGG:1 - chr3L 14025047 5' + Chouto 6011 1 71.11 AACAACTACAACAACAACTGCAACAGCATCTACATCAACTCTATGCTCAATACCGACAGCGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTC:1 + chr3L 7632374 5' - jockey 4636 1 67.33 TCCTTACTTTTTTAGTCTAGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACTCTCTTATTAGATTAAGTTATGT:1 + chr2R 12213913 5' + Transpac 4943 2 56.44 AGTATGCAACAAAGTGCATGTTGTCCTTATGACTAAAATAGCACATTTTAAACAAATGTATCTGTAGTTGAACTGCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCT:1 + chr3L 3944689 5' + jockey 4764 1 59.41 GCAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 18353568 5' + jockey 12 1 65.88 ACTTACGAGAAGCCAGATAAGTGGAATGTGAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGT:1 + chr2L 11047968 5' - Juan 4191 1 53.47 CAAATGCTGCCTAACACTGGCACTAGAACAAAAGCTTTGGCGAAAGCTGCGCTGGCAGCTCGTCCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 11070477 5' - P-element 2876 1 68.32 AACATGAATCAACCGCAATCGATTCAATGGTCAATCCGTTAAAAGATTAATAGCAAAGGGTCTCCTCAGCAAATATGATAGTCATATCATTAGCGTCCAGG:1 - chr3L 719665 5' + R2-element 3262 1 71.29 AAGTTTCCATTTTGTGCTATTTCAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGAT:1 - chr3R 6411257 5' + jockey 4967 1 77.23 TTTTATTAATTTATTTATTAAGGCAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTT:1 + chr3L 26246017 5' + X-element 4556 1 81.19 CGAAAATAAATAAATCTGGGGATGGCAAACAATTTATGACAACGATATTCTTGAACAAAGCCAAAGTTGCAACAAAGTGAGATGATCGCACTTTTAGCTGG:1 - chr2L 2532359 5' - HMS-Beagle2 6997 2 66.34 CAAAAGAGTATTATTTGAAATGGATAATCAATCTTCAGGTTTGTATTAGGTGTTTATTGTGTGCGTCTATTTCTAACAATTCGTACATTTAGCAAGTGGTG:1 + chr3R 2542358 5' - hopper2 1271 2 54.46 TTTATAAGTTGGCGAGACAGTCAGCCAGTTGCAACATTGGTGAGTCAAAACGGAGAGGATGTAGAACGAACTGTCATCAAATTAAATGGAATGAAAATTTC:1 - chr3R 2999671 5' - GATE 345 1 57.43 GAGGCATAACGTTCGGGTTGCCCCACAACTATATCCCCCTATCTATCTGGGTATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAA:2 + chrX 4500184 5' - Quasimodo 7351 2 64.36 TAATCCGTTCGAATGCAGCAGCAGTGGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAA:1 - chrX 4989515 5' + invader2 274 1 71.74 CCATAACTCGTGGCATTAAATCGCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTTGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCAGCTTGATAAATCATGATAG:1 - chr2L 13196451 5' - Chouto 6228 1 81.19 CAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCA:1 - chr2R 19857397 5' + 297 6614 2 71.29 CGTCGTAGCAATGTCAAAGCAGTCATTATCGGCAAATAAGGTAACGTAACCCACAAAAAGGTAACCAAAACCGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 - chr3L 21203095 5' - pogo 2098 1 72.28 TTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chrX 3649713 5' + jockey 57 1 78.35 CGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGACGAAATATGCC:1 - chrX 1018149 5' + 1360 204 1 66.34 CTGAAAATGTAAATAAAACGCTGTAAATAAAACCCCAATCCTTGATAAGTCACCCACTGGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCT:1 + chr3R 31939694 5' + Idefix 204 2 76.24 ATGTACATACTTTTAGCACCGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 - chr2L 487152 5' - P-element 2868 1 59.41 TTAAANCCGCTACGCTCATTGTTAAACCAATCTGGGTTCAATGGCAAAACCAAGCAGAGAGAGTCAGAGACTGAGAGATTGTGAGAGAGCGAGAGAGAGA:1 - chrX 6127540 5' + 1360 101 1 57.00 ATAAAGCCCGCAATTCGGTCAACTTTTTATGCCGCTTTTCCACCATTTATATAGTTTTCGCGTCCTCGTCATCGGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAA:1 + chr2L 9383128 5' + F-element 475 1 67.00 CACAACGAGTAGAGTCAATGTTTAATTAACATTATCTATATTGACGAGCTACTCGTCTTTCAAGTGTAAGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCT:1 + chr3R 7522807 5' - blood 7326 1 80.20 TAAAAAAGAATTGTTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chrX 10251803 5' - flea 4983 2 65.35 TGGTGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chrX 12538523 5' + roo 8694 2 56.44 CATATNAATATTTATAAGTGTGTGCGTGGTGTAGGAGGTCAAGTGTCAGTGCCATTTAGCAACTTGCCTCACACACACACACACACACACACACACTGTGT:1 + chrX 2899051 5' + accord 7105 2 77.23 ATTAAGCGTAAGCAAGAAAACAAAAACGCATAAATTTGTTGTTTGTTATAAAACAGGAGGGGATAATCGCTTGCCAGTCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCT:1 - chr3L 2420661 5' + Ivk 252 1 42.57 GAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:2 + chr3R 5977763 5' + copia 50 2 73.27 CATCTGAAAGTAATTTTTAATTTAATTGGATTTTTAATCAATTTGTATCAGTCTGATTTTTGAGGTGGCGTTGAAAATACACAGAGACCTAAAAATCAAAT:1 + chr3R 1704453 5' + Doc 4415 1 75.25 GTTAATTAGACATTTTTCTAGATGCATTGTGAGCGGGGGAATTTTTAGTGTAATAGTTTTAAAAAGTAATAGGTATAGATGTAGTAGATGTAATAGATTTG:1 + chr3L 21595376 5' - Stalker 7235 2 53.47 ACTCACGATGATTCACCTCACCATTCACGTCCTGCGTTCGTTGTCATCATGACTTTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTT:1 - chr2L 5778004 5' + FB 23 1 56.44 GGCAGCACTGCCCACGATCACGATCTTTGTCTTTGCTCGCCGCTTTAAGCTCATTTCTGCTTCATTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 8063811 5' + P-element 9 2 70.30 CGGGTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 - chr2L 13447179 5' + HMS-Beagle 6825 2 54.46 AAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr2L 13837945 5' + 297 6604 2 57.43 GCATATGCATGTGTGTGTTTTACTTAAAATAAATGTTACTCTTTAATCATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2R 22993697 5' + opus 137 4 55.45 ATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:1 - chrX 5443962 5' - mdg1 7435 2 54.46 CAGCGGGCGGGAAAATCGGTTAGGGTCGAGTGGAGAAAGTGGCTTAAGCAGCGCGCGGCTCTCAGCTTAAAAAACTTTTATAGATCCTGAGATCTCGAAGT:1 - chr2L 19211941 5' - INE-1 143 1 74.26 ACTTGNTCCCCCAAACAATTAAATAATATTGAAAACAATCAAATGAACGCGCTACGCTTCAAAGATTTCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAAT:1 - chr3R 23225884 5' + I-element 419 1 71.29 ACAAGAGTGATATTTTCCTAATATCAATATTTTCTTAAAATATTGTTAATCTCCTCGACTATCAGATTAGTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAA:1 + chr2R 6915138 5' - Circe 7089 1 66.34 CAACAAGAATGATGTTGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2R 9862209 5' - roo 9041 1 59.41 GCAAATTTGATAAGGTTTCAGAAATTTGAAAATGAAAATCCTTCAAGTTTTCTAAATCTAGCATAGGCGAAAATTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGA:1 + chr3L 17855128 5' - INE-1 501 1 70.30 TGGTGAAAAAGCCAAATTATCTAACATTGGCGAGCCGCTGCTGCTGCGGCGGAGAGGCGTTCGAAAATTTTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACT:1 - chr3L 2762310 5' - Tirant 298 2 75.25 ATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3R 14094988 5' + Doc 40 1 66.67 AGTTTCTTAAATCAAATCAAATAAAGCAGGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chrX 20974912 5' + opus 7161 4 70.30 CCCATTTTTAATACAATTTAGCTTTCGATACTAATCGCCTACACTTGATTCTCACCACAACCATTTCCAAAGGCCTTAGCGATCAGACGTGATTTTTGTAT:1 - chrX 16803459 5' + diver 6016 2 75.25 TTACCGCCTTATTTTCTGTGTACCAATTATGGTTTAGATTATATATATTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTT:1 - chr3L 11848395 5' - 297 367 2 62.38 ACGCCTACACGGAAAGCAAAATCGTGCTGGTAGATTAGTCCAACATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCA:1 + chr3L 20389098 5' - Stalker4 6908 2 72.28 CCTCTNCCTACCGATCTTCTTTGACCGAACCGCGCACTATGGGAAATTTGAGCACTTTTTCTGGACAAAATTAATAACTCCAGAACGGAGAGAGATATTAA:1 - chrX 15553640 5' + Transib-N1_DM 46 1 65.35 TCTGTCGTTTTCCTCTGACGACTGCCAGACGTTGTTTGCGCAGAGCGCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 + chr3L 25802991 5' + 1360 27 1 75.25 CGTTGTTGCTACCTTTCACAGGGTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr2L 8031299 5' + P-element 50 1 29.70 TTTCGCGGGCATAAATTGTCACAATGTCTTTTTTACCTTTCTTATTTTTTTCTTTTTAATTTT:1 - chr3L 12572881 5' - Doc 4698 1 77.78 CAACTTTATTTTAACTGATTGTTTAGCTGTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGC:1 + chr3R 10977841 5' - 412 100 2 69.79 CATGTAGACATTCTACAAATATTTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chrX 13347260 5' - roo 403 1 73.27 CAATCNAAAGTGGCGTTCGAAAAATGAACAAGTGAACTAAAACCTGATGTGTTTACTCAAAACTGTAATTAAATTGATGTTAGTAACGCCTTTTGCCTAAA:1 + chr4 704879 5' + transib3 489 1 66.34 CAACTCGCGGTGCCGAGCATGCTGCTCCTCAACGTAGTTGATCACCTCGTTGGGAATGTTCGGGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTT:1 - chr3L 12088769 5' + Doc 337 1 70.30 CAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 18507851 5' + jockey 62 1 76.24 CTAATTAGGCGTTCTCTTATGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTTAAAGGCTATATATAAAGTATATTTATTCTTGATCAGGATCATAAGCCGAGTCGATCT:1 + chr3L 22511818 5' + INE-1 97 1 76.24 TATGATGTAGCTAGTATTGTTTTGGATCTCCCAATCAATGTTAACTAACCTCGGATTTCCACAGGACGAGGATAATACCAATACACACACACACACATATA:1 - chr2R 15524780 5' + accord 184 2 78.22 TTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTT:1 + chr2R 9387345 5' - Stalker2 358 2 72.34 ACGGACCAAGCGCTCATTAAAAAGGAATTTGCAGGGCTAAAATGAATGGACCAGGATGCCGGAAAAGCGGGAACGGATGGGAAACGGAGAAAACCCAGAAA:1 - chr3L 13581489 5' - copia 4731 1 53.47 AGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chrX 12294736 5' + blood 7067 2 82.18 AACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 10457295 5' - roo 353 2 80.20 TCGTTTGGCTGCCACTACGTAGAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chrX 8031358 5' - roo 9037 1 59.41 GCTACAGCTACAAAGTTAGTTTTGAATCAAAGTGATATTATGGTTCGGCTATTACTATTTCTAAGCTATATTTATATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAA:1 - chrX 1020076 5' - 1360 300 1 69.31 ACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTCG:1 + chr3R 11165660 5' + Tabor 54 2 75.25 TATTGATTATGAATAAGCGTGAAAAATTGAAGTTTTTTTTTTAATTTATTTTAAATATCGTTTTGGTGTCCCTAATGTATGCTCTTTCATAATATATAGAG:1 + chr2L 22663425 5' - transib3 69 1 49.50 CTAAATTGGGAAACAACAGTAATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chrX 20437719 5' - roo 403 1 58.42 TTTGTTAATCATTTACAAACAAATGCAAATAAAATAAAATCTAACCGTCTATTGTGGAGTGAGAAATGATGTGTGCCAACATGTGCCAAAAACTAATAACT:1 - chrX 4332123 5' + transib3 433 1 73.27 CAGTCTCCTGAATGAATTGTAAGCAATAGCAGCAGGCAGCTCGAACTTGCAGTACAGTTAGCACCGTTTAAAGTCACTCGCACATACACGGACACACACAA:1 - chr2L 3873015 5' - Stalker 444 1 72.28 TTATACCCATTTGCCTTTTTCATCGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGC:1 + chr2R 24493639 5' + flea 4760 1 74.26 TAATGGCTAAGACAAGAATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 - chr3R 6431084 5' + 3S18 41 2 64.36 TAACAGTTACCAACTTGCCTGTTGAATATAACTGTTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAAGGTTTGTTAAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 + chr2L 22719108 5' + INE-1 30 1 66.34 GCCTTTTGAAATCGGTGACCCCGACGTGATGCGAATCAAGTGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chrX 11282562 5' - I-element 5323 1 57.43 AAATGTAACAATAATAGTAGACAAGCCAGTTGGTGGTATGAATGCCCGGTCGGTCAAACGGCTTGCAAAAATTGTATAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr3R 24621546 5' + HMS-Beagle2 482 2 80.21 ATGAGAATAAAAAACATTGATGAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 + chr4 1152013 5' + transib2 26 1 53.47 GTATAGCATTAGAGTAGAGACAGAGATGGACACACATCGATAGGCAGAAAGGGAGGCAGTGAGTACACAAAACTGCCACGTCCACACTTTTGAAAAATGTG:1 - chrX 15096704 5' + INE-1 256 1 71.29 CCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 + chr3R 25633331 5' + Tirant 29 2 57.14 TGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 + chr3L 14240832 5' + Tirant 8147 2 64.36 ATAAANCCTCATACATAAATACTATGAGCTAAATGTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr2R 13122014 5' + opus 149 4 68.32 AATGAGAGTCCCCAACAGGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 + chrX 19095736 5' + roo 29 2 54.46 TTTCATTCACAAGCAACTATAATGCCATATTGGCTTACAAACTAATTTATACTTAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGT:1 - chr2R 13605625 5' + I-element 23 1 48.51 ACGCCAGGAACTTGTTCCTTCACTCCAAGGATCACTCTCCCCGTTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACAGCCAAATTCGTGTCGTTTTGGCTGTGCAAAAAGA:1 - chr3L 23895025 5' + G3 11 1 65.35 GATTAGCATAAATGATGAGGCCCGCTGAAAGTTAAGTGCGAAATTCGTATGGCTCATGCTTGAAACTGTGTGGGTGGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr3R 20463318 5' - hobo 2936 1 73.27 ATAAATAATAATAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACT:1 - chr3R 14983775 5' + P-element 2776 1 24.00 GCTTATGTCCTAAAATGGTGGGGCCTCTGATTGATTTGGAAAGAATGCAAACCAAATGGGAAGGCAATAAAAAACCGGCATTAAAAACAAAAAAAAACAAA:1 + chr3L 2561452 5' - hopper 152 2 33.66 TTTTAATGCCACACATCTGTTTTCCCACCCTGCCGCCGCCTGGCTTCCCTATTCCCGCAATCTGCTATCCTTCTCAATGCAATATGTCAAGCCTTACGGAT:1 + chr2L 19643655 5' - Dm88 4326 1 70.30 AACTGTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGA:1 - chr3L 13994250 5' - P-element 2836 1 26.73 TCGCACTTAAAAAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTA:1 + chr3R 21695429 5' + 3S18 25 2 54.46 AATATGATGAGTCTGACAAAGCGGCGAAAAGTGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGC:2 - chr3L 14603325 5' - jockey 4947 1 67.33 AAGACCCACAACTTGGTCCACAACTAGGGATTCCTTACGTTATATACACATACATATGTGAATAAAAAATATGTGCACCCCTCTAACTTGCTCGTGTTAAC:1 - chr2R 6623837 5' - gypsy10 5644 2 64.36 ATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 12136322 5' - roo 9021 2 72.28 CCAGTNGTGATCTTTCGTTTATTATCACGCCTGCGGCCATAATTCATTTCGATCTGGTTCGGGGTCTGCTCGCCGGGACTGCCAGTCAAAGTAATTCATCG:1 + chr2L 5238491 5' - Rt1a 4906 1 69.31 TTTTTGTAGTTTTTCATGGCTGTCAAAGCGCGTTAATTACGTGTAATAATGATGCAGTGCGCGGAGTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTGTTTTCTTTTTTT:1 - chr3R 30576759 5' - mdg3 5084 2 73.27 AGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr2L 4189394 5' + 1360 56 1 79.21 GCACCCAAGCGGTTCTTATCAGATTCGTAATTGCATACTTTCGGGCGGCAATTTGGAAACAATTTCACACTGGCCAGCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAG:1 - chr2R 19357457 5' + jockey 4675 1 76.24 AGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTA:1 + chr2R 10863897 5' + mdg3 5285 2 59.41 CTGGCAGCATGAAGCATGTGGCCAGTCAACTGGCTGACTCCTGCCGAGAATGTTGCTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGC:1 + chrX 7409464 5' - jockey 4706 1 55.45 ATCCGAGTTGTTATAATGTAATGGCTAAGACAAGAATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTT:1 - chr3R 6431102 5' + 3S18 23 2 57.43 TTAGCNCAGAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr2R 5849949 5' + jockey 21 1 64.36 TAAAAAAACTCAAACAATCCAACACTCAGCGTTCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGTATAAAGGGTGGAAGGAGGAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGGAGG:1 - chr3R 6848410 5' + Rt1b 4925 1 76.24 GAATTAAGATTTTTTTTCATAGTGTAACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chrX 5018709 5' - opus 7476 2 54.46 AAAAGTCGAAAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 + chrX 4488869 5' - 412 7513 2 56.44 GACACTTTTAATTGATTTTTTACCCTTTTTTTTTTATTTATTTTTAA:1 - chr2R 14824919 5' + hopper 151 4 61.70 ATGCGCTCGTTCTCAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chrX 4041512 5' - hopper 1382 1 56.44 CATGGNGACAATCCACCTTCATTGTAGCTTGCTGGCATTTTGGTTTTCTACTAATTATGATATTTAATATTTTAAGTATTTAATTTAATTTAATTTATAAA:1 + chr3R 16711923 5' - NOF 3956 1 56.44 ATGCACTTCACGACATGGGACTTTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3L 13080952 5' - 412 442 2 76.24 AGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chrX 21087582 5' + mdg3 5279 2 53.47 GTTTTTATCGTATCATCGGTGGGCATCTGTCATACATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3R 23665353 5' + 297 9 2 69.31 AATGATTGCGCATACGAAAAATGATAAGACCGAGATTGTGTGTTTGAGCTTTCAGTTTCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAAT:1 + chr3R 19225085 5' + FB 21 1 59.41 CTCAAGCATTATTAATCATGCAAAAAAAAAATGTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAAC:1 + chr2R 8741492 5' + Quasimodo 40 2 71.29 AAAAAGAATTGTTTTGTTATACGTGGGCCTTTTCAAAAAATATACTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 - chrX 10251801 5' - flea 222 2 67.33 AAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 + chr2L 11065882 5' - P-element 2842 1 36.63 CTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr2L 487111 5' - P-element 2827 1 16.83 ATATTACAAGTTTTACAAAAGCGACATATGGTTTAAAAATCCCATAAATTAGGAATGATCGTAAGGCTATATGTTTATTGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 - chr3L 2024413 5' - copia 254 1 74.26 ATAGTCCAACGCGCACAGACAGCCTAAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3R 4051902 5' + 1360 50 1 76.24 GTACCCCGGCTAATGTGCTTTTTGCTGTCAGCTTACGGCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCGTT:1 - chr3R 24486899 5' - P-element 357 1 51.04 ATGAGAATAATGTGAGTACGCTGATATGCTGACGTGTGACTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 + chrX 18200734 5' - opus 7469 2 60.40 ACCGAGAAACAACAGAAGTGACTTTTCCTTTAGATGGAAATGTATGCAATTTTTTCTTCTACCCAGGTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCC:1 + chr3R 31367660 5' + Transpac 5080 2 74.26 ATAAATGTAAATAGAAATAAAGAAATGTTAGAATGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 6024545 5' + roo 43 2 71.29 GAACATATCTTGTCGTTTTTATAGTACCATCTCGTTTGTGCCTGAATAAATTTAAATTCGTAATTAGTTGGAGAACGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGA:1 - chr2R 21468216 5' - GATE 8270 2 36.63 AAAACGCAGTTTTGAAAAGTTCTAGTTCCCAGTTTGTAAGTTTAAAATAAAAATCAGTATAAAATGCTGAACGCTTATGTTCACACATGAACACGAATAT:1 - chr3R 19657552 5' + roo 8666 2 44.00 GCCACNCATTGACCCCCACCCGCTGCAGGGCGCACTGTAGTTTTCATCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATTGATGAACTCATTTTCACTTCGATAAGTT:1 + chr3R 28443478 5' - Dm88 300 1 70.30 CAGTGAGCAATGTTGGCTGACAAGATTTTTGCAATTCCGAGCCCGTGTCAGTGAGCATACGATTGCTGGATTCGACAAAAGGAGGAGCCACCATCGG:1 + chr2R 13710751 5' + R1A1-element 353 1 59.79 GGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chrX 13548750 5' + blood 7047 2 61.39 TTGGTGTTTATAGTTATGATTTTCCTTTGTTTAATCAACTCTCTTTTTTTTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGTATAGTTTACAAAACTAGA:1 + chrX 5126594 5' - I-element 5331 1 55.45 GAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAG:1 - chr3R 1868194 5' + G-element 52 1 77.42 AATTTGCATACGCTTGTAATGCGCTCGAAGTTGAACTGTAGTTAATTTGAATACCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 - chr2L 7350792 5' - mdg1 378 2 63.37 ATTTCAATGTCTATCGGCTAAGAACCCCCATTTTCTAGCAGTTGACAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAG:1 + chr2R 21409070 5' - 412 7303 2 55.45 TCGCCATTAGTTAGTTAATTTACTTTATTTTCGCATACTTTCTGCCTGGATTCGAAAGCCCTTGAGCCTAAATCTTTTTTCTTTTTCATTTTGTTTTTTTT:1 + chr3R 27561888 5' - Doc2-element 230 1 58.42 CGAGGAAAAAGTTAGACATGCGTGTGCTGGAAGTATGTGTATACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGATTTACAGTTTTAATGGGAAATTTTTTTTTAT:1 + chr3R 31887762 5' - HB 1554 1 67.33 ATTTTACTTTTTAAATGGGCTTTAATTTTGGTTTAGCTTGGGTTTATTGAAGAGTTTTTTGGCTTGTAATTCGTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGT:1 + chr3R 7861041 5' - I-element 374 1 56.44 GACAGATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGC:1 - chrX 4180789 5' - I-element 5306 1 72.28 CTTATGGAAATGCTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 - chrX 21668155 5' + Stalker2 7 2 71.13 CCCACTTCCTAGGAAATCACTTGGGCACTGCCAGCATCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGAGTCAATCGCTGACGCTCACC:1 - chr2L 15995049 5' + G-element 3991 1 78.22 CAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATA:1 - chr3R 11165693 5' - Tabor 7278 2 69.31 TGGGCGTGGCCGCTTCGTTTCATACCCGCTGCTGTTTTTGTTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGATCTTAGTGTGGTCTACA:1 + chr3R 16532019 5' - mdg1 7334 2 65.35 CTGACNGAAGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGA:1 + chr2L 15956011 5' + Max-element 9 2 69.31 GGCCTATTCCACCGAATCCGCCAAGGTAAACTACATTTTTGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCT:1 - chr3L 16368490 5' - Doc 207 1 61.39 GTGCCTGTTTAATTGCAATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 12538521 5' + roo 8696 2 58.42 CATCTGGTCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:3 - chr2L 11551429 5' + Max-element 8243 2 71.29 CTAGGGGTACACTTCAAAAATAACAGGGAAAATAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 + chr3L 2024326 5' + copia 44 2 70.30 TAAGGCAACGGAATTATGCTGCTAAGTGTCGCTGCGAATTGGTAATTGCATTTCCTACAACAAGATACGAGATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTAT:1 + chr3R 27645641 5' + 3S18 5797 2 74.26 ATGACAAGATCATTCAATGAGCACCACTCTTTTGAGAGAGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr2R 18503495 5' + roo 8679 2 55.41 CTTGTCGCACCAAACCCCCCAAGCCACCAAACCCCCAGTGTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAA:1 + chrX 16749565 5' + opus 7369 2 69.31 TGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr2R 14381350 5' + hobo 30 1 56.44 AAACATTTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATC:1 - chr2L 17889375 5' + accord 51 2 74.00 TTATGTATTTTTTTTTATTTTTCGAAATGAATCGTTATCCTGAAGACCCAATTTTGAAATTGATTTTGAATTTGGATTGTTTTTCTTTTTTTTTTAAATAA:1 - chrX 11430173 5' - TART-B 10631 3 82.18 GCGGAAGATTTTCGAGCTTCGCTTTGGTCTTTTTATGCTTTGCTTAGTTGTATGATGAATTCTTTTACCTTATTTATACATATGTACATACAATATTAATC:1 - chr3L 21013612 5' - invader3 5078 1 61.39 GTTCCAAAGGCAGCCATATATTGAAACGCACAAAGTGATAGCAGACATCTGTATGTGTGCACACATATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCC:1 - chr3L 22919812 5' + 1360 205 1 74.26 TTTTGGCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCA:1 + chrX 13350783 5' + jockey 4811 1 74.26 ACACTACATTTCTTTGCATTTTCCCTTGATTTATACAGATTAACCAGAGTAAATATAGCAGCATAGCTTCACTTTCGTTTAATAATAACTTAATAATTATG:1 + chr3R 20942265 5' + gypsy9 310 2 69.31 GAATCAATTTGCACTAAAATTCTAGAAAAAAAAGAATATTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTT:1 + chr2R 617175 5' + diver 41 2 63.37 AGGAGTTTTGCAATGGCAAACGTGCATTTGGTCAACTAGAACAATATATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:2 - chr2R 12779162 5' + roo 8694 2 57.43 CGGCACAATTGCTTTCGACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr2R 19936613 5' + roo 8695 2 58.42 TATTCGTAATCAAATATCTAAGCATTGGAAAGGTACATAGTTAACACCTCTGCGTAAGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTGAGAACACAAGTCCGTTTTT:1 + chrX 4009262 5' - 412 7528 2 58.42 CATGGAGTTCTTCCGTCAATTACCATGCCATCGAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 13080990 5' + 412 43 2 69.00 GCGGGTATTTCAGCTGCTCCTTTTCCCATTGTTGCTAAGTGGCCATGCGGCTAACCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCC:1 - chr3R 14169326 5' - blood 354 2 55.45 ATTTATGCATTTATGTAATTTAGCTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr3L 7989715 5' + mdg3 5261 1 74.26 ATTTCCTGTGAATTAACCTGTGGTTAATTTCTTTGTATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAAA:1 - chrX 18012740 5' + roo 17 2 57.69 CAGTCNCTCAAACAATATACTAAATCCGGGCTTAAGGTGCACCGACATCTCAACTATGTGTGTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chrX 13347374 5' + roo 8678 2 61.39 CATTGTCAAGCGTTTGACCTACAGAGAAAGAAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 6024627 5' - roo 401 1 72.28 GAACCNTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAG:1 + chr2L 18028668 5' + flea 24 2 61.39 CACGGATGGCATCAACAAAAACACCAGCAAAAAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 - chr3L 5975681 5' - hobo 2930 1 70.30 CGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:1 - chr3L 23678149 5' + Osvaldo 20 1 75.26 CAGCCCGTACTTTAGTTGACTTTTACGGTCTTGCCGTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr2L 11065928 5' + P-element 39 1 40.59 ATTTTNAAAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr3L 7808497 5' + jockey 29 1 49.50 ATAGTTTATAGTTTTGCCGGTTTGCTAGTGTTTTTCTTCGGAAGGCAGGGGTACGTGGGCGTGGCGGCACCCAGTAGACATATGTACATATGTATATACAT:1 + chrX 21070574 5' + G3 4507 1 59.41 TTCTGTCGTGGTTTCGGAGGCCTCAGTAGTTGTGGTACTTTCGGCGTTGGCGCTCAAAATCGCAACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chr3L 11610221 5' + jockey 20 1 65.35 TCCTGTTGGCTCACGAAGCTTCTCGCTGGCAAAGTTGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chr2L 7548060 5' - blood 7351 2 65.35 ATGTTNTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACT:1 - chr3L 9925283 5' + Doc 52 1 73.27 CAGCAGGCACCTCGTACGAAAATAGCAGAGATTCCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTG:1 + chr2L 16419539 5' - F-element 4329 1 66.34 CCCGCNCACGAAATCCTTACCCAAAGTTCCTCCACGGATCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCCCTTCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTTCCTTCCC:1 + chr3L 14847404 5' + Max-element 111 2 68.82 AAAAAAAGGGTAAAGATATAAAACTGAGGTCGCTGAAATCAAACATAGATACAAAAACACTCCAATACACACGCTTACATACACACACACACACACAGATA:1 + chrX 11836734 5' + Quasimodo 38 2 75.25 ATTACTCTAGCTTAAAATGAAAGCGACGTAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGCGAAAACTCCCAAATTTGTG:1 - chr2R 9455788 5' + P-element 264 1 32.67 CGAGCTTAGTATTAACCACAGCATAATGCAATATTTTTTGCATGAACTTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGC:1 + chr2L 15893696 5' - Max-element 269 2 53.47 TAAAGGGTTGTGCGTGATTTCAATACATTTTGTAAATCAGTTTCTAGCTTGAATTTAAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 10400367 5' + TART-C 11098 1 64.38 GCCATNAAATTGCTGCAAGGTCCCTCATAAAATGCATAACTAAAGCGCAGTCTTATACTTCGCATTCATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 - chr3R 28095238 5' - hobo 2936 1 73.68 CCGAAAATTGTAATTGTAATCCTAGGAATCCAAAAACAAATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 - chr3L 9925332 5' + Doc 1 1 77.23 ACAGCTCCGTTTCTCTCTTTTTGCGGAACCCGAACGAAAGACTTAAGGCACAAACTCGCCTCGCTTTGTCTCTTCTCAATTTTTGGCATTCCCTTTTCATT:1 + chr3R 16126031 5' - micropia 267 2 64.36 AAATACATAACTGTTCTTTAAGGGGCTCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 + chr3L 5975573 5' + hobo 13 1 67.33 GGGGGCGTTGGCATCGTTTAGGGATGCGCTCGTTCTCAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chrX 4041489 5' - hopper 1405 2 69.31 CCCTGATTTTCTGAGTCTGACTTAGACGACGCAGCATCTTCGTTTTCCACTACGTATTTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr2R 3188668 5' + 1360 20 1 58.42 CGAAGTGTGCCAGCTTAGACTTTTATCTTGGTTGCCCTTTGTAAGTTGTAAGCCCGACGAATACGAGTGCAGTTGATCAAATAATAAAAACATCATAAAAA:1 + chr3R 15944044 5' + jockey 4991 1 74.26 ATTTAAAACAATATAAACGTCGGCCGCGCACGAAGACGACGGCAGTTGGGGGATCCTGGATGCCAGGCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 10957641 5' - hopper 1407 2 71.29 AAAGTGAAGCCATGAACATTGTTTTTTATTAGCGGGGTGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATACATATACATGCACATGCACATACACACACACACATA:1 - chrX 14626167 5' + accord 7028 2 68.32 AGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGACTACTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGAAACA:1 + chr3R 19449356 5' + Cr1a 4018 1 62.77 GGATATTAACCATAAATAAATACTATATATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr3L 22231594 5' - 297 6935 2 78.22 ATGAGACAGAATAACCTGCAGTGCTGCAAATAAGGAGAGAAGTTTCAGCCAAGTATCAGGTTTTTTTTCCTTTTATTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTT:1 - chrX 6502493 5' - BS 5107 114 74.26 GCAATTGGATTAACGACCAGCCATAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTA:1 + chr3R 20888528 5' - flea 4985 2 58.42 GCATCTTATAAAATAAATGATAAGATAAAAGATAAAATTTCCTGTGAATTAACCTGTGGTTAATTTCTTTGTATAGTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chrX 18012776 5' + roo 8668 2 75.25 TCTATAATATATATATATGTTTATCAAAAATATTTCAAATTTGGTCTTACATAGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chrX 5322946 5' - 1360 3369 1 57.43 AATCCGAGAGGTTTAATTCGAGTGTGTGTGTGCTTGTATATTGCTTAGAGGAGTTTCGACCGGTTTTTCGGTTACCACAAAACAAAAAAAAACAATGATAT:1 - chrX 3158920 5' + transib2 2643 1 77.23 AAATCATTATAAGTTCCAAACTGATGCTACTATTGAATGCTACTAAGTTTACTTAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:1 + chrX 14531476 5' - 412 7530 2 62.00 CAGGTACGGAACTTCCGAAATAGTTGTCTCCTTGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGT:1 + chr3L 3204329 5' + R2-element 3200 1 67.33 TGTAACCAGCAGGTTTACAATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGA:1 - chrX 13682642 5' - roo 9058 1 64.36 ATCATGCAGCAATAAAAGGGGTAATTTCTAAAGTTAAGTTGGGAGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:1 + chr3R 14941160 5' + Doc 36 1 59.41 GTTTCCGTATCTTCCGGAAACTTGATGCCGTTCCTTCCGGCCTTCCTACAGCCGCCAATGCCCAATGCTCAACAGCTCCTAAAAGTATTTGGACAAATTAT:1 - chr4 803129 5' - Tc1-2 1429 1 79.21 GAAAAAATACCCGACTAGTTTCGATTTTATAGTGAATTTTAGATTAATTGACATATGCATATTTTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACA:1 - chrX 20886054 5' - Ivk 5364 1 52.48 CAGATNAAAAATCAATTTCGCAATGTTACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 + chrX 12546449 5' - P-element 2839 1 30.69 TCTGCTTCTTTTGACACCTTTAATGGGTTTCTATATATGGATGGGGCTCAAAATTGTTGAGTGTGATTCGAGTGGCAAAAAATGGCACCCTTGCAGTTCTC:1 + chr2L 15081432 5' - hobo 3 1 51.49 AATTTAAATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACT:1 - chr3R 24282012 5' + Max-element 39 2 63.37 GCATTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 + chrX 16798188 5' + diver 16 2 63.37 CGCCCATCCAAAATTTCATTCACAAGCAACTATAATGCCATATTGGCTTACAAACTAATTTATACTTAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr2R 13605638 5' + I-element 10 1 55.45 AATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTT:1 + chr3R 4973111 5' - 1360 2 2 51.49 GTGTCCGTCCGTATTTTCTGTCCGTCCACGGTTCTGTCCGTGTGGCCCAGTTTCCATTGGAGCACGTGCTTTTCGGCTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:2 - chr3L 7032362 5' - accord 182 2 80.20 TACCTTTCGGCTTTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr3R 18960426 5' - hopper 1387 1 58.33 CAAGGTCTCGGTTGGCGGTTCGGCGCCACCTGTTGGCAACCTTTTGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAA:1 + chr2L 1694025 5' + copia 187 2 54.08 TTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chrX 21844333 5' + pogo 4 1 73.27 CGGAGTTGTCAGCTGGGGCCGCCAAATCGCGTGTTACCATATTTCGCATTAATTAAATATAAAGCGAGAGGAGACCGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCC:1 + chrX 21475516 5' - 1731 4625 2 56.44 ATGGGGTGGTGAAAGCGGAGAGAAAGCGAGAGCTAAAGTTGAAAGTTAAATTGAATTGAGGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 + chr3L 10811126 5' + P-element 14 1 65.35 ACAGATCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAA:1 + chrX 4890035 5' + 297 29 2 61.39 CATTTATACCAACATATGTATGTTGAATACTTTAAAACAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 21708614 5' + roo 37 2 67.33 AGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chrX 12546502 5' + P-element 28 1 51.00 ATTGCTTTAGTTACAAAATCTAAAGGAAATATATAGAACAGTTAAATACAAAATAAAAAAAAACAAAAGAGAGTGCTAAAGTCGAGTTCCCCGACTATCAG:1 + chrX 20894635 5' - INE-1 562 1 69.31 CAAACTTTAATAAATTCATTCTATTGTGAAAAAGTTGTTATGCTGTACAGCTATGTATCTACGGGTATAATATTTTTTATAAATTTAATTAATAATTAATA:1 + chr3L 13949027 5' - Tc3 267 1 53.47 ATTGTTTTGCATAAATCTTGTTGCCACAACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 20466632 5' - roo 9045 1 55.45 CAGTTTTATACTGCGTCCAGGTCCGGATGCCAAGGAGTGCGGACGTGTGTTCGCTGCGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTG:1 - chr3L 14187876 5' + Bica 96 1 73.27 GTATTAATATAAAGTATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATT:1 + chr2R 21712757 5' + I-element 243 1 52.48 GGAACACCCAGTTTCCAATTCCATGCTCATCCCCATGAAGGGGCGGATTCGCACTCATTCCTGCACTGCGTTGTTCGTAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTTT:1 - chrX 12080419 5' + Cr1a 245 1 71.29 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTC:1 + chrX 3538814 5' - invader1 3827 2 63.37 AAAATTGACGGATTGATGAAGCATAATAGCGTAATCAACAACTGTGAGTGTGTATAAGTTTAATACATATGTGAACAAATATCAACACATTTTTCAAAAGT:1 + chr2L 21338496 5' - INE-1 262 1 65.35 CCGAGAAAGAAAAGTGGCACATTCTAAGGTCACCAAATTAGCTGATGGCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 22079722 5' - pogo 2075 1 55.45 ATCAAATTGCTGTCGGTCTAAATTTTGACTTATGAGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3R 21501019 5' + roo 8670 2 72.28 CCAACGGCAATTGCAATTAAAGTACATACAAATCGAAAGCGGGCCATAAAGGAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTT:1 + chr2L 20770347 5' - copia 4901 2 57.43 ATGGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACTAGTATACTTAAATGTGCTTAATATTGCATA:1 + chrX 9928024 5' - 412 14 2 76.24 CAACCCGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGC:1 + chr3L 19349970 5' - 1360 3334 1 83.17 TGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGGTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 + chr2L 20118692 5' + Max-element 8269 2 58.42 ACATACTTCTCTATTGATATTCGACCTAGTTGTAAGCTCTACTCCATGGACTGTCGCTGTCATGGGAAGCCATGGATATTTGTCAACAATAATTTGTGCAG:1 - chr2L 19969073 5' + hopper2 410 1 54.46 TCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCACAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chrX 19095783 5' - roo 9018 2 79.59 CTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACAT:1 - chr3R 19609712 5' + Tabor 41 2 64.36 ACAACAAAAGCCATTGAGACATCTACACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr3R 6185934 5' - 412 7496 2 75.25 CCCAGATGGCACTTAAGGCTCTTAAGCGTGGAAAAGCTGAGAAAAGAAATCCCGCACATAAATAAGGCAAACTCCCCATACACACACACACACACTGAGTA:1 + chr2L 4136914 5' + accord 7106 2 73.27 AGAGAGCTGCGCTTATCGGCAAATCATCGCATCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCG:1 - chr3R 22861739 5' - jockey 4594 1 68.32 AGTGTCGTGTAAGTCAGGATTTAAAGTACTACGAATATATTAACTTCATCTTATTTGGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTT:1 - chr3R 22530857 5' + Juan 3971 1 56.44 AAAAAGTATTAACCAAGAGCAAGCTATGATAAGTCGATTTTAAGAAACATCTCAAAATAAAATTTGTAAAGCTACCCTCAATATGTAGAGTAGAGTTAATA:1 - chrX 21668896 5' + Stalker3T 52 1 68.32 GCATATGCCCAACAAAGGCGACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3L 3671383 5' + roo 5 2 74.26 GTATGCAACTTTTAATTCTAACAAGTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATA:1 + chr2R 23945268 5' - BS 5038 1 78.22 AGGTGTTAGGCGGGTGCGCTGACAACCCAATGGAGCTGCAGCAACAATTGCAGCCACATTGCAGCCACAACAACATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAG:1 + chr3R 15926853 5' - mdg3 5271 2 74.26 CCTCATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGC:1 - chr3R 9952271 5' + Ivk 7 1 71.29 CCATCTCAATCTATCCGTTCGTATTAACCTCGAGACCCCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGC:1 - chr2L 21795660 5' - invader4 2769 2 62.38 AAATTTATAATTTTCAGTGCATACTAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 + chr3L 18340308 5' + roo 8714 2 78.22 AACGATTTGGGAATTTTAAAAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:2 - chr3L 7808509 5' + jockey 17 1 57.43 TATTTCTTAACTCTTCAAACTCCAAAATTGTATATGTTGCATAAATGCTGAGTCGGCTTGCCGACCATGGCTTTATGGCG:1 - chr2L 7508115 5' + gtwin 178 2 60.00 ATTCAACTGTGGCAGCGTTCCATTCGCGATTGTTTTCTATTCCTTTTCACTTGTTCACTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:1 + chr2R 21114682 5' + jockey 27 1 58.42 ACCATTAATCGAATTCGAATAGAGGCAACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 - chr3L 12452194 5' - 412 7497 2 73.27 CTCAATATGTGTGGAAAAGGGTTCATTCAAAAAAGTAGGAAATCCCATACTAGTGCCAGTAATATTTAACCATAGATATAACAGCAATAATAATAATAATA:1 - chr3R 5805445 5' + mdg1 31 2 72.28 AATTANGAACCGATTTCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 1626521 5' - roo 389 2 57.43 ATATATGCACGCATTTTGTATCTTAAACGATCATTATTTCACTAAATGATTACAAAACTTCTTATTTGAGAAGAACACCGACCTTTTACAATTAGGTCTCA:1 - chrX 16301937 5' - Idefix 484 2 65.35 TGTCCCTTTCGAACACGCTACGTCGTTATCGTCTCCTCTGGACGAGCACTGGCCGGAGCTGCAGCTGGCGGTTAACACAAGTGTGGCGGAGACCACAGG:1 + chr2R 4297202 5' + Osvaldo 1061 1 60.61 GGCAGATAACATGCGAGATCATTGTGTAATTTCTTTATCCGTTTGCTTGCGACCGTAGTTCTTATCTCTAAAGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTA:1 + chr3L 27168340 5' - Burdock 75 2 65.35 AAACTNCTTCCATGCATGTATACTGATAGTGGATAAATACAGTGTAATTGTTTTAAAAATATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAG:1 + chr2R 7540562 5' - Stalker4 7328 2 63.37 TGTCAAGCTCAACAAATACACTTTTGGATGTGAAGGAGAAGAATATAATATATATAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAA:1 + chr3R 9952187 5' - Ivk 5341 1 46.53 TAACANATGAAAGTTATGTTGGCGATTCGTCACTTAATTATACCTAACATACAAAAACTCATACTAAATTATGCCACAAAATCTAAAAACAAAACAGGCAA:1 + chr2L 7562223 5' + I-element 5189 1 56.44 ACAAACCGTTTTATCCGTTACCAAGCTACAACGATGACGCCGTCCAAAATGTGTGAAGATGACCTGGTTGCTTGGCCGAAAATCTGCAACCACTCTGGAAA:1 + chr2R 5926469 5' + G4 3369 1 53.47 AATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 - chr2L 11551409 5' + Max-element 8263 2 53.47 AGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 - chr3R 24281996 5' + Max-element 55 2 77.23 GCCAGCTGCTTCCCAAGACACCTCAAATCTGGGCAAAAAACAGAAGCTAAATGCCAAGAACCCTTTAGCTTTTATATTTCCTGAGATCTCGACGTTCATA:1 + chr2L 3160444 5' - INE-1 138 1 59.00 GGTAAGGATAGCATTAAAGCACCATATCCTGTATGAATCAGCAAACAATATCAAATGCTGTTGCATTTTTTTATGCAGGGTTGTGTTCCTTACGTAC:1 + chr2L 19144726 5' - BS3 1408 1 48.45 TCTTATCCTCACTCTATTTCCCAAGGAACCAGGAGTAAAGAGTTCCGGGAACAGGATACTCGAGGGATTGGTTTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 + chr3R 14169223 5' + blood 7011 1 71.28 GGCGTNTGAATTATATTATGCCTGGAAGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 - chr2R 5850043 5' - jockey 4974 1 60.40 AAGTAAAGAGCAAAGTGTTATTTGATTAGAAATTATTGTTAGAAATCATCGTATTTTCATGCTATTCTTGATTGCCATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACC:1 - chr3L 4345064 5' + mdg3 5254 1 54.46 TAATAATGCAAAAAAAAAAATAGAAAAAAAAAAGGAAAAA:1 - chr2R 14661990 5' + Bica 337 2 72.50 TACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATT:1 - chr3R 4543239 5' + 3S18 5810 2 67.68 CGAATGGTGCATTATGCTTAAGTATGTTTTTGAGATATTTTCACAGGATGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCAAATAAGTGAGATCTAA:1 - chr3R 16131478 5' - Ivk 5178 1 74.26 AACCGTAAAGACAAGCACTTCCTCAACACCTGCTACTTTCCTCATTTTCTCAAATTTATCGCACCCATTGCTAGGTCGCGATTGAGCAAATGAAT:1 - chr3L 11612462 5' - jockey 352 1 77.89 TGGTGATGATGATTCACTACCTCTGTCCTGCACTGAGAGAAACTCCAGCTATAGTTGCCAAAAAAAAAATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCC:1 - chr3R 9169723 5' + 297 6581 1 79.21 GGCCTTCACTTGCCGTTGACGAGCTAATCTACTGTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATCTGGAAAT:1 - chr3L 21384027 5' - roo 9026 1 64.36 TCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTA:1 - chr3R 14049399 5' - transib2 2775 1 74.26 GAAAATATTGTTATTTCCGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGA:2 - chr3R 1868250 5' + G-element 4 1 76.24 AACTGAGGTGAGGTGCCCTCAAAATCTACAGCGTCACTGTGAGTGTCAAATGTCTTTTAAAACAAAAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTGCACGACTATCAG:1 - chrX 21421904 5' - INE-1 562 1 89.00 GAGCTACTTCTCCGACCGTCAGCAGAGGATGAAAAGTGAAGATCAGGACAGTGTGTATAGCCATTAGAGAATATGATGAAGAAGGGACATGGAAGAAGATC:1 - chr3L 2154156 5' + invader4 220 2 54.46 CGGTTATTCGCATAAAAGGAAGTCTCTCTTGCTTCAAAAAATCCGATTTAATACCTTTAGATCTTTAAGCCGTCAAGTACACAAATAAATAAATAATAAAA:1 + chr3L 17319568 5' + Juan 4214 1 82.18 CAATGAGAAAAGCAACAAACAAAAAATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr2L 16686553 5' - pogo 2053 1 76.24 ATGCTGTTTAACTGATAATTTTTTAAACAACAAAAGGTTTATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3R 12571475 5' + roo 8699 2 70.30 GACAAAGAGATAGTTGGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 + chr2L 10291512 5' + jockey 4784 1 51.49 ATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 + chr2R 6984307 5' + HMS-Beagle2 6893 2 67.71 TACGCGAGTCAAATATTTTCAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 - chr2L 19679804 5' + Doc 17 1 69.31 CATTTAATGCCTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 20248290 5' - Transpac 296 2 63.16 CATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTTGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 + chr2L 7170368 5' + jockey 4624 1 53.47 TGAAAGGCTTCCCATTTCCAATGCATTTTTAATGCTTTGTTTTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTT:1 + chr3L 21735374 5' + Doc 19 1 63.00 AAAAATCGAACAACGCGAAAAACATAAAACTGCTGAACAGGCTGTAAAAAGTTCATGCTTCGTTTTGTCGCACTTGCAGTTTGCCTGAATGAAGTGACCC:1 - chr2R 5183546 5' - mariner2 282 1 59.00 GGCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACA:1 - chr3L 5015880 5' + I-element 4943 1 54.46 GCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 - chrX 10653582 5' + jockey 58 1 73.27 AATTCTTAATATATTTTACTTACTTCAGTTAAGTCTTTTCTTTTATTTATGATTTATGCATAAATAAAGAGTTAAAAAGTTTTATTTATTTTATTATTTAT:2 + chr2R 10186117 5' - BS 5096 2 81.19 GCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr3R 19450182 5' + roo 8715 2 53.47 TTGGCTTTGGCTTTGGCCGCATCAACACATTGGTAATTACGAATGTGGATCGCACCGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 + chr2L 15344123 5' + transib2 20 1 59.41 GTTAAGTTTACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 13144971 5' - roo 9042 1 64.77 CGTGCATAAATTACACTAGTCAAGGTAGCAAAAATGATGAAACTTGCTTGTTCGCATACACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGA:1 - chr2L 13580316 5' + INE-1 560 1 58.42 AAATGCGGCTGTCTACGCCTTCGGGGTAGGGGATTGACAAAAAAAGAGAGAAAAAAAA:1 + chr3L 10425192 5' + gypsy7 5005 1 51.72 ACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 14639354 5' + roo 8709 2 70.30 GGAACCTACCAATGTGACTAGCCACCACGACTATCCTGCATGCCCACGCACCAATCAATACTAACCCAAAGTGAGCATATGGGGCATGTGTCTGGATACGC:1 - chr2R 7321330 5' - R1A1-element 5236 1 72.28 AACCTAAGCAATGTCAGACGACTTTACCAAATCACTCTTGATATTTTTTCTCTCTCTGCGACCTTTTTAATGAATTCCTTTTTTATTTATTTTATTTATCA:1 + chr2R 19413202 5' - X-element 4715 1 66.34 ACAATGTTTTGGTTTTGCAAAGGCGGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 25918993 5' - roo 407 1 72.28 AGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 + chr2L 20118706 5' + Max-element 8279 2 69.07 TTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCGGGATAC:1 + chrX 21949002 5' - 412 7361 2 74.26 CAGCAATCTGTGCCCCCAAACCAAGGAAGAGAAGAAATACAAGTGTCCGTCATCCGAGGATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAA:1 + chr2L 16894347 5' + invader4 2990 2 62.38 GAGCACGCTTGGTTCGACCCAAGTCCCGGGTGGAGAAAGCCCGTCTCAACGTGGGATGGTTGGACTCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTG:1 + chr3L 4105023 5' - Quasimodo 337 2 66.34 AATATGTAATTTCCATTTTATAAAGAGGAACCTAAATAAGATAAAATGCTATATATATATGGCATATATAAATGCTATATATCTGGGATATCGATAGATAT:1 - chr3L 23948238 5' - INE-1 498 1 67.33 GATCGTTCACCATTTTTATAAAGTATCCACGGCATTTTCCAGGCAATTAATTGTTTAGTTGGCATATTGTTGTTCATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 - chr3L 14952742 5' + transib2 46 1 80.20 AAAATATGTCTAAAATTATGTTTTTTCAATGGATTACGGTGAACACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chrX 21204994 5' - 1360 3355 1 58.42 AACAACTCAACAGAATGGTCACTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 20466659 5' - roo 355 2 78.22 AAAACTTTTTTTATTTAAATTGCCTTTTTCATCAATATATATGAATATGTATGCATATGTACATACAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGAT:1 + chr2R 5414788 5' + Tc1 15 1 63.64 AGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATT:1 + chrX 14713204 5' - flea 223 2 68.32 CAGTGNTGTCCCAAATGCCCCAGTTATTAAATTTGTTTTCAGTGTTTTGACTGACATTGGCATTAGCGGCTATTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGT:1 - chr2R 6529599 5' - 17.6 6949 1 72.28 GAATTTGATTCATCACATCCAATCTGAAGTTCCTCCCCCGCTTCTTCGCCAGCCCCCACATTATTATGTAAAAAAAAAGAAAACAAACCAAATAAATAAAA:1 + chrX 4776178 5' - Tc1 1404 1 63.37 GAAGTTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr3R 24152916 5' + P-element 45 1 35.64 GATTTACTTAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr3R 19609630 5' - Tabor 7314 2 66.34 AAAATTATCTGAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCA:1 - chr3L 4048533 5' + 3S18 5783 2 62.38 GTTCTGGTCGAGTGCGAAGGGTTTTCCCAAACCGGCAACAAAATTTATAACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chr3R 18934059 5' - hobo 2935 1 70.30 ATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 - chr2R 20702145 5' + Doc 55 1 75.25 CCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTC:1 + chr3L 19951188 5' + Ivk 20 1 59.41 CTGTGTGTGTATGTGACTTTACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chrX 10730621 5' - P-element 2874 1 68.04 TGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATAT:1 + chr2L 7170378 5' + jockey 4633 1 54.00 GCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr2R 3188737 5' - 1360 3347 1 68.32 TAGCACTACTGCAAAAATCAAGCGATTCGTGCAAGAAACTAATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTC:1 + chr2L 10320413 5' + 1360 3317 1 63.37 TGGTGAAGTTTGTTATTGTTTTTGGCTCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chr2L 18694147 5' - P-element 2839 1 31.00 GTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCT:1 + chr3R 28755946 5' + 3S18 5806 2 62.38 AACGANAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chr3L 10035648 5' + jockey 59 1 75.25 CGGGCATATGATTTTAAAGAGGAGCCAATTCGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAG:1 + chr2L 17889337 5' - accord 7340 2 68.32 CAAATGGCCCCATTACTATCTGTACAACTCACTTAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTC:1 - chr3R 27080823 5' + HMS-Beagle 2 2 77.23 CAAGATCGGTCTCCCAAGTGATTCCGTGGGCGAATCGCAAGGACAAAGATGCACTTCACGACATGGGACTTTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 + chr3L 13080904 5' - 412 7543 2 75.25 TTTTTAGTGATTCAAGTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 - chr3R 19076219 5' + roo 8689 2 51.49 TTCAGCTTATTATCCAAGGAGAAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 - chr3R 8198538 5' - Tirant 8455 2 80.20 ACAAGCAAAAACCTAACCAACTCGGCTAAGCAGTTGGCCTGAATATAAATTCTAAAAATCTAAAACCTAACTACAAGTTAATCAGACTCAGCCACATTAAC:1 - chr3R 17426631 5' + gypsy2 491 1 56.44 GAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:1 - chr2R 5084080 5' + F-element 33 1 52.08 ATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 - chr3R 14688302 5' + pogo 47 1 75.25 GTATCTCTATCCAATGGAAAAAACTGGTATGTGGTGTTTATTCAGTCATATTGACTTATAATATACTTTGCAAATACTATTAACAAATATTATGTTTTAGG:1 + chr3L 13486547 5' - hopper2 1101 1 44.55 TCACCTTTTTCAGCAATTGATCGATGGGTCACAGCACCCGAGTTTTGCGCAACTAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATG:1 + chr3R 13421913 5' - R1A1-element 5024 1 76.24 GTAGTTAACATTCTTGTAATTAAACTATACAAATTACGTGAAAGTTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAG:1 + chrX 6912874 5' + invader2 4728 1 55.45 AACAANAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr3L 22920399 5' - 1360 3337 1 67.33 TCTTTCCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chr3L 13364547 5' - hopper 1370 1 66.34 CCCACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2R 4502433 5' - roo 9036 1 62.38 TTCGTGCTCGGAAAACCCTAATTTCTAGCACTAATTTAGGATGGGATTGTAGTAAAATCAAATTAATTGTGATAAATTAATTAAATTAATAAATAAATTAA:1 - chr2R 13284201 5' + flea 4983 2 67.33 CCCAAAAGCAGACCGTGTTTTGCCCCCAACTCGGCTAATCTGTATGCTGAATCTCCATCTTCTGTCTTTTATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTG:1 - chr3R 8366611 5' + INE-1 112 1 39.60 CGGAAGGTCTTCAAATGATGGCCGCTCTCCGAGAACGTAGTAAAGAACTTGTATGCAGAAGACATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTTAGCATTC:1 - chr3L 21430618 5' - Stalker 7046 4 55.45 AAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAG:1 - chr3L 23678153 5' + Osvaldo 20 1 72.28 AGATTTGTCATAATTCTGGGCTAATAACAGATCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chrX 4890009 5' + 297 2 2 78.00 ATGAAATTAGATTTATCTCTTCATTAAATGTATATAGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 - chr3R 19114260 5' - 297 6941 2 68.69 CTCTCNACTCGGCTGCCTGCACTTGACTTCCAGTTAATCCACACAACTTTTCCAGCATCTCAAGACGTGGGAGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 - chr2R 10931096 5' - gypsy3 424 4 61.46 AAAAANAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAA:1 + chr3R 9254926 5' + F-element 231 1 62.38 AAATAAGTCAAAAACAGGATGGCTCTATGGCTCTATGATTATTAATTGGTTTATATGTATACTGCGACCCAGTCTGATCTATTGTACTACCCC:1 + chr2L 21268661 5' - baggins 5394 1 58.06 TAATGCTGCTAATGGCGGACCATTGTCGAGCGGAAATGCCGGTTGGTACTCAGTTTCGTTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAG:1 - chrX 7400379 5' + Max-element 447 1 53.47 GGACCTAGTTCAGTGCATCTATACCAGTTTTAGTTTTCAGCGTCCTGCGGAAAAAAATTGCATTTATCGCACTTAACACGCAAACCAAATAATGTTCCTAG:1 - chr3L 6527438 5' + TART-B 10342 1 54.46 CGACAGTACTTTAAGATTTAAATAGTGCCCTTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCAC:1 - chr3L 8063125 5' + P-element 272 1 34.65 AAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGGGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3R 7993854 5' + Doc 25 1 53.47 CAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTC:1 - chr3L 19350006 5' + 1360 3219 1 42.57 TAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr2L 11065893 5' - P-element 2831 1 25.74 AAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3L 7808490 5' + jockey 36 1 56.44 ATAAACATTCGAGGAGATGAACTGAAAATGGATATTTCACACATTCTCAGTGGCACAGCAAATAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGA:1 + chrX 7303260 5' - Ivk 40 1 68.00 CAAAAACAGACGACAAATGACAAAAAGGGGAAGGCGAAAATACAAAAAAAAGAAAAAAAAAA:1 + chr3L 5204240 5' + G2 3075 1 79.03 TACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGAT:1 + chr3L 5716899 5' - copia 5071 2 83.17 GCAGGAATTTTTGGCCATAAAAAAACCCTGGGACCTCATATATTCTAGATCAGGATCAGTACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCTCCGTAACTCAAACGTCGA:1 + chr4 591547 5' - R1A1-element 5049 1 59.41 AGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 - chrX 10653615 5' + jockey 24 1 62.38 AAAATNGGTTGTGTTGTGACGATGTAGTTGTATTTAAAATACGTTTTTGTAGATAAATACGCAGTCTTGGGTTCAATGCAACTTTTCGGCCAGGTTTCTTT:1 - chr4 903783 5' - Bari2 417 1 61.39 AATAAAAAGGAAAATCTCGAGGTTAGCGGAGGCAGCGGAGCAATGAGAAAAGCAACAAACAAAAAATACATACAGTATAATTCGCTTCGCTGCCTCGAG:1 + chr2L 16686519 5' - pogo 2095 1 65.66 AAAATTCTCAAACATTAGCCAAAACCAAACAAATTGCGTGCCATAAATAAAAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGAGA:1 - chr3R 9599337 5' + jockey 4968 1 57.43 AACGCCCCTGCGACCACTGGAAATGTTAGTGACCCAAATTGGGTTTGCATAACCGACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTAGCAGAAGCTAAAGGAA:1 - chr2R 8243998 5' + mdg1 471 1 57.00 AAACGCTTTGGATTGGTATTTGGTGGCTTTATTTGTTTGTTGCTGTTCACTATTATTGTGCAGCGCGCGAGTCCGAAGTGTTTTCAAAGAAAACCCGATTA:1 + chr3L 1670381 5' - gypsy10 436 1 69.31 TTTTANGAATTGCCCCTGTGCGTATGCAATAGAAAATATTTAAAGTGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCC:1 - chrX 8364684 5' + jockey 4757 1 77.23 TTAATTAACGGGATGACAAAGTCAGTTTCGAAGATAAATAGAAATTATAATTTAATAGTCCTACCTTTATAGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chrX 9248259 5' + pogo 4 1 73.27 GCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chrX 21668894 5' + pogo 50 1 77.23 TCTGAAAAGTATGCTTTAAATTGGAGAAAAACCAGAGAAACTAAGAAATACCTACTTTTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAA:1 + chr2R 15004750 5' - BS 5073 1 52.48 CAGTTGGTATCCAAGGAGCCATAGGATATCCCTTGAGTGGCATGATTCAAGCGTTGTCCAACTTCATTTCAATATCCGATTCTGAAATGGAATCGTCTTA:1 - chr3L 6242132 5' - Bica 4534 1 70.00 CTTCCAAATAGTCGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 + chr2L 8031257 5' - P-element 2849 1 42.57 CAGTGCATTTTATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 20466733 5' + roo 5 2 76.24 AAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGCTGAAAATATGTATGTAATATGTATGTATATATAATAATATGTAA:1 - chr2L 21570256 5' + Dm88 4386 2 55.45 ATTAATGGGGGAGGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 21978185 5' + roo 10 2 69.31 ACATCCATTTATAATCGCCGGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTC:1 - chr2R 19857431 5' + 297 6580 1 69.31 TTCCATTATGCTACTGGGAAATAAATAAGTCTGTAATAGAAATGATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGCCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3L 17698185 5' - 412 458 2 54.08 ACATCACTACTACGAGAGCAGTAGTGGCTATAATGGAGTCAGCTATTTCGACAAGATTCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr2L 9612205 5' - 1360 3371 1 57.43 TGTGCAACAATATTCGCATTAATTGTGCGACTCTAATGATGCGCGGTCTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACAT:1 + chrX 21474412 5' + 1731 4344 2 67.33 AATTATCAGAAAGACGCAAAATTTAAAACAAACTAAGTAAGCTAGCCAAAACAGTGACTTAGTGCTCACTTCTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCA:1 + chr3R 15157574 5' + invader3 8 2 70.30 GTGAGGAACTTCTTCAATTTGGTAAGACATGAACATGGAAATGTAATAGATTTGGTTTTGGAGCTCAGAGCCTCTGCTCTGTTTGAATCGGTTTATTCGAA:1 - chr3L 17423651 5' - Stalker 7188 4 60.40 GTTAANCCAAATTCCCTTTGACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAAC:1 - chrX 17064848 5' + Tirant 4 2 70.30 GTTATCATAGACCAAGATTGATGGGCCAGCGAGTGGCAGGTGACTTGGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGT:2 - chr2L 11686107 5' - hopper 1414 2 75.25 TAATACTATTATTATTATTATTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 + chr2R 11367658 5' + 412 54 2 79.21 AAATTATTTAGAATACTCTTCGCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2L 19642938 5' - 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chrX 19734602 5' - Doc4-element 485 1 67.68 GGTGCGAAAAAATTATGGGGCATCCTCCAGCGATGAAAACGTCTCCTCCAGCACACCAACGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAATCAGCTTCG:1 - chrX 20478728 5' - R1A1-element 497 1 81.19 TCAAACAGTCGTACCGTGTGGTGGCGGGCTACGAATACTACCTCAGCGTTCCCAACTTATCTTAATGGCGACTAAAGGGTGGAAGGCGGAGCCCTC:1 - chrY 342870 5' + Rt1b 4904 1 70.83 ATTTGTGGGCAACAAAAGTCGAAAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chrX 4488856 5' - 412 7526 2 60.40 TCATACCTGACAGCAAGTACCATTTATACCAACATATGTATGTTGAATACTTTAAAACAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 21708594 5' + roo 17 2 62.38 GGGTGCAATGTTGTTATGGGGTTGATTAGTTTTTTTTTATATTGTACGTACATGTCATATTTTTTGAAGATGAAATCTGATAGGTGACGTCCCCCATTCTC:1 + chr4 1081113 5' - mariner2 755 1 71.29 TGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 - chr3R 18507875 5' + jockey 13 1 62.34 ATCTACAACTATCCTGCTATAATAACTATATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACGC:1 - chrX 15602809 5' + 1360 3201 1 74.26 ATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCACTT:1 + chr3R 27080712 5' - 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297 287 2 74.26 ACGTACACACATGCCAATGCCAATCCTACCCCCTCCCCCCCCCCC:1 - chr2L 2894609 5' + accord2 224 1 82.22 GGTGGCGAGGCTGTCACCATCGCCAGCTCGCCGTCCATGCATCTGCGAGATACATTAGACAGTTTGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAAT:1 - chr2R 11609424 5' + FB 12 1 67.33 ATAATACTATTATTATTATTATTGTGTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr2R 11367660 5' + 412 53 2 78.22 CGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACC:1 + chr3L 25889020 5' + gypsy8 315 1 73.27 TGAAGCTATATACATATGTATATGTATGTATGTAGTATATCCACGTGACTGTATCCATGTACATATGTACATCCATACATTGGCTTGGCACTAGGCAGCCA:1 + chr2R 10250236 5' - 1360 3349 1 75.25 AACAGCGATGGGGAAAAAGGCGCTGCTGCCGAAGTCGATCTGACAACAGAAACAACCGCAAGAGAGCAGTCTGCACGCTGAAAAATTTAGATTTTGTGTGG:1 + chr2R 5999670 5' - Cr1a 319 1 56.44 TATAGCCAGGGAAAAAGTTATTACTCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr2R 8378694 5' - pogo 2095 1 73.27 CCGCGAACCTTGACCGCAGCCATGTGTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - 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chr2L 21067294 5' - F-element 4272 1 69.31 CTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGGGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chr3R 7360335 5' + jockey 62 1 81.63 GTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chr3L 21841336 5' + P-element 58 1 23.76 TCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr3R 9479455 5' - mdg1 377 2 68.32 AAGTGCGTCCTTATCTTCTCCATATTGTGTTTCACTGGACTGGTAAAATAAGTATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAAT:1 - chr3L 22782328 5' + F-element 4476 1 60.61 CTGGCAAAAGCAATGAGATAGACACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 2920929 5' - hobo 2920 1 67.69 ACATAACTGTTCTTTAAGGGGCTCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3L 5975577 5' + hobo 17 1 63.37 GGGCGAGGAACAAAATGAGGGCGCAGTGGAGCTCTTTGGCCTAAAGTTGAACTCCAAGGAAGTGCTCGAGTGCTGGTTTATCTCGTCAAATACCGTTGCGA:1 - chr3R 7473594 5' - X-element 4375 1 66.34 ATTAAGCTGGCCCCAGTGAATAAACACCAGTTGACCCACATCAAGTGATGCAATTGGCGATGCTGA:1 + chr3R 19146622 5' + Juan 138 1 62.12 GTAAANATCTACCCTTTTTCTGAAACTAAAATACTGTCTAGATGAATAGAGGGTAAAAACGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAAT:1 - chr2L 16068570 5' - roo 315 2 63.37 ACATCAAAAAGAGTAGAGAATTTTCTTCAGTGTATTACCAAGTACTTTCACTGAGCGCAGAGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAA:1 - chr3R 20510788 5' + Idefix 7102 2 66.34 ACACATGGAAAGGGTTCCCGGAAGTACATGTTTCTTAATTACCGAAAACTATATTAGAATAATGCTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATC:1 + chrX 4487680 5' + 412 487 2 72.00 TAGCTCCGAAAATAGCTTTCTTCGAAGCGTGCCAAAATCTGTTTGTCTTCTTGTTAGCATATCTCACACTGTGACTGTAGAATTCGTTGTCTACCCATGGA:1 + chr3L 21362765 5' - G2 2804 1 63.37 AGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 + chr2L 15333715 5' + P-element 28 1 46.53 GTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chr3R 31812703 5' - P-element 2833 1 29.70 GTGCTGAACATTCGGTTGACATTGTTAAATTTAAATCTTTAAAAATTCGCGCCAATATTATTATTAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCG:1 + chr2R 649487 5' - 1360 2994 1 65.35 AGGAGGTGAGGGGCAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:2 + chr3R 10457259 5' - roo 390 2 60.40 AATTTAAAATGTTCATTACATAAAATTTGCCGAAAATGCAGACCTATTGTCATCCGGGTCGGATGATGATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAA:1 + chr2L 21089121 5' + flea 4750 1 77.23 AATAAAGGAGAAAATGCTCTTCAAGATTGTTTGAGAGCCAAACCTGGAAGCGCTCACATTTCTTATATCCGGCAGATATAAACAAAAACAACAAAATTATT:1 - chr3R 4545749 5' + gypsy11 3935 1 75.25 AAAGTTTTAATTTAATTAAAGTAATTTATTAGAGTCTTCTCAGATTATAAAAACGAACTAAAAAATAAGAGAGATGCTATAGTCGACTTTCCCGACTATCA:1 + chr3R 4510889 5' - INE-1 563 1 53.47 GATCCNAATCAGGGTTGCTCGCCTTGTATTTGGTTATTAATAGTGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATG:1 - chr2L 5706388 5' - Idefix 5 2 65.35 GGAGGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTGTTAAAATTC:1 + chr2L 10291527 5' + jockey 4798 1 63.00 GAAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr2R 21379499 5' - P-element 2847 1 39.60 GGAACCACATTGATTATTCACTCCCTTTGGAGTTCTGATAAAATGGGGTTTCTTTTTCACTGCTGTGGAAGTTTATTGGTCTCCCAGTGGGAAAACTTTTA:1 + chr3R 1585264 5' - G5A 2564 1 61.39 CAAAAGTCGAAAAACTGTTGACAACATGATGATGGTGATGATTCAGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chrX 4488868 5' - 412 7514 2 55.45 GTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 + chr3R 15998080 5' + pogo 42 1 73.27 AAAAATCAAATTACTCAGCGCCAACGTCTGCGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGT:1 + chr3L 22796905 5' - R2-element 3398 1 70.30 CAAAATTTCGTCAAGCCCTATTTGCTTGTTAAAGCTGCAAGACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 - chrX 14796919 5' - transib2 2791 1 58.42 CTCTCGGGCGGATAAATAGCTCCCCGAAACAATCCACAAGACCAAGTTTAATGCTTTTTTTGTCGCCCCAACCGCGGAAAACAAAGTTCTTCGCACTATGT:1 + chrX 21571529 5' - R1A1-element 27 1 73.27 ACAACTCACTTAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:1 - chr3R 27080800 5' + HMS-Beagle 25 2 54.46 ATATGAAGTCTGTGCTTTGCCACTTTTCGGGAGTAAGAGGCGCTCTCGCGCAGATCAAGTATACAATCCACTAACCCAGTACATCTAAGATTTTCTCACAC:1 - chr2R 4449807 5' + Tom1 252 1 69.31 GGTTCATTACCGGCCGGCGGATGGGTTCTGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3R 27189240 5' + roo 8674 2 68.32 AAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chrX 7787297 5' + roo 38 2 61.39 TCAAACAAATGGTAATGATTATTAGCACTTCACCTATTAGGTTGGTTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 3276390 5' - gypsy7 5011 1 57.38 ACATGTGTATGTGTATGTTTGCTCATTTGCGACGCTATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 - chr2L 7994502 5' + jockey 4780 1 57.43 GCTAAATATTTGATTAGTAGCAGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3R 31884228 5' - hobo 2893 1 77.23 GATACAGATGCAGATACAGATACCGATATAGATACAGATACATTGACTGTTCGTCGCAAAACATACTTGTATTAATTACTCTACCAGACCACAAGGCTGGT:1 + chr3R 21440998 5' + Gypsy6A_LTR 250 1 56.44 TATGTTAATATAAATTAGTTAAGTTCCGCATGTATATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTA:1 - chr3L 19881821 5' + Idefix 36 2 74.26 GATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr2R 10912114 5' + 412 51 2 76.77 TTTCTCTCAATATAGGGTATTAGCAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTT:1 - chr3R 10741137 5' + 1360 3370 1 46.53 ATATTAGCTTGGCTAAAAGCGACATCAATGGAATTCTTGACTAAATTAGCCAAGTCTCATCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGG:1 - chr2L 6296831 5' + F-element 4267 1 72.28 CGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr2R 8378665 5' + pogo 35 1 64.36 ATTTTTTTGTTTTGAACCTTCAATTCCTTACTTATTTTGTGCAAGAAAAAAGAAAGAGAACAAAATGTGAGAAAGATTTTTTAAACCTATTCAGTTGAGCG:1 + chr3R 4576562 5' - Tc3 7 1 52.48 TTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTAC:1 - chr2L 23373498 5' - Tc1-2 1578 1 69.31 CTGGTGGGGCAGTGACGGCGGTGGAACGTGATGTCCATGACCGTGCCCAGAGTAGGGCGGAGTATTGGAGAAGAGGCAGCAGAATCGAGGAATAAAGTTTA:1 + chr3R 21085767 5' - hopper2 289 1 69.31 ATCTCNCCTGCTCGCCTGCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTG:1 + chr3L 2800103 5' - blood 7382 2 69.31 CAGACTACATACGTCGCGCGATAATGCTTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:1 + chr3R 29350682 5' + opus 7 2 72.28 CTGAGCCTTTCCCGGCCTGAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCA:1 + chr3R 11165626 5' + Tabor 6859 2 63.37 ATTTGTTAAAGTTTCTTAAATCAAATCAAATAAAGCAGGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:2 - chrX 20974921 5' + opus 36 4 61.39 TATTCGGAATAGAATTTCGGCTGCAGGTTACATAAGATCTGGGTAGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr3L 7806158 5' - pogo 2073 1 53.47 CCTCGCGGTCTCCGATTTGTTTATTTCTTATTTTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATAACAAGTATTTTTTG:1 - chr2R 23967714 5' - F-element 4605 1 68.32 GGATGTATTTTTTGCGTGAAAGTGCATTTTTGTGCACATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACG:1 + chr3R 19565026 5' - F-element 4365 1 63.37 ATGACAAATTTATTCACGCTGTCACTTGGTCGCCTGTTCCTCCGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTC:1 + chr2L 1471215 5' + F-element 4227 1 57.43 GAGTAAGGTAAACGCCAAGAATGGTGGTCGGTGGTCAGCTGTAGTGAATGGTGGTCGGTCGGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chr3R 19837005 5' - P-element 2872 1 65.35 AAAGCTGTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr2L 2437692 5' + roo 16 2 61.39 AGATAAGTACTACTGCTTTTAATCAGAAAACTACTTGCGGAGAATAAATAAAATATAAAAAAATCTATAAAATTCAAGAAAATAAATAATAAACATTAATA:1 + chr2L 7029285 5' + flea 4998 2 43.56 CTGGTGTTTAATTAATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 + chrX 6605482 5' - opus 7466 2 62.38 GTCAGAAATGGCAACTAAATAAGAGAATATGCAAAGGAAGTTGGCCCTGGAATTCAGCGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAA:1 + chr3R 19449266 5' + I-element 4880 1 66.30 GTTGGGGACCCTCTTAAAAAGCGACCCATATCCTTTGCCAGACGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGT:1 - chr3R 25702258 5' - Tirant 371 2 54.46 AATGGAACCGACGACGAGAACTTCACTGGCGAGCGAGAACCTCCAACATATTAGTAGTCTGAAATCTGACATCATTTCGAGACCCATTTTAAGCAGCGGCG:1 - chr3L 15068918 5' + gypsy4 6404 1 65.35 GCCAGGATAACGCGAGTTGTGTAGCACACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTTAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 29660252 5' - mdg1 371 2 74.26 TTTTTAGTAATCATACTCTTTCAAGAATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 12571547 5' - roo 9046 1 56.44 ACAAGNGCTTAATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chrX 19095810 5' - roo 9042 1 55.45 AAAATGTATGCAATACTAAGAACATTGAGATCTTGAAAAGTATTAAAGCTTGGATACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATC:1 + chr2L 19364079 5' + BS 4783 1 46.53 GTTTGAAATAACTTAGCTAAATGATCGTCGAAAGTGCATTTGCGTAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr2R 5784398 5' - 297 6949 2 55.45 GAATTGGTACTTTTAGAGCAATATCCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGT:1 - chr2R 21140673 5' + Stalker 51 4 75.25 CCACANAATTGTCACAGAAGCTCTTTATTCCAGCCAGCTTAACATCAGCAACGTTTCCCTTGTAGTTAATTTCAAACAATCAACAAATGTTTCACTTTTAT:1 - chr4 1075354 5' - HB 1502 1 70.30 TGTTTCAAATTGAAATATAAACTTCCTGGTGTTTAATTAATATTGCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTT:1 + chrX 6605457 5' - opus 488 2 67.33 GCCCGTACGAGGGTGCTGTTGCGCCGAGTGCTGTCGTCAAAGTGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACTCAGCAACGGAGAGACGTTCTCCCACCG:1 + chr2L 6961001 5' + gypsy6 7691 4 58.42 CCCAGCGGCAATTCGGTGTCTGAGATGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTTACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATAT:1 + chr2R 20748624 5' - copia 4922 2 74.26 TATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCA:1 + chr3R 28755958 5' + 3S18 53 2 74.26 GAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGA:1 - chr3R 1868227 5' + G-element 27 1 53.47 ATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr3R 14639389 5' - roo 355 2 78.22 GGCGAGTGGAGGAGAGGAGATGGGGACATCATGACGGGGGCAAAAGTTAGAGCCGTTTAATTATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAAT:1 + chr2R 16822156 5' + F-element 4591 1 52.48 ATATTGAATGCTTTAATTATTATCGATTTTTCCGTTATTTTTGGCTTTGCATTGCTTTTTACAACGCTTCTATTGAAATTTGTTGACTTTGCTTGTGAAAT:1 + chr3R 6624214 5' + S-element 337 1 78.22 TAGTAGTCATATTTATTGATTATGAAAATCAATTTGTTATGAAAATCAATTTGTTAAGTTTCAACTTTAAAAACCTTTTTTTTTTCATTATATAAATAATA:1 - chr2L 15635134 5' + P-element 2488 1 60.40 TGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGT:1 + chr3L 27356068 5' - Tc3 1694 1 78.22 ACGTACATGTTGCAGTGTGTTGTGCCACATTTCGCGAAAGCGGCAGAAACGGCAACAGCAACAATGGGCCACAAATATTTGAAATATAACCTAAGAACTGA:1 - chr2R 11064108 5' + Rt1a 357 1 78.22 GAAAAAGAGGTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:2 + chr2L 8740867 5' + Burdock 19 2 60.40 CGGCTGCTCCCGGTCCCACTGGTATCGACGGAAGCGGAAGCGGCAACAATAGCAGCGAGCAGAGACGCTAATGTAGCCGCCGACAACGTGCCCAGCAGCAG:1 - chr3R 15066957 5' + G-element 497 1 56.44 GCTAATCCCCCGAAACTTTCCCCAAAACAACAAAAACAAACACATATAACAAATAGGTTTTTTGATAAGCGTCAGCTTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGA:1 - chr3L 17560858 5' - X-element 4524 1 66.34 TACTTTTCGTGACCTTGTCACCCCATAAACTTTTTATGTAGCATCCGTTTTAATATGTTTATGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTC:1 - chr3R 22089861 5' - F-element 25 1 66.34 CTAATTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATTATGAAAGTTAATAAAATTATTTGCACACTGTACCCTCTAATAAATCGTAAATCTAAATTATCAATA:1 - chr2R 21848610 5' + Juan 3746 1 70.30 TAAAGTATATCGTTAAGTCTTGGCACTTATTCTACGCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chrX 2762103 5' - roo 396 1 64.65 CATTAAACGAAACTAATAGATGAAATATGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGAGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGG:1 - chr3L 8087635 5' + BS 58 1 74.26 AAAAACTCCAAACAAAAGCAGGCAGAAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 - chr3R 29469099 5' - hobo 2888 1 72.28 ATCAACACTGCCAGCTACCAAAGACCATGACAATAAATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 27189350 5' - roo 396 1 64.36 GTTTGTGTAGCGTTGCGTTATAATTTATTTTAAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTA:1 + chr3L 21003013 5' - P-element 60 1 37.62 GCAGCAAGCTGACTTTTTTTTGGGAGATGTCGGTCTAAGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTT:1 - chr2L 22213131 5' - I-element 5167 1 62.38 AAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 10457294 5' - roo 355 2 79.00 TATGCCCTATCTGATGAGCCCACAATCTGTAAAATAAAGCAGCAGCCACTCCACCACCTGCCTCCCGATGTCCATACGTTATACATATACATGTGTATACA:2 + chr3R 22066723 5' - Stalker2 7497 2 68.32 TGCATCCTCGCGCGATCCCTTCTTGATCTTCTTTACGGCCACAATTTGGTTGGTCACCGTGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGAC:1 + chrX 5308671 5' - HMS-Beagle 6844 2 66.34 GCTGCCTAACACTGGCACTAGAACAAAAGCTTTGGCGAAAGCTGCGCTGGCAGCTCGTCCATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 + chr3L 11070482 5' - P-element 2871 1 63.37 AAAATNATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTA:1 + chr3R 21695439 5' + 3S18 35 2 58.42 TAGGTCACCTTTTTAAATAAGACACAAAAGAGGCGAAAAGTGTGCTTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCG:1 + chr3L 15942730 5' - R1A1-element 4864 1 61.39 AAAGCTAAGAAAGCGACGTCTGATACGATGAATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3R 9837631 5' + 412 7098 2 67.33 TTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGAGCCACTTTGTGGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTTTAAAGTAACTTTACTACATTAACATAACAATCAC:1 + chr3L 19457486 5' - X-element 4582 1 56.44 ATTCCAATTTCGATACGATTTAATCGGCACTCCAGAGTTGACACCCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr3L 958745 5' - P-element 2858 1 48.51 AAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCG:1 + chr2L 15956026 5' + Max-element 8259 2 55.45 CAGTGTCCAATGCATCTGCATCCCCGTCGATTTCCGATTTCCAGCTTTTTGCAACTTAACCAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATA:2 - chr2L 19679785 5' + Doc 36 1 52.48 GGCAGGAGCGTCTTTGGTCTTAGCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCC:1 - chr2R 6487173 5' - 1360 3332 1 78.22 CCGGAGTAGGGTGCTCTTTCTTGGGGCACGGCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACG:1 - chr2L 19486169 5' - F-element 268 1 69.31 AGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chrX 19457198 5' + roo 48 2 75.25 AGTCTCTTCCGCTTTTAAAGTGTGCTGCAAGTTGCAACATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAG:1 + chrX 22859844 5' - F-element 4356 1 60.00 CAAACTATTGTTACTCAGAGGAATGTGCCGCAGAGTCAAGCATTGCGACAATAGCAGAGAAGAAAGTAAAATACAATGAAAAACTAGCCTCACATCAAAAT:1 - chr3L 240050 5' + Doc3-element 4512 1 60.40 ACTAACTTTTTTGCACACCCATGTTCATGTACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 - chr2L 19075714 5' - Transpac 5185 2 69.31 CTCTTGAGCCAGGGCTGGCAACTCCTCTCTCGAGCCATAAAGTAACCAACTTGTCTCCAAATAGTTTAAATACTTCCAGCCAAAACTAGTTTTTGCTTCAA:1 + chrX 22575260 5' + Transib5 100 1 76.24 AAAAAAGTACAAACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGC:1 + chr2L 20928049 5' + Chimpo 9 1 67.33 CTCGCTCAGCTGATAAATCGAAGAAGAAGAAGAAGCGGGTCTCTAGGTGAGTGACTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTA:1 + chr2R 7745622 5' - 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chr3L 6719318 5' + F-element 341 1 83.17 AGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACA:1 - chrX 8948681 5' + blood 7043 2 56.44 ATCAGTTGCCGATGCCTTTGGTGTCTGCATATTTTTTTTTTTATTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGG:1 + chr3R 1167806 5' - Rt1a 5025 1 68.69 TCTCACGATCATTATCTTGGACTCGGAATTGGAGTGCGCCATTTGGCGGCTAAATGAAGAGGCTGCCGCAATGGGGCATCTACTTCGGCCTTGCATTCATT:1 + chr2L 11387174 5' - Chouto 5951 1 77.23 GTCGTTTGTTTTTGTTTTCCTTCCTTCTTCAAATTTTTTTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTTTTTACTATGTTTTGCTATTTCTTCTTTAACAT:1 - chr3L 17146611 5' - G4 3577 1 63.37 GTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGAGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAA:1 + chr2R 22475977 5' + 1360 3252 1 66.00 ACCATGCATCATCCGTCGTCCAAGATTGTCCGAAAAAGAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 11785333 5' + Doc2-element 221 2 86.54 ATTAATGAACGCGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 + chr2L 11065867 5' - P-element 2857 1 51.49 GCAGACATTTGAAATACGTACACATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGC:1 - 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P-element 2854 1 48.51 ACCCATTTAAGAATATATCCAATCTATAATATTCGGGCTATGTATGTACATATATGATAGTCTTCCATTTTACTCACTAAACTTAAATACTACAATGATTT:1 - chrX 23011775 5' - Tc1 1549 1 71.29 ACTAGCGATATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAAGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCACA:1 - chr2R 4193334 5' + 1360 3178 1 69.31 AGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCT:1 - chr3R 27080788 5' + HMS-Beagle 6831 2 63.64 CAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTAC:1 + chr2L 15956040 5' + Max-element 8273 2 62.38 TATATTTCCTTACTTTCCACCCAGCTGCTACCGGAGCGACCGACATTTTGCAGTACGCCACGCCAGTAGGTAGCACACGGGGATTAACGCGCCACCAACGG:1 - chr3L 6061734 5' + baggins 28 1 55.45 ACATAACGAGGTGACTTTACCCATAGCCAGGTTCTCATTTTCAATTTTCCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 - chr3R 11496892 5' + Doc 33 1 52.48 AAATATTGGTATTGCATATGAAATGCGTTCTGAGCTCGGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr2R 23495440 5' - 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I-element 5313 1 67.33 TTTGACTGCCCTTTTTGCTATCCGTGCTCTTGTAGAAATTGTTAACAAAACTGTAGATTTATGCAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 21383952 5' + roo 8677 2 66.34 AACTTTCAGCATTAATCACAAAGAGAATAAACAGGCATAATTTCATTTCGTTGTATATGGTCTGTTGCAAAGTTCGTTGCATGATTTTATTTTATTTTATT:1 - chr3R 7574907 5' + transib1 1896 1 81.19 TCTGGTGTCTTTTATTTGAGCCCCGCCCTCAAAATAAATAGCTTGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCT:1 + chr3L 9192549 5' + I-element 36 1 55.45 AGATAGTTTTCGGTGTCTAAATATGCATTTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAG:1 + chr3R 25621077 5' - F-element 4343 1 71.29 ATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chrX 10653606 5' + jockey 33 1 53.47 TCGAATTACGGATTTCAAACCGCACGGATGACGACGACTCGACGACGCTGGCCCTTCCAAACCGAAATTTCGAAGTCGTATTGTTGCAGCTCCAGCGCCCA:1 + chr2L 19229899 5' - Osvaldo 173 1 53.47 CGTCTGTACTATCACCTCGACTTCCTGAAAAAACAGAAGTTCACTTTAGTAAACTGCACAACTGTACAAATGTGGGTGTCGGAGGTTTGGGCGGTTTTAGG:1 - chr2R 9146648 5' - INE-1 349 1 72.28 GATTAAATATACATCAGTCAAGCGCAAGGATCCTAATTTCCAGCAGTATTGTCCTTTTCCAAATTGAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTA:1 + chr2R 11174649 5' + Transpac 5087 2 51.49 AGCACAATGTACCAGAGGTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 19642969 5' - roo 9047 1 54.17 ACAGATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chrX 329085 5' - opus 474 2 55.45 ACTTAATCAAAATGTTCAACAATAACGCAGACTTCGACTGTTAAACCAAAGACCCTACAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:2 + chr3L 22920382 5' + 1360 34 1 59.41 AGGAGGGACTCCAGCAGCCCTTTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACA:1 - chr3R 29304860 5' + hobo 80 1 78.22 GTATGAAGAATAAAGTGTGGAATAAGCATAAAATAGACTTGGCTCTGGAGCTCAGAGCTTCTGCCCTGCTTGAAACGGTTTATTCGAATAATCAAAGTGTG:1 + chrX 3673320 5' - Stalker4 326 4 71.29 GACATCTTTGTTAGGCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chrX 19306791 5' - P-element 2829 1 23.00 AATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCCTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCTT:1 - chr3R 6431068 5' + 3S18 57 2 78.22 TTTATTATTTACAGTATTTCCCCTCACACACGAATTCTATTCGAGTGATTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCT:1 - chr3R 24437649 5' + hopper 147 120 74.29 ATTCACTACCTCTGTCCTGCACTGAGAGAAACTCCAGCTATAGTTGCCAAAAAAAAAATAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTTGTCCAA:1 - chr3R 9169712 5' + 297 6583 2 75.00 CTGACCTAATTAGATAAGCGAGAAAACAAAGATTTCAATAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAA:2 - chr2R 21848615 5' - Juan 4179 1 64.36 GATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTATGTTCACACATGAACACGAATATTTTTAAATACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chrX 19457203 5' + roo 42 2 70.00 AAAAAGGCCAAGTGAGTTGATGACCATGCCCACTTTAACGCCCACAAGCCGCACAAAACTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAAAACCGCCCAAAACTGCC:1 - chr3L 21301756 5' + INE-1 349 1 78.22 GTGGCCAGATAGATATACCAAGTGCGAAACGGGTTTTGGTGAAACACAGGCAACTAAGGTTTATAGCGACAACCAGAGTTCCCAGTGCTTAGTGAAAAATG:1 - chr2R 20395430 5' + Dm88 4082 1 74.26 CGGTCTTTATTCGTGCGTAGTTAATAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGA:1 - chr3R 3526161 5' + invader2 4706 1 75.25 GAGCCAAGCGGAACGACCAGAAGTTGGAGGAGGAGGTACGACTCCAAGGATTTCTCATTGGGCCATCGTGACTTATTCATTTTTCACACGTCGCAAGCTGA:1 + chr3R 27131254 5' - 1360 422 1 78.22 GAAATAATATAATTCAGAAATCGGCATCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chrX 18199566 5' + 412 51 2 76.24 GAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGC:1 + chr3L 18576720 5' + springer 42 2 70.30 GGCCAGATATCCACACAAATATGTTGCCTACTTATCGGCTGTCGCTAATTTATGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 + chr3R 29466278 5' - hobo 2916 1 53.47 GTGTCACAAGCTATAGTTTCGATCGCATTTAACTGGCACTAGCACGTGAAATATTTTAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTATTTAGCAAACTTAAGGCTA:1 + chr2L 22342324 5' - G4 3646 1 66.34 AGGTATAAGTAAATGATTAGAGTTTTACACTTTGTTGGTCGCTGAAGGACAAACTTGAAAAATCCAGGATATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTG:1 + chr2R 6436562 5' - GATE 263 1 67.33 AAATAAATAATTCATTGAATTTAATAATTTTTTGCCCAAAAACAACGTGCCCAGACACATATGGGCTTACAAATCCTTCCACATTCGGACTTCTCAAAAAT:1 - chr3L 5472310 5' - aurora-element 4087 1 65.35 GAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 9862231 5' - roo 353 2 76.24 AGCCCAATTTAAATATAGCACAGCAAATAAAGAGATAGTAAACTACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 - chr3R 24282017 5' + Max-element 8269 2 58.42 AGATGACCAGCACACGAAAAAGCTTCCCAATATTCCCCAATTCTTTTGACGTCGACTGGTAAGCTAAAAGAAAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 + chrX 22659748 5' - 412 7542 2 72.28 AACTTTAACGAGAGGGCATGTTAAGTAAGCAGCTTGACGCAAAGAATATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTA:1 - chr3L 23869154 5' - gypsy 438 2 52.63 GGTATTTTGGGGACGCATTCCTTCGACAGTAAGAAACTTTGATATGTATGCATAATGTGTAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 - chr3L 13680654 5' + hobo 18 1 62.38 AGGCCACATTTGGCCCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 - chr3L 10811182 5' - P-element 2827 1 21.78 GGAATAACGGATAAACCCCATATCACACCTAGGGAACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr3R 19837081 5' + P-element 39 1 39.60 AAATAGTTTTAGTTATTAAAAAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACATCTCACCGACAATCCCAAAC:1 + chr3L 27182018 5' + F-element 281 1 77.23 CATACAATATAATTATTCTTATAAATGGAAAACCAAGTAACGGAAGAGCGAGAGAATAGGTGCACAGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAAAACAACACAAAA:1 + chr2L 2358743 5' - Cr1a 251 1 60.40 ATGTAAAGTAATTAAAATGTAAACCATATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCA:1 + chr3R 11399514 5' + I-element 4885 1 73.27 ATCTCCCTTCCAAATGGTCGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 + chr2L 8031251 5' - P-element 2855 1 46.53 GTAATNGGGATAACCGTAGTATTGGCTCGCGGGTGGCTGCAGGAAAATGGCGACCAGGAGCAAACCGAACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAA:1 + chr3L 21842248 5' + P-element 382 1 67.33 GCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3R 9952265 5' + Ivk 12 1 66.00 AATTTACGTGACATTTAAGTGCAAGTACCTGTTTTTATACCTCTTACTATTAAAGTAAAAGGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chr3L 25126301 5' + blood 7025 2 65.35 CTGTGCAACCCCTAGTGCTGATGATTTGGCTATTTAAAAACCTAATAATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTATTGATAATATTTAGTTTTAAGAGATGGTC:1 - chr3R 17605388 5' - FB 317 1 62.38 AGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr2L 18112513 5' - transib2 2787 1 62.38 CTTGGGAGGTCTGAGTACTATTTGGTATGGCCTGTCTCTAGAATCTGTATGCTAAATCTAGCTATTATAGTACCTGAGATCTCGACGTTTATACGAACAGA:1 - chrX 22632883 5' - INE-1 130 1 68.32 TCACGGATCAGCAGCTAGCATCTCAGGCTGGGGCAAGACCCCCATTTGGCTGCGCCACTGCAATTATTTATTTTTTCATTTTTTTTATTTTTTTTTTTATT:1 + chr2R 13434655 5' - Rt1a 5078 4 62.38 AGCGGATTCGGGGGACTGAGCATATCCTTCGGCCTTCACTTGCCGTTGACGAGCTAATCTACTGTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 21384057 5' - roo 9056 1 63.37 TTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr2R 10912112 5' + 412 51 2 75.25 TTTTGAAAAAATTACAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr2R 24965059 5' - P-element 2861 1 54.46 ACTTTTCGATTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAA:1 + chr2L 20928061 5' + Chimpo 21 1 55.45 AGATTCTTCTTTCTGATAACGAAACCCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCC:1 + chr3L 5829956 5' - F-element 4287 1 74.26 CTTAGACAAATGTGTCCAATTTTCCGTTGTTTTCCCATTTTTTCTTCCCACTGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 29289649 5' + roo 8687 2 55.56 TTGTGCGAGTTTTTGGCTGACGAGGGGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAAAACACACGCCAAGGGGGCCAAAAGCAAAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAAAA:1 + chrX 8968663 5' + Doc2-element 246 2 71.72 TCACATATATATCTTGTCTAACATATTTCACCACGGGAACAGGTTCCCTTGGTGTTATCCTCTCTTTGATTTGCGCATGCTCAGCATTCCCACACTCCGCG:1 - chr4 904676 5' - Stalker 185 4 81.19 ATCACNACGGATCCTGTGGAACTATGGGCAGGCGAGGAAAGTCAGACGAGGATCGAGAAGGACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATG:1 + chrX 20935994 5' - F-element 231 1 61.39 ATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 - chr2R 14381358 5' + hobo 19 1 58.16 AGTTAGAAAAGTGTTCTCGCAGATTTCTGTTTTGTTATTATTTTTTTACATATTGATGAAAAAACCTATGAATAAATAGATATTAATAAAAAAAATTCATT:1 + chr3L 19940967 5' + S2 1627 1 72.28 TAGCTGAGTTTATGATAATTATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 19657472 5' - roo 9017 2 78.22 GCCCGNAACCGAAGTGAAAGCATAATGAAAGCAAAGCAGCAGACGATAGCAAAAAACGATGGAGGAGGGGCGGAGGGGCTGAAACAACACAGCTTAGAAAT:1 + chr3L 9288478 5' - jockey 193 1 51.49 TTATACACTTAAGTGTGCTGAGAAAAAGTCGATAAATATACAAATGGTTGTATGTGCATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTAACAGGTAGGGTGGGTATA:1 + chrX 16408540 5' + Circe 7192 1 67.33 TTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTC:1 - chr3R 1868200 5' + G-element 54 1 73.27 TTTACGTTACATAAATTTTTGCCTGTTGCCCTTCCTTCGTTCGCTTTTTGCATTTCGGCAGTCTGGCTGTTAACGTATTGAAGATTTCCGGACTTAAATTA:1 + chr3R 15599712 5' - Transpac 416 1 73.27 ATCATTGGGAAAACATTTAATTTTGCTGTTTTTTTTTTTAA:1 + chr2L 10061422 5' - gypsy11 3931 1 70.73 TGGTTGTGGGCATTTTCTATTAATATTGCTTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 + chr3L 22793948 5' - 412 7511 2 70.30 CTGGACACTGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGC:1 + chr2R 924421 5' + gypsy3 6586 4 68.32 TAAGATATGTACATGCATGCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTG:1 - chr3L 20248348 5' + Transpac 56 2 77.23 ACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 10035649 5' + jockey 56 1 75.26 GCGCTGCATTTTTAAATTGTTCGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAA:2 - chrX 8352227 5' + blood 7065 2 77.23 TGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr3R 27189268 5' + roo 8702 2 65.35 ATCATAGTTTCATTACCGATCATTCCTGGAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr2L 1156828 5' - 412 7537 2 70.30 TATGATATTTTTTCATATTTTTATTAGTCTTGCAAATCAATAGAAATTTACATGACTAATAAAAATGTGAAAAATATCAACACATTTTTCAAAAGTGTGGG:1 + chr2L 21377755 5' - INE-1 257 1 67.33 GGGTCTCCAAATCCGATATATTCTGCATGGTCTGGTGAAGTGCTCGATCCAATTTATCGCAACGTTCCTCCGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAATATTC:1 - chrX 16416497 5' - Max-element 8233 1 76.53 GGTGGACAAATAATCTTGAGAACTATATCAAACACTATATCAAAATAAGTGAAGTATGAGGTCTCGGAGGTCGATAGGGGATAAGACGTCTTGCAAGAAGA:1 + chrX 22726187 5' - Helena 1281 1 55.45 AGATATCTTTTTATTTTGGATTTTGTATATTTACTTATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 + chr3L 16345546 5' + 297 6613 2 71.29 CTGCCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGG:1 - chr2R 5424276 5' + 1360 3356 1 74.26 ACATGATTCTCTTACCAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3R 7993835 5' + Doc 6 1 72.28 TGCTGAATAGGCTGAAATACCAATTGTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAAT:1 - chrX 8031430 5' + roo 8683 2 56.99 GCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chrX 4890046 5' + 297 6621 2 72.28 GCCATTGATGATGGCGATGGGGATGACTCAATTTGTCTTTTGCGGCTTTTATTTAGTTATTTATTTTCCTTCTTTTTTTTT:1 - chr2L 7147821 5' - Doc2-element 250 1 66.67 AAGAGATCTAATTTTTAATCATTAGTCGATATTTGGAGATAAGAAGTGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCAGACCGCATAA:1 - chrX 22576447 5' + Burdock 6328 2 38.61 TACCAAGGGGAAGCGGTGCAGGCACTAGGAATGCAAATTTCCTCCAACTATATAAAGTATATATATTATTGATCAAGATCAATAGCCAAGTCGATCTAGCC:1 - chr3L 14696660 5' + INE-1 101 1 58.42 GTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 + chr3R 12894104 5' + blood 35 2 58.42 ATATGCAAAGCAAAAAGATATCACAACTGTAAATAAACAAATCGAAAAGCCGAGCTGTGAAAAATGAATCATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAG:1 + chr3L 14533326 5' + jockey 4601 1 76.24 CTTTTGAAATCGGTGACCCCGACGTGATGCGAATCAAGTGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGA:1 + chrX 11282564 5' - I-element 5321 1 57.43 AATTTACAACACTGGTTGGTAGCGAGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGTTTTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTG:1 + chr3L 7916029 5' - F-element 334 1 78.22 TAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGACTATTTCTAGTCAATAGTATAGTATATAGATTTAAAGCCAAAGAACTTCTA:1 - chr2R 5260087 5' - 1360 234 1 58.42 ACTGGCAGCAGTACAAAAACAAACGAAAGTGGAAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr2R 16860397 5' - blood 7337 1 67.33 GGAGGCAGTGTTGTTGATAGCAATCAACATCAATTAAAGCAGCTGTCTGTCTTGTTGCTGGCCGTGTAATTATATTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGC:1 + chr2R 18310901 5' - I-element 5059 1 79.21 CTCAAGGAAGGAAGTGTTCAAAATGGGAAAATGTGTTTTATAAAGGGTGAGGCAGCATAACTTCCTTTTTTAAAA:1 - chr3L 16691669 5' + mariner2 12 1 69.33 GGAGAGCGGCCTAGAAAGAATAATCAAAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACA:1 + chr3L 25272523 5' + 1360 13 1 71.29 AGGGGTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chrX 19306749 5' + P-element 29 1 50.50 CCAGTATCCAAGTTCATACCACTTTTTTGTTCCCAATCACACAATATAAAGAAATTGTTACTTGTTCAAAAAGGTATGGTAAATTAAGTAAATAAAAAAAA:1 + chr3L 16808054 5' + X-element 4718 2 56.44 ACTGGTCTATTAACTAATCTTTCCAGCAATTATAGTTTCACTATCAGATCGAGTTGTAAGGTTTACGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAA:1 + chr3R 19805854 5' - Tirant 203 2 64.36 CGGGTGTTTGTGCGCAAACACTTGACAGGGCACAAATACGCGCCGCCTTATCGGGCCGAATATATAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATA:1 + chr3R 5315902 5' - blood 155 2 74.26 TTTTGAATAAAAACTATCTTAAGTGCATCGGTATAATTTTAACTATTCTTCTTATCTAAGTTGTTTTTTACAAAGATTATATGATTAAGAGTATTAAATAA:1 + chrX 22890832 5' - jockey2 3270 1 74.26 CAATTTCTTTCCTCTGGCCACGTTTTTTGTTGTTTCGAATTTCTATAAATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTATGTAAAAGACATCTGCGAAGCT:1 - chr2L 11682472 5' + hopper 383 1 53.00 ACCATAAATATAACATAATAGCTCCTTACTTTTTTAGTCTAGAATTTATGAAATTATTTAATGGAACAACTAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACC:1 + chr2R 12213891 5' + Transpac 4921 2 78.22 TAATGTCTACATGATTTCTAAAAGCTCATGCATATATGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 - chrX 5515805 5' - 297 357 2 72.28 AGCCGGCGCCAGCAACTCATAATTCATTTGTTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATT:1 + chr4 907880 5' - 1360 3346 1 70.30 CACCGTTAGTTGGTCTAGTTGTTCCAATTGTAATGTCTGTACATGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACA:1 + chr3R 14324200 5' + 3S18 37 2 58.42 ATATTCATATTCATTTCGATTTTAAGGCATTTGGTTGTAAAATATGCCAAAGTGAGCATTGCTCCAATTAGATTTGTGAAATTTAAAAATGCCTGGCAAAA:1 - chr2R 8042670 5' + S2 394 1 74.26 TATCTGTTCCTCTTCTACGTGGTCACCATAGTTCTTATTACCTTATCTATTAAGGACCTCCCCTTAGTAATAAAACATTTGCGTGTACTTATGTACGCAGA:1 - chr2L 2817959 5' + Q-element 563 2 69.31 ACCTACCTGACTAGCTATCAATCCCCCATAAAGTGCCAGCTAATTGCTGCATCTGAAGTCGCAAATTTAAAAATTTATTTTTTCAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 24585467 5' - Tc3 1557 1 73.68 GCGACTGAGTTCCTGGCAATTTCACGCTGATGAGTCAACCGCTACATCACTTTGCATATTTTTGTGGTCAGCTTTGGCAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTG:1 - chr3R 29766477 5' - accord 7029 2 63.37 AAGCAACCACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 12452141 5' + 412 30 2 54.46 AATTTNCCCCGAAACCCGTTTACAATTCCGTTTTAAACCCTTTACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr3L 5716857 5' - copia 244 1 66.34 CACTCAAGTACTTTATGCACTCAGTGCCTCTCTGGGTTAAAAGCTAAAGTGTAATATAATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAG:1 + chr3L 8924563 5' - Stalker2 7620 2 52.48 TTTTAATGACAATAAATGCATTCCTCCGAAGCTGAACAAATTAATTACAAATTTATGAATGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATT:1 - chr2R 18895979 5' - Max-element 8429 2 68.32 GTTGCTACTGCTTTGATTTTATTAATTTGGCCTTTGGTCGGAGAAATCAGTTAGATTTGACAATAAATCTTACAGCAAATTGAATGAAATTGGATTTTCGA:1 + chr3R 10449908 5' - GATE 387 1 80.20 GCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr3R 11993287 5' - P-element 2859 1 51.49 ATTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTG:1 + chrX 16798190 5' + diver 18 2 61.39 ATTCCCTCCCATACGCAACCCATTCCAATTTCGATACGATTTAATCGGCACTCCAGAGTTGACACCCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 + chr3L 958724 5' + P-element 7 2 70.00 ACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chrX 16798212 5' + diver 5928 2 62.38 CATTTGTGTAGACTGAATAAAAAATGTAATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1 - chr2R 16898325 5' + Max-element 18 2 60.00 AACAAAATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 + chr3R 7100985 5' - pogo 2075 1 55.45 AACCACTGAAAAGCCCGCCACTGATGCTCCCGGCACCACCGAAGAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGT:1 + chrX 19216090 5' - jockey 4733 1 56.44 GATGGGGATTTTTGGGCACTGTTCAATTAACTATTTAGAAGATGCCAAGACAAAAACTTTCTAATTTCAAATTATAACGTACATATTATATTTGCTAAAAG:1 - chr3R 24871123 5' + invader5 36 2 81.19 ACCGAGAAATGTTCACCAAAAGCGGATGTCTACTGAAAAATTCCAATTGAATCGATTTAGAGACTCCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAA:1 - chr2L 10126602 5' + mdg1 11 2 67.68 GTGCATTTTATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 - chr3R 20466731 5' + roo 7 2 74.26 CCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAC:1 + chr3L 14240842 5' + Tirant 8155 2 73.74 TTCCCGGCCGATTTTTGCTCCCCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCC:1 + chrX 5082797 5' - R1A1-element 4904 1 47.92 GGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAAAAGTAGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAA:1 + chr3R 19449369 5' + jockey 4912 1 70.30 AGTGCACTACAAAATTTTGAATTTCGGAGTCTAGAAGTAGGCAGATGTATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGT:1 - chr2R 1375156 5' - 297 368 2 55.45 ATTCTCGATATTTACTACATTTAAACACCCCACTGATGATAATATCTTTTGAAAGGAATACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr4 306425 5' - 1360 3378 1 59.41 ATACANACATATGGTGTGTATCTAATGAAGGATTAGATCATATGGCATTTCAATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3L 9121895 5' - Transpac 292 2 61.39 GTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 - chr3R 9952256 5' + Ivk 22 1 56.44 TAATTTAAATGAATTTGAATTTACAAAGAAAATTAGATTTAATGTTCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTG:1 + chr3L 1495306 5' + Ivk 34 1 58.42 CTGTCCACTTCCCGATCCCCTCCAGTTGCTGATCCACTGCAAACAGGAAAATAATTACACCCTCTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTG:1 - chr3L 1079002 5' + I-element 14 1 63.37 GGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chrX 19095797 5' - roo 9031 1 67.68 TTCCATGTGGACGGAAGCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTA:1 + chr2L 19075645 5' + Transpac 21 2 58.42 CAAGGCGAAGGTCGAATTCGATGGGGAGAAAAGCCGCCCCCTATTTATATATATATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 - chr3R 30325287 5' + 17.6 6943 1 64.36 ATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr3R 28728342 5' + jockey 36 1 51.49 CTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr3R 13715140 5' - P-element 2847 1 39.60 AAAATTGGTATCCTAAAGTATATCGTTAAGTCTTGGCACTTATTCTACGCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 2762090 5' - roo 407 1 76.24 TCGGAGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chrX 10653619 5' + jockey 17 1 68.37 GTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTT:1 + chrX 21668051 5' - Stalker2 385 2 61.39 AAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 19095792 5' - roo 360 2 73.27 GCTGCTTTGGGGGGCACATTAATTTTATCTTGGCACATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:2 - chr2L 14490482 5' + P-element 4 2 75.25 TGTACGTAAAACATTTGGAGTAAAAAACCATGCCTAAAGACTACTACAAGATACTGGGCATCCAGCGCACTGCTGTTTGTCGAAATGAACGAAACACGGCG:1 - chrX 10478431 5' + Tc1 495 1 72.28 TGTGGCCAGTGAAGAGAAAAACAATTTTAATCTTCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3R 25918864 5' + roo 3 2 75.25 ATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAAGTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3R 9369938 5' + roo 8703 2 66.34 GTGGCGAGAGCGCGGGGCAAATTGAAATGGTCAATTTGTTGCCAGCGATAAGAGTGGAAGTTGCAGACGTTGTAAATAACAAAAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 11922847 5' + F-element 4687 6 80.00 CTGCCATAGCTCCACTTCCAGAGAGATGAGTTCATAAAGTGGGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTG:1 + chr2L 8535227 5' - P-element 2777 1 48.51 GACTATGATCGACTATGATCTATCCAAGACTATGATATTATACAAGAGACCGAGGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGC:2 + chr3R 9657682 5' + BS 19 1 50.50 GCTTATTTAAGACTTGTTAATCATACATATGAATATCAAATTTTAAAACACTTAATCTGTACGCTTAATCTCAACATTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGAT:1 - chr3R 4351653 5' - INE-1 151 1 60.40 ATGCTGCCAGCAGCCGGAGATGTCGATAAGCAGTACGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 20411945 5' + 297 6605 2 64.36 ATGTACACGAGCGGCAGCTGATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGG:1 + chr2L 11551356 5' - Max-element 273 2 71.43 CAATCTTCCCCCTCTCCACCGCTCCCCTTCTAATCCGCTCGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGG:1 - chr3R 11850120 5' - Doc 448 1 55.06 GCCAGGGAAAAAGTTATTACTCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2R 8378690 5' + pogo 9 1 70.00 CTTACAACATACAGTTTTTCTGAACCCCATTCCCGCCCTCCACCAGGATGTGGCATCTCTTTGCCGCTTCAATTTGAAAATTATCACAAGCGGTTTCCTTT:1 + chr2L 18911597 5' - mdg1 486 1 77.23 GCTCATTACACGAAGCTGCCAAAAGAGAACGCTCTCTCGGGCGTTCCGCCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr2L 15333792 5' - P-element 2862 1 54.46 AATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATATCATTATATAAGAGAATTGTATAACAACAATATAATAGAAGTTAATTATGTACCCACAGAAA:1 + chr3R 19449989 5' + Dm88 4184 1 66.34 GCTGCGCTTGCGCCGTCCTTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGTTATTTTCCCTTT:1 - chr3L 24300080 5' - gypsy8 315 1 85.19 CTTCTAAATAATCAATAATATTCTCGTTCTCTATATATCTCGTTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATT:1 + chr3R 21362417 5' - F-element 4495 1 67.35 ATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGA:1 - chr3R 9952267 5' + Ivk 10 1 68.00 GCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3R 7522311 5' + blood 42 2 64.36 GCTCCNTCATTTATTGATGTGTATCCCTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chrX 14041967 5' + roo 8715 2 84.16 ATAATTCAACCCAAAAGCACGCTTTCTTTTCCTAGCACAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTGCCAACAAATCA:1 + chr2L 10003052 5' + F-element 340 1 63.37 CTCGAAAGTTATTTGCCGCATTTGTTACCTGCTTTTAATTAATTTACCGTCCCTAGCTAACCGCAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTA:1 - 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HMS-Beagle2 6855 1 72.28 ACTGACCACGACAACCGTTGATCTGGTGATTAACGAAATAATCGAGAAGCTAGCAGACGCCAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTAT:1 + chr3R 16054326 5' - 3S18 5789 2 67.33 AATTGGGGCTTTTTGTTAAATGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGATCGCGGAGGTATGGAAATCTTCGAAAGATACTAGGTCTGCCAACACTGTGTGTGGT:1 - chrX 20975486 5' - R2-element 3528 1 72.28 CATACTTTGAGGCGCCCCCACACCCTTAGCACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCG:1 + chr3L 13652624 5' - hobo 2891 1 73.27 AGGTTGACTTGCGAGATGACATTTAAGATATATCTATGCTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTA:1 + chr3L 16482251 5' - pogo 2067 1 63.37 CCTCCAACGAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr2L 108081 5' + P-element 13 1 67.33 AGTAATTTATAGCATTTAACGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAA:1 + chrX 868687 5' + jockey 4920 1 67.33 GATTGTAAGCGGAGTTTGATCATCAATATGGCAATAGGAACTGCTGGCTGTGCTCATCCGAGCACCTCGTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGA:1 - chr2R 23305502 5' - I-element 5349 1 70.30 TACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chrX 329080 5' - opus 469 2 57.43 ATTCGGGAAAAAAAACGTGGATTGGGTTTCACTTTTATGATTATGGGCTAAAAAGCAGTAAGATACAAGCTGGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCT:1 - chr3L 20492168 5' - FB 1 1 76.24 TATGATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3R 14688329 5' + pogo 20 1 49.50 AAATTAATTATAATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr3R 9369926 5' + roo 8691 2 57.43 AAAGTTGTGCGCATTGTTGTTGCCCCTTGATGTTGCACATGCAACTGCACAGAGAGCTAAGTTGCCAAGGAAGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 + chr3L 11909908 5' + Tabor 7 2 72.28 TTTTCATATTTTTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3R 25702158 5' + Tirant 8 2 73.27 GAACACCTATCACTGCACAGTCTGTTCCGAAGACCTGGCATCGTCCAATGACCTTATTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCA:1 - chr3R 14572513 5' + Stalker3T 295 1 63.37 AAATAGCATTTACATTGTTTGTATGCTAAAATAAGTTTTATAAGGCAGTGAGCTATTTTAAGAATTATACATAACAAGCCAGCAATTAGTTAGGAAATTAG:1 - chr2L 9321805 5' + I-element 5226 1 70.30 ATAGGCTGAAATACCAATTGTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chrX 8031424 5' + roo 33 2 60.40 AGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACA:1 + chrX 23431790 5' + Stalker2 7283 2 59.41 CGCTTTAAGCTCATTTCTGCTTCATTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr3L 8063851 5' + P-element 49 1 30.69 CCATCATCCCAGTATTCATTGTCTCACACTCCTCAGGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTAT:1 + chr2L 9101936 5' - Stalker4 7011 4 64.36 AACAGGAAAATAATTACACCCTCTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTC:1 - chr3L 1078961 5' + I-element 55 1 77.23 TTATATAATTTTTCTGGGTGCCATCCCGGCAGAATTGCTTTCGACTGACCATGGCCTAATATGAAGCAACACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2R 19936587 5' + roo 5 2 75.25 GCTATAATCTTGTACTAACATAATGGCGTAATCAAAACTTACTACTATCACTTGAATATTACGGTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3R 13375946 5' + 1360 10 2 67.33 TTGGGTTCACTTAAGTGGCCAAGACTTTCTATTTAATATTTTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAA:1 - chr3L 3516186 5' - P-element 2717 1 47.52 AAAGCTTCGATGACAAGATCATTCAATGAGCACCACTCTTTTGAGAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2R 18503486 5' + roo 8697 2 61.39 AGGCGAAACCTGTTTAACCGAGTGTCGCGATTGGTCTACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 15333695 5' + P-element 6 2 66.67 TTTGCGACTGAGTGGGGAAGGTCGTAAAGACCCCCCTCCGCCTCATCCTACTCATATAGGCCCAACCAAATACAATAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr2L 20776746 5' + 1360 12 1 57.58 GGGCTCTGCGTGATTTTCAATCGGTGGCGGTGCAACATGGCGTATGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACG:1 + chrX 2781776 5' - 297 104 2 56.44 TATATATCATTGCGTGAGTGATTATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAAATTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTAAAATCGC:1 + chrX 11961027 5' - 1360 3000 1 79.21 TTTGCTTATGCGAATCCCGTCAAAACACCGTGCGCATTTAGACTGGCCTTCTTACGGGGCATGCCGACTTCACAGCCATTTGCACAAGATTGGCAT:1 - chr3R 31997108 5' + baggins 5165 1 78.12 TCTCAGCATTTTCCCTTAATGGTCCATCCTGCAAGTGGCCAACAACTGCTTTGCTTTCACAGAAGCTGTTTTGTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTT:1 - chrX 12859730 5' - Stalker4 262 4 70.30 CCCTCTAAACTAAAGCAGACAGATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATATATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 - chrX 4180806 5' - I-element 5323 1 55.45 CTTGCTATCTCCTCCCCCCCCCCTCCCCCC:1 + chrX 18245369 5' + accord2 223 1 86.67 GAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr3R 7522378 5' - blood 353 2 54.46 TCTGATAATATTAGTTACTCCTATAGAAAAGTAGGTTCAGGTTACACCCTTAGGCACGCATTATTTCATTTGATACTTAAACTTTCTTATACCATTTTACT:1 + chr3L 12275754 5' + TART-B 10184 1 63.37 GAAGCAGTGCGAGGAGCAGGAGAAGCAGCTGGCGGAAGGACCATGACCGGTAGGCAGTGGCTACGCGGCGGAGAAGTGCAGATGATCGCACTTTTAGCTGG:1 - chr3R 20412216 5' - HMS-Beagle2 114 2 60.40 TAGAAAAATTCTGGGGCCTGTTTGGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGCCTTCATCACTTTATTTCGGCTGTCAGTTTAGAACTAAGTAATACAAA:1 - chr3R 28014186 5' - Chouto 121 1 70.30 CAGCTTAGGCAGCAGCCGCAAATGGCGCACATTTTTGTACGAGCCACTTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chrX 12538452 5' - roo 9040 1 55.45 TCAACCTTTTGCAACTTAAGATTTCAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 7471559 5' + G3 4584 1 80.49 GCTGAGAGATACATTCGATTAGTTTTTAATATCTAAACAAAAATATAAAGTCTATATATACATATATCAATAGCCGAATCGATCTGGCCATATCCGTCTGT:1 - chr2L 22039016 5' + INE-1 113 1 58.42 TAACCGTCAACAATTGATCAAGCCGAGTGGAACTACCGTCTGTAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGAGCACACATATAACAAATTAATTAATA:1 - chr2R 330511 5' + gtwin 36 2 60.40 ATAAGTAACAATGGGACGGTTATCCAGATTAGAGTTGATTGAATCCCCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTCTACGGTTAACT:1 + chr4 868484 5' - Cr1a 4012 1 58.00 TGGCCCGATCTGGGCTTTATTTTCAAATCTCCTCTGATCTCTACCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCC:1 - chr3L 11012772 5' - R1A1-element 5032 1 69.70 AAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2L 326154 5' - roo 9017 2 77.23 ATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689421 5' - diver2 4466 1 56.44 TATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 - chr2L 7994467 5' + jockey 4815 1 78.22 TTTGAGGCGTTTGTGTGGGAAGCCAGAACTTTGAGCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGTATGA:1 + chr2L 9022089 5' - F-element 4317 1 65.35 ACTTAGATCGCTAGCTAAATATCATTTTCGCTTGTTTTACTCCTGTGTGTGTGTTCACAAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTTTTCTTTTTAA:1 + chr2R 10516831 5' - HB 1366 1 64.36 CATGGAGATGCAGCTTGGCTGCCCCGGGTCATTCCTTTCCCCTTGACCACACCAAAAAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACAAAA:1 + chr2L 427207 5' - Cr1a 206 1 52.48 TGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCT:1 + chr3R 28755955 5' + 3S18 50 2 71.29 AAAACGAAGGACTATCGGAAAAGTCTGTTTAAGTTTTAAGTATTAATTAACTTGCAACAAAGAATAGAAACAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCT:1 - chr2R 22606010 5' + Juan 4024 1 77.42 ATACAATCTGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 7809049 5' + roo 8687 2 55.10 TCTATTAGGACCGTTCCTGTCACAATCTTACATCTAAATAAAGAACACCGAAATTACTTTTGAAGTGTTTAATTTATAAAACATTAACTGGCGCCCGAACA:1 - chr3L 25847399 5' + HMS-Beagle 257 1 80.20 GTGCCTCGGTTGCAGCATTCGCCACATGACTTTGCAACTGTTGGCTCTCATTGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCC:1 + chr3R 21970662 5' + 412 191 2 52.48 GCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAAACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTT:1 - chrX 21388560 5' - 1360 3344 1 70.30 TTTACCTTTTTCTGCTTATCAGCTTGGTAGAGATCGTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGC:1 + chr2R 1395463 5' + gypsy 7025 2 64.36 GTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTAGTCC:1 - chr2R 5924410 5' - jockey 4731 1 39.39 AAAACGCCGCAAAGCAATGGCGAAAAAAATGGAGAGAAAAAATTGAACTTTCTTGATTAAAGTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 19457230 5' + roo 8680 2 62.38 AATCCCAAGGTGGATTAATTCAAACAGTTCATGCAGGAGCTTCACGAAAACATCTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTG:1 + chr3R 19446081 5' - Circe 7407 2 71.29 TACCANATCCTTGCTCTGCAACTTTTGCACATAAGCTACAAGCAGGAGGCGTCCATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACCTCTCCCGTGTAACTGTAAT:1 - chr2R 16255920 5' - Tc1-2 112 1 56.44 TTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACT:1 - chr3L 19349988 5' + 1360 3237 1 62.38 TATTTTCCATTTTTATTTACCATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAAGAATAAAAACAT:1 + chr3L 13150429 5' + jockey 4983 1 78.22 ATTTTGAGCATTTATTACAGCTAAACATTGCACTTTTTACACCGAACGGTGGGAGCGCATTTAGATTCTACATACATATTACATACATATTTTCAACACTC:1 - chr2R 8326880 5' - Dm88 4358 1 78.22 AAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 + chrX 4154895 5' + blood 7024 2 66.00 TACACTGAAAACAAAGTTCGAGATACAGTATAATTTGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATTGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr3L 14050005 5' + pogo 47 1 72.04 ATCGATTGGAATTTGTTGCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGG:1 - chr3R 7101074 5' + pogo 21 1 58.42 ACCCTTACAATTTCCCTTAGGGTCTGTATAGAATAAGGAAAACAACAAAGCCTAGGCCAAAAGCAAACGAAGCCAGAGAAAAGTAATGCAAAGTAAAGTCA:1 - chr2R 16894698 5' + TART-A 13122 1 69.31 AAATTTAACACAATAATTTGCACAATTTGTCAAAACAACCCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chrX 7828968 5' + 412 14 2 64.65 GATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACTATTTAATACTTGTTTTGTAACGCGTAACGAAATAAATTGATGG:1 - chrX 22824228 5' - Gypsy12A_LTR 2253 1 46.53 GTCACTGATTGGTCTTGACTGGGGTGATTATGTTACGATTTGCTAGTATGCTTGGCGCAGCGGGTGATCTGGAGAGGGAGGCGTTGTCAGATCAACCGTG:1 - chrX 7555907 5' + Rt1b 37 1 54.00 GAGAACGCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAA:1 + chr2L 107978 5' - P-element 2873 1 65.35 ACTCGCACCACTGCCTTTTGACAGTTGTTTTCCCAGCGGAATTTCAATGAGCACAAGCCCACATACACAAATAGTTTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGC:1 + chr2L 17720248 5' - transib2 2723 1 68.32 GATCCCCGCACTCTACATGGAGAGAACTCCCAGGGAAAACATACGGTTCATACTATAAACTTGTGCATACACTTAATGAGTTCAATTCGGGTTTTTGAATC:1 - chr3L 23452382 5' - rooA 7565 2 71.29 GAGGGTGTTGCGGCAATTAGTGTGCGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr3L 958795 5' + P-element 50 1 29.00 TGAATATGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chrX 4154922 5' + blood 41 2 64.36 GAGGTAGGAATTTTAAAATTAGAGAATAAAACCGAAAATCGCAGGCAAAGTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGTGAAAATGAGGAGAAGCCTCTGTGCTT:1 + chrX 5253827 5' - 17.6 307 2 50.50 TTTCCNACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr2R 9426453 5' - P-element 2844 1 37.62 AAATATATGTATATTTTCTTGGAGCGGCCAGAAATATTAAACATTGGATAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAAAGATAAGAAAAGTGAAAAAAAA:1 - chr2R 20360757 5' + invader2 4748 1 69.31 CAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3R 10457272 5' - roo 9040 1 57.43 TCCGTGACGCAATTCCGTTGGTTTCCAACACTGCGGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chr2R 9426432 5' - P-element 2865 1 59.41 TTGATNAAGATTATTTTTTAGATCAGAATCCTACACGGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chr4 1152029 5' + transib2 42 1 63.37 GTCAGTGTTTCAGTGTTGTTTCTTGAAATTCCTCTTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAA:2 + chrX 21668047 5' - Stalker2 7637 2 65.35 TGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chrX 9248344 5' - pogo 2056 1 74.26 GCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAGGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAA:1 + chr2L 7170391 5' + jockey 4647 1 67.33 CATATTATGCGGCATATCCTTGTTGTCCATGCGACGCTTTTCACTTAATACAGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGAC:1 - chr2R 16900153 5' - Max-element 413 1 59.60 TAAACTTAAATAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chrX 20974838 5' - opus 483 2 64.36 AGTTAAATGTAGTTAAGTTTACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 13144960 5' - roo 9040 1 57.43 CCTTGTCTACAAATAGCAATTCAAGGGCCGTCAATGATCCCTTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCA:1 - chr3L 23821856 5' + HMS-Beagle2 27 2 60.42 CTTAACCATAGAACCCAGCCCCAGCCTGGTATATATGCAAGGAGCACAGTTCGATGGATTGACTACCACTGTAAAGCCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr3R 10321116 5' - roo 407 1 75.00 ACAAAACCAGGCCAATGAATACTTTCATTTTGAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGTATTTTTG:1 + chr2R 15024812 5' - hobo 278 1 68.32 GCAGCTTTAAACCCACCAATTCTGCAACACTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAAC:1 - chr3L 6130508 5' - jockey 4852 1 70.30 CTGCAACAACAACTGCAACAGCATCAACATCAACTATATGCTTAATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCATGCTACGAATAGCA:1 - chr3R 10518781 5' + Doc 39 1 57.43 CGTTTATTCACCCAGCGAATGCACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAA:1 + chrX 1427514 5' - Bari1 1694 1 66.00 TGGTCAACTGAAAGTCGATCCTCTTCAGACGAGATGGCCAACAGAGTGGATGTCTAAGCCCAAACTGGTGTCCTGGGTGACGGCGGG:1 + chrX 9567929 5' + Rt1b 4835 1 72.41 CCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTAT:1 + chr2L 514869 5' + 3S18 44 2 67.33 AAGTTGTTGTTAAAGCAGTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTT:1 + chr3L 13994227 5' + P-element 56 1 21.78 GCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 19076188 5' + roo 56 2 82.18 AACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATA:1 - chr3L 14240907 5' - Tirant 379 2 59.00 TAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2L 6227675 5' - roo 351 2 80.20 AGGTGAATTAGTTTCCCAATGATTGACCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCA:1 + chr2L 10287300 5' + R1A1-element 443 1 72.73 TAAGCTGCCATCATGTTTTATAGTTCCATTTCGTATATGCATTTGTGGCGTTTTGATCGCACGGCATTTAATATTACTTATGTTTCTAACAACATGGCCTT:1 + chr2L 12652892 5' - G4 450 1 56.44 CGACCATCGCGATCTAGAATGTGTAAACACAACCGCACTAACTGCACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAT:1 + chr2L 21978095 5' - roo 9039 1 55.45 CGGATTCCTGGGCATCATGAATGTCACCAACACTAGCTTAGACATGTTTTTGCCGACGCCTGCTGCGCCGCTGCCGACGACTTCACTTGATTGCTAGGGAC:1 + chr3R 4623278 5' + HMS-Beagle 142 2 55.45 TGGCTNCTAAATAAATTTAAGTTCTTATGCCTTTAAGAAGTGTGGACGCCGAAAAATGAATACACGTGCTCCTTCCTTTAAATAACTTCACAATCTCTTTA:1 - chr3R 15157660 5' - invader3 238 2 74.26 ACATATATTTGTTGTTTTTAAAATTTTTTGGTCCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTC:1 + chrX 14796861 5' + transib2 42 1 73.27 AAAATCAAATAGCATTATTAAAGCGATTTTTATTTTATTTGTTTTCCCAGCGTTAAAATTAATTTACATTTTTGTCCCATTCAGATCGCGTTCGATATCTC:1 + chr2R 4887254 5' - jockey2 3019 1 75.25 TATTCTGTTTGAAATAACTTAGCTAAATGATCGTCGAAAGTGCATTTGCGTAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 - chr2R 5784404 5' - 297 6958 2 60.20 TCGGACTGTTGAGGTCGCTAAAGAAAAATGTCCCACATCTCATATTTCAACCACATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCA:1 - chr2R 6045207 5' + HMS-Beagle2 6956 2 72.28 CTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:1 - chr3R 27080784 5' + HMS-Beagle 6837 2 68.32 AATTTGCTCAATTGCACCAGCTTGTGATTCTGCTCGTTGTTCTGCATTTTGCTTATTGCGGGGTCACCAATATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTT:1 - chr3R 12188941 5' - Chimpo 177 1 63.37 AGTTGGGGGATCCTGGATGCCAGGCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:2 + chr3R 10957684 5' - hopper2 1557 1 74.26 ATTGAAAACTTTATTTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 + chr2R 9375150 5' - HMS-Beagle 7031 2 71.29 GTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCAC:1 + chr3R 11165655 5' + Tabor 49 2 72.28 TTTATTCGAAATTCGACAACGTTCTCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr2R 13038934 5' - P-element 2835 1 27.72 AGAAAAGAAGTGCATTCCGGCTGCTGACTTCAACCAGACCGCCGGTTATTTAATAAAGCTCAACGAGGGCCTTTACAGCTTAGTGCACTCTACCAATAG:1 - chr3R 21576114 5' + R1A1-element 272 1 79.80 AAAACAAGACTTAATTGTGTTATTAATTCCATAACATTGAGTTAGTGCTTCTCACATTTAATTTAGAGACCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCC:1 - chr2L 5511349 5' + FB 792 3 68.32 AAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr3L 20903852 5' + F-element 29 1 61.19 CCATTTCGTTTAAAATAATATTAAGGGGGAAAAAAACGAAATGATAGTGCTTGGAGTTTTTTAACGTGTAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACAT:2 + chr3R 7388319 5' + HMS-Beagle 10 2 69.31 CTACTTTTAGGCTGCTGCAACTATGCAATTACAACCGGAATTGAGTTAAGTTAGATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3L 19349939 5' - 1360 3365 1 53.47 CCTGGTCTTTCGTGTCTTCGATGAGAATAATGTGAGTACGCTGATATGCTGACGTGTGACTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chrX 18200714 5' - opus 7489 2 67.33 TTTCGCATAAAAAATTCATAAAATTAAAAAGTTTTTGACATACCGTATATATGTATATTCTTGATCAAGGAGATCTCAGGAGCTATAAAAGCTAGAGGGTT:2 + chr2L 18159039 5' + INE-1 158 1 45.54 GCGAATCAAAAAATCAGGTCAACTTTTATGTTTTAAAATTAATGCAATTTCGAAGTTAATTTACCCCGTTAATATTTGGTTGTATTTAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 11500597 5' + transib2 2633 1 82.18 CTGAAGTTGGTTAAGGTTTCCATTATGCTACTGGGAAATAAATAAGTCTGTAATAGAAATGTTGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 17698168 5' - 412 472 2 52.48 GTGGGCGACCAAAGTATGTAACAGGTAGCAGATAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 6227643 5' - roo 385 2 55.00 CATATNAATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 18881500 5' + roo 22 2 54.44 AGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr3L 2800201 5' + blood 7046 2 58.42 CGGCTAATGTGCAAGTCCGGAATAATCTGTATGTGTACACACAAAATATGCCCTTCACCTTAAAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAC:1 - chrX 19702176 5' + 1360 253 1 74.26 CAAATAATACAATTAATTCAAAAAAGACCAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCT:1 - chr2L 15940320 5' - F-element 4304 1 74.26 AGACCAGATATAAGCAACATGCACTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTC:1 + chrX 16757600 5' - Burdock 6284 2 76.24 ATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTTATTATTTTATTTTATTTTATTTTTTTAATTTTTTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAATCTTGGA:1 + chr3R 16799803 5' - X-element 4693 1 52.48 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCACGCTACTAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGTGAGCA:1 + chr3R 1202714 5' + R1A1-element 313 1 77.23 ATATTTTGTAGTTTTTCCACCGAATGCAGGCACAATTGCTTCGTAAAAACGCAATAAAAGGCGCGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chr3R 31812661 5' - P-element 2875 1 71.29 GCGTATACTTCATTTAACCGTTGGCCACTGTGTAAGGTCGGTCAACTGATTGAATTTTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr3R 20884874 5' + flea 4771 2 68.32 GGATTTGGCTGTTTAATGAGCTTGTTCCACATCAACTGGCCCACACACACACACAGGCACATTACTAAAATATATATACATATATATGTATGTATATATAT:1 + chrX 17029956 5' + 1731 4409 1 68.32 TCGCTGGCTGTTTGTCCAAGGATTACCAGCAGCTGGCTCGTCCTTCCGCTCGTCCTTCCGCCTCCTCATGTCCAAAGCGCTTCACATATCTGCGAAAGCAA:1 - chr2R 24617788 5' - Rt1c 5022 1 57.43 AATAATATAGATAGTTTGCTTAGATCCCACTGAATAACCTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 + chr2L 1129073 5' + HMS-Beagle 6830 2 60.40 GACGTCGCTAACCTCAAGCAGCGCCTGTCATTGTCAGCGGTTGTTCGTCACGTCTCTTGGGTTAAAGTTGAAGACTAAATCGTTTGGAGAAAATTTAG:1 + chr2R 8289018 5' - Bica 4457 1 62.24 CATTCAGGAAATAGCGTTTAAATATGCAAATATTAAATATGATTTCGCTAATTCGAAATTACAGAAAACAAACAGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 + chrX 8352151 5' - blood 374 2 75.25 CTCGTTTGGCTGCCACTACGTAGAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chrX 8031357 5' - roo 9038 1 58.42 AAACGGACTCCCCCTTGCTAAGCAAGGGATATCTGAAAGTCTGTTTATTAAATCGTAGTTTTTTTCGTAGTTTGCCAAAACTAAGTAAAAAAATAAAAAAA:1 + chr2R 5410961 5' - Tc1 1401 1 49.50 ACCGAGAACGCTAGGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr2L 107975 5' - P-element 2876 1 68.32 GATTTAAGTGCCATTTTTCAAAGGCCAATTGTTTATTGGTTGTATTGATGGTTATATTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCCAAT:1 + chr3R 25940858 5' - I-element 4922 1 49.50 GCACACTGCGTCAAAAGGAATTATACTTGCATCGAAATTCTTTAGGTCATTGAATGTTTGCATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chrX 20364214 5' - opus 489 2 70.30 CTGTGGCTGGGACCATTCTTTACGAGAGGCAATAAATTTAACAATTTGTTTAGCGCAGACATGCCTCGCTTAAGCGGCAGAAAACGTCGCGCGAACCATAA:1 - chr3L 21802533 5' + invader1 3965 2 63.37 CCTAACCTGTACTCGAATGTATTAATTCCCGAACCGCCATTTTTGTGCGTTCGGGTCCATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAG:1 + chrY 381070 5' - Doc3-element 387 1 54.44 TCCTTACTTACATTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAA:1 + chr3L 15099554 5' - G4 3814 1 70.00 TATGTATCTATGTATCCCTAGGTGTTGCAAAAAAAGAAAGAATGCTATAGTCCAGTAACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTTTTGTGAATGCGAA:1 - chrX 3386740 5' - INE-1 531 1 74.26 TAGCCAGAACTAACCAACTTAACCGCCCTACTCGTCTGCATCTATGATTAATTTAGATTTTGTGTGGGAGAGCGAGAGAGTTAGAGCGAAAAGTGCAGTTT:1 + chrX 13957822 5' - Cr1a 277 1 52.48 AAAACTTTTTCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr2L 7927253 5' + hobo 46 1 74.26 CATTCTTAAGATCTCCCATATGACAGAAGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACACAACTTCGTCAACTTAAGAACAATTAATGACAACAAGTAAT:1 + chr2L 21652961 5' - invader4 2656 1 72.28 CAAAANATTCTAGTTTTTCTTTTTTCCATTATATTCCATAATACCCTGCATCTACTAATACATTCTTATTACTTAATGCTAGCTTATAAGTAGGACC:1 - chr3L 23346949 5' - invader3 5291 2 56.70 TGAGCACTGCAAGCGGAAAAAACGCTGAGAACACTGAGAAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chr2R 21379462 5' + P-element 3 2 76.24 TTAGGAACACATGAACCCTTATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAAAAA:1 + chr2L 18028656 5' + flea 4769 2 68.32 CTAGANAAGAACTCTGAACTTAAGATCATAAATATCCATTTTTCCCTGCTATAGAAACGGTCCTTTGTGCAGAATACTGAGGTGGTCAGAAGTATTTGCAC:1 + chr2L 18187552 5' - Bari1 1703 1 54.46 GGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 15638285 5' - roo 9031 1 72.00 GGGGCTGGAAATGAGCGACGGAGGGCGGCGTATTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAAGTGTTGATGTGTGGATTGGGTGTGCCCGATGCGTAGACGGATAA:1 - chrX 21269643 5' - Ivk 5040 1 68.32 ATTCGTTGCTCAAACTGAAGACAAACCCCTTTTATTGACATATTCTATAACCACCCTACCTGTGGAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCT:1 - chr2L 16331562 5' - Circe 7158 1 62.38 AGGAACGCAATATGCTAAGTTACGTACATGTAAATCAACATTTACATTTACATACATTTACGTTATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 + chrX 17247257 5' + F-element 25 1 39.60 TATATAGTTATATATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr2L 4189364 5' + 1360 26 1 52.48 AGGAGCCGGATATCCTAAAACAAACAGTTATATATGTGTATGTGTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chrX 11585556 5' + pogo 31 1 64.36 TTTACCATTTATATAGTGGGATAAATATAATATATATAAACATAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGG:1 + chr3R 25510331 5' + opus 7032 4 78.22 GCACACACACAGACACAGGCCAAAAAGAGGAAAATCAAATGAAAAAAA:1 - chr2R 12734107 5' + Doc2-element 4519 1 93.75 AAATTTATAACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3R 18934099 5' - hobo 2895 1 66.34 ACTGAATTTTCTCTCAGTGTGATCCAAGACGGGACTCCGGCCCAATGCTGGCTCAGCACTTTGATATTATGTTTCATACACTAAGCCAACTGTACTAGTTC:1 - chrX 3041103 5' - Gypsy6A_LTR 18 1 66.34 GCAAAAGATAACATAAAATGCGTTTCCAGATTGTATAGACTTCAGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTT:1 + chr3L 495086 5' - invader3 5365 2 56.00 GAGTCTGTGGAATAACAAAACAAATCGAAACATCTTAAACTTAAAGCAAGGAAACTCCACTGGATCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAA:1 + chr3R 18428052 5' + Doc 4233 1 76.24 ATTTTGAGGTCGTTGAGTTCTTTCCGTGAAAGTGAACAAAGAGCCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3L 7792245 5' - 412 459 2 57.43 ATGCCTTTATGAGTTCCTCTGACGCAGACCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATA:1 + chr2R 20221872 5' + Tabor 7282 2 72.28 CCACACTACACAAATATCATCGCAAACAAACAAACAGATATCCAAAGCCTTCACAACTGAACCTTAAAAGTCAGTAATTAAAACTAAAAAACAAATTAT:1 + chr3R 23311079 5' + rover 6828 1 77.78 GATTCAAAATATTATCAATGACTGTGGTTTATTTGATACTTCCCGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCTATGCT:1 + chr3L 10823509 5' - invader2 4986 2 76.24 GACGCCCACGTCCAAGATAGCCTCGTTGTCCGAGGAGCTGTGCATCGGTTGCGGTATTTGCGTCAAGGTGGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGG:2 - chr3L 8974179 5' + P-element 2 2 77.23 AAAGAAAGTAATAAAGTAGCCCAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAA:1 - chr2R 12446403 5' + jockey 4674 1 72.28 AGTAACGTTAAGGATTCCGTGTACATACTCATCAGGATCAATAGCCAAATCGATCTGGCCATGTCCGCCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGA:1 + chr3L 13775894 5' + INE-1 138 1 71.13 CTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCTTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1 - chr3L 4048496 5' + 3S18 54 2 73.00 AACAAAACACCCGACAGAATCTCAAAAAAGAAAACTAAAAAACAAATAGACAACGAGCGCCAACTCTCTTTGCAGCGGAACAATGCATACTTCACGGGCGT:1 - chr3L 23937135 5' + Doc3-element 291 1 73.27 TTCGGATCTGTACTCGTTATAGCAAGAATTTAATACTATATCCATTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2L 6227742 5' + roo 8673 2 73.27 CACAATAAAAACTTAAAGAAAAGTAAAATGTGCAACAACCTTTAATGTGGTTAATAAATATAATCTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 - chr2R 16744211 5' + opus 13 2 60.40 GGATGAACTCTGGATTCAGCCTTACATATAATTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAA:1 - chr3R 28755610 5' - 3S18 6055 2 69.31 ATAATTACCTTATAATTATTTGGCCAAAATACCACGGGGCATGCAGAAATGTGCTAAGAGGAAATGTAAACAAAATAAAAAATCCGAAAGCGAAAGAGACG:1 - chr2R 14683021 5' + F-element 110 1 71.29 ACAATNTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 - chrX 495221 5' + 412 7100 2 69.31 AGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCT:1 - chr2R 12185407 5' + accord 25 2 52.53 CAAGCNCGCTGGCCAAATGTATTTCAATGACTAACCCAACCAAAGCATTTTGCTGATAAATTTATTGATGATATTATGGGATTCGAAGTATCCATTTCTCT:1 - chr2R 24642369 5' + hopper 362 1 65.35 ACTTTCAGATAGTCATACTGCAGCAAAGCGACGATATTTAAAGTTTACTTCATCAAGCGGATTACTTGTTAGAATTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGA:1 - chr2R 23945335 5' + BS 4997 1 75.25 CGGGGAAATTCTCGTGGAGGCAGATAGAGCAAGTTGAAAATTCAGAATAATGAGGAAACTAACGAGCCAAGACTTTCTCATCAGGTATCTCTCGCTGAGCC:1 - chr3R 6590513 5' - G6 1787 1 80.20 GCATGCACGCAGAGCATCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCA:1 - chr2R 7481104 5' - opus 469 2 63.37 GTACCCAATGGTAACTCGATCGAAAGCGATGCCAAGATTACTGGCCTAAATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 + chrX 12857817 5' - 297 371 2 57.43 CAAATGCGTTATTTTTATCTACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr2L 3694174 5' - roo 9053 2 57.43 GCGAAACCTGTTTAGCCGAGTGTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chr2L 15333697 5' + P-element 10 2 67.33 TTGGTTTCACGAACGAGCGACCCGCAAAAGTGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAA:1 - 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Tirant 393 2 68.32 AATCGGTGTAAGGATCATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 + chr3R 25633306 5' + Tirant 8114 2 74.26 TTAAAGAAAGTAATAAAGTAGCCCAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGG:1 - chr2R 12446405 5' + jockey 4672 1 74.26 GTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTG:1 - chr2L 16082651 5' + Stalker 50 4 77.66 TTTATTAAATAAGTTTAATTTGTTAGTCATTTATCTTTGCTTTTATTTTATTTCAGCAATGCTGGTGGGTTTATGTGTTCTTTATAATTCTTCGTCTCCTT:1 - chr2R 11783061 5' - HeT-A 259 1 80.20 AGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAA:1 + chr3L 19951195 5' + Ivk 27 1 53.47 ATTGGCGGCGAAACCACCAGCGTTGTACCAGTGCATCCTCCCACCGTTTCCGCTCAAGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCC:1 - chr3L 20693177 5' - Max-element 8531 2 70.65 CAGGTGGTGGCATGACGCAGTTCCCATCCATACTGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 19076127 5' - 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chr2R 17224662 5' + transib1 48 1 65.38 AAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAG:1 + chr3R 9254904 5' + F-element 203 1 55.79 GCCAAACTGCCTCACCGTCGCCGTCAAACTTAAAGTCACCAAACTCACATCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGAGA:1 - chr4 901034 5' - R1A1-element 4941 1 47.52 AGGGACAGACCATAAACTCTCAGTTTTTGCCTAATTTCCATCCGAGTATTCCAATGTGATTTTCCCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACTGCCAGTCA:1 - chr3L 20740025 5' - Rt1b 4990 1 74.00 GACAGCTCATTAATAAGCGGATTCGGGGGACTGAGCATATCCTTCGGCCTTCACTTGCCGTTGACGAGCTAATCTACTGTGTAATGTCCCAAATGAGAAGA:1 - chr3L 21384072 5' - roo 9071 1 78.22 GAATAGGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2L 22719630 5' - 1360 3342 1 80.65 ATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCC:1 + chr2R 1320699 5' - diver2 337 2 53.76 CCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGC:1 - chr2R 19386727 5' - 1360 134 1 62.65 CTCGACACACACACGGAACAACCATGACTTTTTGGCATTTTTAATTAGTGCTTTGATATGTACGCTGCTTTCTGCCACGTACACACACACACACACACAGA:1 - 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chr2L 2723204 5' - Porto1 152 1 65.35 ACACCGTAAGTATCCCTATTAAACAGGGTTTTATTCCTGCGACTTTTTAAATTCGACTCTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCTGTCAGCTCAACGT:1 + chr3L 16959418 5' - 412 385 2 63.37 TTGGGGCTGTGATTTCACTTGGGCACTTGGGGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr2L 1626589 5' + roo 46 2 71.29 CGGTAGCGCCTCCTCATGGTCCCCACCCGCACTTGCACCCTCGCCTTCTTCTGGGCCAAAAGCAATTAACAAATCCAGCCTGCCCTAATGTAAACATTAAC:1 + chr2R 20135160 5' + Quasimodo 6896 2 70.30 CTCACNATCGCTCTCTTTCGCACCGTCTATAGCCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTT:1 - chr2L 6503196 5' + blood 168 2 92.98 TGCTGAAGCTATTTCCCAGCATTGTGAAATTGAAATTTGCTGACTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTA:1 + chr2L 22921232 5' + copia 3 2 80.20 GATGAGGGATCTAACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3L 15638311 5' - roo 393 1 64.36 TCAAGCTGTACCGCAACCATCTGCAGCATGCTCAAATGATATAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3R 28823234 5' + 1360 48 1 62.38 TCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chr2L 108049 5' + P-element 45 1 35.64 TACATATCCACATTTCAAGAGCATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAA:1 - chr3L 8258255 5' + Quasimodo 207 2 77.32 AAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTCTATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2R 19857397 5' + 297 25 2 67.74 CGACTTCTGGATACCCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chrX 1235440 5' + P-element 59 1 22.77 GCTCAATAGTGATTTTTTTATCTTTAGTTAATCCTTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAA:1 - chrX 21396713 5' - F-element 4632 1 77.23 TGGAGTAATTGATAATTGTGCAAAGACACGAAAACATTTTCATTCAAAAATACAAAGTTAAGTTTCTCGAACTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGCGA:1 + chr3L 10451259 5' + X-element 210 1 73.27 AAGATATGTACATGCATGCATATGGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTGGGTTATGTTAGAATACACAT:1 - chr3L 20248347 5' + Transpac 36 2 70.00 TTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:2 + chr2L 18028686 5' + flea 42 2 74.26 TCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCAC:1 - chr3R 31812727 5' + P-element 52 1 28.71 GTATCCATTTGGTTACGGAAGTCTGTGGAAAAAGGAAGAGATGCATTGGTTGATACTCAACAATATTTATAATGAATATATATATACATATACACATGCAT:1 + chr3R 23381339 5' - Stalker 7093 4 54.46 ATTCCTGGACAAGTTGGTGCTGTTAATTTTTTTTCTTCTTCTCTCATCTGTTTTTCGGTTATTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 11606568 5' - Doc2-element 232 1 60.76 ACTCATTATAATTTCTATAATATATATATATGTTTATCAAAAATATTTCAAATTTGGTCTTACATAGTGGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 2161812 5' + 1360 7 2 70.30 TCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTCGCA:1 + chr3R 11165662 5' + Tabor 56 2 77.23 ACATGAAAGGAGTGGGCGGGGCAAATGAAATCAAATTACATTAACATAAAATTTAATATCAGCATACTGTCTACGTGTGTGTGTGAATGTGCGTGTGTGTG:1 - chr3L 9961085 5' - accord 7036 2 79.21 ACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCAGCACAAAATCG:1 + chrX 21396686 5' + F-element 43 1 70.00 AAACACCTATATACTTTATATGCGATACACACTCACTCACCCCCATTAGCAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCG:1 + chr2L 2459331 5' + hobo 126 1 56.44 CCGCAATACAAACACACTTTGGATACTTACATCACTCCATACACACACTAATACCAACACACATTATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTC:1 - chr3R 4565291 5' + 1360 274 1 64.36 TTTTATGGCACACGCTTACGTGAGAAACATGGGAAAGCTGCGACACTCGCACACACAAAACAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGAAGAGTAAACAAAACA:1 + chr2R 8657005 5' - Cr1a 209 1 65.35 AAGAACCGTGAGGTTTCAGCCTTGATTTTAAGCCTGATTTAAGCGAGTTCGCGTGGTAGATGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGGC:1 - chr2R 5330837 5' - rooA 7410 2 66.34 AATCAGGTCGTATGAAAAGGTCCGAAATAATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 + chr3L 14910565 5' + roo 8690 2 53.47 ACTCACCTTCCTCTCTCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCCCC:1 + chr2L 20048838 5' + accord2 223 1 76.92 AAAAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTTATCT:1 + chr3L 2401763 5' + Tc3 1617 1 68.42 AAAAAACATATAAGCTTGTATTTAGTGAAGAATAAATGTAAATAGAAATAAAGAAATGTTAGAATGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 6024514 5' + roo 12 2 65.35 AGCATACCCGTCTCATCCCCATCGTAGTCATTTTAACTTAAGGGATTACAAAGTTGTAAATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAG:1 - chr3L 19920107 5' - G-element 4192 1 68.00 CATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTT:2 - 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chr3R 14324293 5' - 3S18 6103 2 76.24 TATGTGTATGTTTGCTCATTTGCGACGCTATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAG:1 - chr2L 7994495 5' + jockey 4787 1 50.50 CACCCTTCGAATGAATTTTAAGAGAAAGCCCAAATGTGCTCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 + chr2L 7927203 5' - hobo 2905 1 59.41 CCCCGTCGGAATGCTTTAACCTCATTGGGGAGTTTCAGTGCAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTT:1 + chr3R 14049321 5' + transib2 6 1 73.27 GGTAGCCGATTCACAGGCAGGCCAATTAATGAACGCGACAAAATGGCAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr2L 11065843 5' - P-element 2881 2 75.25 AGGTTACATAAGATCTGGGTAGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAA:1 + chr3L 7806182 5' - pogo 2049 1 77.23 TACCAACAATAGTCTGGAGGATGCGCCCGCTTCTATACAACTCCGTCTTAAAGCCTATCTGGACTTATGGCTCCGAGCTGTGGGGCAACGCATCCAGAAG:1 + chr2R 14274105 5' + Doc 4308 1 77.00 ACTGACTATGGCTTTCCATCGATCAGTTGCAATTTGTTGCAAAAGCGAATAGTGGTCAGCGGAATAATTAACATCATTGAAAACATTTGGGGACTTTTGTC:1 + chrX 12624233 5' + Tc3 1251 1 72.28 TATTAAAGAGAGAGAAACAAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 - chr2R 18503584 5' - roo 407 1 63.37 CAGACACTTAGACACTCCGACTGGCAAATTCTCGTTATTCAGCTGGAAAATTAATTTGAAATACTCATTTTGGTGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAG:1 - chrX 18251460 5' - P-element 2762 1 75.25 CAAGCAGATTGAGTACCATTTTGAAAGTATAAGAATTTAATCTCATCGAAAACAACCGAAAAATTCATTTTGATAGTTTTTAGTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3R 26510480 5' - gypsy7 5018 4 76.00 CCAGCAAGCCTCAAAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCGGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr3R 18507893 5' + jockey 18 1 64.00 ACCCGCCTCCATGTCAATACAGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAATGGCAGAGAAGAAAGTAAAAAAAAATGAAA:1 - chr3L 21707851 5' + Doc3-element 4492 1 80.20 ATTACNCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr2R 8378675 5' + pogo 25 1 54.46 GCAAAGGGTACCGAAAGGAATAATGGTTTCTGTTAGGCCCATATATATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAAT:1 - chrX 20391116 5' + rover 26 2 59.41 TAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTG:1 + chr3R 3590974 5' - Gypsy6A_LTR 383 1 82.18 CGTGGCGAAATAATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTG:1 - chr3R 1868233 5' + G-element 7 1 68.97 CCTTTGCGATTTTCGCACGTGTTGTCTCGCTCTCGCGCGCTAACGGGTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCG:1 + chrX 7195738 5' - F-element 240 1 53.47 TCCGCGATCGAGTGCAGATTGTCGTGGGGAAAAGTAAGTTATTTTCTGATGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATC:1 + chr3L 5831140 5' + F-element 4387 1 51.49 ATGCGTGCCAAAGCCATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATC:1 - chr3R 7388426 5' - HMS-Beagle 7025 2 66.34 GCTGAAAAAACAACCGGAACTGGGCAAGGATGATGCTTTCGCCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGG:1 + chr3L 9365046 5' + micropia 5401 2 58.42 AATCGTAGCAGTACAGAGAAAGCAAAGTACTATGAACTATGGTTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAAT:1 + chr3L 9121809 5' + Transpac 30 2 56.44 ATCAATTTAAAGGATATATAAGTGCAATATGAATGATATGAACTACTCGCATATTATCTTAGCATTTTATAGGACGTGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr3R 17368097 5' + roo 8665 2 72.28 TTGGCAGACTAGCTCCTTGGAATATTTATTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCA:1 + chr2R 2552088 5' + HMS-Beagle2 6890 2 72.00 TAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2L 108000 5' - P-element 2851 1 43.56 CGAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chr2L 108074 5' + P-element 20 1 60.40 ATATTGGGACTTATATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chr2L 18028676 5' + flea 32 2 64.36 TGCTGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3R 13715154 5' - P-element 2861 1 53.47 GTGATAACTGCGTCAAGTTTAAAATTTCATTAAATATGATGAGAGTCTGGTCGCCTGTGTAGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chrX 19392630 5' + F-element 42 1 43.56 ATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 + chr2L 17861775 5' + Doc 49 1 40.59 AGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCT:1 - chr2R 5084088 5' + F-element 30 1 49.50 CGAATCGCAAGGACAAAGATGCACTTCACGACATGGGACTTTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 + chr3L 13080934 5' - 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INE-1 93 1 55.45 AGTCGAATAAATATGAATCTGCAGTGACAGTTTGATTTCCATCCGTTATTTGCCCCCCCTCAAAAATGTATTTTCTCTCGGCATTCGGCATTCCACAGTCT:1 - chr3R 19191582 5' + Doc 1 1 77.23 AAATGAAAGAAAAGCAAAGAAAGCTAGAAAAGCATATCCTTCCCGGCCAGATCTACGCAAAGAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTA:1 - chr3R 11248753 5' + P-element 455 1 66.67 GCAATTAAATCTACCTTTCTTTTATTCGCAATTTGTTTGTTTGCTTTATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 - chr2L 17430727 5' - opus 472 2 62.38 TGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 + chr2R 6984332 5' + HMS-Beagle2 40 2 65.35 AATCTTTTAATATCAACGCCTAGAGTTCATTCCAACTTTGAAACATAAATTAAACGTAAAATCCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCAC:1 + chr3L 20157633 5' + 1360 135 1 61.39 TGAGTATTTCGATCTGAGCTTGATTGTTCTATATTATATGATATTATTTATTTTTATTCGAGATAATGCGTGTTCCTATTTATTGTCAATG:1 + chr3L 24356120 5' + micropia 161 2 78.02 ATTTTTTATTGAAAAGGCCCTCAACACCATTTTAAAAAAAATATTAAAGACAATGACCTCCAAAACTACTACGCCCACACTTTTGCAAAATGT:1 - chr3L 22787679 5' + INE-1 255 1 73.12 TCCTCATGTTTTTGGCCTTTTTACACAGCCAAGGTTTCTTTTTTCGTTTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCT:1 + chr3L 20861120 5' + 1360 3279 1 59.41 GCGGTGGGTCCTAGTCCTGGCGCTGCCCTCGAGTCCTTTGCTGTTATTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAG:1 + chr2R 8828731 5' - Quasimodo 6978 2 53.47 TTATCGATTGGAATTTGTTGCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 - chr3R 7101076 5' + pogo 19 1 60.40 AGTGGTGGCCCGCAACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTAC:1 - chr2R 9014509 5' + blood 6 2 73.00 TTCCACGCATATGAGTAACATTTTTATTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2R 17127678 5' - roo 9022 2 77.23 CAAACGTCACTAGCACATACACGCACATGAATATGTACATATATATAAATGTATAAATATATATATAAATATACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 - chr3L 13338138 5' + opus 112 2 72.28 CCAGCATACCCCACTTTCTTGTGGCCATTTTGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 5467416 5' - gypsy11 3933 2 63.04 AATAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr2L 5974410 5' + roo 33 2 60.40 ACAACGCATACATGTGCTCACTCGTTTCCTTGTGTGCGTAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAA:1 - chr2L 2197166 5' + P-element 13 1 65.35 CCTTTTCCTAAGCAGCTACTAACAGTATTCCCTAGCTAACCGTAGAACAACGCTTGGAACAATCTTTATTTGTAAGTTTATTTGTGGGGATGTTTAGAGTC:1 - chr3R 8324018 5' + Cr1a 4058 1 71.29 TAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 + chr3R 6147273 5' - copia 5074 2 74.00 CGAATNCCAAGTAACTAATTTACTTGGCTCAGTAAGGTAATTTCGCAAAATCGAATAAGCTCAAAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGC:1 + chr2L 16477384 5' - jockey 160 1 66.34 GCCAGCACTCCACTGGTGGTCACACTGGTAAGGCAGCGTGGTCTGGCGGCGCTGGTCGGATGCATGAGTCCCCTAGCACTGGTGAGCCATTTTCT:1 - chr3L 11223809 5' + Rt1c 392 1 70.53 ATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCT:1 + chr2R 5485084 5' + 1360 49 1 75.25 AATATATCCTAGTTCGTAACGTCACCCGATTACCAATTGATCGTATCTTCCTCTCAACAACTCAAACGTCGATCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTA:1 + chr3L 8836402 5' - R1A1-element 5020 1 60.40 ACTCCTTCGGGTCCTTCAGAACGATGACATTTCAAGTCCTTGTCCTTTGTCTCAGTCTTTTGAGTAGAATCAGTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTC:1 + chrX 2063976 5' + INE-1 110 1 61.39 TACACATGTTCCGCTACTACATACAATAAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATT:1 - chr2L 10239893 5' - I-element 148 1 74.26 GGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTT:1 + chr2R 12185347 5' - accord 7337 2 71.29 CCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr4 311580 5' + 1360 38 1 63.37 CAATTGATTAAAGCTTAATTGAATTTAAAGTCAAGTCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGA:1 + chr2L 16148208 5' - Tirant 8447 2 65.35 ATTAATACCGATGTTTTTCACGGCGGCGTTATCTCCTCACCCATAGAAAGTTGTTGTTAAAGCAGTCGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3L 13994180 5' + P-element 9 2 68.32 TAGCCGAATGGTGGAGCAGGGGTTAAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGTAGAGAGGGAGAGCAAGA:1 - chr3L 19155269 5' - Doc 384 1 73.27 ATTGCGGGATTATTGAATATGCCTAAACCCCAAGATAATGTTAAACAATTAAAGCACACACCACCACACATACACACACACACACACACACACATATATA:1 - chr2R 14060624 5' + Quasimodo 38 4 69.00 AGGGAAAAGTTATTAAAAACATGTCTGCCAGCCAAATAACTATTTTTAGGCTTTGCATACTTTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCCTAAA:1 + chr2R 5918942 5' + G2 256 1 38.61 GGCCTGAAAGCCATTTAATTATACAAGTAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - 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chr2L 8740977 5' - Burdock 250 2 74.26 ATGCTGCCAGCAGCCTGAGATGTCGATAAGCAGTACGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 - chr2R 20411945 5' + 297 6605 2 64.36 CCTGAATTATGCCGGGCGGTCGGGGGCATACCAGCGCCATTTTGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGA:1 + chr2R 10911602 5' + P-element 2845 1 49.00 CTACATTTCTTCGAGTTTTATTGAATTTTTATCTTCTGGTGTTGATAATAGAGGGACCGAGGAATCAATCGCTCTGTGCAAAATATCACTCATCGTATTGA:1 - chrX 22562543 5' - transib2 2356 1 55.45 ACGCACGGGCCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTC:1 - chrX 2050877 5' - 412 7511 2 58.33 GGTTGTGTCTTATTTTTTATATTTTCCTTTTTGTGCTCGGCGTTGCATACTTTTTGGGGTGCATTTGGGGATCGGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCG:1 + chr2R 16366740 5' - hobo 2936 1 80.20 CATATGCCCAACAAAGGCGACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3L 3671382 5' + roo 6 2 73.27 TTTTTTATTTTTTTTTTTATTGCCAGTCTGTCACAGACAAAAAAAAAAAGGAACAAGAAAA:1 - chr2L 16613556 5' + Doc2-element 233 1 73.77 TGTATGTTTGCTCATTTGCGACGCTATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 - chr2L 7994491 5' + jockey 4791 1 54.46 GCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTAC:1 - chr3R 1868207 5' + G-element 20 1 54.05 ACTATAGTATTTTTAGATATCTTTTTATTTTGGATTTTGTATATTTACTTATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 + chr3L 16345532 5' + 297 6599 2 57.43 TCTGCAATCCTCTCTCTCTCGCGATTCTGCCACTGCAGAACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3R 30272868 5' - P-element 2852 1 45.54 GGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCT:1 + chr2R 6984304 5' + HMS-Beagle2 12 2 67.33 CGTTTGCTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2L 8031269 5' - P-element 2837 1 30.69 TAGAAGGTATCTAATTTAATATGAGGAATCAGAAAAGACTTGAAATTCTAGTATTGTGGAGCTATCACCATAGCAACTAGCCCGTGTCAGCGAGCATACGA:1 - chr3L 12592837 5' + R1A1-element 318 1 61.39 CCCTAGACGCAGGTAATTAATTGTCGGGAACTCTGAAATTTCTCTCAGTGATACTTTTAGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3L 14364942 5' + blood 7029 2 59.00 TGTACATTAAAAACCTTTTCTAGCCTCCCATAATAAATTAGTCGACAAATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCG:1 - 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chr2L 9389135 5' + 1360 16 1 61.39 AACTGAATTTCGAGATATTAGTGTTTCAATTTCCATATATTGTTTCCAAAACGATACATATGTATGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chrX 14043916 5' - opus 7495 2 48.51 CGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr3R 30272813 5' - P-element 2847 1 39.60 ATACGAAATACAAGTTAAATATTTGAGCAGCCCAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chr3L 2800236 5' + blood 7011 1 79.21 CCAAATTTAGCAAGATCTCAAAACTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chrX 13682380 5' - roo 9031 1 74.26 TGGGTAATCGACTTTTCATTCTGAGCCCCTTAGTGTCCTTCTTTTCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCAAGTT:1 + chrX 18297429 5' - X-element 4616 1 73.27 TCGGATCTGTACTCGTTATAGCAAGAATTTAATACTATATCCATTGGGGCTCACTCCACCTAATCCTCGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr2L 6227741 5' + roo 10 2 72.28 GGTGGCATGCGCTGCGGGAATTTTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGATACCCACTTTAATGATTCGCAGTGGAAG:1 + chr2R 10313106 5' + P-element 293 1 26.73 AAGAAGTAAAATTAAGAAAATAATCAATTGAACCTCATTGAATTATATTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3L 7808490 5' + jockey 32 1 54.64 GAGAANGATCGCGAGAAGAAGGAGAAGGAGCGCGAGGAAAAGGATATAGGATAAAGTCTATTATAAACAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTC:1 + chr3R 23976399 5' - Cr1a 4172 1 55.45 GGAGAGGAGAGCAGGTCGCCTGAATTCCCAATGAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATTTTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGGCTT:1 + chr3R 30326402 5' - I-element 64 1 69.31 GGATTCCCCTTACTATGCAACTGTTACTCCCACACTATGCCATATTGCCACCCACTGCTGCCTTGCGATCGTTCCTTCGATGACTGATTGTCGATAACTTC:1 - chr3R 14097122 5' - flea 4836 1 59.41 TCCGTCCACGTGTACCAGTGTCCCATCTGAATGGCATACTCACGGCTCCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 - chr3R 25823721 5' + hopper 27 1 52.48 CCACAAGCAGCCTGGTTCGCCAAAAGGATCGCAACTTAGGTGAAGGTAGTGAAGAGTCCTGATGACTCTTCGACATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTG:1 + chr2R 1515958 5' + opus 112 2 43.56 TATGTTGCTGCAGCTTGAGATCATCGTCAGCTGCGATATGTTGCTGCAGGCTTAGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 - chrX 1671409 5' - mdg3 225 2 46.53 ACCCGCCGAAAGATCTTCACGCTACTGCTGGCGTAGTGCTCCCGGCTAACTTTGCTGGCGTACTTATATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACG:1 + chr2L 13827606 5' - Max-element 452 1 65.00 GGCCCTAAAATAGAGAGTGAATTTGCGAATATTTCAAAAATATCAAATTATAAGCTGAAAGCACTTGTATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAAAA:1 + chr2L 11737789 5' + Idefix 347 2 66.34 AGAATCTCGATTAGTAAAAAATGGGATTCTTAACAAAAAAATTTAAGATCAATTGCTTAAAGCGTAAATTACTATTTATTATTATAAATATTATTGTTATT:1 - chr2L 7588330 5' - mdg1 31 4 75.25 CGCACGGGAAAATGGCAGAAAAGCGGAAAATGAGAGGGCATCAGGCCAGACACGTGTGTGCGGGGGTTGAAGTGTCCACACACACACACACACACATATAT:1 + chr3L 1926516 5' + accord 185 2 60.40 ACACTGCAGCCAAAACAGATGCTGAAACTGTACACTATGGGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCC:1 - chr3R 1273078 5' + 17.6 7155 2 60.40 AATCCNTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGC:1 - chr2R 19386730 5' - 1360 119 1 48.51 CAAAAAGTTCACTTTTGGAGCGGAAAACATGTCGTAGGGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chrX 1954509 5' + Tirant 39 2 62.38 AATAATCAGCTTACCGCTGATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTAC:2 - chr3R 4543250 5' + 3S18 5801 2 57.43 TAGCATAGAAAACTTTTACTTTTGGCAAGCTCGCTTTTCAACCTGTGTGACACGGACATTTTCCAGCATTTATGTCAGTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3L 2427604 5' + hopper 148 109 74.26 TTTCGTTATCAACAGCTCATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACT:1 + chr2L 20928070 5' + Chimpo 30 1 56.44 AAAACCGTCTATATGGCCGGTTCCAAGTCCCCACCCCACCGCACCGCACCAACACTCACTCCCTCCCTCAGACGGCCACGCTCGAGTTGCAGAATTGAGGA:1 + chr2L 377558 5' + diver2 4418 1 44.55 AGTTGATGGACCAATAAAACGGTAAATTTAATAAGCGCTTGACAGGCGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAG:1 + chr3R 21795535 5' - Ivk 4937 1 53.47 GTTATTTTCGTGTTATTTACACGTCACATGGCTGTCACCGAAGGTGTTAAAGTTCAAATTGTGTCGCTTTGTGGTAGCCCGAATGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 6853740 5' - accord 7032 2 70.30 AAACTTAAATAGAGGAAACTAAAGTCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chrX 20974839 5' - opus 7485 2 63.37 ATGCCAACAACAACAAATAGAATCACAGCTTCCAACAGCAGAAACACCAAAAGAAGTTAAATCGAAACTAAAAATAAATTGTGACAGAACAAGACAGAAAA:1 - chr2R 16507399 5' + Fw2 95 1 74.26 ACGAGGAACTGACCTCATTTATGCAACTACGTACATACATATGGCCATGCATATACATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTG:1 + chrX 15195211 5' + Transpac 16 2 62.38 CTTAGAAAATGTTGAATATTGCAAATCATTTACTTTGGGAGCGAGATAGGGTATTCTTAAGCTCTCTCTCTTTGTATTACTTAGTTCTGAACTGATAGCC:1 + chrX 15507822 5' + Chouto 129 1 60.00 CAAATAATACTTTGGAAAATGTCCACGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2L 11065889 5' - P-element 2835 1 29.70 GTTCGAAAAGTAATTTATAGCATTTAACGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAA:1 + chrX 868679 5' + jockey 4911 1 76.00 GTATTNCATTGCTGTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTT:1 - chrX 20880666 5' + invader4 2784 2 55.45 TTATATGTATAAGTGAAAAATATTGAAATATTCCCATATTCTCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 13127661 5' + roo 8695 2 59.60 GTTCTGCCGGCTCAATAGTCCGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 - chr3L 13994246 5' - P-element 2832 1 22.77 GCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 7101045 5' + pogo 50 1 82.18 GCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCT:2 + chr3L 19951211 5' + Ivk 43 1 67.33 AGCCAGAGCCCGTTGGCAAGCCGATTTGATTTTACCTGTCGCCGGCAGTACCGTTTTGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCA:1 - chr2R 24620578 5' - F-element 490 1 61.90 ATAACTGAAACAAATACTTGTAAATACCAACACAATAAAATTACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACT:1 + chrX 7787200 5' - roo 406 1 74.26 TTATATATTTCATACTATTTTCTTTATTAAATATTTAGTTACATTTACCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 + chrX 13682553 5' + roo 28 2 53.47 CTTGCAATGGAATGTTAATCGATATACCTAGTTAATGTATAAAAATTTGGTTATGTACAGTTGGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAA:1 + chrX 1245564 5' - Juan 444 1 62.38 TAATAAAAATGCTTTATGTATATCGCAAAGTATATTTTGGAAGTATTGCACGAGGTCGTGTAATGGTCAGGATGGCCGTGTCGGCG:1 - chr2L 18009640 5' + invader4 2746 1 52.33 GCATGGTTTTTTTATACCAGCAAGAACTAGACAACACACAGATATCTGGTAATGTTGTAAGACGTGGAATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTG:1 - chr3L 13993267 5' + P-element 154 1 67.33 CACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:3 + chr3R 20845052 5' + 17.6 36 2 71.29 AGTGACCAGGTGGATAGATTTTGGACCTCCACTCCGCCTTATCAATCTGGCCATCAACAATTGGATACCGCCCCGCTTGTTGTTGTTATTATTATTATTAT:1 - chrX 20321576 5' - mdg1 7058 4 55.45 CGGTTNAGGGAGCAAATTGATATCTCGACCATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGACTGTTCCAAGCATAGTTTTACGGTTAGCTAGGGACGGTAAAT:1 - chrX 18416301 5' - Cr1a 3999 1 71.29 TATGANCTGTTTAGAAATGACCCCTTTATTTCTAATGACAACTAATTATTATAATAATATAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCG:1 - chr2R 13643905 5' + F-element 26 1 50.50 CAAGAGATTAATAATAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chrX 12546521 5' + P-element 10 2 67.33 GGAAGCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:2 + chr2L 19075657 5' + Transpac 4952 2 59.41 AAACCAAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 - chr2R 20702156 5' + Doc 44 1 66.34 AAACCAAAATGGCTGACCCTGCTCCTTGGCATATTTGTTTCTGTATCTGTGTCTGTACTCGTTTCTGTATCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCA:1 + chrX 10822928 5' - accord 7028 2 72.28 AAGGCCACCGCTGCCCAGCGGGCGGAAAAGGCCCAAGAGCTGCAGCTAAAGGAGAAACGTGTAGTGAAACTCAGGAGTTAGATTTTGGAGTCTACTCAAGA:1 + chr2R 21327922 5' + 1731 401 1 67.33 GTTTGTGGTGCGCGAGACATTATGGGTTATGGCATATGTATAAGTACTATAAGGGTTGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr2L 9389166 5' - 1360 3371 1 51.49 CCGCTCCTGAAGTGATCAACCTCGTACTGTCGTTCGCATTCTTACTAACTGAGTAACGGGTATCTGACAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTG:1 + chr3L 25243622 5' + INE-1 578 1 67.33 AAGGCGGCCACGACGGATCCTCTGTTGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAA:1 + chrX 1954461 5' - Tirant 8457 2 72.28 ATCTACTTACAAAGCTTTCTTAGCCTAGGTCGAGCAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGAT:2 - chr2R 4794718 5' - Tabor 131 2 71.29 ACCAACCGTTGAAATCAAGTGCATTAATTTATTACACAACAAGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACGTAGGCCTCTG:1 - chr2L 2441383 5' + roo 285 2 58.00 CAACAAAATCATAAAGTAAGGTTGTGAAAAGATATATCTACTACTATATCTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 + chr3R 7100984 5' - pogo 2076 1 54.46 TAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr3R 12894122 5' + blood 53 2 76.24 ATATTTTACAGTTTTCTATAGAGTATATTGTATAAAATGAAACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3R 17368122 5' + roo 8738 2 55.45 AGCTTTGGAACGTGTGAAATATACATATAACTTCAAATAACCTTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAAAATTTTGGG:1 - chr3R 10445261 5' + roo 8689 2 62.37 CAAATGTTATGCTGCCCCACCAATACTGACTGAGGATCACTTCTACGGTTCGCTGACGTGTGAAGACGTGTTTTCATCGAGCTCCGTATAAAATCGGTTGT:1 + chr3L 13606485 5' + Doc2-element 40 1 54.46 CAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTC:1 + chr3R 9254898 5' + F-element 201 1 59.60 GCTTAGCAGGCTAAATAAAAAGCAGACAGGGAAGAGGTCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAA:1 - chr3R 29351981 5' + opus 356 2 72.63 GGAGATTTTGGAGACTTGAAAATAAATGTATTTTCTTATTAGGCGAATTAAGAGCAAACCTTGTTAATTACATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chr3L 14050082 5' - pogo 2097 1 75.25 GGAAAGTTTCCCTAAAGAGCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCA:1 + chr2L 107988 5' - P-element 2863 1 55.45 CTTTATACGGCAAATAAGCAAAGGACATTCTTATAAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAA:1 + chr2L 17841020 5' + Juan 4040 1 51.49 GCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:1 - chr2R 13122068 5' - opus 7466 2 76.09 GATGCAATCAATCTAACTATAATAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAG:1 - chr3R 4543232 5' + 3S18 54 2 75.25 TAATTTGTCCAAATACTTATGCCACTGCTAATTTGTAAGAAAGTAATTTTTGTTAAATCAACAATAGTTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCA:1 - chrX 22943377 5' - Tc1-2 52 1 64.36 TGCGATCCAGAAGAGCGCGCATCCGAGCCCCGATTTTTTATTTTGTGTTTGTCAAACCAGCCATGGTTTTAAATAATATTCTTTAATTATCATATATTTTA:1 - chr3R 20791363 5' + Cr1a 87 1 76.24 CAGAGTCCAACGAAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 - chr2L 13837957 5' + 297 2 2 76.09 CTGATCCACTGCAAACAGGAAAATAATTACACCCTCTCGAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:2 - chr3L 1078974 5' + I-element 42 1 64.36 AATTCNAGCAACTTGGCTACTTTAAATGTCTATAGCTCTCATTTATTTACATAAATATTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 25285056 5' - roo 387 2 56.44 GCCGTGCCCATTGTGTTAACTGGGTCTTTGCCGATAGTGAATTTATATAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAGTATCAGATACCCGTTAC:1 - chr3R 22525200 5' - INE-1 551 1 74.26 CATAAAATTTAATAAAGATATTTAAAATACATTTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCC:1 + chr2L 20928087 5' + Chimpo 47 1 73.27 ATGTTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGC:1 - chr3L 19350031 5' + 1360 3194 1 64.36 GAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATT:1 + chr3R 4543206 5' - 3S18 288 2 75.25 TGTATGCTTTACTATTATATCATAGCTTGTTAAATTATTTTGTGTTTAATTGTGTGTTCGTTTTTTTTCTTGTTGCCTATCCAATGTTTAATATTTTGAAT:1 + chr3R 16350143 5' - invader2 4695 1 62.38 AGCCACGCCCCAACATATCTAAATCTGTAAAAGTGATTAAACAAACTTACGCTGAGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTT:1 + chr2L 12572493 5' - INE-1 167 1 61.39 AGACTTTCTGCATCTATTTATTTAGAAGCACTGCTCCGGAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 19192524 5' - roo 9047 1 56.44 GATTTGGTCAATCGATTTGGATGTGTTGCTTAGATATTTAGCCTTCTGCTGGACAATTTCCGTAGGTCCAAGGCGAACCAGTTATTGCTCGCAGGATTTTT:1 + chr2R 5284654 5' - Doc4-element 2670 1 57.43 CCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 12779110 5' - roo 9021 2 74.26 TTCTGGCACTGCAGAACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chr3R 30272844 5' - P-element 2828 1 16.83 GGCAAAAGCAGCTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACT:1 + chr3R 17308341 5' - P-element 50 1 24.73 AATCTTTTGACACAAATTAAACGAAATTCCAAAAAAATTTCTTCTTCGTCCCTGCTTCCTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACTAT:1 + chr3L 13428270 5' + INE-1 564 1 69.31 TGAGTCAGCTGAAAAAGAATTTCACTTAAATTTGGTTATTAAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 - chr3L 20903864 5' + F-element 51 1 62.38 CAGAANGGTCAGCTTTTACGTATCCACATCATTGTCCTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTCTGAGGA:1 + chr3R 509493 5' - R2-element 3245 1 38.61 GGGGTATGATGATTATATTCACACACCATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:2 + chrX 19306750 5' + P-element 30 1 49.50 GGACTTGTTGCGGTCAACAATTTTGTGAATAAACGGATACCCAAAAGGTGGTAATACCGCCAATCGATTGACTTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGT:1 - chr2R 12218189 5' + Transpac 4848 1 75.00 GTAAGTGCCTTAAGTTGATCCTTCGGCTGGGATCGAGCGCATTTTTTTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGT:1 - chr2L 18402946 5' + Cr1a 182 1 55.45 AGGATGTCCATTGCGACAGTTCTTATAAACAGAAATGATTCTGAGAACTATATCTAGGACACTAAGCTACGTTCGGAACGAAAACATCCAAAGAGACTTAA:1 + chr2L 23048165 5' + F-element 4382 1 68.32 GACAGGGCAGTTCATTCCATAGGCGCTTTACGCGCACCACAGCCTCAGTATTGAAGTCGTATCTCTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGG:1 + chr2R 7923335 5' - Ivk 4982 1 74.19 GAGGCAAAATATTTTCCGGTAATATAGTTTGGTGTTTGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGT:1 - chr3L 12243606 5' - 17.6 6944 1 63.37 TGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGG:1 + chr2L 1626543 5' - roo 9030 1 64.36 TTTGTCATTTGCTGGTCTAAGTTCGGCATTCCGTATGTATGTATAGAGAGCCAGGGCACAGCGCCATTCTATTATGTAATTCTAGTTTTGAGTGTTTTCCT:1 + chr2R 21598291 5' - Porto1 4202 1 66.34 ATTGGAGACAACCTCCATGCTCTCTCCTTCTCACTCGCACCTTCACAATACCACAGCAACGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTA:1 - chr2L 9205532 5' + F-element 4549 1 66.67 AGTATTCTAAAATATTGATTACCAGTTCTTTAATTTTTTCAAAATATATATACATACATTGGTCGTTTTTCTCTGCTGACCCTTGTCAAAGGAGATCGGGA:1 - chrX 17263409 5' - X-element 4518 1 73.27 AAACAGATAAACCCGGCATTTCTCATTTTGATGTGTAAAATTATTTACAGATTTTGTACATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 6780629 5' + flea 4768 2 53.47 ATCGTNGCACACCCGCTTTTGCACATTTACATTCTCACATAACACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATAC:1 - chr3L 11605896 5' + I-element 5136 1 58.42 GTTTAACTGATAATTTTTTAAACAACAAAAGGTTTATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 12571480 5' + roo 8704 2 75.25 GCACACTTTGTTTGTCCACTGGCACACACACACACGCGTTGGCACACGCACACCACGACAAAGAAGGAGGACAGGCACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACT:1 - chrX 10621768 5' + hobo 2 1 77.23 TCCACTGGACTCTCAATGGACAGCCGATAACGAACGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACGGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAAC:1 - chr2R 7343882 5' + F-element 409 1 62.63 TTATGAATTTAAAAAGAGTTAAATTTTGGAAATTAGAGTTTCAGCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr2L 9946984 5' + roo 8695 2 60.40 GTTAATTGTATAACCAGAAAATGATAGTCTTAATTTATATTGATACGAGTTTAATAGTTTTCATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAG:1 - chr3L 6127159 5' - jockey 4804 1 69.31 GCCAGNGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATA:1 - chr2R 4502494 5' + roo 8700 2 62.38 CACGTGCATTTGGCCAAACAGCCAGAGAGCGAGTGCCGCGAATGCGCAGTGGGTGGTCAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTA:1 - chr3L 21194543 5' + jockey 4776 1 61.39 GGACAAAGATCTTAAATACTCTTATTTCGGCACCAACTGACAATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAA:2 - chrX 495260 5' + 412 8 2 69.31 TGCTGATAACGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 - chr3R 7360379 5' + jockey 17 1 67.35 AGCAGNGCATCTGCGTTCTTCAACATTCTTCAACACAACAGCACCAGCAGCAGCAACCGCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGA:1 - chr2L 13060348 5' - P-element 2871 1 62.38 CCAGCATTCCATCCTTCTTATCTGTTCCCAAGAAGCTATCCTGAACCCTGATTTCTGGTGTTCGCTTTTCTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGAATT:1 + chr3L 25255340 5' + GATE 8457 2 52.48 GTAAGAAAGATAATAAAAATAGGAAATAATTGGTATGTAACAAATGGAAGAAAGCGTTTCCGAACATTTAAAGTATAGTATTCTTGATCAGGATCAATAGC:1 - chr3L 17201881 5' + INE-1 86 1 68.32 CAAACGCCAACTACCAAGACGCGCATCGCCATTCTGCGCTTGGGATAGCCTAACTAATTAGAATAAGCATCAGTGTAAAAACTAACCACGCTGAATAAACA:1 + chr3L 21181040 5' + GATE 144 2 67.33 ATAGGCTCGAAAGAAGAACTTTTAGTAACAATTTAAAAAAATTTTATT:1 - chr2L 6799602 5' + HB 326 1 91.67 ACGTGGAAAAATGTTTGGTAATTATTCCGAATTTGGATAATTACAATGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 - chrX 9424019 5' + 1360 78 1 54.46 ACAGTATTACTCAATATTTCTAGTATACCTATATATATGTCGGTGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCA:1 - chr3L 26013737 5' - invader4 3042 2 71.29 GAATGTAATAGCCCCGCTGATTGCGAATGGCTCGAGAGGATGTGGATATGGATGTGGAACTGGAGGTGGAACTGGAGGTGGAACTGGAGGGGGAACTGGAG:1 - chr2R 7109517 5' + R2-element 3188 1 79.21 CGCCCGCGCACTGCAACGCAATGCGTATACATACACCCATCCTTAACATACAAATATTATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGA:1 - 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HeT-A 23 1 51.49 GATGGCCGAACCTTTTTGGACATTTCAAATTATTTGCATGCGAATTTGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATC:1 - chr3L 17610304 5' + 17.6 75 2 53.47 GCCCAATTCAATGTTCTAATTTAGTAGCGTAATCTGTCTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTA:1 - chr3R 16574866 5' + transib2 2785 1 62.38 CACAAGTAAGCCGCACAGACAAGTTGTTTTAGCACCTATTATTTGAACATATAAAGTATTTATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCA:1 - chr3R 14295247 5' + INE-1 102 1 53.47 TAGCAACTGAATTTCGAGATATTAGTGTTTCAATTTCCATATATTGTTTCCAAAACGATACATATGTATGTACATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chrX 14043920 5' - opus 7499 2 44.55 AATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:1 - chr2L 16082668 5' + Stalker4 6996 4 62.38 GCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:2 + chr2L 7548008 5' + blood 43 2 68.32 CCGATTCCAAGAAAAGTATCTAACAGGTAAAACGATGGACATGATGTATATATATATTCTAAATCATCGGGCAAAATGGCAAATCGGTTATAATTGTTGGG:1 - chr3R 4501921 5' - Fw2 125 1 59.41 GATGTTGCCGCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3R 11993278 5' - P-element 2868 1 59.41 TTTAAACAAAATGTAGAAGCTCGTTATGAGAAATCGTAAAGTTAATACAAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCT:1 - chr3L 2292176 5' - Max-element 295 2 66.34 TTTATTAGTTTTTACTATTAGTCTTACTACATATCTTTGCTTAGCTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3R 19967600 5' - pogo 2068 1 61.39 GATATACCTTGCTTGTGAATAGTTAGTGATGTACGCTGACACCAATGACAGTAAGAGAATGAAAATTCGCGCCCTGATTATTATAATTTTAAAGCTTTTTA:1 + chr2R 4181245 5' - 1360 3020 1 69.31 AAATGATATTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATAT:1 - chrX 23457221 5' + Stalker2 23 2 54.46 GTAACCTAGGCTGAAATCTTTTTCGCCGAATCCACTCACCTGGCAGTTGTTGTTGCAGGTGTTGTTGCTAAAGGTGGAGTTGCAGTAGATATCGTGATTGC:1 - chr2L 12389688 5' - Doc3-element 497 1 58.42 CACCGAAAGTGGGCGTGCTCCAAATCAATTTCCATAAAATCATCCAATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGACGTAGAGGAGAAAGTAAGCCAGGAGAA:1 - chr3R 7307042 5' + TAHRE 310 1 50.50 ACAACAACAGAACAAAAATCGGGGAGGTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGC:1 - chr3L 10034025 5' + jockey 4944 1 73.27 ATAAAGGAGTATTTGCATTGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 + chrX 19306777 5' + P-element 57 1 22.77 TAAATCAGGATTTTCGCAGCCCGAACCACAAATGTTTTTAAAAATTTGCGCCCTGACAATTATAATTTTAAAGCTTTTTAAATTTGTTTGTTAGAATCGCC:1 + chr3L 10182020 5' - 1360 2999 1 64.36 TTAGTCACCTGAACGTCTTCAAACAGCTCTGGCAGTTAAGGAAGCAGTCCCAGACCCTTAAACGCGGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTG:1 + chr2R 8464485 5' + jockey 183 1 73.27 TATAAGTTAATTATGTTTAAAAGGAAATACACAATATTTGTTCACCACCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAGTGAACTGTGACAAACAAA:1 - chr3R 1146441 5' + gypsy4 359 1 71.29 CCCAGAAATAGAGCCCCAATCCAAATCTGCGCTGCGCACGCAACGCAGTCCAACTCCCAGTTCCCCATACATAAATATAAACAAAGTGAGGAAATGTTAAA:1 + chrX 13010470 5' - Transib5 2624 1 76.24 CAATCAGTGAGAGTTGAGACTGAGTTTTCCCCTTCATCCGAGACTGCTAATTAAGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGG:1 + chr2R 10908747 5' - 412 165 2 61.39 TGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATATTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGCCTGGTGAAGTCGGCAG:1 + chr2R 5039404 5' - gypsy11 4269 2 76.84 TCATACGGTAAAATCTCAAAAAAGTTATTGGATTGCAACGGATTTTATTTTCGGTCGATACGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 - chrX 21388625 5' - 1360 3378 1 45.54 TATTATAAGAAAAACGGTTCAGGGGTTGAAGTTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 - chr3R 24152943 5' + P-element 18 1 60.40 ATGGGCGGGTAAGGACAGTAGTTAAGACTCTGCTCGCAATTATTCGAAATCTCTGTACTTAGGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAG:1 - chrX 2589815 5' - copia 4993 2 65.35 GCCTAGCATTGGGAAAAGTTGAGCCACCACATTTGCCGCTCACCTACAAAAATTCGTGGATTCGCATTCGAGATTCGCGGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr2R 23248303 5' + Doc 32 1 52.48 ATATTATAGCTTTGGAACGTGTGAAATATACATATAACTTCAAATAACCTTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:2 - chr3R 10445268 5' + roo 26 2 60.40 GTTATCATCTACGTATATATTTCTAAATTTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 - chr3L 7989831 5' - mdg3 5490 2 71.29 TAAAAAAGGAATCTAGTAAATTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 + chr3R 10741075 5' - 1360 3377 1 68.32 AAGGGCAAAGCCAATTTTCTGCGTTCTACCAAACTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAA:1 + chr2R 3492834 5' + 1360 102 1 71.29 AAAGCACTCACCAGAAATTTGTTGGTGCGAAGGATGAAGTTTACTTAACGAAATGAAAGAAATTGAAAAATTACCAGGATGATGTTAAAACTTTGCATAAT:1 - chr3L 15736682 5' + transib1 1863 1 77.23 AGGTGAGGCAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTA:1 - chr3R 20884949 5' - flea 4970 2 73.27 ACTTGGGTCTTTTGTCCGTCTTCTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 - chr3R 19989848 5' - pogo 2051 1 77.23 GAAAATACGATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3R 29432744 5' + 297 30 2 58.42 TTTGTACACGAATGTATCTAGTTACCGGGTTAATATGGCTAAAATATGATCTCAGCTCTACGCAGCCCTAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCT:1 + chr3L 20149838 5' + FB 490 1 49.50 ATAAGCAAACAAAGAAGTTTTTGCTGTCTGGCTTTTGGCTTGTTTAAGAAAAAAATATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 19622897 5' - pogo 2085 1 62.63 AATTAATTTTCCACCGACGCCCAACCCCTTGGCCACAACCAAAAAAATAAAAAAATAATTCATCAAACGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATC:1 - chr2L 7170984 5' - Tc1 1355 1 64.36 AGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr3R 7101054 5' + pogo 41 1 73.27 TGGGCGGCCCGAATTGGGAACGCGTCGGTTTTCACTGGCGGCCAAAAAAAAAATAATTTTTCACACGCCGCAAGCTGAATACTCTAATGACAAATATTCTA:1 + chr2R 11653843 5' - 1360 399 1 52.48 AAGCTGAGTGCAGTTTTGTCGTTCAAGCTGGCAGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGC:1 - chr2L 15893799 5' + Max-element 8234 1 80.20 GGCGAGATTTGACTTTGATGAAGGAATTAGCTTTTTTGGGTTATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 - chr2R 14457760 5' + mdg1 7075 2 59.41 CTTTTGTGCACCATGGTAGCTGTTGCAATTGCCGCAACAACAACAACAACGGAGAACATTGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chr3R 17121617 5' + mdg1 7057 2 59.41 TTTGAGCTTTCTCCGCCTCCAAGCAGGATGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGC:1 + chr2R 21619545 5' + 1360 203 1 71.29 ACTCACTGGCGCATAATTTATTTGAGCCGGCGCGCGCCTTTCATTTCAATTCCCATTTCCATTATTATTAACATTACATTATTATTATTATTATATTATGA:1 + chr2R 21378824 5' - invader3 5053 5 62.38 ACTAATTTATGCTCAAAACTGGAATGTAAAAGTCAGATACTTGCCAACTAACTCCCACAAACTCCGATTGCTGCACGACATTTTTGTTTTGTTTTTTGTTT:1 - chr3L 507402 5' - Porto1 189 1 73.27 ACTTTNGTTTTTCTGGAAATCTTGAGTGAGAACAGTAGATTTATGCTACACAGTAGAGTTGGTAAAAGATTTTTGTTTATTTTTTTTTTTAATAATACAGT:1 - chr3R 6586332 5' + hopper 160 1 62.38 GAAAGTGAAATACATGCACATAATTTAAATAGAAGGAACGAACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAT:1 + chrX 17064755 5' - Tirant 8470 2 61.39 GAGCGGACTTAAGACAACAGAGTAACATTAGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAAT:1 - chr3R 19609751 5' + Tabor 2 2 75.25 GCGTACTTACATATACGCATATACGCATACGCACACGCACGGGCCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACAC:1 - chrX 2050911 5' - 412 7540 2 71.29 AAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chrX 18012688 5' - roo 9031 1 67.33 ATCATACTCTTTCAAGAATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr3R 12571538 5' - roo 9037 1 60.40 AAGCAACGCCATGCCAGACCCAAAAGACCGATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTAAGAGCACTTGTATCCAAGAGC:1 + chrX 7546753 5' + Idefix 324 2 70.30 AGAGTACAATCAATTTCGTATGCAATTTGAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAA:1 - chr3L 15099621 5' + G4 3829 1 42.57 CTCCTTGAATCGTTGAGATGCAGGATGACAGCAAAGTGCAACACAGCTTAGAAATTGCTAGTTGCTGATAAGTTTCGCGAACCGAAGACGTCACCGTTATG:1 - chrX 8397531 5' - jockey 147 1 60.40 AAGGGTTAGCCCCAACTCCTCCAATCTCCTTGGCCTCACATTCTGTGCAACGAAACCATACCTTGACTGGTAGTCCCCGTGAGCGTGCAAGGACTGAAGAG:1 + chr2R 6596171 5' + Rt1b 5006 1 70.30 GTATTTTTAATGAACCATTGCCATCACCAGAGGCAATGTGTTTTTGGGGCCCGGTTGGGCGGTGCCAATTTCAATTTTTTTGTTGAAGTACTTAATTCTAA:1 + chr2R 9461946 5' - P-element 2618 1 72.28 TCTGGCCAAATCGAGGACCCACATAAATAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAG:1 + chr3R 25440171 5' - pogo 2053 1 78.22 ATGACAACGCTGTATATGCTCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 + chr2L 13447092 5' - HMS-Beagle 7024 2 61.39 AGTACTGCATTAGCATGTTGATTCATCTGAATATTGAGTTACATACCCCACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACGATTTTGGGCTC:1 - chrX 18717222 5' + roo 28 2 55.45 GTTTTGGTTCTTCGTATTTCAGTTCTATTGACCTTTGAATATTTATTGGCTTGAGTTGGAGTCCCTGTGTCAGAAATGTTTTCTGCATCGCGGAGAACAAT:1 - chr2R 22979706 5' + S2 494 1 66.34 GCTTTGTTTGCTTGAATTTTTGTTTCCTTTTGGTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATC:1 + chr2R 25101093 5' - Stalker 42 4 76.24 ATTGTCGTACTCAGCCTGCTGATCGTCGGTACACGCTAGATTATCCTGAACGCCCTTGCCCACAATAGATTCAGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCC:1 + chr3L 6170338 5' + micropia 118 1 74.26 TGCACACTTGAATACATATCGTACACCATATGATAAATATTAATGATATAAATACATTTTCTTGGGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTATACCCGTCA:1 + chr3R 19224659 5' + hobo 2650 1 63.37 TTTTTTTTTTTGGGTTTTCGAACATTTTCGAGTTTTT:1 + chr3R 4661594 5' - FB 138 1 64.86 ACAAAGGTATTATCAACTTTTGTGACGAAAAAATAATTTATACTCAGAAAATGAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAA:1 - chr3R 3468324 5' + Doc 4459 1 55.45 AAATCTATAGTTTTAGAAGTATGTTTATTAGGGTCTTAAAATCTAGTTTATACGTACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTTCCAACTTTAA:1 - chr3R 22383394 5' - flea 399 1 61.39 GCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAA:1 - chr3L 5015879 5' + I-element 4944 1 53.47 AATGGGTTTTAATTGATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr2R 10912100 5' + 412 7092 2 63.37 TATACTTAGGCGAATTTATTTATTTATATATATATTCATTCATTTTTTTGTACACATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGT:1 + chr2L 23369587 5' - Transpac 289 2 52.48 ACAAGATATTCGAACTCAATATTTTATTCGAAATTCGACAACGTTCTCCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2R 13038956 5' - P-element 2857 1 49.50 GAGTATCAACCCCGAACACCAAAGAAATTTGGATGACTTACAAATAAAACTTGTCATTGAGACAAAGCAGAGAAAAATGTAAAATACAATGAAACACTAGC:1 + chr3R 435983 5' + Doc3-element 4499 1 66.34 TCTAATAAATAAAATACTTATCTTTTTCTTAAACAATAGCACTCAATTAAAATCGCGTCTAAACCCCACAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGCAAT:1 + chr4 853230 5' + 17.6 490 2 72.28 AAAGCAGACAGATACGAGCGCATATATGGGAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAG:1 - chrX 4180795 5' - I-element 5313 1 66.00 CAGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGGAAGCGGCCAAT:1 - chr2L 15893768 5' + Max-element 8265 2 54.46 TTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCGAGCATGACGAACGCCGACTCT:1 + chr3R 9254923 5' + F-element 228 1 59.41 TATAACTTCCACGCTTGTGGATTGTACAAGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGT:2 + chr3R 18934104 5' - hobo 2890 1 71.29 CCATTTGCCTTTTTCATCGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAA:1 + chr2R 24493645 5' + flea 9 2 68.32 AAAAGCTCGTCATGGATTGTTTGGACATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 + chr3R 22620165 5' + 297 6582 2 79.21 GCTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTAAATAATTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 - chrX 1715627 5' + pogo 44 1 72.00 TAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr2L 14260735 5' + 297 30 2 60.40 CCGCGGGACAGGCCAATTACCGTAATTGCGGGGACCACGAAAAAGCGCCACATCACATCACACAAGCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACAAACTG:1 - chr2R 10345534 5' + S-element 8 2 66.34 GTATCAGTATCAACCTCTTGTAATAGTATTCTAATTAGTCCGAATAGTGAATATAAGCAACATTTGAATTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTTCGGATACTT:1 - chr2R 7269419 5' - 297 436 1 72.28 TGACAACAAATCCTTAGTTTATTGCCCTTTATGTATATGCAGATGCATCCATACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACC:1 - chr3L 18153887 5' + I-element 230 1 48.51 AGAGTGATTATCACTGGACTCGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTTCGTTGGTGGCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTAC:2 - chr3R 17661408 5' - Ivk 4966 1 80.20 CGTGGAGAGATCGAGAGATGCGCTTCTCAAATTCCATTTTTTCCGTTATACCCCGTCTTTCCTGGAGGCACTGCTTTCGCTCAAGGCACTCACGCTGCTGT:1 + chr2L 20822652 5' - R1A1-element 395 1 59.41 TGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 + chrX 329017 5' + opus 7158 4 73.27 ATTTCNCATTTTGATGTGTAAAATTATTTACAGATTTTGTACATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCT:1 - chr2L 21089233 5' + flea 28 2 56.44 ATTTTGAATTTTCCGAAAATGGTATTACAATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 4986300 5' + roo 8710 2 72.28 AATTATTTGGTTACAATTGATACAAAAAGCGGTAATTTCTAAAGTTAAGTTGGGAGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr2R 9364117 5' + Doc 25 1 49.50 CTCCAAAGCGCGTGCGTGGGAGAATCCAAAAAGGAAGAAGAGCCTTAAAAGTAGTACACTGAGGAAAATATAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTA:1 - chr3L 3826838 5' - mdg1 7134 2 72.28 ATCCGGTAGTTTGTGTGTAAACACCACTCTATCGTTCTAACTTTTTGATTTGTCGTTAGATAAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 - chr4 311603 5' + 1360 15 1 64.36 ATTTCGTGGATGCGGTTGCGTTTGTTGTGGTTTCAATGGGTTTGATTATTCGCATTTGGCCTAGGGACTCAGATTGCTATGATCAAATATAAAATTAACGA:1 + chr2L 14290854 5' - gypsy3 6768 2 59.41 ATGCGTTGTCTAGCTGATAAAGCCGTTTTGTTTGCCCACCCAGTCTCGGCTAATTGGATTTAATATAAATATATTAATGAACTATGCACAGCGCCAATTGG:1 + chr2R 14639143 5' - gypsy7 5040 1 57.43 CCTTTGACCTTCGTCGAGAATCGAAAACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAA:1 - chrX 17064834 5' + Tirant 18 2 57.43 TCATACCACAACTTCCCATATCCATATGTATGTAAATACAATAAATAAAACAAGCGAGAATGATATAGTCGTGTTCCCTGACTGTCAGATACCCGTTACCC:1 - chr2R 6024631 5' - INE-1 549 1 69.31 TTTCAATCTGATCGATTTGTGTATTTGTCAAACTGATTTATCGAGTGTCTCGATTTGATGGCGTGAAAGGTGCCGAGCAGAACACACACACACACACACAC:1 - chr3R 22868751 5' + accord 183 2 64.36 TCAGTGTCTATTGGAGAAAAAGTGAATTGATAGTTTCCATAACGGGTATATTATTGGGTTTGGCTTCAGAAGCCTTTTTTTCTCGTCCGCCCAAAGGTTTT:1 - chr4 946938 5' - Tc1 1167 1 55.45 GCCTGTGTGTGTATGTGACTTTACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 10730619 5' - P-element 2872 1 67.33 ATTGGAAAACAAAAATAAGCAAAAATAAGAAAAGGAGGACGACAAAAACCTGTGAACAAGATAAACAAAAGAAACTAGTGAAAACAATAAACAAAACGAAA:1 + chr3R 9228820 5' + Porto1 187 1 57.43 TAAATATACTTTTGTGTAAAATTGTTATAATATTTAATGGATTGAGCCAACCTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCT:1 + chr3R 28755933 5' + 3S18 28 2 51.49 CCACGAATTTCCAGTCAATGCACTCGGTCCATAAAGTTAATAAACTATAAATTACTATCAAAAAACCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 18009650 5' - roo 398 1 68.32 CGTTGGCGATAAAAGCATATATAACGCATACAAACACGCGCACACAACACATCCACATTCAAATTGTTTGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAAT:1 + chr2L 4426840 5' + F-element 4571 1 73.27 GATTCTTAGAAGTTTACAACCATGGCTATTATCAATGGATTGGCAAATCGAAGGAGTTGACCACCATTTAAAGGTTGGAATTTGAATTTGAATGCGAATTG:1 + chrX 9071032 5' - Rt1a 309 1 81.19 AAAAAATAATACTAATACTAAATACGTTGACGAAACTTCCCCAAAAGTGGGGAAAATGGTACCGGCTGGAGTGTATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCT:1 + chr2R 16129675 5' - BS3 1447 1 56.44 GAAACCTTCGATTTGTTGGTCTGTCATCATGCCTCATCATTGTCAGCCGACTCATCCCGGCCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAA:1 + chr2L 1413299 5' + roo 331 2 61.39 GTACCCAAAACAGAATACAAAAGCCTGGCTCTCCTTTCAACTCTCTCGCCCTCTTGGTGGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAT:1 - chr2L 8543972 5' - Stalker 6926 4 55.45 CTGAATACTTTTGTGTCTATGATTATTACTTTGCAATGATTCCTAACTTTGCTGATCTGTATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTACGGTA:1 - chr3R 29048782 5' + Quasimodo 7159 2 58.42 ATCGGCCTTAAACCATCGCCCCGACCACCAAATAGCATTATTGATAAATTAAAATCTTCTAAAGATACCACCTACCGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCA:1 + chrX 13166688 5' - Rt1b 5078 1 55.45 CTGTTGATTTACACATTTGCTTATTGTGTGTGCTCAGATTGTGTAAAGTTATCCGAGGCTCGTTATTTGTGCTTGTAGTTTCAATATGAATAAATTTCC:1 - chr2L 17029952 5' - R2-element 221 1 66.67 ACTAGGAAGTGAGCGGATCGCACAGCTGTGAAGTGGAGTGCTGAAGACAAGAAGTTGATGGCGATGCATTGCATTTGGCCAGGCAGTAG:1 - chr3L 16286964 5' - Helitron 223 1 74.16 ACATTTAATAGTTAAAGGGATGTGGGGTAGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2R 4639939 5' - 1360 3342 1 76.24 TTTACTCACTGTTGTGCATCTCATTTGGATCGGAATGAATATTATTGTTATGTTTTTAATTTTAGACGTTATTTTTAAGGGGGCGTGTTGGAATA:1 + chr2L 20133752 5' + copia 4858 1 61.05 AAGCCACAGCACAAACATTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGT:1 - chr2L 11583668 5' - Juan 3924 1 65.35 TTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGC:1 + chr2L 21089168 5' - flea 215 2 70.30 GTCGCTAATATTTTTAGTTGTTATTTTTTTTTGTATTCCTGTCTATTATTTGTATATGAGGCATCCCGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCA:1 - chr4 1152109 5' - transib2 2814 1 67.33 CAAAGTCCCACTTAAATTTAACAATATAATAATCGTTAAGCTATTGTACCCCGGTGATACCATCGTATCGTATTCGTGATGGTAACCTTCTCCTGCTGGTC:1 - chr2R 558855 5' + Ivk 452 1 79.21 GTCATGCAATTCCACAGCAGATTAGAGCAAAACACAGAGAACATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATC:1 - chr3R 30892132 5' - roo 8939 2 58.42 TAAACTAAGGATTAACCCAATGCGGTTTAAGTATGCAAGATGCTTTCTTATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAA:1 - chrX 9125856 5' + roo 9032 1 59.41 CAAGTTTAAAATTTCATTAAATATGATGAGAGTCTGGTCGCCTGTGTAGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTT:1 + chrX 19392643 5' + F-element 51 1 56.70 GAAGTTGGGCAAAGTGGTAGCTCCCCCGCGTTAATTGGAAATGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAA:1 + chr3R 25818821 5' - mdg1 391 2 58.16 AATAATTTTTAAAATATTTATAATTTTATTTTATATCTATCGATATCTCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTG:1 - chr2L 10958201 5' + INE-1 578 1 91.09 GAGCCTTTCCCGGCCTGAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGA:1 + chr3R 11165628 5' + Tabor 22 2 61.39 CAGCCCGTTTTGGACCCATTCCAACAACACATGTTTGATGATGATGCGCGCTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3L 14240822 5' + Tirant 30 2 54.46 ACCAATGCTTGGATGCAGTGGAAGTTCTCTGAGGTTATCCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 - chr3L 26644799 5' - HMS-Beagle 220 2 56.38 ATCCGCATCTGGGCATCTGGGTATCTGAGTATCTTGGCATTTAACAATTTCCGCTCAATTAATAAAAGCACAGCTCAGATCTTTGACAGTGCGTTAGTCAT:1 + chrX 8764546 5' + gypsy2 370 1 44.55 CCAACTTGAGAGTACTCCAAACCGTGGGGCAAGCGTGTGAGAAAGTAGGTTAAAGCCTTACACACACCAAAACCGGGAACACACACACACACACACAT:1 + chr2R 14444526 5' + accord 183 2 52.04 GTTGTCCGAGGAGCTGTGCATCGGTTGCGGTATTTGCGTCAAGGTGGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 - chr3L 8974155 5' + P-element 10 2 63.53 ATTGTTCGCACTTTGTATGACATTTTAAATCGGCAAAAGCTAATCCGGTGGGTCTGTCATGATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGT:1 + chr2L 4232570 5' - I-element 146 1 54.46 TAACCAAGGAATAAGTGATTCTACAAGAAAGCTTGGAGCTTTCTTACTGGTATAAAATTATCTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAAC:1 - chr2R 8462177 5' + Stalker2 7318 2 68.32 ATGCGAACATTTCAAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTA:1 - chr3R 7388411 5' - HMS-Beagle 214 2 58.42 GCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 - chr3R 14049420 5' - transib2 2798 1 52.53 GAGTTCGAATTTAATTCACCCAGCATAGAATACAACAACAGAGTTAACCAATCACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGG:1 + chr3R 25601569 5' + I-element 5005 1 57.58 ACTGATATAAGCAGTCGCCATCGGAGGGTATATTGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 + chr3L 15504255 5' + Doc 292 1 67.33 AATGCGGGGATAGCTCCCCAGTTCCCATGGCCATCCTGCTATTTAGCCATGTTTTGTTTTTTTTTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGGTGGGCTAACGAAAT:1 + chr2L 13566492 5' - FB 454 1 63.37 AAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTATTC:1 + chr3R 19144406 5' + Juan 28 1 48.51 CATCGCACGAGGCGATAAGCTGGGGTCATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 + chr3L 12085169 5' - pogo 2057 1 72.28 TACGCAATAGGCAGCAGATGACGCCGACGACAAAAGCGACGCAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chrX 10730640 5' - P-element 2851 1 46.53 AAATATACTTAGAAGATAGATATATTTCTTGTTTTAGGTACACAGTTTACAAAAGCGGAGGAAGCAAATTAATATATTCGGACGAAGACAGTTCTAGAAGA:1 - chr2L 21647080 5' - Gypsy12A_LTR 2033 1 55.45 TTTTGAAATATGTTTAAAGATACAGCAAAAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGCCTTCTAGCAAA:1 - chr3L 19350028 5' + 1360 3197 1 61.39 TTCATTGATGGTATCCCATGTAGGCGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTG:1 - chr2L 23394774 5' - X-element 34 1 75.25 ATAACAATGCAACTTCAGTTTATGCTCAAGTTGAAGTGGGACCAAGATTTGGCCCTTTTGGCTACAATCTTGGTAAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3R 7161232 5' + 1360 1 2 58.42 TCGTAGAAATGAGTTTAGAGAGCCAGAGATAAGAAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 + chr3L 15035139 5' - pogo 2061 1 74.26 TGTGAGTGAGTGAGTGTTTTAACAAATTGAAATGCATTGTGAGTGGGGTGATCTGTGGTGGTTTGGGCACCGCGTCAATGGTTTGAATGCCAGGTGCGTCG:1 + chr3R 12777111 5' - HMS-Beagle2 6753 1 68.32 TTTGGATGTGAAGGAGAAGAATATAATATATATAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTACACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTACGGGGGCCT:1 + chr3R 9952209 5' - Ivk 5319 1 66.34 CAATTTCAAGCGATCGACGAGCCGTTCACATAATTGGTGTCAATTTCGAGTGCAATAAACAAGCAGTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCT:1 + chr2L 12074477 5' + Juan 4037 1 64.36 GGGGGGCAAAATTGTATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGA:1 - chr3L 21841366 5' + P-element 28 1 53.47 GCTGCATTTTTAGATTGTTCGCTGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAAT:1 - chrX 8352225 5' + blood 56 2 79.21 GTTATATTACAGCTGACCTTAACTCGTCTACAATCTTTTTCTGTAGATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 - chr3R 28883442 5' + HMS-Beagle 6827 2 54.46 AGCGACGCCAAAGGAAGGAGAGAGAGAGAAGAGCATGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATA:1 + chr2L 7530983 5' - blood 155 2 68.82 AACCTGCGTCCTCTCTTCATTTCTAGTACATAACAAGCCAGCAATTAGTTACCAAATTAGATATTAACTAAATTAAGATATAATAACATTGTAAATAAATA:1 - chr2R 12010638 5' + I-element 5267 1 79.21 CATTTATGGGTCGTCAGGTGGCCGCCGTAGAAACTGGAAACCCAATCCCCCACTTTTGCCAATTTCTGGGGCTTGTATATATACATACATATATATC:1 + chrX 5291606 5' - 1731 4408 1 54.64 GAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 + chr2R 10863904 5' + mdg3 40 2 66.34 GACATTTAGAGAATAGGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCA:1 + chr3R 22620188 5' + 297 24 2 56.44 GGACTACATAAAGCGGACGGCGACACTCTCCCAGGATGCGGAGGTCATTCGGGCATGCGAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAAGGTCACGCAAC:1 + chr3R 19177447 5' + Tc1 1323 1 54.46 GAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 + chr3R 7993869 5' + Doc 40 1 58.42 GAAGGCAGAAGGGTCAGCTTTTACGTATCCACATCATTGTCGTGACGCCAGGCCGTGAAGTGGAGCGCCTGAACGCTAATGATATGACTATCATATTTTC:1 + chr3R 509488 5' - R2-element 3251 1 42.00 TTGAATTGAATAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2L 5974402 5' + roo 8689 2 52.48 CTCGTTTCCTTGTGTGCGTAGGCATATTTCAATGCCAAGGTGACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chr2L 2197146 5' + P-element 31 1 48.48 GGCTTGATACATCAAGTTGATCATAAGCCAAACATGGATGAAGATCCTTTGGATTACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTG:1 + chrX 21396631 5' + F-element 9 1 76.24 GAGTCTGTCCTTAAGTCACACAAACGCCTGGAGTGGGATCCTTCTGCCGATGTGGGCTACTGCAAGAGATATGACCACGCGGGAGGAGATTAGCGCGGTCA:1 - chrX 4635315 5' + rooA 157 2 67.33 AAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 3671358 5' + roo 30 2 58.42 CATTGGCATATTCATTCCAATTAATATTCGATACAATGTCAACTTCTACGCATTGTTTGCCATAAGAAACAAAAACACAAAAATCACGATCAAAGCAAAAA:1 - chr2R 15861710 5' - pogo 283 1 58.42 AGATGAAAAAGAGGTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 + chr2L 8740863 5' + Burdock 15 2 64.36 GGCTGCGTTTCTTCCCTAACAAAGTCATGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3L 4386513 5' + jockey 57 1 70.30 TAAGGGGGGCAAAATTGTATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr3L 21841369 5' + P-element 25 1 56.44 CAATTTATTAAAGCGGTTTTAATATTTAAAATATGGTTATGATAATAGGTAGATGTCTGTACGAAAACGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAG:1 - chr2R 6621458 5' + invader1 3791 2 54.46 TGGTATTGTTGATTTCATTATTATGTTTTATTCTGGCTGGGGCTTGTTGTGGACTCTGGATGCGTGCCACTTCCAACATGCATGTCCGGCCAGCGCTGCAA:1 + chrX 10404979 5' - TAHRE 9978 1 67.33 GCCGCTGTGGTCACGCTTTTCTAAGCGTTTTCTTATCGGCCAGGGAGGCAGGTGGTTTGCAGCTGAGTGTTTCTTCATTCAAAATAAATAAACCGCTTTGC:1 - chr2R 22975174 5' + transib3 2449 1 58.42 TGGGAGCAATGAGTTTCCACTCTCACACCCTCTGCCTTGGCCAACTTCTGCACGGCAGCATCGGGCACACCCAATCCACACATCAACACTTACTGATGAGA:1 + chr2L 20644915 5' + Ivk 5074 1 61.39 CCCAGTGGTGCCAGGGCAGCCCAACGCATTCAATTACCAATAGGTGGAGCTCTACCACCATAGCAACTAGCCCGTATCAGTGAGCATACGATTGCTGGATT:1 - chr3L 8333343 5' + R1A1-element 328 1 64.36 TAATAATAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCTGTCGTA:1 - chrX 12546513 5' + P-element 12 1 65.26 CACCGAAAGAGATAGCTGCGTATCGCTGTCTCTGTCCGGCGAACTGAAGTTGGCCGCCGCTGAAAGGTAAACAATTATTTAAATAAATAATAAATAAACAA:1 - chr3L 13331250 5' + BS 5093 1 86.14 ACAGCGAAAAAAAATATCACAATAAATAAAAATGCGGTGTAAATGCTAGTGTGGCAACGGTAAAAGGAAGGAGGAAGACAATTTAGTGACACTGGGACCCT:1 + chr3R 15075902 5' + Tc3 1299 1 73.27 CATTGCTATTCTCACTTGTAGGTCTACAAGATTCTCTCAGCTTACTTTAGTTTGTATTTGCATAATTACTTGCTTAGTATGTACTTGTTTTTAGCTATAAA:2 + chr4 546301 5' + gypsy12 9751 2 71.29 TTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr3L 19215857 5' - roo 9034 1 62.38 TTTACGAGTTGCTCCAAATTTATGATGTGCACGTACATTTGTGATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTG:1 + chrX 17132460 5' + pogo 32 1 61.39 ATCTCCATTCCCGACATCTTTGTTAGGCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 - chrX 19306803 5' - P-element 2840 1 34.65 TTTATCAAAATGAAATGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAG:1 - chr2L 5249261 5' + invader4 82 2 82.14 ATGTGAAATTTTTGGTGATTATATGTATGTGTATAAATTATATAAGTTCCAATAGGTCCAGGGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCTTCCTTCTT:1 - chr2L 18510223 5' - gypsy 417 2 74.26 AACAGGCGTGGGGCATAAACACGACTTCAATCCCTTAGTGAAACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGAC:1 - chr3L 5015891 5' + I-element 4932 1 65.35 GATGGCATGTTCAGCACAAGTAAAAGATCTGCGAACCGAATGCGATTAGATAGTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3R 24152842 5' - P-element 2876 1 68.32 TTACAGCAAAACACAAAAAAAAAACTGAAGCATGAAAAAGAAGCCGTTTTGTATAGCAAAAAAAAAAACGAATAAAAAACC:1 + chrX 10542529 5' - transib1 7 3 80.25 GCATCATATGCGTTACTTAACTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCC:1 - chr3R 4712631 5' + accord 38 2 60.40 TTCCGCATTTCTGTGTTTTAGCCCCGTTTGTTTGCTCTTACTGGCTTTTATTTTTATTCCTCCTATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAA:1 + chr3R 31347462 5' + 412 7472 2 72.28 CCACCGGTTTCTTAAGCGACTCCACATTGTTGTTATTCGGCAAATTGCTGTTATTGTTGTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTT:1 + chr3R 14647826 5' - Bica 217 1 61.86 AATCGCAGTATGTATGTAGTTATATATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCAT:1 + chr2L 4189352 5' + 1360 14 1 66.34 ATTTATTACATATTTTTTTTTATATATTTCATACTATTTTCTTTATTAAATATTTAGTTACATTTACCAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 + chrX 13682534 5' + roo 8673 2 72.28 ATTTCGAAATCTCACACACACAACAACCGGCTAAAAGTGCGGCGAATTCGCTGTGATGCCGCGAGAGAGGGAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2R 13038860 5' + P-element 4 2 75.25 GTTGTTTTTCAAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chr3R 31812743 5' + P-element 35 1 45.00 GCCAGGAATCCCCATTCTTTTTCCACATAAAGCCCCTTCTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGT:1 - chr3L 11909994 5' - Tabor 7284 2 61.39 ACTGCNTACAATGTCGTCGCTTCACCTAAAATTTCATTGACGTAGATTCGATTCTGTTTTGAGTCGGCAGTTAGTTAACTTTTTACTTTTTTTTTATTATT:1 - chr3L 3777833 5' - Rt1a 5075 4 54.46 CTACCCTCGTAAGAAGCAGCACTTACTATGCTCAATAAAGTGATGTTATCGTAAGATACTTGCCGTGAATATCAAGTCGGAGCTACGACCCTGCTACCGGC:1 - chr2R 4031577 5' + Chouto 199 1 65.35 ATGGTAGTATATGACAATAGTAGTATATGTTGTAGAAGTAGTATGTCAAAGCCCGGTCGGGGAGGTCATTAGGGTGCCGCTTAAGTCTTCTTTTGACTTTA:1 - chr2R 5924416 5' - jockey 4735 1 34.65 TGTTGAGCAACAGAATATCGAGGTATCCTGTTTGATTTAGTGTACCCTATATCGGTACCATGTCTCAAAATCCATAGTATCTTGAACAGCCCCAGAACATC:1 - chrX 22563429 5' - Bari2 778 1 76.24 GTGGGGGTCTGACACTTAGTCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3L 9692650 5' + P-element 8 2 71.29 CATCGGTGGGCATCTGTCATACATCCGTCAAAAGATATATGTACATACATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 - chr3R 23665340 5' + 297 22 2 59.41 AATCCAGCCAGTCTTAGTGACGTCAATAAAACTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATA:1 + chr3L 6131261 5' + jockey 4815 1 69.31 GCTGTCACACGCCCACCAATGCCAAAGTGCAAGCAAAAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAA:1 + chr3R 26828326 5' + BS 5103 6 61.67 TTTTAATATGCTTTCTAAAAAGTATGCTAAATATTTGATTAGTAGCAGTGTGTGTGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 + chr3R 31884203 5' - hobo 2918 1 59.41 AGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTT:1 + chrX 21668893 5' + pogo 49 1 76.24 CCTCCCTGCTAAAGGAGAAAAAGATATCGGTGCTGTACCTGGCTCATAAATGCTCGCTCTCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGT:1 - chr3R 11793172 5' + Doc 4254 1 62.38 CATGTTCGTCAACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACTCGC:1 + chr3R 9254886 5' + F-element 191 1 70.30 GATATATGAAGTTGTCCTGTATTTTTTTTTTCGCATTCGCTCTACATACTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGA:1 + chr2R 9387323 5' - Stalker2 373 2 52.48 GGTCGTATAAATTCTGGCAACAAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr3R 15998054 5' + pogo 16 1 65.35 CAGCAGGTTTACAATATGTAACATATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 13682636 5' - roo 389 2 58.42 CTTTAAAAAAACAGTTGAAAAATTAGTTACAATATATAATTTGTTCGAATATTGAGAATAAAGGATATACAAAATTAAATTTTATTTATATTTTTTGGATG:2 + chr2L 15309377 5' - mariner2 787 1 73.27 GTTTCNTAGAATAAAATATCTTACTAACCGTACTCACTTACCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTC:1 - chr3R 19914405 5' + jockey 4798 1 60.40 TGCATAGTCGGCTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAA:1 - chr3L 6129875 5' + jockey 4698 1 55.00 GGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 - chr2R 19857400 5' + 297 30 2 68.32 AAAGGATCAAAATATTACCAAGAGAGAATCAATAGCAGAGTCGATCTAGCCTTGCCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGCGAGCTGAGGAACTATAAAAGCTA:1 + chr2R 6946959 5' + INE-1 151 1 75.25 CTCGTAGGTTAACAGGGTATGCTGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:2 + chr3R 5505246 5' - mdg1 7406 2 76.24 CGAGTGCAAACAAAATTAACGGGCACGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCA:1 + chr3L 11914832 5' + P-element 377 1 30.69 ATCCAAAACGTGGCCACTTCCATCGCGTTGGGTTTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTGGTGGTAGTCACTGCTAAGGTTTGTGTCTTGGGACAGCTT:1 + chr3L 21406043 5' + R1A1-element 254 1 66.34 ATCTGTGTGCCGACTGACCGGCTTTGTTTGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATA:1 - chrX 2324033 5' - flea 4962 2 72.28 TCTCTGACTTGCGCATCACCTTGATGGCGAACAGCCGCTTCGAGTCGTTGTTCTTTGGGAATTTGTTTGTTTTCGCTTTTTTATTTTTATTTTTTTGGTA:1 - chr3R 18747345 5' - Tc1-2 476 2 55.00 CGGGGAATACAAAATCCAACCCAGTTAAAAAGGCAATAAATGGAAAGAAAAGAAAACGGCGAAACAATCGAAAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGG:1 - chrX 9224027 5' - diver2 147 2 74.26 ATTTGACAGATTAGGCCAGCCTTCTTTTCAGTCTTAATACTTTTAAAAGTTCTCCCCTCACTTTGACGAAGACATTTCATTTTCCCACTTTTTCGAAAATC:2 + chr3R 11085474 5' - FB 129 1 57.43 CGACTCTCCAGTTGGTTACGTCCTGACCCGCTCTAAAACTAAATAATTTTCTTTTGCCCATCCTTCAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAA:1 + chr2R 12241334 5' + FB 834 4 65.35 TTTAGGGTTCATTACCGGCCGGCGGATGGGTTCTGCTTCGCGGAAAATATGCTAATGAAAACTTGGGACTCCCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3R 27189235 5' + roo 5 2 73.27 CACTTTATTTATTTATTATTTCTGTATTTATTTATTTAATTCAGTCTCGAGGTTTTGGATCCTTAAAGTGGGATTTACTGGCATTTCCCCAGAGTGCTATT:1 - chr3L 17997785 5' - Porto1 4280 1 69.31 AGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 + chr2L 20118704 5' + Max-element 44 2 67.68 ATTTTGCGTTTCGGAGTCCAGGTAGGAAAGTTGGGCGCCCCAACTACGATGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAG:1 + chr2R 20414478 5' - F-element 4460 1 50.50 AAGGGGCATAAGAACGCGAATCTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3L 20257358 5' + pogo 51 1 95.05 CATGCNCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 8378669 5' + pogo 31 1 60.40 TGTCTGCATACTTTCGTTTTTCTGGAAATCTTGAGTGAGAACAGTAGATTTATGCTACACAGTAGAGTTGGTAAAAGATTTTTGTTTATTTTTTTTTTAA:1 - chr3R 6586341 5' + hopper 151 4 51.00 GCCCGGACCCATAAAACTTTAAATAAATTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 + chr3L 13312163 5' - mdg1 7408 2 72.28 GGGAAATGCAGTCGCATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAAGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:1 + chr2L 7170354 5' + jockey 4610 1 65.35 TGTCATACGCCTATTCAGCTTATTATCCAAGGAGAAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGA:1 - chr3R 8198551 5' - Tirant 361 2 67.33 AGTAAGGCGTCTCTGGCGGCGGATTGCACATTGCCATTGCCTAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 + chr2R 9014388 5' - blood 7384 2 73.27 TTTTCATTACAACAACCCAAGCCCGCAAAAGTATGCTATGCAAAAATATTAGGCTGCGATGCGTCGCTAATGTGACAGACAAAAAAAAAAGGGAAAAGAA:1 + chrX 7480761 5' + Bica 340 2 63.00 TTTTGTGCTTATTCGGTATCTATGAGAATCGGTCAACACAAAAAACACTAAAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 4427827 5' + 1360 55 1 69.00 TTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chrX 7787291 5' + roo 39 2 66.34 CAGTCAGCAATGTGCAAGAAATGAAGGCTTCACTTGCTAGGTATTTATTTATTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAAATA:1 - chrX 12559893 5' - Ivk 5348 1 56.44 GTTGTAAAATGCCATTTATTTCAGCAGTTTTCTAGTAATATATCCTAAAATTATAGATTATAAGACACATATTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr2R 12779067 5' - roo 401 1 69.31 CAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chr2L 19642966 5' - roo 9045 1 53.47 ACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGAACT:1 - chr2L 13837924 5' + 297 43 2 72.00 GACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAA:1 - chr2R 5084060 5' + F-element 58 1 74.26 CGCCGTGGCGTATACTTCATTTAACCGTTGGCCACTGTGTAAGGTCGGTCAACTGATTGAATTTTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGC:1 + chr3R 20884867 5' + flea 4764 1 73.27 CTAATTTTCGTAAAGGGAATTCTCCTTTATATAAAATAATAATAACAAAAACAAGATCGAATGCAATGTCCAGTTCGCCGACTATCAGATACTCGTTACTC:1 - chr2L 21330752 5' - INE-1 549 1 58.42 AAAGGAATTATACTTGCATCGAAATTCTTTAGGTCATTGAATGTTTGCATATAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGC:1 + chrX 20364227 5' - opus 476 2 57.43 CTTCATTTTTACATCTGCTCTGTTCGCCGACAAAAAGTAAAAGAACTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 833340 5' - P-element 2876 1 66.34 AAGATACAAATTTGCAAAATACACACACAACAAGAATCGTGGGCGGGGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 11437955 5' - roo 340 2 53.47 CCCAGGGAATGGGAATGGGAATCCGAATGGGAAGTGGGTGGCTAGACTGTTGTGGCCATAACCAAACTATTGCTTATAATATTATTATTGTTATTAGTATA:1 - chr2L 2703047 5' - mdg1 25 2 65.35 CGGAGAATGGGTTCGGTGGCGGGCAAAAAAAAACTGTCGGCATACCGACATAAATTGGCAAGAAACTAATAAAATGAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTC:1 - chr3R 26249245 5' - INE-1 580 1 80.20 AACTAGTTTGTTTGGTAGCTAAGGTGACCAAATCTTAGCCTTGAACATGATGCAATTCGGATTGATAGACTGGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGG:1 - chr3R 30833985 5' - Ivk 4941 1 61.39 AGTTGCGAACTTCCGTATGCACATTCAATTACCATATTAACCGAAACGACTAATTAACTAAAGTTGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr3L 10698732 5' - roo 397 1 68.32 CCTTTACGATAATTTTTCTTTCTGTGCCACGATGTAGATGTTAAGTCTGAGGATGTTTTCACTCCGAAGGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAA:1 + chr3L 10845440 5' - F-element 4341 1 54.46 AGATCCAAAACAAAAACAAAACAGAAAACAGCCGATGCGCCGGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr3R 28326699 5' + P-element 35 1 48.51 TGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3L 13194776 5' + 297 6631 2 80.20 ATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:2 + chr2L 15956045 5' + Max-element 8278 2 65.35 TTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGT:1 - 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roo 361 2 71.29 TAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr2L 5974412 5' + roo 35 2 62.38 ATCATTGAAAAAGCTTATTGCCTCAACAAATGTAATTTAACAGAGCTCATCTGCACTGAATTCTGTATACCTAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATAC:1 + chr3L 26179383 5' + Stalker4 46 4 76.24 CTCTTAAATGCTTCTTTCATTGCATACTTTTGTGCGTACGTTTTTACGGGGCTTCACACTAAAATACATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGT:2 - chrX 3649754 5' + jockey 19 1 72.28 GGCTCTCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr2R 9426466 5' - P-element 2831 1 25.74 AATTAATATCGCCAAAGCTGCTTATAAATAAGCATATTACAAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAG:1 - chr3R 24729637 5' + Juan 4122 1 68.32 AAAATAATATGCATTATACATAATATATGTAACATCAATTATTTGAGTTAATAGATGTTTAAATGTATTTCATAAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTG:1 + chr3L 15201911 5' + 1360 451 1 79.21 CTAGCAAGTCCTAGTTGTAGTAACTGCAAAATATTCAAAACTAATTGGCTCTTAGCGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 13203075 5' + roo 8685 2 58.42 TGTTATTGTTATTGTTATTTACACTGGAGTCATTGACACGCGCCGCGTTGTTCTTTTTGTTTTTTTTTTTAATTTT:1 + chrX 8932130 5' - Doc 4698 1 76.32 ATTTTAAAATTTCTCTTTAAGCTTGTTCCTTCTAAACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr2L 8542855 5' + P-element 44 1 33.66 ATTCACTGAAATATGAAACCATAAAAACGGGTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 - chr3R 27189314 5' - roo 359 2 72.28 AAATCCATTTAGGGCAGGTAACTTTAATCAAGGAGAGACCTAAAATTATCAAAGACCACTCGATCGGACCTCACTCAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTC:1 - chr3L 27413335 5' - invader4 101 2 58.00 GAGTCNGGAGGAATACTGCACCTTTTCATCCTGCACTGCTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTC:1 + chr2L 18675794 5' - opus 7242 2 63.37 GAAGAGTTGTGTTGTTCAATAAAGCAGCTTTGCCACTCCGCCGCCGAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAACTCGGCCGTCCTGACAACTAG:1 + chr2R 10865869 5' - mdg3 5231 1 54.46 CCAGTCAAGGTTCTTCACAAAATATTCTGTTATTGTAATCCAAGTATACGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAG:1 + chr3L 9772198 5' - 297 369 2 56.44 GTTGAAAACAAGTTTTCGAAATGCTGCTAATGTTGCTGGCCGGCTTCTTGGCAACATTTCAAGTGGCAGCGAGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 - chr3R 13715175 5' + P-element 5 2 74.26 CCTTTACGGGTTCGAGTAGTCTATAATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTA:1 + chr3L 5716895 5' - copia 5075 2 79.21 TTTTGTCAGGCAGCCAACAGGGCAGCGATACATGGAAACTAACTCAGAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGAT:1 - chr3R 30678171 5' - flea 4868 1 55.45 CATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 + chr2L 13447117 5' - HMS-Beagle 6999 2 69.31 GTGGACATGCAGACCCTAATACACACAAGGAGACGCTGTCTGGTTGACTAATTCCCCGATGTGTGCTGGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGGATCCCGT:1 - chr2R 4231694 5' - gypsy8 327 1 67.33 GGGAATAGGCGCTATCAAATTAGCACAATTCCACTTCCGTTTCCCGTTTAAAGTCACTCGCACCTACATGGACACACACAACACAGAGACA:1 + chr3L 12197476 5' - Stalker 434 1 54.95 ACCCACTTGGAGCATAAAAAACGATTGACACGCACACCCACAAACCAATTGCAGCTAGAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 - chr3L 13364617 5' + hopper 18 1 58.42 ATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 - chr3R 14688299 5' + pogo 50 1 78.22 TCGACGACGAGACAACCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 9370022 5' - roo 399 1 70.30 ATGCATTTTGAAATCGCCAATAGAATCGATACGCCCAGCGAGGCCAATTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCAT:1 - chr3R 7183469 5' - F-element 4285 1 55.45 CCTGGTAGATACTTACACATTCAACCAACATGACTCTTCCTCACAGAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTC:1 + chr3R 4591833 5' + roo 8619 1 54.46 GCTTTGTAACAATCAACAAATACACTGCTTTGAAAGGAACGCCACTTTCTCATTTAAATCCACTTTAACAATATATTACATACCCCTAATCTTAAATCATT:1 + chr3R 4480738 5' + Cr1a 4136 1 79.21 GTGGAAAATGGGGAAATACAACAGGAGGCGAGAAAACATGGCACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCA:1 + chr3L 10736455 5' - 412 7517 2 57.89 AATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAAC:1 + chrX 16798208 5' + diver 5924 2 58.42 CACACATAATATTTTTTTTAGTGATTCAAGTGCGTACTTTACGGCGCTCTCTTTTTCCGATTGTCTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 19076233 5' + roo 8675 2 61.39 TAGATAACGTTTTTAAAAACACAACTTGGGGTTTCATTATTTGTATTGTATATATGTATATTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:2 + chr3L 9858240 5' + pogo 14 1 63.37 TTTCGCTACCGCTGAAAGCAGCTTATATATATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 - chr3R 29432808 5' - 297 354 2 76.24 AAACCATATGCAACGAGTTAATAAATGGGAAACACAGGCTTGGGGGTTTATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAA:1 - chr3L 18154202 5' - I-element 5327 1 54.46 GGCTATCGAGTGCCAGAATAAAATTGTTTATCATGTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTA:1 - chrX 22780772 5' - flea 4951 1 74.26 AACGAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAAGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - chr2L 108076 5' + P-element 16 1 63.64 TGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:2 - chrX 329059 5' - opus 448 2 78.22 AATAGTTAACATTTGATTGTAAGCTAATGATTAAAATCGAGTCCTTCATTTTTACCTCTCTTTTCTTTCGATTTAAAAATATCTAAAAAAATATATAATAA:1 - chrX 10562391 5' + G7 1171 1 49.50 AGTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATC:1 - chr2R 2248341 5' + invader3 51 2 73.27 TAGATATCTTTTTATTTTGGATTTTGTATATTTACTTATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chr3L 16345545 5' + 297 31 2 70.30 ACTTTTCCTCGTCAGCAGGATGTAGCCAATAGATGTAGTTAGGCATGGGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACCAAAATAAGCCAAAAAATCGTATGGCGT:1 + chr3R 4973084 5' - 1360 29 1 56.44 GCCCGNAAAATAACATATATGTGCTGGTGCTTCCACTTTGGAAATATTATTCGGTTTTAGGCACCTATATACAATATAAGTTAACGCAGGTTCCACTTGCA:1 + chr2R 9454213 5' - opus 496 2 76.24 CGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAGAT:1 + chrX 21772479 5' - gypsy3 6560 2 54.46 TCATGAAATTTATATAAATTATAAGTTAGAAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 + chrX 20974863 5' - opus 7461 2 77.23 ATGAGCGTGGGCGGAGTTCTCAGTGGGCGGGGATCTGTAGCGAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACT:1 - chrX 16798304 5' - diver 224 1 77.23 GGAAGGGCACCATTTCCTTCCTGCATTAGTATTTAACATTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTC:1 + chrX 7410182 5' + jockey 4709 1 66.34 AGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:2 + chrX 4154901 5' + blood 7031 2 59.41 CCAGGAATGCACAATAAACGTGGTCAGGGACGCTCGTTTGGCTGCCACTACGTAGAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGAC:1 + chrX 8031310 5' - roo 407 1 46.53 GCTTATAAATAATTCAATTGCCATTTTCCTGGCCTTGTTCTATGGGCTGCAAAGCGAACATATGACGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAG:1 + chr2L 20053155 5' - opus 7162 4 67.33 CTTTGTTCGTCAGCAGATTTTGGATGCTGCAACATCTTTGGTTACACTCAAAATGAATCGAATGAACGCAGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAAT:1 - chrX 6458266 5' - blood 372 2 73.27 AATTGAGTAATTTGCTCACCTTGATTGCTTTCTAGGCTAGTTGTATGTTGTATGTGTATGTGTAGCTGTCAGGACACACTGCACACACACACACACACACA:1 - chrX 11068790 5' + accord 182 2 72.28 AAAATAGATGTTGTAAAAACAAGGGCTTAATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chrX 19095828 5' - roo 397 1 65.35 TCACGAAATCAGCTGGAGTTGAATCATGCTGTAATTGTTTTAAAAAAATGTAACAGGTATAGATGTAATAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTC:1 + chr2L 16082625 5' - Stalker 7210 4 71.29 CGAAGCACGGAAAAACACAGAGGGCAGCGGACAGTCAAGAATATCCAAGACCTTTCACACGTCCTCGTGTGCCTAATCCACCAATCAAGTCCAAGTCACAC:1 - chr3L 27413158 5' - invader4 2696 1 52.48 GACATGCCGTTCTTATCATTCGTGATGGATCGCACTTGGACTCGGGACCTTATAGGATAACAGCGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr4 767936 5' + flea 23 2 67.33 CTTGTGAGGTTAGGTCAGTGTTTTAATGTTGGTCCTCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr3L 22564878 5' - blood 7347 2 66.34 TTTTATCTATAATACTATGCAAGTTTAGTCATTCAATTTACCGTTGGCAAAAAAAAACTTATTACTATTGATGTTGATGTTGATAATTTATAAGTAAAATA:1 - chr3L 485644 5' - S-element 125 2 81.19 AAATAAAATTCCTCCTTCGAAATGCGCATATTATGATTAAGAGTATAAAGGAAATTTAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGGTTTGAATTAAGTAGGAT:1 + chrX 19447666 5' - jockey2 3222 1 69.31 GGGAAATTGCGTAGTGCCATCTTAACTCAATAAAGCTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTGTTAAAATTCATTA:1 + chr2L 10291530 5' + jockey 4802 1 66.34 GTTTATGGATGTAATAGATTGGATGCTGTTTAACTGATAATTTTTTAAACAACAAAAGGTTTATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3R 12571453 5' + roo 8677 2 64.36 GGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3L 9692700 5' - P-element 2829 1 21.78 GGATACATTCAGGATAGTTCGATCTCAGCGTTCGATATCACTTCTTTAATCTAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTACCGCCATACGATTTTTTGG:1 + chr3L 17869909 5' + 1360 26 1 51.49 ATTCTCGTCCGATTTGTTGCAATTGTTTGTCAGTTTTTTAGTGACGGTTTAATTTGCTCTCTGTCCGCTTGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAA:1 + chr2L 8735054 5' - 1360 3280 1 67.33 GCGAAATAGTTAATTCGTTGAGTAAGATATCTGCAAACAATTTTGATGCATTTCCCTCTTTTTATTTATTTATTATTTATTATGATAGATAGAATA:1 - chr2R 12009765 5' - I-element 5346 1 62.50 TTAAACTCAAGATAATGAAAATTGGGCTTTGCTGCATGCTCTCTTCGTAATAGTAATCTCCACCCCTCGGAACCGCACACATATACGCGTTCTCGTCTCCT:1 + chr3L 21769383 5' + 1360 3228 1 80.20 AGATTTTTCCATCAACGAAGAGATTATACACTTTCTTGCTCAAATGTAACTGCTATTTGTGACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACCAATCC:1 - chr3R 6561233 5' + I-element 216 1 70.30 GCAACGGAAGCTGCACCTCATCGTCGGGCCTTCCCCACCAACATCCCAACGACTGTGTCAGTTTTGGGGGACAGATCGGAAGAGCGTC:1 + chr2R 19693119 5' - mariner2 567 1 79.55 TGCACNCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3R 9952266 5' + Ivk 12 1 65.35 ACTCAGTGCCTCTCTGGGTTAAAAGCTAAAGTGTAATATAATTAAGTAATAGCTCAGTGCAATAGATATTGAACAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:1 + chr3L 8924581 5' - Stalker2 7602 2 63.37 GAGCTGAGTAATCGATAGTTCTATCGGAGCCTCCGCAGCCCTGACTCGGCCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:2 - chr2R 24965139 5' + P-element 24 1 55.45 CAGGGCTCCCTGGTGGATGATGAAGCTCTAATCGAAGTTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACATTCGGGCTCT:1 - chr3R 9656316 5' + BS 95 1 61.39 CTGCCGCTTGGATAGCCGTTAGCTGTGCATGCGGCAGTATATATTGTATATATAGGATTATAATATAACTATATAGTAGCATATGGGCCATAGTATAACAC:1 - chr3L 24361688 5' + Quasimodo 6 2 70.30 AGCTGTTCGATTCTTTTGGCCATGAAAGTGATTGACGAAACGCTTGAGGAGAAGCCTCTGTGCTTAAAGAATATGTTGGTTTTTTTGGGAGAGCATTGCTC:1 - chr3R 12155054 5' - 17.6 7194 2 64.36 TTTTAATAACTTTTGCCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATT:1 + chrX 13350773 5' + jockey 4801 1 64.36 AACCCACAAGCCAAAGTGTTGGACCGGACTCTGATCCGACCCGTAGCGGCTCTACACTGAGACCCTAGTTGAAGCAATTAAAAAAGCCTGGGCAACAATTT:1 + chr3R 8256099 5' + Tc3 1334 1 61.39 ATTGCATTTAAAATGCCGCCAATTGATTACATTTTGCATACAAAACTGCCAACTGTTTTGCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 2762213 5' + roo 16 2 62.38 GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr2R 981624 5' + 1360 1 2 67.00 AGACCAGCACCGGAACTACGAGGAAGTGACGAAGGCAACGGCGACGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTAAAAGGAAGGAGCACATATATTC:1 + chr3L 20897771 5' + invader3 5446 2 55.45 CAACAACCCGCAATCACGTACGGCAACAAACAAACGAACCCAACAGCAACATCGCAACAGCAACACTGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTC:1 - chr3L 5949692 5' + F-element 4301 1 71.29 TTGTTATCTTTTTTACATTTTTTTTATGATATCATTTTTTTTTACACCTCTCATACTCGAGTTATGAATATTGTAAAGGAAAAATTAATATTAGCAGCGCG:1 + chr2L 6252091 5' + P-element 2540 1 83.17 AGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACAGTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATT:1 - chr2R 6984416 5' - HMS-Beagle2 302 2 67.33 CGCAACATTAATAACACCCTCATGGCTGGCTTTCTCTACTTGATGATTGAAAATCCTTATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr3R 7360370 5' + jockey 29 1 56.44 ATCATTATGTTATTTAACCCCATTTCATTGTTATTAAGGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGAC:1 - chr2R 6869081 5' + springer 7174 2 61.39 CTCGGCTAAAACTATGGCCAATCTGGATCACGACGATCCGAACCAGTGCCCGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAA:1 - chr2L 18692561 5' + P-element 102 1 48.51 TAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAA:1 + chr3R 19450177 5' + roo 8710 2 58.42 CTTAGGCGTGTGAATTATATTATGCCTGGAAGTAGGCAACAGTAATAAAACTTCGCAAGAAGCGATTATATTTGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACT:1 - chr2R 5850047 5' - jockey 4978 1 65.35 GTGTTATTTATTTGTTTCAATGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 11435625 5' + roo 8707 2 80.68 CTTTTNTAGTAAGGGTTAAAGTTCATTTCATTTCGGAAGAATGGCATATTCAGAGAGTTTCGTTAGTATCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTAT:1 + chr3R 7690463 5' + accord2 7277 1 65.35 GGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr2R 5849990 5' + jockey 63 1 79.21 AAAAGTATGTTTATATTTATACGCATAAAAAAAGATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr2R 20702151 5' + Doc 49 1 71.29 GGTTTTTATTTCTTTTAAGACTCTTGTGATCTTTGATTTAAATTTTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACATGGTGTATGC:1 - chrX 7196927 5' + hopper 1237 1 64.36 TTAAGTTTCTACATGTATTTCTTTCTATATTTTATAAGCAAGTCTGTTATCTAGACCTAACCAACTGGCTGTTACACGCATTTTGTTATTATTATTATTAT:1 + chr3R 18616925 5' - invader3 5060 1 77.23 ATAAATCTAGAAAATACATTTTTTCTTCTAATAAACTAGAGGTTCGATATAAATATGTTTTTAGTCCTTAATGTATTTTTTTTTTTGTTAATTTATTTTTA:1 + chr2L 12244951 5' - HeT-A 307 1 83.17 ATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCG:1 - chr3R 9952230 5' + Ivk 48 1 74.26 CTCTAAATTAAACTATACATTTTCGATGCTTTAATCCAAAATAAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAAC:1 - chr2L 16933680 5' + 3S18 12 2 67.33 GTGTGTTTGTAAGCAGATAAAGCTGTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGA:1 + chr2L 2437674 5' + roo 8662 1 79.21 AAGTTTTCGGTTACGTGTTTAGCTCCGTGTCTGTGTGCGTGCGAGTATTCCAAAGTCATTCTAAGTTATTTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGG:1 + chr2R 8301875 5' + Quasimodo 233 2 69.31 ACTCGAGTCCTCGTATGCGCATCATACAACTGGGTTTCAGCCAGTGTAATATAAATGTCTCTTGTTTTTACTCACACAATCAAGCAAATTATATTTTTAG:1 - chrX 3914745 5' + 1360 3265 1 58.00 ACACTGCATTCTTGAGCGGCACAGGTGTGTCCATCTCCATATCGAACTCCCTATCCACGGTCAACCGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCT:1 + chrX 6789715 5' + pogo 483 1 60.40 GATGTGGCTTTAAGTCTAATGCACTGGATACCACGATGTCACCGATCACTTTACAGCCAGGTCGCACTCCCTTCCTTCAGTGTAGTCCATGGGGGCTCCTC:1 - chr2R 23822441 5' - Rt1b 4915 1 62.38 CGTGACATTTAAGTGCAAGTACCTGTTTTTATACCTCTTACTATTAAAGTAAAAGGGTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3L 25126295 5' + blood 7031 2 59.41 ATTCGGTTGGTCTTTCCCGGGCGGTAAAGTGAGAAAGTCCAGATAGTCAGACAGATATGCAGTTCTATGGACTTTAAATTTAGAATTTAAATAGAATTTAG:1 - chr3R 6236815 5' - transib4 2556 1 58.42 GGGGTTGAAGTTATAGCAACCCTTCAAACCATACTTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 - chr3R 24152922 5' + P-element 39 1 41.58 CGAAATATATGCGGCAAATTTTGTAAACATTAAGGTTGCAAGCTAAAAAAAATGTATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr2L 15955340 5' + Quasimodo 19 2 61.39 ATAATCGCAGTATGTATGTAGTTATATATAGATAGAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCC:1 + chr2L 4189350 5' + 1360 12 1 68.32 TTGTTGTATGGTTTTTGTTAGGAAGTTTTGTTTTGTATAGAATTTATTCTTAACTTGTTTAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGC:1 - chr2L 22975174 5' + Stalker 281 4 51.49 CTAAANTCATCCTTGAAAGTAATTCACCAATTGGAATCGCCCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr2L 2437773 5' - roo 9036 1 61.39 AGTGAAAAGAACTTTCGTACCAACACTGATTTTCATTGCCACCAACGAACGTACATAAACGGGAATGCGCGACCTTTATCCGTCTACGCATCGGGCACACC:1 - chr3L 19951734 5' + Ivk 5044 1 63.37 CGCGCGTTAATTCAAATCTTGATCGTATCACGATGCACGTTGAAATGTTTAAGTTTGGGGGAGAGCTGCATTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTC:1 + chr2R 10052365 5' + 1360 402 1 74.26 ATGAGAATGTCATCTGCGATGTTTGCCGATGTATCTCCAGCCGTGGAATGGGAACTGGTAAAACTTTTAAAAATTTTATAAAATAATTTAAAAATTTAGGA:1 - chr3L 197452 5' + S-element 1460 1 38.61 CGAAAGGAAAGATGATATAATATTTAGCTGAAGGAAAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGC:1 + chrX 3766817 5' - diver 15 2 64.36 TTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chrX 8948667 5' + blood 43 2 69.39 GTTGGAAAATTTATGCATTTATGTAATTTAGCTTTGGTTGGGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTAC:1 + chr3L 7989707 5' + mdg3 5253 1 82.18 CGATGCTGATGTGAAAGCCAATTCAATCGACCAAACAATCTGGAGAACCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCC:1 + chr2R 18601787 5' - Transpac 5225 2 76.24 ATTCCTCCATTCCTCGCGTTTACCCCCAGGGCAAGTGTAACAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAA:1 + chr2R 3640140 5' + F-element 4578 1 60.40 GTTTTTGAGTAGCGATGAAATGTGGAACTATAGGGTATTACAAGTAACCACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 - chr3R 8548806 5' + 17.6 6943 1 61.00 AAATGAAATTACCTTCCAATCTATTGAAATAGCAATCTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAAT:1 + chr2L 14178157 5' - P-element 2674 1 39.60 AATGACGACGCCACAATCCGCTTGCCCCTAAAAAATCTGAACAAGTTTTTCAAGACTTAAACCTTGCTTTATATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGA:1 + chr2R 6128657 5' - Max-element 8403 1 80.20 AAATAGGCCTCCTTTAACCGTTATTCCAGATCCAAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAA:1 + chr2R 4675342 5' + Max-element 274 2 66.34 GGTCGATGGCAAACAACAAAAGTTCCCAAATTCAGCAGCTGGGATACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGA:1 + chrX 4889584 5' - 297 6615 2 64.58 GCGCAGAGGTACCTTGTCACTGGGCATGGGCACCAATACGAACACGAATACCAACTCCTCAAATGCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATA:1 + chr3R 21262381 5' - roo 8623 1 67.33 GTGGTTTGCAGTGAGCGGAACTGCACGAATTAGATCTTGGCAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGA:1 - chr2R 4675484 5' - Max-element 8359 1 56.38 AGTAATTGAGTTTGCTCGCTGAGGCGTTGAAAGTGGCCGAGAATCGGGGAAATCGGGCAAGTGGCGGCTGTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTC:1 + chr3L 14241824 5' - Tirant 8209 2 70.30 ATTGCGTTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTC:1 + chrX 16798185 5' + diver 13 2 60.40 CTGGTCTCCAAGTGGAGATTGTGTTTACTTTAAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr2L 22921275 5' + copia 46 2 73.27 ATTCTGCTCAGAGAGAAAAGAGTGGCTTACGAACAAGGTGATGGCGACTTCTGGATACCCTGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGC:1 + chrX 1235396 5' + P-element 15 1 64.36 TGTTTTTTAAATAGTTGTCGCTTAGTTAAATGTAGTTAAGTTTACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr2R 13144937 5' - roo 9063 1 74.26 AAGTAATTTGTGAACGAAAATTTAAATCACTTCGGATATGCCAAATACAGATAAATGGCATAGGTCATTCGTAATATATTGCAAAAGCAAAAGTTTGTTTT:1 - chr2L 5426267 5' - Bari1 92 1 63.37 ATATCTGAATATTATTTGAGTATTATATTTAACAGATTTAATCTTTTATAATCCTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 12298644 5' + pogo 20 1 54.46 AATCAATTTAAATTGAATTATACAATGCCAGCCACTCGGCGAGCACAAATAAAATCAAGCAGTCAAGCACAATAACAATAATAATACAAACAATAATAATA:1 - chr3R 15805126 5' + mdg1 25 2 53.47 AAAGCCCTAAAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:2 - 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chr2R 4833507 5' + 1360 72 1 55.45 GGAATTGGGAAAAGTTTACGCATTAACTATACACAATGATTTAAGATAAGGGTTTAAGATATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTGAG:1 - chr2L 13155299 5' - Cr1a 4097 1 68.32 GTCGCGATTGGTCGACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr2L 15333718 5' + P-element 27 1 48.45 ATTATGATACTGTCTGTTGTTATTATAAACCCGTCTTCAATTACCATTTCGAGATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCTGTTTTGTCGGGCAATCCGTC:1 - chr3R 4065841 5' - G4 74 1 68.32 GAGTGTTTTTTTTTTGCCTTTTTTTATTTGCCCCTGTGCTCGGAAAATGCCATGAAAATTATTTGCTTTTTAATTTTGTTGCACACACACACACACACATT:1 - chrX 7416062 5' + accord 7028 2 79.21 CGTTTTCATATTTTTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 + chr3R 25702156 5' + Tirant 8113 2 75.25 GCAATGGCATTGCCATTAAAAACGGTGCTAAAATACCAGGCCAGACACAAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTG:1 + chr3L 9585280 5' - Cr1a 4189 1 54.46 CTTTAGACAGCTTCCTTTTTGTCCTCTCCTTAATGCAATTAGCATTCGGAACGCCTTTAATTTAGCCCCGTTGGCTCCCGTCCTAGACCGAAAATCAATTG:1 + chrX 17077468 5' + mariner2 254 1 62.38 TCTAATTGGTTTGCTGGTCTGTTAATACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTAAATATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATG:1 + chr3L 198108 5' + jockey 326 1 74.26 AACAGNGCAATTGAATCGTTGTAGAACCTTCGAACTTTCTCCAATGCCAGAACAATATAGCCATTAAAATCATAAAAAAAAAAACAAA:1 + chr3R 21369339 5' + BS 5098 2 57.95 CACAGACTGCGTCGCAGTGTCGCATATATGTATGTACTTCCTGGAAAATTTAATTTCAGTTCTGCCAAAAATAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGA:1 - 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FB 699 2 77.08 TCAATATGTTAGCCCGCAAAGCGGAGGAGTGCGTCCAGTGTTACTGTTTAGTTTGATTTATTGGTTAATTTCAGACACTTAATATTAATTAATTCGACACC:1 - chrX 2489981 5' - 3S18 277 2 66.34 CGTTAAGGTAGTATTTGGTGAAGAACAGCTTTTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 3188764 5' - 1360 3375 1 42.00 ATTGANAACATCAAATAGTACGCATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chrX 16517326 5' + hobo 49 1 77.23 GAAATATTTGTTGATGATTGACTAACGTTTTTCAAGCGCATAAATGGGGTTCCCACTTATGCAGTTTAAAAAATCTTGTAAAATTAAAACAAATTTTATAT:1 - chr2L 8968053 5' - 1731 4264 1 38.61 ACGACCCCGTCTTCACCGCTCTCTCTCTCTCTCACCACCGCACACAATTAACTAAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr2L 2909623 5' + pogo 22 1 57.43 AGTTACGTACATGTAAATCAACATTTACATTTACATACATTTACGTTATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 + chrX 17247274 5' + F-element 42 1 55.45 AACACATTCTACTTATAACAAACGTAGGATCACAGGACAACGATTATGTATATACTTACGTATTTTACTTTTCGAGTCGAACAAATGATCCGTCGTTTGAC:1 + chr3R 21848090 5' - rover 320 2 56.44 TTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2L 4189420 5' - 1360 3342 1 74.75 CTTCAAACTAAACCTTTCTCCATAACCAAATATTTACAAAGGATAGACTGAGAACCGGTATTTTTTTTTTAATTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCTTTT:1 - chr2L 16755071 5' - Doc 4675 2 43.56 TAATCCAAAATAAAACTGAAATATTTATATGAACAGTTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTT:1 - chr2L 16933649 5' + 3S18 42 2 64.00 CAGATCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chrX 4890036 5' + 297 30 2 62.38 AAGCANACACAACACAAACATAAATGGACTGACTTTTTGCTTTTGCATTTCGACTATATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAATAATACAATAAATG:1 + chr2L 16267390 5' + Stalker4 6977 4 51.49 ATAAAAGTTGTTGCGCTGATTGAATAAAAAATTTAATAAAAAAAAAAA:1 - chr2R 20874890 5' + TART-B 10629 6 50.00 GATTTCTAGAACAACTTTTCGTGGGAGTCTGAAAGCGTAAAAACAAATTGCTGGCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGA:1 - chr2L 6188623 5' + GATE 8296 2 54.46 TACTTCGTTTTCATATGCTATTTGCACTGTTTTTAAATTAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGT:1 - chr3L 22848669 5' - INE-1 542 1 76.24 CCCAGCTCGAGTTTTTGCTTACCACTTTTGAGTTGTTACAGTTTGATGCATTTTTTTTCGGGTTTTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 + chr3R 24493291 5' - Tabor 442 2 45.54 GTAGTTAAGTTTACTTTTGGGGTTTCTTGTATAATACTCGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 + chr2R 13144968 5' - roo 9032 1 65.35 TATATAGCCAGGGAAAAAGTTATTACTCATGCGCCACGTTGCACTGAGCACCAATCAATATGCAGGCTATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 - chr2R 8378696 5' + pogo 4 1 75.25 GCAGGGTAAGCACAAGGTTAATAGAAAGCAGGCAGAACTAAACAAATCGAAATACATTTTTGTTAGTTTAAACCCATCCCTTGGATACACTTTTCATGTTT:1 - chr3L 23883507 5' - Dm88 4247 1 55.45 AGTGCATTTTATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr3R 20466732 5' + roo 8669 2 76.00 CGTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 + chr3L 13194766 5' + 297 40 2 70.30 AGTTTCAACGAAGATGTTTTTGGTTGTGGATTCAGGTATTCCGTATAACTATCCGTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCA:1 + chrX 9023761 5' + Doc 292 1 61.39 GCCCACAAGAGGGAGCTTTAGTTTCATTTAGCGGAGTCTAGCACCACCATTGGTGCCGATTAGTAATTTAAATTTTTGTTTAAGTTTAAGTTTGAATTTTG:1 - chr3R 19096372 5' - Rt1b 89 1 64.36 TTCAGTCTCCAACTAGCTGCAAGTGAGTACGTTACTTCCCACGCAAAAATATTCACCAGCAAAGGTTACCCCAACGCAAACACACACACACACATCTACAC:1 + chrX 11579507 5' + accord 187 2 59.41 AGATCCATTCACCGAGAAGAACAGCATTTTGTTGCCGCCCTCTTCGTGTCGCTCCTTGAAGGCATCGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAAT:1 + chr3R 25035438 5' + BS 4661 1 68.32 GGTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGGGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCA:1 + chr3R 17660024 5' - micropia 426 2 54.46 GCAACCAGAGTCCAACGAAAGCATCGTTCATCACGCTGACAGCGAATTAGAATCGGTATTCGATATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCA:1 - chr2L 13837962 5' + 297 6587 2 74.26 CATTTATGCATATACATATGCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGG:1 - chr3R 13533138 5' - Stalker 148 4 79.21 AATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATT:1 - chr3R 1868215 5' + G-element 39 1 58.42 CAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chr2L 13244979 5' + P-element 44 1 35.64 ATGTTAGCCGCAAAAGTCCCTAATCACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCC:1 + chr3L 19559680 5' + F-element 4452 1 75.25 AGAAGCATGTTTTCTTTGGGATTATCAGTTCTTGAACCCCACCATGATTTTTAAATACGATCAAGTGGTGAAATGGGTCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2R 4502396 5' - roo 410 1 78.22 ACCACATTTTTCAATAAATATTATTTCGCAAGCTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACTT:1 + chr3R 14096653 5' + 1360 229 1 67.33 AATTAACCCATCAAAGCTATTTTATTTTATTTTATTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - 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Max-element 369 1 56.44 CTTTTTACAAACTAATAAATTAGGAAAAATGTATTTGTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTG:1 - chr2R 13122112 5' - opus 498 1 79.21 TGGGCAAGACTTCCTTTGCACATATTTTTCTTGGCCAGCCTTTGTCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGC:1 + chr3R 18551126 5' + Max-element 8267 2 59.41 TACCACACAACCATTGACTTCCGCATACCAAAGAGAAAATAAAATAAAACCAACAACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAC:1 + chr3L 21268216 5' + I-element 161 1 72.28 ACTAACAAAATTTTCTAGATATGTTAATATTTAAGATTCTATTTCTTTATAATCCTATAAATAAATCCAATGAGTACAGTACCACTTCAACCTCCGAA:1 + chr2R 18295581 5' + I-element 1 1 75.51 GGATATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCATTGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCTTATCAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 10457275 5' - roo 396 2 49.37 GGTATGCCTCATGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTC:3 - chr3R 9952277 5' + Ivk 1 1 77.23 CCCGTNTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 19457155 5' - roo 9030 1 69.31 ATAATTATGCTTCGATTTGTTAATCAATATTAAATAACTGGCAAAACTAAAGGAGTGGTATGGCCAAATAATCGATTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGG:1 - chrX 7804349 5' + R2-element 3372 1 80.20 CCCAATTAAAAGTTTCTAATTTCTTAATAGAGGCAGCCTCTACTATAAAAAAAAAGTGTAACAAATAGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGA:1 - chr3L 21882132 5' + invader2 4792 1 55.45 CAGGAGGATGCAGCTCAGCCATCTGGCGAAGAGGAAGAGGAGGAGTTCGAAGAACTCGTTGAAGAAGATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGC:1 + chr2L 20118669 5' + Max-element 8246 2 68.32 TATAAAAATAATGTTGATGTTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:1 - chrX 12294790 5' + blood 2 2 77.23 CCCCACAATGAAAATATACGAAATAAAAAAATCCTCACAGTTGGCTTATCTACAACAGTGAGGACGATAGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTA:1 - chrX 20975134 5' - opus 374 2 77.55 TAATTTGCATACGCTTGTAATGCGCTCGAAGTTGAACTGTAGTTAATTTGAATACCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCA:1 - chr2L 7350793 5' - mdg1 7417 2 62.38 CCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3R 9369993 5' - roo 9033 1 63.37 CTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr3L 9692718 5' + P-element 54 1 23.76 GATGTCAATATTAGAAGTCAAATAAATTTACGGGATCTCTTATTCCTGTTAATCCTTTATTAAAAAAGGTATACTTGATTTGATATTCCCTTTTACCCTTC:1 - chr4 270185 5' + hobo 2633 1 83.17 CGCGAATAATATAGGCGATTGGTAAATAATTTCGATTGCCCACCTTTTAAAACTAAATAATTTCGTTTGCCCATCGTTCAAAATTCATTTTTAACGTTTGC:1 - chr2R 15814482 5' + FB 668 2 74.26 ATCGATCACAGTAGCTTAACCATGGCTTATTCGCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAA:1 - chr2R 23725635 5' - mdg1 104 2 71.29 CGCCGTTCTGCCCTGTTGAGAAATCGGTGGAATGGGCTCGGGGACCAAGTGGAATAAGCCGGTAGCAGGGTCGTAGCTCCGACTTGATATTCACGGCAGTT:1 + chr2L 16112815 5' - Chouto 177 1 58.42 TACATAAAATTTTAAATTGGAAATTACACACAAAACACACTGAGAGAAATTGCGAAAAAAATCAACTTAATAACTGCTGAAAATATGTATGTAATATGTAT:1 - chr2L 21570276 5' + Dm88 6 2 75.25 GTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3R 10445195 5' - roo 9038 1 58.42 TGGGGCAGCTCTCGAAAGGGGCTTTCCGCAGGGGAAAATCGCGAGTTTCGAGTGGCCGCCGCTCAATTTGGGGGATAATCGCAGCGTTAGCCCCAAAGCTA:1 - chr3R 13807210 5' + Ivk 237 1 57.43 ATGAATCTGCAACCGATTTAATCGCAACTACTCGAATACAGCGACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAACGCCGTTGGAAAAAACGAAACTGGCGACC:1 - chr4 545625 5' - Max-element 412 1 57.43 ATTGTTATTATTTTCCCCATTTATACAAAATATACACATGCATATGTCGGGAAGTTAACTGTTTCGGGG:1 + chrX 11533918 5' - invader6 4861 2 63.77 TTTGGCCAAAAGTTACGCTCGAAATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAG:1 - chr2L 16082690 5' + Stalker 6867 4 61.39 AATAATGGAATAAACAAAATAAGGGAAACATATTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 25285121 5' + roo 8710 2 79.21 ATCCTGCTGAATTCTCTGCTGCCAATTCTTGGCTTTTAGACAGTAGCATGGACTGGTAACATTAACATATTGCAGGGCTTGTTTACATTTAACAATTTAAA:1 - chr3R 28269608 5' - HeT-A 5819 1 74.26 TTACGCGGACAAAAGGCAGCAAACAACGCAGACGGAATGTTTCGATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCAATGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTCTGTGTG:1 - chrX 3655100 5' - gypsy3 417 2 79.21 GGAATAGAAACGATAAAAAAGGGAAAATCTAAACAAATTTGATTAGATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 + chrX 2884824 5' + copia 31 2 58.42 TGAAACAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGAATTACATGTATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACAT:1 - chr2L 12074405 5' + Quasimodo 33 2 66.34 CAAAGGCGACCACAAAAATGAATAATTACGGGCGAGCATTGCCGGATAATGGCACATATTTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:2 - chr3L 3671371 5' + roo 8681 2 62.38 CATACAGCTATACTGGCGATTGGGAACAGGTGCTAATCAAGAAAAAAAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGT:1 + chr3L 4068057 5' + jockey 13 1 73.27 TGATCATAAGCCAAACATGGATGAAGATCCTTTGGATTACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATC:1 + chrX 21396648 5' + F-element 25 1 60.00 CAACTTCCTGTTTCCGGTCCGTAGTCGTAGTCCCATAGTATCGTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 + chrX 12535044 5' + hobo 35 1 60.40 TGTAAATGCCCCGTCCGCCACTCAATTGAATTGTGTAAAGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTA:1 - chr3R 17793212 5' - jockey 4533 1 61.39 CCAAACCTTCAATATAGTAAATAACACTTAACAACCAGATCGCGCTCTTAGCCGAAACGGCTCACAAAAAATACAGAAAAGAGTTAAAACAAAAAAAAAAA:1 + chrX 2677782 5' + TAHRE 10441 1 63.37 TGTAAATAGTAATCCTGTCCGGGAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCA:1 + chr3L 18576698 5' + springer 20 2 59.41 TTACCTTTCTCTGGCCAATCGATAGCTAATAGTCAACAACATCAGTCAGCCGGGCAGATATGTAAAGTAAAATAACTAAAAAAAAAA:1 - chr3R 23560818 5' + F-element 4683 1 80.46 AAGAATGCCATTCGATATAGGAATATACTTTTGCTTTTCGTAAGCTGTAAAATCCCAAATGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 12136338 5' - roo 9037 1 56.44 GTAAAAACAAGGGCTTAATGGGTTAAGGCCAGGTCTGGTCCAACTTTCGTAGCCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chrX 19095816 5' - roo 9048 2 55.45 CCAGGAGCTAGACGCTTCTACAAGCTATTGATAAGCCTGCTCCCGCTGGCGTTGTTCCTCCAGTTCCTGCTGCTGGCGACGCTGCTGCTCCTGGCGTTCCC:1 - chrX 17156372 5' - Fw2 3572 1 65.35 ATCGCTGGCCGCAAATAAATTGAGCTGTGCCGCCCCAGCAATACCCATTTCGGTTTTACGATCGATCGAAATTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTG:1 + chr3L 397516 5' + roo 191 2 70.30 GCCCACAAGTCTATATTGAATTGAATAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:2 + chr2L 5974387 5' + roo 10 2 65.35 GACCATATGAAAAACTGAACCCTCCGCTTAACGAGGCATTCATTTATTGCAAATTGATGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr3R 12767102 5' - 412 7529 2 59.41 CACAGCTGTCTCAATTTTGTTTTACATTTGGGGCATCTAAAAGATTGATGACTTCTTTCGGCAAAGCGATTTTTTTATTTTGAGACGATTTTTTGTTTATA:1 + chr3R 4570023 5' - transib3 2430 1 81.19 CGCTCGTTCTCAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCA:1 + chrX 4041515 5' - hopper 1379 1 59.41 ACGGAATAAGCAAGACATTTATTGAGGAAGACAAAAGGATTTATAGATTGGAATACATTGATAGAATTTCATTTGACGCCGATGCTCTCGGTGCGTGCATG:1 - chr3L 27396164 5' - invader4 445 1 70.30 AGTATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTCACTTCAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAAT:1 + chr2R 21712769 5' + I-element 255 1 64.36 AAAGTCATGGCATTCGAGAGCTGGAGGCAGTGAAATACAAAGCGCGGCAGGCGGGAGAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCA:1 - chr2L 15141242 5' + opus 335 2 51.49 AAAAAAAAATGAATGAATTGAAAAACAAAAACAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAAATCAGAAACTTTGCTATTTAACAAATGACTTATCTATTCATA:1 + chr3L 2401764 5' + Tc3 1624 1 71.29 ATTCGGAGTTTCTGCATTTTGGATTGCCTACTTTTCGGGGCAGTCATTTTTGGGGTCCTAATAACTTACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 10653621 5' + jockey 18 1 68.32 AATAATAAGAGGGCAAACACAAACACAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCT:1 - chrX 12546509 5' + P-element 22 1 57.43 ATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGA:1 + chr3R 13423293 5' - 17.6 7382 2 67.33 TCAGGGGGGTGTTAAGGGGACAGCTGCACCGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr2R 22395200 5' + I-element 29 1 53.47 GTGTAGGTGTATGTTTGCTCATTTGCGACGCTATCTGATTATACCGTACAATTGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCT:1 - chr2L 7994498 5' + jockey 4784 1 51.49 TTACAAGAAAATCGATTGTTTAATTTGATTTGGGAATTTTTATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3R 14688245 5' - pogo 2068 1 61.39 CATAGTGACAAGGGGCACATCAGGGTAAGTGCTAAGTTCTTTTGCTCCCGAGATCCTAAGTATATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGAGCTGCC:1 - chr3R 5513253 5' - 412 7367 2 70.30 GGGCATCGAGTAAAAGGGTAGCTCAGACTGCAACTGGAACAGAAATAAATATTTAATTGACTAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCA:1 - chr3L 8831256 5' - jockey2 3339 1 57.43 ATGGGGTTTACGGTGGATTCGCAGCTGTGTATTTTGGGAGAACATTTGGATGCTTAGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTTGAGGAGAAGCCTCAG:1 + chr2L 13212591 5' - 17.6 237 2 74.26 AGCTTNTACTTCTACCACCATGTGAAGCTATGGAAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 - chr2R 3188738 5' - 1360 3348 1 67.33 TTCGAGGCCACTGCGTTAACTGCCGGGATGTAGCACACCAGCGTTCTCAGCTCGTCGAAGGTCAGCACCGCCGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chr3L 3846210 5' + 1360 4 2 80.20 TACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:2 - chr3R 27080783 5' + HMS-Beagle 42 2 69.31 GGATTGATACTGGCTACTGAATTTTGTTTCTCGGTCTACTCTATCCAACCGTAAGTAGTCATATTTTTGAAAGGGGCTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAG:1 + chrX 1278797 5' - Ivk 244 1 52.48 AAACCTTAAATGCTCACATAAAAAAAACAGAATTTTAACCAAAAAATACAGCATCTTAGGCAAAAAATGCCTATATAAAACTCATGCCCATCCCTCCTAC:1 - chr3L 23860576 5' + I-element 5052 1 78.00 CTGGTCTTTCGTGTCTTCGATAAGAATAATGTGAGTACGCTGATATGTAGATAAGATACTTATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGT:1 + chrX 18200715 5' - opus 489 2 45.92 AACTTTTGAATTTTAATTACTTAGCTATCTGGTGATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCG:1 - chr2R 18601877 5' + Transpac 40 2 66.34 TATTGGTTTAAGGTTTTGTCATTGAAAGCGACAAGGCTTTTTGCGATTAATATATTTTTTATAGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAAT:1 - chr3R 20616405 5' + Stalker 7093 4 67.33 TATATAATTGGTAAATATTACTATATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 + chr2L 18953020 5' - copia 238 1 61.39 ACTGATTATGAGTTTTAGTTATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTT:1 - chr2R 8245751 5' - mdg1 365 2 80.20 GTATGAATTTTAAGAGAAAGCCCAAATGTGCTCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr2L 7927211 5' - hobo 2897 1 67.33 ATAGCAAAGAGTTTCCCGAGTTTTGCTTGTTGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTAATCTGATCCCCA:1 + chr2L 12909939 5' - G5 4536 1 75.27 TGCCTTTTTCATCGTCTTAAAGTGAACTGATATATTTCTGGCCGGCTCCACGAACGTGACATTTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr2R 24493650 5' + flea 4771 2 64.36 AACAAAAGCAGCGAGATAAGCCAAGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGATAGACGACGAAGTGGCAATTGGCGGGACAGACAGC:1 - chr3L 7328559 5' - diver2 4729 2 74.26 ACCCTGCCGCATAAATCATTAAAACTTGCCACATTACGCATACGCCGCGTTGCAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCT:1 - chr3R 10913957 5' - diver2 239 2 58.42 AAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chr2L 108045 5' + P-element 49 1 31.68 GCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 28326748 5' - P-element 2841 1 36.63 GCTTGCATTAACCCATTAATATCTGTATCGCTCAGCATTTGACTTTATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGTTCCATGTCTTTGTGGATGTCATGATTAGTCA:1 + chr3L 13447236 5' - G3 4305 1 77.23 CTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGAC:1 - chr3L 24208218 5' + Quasimodo 6 2 70.30 ACTGAGCCTTTCCCGGCCTGAGTATCTCTCGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATC:1 + chr3R 11165625 5' + Tabor 19 2 64.36 ACGGCGCTCAGGAACGGAGAACGCAGAACGCAGATTCATCCACCGAGGTGGCGGAAGGCGGAAGGGCAACACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 + chr3L 7314658 5' + hopper 6 2 55.45 TTTCAGTTTTCCCCACTTTTTTCGCCGTTTTAAGAGAAAATAGTTTACATTTAATTAATTTACACAGAAACGGAATACTTATTTATAGTTATTTATTTGGT:1 - chr3R 19513170 5' - Tc1-2 477 1 77.23 CAAGTTCGCCCATCCAAAATTTCATTCACAAGCAACTATAATGCCATATTGGCTTACAAACTAATTTATACTTAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:2 - chr2R 13605644 5' + I-element 4 1 60.40 GGTGAGGGGCAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACATACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3R 10457263 5' - roo 386 2 54.46 TAATCAAGACCACAGAATGTTTGAGGGATACCAAGAAAAAGGTGGCCGAGCTGCGTTTGGTTCATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGG:1 + chr3L 15117037 5' - R2-element 293 1 53.47 TTTAGCTGTGTAAGGGGTTGCTTTTAAAGCGCCTAAATCTGCCACGCCCACAATTTTGAACAATTTTTAATATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGA:1 + chr3L 23009946 5' + INE-1 544 1 56.44 ATATGATATATATACTAACAGAAAAGGTTTAAGAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGTCTTACAATCGCTGCATTATATAATTAGA:1 - chrX 11670169 5' + rooA 248 2 73.27 GCGCCAGTCTTTTCAGTACTGGAATTTCGTCGAAGAGCATACATTAGGGACACCAAAACGATATTTAAAAACATTTAAGTTGCAACACTGAAGTTTTTATG:1 + chr2L 22678101 5' + transib3 131 1 68.32 GAAATGCAAAATACAAATTTAATTGAACTTGTGCGGGCCATACAAACAACGGCATCTTATGCGGGGCAGATTCGAAGCCGCAGGTGACATTGAATTCCATT:1 - chr3R 2109444 5' + R2-element 3157 1 67.33 AATTTAATAACCAATTGAAGCAACGTAGTCAATTATTGTATATAAATATTAATGCAGTGATTATTCATAAGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 + chrX 5443861 5' + mdg1 7046 2 71.29 CCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 + chr2L 15333741 5' + P-element 53 1 26.00 CGAGAATACCTCAAACACGGTTCCTAACACAGCTACGACATCGACTAGGACACACAAGCATACCCACCAATACTACCTAAGTCCAAATTCAATACCAACTT:1 + chr2L 5158904 5' + I-element 4989 1 67.33 AGCTAGTACAGTGGTAATTGGATAATGCAGTCTAGCTAAACGGGAAATTTGTAAGGAAAGATATTTGAAATAGTCTTAGAATAATAATAATATTTTTTATA:1 - chrX 9654255 5' - Burdock 499 1 70.30 CTCTCTTTTTTATTATTATGTTATCATGACTACTACTGCTTGTTTATTTATTTAAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTC:1 - chr2L 12074556 5' - Juan 4184 1 53.47 GTTGCCTCTGTGGCATTTTTAGTTCCTTCAGCGCGCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAAGAAGAAGAGGGCGATTATTTTT:2 - chr2L 18112562 5' + transib2 2592 1 65.35 TAATAAGAATACATTTAATTTACAAAATGCTTGGATTTCATTGGAACTAGTTCCATGCGCCCATGCTTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATCTA:1 - chrX 2789990 5' + blood 7182 2 71.13 AAATGCATTTGAAAAACCATTTATTGGCCAGCATTGTGAGGGTCGGGAATTTTGTTTTAAAAAATTTTCAATT:1 - chr3R 6134206 5' - hopper 1034 1 89.04 CACTTTCTGCATCTATTTCTTTAGAAGCACTGCTCCGCAAAGTAAATTCAAGTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 19192525 5' - roo 9046 1 54.46 TATCGATACAATTACCAAGTAGATTCACTTTCCAAAGAACCGCTAGCAGATCGCGAACGGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAA:1 - chrX 329452 5' + opus 7391 2 64.36 TTCGGNGTGCTGTCGATGGAGGCTCCAACCACTGGCGTGACTTTGTCGTGGCTCAGGCAATGTCAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTC:1 + chr3R 11735925 5' - F-element 312 1 70.30 TGAAAGATATTATTCGTCTGATTGTGTTGTTTGATTATTTCTTTTGCCTGAGTGTGGCATAACAAATTTAACGCTGAGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGT:1 + chrX 22218737 5' - 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P-element 2837 1 22.83 AATTTATGAATTTAAAAAGAGTTAAATTTTGGAAATTAGAGTTTCAGCTAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr2L 9946987 5' + roo 28 2 57.43 TGGCGNACGTAATTTGCAAGCATTTAATATAGAGTTGAGATTTTAATTGCAGTTTACGAGTACATATTTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGC:1 + chr3R 28728259 5' - jockey 4981 1 63.37 CCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCT:3 - chr2R 19386727 5' - 1360 116 1 48.51 TTAATGATAAGCGGAAGTCGGCGGGGGAATGACATATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 + chr3R 29350709 5' + opus 147 4 68.32 GTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTAGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 + chr2L 8740876 5' + Burdock 6164 2 54.46 AATTTCATTAATAAATCAGCATGTCGCGGAGAAAATGTCTGCCAACGACGTGCATTTCAACGACGTGCATATAGCCTAGTGTTACCCATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 15332222 5' - accord2 356 1 57.43 AGCTTTTGCAATTGCCGAGGATTTCATTTGCTGTTCATGTTTCGAGCGTTAGATCGTATTACTAGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTT:1 + chr2L 11914322 5' - Stalker4 113 4 56.44 CTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGC:1 - chr3R 1977620 5' - micropia 5409 2 54.46 CTTACACATCTTTTCTGATTTTGAATTTCACTTCTCGCTTTCAGCAACTAATTAGTTTTTCTTCTTCTCACCATTTTATTAGTTTTTTTTTTATGATGTTT:1 - chr3L 9681474 5' - jockey 4999 1 85.15 AGAATGGCATTAGAACATCGTAATCGCAGGCACCACAAAAACCGGGTGGATTTTTCCTCGATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATTA:1 + chr3R 6921687 5' + Max-element 463 1 71.29 GGCGTTGTAATGTTTCCACCTCCTGACTCCGAAACGAATCAACAAACTTACGCTGGGTTTATGTTTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTTAACCTTCTAGCT:1 + chr4 1190217 5' - INE-1 168 1 62.38 AACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chrX 18353565 5' + jockey 31 1 52.48 CCTTTGCAGTAAAGACGTCACGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAAT:1 - chr2R 3899479 5' + P-element 2705 1 27.72 AAAGTTTTCAGTTACCAATCTCGCACTTAAAAAATTATTAAAAACTCAAAACATAATAAAATTATATTTTCTAATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATA:1 + chr3R 21695409 5' + 3S18 5 2 73.27 CCAAAAGGCAGTCTACCGGCCGTAAATGTTTTTACGGCATCATCTCCATTCCCGACATCTTTGTTAGGCCAATGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 - chrX 19306844 5' + P-element 6 2 75.25 ACCTCTTTGCCACTGTTTAAATACAAAAAATTAATTTCGAAATGTTTTCAAATAGATTTTAAGCATCGACGGCGCAAATAAAAGGGTGGATGAGTGAAGTA:1 + chr3R 20376982 5' + invader2 341 1 38.61 AGCACCAGCACATAAACCCACAGCCCTGTACTTACATATACTGGGTATGTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 31644132 5' - roo 9045 1 53.47 ATTCCCTCCCATACGCAACCCATTCCAATTTCGATACGATTTAATCGGCACTCCAGAGTTGACACCCCGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGT:1 + chr3L 958724 5' + P-element 8 2 69.31 ATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3R 10445183 5' - roo 9050 2 57.43 ATGGTATCAACAGAGCGGTAGTAGAGGGATGAAGTCCGAATGGCTTTCACAGGTAGGGTGGGTATAAAATAAGG:1 + chr3L 17975765 5' + Circe 7200 1 64.86 GAACTGGACCATAGTTTGTTATTTGTTATTCCAATCTACCGATATGTTTAAACCATATTCAAACTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAA:1 - chr3L 23491605 5' + Juan 16 1 64.36 TATATATAGTTTTTCTGCGCAAAACATACATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chr2L 18028689 5' + flea 45 2 75.25 GAACGGGTCAAACTCGTTTCAAAAACTGAAACAGAATTTTCCATTTGCCATGTGCGGGTCCGAGCTTTGAACGTGGGAACGAGCTTTTCTAATATGGACTT:1 + chr3L 6827219 5' - Idefix 411 2 60.40 CGATGATGGGTTAAATTAAAGGCTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 + chr2R 22395229 5' + I-element 58 1 76.24 CTGTGATAATTCTATGTTAAGCTTTTATGTTAATTATAAGTTTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGTGAT:1 + chrX 12676448 5' - Doc 4376 1 59.41 GCAAATATACACATTGTACATGCTTTTGTATTTTATTGCATATTCCCTATTCGCCTGTACATTTTCCCGACCATCCTGACATTTAAGATCACCTGATCTTG:1 - chr2L 1276141 5' - invader2 4822 1 73.27 ACGCAACCAATGAATTTGTGTATAATATTACTAAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATG:1 - chr3R 11165696 5' - Tabor 7281 2 66.34 AGGGGGGAATTCATTACTTCACCGAGACGCGTGCGTGCGGTTTCTCGATCTGCTGTATATATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 + chrX 12224568 5' + Burdock 6151 2 60.40 TTTATACCTCCAACGAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCG:1 - chr2L 108087 5' + P-element 7 2 73.27 CCCGAGCGATGCTCCTCCATGTACCAGTGGCCCTATGTGCCATCTTCATTCGAAGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAG:1 - chr2L 6041427 5' + jockey 493 1 61.39 ACCGGGGACTCTGCTCTGCCTTCATCAGTCAAGTGTGTTGTCTGTTGGCCTGGACCACAAAAGGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGT:1 - chrX 13905753 5' + R1A1-element 4929 1 63.37 AAGCTATTCAAATTTGCAGATTTCATTAGTGCAGCCCCCATAAGTATGCAATTAGTTGTATAAAACCAAAAGGTCTCTTGTATTTTTTTTTATATTTATTT:1 - chr3R 9657782 5' - Tc1-2 484 1 74.26 AGGCCCAAGAGCGTTCCAAGCAGGCCAACGCCACGCAAACCAAGATGGTGGAGAGACCCTTTATGCTGAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGT:1 + chr2R 9449611 5' + roo 145 2 76.00 GTAACGAAGCTGGCCTGTATCTATTTTCAATTCGCTGTGACATGTCACATCTACATACTTAATATCTATGTGCTTAGTGCGTTTATGGTGTACTGGATTCT:1 - chr3R 25878834 5' - Copia1_DM 4101 1 62.38 GAGGCCGGGATTGCCGGCGCGTTCAAGTGCTGTTTGTTGTCGTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCC:1 + chr2R 6984298 5' + HMS-Beagle2 6 2 73.27 GAGATGGGGTGGTTTGCCGTTGCTATTATTATTTCCTATATGCTATAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGA:2 - chr3L 21319310 5' + jockey 4704 1 53.47 TGGGGTAAGCACAGTGAGCACACTAAGCAACCGCTAATCAAATCACACTTCACTTTTCAGCCATGGAAACTATGTGGGCGTTCTAGCTTTTATAGTTCCTG:1 + chr2R 24388069 5' - INE-1 155 1 76.24 ATATAACATTTGCTGTTAATTTTCAAGTCGGCTTCAAATTGTTTTTGTGTGTTGCAAAAGGTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - 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G4 116 1 68.32 GTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 - chr3L 15638271 5' - roo 9016 2 84.16 AAGGTTGGCGAATTGAAGATATCCTGTAAGCAATGTACTTATAAATATGAGCTATATATTGTCTTGCCACAAAAAATCTAAATATTATTAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 23612215 5' - hopper 160 1 85.00 AACTGATGTTTCGACAAGAAAACATAACTGGTGTATGGTTTTTATTTAATCTAATTTTAGAAATATTTTTTAATTAGTTTCTTT:1 - chr2R 12807119 5' - HeT-A 5764 1 78.57 CTGCTGTACCATTGATCCTTTTCGCAGGCGGCATTAGTCACTCCAGAACTTCTGGCTTGTCACTCTGAACCCACACCCCCGGTCACAGAAGAAGAAACTGC:1 - chrX 9289274 5' + G7 151 1 64.36 TTTGAGCAGCCCAAAGGTGTTTCAAGCGCCAGAGAGACGAAACGAGCATAAGAATGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3L 2800215 5' + blood 7030 2 59.60 TTTGTCATTTTGTTTGCTTCTCGTTTCTCGTTTTCATTTTACAATTGGCAAATCTATTTGAAAGCGGATCTTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTC:1 + chr3L 3955891 5' - Burdock 6038 1 64.36 GGCGAAGAAGGTATTACATCAATACTCCACTTATTACTGAAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr2L 9946879 5' - roo 408 1 41.00 TAACACAATAATTTGCACAATTTGTCAAAACAACCCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 - 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G4 3806 1 62.38 TCCGCCTTTGAGTTCAGTTCCCTGATCTAAGACAGAAAAATGGAGAGGGACCGGCAGCCCGCTCTGCCTCGT:1 - chr2L 1179687 5' + F-element 444 1 77.78 GCCCGGCCCGGCCCGGACCCATAAAACTTTAAATAAATTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3L 13312153 5' - mdg1 7418 2 65.35 GTGCTTATTCAATATCATTAGATGCCCATGCAGCTGCAGATGCAGATGAGGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 17122488 5' + roo 8690 2 53.47 TTCCATATCATTTCTTCTTTATGATTAATGATATACCTATGTTTTTGTTGCAATAATATTCTTAAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3R 19224830 5' - hobo 2925 1 65.35 GAATTCCCAAGGTCAAGGCAATATAGCGCAGCAGATATTTCCTACAACTACACTACCCAGAGTAATCCCCCCATCACCCCAACATTTTGGTCCTTCGAGCC:1 + chr3R 30365848 5' + GATE 268 1 72.28 CATCAAGATGCCAGATATGATTTCCAATAAATTAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATA:1 - chrX 19216720 5' - 1360 257 1 72.28 GACGCGCATGAATGGATTAACGACGGACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTATTTTACGTGGCGTGTTCCAC:1 + chr3L 23112571 5' - R1A1-element 5307 1 79.78 GATGAGTATAGATTTGTTTGGTGCAATTATATGTTTATATCTTTTGATACACACTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTG:1 + chr2R 11702544 5' - I-element 81 1 62.38 CATCAGCTGTATCCATAAAACTATAATTTATGGCAAATTTATAATGTTGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAA:1 - chr3L 22916930 5' + copia 5056 2 52.48 TTGTTCTGGAAATTACCATCGAAACGCCAAACGAATTTTCGTATATCCCAGAAAAATGATGACATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGGTA:1 - chr2R 5718056 5' + INE-1 539 1 60.40 TTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chr3R 31812729 5' + P-element 50 1 30.69 ATATTGCTTAGTTGATTAATTTCAATTGCTTAAATTATTTTTGAAAAAGTTACGGTCCCCAAACACAGAATATGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATAT:1 + chr3R 10320996 5' + roo 8666 2 77.23 AAGCCCCCAAATGTCATTTTATGCACTGCGACAAAACAATCAACTTCTTTCTTTCTAACTACATCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr2L 903788 5' + 1360 8 2 67.33 AGTCTTATTAGATTCCAAAGAGGGAATGAAACGACCGAACCCCCATTTGCCCAGCCCCCCGCAAATAGCATATCTATGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTG:1 + chr2R 16369728 5' + micropia 5285 1 78.22 GACCCTTTGGCGAAAATGGGGAGACAAAAAAAAACCGAAAAATCAGTGGGAAAGGAGCGTTAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chrX 17065205 5' + Tirant 21 2 43.56 GAACAGTGTCAGGGAGCTTTAATTACTTTATTACTCGAGATTCCACAATCTGAAGAATGGACAAAAACACAAAAAAAAAACAAAAAAAAA:1 - 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P-element 2838 1 30.69 ATATATTACATACATACATATGTATGTCGCATATCATTTAAATGTAACGACATTGCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGTCTT:1 + chr3L 16145263 5' + invader1 3655 2 71.43 CTTAATTTGTTTATTTATTGTATTTTAATAAATTTACCTTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGAAACAATCTTTATTTGTAAGCTTATTTGTGGTGA:1 - chr3L 25061922 5' + Cr1a 4047 1 78.22 GCCAAAAGAGAACGCTCTCTCGGGCGTTCCGCCGAGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr2L 15333775 5' - P-element 2845 1 37.62 GGCGATGTCCACGACCGCTGACTCTCCTTCTCCTTCTCTTTCTCGCTCTCTCTCTCTTCGTCGGTCTCGGTCTCTACCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chr2L 11045259 5' + P-element 2 2 74.00 ATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATT:1 + chr3L 24213799 5' - invader2 196 2 76.24 CCTGGTCTAACAGTTCCAGCCGATGGAGCAGACTTTCCACTTGTTCGAGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chr3R 16443674 5' - flea 4973 2 55.45 ATAGGGTTGCCGATGAGGGATCTAACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr3L 15638322 5' - roo 404 1 75.25 CAAACAATCTGGAGAACCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGAT:1 + chr2R 18601818 5' - Transpac 5194 2 61.39 AATATATAAATAATATATATTCTTGATCATGATTAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAA:1 + chr3L 10534918 5' + INE-1 147 1 84.16 GCCCTAGTTTTCCCAGCCCTTTTTATCTATATTTTACTATTTTTCTGTGTTTTTTTTTTTGTCTTTTTTTTT:1 - chr2L 1834876 5' + hopper 145 112 76.39 AGAATGCGACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3R 14639346 5' + roo 8701 2 62.38 GCACCGATTGACGATCGGAACTACCGCTATACTATACTAGTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 - chr2L 487137 5' - P-element 2853 1 44.55 GGAGTNGCAGAAGAAGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chr3R 30272792 5' - P-element 2868 1 59.41 GAAAAGAACAGAACGAATTGGTTTAACCTTACTAATTGTAGTTAATTAGAATTACAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr3R 12877810 5' - mdg1 378 2 65.35 CTCTTCGCACACAAAAGTGTAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr2L 8031275 5' - P-element 2831 1 24.75 AGGCTGGTGCGAGGATGTTGAAGGCGCGCGTCCTTCGGCTTATGTGCAGCGCACTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTT:1 - chrX 10333951 5' - 1360 172 1 60.40 GTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 19642988 5' - roo 9023 2 73.27 AATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTAT:1 + chr2R 9375172 5' - HMS-Beagle 7009 2 63.37 GTGGGCAAAACAATGCCGAGGCCATGGAGACACTACGTCGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAA:1 + chrX 17191044 5' + F-element 4328 1 61.39 AGTGGCAAGTAACAAAGTAATTATGAGAGTTTTTACACTGCCGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGAGACTCCTTGGAGACTCTGAG:1 - chr2L 11392229 5' - GATE 8312 3 73.27 ACTGGCGATTGGGAACAGGTGCTAATCAAGAAAAAAAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3L 4068068 5' + jockey 24 1 62.38 AGAGACTGCCAAAAGAAAACCCGTCGATCAGGTTTGCACAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTATGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTTTGC:1 + chr2R 24925870 5' + Ivk 42 1 67.33 ATGGTTTTTAGGTTAGGTGTCCCTGAAAAGTATGCAACAATATCAATGTTATACATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATG:1 - 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roo 396 1 65.35 ATTTATGACATCGCACGAGGCGATAAGCTGGGGTCATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAA:1 + chr3L 12085161 5' - pogo 2066 1 64.00 AAATGGTTTTTATTTCTGCTCGAAGTCATCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTC:1 - chr3L 19350000 5' + 1360 3224 1 50.00 GTCGGCAGCACTGCCCACGATCACGATCTTTGTCTTTGCTCGCCGCTTTAAGCTCATTTCTGCTTCATTCCGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3L 8063808 5' - P-element 2881 2 73.27 TTTTTCAAATCTCACTTAATGGTGCCTGAAAGTATGCACCAAGTTTTGAAAAACATGTATGTCTCATGGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2L 809642 5' + jockey 17 1 66.34 CTAAGATAATGGAATGCGATGAGACGATTGAGGTCCTGAGACTGTGGCAGTGTGTGTGTGTGCATGTGTCCGTAACAAAAACGTCGAGCATGAAGGCT:1 - chr3R 30368713 5' - R1A1-element 5038 1 67.35 CGCTGAATCGGGCATATGATTTTAAAGAGGAGCCAATTCGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTG:1 + chr2L 17889329 5' - accord 7348 2 60.40 TTTTTNTTTTGGATTTTGTATATTTACTTATATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 16345553 5' + 297 6620 2 75.25 AAACTAAACTATTTTTGTACCACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATA:1 + chr2L 514830 5' + 3S18 5 2 77.23 CGATGTGTTTAGATGATTTGTGCACATTCTTAAATGGTTTACCGTCCTTTACGTATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAA:1 + chr3L 24131082 5' - HMS-Beagle2 7172 2 54.46 TTGACTTTCACGTTTCACGTTGCCTCAAAAGCATAAATATATTCCTATAAATTAAATAAAAAACTGCACACTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTG:1 - chr3R 14049441 5' - transib2 2817 1 70.30 TGGTTTCTTGGTTGCTTTCCCAGATTTTTTGTTAGCCGTCTAAAAATAACGCCAAGAGTTCAGTTTGATTTTATATTCAATAAAGAGCGCATCGCGCCTTG:1 + chr3L 21099636 5' + gypsy6 7599 2 62.38 TGCGGTGTACGGTGTATGGTGTGCTGCCCGCCTGTTCCGTCTGCCCCACCCGCTCCACCTGGTCCACCTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGA:1 - chrX 11482946 5' - opus 404 2 71.29 GAAATGCAGTCGCATATTTCATTGCCAGCTTTGGGGCGCCCGAGAAGGTTTATGGGTTAGAAAGAAAGGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTC:1 + chr2L 7170356 5' + jockey 4612 1 63.37 GTGAAAACGACCCATTTTCGTGCATAAATTGGAACAGAGTTGTCGCATATGCAAACAGCAGACAAAGGCACGTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTA:1 - chr2R 16053659 5' - pogo 2062 1 73.27 GAATGCACTGTCATGTGCGTAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAA:1 + chrX 1427530 5' - Bari1 1685 1 53.76 GTACAAATGCTTTTTAGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr2L 4189432 5' - 1360 3352 1 63.37 GTCATACGCCTATTCAGCTTATTATCCAAGGAGAAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAA:1 - chr3R 8198550 5' - Tirant 8467 2 68.32 AAGCAAGAAAAAAGCAACTAACTGTCGAACCCGTACCTTGTGATCCGTAACCGCAGCTAACCATGTTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGA:1 - chr3L 1720233 5' - flea 162 1 77.17 TGGAGGCATTCCCCGAAGCCATTAGGTATTGGGAACGTGCCTACGACGGCAAGATCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCA:1 + chrX 18026498 5' + Doc 479 1 58.42 GGGAATAGGATATAAAGTATCAATAAATAGTGCACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 22620203 5' + 297 39 2 69.31 GTCGCCCGGAAATATGCAGTGCAAAAACAGTTTTTAATTACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr3R 28728355 5' + jockey 23 1 62.38 AGAAACGCAAATTAATTATAATTAAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3R 9369918 5' + roo 19 2 60.40 AACCATGCACGAAATATATTTATACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCC:1 - chr3L 5015850 5' + I-element 4973 1 77.23 CTTTTTTATATATGAATTGCAAGTCTGAAGTGGAGTCTTAGCTTAGGCCAAATCAAACCATAGTGTTCGTCTATGGTTTTTTTGTTTTTTTTTTATTATTC:1 - chrX 1225308 5' - Rt1a 5074 4 65.35 GTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr3L 19215868 5' - roo 9045 1 54.46 TGGAGAGAAATACCTAACTTGCATAATTCTGGACACTGAAGAGAAATACATAACTTATACAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGC:1 + chr2R 924429 5' + springer 7156 2 60.40 GCTCATTATCATTCGCTTTTCGTTACCTATACATATCGCATCGGTTTAACCTGGCAGCGAACCACTAGGGCCAAGAAATCTACAGCCCAACTGAAGGAAGT:1 - chr2R 925728 5' + springer 7065 1 66.34 ACGCATACGCCATGTTGCGCCATTTGAAGTTGTTGGCGTATACGTAATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTA:1 + chr3L 22500598 5' - I-element 5323 1 55.45 CATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 6024593 5' - roo 9031 1 68.00 GCCCAGAAATGGATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr2R 5849952 5' + jockey 24 1 62.38 CAGCAGCGTTCATTCATGTTATTAAATTTGAAAATAAATATATCGAAAAAATTGTTAACTTAATTTTTTGTTTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 + chr2R 16744090 5' - opus 499 1 68.32 CTCTAAGTTTCTCCCTACAATCGCTATTAATGAATTCCAGGTCGTTAATAGGATCCACTCAAGAGGGCACCCAATCCACCAGACATAAACATCCGCAGCCG:1 + chr3L 15660829 5' + Quasimodo 302 2 60.40 TTTTTGTGGGGGCCTTGAACAGCTGTGAACGCACACGCTGAAGAAGAAGAAGTAGAGGCGAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTTCCGTCGTAAGCC:1 + chr2L 18694082 5' + P-element 16 1 66.34 GTCTAGGGTCTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGC:3 - chr2L 11551423 5' + Max-element 8249 2 65.35 CTGGCGAATTTGAAATGCACTCATGCAGATATACAAAGTACGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCGGTAAATCTTATCGTGTTTAGTA:1 + chr2L 20706960 5' + jockey 277 1 57.73 TTTTACTTTTCTAGCTCACTGTACAAACAGGCCCATCTACATTTTTAATATATATTGTTTGTGTGTGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 14381256 5' - hobo 2927 1 65.35 CGGCCAGCCGTGCGGACAGCCACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 - chr2R 19857413 5' + 297 17 2 55.45 AACTANCTATTGACCCAAATATTGTTCCAATACCAATTGAGTTCAAAAATAAGGTAATGACCAAATTGGACTTTAGACTTTAGGATTCTGATCGTAAAGAG:1 + chr2R 3290702 5' - Idefix 383 2 69.31 ATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTG:1 + chr2R 1320675 5' - diver2 4885 2 59.41 AAAGTGTGGCCAGTGAAGAGAAAAACAATTTTAATCTTCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAA:1 + chr3R 25918860 5' + roo 8663 1 79.21 CTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 4502502 5' + roo 21 2 55.32 ATTATNGCATATGTATAAGTACTATAAGGGTTGCATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chr2L 9389107 5' + 1360 44 1 72.28 GCAACGAGTCCTTGCTGCCTGCCTTTCGTCCTGCCATGGATTGGATATAAACAAAACACCTTTCCGTTGGCCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAA:1 + chr3R 29661903 5' + Quasimodo 7130 2 79.21 ATAATAATTTTACCGCTGCGTAATATCCATTATCAAACATGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGAT:1 - chr2R 21324013 5' + 297 410 1 61.39 GTGATTAAAATAATGGTGTAACTTTTGCGGGGCTTTACTTTCAACTTCATGTACACATATACCTTTTAATTTATAAACAAAACTTACAAGCTAAAATATCA:1 - chr2L 12113894 5' + gypsy7 5406 2 62.38 ACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chrX 329022 5' + opus 35 4 75.28 CCTGTTAGATTTTCATGCTTTTCCGCGTTGCTCGCTGCTTGGCTGCTTTTTATTGCCTGCATTTTATGTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTA:1 - chr2L 5447794 5' - Juan 4190 1 75.25 TCAGATTCAATTAACAATGCCGTGATTGTTTAAATATTATTTTAGGTTTGCGATCAACAGCACCCATGGTTAGAGGAAACCTATCGCTGTATTAGTCGTCT:1 - chr3R 19441445 5' - R1A1-element 4861 1 71.29 GCAGGCACCTCAATTGCATTTTGCAGTTACTCAAATTTGCATATCATTCCATTCCGAAAACTAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTAATTGCAATT:1 - chr3R 30674680 5' + hobo 2538 1 76.24 AAAGTTGAAATGTTTTCTAAGGCATATTAATAGCCACACTTTACAATGTGAGTTTCGTTTATAGTTATTATATAAGTTAACAAGTAACATCAGGAAAAGCT:1 - chr3R 19497526 5' + Chouto 6 1 64.36 AGTAGGGAAGATTTGCTGTGTCCTATTGATAAAACTGAATTGTTTTGAGAAAATAAAAAACAAGAGAGAATGAAATAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATA:1 - chr2L 17974205 5' - INE-1 559 1 52.48 GGAAAACAAAAATGAGAGTCCCCAACAGGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 19095726 5' + roo 8683 2 61.39 CGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 + chr3L 27415239 5' + transib2 40 1 60.00 CGCACNCCCGCTAACGTTTTCCCTATGAAATCTACATGATCACATCATGAAGAATGAGTAGATATAATTATATAAGTTAAGATCCCTCTTCTTGCGCTCTT:1 + chrX 328981 5' + opus 6 2 72.28 CTCTGTGTACAGTGAAACCTGCCTAAGCCTGACCATAACGGCTTAGCTTCCAACTATAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCA:1 + chr2L 7515687 5' + HMS-Beagle2 6792 1 60.40 AACTCGCTCGGGGATCTGTCCGGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - 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chr2R 14381361 5' + hobo 19 1 59.41 ATATATTTTTCATTAGCTTGGTTTACAATCTTATCGTTCTTACATATATATGTCGGCGACACAGGAGTCTCATCCATATTACTTGTTGTCATTAATTGTT:1 + chr3L 27392414 5' + invader4 2657 1 77.00 CTGGANGAAATACAGAGTAGGGAAAGGGAATATAAAATGTATTGTCTTTGACTCGGCTGTTTACGAGACACCCAAGTATTTTCGGAAACACCCATGTGTTT:1 - chr3L 9111233 5' - hobo 241 1 67.33 TATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 10445182 5' - roo 9051 2 58.42 TAAACGACACTTTCGGTTGTTTTTCAAGCTTTCTTATCTTTTCGGACCATGGGCCGCGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr3R 31812758 5' + P-element 12 1 65.22 CGAAAATTAGAGGGAACAACATAAGAAAATGCCCATTTTTTCGACTGTCCAATGTGATGATAATCCACTAAGAGTGTAAGTCATGCGTATTGGGTTGGCAC:1 - chr3R 10775952 5' - Q-element 696 1 66.34 GTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCA:1 - chr2R 13122076 5' - opus 462 2 70.30 CACGAAGCTTCTCGCTGGCAAAGTTGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr2L 7548049 5' - blood 7340 1 76.24 CATTGTACTCGCCGCTGTCTTCTGCAATGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAAT:1 - chr3L 23215156 5' - 1360 3185 1 72.28 CTAGTGGCTTAATTATCTCAACAAAAAAAAAACCTATCACGAAATCAGCTGGAGTTGAATCATGCTGTAATTGTTTTAAAAAAATGTAACAGGTATAGATG:1 + chr2L 16082589 5' - Stalker4 397 1 64.36 TATTCCAATCAACTTATTTTATTAAATGTTGTGGGGGAAGGACACCAAATTTATGGATGCATATTAAGATTCGTACCACGTGCAAAAGTAAGAAAATAATT:1 - chr3R 15075743 5' - transib2 207 1 54.46 CTTAAGACAACAGAGTAACATTAGACAGGGTGCTAGACACTCATAATAAATATTTTGTACTGAGTATTTAATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACT:1 - chr3R 19609744 5' + Tabor 9 2 68.32 AATATATATTTATATACAGTTAGGATTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTATTCGTCAGG:1 - chr3L 13355943 5' + opus 13 2 74.24 GTCCGCCCCCTGCAAAAAATACAAGAAAATAAAAAA:1 - chr3R 6044691 5' + S-element 163 2 66.67 TTGTTGTTGCTGCAAATGATGCATGCGGGTGGATGACAGAAAGAGAAGGCTGCATTCACAACCTACATTTTTCTATTTTCTATTTTCTATTCACACAAAAA:1 + chr3R 7103041 5' - pogo 69 1 66.34 CAGCAGCAAAAGAACACGGTTGTAAGCACAGGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr3L 4065921 5' + jockey 82 1 69.31 GGCATAGGCATTTATGACTCCAACTGTATATAGATATTCTATTGAAAGTTAAAAATTTTT:1 - chr3R 11282607 5' + hopper 1026 1 51.67 TACTTGCCGCTCGCCATGTACTCGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:2 - chr3R 28728317 5' + jockey 62 1 76.24 AAAATAAAAACTGAATTATTTAATTGTTATTATTACTTTTATGGCATATTTCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr4 627515 5' + 412 7080 2 50.50 ATAAAACCTTTTTAAACGCTTGTCAGGCGGCTGGAACCCACGTTGGGCCTAACTGCCAGCGACTTCAAGAGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCC:2 - chr3L 14240921 5' - Tirant 392 2 72.28 CTAATTGGTTGCCGCTACTCAGCGACGGACTTTATCTACCAGTTTTGTTACCATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGTTCTTGTACAACT:1 - chrX 9526285 5' - Bica 418 1 65.91 CAAAAAATTATCTGCCATGGCACATTCTGTTGAATTTTTCAGCATGTGCGTGTGTGTGTTGGTTGGGGGTGAGTGGGTATAACATTGCGTCAATACATT:1 - chr3R 15039709 5' + Stalker4 49 4 76.77 ACACGCACGGGCCCATGTTTAGATAGCCATAAACTATCGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGG:1 - chrX 2050879 5' - 412 455 2 58.42 CAAGTAGGCGACAAAATTAATGTCATTTAATGTTGGAGTTGTAACCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTG:1 + chrX 19510855 5' - Stalker 326 4 55.45 CTGGCAACATTGAACTTGACTTAACTTAATTAACGGTGCCGAACGATGCAAGCCATGTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGTAGACAAGAAGACC:1 - chr3L 19315974 5' + Transpac 93 2 63.37 GGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 25918969 5' - roo 9046 1 54.46 CCTGCCCCAGCTCCAGTCTATGCCGCCCCAGCGCCCGCTCCCGTCCTGGTAGGTGTTTCCAAAAGGACAAACGTTTTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAG:1 - chrX 10215125 5' - baggins 4983 1 58.42 GTATACCTTTCCATCTCTTCCAAAAAGGCGGCCACGACGGATCCTCTGTTGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 + chrX 1954437 5' - Tirant 8481 2 52.48 TTGTCTTGTGCAACTTCTGTCGGGGCCCACGTGGATTTGACCCACCAAAAAGAAGGAGAAATTAGCAAGCAAACACGAGTAAAAGAAATAAATAAAACGAA:1 - chr2R 19581335 5' + Doc3-element 83 2 51.49 TTGCTTGTTCCCATCGCATACTTTTAGCGGATTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAACAATATGGAATAATTATTTATTTTAGTA:1 + chr3L 21735327 5' - Doc 153 1 69.31 CTAATGGCTTAAGTTCTGTATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr3L 19215783 5' + roo 8685 2 57.43 CGGTTTCACTTCATTCGTTGTTATGTCATTCAACCACCATCATCAAGCAGCACCCCTCTATTGTTTCTTCCCGATTTTAATTAAAAAGGTATTTCCCTTTA:1 - chr2L 22097112 5' - gypsy5 328 2 57.43 ACCGCCTCTCTTTACCTGTTTGTGTTGGTTTCTTTTTTATTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAAC:1 + chr3L 10201643 5' - F-element 4623 1 67.33 GCGTCGACTCGCCACAATGGCAAAATTGTTGACATTAATTAAAATGTCATTTAAATGAAATATATAACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCG:1 + chr2L 17892068 5' + accord 7131 2 71.29 CCGCAGTGAAGTGTCCTGTGACCCATTTGTTTGTGGCGTTCATGTATTTGAGTAAACAACAAATTCCATATTGTCCTCAATTAATAACAATATTTAAAATA:1 + chr3L 12363274 5' - Gypsy12A_LTR 1810 1 76.24 CGAATAATCCCACTTGGAGTTAGCCAAGAGTCAAGCAGTTCATGGTCCAGTCAGTCGATTTTGGGAGTTTAGAAGCGCCGGTCATCGCCGCGTACTTACA:1 - chr3L 25264092 5' + Burdock 163 2 61.00 CTTTTGGGTAAGCTAGCACTGATATGATTTAAGCATGTAAATCAAATAATTATCTGATAAGTACAACATGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chrX 18717124 5' - roo 402 1 69.31 TACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 + chr2L 15956038 5' + Max-element 36 2 60.40 CGATGTCAAGGAACCTTGTATTTATGTTTCAAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chr2L 13250462 5' - pogo 2093 1 70.30 TAGAATAACAAGATGCGTAAAACGCCATACGTTTTTTTGGCGTTACGATTTTTTTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGA:1 - chr2R 4618423 5' + 1360 93 1 80.41 ACGCTTACCAACAATATTTGGCCAACAGCACAAACCCGCTGATCAGGCGTCTGCTTCACTTCCGCCACAATGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGA:1 - chr3L 24789701 5' + 1360 95 1 61.39 GAGGCACAAAGAGTTGCTCCTGTTGAGCCCCAAACATTTGGCCGAAAGATAAATGAGAGTTGGACTTGCAGCTGGTCGATGGTAATTCCGCGATAAGTAAA:1 + chr3L 2520252 5' - Ivk 59 1 76.24 GGCCAAGCCAGTCCGTCCACGTGTACCAGTGTCCCATCTGAATGGCATACTCACGGCTCCATGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAAT:1 - chr3R 25823732 5' + hopper 16 1 63.37 ACATTTGTGTAGACTGAATAAAAAATGTAATATAAATACAACATAATACTGCTCATACATATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:2 - chr2R 16898326 5' + Max-element 8253 2 59.41 CATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTT:1 - chr3L 9925292 5' + Doc 43 1 64.36 CAGATGCTGCAAGTATCATGACCGAAATACAGGGTGCGGCAGCATAATATTCTTTCTTCAGAACTCATTGAATACTATTTTAGGCATCGGAAAATATGTAT:1 - chr2L 21687112 5' - mariner2 841 1 68.32 GCTTTTGCATATGCGGAAGTGCAGGCGCGAGAATTGGCGGGGGATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:1 - chr2R 22998026 5' + Transpac 4952 2 57.43 TGAATATAATTTAACGAGTCAAAACATTCTGATACCTGTTACTCGTATATTATAAAGGTATACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 21501272 5' - 1360 3373 1 77.23 TGCCACCAGCTGCAGAGCGATATTAATGTGAATGGCTGCCAAGCAAAACAAAAAAAAAGAACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 27886133 5' + gypsy7 5008 107 70.83 CTCTGCAAGCTTTGCATCCGCACCTGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTAGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATG:1 + chr3R 9256424 5' - F-element 4451 1 74.26 AATAGAATTTCGGCTGCAGGTTACATAAGATCTGGGTAGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGT:1 + chr3L 7806165 5' - pogo 2068 1 59.60 TCCGTATTTCATCATCTCTTCGAACGCTTTAAAAACCAACATTGAAATCATACAGCGAGCTCAGTCCACGATTCTGCGAAGTATCACTGGGGCACCATGG:1 - chr3L 27114113 5' + Doc2-element 4446 1 76.00 AAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGG:1 + chr2R 9408179 5' + FB 32 1 57.43 CAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTA:1 + chrX 16798206 5' + diver 5922 2 56.44 CAACCCCTCCAGGGCGGGGAACGTTAGAACAGGTGGGGGAGTTGGCGTAGAAATTGCTGATGTGGTAAGTCGTGTACTGTAAGATTGGAAGAGTAGTTGA:1 + chr3L 24176138 5' - jockey2 53 1 69.00 CGACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr2L 21089151 5' - flea 232 2 57.43 GTCTTACATCTGCTCACATTGAGAACATCAAATAGTACGCATACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 16517309 5' + hobo 32 1 60.40 GATAAAAACGAAAATACGATGGCACTCGCCCGTATGGATTTTCCCTTCTCCGGGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3R 29432735 5' + 297 6602 2 58.42 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAATTACATATGTATGTATTACTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCG:1 + chrX 124082 5' + INE-1 108 1 97.03 TAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 - chr2L 18914587 5' - mdg1 7409 2 72.28 AAGTAGGTAAGCAAGCTACAAATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 + chr2L 14260713 5' + 297 8 2 66.34 CTCCGCAGCCGGGGGGAAAGAGTGAGAGGGTAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 - chr2L 11045343 5' + P-element 43 1 35.64 GTACCATTTCGTCTTAGCCGGGCACGAGGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAGCAAATGTTTTGAACCAAACGATTTAGCTAAGTCCAATCTCGG:1 - chr2R 18013196 5' - R2-element 3339 1 72.28 TCGCTCTTGGAGCGAAGATGCTCCTCCGGTGTCCTGGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGTTTGATATTT:1 - chr3L 20167162 5' - I-element 100 1 64.00 ATCGAGTGGAAGAACTCAGTGAAGAAAGGCGTCATGATATCTTTGAAGTGAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTT:1 - chr3L 17878010 5' + 1360 3009 1 50.50 GCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCA:1 + chr2R 9014433 5' - blood 7339 1 74.26 TTCCTAAACAAGTTACTAAGCTCAAAGTAAAAGGACTGATAAGATTTAACCACTATATCCGTGACCGTTACGGATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTT:1 - chr3L 677646 5' + Tc3 315 1 64.36 AATTATAGGTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 20437699 5' - roo 9046 1 54.46 ATCACAATGCTCCCGTTTATTCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATGTATGCTATCGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAA:1 - chr2L 6719945 5' - R1A1-element 5301 1 77.23 AGGCAGGTCCATTAAAATGGGGCCACATGTGCCCGTCGCAAACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACAT:1 - chr3R 28272443 5' + accord 230 2 59.00 TTTTGGGCAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 18353574 5' + jockey 22 1 61.39 ATTTCGAGCCGGAGTGCCAGAGTGCAGAACGTGATTGCAAATGCCCTGCTGGAGTTCGAAAAAAGTGGAGAACTCCACACACACACACACACACACATTCT:1 - chrX 1765849 5' + accord 7032 2 74.26 TTTCATGTTCGTCAACAACATAAAACTAAAATGTTTTCTTTTTAAAAATAAGTATTGTGACGAAGTCATTTCTATGAGTTTCTATGAGTCAGAATGACACT:1 + chr3R 9254883 5' + F-element 188 1 73.27 TACAAGTAGTAATGTAATTTTTCAATAATCGAATCTGTAAAATCCCAAATAAGGAGACTTAACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 - chr3L 14910627 5' - roo 9027 1 68.32 ATTGGAGAGACATTTCGACAGAGTAGCCTGTCTAGCAACTCCGCACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTCTACAAAAATTAATACCTCCTAA:1 + chr3R 4489578 5' + hopper 29 1 65.35 GTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGA:1 + chr3L 25889017 5' + gypsy8 311 1 73.00 AGTCTTTTACTTTTATTGTATATAATTTCTTTTATAAACATATAATGTTTAATATTTTGACTACTCCAGACACCTTGATATGGATTTCGCGCCAATTGAAA:1 + chr3L 14281651 5' - invader2 4656 1 57.43 AGTGCNTATTGATAAAGGAAAATGAATTCTTTTTTGAGTGAAGTAAAAAACATGGGATTTATATATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCA:1 - chr3R 18572809 5' - Stalker4 72 4 72.28 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCG:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 5172 1 52.48 CAAATTAGAAAATAAATTTAAGTTATATTGTTATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAAT:2 - chr2L 1129134 5' - HMS-Beagle 207 2 71.29 AAATGGAAGTTTGCCAAACGGCTGACAAAGAGCTATATCGAATGCACAAGTTTAGTCTCTTCCGACAAACGAAGAAGTGGCAATTG:1 + chr2L 23084531 5' - diver2 4743 2 75.58 ACATGTTCCCATTTCGAATGCGATTTAATTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTG:1 + chr2R 5879375 5' + copia 4715 1 80.20 GCCGGGTTGCCCTTGGGGCTGTGTTATTGCAATTCAAAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAA:1 - chr2R 4850422 5' - P-element 295 1 42.86 GAGCAGAGGGCACTGAAGCCGAGCAGCGGGCCTCGAGGACAAGCGTCAATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 - chr3R 7388964 5' + HMS-Beagle 6814 2 69.31 TGGTTATCGAATATTGCATTACGATTAAAATTATGTTCCAGATGTAAGAAAGTATCGTTTTCATATCATTGTCGCCATGTCCATATGTCCGTATGAACGTC:1 + chr4 879084 5' + INE-1 126 1 77.23 CTTAAATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTC:1 + chr3R 19144380 5' + Juan 2 1 66.34 TCGAGAGCCCCAGCAGAGTGAGTAGCGATGGGGGTCAGATGGCCGTGGAAGATATGTGACGATTGCCCCACATGCACTTACATAAACACTCCAGCCAATGA:1 + chrX 14199528 5' + Stalker2 121 2 68.32 CATTTNTGGCTTGAGTTTGGGTTTTTGGCGGGGGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATT:1 - chr2L 13447207 5' + HMS-Beagle 1 2 75.25 CATTTCTGGGGAATTGAAAGCACGGGTTATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chr3L 8974067 5' - P-element 2867 1 57.43 TGTGGCGATGTGTTGTTGTTTGGGCTGCTCTGCGGATTTGATCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGT:1 - chr3L 8750330 5' - F-element 4268 1 59.41 CACAAAAGAGATACCGAGGATCGTTCTAATTTAAACAGAAACCTTTGTTTTTATCTGTATTGCTTGAGTCTAGACCTTTAATATTTTGAGTATATTTCTTG:1 - chr3L 4167354 5' + Tc1-2 1599 1 61.39 AAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTGAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chrX 14713203 5' - flea 4983 2 65.35 TCCTCNTGTAGGTGGGATAATTATCTCTGGACGTTCTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAAATGTTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGT:1 + chrX 21668076 5' - Stalker2 7608 2 61.39 CAGGAAGTGGTGGCCCGCAACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGG:2 - chr2R 9014514 5' + blood 7013 2 77.23 GGTCGGCCATATTCTTCAAACACTATTTCGCAAACTAAAAAATTACAAGTACTTATTATTGTAAATGTATAAGTTATATAATAAGATTTGAATAATTATTG:1 - chr2R 4728961 5' + Doc2-element 4712 1 74.26 CCATTGTTTTTCCCGCCCGTCGTCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCT:1 - chr2R 13038442 5' + P-element 229 1 30.69 TAGGAATCGAAAAGAAAGAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTA:1 + chrX 14713184 5' - flea 5002 2 71.29 AATGCGTTTTATAAGCCAAAATGCGTAGCCATAATAACTATTAATTATGTGGAAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCAACTTCCA:1 + chr3R 22277127 5' + 297 6597 2 64.36 AATACAGAGGCGTAATATGAGTTGCCAAACATGCCCCATTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCA:1 - chr3R 8896042 5' - 1360 3349 1 80.20 GTTAATAGCCACAGATTACAAGGGTCCACTATTGCCCACTGACAGTCCTGTCTATCAGGTGCCCATGGCTCATCACCGGCTGCGAGTGGTTTGTTCGAAAC:1 - chr3R 22409226 5' + X-element 4328 1 73.27 AATTGAGCAATGTAGGCGGTTGTTACTTTTTCGCGATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 326111 5' - roo 9060 1 67.33 AAAAGTAATTTTAATGTAGTATCGGCACTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGA:1 - chr2R 10362661 5' - Porto1 287 1 69.32 CAAAGAAGAAGGTGTCGAAGAACTCGGTGAACTTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTTTTTGTTTTGTTTAG:1 + chr3R 7983080 5' - Porto1 254 1 69.31 CTTTTTGGTCGTCTTGCCTGCCGCGCTGAGCGATCCCATCCCTTATCATTCTCCCACTCTAAAGCCCACAAAACTGGCACGCCTACACATTTGAAAAATGT:1 + chr3R 27924936 5' + INE-1 255 1 54.46 TGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chrX 13682606 5' - roo 358 2 76.24 ATTTCAATTGTTTTTGGCTCTATTGTTGCGTTGAGGATGGAAGCAACAAGCTGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTC:1 - chrX 12919912 5' - G2 184 1 75.25 GCGGTTGCTTCGTCCTGGTCGGCTTAAAGCCGCCAAAAAGTTAATTGCAACTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2L 18914611 5' - mdg1 7433 2 52.48 GGTGACCCCGACGTGATGCGAATCAAGTGTAATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:1 + chrX 11282575 5' - I-element 5310 1 68.32 ACCAANCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGG:1 + chr3R 25633330 5' + Tirant 30 2 57.00 GACGCATATACCTGAATGAACATGCATACTCTCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 + chr2L 15333731 5' + P-element 44 1 35.64 ATAAGACAGGCGGCCGCGTCCTCGAACAATATTTTGACATTTATATAGTGGGATAAATATAATATATATAAACATAATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCT:1 - chr3R 25509254 5' + opus 110 2 46.53 GTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:1 - chr3L 15638287 5' - roo 9032 1 70.30 GGAATCGGTGTAAGGATCATAGTGGAACCAATCACTCCACACCTGTTATTTAGGACACTATTAGCTACGTGAGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACC:1 + chr3R 25633304 5' + Tirant 5 2 76.24 GGGCACATTAATTTTATCTTGGCACATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:3 - chr2L 14490471 5' - P-element 2872 1 64.36 ACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 + chr3R 7522308 5' + blood 29 2 57.14 CTTTCAATAATTATAATTTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGC:1 - chr2L 11551414 5' + Max-element 23 2 56.44 GAAGTGTTGCCAGCCCCGGGGCTTACTGGATTCTCAGGATGGCAGATGGTCAGAGCATGTCCAGCATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATTGTTCCACAT:1 - chr3L 18356372 5' + HMS-Beagle2 10 2 69.31 TTCAACGGCATCGTAATCCTGTGATCCCTCCATGGATTCGTGCGATGTGCATGTGGGGCTGGCCGAATCCGTGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAA:1 + chr3L 19656862 5' + F-element 4532 1 77.23 AAACTGAAAAACAATAAGCATGGAAATTGCTAACTTTCTATACACATTTTGGAGACCCACTCCAGTCCACATACATCAATACTAATGCACACCGCATTTT:1 - chr2L 22175661 5' - invader1 185 2 57.00 TATCGGCCGAAAACACTAAAGAAGACCATGATTCGCTAAATAAACCTGTAAGTGTCAATGTACATTTTAATAAAAACAAAGGAGAATGCTATAGTCGAGTT:1 + chr4 234299 5' - INE-1 575 1 57.43 GGCACTATAGTACCTTTTGTGGCTAAGAAGCCATTTTGCAAAAGACCGTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr3R 13376041 5' - 1360 3363 1 54.46 CCACCTCTCCGCAGCCGGGGGGAAAGAGTGAGAGGGTAGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chr2L 11045349 5' + P-element 37 1 41.58 CCTCCTGTTCGATTTCCGCTATTACTCCCACCACATATTTAACTCATGCCCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAG:1 - chr3R 11742310 5' + I-element 5091 1 71.29 AAACAAAAACAACAAAAGCCAAGTACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAA:1 - chr2R 19858158 5' - 297 6860 2 76.24 CATAGCCATCAGGAAAAATAAAGAAAGATGTTGAAAAATAAACAGAAGATAATATAGTTGAACTATTTAAGTGTTATATGATCGCCCACTTATGAAGCACA:1 + chr3R 3355713 5' + gypsy11 4120 2 73.27 GCCCCTGTGCGTATGCAATAGAAAATATTTAAAGAGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTT:1 - chrX 8364673 5' + jockey 4768 1 65.35 AGGGACTTAATATCTCATTCGTGAGCTTCTTTTGGCAGTGTGCCCCAAAGTATACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:1 + chr3R 23617972 5' + jockey 4785 1 52.48 ATTCGGATTTAACAAATGCTTGCATTATATACACATTTGAAGTAGCTATCCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTG:1 - chr3R 14688325 5' + pogo 15 1 50.00 ACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATT:1 + chrX 16798205 5' + diver 33 2 55.45 GTTTTCGACCATATAAAGTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAG:1 + chr2L 22136609 5' + INE-1 136 1 78.22 CCAGAAGCTGGCTATCTCTCTTGTTTATGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3L 21708664 5' - roo 9026 1 72.28 ATAATTAATGATAATGACAAATACATTCGATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:2 - chrX 12857883 5' + 297 45 2 75.25 CAAGTGTTTACTCTACAGCTGCCACGCCCCCTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 + chrX 4041525 5' - hopper 1370 1 69.00 AACCAAAAGGAGGAGTAAAGGAAATACATTAAAACAACAGAGAATGCTATAGTCGAGCTCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAGCTAGTGTAAATG:1 + chrX 22788647 5' - INE-1 535 1 78.79 GGGCGGAAACGGAGGCAGGCAACACCATTGTGCACCTATGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chr3R 28095154 5' + hobo 37 1 60.40 GCCTATATAAAAGCCTAGCATACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 18881556 5' - roo 9028 1 67.33 CGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAATAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chrX 4488921 5' + 412 48 2 68.32 GGTATTAGCGTTGTCACCCGTGTGTTTTTCAACGGCAGATGCTTCAGCATCGCCAATTGCATCACTTGAACGTTTGATTGTAGTTTTTTGCGAATATCACA:1 - chr3R 18362030 5' - Juan 102 1 76.24 TGTAGGTCATGTCAAATAGTCAGATTTTAAAATTAGACGTCACTAGAATATTTATTCTTGATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGAACTCGACG:1 + chr2R 5868773 5' - INE-1 144 1 63.37 CTTGCATATGCATGTGTGTGTTTTACTTAAAATAAATGTTACTCTTTAATCATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 + chr2R 22993694 5' + opus 21 2 58.42 GGCCTNGCCAACTTAAAGCGTTTAACGGCTCATTTATTGCGAAACATAGCCTCGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3L 17699395 5' + 412 25 2 54.46 AGAAGCTTAATTACTCGCCAACAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATAC:1 - chr3L 21800051 5' - 17.6 140 2 78.22 GTTCATTACATAAAATTTGCCGACAAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGT:1 + chr2L 21089131 5' - flea 5011 2 77.23 TATGATATGATACTATAGTTAGGGTATTCAGCTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chrX 13682613 5' - roo 9029 1 69.31 GTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr3L 9925281 5' + Doc 54 1 75.25 CCTGTTCTCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3R 28326758 5' - P-element 2851 1 44.55 ACTAATTGGCATTCAAGGATTAACTTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAAC:1 + chrX 21396686 5' + F-element 64 1 78.22 GTGCTGACGGAAGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGT:1 + chr2L 15956008 5' + Max-element 8241 2 73.27 AATGATTTGTTTAACTTAGAAATGTTTAATGAATTGAGGAATGCTAATTTCGTTCATCAGAGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGT:1 - chr3L 1809895 5' - diver 208 1 62.38 TCCCTGTCATCAATTCTGTACTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chr2L 7927244 5' + hobo 54 1 77.00 GGAAACAACGTTAACGTGCACACACACACACACACACA:1 + chr3L 7036598 5' + accord 7028 2 68.42 CTTTCTCTTTCTCTTTCTTGTCCAAAAGTAGTTCATATGTACCAAGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGC:1 - chr3R 6090416 5' - F-element 4509 1 56.44 AGTAATTAACGAATAATGTGGCCAACTAAATCAAGCCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 21500985 5' + roo 8704 2 67.33 AGTTCATAGGCAAGGACAAATCTATCCGTCGATACGATCTTAAGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCATTGGG:1 - chr3R 3854103 5' - Idefix 6993 2 57.00 AGCATTTAACAATGAGATACAAATAAGATTCCAAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chrX 21668938 5' + pogo 42 1 70.30 ACGCTCACACACACACACAGGCAGGCACACAAACACACGTATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTC:1 - chr3R 15130818 5' - flea 222 2 61.39 ATTTTCAAGAAGGTTAAATTAATGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chr3R 12571521 5' - roo 9020 2 80.20 CAGTCCTCTTCTTGGCCTCGATGTAGACCCGGCAGCCTTGGTAAGACGCAGTGTGCGCCTCTCCGCAATTACCGCATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGG:1 + chr3L 26645845 5' - HMS-Beagle 6721 1 78.22 ATCTGAGAAGAAAGCAAAAACTTTTGCGATCTGTCTTTCTTCTGCGTTGTATGGATTGTTTTTTACACACTTTTGAGATTGCCAAGAAACTCTTTAGACAT:1 + chrX 17878216 5' + S-element 214 1 63.37 TAAGTTTCTTATTTCATAAACATATTAGTTTCTTGTGTCCTTTAGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGT:1 - chr2L 8542909 5' - P-element 2855 1 47.52 AGTTGATGTGTTGTTGAGTACTTTTAATTTGCATGCTGTTAATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 - chr2R 19936681 5' - roo 9037 1 56.44 GTATATATATACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGA:1 - chrX 20880653 5' + invader4 38 2 68.32 AGGACAAATATGTATGTATGGTTCAGAGAACGGGGGTAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCG:1 - chrX 17776350 5' + F-element 380 1 63.00 AGGAAGCTTCTCTAGGTCCAGCTCACGAAAACAACTTGTAACGAACACACTCATAGAGCGTTGTCCACCCCAACACACTCTGTCTACTATTTTTACCGGCA:1 - chrX 1204671 5' - Circe 7388 2 74.26 AAGCCTTTTTACTGATAAGCCTTTAATATTTTTATTCATTCTTACATAGGTTCTTATCAACCAATTATATAATGCAGCGCTTGTAAGACGCC:1 - chr2R 9870893 5' - rooA 7472 2 68.48 CTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chrX 19457160 5' - roo 9025 2 72.28 AGACAAGAATTCTTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGGACGAGACACACTGTATACGCTAACAAGTCACCCTTT:1 - chr3R 6431075 5' + 3S18 24 2 56.00 ACTAAAATAACAACAAAATCCTCATTTGTTGATCTGCATTGAAATTTTTCCCGAAATTAAAAACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATT:1 - chr3L 233754 5' - Max-element 8445 2 58.16 GTTTGAGGTTAGACTTTAGAAAGACCATTTGTTAAAGTTTCTTAAATCAAATCAAATAAAGCAGGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chrX 20974947 5' + opus 10 2 69.31 CCAAAGTGCCATAAAATATTTATTTGCAACCTAAAAGCAGCTGCCACATGACGAAGGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCA:1 - chr3R 17839488 5' - opus 132 2 66.34 GCAGGAGAAGTAGCTGAGCTGATGATGATTCTGATTTGTGTTTATCTTTTTATTTATTATATTTTTTTCTTTCTCTTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAA:1 + chrX 4353403 5' + G4 3833 1 43.56 ACTAATAAATATGCCAGAAAACACCAGACACACAGATACATTTGTTAAGTTGACTGTAAAAAAGGCACATAAACAAACACGATACAACTACACAAAAACAT:1 + chr3L 22549240 5' - transib1 331 1 69.31 AACAGGTAGCAGATAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:2 + chr2L 6227662 5' - roo 9028 1 67.33 AACGATGGCGGAGCTGCCGGCTATAGAGATGTCTTTGTAAACTATAAGACTTGAATTCTAAATAAATTTATATACCTTGTAATATATAATAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 6800758 5' + BS 5094 2 83.17 ACAGAGGAGCCGACATCATTGAGAGCCTACGACATAAGCAGATTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGG:1 + chr2L 8179868 5' + BS 4801 1 60.40 TAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGT:2 - chr2L 23295859 5' + micropia 4991 2 61.39 ATAAGCCAATTCTGTCATGGGTGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr3R 7849671 5' + 1360 50 1 79.00 TTTACCTTTCGGCTTTCGCCCGACTTTACCCACTTGATTTTCAGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3R 18960424 5' - hopper 1384 1 58.42 TATTTATTATACTGTTTACGTTTAACAATTTAAATTATTTTACAAAAAATTGAAATTTAGGACTAATATAGTTTAATTTGTTTCTTTTCAGGTACCCCCGC:1 + chr3R 16445357 5' - HeT-A 5750 1 81.19 GGTTGAGGGCAAGAGGAGTCAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATT:1 + chr3L 7989742 5' + mdg3 36 2 56.44 AAATAATCCAAATTTAAGAAATTTCTTTGCATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 + chr2R 8560124 5' + 297 42 2 70.30 CACCACTGCAATTAGACGTGGAACCAAAAGACCCATAATGATTTAACTCGCTCGGGGATCTGTCCGGATATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATG:1 - chr3L 13194857 5' - 297 6972 2 76.24 GTGCTACACAGCTAATAAAATCAAAATTACTTTTCGCCATCGCAAAGTTTCGTCAGTCGACGTGCTTAAGGAATTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGG:1 - chr2L 1831104 5' + 412 7532 2 77.23 TGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 14525252 5' + hobo 25 1 56.44 TCGGACGCCATGGGAAATAAAAGCAAGACACCCGGGCACATTCCACAAACTGACTATGGTGAGAACAATAAATTGAATATTGTTCAAAAGTGTGGACGTGA:1 + chr3R 8488967 5' - INE-1 252 1 79.21 TCTGAGAGCAAGAGAGAGAGAGCGGGAGAATGGGCTCCAAAGAGAGTCCAAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 + chr3L 9692669 5' - P-element 2860 1 52.48 AATTCCATAAAATTTTACTACCGCAGTGGCTGGGATGTATCTTTCTAGATTAAGCTTGTTTAATTTCAAAACTTATATTACACACGAGGACGTGTGCTGGT:1 + chr3L 2419908 5' + invader6 4460 1 63.37 GAACATTTTAAAAAGGAAAGGATATCCAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr3R 12894152 5' - blood 329 2 73.74 CAAGACATGGTACAGAGCGGTGTCCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTACCTATTTGTTTACTTCCAAATACGGAAAACTAAGTTCTT:1 - chr2R 12355815 5' - R1A1-element 37 1 76.24 GAAAAGGGTATGCTGGGCTTAAGAAATTCATACGAAAATTAGATCCAACGAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 10283288 5' + BS 5105 102 65.28 GGCCAATAGCCTTGGCTGCAATGTCTATGCTAATCATCGATCTATTTGTTACCTTTCAGAATGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATT:1 - chrX 7961752 5' - roo 143 2 67.33 TTCGCNATGCACACAAATACCATAGTAAAGTATAGCTAGTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2L 326140 5' - roo 9031 1 63.37 CACACCGTCGCACTCACAGGACTCAATAGTGTGTATATATATTGTATGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGTGGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:2 + chrX 7828856 5' - 412 488 2 73.27 TTCAAGCCCACCACAAAGCCCACCAATTAGTTTTTTTTCCCCCACGTCCAGTTTTTGAGATATGAATTTTCGAAAATAAAAAATTTCACTTTTTTCAATTT:1 - chr2R 9912415 5' + FB 164 1 76.24 CGTAGAGGACTCTGTAGTGGAGGACACTGTAGTGGACGAAGCTGTCGTGGTGGAAGTGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTA:1 + chrX 21396885 5' - F-element 4417 1 56.44 GTGTGNGCGAGAATGTGTGGGCACAAAGGGATAAGTACACAGAAAGAAATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGAAATGGCCAGATCGACTCGGCTATTAA:1 - chr3R 17505377 5' - INE-1 100 1 55.45 AAACAAAAATGAGAGTCCCCAACAGGCGATGATCAATGCGCCATTGTTGGTAGATGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chrX 19095729 5' + roo 22 2 58.42 GCCTTCACTTGCCGTTGACGAGCTAATCTACTGTGTAATGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATCTGGAAATA:1 - chr3L 21384026 5' - roo 361 2 65.35 AGAGGGGCGGTGAATTCGAAATCTATCTGATGGAAAGGTATTGTAAGAGTTGAGGCAAAATTGAAATTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTTATACGGACA:1 - chr4 203281 5' - INE-1 132 1 77.23 GGCTTATTTTTTTTTTTAATTTTTTTTT:1 - chrX 7809195 5' - Doc 4693 109 85.71 TTAGAAAATAAATTTAAGTTATATTGTTATATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTAT:1 - chr2L 1129130 5' - HMS-Beagle 203 2 75.25 ATGAAAAAATAAATCACTTCTTATTTTTATCTATTGATAATAATACTAAAAGTTATGAAAAGTATTCACCTTGTTTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 - chr3R 10971978 5' + BS 4999 1 74.26 CTATATCGTTGTTTAAGAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCGAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTACATGTTTTTGAGCACTGCACCCATGTCG:1 + chr3R 19449968 5' - roo 8778 2 74.26 CAAGAATATTGTATAATAATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGT:1 - chr2R 12446382 5' + jockey 4695 1 51.49 AATAGTTGGAAAATGGAATAGGTTTTTAGAATGTTAAAGTGTAAATACTTGGTTTAAAACAGTAATTTTTATAGTTATAATAAGCAACAAATTTCAATTTT:1 - chr2L 14202462 5' - S-element 1539 1 39.60 ACACTGAATGTTTTTTAACAGAATTATCGATAGTCCCGCAGCTCCAGTGGCTTAGTGCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGA:1 + chr3R 18906580 5' + P-element 18 1 61.39 GATTCCAAAAAGAACAAATGCGTTATTTTTATCTACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2L 3694188 5' - roo 404 1 71.29 AGTTTCCAAAGATGCCGCCATCGGTTGAACTCAAATTGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 - chr3L 12085224 5' + pogo 36 1 64.00 CGTTCGCTTTGAAAGCCAAATGATATATGACACAACTTAACACAAATTAGTTTGTTTTCAATTTGTTCTCTGGTAAAATGATATTTGATATCTATGTGCTT:1 - chr2R 3341939 5' - Copia1_DM 4127 2 66.34 TGGTGGATTTACTTAAATTTTACGACTTCATAGCGTTGCTATAAAAACAAGTCAGACCACACGTTTTAGCTTAATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 + chr3R 19609625 5' - Tabor 480 2 71.29 GATAAGTGCTGACTTGGCGCTGGTGTTCGAGATAATTGTAGTGTAGGAGGATTATGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGGTTAGT:1 - chr3R 20026317 5' - Doc 4516 1 61.39 ACTCTTCGCTTGTACAGAGCACAATGTACCAGAGTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATACCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2L 19642952 5' - roo 396 1 65.35 CTGAANGCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3R 19114201 5' + 297 39 2 74.26 GAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 - chr3L 15638273 5' - roo 354 2 84.16 TTCGTGAGCTTCTTTTGGCAGTGTGCCCCAAAGTATACACCACACTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr3R 23617989 5' + jockey 4802 1 64.36 GAGAGACATTACTCTGACCCACAATTCATAATAATAAATAATAATTGATTTTACGGAATGAGAACTACGATTATCAATATCCAATAAGATCATAATTTTTA:1 - chr2L 7605263 5' + Juan 3768 1 72.28 CGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCG:1 + chr2L 15956043 5' + Max-element 41 2 64.36 TTGGCCCGGCCCGGCCCGGACCCATAAAACTTTAAATAAATTGTAGTTAATTAGATTTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr3L 13312150 5' - mdg1 7421 2 62.38 TCGGCACCAACTGACAATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:3 - chrX 495234 5' + 412 34 2 56.44 CACATTGTTGCACAATCGGTAAACAAGATCCGCAGTAGATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTT:2 + chr2L 18112480 5' - transib2 2820 1 73.27 TTTTTTTTATGCGACCAGAAACAGATCTAATGCCAAAGCAAACGCTGCGGAATGGCCAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 + chr2L 4137420 5' + 297 6590 2 52.48 AACATGATATTGCACGCCTCGTGTGACGATATATGGTAGATAATTCTATTAAAGACGCTTCCACAACCTTCTAGCTTTTAAAGTTCCTGAGATCTCGACAT:1 - chr3R 26191533 5' - INE-1 143 1 61.39 AGTTAATAATTACAGTTATAAAATTGATTTTTAAGATCGCAAGCGACCGGTTATTGCAATTTATCATTGGA:1 - chr3L 16228851 5' - HMS-Beagle 196 2 83.10 TTTGTAAGCAGATAAAGCTGTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATA:2 + chr2L 2437679 5' + roo 3 2 74.26 TTTTTGAAAATATAACGCAAGATGAACCGTGAACGGATCAAACAGAAACGGAAACGGAAACAAAACACTCAACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATT:1 - chr2R 14760101 5' + 297 6502 1 75.25 CTAGCNTACTTATTAAGATAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3R 18881542 5' - roo 350 2 82.18 ATTGGCTTAAAGCCCTAAAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 - chrX 8948699 5' + blood 14 2 65.35 TCTAGCCCGCTTTAATTATTTTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 6997143 5' + P-element 5 2 74.26 GATAAAACATTTTATAGCTATCAACTTAACTGCAATTGTAACCAGAACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTA:1 + chr2L 5460115 5' + jockey 4954 1 59.41 GTGAAGTGGGGGCACTTAAAGTATCTGTCCAAGGCACTCGACGACAACAACGCAGTGTGTGTGGCTATGTTTTCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTTTT:1 - chr3R 20687715 5' - gypsy3 420 3 76.24 CTTAGGTGGCTTTGGTCCTCCAGAGCCTTAAGTAGACTTGTGCAATTCTGGCAATTCCGCAATCGGGTATCCTTCCTTGTTTTTTATTTATTTTATTTATT:1 - chrX 2596119 5' - X-element 4716 1 74.26 TTTATAATTTTTTTCTTCCTGGACTTAAGTTTAAGAACTTAAGTGCTAGAGTAAAAATACCCAGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAA:1 + chr4 558309 5' + copia 188 2 72.28 TAATGAAAATGAAACACGCATGTTATATTCGGAATAGAATTTCGGCTGCAGGTTACATAAGATCTGGGTAGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTC:1 + chr3L 7806133 5' - pogo 2098 1 74.26 GGATGAGCCCCGGGGTAGTGGGGCAAGCGGAGTAGCTTGGGAACTCTGGGACTTGGGAACTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chr2L 10791900 5' + flea 26 2 59.41 CTAACCAAGCAACCGGCTACCACCCCTCCACTCCTGACAGTGACCCCTCGCTGACCCTCCATCCCCCCCTCCGCAGCAACACCAGCAGCACCAGCAGCAGC:1 + chrX 5755969 5' + TART-B 152 3 73.27 CTTTTACCGTATACCCTTCATACATGTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 - chr3L 10736502 5' + 412 51 2 78.22 TCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGCGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACCCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2R 14381346 5' + hobo 31 1 53.06 CCAGAACACACGATTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGAAAGCAGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chrX 6654736 5' + P-element 49 1 22.22 CATACTAGGTTCCTTGGGTGATAGAGAATGTGAACTGACTTACTGATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCA:2 - chr2R 12213994 5' - Transpac 281 2 55.45 ATATGATTTAAGCATGTAAATCAAATAATTATCTGATAAGTACAACATGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chrX 18717145 5' - roo 9044 1 54.46 AAGGANACAGTCTCTCAATGTAACGTCTCTTCAGCTCGTTCCGATCCTTTTGGCATTTTATTTAGAATTTTCGTTTTGCAGTATTGCATTTAAATAAAATA:1 - chr3R 17465227 5' + Bari1 1397 1 76.24 TACAGCTATACTGGCGATTGGGAACAGGTGCTAATCAAGAAAAAAAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:3 + chr3L 4068059 5' + jockey 15 1 71.29 TGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 9862224 5' - roo 9028 1 73.74 ATAGGGGGGCACTGGACTGAGACTTCTTTCGGTTGTGTTCACACCCGCATCCGGATCATCAAAGCGAAATGGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTG:1 + chr3L 18720232 5' + Doc 469 1 72.28 GTCAAAACGAGGTTTAGTATGGGCAGAATCGAGGAATAAAGTTTACAAGTCAGACAGACTTCACCATGCAAGGAAGCATAATCGTATTTGTAGCTTCGC:1 + chr3L 26657082 5' - hopper2 235 1 77.78 CGATGGATGTTGAATATTAAATATTTCCATGTCTTGATGTAAATTGGAGCAAACTCAATCTTATTATTCACTCGATTTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATT:1 + chr2R 17442437 5' - S-element 393 1 79.21 GAGTTCCTCAAGGTTCTGATGAACCAATGCTTGGATGCAGTGGAAGTTCTCTGAGGTTATCCTCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 - chr3L 26644821 5' - HMS-Beagle 7031 2 66.34 ATGAAGAAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAG:1 + chr3R 4543190 5' - 3S18 6069 2 59.41 TACCTTTTTCTGCTTATCAGCTTGGTAGAGATCGTATATAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTG:1 + chr2R 1395465 5' + gypsy 7027 2 66.34 AGGCTGCCCCGGTGGCAGCCACTTCTGCTTCCGCTGAACCGGAACCGGAAGCCAAACCCGAGTCCGTTGTGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCC:1 - chrX 9659312 5' - R1A1-element 4994 1 71.29 CAATTAATTAAATAACAATTCGAATTTAAAGTACCGCTGAGAATAGAAAAACACCAGTCAGGGGCCAAACCTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAA:1 + chrX 12013291 5' + 17.6 147 2 69.31 AATTGGCTTAAAGCCCTAAAGTCTTGACTTCTTTTTAGACCACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:1 - chrX 8948700 5' + blood 7024 2 65.35 GTTCCGTTATTGAGTAAAAATCCTTTGTGTATGTATTCAAATGAGCATGGCGCCAGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTAATATTGTTATTG:1 + chr2L 22171111 5' - mdg1 18 2 63.37 ATCGGNGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTACTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAA:1 + chr3L 27356088 5' - Tc3 1674 1 61.39 AACGGAATGCGAGCTGGGTGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 + chr2L 1828772 5' + 412 7086 2 56.44 TTAGTACATTAATTAAAAGGGAATTAAATCTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCTGGTGGATGTGACATTGGGTCCTTCGACGTTTG:1 - chr3R 11456823 5' - flea 4634 1 70.30 TACACATTCTAAAGTTCGCATTTAGCACGGTGAGCAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAATGA:1 + chr3R 28687745 5' + P-element 135 1 39.60 AAGTCCATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTC:1 - chr3R 3320512 5' + 1360 40 1 81.19 GGCGGGGATCTGTAGCGAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTT:1 - chrX 16798279 5' - diver 199 2 54.46 ACATTGCGCAAGCGAACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGA:1 + chr3R 27080687 5' - HMS-Beagle 231 2 81.19 TATGTCCAACAGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTT:1 - chr2R 5084098 5' + F-element 20 1 58.42 CTTATGGAAATGCTGCAATAGAAGTAAATGGACTGGACTATGATAACACTAAAGAAAGTATATTAGAACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACT:1 - chrX 21668155 5' + Stalker2 11 2 68.32 AATAGAGAAACTTAATCCATTGCCAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATT:1 + chr2L 7459588 5' + BS 5048 1 75.25 AGCCAAAACTATGGATATCCAGAATATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGACTCCCACCAGAGGGTCAA:1 + chrX 9027946 5' + Quasimodo 329 2 75.25 AACACACAAACACACACACACACAACCGCAACTCACGAACAGGTATGGGATACATCATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chrX 9449658 5' + F-element 37 1 46.53 CCCTCTGAGTAGCAGTCTTCGTTGCTTTTGCTTTTGATTTCCTTTAAAATAGGTTTGCAATTTGCTATGTTAAAAATATAAACCAACAAATGCCGTATTTA:1 + chr4 135055 5' + hobo 2529 1 72.28 CATATTTTGCATTTTACATTAATCCGCAGCTCTTCTTATTCGCTGGTCACTGTTCGGGCGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCG:1 + chr3L 20729918 5' - HMS-Beagle 7024 2 63.37 AAATGACCCCTTTATTTCTAATGACAACTAATTATTATAATAATATAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAA:1 - chr2R 13643891 5' + F-element 40 1 64.36 ATATATTTCCCAACAAAGATTTATGGTTTTTTAAAAACAGACAAATACAAAAAAAAAACAAACAAAAACAAAAAAAAACATCAA:1 - chr3L 10674762 5' + Transib5 22 1 77.38 CACTTCCCTGGCATTACCATTAATCGAATTCGAATAGAGGCAACTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGT:1 - chr3L 12452209 5' - 412 459 2 58.42 CAGACGATTCGATGCTTATCGATGAGCGCAAATCTCGTGCCTCCCATATTCATGTATATATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 + chrX 5515715 5' + 297 6588 2 69.31 AAGGGATAGCCGAAGAGGGTGGGGCGGGGGAGCGGGGGGAAAAACCCCTCGGAAAAGCGCCACAAAGCGATTCAAGAAATAGCGCGCTCCTGCTCTCCTG:1 - chr2R 9737506 5' + F-element 366 1 76.00 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATACATATGCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCG:1 - chr3L 23730764 5' - Stalker 187 4 70.00 TATGTATTCGTGTTGGTTTGTTTGATTTGATTTTATACATATTTGGACTTAGGCTAATCCGCGTAGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGT:1 - chrX 13753141 5' - 412 289 2 67.33 AAAAGTAAAAAATATATATATATATTCAATTAAAATCCCTCTATGTGTAGGGACCATTTCATCAGTTGTCAGCCAACAAAACAAACAGCAATTTTAGTTAT:1 - chrX 21410621 5' - gypsy4 6827 2 79.21 TGTTGATTCATACCTGACAGCAAGTACCATTTATACCAACATATGTATGTTGAATACTTTAAAACAATACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 + chr3L 21708587 5' + roo 8674 2 69.31 GCTCTCGGCATTCTTTTTTGTCTTGGGTGCTGTCATCCACATTTTGTGGGGGCAAATAATTTGGCACTAAAACATACAATAATAATAAAGAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3405127 5' + Rt1a 5074 1 77.23 ATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chrX 8977409 5' + jockey 61 1 78.22 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCC:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 5255 1 72.28 AAGCGTAATTTTAATGACAAAGAATGCAGTTGCTCAGCTTTGCATAGACCGTGATTAAGTCGGGCATGGAGAACCATCCGAAACCGAAATAGATCGGAAGA:1 + chr3L 8381457 5' + Penelope 72 1 55.45 GTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAGTAAAAGTTAATAAAAATTAAACAAATTTAATAAATAAATAAAATAAATTAAAC:1 - chr4 1294994 5' + HeT-A 2 1 53.47 CGAAAAGTTTGTTTATTGATTAACAATCAAGTGATTTTTAAGTGCATTGAGTGATTTATGAATGATATCTCGACTGGGGCACTGCCAGCATCTCAAACCGC:1 + chr2L 13845973 5' + G-element 3937 1 78.22 GCAGTGGTGGTAACTGGTTTCCTCGAAGGAGGCAAAGTTCCGCGAGTTCTGGTTTGATGTTATATGGACTGATGAAGTTGGGTTTCAGTTTCAGGGATCCT:1 - chr3R 19040188 5' + Bari2 673 1 56.44 CAACAAATGTTTAAAAGCAAAAAATTAAGCCAGCAAACTAAAAACGAAGGAAAAAAAAAACAAGCATAGAAATGCAAAAATTAAAAAATGAAAAAAA:1 - chr3L 3717290 5' + Doc 4697 1 54.64 ACTTTGCCTTATGTACATTGGGCGCCGATACATATATGCAATGTGTAACAAGCTGTATATACTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3R 31644224 5' + roo 8678 2 65.35 GTAGGCGTTAGAGTGGGCGTGACAAGATGGGTAGAATCTGTGTGCTGAATCTCAACCTTCCAGCTCATATACAGGGTGCGGCAGCATAACATCCTTTTTTT:1 - chr3L 22511714 5' + mariner2 9 1 46.53 ACCAAAACCGAAAACTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTTTGCAGCAAAATTTGCAA:1 + chr2L 19602718 5' - P-element 161 1 22.77 AGTTTGTCAAAATACTTATGCCGAACAAAAATTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAATTTATGTGTATTTTAACAGAAAATTCTAACGTGTC:1 - chrX 22928839 5' + transib2 373 1 68.32 ATCCCATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 1156732 5' + 412 7081 2 55.45 ATAGAGTCCCTTTTGTGGATTACGATTTGATAAGGATTTGGATGTTGTATGTTTTCTGTGTCCCATAAATATAAATATTGTGACAAAGTGTCACAATGTAT:1 + chr2R 21140595 5' - Stalker 6913 4 70.30 CGCGAGTGAATGAAAGTACAAAAGCGAAAGGTATGATGTTTTTAACGTATATATGTAATATATGTGTAGTTGTACTGTTTTTATGTTGTGTGACATCCAAT:1 - chrX 20502328 5' + transib2 339 1 73.27 CACTGCAGTGATGCCTTTTTTTACTTAGTTTGTGTGCGCTGATGTTTTCCTTTTATGCTTGCAGTTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chrX 6405024 5' + jockey 4771 1 64.36 GAATTGAGCATTCGTCTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr2L 9389055 5' - 1360 3354 1 65.35 TACCTGTAAATCTATACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr2L 13250346 5' + pogo 12 1 65.35 CTCGTTGTAGGAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr2L 22719640 5' - 1360 3344 1 68.32 TACAAAAATGAAAATACAAAAGTCACACTTATGCAAAATTGTGTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 - chr2R 1373184 5' + pogo 31 1 56.57 AAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCA:1 + chr3L 7989762 5' + mdg3 56 2 76.24 AATAAATTTCAAAGAAATTTAATTTTTAATTCCGTTTAAGTAGTTCGGTATATCTTTTGAAAGGAATACGGTATTACCAAAGACACTAGAATA:1 - chr4 307791 5' + Tc3 237 2 59.14 GAAAAAGTGGGCGCATCGGTCCTTTGGGGGGCGTGGCAACTGCACCTCATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGA:1 + chrX 14163514 5' - F-element 45 1 52.48 GACGGTGAGGCAAATAAAAATGTATTTATATACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chr3R 20884951 5' - flea 4973 2 71.00 ATATAAACGGGCATATATATACAGTGAGCCAGCATACTTAAACTGGGTCAATTGCCGGCGTCGCTGCTGCAGTTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTG:1 + chr3R 9981470 5' + jockey 4765 1 71.29 GTTCATGACGCAAGCTGGGATCTTTTCGGTTTGTATATAATCTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:1 - chr2R 5485134 5' - 1360 3357 1 58.42 TGTAGGACCTGATATATTTAAACCATAATGTGTATAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 26469450 5' - hobo 2911 1 73.26 ATGGAGACGTTCTTAAAATAAACCCCGCTAAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAA:1 - chr3R 15943358 5' + jockey 4647 1 65.35 AGGATTAACAAAACAAAAACTTCTTCGTGTCACGACTGCCGCGATCACGACTCACGCAGCCCTCTCTAGGCCGATCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTT:1 - chr2R 16366863 5' + hobo 4 1 74.26 AGGACCACACGCCGTGTAATCAAAAAAAACGATAACCAAACGGTTAAGAAGCGGACAAAAAAGTGTACCTATTGAAGATGAGGCCCAGATGTTATTGGCCT:1 + chrX 9906689 5' - Circe 9 2 79.21 AATTATTTAAAAGATTAATTTCACGCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTG:1 - chr2R 2552213 5' - HMS-Beagle2 311 2 78.22 CTCGTCCCCGTACATCTCCACTTTTTCGCTGAGCTTCGCATATAGCAGCTTGGAATTCAAGAGTCGGAGGGCAGTATACTAAG:1 + chr3R 2831904 5' - G5A 330 1 72.29 ACCAGCAAAAAGGATACTCAGCAAAAGAACAAAATGGTAAGATTCAGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr3L 5975659 5' - hobo 2908 1 57.43 ATGATGTTGTGTATGAGCGTCGGCAGAAACATAAACATACATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr2R 9862217 5' - roo 9033 1 67.33 CATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTT:1 - chr2R 6984381 5' - HMS-Beagle2 7150 2 73.27 CTGTGGATAACCGCGAGTTAAAAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCTGGAGAAGGACCGACAGCCCGCTCT:1 - chr3R 31132849 5' + F-element 437 1 71.43 GAGTAGTTATAGTTGTGTGCTTGATGTGTTGTGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGAGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTG:1 + chr2L 4189384 5' + 1360 46 1 70.30 CGATATTTATGAGAGATGGGTCAATCGAGCGAATCACAAATCCGGAATCACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTG:1 + chr3L 5021235 5' + I-element 4990 1 52.48 ATCAAAAGAACATAATATTTAAGCTTTAGTTGGACTACGTTTAGAATTTTCTACTTTCTTAGATGATAATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 - chr2R 17384116 5' - mdg1 7452 2 43.56 GTGTAAGGAAGAAGGTCAAAAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAAA:1 - chrX 9584968 5' + Doc2-element 240 5 64.29 CTTTGNTTACACTCAAAATGAATCGAATGAACGCAGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCATGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chrX 6458231 5' - blood 7349 2 62.38 TAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGAC:1 + chr2R 5617479 5' - invader1 404 1 70.30 CGATGTTATATCCTGGCATTTCGGGTTCTTCGTTTAGTCTTTTATTTACCTCCCCCAGCTAACCGTAGACCAATGCTTAGAATAGTTTTTATTTGTAAGCT:1 - chr3R 13321823 5' + Cr1a 4035 1 57.43 ATCGTCGCGTCATATTGCGTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 - chrX 10730676 5' + P-element 58 1 22.77 CTCTTATACGAGCCGGAAGAGAGCGGAAAAACTCTATCGGTTTGGCAAGAATTATATAGTAGTACTTTGATATCAATAAATAAATAAATAAATAGTAAAT:1 + chr2L 6178717 5' - copia 223 1 66.00 TCCCAAATGCGATAATCTCTAAGCCCAAAAGTTTGAATCACGCCCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2L 1626536 5' - roo 9037 1 57.43 CAGCATTGTTATTCATTTTTATCCAGAGGGTGGCTTTCAATTTAATACCAACTTGTCCTAGATTGTATAGCTAAGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTC:1 + chr3L 11461313 5' - copia 252 1 76.00 ACTCGAAGGTCCGAGAAAGAAAAGTGGCACATTCTAAGGTCACCAAATTAGCTGATGGCTTATACAGTATAATTCGCTTAACTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 + chr3R 22079712 5' - pogo 2085 1 60.40 CTTCCGCACATTCAACACCTGACATTGAGGGATACAGAACAAGTTCACGCAGAGATCCACCACCTATAACCCACAACAATG:1 + chr2L 322185 5' + G-element 4197 1 72.84 CAGGAGCAAAAGCCTGCAGGTGTCCGTCCCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 + chr3R 25823662 5' - hopper 1372 1 73.20 GATCATTCCTGGAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAG:1 - chr2L 1156811 5' - 412 467 2 57.43 ATTGCNCAAGCGAACATTAATCGATTCATTGTACATAAAGACATGTGAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATC:1 + chr3R 27080689 5' - HMS-Beagle 7025 2 78.22 CGGATGCGCTTGCATTGCTGATTGAGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTAT:1 - chr3R 5977795 5' - copia 205 2 74.26 GTACACTCGTACTATTTGCCCCCCCCTTTCGACTAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTATCCAAAAGATCGTTGC:1 + chr2R 22997966 5' - Transpac 269 2 68.32 GCCTTCTTCGGGCCGGGAGAGGGAGAGAGAAAGAGACCAATGCCACCCGCACACACCTACAAATACTTATTGGCATGAATAAACATATACATATGCATGCA:1 + chr2R 15610105 5' - Stalker4 7197 4 64.36 TACATCGGACGAATTTGTTATTGTCACCAAGAAGTTGGGGTTCTAATAATTGTTTATCTTATGTGCTAAGGCATGTGCGCGCTGGGTGACCGTCGAAGGCA:1 + chrX 21999984 5' + gypsy10 5807 2 73.27 AATACAATTAAAAATGTATGCTATCTTAAAGACAAAACCATGGATGGCCGAAGTATTGGGTCTAATCCTCCAAATAGATTTCTTTCGCTTTCGATTTCTTT:1 - chr2R 14498594 5' - Doc2-element 99 2 64.36 ATTCAAAATGAAATCATAACATGAACTAGCAGGATTTAAATAATTAAAACATTAATTTATATGCGGTAATTAAATTAAATTATTAAAAAAAAAACATTAAA:1 - chr3R 28013482 5' + P-element 2689 1 57.43 AAAAATTGCGTTTACTGATGCGTTTCTAAAATGCATGTGAAAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAAC:1 - chrX 7397427 5' + jockey 4956 1 59.41 GATGGCTGGCCAACAGCTCGTGGTCCTAATCCCCAAATATAATCCAAGAACTGCAATTCTGTTTCCCACGGAGCGCTGGGGACCAACAAGCCATAGTCCCC:1 + chrX 6591583 5' + Rt1a 407 1 66.34 GAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTG:2 - chr3R 9952237 5' + Ivk 41 1 67.33 CACAACCACTTTAGTACCAGCTCTCCACAACGCCAATAGCATCACCAACGACAACCAAGTCAGCCACAATAACGCCTAAATTTGAAGTTTTTTATTTTTGT:1 + chr3L 27361255 5' + Tc1 1467 1 75.25 GAAACATTCAACCTACAAGGTGTCTTATTCATTGTTTTACAGGCTTAAGTGACCATGTCACGGTCGCCATGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTT:1 + chr3L 9673815 5' - Tabor 475 2 74.26 ATTAGTGGGATAATACTCTATAGTCAAAAACAAAAATATATAACAAATTTGGGAATTTTGAGAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chr3R 25510419 5' - opus 7490 2 61.39 CTGTATCTCACCAAAGCATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 14639406 5' - roo 9036 1 61.39 ACAACTTAAGATGAAAAAGAGGTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAA:1 + chr2L 8740855 5' + Burdock 7 2 72.28 CGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTCTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTCGGAAACATACTAAAGCAATAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCG:1 + chr3L 27587 5' - INE-1 570 1 63.00 CGTCGCACTCCGTCGTTATTAAATACATCTTTTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCA:1 + chr3R 11165654 5' + Tabor 6887 2 71.29 TATTGCTTTCACTTTATAGGACAATAGTATTGTATTTCCGTCAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCAC:1 - chr3R 6148121 5' - copia 5035 2 58.42 CGAAAGTTTGCGACAGTTTGCCACAGGATAAACTTGGACTTATCGCCATAGCCGCACAAATTGAACTGTATTGTGTGTGTTTTTTATTTTATTTATTTAT:1 - chrX 2993978 5' - X-element 4717 2 70.00 TTTGCNTATTCCTATAATCTCCAAAAGGAGAATCCCTCGTCCTTATGATAAACCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 15638217 5' + roo 8687 2 58.42 AATTCAAAGAAATTTTTTTGAGTATAAATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGGTAGTATAGCATTAGCTA:1 + chr3L 5015826 5' - I-element 5304 1 79.21 CTATAGCTTATAGATCTTTTTCTCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACC:1 - chr3R 21501054 5' - roo 433 1 78.05 GTGGTTGGGCTCCACTACTACCTCTACTAAGCAAATAGAAAAAAGGGTTGCGCGAAATGTTTGGTGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTTAA:1 - chr4 416403 5' + mariner2 771 1 55.45 ATTCTACAAATATTTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chrX 13347269 5' - roo 394 1 64.36 CGGCATACGTTGCGACGTCGACTGCGGCAGCGACTCCCCCGCATGGTGGGCATTTGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGC:1 - chr3L 9692751 5' + P-element 21 1 54.46 CTGGTGGTGGCATGACGCAGTTCCCATCCATACTGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 19076127 5' - roo 393 1 60.40 TAGTTATTCATAAATGTGTTCACCCTACTCTGCTCTTCGTCTTTGTGTTTGCTTACTCTTCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTTGTTTTT:1 + chr3R 1848892 5' + Cr1a 244 1 65.35 TGGTGCAATACTTGTGCCCCAGAGCTTTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATC:1 + chr2L 21007317 5' + Idefix 301 2 74.26 GGAACTCAAGGCATTTTAAGTTTCTTTCCTCTGTACAACTTTGTTAGACAAGCGTTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 + chr3L 13364525 5' - hopper 1392 1 50.50 TTAATAGTTTTTCTTTTTTTTATTTAGTTTTGTAAATTTCTATCGATTTCTATCGCTTGTTCGTATTTCCACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGG:2 + chr3R 15251762 5' + INE-1 551 1 46.53 TATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chrX 18012693 5' - roo 9026 1 72.28 CCTGCTTTCTACTCTGCTGGTAGAACATCAGACAGATTTTCCTAGTGTTTTTCCCAAACTTTTCTAAAGTTTTGCCTTTTCGTTTGTTTTTTTTTTCTT:1 + chr2L 10591129 5' - Doc2-element 226 1 74.75 TTAGTGTTTAGGGAAATTAAGTTGTAAACATTTTCTTATTTTGATTTCATTACTTTTTTTGTATTTATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 - chr2R 969258 5' + flea 4765 1 76.24 AAAATAAAATCGGCAAACTTTCTGTTCTGTTTATCCAAACACACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chrX 20727271 5' + 297 6608 2 75.51 ATGGGAGAGACCACAGATACAAAACGCAACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chrX 329097 5' - opus 487 2 68.00 AAGTTGGGAAACTGCGGTGCTGCGAGTATTTATTACCCACCAACCTTAGCTCTTTTGTACACCTGCTTTTATATGTAGGTACTTAGTGTTTGTGTAATAA:1 - chr2L 1283707 5' - Juan 3911 1 48.00 GTGGTGGCCCGCAACGAGCCATAGCTGCAGACGACCCTCGAAATCCCATCCGAACCTTTGGCAATGCAACACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - 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chr3L 1810562 5' + diver 5935 2 70.41 ACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr3R 6147256 5' - copia 221 1 57.43 AATTCATGACAGCATGTTTTTTCATTTTCACAAAAATATCCATCATACGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 - chr3L 9925296 5' + Doc 39 1 60.40 AGTGGCGGAGAGAAGCTATTAAAAGTGGCCAATAAAAACTAGATAATGCCTTTAGACAGTGGTCATAGGTAGGGAAGGGAAATCCGCGAACACGATTACAC:1 - chr3R 6509819 5' + Gypsy12A_LTR 1972 1 60.40 AAAAAGTAAATTTCCGCTGAATTTGGAAATTAATATTGTTTTTAATTTATATGGGGTATGGTGTGCATTTAGATCGTAAGATACCAGAATTCAGAGCAGTT:1 - chrX 12730475 5' + gypsy10 294 2 69.31 AAAAAAAGAGCAAAAAAAAGAAGTTGTGGGTTGGTCTCGCTCTCAGCTGAACTTAAAAAAAATAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATG:1 + chrX 8365790 5' - jockey 4769 1 60.40 TGAGCTGTTTAGAAATGACCCCTTTATTTCTAATGACAACTAATTATTATAATAATATAATAATAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTG:1 - chr2R 13643903 5' + F-element 28 1 52.48 GCAACCAACATATGTCCAACAGGGCCCGGAGCAGGATCAGCGAAAAGTGACCCGTGGGACAGAGTCTATAGTCGTTTTAATCAATTCGATCGCCGACGTGT:1 - chr2R 5084108 5' + F-element 10 1 68.32 ATCTTTGGTTACACTCAAAATGAATCGAATGAACGCAGTGCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCA:1 - chrX 6458233 5' - blood 339 2 62.38 CATCGTTCCAAGAAGTATTTATTTGCAAGTATTACAGGCAAATAGTTCCAAAGTTACCATATAAATTTAAGGGTTACAAATTATTAAGTATAAAAGTAAAA:1 - chr3L 19014111 5' - G5 4723 1 51.49 AGGGAAATGAAAAAGAAATGAAAGAATGTTAGGTTTCACAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTG:1 + chr2L 23368451 5' - Transpac 4767 1 76.24 CATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAG:1 + chr2R 4788805 5' - 297 360 2 69.31 TTTTAGTTTTTTATTTAGTTTTAGCAAACTACGAGAAACAGTGCTATTTTTGTTACCGCCTCATTTCGCGCACTTTTGCAGCAAGTGCG:1 + chr3R 27260061 5' - Tc1 176 1 69.66 GAAAAGTATAACATATCCGAATGTAATTTTATAAAATGAAAGGTTTTCGCTAGTGTTATATAACCAAAGCGTATCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTG:1 + chr3R 28883344 5' - HMS-Beagle 241 2 72.28 GAATTATTCTTATTTTATGATTACTGTTTGGGAATGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTTATTTGTCTGCAGCT:1 - chr3R 6431069 5' + 3S18 56 2 77.23 GCAGCAAAGGGGTATATTGTGGGCGACCAAAGTATGTAACAGGTAGCAGATAGACTTTTTCACCCACACCGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chr2L 6227625 5' - roo 403 1 73.00 CGTAGCCATTTTTGTTATTTTGTAGTTTTAGTTTAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2R 8378605 5' - pogo 2060 1 71.29 TATACTCTTTATCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATATTACGTCACTTCTTTAAAAAGGCAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAA:1 - chr3L 9634074 5' + Stalker 6859 4 84.16 TTTTATATTTTCCTTTTTGTGCTCGGCGTTGCATACTTTTTGGGGTGCATTTGGGGATCGGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr2R 16366754 5' - hobo 2922 1 66.34 TACACAGACAGGCAAAGAGGAAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAGGCAAGCAGATAGAACCACACATACACACACACACACATACACA:1 + chrX 19989660 5' + Quasimodo 38 2 63.27 GGGGTCAAAAGGGGGGTCAAAACGGGGTATTGAGCGGTGAGGCAGTTGCTTTTCTCGACATCCAACAGGTGAAAGAGAGTAATAGTAATAATAATGATAAT:1 + chrX 6057554 5' + mdg1 7086 2 74.26 GGAGCACATGAACAACTCTGGTCACTGGTCGTATTGTCTGAATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCT:1 - chrX 6654769 5' - P-element 2850 1 43.56 CTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAG:1 + chr2R 2552125 5' + HMS-Beagle2 6928 2 73.27 AATAAGTAGAATACATCATCCTTCTTGTCGAGGTTCTTTATTTGAATCATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATAT:1 + chr4 174863 5' - Stalker4 7240 4 73.27 CAAGAATTACATCAATGCAATTCGAGTGGAGAAATCTTTCAGAGAATGAATGTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGG:1 - chrX 18997765 5' + jockey 145 1 54.46 GTTTAATGCTTACAACACTTTATTGGACCACTGCCAAATGGTTGATTGGTTGACTAGCCTTAAGGGCACTCAACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCGTATC:1 + chr3L 11366953 5' + springer 259 4 62.38 ATATTGGTATTGCATATGAAATGCGTTCTGAGCTCGGCAAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGG:1 + chr2R 23495442 5' - 412 456 2 59.41 AGCCGTCAGCCCTACCAAAGGAGGTGGTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:2 + chr2R 3641133 5' - 412 7496 2 73.27 TAATGCTACGAGCCGTAAACTAATGAGATGTGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr2R 9014429 5' - blood 331 2 70.30 GCTCANGATCGGTCTCCCAAGTGATTCCGTGGGCGAATCGCAAGGACAAAGATGCACTTCACGACATGGGACTTTGTTCTGTAATGATGAACTCCAATTAA:1 + chr3L 13080901 5' - 412 7546 2 77.23 CTGCACCTAACGAGCCAGCAAAGAGCCGGACAAAAGCTGAGTCGAGTCACTTTGAACCCATCACCGGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCA:1 + chr3R 13346610 5' + Ivk 483 1 72.28 AAGTTACGGTTAATCGCTCTACACTGAAAACAACTGCATAAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGAC:1 + chr3R 17719837 5' + Tirant 8499 2 60.40 CATATACAAAATATATTCAAAATATAGTCACAAAATGAGGCGAAAAACTGTCACGAAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGT:1 + chr2L 4032642 5' + R1A1-element 4881 1 57.43 TGCACTCGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 - chr3R 9952266 5' + Ivk 12 1 66.34 GGATCTCGAGCCAATGGCACATCGATCTCCAAGTATATATGGTGCTGTTATTGGCACTAGTAAATGTCACCGTTGTTGTGGTGACGCTACTGCTTTGAGTT:1 - chrX 8446771 5' - BS 481 1 68.32 AACCACGGCGATCCCATAGTTTTATCAGCCCTGTAAGGAAGGGTTCGCCTATCAATTAGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr2L 1156722 5' + 412 7071 2 61.39 AATGCCTTTAATTAAATTTTAAAAAGTTATTGTAGACCTAGTAGTGAACGTGCTACACCAATCACTTCCCAGAAATGATTTTTTTTTTTAGAATTTATTAA:1 + chr2L 4784466 5' - BS3 1767 1 21.78 AAACATATTGATGTTAAACTTAAAAGACTTCCTCATAACTTTAATAGTCAAAAAATGGGAAAAGGCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2L 12153286 5' + roo 12 2 65.35 ACTCTCTTGCCATCTCGTTTTGTAGCTTCGATCGCAATGAAGTCCAACAGACCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCTGGA:1 + chr2L 1175191 5' - R1A1-element 5241 1 54.46 CTAAATTATGAATATCAAAGACAAGAATTTTTCTACTACTGATATGAGTTAGGAATTGAACACACTACAACATGGATATAAACACTTGCTGAACAAATTTG:1 + chrX 3463828 5' + hopper2 1191 2 63.37 TGCTGGAAGTGGTGCTTGATTTGATGTGGGATCATGGGGTATTTGAGAGCAGAGGGGGAGTATTCTTCTGTAATTCGTAAGTCATATCATATGGTGTGCGG:1 - chr3L 7980590 5' + R2-element 56 1 73.27 GGCTCGCCCACGCAAAAGCGCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAA:1 + chr2R 9426466 5' - P-element 2831 1 23.76 CATTTAATGCCTTTTGCCGCCTTCTAGATGACATATGTATGTATATGTACATTTGTATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3L 20248290 5' - Transpac 5209 2 59.41 TCTACTTGGGGGTGACATTGAAATAAAGAAGTACTGTATTTTCATCAGAATTCACTTAGTTGTCAATTATTGGTGGAGTCAAGCGGGTGTTTCCTCTTCAG:1 - chr2R 5192317 5' - G-element 4168 1 74.26 TTGCTTGATCCGACGATGTTGCCGCTTCAAGTCGCAGTTTAAAACTAACTGCCCAAGAACGTCGAGCATCTGGTACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chr3R 11993264 5' + P-element 5 2 74.26 TTATAAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chrX 14525245 5' + hobo 18 1 63.37 ATTTGCACAGCTCCAGAGAACTTTATTGGCTTAAATTGCTGAACCAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTC:1 - chr3R 6797037 5' - 1360 3199 1 55.45 AATGAACTTCAAAGGAAAGTCAGGGTGAGGGGTCAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAAC:1 - chrX 8634314 5' + opus 322 2 81.19 GTTGGCATAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 + chr2L 7547990 5' + blood 25 2 54.46 TGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr3R 14094979 5' + Doc 50 1 74.00 CGTAATAATAATTTCCACACCATCATAACCCTAGAACAAATATAAAGGTAAACGTTAAATACATATATATAGTGACATATCCATAATTCCCTAAGACTTAA:1 - chr2R 1885994 5' + Idefix 9 2 82.18 GAAAGTTAAATTGAATTGAGGTGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chr3L 10811166 5' + P-element 54 1 27.72 GTTTCGGAGGCCTCAGTAGTTGTGGTACTTTCGGCGTTGGCGCTCAAAATCGCAACCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr3L 11610211 5' + jockey 30 1 57.43 GAAATGGTTTTCCTTTCTGTGAACCGTTCATATTTGTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTGTTGG:1 + chr3L 14089316 5' - gypsy7 5002 2 75.81 ACCCAGTTCAAAATGCAAATATAAATAAATCAAAGAAATTATCTTACCATTTAAATAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGAC:1 - chr2L 2791592 5' + transib2 2788 1 57.43 GTAGANTACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGG:1 - chr2R 1949149 5' - Cr1a 4418 1 78.79 GTATTTGTTGTTGCTGTTGTTGGCATAGTAGTCAGCGCTTTTTGTCCGCTCCTTGGGGTAAAGGATATTATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACA:1 + chr2L 7547972 5' + blood 7 2 72.28 CAAGCGTCGACTGCCAGAAGCTGGCTATCTCTCTTGTTTATGGTATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 - chr3L 21708677 5' - roo 385 2 55.43 CTTCACTTAATTAAGCTTTTTTTTTTAGAGTTTAAATCATTTATTATTATTCACTAGAATTCGTTCAGTTCCTTCTGAACTTAACCTAAAATGTAGCTTAA:2 - chr2R 4339506 5' - G5A 2781 1 80.20 GGCTTGAGTTTGGGTTTTTGGCGGGTGGGGGGAGGAAATGTCAGCAGGGGCATTCCTATTTATCATGATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAAC:1 - chr2L 13447200 5' + HMS-Beagle 6804 2 71.29 ACAATTAAACTCGTTAATACTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTATNATAGATAGAATAGTTNACAAAACTAGACT:1 - chr2R 21712768 5' - I-element 5329 1 69.23 ATAATTTAACGAGTCAAAACATTCTGATACCTGTTACTCGTATATTATAAAGGTATACTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 21501267 5' - 1360 3368 1 72.28 TTTTTATTTTACCATCGCCATGCTGTTTTTTCCCAACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 - chr3R 8550008 5' + 17.6 6952 1 51.49 ACTTGGCTGGGCAAAACCTAAATTTACATTTCACATTTACTTTGACGAACCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTT:1 + chrX 5820919 5' - jockey 4959 1 59.41 TTACANGTGGATCGGTGGGCAGGGAGCTTAGCGAGTCCTGCTGTTCACTCATTATTAGGCCAGAGACAGTTTTTATTTTAAAAAATAAACTAAATAATAAA:1 - chr2L 11121892 5' + F-element 91 1 63.37 CTTTTACCCAGTCAAGGTTCTTCACAAAATATTCTGTTATTGTAATCCAAGTATACGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTC:1 + chr3L 9772191 5' - 297 376 2 62.38 TTTTTCGTGGTGAGTTCTGTAGGAGCCGGATAGCTCCTCAGAAAATATAAAAGCGCTAATTCTTGAAATAATAAACAAGAGAGAATGCTATATTCGAGTTT:1 - chr2R 2749997 5' - INE-1 574 1 54.46 TGTTTGCTGTTCTGGGCCTTTTACAGGCAGTCGCTTAATGACGTAACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3R 18934946 5' + hobo 30 1 53.47 GCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTCGCAATAAGTGC:1 - chr2L 14490437 5' - P-element 2838 1 30.69 GTTCTCCGCTTCCTCCTCTCTCACGCATCCATGAACCGGCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chr3R 28326755 5' - P-element 2848 1 43.56 ACAACTGCACACAAGTGCTGCGCATTTTGATATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAACTATCACTAAGTGAAAGTT:1 - chr2L 17140661 5' + Doc 4604 1 63.10 TTTCATCAATTTTTTAGAGGGTAGTCCAAAGCTATAGCCTCGCATTGATTTGTCTTGATTTTGGAAGATTAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGTACTTACTA:1 + chr2L 10575171 5' + Burdock 6300 2 59.41 CTTTTTAATCCTTATCACACTCACATTCTCACAGATGGGTCATGTGGCCCGTTCTCCTGGATACGTGCCATCCAGTTTGGTTTGGCAAAAATCCAATTAAA:1 + chr2R 12458232 5' - Tc1 315 1 72.28 GTTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 + chrX 14713211 5' - flea 4975 2 75.25 ATATTATTTGAGTATTATATTTAACAGATTTAATCTTTTATAATCCTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATA:1 - chr3L 12298636 5' + pogo 28 1 56.44 TCTGTGGTGCTGACGGAAGCGGCAAAGAAAACAGAGTACAACGATTCCTTTTGCACCTGACACAAAAACCTGATACACACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCA:1 + chr2L 15956002 5' + Max-element 8235 1 77.23 AGCAATACATAACAGCTAGCCTATGTAACATATGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chrX 6997225 5' - P-element 2844 1 36.63 GTTATTTTGTTCACTAAAATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 13202981 5' - roo 9054 2 62.38 CTAAATCACAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGT:1 + chr2R 5485080 5' + 1360 45 1 71.29 TAAACCCCATATCACACCTAGGGAACCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chr3R 19837070 5' - P-element 2837 1 30.69 AATCTGAAAGCACTTTGTCACTTTTCGTTTTGTTTTGCTGGCAGTGCAGCAGTACCGTTTATTGCTAGCGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTG:1 + chr2L 6870188 5' - F-element 483 1 79.21 ATTCAATATTAACATAGTCAAAGGAGAATTCTTGTATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr3R 18881507 5' + roo 8704 2 66.34 TCATTCACAAGCAACTATAATGCCATATTGGCTTACAAACTAATTTATACTTAAGCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCT:1 - chr2R 13605623 5' + I-element 25 1 50.50 TCTTCACGAGTCGGAAACTCAGCTCAAATTGGAGCAGCCTGAAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr3R 25918894 5' + roo 8696 2 58.00 TGATANAATCTAACAAAAGGGAATAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGAAGGTGAAAAGCAGCTGCTCAAGCGATAGCAGCTCCTCGGAGTCAGAGCCTGGGGA:1 + chr2L 18291749 5' + G-element 434 1 77.23 ACACTTTTTGGCCAGCTCGCTTTGAAGCCCCAAGTAGCCGATGCCACGTGTTTGCTCCACATGCAACATTTAAATTTAAATTTATTTATAAGTTTTTTATC:1 + chr3R 20575057 5' + S2 111 1 66.34 GTGGTCAGCAAATAACACAGCCTAGACTCTTTTACCAACAAGGTCTGCTGGCAATGGATTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAA:1 - chr2L 7459639 5' - BS 5078 1 55.45 CTATGCTCAACAGCTTTTCCACCCATGAAAAAGATCAAGGGATTCGCAGTTTACACTAATAGGTGTAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACA:1 + chr3R 9181684 5' + P-element 459 1 74.26 ATGTGTGTGTTTTACTTAAAATAAATGTTACTCTTTAATCATAATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCT:1 + chr2R 22993705 5' + opus 7034 4 63.00 TGTGAGAAGGATGTGTATTAATAGGAAACCCTTGTTGCGAAGGCTTCGGGGCTCGTCCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCAGTTGTTTAAAGAAAA:1 - chr2L 18028310 5' + flea 310 1 53.47 AGCTGCAGATATTTGCGCGGAACTACTGCAATCTGTTTATTCGAATGATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATC:1 + chr3R 25474977 5' - Stalker4 7239 4 71.29 AATATAAAAATAATGTTGATGTTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGA:1 - chrX 12294792 5' + blood 7011 1 79.21 CAGAACTACTGATATTAAAGATACTCTTACAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 + chr3R 14049361 5' + transib2 46 1 71.29 ACTTTAACTTCGAAGTCAATTATCCAACCTAGTGATAATCCAAAGGCTAATTTATTTTCATGTGTTCTTCGCCTGTCTATATATTTTTTAATATGTTTTGC:1 - chr3L 24233763 5' - G4 3594 1 58.42 CATACTGTCTCAATGTCAGCAGACACTGCAGCTTTAAATGTAAATAATTTAGATACAATATCTTCAATTAACTTAGAGATCTCGGGAACTATAAAAGCTAG:1 - chr3L 18923299 5' + INE-1 152 1 68.32 ATGCCNCCAATTGATTACATTTTGCATACAAAACTGCCAACTGTTTTGCCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chrX 2762201 5' + roo 28 2 55.45 AAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3L 1583816 5' - roo 9031 1 69.31 TTGCANTACGCATACGCCATGTGACTCACAACGGAAAGCGCGGAAGGCGACTGGGGAAAACTCTTTTGTTGTAGCATACTTTTGGACACCATATAAATGAA:1 - chr3L 3476295 5' - Circe 7094 1 65.35 ACAGTCTCAATTCGAATTGAGGTTTTTGGTCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chrX 20437654 5' + roo 8712 2 72.28 TGAGATGAGAGATTTAAAGAAAATAAAATTAAAAAACCAAAAGAGGGCGACACAGTGCATTGACTTTATTACATATTATTATATATACATACATATTACAT:1 + chr2R 2953335 5' - Dm88 15 2 65.35 TTGAGNAACTTTCCATTGTGCTGAAAGCGAAGTTTCTTCTCAGATACACGTAAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:1 + chr3R 19114181 5' + 297 19 2 60.40 CACTTTAGCTTTCGATCCTAAGCTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGAC:1 + chr2R 6779791 5' - 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Cr1a 123 1 75.25 ATAGAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCAAGTCGATCCAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTTGAGATATCACGAACTATAAAAGCT:1 + chr2R 8443974 5' + INE-1 150 1 86.14 CTGTTGTTCTTGTTGTTTCCGCCTCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAA:1 + chrX 13014626 5' - I-element 5009 1 82.18 ACACCGTCGCACTCACAGGACTCAATAGTGTGTATATATATTGTATGTGCGTGTGTGTGTTTGTGTGTGGTTTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 + chrX 7828857 5' - 412 7540 2 72.28 ATATTTAAGCTTTAGTTGGACTACGTTTAGAATTTTCTACTTTCTTAGATGATAATGTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr2R 17384102 5' - mdg1 400 2 46.53 CAGCTCGCCGTCCATGCATCTGCGAGATACATTAGACAGTTTGCTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 - chr2R 11609401 5' + FB 35 1 61.39 AGTTCAAAGCGACGGCTGCGACTAGACCAAAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTG:1 + chrX 9732920 5' + Ivk 298 1 69.39 TACTTTCTGTCTTTCATTAGTCATATTTTTAAGTATTGCCTATTTAAATGGGGCCTTAAAATGCTTGCCATAAAAATGTTATGTACACCCCAACAGCCTAG:1 + chr2L 18513546 5' + jockey 4667 1 28.71 GAGCACTGCAAGCGGAAAAAACGCTGAGAACACTGAGAAAACGCTCGTCTGCGTTCGGGCTGGCCTTCGTGTCGGTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr2R 21379463 5' + P-element 4 2 75.25 TTAATCAAAATTGTATTAGCTTCATTTGTTAAAAAGTAAGTAACATGGAGAGGGAGGCGTTTCCATATTTTCTTATGTGTCCGTATGAACGTCTCGATCTC:1 - chr3L 2521845 5' + INE-1 134 1 73.27 ACAACTCCAATCTAATCCATCTCTCCTTTTTCGACGGTACAATGCTTTCCGCGACCCATAACTACAGAATTTTTGGTCTTCGTTTGGAAAAAATTCAATTA:1 - chr2R 18287754 5' - Tc1 317 1 74.26 GGAATAATGGTTTCTGTTAGGCCCATATATATGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTG:1 - chrX 20391100 5' + rover 42 2 75.25 ATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 - chrY 311343 5' + 1360 12 1 50.50 CATAGTTTCGAGTGTGTTCCTTGGAAAAAGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr2R 10912148 5' - 412 7500 2 70.30 ATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chr3L 19951213 5' + Ivk 45 1 69.31 ATAATTTAAATTTTAATTTTTTAATTTAATTTAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGA:1 - chr3R 16818381 5' + Cr1a 104 1 83.17 TAGAACAAACACATTTCGCGCAGACTAGTCGGAACTTTGCTCCTCATCAACCAAGTCCACGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGC:1 + chr3R 4282717 5' - 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chr2R 10912147 5' - 412 446 2 71.29 TGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 - chr3R 27080780 5' + HMS-Beagle 44 2 72.00 CGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGGTCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAAC:1 - chr3L 23678149 5' + Osvaldo 24 1 74.26 CCATAGAATACAGGTTATATGAGATTGTTTTTGAAAGCCCTCTGTGATTTCTTCCTCTACTGACTTCAGTAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACC:1 + chr2R 5656684 5' - baggins 4955 1 55.45 TAATTATGATGCTCCTGTTGATAGTCAATTTCAAAGTTTTCCTCTTGTTTTTGCCTCTCCGCTTTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATC:1 - chr2R 8654132 5' - accord 7026 2 62.11 CATCATTATTAATTCATTGGATACTGAAACCATATGTTTTGTTTGTTCTGCACTGCATACTTATGTTGTTTTCCCTATTTAATTGTATTTTTATATTTATT:1 + chr2L 1535171 5' - Stalker 6935 4 73.27 AATAATTTTTGCACCACAAGTTGAAGGAACTGGGAAGCAAAAAGGAAAAATATTGAAAAAGCGAGGGAAAGTCGAACAAAAAAAAAAACAAAGAAAA:1 - chr2L 16625414 5' + G2 3076 4 35.05 ATAATCATAAAGACATAAAAACTGTAAACTGTTGCTGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATATCAAAATGAAGATTGTGAAACCTAA:1 - 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chr3R 18507882 5' + jockey 29 1 55.00 TTTTGTAGCTGCCCAATGGATCGGGTTTGAGTCTGTATCTCACCAAAGCATTCTGCCCCATATCCCCATCACTGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 - chr3R 14639438 5' - roo 405 1 75.25 GAACTCTTTCGGGAGTAGCTATTGGTATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGAT:1 - chr3L 12673045 5' - F-element 4333 1 77.23 CTTTCTCGCTCTCTCTCTCTTCGTCGGTCTCGGTCTCTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:2 - chr2R 18288820 5' - P-element 2847 1 38.61 TATTGCGGCTTTTCCCCCCCACCGACAGATACGTATTCAACTGAGTTAGTTGAAGGTGATGGTGCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTA:1 - chr3L 13823416 5' - Doc 291 1 58.42 CCCGTAACCCCTTCCCCATCTTCGTTCCACACCACCACGATGTCTTCCCCGTTTGCTGTGCCAATTGTAAGGCAAACACACGTGTGTGTGTGTGTGTGCAT:1 + chr2R 8653752 5' - accord 181 2 80.20 TAAATAAAACAACTTTTCAATAAATATAAGTAGAAAAATCGGCAAGTACGCGCACACACAAACACGTTCTCATTTATTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCA:1 + chr2R 2248192 5' + 1360 3251 1 57.43 AGTTTAAAATAAAAATCAGTATAAAATGCTGAACGCTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr3R 12136281 5' + roo 41 2 65.35 AGAATAAAAAACAAACAAAAATTAAAATAAGTACGAGAAAGGCATCCGTTTCGTTGTAAAGAGAGCCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACG:1 - chr2L 19681376 5' - Doc 231 1 56.44 AAGCGTAATTTTTGGTTTGGGAACTTCATGCTGCAGTTCAACAAACGAATGAGTAACGATTAAGTGTATGTCTAGAGGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATC:1 + chr2L 6345946 5' - HMS-Beagle 6729 1 74.26 AAAAAGAGGTAAAATATATTGTAAGAGTTCACATTTTCGGTACCTGATTGTTTCCATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGC:1 + chr2L 8740868 5' + Burdock 6156 2 59.41 ATTAGGAAAAATGTATTTGTATGATGGCATGTCATTAAAAAACAAATTATTTATAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr2R 13122094 5' - opus 7483 2 61.39 AGAAGAGCGAGGGAAGCAATTCGAGAATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTA:1 + chr3R 30272806 5' - P-element 2854 1 46.53 GAACATGTTTCAATAATTTATCATATCTTATGATATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGC:1 + chr3R 27080735 5' - HMS-Beagle 183 2 67.33 TTGCTAATGGGTCTCATTCGCGGCTCAAAGTCGTTGTACCTCTTGGTCCGGTTCGTTTTCCTAATCTTTTTTTTCGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGTAT:1 - chrX 18926381 5' - HMS-Beagle2 483 10 58.00 ATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGT:1 + chr3L 19951219 5' + Ivk 51 1 75.25 GGACCGCCTATTAGCACATTTCGGTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 + chrX 2589687 5' - copia 235 1 80.20 TTTTGGCCAAAAGTTACGCTCGAAATGGTAAACGATTTTCGTACTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATA:1 - chr2L 16082691 5' + Stalker 6866 4 62.38 GCTTTTGATTAATTGAGTGTCAAACAACTTAATTTTCCAATAAACTATTACAATTTTGACCTAACTTAAAGTTAGGCTTTAAATTGAAAAAAAAAACGATA:1 + chr3L 12871297 5' - Circe 7286 1 83.17 ATAAATGTCTCGGCTCACTTGTTGGCTGCGCTGTCTGCTCCGCACTGACTTGTTGTCTTGTTCTCGTTTTGTTATGACATTTTACATTTTTAATGGGAATT:1 + chr3L 383756 5' - HB 1564 1 74.26 AATCTGCTTTCAAGGTCTGTTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr3R 30272831 5' - P-element 2829 1 21.78 ACACAAAGCGCATGCACGCAGAGCATCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTC:1 - chr2R 7481113 5' - opus 7481 2 59.41 CTTATNTACACATAAACTAACGGAGAACCTAATTGTCTGTTAGCATGGTACAATAAGCAGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 - chr2R 5311508 5' - 1360 3372 1 45.54 GCTCGTTGTAGGAATAAGTTGGTGTATCGGCTAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTT:1 - chr2L 22719641 5' - 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P-element 2871 1 63.37 GTTCTGCACAGGTTCCCCTCGGGAAAGGGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTG:1 + chr2R 6984339 5' + HMS-Beagle2 47 2 72.28 AAACAACTAAATAAATTATGCACAAATTACACAGACATATTCGGACATATATTCGGGAAATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGC:1 - chr3R 22852825 5' + F-element 29 1 45.54 TCTCTATACCAAAAGTAAATCTCCACCATTTTTGCTCCACATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAA:1 + chr3R 23984769 5' + I-element 5128 1 60.00 TTTATGTACACGAGCGGCAGCTGATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTTCCCGAAATTAAAAA:1 + chr2L 11551353 5' - Max-element 245 2 75.25 ATTGCTGCTTTGTTTGACTCAGAAACCCTTTTAAAGAAATCAATTTGACTGAGAGCAAAGTTTTTGCGGCCGGAGCCGAAAAATCAAATAAAATTAATTA:1 - chr3R 21515526 5' + NOF 3959 1 62.00 GGTACNACATGAGTCAGACAGGCAAGCAAATCAGCAAAGCTAAATAATGAACATTCTCAGGTAAACCGGTTCCGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAA:1 + chr2R 9408152 5' + FB 5 1 71.29 CATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 12452157 5' + 412 38 2 67.74 GAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTC:1 + chrX 21087563 5' + mdg3 5260 1 67.33 ACGACTACGTCAAAGATCTACGTTAAAAATCAAGAAGACTCTGTAGACGTTGAGCGGACAGAACCATTTCTGCCTACTCAAAAATCAAAAGAAGAAATTGA:1 + chr3R 26052588 5' + 412 7471 2 69.31 TTAGGTTGGAAGAAATAGCAACTTACTGACAGAATTAAGTGCAAAAGAAACGAAAAGAAATAGAAATAAAGGATGATAATATTTTAAATAAAAAATAAAAG:1 - chr2R 13283298 5' + G2 3051 1 82.18 TTGATAGACTAGTTACAGTTAATTTCACTACTAAATCTTTACCTTTGCTGCCCTGAATATTATATATTGAATTATATGTAGTATATACGAACATAATAACA:1 + chr2R 8245678 5' + mdg1 4 2 75.25 TTTTCCGTTTAGAATTTGTTCAACAGCAGAAAAAAGCGCACAAAGTTAAGCACAAGAGTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 + chr3R 25702167 5' + Tirant 17 2 64.36 ACTTTCATCTGCCAGCCAGAGTCTTCGATTAGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chr2R 21111189 5' + jockey 25 1 59.09 TGATGAAGAAAATAAAAAGAATGAATAGCATTCGTAAAAGACTATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTTTTACTGTTAATTTTCATTTATTGG:1 + chr3R 4543188 5' - 3S18 6079 2 51.61 ACAAGTTGATTGTTGACGTTGTCGAAGCTCTCACAAAGCTCATCGAGTTGTTTAATGCTCTCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 18503568 5' - roo 391 2 49.50 CAAAAAAGAAATAAACTTAAATTGGTGATATACAAGACGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATGTGTATGAGCAAAGACCCTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 27390371 5' + 1360 1 2 43.56 ATTCTCTCGGCTCCAATTTAAGTTTCCGGTTTTCGTTGTCAGTTATTAAAGTTGCGGATAATGTTGATAAACTGATGTCTTGTTGGGCACCAAAGGGTATG:1 + chrX 11658093 5' + Circe 7133 1 75.25 TAGTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCT:1 + chrX 1427549 5' - Bari1 1658 1 71.29 AGAGANCATAAGAAAACAAAATATTACTATCGAATCAAAACAAGAGATACACAAATTAATTAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTCTAAAAAGGGAG:1 - chrX 21668640 5' + Stalker2 7226 1 66.34 CATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 - chr3R 14094976 5' + Doc 54 1 79.21 CTTTTATAGAACAGATGCCTAGATATTTCTACTATGAATCCTCACTCTAGGTTGATCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCTGGTATCT:1 + chr2L 7507202 5' - Idefix 106 2 63.37 CGAATCCGAAGCGGGCGTCGATTGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCTAGGCTTATCGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTG:1 + chrX 2050973 5' - 412 216 2 77.23 AAGCGAACAGCTGGAAAAACGCCGGGCTTTGGGCCGAATTGGTTTCACGAACGAGCGGCCCGCAAAAGTGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr3R 29660326 5' + mdg1 8 2 71.00 GGGGAGAGGAGGGAGAGCGGCAAACGAGGAGAGCAAAGCGAAAGCTCGCAAGTGCTGTCTGCTCCCCTTGAGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCAGCGG:1 + chr3R 1289765 5' + diver2 4503 1 64.36 CGCAGTCGTGATTTATGGTGAGCGAGATATATGGCATATACATATCGTATTATTCTTCTCCCCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTG:1 - chr3R 9952260 5' + Ivk 16 1 61.62 TTCGCTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - 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P-element 2876 1 68.32 AATTCTGGCAACAAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 + chr3R 15998063 5' + pogo 25 1 56.44 GAAACTGAACCAAAAAAGCAGCAAAAATAGCCATATACATATGTATGTGTCGCATCATTATTAGTCTTATTTTTATTTTCTATGTTCCATCTCTAATAAAC:1 - chrX 11533983 5' + invader6 4525 2 58.42 TTCGATTTCGTTGTATAAGTTAATCAGGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTG:1 + chr3R 14618780 5' + R1A1-element 78 1 79.21 ATATATGCATGTATAAATATATGAATGCCATCTCTTCAAGTCGGTGAGCTTAATTTTGAACATTTTTGATTGCGTTCGCTGAATTAGCTGTAAAAGGGATT:1 + chr3L 15901359 5' - Porto1 4306 1 59.41 GAGTAACTTTTAAGAACTCTATATTAAGCAGAGCAATTGCTCCTGCTTATGAGGGTAGAAAGGAAATGAATATAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAG:1 + chr3L 25960395 5' - Cr1a 4307 1 61.39 CAAGTTTAAAATTTCATTAAATATGATGAGAGTCTGGTCGCCTGTGTAGACGTGTGAAGACGTTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 + chrX 19392643 5' + F-element 54 1 58.00 TTTGTTTAATGTCATTTTATTTAGCACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 - chrX 17204131 5' + Tabor 53 2 74.26 ATCGCATGATAGCCGTTAGTTGTCCGTGGACATGTTTCTTCTAAATACATTCTACATTATGTGCAGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 - chrX 1235499 5' - P-element 2875 1 67.33 CGTCTCCAGCGGTACAACAACAATAGCGACAACTACACCATCGCACACACACATAAGCAATTCTTTAAACAACACAAAAAGAAAAAAAAATAAAAGAAA:1 + chrX 15497902 5' + Doc2-element 225 2 47.47 ACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chrX 14525271 5' + hobo 43 1 69.00 GTACGAGTATTTGCGCAGCGAGGATGTAGGATGAGGAAATGTATTCGGTTTAAATAGGTGACATGATAATCGCATCTTAGAGTAAATGGCCTACGCAGAGG:1 - chr3R 6516015 5' - roo 8965 2 62.38 AAAATAATATTTTTTATTAATATATAAAAAAA:1 + chrX 339532 5' - S2 1588 2 75.00 GCATCACATATATATTTTTCCCGTGGTTTTTATCTCTTCAGTGTGGAACACTCCACGTAAAACAAGTTCG:1 - chrX 12279111 5' + R1A1-element 5313 1 62.86 CACCTNTCCGGAGTACTTTTTTTTTTTCATTTTCC:1 + chrX 9907146 5' - Doc2-element 243 1 91.43 GTAATGTGAATTTGAAAATCATGTATATTACATGGGCATTACCATTGGACATGTAGACTCGGCTATTGATCCTGATTAAGAATATACATACATGTATATAC:1 + chr3R 4190933 5' + INE-1 68 2 54.46 CCAGTTAAAATGGAATGAAATCTTGTTGCCCTAAAAAGCCCTATAATTTAGCATTGAAAGGCAGAAAATACAATTTACTTTTTATTGTGCAAACAATTTTT:1 - 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roo 404 1 74.26 ACAACAATAAAAAGCTGCTAAATTTGCACACCGAAGACAATAAAAAAGTACAATAAATAGGTTGTTCCGTTTCGCAGCTGCCGAAGGACATCATCATCCGG:1 - chrX 16724714 5' + BS3 1573 1 59.41 ACACATCCCAGGCATTCTTACACTCCGCACAAATCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACT:1 - chr3L 22324315 5' + jockey 4714 1 67.33 GTATATTCGCACGAACGTGTAACGCGCACGAAATCGGCCACTGTCAACCACCCCTAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr2L 22719576 5' + 1360 22 1 57.43 CCGCTAAGTAGGCAACAGTTTTTATTGCCGACTTCAGTGCTCTCTAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAG:1 - chr3R 15943334 5' + jockey 4671 1 55.45 GTCAGCGGCAACTGAACACCCAGCGTTCGCACAAAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCTATCTGGATCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATG:1 - chr3R 5179874 5' + F-element 4274 1 66.34 AGGACATTTGCACGCAGTAGGGCACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr2L 4189417 5' - 1360 3340 1 77.55 GGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 3694149 5' - roo 9028 1 74.26 ATATCAATAGTAAATAAACAATAAAATAATATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTG:1 + chr3R 19449913 5' - roo 8701 2 70.30 ACCGTCGCCGCGGCCTTTGTTGCATTTTATTTTGACAGATTGTTGACAAATGTCACCGGGGTTCGTATTGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTA:1 - chr3R 19819554 5' - P-element 2723 1 75.25 AGGGGCAGGGAGATTCGTTGGTGAGACAAACACACGCAGAGCAAAAAGATAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr3R 10457267 5' - roo 9045 1 52.48 GCTTGNTGAGAGCGGAAAGTACCGCTAGCAGATGAAAAATCAATTTCGCAATGTTACGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 12546421 5' + P-element 5 2 68.60 AATATTATAATCGGTTGACAGTAAGCGAAATTTGTGTATGATTACCCAACAAATTATTAATTTAAGTAATTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGT:1 + chr3R 6431002 5' - 3S18 6096 2 69.31 TAATGGCAGAACTGCGGATCCGTCCGTCCACTGCAAGCGATCTCGTGAATCCGTCCGCAGTGCACTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGG:1 + chr2L 19074368 5' - Transpac 317 1 69.39 ACCATCCTCTGCACCTATATATAAATAACTATATACGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr2R 19857392 5' + 297 38 2 76.24 GGTTACGTTTCGTTGGGTTTTTATGTTTGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chrX 12294706 5' - 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chr2L 12739204 5' + Doc 4538 1 70.30 ATTAAATACTGTAAGCAAAAGGAAAATTAAATCATAAGTACTATTCACACATGAACACGAATATATTTGAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 9369938 5' + roo 8687 2 58.82 AAGGAATGTTGTTGGCCTTTGTGGCTGCGTTTCTTCCCTAACAAAGTCATGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCCATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3L 4386535 5' + jockey 33 1 55.00 TATATGTGTACTTTTGTTTGCGGTTTTTGGGTCAACAAACTTGTGTCTGTCTCTAGAATCTGTCTGCTGCATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGA:1 + chr2L 18750543 5' - INE-1 154 1 73.27 TACGGCAAATAAGCAAAGGACATTCTTATAAAGTACTAATTTAAGTTAATGTCCTTTTGGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAAT:1 + chr2L 17841025 5' + Juan 4045 1 60.40 ACATATCGTACATCAATGCTTTGCCCATAAGCACATTTCGTGTTTGTCTCAACGTTTCTCTATTTTCTGACATTTTTTCATACTTTTACTCACTAAACTTA:1 + chr3L 14293520 5' - Tc1 1565 1 76.24 TTAAAGATATGTTGCTAAGTATGCCAAGCAATTTTTTGAGATCTAATATTTAAAAAATTGTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr3R 4986371 5' - roo 393 1 68.32 ATAATAGAAAAGTAAATGCATAACTATACACTTCATAAAACCAAAATCTATCGTACTGCGCACTTTTGTTTAATGTATTCCCTTTTACCCTTCATTTCTTA:1 + chr2R 16365654 5' + hobo 2641 1 75.25 TATATAAAATAAAGTATTAAAGAAAGTATTAAAAGTAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 + chr2L 18953043 5' - 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roo 9045 1 52.48 GAATGCACAATAAACGTGGTCAGGGACGCTCGTTTGGCTGCCACTACGTAGAGGATCCAGCGTGTGGAGTACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 + chrX 8031314 5' - roo 403 1 46.53 ATTTAATGGAAAACTACCAACGGCAGTACACTTATATATTCACTTTTTCATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr3L 9772286 5' + 297 18 2 60.00 GTCGCGTGTCTGTGGGGGTGTGTTTGGGTGTGAGTAAAGTAAAATACGTAAGTGGCGCAGCCGGTAGGATAATACATTGTTGATGCGATAGTAACCCTATT:1 - chr2L 12242981 5' + rover 394 1 63.37 CCTATTAAAAAATCGAATATTTCTCGTAAGAGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCTAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTA:1 - chr2R 5424273 5' + 1360 3353 1 75.79 ACAGAATTATCGATAGTCCCGCAGCTCCAGTGGCTTAGTGCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 + chr3R 18906597 5' + P-element 35 1 44.55 ACCCACTGCCACCGACACAGCCAAAGGCGAATCCGAACCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCCTCGTTCCCACGTTCAAAGCTCGGACTCGCAATCC:1 - chr2R 6928691 5' + Idefix 257 2 63.37 TTTTTACACACATTGCAGTATGTATTTTCTTTTTTTTGGAGAGAGCCTAGTTGATTTCATTTAAAGATGAAGCAACAAGTGATAAATTGTTAAATTTTTTA:1 - chr3L 16988281 5' - NOF 4123 2 65.35 TATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3R 10445201 5' - 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roo 9034 1 79.01 CTTTAACTTAGATTTTCCTCTTATTTGATTGTTATTTTAGAGGGCGTAGCAGACGCCTACGTACTAAAACCATCCTCATAGCCATTTAATTATAACCATTA:1 + chr3R 20518637 5' - R2-element 3427 1 54.46 TTATGATGATTACAAGAAAAGCTATGATGGAAAAACTATCTGAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAG:1 + chrX 4154882 5' + blood 1 2 78.22 TTTTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGAAGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTT:1 + chrX 6997161 5' + P-element 23 1 56.44 CAAGTCAGATTTAGGTAAATTGGTTTTTCCCGAGTAACCACAAAGCCTAGTTACCACTCAAATGGTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:1 - chr3L 11654624 5' - pogo 2091 1 65.35 CTCCCACTCCAATACTTATTATTTATTATTCTATCAAGCGTTACACTGTCAGCACCAGCACATGAAATCTTTTAAGTCTTCTGACGTTGTTATTATTATTT:1 - chr2L 8466958 5' - G4 3662 1 58.42 ATGGTTATCCACCAAATCCTAAGGCTTAAATTGAAATAGTCCAATAAACTAATTGTTTATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3R 12767004 5' + 412 7071 2 61.39 GTTGTGCTGCTCTCTGTGGTTGAACTTTCAGGGGTGACGCCGGATGCATGGCAATTAGGTAATTGGGTTTTTGTTTTCCTTTTCCTATTTTTTTTTT:1 + chr3L 21743777 5' - 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Tc1 100 1 76.24 GCTATGTTTGTTGAGAAAGATAAGAAAGTTTCGCAAATAACTCTACTACCACAGCCACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTG:1 + chr3L 19295975 5' - R1A1-element 4963 1 53.47 TCACTTTTAATTTTGTTCTCCAATTGTCACATACAATAAATGAAAACAAATAAAGACACTTTACTAAAATATTATGATTCCTTACCAAACCGTATGTTCGG:1 - chr3R 1529427 5' + Tc3 1386 1 68.32 CGTTGAAGTTCAGACAAGCACTTGGACTGCCGTTAATGAACATCAAAATGTGGCACTAATCTTAAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3R 7522283 5' + blood 7025 2 65.35 TCGGGCCACAAAACAAACAAATTAAGGGAAAAAAAATTTTGGAAAAAAAAA:1 - chr3R 17315309 5' + HMS-Beagle2 396 1 47.06 TCAGCCTTTTGAATATGTTTCATATATTTCTGTGATGCCTTAATTTCTTCTCATGGTCGGATACCTTAATGCAATGACTAAATTAAGATATAATAACATTG:1 + chr3R 16626752 5' + I-element 5257 1 77.23 AATGCTTAACAGTAAAAATCAACTAAATGCTTCGCTTAATACATTTTATTTCAATGGAATCGAATAACTTTAACCTTCTAGCTTCTATAGTTACTGAGATC:1 - chr2R 5860468 5' - INE-1 150 1 76.24 AAATAAAGTATGTAAACTTAATAAAGCCATTTATGCAAGATGCCGGTTTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTA:1 - chr2R 1375217 5' + 297 323 2 53.47 ACTAACTAGCTGCCTGTCCTTGGCCAGTTAGCATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTT:1 - 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chr2R 5485129 5' - 1360 3352 1 63.37 CAAGTGGGATTATGTTATTACTTGGCCTTGGTCCGCATGCTTCCCTAAATCTCTATTATGTACATGCCACCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3L 17122390 5' - roo 9063 1 71.29 AAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAA:1 + chr3R 10445193 5' - roo 9040 1 56.44 CAAACAAACATGTGCGCAAGTCAACGTCGTAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chrX 12546484 5' + P-element 47 1 32.67 ATTGTTAATCAAGCGCAGCTTTTACAAGAGTTGGCGCTAGAAAGCAGTCAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCA:1 - chr3R 1868221 5' + G-element 32 1 52.00 CTACCCTTCAGGCCACATTTGGCCCACCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3L 10811191 5' - P-element 2841 1 32.29 TGGGTGGCAGTTGGTCTGAAATGGGTGGTCTGAAGTGGGTCGGAGTGGGATGGGTGCTCAGTGGGTTGGGTGCCTTCTTGAGTGGATCACTCATGGGTACT:1 - chr3L 9330740 5' - Quasimodo 261 2 63.37 GAAATCACAAAAGAAAAAAAGTTTACTCAATATAAGTGCCGCGCATCAGAAAAATAAAAAGAGGCGTCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACACGAAATT:1 - chr3L 23010096 5' - invader1 27 2 64.36 AATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3R 11516611 5' + roo 8707 2 72.00 AGTTTATTCAATAGGGCCATAATAAGACACGATGTCCGCAATCTGTTAATAAACACATCTGGCCAAATGTAAAATCCCAAATTGAGAAGACTTTACTCTTT:1 + chr3L 17011647 5' - roo 9060 1 65.35 CCACGGGCTAATTAGAACATTTGAGGGTACATCTGACATAAAGATCGAGCAGTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATT:1 + chr3R 11166851 5' - Tabor 6985 2 66.34 CGAAAAGAAAGAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAAT:1 + chrX 14713191 5' - flea 236 2 64.36 TTTGAAATGAAATATTGCCTTCCAATTAAAACCTCAACTTGGTAGCAAACATCCAACCAAAATTATCTTAACAGGTACCTTTTTTCAATTTATAAAATTTT:1 + chr3L 22635170 5' + Tc1-2 1406 1 73.27 CTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chr2L 17957290 5' - opus 7460 2 72.28 GAAAACGACAGGATAACTGCATGCCATCCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3L 10035645 5' + jockey 56 1 72.28 GCCAAGTCCCGAAAAGAAAACTGTCTCGTAATCGCAGGCAATAAAAAAACAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCAAAAAAATGTTTAAGACCGTT:1 - chr2L 17984541 5' + mdg3 5117 1 55.45 GGTGGGATCTCGGGAACTACGAAAAGCCAATTCAAATGCCCTTAATTTTGGTTTTATTATTTTTCTCTCCCGCATTCTGGCAAGCTGAGTAACGGGTATCT:2 + chr3R 20343280 5' + INE-1 542 1 87.13 TGTTGGTTGTACTTCAGTTGATTTCCTTTTAGTTATGCGAACAACGCAAAAAATAAAACACAAAGACGAAGAATGCAAAAGACTTTGTATATTTGTTTAAA:1 + chr3R 24683272 5' - Cr1a 168 1 61.39 TGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chr3R 19076160 5' - roo 9029 1 76.84 CGCAGTAAAACGAATAGATACTCTAATTGCAAACAAAGAGAATGGTGTTATGCAGCCCTCTTGTGCACACACAGTGTATGCTAATGCATTGTAAATTTGAC:1 - chrX 1018159 5' + 1360 194 1 76.24 CTAAAAGTGCGGCGAATTCGCTGTGATGCCGCGAGAGAGGGAGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATA:1 + chr2R 13038890 5' + P-element 34 1 45.54 ATAATTTTTCATTAGGCCAAGAACAACAAAATCGAACAATATTTGCTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chr2L 2909539 5' - pogo 2071 1 62.38 TATGGAAACTCTTCTCAACATATTTAGCTTGACCTCAGCATTTAAGCTATCCTTGCCAATTTTTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGA:1 + chr2L 13950941 5' + opus 7346 2 66.34 TGTTGGAATAGGGAGCAAATAAGCTATAAATGTATTCGGCATCTGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3R 12894103 5' + blood 7045 2 57.43 CCGCTTTAATTATTTTGTACAATCGAGTACACGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chrX 6997149 5' + P-element 9 2 69.70 TTTTATAATTGCATTATCTCGACGTTAACAAATTACATTTTAGTATAATTTCCATATAAATTATCGTTACTTTGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCG:1 + chrX 16798178 5' + diver 5894 2 73.27 AAATCGTATGTAGCGACTTTAAAGTGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAA:1 - chr3L 2292128 5' - Max-element 8482 2 75.25 GCTGCGAAATTTATGTTTAGTGCAAAGTGCCTACAGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGC:1 + chrX 4775753 5' - 412 7126 2 65.35 AAAAAATATAATTTGTATAAACCCTCATACATAAATACTATGAGCTAAATGTTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2R 13121998 5' + opus 7023 2 62.38 AAATGCACACAAAGAGCGAATCCTAGATTATCTAAATATATATACATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAA:1 + chr3R 20845047 5' + 17.6 6956 1 65.66 AGTTTNCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATAAGTAAATAATTACAGTTTATTGATTTTTATT:1 - chr2R 6984416 5' - HMS-Beagle2 7185 2 68.32 GCCGGCAAATAAACATCGCAATCGAATTCAATTCCAATAGCCCGCTGGCAGCCGCCGGTTCGAGCGGCCAACCCTTTTCATAATTGGCGCCCAACCAGTGG:1 + chr2L 6195853 5' + gypsy2 348 1 70.30 GCTATTATTATTTCCTATATGCTATAACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAG:1 - chr3L 21319289 5' + jockey 4725 1 74.26 AAAACAAAACAGAAAACAGCCGATGCGCCGGTTCATGATGAGATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr3R 28326711 5' + P-element 47 1 36.63 CAGTTTTTAAAGCTTTGCCAGTTTAAATGCGATTTATTTTTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAAT:1 - chr3R 19144450 5' - Juan 4172 1 68.32 CTGTATATGGGAATCATAATTCTACAAGAGCTTACGTTGTGCGTCCAGGTTACTTGACATTAGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTA:1 - chr3R 25440248 5' + pogo 11 1 69.31 CCTCCNACCGCATTGCATGGCACCTCCCCTGCGAGCACTTGGCATAATAATGAATTTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGA:1 - chr3R 25407561 5' + jockey 4966 1 58.42 TAGAGTCGACCAAGTCCATCGAATTGAATCGCTGCCATCAAATTCACAATGTGCTATAAATCTACATGCTTGACTACCAACAAAAAAGAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 13688671 5' + G2 3076 2 63.37 GGATGACGACCTGATGAACTTCTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATCCGGCCTCTCCTGACATTCCTGCGTCGTCGTTATATTCATATAT:1 - chr2R 9047980 5' - Bica 4897 1 76.92 AGTTAGGTAGCAATTACAATTTTAGAATGTTTGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAG:1 + chr2L 5946959 5' - 1360 129 1 72.28 GGTACAACCATACTGATTACATTTGACTAACATGATTTTTGTTTTAGTACGTAGGCAGAATTGCGCTAGGAATCTTGCATGCCACCTACGGACGGTATGTG:1 + chr3L 24166523 5' + Rt1b 5089 1 67.33 AACTATCAATTGCTAAATATTCTCTGATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATT:1 - chr3L 9943789 5' - Ivk 324 1 77.23 ATTAAATGTTAAAAGAGAAAATAACAGAACGAATTGGTTTAACCTTACTAATTGTAGTTAATTAGAATTACAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr3R 12877794 5' - mdg1 394 2 51.49 TTAAGTCACTCTCGTCATAAAACTGCACCTTGTCCCCTTCAGCAACGCTCTCCAAAACACCATTTGCGGAGTTTAAAATTGGCTGTGAAGTCGGCAATGCC:1 - chr3L 24150326 5' - baggins 5147 1 80.20 ATAAAAAAAAATTGCAGATGTAATTAGTAAACACTACCCCAAATCAAATAGAAAATCAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCCGCAT:1 - chr2R 12336664 5' + pogo 18 1 61.39 TCGGTACTTTAGGTGTCTTAAGACTTGCATTATATCTGAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3L 5975599 5' + hobo 39 1 62.38 TCATTAATATTTGTATGGGAATGTTGTGGCTGGGTGTTGAAAGCAATAACAATAAATTGCTTATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 + chr2L 8620252 5' + Juan 4046 1 61.39 AAAAATTATTTGTAAAAACATCAAATTTATTATCTCTATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chrX 18012687 5' - roo 9033 1 66.00 GTAAAAGTATTACGTAATTAACTAGAAAGTGAAATAGACCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTAT:1 - chrX 7144121 5' - roo 8888 2 70.30 ACATAAAATTACATATGTATTGTGTTATGTTATGTTGCCTACATTTTGGTGCTCACAAAAAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chrX 9248376 5' - pogo 2088 1 66.34 AAGGCGGTAAATGTATTTACGGGATTAAAGTAAAATATAATTTTTATCCCTAAGCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3R 25918974 5' - roo 388 2 55.45 ATTGATCTGATTATGATCTAATTAGGAGCATTAGCCGAGTTCAGTATTTAAATTTTTAGATGTTCATTTCTGTATTAATTTTGGTGACTAATAATTAATAA:1 + chr2R 19528293 5' - Gypsy12A_LTR 1824 1 60.40 AATGGGGGCACATTCTCGGTTCGCATTAGTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTCAAT:1 - chrX 12538505 5' + roo 48 2 72.28 TAATAACCATCAAAAAGCACCTTGAATGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTT:1 + chr2R 18057427 5' - F-element 4444 1 73.27 AATATNCTGTGAACGACACGTGACCAACTGAGGTTCACTGGGCTGTATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 13194748 5' + 297 6603 2 56.44 ATTGAATTAGAACAATGTTTTTTTTCAACAATAAGGCAAAATAGAGCAAAATGCAGAACACCGGAGATTGTTTGCCTGCACCGCCCACTTAGCCTGACTCT:1 + chr3L 7828735 5' + Chimpo 260 1 57.43 ATATGTCACGCTCACTCTCCCTCTCTGTGTCTCTCTGGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 - chr2L 14490446 5' - P-element 2847 1 39.60 AATTGTATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACAC:1 - chr3L 21841357 5' + P-element 37 1 44.55 GAATCTTCAATGAGTCTCAATTTCATTGGGACTTTCACATTGCCCAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACAAAATCTGTACAACTGATTTTT:1 + chr3R 13986347 5' - flea 409 1 56.44 AAAATGGTATCATAGTTTCATTACCGATCATTCCTGGAAACTTTCCAAATAGTAAAGATAACTCGGTGTTGTCACAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAG:1 - chr2L 1156836 5' - 412 7545 2 76.24 GGCAGGTGTGGACGCGTTTAATGACCCTCTGCATCCGATCGATTTCCTGCCTGCAATTAAATACCTCACGAGATTAGAAACGAGTGCCGATCAGCAATTCA:1 + chr3R 9653728 5' + BS 441 1 66.34 CCCATTGTAATTATCAAGTTTAAAGTGTGCCGCACATTTTGGCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAATGGCAGGATACAACAAGTCCTCTTTAAAAA:1 - chr3R 24582750 5' + Q-element 431 2 58.42 GAAGTTGAAAGGGCACATTCATTACACATACATTATACATATTTGTAATAAAGTAATTAAAGTGTAATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAG:1 + chr2R 1859920 5' - accord2 51 2 63.37 TATTCCGGGAACTACAGCAGTTGTAGGTAAGCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr3L 8974094 5' + P-element 43 1 38.61 ATGATAACGATTATGCAATTGTGCATTCGCGTCCAGGCTCTAGACATTCCACGTTACACGGACAGCGCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCG:1 - chr3R 10171703 5' - Ivk 22 1 67.33 GTGTGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTG:1 + chrX 23291023 5' - R1A1-element 5303 1 56.70 GGGCCAGCGACTTCTTTTCTTTAGCCTTGTGGAATTTTTTATACTTTTCCTGATACGGGCTGATGTGATGGGAGTCAATAATGACTTTATTGTGTACTTAT:1 + chr3L 19786373 5' - accord 7297 2 61.39 ATTTCTACTTTTGTGTTGCTAAGCTTGTATTGTATAGCTTATTTTTAATTACATATCATTTAAGAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - chr3R 19224932 5' + hobo 14 1 65.35 GTGAACATTTCTAATTTATTTTCCATAAAAATTAGGCATTTAGACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:2 - chrX 20437691 5' - roo 9038 1 62.38 AAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 4068104 5' + jockey 60 1 77.23 GATATATTTTTTTAACGACAAAATAGCGCCATCTTCGAGTATAATTTTTTTTCCTGTGCAGCAATAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAAC:1 + chr3L 20504019 5' + accord 7367 2 48.51 TCTAACAGGGGGAAGGTTGAGTTTTCCAGGGGTTGAGGGGTGGTGTCCCCTGTGTTTCGTGGAGTATAACTAATTTTCTGACAATTTCTGACAAAAGTTAA:1 + chr2L 7867148 5' + transib2 427 1 58.42 AATAATGGTTACTAACTACATTTTAAGCATTAAATTGATGATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2L 14260733 5' + 297 6609 2 58.42 TGCCCTGCCGATTGGACACCATGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCT:1 + chr3L 21189774 5' - jockey 4682 1 79.21 ACTTTTGTGGAGCTTGTAATTGAATATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAA:1 - chrX 9490020 5' - transib2 467 1 76.24 CCGTGAGATGCCTGCAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCG:1 - chr2R 19386727 5' - 1360 120 1 50.52 GCAATTATTAAACGATTTGATGAATATGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 2762138 5' - roo 9022 2 75.25 AACTGTGAAATTAGTTTGTGTTTTTATGATTATTCCTTAATGACATTAGGATAATTAAAACACTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCA:1 + chr3L 2292062 5' + Max-element 15 2 54.46 CACATGCAAATCGAGACGATTTTCGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTT:1 - chrX 1543393 5' - hobo 2887 1 80.20 CGACACGAGCAGTCAGCGAGAAGAATTTTGAAAAAATTACAGAGAGGGAAGCATTGCCAGTTGCTTTTATAGTACGGGCCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr2R 24965034 5' + P-element 1 2 79.21 GTGGCTGTTGCAAAGTTTTGCATTATTCACTTAAGCGTTTTCTTTGACGCTTTCTTTTTAAACCTGACGCGGCCACAGCTTCATGAATTTCATTTGTTTTT:1 - chr2L 399494 5' - pogo 480 1 63.37 ATTACGACATGCTAAAGTGCTTGTCGTGCTTTTGTCTATGCGGGCGTTTTTTGCTTTACCCCTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATAT:1 + chr2L 1388361 5' - I-element 5088 1 64.36 CCTTTTGGCGTGAACATCCTCTCCTAGCGTGTTGACTGCCTCTAGCTGCACTTGCCCCGTCCCTTAATAGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGC:1 + chr3L 24568175 5' - gypsy8 312 1 79.21 AATTAGAGCATGGCCTGAGATAACCGAGTGACACCTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCC:1 - chr3R 7522403 5' - blood 378 1 77.23 AATGAAACACATTTTATATAGAATTGACCATATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCAC:1 - chr2L 21091417 5' - flea 345 1 69.00 CTAAAATTAAAAACCAAAATTTAATCGAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2R 13145011 5' + roo 8714 2 76.24 TAATATATTTTACCTGTAAATCTATACATCAAGTTACTTACTTTTGACATATGTCAAACAAATATACAATATTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCAT:1 + chr2L 13250336 5' + pogo 2 1 73.27 TCCTGTGTGCGAGCATAACCTCGGCTAACGCAAATGCAGCGATGAAGATGCAAACTTCAACTTTAAATATCAGAAATATGTATATACATATATACATATTT:1 + chr2L 9217736 5' - G3 4505 1 62.38 CAAGTTAAGAAGTTTGCTGGCGAAAGTTTGTTTGTGTGTGATGAAAGCCAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCA:1 - chr2L 2900383 5' + jockey 4985 1 56.44 AACGACAATAAATCTTATGGTGTAGGGTATAAGCACACTACGCATTAAAATGCTCCATACGTCGTAATTGTCGTCGCCTAATTTTTCTATTTGAATTGACA:1 - chr3L 6486603 5' - Copia1_DM 336 1 73.27 ATTTGTAATTATTGATGCTACTTCAAAACAGATGAGCAAAAATGTATAAGTATAATCCTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATAC:1 - chr2R 13256231 5' + F-element 4636 1 57.43 AATTTATAACCATTGTTTTGCACACCTTACTACTTCAACTACTATTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTT:1 - chr3L 7989806 5' - mdg3 213 2 59.41 TCATCTCAACATAACAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 19215887 5' - roo 401 1 73.27 CCTCTTCGGAATCTTCGATGGGAAGGGCGCTTCGCTGGTGCTCCACTAGGACGGCCTGACTCGGTTCTTTTCTATCATTCTACCCGCCTAAAAAGTTAGAA:1 + chrX 19597120 5' - Gypsy12A_LTR 489 1 66.34 TTCGAAAAAACTGCTTTCTGCACCCACAAACCTACCAAAACTATTACTTTTTTTCGTTTTATTATTTTTTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 + chr2R 5788286 5' - I-element 5334 1 52.48 CTTTATGAATAAGCCAATTCTGTCATGGGTGTCCAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr3R 7849663 5' + 1360 43 1 75.25 CATCAATTTGATGGCTGCATTTATCATTTTCGGTCGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACT:1 - chr2L 8591917 5' + pogo 2099 1 65.35 TTCGTGCTTCGCCTGAATAAGAGCATTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGAC:1 - chr2L 16082654 5' + Stalker4 54 4 76.24 GAAATATTTCGGAAAATGGGAAACAAATCAACATAATTCGGTTAGTTTCCCGTGGTCAGAAGCTAATTTGTTTCCTTGTTGGCAGCTTCGGGGAGTCCGGG:1 - chr2L 9322594 5' - Gypsy6A_LTR 320 1 83.17 AAACCTTAAAGAGGTTTTATGAACTGATTATGAGTTTTAGTTATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCA:1 - chr2R 8245773 5' - mdg1 387 2 58.42 CATAGCCACTTTATGTGTAGCTTTTCCATTCGGTTGTAGTGTTTTATTTGGCCGATTTTTATGCGTTTTTAATGTGTAGCACATGGCACTACCCTTCACCG:1 + chr3L 18127068 5' + BS 4778 1 81.19 GCATAATGTTTGCAATCCATTTTTCGTCTACAACAATTTTCCAAAAATGACGACTGAATCTCAACCATCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTC:1 + chr2R 11426613 5' - INE-1 141 1 70.30 TATATTACATTACTTTAACATTTTCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAA:2 + chr3R 9479432 5' - mdg1 400 2 51.49 ACGATAGAGTTAATAGACATATATACAAGAATATATAAAAATGAAATTTGAAGTTGTAAGTAGGGAAACTAAGTAATACAAATTTTTCCATGTCCCTTTTC:1 + chrX 21626893 5' + HB 56 1 60.40 AGTTTTCTTTTATTGTTTATTGCCTCAAGTGCCCCCATAAGTAGGCAATACTTTTTGCCGCCTTTCTTTTCTCCATTCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chrX 18193695 5' + hopper 2 2 78.22 CGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTA:1 + chr3L 12452166 5' + 412 7108 2 79.21 GAGACGGAAAAGTTTTTTTTGGTTGGCCATCGAAACGTGAAAAAAATCAAATTATCATCGAGGCGCTGGATTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr2L 22208045 5' + FB 27 1 65.35 TGCCTTTATCTCATTTAGTGGCCATTGCTCAAATATTTACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAA:1 - chr2L 19682545 5' + roo 178 2 71.29 AGGACAGAGGGTTCATAAACTAACATGCTATCAAAGGCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr3R 97132 5' - 1360 3340 1 96.04 CGTAGATGCACCGAAACGAGTGACAAGGCTAAGTGCAAAGGTCAGTGCAAAAGAGCCAGACGAGTTGAGAAAATCACTTACCCGGGACGGTCGTTTGGTGC:1 - chr3L 9926129 5' - Doc 464 1 76.24 GACCCACTTAAAAAGCGACCCATATCCTTTGCCAGACGAACGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGT:1 - chr3R 25702252 5' - Tirant 365 2 60.40 AGAAAGAAAGATTTAATTGCAATAAATTCCATATATATACACTTCGTACATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTA:1 + chrX 14713196 5' - flea 4990 2 60.40 TGACCATGAATATAATCCCATTCACTAACGCATTCATTCAATTATTCAATCAGTCCAATATAGTATTTTAGTTTTGTAAAAAAAAATAAACAAAATACAAA:2 - chrX 15902681 5' + transib4 2538 1 67.33 GCGCGTTTGCGAAAATGCGAATACATTTCGCCAGCTAAGAACATTTACGGATGTCGCGGTAACCTAAACACAAAAAAAATAAATAAATATAAATAAAATAA:1 - chr3L 17205859 5' + diver2 448 1 60.40 AATCGCTGCTGGTGGTGGCATGACGCAGTTCCCATCCATACTGGCAATAAATATATATTCATCTATGGCTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 19076119 5' - roo 401 1 68.32 AGGACCTCCGTACACAATGTTTCCGGGGGGTTCAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 24153120 5' - P-element 2844 1 26.73 GTACANGAAAAAAAAGAGTTAACAGTGCCAGTCACCTTTTCCATTTCTAAAAAAAACGAGAGAAGTAAATTCTTTATTTTTTCGTAAAA:1 + chr3R 14694692 5' + pogo 2015 1 78.65 TTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCC:1 - chr2R 12185413 5' + accord 21 2 54.46 ATTGTGTTATAATATCAAGTATCTGTGATAAAATGCATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCT:1 - chr2R 11478370 5' - G2 2901 1 62.89 AAAAGGAAAATCTCGAGGTTAGCGGAGGCAGCGGAGCAATGAGAAAAGCAACAAACAAAAAATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 16686523 5' - pogo 2089 1 60.40 GTTGACATATTGCATTGAGAAGGAGTGTTGAAAATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTT:2 + chr3L 26544687 5' - roo 9032 1 67.33 GGAAAGTTATTCGCAACAACGGAATGCGAGCTGGGGGGCGCAGTCTAGACATCGCCTGGAAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 1828755 5' + 412 7069 2 59.41 AAAACAAAAAGTTCTCCCAAATGCATAGTCGGCTTTGCGGATTTAAAGTGCATAGTTTAATCATAAAAGACTCTTACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTA:1 - chr3L 6129896 5' + jockey 4678 1 75.25 AAATGTCTGTTATAAATGCACACACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 14525236 5' + hobo 9 1 72.28 CGCCTAAAAGCACACTTGCGATTTCAGCAATTTGCTTGGGTGCGAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAA:1 + chrX 868706 5' + jockey 4939 1 56.44 CATTGAGTTGCATAATGAAAAATAATTACTATATTATCGATAATGTTACATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr2L 13739990 5' + 412 7080 2 55.45 TCTTTCGGTTCAGGATTCATATGGCATAGTGGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 - chr2L 14260797 5' - 297 6933 2 74.26 TGGGTTGCTCGTCAGTCCTTTCTTCGCTTTCAACTAATTTTTCTTCATAAAGTACAGAGTTAATATACTCGAAGTGGGGCTCCGCTGCCCAGCTGCCACGC:1 + chr2R 20622305 5' + X-element 208 1 64.36 GAGAAATACAGTTTAGCTCAGTCTTTAAACGAATGTTATTTTGCTTTCCCAATGTATCTTAACATATATAGTTTGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 - chr2R 20838699 5' + 1360 3 2 76.24 CGTTGCTTTACTCGTTGGAATAGAAACGATAAAAAAGGGAAAATCTAAACAAATTTGATTAGATTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 + chrX 2884808 5' + copia 4884 2 65.35 AGCGGAGCAATGAGAAAAGCAACAAACAAAAAATACATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 + chr2L 16686546 5' - pogo 2060 1 69.31 TCAATGGCTGCAGGGCAGACACACACACACACACATTATGTCCATTATTGGAAGTTGGAGAAAAAAGAACATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAA:1 - chr2R 17383515 5' + mdg1 8 2 47.52 AAGGGGGGCAAAATTGTATCGGTCTGCCGATAGTTCCCGGCCGTTAGCCAAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACC:1 - chr3L 21841368 5' + P-element 26 1 55.45 TAAATCAATCACGGAATGGCGGCAATAATATCAAATGCAATCTTAACAAGTAAGGCAGTTTCCGAGAGCAACGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGG:1 + chrX 20156722 5' - HMS-Beagle2 26 2 76.77 TAAATAATTGTTTTGTATTTTAATTTAAAAAGGTTAAAGAGGATTGGAAATACGTTGCTATGGTATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGT:1 + chr3L 23283701 5' - 1360 186 1 63.37 TGCACNCACATGGACACAGACACAGGAGCTGGAAAAGTTTGAGACAGGCTCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 14525252 5' + hobo 25 1 55.45 GAGCTTGCCACTCCCCTCTAAAAAAGTACCCCTTCTTACCGGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 + chr3L 5964250 5' + BS 34 1 59.41 AAAAAGTTACGGTCCCCAAACACAGAATATGTGGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 10321039 5' + roo 45 2 70.30 ACTGGTAACGAATGTGATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTC:1 + chr3R 1418271 5' + BS3 208 1 46.53 GGGGAGTGCGCCCAGCTGCTGAACCCCCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTA:1 - chr2L 11686061 5' - hopper 1368 1 73.27 AGCCGAGCACTTCAATCATCCATGAAATCAAAGCAATTTCTATCCGCGGCTCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 + chr3R 5977740 5' + copia 27 2 52.48 AATGCATTTTTAATGCTTTGTTTTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTACACAGTCTTCGGGTGGAGACGGGTTTCTTT:1 + chr3L 21735393 5' + Doc 23 1 51.76 GGATTAGTGGGATAATACTCTATAGTCAAAAACAAAAATATATAACAAATTTGGGAATTTTGAGAGATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:2 - chr3R 25510421 5' - opus 489 2 63.37 CGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGT:1 + chr2L 23372625 5' + 1360 6 2 54.46 ACAAGTCACATGTTGACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3L 12452149 5' + 412 7091 2 62.38 AGTGCGGAAGACTCGATTGAAGTGGGGAACCGAAGCGGCCAAGTTGGCGGCGCGGGAAAGAGCATGGAAGTGGGGAGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTT:1 + chrX 10738861 5' + blood 497 1 77.78 AAGCCAAGACTGCCAAGGCTTCTGGTTATTCAAACGGAATTTCTTTGCACTAATTGCATATGACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAAACAGATGTTT:1 - chr3L 2612805 5' + G2 2719 1 64.36 CCATAAGAAATAAATGTGTTTTCAGATTGTATAGACTTCAGACTTCTCCCTTCAAGCTCACGCCACCGAATGCCGCGTCTCGCGTATTCCTCTTTTCTTAT:1 - chr3L 20895025 5' - invader3 5360 2 60.40 TATCTGAAATATGGGTCAAAAACTACAGGTTTCTGGTTTCTCGCAGCGAAATATGTGTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCTTT:1 - chr3L 4048528 5' + 3S18 5788 2 57.43 ATGCGGCTGTGGGAAGACATCGTTGTCGTCTGCAGCAACATGCAGTAACAAGTACAACAATAACAGGAAAGGTACAGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2R 9277485 5' + roo 3 2 77.23 ACCGTACCGAATCGATAAAGAGTTTAATGTAAAATAACTATCTTAAATATTAGTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTT:1 - chr3L 25271247 5' - Cr1a 4259 1 76.24 GAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3L 3671307 5' - roo 9020 2 76.24 AGGGTTCCGAAGGAATTTTCCAAGGCCTATTGAGCAGAGGAATGCCAGAGAACAGGAACGAGGAAATAAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTAG:1 - chr3L 19452008 5' - Cr1a 4307 1 54.46 TTTTGATTTCTTCGTTTGCTTCCGCTTCTGAGCCATTCAATCAATCTTTCTCAGCAATGTGATCTCATCGTATCGATTCTTATTTATTTATTTAATGATAT:1 - chr3R 25100421 5' - Doc3-element 77 1 66.34 CGAGGNAAATAAAATCAAGCTGAATAACACAGAAGAGTCAATCAATCCACTCGGGGAGAAGTACATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr2L 18028766 5' - flea 244 2 71.29 TAATCGGTTATTTTGTTCACTAAAATTCAATACATGCCAATATATTAGTATAAATGTAGTATCATCGCTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 13202975 5' - roo 397 1 68.32 GTGTTTTACGTAAAAATAAGTTAATCGGTGCCGTAATTCGTTTAAAGGAGCTCTAGTACGCTGTCAAAGAATTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGAT:1 + chr2L 129791 5' - 17.6 147 2 61.39 GTTACNAAAATTAAAAAAGAAAATTAGTGTTTATAAATACAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATT:1 - chr3R 21695484 5' - 3S18 6053 2 71.29 ATTCCGAGATCACAGCGTTCAAACTTGTTTTATACTTTTTAACAAGTCCAGTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr3L 21501140 5' + 1360 24 1 72.28 AAGCCAAACATATCAAATAGACACAATTACGCACACACACACACACACACACACATATACT:1 + chrX 18237384 5' + accord 186 2 75.41 CAGTACAGAGAAAGCAAAGTACTATGAACTATGGTTTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGG:1 + chr3L 9121817 5' + Transpac 4957 2 64.36 TTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAA:1 + chr2R 2552118 5' + HMS-Beagle2 38 2 66.34 TTTTTCCTACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAAAATCATTTCTGGG:1 + chr2R 2552116 5' + HMS-Beagle2 35 2 62.00 GCTAGTGCTTTTGCTAGTACTTGATAGTTCTTTTAGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr3R 7101057 5' + pogo 38 1 70.30 AAAGAGTCAATTATTTGCAAGCCGTTTGTTTGATAATTGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTA:1 + chr3R 15998075 5' + pogo 37 1 68.32 GAAGTCGCTGAACTGTTAGCTTTCGTCTGCGGTCGCTCCATCTCCTTTTCGCGCATAAGCCCTCTCTCTCTCATATACACATATATATATATGCTGCTCTT:1 + chrX 8946655 5' + blood 191 2 51.49 TCGTTCCGGAATTCTAACAAATATTAATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGGATACCAGATTCTTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGAAG:1 + chr2R 328359 5' + INE-1 28 1 78.22 AACAATTGACAATTGCTGGAGTTATATTCAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAA:1 - chrX 5018684 5' - opus 7451 2 76.24 CTACTTTGCCAGTTTGCTACCTCACTTCTTGGCGAGGAGACAACTCCATCGTTGGGACCATAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 3671271 5' - roo 393 1 64.36 CGAGCAAATTTCACAATCAACAAAAGTGGACGACAAAAAAGTCTCCTCCGCTAAAATACAAAAAAAGAAAAAAAAAACT:1 - chr3L 10234336 5' + HMS-Beagle2 489 1 53.16 AAACGGAATGTGTCTCGTGTTGTTTAGTCGCAGCACTGGTATGCCCAGACCCAGATCCTTCGCATCCTTGCTTAAGCCCTCACCCCATCGTCACGTTCCCA:1 + chr3R 16587598 5' + Idefix 7049 2 66.34 AAAGCAGGGGCATAAGAACGCGAATCTTAACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAA:1 + chr3L 20257354 5' - pogo 2058 1 73.20 GGTTTGATAATTGCGATTGTTTTTGTTCGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTG:1 + chr3L 12439236 5' + invader4 34 2 58.42 AGAGGTCAGCTTACAATCGAAGCACGGAAAAACACAGAGGGCAGCGGACAGTCAAGAATATCCAAGACCTTTCACACGTCCTCTTGTGCCTAATCCACCA:1 - chr3L 27413175 5' - invader4 2714 1 70.00 CCGGCCATGGGACACACAGCCACTGGCGGCGCTCCATCCGTCTTTTGTTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCTTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCC:1 - chr3R 31619756 5' + 17.6 260 2 52.48 ATATAAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 10445181 5' - roo 9052 2 59.41 TTTTAGGCCCTGCGCAAAGTGGGCACCGATAAGACCGTGCTGATGCTGTGCCTCACCGTGCTGTTATCCTATCTGCCGCTCTTAATGCAATCGATTTTAAC:1 - chr3L 3130432 5' + Cr1a 4254 1 76.24 GGATAACGAGAATTTGATGGAACGCAGCCGTTTTTATATTTCCTTGGAGAAAATCGGTGTGTTTACACAGGCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCA:1 + chr3R 22053153 5' + R2-element 3565 1 76.24 TTTTATTTACGACTAGGCAATGAAAAACACTTTTCATTTAGCAATATTGTTTTGCGTTATTTTTTTAGGTTGTGATGTGTTTAATTTATTATTTTATATAA:2 + chrX 21368148 5' - HeT-A 341 1 52.48 GATATATCGGTTTTTAATGCGATTTGGGGCTTGGCAATTGACCCGCAAAAAAAACCCCTGAAAAGCAAACTTTAAATTTAGAAAAATAAAAATAATATTTA:2 + chrX 6664683 5' + invader6 4386 1 77.23 TTTTAAATGTGATGTTAACATCTTTTGTCTTTACACTGCGTTTCTAGATAGATATGTTGCTTGCAGCGGTTGATTCAGGGTAACTCCTTCTAGCCGGATTG:1 - chr3R 9449713 5' - Helena 854 1 56.44 ATTTTAAGCTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTATAAAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:2 - chr2L 17957298 5' - opus 465 2 64.36 GCAGAGCAGAATTTTTGTTTTCCCAAAACAAACAACAAAGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTATATTAGGGTGGAGTCCGAATGGATTTCACAGG:1 + chr3R 14973211 5' + Circe 7179 1 59.41 ACTGGCGAAGAAGGTATTACATCAATACTCCACTTATTACTGAAATGAGCATGTTTTTTTTTTAAATTTGCAGTCACTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAA:1 + chr2L 9946876 5' - roo 410 1 43.56 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrY 311346 5' + 1360 9 2 61.39 CTGATGTGTGTGCTGCTGACACTTCGATGTAAAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 16038872 5' + F-element 4680 1 60.87 ATGTTCTAAAACTATATAAGATTATTTTTATTTATTTATTTATTTTATAT:1 - chr3L 15211117 5' - Doc3-element 80 1 60.00 CATTCTACAAATATTTGATAGAAAAACTTCGAAATGCAGCATTTTCCACATGCAATTATATACTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chrX 13347268 5' - roo 395 1 65.35 AAAACACAAGAACCCCGCACTTTCCCACTGAAGAGACAGCTGCAAAGAAAAGAAACTCTCCGA:1 + chr3R 30841610 5' + Ivk 4923 1 74.60 AGATTGCCGAGCTTTAGAGCTGAAGAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3L 22920432 5' - 1360 3342 1 75.25 AGTGCCAATTTCGCAGAGTGTGTTGCTAATTTGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATCCCGTTAGTTCTAGATAGCGAT:1 - chr3L 20251917 5' - accord 7149 2 67.33 GAACACCTCGGAGGGCCTCACTGCCAAACTGCGACTCAAACGTAATACGTGCCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATAC:1 + chr2L 13245544 5' + P-element 400 1 53.47 CTGTACAACTCACTTAAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 - chr3R 27080804 5' + HMS-Beagle 6817 2 58.42 TTTGAAGGCGACAACGAATCAAAAAATCCATGAAACAAGAGAAAATGCTTTGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCTTTACACAGCTAGTGTGAATGC:1 + chr3L 5723748 5' - INE-1 534 1 68.32 CATCCAGGCATCTCGCCTGCTCGCCTGCATTTTCCATTTTCCTGGCCCTGGTTTTTCGGTTCTCCCCGCTCCTAATGCTCCTGTAATAAACCAATATATGC:2 + chr3L 2800094 5' - blood 379 1 79.21 AAATACTGTAAGCAAAAGGCAAATTAAATCATAAGTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3R 9369941 5' + roo 8706 2 72.28 GAATGAATTTTAAGAGAAAGCCCAAATGTGCTCAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGC:1 + chr2L 7927211 5' - hobo 2897 1 67.33 AGCGCATGCACGCAGAGCATCCCCAAAAAAATCGCATGTACTCATATATATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 - chr2R 7481107 5' - opus 7475 2 60.40 GACTCCTTCACCGCTCCCACACCCACTCACCCGTGCTCACAATTATTATCCACAAAAGAACTAACGCAGTCGCGTCGTGCTAAGTGGAAAGTGCTAACCA:1 + chr3R 17700098 5' + rover 463 1 61.00 TATACTGGCGATTGGGAACAGGTGCTAATCAAGAAAAAAAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 4068065 5' + jockey 21 1 65.35 TTGTNGGCGAAGGCTGAGCACTAAACATAATATACAGCTGTGTTCAGAAAAATATCAGTGCTTTGGACTTGAGAGTTTAAGATAAAAAA:1 + chr3L 12072562 5' - HB 1594 1 65.17 AATGAAATCTGCAAATTTGAATAGCTTAACAAAAAATATAGTAGCAAGTTAAGAAATAAATTACAAATTAAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTG:1 + chr3R 9657777 5' - BS 4878 1 75.25 CGCATTCCGGAGAATGCGACTGTGGGAACGCTGATACTACAGGCTTATGCCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3R 14639336 5' + roo 8687 2 54.64 ACTAAACTATTTTTGTACCACTATTGAATATTCCTATCCCTTAATTTGATGTTAGGGGTGCTTTGTTAGGTATTGTTTGGGAACGAGACACCCTGTATACG:1 + chr2L 514832 5' + 3S18 7 2 75.25 TCGTTTGAAAATGTATTATCTGTCTAATCTAACCAAAAAAAGAAAAACGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 - chr3L 7806241 5' + pogo 26 1 53.47 TACTAACCTTCTCAAATCCAAACTACAACGTTGATGGCACGCCAATGGAACCGAACAAGACATATTTAACAAAACTAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAAC:1 + chrX 15919592 5' + I-element 5106 1 54.46 ATGATTCTCTTACCAAAAAACAGCTGAGTGCCGAGCGGCAGTCAACAATAAAGCGACGTCAATGCGTCTGACGTCGTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3R 7993837 5' + Doc 8 1 70.30 TAGTAGTGAATACGGCTTCTCCTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAGAACAACTGTCATAATTGTGTTGGTATTGCATGTAAAGTCAAAAACTACGCA:1 + chr4 904810 5' + invader1 253 2 78.22 ATATTTTAGAATGAAATATATGTATATATAAAGACAAAATTATAGAAAATATTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:1 + chrX 23431783 5' + Stalker2 28 2 52.48 GGTTGTTGTTATTCTTCTCGCTGGGGGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chrX 10621671 5' - hobo 2908 1 52.48 CGATTNTGTGCTTAGCCATTAAGATAATAAATAAAAGTTGAAAATACATATTACAGGCTTTTGACGACTACGAGTACTCCAACGCTGTCTTTATAGATATG:1 + chr3L 6056800 5' + Helena 381 1 58.42 GTTTACATATTTATATTTATGTTAATAATGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAACATACGAAGAAGCATACGATCATATCC:1 - chr2R 2248340 5' + invader3 52 2 74.26 ATGCGGGCTAAAGTGGGGAATGTGGCGCCCACAGAAACTCGGCTTATGTGAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGA:1 + chr3L 8924477 5' + Stalker2 7550 2 66.00 ACGTAACTAACAAGGCAACTAGATAATAAGCTATTAAGATACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chrX 21401924 5' + roo 34 2 62.38 TTAACTTCGCTGACGTCGCCAGGGCTGCGTGTGCCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2R 4502511 5' + roo 8683 2 60.40 AATTAGGTGCGCCTTTCTATATACAGTAATGCGAAAGCTTTTCTGCATACTAAAATAATATAGTCATATGATTTCTGCTAGATTCGTTGAAAAGCATGTAA:1 + chr3R 18084338 5' + INE-1 14 1 89.11 GAAAAGTCCTACGGTCAGAATCAATTTCTGGATCCGTAATCGTTTCGCTTTTCGCTATTCGAACTAATAGGGAAAAACTTATCGAAGTGAAAATGAGTTCA:1 - chr2R 18802306 5' + Dm88 304 1 74.26 AATTAAATGTCAAAAATTTCCCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAAC:1 + chr3R 19144384 5' + Juan 6 1 62.38 CTGGCCGGTCTTCAAATAATCAGTGGCTCTTTTGAAGACTGAAAAGAATAAGTTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:1 - chr2L 15893772 5' + Max-element 8261 2 52.48 AATAGGCTGAAATACCAATTGTTGTCTCTTAATATACCCTATGAAAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTCACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chrX 8031425 5' + roo 32 2 59.41 GCCAGCAATAAGAGCTCAACAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAACAGTTAAAAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATA:1 - chr2L 18695370 5' + Gypsy6A_LTR 284 1 45.54 GTTGTGTCTAATTTGTTATTTCTCTAAGACCAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 19642985 5' - roo 9026 1 70.30 AAAAAAAGCGTATTCATACTTCTTGGCCAAAACACTGTTACTTACTTTTTTAGTGCGAGACTGCAGAACGAACACAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 + chr3R 6147223 5' - copia 254 1 84.16 TAGAGTTCTCTTCTTGACTTTTCCACTTTATCCGAATGACAAAAACTTTTTACCACAGGGAAAAGCAGCAAAAACAGCAGCAAAACTAAAAAGTAAATACA:1 + chr3R 15899077 5' + Penelope 247 1 77.23 TTTTTGTCGGTCCACGCCAGTTGCCATTGCAGTTGAGTACCAATCTACCCCAAACCAAACCCCTACCAAAACAATAAATGATTGGGTATAACTTAGCGTCA:1 + chr2L 9323480 5' + Stalker 42 4 60.40 AGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAATAACATAACAGCGCATTTAACATATA:1 - chr3R 25796052 5' - BS 5036 1 71.29 TCGCCTGGTTGGTGGCATTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chrX 8977374 5' + jockey 24 1 61.00 AATTGAGGAATGCTAATTTCGTTCATCAGAGGTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATAC:1 - chr3L 1809864 5' - diver 6065 2 69.31 ATACGGGTGCTGCCAAAAAGCGGATAAATCCGATAAATAGGCAGTGCATTCAATAACTAACCTTGCAATAACTGCAACAAGTGGAATTTTCGACTTTAAA:1 - chr2R 12869254 5' + S-element 36 2 78.00 TGTTCGCCGACAAAAAGTAAAAGAACTATAAAAGTAAAAATGGTGGTGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 833360 5' - P-element 2856 1 48.51 CGGCACCAACTGACAATGTGGCTTATGATTGTAATAGACCGCCATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chrX 495233 5' + 412 35 2 57.43 GAACACCTAAACATTATTTAGTCGCAAATATAAGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAGGC:1 + chr3L 18576720 5' + springer 7179 2 68.32 ATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAATAACATAACAGC:1 - chr3R 25796066 5' - BS 5050 1 59.41 GCATTGTTAAAAGAACAGAGACAAACAAATTTTTCACTTCCGTGAAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCAGTTTATGTGCATGCAATAAACAACA:1 + chrX 11982687 5' - Cr1a 256 1 58.06 GAAAATATACATGTACAAATATGAAGAGAAATTGTTAGTGGAGGAAGCGAAAAAAAAAGATTCCCATTAAAACTGTAAATCATAGGTATTTTTT:1 - chr2L 17058141 5' + HB 1578 1 55.32 TTAATTTAAATAGTTTTGCTATTTTGTATTATTTCTATAATAAAACGGATGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 + chr2R 9375164 5' - HMS-Beagle 221 2 57.43 GTGTTNATCCTGGATATCCTTATCCTTAAGATATCCTCTTTTCAAATTGGTTCAATAATAGTAAGTTAAGTAAATTTATCTATTATCTGTGAGAACATTTT:1 + chr3R 13937965 5' + Juan 44 1 44.55 AGGAAAGTCTTAAAAAAGGTCTTCAAACGTACTAAATATAACAAATAATATATATGATAATATTTATGCTACTCATACATAAAAATAAAATATAATTAATT:1 + chr3R 29325518 5' + NOF 3958 1 67.33 ATCTGCTGAATACTACAACTATCGAGAGCACTGATATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 - chr2R 9454309 5' + opus 7039 4 67.33 ATAACATATCCGAATGTAATTTTATAAAATGAAAGGTTTTCGCTAGTGTTATATAACCAAAGCGTATCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:2 + chr3R 28883351 5' - HMS-Beagle 7030 2 65.35 TGTAAGCAGATAAAGCTGTTGGGGAATTCTTGAGATATACGGAAATGGAATTTATTCACAGGCATCCTGAGTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2L 2437681 5' + roo 8669 2 72.28 ATATTATGCAAATAGTGCCGTGTTGCCACTGACAACGTTCTGTTTCGTGAACTACTTAATAGGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:3 - chr3R 11516708 5' - roo 394 1 41.58 AATCTCAACGATGCTGGCCAAGTGCTGGGAATTGGCAATAGTGCCCTAAATCGCATTCCATACCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCG:1 - chr2R 9791796 5' + accord2 140 2 68.32 ACTTATGTTAAAAGAGTTTTGAAGTCTACAAGGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTTCTAAGTCCACATATAACAATTACCAGAGCAATATGGAATA:1 + chr3L 21854166 5' - Doc 169 1 66.34 GCACGTGCTGACGCTACCCACAAAATCAGCTCGGATCACCGACTAACGGAGCAACTACGTCAACATATCAGGGCAGCCCGACCTACTCCTGCAGCGCATCA:1 + chr2R 18451678 5' + Chimpo 3888 1 68.32 TTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTAAGAGACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGAGCAA:1 + chr3L 23112566 5' + R1A1-element 4889 1 53.47 CTAAAAAACCAAGGGAGTGTGAGTTTCTGAACTCAAACCACAACTTTAAATCCCCAAGAAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 + chr3L 18154128 5' + I-element 22 1 53.47 ATCCTCATATCCCATTATTAATTTGTAGTTTCCACTTTAATGCCTTTCCCTTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTC:1 - chr2R 8227620 5' - micropia 5188 1 56.44 AATTGTTGTGAAATAAATAATTTTAAATAATTTTCACTCTCCATGACTGCGTGTGTCCATGTGTGAGCCAAGTGTACGTGTGGATATGTGTGTGTGTGTGC:1 + chr3L 6620557 5' - accord 7033 2 65.35 TTTGCCCTATCCATTGTGAAAATAGGTAGAGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGA:1 - chr3L 5716934 5' + copia 4913 2 67.33 AGTGCCTCCATTTTGGATAGCGCTTTAGTGACTCACTCGCCACTAATGGTGCCGCCACTTCTTCTCCACAGAGTTCATGCAATGGAAAATAAGTTAAATTT:1 + chr3L 1924202 5' + 297 461 1 79.21 GAACTTAGACGGCACAGCCTACAATTTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTA:1 + chr2L 11047997 5' - Juan 4162 1 78.22 CAATTGAAGCAACGTAGTCAATTATTGTATATAAATATTAATGCAGTGATTATTCATAAGGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chrX 5443872 5' + mdg1 19 2 60.40 TGGCTTAAGTTCTGTATATAGCCAATAATTACTCCAGCGAAAGATTCTCAGTCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr3L 19215787 5' + roo 8689 2 53.47 GCGCCCAAATAAGTCTCAAAATAATAATCGAGTCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 + chr2L 108006 5' - P-element 2845 1 37.62 CGAGTCAAGTGTCTGCCCTTCGGAACATCCCAAATCGGCTGAATCATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:2 - chrX 4488956 5' + 412 13 2 66.34 GAATCTGAATTGGCATTTTTCTACTGATTGAGTGCTATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chrX 4154923 5' + blood 42 2 65.35 GTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chrX 12294749 5' + blood 43 2 69.31 GGCGCGTCTAGACAGGAAGCGATGGTATTGATCAGTTTTAGTGGCACCATATAGTATAATCACGATTGCAGGGAAATAAGCGGTCCACACGGGCAGAGATC:1 + chr3R 11566088 5' - baggins 350 1 69.31 GCAAAGGAATAAATGGAAAAAGGAAATTCCTAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTAC:1 + chr3R 19447899 5' - 1360 205 1 66.29 CATTGGACAGTTCCATGTATTTTTCAGTTTTCAAGTTTTCAGCTTGGCTTCCAGGGATCTCCGTTCACTAGCATTTTTTTCGCACGAGAAGAGTACGTGCT:1 + chrX 21156776 5' - Rt1c 5108 1 56.44 CTACTCCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACAC:1 + chr2R 2552122 5' + HMS-Beagle2 42 2 70.30 CGCACTTGAGAGCTATAGCAGTATAAGGTAGTACATATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAA:1 + chrX 6997180 5' + P-element 42 1 37.62 AAGGAACCTTGTATTTATGTTTCAAAGGAAAGGGAATTAACATATATGTTAGATTTTTTATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCA:1 - chr2L 13250455 5' - pogo 2086 1 63.37 GTTTTCACTGTCTATTGTTGCTGCTGCTGCTGTCGGCTGAGTGGATTCAAGTCCAAGTCGCAAGTCTGGCTGCCCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAA:1 - chr2R 11102781 5' + Juan 174 1 77.23 GCAATCATATTCACATAAATACAAACGTGTGATATGTACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr2L 19075661 5' + Transpac 36 2 63.00 CACAATAAATTCCAAAACTCTATATTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:2 - chrX 8948660 5' + blood 7064 2 77.23 CACATCACCATCATGGAAAGTCCCGCAAACACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGTTTCAACAACATCCCGTTTTTTTGATGACCGCTTGAAGACAAGC:1 + chr3R 17865144 5' + HMS-Beagle2 6844 1 74.26 TCCCAGTTTGTAAGGTTAGATATAAAAGAGGGTGAAAGGCTATAGCCAAGTACCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 - chr3R 19657526 5' + roo 24 2 55.45 TAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTAGTCAACCCTTACGGATAATATTTTTATCTTAATTCCAAAATCAAAATACATTTTTGTTATTTTAAACC:1 - chr3R 19445142 5' - Dm88 4274 1 67.33 TAATTCTGTTGAAATGGGCAAGACTTCCTTTGCACATATTTTTCTTGGCCAGCCTTTGTCTGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chr3R 18551112 5' + Max-element 8251 2 63.64 CCTTTTCTCTCTAGCATAAATTTTGTTGATATCTCAGAATGTCATGACAAATTTATAATTATCAGCTCACTATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:2 - 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invader3 232 2 72.28 ATTATTTAAAAGATTAATTTCACGCGAAGATATTTATTTTTACATTTGTCCCTATAATAACCGGGGTGCCAACATACAAGTAAATAATTACAATTTATTGA:1 - chr2R 2552212 5' - HMS-Beagle2 7193 2 77.23 ATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chr3R 9369989 5' - roo 9029 1 67.33 AAACAGGCGCAGATTTTAAGATCCGTCTCAAATGAAAATAACACTTTTTCCTTTATGTTTATTGGCAACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAA:1 + chrX 14531436 5' - hobo 485 1 65.35 GCTGTAGCATACTCTTGTGTGCCCCCTCGAGTGTGTTTCGTTTTGGTTTAAACTTTTATTGGTTTTCTGGTTGCTGTTTTTTTTTTTGTTTTTCTATTAT:1 - chr3R 18893200 5' - Rt1b 5150 3 74.00 ACATTTTCCCGCACATAGGAAAGGAAAGGGTACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3R 31884269 5' + hobo 43 1 70.30 CCTTGAATGCAGATCCATATTTTCCACCTTTGTGTAGTAACGATATATACGTACTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3R 9370007 5' - roo 9047 1 55.45 ACCAATCTATCAGTTAATAAAAATATGACAGCAGTGAGGTAAGGGATAGTGTGGAAAGGTTGATCCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAG:1 + chr2L 17054627 5' + F-element 310 1 66.34 AACGGTCACCTTGATGGGGGTAGTACCACATATGTATATTTAGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTA:1 - chr3L 22321948 5' + I-element 4963 1 58.42 AACGGAGACAAGGTGGTTCGGTACTGGAGTCGAGTGCGTTAGTAAAGGATGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 15638299 5' - roo 9044 1 58.42 TACCATTATTATGTTGAGTGAAATTAATTTATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTA:1 - chrX 20880644 5' + invader4 45 2 76.77 ACTTCCAACGTAAGATTACCCGGGACCCATTATGTAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 + chr2R 2552124 5' + HMS-Beagle2 44 2 72.28 GGAGGCTGCAGGGCCTCAAGCACTGTGCATATCAAAATAATCAAGTTTTTGATTGAGTGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr2L 21978176 5' + roo 8683 2 60.40 CTGGGGGTTGAAATTCCTTGTGTGCCTGACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTT:1 + chrX 10621691 5' - hobo 2888 1 72.28 AAGTTCATTGACGCAGCAAACTCTGGCCAAGAAATTGAGGTAAAGTACGGCAAGTGAAGTCATTGTTATGTGCTGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chrX 7787325 5' + roo 8669 2 74.26 TGATCTTCTGTGTTAGATTCAAAAGGTTTCCTCAGAATTTTTGTATTCTAGCTCCTTCATTTTGTTGTTGTTGCAAGCACGCTCAATTTCTTAATCTTATT:1 + chrX 16370787 5' + gypsy12 10075 2 70.30 ATTTCCAATGCATTTTTAATGCTTTGTTTTATTCTAGTTATAGTGGCTGGACTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAACTACGA:1 + chr3L 21735387 5' + Doc 33 1 51.49 GCTTAGATTATCGCGCACCGATCACCGAAATCGATCAGTTAAGCATAAGGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3R 8198479 5' + Tirant 26 2 55.45 TATGGAAAGTATAACCATGCATATCATGTTTTTAATCAAGTTTCTTTTTTCGACGGCATAATGCTCTCCGCGACCCATGACTAGAGAATTTGTGGTCTTCT:1 - chr2R 24694795 5' - Tc1 336 1 67.33 GGTGGTGGGTAGTGGGTGGTGGTGCTGGTGTCGACCAACTTTTGCCATTGTCTGGCATTATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chrX 4026541 5' + roo 8680 2 62.24 GGAGAGCATAATTGATATGCATAATCATTATTCGGTTTTTGTTGTCGCGCTTCAATTAAGGCATTATGAAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chrX 5018610 5' + opus 10 2 69.31 ATACCAACACAATAAAATTACTTACATACCCCCAGTGACTTTTTTTTTCCAGCATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCTTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chrX 7787223 5' - roo 9046 1 53.47 GACCGCAGAATAAAAACCTCTTACGTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 + chr3L 12452163 5' + 412 7105 2 76.24 CTGTTACATACTTTTCAGCGAATCAAGTATACTCCGTAACTTGTAGAGTAAAGGAGTATACTTGATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAATCGT:1 - chrX 124083 5' + INE-1 31 1 71.29 CATTGCCACCAACCAGCCAACTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chrX 4488912 5' + 412 57 2 79.21 ATTTCTAACTGAAAGCCCCACTGCCGGGGTCCGTTTCCTATCGCTTCTTGCAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr2R 5849964 5' + jockey 36 1 53.47 GCACAGGAACGACGAATGGGACCGCTAAGCCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTA:1 - chr3L 22445528 5' + R1A1-element 4979 1 66.34 GCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCAAG:1 + chrX 21772477 5' - gypsy3 6562 1 52.48 TCAACTCGTAATTGATTTCATGATCTGCATACAAAGATTTCTTAGCCTAGAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACTCTGTAAGGGTCATG:1 - chr3R 3181286 5' - Cr1a 4178 1 50.50 CTATTTTGAGTGAACTGCATATTATGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr2L 9389070 5' - 1360 3339 1 76.24 ACCGTTTATTTTGGGTACTTGATAATTGGTAGTTTAAATGATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTAAAATAAGTTGACTTTTTGACTTTAA:1 + chr2R 19461345 5' - S-element 1681 2 63.37 TTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGT:2 - chrX 12294771 5' + blood 21 2 58.42 ATAGAAAATATTTAAAGTGTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTT:2 - chrX 8364656 5' + jockey 4785 1 51.49 GATCATCGAGCAAGATGTACAAGTTTTGTTGATGCGCTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAA:1 + chr2L 18112517 5' - transib2 2783 1 66.34 CCAAGCATACTTTCCAGCATATTGCATTTCTAATTTGCATTTCTAAATCGCATTTCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGATGTAAAATCTTCTAT:1 + chr3R 19144404 5' + Juan 26 1 46.53 CATTTACCCAAAAGATTAATATTGCCCAAAAGATTAATATACACTAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2L 326200 5' + roo 8696 2 61.39 TATAATGAAAAGTATTATCTTCATTAAGAGCCCTTCTGGTTTTTATAAATTTTATTCAACATTTTTGCTTTTTGCTTTTTTTTTTTCTTTT:1 + chrX 8967532 5' - Doc2-element 246 1 54.95 ATGAGNAAACCCTCGAGGTTGGTGGGTGATGGTCGCATAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTT:1 - chr3R 6664050 5' - I-element 180 1 66.34 GTGCAAGGCTACAGTCGAAGAGCTAACTACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTTAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTC:1 + chrX 1427551 5' - Bari1 1656 1 73.27 CGATAGGCGGGAGAAGTCAACGAGGGAGGGGATAGGTCAGTCCTTTGTGAGAAAGAAAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chr2R 10863883 5' + mdg3 5271 2 57.43 ATTTGAGTATTATATTTAACAGATTTAATCTTTTATAATCCTTTGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGC:1 - chr3L 12298631 5' + pogo 33 1 61.39 GACCACCAGACATTATAATAATAAGCAAAAAACTTTACAATGAATTCCTTATGGCCCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAA:1 - chr2L 13245004 5' + P-element 19 1 58.42 CAATTCGCTTTCGCTCCTCCTGCTTCTTGGCGCGCTCGGCGGCCAGCTTGGCCATACGCTCTGCCCGCTCCCGCTCAAGGCACTCACACTGCTGTCGCTCT:1 - chr2R 7280858 5' - R1A1-element 389 1 75.25 GATTCCAGGAAGCGGATCTAACGGAAAAATGCTATTATGGAAAACCCGCTCTGGAGAGAGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAG:1 + chr3L 10811033 5' - P-element 2796 1 61.39 ACTATATCCCCCTATCTATCTGGGTATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGC:1 + chrX 4500211 5' - Quasimodo 7324 2 74.26 CCGAGCAGCATAAGCTGGTTTCAAAGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 4502478 5' + roo 52 2 78.22 AACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATC:1 - chrX 8364630 5' + jockey 4810 1 77.00 AGCGTCTAAATCTTTTAAGTGGGCGATCAACCTAGGGAAATCCCCAAAAACGAGTTCTATGCACAATTCGGAATTGCCCAAGGTTTTTTTTTTTGTGTTTC:1 - chr3R 30447931 5' + Tc1 1472 1 52.48 AATGGGCATAAAGACATATTTTAGCACACTTTCGGATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGA:1 - chr2R 12446365 5' + jockey 4712 1 65.35 GTGTATACGTAAACTTTATTTACATTAAAACATTTTTCAAAATATTTCAAGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCT:1 - chr2L 17889402 5' + accord 25 2 54.46 TAAGAAAGCGACGTCTGATACGATGAATTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:4 - chr3R 9837626 5' + 412 50 2 72.28 CGTGTGCCCTCGAGCGTGTGCCGACCAATTTGACTCCTCGCGAACTGGAAAAATACGAAGGTAATAATTAATAGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTA:1 + chr2L 3595482 5' + Tirant 435 1 68.32 ACTCAAAGCGCCACTTTTCCCATTTTTCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATAAGTCATA:1 + chr3L 11658009 5' + Quasimodo 94 2 73.27 ATCCTTTGATTTGTACCTAATCATTTAAAGCCATTTAACAAATAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:3 + chrX 21401856 5' - roo 9041 1 59.41 CCCGTCTTCGCCAACTGAGTTGCGTAGCGGAGAGACTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chrX 19457155 5' - roo 9030 1 69.31 CAATACCATCTGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chrX 7809051 5' + roo 20 2 58.76 GCTTCCTTTTAGCTGAGTTTATGATAATTATGGTTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 19657463 5' - roo 9026 1 67.33 GGATTATTTTTGCATATTTTTTTTCTTTTTTTTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTACGAGCGGCGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATA:1 - chr3R 29269796 5' - Cr1a 4220 1 66.34 AGCACTTAAGCGACTTCAGGCATATGTTCCATATACAGCTCTATTATACTTGTGATTGATTACAGCTTCTAATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAA:1 + chr2L 10626589 5' + transib2 2744 1 73.27 AAATCGTAAAGTTTTATATTGAATGAATTAAGTCATGACGTACTTATTAATCTTAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3R 10445185 5' - roo 385 2 55.45 GGTCTNGAGTTTTCTTGAGTGAAGATCGCGAGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTT:1 - chr3R 25633392 5' - Tirant 356 2 70.30 GGATGCGCTTGCATTGCTGATTGAGAGCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATG:1 - chr3R 5977794 5' - copia 5073 2 75.25 ACAAATCTATGTATGCTTGAAAAGAATCGAACAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTACCTACATCAGAAGTATTGGAATTCTA:1 + chrX 1245446 5' + mdg1 411 2 69.00 TCGCCCCATTGACATATAGAACCTCCTATGTAACGCCCATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 + chr2L 13447111 5' - HMS-Beagle 7005 2 63.37 CTTATCTGATTCGTAATTGCATACTTTCGGGCGGCAATTTGGAAACAATTTCACACTGGCCAGCACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 - chr2R 19357443 5' + jockey 4689 1 64.36 AAAACGTGCATCGTCTACAAGGGGACTTTTTGGTCCTCGCAACTCCTTTCGAGCTCGTGGCACCTTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGG:1 - chrX 10571602 5' + R1A1-element 5013 1 76.34 TTGGGTGAGAAAGTTTAAATAAGTTTCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 11435599 5' - roo 357 2 77.23 GAACTATTTAGCCTGGTTGTTAATTGTATAAGTCAAAGTGAATAGTTGAGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCA:1 - chrX 16798263 5' - diver 184 2 62.00 CTTTAAATTTTTAGAAATTTTTTTAAAAAATAAAAAACATTTCACAAAATTTTTTTTT:1 - chr2R 13425362 5' + FB 405 1 50.00 ACTTCCTGTAATGCTGACATTGAGGCACTATTTAAAAATCTGGGTAATTGTGTCTGTCGCTGTCGTCGCCATTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:2 + chr3L 16838160 5' - P-element 2827 1 79.21 ACAAATTTACAGAATTTTAGGGAACTCATTATGAGTTTGGCTTAACGTTTTCTAATAGCCAGCTTCCACTGTACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGAC:1 + chrX 20394213 5' + rover 177 2 75.25 AAGTATGCCCCTTCAACCAGCCCCTCAGCCAGCCACGCCCACCTGGCATTGACGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr3R 18507880 5' + jockey 32 1 52.48 GAGCAGGTTCAGCTGGATCAGTTCCAGCTAACCTAAGGGATGACAAGGAACTGATCCAGCTGAACCTGCTCAATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAG:1 - chr2L 8365210 5' + R2-element 240 1 58.42 TTAGATAGGAAAAAAATCACATTTAAATTACGGATTACGGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAATCTAAAA:1 - chr3L 8164442 5' + I-element 5176 1 61.39 CTTTGTTTTGTGTTTTGCGAGACTATTGGTCGGTCGGTCGAATTTGGACTTGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 + chr3L 21841290 5' - P-element 2861 1 53.47 TTTAAGGAATGTTGTTGGCCTTTGTGGCTGCGTTTCTTCCCTAACAAAGTCATGGGAGTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr3L 4386538 5' + jockey 31 1 57.43 CCAGCCCGCCCACACAAACAAAACAAACTCAACGTTACTTTGTATTAACTTGAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chr2L 6252574 5' + P-element 25 1 54.46 TTCCTGGCCGGACCATTCCATTCCCCTTTCCTTGGCTTTATGAACTCGCTAAAGGCGGTAAATTATATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chr3L 9304680 5' + jockey 12 1 69.47 AATAATGTTGATGTTTGCTCTCACTCTCAGTGGCAGTTAACCTTTGGCAGAACACTCGGCGAAATGTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTA:1 - chrX 12294784 5' + blood 5 2 73.47 TAATAGAAAAAGAAAAAAAAACTAAAAGAGGGGGTTGCGAGTAAGTTCGGTAAGATTTTGTTCCTTTTATATTTAATTATCAGTCTTCGACTAGCTCTTGT:2 + chr3L 20628498 5' + Juan 1 1 79.21 TGATAACGAATAAGGTCACTTGGCGCCACTGATAAAAATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 + chr3R 19467879 5' + Transpac 37 2 66.34 ATAATTTTAAATATTTAATGCGCTAGCGAGAGAGTTTTTCCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAG:1 + chr2L 6252632 5' + P-element 435 1 53.00 ATGGAGTTGCTGTAGTTGTTGCCGGTATTTCAGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAA:1 - chr3R 17121713 5' - mdg1 7438 2 57.43 AAGAACAGGTTGTCGAGCGGAACATTGTGTGGATGGCGGAATTTTCGTGGTAGGGATGGGCGTTGGAGACTATTCTCAA:1 + chrX 18312840 5' - G2 2739 1 64.56 GCGCAAACATAATATTCAATACCATTTAAAAAGCAGCAAACGTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATA:1 - chrX 5572982 5' + flea 4677 1 73.27 ATACAACTTTTTTCACAAACAAGACGAATGTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGA:1 - chr3L 20604700 5' + 1360 226 1 77.23 AACTCTTGACTATAAAAAGAGATAATGCTTATGTTGAGTATCGTTACTAGTAGACTTTTATTTGGTTAAGAATTTAATGAATTTTTTTAAATTTTGTAATT:1 - chr2L 16437489 5' - HB 321 1 73.27 GCCATATCAGATTATCTAAAATCCAACAACTCAGAAATTACTTTTGACAACATTAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTA:1 - chr3R 1206462 5' - I-element 5333 1 56.44 ATGCTAATTTATTGCTGTTGATTTTAATAACTTTTGCCCAGCCCACATATAAGTATTTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAA:1 + chrX 13350752 5' + jockey 4780 1 55.45 ATTTTTTTTGTGATAACCCTAAACTGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAACAT:1 + chr3R 21606335 5' + I-element 208 1 78.22 TGAATAGTTTCAGTTTCTTGACGAATGCCGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGCAGAGT:1 + chrX 8074804 5' - mdg3 5404 2 72.28 ATTTAACACAATAATTTGCACAATTTGTCAAAACAACCCTCCGGCTAAATGGTATCATAAACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATA:1 - chrX 7828966 5' + 412 7071 2 61.39 CAAAATAAGTTTCTGAACGTAAATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAG:1 + chr3L 7989761 5' + mdg3 53 2 74.75 CATCTGGCTGGGGAAAAGACAATGACACAAATCAAAAACTTTTCCCTTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:2 - chrX 7809045 5' + roo 8694 2 56.44 GCAGAGAGGATGGTGCCATGAAGGATGGCCAAATGTCGAGGCTCAAGGCCCTTTAAACGGCTTTAAAACAACCGAGACTGCCTCTCATAACCTGGACGCTA:1 + chrX 19054840 5' - R2-element 3273 1 68.32 ATTGTTACATTTTTATTTATTTCTTGGCAATCTTGTTCTATAATAGTATTTTTTATATTCCAAGTAAGTGTTAGTGATTTACCGTACGATCAGGACAACCG:1 - chr2R 12507488 5' - Copia1_DM 171 1 68.32 ACTAAATCGGTGGAGAATTGAAAAGTCTAGGGACCACCTATTCGTGACCTCCACTTTCGCAAGCCTTCTATCAAAATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCAT:1 - chrX 22638572 5' + INE-1 103 1 63.37 CTACTGATAAGGCAGAACAACTGCTTCTGCTCATTAAATATTCTTATGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr3R 7522369 5' - blood 7356 2 59.41 AGCCTCTCATCTTATCGTCGATATGCATTTACTATAAATAATTTAAAGCGTAAGCCACACATGACGTTAAGTGGAAACGAATTTAAATTTTGTTTCTATTT:1 + chr3R 17251449 5' + HB 1397 1 87.13 AACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATGCAATACAAGTTTGTTTCCAGATGTTGCCCACAATTTAAGAAAATGATTTGATATTTTTTTATTTTTTTTTTTAG:1 - chr4 829446 5' + Tc1 1400 2 53.47 ACCAACAAGGTCTGCTGGCAATGGATTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 - chr2L 7459606 5' - BS 5048 1 78.57 GCAAAGTTTTATATTACATTACTTTAACATTTTCCTTGAAATACGCCTGAGGGCGGAATCTGTCCATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTA:1 + chr3R 9479423 5' - mdg1 7447 2 60.40 GTGATTAATATACAAATTCATAAGCTTTCGGTTAAACAAATTCCTGCGAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACAT:1 - chr2R 18629236 5' - Transpac 42 2 56.44 GGACTTAGTTATACACTCTTCCTTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2L 3694114 5' + roo 54 2 79.21 GATGAAAGCTTTGGTACGCAATGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGC:1 + chr2R 10912114 5' + 412 53 2 77.23 CAACCTTCGCCTTCTCCGCTTTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAAT:1 + chrX 11501795 5' - 1360 324 1 80.20 TTAAAGAAAATCACTTCTAATTGTTAATTGTTTATCTTTCGCGATTTACATGACCAATTGTGTCATGAGCCCGGCTTTTTTGTTTTAATTTGCATTTATTT:1 + chrX 15800877 5' + S2 93 1 72.28 CAATGAAACTCCGGCCACGCAGTTAATATTCTCGGTGATGTAGCGGAATTTGCAAAGGACCTCTATGAGGTTGCTCATTAAACAGATCAAATTTAGTTGCC:1 - chr3L 11752018 5' + jockey 4945 1 76.24 TATTTATTTATTAAATTTGTTTAATTTTTATTAACTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAA:2 - chr2L 584012 5' - TAHRE 10414 1 62.38 CGACCAAACAATCTGGAGAACCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr2R 18601814 5' - Transpac 5198 2 57.43 AAAATGAGATTAAAACGCGAGTTCTCTGTCCACAGTAAAACACAAGAGCGAATGCTATAGTCGAGATCCCCGAATATTAGATACCCGTTACTAAGCTAGTG:1 + chr2R 25132110 5' - INE-1 541 1 73.27 ACAGCTGTCACGAAACTTTATGGGTTGAATAATCTTCATGCGATGTTAGTTAGAGTGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 - chr3L 19215874 5' - roo 9051 2 60.40 AGCTCACAATTATTTATTGGACATGCAGCTTATTGCGTATGCAGAAATTAACTTTTAACAATCCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAG:1 - chrX 5443973 5' - mdg1 408 2 64.36 AAGTGCTACTGGTAGTTAACGTATATGATAGTAACGGATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:2 - chr3R 27080789 5' + HMS-Beagle 6832 2 63.37 AAGTACCAGGCAATCAGATTCAGTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGAATAAAAAAAAA:1 - chr3L 10810261 5' + P-element 132 1 31.68 ACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAA:1 - chr3L 23678150 5' + Osvaldo 23 1 75.25 CAATCAAAAGTGGTAACATGCACATAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr2R 5485088 5' + 1360 53 1 79.21 AGACATTCATAGTAATGGTTTCAAAAAGTTAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATTGCATCTTAAAGTAAATGGC:1 + chrX 19095335 5' - roo 312 2 68.32 GTTTAAAAAACTTTAATTTTAAGCCAATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAG:1 - chr2L 19768418 5' - I-element 5307 1 71.29 TTGCGGGAGAGCCCACAAGTCTATATTGAATTGAATAGGTGATAACGCCAGTCTATTTACATGCCAATTATGACCGTAACTGTTCACACATGAACACGAAT:1 + chr2L 5974377 5' + roo 8664 1 75.25 GCATACTATAGAATAATTATTAATTTGCTTGGCTGCTCAAGCACAAATATAATATACCCATACACACAGTTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCAC:1 + chr3R 8548359 5' + 17.6 5 2 75.25 CAGCGTTCATTCATGTTATTAAATTTGAAAATAAATATATCGAAAAAATTGTTAACTTAATTTTTTGTTTATTATAGAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 + chr2R 16744093 5' - opus 7499 2 65.35 ATAAAGTAAAATAAAATAAAGCTTCTTTGCCTTTTGCTATTCCTCGCCGTTTGTCGATTTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTACAACTGTTTTGCTA:1 + chr3R 19000729 5' - Bica 409 1 78.22 TACTAAGCGGAAACGGAAGTGGAGGCGAGGACACCTTACATTTAAGACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCC:1 - chrX 20764850 5' + Doc 243 1 55.45 TGGGCAAACCCATCAATAGTTTTCCAGCCCATACGTTTTGCGAGGCACCCATATAGTCTCACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 18353571 5' + jockey 22 1 60.20 ATTGCTCCATTCTGCGGATAGATTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 14910594 5' + roo 8717 2 78.79 AGGTGCTAATCAAGAAAAAAAGAAAAATTCCATTCATAAATATTTCATTTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3L 4068084 5' + jockey 10 1 66.20 GTGAATAAATTCAAGAGTTTCAAGCGATTCCTTCAATCACTTTTCGTAAATACTGATTTGCACGTAAGCGTTGATAAGGGTCTTTTTTTCTTAGCTTTGGG:1 - chr3L 11232645 5' - Ivk 249 1 61.39 TTGTGTGCTTTAATGAGACGCGGAGTGGGGTTTTAAAAGGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTC:1 - chr2L 11551397 5' + Max-element 8275 2 65.35 CTATGNTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAAC:1 - chr2R 12185420 5' + accord 14 2 60.40 TGATAATAAATGGCATAAATGATGCATCGTTACATTAATGCACGACATAAAACGGGGCGGCAACACACACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTT:1 - chr2R 14381372 5' + hobo 6 1 71.72 GATTTGCAATCACAATCTGGGCTGAAACTGAAAAAATATCCATCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3L 9925706 5' + Doc 39 1 61.39 TACGGAGGATGTCAAGGCAATGAAAATTCATTTAAATCCAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 - chr2L 3694155 5' - roo 9034 1 68.32 CCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTA:1 + chr3R 19450165 5' + roo 34 2 70.30 GTTTAGCTCAGTCTTTAAACGAATGTTATTTTGCTTTCCCAATGTATCTTAACATATATAGTTTGAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr2R 20838689 5' - 1360 3376 1 66.34 AGAGAAAGAAATCATAGATATAGGAATCAAATTCGTTTTTATTTCAGCATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:2 - chr3L 6024605 5' - roo 9042 1 56.44 GGGGGGCCCAGCAATTTATGTTTTAAATATATGAGGAATTTTGGGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chrX 13548748 5' + blood 7045 2 60.40 TTACATGTGCAGAAATAATTTTAAATCAGAAGGGGATTTTTCTGAAACATTTCTCTTATGGTTTTTTTTTTTATATGTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGA:1 + chr2R 16898215 5' - Max-element 300 2 72.73 TTCTAAGAAGATTCTAGCTGTGCAACCTGCTAGTCAGAGCACTAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTA:3 + chr3R 10741095 5' - 1360 3357 1 61.39 TCTAACCAAAGACCCTAGAATACCCGAAAATCGTCTTCTAGCAAAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAA:1 - chr3R 31959305 5' + 1360 3253 1 76.24 ATCCCTCATACAAACTTCAGTTTTGAGGGATCTAATATGCACTGTATAAATGCTACAATTTTATTGGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGTGGGACTAC:1 + chr2L 7758543 5' - baggins 5299 1 64.36 ACGAGTTAGGGAACGGAAAGGAGCCTCCACATGATTGCTAGGGACTTTGGAATATATTTGGTATGTTAGTTTCAGTTTCAAATGATCAGTTACAATAAACG:1 - chr2L 15988286 5' + HMS-Beagle2 262 2 78.22 AAGACATCCGAGCAACATTTGCTGCCAGGCATACAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCA:1 - chr3R 7388398 5' - HMS-Beagle 201 2 71.29 AAAGGCCAACCTATTATCTGTACATATAAACATATATGTACTAATCATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 + chr2L 21089155 5' - flea 228 2 57.43 CAGACNTTCTGACCCCCCAAAAAAGCAGACTGACGCATTTATATATTATTCAAGGCGAAGGTCGAATTCGATGGGGAGAAGCCTCTGTGCTTGCTTAAA:1 - chr3R 30325337 5' - 17.6 300 2 79.80 ATGGCATACCGAATGGGTTAGCCAGAAGACTGGCAATGATGAGCTTACGGGGGAGTGGAAAAAGATAAAGTCCAATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTG:1 + chrX 171037 5' + Rt1b 4930 1 78.00 CATTTATTAAACCATAAAGAGGTTTTATGAACTGATTATGAGTTTTAGTTATATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTC:1 - chr2R 8245781 5' - mdg1 7433 2 50.50 TTAGCCTTGGTCCCGAAATCGCAAAGCCAGATAATTCCTGCCAACATAAATCACAAAATAGTTGTTTTTGATCATTATGTGGTTTTTTTTATATTTATAA:1 + chr3L 17677589 5' - transib4 2578 1 54.00 CGGAAGCCCCCAACTTCAAATCCAACCTCAGCCTCAGTCCGGCACTCAGTACGGCCTTGTTGTTCGCAGTAACTTTAGCCGAATGTAACTGTTGATACCAC:1 - chr2R 5804869 5' - G-element 193 1 63.37 AGAACCAGCATGATCTATGCCAGGCTTGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chr2R 18601830 5' - Transpac 5182 2 73.27 GCCTGGTTGGTGGCATTAAAATTACATCATTGTATACGCAATGCTGTCATTAAAATCCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAG:2 + chrX 8977376 5' + jockey 27 1 58.42 GAGAGAGCGGGCTTTTGCTTATCGTCGCAAACGGAGGAGGCGGTTCTCTTCGGCTGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCC:1 - 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P-element 154 1 48.28 AGATATCCACTTAATTTAGAGAAGAGTCTATCACAATAATACAAAAAATAAAAAAAA:1 - chr3L 1597570 5' + Rt1b 5150 3 73.68 CCCCGACTGTAAAATAAGTAATCTAATGAATGCTTCTATTTAGGAAGTTTGAAATAAAAATAATCTTCAATAACCTTCGTTAATGTAAAGGTCGTTATGAA:1 + chr3R 24228647 5' - gypsy7 437 1 67.33 GTTTGCCAAACAATTTTGAGCGATTACGAAATGTGTCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAG:1 - chrX 8364638 5' + jockey 4803 1 69.31 AGCAGCCAAAATCTGGATAGCACATTGCTCGGAAATAGTCTGGCCAGTTTGGGCACTGAAACAGCAGCCACTTCACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGG:1 - chr3L 7766080 5' - Quasimodo 6926 2 77.23 TTTTCCATGCAAAAATTTGTCCACTGAAAATTAACGATGCTCCACAGGCAATGCAGCTGAGTTTTATTCTTAAATCTATGTTTGAGGCCTATGACCGCGCT:1 - chr2L 4125810 5' - rooA 7404 2 56.44 AGTTGTACTTGCAGAACCCCAATCAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr3R 17121682 5' - mdg1 369 2 76.24 TTCGATTGGTTTTTGGGTCTAGAGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTATAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCGGGAC:1 + chr2R 21986719 5' - Cr1a 4077 1 80.20 GCGTAGATTTCCACAACTAACATATAAGTTAACGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 + chrX 6605501 5' - 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HMS-Beagle2 489 1 91.40 CAAATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGCGAACGAAAATGCAATAAATACATTATCTTAAATTTAAAAATAATTTGCCTTTATACAAAAATGTGTTAAG:1 + chr3L 25115194 3' - INE-1 543 1 70.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTAAGGACCGAGTGCATTGACTGGAAAT:1 + chr3L 18009644 3' + roo 9055 2 60.40 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTTTTGGCAAATCTGTGGCAACAACCT:1 + chrX 1954530 3' - Tirant 8125 2 61.39 AAGGGTCAAAACCGCTAACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCGGAAACTAAAACTTAATCACACACACTTAAAAAATGGCCGCCAACTACAAAAG:1 - chr2L 15478088 3' + Quasimodo 6947 2 58.42 TATGGGTGGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATGTATTTATATCATTAATATTTATCATATGGTGTACGATATG:1 - chr3R 19224673 3' - hobo 2664 1 59.41 CTAAATATGAATTTATTTTATTTTTCCCTGTTTTAATATTACAGAACTCAACACAGAACAGAAAGAGAATGTGCAAAAATTTCACGTGTCAAAGATAGAAT:1 + chr2R 5644902 3' + transib1 1891 1 65.35 ATGGGAGATACATACATTATACATATTTGTAACAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACAACTCAAACTGTTCCTGGTACTTCAAACGCTCCCTCGGGG:1 + chr2L 21141736 3' - accord2 106 1 65.35 CTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGAAACAGAAGCTCGCTCAAGGTCAGAGCTCACGACATGTGGTGTAGTTAAGTTTAATGCATTATGGTCGGCTG:1 - chr2R 6248834 3' - 297 227 2 75.25 AAAATNGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGG:1 + chr2R 12779170 3' - roo 8686 2 60.40 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAA:2 + chr3R 19967671 3' - pogo 32 1 57.43 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAG:1 + chr3L 13994248 3' + P-element 2834 1 24.75 GTCCCACGTGCACACCTCCCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTGTGCACGTGGGACCCATGCGAAAAAAAAAAATACGACTGACCCTTCGTTG:1 + chr3L 25959913 3' - Cr1a 4434 1 76.04 GAATTTTGTATCTTAAACTCTCAGGGCCAAAGCACTGCTATTTTTATGAACACAGCTGTATGTATTATCAATACCGATGTCGACGTCGTGCCGCCCAGCAT:1 - chr2L 15457628 3' + HB 1591 1 78.22 CAATGGATTGACGCTATGTTATACCCAATTCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTACTCCAATATGCTACAAGGGATATTGCTCTAAAAGTACCAATTCC:1 + chr2R 21140674 3' - Stalker4 7006 4 70.30 ATCACAAAAAAAAAGAAGAAAAATCAGAATAATCCTCTCAAATGCTTGACCAAATCTGACGCCGTGAGCAGTTGGGATTGTCTGTTAACAGACAGATATG:1 + chr2R 5777592 3' + gypsy7 5002 1 78.00 CAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCC:1 - chr3L 17869909 3' - 1360 25 1 51.00 CTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGCTGCGCAGATAAGAAACGCACACTTCTAAGGCAGCCGAAGTTCCTGCTATTTGTGCTCCCCCTCTAAAGTTT:1 - chr3R 14296994 3' + Tirant 440 1 75.25 CCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCACCAAGGAGGCTCATTAGGGGTTTCTTATCTGATTTGATTAGTATAAGAGCCGAAACAAGTGAATTAGTGGCTGTG:1 + chrX 17263247 3' + X-element 4453 1 61.39 GCCAGGCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAACAAGTAAATTGCGCTAAATTTCTCTCAGTCTCAGTCCGCGAGCGAGGCAAATGCGAAGATGTC:1 + chr2L 6255859 3' - flea 4764 1 73.27 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTA:1 + chr2R 19936663 3' + roo 397 1 61.67 ATCAGAGTTCAGTTTGAGACCTAATTGTAAAAGGTCGGTGTTCTTCTCAAATAAAAAGATTGTAATCCGATTTGCAGTACTGCAAATTTATGCCCCGCATT:1 - chr3R 9484344 3' + Idefix 470 2 66.34 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGACACTTTTCGCTGAT:1 + chr2R 5084073 3' - F-element 36 1 57.61 GGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCATCGCCATCGGGGAATCCGTACTTGAACGTGA:1 - chr2L 1131817 3' + HMS-Beagle 6790 1 73.27 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCTCTCTCTTTA:1 + chr2R 18503581 3' + roo 404 1 60.40 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGACAAAGGCTGGCCAAGAAAAATATGTGCAAAGGAAGTCTTGCC:1 - chr3R 18551128 3' - Max-element 34 2 61.39 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGGTACTTGCTGTCAGGTAT:1 - chr3L 21708596 3' - roo 8683 2 60.40 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAAATCTGTTGGAGAAAAACTGCTCAAAACTTTTACA:1 - chr3R 9837549 3' + 412 7540 2 73.27 GGGAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTCCAGTTTATCTACATGCAAAAAACAAGACCAAAACAGACTCACGATGTACAAGCCCGTAAACAGAACA:1 + chr3R 7380448 3' - Cr1a 291 1 59.79 AGTTTGCCTACTTATCATGTCTAAACACAACACATTCATTTGTTCTTACCTCACTTATCTTGGCCCCAGCTCATATAATATGCGTAGTCCTGTTTGCATGT:1 - chr3R 19201932 3' - rooA 18 2 68.32 TGCCTGAACACACACACACACACGAACATACTCAGGCGAATGTCAGTAATAATGCAGCTGGGTCCTGTCGAGGTCCTTGCTGGAATGGCTGGAAGGTCTCC:1 - chr3R 15615259 3' + accord 178 2 57.43 GGCTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGACTAGCATAATAAAAGTGACAGGGAGCATGACAAAAC:1 - chr2L 2694963 3' + F-element 470 1 66.27 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACCACCTCCTTTGGTAGGGCTGACGGCTGAGTGCGAGCGCAGAAG:1 - chr2R 3641116 3' + 412 7513 2 56.44 CCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATATAGTGCGAAATTAA:1 + chr3R 12894169 3' + blood 344 2 57.43 GGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGA:1 + chr3R 15943348 3' - jockey 4657 1 57.43 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCCCCCAACTGCCGTCGTCTTCGTGCGCGGCCGACGTTTATATTGTT:1 - chr3R 10957647 3' - hopper 14 1 65.35 TAATATAAAATACATAAATATGAATAATCATATTACACATGAATGCACGAATTAATGCAGCAATACATGCTTAAAATATT:1 + chrX 17441897 3' + TAHRE 434 1 92.50 AACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGT:1 - chr3R 5977729 3' - copia 16 2 63.37 GTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACGTCG:3 - chrX 16798197 3' - diver 5913 2 54.46 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTTATGATACCATTTAGCCGGAGGGTT:1 + chrX 7828932 3' - 412 7081 2 66.23 CATTTGAATTTAATTTTAATTTACGCCCAACGGCAATTACACGCAGGAGCCACAGAACATGCCCGTGGGCGGATGGATGGTCACGGAGTTTG:1 + chr3L 11397737 3' + Rt1b 124 1 70.65 CAGAGTTTTCAAACATAAGTGCCCCGTGTACATTTCAACATCGCTCTATCTCGCTTGATACATGCTGGATAAATTATTGCTTTAATACTAATGATAGTATT:1 + chr3R 19449809 3' - invader6 275 2 67.33 CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGTTGGTGGC:1 + chr3R 7388436 3' + HMS-Beagle 7037 2 77.78 TCGGCNTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAATTCATCCTTCCGATCCGA:1 + chr3R 19837102 3' - P-element 18 1 58.42 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAAC:1 + chr2L 1626593 3' - roo 8706 2 67.33 GACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAATGGCAATCGGAATCGGAATGCGAATGGGTGTGGGTTTGGATGTGGGAAGTGTAACGGAATGAGTCACGTAGTA:1 + chr2L 17544893 3' + F-element 491 1 74.26 TACTTCGATTACTAATTTGATTTTTATGATCTGCACTCTTCAATGTATTCGTAGTTATTAAATGTTGTCATCTTCCTGTCGGAGAAATTCCTGAACATACA:1 - chr3R 30166623 3' - Doc 4429 1 75.25 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACTACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCCATCTAGCGG:1 - chr3R 19657424 3' + roo 402 1 73.27 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTACCCTTTCCTTTCCTATGTGCGGGAAAATGTGTGGCACATATGGCCAGGACGATAAGCTGCTGT:1 + chr3R 31884302 3' - hobo 7 1 71.43 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATATTTGTACATATTGGACCAATGTGCCCGTGTTGCGGGTCAATGCCAATAAGA:1 - chr2L 13837850 3' + 297 378 2 64.36 TGTAAGACGCCGCAGTCTGCGTTTGTAAATTCAGCTGAGTTGGGGGTGGCAGTGAATTGATTTGAAATGTCAGCCAGCGGGGTGACCTACAGCTATGGCTG:1 - chr3R 9833849 3' - rooA 7461 2 65.35 ACGGACATGGCTAGATCGACTCGGTCATTGAACTTGATCAAGATTAAATAAGGTCAAACAACTTTCACATGATTCAACACAGATTTTTTTTGCAATATTAA:1 - chrX 17043288 3' - INE-1 109 1 62.38 ATTCCGTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCG:1 + chr2L 15333755 3' + P-element 2825 1 17.82 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTG:1 + chrX 21668943 3' + pogo 2064 1 64.36 GGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGGAGTGGAGTGGAATCCAAAGATTCATCGAGTTGGCGTTGTGCTGAAAAAATA:1 - 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Doc 4691 1 70.30 AGTATGTAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACCAACCGGCCCAGCGTTAAATTTAGGCCATTAAATTAATGCTGCAACTAATGCTGATCTGCCCAGCGT:1 - chr3R 16894611 3' + Doc3-element 4557 1 61.39 TGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAATTTACTGAATATTCGACCAATTGGAGTGTGGTTCATTTGTGGATCGGAATTCTCT:1 - chr3R 26525720 3' - FB 66 1 60.00 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTG:1 - chr3R 19450161 3' - roo 25 2 78.12 TGAGTAGACTCCAAAATCTAACTCCTGAGTTTCACTACAGCACTTTCTCGAATTTTTGGGTTCAGCGAAGGGGAAATTAGGAAAACGCTGCCGCTGCGCAC:1 - chr3L 5654719 3' - 1731 398 1 66.34 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGCTATTTTA:2 + chr3R 31458541 3' + jockey 4968 1 53.47 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTTACATACTTTGGTCGCCCACAATAT:1 - chr2L 6227638 3' + roo 9052 2 59.41 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATACCGGCCCCCCTGAACGGTTGTTCAGCAGTACAGAGGCAATGCAAACGATTTTCAAACTGGGCGTATACG:1 + chr2L 938989 3' - 3S18 5774 2 79.21 CTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTGGACATATGTTGG:2 + chr2R 5084104 3' - F-element 14 1 64.36 TTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCAAGCCTGGCATAGATCATGCTGGTTCTCCAGATTGTTTGGTC:1 - chr2R 18601815 3' + Transpac 5197 2 58.42 TGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCTTATGTATGTACATATTGCTGACATGGAGAGCCACAAAGCGCGAG:1 - chr3L 19779016 3' - Tirant 9 2 66.34 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTATTTGTTAAATGGCTTTAAATGATTAGGTACAAATC:1 - chrX 21401863 3' + roo 9034 1 66.34 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATGTAATTCGGCAACTCGAAAATATTTATTTTTTTGTTTCATTATCAGTTTGTTAAAAGGTCATT:1 + chr2L 12074429 3' - Quasimodo 9 2 74.26 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTTTCTATGGGTGAGGAGATAACGCCGCCGTGAA:1 - chr3L 13994196 3' - P-element 25 1 52.48 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTT:1 + chrX 329077 3' + opus 466 2 60.40 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTATGATTGCCTTTGCAGAAACTATAAGCCCCACCC:1 - chrX 14041927 3' + roo 9030 1 67.33 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAACCTCGCACGAAAACAC:1 + chr2L 1626616 3' - roo 19 2 55.45 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTATGTTTATATATATTATATTTATCCCACTATATAAATGGTAAAAATAGC:1 - chr3R 25510325 3' - opus 23 2 65.35 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTCGGCAAAGTCCTGGCTGGGGCCACCATTTCTGAACATGGTCCTTGTTTG:1 - chr3L 15434490 3' - flea 28 2 55.45 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTTATTTGATACAGTTTTTGCACAGATGCGTT:1 + chr3L 19949041 3' - Ivk 42 1 67.33 GTTGTACTCAGTAATCCCACCATTAGTCCCGTTTTAATTGCCTATGCAGCGCAGTTTGACACTGCTTAAATATTCGTAAAAGAATAAAAACCTCGATTAAT:1 - chrX 21631097 3' + Bari2 473 1 62.38 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCAGGCACACAAGGAATTTCAACCCCCAGCG:1 - chrX 10621689 3' + hobo 2897 1 68.09 GACTCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATTTTCC:1 + chrX 158244 3' - INE-1 92 1 75.00 TTATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCACACCTCAAGCTACTCAGTCGTTTTTCGATTTCTATATCTTAATTTTATTGCTTT:1 - chr3L 15235779 3' - accord2 7524 1 67.33 AATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTACGTGGGAAGTTGGGTAGTTAGGAGGAAA:1 + chr3R 26034074 3' + Transib5 2935 1 72.28 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTTGTTTTTACAACATCTATTTTTGAG:1 + chrX 19095832 3' + roo 401 1 69.31 CCTCCCCCCACCCCCCCCCCCTTTTTGCT:1 + chrX 7776466 3' + accord2 225 1 82.76 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCC:1 - chr3R 14049347 3' + transib2 2792 1 57.43 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCCTGCTTTATTTGATTTGATTTAAGCAACTTTAACAAATGGTCTTTCTAAAGT:1 + chrX 20974935 3' - opus 7025 2 55.45 GCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTAGATAAAAAAAACGTTTACGTAAACAAAATTAAGAGCGTAAAAGAGCCTTAAAATTGTAGGTAAAGGGATTA:1 - chr2R 4738941 3' + rooA 238 2 72.28 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTTCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAGACCGCTGGTTGATGAAAGAAAGAGACGACATCTGGCTTATCGCAT:1 + chrX 10089071 3' - FB 31 1 52.48 ATATGTACATATGTATATATATATATATATTTACGCCTGATTTTTATACGCCAGGCCATAACAAATTAATTAGGATTTCGGTTCCTTTAGGAAATTGGGTT:1 + chr3R 24599310 3' + G3 4507 1 78.22 GTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTGTTTAAAAGACAGTAATTATTTTACATTTTTGCACTTATTAAATCATATTAAAATGTAATTTAATTTTAA:1 - chr3R 31343331 3' - Stalker4 6904 2 68.32 GGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTTATCTCAGGCCATGCTTT:1 + chr3R 7522399 3' + blood 7386 2 75.25 GGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTA:1 + chr3L 25350824 3' + baggins 5417 1 40.59 CTTCAAATGAAACCGCTGCGGCTGATGAATCGTTGGATACTGCGTTTCTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCGCTGAGTTTCCCTCGTTTCTGCACAATTAGT:1 - chr3R 23242847 3' + X-element 329 1 69.31 ATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACACAAGGTTGTATAAGTATAGCCAAACAAAATACTTGTAACGAAATTAAATTAATTTCCACATCAA:1 + chr2R 24823203 3' + Bica 128 1 59.41 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAAACCCAAACTC:1 + chr2L 13447195 3' - HMS-Beagle 6809 2 66.34 AAGATATGATCCCTTTGTTGAATCCTTTTTTTATTTTTTTACTTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCC:1 - chr2R 5410986 3' + Tc1 1376 1 61.39 TAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTAT:1 - chr3R 6769712 3' - mdg1 7082 2 56.44 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATGATTTCTCTTATTAATTTCAG:1 + chr2L 14886037 3' - pogo 4 1 54.46 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTT:1 + chrX 329070 3' + opus 468 2 64.13 ATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAATAATTGT:1 + chrX 5443968 3' + mdg1 7441 2 60.40 ACTTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAAT:1 + chrX 21668889 3' - Stalker3T 59 1 61.39 GAAACGAATTTACATTGTACACATTAGGGTAGTTTTTGCTTCAATGTGCCTTCTTTTTGCGCAGACATCGACTGAATCAGGCGCTAATCGAGGAGGGTTAC:1 + chr2L 15026400 3' - 1360 3153 1 70.30 GTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATCAACAGACAAGCGAAAATTTGATGAGAAATCAATCAAATGTATCCTTTTTGGATATG:1 - chr3R 779367 3' - F-element 36 1 50.50 AGAAGCGGACCAAGATGGCTCCCTTGAGGGACACCGGATGTGACTCGGAGAAAATACCGAAAAATACTAAGGCATAAGGTGTAAACTATCGGATATAGAAT:1 - chrX 17148932 3' - Q-element 497 2 55.45 AATTATTTTAAAAAAAACTTTGATGCGGTGTATATAGATTGGCTTAGATTATTTTTTAGCATGAACGTATTTAACAGACTAAACCTTTATTTCCTCATAGT:1 + chr2R 14921647 3' - HeT-A 5799 1 53.47 AATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGAAACTCAATATACTATGTACTTCAGATCTTTGCTCACGATTAGTTGTAATTTCACTTTTCACATC:1 - chrX 16222649 3' - P-element 449 1 67.33 ACATTNTGTGTTTGTCCCAGCGTTTCTCCATTTTCTGAAACTTTTTCAAAAAAAATAATTGTTAAAACAAAAAAAACATTAAATACAAATGTATACAACTA:1 - chr4 1048586 3' - Tc1 1612 1 75.25 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACTACCAGGCGCACAATGTGGACGAGGACATTCCGCTGGGAAAAAGCATACTTCGCGTTAAAGCCATG:1 - chr2L 17719579 3' + 412 426 2 70.30 GTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCATCTCTCATAAATATCGAGCTAGAGTTTGAGATGGTAATCAGTCATCAAGTGTCTGGTCTCGAG:1 - chr3L 5021188 3' + I-element 5026 1 66.34 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACTATTTCTGCTTATGATTCAATCCACGAATTTGGTTGCACTCAAAGTGAATTTATATTGCCTACTTAAGCGGGCAG:2 - chrX 10251703 3' - flea 4758 1 78.22 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAG:1 + chr3R 7101056 3' - pogo 38 1 71.00 TAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTATCGACATTTTTGCAGGCCCATT:1 - chr2R 10863864 3' - mdg3 5252 1 76.24 AAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATT:1 + chr3L 7989806 3' + mdg3 213 2 59.41 TATAAGTAAAATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAATATCACTTCGTTTCATGGAGCTTCTGACTATGTACGATGTACATACATAATAGCATGGATA:1 + chr2R 9873408 3' - S-element 116 2 68.32 GAATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATAATTTCAGTTTATTATTTTGTTTTCATTTTTTTCCCTCTCTTTTTGCACTCGGCCTGTGCCGC:1 - chr3R 12153094 3' - Tc1 1366 1 65.35 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTGATTTTATTTGC:1 + chr2L 18028762 3' + flea 241 2 69.00 AGGGGACACGTTAGAATTTTCTGTTAAAATACACATAAATTGGATGTCACACAACATAAAAACAGTACAACTACACACGTCACTATCAAATATTTGCACAA:1 - chrX 14213116 3' - transib2 377 1 76.24 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAATAAATCGCATTTAAACTGGCAAAGCTTTAAAAACTGACGGA:1 + chr3R 19144455 3' + Juan 4177 1 63.37 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAA:1 - chr3L 5975606 3' - hobo 46 1 69.31 CNTGCCGATGCAGCTAACTATCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTACATTGCATGAACGAGGACTCAAGGAACTTATCAGTTCGATTCATGG:1 + chr2L 6177243 3' - pogo 25 1 53.06 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCG:1 + chr2L 7548047 3' + blood 7338 1 78.22 CGCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTAAACGATTGCTTAGATTAATAT:1 + chrX 19810285 3' - INE-1 30 1 56.44 TCACGAAGTACGGACACAAGCACTCAACTTCCTGTTTGCCATCTTCTCAACTGGTTGGAGTATCCCACTTGGCTTGCCATGTGGTTGCTAATATA:1 + chrX 10506332 3' - 1360 467 1 67.37 TCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATGAAGGTAAAAGGTAAACCGATATTCTTATTGCCCTATTCCGTAG:1 + chrX 6268745 3' + F-element 482 1 59.30 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTA:1 - chr2R 20411870 3' + 297 6948 2 58.42 AATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTGATTTTATTTGC:1 + chr2L 18028762 3' + flea 4999 2 68.32 TTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACATATTTCGCTGCGAGAAACCAGAAACCTGTAGTTTTTGACCCATATTTCAGATAATTTTCGCCAGA:1 + chr3L 4048540 3' - 3S18 5776 2 69.31 GAGTCCGACCCAGGGTGCAGTTCGACGACTCGGCCTGTAGTCCATTTAGCTGGTGGTAAATTATCATCCTTTATAATGACTGTTCACGCCAGAAGGGCGCA:2 + chr2R 4253304 3' - diver 5711 1 80.20 AAATTGGATTGCGGAGAAGCCTCAGTATTTTAACGATGGGAATTTCTCATTATTAGTATACCCTAACACACAGGGGGTGTTGGTGATTAGTGATTACTCA:1 + chr3L 1239031 3' - 297 247 2 74.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAACGATATACTT:1 - chrX 2762105 3' + roo 9055 2 61.39 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGTTCCCTAGCCAGC:1 - chr3L 14240798 3' - Tirant 8112 2 76.00 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTG:1 + chr2L 15333784 3' + P-element 2854 1 46.53 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGA:1 - chr2R 20411889 3' + 297 6929 2 77.23 GCATANTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCCCTTCCGCCTTCCGCCACCTCGGTGGATGAATCTGC:1 - chr3L 7314687 3' + hopper 1380 1 58.42 CTTACCTGTTAACAGTTAGTTTAAGTTCCAATTAAGCGATCAACATCAACTAGAACACGGGCGCGTAGACCGAATGTTAAGTTGAACGGAATCTTGAGCTG:1 - chr3L 16818904 3' - Bari2 200 1 55.45 TTGATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATAAGCGATTCGATTTCTTTCGCCGCAAGAACATTGTTTATTTGAT:1 - chrX 15384743 3' - 412 32 2 54.46 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTT:1 + chrX 14796907 3' + transib2 2786 1 68.09 GCCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAACAAGTTCTTTCGAATGTTTAAGATTTTAGGCACAATAAATATTTGAATCAAAAAGCAC:1 + chr3L 17121851 3' + roo 8651 1 63.37 TATTCTGAGCATTTTTGAGTGCGTTCGCTGAATTAGCTATAAGTGGGATTTACTGACAGTCCCCTCCCGAGAACCACCGCACTCAGTTCATGTTAAACATA:1 + chrX 18879264 3' - Porto1 4334 1 60.40 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGG:1 - chr3L 21708613 3' - roo 8700 2 66.34 TTTTTTTTTTATTTTTTTTTTGGGATTCCTCCACCCCTTGATGGAAGAAAGAAAGAAAAAAAAA:1 - chrX 3142003 3' - G2 3077 4 67.19 TGTTAAATATATCTTGCTTGGCTTGTAGGATAATTTCGACATGGCCAGGAGTGGGCTGAACTTTTTGGCCA:1 - chr2L 3224449 3' - I-element 5076 1 67.61 AGCTGAGTAACAGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCCAGAAACATTCCA:1 - chrX 10445550 3' + INE-1 545 1 77.23 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGA:1 - chr3R 25440171 3' + pogo 2053 1 78.22 TAATTATAATGTATACAAATATTTATCTTATTTAAAAACTATTCGTCTACAGTATCTCAAGAATTCCAAGACTCCGGGTAAATATTTGTCGATCAAG:1 - chr3L 12187242 3' - G5A 2736 1 67.01 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCAAGCCTGGCATAGATCATGCTGGTTCTCCAGATTGTTTGGTCGATTGAATTGGCTTTC:1 - chr2R 18601799 3' + Transpac 5213 2 64.36 GGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTT:1 - chr3R 15157608 3' - invader3 54 2 62.38 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAGGGGCTGGTTGAAGGGGCATACTTTGAGG:1 + chr3R 18507885 3' - jockey 27 1 57.43 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAATGCT:2 - chrX 13347305 3' + roo 9021 2 77.23 TTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGC:1 + chr3L 20903857 3' - F-element 58 1 69.31 AGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAAGACATTACATTACATACATAAAAATAATACGTAGTAGAAAATATAAACTTATTAAATAAAAAAAAAAA:1 + chrX 10756576 3' + gypsy10 5942 2 75.25 GACACAGCTTGTTCACCGCCGGCATTATTATCATTATATTTCCACGCTGATTGACTCACGTGAAGGTTATGACATTCAAATTAGATTTTCAATAGCCGCGA:1 - chrX 10391264 3' - diver2 4460 1 71.29 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAG:1 + chr2R 19936698 3' + roo 391 2 64.36 ACCAATTACTTATTGTTAATTAAAACAGATTGTAATTTAAAGAAAAATAAAAAAAAAATGAAGTACAATTGAATGACACTAATAAGGACCTAATTATTGGA:1 + chr3L 3923519 3' + Porto1 4631 1 59.41 CCATCCAAGTGTGGGGAACAGCCTCTAAGACTCAGTTCAATAGGCTTAGAGTAATACAATCGCGAATGGCATGACTTTGCAAACTTTGATAAGTACATGTA:1 + chr2R 8449656 3' + G5A 2438 1 74.26 AAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAAAAATTGTTTATTAATAAGTCAACAAATATGC:1 - chr3R 20264704 3' + mdg1 7028 1 72.28 CACTGTATATATGTATATATATAAAAGCCGATAACCTCATGAACTTTAGCGCCCCTTGTGAGCGCGGTAAGTGGCCACGCCTCCTTCCTCCATCGTCGTTT:1 - chr3L 4000208 3' + 1731 97 1 70.30 AAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTA:1 - chr2L 23295815 3' + micropia 402 2 73.27 CGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCAAAAGTGGAAATTATGCTAATCTCGACAGCGA:1 - chr2R 11640824 3' + R1A1-element 5315 1 67.33 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTTACATACTTTGGT:1 - chr2L 6227650 3' + roo 9040 1 55.45 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTGGGCTAACCG:1 - chr2R 5849946 3' - jockey 18 1 68.32 GAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTATACACAAAAATCCCATATTATCTTACACTTTTTGCAA:1 + chrX 12729584 3' + gypsy10 301 2 71.29 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATATTTTTTTCTTAAACAAGCCAAAAGC:1 - chr3R 19622927 3' + pogo 2053 1 79.21 TTTTTTTATGATTTTTTTTTTTGTGTAAATAAAAATGGATAGTAAAAATACAAATGTGGAATAGTCCTTATTTCGTGTTGTTTAACTTTTACGTGGCGCCC:1 - chrX 9895518 3' + Tc3 79 5 65.35 ACAAAAACAACTCGTACCTCTCATTCACTGACCTATGAAGATACCTACAACACCCTTAAGTACGCTAGCCGAGCTAAGAAGATACGCACAACTCTGAAACA:1 - chr3L 9365668 3' + Porto1 263 1 74.26 ATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTGAAGTGAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATATTAATACATACCATT:1 - chr2R 21712749 3' - I-element 235 1 49.50 ATGGATTCTGATCAAGAATATATTTACTTTATATAGTCGGAACCGCTTCCTCCTGCCTGCTACATACTTCTCAACGAATCTAGTATACCCTATTACTCTAC:1 + chr3R 2473817 3' - INE-1 83 1 79.21 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACA:1 - chr3R 17121621 3' - mdg1 23 2 55.45 TCTCTAACACACTATTTATGACAGAAACATTATTTTTTTAATATTCGTCTAAAAATGCTCTTTCAGAGGCAGCGCGGAGGTAACACAAAGTTTGTATTTTA:1 - chr3L 23600425 3' - invader4 145 2 74.26 AATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACAT:1 - chr3R 4160059 3' + invader2 239 2 68.32 CTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTATAAAGAAATAGAATCTTAAATATTAACATATCTAGAAAATTTTGTTAGT:1 - chr2R 18295581 3' - I-element 4 1 73.27 AATTATTTTACAAAAAACATTGACATTTAAGACTAACATTGCTTAATTTGTTTAGTTCTAATTAAAGTGTTTTTAAGATTATTTATAGACGCTATTAACCG:1 + chrX 4947401 3' - HeT-A 5799 1 53.47 GCTGGAACTTTTTTCTCAAATGAAACAATAATTTTAATTAATACATAAATTTATAAAATATATTTTCACAAAACTATTTCATTTGTCGAACGCCTGTCTTA:1 + chr2L 12169749 3' - Fw2 223 1 66.34 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACTTATTCTTTTCAGTCTTCAAAAG:1 + chr2L 15893744 3' - Max-element 8289 2 80.20 GCCCAAACCACCACAGATCACCCCACCAACAATGCGCTTGTTTGCTTACTTAGAACCGCGTCGAATGTAGACGCGGTGTCGCGTAAAAATCACGTGTAGAA:1 + chr3R 23846625 3' + HMS-Beagle2 6786 1 74.26 CAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTC:2 + chr3R 9952237 3' - Ivk 41 1 67.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGGTGTCTCGTCGTC:1 + chr3R 9370020 3' + roo 397 1 66.34 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCTGGTGCG:1 - chr3R 31644126 3' + roo 400 1 65.17 ATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTCTGTACTGCTACGATTTTAGGGTTTACGTTTT:1 - chr3L 9121793 3' - Transpac 4933 2 66.34 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTT:1 - chrX 19457167 3' + roo 354 2 81.19 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGTTTGTGTGGGCGGGCTG:1 + chr2L 6252573 3' - P-element 26 1 53.47 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATTGAAATCTTTGTTTTCTCGCTTATCTAATTAGGTCAGCTTGGCAGCTATGACACACGTT:1 + chr2R 21848637 3' + Juan 4201 1 64.36 TTTTCCCAATTATTTTTACAATTTGTCAAGTACAACATATTGTAATTTACTAATATATTTTGTCTGTCACTGCTTTGAGTTAGCATTATCTTGGCGTGAGT:1 + chr3R 5473129 3' + Tc1 1488 1 38.61 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTTA:2 - chr3R 7388329 3' - HMS-Beagle 6816 2 59.41 ATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGC:1 + chr3R 4543242 3' - 3S18 44 2 65.35 AATCATCAGTTTTAATTTTAGCCATTAGCTCGTGTACAAATTTTGTATTTTGTTTAATTAATGTTATAGGAGCTGGTGGCCCCACATATGTACATGTTTAT:1 - chr2R 11002348 3' - Juan 386 1 75.25 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGTGGGTTCCAGCCGCCTGACAAGCGTTTA:2 + chr3L 14240909 3' + Tirant 8487 2 60.40 ATCCACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCCAGCAGCAGCAGCAGAACCAATACAACCTGCAGCCATCGAATGACAGTCGCAACATCTACA:1 - chr3L 22583249 3' - flea 486 1 63.00 CTCTTTATTCGACCTCTCACTTCAAGCTCACTTGGCCGGCTGCTTGCCTGCATTACAGTATAATATTTAATAATATTCCGGTGATCTTCATATCCTTCTTC:1 + chrX 22426832 3' - invader3 223 2 73.27 AACTGNTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTTATTGGCT:1 - chr3L 2292054 3' - Max-element 8242 2 62.38 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTTAGTTTGGAGGGTCGGAGGCACCTCGATTCCCGGG:1 + chrX 4180829 3' + I-element 5346 1 68.32 TAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTATTATTTGGCTAGTTGGCTCTCTCGCATCGAACCTGTTTGCTGGTCGCCTTTAGATTGGAG:1 + chr3L 14205360 3' + Transpac 5056 2 70.30 TGTGGGGCAACGCATCCAGAAGTAACATAGACATTATTCAGCGAGCACAGTCACGCACTTCCTATTCTCACAAATTTTGACAACTTAATGCGGCGACCTCG:1 + chr3R 16604848 3' + Doc 4308 1 52.48 GCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAATACGAACAAGCGATAGAAATCGATAGAAATTTACAAAACTAAATAAAAAAAAGAATGTGAAAA:1 + chrX 17719058 3' - INE-1 553 1 45.54 TAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCTTGGTACATATGAACTACTTTTGGACAAGA:1 + chr3R 6090401 3' + F-element 4494 1 70.30 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATC:1 + chr2R 14457755 3' - mdg1 7080 2 64.36 ATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTC:1 - chrX 2589688 3' + copia 234 1 81.19 AGATAATTCGTATTTTTAAAAGGGCAATAAGTTAAAAAAACTAGCTGATTTTAATAATATTTTTATTTCGAGTCTAAAATAAACAAATTTTAAGATAGAGG:1 - chr2L 8499203 3' + HB 292 1 76.24 CTCAGCTAGTGTAAACGCGAAATATTATAATTTTTTGGGATATCGATAGATACTGGGAAATCTGCGGCAGCTTTCCAATCAACAAGATATTCACCAATTGG:1 - chr2L 22133022 3' - INE-1 530 1 60.40 TTCATTTTAAAAAAAATTTTAAAACTCGGACAGGACTCGATTTAGTTAGAAGACTTTTGAACCCACATTGCGCACAGACTTCTTGACCTTTGGACGAACAA:1 - chrX 2059841 3' - Penelope 337 1 90.10 CACAANTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCA:1 + chr3R 9952245 3' - 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mdg1 25 2 75.25 CAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGG:1 - chr3L 24213792 3' + invader2 5061 2 69.31 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATTGCATTCAATTTGATGA:1 - chr3R 23665243 3' + 297 6960 2 65.35 GACCTAAAAAAACTCATACATTCCATGAAAAAAAGGCTTCAACTTGTAGCCAAAGCCAATGGGGGTCATACTATTAGCGGCTTTTGCATTATACAAATTTA:1 + chr3R 23305865 3' + S-element 1361 1 72.28 GGTTGGTTCTTGTACTTCACTTAACTACCCTTTTAATTGCGCCGTCGATGCATTGATTATATAGTACGCCGTTTTGTTGGTGTTTCTCCTGATCGTTCAGA:1 + chr2R 7034057 3' - invader2 353 1 59.41 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTG:1 + chr3R 19967656 3' - pogo 47 1 72.28 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACTTGTTAGAATTAAAAGTTGCATACT:1 - chr2R 23945267 3' + BS 5039 1 77.23 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCG:1 + chr3R 5977797 3' + copia 207 2 72.28 TTAGTTTTGGCAAACTACGAAAAAAACTACGATTTAATAAACAGACTTTCAGATATCCCTTGCTTAGCAAGGGGGAGTCCGTTTTTTTTTGCAATTTTAA:1 - chr2R 5410945 3' + Tc1 1418 1 66.00 GTTTANCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTATGAATGCGAAGTATAAGACTGCGCTTTAGTTATGCATTTTATGAGGGACCT:1 + chr3R 28095221 3' + hobo 2913 1 53.47 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTTTTGCAACACACAAAAACAATTTGAAGCCGACTTGAAAATTAA:1 + chr3R 20466707 3' - roo 31 2 58.42 AAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTTTACAACAGAA:1 - chr2R 12779063 3' + roo 405 1 73.27 GTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTATGTGAATATGATTGCTTCCGTCCACATGGAAAAGCATTCTTTTGTTGGCCA:1 - chr2L 19075625 3' - Transpac 4920 2 78.22 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATCATAAAATAAGAAGAATTCTTGTCTTAGCCATTACATTATAACAACTCGGATATGCACTTTTTTTTTGT:1 + chr3R 6431119 3' - 3S18 5771 2 74.26 CGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGAGGCGTGCCGATCGCCGGCACCGCTGGCTACT:1 - chr2L 6044452 3' + R1A1-element 393 1 68.32 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTCGACTTT:1 - chrX 4488870 3' + 412 7512 2 57.43 CTTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTTAGACACTGTTTATGGAGATTATGTTGGACGCCGAGGATAGCCTGGATCAGGCTATAGACAACATCGAAGACTCA:1 - chrX 6687228 3' - gypsy 7392 2 54.46 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAG:1 - chr2L 107985 3' + P-element 2871 1 61.46 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGGCAGACCGATACAATTTTGCCCCCCTTACTAT:1 + chr3L 21841373 3' - P-element 21 1 60.40 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTCACGTTCGTGGAGCCGGCCAGAAATATATCAGTTCACTTTAAGACGATGAAAAAGGCAA:1 - chr2R 24493649 3' - flea 13 2 64.36 CCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAG:1 - chr3R 20466648 3' + roo 366 1 67.33 AGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAG:1 - chr3L 23933557 3' + Cr1a 244 1 65.00 ATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATTTCATTCTCTCTTGTTTTTTATTTTCTCAAAACAATTCAGTTTTATCAATAGGACACAGCAAATCTTCCCTACTT:1 + chr2L 17974206 3' + INE-1 560 1 53.47 GAAGAAGGGCATCCTGATGACTCTTCGACATATGTATGTAAGTGACTTTTACTCTAATAACATAGGCACCACATAACTGTATATCCCGAGATACCCATTAT:1 + chr2R 5862391 3' + invader1 4003 2 40.59 GATCTNAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGCATGTTGCTGCTAGCAAACCACTCGCCACTTCAAGTCTTATTATTATATTT:1 + chrX 22670289 3' - roo 8824 2 60.40 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCTACCGAAGTCGCC:1 - chr2L 13244953 3' + P-element 2827 1 22.77 GCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGTGTGTTGTTCGATACGAGTACGAGTACGAATTACTGAAATCGGGGAGGTCCTTTCTTGATAGCAAAG:1 + chrX 16478318 3' + R1A1-element 376 1 72.28 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAG:1 - chr2R 12779111 3' + roo 356 2 75.25 ACTCGAAGGCAAAAAGGATAAGTGCATGGTCGGCGTGTGATATAATAATTAATTAAATTATTATAT:1 - chr3R 7615601 3' + 412 168 2 43.94 AATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCCAGTGAATGCTTATAACTTATATTTAAGATATATATGGACCTTTCTGTGAATTCAAGGAACCGGCGGG:1 + chr3L 14864992 3' - Cr1a 4136 1 57.14 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGACAATGG:1 + chr3L 6024628 3' + roo 402 1 73.27 CACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGGCGGCGTAATGGCGGGGG:1 + chr2L 18745089 3' - Doc 494 1 67.27 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAATTCTTCGAAAAGATAGGTAGTA:1 + chr3L 13994275 3' + P-element 2861 1 51.49 TGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTATTATTCTATTAGTTTCATCGATAAATTCATCATAGAGCAACTGATTTTTACAATGAAGAATTTTT:1 + chrX 15285003 3' - 17.6 232 2 68.32 TTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTATATATATAT:1 - chr3L 4653195 3' + Idefix 7387 2 82.19 GTTCAAACGGACAGACGGACATGACCAGATCCGAGCTAATCAAATTAAGGCCACGCTTTAAGAATTAACGCGGCTTGTAAATAGTTTTAACGGTGCTGAAG:1 - chr3R 18459862 3' - INE-1 123 1 77.23 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGCTCTGCGCCTACATTTGGCGGTATTGATTAGAAGTTGCGACATTGCGAATTTATGCAAAG:1 + chrX 1523729 3' - jockey 28 1 60.40 GACAGCATAAGTGGCAACTACAGATAAGTACGCTGCAGTTTTGGATTGTCAACGACAAGCAAGCGGTGAAAAGAGCATTACGCCTATGTGTGCTCTGCTTT:1 - chr3L 24351175 3' + rooA 7317 2 72.28 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAAAAATGCAGCTGAGCCAATTTTG:1 - chr3L 18009550 3' - roo 8686 2 57.43 ACAAATGGTGTGAAAAAATCTTAGATGTACATGGCTGTGATTTTTATCGCCGGCGTTATTATTAGTTGCAATTAGATGTCTATGTATGCGTGTGTGGCATT:1 + chr2L 16470424 3' - Tom1 259 1 74.26 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATCTTATTTGGTTTTATATTTTAGAATACAAAACGCAT:1 - chr3R 22530794 3' + Juan 4174 1 63.37 ACCCGCGAACAGACTACGTTCGGCAGAAACTCTAACGGTTCTCTGCCGCTCATCAAAAGAACAGAATAAACCCTCACCTGCACATAAACCATTCATATTCA:1 - chr3L 15364056 3' - invader1 3722 2 65.35 AAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATGTCATTCCCCCGCCGACTTCCGCTTAT:1 - chr3R 29350715 3' - opus 7156 4 74.26 ATTAATTTATTTATTAATTTAATTAATTTATCACAATTAATTTGATTTTACTACAATCCCATCCTAAATTAGTGCTAGAAATTAGGGTTTTCCGAGCACGA:1 + chr2R 13284200 3' - flea 225 2 66.34 CGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCAGAAGGAAAGGGGAAATTGGATGGAGGGACGGGG:1 - chr2R 15589357 3' + gypsy8 443 1 60.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAG:1 - chrX 19457148 3' + roo 9037 1 62.38 TTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACAAAGGATACTTGCCGGTGTCGTCCTGTTGACT:1 + chr3L 20903902 3' - F-element 13 1 70.30 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTATGTTTATATATATTATATTTATCCCACTATATAAATG:1 - chr3R 25510336 3' - opus 7026 2 73.33 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCACACACTTTAAATATTTTCTATTG:1 + chrX 8364658 3' - jockey 4783 1 50.50 TAATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCTGCGTTTGCCGTTTGTCCGCTGTGA:1 + chrX 17963665 3' - HB 1328 1 79.21 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAA:1 - chrX 328999 3' - opus 7027 4 55.45 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTC:1 + chrX 21668940 3' + pogo 2061 1 67.33 CCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAACGGC:1 - chr3R 7522281 3' - blood 7014 2 73.91 AGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAGGCGAGTCGAACCTTCACATCGACCGCTGGCGACTTTCACTGTCATGGCCATGGTCAAAATGGTAAGATGT:1 - chr2R 23509685 3' - blood 168 2 60.40 AAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTTAGTTTGGAGGGTCGGAGGCACCTCGATTCC:1 + chrX 4180825 3' + I-element 5342 1 64.36 ACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAGTGAGCTGATAATTATAAATTTGTCATGACATTCTGAGATATCAACAAAATTTATGCTAGAGAGAAA:1 + chr3R 14095015 3' - Doc 15 1 70.30 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCAAAAGAGTGGTGCTCATTGAATGATCTTGTCATCGA:1 - chr2R 18503492 3' - roo 8703 2 67.33 ATGAACACCCTAAAAGTTGTGAATTTGCTCAAGAATGTAAATAACGTGACGCAGGTGGGTACATGGACACGTTGACGCTGTGATTTCCATTAATGAAACTG:1 + chrX 22457577 3' - HB 194 1 67.33 GGAACNACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTT:1 - chr3R 7388330 3' - HMS-Beagle 6817 2 58.42 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTCATAGGGTATATTAAGAGACAACAATTGGTATTTCAGCCTATTCAGCATTATACTCTGTTCTAC:1 + chrX 8031446 3' - roo 4 2 73.40 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGCTCTCTGCTGTTTGACTGAAAGCCACTTGACTGCACA:1 - chr3R 31877865 3' - FB 39 1 61.39 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTC:1 + chrX 4154960 3' + blood 7336 1 79.00 TTTTAAAGTTTTGTCATCGAAAACTCCCTTTATCCTGTCATATCCCCCATGGCTTTATCTATTTCACCTTCGCACCCCTCCGTGCTGTAAAATAAACTTTA:1 - chr2L 10795181 3' + transib1 255 1 81.19 ACCAGTTGGCTCAGTGCACGAAATTTAATCCTATTTAAAAAAATGTATTTTGAGCCTTTTGCCCCCAAAAGAGTTTACTCAAGTCACACATTTCTCGCCGT:1 + chr2L 244976 3' + Gypsy6A_LTR 25 1 46.53 TTTTTATTTGTTTTTTTTTTAACATTTTTTTTTTTAAAAATATCACCCCCATTGAAAAGTGATTTCAAAATTATT:1 - chr2L 14487747 3' + hopper 151 4 82.67 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAGTGAGCTGATAATTATAAATTTGTCATGACATTCTGAGATATCAACAAAAT:1 + chr3R 14094999 3' - Doc 31 1 56.44 CCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGAAATAGGCGCACACAATAAACAGTCAATGGAGGGAAAATTGCAGGCACTTTTTTCGTGTCAGAACGATTTTAAC:1 - chr2L 20939438 3' + hopper 1069 1 59.41 GCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTTGACCTCGCGCTAGGTGGTTGCATATGGAAAGACTGGGCAAAACGAAA:1 - chr2R 24979904 3' - F-element 4526 1 71.29 GCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATAGTAGTATACAAAGAAGAGTTAAAAAAGATCCGGAAAAACGTAACAAATAAAAACGCAAGCTAATGATAA:1 - chrX 12729497 3' - gypsy10 5649 2 68.32 TTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTCTCCATTCAAATCGAGTAATTTGTCCTAATTGACTTATACAAAACTAA:1 + chrX 12989777 3' + micropia 83 2 58.42 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGAAAATTGTTGTACACAGTCAAGATATTGATTTTTGCGAGCCGAGAGGAAAA:1 + chr3R 18906672 3' + P-element 2867 1 59.41 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTGACTGCAAATTTAAAAAAAAA:1 - chr2L 9946935 3' + roo 9040 1 76.25 TTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGG:1 - chr3L 14240837 3' - Tirant 8152 2 67.33 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATTCATCGTATCAGACGTCGCTTTCTTAGCTTTTAATGGAATTATT:1 + chr3R 9837644 3' - 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chr2L 13447109 3' + HMS-Beagle 211 4 61.39 CTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCG:2 + chr3L 23678155 3' - Osvaldo 18 1 70.30 CAAAGGTATTTTTCCTTGTCCCTTTTCGGAATCGACTTTTTATTCCACCTTTTTTTGTAAATATACAAATATTGTCACCAGCATAGCTAAGTATAAAATAA:1 + chr4 1077673 3' + HB 51 1 60.40 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGC:1 - chr2L 22235215 3' - 1360 51 1 75.25 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCATTCTTATGCTCGTTTCGTCTCTCTGGCGCTTGAAA:1 + chr3L 2800196 3' - blood 7051 2 63.37 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCC:2 - chr2R 6984300 3' - HMS-Beagle2 6891 2 71.29 ATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGAGCTTAATGTTGATAGGCAAACGAATGAACTCGTAAAAGGGCGCTA:1 - chr3L 8421455 3' + roo 68 2 54.46 GTTTCTCCGGAAATAGGGCACATAAGAGGCCACTTGACCACAACTTTCAACCCAACTTTGCCCCATTCAAATGCACGAGCAACAAAAACAATGGAGCCTA:1 + chrX 5058190 3' + Gypsy12A_LTR 1896 1 47.00 GGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGCTACTCTACTATAGTACTCTACTATATTTATTTTTTTTCACCGTACATCCGGCGGGTAAATAAGTATTTGCAATGCG:1 - chr2L 16192945 3' + INE-1 550 1 63.37 AGCTAGTCAGTAAGATTCAAACACCCGAATTTTAATTTATTTACAATCTAGATAAGAAAGTTTACGTGACCAACATGCAGATTACAAGTAAGGAGCCGCGG:1 + chr2R 4071362 3' + rooA 7552 2 74.26 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCGTTCTGTTATTTTCTCTTTTAACATT:1 - chr3R 12877798 3' + mdg1 7428 2 53.47 TGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCA:3 + chr3R 9952252 3' - Ivk 26 1 52.48 ACTGCNGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCAGTCTAGCCTATACATGTGAAATCAGCCCTCATTATTTATTCCCGGC:1 + chr2R 5953990 3' + aurora-element 4212 1 77.23 CGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTTGCTGCTGTTTTAGCTGCTCTTATATCG:1 - chr2L 20777943 3' - Doc 4253 1 76.24 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGC:1 + chr2L 17957291 3' + opus 7461 2 71.29 AATACTACAATGATTTTCAATTGAAATAAAAAAATTAGTAATAGATCTCATGGATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAGCTTATACTTACCTGCGATTTT:1 + chr2R 5305376 3' - Tc1 1543 1 74.26 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTGCTCAATT:1 - chr2L 326111 3' + roo 9060 1 67.33 CAGACTTCACCATTCAAGAAAGCATAATCGTATTTGTATATTTAATGAAGTGTGAGAGAGATGGCCTCCACTTTCGCATTGCTCCTCTGCTCCCACCTGCA:1 + chr3R 21559564 3' - hopper2 258 1 69.31 GAGACACTGGACCAAAGACCCAATCACGGGCATCTCGGTCTACCTTAACCCAAAAA:1 - chr3R 9799353 3' - hobo 347 1 62.50 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCC:1 - chr2L 11065858 3' + P-element 2866 1 60.40 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTCACGTGTCGTTCACAGGATATTACTTTTAT:1 - chr3L 13194740 3' - 297 6595 2 65.35 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCG:1 + chr3R 30272849 3' + P-element 2833 1 26.73 GAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATCAAAGTACCTTAAAAAATATATAACTCGTAATTATATAATTTAGTGCAATTTAGCATGTAT:1 - chr2L 17430632 3' - opus 4 2 58.42 CGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTTGGCTGATTCTGTTTCATCCATTTCAGCTGCATCAACTGGTATGCCAAGGATTC:1 + chr3R 9291185 3' + Ivk 8 1 46.53 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATA:2 + chr2L 12074543 3' + Juan 4171 1 66.34 GCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCAGTGCCTCCATATAGTATTCTGGTATTCTGGTATGGCTCAACGAGATGCTGATGACGA:1 - chr2L 1125446 3' + HMS-Beagle 6809 2 61.39 AGAGAGAATGCTATAGTCGAGTACAACGACTATCAGATACCCGTTACTCGGAGCTTGGCTTGATTTATTAACTCTGCGATAGCAGTTTCT:1 + chr3R 30084227 3' - INE-1 576 1 54.44 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTCCCCATTT:1 - chr3L 10736460 3' + 412 7506 2 65.35 ATGGCCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGTCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCCACCGATTTAGT:1 + chrX 22638572 3' - INE-1 103 1 63.37 GGGAAACTCGACTATAGCATTCTTTCTTGTTTATTTTAAAGAGGGTGCTGGCAAGGGCACACACACTAGGACACCAGCACACACTCACTTACTCACTCACT:1 - chrX 2368042 3' + INE-1 571 1 59.41 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCT:1 - chr3R 31644132 3' + roo 9045 1 53.47 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGCTTGATGCTTGTGTCCTTTGTAGTTGCCTTTGAAGTTGTCGCTGTCGCTGCAGAAGGTACATGGATCTCAGTTGGCGGAT:1 + chr2L 19513110 3' - Tirant 10 2 58.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGATGACCCAATTTTGATTTACCTC:1 - chr2L 22717854 3' + roo 398 1 49.50 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGGACAAAACATTTCGGACGATGAGTCAGTAGCAACTGCACCAATTATGACAAACGAA:1 + chr2R 3595819 3' - roo 8684 2 59.41 GTGTGTGTGTGTGTGTGTATATACGAGTCGCGGGAGAAATCT:1 + chr3L 11040755 3' - Quasimodo 31 2 57.14 TTTCTACGCATACAGTGATAGCCGGCAACAGTATGTGTGCACACGTATGCACATATGCAAATATTGTACATATAAGCTGGGGCACTGAAAATTGTGGCCAT:1 + chrX 22916697 3' + 1360 146 1 63.37 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCCAAATGGGAAGCGCAGTTAATA:2 + chr2R 9277588 3' + roo 9045 1 55.45 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTAATGTCAAGTAACCTGGACGCAC:2 + chr3R 25440210 3' - pogo 49 1 77.23 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGATGTTGCAGCATCCAAAATCTGC:1 + chrX 6458254 3' + blood 7372 2 61.39 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACCTATATGAGATGCCACAGCATCCAGCTGGGGCAC:1 + chr3R 26469529 3' - hobo 8 1 71.29 AAATAAATTAAATAAAAATAATATATAAATAAGTTCATAAAATACTTTTGGTGTCAGGATCTTTCCCGGATCATATCGTATGCACTGCGTATGAGTGATAT:1 + chrX 13801434 3' + X-element 4719 2 83.17 CCCACTGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCTATCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTTCAT:1 - chr2L 8898908 3' + R1A1-element 4921 1 69.31 TATATATTCTTCATCAGGATCACTAGCCGAGTCCATCTGGTCCATGTCCGTCTCTGGATGCCAGGACAACTTGCTGTCG:1 + chr3R 17643564 3' + INE-1 81 1 70.89 GTGTTTTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTACACACTCTGAGTGCCTATACTTCTGAATGAATAAGTGGCTATTT:1 - chrX 495143 3' + 412 7540 2 69.31 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACGAGTATGGAGTATGTACTTAATTT:1 + chr2R 20051459 3' - Juan 4069 1 76.24 TATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTGAATGGTTGAAGATGACCGACTTGCTGGCACCCATCGCCAGGACGCAGGTCATGAGCAGCGTGAT:1 - chrX 19723685 3' + R1A1-element 5026 1 70.30 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAATTTCGA:2 - chrX 20364245 3' + opus 458 2 71.29 CGCTTTAGAATACGGCTCTAGCTCATGGCGTTGGGTGTGGTGGCCGAGGAGTCACTGCTGCTCCGTCCATTCAGTCCGGACTCCTCCTCGTGCTTCACGTA:1 + chr3R 18759734 3' - Gypsy12A_LTR 2201 1 59.41 GCTGCTCAGGTTTTATAACCTGGCAGCAATTTTTATAACAGCAGAGTGTAAGTGCACTCAACGCAGTTAACTGGCTGCGGCGTCTGCGAAGCAATTTGTGA:1 - chr3R 7718799 3' - Cr1a 477 1 63.37 CACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTGTAATGAGCCGAGCGCCGAGTGCAGGGGCAGTA:1 + chr2L 15333816 3' + P-element 2886 2 76.24 GACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCC:1 + chr3L 25350820 3' + baggins 5413 1 42.57 GCAAATATAATATGTACGTTATAATTTGAAATTAGAAAGTTTTTGATTGGCAATATGCTCCGTTGACCCCTAAACAAGTTGCCAGTCGATCGTAGACCGGA:1 + chr3R 16748123 3' - invader5 30 2 60.40 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCGGCGTTTTTCCAGCTGTTC:1 + chr3R 29660322 3' - mdg1 7051 2 66.34 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTTATCTCAGG:1 + chr3R 7522390 3' + blood 365 2 66.34 GTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATTATATTTATTAACCACATTAAAGGTTGTTGCACATTTTACTTTTCTTTAAGTTTTTATT:1 + chr2R 16744208 3' - opus 15 2 58.00 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACGTCCTATAAAATGCTAAGATAATATGCGAGTAGTTCATATCATTCATATTGC:1 + chr3R 17368074 3' - roo 24 2 53.47 CCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGATATTCATTTGTTTATTTTAGTTTGGCACATCTTTGAAAATAATGCATAATG:1 - chr3L 14049865 3' - 297 6935 2 54.46 CCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATAAACCTTTTGTTGTTTAAAAAATTATCAGTTAAACAGCATCCAATCTAT:1 - chr3R 12571466 3' - roo 25 2 61.00 CAGATGTGCCGGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCAACCCAAGTGATATCATTTTCCTTTTGAGATGGAGCGATGAATAGTTCT:1 + chr2R 2527438 3' + roo 250 2 55.45 GAAAATAAAAACGGAAAATAAATAAAAATAAAAATTCGAAAAAAAATGCAATACAAATTAATACGAAATTAATTGGAGTAAAAGAAAGGAGTAGAAAAAG:1 + chr3L 5162725 3' + Doc2-element 250 1 83.00 ATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTGTATTTATCCACTATCAGTATACATGCATGGAAGCAGTTTTATGAAAACAAACAATTTCTTTTATT:1 - chr2R 7540536 3' + Stalker4 398 1 82.18 TGTAACACATTAATAAAAGAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACAATTCAGAAGTGGGATACAAATCATGCATCACAATTTCACGCTCAATCGCCAAT:1 + chr3R 13060444 3' + Bica 116 1 68.32 TTTCATAATATATATATAAATTATCTGTATCCATTATACCTCAATTCGGTTTAAATGTAGGTAACTGAAGGATTTGGTATCTGATACTTGTTTCCGTTCTT:1 - chr3R 20378269 3' - transib3 64 1 55.45 GCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCG:2 - chr3L 19951210 3' - Ivk 42 1 66.34 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTT:1 - chr2L 108002 3' + P-element 2849 1 41.58 ATCCAATTTCGTTCAATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTTTCCGACTTAATGCCTTATGTAAATCCAATGCGATCAAGACGGG:1 + chr3L 14158091 3' + GATE 393 1 59.38 GTCTTNAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACCTTTTCATACGACCTGATTGGCAAACAAATTTA:1 - chr3L 14910551 3' - roo 12 2 67.33 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAAT:1 + chr3R 9369989 3' + roo 9029 1 67.33 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCCGCGAAGCAGAACCCATCCGCCGGCCGG:1 - chr3R 27189249 3' - roo 19 2 59.41 GTTATTATGTTATTTAAATTTACAGATTAACCAGCCTTAATGTCCAATTCTTTATGATTTCTGAGGCAGACAAGACAAGTTGAACTCGTCTTCGCAGCCCT:1 - chr3L 16702870 3' - HeT-A 336 1 67.33 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCCATCAGCTAATTTGGTGACCTTAGAATGTGC:1 - chr3R 22079738 3' + pogo 2059 1 71.29 GGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAAAACCCAAGGCACCTTTT:1 + chr3L 3279817 3' + Juan 4205 1 68.32 TTGGGCGCTGCATTTCGGCTGTCTATACCGCCAATTGCCACTTCTTCATATCTCGGAATAATTTCCACCAGGTCTATTATTAATGGCTCCTAGTACGCTTA:1 + chr2R 5038359 3' + diver2 4712 2 57.43 GATGATTTTAATTTTTAATTTTTGTTGTTTTTAATTTTTTTTATGTGAGATTTAATTATTAAATTATAAATATTTTGCGATACGTGTGTGAGTGATTTCAA:1 + chr3L 25342861 3' - TAHRE 158 1 75.25 AAATGCGCTGTTATGTTATTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAAGCGCATTTAAAATTCGTGACTACCCCAGT:1 + chr3R 25796060 3' + BS 5044 1 63.37 TAATATTGTACAAGAAAATTTTAAAAACAAAGCGAGCGTACAAAAAGTACTACCTTTAATGCGAACCACATTGCAGGGTATTAAAGAGAAAATCAATGCAA:1 + chr3L 8979297 3' - TART-B 10182 1 53.47 AGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGTAGGTAACACTTAAAAAGTTTTCGATCCTATTGTATTGTATACATATGCCTTATCAGAATATATAGCCG:1 - chr3L 11581633 3' + 1360 159 1 76.24 ATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATTTAAGGGGGCTGGAAATGAGAAAACACTCCAGTCTTTTGCTATTCTGACACAATTTCGCGGCGAAGCACA:1 + chr2R 7890278 3' + BS 19 1 72.28 AATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAAAATACCTTGTATTGTGGAAAAATTACAGTCCGCAAGAAAGATAGAA:1 - chr3L 23090885 3' - 1360 273 1 59.41 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCAACCCGCCAAAA:1 + chr2L 13447185 3' - HMS-Beagle 6812 2 58.51 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCTTTTCAGGAATATTAAAAAGCTACCTACACTATTCACGTTTTATGTTAAGTACAAAT:1 - chr2L 13566916 3' - FB 20 1 57.43 TTGATACTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCGCGCGACATTGTTAAATTCACTC:1 + chrX 14839028 3' - Transpac 324 1 75.25 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGAAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTTT:1 - chr3R 178121 3' - BS 34 1 61.70 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAA:1 + chr3R 9952248 3' - Ivk 30 1 56.44 CTTCGAGTGTTTCTTTTCAGCATATTTGAATTCCAGGACAGCCATCCCCCTAAATCCCAACATTTTGTCCTCCACCTATAATTAGTTTTTTTGTGAGTTCG:1 - chr3R 3005252 3' + GATE 8447 2 69.31 GAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATT:2 + chr3L 19349999 3' - 1360 3226 1 49.50 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGAT:1 + chrX 4488930 3' - 412 7092 2 61.39 AAAAAAAGTTTGTCCAACCATTATTATTAGTTTTTATCGTTTACCCACCCTTAAAAAACCTTTAACAAAACATATTTACAATGACTTTTTAGACGGCTTTC:1 + chr2R 4132549 3' + FB 347 1 69.31 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGC:1 - chr3R 28755927 3' - 3S18 22 2 57.43 AGCCAAGTGCTGACACTAGCAAATTCTGCAATATGTATGTATGAAGTTCATACTCGATAACCAATGGGAGTCGAGAATTTGTTATGTGCTTGTGGGTAGGA:1 + chr2L 18916562 3' - mdg1 7295 2 74.26 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGTTTTCTCAGT:1 - chr2R 21379494 3' + P-element 2852 1 44.55 CTCGAGTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTGGGCTAACCGGACGCC:1 - chr2R 5849940 3' - jockey 12 1 74.26 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGCCGCTCATACACAACATAATTCTTGTTGGCCCCTTTTT:1 - chr2R 9862199 3' + roo 389 2 50.00 ATGATCAATTTTCTCTTAGAAAATAATTGCTAAAGGACGATATATTGACATAAAAATTTCGATAAATCTTAAACCGAATTTATGTATTGCTGAAAATCTGG:1 - chr3L 14948769 3' - transib2 77 1 57.43 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAA:1 + chr2L 13447185 3' - HMS-Beagle 20 2 58.16 GTCGCNCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGAGGAAGAAGGGCATCTTACTGCACTCCAGCGGATGCATTTTGCATGTCATCCAGTTTCAACGGGGGATCGC:1 + chr3R 29070658 3' + invader1 3971 2 62.38 CAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAA:1 + chr2R 10863951 3' + mdg3 201 2 73.27 CGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAATAT:1 - chr3R 25702163 3' - Tirant 13 2 68.32 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGGGAAAGTTCTCGCTGGCCAGCATTTTATTGGCTCTC:1 - chr2L 13821374 3' - roo 8712 2 64.36 AATATTGCGATCTCCACGGTGTTCTGCGCGCAAACACGCAGCTTCCCTTTGACTATCCGCTTTTAAAAGCTGAACTTTGTAGTAGGAGTTCTTATTTCTCT:1 + chr3R 3468945 3' + mariner2 382 1 58.42 CGAGTTGCGCCCTCTCCTCGGCGAACCTGGAGCACCTGGCCCCTTCCCCTGTGCCCTTTTTTTCCGGACTAGCATCGCACAGCATCATCCTTGGCTGCTGG:1 - chr3L 17170425 3' - Rt1a 4616 1 69.31 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGGGCAAAATT:1 + chr2L 2920948 3' + hobo 2911 1 56.99 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCATTTTATC:1 + chrX 4154968 3' + blood 7343 2 71.29 ATTTGAACTTGGCACAAATTTCCTTTTTGTCCACTTTGTTGGTCACTAACTCGATTATTTTCTGGGATCTTTGGGTTACTTACTTCTAGGCGACAGAGACC:1 + chrX 17074791 3' - pogo 427 1 59.41 GGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGTAGAGCGAATGCGAAAAAAAAAATACAGGACAA:1 - chr2R 9387334 3' + Stalker2 7610 2 63.37 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGGTGGCTGTCCGCACGGCTGGCCGGCGATTATA:1 + chr2R 19857422 3' - 297 8 2 60.40 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTACACTTGATTCGCATCACGTCGGGGTCACCGATTTCAAAAGGCAATCCC:1 - chrX 11282556 3' + I-element 5329 1 56.44 CTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTACAAAATCTGTAAATAATTTTACACATCAAAATG:1 + chr2L 21089227 3' - flea 34 2 64.36 TAAATGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTATGTTGTATATTCGGGAGGAATTGCACAAAGCTAGCTATAAAGCACTAATTTCCTCCGACCCCAAC:1 + chrX 20975971 3' + Tc1 1470 2 47.37 GGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCGTATGGCCTTAAAAATAATAATATATAGTTAAACAAAAAAAAAAT:1 + chrX 5341191 3' - 1360 3320 1 62.38 CTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATGACGAGGAGGCGGAGGCCATGCAACTATCGACCGTGAGCTT:1 + chr3L 18624133 3' + roo 302 2 59.41 AGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCCGTGTGTGACTTTTCCCAGTTGT:1 + chr3L 15896688 3' - Doc 383 1 77.23 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAAGAATATTATTGCAACAAAAA:1 - chr3R 19224871 3' + hobo 2894 1 78.02 GTTACNACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGAATGCCTTACGTTATCTGGATACTTTCAAGCAT:1 + chrX 2149158 3' + Tirant 4 2 66.34 CTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAATTTTATTGTGTTGGTATTTACAAGTATTTGTTTCAGTTATATT:1 - chrX 7787197 3' + roo 409 1 77.23 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACGGCAAGACCGTAAAAGTCAACTAAAGTACGGGCTGG:1 + chr2L 11065929 3' - P-element 38 1 41.58 TCCATTAATCCCTACTACATACTCTAGGCATAACATGTTTTAATAATTAATACCTGTCCGGGGAATGACGTGGTGTCCATCGCCAGCACCAGATAGGTCAA:1 + chr2L 8782162 3' - G4 3753 1 55.45 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAATTGTACGGTATAATCAGATAGCGTCGCAAATGAGCAAACATACCCATACACATGTG:1 + chr2L 7994503 3' - jockey 4778 1 57.00 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAAGTAGGAGTAAATGCATCCATCAGACACTC:2 - chr2L 609005 3' - FB 47 1 70.30 CGATGGAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGTTTTTCTTTTTTTGGTTAGATTAGACAGATAATACATTTTCAAACGAACGAGT:1 + chr3L 7806247 3' - pogo 20 1 52.48 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTCTCAAAATTCCCAAATTTGTTATATATTTTTGTTTTTGACTATAGAGTATTATCCCACTAATCCAA:1 + chr3R 25510423 3' + opus 491 2 65.35 TAATAAAACAAAAAAAAAAACCGGGCAATCTGCAAGAGAAGAAA:1 - chrX 19446258 3' - Tc1 1474 1 90.91 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAA:1 + chr2R 19936668 3' + roo 9025 2 68.00 GTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTCGGGCGCCCCAAAGCTGGCAATGAAATATGCGACTG:1 - chr2L 7170362 3' - jockey 4618 1 61.39 ATTGAGAACACGTGTTTTCCATTCCATTCAATTTCATTTCGTTCCAGGCCATCAATCAACCTGACGGTCTCTGCCGGTCTCAGGCTGGCTCAA:1 + chrX 6453106 3' - blood 7364 2 80.65 AGGCACCGGACACGATCCACCCAAACACGGTCTTTTGAGCGACCGGCATTTATTGTGTGTCCATTGTGGGTTATCAATAAAGCAAATTGAATTTGCTGCGG:1 - chr2R 14633371 3' - GATE 8160 1 62.38 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCGTCGATCGCTTGAAATTG:1 - chr2L 12074477 3' - Juan 4037 1 64.36 GATGTNTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGC:1 - chr3L 958738 3' + P-element 2865 1 55.45 CCCACGGCCACACCTGCCGCCCAATCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATCCGGCGCGAATCTTAACGCTTCTCAT:1 + chr3R 6616373 3' - Cr1a 4432 1 68.18 ACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTTTTGATTTCGCCCTTGGTGCAGGTGCCAATGGTTTCTTGAACACCACATCC:1 - chr3R 8567609 3' + Cr1a 181 1 58.42 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATACAAAGAAATTAACCACAGGTTAATTCACAGGAAATTTTATCTTTTATCTTATCATT:1 + chrX 18012761 3' - roo 19 2 60.40 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCG:2 + chr3R 20884949 3' + flea 211 2 73.27 TAAGCNTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGGTTCATAGTTTATATGGGTCATGGAATACATGCTAAATGAAAGGCAGTTAGGCTTACTGC:1 + chr3R 6826746 3' - jockey 4646 1 71.29 TGTAGGTGAATGTTGGGCGCCTGTCAAACAAACAAGAGATGCGTCTGTCCCATTGATGCAGCTGGTCAATGGGACAGACGCATCTCTTGTTTGTTTGACAG:1 + chr3R 16939796 3' - gypsy7 251 1 52.48 ATCATGCTTGCATGCCTACCGGTAAGCCGTACAGTGTCCACTGTGGCAATGCAGGTGCTCGCTGGCAGACGGAAATGAAAGAGGGCAAGCCAAATGAATGA:1 + chr2R 5152507 3' + R1-2 3149 1 61.39 TCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCATTCTTAATACGTACTTGTTTAAAAAT:1 + chr3R 12136359 3' + roo 9058 1 65.35 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAA:1 - chr2R 20838607 3' - 1360 36 1 62.38 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGAAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCA:1 - chr3R 446036 3' - pogo 54 1 79.00 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGC:1 - chr3R 9981480 3' - jockey 4775 1 61.39 CACACATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCGCTAAATTATACGAAAGCAGCCTGCGAAAAGCGGAAAAAAAACAGCAG:1 - chr3L 18474815 3' + 1360 3226 1 53.33 CAAGTATTTTTTGAACAGTTGTATTATTTTTCCAACTGTTCTATGTTTAAACGGCCCTAATAATTTATTTTATTTATGAAATGTTATATTTTTGTATAGGG:1 + chr3R 19556271 3' - F-element 4596 1 68.32 AAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCTTGTACCCG:1 + chr3R 28755644 3' + 3S18 324 2 50.50 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGACTATTTCAATTTAAGCC:1 - chr3R 12767026 3' - 412 40 2 66.34 AGGGAGTTGCCTTAAACGGCTACCCCACACATTGGTTCCCGCAAGGTAAATGACAGACGGCTTAAGTTATTAATATATTTCCGTCGACTGCGTAATTCGAC:1 + chr3L 2007139 3' - aurora-element 76 1 62.38 AACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACGAGGTGCTCGGATGAGCACAGCCAGCAGTTCCTATTGCCATATTGATGATCAAACTCCGCTT:1 + chr2R 23305496 3' + I-element 5343 1 64.36 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAG:1 - 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chr2L 2437722 3' - roo 46 2 73.27 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTA:1 + chr3R 29350782 3' + opus 471 2 59.41 CGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCGTTGTATAGAGAGCCGGACGATTGGCTACATCATACTTACTAGATTATCTCATCTTTCGCAAAAACAAACCCCTTCA:1 - chrX 7020349 3' - Doc 282 1 61.39 TATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGAAACTAAGTACAAAATTCATTTGTCGAGAAA:1 + chr2L 8740945 3' + Burdock 6385 2 55.71 TTTGATAATTGTTTGTGTAGTTTGATATGTGTGTGAATGAGAGGTATAAGTTGTATTAGAGAGTTTGCGTATTTGCGGGTCATTTCGGAGATCCCTCGATT:1 + chrX 20631863 3' - Porto1 301 1 53.47 CTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATCCATGGATAATGCCCACTGCCAACCGTGCCTTCTGCAACATTTTTTGAGTGGCCAGTGGCTG:1 + chrX 16200820 3' - copia 4952 2 65.35 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCC:1 + chr2R 4502490 3' - roo 26 2 60.92 ACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTCCCCAGTGAAATATTCATGGAGCACATCGAACGGGAAACGAATGGAAGAACTTCAATGAAATTTATGTAATAC:1 - chr2R 23303109 3' + I-element 457 1 75.25 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGG:1 - chrX 329002 3' - opus 140 4 58.42 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAACAACAAACAATGAGAGTGCGCACAAATCCCTACGTCTTCAG:1 - chrX 2050796 3' - 412 12 2 67.33 TTTCCTGAGATCTCAACGTTCATACGGACAATCGGACAGGCGGACAAGGACTCAGCGGGAGAATGCGAAGGAGCTGTGGAGGAGCTGCATGC:1 + chr3L 22061343 3' - INE-1 140 1 60.87 TGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTA:1 - chr3L 27415231 3' + transib2 2791 1 59.41 AGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCACCGACAGTACGGCTGATGCACTTACTACTTAGCAATCAGCTGTTTTGCGGACAATTATCTATCGAT:1 - chrX 21116866 3' + invader4 306 2 69.31 ATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATGTATAGATTTA:1 - chr2L 13250352 3' - pogo 18 1 59.41 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCA:1 + chrX 4488917 3' - 412 52 2 74.26 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGC:1 - chr2L 15333711 3' - P-element 23 1 54.00 AATAAAAATGATATAAAAACAAATTTAAGAGATCAGAAACTTTGCTATTAAACAAATGACTGATCTATTCATACAAAAAAATTGTATAGAAAAAAACGCAA:1 - chr3R 4576543 3' + Tc3 1573 1 80.20 GTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATGCCACGGCAAGGGTACGAAAACAATTGTATAGCTTAAT:1 + chrX 13254530 3' + Doc 4439 1 62.38 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACAAAAGGAGGAGGATGGCAAA:1 - chr3R 17121602 3' - mdg1 4 2 74.26 AAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAACTACTTTATTTTTGCTCTTAAATGTAATGTTACTTTAC:1 - chr3R 24281959 3' + Max-element 260 2 63.37 CTTAGGGATTGGCTCTGGTCTAGAAGGTTGTCAGTCGTGGTTGATTAGCACACTTTATTGGGAAATCAAAATTGTTCAAGCGCCCTGTACATCTGTCATCA:1 + chr2R 19931196 3' - G2 2893 1 72.28 CTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTATCAAATATTATTTTAAAATTGGATAAAATCACTCATTTTAATTTAAG:1 + chr3L 8058075 3' - P-element 393 1 52.48 GAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTG:1 - chr3L 22848579 3' - INE-1 571 1 71.76 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGTTAT:1 - 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jockey 34 1 50.50 TTAAAATTTGTTTTTTTCGTTTGCCCACTCTTAAATGCCTCTATAAAATAATTTTTAATCTTATGATCTGATTTATATACTAATGAAGCGGTAATGAGCAT:1 + chr3L 27140537 3' + FB 728 2 70.30 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTTTTGTAATAAAAAAAAACCAACCGATAAACA:1 + chrX 13548836 3' + blood 375 2 72.53 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAA:1 - chr2L 20939499 3' + hopper 1406 2 70.30 ATTCGNAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAA:1 - chr3L 21735389 3' - Doc 35 1 54.46 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTT:1 - chr3R 28755951 3' - 3S18 46 2 67.33 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAGTAATAACTTTTTCCCTGGCTAT:1 + chr2R 8378693 3' - pogo 7 1 72.28 ATTCCNCAATAACGGTGCCAGGACTTGGTGAACTCCATGCCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAAAGGTCAATCAACTTTTTCCGCACCAGTGC:1 - chrX 7938384 3' + Tc1 1262 1 76.24 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGC:1 + chrX 7787276 3' - roo 53 2 81.00 AAGTGCAAAGTGAAGCATTTTTTCCGACCAACAACACAACAAACAAAGCGAAAATATAAAAAAAGGAATGGAACTTGTTACTCATACGCCCCGTG:1 - chr2R 18734031 3' + gypsy4 453 1 67.37 CATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTGCTCTTCTGCCGCCAACCGACTGGCGAGCGGTACGGCACGGAGCGAGCCCAGCCGAG:1 + chr2R 9013594 3' + blood 163 2 56.44 TACAAAAAAAAAATCAAACTAATTAGGCGG:1 + chr2L 1890139 3' + gypsy2 434 1 86.67 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTA:1 + chrX 21668932 3' + pogo 2053 1 75.25 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCG:1 - chr3L 21841307 3' + P-element 2844 1 36.63 CGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACAATTTGCCTAAAAACACACCATGGAGTGTCTTTAAAAATACATTTCAACTGTGCGTTCTCCGCCGGTTCT:1 - chr2L 17660010 3' - 412 7245 2 73.27 GAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACAGTGGCAGACTATAAGGCCCTTTTGGCTACCATTAACAATGGCGGACCCGG:1 - chr3R 27067383 3' + Doc 4468 1 57.43 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGTAACATTATCGATAATATAGTAATTATTTTTCATT:1 + chr2L 13739977 3' - 412 7092 2 68.00 TTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAGAAATTACGAAGTTAAAG:2 - chr3R 10734436 3' - G2 3003 1 50.50 TGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAAA:1 + chr2L 13447186 3' - HMS-Beagle 22 2 57.43 TTTATTTTATTTTATTTGCTCTATTTTATATTTTACCCTCATCCTCGAAATCTCCTCCAAAAGAACTCGTCACAATTCAAGTAATGAGAACCATAAAGGCG:1 + chr3R 11725305 3' + transib1 1902 1 69.31 CCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAAGAAGCGCTTGTTTCTGTGTGTTTTTGTGCACTTTACGACTTTAATTACGTA:1 - chrX 18451232 3' + P-element 210 1 56.44 ATAAGATAAGATGATAAAGTTCATAGTACAAAGCTTAAAGCAAAGAAGAGATAGAGGCATTGTGAATGCATCGCGAAATGCTTGAGAGGAATCGGAAGCAT:1 - chr2L 3451743 3' - Ivk 106 1 54.46 TGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGCGGAGCCTTTTGCTTGATATGCATATATTCTATTTAGGTCGGCATTTAGGCAAATGGATTCCAAAAA:1 + chr2L 15031865 3' - Tirant 404 1 59.57 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCCATCTTAAATAAAGTAGGAAGGAAACTATTTCT:2 - chr3L 11654506 3' - pogo 8 1 66.34 CTCGCAATCCCGAAAAACAAAAGCATTAGATATCCAAGAGCGAATGCACTTGAATCCAAGAGAAATGCAGAAAGAAGCAAACGAAATGCATAACTAAACGA:1 - chr3R 17651239 3' + Idefix 7086 2 80.20 TTATGTGTATGTATGTATGTTCACTTTCACCACACTTTAGCACTTTTCTTTTAGGCAGCCACCGCACATGCAATCCCCTCCATGAATCCCCACCATCTCAA:1 - chr3R 25388562 3' - 1731 76 2 53.47 TAATATACATACAATTATACTTGCTGGCTTCAATTTTTATATACTTTTTTTAGTCTTTACACTTATTTCGAAACATTTTTATTCGTTTGAAGAGCACATTC:1 - chr4 251974 3' - transib3 2619 1 69.31 GTCTTAAATAAGCTAACAGTGAATATGTATACGTGACTCACCAGGTTACAACGCTTCCAGCCAACGAAAAAAAACACAAATCTAATAACAAATCGAACACT:1 - chr3L 23436405 3' - ZAM 8249 1 73.27 AAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAGGATTAACTAAAGATAAAAAAATCACTATTGAGCTAAAAAAAAAAATTTATTACGCACAGATTCGCTTTTTGA:1 + chrX 21396752 3' + F-element 4671 1 68.32 AAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGTTGTCATTAACGGTGATTAGG:1 - chr2L 13447078 3' + HMS-Beagle 7038 2 75.25 GCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATAAGTTATGTATTTCTCTTCAGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCA:1 - chr2R 924429 3' - springer 19 2 60.40 AATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTT:1 + chr3R 17615182 3' + mdg1 34 4 62.38 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATCCTAACTGTATATAAATATATATTGGTTTAATTTATATTTAGATTTCAAAGTTAAACATATAACTG:1 + chrX 20364333 3' - opus 5 2 74.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGAGATTCAGCCTCTAAAGCCAGATAAAGCGGCGAACTGCATCTATAAAACAGTAGTCGACTCTAAAAGTTACTGGG:1 + chr3R 19449394 3' - roo 10 2 81.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCATATGATCACCACTCTCAATTTAGTTTATAAACAACGCTCGCCGGCTGCAGTTGGAAACGGAGAGCGC:1 + chr3L 11070588 3' - P-element 8 2 67.33 GAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTAATTACGCTTTAATTTGTTGCGTAAAATGTTTGTTTAATGGCAGCGATGTCGTTGCGAGTGT:1 + chr3L 10035523 3' + jockey 432 1 73.27 TCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCATCGCTGAGCCAAACGTTGGGATTCCGAAGAAAAAAAA:1 - chr2R 9928394 3' - R1A1-element 5091 1 62.00 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAA:1 - chrX 13347309 3' + roo 353 2 81.19 CACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACC:1 + chr3R 15157693 3' + invader3 271 2 70.30 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGGCTGCTGCCTAAG:1 - chrX 12538455 3' + roo 9037 1 58.42 ATTCTNCCAAAGGGCCAGCAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTAAAAGTTACTGGGTAGAGTTAGAAAAGAA:1 + chr3R 19449410 3' - roo 8644 1 71.29 TTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTTTGATATGCACAGTGCTTGAGGCCCTGCAGCCTCCCCCATTAATAATTTCAGTCA:1 + chr2L 21978196 3' - roo 8663 1 80.20 TGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGACGATTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGGGCAAGTTTGTTGACCCATATTGCCACG:1 - chr3L 23702893 3' + INE-1 147 1 82.65 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCAC:1 - chr3R 10457287 3' + roo 361 2 72.28 GATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACC:1 + chr3R 10741139 3' - 1360 3368 1 44.55 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAATTCACCCGAAGAAG:1 + chr3L 22744703 3' - FB 37 1 66.00 GTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAACATGATGAT:1 + chr3L 19881836 3' - Idefix 21 2 59.41 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAACGCAGATGCTCTGCTGTAACAC:1 + chr2L 13060355 3' + P-element 2878 2 70.30 ATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTGGA:1 + chr2R 5084094 3' - F-element 24 1 54.46 ATGATAATAACAATAATAATAATAATAAACCAAGCTCTTCGGCAACATGTTGCCAGCGACCTA:1 - chrX 16930952 3' + mdg1 26 2 55.56 ATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTGAAGGCGAAATGGAAATAGCGCACTTAAGTGATTTTGGTAGTCTTATTACCTAAATTTTCTC:1 + chr3R 2555592 3' - Bari1 14 1 66.34 TCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGACTTGGCTTTG:2 + chr3R 16626843 3' + I-element 5321 1 64.36 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCGAGAT:1 - chr3R 21695426 3' - 3S18 5787 2 56.44 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAAT:1 + chr2R 18503560 3' + roo 9047 1 51.00 TCATAGTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTGGCGCAGTCGGTAGTTGGGGCATCGATGTCCTTAAAT:1 - chr2L 7154282 3' + 17.6 449 2 75.25 ATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTGGCTGCATAGTGGCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATT:1 + chrX 20783463 3' - 1360 135 1 52.48 TCTGANGAGAATACATTCCCATGAATTCTTACACGTAAGATAGTATAATCTCTCCACGGTACATATTTATACACGGAATACCGGAAGCGAGTGCTTGAGCA:1 - chrX 2427888 3' + G5A 2682 1 72.28 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAA:1 - chr3L 19349967 3' + 1360 3337 1 81.19 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCCTGCTTTATTTGATTTGATTTAAGAAACTTTAACAAATGGTCTTTCTAAAGTCT:2 + chrX 20974937 3' - opus 7023 2 59.41 AAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCTTAGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAGGTGCTGGCGGCTTTTGAGT:1 + chr2R 20205041 3' + 1360 3138 1 80.20 GTACATGTCTAATGTTTTTATTCATAGTTTTTTGAAAATGAAATAGAAAAGATGCCGCCGCAAATGGAACTGGTCCAGGTCCCAGAACTAAGGCCAAAGC:1 - chr2L 22008864 3' - mariner2 802 1 64.00 TTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATCCGATTTACTTTCAGAGAGCTGTGCATAAAAAACGAT:1 - chr4 406762 3' - BS 5075 1 62.38 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGAC:1 + chr3R 25823722 3' - hopper 26 1 53.47 TCTAGCATTTTGTACATTTAACTCATTTTCTTTTATCATTATATATGACCTATTAGTATATAAAATTATTTTATGAATTGAATATTTCCCCAATTAGCTTA:1 - chr2L 12584487 3' - hopper 1075 1 51.49 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCTTGAAGGTTATGTGAGCTTCACGTTATCAGCGATTTTGTGCACAAACTTTTCTCACTTATACATTTACCCAACTTGCC:1 + chr2R 21200311 3' + blood 168 2 73.74 GACATAAATCCTACTTAATTCAAACCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTAAATTTGCTTATCCTACGGGAATGTGCAGCGGCAGTTGATAGTGCCAAAA:1 - chr2L 4300539 3' + jockey2 3215 1 56.44 TCCTANCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCC:1 + chr3R 15943324 3' - jockey 4681 1 64.36 GACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCAGAATTATGACAAATCTTGAT:1 - chrX 4890005 3' - 297 6580 1 81.19 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGCAGGTTCACCCTAATCCAAATCGTATCCTGAAATGTGCAGCACTTAAGTCACAGACAC:1 + chr2L 9731109 3' - pogo 9 1 62.38 AGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAA:1 + chr3L 5015857 3' - I-element 4966 1 70.30 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCTGTTTATCTCTCTTTTGGACCGACCAATTTTCTGTGTTTGT:1 + chr3L 20248399 3' - Transpac 4924 2 75.25 GGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACTTTAAAGTCGCTACATACGATTTGTATTAACTT:1 + chr3L 2292138 3' + Max-element 257 2 65.35 ACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCTTTCCAAAACAGAAGACAGATAACG:1 - chr2R 20573778 3' + R2-element 3398 1 75.25 TTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTGGAATCGCGGAAATTTGCATGCCCATCGAGCGATCCTGCAGATAATAAAAGCGCAGCTA:1 - chr3R 29533893 3' - R1A1-element 142 1 55.45 GTGGGCGTCAGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATGGTGGGTTCCCGGCCGAAGATGTGGGACTTTTGCTCATACGGAGCCGTCGGTGGCC:1 - chr2L 1165346 3' - HMS-Beagle2 189 2 60.42 CATCGCGGGTACTTACAAATACCCAAATCAAAAACTGCATGTGCTTTAATTTAATTATTTTTTACAAAAATTTAAAAAACACTAAATAGACATTCCTGTTT:1 - chr2L 10118389 3' + hobo 81 1 86.14 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCATAAACAAGAGAGATAGCCAGCTTCTGGCAGTCGACGCTTGTATATAAAAATG:1 + chr3L 21708689 3' + roo 388 2 58.42 TGTGAGTAAAAGCAATAGACGAAAACGGGTATATGTGTGTGTACGAGTGCGGCTGCGAGGGTGTGTGTGTGTGTGTTTGACAGGTGAGCAGGTTGGCCCGA:1 + chr2R 24813934 3' - 1360 3241 1 72.28 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGTTTGGATCTGGCATATTGCCAGCC:1 + chr2L 15344185 3' + transib2 2773 1 72.28 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTTGCAATTAACTTTTTGGCGGCTTTAAG:1 + chr2L 18914589 3' + mdg1 7411 2 70.30 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATATATAGTATTTATTTATGGTTAATATCCCTTAAAAAGTTTCCATCT:1 - chr3L 22231576 3' + 297 6953 2 60.40 TGGAACACGCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAACAAAGTCAAGTTGAAATCAAT:1 - chr3R 13092512 3' + R1A1-element 5308 1 76.24 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTTATTGTCATGGTCTTTGGTAGCTGG:1 + chr3R 27189340 3' + roo 9049 2 54.46 AGAACGCGGTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCTCGTTTTTAGCTTGTCAGTTCTTCGATTCTTCGGTTTGATAGTTGTTTTTTTTTTCGTTT:1 + chr2R 8064901 3' - Doc 365 1 65.98 TATGTTACTTCTGGATGCGTTGCCCCACAGCTCGGAGCCATAAGTCCAGATGGGTTTTAAAACTATTATTTACAGAAAAGCATATATGCAACTAAGTACTC:1 + chr2R 20700055 3' - Doc 4315 1 57.43 AATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTATGGCAGTCAGCGAGCATATTGAAGTGTTGAAGTCCCCCATTT:1 - chr3L 13734081 3' - copia 4945 2 57.43 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACATTACAGATGCTTTTACTTATATCCCTTAATCGCTTGCTCATGTCACGAGCTCATTGGCTC:1 - chr2R 10688009 3' + roo 9047 1 52.48 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGCTTTTGTCCGCTATTCAGCGATTTTTTTTGTGTTGTAAT:1 - chr3R 11764316 3' + 412 7474 2 61.39 GGTAANCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAA:1 - chr3R 13715076 3' - P-element 26 1 53.47 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTATAAAGAAATAGAATCTTAAATATTAACATATCTAGAAAATTTTGTTA:1 - chr2R 18295583 3' - I-element 6 1 71.29 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGGCTATAAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATCCTTGGCAACAGTTTGTCAGATGTAGGTTTCTTTTA:1 - chr3R 9504041 3' - INE-1 579 1 66.34 CTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAAACATTTGATGTACCACACCGCAGAATGG:1 + chr3R 10307476 3' + Quasimodo 233 2 74.00 CTTAAGCCTCACCCCACCATCACATTCCCACGTTCAAATGGCAACATCCCAGCTTTCCAGCATCGTGGCGGCACAAGTTGCCAGTTGCCAATGCTGGCGAC:1 + chr3L 7230387 3' + Idefix 224 2 56.44 AATGCACAATTTTAGTCTCTTCCGACAGACGAGCGAATGTTGCGTAAATTACACGAAAGAATAAGACAAACACGAAGCTTGAAAAAGCACTAAACAACGG:1 - chr3R 21837339 3' - diver2 235 2 76.00 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTG:1 - chr2L 20118669 3' - Max-element 8246 2 68.32 AACAATGAACCCCCGACCAATCTACAACTTTGTTATCCCTTTTGCGGATGTTTGTCATGGTTACGGATGAGCAACTAATAAAGATTTCCAGCATCCCAG:1 + chr2R 22863370 3' + G-element 4212 1 71.72 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAAACAC:1 - chr3R 5505228 3' + mdg1 7424 2 58.42 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTTTCTATGGGTGAGTTATAGACGTTAGAA:1 + chr3L 13994399 3' - P-element 29 1 33.66 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCAAAAGAGTGGTGCTCATTGAATGATCTTGTCATCGAAGCT:1 - chr2R 18503488 3' - roo 8699 2 63.37 CATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACAAGCACTCAACAATCATTGCCCTTATAATTTTTCACACGTCGCAAGCTTGTGGTGGCTTTGTATGGCTAAACGCT:1 - chr2L 10419436 3' - 1360 478 1 73.27 GCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCG:1 - chr3R 7388355 3' - HMS-Beagle 6842 2 72.28 CTCGTTGTCGCCTCTGTAGCTGTGGTGTGGTACAGAGTGCGGATCAGGACCAGGTGGTGGTCAGTGCCAAGTGAAAAGTGCCAAGATTTACGAGCTGTTCT:1 + chrX 10675270 3' - Chouto 447 1 59.41 AACCGCAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACAT:1 + chr3L 14910616 3' + roo 352 2 81.19 CTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTACTGGAGGATGACTTTTCCGCCATAGCAAACGCACTTGGGATCAAGCTGGAGGGTTTGGTAGAGGAAATGGGGAAAACGC:1 - chr2R 3186157 3' - Osvaldo 18 1 74.26 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAA:1 - chr3R 7522285 3' - blood 7027 2 63.37 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAATCATCATCATCATCATTGGAAGCAGAAAAAGCGAAATAACCGGACATTATATCGCTTTGGA:1 + chr2R 6108020 3' + jockey 4961 1 61.39 CTTTAAGTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAATATCTTTTGCCCATTTTTGTGGCTTTCTTAAATGTGTCATAATTAAAGGCACCACTTTTTCGTGGGCCGAT:1 + chr3R 26885599 3' + transib2 465 1 55.45 CGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACG:2 + chr2R 6984406 3' + HMS-Beagle2 7175 2 59.41 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGTAACATTATCGATAATATAGTAATTATTTTTCATTATGCAACTCAA:1 + chr2L 13739988 3' - 412 7070 2 58.43 CGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGAGGACCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGGAAAATAATAACAATAACATG:1 - chrX 11533912 3' + invader6 343 2 52.48 AATGAATAAAAGGCGAAGCCCTCGCAGTAGCAAGTCAGTTAGATTCAAACACGTAACCCGAGGCCTAAATAATATTTAAAGTGTTATAAAACTGTCACCAG:1 + chr2R 11511908 3' + rooA 7524 2 54.46 ATAATCGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCC:1 - chrX 4890026 3' - 297 6601 2 60.40 ACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGTTCCTTCTATTTAAATTATGTGCATGTATTTC:1 - chrX 17064761 3' + Tirant 357 2 67.33 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGGGTATCCAGAAGTCGCCATCACCTTGTTCGTAAGCCA:1 - chrX 1235418 3' - P-element 37 1 42.57 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAGCACAATGGAAAGTTTCTCAAGCTGGCCCCGAAATA:1 - chr3R 19114166 3' - 297 4 2 76.24 AAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGCTAAATAAAATGACATTAAACAAACC:1 + chrX 17204133 3' - Tabor 6890 2 72.28 TTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGGTTTGCATTGGGATAGTTGTAATGGGGTCTTTCATTTGCGGGATTTTCAAAACGAACCTTATTT:1 + chr3L 18155379 3' - I-element 5110 1 67.37 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCG:1 + chr2R 18503546 3' + roo 9032 1 65.35 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTAGTTGCCTTGTTAGTTACGTAGCTTTACGCTCTTTGAAAG:2 + chrX 21401944 3' - roo 8678 2 64.36 CCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGT:1 - chr3L 25889014 3' - gypsy8 309 1 77.23 GCAAAATACTTTGTATATTTGTTTAAACTACTGCACAAATCACAAAAGAACCTCTCTATCTGTCTTTACAAATTCTGAATCCACTTAAAAGTGAATTTTAA:1 - chr2R 14946951 3' - Cr1a 173 1 52.48 CAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCT:1 - chr3L 17869908 3' - 1360 25 1 50.50 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTT:1 + chr2L 2437758 3' + roo 9021 2 76.24 AGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGT:1 - chrX 21087572 3' - mdg3 5269 2 60.40 GAGCGGAAGTTGTTGTTGGTTTGTCCTCTTCGGGCTCCTTGATTTCCGGCTGGGTTTCCAGCTTGACCTGGAACTCGTTCTGTAAGGAAATGCATTTTTAG:1 - chr3L 21132727 3' - Porto1 436 1 79.21 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACGATCAAGT:1 + chrX 21667938 3' + flea 4991 2 55.45 ATCGTTCTAAAATAAGCCAACGCGAATTGCGCGCTCACCGTCAAAAAGACCAAGAGACAGGCGCCCGTCAGCAGCGGCGCACTCACGAGCAGCCCAAAGGC:1 - chr2R 16133540 3' + Doc3-element 210 1 64.36 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTGTTGGTGTACCAGCCTCAGCAGATCTGAGAATTCAAGGCTCGCTCAATTTTAATACCATCTGT:1 + chr2R 17639913 3' - 1360 13 1 59.41 ATCAATTGCATTATACGGCATAAGTATAAAGACAATTGATATAATGGAACCAATTCATTCGCAACGATAAGGGGCGAGAAAATGGGGAAAAATAGTGGGGA:1 - chr2L 18437940 3' + jockey 302 1 62.38 GTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGCA:1 + chr3R 15157696 3' + invader3 5460 2 73.27 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTATGATACCATTTAGCCGGAGGGTTGTTTTGACAAATTGTGCAAATTATTGTG:1 + chrX 7828960 3' - 412 24 2 55.45 GAGGTCACTGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCAATGCGAGCAGAGTCTATTAATATAGCCGCAGGCCGTCTTGTCATG:1 - chr3R 5318585 3' - Doc 499 1 58.42 GCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACCAGCTAAAAGTGCGATCATCTGATACTTCTCCTTGGTGAACTTGTGCACAATGG:1 - chr3L 15159572 3' + HMS-Beagle2 68 2 74.26 CCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACACAGTGGCCAACGGTTAAATGAAGTATA:1 - chr3R 20884877 3' - flea 17 2 65.35 GGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTGTGAGCACCAAAATGTAGGCAACATAACATAACACAATACATATGTA:1 + chrX 9248367 3' + pogo 2079 1 58.42 GGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGAGCAGGAATATAGCAATATACATCTATTCCTTGGGTATTTCACAACAAGCACCAAACAGGATCACATTCTAGC:1 + chr2L 21681788 3' - INE-1 101 1 66.34 TCTCGCACGCATTTATCTGTACGGCGCTCATTCAATTATTTTGTTGAGTCTGTCTCCGCTATTATCTGCTTTTCACACGGCAGCGCCGAATCAATTGTGCC:1 - chr2R 17585026 3' + diver2 4647 2 76.24 AGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTTCTATTGCATACGCA:1 + chrX 8364666 3' - jockey 4775 1 60.40 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCCCACGTGT:2 - chr3L 9692646 3' - P-element 4 2 75.25 CCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCATGCTCATGCCCATGCCCATGCCCATTCCCATGCCCAA:1 - chr2L 17309108 3' + F-element 4419 1 62.38 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCACTCAATCAGTAGAAAAATGCCAATTCAG:1 - chrX 4154927 3' - blood 46 2 69.31 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACGGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGC:1 - chr2R 9014440 3' + blood 7336 1 78.35 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATG:1 - chr3L 19951199 3' - Ivk 31 1 57.43 AGCCCNCGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATACTTTAGAATTTAAATTGTCATTAATTAACTTGGTTCGCATCGGTTAAGAGAAGGGACG:1 - chr3R 31876895 3' + FB 216 1 56.44 CTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGAAATATATG:1 - chr3R 16626772 3' - I-element 5277 1 57.43 TTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAACAATGAGTAAATTTGTAGCTGCATAGAACTAGAGAAACAAAACTCAGCTAATCAGTGAGTTAGTTTGTTTA:1 - chrX 12703612 3' - FB 4 1 76.24 TTTTGAAAATATTTGAAAAGATGTTTTGTTTATATGATATATTTAAAATATTAATAATAAGGAGAATACATTTGATAAAACTTCTGTTTTCAAAAAAAAAA:1 - chr2L 16998156 3' - S-element 1442 1 79.21 GAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATAC:1 + chr2L 23295869 3' - micropia 4981 2 51.49 AAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTATATACGTTCTTCCCTGTTTTTTTT:1 + chr3L 13652826 3' + hobo 2888 1 74.26 ATTTTTCTGGGATATCGATAAATATTTGGGAATAAAATGAGAAAAAATTTTTCAAAAGTGTCTCCGCGGGAGGCGTTGTATGAGCTCGGTAGCTCGGGTCT:1 - chr3L 6315095 3' - INE-1 501 1 57.43 TTAAANCGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTAAGTAAACTTAGTAGCATTCAATAGTAGCATCAGTTTGGAACTTATAATGAT:1 - chrX 14531478 3' + 412 7527 2 59.41 AAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGTAGAGCGAATGCGAAAAAAAAAATACAGG:1 - chr2R 9387338 3' + Stalker2 358 2 67.33 AACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACC:1 - chr2R 12185347 3' + accord 7337 2 71.29 AAATTTTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:1 - chr2L 21750457 3' + Stalker4 6876 2 67.33 CTTCGNCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTAAA:1 - chr2L 15333707 3' - P-element 20 1 57.43 TAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCGAATTGGCTCCTCTTTAAAATCATATGCCCGATTCAGCTCAAAATTAATTTT:1 - chr2L 17889316 3' + accord 7362 2 57.00 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTC:1 - chr3L 21841308 3' + P-element 2843 1 35.64 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATAATTCAATGAGGTTCAATTGATTATTTTCTTAATTTTACTTCTTTTAAAATTC:1 + chr3L 7808499 3' - jockey 27 1 47.52 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAAACCCACCCAACTCACCGCTCTTCCGGGTTTGAT:1 - chrX 3363620 3' - hopper 67 1 69.31 AGGGACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCACACAGATTCTACCCATCTTGTCACGCCCACTCTAACGCCTACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCC:1 + chr3L 19271023 3' + INE-1 156 1 73.27 AACGAGAATAGTGAAGAGGAAAAAGAGTGTCCTGATGACTCTTCGACATATATGTATATGTATGTAGAGGCCAAGCTTTCGCTTAGTCAATCTGCATCGGC:1 - chr2R 5617507 3' + invader1 376 2 57.43 AAAATGTAAATATATATATATATAATGGATTTCATTCGCCACTCACGGGCATCTTTTGGAACTGCCGGGCATAGTGTTGCAGGTGGCAGGTGTGCAGGCCG:1 + chr3R 27313954 3' + G3 4506 1 70.30 CACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTC:1 - chr3L 19951186 3' - Ivk 18 1 61.39 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTGCAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCGTT:1 - chr3R 12877821 3' + mdg1 7405 2 74.26 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATA:1 + chr2L 3694165 3' + roo 9044 1 60.40 CCACTNTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCCTAAGTACAGAGATTTCGAATAATTGCGAGCAGAGTCTTAACTACTG:1 + chrX 2589800 3' + copia 109 2 52.48 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTCATCGGCAACCCTAT:1 + chr3L 15638322 3' + roo 404 1 75.25 GGTGACCCCGCAATAAGCGAAATGCAGAACTACCTTAATGTGCTGTGGGGCAAGCTGGCCGCCGAGATTCTGACCCTCAACTGGAACACTGCTCTGGAGGA:1 - chr3L 16786097 3' + Chimpo 210 1 78.22 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACG:2 + chr2R 18503552 3' + roo 9038 1 59.41 ATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTAAGTAATCTAAAAGCACATACCTTTTGTTAAACAATTTGTGACTTGTGTAAATA:1 + chr3R 7183355 3' + F-element 4574 1 57.00 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTGTAC:1 + chr3R 27080802 3' - HMS-Beagle 6819 2 56.44 CGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTTCCTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTTGTGTGTGCGAGTGTCGCAGCTTTCCCATG:1 - chr2R 8657032 3' + Cr1a 182 1 75.25 CATATACATACTCATACTTTCTGCTGTGTCAGATACTTTATTTCTAAGAATTTTAACATTGTAACACACACCTGAAACCAGAAAGTAGGTTAACTCGTTCT:1 + chr2L 16674200 3' + ZAM 8170 2 70.30 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCACG:1 - chr3R 23617991 3' - jockey 4796 1 65.59 CTAATNAAATCTCCACAACCACTGCCGTCACATGTTCAATACCTATGTAGAGAAACCCGATTCCAAAGAGATTTGACGACGCCCTAGCAGCGGACAACGAA:1 - chr2L 19569119 3' + accord2 7342 1 62.38 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCACAATCATCAACTTGCCCAGCAATCTGGAGAAGCACACAACGCATCGATACAGCAAGAACTCCTTCAAGCTGCAT:1 - chr3L 8973976 3' + P-element 2879 2 78.22 TGTTACACAACAGAAAAACAGTACAACTAAACGTCTACTCAATGTTATCCAAATCTAGAGTGGAGAATTAAAAACGCGAAACTACTTTAACTTTTGCTCTT:1 + chr2R 4546219 3' - transib2 333 1 56.44 ATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTAGGCTTTTCATGTTTTTGAAGGCTGTAAA:1 + chrX 13134985 3' - jockey 4796 1 51.49 CTTTTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTT:1 - chr2R 5249847 3' + Tc3 236 1 66.34 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAA:1 + chr3R 7101049 3' - pogo 46 1 78.22 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTTATCTCAGGCCA:1 + chr3R 7522393 3' + blood 7380 2 69.31 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCC:1 + chr3R 9952228 3' - Ivk 50 1 76.24 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACAGCCTTCGAACTGTCCGGAACGTGTTTCAATTCCCAA:1 + chr2R 4044725 3' + pogo 2065 1 64.36 ACTGCCAGTCAAGGTATGACTTCGGTGAGCAGAGATAGTGAGTCCGAGGAGCGGGAAAAGCGGGGGAAAGGTGGGGAAAAGCTGTGCTGACATGCACAAGC:1 - chr2R 23822821 3' - Rt1b 4979 1 72.28 AGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAGTTCATGCAAAAAATATTGCATTATGCTGTGGTTAATACTAAGCTCGACAATTTTGCATTGTGTGTTGTTAAG:1 - chr2L 15893670 3' + Max-element 295 2 74.26 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGC:1 - chrX 2762125 3' + roo 9036 1 62.00 CATGCAGCAGAAGCGACAGAGTTCACTTCTGCAATGCCAATTTGTACAAATGGCTGTGAAGCCGGCAATGCCCCTTTCAGAATGGCGAATCCTTGGACTGC:1 - chrX 1032010 3' - baggins 5199 1 73.27 TCTCTTCCTTCAGTGTAGGCCATGAGTGCGCCTCCTTTCACCCTTTAGTCGCTTTTTACTTCACACATAGCTTAGGAAAAGGTGTGAAAAGCGTATACTGT:1 - chrX 18783381 3' - Rt1b 4927 1 56.44 ACACACACACACACACACATGAGCGGGCATCTCGTCAGGATAGAAGTAATTAAAAGTAAATAAAGTCAAACAAGAGATAAAAGCAAGGATTAGTACGTTAA:1 + chr2R 19928551 3' + Quasimodo 39 2 69.31 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGACCAAAAACCTCAATTCGAATT:1 - chrX 20437662 3' - roo 56 2 80.20 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGCAAAACAGTTGGCAGTTTTGTATGCAAAATGTAATCAATTGGCGGCATTTTAAATGCAATTTGTAAATGACAGCTA:1 + chrX 2762229 3' - roo 8664 1 78.22 CGGGAAACTCGACTATAGCATCCTCTCTTGCTCTTCTGTGCTTGGGGTGTACACACCTAAAATGTTGTTAAGAATATTGACTAGAATAGTACGGTTTAGGT:1 - chr2R 5246360 3' + INE-1 570 1 72.28 GTTTANCGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAATGACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGG:1 + chr2L 18953115 3' - copia 4889 2 60.40 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATGTGT:1 + chr3L 22324315 3' - jockey 4714 1 67.33 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTCACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCTTATGGATGTACATATTGCTGACATGGAGAGCCACA:1 - chr3L 19779025 3' - Tirant 12 2 58.95 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCG:1 - chrX 6997180 3' - P-element 41 1 38.00 GGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGT:1 + chr2R 6984397 3' + HMS-Beagle2 283 2 57.43 GCGCCNTGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTT:1 - chr3R 19467883 3' - Transpac 41 2 69.31 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGA:1 - chr3L 5975599 3' - hobo 39 1 62.38 TTTTAATGTCAAAATTATTATTGGTTAATTATTATTGGCAGTGGCAAATCAAAAGACTGAGGCAACAAACTTGGTGCTCAAGCAAGTTCAATTGGTATGGT:1 - chr3L 3103446 3' - P-element 2506 1 61.39 ATGGGAAAAAAATGGGCAAACGGTTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAAGTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAAGTAGGAGTAAATGCATCCA:1 - chr2L 609015 3' - FB 57 1 76.24 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGA:1 - chr2R 20838618 3' - 1360 47 1 74.26 ACATTNATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGGGTACTTATAGGGACAGTGTACCCTCGATATATGCACAAACTACAATAGCACTCAATCAGAAGAAAA:1 - chrX 4154939 3' - blood 58 2 74.26 ACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTACCAGGACGAGTAACTACAAAAA:1 + chr2L 17940375 3' + Doc 278 1 77.23 TCGGCTATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATTTTCCCAAA:1 + chrX 158248 3' - INE-1 89 1 75.25 TAATAACGTTAAAGCAATGCAAACAAGAATTTTTCTTGGTCATAAGAAAAGACACACGTTGGCTTTTTGGTATTTGAATTTTAACTTTAAAAATTTTTATT:1 + chr3R 869927 3' - 1360 300 1 74.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCCTGTGAATCGGCTACC:1 - chr2L 11065843 3' - P-element 6 2 75.25 ATTTCGTTTGTTTCCTTTGTTTTACTTGCACTTGCACGTTATTATTTTTCAATACGCTTTATCCAATTTCACCACCCCTATTAGAAACCCCATCACGTTTC:1 - chr2L 17134861 3' + accord2 7254 1 71.29 ATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATAAGTTTCATTTGAAAAAAGTTTAAGATACTAAATATATTTTTAATGA:1 - chr3L 17917795 3' - I-element 5028 1 57.43 CGACGGCTGCCTTCAACTGAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCTTTTTAAATGTGCTTTATACTAATATTGTTTTAATTAAA:1 + chr3R 26404541 3' + 412 7510 2 58.42 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGACAGCATTGACCACAGCTGCAGTTAACGTTGTAGTCCCACTCACAGATTCT:1 - chr3L 3267503 3' - jockey 4749 1 69.79 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCTCCTCTCGTGGCGATTTCGATTGTGGCCGGCAATTCCG:1 - chr2R 14466638 3' - mdg1 7047 2 42.57 GCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCACTGCAT:1 - chr3L 12072522 3' - HB 11 1 65.35 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATGC:1 - chr2R 22997960 3' + Transpac 5194 2 64.36 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACA:1 - chr2L 19642989 3' + roo 358 2 74.26 ATTGCNACGAAATTGGCCAAAACTCACCAAATATGTAAATTCGTTTCTTCGATCAGAATTGAGAGTTTAGGGAAATGTAAATTTTTCTTTTCCCATCCCAA:1 - chr2L 13886357 3' + 1360 3119 1 71.29 GAGCCAACGGGGCTAAATTAAATTAATTAAATAATTCAGCAACGCGTTGTTGAAATAACAAAACTTCCGCCCACACAATCGTCTCAGGATTCTCTAATTAT:1 + chr2R 624520 3' - mariner2 230 1 54.46 CACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTG:1 + chr3L 20903859 3' - F-element 56 1 67.33 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACGAGGTATTGGGTGACAATAAAGTTTG:1 - chr2R 7255814 3' + 297 348 2 79.21 CTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCATATATTTTTCGATTTTCGACTGAAATTGCTATACTTTTTCGAAGTGAT:1 - chr2R 12258644 3' - transib2 2479 1 57.43 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTG:1 - chr2L 326151 3' + roo 9020 2 74.26 CCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTATATATGCCTCATACTGCTTATTCTC:1 - chr3L 19901430 3' - 17.6 72 2 79.21 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTCTTTCTGTCTGGTG:1 - chr2R 9862181 3' + roo 406 1 71.29 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGTATGTAATATGTATGTATATATACT:1 + chr3L 9663333 3' - roo 37 2 74.42 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGTAGTGGCAGCCAAACGAGCGTCCCTGACCACGTTTATTGTGC:1 - chrX 8031318 3' + roo 399 1 46.53 AAAAGCAAAGAAAAACAAAAAACCAACAGCATACAATGTGAAGAACGCCATACACACTCTAAAAAGTGAAGTACAATTTAGAATCGTCAGCAGCCCG:1 - chr3R 25885080 3' + F-element 4675 1 57.73 TTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAATAACTAATTAATAATTAATTAATAATGTCCTTTTGGTTCTTATGTGAGATAAATATACT:1 + chr2L 17841086 3' + Juan 4052 1 43.56 GAAGTACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGGAATTCAGCGTTTAAAAAGTGAAAATGGCTCAGCAGCAGCTAATTA:1 - chrX 19611291 3' + R1A1-element 36 1 52.33 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATAAGGCCACTAATGT:1 + chr3R 7101088 3' - pogo 7 1 72.28 CACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAACGCAGATGATCTGCTG:1 + chr2L 13060349 3' + P-element 2886 2 72.41 TGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCG:1 + chr3R 2689392 3' + diver2 4476 1 45.16 ACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCC:1 - chr2L 11047990 3' + Juan 4169 1 71.29 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGT:2 - chr3L 543436 3' + P-element 2833 1 25.74 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACG:1 - chrX 16798200 3' - diver 28 2 51.49 TATGGGGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAG:1 - chr2R 5485050 3' - 1360 15 1 64.36 TTTATGAAATGATTCGTTCTGTTATGTTCTGTTATGTTCTGTTCTGTTCGGTTGAGTTCAGTGCAGTCGGTACTCCCCTACTCTGTACTCTGTACATACAT:1 - chr3R 21326757 3' - Doc3-element 4623 1 75.25 CGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTGGACATATGTTGGTTGCCCC:1 + chr2R 5084111 3' - F-element 7 1 71.29 AAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTGA:1 - chr3R 7100970 3' + pogo 2090 1 64.36 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGT:1 + chr3L 12085226 3' - pogo 35 1 62.38 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGTCTCTAAATCGATTCAATTGGAATTTTTCAGTAGACATCCGCTTTTGGTGAACAT:1 + chr2L 10126594 3' - mdg1 7059 2 58.42 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTG:1 + chr2L 15955326 3' - Quasimodo 33 2 64.36 CTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACAAAAACTTTGGGCATCATACTACTCAACATGATACTAGTGCTTTATCCCT:1 + chr2L 20690085 3' + 17.6 237 2 52.48 GGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATTCACGATTTATTTTGTAGCTAAAGGACGTACATATATATCTTGAAATAAGTATAGTAAAAATG:1 + chr3L 16519788 3' - TAHRE 10416 1 54.46 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAGCGTGATGAACGATGCTTTCGTTGGACTCTGGTTGCC:1 + chr2L 13837963 3' - 297 5 2 75.25 AACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATATATAAGTTCCACAATATTACTGGTAA:1 - chr3R 8283309 3' + F-element 4598 1 73.27 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAAGGCACACCACACTTCGT:1 - chr3L 21841274 3' + P-element 2877 2 69.31 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCCGCGAAGCAGAA:1 - chr3R 27189265 3' - roo 8699 2 62.38 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCAT:1 + chr2R 14381335 3' - hobo 44 1 71.00 AAAAAAAAAAACAAAAAAAATCACTCGAATAGAATTCGTGGGTGAGGGGAAATACTGTAAATAATAAATGAGATCGGGACTAGAAGAAGTTCTTACCCTTA:1 + chr3R 24437682 3' - hopper 142 15 78.22 CGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACTATTTCTGCTTATGATTCAATCCACGAATTTGGTTGCACTCAAAGTGAATTTATATTGCC:1 - chrX 10251718 3' - flea 16 2 63.37 TCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCTCTTTCTCTTTTCCTGGCTGTGCCACACAGAATATACATATGCAGACGTCTATTTTTAAATGAA:1 - chrX 10088983 3' - FB 10 1 61.39 AATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTATATTATTTTCATATTACAGGTATCAAAAGAGAATAGAAAA:1 - chr2L 1129040 3' - HMS-Beagle 6797 2 76.24 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATC:1 + chr2R 19936677 3' + roo 9033 1 61.39 CAGACNGTACCAAGCTGTGGATATAATCTATTGAAATATCTTTCCATAAGGTTTGAATGTTCGAGTGGCACTATGAACCCTTTCCCTTAAGACTGAAGCCC:1 + chr3R 28772768 3' - Tc1-2 1301 1 56.44 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACCTTTTCATACGAC:1 - chr3L 14910571 3' - roo 8696 2 59.41 CATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAACGGTAACAGTAATAGGAATAAAAAA:1 + chr3L 16896349 3' + Burdock 193 2 75.25 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTG:1 + chrX 18193785 3' - hopper 41 1 65.35 CACGCCCACTCTAACGCCCACAAGCCACCAATTTTTTCATTATATTCTCCAATTTCCTAAAATTTATTAGCATTTTCCCCAAGTGCATCATATGTGTGCTG:1 + chr3R 24143250 3' + INE-1 215 1 58.42 TGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCATATGAATACCGGGGTTTTTCTTGGGCTCGAGCGGAGCCAATCGATCGCCAC:1 + chr2R 11419779 3' - roo 151 2 58.42 CGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACACACACACACACACACATAGAGGCCTCGTCGCTTTGTAGCCGTCGCTTCGCCTCTTTTTTTCGGATTTCAGATTG:1 + chr3R 22781660 3' + 1360 3193 1 76.00 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTGCGTCACGG:1 - chr2R 9426433 3' + P-element 2864 1 58.42 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATAAAGGTAGGACTATTAAATTATAATTTCTATTTATCTTCG:1 - chrX 9248287 3' - pogo 27 1 59.38 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAACTTATAACGTGTAATTAAATTTATATATAAATTTCTATTAGCTTGTATGTTAACTAGCTATTTAA:1 + chr3L 20490748 3' - FB 12 1 63.37 AAAAATAATATTTAATTTATTTGAAGGAATTGGCTCCAGATGCACTCTGAGAGGGAAGTGCGGCTGAGATGCGCTGTGCCAGATCCTTAGTATTGATCTCC:1 + chr4 603658 3' + blood 6917 1 64.36 AGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCTAGGAACATGTTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTGTGTGTTTCAGTTGTTTCTGCAGCCGCTGCCTCCTA:1 - chr3R 19271500 3' + opus 7190 4 64.36 CGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCATGCCATCGACTGTTGGCAAGCAGTTTGTTACCTCTTTCCTTGGATCGG:1 + chr2L 5111717 3' + F-element 4423 1 52.48 CAATTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAACCTATCTTAGCAGATCAGGAATGTTTGGAACTTAAAAAAGGATGCGAAA:1 - chr4 1006638 3' - hopper2 1560 1 60.40 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCAGTATGGATGGGAACTGCGTCAT:1 - chr3R 19076138 3' + roo 9045 1 58.42 CGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTGGGAAATACCAGTAAAGTATGGGTTTCCCCATCATAATGCCGCCCACCTCTGAACCGCCCAACCAGCAGATAAAA:1 - chr3L 20592256 3' + gypsy8 443 1 72.00 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTTCTAGT:1 - chr3L 11070498 3' + P-element 2855 1 47.52 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAG:1 + chr3L 9692718 3' - P-element 49 1 25.00 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTG:1 + chr2R 12779146 3' - roo 8710 2 73.27 CTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCTTGTGCGAAAACCCACTGAATAAACATTATCCCCACAGAAAGTAGAAGATTGAAATCGAGTCTGCGTTATGT:1 - chrX 22599873 3' + INE-1 577 1 62.38 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCCGCCTCACTTGACTGGTTATAGCATTGTGTTGTCTAAATAAT:1 + chr2R 15307976 3' - FB 37 1 58.42 AAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAG:1 - chr2L 20928085 3' - Chimpo 45 1 71.29 ATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTAGCTTTTCCCCAGCGGTTCATTTCATTTTG:1 + chrX 4180103 3' - I-element 5037 1 72.28 TTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGA:1 - chr2L 20928072 3' - Chimpo 32 1 58.42 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTT:1 + chr3L 15638299 3' + roo 9044 1 58.42 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATGCATGAGCTTTTAGAAATCATGTAGACATTAGTTGCCCTGCAGTCGTTTGACTGTTT:1 + chrX 5515831 3' + 297 383 2 64.36 GGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCGCATCCGATTCGAGTGGCCAAGACGATCGATGTCATCGCT:1 - chr3L 15851824 3' - hobo 54 1 60.40 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGG:1 + chr3R 7522380 3' + blood 355 2 56.44 CTACATGGCGACCGTGACAGGACCGTCATAAGTGCAAGCACTGGACGTGGTCCTGAAGCCGGTGATCGA:1 - chrX 23339371 3' + Stalker4 426 2 68.12 ACCCCNAGTTTCGACTGGGGCAATTACAGGTCAGTAAACTTCAGAAAAATGTGAATAAGGATCTGCGTTATGAAGGAAAGGATACAACTCAGAGGAGCGTG:1 - chr3R 15202812 3' + Gypsy12A_LTR 419 1 53.47 TTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAACATTTTTATGGCAAGCATTTTAAGGCCCCATTTAAATAGGCAATACTTAAAAATATGACTAATGAAAGACAGAAA:1 - chr2L 18513549 3' - jockey 4670 1 25.74 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAAATCTAACATATATGTTAATTC:1 + chr2L 13250422 3' + pogo 2053 1 76.24 GGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGATAAGTACTGTAA:1 + chr2R 5485153 3' + 1360 3376 1 64.36 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAATATAAGGGTTCATGTGTTCCTAAGCAGTC:1 - chr2L 18028650 3' - flea 4763 1 74.26 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGC:1 - chr2L 326143 3' + roo 9028 1 66.34 TAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCCAGCATAATTGAGTCGGGCCAACGTGTGAGCAACATTCCACCGCATTCAGG:1 + chr3L 18568919 3' + 1360 234 1 55.00 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGATTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATGCAATTACGAATCAGATAAGAA:1 + chr2R 19357445 3' - jockey 4683 1 67.01 TATTATTATTATTATTTTTATTATTGCTGATGCTGTGGCTGGTAATGATGATGATGTTGCTGCTGCTCCTTCGATTGCCGTTGATTGCCCAATGAAAACGA:1 - chrX 11691162 3' - mdg1 7069 2 76.24 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTTATGTC:1 + chr3R 11496893 3' - Doc 31 1 54.00 CGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTA:1 + chr3R 20119942 3' - S-element 70 1 81.19 ATCTATGTTTGAGGTCTATAACCGCGTTAATCACCTCCCGCGAGACAAATCATGCCTCCATCCCGCTCCCACCTGCAATTGCAATTGTAAACCGCTGTTTT:1 + chrX 15453448 3' - rooA 7410 2 65.35 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCA:1 + chrX 6654744 3' + P-element 2825 1 22.77 ACTGACGGGACATTAGTTCCACTCAATAAACACAAGCATTTCACTATATATATATCTTTATAATTCTCTAAAACTCGTCTATCGTTCATTATGGAATCTGT:1 - chr2R 4788797 3' + 297 6949 2 61.39 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGGGAACTTTTTCTTGATGGGGCTGTCAGCAGAAGCAGCGCGGCAGTGGTGGCGGCAGCGGCGCGACAGAG:1 + chr3R 11471877 3' + P-element 2883 2 69.31 ATTAAATTTAATAAATCGCTTTAAGCACGTTCGATCAGCAAATTTACAATAAAATTCAATAAGGTGTTGGGGTTGGACTTAATGGAGATTGACTGACAGTA:1 + chr3R 25499744 3' - S-element 379 1 60.40 GTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGTAAA:1 + chr3L 25350826 3' + baggins 5419 1 38.61 GAAGGGAAGGCAGCTCTGCATATCTGGATGATCAGCAGAGGCAGCAGCAACGCAAGGAAGCCAAAAAGGAGCAGCAGGTGACGCGGGCAGAAACGTACGAG:1 - chr3L 6567587 3' - Burdock 5982 1 69.31 AAACGTGCTTAAAGCGAATTATTAAATTTAATAAAATGCCTGGAAAGAAATCGAGTGAATAATAAGATTGAGTTTGCTCCAATTTACATCAAGACATGGAA:1 - chr2R 17442461 3' + S-element 369 1 56.44 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATTAACAAGGTTTGCTCTTAATTCGCCTAATAAGAAAATA:1 + chr3L 14050054 3' + pogo 2069 1 60.40 CACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATGATTTTATTGTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCAAAGGTTATTGCTTGCATT:1 - chr3R 19449870 3' - Quasimodo 129 2 69.31 GGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAA:1 + chr3L 5015866 3' - I-element 4957 1 60.40 TATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTCATAA:1 + chrY 3648914 3' + 17.6 7416 2 75.25 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGCACTAAGCCACTGGAGCTGCGGGACTATCGATAA:1 - chr3R 18906603 3' - P-element 41 1 38.61 CTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATTTTTTATGCGAAAAATTCC:1 - chr2L 18159033 3' - INE-1 152 1 51.49 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGCCGTACT:1 + chrX 7787282 3' - roo 48 2 75.25 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAGGTTGTCTTCTGATAAAACCAATGATCACAATGATTCTTTATTGGGCGCCAATAAAACAGAGTTTATT:1 + chr2L 6868005 3' + Juan 4204 1 73.27 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATATGTATCGGCGCCCAATGTA:1 + chr3R 31644211 3' - roo 27 2 56.44 GAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTAGCTACCGAATGTAAGCACCTGGCTATAACCTTTGCCAGTCAAACACATCGCTAAGCATGTCAACTTATTTCT:1 + chr3L 25585664 3' - roo 8917 2 72.28 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGT:1 + chr3R 25285133 3' - roo 34 2 67.33 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGACACCACCCATCGCCCACTTTCCACCCCATATGCCA:1 - chr2L 2920894 3' - hobo 40 1 63.37 TTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGATGTTTAACATTAAATTCTGCATTGGAATTTTGCAATCTTCCTCCAACTCTTAGAACCCC:1 - chr3R 19446907 3' - I-element 250 1 65.35 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTCCAAGGGCGTCGAAAGTGAGGGGGGTGGCTAGCCAAGGGCGCA:1 - chrX 2589646 3' + copia 242 1 66.34 TTAGTNAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATATATAGTATTTATTTATGGTTAATATCCCTTAAAA:1 - chr3L 22231587 3' + 297 6942 2 70.30 AGCTGAGTAGCGGGTATCGGATAGTCGCGGATCTCGAGCCGTTGGGATGTATATTTCGCACTCCTTTATTATTTTTATCGATTTTCAGCTGATGGCTTTAT:1 + chr2R 5813446 3' + INE-1 545 1 63.37 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAACGATATAC:1 - chrX 2762107 3' + roo 390 2 59.41 ACAGATGCTATTGTTAGGCAGTTCATCAACTTAAAGTACATTATTTTATATTTTCCGTTGAAAAGATTAAATGTTTAGCGATCTGAATTTTACTACACGTG:1 + chr3R 1872846 3' + G5A 361 1 79.21 TGGTGACTTATAATTAATAATAATTTTTTAAAAACTATTGATGAGTTCATAATAAATTAAAAAAGGAAACGAAAACATAAACCTGAACCGGAAACATATCT:1 + chr3L 22932362 3' - Gypsy12A_LTR 1822 1 69.31 AAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTGTGAGAAGGCCGACGCAGAGCAGCATGTATGCACTTTTGGGCACA:1 + chr3R 22267681 3' + 297 6881 2 55.45 GCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAGCAGATCCATTTAGGGTCAACGTTACTTTCCTCTGGACAATG:1 + chr2R 9454345 3' - opus 113 3 79.21 GTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTAGGTATTTCTTAGTTTCTCTG:1 - chr2R 15005058 3' + BS 5041 1 84.16 GAGTANAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAATGGCTTTCAGGCCGGGAACAATAACAAA:1 + chr3L 14910663 3' + roo 400 1 71.29 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGAA:1 - chr2L 8542865 3' - P-element 54 1 15.84 GAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACGCTACTCAGCTATACTTATTTAACGCATTTGTGATACTTGTTTTCAGTGCATCTAGAATGGACAAT:1 + chr2L 14584737 3' - INE-1 571 1 54.46 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATTTCCCTCCAACTATCTCTTTGTCCGCCATGT:1 - chr2L 10291504 3' - jockey 4776 1 59.41 CCGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATAT:1 + chr3L 7989815 3' + mdg3 222 2 55.45 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTACTTTTAATACTTTCTTTAATACTTTATTTTATATATAGTAATATTTACC:1 - chr2L 18953029 3' + copia 229 1 56.44 AAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGTGTTAATCACTTCCCATGAATTATTCAATAAATTTCGCATAAAAAAGCAGCGACAAATCT:1 - chr3L 4048435 3' + 3S18 6089 2 62.38 CGACGNGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAAACTTGTTT:1 + chr3R 13715170 3' + P-element 2877 2 69.31 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGA:1 - chrX 20364252 3' + opus 451 2 78.22 GAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATTAAGGGATAG:1 - chr2L 514865 3' - 3S18 40 2 63.37 AGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAGTCTTTTATGATTAAACTATGCACTTTAAATCCGCAAAGCCGACTAT:1 + chr3L 6129872 3' - jockey 4702 1 51.49 TGAACCGTGTCGGGACAAAGCCTTGCAGTAGCCCCTCTTGCCGTTTTTCTGCCTCTCCATATTTCCACCCAGCTGGCTGTGCAAACATGCGCCCCACTCCA:1 - chrX 902675 3' - mariner2 103 1 68.32 TCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAGCTATGAAGTCTTTCGCAAACTTTCCTCATACTTTG:1 - chr3R 19448398 3' + roo 73 2 64.36 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCA:1 + chr3R 13376042 3' + 1360 3364 1 55.45 AATAACTAAATAAATAAATAACTAAATTCGCGATTTGCTGCCGCAATTACGTTTCTACGGGTACACGAGACATTGAAGACGCAGCCCATTAATTGGATTAC:1 - chr3R 10136678 3' + HeT-A 25 1 70.30 CGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCAGTGCATTCAGGCCATTAGCTCTTTAGATGAGCTGAATAAGACTTTTTGTCCAAAGCAAGTCAAA:1 + chr2R 18348382 3' - F-element 4447 1 67.33 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTA:1 - chr3L 2292073 3' - Max-element 8261 2 53.47 GTCTCGGGAAATGTAGGTGCGTAAATAGTTTTTTTTTGCCTGGTTACTGATGGAAATGGGGAATGGTACAAAA:1 - chr3R 14357352 3' - gypsy7 262 1 53.42 TCCACCAGGGAAGACACCTCCGGATCCACCGGTTGAACCACAGACATAAAAACAGCCAACAGCACATATTCAATATTAGCAGTCAACTTTATTTAACCAAT:1 - chr3R 19544376 3' + transib4 2362 1 53.47 GGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCC:1 - chr3L 17869900 3' - 1360 9 2 40.86 ACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAAAAATCATTACCTTATTAATTTTTCACACACAAAGTGCAGGCCAGGCTCAAGGGCGATTGCCGTAGGCGGGGGATCC:1 - chr2L 11987622 3' - 1360 465 1 55.45 TTCTTCTTTTTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTTTTTGGTGTGGTCAAGGGGAAAGGAATGACCCGGGGCAGCCAAGCTGCAT:1 - chr2L 427214 3' + Cr1a 199 1 59.41 TTAATTTATTTATTAATTTAATTAATTTATCACAATTAATTTGATTTTACTACAATCCCATCCTAAATTAGTGCTAGAAATTAGGGTTTTCCGAGCACGAA:1 + chr2R 13284201 3' - flea 224 2 67.33 TGGTTGGATTGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACTTACGCGGCATGAAGTCCACTATTCAATACGACAACGCGTAAACTATTGGAGTCAGAGGAG:1 + chr2R 5515299 3' - HB 1321 1 61.62 TATGTGTGTATTTATATTTATTTAAATTAAAACGCTCCCAACTTAACTTTTGCCTGGGCGGCTCGTGAAATTGAAAACTTTACAAATTCAGGTTTGGGTCA:1 - chr3L 6681400 3' - Stalker 6935 4 53.47 GGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTGAAC:1 + chr3R 20845120 3' + 17.6 7389 2 65.35 AGAACTAATTGTAAGCGTGCCTTTTGCTCGTATCTGCTCATTCTTTATTATAACGGTTCTTTTATGTGTTCCTCTGGCCTCTTTGTTTTTCGGTTTTCCAT:1 + chr2L 17252250 3' + looper1 49 1 66.34 GTTTAGTTTTTACACTGATGCTTATATCTATATCGTGCTACATCGTTTGTTGTTGCAGGAGTAAGAGCGTAGTTAGGTTTTGATATTTCCCGAACTCGTTG:1 - chr2R 24125528 3' - GATE 8365 2 80.20 TATGTTTTTATTACTTAGATTTATTCATTGCTCAATATATTTAAGTCTTCCTTTTCTGTAGAAGATTGGACAACTCTATTCTACTATTATACTAATACCAA:1 + chrX 19882611 3' + hobo 2489 1 82.18 AGATGCCGAAAATTCTAATTCGTTTAGAACCATTGTGACTTTTATTATTATGACTATGCACGCCACATGCACATAATTGTATCTCTATAATTACTACACCT:1 + chr3R 21069619 3' - Dm88 245 1 73.27 GGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATATTTATATTTATGGGACACAGAAAACATACAACATCCAAATCCTTATCAAATCGTAAT:1 - chr2R 21140613 3' + Stalker4 7002 4 52.48 GTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGCGCAAAACTCGGGTGGATCAACCACATTGATGGGAATGAG:1 - chr3R 5104179 3' + R1A1-element 5015 1 75.25 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATT:1 - chr3R 20466631 3' + roo 9046 1 54.46 AATGCGAAATACTTTGTATATTTGTTTAAAATACTGCACAAATCACAAAGAAGCAATCGCAAAGCGAACGCTCAATTTCATTAGGGAATTCGGTTATATCT:1 - chr3R 5196274 3' - Cr1a 176 1 69.31 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGTCTTTGG:1 - chrX 8588577 3' + roo 395 1 66.34 GCTCGATAAAAACGTCTTCACACGTCTCCAGCAGCCGGCCATCTGGGCAGTCGAAAAAAAAAAGGTGCAAAAAAAATAAAAAACCGAAGGTCCCAAAC:1 - chr3R 16290273 3' - F-element 29 1 43.88 TATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTATTCAAATCGTACATTAATGGTAAATCTCATCGCCCAATAAACAGATCGGAGTA:1 + chr2R 17670964 3' - Doc 4676 1 55.45 CAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATG:1 - chr3L 19951199 3' - Ivk 30 1 57.00 ATATAACCAAAGACACTAGAATATTAATTTATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGC:1 - chr3L 18284590 3' - Tc3 317 1 69.31 ACTGCTAACACAGCTTTAAGGGTCAAAACTTTCCACGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATGTTTGTCGTTACGCTTTTGTGCTCATTA:1 - chr3R 23134525 3' + Quasimodo 352 2 72.28 GCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTATAA:1 - chr2R 1320676 3' + diver2 352 2 56.44 GTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAAC:1 + chr3R 15943350 3' - jockey 4654 1 60.00 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGCTCTTTGTTCACTTTCACGGAAAGAACTC:1 + chr3L 7792231 3' + 412 7498 2 71.29 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAATTAATGTGCCCC:1 + chr2L 14490472 3' + P-element 2873 1 65.35 TGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCT:1 - 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P-element 40 1 37.62 TTTGAGACATGGTACCGATATAGGGTACACTAAATCAAACAGGATACCTCGATATTCTGTTGCTCAACACGTGCCTTTTCAGTACCCTCAGGCCAGCCTCC:1 + chrX 22563461 3' + Bari2 810 1 52.48 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGG:1 - chr3L 5716894 3' + copia 207 2 78.22 AAGAAAAAAAAACCAAACAAATGCTGCTGCTTATACCACATTATAGTAACAATACAAATTAGTCATAGGGTTTGCTAATGAAATCATTAAAAATGTTTCAA:1 + chrX 16927316 3' + mdg3 5104 1 70.30 AGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCACACGCCGACCAAATACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGAT:1 - chr2L 1156732 3' + 412 7235 2 51.49 TCGCCAGGCTCTGACTCCGAGGAGCTGCTATCGCTTGAGCAGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCGTTTTCTAGGCGTTCTTTCTCCTCG:1 - chr3L 16900622 3' - G-element 434 1 73.27 AGTTTNTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCAA:1 - chr3L 17122411 3' + roo 9042 1 56.44 AGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATCATAAAATAAGAAGAATTCTTGTCTTAGCCATTACATTATAACAACTCGGATATGCACTTTTTTTTTGTATAACT:1 + chr3R 6431125 3' - 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chr2R 18295601 3' - I-element 24 1 53.47 TTTAATTTAATTTTTAAACACCTTTTGTGTGTTGTATTTGATGTTTAATTAGTGTTTGCAACTTTAGTAGTGGTAGGTTTTAAAGTTCGATTTGGGGGATT:1 - chr3L 15939816 3' - NOF 3952 1 58.42 AGGCACGATATAAAAAAGAGAACAGGAAGAAGAAAAAAACAAAAATAGAGATACAGATACGAGGACCATTGACGAAGCTACGATGAATCTTTGAATGATTG:1 - chr3R 26071045 3' - Cr1a 4356 1 66.34 GACAAAATATGCCCTTCACCTTATTATAAATATAATATAAGTGTATTGATCATATTTGCTTCCTGAGGTGTATACATTTAATGTTTGAAATGTTTTATACA:1 + chr2R 4609738 3' + 1360 213 1 78.22 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGCACTCAGCT:1 - chr3R 7993858 3' - Doc 29 1 49.50 GGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGATGGACCGTTTCTGGAACGTGCGCGAAATGAAGAGGACGATCCTGTAGTCTAGGCCATTTCATCCCATCG:1 - chr3L 2292617 3' + Max-element 8112 1 79.21 AGCGAAGAGCGCTACAACGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTGCATTTAAATATTTTATTGCATTCAACGTAAAACC:1 + chr2L 18173201 3' + 1360 118 1 68.32 GGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTCTTGATTTTTCGAACAAGCTGATAAATATGGTCATTTTAATTTTTCAACTATTTAAAGAACAACTCTATTAA:1 - 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Max-element 11 2 68.32 TGTCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATATTGATCGGTTAGTACGTTATTTTATCTGCCCCTTTTTAAATCCTTCGCACGCCTCTGGCTGG:1 + chr3L 3073753 3' - Tc1-2 188 1 73.27 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCAC:1 - chr2R 20411865 3' + 297 372 2 56.44 TCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTGTGTTAACGACTGTACAGAATGGTACTCGATACTCGATACAGTGAGGGTGCTATCTTG:1 + chr2L 21836550 3' + roo 58 2 55.45 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCGAGAGAGAGAGGATTGCAGAAGAGAGTGCATAGAAGTTGAATAGCTCGTGG:1 + chr3R 30272899 3' - P-element 4 2 76.24 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGCAC:1 - chr3R 7993864 3' - Doc 34 1 53.00 TTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTTTGCCTCCTGACCTCGCACGTCCAGCGAGCTGTCCGTATCGTTGCCACTGGGGGGACTT:1 - chr3R 4937151 3' - Burdock 6265 2 65.35 GTAAGTAAACATGTAAGAAACGAAACAAACTATATGCAAGATGTCGACTGAAAGCGACTAACGGGTTCTAGGCTGTGGGCCAAGCTACAAAAAAAGAAGGC:1 - chr3R 13785955 3' + Tirant 464 1 57.43 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCCGCG:1 - 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P-element 14 1 64.36 TCAGGAACTGTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATACATATACAGACACAGAGAGCCAGTTTGTTCCCACATGTTCAAAACTGCCACGCCCACATTTTTGCAAAA:1 - chr4 857193 3' + INE-1 154 1 42.57 TTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAAAAAA:1 + chr2L 12074551 3' + Juan 4179 1 58.42 ATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCGAATAAACGCGAACGAAAGACAAAATTCTAAGTGTTCGCGAATAAAAGAGCAAAACGCCTCTACGCTCGCGTC:1 - chrX 21961460 3' + HMS-Beagle 260 1 66.34 CACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTTATCGTGGCGCGGCAGAGTTGCCATGGCGCCGGATATCTGGCGGTAGGTGGGCGTGGCCGGGGGCTTGGTGC:1 + chr3L 17409766 3' + Circe 7141 1 79.21 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCGAGAGAGAGAGGATTGCAGAAGAGAGGGCATAGAAG:1 + chr3R 30272884 3' + P-element 2868 1 59.41 ATTGGCACCATGTGAAAAATTCTTGTCTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTGGCGCCAGTCACATTCCACGCTGAAGTCAAATTCTAAGAATGATTTCTCAA:1 + chr2R 2308198 3' + 1360 274 1 61.39 AATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATATTTGCACCATAAAC:1 + chr3L 8924625 3' - 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FB 38 1 58.42 AAGATNTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGC:1 + chrX 19095789 3' + roo 357 2 75.25 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTC:1 - chrX 14525270 3' - hobo 43 1 68.32 TCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTGGCCAA:1 + chr2L 16082689 3' - Stalker4 19 4 60.40 AGATGGTGAAGGTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTCTGGATTAGGGCAAAGTTGTGTAGTCGTCGTATGTCCGGAGATCAAGAAGTGCTGG:1 + chr3R 3507685 3' + invader2 4643 1 57.43 GCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATATACAGCGTTGGCACTGCAAGTGATTAGATAGCAAGTGCCCCATGCAAAATTTTGCGAACAT:1 - chrX 20570692 3' - accord 6956 2 54.00 GTCGCGTCGGGCTAATTGGAAATTGCTAACCAACGGTATAACTAACTTTATAACAAACGC:1 - chrX 22093376 3' + rover 453 1 86.67 CCACACTTTTGAAAAACGTGTTGATATTTTTTCACGACATGGGTAAATAGTTACAGCGCCTAATTAATTGACTGACTACTTCACTTAAAAAGACTAATAGC:1 + chr4 379993 3' + INE-1 258 1 69.31 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTC:1 - chr2R 10863904 3' - mdg3 5292 2 66.34 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATGCCCCAACTGCCGTCGTCTT:1 - chr3R 10957673 3' - hopper 13 1 51.35 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCG:1 - chr2R 21379504 3' + P-element 2842 1 34.65 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTGACATTATT:1 - chr3R 19467864 3' - Transpac 22 2 58.42 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATATTTTAGAAATTAAAAGCCTACTCAGGTCTTGCTTTAAATCA:1 - chr3L 3951053 3' - pogo 29 1 62.24 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCC:1 - chr3R 19657433 3' + roo 393 1 63.37 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACAT:1 + chr3L 24208192 3' - Quasimodo 32 2 66.34 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATTCAGCTGCAAAAAATTATTTTTTAATGACAGAATATAACAATTCTTATCTTCATTAA:1 - chr3L 25782377 3' + flea 5000 2 66.34 TAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAACGTATCCATA:1 + chr3R 15943359 3' - jockey 4646 1 68.32 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAAT:1 + chr3L 9925295 3' - Doc 40 1 61.39 ATATTGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAACTAAAACACAAACTTTTGTGTGGCTTTGATCCCGTCAACGTGTACTCTGCCCATAAATGAACCTAGC:1 - chr3R 3497924 3' - invader2 249 1 51.49 TATGTAAGTATATATAACAATACATACGCATGTAACTCGATAAGTGGCAGGGATAAAATCAGCTAACAGTATGTGGGTTTTAAAGGGTACATTTAGGGAG:1 - chr2R 17356877 3' + Dm88 4381 2 75.00 CCAAGGACATTAGATGGTATCTTTAGAAGATAGCGAAAGAGACGGGTATATGTGGCTCAGTGGGATGGGGAGGGGGAGGGGGTCGCAGACAAAGACG:1 + chr3L 11277449 3' + Rt1a 5025 1 75.26 ATTAGTTCATTTTCGACCCCATATAATTGAAGATAAAGATAATATTTCGATACATTTTCGATAGCTTTCTCAAGAAGTGAATCCTAAATTCCAATACGCAG:1 + chr2L 8496510 3' - Circe 7103 1 58.42 TTGAACCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGA:1 - chr3L 17122441 3' + roo 348 2 75.25 GATTTTCCGGAAGAGGAAAATACTTATCGGCATAGCATTGCCCATTGGTGGATCACAGTTTCGTTAGTTAGGAAAACCAGTGACGGTGATGCGATCTCCCA:1 + chr2L 7125745 3' + HMS-Beagle 449 1 61.39 TCCGCAAGACTCCCCGGGGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAGTTGGCAGAGTGAGAGCTTTGCGACAAACGAGCTACATGGCTTATTTAGGTGAACGTGATGG:1 - chr3R 3753055 3' + ZAM 8411 2 75.25 TATGCCCACCTTCTAGCAAATATAAAATTCCGTTCATTTTGACTTAAATGAAAGAAAACACTCGTTTCCTTAACTATAGATGTCATGTTTACTAATTTAAT:1 - chr3L 23393333 3' - invader5 3731 2 76.24 AGAAACAAATTAAAACATATTACCAATAGGTTAATTATCGATTTTTCATTAAATCTACTTAAAATTGAAGTGAGATTTGTGCGAGGGAAATCTTAATTTCT:1 - chr2L 12275129 3' + HeT-A 5766 1 62.38 CAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACTTTAAAGTCGCTACATACGATTTGTATTAACTTTACGATTTCTCATAACGAGCTTCTACATTTTGTTT:1 + chr3L 2292173 3' + Max-element 8527 2 63.37 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTC:2 - chr3L 15035144 3' + pogo 2056 1 79.21 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCGAAA:1 + chr3R 5977800 3' + copia 5079 2 69.31 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAA:1 - chr3L 2800152 3' + blood 7340 1 75.25 TTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGAAATCGAAAAGT:1 - chr2L 20928061 3' - Chimpo 21 1 55.45 AAGAAAAAAGGAAGAAGAAAAAACAGTGATGAGGAGGGGG:1 - chr2L 13536783 3' + Doc2-element 234 1 90.00 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGGGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCTTTGCCGCTTCCGTCAGCACAAC:1 - chr2L 15956005 3' - Max-element 3 2 74.26 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTCATAGGGTATATTAAGAGACAACAATTGGTATTTCAGCCTATTCAGCATTATACTCTGTTCTACGTATCTG:1 + chrX 8031453 3' - roo 8668 2 75.25 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAATATAGAGTTTTGGAATTTATTGTGGTCTAAAAAGAAGT:1 + chrX 8948674 3' - blood 39 2 63.37 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAG:2 + chr2R 24965119 3' - P-element 44 1 35.64 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATATATAGTATTTATTTATGGTTAATATCCCTTAAAAAGTTTCCATCTCTGTGCC:1 - chr3L 22231569 3' + 297 379 2 65.35 ATCGCCAGGACGATTACCGGCTGCAAATGGTACGTAAGGAACACAACCCTGCATAAAAAAATGCAACAGCATTTGATATTGTTTGCTGATTCATACAGG:1 - chr2L 19144753 3' + BS3 1379 1 55.56 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTAAATACTAATGCAGGAAGGAAATGGTGCCCTTCCACCATCGCTATCAAAAAAGACAATGAAA:1 - chrX 7410154 3' - jockey 4681 1 65.35 CGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTA:1 + chr2R 12185412 3' - accord 22 2 53.47 ATAATAGTAATAATAATTTTAATTATCACTCAGAACGAACAACATTGCCTACATAGACAATGCCATCACCTCTC:1 - chr2L 15770331 3' + mdg1 7085 3 81.08 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCCCACG:1 - chr3L 9692649 3' + P-element 2880 2 72.28 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCAATTCATTTTCGAGAGTTTCTCTTCTCTCTTAGCTCTG:1 - chr3L 543394 3' + P-element 2875 1 67.33 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCCTATTAAGTAGTTCACGAAACAGA:1 + chr3R 11516648 3' + roo 9020 2 79.00 CACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTTCGTTTTAGGGTATATGCAGTTCGATACCCTGTCCTAAAATTATTCGTAATTAGAGCGGCACAA:1 + chr2R 13054848 3' - P-element 473 1 72.28 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTCGTTGCGGG:1 + chr2R 9014501 3' - blood 7021 2 67.71 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGAT:1 + chr2L 2437765 3' + roo 9028 1 69.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGGCAAATGTTTGAGGTGGCGAAACTTT:1 - chrX 19457122 3' + roo 400 1 71.29 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTAGGCTTTTCATGTTTTTGAAGGCTGTAAAAGTGTTGCATAATTTCAGGG:1 + chrX 13135005 3' - jockey 4776 1 69.31 ATTAAAAACCACGGCTGGTTTGACAAACACAAAAACAAAAAAAACAC:1 + chrX 4666775 3' - Cr1a 60 1 89.36 TTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACGAACTAAATGCACACCATACCCCATATAAATTAAAAACAATATTAATTTCCAAATTCAGCG:1 + chrX 12730461 3' - gypsy10 308 2 55.45 ATTTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTAACGATAGATGATTTGGCCCCATTTTTACGTTTTCTGCCT:1 - chrX 12294665 3' + blood 7383 2 72.28 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTATGTTATTTATTTCATGTATGTATGTTATTTCATCATGGTGACGACCTCGCCGCAGTAGATCGCT:1 - chr2L 2197102 3' + P-element 2874 1 32.67 CACACACACACACACACATATATATGTTTCGCCTCGCAGGATGTAGCTCCATATCCCTCATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGG:1 - chr3R 27499989 3' + accord 7030 2 75.00 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACCCCCCGGACTATCTAATCGCATTC:1 - chr3R 24152879 3' + P-element 2839 1 31.68 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCACGAATG:1 - chr3R 23617987 3' - jockey 4800 1 64.36 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTTGTTCTT:1 + chr2L 2437781 3' + roo 9044 1 53.47 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAACTTTA:1 + chr3R 15998136 3' + pogo 2063 1 66.34 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGTGCTACACAACTCGCGTTATCCTG:1 - chr3R 29660254 3' + mdg1 7407 2 78.22 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTAAGTAAACTTAGTAGCAT:1 - chrX 14531512 3' + 412 440 2 78.22 TGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATATATATGGGCCTAACAGAAACCATTATT:1 + chrX 20391098 3' - rover 44 2 77.23 TTAAATTTGAAAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTAACCGCAGTCTAAACTAAGATCAGGCGATATCTCTAAGTTATCCCGCTGAGCAACTCGTTTACT:1 - chr3L 3258988 3' - copia 4668 1 67.33 CCTTTGCACAAGATTGGCATTGCAGGAAGGAACAGACTCCTGAGCATGTATGTAGTCCCACGGAACTAGTCGAAAGTTTCGAGTTTGTGCGCTCGACCAGT:1 - chr2R 9860755 3' + baggins 5167 1 62.38 ATTAATCAGACAAAATACAAAACGTAAAATGGAAACATCAAATATCAAATATCCATTTACATTTTTAATTTATCCAAAAAAAAACTGCAAGTTACTTAATA:1 - chr2L 16140764 3' + Juan 346 1 82.18 GATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGTACTCCAATTTAGTACTTATTTAAGAGTACAACTTATTTTTCTCAGTGCTTGTCATTCCAC:1 - chrX 18035517 3' - Idefix 7037 2 61.39 AGGACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTATAAATAATTTGTTTTTTAATGACATGCCATCATACAAATACATTTTTCCTAATTTATTA:1 + chr2R 13122100 3' + opus 486 2 67.33 AATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATGCTATATTGTAGGATGACTTTTTCAATTTGCAAGAGAAGTATAGCTTTAAGGTTTATTTTTTAT:1 - chr3R 21849221 3' - rover 4 2 45.54 CCTTANACGGGACCTCATCGGGTAATACGCCGGGTCATCAATGTTGGCCAGGATGCGCAGCCGGAAGAGGACTACTTGCCCTGCAACTACTGGATCAGCA:1 + chr3L 16776304 3' + Chimpo 4001 1 73.00 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAATATGTGCCATTATCCGGCAATGCTCGC:1 + chr3L 3671340 3' - roo 8712 2 76.24 TATAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTT:1 - chr3R 6769714 3' - mdg1 46 2 54.46 CAGCGCCTTTTTACGACCAACTGAGCGTACCAGTCGTAGAGTTCTTGCCCCGCCAACATACGGGGGTACATGCATACCCTACATGGCAGCGGATTGATCGT:1 + chr2L 7117817 3' - Rt1a 4833 1 68.32 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATC:1 - chr2L 11047964 3' + Juan 4195 1 57.43 TGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCG:1 - chr3R 29384374 3' - jockey 4811 1 73.27 GTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACT:1 - chr3R 11165645 3' - Tabor 39 2 62.38 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGG:1 + chr3R 29660293 3' - mdg1 7080 2 67.33 GTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGGATATTGCTCTAAAAGTACCAATTCCACTGCTCGTTTCTTTTAGTGTAGGGACACGTAACAGGA:1 + chr2R 21140712 3' - Stalker 13 4 64.36 GCACAGCATTAATGGTTTGTATGCCTTTCGTTTATTGTTGTTTTATGCATCGTTTGCCAAGTTGCCTGCTTTTGTAATTGCTTTTCATGCTCTGCAAATGG:1 - chr3R 29563120 3' - HMS-Beagle 6679 1 45.54 TCGATATTATGTTTCATGCACTGAGCCAACTATTCTAGTTCGTTGGCTTGTGCTAACTTGCATTGAACATATCGAAAATCGCACGAAAAAGCGCAGCAA:1 + chr2R 2923153 3' - Gypsy6A_LTR 37 1 68.69 CAATCCAATTTGCATTTGATTTTCAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTGCAACAAGTACTCCCCCAG:1 - chr3R 22620438 3' + 297 258 2 79.21 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGACGTATGAGTGACTT:1 - chr2L 17210090 3' - jockey 4705 1 57.43 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAACCTCGCACGAAAACACATAAAACTG:1 + chr2L 1626625 3' - roo 10 2 64.36 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTC:2 - chrX 4488887 3' + 412 442 2 74.26 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAAGAAGAA:1 - chrX 21388519 3' - 1360 42 1 73.47 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAATCCATACTTAATGGCGAAATAGT:1 + chr3L 3951109 3' + pogo 2053 1 76.24 GTTTTAAAACATATTGAAAGAATTCGCGAAACACACTTCCGTTGTTTCTCTATTATTTTAATAAATAGAAACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGGGTCTT:1 + chr3R 4565351 3' - transib1 1828 1 71.29 CTGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCAAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCATAAGTTAT:1 + chrX 21668159 3' - Stalker2 7249 2 74.74 GTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTGAAATTGCTGCGAACAGCGAACTG:1 + chr3R 25818918 3' - mdg1 7041 2 76.24 AGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGTTGAGCTTGACTTTTCCCCCGCTG:1 - chr3R 9952175 3' + Ivk 5353 1 56.44 GTATGTATGTATGTATGTAATATATGGTATATAGTATATATGCAGAAAAACACACGACCGCACAGATAAGTGGGCTTATCGGTTGCTGGGAACCCAGTTTA:1 - chrX 3189381 3' - 412 7277 2 59.41 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCATGTGCTCCATCCAGGGTATCCACATACAACCAACGGACG:1 + chrX 6654800 3' + P-element 2881 2 74.26 CCCTCCTACAAACCAAGCATTATACATTAATTTAATTAGCTGTCATATATTATATATATATATACATATATATGGGAGGATACAGAGATAGGAGAAAAACC:1 - chr2L 10746399 3' + I-element 5065 1 83.17 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAGAGACCGAGACCGACGAAGAGAGAGAGAGCGAGAAAGAG:1 + chr2R 18288822 3' + P-element 2849 1 40.59 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATATTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATA:1 + chr2R 13038932 3' + P-element 2833 1 25.74 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAG:1 - chr2R 5485052 3' - 1360 17 1 62.38 TTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTTAACAATGCTTTTACCTTATGGTAGTAAAGTACGTATAATTTCTACCAGC:1 + chrX 21397774 3' - F-element 4672 1 55.67 ATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTA:1 - chrX 868703 3' - jockey 4936 1 53.47 TTAATATGACCCTAAATTAGAATGTCACAGCTGAGCGCAAGCTTCCTTGCAATACTCCAAAACGATGTAAATATTTCTGAAATAAAGTAGACATTGTAGCA:1 + chr3R 9333949 3' - Gypsy12A_LTR 78 1 54.46 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATATAACTCGAGTTCTATTCGGAAAAAAAATTGTCAATGTCTTTTATTTTCCAAACTAT:1 + chr3L 47001 3' - FB 21 1 56.44 ACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACGTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTTGTTGCTGTCTTGCAGGGGAATTAAATGTTTGTGTG:1 - chr2L 2440019 3' + roo 270 2 64.36 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATATTTTGTGAAGAACCTTGACTGGGTAAAAGT:1 - chr3L 9772190 3' + 297 6958 2 63.37 CGTGGAGTCAAGTCGTGAAAAGTTCGTGTTGTTGTTACTGTTGTCGATTCGGTGGTTGTTGTCTTTGGAGTTGTTGAAACGGTTGTTGGCTCGGTTGTCGT:1 - chr3L 5483352 3' + Gypsy12A_LTR 280 1 74.26 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAACATGCACT:1 - chr3L 3944701 3' - jockey 4776 1 47.52 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGG:1 + chr2R 19936695 3' + roo 9051 2 61.39 GGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCG:1 - chr2R 6984297 3' - HMS-Beagle2 6888 2 74.26 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACATATGTTACATAGGCTAGCTGT:1 + chrX 6997214 3' + P-element 2833 1 25.74 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAATATTGTTCGATTTTGTTGTTCTTGG:1 - chr2L 2909555 3' - pogo 46 1 73.27 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTAC:1 + chr2L 326214 3' - roo 18 2 62.38 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTATTCAT:1 + chrX 18193806 3' - hopper 20 1 55.45 AAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATGAGTGAAAGCTGTTTTATCCGTTTTGCAACTGCTAGAAC:1 - chr2R 11652483 3' + P-element 2638 1 44.55 TTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATACGAATTAACTTAACCAATCTCACTGATTGGTATGTTCTTATCCTTTCACTTACTATTACCAGTCATTATATAGGG:1 - chr2R 18213935 3' - HB 306 1 52.48 TTTCTNACAGAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAATGCTGCATTTCGAAGTTTTTC:1 - chrX 13347288 3' + roo 9044 1 48.42 CTCCCACCAGAGGGTCAAAACTGCTAACACCGCGCGTATTTGATTTCGATTAATTTTCAATTTTAATTTAAAGGAAGTGCGAATTCTATTTCATTCAATTG:1 + chr2L 15955114 3' + Quasimodo 333 2 76.24 GTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTG:1 + chr3L 5015864 3' - I-element 4959 1 63.37 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCATCCAAATACGTCACTATATATATATATATATATACATGAATATGGGAGGCACGAGATTTGCGCTCATCGATAAGCA:1 - chrX 5515727 3' - 297 6599 2 59.00 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACCCCCCGGACTATCTAATCGCATTCGGTTCGCAGATCTTTTACTTGTGC:1 - chr3R 24152855 3' - P-element 24 1 55.45 GACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAGT:1 + chr3R 9952263 3' - Ivk 14 1 64.00 GTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACCAAAGCTAAAT:1 - chr3L 7989732 3' - mdg3 5278 2 57.43 TATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAATTCGAGCTGCGAAAATGA:1 - chr2R 22395178 3' - I-element 7 1 73.27 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCGGCGTTTT:1 + chr3R 29660311 3' - mdg1 24 2 55.45 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTATCTTAATAAGTATGCTAGG:1 + chr3R 18881543 3' + roo 9015 2 80.20 GCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTCATCTGAATTTCCTCATTGACAAGATTTATGTGGCCTCTCAATATTCATTAGTGCTTTGATTTGTTATGGTTTCCCG:1 + chr2R 19866588 3' - Doc2-element 4537 1 57.43 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTC:2 + chr3R 7101066 3' - pogo 29 1 61.39 AAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCA:1 - chr2L 20118692 3' - Max-element 8269 2 58.42 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTAC:1 - chrX 495184 3' + 412 444 2 71.29 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAGGC:1 - chr2L 7459543 3' - BS 5003 1 68.32 TACAGGGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCCTTTTACTTTAATAGTAAGAGGTATAAAAACAGGTACTTGCACTTAAATGTCACGTAAATTTT:1 + chr3L 25126303 3' - blood 12 2 67.33 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCGCTTG:1 - chr3R 27080695 3' + HMS-Beagle 223 2 73.27 TCTTGTATATGTATATACAATACATTTCTAAAACTTGCAAATAAATAAATTAATCAATTCCACGCTGTTTTCTATAGTCCCTGAC:1 + chr2R 9747623 3' + Stalker2 7504 2 80.00 CGTAGCAATATGATAAAAAAAAAAATAATTATTAAAAATTCACGCCCTGACTATTATAATTTTAAAGCTTTTTACTGGGTCCACGGGGTCCTGTGAGTCC:1 + chr2L 20123828 3' - 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chr3R 19622909 3' + pogo 2071 1 61.39 AATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGTTGTCATTAACG:1 - chr2L 13447087 3' + HMS-Beagle 243 2 73.63 AAATACGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATTGTTCCATTAGCAGTTTTTATGTATTTTATGTAATTCTCGATTGCTTTTA:1 + chr2R 13985290 3' + F-element 110 1 59.41 AGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATGGCAATCAAGAATAGCATGAAAATACGATGATTTCTAACAATAATTTCTAATCAAATAACA:1 + chr3L 4345049 3' - mdg3 5269 2 41.58 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTGTTTGTTTTCTGTAATTTCGAATTAGCGAAATCATATTTAATATTTGCATATTTAAACGCT:1 - chrX 8352163 3' + blood 7374 2 63.37 AACAAAATTCACGGTCGGCTATAAAATAAAATTTGGTGAGTGAAGGGGGGAATATACATGTGGGTGTTTAAAAATAGCCTCGATTTTGTTGCATTTGATTT:1 - chr2L 16271759 3' + HMS-Beagle 400 1 71.29 CAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGTGAGGGTGCTTAAAGAAAAGTGGTTAAGGAATTGACGAGCGGCAATTTGCATAAATGGAATTAGTGAGCCGCCGCTA:1 - chr3R 23870027 3' - Doc 338 1 71.29 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAAAAGGCCCAGAACAGCAAACAAAATAAATAAATAAGA:1 + chr3R 18934962 3' - hobo 14 1 65.35 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAAGGAATGAGC:1 + chr3L 13081012 3' - 412 22 2 57.43 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATATGTATCGGCGCCCAATGTACATAAGGCAAAGTGTAAGTAACA:1 + chr3R 31644234 3' - roo 8668 2 75.25 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTTGCAATTAACTTTTTGGCGGCTTTAAGCCGACCAGGA:1 + chr2L 18914599 3' + mdg1 7421 2 61.39 ACATAACTGGAAAGCTTTGGAACACCTGCATTTACTCCAGTGTTTACTCTACCCAAATTAGTGCTACACCTCGGACCGCAATTAGAGGTGCTAATTGGGTG:1 + chr2R 18602495 3' + Transpac 484 1 73.27 AAAATTAAAAGAAAAAAATAAACATGGCGCGTGTTTGCGATGAGGGCAAGACGAAAAGTTGGCCCAAGGAATCCCATTTTCCATTTGCCGAATTAGTTTTC:1 - chr2R 19222302 3' + Doc 4698 1 62.38 TGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAAGTGGAATATAAAAAAAAATGAATATGAAAAACAACTGAATCTAATGTGCATTTTAAATTATAAAATTGGA:1 - chrX 2754345 3' - 1360 3116 1 75.51 CGCATTTTACAAAAAACAAATGAAATTCATGAAGCTGTGGCCGCGTCAGGTTTAAAAAGAAAGCGAATTATACTGTATACTATATGGCCAACAGGTCGATG:1 + chr2L 2935480 3' + pogo 469 1 64.36 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTATAGCATATAGGAAATAATAATAGCAACGGCAAACCACCCCATCTCCAGGCGAAAGCCCCGAATAGCGGATTCATTCA:2 + chr3L 21319342 3' - jockey 4672 1 79.21 TCTTTATTCTTTCGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATTAAATGCAAAATGGCTAAATTGAGAAAAAAGTTTGTTTTCTTTTTGGCAAAGGATGCTT:1 + chr3R 17002131 3' - 297 6871 2 57.89 GGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATATATATATATATATATTTGTATATACTTTGAAATATTTAGCTGGCTATCACTGTCAA:1 + chr3L 7926427 3' - flea 4772 2 64.36 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTGTAATGAG:1 + chr2L 15333791 3' + P-element 2861 1 53.47 AATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGGTCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAACACGCAGTTTCGTATTTAGAGCG:1 + chr2L 4248553 3' - F-element 4233 1 73.40 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTGTTTGTGTT:1 + chrX 12546494 3' - P-element 37 1 42.57 CAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAATTGTAACCTATCATGATCGAGCAGCATTTCATTTAGTTTCTGCATTTG:1 + chrX 19351567 3' + I-element 4963 1 60.22 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGGGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTT:1 + chr3L 21203041 3' + pogo 2089 1 63.64 ACAGCATCGCAAAACGGTGCGATCAATTGTAGTGGCGACTGAAGCAGTGGGTAGGTCCTTGGACTTGGCCAGAAAGTTTATGATAAATGAAATTTTTGCAC:1 - chr2L 9145136 3' + Gypsy6A_LTR 382 1 54.46 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTAATGTAACGATGCATCATTTATGCCATTTATT:2 + chr2R 14381368 3' - hobo 12 1 66.34 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAA:2 + chr3R 9369986 3' + roo 9026 1 70.30 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCT:1 + chr2L 3694150 3' + roo 9029 1 73.27 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTACCTTTCCTGTTATTGTTGTACTTGTTACT:1 - chr2R 9277528 3' - roo 46 2 71.29 ATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTATG:1 - chrX 2082621 3' + Transib-N1_DM 446 1 91.09 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATACTGGACTTGTTAAAAAGTATAAAACAAGTTTGAACGCTGTGATCTCGGAATCTAT:1 - chr3L 21501136 3' - 1360 20 1 76.24 TCGCAATAATCATGTGAGGACTTACAAGACAATACTGGATATATATAAAATCTCAATAGCTCATTCAGTATTTGGTGATAATGAGGACAGATTAAAAAACT:1 - chr3L 15056282 3' - BS 4997 1 73.27 CGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAAAGCACACAAATTATAATTATTGAAAGACCCTAGACCA:1 + chr2L 11551425 3' - Max-element 8247 2 67.33 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCTACCCAGATCTTATGTAACCTGCAGCCG:1 - chr3L 7806175 3' + pogo 2056 1 70.30 ATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGAT:1 + chr3L 11909987 3' + Tabor 438 2 68.32 GCCATNAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTT:1 + chr3L 17699380 3' - 412 40 2 61.39 GAAAGATTATTATATCATCCATATAAACATGACAAGTTTTCCATGATGGTCACGATGGGCACGCGGGCGGGCAGTGCGTGCTGTTTGCCTAGTACCTTGAT:1 + chr3L 7124564 3' - TLD2_LTR 46 1 70.30 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTACCTTTCCTGTTATTGTTGTACTTGTTACTGCATGTTGCTGCAGACGACAACGATGTCTTCCCACAGCCGCATC:2 - chr2R 9277484 3' - roo 2 2 78.22 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGCAGTAGTGAACAACCACCCAC:1 + chr2R 24493755 3' + flea 5002 2 69.70 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATTCAATTTGGACTT:1 + chr2R 9375240 3' - HMS-Beagle 6829 2 65.35 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCGAAACTCG:1 + chr3R 5977804 3' + copia 214 2 65.35 AAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTAAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACC:1 + chrX 16798249 3' + diver 170 2 76.00 ATGACCAAAGACACTAGAATATTCTAGGGTCTTTGGCATGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGCCCACAACCCAACAAAATAAAATAAATAAAAAAC:1 + chrX 5511967 3' - Tc3 315 1 64.36 TAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTACAACATCTTCAATAATTCTAACTTC:1 + chr3R 4542530 3' + 3S18 297 2 66.34 GTAAAAGCTAGAAGGTTGAGATACATATACAGACACAGAGAGCCAGTTTGTTCCCACATGTTCAAAACTGCCACGCCCTCTGGAAAAGTGGGCGTGGCCAG:1 - chrX 5851870 3' + INE-1 163 1 36.63 CACTTTTCATTTTTAAATCTTTGATATCTTTGATATGACTTAAAAAGTGTAATATTGATAAAATCAATAACTAAGAAACTAACTTGAACTACCTCCATGGC:1 + chr2L 9982794 3' - Dm88 4239 1 89.11 CCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCATGCTCTTCTCTCTCTCTCCTTC:1 - chr2L 7530996 3' + blood 134 2 84.16 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAGAATATGGGAATATTTCAACATTTTTCACTTATACACATAATAAATATTAATTTTCATA:1 + chr3R 4986197 3' - roo 19 2 59.41 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCAT:1 - chr2L 11065871 3' + P-element 2853 1 47.52 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCT:1 + chr2L 11686070 3' + hopper 1377 1 64.36 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCAC:1 + chr2L 18694161 3' + P-element 2852 1 44.55 TATATGCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAAAAATGCAGCTGAGCCAATTTTGCGCCGATGTTCGTGCAACA:1 - chr3L 18009531 3' - roo 3 2 77.23 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCTATATACATTTAATGAAGAGATAAATCTAATTTCATACCAAATTTATTGTA:1 + chr3R 19114275 3' + 297 6954 2 59.41 TTTGGTGTTTTTTTTTATATATTTACAACAGCAAAAAGTATTTATATGAGCTTAATAATATGACCGTTCTTACAGCATGGAAATGTTATCATTTGCAACAC:1 - chr2R 16585857 3' - gypsy11 3929 1 86.14 CTAGTGATCCTGATCAAGAATATAAATCATTTATAGGATCAGAAACGCTATATTGTGATATTTCCACAAAAGCTCTGATATATAGCATGAGATAATAATAG:1 + chr2R 7402906 3' - INE-1 85 1 55.45 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACT:1 - chr3L 15035150 3' + pogo 2050 1 78.22 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACG:1 - chr2R 21379508 3' + P-element 2839 1 31.00 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAG:1 + chr3L 11910003 3' + Tabor 7293 2 52.48 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAGATGGACTTAATACACCAAGCAGACAAGATCTGATTTATT:1 - chr2L 10118864 3' + hobo 2933 1 68.37 ATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGGATGGAAATGGGAATGCGAAAGGGGATGTGGATGG:1 - chr2L 20131745 3' - Rt1a 40 1 64.36 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAACATGAACTTTGTTGCATACTTTCAG:1 - chr3L 3944684 3' - jockey 4759 1 66.34 GCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATT:1 + chr3R 24282006 3' - Max-element 45 2 67.33 AAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAATTCGATCACCTCCCACCGCCCACTTGGCACCACCCACTGCCTACGCCCGCTCGGCATGC:1 + chr3L 12482766 3' - R1A1-element 5193 1 59.18 CGTATATGTGTACATCAAACGCTGATAAGGCACCGGGATCATCCATACACGTGTGCTCTTCCGATCTCATCTGAAAAGTGGGTCCAGTGATGGGGGCTCC:1 + chr2L 1497931 3' - accord2 7206 1 48.00 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATACGCGAATGATTTTCGAAAGAACACTGCAGCACACAACAGCAATATAAGA:1 - chrX 3650300 3' - jockey 88 1 54.46 AAAAAAAAAGAAAAAAAAGATGGGGAGAAGGGGGGTAAAGGGTACTGGAATGGAAGCGAACCAATCCAAA:1 - chr3R 20879147 3' - hopper 142 3 80.00 CATACATGCCCAGGAGTCTGTTCCTGCTGGTGCGCAGGCGACTTAGGATCGGATACAGTTTTGCAGGTGACACAACATTGGAGCTCGCAAACCCAACCTGA:1 - chrX 7680119 3' - baggins 5278 1 73.27 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGACTATTTCAATTTAAGCCTTAGGATTTGGTGGATA:1 - chr3R 12767009 3' - 412 7075 2 57.00 AAGAAAATGACAAAAAAAAAAACCGGGGCTAGGGTTGGGGGGAAAAAACTGCAGCACCAGCAGGGCCTTACTGCCTTTCTATTTCGC:1 + chr3R 26832833 3' + Doc2-element 220 1 93.10 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCTCTATATATATATATGAAAAAGTGAATATATAAGTGTACTGCC:1 + chr3L 9772265 3' - 297 6619 2 77.78 AAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTAT:2 + chr3L 18009620 3' + roo 368 1 68.32 GAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - chr3L 19782216 3' + R1A1-element 145 1 70.30 CGAGTNAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAATGGCTTTCAGGCCGGGAACAATAACA:1 + chr3L 14910661 3' + roo 399 1 70.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAGAGACCGAGACCGACGAAGAGAGAGGAGCGAAGAACGATGGGCAGGAGGGACGATACAGTATGTACA:1 - chrX 342839 3' + P-element 2878 2 49.00 TTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTTCTGTCAGATTGATATGCCTTTCGACTACGCCTATGGAATTCTTGACTTGTTTGAGTTCTTTGACTGCCT:1 - chrX 13741393 3' - copia 7 2 48.51 AGATAAGTTTGCACTTCTTTTTCTTTTTAAATATGACCAGAGGTTTTCTATGTTTCTATCGGTTTTCTGAGGAAAAACATTTCATATTTTGAAGAAATTTG:1 + chr2R 12321046 3' - Tc1-2 1216 1 56.44 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGAATAATGGAAAATGAAGTGTTCATATATTCTCGTAATATATAAGAGAATAGCCCG:1 - chrX 23283797 3' - opus 7022 2 58.42 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAAGTCGAAAAAAAGTGTTGCAAGTCCGAGGTT:1 - chr3R 31369318 3' + Transpac 267 2 68.32 CGACGAGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACATACACACACAGGCTC:1 - chrX 10730617 3' + P-element 2877 2 71.43 ATATATATACATATATATAGCTATATGTATATGTGGGTGTGTGTATCGATCCTTGTGGGTGTTTGTGTCAGAGGACCCTCC:1 + chrX 10425803 3' - 1731 4409 1 62.96 CGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCATGAGCCGAGTTTCTTGCCCGGTCCGA:1 - chrX 14270394 3' - 297 423 1 74.26 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCCTTTTACTTTAATAGTAAGAGGTATAAAAACAGGTACTTGCACTTAAATGTCACGTAAATTTT:1 + chr3L 25126303 3' - blood 12 2 67.33 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGGCGCTACTGATAATAT:1 - chrX 6654678 3' + P-element 2885 2 75.25 GCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAATAGA:1 + chr3R 10971949 3' - BS 5028 1 58.42 AAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGGCTTTGGGTCAACTGAAAAGCTCGCAAATTGCGAGGCCCACTGCCACTGGCCCTGAAT:1 + chr2L 1828856 3' + 412 7530 2 63.37 CATCAATTTGGATTTCGAAAGGGACACGAAACTATTGAACAGGTCCACAGACTGGTGAAACACATATTACAGGCTTTTGTAAGTAATTTAATTTTCTTATT:1 + chr4 211824 3' + Helena 286 1 78.22 GAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATCAGTGAGCGCCTGTGTGTTTGGTTTTTATCTATGAAATTCATGAATGCTTCGG:1 + chr2L 527572 3' - Stalker4 302 4 65.35 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCA:1 + chr3R 6147320 3' - copia 34 2 55.45 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGT:1 + chr3L 9692719 3' - P-element 52 1 25.00 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAA:1 + chr2L 108061 3' - P-element 33 1 47.52 TTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAATAG:1 + chr2L 15957500 3' + Max-element 8487 2 69.31 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGTATATTTTTTGAAAAGGCCCACGTATAACAAAACAATTC:1 + chrX 10251796 3' + flea 217 2 72.28 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGCCTTTTCCCATTTTTTGACTATTAAAGT:1 + chr2L 12153249 3' - roo 8713 2 74.26 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCACCTATAATTACTGTTGTTTC:1 + chrX 20437710 3' + roo 394 1 49.50 GAAAAATACCTTTGTATTACTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGAACACACAGCTGTATGTATATAGGCCTCAGTGCCCTCTCTTAGTGGCCGCGG:1 - chr3R 4515199 3' - HB 43 1 68.32 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCTCATCTGCATCTGCAGCTGCATGGGCATCTAATGATATTGAATAAG:1 + chr3L 17122485 3' - roo 8693 2 55.45 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTACTGTTGCCTACTTCCAGG:1 + chr2R 5850023 3' + jockey 4955 1 57.00 CACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACGTCGAGATAATGCAATTATA:1 - chrX 16798181 3' - diver 9 2 70.30 AGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAA:1 - chr2L 15956051 3' - Max-element 49 2 71.29 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCGCC:1 + chr3R 18960476 3' - hopper 50 1 75.25 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTG:3 - chr2L 326149 3' + roo 358 2 72.28 GCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTCG:1 - chrX 4488875 3' + 412 454 2 62.38 TGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCC:1 - chr3L 7989747 3' - mdg3 41 2 61.39 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAGCAGATCCATTTAG:1 + chr2R 9454317 3' - opus 7144 4 59.41 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAAAGCAAACAAACAAATTGCGAATAAAAGAAAGGTAGATTTAATTGCTAGAAATGTATATCTACAGTCA:1 + chr2L 17430749 3' + opus 494 2 67.33 GGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCGAACCATTTAGGCATTTAATTTATCGCTTCCCGCAGTTCAAATG:1 + chr3L 3641040 3' - roo 8915 2 56.44 AAACANAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAA:1 - chr3L 5716887 3' + copia 5083 2 70.30 GAATTNAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGGCCATAAGGAATTCATTGTAAAGTTTTTT:1 + chr2L 13244978 3' - P-element 45 1 34.65 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCGGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTGTGGCACTTAACTTAACATTGTTGGATGGCTTAGAAAGCTTTGCC:1 + chr3R 16510912 3' - flea 25 2 54.46 TGAATAATCAAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGCATTCTTACTTCCACCCCAAACTGTGACGACTACTGT:1 + chr3R 19352260 3' - Stalker 321 4 74.26 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGGCTTTAGGCCTTTAGAATAGACGATGCCTGCCTGACTGCCTA:1 + chr2L 6158517 3' + 412 7514 2 55.45 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTT:1 + chr2R 5084091 3' - F-element 27 1 51.49 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAAGG:1 + chr3L 13081005 3' - 412 7082 2 54.46 CGATGAGTGATATTTTGCACAGAGCGATTGATTCCTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTT:2 + chrX 22562549 3' + transib2 2362 1 49.50 CTTATATCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAATTTGAGCTGCGAAAAT:1 - chr2R 22395180 3' - I-element 9 1 73.27 TACTAGGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAGTCAGTAAATAAATCGAGTGTAATA:1 + chr2L 3194659 3' - P-element 357 1 28.71 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTNNNNGTTCTCTGGTGCAAACCACATATGGCCAACTAGTTTTG:1 + chr2L 10118934 3' - hobo 45 1 72.92 CCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACCTCTACCTATTTTCACAATGGATAGGGCAAAGCCAA:1 + chr3L 5716939 3' - copia 4908 2 61.39 AATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCATAATGTCTCGCGCACCACAAACGTTCTAATCTCTTGATTTATCTTATTGTATTTGT:1 + chr2L 9389200 3' + 1360 3165 1 67.03 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCACCTATAATTACTGTTGTTTCCCAATTTA:2 + chrX 20437718 3' + roo 402 1 57.43 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGCCTTCGTCATCGCCACAGAGAATGGGAGCGGGGAAGGAATC:1 + chr3R 19989892 3' + pogo 2098 1 75.51 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGG:1 - chr3L 21735385 3' - Doc 31 1 51.49 CGAACAACTCAGCAGCAGCCACGTGCTGAGGCTGGTACACCAACAAAAACGGATGCCCTGACAGCTGTTCGTGTTTTTCGGTCGGTCTGGTGTGGCCTGGA:1 + chr3R 11705739 3' + G-element 228 1 63.37 GATACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGAAATAACTTAGAATGACTTTGGAATACTCGCACGCACACAGACACGGAGCTAAACACGT:1 - chr2R 8301887 3' - Quasimodo 6973 2 57.43 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGATCTGAAATATTCCAAAAAACATAGTGACACATTCTGTCAGATTTGAGTCGTAGCAGTGCTACCTTTCTCACAGATT:1 - chr2R 8245436 3' + mdg1 396 2 81.19 AACTAAATAAATAAATAACTAAATTCGCGATTTGCTGCCGCAATTACGTTTCTACGGGTACACGAGACATTGAAGACGCAGCCCATTAATTGGATTACAAT:1 - chr3R 10136675 3' + HeT-A 28 1 73.27 CGGGAACACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCGGCCCATGGTCCGAAAAGATAAGAAAGCTTGAAAAACAACCGAAAGTGTCGTTTAACATCGGAGAAAAG:1 + chr3R 31812772 3' - P-element 7 2 73.27 CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACACTAGCGAAAACCTTTCATTTTATAAAATTACATTCGGATATGTTATACTTTTC:1 - chr3R 28883344 3' + HMS-Beagle 241 2 72.28 GTAGCAGTCTTCTTGCAAGACGTCTCATCCCCGCTAAACCTCTGAGACGACTCAAAAGGCAAGGCTTCGCCAAGAACAAGCAATAAAGGCCATTTTTGGGC:1 - chr3R 7477180 3' + Helena 1274 1 73.27 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAAGGTTATTTGAAGTTATATGTATATTTCACACGT:1 + chr3R 10445252 3' - roo 8706 2 76.24 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCATTCTAACATTTCTTTATTTCTA:1 - chr3L 6024556 3' - roo 54 2 82.18 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAAAACGTTAGCGGGTGTGC:1 - chrX 328982 3' - opus 7 2 72.28 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAG:1 + chr3R 31458518 3' + jockey 4945 1 70.30 CTAAAAGCCAAGAATACAAAAAATACTAATTATAAACAAGAACTCTAATGTAGGCAAATGGCAAACACATACAAAACTCACGCACCGCACTCGAAACCCAA:1 + chr3R 8881579 3' + HeT-A 5881 1 67.33 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACAC:1 - chr3R 13715097 3' - P-element 39 1 35.48 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGTAGAAGG:2 + chr3L 10811195 3' + P-element 2840 1 34.65 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAAAGTATGTACATGCGTGAGGCG:2 + chr2L 487162 3' + P-element 2878 2 69.31 TTACAGAGTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAAGAAGCAGAGACCGTAATTTTTCCACGACTCAACCTAGCGAT:1 - chr2L 12109050 3' - R2-element 77 1 59.41 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACGAAACAGCCGGCCGTCAAAATTTTTCCTAACATTTCACTATTTTCACGCTTGTGTTACGGCAATAAAG:1 - chrX 8243234 3' + P-element 2883 2 75.25 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAATTT:1 + chr3L 9925297 3' - Doc 38 1 59.41 AAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTGCGAATTTCATTTCTTTTAATTTATCTGAGTTCACTTGGTTCTCAGTCGT:1 + chr3R 18905624 3' - P-element 261 1 55.45 GGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGA:1 + chr3R 15943348 3' - jockey 4656 1 58.00 TTAGCNAAAACGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATGCTTAAGTGTGCAGCTCCTATTGCCCCCTCTC:1 - chrX 17319538 3' + R2-element 3351 1 63.37 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTG:2 - chr3L 21735392 3' - Doc 38 1 58.42 GTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGG:1 + chr2R 6779818 3' - Doc 4534 1 62.38 CCTTACTTATTTTGTGCAAGAAAAAAGTAACGAGACAAATGCAACGGTAATTCCACAGGGCGCGATCCAGGGCGATGTATTCGGTGCGCAGAGCGTCCACT:1 + chrX 7944150 3' + Tc3 120 1 51.49 ATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTAAGTGGTTTCATTTTGGCTGACTGGGCAAGGT:1 + chr2R 24982722 3' + P-element 2725 1 38.61 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTATGTTATTTATTTCATGTATGTATGTTATTTCATCATGGTGACGACCTCGCCGCAGTAGAT:1 - chr2L 2197106 3' + P-element 2870 1 28.71 AACATCGTCTGCGAACATAAGTACACGCGAATATTTTATTACTAAGCGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAACGTTTAGCAGCAATTTTTCGTAATTTTC:1 - chrX 6313969 3' - Q-element 570 2 72.28 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGACGTATGAGTGA:1 - chr2L 17210093 3' - jockey 4708 1 60.40 AAAAAAAAAAATAAAATAAATGGGAATCCTCAGAACAGCAATCGGGCGGAACAGCAATCGGTATGTTACCCTTATCGATTGTTGTCAAAAAACCTTCCTTT:1 - chr3R 1060771 3' - hopper 142 2 55.45 CAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGA:1 + chrX 5018693 3' + opus 7460 2 67.33 CTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTCACAAGCACCAACACACCCATCAGCACAAAAGATCAT:1 + chr3R 7181220 3' + F-element 4399 1 71.29 CCTTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAAAAAGTTAACGAAAAAAGGTTCCGACTGGAAGAACGAGAAAAATTTCACCAGAACCAATGGAACAA:1 + chr3L 13880150 3' + G4 3649 1 68.32 AATTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCTCCGCTGAAAGAACAAATCTGCAACTGGGTGGCCCCGCCAGAGTTCTGTGATGATGGGC:1 - 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P-element 16 1 68.32 CTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAA:1 + chr3L 24208220 3' - Quasimodo 4 2 72.28 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCTACCCAGATCTTATGTAACCTGCAGCCGAAATTCTATTCCGAATATAA:1 - chr3L 7806155 3' + pogo 2076 1 54.46 TCTGCAGAGTGGCGAGTCGATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTTGTATGTTAAGGATGGGTGTTAATGTGTTCGTGTGGATTATGTGACGTGTTGCC:1 + chr2L 9809091 3' - mdg3 5392 2 66.34 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACCTATATGAGATGCCACAGCATCC:1 + chr3R 26469518 3' - hobo 19 1 60.40 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGT:1 + chr2L 2197163 3' - P-element 16 1 62.38 CTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTTTACAACAGAAAGTA:1 - chr2R 12779059 3' + roo 409 1 77.23 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAA:2 - chr2R 19192545 3' + roo 9026 1 73.27 AGCTTTTACAGTTCCTGAGATCACACCGTTCATATAGATTGACATACGGCACAGGAAATAACGCACACTCTTACTCAAAAATAGCAGTGGTCAAAAACGAG:1 + chr4 389334 3' - 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R1A1-element 5010 1 66.34 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGACAACACCGAGTTATCTTTACTATTTGGAA:1 + chr2L 1156794 3' + 412 450 2 74.26 ATCGGCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAG:1 + chr2L 18112568 3' - transib2 2585 1 57.00 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTGCAAGTCATGCATACTCTTTGAAATGTACTAT:1 - chr2L 2435248 3' - roo 8747 2 72.28 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATCTACCAACAATGGCGCATTGATCATCGCCTGTTGGGGACTCTCATTTTTGTTTTC:1 - chrX 19095727 3' - roo 8682 2 61.62 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAAT:1 - chr2R 5485077 3' - 1360 41 1 68.00 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGGCAAATGTTTGAGGTGGC:1 - chrX 19457130 3' + roo 9055 2 63.37 TTTTTTTTATTTTTTTTTTTGTTCCGCTTTTCTCGGTGGG:1 + chr3L 11009398 3' - G2 3076 1 80.00 ATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGAGCACCGGAGCGAGTTGTGCTGCCTACTAAAGTATGGGTTCTTTGACCCGCTTG:1 + chr3L 25960081 3' - Cr1a 4150 1 59.41 TAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTG:1 - chr2L 7459556 3' - BS 5016 1 55.45 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGG:1 - chr3R 18960443 3' + hopper 1365 1 77.23 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAACATC:1 + chrX 12294775 3' - blood 17 2 62.38 CGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGCAATAATCATAATTCATTTTTCTCGCCTTCTCTGCCTCGCCCTCGGAAGAAGAGGCGTGTCATG:1 - chr2R 5710108 3' + F-element 281 1 65.35 CCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCACCGAAAGCAAAGTCGTCAGCCATGCTGTTGGCCAGGATTCCCTGCGA:1 + chr2L 11439124 3' - F-element 4357 1 52.48 GGAATNCGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATGATAAATTAAATGTGTGAGCTATTAAAGCAAGCAAAATCGAAGTGCA:1 + chrX 10407646 3' + invader3 185 2 52.48 ACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGGCTACTGCCTTTGGCTTGGCTCGCCCTCCTGTCAAATTGACTGCAAAAAAGGA:1 + chr2L 5925824 3' - F-element 4492 1 60.20 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCG:1 - chr3L 12085176 3' + pogo 2055 1 78.12 ACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTTC:2 + chrX 8364653 3' - jockey 4788 1 54.46 CTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAA:1 + chr3R 1868220 3' - G-element 34 1 53.47 ATTGACCGAAAGCTTCACTAAATCGTTTTATGGTATCATTAAAGTTATTGACTTACCTGAGAACTTTTTCTTTTTTCGTTGTGCAGGAACTCTACCACCAG:1 - chrX 14794813 3' + transib2 121 1 70.30 AAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAG:1 + chr2R 9454304 3' - opus 7044 4 72.28 TCATTGACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTTTTGCAACACACAAAAACAATTT:1 + chr3R 20466687 3' - roo 50 2 76.00 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACGAGGTGCTCGGATGAGCACAGCCAGCAGTTCCTA:1 + chr2R 23305468 3' + I-element 5315 1 65.35 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAATCTATTCCTAGAATGTTCGAGACCATGTATGCTCAAAGTGTGTGTGTAACATATGTATGAGC:1 - chr2R 973743 3' - 1360 12 1 67.33 AAACTTCTCCTTTACAAGGCCAACATGTTCACTCACATATGTATGAGTATCTTTATGAGCCATTTTCTTCAAAGAAAACATTTTCTGTTTA:1 + chr2L 6689261 3' + G-element 3875 1 78.02 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTG:1 + chr3R 24281999 3' - Max-element 52 2 74.26 AAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCAAGTAATAACATAATCCCAC:1 - chr3L 17122393 3' + roo 9060 1 68.32 AAAAAAACAAACAACAAAAAAATTTATAGTTAAGTCTTCTTTTTAAGTTCAGCTATTCTTACCGATTCTGTGTTGACTGAGGTACATTCTTAATGGAATTC:1 + chr2L 7060849 3' + gypsy11 3933 2 81.19 GAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATTTCATTCTCTCTTGTTTTTTATTTTCTCAAAACAATTCAGTTTTATCAATAGGACACAGCAAAT:1 + chr2L 17974195 3' + INE-1 549 1 56.44 ATTTTGTCTTTCGTTCGCGTGTATTTATTTCACTGTGTCGTTTTCAATCGATGGATCAGTCTGACGGCGAAAACGTCGCCAAACTAGTTTTTATGAAAATT:1 + chr2L 8840988 3' - HMS-Beagle 292 1 79.21 CTTCCACGGAACACTAAATTATTTATTCGTATACTTTCAAAAAAGGAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 12611831 3' - R1A1-element 76 1 77.19 TGAATAACGGGTATCAGATAGTCGAGGAACTCCTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTCTTGTGCGAAAACCCACTGAATAAACATTATCCCCACAGAA:1 - chrX 22599905 3' + INE-1 548 1 59.41 GGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAAAGTTCTTTGGGATTTTTCTTTTACAGTTACTTTTCCCAGTGTCAAGGTCATTTCGAAGT:1 + chrX 3996282 3' - roo 8988 2 65.35 AAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGGATGGAAATGGGAATGCGAAAGGGGATGTGGATGG:1 - chr2L 20131745 3' - Rt1a 11 1 51.39 GCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCACCTGTCGAGCAAATGAAAAATGAAAGTTTTTTATCTCTTTACTTAGGTTGTGTCCATAACTGATTTGGATAAT:1 - chr3L 3279047 3' - jockey 4545 1 78.22 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAAGAAGAAGCTATAAGTCAGCT:1 - chrX 21388505 3' - 1360 31 1 60.40 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGAATTGACCACAGCTGCGCGTAAAAGACGAGGTGGGCATTCGGGCCCAGAAGTTGTTTCAGGATTTCCTC:1 + chrX 6674571 3' - jockey 4724 1 64.52 ATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAAGTAGGTATGATTATAGTATCTTCTTTTGCGGAGTTCAATGAAATAGCTTTCTAAAATTAGCATGGC:1 - chrX 20885948 3' - Ivk 5354 1 71.29 GAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATAATTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCG:1 + chr3L 5015870 3' - I-element 4929 1 55.84 ACATGGACATGTACGAGGACGCTGGCAAGGCGCTGACTGACGCAACCCGCAAAAGTCTCTTAGAGAGAGAAAGAGTTATGGAGCTGTATACCAAGTTTCCT:1 - chr3L 5707450 3' + Chouto 6289 1 82.18 TATATTTTTATATTTATATTTATACTTCTGCAACTGTAAGTTATCAGATATTGATAAGCAATATAGTAAAAAAATATTATATTAATTTTAGCTTCATTAAA:1 + chr3L 19514581 3' - Stalker4 88 4 63.37 GATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCCCGACACCCCAATCCGTCGTCTGTCTACA:1 - chr3L 20063718 3' + copia 4722 1 75.00 GCGAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCTCTTTCTCTTTTCCTGGCTGT:1 - chrX 10089026 3' - FB 53 1 77.23 CCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCCTCGATCGGGAAAACTATTAATTCGTGAGCTGATACAAATTTGGACTATCAGCGCTGGAACGTTACAGAAGAG:1 + chr3R 6186172 3' + 412 311 2 72.28 GATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACATCCACCTGTGCCGAACCAGTTTCTGGACCATCTCCCGGCTCCTTAGAAACTCCATTCAGCGGTAACAATTAGCC:1 - chr3L 16913534 3' + HMS-Beagle2 7053 2 72.28 TTTGAAGGTGTAAAACTACTTGCTTATACTATTCCACACACAGAATATTTTGTAGTATAGCAATTTAACATTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTT:1 + chrX 9944358 3' - Doc2-element 199 1 70.30 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACCGACCGACCACCATTCACTACAGCTGACCACCGACCACCATTCTTGGCGTTTACCTTACTCGCCCA:1 - chr3R 19837000 3' + P-element 2877 2 70.30 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGTAAATAAGTACAAAATTCATTTGTCGAGAAAAAGTTACAT:1 + chr2L 8740954 3' + Burdock 6366 2 57.14 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAA:1 + chr3R 7101059 3' - pogo 20 1 62.35 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGGGTACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTG:1 + chr2L 326192 3' - roo 16 2 53.25 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTATGTGAATATGATTGCTTCCGTCCACATGGAAAAGCATTCTTTTGTTGGC:1 - chr2L 19075627 3' - Transpac 3 2 76.24 ATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGTCATTGTTCGCTTGCGGGTGGCATTCTCTGTTTCGCAACATCGGCATAACATTACTACAACATTAACAACATAT:1 + chrX 13017681 3' + invader2 4900 2 68.32 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAATGCCGCATACTAAATAAAGCCTGTG:1 + chr3L 10324094 3' + jockey 4924 1 75.25 TGGTGCGCAAATTTTCGCGAATTAAAAACGAGCTGCTTGCAAATGCGAGTAAGTACTCGGCGTCTACATCCTCTCCAGCAGTCACTGTTATTCCGCCCGA:1 - chr3L 192921 3' + R1A1-element 98 1 76.00 CTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTA:1 - chr3R 15157616 3' - invader3 5245 2 69.39 CAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCCAGGGATCCTAAATTTAAGGAAGTTTAGAAACTTAATGGTTTCTGGTAGCCCAAGAATCTGA:1 - chrX 12250601 3' - Doc 4525 1 65.35 CAGGGAGATCGGTGGGGTCTACCCTCTTCAGCCTTCGGAGGCAAATTTAGGACATGCAAAAATTTGGCTTTATCAACAAGTGGCTCTGCGGTCATACTGCC:1 - chr3R 5217470 3' - G5 4648 1 64.36 TATTTAATAAAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACACATACATATGTATATGGCTATTTTTGCT:1 + chrX 11533964 3' - invader6 52 2 74.26 ACTACATCAGAAGAATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGTGCTACACAACTCGCGTTATCCTGGCGGTTGCAACAAATG:1 - chr3R 29660238 3' + mdg1 7445 2 55.70 GCTTTCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTAAACGATTGCTTAGATTAATATT:1 + chrX 19810286 3' - INE-1 29 1 57.43 CTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGACTTGGCTTTGGCGAAGTCAATAAATTTAGCTTGCCACCT:2 + chr3R 16626872 3' + I-element 5350 1 70.30 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCATAAACAAGAGAGATAGCCAGCTTCTGGCA:1 + chr3L 21708666 3' + roo 9029 1 70.00 AATCAAGTCGGGCCTCTCAACATCACCACCAATGAGCTTTCAAATAACGTAGGTTGAGATTAGGCGTACAGACTCTAAAGACATAGATGCAGCGCAAGTTT:1 - chr2R 5484895 3' - Cr1a 4069 1 63.37 AGTCTACTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCGAAGAGTATTCTAAATA:1 - chr2L 19642942 3' + roo 406 1 75.25 TGTTAGCATAGTTTTTTTTTTATGGGCGTATGCGTAATATTTGTAAGTCCATTAAAAGTATATCAATAAAGAGGAAACCCGCCAGCTAAACCTATGGCTAA:1 - chr2R 14323299 3' - looper1 1698 1 78.22 ACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGG:1 - chr3L 5964262 3' - BS 45 1 71.00 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCT:1 - chr3R 6147229 3' + copia 248 1 78.22 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAATATAATGTATAATCATTTATGTAATAATAAAAAATAACAACAACTAACA:1 + chr2R 978515 3' - copia 4897 2 54.46 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGACCGCCTTCATTACTTTGCCCAAGCCATCAGGATCCTTTGCCCTCGGACTCCTTTTCCTTTGCCCAGC:1 - chr3R 27374772 3' - mdg1 8 2 71.29 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCC:1 - chr2L 23372628 3' + 1360 3356 1 67.37 TCGCAGCCGTAAAATATCATTTTATTATTTGAATGTACGTGTGTGGGGAAACTGGAAACCGGAACCGCCTCGCTTGTGCGCCTGTGACGTCCCTGTGTCCT:1 + chr3L 13471424 3' + gtwin 295 2 76.24 TTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATGGTACACATTAGGGTAGTTTTTACCTTCTTTCCCATTTTCTATATTTATTTTCTATG:1 - 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chr3L 2975690 3' - Porto1 4219 1 79.21 TAAATTAACAGAGGCAGTAGTAATCCATTAATCCAAAGTACACAGCCCTTTTCTTATGCACTCGCTGAATCCACCTGTCCTGTTTTCCCATCCCAACAAGT:1 + chr3R 22098515 3' - G4 3776 1 63.37 GTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTTTCTATGGGTGAG:1 - chr3L 13994215 3' - P-element 35 1 36.96 ATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCGCGATCTTCACTCAAGAAAACTCAAGACCACGTAGG:1 + chr3R 25633399 3' + Tirant 363 2 63.37 TATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGACTACGTTGCTTCAATTGGTTATTAAATTGCAATTA:1 - chrX 5443854 3' - mdg1 1 2 78.22 AGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAA:1 + chr2R 10863947 3' + mdg3 5449 2 77.23 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCCGGAGAAGGGAAAA:1 - chr3R 29432773 3' - 297 27 2 81.16 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGGGCGTATACGTAGCGCGCTACCGTTTCTCGCATTACTCAT:1 + chrX 3326997 3' + hopper 1380 1 58.42 ATATGTATATATGTATATGTATATAATATGTATATTATAAAATACATAAAAAAACAAAGCATAATTTATTTTGCACTTTCCTGAATGGCTTTGGGAAATTT:1 + chr3L 19784674 3' + G3 4507 1 60.40 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCG:1 - 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1360 3358 1 42.57 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGAATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGGGAATTATACTGTACATTCATACGCAAATATGCGATTTTTT:1 + chr3R 15998123 3' + pogo 2052 1 74.75 GAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATACATATGTATGTACATATATCTTTT:1 + chr3R 23665311 3' - 297 6604 2 78.08 GTTTCNGAGATCTCGACGTTCATACGGACATGATCAAGAATATATATACTTTGTATGGTCGGAAACGCTTCCTTCTGTCTGTTGCATACTTTTCAACGAAT:1 - chrX 124082 3' - INE-1 140 1 83.17 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAAT:1 - chr3R 5977733 3' - copia 20 2 59.41 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTTCTATTGCATACGCACAGGG:1 + chrX 8364671 3' - jockey 4770 1 65.35 GCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAGAAAGTGTGTAAAGGGGGAAAATGTAGAAAATACTGAATATCTACGTGTCGACTACTTTGATTGGCCATCCGGTA:1 + chrX 18179520 3' - accord 185 2 67.33 TTTGTCGAAAAGGACGAAACACGTGGAAGAAAGCCCTCAATGTCCAACGTGGGTCAGTCGCTTTTCTTTGTGGGTTCGGTGTGCGGAACTCTGGCTTTTGG:1 + chr3R 14797019 3' + Tc1 491 1 52.48 GTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACTGACTTCGAATACCGTCTTAGGCTCTGTTAATGCACAGCAAATTATTACCCTCTGCTATAAAAATTAGCTTGTT:1 - chr2R 10880061 3' - Stalker2 5 2 50.50 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTGGGCTAACCGG:2 - chr2R 5849945 3' - jockey 17 1 69.31 TTCATAATTATTATTAATATTATTATCATAATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGT:1 + chrX 21947700 3' - mdg1 48 2 70.30 GGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATACAATTTCAACATTAATGTATGCAATTTTAATAGAATTT:2 + chr3R 16799817 3' - X-element 4622 1 58.42 ATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCC:1 + chr3R 10741140 3' - 1360 3367 1 43.56 CAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGATTGTGCAACAAT:1 - chr2L 18112483 3' + transib2 2817 1 70.30 AAAGTTTAATCCTAAATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCGGCAAACATCGCAGATGA:1 + chr3L 197443 3' - S-element 1469 1 46.53 ATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTGGGATTGGATATACTTTGTGCTGCTGATTGTGGTGAGTGTTGTTCTCTTATTTTGG:1 - chrX 6130540 3' - 17.6 62 1 67.33 GTAATTTCCCCACCATCTGTGTTTTTATTATTTTTTAAATAATCCCATGCTGATTGGCACACCCATCCAATGCAGTGTTTTTACTCTTATCTTTACACAAA:1 - chr3L 13768817 3' - G5A 435 1 80.20 GTGTANATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAACG:1 + chr3R 15943351 3' - jockey 4654 1 60.40 TATTATGCAGCGGGAATATACTAGACGGGATGCAACCCTTATCGTTATCGGAAGCGAACTTAAGTGAAGATGGAAACACTATAATAGTTCGGCTGGCGTTG:1 - chr2L 14477351 3' + Gypsy12A_LTR 106 1 66.34 ATCAGGATCAATAGCGGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAA:1 + chr2L 12286074 3' + INE-1 93 1 65.35 GCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAAATTAATGTAAGGTCATTCCGGGCCAATTC:1 + chr2R 23495917 3' + 412 318 2 54.24 AAAACGCGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGA:1 - chrX 5018641 3' - opus 7157 4 71.29 CTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTGC:1 - chr2R 23305429 3' - I-element 45 1 67.33 ATAAATATTATTGTTATTATTACTAAGGTAAACATTATTTATAATGGAAATTAAAGGAAGTAGGATACCATAAACATACGAATCATTTATGGCAATATACA:2 - chr2L 7588179 3' - mdg1 27 3 80.20 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCGTCGGCAGTCATTTTCCGGCGGCATTGATAACT:1 + chr3R 20884981 3' + flea 5002 2 68.32 TCCGAATGGATTTCACAGGTTGGGGAGGGGGCATGACCTTTCGTTGCTTGGCCCCAACAAGGGTGATGGTGGTTTTTGCCACTCGAA:1 + chrX 17609952 3' + Circe 7182 1 77.01 CACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAAATGAAGTATAACGAAATTAGCTTAAACACAACTGTACTTGGGAACTCAG:1 - chrX 12530738 3' + Doc 4415 1 65.35 TCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGCCATGACCATTTATCTCGAACTCCGAGGAGGAGCAGCCTTCT:1 + chr3R 22177063 3' - roo 9043 1 56.44 GTCCAAAAAGCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAATATTGAATCGTATCAATTCCAGCCATAAGCATGTCCATAACCATTGTCACAGCCACCTTCTTGTT:1 - chr2R 18756326 3' + Ivk 5264 1 61.39 GGGACTTTGAGCACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGAAAACTTGACCGTACGTATATCTTA:1 - chr3R 26331666 3' - G-element 56 1 75.25 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCAT:1 - chr3R 20466627 3' + roo 387 2 58.42 GTGCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTGAGGTGAAGGGCTTATTTTGTCAAATTTACAATTTATGGCTCCCTATCTGCCAT:1 + chrX 14458294 3' - 1360 260 1 78.22 CCCCGGTGCTTTTATATCCGCTTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTAGGGAGAGGGGAGTGGACCACTGGGAGGACTATTCAA:1 + chr2R 14582716 3' - opus 7288 2 61.39 GTTTGGACCACTCAAATACGTCACTATATATATATTTCCACATAATTAATAGTTATTATGGCTACGCATTTTGGCTTATAAAACGCATTATCGGATTT:1 - chr3R 22277118 3' - 297 4 2 75.51 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGAACTGTATCAGAGAGTTCT:1 - chr2L 6252525 3' + P-element 2831 1 23.76 CAATGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCGTGTTGCGGCGGCGCTGAGAATTTGATCGATTCGTTCGATT:1 - chr3L 722253 3' - F-element 4337 1 57.43 AAGAAATTTCGCAAGTGTTTGGAGATTGGGGGTTTTGTGACAGTAGTGAGGGTGAGCGTCACACGGCCGAGACGTGCGATAACTTGGACACGGGCGGAAA:1 - chr3R 28838720 3' - Doc2-element 498 1 55.00 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTCACGTTCGTGGAGCCGGCCAGAAATATATCAGTTC:1 - chr2R 24493673 3' - flea 4792 2 64.65 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGC:1 + chrX 13347345 3' - roo 43 2 69.31 GTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAAAAAGAAAACA:1 - chr3R 9254914 3' - F-element 219 1 56.44 AAGATATGAACAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCTAATGCCATTTTATTTTGCAATGTACAACGAAAACGTAACGAGGATAGGTAGTAAGTTAAACAAAG:1 - chr2L 4198855 3' + 1360 492 1 65.35 CAGGTAAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTAAGTGAGTACGGTTAGTAAGATATTTTATTCTACGAAACTCATATAAAACACACTAAGTATAATTGATACCA:1 + chr3R 19914438 3' - jockey 4765 1 64.36 GGGACNTTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATATATAAGCTGCTTTCAGCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGC:1 + chr3R 29432828 3' + 297 6955 2 58.42 CGCTGGCAGGATCAGAGCTCATCCGGCTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCTTCATATAGTTGACGATATTTGCTTCGCCAGTGATCTC:1 - chr2R 16898765 3' - Max-element 338 1 62.38 CTAGAATTACACAATAAAATAGCAATATACAAGGTTCATTGATATAAGAAAATCTGGATACGTATTACGTAACGTTGAGTTACAAAGGAGAATAAGGAACA:1 - chr2L 22054741 3' + Porto1 4218 1 67.33 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCCACGACAGAGTGACAGTTGACACAATCAAACAATAGGCAAATCAAAAT:1 - chr3L 23152037 3' - Doc 34 1 55.45 TAATAATAATTTCAATTGATTTCGCTTTTCTTTTTGTTGTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTGGAAGTGAATGGTGGCATGGAATCTCCATTTTGTGTCT:1 - chr3L 16147389 3' - invader2 431 1 70.30 AAAGANAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACTAGACCAACTAACGGTGGTGGCTA:1 - chr3R 14324193 3' - 3S18 5795 2 52.48 CCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGGAAAATAATAACAATAACATGAAATGATGTATGGACTATGTGGACTA:1 - chrX 11533886 3' + invader6 4861 2 75.25 AAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTG:1 - chr3R 4973110 3' + 1360 3 2 50.50 GATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAG:1 + chr3R 27080784 3' - HMS-Beagle 6837 2 68.32 GGTTCTGTCAGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTACAGTTTTTTATTATAAAATTAGGCGATTGTGTTGCTGCCTTAGGTAAAGTCGGAAGGTTA:1 - chr4 542713 3' - 412 382 2 57.43 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGAAAATTGTTGTACAC:1 + chr3R 18906636 3' + P-element 2831 1 23.76 AAAAAAAAAAATATTTAAAAAAAATGAAGGAAAATTGTAAATTTAATATTCTTGTGCGCCAGCTTGATGATTTAAATTAATTTGCAGCCAGTTGGGCACGG:1 + chr2R 13469817 3' - FB 175 3 87.13 TAACTTGTTACAAATGCTTACAATCAAATCCATTTAGCCTGTAATGGCTGTCGGGTCGTCAGGCATTTTCAGGCTACTGATCCCGTGCTGCTGCGATTGCC:1 + chr2L 15537534 3' + Chouto 6152 1 74.26 TGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATCAGTTCGTAAGTTCATACAAGAACTAGAAGCAAAATGTTTTATTATAACAAATAAGCTAGCCCTAGAAAATAATGAA:1 - chr3L 26817436 3' - Quasimodo 7026 2 77.23 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTA:1 - chr3L 11435592 3' + roo 9028 1 70.30 AATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTATAATAATTTCAGTCTGGTGATATAATATTCTT:1 - chr2L 5478323 3' - invader1 3827 2 67.33 CCCTTTGGCAGAATGTTCACACATGAACAACCGAACATAAATAAGCCAATGACAACAAATTGGGGAAGTACCCACATAGTAAATGTGAAGTGGGGGGGACC:1 + chr3R 6186584 3' + roo 8652 1 76.24 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAATTCATCCTTCCGATCTGACGAAACTGCGGCTCA:1 + chr3R 19837117 3' + P-element 2884 2 75.25 AAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGGGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTGTTCATATAAATATTTCAGTTTTATTTTGGATT:1 + chr2L 16933648 3' - 3S18 42 2 62.63 TTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAAATTATCTATTTGTTTATGAAGAGTATATATCTTTGGGATTTTCGTAACACGCAAAC:1 - chr2R 12727097 3' - R1A1-element 104 1 58.42 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGCAAAACAGTTGGCAGTTTTGTATGCAAAATGTAATCAATTGGCGGCATTTTAAATGCAATTTGTAAATGA:2 + chrX 2762223 3' - roo 8670 2 72.28 TTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATTAACCACCAGCCAAATGCATATTGAACAGGATGTCGACTTCGCATAGGGAGGA:1 - chr3R 7745986 3' - P-element 389 1 59.00 GTGTGTGTGTGTGTGTGCATGGCACCAAAATCACCTTGCCCATTTAGCACACTTCAAGAACTTGTTCTTCAGAATCAAAACCATCAATTAAGTTGTGAATA:1 - chr2L 2826171 3' - accord 179 2 78.22 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACT:1 - chr3R 18960415 3' + hopper 1393 1 55.45 CAATCTTCATTTTGATATTTATATTTCCGTTTCACCTGATCCTTATAGATTTTTCGTTTATTGTCTTTATTATTAATTTCTATAACTTATTCGAATGCGAT:1 + chr2R 24139353 3' - Transpac 4808 1 76.24 TATTGATAATTTAGATTTACGATTAATTAATTAAAAATAAATAAACTTTCAATTGAAACAAAATACGATCTATCTTCTGATCACCTACCTGTAGTAGCAAC:1 + chr2L 20120182 3' - Juan 3746 1 59.41 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGAGA:1 - chr3L 7792176 3' - 412 30 2 51.49 TTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGG:1 + chr3R 7388391 3' + HMS-Beagle 194 2 78.22 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTTTGTATGTATAAAAGTGGAATCGAGC:1 - chr3R 14024815 3' + pogo 2058 1 76.24 AGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTGATTTTACAGTTTGTAAAAATACATTTATACATAGTACATATCATATATCCCAATTTAATGCGGTGTTTCATTTCA:1 - chr3L 5864021 3' - 412 7426 2 66.34 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCGTGGAGCTCTCTT:1 - chr2L 13060254 3' + P-element 2870 1 56.00 CACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAGTTCATGCAAAAAATATTGCATTATGCTGTGGTTAATACTAAGCTCGACAATTTTGCATTGTGT:1 - chr2L 15893679 3' + Max-element 8521 2 65.35 CTTTTATTTTTTATTTAAAATATTATCATCCTTTATTTCTATTTCTTTTCGTTTCTTTTGCACTTAATTCTGTCAGTAAGTTGCTATTTCTTCCAACCTAA:1 + chr2R 13283298 3' - G2 3051 1 82.18 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCGCGATCTTCACTCAAGAAAACTCAAGACCACGTAGGATCAA:1 + chr3R 25633404 3' + Tirant 8475 2 58.42 CCAGATATTTGCAAATAAAATGTCAACATGCCGAGCACACTCGAAAAGTCTTAGCGCCCGAGCTGCTAAGTTCAATATGTCGAGACCAAATTAGTCTG:1 - chr3L 156245 3' + transib3 252 1 63.27 GTTTCCAAAAATACTCGGGTGTTTCCAAAAGCATTAGCAAAGCAGTCATGGGGTTTTCAGAAGGGAATGGGAAACGAAAATAGGACTGAGAAGGGGATTG:1 - chr3L 5969284 3' + hobo 253 1 74.00 CTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCCATGCCGATGGTGATGGATCCCAGTCGGAGGCGGAGGACGGACTGCCGCTGGACTCTCGCCAGCGATTCCGC:1 + chr2R 22296096 3' + Cr1a 4158 1 72.73 AAGTGNTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCCCTATTCCAAC:1 - chr3R 12894104 3' - blood 7046 2 57.43 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATTTTTTGTTTGTTGCTTTTCTCATTGCTCCGCTGCC:1 - chr2L 16686543 3' + pogo 2063 1 66.34 CTCTTGTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTGACAGCAGGACACACAGGATATATGTACTCGAATATAGTGAGTCTACTAGTGG:1 + chr3R 22660432 3' + opus 125 2 59.41 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCAATTCATTTTCG:1 - chr3L 543420 3' + P-element 2849 1 41.58 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTCGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTACATTGTCCGTGTGTGTGGCCGAGAAATAAATACAATAAATTAGTTTA:1 + chr3L 21316259 3' - 1360 27 1 57.00 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAAAACAAAACAAAAACAGTAACAAAAGAAGCCAAATAGGCTGAAGAAAAGGGACA:1 + chr3R 10818447 3' - 412 22 2 54.46 AGCTTGACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCGCTCACCTGGTTTCCGTATCCTGTTCCGCCTTCGTTATTATCTTTCAATTTACACGCAG:1 - chr3L 20766854 3' + F-element 4458 1 61.39 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATTAAATTAGTTATTTCAATTTTTATACTCGTACTAA:1 - chrX 5651605 3' + flea 4980 2 70.30 AGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCAAAGCAGCTTCAGATCGATTTTATA:1 + chrX 21587716 3' - INE-1 133 1 75.25 ACAAATTCTCATGCTTTTCCTCCTCTTCTGTTCTTCTGTCTTCCTTCAATTGGGTCGTCTTGATTATTATTTATTGGGGTCTTCCTTCAATTTTGTACCTA:1 + chr2R 1918586 3' + Gypsy12A_LTR 2010 1 63.37 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACG:1 - chr2R 6984338 3' - HMS-Beagle2 46 2 71.29 AGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGA:1 + chr3R 4543245 3' - 3S18 5806 2 62.38 ATAACTTCATGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGCCAGACCCAACATTCCACTCTACAGCCAACCAGAATCCGAAATATTTGCTGACA:1 + chr3R 25817782 3' + mdg1 6998 1 59.79 AGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGATGCATTGTTTGCAGAATCGAACACCTA:1 + chr2L 8327942 3' + F-element 4323 1 73.27 TGACTCATGAGACATACCAGTAGTTAATATGGGACGCCAGAGTGGTTCCGCACCGCAGTGTTGCTTCCTGGGGTGTAATATTATCATTATCAGCTAATAAA:1 + chr3R 4228647 3' + transib2 2670 1 69.31 ACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCGGGACTTTTTATTTCGTTATGCTGATGCCATTGCCCACGCTGTCCGCCGTTTTGGGCCATCCTTCTGCGCTTTA:1 + chr3R 6780971 3' + 1731 182 1 65.35 CACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCGAGAGAGAGAGGATTGCAGAAGAGAGGGCATAGAAGTTGAATAGCTCGTGGG:1 + chr3R 30272900 3' + P-element 2886 2 76.77 TAGCAGAAGCTAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGCGCTCAGTAATGGATATCTAATAGTCGTGACACTCGACAATTTCTTTATTAATTTGA:1 + chr2R 7476112 3' + mdg1 475 1 61.39 AAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGGGTGGGATACTTAAACAATTCGAGAGACTATGTGTACCCCTGCCCGACTCGAAATATATTCAGTTTGCCA:1 - 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chr2R 12779088 3' + roo 9043 1 52.48 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTG:1 - chrX 10730644 3' + P-element 2853 1 45.26 ATGGGGAAAGCAAAGGAACTAAGTATATGAAAAGCCGTCTAATGCCTGCGCCAGAAATGAGAAGCCCAATGCAGTCGATAAGCGATTTGCTTGTACTCTAA:1 - chrX 5124326 3' + Tc1-2 356 1 74.26 AGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTT:1 - chr3R 27080726 3' + HMS-Beagle 192 2 58.42 ACTAATCGACTCGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCAGTCGAAGCCCAATTGCATTTCGGTTATGCAAAGAATCAAATCACATTTA:1 + chr3L 4345255 3' + mdg3 137 2 55.32 AGCCAAGGTATGTTGTTTTTAACGTATGTAGCTAATATGTGTGTAGTTGTACTGTTAGTGAGTGAGTGTGTCGTGTTTCATTATAAGCTCAACGGCACTTA:1 + chr3L 10599855 3' + transib2 283 1 55.45 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATGTATTTTAGTGTGAAGCCCCGTAAAAACGTACGCACAAAAGTATGCAATGAAAGAAGCATTTA:1 + chrX 3649750 3' - jockey 23 1 68.32 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCTGCAACCCTT:1 - chr2R 20838587 3' - 1360 16 1 63.37 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAATAGATAAAAATAAGAAGTGATTTATTTTT:1 + chr3R 10971974 3' - BS 5003 1 70.30 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTG:1 - chr3L 9692677 3' + P-element 2852 1 44.55 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAA:1 + chr3R 15943313 3' - jockey 4692 1 76.24 TTTTTGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTC:1 + chr3L 24916687 3' - Porto1 152 1 59.41 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGAGCAG:1 - chr3L 2800110 3' + blood 7375 2 63.37 CTCGACTATAGCATCCTCTCTAGTTTGTATAATAAACTCGTTAATATACTTAAGTAGATAAAAAGTCTAAGAATATTGAAGTAAGCCAATTGGTATTTATA:1 - chr3L 22969015 3' + INE-1 577 1 60.40 AAGTGTACGTACAAGTTTATAGTGTGAACAACCAGGAATCCATAAATTCGAAAGGAGCACGCTTGCTTCTAGATCTAGACTGTATCATAAACAATTTATTG:1 - 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hopper 26 1 52.48 TCTAGTAACATGTTCGTGTAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGATCTCGGCTCACAGCTCACCTCACGACCTTGTTGGTT:1 + chr2R 16741953 3' + opus 7097 2 69.00 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCTCATTGCTCATCATCATCATCATCTGATGCGACAGCTTGGCGGGGTGGCAGACTTATAAGGGGG:1 - chrX 11642184 3' - hopper 22 1 55.56 TAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGGAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTAT:1 - chr3L 19951213 3' - Ivk 45 1 67.33 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATGTGTATATAGTTTCTAGTATACCCGAAGAGAACAACA:1 - chr2L 4009446 3' + pogo 2070 1 63.92 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCCCTTCCGCCTTCCGCCACCTCGGTGGATGAATCTGCGTTCTGCGTTC:1 - chr3L 7314676 3' + hopper 1391 1 54.46 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTATATT:1 - chr2L 1129076 3' - HMS-Beagle 6832 2 63.00 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAA:1 - chrX 2762122 3' + roo 9038 1 59.41 AAGAAAAAAAAAAACATTTAAAAGGGTTATTTTACGTTTCTTTCATTTCCAATTGCTTTGCGGTTGAAAAATTCA:1 + chr3L 4798589 3' - FB 880 1 80.00 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCCGCGAAGCAGAACCCATCCGCCGGCC:1 - chr3R 27189251 3' - roo 21 2 57.43 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAAGTTATTAGGACCCCAAAAATGACTGCCCCGAAAAGTAGGCAATCCAAAATGCAGAA:1 + chrX 10653612 3' - jockey 27 1 59.41 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCCCTATT:1 - chr3R 12894109 3' - blood 7051 2 63.37 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTGTGTATAACAAAGAAAAACAATA:1 + chr2R 19192579 3' - roo 8717 2 83.17 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAACATCAACATTATTTT:1 + chrX 12294786 3' - blood 7017 2 73.27 TACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCACTGAGA:1 + chrX 16798287 3' + diver 207 1 62.38 ATAAATATAAATGTGTAAACGGTAGCGTTCTTCGTTCTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAAAATATATATGTTTTAGCAATAAATGAATAAGTTTAAA:1 + chrX 21205156 3' + 1360 2963 1 57.43 GTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATACGCTTTTGCTGTCATCAGAGCGACATGATAAATTTGCTTAATAATAGAGAATAAATCCCCATAGT:1 - 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chr3L 7926340 3' + flea 4983 2 62.38 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGT:1 - chr3L 958741 3' + P-element 2862 1 52.48 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTGTCTCGTCGTCGAG:1 + chr3R 9370023 3' + roo 400 1 71.29 TAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGCATTTCAGCAACTAAACAGTGCCCGTTTTGTAAAGCCAAACCATCCAAATTGTTGGAAGAGAAG:1 + chr3R 25983112 3' - Cr1a 3982 1 57.30 TGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGACCGAAGCAACAAATAAAAAAAAAAACTGGACAGAACACCACATTCGAGTGCTCG:1 - chrX 17438748 3' - BS 5069 1 60.82 GGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGGGTATCCAGAAGTCGCCATCACCTTGTTCGTAAGCCACTCTTTTCTCTCTGAGCAGAA:1 - chrX 1235397 3' - P-element 16 1 63.37 TATCATCTTCAAATAAATATAAAATAATTTTTAATGTATTTTCTTCGCGGCAATTGATATGCAAATGTTGACAAATTTTTACGAGTCTAA:1 - chrX 7482973 3' + mariner2 781 1 74.44 TTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACAAAATGCACAATTGCCGGACACCATGCCGACCCCCTCCTACCTAACCCAAGCCCCTACCAATTTGAAATG:1 - chr2R 19819664 3' - jockey 4724 1 73.27 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGA:1 - 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chr3L 19659367 3' + FB 371 1 56.44 ATGTACAAATAGTTAATAATAGTTACTTTGTTTTTAGTGGAAAATATGGAAAATCGTGAATGGTAAAAGTT:1 - chrX 19555350 3' + hopper2 1284 1 66.20 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCTCGTT:1 + chr2L 108076 3' - P-element 18 1 62.38 AAAGTAAAGTAAAGTAAAGTATTAAAGTAGTAAGTATTAAATTAAAGTAACCCCGATTTGTTTCAATAAAGATGAGACTTGGCTAATTTAGTCAAGAATTC:1 + chr2L 6296801 3' + TART-A 13152 10 55.45 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAAT:1 + chr3L 12085237 3' - pogo 24 1 53.47 CTCGACTATAGCATTCTCTCTTATTTTTGTCTTGTAAATTTGTATCGCCACGTCCACCAAAACTGAACCAAATGAATTCCTGATATCGCTTAGCTAGCATA:1 - chrX 1095271 3' + INE-1 577 1 70.30 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATTGC:1 + chrX 12538507 3' - roo 8710 2 72.28 TTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCTCTCTCTTTAATATTT:1 + chr2R 18503587 3' + roo 410 1 66.34 GCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACAGTTTTAATATAGTTTTAAAAATGTATAGTATTTAAACAA:1 + chr2R 7540620 3' - Stalker4 38 4 64.36 TGAAACCTAACATTTCTGTACTCCTATTATTTACATATGTATTACTTAATGAAATAATTTCAACCACATACTTGATTAATTTTTGGTGCGTTTGGCAACAG:1 + chr2R 18573834 3' + Transpac 4830 1 74.26 AATCCTTAAAATAGCATTAAAGATTATGTTTCGGCAGTTATTTATTATTTAGATGTCCAATGGACTAATTACTTAGTTAATGAAATTCATAATTCTTCCAA:1 - chrX 19227359 3' - Helena 81 1 62.38 CTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTACAATTATCGACTTCTGTTTAATGTGGTAAGAGGGGCTTGGATAAAACCTAT:1 - chr2R 9087061 3' - flea 4624 1 61.22 AGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAAACCCAAACTCAAGCCACA:1 + chr2L 13447203 3' - HMS-Beagle 5 2 74.26 GCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATGTATTTTCGTCAAATGGCAGCCACCGCAGCGGCAGCAGCAGTGGGACAAAG:1 + chr3L 5715898 3' - blood 124 2 58.42 CTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTTATTGGCTAT:1 - chr3L 2292052 3' - Max-element 8240 2 64.36 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGGTACTTGCTGTCAGGTA:1 - chr3L 21708597 3' - roo 8684 2 59.41 ATTAACTTGTAGTTAGATTTTTTTAGTTTGTTTTCCACTTTTTTTGTGTTCGTGGCTAATGACTAACGCACTGTCAAAGATCTGAGCTGTGCTTTTATTAA:1 - chrX 8764262 3' - gypsy2 472 1 77.23 ACCAAAGCGCCTAGAAAGAAGGCGCTCAAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGGAGCAGAAGTAGCCGGAGCAGCGGGAAGGAGATGAAACAATTACCGGGGCAGA:1 - chrX 8621052 3' + G-element 358 1 70.30 CTTTAGGGGTCGCACTCGACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATTATCATAGCTGAAACCGCGACTCTGGCTGTGTCTGCCGCCA:1 - chr3L 5865434 3' + mdg1 7228 2 58.16 GTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCG:1 - chr2R 6984315 3' - HMS-Beagle2 6906 2 56.44 CTTTTTTCGACGGTACAATGCTTTCCGTGACCCATTTCGTTATAGAGAATTTATGTAGTTTTAAAGTATATTCACGGCTATTCCAGGATTTCAAATTTGGG:1 + chr4 1026295 3' - Tc1 372 1 69.31 GGTTTGTGCAACTCGGATGTGTTCTGCATTGACAACTTGATTGCTTCTAGTAAAACACCTCATACAAAAGGAATCTCGTTTGTAGTGAACGCATTTGAATG:1 + chr2R 10573157 3' - HMS-Beagle 6628 1 52.48 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCATATTAAACGTAAACTAAAAGTACA:2 + chrX 4009326 3' - 412 51 2 78.22 CACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTAAACAAGTTAAGAATAAATTCTATACAAAACAAAACTTCCTAACAAAAACCATACAACAAC:1 + chr2L 22975175 3' - Stalker 7129 4 52.48 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCACATAATGTAGAATGTATTTAGAAG:1 + chrX 1235462 3' + P-element 2838 1 30.69 GAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTGGTGGGGAGGGGGGTCTATTGAGCTTGAGATGCCGGCGTCTCGTCGTCTAACTGTTCTTTGCC:1 + chrX 11757024 3' + 1360 438 1 67.33 AGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGTTTAAATGATCTGCGACATATACATACATATTACATACATATTTTCAACACTCCTTCTCAATGCAATA:1 - chr3L 26544694 3' + Dm88 167 2 67.33 CCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGC:2 - chr3R 15157614 3' - invader3 5246 2 68.32 GACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCGTGTGCGTATGCGTATATGCGTATATGTAAG:1 + chrX 2050906 3' + 412 482 2 66.34 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGG:1 + chr2R 8378663 3' - pogo 37 1 66.34 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATACTGGACTTGTTAAAAAGTATAAAACAAGTT:1 - chr3L 21501161 3' - 1360 45 1 73.27 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAAACATTGCGAAATTGATTTTTCATCTGCTAGCGGTACTTTCCGCTCTCACCAAGCG:1 - chrX 12546420 3' + P-element 2881 2 67.05 AGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCGAGATTGGTAACTGAAAACTTTGCTTC:1 - chr3R 21695404 3' - 3S18 5765 1 78.22 GAAAATCATTGTAGCATTTAAGTTTAGTGAGTAAAATGAGATAAAAGTTAAATTAGTTTTTAAGTGTGGGCGTGACCGTTTTGGGCGTTTTGTTGGTGAAA:1 + chr2R 5119209 3' + Tc1 1547 1 54.46 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGG:1 - chrX 19457147 3' + roo 9038 1 61.39 GGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACTTGGGGGCTCAGCAAATAGACTTAAAAATGCACAAAACAGAAGTTATTGTTAGGTACTTTTTGGCTTCAAATG:1 + chr3L 17616264 3' + Rt1b 4928 1 76.24 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGCTATTTATTTTGAGGGCGGGGCTCAAATAAA:1 - chr3L 9192559 3' - I-element 46 1 65.35 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAATTTGTTTTTGGATTCCTAGGATTACAATT:2 + chr3L 9925321 3' - Doc 12 1 66.34 AATAATAATAATATAATAATATCTTCATCTAAACATTCGCATAACTGCCAAAATACCGCCTGCAAGAGTATTTCCAACTTCCCAACCCGATTATATCCTTT:1 + chrX 13977273 3' + invader3 5048 4 62.38 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAACTTTATTCTTTAGTCA:1 + chr3R 15998147 3' + pogo 2074 1 55.45 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGCGTTACTAAGTTTATCCAAGTGGCAGAGGCGT:1 + chr2R 20533657 3' - jockey 4809 1 68.32 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGTTGTTCATCGGA:1 + chr2L 2197174 3' - P-element 5 2 73.27 TGGCCATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACCAAATCTACCAATAATTCTTGTGTCTTTGAATCTACATTGAGTCAGGAAAGATTTATAA:1 - chr4 311191 3' + 1360 3375 1 64.36 TATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCT:1 + chr3L 13312196 3' - mdg1 49 2 72.28 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTATCGACATTTTTGCAG:1 - chr2R 10863871 3' - mdg3 5254 1 72.92 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAACCTCGCACGAAAACACATA:1 + chr2L 1626619 3' - roo 16 2 58.42 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTG:1 + chrX 12546486 3' - P-element 45 1 34.65 ATAAAATTAACTTAATTTTTTTGAAGTACTAAGTTGAAATATAACTTTAATAAAAAATGGGGATATTTTAATAATATTAAATTCTGCATTCTTAGCTAATT:1 - chr3L 13787162 3' + NOF 3963 1 81.19 GCATTATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGCCAGGTGCAGCAAGTGGAAACAATAAGAGCAACAGACGGCTAACGTAACTTTAAGCCGATATCAA:1 - chr2L 12763275 3' + Rt1b 4762 1 68.32 AAGCAATATTTAGCAATAGTATAGAGGGCTGGAGGGTACCAAACAGCTACTGACCACCAAGATGCAGCAGCTCACCGAGAAACTGGACAGCAGCAACTCCA:1 + chr3R 24122198 3' + Osvaldo 61 1 67.33 TAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACACAGCCCCAACTTGGAAAGGGTATTTCCACAAAGGGTCTGCGTGTTCGAC:1 + chr3R 31369401 3' - Transpac 4927 2 72.28 GTTAAACTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATACGTGTTTTTTGTGTGAGTTAAGCTGTTTATAGTCCAGTTGTTGTTGTTGCGGAGAGGGCGT:1 + chr3R 11002078 3' + hopper 1216 1 65.35 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTT:1 - chr3L 14910589 3' - roo 8714 2 77.23 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAACATCA:1 + chrX 12294776 3' - blood 7026 2 64.00 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATACATATATACAATACAAATAATGAAACCCCAAGTTGTGTTTTTAAAAACGTTATCTATAAAGCATGTGA:1 - chr3L 9858228 3' - pogo 2 1 75.25 GACCAAAGCAAAGACACTAGAATAATTCAAAGCAAGCTAAGCTCAGCATTCTATATCACAAATAAAAAAATTAGCGATATATAAATAATTGACGACTGAAA:1 + chr2R 4402687 3' + 1360 499 1 65.35 TAATAATAATGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCTGCGGTCATCACACAATTTGTGTGTCATTCCTTGGTGGCCCGACATCAGCGTTTCGTCACTA:1 + chr3R 13096612 3' - 1360 303 1 72.28 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAAC:1 - chrX 2050836 3' - 412 7087 2 73.49 AGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAACCCTGTGAAAGGTAGCAACAACGTTTCCTTGGAAAAAGCTGTAAATAGTAA:1 + chr2L 8031327 3' - P-element 22 1 57.43 TGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACGCCCACAAGTTGACCCTAACGACCAACCGCAAGAGGTCATGGTGTGCAGAAATGCT:1 + chr2L 17644167 3' - R1A1-element 5298 1 54.46 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCAATTAATAAGGGTTGATGCTGTCGTTTTTATGCTCGTTAACGTTAATATCGCCC:1 - chr2R 5859336 3' - jockey 4762 1 53.47 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGTGCAACCGATAACATCATTATTG:1 + chr3L 13312233 3' - mdg1 7050 2 67.33 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTG:1 + chr3L 22324307 3' - jockey 4722 1 75.25 CACAGTTTTCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGTGGGCTTTAGAGTGGTCGTGGCAACATGTATCTGTGCTTTCCTATATGTATCTGTGTAGCTGCAT:1 + chr2R 6133677 3' - INE-1 256 1 63.37 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGGGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGA:1 + chr3R 9952261 3' - Ivk 17 1 61.39 GTTATAATTTAAATAAGCTTTATATGTTTTGATCTGGCACGGCTCAATTATAGCTTAAGAAGTCATTGTGGTTTTATTTTGGTTCGCGATTTGGATAGGGT:1 + chr3R 3374374 3' + Copia1_DM 13 1 65.35 TTACATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATAC:2 + chrX 21668891 3' - Stalker3T 57 1 63.37 CGCAAGTTGCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTTGATGCTGCCTTTTGGAGGGTGGAGGGGGACAGTTCCCACCCTATG:1 - chr3R 6475317 3' - opus 491 2 54.46 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATATTTTGTGAAGAACCTTGACTGGGTAAAAGTTT:1 - chr3L 9772188 3' + 297 6960 2 65.35 AAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATT:1 + chr3L 17921215 3' - Quasimodo 17 2 63.37 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCACTG:1 + chrX 16798284 3' + diver 205 1 60.00 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTTTTGTAAT:1 + chrX 13548812 3' + blood 342 2 58.42 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTGGGGGAACTTTTTCTTGATGGGGC:1 - chr2L 14490408 3' - P-element 52 1 27.72 ACAGTGTGGTCTGGCAGATCTTCCACCATATACCGATCGTTGTTGAGGGCATTTGTTATATATAGCTTGTGGAAAAAGTAAAAGGGCGACATTTTAATCAA:1 + chr3L 12655709 3' - Bica 4787 1 58.42 GCACGCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGTAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAA:1 + chr3R 9952248 3' - Ivk 7 1 60.26 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAAAAATGCAGCTGAGCCAAT:1 - chr3L 18009554 3' - roo 26 2 54.46 TTTATTTTTGATTTCAATGATGGTTTCTTCTGCTGACGTAGTAGTTACATATTGCATATCAATATGCTTACTTATGTATAATAAATGTTTTTAAAAATAAT:1 + chr3L 18429306 3' + hopper 189 1 84.16 AAAGGCACATTAACAAAACACGATACAACCGCAACAAAAACAACTGGACCTGGGACATCCGCAGAGCAACAAAATTCCCAAAATTCTGTACACAGAAAGGA:1 + chrX 4505126 3' - transib1 351 1 69.31 CGACGNGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTATGCCGACTCTTGTGTG:1 + chr3L 9692762 3' + P-element 2877 2 65.35 GCTGTNTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTAT:1 + chr2R 9014488 3' - blood 28 2 51.49 CAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAG:1 + chr2R 22605986 3' - Juan 4056 1 53.47 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATAAACCTTTTGTTGTTTAAAAAATTATCAGTTAAACAGCATCCAA:1 - chr3R 12571471 3' - roo 31 2 66.34 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGG:1 - chrX 6654722 3' - P-element 36 1 37.36 CCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTAT:1 + chr2R 12253304 3' - BS 4671 1 63.16 GCCAGNCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGCCGTCTGCAGAAGCAACAATCAACCCGTGATTCCGATCATTATCACCGGCGCCGGAACCGGGACTAGCACA:1 + chrX 2945786 3' - G5 4583 1 59.41 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCG:1 + chr3L 27450446 3' - Quasimodo 37 2 70.30 ATACATAATTATTATTATTATTTATAAATCCAAAATTACTTGTTGTAAAGTCATGCTCGATTATTCATAGATTGCGACCTATTGTTTCGACCCCTGCTGTG:1 - chr2R 9738329 3' - invader6 4391 1 37.62 TTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTGGCCAAAAGT:1 + chr2L 16082693 3' - Stalker4 6971 4 64.36 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCT:1 + chr3L 20248359 3' - Transpac 45 2 66.34 TTAGTTGTAATTTACCAGTGCGTGAATAAAGAACGAAAGGTTGAAGTCCATTCATAAATTTGTAATTAATTTGTTCAGCTTCGGAGGAATGCATTTATTGT:1 + chr2R 18895971 3' + Max-element 8421 1 60.40 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCTCCCAACTTAACTTTAGAAATTACCGCTTTTTGTATCAATTGTAACCAAATAATTCAACTATATGCA:1 - chr2R 9364105 3' - Doc 13 1 61.39 GATATGTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAAT:1 + chr3R 14688319 3' - pogo 30 1 56.44 TCGGTGAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCACCTCAATTCAATTTAACTTTCAACTTTAGCTCTCGCTTTCTCTCCGC:1 - chr3L 10811140 3' - P-element 28 1 53.47 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGTAGAAGGCATTGGGATGGTAC:1 + chr3L 10811209 3' + P-element 2856 1 47.47 ATTTTTGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCGCTACAGCGAATCAGCGATTGTGCAGAAATCGGTCGATAATTTTACGTATCCAGTTTCATGCATGCAT:1 + chr2R 4426583 3' + 1360 97 1 62.63 TGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTGAATTATTATATTTTTCTAAGTGCACTTTGCATTCTAAATCTGCATCCGTACCTTCGATCTTTTCTCCTCCGTTTC:1 - chr2R 19357815 3' - jockey 4948 1 75.25 ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTATACTGTGTGCTCCTTATTTATCTCGCTTTTGT:1 - chr3L 6001391 3' - gypsy3 424 4 89.47 ATAAAATTGTTTGAGAAAAAAACAGATTTTCCGCAAAAGGAAATATATTTAAAAAATATCTAAATATTCGCGCGTGTGTTTTCCGATCACTTATATTCGTT:1 + chr2L 13457610 3' + HMS-Beagle 425 1 71.29 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCTCTACTTCTTCTTCTTCAGCGT:1 - chr2L 18694116 3' - P-element 50 1 34.65 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATT:1 + chr3R 6147300 3' - copia 4923 2 75.25 ACGTTNGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCAAGAACATTCATATACATATATGTGTGTGCGGCTGCTCGGTTGTTTGCCAAAGGATTTCAATTCCCCCA:1 - chr3R 26834134 3' + P-element 72 1 75.25 TGTCGCTAAGAGCCAAAAGAGCAGTATACGTGGATTGTATAGCCCCAACTGACTTAAAAGACCATTGGGGAAACTGGGTTGCTCACGTAATATAACTCTCT:1 + chr2R 14626235 3' + BS4 524 1 61.39 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATTTAGGCCAGTAATCTTGGCATATTTCATCAAGTTCAGCATACCATAGCGAATTT:1 - chr2R 21802580 3' + 297 376 2 46.53 GTTATNCCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAA:1 + chr2L 23069853 3' - Stalker4 33 4 68.32 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGC:1 + chr3R 13715125 3' + P-element 2833 1 25.00 GAAGAGGCCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTTTGAAATCGGCGACCACAATGGAGCAAAGGCATTGGCAGTGCCCAAGGGAAAGCCCT:1 + chrX 20363541 3' + opus 7315 2 63.27 CATAGATAATTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGAGAAATGGGAAAGGCGAAGCCAAAGTATAGAGAAAG:1 + chr3R 21338531 3' - micropia 190 2 64.36 ATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAACATGATGATATATTC:1 + chr3L 19881842 3' - Idefix 13 2 65.66 GAGTGAAAGAGTGAGAGAGTGAGTGAGATTGCGATCGGGAGTTGCTCCAAAAAGTAAAAAGTACACGCACACACCTTCG:1 - chrX 9109752 3' - Cr1a 295 1 82.28 CAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAATGGGAACTGGTGGTTGGTCTTAAAGCAGGACGTGCTCTACGACT:1 - chr3L 1541011 3' - Doc 477 1 55.45 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATATGGGTCGCTTTTTAAGAGGGTCCCC:1 + chr3R 25702255 3' + Tirant 8475 2 57.43 GTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTCAGCTTTTATTTGCTGCACTTTGCTGACGTTTTTCCAGCTGGCTGTCACTGCCGCCGCCGT:1 + chr2R 14456938 3' + mdg1 138 2 66.34 TTACACTGCGGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCTTTGC:1 - chr2L 15956023 3' - Max-element 21 2 58.42 CTTTCAGCACCAATCAAAATATGTTTACATTTCAATGCTATTTTGATTGGTGCTGAAAGCATGCAATTTTTTTTTCTTCACACTCTCTTTTTAAAATGCAC:1 + chr3L 6536111 3' - Gypsy12A_LTR 338 1 55.45 GACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTCGACTTTTGTTGCCCACAAATCAAAGCCTT:1 - chrX 4488847 3' + 412 482 2 69.31 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCAACAGAGGATCCGTCGTGGCCGCCTTTTTGGAAGAGA:1 - chrX 1954450 3' + Tirant 361 2 64.36 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAAGTCGAAAAAAAGTGTTGCAAGTCCGAGGTTAAGATTATCTCATTTTTATGGGAA:1 - chr3R 31369294 3' + Transpac 291 2 63.37 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTATCTTAATAAGTATGCTAGGCTTTTATATAGGCCATTATATTAGCTCATTTG:1 + chr3R 18881575 3' + roo 9047 1 54.46 CTGTCAGATACCCGTTACTCAGATAGTGTGAATGCGAACGAGAAATTATATCATTTTTCTCGTTCTTCAGATATTTCCTTGCCCTCCCAATGACGTTATAT:1 + chr3R 20214010 3' - INE-1 547 1 59.41 TCGTGTGCCAAAAAATTGTATCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCATACCGACCGGCAGGTGGGTTTCCAGCGGAGACGCCAACGACG:1 - chr2L 23189390 3' - 1360 33 1 90.82 ATAATAAATAATAATAATAAATAATAATATAAAATATTCCAAATATATTTTCTATAATAAAAGAGTGTAGCATAAGGTGAATGGATTGATTTTGGAACAAT:1 + chr2R 12067027 3' + flea 245 2 78.22 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACTATTTCTGCTTATGATTCAATCCACGAATTTGGTTGCACTCAAAGTGAATT:1 - chrX 10251727 3' - flea 25 2 54.46 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCATCAATTTGCAATAAATGAATGCCTCGTTAAGCGGAGGGTTCAGTTTTTCATATGGTCTTTAATAA:1 + chr3R 12767110 3' + 412 484 2 67.33 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAATCCATACTTAATGGCGAAATAGTTGGTTACTATTTGATTATAACTCT:1 + chr3L 3951133 3' + pogo 2077 1 56.44 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATGATTAAAGAGTAACATTTATTTTAAGTAAAACACACACATGCATATGCAAGGAAAAACAATAAAAAAAAAA:1 - chr3L 11714624 3' - opus 1 2 74.26 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCAC:1 - chr3R 14639357 3' - roo 48 2 73.27 TAGTCNGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTAAATACTAATGCAGGAAGGAAATGGTGC:1 - chrX 7410188 3' - jockey 4715 1 71.29 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATGCCGTAAAAACATTTACGGCCGGTAGAC:1 + chrX 19306834 3' + P-element 2872 1 66.00 AGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTCTGTGTCCATGTGTGTGCATTTATAACA:1 - chrX 14525243 3' - hobo 15 1 66.00 AACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAGAATTAACGAGTTTAATTGTCATTAATTTTCGATTAGTTTGAAAAATCAAAATACAG:1 + chr2R 21712805 3' + I-element 5343 1 57.43 AAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCC:2 - chr2R 6984305 3' - HMS-Beagle2 6896 2 66.34 GCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTCACT:1 - chrX 21474401 3' - 1731 21 2 78.22 GAGTANAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTCATCGGCAACC:1 + chr3L 15638318 3' + roo 400 1 71.29 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAA:1 + chr3R 4986336 3' + roo 357 2 79.21 GTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAA:1 + chr3R 6147302 3' - copia 4921 2 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGACTGGCTTGGCC:1 + chr3R 25823732 3' + hopper 1411 2 71.91 ACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCTATATACATTTAATGAAGAGATAAATCTAATTTCATACCAAATTTATTG:1 + chr3R 19114273 3' + 297 6953 2 58.00 GGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTAGAAGCGGTAAGTAGAAGATAAGCTGGCAGCCGAGCATTTACATCATAACATGGCCGCCTGATG:1 - chrX 12370855 3' + pogo 41 1 76.24 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCT:1 + chr2L 15333779 3' + P-element 2849 1 41.58 GGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGTGTATAAATATATATATATGTATGTATGTATGTATGCATGTATATATATATATATGTATATATATATG:1 - chrX 4486483 3' + McClintock 476 2 75.25 GACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAACTGCAAGCATAAAAGGAAAACATCAGCGCACACAAACTAAGTTAAAAAAGGC:1 + chrX 6405012 3' - jockey 4783 1 54.46 ACGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTCTGTTGGACTTCATTGCGATCGAAGCTAC:1 - chr2L 1175212 3' + R1A1-element 5220 1 73.27 TATGTNGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTT:1 + chrX 21668148 3' - Stalker2 18 2 61.39 TCAGCATTGTTTATATTAATTAATTTGCTATATGTGTGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACAGACGGTAGTTCCACTCGGCTTGATCAA:1 + chr2R 330498 3' - gtwin 49 2 71.29 AGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGACTTGGCTTTGGCGAAGTCAATAA:1 + chr3R 16626856 3' + I-element 5334 1 56.44 GAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATTGTTTACCTTGTTGTATCCCTGAAGCTCAAACCAATGTTGATTGTTCAAGTACTC:1 - chr3R 20843332 3' + copia 5023 2 61.39 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACCTCTACCTATTTTCACAATGGATAGGGCAAAGCCAATTCACTGGTACGCTTTTGGAAA:1 + chr3L 5716961 3' - copia 17 2 63.37 TAAAAAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATTATTTATTTATTAGCTAAAATGTTTTTTGTTGGCGTTCAAACATGTTC:1 - chr4 772754 3' + Tc1 53 1 52.48 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGTTTTCTCAGTGTTCTCAG:2 - chr2R 21379486 3' + P-element 2860 1 52.48 GCAGCGGGAAGCTGACACTTCTTATTCGTAGTGTTTCGATTAGTTTCGATTACTTTCAACTCCTAAGTCATAGTTTTGAAGTGCAATGAGCCACTGCACAA:1 - chrX 3428635 3' + gypsy 105 2 62.38 AAATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCATTATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAA:1 - chr2R 15052054 3' + Juan 4059 1 42.57 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTTCTTAGAATGAAAATTCCCTTACTATTATTATTCATTCAGAAGGGTATTAAAACAACAGACTTGATAA:1 + chr2L 4009544 3' - pogo 3 1 76.24 GATAAAGACGTCTTCACACGTTGGCGATCGAATGATGTATCCCATACCTGTTCGTGAGTTGCGGTTGTGTGTGGGTGTGTTTGTGTGTT:1 + chr3R 9291923 3' - F-element 25 1 49.44 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTTGAAGGGAAACGCTCCTTTTTCTCCGTG:1 + chr3R 12877876 3' - mdg1 24 2 55.45 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATT:1 - chr2L 326119 3' + roo 389 2 59.41 TTTATTTTTTTTTTTCAATAATAAATGAACTGTTTTTTAGAAAATATTTACCGAAAATGAAGTTTGAACAAGCGCATTGACATTCTGAAGAATCATAGTTT:1 - chr3R 18813284 3' + hopper 155 1 34.65 TAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAAAAGCAAGAGCAAAAGCAGAAGCAGAAGAAAAGCAAACAAATCGATAGATCAATGTGTAGCTCTGTTGCCAAT:1 + chrX 8639119 3' + Stalker3T 58 1 75.25 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGGGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCGTAGGTGCACAATGGTGTTGCCTGCCTCCGTTTCCGCC:1 - chr3R 28095155 3' - hobo 34 1 59.79 GTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATATCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTGTGGCGCTCTGTCCTCACAGAAAATATAAACGTGTGTGTGGT:1 + chr2R 17793385 3' - invader4 207 2 43.30 CCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTAGACGACGCAGTGCTG:1 - chr2R 8321598 3' - P-element 2862 1 21.78 CCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTG:1 - chrX 868718 3' - jockey 4951 1 68.32 TCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTCGCGATCTGCTAGCGCAGCTCCTACTTCTGCTCCTGATCCTGCTGCTGCTCCTTGCCAGCCAGT:1 - chr3R 19016364 3' - opus 378 2 51.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAGTTTTAAACTGCGACTTGAAGCGGCAACATCGTCGGATCAA:1 - chr3R 11993268 3' + P-element 2878 2 70.30 CAGGATGTGAGGCCAGGTCGTACTCCCTCCCTTCAGTGTAGTCCATGGAGGCTCCTCCTTCCACTCAGAATGTCTGTGTTGTTTAATTTGAAAAAATGTAA:1 - chr3L 7211739 3' - Rt1b 4950 1 63.37 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTCGATTAAATTTTGGTTTTTAATTTTAGTT:1 + chr2R 13145013 3' - roo 48 2 74.26 GTATAACAATATTTATTTTTTTAGTTTTTATATTTATATTTTATAATAAATCCACTAGTTAGCCTATTTAAATCCTATTAACCTACGATCTATGCTTGCTT:2 - chr3L 3279708 3' - Juan 4062 1 71.29 TAATATTAATATTAATATTAATTAATATTAATGTCTTAGTAAACACCTTTTTACAATTTTTGTTTTTTATTCGACAATTACTTGTTAGTATCCACTACTAT:1 + chr3L 17754963 3' + mdg1 42 2 74.26 TATTCGAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTC:1 - chr2R 981617 3' - Tc3 237 1 73.27 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTTTT:1 + chr3L 14603328 3' + jockey 4950 1 64.36 ATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGCCAAGTGTTTGCCTAACCTCGGGGTGTCTGCAAGTGTGTTACTGCTGGCTTATTGAGTTTC:1 + chr3R 20150664 3' - blood 235 2 62.38 AATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATATATAAGCTGCTTTCAGCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGCGACAGCTGGCATAACTCAGTA:1 + chr3R 29432849 3' + 297 395 1 79.21 CAATTAAAACCTTTAATGCAAATCCTTTTTTTTTCAATTTTTCGAAAAAAAAACCGAACTCCAATTATTATCTGACGAGCATATGTGTGAATTTGTAGAAC:1 - chr2L 23179578 3' - Tc1 301 1 67.33 TTTATTTTTTATTTTTTTTTTATGTGAAAACTAATATTTTATTATATTCAAACATTTTTTTTATAAAGGTGCCCTATGCAATCCGTATCGACTTCAATGTT:1 + chr2L 11561205 3' + hopper 150 14 56.44 CTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTATAGCATATAGGAAATAATAATAGCAACGGCAAACCACCCCATCTCCAGGCGAAAGCCCCGAATAGCGGATTCAT:1 + chr3L 21319339 3' - 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P-element 26 1 46.88 TGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGACACAACGGGGCATATGTATAATCG:1 + chrX 2498685 3' - Doc 4543 1 75.25 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCGCCCCGAGCAGCTTGAACACGCCCC:1 + chr3R 18960498 3' - hopper 28 1 53.47 GAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTCTAACTTATAATTTATATAAATTTCATGACTTTA:1 - chrX 20974858 3' + opus 7466 2 72.28 CGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTTCCAACGGCGTTTATTCTTTCCGTCCATCCGTATCAAGTGAAAAGTGAAAATTATAATATAGTTATAAGCTAATCG:1 - chr2L 8335421 3' + Max-element 405 1 82.18 AAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTGTGGGTTCCTGGAGTTGGGTTCCATTCCTTTGTTGTAAGCTGTCATAAATACTTCGGCCCAGT:1 - chr3L 16666796 3' - springer 444 1 57.43 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTC:1 + chr3L 13080986 3' - 412 48 2 72.28 ATAATTTACTTTTTTTTAGGAAAAACTTTATGAGTATTATGAGTTTGTTTTAAATCCTATTTGTTACGTTGTTACGTTTAGTTTCTCAATTCGTAAAATGT:1 + chr3L 12118138 3' - I-element 5160 1 59.41 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACATACACACACAGGCTC:1 - chrX 10730617 3' - P-element 7 2 73.68 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAACGGAATTGTAAACGGG:1 - chr3L 5716871 3' + copia 230 1 55.45 GTAAAAGCCGCGCGCGTTAACCGCCGGCCAACCCTTTTCATAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGA:1 - chrX 21668383 3' + gypsy2 6797 2 57.43 TATTTACATATTTTTATCTATATATATATGCTGTCATGGCATTCTACGAACGAGAGAAAATGGTAATGGGCGAGGAGAGAAACAAGTTTGGCATATGTAAT:1 + chr2L 6998606 3' - G3 4496 1 76.24 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCACCATTTTTACTTTTATAGTTCTTTTACTTTTTGTCGGCGAACAGAGCAGATGTAAAAATGAAGAGTTCT:1 - chr3L 833334 3' + P-element 2882 2 72.28 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACCTATATGAGA:1 + chr3R 26469505 3' - hobo 32 1 59.41 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATA:1 + chr2R 24493721 3' + flea 4966 2 76.24 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCCATCAGCTAATTTGGTGACCTTAGAATGTGCCACTTTTCTT:1 - 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Quasimodo 342 2 64.36 GTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCATTTGAGTGGTAACTAGGCTTTGTGGTTACTCGGGAAAAACCAATTTACCTAAATCT:1 + chr3L 11654618 3' + pogo 2085 1 59.41 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTA:1 - chr2R 17384013 3' - mdg1 7069 2 58.42 AAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACAC:1 - chr2R 22395208 3' - I-element 37 1 55.45 GGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACGAGCCACGTCAAAGGCCGAAATTCTCAATGGCAGACCACCTCTCG:1 + chr2L 9557006 3' - 1360 211 1 55.21 CCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTGTGTTGTTTACTGTTAACTGTGTAAATTTTGTTTTCCATAATATTCGCTACACATAAAAATGTTGG:1 - chrX 9179629 3' - 1360 3286 1 70.30 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTCCC:1 - chr3L 10736465 3' + 412 448 2 70.30 AATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATT:1 + chr3R 13423364 3' - 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I-element 33 1 55.45 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCTCTACTTCTTCTTCTTC:1 - chr2L 18694121 3' - P-element 26 1 41.67 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGTT:1 - chr3R 14639324 3' - roo 14 2 65.00 CACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGGGTTTGTGTTTGCCCTCTTATTATTATTAATTTCTTGTTGTTTTGC:1 + chrX 12546530 3' + P-element 2886 2 76.24 CTCTANTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGAC:1 - chr2L 17210103 3' - jockey 4718 1 69.31 CAGACAGTGAACTCTGTCGCTTCTGCTGCATGGAGAGCTCTGCACATATTATATGTGATTGCATGGCGCTTGCCATCAATATTCGTGAACTCGTCAACGCA:1 + chr3R 24086604 3' + baggins 5189 1 78.22 CAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATCATAAAATAAGAAGAATTCTTGTCTTAGCCATTACATTATAACAACTCGGATATGCACTTTTTTTTTGTATAAC:1 + chr3R 6431124 3' - 3S18 1 2 79.21 ATGAAAAGCATATTATGTTACTATATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCAAGG:1 + chrX 21907835 3' - rover 1 2 74.26 CGGTCTCTTGCGATCTACAAAACTAAAAGAAAATAGCTGTTATTATTGACTTATATTCTTGAACAGCTGAAGATGGAAAACAGCAGGTTGAAGTAACCAAA:1 + chr2R 9010153 3' + HMS-Beagle2 282 2 63.37 CTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAAATAGAATAGAATAAAAAAAAAACCAAACAGAATACTGACCAAA:1 + chr3R 11391478 3' + R2-element 3381 1 57.43 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATGCATGAGCTTTTAGAAATCATGTAGACATTAGTTG:1 + chrX 5515809 3' + 297 6942 2 68.32 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTC:1 + chr2L 108040 3' - P-element 52 1 27.27 ACTACAGACGGCCGAGGGCGGCCTTAATTCTTGGTCAGCGCAGCGATCTCCTTGTTGTCCACATCGTCGTTAATCTTGTTGAATTCACGCATCCGCTTGG:1 - chrX 13260709 3' + gypsy6 7380 1 75.00 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGTTT:1 + chr2L 6252559 3' - P-element 40 1 39.60 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGGATTTTAATGACAGCATTGCGTATACAAT:1 - chrX 8977404 3' - jockey 56 1 73.27 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTAA:1 - chr2R 17394621 3' - jockey 35 1 50.50 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGCGTA:1 - chr3L 958735 3' + P-element 2868 1 58.42 CTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCAGATCCGTACCAGCTGCTGAACGATGCCTCGCACCGATTGGTTGCCCAAGGCTCAGGGGGCCAAATC:1 - chr2L 548154 3' + Cr1a 280 1 77.00 TAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAACGAGGAAAAATGGTTAAAATGGCCAAGTTGTTTCTGGAGTC:1 - chr2L 23352627 3' + G2 3056 1 94.25 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGCATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTCT:1 - chr3R 30272800 3' + P-element 2860 1 50.50 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATGAAATATTTATGAATGGAATTTTTCTTTTTTTCTTGATTAGCACCTGTTCCCAATCGCCAGTAT:1 - chr3L 4068066 3' - jockey 22 1 64.36 TTTTATCTTAAACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAG:1 - chr3L 12072548 3' + HB 1596 1 55.45 GGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGG:1 - chrX 329001 3' - opus 21 2 56.25 GAGCGNTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTATGCA:1 - chrX 5018627 3' - opus 7030 4 58.42 AGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGATGCTCTGCGTGCATGCGCTTTGTGTGCGAGTAG:2 + chr2R 7481121 3' + opus 7489 2 67.33 ATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATTAAACGGAGTAAAAATTTAAATTTAATTATATCTAAACTATTAAAAAAGGGGTAATATGCGTAATACCC:1 - chr2R 21852603 3' + Juan 4167 1 63.37 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAG:1 - chr3R 11165652 3' - 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P-element 39 1 42.57 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATGTGTTCTTTGGCA:2 + chr3L 22324324 3' - jockey 4705 1 58.42 AGTATAAAGTTTATTGTCAGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTCTGGAACCACCGCATTGCATTCACATTTAAATCCGGTGCAGTGCAACATTTCTCAT:1 + chr3R 25631693 3' - Tirant 258 2 63.37 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAATATGTGCCATTATCCGGCAAT:1 + chr3L 3671334 3' - roo 8718 2 82.18 AAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTTTAC:1 - chr2R 12779070 3' + roo 398 1 66.34 CCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGCTATAACTATTCCCACTAGTTTGATAAACGGTTCT:1 + chr3R 18235404 3' - R1A1-element 5067 1 65.35 TTGGANTGCTAACGGCCTGCAGAGGAGCAGAGCCGAGGTGGAACACCTCCTAACAACAGATGCCATCGATGTACTATTTTATTTTCCCAATAGGTAAATGA:1 + chr3R 31796257 3' + G2 287 1 72.28 CGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTGCGGCACTACAAT:1 - chr2L 20118657 3' - 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INE-1 556 1 63.37 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGA:1 - chr3L 17122421 3' + roo 9032 1 65.35 ATTTATTTCGCTTAAATCGGATCGCATATAACTAAGTTACAATAAGAGGATAAAAACATGTCTAAAGTTCGTGAATAACCAAATCTAAATAAATAAACATG:1 - chr3L 16191453 3' + Tc3 1653 1 53.47 ACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGATAATTCCAAGCCATT:1 + chr2L 17957322 3' + opus 7492 2 70.30 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCC:1 - chr2R 9426466 3' + P-element 2831 1 25.74 CGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTGAA:1 + chr3R 20845119 3' + 17.6 461 2 66.34 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACAAAGTCCCATGTCGTGAAGTGCATCTTTGTCCTTGCGATTCGCCCACGGAATCACTTGGGAGACCG:1 - chr3L 13080910 3' + 412 484 2 69.31 ACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGCCACTTTTTTTGGCGTCACACGCTTGCCACTCATTCAATGGCCAAATAAT:1 + chr3L 785474 3' + 1360 8 2 63.37 GGGGTTCAGGGCTGCAATTGTTGAATCAGTTGGTAAGGTAAGGCGTTAAGGCAAAACGAAGGCAATTCGGCCAAAAATGCCGGTAATTGGGGAAATTTATG:1 + chr2R 7776970 3' - baggins 5313 1 81.19 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAAAGAGTGTTGCAGAATTGGTGGGTTTAAAGCTGCTTACAGTGAAAGCAACTTCACTTATG:1 + chr3L 6130534 3' + jockey 4938 1 64.36 ACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACT:1 - chr3R 9657678 3' - BS 15 1 54.46 AAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCCGGGGGCCATGGTTAATAAATTTATGGATATATTTATTCGAACGGGCTTGCGGTGGTTAGTTCATTTACATTT:2 + chr3L 19935623 3' - Ivk 208 1 58.42 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGTGGTCTCTCCCATT:1 + chrX 329098 3' + opus 7490 2 68.32 GCACAACACGCACACATATACGCGTTCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' + 1360 3214 1 74.26 TATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGC:1 + chr3L 13194808 3' + 297 6924 2 81.00 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACA:1 - chr2R 20411858 3' + 297 6960 2 63.37 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATC:1 - chr3L 958756 3' + P-element 2847 1 37.62 ACTACATGGCGACCGTGACAGGACCTTAAAAAGGATGGCAAAAATAAATTGAGGGAAAACCAAAGAAAATAAAACATTCAAATTAGTGGAATTGTGTTGGA:1 + chr3R 11592708 3' + Stalker4 425 2 59.41 AATTCGTTTCTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCATAATGTCTCGCGCACCACAAACGTTCTAATCTCTTGATTTATCTTATTGTATTTGTGTTTGTTGGC:1 + chr2L 9389210 3' + 1360 3165 1 70.30 AATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTATGTCTCACCGACAATCCAAAAGCGAACAACAAAGCAATAAAGTCAACGAAATTTGATGACGATTTAATAAT:1 + chr3L 5258173 3' + F-element 251 1 58.42 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAAATGCATACACAAATAAATTAGCAACTAAACAAAAAACAAAGACGAGCTCCAGCAGC:1 + chr3R 26824297 3' - pogo 14 1 58.42 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAATGATGTAGTTAGAAAGAAAGAAGTTGATTGTTTTGTCGCAGTGCATAAAATGACATTT:1 - chr2L 903796 3' - 1360 16 1 61.39 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTTGTGGTTGCTTCATGAGGCACAACTTCTTGACTC:1 - chr3L 12452118 3' - 412 7 2 68.32 TAGACGGATAAAGGTCGCGCATTCCCGTTTATGTACGTGCCTTGCAATTTTTATATCAGTTACTCGTAGGTTTGTTCAAAAATAAGTAAAGTATATACGAA:1 - chr3L 20342445 3' - Ivk 5029 1 71.29 AAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAATATTATTTTAAACGAAA:1 - chr3R 7388322 3' - HMS-Beagle 6809 2 66.34 AATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGCGGTAGGTGCATGAGTATACATATCCGGGTAATTGATGCATTGATGCGCAGGTC:1 + chr3R 18183154 3' - G5 4678 1 60.00 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAACGATA:1 - chrX 2762110 3' + roo 388 2 57.00 CTGGACCCCACACAACTGGCTCTACGCAAACATATATATGTTTTCATTACCGAGCCAAAAGTCTTTGCTGGGTTCACCGAATCCATTTTTGTAATCCGCCC:1 - chr2R 1762163 3' + jockey2 398 1 72.28 TAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACT:1 + chr3L 14603316 3' + jockey 4939 1 76.00 CACGCAACGCATATAGCGTAAATGACGATTATGTCATGAGAAAGTCGGTGAGAGAGCCCGCCAAGAATGTGTGGGTGGTGGGTGATGGAAATGCACCCTGA:1 + chr3R 23888412 3' - S2 303 1 54.46 GATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGCTAAATAAAATGACATTAAACAAACCCCTCTAAGTTCTATATTCTATACATATACAGA:1 + chrX 17204165 3' - Tabor 19 2 56.44 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATATAATTTACCGCCTTTAGCGAGTTCATAAAGCCAAGGAAAGGGGAATGGAATG:1 + chr3L 9304667 3' - jockey 31 1 52.48 TGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGAATATATATTTTTATATTTATAATAACACAACAAGA:1 - chr2R 6493956 3' - 17.6 6964 2 78.22 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATCCGTGTTCATGTGTGAACACGCATTCTAACATTTCTTTATTTCTATTTACATTTATTCT:1 - chr3L 6024542 3' - roo 40 2 66.34 CGCATTCACATTAGCTGAGTAACAGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCC:1 - chrX 10445562 3' + INE-1 533 1 66.34 AAGCTGGAGACCGTAGTTTGAGTTGGCATACCTTCCAGGCCATCCTGACCAACGCTCAGTAATCCGCTATTGGGATCCACTCTCAGAGAATCCCCCATTAT:1 + chr2L 4206437 3' - jockey 496 1 67.33 AAGCAAAGTTTATTTTATAAAGATAAAGGCCACTTTCCAAGTTTTCTACTTAAGGCCAACTATCTTTATAAGGCTCGAGAAAGTTTGCCAGCGATGAGAAA:1 + chr2R 14266152 3' + Ivk 5271 1 50.50 AATTATAAATTACAACAGGCTATTACTATTTCTAAGATATATTTAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAGCATGTGCTAATAAGCTAAAAAATAAAA:1 + chr3L 22919669 3' + copia 260 1 54.46 TTACTTCACGGTGCGGCCTCTTTGTGCATGCACCGTTAGGTGCACCTCCAAGGTCCAGCGCGGTACCGTTAGTTTACG:1 - chr4 249255 3' - gypsy8 251 2 44.87 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATT:1 + chr3R 14688311 3' - pogo 38 1 66.34 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCC:1 + chr2L 108038 3' - P-element 56 1 24.75 TACACNTAGTCTCTCGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTCGGTGCTTACTCTTATCGCACCTTAACGCGGTGCT:1 + chr2R 19580346 3' + Ivk 5197 1 64.36 ATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTT:2 + chr2L 15955325 3' - Quasimodo 33 2 65.00 AGTGAACAAGCTGTGTCTGCTTCCCCTTGGGGACTCTGTTGGAAGCCAAGCTTCCGACGGGGCGATTATGTTGGCTACTGCCACCGCTCGCCCTCCCAGTT:1 + chr2L 11033079 3' + diver2 4465 1 67.33 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCACTATGCCATATGAATCCTGAACCGAAAGAAACCCTATATCCACAATATTCCATAAATAAATAATAT:1 + chr2L 20370295 3' + 297 6970 2 70.30 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCC:1 + chr2L 11686073 3' + hopper 1392 1 53.93 AATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGC:1 + chr3R 15157658 3' + invader3 236 2 76.24 GTTGGAGGCAGCGGGGCTTCTGTCGGATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTCGTTGTAAAGAGAGCCTTTAAGATGACAAATCT:1 + chr2R 9362416 3' - F-element 403 1 66.34 TTGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATATGGTCTTGTGTATCCCATGAGCAAACAACGAACTATCAGGAGAACGAGAAAGTATTTCAGGAACCAA:1 - chr2R 1717318 3' - 17.6 38 2 65.35 GTAAATAATAAGAAAAAAAAAAGAAAACCTAACTACAGGTTACCGTAAGTTTGTTGTCTCTTTTTTTTGGCTATGAATATGGTTACTTACCTTGGCACAG:1 - chr2L 15035787 3' + BS 5096 2 91.00 TTTATCGTTTACCCACCCTTAAAAAACCTTTAACAGGCTTAAATCGCGACCGACAAAACGACACCCGAAACTAATAATAACCCTCTGCAACCAAGATTGTC:1 + chr2R 4135554 3' + FB 379 1 69.31 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTTTCTGTTTTCGGTTAGGGGGCTACAACTCCT:1 - chr3L 10035617 3' - jockey 27 1 58.42 AAATGTACAAATAGTTAATAATAGTTACTTTGTTTTTAGTGGAAAATATGGAAAATAGTGAATGGTAAAAGTTTTAATTTAACATGATTGCTTTTAAAACA:1 - chrX 19555322 3' + hopper2 1282 1 74.26 ACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGACCTTTCAGGATATTTTCGATATATTTTTTTTGGCGATTTGTGGGCGTTTCTTTAAACACCG:1 - chr3L 11929081 3' - Juan 3980 1 63.37 AAAAAAAAAAGGAAAGAGAAAAAGGAAAATTCGAAGGTGGGTGGTTAGAAAATGGTGGGGACGTCAGCTGAGAATAGAAAGACATCTGGGACTGGCTTTGT:1 - chr2L 19100961 3' + Doc2-element 233 1 60.40 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCTAAAGGACACAAGAAACTAA:1 + chr2L 8542885 3' + P-element 2831 1 23.76 AAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTAATACATTCACGCAACATGCTCTACAATTTGTAGCAGTG:1 - chr2R 7068829 3' - 17.6 104 2 62.38 TTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTA:2 - chr3L 23112567 3' - R1A1-element 4890 1 54.46 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGATCGCGATGGTCGAAAGATCGATTCGACTCATTTTCA:1 - chr2L 21978071 3' + roo 9063 1 69.31 ATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATAACCTTTACTCAGCTAGTGTGAATACCCAAATTGTTCACGTGCCATAAAGTGGAACAGTGCTTTGATGTT:1 + chrX 721090 3' - INE-1 569 1 54.46 ATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACATCAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTTGTTACAAGAAAGTATTAGCCTACTATTAT:1 - chr4 453858 3' + 1360 192 1 70.30 ATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATGAAAAAAAAAAATAATATGGATTAGAAGAAAGCTTAATAAAAACTTTTTT:1 - chr2R 10206309 3' + F-element 4641 1 63.00 AGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCTGCACTTCTATCAGTATCATCATTATCATCATCATCTGATATTCATTACAGTTGCATAAGA:1 - chr2R 23304499 3' + I-element 22 1 69.31 ATACATATACATATATACATATTATATTTTTTTGTTTTATTTTGTATTTATGTATAATTTTACTTGTTTTTATTCTGTGGAAATATTTAAGTGTAAACATT:1 - chr3L 19784593 3' - G3 4507 1 53.47 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACAT:1 - chrX 10730631 3' + P-element 2860 1 55.45 CAGGATCAGAGCTCATCCGCCCACTCCATTTCAAGTTCATGCAAAAAATATTGCATTTAATGTCGTCATTATTATTCTGCTTAACGATGAGCGAACGTTTG:1 - chr2L 12409266 3' - Max-element 332 1 49.50 AGAAAAAAGAAAAAGAAAATAATTAAATTCAACATTCTCAATCGCCATAACCTGCCACACTTGATCGCATTATGGCCTGAATCATCACGGGGTCGTTAATT:1 - chr2R 21649989 3' + Doc2-element 249 1 62.38 AAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAGAACAGTTATGTATTTTAGTTG:1 - chr3L 5975567 3' - hobo 5 1 74.75 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGCAACCCTTATAGTACTTATACATATGCCATA:1 + chr2L 9389105 3' - 1360 46 1 74.26 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCTCCA:1 + chr2R 19936707 3' + roo 400 1 73.27 TCAAANCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGTTGGTGGCT:1 + chr3R 7388437 3' + HMS-Beagle 7036 2 77.23 TCAGAGAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATTTGCGACTTTCTGTCGCTGGGTTTCTTGATTTAGACTCTTGTTTCGGCCGGATTTCTCTTT:1 - chrX 17064686 3' - Tirant 8349 2 71.58 ATCAGGATCAATATCCGAGTCAATCCAGCCGTCTGTCCGTATGAACACCGAGATCTCAACTGAACCGAGCTGAGCTGAGCTTTCGCCCGGCGTGGCCCACT:1 + chr2L 15462411 3' + INE-1 93 1 57.43 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCTCTCTCTTTAATATT:1 + chr2R 18503586 3' + roo 409 1 65.35 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGATACGCATCTTGTTATTCTAGTGTATTTGGTTATACTGAAAAAGACAATTTA:1 - chr4 612346 3' + 1360 3348 1 89.41 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGT:1 - chrX 8031374 3' + roo 357 2 75.25 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTA:1 - chr2L 7547997 3' - blood 32 2 57.43 GGTGCNTGCATGGTTCTTATTATTTCCATTCGTTTCATCAGCAGCTATCGATAAGTTATCGGCTGTGATCCAGTGGTGTGGGTATTGTTTTCATTTATTTT:1 + chr3R 25074874 3' - invader4 435 1 78.22 TATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGACGCGGCGCGACGCTTGACGCCGTGCTTGCTTGTATACTGTTAAGTTCTGTTCAATTCAGTTGAATTCTTT:1 + chrY 1076855 3' + INE-1 85 1 66.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTCA:1 + chr3L 15638309 3' + roo 9054 2 62.38 TCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTACAGTGCTCGCTCGTTACAATG:1 - chrX 1963990 3' - Tirant 8491 2 76.24 ACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTAT:1 - chr3R 10445183 3' + roo 9050 2 57.43 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTATTTT:1 + chr3R 13376057 3' - 1360 9 2 71.00 GAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCAACTATCAGATACCCATTACTACAGTTTACAATTGCCAAGCGGCTTTGCTGCGGGATTTCCGTGTGACCCGACCAAC:1 - chr2L 18186590 3' - INE-1 573 1 59.41 CAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTACATTTTT:1 + chr2R 16898306 3' - Max-element 8270 2 61.22 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTAAACAGGTTTCGCCTTGTTT:1 - chr2L 15333690 3' + P-element 2884 2 74.26 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGTTGCTTCATATTAGGCCATG:1 - chr2R 19936636 3' - roo 54 2 81.19 GCAAGGATACGATAATACATTAATAATTTAATAGTTTAATTCTGTAGTCGTGATCTCAGTGGTTGTTGTGGTAATTGGGGTAGCAGTGGTAGTTGGGTTCT:1 - 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pogo 9 1 71.29 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATAAAAATTCCCAAATCAAATTAAACAATCCGTGAAGCCGGGAAGGA:1 + chr3R 14688489 3' + pogo 2072 1 57.43 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAACT:1 - chr3L 13364543 3' + hopper 1374 2 62.38 ACCCCTCCAATCCGGCTAGAAGGAGTTACCCTGAATCGCGCCGCTACTCGGACAACCAGGCCACTGAATTGGCCGTGCTCGGCGGCATCAGCATGTGCCTA:1 - chr2L 10508735 3' + Helena 847 1 67.33 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCGCCAATTCTCGCGCCTGCACTTCCGCATATGCAAAAGCGAG:3 + chr2R 22998029 3' - Transpac 30 2 54.46 AAGAGAGAGAGAGAGATGGCTTTTGCGGTAGGCGTGGCAAAAGAGCTGTGACAATGGAAAAGGTAGGTGGAATGCAAGCGATAATCCAAGACGAAAATCTA:1 + chrX 22731824 3' - blood 166 2 77.23 TTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACA:1 - chr3R 20466650 3' + roo 364 1 69.31 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCAACATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGTTTGTGTGGGCGGGCTGGG:1 + chr2L 6252575 3' + P-element 2863 1 55.45 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGAGGCGGGGGTGGGGAGAAAGAAACCAGAAAAAACGGAATAGAATATTTTTATTATCTCAACGATTCCCTGGAAT:1 - chr2R 15307887 3' - FB 3 1 72.28 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAA:1 + chr2L 13060320 3' + P-element 2843 1 35.64 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCA:1 + chr3L 10698715 3' + roo 9043 1 57.43 AAAACTCATACTTTTCCTTAAAAAATCCTTGAATAATAAAAGATCCTATTATTTTGTTAAATCCAGCAGATAGTATTTAACAATATTAACAACAAATTCAT:1 - chr2L 12806761 3' + I-element 5147 1 77.23 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCGTGTGCGTATGCGTAT:1 + chrX 2050891 3' + 412 7520 2 53.47 GGAACTTAGTGCACAACCAATGTTACCCGTAAGATCCGCTTTCAAATAGATTTGCCAATTGTAAAATGAAAACGAGAAACGAGAAGCAAACAAAATGACAA:1 - chr3L 3955892 3' + Burdock 6037 1 65.35 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCCGTATCCTTTGCACGGCCAGAAGCATG:1 + chr3R 10957751 3' - hopper 15 1 65.35 TTGTTTATCTATTTCGAGTTTCCTAACTAACAACAAGCCTTGTTTGTATGATTTTTTTACCTAGTCTATGTATCAAACTTTTGAATCTTTGACTGTTTTCT:1 + chr2R 22682811 3' - 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accord2 7507 2 71.43 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTT:1 + chr2L 18028741 3' + flea 222 2 62.24 GGAGACCACAGATAAGGTCCGCCACCTGCTCCACCATAACCCCCTCCACCTCCTAAAAAATAAATAGTATTTTAGATCCAAGTGTAAGCCGTTGGAACATA:1 + chr2R 11269093 3' + roo 8877 2 56.44 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATCTCTCAAAATTCCCAAATTTGTTATATATTTTTGTTTTTGACTATAGAGTATTATCCCAC:1 + chr3R 25510415 3' + opus 483 2 57.43 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCCGCATATATTTCGTTCCGCG:1 + chr2L 15955347 3' - Quasimodo 12 2 68.32 TCCAGGACTGGTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCGTATGGTATTGGATCTGCGGCAGTTTGGTCACCACCTTTTCGAAGGG:1 + chr3L 5540017 3' + R1A1-element 4961 1 53.61 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGTAGTGGCAGCCAAACG:1 - chrX 8031359 3' + roo 9037 1 60.00 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAA:1 - chr3R 5505243 3' + mdg1 371 2 73.27 CCAACAAAATACGAAGTTAACGATTTAGTCGTCATTACCTTCGTACCATCGGCTACAGGAGAGTCACATAAATTTTTAATTTCTGCTCAGGGCTTCGATGG:1 - chr3R 30768063 3' + Bica 4648 1 73.27 CCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACCTCAA:1 - chrX 21204987 3' + 1360 3362 1 51.49 CATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTGCTTTAATTGGGCTAACGAAATTCGCTGTTGCCACGCCCCCTTTCGCCACCCTTCA:1 + chr3R 26758364 3' + 17.6 7061 2 60.40 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATTTCAATTATTCTATGCACTCGCTTCTTTTGAATTT:1 + chr3R 9479526 3' - mdg1 7055 2 56.00 GCCATGAGCAGCACAGAAGCAGAGTACGTTGCTTTATCCACGGCTGCAAAAGAAGCGGTGTATCTTAGCGTCTCGAGCTTTTCTCGTTTTATGCGTTCCTC:1 - chr3R 10332387 3' + Copia1_DM 3950 1 65.35 TCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTTCGGTTTGCTCCTGGTCGCCATTTTCCTGCAGCCATCCGCGA:1 - chr3L 21842274 3' - P-element 408 1 44.55 ATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACAGTACTAATACTACAGCAATCAATGGAAAGGGGTAAAAACAAAGCGAGAAATAAAACTATGCC:1 + chrX 6183987 3' + Idefix 43 2 67.33 GAGCCNCGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATATTCTAGTGTCTTTGGTATTAAACTTTGATGCCACACTTTGACTTTACATATGCGGACAAAACCCCGA:1 - 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chr3L 7314662 3' - hopper 10 2 51.49 CTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTG:1 - chr3R 25633332 3' - Tirant 32 2 58.00 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAGGGGCTGGTTGAAGGGGCATACTTTGAGGC:1 + chr3R 18507886 3' - jockey 26 1 58.42 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCCGCCACTGCTTATGCATAAAGAAT:1 - chr2L 11686024 3' - hopper 47 1 76.00 TTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACAATATTCTTGGGCTACTTTATTACTTTCTTTAATT:1 + chr2R 12446407 3' - jockey 4670 1 76.24 TTTAATTGTTTTTTGGGTATTTAATGACTGATTGTTAACAAACCTTGGTCACTACTCTTATATGCGATTAGATACGAGGCTGTAGATGGGGTTCTCTTAAA:1 - chr3L 12598256 3' - Bari2 915 1 33.66 TGTGCTGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAAAAAAAAACGATGAAATAAAAAGAGCTGAACTGAACGGCCAAGAATCGTTACAAC:1 + chr2R 9698228 3' + Stalker4 298 4 56.44 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCAC:1 + chr2L 11686056 3' + hopper 1364 1 78.00 CTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGTGGGTTCCAGCCGCCTGACAAGCGTTTAAAAAGGTTTTATTT:1 + chr3L 14240923 3' + Tirant 8501 2 74.26 ACATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTCCTTGCGTCTTATACGCCTCCTCCTCGATTTTGTACATGTCCATAAGCTTGTTTTTGAAGCGGCAGT:1 - chrX 4361946 3' - INE-1 255 1 73.00 CCTAAGACTTAAGCATATGCCTAAATACTAATACACTTTATAACGATAATTGTGAAACATGATTGAAGATGATCTCTCACTATATTTCTCATTTCAAAGGA:1 - chrX 19786506 3' + Idefix 19 2 60.40 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTA:1 - chr3R 10445184 3' + roo 9049 2 56.44 TAATANAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACAGATCGTGATCGTATGCAAATA:1 - chrX 8476354 3' - F-element 374 1 75.25 AGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATATATACGTAGATGATA:1 + chr3L 7989829 3' + mdg3 5489 2 70.00 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCG:1 + chr2L 487126 3' + P-element 2842 1 33.66 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAACAACAAACAATGAGAGTG:1 - chrX 2050819 3' - 412 7088 2 61.39 CGGTAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGACCACTAGTGTATACATATAAAAAGTGAAAAACCGCTTGACAAAGCAACGAACAAAACTTTCTGA:1 + chr4 220567 3' - Tc1-2 25 1 72.28 CTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATG:1 - chr3L 14240838 3' - Tirant 8153 2 70.30 TTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCTTGGCAGGACTTGCCAGTCGGACGAGGGCAATGTCGTTGATCTGCGTCCTGTCGGTGCGATTGTAGAGCGGATG:1 - chr3R 14658710 3' - F-element 485 1 78.22 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGC:2 + chr2R 8378664 3' - pogo 36 1 65.35 GGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACACCATTACTTGTATGCGGATGATGTTTATTTGTTGTTTTTTATTTCTT:1 + chr3R 26254142 3' - HMS-Beagle 6728 1 57.43 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATACCCAGATAGATAGGGGGATATAGTTGTGGGGCAACC:1 - chrX 4500199 3' + Quasimodo 7336 2 62.38 GTCAGCACTTGGCTGTCACGAGCGATCTGCCTGTAGACCACAACAAGTTCAGTTATATTTCCACTAAACTATTTAAATAAAACACACCTCGGTTTATTTT:1 + chrX 23316661 3' + mdg1 265 2 56.00 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTT:1 - chr3R 29384367 3' - 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pogo 46 1 77.23 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCCTGTGAATCGGCTACCTGT:1 - chr2L 11065840 3' - P-element 3 2 78.22 TGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTATTTTAAAGTAAACTAGATTAGATATGCACACGCATACGGATGTGTAACTATTTCTTTATATAAATATAGA:1 + chr3R 17532682 3' + jockey 4723 1 77.23 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCT:1 - chr2R 20838596 3' - 1360 25 1 56.44 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAATATAAGGGTTCATGTGTTCCTAAGCAGTCAATTT:1 - chr2L 18028645 3' - flea 4758 1 77.23 CTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTACCACGGCGCTCCAGCTGAGTCCTCCTCCTTATTTCATGCTGATGCGTTGCCGTCCATTTGTATGATTAGTTCTGC:1 - chr3R 14094073 3' - Doc 4398 1 64.36 AGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTTATTCGAGCTCTCAAGG:1 + chr2R 4339526 3' + G5A 2801 1 78.22 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCCAAAT:2 + chr2R 9277571 3' + roo 9028 1 70.30 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTCTGCAACTCC:1 - chr3R 30272792 3' + P-element 2868 1 60.40 ATCTCAGGAACTAAAAAATCTAGAAGGTTGAGATAAAACATACCGAAACATTATTTTTCAATATGAGAAATTGCTCGGGATACAAAATGGGAAGAATCGA:1 - chr4 216399 3' + INE-1 151 1 55.00 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGCGTTCAGCATTTTATACTGATTTTTATTTTAAACTTACAAGAATGTTTGCTCATT:1 - chr3R 12136261 3' - roo 21 2 58.42 AATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTG:1 + chr3L 15035199 3' - pogo 36 1 67.33 GTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATTGAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACA:1 + chr3R 8197890 3' - Quasimodo 7162 2 68.32 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTTATTGGA:1 + chr2L 326228 3' - roo 8668 2 74.26 CTTGATCAGGATCAATAGCCGGTTGATCTGGCCGTGTTCGTCCGCCTGTCCGTCATTTCGTAGGTATTAACGCTGATATCCCAGGTGGGAAATTATAATTC:1 - chr2L 22047564 3' + INE-1 89 1 55.45 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAATATAAGGGTTC:1 - chr2L 18028668 3' - flea 4780 2 61.00 GATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATAACAATATAACTTAAATTTATTTTCTAATTTGTTATCTCAAATTTTAGCATTCT:1 + chr2L 1129156 3' + HMS-Beagle 7025 2 62.38 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAATGCTTTGGTGAGATACA:1 + chr3R 14639405 3' + roo 9035 1 62.38 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGT:1 - chr3L 12452156 3' - 412 7098 2 69.31 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAACGAGCGC:1 - chrX 4041514 3' + hopper 1380 1 58.42 ATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTAG:1 - chrX 4796942 3' + copia 230 1 52.48 CGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTGGACATATGT:1 + chr2R 5084101 3' - F-element 17 1 61.39 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACT:1 - chr3R 19657439 3' + roo 9050 2 57.43 CCGAGAGGAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGTGCCGTGGAGGAGCACCCACGACCATCCAGCAGAGACCATCCGAGTTCAAGGAACTAGCAA:1 - chr2R 14744022 3' - Max-element 97 2 54.46 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAAATGTACGTGCACATCATAAATT:1 - chrX 17132476 3' - pogo 48 1 77.23 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAATAAACTTTCAATTGAAACAAAATACGATCTATCTTCTGATCACCTACCTGTAGTAG:1 + chr2L 20120178 3' + Juan 4199 1 50.00 GTTCGTATGAACGTCGATATCTGAGGAACTATAAAAGATAGAAAGTTAAGATAAAGCATCGGCGATAAGCCTAAGCGCAGCAATTTTAGTTAGTTTCTTCC:1 - chr2L 9179242 3' + INE-1 133 1 58.42 CGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGTCGTGGATTGGAGCGTTTGCAGTGTTTGGTCACACTATTTATGCTTGCATTTCGTCTGTGTAAATTTCATTTC:1 + chrX 15712669 3' - Ivk 50 1 79.80 AACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGTACGAGATACCCACTGGCCACGCCAGCTACGGTCCGCCATCGAAGCCCCCGACCTA:1 + chr3R 27079924 3' + HMS-Beagle 6669 1 61.39 TTGTTATTATGTTCGTATATAATACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTT:1 - chr2L 7350739 3' - mdg1 7043 2 56.52 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACACAGCCCCAACTTGGAA:1 + chr3R 31369368 3' - Transpac 35 2 60.00 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAATTAACCTTAAC:1 - chr2R 6779751 3' + 17.6 7407 2 64.36 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTA:1 + chrX 13347342 3' - roo 46 2 72.28 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATTGTATATAGGTGCCTAAAACCGAATAATATTTCCAAAGTGGAAGCACCAGCACA:1 - chr2R 9454232 3' + opus 7481 2 59.00 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCA:1 - chrX 329017 3' - opus 7045 4 73.27 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGAC:2 - chr3L 17122420 3' + roo 9033 1 64.36 AACTATGAGTTGCATGACCTTTACAGAAAATTATGTTATGAGTGGTGAGACACTCTCTTTGCCAGCACTGACCGCCGTTCGGAGGGTTTCGAGGAAAGCGG:1 + chr3R 1955140 3' + Cr1a 4166 1 75.25 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGCGATGT:1 - chr3L 12085168 3' + pogo 2058 1 71.29 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCGATT:1 + chr2R 24965130 3' - P-element 30 1 47.96 AAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTATAATTTGACTTGCAAATATTACACAGCCTCAGTTCAATAAAATTCAATTTAAATTTGGCTTG:1 - chr2R 2943203 3' - 17.6 7162 2 65.35 ACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAACCAGATTCTCTCCACTTTGCCACGCCCAGTTTTCCGGGCAGAAAAGCCATTAGCAGGCGGGGCGGACGTTTTGTAT:1 + chr3R 15032854 3' + Idefix 188 1 77.23 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGG:1 + chr2R 19857391 3' - 297 39 2 77.23 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGATGGACAACAA:2 - chr3R 25440161 3' + pogo 2063 1 68.32 ATATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAATTTA:1 - chrX 2082623 3' + Transib-N1_DM 444 1 91.09 GACCANCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGGTACTCTTTTTTAGATCTCTTGCATCTCCCTCA:1 + chr2L 11045382 3' + P-element 2883 2 74.26 ATGAACGGAGCCCAAAATCGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGGGGTATGTAACTCAATATTCAGATGAATCAACATGCTAATG:1 + chrX 18717215 3' - roo 35 2 58.42 GTAAGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATTCTTTGTGGTCCACCCGTGGG:1 + chr3R 24389712 3' - Stalker2 101 2 79.21 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCC:1 - chr2R 9862205 3' + roo 9045 1 55.45 TAGCAGTATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACGGAACTCTGCGGAATTGCCAGTAAATCCCACACTTTTTAATTACCGAATACTTAA:1 - chr3L 20063290 3' + Porto1 4237 1 74.26 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTCAGGATGCCTGTGAATAAATTCCATTTCCGTATATCTCAAGAATTCCCCAACAGCTTTATCTGCTTACAAA:1 - chr2L 2437679 3' - roo 3 2 74.26 CCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATCCAC:1 - chr3L 12072527 3' + HB 1617 1 60.40 TATACCTGTTACTCAGCTAGTGGAAGTGAGAACGCGAAATTTCATATTTTTTCTGCGTGGCAAAAAATGCTTGGGAAAGCATCAGTGTTTTGGCTGGGACT:1 - chr2R 15722429 3' - INE-1 541 1 64.36 GAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACTCTTTGTGATATTTGCCCTGACATGTTATTAATTTCTCTGTTTAATATTTGGTTGCATTC:1 - chrX 6187533 3' + Quasimodo 435 2 62.38 TTTAGGAAGCTTGCGCTTAACCGTGGGATTCTTATTTAGGGTCATATTAAATGCAGTATTATGCATGGGGAACGACTCCCTACCATTCTGTGTCATGAAAT:1 - chr3R 11443683 3' + Gypsy12A_LTR 50 1 71.29 GATTTTACGATTTAGGATTTACATTGTGTTAGAATTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTGTATTCCTACTTCTTAAATATAGGTATTTTGACATTGAATATG:1 - chr2R 4821114 3' - TART-B 10297 1 49.50 ACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGGCTTTGGGTCAACTGAAAAGCTCGCAAATTGCGAGGCCCACTGCCACTGGCCCTGAATTG:1 + chr2L 1828858 3' + 412 479 2 65.35 CGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAA:1 - chr3L 5975590 3' - hobo 29 1 52.00 CCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATAATACGAAAACAGAAAAAACTTAAACTCGAAAGTTTTAATAAATTTCCTTGAAATGGAATAGACTCATT:1 + chr2R 5952403 3' + I-element 4908 1 69.31 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCA:3 + chr3L 15638286 3' + roo 9031 1 71.29 AGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCACCCA:1 + chr2R 12213980 3' + Transpac 5186 2 69.31 TAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGATTCTTTTACCAGCTCGACTCTCTTTTGCCCATC:1 - 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chr3R 25918904 3' - roo 43 2 68.32 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATT:1 + chr2L 23295861 3' - micropia 4989 2 59.41 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTGAATACCCTAACTATAGTATCATATCATATGTTACAT:1 + chrX 13682621 3' + roo 9038 1 61.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATACAAAGAAATTAACCACAGGTTAATTCACAGGAAATTTTAT:1 + chrX 18012745 3' - roo 35 2 64.36 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 26250645 3' - BS 6 1 53.52 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCA:1 + chr3R 7101058 3' - pogo 37 1 69.31 GAGAGNGAGAGCTTATGCGCATATTTCCCCTGCTTTCTTTTTTTGGTGTGTTTGCAGGATCTCGCAGCCTTTTGCTGCGGTCGCTGATGAACTGCACACAT:1 - chrX 13548051 3' - blood 7169 2 73.27 TTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGT:1 - chr3L 14240810 3' - Tirant 18 2 63.37 CCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGAAGGAATCCGTTGCCCGCTCCGGCACATAGCTCTATCCAGCCCTTGTTGAGCAGCCGTCGGCCGGCG:1 - chr2R 14257284 3' + F-element 4473 1 73.96 CATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTAGCGCCAAATCTTGCACTAAAAACACACCAAATACGACATCAAAGCTATCCCTTCGATTCCGATCGATC:1 + chr3R 13917173 3' + Gypsy6A_LTR 110 1 56.44 AAAATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATT:1 + chr3R 25823692 3' - hopper 56 1 76.24 CTGGCGCTTGAGCGAAGCATGTCTGTTCTGCTCAACGATCGATCACTAACTGACCCACACACACAAAAATCACGCATGTGGTAGCTTCGATTTTTCCGATA:1 - chr2R 21109260 3' - invader1 3944 2 56.44 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATGCATGAGCTTTTAGAAATCATGTAGACATTA:1 + chrX 5515805 3' + 297 357 2 72.28 TTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACATGCCGCCCCGAATGCACAACCGGCAACCCGCTGACCAACCGAACTGACCGAAGGAGAACCCTTTC:1 - chr3R 6148797 3' - copia 4868 1 69.31 GCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCAACACGATAAAGGGTGTCCTTACTCTCAATATAATATGGGTTAAGCATTACTTGTTTATCTGCCATTTTGTTG:1 - chr2L 11149795 3' + 297 158 2 72.00 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGAT:1 - 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chr3L 9121815 3' - Transpac 36 2 62.38 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGC:1 + chrX 495213 3' - 412 7108 2 77.23 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACG:1 + chr2L 108051 3' - P-element 43 1 37.62 ATAAAGAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGATGAAGTGAATAATCCAAATTGTTTGATTTTCTTGAGCTCCCGTGTTTGTTTTATCAAATATTTGCATTCAAA:1 - chr2L 20617451 3' + I-element 313 1 75.25 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTGACTGCAAATTTAAAAAAAA:1 - chr2L 9946936 3' + roo 9018 2 82.18 GTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGG:1 + chr3R 19191529 3' - Doc 54 1 82.18 GTTAAAAACGTCAGTTTGTACCTTTAACTATTGTCTTTCACGGTAAAGTAACATCTTTTGGCCCGGCATTTAATTACATTACGCTCGATTAAGGCGCAAGA:1 - chr3R 29657863 3' + transib2 444 1 57.43 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAAAAATGCAGCTGAGCCAATTTTGCGCCGATGTTCGTGCA:1 - chr3L 18009534 3' - roo 8669 2 74.00 AATAATGGTTGGGCAAACGTTTTTTGTTGATAATATTTGGTTTTAAGAGATGGGCAAACGATTTACTCTCTGATTGCTGTTAGCGCGCACAAAACAAAAAG:1 - chr3R 13571889 3' - FB 350 1 74.26 GCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGGATGGGGACG:1 + chrX 15195317 3' + Transpac 300 2 70.30 TCTTGATCGGTGTGTTTATCATGCTATGGATTTCAGTCTCGCC:1 + chr3R 17534174 3' - diver 5823 1 90.70 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCAC:1 + chr3R 9952253 3' - Ivk 24 1 53.47 AGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGC:1 + chrX 16798253 3' + diver 174 2 74.00 CATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTT:1 + chr3R 12877849 3' - mdg1 51 2 80.20 CATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTCGCTTCTTTGTTGTTGACT:1 + chr2L 21007091 3' - Idefix 16 2 63.37 GACAGAGGAGAACGGAGAAGGATATGTGAAGGGTCAAGATGCCCGGATTTACGTCTCAGTTATACTAAAGCTGATACTTTAACAGTTTTATAAGCTGATCG:1 - chr3R 4345124 3' + gypsy8 4471 1 62.38 GCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATAC:1 - chr3L 27356086 3' + Tc3 1676 1 61.39 GTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGATGTACAGCCAAGTGGAGCTCATAAACTTTGCGGGCGTCGCACCAAATCCATTTGCAACC:1 + chr3R 19960270 3' - jockey 4683 1 60.40 AAATAAAAAAAAAATAAAAAAAAAGGAACAAGACCCAAACAGTGACTGAAATAGCGGTTAACTGCGCTCCCTTACGGCGAA:1 - chrX 19851226 3' + F-element 4687 2 90.12 ACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGA:1 + chr3R 10741135 3' - 1360 3372 1 48.51 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAAACCACATATGGCCAACTAGTTTTGGGGGAAATTAACCCACATAGCTCAAC:1 + chr2L 10118960 3' - hobo 15 1 52.17 ACCGCTCTTTTCTACGCATACGTGTGCAAGTTATCCAACCCATAAACTGTGGAAGGGTGCTATGTTTATGGGTTGGATAACTTGCACACGTATGCTCATGC:1 - chr3R 3346322 3' + 1360 138 1 59.41 TTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATTTCCAACTTTTTATTTACAACTTTATATTTGGCACTTTTGACGTAATTCCACAACTGTTCAACTTTCTGCACTTT:1 - chr3R 3489260 3' - invader2 4819 1 78.22 GGAACTATAAAAGCTAGATGGTTGAGATTAAGCATACAGATTTATGGGTGACGCTTGATAGAACCTGTTCCTCCCCATCAATTTTGGAATCCAAATCCGGA:1 + chrX 20345072 3' + INE-1 157 1 66.34 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGC:1 - chr2R 9014440 3' + blood 7350 2 77.11 GAGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTATGATCCTTACAC:1 - chr3R 25633311 3' - Tirant 8119 2 69.31 CCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTA:1 + chr2L 2437754 3' + roo 353 2 78.22 GTTTTNAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGA:1 - chr2L 12074516 3' - Juan 4076 1 71.29 TGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTC:1 - chr2L 7170397 3' - jockey 4653 1 73.27 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCGGCGTTTTTCCAGCTGT:1 + chr3R 29660320 3' - mdg1 15 2 64.36 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTTCAGGCTGCTCCAATTTGAGCTGAGTTTCCGACTCGTGAAGATTAAAATTGTTTTTCTCTTCACTG:1 - chr3R 25918870 3' - roo 9 2 69.31 TAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCCCTTTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTGCAGCATTTCTCAGCTGCCGCATGTGGCAAGTGCGGTAGACCGTCAAT:1 - chr3L 9288804 3' - accord 226 2 76.24 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCAT:1 + chrX 19095799 3' + roo 9031 1 66.34 GCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATACAAAAAAAAATAACAACTAAAAATAT:1 + chr4 1152102 3' + transib2 2815 1 65.59 GTTCATATATATACATACATACATACATATATATATGCTTTTTTTTCTCTGCCTTTGGCCACGGGATTTGTTATGCCGACCACAGTATGTAATTAGCAGCA:1 - chrX 10507753 3' - 1731 101 1 62.38 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGATCGC:1 - chr2L 1156729 3' - 412 25 2 54.46 TTACANAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCAGTATGGATGGGAACTGCGTCATGCC:1 - chr3R 19076135 3' + roo 385 2 54.46 TGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGTTGTTGTCAGACTGACCGCATTCCCCAGCGCCTGTATCGACTGGCCAACC:1 + chr3L 19633165 3' - accord 49 2 58.70 CTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAAAATATATAAGGATTTTAGGGTATAAGGAATTATACCTGAATCCCTCGAAGG:1 - chrX 16889911 3' + I-element 5332 1 54.46 CCAAAGCTCTCTCTCTCTCTCTTCTGCCAGCGATTCTGCCCTCCAAAGTCTCTACGGGGACTGGCTTGCCGCACCGCTCAATGAGCTTCCACAAGCCCGTA:1 - chr2L 8438384 3' + blood 163 2 65.35 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCCGACCACATTTTTCTAGTTTTTGCACGTTTCTACTTTATTACGGTCCGTTTCTCCACCACCCA:1 - chr3R 26768498 3' - hobo 13 1 62.38 ATCGTTGAAAATGAAGTGAAAATGATCTTGAGAGTGTAGGCGCATACTGTTATTTATTTATCATTTTATATACAAATACACCGCTAGAAATTGGACTCTTG:1 + chr3R 30404488 3' - transib4 2481 1 37.62 TCATANATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATATATTTGTACATATTGGACCAATGTGCCCGTGTTGCGGGTCAATGCCAATAAGAAAGTCGCGTGCG:1 - chr2L 13837838 3' + 297 390 2 76.24 AAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTGTTTTCGTGTGTGGTTTCG:1 - chrX 21361195 3' + P-element 2746 1 26.73 CTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAGGATTAACTAAAGATAAAAAAATCACTATTGAGCTAAAAA:1 + chrX 21396719 3' + F-element 4638 1 71.29 TAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:1 + chr3L 25232906 3' - GATE 36 2 51.00 TGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGTTGCTCTGCGTGCATGCGCTTTGTGTGCG:1 + chr2R 7481116 3' + opus 7484 2 60.40 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGAAATTTTAAAATGAGAGGCTCTCTTCAATAAACCCTCTCCTCTCACT:1 - chr2L 8542820 3' - P-element 9 2 66.34 ATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATGACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATA:1 + chrX 16798259 3' + diver 6067 2 66.34 ATTATTTTTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTAAGGAGGCGCAGCAGGACCAACTGATTTTCAGGCGCGGCCAGGATAAACAAATTTCGGACCACC:1 - chr2L 18914516 3' - mdg1 12 2 65.35 GAAACNTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCGCGATCTTCACTCAAGAAA:1 + chr3R 25633382 3' + Tirant 8453 2 79.21 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGAGGATTAGGTGGAGTGAGCCCCAATGGATATAGTATTAAAT:1 + chr2L 6227715 3' - roo 8700 2 60.40 CGACCAAACAAAAATAATACGACTTAGACTAGGCGCGGTCGTAGGTGTCGAAGTCAAAAACAATACCCAAACGATCATTTTAAAATTTCACATGTCA:1 - chr3R 23810110 3' + I-element 4925 1 77.32 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTTCTAG:1 - chr3L 11070499 3' + P-element 2854 1 46.53 CGAACACGAAGAAGTTTTATTTGAAACTGAAACTGATACACATAAAAATGCCAGCTTCCGCCGTTTGTTCTTCACCAACATCTCTGCGCGTTCTCACTTAC:1 - chr3R 1363017 3' - 1731 4487 2 57.43 AAAGAAAAAAAAAAACAACAAGGCAAT:1 - chr2R 18571481 3' + gypsy7 5013 1 88.89 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAA:1 - chr2L 15956052 3' - Max-element 50 2 72.28 AGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGTATGTGTATTTTAAAAAGTTAATCATTGAATA:1 + chr3R 25628318 3' - Tirant 420 1 73.20 ACCCACCAACACTACCTAAATCCCAAAAATCGAGTTAATATTTAGGGGTTTATTTTATATACATATGTATATCAGGTGCTTCAGCTTGGCATGTCCCTTTT:1 + chr3L 3408641 3' + I-element 4971 1 77.23 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCATAATATGCAGTTCACTCAAAATAGACGAATGCTCAATTC:1 - chr2L 9389055 3' + 1360 3354 1 65.35 GTGTTNTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCGGTTAACAGCAGTTGTTGTCGCCGTGTGTGTACATATGTGCACAGCGGCGGGC:1 + chrX 2589740 3' - copia 25 2 52.48 CTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCAAGTAAT:2 - chr3L 17122406 3' + roo 9047 1 55.45 GAGTGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGAGGACGACTGCTCGGTAAGACGTCTTACAGATCTGATTA:1 - chr2R 24776622 3' + micropia 322 2 60.20 ATGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCTTATTTATGTGTACTTTCCGTCTCTTATTTGAGTTTCTCAGTTCTTTTACTGTGTTTTTCGAGGCGAGAG:1 - chr2R 14687587 3' - 412 7170 2 75.25 CTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTAC:1 + chr2R 16898300 3' - Max-element 8279 2 68.32 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTTAGTCT:1 - chr3L 18154125 3' - I-element 19 1 56.44 GTACACACACACACACACATACATACCTTCTGCTCCTCCCCCTCTCCTCCTTCTCCACCTTTATTTTTTTGGCTGCCTTGAGTAGCTAAATTTTTGTGTG:1 + chr3L 22004937 3' + accord 183 2 69.00 GCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAA:1 - chr2L 18028679 3' - flea 4792 2 67.33 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGC:1 + chr2R 14457759 3' - mdg1 38 2 60.40 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAATTCTTCGAAAAGATAGGTAGTATACTAGA:1 + chr3L 13994282 3' + P-element 2868 1 58.42 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTATTTGTTAAATGGCTTTAAATGATTAGGTACAAATCAAAGGATATTTCGAAATGATAATTGTGACATCT:1 - chrX 21401830 3' + roo 404 1 71.29 TATTGNTATTATGTTCGTATATACTACACTGTATTTATCAAATCTATTTTTCTTGTCCATATGCACCAAGGAATGCCTAGAATATAAAGAAATTTAAATTT:1 + chr3R 5505318 3' - mdg1 7045 2 72.28 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATTGATTGGGGTTCTGCAAGTACAACTGAAATACCGGCAACAACTACAGC:1 + chr3R 17121705 3' + mdg1 7430 2 53.47 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGAC:1 + chr3L 6024623 3' + roo 397 1 68.32 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTAGGCTTTTCATGTTTTTGAAGGCT:1 + chrX 13134980 3' - jockey 4801 1 51.49 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCACTTTTACAAA:1 + chr2L 18694170 3' + P-element 2861 1 53.47 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAA:1 + chr2L 14490460 3' - P-element 24 1 54.55 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACA:1 - chr3L 2292065 3' - Max-element 18 2 51.49 GGGAATTCTTTTTTCTTTGAACTTCGGAAGAGGCTTGGCGTGGTGTCTTTTTTTGACTAGTTTAAAAGCCGGCGATTGGAAGTAGTCGTTGTTGTAGTT:1 + chr2L 7219271 3' - G4 5 1 55.56 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCA:1 - chr3L 543431 3' + P-element 2838 1 30.69 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTCGTTG:1 + chr2R 9014497 3' - blood 7030 2 60.40 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAA:1 + chr3R 7360363 3' - jockey 35 1 56.00 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCGGCGCATCGGCTGTTTTCTGTTTTGTTTTTGTTTTGGATCTGAAG:1 - chr3R 28326695 3' - P-element 31 1 52.48 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCT:1 - chr3L 17869899 3' - 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chrX 14138196 3' - Doc 4699 1 82.76 GAAGCGGCCCAAGATGGCTCCCTTGTGGCACAAAGTCATCATCATCATCATCATCAGCAGATTACAACGATTTTTCACATGCTCACCGCCGCCCGGGCA:1 - chr3R 22055944 3' - Q-element 496 2 74.75 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATATTT:1 - chr3L 9772217 3' + 297 350 2 75.25 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTTAAACAAA:1 + chr2R 4502516 3' - roo 13 2 66.00 TCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGACACTATTCTAGTGTCTT:1 + chr4 227027 3' - INE-1 121 1 65.35 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAACAACAAACAATGAGA:1 - chrX 2050822 3' - 412 38 2 64.36 GACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGTTTTATTTCGTATCTTTTATATTTTGTTTAAGGATGTTTTTAT:1 + chrX 9354892 3' - F-element 4213 1 57.43 GACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAA:1 - chr4 1152029 3' - transib2 42 1 63.37 GGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTCCAGCTGCAATTGGCTTGATTGTTGATCAGGCGATCGTTCTTTT:1 - chr2R 5857399 3' + jockey 4662 1 55.68 TGACCCTCGGACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCACCGAACGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTC:1 + chr2R 5924404 3' + jockey 4723 1 44.55 GCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGGGTCAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGGACGATGGGTGAGTATCGCAGTCAAGAGTGGT:1 - chr3L 1525261 3' + Quasimodo 194 2 68.32 AGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGTGTGCGACAAAGACAAAAGCCGGAGAGAACAAC:1 - chr3R 13238890 3' - Doc 383 1 67.33 AGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACA:1 - chr3R 28755955 3' - 3S18 5815 2 71.29 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCA:1 - chr3R 13715077 3' - P-element 27 1 52.48 AGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTAC:1 + chr3R 1977614 3' + micropia 5403 2 60.40 TATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGTGTGAATGCAAAAGTTCCAAAGCGTGGGCATAGCGGATTGGATCCTAAGGAAGAAAAGAGGAAGGACACTGGCAGT:1 - chr3L 23771278 3' - INE-1 546 1 55.45 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGCAAAGTTGCGTTCTAAAAATGTTGGCATCGGGCTTGTTTTACCTTATAATTTTACTATTTCCTGG:1 - chr3R 11166028 3' + Tabor 7272 2 71.29 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAG:2 - chr2L 19642992 3' + roo 9019 2 77.23 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACC:2 + chr3L 15638288 3' + roo 9033 1 69.31 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTATGTGAATATGATTGCT:1 - chr2L 19075660 3' - Transpac 4955 2 62.38 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAG:1 - chr3R 7522309 3' - blood 7051 2 62.38 GCACATACACACACACACACAAACCGCAGTGAGACCCAGCTCATCATTATGTGAGGTGACGCCTGCTGATGGTGACATCATCATTATGGCGTTAGGAAACT:1 - chr2L 12872398 3' - Stalker 444 1 75.25 GGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATATCCGTCTCTCCGACTGTCCATATGAACGTCCCCAGTATTTGGATTATCTTCTTGCACGACCATTTT:1 - chr3L 8975121 3' + INE-1 91 1 64.36 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTGCGTC:1 - chr2R 9426437 3' + P-element 2861 1 55.00 TAGGGNGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTTTGGGGCCGTGAAAAAATG:1 - chr3R 29384323 3' - jockey 4760 1 78.22 GGCGATCATATAACACTTCCACTTGAACATTATTGTTTATGCTAGCACCGCCAATGCGTATGTAAGCATCGAACTAAATCCAAAAAAAAAAGGTTCATCT:1 - chr3R 23366771 3' - gypsy11 4105 2 65.00 ATGGTGCCTATTGATCAAAAATAATATAGATTTTAAGTCAAAGAACTTCTTTAGGTGATGGGCATATTTTGCCAACTTTACTGCACCTGAGCTGTGCAATA:1 - chr2L 22633079 3' - 1360 263 1 68.32 AACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTA:1 - chr3R 15157611 3' - invader3 5243 2 65.35 ATTAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAG:1 - chrX 2762121 3' + roo 9039 1 55.45 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAA:1 + chr3R 19837084 3' - P-element 36 1 42.57 TCCCAACAGAGGGTCAAAACTGCTAACACAGCTTTAAGAATCTGGGCTTTCAATTTGCACGTTCGCGTCTCGTTCCTTTTATTCCCATCCATTTCATTTAA:1 - chr3R 28157418 3' + Quasimodo 334 2 71.29 CGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAATTATTTCGCCACG:1 + chr3R 1868233 3' - G-element 21 1 59.41 ATGCTCATGCATTGTAAATTTGAGATATGTTCTCTAACAATCTCAAAAGGATATCCAATGGATGAGCATACTTGAGGTTCATTTTCGTTTAACAATTTCCA:1 + chrX 10400822 3' + 1360 192 1 62.38 TCGCAAGAAAACTAATCCGAGTACGCAGTCAACTCACATATCTAGGCATAAAGTACTCCCATCGCAGGTCTCCTCCTCGTAGAAGGAGTCACCATATTTG:1 + chr2L 11047165 3' + Doc 4506 1 77.00 TATTATATATGCATACAAATTAAAAGTTCTTTATCGGGATAAATACATATTAAAGTGGTTCTATTTTATAGTTATTCCGCTTTTATCCAAGATATGATCAT:1 + chr2R 10286800 3' - Dm88 4378 2 34.65 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTTGTTTTTACAACATCTATTTTTGAGTCAGCCA:1 + chrX 19095839 3' + roo 408 1 76.24 TTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATATTGTATAATTCAAACCCGTCTTCCTCTTCACAATCAGTAGAGTCTGAAGAATTTTTATTTTTTGGGCTTGGCTGT:1 - chr2R 14213702 3' + hopper 182 1 77.23 AAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAACAATGAGTAAATTTGTAGCTGCATAGAACTAGAGAAACAAAACTCAGCTAATCAGTGAGTT:1 - 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chr2R 4502442 3' + roo 9037 1 64.84 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTG:1 + chrX 5443948 3' + mdg1 383 2 63.37 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCT:1 + chr3L 8974147 3' + P-element 2856 1 46.94 AGGAGATCGGGAGTGAGAACGCGCGGTCAAGTCGGAAATAATAAAAGAATTGCCAGCTAGAATTAAATCGAAATAAAATAGTACAATAATGGCTATTGAAC:1 - chrX 14770769 3' + gypsy8 436 1 58.42 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATCTACCAACAATGGCGCATTGATCATCGCCTGTTGGGGACTCTCAT:1 - chrX 19095737 3' - roo 8694 2 55.45 TATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAAACTGTCAGGGCCGTAACAACATTAACATAAAGCTCACACAAATTAGATGC:1 - chr3R 14140563 3' + Doc 4527 1 58.42 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAG:1 - chr3R 31644157 3' + roo 9020 2 78.22 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTG:1 - chr2L 326153 3' + roo 9018 2 76.24 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGATAGCTCGATATTGATTAGATATTGGTGTTCTTGGA:1 - chr3R 9440195 3' - opus 7074 4 65.35 GGTTCTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATGGCCTTATGAACGAGATGCGTGCCACAGTAAAGGTGCGTTGAAGTGCG:1 - chrX 5859559 3' - Quasimodo 117 2 52.48 CAATTGTCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTTTGTTTCGATTTTTTATTACATCGCGTTGATGGTGTGTTTGAGTGTGT:1 + chr3R 20255670 3' + 1360 272 1 60.40 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGAACACCCAAATACGTCACTATATTAATGCAAAGAAATTTCTTAAATTTGGATTATTTAACAAATCTT:1 - chr2R 8560114 3' - 297 26 2 55.79 TTTTGNTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCCTGTCCGTCGTCTATCTGC:1 + chr2R 12894145 3' - I-element 5182 1 80.20 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTAACGATAGATGATTTGGCCCCATTTTTACGTTTTCTGCCTT:1 - chrX 12294664 3' + blood 372 2 73.27 ATACAATAAATGATTGGGTATGTATTTGTATATTTATATAAATATATACCCAATCATTTATTGTATTAGTGCTACACTACAATATGCTACATTAACGGACA:1 - chr2R 545138 3' + Stalker 31 4 79.21 GCGGCAACAGAGGACCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGGAAAATAATAACAATAACATGAAATGATGTATG:1 - chrX 11533900 3' + invader6 4847 2 61.39 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTCACGTGTCGTTCACAGGATATTACTTTTATCGGCCAGTGC:1 - chr3L 13194730 3' - 297 6585 2 75.25 TGTATTTATTTTATTTTATTAATAAAGTTCATAAAAGAATAAAAGAAAAGATTTTTTAGTGTGCACATCCGTTTTCCGTTTTAACCTCGCAAGTAGATCAA:1 - chr3L 18100658 3' - Doc3-element 74 1 46.53 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTT:1 + chr2L 2437775 3' + roo 9038 1 59.41 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAAGGCACACCACAC:1 - chr3L 21841279 3' + P-element 2872 1 64.36 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGATGCTCTGCGTGCATGCGCT:1 + chr2R 7481107 3' + opus 472 2 60.40 GTACATAGGCTCTCATTTATGTTAACGTTTTCGGTTTTGGAGAATTGGATTTTTTTTACCCCACTACTAGTCTCTAGTATATTTTTGGTAAGGTCGCGTCT:1 + chrX 21945920 3' - Quasimodo 454 2 76.24 AGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTGGGAAAATAATAGAAAAGAGCCCTAGATGAGATGGACAACCCTTGAGATACATCGAATTCGAACTG:1 - chr2R 17333171 3' - R1A1-element 5107 1 72.28 TGCCGNCGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTGTGGGTCCTGCGAGAGTCCTTCGGAAAAT:1 + chr3R 11260615 3' + HMS-Beagle2 177 2 70.30 ACAGTATGTGCAATATATAGGTACAATTATTTGAATTTATAGGTTTAACATTGCATGGGGTGAGTTTGGGAGTTGGGCAAATGCAAAAGCGTCAGTTGGGC:1 + chr3R 17900227 3' - HeT-A 5985 1 75.25 GGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCC:2 + chr2R 5084086 3' - F-element 32 1 48.51 CCAGGAAGTGCGGACGTGTGCTCGCTGCGTGAACGATGAATGCTTCAAACTGTTGGCCTCCAATGAGAATTAACATACCCCATAAGAATTTTATTTACTTT:1 - chrY 676991 3' + Bica 46 1 37.62 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGACAATGGGCT:1 + chr3L 6024631 3' + roo 405 1 76.24 CCTACCGACTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATAAAAAAGCCCCATAGCAGAACATTTGAGAGA:1 - chrX 1964186 3' - Tirant 413 2 66.67 GTGCANACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGTTCTTCGTTCTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAAAAT:1 + chrX 21205122 3' - 1360 166 1 66.34 CAGATNAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAA:1 + chr2R 10863951 3' + mdg3 5453 2 72.28 GTAGCGAAAAGGAATCTGTACAAGCAAGGCCACCACACCCAATGCCAGTGTATATCGAAGCTAGCTTTAAAATTTCGGGATATATAGGACTCAGTTTGATC:1 - chr3L 23773364 3' + Gypsy12A_LTR 2150 1 55.45 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTACTACGAGTATACATCC:1 + chr2R 20838815 3' - 1360 22 1 53.47 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTTGCAATTAACTTTTTGGCGGCTTTAAGCCGACCAGGACGAAGCAACCGCCCCGCTATAAATGACC:1 + chr2L 18914627 3' + mdg1 411 2 68.32 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCC:1 + chr2R 12779161 3' - roo 8695 2 58.42 ATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAAAAATAAAAACTGTGCACAGCCCAAGCCGCAGGGGAAAAGCCAA:1 - chr3R 10925613 3' + P-element 2613 1 46.53 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCATAAATCTACAGTTTTGTTAACAATTTCTACAAGAGCACGGATAGCAAAAAGGGCAGTCAA:1 - chr3L 21383953 3' - roo 8678 2 65.35 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCA:1 - chr3L 15035132 3' + pogo 2068 1 67.33 CATAAATAAAACAACAATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAGAGAAAAGCAAAAGAAGGTAAAAAGAATGAAGGCGAATAAAAAA:1 - chrX 13285176 3' + 297 6972 2 62.38 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACATATAAAAAAAAAAACCATAAGAGAAATGTTTCAGAAAAATACCCTTCTGATTTAAAATTATTTCTGCACA:1 - chr2R 16898220 3' + Max-element 293 2 68.32 ACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTAT:1 - chr2R 10863885 3' - mdg3 5273 2 55.45 CGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCCCTTTCTCTTTTCCTGGCTGTGCCACACAGAATATACATATGCAGACGTCTATTTTTAAATGAAA:1 - chrX 10088982 3' - FB 9 1 59.41 TTGAATAGTATATTCCAACATTTATTTTCCCTGTTATTTTTGAAGTGTACCCCTAGGTTCCTTTTTTCGTGGACAGAACGAAAGGTCCGGAATGTGACACG:1 - chr3L 2024281 3' - copia 4868 1 78.22 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTG:1 + chr2L 13060307 3' + P-element 2830 1 22.77 CGATCGTACTACGTGCAAAAGTAAACAAATAATTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCTGTTTAAAACTTCAACAACAAAAAAAAACGCGAGCAGAC:1 + chr3L 21127958 3' - transib2 219 1 77.23 TTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAACGGCTGAAGAAAGATTGTGTATCGCGTTGATTTGCCGATCGTAGAATGCGTTTTCCGATTCGCGTGCGGTAC:1 + chr3L 12056416 3' - F-element 4520 1 67.33 AATGCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCA:1 + chr3R 25823694 3' - hopper 54 1 74.26 TCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAAGTTAGTTTTGCTAGACGAGTTACCGTTATGTGACTCTTAT:1 + chr2L 19075748 3' + Transpac 5219 2 69.31 GACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTGATGCGGCCAAA:1 - chr2L 15344134 3' - transib2 31 1 54.46 TTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATTATGAGTGTCTAGCACCCT:1 + chr3R 19609718 3' - Tabor 6874 2 58.42 GCCAANAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACA:1 - chr3L 27415225 3' + transib2 2815 1 63.86 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACATATGTTACATAGGCTAGCTGTTATGTATTGCTTTATATGTCTATATAGCCCAGATAAGCCAGCGT:1 + chrX 6997258 3' - P-element 10 2 69.31 TTCTGAAAATCCAGTGAAGAAAAAATGTCGTTTCCTGGTGGAGCGTTTTTCTGGGGGTGCTCCGGTGGAGGATATCTTCTGGGTGGGCGAGGAGGAGAAGG:1 + chr2R 18127001 3' - mdg3 486 1 68.32 ATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGACGCTGGCGACCCGCCGTCGAGG:1 - chrX 5984261 3' + copia 4690 1 77.23 AGATATTTCCAAATGAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTATCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCAT:1 - chr3R 10445219 3' + roo 9022 2 74.19 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTGGAATACATTATATATGCGTACCATTTCTGGGGTCTGGGGCTAAATTGGTATCACTTCAATTA:3 - chr3R 17367979 3' + roo 395 1 61.39 GGGCTTGAATTTTGCTTTTAAACTTCGATTCCCAGTTTCCCTATTCTTCGCAGGAGGAGTGGACAGAATCGCTCCTCCACTCACATGTCTGTCGACAGGCG:1 + chr3R 30144008 3' - Porto1 59 1 75.25 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGACAAAGGCTGGCCAAGAAAAATATGTGCAAAGGAAGTCTTGCCCATTTCAACAGAATTAA:1 - chr3R 18551111 3' - Max-element 17 2 63.37 TTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTCGGGCGCCCCAAAGCTGGCAATGAAATATGCGACTGC:1 - chr2L 7170361 3' - jockey 4617 1 62.38 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCATTGCGTACCAAAGCTTTCATCAATTA:1 - chr2R 10912109 3' - 412 7101 2 72.28 TTGCACACAAAATTTGAAGTCTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCGTATAAACCTCTTCTCCCAGCAACCTTTTATGCATGGCAATGAGCTCCACTCGGAC:1 + chr2L 5449960 3' - transib2 2727 1 59.41 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCTCT:1 + chr2R 18503574 3' + roo 397 1 53.47 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGGTACTCTTTTTTAGATCTCTTGCATCT:1 + chr2L 11045376 3' + P-element 2877 2 68.32 CGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATTACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTAAGGAAATGAATCCGTTGGCTTGGATGTTTCTTTTACACTGTCTAA:1 - chr3L 21698117 3' - mdg1 430 1 54.46 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGA:1 - chr3R 7993878 3' - Doc 49 1 67.33 CAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTGACAATCACAGGAATGTCGACAACATGAATTTGATCGGCA:1 - chr3L 4067396 3' + jockey 463 1 68.32 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGACAATACTGGATATATATAAAATCTCAATAGCTCATTCAGTATTTGGTGATAATGAGGACAGATTA:1 - chr3L 15056289 3' - BS 5004 1 77.23 CCAAAGAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGG:1 - chrX 19457155 3' + roo 9030 1 67.33 ACTGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCTTGTACCCGAAGGGTGGACGCCAA:1 + chr3R 28755659 3' + 3S18 6104 2 63.37 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACT:1 - chr2R 10863897 3' - mdg3 32 2 59.00 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTC:1 + chr3R 19967654 3' - pogo 35 1 70.11 AAAACCAATATGGACGTATGGAGTAGAACTCTGGGGAACTTCCAGTAAATCCCACTTACTAACAAACGATTTAGATTTAAAATTATATATACTGTGTATTT:1 - chr2R 21015655 3' + Porto1 4259 1 58.42 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTA:1 - chr2L 11065869 3' + P-element 2856 1 50.00 AGGGGCTCCAAGATTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATAAAAAAAAAAAGAATGAAGGACTCCACCGGAACTGTAG:1 - chr2R 2738384 3' + X-element 4687 1 95.12 AGAACNCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGATGCTCTGCGTGCATGCGCTTTGTGTGCGAGTAG:1 + chr2R 7481121 3' + opus 486 2 67.33 TATTGATCCTGATCAACAATATACATACTTTATATAGTCATAAGGCACACACACACACACACATGTGACATTGAAGACAGGATGGCCAGGAATCCACCACA:1 - 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chr2L 20118678 3' - Max-element 8255 2 59.41 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAAAACCCAAGGCACCT:1 + chr3L 3279814 3' + Juan 4202 1 65.35 TCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCGAATTGGCTCCTCTTTAAAATCATATGCCCGATTCAGCTCAAAATTAATTTTGTTCTAGTTAGGAGATGGAAAT:1 - chr2L 17889294 3' + accord 7383 2 78.22 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCC:2 - chr3R 14049349 3' - transib2 34 1 59.41 ATATTGCATAGGCACATACTACAAAATTCATCGTATCAGACGTCGCTTTCTTAGCTTTTAATGGAATTATTTGAGAAAATTATGAAGCATTTTAATTGG:1 + chr3R 9837676 3' - 412 2 2 71.72 GATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATAATATCACAAAAATATTATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAAACTCATCTACTAGGTATGTATGCCTAT:1 + chr2L 903863 3' + 1360 335 1 42.57 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATC:1 + chr3L 13080995 3' - 412 7092 2 64.36 TCTGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACAAAAATATTAAGTCCAAAGGCAACTAAGTTTTAAAACCAACATATAAAAATAAAAAATTAAAACAA:1 + chrX 16499435 3' - 412 7150 2 69.31 AACCAATGTATGGCCGTTACGCAGCTTGTTATTCCAGCGTCTTTGGCTGAACTCTATTATAGCGCGTCAGCATTGTTTATGCGAAGCTACTTAGTTGCTAA:1 - chrY 475865 3' + 1360 3365 1 71.29 CTGGGAGGTCTGGGAAATCAACTTGTAATTTCCGAAAGATATTTTTGAACTTTGGGGGTTTAGACTGTCCATGTTAGTTTAAACGGCTTGCTGGTAAATTT:1 - chr4 1186489 3' - Ivk 288 1 73.27 TAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAAATCTGTTGGAGAAAAACTGCTCAAAACTTTTACAGCCACCA:1 - chr3R 9837542 3' + 412 494 1 80.20 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATATAGTGCG:1 + chr3R 12894162 3' + blood 7351 2 63.64 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAA:1 - chr3R 11165634 3' - Tabor 28 2 55.45 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTC:1 - chr2L 12074495 3' - Juan 4030 1 61.84 TAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACATGTATACATAGTTGTTGTTGGCTAATATATCAACATTC:1 + chr2L 21010534 3' + flea 4951 1 62.38 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCAT:1 + chr3R 11165687 3' + Tabor 434 2 75.00 AGTGGTTGTTGATCTGCGTTTCATAAAACCGTGCTGACACGGTGATATCTACAAAGGTGCTGCAAATGAGTTGTACATAAATTTTTTGCAGTTTTCATTG:1 - chr3L 5090398 3' - Q-element 222 2 70.00 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGCATG:1 - chr3R 6147237 3' + copia 244 1 71.13 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGACAATGGGCTT:1 + chr3L 6024632 3' + roo 406 1 77.23 GCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATAGTCACACGTCAGCATATCAGCGTACTCACATTATTCTCATCGAAGACACGAAAGACCAGGGAGGCAAATTT:1 - chrX 18200703 3' + opus 497 2 78.22 TAATGCCCTCACTCCAGTTTCGTGCAGCCTGCTTTGTCTCTTCTCAGCGTTGTTGTTGGTCCTCGCACTTACGTAAGCCTCACGTATTTCGTTTCTTATCC:1 - chr2R 12589475 3' - micropia 5299 1 62.38 AAAAAACAAAAAAAAACAAACTGACATAAATGCTGGAAAATGTCCGTGTCACACAGGTTGAAAAGCGAGCTTGCCAAAAGTAAAAGTTTTCTATGCTACTC:1 + chr3L 2427607 3' + HMS-Beagle2 489 1 74.26 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACCAAAGC:1 - chr3L 7989737 3' - mdg3 31 2 52.48 TTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGT:1 - chr2R 6984346 3' - HMS-Beagle2 54 2 79.21 CAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGTTGTCATTAACGG:1 - chr2L 13447086 3' + HMS-Beagle 235 2 68.00 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCATTCGTTTGCAAGTGGCACATTTAAAAGTAACTACGGTAGCTATAGCTGCCCAG:1 + chr3R 27412520 3' + 412 7525 2 53.47 CAGAGGCCAAGAATAAAAAAACCATCTAAATATATTTACACATAAAGCAGCGGCAGGCAGCGGGAGGCTGGATAGAATGGCGATAGGAGGCGTGGCAGCCT:1 - chr3R 7449321 3' + Transib5 15 1 62.38 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATTGCATTCAATTTGATGAGTTGTTGGC:1 - chr3R 23665234 3' + 297 6969 2 74.26 CCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTTA:1 - chr3L 2292060 3' - Max-element 8248 2 56.44 GTGCGTTCGGGTTTATTTCGTGCAGTCATAAGCATTGGTGAGCAAGACCGCGATCGTCCACATTCTCAGCCGGTGCTAATGACAAACTAAAATGGTGAGTT:1 - chr3R 13970501 3' - Doc3-element 411 1 66.34 CCAGGGTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATTTCCCTCCAACTATCTCTTTGTCCGCCATGTGTGCATTTGG:1 - chr2L 10291494 3' - jockey 4766 1 69.31 GAATTTTAAAACTAAGACTTTCGAGATGTGCCTCGGGTCGTGACGTCAGTGGATTGTCGGCGGCAATCGTCTTGGGTTCAAAGTTCTCTAATAAACAA:1 - chr3L 3547189 3' - jockey 4798 1 75.51 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCGAACAATTTAAAAATGCAGCGCATTGAGTACTTAAATACTTAAAAGTGTAACAAGTTA:1 + chrX 8352255 3' - blood 7029 2 51.49 ATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGACCAAGGACAGGCAGCTAGTT:1 + chrX 329066 3' + opus 7458 2 71.29 AACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACAGTATTTTCACATCAAACGGCACAATTTCAATTGCATACGATTG:1 - chr2L 16933593 3' + 3S18 307 2 56.44 GACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAA:2 - chr2L 12074521 3' - Juan 4081 1 77.23 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGTTTTTTATGCTCCAAGTGGGTGAGAACACACAATCA:1 + chr3L 13364632 3' + hopper 1412 2 73.27 AAATANTGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATGCAAAGAAATTTCTTAAATTTGGATTATTTAACAAATCTTGAGAGTAATT:1 - chr2R 8560104 3' - 297 22 2 58.42 TTATACCACAAAATCTAAAAACAAAACAAGCATTTTAAACAAAATAAAAATGGAAAAAAAAAATGAAGGGCTAGGAAAAATGCGGGGAAAGCTGTGGAAGA:1 - chrX 5130343 3' + I-element 5178 1 58.42 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAAT:1 + chr2L 326199 3' - roo 33 2 62.38 GTTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCG:1 - chr2R 6984303 3' - HMS-Beagle2 6894 2 68.32 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATAAGGCCA:2 + chr3R 7101081 3' - pogo 14 1 65.35 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACAAACAATATATATTAAAAA:1 - chr2R 14381297 3' + hobo 2890 1 80.41 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATT:2 - chr3L 14910590 3' - roo 51 2 77.23 CACAGTGCAGTTTATGTGCATGCCAAAAACAACACAAAAAGGCACTGCGAACAACGCACAAAATATACCAGCAAAAACGAACACGATCCACATTCAAAGAA:1 + chr2L 14967858 3' - Cr1a 268 1 62.38 AATTTAATTTTATTTTAATTTTGCTTTTATTATTTTCATTATTTCATTGCTTCATTATTTTTCCATTCAACTTTGCTTAATTGCGGTTCTTTTTGACCAGC:1 + chr3L 7031645 3' + Rt1b 125 1 78.22 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCATGCCTGGCATAGATCATGCTGGTTCTCCAGATTGTTTGGTCGATTGAATTGGCTTTCACATCAGC:1 - chr2R 18601791 3' + Transpac 302 2 70.30 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGA:1 + chr2R 24965120 3' - P-element 43 1 36.63 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTACATTTTTTATTCAGTCTACACA:1 + chr2R 16898321 3' - Max-element 8258 2 56.44 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCTTGAAATATTTTGAAAAATGTTTTAATGTAAATAAAGTTTACGTATACACTGAAGAGAACTGCCCGC:1 + chr2L 17889419 3' - accord 8 2 71.29 TGGATTATTAATCCCACTTCTGAGATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTAGATTTAATGTTTTTCTCTCAAA:1 - chr2R 12163730 3' - mdg3 272 1 75.25 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGA:1 + chr3L 21384050 3' + roo 386 2 56.44 GGGTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATCAAGTATCAAGTTTATTATAGGATTGACAAATAATCACAAAACATCAACATACCGTGCATTTCCTGA:1 + chr3L 22987138 3' + S-element 70 1 65.35 GAACTCCTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCATTTAGCTCACTTAGTTAATGTGCAAAAGGGCTCTTAATTTCTGTGCTC:1 - chrX 14520537 3' + transib2 13 1 56.44 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATGTATGCCACTTGTATATTGTTTGTCACCAATTTGCGTATTTT:1 + chr3L 540126 3' + P-element 2872 1 44.55 ATACTTGGTTGGATAGCCTTTGTTAGCCAGCACAGCCTTACACCCACCGGCATGCATCAACTACCTTGTTGACACGATCGCCAACTGCTCCACGATAATGG:1 - chr3R 4561586 3' - HB 1326 1 58.42 TCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTCAGATGGGCAAAAAGCCAGGGCAATCCAGCACCTGGCAGTTAAATTTGGTGCATGTTCGCTGATTGAACACAAATG:1 + chr3L 5826587 3' - F-element 4358 1 77.23 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGTTATGAAGTGGC:1 - chr3R 14639314 3' - roo 8669 2 74.26 GCGTGAGTACAGCCAAAGCTTAAGTTAGTCACATTTTTGATCTGCAAACAAACCGAAGCTGAATCACTGACAGCCGCCACAGTGAAAATCGGCTAAAATAC:1 - chr3R 7478527 3' + 3S18 5980 2 58.42 AGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCGAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGTATGGAATGCGATTTAGGGCACTATTGCC:1 + chr2R 9791763 3' - accord2 7600 2 71.29 CCCGGACTCCCCGAAGCTGCCAACAAGGAAACAAATTAGCTTCTGACCACGGGAAACTAACCGAATTATGTTGATTTGTTTCCCATTTTCCGAAAT:1 + chr2L 9322589 3' + Gypsy6A_LTR 320 1 82.29 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGGGGCAAATAACGGATGGAAATCAA:1 + chr3R 19191551 3' - Doc 31 1 59.41 GATCGCCGACGAGTGAAGACGTTTTATTCGCACTTTTCTCCGAAATTCGCAGCTTTGTCCAACATCAATCCGCTGCGAGTGGCCACCAACGAAGCTGGCCA:1 + chr3L 8717902 3' + F-element 18 1 80.20 CACAGCTTTTTTTATTGTTTTTGGGAACATTTGTCGATATCAAATCGTGCATATTTCAATGTAA:1 - chr2L 14221604 3' - Bari2 924 1 90.62 AGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTGGTAAGTATAGTTACT:1 - chr3R 28755905 3' - 3S18 5765 1 77.23 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATAGTCACACGTCAGCATATCAGCGTACTCACATTATTCTCATCGAAGACACGAAA:1 - chrX 18200721 3' + opus 479 2 60.40 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTCACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATT:1 + chr2L 2437753 3' + roo 352 2 78.22 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCACCTATAATTACTGTTGTTTCCCA:1 + chrX 20437713 3' + roo 397 1 52.48 TTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCGTGTTATTGCATCAATGTCATTTTTGTTATCTAGCATT:1 - chr2L 17432026 3' - 1360 3345 1 49.50 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 350 2 71.23 GTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCTTATGTATGTACATATTGCTGACATGGAGAGCCACAAAGCGCGA:1 - chr3L 19779017 3' - Tirant 8117 2 65.35 CCTACAATATCAGAAGTGGGCCGATCATGAGCCAAAGGTAGTAGGAAAAAAGCAGGCAGTGGAGGTACCCACTTGATAGATGAAAATAA:1 + chr2L 7502621 3' + invader2 261 1 66.29 GGGTTNGCTAAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCAAATAAAGAAACTGGGGAGCGCTCAGTTACAGGATATCTTAAGGGCATGTGTGAGCAATCAA:1 - chr2R 24644912 3' + Stalker4 7259 4 64.36 GCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCGAACAGGTAACAAATGAATATGACTTCTTATTTTATCTGAAAATTACATTTAAGGTGTAGAGTTAGTGTGTCA:1 + chr3L 27391099 3' + invader4 2767 2 77.23 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAG:2 - chr2R 17394641 3' - jockey 56 1 69.31 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTAAGTAAACTTAGTAGCATTCAATAGTAGCATCAGTTTGGAA:1 - chrX 14531489 3' + 412 7516 2 55.45 ACAAAATAAACAAAAACCAAAAAAGTAATCGCCAAGTACTTTAACTACTGTACAAAAAAGAGAACGTTTAGCGAACTTGATTTACTCAACACTGGCGCATC:1 + chr3R 25597307 3' + transib4 2539 1 79.21 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTA:1 - chr3L 14910592 3' - roo 53 2 77.23 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACTGGCGTTATCACCTATTCAATTCAATATAGACTTGTGGGCTCTCCCGCAA:1 - chr2L 5974377 3' - roo 8664 1 75.25 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGT:1 - chr3R 14639327 3' - roo 18 2 61.39 AGATTATCGTTTGCCAAAAGGCCAAAACCAAAATTACTACCGCTTTCAACATGGCGATTGACTGACTATTCCCCAAATTGCCTTAGCTTTTTAAGGGCAAT:1 + chr3R 28755818 3' - 3S18 430 1 80.20 GTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATCAAGTATCAAGTTTATTATAGGATTGACAAATAATCACAAAACATCAACATACCGTGCATTTCCTGATG:1 + chr3L 22987140 3' + S-element 72 1 67.33 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATATAATTTACCGCCTTTAGCGAGTTCATAAAGCCAAGGAAAGGGGAATGGAATGGTC:1 + chr3L 9304670 3' - jockey 28 1 55.45 ACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGCAGCAATCCGAGCAGGATCCGCTGGCACCCAACTCACCAGCAACACC:1 + chr3L 9471273 3' + I-element 146 1 52.63 AATTGCTTGGAGCCCCGTTCGTTCTGGCGCTCCACTAGTGGTTCATTGAGTTAGCGAACTGGTCTTATTAATGACAGACAGGCGGCCTTGCTGG:1 - chrX 17039712 3' - Juan 219 1 59.57 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGCGTTCTGCCAAAGGTTA:1 + chrX 12294747 3' - blood 7056 2 71.29 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGCACCAAAGAAAATTGTCGAGAAAGGGGTGATGGGGTGAGTAAAGAAAGAGG:1 - chr3R 14649694 3' + roo 9001 2 77.03 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATAAGGCCACTA:1 + chr3R 7101084 3' - pogo 11 1 68.32 GTCGANGATCTACATGTTCTGTATGATGTGGGCGGGTGCGCTTCGGTGCTGCAGAACAGCTGGTAATAGGAGCCGGGCTCCAATCTCATATTCTTTTCAAA:1 - chr3L 3201660 3' - gypsy6 448 1 62.38 CGCTANCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACTTTCACCCACTCAGGAGCCTTGTTAAACAATCACAAAAACA:1 + chr3L 4929790 3' + accord 141 2 58.42 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACCGACCGACCACCATTCACTACAGCTGACCACCGACCACCATTCTTGGCGTTTACCTTACTCGCCCACTACTT:1 - chr3R 19836994 3' + P-element 2883 2 76.24 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCAGTACAGAATTGATGACAGGGAAAAAGTTTTATTGCGAATTCCCGCGAGAAGTG:1 + chr2L 7927276 3' - hobo 23 1 58.42 TTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCA:1 + chr3R 11165686 3' + Tabor 7271 2 76.24 CCGTANGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAATTATTTCGCCAC:1 + chr3R 1868232 3' - G-element 22 1 58.42 GCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACAAGGGCGTAAATTAAGAATGGCTTTTATCTTAGGTGTGACAGTGGGAAGGTC:1 - chr2R 1327863 3' + diver2 4870 2 51.49 TTATAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATT:1 - chr3R 6769715 3' - mdg1 47 2 53.47 GAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTAT:1 + chr2R 6984380 3' + HMS-Beagle2 266 2 74.26 GGACTTAGGGAAATATTTTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAACCAACCAATCGCTTCCAATGGAAATCATGTGCCTAAAAATGCAAATT:1 - chr3L 3417603 3' + HMS-Beagle2 224 2 53.47 TTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGTGCTAGTTGTTTAGCATGGTCTGTGAGTTACGGCAAGTGGCGCGAAGTCCGTGGATTTGCTCCACCAACTGCACAC:1 - chr3R 16342649 3' + R1A1-element 5042 1 71.29 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGT:1 - chr2L 15333732 3' - P-element 45 1 34.65 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTT:1 - chr3L 13994227 3' - P-element 56 1 21.78 TTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAAC:1 - chr2L 7170403 3' - jockey 4659 1 79.21 TTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTACAAAGTGCATGCTCAGCATTCCTTATCGTATTTCTCTTGTGGCTTGTTGCTTGT:1 + chr2R 13319127 3' - Stalker4 243 4 68.32 TGACTATAATAGACTTTTTCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCATTAAAGCAATCAATTTTAACTTTTTAGTTATTTTTTCGTCGGTTTTTGTT:1 - chr3R 14718004 3' + Cr1a 4204 1 75.25 CTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGA:1 - chrX 6654696 3' - P-element 20 1 57.43 TATAAACAGACTTTATTTTTCAGAGTGGTTGCACATTTTCGGCCAGGTAATTTTCAAACTTTTTTGATTTAGTTGGCGGTCGAATGTAGAAGGAAGACATT:1 - chr2L 19820409 3' - G4 3385 1 53.47 CTTCANAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGT:1 + chr3R 7388429 3' + HMS-Beagle 7028 2 69.31 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGCGATGTCATAAATTTTGTGAAAAATATA:1 - chr3L 12085146 3' + pogo 2080 1 56.44 TTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTAACCCATTAAACATGGATTATGGAATG:1 + chrX 17745297 3' - I-element 5105 1 73.27 TATTACTATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGACCGCCTTCATTACTTTGCCCAAGCCATCAGGATCCTT:1 - chr3R 27374802 3' - mdg1 37 2 61.00 TCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTATTAAAT:1 - chr2R 5674632 3' + S-element 1705 1 68.32 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTACAAAATCTGTAAATAATTTTACAC:1 + chr2L 21089218 3' - flea 4785 2 68.60 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGAGATAATAAATTTGATGTTTTTACAAATAATTTTTAATGCAGTACGTGCAATTGTACAAATAGTTAGTTTT:1 - chrX 18012651 3' + roo 405 1 75.25 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATATTTTAGAAATTAAAAGCCTACTCAGGTCTTGCTTTAAATCAATGTTTTGCCT:1 - chr3L 3951042 3' - pogo 21 1 58.42 ATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGG:1 + chrX 22824234 3' + Gypsy12A_LTR 2259 1 52.48 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAAGTCGAAAAAAAGTGTTGCAAGTCCGAGGTTAAGATTATCTCATTTTT:1 - chr3R 31369301 3' + Transpac 284 2 56.44 GTATTATTAAAAAAAAAAATAAACAAAAATCTTTTACCAACTCTACTGTGTAGCATAAATCTACTGTTCTCACTCAAGATTTCCAGAAAAACGAAAGTAT:1 + chr3R 6586334 3' - hopper 157 1 60.00 AGTGTAGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGT:1 + chr3R 6147328 3' - copia 4895 2 53.47 TGAGATGTGATTAGGGTGAATGCTTTATTAGAACTGAACTGTGTACAATGAACTCCGGAGCGTGAAATGTTTGAAGCTCTTCGTTCTTTTTCGGTAACGA:1 - chr3R 13791677 3' + frogger 43 2 59.00 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCTAATTAACTACAATTTATTTAAAGTTTTATGGGTCCG:1 - chr3L 13312166 3' + mdg1 7407 2 74.75 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATGCTACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAATGATATTAAAAATTCCGTGCCAAT:1 - chr3L 17921223 3' + flea 234 2 50.50 GGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTTAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGTTTCTTGGACAACAATAACCAAGACGGACAGGAGCAGGGTGCA:1 - chr2L 15198925 3' + roo 8785 2 55.45 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATTGAAATCTTTGTTTTCTCGCTTATCTAATTAGGTCAGCTTGGCAGCTATGAC:1 + chr2R 21848630 3' + Juan 4194 1 57.43 GGATCGCAGACGAAGACCACATCAACCTGGTGGATGGGCTCCGTTCGTCGGCACCACTTCTCACTGCGGTGGCTTCGATTTCTATAGTGTAGTTTTGTAAT:1 + chr2L 20302253 3' - aurora-element 3841 1 59.41 AAAAATAATATAGATTTAAAGCCTAAAAACTTCTAAGGTGAAGGGAATATTTTGTCAAATTCACAATGCACATCCCATCAAGTAGATTTCCGCACGATGGA:1 + chr2R 4786521 3' - 1360 247 1 64.36 TAAAGCACAAATAAATTAATTAAATTAAAAGAATAGAAACAAACATAGTAGTTTAAATCGACGAATATATATACATATAAAAGTAAGCGTTTACTTAAATT:1 - chr2R 22605900 3' + Juan 4209 1 78.22 GGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACGTCGAGATAATGCAATTATAAAAA:2 - chrX 16798177 3' - diver 5 2 74.26 TTATGAAAGTAAATTAATAATTAGAGCGGCCTAATTAGCACCTTCAATCGCAGAGTGGGAACTATTATAAAACCTGAACACCCCGGCAGTTTCTGTCCCAC:1 + chr2L 11953749 3' - looper1 234 1 61.39 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGCGAGCAAAG:1 - chr3L 8063841 3' - P-element 38 1 41.00 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTTAAACAAAGAATGTGTT:1 + chr2R 4502525 3' - roo 5 2 74.26 ACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAACTACATTTAACTAAGCGACAAC:1 - chr2R 13144950 3' + roo 387 2 61.39 CATGGCATTCCAAGCTCCTTGTGGATAACGGAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTAGCCTCAGGCACTTGTCCTGACCGCCCCAGTTAGTTAG:1 + chr3R 1865684 3' - G-element 4037 1 78.22 ATCAGGTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTTACATACTTTGG:1 - chr2L 6227651 3' + roo 9039 1 54.46 AGAGANTCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACTGATATATGTACTATTTTTTCTAAGCTGCATATACATATCTATATTTCGATTTAATAGACACTTTATC:1 + chr3R 5054474 3' - HMS-Beagle 6801 2 74.26 AGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATG:1 + chr2R 19357424 3' - jockey 4708 1 59.41 CTCGGTCCCTCTATTATCAACACCAGAAGATAAAAATTCAATAAAACTCGAAGAAATGTAGATTCTTTCAAAATATTTAAACGTATATTTAACCTCGATTA:1 + chrX 22562583 3' + transib2 2396 1 77.23 CTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTAACATTGGCATGGGGCAATCGTACAGGAGTACAGGATCCTTCTTGTG:1 - chrX 4008892 3' - 412 433 2 54.46 TATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCGTGTTATTGCATCAATGTCATTTTTGTTATCTAGCATTCTATTAAA:1 - chr2L 17432018 3' - 1360 3337 1 57.43 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCA:2 - chr2R 19192555 3' + roo 9016 2 83.17 ACCGTGTTTTTGAGATGCGGCCCAAGATGAGCCGTTTATCCACCCTGTGATGTTAAGTTACAATATGATGTACGGATTATTCACTTAATAAATAATAATAA:1 - chr2R 4090258 3' - Helena 938 1 66.34 TCACTNGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGA:1 - chr2L 108019 3' + P-element 2832 1 24.75 TAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTCGATTAGATAAAGTATATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGAATATTTGGAGTTGTTATTGTTT:1 + chrX 22850144 3' + INE-1 33 1 76.24 AACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCGTATACTTATTTTCTCCGACGGGTTGAATTTTAAAT:1 - chr4 725884 3' + HMS-Beagle 6646 1 64.36 GCATTNCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATAGTAGTATACAAAGAAGAGTTAAAAAAGATCCGGAAAAACGTAACAAATAAA:1 - chrX 12729515 3' - gypsy10 25 2 50.50 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAAT:2 + chr3L 14910636 3' + roo 9036 1 63.37 TTCATATTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATATCCATATTTGAGTTGCTGGTAGTACCCCAGAAGTAATGCAAAAATCAAAAGTGGTGACCTCTAAATGCT:1 + chr3R 9674166 3' - G4 3489 1 62.38 CCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAACACATCAAGCACACAACTATAACTACT:1 - chr2L 4189385 3' - 1360 47 1 71.29 ATAGCGACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATTCATCGTATCAGACGTCGCT:1 + chr3R 9837620 3' - 412 56 2 76.24 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATTTCAATTATTCTATGCACTCGCTTCTTTTGA:1 + chr3R 9479522 3' - mdg1 22 2 56.44 AAACTTACTTATAAAATATAAAAGAATTAATTATCTTAATTTAATTAATTTAATTAATTTATCTTAAAAAAAATTTTACGAAATCAAATCGAATTCGGAAA:1 - chr4 958809 3' + Penelope 495 1 43.56 ATAAGTTTATTGCTGGGCTGGCACACACACACATAGGCACACACACACACACACACACACACATAGCCACTGTCATACAGACAATCGCGCGTTGATGCATT:1 + chrX 10440794 3' - Doc 4561 1 76.24 CACACTAGCTGAGTAAGGGCTAACTTGTTCATGAGCTCCCCAATGCGGCTGCAAGAGATTAGAGATATAGATTAGGTATTTTTTCATGATTTTTGATGGTT:1 + chr2R 13156662 3' + INE-1 539 1 72.28 CGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATTGAAATGCCATATGATCTAATCCTTCATTAGATACACACCATATGTATGT:1 + chr3L 9121893 3' + Transpac 290 2 60.40 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTAAATCAT:1 - chrX 18717147 3' + roo 9042 1 56.44 CACGCACTGTAGTTTTCATCATCAAGTTTTTCTATTTGGTTTATTGATGAACTCATTTTCACTTCGATAAGTTTTTCCCTATTAGTTCGAATAGCGAAAAG:1 + chr2R 18802259 3' - Dm88 351 1 79.21 TTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAG:1 + chr2R 6779843 3' - 17.6 6957 1 59.41 TTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGGCGTGAGAGAAGCAATCAGGGAGGGTGCACGAGTGGCCTA:1 - chr3R 11517850 3' - roo 9040 1 60.40 GTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCATATGAGGCAAGAATTAACGATCCTGCACTTTGAACTTTGGCTGGGAACCGATCTCGGTAATCGCCT:1 - chr3L 3341182 3' - INE-1 561 1 71.29 AAATTAAAATATATTTTAGCATGGTGAGGGTGCCTGTAAACGACGTTGCTTTTAGCGCCAGCCAAGGGAAACTCAATTAAATGTGACAGTGAAAACGCTGC:1 - chrX 3307438 3' + P-element 2603 1 79.21 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTC:1 + chr2L 15333781 3' + P-element 2853 1 44.44 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTTACCTACAACTGCTGTAGTTCCCGGAATAACCCGTGCTTTCAATTCCCCAGAAATG:1 - chr3L 8974067 3' - P-element 16 1 65.35 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGCGATGTCATAAATTTTG:1 - chr3L 12085157 3' + pogo 2069 1 60.40 GTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCACCCAAGGAACCTAGTA:1 + chr2R 12213992 3' + Transpac 5198 2 56.44 CTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTACAGCATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTTTTTTGTTGAGATAATTAAGC:1 - chr2L 16082595 3' + Stalker4 391 1 59.41 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCATTGACTGGAAATTC:1 + chr3L 18009646 3' + roo 394 1 64.36 AAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGGGGGGAAATACAAAATGTCTAAGGGGATTTACCAGGGGATTTGACCATTCGGCCATAGTTTAGCAAAGTACGTTGACAT:1 - chr3L 7297703 3' + Doc2-element 218 1 67.33 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTATGAAAA:1 + chr2R 12779178 3' - roo 8678 2 68.32 AGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCACTTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCAC:1 + chrY 3648871 3' + 17.6 7373 2 79.21 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGTTGAAATACATATGTACATAAGTACTTACG:1 + chr3R 25285162 3' - roo 8669 2 73.27 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTTTTTTATGCGTATAAATATAAACATACTTTTGGTTTTCACC:1 + chr2R 20702161 3' - Doc 39 1 61.39 ATCTGTCCATCTAATAGTCGGAGGGCAGTATACTGAGTCAACATTAAAGTTTACTCTGCTTGCCGTCTCGAGATCGTTTGTCGCGCTGCCTTTATTGCTTA:1 - chr3L 3380057 3' - G5A 345 1 62.38 CGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCGCTTGCGCAA:1 - chr3R 27080690 3' + HMS-Beagle 7024 2 78.22 AAGAATATATATACATACATATATAGTATGTATGTATGTATGAATTCATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTATTT:1 + chrX 11541560 3' - 1731 4413 1 72.28 TAATAATAATAATAAAAATAATAATGCCCATTAAGAAGCGAAAACGAGAAGTAACAAGAAAGAATGCTATATTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chrX 15903347 3' + mdg1 7065 10 68.32 TTAATTTTGTTATACAAAATAAGTAGACGTGCCATTTTCTCGCAGTGCAGATATGAACTCACCTTGACAACCTCGCTGGCGGCGAAGGGTTCACGGGATAT:1 + chr3L 11183651 3' + Ivk 5376 1 67.33 GCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACA:1 + chr2R 12446373 3' - jockey 4701 1 56.12 CTACCCAAAAAAATAAAAAAAAAAACCCGTTGCCAAATTGCAAAGGGCGAGCAGAACGAAAACAAATGCAGAACGAGGTTTTCAATGGAAAATTGTTT:1 + chrX 4878765 3' - Tc1 1400 1 66.33 AATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTG:1 + chr2L 16082684 3' - Stalker 6873 4 55.45 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAATATCGCACTGGGTGCCAGTGGTACTGCTG:1 + chr2R 8899392 3' + P-element 2864 1 33.66 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATAACGTAAATGTATGTAAATGTAAATGTTGATTTACATGTACGTAACTTAG:1 - chrX 17247271 3' - F-element 39 1 52.48 GTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGAT:1 + chr3L 5015862 3' - I-element 4961 1 65.35 AATATAAATATACAAATATACATGAACCCACCAAAGAGGGGCCACTGTCCGTTCAAATCTCAGTCAAAAAGATTGTGTTTCCTCGCTCATCCACGATCCAG:1 - chr2L 636997 3' + Stalker4 7046 4 69.31 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGGGGGTCAGCATTGACCACAGCACAGCACAACAAAGCAGAAATGGCAAGCAAACAACCCA:1 - chrX 19297178 3' - jockey 4750 1 60.40 GGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTTTAACCTCTATTAGATGCCTAAAACATAATCTTGTCAGCTAATGGCGAATAACGCTGATTCCGCAGATATATTGG:1 - chr2L 15941324 3' + Transib5 2869 1 54.46 TGGGGATCAGATTAATTTTCACAGCAGACGTCAGTCAGGTCGGACACGAACTCCACCTGCGAGTATCTAGACGCAGAGGGCGATCCGGAGTCCCCAAATCT:1 + chr2L 4850818 3' + G5 4536 1 78.22 GTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTTGCACACACACACACAC:1 - 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chr3R 20466649 3' + roo 365 1 68.32 GGTTGCGCAAAACTCGGGTGCTGAGACCCAGAGATCAGTAGAGATTTCATCTGTATGTGCTGCCTGTCGTCGCTTCTTGGTCTCGTGTGTCTTTAGCCAGC:1 - chr2L 21165656 3' + R1A1-element 5071 1 58.42 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGTTTTCTCAG:1 - chr2R 21379495 3' + P-element 2851 1 43.56 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACAAAAGGAG:1 - chr3R 17121614 3' - mdg1 16 2 62.38 TTAATACCAAAATTTCCGGCTTTTTACCCATAGTGCCTTGGTTAGTCCTGTATTAAGTGTCACAATGTTCGAAAGTGTCACAACAGAATTAAAGCAGCAAC:1 - chr2R 17485783 3' + transib4 2622 2 76.24 CCAAAAAAAAAAACTTTTAAAAAAGAAAA:1 + chr3R 14676543 3' - FB 879 1 82.76 AAAAGTTCAAAAACATAATAAAAAAGAGTAGAAACGCTTTCCTAGTATTGGTACCATAATTTTCGCGCAGTGCACCCTTGTTGTTGCTGCTGTCGGAAAAC:1 + chr3R 22003027 3' + TAHRE 19 1 86.14 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACTTGCCCTA:1 - chr3R 18960408 3' + hopper 1401 1 63.00 ACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACTTATTCTTTTCAGTCTTCAAAAGAGCCACTGATTATTTGAAGACCTGCCAGCTTGAACGA:1 + chr2L 15893781 3' - 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F-element 4356 1 53.47 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCGTTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATG:1 + chrX 2050866 3' + 412 453 2 65.56 CTTTACCCTTTTTTTTTCTTATTTAGGTGGAAACAGGCAGCATTGAGCAGAGTCCCAAGTTGATGGATCGCTTCCGACATGGTCACTTGGATTCGGATTAT:1 + chrX 11826908 3' - Bica 338 1 71.29 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTACGAGTTTGCTGCGCCGCATTTGTTTCATATTTTATGCATTCATACAAATTTT:1 - chr3L 22540114 3' + roo 318 2 47.52 GCGAGCGGACAGAGAGCAATTTTGGCCCACATTGAAAAGTGGCTGCTGCGACTCCAGGCATGTAGAATCACCCTTATCTTTAAGTCCGTGATAGACAACAT:1 + chr2R 2945041 3' + 1360 3309 1 77.23 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTG:1 - chr3R 7100971 3' + pogo 2089 1 63.37 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAACCTTACAAACTG:1 + chr3R 19657523 3' - roo 8674 2 63.10 TCGCGCTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAG:1 + chr3R 28326743 3' + P-element 2836 1 31.68 AAAAAAAAAAACAACAAAAAATTGAACAAAAAGTAGGGGCCGAATAAATAATCA:1 + chr3R 31040111 3' - 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1360 3262 1 73.27 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAATGACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGGAC:1 + chr2L 18953117 3' - copia 4887 2 62.38 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCACCGCGATGTTGGCACACTGAAAGAAAATGGCCAGGCATTGCGATCGAATCTGATTGATTTCAAAAGAA:1 - chrX 6458145 3' - blood 7 2 74.26 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTC:1 + chr3L 15638308 3' + roo 392 2 62.63 GCTTAAATCGGATTGTATATAACTAAGTTAAGTTTCAAAACTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTGAGCGGCACTGTAAATGATATCGTTCAGCTTTC:1 + chr3R 3589848 3' + Tc3 1662 1 73.27 TTTTTTTTCCTATTTTTTTTTCTTTCCACCTTTTCCGACTTTCTGGACCACCAACACATTCGACCTTGGACGAGCAAGGTGTTGAATAAATTATTATTGG:1 - chrX 3459096 3' - Doc2-element 250 1 72.00 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCGTCGATCGCT:2 - chr2L 12074485 3' - Juan 4045 1 56.44 TCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGGAAACAATCAGGTACCGAAAATGTGAACTCTTACAATATATTTTACCTCTTTTTCATCTTAAGTTGTTT:1 - chr2L 8740853 3' - 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roo 8674 2 69.31 CAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGAACGTCTTCAAACAGCTCTGGCAGTTAA:1 + chr2R 8464502 3' + 297 6880 2 73.27 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCAT:1 + chrX 6654762 3' + P-element 2843 1 36.63 GTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATATCATGCACAGTAACACAAACGTTCATTTTTTGAGTGCCATTTTGAAAAACAA:1 + chr3R 20848485 3' + Bari1 1683 1 55.45 ATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATGCTATATTGTAGGATGACTTTTTCATTGAATTGTTGAATCGA:1 + chr3R 21848171 3' - rover 6977 2 59.41 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCATTTGAGTGGTAACTAGGCTTTGTGGT:1 + chr3L 11654588 3' + pogo 2055 1 76.24 TCTTTTTGCACAGCCAAAACGACACGAATTTGGCTGTAGGCAAAGAAGAAACCGAAAACGGTGGAGATGCTGCAGAAAAGGAACGCCCTGATAAGCTCTGG:1 + chr3L 1297508 3' - G3 11 1 66.34 GCAAAAAAAAACTTTTTGCCACGCCCAGTCTAGCTCCCTACAACCGCCATAAACTGCGGGGCGTGGCCAGTGGGTAAATATGCAGCAACCATAATAAATAA:1 - chr2L 2931207 3' + INE-1 324 1 55.45 ATCTTNCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCAAATTATACTGTATCTCGAACTTTGTTTTCAGTGTATAACTGATAAGCAATTCAACTAAACAGT:1 - chr3L 14049976 3' - pogo 27 1 47.52 TTTTTATTAATTTTTATTTTTTATTTAAATAAACTTATGAATTTCGAAGCAAATCCATTTTTTCCGGTGCAATTGTAGGGTTTTTTATATAGTTACTCGCG:2 - chr2L 16548429 3' - Doc 4690 1 77.23 GGCATNCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTTCTTATGTTCGAACTGAATCTAAAAAGTTGCTCAT:1 + chr3L 20895052 3' + invader3 201 2 59.41 AAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACCAAAGCTAAATTACATAAATGCATA:1 - chr3L 7989718 3' - mdg3 5264 1 71.29 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACCACACACAAACACACACACGCACATACAATATATATACACACTATTGAGTCCTGTGAGTGCGACGGTG:1 - chrX 7828858 3' + 412 486 2 71.29 CCCTGCTTGTCGGAGCAAAAGGGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGAGGAAGATCCAACCCGAAATATCCATTGTCAACTGGGCGTTACG:1 + chr2R 8173360 3' + R1A1-element 4893 1 56.44 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACGTA:1 - chr3R 25823635 3' + hopper 1395 1 55.45 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCTGCA:1 - chr2R 20838593 3' - 1360 20 1 58.59 ATATTAGGATCTTCCCATTATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAATAAACAACACAAAATAATCGTACTACTATTATCACAGAAACAGG:1 + chr3R 433124 3' + 1731 4583 2 63.37 CATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGGATATTGCTCCACTGTCCCACTGTCCCCTGCACATCATGTGTTGCGATTATTAATT:1 - chr2R 21136465 3' - Stalker 6870 4 49.50 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGGTACTTGCTGTCAGGTATGAA:1 - chr3L 21708593 3' - roo 16 2 63.37 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCACGGGCGCCCCAAAGCTGGCAATGAAATATGCGA:1 - chr2L 7170365 3' - jockey 4621 1 56.44 GTGGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTAGTTTCCTTATAGTTA:1 - chr3L 27181997 3' - F-element 260 1 56.44 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAAACTTGTTTTCAA:1 + chr3R 13715174 3' + P-element 2881 2 73.27 CAACCAATAAGTAAACTTAAGACCACCCTATGTTTTAGTTAGAGAAACAGTGAAGACCTGTGCTGGTTATGCCAAGTTAAGAGTATTTTTAATACGGTTTT:1 - 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pogo 47 1 78.22 TAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTC:1 - chr2L 11047997 3' + Juan 4162 1 78.22 ATAATAATAATAATAATAATAATAATCGATGGATGCAGTCGTTTTCCTTTAATCTGAGAAGATCCTTTTCTTGACAAACAGTCGTGTTGCCGATAGATAGA:1 + chr3L 24368142 3' + mdg1 29 8 76.24 ATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGTGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAAT:1 + chr3R 9952250 3' - Ivk 28 1 54.46 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTATGATCCTTACA:1 - chr3R 25633312 3' - Tirant 8120 2 68.32 GCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGGACTATATGTAGGGGTACTATAAG:1 + chr3R 1977620 3' + micropia 5409 2 54.46 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTCACCTCCTTGCATT:1 - chr3R 10457253 3' + roo 396 1 66.34 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATT:1 - chr3L 27729217 3' + 1360 1 3 66.34 AATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATATATATATGTATAGGATGGGGCTGCCGGCTGTCTTAGTTCTC:1 + chrX 14368247 3' + Quasimodo 7340 2 69.00 CCACAAGGAGCTTGGAATGCCATGGGTAGAAGAGGAAGAAGTCGAGGGAAAAAAGTGGGCAAACTAGTTTTTTGGTATCCGAGCATCCGTTGGCTCAGGTT:1 + chr3L 16478848 3' + G-element 4035 1 76.24 TTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAAGTTCATGCAAAAAATATTGCATTATGCTGTGGTTAATACTAAG:1 - chr2L 15893700 3' + Max-element 265 2 57.43 GTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGT:1 - chr3L 19951225 3' - Ivk 57 1 81.19 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAAT:1 - chr3R 9981520 3' - jockey 4815 1 78.22 AAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTACGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATC:1 + chr3R 973197 3' - Rt1a 14 1 58.42 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAG:1 - chr2R 3188684 3' - 1360 36 1 62.38 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCAAATGCTGAGCCGTGTGATTAGGCGGGGTGTCGTCG:1 - chr2R 9634431 3' + mdg1 366 2 64.36 TACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACGATCTCTACCAAGCTGATAAGCAGAAAAAGGTAAACAAACGAATTAATTTTAC:1 - chr2R 1395445 3' - gypsy 20 2 57.43 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGAATCA:1 + chr3R 14688327 3' - pogo 22 1 50.50 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACA:2 + chr2R 19936673 3' + roo 9029 1 65.35 GACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCTGATTCGAGTTCAGATTCGGAAAATTATAATGTTGAGCTAGAACGTTTGCCCGCGGGCTTTTCTTCCTCATC:1 - chr2R 22376548 3' + transib2 2520 1 71.29 CCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCAGGTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTA:1 + chr3R 25554217 3' + R1A1-element 169 1 61.39 ATCACNATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGC:1 - chr2R 17394646 3' - jockey 61 1 73.27 TATTTCATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGTAACATTATCGATAATATAGTAATTATTTTTCATTATGCAACTCAATGTGGTTTCAG:1 + chr2L 13739999 3' - 412 7071 2 61.39 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGT:1 - chrX 4796954 3' + copia 218 2 63.37 CTGGGCTATTGATACTGATCAAGAATATATAAACTTTATATGGTCGTAAACAGCTTAATGCATATATAATTGCCAGTTCTTATTTTATTCAATTATCGTT:1 - chrX 307528 3' - 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chr2L 11468508 3' + invader6 10 2 55.45 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTCGATTAAATTTTGGTTTTTAATTTTAGTTTAATGTTCTCTGGGTTGAAACGCTTCAAACGCAT:1 + chr2R 13145047 3' - roo 8678 2 63.37 GCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACGATCTCTACCAAGCTGATAAGCAGAAAAA:1 - chr2R 1395469 3' - gypsy 7031 2 70.30 AATCTATACCCACCCTACCTGTGAAATCCATTCGGACTCCATCCTTTTTCCTCGCATTCGTCATCGATGTTCTCCAGCTCGTTAAGGATCTTTTGGGCCTT:1 + chr2R 6732146 3' - Circe 7196 1 57.43 GTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTAATGAAAATAAAAACTGTGCCGCGAGAGGGAGTTGGGAGAGCAGAGTGTGGCGAACAGAGAGAGCGGAGC:1 - chr2R 8272799 3' + P-element 486 1 65.35 TATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTCGCTTCTTTGT:1 + chr2L 21007083 3' - Idefix 24 2 58.42 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCCTGTGAATCG:1 - chr2L 11065849 3' + P-element 2875 1 69.31 TGTTAATCAGGATCAATAGCCGACTAGATATAGCCATTCTAGTCATTTTGTTCATCAATATCTATCGACATCAATTATTTTATCGTGTGGAAAATAAAACT:2 - chr3L 11887689 3' + INE-1 88 1 72.28 AAATTATTTAAAAAAAAATAAACAGTGCTTAAGCCGCCGCGAACCGGGGAGTCGGGGAACTGGAGTGGAGTGGAGTGGATGAGCGGTGCATGGGAAATGGA:1 + chrX 1712337 3' + TART-B 10628 2 42.57 CGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACCTTATATGGTCGGAGACTCTTCCTTATGGGTCAAGCGGAAAATTGATTAATTGCCGCCTTGGCTTCA:1 + chr2L 12822081 3' - INE-1 88 1 60.61 ATTAGNCCGAGGTAAACTTAAAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTGTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAACCTTGTCATCGTGTCCGAAATGGTCA:1 - chr3L 20491455 3' - FB 278 1 71.29 CCTAACAGATTTTCCCAAATGGAGATTATAAAAAATCAGTTGAACTACATTAAAACTCAATCTTTTGCTGGAATTTCTGAGATGGCCATCTTTGGCAATCG:1 - chr3R 14292941 3' - S2 456 1 70.30 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTAGTTGCCTTGTTAGTTACGTAGCTTTACGCTCTT:1 + chrX 21401938 3' - roo 8677 2 62.77 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTGACAGCTGTTATGTTGAG:1 + chr3L 19215883 3' + roo 397 1 69.31 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCTACCGAAGTCGCCGGGCACTACACAAAAAATTATTTTAGACTCATTAGA:1 - chr3L 3090871 3' + P-element 2863 1 53.47 CAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGT:1 - chr3L 11909944 3' - Tabor 43 2 69.31 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTGTTCATATAAATATTTCAGTTTTATTTTGGATTAAAGCATCGAAAATGTATAGTTT:2 + chr2L 16933671 3' - 3S18 5786 2 58.42 TAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTTTAAACTTTGCTGGTGGTTTTTAACTTTTTTACTTTTTT:1 + chr3L 10314108 3' - HeT-A 7 1 64.36 GCTATNCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGGGCAAATAACGGATGGA:1 + chr3R 19191545 3' - Doc 38 1 65.35 TGGGTNACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAAAAAAGACCTGGCATTGACAACCGAATAGCGGAATCGAGTGAAAAG:1 - chr3R 18507822 3' + jockey 4970 1 47.52 GAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTATGCCCCACGCCTGTTGCG:3 + chr3L 5015894 3' - I-element 4929 1 68.32 GCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAAAACCTATTGTGTCCAGCAAATACCTAAAATAGTATAGTTTATGAAC:1 + chr2R 1866811 3' - Cr1a 4229 1 57.43 AGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTAAGTATAAATTAGTTTGTAAGCCAATATGGCATTATAGTTGCTTGTGAATGA:1 + chr2R 13605623 3' - I-element 25 1 50.50 AATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCCCCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGGAGAAACTTCGCTTTCAGCACA:1 - chr3R 19114197 3' - 297 18 2 57.14 CACACACACACACACACATATGAAACCAACATTTTCATTGCTTTGCTAAAGTACAGACTGGCTAATTTATGGTTAAGCTGTAACTTTAATGAATAGAAATA:1 - chrX 21069998 3' + accord 7030 2 72.28 TGGCGNAAATAATGAATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTTACTGGCCACCCCCACCGCGCATCCCCCTCCACTTTCCACTGATGGGCGTTGAGTTATGAA:1 - chr2L 11584211 3' + micropia 95 2 58.42 ATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTA:1 + chrX 13134957 3' - jockey 4824 1 74.26 TAATTGGCGCCCAACCAGTGGTAATTACACCACGACTCGAAAATAAAAAAGAACAGATCTAAAACATCATGATAAGTACTATGCATATGATCGAAAATGCA:1 - chr2R 962728 3' + gypsy2 349 1 69.31 CGATCTTTTTGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATTGAAATGCCATATGATCTAAT:1 + chr3L 9121864 3' + Transpac 5192 2 76.40 GGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGTTCCCTAGCCAG:1 - chr3L 14240799 3' - Tirant 8114 2 74.26 GTTAAGGGCTTGAGCCCGGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCCCAGTAAACTGACTTTCGTTGAACCCTCATCTAGGGGT:1 + chr2L 5796481 3' - I-element 157 1 62.38 GATCAATAAAAATACTTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATTATTTATTATAAGAAAATAAAACCTTCCCCTCTAG:1 - chr3L 23688540 3' + Quasimodo 7336 2 69.31 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAATTAAATCTTTCTTTCTTTTCGATTCCTA:1 - chrX 14713184 3' + flea 243 2 71.29 ATTAATATTATTATTATTATTGTTTTTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTTGAAGGGAAACGCT:1 + chr3R 12877862 3' - mdg1 7074 2 64.65 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGACGAATGGAGAACTGAACTGGCTTAAAAATCGTGGCGCGATTATATCATATTGTAGTCGCC:1 + chr2R 9455000 3' + opus 7461 2 62.38 ATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCTTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCA:1 - chr2R 981616 3' - Tc3 236 1 74.26 ATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCAGTGCTCAAAAACATGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTCGCTTTTTCTATGTAGAAGTA:1 - chr3R 19449993 3' + roo 89 2 54.46 CACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACCCCCCGGACTATCTAATCGCATTCGGTTCGCAGATCTTTTACTTGTGCTGAACATGCCATCGATGTTAACA:1 - chr3R 24152832 3' + P-element 2886 2 78.22 CCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACAGAAAGTTCTCAAAAAGACGTAAAAAAAATTGAAATAAAACAAGAAGGGA:1 - chrX 12239189 3' + accord 6992 2 58.42 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTGACATTATTTGAATTG:1 - chr3R 19467857 3' - Transpac 15 2 65.35 TGGAGCAACTTTTCAAAAAACACAAATGTCAAGGTGGTGTGTGGAATATCCTGGCGACGTCATCGCATGTCCTTCGCAGAAACGCCCATGTAACCTTCTG:1 + chr2R 14170767 3' + 1731 312 1 60.00 GTCTTAATTCATGCAGAATTATGGGGGATGGTTACCCGTGTGGTTCCATTGACAATTTCATTAGCTTGTCAGGCGCAAGTTTCCAGTGGCGTAATGCCAGG:1 - chr3R 8585877 3' + Dm88 392 1 76.24 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAAAACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGTTAGTAACCATTATTTGTAGCTTGCTTA:1 - chr2L 14260720 3' - 297 15 2 65.35 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTA:1 + chrX 21401905 3' - roo 53 2 81.19 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCCGCCTGCATTCGGCTGGCGGC:1 + chr3L 8063877 3' + P-element 2841 1 27.17 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAATTTTATTGT:1 - chrX 7787231 3' + roo 9038 1 57.43 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATAACAATATAACTTAAATTTATTTTCTAATTTGTTATCTC:1 + chr2L 1129141 3' + HMS-Beagle 7010 2 64.36 CATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAATCTTCTCGCCGTACAATGCACGGCACCGCCCCTCGGTCGGTTAGGCGGGAGGTGTGGGCGCCGCTCTTGGCCATCG:1 + chrX 19668058 3' + Cr1a 4368 1 74.26 TATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATATAGATGGGCCTAACAGAAACCATTATTCCTTTCGGTACCCTTTGCCATCTTTTGAGAATTTAGATTGTG:1 + chrX 20391140 3' - rover 2 2 74.26 GCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGCGGCGAGAGCGAGCGAAAGTGCCGCGAGAGCGTGTGAAAAGTGCGGCAAGAGCGAAAGTGTATCGGC:1 - chr2L 7249512 3' - blood 187 2 73.27 ACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATAAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAG:1 - chr2L 13447110 3' + HMS-Beagle 217 2 57.45 TGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACGGAAAGTCGAGTTCCTTGAAATATTTATTTTATATTACGCTCTTC:1 + chr3L 1090999 3' + I-element 326 1 55.45 CGTAGNTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAG:1 - chr3R 9952207 3' + Ivk 5326 1 63.54 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAAACTTGTT:1 + chr3R 13715169 3' + P-element 2876 1 68.32 GTTTTNGTTGCGCTCGTGGACATATTGCGAAGAACTTAGTTTTCCGAGAGTCAGCGCAAATCTGTTGAAGAGCAGCCCCACCAGGCTAAATAAAACCATTT:1 - chrX 17248382 3' + R1A1-element 8 1 60.40 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGGCTGCTGCCTAAGCTGATTTGT:1 - chrX 12538446 3' + roo 9046 1 53.47 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGTTTTCTCAGTGTTCTCAGCGTTTTTTCCGCTTGCAGTGC:1 - chr2R 21379465 3' + P-element 2881 2 73.27 GGAAGGCCCTATCAACCTGCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTGCACATTCTCTATCACCCAAGGAACC:1 + chr2R 12213987 3' + Transpac 302 2 58.90 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTTGAAGGGAAACGCTCCTTTTTCTCCGTGTACCAGTTTGCTTTT:2 + chr3R 12877891 3' - mdg1 7047 2 70.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTGCT:1 - chr2L 326116 3' + roo 392 2 62.38 TGCCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGCTTGTGACTCTGAATGACGCCGGAAGTTTTATTGGTTTTGCACACGTCAACGAAATGCTGATCGCGG:1 - chrX 12292741 3' - blood 382 1 74.26 GACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAGTCTTTTATGATTAAACTATGCACTTTAAATCCGCAAAGCCGACTATGCATTT:1 + chr3L 6129878 3' - jockey 4696 1 57.43 GATATAATAATAATAAAAAAAATGGGCTAAAGTCAGAGTGGGGTTGGTGGGTGGGCTAGATGTTATTATTTTCGGTAAGGTAGGTGTGTTTCGATGTTTCC:1 - chrX 17167796 3' + Rt1a 5070 2 86.14 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCAC:1 + chr3L 15638287 3' + roo 9033 1 70.00 GTGCTCGCTGGGTGAACGATGAAGGCAGATGTATACTGAAGACTTATAACTATTGTCCACAGGTGCCGGAGATGACGCTGCCATGGTTGTCGTAATGCTGG:1 + chr2R 12372350 3' + Bica 63 1 55.45 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATG:2 - chr3R 7100993 3' + pogo 2067 1 63.37 TCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGT:1 - chr3L 10035649 3' - jockey 60 1 76.24 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGATGTTGCAGCATCCAAAATCTGCT:1 + chrX 6458255 3' + blood 368 2 67.02 TAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTACGAATGCTATTCATT:1 - chr3R 4543207 3' + 3S18 291 2 75.26 CGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTCCCGGAACTCTTTACTCCTGGTTCCTTGGGAAATAGAGTGAGGATAAGACAACGGCC:1 - chr3R 14169215 3' - blood 7010 1 76.24 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCACATAATTAATAGTTATTATGGCTACGCATTTTGGCTTATAAAACGCATTA:1 - chr3R 22277126 3' - 297 6596 2 65.35 TGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATAAGTTATGTATTTTTCTTCAGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCAGT:1 - chr2R 924427 3' - springer 7154 2 60.40 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGACGTATGAGTGAC:1 - chr2L 17210092 3' - jockey 4707 1 59.41 TCCTTNCTAGGCTGTTGGGGTGTACATAACATTTTTATGGCAAGCATTTTAAGGCCCCATTTAAATAGGCAATACTTAAAAATATGACTAATGAAAGACAG:1 - chr2L 18513552 3' - jockey 4673 1 25.74 AAAATTAAAAAAAAAAATTAAAACAATTTTTAGAAAAATTTCTTTTAATTTAGTTCGTTAGTTTCTAACAACGTTAACAACTAGACAACAATGTTTTTGCA:1 - chrX 9202095 3' + Doc 4698 2 34.65 GCATCACATCCTGCTCACCGATGAATTACTTTGACTGGCAGTCCCGGATCAGGACGAGAGTGTGGGTTATTGTAATGCCATTAGGGCTTAGCGTGACGGAC:1 + chr2R 20041336 3' + Rt1a 4888 1 61.39 GCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAAAACGTTAGCGGGTGTGCGACAA:1 - chrX 328977 3' - opus 2 2 77.23 AGCATTAAAATATCAATCACAAAAATATTACATTAATACCAAAATTCCCGGCTTTTTACCCATAGTGCATTGTACTCTACAACTAGTGGATATAAAGCTAA:1 + chr2R 5144529 3' - transib4 47 1 69.31 AATTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGAT:1 + chrX 8958638 3' + Doc 4700 1 78.22 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATTGATTGGGGTTCTGCAAGTACAACTGAAATA:1 + chr3R 17121688 3' + mdg1 7418 2 68.75 CTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTCCGGTCACTTTGGCCCATGGTGCAACCAGTGAAATAA:1 - chrX 13141390 3' - Tabor 6885 2 63.37 ATGTGTATGGATACGCCAGACAAGCGTCTCCGGATTCAGCTGATAGTGTCGATTCCTCTTGTAGTTGAACTTGGAGATCTTGCAGT:1 - chr3R 25980741 3' - R1A1-element 5230 1 70.93 TTGTTCGCTGATGGACAAACTTGAAAATCCAGGTGATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTTGTTCTTGACGGTGGGAGGGGGTGGGGGTGGGG:1 - chrX 1581769 3' - GATE 307 1 67.35 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAA:1 - chr2R 6984308 3' - HMS-Beagle2 16 2 63.37 TATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGATGTTCCGAAGGGCAGACACTTGACTCGGGATGCTGGCTG:3 + chrX 4488968 3' - 412 1 2 78.22 CACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTG:1 + chr2L 11686049 3' - hopper 106 1 47.52 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGC:1 - chr2L 15333734 3' - P-element 47 1 32.67 ACACGNCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAA:1 - chr3L 21735371 3' - Doc 17 1 65.35 AGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGCGTAAAAAATCTAAAAATTAGTTTCTTGCACGAATCGCTTGATTTTTGCAGTAGTG:1 - chr2L 10320416 3' - 1360 3320 1 66.34 AATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACTTATATAATTTATATTCTTTGCGTCAAGCTGCTTACTTAACATACCCTCTCGTTAAAGTTTTCAATACTACTT:1 + chr3L 23869167 3' + gypsy 445 2 62.38 AATCATTTTGCAACATTTGTGGTTTATATTTCCTCAGAGAATTAAAAAAGTTTAAAGTAATCTAATGAAATGTTAGTCCGCGATTGATAAACATAAACTAA:1 - chr2R 8590854 3' + transib1 206 1 57.43 GGGTTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGCCTGTTTTTCCGCCTCTTCTTCTTCTTCTGCCAGCCCGTCTTT:1 + chr3L 11298249 3' - I-element 140 1 57.43 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTG:1 - chr2R 6984347 3' - HMS-Beagle2 6938 2 80.20 TATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATAACCTTAACCTAAACAGC:1 - chr2R 6779742 3' + 17.6 7416 2 75.25 GTAACACTGCAATAACGAGTGCAGTGACCTCAATGGCAACTGCCACTGCTACCACAACATCAACTTCGTCATGCTAATTCATAAATCTCAATAATTAAAGT:1 + chrX 21085550 3' + Doc 490 1 68.32 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATT:1 + chrX 12538505 3' - roo 8712 2 74.26 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCAT:1 + chrX 12538504 3' - roo 8713 2 75.25 GAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGGGCAAATAACGGATGGAAATCAAACTGTCAC:1 + chr3R 19191559 3' - Doc 24 1 54.46 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCAGGACTCACCAGCGCTCTTTGCTGCTCCCGCTGCCGCTGCTTTCTGTCAGAGTTATAGA:1 - chr3L 11829939 3' - P-element 18 1 48.51 AACCANGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTTTGGGGCCGTG:1 - chr3R 29384331 3' - jockey 4768 1 70.30 AATATGTATATATGTATATGTATATAATATGTATATTATAAAATACATAAAAAAACAAAGCATAATTTATTTTGCACTTTCCTGAATGGCTTTGGGAAATT:1 + chr3L 19784673 3' + G3 4506 1 59.41 CACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCCGAGCGAACAAAATTCAAATTGAAATCAATTTCAATTTAATTTGTTGTTGCCAAACAACACAGCAAA:1 + chr3R 24570347 3' + Stalker 326 4 72.28 AACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGTTTTG:2 - chr2L 18177032 3' + INE-1 553 1 64.36 CGATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACATCAAGGGGC:1 - chr3L 11909929 3' - Tabor 28 2 52.48 ATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGACTTGGCTTTGGCGAAGTCAATAAATTTAGCTTGCCA:1 + chr3R 16626869 3' + I-element 5347 1 67.33 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCGTATCGACCGAAAATAAAATCCGTTGCAATCCAATAACTTTTTTGAGATTTTACCGTATGACTTT:1 + chrX 21388629 3' + 1360 3382 2 45.54 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAGCTATACAATCTAGGACAAGTTGGTATTAAATTGAA:1 - chr3L 11461348 3' + copia 250 1 60.40 CATAANCATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGTATTTTTGATATTTTGATCTTTTGTGTTCGACCGCCCAGGATGCAAATGCAATTATAATTTCATA:1 + chrX 9547533 3' + R2-element 3411 1 62.38 TTTATTTATTTTAATTAATTTATCAATAAAAAGTGTCCCTCCAACATATTTATAAATTTTCAAATTATTCAACATTTTCTATACACAATTTTTTCCAGTGC:1 - chr3L 12460846 3' - jockey2 3407 1 62.38 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTTTGTTTCTCGTGCAAACTGCAACTTTTGCAGGACTTCATTTGAGACCCACGAGTGGGCAACAACA:1 - chr2R 21401160 3' + roo 398 1 64.36 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGTGCAACCGAT:1 + chr3L 13312220 3' - mdg1 7063 2 54.46 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTAAACAG:1 - chr2L 15333704 3' + P-element 2881 2 67.78 ATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATATCAATTCTGATCAAGAATATATATACCTTATATAGTCGGAAATGCTTTCTTATACCTG:1 + chr2R 2947138 3' - 1360 3211 1 56.44 GCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGTAAATAAAAGCCTAACCGCAGGAATATTAATTGAGTTTAATCAATCCATTC:1 - chrX 20798566 3' + Doc 4546 1 55.45 CACGAACACATACACACACACACACTCACACTCACAGAGAGGCGATGGCGATGGCGACGACGTTGACGGGGCCAAAAACTTTAATGTGGCATCAGCAAATG:1 + chrX 14979306 3' + accord 7026 2 28.71 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCG:1 + chr2R 24965127 3' - P-element 36 1 43.56 ATTAGCCTAAGTCCAAATATATAAGAAACTGAGAATATTATTCAATAATTTTAATATTCCAAAATGGTTCTCAGCTCGATTGCCTTCCTTGAATGGGACTT:1 + chr2L 13738677 3' + 412 332 2 76.24 GATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTAC:1 - chrX 21668083 3' + Stalker2 7601 2 68.32 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCTAAAGGACACAAGAAACTAATAT:1 + chr2L 8542888 3' + P-element 2835 1 27.00 AATTTCTCTAGAAAAATCTAAATTCTTTAAATTAGAGACAGCATTTCTTGGTTATATTGTATAAATTAAGAACGAAAACAAGACCCACGGAGGGCAGCTGT:1 - chr2R 1892090 3' + TLD2_LTR 140 1 59.41 CCAATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTCGGTATTACAGCGGTGGTCCAGATAATAAGGAAATGTGTCAACGGCAGTTGCAAGTGCGGCTCTGCTTTATGAGCC:1 + chr3L 5384326 3' + hopper 141 2 59.41 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAGAACAGTTATGT:1 - chr3L 5975577 3' - hobo 17 1 63.37 CAGGATCAATAGCCGAGTCGACGATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAAGTTGTTCTTCTAATTCCACTGAAACCA:1 - chrX 720761 3' + INE-1 95 1 72.28 ATTGTTCCCAATGTTCNGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTANCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACAT:1 - chr3L 11909937 3' - Tabor 6875 2 56.44 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGC:1 - chr3R 29384375 3' - jockey 4812 1 74.26 ACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTTAACAATCTTATTCAGTTAATTACCATATTTCTTGTCGTATCATTCAAAGAGTTTCCACTGTATA:1 - chrX 16617109 3' - Idefix 164 2 58.42 ATTATTAATTTTATTATTGTTACCTCGACTTTTGTCGTTCTGTCTGACTGCAGGAGTATCTGGTGTATGGGATATGACGATTGCTATCGATGTCAGCGATA:1 - chr3R 12306738 3' - mdg1 39 2 78.22 GTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGA:1 - chr3R 7522292 3' - blood 23 2 56.44 AAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAATTTTATTGTGTTGGTATTTACAAGTATTTGTTTCAGTTA:1 - chrX 7787201 3' + roo 405 1 73.27 CGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCATTCGTTTGCAAGTGGCACATTTAAAAGTAACTACGGTAGCT:1 + chr3R 27412508 3' + 412 460 2 57.43 AACTGGCAAATGTGGGTGGTGTATGTATAAAAGGTAGAAATTTGTGCTAAATGAGAAACGTAACATATGGTACTGATTTTTATACTGAGAACTGAGACTTA:1 + chr2L 20750349 3' - copia 4793 1 54.46 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTATTGAAATCTTTGTTTTCTCGCTTATCTAATTAGGTCAGCT:1 + chr2R 21848617 3' + Juan 4181 1 62.38 CTAACNATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATAAGGCCACT:1 + chr3R 7101083 3' - pogo 12 1 67.33 AGGCAGTAGTGATCCATTAATCCCTTCTACATGCTCTATGCATAACATGTTGGAGGATAATATAGAAGTTTACTATAAGAATGATATTCCGCCTATGCTGG:1 + chr3R 5442794 3' - G4 3765 1 51.49 CGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACTTATTCTTTTCAGTCTTCAAAAGAGCCACTGATTAT:1 + chr2L 15893757 3' - Max-element 8276 2 67.33 AACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAAC:1 - chr3L 5716886 3' + copia 5084 2 70.30 ATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTT:1 - chr3R 15157604 3' - invader3 5236 2 58.42 TGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACACTAGCGAAAACCT:1 - chr3R 28883384 3' + HMS-Beagle 201 2 71.29 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCA:1 - chr2R 9862218 3' + roo 9032 1 68.32 TAAAAAATATAAACATTTAATAATTTTTTTTCCACCTGCAATAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATAACTAATTGTGTCGTATATCATCATCATGCG:1 + chr3L 10381599 3' - Tc1 63 1 54.46 TGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTCACCTCCCATCGCGTCCAGTTGGC:1 - chr3R 18831007 3' + Stalker4 7289 4 76.24 AATCCNACAGACATAAACATCCGCAGCCGCATTCGCGCAAAGGAGCAACCTCAACGTTTACAACCGAAAATTGGGTTAGACCACTCGCTCTGTCTAAAATC:1 - chrX 14984206 3' + Quasimodo 7023 2 64.36 ACAAGCGAGGAAGAAGATTTCGACGGAAGCAGCAGTGTTTAAAGTTCTTCTCTACAAGCTGCCAGGAGGAGCCCGTTTTGTTGATGTACCTTAGCCAATCC:1 - chrX 6046587 3' + invader2 453 1 73.27 GGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGATGAGATCTCGGAAATTTGACACCCAACATAGGTTTGAGATTCTTCCTCGAAAATCGGAATATTTGTGACCTGTGG:1 - chrX 6558616 3' - INE-1 150 1 65.35 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTCTAACTTATAATTTATATAAATTTCATGACTTTAGTTTCCTCTAT:1 - chrX 20974847 3' + opus 476 2 60.61 AAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTCACAGTTTTTGTAAGTAGGTGTGTGTGTTTGTGTGTGAGTGTATTTTTAAGTTAAACTAATATTTATTCGTAT:1 + chr2R 22993808 3' + opus 499 1 80.20 GTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCCACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCAGAGTAATCGATGATTTTCATAGCTCAACCACCT:1 + chr3R 4648582 3' + mdg3 5237 1 66.34 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCATTGACT:1 + chr3L 18009638 3' + roo 9049 2 56.44 TATTAGTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGTGCAACCGATAAC:1 + chr3L 13312223 3' - mdg1 22 2 57.43 GTTTTAATAATAATTATTAATATTTTGGAGCTGTGTGGTGAATCTCTTGTAAAAGCATTTTCTCTTTTGACTCTCGCCCACTGTTGGGTAATTCGATAGCT:1 - chr3R 22198451 3' - BS 318 1 58.42 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATTAGCAAGTTCAATGAGTGAATTTTAAGCAAACATCAAGTTACGTAGGTGAAGAAGTTTATAA:1 + chr3R 19467964 3' + Transpac 5217 2 67.33 GAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACGCACAAAGTGATAGCAGACACATGCAACAGCGTTCGGCATCAGCTGGCGGCGGCCTGGGCGGCGACCTTGAC:1 - chrX 13883257 3' + 1360 124 1 59.41 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTA:1 + chr3R 16626826 3' + I-element 5304 1 81.19 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTTACCTACAACTGCTGTAGTTCCCGGAATAACCCGTGCTTTCAATTCCCCAGAAATGCCCCTTC:1 - chr3L 8974060 3' + P-element 2884 2 76.84 TGTTATTAAGAATTTGCATTTTTCGCATTTAATTACATTTTGACGTTTAATTAAATTTATTCAGCGCAAAATAGATTGTCATTGGCAGGAGGTCCTGGTGA:1 - chr3R 27972196 3' + G4 388 1 77.23 GCGAANTAAACAGTATCGTAAAATAAACAACTACAACGTTTAGGACCTCCAAGTAACTATGTCACTTGTTGGGCCTCCCAAACAGTTAGTCTAATCTAAGC:1 - chr2L 15261416 3' + diver2 4830 2 72.28 GTTCANCTAACCCGCATATACAATGCTTATATCTAATAACCTAAACCATGGAGAACTTTCTCGTTTGCTGCCTTAATGGCTCCATAAATGCTGGCCATTTT:1 + chrX 3450936 3' - Stalker4 7250 4 72.28 CCTTANTCAACTGACGGGACATTAGTTCCACTCAATAAACACAAGCATTTCACTATATATATATCTTTATAATTCTCTAAAACTCGTCTATCGTTCATTA:1 - chr2R 4788807 3' + 297 6940 2 70.00 GATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATGATGTATTGAAGATAGTTTCATGCCAACCGTTATAATTTTTATTTCGATTTTGCAATGGACGA:1 + chr3L 27680865 3' - F-element 25 1 62.38 GCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGATA:1 + chr2L 17957309 3' + opus 476 2 57.43 TCTATGATTAGACGGCCCTAATAATTTATTCGCTCGGTTGGGTGGGTGGTGGGTGGGCGAACCTCCATCATTTGCCCCGCCCCAGTTGGTCGACATTCAAC:1 - chrX 18741634 3' - F-element 4557 1 45.54 GTTTTTATTTATTTTTTTTTTAACCCTTGGTCATTCAAAAACCGTTTTCCAAAAGCGATACGAAAGCATTTTTTTATTTGGAGAAGCGTTCAATATTATTT:1 + chr2R 21018859 3' - mariner2 789 1 77.23 ATAATAATAATTATAATAATAATACTTGGCCCTGCGCGACGAGGTCTATTGCCAGCTGATGAAGCAGACGACGGCTAACCGGTCACCATGTCCGGATAGCT:1 + chrX 10962162 3' + mdg1 7064 8 74.26 TTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAACG:1 + chrX 21667931 3' + flea 4984 2 61.39 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATA:1 - chr2R 23495449 3' + 412 449 2 66.34 TTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTA:1 + chr2L 22150632 3' - S-element 35 2 78.22 AACGGNGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATTGCAATTAAACAGGCAC:1 + chrX 12538521 3' - roo 8696 2 57.43 CTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGTTCCTTCTATTTAAATTATGTGCATGTATTTCACTTTCGTTTTCATTTGCGACTTTCTGTCGCTGGTTTTCTTGAT:1 - chrX 17064717 3' + Tirant 401 1 76.24 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCCGGATTTAGTA:1 + chrX 13347357 3' - roo 8695 2 57.43 ATGTGGTGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTGGGCAATTAATCAAAACTCGAATCAAAATGGAAATTTAATGGAAGAC:1 - chr2L 720680 3' - ZAM 8102 2 56.44 CACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATGTAAGAACTTGAAACAGGAATCAAAATAGGAT:1 + chrX 835956 3' + Tirant 407 1 79.21 GCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGGCAAAAGGCATTAAATGAAGCCGC:1 - chr3L 20248283 3' + Transpac 5217 2 65.00 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGTTTCTTATCTGGTTATCGAAATCTTTGCCGGATAA:1 - chr3R 17485460 3' - roo 8706 2 69.31 AAAAATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATAAACATGCATATATGTGGTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGC:1 - chr2R 22063114 3' + G3 4503 1 53.47 TTTCTAACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACA:1 + chr2R 18503558 3' + roo 9044 1 51.49 GAACTGCAAGGGTGCCATTTTTTGCCACTCGAATCACACTCAACAATTTTGAGCCCCATCCATATATAGAAACCCATTAAAGGTGTCAAAAGAAGCAGACA:1 - chr2L 15081430 3' + hobo 5 1 50.50 GCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACCTTAATAACAATGAAATGGGGTTAAATAACATAATGATTTTGATAGTATAATTAGA:1 + chr2R 6869099 3' - springer 19 2 60.40 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGTGCAACCGATAACATCATTATT:1 + chr3L 13312232 3' - mdg1 7051 2 66.34 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAATGTTGCGTTATCAGCAGGCCGTCCCTT:1 + chr3R 7360390 3' - jockey 9 1 76.24 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGTAGAAGGCATTGGTATGGTACTCAGCAT:2 + chr3L 10811216 3' + P-element 2861 1 55.45 CTGTGCAAGATTGTATGTACCATGCTTATGTACAGAGCTTTGATCGGCTCGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGAGTGGAAGCAAAAATGTGAAGCATATTATG:1 - chr2R 4122581 3' - rover 47 2 64.36 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTC:1 - chr3L 10736467 3' + 412 7499 2 72.28 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACATATGTTACATAGGCTAGCTGTTATGTATTGC:1 + chrX 6997224 3' + P-element 2843 1 35.64 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACCCGGAGAAGGGAAAATCCATACGGGCGAGTGCCATCGTATTTTCGTTTTTATCG:1 - chr3R 29432734 3' - 297 6601 2 59.41 AGTAATAAATAATTCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTTTTAGTTAACTAAGAGGATATATAATACCGAACATTGCCATTGTGTTTGTCTTCAATTTG:1 - chr2L 12658814 3' + invader2 5047 2 69.31 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACATATTCTGTGTTTGGGGACCGTAACTTTTTCAAAAATAATTTAAGCAATTGAAATTA:1 - chr3R 10321012 3' - roo 8682 2 61.39 GAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAGTGCATGAGGCATACC:2 + chr3R 9952277 3' - Ivk 1 1 77.23 ATTATTAAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGATTTTCACCATTCATCGTAAATATCTTCGAGTTCCAGATTGCTTTTCTCGTTTGATTCTTCCA:1 + chr3R 6597707 3' + I-element 262 1 57.14 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGTAGGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTCCGGGCATCGAAGGCATTTTCCGTGCCCA:1 + chr3L 7314757 3' - hopper 13 1 60.82 CTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAACGG:1 + chr2R 6779859 3' - 17.6 6941 1 67.33 TTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTAGTTGCCTTGTTGGTTACGTAGCTTTACGCTCTTTGAAAGTAATATTTTATGCTG:1 + chrX 21401959 3' - roo 8663 1 77.23 TCCATCAATTTATTTCCTTAGACGTTACAAACGGCATGATGTCTTTTAGGTGCCGACGATGTCCTTTCTCATGCATGATAACCAATTTTCCCAGG:1 + chrX 4815734 3' + Gypsy12A_LTR 2252 1 62.11 CTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTGTATTTATCCACTATCAGTATACATGCATGGAAGCAGTTTTATGAAAACAAACA:1 - chr2R 7540548 3' + Stalker4 391 1 73.96 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAA:1 - chr2L 22719573 3' - 1360 19 1 59.41 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCGTGTACTCGATTGTACAAAATAATTAAAGCGGGC:2 - chrX 6997147 3' + P-element 2878 2 70.30 GTTTTCTTACGAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAAC:1 - chr3R 20466635 3' + roo 379 1 54.46 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTATTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATTGTTTTAAAGTATTCAACATA:1 - chr3L 21708632 3' - roo 53 2 79.80 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATCTACAGAAAAAGATTGTAGACGAGTTAAGGTCAGCTGTAATATA:1 + chr3R 28883440 3' - HMS-Beagle 6829 2 56.44 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCGCCCCGAGCAGCTT:1 + chr3R 18960487 3' - hopper 39 1 64.36 TACATGCTCATACTTTCTGCTGTGTCAGAAAATTTTTTTTTTAAAAA:1 - chr4 512509 3' + ZAM 8174 2 57.45 AATGCACACACACACACACACAAGTCGTTGAGGCAGGAGCAAAGGATCAGAAAAAAAATGGGAAGCGATGGACGAGCGGAAAAAAAATAAACAAAATCAAT:1 + chr2L 3378760 3' + accord 7026 2 49.50 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTAC:1 + chr3L 14910622 3' + roo 9022 2 77.23 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAG:1 - chr3R 5505246 3' + mdg1 368 2 76.24 CTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACCGTAATAAACATTAATATTAAGCTCCGCCGCTGAGCAGGAGTGCAGGAGCCACTGCAAAGTAGTTATCAGTTCGA:1 + chr3R 17863660 3' + Stalker3T 112 1 74.26 TTTCTTTATTTTATATAAATACAATACTAATATTTTTAGTGCATCAGCAGCAACAACAACATCAATCTCAATAACAATTCATAATTCATGTTTAACATGCG:1 + chr2L 5446177 3' - Bari1 1403 1 70.30 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAAAAGGCCCAGAACATCAAACAAAATA:1 + chr3R 18934951 3' - hobo 14 1 57.78 TATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAA:1 + chr3L 19881827 3' - Idefix 30 2 68.32 TTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGGTGTTTGAAAAAATTTTCAACTTTCAATAGAGCTACAACAATTAAGCCTCGCGTGGTGTTTCAATCCCTTAATAAGG:1 + chr3L 24149920 3' - hopper 1058 2 62.38 AAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTT:1 - chr2R 10673398 3' + Tirant 8462 2 69.31 ATTTTATTTTATTTTTTATTTATCGGCATTACCCAGTTCAAATCGTTCCCATTTACCCTGTGTGAGACAAGTCACGTAGGCCTTGAAATGGCGAAAT:1 - chr3R 19793309 3' + transib1 1905 2 75.26 AGGGCAGCGTCCTTGGCCCGCTGCTCTATTCTTTATATACTGCTGACTGACATCCATTTTGACGGAAATACTCAACGCCATGACCTGGCTGGCAAAGGAGG:1 - chr3R 4590374 3' + BS4 83 1 61.39 ATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGAACTTTTTTGACGAGTCTTTAAAGCCAGGGAAGTAAGTAA:1 - chr2L 11600187 3' - Quasimodo 424 2 72.28 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCA:1 - chr3L 21735395 3' - Doc 41 1 61.39 CAGATCTATTCCTGATTTATATCTGATCAAAAGACTGAGGCCTTGCAGTCAAATCCCCCAGCAATCGCTGAGAAAATACAAAAATTTGTCTTCGTCCA:1 + chr3L 3561781 3' - mdg1 317 2 76.53 GTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATCATTTAAACTACCAATTATCAAGTACCCAAAATATGTCGACAGCAATGCGCACCACACTGCAGTCAGTT:1 + chr2R 19459947 3' + S-element 1710 2 40.59 CTCTATAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAACAATCTAGAACAGACGATCCCCCATCCCCATCCCCATTTCC:1 + chr2L 16055733 3' + hopper 380 1 57.43 ACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTAAACAAGTTAAGAATAAATTCTATACAAAACAAAACTTCCTAACAAAAACCATACAACAACA:1 + chr2L 22975176 3' - Stalker4 7235 4 53.47 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAATT:1 + chr3R 19837086 3' - P-element 34 1 41.58 GAATAAAACTCAGCTGCATTTACCAACGCAGACTGCGGCGTATGCGTAATATTTCGATATTAATGTTAGCCAACGTAACGCGGCAATTAACGTCTTGTCAA:1 + chr3R 9437352 3' + rooA 201 2 65.35 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCC:1 + chrX 19457212 3' - roo 8698 2 61.39 CAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGTGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATT:1 - chr3R 10741084 3' + 1360 3368 1 59.41 AACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGA:1 - chr3L 24213782 3' + invader2 5071 2 59.41 GTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGCTATTTTACTTTC:1 + chr3R 31458546 3' + jockey 4973 1 58.42 TACGATGCGTGCAATTTCGCTGCACAAATGAACACGTGTGCATAACATTAATTCTATTTTTTTCAAGAACTGAGATACTTTGGATAGTTCAAAATTTTGTA:1 - chr3L 23784731 3' - Transib5 178 1 60.40 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATAT:1 - chr2L 18028690 3' - flea 4803 2 74.26 CCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCTCTTTCTCTTTTCCTGGCTGTGCCACACAGAATATACATATGCAGACGGCTATTTTTAAATGAAA:1 - chrX 10088982 3' - FB 2 1 64.89 GCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATAGTGTGTGTGCTCGATGAATGTCTT:1 + chrX 3512886 3' - F-element 412 1 75.25 ATACTGGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCAC:1 + chr2L 11686075 3' + hopper 1382 1 55.45 TATATATTCTTAAGCAATAATCCATATTATGCAGAACAACTCTTGCTAAGTATTTTCGCTGAGTGCATGACGAATGTCATGTGGTCGGAGTGCCAAAACCA:1 - chr2L 12089817 3' + TART-A 13347 1 64.36 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATG:1 - chr3L 17122425 3' + roo 9028 1 69.31 TAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCTCGCTCTCGAACAAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATTGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:2 + chr2R 1982173 3' - 1360 123 1 89.11 CTTGTNTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACCACACACAAACACACACACGCACATACAATATATATACACACTATTGAGTCCTGTGAGTGCGACGG:1 - chrX 7828860 3' + 412 484 2 69.31 TGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGCAGGCATCTCACGGATTTTTGTTTTTTTCAGTGCTCCAGAATCGTGGCTTGCTTTCTCGTCCTGGTTTCATCCAA:1 - chr3R 22822807 3' - 1360 136 1 61.39 ATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGACTACTACTACAATTAATTGATTTAGCTTAACACAGAAGCTGTCTATTTATATATACGATTC:1 - chrX 22651411 3' - INE-1 10 1 65.35 GCCCTTCACCTCAGAAGTTCTTAGACGGTGCAACGCCAGTCGAATAACCCAAACGAGGAGGAGAAGGGTATTAAATTTGAATACT:1 - chr2R 7556125 3' + 1360 223 1 68.24 TTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTCTAAAAATTACTTATCAAATGAGAAATGGTTTTTACTTATTCCAGGG:1 + chr2L 20813413 3' + roo 41 2 53.47 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCGAGATTGGTAA:1 - chr3R 21695420 3' - 3S18 16 2 62.38 CTTTAACAAAAATTTTTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCCATTGCCCAAACAGGACCTTCTAATCAGAATTCTTATGTTGCTCTACTC:1 - chr3R 18657959 3' + FB 407 1 54.46 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTT:1 + chr3R 7522382 3' + blood 7369 2 58.42 AAAATAAACAAAATCCAAAAAAAGTGTGAAACTGGTGATTCTCGGCTTGTACGCCCATTTTTGTTTCTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 10577231 3' + transib4 2541 1 50.00 GTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAGATCCAACGGATTAGGTCAATAGGTCCTTTGCTGAATAATACATTA:1 - chr3L 23579575 3' + Bica 205 1 54.46 AAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAAGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACATATTTCGCTGCGAGAAACCAGAAACCTGTA:1 + chr3L 4048505 3' - 3S18 5811 2 64.36 AAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTAT:1 + chr3L 15035185 3' - pogo 50 1 81.19 TTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCTCAAAAGCGTTGAACACTGCGTGTGTGAATTTTTAAAACAGTCACCAGCTGCCTTACTACCTCTCAC:1 + chr2R 25097149 3' - roo 9032 1 70.30 TTCTTNCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGGAAGATTTCCCAAGTGCCGAAGGCGA:1 - chr2R 17127655 3' + roo 9045 1 54.46 ATTTAAACAATTCCTTGGTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATCCCAAATAGCGGACACGTTGCATCGGAAAAA:1 - chr3R 6218433 3' + Idefix 207 2 73.27 ATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATTAAAAATCATCTTATACCTTAC:1 - chr3R 10971888 3' + BS 5067 1 53.47 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAAGTCGAAAAAAAGTGTTGCAAGTCCGAGGTTAAGAT:1 - chr3R 31369313 3' + Transpac 5191 2 63.37 TTAGCTTCTATAGTTCCTGAGAAACGGACGGACATACGGACGGACAGACGGACATGGTCAGACCGACTCGGCTATTGATACTGGTCAAGAATATATATACT:1 - chr2R 8443980 3' - INE-1 152 1 76.24 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAATTGTACGGTATAATCAGATAGCGTCGCAAATGAGCAAACATACACATA:1 + chr2L 7994495 3' - jockey 4787 1 50.50 GTCCATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATTTAGATTCAGCAGCGAGTATAAATACTATCAGTTGCAACCCAGTTAA:1 - chr4 176237 3' + INE-1 125 1 60.40 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGCCCGTTTATA:1 - chr3R 9981471 3' - jockey 4766 1 70.30 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATGTGCGACTCTGCCGCTGGTGTCTGTGTGTTTTTGTGCGTT:1 - chr3R 178122 3' - BS 42 1 67.33 CTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTAATCAGGCTCCACAAAACGACATAATTTTGATAAGAAACCAGACAGATAATAGCAACTTTTGAAAGTCT:1 + chr2L 13211847 3' + R1A1-element 4989 1 65.35 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATACCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAACGAGCGCATCCCTAAACGATGC:1 - chrX 4041499 3' - hopper 20 1 59.41 CCTAAGAATACAATAAATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATAGATATATGTTTGATAGAATGCAT:1 - chr2R 12643417 3' + Stalker 6873 4 78.22 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGATCGCGATGGTCGAAAGATCGATTCGACTCATTT:2 - chr2L 21978074 3' + roo 9060 1 66.34 CACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAATCCATTAAGTTTGGCAGTCCCCCACCGGAGGAGAAAGAAGTCAAGAAAGAGGACCCAGATGAGATGTT:1 - chr2L 6907060 3' + I-element 110 1 74.00 TAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGCCCCAAAGCTCTGACTAAAGAAAACATCGAAATCCAAAGTTGCTTGTGTGGTTTTTAGGTTTTTTT:1 - chr2L 18515176 3' + jockey 4886 1 70.30 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATCATTTCTATTACAGACTTATTTATTTCC:1 - chr3L 17698201 3' + 412 439 2 73.27 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCTTCAGCTCTAAAGCTCGGCAATCTGGCCCACAAATCACCACGAAACATGTTGACAGCACA:1 + chr3L 22920468 3' + 1360 3378 1 68.32 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGGGACAACAA:1 - chr2L 20939496 3' + hopper 1409 2 73.27 AGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCCTGCTGACG:1 - chr3R 4973093 3' + 1360 20 1 47.52 CTCAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGAGATAATAAATTTGATGTTTTTACAAATAATTTTTAATGCAGTACGTGCAATTGTACAAA:1 - chrX 18012662 3' + roo 394 1 64.36 CCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGT:1 - chr3R 9952204 3' + Ivk 5324 1 63.37 CTCGACTATAGCATTCGCTCTTGTGTTTTACTGTGGACAGTAAGTGTATCAAAAGAGTGGCCGAAGATTTGGTTGGACTTTACTGACGATCCAAAACCCTC:1 - chrX 20445171 3' + INE-1 577 1 57.43 TTTTTCTTTAATTTTTTTTTTCTTTTCCAATGCCCGTACCCCGTTCGAAGTAAACCCCCTCCTCGGCGCTCGGCGATCCTT:1 + chr3R 29273916 3' + Tc3 79 1 86.42 TATATATCCTTGATCAGGATCAATAGCCGAGCCGAACTGGTCGTGTCCGTCCGTATAAACGTCGAGATTTTAGGGACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGAT:1 - chr2R 1751255 3' + INE-1 81 1 88.00 CAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATGCAATTACGAATCAGATAAGAACC:1 + chr2R 19357447 3' - jockey 4685 1 68.32 TAGTCCCTAGCAATCAAGTATGGGCGTCGGCAGCGAAGCAGTGGCCGTTAGAGGCGGAGAAGTGCAGATAATTCCACAATTTACTCTAAACAATATTTGCG:1 + chr2L 5269279 3' - HMS-Beagle2 7091 2 40.59 TTACACAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCC:1 - chr3R 27189276 3' - roo 8710 2 71.29 CAAATATAACAATTAACAATATATCAATTTGATATCATCATCATCTTATGGCTCTCGTCAAGGGAGCATGATGAGGTCCTTCGTCGCACGTTCTCCACACA:1 - chr2R 7941400 3' - BS3 1641 1 80.20 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTTTCCGCGAAGCAGAACCCATCCGCCGG:1 - chr3R 27189253 3' - roo 8687 2 55.45 TATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAA:1 + chr2L 8960001 3' + Ivk 5366 1 62.38 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGCTTGACGCCAACGATCGTTAAAAAACATTTGTCTGTCT:1 - chr2L 17447620 3' - FB 32 1 61.39 TGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGAC:1 + chr3R 25823722 3' - hopper 26 1 53.47 TACGATAATTAGGCGCTCTCTTGAATGGTTTTCGCATGGATACAGAGGAGTAGCTATTTCATGCGGGCTTGGGGTCACTTCATTGATAAGAACCACGTAGC:1 - chr3L 11554191 3' - Quasimodo 431 2 58.42 GAATTTTTTATCTTAAACTCGCAGGTCCCGCTGTGTTATGAACACAGCTGTATACTCGCCACATAGCCACATTCGCCACAAATAAACTAATAACTATTAAA:1 - chr3R 23385917 3' + HB 1591 1 46.53 GTGCTGGTTCGATGAGATGAGCCGCCAATAATCTGAACCAGTTCCATGTGAGCCCCCGCACCAAATGCACCTCCAGTTGCTCGCAGCCTCATCCGCAAGCG:1 - chr2L 12188441 3' - Chouto 6032 1 56.44 TTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCC:2 + chr2R 12253297 3' - BS 4684 1 72.28 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTCCCTCTCTCGCGGCATCACAGCGAATTCGCCGCACTTTTAGCCGGTTGTTGTGTGTGTGAGATTTC:1 - chr2R 13038865 3' + P-element 2879 2 71.00 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAATTAATGTGCCCCCCAAAG:1 + chr2L 14490478 3' - P-element 8 2 71.29 TTTTACAAATTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 + chrX 17592037 3' + FB 175 1 96.43 ATATATACATATATATATTTCAGCTGTGGCTTCTCGCCTGACTGCATTTCAATTTTAGAGATTGCAACTGTTTTTGTGTGCGTCACATTTAAAGTGCCTT:1 - chr3R 9183047 3' - 1731 4407 1 72.00 ACACATACTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACAGTACTTCTGATCAGCTTATCTGCATTTCCATTAGATAGT:1 - chr3R 19815104 3' + accord 7053 2 61.39 GGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGCGATGTCATAAATTTTGTGAAAAATATAGTTTGGCTTGAGCTTGAACC:1 - chr3L 12085126 3' + pogo 2100 1 76.24 TTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCA:1 + chr3L 16047736 3' + Tc3 313 1 31.68 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAAT:1 - chr3R 10445202 3' + roo 9031 1 65.35 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCCGGATTTAGTATATTGTTTGAGCGACTGTCCTTAAATCTTT:1 + chrX 13347387 3' - roo 8664 1 76.00 CTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTATTCCCTATTCTCTAAATGTCCAAACAATCCATGACGA:1 - chr3R 22620171 3' - 297 6588 2 73.27 AATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATGAAAACGGAGGATTCGAGTAGCCACTTTCTGACAATAAACTGAGCCTTATGCAGAAATGCCCGAGTGAAA:1 + chr2L 3822380 3' + Tirant 8308 2 71.29 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATGTATATGAAATCGGGCCTATACAATCTTACCAACGCGTTTCTTAAAAGCATGTA:1 - chrX 14043881 3' - opus 21 2 52.48 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTT:1 - chr2L 1626528 3' + roo 9045 1 51.49 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTCCCGGAACTCTTTACT:1 - chr3R 14169256 3' - blood 7050 2 65.00 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAATATG:1 - chr3R 25702162 3' - Tirant 8119 2 69.31 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGTAACATTATCGATAATATAGTAATTATTTTTCATTATGCAACTC:1 + chr2L 13739986 3' - 412 7084 2 59.41 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGACAAT:1 + chr3L 6024626 3' + roo 400 1 71.29 TCTCAGGAACTATAAGAACTAGAAGTTTGAGATTCACCTTCAGTATTTACGGCAAGCACTCGGAATT:1 - chr4 756561 3' + INE-1 152 1 55.22 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTAATTTTTTCAAAATTCTT:1 - chr2R 24965054 3' + P-element 2866 1 59.41 CACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAA:2 + chr2L 16082656 3' - Stalker 6901 4 74.26 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAGTTTATTATTGATAAATATCAAATTATCGATAGTACTTCCCCGATAAGATTCTGTTAACACACA:1 - chr2R 17095081 3' - Juan 4041 1 60.40 TTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCAAATCGTCGCAGATTGCTTTGTATTTTTCCTTCTCATTGAAGAGACGGTCTGCAAA:1 - chr3R 15313584 3' - opus 7359 2 59.41 CCCTCTGGTGGAAGTCGCGGATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTATCCTCCTATCCTCCAGTTCGTCTCGTTATCATTACCTGCCTCGTTT:1 - chrX 10125220 3' - Quasimodo 7053 2 57.45 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATA:1 + chr2R 13038932 3' + P-element 2839 1 27.37 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAACTTAAAATG:1 - chr3L 13364536 3' + hopper 1381 1 55.45 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATT:1 - chr3R 23665259 3' + 297 6944 2 64.36 TTTAATTTATTTTTTTTATTTTATACAACTTGCTCGCTGTTTGTTCCCCCTAGCCCTGAAACACAAGCTGTCAAACGGAGAGTAAAAAAATGGATTTAACA:1 - chr3L 65326 3' - HeT-A 1 2 77.23 ATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATACCCAGATAGATAGGGGGATATAGTTGTGGGGCAACCCGAA:1 - chrX 4500195 3' + Quasimodo 7341 2 58.00 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCATGTGCTCCATCCAGGGTATCCACATACAACCAACGGAC:1 + chrX 6654799 3' + P-element 2880 2 73.27 GTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCCTTTTTCTTGAGCAGCTCTTCCTTCTCCTTGAGCTTTTCTTCCTTTT:1 - chrX 11831318 3' + Max-element 56 2 55.45 TGGTAGAAGAAGGTTTTTTGGGCTATGGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGGGTGCGGAAAATCGAGGAAAATCGCATAAAATCGGACCAA:1 - chr2R 22279908 3' - F-element 332 1 43.56 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATATATAAGCTGCTTTCAGCGGTAGCGAAAATATAACTCG:1 + chr3R 29432818 3' + 297 6945 2 66.34 ATGCAGCTAAGCAAATTATACTGTATCTCGAACTTTGTTTTCAGTGTATAACTGATAAGCAATTCAACTAAACAGTCGATATGTTCGTTGAATGTATGGAT:1 - chr3L 14049951 3' - pogo 2 1 69.31 GGACCNCCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCACTTTTACAAAATCGTATGTTATGTTTTGATC:1 + chr2L 18694191 3' + P-element 2882 2 74.26 TTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGGAAATGATTTTATTATGCGGTAAATTAAACTCAGTTAGAAGAATATAT:1 + chr3L 23933997 3' + Cr1a 150 1 52.48 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTATAAATAATTTGTTTTTTAATGACATGCCATCATACAAATACATTTTTCCTAATT:1 + chr2R 13122095 3' + opus 482 2 63.00 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATTGACCGACCGCCTTGCCGATGTTTCGATTACGCGCCTCAAGTGGCAATCAGGCTGCATCC:1 + chr3R 27374884 3' + mdg1 409 2 66.00 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCGATTACTCAGCTCGGGGCAATCGATG:1 + chr2R 24965152 3' + P-element 2877 2 69.00 TGCACNCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATC:1 + chr3R 7522364 3' + blood 339 2 63.37 CATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCATAGGATTTTAATAGCAACTGAGGCCGCCTTAACTGTACATAAATTTGATTTAAAAATACTTCAGATT:1 + chr3L 16424473 3' - Quasimodo 249 2 73.27 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGTTTCATTTGAATT:1 - chr2R 17383998 3' - mdg1 16 2 43.56 CGACTATCTGATACCCTTTACTCAGCTAGTTGGAATGCAAACAAGAAAGTTCAACAAAATGTTTGGCATATCAATAGAAATATAATTTGCGCATTTCTCCT:1 + chr2L 17211190 3' - INE-1 550 1 78.22 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTTAGTTTGGAGGGT:1 + chrX 4180807 3' + I-element 5324 1 57.43 CTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAGAAAAGGCCAAGCAGCATCAA:1 - chr3R 7461090 3' + blood 7126 2 78.22 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCCCACGTG:1 - chr3L 9692647 3' + P-element 2882 2 74.26 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAACTTAAAGGGGAAATATGAAACA:1 - chr3R 28398200 3' + Tirant 8482 2 78.22 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGGCGCTACTGATA:1 - chrX 6654682 3' + P-element 2881 2 71.29 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTTCCAGGCGATGTCTAGACTGCGCCACCCAGCTCGCATTCCGTTGT:1 - chr2L 1828770 3' - 412 31 2 54.46 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAAC:2 + chr3L 6024616 3' + roo 390 2 61.39 GTTGCAGTGCGACTTTTGTGTAATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGAACCGGACTGAAAAGGAGGCCAGG:1 + chr3L 14240685 3' - Tirant 8233 2 76.00 ACAATAATAATAAACAATCTTACATAGTATATTTTTTGAAAAGGCCCACGTATAACAAAACAATTCTTTTTTAATAACAAAGCTAAAATAAATATAACAAA:1 + chrX 10251831 3' + flea 5011 2 75.25 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAACAACAGAAAAGTTAGCTGCATTGTTCA:1 - chrX 10653527 3' + jockey 4983 1 56.44 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATGTATTTTAGTGTGAAGCCCCGTAAAAACGTACGCGCAAAAGTATGCAATGA:1 + chrX 3649738 3' - jockey 35 1 54.46 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTG:1 - chr2L 15344145 3' + transib2 2782 1 63.37 CACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTGTTTGCCTTTGTGCGGTTAATGATTCGAAATGGTAAAACGCATTCGAAATCGAAATTGTAG:1 + chrX 8530447 3' + 17.6 7237 2 63.37 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACA:1 + chr2R 22605985 3' - Juan 4057 1 54.46 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTGGAATACATTATATATGCGTACCATTTCTGGGGTCTGGGGCTAAATTGGTATCACTTCAATTAAGACC:1 - chr3R 17367974 3' + roo 400 1 66.34 CAATCNTGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTGTGGCACTTAACTTAACATTGT:1 + chr3R 16510889 3' - flea 48 2 75.25 CACACACACACACACATAAACACTTTTTCCATTTTATTTTCGCCCGTATGTGTGTGTGCGCCCGTGTAAGTGTGTATGTATGTCCTGCGGTCGGGCAGCAG:2 + chr3L 11399228 3' + accord 186 4 46.53 AAACANAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTATATCTGGGCAGTGATCTCGGGCAATTGCGAGGATGGCATACGGCCCAGT:1 - chr3R 10172687 3' - 412 60 2 58.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTCTTT:1 - chr2R 9862191 3' + roo 396 1 61.39 TGTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTGTCTTTCGTTGACTGTCTGTCTTGCGTTTGGGTTTCCTCGGGACTCCCTCTGCTTAACTTGGCTCTTTTTCAACAC:1 + chr3R 15670232 3' - gypsy7 5008 1 70.30 CGGCTNACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTGTTTGTGTTTGCCCTCTTATTATTATTAA:1 + chrX 12546514 3' - P-element 17 1 62.38 AATACACAAGGCGATAACAAAACCAATATGGGTATCTGATAGTCAGGGAACTCGAGCATAGCATTCTCTCTTGTTTAATTGTCTGTTTGTGGACTTAATAA:1 + chr2R 100918 3' + Porto1 4241 1 73.27 AGTTCAGCTTTAGTATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTTGCGATCTGCCTCCATGCTTGTTGCTACAGAGCTTTGTTTTCCGCTCTTTGGTAAGCCGGAAGA:1 + chr3R 22092644 3' - invader2 5020 2 67.33 CGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTTGTAATATCTTCGGCTTAAATATACGATTCGCTGTGATGGGGGTCAGTGGGGCTTTAGAATGGAAGAAT:1 - chr2L 11062655 3' - roo 9042 1 53.47 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAATTCTTCGAA:1 + chr3L 13994262 3' + P-element 2848 1 38.61 CTTGGGGGGGAGGAGTTACCACTATACATTCACCACTCCCCTGAAACCGTCCAGATCAATGCGGCCCTGCAGAGCAACTCCAAATGACAAAGACTTGACTC:1 + chrX 18878114 3' + Tirant 8097 1 55.45 TAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTGTTCATATAAATATTTCAGTTTTATTTTGGATTAAAGCATCGAAAA:1 + chr2L 16933661 3' - 3S18 31 2 52.48 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTAGCGAGATTTGTTAGCCAGTTGCTTAAGTCGCTTGTCAGATGGG:1 + chr3R 17175849 3' - Transpac 9 2 45.54 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATCGCGAGCGGCAAGTAATT:1 + chr3R 28728320 3' - jockey 59 1 73.27 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGGATACACATCAATAAATGAAGGAGCCAAGTTCCGAACTCTACAGTTTTATTTTCCATTTTTTTTTT:1 - chrX 16769722 3' - roo 8674 2 71.29 AAGAAAAAGTTTTTTTGAAATTTGAAGAAATATTATTGCACTTACAAATACTAAAACCACATACTAATTTGCAGACTCCGCATAGCGGCTAACACACAGCC:1 - chr3L 9835407 3' - Stalker4 6865 1 67.33 CTATTGATCCTGATCAAGAATACTTTTAAATGGTTGGAAACGCTTCGCTCTGCCTTTTAAATACTTTTTAACGAATCTAGTATAAATAAAAAAATAAATA:1 + chr3R 14948558 3' - INE-1 85 1 68.00 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCC:1 - chr2R 20411867 3' + 297 371 2 55.00 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCT:1 + chr2L 16686606 3' - pogo 35 1 68.32 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCCACTCACTGCTTGTTAAGTGCTTAATAATATGTAACGATGAACTAAAGAC:1 + chr3L 21840903 3' + P-element 2783 1 54.46 CATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCAAAAAAATTTTTTTTTTAATGACAGAATATAACAA:1 - chr3L 25782393 3' + Stalker 83 4 62.38 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCCATCTTAAATAAAGTA:2 - chr3L 11654523 3' - pogo 25 1 53.47 TTCTTATGAAAAGCCAAAAAATTGCGATTTTGCTCAAGAATGTAAATAAAAAAAGGTAAGTATATACTCGATACCCTGTTACAAAAGATGGGGCATACTTA:1 + chr2R 9930469 3' - HB 199 1 55.45 CAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCC:2 + chrX 15195287 3' + Transpac 270 2 70.30 TTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTT:1 - chr3R 19144396 3' - Juan 18 1 50.50 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATC:1 + chr2L 18694157 3' + P-element 2848 1 40.59 GCATTNTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACGATCTCTACCAAGCTGATAAGCAGAAAAAGG:1 - chr2R 1395467 3' - gypsy 7025 2 65.98 CTAGTAGGCCTAGTGCTAGGACATTATCATAGTCGTGTAGTTTACTTATGTGTCGCTCTACATTTGACTATATATTTTCGATGTATGCATTATTTCATTAA:1 - 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chr2R 1982172 3' + Doc3-element 4633 1 81.19 CTTCATCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGT:1 - chr3R 3177921 3' + Stalker 7169 4 80.20 AGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAAATTTAATATATATCTGAGGCAAAGTATCATTTTTATATACCCAAGAAAATTCTCAACTTGAAA:1 + chrX 10145829 3' - accord2 137 2 66.34 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCTCC:1 + chr2R 19936706 3' + roo 399 1 72.28 TTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGATTTTTGCACTGCGTTTCCGGTTGCAGTTCGCGTTGTCTTGGTCACCTGTTGATTGGTCATCAAAGGAGGCG:1 - chrX 3664580 3' - Ivk 334 1 57.43 TTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGG:1 - chr3R 18960422 3' + hopper 1386 1 56.44 TCATTGCCTTATTAATTTTTCACACGCCGCGAGATGAATACTCATCAGATAAATTTAAGAACAATAAATAAATAAATGTGCATTCCTATATGTACTTG:1 + chr4 1167178 3' - 1360 437 1 60.20 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTC:1 - 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chr3L 12468673 3' + Doc2-element 255 1 65.35 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCT:1 + chr2L 108036 3' - P-element 58 1 22.77 TTGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGATTCTTACAGTGGAACTTTTCTTAAGTTTATTATTTCTGCTTTTGATCGATTAAAGTAATTTTTAAAAA:1 - chr3L 1490236 3' + 1360 3192 1 73.27 GGGAGTCAGTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGGAAGTATCAAATAAACCAAAGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATATAGTACC:1 - chr3R 1977616 3' + invader2 155 2 78.57 GGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAACCAGGTAGTATATTGAAATCAAGCTATTTCCC:1 - chr3L 6477992 3' - 412 113 2 63.22 CATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGCAGT:1 + chr2R 5424277 3' - 1360 3355 1 73.27 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGGCGCTACTG:2 - chrX 6654685 3' - P-element 9 2 68.32 AAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTACCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGGTCAAGATTTGTATACGCTGTTCATAGCTCCTTCTCGAGGGCCTT:1 + chrX 3797584 3' - INE-1 577 1 55.45 GTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATGAAAATGATAAATATGAATGCAAATGAATAAAGCAAATGGGATAAAT:1 - chr3L 19656278 3' + mdg1 7038 1 54.46 AAAGACCCTAGAATAAAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTGCAAGCTGAAAGCAATTTGGCAGGGACTGAAA:1 - chr2L 12907185 3' - 1360 3387 2 68.32 ATGAACACTCCAGCTCTTGAAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGAGAATGCTGAGCATGCATTAGAGCTCGTGAAGCCGATCT:1 + chrX 18804134 3' + Stalker3T 105 1 83.17 ACTCANCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGTA:1 - chrX 8031373 3' + roo 393 1 59.70 TACCTGCAGCCTTAATCCTGCCCTTTCTTCACTAGTCAAACCAAGAAATTCATCAGCTATATGGCATTTTTGACTAAAACTGAAAAATAAAATACTAGGTT:1 + chr2R 4471881 3' + Chouto 6092 1 54.46 CGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACAATTGAGCACATTTCGAGAACACAAATTAATATGCGAAAAA:1 + chr3L 16391689 3' + F-element 243 1 59.41 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGT:1 + chr2L 16686604 3' - pogo 37 1 70.30 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAATGTATTTGTCATTATCATTAATTATGATTA:1 + chrX 12857888 3' - 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pogo 35 1 63.37 TTCTTCACTGGATTTTCAGAATTGTGAAATTAACACCGATCATTGCTCGTTTTCGATGAACATGAACTTGATGGGTTCATAAATAGCTTACAGACAGTTCT:1 - chr2R 10863086 3' + mdg3 487 1 63.37 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTTGCCTCTATTCGAATTCGATTAATGGTAATG:1 + chr3L 12452198 3' + 412 448 2 69.31 TCTCAGGAACTATAAAATCTGGAAGGTTGAGATAAAGCATACAGAAAGACAGTATATTTGAGGACCTTGCAGCAATTTGATGGCCC:1 + chr3R 28095240 3' + INE-1 152 1 47.67 TAAATCATTATGTTTATCTTCGTTTCTAATGTTCCATTAGACTTTTGTGCTTTTTCTGAGCATTTTTACTTCTCTTTGACCTTGCCTGACCCTGCAAAAAT:1 + chr2L 8274026 3' - Porto1 4385 1 62.38 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAAGCAATTTATTGTTATTGCTTTCAACACCCAGCCACAACATTCCCATACAAA:1 - chr2L 8620261 3' - Juan 4055 1 52.48 CGGGAAAGTCGACTATAGCATCTCTCTTATTTTTTAGTTCGTTTTTAGACATCATATACGAAACAAGAATTTACCAAACAAACGTAAAAAATTGATGAAAT:1 + chr3R 24172953 3' + INE-1 570 1 66.34 TACAGTGTACCCTCGATACATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTC:1 + chr2R 9014493 3' - blood 12 2 63.33 TCGAACTAGAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGCCACCACCACCGTGACCACCCCGACTGGGTTTCGGCATGGTAGGACATACATTTAAAAAAAGGTGAGGTGA:1 + chr4 714500 3' + jockey 4729 1 82.18 TTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATGTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACAC:1 - chr3R 28883396 3' + HMS-Beagle 6985 2 81.19 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGA:1 - chr2L 8542866 3' - P-element 55 1 19.80 CTAGAATTACATAATGAAAAAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACTCTGGGGAACTGCTGCTCTGGAACACCATGTGTTCG:1 - chr3R 3702658 3' + Porto1 4218 1 77.23 AGGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAA:1 + chr3R 10971945 3' - BS 5032 1 60.40 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTTAAACAAAGAAT:1 + chr2R 4502520 3' - roo 8674 2 69.31 AAAAGTTAAAATTGATTGCTTTAATGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGAAAAAGTCTATTGAAAACTTACTGGAAGAGGTAAAACGATTATAT:1 + chr4 92194 3' - Cr1a 4258 1 67.33 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAATTAATGTGCCC:1 + chr2L 14490471 3' + P-element 2872 1 64.36 GAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTATCTATTTGGGTCTTCCTTCAATTATTTGTTTTCAGTTGTAGGGAGGGATTGCCTTCAG:1 + chr3R 1207085 3' - I-element 5329 1 61.39 GAAAGAAGGAAATTATGCTGCCTGTAGCATATCAAAAATTTAATATGGAGAACACACATTATATACAATACATATGTATGTCCATTTGTTACCATATTTGT:1 + chr3L 22915024 3' + mariner2 883 1 78.22 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCATTCT:1 + chr3R 12136337 3' + roo 9036 1 57.43 ACGCAGCTTTTCCTGATGTTACTTGTTAACTTGTACTTGATCCAAATCATCCATTATTTGCAGAGCTCCTCTATTTCTGCTTACATTATCGGGTAAAACTC:1 + chr3L 20885626 3' - Chouto 10 1 75.25 TGCTATAGTCGAATTCCCCGACTATCAGATACCTGTTACTCATCTAGTGGAAATGCGGGTGGTATGCTACCGGATGGCCAGGGCAGGTGGCCAAAACCGAG:1 + chr2R 13806389 3' - INE-1 568 1 56.44 GGGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTAAGCTGAGATATACTTATTTATTTGTACATTGTCGACAAAAGGGGGAAGTGGGGATTATAG:1 - chrX 20099904 3' + S-element 1708 2 67.68 GCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTTCTTATGTTCGAACTGAATCTAAAAAGTTGCTC:1 + chr3L 20895050 3' + invader3 5385 2 57.43 GACGACTAATACAGCGATAGGATTCCTCTAACCCTGCTTGTCGGCCATGTTGATGAGGCGTCGTGTGGCGCTTGCGATGATATATTTGACAATGTCCCT:1 - chrX 9024351 3' + R1A1-element 4862 1 63.64 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAAAGGCTCAGTTTGAT:2 - chr3R 11165620 3' - Tabor 6853 2 69.31 GATCTTCCTTGGTTTCTCTCTTTGCTCTTGTTACTGTTTTGCCAGCTCTCCTCATATATAATTCTCCACTTTATGCCTGCCTCTCCAGCTGCCTCTTTTCA:1 - chr2R 11550516 3' - Bica 433 1 38.61 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 77 1 77.23 GACCTNTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGT:1 + chr2R 22605961 3' - Juan 4081 1 77.23 CATTTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATCTTCTCGCGAATCGAGCCATACGATACACTGCAGTAAAATGGCTTACCGCAAATGCCAAAA:1 + chr3L 2001109 3' + Cr1a 4340 1 73.27 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATC:1 + chr3R 14688320 3' - pogo 29 1 57.43 GATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTA:1 - chr3L 27182012 3' - F-element 275 1 73.27 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAACGCAGATGCTCTGCTGTA:1 + chr2L 13060351 3' + P-element 2874 1 66.34 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCCATTGC:1 + chrX 19457217 3' - roo 29 2 56.44 GGGGGGGGGGGCGGGGGAGGAGTCGAAATATTGATTATGGCCACTGCGATGACAAGTTGGGGAAAA:1 - chrX 3715719 3' - accord2 223 1 77.27 TTGGCTGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACATCTTGTATTCTCCTAGTCACATCCTGGATCGACTGAGAGCGTGTGTGTGTG:1 - chr2R 6859152 3' - Max-element 29 2 69.31 GGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCACTGAAATGTTTTAATATTTATGATTAAAACTAAGGCAA:1 - chr2L 16521913 3' + 297 428 1 62.38 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAATAAGATTGAAATTTGTAAATTTTATGCGCTCTCCTGGCAGCAAGTTATGTATTTTGCATAGACAC:1 - chr3L 7926317 3' + flea 5009 2 74.49 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCA:1 - chr3R 14049359 3' - transib2 44 1 69.31 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCCACTATGCCATATGAATCCTGAACCGAA:1 + chr2L 14260794 3' + 297 6930 2 77.23 GAATAAACATGAAGATCAACCTGACAAAGGCTGAGGAAGGTATAAGGATGTTGGCTACACAGGACGATGACGTAGGGACAACGCGGAAAAACTGTGCTGGG:1 - chr3L 21043855 3' + Bica 139 1 78.22 CTTTANGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATT:1 - chr3R 14049330 3' - transib2 15 1 64.36 TAGTGTCATTGCTTTGGTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGTACTCAACGAGTCATTGAGAGTTTTTGAAAAAACACAACATATAATCGAATA:1 + chr2R 2880619 3' - 1360 496 1 61.39 AAAGGGAATATAAATTATAAATTACAACAAGATTTATTCGATTTTATTCAGAAAGCTGCTGCGTCAGTCTTTCACGTGCTCATCTCATGTTTAAATCCATA:1 + chrX 2884918 3' + copia 248 1 61.39 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCATTGTT:1 - chr3R 20466623 3' + roo 392 2 63.00 AAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATGTTGGGTCGAGGAAAAGTCAAAGCTAAGCTGAATTGAACTGAGCATTCAAT:1 - chr2R 9427978 3' + P-element 2602 1 50.50 GGCAGATAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTGTGAGCACCAAAATGTAGGCAACATAACATAACACAATACATATGTAATTTTATGTGTATGTTTGTG:1 + chrX 9248387 3' + pogo 2100 1 77.00 CCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCATTCTCCGTCTCTGTCGCGCCATCTCACGCCCTCTCTTTCTAGTCTCGCTGTTTTTTACTGGCCCCCAC:1 - chrX 19393418 3' + F-element 4480 1 71.29 AACAAAAAAAAATGAAAGATTGGCGCGGGCGCGCAGGCTT:1 - chrX 3692176 3' + P-element 142 1 87.50 GAAATCGAAGCTATAGACAATCGCCAATCTGGGCGTCAAAGTGGAGTTCCTAGGAATGCTGAGCAGTTGGAGTGTGTTTCAAGTACTGGTCGATGACTTGA:1 + chr3L 11458800 3' + flea 4830 1 76.24 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAAT:1 + chrX 5443962 3' + mdg1 397 2 54.46 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGTGGTCTCTCCC:1 + chrX 329095 3' + opus 7488 2 66.00 ACAAAGCTTTGTGATTGACCTAATTAGCTTAAGATTCCTGGAGCGGAATTCATCTTCCATTTACGTAGGCTGCAGAAGGATACCAGTGCTGCAGCTGAAGG:1 - chr2L 12377244 3' - diver 5778 1 81.19 AATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATGCTACTTGGCATTTTAGTTTTAAATTTGCGACGGTTTGTTGAAAATCAAGCTAGCGATCGCGGCG:1 - chr2L 5328822 3' - 1360 378 1 70.30 ACACATACACACTGCGTAATCGCGACGTCCTCGTCTAGACTCGCTATCTAGAACTAACGGGATCAAAAGCACTGCTGCTTAAAGTGTAAAAACAATTTGGA:1 + chr2L 17890625 3' + accord 7110 2 79.21 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACTTTGCCCAACTTCCGGTGGCGGGGCATGCCG:1 - chr3R 25818803 3' + mdg1 406 2 62.38 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTATGAATGCGAAGTATAAGACTGCGCTTTAGTTATGCATTTTATGAGGGACCTTGCAGCAATTTGAT:1 + chr3R 28095235 3' + hobo 2927 1 67.33 AAAAAAAAAAACGGAACAAGAACAAAGTGGATTGGACTGGAGTGGGAATTTGTGCATAAGCCAACTTAACGAAACAGCAAGATGGCAGCACATTTTGTATT:1 - chr2R 15023100 3' + Doc2-element 231 1 63.37 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCATTGTTGTCTCAAG:1 - chr3R 20466615 3' + roo 399 1 68.32 CACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTGGCTTCTGTATGGCAAAAATAGATTAAATTCGTGTCCTGCGCCCTAATGTATGCAGCATTTTT:1 + chr3L 12874947 3' + copia 4979 2 65.35 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTA:1 - chr2R 5485054 3' - 1360 19 1 60.40 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGGAGCGAGTACACTATATACA:2 - chr3R 21296512 3' - P-element 55 1 25.74 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACGAGGTGCTCGGATGAGCACAGCCAGCAGTTCCTATTGCCATATTGATGATCAAA:1 + chr2R 23305488 3' + I-element 5340 1 59.38 TGTTATTACGTTATTTTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAAAGATACAAAATATTGCCACTGAATGCAGGGAAATAGCCAA:1 + chr3R 24026444 3' + mdg1 7007 1 60.40 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAAAAATTAGAGCTTATTTTG:1 - chr3L 11435573 3' + roo 9047 1 51.49 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACAAACAATATATATTAAAAATGTAGATGGGCCTGTTTGTACAG:1 - chr2R 14381274 3' + hobo 2909 1 58.42 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATGCAATTACGAATCAGATAAGAACCGCTTG:1 + chr2R 19357452 3' - jockey 4680 1 73.27 TTTTATTTTGTATTCCGTTCTGTATTTTTACTTTTTTCCTTAACGCAACGTGTTGACAGCAAGTGACAGACACATTCATTAGGCGGAATGATTCATATTCG:1 + chr3L 21452303 3' + gypsy2 186 2 67.33 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCGTCGGCAGTCATTTTC:1 + chr3R 20884964 3' + flea 226 2 58.42 AAACTGAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTT:1 + chrX 8364651 3' - jockey 4790 1 54.46 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAAAAATAGACAAGCACTGGAAGAAAAATTTCACCCCTTTGGCGTGCTAATTATGGAACTG:1 - chr3L 12298544 3' + pogo 2086 1 58.42 AAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGAATCCGCTTATTAATGAGC:1 + chr3L 21384068 3' + roo 9067 1 74.26 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATGTGTATATAGTTTCTAGTATACCCGAAGAGAACAACAATCTCTTAATTGATTC:1 - chr2L 4009430 3' + pogo 2082 1 60.40 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCAT:2 - chr3L 17122426 3' + roo 9027 1 70.30 GTGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAAGTTCAGCCATTGGTGGTCCATGCCACCCATCGGGTGCTCCCAGTTGGTGGTGGATTTCC:1 + chr3L 8557083 3' - jockey 4748 1 62.38 ATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACAT:1 + chr3R 13423352 3' - 17.6 6965 2 72.28 CCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTAC:1 + chr3R 26469495 3' - hobo 42 1 69.31 TGGCGGTTTTATTTATAAACAGGTATTATTTGGAAGTGTAAGTCTAGTGTGAGCACCTGCCTACAATAGAACTCCAGACCTCGAGTTACGCCCGCCCGCCC:1 + chr2L 514958 3' + 3S18 341 1 76.24 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGAT:3 - chr2L 18112521 3' + transib2 2779 1 70.30 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGA:1 - chr3L 2800114 3' + blood 7371 2 53.47 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTGCGTCACGGATCCG:1 - chr2R 9426428 3' + P-element 2869 1 63.37 ACTCCCATTGGTTATCGAGTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACATGTCGTACATAAGCCCGTCTAAAA:1 + chr2L 1882476 3' + mdg1 208 2 76.24 GCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATACATATATATGGGCCTAACAGAAACCATTATTC:2 + chrX 20391099 3' - rover 6994 2 76.24 TTCAGCACACTTTGATTATTCAAATTAATAACCTCGAACAGAGCAGAAGCTCTTCTAGTCTTATAAAAATTAACATTTTACATGGCGACAGTGACAGTGTC:1 - chr3R 3177920 3' + Stalker4 7277 4 82.18 CGAGTNAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTCATCGGCAAC:1 + chr3L 15638317 3' + roo 399 1 70.30 ACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAACACATCGAATGAGAGA:1 - chr3L 24131073 3' + HMS-Beagle2 7181 2 63.37 CCGGGCGTATGTTTATTCAGCGTGGTTAGTTTTTACACTGATGCTTATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGAATGGCGATGCGCGTCTTGGTAGT:1 - chr3L 21181049 3' - GATE 8388 2 76.24 AAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTTCTTATGTTCGAAC:1 + chr3L 20895031 3' + invader3 181 2 54.00 GGCAAGCACTCCCCCTTGCTGAGGAGCGAGATCGAGAATTACAGAAAACTATGACGCACGCAAGGAAACTTATGAATGTACCACATGTACATATATCTGTG:1 - chr3L 632476 3' - R1A1-element 5135 1 74.26 GACTTNTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAGACTATATGGGTGCCTCGCAAAACGTATGGGCTGGAAACCTATTG:1 + chrX 18353558 3' - jockey 32 1 51.58 AACTTTGCGGCCGGAAGACAAATTTTAAACTTTTAATTTTTAAACTTGAAAGTGCTTTTGTTTGTTGTTGTTAATAATTATTATTGTTGGTTTTGTAATTT:1 + chrX 8046180 3' - TAHRE 174 1 53.47 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCTGTTTATCTCTCTTTTGGACCGACCAATTTTCTGTGTTTG:1 + chr3L 20248398 3' - Transpac 4925 2 74.26 GAGAAGTGCAGATGATTGCACTTTAGCTGGTCGATAACAGCGTAAGCTTTCCCACGCAGGCACATCGTCTAAGTGTTGGCGGCAGAGACAAGGACAATGGC:1 - chrX 21790434 3' - HMS-Beagle2 7006 2 61.39 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGCGAGAGCGTGAGC:1 + chr3R 28326784 3' - P-element 10 2 70.30 TGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATGCTATATTGTAGGATGACTTTTTCATTGAATT:1 + chr3R 21848161 3' - rover 6987 2 69.31 GTGTGTGTGTGTGTGTTCTGGCTGGTTTATGTGGTTGAACTAATGCTCTGAAGGTCGGCACTGGCACCCAGTAAATCGGGCCTGACTAACTAACGCTTCGA:1 - chrX 6328697 3' - accord 7025 2 66.34 TTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAATTAAATTTAATTTGCTTTGTTTTATTATTTTTATTTATTAACTTTGCTGGTTTTAACTTTGCTGGTGGAGG:1 + chr4 1294991 3' - TAHRE 68 1 54.00 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAA:1 - chr2R 3188674 3' - 1360 26 1 52.48 ATATATATTCCTGATCAGGATCAATAGACGAGTCGTATGAACGTCGAGATCTCCGGAGCTATGAAAGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAAT:1 - chrX 124082 3' + INE-1 80 1 66.34 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCG:2 + chr3R 15998126 3' + pogo 2053 1 76.24 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTTTGGGGCCGTGAAAAAATG:1 - chr3R 29384323 3' - jockey 4760 1 78.22 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTCAGGATGCCTGTGAATAAATTCCATTTCCGTATATCTCAAGAATTCCCCAACAGCTTTATCTGCTTACAAAC:1 - chr2L 2437678 3' - roo 2 2 75.25 ATATTNTTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTTGAAGGGAAACGCTCCTTTT:1 + chr3R 12877868 3' - mdg1 32 2 60.40 AGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATATGCGTGGGAAAATCTGAGTTTTTGGAGCTCGAAGGGCGTCGGGGG:1 - chr3R 30325199 3' + 17.6 7401 2 62.38 ACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACATGCACTCCAGCGGGTACCACGACAGGCTAGAGCGCCACAGTGCTAGTGTGTGCTAGTGT:1 - chr2L 16287408 3' + BS3 1431 1 81.19 ACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTGCTTGTGTATTTGTGTAGAACTCGTTTTTTAA:1 + chrX 10264213 3' - 1360 3186 1 70.41 AACACACACACACACACGCATTCAGGGAGGCATGTTTCTTGCCACTTTTATCGACTTGTCTCGAGTTACGCTTATCGATGTCTGCCGATCACGCGCCATGT:1 + chrX 3047207 3' + accord 184 2 63.37 AGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGATCTGTGCGGACAAAGCAAATTTATGTATGCCAAATTGATTGATTGTG:1 + chr3L 3669713 3' + roo 8873 2 53.47 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCTAAGAGCCAATTAGTTTTGAATATTTTGCAGTTACTACAACTAGGACTTGCTAGAG:1 + chr3R 13203077 3' - roo 19 2 60.40 AAATCCAGGAAATCCGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGGTGAGCTCTTTAAATCCAGGAGAGCTTATGGAAGTCTTATTCAAAGTTTTTCCTTCTCAAAA:1 - chr3L 1934738 3' - GATE 283 1 58.42 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGGAAATCGACGGGGATGCAGATGCATTGGAC:1 + chr2L 19679781 3' - Doc 40 1 48.51 AACATTTTTTATATTATATTATTATTTTTTTTTTATTTCATTTGGATTATTTGGTTCTCGAAATGGATACGCATCTTACTTAAGGGGATTAAGTACTTTAA:1 + chr2L 8578912 3' - Stalker2 7176 1 74.26 CTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGT:1 - chr3L 19951192 3' - Ivk 4 1 69.14 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCAC:1 - chr2L 11047995 3' + Juan 4164 1 76.24 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTTCTTAATTAATTAGAA:1 - chr2L 1626513 3' + roo 397 1 66.34 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTGAAATTG:1 + chr3R 25818901 3' - mdg1 20 2 59.41 ATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCGCCAATTCTCGCGCCTGCACTTCCGCATATGCAAAAGCGAGGCTTTCGCAGCTGTTTTCAGTCGGTACGGAG:1 + chr2R 22998060 3' - Transpac 4918 1 83.17 ATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCTT:1 + chr3R 28755637 3' + 3S18 6082 2 43.56 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAATAATAATAATAATAGTATTATTA:1 - chr2R 11367658 3' - 412 7104 2 76.24 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTAACGC:1 - chr2R 17394618 3' - jockey 32 1 53.47 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACT:1 + chr2L 11686057 3' + hopper 1364 1 77.23 GCATTGGCAGAGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGAATAAATTGCGAAAACCCGTTGATGAGCGA:1 - chr3R 22183841 3' + springer 104 2 76.24 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAA:1 + chr3L 8974131 3' + P-element 2855 1 36.14 GGAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTTTGGACAGTGCCTGTCAGTGTACATTTGCATTTTTTATGTTTACTCCATATACATATGTATGCATGCTGAAGTGGAGA:1 - chr3L 22846456 3' - BS3 1541 1 54.46 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTGC:1 - chr2L 326117 3' + roo 9054 2 61.39 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCATTAAAGTGCTCTCCGGTCACGGAGTTCCGCGGCGGCAACAT:1 + chr3R 28781866 3' + copia 220 1 61.39 GGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTCCGATAGTCCTTCG:1 + chr2R 22606006 3' - Juan 4036 1 67.33 GGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAACAACAGAAAAGTTAG:1 - chrX 10653539 3' + jockey 4971 1 54.46 AAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACATATTATCACAAAATAAATTTTGATTGCAGTGCATATATGGTCGCCCTGGTCAGGATCTTTTAGTGTCC:1 - chr2L 7480858 3' + 1360 329 1 57.43 CACCCTTTTATTTGCGCCGTCGATGCATTGCTTATATCCATTTTTTTTTCTTCTTTGGCTCGTATATGTATATGCATGTATAAAGTTGCCGATTTCTCGG:1 - chr2R 17465646 3' - invader2 328 1 63.00 AAAAATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAAGTTGTGAAATACGTGCGTTTATTTGCGTAAAAACTTGCACTGTTTTTTCTGACGCTT:1 - chrX 18354309 3' - jockey 117 1 61.39 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTT:1 + chr3R 9370009 3' + roo 9049 2 57.43 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACTATTTCTGCTTATGATTCAATCCACGAATTTGGTTGCACTCAAAGTGAATTTATATTGCCTACTTAAGCGGGC:1 - chrX 10251705 3' - flea 4758 1 77.78 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATAT:2 + chr3R 9952234 3' - Ivk 44 1 70.30 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATTTTTTTCTTTGAAGCGGTTTCATAAGTCCAATTGAATT:1 + chrX 14713273 3' - flea 32 2 66.34 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCA:2 + chr2L 13447182 3' - HMS-Beagle 6822 2 53.47 GCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATCCTCGGATGACGGACACTTGTATT:1 - chr2L 16894382 3' - invader4 3025 2 76.24 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTGAAAT:1 + chr3R 25818899 3' - mdg1 22 2 57.43 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAATTCGAGTTACATATTTCATTTT:1 + chr3L 12085258 3' - pogo 3 1 74.26 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAA:1 - chr3L 14240829 3' - Tirant 8123 2 56.25 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGACTGAGAATCTTTCGCTGGAGTAATTATTGGCTATATACAGA:1 - chr3L 19215797 3' - roo 8699 2 60.40 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCG:1 + chr2R 8378665 3' - pogo 35 1 64.36 TAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTAAAAATATGTTGACCCCAAGGCGTT:1 + chr2R 11937485 3' + R1A1-element 5216 1 75.25 AAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCAC:1 - chr3L 23933649 3' + Cr1a 171 1 79.21 ATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTG:1 - chr3R 17121625 3' - mdg1 7065 2 51.49 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAACATTTAGCTCATAGTATTTATGTATGAGGGTTTATACAAATTATATTTT:1 - chr2R 13122000 3' - opus 7025 2 60.40 TGTCATCGGTATTTGTCTCAAGTTTATGGTTGGTGTTGAGTGTTTTTTGTTGTTGGTTGAGTGCTTTTGCTCCAATTGTTCTATATTCTTTTTATTTATTA:1 - chr3L 5983902 3' - Porto1 4488 1 79.21 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATT:1 + chr2L 18028727 3' + flea 205 2 76.24 CTTCTTAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTTATTTAAAATTACGAACCTTTGCGATTCTTCATTGCCTACTTTTTGGGGATTAAGTGGACACAATTCA:1 + chr2L 7937338 3' - copia 229 1 64.36 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCC:2 - chr3L 9692653 3' + P-element 2876 1 68.32 AAAGAGCTGCATTATATAATTAGATGATTAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAATCAAAGCCAGGACAGAAAAACAACACGCCTGAGGCGAGCCAAGGAT:1 + chr2L 16085939 3' + rooA 7481 2 51.49 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTGGCCTTTGTCGGCAAAT:1 - chr2L 21089145 3' + flea 238 2 63.37 AAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCTTTCAATACCCAATCCCCAAACTGTACGCTTGACAGTTACTCTCAAACTGTAGCTCGCAAACTGTACAAA:1 - chr2L 13892914 3' + X-element 413 1 69.31 ACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTCGGG:1 - chr2L 7170394 3' - jockey 4650 1 70.30 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACACGTTTCAAAATATATATTGTTTGTATGTTAATTCCCCTGATTGTTTATTTG:1 - chr3R 8636190 3' - BS 5079 1 54.00 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATA:1 + chr2R 13038932 3' + P-element 2833 1 25.74 CATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAAAAAAGAGAGTCCATCTG:1 + chr2L 12074564 3' + Juan 4192 1 55.45 TTAAGAATGTACACCTAGCTCACTCACAAACGCATACACACTTCAGTCATTTCCTTGACGACTGCCAAGCCTCTCATTTTACAAACGACCTTTCCTTTAGT:1 - chr2L 21117246 3' + invader3 133 2 63.37 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTT:1 - chr2L 108024 3' + P-element 2827 1 19.80 ATAAGGAGTACTCCCGTATGTTGGCGGGGCAAGAACTCTACGACTGTACGCTCAGTTGGTTGTAAAAAGATCGCTTCAAAATATCTGTCAACTTCCTGTTA:1 - chr2L 23489036 3' + Rt1a 4780 1 68.32 ATACAATGCAATAACAGACACAACGACTGCGCTGCGTCGTACGTTTTACTTAAGTTTCCTTTCCTTTTTTCCCATTTGGATGAACTCACTCTGGATACCAA:1 + chrX 11816221 3' - BS 5057 1 51.49 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTTTAAGTTGGCCA:1 + chr3L 17699391 3' - 412 29 2 51.49 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGCGTATGGGAGGG:1 - chr3L 958727 3' + P-element 2876 1 66.34 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCATGTGCTCCATCCAGGGTATCCACATACA:2 + chrX 6654789 3' + P-element 2870 1 63.37 TATGGTTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTT:1 + chrX 16798262 3' + diver 182 2 63.37 TTTTTGGTTGTGTGTGTTTTTTATATTTATTTATTTGGTAATACACCGTTGCCCGGTGAATTTTGTACCGAAATACCAGATTAATTAATTAATTAATTTTT:1 - chrX 3789650 3' - Tc1-2 495 1 63.37 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTAT:1 - chr2L 11065892 3' + P-element 2832 1 26.73 TTCTAATGAATTTTAACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATT:1 - chr2L 10291534 3' - jockey 4805 1 70.00 CTCTCTCATGCTCTTCCTCTTGACATATTACACAATATCATTTCTAGGTCTTTAAAATATACTGTGCATCTAAACTAGTTTTGTTGCATCTTGCTTTCCTG:1 + chr3L 5860046 3' - Bica 4 1 63.37 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGTTGTTCATCGGAAA:1 + chr2L 2197176 3' - P-element 3 2 75.25 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTATCACGCGTTCGACTATTCGGCTTGC:1 + chr3R 12091814 3' - HMS-Beagle 6840 2 70.30 GAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTGCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACCAAAAC:1 - chrX 5018644 3' - opus 34 4 69.23 CTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATACATACCTTTCATTTATAGAGAAGTTTATTCTGATTCGTCGA:1 - chr2R 6869019 3' + springer 7486 4 61.39 ATAAAATATAAAAGAATTAATTATCTTAATTTAATTAATTTAATTAATTTATCTTAAAAAAAATTTTACGAAATCAAATCGAATTCGGAAACAAATTACGA:1 - chr4 958799 3' + transib4 2280 1 43.56 TTTTCCTTTTTTAGAAATATATAAACCTGTGTTGGAAATATATCAATTAAAGGAAGTGCGTGTCAAAATAAGTTTTCGTAATATAAAAACTCCGCCTCTTT:2 - chr3L 428188 3' - TART-C 11035 1 49.50 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCATATTAAACGTAAACTAAAAGTACAAAAGCAACTTAGATCACGAGTCACGATTTCAT:1 + chrX 4009358 3' - 412 19 2 59.41 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATACCAATATTTACA:1 - chr2R 23495437 3' + 412 7514 2 54.46 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACAGATTCCGCCCTCAGGCGTATTTCAAGGAAAATGTTAAAGTAATGTAATATAAAACTTTGCAAAATACAG:1 - chr3R 9479414 3' + mdg1 418 2 69.31 ATATTTAAATAATTGAATAAAACTTAGATTTTGTGGTCGCTCATTCGGTTGGTATCTTTTACAGGGTGATCTTCCGCTGGCAGTACGATTCGCATTCGAAA:1 + chr3R 14812206 3' + Bari1 317 1 69.31 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGACAATAAAA:1 + chr3R 29350804 3' + opus 7496 2 72.28 CACCGGACACATCCCGAAGGAGGAACACATTAATTTGTACACTTCTGAAAATTTTTTTAATTTTTTTTTTTGCATAAGTTATATATTTTTATCGATTTGGC:1 - 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P-element 96 1 39.60 ATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACCACCCACCCATTCGTGCGAGTCGTTTATTTCACTTAACTGGAGAATTTCGA:1 + chrX 18200468 3' - micropia 4989 2 53.47 CAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACTAG:1 - chr3R 14324214 3' - 3S18 5816 2 72.28 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTA:2 - chr3L 21708620 3' - roo 8707 2 73.27 ACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTAAACCCAAACCTATTCAGGCAGTTAATTAAGCGACCCTCAAAACAATCTTAAGTTTC:1 - chr2R 7350303 3' + jockey 4733 1 62.38 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGG:2 - chr2L 107998 3' + P-element 2853 1 45.54 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAA:1 + chr3L 13994253 3' + P-element 2839 1 29.70 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTG:1 - 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chrX 17064774 3' + Tirant 8451 2 80.20 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCA:1 + chr3R 7101068 3' - pogo 27 1 59.41 AGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGC:1 - chr3R 25796003 3' - BS 5012 1 58.42 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATATCAAAGTACCTTAAAAAATATATAACTCGTAATTATATAATTTAGTGCAATTTAGCATGTATATA:1 - chr2L 17430629 3' - opus 1 2 64.36 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACTAGACCAACTAACGGTGGTGGCTAATGCTGA:2 - chr3R 14324186 3' - 3S18 5788 2 59.41 GTTTGTATGTGTACTGCGACCCAGTCGGATCTATTGTACTACCCCTTTTGGAAGCCCCTTCGATGCCATTCTGCTTCCGCTGCCTGCTAATTGCCATCTGA:1 + chr3L 14687689 3' - baggins 5417 1 59.41 CAAAGACACTAGAATAACACTAGAATTATTCTAAGGGGTCTGTGGTTACTGCGCATTACGTTGGTCGATCCCCCCTAAACGATCTGCTTTCACAGGGCAA:1 - chr3L 22071551 3' + 1360 1 3 63.00 CTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCAGCAAATGAAGATCGAAGGAATTCCTCAAATTGCCATCGAT:1 - 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chr2L 21687186 3' - INE-1 162 1 62.38 TGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATTGATTGGGGTTCTGCAAGTACAACTGAAATACCGG:1 + chr3R 17121692 3' + mdg1 7417 2 66.34 TCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCACTGAGAACTCCGCCCA:1 + chrX 16798297 3' + diver 217 1 70.30 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCACATAATGTAGAATGTATTTAGAAGAAACATGTCCACGGACAACTAACGGCTATCATGCGATGCA:1 + chrX 1235502 3' + P-element 2878 2 70.30 ATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGTATATATATTTAGATAATCTAGGATTCGCTCTTTGTGTGCATTTATGTTTAA:1 - chr3R 20845039 3' - 17.6 6950 1 58.42 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTT:1 - chrX 4488879 3' + 412 450 2 66.34 CATAANCTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGG:1 - chrX 4796955 3' + copia 217 2 63.37 AAAAACTAAAACTAAAAAGCCCCATATAACCTTATCTGCACCATAACTAATTTCTCAAATTTCTGGCTAAATTAAACAGTGAAGTGGGTGGCCGCACTGTT:1 - 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chrX 5457567 3' - roo 167 2 56.44 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACTGGCGTTATCAC:1 - chr2L 5974415 3' - roo 38 2 65.35 AAATAAAAACAAAAAAAAAATGCTATAGTCGAAGTCCGATCCTCAAAACGTGTGATAATAAAATCACGGAACAATCAGAAAAATATCGAAAGAATAATGCG:1 + chr3L 20226640 3' - hopper 142 2 76.24 TTATAAATGCAACAAATATACTAATTTACATCTCAGCTTGGTGGCCCTTTGG:1 + chr3R 19450204 3' + roo 8607 1 88.46 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCAATAAACTCATCTTCTTCAATTTTTACGGATTACGGTTTACTGTGTTTTTGTTTT:1 - chr3R 446000 3' - pogo 19 1 60.40 AAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTAC:1 + chr3R 846264 3' + Stalker4 95 4 70.30 CATACNTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTT:1 - chr3R 30272808 3' + P-element 2852 1 44.55 CACAAGGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATATTTGCACCATA:1 + chr3L 8924622 3' - Stalker2 44 2 63.37 GAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCCAGTCGAAACGCAGCTGTTTATTTATAAAGTATCTGCCAACTTCCTTTCCAATCGGCAAATTCCGA:1 - chr2L 7867362 3' + Idefix 326 2 67.33 GAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCTTTGATATGACTTTTGCAATACAATTTGATTGTTTAACTA:1 + chr2L 7828550 3' + 1360 416 1 65.35 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGTTGTTCATCGGAAA:1 + chr2L 2197176 3' + P-element 2885 2 76.00 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGGATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAAT:1 + chr3L 13364594 3' - hopper 41 1 68.32 TAGAGATCATGTTTTTAATCACATTTCTTTTTTCGACGGTTCACTGTTTGCCTTGTTGTTGCCTCAATTACCACCTTCTGCCGTGGCGATAATAACCCAG:1 + chr2L 18114555 3' - Tc1 398 1 66.00 GGGTCNCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCGGAAATCACAGAGAGTTCGATAAAAA:1 + chr2L 14241451 3' - R1A1-element 5078 1 68.97 AAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTAAATGCTATAAATT:1 - chrX 868690 3' - jockey 4923 1 64.36 TTTATTTGTTTTTTTTTTGTATTTTTTTTATTATTGTATTCTCTGGGGGGGATAAACACGAAAGTACTTAGAATTGATCGCAA:1 - chrX 19777103 3' + Circe 426 1 92.77 TGCAAGCATACGTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAA:1 - chr3L 8063855 3' + P-element 2846 1 26.73 TTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCATGTGTACATTCCTGATCTATTCCTGATTCTTAGCTGACTGAAGTTGGCCATTTTGATAGTACTTCCGAAAGTG:1 + chr2L 3704974 3' - mdg1 356 2 56.44 AATTAATAATAAACAATAAAATATGGGTAAACACTCAGAATTAGCTATAAAAATCTATATTGCTTGACTATCTAAAAAGGAATACTAACACGATTTTCTTA:1 + chr3R 17129394 3' + flea 4999 2 84.16 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCGAGTTAAATCATTATGGG:1 + chr3L 13194826 3' + 297 360 2 63.37 TATAGATTTTTTTATATTTTATTTATTCTCCGCAAGTAGTTTTCTGATTAAAAGCAGTAGTACTTATCTCGCTGCACTTCTAATTCTAATATTGTCGATCT:1 - chr2L 7029253 3' - transib4 2280 1 73.27 ATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGACAATCAGTCATCGAGTGGAGCTGCCAGTGGCAGCAGTGATGCTCTCGCCTCTTTTCCGCACTGAAAATTGCG:1 + chr3R 16504821 3' + flea 4823 1 62.50 CTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTTTATGTGTGCGTGTTCTTCAGGTGCAGATAGTGGACCTCCGGCTCGC:1 - chrX 5068929 3' - 1360 3265 1 72.28 AGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAAAACGTTAGCGGGTGTGCGA:1 - chrX 328980 3' - opus 5 2 74.26 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTGTTTGTGTTTGCCCTCTTATTATTATTAATTT:1 + chrX 12546517 3' + P-element 2873 1 65.35 AACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCCTGCTAAAAAGCGATAAATAATGAAGTCAGCAAGTGCGGCTGGCATTCTCGCA:1 - chr2R 5849785 3' + jockey 185 1 66.67 AGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTA:1 + chr3R 24282008 3' - Max-element 8268 2 63.74 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACAATATT:1 + chr2R 12446378 3' - jockey 4699 1 52.48 GCAGTAGTTATCCATTAATCCCTACTACATACTCTATGCATTGGAATGTTTTTGTTGTTATTATATCTGGCATTCGGGCTTCGAGTGTTTGACATTGATTG:1 - chr3L 22642401 3' - G4 3763 1 45.54 CTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATAGTAACATTTCCTCATCGAATCCGCCGCC:1 - chr3L 2721781 3' + F-element 4238 1 72.28 TACAACAGTATAGTGAAAATTAATCACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAACAATGAGCACGCGAAATGTGATGATAACGGACCTGGATCAGCCAG:1 - chr2R 15688938 3' + Doc 73 1 59.41 AATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTA:1 + chr3R 15157656 3' + invader3 5422 2 77.78 GGAAACTCTCCGAATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCATCATGTTCAAGCCACTGGTGGACTACAAATCCGAGAGTAGC:1 - chr3R 28519887 3' + Ivk 4932 1 74.26 CTGTTGCCGCGCTCCGCCCGCGAGACGTACACTTCCTCGGTTGCGACATATTCACGCGTCTGCTTTTCTGACGTGTGTTACCCTTGGCCTCCTCTCGTTCC:1 - chr3R 27113289 3' - invader6 343 2 65.35 TATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATTCCG:1 - chr3R 14049327 3' - transib2 12 1 67.33 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCTC:1 + chr2L 108073 3' - P-element 21 1 59.41 AAAATCAGTTTCTTACAAAAGCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTA:1 + chr2L 2437772 3' + roo 9036 1 60.00 ACCGGNTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACTATTTCTGCTTATGATTCAATCCACGAATTTGGTTGCACTCAAAGTGAATTTATATTG:1 - chrX 10251720 3' - flea 18 2 61.39 CAAAANCTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAG:1 - chr2L 19642960 3' + roo 388 2 57.43 TTTGCTTAATAAATAATAAAAATCGCAAAAAATAATATTTGCTTTTTACAGTTGTTTGAAAAACATTAACTTGAAGTATGCACATATATTTCAACTCAGCA:1 + chr3L 19696623 3' + Juan 4053 1 76.24 AATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAAGGAGTCTTTCAATTTCATTCGATTCA:1 - chr2R 21855241 3' + Juan 3806 1 74.26 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTATGATTTAATTTGCCTTTTGCTTACAGTATTTAATTATAATTAATTTGCGTTTC:1 - chr3R 9369919 3' - roo 20 2 59.41 GTTGCNGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGC:1 + chr2R 9014485 3' - blood 7042 2 53.47 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATGCAATTACGAATCAGA:1 + chr2R 19357439 3' - jockey 4692 1 61.00 TGGCTATTGATCCTGATCAAGATTATATAGAATTTCAAAGGATCGTTAACGGTTCCTTTCACCTGTTGCATACTTTTCATACAGCGCGTTTAAATCTTTAA:1 + chr4 521322 3' - INE-1 88 1 69.31 ATAAAAATTAATAAAATAAAAATGAAACAAGCTAAGTGGAATGATTGACTACTTGGGACTAGTGCTTCGCTCTGAACCTAAAGTATTTGCGGTTTTTTCTT:1 + chr2R 25160107 3' + Doc 4695 1 62.38 TCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGTTCTGACTATAAAGACTTTATCCTATTACCGTCCATAGCCTAAAGCATTTAAAGAAAATTATAGT:1 + chrX 10821955 3' + Cr1a 4146 1 53.47 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGAG:1 - chr3L 7792177 3' - 412 7084 2 52.48 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTGTACAGATAGTAATGGGGCC:1 + chr3R 27080818 3' - HMS-Beagle 6803 2 72.28 CCTGTGAAAATATCTCAAAAATTTACAAATTTGTCCAAAAAAGCTGAAGATCGACGCTATCAGATGGAATGAATAATTGTGTTAACAGGCTGGTGTAATAA:1 + chrX 3438528 3' + Ivk 5232 1 69.31 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGA:1 + chrX 19306802 3' + P-element 2839 1 33.66 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 370 2 60.38 GATCGACTCGGCTACTGATCCTGATCAAGAATATACAATATATACTTTATTTTACTCTACATGTAACGGATAAAATAATGTAGTTCCAGAGGAGTTTGTAC:1 + chrX 132329 3' - INE-1 96 1 64.36 ACCGAATTCGGGCGGCCACTTGGATTGTAGGCTTGCCTACAATGGTTAACGGAATATGTGTGTAATTTGTTGCTATATGGTTGCAGTTCATTCCGACGTCG:1 + chr3R 12251729 3' - Doc4-element 443 1 74.26 ATTATTTAAACTATCCAGTACCTTGAAATTTTGCTTTATACTAATAAATGTATAGGTCAAACCTATTCAGTTGAGACAAAAAAAAAATGAATGAATTGAAA:1 + chr3L 2401765 3' + Tc3 1468 1 51.49 GCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGCTAAGACCAAAGACGCTCCTGCCA:1 + chr2R 6487174 3' + 1360 3333 1 77.23 AAATAAAATAAAATAAAATAAAAGAGAAGCGGAGCATAGAGAAGAAAGAGAAGCAGAAACGCAGACTCAAAACTCAAGTGTGGA:1 - chr2R 12980160 3' - transib1 1897 3 88.10 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATAT:1 - chr3R 10445200 3' + roo 9033 1 63.37 TATAAATTAATTAAATATAAGGTGCAGGTCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACGGGGGGTTCGTTCGGGATCGTATTGTATCGGTCG:1 - chr2L 12587720 3' - springer 7524 1 74.75 AGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTGCGCTTAGATCGCTTTGCAGCCATATGTGTGATAATGC:1 + chr3R 25632651 3' - Tirant 8347 2 60.40 ATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACAAAAGGTTGCCAACAGGTGG:1 - chr2L 1694050 3' - copia 5083 2 80.00 AAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAA:1 - chr3L 17122417 3' + roo 9036 1 61.39 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACT:1 + chr2R 5084063 3' - F-element 55 1 71.29 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAG:1 - chr3R 11993308 3' + P-element 2838 1 30.69 ATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCC:1 + chr3R 15157659 3' + invader3 237 2 75.25 GACTTGCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATTTCCCTCCAACTATCTCTTTGTCC:1 - chr2L 10291511 3' - jockey 4783 1 52.48 GTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCCATTCCAGTCTGCCAGGTCGACCCAGCTTTTTTGTTTACGTTTTCGTTTT:1 + chr3L 1307195 3' + F-element 269 1 56.44 AAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATAACAATATAACTTAAATTTATTTTCTAATT:1 + chr2L 1129132 3' + HMS-Beagle 205 2 73.27 AAGCAGGACCACCACACCAAACGCCATGAGCTAGCGCCGGATTCTAAGTCGTGGCAAGCGAGTGATTGTCAATTGAAAAACATCCATAAAATTTAAGTGGC:1 + chr2R 23615605 3' + Gypsy12A_LTR 2171 1 51.49 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACT:1 - chr2R 12779100 3' + roo 9031 1 64.36 AGGATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGTTCGCGCGACGTTTTCTGCCGCTTAAGCGAGGCATGTCTGCGCTAAACAAATTGTTAAATTTAT:1 + chr3L 21802502 3' - invader1 3996 2 72.28 AACGGGCAAGTTGTTATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGTTATTGGCGGCTTGGTTTTGTGGAT:1 + chr2R 18944599 3' - I-element 4996 1 65.71 ATATATATTCTTATTTTAAAATAAAATAAAAGTTAGATTATTCTAAACACAAACTATCTCCCATTTAGTTATATTAATCGATGAGTACGAGGACTTCGAGG:1 - chr2R 10146411 3' - P-element 2597 1 74.26 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTT:1 - chrX 16798204 3' - diver 5920 2 54.46 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCAAACGATTCGAAACGAAACGAACACCGGGCGAAACCTCTAAAATGTTTTCATATGCAGGCTAATTATGTGGCTGC:1 - chr3R 16609516 3' + 1360 3387 2 78.22 TTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCTTAAATTGCATTATATCTTTTTA:1 + chr3R 24282049 3' - Max-element 2 2 78.22 ACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTTGTTGTTGATATTTGGACGTGCAGTCGAGCGAAAAGAAGAACACAGACCTCTCCAA:1 + chr3L 13829732 3' + Quasimodo 448 2 65.35 TATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTGAACGCTTTAAGAGAGGCAGATAGGATAGGA:1 + chr3R 20845147 3' + 17.6 7416 2 76.24 TCTGCCGCTCTTAAAGCAATCAATTTAAACATTTTTAGTACATATCTAATTGGGTTTTTAGTTTGTTTATATTAGTTTTTATTAATTAGGACGACGCTCCA:1 - chr2L 13499815 3' + Cr1a 4246 1 63.37 TAACTCCTGAATGGAGAAAGATAGTTATCATTGGGTTACACTAGCCCATATCTTTTATAATACAGTGCAATCCATTGCAACATGGAGGAGTGAATTTCTTT:1 + chrX 3477002 3' + Transib-N1_DM 41 1 62.38 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAATCAGGGTGGAATGTAA:1 - chr2R 3188658 3' - 1360 10 2 68.32 TTGAATGTTGGTTTTCAAATCTTGTAGGGATATAAAAAAATAGATATATAAAAAGTGTACGACGACTTCTACTTAAGAGCAGATCAGAACGCCAAAGTTCA:1 - chr2R 1774687 3' - mariner2 655 1 71.29 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCATGTGCTCCATCCAGGGTATCCACATAC:1 + chrX 6654788 3' + P-element 2869 1 62.38 ATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTCGACGTAAATACGGACATTGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATAAAGTCG:1 + chr3L 12364635 3' + INE-1 93 1 79.21 TGGTAGTTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTACAGTGGACGTGGCAAGAATTTTTTTTTTGCAAATCGATGACTATTTACAAGACTAATAAAAATGTGTAAAAA:1 - chr2L 22063437 3' - INE-1 350 1 67.33 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGGAAATCGACGGGGATGCAGATGCATTGGACACTGAAAA:1 + chr2L 19679789 3' - Doc 32 1 56.44 TGGAATTCAATGTCACCTGCGGCTTCGAATCTGCGACGCAATTCAGTTCGTATGTGGCTGTCCGTCCGGTCGTAACTACGCCAATAATTCTGACCCGGCC:1 - chr2L 3575293 3' - R2-element 3155 1 60.00 AGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCGATGGCCAATATTTGAGGCTTCTTGTCTCTCGTAT:1 + chr3R 18861911 3' - 1360 3227 1 69.31 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGGCTGCT:1 - chrX 12538462 3' + roo 9030 1 65.35 TTTGGGCACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATTAGCAAGTTCAATGAGTGAATTTTAAGCAAACATCAAGTTACG:1 + chr3R 19467945 3' + Transpac 279 2 55.45 TGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTTTTATTGCATACTTTTGTGCGCACTCACGTTAGGTTA:1 + chr3L 14603362 3' + jockey 4985 1 71.00 TTTCTATCCACTGCAAAGCACTTTTACACGGCAAAAAATTCATAAAGAGTGCTCATGTATAATCAACAACATTCTATTTTAGCATCTAAGTATATAAGTAT:1 - chr2L 20946928 3' + jockey2 96 1 59.41 TAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAAAAAAAAAGGGAGGGAGAACATGCAATGGTGGGCCAGCGAGCAGCTCCATGGCC:1 - chrX 20417672 3' + Rt1a 5035 1 55.45 CGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAAAAAAATAAATATTTTCGAGTTGCCGA:1 - chr2L 12074393 3' + flea 4940 1 80.20 CAGCCATTTGCACAAGATTGGCATTGCAGACAATGAATCTAGTAGAGTTCAGCTCATGGAAGAAGGGAGTAGACCGTATTTTGGAAATAATAA:1 - chr3L 25351088 3' + baggins 5163 1 65.59 GGAGCAATGCCGATGGAGAGCGCCAGCAGCGTGAGTGGAAGTGCCGGGTACATCATGTACTGCGCTTATTCTCGGATTTTCATGAATATGTGAAATATGCA:1 - chrX 20089638 3' + R1A1-element 373 1 68.32 AGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTAAGTGAGTACGGTTAGTAAGATATTTTATTCTACGAAACTCATATAAAACACACTAAGTATAATTGATACCAT:1 + chr3R 19914439 3' - jockey 4764 1 65.35 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGGCTGCTGCCT:1 - chrX 12538458 3' + roo 9034 1 61.39 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATCATTTCTATTACAGACTTATTTATTTCCCAGTAGCATAAT:2 - chr3L 17698189 3' + 412 7504 2 61.39 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACATATGTTACATAGGCTAGCTGTTATGTATTGCTTTATATGTCTATATAGCCCAGATAAGCCAGCGTGT:1 + chrX 6997260 3' + P-element 2879 2 71.29 CATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCC:1 + chr3R 10957716 3' - 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Stalker4 40 4 62.38 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCTCCATCTCCAGC:1 + chr2R 19936715 3' + roo 408 1 81.19 GCGACNGGGCGTATGTTTATTCGCTGTGGTTAGTTTTTATTGTTGCCATATCTGTTATTATTCCGTATGCTTAATTTTTTAATGAGCGTCGCTCGATTTGT:1 + chr3R 29769925 3' - GATE 157 2 69.31 CAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTGAGAGACAGGGCGACTGGAGAAAGGGAGCACGAGGAGCACG:1 + chrX 3830980 3' + jockey 4606 1 59.41 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTATATTGT:1 - chr3R 10445178 3' + roo 9057 1 63.64 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATC:1 + chr3R 30272846 3' + P-element 2836 1 25.26 AGATAACTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTTCTTAGAATGAAAATTCCCTTACTATTATTATTCATTCAG:1 + chr2L 4009516 3' - pogo 31 1 56.44 TCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTTTCTGGC:1 - chr2R 10673392 3' + Tirant 8468 2 63.37 GTTGGTACCCATATCGCGAGTAGAGCCTTCATGCTCGACATTTGAGTTACGGTGCTGTTTGCGCATCAGGATTACGTTTACGCGTGTAAACTAATAAAATG:1 + chrX 5592228 3' + R1A1-element 5015 1 58.42 TTTAATTTTATTTTAATTTTGCTTTTATTATTTTCATTATTTCATTGCTTCATTATTTTTCCATTCAACTTTGCTTAATTGCGGTTCTTTTTGACCAGCCG:1 + chr3L 7031647 3' + Rt1b 127 2 78.22 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGAATC:1 + chr3L 21384053 3' + roo 389 2 59.41 CCGATTAGATTAGGTTGTCTAAAAAGGGCAAAAGGTACGCTAATCCGTTAAATAATTTTGTTTAATAAATTATTAAAAAAAAAAACAAATGG:1 + chrX 10609077 3' + jockey2 3338 1 88.04 ATTATTTGTTCGACTCGAAAAGTAAAATACGTAAGTATATACATAATCGTTGTCCTGTGATCCTACGTTTGTTATAAGTAGAATGTGTTACTACGTTGAAT:1 - chr3R 21848078 3' + rover 332 2 65.35 ACTAGCTGAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGCATAGCATTTTCTCTTGTTTTTTATTAAATACATTTACGGAAAGGTGTGGGCGTGGCAGTTCTGGG:1 + chr4 479198 3' + INE-1 542 1 75.51 AAATGGTATCCAATACCATTAAATATGAAGAGTCGCACAGGAAGGCATAAAAGCCGAAAATGTTCGAATCTTATGTT:1 - chr2R 10239013 3' + HB 460 1 72.73 CACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTAAGTAAACATTGCATGGAGGGATAAACCTAATGCGAAACTAT:1 + chr3R 19447041 3' + Tirant 407 1 68.32 GAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAAGCTTACTTTAAGTTTGCGGGTGTGAGATTAAATTAATTTAGTTTGAAATCCAAGCGTTGC:1 - chr3L 1020915 3' + F-element 4382 1 66.34 GAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTATCGAC:1 - chr2R 10863881 3' - mdg3 16 2 60.00 CATAAAAACTTCAGTGTTGCAACTTAAATGTTTTTAAATATCTAATCTGTGCGGCGCCAGTGCAGCATCCTGGATTCGAATGACCAACGGTTGCTGTC:1 - chr3R 20618012 3' - transib3 131 1 63.27 GCGAGGGCGCTTCTTGCTTATGCTTACGTGGCTATAAATACGACAAGGATGCGATGTCGATGGCTAGGGCTGTCTGGCATTTTTAGCACCCTGGCACCAC:1 + chr3R 5436260 3' - Tom1 200 1 70.00 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGTTTGGATCTGGCATATTGCCAGCCATTGGCTTCT:1 + chr2L 15344195 3' + transib2 2812 1 54.17 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTATGTTATTTATTTCATGTATGTATGTTATTTCATCATGGTGACGACCTCGCCGCAGTAGATCGC:1 - chr2L 2197103 3' - P-element 14 1 31.68 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCT:1 - chr2L 108003 3' + P-element 2848 1 40.59 ATTCANTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATACAAGAATTCTCCTTTGACTATG:1 - chr3R 18881519 3' - roo 52 2 77.23 GCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACA:1 - chr3L 23146515 3' - 1360 60 1 85.15 GGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAG:3 + chr3R 15157689 3' + invader3 267 2 66.34 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCT:1 - chr2R 17394653 3' - jockey 35 1 72.46 CTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTTGGATTAGTTTTCTTCCCAGCTTTCGTATTAAAAAGTGGTCACCTAACTACTGTACAACT:1 + chr2L 12394020 3' - Doc 4544 1 53.47 AATCCNTAAGACGCCTGCAGAGAACGCACCCGCTTGACCTCACTCAACATAAAGTCAATCTTCTTGATTAATTAACATTTGCAGATGGATTCCGTGGAAAC:1 + chr3R 7840034 3' + G2 2905 1 58.42 GCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGG:1 + chr2R 5084084 3' - F-element 34 1 50.50 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTA:1 + chr2L 326213 3' - roo 19 2 61.39 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCA:1 - chr3R 20466628 3' + roo 386 2 57.43 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTAT:1 - chr2L 1129083 3' - HMS-Beagle 44 2 70.30 TGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTC:1 + chrX 22386792 3' - hobo 55 1 61.39 CACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGAACATTAAATCTAATTTTCTTTGTAAATTCAAATTCATTTAAATTA:2 - chr3L 1495306 3' - Ivk 34 1 58.42 TTTAATATATTTTTTTCAAATTTAAAGCTAACCATTAAAAGCAATATTAAAAA:1 + chr3L 3259066 3' + copia 4665 1 67.92 CGGCTTATGTTTAAGCGCTCGATCGTATTTCAAGAGCTGGAGTGTTCATGTAAGTGTTGGTGGTCTTTTGCTTAAGTTTGGACTGCTTCTTAAATATTTTT:1 + chr4 464256 3' - Stalker3T 132 1 73.27 ATTTATTCATATTGGAACTACAAGCACAAATAACGAGCCTCGGATACCTTTACAACATATATGGGGTTCATATTGGGGGGGCTCTTTTTTTGAAAGAGACG:1 + chr3R 23137510 3' + R2-element 225 1 53.47 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGCG:1 + chr3R 28326773 3' + P-element 2880 2 68.97 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCATTTGTTCTTTTTGG:1 + chr2L 3694184 3' + roo 400 1 67.33 AGCGCNATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGGAAGGGTATACATGACTATATCACCCGCCAATTCTCGCGCCTGCACTTC:1 + chr2R 22998011 3' - Transpac 42 2 67.37 ATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAATATTCTTTTTTTTCTAGAATTTTAGTGCAAATTGATTCTTCTCCATT:1 - chr2R 617166 3' - diver 32 2 54.46 TACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAACCCTCGATTCGGGTCCA:1 + chr3R 10741154 3' - 1360 3353 1 42.57 ACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCACCTCATCAAAGGCCACCTGCATCTGATCCTCGTCATTGCTGAGTCCCAGTAAACTGGCCAAAAACGACAC:1 - chrX 20467686 3' - INE-1 31 1 69.31 CCAGTCCTAAATCGGTTATATGAAGGTGCATGGTTTTTGTGCGAAAAAATAGTTTCATGTGCTTAGACCATAGATATATAGTATGTATAATGCTTCAGAAC:1 + chr3L 7927344 3' + flea 287 1 76.24 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTAAATCATATCAGT:1 - chrX 18717141 3' + roo 9048 2 54.46 CATATGTATATGTATGTATGTATGTACGTTTGTATATTTGAATACCCGCCAGATCTGGCTACAAGTGTATATTTATGCGTTTTCGAATGCAGCTCAACTCA:1 - chr3R 16713687 3' + Stalker 247 4 75.25 ATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGGCCGAAAAAAGTATTAAAGTGGCGCATTTTTTCGCAGATCTATAAAAGTTTAATCATTGCACTCA:1 - chr3L 14932917 3' - 1360 3209 1 54.00 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTCTAACTTATAATTTATATAAATTTCATGACTTTAGTTTCCTCTATTTAA:1 - chrX 20974843 3' + opus 7481 2 59.41 TTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTTTCTGGCCAAACGCTCAAAAC:1 - chr2R 10673378 3' + Tirant 8490 2 58.06 TTTTCTTTTTTTGTAATATATTAAGTCCAGTCTAGAGTTAATATATTACAAAAAAAGAAAATTATTTCAAAAGCTAAGCAGAAATGTGAAATATCAGATAG:1 + chr3R 14635056 3' - BS4 733 1 79.21 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCGTGTACTCGATTGTACAAAATAATTAAAGCGGGG:1 - chrX 6997147 3' + P-element 2878 2 69.31 CGAGGGATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAACTTTATTCTTTAGTCACT:1 + chr3R 15998149 3' + pogo 2076 1 54.46 GGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGAAAATAATATGCACTGTCATTGTAATTCGCTTGATTAATTCTTGTGAAGGGTATTTACTGCAAGCAGTTCAGG:1 - chr3L 6911011 3' - Max-element 8345 2 75.25 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGC:1 + chr2L 14490450 3' + P-element 2851 1 43.56 TAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACAT:1 - chrX 1427542 3' + Bari1 1665 1 64.36 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTA:1 - chrX 7787241 3' + roo 9029 1 67.00 GTGTGNGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCC:1 + chr2L 15955328 3' - Quasimodo 31 2 61.39 TTTTTTTTGTTATTTTATAAATTGTATTAGCCTTCATTATTTGCTCGCTTGAACTCAACTTTTCCAGATTTCTTTAGCAGAGCATTTGATTATTCTGCTTG:1 - chr2R 22449300 3' - HMS-Beagle2 479 1 45.54 GAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACG:1 + chr3R 9952254 3' - Ivk 24 1 54.46 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGTGCAACCGATA:1 + chr3L 13312221 3' - mdg1 24 2 55.45 CGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTAATAGTCTAGGTCAATTTCTACTAGACAATATCTGGATTCTATTGCGTGCATTATC:1 + chr3L 21709002 3' - jockey 149 1 62.38 ACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCATACCGCCCAGACTAATACCTAATGCAGTACCAAA:1 + chr2R 4887214 3' + Doc 4466 1 66.34 GAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACGATACTCCCGGTCAAGTTGGCACCACTCGACAGGACACTGCCACGCTGCATGC:1 - chr3R 12798118 3' - R1A1-element 5029 1 56.44 GAAAGACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGC:1 - chr3R 25823658 3' + hopper 1390 1 61.45 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTTCAGGCTGCTCCAATTTGAGCTGAGTTTCCGACTCGTGAAGATTAAAATTGTTTT:1 - chr3R 25918881 3' - roo 8684 2 58.42 CTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTT:1 - chr2L 18112504 3' + transib2 2796 1 53.47 CGGAANGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATGCGTTTGCAACCTGCTAATCAAGAGTGC:1 - chr2R 22997934 3' + Transpac 5220 2 70.30 CACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTAAGTACTCGAATTGCTACCGTGGTGGTGTGCTTCTTCCTCTGCTGGGC:1 - chr3R 14101297 3' + R1A1-element 5318 1 51.49 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAACGAGCGCATCCATAA:1 - chrX 4041506 3' + hopper 1389 1 51.00 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAAGAATATTATTGCAACAAAAACATAGGTATATCATTAATCATAAAGAAGAAATGATATGGAAAAATTTTAAA:1 - chr3R 19224820 3' + hobo 2935 1 75.25 GGTAGATGGTCTTAGTATTTAATATTATATTTTTAGTCAATTTCGTTAATACTGTCTGTTCTCCCTAAGTTTTTTTTTTTAATTTTATTTTCTGTAATCAT:1 + chr3L 25255931 3' - Burdock 421 1 75.25 AATTGCTGGCTTGTTATGTACAAATGCCTGTTTTGTTTTTAGATTTTGTGGTAGTTGGTAGTTTTTGCATAGTTTTGAAACGCAAGAAATTTAATTTCTTG:1 - chrX 6880429 3' - I-element 5212 1 66.34 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATCATAAAATAAGAAGAATTCTTGTCTTAGCCATTACATTATAACAACTCGGATATGCACTTTTTTTTT:1 + chr3R 6431117 3' - 3S18 8 2 72.28 GTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTTTGCTATATCGTGCCGTGACGTTTGCTAAGAAAAAAACACGTGCCTGCTTCACTTACTCCACGCTGTGAAC:1 + chr3L 6972284 3' - Bica 351 1 57.43 GAGCTGTTCGCTGTAGCGTTCTTCGTTCTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAAAATATATATGTTTTAGCAATAAATGAATAAGTTTAAAGGATATCTT:1 + chrX 21205165 3' - 1360 123 1 66.34 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAAAACATAAATTGCTGGGC:1 - chrX 13548753 3' - blood 39 2 65.35 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGTTGCTTCATATTAGGCCATGGTCAGTCGAAAGCAATTCTGCCGGGATGGCACC:1 - chr2R 19936603 3' - roo 8685 2 59.41 TAAATAAATAAATAACTAAATTCGCGATTTGCTGCCGCAATTACGTTTCTACGGGTACACGAGACATTGAAGACGCAGCCCATTAATTGGATTACAATTCT:1 - chr3R 10136672 3' + HeT-A 31 1 76.24 CATTCAAAAAACCCTTGAATGTTTTCCAGCATTCACTAATTGCATTAAAAAAGAAGTTCATACCCCCATCTCCAAGCCATTTCACATCGCCGTCTGG:1 + chr3R 15570369 3' + HB 431 1 78.35 CTCAAACTGAACTTTGATAATTATTCTGGAATTATCGTCTTGACAATCAATTCACGTTTCTGACCCTATAAAATACATATATTTATAATATATATATATAT:1 + chrX 3391354 3' - Idefix 7283 2 78.22 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAAGGATTTGAGATGCACCAGAGCGTCATTAAGTGCATCGGTGAGAGCCAAGGCAACAATTTAATGTCCA:1 + chr3L 22921373 3' - copia 4897 2 71.29 TATACGATATCAATAAAATATTAGCCCATCGGCCCTGGCTGTCGTAATCCGGATTTGCATTGTTGAGCGAGATCTCCGCCAGCACTGGCTTCCC:1 - chr2R 23731379 3' + transib1 1923 1 63.83 GCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGAAATATATGAAACAT:2 - chr3R 16626766 3' - I-element 5271 1 63.37 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATATCATTTGAGCATGCTGCAGATG:1 - chr3R 28823251 3' - 1360 65 1 77.23 GTTTTGTGCGGTTTTTGGGCGTTAGAGGGGGCGTGACCGACTGCAATGGACACCAAATCGATTCAACAGGTGGCCGGGTCATAATGTATCACATGGATTAC:1 - chrX 19243816 3' - INE-1 345 1 75.25 TAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCCAATAACCAAAAGGACACACGTGTGCCTTTAAAATTATTTC:1 - chr2R 8849489 3' - mdg1 389 2 59.41 AATAACAAAAAATAAATAAAAACGTCCCCTAGTTCCATATTCCACTGTTCCTCCACCCCCGCCAAAACACATCTTAAAGATATTGGTATTTTTTAGTACAT:1 + chr2R 13168485 3' + Doc3-element 76 1 91.09 GCTAGNACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGT:1 - chr3R 9952198 3' + Ivk 5330 1 56.44 ATGTACGCATACCACATCTCCCTCATTTTATAATGTGTGTTTATTCGTGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGTGGCCCTTGTCTTGTGGCCCTTGA:1 + chr3R 3355220 3' - gypsy11 3971 1 76.24 GTTTATTAAGTAAGTTTAGTTTATAACCACTTCACTCATGTTTTCCTCGTAAAAGTTGAATACCCAGCTCAAAATGGTTTTCTTAATTCCATTTAAACGAA:1 - chr2R 13551664 3' - HeT-A 355 1 70.30 ACAAATTGTTGTAGCTCTTTTCAAATTTTTATTTTTTTTTTTCAATGCTACGGTGACCAAATAGGCTTACTCGACTTTGAATATCGTTTTAGACACCATT:1 + chr2R 15051100 3' + hopper2 1214 2 54.00 GACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCGCAGAATTCAAATTTTCCAGATAATCGATCGAAATTGCCA:1 - chr2L 2921310 3' - hobo 2748 1 57.43 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCT:1 - chr3R 7522294 3' - blood 25 2 54.46 AGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGAATTTAGACTACCTGCTCATAA:1 - chr3L 5015625 3' - I-element 5172 1 78.22 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTGCTC:1 - chr2L 326115 3' + roo 9056 1 63.37 TTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACACAGTACCTCGAACGGACAAGTTGAATAACTTGTTGTCAATGACAATATTGAGTTTTAACAAATA:1 + chr4 299930 3' + 412 7543 2 71.88 ACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCG:1 + chr3R 9952260 3' - Ivk 17 1 61.00 ATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAACAGCGG:1 + chr3R 24729657 3' - Juan 4102 1 52.48 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTTATTTAAAATTACGAACCTTTGCGATTCTTCATTGCCTACTTTTTGGGGATTAAGTGGACACA:1 + chr2L 7937333 3' + BS 5084 1 59.41 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATCGTTCTTGTCAGGCAGTTGAGTATCGAAGTGTATGCAAATTATTCTTACAAAGTTGCAAGATTTATAAAATT:1 - chrX 4489207 3' - 412 39 2 74.26 TGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGCTCTCTGAAGGATCAGGCTCAGCTCCACCACCAGGACATGG:1 + chr2R 9795589 3' - 1360 3243 1 59.41 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCATGAACAATACGTGTGCTGTCACTGT:1 - chrX 3464229 3' - hopper 47 1 71.29 CGTCCTTACGGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATCGAGATGACGGGAACCATGTCTGGTGGCGGCAGTCGTCCTATACGCGGAAAAATGGGCACCCAG:1 - chr2L 16735782 3' - Rt1a 4737 1 80.20 TCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATCCTCGTGGTGCAGGTCGGTGGCTATAATGGCCACCTGGTAGGGGCTGTGCAGGTAAGGTGACTCC:1 - chr2R 12180706 3' - accord 281 2 69.00 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCCGCCACTGCTTATGCATAAAGAATGAACTGTCGAAGCGTATACTTATAATTTGCCTATTGATTTCTGGATT:2 - chr2L 11685977 3' + hopper 1413 2 72.28 TTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAAC:1 - chr3L 18154150 3' - I-element 44 1 63.37 TTTATATATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTC:1 - chr3R 14169271 3' - blood 7066 2 78.22 ACTCANCGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTC:1 - chr2R 9862194 3' + roo 393 1 58.42 CCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAAACTGAAAGCTCAAACACACAATCTCGGTCTTATCATTTTTCGTAT:1 - chr3R 19225096 3' - FB 32 1 62.38 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTGTGAGCACCAAAATGTAGGCAACATAACATAACACAATACATATGTAATTTT:1 + chrX 9248372 3' + pogo 2087 1 64.29 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTTG:1 + chrX 14796919 3' + transib2 2792 1 58.00 TTTAAAAATTATTTTATTTTATTTTTATTTTTTTTATTATTATTCAAAAATTATTTTTAGGCGAATGCATACGCATTAAAAGCAAATCGATTTATTCGGTT:1 - chr3L 17652820 3' + 1360 3094 1 57.43 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCG:1 - chr2L 7548018 3' - blood 53 2 78.22 ATTCAATTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATACAAAGAAATTAACCACAGG:1 + chrX 18012724 3' - roo 8716 2 80.41 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCGCCTTCTGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAGTTTTAAAC:1 - chr3R 11993300 3' + P-element 2862 1 45.88 AAACTGAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGTCT:1 - chr3L 24531543 3' + roo 9054 2 62.38 AATTGAAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTTAAATGATATGTAATTAAAAATAAGCTATACAATACAAGCTTAG:1 + chr3R 19224914 3' - hobo 32 1 56.44 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCT:2 - chr3L 20248315 3' + Transpac 265 2 80.20 AAAAAGTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCA:1 + chrX 8958634 3' + Doc 4697 2 75.00 TGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACT:1 - chr3R 14324216 3' - 3S18 5818 2 74.26 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAA:1 - chr3R 25702185 3' - Tirant 35 2 61.39 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAACCTTACAAACTGGGAACTAGAACTTTTCAAAA:1 + chr3R 19657543 3' - roo 7 2 72.28 TATAAAATATAATTAAACAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAATAAATTAAAATATTATTACGACATATTTCATAAACATAATAGATACCTACATTC:1 - chr2R 20855861 3' - S-element 1615 2 59.41 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGAATCTTACCATTTTGTTCTTTTGCTGAGTATCCTTTTT:1 + chr3L 5975653 3' + hobo 2903 1 63.00 ATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCG:1 - chr3R 21695430 3' - 3S18 5791 2 54.46 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTGACATTATTTGAATTGAAT:1 - chr3R 19467854 3' - Transpac 4931 2 68.32 TTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGGACAAAACATTTCGGACGATGAGTCAGTAGCAACTGCACCAATTATGACAAACGAAAAAAATAGGTCATGGTTTACT:1 + chr2R 3595840 3' - roo 8663 1 80.20 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAATTAATGTGCCCCCCAAAGCAGC:2 + chr2L 14490482 3' + P-element 2883 2 75.25 ATTATTTTATTTATTTTATTTATTATTTTTACAACTCTCATACCAAATAAATATGTTAAATGAAATGATATAAAATGGTTTACTTCCCCATTTTGTGCAGT:1 + chr3L 16258161 3' - HeT-A 5 1 69.31 GTAAAAAAAACAGGACAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGACTGGCTTGGCCCG:1 + chr3R 25823734 3' - hopper 10 2 68.04 ATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCATAAGTTATTATCA:1 + chrX 21668164 3' - Stalker2 7250 2 77.23 GTGTGGTCAGTTTTCCTAGCATGCACTCTCGGCTGGACGACCTGCAGGCTGAGGAGGCCCACCACCTGGCCCTCATCTGCGATCTTCACGACAACGACCTG:1 - chr3R 24648881 3' - R2-element 3513 1 82.18 TGGCTTGTTCGCGGCTATGCTGGCGAACAGGGGGGCTTAGAAAAGCGGTCAACCGACAGCCGTCTCCGACTACTGGCCTTTTTTCGAGCGCCAATG:1 - chr3L 23823464 3' + Rt1b 4709 1 64.58 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAAAG:1 - chr3R 11165632 3' - Tabor 26 2 57.43 CACACACACACACACACATTCAGCCGAAAAGCACGTGCTCCAATGGAAACTGGGCCACACGGACAGAACCGTGGACGGACAGAAAATACG:1 + chr3L 7032353 3' + accord 186 2 77.78 AAATTTAAAATTTGTTTTAATTTTATTCCCCAATATCAGGAATGTTTATACAAACTACGAAACAAATTATAATTTCGCTACTCTTGGCATTCCAAACTGGT:1 + chr2R 11062842 3' + 1731 4262 1 70.30 AAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATTGAAATGCCATATGATCTAATCCTTCATTAGATACACACCATATGTATGTATTGGAAACACAAT:1 + chr3L 9121907 3' + Transpac 304 2 74.26 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTGAGTGTCCT:1 - chr3R 7100963 3' + pogo 2097 1 69.31 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATG:1 - chr3R 31644166 3' + roo 9041 1 81.69 ACGCCAGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGCAGGTGGACAGGTGAGCCGGAGTGATTGTTGTTGGCTGACTTAAGTGCCAACTTGAAGCAA:1 - chr2R 20487220 3' - Chimpo 4224 1 60.40 GGTGAGCTAATAAGTTAAGTTAGTTGCAATTGTGAAACTTACAAAAAATGATCCGCGAAAGTTGTTGGGAGCAGCTGCGTGCATAGACGAGCGGAATAG:1 + chr3L 24880579 3' + aurora-element 4217 1 64.65 TTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCTTAAATTGCATTATATCTTTTTAT:1 + chr3R 24282050 3' - Max-element 1 2 79.21 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACAGCGAACAATTTAAAAATGCAGCGCATTGAGTACTTAAAT:1 + chrX 8352242 3' - blood 7050 2 62.38 ATTCANACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGTAGAGCGAATGCGAAAAAAAAAATA:1 - chr2R 9387342 3' + Stalker2 354 2 70.30 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATAT:1 - chr3L 9772219 3' + 297 6929 2 77.23 GGGACTCTCAACATCACCACGAATAAGCTTACAAATAAAGGTTGCTGACCTTAAGCCAAGTCTTAGGTCTTTGTCTTTGTCTATGCAGCCGGAGTAAAGTT:1 - chr3L 22146387 3' - Cr1a 4060 1 66.34 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTCGCAGCTTTTAGGTAAAATCGGCGTTCTTTCGAACATTGGAGAATCCAGAGCCACCTGGAGTCGCATTCT:1 + chr2R 9426536 3' + P-element 2883 2 75.25 ATATGTTTATGTTAGGTAATTTATTTTATATACATAAATTGTTAATTTAAAACATTTATTGGTATTGTCAGTCGTGCCCGTCAGCACTTGTCTCATCCCAT:1 + chr3R 21676153 3' + Tc1-2 1505 1 74.26 CCAGCATTGGGCCGGATACCCGTGCGCAGCCGGGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTGTTAGCTAAAGGAATCATTTTAAGCACAGAGAGGAACTA:1 - chr3R 9571191 3' + Gypsy6A_LTR 68 1 76.24 AAAAANTGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGG:1 + chr3L 12085210 3' - pogo 51 1 77.23 TTGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCTCCTTTCCCACTGATTTTTCGGTTTTTTTTTGTTTTCGATTCTCGACGAAGGTCAAAGGGAATTT:1 + chrX 17064840 3' - Tirant 8119 2 63.37 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGGACAAAACATTTCGGACGATGAGTCAGTAGCAACTGCACCAATTATGACAAACGAAA:1 + chr2R 3595820 3' - roo 19 2 60.40 GACCGTGACAAAGGATCGTTATAAGTTGTATCACAAGCGGTTTCCTTTAGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAAT:1 + chrX 21555681 3' + mdg1 447 1 77.23 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTT:2 + chrX 14796918 3' + transib2 2790 1 59.41 AAAAGGAAATAGAAAAAAAAAGAAAAACCCTTAAAAGGCAAAGGTATCAACATGTTGACAATCTGTTGATATGTTCATTGTCATTTTCCCGTTTTTTTCCC:1 + chrX 18362049 3' + Doc2-element 239 1 70.30 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGAT:1 - chr2L 1156732 3' - 412 13 2 60.47 TCCAATTCCTTTCTATTTCACCACTTACTAATAAAATCGAATTTCATGGCAATTGTGTGCAAACAATTCTTTCGGTAAGAAAAACGTACAGCTGTGTTCAA:1 - chr2R 15243808 3' + accord2 7315 1 68.32 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATTAAAAATCATCTTATACCTTACTTGAAAGGATCCCA:1 - chr3R 10971874 3' + BS 5081 1 62.38 TATCACCTTGGCAAAACGGACAAGTTGGTAATGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGACCTTCTTGTGGATATTTCTGTGCATCT:1 + chr2R 6137526 3' - I-element 5010 1 72.28 GATGTGTCCGGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGCACTGTTTCAACTAGCGCCTTCAATGAGGTAAAGATGGTA:1 + chr3R 16934668 3' - gtwin 452 2 58.42 GTATTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAAGGTCCTGACTGGCCAAGAGAACCAGTCA:1 - chrX 4247587 3' + F-element 269 1 62.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCATTTGTT:1 + chr2L 3694176 3' + roo 9055 2 59.41 CGTCTNCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAG:1 + chrX 1954498 3' - Tirant 8156 2 72.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGA:1 - chrX 19457150 3' + roo 9037 1 63.64 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATGGCGACCGTGAAGTGGCCGAAACTGCCAACGAAGTTCTCGGGAGTTT:1 - chr3R 14168112 3' + blood 346 2 64.36 ATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGGGGACCAAGGC:1 - chr3L 17122414 3' + roo 9039 1 58.42 GCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGT:1 - chr3L 19951205 3' - Ivk 37 1 61.39 GTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGCCAGGTGAAGGCGGTGGCCACAGCGTTTTGGACATGGTGCCACAGGTAACCAGGAGTCTCGTCCACTTCGTCCC:1 + chr2L 16860182 3' + X-element 4383 1 80.20 ATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATGTATATGTATGTATACGTTCATGTAAATGGCTGTAACCCGCATTAT:1 + chr3R 14164175 3' + Quasimodo 7347 2 60.40 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTGTAGATGTCTCAATGGCTTTTGTTG:1 - chr3R 6185935 3' + 412 443 2 76.00 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAAACAAAAAATTAAGTTAACAATTTTTTCGATATATTTATTTTCAAATTTAATAACATG:1 - chr2R 16744104 3' + opus 7488 2 55.45 TTCTATATTGAAACCAATCTGGACTTAGTCACGGTTTATGGTTGACATTTATTTTATGAGCGTGAAAAATATATCACTCGCCAGTGGCAGCCACACCACCC:1 + chrX 4378058 3' + F-element 4246 1 77.23 CCAATGTATGGAAGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTTTTGCTAAAAGTGTCACACCCACTTTTGAAATTTTATACAAAAAAAGGTATCTTCCTAAATG:1 - chr3R 4051719 3' + 1360 3367 1 79.21 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAAAGATTTTTTGGCACAAGATTTTTTCGTTGTGGCGCATCAATTTCACTAGCGGACGCTATTTGTCTGAAATCTAAG:1 + chr2R 4786737 3' + 1360 10 2 56.44 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTAACGCTTTCGCGGGCAA:1 - chr2R 17394606 3' - jockey 20 1 65.35 CGATCTATTTATTAATTTAAAATCTGTCCATCTGGACAATAATTACATGTTTGGGTGGGGGGGCATATAGCCACTACGTTGGTGTAGTTATTGGTAAGATA:1 - chr3L 25515779 3' - G-element 4304 1 61.39 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTTTTGGGGCTACGAAGGCAACACTCACGCACACGGGGGGCGTAAATAAC:1 - chr2R 15283522 3' + S-element 1707 1 65.52 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATG:1 - chr3L 12452157 3' - 412 46 2 70.30 GTCAAATTGCTGACCAAGCATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTTATATTTGCGACTAAATAATGTTTA:1 - chr3L 18576727 3' + springer 7182 2 58.42 AAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTCAGAAATAGAATATTCATTCTTCCGCCCTATTTAGCGGGGTAG:1 - chrX 7891700 3' - Cr1a 377 1 64.36 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACATTTATACTAATATATTGGCATGTATTG:1 - chr3R 13203002 3' + roo 9033 1 65.35 ATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGGATACTATTGTATTCGTATTCGTGTGTTTGTGTTCGTGTAGAGATTCATTGAAAGTTATTTC:1 - chrX 18217111 3' - G6 1975 1 53.00 AAAAAAATCAAGATGCTATCTTTAAAATTGTATAATTTATATATCTATGGGATTTATGGGTTTATCCAAGCGCTCAGTTGGGCTTATCCAAAAGCGTTTAC:1 - chrX 6752995 3' + transib4 2589 1 71.29 CTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTATGCATATCAATTATGCTCT:1 - chrX 5018612 3' - opus 12 2 67.33 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGAGTTTTAAAGTTGTTTGAGTGTTTAAGTTTATTTTATAAAAATAGTAAACA:1 + chr2L 6041211 3' + roo 9033 1 58.42 TATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTTCGAACAACTTTTTCTTTTATGGATCATCCTTTTCGGACCAAAACTAAACCCAAAAGAGACGCTGAAGA:1 + chr3L 63048 3' - roo 1 2 76.60 CGCCAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAATCTTTTGAGCTACTCCTCTTATACACACATACACATAAATTAATTATCCCTTTCATTAAGTT:1 - chr3L 21927910 3' - HMS-Beagle 249 1 66.34 GCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTT:1 + chrX 4180795 3' + I-element 5312 1 66.34 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCACATAATTAATAGTTATTATGGCTACGCATTTTGGCTTATAAAA:1 - chr3R 22277133 3' - 297 6599 2 60.82 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTGTTTGTTTTCTGTAATTTCGAATTAGCGAAATCATATTTAAT:1 - chrX 8352182 3' + blood 343 2 57.43 CGAAATATTATCTTTATCTTCAATCAAAATGAACTAATCTGTCTTAAGGACAAAATAATTGATAGCTGGGCCGGAGTAAATATAAAAAAGAAATTGCTGGA:1 - chr3R 2914295 3' + Circe 7076 1 59.41 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCATTTTTGATTCTTTC:1 - chr2R 9862190 3' + roo 397 1 60.40 GCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATGTATAGAT:1 - chr2L 13250355 3' + pogo 2080 1 56.44 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTAACCTCGTTATGTCCT:1 + chr3R 11496895 3' - Doc 30 1 53.47 TATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATATATATGGACAGACGTGTTATCAGCTGCATGCTGTACACGCTGAAATTGACTAACTTTTTGATCCGCACTA:1 - chr3R 6143778 3' - rover 6953 2 76.00 ATTTANTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTTGTGGTTGCTTCATGAGGCACAAC:2 - chr3L 12452128 3' - 412 7070 2 58.42 TCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAACG:2 + chr2R 6779858 3' - 17.6 6942 1 66.34 GGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATA:1 + chr2R 12446371 3' - jockey 4706 1 59.41 GTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGT:1 - chr2L 14260747 3' - 297 6623 2 72.28 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGTGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAACGAGC:2 - chr3R 10741069 3' + 1360 3383 2 74.26 TTTCCNAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAA:1 + chr3L 19215850 3' + roo 9027 1 68.32 ATATGTATATCTGTATATATATATGCACTATACTACGAGTATATGTACATATATGCACCGATATCGCGTGGGGAGATCTCGGCTTGACATTGGCATCTCAA:1 - chrX 15543356 3' + G3 4507 1 74.26 TGATAATTAATAATAATTATTTTTTGGCGGCTTATTTATTGCCTCAGATTTGTAATATGATTAAATGTTGACTGCAATGCATTAATTATATTTACAAAAGA:1 - chr3R 12790356 3' - gypsy9 297 2 66.34 AAAGTGGATGGATTGTTTATTAACGGGAAGCTCGGCTGTCAAACGACAAGTGCCTAATCAGGCACCTAAATTATGCATGACGTACGCCTTTCCGGCTCAAA:1 - chr2R 16578506 3' - Circe 318 1 63.37 GATATGACATCAACTAACTGAATGGAGCGCATAAAAAAGAAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATTATATATATACATATAAAGAGAAACTGATGTATACC:1 - chrX 23042040 3' - mariner2 43 1 68.00 GTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGAAAAAAAGTGCGCATTGGCCACACATACACATACGTAAAGCTTTTAGTTTAAGCCCCACAAA:1 - chr2L 10606542 3' - roo 8963 2 59.41 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTGTATGCCAACAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGTCACCATGAGTTCTTCTCGGTCAGACAACT:1 - chr2L 20213619 3' + transib2 2774 1 70.30 ACAAGAGTGTCACAGCTACAATACTGTAGACAGAGATACGGTAGATGAATAAAAAACTAATTAAACATACCCTGTTTCTGATGCCAAAGCTACGTTATACA:1 - chr3L 2894745 3' - Circe 116 1 54.46 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGAAAAAAAATCTTAATTCAATGCCTTT:1 + chrX 5018718 3' + opus 482 2 63.37 AAATANAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTTTTTT:1 - chr3R 6147224 3' + copia 253 1 83.17 GTTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATATATACGT:1 + chr3L 7989821 3' + mdg3 229 2 62.00 GCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTACCCAGCTTGTAATGGGTGTAAATACCGAAACTTCAACTTCTGACTATGGCA:1 + chr2R 18875410 3' - R1A1-element 252 1 56.44 AAAAAAATTTTTTTATTTTTTTAAAAAAAAAA:1 - chrX 2856077 3' - HB 326 1 75.00 GTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGATAAAAGGTTATGAACGACAGCCCGCTGGGGTGCACGATGCACTGCCGGAAAAGTTGTCGACTAATATCAAGG:1 + chr3L 12444131 3' - 1360 3199 1 74.26 CACAAACGACTTTCCATAGATCTGCTGTTATTAACTTAAATGCCGGCCAATCAGACGTTGTAACTTGAAATAAAAATAGTCTTCTATTTACTTTGATGATC:1 + chr3R 16288400 3' - Copia1_DM 416 1 71.29 ACTGTAAACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCTGCAAACAAATTCATTAATTTCAACAATCGATGCAGTCACAAAAAAAAAA:1 + chr3R 27509451 3' + X-element 4610 1 56.44 AGCTTTGGGCGGTTTTAGGGCGTTATAGTGGGGCGTGGCATTATTGAGAGTGCTTTTCGGCATGTAATTAATCATTTGACAAGGTTCAAGCTTCGCGG:1 + chr2L 527938 3' - INE-1 346 1 58.16 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTGTCTCGTC:1 + chr3R 9370017 3' + roo 394 1 65.35 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAATATTGTTCGATTTTGTTGTT:1 - chr2L 2909560 3' + pogo 2058 1 81.72 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCGATAAT:2 - chr3R 8198485 3' - Tirant 32 2 57.43 TCGAGTTCCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGA:1 + chr3L 23871824 3' - INE-1 560 1 66.34 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGATTTTTAT:1 + chr3L 13364604 3' - hopper 31 1 60.40 TCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACA:1 + chr3L 24531007 3' + 1360 91 1 66.34 GCGAGAGATACCTGAAAAGGCTCGAAAACCACCCTAACCACCTCGCCTCCTAAGAAACAGCTTCCAACCAAGAAGAAGACGTGCCCAGCGGACTG:1 + chrY 1896994 3' + G6 1793 1 52.63 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTA:1 + chr3R 25285119 3' - roo 48 2 81.19 CCCCCGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATACATACCTTTCATTTATAGAGAAGTTTATTCT:1 - chr2R 6869029 3' + springer 339 2 71.29 CCAGGACGATGCGCGGCTGTCATTGCCAACAAGATGCCCCATCGATACCAAAGATTCGTGAAACATGTCAACTGTTATGATGCCTGACACTTGCCGCACAA:1 + chr3L 22350828 3' + Tc1 1301 1 74.26 TATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGTAAATAAGTACAAAATTCATTTGTCGAGAAAAAGTTACATTGGCACCATTGTATAACAGT:1 + chr2L 8740974 3' + Burdock 247 2 71.29 CAATAATAATAAACAATCTTACATAGTATATTTTTTGAAAAGGCCCACGTATAACAAAACAATTCTTTTTTAATAACAAAGCTAAAATAAATATAACAAA:1 + chrX 10251831 3' + flea 5012 2 76.00 AAAATGTAAATATATATATATATAATGGATTTCATTCGCCACTCACGGGCATCTTTTGGAACTGCCGGGCATAGTGTTGCAGGTGGCAGGTG:1 + chr3R 27313945 3' + G3 4506 1 68.48 AATAGTATATTCCAACACGCCCCCTCAAAAATAACAAACAATTAAAAAATACATTAACCCACATTAATATACCAAAACCAGTTTGGTTACTCCACAATGCG:1 + chr3R 4567480 3' - copia 4865 1 73.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAAAAATTAGAGCTTATTTTGCAT:1 - chr3L 11435570 3' + roo 387 2 48.51 TTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTACTTAGGACCTACTTTCTTGCCCGCCGCTGTGCACATATGTACACACACGGCGACAACAACT:1 - chrX 2589719 3' + copia 115 2 63.37 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAATGCTTT:1 + chr3R 14639394 3' + roo 9024 2 73.27 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCG:1 + chr2L 487133 3' + P-element 2849 1 40.59 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTCACGTGTCGTTCACAGGATATT:2 - chr3L 13194748 3' - 297 22 2 57.43 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACCCTGTTAACAATAAAAAAAACATTAACAAAGAGCCATGTTAGCTTTGTTAGATATATCTAA:1 + chrX 14597495 3' - BS 5009 1 63.37 AAAAAAAAGAAAAACGAAAACAAAAATTTTGTATAATGGAAACTGAAGGAAAAGCAAATGAAAATGGAGAAAAACACATG:1 + chr3R 24014003 3' + gypsy7 5008 1 78.75 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATTTATACTTAAGTATAGTATGTGCAAAAAATTTACCTACTCATTGAAAAACTCCTTTTGATTCA:1 - chr2R 13605561 3' + I-element 5346 1 37.62 CCTCAAACAATCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAACAAAACAAAAACAAAAGGAAAACAAAAATACATCAACATTATGAATAAAGAAAA:1 - chr2R 13943933 3' + I-element 4892 1 62.38 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACGTCCTATAAAATGCTAAGATAATATGCGAGTAGTTCATATCATTCAT:1 + chr3R 17368069 3' - roo 28 2 58.00 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACCCCCCGGACTATCTAATCGCATTCGGTTCGCAGATCTTTTACTTGTGCTGAACATGCCATCGATG:1 - chr3R 24152838 3' + P-element 2880 2 72.28 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTG:2 - chr2R 5485086 3' - 1360 51 1 77.23 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCATTT:1 + chr2L 3694173 3' + roo 9052 2 56.44 ACCACCCGAGTATTTTTGCAAAAACCCATGTGTTTAATGGTAAAGCCATAAGTATTTTTGTTACTCATCCCTTTTGATAGTTATTGACAAACAGATACTTT:1 + chr3R 5691869 3' - hobo 274 2 76.24 TCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTGCTGATGTTTCCAGTTATTTTTGCTGTTGCTGTCACTGATTTGTTGTTGTAAATTGTTTTTGTG:1 + chrX 9152631 3' - F-element 108 1 76.24 TAATTCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACAGAACACAGTCTTCTTGGGAAGAAGCCATGCAGCGCAACCGGTCGCAGTCGGGATCAGTTGCCGGCCTAG:1 - chr3R 5089720 3' - R1A1-element 100 1 72.28 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATCTACAGAAAAAGATTGTAGACGAGTTAAGGTCAGCTGTAATATAACAGCT:1 + chr3R 28883446 3' - HMS-Beagle 6823 2 50.50 GCCCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTACATACAAATGTCGCATGTTCTGTGTGTGTATTTGTTTGTTTG:1 - chr2R 16928945 3' - Rt1a 26 1 45.78 AAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGGTGAATAAACGATGAGTGGCTGG:1 - chrX 1427502 3' + Bari1 1707 1 78.79 GATTGTTGGTTAAGGGCTTGAGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGCTGCTGCTGTTGCTGATGTTGTTGCT:1 + chr3L 13280628 3' - I-element 165 1 74.26 TATCTCTTCGAGTAGCAGAAACGGTTCTGCCCGCTTAACCTCTACAGAGTGTCTAATCTTACCAAAACAAAAAAAGGCAAAAGTTCATAGCGCAAACAAAG:1 + chr3R 29383061 3' - blood 290 2 62.38 AGTCACCGCTAAGGATTGTGTCTTGGGACAGCTTAGTGCTTACATACCAATACAACTTTTCACGATTGGCGAGCCAAATAAAACTT:1 - chr3L 17084279 3' + R1A1-element 242 1 59.30 ATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCTATGGTGTGGCATTATTATGAAACAG:1 + chr3L 7791071 3' - 412 224 2 74.00 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTT:1 + chr2L 326222 3' - roo 10 2 70.30 GGCGCCATCTATACTTATTTCTGGTATGCAGACCCAAACATTTCGCTCCCTTGTTCGTGTTATTGCAGCGCAATTAAATAAGATACGTTAGTTGTGGCCAG:1 + chrX 2077018 3' + Transib-N1_DM 377 1 72.28 AACGACTTTTCGCTGACAACCCTAAAAGATTGGCTACGTATTCTGGGCCAAAATACGGAGGGCACGAAAACCGAACTGCGATCCTGGTTTGGAAATATAAG:1 - chr2R 7409188 3' + mdg3 317 1 72.28 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTTTTTCCAAGGAACACACTCGA:1 + chr2R 10912141 3' + 412 440 2 77.23 GCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTCTAGCACCTCCTTTTC:1 + chr3R 14982878 3' - 1360 3365 1 85.15 CAACCNAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACTTTAAAGTCGCTACATACGATTTGTATTAACTTTACGATTTCTCATAACGAGCTTCTACATTTT:1 + chr3L 2292169 3' + Max-element 288 2 59.41 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGATCGCC:1 - chr2L 1156728 3' - 412 24 2 55.45 AGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTAGCTACCGAATGTAAGCACCTGGCTATAACCTTTGCCAGTCAAACACATCGCTAAGCA:1 + chr3L 25585649 3' - roo 268 2 57.43 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCAAA:1 + chr3L 22744689 3' - FB 52 1 80.20 TTTCAAAAGGAGGGAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATACCATAACGAAAGAAATTATAAATAGATGAAACAATAATCAGTAGAGATTAAACCCC:1 + chr2L 20856937 3' + mdg1 7022 2 61.39 AACAAGGTCCGAGTCGTTACAGTGAAGACTGCTCACGGATGATAAAAAAGCTGTCGCTTGATCTCTGCCCCGCCACCATTCCACCATTTATTTAAATAATT:1 - chrX 14579454 3' + 3S18 5656 1 63.37 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATAAAAAATCTAACATATATGTTAATTCCCTTTCCTTTGAAACATAAATACAAGGTTCCTTGACAT:1 + chr2L 13250460 3' + pogo 2091 1 68.32 GGTGGAGGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTTGTACAATCCACAAGCGTGGAAGTTATAAATTTTGTTGCCGGTTTGGG:1 - chr3R 18934084 3' + hobo 2921 1 51.11 TATTTATTTATTTATTTAGAATATTTTGTATAGAGCAATAAAGAGCAATAAAAAACCAGTGTGTAGGTAAGTACAAAAATTAAGTTTCTCTCCTGCTTGTA:1 - chr2L 9076664 3' + copia 229 1 64.36 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGA:1 + chr2R 9014471 3' - blood 45 2 68.32 TTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTTCGTCGTGAACGAGGGGATTACCCATGGCCAACTGGCACTGGGCC:1 + chr3R 28756158 3' - 3S18 304 2 55.45 ATGAAATAAGTAATAAGTAATTCTCTTCAAAATACAAATATTTAAGTAACATACACAAATTATTTATAACTTTTAA:1 + chr3R 21655626 3' - Stalker2 404 1 69.74 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGTTGCGTCGAAGAACT:1 + chr3R 11165705 3' + Tabor 451 2 57.43 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTCTTCCTGGGAAAATAAATAGATATACAATTTTGGATATGAGTAATATGATTAAG:1 - chr3L 20268557 3' + 412 473 2 59.41 AAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAA:1 - chr2L 22076769 3' + 297 6737 2 77.23 CGATTNATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGACCAAAAACCTCAATTCGAATTGA:2 - chrX 20437660 3' - roo 54 2 77.23 GCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGCACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTGCGGCACT:1 - chr2L 20118662 3' - Max-element 8234 1 77.08 TAAGATAACAAATCACTATATATTTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTTATTTACAATTCATTACCCCGGGAATAA:1 + chr2R 2124590 3' - F-element 158 1 78.22 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTTCTAGTGCCAGTGTTAGG:1 - chr3L 11070486 3' + P-element 2867 1 59.41 CAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTAAATGCTATAAATTACTTTTCGAACGGCAT:1 - chrX 868674 3' - jockey 4907 1 80.20 TTCATNTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGAGGGGTTGCTGAAATTGCTGTGCAACG:1 - chrX 13560733 3' - roo 8715 2 77.23 ATTGAATTGGGATTTAGGTAGTGTTGGTGGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTTCCCGCTGCTGGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr2L 11824272 3' - I-element 4981 1 75.25 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACTGGCGTTATC:1 - chr2L 5974417 3' - roo 40 2 67.33 TATCTNGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCG:1 + chr3L 15035207 3' - pogo 28 1 58.42 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTAATTTTTTCAA:1 - chr2R 24965061 3' + P-element 2861 1 53.54 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAAT:1 - chr3R 10445211 3' + roo 9022 2 74.26 CAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTTACCACTTGAGCTGCTAAGTGCATGCTCAGCATTCACGGAAACGAGGGAAAAAGAAACATTTTT:1 - chr3R 16941326 3' - Stalker2 7477 2 67.02 TCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:2 - chr3L 25232766 3' + accord2 7601 2 52.48 CGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCA:1 - chr3R 23665269 3' + 297 6934 2 74.26 ATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACAATATACAAAAACCATAAACCCTTGGTTAACATCATCAATTTGTCACATCAAACAAAC:1 + chr2R 19477094 3' + I-element 88 1 62.38 AAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTT:1 - chr2R 6984322 3' - HMS-Beagle2 30 2 55.45 AAAAATAAAATCATATTAAAATATATATGAAAGAAGTGGAAGTCGACAAAAAAAACCAAACGTTATTCTCTGTGTACCTGCCTGTACTGCAAAAGTCAAAC:1 - chr2L 4086692 3' - transib1 1889 1 72.28 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTATATT:2 - chr3R 10445180 3' + roo 390 2 60.40 TATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAATAAAAATTAAAAAAAAAAATATATATTTATGTATTGCATAACTGGTCATTAGATAAGA:1 - chrX 15558545 3' + Doc 4654 1 61.00 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATTGACCGACCGCCTTGCCGATGTTTCGATTACGCGCCTCAAGTGGCAATCAGGCTGCA:1 + chr3R 27374881 3' + mdg1 405 2 62.38 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTAAGCAAAGATATGTAGTAAGACTAATAG:1 - chr3R 19967614 3' + pogo 2055 1 75.00 CGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGA:2 + chrX 19306800 3' + P-element 2837 1 31.68 AGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTAAGCGTGACCGTTTTGACTTCATTATTCCCCCGCCGCAGTTTACTTCCCACCTCGACACTCGGAAAA:1 + chrX 19884260 3' + Stalker4 273 4 76.24 CATACCTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAG:1 - chr2L 107999 3' + P-element 2852 1 44.55 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGCTAAATAAAATGACATTAAACAAACCCCTCTA:1 + chrX 17204139 3' - Tabor 6884 2 66.34 GGCAGCGGATGTTAATGTATACATTAGGGTAGGCTGGGCTTGTTCTTGTTAGGATTGTGGAATGATA:1 - chr3R 11556375 3' - Quasimodo 178 2 70.15 GGATTNTACAAACGCCCAATTGCCAAAAAGCAATGTTTGAACACAAATTATAAAGGAAAAATGCATTAAACTCCTGTAAGTAACAAAATATAGTCAAATGA:1 + chr3R 12841731 3' + 3S18 5692 1 75.25 ATATTGGTTTTATTATCGCCTTGTATATTGCTATTTTATTATGTAATTCTAGTTTTTCATTTAGCTCTCTCGTCCCGCTCAATCGCGTATGGATTTTAAGT:1 - chrX 17330041 3' - Porto1 4248 1 55.45 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCGGTTAACAGCAGTTGTTGTCGCCGTGTGTGTACATATGTGCACAGCGGCGGGCAAGAA:1 + chrX 2589745 3' - copia 20 2 57.43 TTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCTTAATGCGTTTTCCTGCGGTTACATTTGGATG:1 - chrX 17485153 3' + Cr1a 4194 1 68.32 TTCAGCTATAGTCACCGATCGTGGCCGTTATCATTGATCCTGTTTAGAAGCAGGCGAAACGAGGTGCCCAATTGGTCAAGTATTTGAGATTCGAGGATCTG:1 + chr2R 2374760 3' + Chouto 238 1 78.22 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTTTACTTTAATCCCGTAAATACATTTACCGCCTTTGCA:1 + chr3R 25918978 3' + roo 9055 2 59.41 ACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCCGGGTGGCAGGATTGGCACGGGGGACCATGGCTGTGGATGGGAATTCCGCATTGCCAGCGGCTG:1 - chr2R 12445924 3' - jockey 4767 1 65.26 AAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTATGCCCCACGCCTGTTGCGG:1 + chr3L 5015895 3' - I-element 4928 1 69.31 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGAAATTGATAAGAACA:1 - chr2L 16065379 3' - 1360 33 1 79.03 AACATTTCTCAATTATGAATGCAAAGAAGTCTCATTCATGATAAGTAATTACCGTTTGATATCCGTGATATTAAACCCCAAGGCTGCTATTTAATAGAAAC:1 + chr2R 14622621 3' + Transib-N1_DM 413 1 61.39 TTTGTNAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCCGTATCCTTTGCACGGCCAGAAGCATGAC:1 + chr3R 10957753 3' - hopper 13 1 67.33 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGCA:1 - chr3R 13715065 3' + P-element 2872 1 64.36 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTGCGTCACGGATC:1 - chr2R 9426430 3' + P-element 2867 1 61.39 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTTATTGGAAA:1 + chr2L 326230 3' - roo 8666 2 76.24 AGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACAAAGTCAAGGTTAATGGGTAGACTAAAAATAATTAAAA:1 - chr2L 7146915 3' + flea 376 1 67.33 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTT:1 + chrX 13548805 3' + blood 7347 2 65.35 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATACAAAGAAATTAACCACAGGTTAATTCACAGGAAATTTTATCTTTTATCTTATCATTTATT:1 + chrX 18012765 3' - roo 15 2 64.36 TGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTATGTGAATATGATTGCTT:1 - chr2L 19075659 3' - Transpac 4954 2 61.39 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATATAACAAGTAAATTGCGCTAAATTTCTCTCAGTCTCAGTCCGCGAGCGAGGCAAA:1 + chr2L 6255847 3' - flea 19 2 61.39 GGATCAATAGCCGTGCCGATCTGGCTCTCTGGACTTTAAATCAATATCTTCTGTACAACATCGTTGTTTTCTTATAT:1 - chr2L 5608544 3' + INE-1 97 1 64.94 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTAAA:1 - chrX 18717151 3' + roo 9038 1 58.42 CTCGCAGCGGCCACGCAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCACGGGTTTCCGGCCCGCTTCTGATGCTGCCATGCTTATTTTATGAAA:1 + chr2L 16018806 3' - Gypsy6A_LTR 111 1 70.79 GCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAAGGTGTCGCTCGACAGCTGCGAATGTGGGAAT:1 - chrX 7842308 3' + R1A1-element 381 1 70.59 CTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGATGTACTCCCCTTACGAAATCGGAGAAGAGGCATTAACGAAAACCCC:1 + chrX 4091764 3' + G2 2937 1 69.31 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCCCCCAACTGCCGTCGTCTTCGTGCG:1 - chr3R 10957667 3' + hopper 1380 1 56.44 ATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGTTGAGCTTGACTTTTC:1 - chr3R 9952183 3' + Ivk 5345 1 48.51 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTTGAAAAGATGGAAGACACACAGGTTAGAACGACTAATCGTGCAACGGGCGCAGCCTCCCTTATGTACTTAT:1 + chr3R 21364696 3' + jockey 4945 1 75.25 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTC:1 + chr3L 9925289 3' - Doc 46 1 67.33 CATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAGCAACAGCA:1 - chr2R 20411846 3' + 297 6972 2 75.25 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGTAGAGCGAATGCGAAAAAAAAAATACAG:1 - chr2R 9387339 3' + Stalker2 360 2 67.35 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGCCT:2 + chr3R 19989854 3' + pogo 2057 1 71.29 TTGTTTAATTTATTTTATTTTGTTTATTTTAACTTTGTTTTTTTAACTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTAACTTTGCTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACG:1 + chr4 1294995 3' - HeT-A 4 1 92.08 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGC:1 + chr3R 4986349 3' + roo 9034 1 66.34 GTGAGCTTTTCGAACAGCTGTGAGAAGCTTATTAGTGGTAGCATCAAGCAGGAGCACACGGAGATACACTCGTCGAGCAGTGCGATTTCG:1 + chrX 1998207 3' + R1A1-element 203 1 63.33 CGTGGNGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTTTTGGCAAATCTGTGGCAACAACCTGCGTTAG:1 + chrX 1954537 3' - Tirant 8118 4 68.32 GTGAANATAATTTTGACCATGACTGTATATAACTAGCTAACTAACTAATTAACTAACTAACTAACTAACTAACTAACGTGCCACATCCTTACTGATCTCCT:1 + chrX 1427632 3' - Bari1 5 1 73.27 TAAATTATAAATTACAACAAGATTTATTCGATTTTATTCAGAAAGCTGCTGCGTCAGTCTTTCACGTGCTCATCTCATGTTTAAATCCATATTCAAAAATC:1 + chrX 2884928 3' + copia 258 1 71.29 CAGAGCTACAGTTAATATCGAAGTTTAAGTGAAAAATTCAAGCCCAAACAGCCAGCCAGCAGCAAAAGCAACAACTGCAGACACACAAAGGCTTCTAAATG:1 - chr3R 23500261 3' + Porto1 36 1 58.42 GAGATCTCGACGGTCATACGGACAAACGGACATGGCTAATTGGACAAAACGGAGGGGACAACAAAAAAGCAGGGGAAAACGTGCAAAATGAAATAAAAAAA:1 - chr3R 24039824 3' - INE-1 134 1 60.40 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTTTAAGTT:1 + chr3L 17699386 3' - 412 34 2 56.44 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCC:1 - chr2R 22395217 3' - I-element 46 1 64.36 ATACTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTT:1 - chr3R 15157623 3' - invader3 69 2 77.23 TTGTGAGACTAACAATAATTATTCAAATCTTATTATATAACTTATACATTTACAATAATAAGTACTTGTAATTTTTTAGTTTGCGAAATAGTGTTTGAAGA:1 + chr2R 4728949 3' - Doc2-element 4724 1 62.38 GGAAAAATAAAGAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAAAAGGCCAAGGGCTGTCAAACTGTATGATGACAAACACAATAAGTACACGAA:1 - chr2L 2907899 3' - pogo 2009 1 50.50 AAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCCAAATGGGAAGCGCAGGTAATAAACTACAATGTTACCCAAAGAAT:1 + chr2R 9277611 3' + roo 405 1 71.29 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCAAAAGAGTGGTGCTCATTGAATGATCTTGTCATCGAAGCTTTTCACAAGCAAAAGCTCAGAT:1 - chr2R 18503466 3' - roo 8677 2 66.34 TTTTCTAAAACACTTTTATTTTAATTAAGTAAAATATATTGAATTTATTATTTTTAATTAACTAATATAGATTTCACTTCGGTCATTGCCAAAATAGATTT:1 - chr3R 26041165 3' - HMS-Beagle 422 1 47.52 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATAAAATATTGAGTTCGAATATCT:1 + chr2R 13038953 3' - P-element 33 1 46.53 CAAATTTGAACAGATTGTTTTAGAGGAAAAAATGATAACAAATTGAGTTGGCAGCGGCAAAAAAAAAAGAGATGAGGGAAAAGAGCGCTTTATGACTTTGG:1 + chrX 10559373 3' + hopper 1001 2 73.27 TGTAACACATTAATAAAAGAAAAGAATAAACATGAAGATCAACCTGACACAAGGTTGTATAAGTTGCCCATACCCCAACCAATATACATAAGTATATACTA:1 + chrX 5428803 3' + Bica 116 1 63.37 ATTTATGCTTTATGCTTTGTGTGGGTGTCCGATTTTTATGATATTTATTTGATGCCCTGACATATGGCCAGCGTTTTGTATGCTCATCTATTCAGCAATTC:1 - chr3R 27855887 3' + S2 302 1 66.34 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGC:1 - chr2L 15333711 3' - P-element 24 1 53.47 AATACCTTTGTATTTCTTAGTGTCCCCAGCACTCTTTTTTTATGAACACAGCCGAACGAAGAAGTCAGCTCAGCTATCTGCTGAATGTCTGCTGAATGTA:1 + chrX 15023885 3' - HB 39 1 81.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACA:1 - chr3R 19449977 3' + roo 387 2 48.51 GCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTTGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGCTTTACTTTTAAATATCGGACATTAAAACAGCAACAGTGCTTCTGTC:1 - chr2L 22020543 3' + INE-1 546 1 67.33 CACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACGCCGCAAGATGAATACTCTAATGAGAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTT:1 - chr2R 5260084 3' + 1360 3226 1 66.34 ATATTTTCACTTTTCACTTGATACGGATGGACGGAAAGAATAAAAAACTGGCGAATAGAAGGGAATATATAGAAGGCAACCCGGGAAATGGTCGCTCACTC:1 + chr2R 16096373 3' - Max-element 463 1 43.56 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTT:1 + chr3L 14603326 3' + jockey 4948 1 66.34 AAGGCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGATGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCCGGATTTAGTATATTGTTTGAGC:1 + chrX 13347369 3' - roo 8678 2 58.33 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGGGTTATTCAGCTTGATTTTATTTGCCTCGCAGG:1 + chr2L 18028770 3' + flea 5007 2 74.26 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTCACAGTTTTCGTTACTCACACAGCACTAAGCGCACAAGAAAATATCCCGAGC:1 - chr2R 22993980 3' + opus 478 2 52.48 TCTACNTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAACG:1 + chr2R 6779858 3' - 17.6 6942 1 66.34 TAATGNAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGG:1 + chr2L 16686603 3' - pogo 37 1 70.00 GTAAGTATATGTGGTCTTATACTACTTATAATTAATATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCT:1 + chr2R 8505078 3' - Quasimodo 19 2 51.49 AAGTTNCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTCCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTTTTATTGCATAC:1 + chr3L 14603337 3' + jockey 4959 1 54.46 GGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGTGAGAAGTCGAATGATAAATTAAATGTGTGAGCTATTAAAGCAAGCAAAATCGAAG:1 + chrX 10407642 3' + invader3 5371 2 55.67 AAAAAATTTTTCCTTTCTAAAAACAATATTAATATGAGACTTCAAGACAGGGCCAATTATTTGGCTTGCAACCGAATCGGGTAATAAATA:1 - chr2L 18305890 3' + Stalker 6766 2 60.00 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAACCTTACAAACTGGGAACTAGAACTT:1 + chr3R 19657536 3' - roo 14 2 65.35 AACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATT:1 - chr2R 1320674 3' + diver2 4886 2 60.40 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCACCATTGATTTTGACACCTTCCCGGAAGAAGATCCGAATGCATCCCTGGGACTA:1 + chr3L 20245099 3' + Transpac 231 2 60.40 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAGCGTTCT:2 - chr2L 107979 3' + P-element 2872 1 64.36 AAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAGGGAAAATAGGGAAAA:1 - chrX 4446514 3' - hopper 147 105 84.21 ATATTNACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTGATGC:1 - chr2L 15344141 3' - transib2 36 1 59.60 GCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGTGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTA:1 - chr3R 10741091 3' + 1360 3361 1 57.43 GTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATAATAATAATAATAATGTAAT:1 - chr2R 8649182 3' - P-element 2788 1 29.70 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCAC:1 + chrX 495216 3' - 412 52 2 74.26 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTAAGTAAACTTAGTAGCATTCAATAGTAGCATCAGTTTGGAACTTATAATGATTTTATTTTC:1 - chrX 14531469 3' + 412 7536 2 68.32 TAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATTAAATTAGTTATTTCAATTTTTATACTCGTACTAAATTTT:1 - chrX 5651600 3' + flea 231 2 63.54 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAAC:1 - chr3R 25702184 3' - Tirant 34 2 60.40 GGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAATCGAAATTAGCTAATTAAATAAAAAAGGTAAGATCCGCATATTTTGTGCATGTGACAAAA:1 - chr3R 10644963 3' - FB 643 3 59.41 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAATTATTT:1 + chr3R 1868226 3' - G-element 28 1 52.48 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTA:2 - chr2R 17394622 3' - jockey 36 1 50.50 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTGCACTACTTTTTCCAAGGAACACACTCGAAACTATGTATCAAGTTTTG:1 + chr2R 10912160 3' + 412 459 2 56.44 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAACGAGCGCATCCCTAAACGATGCCAACGCCCCCTTC:1 - chrX 4041486 3' + hopper 1409 2 73.00 TCGCTCAAATCTCTTTTTACTATATAATTTTATGAAGCTGTACTTGGGGATCATTAATTACTTAGTATTTGTTATATATTTTGATTACTAATCCTTTTCAA:1 - chr2R 12225374 3' - micropia 401 2 63.37 AAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACAAAAACAAAAAAAAGGGCCCACAAATGCTGTTTTATTGG:1 - chrX 5298925 3' + Doc 4408 1 60.61 TTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATTTTTTGGGGCTACGAAGTCAACACTCACGCACACGGG:1 - chr2R 15283535 3' + S-element 1680 2 64.36 AAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTAC:1 + chr3R 19450020 3' + roo 8692 2 65.35 GTATACAAGTTTTTCTTGGCATTTGCCAAAATGGCAAATCGGTTATCATTGTTGGTTTCCGGGCTGCTGTTCGCACTGCTGCTTGACTTGCCGGGGCCTGC:1 + chr3L 7338666 3' - Fw2 384 1 54.46 CTTCTGACGGGGCACTGCCGACTTCGCATTTGCATAAGATTGGCATTGCAGACAGAAAGAAAGGGAGTTGATTCAAGAAGCTTAGCTCAGATTAGCTCAAT:1 - chr3L 3596858 3' + baggins 5137 1 48.51 TCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGTTCCTTCTATTTAAATTATGTGCATGTATTTCACTTTCGTTTTCATTTGCG:1 - chrX 17064742 3' + Tirant 376 2 51.49 GTGGCATGCACTATTCATAAGCCCTATTGGAATTATACCTACATACTAAAGCAAAAACCCGAGGAAGATCGAGACGCAGAAGCTTAGGGAAGCACAGATGA:1 - chr2L 6673172 3' - Rt1b 5073 1 58.42 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTCAGACAATACGACCAGTGACCAGAGTTGTTCATGTGCTCCATCCAACTGGTCACCCTGGTTTGGCGG:1 - chrX 6654541 3' - P-element 10 2 48.51 GGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTCTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAAACGGAAACTAC:2 - chr3R 17733237 3' + INE-1 557 1 76.24 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCTT:1 + chr3R 24282028 3' - Max-element 8253 2 60.42 AAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGGTGAATAAACGATGAGTGGCTGG:1 - chrX 1427502 3' + Bari1 1706 1 78.00 GTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAACTACATTTAACTAAGCGACAACTATTTAAAAAACAAAAGAGT:1 - chr2R 13144930 3' + roo 9070 1 81.19 GTGTGAGTATGTGTGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGAGTGTGTGCGTGAATGCGGCTCG:1 - chr3R 22594681 3' - accord 7035 2 67.65 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATAGCAAAAGCGCATAATAATGTGTGACTTAATTGCTGAGCGAACAGCAGAACACTAAGCC:1 - chr3L 23717115 3' - opus 43 4 60.40 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGATCGCGATGGTC:1 - chr2L 21978096 3' + roo 9038 1 56.44 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTGATGCGGCCAAAGCCAA:1 - chr2L 15344129 3' - transib2 26 1 53.47 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTTCTCCTTGGATAATAAGCTGAATAGGCGTATGACAA:1 + chr3R 8198552 3' + Tirant 362 2 66.34 TCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCTGGGAAGTTGCTCAAATACCAAACGGAAACGTTACTTTTTCCGG:1 + chr2L 21976164 3' + roo 58 2 65.35 AGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACTTTGCCCAACTTCCGGTGGCGGGGCATGCCGTTTGGTAAA:1 - chr3R 25818794 3' + mdg1 415 2 71.29 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGCACGGCAGCA:1 - chr3R 13715057 3' + P-element 2880 2 72.28 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATTATTTTCTTTTAGTTTGTGGGTCGCAAGCCACCGTTTATTTGGATTGATTAAAT:1 + chr3L 4681581 3' - pogo 20 1 59.41 CTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATGTAATTCGGCAACTCGAAAATATTTATTTTTTTGTTTCA:1 + chr2L 12074405 3' - Quasimodo 33 2 65.35 AAAACCTCCGCTCTCTCTCCTGTCCTTGTCAAGCTCACCGGGACCCTCTGAACTGAACTGAAGTGAACTGGCACTGGCCCCAAGTGGACATAAATTCCACT:1 + chrX 18340014 3' - Rt1a 4949 1 60.40 ATGCACGATTCATAAGCCCTATTGGAATTATGCCTACGTACTAAAACAAAAACCTCCGCGTGCTCTACAGTCCAATTACTCGTTCTGTATGACCCACATTT:1 - chr2R 23822689 3' - Rt1b 5068 1 72.28 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTTACCTTATTTGCCGATA:2 + chr3L 21203070 3' + pogo 2072 1 53.47 AATCTTAACTCTCTGCCGCTCTTAAAGCAATCGATTTTAACTTTTTTATTCACAATCCACATCCACTACAATCAATATCCCAAGCGGGCGATATAACATTT:1 - chr3L 23268005 3' + Cr1a 4235 1 53.47 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTATCTTAATAAGTATGCTAGGCTTTTATATAGGCCATT:2 + chr3R 18881560 3' + roo 9032 1 63.37 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACCGACCGACCACCATTCACTACAGCTGACCACCGACCACCATTCTTGGCGTTTACCTTACTCGCCCACTAC:2 - chr3R 19836996 3' + P-element 2881 2 74.26 ATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCACACAGATTCTACCCATCTTGTCACGCCCACTCTAACGCCTACAAACCGCACAAAACTGCCACGCCCAAACTAT:1 - chr3R 4322610 3' + INE-1 163 1 70.30 AATCGTGCATGCCACCTACGGACGGTAGGTGGTATCTTTAGAAGATTTTAATTTTCCTACCGTAAGTCAAATCTCGCTAAATCCCTGTAACTACTTTCTA:1 + chr3R 19361432 3' + Rt1b 5080 1 72.00 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGC:1 - chr3R 13715093 3' - P-element 43 1 36.63 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGCGAGAGCGTGAG:1 + chr3R 28326783 3' + P-element 2876 1 69.31 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAATATGA:1 - chr3R 25702161 3' - Tirant 11 2 70.30 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCT:1 + chr3L 9925286 3' - Doc 49 1 70.30 GATACCTACTGGCGTGGCGGCCCACATTTTATTTTAGTTCAATACAAACTAACATACGTCCGCCCCCACCGGCATCCCGAATACCACTCCCGTCCTACTGC:1 - chr2R 488957 3' - baggins 1 1 25.74 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACAGTGAAGTGAAGAGGCAAAGTGCCTGCAAAATAA:1 - chr2R 5262590 3' + 1360 3350 1 67.33 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGTGGCCGATTTCGTGCGCGTTACACGTTCGTGCGAATATACAAATGAGAAGTAG:1 - chr2L 22719563 3' + 1360 3380 2 69.31 ATTTAGAAGAAAAGGAGGAAAACCTAACAGTATAAGTTAAGTAAGCAGCGACAACTCAAATAAAGGGCCAGCGGAATGAGATTCCAGATAGTTTCGCTACT:1 - chr3L 6345312 3' + TAHRE 332 2 65.35 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATT:1 - chr3R 7100990 3' + pogo 2070 1 60.40 AAAACATTCGCGTGTACTTATGTAGACGATAATCATAGCCCGTGGTGCCGGCTGCGTTCGATGTGGCCACCACTTGGGCCATCGTCGTGGCCGGATTCGGA:1 - chrX 16336452 3' + Q-element 555 2 78.22 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTTACCTTATTT:1 + chr3L 21203063 3' + pogo 2065 1 60.40 GTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAGCGTGATGAACGATGCTTTCGTTGGACTCTGGTTGCC:1 + chr2L 13837963 3' - 297 4 2 76.00 TCTGTATGTATGTATGTATATTGCGGAATGAAAAATCGTGGCCAAGAGATTGGGCAGCGGGAGTGGGGTACTCAAATGGCAAGTGCTAGCAAAATATATTA:1 - chr2R 20816884 3' + 1731 98 1 61.39 CATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGC:1 - chr3R 13423282 3' + 17.6 466 2 56.44 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAAATGAAATATTTATGAATGGAATTTTTCTTTTTTTCTTGATTAGCACCTGTTCC:1 - chr3L 4068079 3' - jockey 35 1 53.47 AAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATG:1 - chr3R 20466641 3' + roo 373 1 56.44 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCCGTATCCTTTGCACGGCCAGAAGCA:1 + chr3R 10957749 3' - hopper 17 1 63.37 AAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATTAATTTAAATTGATAATGGAGGCGGTGGCGATGCCTACGCAATGCGGACATATGTATGCACACATG:1 + chr2L 8272614 3' - Juan 4033 1 29.90 TTTAAGATCACCTGATCTTGTCGAAATCATTGGGTCTTGCAATAAATATGACAACTTGCTAACGGTCAATTAATCACAAGACCCAATGATTTCGAC:1 - chr2R 10873050 3' - invader2 4820 1 58.33 TCTAGATCGATTTCAAATATGGCTCCAAGTGTAAAGTTATGACCTTTCATGTGCCACAGATTCGCCAGATCCTGTTCCCACAGCGAGTTCTTGTTGTTCTC:1 + chr2R 22100323 3' + Q-element 645 1 63.37 CAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTATATTATTTTCATATTACAGGTATCAAAAGAGAATAGAAAATTT:1 - chr2L 1129037 3' - HMS-Beagle 6794 1 79.21 CCATTNCAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCACT:1 + chrX 16798283 3' + diver 6091 2 58.42 CCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATATGCATGGCTATATGTATGTACGTAGTTGCATAAATGAGGTCAGTTCCTCG:1 - chrX 15195212 3' - Transpac 17 2 63.37 AATTGAGAAGAGACAAAGCAGGCTGCACGAAACTGGAGTGAGGGCATTAATCGTAGAGAACGGTGGCAAAGAACTCAGCCAAATTCTGATGAACCTGGAAT:1 - chr2L 8966833 3' + micropia 287 2 57.43 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCC:1 - chr2R 9862206 3' + roo 9044 1 56.44 GTCGACGGCGGCGCAGTCGCAGTATTTAGGTAAGGACTCTCTACGGTCTCCTTCTCCTTAAAGCCCACTCTTTTACTCCTTTTCTGACAGAGTGTTCACAA:1 - chr2L 7551330 3' + blood 7232 2 71.29 AATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACTTCCAAGCAGAGAATAGTGTCCACTGGCTTTAGCATCAGTAGACCTTGCTTCTTATAACATT:1 - chr3L 2916637 3' + 1360 3184 1 68.32 CTCATGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGAGAGAGCAAAGAGAGCAGTCAAATCTGCTACCCCCGCCAACAGTTGTCACTCGAGGCCACTTTGCTAATTGAAT:1 - chr3R 11086625 3' - 297 6768 2 51.49 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGCAAAACAGTTGGCAGTTTTGTATGCAAAATGTAATCAATTGGCGGCATTTTAAATGCAATTTGTAAATGAC:1 + chrX 2762224 3' - roo 5 2 73.27 TAACAATAATAATAAAAATAGTAAAGCGCAAAACGACGCGAGTGGAAGAGGTAAAACAAAAGCGATAAGCTACCATCA:1 + chr3R 15994827 3' + mdg1 7071 4 84.62 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGAT:1 - chr2R 4830339 3' - 1360 56 1 94.06 TGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTATGTATGTACATATGTATGTGCCGATTGCAGCTGAACAAACCGATGTAAGATCGTCGCGGAAA:1 + chr2R 17443168 3' - S-element 3 2 70.00 TCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACATCAAGG:1 - chr3L 11909932 3' - Tabor 31 2 57.43 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTACACTCTGAGTGCCTAT:2 - chrX 495169 3' + 412 459 2 56.44 ATTTTTAATGTCAAAATTATTATTGGTTAATTATTATTGGCAGTGGCAAATCAAAAGACTGAGGCAACAAACTTGGTGCTCAAGCAAGTTCAATTGGTATG:1 - chr3L 3103448 3' - P-element 2508 1 59.41 GGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCATCTGCCATTCAATGGCGTGTTGCATTCCGTACAGTGCGATTCATAATAGTTCAAATCCCATT:1 - chr3L 5707109 3' + hopper 9 2 67.33 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCATTTGTTCTTTTTGGA:1 + chr2L 3694185 3' + roo 401 1 68.32 TGGCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGATTTTACCACGACCATACGTTACGCATACGCCATGTG:1 - chr2R 22353683 3' - R1A1-element 346 1 65.35 GGGTCGGGGGACTCCAGTTCCTTATCCACAATTTTATATTATATTATATTATTATTTTATATATATCTTTGATTTTTCATAAGCACCTACTAGTCTCCTAA:1 - chr2R 20563108 3' - mariner2 322 1 80.20 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATAAAGGTAGGACTATTAAATTATAATTTCTATTTATCTTCGAAACTGACTTTGTCATCCCGTTAATTAAT:1 - chrX 9248258 3' - pogo 3 1 74.26 CTGCANTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATACAAGAGACCTTTTGGTTTTATACAACTAATTGCATACTTATGGGGGCTGC:1 + chr3R 9657752 3' + BS 5068 1 49.50 GGATCCCTGAAACTGAAACCCAACTTCATCAGTCCATATAACATCAAACGGATGGTCAGCCTCGAGAAATTCTCGCAAAGGAAAACAAATGCCGCAGAAAG:1 + chr2L 2085381 3' - Bari2 672 1 53.47 ACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTGTCTTTTATTTAAGGCTATATTCCCTATTTTCCTTGCTTCTTATGCGTGGGAGATTC:1 + chr2L 17668333 3' - S-element 1504 1 63.37 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTG:1 + chr3R 25818895 3' - mdg1 7064 2 53.47 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGC:1 + chr2L 108063 3' - P-element 31 1 49.50 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTTCACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTA:1 - chrX 18717153 3' + roo 9036 1 57.43 GTTTGTATTTTGTTTATTTTTTTTTACAAAACTAAAATACTATATTGGACTGATTGAATAATTGAATGAATGCGTTAGTGAATGGGATTATATTCATGGTC:1 + chrX 15902680 3' - transib4 2539 1 48.51 AACAGGACAATAATTTAAAAAAAAAATAACTAACTTGGAGCTTAAAAAAACTTGAAGTAACAGGGTAGCTTATGATATTTTTCAAGAAAAGCAACTAACTT:1 + chr3R 20898619 3' + HB 309 1 61.39 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATACCATAAACAAGAGAGATAGCC:2 + chr3L 21708655 3' + roo 353 2 81.19 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTG:1 - chr2L 17841010 3' - Juan 4030 1 61.39 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATT:1 - chr2R 12779103 3' + roo 9028 1 67.33 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTTCAGGCTGCTCCAATTTGAGCTGAGTTTCCGACTCGTGAA:2 - chr3R 25918896 3' - roo 35 2 60.40 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGCGGGACTCCTGGCAACAGCAATTA:1 - chr2R 3171113 3' + 1360 3337 1 77.23 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCC:1 + chrX 13347347 3' - roo 8697 2 64.52 TGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATAGTCACACGTCAGCATATCAGCGTACTCACATT:1 - chrX 18200742 3' + opus 459 2 67.00 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGT:2 - chr2R 17384010 3' - mdg1 7066 2 55.45 TCAGATACCCGTTACTCAGCTAGACGGACATGGCTAGATCTAGATTGCATATGTACAAGGTTGGGGTTGCGGGTTCCCTTCGGCCAGGGGACACTTCAT:1 - chr2R 7300394 3' - INE-1 544 1 64.65 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGAGGATTAGGTGGAGTGAGCCCCAATGGATATAGTATTAA:1 + chr2L 6227713 3' - roo 8702 2 62.38 CCAAANAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAA:1 - chr2R 19192541 3' + roo 9030 1 68.32 TTTTTTTTATTATTCTTTATTTTGTTACTCCTCGCGTAACATAAAAAGGCAATTCTACCCTTTACAACATTTACTTTAGTATGATTGAAGTGAATTCTAA:1 - chr3R 22195935 3' - BS 5094 2 71.00 GACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCCCGGTAGCAGTTCGAGTACTTGCTTGCCGGGCAGGAGTGCTTGCCCTTGCTGATGGGCGTCCGTCG:1 - chr3L 11662874 3' - R1A1-element 5199 1 73.27 ACGTGNACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAG:1 + chr2R 24965109 3' - P-element 54 1 25.74 ATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAAGACGGCACTTGTTGAAGCAATTGTGTCGATAGTGCCGCTTCTATCTAAGT:1 - chr2R 18796673 3' - hobo 2569 1 60.64 AGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAA:1 - chr2L 7170405 3' - jockey 4661 1 80.20 TCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCAGGTAGTCTCTATGTGCGGACAGCATGTTGATAGGTCTTAAGTCTTTGGCCACATGACGATTACA:1 + chr3L 19544031 3' - hopper2 1166 2 53.47 CCATCATCGGAGCAATGCCGATGATGGCAGAGCTGTCGGCCACCCAGCGCATGGTGCGAAGCAGTTTCCGCAGTCTGGGGATGGACGTGGAGATGGAGCTT:1 + chr2L 7332339 3' + R1A1-element 365 1 56.44 AACGGGTATCTAATAGTCGAGAAAATATGCACCTATTTTTATCTATAATAAAGAAAAATTCGTCCTTAATTAGTTTCATTCATAAATGAAAATTTCTATAG:1 - chr2L 7887656 3' + INE-1 553 1 53.47 GCCATGGTTAATAAATTTATGGATATTGAATGTTTTTGATTGAAATACTTTGGAATAATTCAAGCTTAATTAATTATGGGCAAGCCTGTTGAATATTTGTT:1 + chr2L 20640745 3' - Ivk 175 1 67.33 AACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGGACTTGTTCCCAAATGGTTTTACCAAACAATAAAAGATC:1 - chr2L 7928656 3' - hobo 498 1 61.39 TATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAA:1 + chr3L 7989812 3' + mdg3 233 2 60.92 GATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATTGATTGGGGTTCTGCAAGTACAACTGAA:1 + chr3R 17121685 3' + mdg1 372 2 73.27 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCCATCTAGCGG:1 - chr3R 19657424 3' + roo 402 1 72.28 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAA:1 + chr2L 19679755 3' - Doc 64 1 75.00 AAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAATGACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATT:1 + chr2L 18953098 3' - copia 4906 2 60.40 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACT:2 - chr3R 25818833 3' + mdg1 376 2 71.29 TGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACGTC:1 - chrX 16798198 3' - diver 26 2 53.47 TTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCCACATCCCCCTTAATCAAACCA:1 + chr3L 18786507 3' - I-element 397 1 78.22 CTCAANTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCTTAAATTGCATTATA:1 + chr3R 24282041 3' - Max-element 8245 2 70.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGG:1 - chrX 12538467 3' + roo 9056 1 58.57 TGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAACATGATGA:1 + chr3L 19881835 3' - Idefix 22 2 60.40 TTTTTGATTTTAACGGTCAAAATTAAGGGTTATTTGCTTAATTCAACGTTTTTTTTTATGCTTTGGCTTTATTCGATTGGCGCTTTTTTCTCAAATGCCA:1 + chr3R 15283224 3' - 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Doc 13 1 67.33 GAACTTCATACATACATATTGGCATAGCGATTGTGATTCTGTCTTATTTAAAATGACTTGATTAAAATTATCTCAAAGTTATAAGGCATTTTAATTATTTT:1 + chr2L 17805315 3' + mdg1 230 2 79.21 CCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGGCTCTTTGTTCACTTTCACGGAAAGAACTCAACGACCTCAAAATGCGCAAT:1 + chr3L 7792252 3' + 412 7519 2 51.49 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTA:1 - chr3L 17122435 3' + roo 9027 1 77.17 TCTTATTAGAAGGTAATGATTAACAGAGTCAAATGCTTTCAGTTATTTGACTTTGCGAGTCGCGAAGATGTAAAATAAACACTGATTCCCCTAAATGCCCC:1 + chr3R 1135635 3' - Q-element 342 2 70.30 TTTGATTTGATTTTATTTTATTTTCCTCACACTTCATGCTTGTGCCCCTGGACTATTGTATTGGGTTTTAAGGGTTGACGGTCCTCTATTGTTATGTATTT:1 - chr3R 15061958 3' + transib1 1896 1 76.24 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAATAAGATTGAAATTTGTAAATTTTATGCGCTCTCCT:1 - chr3L 7926347 3' + flea 4976 2 69.31 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTTCTTAATTAA:1 - chr2L 1626519 3' + roo 391 2 60.40 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGCTTGATTTAGTTGGCCACATTATTCGTTAATTA:1 + chr3R 21500983 3' - roo 8706 2 69.31 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTTGCAATTAACTTTTTGGCGGCTTTAAGCCGACCAGGACGAAGCA:1 + chr2L 18914606 3' + mdg1 7428 2 54.46 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTGCGTTTTTACGAAGCAATTGTGCCTGCATTCG:1 - chr3R 31812681 3' + P-element 2855 1 51.49 AACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTAAAACATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTT:1 - chr2L 16082615 3' + Stalker4 383 1 52.81 CATATNAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGC:1 + chr3R 6147311 3' - copia 4912 2 63.37 ATGTATATGTATATGTATATATATTATATTATATATATTATATATATATATATTATATATGAATATAAAAGCTCTTTTTTTGCACACAATTCAATTATTCC:1 + chr2R 16846091 3' + Stalker 244 4 56.44 CGCAGCTACGCAGCTTAGCCTAAGACGAAAGATATTTTAAAACTCACAGAACATGCAATTTTAGTCTTAGTAACTAATTGCTAAAACATAAGAC:1 - chr3R 9160813 3' + 412 319 2 56.38 GAAGAGAATCAGAGAGGGGGAGAAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGATCCGTGCCAGAAAAGGATGAGTTTATCGATGCGACGGGCAGGACCGCAAAGAA:1 + chr2L 697232 3' + Bica 10 1 80.20 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGCCTTCGTCATCGCCAC:1 + chr3R 19989867 3' + pogo 2070 1 58.42 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGCATTTCAATCGCTAAGGACTTTATGGCGCACGTATATGTTTTTTCAGCCAGGTCCTTATTACACACT:1 - 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chr2L 562450 3' + gypsy10 5562 1 66.34 CACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAA:1 + chr3R 28326746 3' + P-element 2839 1 34.65 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAGTTTTACTAGAAGTGCGTTACGTTTTTCTTCTTACCGCAAA:1 + chr3L 11461406 3' - copia 4904 2 60.40 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGCATACTTAGCAACATATCTTTAACT:1 + chr3R 4986373 3' + roo 395 1 70.30 AATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGGTAATCCCTTTTTGTGCGCCGGTTCAACTGATTTGTATCCGGACCTCAACTGACGGAATCCACCTTTT:1 + chrX 8223573 3' + Doc 4519 1 72.28 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTGTCCAGACCGTACTCCGTAAAGTTGTCCAGGTTGAATTCGGAG:1 + chr3R 5820690 3' + 1360 3355 1 64.00 CAATTNCGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGGATTTTAATGACAGCATTGCGTATACAA:1 - chrX 8977405 3' - jockey 57 1 73.27 GTGATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCAAACTAAAAACTTCGTTTCTTGAACCCCGTAAGCTTAGAAAGGCAAGCTCGA:1 - 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X-element 18 1 37.62 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATATGTATCGGCGCCCAATGTACATA:1 + chr3R 31644215 3' - roo 23 2 56.44 GGAACTATAAAAGCTAGAATGTTGAGATTAAGCATAGACATAGACGCTCACTTCACCAGTCAAGTCATACAAAGACAGCCCTCGAAAAGCAAGAAGTTGTC:1 - chr2R 4516576 3' + INE-1 157 1 53.47 CCCACACACACACACACATACATACACACACTCAGGCACACACAAATAAGAAATTCCGCTGCTTTTTTTTTTATTATCCTTTTCATGTTGGTACTCACTCA:1 - chr2R 12979508 3' + Quasimodo 36 2 64.36 AATATAAAAATAAATAAACATTTTTTTTTCTTCTTCCAGTGGAAATGGAAATCGTATTGAAAGAGCGATCTTGTGGTTCTTCTCAGTGCAATAGTGCCATT:1 + chr3L 16710558 3' + mariner2 828 1 87.13 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTTTGATATGCACAG:1 + chr2L 21978154 3' - roo 41 2 70.30 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCGACAAACTTATTGTGGAGTTTCTCATTCTCATTGGCGAATTCAGTGCTAACGCCCAGTAAACCCAA:1 + chr2L 19814059 3' + 412 437 2 70.00 CACATNATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCTGGCCCATCA:1 + chr2L 11686089 3' + hopper 1396 1 57.43 TTATTNATTAACGTTCAGCTTAAGACTAAAAATCAAATGAAAGATATCACGGGATGATATTTATGTCATCATGGGTTCTGCATTTATCGCATTTCATTTTT:1 + chrX 3697974 3' - 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roo 8691 2 78.22 ATAGTCGCTTATGTTTTCGCCTCTTTAAATTTATTGATTGAACTCGGTATCCAGTTTCCAGTTTCAGTTTCAGTTTACCACCGTCAAAGTTCGGAAGCCGA:1 - chr3L 10208287 3' + hopper 314 1 72.28 GAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCTTGAAATATTTTGAAAAATGTTTTAATGTAAATAAAGTTTACGTATACACTGAAGAGAACTGC:1 + chr2L 17889415 3' - accord 8 2 70.10 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTAGTTGCCTTGTTAGTTACGTAGCTTTACGCTCTTTGAAAGTAATATTTT:1 + chrX 21401953 3' - roo 5 2 73.27 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTC:1 + chr2R 18503571 3' + roo 398 1 53.61 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTAACATTGCGAAATTGATTTT:2 - chrX 12546456 3' + P-element 2832 1 24.75 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCG:2 - chr3L 3671303 3' + roo 360 2 72.28 TATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTTGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTT:1 + chr3L 5015874 3' - I-element 4949 1 51.49 GGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - 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Transib5 2722 1 37.62 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGCACTAAGCCACTGGAGCTGCGGGACTATCGATAATTCTGTTAAAAAACATTC:1 - chr3R 18906585 3' - P-element 23 1 56.44 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACATGTATGAAGGGTATACGGTAAAAGCTGTAAAAGTCTAACTTTAATAACGTC:1 + chr3L 10736529 3' - 412 24 2 55.45 AGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTCGCTGCTGACTTTGCCGTTTTGCTAATTATGACGTATTGGCAGGCAACGCGTGCCGCATATTTTAGTTT:1 + chr2R 19412571 3' - opus 7388 2 76.77 GACTTNCACTCTAAGTGAGTGCCCTATGGACAGAATAGCGCGGGTTGATGATCTTGGTGTTCTTCTGGACCCTAAACACGCCATGGATCATTTTTATTTTT:1 - chrX 17055773 3' + Q-element 715 1 75.25 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTGACTGCAAATTTAAAAAAAAA:1 - chr2L 9946935 3' + roo 355 2 81.19 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTC:1 - chr3R 30344461 3' - P-element 34 1 38.61 AAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAG:2 + chr3R 14688307 3' - pogo 42 1 70.30 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACACTGCTACTAATCAAATATTTAG:1 - chr3R 31884229 3' + hobo 2892 1 78.22 ACGGTNCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACTTTAATTTACTTTATTTAAATATGGTTCATGCACTTGCTAA:1 - chr3L 710792 3' + 17.6 460 2 65.00 GCGTTGGTAGTGGTAGCGATACCGTAAGGTTCGCCGGCTGAACCACCACCACGACTACAACCACTACAACTACAACAACTTGTACCCCAACAACTACGACT:1 - chr3R 25399393 3' - G-element 153 1 60.40 AAACATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAATTTTTTTTTCTCAAACTCATCTTTTTTTAAGCTACGAATAAAATCGTAAAAGATATACCAATT:1 + chrX 22490469 3' - FB 50 1 62.38 GTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAAATTAGTCCAATATGTACATACATTTTCAAAGAATTTGTATATTGAAAAACGACGTCTTTTGACTTA:1 - chr2R 7542001 3' - Stalker4 6989 4 57.43 ACATATGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTATGATTTAATTTGCCTTTTGCTTACAGTAT:1 - chr3R 9369943 3' - roo 8708 2 72.28 GCTATCGCTTGAGCAGCTGCTTTTCACCTTCTCCTTGAGCGCCTTCTTTCTAGGCACTTGCAGGGCAGAGTGTGGGTGCGGATGTGCATCTTGAGGGCTCC:1 + chr2L 15477210 3' - G-element 408 1 58.42 CAGTCTGCACGCTGAGAAATTTAGAGTTTGATTAACGATGATTGTAGCTTGTATATTAGCCACGAGCAATGTACTCAACTAATTGCAGTGATTTGTAG:1 - chr2L 2628376 3' - Cr1a 332 1 80.61 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATT:1 - chr3R 29384356 3' - jockey 4793 1 55.45 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAACCCTGTGAAAGGTAGCAACAACGTTTCCTTG:1 + chr2L 8031307 3' - P-element 42 1 37.62 ACTGTGCTGCAAGCGATGTTAATCAGTTTCTTTCTGTTGCCATAAATCGAAAAGATTTATGGCAACAGAAAGAAACTGATTAACATCGAATAATGACAA:1 + chr2L 6201843 3' + Stalker 487 1 56.57 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCTACCCAGATCTTATGTAACCT:1 - chr3L 7806182 3' + pogo 2049 1 77.23 GTGGGCGGTGCAGGCAAACAATCTCCGGTGTTCTGCATTTTACTGGTGCGGCGGAAGTGGGCTGGAAGTGCGAAAGGACACTGGTCTCAGATTATAAATTA:1 + chr3L 7318829 3' - Chimpo 247 1 59.41 ATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCC:1 - chr3L 27356094 3' + Tc3 1668 1 69.31 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAG:1 - chr3L 13364553 3' + hopper 1364 1 72.28 AAGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAATCCATGCAAAGAAAGCACTTCACACGTTCTAACAACGCAGTCGCCGCCGGG:1 + chr3R 21968131 3' + S-element 1332 1 55.45 GAGATCGCATGTGAACACCGAGTCCTCTCTTGCTGTTAAAGGACCGGCCACATACTGTGCAGGGAACCCTAGATAAAAGCATTGCCAAGCAGTTGATCAAA:1 + chr2R 10740409 3' - R2-element 406 1 74.26 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACAGCGCCAAAAAAGGTTCTAAGGCAAAATGAAAAAAGTCAATCGTAAGGAATTTTAAAATCTGGGTTGCTGATAATTT:1 - chr3L 5356230 3' - opus 7061 4 77.23 AAGTCNTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCTCCATCTCC:1 + chr2R 19936712 3' + roo 405 1 78.22 CATTATTATTTCATATTTTATAGTTTCTTAGCCACATAGCACTATATCTCCTCTTTTCTGCATATAATTTCAAGAACATATTAAACCAT:1 + chr3L 6986599 3' - Tc1-2 385 1 71.91 AGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACATATTTCGCTGCGAGAAACCAGAAACCTGTAGTTTTTGACCCATATTTCAGATAATTTTCGCCAGAAATTTGAATAC:1 + chr3L 4048551 3' - 3S18 5765 1 80.20 CTCTTNCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTGTAATGAGCCGAGCGCC:1 + chr2L 15333800 3' + P-element 2870 1 60.40 CAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTGCTAAATAAAATGACATTAAACAAACCCCTCTAAGTTCTATACTCTATACATATACAGATCTATAAGC:1 + chrX 17204174 3' - Tabor 6849 2 67.33 GTCGTGCTAAGTGGAAAGTGTTAACCAATGGTACTCAATCCCATAAAGTGACCACGAAGTGAAATAACTTAAATCAACTGCCATTCACAGGCTAACAAACC:1 - chr3L 15706953 3' + rover 458 1 72.28 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACACTTTTGGGCAGACAAAATCACTGATTGTATTCTATTTCTTCCACATATTTGCTGCTCATTTAT:1 - chrX 17204062 3' + Tabor 474 2 71.29 GTGGTAGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCA:1 + chr2R 12185417 3' - accord 17 2 58.42 AGTGGNCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAGCTGCATTTTGAGCTCCAATTTCG:1 - chr2R 11934314 3' + blood 277 2 73.27 GTACACACACACAGACACACTGACTCCCGCCCACCCACTTATACAAAAGCCTCACACCAAACACGCTGTAAAAACACAAGATACAACACCACACACACTGA:1 - chr2R 16329174 3' + accord 7102 2 67.33 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGTTTATCATAAGGACGAGGGATTCTCCTTTTGGAGATTATAGGAATATGCAAAAGG:1 - chr3L 15638214 3' - roo 8684 2 57.43 TATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATATGTATTTTGGCGTATGTAACCTCCGCCGCCATGTCAGCATTTTCGTACCATTTTTTGTC:1 - chr2L 20905622 3' - P-element 2801 1 36.36 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGGAAATCGACGGGGATGCAGATGCATTGGACACTGAA:1 + chr2L 19679787 3' - Doc 34 1 54.46 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGC:1 + chr2R 5084085 3' - F-element 33 1 49.50 TGCGTNGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGGTGAATAAACGATG:1 - chrX 1427511 3' + Bari1 1697 1 69.00 AGAGGCAGTAGTTATTCATTATTCCCTACTACATACCCTACTCATAACATGTTTAACCCAAAGCCAACCCACTGAAATCCGCACACATATTCTCCCAAGTG:1 + chr3R 12845001 3' - G4 3767 1 58.42 CCAAAGAATAAATTCGTGAAACTATTTCCCCCATAACCCTATTACAACTCCTTCGTGTTGGTCGGTCAGTCAATCAAAGGCACAAAAACAAAAGGCAGAGC:1 - chr3L 14611923 3' + 297 6879 2 76.24 TTATTCTAATGAATTTTAACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAA:1 - chr2L 10291536 3' - jockey 4808 1 72.28 TCAGGGAAAATGGGCGTGGGTTTTGTGTTGAGATAGAACTCTCTTCTGCCCTTATACCATTTCACCGAGTACAGACTGTCATCCTCGATATCGTAGAAGCA:2 - chr2L 16075175 3' - Circe 152 2 69.31 TGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAACAATAAGGGAATGCAAAATAGTTCGACGTTCTCCAGTTCTCAGAGGCTCAAGCTCCTGGACAGGAAACAAAA:1 + chr3L 19213933 3' + roo 8675 2 71.29 TAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTAAATTTTTCGTAGAAAATATTTTTTGTGAAAGACGCCCACGTCGAATTCCCAATGGGGTATAGAGAAAAT:1 - chr2L 7406384 3' - gypsy3 426 5 82.18 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTTAA:1 - chr3R 7388339 3' - HMS-Beagle 6826 2 56.44 GATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAATGGGAAATGTTAAGGCTTGTAGGACCAAATTGTGTGAGCTTTGTTAGGGGTTATAAAG:1 - chr2L 6412029 3' + flea 478 1 62.38 ATTTTCCCAACTGGTGGTGTTATAGATAACAATATTAATAATCTTATAACTAACAATAACGAACAAATTATTATAAATCAACTAATTAGAAAATTACGATG:1 + chrX 14752916 3' - S-element 449 1 60.40 ATAAAAAAAAATAAAATAAAAAATGGGGTATTCGCATTAGTAAGCCCACAAAGAGGAAGACAGACTGGTAGACAGAGGAATTTTTATGGCATTTCTCATGG:1 + chr3L 12054464 3' + HMS-Beagle2 483 8 56.44 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAATGGCTACGAAAATTTAACTCAT:1 - chr2R 8378591 3' - pogo 27 1 60.40 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCAAGTGTGAAGCCTAAATTTAATCATTTTTCTGGGATATCGATAAATATTTGGGAATAAAATGAGAAAA:1 + chrX 20806207 3' - INE-1 557 1 92.08 ATAAATTTAAAATAACACACACACTCCATTTATAAATTAAAAAAAACGTTAACGAAACAAATTTCACAAAAGAAAACATAATATTCATTAAAAGGTTACAC:1 - chrX 1217674 3' + Tc1-2 486 1 58.42 ATGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCGAGA:1 - chr3R 21695427 3' - 3S18 23 2 55.45 CACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAGTGCATGAGGC:1 + chr3R 9952272 3' - Ivk 6 1 72.28 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGC:4 + chr2R 12779139 3' - roo 53 2 80.20 CGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGAGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCGATGCAAGATCGCTTAAATATATA:1 - chr3R 778388 3' + F-element 24 1 51.49 GAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGGTGAGATTGAGGAGTTTATTGGAAGTGCAAGTGATCGAAGCACTTTGAAATTGGCGCAAATTG:1 - chrX 14525041 3' + hobo 2902 1 70.30 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCC:2 - chr3L 9692693 3' + P-element 2836 1 28.71 ACCACNTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTAATTTTTTCAAAATTCTTCTCGCTGACTGCT:1 - chr2R 24965041 3' + P-element 2884 2 76.04 AAGGAAAAAGAAAAAACAAAAATCCAAATAAAAAACAACAAAAATCCAAGCTAAAACACAGAAATCTCCCTATTTCAACACTATTTTTGGGGAAACCAACT:1 + chr3R 13066242 3' + Doc2-element 241 3 62.38 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCCATCTTAAATAAAGTAGGAAGGAAACTAT:1 - chr3L 11654510 3' - pogo 12 1 62.38 TTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAACGGAAAAAAAAGCAAGCAAACAAACAAATAATAACACTGCATGATGCAAATTAA:1 - chr3R 13227565 3' + P-element 2595 1 58.42 GATATGAACGGAGGCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGTTTATCATAAGGACGAGGGATTCTCCTTTTGGAGATT:1 - chr3L 15638232 3' - roo 38 2 62.38 ACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACGATCTCTACCAAGCTGATAAGCAGAAAAAGGTAAACAAACGAATTAATTTTACA:1 - chr2R 1395444 3' - gypsy 7006 2 58.42 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTATATTGTAATGT:2 - chr3R 10445173 3' + roo 9060 1 67.33 ATTGAGGAAGGCTGTTGAATATAGGTAATGCCCACATGTGTGTATAACAAAAGGAATGACACCTGAAATGGTGTTCCACAGAGGGAAAGGATAAAAGGTGA:1 + chrX 22900774 3' + 1731 4301 1 67.33 AAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAACACCCACTCAGTCACATATTCAACGCAAATGGACTTCCA:1 + chr2R 23495503 3' - 412 35 2 61.39 CAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGAACGGTTGGTTGGCGTTAGAGTGTGCGTGGCAAAAAGTTTTTATTTGTGTATTTTGTTGTGTTCTTGTTAGTTGTA:1 - chr2R 1845336 3' - INE-1 247 1 64.36 AATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTG:1 - chr3L 11909943 3' - Tabor 6881 2 68.32 ACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATCTCTCTCTAACACACTATTTATGACCACTCGTTTTTTCGCCTTTCTGATATCTATATTTGTTTTTGGATGCAGGTC:1 - chr3R 25424307 3' - invader4 173 2 55.45 CCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCCAAAAACTCACAGTAAATGTGATAGGGTAAGAGCAAAACATGATTTAGATTTAGACGCCAAAGGAAACG:1 + chr2L 18842422 3' + F-element 477 1 79.21 AGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCAGTCCGCCGACCGACCGGCGACTTACTTATTGATGGCGA:1 + chr2R 9860361 3' - Doc 420 1 61.39 TTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTCCGAACGAGGCAGCAGCAGCACTAACAACA:1 + chr3L 4574982 3' - copia 234 1 70.30 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGG:1 + chr3R 13423369 3' - 17.6 6948 1 56.44 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACATATTCTGTGTTTGGGGACCGTAACTTTTTCAAAAATAATTTAAGCAATTGAAATTAAT:1 - chr3R 10321010 3' - roo 16 2 63.37 CACTATATAAATGCCAGAACTTCATTGTGGTTCTGGGCTGCAATTGTTTCAGGAGTTTGTTCGCTCCGGATGACATGCAACTTTTGCCCCGAGCTGTTTGT:1 + chr2L 1272205 3' - baggins 5339 1 59.41 AATTTGAATTTGAATTCGAATTTCGGCCCAACGAGCGTTACCTCGCCCCAAGACGATACACCCGGCACCAT:1 - chr2L 23191519 3' - Rt1a 310 1 57.75 GATCAGAATTGATTTCGGTCCGAAAATCTTCTAGCACAACACGCACACATATACACGTTCTCGTCTCTTGTTTTCCCCGCGAATACAATGAGCTCTTTCTG:1 - chr2L 21243866 3' + 1360 3178 1 73.27 ACTTTATTAAGGCATACTGGGTAGCTTTGTCACCTTGGGCGCTAATAATTATTTATTGATTGCTACTTGGATTGGTAAACAGTGTCCGGTTCCCATTCCAG:1 + chr3L 20113420 3' - BS3 1755 1 57.43 GAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATCTATTCTTACTTACATTTATACATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTAT:1 - chr2R 5029211 3' - Stalker 7151 4 73.27 GTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTGGTAAGTATA:1 - chr3R 28755911 3' - 3S18 5771 2 71.29 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCATAAATCTACAGTTTTGTTAACAATTTC:1 - chr3L 21383986 3' - roo 8711 2 75.25 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTTTGGCCAAGAAGTATGAATACGCTT:1 - chr3R 6147228 3' + copia 249 1 79.21 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAACCCTGTGAAAGGTAGCAACAACGTTTCC:1 + chr2L 8031304 3' - P-element 45 1 34.65 AACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGGGGCGACTGAGGGACAGGCGTAGGGCATAGG:1 + chrX 18194751 3' + hopper 50 1 73.27 TATTTNTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACAAGCAAGATCAGTAAAGCCAT:1 + chr3R 22620247 3' + 297 6924 2 78.22 CAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGCCTGGCAGCAAATGTTGCTCGGATGTCTTGAAATGTTCGCATGGCTTTGGCACGCATTGTTGG:1 + chr3R 7388432 3' + HMS-Beagle 235 2 72.28 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGGCGCTACT:1 - 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chr3L 19951193 3' - Ivk 25 1 54.46 CAGCGATCAAAAAGAAACGAAGACAAGAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGGAAAATAATAACAATAACATGAAATG:1 - chrX 11533907 3' - invader6 4590 2 54.46 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGC:1 + chr2R 18503542 3' + roo 9028 1 69.31 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATGTGTATATAGTTTCTAGTATACCCGAAGAGAA:1 - chr2L 4009451 3' + pogo 2061 1 70.30 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAATAAACTTTCAATTGAAACAAAATACGATCTATCTTCTGATCACCTACCTGTAGTAGCA:1 + chr2L 20120180 3' + Juan 4201 1 58.00 ATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACACTAGCGAAAACCTTTCATTTTATAAAATTACATTCGGATATGTTATACTTTTCCGT:1 - chr3R 28883341 3' + HMS-Beagle 244 2 75.25 ACGCACACACACACACATATACACCCCACCCCATGTGTCGTCACTATCGATTTTTGTGTA:1 - chr2R 15568978 3' + accord 7031 2 80.00 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAACTTAAAATGCCTTGAGTTCCTTTAAAC:1 - chr3L 13364518 3' + hopper 1399 1 57.43 CTTCGGTGAGCAGGATGTGAGGCCAGAACGTTCTCTATTTTATTATACATTTTATGTTAAAAGCTTACCAAATTTACCTTTATATTTCCACAACAATCGCT:1 - chr3R 23548740 3' - Rt1b 4960 1 79.21 GGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGC:1 + chr3R 29350771 3' + opus 7463 2 70.30 CAATATCTATTACACTGAACTATTACTTATTACTTATTACAATATATTACAATAATTGTATGATCTTCTTGTTATATTGGTAAAACAAGTAGAATTTAAAA:1 - chrX 23283146 3' + Stalker2 7632 2 57.43 ATTTATTTAGTGTTTAATTGATTTAAGTTCATTTTTATAAGCACAAAACGTTGTATGCGTTTTTTATATTTGTAAACGTAGTTTCTGCTTGGTTGAAACAG:1 - chr2L 9158821 3' + McClintock 6300 2 65.35 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATTATGAGTGTCTAGCACCCTGTCTAATGT:1 + chr3R 19609727 3' - Tabor 6865 2 51.49 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTCGTATTTGCTTTTGTTAATGGCGCCCGTTCTTGTTGTTGTTTTATG:1 + chr3L 7298528 3' + roo 9027 1 54.46 ATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATG:1 - chr2R 22997961 3' + Transpac 275 2 64.36 AAAAANTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTTGTTCTTCTAAAAGA:1 + chr2L 2437789 3' + roo 389 2 58.42 GGCCCGATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGGCAAAAGGCATTAAATGAAGCCGCACACAAAAA:1 - chr3L 20248274 3' + Transpac 5225 2 73.27 TAGTGTTGGTGAGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTGTTTGCACAGGAATCGGGAATGAAAATTCGAATGTAAGTAAACAAC:1 - chr3L 19819069 3' - I-element 4963 1 57.73 GAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATATATAC:1 + chr3L 7989819 3' + mdg3 5478 2 59.41 AGCAAGTACTCGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATATACATAGCTAGCTTCTCTGGCTGATAACTGCTAGCTGATAACCGATGAGTGGAACCCCTTTAGG:1 - chr3L 9360466 3' + R1A1-element 5162 1 61.39 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCGCCAATTCTCGCGCCTGCACTTCCGCATATGCAAAAGCGAGGCTTTCGCAGCTGT:4 + chr2R 22998043 3' - Transpac 4935 2 66.34 AGTGTGTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCAGGCACACAAGGAATTTCAACCCCCAGCGAGAAGAATAAAAACAA:1 - chrX 10621673 3' + hobo 2910 1 50.52 AATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAAT:1 - chr2R 6779760 3' + 17.6 471 2 57.43 AATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTACACAAGAATACCCAAAAAAGAAGAACTTCTTATATC:1 - chr3R 7184387 3' + F-element 4590 1 73.27 TATTTNATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTATGATACCATTTAGCCGGAGGGTTGTTTTGACAAATTGTGCAAATTATTGTGT:1 + chrX 7828961 3' - 412 7076 2 56.44 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGA:1 + chr3R 12136327 3' + roo 9031 1 65.62 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCGTTCTGTTATTTTCTCTTTT:1 - chr3R 12877804 3' + mdg1 384 2 59.41 GAATTCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAAGAAAAGCGAACACCAGACTTTTCGTAATTGCGCGGGCGCCAGCGGATGGCTCACTTTACATATAGTTTA:1 - chrX 9246203 3' - GATE 223 2 72.28 TTCGTTTCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCAAAAAATTTTCACTGCCAACTGCACCGAATATTTGACCGCCAAGAGGAAAAAAATGCTAGCTATTTAAC:1 + chr3L 24803158 3' + 1360 3167 1 71.29 ACCACACACAGTGTTGGCAGACCAAGAATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCTATCTGTGCGTCCATTGTGTATTTGAGGTGTATAGAATTTTTAAAGC:1 + chr3L 18291093 3' + R2-element 3528 1 52.48 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAAT:1 - chr2R 22395195 3' - I-element 24 1 58.42 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCGATCCCCAAATGCACCCCAAAAAGTATGCAACGCCGAGCACAAAAAG:1 - chr2R 16366766 3' + hobo 2910 1 54.46 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAGTATTAACGAGTTTAATT:1 + chr2R 21712766 3' + I-element 5304 1 75.25 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAAC:1 + chr3L 19215851 3' + roo 9028 1 68.32 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGAAAAAAAATCTTAA:1 + chrX 5018706 3' + opus 473 2 53.06 GCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGACAAAGGCTGGCCAAGAAAAATATGTGCAAAGGAAGTCTTGCCCATTTCAACAGAATTAAGTTGCT:1 - chr3R 18551105 3' - Max-element 11 2 69.31 TTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGG:1 + chr2L 18112558 3' - transib2 2596 1 69.31 AAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATGTATATAAG:1 + chr4 1128522 3' - transib1 1893 1 76.24 AGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTCCAGACTAAGTGGAGAGCGAGCATTTATGAGCCAGTGGAGGTTCCTATTTGTGCCACGCCCGCATCCGTGA:1 - chr3R 9061915 3' - Doc 4256 1 75.25 ATCACGGAACTTAAGGAAAAACACCAATATATAGAATATTTACAACGCTATCAATGCCATTATCAGCAACATAACTTTAAACAAGC:1 + chr2L 5703409 3' + F-element 4427 1 79.07 TGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTT:1 - chr2R 2492933 3' + invader2 227 2 56.44 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGATTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTTTAAGTTGGCCAGGC:1 + chr3L 17699394 3' - 412 7079 2 52.48 ATTTATTATAAATTTAAGTTTATATCGATCAACCAACAATAAAGTTACAGTCTAATTTTTTTAAGTATTTTAATGTATTTACTATTTATTATTATATAATT:1 + chr4 54601 3' + INE-1 428 1 74.26 AAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCTACACAGGCGACCAGACTCTCATCATATTTAATGAAATTTTAAACTTGACGCA:1 - chrX 19392638 3' - F-element 50 1 51.49 AAGAAGATCCCTTCAGTCAAGTTTGAATGGTCGTGTTTTGATGATACAATGACGCTGCGCTTGGCAGCTGTTGTCTGTCGTCAGCCAGGTTCTAAAAGGGA:1 - chr3L 5847687 3' + invader4 233 2 68.32 GCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTATTTTAAACATTATTATTGTTTAGATAAAATTTGGCCTCTG:1 + chr3L 24213507 3' + invader2 170 2 63.37 TTTATAACCAGGCAGCAATTTTTATAACCTGGTAGCAATTTTTAAAAAAGCAGACAACATCAGGCGGCAACAACGAAAATGACGACGTCATTGGAG:1 + chr2R 20063859 3' - Cr1a 466 1 57.29 GCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAG:1 + chrX 6458231 3' + blood 7349 2 64.36 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTGGCCTTTGTCGGCA:1 - chr2L 21089148 3' + flea 4994 2 60.40 TAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAATTGTACGGTATAATCAGATAGCGTCGCAAATGAGCAAACATACACATACACATGTGCGG:1 + chr2L 7994506 3' - jockey 4776 1 61.39 TATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCGGCGTTT:1 + chr3R 29660310 3' - mdg1 7063 2 54.46 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGT:1 + chr3L 6024611 3' + roo 385 2 56.44 CTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGAGGAAAAATTATATAA:1 - chr3R 25795983 3' - BS 4992 1 78.22 CACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTAGCACATTGGAATACTTGGCTAAGGGCTGTGGCAAATAAAACGAGCTGAATCCAGGGAG:1 + chr3R 29795773 3' + R1A1-element 5318 1 66.34 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTATGCATATCAATTATGCTCTCCACC:3 - chrX 5018607 3' - opus 7 2 72.28 TCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAAATAATTGATTGAGAGTCGTAAACAAAATATAATTTTTTTTTTAAAAC:1 + chr3R 15871145 3' + F-element 4497 1 56.44 CGGGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACT:1 - chr2L 20118712 3' - Max-element 54 2 74.26 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGT:1 - chr2L 15333740 3' - P-element 53 1 26.73 AAATTGTTCCTTTCTAAACACAATATTAATATTGAGAACTCAATGACTACATATATTACGTCATTACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACA:1 - chr2L 21750457 3' + Stalker 6769 2 65.35 GAAACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGATACTAACGAAACTCTCTGAATATGCCATTCTTCCGAAATGAAATGAACTTTAACCCTTACTAT:1 - chr3R 7690468 3' - accord2 7282 1 61.39 ACGAAATTTCGTTTCATTTAAATGATCTGCGACATATACATACATATATTACTTTCCACGTAGTGACGAAGCGCACCAGTAGAGTGTGCGAATGTGACTAC:1 + chr3R 9166701 3' - invader1 3622 2 64.36 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTTATCTCAGGCCATGC:2 + chr3R 7522396 3' + blood 7383 2 72.28 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTGATGCGGCCAAAGCCAAAGCCA:1 - chr2L 15344124 3' - transib2 20 1 59.00 GAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGA:1 - chr3R 25633335 3' - Tirant 36 2 62.38 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGTGGGTTCCAGCCGCCTGACAAGC:1 + chr3L 14240904 3' + Tirant 375 2 55.45 AGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACACATACATATGTATATGGCTATTTTTGCTGCTTTTTTGGTTCAGTTTCAATTCCGAT:1 + chrX 11533992 3' - invader6 4516 2 55.45 CTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGGAGACGGGAAAAGCGTCCTATGGAGGATTGGGAAATGGAGCAGAGACCTTCAGTCGGAGCTGTGAGCAA:1 - chr3R 12522512 3' - F-element 4525 1 70.97 TTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAATCAATGGAGGAGTGCCGCCGGTCACCACGATTGTG:1 - chr3R 18170056 3' + Ivk 5279 1 65.35 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTGACATTATTTGAATTGAATTC:2 - chr3R 19467852 3' - Transpac 4929 2 70.30 CAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAAGAAAATCGCATACTAGGCATTGAAAAATATACTCGGAAATTTACAATATACATCAACCTAGTTAGTGCACAT:1 - chrX 21394748 3' + F-element 334 1 42.57 CCGGCGTTGCAGGTGGTTTGTTCCCGCGCCGCAGTCAAGTTGACGGAGTCAGAGGGCAAACAATTTGAATACGATCTTGGCGATTGTGGTAGGTTGTCGAC:1 + chr3L 6854670 3' - HeT-A 5605 1 71.29 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAAA:1 - chr3L 11435590 3' + roo 9030 1 68.32 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACGTACCCA:1 - chr3R 25823631 3' + hopper 1399 1 59.41 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTGACAGCTGTTAT:1 + chr3L 19215877 3' + roo 392 2 64.00 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTCGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATACTCATTATATAGTCTTTTAAATATAACAATTGTATTGCTAAACTTTG:1 - chr2L 13739915 3' + 412 7517 2 57.43 CCCACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTAACGCGGTAGAGTGGGCGATAATTCAACTTACTTTGGCTTAGGTATGCTCAGCACTGCACCTGCAAGCTGAA:1 + chr2L 9790634 3' + G5 4654 1 74.26 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTGCTAGATAATGTTCATTTCATTTCGGTCGTTTATGATTTAGCTTTC:1 - chr3L 895265 3' - F-element 123 1 57.43 CACCCATACAAATCCCCTCCCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCATTGTTAGTCTCTTAAAACAAAGGGAATATACACTGTATGCCCATCCCCGAGTAGA:1 - chr3L 19200835 3' + Doc 4489 1 56.44 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGT:2 - chr3L 21708625 3' - roo 48 2 78.22 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATT:1 + chr3R 9479492 3' - mdg1 52 2 74.26 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTAAATCATATCAGTGCTAGCTTACC:1 - chrX 18717130 3' + roo 396 1 65.35 GAAATATGACTCCTGCATTCCAACATTCTACTGCCCGGAGCGTGTGAAGCTCAATGTCAGCATTCTGCAGTGAGAAACGCGCAGGATACAGAAGAAAGGAC:1 + chr2L 23299827 3' + gypsy4 89 2 71.29 GAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTT:1 - chrX 4890050 3' - 297 6625 2 76.24 ATGCTNTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAACACCCACTCAGTCACATATTCAACGCAAATGGACTTCCAACGGACAT:1 + chr2R 23495511 3' - 412 27 2 52.48 ATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCCTCTCTTCTCTGATGGCATCTCTGCCCCTAAAGTGTTTAAAAATTAAAATACTAGCTGAAGCGCCTT:1 - chrX 10250991 3' + INE-1 103 1 72.28 ACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTATGCAATTACGAATCAGAT:1 + chr2R 19357440 3' - jockey 4692 1 61.39 ATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACAGATTCCGCCCTCAGGCGTATTTCAAGGAA:1 - chr3R 9479454 3' + mdg1 378 2 67.33 TATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCTGTTTATCTCTCTTT:1 + chr3L 20248373 3' - Transpac 31 2 52.48 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCG:1 - chrX 4796965 3' + copia 5076 2 74.26 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCA:1 + chr3L 8974130 3' + P-element 2836 1 28.71 ATCATGATTTATCAAGCTGCAAAGTGGAGCCTCGATGTCGACAACGCAAATCCTTGATAACATAGACATGGACGAGCGATTTAATGCCACGAGTTATGGAG:1 + chr2L 13196453 3' + Chouto 6230 1 80.20 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCC:1 - chr3R 12894114 3' - blood 45 2 68.32 AATATAAATTATAAATTACAACACTTAGCTATACGTATACATGAAAAGTGAATTAAAAAGAAGAAACCATTAATGACAGCGAAAGTTTTTATAGTTTCCCT:1 + chr3R 19450743 3' + copia 254 1 73.27 TCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCTTCCTTGTTTTTCCTTCTTATATATTTTATATTATTAGTTTTTAATATTTGCTTCCT:1 + chr2R 2496126 3' - X-element 4411 1 63.37 CAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCATTGCCTTCCGCCCACTTCATTTGCACTTGCGTCATGTGGGCTGAACGTGCTTCTG:1 + chr3R 13342750 3' - BS 4649 1 58.42 GTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATGCCCCCAACGGTGCCCAAAA:1 + chr2R 6779868 3' - 17.6 5 2 76.24 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAGAACAGTTATGTATTTTAGT:1 - chr3L 5975569 3' - hobo 9 1 71.29 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCAATTCAT:1 - chr3L 543425 3' + P-element 2844 1 36.63 GGCTCGAAGTGAGTCGCGGGAAACGGGAATGTCAAATCAGGGCAAGAACGAGAGCTCAAGGGGTTAGCTGTGCCGGAGGAAAATGTCTGAATAAG:1 + chr3R 19546964 3' - rover 189 2 68.42 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCCCTATTCCAACATGAATCATTCATGCCCCTATAACGTAA:1 - chr3R 12894076 3' - blood 7 2 68.32 TAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGCTAATTTATATGGA:1 - chrX 16798228 3' - diver 55 2 78.00 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCGTCGGCAGTCATTTTCCGGCGGCATT:1 + chr3R 20884974 3' + flea 4995 2 61.39 GCAATCGATTTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACAGTAATATTATCATCTGTATGCTGAATCTCAAGCCTCTAGCTTTTATAGTTCCTGA:1 - chrX 14317596 3' + Cr1a 4261 1 53.47 CTCTCTCTCTCTCTCTCTTTAACTACAAATGACATCTCTTAATCCTACTACAGATACAGATACAACTATCTGAGGAGCAACTGCGGAGCAAAAGTAATTTT:1 + chr2L 4783840 3' + blood 7180 2 62.38 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGTGTGCCAATTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGAACCAAATATCTTAAGATATTTTAAGATTGGAG:1 - chr3R 3282479 3' - 1360 66 1 66.34 TATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGTTGGTATTGGTGCTGTTGTCTCTGTGTCGGTGTCCGCTTCCCATGTCCATGTCCG:1 + chrX 14328002 3' - ZAM 8034 2 58.42 AAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCTGTAAAATTACCTGCGGGGTATTCTGAAAGTTAAAGGGGCTTTCCAGAAACAAGGCTCTCAATGTTCACACAT:1 + chr2R 25127068 3' - roo 9025 2 77.00 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGT:1 + chrX 495225 3' - 412 42 2 65.00 AGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATT:1 + chr2R 16898298 3' - Max-element 8281 2 70.30 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAATATGTGCCATTATCCGGCAATG:1 + chr3L 3671335 3' - roo 8717 2 81.19 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGC:1 - chr2L 11065877 3' + P-element 2847 1 41.58 GAGGCAGGACGGTTGCCGCAGACCTCTTTTCCTAAATTGGAAGATACGGTGGGAGAACGTCTCTCCGTTGTTGACTGTGTAATAAATAAATCCATGC:1 - chr2L 22943978 3' - springer 7438 4 78.35 CAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGG:1 + chr2R 24493734 3' + flea 253 2 70.59 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTA:1 + chr2L 2197128 3' - P-element 51 1 29.70 AAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACAGACGCAGGGCGGTCGTCCATAGAATTACCATGGTGGTTACCGCAATCTGGTTCTGTGGTTCCAAACT:1 - chr2L 22016913 3' + INE-1 174 1 61.39 TAATTCTGGTATTTCGGTACAAAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGCCAAAGATAAACAGCGACAGTTTTTCTACCCGATAAAGGGAATGGCCG:1 - chr3R 26429578 3' + Tc1-2 412 1 52.00 CGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAAATACCAACTAAAACATTTTTATTTGCGTCATAAGTACTTGTCGTGAGCAAGCTTTAAAGTTTTCAAAT:1 - chr3R 7102346 3' - pogo 2077 1 77.23 CAGTTNCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGT:1 - chr3L 14240848 3' - Tirant 56 2 79.21 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGGGCAAAATTAAGCGTCGCAACGGCATTTTATGAAGTGG:1 + chr2L 2920977 3' + hobo 2933 1 75.00 TTTTGTTTTTTGTTTTTATTTTTCGTTTTTGTTGCTGTGTGTTTTGTATTGTTCAGATCAGCTGGAACTTTATGCTGATCCTGAGTCTGAATAGAGGAGTT:1 - chr2L 21224212 3' - transib2 100 3 58.42 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGGCAAAAGGCATTAAATGAAGC:1 - chr3L 20248286 3' + Transpac 294 2 63.37 ACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTGGTTGAGGATCGGTGCTGGCTCTGGACCGTATTGAGGCTGTGAA:1 - chr2R 9458206 3' - P-element 472 1 44.55 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAA:1 - chr3R 18960424 3' + hopper 1394 1 53.85 GCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCTTCTATTTTTAGCCAGTCGCCTAAACAACCTTTAGAATTCTTTTTGATTAGCACACAAAATAC:1 - chr2R 17435528 3' - 1360 3331 1 72.28 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATATTTGCACCATAAACGTTAT:1 + chr3L 8924630 3' - Stalker2 7284 2 57.43 CTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAA:1 + chr3L 2024382 3' + copia 223 1 60.40 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACT:1 - chr3R 7100998 3' + pogo 2062 1 68.32 ATAAAATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTACTTACAAATAAATATTTATTAATTTGCATGATGAT:1 - chr3R 21500930 3' + roo 9034 1 62.38 ACGGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGACAACTAAAGAAGATAATTAAAAACCACGACTGGCTATAATAATTCCCCCTGTGCTACCAGTATTTCA:1 + chr3R 16128052 3' - Cr1a 109 1 66.34 GTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCATCTTCAGCCTTCGGAGGGAGATGGGATTAGCTGGATTTCTATTGTCTCTGTCCGGTTCGTTAACTCTCAGCTGCCC:1 - chr3R 902784 3' - G5 4649 1 59.41 AATATGAAAAGCATATTATGTTACTATATGTGTAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTGGTAGTCA:1 + chrX 21907832 3' - rover 4 2 71.29 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGCACGGCAGC:1 - chr3R 13715058 3' + P-element 2883 2 74.23 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAAC:1 - chr3R 9837598 3' + 412 7494 2 81.63 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCT:1 - chr2R 9014439 3' + blood 7338 1 79.17 CCCGANGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAAAT:1 - chr3R 9837581 3' + 412 455 2 64.36 GTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGTGTTTAGCCGGGATAGGGAAGGCTGAACAGAACGCTTTAAATTGCAAAAAGCTTT:1 - chr2L 18280751 3' - Quasimodo 7046 2 58.42 TACAACCGTTTTGCTATTCCGTGGATTACGTCTCTAATCCAATCGTTTACTATTTAACTCGTTCGCATTCACACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTC:1 - chr3L 22753753 3' - Bica 267 1 61.39 GCGGCGGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTT:1 + chr3R 29350781 3' + opus 7473 2 58.42 GGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATG:1 + chr3L 22324312 3' - jockey 4707 1 67.03 GCCGAATTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCCGGAAAGCGGGCGGGTGCAAAGATCTGGATGGCCCGCTTGG:1 - chr2R 12180933 3' - accord 159 2 57.43 CACGATATTAAGAACAAATGTTCAAATGATCTAAAAAAAAGTAAAAAATTAGATATTTTTAGGATTGAAATTCCAATGACAACATGCACTTTTTCCCAGAA:1 + chr2R 12317753 3' - Tc1-2 295 1 65.35 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTTTTGTAATAAAAAAAAACCAACCGATAAACAGCCAAATGAA:2 + chrX 13548846 3' + blood 375 2 75.25 TAAACTCATGCCCATCCCTCCTAGAATTATGCTATAAATATTTAACTTGCCACATTAATGAGAAGCCGGCGACGAGGACGAAAAGGACGCCATTTTAATGA:1 - chr3R 20140498 3' + I-element 5050 1 81.19 TGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGACGTATGAGTGACTTTTATGTT:1 - chr2L 17210083 3' - jockey 4697 1 50.00 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTTTCTGTTTTCGGTTAGGGGGCTACAACTCCTCTTGTGAAAAT:1 - chr3L 10035606 3' - jockey 16 1 69.31 GTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTACAGTAGTATCTGCTGCTAATATCTCAGTTGCTGTTTATGATGGTGCTGCTGCAGATCCTGCT:1 + chr2R 10728669 3' + F-element 4582 1 65.35 TGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACATAATATTAAGTTGTTTATACATAGTGAGGCTAGTACAATATGAGTGACTTGAG:1 + chrX 6746451 3' - 1360 3195 1 55.45 AGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTAACGCCATTTATGCAAACGCACATTTGATTGAATTTCGCTCGCAACAAAGTTTATACGA:1 + chrX 8003103 3' + hobo 310 1 65.35 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTGTTCATATAAATATTTCAGTTTTATTTTGGATTAAAGCATCGAAAATGTATAGTT:1 + chr2L 16933670 3' - 3S18 5787 2 57.43 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCGAGAGAGAGAGGATTGCAGAAGAGAGTGCATAGAAG:1 + chr3R 30272884 3' + P-element 2868 1 61.39 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAAGGAATGAGCAT:1 + chr3L 13081014 3' - 412 20 2 59.41 AAAACAAAAAACAAAACAAATAAAAACGTATATTTCAATTGATTTCCAAGCTTAAAATACAAGAATGACCAAAAAGTCTTTTCAAAAAATTAATAAACAAA:1 + chr3R 24112884 3' + Porto1 188 1 28.71 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCTAGATGGACAACAAAGCAACATCATCATCGTCTAAGACGTTGCACAGT:1 - chr3R 25440127 3' + pogo 2097 1 73.27 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCGCCAAGAAGTGAGGTAGCAAACTGGCAAAGTAGCAACTGG:1 - chr3L 3671264 3' + roo 400 1 71.29 CACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCACAAATGACGCAAATGAATCACAAATGCTATATAAAAATCA:1 - chrX 19700054 3' + mdg1 7343 2 71.29 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACCGACCGACCACCATTCACTACAGCTGACCACCGACCACCATTCTTGGCGTTTACCTTACTCGCCCACT:1 - chr3R 19836998 3' + P-element 2879 2 72.28 CACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCTCAAAATACTTTCGAGAGTTGGTCCTTTTCGCAAGTACAGCCCTTCCCTGCGCTTTGTTGTCTGCCACCAGTG:1 - chr2L 1364869 3' + 17.6 7179 2 72.28 CAAAAAGAAAAAAAAAAAGAAGGAGGCG:1 + chrX 9420734 3' + Doc2-element 222 1 96.43 ACCCGTTACTCAGCTAGTATAATTGCGATTCATCATTTTCCTGGCTGGCCAAAAGGGTCAAGGCACTTGATTGGGGCTGGGCGATTTGGGTGGCATAAAGT:1 - chr3R 15124271 3' - INE-1 538 1 63.37 GTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGG:1 - chr3R 25633331 3' - Tirant 32 2 56.44 TCGATATATGCACATACTACAATAGCACTCAATCAGTAGAAAAATGCCAATTCAGATTCAGATAGTTTTTCCATCATAGCTTTTCTTGTAATCATCATAAA:1 - chrX 4154881 3' - blood 7011 1 79.21 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCTCTCTCTTTAATAT:1 + chr2R 18503585 3' + roo 408 1 64.36 TACATTTTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGAATTCTAGTGAATAATAATAAATGATTTAAACTCTAAAAAAAAAAGCTTAATTAAGTGAAGTTTTAT:1 + chr2R 4339512 3' + G5A 2787 1 78.22 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTGAATACCCTAACTATAGTATCATATCATATGTTACATATTGTA:1 + chrX 13682627 3' + roo 9043 1 55.45 TTATTGTTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGTTTCATTTGAATTCCGAT:1 - chr2R 17383993 3' - mdg1 7049 2 42.57 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAG:1 + chr2L 108056 3' - P-element 38 1 42.57 CATGAAGTGGAGTGGGCGGAATTGTTTGTTGTTGATTATTTTACTGGTTGGCCGATCGAATTGTGACTTCACAACTTTTTACTGTGTTTGACTACAGTTTT:1 + chr3R 14752088 3' - Max-element 302 1 43.56 ACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGTTGCGTCGA:1 + chr3R 11165699 3' + Tabor 7284 2 63.37 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCG:2 + chr3L 19215864 3' + roo 9041 1 56.44 CGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATGGCAATCAAGAATAGCATGAAAATACGATGATTTCTAACAATAATTTCTAATCA:1 + chr3L 4345042 3' - mdg3 5262 1 41.38 AATGTATGTATATATTATATATGACCGAGGTCAGGAGATGCCTCTATGTCTGAATTTGTAAATAACACACATTTAAAATTTAATTTTTAAGACTTGAGTA:1 + chr3R 28546783 3' - INE-1 61 1 76.00 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAACCATATGTCGCTTTTGTAA:1 + chr3L 2024401 3' + copia 242 1 62.38 GTGTGNGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAAAAGGCCCAGAACAGCAAACAAAATAAA:1 + chr3R 18934953 3' - hobo 23 1 56.44 TCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGCCATAATTTTTTACCGCAACGAGCAAGATATGT:1 + chr3R 25074443 3' + roo 8937 2 67.33 CATCGTATAGAATCGTTCCCTTCTTTCGACCACCATCCTGAACATGGTCAACCAAACGGAGGCCTACGAAGGTTCCTACGGGCATATCGATGGG:1 + chr3R 21379411 3' + 3S18 463 1 63.83 GATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCTCTTTCTCTTTTCCTGGCTGTGCCACACAGAATATACATATGCAGACGTCTATTTTTAAATGAAAA:1 - 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P-element 30 1 50.50 ATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTTTTATTGCATACTTTTGTGCGCACTCACGTTAGGTTAGAA:1 + chr3L 14603365 3' + jockey 4987 1 73.27 TTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCATGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGAAACATAACAACAATGATTTATTAGAAT:1 + chr2R 15373242 3' - 1360 76 1 96.04 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCGGCCTAGAGAGGGCTGCGTGAGTCGTGATCGCGGCAGTCGTGACACGAAGAAGTTTTTGTTTTG:1 + chr2R 16366855 3' - hobo 12 1 66.34 AAGGCTGCACAGGAGGCAGCCGAAGGACCTCATCATTCTGGGTTATCCTAATATGCTGCCTTGACATGAGAGTTGCACTGATCTTCCCTTAATTATTGTGA:1 + chr3R 14848059 3' + BS3 1555 1 74.26 ATATTGTAAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTTGCAGTTCAAGGATCGCTGGCGGGGAGCTATCGTTTGCGAGATTT:1 + chr3L 5714413 3' + copia 93 2 56.44 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAAA:1 - chr3R 5505231 3' + mdg1 383 2 61.39 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACA:1 + chr2L 2197134 3' - P-element 45 1 35.64 TTGACTTTAAAGTTAAAAATTAAGGGTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATCAAGTATCAAGTTTATTATAGGATTGACAAATAATCACAAAAC:1 + chr3L 22987114 3' - S-element 1669 1 56.00 TTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTTAGTCTCTTGTTCTAA:1 - chr3L 18154115 3' - I-element 8 1 67.00 CGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAGCTCTTCGTTTGGCTTGGCTTCCATTTCG:1 + chr3R 11497675 3' + Doc 421 1 71.29 GAACAGAGAAGTTAAGCCGACTAACCAAGTCGGGACTCTCAACTTCACCACGAATAAACTCCGGACGACTCACCATCCACCCTGGCCACATAACCAACGCA:1 - chr2R 20641903 3' - Cr1a 4091 1 54.46 GAAGGNCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGGCAAAAGGCATTAAATGAAGCCGCACACAA:1 - chr3L 20248277 3' + Transpac 5222 2 70.30 CTTTGTATTACTTAGTTTCCCAAGAACTGCTATTTTTATGAACACTGTAAATACTAGAGGCGTGGGTGCACGTGCCGAGTCGGGGTACTGAATTTCTAAAG:1 + chrX 22883578 3' - HB 34 1 79.21 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCGTTCTGTTATTTTCTCTTTTAACATTTAATA:1 - chr3R 12877793 3' + mdg1 7433 2 52.48 ACCTCATGGAAATAATAAGAACCATGCACGCACCGAGAGCATCGGCGTCAAATGAAAAGTCCACTCCGATGGTGTTCCCATGTCGCTCTATGTAGTTCCC:1 - 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Doc 17 1 61.39 GGAACTCAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAACAATCTCAACTGGCTTATCGTTATTGCGGTATTCAGTAACCACCAT:1 - chr2L 8916956 3' + roo 483 1 54.46 CTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTTTTTTGTTTAACTTATGCCTTGTTTAATTACGATAATTACAAATACGTCCCACAGGATTCTCGGTTCAAAACCTAA:1 - chr3R 15946881 3' + Quasimodo 145 2 76.24 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTTGTACAATCCACAAGCGTGGAAGGTATAAATTTTGTTGCCGGTTTGGGAAAACCCTTC:1 - chr3R 18934074 3' + hobo 2937 1 64.29 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACATA:1 - chrX 10730630 3' + P-element 2861 1 56.44 AAATAAATTTGTATGTATGAATAGAACTAGAAATGGGGCAGAAAAAGAACTCTTCGCTTTAGCCGTGTCCCCCGACTATCAGATACCCGTTATTCAT:1 - chrX 15903341 3' - Tc3 1639 1 31.96 ATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATATTAATTCATGACGATTAAAACAGCGGTGTA:1 + chr3R 24729661 3' - Juan 4098 1 56.44 TTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAATTTAAGTTTTTGTTTTTGTTGGCCAAAAACACAATACAATGTACACATTGATGCACGGCTTCTACAA:1 + chrX 9107152 3' + I-element 10 1 69.31 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTA:1 - 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BS 5026 1 55.45 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTATAGCATATAGGAAATAATAATAGCAACGGCAAACCACCCCATCTCCAGGCGAAAGCCCCGAATAGCGGATT:1 + chr3L 21319336 3' - jockey 4678 1 73.27 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAGAGGGTGTAATTATTTTCCTGTTTGCAGTGGATCAGCAACTGGAGGGGATCGGG:1 + chr3L 1078992 3' - I-element 18 1 58.95 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATATTTTTTTCTTAAACAAGCCAAAAGCCAGACAGC:1 - chr3R 19622919 3' + pogo 2061 1 71.29 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATTAAGGGATAGGAATATTCAATAGTGGTACAAAA:1 - chr2L 514842 3' - 3S18 5782 2 65.35 AAGTATCTCCACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAACAAGAACAACAACAGTACTAATACTACAGCAATCAATGGAAAGGGGTAAAAACAAAGCGAGAAA:1 + chrX 6183975 3' + mdg3 5142 1 70.00 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCCGTATCCTTTG:1 + chr3R 10957735 3' - hopper 31 1 57.43 CCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAGTACAACTACTAGTTCCCTAAACGTTGCAAACGCACTAATCCAATTGGCAAGCGCCACAACTCACACG:1 + chr2L 5185487 3' - R1A1-element 276 1 73.27 TGGAAATAGTCAAAAAAAAAAATGCTATAAAGTGTTGAGTGCATTGTTTCGGTTTATTGTTTGCCGGCTCTCTGTTCAGTTTTGCCGCTTTTGTTTGTTTG:1 - 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chr2R 10912101 3' - 412 40 2 64.36 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAAGGTCTTTGGTGAAACCTTATAAATAGGATCTCCGAAA:1 - chrX 21388525 3' - 1360 51 1 80.20 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTG:1 - chrX 2762139 3' + roo 9021 2 76.24 AGAGAAACAAAATAAAAAAAACACTAAGACCTGCCCCAATCCGCTCCGAATCCGAAAACGAACCCATCTCCTCAGGGACTCACGAACTCTCCGTTCCGGGA:1 - chr3L 1526373 3' + Porto1 161 1 73.27 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGG:1 - chrX 21668077 3' + Stalker2 360 2 62.00 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGT:2 - chr3L 9692661 3' + P-element 2868 1 60.40 ATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTATAGGGACAAATGTAAAAATAAATATCTTCGCGTGAAATTAATCTTTTAAATAA:1 + chr2R 2552211 3' + HMS-Beagle2 7192 2 76.24 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTG:1 - chrX 18717166 3' + roo 359 2 73.27 GATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAAATCAAACAATTCAATTTGAGAGCCAGTACATTGCAGACGGACTTTTGAATTCGCAGGAACCTTAAACAACC:1 - chr3R 19449440 3' + roo 8887 2 76.24 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCAGAATTAT:1 - chrX 4890018 3' - 297 6593 2 68.32 CTCTAGACCTTCTTAGAAAACCCAATCCAGATAATATACAAAAACTCATTCTTTTCCTAAAACGAAAACGTATTCAAAGACGAACGTTTATATTGGCTAG:1 - chrX 13817456 3' + I-element 5107 1 62.00 TAGATCTACATATTCATATTCTACTCCCTCTTAACCTCAGCTGCGCCCAATGCATTTAATTATAATTCTGCGTGCCTGTTAG:1 - chr3L 13749607 3' + gtwin 7135 2 73.17 AACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAATTGAGCCTCAATTTGGCCGCCCGATGCTGCTGGCTATGACCTGTGTGCATCATTAGCTTATCATTCAGCGTGGC:1 - chr3L 22233972 3' + 297 180 2 75.25 GCAGCNCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGGATGGAAATGGGAATGCGAAAGGGGATGTGGATGG:1 - chr2L 20131745 3' - Rt1a 24 1 56.47 AACCGCAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAG:1 - chrX 19457169 3' + roo 352 2 81.19 AACAGGAGGAAAAGCTAGAGAATTTTGTCGCCTGCGAAGCACAGGTGGTCTACGTTTCGTATGGTGCTGATATATGTATATATTATATTTACCC:1 + chr3L 20269339 3' - Gypsy12A_LTR 2015 1 56.38 AGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATTATGAGTGTCTAGCACCCTGTCTAATGTTACTCTGTTGTCTTAAG:1 + chr3R 19609744 3' - Tabor 6848 2 68.32 GGAGANATACAAGTCGATACAGTGGCAGATTACTGATTATAAGCATTACGTTGTTATTCAATTTAAATTTATTTGAGGGTTCACATGGGGGTTTCAAAAAA:1 + chr4 636685 3' + Helena 1235 1 72.28 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATCATTTCTATTACAGACTTATTTATTTCCCAGTAGCATAATGGAAACCTTAAC:1 - chr3L 17698177 3' + 412 463 2 49.50 CTTATCGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTATGCCAACAACAG:1 - chr2L 7547985 3' - blood 7031 2 59.41 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAA:1 + chrX 14796913 3' + transib2 2790 1 62.50 CTCAAGAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTATCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGGGTATCCA:1 + chr3R 12554352 3' - P-element 66 1 19.80 CTTAAACATATTAACAGGATGTAACTCTTGCCAAACTGCCACTGGCACTCCTTCGGTCGGAAAATGCAACTGGAAATCGGTCGGGAATAGGAAAAACATAT:1 + chr3L 2993107 3' + transib1 1668 1 74.26 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGAAATATGCCATAAAAGTAATAATAACAATTAAATAA:1 - chr3R 27031256 3' - 412 42 2 65.35 CAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCAGACACAGTACCTCGAACGGACAAGTTGAATAACTTGTTGTCAATGACAATATT:1 + chr4 299915 3' + 412 470 2 53.47 TAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCAT:1 + chrX 21668152 3' - Stalker2 7262 2 65.35 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAGAACAGTTATGTATTTTA:1 - chr3L 5975571 3' - hobo 11 1 69.31 CTACGTAAGTGGCGCAGTCGGTAGGACGCCTCCTTTGATCCGCTGTATATCAACACTTGGTTCCAGAACCTGCTGCGTAGAGTTGAGGATATGGGCAATGA:1 - chr2R 18470546 3' + rover 358 1 78.22 GGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCCAGGTCCACTTTATCGTGCTCTACCAAGTTGCTAAA:1 + chrX 17248546 3' - F-element 4388 1 64.36 CGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTG:1 - chr2R 20411872 3' + 297 373 2 56.99 CGCAATTACGAAAAGTCTAGTGTTCGCTTTTTCTTCGAGCGTTTCTTTTCAGCATATGTGAATTCCAGGACAGTCCTCGAATGATGTCATTTAACGCCAAC:1 - chr2R 3464398 3' + GATE 8416 2 72.28 ACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTTATGGTCCTTTCTTTTGCATCCAGATCAAAACTCAGCTGCAATCACAAGCCGCCA:1 + chr2R 14166152 3' + 1360 17 1 59.41 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTCGACTTTTG:1 - 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chr2L 1535171 3' + Stalker4 86 4 73.27 AGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGGATGGGGACGGTGGT:1 + chrX 15195322 3' + Transpac 5224 2 75.25 CAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTGTACGTGCTGTGAGAAGTGGTGAGTCGGAACGTGATTCACTTTGTTCTGTC:1 + chrX 2116745 3' - springer 462 1 60.40 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCAC:1 - chr3R 23617992 3' - jockey 4804 1 69.00 CACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAGCGTTCTCGGTACTCTCAAAT:1 - chr2L 107965 3' + P-element 2886 2 78.22 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAAAAATGAACAACAAAAACCACAAA:1 + chr2R 14457789 3' - mdg1 9 2 67.33 AATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGCTTGACGCCAACGATCGTTAAAAAACATTTGTCTGTCTGGAGTTCTTG:1 - chr2L 17447610 3' - FB 22 1 62.38 GTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTTTTGAGGAATTTTACTCCATGAATCCCGCACAATTAGACCCTGCTGGTAGCCGTGTAGACGCACTTGGTCCACGTCCT:1 - chr3R 26971488 3' - Tc1 1273 1 53.47 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAATATAGAGTTTTGGAATTTATTGTGGTCTAAAAAGAAGTCAAGACTTTAGGGCTTTAAGCCAATT:1 + chrX 8948700 3' - blood 7024 2 65.35 GTGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATGATTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATAATCTATGTACATATTATTACAAAATAAATTTCAAAAATGACTT:1 + chr2R 5260085 3' + 1360 429 1 64.36 AAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATTATTTAAGATAAGAGGTATATCCTTTATAGTAAGTGCATTTACTTATATTTGAATCTTATTTAACAA:1 + chr2R 19454218 3' - Cr1a 4166 1 60.00 ATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTAACATAGGAACTATTTTTAGTTT:1 - chr2R 969184 3' + flea 204 2 77.23 GTGTGGCAGCATAATTTCCTTTTTTTTCGGAACGCCTACAAGGGGAAAAGGGCCTTTGGGCTTTGTTACATAAAAACTTAAGACAAAACATTCGTTTTTGT:1 - chr3R 3469565 3' - mariner2 887 1 78.22 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAAGGAATGAG:1 + chr3L 13081011 3' - 412 7074 2 57.58 AATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATTAAGGGA:1 - chr2L 514868 3' - 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Ivk 28 1 53.47 AGCCTAAAAGTTGTGATTTTGCTCAAGGGCCAGACGGAACCGGAGCTGGATTGCTCCATTGGATCTCATGGATTCTCTGGATCTCACGAAGAAGGCCAAGA:1 - chrX 8465762 3' - HB 188 1 80.20 AATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAACGAGGTGCTCGGATGAGCACAGCCAGCAG:1 + chr2R 23305462 3' + I-element 5309 1 71.29 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTCACGTG:1 - chr3L 13194764 3' - 297 38 2 66.34 AAAAATTATGACAAAATAAAAAAAAATTTTTTTGAATTCATGTGTCACGCGAGCAATCGTTTTTCTATGTTTCTATCGTTTTTCTAGAAGTCGTTTTCTAC:1 + chr2R 12319819 3' - Tc1-2 1372 1 73.27 GAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACAGCTCTTTTCAACACATATAGTTGTCTGCTACCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGCAGGCATCTCACGGA:1 + chr2R 19386728 3' + 1360 117 1 48.51 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATATGGGTCGCTT:1 + chr3R 25702240 3' + Tirant 353 2 72.28 CAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTGTTCAATATCTATTGCACTGAGCTATTACTTAATTATATTACACTTTAGCTTTTAACCCAGAGAGGCACTGAGTGCA:1 - chr3L 8924578 3' + Stalker2 7605 2 60.40 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATACTACATATA:1 - chr3R 4986285 3' - roo 8695 2 57.43 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAATTTGT:1 + chr3L 9925299 3' - Doc 36 1 57.43 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAATTCATCCTTCCGATCTGACGAAACTGC:1 + chr3R 19837111 3' - P-element 9 2 69.31 CATGTAATCCAAAATGGCCAGAGATTACATCTTTACTACTGCCTGGCCAAATGCAATGCATCGCCATGAAGTATTTGATCTTGCGGTTTTCGACCATGAGG:1 + chr2R 17434142 3' + Helitron 188 1 68.32 AGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAATTTCATGCGAGGAAAGAATTTCAAAATCTTTTGAAGAAAAATCTAGATACAATTGAAAATATAAGTTTTAGCCTAGG:1 + chr3L 8146923 3' - 1360 228 1 76.24 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTTTACAACA:1 - chr2R 12779066 3' + roo 402 1 70.30 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGAGAGTTTAACG:1 - chr3L 7792168 3' - 412 7075 2 57.43 ATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAA:1 - 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gypsy6 440 1 55.45 TACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTGTTGGCCATTTGACATTATCTATAAGTAGCTCATAATTAATAACTGCTAACTTACTTAGCGAGCTATTGTGTTGGC:1 - chr3R 18053773 3' - 1360 7 2 77.23 CAACCGGCAGATCATCGGAGACTGCAGCGAGGGACCCCCTGCAGCACCACCACATTTAATAATTTATACACTATTAAGGGAATTAAAATGTTATTATATAA:1 + chr3L 12963605 3' + gypsy3 335 2 77.23 GTTTTTTATATTTATTTATTTATTTAGAATATTTTGTATAGAGCAATAAAGAGCAATAAAAAACCAGTGTGTAGGTAAGTACAAAAATTAAGTTTCTCTCC:1 - chr2L 9076672 3' - Tc1-2 479 1 56.44 TTTTCAAAAAGTTTTGGGAAAGCCGACAGTTTAGAGATTCCTTTGGAAGTATATTTAGGGATTTATTATTATTAGGGATTTGTTGATTTATACTTTTCAAA:1 + chr2R 1655227 3' - Q-element 134 2 53.47 CCGTAATGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGCGAGATGGAAAATAAGCCTACCC:1 - chr2R 3159319 3' - diver2 4708 2 80.20 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCATTCTTATGCTCGTTTCGTCTCT:1 + chr3L 2800183 3' - blood 7064 2 76.24 AGGACAAGCATTTGTCTCACTCTAACGCATCGTCGAACCGAGGCTATGTAGAACAGAGATCTGTTGAGTGCATCCGCTCTTGTATGATATGACACCGCTAT:1 - chrX 16513023 3' - invader6 193 2 61.39 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGGCAGACCGATACAATTTTGCCCCCCTT:1 + chr3L 21841368 3' - P-element 19 1 59.57 AAATTTACTGACTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGACCTTTGGGTATAGCGTGCTTTCAAT:1 - chr3L 9866393 3' + pogo 1874 1 73.27 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAATTCAATATATAATATTCAGGGCAGCAAAGGTAAAGATTTAGTAGT:1 - chr2R 8245704 3' - mdg1 7068 2 56.44 GCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCCATCTCCTAGCCACCCCCTATTTTACCACCATTTTTTCCCCAAACCCTTTGCAAATTAACAAACCGAGTTG:1 + chr2L 7547804 3' - blood 430 1 75.25 GATTCNTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACA:1 - chr3L 21708630 3' - roo 8717 2 82.18 AGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGGCGGTCGCCGTCTGTCGGTTGACCATATCTCCGCCCCCTTCAACCGCTGCCCCCTTTGCGGTTTGGTTCGGGCCAAAAC:1 + chr2L 13603007 3' - accord 7034 2 80.20 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCATGTGTATATAGTTTCTAGTATACCCGAAGAGAACA:1 - chr2L 4009449 3' + pogo 2063 1 68.32 CACGAAGTGTGGTCACAAGCACTCAATTTTTTATTAATTTTTCACACGTCGCAAGCTGAATACTGTATTGATATCATCAAATTTAATTTAGTTAACTTGTC:1 - chrX 10077647 3' - 1360 466 1 63.37 TAATATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGTGTGTGCCTGGGCAACCGATAACATCATTATT:1 + chr3L 13312232 3' - mdg1 7051 2 64.36 GACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATT:1 - chr2L 514874 3' - 3S18 49 2 72.28 CCGATTGCTGTTGCTGACCGTTCGTGGCGCAGAGCGCTGAACTCAGTTTGGGCGCGTCAGCATTGTTTATACAAATGATGAAAGGGGATTATTATGGCTT:1 - chr2L 10613756 3' - gtwin 105 2 71.00 CCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCTCTTTTCGTTTGTTTACATTTTGGCCA:1 + chr3R 20791257 3' + 17.6 251 2 79.21 TCTCATATACCTTTATACACACATTAGGTTAAGTTCAGAGGAATTGAAAATGAAAAATTAGGAATAAGTAAACAATCACACATACACATTAATGTCTAAGT:1 + chr3L 26007757 3' + G5 4760 1 52.48 ATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGA:1 - chr3R 19447064 3' - 1360 477 1 64.36 TAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATCCTGCTGACGAGGAAAA:1 - chr3R 4973086 3' + 1360 27 1 54.46 CAAGCNTTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTAC:1 - 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INE-1 565 1 61.39 GGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCAC:5 + chr3R 9952253 3' - Ivk 25 1 53.47 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTACACATACACATATATAACTGTTTGTTTTAG:1 - chrX 11585570 3' - pogo 45 1 78.22 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCATTCTAACATTTCTTTATTTCTATTTACATTTATTCTTCACTAAATACAAGCTTATATGTTTTTTCAAGTGT:1 - chr3L 6024507 3' - roo 5 2 72.28 AGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTAT:1 + chr2R 6947359 3' - 1360 68 1 73.27 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTTTTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTTAAAGAGGCGCAGCAGGACCAACTGATTTTCAGGCGCGGCCAGG:1 - chr2L 18914537 3' - mdg1 33 2 54.46 GTACGTGCAGATGAATTTGGCGCGCAGAACGCTCCTGTGCTGAGAGTAATTGTTGGGTCTCTCCAATGCTGGTCATGTCTTTACCTCGTTTAGAGTTAGAA:1 - chr3L 26345174 3' - Porto1 416 1 71.29 GCACTAATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCA:1 - chr2L 11065886 3' + P-element 2838 1 32.67 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAG:1 - 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chr3R 12877812 3' + mdg1 7414 2 67.33 CCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGACCTTGGCGATGGTCCCTCTTTGTTTCACAAATGAATGCACAAATTTCGGGACAAGTCTGCTCTGCG:1 + chr3R 10579956 3' - F-element 4246 1 70.30 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACT:1 + chr2L 22150634 3' - S-element 33 2 78.22 AGTTAACAACTAAAAATGTATTACTTCTTCATCCTAATTGACTGGAATTAACCCAGCAAAATTACCTATATCCTAACTAGCTCTATTTCCTTTGCCAACTG:1 + chr3R 22100978 3' + gypsy 1 2 77.23 ACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCA:2 + chr3R 9952245 3' - Ivk 33 1 59.41 TCTCGGTTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAA:1 + chr2R 12779135 3' - roo 8721 2 82.18 AAAAAAATAAAGGAAGATAAAATTTCGGAATAAGGATTTCTATTTCCAAGCTATCATAATCAATCATAAGAACAATAAGTTCATTATATTAAGTTTAAAAA:1 + chr3R 21535509 3' + Doc2-element 251 1 50.50 AACCGAGGAAGTGTACGACTCGCGGGCGGAGCGCGGCAACAGAGGACCCCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGG:1 - 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HMS-Beagle2 27 2 52.48 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATACATTCATACACATACATTCTTTGTCAAATCAAAACACAACCAAAGAAAATTCGATTATTCATCCGT:1 - chr2R 5784295 3' - 297 6586 2 74.26 GTCCANTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTT:1 + chrY 3648888 3' + 17.6 7390 2 63.37 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATGGCGAGCGGCAAGTA:1 + chr3R 28728317 3' - jockey 62 1 76.24 CCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTTGTGAATTACTCACACATGAATGAAATGTTGGCATATCAATTTTTA:1 + chr2L 19632546 3' - P-element 407 1 55.00 TTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCA:1 - chr3R 16626784 3' - I-element 5289 1 56.44 AATATAAATATACAAATACCCAAAAGACCGCCAACAACTACAACACCACCATCAGCGGCAGCAAAGAAATGCAACAACAAATACGGCAATCTCCAGACAAC:1 - chr3R 21097165 3' + Stalker4 90 4 65.35 CTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTGTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAA:1 - chr3L 27356078 3' + Tc3 1684 1 66.34 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGG:1 + chr2L 2920940 3' + hobo 2895 1 68.32 AAAATAAAGAAAAAAAAAACCAAAGCAAAGTAACACGTACACATTGACGGTGTGGTGATTTAATCGATCTTATGGATACAAACAC:1 + chr2R 15944901 3' + gypsy7 5008 2 82.35 AGCAGNCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCGCAATCCCAAGCGAACCTCATGACGCACACTCACACACAGACTCGCAAAACACCCATA:1 + chr2R 5953670 3' + Max-element 268 2 62.38 TAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAA:1 - 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BS 4840 1 53.47 GACTATCAGATACCCGTTACTCAGTTAATGCGAATGCGCGTGAGCCTGTGCCGCACTTACGGCGGCGGCTGTCGTCTGAACCGCTGTGGCGG:1 + chrX 272567 3' - INE-1 549 1 69.57 GACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAACGGAATTGTAAA:1 - chr3L 5716875 3' + copia 226 1 59.41 AAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGCTGCCGTTGTTGCAGTGGAAGATGTGGAAAAGAACCGCAATGCCAAAGCCACTAACGATATCCAAGTGATGGCCA:1 - chr3R 31508757 3' + roo 9068 1 73.27 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTTTTAACAATTTTGGTGAAAATGAAAATGAAAG:1 + chr2L 20939619 3' + hopper 1411 2 74.26 TGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGAGCAGGCGAGATGCCTGGA:1 - chr3L 2800096 3' + blood 377 2 77.23 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAAT:1 + chr3R 19967672 3' - pogo 31 1 56.44 TAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTGACATTATTTGAATTGAATT:1 - chr3R 19467853 3' - Transpac 11 2 69.31 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTA:1 + chr2R 5850005 3' + jockey 4936 1 75.25 AATTAATTTTGTTATACAAAAAAGTAGAGTAGAGTGGCATTTTCTCGCAGTGCAGATATGAACTCACCTTGACAACCTCGCTGGCGGCGAAGGGTTCACGG:1 + chr3L 11183646 3' + Juan 4067 1 62.38 TTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGATCTAACCAGTTAAGATCTTGTAGCACTAAAGATCTTTTTGGCCTAAAATGTCATATTTAGTAT:1 + chr2L 7951030 3' + Burdock 6322 2 65.35 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCATGAGACATACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAA:1 - chr2L 809642 3' - jockey 10 1 71.28 CATAAGCACACACACACACACACACGCACGCACGCACTCGCACACGCACACACACACCTAGACAGTACCCTGTTTTCCCAAAATGGTCAAAAC:1 - chrX 13301046 3' + accord 7026 2 47.31 AATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATGGATATAACACCAAACAACTGAGAAATGATTTTTCTTATATCCATCCACACACACACACACACACA:1 - chr3R 8376617 3' - accord 184 2 62.37 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTTTTGGCAAATCTGTGGCAACAACCTGCGTTAGATG:2 + chrX 1954540 3' - Tirant 8115 2 71.29 AATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTAAATGCTATAAATTA:1 - chrX 868689 3' - jockey 4922 1 65.35 AATCTTTAAACTATGCTTAATTTGAAGAATAATTCTATATGTACCAATACAATTGACCTTTGCGATTTTTTAACACCCCTTAATAATAAAGGCACTTGAAA:1 + chr3L 10784233 3' - Transib5 439 1 79.21 AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATATGATGCCATAAAATAAAAAATGAAATTCAAAGGAAAATACACTTAGTTATGACTTGAG:1 - chr3R 19421158 3' + mdg1 7075 10 64.36 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCGTTCTGTTATTTTCTC:1 - chr3R 12877808 3' + mdg1 380 2 63.37 ACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCTTTGCCGCTTCCGTCAGCAC:1 - 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baggins 4979 1 55.45 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCATTCGTTTGCAAGTGGCACATTTAAAAGTAACTACGGTAG:1 + chr3R 27412506 3' + 412 7511 2 59.41 TATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGT:1 - chr2L 7459558 3' - BS 5018 1 53.47 GCGACCACGGACGGAATAGGATTTAAACACGTACTTATGCGTTTGTGTATGTGTCAGTGCCTAGAGTCTATATAAACTGACTCGCGCAGATTAAAAGCTGA:1 - chr2L 15893814 3' - Max-element 396 1 79.21 AAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATCTGCTCACCTTCTGCAATGCCTGTTGCCGCCGACTTAGCTCCAGCTTGAGCATCTGCAGG:1 + chr3R 27262146 3' + Idefix 281 2 62.38 CTGCACCCGCTCACGGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCTAGCAATAAACGGTGTTAGGATGAGTGAAAAGTCATGAACAACATTCGGTGGCAGG:1 - chrX 703881 3' + F-element 472 1 58.42 CTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATACTCCCCCTCTGCTCTCAAATACCCCATGATCCCCGATTTGAATGACCGACTAAATTC:1 - chr2L 3768379 3' - R2-element 59 1 76.24 GTTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTTAATTTTTCAGTTTGTTGGTGTTTCTCCGCCTGCGGTGGATAATT:1 - chr3R 14297784 3' - 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Doc 1 1 75.53 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGT:1 - chr2L 19642979 3' + roo 9032 1 64.36 TGGCTGGGCCAATCAAAACGCGCGACAAGATCACGCGACGCGAAGTGGCTGGGCACAAGTAACGTGACTTAATTAACCCTCTCAAATTGGCTGACG:1 + chrX 13579113 3' - G6 117 1 72.92 ATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAATTCATTATTATGCCAAGTGCTCGCAGGGGAGGTGCCATGCAATGC:2 + chr3R 25407552 3' - jockey 4975 1 54.46 TATATACATATATATGTATATGTATATATATTCACTGATGGGTTTATATCTATAGCATGCTTTGCCCACATTTTTGGAGTATCTGCTGAAGTTCATTTGCA:2 - chr2L 9810024 3' - Stalker2 251 2 76.24 AAAGACTGTTCTAAGCATAGTTCTACGGATAGCTAGGGAAGGTAAATTAAACCATAACAAATATTCAATGTTATAACATAACTTTTGCAGGCAGACATTAA:1 + chr3L 19050460 3' - Cr1a 4024 1 58.42 AGTGTGTGTGTGTGTGGGTAGGCGGGTATGGGGGGATTGGCATGAGGATTGAATTGAGAATGGCATGATGACCATGGAGGCATAAAGCGCAGTTAGTTTGC:1 - chr2R 14655237 3' - accord 7101 2 76.24 AGGCAAGATGGAGTGATGAAGAGAAGTGGATGATGGAGGAGTTATACATGTGCTCAACGCTGCTGCTATTAAGGATAATTTTATTTTACCATTCTACATGC:1 - chr3R 26962143 3' + R2-element 473 1 74.26 TATTGAAACTACAAGCACAAATAACAAGCCTCGGATAACTTTACACAATCTGATGACGACCCGTCGCAGGCCAAATAGTAATAAACCAA:1 + chr3L 19081170 3' + R2-element 234 1 68.54 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCCAAATGGGAAGCGCAGTTAATAAACTACAA:1 + chr2R 9277596 3' + roo 390 2 58.42 AATTGGGAAATCAAAAAAAAAAACATGTAGAAGACATCGAATTACAGATAAAAGATCTTTTTAGCGTATATTATTATTAAACAAGAGACTTCACTGACATT:1 - 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chr2L 2195071 3' - P-element 2665 1 73.27 AAAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGCCT:1 + chr3R 18833110 3' - 1360 3045 1 69.31 ACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTTGATCATAGTCGACTATAACTG:1 - chr3R 9657671 3' - BS 8 1 59.41 AAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTATTTTTT:1 + chr3R 4543254 3' - 3S18 23 2 50.00 CACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTGACACCCCCATACTGTATGCCATCTGCGCAGTATGCATTCTAATAAACAAATTCT:1 - chr3R 15236362 3' + 297 30 2 63.37 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAAAAGCTAACAAACAAAAGATTACACCACATCACTCAGTTAACCTATTT:1 - chr3L 21575736 3' - hopper 14 1 52.48 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCC:1 - chr3L 11654538 3' + pogo 2061 1 67.33 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAA:1 + chr2L 108061 3' - P-element 15 1 57.83 ATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGCGCCGGCTCTCTTTACAACGCAACAATGCATACTATTAAACCAAAGGAAGACCCAAA:1 - 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chr3R 20466623 3' + roo 391 2 62.38 AGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCACCCACACATACCTAAGCGAAATGGACTGCTCATGCAGCC:1 - chr2R 4184622 3' + mdg3 40 2 66.34 CCGGGGTTCCTGAAAATTGAGGATGGGTTGCCCGTCGCGCAGAACACGGTGTTCGGAAGTCACGTTACGAATGTGGCACGTAGTGCGCCCAGCACGTCGGG:1 + chr2R 11184206 3' + Max-element 8087 1 56.44 AAACTNATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCT:1 + chr2L 18028749 3' + flea 227 2 55.45 CGTCTCCTTTGTGCACGCCCCGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTTGCCCGTTGGAGGACGGCGGGCCAGGAGTCATGCGATGCGCGGCTACGCGCCCG:1 + chr2L 22405107 3' - gypsy8 150 2 58.00 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCATGAGACATACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAA:1 - chr2L 809657 3' - jockey 32 1 51.49 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAAT:1 - chr2R 8378612 3' + pogo 2053 1 79.21 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGTGCTACACAACTCGCGTTATCCTGGCGGTTGCAACAAA:1 - chr3R 29660240 3' + mdg1 383 2 64.36 TATTTTTTATTAATTTGTCATAATTTATTATTAAAAAAATTATTAACCAATTTTGCTTTAAGTAAAAAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTC:1 - chr2L 14099896 3' + Tc1-2 1366 1 63.37 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAA:1 + chr3R 18934926 3' - hobo 50 1 73.27 CCTTCGACGTTTGCTGCTTTTTTAACGTCATATCTGCCATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCATTTTTTCTTGATTTTCTGCT:1 + chrX 14961202 3' - flea 4625 1 79.21 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATACCAATATTTACACAAG:1 - chr2R 23495433 3' + 412 465 2 50.50 TTTACAACCTGGCAGCAATTTTTTAAAAGCAGACATTTACTGTTTCCATGTTAATCTAAAATCAGACCACTGTGAAACGAAAGGAAGTTATTGTTTTCTGT:1 + chr3R 10388549 3' - Cr1a 466 1 70.30 GCAGACTGCAGACCAAGTCACGTCTCCAGGTCTCAAAAATATGGCCAAGATAGTGGGGTTGCACGGAAACCAGAGAGAGAAAAAGTGGTAAGCCGGCTTAA:1 - chr2R 16796612 3' - Stalker2 432 1 69.31 ATCAGATACCCGTTACTTAGCTAGTGGAAAAAGAAATTTCAAAATTGCGCAAATCGGAGGGTGGTTTAAATTGAATTCGGTCAAGGCAGATATCATAGATT:1 + chr2L 1857855 3' - INE-1 545 1 59.41 CTTGTACAATTAATTTTAGTTTGTATGGTAGATAAGTCGAAAGTGCGCACCACTCCAGTATCTACTCGATATATTGCTATCACAGCCGATAGTTTGCAGCT:1 + chr3R 15793617 3' + Chouto 5871 1 66.34 GTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGGTCGGTCGGTCGCAGCTCAAAATAGGTTTCATTAATTAAAAATGAACAAAACGTGTTGTACGTT:1 - chr3R 20265176 3' - hobo 111 1 69.31 TATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACACATTGCAAAAATTAAGTAAGGTTTTCAATATCT:1 - chrX 21456765 3' + Ivk 12 1 71.29 CTCTTGCGACATTTCTCGCAGTCAAGGCCTGCGGTATGTTAATATTTTTGGGTCTATGGTTCATGGTTCCCACGATTAAGTACTTAAATCCTCTACCCCT:1 + chr3R 24286253 3' - baggins 440 1 75.00 CGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACCCACACATTCAAAGTGTATATCGTAAGTAGTAAACAAGTAGTAAAATCTGATGTATGTACCTGAAGCAATA:1 + chr3R 8381339 3' + 1360 3193 1 78.22 ATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCAC:1 - chr3L 25889017 3' - gypsy8 312 1 73.27 ATTTTNTGCGTTATCTGCGTGTCGATCGTTATTGCCGCTCTTGCTGATGGCGTATCTGAAGGTATACTCCATGCTCGAATAGTTCCGAATTTGGTCGATAT:1 + chr3R 25887250 3' + McClintock 143 2 74.26 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGG:1 + chrX 14796904 3' + transib2 2776 1 73.27 GGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTTGGTTAAGGTCTTGAGCCTGGATCTGCTCGGGCTGCAAAGGAA:1 + chr3R 30523319 3' - I-element 217 1 75.25 AACCTAAAAAATAAAAATTTCCTTATTACATAAAATATAAACTTCGACTATACATTTGACAATCTAAAAGTTTTGATCAAATTGTATTGTTTCAAAGAAAC:1 + chr4 830442 3' + Burdock 379 1 69.31 TTATTNTTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTGAGCCACC:1 - chr2L 7350731 3' - mdg1 7067 2 49.50 TGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCACCCTAATTCCTTAGGGTCACCCTAGTAGATGGCCTCACCTTGACACTCGCTCAACTGC:1 - chr2L 4863351 3' + mdg1 7109 2 72.28 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTGAGCCAC:1 - chr2L 7350732 3' - mdg1 30 2 51.49 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCTACCCAGATCTTATGTAACCTGCAGCCGAAAT:1 - chr3L 7806171 3' + pogo 2060 1 66.34 ATTAATATATATATTAATATATTTATTGATCACCTATAACCAAATTTATGATATATAAATGTACAGTAAGAATGTTCTCAGTGTATGAAAACGCAAGACGA:1 - chr2R 17205975 3' + Tc3 285 1 64.36 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCT:1 + chr3L 17699379 3' - 412 41 2 63.37 AAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAAGTCAAGT:1 + chr3R 14049443 3' + transib2 2819 1 72.28 CTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGACCCCGATTTCCTACATTTCCTAATACCCTG:1 + chr3L 18848053 3' + INE-1 170 1 61.39 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGGATTTTAATGACAGCATTGCGTATACAATGATGTAATTTTAATGCCACCAACCAGGCGATATCTTAA:1 - chrX 8977366 3' - jockey 17 1 68.32 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGCGAGCAAAGACAAAGATCGTGATCGTGGGCAGTGCT:1 - chr3L 8063814 3' + P-element 2875 1 67.33 GTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGCCCAGCATCTTCTTACTCTTTTCGTGCGCTTTTTTTTTTCTT:1 + chr2L 18869453 3' - P-element 458 1 43.00 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTATCGTT:1 - chr3L 10035648 3' - jockey 59 1 75.25 GGTAANAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTTAAATGATATGTAATTAAAAATAAGCTATACAATACAAGCTTAGCAACACAAAAGTAGAAATCGAT:1 + chr3R 19224936 3' - hobo 10 1 69.31 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTT:2 + chr3R 19837076 3' - P-element 44 1 34.65 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGTTTCATTTGAATTC:1 - chr2R 17383997 3' - mdg1 15 2 42.57 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCG:2 + chrX 2050876 3' + 412 453 2 61.00 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTG:1 - chr3R 29384362 3' - jockey 4799 1 61.39 ACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTT:1 - chr3R 28755921 3' - 3S18 5781 2 61.39 GCTGGCCAGCGCTCTTAACAGATCTCGCCCGCAAAGTAGGCAATCCAAAAGGCAGAAAATGGTTTCTCTTATTTATTTATCATTCGGTTCTATGGTCTTTT:1 + chr2L 19400800 3' + X-element 4448 1 73.27 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAATAAAATG:1 + chr3R 19967678 3' - pogo 25 1 54.46 CGGGCAAAATGGCAAATCGGTTATAATTGTTACACTGTTTTTTTGTACTTTTTAACTTAATTTCTCTGTGTGTCGATGTGTTTGAGAGCGAGGCGGTCGAC:1 + chr3L 14737928 3' - Fw2 137 1 75.25 AGGCGGAGGTATGGAAATCTTCACACACCTACACCAAAAAAAAACACATACACACAACTGGACTGGACCTGGCCAAATTGAATGACCTACATTGAAAAATA:1 + chr3R 20753431 3' - R2-element 3562 1 83.17 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCGTGGAGCTCTCTTGTCCGCTCCGCTCGGC:1 - chr2L 13060238 3' + P-element 2883 2 75.25 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTTT:1 + chr3R 25918943 3' + roo 9020 2 80.20 GTTGTGTGTTTTTTTTTATATGAGTCTACAGATGGTAATAATTATTAAATAAACCAACACATATCTAGTTTTAATAAAAGTGTGATACTTTAGGCCTAATG:1 - chr2R 18327579 3' - Tc1-2 489 1 63.37 TAATAATAATAATAATAATAATAATAATCGATGGATGCAGTCGTTTTCCTTTAATCTGAGAAGATCCTTTTCTTGACAAACAGTCGTGTTGCC:1 + chr3L 24368132 3' + mdg1 39 8 72.04 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCGAAGAGTATTCTAAAT:1 - chr2L 19642943 3' + roo 405 1 74.26 GTCTGCTCAAGGACGTTCGGCGCCTTTTCCCCAACCCGCGAGTCACGTCTCTATTTCGCCACCGCACATCCTTTTCCCTTTCTCCGCTCCATTGAATAT:1 - chr3L 14379167 3' - R1-2 415 1 77.78 ATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAAAACCACATAAAAATATTTGTGCCAAAATATATGTGGGTTGCCTATTGGATGT:1 - chr2L 20353601 3' + Stalker4 7024 4 56.44 AAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACCTTAATAACAGTGAAATGGGGTTAAATAA:1 + chr2R 6869072 3' - springer 46 2 70.30 AACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGACAATACTGGATATATATAAAATCTCAATAGCTCATTCAGTATTTGGTGATAATGAGGACAGAT:1 - chr3L 15056291 3' - BS 5006 1 77.23 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAGTAATAAC:1 + chr2R 8378678 3' - pogo 22 1 57.43 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATCGGTTAACAGCAGTTGTTGTCGCCGTGTGTGTACATATGTGCACAGCGGCGG:1 + chrX 2589738 3' - copia 27 2 50.50 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATG:1 - chr2L 15333735 3' - P-element 48 1 31.68 AAGCAGAGAGGCAGATCGCAAACGGAAATTCATTTGTACACAGATTCTATAGTTTAGGTTTCAATAGCAGCGTATATACAGTGTCCTTAAACTAACATATT:1 - chr2L 9573410 3' + invader2 127 2 82.18 AACTTTACGGTCTAACTTTCAACTTAAGACTGATTTCAAATGTGAGTGCTAAGGTAGAGTATACAGAAATTCATGTCGTTTTATGATCACTAAACTTTAT:1 + chr2L 2834540 3' - McClintock 285 2 54.00 ATATATGTACTATGTATGTATATAACGAAGAGAAAAAACTATCAGAATACAATTTTTTGGTGAAAAGTTAGCATTAGCAGCACGTGAAGCTGAATTTCATT:1 - chr3R 18431059 3' + Dm88 4371 2 73.27 AAGGCCCCCGTAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAA:1 - chr3R 9952210 3' + Ivk 5318 1 69.31 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTGATCATGATATGGACGCGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTGCTAG:1 - chr3L 11070499 3' + P-element 2866 1 48.31 AAAAANATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATTATTAAAAATGAGTGAAAGCTGTTTTATCCGTTTTGCAACTGCTAGAAC:1 - chr2R 11652483 3' + P-element 2638 1 44.55 CTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAG:1 + chr3R 13715129 3' - P-element 73 1 28.71 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCT:1 + chr2L 326205 3' - roo 27 2 56.44 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTTCTTAATTAATTAGAAAATATAT:1 - chr2L 1626506 3' + roo 404 1 73.27 CCCCGGCTCGTCGTAAAAGGCGACTAAAGGGTGGAGAGGCAAGGAGCCGTGGATCCTTGGAAGGCTCTGTCATGCAATATTCACATGAACGAATTACCTTT:1 - chr3L 1986136 3' + Rt1b 4878 1 71.29 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATTGACCGACCGCCTTGCCGATGTTTCGATTACGCGCC:1 + chr3R 27374860 3' + mdg1 384 2 60.40 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTA:1 - chr2L 11047985 3' + Juan 4174 1 66.34 CGTAGCTCAAACTCGGCTGATCTATATCCATGCGCAATCCACTCAAGAGAGCGCCTAAGGGTCTGAAACAGCCATTTGTGCCCGAACTGCGACTGCTGGGC:1 + chr2R 18956302 3' + Quasimodo 387 2 57.43 AGTGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTTCACCGTAATCCATTGAAAAAACATAATTTTAGACATATTTTACC:1 - chrX 21204991 3' + 1360 3358 1 56.44 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCCAA:2 + chr2R 9277569 3' + roo 9026 1 72.28 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATATGCAGCGTGTGCTGGCCTCGTTGCCTTCGGT:1 + chr3L 13312201 3' - mdg1 44 2 67.33 AGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAATGGGAACCCTAACTGAAGCCAA:1 - chr2R 23587630 3' + accord 6919 2 78.22 ATAAAAAAAAACATACAAATATTGTTGAGATTAATTATTAATCGAAAAACATACTCTAAATTGTTTGTACACCTGTTGATTGACTGCGGAGGAGCAGGAG:1 + chr2L 19316108 3' + Transib5 27 1 74.00 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGTTTCATTTGAATTCCG:1 - chr2R 17383995 3' - mdg1 13 2 40.59 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTATGATCCTTAC:1 - chr3R 25633313 3' - Tirant 8121 2 67.33 TAATCTTGACTCTCTTCCGCTCTTAAAGCATTTCGACCCTAATAGTTTTCTACTTTCTCTCTCAGTAATACAATCTTATTGTGATGTTTCTGCGTAACGTA:1 - chr2L 16723007 3' + Cr1a 4234 1 74.26 GCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTTAAAATGATTCAACATAATGCAATGTAATGCAAAGTACAACGTGGACCCCG:1 + chr4 200041 3' + 1360 3385 2 64.00 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATTGCATTCAATTT:1 - chr3R 23665248 3' + 297 374 2 60.40 CATGCCATCCAAGGACGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTAATTTGTCAGATAGGGTGTTTTTCGTGGCTTAGGAGCATCTTTGAATTAGCTTCATTTAA:1 - chr3L 12997877 3' + Rt1a 5017 1 60.40 AACCATATGTTTTGTTTGTTCTGCACTGCATACTTATGTTGTTTTCCCTATTTAATTGTATTTTTATATTTATTTTTGCTGTGGCATGTCCACGAAAAAAC:1 + chr2L 1535255 3' - Penelope 531 1 75.25 GAGAATGCTAAAGTCGAGTTTCCCGACAATCAGATACCCGTTATCCAGCTAGTGTAATTGATTGCTTTGAATGTCAATTAGAAGTTTCCTCGTCGCTCTCG:1 + chr3R 27312409 3' - INE-1 573 1 57.43 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTGAATACCCTAACTATAG:1 + chrX 13682601 3' + roo 9017 2 81.19 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTCCCGGAACTCTTTACTCCTGGTTCCTTGGGAAATAGAGTGAGG:1 - chr3R 14169229 3' - blood 7024 2 62.38 TTTTTTTTCTTTTTTTTTTTAACCGGCCTGGTCGCAATATAAGAAAGAGCATAAAGCCTCTGCTTTTGTCTCGCCTTTTGTTTATGGGGCATATAA:1 - chr2R 23962715 3' + hopper 151 4 60.42 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAAC:1 - chr3L 27415233 3' + transib2 2790 1 61.00 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGGTGGCTGTCCGCACGGCTGGCCGGCGATT:1 + chr2R 19857419 3' - 297 10 2 58.00 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGC:1 + chrX 2050875 3' + 412 7506 2 61.62 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAGATGGACTTAATACACCAAGCAGACAAGATCTGATTTATTAACCCAT:1 - chr2L 10118857 3' + hobo 2937 1 73.27 GTCGAACTGCACCCTGGGTCGGACTCGCTAGTCAGAGTGGTTACATTAAAGACAAAATCTGGCATTCAAAAAGTGTCGAATGCAGTAAATGATGACAAATA:1 - chrX 13648053 3' + diver 5707 1 68.32 AACAGNAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACAGTATTTTCACATCAAACGGCACAATTTCAATTGCATACGATTGTGGGGGAAAAATAACCCAAATTA:1 - chr2L 16933570 3' + 3S18 6095 2 75.25 AAAAAAAACAAAAAAAAAAACTTTATTTTAACTAATTTTTTATCGATTGTCTTGGGCCGTTCATTGAAAATAGCTAAAATAAAA:1 + chr2R 12497071 3' + HMS-Beagle2 489 1 55.95 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATTATGAGTGTC:2 + chr3R 19609709 3' - Tabor 44 2 67.33 GTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAATCTCGACCACGATGTTCGGCTTGATATTGGATTGCTTGCGCAATGTCTGCAGAAGGCGCACAGC:1 - chr2R 12922075 3' + R1A1-element 5290 1 67.33 GAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATTCAATTTGGACTTCACGCCTCATCTTCACACTGTAATATCCGC:1 + chr2R 9375269 3' - HMS-Beagle 2 2 75.00 GAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGATAATTCCAAGC:1 + chr2L 17957318 3' + opus 7488 2 66.34 GCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGT:1 - chr3L 11909956 3' - Tabor 55 2 81.19 ATAGTAATAATAATAATAATAACAACAATAATAATAATAATTATAATAATACGGTTTGGTTGAAAATTGATAAAAGGATTTATGGCTCTACCGGAAGTGGG:1 + chr2L 15763077 3' + mdg1 38 8 70.30 CACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGGAGTGGCAAGCTCTTTTGTGG:1 - chr3L 5964242 3' - BS 26 1 51.49 CCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTAT:1 + chrX 4180784 3' + I-element 5301 1 77.23 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCA:1 - chr2R 21379512 3' + P-element 2834 1 26.73 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGCGTATG:2 - chr3L 958733 3' + P-element 2870 1 60.40 CAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCCCTTGGATGCATTCTACAGTTTTAAAGTCGTACTCGCGTTTC:1 - chr2L 7451405 3' + hopper 1130 1 58.42 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTTCTATTGCAT:1 + chrX 8364661 3' - jockey 4779 1 56.00 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAACTTTATTCTTTAGTCACT:1 + chr3R 15998149 3' + pogo 2077 1 55.00 CAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAAAAGATGACACCGGAGGAAGAGGCAGCCAACTCC:1 - chr2L 13028510 3' + Stalker4 7279 4 67.00 TTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAATGAATCGCCCTTATGGAAGTTCCATTCTCTACTTAAAGTATTTTCAATACTTTTAGCTGAAA:1 + chrX 10028908 3' - F-element 4372 1 60.00 GGCAACTAACTTAACTTATTAGCTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGCATAATGGAAGAATTTAAAAAAAAATGTAAGAAATTATAT:1 - chr3R 7740961 3' - aurora-element 4223 1 59.00 CAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTT:1 - chr2L 17841012 3' - Juan 4030 1 74.75 CAAGCTCTCCCCATTCCAAACTGTGCCACAATTTCGGTTTACACCTGTCGAAGCTGCCACACCCACAAGCAACTTTTTCTACCACCAAACCGGCAACAGCG:1 + chr2L 4865219 3' + Doc3-element 448 1 79.21 TTTGAGCGGCAAAACTTTTCCGATGGGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTATACCTATTAAATAACGTCCCTTGACGAATTAATATCCTTTGTT:1 + chr3R 17488428 3' + R2-element 181 1 56.44 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCAC:1 + chr2R 12779141 3' - roo 8714 2 78.00 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTTATGTCCTCCGCCAAACTGGCAGAATCCC:1 + chr3R 11496916 3' - Doc 9 1 76.24 TCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCATCCTGCCAGCCAGCTCTGGGGAGCAGTATAAGCAAGGCAATGTCACTAAGCCAGCCACTAAATATGCTGC:1 - chr2L 13495320 3' - 1360 87 1 76.24 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCT:1 - chr3R 13423281 3' + 17.6 7394 2 55.45 GCGTCTATCACCTTTTGAAGTCGTTTTGGTACAGACTATACCAAGCATGCATTTATTTCATCTTTTCAATTTGCGTCCAAAATATTTCTGTTGAACTTTGG:1 + chrX 4504532 3' - Tc1-2 1332 1 59.41 CTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAAATCAAATATAATAAAACCCCGGTTCTCC:1 + chrX 10252471 3' - flea 4832 1 71.29 CCACGCCCATTTTCCCTGAGCATGCCGGTCAAAATAGTAGACAGAGTGTGATGAAGTCATGTGGAAGTAGCAGTACAATTATAGGCAAAAGTTAATTAAAC:1 - chr3L 15911589 3' + Circe 7366 1 54.46 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGC:1 - chr2L 13060267 3' - P-element 33 1 46.53 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCCCCCAACTGCCGTCGTCTTCGTGCGC:1 - chr3R 10957666 3' + hopper 1382 1 56.44 CAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTGCCCTACTGCGTGCAAATGTCCTAAAAAGCATTTGTACTTCTAACATTCA:1 + chr2L 4189444 3' + 1360 3364 1 54.46 AGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGGATCAATTTATACACTAAGGTATGTAATACATTTGTAAATACCTATAACCTATAACA:1 - chrX 20977462 3' + opus 7482 2 54.46 AGCTGNATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTCAAGATGTTTACTTATTTTTTGT:1 + chrX 11585611 3' + pogo 2051 1 77.23 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAGGGGCTGGTTGAAGGGG:1 + chr3R 18507873 3' - jockey 35 1 52.58 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTACTGGAATTCTAATTAACTACAATTGATTGGGGTTCTGCAAGTACAACTGAAATACCGGCAACAAC:1 + chr3R 17121699 3' + mdg1 7424 2 59.41 ATCGAGACGTTCATACGGACAGACGGGCATGGCCAGATCGAATTCTGCTATAATTTATGCTCGTCACTTTCAGTTTCAGGCTCTTATTCCCGGTAAAACTT:1 + chr3L 21731636 3' - INE-1 131 1 68.32 ATATTTATATATATATATTTATATATGTATATTTGTTGATTGAGATAATGGGCCGGAAAAGTTTGAACAACGAGGATTAAATAAATCAGAACTAGAGAGCA:1 - chrX 10131115 3' - Stalker4 87 4 69.31 CTGTAAGAGCTTTAAACCCTGGTTGTTTCGTGTCCACGGTACACTACTACTTTCAGCAGAATGCTGCGTATTTTGATTTGAGCTTGTAGAACAATCAAACT:1 - chr2L 21607664 3' + G5 249 1 56.44 AATATATTCGGGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATACTACATATACTGAGCAAAAGTCATTGCCCCGTGAC:1 - chr3R 4986259 3' - roo 5 2 74.26 TGTGCTTGCTTAAAGAATATGTTAGCGCTTATGCGCATATTCAACCAGCTTGGCAAGCCAAAGTTACTAAAGGCGGCAACAACGAAAATGAC:1 + chr2R 20063846 3' - 17.6 7219 2 56.52 CATCTAACCAAAGTGTTCGTCTATTGTGGAGTGAAAAATGATTGGCTGCAGGTGGTGGCCAATCTGAAACGCAAGCTAGGCGTGGACATCTTCATCGG:1 - chr3R 22765570 3' + transib3 382 1 60.20 AATTTACAAAAAAAAAAAGAAAAAACTAAAACGATATATATAATAATCAAATTTTCGGTATCTGGACCCTAATTGAACATAGTTTGAATGAA:1 - chr3L 19662684 3' + TART-C 11098 1 82.61 AATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTAAGATACTGTATACGGCTAGGACCGACAGGCAATTGAATCGAGTGTTGTCCGCCAATAAGTTCCGTGGCA:1 - chrX 9369709 3' - diver2 4858 2 56.44 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGGCTTAAAATTAAAGTTTTTTAAACTAAAATTTCACTGCAGTAG:1 + chr2L 19768437 3' + I-element 5326 1 54.46 AGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATGCAAATACTCCTTTATGGTGTGTGAATATAATCAT:1 - chrX 19306758 3' - P-element 38 1 41.58 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCATTCTTAATAC:1 + chr3R 12136343 3' + roo 9042 1 51.49 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAG:1 + chr3R 27080781 3' - HMS-Beagle 44 2 71.29 ACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAA:1 - chr2L 19642961 3' + roo 387 2 56.44 GTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTCAGAACATTGGCACGGAATTTTTAATAT:1 + chr3L 17921223 3' - Quasimodo 9 2 71.29 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATT:1 - chr3R 13375967 3' - 1360 31 1 58.42 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGTTGGTGCCGAAA:1 + chrX 495236 3' - 412 7085 2 54.46 AATCTGTTACATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTACAGCATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTTTTTTGTTGAGATAATTA:1 - chr2L 16082598 3' + Stalker4 388 1 56.44 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTATAGCATATAGGAAATAATAATAGCAACGGCAAACCACC:1 + chr3L 21319303 3' - jockey 4711 1 60.40 GCTCAGCAGCAGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATCTTCTTCGATAGACCCTGAG:1 + chr3L 2390604 3' + F-element 4501 1 74.36 TACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCCTCCCCTAATGCCCCTATATCTATCTAATACCTCTGTGTGAGTGATGCCGACAAACTCATTAGAAGCCAAAG:1 + chr3R 15572627 3' - roo 131 2 77.23 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTTTTTCCAAGGAACACACTCGAAACTATGTATCAAGTTTTGTTTT:1 + chr2R 10912164 3' + 412 7516 2 54.46 GATTGATTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGCTACTTGGCACGTTTAAATATATTACCTGTAAGGTTTTTTCAAGCTACTTGGCACGTTTAGATTTACTAAC:1 + chr3L 26716513 3' - Cr1a 4245 1 74.00 AACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCCGAATTGGGAAGAAAACGTTGACCATTGT:1 + chr2R 8559564 3' + jockey 150 1 71.29 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTCCAAGGGCGTCGAAAGTGAGGGGG:1 - chrX 2589665 3' + copia 257 1 58.42 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAA:1 - chr3R 25702175 3' - Tirant 8132 2 56.44 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATGCGTTTG:1 - chr2R 22997955 3' + Transpac 280 2 59.41 GTGGCCATACCAAATCCTAAATAATAATAAAAGGCACTGTTTTAGCATTATTTAGGATTTGGTATGGCCACCCTTGTTTTTAATTACTTCAAACATTCGGT:1 - chr2R 4723154 3' + Tc3 1425 1 78.22 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCCGCGAATCTCGAATGCGAATCCACGAATCCACGACAGAGTGACAGTTGACACAATCAAACAATAGGCAAATC:1 - chr3L 23152042 3' - Doc 39 1 60.40 CCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGGAGTGGCAAGCTCTTTTGTGGCGCACAATCTATATGAAACAGAAA:1 - chr3L 5964218 3' - BS 2 1 65.35 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTAC:1 - chrX 8031376 3' + roo 9019 2 77.23 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTTATTGGCTATTA:1 - chr3L 2292050 3' - Max-element 8238 2 66.34 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAGCTATACAATCTAGGACAAGTTGGTATTAAATTGAAAGCCACC:1 - chr3L 11461341 3' + copia 257 1 53.47 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAA:1 + chr3L 3279800 3' + Juan 4188 1 53.47 TCCAGACCTCAACATAATAGAAAACCTCTGGTACCATAAAAAAGAGCCCTGGTAATAATATTTCCTCCTTTGCAGATTATTAAACCTTAAACCGTAAACGG:1 - chr3R 11540076 3' + Tc1-2 1171 1 73.27 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTAACATTGCGAAATTGATTTTTCATCTGCTAGCGGTACTTTCCGCTCTCACCA:1 - chrX 12546424 3' + P-element 2870 1 60.00 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTCCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTG:1 + chr2L 13447156 3' - HMS-Beagle 32 2 69.14 TGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGAATCTTACCATTTTGTTCTTTTGCTGAGTATCCTTTTTGCTGGTGTTT:1 + chr3L 5975663 3' + hobo 2912 1 53.47 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGTGGGTTCCAGCCGCCTG:1 + chr3L 14240898 3' + Tirant 8479 2 54.08 AGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAA:1 - chr2L 12074510 3' - Juan 4070 1 66.34 CTAAAATATATTCTAATTTTAAAATAAAAAGATTTTACTTGTTTATCATGGTATAAAAATGTAAGTTCTTAACTATACATTAACGGGATTCCATCGACATT:1 + chr3R 13718285 3' - P-element 2600 1 60.40 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATATGCGTGGGAAAATCTGAGTTTTTGGAGCTCGAAGGGCGTCGGGGGGTCGGAGCTTT:1 - chr3R 30325188 3' + 17.6 485 2 73.27 CGGAGACAAAACCAGCGGCTTTGGCTAATTAACTCTAACCTATGCCCTGTGTATGGCCAATTCTGCTCAGCTTCAACTTTTGGTTCCGCTTTTTTGTTTAG:1 + chr3R 28731873 3' + Burdock 343 1 68.32 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGAGAGTTTAACGACCA:2 - chr3L 7792164 3' - 412 18 2 61.39 TCTTAGAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTTC:1 - chr2L 1626527 3' + roo 9046 1 52.48 GTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTTGTAATATGCTTATTTATAAGCAGCTTTGGCGATA:1 + chr3R 24729631 3' - Juan 4128 1 74.26 CCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGA:1 - chr3L 19951179 3' - Ivk 9 1 69.70 CAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACACTAGCGAAAACCTTTCATTTTAT:1 - chr3R 28883374 3' + HMS-Beagle 7007 4 61.39 ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGGAAAATATTTAAACCACAACGTTCAGTCAACGAATGTTAATATTAAAAACGATTTAC:1 + chr3L 16530041 3' - BS 5084 1 64.36 AACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTTATTGGCT:1 - chr3L 2292054 3' - Max-element 8242 2 62.38 GTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATTTCACATCGAAATTCAGTTGTATATTGAAAC:1 - chr2L 20224423 3' - Idefix 40 2 71.29 ATAAAGGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGA:1 + chr2R 6984391 3' + HMS-Beagle2 277 2 61.39 TTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAAT:1 + chr2R 22605969 3' - Juan 4073 1 70.30 TAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGAAGCGTCTTTATTGCTTATCCCGTCCTCACATGCTGCGTTCTTTATTGGCGACCTTGCCCCTTTTGCCCATTTC:1 + chr3L 17699681 3' + 412 7087 2 76.24 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGTGAACAAGTGAAAAGGAATAGAAAACAATCGCGAATGGAACGCTGCCACAGTTGAATAGCA:1 - chr2R 21114678 3' - jockey 20 1 64.29 GCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATTAACAATTA:1 + chr3R 1868223 3' - G-element 31 1 50.50 AAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTTCTTATGTGTGTATGTCTGTGTGACTGGTGATGCCGTATTTAAATTGTATATATATTTCTGTTTTAGTGTATA:2 - chr3R 28090143 3' + hobo 2518 1 80.20 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGCGAGCAAAGACAAAGATCGTGAT:1 - chr3L 8063827 3' - P-element 25 1 54.46 CCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCATCGCTATAAACGTAACCATCATA:1 + chr2L 1129304 3' + Doc 4488 1 77.00 GATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAAC:1 + chr3R 19657512 3' - roo 8702 2 63.37 ATCGTTCTACGGTTAGCTAGGGAAGGTATATTAATTAAAAGTAGTCTACTGAAATAAAGAGATAAAAATGGCAACAAAATCCATTCTCAAAGTTATCAGAA:1 - chr3L 24740391 3' - Cr1a 4008 1 67.33 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCATCAATTTGCAATAAATGAATGCCTCGTTAAGCGGAGGGTTCAGTTTTTCATATGGTCTTTAA:1 + chr3R 12767107 3' + 412 7534 2 64.36 CGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTCACGTTCGTGGAGCCGGCCAGAAATATATCAGTTCACTTTAAGACG:1 - 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chrX 1235384 3' + P-element 2884 2 76.24 TCCAAGTAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGAGATAATAAATTTGATGTTTTTACAAATAATT:1 - chrX 18012690 3' + roo 9029 1 67.33 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATCATTTCTATTACAGACTTATTTATTTCCCAGTAGCAT:1 - chr3L 17698192 3' + 412 448 2 64.36 CATATATGTACATATGTACATATACCACATTCTACTATAGCTAACTATGTGTACATATTTCGCTTTGAATGCGGCAATAGCGAGCGTGGTCGTCGTGTGGG:1 + chr3R 29788643 3' - G3 4508 1 83.17 TTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATGTTTCAATTAAATTAAATTCAACTTTCGGCTGAAATAATATGAATTTGTTAATCACATT:1 + chr2L 7172481 3' - jockey 4971 1 70.30 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAG:1 - chr2R 20411854 3' + 297 6964 2 67.33 CGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAGTGCATGAG:3 + chr3R 9952270 3' - Ivk 8 1 70.30 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTTATAAATATATTTTGTACTACTTATTGTACGGCTTTAAATCGCCTTTCATCAAGATATTCA:1 - chr3L 17926079 3' + roo 9055 2 62.38 TAATANTTCAGTGTAATAGATATTGAATAGACGCTCAGGATGACCTCTGTCAGTTCGGCGGGAAGTTCATGGGGATCTGCGACTAAGTACACATGTGCTTT:1 - chr2R 10881009 3' - Stalker2 7635 2 73.27 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCCTTTTACTTTAATAGTAAGAGGTATAAAAACAGGTACTTGCACTTAAATGTCACG:1 + chr3L 25126295 3' - blood 20 2 59.41 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTAAAAAAAAAGTCGACAAATTGAGAACTGCAGAATGTGAATGTTTGCTTATGCAACTT:1 + chrX 16749717 3' - 297 23 2 62.38 GTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACCTAAAATAAATGTTGCGAAATGTCTTAGTTTCAT:1 + chrX 23280397 3' - 17.6 40 2 71.29 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGTGCTCTGACTAGCAGGTTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTT:2 - chr3R 10741080 3' + 1360 3372 1 63.37 AAATCNGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCTTATTTGGGATTTTACACCAGCTGAATACCCTAACTATAGTATCATATCATATGTTACAT:1 + chrX 13682621 3' + roo 9037 1 60.40 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACACTTTTGTGTGCGAAGAGCAAACGACT:1 - chr2L 8031266 3' + P-element 2840 1 33.66 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTCCCTCTCTCGCGGCATCAC:1 - chr2R 13038912 3' - P-element 56 1 23.76 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGGCCATAAGGAATTCATTGTAAAGTTT:1 + chr2L 13244975 3' - P-element 48 1 31.68 GTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTCCCGGAACTCTTTACTCCTGGTT:2 - chr3R 14169249 3' - blood 33 2 58.42 TCCGANGTCTGAAGAGAACACATCCCCATGAACTCCTTACTCGGACGCCCTGATGCCAAGAAATCAGGTCTTTGATACGGACATCTATGCTCCCA:1 - chr3L 21405961 3' + G5A 2675 1 63.16 CAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACT:1 + chr3R 10971928 3' - BS 5049 1 79.21 ATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACTATAAGTAAACAAAAAACAACAGCACTGGGAACGGGAACGGGAACAGAAGGAAGCACTTGAGTATTCATGCAATTTCT:1 - chr2L 2903548 3' - blood 7179 2 59.41 ATTTTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGGAAAAAGGTGGCGCTTGGGAAATTGGAGGAGGGGTAGCTGCAAGCTTGCATTTTCAACA:1 - chr3L 17209327 3' + hobo 2856 1 68.32 TAATAATAATAATAATAATAATAATCGATGGATGCAGTCGTTTTCCTTTAATCTGAGAAGATCCTTTTCTTGACAAACAGTCGTGTTGCCGATAGATAGAC:1 + chr3L 24368143 3' + mdg1 30 8 77.23 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCA:2 - chr3L 9692659 3' + P-element 2870 1 62.38 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCCGTATCCTTTGCACG:2 + chr3R 10957739 3' - hopper 27 1 53.47 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATAAAGGTAGGACTATTAAATTATAATTTCTATTTATCTTCGAAACTGACTTTGTCATCCCGTT:1 - chrX 9248265 3' - pogo 10 1 67.33 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGGAGTGGCAAGCTCTTTTGTGGC:2 - chr3L 5964241 3' - BS 25 1 50.50 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAATGGCTTT:1 + chr3L 14910642 3' + roo 9042 1 59.41 TAAAGGAAACCGCTTGTGATAATTTTCAACTTCGATGCTCATCCACCAAGACGGCGGCAATTATGAAGAAAAAATGTTACCCTGGCAGGAAGTAAATTCAA:1 - chr2R 14841233 3' + mdg1 485 1 73.27 GAACGNAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCCA:1 + chrX 19457213 3' - roo 33 2 59.41 CTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATACCAGCATTTTTTTTGTTGGGCAGGAAATGCAGCGCGGCTCGTCAGTGTCAGTGTCAAAAGTCGGACATC:1 - chr2L 18900642 3' - baggins 5352 1 64.21 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACC:1 - chr3L 7989742 3' - mdg3 5288 2 56.44 CTGTGTATGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGGTTCTATCTGCTTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCTTCCTCTTTGCCTGTCTGTGTAAT:1 - chrX 19989658 3' - Quasimodo 39 2 52.48 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGGATACACATCAATAAATGAAGGAGCCAAGTTCC:1 + chrX 14041975 3' - roo 8707 2 76.24 TATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACCAAAGCTA:1 - chr3L 7989735 3' - mdg3 29 2 54.46 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCCATCAGCTAATTTGGTGACCTTAGAATGTGCCACTTTTCTTTCTCG:1 - chr3R 22079723 3' + pogo 2074 1 56.44 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAA:2 - chr2L 107994 3' + P-element 2857 1 49.50 AATAAAATCTATGCTTATCAGCAAAACAATATAACAAAGACATAGATATAATCGAATTTTTATTAATTCAAAATAAGAGCAATAATATCAAATATGCGCAC:1 - chr3R 11021236 3' + BS 240 1 57.43 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATC:1 + chr2R 19936703 3' + roo 396 1 69.31 GCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCGTGAAGACATTTAATAAATGGCGTAGGCATTAGACC:1 - chr2L 15399004 3' + roo 8945 2 68.32 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTTTACTTTAATCCCGTAAATACATTTA:1 + chr3R 25918967 3' + roo 9044 1 56.44 CTTCTAGCACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCTTAGAGGTTTCAACTGGACAGGTGAGTTAACTTCAAATTTGAATTGTCAATAATAGCGAAGTAATC:1 - chr2R 15671947 3' + 1360 3208 1 71.29 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGGCAGACCGATACAATTTTGCCCCCCTTACTATCGTGCACCTT:1 + chr3L 21841383 3' + P-element 2876 1 70.30 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTAATTTTTTCAAAATTCTTCTCGCTGACTG:1 - chr2R 24965043 3' + P-element 2877 2 70.30 TTGCAGTCTTGAGCAAAATCACAACTTTTAGGCTGTTTCACTATTCTGAGAAATTGAAGCTTCTTTTTGTCCGTTTTTCCAAAAGTCTTCTTGATCATTTA:1 + chr3R 4520385 3' + HB 176 1 71.29 AATTAAAGAATATTATTTAAAACCATGGCTGGTTTGACAAACAGAAAATAAACTCTCAGCATCTGTCAAAAAAAA:1 + chrX 8644743 3' - Cr1a 74 1 69.33 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGAT:1 - chr2L 21978106 3' + roo 9028 1 66.34 CACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCTCCCCTTCTTCTGATTATGATTTTATTTAGCTTTTTTATTATATTTATTTCTGCCCCCTTTCCTTAGCTAT:1 - chr3L 10941969 3' - blood 7356 2 77.23 CCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTT:1 + chrX 1954506 3' - Tirant 42 2 65.35 CATAAAACATTAAACTTCTCTAAGGGAGTTATTTATTGTAAAGACCTTAGCCACCATCGATAGCAGTTCAGAAACAACACCCACCCAAATATCAACCACA:1 + chrX 10044282 3' + I-element 469 1 56.00 TAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATGTATATGTATGTATACGTTCATGTAAATGGCTGTAACCCGC:1 + chr3R 14164170 3' + Quasimodo 7342 2 61.39 CATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTT:1 + chr3L 21203054 3' + pogo 2056 1 69.31 AGTCAAGAAAACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTGTAAGGGTCATGCAACATAAAAATGATCGACAACAGTGACACTT:1 - chr3R 8202805 3' - Cr1a 4223 1 72.28 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATCTACAGAAAAAGATTGTAGACGAGTTAAGGTCAGCTGTAATATAA:2 + chr3R 28883441 3' - HMS-Beagle 32 2 55.45 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGCATGGGGATAGGTCCTGGCCATCCAGACTATCC:1 + chr3R 10957725 3' - hopper 41 1 67.33 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGTTTTTTCCAACCAACCTTATTTCAACTGGAACTTCTTCTAC:1 - chr3L 15639317 3' + roo 359 2 59.41 TTTCCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGCAGCAACAAAAGCAGCAGCAACAGCAGCCGCAACTGCCGTGCTCCTGCTG:1 - chr2R 24273657 3' - HMS-Beagle 6947 4 50.50 TCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTTTGAAAACTA:1 + chr2R 6984417 3' + HMS-Beagle2 310 2 75.53 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCTTCAGCTCTAAAGCTCGGCAATCTGGCCCACAAATCACCACGAAACAT:1 + chr3L 22920456 3' + 1360 3366 1 56.44 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCT:1 - 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chrX 2304202 3' + mdg1 31 5 70.30 ATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAAC:1 + chr2R 4677355 3' - invader3 16 2 64.36 CGACTATCAGATACCCGTTGCTTAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAA:1 + chr3L 24731967 3' - INE-1 550 1 79.21 ATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATA:1 + chr3L 19881813 3' - Idefix 44 2 77.23 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGA:1 + chr3R 24282020 3' - Max-element 8266 2 55.45 TTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGGATTAACTCATACCATTTGGCTATATA:1 + chr2R 23051115 3' - G2 3050 1 73.27 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAAT:1 + chr2R 9277561 3' + roo 9018 2 80.20 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTC:1 - chr2R 5849957 3' - jockey 29 1 57.43 ACATTTTTGTTGGTTTTTTTTGGTACTTGGATACAGCTTCTGTATCCATCGATGCACTTACATCGATGTCTTTGAGGACCAGCGCCGGTTCGCGTGGTACT:1 - chr3R 22703000 3' - Fw3 3057 1 45.54 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCAGTATGGATGGGAACTGCGTCATGCCACCACCAGCAGCGAT:1 - chr3R 19076120 3' + roo 400 1 67.33 AATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTTTAGAATACATGATCTTTGAAACAAAGTAATTAATCTAGATATGTCCAGGTTTTCAATTTTAT:1 - chr3L 9691354 3' - P-element 107 1 66.34 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTA:1 + chr2R 14381337 3' - hobo 43 1 69.31 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACA:1 - chr3R 13715108 3' - P-element 58 1 21.78 GCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGAAATATAT:1 - chr3R 16626773 3' - I-element 5278 1 56.44 CAAAAAAAAAAATAAGAAAAAAAAAACTAGTTGCTGTAGCACGAGAAACCCCTTTTGCTACTTGACCATTTCTCATTTTCAGATTGCGCCAAATTCCATGG:1 - 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chr2L 18002238 3' - 412 424 2 71.29 AAGGAATTGTTTAAATCAGGGAATGGATGTAGCTGCTGAATCCTCGACTGGATCCTGGGTGCACGTTACCGGATGACCATTAATGTTTCGTTTCTGGGG:1 + chr2R 21986226 3' - Idefix 7018 2 77.78 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCT:1 + chr3R 24282027 3' - Max-element 24 2 56.44 TGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTCGCAGCAAATGCTGGATCAGTTAACATAAAAAGTTCTTCGACGCCAATTACGACG:1 + chr2R 6753299 3' + copia 4708 1 72.28 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTCGTAGCATTAGGCAATGGCAATGTGCAATCCGCCGCC:1 - chr2R 9014402 3' + blood 372 2 71.26 GATCCCCTGATCACGGTTTACATTGCTTGTTTACATTTTGTAGCCACATAATCAGCCAAATGTAATCAAAATGATTCCAAATTGTTGCATTCTCAACGTAT:1 - chrX 6183601 3' - invader3 5144 1 40.59 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCAACATGTCAGTTTGCTGT:1 + chr2R 15005113 3' - BS 5011 1 53.47 AGATANTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTC:1 + chr2R 19936666 3' + roo 9022 2 71.29 CCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTCGTTGCGGGCCACCAC:1 + chr2R 9014508 3' - 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BS 5024 1 54.46 CGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTG:2 + chr2R 5084092 3' - F-element 26 1 49.50 TCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAAAAATGCAGCTGAGCCAATTTTGCGCCGATGTTC:1 - chr3L 18009539 3' - roo 8662 1 78.41 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAA:1 - chrX 20364251 3' + opus 452 2 77.23 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATACCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 10126541 3' + mdg1 7440 2 70.49 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCTGGCCACTTGTCCG:1 + chr2L 16686619 3' - pogo 20 1 58.59 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATGTCATTCCCCCGCCGACTTCCGCTTATCATTAAGCATTATCGCGCG:1 - chr3R 29350696 3' - opus 20 2 59.00 TCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGT:1 - chr2R 20838625 3' - 1360 54 1 80.20 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTAATAA:1 - 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412 30 2 58.42 AAACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATAGCTCCCAACTCTGATTTAGATCCATAACCGAAATCCCACCGGAAACAACAACAAGAATAAGAGCT:1 - chrX 159041 3' - Cr1a 4175 1 72.28 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTCAATTGGAGTTCATCATTACAGCACTTACGCAGAGGTGTTAACTA:1 - chrX 4009299 3' + 412 7491 2 74.26 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTTTACAAC:1 - chr2R 12779067 3' + roo 401 1 69.31 AGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACCGTTCCATTCCTTTTAGTTTCATTCAAAAATGATTAACTGGCAACGGA:1 - chr3L 20761999 3' + 1360 3182 1 57.43 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACAGATTCCGCCCTCAGGCGTATTTCAAGGAAAATGTTAAAGTAATGTAATATAAAACTTTGCAAAATACAGT:1 - chr3R 9479413 3' + mdg1 7457 2 70.30 AATAAAACAATTAAATTTAATTTTCAATATACATACATACATAGCCCGTCTGCGCGGCAGTTGCAAACAGGAACTCTGGCAAGGGCAAAAAACAACAATGC:1 + chr2R 15043279 3' + TAHRE 63 2 72.28 CGTTCATTGTTAATAGTTTTGAAATTATTTCTTTACATATTGATAAAAAACATATAAACAAATAAAAATTATGCTCAAAAAGTGACCTGTAATTGTATAAT:1 - chr3L 6752079 3' + S2 1561 2 68.32 AATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTG:1 - chr2R 10863900 3' - mdg3 5288 2 62.38 AGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGAATCCGCTTATTAATGAGCTG:1 + chr3L 21384070 3' + roo 9069 1 76.24 ATATCNTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATC:1 + chr3R 14688320 3' - pogo 29 1 56.44 TATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATGGCAATCAAGAATAGCATGAAAATACGATGATTTCTAACAATAATTTCTAATC:1 + chr3L 4345041 3' - mdg3 5277 2 49.50 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCA:1 - chr3R 9981494 3' - jockey 4789 1 52.48 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATT:1 - chr3R 7522317 3' - blood 48 2 70.30 GCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTGCGGCACTACAAT:2 - chr2L 20118657 3' - Max-element 8234 1 80.20 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGTACTAAGTACTAAGCCCAAGTACTATAACCTTGAACAACAAAAATCAAAGGGATCAAAT:1 - chr2R 9198704 3' - 1360 17 1 62.38 TACATATTTTCCGATGCCTAAAATAGTATTCAATGAGTTCTGAAGAAAGAATATTATGCTGCCGCACCCTGTATTTCGGTCATGATACTTGCAGCATCTGC:1 + chr2L 21687113 3' + mariner2 842 1 67.33 AAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGTGTGAGCCGGCTTAATGATAATTG:1 - chr3R 27244617 3' - P-element 2853 1 25.74 GCATAATTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCCCTTCCGCCTTCCGCCACCTCGGTGGATGAATCTGC:1 - chr3L 7314687 3' + hopper 1380 1 58.42 AAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTA:1 + chr2L 22150635 3' + S-element 1684 2 78.22 CCTCGGTCTAATCAGAGAGTAAATCGTTTGCCCATCTCTTAAAACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCCACCAACACTCGAAGCTGCAGGAAAAA:1 - chr3L 5625099 3' + FB 288 1 76.24 TTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGACAGGCCTTCGGGTATACCAAGAGGTAT:1 - chr2R 4502779 3' - roo 176 2 72.28 ATATAATAATAATAATAACAAGAAAGAATGCTATAGTCGAGTTATACCATTTTCATTTAAGATCAAATCGACAACATTACCCCCATTATTTAGAGTGCATG:1 - chrX 7016936 3' + invader3 5058 1 53.47 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGAACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGG:1 - chr3L 15035129 3' + pogo 2071 1 62.38 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAACGTGAAACGTGAAA:1 + chr3R 14049436 3' + transib2 2812 1 65.35 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGGGCAAAATTAA:1 + chr2L 2920950 3' + hobo 2926 1 60.00 AAAAGGCCAGCGATCGACAAAGAGGGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTTTATTCCACAATACTTACACATCGCT:1 + chr3L 210801 3' + gtwin 343 2 74.26 CCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGTTTGCTGCCCTCGTGGAAATTCCCACGCTCCTCTGTCCAAATATTCGGCATTCTC:1 + chr2L 12021815 3' - Tirant 409 1 60.40 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGG:1 - chr3L 17122422 3' + roo 9032 1 66.00 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATAAATACAAAAAAAGTAATGAAATCAAAATAAGAAAATGTTTACAACTTAATTTCCCTAAACACTA:1 + chr2R 969257 3' - flea 9 2 75.25 ACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACCGGGCGTATACGTAGCGCGCTACCGTTTCTCGCATTACTCATACGCAGCGTGACACCCAAAGAAACGCTGTGGCAC:2 + chrX 3327031 3' + hopper 1414 2 69.31 TAATTTATATACATACATACAACTACTGGAGTGCCATACGGACGGCGGTGCTCCTCCTCGTTGACCCAACATTGC:1 + chrX 5108376 3' - 1731 99 1 70.67 TTTTTTTTGTTTTTCTATTATTAATTTGGCTTGGGATGTGTGTGTTTTTTGTGTGTCTGCTGCTGTTGATTCCGTTTCCTCCTCGGTTGCCTCTTTAATAT:1 - chrX 8531762 3' - Rt1b 5149 3 85.15 CGGAAGTTATGCTGCCGCACCATGTATTACCTTTCTGTTAAAAAATAACTCGTGCCCACCCTGTAGTTGCGCTTGATGCAAAAAATTACTCATCCGAATCT:1 - chr3L 23570525 3' - mariner2 3 1 48.51 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGTTGCTTCATATTAGGCCATGGTCAGTCG:1 - chr2R 19936628 3' - roo 46 2 73.27 TTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCGCTTGCG:1 - chr3R 27080693 3' + HMS-Beagle 225 2 75.25 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACATTAATTTAACCTTCTTGAAAATTCTTGAAAGAGTATGATTACTAAAAAAA:1 + chr3R 12571549 3' + roo 385 2 55.45 ATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCG:1 - chr3R 21678310 3' + Idefix 7110 2 80.20 AAGACGGTGCGATCAATCATTAGATTAATTGGCGCCCCACTAAGGAAACCCACATACACGCGCACACGGATCTCATAAAAATCCTTTTTACCAAATG:1 - chr3R 27614730 3' + Gypsy6A_LTR 392 1 55.67 GATTATGCCTACGTACTATACAAAAACCTATGCTCTCTCTCCTGTCCTTTTCTGGACCCTAGAAGCTCGACGCGTGTTGACAATTTTGGGCTCAGTGCTTG:1 + chrX 17919931 3' - Rt1a 4971 1 54.46 TACCGAAGTATACACTTAAATTTTAGATTTTAATTTCCGTTGGATTTCTAGGGTATCAAACAGTTCGTACTCAAGATAATCAAATCTTTAGTGTTTATTGT:1 + chr3L 18419656 3' + P-element 44 1 73.27 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCGTGTGCGT:1 + chrX 2050883 3' + 412 7512 2 54.46 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCGAAGAGTATTCTAAATA:1 - chr2L 19642942 3' + roo 406 1 75.25 GATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATAC:1 - chrX 16798220 3' - diver 48 2 70.30 ACGGTTAAGGGTAGTGCCATGTGCTACACATTAAAAACGCATAAAAATCGGCCAAATAAAACACTACAACCGAATGGAAAAGCTACACATAAAGTGGCTAT:1 - chr3L 18127069 3' - BS 4779 1 80.20 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATACTACATATACTGAGCAAAAGTCATTGCCCCGTGACA:1 - chr3R 4986258 3' - roo 8668 2 75.25 GATTCNCAGTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAAAAAATAAAAAAAATAAATAATAATAAATAATTTCGTC:1 + chr2L 8152452 3' + P-element 300 1 29.70 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAGAACAGTGAAGTGAAGAGGCAAAGTG:1 - chr2R 5262602 3' + 1360 3338 1 79.21 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACTGGCGTT:1 - chr2L 5974420 3' - roo 8706 2 70.00 TTTTATAAATTTTTTTTTTCTAGCTTTTGTTGCCACCGGGAAGATGAGCACGACTGGCGAACAACAAACAAATCAGGCAAATTATTGATATGAAAAATAT:1 - chrX 21306545 3' + Circe 425 1 61.00 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGTTGCTTCATATTAGGCCATGGTCAGTCGAAAGCAATTCTGCC:1 - chr2R 19936614 3' - roo 8696 2 59.41 TTTCCAGAGTGGTTGCAGATTTTCGGCCAAGCAACCAGGTCATCTTCAAACTTTTTAAATATTGTTTCTAGTTTTTGTGATCTGTCACCAGCTCAAATTCC:1 - chr2R 3914771 3' - G4 3369 1 59.41 ACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCGCCTAGCGACACTGGCGAGTTCTAATGAAACTGAATTTGACCCACATTTCATTTCATTCCGGACT:1 - chr3L 17934185 3' + I-element 5098 1 67.33 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCTTAAACAGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGAT:1 - chr3R 11516588 3' - roo 21 2 59.41 GAAGACGATTTTCTGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGCAGAAACGGTTTTGGGATCAGAACAGAGGGAGTGGGGAGGGTCCGGAGCCCGAGCACC:1 - chr3R 7849392 3' - 1360 3190 1 67.33 CTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGGTTTGTGCTGTTGGCCAAATATTGTT:1 - chr3L 26822243 3' - 1360 103 1 53.00 GAAAGNAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAACGGAATTGTAAACGGGTTTCGGGGTAAATTGTT:1 - chr3L 5716854 3' + copia 247 1 70.30 TTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATCGGGGGAAATACTACGGCGATTAGTACTACAGATCGCTAGAGATG:1 - chr2L 8176242 3' - Juan 3841 1 55.45 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGAACCGGTTTACCTGAGAATGTTCATTATTTAGCTTTGCTGATTTGCTTGCCTGTCTGAC:1 - chr2R 9408164 3' - FB 16 1 61.00 TACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAAGCAACTTGATCTCGTTTAGG:1 - chr2R 912935 3' + mdg1 7447 2 67.33 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGCACTCAGC:1 - chr3R 7993859 3' - Doc 28 1 49.49 TATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAAAATAATAAAACGAAAAAAAGTAATAGTTTTGGTAGGTTTGTGGGTG:1 - chr2R 5788306 3' + I-element 5314 1 66.34 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTGACAGCTGTTATGTTG:1 + chr3L 19215881 3' + roo 395 1 67.33 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATATTTATGTAAATAAATGAGAGCTATAGACATTTAAAGTAGCCAAGTTGCTCG:1 - chr3R 25285060 3' + roo 9046 1 53.47 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGATCCCTCATCGG:1 + chr3L 15638313 3' + roo 395 1 66.34 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAACACCCACTCAGTCACATATTCAACGCAAATGGACTTCCAACGGACATTG:1 + chr2R 23495513 3' - 412 25 2 54.46 TAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAATCATTTGAAATATAAACCATTTATTTTCGCTTTCAAGACATTAAAGCAGCCCTAT:1 + chr3R 22277232 3' + 297 6962 2 67.33 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAG:1 - chr3R 19657464 3' + roo 361 2 70.30 TATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAAAACTGAAGCCTGTCATTTGATAAGCTTTCGCCAGGATTTTCTCTCAGTGAACCGCACAAGAAT:1 + chr3R 18964854 3' + hopper 82 1 58.42 AGAATTCCCAAATCAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGCTACTTTGTATGCAGCGACTGCTGCTATCAGTTGTTGGATTTTCAAT:1 + chr2L 15846705 3' - blood 459 1 53.47 TATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCT:1 + chrX 21947747 3' - mdg1 7042 2 73.27 TCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAG:1 + chr3L 11910000 3' + Tabor 451 2 55.45 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAG:1 - chr3L 27415224 3' + transib2 2798 1 53.47 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTAT:1 - chr2L 15333738 3' - P-element 51 1 28.71 GGGACAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTGTATGTATAGGAAACGGATATTTGAAATCTATATAGGTTAACGAAATGAAATA:1 + chr4 126695 3' + Tc1 1616 1 75.25 CTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATTAAAAATCATCTTATACCTTACTTGAAAGGATCCCAAATGTTTTTAT:1 - chr3R 10971863 3' + Tc1-2 478 1 73.27 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTATCATCGGCGGAGGGTTGCTTATCAAC:1 + chr3L 14602600 3' - jockey 4833 1 74.26 ATACGGAAAACTAAGTTCTTCGCAATATGTCCACGAGCGCAACGAAAACAGAGGAGTAGGAAAATGTGAAGGCAGGAAAACGCCGACCTCGCAAAACCCTT:1 + chr3R 31700947 3' - R1A1-element 35 1 56.44 AAGCTCACCGGGACTGCCAGTCAAGGTATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGATGCCATGTTGCTTATGTGGCATCTATCTTTTACCGAATCGTGCCAGAATC:1 + chr2R 22837097 3' - Rt1b 4991 1 59.41 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCCGGATTTAGTATATTGTTTGAGCGACTGTCCTTAAATC:1 + chrX 13347384 3' - roo 4 2 72.28 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTG:1 + chr3L 10811183 3' + P-element 2829 1 23.00 CGCTTACGCTGAGAGCGTAAGAAAAAATAGAATTTGCTTGCGTGTGTGGGTGGAGCGGTAAAGTTAGTCGGAGGTGCTGTGCGCACCACACACGTTTAAT:1 + chr2L 14952937 3' - 1360 3290 1 59.00 CTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGCCAAAAGAAGACTCAGCGCCCACTCACACATTCAGACAGGCAGTGAAATTAATTAAATAA:1 - chr2L 17209516 3' + jockey 4704 1 53.12 ATTCTGGACTTGTCCATAAGATTTTCCCACCTTGCACTTGGTAAATCTGAGAAAATTTTACATTTGCACTTTACTTTAGACACTTCTTTATACGTCAAAAG:1 - chrX 5464808 3' - X-element 78 1 72.28 CTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAA:1 + chrY 3648902 3' + 17.6 477 2 63.37 AACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATTAGAAGCTGTAATCAATCACAAGTATAATAGAGCTGTATATGGAACATATGCC:1 - chr2L 10626607 3' - transib2 2762 1 55.45 TATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAGAAATGAACAACAAAAACCACAAAAA:1 + chr2R 14457791 3' - mdg1 7045 2 67.33 AGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTAATACATGTCCAGTTGTCACGTTACGTT:1 + chr3L 18307268 3' + roo 310 2 72.28 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACAAAGTCCCATGTCGTGAAGTGCATCTTTGT:3 - chr3L 13080946 3' + 412 7501 2 70.30 CTACGTACTAAACAAAAACCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATTTCTCTCCCTTTTTCTGGCTTTATCCTTCTGCCTCACGAAGTCATAAAATTGA:1 + chr2R 9519248 3' - Rt1a 4963 1 79.80 TATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTC:1 + chr2R 22605993 3' - Juan 4049 1 54.46 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATATAGTGCGAAAT:1 + chr3R 12894166 3' + blood 7353 2 60.40 CTGCTGTCGCTCACCATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTGTTTACGGCCTTTTAATAAAACGCG:1 - chr3L 10953596 3' - R1A1-element 380 1 64.36 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATTTCAATTATTCTATGCACTCGC:1 + chr3R 9479513 3' - mdg1 31 2 53.47 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGGATTGGAAGGATTTTAGAAAGTGCAGCCAAGCTTTTCGGAAAGGC:1 + chr2R 24419914 3' - roo 8695 2 58.42 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAACATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCA:1 - chr3R 19609661 3' + Tabor 7287 2 59.79 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAATA:1 + chr3R 19967673 3' - pogo 30 1 55.45 ACCACTGTGCACGGAAACACAAAATCAAATGCATGCAAAAAACAACTCCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAAGGGAGAGTAAACAAAACACAAAGAC:1 - chr3L 24796711 3' - Cr1a 397 1 69.31 CCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATCTAGTCATTAAAGGTCTACAAAAATATACAGAAAGTAGATGCAGCGAGTGTTGG:1 + chr2R 18676045 3' + I-element 160 1 56.44 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCATTCTTAATACGTAC:1 + chr3R 12136347 3' + roo 9046 1 53.47 CCGACTATCAGATACCCGTTACTCGCTAGAGCGAATGCGAACGCGGAATTTCATTTCAAACGCAGATGGTATTAATAAAATATATCAAAACTTTTTCATAC:1 + chr4 236544 3' - INE-1 551 1 56.44 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTA:1 + chr3R 13715148 3' + P-element 2855 1 47.52 CGATGGCATCTGTTTTTAGGAGGTGTTCCACCTCGGCTCTGCTTCTGTTTTCTTGGTAAGCCGACACCTTCGGTTCCGTCACACTCGAGCTGTTGCTGCCG:1 - chr3R 16528479 3' - G2 333 1 62.38 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCGGCCCATGGTCCGAAAAGATAAGAAAGCTTGAAAAACAACCGAAAGTGTCGTTTAACATCG:2 + chr3R 31812764 3' - P-element 15 1 65.35 GGACTCTTTGGTTTATTTGATACTTTCCGTTTCAGCTTCCTTTATTTTTTTGGCCAGCGAAATCTTTTGAAAATTGCTTGTGTTCTTATGTGTGCACATCT:1 - chr2L 18845791 3' - invader2 5049 2 71.29 CTTTCAGCTGAAAGCACTCACATGCACGCACACCCGCGTTTAGCGCACCGCTCGTGCGGCGAGCTTTTGAGAGGACTTTCGGCCGGAAGGGACTCGATGG:1 - chr3R 4222730 3' - G5 234 1 73.00 AATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCG:1 - chrX 21474426 3' - 1731 4358 2 71.29 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTATGATCCTTACACCGA:1 - chr3R 25633308 3' - Tirant 9 2 72.28 GAGAATCATTACTGGAGCTCCATAGTATCTTCGGAACGAGAATATACACAGACTTACAAATATTTGTGGTCATTGGCTTTTGCATAAATTGTGAGGAGATG:1 + chr3L 18521291 3' + Doc3-element 4401 1 64.36 ACGTGGCCGAGTATAAAGAGGAACTTAAAACAGAGAGAAAAGGCAGTCAGGGATTGATTGCGAGTGAAATGCTGGCCAACTTACT:1 - chr3R 19467403 3' + Transpac 455 1 62.35 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGAATCATATGACGACAAGCCCTCGGT:1 + chr3R 14688347 3' - pogo 2 1 67.33 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAA:1 - chr2L 7548013 3' - blood 48 2 73.27 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAGTGAGCTGATAATTATAAATTTGTCATGACATTCTGAGATATCAACAAAATTTAT:1 + chr3R 14095003 3' - Doc 27 1 58.42 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCGCCAAGAAGTGAGGTAGCAAACTG:1 - chr3L 3671280 3' + roo 9047 1 55.45 ATAAACATAAATATAAAAATATATATATCGTGTCATATCTGTGTTGTGGCACATCTATTGCATATACGTAAATTTATGTATTATTTTCTCCGCTCGAGGAG:1 - chr3L 19514492 3' + Stalker4 7043 4 45.54 TGATCGGGATCAATAGACGAGTCAATCTGATCATGTCCGTCTGTCTTTACGTCCATATAAGCGTTGTTATTTCAGGAACTATAGAAGCTAGAAGGTTGAGA:1 - chr2R 1751256 3' + INE-1 91 1 49.50 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAA:1 - chrX 328999 3' - opus 21 2 57.14 CTCGAAGGACCATGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCAGCAGAGGCAAAAGCAGAAGCACCAGGCTGACCCTTTCA:1 - chr2L 4634278 3' - Max-element 312 1 61.39 AGTGCTTTCGATGCTGATATATTGTGCTCTGCGGCACAATTCGACACACTTTCTTTTGAGGAGCGCAATCTTTGTCAGCGGCCACGTTGTTCTCTGCAACC:1 - chr3R 23169888 3' + Chimpo 459 1 84.16 CATGTTGGTCGCGCCGATCTCATCAGTAATGACTTATATATAATACATACATTGACCTATAAAATGACAATAATTTCTTAAATCTACAACCAATGTAACAG:1 - chr2L 8959897 3' - Ivk 5091 1 61.39 TTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTGAAGTGAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATATT:1 - chr2R 21712762 3' - I-element 248 1 57.43 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCCATTGCCAGCAGACCTTGTTGGTAAAAGAGTCTAGGCTGTGTTATTTGCTGACCACCTCCATC:1 + chr2L 7459646 3' + BS 5085 1 62.38 AATAACAACACATAATAAAAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTCTCCTTCTTCTTCTTTTTTCCTTCTCGTCTCGTGTCGTCTCGTCTTT:1 - chr3R 27140401 3' + hopper 1125 1 71.29 CGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAATATAATTCAATGAGGTTCAATTGATTATTTTCTTAATTTTACTTCTTTTAAAATTCCCAAATCGTTCTTTCCA:1 + chr3L 7808516 3' - jockey 10 1 64.36 GCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGTAAATAAGTACAAAATTCATTTGTCG:1 + chr2L 8740940 3' + Burdock 6349 2 72.28 CTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAGCTGCGGGAGCAGAATAAGATTCTC:1 + chr3R 5676360 3' - INE-1 167 1 74.26 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTCACCTCCTT:1 - chr3R 10457258 3' + roo 9054 2 61.39 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCG:1 - chr2R 12185346 3' + accord 493 2 72.00 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACATTAATTTAACCTTCTTGAAAATTCTTGA:2 + chr3R 12571527 3' + roo 9026 1 74.26 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTAGACTTTTGTTGCCCACAAATCAAAGC:1 - chrX 4488850 3' + 412 7534 2 65.66 GCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAAAGGAATATTGTATTAGCTTTAAGAATCAGAAACAAATAAAACATTCATTCA:1 - chr2R 5039404 3' + gypsy11 4263 2 78.22 ACAACTTAGCAGTGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATGTTATAAACAATAAACAAAAATGTAAACTACTGCAAATCGGTGAAAACCAAACAATGT:1 + chr3L 8398538 3' - Tc1-2 1444 1 54.46 TATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATGTTTTTTGTGAATGTGTGTTGGGCTTGAAGGTCAAACTTAAAAAGTTAAAAATAAAATGAAGTCAAGTGG:1 + chr2L 7666885 3' - P-element 2834 1 77.23 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTATGACTCGAATGCCTGAATTGAAACCTTAAATAAATCTCTTTGAAAAGGGATTTTAAGTCAGAAAATGT:1 - chr3L 10698616 3' - roo 8669 2 62.38 AGAGCCTCGAGCCACCTCTAGAGACACGGCGAAAAAATCGAAATTGCGGAGAGATCCTGATGAGCTGCTACTATGTGATGATGCCAACTTAAAAATACA:1 + chr2R 13671367 3' - 1360 70 1 67.68 AAACGNATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCC:1 - chr3R 14049347 3' - transib2 1 1 68.57 ATTTTTATTACTTACTCTGGCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAAAGTGAAAGTGGCTGGAGCGAAGAGAAATGGAAAGAGACGGAGGATACAGTCGCAA:1 - chr3L 1518850 3' + Gypsy6A_LTR 235 1 55.45 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCAT:1 + chr3R 12136334 3' + roo 9033 1 60.40 TATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAATTATATAAAAATGGCCAT:1 + chr3L 19951297 3' + Ivk 5373 1 79.21 CTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAACAT:1 - chr3L 3944706 3' - jockey 4781 1 47.52 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCACCATTTTTACTTTTATAGTTCTTTTACTTTTTGTCGGCGAACAGAGCAGATGTAAAA:1 - chr3L 833346 3' + P-element 2870 1 60.40 GTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAAAAAG:1 - chr3R 9254920 3' - F-element 225 1 56.44 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACTTGCCCTAATCTGCATAATAA:1 - chr3R 18960395 3' + hopper 1413 2 75.25 TGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGAGTACTCTCATCGGCTGAGAATATT:1 + chr2L 17517131 3' + R1A1-element 5230 1 75.25 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTTTGGATCGGCCTAGAGAGGGCTGCGTGAGTCGTGATCGCGGCAGTCGTGA:1 + chr2R 16366834 3' - hobo 33 1 50.50 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTGCGTTTTTACGAAGCAATTGTGCCTGCATTCGGTGTAAAAA:1 - chr3R 31812672 3' + P-element 2864 1 58.42 ACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTTTTTGTGTTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTG:1 - chr3L 23933639 3' + Cr1a 181 1 69.31 GGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCGCTGGTTTTCTTGATTTAGACTCTTGTTTCGGCCGGATTTCTCTTTATGGCCAAAA:1 - chrX 17064676 3' - Tirant 63 2 66.67 ATCCANGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGTTATCCCGTGAAATCTCCTGGTACTCGCACTCCAGGGTGGCATTGCCCTTCCTGTTCATAAT:1 + chr2L 20071894 3' + R1A1-element 4960 1 69.31 AACATAATAACGTGCAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGTAATGCAAGTACTCGACTTGAATGCCACCTGTGAGTTAA:1 + chrX 7562580 3' - accord2 7280 1 54.22 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAA:1 - chr3R 14049336 3' + transib2 2803 2 58.42 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCAAGCCTGGCATAGATCATGCTGGTTCTCCAGATTGTTTGGTCGATTGAATTGGCT:1 - chr2R 18601802 3' + Transpac 5210 2 61.39 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAA:1 - chr2L 326137 3' + roo 9034 1 60.40 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGTTGTCTACTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGC:1 - chrX 3464213 3' - Max-element 8271 2 64.52 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGGAAGATTTCCCAAGTGCCGAA:1 - chr2R 17127660 3' + roo 385 2 56.99 CTGAGCCAACTGGTCTAGCTCGTTGGCCCGTGTTAACTTACAGGTCCCGTACTCGTTCCCGTACTAGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCGGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Gypsy6A_LTR 17 1 66.34 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATATGGGTCGCTTT:1 + chr3R 25702241 3' + Tirant 354 2 71.29 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATCGTTAAATATTTTGCCCCAAAGGATCGTTTAAAATATGGTCATCTTCGTTGCCCCTGGCTGTTGGCCA:1 + chr2L 12263557 3' + P-element 2826 1 75.26 AATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACGGCAAGACCGTAAAAGTCAACTAAAGTACG:1 + chr2L 11065923 3' - P-element 44 1 35.64 TTATTTGAAAATAGATTAGAAATGCCACACCTCTAACCCAGTGCACTTGCTCTGTCTGCTCCGCTGGGCAATCAAACTAATCGCCAATTCATATTACTAT:1 + chrX 11693152 3' + 1360 322 1 81.00 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCT:1 + chr2L 108072 3' - P-element 22 1 58.42 GTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTAT:3 + chr3L 5015877 3' - I-element 4946 1 51.49 AGGCACTTGTCGTTTGACAACCGAGCTTCCCGTTAATAAACAATCCATCCACTCTTAGTTTCAGTTCGGCGTTCGGTTCGCTTCTTCGGCGCCTACTCCTC:1 - chr3L 1144990 3' + Circe 285 1 65.35 TATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAATTTACTTATTAGTTGACTTATTTCTGGCCAGAAATAAGTCACGATAATTGAT:1 - chr3L 9672871 3' - mdg1 131 2 68.32 ATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTGTTTGTGTTTGCC:1 + chrX 12546498 3' - P-element 33 1 46.53 AACATAAATACATACATATAGTATGTACATATGTTTCGAAGGAGCAACTAATCCGATAAACAATATTATACGGACCCTGCCTAAATCACCAAATGCGATTA:1 + chrX 19383951 3' - 1731 4410 1 66.34 CTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCGTATGTTTGGTGTGACGGCTGAATAAC:1 + chr2L 19078271 3' - Transpac 4964 2 79.21 CTCCGATGGTGGCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCCATGGTGATGATGTGATCCGCTCCAGCAACGG:1 + chr3L 9686399 3' - R1A1-element 355 1 74.49 CATCGTAAATCTCCAAGTGGATTTATCACCCTCTTCCCCTGTAAGAGAGACACCATCAGCCAACCAACAGCAGCCTTGAAGTGACCCTCACGTTCATTCAC:1 - chr3R 31966385 3' + gypsy3 275 2 64.36 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCGGCGCATCGGCTGTTTTCTGTTTTGTTTTTGTTTTGGATCTGAAGCCACAGTG:1 - 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P-element 289 1 66.34 GCGGGCTTCATAGGCGGAGGGGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTT:1 + chr2R 12185398 3' - accord 36 2 60.40 AAATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGT:1 + chr2R 14793489 3' + Dm88 7 2 77.23 TTTTTAATACATAATTAGATCATGTTAACACTAAAATTTATTCGAGTTATTTTACAATATATTTATTTTCTCGTTTCAAGCAGCGGGCATATCTCATATAA:1 + chr2L 12773543 3' + Cr1a 4277 1 76.24 TTCTTGATGACGATCAATAGCCGAGTCGATCTGCTGGCCATGAACGCAGGTGAAGTAGCCGCGGCAGTTGTCCGCATCCCGGGCCAGTTGTCCGTGCTTTC:1 - chr3L 11983349 3' + INE-1 87 1 76.24 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACATACACACACA:1 - chrX 10730622 3' + P-element 2869 1 64.36 TCATAGCCATTTAATTATAACCATTATTTTGCGATGTTTATGCCTTTATTGATGTTATGCCAAGACAGCAAAGGAATCGGTTGCCCATCCTGCTGGCCTTG:1 - chrX 7105826 3' - R2-element 3431 1 70.30 ATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAACGTACAAGAATACAAATGAAAAAAAAAAGATATAATATT:1 + chr3R 8854787 3' - 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transib3 47 1 58.42 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGGTGGCTGTCCGCACGGCTGGCCGG:1 + chr2R 19857414 3' - 297 6593 2 54.64 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGCCGTACTTTACCTCAATTTCTTGGCCAGAGTTTGCTGCGT:1 + chrX 7787315 3' - roo 15 2 64.36 GGCATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chrX 3538815 3' - Bari1 1353 1 68.32 GGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGAACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAG:1 - chr2R 6984342 3' - HMS-Beagle2 6932 2 73.00 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGACCCCGCCCACTCGACAAGGCCACATACTCCAGTTCAGGCATTTCT:1 - chr3R 9522293 3' - hopper 27 1 51.49 ATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATG:1 - chr3R 27080715 3' + HMS-Beagle 203 2 53.47 GGTGTGAGAGGCAGGCCGCCCCTTACACCAGTGCGGGAGGCCTGAGGGGCTTGGTCCTTGAACTCACTCATTTCACTCACACGTGAAATCGCAAATAA:1 + chrX 14356052 3' + blood 495 1 59.18 TCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTACAGCATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTTTTTTGTT:1 - chr2L 16082608 3' + Stalker 378 4 54.46 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTAACGCAGTTGT:1 + chrX 21668961 3' + pogo 2082 1 58.42 AATCTTTTAACGGATTGACCACTCCAGATCCCCCTCCAGTTCAGGGTGGCAGAATGGAATTCAATGTCACCTGCGGCAAGGAGACAACTATTTCGGAAGT:1 - chr3L 3204339 3' - R2-element 3209 1 77.00 CGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAAC:1 - chrX 16798201 3' - diver 5917 2 51.49 GTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGATCGCGATGGTCGAAAGATCGATTCGACTCATTTTCATC:1 - chr2L 21978069 3' + roo 9065 1 71.29 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCATAC:1 + chr3L 10698718 3' + roo 9046 1 54.46 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAA:1 - chrX 4041532 3' + hopper 1362 1 76.24 GAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATAAATTCTAGACTAAAAAAGTAAGGAGCTATTATGTTATATTTAT:1 - chr2R 12213894 3' - Transpac 5 2 75.25 TTACTTTATTTCTATATTATATCTATACTTACCTTCTTTCAACACGTAATGATTCTTAGCGACATATTCATGGTTGATTATTTCTCCATTAGCTGTCCCAT:1 + chr3L 4001003 3' + accord2 440 1 51.49 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATAAAAATTCCCAAATCAAATTAAACAATCGATTTTCTTGTAAGAAGCA:1 - chr3R 14688239 3' + pogo 2074 1 55.45 ACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAACACATCAAGCACACAAC:1 - chr2L 4189395 3' - 1360 57 1 80.20 AGAGGAAAACACTCAAAACTAGAATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGACGATAATAAAACCAATATGAACACAACTATCGACCAGATCTCTTACTTA:1 + chr3R 24128197 3' + Porto1 4200 1 72.28 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGACGTATGAGTGACTTTTATGT:1 - chr2L 17210084 3' - jockey 4699 1 51.49 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAAAAGACCATACAA:1 - chr3L 21735359 3' - Doc 5 1 77.23 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGCCGTACTTTAC:2 + chrX 7787286 3' - roo 44 2 71.29 AGAAGAGATCAGTCAGTCAGTTTTCGGTGCTTCTATGCGTCTAATTAACTTAAAATTGATTTGCATAAGTGCAAAAATTCATGATGCCCAAATGGCCAAGC:1 - chr3L 14868374 3' + invader1 292 2 80.20 TTATTTTTTTTTTTAACTTTACTTACATTTAAAAGTCCCTAAAA:1 - chr2R 12643781 3' - TAHRE 10439 1 81.82 ACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAATAGATAAAAAT:1 + chr3R 10971956 3' - BS 5021 1 52.48 ATGGGGAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCTTTTCAGGAATATTAAAAAG:1 - chr2L 13566953 3' - FB 57 1 76.24 AAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAATTACAAGTTGATTTCCCAGACCTCCCTGAACCATAATCACGGGTGGCGGCACCTTGCCGCACGATGGGAAG:1 + chrX 15707757 3' + Ivk 252 1 59.41 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTTGTTTGGAAG:1 + chrX 14796927 3' + transib2 2799 1 54.46 CATACATATGTATATGTATATGTACATGTATGTATGTACTTATATATGTTATATAAAAAAATGGAGAAGTACCAAAGCGCACACACAAAACGTCTTGCGAA:1 + chrX 17125491 3' + Stalker2 251 2 66.34 TGGCGGTTTTATTTATAAACAATGTGTTAATCACTTCCCATGAATTATTCAATAAATTTCGCATAAAAAAGCAGCGACA:1 - chr3L 4048440 3' + 3S18 341 1 73.42 GTTTGTGGAAGTTAGAGAGGGCGTGGCAACATGGGTCAACATTGCGCCCACGATATACAACTCGGACGCGGACAACGAGCTCCGTCGTCAGGTAGAGGAAA:1 + chr3R 5673988 3' - INE-1 218 1 56.44 CCATGNCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCACATTAAATCAATGTCAGAAATGG:1 + chr3R 19449255 3' - roo 100 2 75.25 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTT:1 - chr3R 14639362 3' - roo 8717 2 76.24 AAATGTTATAAAATGAAAAGAACAAAAAGTCAACTAAAAATTAAAATGAAGCTAAGCAGCAGCTGCAGCAGTTTGCATAGCCGGGATTCTATCGCCATTCG:1 + chr2L 13052513 3' - Tc1-2 1405 1 67.33 GGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAGATGGACTTAATACACCAAGCAGACAAGATCTGATTTATTAACCCAT:1 - chr2L 10118857 3' - hobo 2709 1 76.29 GGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTAAGTATGATTAAGTATGTTGAGTAAGGTCAAGCAGGTACGTTGGAGGGGCCTTGTTAATAACCGTTTA:1 + chr3L 7250936 3' - G2 2980 1 70.30 TTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACT:1 + chr3L 18009616 3' + roo 364 1 72.28 CATTTTTTTTTTATTTTCTTTTAAAAAAA:1 + chr3L 6904723 3' + hopper 142 2 89.66 ATTTCGTCTTTAACAAGTGGAAGCGCACTCAGTTCCATTTCGATACCATCGATGACGCATGGGGAGACCGATATCTTATCGAATACTTTTACTGTTTTGGG:1 - 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Cr1a 4385 1 59.18 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCC:1 + chr2R 19936700 3' + roo 393 1 66.34 CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACACTTTTGGGCAGACAAAATCACTGATTGTATT:1 - chrX 17204094 3' + Tabor 7281 2 64.36 CAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAAGATATATGCACGCGGAAAGGGTCGACTGCG:1 - chrX 5864831 3' - G2 2919 1 67.02 ATCGTGTAGAATCGTTCCCTTCAGATGCGAGATGACAACGGCGACGACGAAAGGCCTCATCGGAAATGTTGCTCTATGCAGCCTTATCAGCTGGCATTCCT:1 - chr2L 517853 3' + 3S18 464 1 77.23 TTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCAGTATGGATGGGAACTGCGTCA:1 - chr3R 19076139 3' + roo 9044 1 57.43 CTATANATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGGAAACAATCAGGTACCGAAAATGTGAACTC:1 - chr2L 8740892 3' - Burdock 6180 2 69.31 GACACTGGACCAAAGACACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGATAAAAACTGAAACCTTCAATT:1 - chr3L 3031033 3' - hobo 345 1 79.21 GAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATTGACCGACCGCCTTGCCGATGTTTCGATTACGCGCCTCAAGTGGCAATCAGGCTGCATCCGCGTCTGC:1 + chr3R 27374892 3' + mdg1 7454 2 73.27 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAA:2 + chr3R 15998131 3' + pogo 2058 1 71.29 AATAGCGTCTCTTTCGCTTTCAATTTATTTATTTATTTTATGATATTAACTATTTACTTCATTAATTATTATTATTATTATTATCATTATAC:1 + chr2R 1247765 3' - Doc3-element 101 1 64.13 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCAT:1 - chr3L 543439 3' + P-element 2830 1 22.77 TACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATGACAACAACTCTAAGCATTTGGAGGTGCGGGAACGTGGATCGGGCGTTTATGT:1 + chr3L 11796486 3' + I-element 229 1 59.41 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCGATGCTCACAAAGTAGAGATCGCGTTCGTTGATATGCACAGAGTAG:1 + chrY 311463 3' + 1360 3387 2 67.33 GCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCATCTCATTAAAGCACACAAATTATAATTATTGAAAG:1 + chr2L 11551414 3' - Max-element 23 2 54.46 TATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATTAAATCTTCGTTTTAGTTCTTCAATGATTTTTATTTGTAGCATACTCCGCATCACCTGGCACTGCACTTTT:1 - chrX 3913266 3' + roo 8725 2 60.40 AGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCATGTATAATTTTTATCACCTTTAATTAACTTTTCAATTAATAAAAAAAACGTAGCAACAACATCGCCAAACATG:1 - chrX 17802289 3' - F-element 413 1 76.24 TCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAACACATCAAGCACACAACTATAACTACTCTATCTATATATAACTACATACATACTGCGATTATGTATTTAACTA:1 - chr2L 4189339 3' - 1360 1 2 79.21 CTGGAGTTGACCAGCAGGAGAAGGTTACCATCACGAATACGATACGATGGTATCACCGGGGTACAATAGCTTAACGATTATTATATTGTTAAATTTAAGTG:1 + chr2R 558847 3' - Ivk 460 1 71.29 TAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTTAAGGAAAGAGATAAGCAGTCTTATAG:1 - chr3R 7181478 3' - mdg3 86 2 78.22 TGGGAGAGCATTGCTCTTGGATTCTTAAGTGGAGGAGAAGCCTCAGAGAGAGCAGGCAGACTTTAAGAGTTGCGAGTGTGATGCGGACATTTGGGCCATTG:1 + chr3R 12757672 3' - 17.6 261 2 67.33 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGCACGGCAGCA:1 - chr3R 13715057 3' - P-element 5 2 73.74 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCAT:1 + chr3L 18009633 3' + roo 9044 1 59.41 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCA:1 + chr2R 24493729 3' + flea 215 2 68.32 ATTAANATTATATATTATTAAAATAAAATATAAATACAAAACTTTTCAATTTGTGAAAAAAAACCGCACTTAACTTATATCATAATTAATTTGGAAGGTCT:1 + chr2R 16749740 3' - Tc3 252 1 57.43 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 7370 2 67.69 ATATGCTCACTTGTGGAGGTATAGGGCATCCCCAATAACGCTGCCTTGAAACTCCCCAATCGTGCAAACGATAGTTTATTGTTTTTTTGCCTATTTTTTTT:1 + chrX 12723511 3' + R1A1-element 5257 1 23.76 CAGCCNGACTGCAACTAAGTCGCGAAATATGACTCCTGCATTCCAGCACCAGCCATTTGTTTGCTCCGCTTAATGCCCATATAATCAAATTGAATTGAATT:1 + chrX 13627156 3' + gypsy4 66 2 51.49 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAACA:1 + chrX 12294773 3' - blood 7030 2 60.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGACCCATTTCACCACTTGATCGTATTTAAAAATCATGGTGGGGTTCAAGAACTGATAA:1 - chr2R 4502417 3' + roo 391 2 60.61 CAACAGATCAATGCGAACTAATTAAATGTGATGTCTAAATACTTTTGTCACCGCCCAAATCGTTGTCTGTCTAATTGTGCACGCCACAGCTGGCCCCCTTC:1 + chr3L 14161880 3' - Tc1-2 233 1 73.27 AATTACATAATAAAATAGCAATATACAAGGCGATAATAAAACCAATATGGACGTATGGAACGGAATTTTGCGAAATTCCTCTAGCTATAAATGTATGCATA:1 + chrX 11620851 3' + Porto1 4222 1 74.26 ACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTTTTTTATGCGTATAAATATAAACATACTTTTGGTTTTCACCCCCCCAAAAAAAAAGCTGCTTGAAGAAACAAA:1 + chr2R 20702191 3' - Doc 7 1 73.27 ATATTTTCAATATATTTTTTTGAAACTTAACATAGCATTTAAATGTTCAAAACTTTGGGTTTCTTTGTTGCCGTTTGATGCAAGGATCACAAAAAAAGCTA:1 + chrX 8015443 3' - Tc1-2 1593 1 71.29 TCCACGAGCGCAACGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTGACAGTAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACT:1 - chr3L 23112568 3' - R1A1-element 6 1 62.38 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCGTGGAGCTCTCTT:1 - chr2L 13060254 3' - P-element 19 1 60.00 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGCAAATAATTGACTCTTTGTTGCCCGAATTTATACGACCAAGTCT:1 - chr3R 15998048 3' - pogo 7 1 71.43 ACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTGTTGTTAGCCAGCATGTAGTGTGCGGTATGTAGGTCAGTAAGCAGCGC:1 - chr3R 7191020 3' - F-element 4212 1 56.44 TGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAGCACAATGGAAAGTTTCTCAAGCTGGCCCCGAAATACCA:1 - chr3R 19114163 3' - 297 1 2 79.21 TTTTGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCATCTGTCCGTATGAACGTATGAACGTCAAGATCTTAGGAACTATAATATCTAGAATGTTA:1 + chr2L 9871635 3' + INE-1 88 1 72.28 AACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTAGAGGAAAATTAGCAGTTCACCGAACACAAATTAGGTCAAAAACTAGAG:1 + chr3L 5016630 3' + I-element 4965 1 54.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGG:1 - chr2R 17127680 3' + roo 356 2 79.21 TTAACNGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTACATGTGATTCTAAATACAATTTATCGTAAGGATAAACTTTTTGATTGTTTGTTGAGATAGTTAG:1 + chr3R 14324283 3' + 3S18 328 2 66.34 TAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCATGTTCATATGTAAATTTAATAGCAAA:1 - chr3L 9694899 3' - P-element 451 1 31.68 ACTCGAACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGG:1 + chr3L 10811188 3' + P-element 2834 1 28.00 ATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGATTATTTGTCCAC:1 - chrX 22726188 3' + Helena 1280 1 54.46 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTG:1 - chrX 4796959 3' + copia 214 2 68.00 AAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGTGACTGGTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTAATAAAATGTGAAAGAATATCAACACATTTATCAAAAGTGTG:1 - chr2R 5212079 3' - INE-1 255 1 68.32 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTATTCCCTATTCTCTAAATGTCCAAA:1 - chr3R 22620184 3' - 297 20 2 60.40 TTTTANACTTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCGATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAGGATTAACTAAAGATAAAAAAATCACTATTGAG:1 + chrX 21396712 3' + F-element 4631 1 75.25 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTTATTGG:1 + chr2L 326227 3' - roo 8669 2 73.27 TTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCTTGTTACATATATATAAAGTCGTTCGACTGATTCGATTAGTCCTCACAACGGGACTACAGACTCCCAGAC:1 + chrX 3629584 3' - flea 4769 2 65.62 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCA:1 - chr2L 1626543 3' + roo 9030 1 64.36 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCAATTCATTTTCGAGAGTTTCTCTTCTCTCTTAGCTCTGCTTCCTCT:1 - chr3L 543386 3' - P-element 4 2 75.25 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTGC:1 - chr2L 20118668 3' - Max-element 8243 2 70.71 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCGTGTACTCGATTG:1 - 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mdg1 32 2 55.45 TTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTA:1 - chr3R 7993885 3' - Doc 56 1 74.26 AATTAACGGGTATCTGATAGTCTCGCTCCCTCTCTCGCCGTCTGCTCTTTGTCTTTTGTTGCTGCACTGTTTTTTTTTATTTCACTTTTCTTTCGACTTCT:1 - chr3L 16410372 3' + INE-1 549 1 80.20 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGAGCAGGCGAGATG:1 - chr3L 2800102 3' + blood 371 2 71.29 CCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCT:1 + chr3R 15943325 3' - jockey 4680 1 64.36 AAATTTTCGAAAATCAAAAATTTCGCTTTTTTCAAATTTGATGATCAGATCGTTTGACACTTTCCACTGGTTTACTGCGCTTTCTAACGTGGGTTTCCCCC:1 + chr3R 14744319 3' + FB 148 1 72.28 TTTATTTTTTTTTTCATTTTTACTATAGTTTTATCCATTTCATTTTCCGAGTGTTAATTTACATCTTTTGTAATTACCAGCCTTTGTTATCCGATTTTGCC:1 - chr3R 6533907 3' - Doc 4696 1 67.33 TTAACTCTACTTAACAAATTACCATGCCTTTCCCTAGTATTATGTATGTGTTTTTTGTTTTTCGGGTTTCCCGCTGCGGCCGCAGGTCATTTATTATGTTG:1 + chr2L 14540418 3' - Stalker3T 50 1 79.21 TATTGTGACTGATCTAGAGTACAATGTTACTGCACGCAAGCAGCCAAATTACACAACGAAAACATCAAACGCAGGGTGGTGTTTACTTTCCTCGATTTGTC:1 - chr3L 2697002 3' - Dm88 160 2 52.48 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAACTTACGATTTCTAATCGGTCGTTTGCCTCCGAAAAAAATAT:1 + chr2R 9272942 3' - FB 34 1 64.36 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCGTGAGCCAACAGGAGGTTATAAATGGG:1 + chr2L 7548073 3' + blood 353 2 54.00 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGT:1 - chr3L 12452156 3' - 412 7095 2 68.37 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATTGCAATTAAACAGGCACCACCCACTTCCA:1 + chrX 12538533 3' - roo 8684 2 59.41 CCGAAACAGTTAACTTCCCGACATATGCATGTGTATATTTTGTATAAATGGGGAAAATAATAACAATAACATGAAATGATGTATGGACTATGTGGACTAAC:1 - chrX 11533884 3' + invader6 4863 2 77.23 AAAGTACTCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATACATATATACAATACAAATAATGAAACCCCAAGTTGTGTTTTTAAAAACGTTATCTATA:1 - chr3L 9858238 3' + pogo 2089 1 65.35 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTG:1 + chr2L 16686602 3' - pogo 39 1 72.28 TATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGCCAAGTAAAAGCAACCTTAAAAAG:1 + chr2L 6254539 3' + flea 4964 2 75.25 GTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCATCCGCACCACAGCAGCAATAACAATA:1 + chr2L 7282644 3' - P-element 116 1 48.51 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTACAGCTCAAATAAAAATAAATAACCGATATGCTGACAA:1 + chr2L 17447680 3' - FB 20 1 55.95 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCCATCTAGC:1 - chr3R 19657426 3' + roo 400 1 70.30 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGTTGCGTCGAAGAACTCCCACGTGTTTTTCG:2 + chr3R 11165720 3' + Tabor 466 2 62.38 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACAT:1 + chr2L 14490444 3' + P-element 2845 1 37.62 ATTGTGAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGG:1 - chr3R 14639328 3' - roo 19 2 60.40 TTTTCCCTTTTTTGTTTTTTTTTTTAACTGCGGCGCTTGCCA:1 + chr3L 1460380 3' - Bica 337 1 64.29 GGCTGCAAAGAAAAGCCGCGGCAACAATAAACCCTTATCGCCGTGCACTCATAAATTGCAACGGAACAAGAAGGTAAACAAACAACCAGGATGGGACATGG:1 - chr3R 28580653 3' + HeT-A 151 1 74.26 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTT:1 + chrX 13134955 3' - jockey 4826 1 76.24 GCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGCACGTCAAATAGCATTGGCTACAAATCGGAGGGTCTAAGAGGCATACAAAGTCACAAGGGAAATGCTTGCCCCAAA:1 - chr2L 10119064 3' - hobo 2704 1 62.38 GACTAAAGCATTCTCTCTTGTTGCTCCTCAAAACTGCCACGTGTTTTGGTAAAGCTAGCTTCCATCTACGTTTATTGTTAATACAAATATTTGTTTTGTTG:1 + chrX 14817860 3' + INE-1 580 1 69.31 AACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCGCGATCTTCACTCAAGAAAAC:1 + chr3R 25633384 3' + Tirant 348 2 78.22 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGC:1 + chr2R 5485125 3' + 1360 3350 1 66.67 CCGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAACTGTCTCCGTACCTCCACCAGCAAAATTAAAAAAAGTAAAAAAGTGATGAATCAAACACTGGCACTGTGCGAAAA:1 + chrX 14742023 3' + HeT-A 6056 2 59.41 ACTATNGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTAATGTCAAGTAACCTGGACGCACAACGTAAGCTCTTGTAGAATTATGATTCCCATATACAGCC:1 + chr3R 25440250 3' - pogo 9 1 71.29 TCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCGAGTT:1 + chr3L 13194813 3' + 297 347 2 76.24 TATGTCTATGTATGTTTATTATTCCTTCAGTTTGGCATTGTTGAAACTGTACTAATATTTTTAAAATTAAAGTTAAAATATTTACTAAAACCTTTCCCC:1 - chr2L 10870660 3' - FB 1083 1 66.67 ACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCACAACTTCATGTTGTCACAGCCAGGGTTATCCCCTGCGGGCAGCCACTTTGCCGCGCGC:1 + chr3R 29721986 3' - flea 4708 1 62.38 TAAATCGTTTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCCTGGCTTTCGGTCGGCCACTTGGCCACTTGGCCCGGCTCATGTGATTTACCGGGCCTCTGCT:1 - chr2L 16441670 3' + R2-element 3356 1 71.29 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGACCGCCTTCATTACTTTGCCCAAGCCATCAGGATCCTTTGCCCTCG:1 - chr3R 27374794 3' - mdg1 30 2 55.45 GAGGGAAACTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCGAACCACCCGAGAATTGAGATCGTTGCAGTGCAGATTTTTGTACTGCGCCAGGGGCTGGT:1 - chr2L 6040032 3' + HB 33 1 67.00 AGAAGTTTAATGTGTTATGTTCACTTGCTCTTACATCCACATCTGCAATTTTTGTTAGTTCTAGGAGTTTTTTTTGCTTGAAATCTTTGAAGCGTAGCGCG:1 + chr3R 23225837 3' - I-element 466 1 79.21 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAGTTAATCCTTGAATGCCAATTAGTAATCCAAAGGATCTTCATCCAT:2 - chrX 21396664 3' - F-element 42 1 56.44 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCAGAAT:1 - chrX 4890021 3' - 297 15 2 65.35 TATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTGAAATTGCTGCGAA:1 + chr3R 25818908 3' - mdg1 13 2 66.34 GAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTGAAGGGTAGTGCCATGTGCTACACATTAAAAACGCATAAAAATCGGCCAAATAAAACACTA:1 - chr3L 18127113 3' - BS 4814 1 53.47 CAAAGNGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATAAATGGCATTT:1 - chr2R 12779073 3' + roo 396 1 64.00 TATATNTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAATGGCTTTGGGTCAACTGAAAAGCTCGCA:1 + chr2L 1828824 3' + 412 445 2 70.30 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAAAAAAGACCTGGCATTGACAACCGAATAG:1 - chr3R 18507839 3' + jockey 4953 1 65.35 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACTTGTACAATCCACAAGCGTGGAAGTTATAAATTTTGTTTCCGGTTTGGGA:1 - chr3R 18934083 3' + hobo 2911 1 50.50 TTAGAGATTCCTCTGTAATTGCTTGCATCCAGTTATCCCCGCCTATATTTTGCCCGATCAACGACCTCTCCCACCCGCGCCCAAAATTCCGTGGGCCAGA:1 - chr2R 13997472 3' - Q-element 104 2 66.00 GACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGAC:1 - chr2R 20411861 3' + 297 6957 2 60.40 AAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAACTACTTTATTTTTGCTCTTAAATGTAATGTTACTTTACA:1 - chr3R 24281958 3' + Max-element 8496 2 62.38 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATAGAGATAATAAATTTGATGTTTTTACAAATAATTTTTAATGCAGTACGTGCAATTGTACAAATAGTTAGTTTTAA:1 - chrX 18012649 3' + roo 407 1 77.23 CCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGACGCACTTTACACTCGCAAATTGAATGAAGACATTTGCCAGCCAGACGAAAACATTGCCAGC:1 + chr3R 22887628 3' + 297 172 2 67.33 GGAGGCACCCATTGAGTCCATCAAAGAGCAAAGACATTTCCACATAGTTCACAACAATTCGCTCTTCCTGGCCTTTTCCATTGCTTTCCTTCTGGTACGCC:1 - chr3R 13965199 3' + hobo 2579 1 68.32 AATAATAATAATAATAATAATAATCGATGGATGCAGTCGTTTTCCTTTAATCTGAGAAGATCCTTTTCTTGACAAACAGTCGTGTTGCCGATAGATAGACA:1 + chr3L 24368144 3' + mdg1 7069 10 78.22 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACG:1 + chr2R 18503552 3' + roo 9039 1 59.00 TTTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTCGATTTCAATTTGCTTTAAGATTCTACCCTCGAATTTCTCTTTTCCCTTTGACCATTAATATCGAGC:1 + chr2R 9362506 3' - Doc 4687 1 73.27 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCAACCAAGTTGTGTTAACCAAAACTTTTACAGGCTTTTGTTAAAAAAAACGAGAGCGTAAACAGAAATCGGG:1 + chr3R 14691141 3' + pogo 2076 1 76.24 ATGAAGTATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAAAGTAAACACAATCTCCACTTGGAGACCAGTCAGCA:1 - chr2L 22921269 3' - copia 40 2 60.40 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATGCCGTAAAAACATTTACGGCCGGTAGACT:1 + chrX 19306835 3' + P-element 2872 1 66.34 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGTTAATTGTGTGCGGTGGTGAGAGAGAGAGAGAGCGGTGAAGACGGGGTCGTTCGACTCTCTTGCCT:1 + chr2L 2909638 3' - pogo 7 1 72.28 CACACACACACACACATATATAACGGAATATCCCCGTCAAGCTGGGCGACTTCAGCGTCATCGACACGGAGTTCAGCAACATCCGCGA:1 + chrX 19605565 3' + accord 186 4 70.45 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGTAGAAGGCATTGGTATGGTACTCAGCATAGGGTTGAAGGCCCCTGGGG:1 + chr3L 10811236 3' + P-element 2881 2 75.25 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAGCAGATCCATTTAGG:2 + chr2R 9454318 3' - opus 140 4 58.42 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTTATCTAACGACAAATCAAAAAGTTAGAACGATAGAGTGGTGTTTACACACAAACTACCGGAT:1 + chr4 311603 3' - 1360 15 1 64.36 CATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTTCACTTTATATAATGGACTTTCTTCTCATGTAACCTCCGATTTGAATGTATTAAATAG:1 - chr2L 84581 3' + BS 5005 1 62.38 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTT:1 + chr3L 6024601 3' + roo 9038 1 60.40 CAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAG:1 - chr3L 24131110 3' + HMS-Beagle2 7144 2 74.26 ATTGTAATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATGTTCTTTTTTCTCCAACTTCCAATTGAAACCATGTTAAAGTGTCTTAAGTTTCATTTGAA:1 - chr2R 17384000 3' - mdg1 7056 2 43.56 GTTACNCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCACTAT:1 - chr2R 5485044 3' + 1360 3380 2 70.30 AATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATTCCGAGCCCCTTGGGCTTGG:1 - chr2R 7154732 3' - jockey 4937 1 80.20 GATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACATCAAGGGGCAACAACAATGCGCA:1 - chr3L 11909915 3' - Tabor 6853 2 65.35 CTCTACAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGCGAGATT:1 - chr2R 4830338 3' - 1360 55 1 90.10 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCC:1 + chr2R 12779148 3' - roo 8708 2 70.30 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGAC:1 - chr3R 12767042 3' - 412 53 2 81.63 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGGCCATAAGGAATTCATTGTAAAGTTTTTTGCTTATTATTATAATGTCTGGTGGTCATATATATGGA:1 + chr2L 13245015 3' + P-element 2879 2 67.33 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCCATTGCTTTGCGGCGTTTT:1 + chrX 19457230 3' - roo 16 2 62.38 GCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACATTTT:1 - chr3L 22920390 3' - 1360 42 1 67.33 AAACAAAAAAACAAACAACAAAAAAATTTATAGTTAAGTCTTCTTTTTAAGTTCAGCTATTCTTACCGATTCTGTGTTGACTGAGGTACATTCTTAATGGA:1 + chr2L 7060845 3' + gypsy7 5013 3 77.23 ACTGGCAAAGCGATTATCCCCCAAATTGAGTGGCCTGGGGGACATGGTTAATAAATTTATTGTTTCAAATGGTGTGACATGTTGTGTGGGTTCTTCTCTTC:1 - chr3R 20002835 3' - Ivk 215 1 59.41 GTTTGTCCCAGGGATTCTCTATTTTCTGAAATAAAAAAATTATAATATTAGATATAGAGGACGCTGTCTCCTAATAGAAGTGAATGACTGCACACTAGCTC:1 + chr2L 10986214 3' - Tc1 1603 1 68.32 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAAC:1 + chr3R 7101060 3' - pogo 35 1 67.33 CCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAA:1 - chr3R 5505232 3' + mdg1 382 2 62.38 TGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGATGTTGCAGCATCCAAAATCTGCTGACGAACAAAGCG:2 + chrX 6458268 3' + blood 7386 2 75.25 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAACTATTGACACACGGAAATCAAGGTAGTAAAGTTCAAAAACCTGCCCGACCGAAACAGATATTGTGTTATT:1 - chr3R 16289210 3' + Burdock 236 2 74.26 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAG:2 - chr3R 23617997 3' - jockey 4810 1 74.26 AAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATTATATGTATATTTTTTAGGTATTTTTTTCTCATGTTTTTATATAAATATACCCGTTTTCGACACGA:1 - chr2L 12067311 3' + Quasimodo 7361 2 68.32 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCACCATTTTTACTTTTATAGTTCTTTTA:1 - chr3L 833377 3' + P-element 2840 1 32.00 GGCTGACTCAGCGTCGTCGATGTTGTTGTTGGGCTTTCAATCGTTAGATAAGAAAGATGATGACCAGGGTTATTGAGGCTGTGGAGGAGGCAGAGCAAATG:1 - chr2R 5161935 3' - gypsy10 75 2 73.27 ATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCCTTTCGCCGCTTTATCTGGCTTTAGAGGCTGAATCTCACATGCATTATCATTCGCTGAAT:1 - chr3R 19449317 3' - F-element 4537 1 66.67 ACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGTATTTATTTTGACTTGATGCCATGACATTCGTGGATTTGTCACTGTTTTTTTTTACGTTT:1 + chr3L 19938692 3' - Stalker 6808 2 63.37 AATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACATCAAGGGGCA:3 - chr3L 11909928 3' - Tabor 27 2 53.47 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGAC:1 + chr2L 3694145 3' + roo 360 2 78.22 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTAATGTCAAGTAACCTGGACGCACAACGTAAGCTCTTGTAGAATTAT:1 + chr3R 25440233 3' - pogo 24 1 55.56 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATG:3 - chr3L 19951212 3' - Ivk 44 1 68.32 AATAANATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGGTAGTCAATCCATCGAACTGTGCTCCTTGCATATATAC:1 + chr3R 10321088 3' + roo 9033 1 61.39 CACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGTGTTTAATATAGTATACGTATGGGACTGGAGAAAAAGTTATTATTCCCTCATAT:1 - chr3R 25819163 3' + mdg1 7343 2 54.46 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACGTACCCAGCC:1 - chr3R 25823628 3' + hopper 1402 1 62.38 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCGGGAATTGCTCTGTCCATATCGGAGCACTCTTATTCCACAACAGT:1 - chr2L 7723788 3' + P-element 2784 1 49.50 CTTTANTGAAATGTAGATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGG:1 + chr3L 3279789 3' + Juan 4177 1 61.39 GGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATGACGAGACCAAAAACTCAAACCA:1 + chr3L 22744687 3' - FB 54 1 82.18 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTT:1 - chrX 12538471 3' + roo 9051 2 64.79 GATACCCGTTACTCAGCTACTGGGATTAAAGTTTTTGAGTGAGTTTTGATTTTAATCACTAGCACCGACTGATAAAATGAGTACAACATATTCTGCCCCGA:1 + chr3L 11489480 3' - INE-1 541 1 70.30 GGTCTNTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGG:1 + chrX 15195308 3' + Transpac 291 2 61.39 ATAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCGTCGATCGCTTGAAATTGAACG:1 - chr2L 12074473 3' - Juan 4031 1 69.70 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGAAAATTGTTGTACACAGT:1 + chr3R 18906639 3' + P-element 2834 1 26.73 AGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCATTTTATCTGCTCGCTTTTTCCATGTGACT:1 + chrX 4154990 3' + blood 353 2 54.46 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGCGTATGGGAGGGAATGTG:2 - chr3L 958721 3' + P-element 2882 2 72.28 TAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCGAAAACTGCAAGCAGACGCATGCATGG:1 - chr2L 22083732 3' - HMS-Beagle2 14 2 45.00 GCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGTCTTCTGCAGATTGTTTTGCAGTGATTTAACTAGGTCTCTGGTTTCGGCTTCTTCA:1 + chr3L 27396505 3' + Stalker4 191 4 53.47 AGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTGGCCAAAAGTTGCCAACAGA:1 + chr2L 16082703 3' - Stalker 5 4 74.26 CAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTTTCCCTTCGTTGCGGCCCAGACTA:1 + chrX 21584651 3' - mariner2 254 1 41.58 CATTATGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGGATACATTTAATATTACACAAATCCGTCCGATTCTTGCACGATCCCATAA:1 - chr3L 12595691 3' - Quasimodo 157 2 57.43 GATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTGAGGCGGGGGTGGGGAGAAAGAAACCAGAAAAAACGGAATAG:1 - chr2R 15307920 3' - FB 36 1 58.42 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAAACAAAAAATTAAGTTAACAATTTTTTCGATATATTTATTTTCAAATTTA:1 - chr2R 16744112 3' + opus 478 2 56.00 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGGACACCCATGACAGAATTGGCTTATTCATAA:1 - chr3R 7849665 3' - 1360 45 1 73.27 AGTGCNTTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTAT:1 - chr3R 22620207 3' - 297 6624 2 72.28 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAATTAATGT:1 + chr2L 14490467 3' + P-element 2868 1 60.40 TATTATGTTCGTATATACTAAAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAA:1 + chr3R 29660288 3' - mdg1 7039 2 60.00 TTTGTTTATTAGAATGCATACTGCGCAGATGGCATACAGTATGGGCGTGTAAATTGTTCTCTGTAATGGGCGTGAATCTAACGGTTATGGGAACACAAAAT:1 - chr2R 6778415 3' - 17.6 155 2 56.44 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCATTGT:1 - chr3R 20466624 3' + roo 390 2 61.39 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACACCTCTATCGAAGAATCGCGGATG:1 + chrX 22354529 3' + roo 9019 2 79.21 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAA:1 + chr3L 8974123 3' + P-element 2829 1 21.78 ACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGGGCAAATAACGGATGGAAATCAAACTGTCACTGCAGATTCATATTTAT:1 + chr3R 19191576 3' - Doc 7 1 71.29 CATACAAATATTATCGAGAAATGATGGATTTTATCAATATTCAATAATTTATATTGATAAAATCCATCATTCCAGTGCACTAGACGGATTCCCCCAGCCCT:1 + chr3R 12377143 3' + mdg3 5361 2 47.52 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCGATAATCTAAGCGGGGGAGAACGGCAGAGC:1 - chr3R 8198461 3' - Tirant 8 2 72.28 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAG:1 + chr3L 17699367 3' - 412 7106 2 75.25 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCC:1 + chr2L 1626586 3' - roo 49 2 74.26 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAATTTTATTGTG:1 - chrX 7787230 3' + roo 9039 1 56.44 AAAAACAAAAAAAAAAACAACAACGACAACAGCTGAAAGCACACGGCAAAAAATTTTGAGTGGTTCTTAGACTCTTTAGAAGAAGTATATTTTACCAAC:1 - chr3L 6824022 3' + gypsy7 5011 2 73.74 TCTTCNTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCCATCTAGCGGCGGTTA:1 - chr3R 19657418 3' + roo 408 1 78.22 GTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAAGCAATTTATTGTTATTGCTTTCAACACCCAGCCACAACATTCC:1 - chr2L 8620269 3' - Juan 4062 1 55.00 AAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGGATTGGGATAAGTGCTTTGTTAATGGAGAAGGTGTGCCAAGTGGGCAGACCAGCTGTGGCTTGGC:1 - chr2L 9514841 3' - 297 6737 2 76.84 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAATGGCTTTCA:1 + chr3L 14910644 3' + roo 9044 1 57.43 ATATACACATTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAAGAAAAGAATGTTAATTCACCAATCAAAGAAAACATTTCACACATATTCTGCCTTCAGTTGTGTCCAT:1 + chr2L 21796221 3' - HB 105 1 70.30 CGTCGAAATCTCAGGAAATATAAAACCTAGAATGTTGTCATTTTTTGGCGTAGCGATATAATTTCGCAAAACATATAAAAAATTTTGGAGTCGTCAAA:1 - chr2R 5743859 3' + INE-1 144 1 69.39 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCGCGGCCCATGGTCCGAAAAGATAAGAAAGCTTGAAAAACAACCGAAAGTGTCGTTTAACATCGGAGAAAAG:1 + chr3R 31812772 3' - P-element 7 2 73.27 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTATGATTTAATTTGCCTTTTGCTTACAGTATTTAATTATAATTAATTTGCGTTTCTAGCCCATAGC:1 - chr3R 9369908 3' - roo 8673 2 70.30 GAGCGGGTTTTCCCGAGATTGGACTTAGCTAAATCGTTTAAGAGCACTAATGCAGGTTTTTAAATAGGAGGAACATATGAAAAAATACAAGTATTTAATCA:1 - chr3L 24039753 3' + R2-element 3327 1 67.33 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATAAAGAAAATGCACCGGG:1 + chr3L 2799617 3' + blood 7373 2 50.50 TTTTTTTTTTGTTTTTTTTTCGAGTTTCTCCCCTTTTCGGAATTTGTTTGCGGGTAAATGCAATTAAAAA:1 + chrX 4756149 3' - G2 3077 8 54.29 TAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATAAAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATG:1 + chr2R 6984381 3' + HMS-Beagle2 304 2 51.56 TCCGTCTACGCATCGGGCACACCCAATCCACACACATAGATAGAAGCATGAAAAGCACCGTTTTCTGCTTGCTGCATCGCCATTTTGAATGCAACTAAGAA:1 + chrX 6279082 3' + Ivk 5043 1 70.30 GGATGGGATGTTTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTGGCGTCGATGGTATTTATGGTGCTATGTGTGCCATGCCCTTTCTGCCCAGCCAGG:1 - chrX 19526828 3' - HMS-Beagle 6732 1 59.41 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATACAAGAATTCTCCTTTGACTATGTTAATATTGAATTTATATGCGTTTATACGTTTCTGCGCCATA:1 - chr3R 18881477 3' - roo 10 2 69.31 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTCT:1 - chr2R 9862193 3' + roo 394 1 59.41 GGATGCATTTTTTTGCATTATAAATTTCTGATTGAGAATGCATTTTCTTTTTATGCACTGTATCTAAAATTTTGGAAATTGCGGTAATTGTTTAAGTTATG:1 - chr3L 3218998 3' + P-element 2479 1 88.12 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAGGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAAACTTGTTTTC:1 + chr3R 13715172 3' + P-element 2879 2 69.31 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTT:1 + chrX 19095808 3' + roo 9041 1 57.00 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGAGGATTAGGTGGAGTGAGCCCCAATGGATAT:1 + chr2L 6227705 3' - roo 43 2 69.39 GCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACTGACTATATAAATAAAACCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTG:1 + chrX 23280901 3' + R2-element 3544 1 61.39 GTGGGCAATCGAAATTATTTAGTTTTAAGAGTGGACATGGCAATCTCACTAGAATGTGCTTGCTCAATCTCATCTTTCTAGCCTTTATATATCTCGAGATA:1 - chr2L 662097 3' - FB 918 3 72.28 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATT:1 - chrX 16798208 3' - diver 33 2 57.14 CTCGTGCCGTCTGGAGTTACATGCCTTCGACGATCACCCAGCTAGTTAACATACCCCACTCCGCATGTGAAAATGTTCTTTTTCAGCTCTCTCGGAAAATC:1 - chr2R 14030413 3' - gypsy10 186 2 56.44 TAATTATTTACTAAAATAAATAATTATTCCATATTGTTTGGCCTCTTTGATGAAACATGAAGTTTATTTAGTTAACAATGAAATATATACCCTATACTTGA:1 + chr2L 21317840 3' + Doc 145 1 68.32 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAA:2 - chr3L 5716897 3' + copia 204 2 81.19 TTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAGAATACGTAGCCAATCTTTTAGGGTTGTCAGCGAAAAGTCGTTCAGTTTATTTATATTTAGCGACAAATTAAATT:1 - chr3R 14295316 3' - mdg3 364 1 71.29 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGA:1 - chr3R 5505239 3' + mdg1 375 2 69.31 CCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCCCGACGAACGGCTGCAATGTCAAAGGATTTCCAACGAGTGAGAGGAG:1 - chr3L 13074763 3' + Quasimodo 230 2 58.33 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTGTGGCACTTAACTTAACATTGTTGGATGGCTTAGAAAGCTTTGCCTCTTGGCCAGGA:1 + chr3R 16510924 3' - flea 4770 2 66.34 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGAT:1 + chr3R 31458522 3' + jockey 4949 1 66.34 AAAAAAAAAAACAAAAAATTATAAAAAATGGTGGTAAACATTTTGTCGCCTTCGGATTTGATGCCTTCATTAGGAGCCAGAATAGAATAGACAGAAACTTT:1 + chr3L 13234896 3' - Tc3 86 3 78.22 GATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAATAAACTTTCAATTGAAACAAAATACGATCTATCTTCTGATCACCTACCTGTAGTAGCAACATTAA:1 + chr2L 20120187 3' + Juan 4207 1 64.36 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATCGGTTCTT:2 - chr2L 1626525 3' + roo 385 2 54.46 AGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCATACTTACTTGTGAATGTTTAACCGCTACCGCAAACTTTGTTGCAAACGTATGTTTTTATCAAACA:1 - chr2R 17443047 3' - S-element 7 2 72.28 ATATTCTTGATCAGGATCAATAGAACGTCGAGATCTCAGGAGCTACGAAAGGTAAAAAGTTGATATTCAGCAAGCGGGATACAGCTTTGGAAATTATAATC:1 - chr2L 37772 3' + INE-1 84 1 71.29 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGTTT:1 + chr2L 6252559 3' - P-element 36 1 41.24 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTT:1 - chr3L 15035135 3' + pogo 2065 1 70.30 AAAGTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGGAAGCTGGGGTAGGGGAAAAGGGAATACAAGAGCAGGGAGGGAAGTTGAAGATTTGGGG:1 + chr2L 15216554 3' + TAHRE 10441 1 70.53 GCGTTGTTCGCAGTGCTCTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAGCTGCACTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC:1 + chrX 12649914 3' + Cr1a 233 1 81.25 AAGATGACATGTTTATTAGAGATGGAACATAGAAAATAAAAATAAGACTAATAATGATGCGACACATACATATGTATATGGCTATTTTTGCTGCTTTTTTG:1 + chrX 11533973 3' - invader6 4535 2 67.33 CATCGGAGCAATGCCGATGGAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAATCTCGGCCAGCGGAAGCGGAAGCATAG:1 - chr3L 21140735 3' + R1A1-element 369 1 73.27 TTCAANTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATC:1 - chr2L 18112517 3' + transib2 2783 1 65.35 CGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAATTTACAGCTCAAATAAAAATAAATAACCGATATGCTGACAAATCGATGGAACTAGTTGCCAAAAGCTAT:1 + chr2L 17447708 3' - FB 9 1 70.30 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCATGACTTTGTTAGGGAAGAAACGCAGCC:1 + chr3L 4386513 3' - jockey 57 1 70.30 AAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTTGGAAGCCTCGCTTTGTTTGGCTTCTATCGTGTAGTTTGTTTTGTTTGAC:1 - chr2L 11067948 3' - P-element 242 1 58.42 ATATATAATAATATGTACCAAAAGTAATTTTATATAATCAAACATTCGATCAAAAGATGCCATTATGGCCAGGTTACAATTAAAATCCTGAACAAAAAGCC:1 - chr2L 15348474 3' + Dm88 30 2 72.28 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAATTAAATCTTTCTTTCTTTTC:1 - chrX 14713192 3' + flea 4995 2 64.00 GTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTGTGTGTGTGTGGCAGGCAGGCAGTGCCATCATCATGGTTTCAATGGTCGTCCAAGAGCCTAGCTCAT:1 + chr2R 10579360 3' - Tirant 345 2 71.29 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTCGATTAAATTTTGGTTTTTAATTTTAGTTTAATGTTCTCTGGGTTGAAACGCTT:1 + chr2R 13145038 3' - roo 23 2 54.46 TAATAAAGTACAAAAAAAAAAACGGAAAAAGTAAAAAAAATTGTTGCGTTTATTTATTTATTTATTTTTTTTCGTTACATGTGTAACAAAGTTTTGCATT:1 + chr2L 19652159 3' + BS3 1768 1 67.00 TCAACNAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTTGTTTTTACAACATCTATT:1 + chrX 19095826 3' + roo 395 1 63.37 TAGCAACAATACCAGCCCGGGCCTCAACTGTTAACTCTTACGTTGGCTCCTTGACTCAAGCTATGAAGGACCTGACCTTTTGGGTTACCATGTTGATCACG:1 - chr3R 12070235 3' - Bari1 409 1 64.36 CACTGNATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGAAATTT:1 - chr2L 8542861 3' - P-element 49 1 28.00 AGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTGTTGCTTATCGGGCGCTATAAATCTTGATAC:1 + chr2L 6236674 3' + BS 4997 1 72.28 AAAAAAAGAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAGGAGCGGAAAAAAAAAAAGAAAACCCCTGCCC:1 - chrX 6502028 3' + Doc2-element 243 7 86.67 ATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACG:2 - chr2R 6984317 3' - HMS-Beagle2 6908 2 54.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGC:1 - chr2L 6227670 3' + roo 9020 2 75.25 TGTTTNCCGGCTATGCACGGGCTTCCGGCCAGACGCTGTGTCGCCCGGTGGACAGAGACGGAGCGTAACACTTACAATTTGTAATGGCCCCTAATCATGCG:1 - chr2R 25057148 3' - gypsy6 88 2 68.32 AGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTGG:1 - chr3R 28755919 3' - 3S18 13 2 60.00 GGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGGATGGGGACGG:1 + chrX 15195318 3' + Transpac 302 2 72.00 CGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATGCTATCTTGTAGGATGACTTTTTCATTGAATTGTTGAATCGATATGTAACTGAGATCTCCA:1 + chr3R 21848190 3' - rover 7 2 76.24 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTTACCTACAACTGCTGTAGTTCCCGGAATAACCCGTGCTTTCAATTCCCCAGAAAT:1 - chr3L 8974068 3' - P-element 17 1 64.36 TATTGATCCTAATCACGAATATCATCACGAATATACATACTTTATATGGTCGGAATCGAGTAACGGATATAACACTCCAGACTCTATTTTCCCAAAAATCA:2 + chrX 158253 3' - INE-1 84 1 75.25 AGGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATAACTCAAAGATTGCTTGATGCGAAAATATAAAATTTTTAATTCC:1 - chr2L 16329279 3' - McClintock 6023 2 67.33 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTT:1 + chr3L 18009609 3' + roo 9021 2 79.21 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATGGCGAGCGGCAAGTAATTAAAAACTGTTTTTGCACTGCATATT:1 + chr3R 28728345 3' - jockey 33 1 52.48 AAAAGCGGAAGTCAAAACGGAAGTAAACTTCAGAGCGCCAAATACCTCAAAAAAATTAGAAATCAGCCCGCATAAGAATCAAAATTTTAAATTTGTTGCCC:1 + chr3R 25879886 3' + Fw2 328 1 52.48 GTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAATAATTGTGAGCGGTCAAATGAGA:1 + chrX 5443984 3' + mdg1 419 2 76.24 CTTAGTTTTTCTTTTTAATATGTTAATTAGGGCCTAATACTTGGCTGGAAAGTGCTTTTCGCTTTTATTTCTTCACATTATTATGGTTACCTGCTATATGA:1 + chrX 11777019 3' - HB 1362 1 53.47 ACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAG:1 - chr3R 6147267 3' + copia 5079 2 68.32 TAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATTCAATTTGGACTTCACGCCTCATCTTCACACTGTAATATC:2 + chr2R 9375266 3' - HMS-Beagle 6 2 71.29 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGCCGTACTTTACCTCAATTTCTTGGCCAGAGTTTGCTGCGTCAATGAACT:1 + chrX 7787324 3' - roo 6 2 73.27 ATAAAAGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACACACATATTTCGCTGCGAGAAACCAGAAACCTGTAGTTTTTGACCCATATTTCAG:1 + chr3L 4048525 3' - 3S18 26 2 54.46 AATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAG:1 + chr3L 27264572 3' + 1360 96 1 59.41 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTCTGTGTCCATG:1 - chrX 14525260 3' - hobo 33 1 58.42 GGTACCTGTGCATGAAGAGTGCCCATTCGGAGAGTTTCTTTTCTTTGAGGTATTATGTTTTCCACTGTGTTTTAAATATTGCGTATACAAATACTTTTAGC:1 - chr3R 7255319 3' - Ivk 4949 1 53.47 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATTGAAATGCCATATGATCTAATCCTTCATTAG:1 + chr3L 9121874 3' + Transpac 271 2 72.28 ACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGCCTTGCGATCGTGCACGGTTATCAAATCGACTTCCAGGCTATATGCTCGCATACATGCATAT:1 + chr2L 9015017 3' - flea 135 2 52.48 TGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGATGCTCTGCGTGCATGCGCTTTGTGTGCGAGTAGTGTTTTG:2 + chr2R 7481128 3' + opus 493 2 74.26 AACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCTCGGCTCACCGTCTTACCGTAGCGCTCTGCACATAAATTTTCCAGCGTTTTTGTCACAATTTCTTATCTCA:1 + chr3R 29454192 3' - 1360 3231 1 74.26 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATTTCAATTATTCTATG:1 + chr3R 9479506 3' - mdg1 7076 2 60.40 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTGAGCC:1 - chr2L 7350734 3' - mdg1 7070 2 53.47 CTTGAAAATAAAGTGAAAAATTTATTTATATACAAATGAAAGCTGTTTTAAAGGGAGATGGATGGGTGGCGGAGAACAATCTGGATAAGTCTGAGAAGCTT:1 + chrX 6762537 3' - transib4 2478 1 64.36 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGCCACCTTGGCATTGAAATATGACTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGTTGTT:1 + chr2L 2197167 3' - P-element 9 2 64.29 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCTTCAGCTCTAAAGCTCGGCAATCTGGCCCACAAATCACCACGAAACATGTTGACAGCACACGGAGCA:1 + chr3L 22920475 3' + 1360 3385 2 75.25 ATTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTATGCCCACTAATGTATATAATTTTAATGTATTATTACCTGGTGAC:1 + chr3L 26720730 3' - Tc1-2 48 1 72.28 TTAAGTTTTCCTCCTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGCTTACTTTCTCCTCTACGTCTTTTGGCTTCTTCTCCTTTTGGTTATTGGATGATTTTATGGAAAT:1 + chr3R 7307015 3' - TAHRE 337 1 31.68 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCT:1 + chr2R 4502491 3' - roo 8703 2 65.35 GGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGGTTTTTATGGAGATTCTTGCGCTGAATGATTCTCATCTAAAATTTGTCTAG:1 - chr3R 25409452 3' - jockey 4655 1 55.45 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACGGCAACTCTGAAGCCAAAGGACTCTGCCCACGGGGTCCTTTCAACCCCTT:1 - chr3L 11911730 3' + Tabor 7272 2 51.49 AATTTTACTGGCGCAGTCGGTAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAGAACCTTCGAGTAGCTAATGAGTGGGTCAACAAGTGAAGTGAAGGGAAGTGAATC:1 - chr3L 16345006 3' + 297 406 1 57.43 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTTTTAA:1 + chr2L 20939592 3' + hopper 1383 1 55.45 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACT:1 - chr3R 25633324 3' - Tirant 24 2 57.00 TTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACTTTAAAGTCGCTACATACGAT:1 + chr3L 2292126 3' + Max-element 8480 2 77.23 TGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGCCCCGCTTTCCAGGAGATGGTGAGTTCATTAAAATTATTTGAGCAACCTT:1 - chr2L 18396960 3' + P-element 235 1 56.44 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACAAAGGATACTTGCCGGT:1 + chr3L 20903887 3' - F-element 28 1 55.45 ATTAAGTAAGTAAAATAAATTAAAATATCATTGAAAAATCCGCTTATAATATTAGCAGTGTATCTTGTAGATTCAACTCAGTTTTCCCTATACCATTATCG:1 + chr3L 12714315 3' + copia 5110 1 76.24 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGCATACTT:1 + chr3R 4986355 3' + roo 9040 1 60.40 ATAGATATAACTTACTGATTTAGAACTATGTGTTCCATCCTGTAATTGCTTTGAGTGAACTGGGACTCTAATCTCACCAGATGCTATCACAGAAGCTGTAG:1 + chr4 902309 3' + transib3 301 1 56.44 CAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTT:1 + chr3R 27080789 3' - HMS-Beagle 6832 2 63.37 AACTGTGATCCACCAATGGGCAATGCTATGCCGATAAGTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGTTTTTTTCCTCCTTGATGCGCTTTCCGCTCAGTGCGCAC:1 - chr3R 30979767 3' - HMS-Beagle 487 1 69.31 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACATGTTGTACTTATCAGATAATTATTTGATTTACATGCTTAAATCATATCAGTGCTAGCTTAC:1 - chrX 18717131 3' + roo 395 1 64.36 ACACANACACACACACATTCACAAGCACAAACACACACAAGATGTTGGGCAGCTAACATTTCCCATTTTCCATTTCCCTTGCCTCTGTTCTGTTCTGTTTA:1 - chr2L 20261803 3' + accord 7033 2 83.17 AAGCAGCAGCTCAAGCGATAGCAGCTCCTCGTAGTCAGAGCCTGGGGAAGCGCAAAGCAGCGATCCGTTCTCCACCAGCACCACTCGACGACCCACTAGAC:1 + chr2L 13187141 3' + G-element 408 1 61.39 GGCTAGCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAACCCTGTGAAAGGTAGCAACAACGTTTCCTTGGAAGGGAGATGGAGAGAGCGCGAAG:1 - chr2L 8031236 3' - P-element 16 1 41.00 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCC:1 - chr2R 10863907 3' - mdg3 5295 2 69.31 GAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTTTTTAATAACTAAAATTATTTTTATTAGTTTCCTT:1 - chr3L 27182004 3' - F-element 265 1 64.65 ATTATTATTATTATTATTATTGTTGTTTATATTCGGGCTGCTGCCAGTGGCGCTTTCGCTCTCGCTGCTCCTCCAGTTCTTTCTTCTGTTGCAACTGTCGT:1 - chrX 8426765 3' - mdg1 7074 4 54.46 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATGTAACAGGAATTAGTATTCGTATCGTATTAGTATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTT:2 - chr2L 7112791 3' - roo 8679 2 68.32 GAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAA:2 - chr3R 9254924 3' - F-element 229 1 60.40 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATGGCGAGCGGCAAGTAATTAAAAACTGTTTTTGCACTGCATATTTCCGGGCGACGTTCG:2 + chr3R 28728360 3' - jockey 18 1 67.33 AAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGTTCTTCGTTCTCGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAAAATATATATGTTTT:1 + chrX 21205133 3' - 1360 155 1 62.38 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGT:2 - chr3L 14240821 3' - Tirant 29 2 53.47 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTTTCTATGGGTGAGGAGATAACGCCGCCGTG:1 - chr3L 13994198 3' - P-element 27 1 50.50 GCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACATCAACGCGGATAGCATAACAGTTTCGCACTGGCTGCTGTGCCAGTCAGCTTTTGTCCGT:1 - chrX 16574298 3' + 412 262 2 69.66 AAAAAGACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATACCCAGATAGATAGGGGGATATAGTTGTGGGGCAACCCGAACGT:1 - chrX 4500192 3' + Quasimodo 7343 2 56.44 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAA:2 + chr2L 487141 3' + P-element 2857 1 48.51 ACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTATTAGATCTTAAGCTGTTGTAACCTATTTTAAGCGTTCGCGCAACCACAACAAACCTAGAAATG:1 - chr3L 15066448 3' + 17.6 7238 2 67.00 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATATTTTAGAAATTAAAAGCCTACTCAGGT:1 - chr3L 3951067 3' - pogo 46 1 77.23 TGAAGGGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCT:1 + chrX 1018144 3' - 1360 209 1 61.39 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTTATGTCCTCCGCCAAA:1 + chr3R 11496903 3' - Doc 22 1 63.37 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTT:1 + chrX 19457207 3' - roo 8703 2 66.34 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGGTACTTGCTGTCAGGTATGAAT:1 - chr3L 21708592 3' - roo 15 2 64.36 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAACAATGAGTAAATTTGTAGCTGCATAGAACTAGAG:1 - chrX 12703649 3' - FB 31 1 59.34 CAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATTTAATTGAATTTAATTAAATTTGTATATTGTATTGTATTGTATATTTTA:1 + chr3R 17222645 3' - gypsy 7013 2 53.47 CGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAACTCAATCTACGGTCTCCAGCTTAATGGTTAAATCCATGCGAAAGCCTCCCATAAAGC:1 - chr3R 7509124 3' + jockey 452 1 71.29 GCGTGCGTTCGAGGTTTGAGCCGCGACTCGGCGACGTCACTTCATTTTGTTCATTTGTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGTCGCTTGCAGCAATTTCTTTGGGC:1 + chrX 7834060 3' - HMS-Beagle 6640 1 67.33 TTTTANAAAAGCAGACAACATTTACGGTTTCCATGTTTATCTAAAATCAGACCACTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACGATGCGGCATATGGCAACAG:1 - chr3R 14186295 3' - Cr1a 447 1 79.21 AACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGTGGGATGTTGGTCAAGGGGGTGGCTGGAAAGCGAGAATTAAATAAAAGTATGTTTAATGTAATTTTTGAAG:1 - chr3R 15574296 3' + P-element 12 1 76.24 TTAATGTTTTTTTTTTAATAATTTAATTTAATTACCGCATATAAATTAATGTTTTAATTATTTAAATCCTGCTAGTTCATGTTATGATTTCATTTTGAATT:1 + chr3R 28013483 3' - P-element 2688 1 57.43 TGGAGNAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACTTATTCTTTTCAGTCTTCAAAAGAG:1 + chr2L 15893746 3' - Max-element 52 2 77.23 GGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATAAATTCTAGACTAAAAAAGTAAGGAGCTATTATGTTATATTTATGGT:1 - chr2R 12213891 3' - Transpac 2 2 78.22 TCAGAGAATTAAAAAAGTTTAAAGTGCCTTGAAGAAATTGATGGAAACAGAAACAGAAGCAATTTGCAAACATTTCATTTTAAAATATATGATATGATATA:1 - chr2R 10503862 3' + transib1 239 1 79.21 GGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGAATATATATTTTTATATTTATAATAACACAACAAGAGAT:1 - chr2R 6493953 3' - 17.6 34 2 75.25 ACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTATGCCAACAACAGCAACAACAAATA:1 - chr2L 7547973 3' - blood 4 2 74.23 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACTCTAGATCTATTAAAGTTACT:1 + chr2R 20201012 3' + roo 9017 2 82.18 GTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTT:1 + chr2L 16082661 3' - Stalker 6895 4 69.00 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTACTGCTTATTGTACCATGCTAACAGACAATTAGGTTCTCCGTTAGTTTATGTGTACATAAGAG:1 + chr2R 5311510 3' + 1360 3374 1 43.56 GTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTATCTTTAAACATATTTC:1 + chr3L 19350024 3' - 1360 3201 1 57.43 TAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGC:1 - chr2L 11047957 3' + Juan 4202 1 64.36 GAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAAATTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGATAATTCGT:1 - chr2L 18177036 3' + INE-1 549 1 60.40 AGATCNCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTACCCTACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCAAAGCAGCTTCAGATCGATTTTATA:1 + chrX 21587716 3' - INE-1 133 1 72.28 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATTTTCTATTTGATTTGGGGTAGTGTTTACTAATTAC:1 + chr2R 12336645 3' - pogo 37 1 65.35 GAGCCACAGCAATCTTCTTGCAAGACGTCTTATCCCCTATCGACCTCCGAGACCTCATACTTCACTTATTTTGATATAGTGTTTGATATAGTTCTCAAGAT:1 - chrX 22726199 3' + Helena 1269 1 46.53 ACACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCAC:1 - chrX 21668087 3' + Stalker2 349 2 70.30 TTGTATTTTTGTAGAATTGGTGCATTTGTAAGCACTTTGCGCTTAATTTGCATTTCTGTTTCTGTTTTGGAAGGCGGTGCCGAAGACCAAATTCAATTTAC:1 - chrX 18022574 3' - transib3 2805 1 78.22 TTTTGGGCGGTTCTAGGGCGTTAGAACGGGCGTGGGAAACATTTTTCTTGTTTATAATAATATTAATTTTGTTTCGCTTAATTATGATTTCATTTCAATTT:1 + chrX 135815 3' - INE-1 344 1 55.45 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTGTCTCGTCGTCGAGTGACT:1 + chr3R 9370028 3' + roo 405 1 76.24 CGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAATAGTATACTCTCTTAATATACGAGAAAC:1 + chr2L 15957525 3' + Max-element 8512 2 56.44 GGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCGATTAAGTGGCTTTGGATACTGATATTTCC:2 + chr2L 17284205 3' - F-element 4490 1 75.25 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGT:1 + chr2R 18503553 3' + roo 9040 1 58.00 GGAGACCGTAGATTGAGTTGGCATACCTTCCAGGTTAGGGGAAACAACTGCCTACTTCTTAACAAGATGTTTAATTATATTTATGAGTAATAATTAGCTTA:1 - chr2L 6815924 3' - jockey 491 1 50.50 GCGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGGCTGAAAGATCTACCTACCCGGCTGGCAGTTCATTTAAAGTTTACGCAGCTCGCTTTTAATTAGCATCGAGATT:1 - chr3R 15712814 3' - Cr1a 293 1 55.45 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTGTAGACTATTTGTTTTCATACTCACTTTTTTCTCAACTCATCGA:2 + chr3L 9858335 3' + pogo 2074 1 54.46 TATGTCAAATAATAAAATAAAAACCAATCAGCAACAGCTGCAGGGCATTAACAAAGAAAGGAAAGGAAGAAAATGTGAAATAGGAGGAGAAACTTTGAGGA:1 + chr3L 5197032 3' + Rt1b 5142 1 55.45 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGATACTTTGATACAGTCACAATTGTCTCAGTAATGTATAGACTCGAAATAAGGTTAGAAAGTAATC:1 - chr2L 12643625 3' - roo 63 2 68.32 AGTATCATATGATAAATTGCAAATTATATTAAACGAGAAAAATACAAGAGGGAAATCTGTACACCGGAAAGGGACAGACTTGGAGTTCATCTTAAAGCATG:1 + chr3L 2866680 3' + HMS-Beagle 192 2 67.33 TTATAAAATCTTTTAATTTTAATCTTGCAATAACAAACAGGTGCTCAACCAAAATACATTATTTTTCGAAAACATCCGTGTCGAACATTTTACACACCCCA:1 - chr3R 11268869 3' - 1360 3029 1 69.31 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAAAAAAAATTAAATTAAAAATTTACACAACGATATGATAGTGTTATATGTTTTATAA:1 - chr2R 3905554 3' + Juan 4193 1 53.47 ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGA:1 - chrX 21087604 3' - mdg3 35 2 70.30 ATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGCACATGCAACTC:1 - chrX 21474404 3' - 1731 4336 2 75.25 TATGTACATATGTATATATATGTATATTTAATTTCTTTTTAATTAGTTTTCTTTTTCTACTATTTCCGGTTCATCTCGTTTTGCTTTATTGCGTCATTCAT:1 - chrX 12477462 3' + G3 4508 1 66.34 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAGAGGGTGTAATTATTTTCCTGTTTGCAGTGGATCAGCAACTGGAGGGGATCGGGAAG:1 + chr3L 1078995 3' - I-element 19 1 59.60 CATGTTGTAGTGTGTTCAATTCCTAACTCATATCATGTAGTCTCTATGTGCGTTTTTTTTTTCTTCTTCTTACACTTTTTGTTGTTGCCAAATAGAAAACT:1 - chr2L 5295783 3' - hopper 960 2 60.40 TATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGCTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCTTCATGTTGACCGCCGTAGGCCTGGCGGAAACCAAATAGTTCAAC:1 + chr3R 31461025 3' - jockey 4556 1 55.45 GTTATTATTATTGTTATTATTATTATTTTAACTTCATATTGGTAAAATATGTAAAATAATAATAACTATAAACTAGAATACATCAGTTAATATGAATAGAA:1 + chr3L 15198561 3' - mdg1 27 2 59.41 ACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACTTTAATTTACTTTATTTAAATATGGTTCATGCACTTGCTAAC:1 - chr3L 710791 3' + 17.6 460 2 65.35 CGAAGATCTCGAAATGGTAAATGATGACAGCGCAACTGAATTCCTGAGACCAAACCTGAATTCCTTGACGAATATAAGTCTCTCGGTCATTTGGAGTTGGT:1 - chr3L 26291296 3' + G4 115 1 67.33 CGAGAAGAAGATTAAAACACCACCTGTCTGACCGGAACTTGACATAAATCATACTTAATTCAAATCTTCTTAATATTGAATTATTATCTGATGCAGATGCT:1 + chrX 8501387 3' + jockey2 3163 1 74.26 TATTTNTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCG:1 + chr3L 13194809 3' + 297 6924 2 79.21 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATCCGTTATGAAATTTTATCTACTTCACATGAAGCCTAATATCATGTTTAAATGTCTTCATTC:1 - chr3R 5508115 3' - mdg1 44 2 66.34 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAAT:1 - chr2R 8378621 3' + pogo 2077 1 79.41 GTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAAAAATGAACAACAAAAACCACAAAAAAAGG:1 + chr2R 14457795 3' - mdg1 3 2 71.29 CCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCA:1 + chr3R 3320505 3' - 1360 47 1 74.26 TTGGTAAAACAAAAATAAAAAACTTCAAATTTAGGCGTTATTGTGGCTGACTTGGTTGTCGTTGGTGATGCTATTGGCGTTGTGGAGAGCTGGTACTAAAG:1 - chr3L 27361263 3' - Tc1 1475 1 67.33 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCTGTTTATCTCTCTTTTGGACCGACCAATTTTCTGTG:3 + chr3L 20248394 3' - Transpac 10 2 70.30 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCAAACTATATATGTTAAGATACATTGGGAAAGCAAAATAACATTCGTTTAAAGACTGAGCTAAACT:1 + chr2R 20838690 3' + 1360 3377 1 67.33 ATTTAGTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTCTATGTACATAAATTTAGTTGTTCGCGATGATGTTGGCGGCAACATTTTCGA:1 - chr3R 28792581 3' - FB 933 3 51.49 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGAGACGTC:1 + chr2R 4502500 3' - roo 30 2 56.44 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAAAACATAAATTGCTGGGCCCCC:1 - chrX 13548749 3' - blood 35 2 61.39 AGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCA:1 - chr3R 13423302 3' + 17.6 446 2 76.24 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTTA:1 - chr2L 6227661 3' + roo 9029 1 66.34 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTTATTGTCATGGTCTT:1 + chr3R 27189330 3' + roo 9043 1 56.70 TAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCA:1 - chrX 4890025 3' - 297 6600 2 61.39 GCTCGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCGACAAAGCATAATTAACTAATTAATTTGCCAGACAGCCGGCAACTCAAAAT:1 - chr3L 2415151 3' + 1360 298 1 57.43 AAGTCAAGCCCTCCAACATAATCTTCCTAATTCAGTGTTCAACCTGCAGAAGCAGATGGAGGAACTGGGCCAGCTGGTGCACCCGGAGTACTTGAAGCGCG:1 - chrX 19601262 3' + gypsy 361 2 63.37 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTACAAAATCTGTAAATAATTTTACA:1 + chr2L 21089217 3' - flea 4801 2 74.26 AGCTCACATTCAATCAATAAAAATGATATAAAACGCTTATTAGCTTAATAAATGTTTTATATCATTTTTATTGTTTAATACATCTAACTAACATTTAACTA:1 + chr3L 23226621 3' + Tom1 291 1 72.28 TTTTAATTTAAATTTTTAAATGGTATAAGTTTGAATGGTAAGTTTATGGCTCCCCTCACTTTCATACTCTATTATGCATGCACAAGGAGGGGAAACACCC:1 + chr3R 25826448 3' - 1360 3041 1 58.00 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCA:2 - chr3L 12452162 3' - 412 7104 2 75.25 AGATCGGCACGGCTATTGATCCTGATTAAGAATGTAGTAAAGAATATAGTTAAGAATCCACTAAAAGTTAATTCACTTAATGCATTACTCAATACTTTTCG:1 + chr2L 5608696 3' - INE-1 97 1 75.25 TAATAAATTAAAAGTGTAATAAAAGTTATATGAAAATCGGGTCAATTATATCACGTCTAAAAATGAAAAAGGTTCTTTCAAAAATCATTTCTTCTTATAAC:1 + chr3L 12319300 3' + HeT-A 458 1 78.22 GCATAGTGCAAAAACAATGTATGGCCGTTACGCATCTTCTTATTCTTGTATTGGTATTCTAGTGCTGGGTATTTAACAGTGAGCCATCTCTTTAGTTTCTT:1 + chr3R 11034388 3' + 1360 3354 1 79.21 CGACCGAGGGGCGCTGCCGTGTATCGTACGGCTCGATACTCTTTAAATCTTCATTTAGTTTATGAAATTCTAGAAATTAAATCAATAAAAAACAAGTTAAT:1 + chr2L 11953621 3' - Cr1a 4407 1 62.38 GTTGTGTTGTTGGTCGGAAAAAATGCTTATACACACACTTTGGTTTCTCCCGTACTTAGTATATTCGCTAGCTCCTTTCGAACGCTAATTACGCATATTG:1 - chrX 18572331 3' - gypsy4 471 1 77.00 TAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATATCCGGGAATATATAGCTCGCCTCAAGAATAGGTGCCACACAAAGACATGTTTCAGGGTGTGTACGAGCTCAAAGC:1 - chr2R 25087894 3' - INE-1 563 1 63.37 CTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACATGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATCTGACCCTGTGCGTCTTATCCGCCGATGCTGCAATCGTAAAAACGAGTC:1 + chr3L 6148278 3' + INE-1 12 1 67.33 AAACGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGTGCACGAATTCATCGTTTCTGCCTTATGAACGGTTTAATTCATTTGAGTATGTA:1 - chr3L 6078011 3' - pogo 89 1 63.37 CACACACACACACACACATTCAGCCGAAAAGCACGTGCTCCAATGGAAACTGGGCCACACGGACAGAACCGTGGACGGACAGAAAATACGGACGGACACGA:1 + chr3L 7032364 3' + accord 7032 2 80.20 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTGCCCTACTGCGTGCAAATGTCCTAAAAAGCATTTGTACTTCTAACATTCATCCTTCGTTC:1 + chr2L 4189454 3' + 1360 3374 1 64.36 AAATGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTAACGATAGATGATTT:1 - chrX 12294690 3' + blood 7358 2 52.48 CTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATATGCATGGCTATATGTATGTACGTAGTTGCATAAATGAGGTCAGTTCCTCGTGCTC:1 - chrX 15195207 3' - Transpac 4931 2 68.32 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATGTGTTGATTCGGTGCAGTCACGTT:1 + chr2R 6984408 3' + HMS-Beagle2 294 2 61.39 TTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAATAGT:1 + chr2L 15957501 3' + Max-element 8488 2 68.32 GAGCTCTTTGTGATTCCTCTTCACACAAAGGGTAACAAATTGTATGCAAGTAAAGTTTTCCTCCGCTTTTCTCGCTCGTTCTCTAGTTTCCATTTCCATCT:1 + chr3L 3725853 3' + Q-element 55 2 52.48 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCA:1 - chrX 2050839 3' - 412 42 2 78.41 CAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGCGACAGGGTTCTACTGTACTAACTGAGACAACACTATCCACA:1 + chr3R 7181153 3' + F-element 4300 1 58.42 CATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCTCGTTGGAGATCCAGCAGAACATCGTTGGTGGACACGGCCTTGTCCAGTTTGGTCAGCAGCTGCAGTGATT:1 + chr2R 9374136 3' + HMS-Beagle 59 2 77.55 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGG:2 + chr2R 12779170 3' - 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Porto1 4360 1 64.36 TATTATTATTATTATTTGTATTATTGTTGTTATTGTTCAGGTCAGTGGACTAAACAGGGGTTCAAAGTGCTTATTTAACTTGATGTCCCTGGGCACGCCCA:1 - chr3L 4968793 3' - mdg1 7069 2 69.31 AGATTTAAGAATAAAACTTAGCTACATGTACCAAAGCATTATTTACCAATTAATTTTAAGATTTTTAAAGGGGGACAAATAACCTGATATATGGGGCACAT:1 + chrX 10616805 3' + rooA 7428 2 65.35 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTACATCTGTT:1 - chrX 4890034 3' - 297 28 2 60.40 GGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTGTTCCCGTCTCCGGATCTT:1 + chr3R 6147353 3' - copia 1 2 78.22 GGGTATATAGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAAGCAAGTCGGGACTCTCAACACGATCTGAAATCTCTGACAAACTAAAAC:1 - chrX 22889767 3' - Cr1a 4120 1 72.28 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTTGTGGTTGCT:1 - chr3L 12452142 3' - 412 31 2 55.45 AAAATGAGAAAAAAAAATAAAAAATAGAAGGAAGAAGTAATGCCAAAACAGATGGAATTAGCCGGCGGCACTTTTACAAAATCAAAGGGTTTTGCGTTCAA:1 - chrX 8024458 3' - INE-1 471 1 62.38 AAATGCTGGATCAGTTAACACTTCCCAGAATGCACACCACCCAAATTGAGTTAGACGATGACCGGGATATTTAAGAGATGTGGGCTTATTTATTATTGGAA:1 + chrX 5811181 3' + copia 4760 1 61.39 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCTGGCCACTTGTCCGTCTGTCTGCCAGC:1 + chr2L 16686632 3' - 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chr3L 11070490 3' + P-element 2863 1 55.45 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTGTCCAGTCATTCCAGATAGGGAATG:1 - chr2R 19857347 3' + 297 349 2 76.24 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAA:1 + chr3R 14639388 3' + roo 354 2 79.21 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGTT:1 - chr2L 13447097 3' + HMS-Beagle 7019 2 56.44 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAA:1 - chr3L 5975590 3' - hobo 30 1 53.47 TCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTGCCTTCTACTACTATATATTTAACTTTCAGGCAGTTTCAACATGTCAGTTTGCTGTATCTTGCTGATAGGCA:1 + chr2R 15005129 3' - BS 4995 1 61.39 AAATAAGGCAAAAAGAAGCGGACCAAGGTGGCTTTCTTGTGCGACCTCTTTCTTGACAGAGCGAATGCAAGACGTACCGAAAACTGAAGTCGGTTCAGAGC:1 - chr2R 2009084 3' - Q-element 510 1 62.38 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCC:3 + chr2L 11686059 3' + hopper 1366 1 75.25 CAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAAT:1 + chr2R 19502068 3' - 1360 3388 2 64.36 ATGCTGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTATGAATT:1 - chr2L 18159051 3' - INE-1 170 1 41.58 AGTGANAACAATAAACAAAAAAAAACAAGCGCATCCGTCACTCTAAATGAGGGAAAATGAAGTGCCAAAGTGTTGAAAATAAAGCGAAAGCCAAGAG:1 + chrX 5175016 3' + Porto1 184 1 54.64 TTTTNCTGCAATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTATTTGCCTTCGAAGCAACA:1 + chr3R 9663683 3' - BS 4686 1 80.00 ATATATACATACATACATTACATACATACATACATACATTTGGGTAATTTAATTATTTTTTGACATATATTAGGGTATTTAAAACTGGCCATCTGTTTGCA:1 + chr3L 14284656 3' - 1731 95 1 68.32 AAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTGAACAGTGCTTAAATCTGATTTCTTCTGGTATTTTTTATAATCGTTATACATCATATTCCATATTCCTATATG:1 + chrX 9628279 3' + Quasimodo 159 2 78.22 GTGTANACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGAC:1 + chr3L 9692735 3' - P-element 37 1 40.59 CTCACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGTACACTCGACAGCTGTTGTTGACCTTACCCCCAAAATGGTCCGCAATTTATGGTTGCAAAT:1 - chr3R 22265262 3' + G2 2943 1 55.45 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGC:1 - chr2R 9014440 3' + blood 357 2 70.31 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTTTCTGGCCAAACGCTCAAAACGCGTCCAATCGGTCCG:1 - chr2R 10673362 3' + Tirant 8498 2 69.31 TATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTT:1 + chr2R 6779823 3' - 17.6 50 1 78.22 TATATAAAAAACTGTAAAATCGGAGAGACTCTGTAGCATTATTCGCATAAGAACGATAAACTGACGAAACCCACATACATCCCGCCGATCCGTATGGAGTC:1 - chr3L 11641516 3' + 412 7402 2 68.32 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGTGGTCTCTCCC:1 + chrX 329095 3' + opus 7487 2 65.35 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATAACTAAAACTCATAATCAGTTCATAAAACCTCTTTATGGT:1 + chr2R 8245771 3' + mdg1 7423 2 60.40 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAACGAGCGCATCCC:1 - chrX 4041509 3' + hopper 1385 1 53.47 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 355 2 69.12 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAACATGCACTTTGTTGCATACTTTCAG:2 - chr3L 3944684 3' - jockey 4759 1 64.36 AAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCAACAGAGGATCCGTCGTGGCCGCCTTTTTGGAAGAGATGGAAAGGTATACGGGCGAGATGCCCTCA:1 - chrX 1954421 3' + Tirant 8497 2 68.32 TAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAATATAGATACTTTATTTAAACACAAATATTTATGAAGTGAAGAAATCATATGAT:1 + chr3R 17012641 3' - roo 451 1 60.40 GATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATGTGGATATTTTTCGGTTAGTCTCGGTAGCGATTGTGGTATTCTGGTGTGTCCTCT:1 + chr3L 15855729 3' - F-element 129 1 61.39 ACCCCCTGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCAGCGACGAATCCGTATGCCAAATTGAAATCACAGCCATGGATGGTCTACAATATGCGG:1 + chr2L 10937385 3' + springer 7474 2 69.23 CGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACTGATTCCCACTGCTTTGCCGCCTTTCAGGTCGAAGACGTGTACCTTTTGCTTGCTTATC:1 + chr3R 2208141 3' + 1360 3193 1 68.32 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCA:1 + chrX 4154961 3' + blood 7336 1 78.22 AGTGAAAACATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGCTTATCGCCAGTGATCACAATCCGGAATCAGACGATCCAATTTCAT:1 - chr3L 18952314 3' + F-element 4379 1 54.46 CTCAAAAATAACGTCTATAATTAAAAACATAACAATAATATTCATTAGTAACTATCAAATGTGGGTGGTGTTTGTGTGGTTGGATTTGGCCAATGAACTTG:1 + chr3R 11913974 3' - copia 4842 1 70.30 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATACTACATATACTGAGCAAA:1 - chr3R 4986276 3' - roo 8686 2 57.43 TTTTTGGCACACGATTTTTTGGCACTCGTACCCCTTTTACGCACCGCTAAGCTGCGTTTGCTTCAATTAAATGCCAAAATGCCAATTAATTAAAAGCCCAT:1 - chrX 2461817 3' + 1360 41 1 79.21 AATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCTCTGATGAACGAAATTAGCATTCC:2 + chr3L 1809858 3' + diver 6059 2 75.25 CGAGTNAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCACCTATAATTACTGTTGTTTCCCAAT:1 + chrX 20437715 3' + roo 399 1 54.46 ACAACGAACTAGCGGCTCAGCGTGGAGGTTTAGGGGGGTGGGGAAGTAGTGGCGTGGACTGCTGATGTGGTCATGTGGGACTAAACTTCGTGTCCGAGG:1 - chr3R 28826841 3' - gypsy5 126 2 78.79 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCTGGCCCATCAATCTTGGTCTATG:1 + chr2L 11686102 3' + hopper 1410 2 71.00 CAACGNAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCTGCAGACGCGAGGCATTCTGCAACGGGAGAAAAGAGGTTACAAATATGTATATCCACATA:1 + chrX 16760401 3' + Doc2-element 345 1 55.45 GAAAAAAAAAAAGAAATATAAACAGATTTTGCGCTCGCCCCATAATGTAGGCAATAGAACTTAATTTGCTGCCCATTGTTGACACATAAATCTAAAAAAAA:1 - chr3L 10572322 3' + Doc2-element 250 2 50.50 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTTTTTCCAAGGAACACACTCGAAACTATGTATCAAGTTTTGTTTTTAACTAAGCCTT:1 + chr2R 10912176 3' + 412 7528 2 58.42 AGGAGGAGTTGCTTGCGATATGCCAGGGAGGTTTAGCCCGCCCGACTGGTTTAGTGGGGATTGGAGGAGCATCGAAGGTGGGGGGTACAACAAAC:1 - chr3L 21899230 3' + Bica 24 1 71.58 GTTAAAAACGAAAGTGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTCGTTCGACGCGAAGGAGTTGGGATTAATTATCGACAGATAATGACATCTTAATTTATAAACGTT:1 - chr2R 2947743 3' + Dm88 437 1 53.47 GATCTAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAAAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTTCGCCTTTTGTTTGCTAGTAG:1 + chr3L 3577577 3' - F-element 378 1 75.25 ATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCC:1 - chr3L 7989748 3' - mdg3 42 2 62.38 TTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTC:1 - chr2L 12074495 3' - Juan 4044 1 52.22 GTGTGTTCAGTTTTCCTAGCATGCACGATTCATTGCTCTATATGAACCGAAGTTCCGCAACGCCTACGTACTAAAACCATCCCATTAAAAGATGATTTCTG:1 + chr2L 19596393 3' - R2-element 3513 1 80.20 TTTCTNACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACA:1 + chr2R 18503558 3' + roo 9044 1 52.48 AGTCTACTGCACAGTTTAGGCGGCTGTATGACCCAACATCCCAACATTTGCTTCGGCTTCCGCCGGGTGCATATGCTTGGTTTACATTTCGAGTAATAAG:1 + chr3L 16890518 3' - diver2 4549 2 75.00 TATCCCGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGAAAAA:1 - chrX 21949001 3' + 412 309 2 74.26 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCAC:1 + chr2L 2197153 3' - P-element 26 1 54.46 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGTTG:1 + chrX 495227 3' - 412 7091 2 62.24 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCGAAACTCGTGACC:1 + chr3R 5977809 3' + copia 219 2 60.40 CTTATGTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAATTTGAGCTGCGAAAAT:1 - chr2R 22395180 3' - I-element 9 1 73.27 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTG:1 - chr3R 10457293 3' + roo 355 2 78.22 CATTAATTGGTTTATTAAATTATTTTGTAACTAATTCATTGCTTTAATGTGCTTCTTATATCAATATATATCTGTTATTTAATGTTTTGTTATTTTCTTTA:1 - chr3R 18220370 3' - HeT-A 364 1 86.14 CTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCTGTTACTCAGCTAATGTGAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGATAGATATTGGGG:2 - chrX 23078696 3' - INE-1 566 1 89.11 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTATAAAGAAATAGAA:1 - chr2R 18295617 3' - I-element 40 1 63.37 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTGT:1 + chr3R 27080800 3' - HMS-Beagle 25 2 54.46 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGACTACGTTGCTTCAATTG:1 - chrX 5443872 3' - mdg1 19 2 60.40 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAGGGGCTGGTTGAAGGGGCATACTTTGAGGCTTGCTGGAGACGCC:1 + chr3R 18507900 3' - jockey 9 1 74.49 GTTCCCTCGGTACCGACTATTACACATATTACACATAAATAATTCATCAGTGTAGTATATACAAGCAATGGCAACTACAATAAAAATGGTATTCAACGCTC:1 - chr3R 833416 3' + 1360 2913 1 56.44 TTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCGAAGGTCAACGAAGGCGGAAGCTTGGTAAAGCCAGAGGGGTCAGGAAACCAGGAGCAGGGTGTAG:1 + chr3R 29224626 3' - jockey 4978 1 66.34 GTCGCGCATGCTAATTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTTTGAATAGCATTTGCTTAATTATTTGTATTTGTTATTATAATTTCCATCGTTTATCGTTATAA:1 + chrX 16461600 3' - Tabor 7013 2 64.36 TATTTTTAGATTTTTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAGCGGACAGAGGGAAATTTTGTACATCATCTTTATGCCTTGTGTTTCTATGTTTATAGATTCTGGTT:1 + chr3R 30813993 3' + 1360 3278 1 54.46 ATGTCGCCTTAGATTACAAAATCTTAAATTATATTTAGGATTTAGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCACA:1 - chr2L 3672973 3' - roo 98 2 73.47 AATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAA:1 - chrX 5443896 3' - mdg1 43 2 69.31 TCTCGCAGTCAGTTTGGAAAGCAGTACTGGTAAATGGTTAAAGCAGCGTAATTAGCTGTTAATTTGGACTACCACTTGGCAACCGGGCGTGGAATTTACTT:1 + chrX 12071921 3' + Rt1c 309 1 54.46 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAG:1 - chr2L 10118903 3' + hobo 2894 1 73.47 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCGTGTGCGTATGCGTATATGCGTAT:1 + chrX 2050899 3' + 412 7529 2 60.00 AATAAAATCAAATTTAAATAATACAATACAAGATGCCATGCAAGGCCGTCATCTGCCAGGTGTGCAAGTACACAGCCTTTTCCGCTTCCGATCGCTGCAAG:1 + chr2L 21182130 3' + HeT-A 328 1 75.25 ATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATATATATATAAATAGGGGGCGGCTTTTCTCCCCATCGAATTCGACCTTCGCCTTGAATAATATA:1 + chr3R 30325296 3' - 17.6 7 2 73.27 GTGTACTTATGTACGCACACGATGTTAAATTATGCCTCCAGCACAATTTCCTAGACACTTTAACGGCGACTTTTGATTTCCATTCCCAAATCGCTGGGTTG:1 + chr2R 19955916 3' + Q-element 566 2 60.40 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGG:1 + chr2R 9014459 3' - blood 57 2 80.20 ATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGTTATGAAGTGGCCTCA:1 - chr3R 14639310 3' - roo 8664 1 79.00 CTCAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTC:1 + chr2R 18503571 3' + roo 394 1 51.49 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTTTTTGTGAGCACCAAAATGTAGGCAACATAACATAACACAATA:1 + chrX 9248359 3' + pogo 2071 1 59.41 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGG:1 + chr3R 28326750 3' + P-element 2843 1 38.61 TATGTNTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTTTTTTAGTTTTTATATTTATATTTTATAATAAATCCACTAGTTAGCCTATTTAA:1 - chr3L 3279738 3' - Juan 4092 1 45.54 GATATNTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTT:1 - chrX 12538471 3' + roo 359 2 72.73 ATAGATTTTGTTTGTGAGATAAGCACAGGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTACAATAAAATATTTTAATGGCCGTGAATGG:1 - chr3L 4384645 3' - jockey 113 1 68.32 TTTCTTTTTTTTTCTTCTTTTTTTCCTCATTGGGAAAACGAAGGGGAAACTCTCGAAAACTGAAACTAACGTGATTATGTATGTAAGTGGAATTAATGCAG:1 - chr2R 21434867 3' - Doc2-element 245 3 45.54 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAA:2 + chr3R 9369987 3' + roo 9027 1 69.31 AAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCTTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGAGCTTTGGCCTTGGCTTCAACCGATTCAACCCAC:1 + chrX 10256751 3' + 1360 3343 1 68.32 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCAACAGTTTTTCGACTTTTGTTGC:1 - chrX 4488864 3' + 412 7518 2 52.48 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCACTAGTATGGTGCTCGTGTGCGTGTGTGTGCTGTTGTGTGTGGGAGAGAGAGGGAG:1 - chr2L 9626466 3' - P-element 21 1 59.41 AACATCATCAATCATCATCAATTCTTCATCAATAAAAATCAATTTGATCTTTCCTACTCTTCAATAAATAATCTCTAAATTTCGTTTGGCAAGTTTGGATT:1 - chr2L 9426125 3' + gypsy7 327 1 72.28 GCAACACCAATCTTGTGCAAATGGCTGTGCGTCAGGCAGTGGCAAATGTTTAAATGAATTTGCATAACTTCGGGCCATCTATACATGCAATTAAAATGTCT:1 + chr2R 9622671 3' - baggins 5168 1 76.24 CATCACAAAATAAATTTCAAAAATGAGTTAATATTTGTCTAGTTTTTGAACATGCCGCTTTTGTCTCAGCATATGCTTTTTCGGAGGCGTCCGCAAATCCG:1 - chr3R 19446129 3' + 1360 365 1 47.52 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTACCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAA:1 - chr2R 5849966 3' - jockey 37 1 53.00 CAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAAGGTCAATAACATAAATCCTTTGGCAGCACAAAAAAAGTCAAATCATTTGAATTACTATCCGA:1 - chr2L 3184237 3' + Doc 4568 1 70.30 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCTGGCCCATCAATCTTGGTCTATGAT:1 + chr2L 11686104 3' + hopper 1411 2 72.28 CTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTAAA:1 - chr2L 15333707 3' - P-element 20 1 57.43 GAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTATCTTTGCCTTCACTCTACACTCGCTCCCTTTTTATCGATAACTTG:1 - chr3L 25633861 3' - 1360 40 1 70.30 ACTCAACGAGGAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAATGGCTTTCAGGCCGGGAACAA:1 + chr3L 14910656 3' + roo 393 1 64.36 TTTCATTAATGCCCTAATTAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGAATATTTCGCTAGCCTGCGGCTTCTTTGAGGTGAACCGAAAACTTTTTCCAGCT:1 - chrX 9402434 3' - Doc 4577 1 60.40 ATTTCTATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCAACGCTATGAAGT:1 - chr3R 19609649 3' + Tabor 7295 2 49.50 GGCATCAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTCTGCTACGCCCTCTAAAATAACAATCAAATAAGA:1 - chr3R 20518655 3' + R2-element 3409 1 64.36 ATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCTTACTTACGAATTGTGGTGCGAAAATTTTGGAGACGACGAAGGTAGCTCAATGAAAATGGATGGGAA:1 - chr4 914189 3' - invader4 373 1 73.27 TAAGACTTTAAATGTATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACA:1 - chr3R 14639332 3' - roo 15 2 61.29 GAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAAACCCAAACTCAAGCCACAA:1 + chr2L 13447204 3' - HMS-Beagle 6800 2 75.25 ATTGTCAACTATCCCAAAACTTTTTGGCTGTCATTACTGAATCATTCCAAATTTTTAATGTCTCATTTGCGAAAGTTGTCGGGATGCTACTCCTAAGTGGT:1 - chr2R 11247747 3' + Q-element 126 2 79.21 TTGCTAGTTTCAGGTCTCTGTGCAGGGTGAAGTTTCGCACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTCCAATGCCCTCTGATCCCAGCTTAGCTTCA:1 - chrX 3825957 3' - X-element 4359 1 69.31 CGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTTATTTAGTAGCCAAGTAAACAGGCAAAAGCAATGCCAAATAGCACCGC:1 + chr3R 15157695 3' + invader3 5459 2 72.28 GATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCATGGTCAATTGGGACTTGGCGGAATCGAGG:1 + chr3L 1314061 3' - R1A1-element 4941 1 73.96 CCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCA:1 + chr2R 964171 3' + 1360 3334 1 82.18 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCATCAGCCCCTAATTGTGCGTTGATTGGTCAGTTTACATTTCTTGCTT:1 + chr2R 973853 3' + 1360 3380 2 59.41 ATAGAAAATATTTTAAATATGAGTGTGAATTGTTGAAAAGCGTGAAAACATTAAAGCCTTGAATATGGATATTCATAAAAAGCTTATATATTTTACATATT:2 - chrX 11918826 3' - NOF 343 1 82.18 TGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATGTAGACTATTTGATGTGAAAGAAACAACACCAAATAATGCCCAAAGGA:1 + chr2R 15372239 3' + 1360 268 1 58.42 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGCGAGCAAAGACAAAGATCGTGATCGTGGGCAGTGCTGCCGACT:1 - chr3L 8063807 3' + P-element 2885 2 76.53 CGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTATGCATATCAATTATGCTCTCCACCATGCGG:1 - chrX 5018601 3' - opus 1 2 78.22 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCATTTTATCTGCTCGCTTTTTCCATGTGACTCATTTG:1 + chrX 4154996 3' + blood 7371 2 60.40 GCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATGTATAACTTTATAAATATTTATTAGCTTTAGCTTGGCCCACGCGACTACACAAATTTGTATTTT:1 - chr3R 8844249 3' + FB 217 1 63.37 CCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACTGATTAGACATTCCCGCCACCCACTTTCCCACTTAC:1 - chrX 5144805 3' - Transpac 38 2 65.35 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGACAACACCGAGTTATCTTTACTATTTGGAAAGT:1 + chr2L 1156797 3' + 412 453 2 71.29 TATTCACATTAGCTGAGTAACGGTTATCTGATAGTCTCTTGTCTGGAAAATATAAATAGATTTCCAAACAGTTTGGTAGATATTAGAATGTTTTTTTTCTC:1 - chr2L 12156890 3' + INE-1 535 1 50.50 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCAGTTTCAATCTCCTGTATGCAAGCCGCTCGGATTTTCCTTGATTTTCCGACAG:1 + chr3R 19225169 3' - FB 24 1 63.37 TTTTTTTTTTATTATTATTTTCTCTTGTTCCCAAAGCAAGTAATGCGCTTTTGGAAAGTTGACGAGTCCTTCGCCCGAACTTTGCGAGCAAACCGCTTTA:1 - chrX 10161442 3' - Rt1a 5069 1 73.00 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAA:1 - chr2L 19642997 3' + roo 9015 2 82.00 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGACTGCTTTAACAACAACTTTCTATGG:1 - chr3L 13994220 3' - P-element 47 1 29.29 CCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTT:1 - chr3R 25702200 3' - Tirant 8157 2 76.24 CTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAACTTATTCTTTTCAGTCTTCAAAAGAGCCACTGATTATTTGAAGACCTGCCAGCTTGAACGACAAAACTGCACT:1 + chr2L 15893793 3' - Max-element 8240 2 74.26 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAAGGCGG:1 - chr3L 20248306 3' + Transpac 274 2 69.31 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGAA:1 - chr3L 20248311 3' + Transpac 5188 2 70.30 AAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAGATACTTTTCGTGTAATTTACGATGATGGTGGAACAGCAATGATGGCGAACGATAGCAA:1 + chr3R 16863875 3' - HMS-Beagle2 269 2 67.33 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATCGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTGGGGTATGTAACTCAATATTCAGATGAATCAACA:1 + chrX 18717207 3' - roo 43 2 66.34 TGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCAT:1 - chrX 21087561 3' - mdg3 5258 1 69.31 GAGCATACGTGTGTACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCAATGCAAATACTGTAACCCAATCGGATCGGAAAATTGATGAACTTAAGCAAAACA:1 + chr2L 7261073 3' - 1360 176 1 55.00 TTTTAATTGTTTTGTTTGCAATTTAATTGCACTTATCAGAAAAATTTCTTATATATCACTCAACTTGATTTAGAAACACACACATTAAGCTCAAATTAGTT:2 + chr3L 7577599 3' - Doc4-element 384 1 72.28 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCCTGTG:1 - chr2L 11065854 3' + P-element 2870 1 64.36 ATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGAGATGCTACTTATTTTCAGTGGTTTTCCATTTCGGTGTACGACTTT:1 - chr2R 9016093 3' - blood 7179 2 63.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGT:1 + chr3R 9370008 3' + roo 9048 2 56.44 CATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAACAAAGGCTGCACCACTCGAAACAAAAGCATTTTCATTTAACATTCAAACTGCA:1 - chr3R 23219380 3' + Stalker4 67 4 55.45 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGTTAGTAACCATTATTTGTAGCT:1 - chr2L 14260726 3' - 297 21 2 59.41 AAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATATTGATATTGAGGCTCAGTTTTCTATAAATCAGTCC:1 + chr3L 27137080 3' - FB 99 1 64.36 TTTTTTTAATTTTTTGTCGTTTTGTGTGCCACTGCTTAACTGTTTTTAATTGAAACCCGTTTGCGGTAATTGTCTTTCGAACCGCTAAGACGTCTATCAAG:1 - chr2R 11325809 3' - HB 310 1 74.26 GTATATGGAATTGTATGCGTTGCCCTGTCTGATCTCAAAATATGGTTCTTACTTGAAAGAAAAATTTGAAAAGCTATTGTAGATTTCCTCAG:1 - chr2R 25195462 3' - ZAM 8143 2 66.30 TTTCTGGAGACAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAA:1 + chr2L 19075708 3' + Transpac 260 2 73.27 TATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATATTATTATATATTATATTTTCTGTAAAACTGGTAACAAACTTATTTTTCATTTCAGTCC:1 + chr3L 24131177 3' - HMS-Beagle2 6899 2 63.37 GGGGAGGCCCACCGAGCCTCTTTTCGGTACCACGGGTTGAGCAGCCCAATGCGGAGGTGTGGCATCCGGCAGTTAAGTTCTACGATGTGTTCGATGCTGAT:1 + chr3R 24933488 3' + R1A1-element 4914 1 65.35 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAATTCATCGTATCAGACGTCGCTTTCTTAGCTTTTAATGGAATTATTT:1 + chr3R 9837645 3' - 412 31 2 53.47 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTA:1 + chr3R 15998130 3' + pogo 2057 1 72.28 GCTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTG:1 + chr2L 2197148 3' - P-element 31 1 49.50 AGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAA:1 + chr2L 23295871 3' - micropia 23 2 52.48 ATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATA:1 + chr3R 14049396 3' + transib2 2772 1 77.23 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACTTGCCCT:1 - chr3R 18960409 3' - hopper 16 1 61.39 GAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAGAGGGTGTAATTATTTTCCTGTTTGCAGTGGATCAGCAACTGGAGGGGATCGGGAAG:1 + chr3L 1078995 3' - I-element 20 1 59.00 CGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGGCTGGCTGACTGACGTTAAGGGTCTTAGAAGTTGGGTGGTTCTGGGCTGTGC:1 + chr3R 19964321 3' + R1A1-element 5183 1 54.46 TCACANAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGATTTCTTACGCTCTCCGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGTCAAAGGGTCTCGTGAAGTTCTCCAC:1 + chr3R 27110376 3' + 1360 3258 1 71.29 GTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCGGAGCTGAAGTTTCAGTGTGTTTCAGTCTGACGATATTTATGTTAAATAGTCACGGCCTGCTTCTGTGGCTTCG:1 + chrX 22807970 3' - Chimpo 130 1 59.41 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTT:1 + chr2R 4502509 3' - roo 8685 2 58.42 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGCAGTAGTGAACAACC:1 + chr2R 24493749 3' + flea 4994 2 62.38 CCATACGAAGTCACAGGGGTCAAAGGACCTTGACGATTTAGCGAAGGACCCAAAGTCAGACCCCAAATCCCCGACAAAGGCTTCTACAGGGTCCGGTCCAG:1 - chr2R 24510319 3' + flea 4579 1 78.22 GGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTAGCTACCGAATGTAAGCACCTGGCTATAACCTTTGCCAGTCAAACACATCGCTAAGCATGTCAACTTATTTCTGC:1 + chr3L 25585666 3' - roo 251 2 74.26 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGAATCATATGACGACAAGC:1 + chr3R 14688340 3' - pogo 9 1 60.40 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCCATTGCTTTGCGGCGTTTTCGATAGCGAAA:1 + chrX 19457241 3' - roo 8669 2 73.27 ATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATATTGACTTTTAGTGCGATAGTCAAGCCAGCGGA:1 - chr3L 13607705 3' - mdg1 7451 2 67.33 CTTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAGAATAATGTCCTTGTGCTGAGATATTTTGAGGATGTTTGTTCCGATGAATATTTTGTCGAAATTAAACGTAA:1 - chr2L 20262723 3' + 1360 189 1 78.22 TTTGTAAAATAATTTAAATTGTTAAATGTAAACAAGCCCTGCAATATGTTAATGTTACCAGTCCATGCTACTGTCTAAAATTTGATAGCAAGCGAAATTCT:1 + chr3L 16566811 3' + HeT-A 5807 1 77.23 ATAATNAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAATTAAATCTTTCTTTCTTT:1 - chrX 14713194 3' + flea 233 2 61.39 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCATGACTTTGTTAGGGAAGAACCGCAGCCACAAAGGCCAACAACATTCCTTAAATTG:1 + chr3L 4386541 3' - jockey 28 1 58.42 ATAGAGCTACAACAATTTGTTCAAATTTGTTCAGTAATATCCATGTTGTAGTGTGTTCAATTTCTAACCAATTTGAAAAACTTTCAAAAATTCATTTATTT:1 + chr2L 8736594 3' - hopper 1008 1 66.34 AAAAANGGGGCGCAAAAAAAAAATAGAAAACTGAGGGGGAGTTCTTCGATGAGATGCGAGTCAATTGCACATGGTTTTCCATGCAGAGCGATTGTGCTG:1 - chrX 4758803 3' - Cr1a 24 1 77.78 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATATGTACTCGTAAACTGCAATTAAAATCTCAACTCTATATTAAATGCTTGCAAATTACGTTCG:1 - chr3R 28728262 3' + jockey 4978 1 61.39 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGCTGGCCAGTGTGAAATTGTTTCCAAATTGCCGCCCGAAAGTAT:1 + chr2R 19357423 3' - jockey 4709 1 59.41 TCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTGTAAGCAGCCCAGGTGCACATTTTCCAATACATATCTTTGGCTGTATATACATTGATGTATCTTCTG:1 - chrX 22502207 3' + INE-1 146 1 65.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAAAAATTAGAGCTTATTTTGCATCACTATTCCAGCG:2 - chr3L 11435557 3' + roo 400 1 58.42 TTTATATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTGTGTATGACTCACAATAATTGGGCATTTCTG:1 - chr3L 10699109 3' - roo 8711 2 67.33 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATGTACAAAATCTGTAAATAATTTTACACATCAAAATGAGAAATGCTTAAA:1 + chr2L 21089240 3' - flea 20 2 59.00 GTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTT:1 + chr3R 7522351 3' + blood 7338 1 77.23 AAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCT:1 + chr3R 4604451 3' - gypsy 150 2 58.00 CTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGCAGTAGCAGGCTATTAAATAAATAAAACTTGGCCAGAAAGTTATTATTTGGCCGA:1 + chr3R 20502623 3' - Doc 4512 1 60.40 AAAAATATGAAAAAGAATTCTTCATCTATTTGTTCTCTAGAAAATAGAAAATTAGTTTCTCCTACATATGTAGTTTTTTCAGAATTTTAATTTCTATAACT:1 - chr3R 19680436 3' - Tom1 169 1 52.48 TAAGCACCCATCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGCAAATGTAAGGACACTCAATTAAAGGAGCCATTCATGAAAACTGGC:1 - chrX 11014862 3' - Transpac 195 2 57.43 ACTGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCT:1 + chr3R 28755636 3' + 3S18 6104 2 55.13 TTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTGG:1 - chr3R 28755919 3' - 3S18 5779 2 59.41 TCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTAAACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAACTACATTTAACTAAGCGACAACTATTTAAAAAACAAAAGAGTT:1 - chr2R 13144929 3' + roo 9071 1 80.20 AGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCC:1 + chr3R 9952228 3' - Ivk 50 1 75.25 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATAC:1 + chr2R 12446372 3' - jockey 4705 1 58.42 ACGTGCCTCTGCCGCAGCGGTCAAACGAAAGCGCCTCGCACCACGCCCATGAATCTCTGACACCCAGCCCTAGGGCAAGGAAGGTGTGTTGATATTAATGT:1 + chr3L 20381718 3' - invader4 88 2 64.36 TTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTCTGTGCGATATTATTTTTATTGTAATTTAATGAGTTCTGAGCCTAGGGCAGCTTCTTGGTCGGAGGAATTGA:1 + chrX 10434515 3' - P-element 439 1 80.20 GCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCC:1 + chr2L 13447167 3' - HMS-Beagle 37 2 64.95 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCATATGATCACCACTCTCAATTTAGTTTATAAACAACGCTCGCCGGCTGC:1 + chr3L 11070569 3' - P-element 27 1 48.51 ATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTAGGAACACGAATAATAGGAGAAGGAACATAGAGAAGAAGTAAATAGCGACCAAGCACATACACATTATTT:1 - chr2R 4260432 3' - micropia 178 2 82.18 ACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGTAAATGTAACTAAATATTTAATAAAGAAAATAGTATGAAATAT:1 - chrX 13682557 3' + roo 9050 2 49.50 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCCATTGCCAGCAGACCTTGTTGG:1 + chr2L 7459605 3' + BS 5045 1 80.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTTGAACCATAAAGATGGAGAGAGAGAGAGAGCGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - P-element 9 2 37.14 TAAACGGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCC:1 - chrX 8031381 3' + roo 350 2 80.20 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACTTCAACGGCA:1 - chr3R 7522280 3' - blood 11 2 68.32 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATA:1 + chr2L 12074546 3' + Juan 4174 1 63.37 TCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATTATGTTTATATATATTATATTTATCCCACTATATAAATGGTAAAAATAGCGAAAAAT:1 - 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jockey 35 1 56.44 GAATATGGTCAACGGTGAGCTCGTCCCCGCATAGTTGGCAAGTAGTTTCAGATGCGCCTCAATTTCCTGCGGTGTGAGGTTCGCCCGGAAGCTGTTCTGGA:1 + chr2R 15377108 3' - Ivk 5129 1 66.34 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAG:1 + chr3L 13081001 3' - 412 7086 2 58.42 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGTGCAGTTAGTGCGGTTGTGTTTACACATTCTAGATCGC:1 - chr2L 21978103 3' + roo 9032 1 63.00 ATCAATAACTGCTTGAAGTCTTTTTGGTATTGACCTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 - chrX 3538812 3' - Bari1 1350 1 71.29 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTTAAAGTAAACACAACCTCCACTTGGAGACCAGTCAGCAAATTTCAAT:1 - chr2L 22921260 3' - copia 4900 2 58.42 TAGAGNAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGC:1 - chr2R 12185322 3' + accord 7362 2 55.45 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATT:1 - chr2R 9862195 3' + roo 9055 2 57.43 GTTGTCTTCATTTCCCATTTCGATCATTCAATATTCAATGTAAACTTAAAAACCGTGTAGTACATCAGAAAAACATAATTATTTTCATTAAAATAGTATCA:1 - chr2L 6151623 3' - G4 124 1 64.36 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAACCATATGTCGCTTTTGTAAAAC:1 + chr3L 2024404 3' + copia 245 1 65.35 GGCTCNCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGACG:1 - chr3L 25232764 3' + accord2 7603 2 49.50 GAGAANCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAATTTCGATGCAAGTATAATTCCTTTTGACGCAGT:1 - chrX 20364218 3' + opus 485 2 66.34 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATATTTGCACCATAAACGTTATTTAAAACAAAAAATTAAAAA:1 + chrX 8854737 3' - Stalker2 7263 2 58.00 ATTTTCATATTCTTTTGTATTCAGTCTTAAGCCAGAGCTTTAATAAATCCTTTTGAGGTTCCCATTTTAGTCCTAAAGTTTTAACACATTCATTTTCGATA:1 - chr3R 19445784 3' + gtwin 228 2 59.41 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATCTTATTTGGTTTTATATTTTAGAATACAAAACGCATATGATATAACTATGGCT:1 - chr3R 22530777 3' + Juan 4191 1 54.46 GTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGAGCAGGCGAGATGCCTGG:2 - 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Cr1a 4046 1 68.32 AATTTACAATGCATTAGCATACACTGTGTGTGCACAAGAGGGCTGCATAACACCATTCTCTTTGTTTGCAATTAGAGTATCTATTCGTTTTACTGCGTATT:1 + chrX 1018163 3' - 1360 190 1 80.20 TTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTT:1 - chr3R 6769706 3' - mdg1 38 2 62.38 TGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGGCCCCGATGTAATCTTCTTTTTTGCCGTCCACAAAGCTTAAAAGAGATTGCGGTTTATGA:1 - chr2R 5698432 3' - 297 6927 2 68.32 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCAAACTATATATGTTAAGATACATTGG:1 + chr2R 20838651 3' + 1360 3338 1 77.23 CACTTTTTTGGTGACGGTCAAAATTAACCACTTTCCGCTCCACGCGAAAATCGTCGCGCAAAACTGGCGAAGAAAAATTGCAAAAATATCAAAAAAGCACA:1 + chr2R 22699101 3' - 1360 3329 1 62.38 TCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATAAATTAATTTCACTCAACATAATAATGGTATATATATACAGCAATGAAATACCTT:1 + chrX 20880669 3' - invader4 22 2 58.42 GGTGTCAAGACGAGGCAGGCGTAGAGGCCATCTGTCCCGTTAAGCTCAGCTCCACAATGTTGACATCCACCTGGAATTTGCGAACCAGCTCCACCAAGGCG:1 + chr2R 22611757 3' + R1A1-element 435 1 70.30 ATATATTTTTATTTTATTTTATTTATTTAGGAATTAGTTTGAAAAATAATTCATTGGCATACAATAACCAGATTCATTAATTCGCATCGGTTGCATTTGCC:1 + chr3L 14334947 3' + transib1 1895 1 76.24 CTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGTATTATTTGGAAGTGTAAGTCTAGTGTGAGCACCTGCCTACAATAGAACTCCAGACCTCGAGTTACGCCCGCCCGCC:1 + chr2L 514957 3' + 3S18 340 2 75.25 CTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGACAACACCGAGTTATCTTTACTATTTGGAAAGTTTCCAGGAAT:1 + chr2L 1156807 3' + 412 463 2 61.39 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTG:1 + chr3L 10811183 3' + P-element 2828 1 22.77 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTT:1 + chr2L 21978142 3' - roo 53 2 76.24 GTTTANTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTGATTTCAGATA:1 + chr2L 8691297 3' + Cr1a 215 1 55.45 AATAAATAATAAATATTGTTAAGAAACAAAAATTTGATTACCATTACGATTTCTAATCATTATTTAGTGCCACCTGTCGGCCCAGTGATTATTGCTTCAAT:1 - chr2R 15052053 3' + Juan 4060 1 40.59 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGG:1 + chrX 15195308 3' + Transpac 5210 2 61.39 TATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGCATCATCTAGTCTTCGGAGGCATCGCGCACAGCCTCTGTGGAAGACTCGGCACCACTGGGTGTCTCCTCCTCCT:1 + chrX 18390841 3' - F-element 302 1 76.24 CGAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTAGTAAAGGGGATGAGGATAAGGCCAAGGAATAAAAAGGAT:1 + chr2L 19857357 3' - 1360 41 1 71.29 CTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGTTTGCTTCGTTTGATATACGGATGAAAATTTAAATTGA:1 + chrX 22636452 3' - jockey 4958 1 62.38 TTTATAATATCATTAGGTATTTAATTTCAAACAATTTAACAAATGTTTCACTTTTATTTCTTCAACAGTTGTAGCGCTTTTAATGACGATCATCACGACA:1 + chr3L 24253266 3' - 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roo 46 2 71.29 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAAGTTATTAGGACCCCAAAAATGA:1 + chrX 10653578 3' - jockey 62 1 77.23 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTA:1 - chrX 12294704 3' + blood 7344 2 68.32 TTTTAGGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTTACC:1 + chr3L 21203057 3' + pogo 2059 1 64.36 TTACTNATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAGCA:1 - chr3R 19114199 3' - 297 37 2 71.29 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATAAACCTTTTGTTGTTTAAAAAATTATCAGTTAAAC:1 - chr3R 12571480 3' - roo 40 2 75.25 CAAGGTATGACTTCGATGATCACGGTGTGAAGGCAGATCGCACTCCCTTCCTTAAGAGTATACCAGGGGCACTCCATCTCGCATCGTATTACTCGATTCGA:1 + chrX 5442450 3' - Rt1b 4970 1 73.27 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGTTGGTGCCGAAATAAGAGTA:1 + chrX 495244 3' - 412 7077 2 53.47 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGTATGTACATATATCTTTTGACGG:1 + chr3R 23665316 3' - 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chr2L 15956025 3' - Max-element 23 2 56.44 TTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGAAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTCCGATA:1 + chr2R 22605998 3' - Juan 4040 1 59.79 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCATTTGAGTGGTAACTAGGCTTTGTGGTTACTCGGGAAAAACCAATTTACCTAAATCTGACTTGCTCCA:1 + chr3L 11654629 3' + pogo 2096 1 70.30 TTTAAAGTTTATTTTTAAACTCAAACATATGCTTTTTCCATACGAAGCCGAATTACTTCATTTCTGATAACGTAGTTAATTGAGAGGGCTTAACGCGTTTA:1 + chr3R 19355296 3' + hopper 182 1 88.12 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTCTAACAAGTAATCCGCTTGATGAAGTA:1 + chr2R 23945290 3' - BS 5042 1 73.27 ATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGCAGTAGTGAACAACCACCCAC:1 + chr2R 24493755 3' + flea 5000 2 68.32 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGGTACTCTTTTTTAGATCTCTTGCATCTC:1 + chr2L 11045377 3' + P-element 2878 2 69.31 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTCCTTTTATGCGATACGACTGCCATATGTGAGCTTGGAGCGGCAACCTTTTA:1 + chrX 18193801 3' - hopper 25 1 52.48 ATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAAGGTGCAAACTCTCGGTCTGCAGTATTTCAGCAGTTCAGTTATTATTGGGAAAGTTCAAGGGGCG:1 - chr3L 5004373 3' + 3S18 6060 2 61.39 GATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACCTATTAATAATTACCTACCTGTATATTTAACACGTGTCGACACTTAAAGTAATAAAATGGT:1 + chr3R 16931842 3' + Tirant 404 1 60.40 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTAC:1 - chr2L 19642977 3' + roo 9034 1 62.38 AGGCCGCTATGATGTTTTTCCCTTTGTTAGCTTATAGTCAGTTCGTTTTGGATATTCAAAGAATAAACGAGCAATGCAGCAACAGCCCTTGCAGAAGCAGC:1 - chr2R 924955 3' + springer 114 2 72.28 GCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAAAACGGTGTCAAGCGCTCATTTCCCTAATTTAGTTTACATTTT:1 - chrX 17724230 3' + roo 8816 2 57.43 TTTTTTCAACTATTTTTTTTTTTCGTTTCAGATTTGCAACCTAACAAGTAAATCCCCAATAAAAGTTAACTTTTTTTGCGGTAGTTCGATAACTGCCTTTT:1 + chr3L 1907010 3' + FB 174 1 78.22 TTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGAGAAATTTTTGACATTTAATTT:1 - chr3R 19144383 3' - Juan 5 1 61.39 AACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGTACATGTGATTCTAAATACAATTTATCGTAAGGATAAACTTTTTGATTGT:1 + chr3R 14324267 3' + 3S18 6077 2 51.49 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACACAAGATGTGGGACAATCACTTGTAGGGAAATAACTTGTATAAAAAGTTCACACA:1 - chr3L 25663130 3' - HMS-Beagle 6858 2 73.27 ATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATGGTCGAAAAAGCTATATTCTACCTGTTACATATTTACAACGAATCTGGTATACCCATTTA:1 + chr2R 2957715 3' + McClintock 465 2 60.40 AGCATCCGAAGTATAGCTTCGTGTGTCGTTCGTCGTTCCTGATGTTACAGAGAGCACTAACTTATAAATAGTTAATACTATAATCTATGTGCTTAATGTCG:1 + chr2L 16303322 3' - Chouto 49 1 58.42 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTATGCCGACTCTTGT:1 + chr3L 9692759 3' - P-element 13 1 62.38 TTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGCATACTTACTTGTGAATGTTTAACCGCTACC:1 - chr2R 17443083 3' + S-element 1673 1 71.29 AAATATAACAGAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTG:1 - chr3R 2555516 3' + Bari1 1660 1 69.31 CGCAGCCGGCAAACACAGCATATTTGCGTGGCCGCTGCGAGTCTTTTGTTTTTCAATGTAACTACATTTATATTCCATAGTTCATATTCACTTTAAGTTTG:1 + chr2R 14740179 3' + Gypsy6A_LTR 92 1 57.43 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCT:1 + chr2L 11686080 3' + hopper 1387 1 54.46 TTCACACTAGCTTCGTAACGGGTATCTTACAGTCGGGGAACTCGACCATAGCATTTTCTCTTATTAAATATTAATTATATACGAAAATGCATTTTTGTATA:1 + chr3L 21145686 3' + INE-1 537 1 71.29 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTA:1 + chr2R 12779172 3' - roo 20 2 62.38 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGC:1 + chr2R 19936688 3' + roo 9044 1 54.46 ACCCCTTTTCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCATGACCACATCCACCATCACTGCATGTTTCATAACTTTTCATTTGAAAACGACGCCGGAG:1 + chr2L 15919874 3' + Cr1a 4138 1 60.40 CGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCG:1 + chrX 22386795 3' - hobo 52 1 64.36 CCAAATAGAAAAACTTGTTGGTGAAAACTACAGTGCGTGGGCTGTACAAATGAAGAGTGTCTTAATTCATGCGGAAGTTAATCGGTTAAAGTTATATCATT:1 - chr2R 2952940 3' + Dm88 334 1 73.27 GCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAACACAT:1 - chr3L 24131084 3' + HMS-Beagle2 7170 2 54.46 ATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATATATAAATCCCATGTTTTTTACTTCACTCAAAAAAGAATTCATTTTC:1 + chr3R 18572792 3' + Stalker 6904 4 56.44 TTTAAATAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAACACAGTTCGATAATATTCGAAAATTGTTAAATTGCTTGTTTTCTTTTTCGAGTGTTTAGTTGTGATTTGCAT:1 + chrX 19373070 3' + TART-C 11100 3 76.24 ATAATCTTCTTTAATTATCATATATTTTAATACATAATTATTAAAGATCCGTTCGATAGGCGAGGAAGGAACGAATGTGCCAGATGTGATTTGCTAGTAG:1 + chr3L 27089674 3' + Cr1a 80 1 60.00 AAATTGTTTCAATTTTTTTAATATTTTTTAATTCCCTCGAGAATTGAATAAATTTTATTGTAAAAAAACATCGCCTCTTAATACTTTTTTTTATAGCAAAT:1 - chr3L 9758350 3' - HB 322 1 44.55 TTAGATCTAGAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTAGTGAATTTAATTTCTTTTCAGATACTTGTTCATAGGAATCGCTCAAGTATAAAATCTAA:1 - chrX 13132640 3' - Cr1a 4146 1 59.41 CGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGTATGTGTGTGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGAGGACAGTCTGTTCCAAGTAAACAGTTTGCTCCGACTCCTCCTTTG:1 + chrX 6461514 3' - blood 7354 2 75.25 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACAAAAGGAGG:1 - chr3R 17121613 3' - mdg1 7053 2 63.37 GAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTAATTTTCAAACATTATGTACGTTATATACTTTTCT:1 + chr3R 14519217 3' - Doc 4540 1 66.34 TTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTTTAACTCTAAAATGACTTACCCAACGTTCCTTTTAA:1 - chr2L 17520057 3' + 297 458 1 68.32 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGGTGGCTGTCC:1 + chr2R 19857400 3' - 297 6611 2 68.32 TTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTACACAAACGCCCTTGACAGGCGCAGTCTCACCCGCGCCCACTGAGAGCGGAACGACGG:1 + chr2L 8542617 3' - P-element 127 1 66.34 AGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTTCCAAAAAGCCGACGAACCGGTCACGCCCACATATCACATTATACTATGTGGCCAACGACATGAATCACGGGCCAAA:1 - chr3L 2892327 3' + INE-1 300 1 57.43 AGTGTACCCTTGATATATGCACATACTACAATAGCACTCAATCAGTAGAAGAATGCCAATTCAGATTCAGATAGTTTTTCCATCATAGCTTTTATTGTAAT:1 - chrX 4154890 3' - blood 7020 2 66.34 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAAC:1 + chr3L 21841336 3' - P-element 49 1 26.09 AAATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTGTAATTCAGCTTAGTA:1 - chr3L 19938439 3' + pogo 2014 1 54.46 ATTATGGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACGTACCCA:1 - chr3R 25823631 3' + hopper 1399 1 59.41 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAACTTTAT:1 + chr3R 15998137 3' + pogo 2065 1 65.00 ACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTACACAAATTCCCTTGAGAAAAGTGTGCATTTCCCTTCGAAAATTATCCTGAGCAATTTTTTGATTA:1 + chr3L 10450680 3' - X-element 25 1 35.64 TTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCAGATCAAAATTGTGACTGACTGCAGCTTAGCATGCCAAGACTTTTGCTTC:1 - chr3L 4047709 3' - 3S18 6052 2 76.24 AAAACACAATTAAAAAAAAAAACAATCTCATTTAC:1 + chrX 11977347 3' + gypsy2 424 2 97.14 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCATTG:1 + chr3L 18009635 3' + roo 9047 1 57.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAACGATATACTTTAGGA:2 - chrX 2762100 3' + roo 397 1 66.34 AGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCATAAGTGCCTGCGCATAATAGTGAAGGATCAAAGAGTCTGCAGGAGAAAATGC:1 - chr2L 2253617 3' + F-element 305 1 55.45 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTACACTCTGAGTGC:1 - chrX 495173 3' + 412 7508 2 60.40 AGAGAACAGGAACGAGAAAATGAATATAATGTAAAAAACCTATAATAATATTAAGTTTGATTATCAAATCAATTTATTTATAAATTTATAAATAAATATAA:1 - chr3L 19561357 3' - Cr1a 4340 1 60.40 CGTGTGCACACATAAAGTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGTTCTTCGTTCTTGTCTAAACTAAACTTTGCTTAATAA:1 + chrX 21205119 3' - 1360 169 1 70.30 CTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTAGTGTTCCGTTTGTAGTCCACAGTGTGCACCAACTGCTATTTACCCGCTCTTATATTGTTT:1 - chr3R 31011235 3' + R1A1-element 42 1 56.44 TTTTTAGGCGGGTAGAATGATAGAAAAGAACCGAGTCAGGCCGTCCTAGTGGAGCACCAGTGAAGCGCCCTTCCCATCGAAGATTCCGAAGAGGATAAGAA:1 - chrX 19597113 3' + Gypsy12A_LTR 496 1 66.34 AAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAAAAAACAAGAGTGATTCATTGAG:1 - chr3R 13000355 3' - R1A1-element 4915 1 67.14 ATGTGGGCGGGTGGGTATTTCCCGCTAGTTTGGCGCCACTTTGCACGTATTGCGCTCTTTGCAATTTGTTTTGTTGATTCT:1 + chr2R 17326629 3' - gypsy6 423 1 54.32 GTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATAGTAGTATACAAAGAAGAGTTAAAAAAGATCCG:1 - chrX 12729534 3' - gypsy10 44 2 68.32 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAGCACATAACAATGACTTCACTTGCCGTACTTTACCTCAATTTCTTGGCCAGAGTTTGCTGCGTCAATGAACTTC:1 + chrX 7787326 3' - roo 4 2 75.25 CTTAGCTTTTTGGACAAATTTGTAAATTTTTGAGATATTTTCACAGAAGCCAGTGGTGGCTTGTGGCTGCTGGTTTCGCTGGTTATTGTGGGTGGCGGGGC:1 - chr2L 21230806 3' - Ivk 5257 1 54.46 AATAATAATAATAATAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACC:1 + chr3R 17615178 3' + mdg1 31 10 59.00 TAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAAAAATCCAATGAGTAATAAATTATTGTTCTA:1 + chr2R 18295651 3' + I-element 5304 1 77.23 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAA:1 - chrX 13548770 3' - blood 7061 2 81.05 CCCACTGCGCTATCCATCAACTATAAGATGGCCTACGGTAACGACCTCGCCAACTGGACCCACCACCTCAACCGGCACATCGACCACCACAACCACACC:1 + chrX 2941813 3' - Rt1b 378 1 65.66 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTCCCC:1 - chr3L 10736464 3' + 412 449 2 69.31 CAAATTCATGTCGTTTTGGCTGTGCAAAAAAGAACCGACTTTTTGGAGAAAACAATAAATACATTCGGATATTTTCAAAGGGGGGACCATGTTGTGAAGTG:1 - chr3R 3591763 3' + G3 1 1 65.35 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCCAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAG:1 + chr2L 13837927 3' - 297 6621 2 69.00 AATTTTTAAATTTTTTCATTTTATTCGCCAATATCTATCGATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGTGTTCTCAATGTTTCCTTTGCTGATTCAAATACA:1 - chr2L 21301785 3' - 1360 3031 1 71.29 TGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTCACGTTCGTGGAGCCGGCCAGAAATATATC:1 - chr2R 24493678 3' - flea 4799 2 70.30 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGCCTTCTGTGTGAACCTGCACACATTGCAATTTGCAATTGGTAAGGCGGGTCGGGTTCCAGGATCCCTTTCCCTGGA:1 - chr3L 946259 3' + Tirant 8475 2 83.17 TAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTGGCTTAAAATTAAAGTTTTTTAAACTAAAATTTCACTGCAGTAGTATTAGGCCATGGAA:1 + chr2L 19768452 3' + I-element 5341 1 57.43 TTTTTCGATTGCCCACATTTAAAATACACCCAATTTCGTTAGCCCACACACGATAGTTGAAAAACGAACGAAAAACGAAAACAGTTACTGCGTAGAGATAA:1 + chr3L 3992872 3' + FB 422 1 58.42 TGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAGATGGACTTAATACACCAAGCAGACAAGATCTGATTTATTAACCCATCG:1 - chr2L 10118855 3' - hobo 2710 1 76.00 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCATCAATTTGCAATAAATGAATGCC:1 + chr3R 12767068 3' + 412 7495 2 76.24 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTGTAGACTATTTGTTTTCATACTCACTTTTTTCTCAACTCATCGAACGCAATTTGGGCCAGC:1 + chr3L 9858352 3' + pogo 2091 1 71.29 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGC:1 + chr3R 31458534 3' + jockey 4961 1 54.46 TATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTGCTGGTGTTGCAGTTTGAACTTGTTTTTCATTTTCTTTATTTTTATTATTTA:1 - chr3L 23628598 3' + copia 119 2 63.37 TCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAAGTATTTAGTGAGACGGCGATAGCGACACCAGGCACCTTCCGGTGTCCTGGTGACTGCACAGGATTTAATT:1 + chr3R 9396419 3' + roo 8771 2 75.25 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCTACAACTGCTGTAGTTCCCGGAATAACCCGTGCTTTCAA:1 - chr3L 8974080 3' + P-element 2854 1 44.55 ACACAAAAATGCACTACGATTAGAGGCGACTGGAGAAGCGGAGTGGCAGATGTTGA:1 - chr2L 17756174 3' + Tabor 480 2 89.29 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAATTCT:1 + chr3L 13994257 3' + P-element 2843 1 33.66 CCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAAT:2 + chr2L 12074542 3' + Juan 4170 1 67.33 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTGCGAGATTGGTAAC:1 - chr3R 21695419 3' - 3S18 5780 2 63.37 CTCTGAGCAAGAAATTGTTAATAATATTCAGTAGCAGCTCCTTCCCCGCTCTCCCGCTCGCCACAATTTCCGCACAGAGCTGCTACTGAATATTATTAACA:1 + chrX 2676106 3' + Tc1 124 1 63.37 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCACATGTATGAAGGGTATACGGTAAAAGCTGTAAAAGTCTAAC:1 + chr3L 10736517 3' - 412 7089 2 63.37 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAGTTTTAAACTGCGACTTGAA:1 - chr3R 11993289 3' + P-element 2857 1 49.50 TGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATGCTGCTTGATATTCGAAAATGTAGCTCCTGAGTGTATACCACATTGTCA:1 - chr3R 2555497 3' + Bari1 1679 1 52.48 GAGTANAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTGCTCAATTTAC:1 - chr2L 326108 3' + roo 9063 1 74.26 GTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGAAAAAA:1 + chrX 5018698 3' + opus 7469 2 60.82 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGTTTGTGTGGGCGGGCTGGGCGGTGAAAGGTGAAGCAGGTCC:2 + chr2L 6252597 3' + P-element 2885 2 77.23 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCAATGCAAATACTCCTTTATGGTGTGTGAATATAATCATCATACCCCTTGCCTGATGGGTCGGAACGGAA:1 - chrX 19306727 3' + P-element 2881 2 73.00 TACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCAT:1 - chr3L 11909946 3' - Tabor 6884 2 71.29 TACGGTGCTGGTTGCGCAAAACTCAGGTGCTGAGTTGTGGGTGTTTGGGCACAGGCCCCCGATTTAATTCGGATTTTTCCCGGCAGGATGTACTTATCCTG:1 - chr3R 10687120 3' + R1A1-element 5062 1 64.36 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTGG:1 - chr2R 5849954 3' - jockey 26 1 60.40 ATGCTNTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGATC:1 - chr2L 1156731 3' - 412 7080 2 53.47 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCA:1 - chr2L 7459547 3' - BS 5007 1 64.36 CGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTTATATTTGCGACTAAATAATGTTTAGGTGTTCCCGGACAGGATTACTATTTACATGCAGCC:1 - chr3L 18576691 3' - gypsy3 6585 4 68.37 TAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAGGTATTTTCGGATTTGCTTTGAATAAGTACAGCAATATGCCCTATCAAACTTGGGACCTGCGGC:1 + chrX 18047922 3' + P-element 444 1 69.31 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGGGCCATAAGGAATTCATTGTAAAGTTTTTTGCTTATTATTATAATGTCTGGT:1 + chr2L 13245000 3' - P-element 23 1 54.46 ATTGACCGTCCCTAGCTAACCGTAGAACTATGCTTGGAACAGTCTTTATCTGAATCAATTTGGGTTAATTGTTCGGCTCCAAAGAATGACGAAATGGATCA:1 + chr2R 19629533 3' + Cr1a 3999 1 56.44 CGAATTGTTTAAGTATCCCATCCTGTGAAAATATATTCTTTGGAAAAAAGTATACTTTCGCTTACAAGGGCAATTAAATTTGTGCTGAGGTGGAGATGATC:1 + chr2R 17064134 3' + Ivk 5211 1 71.29 ATATAAAAAATAAAACAATAAATTTAAAAAATGTAGCTTTCAATGTTTTATACATGATCAATTTGTTTCTCTGTACTTTTACACACATGATTACGAATGTT:1 - chr3L 2410982 3' + gypsy11 3929 1 44.55 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGGCAGACCG:1 + chr3L 21841349 3' - P-element 43 1 37.37 ATGTTGGTTTTCAAATCTTGTAGGGTTCTAGTCCGGTTGTCTGGCCAAATGGCAAAACTCGTTTTTAATATTCAGCCTGC:1 - chr3R 28060693 3' - mariner2 651 1 67.50 ATTTTGCTTAAATCGGATTGAAATCGAAACAGTTGAAAAGAGAAGTAAATTCTTTAGTGGCGAGGGACAAACCAAAGTGGGACATTTCGGAAATAAAAAAG:1 - chr2R 23201204 3' + Tc3 1657 1 69.31 ATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGAATATGTCTGTCTATCTATCATGTATCGCCTGCAGATGGTCCAGCTGTGGTGCGCGTCAACATA:1 + chr3R 19756061 3' - R1A1-element 319 1 67.33 ATAGATTTTTTTATATTTTATTTATTCTCCGCAAGTAGTTTTCTGATTAAAAGCAGTAGTACTTATCTCGCTGCACTTCTAATTCTAATATTGTCGATCTG:1 - chr2L 7029252 3' - transib4 2279 1 74.26 GAGACNCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCCCAAGTCGTCATCCATTAAATGT:1 + chr2R 17028281 3' + invader3 5380 2 76.24 TATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGGATATTGCTCTAAAAGTACCAATTCCACTGCTCGTTTCTTTTAGTGTAGGGACACGTAACAGGAA:1 + chr2R 21140713 3' - Stalker4 6968 4 65.35 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATAAATTCTAGACTA:1 - chr2R 12213925 3' - Transpac 4955 2 62.38 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAA:1 - chr2L 13250377 3' - pogo 43 1 72.28 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAGGTACTATAGTGCCAATGTATGTTTATTTTTAAT:1 + chr3R 13376061 3' - 1360 6 2 74.26 AAAAAAGGTGGTCCTTCAAATCGACGCACCTGGCATTCAAACCATTGACGCGGTGCCCAAACCACCACCGCCTCCAGCAACGTTCCCTACCAGACCACCGC:1 + chr2L 2368464 3' + HMS-Beagle2 6732 1 67.33 CGTATGAATGTCGAGGTCTCAGAAACTTTAAAATGTTTTGAAAGGAAGTGCGAGGGAATATTCAAGCCGCAAGGCCAGATAAAACGCGAGCTTTGAAACAC:1 + chr4 155211 3' + INE-1 136 1 73.27 TCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAA:1 - chr3L 24213779 3' + invader2 5074 2 56.44 GTCTGTACGAAAGCGAGAAGCATACAGAAAAATGCGGTTAGGGTTGAGTGAGCGGTCCCAGTGAATGGAGTTGGGTGCGTGTACGCCTGATTATACATAAC:1 - chrX 18578277 3' + invader1 157 2 68.32 TGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCACCGCTGCAGTGACCGCCATGGTGGCACCGATTTCCGTATCGCCCAAGGGTGGATTACCTTTGCCGCCATCGAAG:1 - chr3R 14647971 3' + 412 389 2 80.81 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTACTGTTGCCTACTTCCAGGCATAA:3 + chr2R 5850028 3' + jockey 4959 1 52.48 CAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATCAGGAGTTCGCCAGGCATTCGAAGGGTATTCACACTCCCGTTTTCGGGTTGAACACTCTTCCA:1 - chr2R 8805158 3' + BS 4817 1 66.34 CAATTAACGTTTCTTAAAGCTAAGGGTCCTGTTTCTTATTTAGGGAAAGTTTTTTTTTTTCAATATTATTTACAATAGCATCGGGGCAAGATCATGAGATA:1 - chrX 17264794 3' - mdg3 5184 1 64.36 GATTCAAAAGGAATCGTTTAGTCAATTCCTCTGAACTTAACCTATTGTGTGTACCACCTTGTTTGGCTGCCATTTCATCCACGACTTGAGCCCGCTCATTA:1 + chr2L 8864173 3' - G5 4806 1 56.44 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTATTCTATGCG:1 - chrX 4796934 3' + copia 238 1 61.39 ACATAAATAGAAATATGTAAAAACTTTTTAATATGAATTTGTTAACCTTACCCAAAATAAACACATTCCCTTTATTGAATCATTGTATTGTATATTGGTGT:1 + chr2R 11619378 3' + 1360 2961 1 65.35 CCCTAAGTCCCTAGCAATCAAGTGTGGGCGTCGGCAGCGTCGCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCAGTGGTCGTTCAATACTCATATGCGAATGCGAGCCGG:1 - chr3R 6935726 3' - HMS-Beagle2 7095 4 72.28 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACAGTAAAGCCTCTCGCAGACGAATAGTGCC:2 + chr2R 9277567 3' + roo 360 2 74.26 GATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGC:1 + chrX 16798265 3' + diver 185 2 62.38 AAAAGCTAGAAGGTTAAGATTCAGCATACAGGTTCTAGAGACGTTTCCCCCGACGTTGTTCTGCTGCTGGTGTCGAAGGTTGCCATTATCACCACGTTGAC:1 + chr4 919054 3' + INE-1 165 1 64.36 ACATGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACACCCGAAGGCGTTCCGAGTAGAAAGGCGGAGAAAGCTACTCGGAGTGTAGACAACAGGAG:1 - chr3L 20286318 3' - Tirant 456 1 63.37 AAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAA:1 - chr3L 24213790 3' + invader2 205 2 67.33 ATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTCGTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTAAATCATCTGCTAGTTTTTCTGTTATAAATTAT:1 - chr3L 7990477 3' - 1360 3146 1 69.31 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGGCACTATATATATTTATTTTTTTTTT:1 + chr2R 11641614 3' - 297 6600 2 85.25 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAA:1 + chr3R 13715162 3' + P-element 2870 1 62.00 AAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAAAAATGTAAAATATAAATGTGGAAAACCTTTCCCTTTGTTTTCGGGGAAATTTTGCTCACTTGAATGTTGGGCTATTAA:1 + chrX 14301734 3' + gypsy7 5008 1 70.30 CTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAATGTTGCGTTATCAGCAGGCCGTCC:1 + chr3R 7360387 3' - jockey 12 1 73.27 TAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAGGGCTCCCCATTCGTAAACAAATCCGACATGTGAGTCAGCCAGGCGGGC:1 - chr2L 19786135 3' + I-element 5138 1 55.45 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAAAGTCACATACACACACAGGC:1 - chrX 10730619 3' + P-element 2872 1 67.33 ATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGACGACGGGATTTTCTCGGCGGCCTTGGGATCATAT:1 - chr3R 12992062 3' + F-element 4316 1 56.25 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCTC:1 + chr3L 8974148 3' + P-element 2854 1 46.53 CTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAAC:1 + chr3R 15943317 3' - jockey 4688 1 72.28 ATTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTCTGTGGTCGCTTTCCGTTTTCCGTTTGCTTACTTTGCATTTTAACACCTACCGTCTGTTCCATTTCGTTTCCAACACGT:1 - chr2L 5461067 3' + hopper 143 10 77.23 TTTTCTTGAATATCGATAGATATTGGTTAATAAAATGAGAAAAAAAGTTAAAAACTGTTTAAAAGTGTAGCCTGGCCTTTAACTTCCTTCACAATCGAGAT:1 - chr2L 20643268 3' - INE-1 499 1 65.35 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGGTCATCATTACAACTGAATCATCACCATCATCATGTTGTCA:1 - chrX 4488886 3' + 412 464 2 63.75 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATGCAAAGAAATTTCTTAAATTTGGATTATTTAACA:1 - chr2R 8560120 3' - 297 38 2 66.34 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCCACGGC:1 + chr3L 21384016 3' + roo 9039 1 70.13 TCTAGACCAAGTACAAGGCAGTCGTAAAGGAGTCGTCAAAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTTGTTTGGACTTGCATGCTTGCAAGTGTACTTC:1 + chr2L 10875882 3' + Tabor 337 2 68.32 TCAAATAATTAAAATAAAAAAAACTAGAATCTTTATCAAGCTTATACCGCTTTAGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACCTTTGGC:1 - chr3L 2532490 3' + Rt1b 5146 1 63.00 AACATACACACACACACACACACACATAACCCCAGCTAATTCCTCATTTCCTGTGACGTATGCACTAATCCAGCTTGTATTAAAACGAATCTTGGCCGTCC:1 + chr2L 16769913 3' + accord 7099 2 77.23 AATATCTTTTAAGCTACACATTAGGTTAAGTTCAGAAGGAACTGAACGATTCCTGATAATAATAAATGATTTACACTAAAAAAAAAATAGCAAGGAGGCGA:1 + chr3R 10096696 3' + G5A 2773 1 80.20 GTTAGATCTACAATGATTTAAGATTAGGGGGATGCAGTTCTGTGGTGGGTATCGGGGGAACCCCGATGTTTGTAGCGACTCAGCACTTCAAGTTCGATACC:1 + chr3L 27391959 3' - Cr1a 4147 1 69.31 GCGAAATTTCATAATTTTTCTGGCATATCGATAGATATTTTGGAATAAAATGAGACGGGCAGATCGATTTATTCCAAATTGAGTGCTGACCGGCATTTGTC:1 + chr3R 9903792 3' - INE-1 514 1 67.33 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGC:1 - chr3R 13715066 3' + P-element 2871 1 63.37 CAAAACGAACTGCTTAAAGCTAACAATGCTTGGTCAGCAATTTCAGCTACCAATATCAAATTAAGTTCCAGCCGATCGAAGTCCATGAACACAGCCTGAC:1 + chr3L 15562110 3' - gypsy3 6692 2 40.00 AAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATGGTCCTTCTTGAGCTGAAACGGTGGGAGGATGCACTGGTACAACGCTGGAGGTTTCGC:1 + chr3L 20693170 3' + Max-element 8528 2 61.36 ATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGATGGCTTGCGAAAGTGGCAGTCAAGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCCACCGATTTAGTCCTTTTGT:1 + chrX 22638580 3' - INE-1 95 1 39.60 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTT:1 - chr3R 25702198 3' - Tirant 48 2 74.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAACGCAGATGCTCTGCTGTAACACTGC:1 + chr2L 13060358 3' + P-element 2881 2 73.27 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACACTTTTGGGCAGACAAAAC:1 - chrX 17204107 3' + Tabor 429 2 77.23 CCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTGGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTATGCCCCACGCC:1 + chr3L 5015887 3' - I-element 4936 1 59.41 TGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCACTGAGAACTCCGCCCACGCTCATCG:1 + chrX 16798306 3' + diver 226 1 79.21 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAA:1 + chr2L 13060320 3' + P-element 2844 1 36.00 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCT:1 + chr3L 12085215 3' - pogo 46 1 73.27 GTAAAATAAAAAATAAAAATAATATAATAGAAGGAGGTGTATATTTCATAAGATAATGTTAATTACCGGACTTAAAGATACCTAATCTTCGAAGTTCGAAT:1 - chr2L 1303862 3' + F-element 4684 2 43.56 GTGGAGGACAGCACTGCTCCCAGGAGAAAAAACGAAAGAGCAGGGAAAATAGAATATAACATAGGCAACAGCAACAACCACCTAAATAGCACAAAATGTT:1 + chr3R 31899838 3' + HB 355 1 73.00 GGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATCACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTCCGCCATCATCCTTCGGGTAAACTATCCACATTCTTGCACAGGT:1 - chr3L 17170736 3' - Rt1a 4728 1 66.34 CTTCTNATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCATTGTTGTCTCAAGCATCCAACTC:1 - chr3R 20466605 3' + roo 409 1 78.22 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTCTT:1 - chr2R 9862192 3' + roo 395 1 60.40 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACG:1 - chrX 8031375 3' + roo 9020 2 76.24 GGGGCACTGCCAGCATCTCAAACCGCAACCGCATACAGCGCTTCCAGAACAAGTGCCTGCCACAGCCATCAAGTCAAACAACTGTCAGAAACTGTGAAACC:1 + chr2L 9226300 3' + G-element 3933 1 58.42 GATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTA:1 + chrX 22386784 3' - 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1360 3365 1 42.57 TATAACAAAAAGAAGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCAC:1 - chrX 1427544 3' + Bari1 1663 1 66.34 CTTAGNCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTGTCCAGTCATTCCAGATAGGGAATGGGACCCACACT:1 - chr2R 19857336 3' + 297 360 2 64.36 AGCGACACCACCCTCATGACCCCTCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCTTTGGCCAATAATTTTGACACTAGACAATTTTACATACAGAGTATCTATGGC:1 + chr3R 28729853 3' + jockey 4755 1 61.39 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAAAAAAGACCTGGCATTAACAAATGCTTTACTCACATTCATCTGCT:1 - chr3R 9016258 3' + jockey 4969 1 49.50 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGATGGACAACAAAGCAACTTCATC:1 - chr3R 25440149 3' + pogo 2092 1 61.90 AAGTTCATTTCCCAGACCTCCCTGAAACGCAGTGCAAAAATCTATCAGCGAAATATTAACTTTTGTATTCAAGTCGAAGAGTTCGTCTGGCGAAAGTAGAA:1 + chr3L 12183731 3' + Ivk 286 1 67.33 GGTGCTTTTATTGTTACCGCAACTGTATGAAGTGATCGTTATCAAGATGATTGCCTCATCATTGCCTTTGAATTGCTCTAGGAACTTCAGACTCTCCGTTC:1 - chr2R 9243038 3' + Tc1 1640 1 56.44 CGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATAATTATATCTACTCATTCTTCATGATGTGATCATGTAGATTTCATAGGGAAAACGTTAGCGGGTGTG:2 - chrX 328983 3' - opus 8 2 71.29 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACC:1 + chr3L 15638285 3' + roo 9030 1 72.28 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCA:1 - chr3R 19076160 3' + roo 9023 2 78.22 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTC:1 - chrX 495189 3' + 412 7500 2 74.19 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAATCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTATAGTTGATTAGTTATGTAACGGGTATCTTAAAGTCCA:1 - chr3R 12054405 3' - roo 8702 2 63.64 ATAGTNTCGTTGACTGTTTCTATGTTTAAGTCATTATGTATAATTTCTTTATAATGTACCATTCGGCTTTGTTCGCTCCTCCGTTGGCTGGCCAACGCAA:1 - chr3R 29514377 3' - Porto1 4411 1 67.00 ATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTAATGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACC:1 + chr3R 25818882 3' - mdg1 39 2 59.41 CATTTATACAGTGCATTGGACTTCAGGGGGATCTTTGAGTGATGTTATGAATCCGAACCGATAGTTTGTCCGATAGTTGTAATCGCTGTATGACTCATCTC:1 - chr2L 2226290 3' + baggins 5348 1 59.41 GTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAAAACATAAATTGCTGGGCCCCCCAAT:1 - chrX 13548745 3' - blood 31 2 57.43 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATTAAGGGATAGGAATATT:1 - chr2L 514858 3' - 3S18 33 2 56.44 GATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTA:1 - chr3R 19450169 3' - roo 8702 2 66.34 GGCAGNGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATATATGAGTACATGCGATTTTTTTGGGGATGCTCTGCGTGCATGCGCT:1 + chr2R 7481107 3' + opus 7475 2 59.41 ACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGATCGTCCGTCTGCCTTTATGAAGTTTGCGGAAACAAACATCTACTCT:1 + chr4 400852 3' + Doc 335 1 53.47 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATAAGGATTTTCAATCATCAAGTAGAGAAAGCCAGCCATGAGGGTGTTATTAATGTT:1 + chr3R 7360367 3' - jockey 32 1 53.47 AACAGGAGACGAGAACGCGTATATGTGTGCGGTTCCGAGGGGTGGAGATTACTATTACGAAGAGAGCATGCAGCAAAGCCCAATTTTCATTATCTTGAGTT:1 - chr3L 21769386 3' - 1360 3231 1 77.23 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGAAATTTTAAAATGAGAGGCTCTCTTCAA:1 - chr2L 8542839 3' - P-element 28 1 49.50 TACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATATGCAATTTTCCCAGAGCAAAGCACCAAACTTTGATGCTGTGACATTTGCC:1 - chr2L 21872507 3' + F-element 4448 1 56.44 AGATTAGTCCAATATGCTACAATGTACTGAAACAAAGCAGAAAAGCGCAAAGAGGCGGTCAGGAGAGGGAGGTTGCCTGGCTGGCCCACAAGATT:1 - chr2L 6692715 3' - Stalker4 6956 2 80.00 AAAATGAGAGCGATAGAGCTGCGGCTAAACGTGGCCACTTGCAGTGCTTGGTTAGAGTGAGAAAGCGACATAATGAAAAGTCAGCAACATTGAGGTTACAC:1 + chrX 11410541 3' + micropia 5181 1 79.21 TAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTT:2 - chr3L 27356070 3' + Tc3 1692 1 76.24 ACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCGTCGGCAGTCATTTTCCGG:1 + chr3R 20884967 3' + flea 229 2 55.45 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGAACTGTATCAGAGAGTTCTGCAATTTAAGAG:1 - chr2L 6252513 3' + P-element 2843 1 35.64 TATATTCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTGTAACGAATTGTTTTTTCTATTTCTGCTCGATACGAATTGCAACGGCTAACTCAGAG:1 - chr3R 1363409 3' - 1731 4302 1 61.39 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCATGACTTTGTTAGGGAAGAAACGCAGCCACAAAGGCCAACAACATTCCTT:1 + chr3L 4386535 3' - jockey 34 1 54.46 ATCAAAAAACTCTCCGAAAACCATATCCGACTACAACTGCTTTGCTGTCCATAGCTTCTGGAGACGGCTTCATCCCTACAAAGCATTGCATACTTTGTTTT:1 - chrX 7744554 3' + Ivk 347 1 56.44 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAAC:1 + chrX 12294772 3' - blood 20 2 59.41 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGT:1 - chr3R 5977748 3' - copia 35 2 58.42 TAAAATAAAATAATTAAATAAAACGATTAAAATAAATCAACATATAAATCAAAGATTTATTGGCAATTAAATTATGAAAAAGAACATCAAAAAACGATTAA:2 + chr2L 16164053 3' + Doc3-element 78 1 88.12 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGGTACTCTTTTTTAGATCTCTTGCAT:1 + chr2L 11045374 3' + P-element 2877 2 67.68 GTCGTCGGCAGCGGCGCAGCAGGCGTCGGCCGCGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTCGCTTTGTTGTACCGCTGTTGCCCTT:1 + chrX 21402083 3' - HMS-Beagle 6918 2 74.26 CAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAA:1 + chr3R 15943314 3' - jockey 4691 1 75.25 GATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGCTATTTTACTTTCTAAACTGTACACA:1 + chr3R 31458559 3' + jockey 4986 1 71.29 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAG:1 - chr3R 19114201 3' - 297 39 2 74.26 ACGCCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACACGTCTTGTTATTCTAGTGTCTTCGGTCAAACTTAAGAATGGCGTCGTCGTCGACCTTTC:1 - chr3L 26852647 3' - 1360 45 1 60.40 TTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGCCGAATAATTGTTGTTCGTTTTTTATATTTTGTGTTCATCTATAT:1 + chr2R 17378690 3' - mdg1 7454 2 55.45 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAACAACAAACAATGAGAGTGCGC:1 - chrX 2050816 3' - 412 7084 2 58.00 ATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGAAAGTCAGCAGCAACAACAAATACCCAGGAGAGCG:1 - chr2R 17719203 3' - accord 224 2 63.37 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACT:1 - chr3R 19450162 3' - roo 31 2 73.27 TTTTAATTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTATTCAAATCGTACATTAATGGTAAATCTCATCGCCCAATAAACA:1 + chr2R 17670954 3' - Doc 4686 1 65.35 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACTTTTTCCAAGGAACACACTCGAAACTAT:1 + chr2R 10912147 3' + 412 7499 2 71.29 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTAT:1 + chr2L 18694156 3' + P-element 2847 1 39.60 TCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGCGAGCGAGAGCGTGCAATGCGCAACAGGGAAAATGAAATGAAAAACGCCAAAAA:1 - chrX 17789697 3' - blood 7215 2 61.39 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATTTTTTTCTTTGAAGCGGTTTCATAAGTCCAATTGAATTTGTTTCA:1 + chrX 14713280 3' - flea 4782 2 59.41 ACAACGGAGAGACGTTCTCCCACCATATCTCCCAATCTAGGAGGCGTCTCTGCCAGAATTAGAAACAGGCTGTTGCTGAATCATTATTGAAAAGTAACCAA:1 + chr2R 6869222 3' + gypsy6 7688 4 65.35 AAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAAGTAACCATTATCTTGGTGACAAATTCACTTCCTCGC:1 + chrX 11517309 3' - FB 40 1 62.38 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATGAACAACAATATGCCAACTAAACAATTAATTGCCTGGAAAATGCCGTGGATACTTTATAAAAATGGTGAA:1 + chr3L 14952737 3' - transib2 51 1 75.25 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTGAGTGTCCTC:2 - chr3R 7100962 3' + pogo 2098 1 70.30 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATACATATATACAATACAAATAATGAAACCCCAAGTTGTGTTTTTAAAAACGTTATCTA:1 - chr3L 9858240 3' - pogo 14 1 63.37 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTATGATTTAATTTGCCTTTTGCTTACAGTATTTAATTATAATTAATTTGCGTTT:1 - chr3R 9369920 3' - roo 21 2 58.42 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAACTTGGAA:1 + chrX 21667929 3' + flea 223 2 63.37 TCTATGATAAGTAAAGTAATTGTCTGTCACCACTGCTGTGCAGAATATCATTACAGCGAGACTTCACTGTAC:1 + chr3L 17166246 3' - jockey2 127 1 55.56 CTACCAACAAATCAAGAAAGAGCAGGTGGCAGCTACCGAACGAGATACGATTGGGGGTATATAGGCAACAAAAACAGTTGCCAACAGCTCGGCCGGGCGGA:1 + chr2R 16909362 3' + F-element 348 1 81.19 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAAATAGATGCAGAAAGTGTACAAA:1 - chr2R 19192519 3' + roo 9052 2 63.37 TAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAGGATACATGGCACATCGTTAA:1 + chr3L 11910023 3' + Tabor 474 2 67.33 CTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7594 2 57.43 GATAGCGAGTCTAGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCTCTGCACTTCACTCACACACGCGC:1 + chr2R 11632348 3' - accord 7136 2 76.24 GTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATGTTATAAATAATTTGTTTTTTAATGACATGCCATCATACAAATACATTTTTCCTAAT:1 + chr2R 13122094 3' + opus 480 2 61.39 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGA:1 - chr3L 11654550 3' - pogo 52 1 80.20 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTT:1 - chr3R 29384341 3' - jockey 4778 1 60.40 ATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCC:1 + chr3R 18960473 3' - hopper 53 1 78.22 ACTATTTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAAAAAATAAAAAATACTTTTTCAACGAATTTTTCAACCCGAA:1 - chr3R 19447084 3' + I-element 5317 1 66.34 GATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGTAGCTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGAT:1 + chr3R 4604461 3' - Ivk 47 1 67.33 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAAAGTATGTACATGC:2 + chr2L 487154 3' + P-element 2870 1 61.39 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGCGAGAGCGTGAGCG:2 + chr3R 28326785 3' + P-element 2878 2 71.29 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTA:1 + chr3L 23821843 3' - HMS-Beagle2 45 2 75.25 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAATATAGAGTTTTGGAATTTATTGTGGTCTAAAAAGA:1 + chrX 8948671 3' - blood 7053 2 66.34 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTTTTGCAACACACAAAAACAATTTGAAGCCGACTTGAAAATTAACAGCAAATGTTATATAAAATGCACTGC:1 + chr3R 20466734 3' - roo 4 2 77.23 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATGTCATTCCCCCGCCGACTTCCGCTTATCATTAAGCATTATCGCGCGACGTATGTAGTCTG:1 - chr3R 29350682 3' - opus 7 2 72.28 TTTTAACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATTTCCCTCCAACT:1 - chr2L 10291523 3' - jockey 4795 1 59.41 TTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCTGAAATA:1 - chr2R 12779083 3' + roo 385 2 53.47 AAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTTATATTTGCGACTAAATAATGTTTAGGT:1 - chr3L 18576724 3' - springer 7183 2 74.26 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCT:1 - chr2R 9862203 3' + roo 9047 1 53.47 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACGAAACAGCCGGCCGTCAAAAT:1 - chrX 8243281 3' + P-element 2836 1 28.71 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGT:1 - chrX 6997183 3' - P-element 45 1 34.65 ACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCAATGCAA:1 - chr2R 18241018 3' + P-element 2822 1 19.80 CATCGGAGCAACGCCGATGGAGAGCGACAGCAGTGTGAGTATCCTTGTTCATGTAGTGCACGTAACTGAAAGAAATTGGGGGGTTGCAATGGCG:1 - chrX 9024231 3' + R1A1-element 369 1 59.57 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCAT:1 + chr3R 14688310 3' - pogo 39 1 67.33 GGGCAGAACCGTTTCTGCTACTCGAAGGGAAACGAAGAACACAGAAATGAGGGGGAGAATCGTAGAGAATTGCGGAGAACCTCCTACCGATATCCC:1 - chrX 17495821 3' + blood 280 2 75.00 GGAGAAGTCGAATAAAGAGATTGTGAAGTTATTTAAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACACTTCTTAAAGGCATAAGAACTTAAATTT:1 + chr3R 15157648 3' + invader3 226 2 86.14 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTG:1 - chr2R 5849955 3' - jockey 27 1 59.41 AAAATGCTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGGTGAATAAACGATGAGTGGCTGG:1 - chrX 1427502 3' + Bari1 1706 1 78.00 AAATATTTTTACCAAATATGGACTGTTACAAGCTGCATTGAAACAGTCCATATTTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTCCAATTAAGAACTGCGCCTCTG:1 - chrX 14142539 3' + Juan 438 1 54.46 CAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAGTCATGATGACAACGAACGCAGGA:1 + chr2L 5777975 3' - FB 52 1 80.20 TCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAGAAGGGGTATGATAAGCCGCAGTAAAGCGGCTGAGGC:1 - chr3L 7208459 3' + P-element 2683 1 44.55 GATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAAC:1 - chr3L 11909939 3' - Tabor 6876 2 64.00 CTGCANAGCTGGCGCGGAGTTGGGAGCGTGAGAGCTTTTTGTTCTGGGATTCCGGATGACTTGGATAGGTTGGGAATTATGACCGCATGGGG:1 - chr3L 13254804 3' - jockey 444 1 77.17 TTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCTCACCAGCCCCAGTCCCATTTTGCAACTCAATTCCAACATACATTTGCATGTCAGGACACCTAATCACAAACGGATA:1 + chr3R 15755343 3' - P-element 307 1 76.24 GGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGAATATATCGTCTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTCATGAAAGGGAAAC:1 - chr3R 17733246 3' + INE-1 556 1 59.14 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCACCATTTTTACTTTTATAGTTCTTTTACTTT:1 - chr3L 833373 3' + P-element 2843 1 35.64 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTTACCTACAACTGCTGTAGTTCCCGGAATAACCCGTGCTTTCAATTCCCCAGAAATGCCCCTTC:1 - chr3L 8974060 3' - P-element 6 2 74.49 GACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGA:1 - chr3R 29384352 3' - jockey 4789 1 50.50 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTA:1 - chr3R 14049337 3' - transib2 22 1 57.43 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTC:1 + chr3R 15998125 3' + pogo 2052 1 77.23 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGT:1 + chr2L 487127 3' + P-element 2843 1 34.65 GTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACA:1 - chr3R 19467876 3' - Transpac 34 2 63.37 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTT:1 - chr3L 543435 3' + P-element 2834 1 26.73 CTTGTATATTGCTATATTATTATGTAATTCTAGTTTATTCGTATATATTTATAACTTTTATTTAGAAAGATATTTTACATGTATAGTTTTGTGTAGGAGGT:1 + chr2L 11076213 3' - Porto1 4229 1 68.32 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGTTTATCATAAGGACGAGGGATTCTCCTTTT:1 - chr3L 15638239 3' - roo 45 2 71.29 CCATAACTCGACAAGTTTACCATTGCCAATAACTCAAGAAAGAGCGCGTTCTTGCTCTCCCTCACTACTGTCACAAAACAACAAACACGATGGGTCTTGAC:1 - chr2L 3584472 3' + Doc2-element 410 1 83.17 ATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGTCTCCGGATGGAAATGGGAATGCGAAAGGGGATGTGGATG:1 - chr2L 20131746 3' - Rt1a 30 1 61.11 CTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCTTTTCAGGAATATTAAAAAGCTACCTACACTATTCACGTTTTATGTTAA:1 - chr2L 13566924 3' - FB 28 1 50.50 AACTCTGTACGAAATAGAAAGTATAATTTAAGAGAATTTTAAATTATATTAAAAGTTTAGAATAAACTTGAATATACCGAGTACCTTAAGTACCTTAAATA:1 + chr2R 10854568 3' + mdg3 5041 3 69.31 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACACTAATTGCCGCAACACCCTCGTGGGGCATTAAG:1 + chr3L 958808 3' - P-element 25 1 47.73 TAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAACCTACTACAATGGCAATCAAGAATAGCATGAAAATACGATGATTTCTAACAATAATTTCTAATCAAATAACACTTT:1 + chr3L 4345053 3' - mdg3 5265 1 45.54 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGACTGAGAATCTTTCGCTGGAGTAATTATTGGCTATATACAGAACTTAAGCCATTAGATTAAT:1 - chr3L 19215777 3' - roo 8679 2 63.37 TGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTCACAAATAGCAGTTACATTTGAGCAAGAAAGTGTATAATCTCTTCGTTGATGGAAAAAT:1 + chr3R 6561231 3' - I-element 218 1 68.32 ACTTCACTTGATTGCTAGGGACTTAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATATTACATTTGCGCCATGTTTCCTGCTTGTTTTTCGGCATTC:1 + chr2L 13457038 3' + HMS-Beagle 142 2 59.41 CATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAG:1 - chr3R 18960429 3' + hopper 1381 1 62.63 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACTTTGCCCAACTTCCGGTGGCGGGGCATGCCGTTT:1 - chr3R 25818800 3' + mdg1 409 2 65.35 AACTGNGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAACCGGCGACAGGCATCCGCAATCCAGTGGAGCTGATCCGTGCTCGTAGCGGCACATACCAAATCCTGCTGG:1 + chr2R 22474786 3' + McClintock 6010 2 74.26 AATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATATTAATTAATATAAATATATTTTATATAAATTA:1 + chr2L 7418985 3' + HMS-Beagle2 270 2 67.33 CCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAAAGAAACGACATACCACCTCGCCCATTTCTTCCACCACCACCAAT:1 - chr4 702206 3' + Quasimodo 163 2 58.42 CTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGTGGTCTCTCCCATTTTCCA:1 + chrX 329103 3' + opus 492 2 73.27 ATTATAATAAAATAAAATAATTTTAAAAAGAGAGCTGTGGGCTTTGAAGGGAAAGTTAAAATAGAACCTAATAAGC:1 + chrX 17154282 3' - 1360 3100 1 85.53 AAAACNAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGGGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCACGAATGAGATATTAA:1 - chr3R 23617978 3' - jockey 4791 1 52.48 ACAAAAGAGAAGTGTGCAAACAATTTTTTGACAGTGTCAAATCTGTGCAAACACAACGCTAAGGATAAAGACAAGAGCAAAGAAAAGGATAAAAATAACGA:1 - chr2L 330730 3' - S2 224 1 54.46 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTCTGCAACCCCTACACTGAAA:1 - chr3R 30272782 3' + P-element 2878 2 68.32 CAAGTGCAAGTAAAACAAAGGAAACAAACTAAATCAATATGCACGCGGCGTATACTTAATCAAGACATAAAAAATCTCCAAAAACCGGGAGAAAAATGGAG:1 - chr2L 632471 3' - accord2 7266 1 75.25 ATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATATTAAAAATTGTTCAAAATTGTGGGCGTGGCAGATTTAGGCGCTTTAAAAGCAACCCCTTACACAGCTAA:1 - chr3L 23009947 3' - INE-1 545 1 57.43 ATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAAGTAAATTGAGCTACTGAAATTACGAAGTAACCG:1 - chrX 17700741 3' + I-element 79 1 67.33 ATATATGTACATATTTACATTTTAAAATCCGATTTTTTTCGAGCATGCTCAAACTCTTCCTCAAAATCGTTGAAAAGTTGTTGCACTCTCTCCTCTTGTCT:2 - chr2L 16496285 3' - G3 4507 1 58.42 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCC:1 - chr3R 9981514 3' - jockey 4809 1 72.28 CTGGTNGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTGGTTTTGCAGGCCCACGTTCGATCGAAAGGACCTCTCGCAGATGGAGCACTTGAAGGATGGCT:1 + chr3L 7355420 3' - Quasimodo 321 2 71.29 GCCATAGTATAAGACTACATATACTTACACACATACACACAACCAGGGCCAAGGAGGCCTACACACCCACAACCTTCCGGCCCACCACCTATAAGAAACCG:1 - chr3R 24898904 3' + Quasimodo 13 2 61.39 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGACAACACCGAGTTATCTTTACTATTTGGAAAGTTTCCAGGAATGAT:1 + chr2L 1156810 3' + 412 7520 2 58.00 TAATACTAAAATAGAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCC:1 - chr3R 10957691 3' + hopper2 1550 1 79.21 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTA:1 - chr3R 25633323 3' - Tirant 24 2 57.43 ATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGTGGTCTCTCCCATTTTCCATAA:1 + chrX 329106 3' + opus 7498 2 76.24 ATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGATGGTGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGGGTAAATAGGTGGGTGGTGCG:1 - chr3R 20242329 3' - Idefix 277 2 75.25 ACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTTAGTTAATTGTGTGCGGTGGTGAGAGAGAGAGAGAGCGGTGAAGACGGGGTCGTTCGACTCTCTTGC:1 + chr2L 2909636 3' - pogo 9 1 70.30 CAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAATGTGTTGCCTACGTCAAG:1 - chr2L 7459545 3' - BS 5003 1 67.68 GCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTCTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAA:1 - chr3R 17733248 3' + INE-1 546 1 60.40 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGC:1 - chr3L 19349949 3' + 1360 3355 1 63.37 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCA:1 - chr2L 11065886 3' + P-element 2838 1 32.67 TTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCAT:1 - chr3L 21735394 3' - Doc 40 1 60.40 GTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTACTGTTGCCTACTTCCAGGCATAATATAATTCACACGCCTAAGC:1 + chr2R 5850048 3' + jockey 4979 1 66.34 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAA:1 - chr3R 9837583 3' + 412 7506 2 67.33 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTATGC:1 + chr3L 9692749 3' - P-element 23 1 52.48 CGCCACGTTCAGTTGTCTTGCGGACCTCTTGGCCTTCCATGCGCGCCAGCCCACAATGGCCGGGTGTTATCGATGGTAGCCAACAGAATGTCTCAAAAAGA:1 + chr2L 15896415 3' - gypsy2 6419 1 59.41 GAGAGCAAGAGTGCGCTCTCTGGTCTTGGGAGAGTTTTCGGTTTCTTTGCTTACTCACATAAGCATTCACGCGTAGCGGCAAATTAACCCGTCTCGCTCGC:1 - chr3L 25952801 3' - Doc4-element 118 1 63.37 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTTTTCTCTCCATTTTTTTCGCCATT:1 + chrX 19457215 3' - roo 8695 2 58.42 ATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTA:1 - chr2L 14260756 3' - 297 6632 2 81.19 AGTAAAGTAAAGTAAAGTAAAGTTCAGTACCGAACACCATTCATAATCGCACACTCCATGATATTCCAAAAGCGCTTCGTGATTCTTCGCATGTGAGTGCT:1 + chr3L 24532234 3' + TART-A 13139 7 69.31 CAGTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGAGGAAATCGACTACAGCGTACTCTCTTACTAACTTCTCAAATTGCAATTGAACTAGTAATGTAATTGAGA:1 - chr2L 18177044 3' + INE-1 541 1 66.34 TTTAAATTTGAAAAAAATATATTAAAAAAGCTAACTCTAACCGCAGTCTAAACTAAGATCAGGCGATATCTCTAAGTTATCCCGCTGAGCAACTCGTTTA:1 - chr3L 3258990 3' - copia 4669 1 66.00 CAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTACGAATGCTATTCATTCTTTTTATTTTCTTCATCATTGAAAGAGTTAAGAATATGTGCAA:1 - chr3R 4543163 3' + 3S18 6097 2 71.00 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGGTACTCTTTTTTAGATCTCTTGC:1 + chr2L 11045372 3' - P-element 14 1 64.36 GCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAATTAAACAATCAGCGAATTGGGGTACCCGAAATGTTT:1 + chr2R 22283120 3' - opus 7049 4 68.32 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATAT:1 + chr3L 10698699 3' + roo 9027 1 71.29 TTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAATGACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCCCGCCCGAGCTGGACCTCATGGATGTC:1 + chr2L 18953129 3' - copia 4875 2 74.26 TAGCCGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTTCTTATTTAATCTTGATTACGCGGAGCTTAAACGAAAGCGAAATTTT:1 - chr3R 10154089 3' + INE-1 544 1 79.17 CGAGATCTGAGGAACTATAAAAGCTAGAATATTGAGATTAAGCATCCAAATTATACAAACATACAGCTTAAAAAAATATTTATAAAATAAATTAATTATGC:1 + chr2L 23180445 3' + INE-1 147 1 58.42 CTGACCGGACTCGTATATGACGAAATTCGCGCAGCGCAGCAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGACCGGTAGATGTCTCTGTTCCTGTCTCCTTC:1 - chr3L 960111 3' - Rt1a 54 1 73.27 CGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATT:1 + chr2R 5262636 3' - 1360 44 1 70.71 CCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGAGTTAAACGTAAGCCCAGGAGCAAGGAAAAGGCAAGCAGTGGCGCAGGGGC:1 + chr2R 24773157 3' + jockey 4613 1 49.50 AAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTTTTAACAATTTTGG:1 + chr2L 20939601 3' + hopper 1392 1 57.43 AATAAGCTCAGCCAAAGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGGATTTCAATTGTGCAATCCTTCTTCGTAAGAGATGAAGTGTAAGTGTGG:1 - chr3R 14163650 3' + Quasimodo 7222 2 59.41 CTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCG:1 - chr3L 25232767 3' + accord2 173 2 53.47 AGTTGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGTTCTTTTTTTTTTATACATATATGCATTTTTTTTCTTGAATTAATTGGGTGGGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 2944494 3' - HMS-Beagle2 489 2 84.78 TTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTT:1 - chr3R 9254926 3' - F-element 231 1 62.38 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTT:1 + chr2R 18503544 3' + roo 9030 1 67.33 ATGCACTTATACTTTGTGGCCTTCGAGTGGTTTTTGAGCAGCTATTCAACGGTTACGCGCCCACCACCCACTCACCACTAACACCGAAGAATCAGCAACGC:1 - chr3L 2820938 3' - 412 7194 2 72.28 GGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCTTTGTGTTAACGCTTCGTTAAGTCTGCGTTAATTTATGTGGGCGTGGCTGCCTGTAGGCCAGAAGCCAA:1 - chr3L 9545084 3' + INE-1 97 1 73.27 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAAGTAACCATTATCTTGGTGACAAATTCACTTCCTCGCCTTGCTGGCAAGTAAATACATATATAT:1 + chrX 11517336 3' - FB 13 1 66.34 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGC:1 + chr3R 7522358 3' + blood 7345 2 70.30 TTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAAAGTAATAGACAACCCCCGGTCGCCGTAAAAAGCAG:1 + chr3L 5895361 3' + 297 6847 2 60.23 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGTTGGTGCCGAAATAAGAGT:1 + chrX 495243 3' - 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roo 6 2 71.29 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTTACCTTATTTGCCGATAATGACTGCTTTGACATTGCTACGACG:1 + chr3L 21203095 3' + pogo 2098 1 72.28 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAAT:2 - chrX 14713211 3' + flea 216 2 75.25 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAAC:1 - chr3R 7522290 3' - blood 21 2 58.42 ACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGA:1 - chr3R 25796029 3' - BS 5038 1 65.35 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTT:1 + chr2R 18503570 3' + roo 393 1 51.49 CTTCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTATTCACCACTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTAGTGTCTCTTTATGGGAATTGTTGTTTGTTGTT:1 - chr3R 18550327 3' + Max-element 109 2 72.28 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGTTCCCTAGGTGTGATATGGGGTTTATCCGTTATTCCCAATTCATCCTTCCGATCTGACGAA:1 + chr3R 19837106 3' - P-element 14 1 64.36 GAGTCGTGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTAATGTAACGATGCA:1 + chr2R 14381350 3' - hobo 19 1 54.44 GTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCACGAACACCTTCGCCTCGAGGAAAGGTTATCAGAGGCGGACACCCATAT:1 - chr2L 17123488 3' + F-element 38 1 52.00 GCCAATTGCCACTTCTTCGTTTGTCGGAAGAGACTAAACTTGTGCACTTTTCCGGCAAATTCACACCCCCGCCTGAAGGGGCCTCGGATTTAAAAGCCACC:1 + chr3R 23549383 3' + diver2 209 2 62.38 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTTGTTCTTCTAAAAGA:1 + chr2L 2437789 3' + roo 9052 2 58.42 AGCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGATTATAAAGTGTCGCACAGATCTAGCCTATTAT:1 - chr2R 13210394 3' - I-element 145 1 70.30 TATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGATGTTGCAGCATCCAAAATCTGCTGACGAACAAA:1 + chrX 6458265 3' + blood 7383 2 72.28 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCGATTAC:1 + chr2R 24965132 3' - P-element 30 1 49.00 TGCACTCGTTATTGCAGTGTTACAGTTACCCAGAACTGATCCAGAGCGGATAATCTGAGCGGATCGAAGCTTCTCTGGGGTCGGACGACGACTGAGGAGG:1 + chr3L 21733000 3' - Doc 491 1 71.00 CATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATAT:1 - chr2L 18028688 3' - flea 44 2 75.25 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTATGCACACAAG:1 + chr2L 2197138 3' - P-element 31 1 41.76 CCAGGAATATTTTGGAAAAGTGCGCGTGCCCCAACTCCGCCCTATTGTTCTTATTTTTGTTGCAGCCTGCACACCTCGGAGGTTCTAGATGATAAGGGGTG:1 - chr2L 3478172 3' + hopper 100 1 61.39 AATCGTTAACTTCGTATTTTGTTGGTTGTGCGTGTTTTGCGTCGAACCTAATTTTCCATTTCTTCTGCTCGTTTGTGTGTGTGTATCTTGCATCGAAGCCG:1 + chrX 561247 3' - Bica 4651 1 75.25 ACGCCNCAAGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTACTTTCTATGATTTTGATTCCGGATCTTACAAATATCTTTTACTATAATCTGCTTATTCCAATCT:1 + chr3R 22574731 3' - 1360 414 1 72.28 AGCTGCGCTGCCGGGTACGCCAGCAGCGGAGCGGCGTTCTTATGTATATCTTATATATCCGAACTTCCATGTGGGTGAATGGAATAGATGTGGGGTCCAGT:1 - chr3L 15000835 3' - 412 304 2 58.42 TAATAAGTAAACTTAGGACCACCCATCCACCCATCCAGCCATCTATCCATCCAGCAGCGATCTAGCAAGTCACCAAGCCACCAAGCCACCAAGCTACCAAG:1 - chr3R 19348258 3' + mdg1 93 2 70.30 TATTGGTTAATTGCTTTATATAATAAACTTAGCTTTTTGGACAAATTTGAAAATTTTTAATGTATTTCCGTTGCTGTGTTGATAAGATTTGTTACCCAAAA:1 - chr2L 21238466 3' - Ivk 5284 1 64.36 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATACTTATATGTGGGCTGGGCAAAAGTTATTAAAATCAACAGCAATAAATTAGCATATT:1 - chrX 13350749 3' - jockey 4777 1 58.42 TGAATGTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACACTTTTGGGCAGACAAAATCACTGATTGTATTCTATT:1 - chrX 17204089 3' + Tabor 447 2 57.43 TTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAAACAGCAGTCGCAAAACTCGCACACACATGCCAATAAATATTTTTGCAAGCTGCAGCAGCGAGAC:1 + chr2L 7574687 3' + jockey 4884 1 70.30 ACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTAAAAGTCTAATATTTATTTTGAAAATAGAATCAAGTGCCGATTTGAGTAACATTTGAGTAAGTTTCTCTCT:1 + chr3L 2675027 3' + 17.6 192 2 75.26 TAGCACATATCTTTTATGACTTTATGACTTTGACTTATGACTTTCTCACAAGTCAAGGGGAATCGGAAGTGACTATATGAGTTCTGAGCGCGGAAGGGAAG:1 - chrX 2089997 3' + Transib-N1_DM 95 1 50.50 GAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGATAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTAAATACTAATGCAGGAAGGAAATGGTGCCCTTCC:1 - chrX 7410182 3' - jockey 4709 1 64.36 ATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCT:1 - chr2L 11047978 3' + Juan 4195 1 52.87 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGACTACGTTGCTTCAATTGG:2 - chrX 5443871 3' - mdg1 18 2 61.39 TAGTCAGAACATAATACTCAGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGATATAAGATAAGGGGTAAAGCCAGCGAGCTCAGTTCCCCATGTCT:1 - chr3R 9166477 3' - Cr1a 4188 1 68.32 ACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTTAGTCTCTTGTT:2 - chr3L 18154119 3' - I-element 13 1 62.38 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACCTTTTCATACGACCTGAT:1 - chr3L 14910566 3' - roo 26 2 54.00 GTTGATATAACATAGTAGTTATTATTTATTTGATTATTCTAATGACTTTGGTAACGAGAGCTTCTTGCCCAAAACCAAGGGTAAACGGCCACAGAATG:1 - chr3R 21355471 3' - jockey 4841 1 57.14 TTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAGCTGCCGCTCGTGTACATAAAAATAATTTTAAATCAGCTG:1 - chr2L 11551334 3' + Max-element 8499 2 58.42 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGC:1 - chr3R 15998091 3' - pogo 53 1 84.16 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGACAACGTCAACAATCAACTTGTTTCT:1 + chr2R 18503572 3' + roo 395 1 51.49 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTGCGTTTTTACGAAGCAATTGTGCCTGCATTCGGTGGAAAAACTAC:1 - chr3R 31812668 3' + P-element 2868 1 64.36 TTTGTTATTTTTTTTTTCATATTGTAAACGAGGTCGGTGAGACCTCGTTTCTCGTTTTTTTCTTCAGCTTCTTTTGGTGGTTATCATTTTATCTTGCAACA:1 - chrX 13591084 3' - gypsy11 3929 1 52.48 TAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTGGCCAAAAGTTGCCAACAGAAATC:1 + chr2L 16082707 3' - Stalker 1 4 78.22 TCGACAAAGAGGGCAAAGTCACGCCCTCCAACATAAACTTCATAAGAAGATATTATCCTATTATCCCTGGCGACAGCAACAACAAATGTAAGGTTAGTTTA:1 + chr2R 10049892 3' + gtwin 7272 2 69.31 CCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACA:1 + chr3L 20903871 3' - F-element 44 1 55.45 AATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAGTATTTATACCAAATGACCGAAACACAATAAAATGCAGTAACGAAATAATAGCGAAACA:1 + chr3L 9736842 3' + Stalker4 63 4 66.34 GAACTATAAAAGCTAGAAGATCGAGATTCATACATACACGCCTCGCAAGTCAAATCACACTTAGAAAATGTTTCGATATTACTTGTTAGTTTTGCTAATTT:1 - chr3L 25481344 3' + INE-1 158 1 69.31 AAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGCGCATTATGGCGGAAGTGAAGCAGGCGCCTGATC:1 - chr2L 22975407 3' - 1360 126 1 64.13 TACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACTCGAACAAGTGGAAAGTCTGCTCCATCGGCTGG:1 + chr3R 16443659 3' + flea 211 2 62.92 ATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCGGCTGCTGTCAACTGCTAGAAAATGGGG:1 - chr2R 21409095 3' + 412 7278 2 78.22 TCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTGTATGTTGGCACCCCGGTTATTATAGGGACAAATGTAAAAATAAATATCTTCGCGTGAAATT:1 + chr2R 2552197 3' + HMS-Beagle2 7178 2 62.38 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCTGCAACCCTTAGCGA:1 - chr2R 20838582 3' - 1360 11 1 68.32 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACAAACAATATATATTAAAAATGTAGATGGGCCTGTTTGTACAGTGAGCTAGAAAAGTAAAAGTGCGCTCTT:1 - chr2R 14381246 3' + hobo 2937 1 75.25 ATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGCCACAAAGCATACACAATTAGACATGGAGCCCGAGTAGACAGGTGAAGGGATGTGAATGGGCCAAGGGGCTGG:1 - chr3R 18896068 3' - hobo 263 1 74.26 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATG:1 + chr2L 326200 3' - roo 8696 2 61.39 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATA:1 + chr3L 7989814 3' + mdg3 221 2 54.46 GTAACGGGTATCTAATAGTCGAGAAAATATGCACCTATTTTTATCTATAATAAAGAAAAATTCGTCCTTAATTAGTTTCATTCATAAATGAAAATTTCTAT:1 - chr2L 7887658 3' + INE-1 551 1 51.49 TTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGCTCTCTGCTGTTTGACTGAAAGCCACTTGACTGCACACAGACATGAAGTTCGCCATTTCCCAGACTGTATCCT:1 - chr3R 31877829 3' - FB 3 1 76.24 CGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTAAGCAAAGATATGTAGTAAGACTAATAGTAAAAACTAATAAAATATTCATTATAAAAACTATCTCCTAAA:1 - chr3R 19967572 3' + pogo 2097 1 75.00 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAACCGCCTACATTG:3 - chr2L 326118 3' + roo 9053 2 60.40 AAAAANAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCG:1 + chr2L 16686599 3' - pogo 42 1 74.26 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTC:1 - chr3R 30272814 3' + P-element 2847 1 39.00 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGACTGAGAATCTTTCGCTGGAGTAATTATTGGCTATATACAGAACTTAAGCCATTAGATTAA:1 - chr3L 19215778 3' - roo 8680 2 62.38 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGAAAATTGTTGTACACAGTCAAGATATTGATTTTTGCGAGCCGA:1 + chr3R 18906664 3' + P-element 2859 1 51.49 ATCATATAAAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTTATGTCTCTCTGTTTCCATAACCGCCGTGTTGATCTAATTTTATTGACC:1 - chrX 16596640 3' + Porto1 91 1 64.36 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTCTGCA:1 - chr3R 30272797 3' + P-element 2864 1 56.00 AAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAACCATATGTCGCTTTTGTAAAACTTGTAATA:1 + chr3L 2024412 3' + copia 253 1 73.27 CACAAAGTCTGCTCCGAGATCTTAAGCCACTAAGGAAAATTGACCTGCTGATAGGCGCTAGTCTTTTCTTTGATCTGCTGTGTGTAGGCCAAATAAAATTG:1 + chrY 3612772 3' - G3 398 1 63.37 AAATTATAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTATGCGTACTATTTGAGAGTAAGAACTGTGTTTTCTGTAACC:1 - chrX 16520443 3' - hobo 33 1 59.41 TAAAACAATTTTTAATCCAATATTAATGTATGGGTCATCGGATTGGGGTACTTGCGCCACGCCGCCTGCGTGACCGTCTCCCACGGGTGGTTGAATATGTG:1 + chr2L 6047658 3' + Juan 3788 1 67.33 TATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTTGAGCTTTTTTTCACAGAAGTTTATCACCCGCTATTGAATTAGGAGCATCATGACCTCCTATAGGAATT:1 + chr3R 1272057 3' - mdg1 7075 10 63.37 AACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTAATTATCAATACTAACTTTATCGCCTTATCAATAAAAATATAGTGTACAGTATACGTAA:1 + chr4 220519 3' - Tc1-2 117 1 54.00 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCACATTGTCAGTTGGTG:1 + chrX 495230 3' - 412 38 2 60.40 GTTCAAGTGGAACCGTTATATGATCGCCCGCTTATGAGCTACATACATAAGTGCATGGTCGACGTTCTGGTTTCCCAAATGCTTTTACATTCATACTTAG:1 - chr3R 16291192 3' + gypsy11 123 2 60.00 TGTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGTGATCAACTACGATAACTTCTACCGCTTCATGGAC:1 + chr3R 19852127 3' - Tirant 453 1 70.30 CAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGTGTGGCACTTAACTTAACATTGTTGGATGGCTTAGAAAGCTT:1 + chr3R 16510908 3' - flea 4786 2 57.43 TTATACATATTTGTAACAAAGAATTCATTATCATTCTCATTTCATATCGTTTTTTTACTCAAAAAAACGATATGAATGGTAACTTCTTTTATACGAAG:1 - chrX 17186441 3' - accord2 7521 1 42.86 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAATAAA:1 + chr3R 19967675 3' - pogo 28 1 53.47 TGCAGCATGATCACCACCGCAGTTGATACACAAATAATTGTCCTCGTGCATAGCGTAGAGCCAGTTGCTCGGCTTCTCAGTTTCTCAGTTTCCCAGATGCT:1 - chrX 18666199 3' - jockey2 456 1 67.33 CATGTNGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATAT:1 - chr2L 18028688 3' - flea 4801 2 74.26 TCACANTTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGCTCTGCGCCTACATTTGGCGGTATTGATT:1 + chrX 1523698 3' - jockey 60 1 72.28 ACCATCGCCGTGGTCCTAATTGTTTATGGGATCATCCAAAGCATAGTTCATTGTTGCAAATTAGGTCTTAAAAAGCATGTCTATTGAGATTGCCCCAATAT:1 - chr3L 10454307 3' + gypsy4 6428 1 62.38 AATATNAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTTTGTAGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGCTTCATACGAGTTCCGTGTTCTATGGA:1 - chr2R 5952597 3' - I-element 5137 1 70.30 GCAGAGAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAA:1 - chr2L 514877 3' - 3S18 52 2 73.27 GTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGG:1 + chr3L 21841342 3' - P-element 52 1 29.70 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCT:1 + chr3L 15035183 3' - pogo 52 1 83.17 AACCAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATAATCCATTTGTTGAATTATTCTTATTTTTATTTTCGCCCCCACAGTCCAATTGACGGAGC:1 - chr3L 1857198 3' + Tc1 1342 1 67.33 AAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTC:1 + chr2R 5084067 3' - F-element 51 1 67.33 CCATCCACTTCATTGCTTTGCATGGCTAATAGAAATGTATTTTGTTGAAAGGTATTTTGAATAATTATGTTTTACCAATAGTCTTAAAAATAAACTTGTTA:1 - chr2R 25078324 3' + Helitron 444 1 72.28 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGT:1 - chr3R 9981511 3' - jockey 4806 1 69.31 AGTAAGGGGTATCTAATAGTCGAGAATCTCGTTTATAGTGTTCTCTCTTGTTTTAATACGTGAATAATTATAACCATCTTCATATATATGTTTTCTCTGCT:1 - chr3R 12787168 3' + INE-1 550 1 74.26 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATGATGTATTGAAGATAGTTTCATGCCAACCGTTATAATTTTTATTTCGATTTTGCAATGGACGAGCAAATCATC:1 + chr3L 27680875 3' - F-element 15 1 72.28 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTTTGGGGCCGTGAAAAA:1 - chr3R 29384326 3' - jockey 4759 1 78.35 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGGCAAATGTTTGA:1 - chrX 19457136 3' + roo 386 2 57.43 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACTTTGCCCAACTTCCGGTGGCGGGGCATGCCGTT:1 - chr3R 25818801 3' + mdg1 408 2 64.36 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCCTGCTTTATTTGATTTGATTTAAGAAACTTTAACAAATGGTCTTTCT:1 + chrX 20974930 3' - opus 27 4 52.48 AAACTATGCACAGTGCTAATTGGTTAAGTTTGTGTACATTACATCTTGTACACAAACTTAATGCAAAGTAAATACCGATCCCCTCTGCCTTTCCGCCTGC:1 + chr3R 21089629 3' - 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blood 7029 2 64.62 CCAGGGAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTT:1 - chr2L 20928090 3' - Chimpo 50 1 74.26 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCTATGATTGCCTTTGCAGAA:1 - chrX 14041943 3' + roo 359 2 81.52 TTTTTGTTTTACTTTTTCTTTTTTGTATTTCTTGAAGAATTTATTTTGTTCGTACGGACATGAACCATAATTGATAAGGATTTGAGTTCTTGGTCTAGATA:1 - chr3L 7309783 3' - Doc2-element 218 1 80.20 TACGCTCACCCGCTGTCACCCGCTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTTCTCCATCTTTTTTCAACCTTATCCAACCTTA:1 - chrX 9126386 3' + GATE 10 2 73.27 ATCTATTGTACTACCCCTTCATCACTCCATCTAGTAAGCCATTGGCTATATCTGAGGAAAACATCTGGTATGTGGCCTGCATTTTTCTAATGCCTTCAGCG:1 + chr3R 30511662 3' - baggins 5389 1 76.24 ACACTAGCAGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGAAAGCACGTCTGCACCTATCGGCGCCCAGAAGCCAGTCCAGCCAGTGACGGTGGAAGA:1 - chr3L 19594666 3' + INE-1 540 1 81.11 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCAAAAATATAACAGCAATATTACTATATATATGATTTCAGTCAAGAAACTTCAGCCAGGAAAATTGTAT:1 - chr3L 21163295 3' + 297 6940 2 65.35 CTACGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTTTTTTCAACTACTTTATATAATATACGTGAACCATTTAAATGTGATTTAAGAGTCTC:1 + chrX 18410723 3' - hobo 281 1 61.39 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATATAATTTACCGCCTTTAGCGAGTTCATAAAGCCAAGGAAAGGGGAATGGAAT:1 + chr3L 9304666 3' - jockey 32 1 51.49 AAGTGTTTTTCTCACTCATCCTTTTTTAGCCACTGTTAAGAGCTTGCTTGGGCCAATTGTTTTAGCCTGATGATAAACATTTTTTATTGATTTGTGATGAT:1 - chr2R 14466463 3' - hobo 205 1 80.20 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAAGAGGGAAATGCATCAAAATTGTTTG:1 + chr2R 12009732 3' + I-element 5308 1 72.28 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACAGCAGCAGCAGCTCAGTTGGTC:1 + chrX 8714620 3' + P-element 2833 1 25.74 ATAGGTGACGTCCCCCATTCTCCATACATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTCTACATCGTCAGCGTTCCGTTCCGTTCCGTTCCGTTTAGCTTAGGTTTTT:1 + chr3R 26075694 3' - mariner2 755 1 50.50 GAGCGNAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATATGTCATTCCCCCGCCGACTTCCGCTTATCATTAAGCATTATCGCGCGACGTATGTAGTCTGCTT:1 - chr3R 29350679 3' - opus 4 2 75.25 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTAACGCTTTCG:1 - chr2R 17394613 3' - jockey 18 1 64.13 ACATGNACACACACACACACACGCGCGCGCGTTGAAATGTCAAGCAAACGTCGTAGGCGAAGTTTTCACAAATGATGGTCACGATGGGCACGCGGGCGGG:1 + chr3L 7124534 3' + accord 7025 2 71.00 TTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCTTGAGTGTGGCTAATGCTTGTCTGGGAAAATGTGTTCGCATGT:1 + chr2R 9271192 3' - 1360 322 1 58.42 AGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGGCCCTGGGTGTGGAGAAGCTGCAAATGAGTCGATTGCATGTCGGCAGGATATTTTAATATA:1 - chr3L 9315203 3' - invader4 3072 2 65.35 TTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTATAAAGATGGAGATGTATATCCCCCAGAAAAGAGTTCACCACCAGCAAAAACAGTAATTCCACTTTATTCGATGAATAT:1 + chr3R 10609940 3' + hopper 150 11 81.00 AGCCGCCGCAGCACCCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACTTTAAAGTCGCTACATACGATTTGTATTAACTTTACGATTTCTCATA:1 + chr3L 2292152 3' + Max-element 8506 2 51.49 AAAAAAAAAAGTGGAAAAAAGCATATGCAATTGGAATGTCCAGCTGACGTAAACATTACTCATACACGCATTACTCACACACGCATTACTCACACACACA:1 + chr2L 13731414 3' - FB 172 1 69.00 AGCTANCTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATAAGGCCA:1 + chr3R 7101081 3' - pogo 14 1 65.35 AGTTGAACTAAAATTTTAAATATAATCCAAGAAATGCACTTGTTACTCGAATCCATCGGGTTTTTACTGTCGGATCTCGACAACACTGAGTTGCAGTCGCT:1 - chrX 19160585 3' + Rt1a 342 1 70.30 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTC:1 - chr2L 107989 3' + P-element 2862 1 54.46 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGT:1 - chr3R 10457292 3' + roo 356 2 77.23 ACATANACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCGAAACTCGT:1 + chr3R 5977805 3' + copia 5085 2 63.00 GAATTGTAGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGAACCAGAGTTGATGAGCCAGTGTAAGTTTTTAATATTTTCGTAAAGTTGTTTGTTTTAAAA:1 + chr3R 9344981 3' - F-element 4227 1 67.33 AGGTTACCATCTCGAAGATTAGAGATGGATGTGATGTCTTTGCTTTCATTTAAAATATTATCTTTGTTTTCTTCACAAACCAAATATTTACTTCACCTATT:1 - chr3L 2908251 3' - Ivk 439 1 61.39 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACA:1 - chr3R 13715098 3' - P-element 48 1 31.68 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGC:1 + chr3L 9925285 3' - Doc 48 1 70.71 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTATTTGTTAAATGGCTTTAAATGATTAGGTACAAATCAAAGGATATTTCGAAATGATAATTGTGACATCTGAT:1 - chrX 21401827 3' + roo 407 1 74.26 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTGTAGACTATTTGTTTTCATACTCACTTTT:1 + chr3L 9858320 3' + pogo 2059 1 69.31 TAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAGTTCTTATTCAAGAAGATTTAATAAATAAAAGCAAAGTTAAAAAATGTAATTCCCCAATATCTATCGATATGCC:1 + chrX 23078696 3' + F-element 4621 1 67.33 CTGTAATGAGATGAATTGTCAATTAAAGTTTATGTAAGCGGCTCTGGACATATAAGACTCAGCCTCAGGTCTTAGAAGTTCTGAGAATCTGCCTTGTAAAT:1 + chr3L 21778470 3' + invader4 2617 1 61.39 ATTTAAAGAGGCGAAAACATAAGCGACCTACGACAAAGCGATTGAAAATGCGCATAAATTCGACAAAGGAGCAGCCACTGTCTGCCTCCCATTGGCGAAAA:1 - chr3L 5638004 3' - hopper 322 1 77.23 CGCTGTTATGTTACTATTACTGCATTGTATGGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATAAATAACAAAAAAAATAAATACGTATTTTATTGCTTAAAACATA:1 - chr2R 22666110 3' + BS 5049 1 72.28 ACCGCGGCGAGGGACCTGCACCTTATATTTAATTAATTTATACATACCTTTCATTTATAGAGAAGTTTATTCTGATTCGTCGAAAACGTTGCAACGATTCC:1 - chr2R 6869001 3' + springer 7504 2 62.38 TAATANTCTAGTGTCTTTGGTTATATTATACAGTACAATGCAATGGATCAACTCTGCTCTACTTATGTTGATAAAATAGTATTTTTGAAAAAAATCCATTA:1 + chr3L 18284716 3' + Tc3 313 1 91.09 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATCTACCAACAATGGCGCATTGATCATC:1 - chrX 19095756 3' - roo 8713 2 74.26 TGCTATACTTAAGTTAGTCGATTTTGGAAGATTAGAACACCTTAAGACCTATAAAAACTAAACTTATAGCTATCTTCTGTTTGTGAAACTCACTTAATATA:1 + chr3L 6082083 3' + Burdock 122 2 70.30 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGT:1 + chrX 1954499 3' - Tirant 8155 2 72.00 CTAAANTACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAG:1 - chr3L 13364555 3' + hopper 1362 1 73.27 CGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCACACACATTTTTTCGGGGGTTACGGGGCTCGC:1 + chrX 334671 3' - opus 464 2 69.31 TTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAAAAGGCCAAAGCCAGCTGGCGTCAGGTTCAAAGGCGTCGTTAAATTTTTGGCAAAATTCTTT:1 - chrX 20933650 3' - pogo 1986 1 69.32 AGAATNAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAATTAAAT:1 - chrX 14713206 3' + flea 221 2 69.31 TCACCAAAAAAGTGGGTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCGTGTTACCACTTTTGATTG:1 - chr2R 5485088 3' + 1360 3337 1 80.00 GGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAAAAGGCCCAGAACAGCAAACAAAATA:1 + chr3R 18934951 3' - hobo 25 1 54.46 GGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAA:1 + chr3R 15943349 3' - jockey 4656 1 58.42 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAATTAAATCTTTC:1 - chrX 14713201 3' + flea 226 2 65.35 AAATATTTAAAAAAAAAAACACACACAAAGCGCCGCCGCAACGAAGAAGCCATGAATAGTGAATAGCGTTCAAAAATGTTGCACCATTAATATTCCGCTAG:1 - chrX 2508718 3' + TART-B 10508 2 75.25 CAAATNAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCAT:1 - chr2L 1626542 3' + roo 9031 1 62.38 CACTCNCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGC:1 - chr2R 21379513 3' + P-element 2833 1 25.74 AAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAG:1 - chr3R 25796004 3' - BS 5013 1 57.43 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCACTTTTACAAAATCGTATGTTA:1 + chr2L 18694181 3' + P-element 2872 1 64.36 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGCTAAGCCTGTCAACT:1 - chr2L 22235201 3' - 1360 37 1 58.42 TTTAAACTTATTGCGTTATTTATTGGATCTTCTCTTTTTGTGAGACTAACAATAATTTTTCAAATCTTATAAAACTGTTCCTTCTTCATCACTAACATTGG:1 + chr2L 21973975 3' - Doc2-element 4761 1 69.31 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTGACAGCTGTTATGTT:1 + chr3L 19215880 3' + roo 394 1 66.34 GTATGGATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTC:1 - chrX 21087613 3' - mdg3 5296 2 76.24 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCTACCGAAGTCGCCGGGCACTACACAA:1 - chr2L 13244940 3' + P-element 2840 1 33.66 TTTTTAAAATAATCTTTCTATTTAGAAAATATTAAAAAAAGTATGTGTTTTATGTTGGTTACAATGATGCCACATAAGTAATTTT:1 - chr2L 17566562 3' - G5 4835 1 87.06 CGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTAGTCCCCCCAGACCCAACGCCCTGCCATCGATCGGCTTATTTCTTA:1 - chr2R 15833857 3' - gypsy6 7433 2 55.56 AACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGCAGTAGTG:1 + chr2R 24493742 3' + flea 228 2 55.45 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATGTATAGA:1 - chr2L 13250356 3' - pogo 22 1 55.45 AAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAGGATACATGGC:1 + chr3L 11910013 3' + Tabor 464 2 57.43 AAAAAGAAAAAAAAAAAGCAAAAAGCAAAAAACTAAGGGT:1 + chrX 8968743 3' + Doc2-element 245 1 80.00 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAGTAATA:1 + chr2R 8378676 3' - pogo 24 1 55.45 AACAGTGAACAGCAACACAAAAACAAACAACCAAAAGTTGTGTGCAACAATTGATAAGCAACAAAAGCAACTATCGTGTCGCTTGGCAATAAACCATAAAA:1 + chr3R 25858076 3' + gypsy10 483 1 74.26 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAGTTTGGTAGAACGCAGAAAATTGGCTTTGCCCTTCGTAAGATCATTGTTAAATTTAAAAACTGGTAA:1 - chr2R 3492801 3' - 1360 69 1 65.35 GTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGCCACTGAGCACATGGCGTAGCCAACTTTCAATTGACCCATTTTGCGGTGGTCGCTCGGTGGTTT:1 + chrX 5658856 3' + flea 420 1 69.31 CTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGATTTACTTATGTCCTTTGTATTGGTTTCTGTTGACGCCCTTTAAC:1 - chr3L 10241503 3' - 1360 105 1 56.44 CGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCC:1 + chr3L 11826435 3' + INE-1 136 1 63.37 ACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAACCATTTTAATTAGTTCAGATCCCTTGATGCGCTCTCATTTCGCTCTTCTG:1 - chr2L 7140758 3' + copia 40 2 55.45 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGTTAGCCGCATGGCCACTTAGCAACAATGGGAAAAGG:1 + chr3R 14169308 3' + blood 336 2 69.31 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTATATTATTATAATAATTAGTTGTCATTAGAAATAAAGGGGTCATTTCTAAACAGCTCAT:1 + chr2R 13643904 3' - F-element 27 1 51.49 AAGAGAGAAAGCTATAGTCGAGTTCCTCGACTATCATATGCCCTTTACTGTTCTTAAGATCGCTCGCTATATGAAGGCTAGCAAATAACAAATCAGCTGTT:1 - chr3L 22940800 3' - INE-1 577 1 54.46 TATTANTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCATCCTCAAGTTGCAGCATTGAAAATTTCAATTATTCTATGCACTCGCTTCTTT:1 + chr3R 9479519 3' - mdg1 7063 2 54.46 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAAAGTATGTACATGCGTGAGGCGA:1 + chr2L 487163 3' + P-element 2879 2 70.30 AAACAAAATGTACAAAGTTTTAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGTTGCTTTTCGAATCAT:1 - chr3L 24889854 3' + transib2 2765 1 77.23 AGTTTGTTTATTTTACGATACTGTTTATTTCGCGAATTGTTTACAGCAGCTTGAAAGTGAATTATGTATACCGCCCGTCCGCACGTCCATATCAAAG:1 - chr3R 4284465 3' - diver2 4841 2 55.67 CTAACTATAAGTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCAGTAATCTTAATTGGCCGGAAATTAGTCGCACC:1 + chr3R 17598737 3' + Cr1a 4164 1 78.22 CAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTATATACGATCTCTACCAAGCTGATAAGCAGA:1 - chr2R 1395473 3' - gypsy 7027 2 72.04 GTTGCATGACCCTTACAGAGTTTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTTGTGTCTGGCCTGGTATTTTAGCACCGTTTTTAA:1 - 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S-element 37 2 77.23 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTAGTGCTCTGACTAGCAGGCTGCACAGCTAGAATCTTCTTAGAATTTACTAGATTCCTTTTTTAAGGAGCAG:1 - chr3R 10741067 3' + 1360 3385 2 72.28 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAG:1 + chr3R 18507857 3' - jockey 9 1 54.55 AATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACAC:1 + chr3R 25823704 3' - hopper 44 1 68.32 ATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAA:1 - chrX 10653554 3' + jockey 4956 1 69.31 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGCGTTTAATGAGCTGTCAGAATTATCATAAAGCAATTAAACGCATTTCACACTCATAACCGTAGGCAAGTATTC:1 + chr3R 16897339 3' - accord 7028 2 71.72 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGACTACGTTGCTTCAA:1 - chrX 5443875 3' - mdg1 7060 2 57.43 TAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATA:1 - chr2L 13447106 3' + HMS-Beagle 7010 2 58.42 ACTTAATGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACGAAACAGCCGGCCGTCAAAATTTT:1 - chrX 8243278 3' + P-element 2840 1 32.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTA:1 - chr3R 10445213 3' + roo 356 2 76.24 ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTAC:1 + chr2L 16082664 3' - Stalker 44 4 66.34 GTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGC:1 - chrX 868723 3' - jockey 4956 1 73.27 AACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAACTTACGATTTCTAATCGGTCGTTTGCCTCCGAAAAA:1 + chr2R 9272937 3' - FB 39 1 69.31 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAACTACATTTAACTAAGC:1 - chr2R 13144956 3' + roo 9044 1 56.44 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATT:1 - chr2L 1626541 3' + roo 9032 1 62.38 ACAAGAACTCAACAATCATTATGTATGGCGCCATTTGACTCGACTACCTACGAGACCACTCGAGAATTTTTGTTTCCACTTCATTTTTTTT:1 - chr2R 18588290 3' - hobo 328 1 76.92 TCCAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATATACATACATACATACATAATAGAATCGTGGATTTTTCGAAATATCTAATATCTATCATGT:1 + chr2L 8991313 3' - INE-1 100 1 64.36 TTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGTCTCTCCATGTCTACGGAATTGCCAATTC:1 - chr2R 18531472 3' - F-element 4401 1 71.29 CCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACACAGTGGCCAACGGTTAAATGAAGTATACGCCACGGTG:1 - chr3R 20884867 3' - flea 4763 1 76.00 ATTTTNGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCCCCCCGAGCAGCTTGAACACGCCCC:1 + chr3R 18960498 3' - hopper 16 1 57.30 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATGGCGAGCGGCAAGTAATTAAAAACTGTTTTTGCACTGCATATTTCCGGGCG:1 + chr3R 28728353 3' - jockey 25 1 60.40 TGCAANCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACACTTTTGTGTGCGAAGAGCAAACGACTATTTGG:1 - chr2L 8031260 3' + P-element 2846 1 39.60 ATAAGGAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATAT:1 + chr3R 9952232 3' - Ivk 46 1 70.30 TGTACTTTGTATACAAAAACAACGAACCCAGNAGGAATAAAGACAGGAGATACANNNNNNGAATCTTCGAACACCCTCANCATGGCCACG:1 + chr2R 10762032 3' + Transib5 295 1 53.33 CTAGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGATCCATTGGAATTTATATAATTTATATAGTCGTGAGACGTCGATA:1 + chr2R 1395502 3' + gypsy 431 2 55.45 CATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAACGTATCCATATTGGTCCATA:1 + chr3R 15943369 3' - jockey 4636 1 78.22 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCGAG:1 + chr3L 13194811 3' + 297 6926 2 78.22 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCAT:2 - chrX 21087561 3' - mdg3 5258 1 69.31 ATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGTTCCTTCTATTTAAATTATGTGCATGTATTTCACTTTCGTTTTCATTTGCGACTT:1 - chrX 17064738 3' + Tirant 8487 2 55.45 GCTGCTGCTGATGAATCATTGGCTACTGCGGTTCTCTCGAGCCCCCAATGTGCTGCCCCGCAGCGCTTTCAAACTGTAAGGCGGAAGACAATACCAGGCGC:1 - chr3R 1988498 3' + X-element 343 1 70.30 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTC:1 - chr2R 9862194 3' + roo 393 1 58.42 GGTATGTTTTTGAAGTGATTTGAAGTGAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATATTAATACATACCATTTTATATTAGATAAAAAAGATATTT:1 - chr2R 21712725 3' - I-element 211 1 73.27 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGTTTGGATCTGGCATATTGCCAGCCATTGG:1 + chr2L 15344190 3' + transib2 2778 1 67.33 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCATTTTATCTGCTC:1 + chrX 4154973 3' + blood 336 2 66.34 ATTGTNCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATTAACAAGGTTTGCTCTTAATTCGCCTAATAAGAAAATACATTTATTTTCAA:1 + chr3L 14050067 3' + pogo 2082 1 60.40 GTCTAAATGGCACGAAGGGTCCTTGTACTGGAGAGAAAGAGGTAAAGTTTTAAGTATAAGTATAGTTTTATATTCATAAAATAGCTCCAGATTATAATTCT:1 + chr2L 2267804 3' - Q-element 612 1 68.32 AGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGT:1 - chr3L 11909951 3' - Tabor 6889 2 76.24 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTG:1 - chr3R 25795999 3' - BS 5008 1 62.38 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCGCCCCGAGCAGCTTGAACACGCCCCCTGCCA:1 + chr3R 18960504 3' - hopper 20 1 59.60 GCAAAATTAAAATAAAATTAAATTACAAATGAAAAAGTTATCTTAAAGAATTATCTAACGAGTTCAATTTAAATTATTATTTCACATACATTTAAAGGTGG:1 - chr3L 7031502 3' - Rt1b 127 2 90.10 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAATTCG:1 + chr3L 12085240 3' - pogo 19 1 57.58 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTT:1 + chr3R 7522361 3' + blood 7348 2 67.33 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGC:1 - chr3L 12085173 3' + pogo 2053 1 76.24 CGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACCCTAGGATAATGCTATGCCAACAAGCCTGAAATGCATTAACTGGTGTGGCTGAAAAAAGTGCAT:1 + chr3R 31876496 3' + 1360 3198 1 72.28 TAATTTAAAGATTTTAGATTATAGAATTCGGTTTTTACATTCCTTTTTGTACTTGTTAATCATTTTCATTTGATACTTGATGAACGTGAGCTGGGGCTTCG:1 + chr3L 19650068 3' - TLD2_LTR 152 1 77.23 TTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAAGTTAGTTTTGCTAGAC:1 + chr2L 19075724 3' + Transpac 5198 2 58.16 TCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATAGCATTCGCCTTGAAATGCTTTTGACAGTCGATTAGATGAGCGCCCCAAATTAAAAATATCCGGGGAA:1 - chr2R 16902137 3' + Max-element 232 2 74.26 CGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATGCATGAGCTTTTAGAAATCATGTAGACATTAGTTGCCCTGCAGTCGTTTGACTGTTTGTT:1 + chrX 5515834 3' + 297 386 2 67.33 CGAATCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTTAATTGTAAGCATAATGAACATAACCGATCCGAAGATTGTGCAGAACGTGCTGATGTGC:1 + chr3L 9954437 3' - Tirant 8333 2 63.37 CAATCCCAGCCCAAGTATAGGCTTCTCTTTAAGGGAAGGAGAAAAAACAAACGTTTCAAGTGAAAGTCGAACACAAAAACAGAAAAGGAGAAGGCGAACGG:1 + chrX 6340490 3' + 297 6541 2 62.38 CTCGGCGCCAACGCAGGCGAAGCTGGTTGCCAAGCCCCACACTAACTATATAAATAAAACCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGG:1 + chrX 23280891 3' + R1A1-element 480 1 65.35 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATCTTTTTTTATGCGTATAAATATAAACATACTTTTGGTTTTCACCC:1 + chr2R 20702162 3' - Doc 38 1 60.40 ACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATGTGTTCTTTGGCATTTTGGCCAG:1 + chr3L 22324334 3' - jockey 4695 1 53.47 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTG:1 - chr3R 7100984 3' + pogo 2076 1 54.46 CCACAAGTAAATAAATAAATAAGAAACCATTCATCAGGCGATGGGGTTGCCCTTTGTTTCAACTGTTGCCCAACCTCAATGTCAGTCAGTCACTTGCTCAA:1 - chr3L 7449278 3' + Juan 4213 1 62.38 AGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCAACGCTATGAAGTCGTAAAATTTA:1 - chr3R 19609638 3' + Tabor 467 2 58.42 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGC:1 + chr3R 19989852 3' + pogo 2055 1 73.27 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAATAAAATGTAATTATTTCATGGTCG:1 + chr3R 19967695 3' - pogo 8 1 71.29 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTCACTATGGTATTTGT:1 - chr2L 326152 3' + roo 9019 2 75.25 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGG:1 - 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Ivk 2 1 76.24 GAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACATATTTTGGCCGGCCTTTAATGGCATCATAAAGCTGTTAGCAAATATTAGGTGCATATTTCG:1 - chr2L 6253594 3' - P-element 253 1 57.43 AGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTCCGATAGTCCTTCGTTTTGCAGCACT:2 + chr2R 22606018 3' - Juan 4024 1 79.21 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATATTCCAAGGAGCTAGTCTGCCAA:1 - chr2R 2552088 3' - HMS-Beagle2 6891 2 71.29 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGC:1 + chr2R 5084069 3' - F-element 49 1 65.35 CATATTTTTATCTATTTGTAAATCTATATGGCAGGGCCAGTACATGAAAAATTTTTTTTTTCCAGTACGAATAAGTGTTTT:1 - chr3R 24826335 3' - G3 4490 1 58.02 AAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAATAACTAATTAATAATTAATTAATAATGTCCTTTTGGTTCTTATGTGAGATAAATATACTGCGACCTGGAT:1 + chr2L 17841097 3' + Juan 4063 1 47.52 TATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGCAATATCATTAACAACACATGACCCATTCTCCGCATCCGGGCTCATATGTGATATAATTAAATTG:1 + chr3R 5155736 3' - 1360 239 1 69.31 GAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAGTGGTGTCCCCGGGGATTCGGGGGTGCATAT:1 + chrX 4274272 3' - P-element 2816 1 59.68 AAACGNACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCATCAATTTGCAATAAATGAATGCCTCGTTAAGCGGAGGGTTCAGTTTTTCATATGGTCT:1 + chr3R 12767103 3' + 412 7530 2 60.40 GTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATACATTTTTTTTAGCTTGCAACCTTAATGTTTACAAAATTTGCC:1 + chr2L 15955328 3' - Quasimodo 31 2 62.38 GCACCTGCACACAAAATTGTTGGGAGGTTTCCCCCGGAGGGAAAACTGTAGTTTCCGTGGAGCGGCGAGTGTGTGCGCCGTTTACCTTTGTCGCGTACCCG:1 + chrX 22386801 3' - hobo 46 1 70.30 GAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACGGCAAGACCGTAAAAGTCAACTAAAGTAC:1 + chr2L 11065922 3' - P-element 45 1 34.65 ACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAGGCGCATTTGTGTTCGGAATTTATAATTTGGGGGTGGAGCTGCTG:1 + chr3L 19206470 3' + roo 16 2 55.45 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGAC:1 + chr3L 13080992 3' - 412 7094 2 67.00 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTACACTCTGAGTGCCTATAC:1 - chrX 495167 3' + 412 461 2 54.46 TAACCTTCTAGCTTTTACAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCACACGGACAGACGGCCAAATCGACTCGGCTATTGATAAAGAGGAAAACGACACAAAAATTA:1 - chr2L 21268218 3' - INE-1 159 1 75.25 AAATANTGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCC:1 - chr3L 11654538 3' - pogo 40 1 67.33 TTTTTTTTTTGGGATTGCGGCTCCTTGCTTTGGATGTTGATCTGGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGTGCGCCATCATCTTGGACACGTGCTCCACTTTGGGG:1 + chrX 18608006 3' - Idefix 268 2 56.44 CTTCGATCTGCACAAACCATAACCGCACATTTTGCTTCCTAAATGGCGGTAGCTTGATGGTGGCAACCGACTCGATGAAACGAAGCTGGCCTGGCTGAGGA:1 + chr3L 14878130 3' - Chimpo 381 1 72.28 ACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAATT:1 - chr2R 22395194 3' - I-element 23 1 59.41 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCACTA:1 - chr2R 5485045 3' + 1360 3379 2 69.31 GCCCCGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTATACTCAAAAAAATTTCTT:1 - chr3L 5015832 3' + I-element 5298 1 85.15 AGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTG:1 - chr3R 9952199 3' + Ivk 5329 1 58.42 GCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATAACTAGCTAACTAACTAATTAACTAA:1 - chr2L 1538984 3' - Bari1 50 1 75.25 TTTTGGCATTCCCTTTTCATTATATAGTTTTCAAGGAATCAGGGAGAGGTAGCTGGATATGTTGTACAAGTTTAAAGAAGATCAAGTACATTTCACTTAAT:1 - chr3R 11020973 3' - micropia 5251 2 79.21 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTG:1 + chrX 329078 3' + opus 7470 2 59.41 ACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACAAAGGATACTTGCCGGTG:1 + chr3L 20903888 3' - F-element 27 1 56.44 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGCCATAGATGAATATATATTTATTGCCAGTATGGATGGGAACTGCGTCATGCCACCACCAGC:1 - chr3R 19076126 3' + roo 394 1 61.39 AAAAAAAAAAATTTTAAAGGGTGGAAACGCCGGGCAGAATAACTTACCAATGGAAAGTCCAATTGCTGGTGTTTAAATGGAACTTTGAGTTTGCGAAAT:1 - chr4 1108293 3' - FB 723 3 89.90 AATTACAAAATTTAAAAAAATTCATTAAATTCTTAACCAAATAAAAGTCTACTAGTAACGATACTCAACATAAGCATTATCTCTTTTTATAGTCAAGAGT:1 + chr2L 16437488 3' + HB 321 1 73.00 CGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAGATACGTATGTATATAAGCGTCGCTGCGCTGCAGGCTACGCCGGCAGCGCTGCTCCTCGACTT:1 + chr2R 2308849 3' - McClintock 7 2 61.39 AGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATATACATATATAT:1 - chr3L 7804780 3' + blood 7136 2 92.63 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGC:1 - chr2L 6227670 3' + roo 9021 2 75.00 AAGTGAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCCCGCACGTTTCCGGCGAACAACTTACT:1 + chr2R 1185092 3' + Doc 4615 1 72.73 TTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAAC:1 + chr3R 13423345 3' - 17.6 45 1 79.21 TTTGGCGGGAATTGCATTCTCTCAATCAGCAGTTTAACACTTCACCTTTAAAAGCTCATCAACTTTATGCTCGGACTTCGCCTGTCGCGTTATGCTACTTC:1 - chr3R 2159521 3' - transib2 187 1 58.42 TATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGTTGAGCTTGACTTTTCCCCCGCTGGCCATTACATTAA:1 - chr3R 9952162 3' + Ivk 5366 1 69.31 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCCC:1 - chr3L 9692652 3' + P-element 2877 2 69.31 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATTGTATATAGGTGCCTAAAACCGAATAATATTTCCAAAGTGGAAGCACCA:1 - chr2R 9454237 3' + opus 7475 2 55.45 AAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATA:1 + chr3L 8924611 3' - Stalker2 51 2 75.26 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTT:1 - chr2L 11047962 3' + Juan 4197 1 59.41 TAAAAAATAAAAATAATATAATAGAAGGAGGTGTATATTTCATAAGATAATGTTAATTACCGGACTTAAAGATACCTAATCTTCGAAGTTCGAATTATCCC:1 - chr2L 1303856 3' + invader3 5043 1 38.61 CGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGT:1 - chr2L 13447098 3' + HMS-Beagle 7018 2 55.45 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCACCCGCCAAAA:1 + chr2L 13447185 3' - HMS-Beagle 23 2 56.44 AACGGCAATGAGCCGGAGCAAGCTGTGGTTTATTAGGGGCTTCGTCTTGAGCCGCATCTTCACCAGCACCAAGAGCACTTCGTTGTCCTGTGTGTTGCGTC:1 - chr2R 24039182 3' - gypsy 7256 2 76.24 CAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCATATTTTTTTCCGCCGA:1 + chr2L 18112592 3' - transib2 2562 1 63.37 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTG:1 - chr3R 9657706 3' - BS 43 1 73.27 TTTTTTAAGGAAAAATAAACAATTTATTTCTTTATAACAATGTTAAACATAAAAGGAACTGATAATTTCATTCTGAATACTAAATGTGAAAGATCATGAAG:1 - chr3L 21836965 3' - pogo 2017 1 71.29 CGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATTGTTGATTGTCGATCCTAAGAGGAGGATGTAGGCTAAGGTGTC:1 - chr3R 5054369 3' + HMS-Beagle 7018 2 55.45 CTTAGGAATCCCTTATGTTAAAGAAGAAATAGCCAAGTAAATGCGATTTGTCGCACTCAAGTTACAAGTGTGTGACAGTGAGGGAAAACTATACTACTATA:1 + chr2R 20542180 3' + G4 3563 1 68.32 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCA:1 + chrX 8364635 3' - jockey 4806 1 72.28 GATGCAATTGGCGATGCTGAAGCATCTGCCGTTGAAAAAATGCGTACTAAAAGGAATAAACCATGAGCCAAGCATCGTAGTCCGAAATTGCATGAAATGTG:1 - chr2R 25134727 3' + Juan 140 1 62.38 GAGCTGCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTC:1 - chr2L 20118705 3' - Max-element 8282 2 67.33 CGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATATACAATACCCTATCAAAATCAGTCTTCAG:1 + chr3R 14014244 3' + jockey 4757 1 71.29 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTA:1 + chr3L 6024591 3' + roo 9028 1 70.30 TTCAAGCGGATGTTCGGGTCTTAAAACGCAGCGTGCATTTCGGAATCGCTTTAATTTAGCCCCGCTGGCCACTCGCTCCGATGAGCTGTTCCCGAGCCTGG:1 + chr3R 18020554 3' + mariner2 181 1 64.36 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAATATACATATATACAATACAAATAATGAAACCCCAAGTTGTGTTTTTAAAAA:1 - chr3L 9858249 3' - pogo 22 1 58.00 AATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTATATAAATACATTTTTATTTGCCTCACCGTCGGCAGTCATT:1 + chr3R 20884961 3' + flea 4982 2 61.39 CACACATTGAGCGAATTTTACGATGAAAGCCAAATTGCGAATTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACGACCAAATTGAGAGTAGTTTTT:1 + chr3R 19445241 3' - Tc3 189 1 59.41 TCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCA:1 + chr2R 5084061 3' - F-element 57 1 73.27 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATAGCGTGCTTTGTCTTAAGCTGGCACTTATAATGTTGGAAGAAGTTGAATTC:1 + chr2L 17298506 3' + Juan 4145 1 57.43 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTTGTTCTTCTAAAAG:1 + chr2L 2437788 3' + roo 9051 2 57.43 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGTTCCCTAG:1 - chr3L 14240803 3' - Tirant 11 2 70.30 CTCCCGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGGGCAGGATGCTCTTTCCTTGCTCCGAAACATCGTTGATGAGGCCGCCCTT:1 - chr2L 5143232 3' - 1360 3288 1 57.43 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTTTAATGCTATTGTTAATTGGTTTGCTTGCTAATTCGCTTTTGCCTTCAATTTCCAGT:1 - chr3L 15521333 3' - roo 8718 2 66.34 GTGGAAGGCTGCACCTGCAAAAGGTCAGACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGAGTAACAAAGGCCGACACAGAAGC:1 + chr3R 24625818 3' + P-element 308 1 33.00 GCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGA:1 - chr2L 17210104 3' - 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chr2R 3919664 3' - 1360 32 1 55.45 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCCATGAGACATACATGTTTTTCAAAACTTGGTGCATACTTTCAGGCACCATTAAGTGAGATTTGAAAAACCC:1 - chr2L 809639 3' - jockey 14 1 69.31 CACGTATGCCCATGCATTGTAAAGTAGACACTCAAATAACACTTAGGCCATCAATCAGCGCACTAGCCAAGGTCAAAAGCCCAGCCACGCCCATGTCCATC:1 + chr3R 5155921 3' + 1360 187 1 79.21 ATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGGTAAAAGTCAAGTCACTCGTTAAGTCGTGCGCGAAAATGTTCGAGGTGTT:1 - chr3R 9816944 3' + F-element 358 1 56.44 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTAT:1 + chr3L 9692747 3' - P-element 25 1 50.50 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATAAAAATGTTATGGCATTCTTATTGGGGGGAAAAATAACAAATGTAGAGTAAAATGT:1 + chr2L 18513608 3' + jockey 4976 1 53.47 CGTTTGGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAAATCAAATTAACTACAATGTTTAAGATCGCCGCCGTCGACCACGTCAAACTTCTTGGAGATAA:1 - chr2R 912955 3' + mdg1 389 2 49.50 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGG:1 + chr3R 9369993 3' + roo 9033 1 63.37 CTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTTGCCTCTATTCGAATTCGATTAATGGTAATGCCAGGGAAGTGGCCACAATTTAATC:1 + chr3L 12452223 3' + 412 473 2 55.45 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACTCCATTGACCGACCGCCTTGCCGATGTTTCGATTACGCGCCTC:1 + chr3R 27374862 3' + mdg1 386 2 58.42 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTG:1 + chrX 15195303 3' + Transpac 5205 2 56.44 GGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTG:1 - chr3R 5977768 3' - copia 4924 2 78.22 AAACGCAATTGGACCAAAGAAAGAGAACAAAATGTGAGAAAGATTTTTTAAACCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATTTGAATATTCTAATGTCTTTGGTT:1 + chr3R 4577555 3' - Tc3 58 1 79.21 CAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGTTTAATAGAAAATGTACTTCTACATAGAAAAAGCAAAATGTTTAAAATAAGTTAATTGAGTAC:1 + chr3R 19450020 3' - roo 412 1 68.32 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCTTATGTATGTACATATTGCTGACATGGAGAGCCACAAAGCG:1 - chr3L 19779020 3' - Tirant 13 2 62.38 AGGCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTGAAAAAGTAATCGAGTGCAGCGCACTCGGGCAATTCTGCGAAGCAAAT:1 + chr2R 10657356 3' + R1A1-element 4983 1 49.50 TTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTATATCTTTTATTGCTTCCTCAGTACTTGTTGACTTGTCCAATAACTAATACGATAATGTGATTTATAATCCTTGATG:1 + chr2R 4905139 3' - G4 3619 1 74.26 GCGAACAAGTACTTCATGTTTATATACTATGTTGCTGTTATTAACTGAACTTATGTATGTGTATCCTGCAAGTCCTGGTCCTTGCTCGTTGGTCCTCAGCT:1 - chr3R 11272863 3' - invader2 58 2 60.40 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTG:1 - chr3R 9981491 3' - jockey 4786 1 50.50 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAACATAAAATGCAGGCAATAAAAAGCAGCCAAGCAGCGAGCAACGC:1 + chr2L 5447770 3' + Juan 4166 1 65.35 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGG:1 + chr2R 1243235 3' + mdg1 7422 2 61.39 TATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATGGGTGGCCACTGGATCGAGTGGGTGGTGAGTGATGTGGACTATCTCTACA:1 - chrX 12855102 3' - 297 373 2 60.40 AGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATTAGAAAATATAATTTTATTATGTTTTGAGTTTTTAATAATTTTTTAAGTG:2 - chr3R 21695432 3' - 3S18 5793 2 52.48 AAGGCAAAAAAAAAGGAAAATACAAAAAATGGCCGACGGCGTCGCTTTGTCCGCACAAACCGCTTTCCAGCCAAATATTAGTCAGAAAACAATCTGATTGT:1 + chr3R 28133220 3' + Doc2-element 248 1 56.44 GTCAGACACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGAAACTCAAGTCCGGCTCGACC:1 - chrX 19690865 3' + roo 8829 2 78.22 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACAAAAG:1 - chr3R 17121617 3' - mdg1 7057 2 59.41 TATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTATTCTTTGGTCGCAAATCCCAATTTTGACCAACC:1 + chr3R 4543281 3' - 3S18 5 2 74.26 AAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTCGCAGCTTTTAGGTAAAA:1 + chr2R 9426484 3' - P-element 56 1 23.76 GTGGGTGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCTTATGTATGTACATATTGCTGACATGGAGAGCCACAAAG:1 - chr3L 19779022 3' - Tirant 10 2 63.54 AGAAANGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAGCTATACAATCTAGGACAAGTTGGTATTAAATTGAAAGACACCCTCTGGATAAAAATGAATAACAA:1 - chr3L 11461318 3' + copia 246 1 68.32 AGCTTNGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTA:1 - chr2L 15333709 3' - P-element 22 1 55.45 CCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAACAAAAACGAATCCGAAAGCAACAATGACAAAGATAGCAATCACTAAACAT:1 - chrX 2458770 3' + I-element 152 1 57.43 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTT:1 + chr3R 27189316 3' + roo 361 2 70.30 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGC:1 - chr2L 7548006 3' - blood 41 2 66.34 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGGGAAAAGTTTTTGATTTGTGTCATTGTCTTTTCCCCAGCCAGATGGTATTGTTGTTCTTGTTGTTTGTG:1 + chrX 7809069 3' - roo 6 2 74.26 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTC:3 - chr3L 9692696 3' + P-element 2833 1 25.74 ATATANGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACAAAGTCCCATGTCGTGAAGTGCATCT:1 - chr3L 13080950 3' + 412 7497 2 73.27 TAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCAATTGATCCAAAATAAAAGAGTTACGTCTGCGGGCCAAAATTAAGAGAAACGGGC:1 + chr2R 10977254 3' - 1360 300 1 63.37 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATG:1 - chr2L 15344150 3' - transib2 47 1 70.30 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGATGTTCCGAAGGGC:2 + chrX 4488942 3' - 412 27 2 52.48 ATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTACTCATTACCCTTTATGCCCTTCACTCATTGTTTT:1 - chr3R 25826236 3' - hopper 1102 1 66.34 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTA:1 - chr3L 17869912 3' - 1360 29 1 54.46 CCAGATCGACTCGGCTATTGATTTTGATAGAAGGCTTGCGAAAGTGGAGGTCACGAATAGGTGGTCCCTAGACTTTTCAATTCTCCACCGATTTAGTCCTT:1 + chrX 22638576 3' - INE-1 99 1 59.41 GGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGGCTATACACACTGGCGTGTGCCACATTGTCATTGTTGCGCTCGGCCCGCCCAACTCTTGT:1 + chr3R 23615817 3' - invader4 2980 2 72.28 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTAACGCTTTCGCGG:1 - chr2R 17394610 3' - jockey 24 1 61.39 ACGAATTCCAAGTTTACACACTTTTAAGACTGTCAAGAAACTCTTTACACATTGTAATGATCGATTGGCGCCCTTTTTGTCTGTGATGTATTACGTGCGAC:1 - chr3R 5263472 3' - S-element 1532 1 52.48 GCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCG:1 - chr3L 27356090 3' + Tc3 1676 1 63.92 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGCGCAATCTAGATCGTCAGCATCGCCTCAGAGAACAAT:1 + chr2R 5262679 3' - 1360 3 2 76.24 TTTAACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTGCTGTG:1 + chr3R 6147335 3' - copia 19 2 60.40 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCT:2 - chr3R 10457273 3' + roo 9039 1 58.42 AACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTT:1 + chrX 8364652 3' - jockey 4789 1 55.45 TATTCAAATGATCTAAAAAAATACCCTGTACAAAAAACAGGCTTAGACGGGAATTAAAGCCGTCGATAGCCTTCCGTGCATCCCGTGGTGCTGAAATGGTA:1 + chr3L 12306959 3' - Tc1-2 277 1 89.11 GTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATTG:1 - chr3R 23665258 3' + 297 364 2 63.37 GGTTGATGAAAGTTATTTGATCTAACAAGGATCGCCGCGCTTCCGTGTTGGCTGTCATTATCTCTCTCTCTGCTTGGGGAAAGGTATGAGGGGGTGGGGA:1 + chr2L 18796112 3' - G5A 230 1 58.00 GTCTGACGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCTATCTTGTCTCCGAGATGGCCGCTCGATAACCGATGCCAACAAAAGGAAAACTATTGGAAAATAGACACAAC:1 - chrX 7178229 3' - Doc 357 1 75.25 CGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAGCATATGCATCACACAAAACAACGAGCGATTTCATTGTTTTCAAACATTGAGAAA:1 - chr2R 12001672 3' + Stalker 6908 4 68.32 AAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTA:1 - chr2L 23295812 3' + micropia 5391 2 73.00 CCATTTCCCATTACGGCCTTCTCTTCGGACTGGGGGGGGGGAGGAGCTGCAGTGTCGGAGAGCCAGCTGAAAAGTACTGTATTGCTTATTTGAATGTAAAG:1 + chr3R 30814471 3' - accord2 255 1 59.41 GAAAAGACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCA:1 + chr2R 9454303 3' - opus 7045 4 71.29 CTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGC:1 - chr3L 8063849 3' - P-element 47 1 32.67 TGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTGTGGCGAGAAGGGGGCAGGTTCAGCAGCTAATTTTGCCACATTGTCACATACTTGGC:1 + chrX 19326321 3' - 412 202 2 59.41 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAGTTTTAAACTGCG:1 - chr3R 11993296 3' + P-element 2851 1 43.00 CCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTCACGTTCGTGGAGCCGGCCAGAAATATATCAGTTCACTTTAAGACGATGAA:1 - 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P-element 6 2 68.67 CGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAGGTTACTTAAAGTCTTTCGATTGAATATTATATTGGTTTATTTGGACTTTTGT:1 - chr3R 5178511 3' - Doc 4424 1 53.47 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAG:1 - chr3R 19657437 3' + roo 9052 2 59.41 ACCGACACACACACACACACACACAGACATGGGGCAATCCACCCCCCCAATATTATATGTGCTTTTAAATATTTTGTAAGAAAAATCT:1 - chr3L 17442360 3' + accord 254 2 68.18 AAATAAAAACAAAAAAAAAACTAGCCAACTCTTAACATGCCAATCGAATATAATAGCATAGACTTTCTTGCGTCTAGCCAACTCTTAACATGCCAATC:1 + chrX 18414710 3' + HMS-Beagle2 489 1 78.57 ACAATAAATTATTGGAAATTTTCCACTCCGCACGTGTTGCGAGGCGAGCTTGCGGGTGAGCTTTTCGAACAGCTACGGCCAGAGAGCACAGCAACAGGCGC:1 + chr3R 5527669 3' + R1A1-element 147 1 73.27 AACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAACTACATTTAACTAAGCGACAACTATTTAAAAA:1 - chr2R 13144940 3' + roo 9060 1 71.29 GACATNAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATATATAAGCTGCTTTCAGCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGCGA:1 + chr3R 29432830 3' + 297 6957 2 60.40 GCATACAGAAAAATGCGGTGTGCATAAGTATGGTGTAAGAAAATACATCAACGTGTTCTAAATGTAAAATATACATTCAGTTTGCATATTCAATTTTATTT:1 - 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BS 4673 1 61.39 AAAAAAGAAAAAAAAAAACGGGTGGGGGAAAAATGGGGGGCGAAAA:1 + chr3L 9588508 3' - hopper 140 1 76.09 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGATGTTCCGAAGGG:1 + chrX 4488941 3' - 412 7080 2 52.00 GCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCTTGTTTTTCCTGCACGAGATAAAAATTCAATTATGGCCTCTTTTTG:1 - chr3R 19965040 3' - Doc 4434 1 58.42 CGCATTAACACTAACTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTCTTTATTTGGTCTCTTCGTGAGATCGACATTTT:1 - chrX 22519004 3' + INE-1 533 1 64.36 CACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCG:3 + chr3R 9952260 3' - Ivk 18 1 60.40 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCATGGAGTGTCCCTAATTTCTCTCACTACACTCTGAGTGCCT:1 - chrX 495171 3' + 412 7510 2 58.42 GGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATA:1 - chr2R 4830333 3' - 1360 49 1 93.00 ATAAANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAACTTAAATACA:1 - chr2R 13144967 3' + roo 9034 1 63.00 CCGTCACGCTTCCACCCATACAAATTTTATGAGCGCATCGTTTAACAAATGAATTTACAACCGTGCAACGCCCAAATGTCTGGCGTTCAAATTCAAATTCC:1 - chr3R 13938159 3' + hobo 2666 1 80.20 CACTGCGGCACCGTGGTACGTTCGGGGTTTGCTTTACGAGTATCCAGACAATCTTTGGCCTTGACGTAATAGCTGAATGCCTCGTTGTAGAAGGCTTTTTG:1 - chr3L 8724511 3' + F-element 4354 1 79.21 TGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGAGTCTCAT:1 + chr2L 11551385 3' - Max-element 52 2 75.25 CATGCAGGTGTTCCAAAGCTTTCCAGTTATGTTTTATGTTCCTCTTTATACTCGGCCACGTGCATTGGTCGTAAAAGCTTAATACTTAATATTTCGGTCTT:1 + chr3L 12498175 3' - Transpac 494 1 68.32 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCATCTACCAACAATGGCGCATTGATCATCGC:1 - chrX 19095754 3' - roo 47 2 72.28 ATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATTAAATTAGTTATTTCAATTTTTATACTCGTACTAAATTTTTAACTAGAATTAACTGTAA:1 - chrX 5651581 3' + flea 245 2 70.30 CGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTTCTCGCTTTCTATATGACATTACCGCCTTTCCCATTCCAAGGACCTCGGTCAACTGTCACACAC:1 - 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chr2L 15893680 3' + Max-element 8520 2 64.36 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGACCACCCAAATACGTCCCTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATT:1 - chrX 4890031 3' - 297 24 2 56.00 CCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAGGTTCCTGCGAATTCAAAAGTCCGTCTGCA:1 + chr3R 19449458 3' - roo 399 1 68.32 GTGCGNTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGCTATTTTACTTTCTAAACT:1 + chr3R 31458552 3' + jockey 4979 1 64.36 TGTTCTCGCAAATGACGCAGCTTGTTGCTTCCATCCTCAACGCAAAAGTATGCAAAGCTAAAAATCTAAACAAGGCAGTCTGTATTGCCGGTTTTTAGATG:1 - chr2L 17039209 3' + G2 215 1 63.37 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAGAA:1 - chr3L 5975586 3' - hobo 26 1 54.46 CAATGATTTAAGATAAGGGGTATATGGATCTGGTTACCACAATATAAGCTAATTGCGGTGGGCTTAGCTGGACGCGGGCGTATTCAGTTTTCAACTTCTCA:1 + chr2L 10983057 3' - Cr1a 4137 1 77.23 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTTTGCTGCGTGCCAAGCGGCCACATTTACAAATACAGATACAGATACATTTGCAGATG:1 - chr2L 2399008 3' - FB 19 1 60.40 GTGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTTCAATTTGCTTTAAGATTCTACCCTCGAATTTCTCTTTTCCCTTTG:1 + chr2R 9362490 3' - Doc 4474 1 58.42 ACTTANAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAAATCTGTTGGAGAAAAACTG:1 - chr3R 9837564 3' + 412 472 2 58.42 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCA:1 + chrX 5443956 3' + mdg1 7429 2 55.45 AATTTGCTGTAAGATTTATTGTCAAATCTAACGGATTTCTCCGACAAAAGGCAATGCTCCTGAGATTGAAATTTGAAATTTGTTTGTCAACTGCTGCAGAG:1 + chr3L 25254981 3' + GATE 407 1 54.46 ATTTATACATATGTACATATATACAATATATACGTATATACGTACGTACATAAATATGTGCATGTGGCTACTTATAAAATTTATTATAATTCATTACAATG:1 - chrX 21468669 3' - invader3 5086 1 71.29 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCG:1 - chr2L 19642958 3' + roo 9053 2 59.41 CTAGCTCCAATGCATCACGCCATAAAATCGTGGTCGCCGTTCTCCAGTTCCTCCATCTTTTTGGTGAACTCATCGTATCCCTTGACGTTGTGTGTGACCAC:1 - chr2L 5520404 3' - gtwin 7111 2 68.32 CCGCGGTATGGCCGTGAAGCATTGCTTCGCGGGGACGAAGCATTTGCTGACCACAGACCCCACTGACCCTTTCAGACACGCCAGTCCTTCTTCTTCTCTCC:1 - chr3R 1027698 3' - Rt1c 5335 1 58.42 TATTTATAAAATTAAAAATTGGGGAGCACATTAATTTATTAAGTTTTAAGGAAAAATACTTTGTAGGTCTCTAATTTTTTTCACAACAATTTGTATACTCA:1 - chr2L 7749135 3' + 3S18 350 1 78.22 GGTCAAGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGCCTGTTATGTCAGTGGTTCCTCCACGTTGACCACACATCCG:1 - chr3L 16104765 3' + HB 1393 1 69.31 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTGCATCGTTAATCTTCTGAAATTCGAATCCTCTTGC:1 - chr2R 23305396 3' - I-element 12 1 64.36 TGACTTTAAAGTTAAAAATTAAGGGTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATCAAGTATCAAGTTTATTATAGGATTGACAAATAATCACAAAACAT:1 + chr3L 22987116 3' - S-element 1668 1 54.46 TCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGA:1 - chr2L 7350754 3' - mdg1 52 2 73.27 GCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAATGAATTTACATTGTACATATTAGACCTAATTATCTTCTCTCTGTGCA:1 + chr2L 3901010 3' - 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I-element 180 1 65.35 GATATTTCCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAG:1 + chr3L 21384024 3' + roo 9023 2 67.33 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGG:1 + chr2L 326218 3' - roo 8678 2 66.34 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGACTGGCTTGGCCCG:1 + chr3R 25823734 3' - hopper 14 1 65.35 CGGTCTTATCGTGGAGTTAGCGATTTTGGCCCTGCGCAGTAAAGTCGAGCCGGCTTTTCTCTATCGTACGACCCTACGCTCCATACTCCGACATCCCCCTT:1 - chr3R 16248421 3' - gypsy4 6595 2 71.29 AAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGTTGCGTCGAAGAACTCCCACGTGTTTTTC:1 + chr3R 11165719 3' + Tabor 7304 2 61.39 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTGAGGGGC:1 + chr3R 18507861 3' - jockey 20 1 51.43 TAGCATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAATAGAGCAACCAAGCAACATTTCACGAT:1 - chr3R 15270670 3' + Stalker 6900 4 71.29 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCC:2 - chr2R 5849989 3' - jockey 62 1 78.22 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTG:1 - chr3L 12452155 3' - 412 14 2 54.93 TTTTTNTTTATTTTTTTTTTGTGCGATCGTGACTGCAGTAAATGTGGGCAATTAAGGCAAACAATCGCTGGGCAAAGGCATTGTGTAC:1 - chrX 14753915 3' - G2 3076 1 63.64 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGAATCTTACCATTTTGTTCTTTTGCT:1 + chr3L 5975640 3' + hobo 2892 1 75.51 CCAACCAAACCCGTCAAACCCCACCTGAATCTCCGCAACCCAGTAACATGGAACAAATGTTTGCTCGCCTCTCGTAGCTGGATAGCCAGTCGTGGGAGGGT:1 + chr3R 24942310 3' + G2 113 1 67.33 ATGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAAT:1 - chr2L 12074509 3' - Juan 4029 1 57.38 TAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGTGTTAATCACTTCCCATGAATTATTCAATAAATTTCGCATAAAAAAG:1 - chr3L 4048448 3' + 3S18 6076 2 54.46 GGTGACATTGAATTCCATTCTGCCACCCTGAACTGGAGGGGGATCAGGAGTGGTCAATACGTTAAATGGCACTATATCAACTATATATAGTATTCAGCGTT:1 + chr3L 10897426 3' + R2-element 3160 1 65.35 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGTTAGTAACCATTATTTGTAGCTT:1 - chr2L 14260725 3' - 297 20 2 60.40 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCG:1 - chr2L 108007 3' + P-element 2844 1 36.63 ATGTACATATGTATGAATAATGATGTAAGATTAAAAGTTATCTTGAATAATCGTTTCTCCCAAGCTAAGATTCCGAAACGGGTAATTCGACGGGCCTATAA:2 - chrX 11624270 3' + invader3 5090 1 71.29 ATACTTGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATCTAACCTCTCCCCTTTCGCGCGCTCTCTCGCGTATTCTAGCAGCTACACCTTTGGATTAGCGTTTTGC:1 + chr3L 23948559 3' - Cr1a 4209 1 75.25 AGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTTTTGTGTTTGCGTTCGATAAAATATGAGAATTGTATTTCATTTGGCATTGAAAGTCAATGCACTTC:1 - chr3R 25936760 3' - GATE 33 2 70.30 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACACAGTGGCCAACG:1 - chr3R 20884892 3' - flea 32 2 62.38 GACAGGAGAGAGAGCGGAGGTTTTTGTTTAGTATGTAGGCATAAGCCCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATTGTGAGCGCTAATTGCCGCTTAAGGAG:1 + chr2L 4102621 3' + Rt1a 4947 1 73.27 TTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTATTCTAT:1 - chrX 4796937 3' + copia 235 1 58.42 AAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTTAAAAGTGTGGCAGAACTAGGGGACATGCAAAGCTTAGGAAGTAACATCAAAAAATGGGCGTGTTCCGTTGAGGA:1 + chr2R 1368054 3' - INE-1 470 1 66.34 AATTAAAATTAAAATTAAATCAATTGTGGGGGGGGCAAGGTCATCGGGCGATAATGGAGCCATTCGAGAACACTGTGCGACCCCTGGCACCCTTCAACT:1 - chrX 18523191 3' - Rt1b 129 1 81.82 AAAATAATAATAATAATAATGTGTACTATATCCAACCTATTTTTCGATAATATTTTTTATTATTAATTGCTTTATGTTCCACTGCCTAATTAACCCCGTTT:1 + chr2L 12495605 3' + invader6 4389 3 57.43 TCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTTTTTATCGCATGTCGTTGCGCGATTTTTGTCGTTTCTTGTTTTGATTTACTTTCAGTTTTCGTTTACATT:1 - chrX 2766359 3' - invader4 323 2 74.49 ATGACAGAGTTGGAACCAAGAAGATTAAAACGCAGAGCAGATTGTTACTTAGAGAAAAAAAAAAACAAACCAGCACGAGGAAACGAGGGGCTGGGCAGAAA:1 + chr3R 10533714 3' + Porto1 4504 1 60.40 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTC:3 - chr3L 13194769 3' - 297 43 2 73.27 TATAACATGGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAAGAACTACTGAGTATATATATATATTCAGCTGCA:1 - 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Porto1 4269 1 59.41 CAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATACTTATATGTGGGCTGGGCAAAAGTTATTAAAATCAACAGCAATAAATTAGCATATTTTATGCTTTCAA:1 - chrX 13350737 3' - jockey 4765 1 70.30 CATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCAACAGAGGATCCGTCGTGGCCGCCTTTTTGGAAGAGATGGAA:1 - chrX 1954445 3' + Tirant 366 2 59.41 ATGGGAGAACGTCTCTCCGTTATTGAGTGCCCTTAAGGCTAGTCAACCAATCAACCAATTTAATAATGACAATGTCGGTCTGCGACCCTTCAGCGATTTCT:1 - chr2L 17865941 3' - gypsy6 7689 4 70.30 TCCCATCGTTTCTGTATTTTCTGCCACTTGAGCGGGACCCAGTCCTTTTCTGGAGGTGCCCTGCAGGATAAGAGACAGATAAGCCTATAATA:1 + chr2R 18854275 3' - Tc1 1598 1 76.09 AATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCATACGCAGATATGCGATTTTTTTCGGTTAA:1 + chr3R 15998131 3' - pogo 2094 1 58.00 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATA:1 - chr2R 19192542 3' + roo 393 1 60.81 CACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTCGCAGCTTTTAGGTAAAATCGGCGTTCTTTCGAACATTGGAGAATCCAGAGCCACCTGGAGTCGCATTCTTA:1 + chr2R 9426538 3' + P-element 2886 2 78.00 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCATAAGT:1 + chrX 21668156 3' - Stalker2 7258 2 69.31 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACA:1 + chr2L 2197136 3' - P-element 43 1 37.62 TAAACCGAAGATATTTCCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGG:2 + chr3L 21384015 3' + roo 9014 2 76.24 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGG:2 - chr3L 17122433 3' + roo 9020 2 77.23 TAAGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGGCTAATCTTTATCGGCTAATAGAGTCGTCGCTTCCTGAAGAACACGCGTCCGCCGGCGATCAAACATTTCC:1 + chr2L 3058053 3' - Quasimodo 38 2 77.89 AAATATTTTTTTTTTTGTTTTGGAATTTTATAAACTTGGTAATTAAATAAT:1 - chr2R 18737910 3' + Tc3 87 1 49.02 ATCAAACAATTATTTTTATTTACTTTGAACATAGAGAAATCCTTTACTTTTTCGATTTGTCAATACCGTGAATGATACACTTTTAATATAGACAGTGATAT:1 - chr3R 28095734 3' + TAHRE 64 1 83.17 TTGATCTGCGTCACATAAAACCGTGCTGACATGGTGATATAGTTGACCTACAAAGCTCAATTTATTCACATTTTCACTCAACTATTTTCATTTGTACATTT:1 + chr3L 9347398 3' - Q-element 214 2 65.35 TTCACGGAGTAGAATCTTAGACTGCCTAAGTCCTGTAGAATATTGGAAGGTAACTATACCTATTTAATTGCGGATGTTGTGTACAACTACAAAAAACTGAA:1 + chr3L 18382024 3' - baggins 5049 1 64.36 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGTTTTTTATGCTCCAAGTGGGTGAGAACACACAAT:1 + chr3L 13364630 3' + hopper 1410 2 71.29 GCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAAACGTCTTCACACGTCTACACAGGCGACCAGACTCTCATCATATTTAATGAAA:1 - chrX 19392654 3' - F-element 66 1 67.33 GTTAGTCCAACGACACGCTTTGTTTTACCCATTTTGAGAGACGACGCTGCACTTTTATGGGCCAACAAATTTTCCGCCTTAACTCGCTCAGACCGAAAGTG:1 - chr3L 18119392 3' - pogo 350 1 76.24 CAGTATAGGGCTACGTTGGAGGCCTGATGTACAGCATGTTTTATGCCTGCTCTATAAGCATGCTGATCTCAACTTACCCAGCTCTATCGTCCATCTAATGA:1 - chr3R 21788143 3' + invader4 389 1 77.23 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATA:1 + chrX 14796901 3' + transib2 2773 1 76.24 TATAGATAATATAAATAAAATATAGACAAAAATAATGACTATTGAAATGCTGAATATTCTTTATAATTATCATCTCTGCAGCAAAGCTGCCCATCAATGGT:1 - chrX 16813811 3' + transib1 1921 1 49.50 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCGCCAAG:1 - 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chrX 22927605 3' - Tc1-2 1622 1 77.23 GCCACTAAGGAAGAAGATTGACCAGGTGATGATTCCTGTGAAACCAGAACAAAAACTCTAGCATACAAAAAATAATAAAAAAAATGTAATATAGAAGACCA:1 - chr3L 10617752 3' - G3 373 1 57.43 AGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAA:1 + chr3R 15943315 3' - jockey 4690 1 74.26 AATCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACATATAAAAAAAAAAACCATAAGAGAAATGTTTCAGAAAAATACCCTTCTGATTTAAAATTATTTCTG:1 - chr2R 16898224 3' + Max-element 289 2 64.36 AATTTAGGTTCGCCTAATTGGGTTTGGTACGTTTTTTGGTTTTTTTTTTCCAAG:1 + chr3L 13867890 3' - I-element 236 1 59.26 ACCTTCTAGCTTTTTTAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGATTCCTTTTGCGGCACGAGCCTTCAGTTTGCAACGATGAGAAGGATGAGG:1 - chrX 9289675 3' - INE-1 157 1 61.39 GAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTAATAAATTATTTATGATCCAATTGCTTTGTCAATAAGACCTTGAAAATGGCAAATACACTGGTTTTCG:1 - chrX 13136531 3' - jockey 4854 1 64.36 ATAGATATAACTTACTGATTTAAAATTAAAATTATTGTCTTTGTTTATGTGTTTATGCCTTATTTAGCAAAATCTCCAGGAAGCCGAACCGGAATTGGTTT:1 + chr2L 16757031 3' + transib3 301 1 63.37 TGGCCGAAATCAACTCTGATCTACGAAACGAATTTATTGGGAACCCGCCATAGTAGAAACCTGAAGTATCTAAGGGTTACAGCCAAAAAAAAATAAAAATA:1 + chr2L 22995837 3' - 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roo 8693 2 63.37 AAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAA:1 + chr2R 5674700 3' - S-element 61 1 82.18 GTTCGCATTCTCACTAGCTGAGTAAAGGTTATCGTTTTTCGGGGCTATTCAAACAGAAACTCGTTTTGAATAGCCCCGAAAAACTTCATACCCTGTAAGT:1 - chr3L 20630948 3' + INE-1 530 1 52.00 TCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTGTTGTTGTACTTGAAGCTCATTTCACACATAGACACATGGCAAGTACAACGAGGCAC:1 - chrX 8188573 3' + 412 7504 2 61.39 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACT:1 + chr2R 19936681 3' + roo 9037 1 56.44 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGT:1 - chr3R 14639325 3' - roo 14 2 64.65 TTAATTATTATTATTATTATTATAACTTAAGTCCGCATACTCGCTGTCCACAAACCAGCTGGGGAAAAAGGAGGCCAGCACCATCTTCAACTGACCCATAG:1 + chr2R 18856480 3' - mdg1 45 2 72.28 AAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCAACCTGATAGGCCGCAAAAAATATACAAGCGTAGCCACAATGAACTCATGAAATATTGAAGAAATTATGATTA:1 - chrX 15366996 3' + Doc 4462 1 75.25 GTTAATAGTGAACAATAAGACACAAACCATTAGTGAGAACGCAAATCCTATCCAAATCATAAACCTAAATAAAAACGAGAAAAAAAAGGGATGGGATGGGA:1 - 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Tirant 8153 2 68.32 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTAC:1 - chr2L 18112514 3' + transib2 2786 1 63.37 GTCAATGACCTAGCACCTGCAGGATGCAAACGATGGCGGTCTTGCTCACCAATGCTTATGATCATTCTGAACGTTTGGCAGGCGGGTTTGTGGAACTACTG:1 + chr2R 19509200 3' + Doc3-element 347 1 60.40 GTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAA:1 - chr3L 27415234 3' + transib2 2788 1 62.38 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTGGAATACATTATATATGCGTACCATTTCTGGGGTCTGGGGCTAAATTGGTATCACTTCAAT:1 - chr3R 17367981 3' + roo 393 1 59.41 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTCTACCCTCTCACTCTTTCCCCCCGGCTGCGGAGAGGTGGG:1 + chr2L 11045350 3' - P-element 31 1 44.79 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTG:2 + chr3L 19215866 3' + roo 9043 1 55.45 AACTATACTAAAGCCCGTGTGGACTTATGGCCTCGGATATTGAAAAGTTGTTCCTGGTCTTTTGCCAAACGAAGAAGTCATAAAACCGAATATTGTGTTTT:1 + chr3L 5993377 3' + G4 3410 1 75.25 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTCATTGAAACAAATAAATAACACTTT:2 + chr3L 11435628 3' - roo 8717 2 80.20 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGACTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTATAATTAAAT:1 + chr3L 14910636 3' + roo 9036 1 63.37 AAATCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTTAAGAAACTCTTTACACATTTTGTTTTCGTTTTGTCACTAATCGGACTTTGGATTGCCAAGCGAATTACAC:1 - chrX 15078046 3' - S-element 1529 1 61.39 AAAGAAGCGGACCACGATGGTTCCCTTGTGGGACACTCGGAGAATACAAGATAAAGAATTTTTAAAGAGGACTTTCTGCGTCCTGCGCGTTCTCACTGTCC:1 - chr3R 2534121 3' - Q-element 499 2 74.26 GGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCGGTCGCCTTGGGTTCTTGTATAGCCACAGCTCTTCCTCGTGGATTTCCCGTTTGAATGCTGTC:1 - chr3R 5566482 3' - Transpac 5216 2 68.00 TGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTG:2 - chr3L 11909949 3' - Tabor 48 2 74.26 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACGGCAAGACCGTAAAAGTCAACTAAAGTACGGGCTGGTCTGACACACATGCTTCACATTCCCTATTACG:1 + chr2L 11065961 3' + P-element 2881 2 73.27 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGCAACCCTTATAGTACTTATACATATGCCATAATCTGAGAA:1 + chr2L 9389114 3' - 1360 37 1 65.35 AGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTT:1 - chr3R 7100996 3' + pogo 2064 1 66.34 AAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATGGCCATCTATGTATTTTCCGGCC:1 + chr3R 14356113 3' + jockey 4930 1 77.23 ATCTGTATGCTGAATCTCAACCCTCTAGCTTTTATAGCTCCTGAGATCTCCTTGATCAAGAATATACATATATACGGTATGTCAAAAACTTTTTAATTTTA:1 - chr2L 18159057 3' - INE-1 176 1 46.53 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAATTCGAGTTACATATTTCATTT:1 + chr3L 12085257 3' - pogo 3 1 74.00 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGA:1 - chr3R 20884911 3' - flea 51 2 81.19 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAAATGTACGTGCACATCATAAATTTGGAGCAACTCGTAAAATAGTATA:1 - chrX 17132452 3' - pogo 24 1 55.45 TCCATTGCTCTATAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTCTGCCGCCTTTTGGTTTGATTTTATTTTATTTCTCTGTTCCGGTAAGCCTTTGAGCCT:1 + chrX 4047957 3' + hopper 373 1 61.39 TCGGCTGATCAGTATCCATGCGCGCTCCACTCAAGAGGGCAGCTAATCCACCTTAATGGATTCCTAAACTTGTTGCTATGACCGTTTCAAAAACAGTC:1 + chr3R 3671496 3' + Quasimodo 6979 4 53.06 CAATAATAATAACAACATCAGAACACATATACACACTCACACACACACACACACAGACGAATGCAGAGCAATGCAAAAATGATAGCATACTTTGTAGGGCG:1 - chrX 12790044 3' + G4 3662 1 71.29 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGAT:1 - chr2R 5485084 3' - 1360 49 1 75.25 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTACATTTTTTATTCAG:2 + chr2R 16898313 3' - Max-element 31 2 55.45 ACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAACAA:1 - chr3R 19449976 3' + roo 8672 2 72.28 CCGTATGAACGTCATGATCTCAGGAACTATTTAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCGAATATTAAAAATAGTGATCGCCTCAATGCGCTCAATTAAAACTAG:1 - chr3R 13305214 3' + INE-1 135 1 53.47 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCGATCCCCAAAAGCACCCCAAAAA:1 - chr2R 16366790 3' + hobo 2909 1 66.67 CTCCCAAATGGGCTGAATTAATTGCTGCCAAAGTCACGATCCACAATTTTATGCTCAAGAACATTAAATAGCAATAACCCACGGTGCAGCAACGCCCCACA:1 + chr2L 14995530 3' + X-element 4648 1 83.17 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGCGTGCCAGTGATTCA:1 + chr3L 15035220 3' - pogo 15 1 66.34 ACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAAAAC:2 + chr3L 3279803 3' + Juan 4191 1 54.46 TTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTAAATGCTATAAATTACTTTTCGAAC:2 - chrX 868679 3' - jockey 4912 1 75.25 GTGTTNTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTTTTGTAATAAAAAAAAAACCAACCGATAA:1 + chrX 13548833 3' + blood 363 2 64.36 GAACACACACACACACACATACGCACACACAGGCACATGGACATAGACAAGTCCCTGCTCCGAGATCCCTGCTCCCCATGCCCATGGCCACATTTTATCGC:1 + chr3R 28774149 3' + accord 183 2 49.50 TGCCTACATAGCACGTGCAGACGCACAGGTGTTTCTGGGTATGGATATAGGATGAATCGTTTGGTTCCATCTACCTAGTCTTTGAGCACTCTGTCCTCCAT:1 - chr2R 7427820 3' - NOF 4273 2 65.35 TGTATAAACGGACTTTATTTTCCAGAGTGGTTTCTTGTTTTTGGCAATGATTTCGTGTTTCCCTCAACCGATGATTAATTAATTGAAATCCACAGCGCCTC:1 + chr3L 9015673 3' - G4 3387 1 71.29 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTGAACCCCCCGGACTATCTAATCGCATTCGGTTCGCAGATCTTTTACTTGTGCTGAACATGC:1 - chr3R 24152846 3' + P-element 2872 1 64.36 ATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTA:1 + chr3R 13423365 3' - 17.6 6952 1 59.41 ATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATATTTTCTATAATTTTGTCTTTATATATACATATATTTCATTC:1 - chrX 23431791 3' - Stalker2 7284 2 60.40 TGTATAATTAGGTATGTATAATCACGGTAGTTAATTAGTTAGTAGTTAATTACAGTTAAGTGTAGAGTTAACCAAATATACAACATTTTTTGTTTTAAAAT:1 + chrX 21087978 3' - mdg3 5293 2 78.22 ATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTCAGCTAAAACGTGTGGTCTGA:1 - chr3R 19609676 3' + Tabor 429 2 78.22 TTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTATTCAAATCGTACATTAATGGTAAATCTCATCGCCCAATAAACAGATCG:1 + chr2R 17670959 3' - Doc 4679 1 59.60 CAACCGAGGGATCTCATTACCCGATCTCCTTTGACAAGGGTCCGCAGAAGCTGACGCTTATCTTAAATCCTTTGGCAGCACAAAAAAAGTCAAATCATTTG:1 - chr2L 3184250 3' + X-element 4500 1 70.30 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAA:1 + chr2L 16686588 3' - pogo 28 1 81.58 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTAGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCT:1 - chrX 10730648 3' + P-element 2843 1 36.63 ACGGGNCCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTAACATTGCGAAATTGATTTTTCATCTGCTAGCGGTACTTTCCGCTCTCACCAAG:1 - chrX 12546422 3' + P-element 2879 2 67.05 GTTGCAGAGAAATAAGCGGTCCACCCGGGCAGAGATCCGCAGTACCCGGGTAAGGCTAACATCCTATAGCTTTTCATCAATCTGGAAAACATCGTGCCCCC:1 - chr3L 11061257 3' - baggins 365 1 59.41 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGGAAATCGACGGGGATGCAGAT:1 + chr2L 19679772 3' - Doc 48 1 53.00 AATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGCTTTTGAGGCAA:1 + chr3R 14049422 3' + transib2 2799 1 52.00 AGTAAAAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTCTAACAAGTAATCCGCTTGAT:1 + chr2R 23945284 3' - BS 5048 1 77.23 TTTTANTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACA:1 - chr2L 12074514 3' - Juan 4074 1 69.31 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTAT:1 - chrX 5018630 3' - opus 23 2 59.57 CAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGCTGTATTTCGTAATTAACGCGCGTAATAAGATCACGATTAAGATTTTCTCTCTCGACCAGCAGTGGAAA:1 - chr3R 20132285 3' + pogo 43 1 80.20 GAGATCTCCACGCTCATACGGACAGACAGACAGACGGACTTTTCTGGGCGACCGTGCGGGGGCTATCGGAGGTAGCCCCGCGACGATCAGGGCGCAAACCA:1 - chr3L 23255080 3' - INE-1 134 1 68.32 TCCGTAAGAACGTCAAGATCTCAAGAACTAAAATGCTAGAATGTTGAGATTCAGCATACAGATTCCGGAGACAAAGACCAAGCGCAAGTTTGTTGACCCA:1 + chr2R 5296377 3' + INE-1 134 1 77.00 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGGTAGTCAATCCATCGAACTGTGCTCCTTGCATATATACC:1 + chr3R 10321089 3' + roo 9034 1 61.39 AGACTNTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGATCTACTGCGGATCTTGTTTACCGAT:1 - chr2L 18112494 3' + transib2 2806 1 59.41 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACACCTAAAGTACCGAGCCCCTTAAAG:1 - chr3L 5975588 3' - hobo 28 1 52.48 GAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTTCTTGCTTGTGTGAGAAAAAACAAGAGACCAGATCGAGATTTTAAAGCAAATTTTTCTAGTATTACGAAAC:1 - chr3R 26314858 3' - 1360 3280 1 75.25 ATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATATGCGTGGGAAAATCTGAGTTTTTGGAGCTCGAAGGGCG:1 - chr3R 30325206 3' + 17.6 7394 2 63.37 ACCTAAGCAGATTTGACTGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGTCGACGAAAAGCCAAAAAAAATGTTCCAATCAGTTGCAGT:1 + chrX 6303963 3' + 297 6733 2 60.40 AGGGAGAAGAAGAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACG:1 - chr2L 12074499 3' - Juan 4028 1 57.14 TAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCT:1 + chr2L 21007071 3' - Idefix 36 2 70.30 GGTAAGAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAAAGCAAAAAAAAAGACCTGGCATTGACAACCGAATAGCGGAATCGAGTGAAAAGTA:1 - chr3R 18507820 3' + jockey 4972 1 44.55 AGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTACGAATGCTATTCATTCTTTTTATTTTCTTCATCATTGAAAGAGTTAAGAATATGTGCAACA:1 - chr3R 4543161 3' + 3S18 333 2 72.28 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATAAAGCAAACAAACAAATTGCGAATAAAAGAAAGGTAGATTTAATTG:1 + chr2L 17430726 3' + opus 471 2 63.37 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACATATGTTACATAGGCTAGCTGTTATGTATTGCTTTATATGTCTATATAG:1 + chrX 6997241 3' + P-element 2863 1 54.08 ACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATATAGTGCGAAATTAACCTGCAATATTCTTTTT:1 + chr3R 12894186 3' + blood 361 2 59.41 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCTGAGCTGCATCCTCCTGCGG:2 - chr2L 20118666 3' - Max-element 8 2 71.29 GTTAAATTGGTTTTATTTTTTTGGTTTGCTGCCGTTTGCCGCTAAATGGTTTTGTTAAAGTTTTCTGGGTTGAAACAGCTTGTCCATTCATTTAATTTGTA:1 - chr3R 9288613 3' - McClintock 6366 2 62.38 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATG:1 + chrX 19306804 3' + P-element 2841 1 35.64 GTGCGTTGTGAAAATACTTTTTACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATAACATTGCATTCGCTGGGTGAAT:1 - chrX 1427519 3' + Bari1 1696 1 61.29 TAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAACGTCGAG:1 - chrX 16798195 3' - diver 5911 2 56.44 CGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCTTGAAATATTTTGAAAAATGTTTTAATGTAAATAAA:1 + chr2L 17889388 3' - accord 39 2 61.39 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTC:1 + chr2L 15333768 3' + P-element 2850 1 34.83 GCACGTTTGATCAGCAAAATTTCACGAGCAAAGTCAAAAAATTTCAATAGAAGCGTTGTAAAAAGCAATGCAAAGAGGAGGAAAAACATTATTTCTGCAGA:1 - chr3R 20958543 3' - S-element 355 1 76.24 TTAATATTATCTTAATCGACCGACTTTCATAAAATGGGTTTTGGCAAAAAAAAAGGGGGTAAATTTCCCATAGTGCGCGGGTGTGCACGCGATTATCAAAT:1 - chrX 2082626 3' + Transib-N1_DM 441 1 91.09 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAA:1 + chr3R 9952249 3' - Ivk 29 1 55.45 CATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAAC:1 - chr2L 21936092 3' - INE-1 11 1 49.50 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTGCGATGTCATAAATTTTGTGAAAAATATAGTTTGG:1 - chr3L 12085140 3' + pogo 2086 1 62.38 GTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCGCACCCCGCACCCCGCACCACCGTCCATTGGTCCTTTCTTCTC:1 + chrX 8221928 3' - opus 7348 2 62.38 AAACGGTGCCAGGACTTGGTGGACGATGCGCAGCTGTCATTGCCCACAAAGGTCACGCAACCAAATAATATGTTTAAAGGAGCTCATAAAAGTATTCATTT:1 - chr2L 21125022 3' + Tc1 1271 1 69.31 CACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAA:1 + chr3R 15943310 3' - jockey 4693 1 78.79 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGGCCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCCCCATTTTTACTTTTATAGTTCTTTTACTTTTT:1 - chr3L 833371 3' + P-element 2853 1 38.71 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCC:1 + chrX 5443955 3' + mdg1 7428 2 56.44 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTAT:1 - chr3R 19609665 3' + Tabor 7279 2 67.33 TATTGATCCTAATCATGAATATATGTACTTTATATTCGCTTCCTTTTACCAGTTCCATACTTAGGGGCTGGAAGTTGAGTGTTATTAAGGGTTAGCTGGAG:1 + chr2R 5939711 3' - INE-1 84 1 62.38 GCTCCTCCTTTTGACGAGTCCAGCAATCGTATGCTCGCTGACACGGGCTTTCCCATCACCCCTTGAACCACCCCCCTGTACCCCCTCCTCCTTCCTTTCCC:1 + chrX 10004232 3' - R1A1-element 344 1 48.51 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGT:1 - chr3R 7100986 3' + pogo 2074 1 56.44 GTCCATGCCTAATAAACAATTAAATTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGTGAAATAGCAGTGAAAAGGAAAGTCTTTCGTTTTCCTAACGACACGT:1 - chr3L 1703395 3' + copia 290 1 63.37 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCACCTCAATTCAATTTAACTTTCAACTTTAGCTCTCG:1 - chr3L 10811152 3' - P-element 40 1 41.58 AAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATTA:1 + chr3R 19609701 3' - Tabor 52 2 75.25 CAGAATGCGCGCCAAATTCATCTGCACGTACAATGTTACGGGTATGCGAGCCAAGGGTCGGGATTATCCTCGAGCAGCCACTCTGCAGAGCAGACCCAAGG:1 - chr2L 8252360 3' + Porto1 407 1 73.27 TATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACC:1 - chr3L 25889010 3' - gypsy8 305 1 77.23 GTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCT:1 + chrX 21668136 3' - Stalker2 30 2 52.48 ATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATACGCACGGGCAAGCAGCAGTGCTTTTGATGAATCCACTTCATGCATAACTGAGCCGTGCGGTGCGAC:1 - chr2R 22431630 3' - accord 7212 2 62.38 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGA:1 + chrX 12294766 3' - blood 7037 2 53.47 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGACCCATTTCACCACTTGATCGTATTTAAAAA:1 - chr2R 4502443 3' + roo 9026 1 72.28 GAGTCGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTCCAAAAGCACTTAGAGAAATAATTGCTAATTAAATTTCAGTATCACAAA:1 + chrX 5646375 3' + flea 126 1 51.49 AGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAACATG:1 + chr3L 19881831 3' - Idefix 26 2 64.36 GCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAATATAAGGGTTCATGTGTTCCTAAGCAGTCAAT:1 - chr2L 18028647 3' - flea 4760 1 75.25 TTTCTAACCAAGCAGCGCAAGTGGCCACGTTCAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATGAGCGTTAACAAGTGTCAATTACATACATATATTC:1 - chrX 2335916 3' - micropia 5217 2 65.35 GGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAGTG:1 - chr3R 24729568 3' + Juan 4206 1 57.00 AAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAGTAGTGAAGGTGGGGGTGACAAGTACACGGGCTTTTTGGTCTTTTGTTTGCAACTTAATTTCGTATCTGTCGTTA:1 + chr2L 18784216 3' + invader1 357 2 71.29 CAGCAACAGCTCTATCGCTCTCGTTTTTGCAAAATCTCGTTCATAGATAATTCATCTAAAGCGTTCGATTTGTCAAAGCCACAGCTCGATTTTTCATTA:1 - chrX 3421476 3' - micropia 5186 1 58.59 TATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTCGCGATCTTCACTCAAGAAAACTCAAGACCACGTAGGATCAAACGTATGCATG:1 + chr3R 25633415 3' + Tirant 379 2 59.41 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTGGAATACATTATATAAGCGTACCATTTCTGGGGTCTGGGGCTAAATTGGTATCAC:1 - chr3R 17367987 3' + roo 387 2 51.49 GTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTA:3 + chr3R 15943345 3' - jockey 4660 1 54.46 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAACGGAATTGTAAACGGGTTTCGGGGTAA:2 - chr3L 5716860 3' + copia 241 1 64.36 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGGATTTTAATGACAGCATTGCGTATACAATGATGTAATTTTAATGCCACCAACCAGGCGATATCTTAACGGTCA:1 - chrX 8977360 3' - jockey 11 1 74.26 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAATGTATTTGTCATTATCATTAATTATGATTAAGTGATTACGTTGATTAAGTCAGGCGAAAA:1 + chrX 12857918 3' - 297 6591 2 74.26 AAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTAT:2 - chr3R 20466642 3' + roo 372 1 57.43 TGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGTGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTACATTCGGGCACTGGGAAAACGGCCATGAATGAGCAACCATGA:1 + chr3R 27325599 3' + BS 46 1 67.33 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTA:1 - chr2R 24965071 3' + P-element 2849 1 42.57 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAATGGCTACGAAAATT:1 - chr2R 8378599 3' + pogo 2067 1 65.00 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTTTACTTTAATCCCGTAAATACATTTACCGCCTTTGCAAAACCAA:1 + chr3R 25918985 3' + roo 399 1 66.34 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATC:1 + chr3L 21841340 3' - P-element 54 1 27.72 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAA:1 - chr3L 3944709 3' - jockey 4784 1 50.50 TTTATTTATTACGGCATACGGGTAAATCTTGGAGCCCCTTTGTGTCCTTTTCTGCATTTTTGAGCCAATTTCTACCGATTTCAATTGGTCTCAATAGCTTT:1 - chr2L 9735332 3' - X-element 4704 1 55.45 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCA:1 + chr2R 8378657 3' - pogo 43 1 72.28 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTAGCGCCATCTAGCG:1 - chr3R 19657425 3' + roo 402 1 72.00 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGC:1 + chr3L 9692722 3' - P-element 37 1 31.82 GGAGAGCGCGAGCAGCGGTGCTTGCGAGCCGTGGAGCAACTCACTCACATCACCACGGGCCAGCCACATGCGGCATCCACAACCAAATCCACGTCAGCCTC:1 + chr3R 18550429 3' - Max-element 83 2 69.31 TATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTATTCAAATCGTACATTAATGGTAAATCTCATCGCCCAATAAACAGATCGGAGTACTTCCCC:1 + chr2R 17670971 3' - Doc 4669 1 51.49 TCTGGACCTTGGACTCCAGCGGGCCAAGGGCAAAGAGGTCAAACGGTAACGGTGCGTGCGGAAAGAGCCGGCCGAAGGGCAGTTTGTTGAAGG:1 + chr2R 24692785 3' + gypsy8 4752 2 69.89 TTTAAAGTTCCTGAGATCTCGACGTTAATACGGACATGGCCAAACCGAGCCGGACTCTTTGGCTCTCGGCTTTATTGTTGTCATATCAAATGC:1 - chrX 21244733 3' - INE-1 146 1 60.22 GACTTNCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCACGAATGAGATATTAAGTCCCTAT:1 - chr3R 23617970 3' - jockey 4783 1 54.46 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACTTGCCCT:1 - chr3R 18960409 3' + hopper 1399 1 61.39 CATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCC:1 + chr3R 5977794 3' + copia 5073 2 75.25 TCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAG:1 - chr2R 1320696 3' + diver2 332 2 54.46 TCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACATACATCAAGGATGCATTTAAATTTTAAGTG:1 + chr3R 8548445 3' + 17.6 7376 2 72.28 GGCCAGGGCGGATGTAACATGATCGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGGTCAGCATTCGGCACATCCTTTCCAGCGTTAGCAGGATCCACGGC:1 - chr3L 14870711 3' + 412 7160 2 65.35 CGCCATACGATTTTTTGGCACTCGATTTTTTCGCCGTAGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCACTCACGAATTTTTGTTTTTCGGTTTGATTTCGACCTCATTT:1 - chr2R 14067204 3' + 1360 30 1 75.25 ATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAAT:3 + chr3L 13364594 3' - hopper 41 1 70.30 TAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGATAAAATGTATTCTTATGGGTGTAAATTTCTTGCATTGTTATTTTACCGAAACCGGTATACATTGCAAAAAT:1 + chr3L 22532196 3' - Cr1a 4282 1 62.38 GTATGTGTGTGTGTGTGTTTGTTATTTCCAGTTGCACAAGCCAAATGAAAATAACAAACACACACACACACATACAGTCGTTGTCCAGCACTTTTATGTAC:1 + chr2R 17304442 3' - Quasimodo 35 2 70.30 TAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTA:1 - chr2R 4830335 3' - 1360 52 1 94.06 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACGAGTATTATACAAGAAACCCCAAAAGTAAAC:2 - chr2R 13144976 3' + roo 9024 2 73.27 ATTTTAAAATTTAAATTAAATTAATTTAAATTAATTTTTTTTTCAATAAAATATTTTATTTTCCCCAATTTCACGATATTCTAAAAAGTATTGAAACGGTT:1 - chr2R 5883600 3' + 1360 3042 1 30.69 TAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAGTACCATATGTTGGCGACCAGAAATTTTTCGAGTATGTAACTTAACTTAATTAATCTTGACCACATCAATATACTT:1 - chr4 1047220 3' + Tc1 83 1 60.40 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTAT:1 + chr2R 16898295 3' - Max-element 48 2 73.00 ATATTNCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGT:1 - chrX 2762136 3' + roo 9024 2 72.28 TTTAGACATGATAAGTAGTAAAAAGAGCAAGGTTATTCGAGTGATCCTTAAAGTACTAGGATGCATTTGTCCGCGAAGTCAAGATGGTGTAATCCAGCGAC:1 - chr3R 3610665 3' + rooA 15 2 60.40 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAA:1 + chr3L 13081003 3' - 412 7084 2 56.44 AAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATGCCTTGCACTCCAACTTGTTTGTTGTTTCTAAAGTTTC:1 + chr2R 23070505 3' + P-element 2764 1 40.59 GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTTATATAGGCATTTTTTGCCTAAGATGCTGTATTTTTTGGTTAAAATTCTGTTTTTTTTATGTGAGCATTTAAGGTTT:1 + chr3L 23860576 3' - I-element 5052 1 78.00 CAAATAATAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGTCTCGTGCTATGGACCGTAATGGCAGCAGCGCATTTGGTCACCGTCAAAAATCAGAT:1 + chrY 1688097 3' - 1360 307 1 44.55 AAATCACCGCTCGAATTAGCTACCGTTTAGGGGTATGCAGAGGGGCCTATCTGCGTTTAAGCACTCACAAAGACGAAACGAAAGACTGAAGCAGCGAACGC:1 - chr2R 14808446 3' - 1360 2985 1 70.30 CTGCCGGTCCCTCTCCAGCTGTTGTTTTACAAACTATTTGATGAGTACATGTCGCACGTTGTTTTTTAAGCGAGTGCGTCATTCTGCGATCACGACCTTCA:1 + chr3L 12657596 3' - F-element 429 1 81.19 ATGCANATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAACTAAGTGAACTAGAATAATAACAGTTAAACTAAGTGAAAA:1 - chrY 3649158 3' - pogo 35 1 59.41 GCGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGCGTGGGATACTTATCCTCCCCCGACTCCCCGATCCCTTCTGACACCGCCAGCCCTAGTCCACTCTG:1 + chr3L 25243524 3' - GATE 50 3 74.00 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGAAGTGTGCGTGCGCCTGGTGCCACGTGCCACAATGTATTCTTGTTATTTTTTTAAGGAGCAGGGGGTCTGGT:1 + chr3L 5168502 3' - pogo 31 1 72.28 AACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGAACTTCGTTGCCTTCCATTTCCATCACACAGGAAA:1 + chr3L 13786409 3' + R2-element 3415 1 72.28 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCTGG:1 - chr2R 5849954 3' - jockey 25 1 61.00 CTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATCCCGAAATTTTGATTCGTTTTATTTTGGCAAAAATGTTGTCAAAACATTATTATGGATAGTAAGGGCTA:1 - chr3L 19035158 3' + 17.6 7286 2 64.36 GTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCAAATGGAAGGCTGAAATTAGCGGCAAGTGGGGCTATTTTCCGCGCGGTGTATGGTTATCACAACGCTT:1 + chr3L 3246094 3' + R1A1-element 5148 1 73.00 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATGTGTTAGTAGAAGATTTTGATTTGA:1 + chr3R 6142686 3' + copia 181 2 75.25 GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATGTGCGTTAAATTGCTAAGCGTTTTGCCAACTTTGTCGGCCATTACAATTACCGTTGACCGTTTCTCTTGGCCAAG:2 - chr3L 13611206 3' - I-element 5052 1 79.21 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTGCGTTTTTACGAAGCAATTGTGCCTGCATTCGGTGGAAAAACTACAAAATATTAT:1 - chr3R 31812658 3' + P-element 2878 2 74.26 TTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAATTTAATCGTAAGAAAACATGGCATATCGTCAAATCAATTCGAGCAAATGTAATATAAGCGGTGT:1 + chr3R 31814212 3' + P-element 2651 1 68.32 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGTTTATCATAAGGACGAGGGATTCTCCTTTTGGAGATTATAGGAATATGCAAA:1 - chr3L 15638217 3' - roo 16 2 58.51 AATAAGGAAAATAAAAAAAGAAAAGAAGGGTGTCTCTATATCTCTCTCTCTCCTTCTCGGAGTCTGGCAATGTTTTGTTTAAACATTTATGAT:1 + chr2L 9558063 3' + Doc2-element 257 1 72.04 CTCACCCTGAGTGCGACCAACGGCACTTGTTCCGAATGCACACATACACAAACATGTTCCTTCAATTTCTTATATTTTTTTTTTTCGACACATGTGATAAG:1 - chr3R 11247982 3' - opus 7252 2 60.40 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATA:1 - chr3R 10445201 3' + roo 9032 1 64.36 GAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTATCGACATTTTTGCA:1 - chr2R 10863872 3' - mdg3 5260 1 68.32 ATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTG:1 + chrX 21947748 3' - mdg1 3 2 74.26 ATATAAGTATATATAATAATATGAAAAGTAGTGTACATCTGTTTCTAGAATCAAAGAATGTACTCTACTTTTTAGAACGAGCATTCTTGTGTCATAAAATT:2 + chr2L 5460030 3' + Dm88 4382 3 20.79 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCGTGAGCCAACAGGAGGTTATAAATGGGTATTACTGACA:1 + chr2L 7548084 3' + blood 7375 2 64.36 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATA:1 + chr3R 12894155 3' + blood 7342 2 71.29 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTG:1 - chr3L 11435594 3' + roo 9026 1 72.28 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGTTTATCATAAGGACGAGGGATTCTCCTTTTGGAGATTATAGGAATATGCAAAAGGGTT:1 - chr3L 15638211 3' - roo 8681 2 58.42 TATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCCCCAATCCCCTCTCATCACTTCCTTTCGTAATGAGCTGCAAAA:1 - chrX 4011928 3' - 412 7264 2 57.43 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCGAGTTAAATCATTATGGGTCTTTTGGTTCCAC:2 + chr3L 13194840 3' + 297 374 2 59.41 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAAAAGTATTAACCAAGAGCAAGCTATGATAAGTCGATTTTAAGAAACATCTCAAAATAAAATTTG:1 - chrX 21844337 3' - pogo 8 1 69.31 GCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTCTGTACT:1 - chr3L 9121818 3' - Transpac 4958 2 65.35 ATTCACATTAGCTGAGTAACAGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGACTGCCAGA:1 - chrX 10445559 3' + INE-1 536 1 68.32 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCGAACGAAACAGCCGGCCGTCAAAATTTTTCCTAACATTTCACTATTTTCACGCTTGTGTTACGGCAA:1 - chrX 8243239 3' - P-element 9 2 70.30 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATATATCATCAATTTAATGCTTAAA:1 - chr2L 14260754 3' - 297 39 2 75.82 CATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACATTTTGATTAAGTAGAGAGACAAATTGTTCTGGCAGCTAATGTA:1 - chr3L 22920351 3' + 1360 3386 2 76.24 GTTCGGTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGT:1 + chr3R 27080771 3' - HMS-Beagle 54 2 75.25 GAGAGAGCGCAGAGCTCTACAGCTAACCACTATACAAAGCTTAATTACATACTGTCAAACGTTTCAAGTCCCAAAAATAGAGGCTTGATCTATATGTTCTT:1 + chr2L 21745422 3' + 1360 113 1 81.19 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTCGCTGATCCTGCTCCGGGCCCTGTTGGACATATGTT:1 + chr2R 5084102 3' - F-element 16 1 62.38 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACCACCTCAATTCAATTTAACTTTCAACTTTAGCTCTCGCTTTCTCTCCGCTTTCACCACCCCTTGAGC:1 - chr3L 10811122 3' + P-element 2879 2 68.69 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTCTCAAAAGAGTGGTGCTCATTGAATGATCTTGTCATC:1 - chr2R 18503494 3' - roo 41 2 69.31 ATAACNGATTTGCCATTTTGCCCGATGATTTAGACGATCTGCCAAATTCTGACAAAGACATTAAGCGATGGATACTCGTAGATAAAGACAGTGGGACGAGC:1 - chr2L 4958902 3' + Fw2 135 1 63.37 GTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAGTTTTACTAGAAGTGCGTTACG:1 + chr3L 11461387 3' - copia 4923 2 79.21 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAAAACGTCACTATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTATTCCCTATTCTCTAAAT:1 - chr3R 22620191 3' - 297 27 2 55.45 GCAGGGCAGCGTCCTTGGCCCGCTGCTCTATTCTTTATATACTGCTGACCTACCTAGACCTACCATCGCATTTGCTGGAATTCAATACATTTTTGGAAATA:1 - chr2R 12466380 3' + BS4 81 1 63.37 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATAAACCTTTTGTTGTTTAAAAAATTTGTGTTTGCGCCGGCATTTTC:1 + chr3R 12569062 3' - roo 30 2 66.34 TTAAGNAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTCCAAGGGCGTCGAAAGTGAGGGGGGTGGCTAGCCAAGGGCGCAG:1 - chrX 2589645 3' + copia 243 1 70.30 GCTACCGTGTATTGTACGGCTCGATTCAGGACAAGATAGTCGCGACATAGGAAAGAAGAAAGAGCCGCTTAGAAGAAATTTATGGCTCTTGGGGAATTCCC:1 - chr3L 12195494 3' - Cr1a 4395 1 56.44 TAAGCNGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTACTGTTGCC:2 + chr2R 5850013 3' + jockey 4944 1 66.34 GAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAAAAGACCATACAAA:1 - chr3L 21735358 3' - Doc 3 1 79.00 TATCTTATCTTATAATATCTTATACTTATACTATACTGGCACATATGCTACTATATATATATATCTTTAGATTTACTTAGTATTGTTTCAAATCTAGCGAG:1 + chr2R 4673651 3' - Stalker3T 202 1 49.50 AGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGATGGACAACAAAGCAACATCATCATCGTCTAAGACGTTGCACAGTTT:1 - chr3R 25440125 3' + pogo 2099 1 77.23 GATATNTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAA:1 - chr3L 17122430 3' + roo 9023 2 73.27 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGGC:1 - chrX 19457146 3' + roo 9039 1 60.40 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACTATGATC:1 - chr3R 25633318 3' - Tirant 8117 2 68.48 AGTGGAGTGGAAGTCAGCGTTGCAGTCAGTCATTTCGCCCAACTCCAGCCACACAGACTACTTACACACATCCACGATGTGTTATTCAAATTCGTTATTTA:1 - chr3R 27248292 3' + flea 127 1 77.23 TGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCA:1 - chr2R 5485048 3' - 1360 13 1 66.34 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCT:1 - chr2R 5485056 3' - 1360 21 1 58.42 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAA:1 - chr3R 10445197 3' + roo 9036 1 60.40 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCCATCAGCTAATTTGGTGACCTTAGAATG:1 - chr3R 22079741 3' + pogo 2065 1 71.74 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCT:1 - chr3L 3671305 3' + roo 9022 2 74.26 GCTAANGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAATAAATAAATAAAAAGAGGGAAATGCATCAAAATTGTT:1 + chr2R 12009730 3' + I-element 5306 1 73.27 TAGGATACAAAAGTATCCGAAAAAAAAGAACCTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAACCAGTTGCCAATGGAGTGCAAAATAT:1 + chr2L 20631338 3' + 297 426 1 74.26 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTTGCCTCTATTCGAATTCGATTAATGGTAATGCCAGGGAAG:1 + chr3L 12452207 3' + 412 7511 2 60.00 AGTTGTACAAGAGCACTGAGAGAAAATGGGGCCTCAAATGTAGGAATAGATATGGCTACAGACCAAAGGTTAACTTTCTACAGATTCCAGTACCGATTCTA:1 - chr3L 3189098 3' + Bica 418 1 74.26 CAAAGATAACAATTTTAAACTGAAATTTATTGCCAAAGAAATAGTTGCAAGTACTAACTGTGGATTATTATTTTTTTAATATTTTCCCCCGTTGAGTTGAA:1 - chrX 20919845 3' + looper1 1404 1 73.27 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGTTGCAATTAACTTTTTGGCGGCTTTAAGCCGACCAGGACGAAGCAACCGCCCCGCTATAAAT:1 + chr2L 18914623 3' + mdg1 407 2 64.36 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTT:1 - chr3R 9981509 3' - jockey 4804 1 67.33 TTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACGTCAGGTTCACCGCCGGCCAGGAATTATAGATTTCAAAATTATATATGAA:1 + chr2L 23369938 3' - F-element 104 1 55.45 GAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAAAAGACCATACAAAT:1 - chr3L 21735357 3' - Doc 3 1 79.21 AACAATTGATTTGCGGTGTGGGACCATGTGGGACCAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAG:1 - chrX 21585274 3' - mariner2 256 1 63.37 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTATATTATTATAATAATTAGTTGTCATTAGAAATAAAG:1 + chr2R 13643882 3' - F-element 49 1 73.27 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAAGCCATCTTAAATAAAGTAGGAAGGAAACTATTTCTCATA:1 - chr3L 11654502 3' - pogo 3 1 71.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACAT:1 + chr2R 19936676 3' + roo 9037 1 59.38 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTTGTAT:1 + chr3L 14910628 3' + roo 9028 1 71.29 CTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTCTTCGAAAAATATGTCTTGATCTATCTCCGCATAGTTTACTACCTCTACCAAGCTCTGTCCTGACACTGCCCTGTAC:1 + chr3L 27412398 3' - hopper 1396 1 79.21 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGAGACTAGGCAATAGTCTCCTTAAGTCTTAGAATTTCTTATAGCATATTTTGTATTCGCTTCGGCAGAAACTACCCAA:1 - chr2L 21008704 3' - 1360 2 2 65.35 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCA:1 + chr3L 14240878 3' + Tirant 350 2 75.00 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCTGGTGCGGCAGGCACGAGAAACGATT:1 - chr3R 31644107 3' + roo 408 1 77.00 TTTTTTTTTTTCTCGTTTTTTGATTAATTGGCAATGGCCCAGATGGGCATAGATACATTTACACAGAGCCAAAGATACAGATACAGTTGCATTGTCAACG:1 + chr2L 16600107 3' - gypsy7 5006 1 54.00 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCAGATATAATGCAAGTCTTAAGACAC:1 - chr3L 5975611 3' - hobo 51 1 74.26 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTC:1 - chr3R 19657453 3' + roo 9036 1 59.41 GGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTCCTTTGGGTTTTTATGCTTCTTTACTACGATTCGTCATCACAGTCGTCGTCATCGCATCTTTTGCG:1 + chr3R 11527845 3' - F-element 4457 1 69.31 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCGAGAGAAAATACATTTTTGAGGGGGGGCAAATAACGGATGGAAA:1 + chr3R 19191547 3' - Doc 34 1 63.64 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGACCCATTTCACCACTTGATCGTATTT:1 - chr2R 4502448 3' + roo 9021 2 77.23 CAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATA:1 + chrX 22824232 3' + Gypsy12A_LTR 2257 1 50.50 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAA:1 - chr3L 21735413 3' - Doc 59 1 79.21 AGATATAAATATTGCTATTGATTCGAAATTACTCACAAGGCTTCTGTTGACACCTTCAAGGTTGCGCCCATCTCAGCCAACTTCCGACAATTGGCCTGGTG:1 + chr2L 3995203 3' + gypsy12 9764 2 54.46 CTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAATACTTATGTAAGCAAGATGGACTCTATAAGAACTTTAA:1 + chr3R 18204047 3' + hobo 476 1 62.38 TTTTTTTTATTTTACTTTGCTGTTATTTATTTATTTATTTTTTGTTTAGCTACTGATCGGCTCTTTCGCTTTTTGTCTACAGCTGCCTGCACTGTGTCACG:1 - chr2R 23789935 3' - F-element 4677 1 78.22 AAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACGTACATACTAAATGAGTGGACTTTGCTTCATTCGAAAA:1 + chr2R 19461407 3' - S-element 33 2 69.47 AGAGTGTGAAAAGATCCCGTTTGAATATTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAATTACATAAATATTACAGGGAAAAACTCTGGCAACTATTT:1 + chrX 12880425 3' + S-element 1333 1 45.54 GTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATCCCCAAGCCTGTGTTTCCCATTTATTAACTCGTTGCATATGGTTTGCATACAAACGG:1 + chr3L 18154214 3' + I-element 5340 1 62.00 GCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGA:1 + chrX 22824223 3' + Gypsy12A_LTR 2248 1 47.52 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATGGCAAAAGAGAAATAAAATTAATATTGCAAATATG:1 - chr3R 16004026 3' + jockey 4953 1 63.37 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTACCCTTTCCTTTCCTATGTGCGGGAAAATGTGTGGCACATATGGCCAGGACGATAAGCTG:1 + chr3R 31884298 3' - hobo 14 1 65.35 GTTAAATAGCAAAGTTTCTGATCTCTTAAATTTGTTTTTATATCATTTTTTTTTTATATGAATGGAGATGAACCACCAAATTTCTAACACTCTATAAAAAT:1 - chr2L 23071822 3' - Tc3 1604 1 54.46 AGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTTAGTCTCT:1 - chr3L 18154123 3' - I-element 17 1 58.42 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAGCCTTTAATTTAACCCATCATCGGTGCAGCTGTCCCCTTAACACCCCCCTGATGAATTTGAGCTGC:1 - chr2R 22395186 3' - I-element 15 1 67.33 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATTGTTGATTGTCGATCCTAAGAGGAGGATGTAGGC:1 - chr3R 5054378 3' + HMS-Beagle 213 2 62.38 TGTATGAACGTCAAGATCTCAGGAACTATAAATGCTAGAAGGTTGAGATTAGGCATACCGAAAGTGTCGAGAAACTTCATGGTCAAAAGAACGGGAGGGG:1 + chr2L 22015704 3' + INE-1 136 1 61.00 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAATAAAAATGTTATGGCATTCTTATTGGGGGGA:1 + chr2L 18513587 3' + jockey 4950 1 79.21 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCCCCCAACTGCCGTCGTCTTCGTGC:1 - chr3R 10957668 3' + hopper 1380 1 58.42 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGGTGGTACGGGCGATGCACTGCATGTGGCAACTAGACTGCGACCACAGCGGGGGACT:1 - chrX 3326929 3' - hopper 22 1 53.47 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATT:2 + chr3L 6024581 3' + roo 9018 2 80.20 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATTGAACATAGAAGTTATTTCGGTGTAACTAATGATAAATTT:1 - chr2L 8960304 3' + Ivk 5360 1 44.55 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATATGTACTCGTAAACTGCAATTAAAATCTCAAC:1 - chr3R 28728292 3' + jockey 4948 1 70.30 GGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCACC:1 + chr2R 12213978 3' + Transpac 265 2 71.29 TTTTTCACTTATAAATATTGCAAGTATTTAATTATATATATATATATAGGTATATCTATACGTACAGAAAAACCCTCCGAGGAGATGGGGATCGTGGGGTT:1 - chr2L 21006976 3' + Idefix 7379 2 55.45 TCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGTTTTATAACCACCTTTGGTAAAACTAGCTTTTTTACCTGTATAGTCTTCAT:1 + chr2R 20224347 3' - mdg1 352 2 56.00 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGGTAGTCAATCCATCGAACTGTGCTCCTTGCATATATACCAGGCTGGGGCTGGGTTCTATGG:1 + chr3R 10321111 3' + roo 395 1 64.65 AACCAACTGTTCTAGTTGGTTGGCTTGTGTTAACGACTCCCCCTTTAAGATTAGGCTAGTCATTCCCCTTCCATCGAGTCAATTCAGACCTCACCACGGG:1 - chr3L 22478093 3' - Gypsy6A_LTR 14 1 53.00 TAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTTCGTTCCTTCTATTTAAATTATGTGCATGT:1 - chrX 17064766 3' + Tirant 8459 2 72.28 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATTATCATCTAAGAAAGTAGAAAATTCTAAACGTAGTCCAACTAAAGCTTAAATATTATGT:1 + chr2R 17384107 3' + mdg1 405 2 41.58 AAACANATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACGGAGCACCCACGTCCGGGTCGAGTGCATCTGTGACATCCAGCCGGTCGGCCCGCTCTCG:1 + chr3L 13442882 3' + 17.6 7097 2 65.35 GGCTGNACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGTTAGCCGCATGGCCACTTAGCAACAATGGGAAAAGG:1 + chr3R 14169308 3' + blood 336 2 68.32 ACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACACAGTGGCCAACGGTTAAATGAA:1 - chr3R 20884882 3' - flea 4775 2 62.89 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTTACGTCATTAAGCGACTGCCTGTAAAAGGCCCAGAACAGCAAACAAAA:1 + chr3R 18934949 3' - hobo 26 1 53.00 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTATTTTTTGTTTGTTGCTTTTCTCATTG:1 - chr2L 16686553 3' + pogo 2053 1 76.24 TATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATATTTTCTATAATTTTGTCTTTATATATACATATATTTCATT:1 - chrX 23431792 3' - Stalker2 7285 2 61.39 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTCGC:1 + chr3L 15035206 3' - pogo 29 1 60.40 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGC:1 + chr2R 24493735 3' + flea 222 2 62.00 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTGTAATGAGCCGAGCGCCGA:1 + chr2L 15333802 3' + P-element 2872 1 62.38 TTGAAATCGGAAGTGGACAAAGCTTTCTGATTTCTCACTGAGGCTGACCAGTTGATCGCTTCAAATTAATAACAAATCTGCCTGTGGAGGACGGCCGA:1 + chr3L 1812431 3' - diver 5794 1 76.53 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCTGGTGCGGCA:1 - chr3R 31644123 3' + roo 9054 2 60.40 CTCCGTATAAAATCACTTGATTAGTGAAGCAAATAATTAATTCCATATGTTTGTCGTTAAATGTATAACTTATATAAAAGCAAGAGACGACAGGAATTCGA:1 + chr2R 2093146 3' + Doc3-element 36 1 63.37 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGGGACAAGGACGAAGGACGCACGAGGAGCAGCAAACAGAAGGCAAATGGCAAAAA:1 + chr3R 9273901 3' - 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P-element 4 2 77.23 GGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATGCTATTACTATTAGATTAGATCCTTTTTTCGCGGCGTG:1 + chr3R 27811981 3' - Stalker4 128 4 62.38 TTGATAGTCGGGGAACTCGACTCTAGCATTTTCTCTTGTTTTCTAATACTTTTTCTCTGTTGTCTTTGGAGTTGCTGAAACCCTCGGAAGCTCGTCTAATC:1 + chr3L 5484179 3' + INE-1 562 1 61.39 GAGATAAACCAGCACTCGAGCAGGTACCATGACAGGCTGGAGCGCCACAGAAATTTCCAATATGATGCGCTCAGATTACTAAAGACGTCGTCACCATGACA:1 + chr3R 7472922 3' + X-element 4392 1 53.47 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAAAGTCATGATGACAACGAACGCAGGACGTGAATGG:1 + chr2L 5777984 3' - FB 30 1 67.05 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCT:1 - chr3R 12894116 3' - blood 7058 2 70.30 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGA:1 - chrX 19457162 3' + roo 359 2 76.24 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTATCTTAATAAGTATGCTAGGCTTTTATATAGGCCATTATATTAGC:1 + chr3R 18881568 3' + roo 9040 1 56.44 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATAGGTGCACAATGGTGTTGCCTGCCTCCGTTTCCGCCCGCAAAACCC:1 - 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gypsy8 310 1 77.23 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACTCTTCAGCTCTAAAGCTCGGCAATCTGGCCCACAAATCACCACGAAACATGTTGACAGCACACGGAGCAGG:1 + chr3L 22920477 3' + 1360 3387 2 77.23 ATAATAATAATAATAATAAATAATACAAGTATTGTAAGTAAGTACCATAGAATCATAAGCAGTTAAAAAACTTAAATCTAAGTCATAGTAAACATTAAAGT:1 - chr2R 20818658 3' + mdg1 44 3 81.19 TCGCTCTCGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACCTCCACAGATCCGAACGCTGCGTGATATAATTTCTAACATCTATAGACAGATCTCGCTCT:1 - chr3R 23435298 3' - 1360 93 1 67.33 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGTGGTGACTGTGGTAACTCTGGCGCAAATGTAGCCAGAGCT:1 - chr3L 19779060 3' - Tirant 8118 2 69.49 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCGATAATCTAAGCGGGGGAGAACGGCAGA:1 - chr3R 8198463 3' - Tirant 10 2 71.29 CAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 7197 2 96.49 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGG:1 - chr3R 19657444 3' + roo 9045 1 52.48 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGAAATACGTAGTGGAAAACGAAGATGCTGCGTCGTCTAAGTCAGACTCAGAAAATCAG:1 - chr2R 3188670 3' - 1360 16 1 60.00 AGAGCAAGACCTTGTGATCTAGGCTGAGCGGAGACATCGCAATTTATTAGATTGTGTGCTTTTAATTTTATCACGTTGATTAAATATTTTTGTAATCTCAT:1 + chr3R 26920385 3' - F-element 4220 1 71.29 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGCGTTCAGCATTTTATACTGATTTTTATTTTAAACTTACAAGAATGTT:1 - chr3R 12136269 3' - roo 8693 2 53.47 CTTATTACACAAACACTAAGTACCTACATATAAAAGCAGGTGTACAAAAGAGCTAAGGTTGGTGGGTAATAAATACTCGCAGCACCGCAGTTTCCCAACTT:1 + chr2L 1283707 3' + Juan 3910 1 48.51 TTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAAATGCAT:1 + chr3R 13423381 3' - 17.6 9 2 68.32 ACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAAC:1 - chr3L 25232774 3' + accord2 7593 2 58.42 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCTGAATCTTACCATTTTGTTCTTTTGCTGAGTATCCTTTTTGCTGGTGTTTTTGTTG:1 + chr3L 5975669 3' + hobo 2919 1 59.00 TACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTG:1 - 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Doc 33 1 52.48 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTGTAATTTTTTCAAAATTCTTCTCGCTGACTGCTCGTGT:1 - chr2R 24965036 3' + P-element 2884 2 77.23 GTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTATACTCAAAAAAATTTCTTTGAATTACAGAATTCAGCTGACCTAAGAAATA:1 - chr3L 5015800 3' + I-element 5330 1 56.44 CTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTAATTATCCATCAGTACCACCACTTGGGTTTCACTGTGCACAGATACTCCCACTTTTTTTTTGT:1 + chrX 14732533 3' + accord2 7548 2 65.35 GACGTCTAAGGCTCAGATTTGGCAAGTTGTGCAGGGAACAGTCCGAGCGCCTACCAGGTGGGTCGGAGGCCAGCGCAGCTCAGCTCCGGGCAGGACATCTG:1 + chr3R 5370531 3' + HB 1209 1 69.31 ATACTTTTCAACGAATCTAGTACAGCCATTGATGTATATGTCCTGAAAGGCAGGCTACGATATTTTGGAAACGGAAAATTATGGTAAACTTTGTGAGACCA:1 - chr2L 12813130 3' - INE-1 10 1 71.29 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAAAACCACACACAAACACACACACGCACATA:1 - chr2R 10491445 3' + 412 444 2 74.26 ATAATATTTTTTAAGCTACAAATATATTTTTATATTATATTTGTGTATATGGTGGCGGCATCTACCGGATTATGCGATGCACGCTAGATGGCGCTACCGAT:1 + chr3R 23159467 3' + G5A 2771 1 72.28 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAACTTAAAATGCCTTGAGTT:1 - 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pogo 8 1 71.29 CACTAACATATTCTTTAAGCAAGTTTTAATTAAACTTTAAGTTTTTAATTAAACCTCGACAATAAAGTGACATAAAACCATCAACTGCGTGGCGCAGACAG:1 + chr2L 21868243 3' + 17.6 7214 2 69.31 AGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCCGCAGCAAGTTTATATTTAATTTCTT:1 + chr3R 22870460 3' - Max-element 8516 2 54.39 ATATGCATATATGTATATATATATATATATTAAAGCGATTGGACGGCATGGACGGCGTGCGACAGGACTGGCGCATGATGCACCAGCGCAGGGGCGTAGTG:1 - chr3L 8326208 3' + G3 4507 1 61.39 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAAC:1 - chr3L 13364544 3' - hopper 42 1 64.36 AGTTATTGAAAGGGACTTAAAAGTTTTCCCATAGGCAGACTCGTCTTCGGTAATTTAATATGAAAATACCTTTGCAACTGTTGACTCCGCACGGATGTGTC:1 + chr2R 6818607 3' + G5A 2547 1 68.32 GAGAGAGCCAGGAGGGTCCACGAGTAAGCAAATCTTGTTCGTCCTACATTGTTTATTGAGCCTGATTGTATTGTCCGTTATGTTGGACCAAAGGTCTCCCC:1 - chr3L 25847454 3' + Rt1c 5281 1 54.46 CTGGCCAGCGCTTTAAACAGATCTCGCCCACCAAGGCGACAGCTTGAAAATGTAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAACTTAAATAGCCGCAATGCTAAACT:1 - chr3R 30816595 3' + X-element 4449 1 69.31 TGGTCAGTTAAGCAAGTTATTTTGTAAATATTAAGAATAATTATTAAAGAAATTTTTTATTTAACTGTATAATAATGGGTTTATATTCATAGACTAAGTTT:1 + chr2R 14719112 3' + BS 290 1 58.42 TTTTAAAGATAGCATCTTGATTTTTTTTTATATTTATAATTAGGATTTAAATAGAATTTCGATTTTTCTTCAAGCCTTGAAAATAAAGTGAAAAATTTATT:1 - chr2L 3860081 3' - transib4 2594 1 73.27 CCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCATCAGCATCAACAGAATCCGCAGCACCAGCAATACGATGCGTTCTTCAATTAACAGTCCATAA:1 + chr3R 7183593 3' + F-element 4450 1 66.34 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTTTCTGTTTTCGGTTAGGGGGCTACAACTCCTCTTGTGA:1 - chr3L 10035610 3' - jockey 20 1 65.35 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTATACTTTGGGGCACACTGCCAAAAGAAGCTCACG:1 - chr3R 23617991 3' - jockey 4802 1 67.68 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGTTCCCTAGCC:2 - chr3L 14240801 3' - Tirant 9 2 72.28 GACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTATTCTTTGGTCGCAAATCCCAA:1 + chr3R 4543269 3' - 3S18 17 2 62.38 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTGCGTCGCTTTTGTCGTCGGCGTCATCTGCTGCCTATTGCGTAA:1 - chrX 10730639 3' + P-element 2852 1 47.52 TGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAGCAGATCCATTTAGGGTCAACGTT:2 + chr2R 9454327 3' - opus 18 2 61.39 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAAGGTTATTTGAAGTTATATGTATATTTCACACGTTCCAAAGCTATAATATAC:1 + chr3R 10445270 3' - roo 8688 2 58.42 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAA:1 - chrX 7787240 3' + roo 9029 1 66.34 CATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCTTTGCGCGCCGCCTGCTGCATTCTTCCCCGCGAAAAGCGGCGGGAAAAACCCGAC:1 - chr3R 23609653 3' + HMS-Beagle2 7014 2 54.46 ACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGGAGTTGGGGTTAATGTTCAGCGGGCCGGGGGCTTCGAGGTCCTGGCTGAAAAG:1 + chr2L 3868135 3' - 1360 3285 1 50.50 GCTCGATCACCGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATATATGCGTTATATTAGTGATGGGTATATCTTAGGCCTGGTAGTTTGGCGGCTTACTTG:1 - chr3R 18715122 3' - Doc 307 1 61.39 AAAAACTTTAAAAAAAAAAATCACGGAATATAGTGTATAAGCATCATCTATTGCAAATAGTATCTGATGTATCAAACATTTGGCATTGACCACATTGTTG:1 + chr3L 7772068 3' + gypsy2 427 1 67.00 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCATTGAC:2 + chr3L 18009637 3' + roo 385 2 55.45 GTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCGTTTCTCGCGACGGCTGGAGGGGCGAAAGCGATCAAATCGCAAAATAAATGACAAATCAATCTG:1 - 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G5 4575 1 64.36 TCTCAGTTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCGTGAGCCAACAGGAGGTTATAAATGGGTATTACTGACAGAAA:1 + chr2L 7548088 3' + blood 7379 2 68.32 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAAAC:1 - chr3R 5505230 3' + mdg1 7422 2 60.40 GATGAGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGACGGATGTTTAGTCACCTACGTGGGCAAATTCATACCAGATTTAGCTGATCGTACCTAGC:1 + chr2R 3291396 3' - Idefix 7037 2 54.46 TAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGA:1 - chr3R 9657704 3' - BS 41 1 71.29 CTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTG:1 - chr3R 28755920 3' - 3S18 5780 2 59.41 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTATTTGTTAAATGGCTTTAAATGA:1 - chrX 21401876 3' + roo 9021 2 79.21 ATTTGNATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCG:1 - chr3R 25823654 3' + hopper 1376 1 65.35 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACACTAGCTATACTTTACTATGGTATTTGTGTGCATCGCGAAAAAGTAACAA:1 - chr2L 326130 3' + roo 9041 1 53.47 CGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAATAAAATAGCTTTGATGGGTTAATTT:1 + chr3L 9192585 3' + I-element 5302 1 76.24 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAAC:1 - chr3R 25702184 3' - Tirant 34 2 58.42 ATTATTATTGTGATTATGATTGTGTCAACGGCACAATCATAATCACAATAATAATGCCTTCGTCTGGGAACCCAAGGGGCCTGGGGCTCTTTATAAAGACC:1 + chrX 17735842 3' - mdg1 24 2 79.21 GTAATCATTTAGTGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTATAAATATTGCAAGAATTTAATTGGCGCAGTCGGTCGTCCTAAAGTGCCGGCAAGTGGAA:1 - chrX 13509170 3' + Idefix 7349 2 75.00 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTG:1 + chr3R 27189311 3' + roo 9020 2 75.25 AGTGACTGACTCATGTAGTGTGTACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATAATTTTTAATGCAGTACGTGCAATTGTACAAATAGTTAGTTTTAAAAAGATT:1 - chrX 18012642 3' - roo 8817 2 64.36 CAAAANACAACACAAAACAGCACTACGAACAACGCAGTGCAGGAATGAGTGCGAATCCGCCCCTTCATGGGGATGAGCATGGAATTGGAAACTGGGTGTTC:1 + chrX 12080418 3' - Cr1a 246 1 70.30 CATCAAAACAGCCATCGATGCTCTTGAAGTGTGTGCTGTTGCACCATTTGTTGAAAACAAGTGTCCCCCAAATCCAGTTGTTCTCCGGCTGCCGTAAGATC:1 - chr3L 15118099 3' - mariner2 493 1 75.25 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGGAAATCGACGGGGATGCAGATGCATTGGACACTGA:1 + chr2L 19679786 3' - Doc 35 1 53.47 GGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCT:1 - chr3L 17869899 3' + 1360 3380 2 39.36 TTTTGAATCTTTATTATTTATTTCCAGAATAGTGGAATTACTGCGCAGCACCATGAATATTTTGGAAAATTGTTGCTGCACCGCAAGAGTAAACTTTTTTC:1 - chr2R 15031164 3' - Doc 4687 1 59.41 ACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCCCTTTCCCACCATTCTATTACTGAGCCACTTGCGATCCATCTCC:1 - chr2L 8796569 3' + Idefix 188 1 63.37 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGGGCAAACATTGCAA:1 - chr3R 13715076 3' - P-element 26 1 51.49 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTTAATTCATTCAATATAAAACTTTACGATTTATATTGTAATGTAA:1 - chr3R 10445171 3' + roo 9062 1 69.31 CAGGATCAATAGCCAAATCGATGTGGGCAAATTTATTTCTAAGCATTTTAGGAACAACGAAGAAAGTAAGTGAAAGCTGAGTTAAAGCGAGGAAATGGAGC:1 - chr2L 9369090 3' + INE-1 95 1 56.44 ATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACTCAAGAAGAAAGCCTCTGAAAATAAAACTTCACTCT:1 - chr3R 2247528 3' + HMS-Beagle 6600 1 64.36 CCAGGTGGTGAAGGTAACGGTATAAATTCTGGAGCTGCAGGTGCAGGGCTCGGCGGTTTAGGTGGCTGCGAAATCAAACGATCCATTTGCGCACCAGCAGC:1 - chr3L 16784970 3' - Chimpo 4221 1 74.26 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACC:1 + chr2R 19936692 3' + roo 385 2 58.42 TGTGAAGTGAAGTAATAACGATCGACACGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACGGTAAAATCATGGTAAATACCTATTAATCCTTTTTTACCTTCTAA:1 - chr2R 20076177 3' - McClintock 167 2 67.33 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGCCTTC:2 + chr3R 19989856 3' + pogo 2059 1 69.31 ATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAATATAATTTGTAAATTCTTATTTGTAGGTCTATTTAATTTGATGCACTCATCAACTGAGACGAAAGCGGAAATG:1 + chr4 1128514 3' - transib1 1900 1 69.00 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCC:1 + chrY 311346 3' - 1360 70 1 77.23 GCTATTTGGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTTTTCGCTCTCACTCTCTCTCTCTTTCGCTCCCCGAGCAACAGAAACAATCAAATTCAGCTT:1 + chrX 14402941 3' + Cr1a 247 1 69.31 AACACNGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCTTGTACCCGAAGTGTGGACGC:1 + chr3R 28755656 3' + 3S18 336 2 62.38 TAACAAAAAAATAAAAAAAAAACACAAAAAAAAAAGGGAACACCTATAAAATTGTGATGTAAAAA:1 + chrX 9299924 3' - hopper 150 16 76.92 CACGTTGTGTTAGAGTACACTTCTACGAATGAGATGATAGCAGACATTATGACAAAGAATCTTTCAGCATGTCAGTAGGTATAAATATAATATAAATTATA:1 - chr3L 11475582 3' + 1731 4171 1 65.35 TTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTGCCTTGTTGCTCTTTATATGCCGGCTAACGAGGACT:1 - chrX 7767057 3' + roo 8705 2 64.36 AGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTTCAGTGTGCTATGTGGATGTTCTGAGCTGTGTGTTTTGGTGCACCATCGAATTGAAAACGAAACGTCGCGGCAAACAA:1 - chr3R 4642232 3' - F-element 362 1 77.23 GAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTC:1 - chr2L 20118705 3' - Max-element 47 2 69.31 GTATGCTCATGCATTGTAAATTTTGAATTCTAATATTCAAATACAGTGCCGTTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAACCGTTGTAACTA:1 - chr3R 4577492 3' + 1360 190 1 69.31 CGACTATAGCATTCGCTCTTGTGTTTTACTGTGGACAGTAAATGGGAAATCCGCACATGAGCTCCGAGTCGGAAGGTTCTTGCTGTGTGCTGTAAGAGAAT:1 + chr2R 19368250 3' + INE-1 579 1 40.59 GAATTTTTATTGTTTTTTTTTTAATAGCTAAA:1 - chr3L 18993171 3' - transib2 2646 1 81.25 CCTTCCATCAATTTATTTCGTTACGCGTTACAAAACAAGTATTAAATAGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGAT:1 + chrX 22824224 3' + Gypsy12A_LTR 2249 1 46.53 GTTGGGGTGTAGATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAA:1 - chr2L 7170405 3' - jockey 4660 1 79.00 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATTCAATTTGG:1 + chr2R 9375236 3' - HMS-Beagle 31 2 67.37 CCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATAGGGGCTGTATCCGATTTCTAACCCTGCTCACGCTCTCTCTCTCTCTGACT:1 - chrX 16236663 3' + blood 7146 2 76.32 ACACACACAAACACACAGCTCATCGCCCAGCCGAGGCAAGTATTGTTGTGGTGGGAATTGTCGTGGAGAGGGTCCTCCAGTTGCTCTACAGCCAACATGGA:1 - chrX 13352340 3' + gypsy3 426 2 69.31 GTTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAATTGCGTAACGGCCATACATCGGAAGTTCTGCTTTGGAGTGGAGCAGCGTCGTCGTGACCGAGGTTTCTGCCCT:1 + chr3L 13939448 3' - Tc3 317 1 57.43 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCATTTGAGTGGTAACTAGGCTTT:1 + chr3L 11654583 3' + pogo 2050 1 81.19 AAAATTCAAATTATTGTACCTACATATTGCATACTATGTAATCAAAGGCAAAATAAAGCGGGTGGTGAAAAATTAAATTATTAAACCATCGCCGGATGTCC:1 + chr3R 6616178 3' + TAHRE 10337 1 56.44 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACAAGCAAGATCAGTAAAGCCATTTCAAGTACGTGGGCG:1 + chr3R 22620263 3' + 297 6940 2 63.37 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTT:1 - chr2L 108023 3' + P-element 2832 1 21.65 GGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTGGCCAGGTGATAGACAAGCCGCGAAGTG:1 + chr3R 13541922 3' - F-element 4490 1 72.28 TCCTAGATTTTTAAATTATTTTATAAAATTTTTAAAAGTTTTACCAGTTCCCATTCCACGGCTGGAGATACATCCCCAAACCATCAGGGACATTTTT:1 + chr2R 4659346 3' - S-element 1460 1 45.36 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACATTTATACTAATATATTGGCATGTATTGAATTTTAGTGAACAAAATA:1 - chr3R 13202983 3' + roo 389 2 60.40 ATACGNTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGT:1 + chr2L 15333783 3' + P-element 2853 1 45.54 ATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTG:2 - chr2R 12185302 3' + accord 7382 2 73.27 AATTTACAAAGCATGACCATACATGTTCCGACTTATTCAAAGACATTATATCAAATTTATTGGCATTTCTTCACTGGCACTTCGGCGAGAAGACAGTGTCT:1 - chr2R 13936658 3' - 1360 190 1 49.50 TGCCGNCGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACTTGAACTGTATCAGAGAGTTCTGCAATTTAAGAGCGTGCTCCGCTCTCTTCGACTCTCGTTGTTT:1 - chr2L 6252482 3' + P-element 2874 1 66.34 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTATGAAAATATGG:1 + chr2R 12779183 3' - roo 8673 2 73.27 AAAAATTATAAAAAAAAAACAAAAAAAATAAACACCCACAACTGCTTGCTTTTGGTGTAGAAACAAGCCATAACAAAGTGTACCAGTTGTACAATTACCAA:1 + chr3R 6396543 3' + Doc 4697 2 72.28 TTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCACGCTGAA:1 + chr2L 8960001 3' + Ivk 5376 1 69.23 CCATCTTTCAAATTTCAAAAATTCAATTTACGAACCGAAATTTATTGTAATAACCAGAACAGATGGGGAAAGTTTCGAAAATTTCACCATTTGTGATTAAA:1 + chr2L 23023204 3' - FB 32 1 77.23 GTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTATGCCAACAACAGCAACAACAAAT:1 - chr2L 7547974 3' - blood 8 2 71.00 AAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTAC:1 - chr3R 13375973 3' - 1360 37 1 64.36 AAAAAATAAAAATTAATAAAAAAAATGAAGAAATAAATGTTTTAATCTCTAAAAATATTCCATGTGAAGTATACAGTGATTAAAAAAGTTACTTTTTTTTA:1 - chrX 17089435 3' + Doc 4690 1 75.25 ACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGATAACGAAATCG:1 - chr2L 20928067 3' - Chimpo 27 1 53.47 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAA:1 - chr2L 11065899 3' + P-element 2826 1 20.00 ACAGGGTGTCTCCTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTATTCTTTGGTCGCAAATCCCAATTTTGACCAACCAAG:1 + chr3R 4543284 3' - 3S18 2 2 77.23 GAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGCCGATATATTCTCGACATGCATTTGGCCAGCTGCTCATCGGATAATTTTAAATATATTGCCACTTTTTTAGTTTTTT:1 - chr2L 22197270 3' + jockey 4701 1 70.30 GCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTG:1 - chr2R 23305430 3' - I-element 46 1 68.32 TAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACAGTATTTTCACATCAAACGGCAAAGTTTCAATTACATACGATTGTGGGGGAAAAATAACCCAAATTAACAGT:1 - chr2L 16933565 3' + 3S18 335 2 74.26 GATATGGTTTTCGGAGAGTTTTTTGATGAGACCACTAAATATCTCGGTTTTATTTCTGCTGCTGCATTGTGGCACTTATTAAAAATTTTCTGGTATTTTTT:1 - chrX 21471295 3' - Ivk 352 1 59.41 CCCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGTCACTGCTGATTAACCATTTTTAATAAGCTCAGCATATTGTTAAACCGCAATTGCCAAAGAAAAATTAGATTGGGAGC:1 + chrX 14497426 3' + hopper 140 2 65.35 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCGGCGCATCGGCTGTTTTCTGTTTTGTTTTTGTTTTGGATCTGAAGCCACAGTGGGACTTCTTCGGGTGGATGT:2 - chr3R 28326667 3' + P-element 2884 2 80.20 ATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTC:1 - chr2L 12074495 3' - Juan 4041 1 54.02 TTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAAACATTCAAGATCGTTTCAGATGTTCAAATAGCTCGCTTCTACATTCCTAATAGCGAATTACTCTAGTGCTG:1 + chr3L 9846705 3' + P-element 168 1 75.25 CTGTTAAAGTCAGCTGTTGCGAGCACATACCACGTGGCTGCATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAA:1 - chr3R 1047974 3' - hopper 1259 1 59.41 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTTTACTTTAATCCCGTAAA:1 + chr3R 25918959 3' + roo 9036 1 64.36 AAAAAAATAATAATAAAAATTATCAAACTTTTAAGTAAGGTGCTATTTAGATTCTCGACTGCAATATGCATCAGCTGGACATTCAAATTCCTATACACC:1 + chr2L 15319115 3' + invader6 4386 1 78.79 TATCCGGCTCGAAGGACCAAATTCGTGTTTAACCATACTTAACAGATACTTGGCATAAGTAATACACCCCAATGACTTTCCACCTAACGCAATCAATAAA:1 - chr3L 816237 3' - 3S18 366 1 71.00 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGG:1 + chr2R 5262640 3' - 1360 42 1 67.33 AAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATTAAATACTCAGTACAAAATATTTATT:1 + chr3R 19609700 3' - Tabor 53 2 76.24 AAATAAATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAAATTTGCATCCATTTCGACAATTTAATATTAACCATTAAAAGCAAT:1 - chr3L 21735125 3' + Doc 158 1 55.45 CTGCCNACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACACAGTGGCCAACGGTTAAATG:1 - chr3R 20884884 3' - flea 24 2 58.42 TATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCG:1 + chr3R 29660304 3' - mdg1 31 2 56.44 GTAGGCCCCCTGGTGGGAGTATCGTGGTGGCTACCATGCCATGTGGTGGTGGGGAGCTCCGGGTTAATCTTCAGATTTTCGGTGTTGTCGGTTTTACGAGC:1 + chr3R 17862565 3' + R1A1-element 4980 1 73.27 CGTAGTCTGGTCGCGGGTAGGAGCGGGGGGCAGTAGATGTCACGTTGAGTGGAAAACCCCACGGCAAGCAACAGGTATTCGCCTCGCCTCGTTGCGCTTCG:1 - chr3L 16257430 3' + invader1 3726 2 62.38 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAACGATA:1 - chrX 2762110 3' + roo 9050 2 56.44 GATTTTAAGCGTCGGATGCGCTCTTATGTTTGTTTACAATATTATTTTCATTTATTAGAATGGCACCTTCTTGAATGATATCTATATTCTTATTTTTTTCG:1 + chr2R 4270371 3' - Porto1 214 1 69.31 TTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGA:1 - chr3L 5964266 3' - BS 50 1 75.25 TACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTTTCTGGCCAA:1 - chr2R 10673389 3' + Tirant 364 2 60.40 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAGCGTGATGAACGATGCTTTCGTTGGACTCT:1 + chr2L 13837956 3' - 297 6593 2 68.32 AGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGA:1 - chr3L 22920397 3' - 1360 49 1 74.26 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATG:1 - chr2L 13250383 3' - pogo 49 1 80.20 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCC:1 + chr2L 326220 3' - roo 8676 2 68.32 TAACAATAATAATAATAATAATAATAATAACAAAGAAATACAGAAGACAATGAAAAAGTCTGGTTTTTATGGGGTTCATATTGAGGGGTGATCTGTAGAAC:1 - chr3R 31956754 3' + mdg1 7059 4 80.20 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGTAATTAACAAGGTTTGCTCTTAATTCGCCT:1 + chr3L 14050042 3' + pogo 2057 1 72.28 ATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAGACACATTTATTTCTTATGT:1 + chr3L 20895025 3' + invader3 174 2 60.40 AAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATGATTAAAGAGTAACATTTATTTTAAGTAAAACACACACATGCATATGCAAGGAAAAACAATAAAAA:1 - chr2R 22993679 3' - opus 6 2 73.27 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGGAAATC:1 - chr2L 1626532 3' + roo 9041 1 53.47 GGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGGATATTGCTCTAAAAGTACCAATTCCACTGCTCGTTTCTTTTAGTGTAGGGACACGTAACAGGAACGATCCGCA:1 + chr2R 21140722 3' - Stalker 6852 4 73.27 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATACCATTTGAGTGGTAACTAGGCTTTGTGGTTACTCG:1 + chr3L 11654594 3' + pogo 2063 1 69.70 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTTAGCTGAAACTCTAATTTCCAAAATTTAACTCTTTTTAAATTCATAAATTTAATACGCT:1 + chr2L 9946996 3' - roo 8683 2 60.40 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCGAGGATTAGGTGGAGTGAGCCCCAATGGAT:1 + chr2L 6227703 3' - roo 48 2 72.28 TTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTACGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGACTACTCTCAACTTTATTTATTAAAGTTAAGTTGGGCTATATA:1 + chr3R 3187391 3' - I-element 5150 1 61.39 ATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACCATAATTTTTGTAATAAAAAAAAACCAACCGATAAACAGCCAAAT:1 + chrX 13548843 3' + blood 7384 2 72.28 AGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGGATATATTACTAGAAAACTGCT:1 - chr2R 12779089 3' + roo 9042 1 53.47 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAACCTTACAAACTGGGAACTAGAAC:1 + chr3R 19657534 3' - roo 16 2 63.37 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCATGACTTTGTTAGGGAAGAAACGCAGCCACAAAGGCCAACAACATTCCTTAAATTGGA:1 + chr3L 4386543 3' - jockey 26 1 62.38 GCAAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAAGGCGGCCAGCCCATA:1 + chr3L 23678120 3' - Osvaldo 32 1 69.31 AATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTC:1 - chr2L 12074495 3' - Juan 4055 1 51.49 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCATCGAAGAAAATGCCGAAAAAAACTTTCACAAA:1 - chr3L 18009572 3' - roo 44 2 72.28 TTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCCGTGTAGGATTCTGATCTAAAAAATAATCTTCATCAATGTTTTTTATTCTCATACCTTTCT:1 - chr4 1152005 3' - transib2 14 1 63.92 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATGAAAAAGTGAATATATAAGTGTACTGCCG:1 + chr3L 9772266 3' - 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jockey 4815 1 64.36 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTTAGCTATTACTTTGCCTGCTATTACACATTGGCCGGGTGTCAAGACTGCGCCCATCATGATGTATTCAACGA:1 - chrX 1980735 3' - INE-1 557 1 74.26 AGATATTTCCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAA:1 + chr3L 21384023 3' + roo 9022 2 68.32 AACAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAACATGGGTTCGAGCACAACGGCGTGGGTGTGGGTGCTTCTAGTAGCGGAAATG:1 - chr3R 23267431 3' + I-element 136 1 58.42 ATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATTCACGCAAGACTAAAAAGTGTACAGATTTATACGTAATACAAACTAAATTATGCATGAAATG:1 + chrX 14603819 3' + 412 57 2 55.45 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGG:1 - chr3R 25633340 3' - Tirant 8147 2 67.00 GAGTGNTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTTAAATGATATGTAATTAAAAATAAGCTATACAATACAAGCTTAGCAACACAAAAGTAGAAAT:1 + chr3R 19224932 3' - hobo 14 1 65.35 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGA:1 + chrX 12294760 3' - blood 7043 2 58.42 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCCTATTAAGTAGTTCACGAAACAGAACGTT:1 + chr3R 11516653 3' + roo 9024 2 74.26 GGTCTGACTAAGTCAGCGAAAGCAAAACCGCAAAACGGTACTGCCGGCGACAGGTAAAATCAA:1 + chr2R 24620553 3' + F-element 486 1 69.84 AGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTAT:1 + chr3L 20248349 3' - Transpac 55 2 76.24 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTGTGTATAACAAAGAAAAACAATACTAGAGAGCAGAATAAACTTCTGAGAGAAGCAT:1 + chr2R 19192612 3' - roo 20 2 59.41 TATTTTTATTTAATAAAAATAATGTAATGAGGTACCATCAATGGAAATCTGAATTCCCTTGTCAGTTTTTAATTTACTTTTAATGACAATTGATTCTGTCG:1 + chr2R 20068442 3' + TAHRE 74 1 80.20 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACTATAAAGGTAGGACTATTAAATTATAATTTCTAT:1 - chrX 9248296 3' - pogo 41 1 70.30 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGCA:1 - chr3R 15998090 3' - pogo 52 1 83.17 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTCAGGCACACAAGGAATTTCAACCCCCAGCGAGAAGAATA:1 - chrX 10621680 3' + hobo 2899 1 61.39 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTTGCCTCTATTCGAATTCGATTAAT:1 + chr3L 12452191 3' + 412 450 2 73.91 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCC:1 - chr3L 958770 3' + P-element 2833 1 23.76 ATTGTAACGTGATGTCAAGCGACCATATGATGGCCCAGTAGCAGTACGAGAAATTGTACTGACCAGCGCTCATGCGCAGCACGACGCCCTCTAGATTCTGG:1 - chr3R 24948150 3' + Bica 4823 1 73.27 CCGAANACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAAATGAGCCAAGTTTAAAGCAAAAAAAAAGTT:1 - chr2L 17957244 3' - opus 157 4 72.45 ACGATNAGCTTTATTTTAAGATTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGCGATCAGCTTGCTCCGCTTGGCCACGTTC:1 + chr2R 13130037 3' - opus 370 2 71.29 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCCCTATTCCAACATGAATCA:1 - chr3R 12894096 3' - blood 7038 2 50.50 AGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGA:1 - chr2L 20118715 3' - Max-element 57 2 79.21 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCTAACTGCTGGTTTGGATGTCTTAACC:1 + chrX 13548798 3' + blood 7340 1 72.28 ATTTCGTCACAAGATTTGAACTGAGTAGAAGACAAACTAGATGTGGACTTGGCAGCACTCAAAACTTGGCCAAAAACACATTTCCCGCCATCCACCGTACC:1 + chrX 19986458 3' - gypsy 238 2 72.28 AAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATAATACTCAAAGCAAGAACTGGTCTGAAGAAG:1 - chr2L 12123851 3' + invader4 251 2 70.00 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAATATAATGTATAATCATTTATGTAATAATAAAAAATAACAACAAC:1 + chr2R 978510 3' - copia 4900 2 58.59 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGGATGCTTAAACAGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAA:1 - chr3R 11516599 3' - roo 8692 2 58.76 GTCTTAAATAAGCTAACAGTGTGTGTGTTGTGTGTGTTAGTGTGAGTATCTGTGTGCGATGACATGGACGATTTAGTTGCGCATCCGTTGGCAGCTTCATG:1 - chr2L 8576461 3' - ZAM 8249 1 70.30 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTGCGTTTTTACGAAGCAATTGTGCCTGCATTCGGTGGAAAAACTACAAA:2 - chr3R 31812665 3' + P-element 2871 1 67.33 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCG:1 + chr3L 10698691 3' + roo 9019 2 79.21 ACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAAAACATAAATTGCTGGGCCCCCCAATTCGATTTGGAATGTTAATTCTCTGTGA:1 - chrX 13548718 3' - blood 7015 2 70.30 ATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGGATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTC:1 - chr3L 9121824 3' - Transpac 4955 2 66.30 GATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTC:1 - chr2R 6984298 3' - HMS-Beagle2 1 2 77.08 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCTCCATC:2 + chr2R 19936709 3' + roo 402 1 75.25 ATGTCAAGAGACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTTTAATTGCTTCAAAACAATGAGTTGGGGAAGATGATTCAGGGATCTAATCAAAAACT:1 - chr3R 25496566 3' + S-element 5 2 64.36 AGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTATGAGTATGGGTTTACGGTTCAGCGGCCAAAGCAA:1 + chr2R 24789608 3' - F-element 368 1 65.35 GGACTTTAAAGCGTGCACCCGCAAGTACAGGTTTCTCCCTTGGCCTTGTTCATAAACTTATTTCGTTAATAATAAGTAATAAGTTGTATAAGATAAAAGGT:1 - chrX 19595899 3' + Gypsy12A_LTR 2210 3 63.37 ACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAA:2 - chr2R 1320704 3' + diver2 4856 2 61.39 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTT:1 + chr2L 6252549 3' - P-element 50 1 29.70 TGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACTACATTCTTTAAGAAGCCTAAAAACTTTGGATACCCTTTTTACCCAG:1 - chr3L 4995396 3' - blood 377 2 61.73 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGTTGCCCTTCCGCCTTCCGCCACCTCGGTGGATGAATCTGCGTTCTGCGTTCTCCGTTCCTGAGCGCCGT:2 - chr3L 7314658 3' - hopper 6 2 55.45 ATCACNCATAACCCGACAAGTTTACCATTGCCAAAGTTCGTCGTCCGCTGGGAATTGAGCTTGAAAAATCCACCAGGCGATGCTCTGCTTGTCGATTTTCA:1 - chrX 7483326 3' + Doc2-element 405 1 75.25 CTGCCCATTTGGGCGCGCCGGCTAACTATAGTTAGCTTTTTCTAGTACGTGTGTAAATAAACAAGGTAGTTAATAATAAATACAATTTCAACATTAATGTA:1 + chr3R 16799798 3' - X-element 4641 1 45.54 CTTTTGTGCGTCGTTCGCAGTGCTGTTTGTTGTTGTTTTTTGAAAGTTTCGCTCGATGATGTTGTGTCGTTGTGGCATCGCCTCCATGGGCAGCAGCTCTG:1 + chr3L 4039792 3' + Cr1a 226 1 52.48 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAGGCAGCCATCT:1 + chr2R 19936704 3' + roo 397 1 70.30 AAGCTNCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTATGC:1 + chr3L 9692749 3' - P-element 23 1 52.48 AAAAAAATATTGAAATATTGAAAACTAATTAATGTAAATGTGTACTCCTAGAGCATATGATGCTACGAGTATGTATATATTATATACTATACTATATATAT:1 - chr3L 542982 3' + Penelope 156 1 55.45 TTTTTCTTTCTTTTTTTTTTGTCATTGGTGGGAGAGGGATTATTCTAG:1 + chr3L 10354085 3' - G2 3076 3 91.67 AAGATNCGTAACGGCCATACATTGGTTTCAGTCGGATGGAGGAGCATGGTGGAAGCTAAGCGCGGTGCCTTGGTTTCCTCGGTGCAGCACCGACACAATAA:1 - chr3R 31482482 3' - 1360 3370 1 76.24 CGATTTTGTCCGCCATCATAGCAGCAACCAAGGATCTTCGACAAAGTTTCTCAAGCTCTGCCATGCCAATTCAAATAACACTTTTATTTCGCTCTCGAATG:1 - chr3L 17170589 3' - Rt1a 4681 1 79.21 CTAGACGCAGTTTGGAGTAGTGTTTAAGTTGAGAATCCCACTTACATGATTCAGGGTAGTGGTTTTGGGTTTTATCTGTAACACTGTAAAAAACGTGGAAA:1 + chrX 13862740 3' - springer 469 1 66.34 AGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCGTCGATCGCTTGAAAT:1 - chr2L 12074479 3' - Juan 4037 1 63.64 ACCCCCGCCAGAAGGACGGAAGCACCGAGTCGCAGGAAGCTTCAGGAGACGTTGCAGGTGAGTATTTGTTGATTTGTGGGCTGAGTGGGTGGGTGCTGTGG:1 + chr3L 1705310 3' - HeT-A 5736 1 74.26 GCCAATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATTGCGATAATAGATAGTGTGTGCATAGCTATGTACTATCAAGT:1 + chr3L 16396509 3' - 1360 258 1 60.40 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTTATGTCCTCCGCC:1 + chr3R 11496900 3' - Doc 25 1 60.40 CCTATNCTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGTCACGCGACCGTCGCTTCATCGCTGGTCGACCTACATTCAATTTGCGAGCGACCGCAAAACGCG:1 + chr2L 7934318 3' - 297 6540 2 69.00 GGGAAACCCAGAAAAACCCGATCAGATCATTGTAACAAAATATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATATATACATATTTTACTCTGCTCTGC:1 + chr3L 13261728 3' - copia 4723 1 74.26 AATAGAAGATTTTACATCCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTG:1 - chr3R 19144405 3' - Juan 27 1 47.52 AACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCCTGAAAGATTGTGTTAAGTAAAATTGTTGGGAGATTAATATTTTTGTGCGTTATTG:1 + chr4 302561 3' - 1360 3373 1 61.39 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCC:1 + chr3R 7522359 3' + blood 334 2 69.31 AAAAGTCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAACAACGGTAACGGAAAAAAAAGAGTGGAAAATAGCAAACGGCAAGTCGAAAATA:1 + chrX 5477580 3' + Bica 475 1 66.34 TTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAA:1 + chr2L 19075708 3' + Transpac 5179 2 75.25 TTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGC:1 + chr3L 25232861 3' - accord2 22 2 58.42 AAATTNTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAATGAAAATTATCGTGCCACCGAGCAGAGAAATAAAGGAAAAATGC:1 - chrX 16864581 3' - FB 132 1 55.45 AACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTCATTAAAGTCGAAAAAAAGTGTTGCAAGTCCGAGGTTAAGA:1 - chr3R 31369314 3' + Transpac 5190 2 64.36 CCGCGGTCCCGCGGTATTTCCAATGTTAGTTAAGCGGCTTTTTCGGTGATTTTATTGTCTTTTGCGCCCAAGAGTTGGTGGTGGCACGTAGTGCACTTCGT:1 - chr2L 1924639 3' + Max-element 150 2 77.23 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGA:2 - chrX 5018634 3' - opus 147 4 66.34 AAGCGAAAGAGACGCTCTATGCCCTGCATTTGAAAGGGGAACTAAACTCTGTGAAATAGTTGCTTATTATGTGATGCTATTTTATTGATAACTATGCTGTG:1 - chr3R 30980029 3' + F-element 118 1 79.21 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTTGGCTTGTTTTTAAATACAATTCAATATATAATTAAGCTATGATTGCTAGATAGCTTAATACTTTTGTA:1 - chr2L 7743470 3' - 297 32 2 70.30 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTGTACAGATAG:1 + chr3R 27080808 3' - HMS-Beagle 17 2 62.38 AAGTTTTTTTTAAAATAATTTAACCATTTAGGTATACATCTAATGTCATTTGTTCATCAGTTATCCAATGATTTATGACCACATTTAATTCTCCTATTGGC:1 + chr3R 27402099 3' + HeT-A 5801 1 69.31 TCGATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAG:1 - chr3R 19450186 3' - roo 55 2 49.50 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCAGTTTGCTGCGTGCCAAGCGGCCACATTTACAAATACAGATACAGA:1 + chrX 19351040 3' - FB 33 1 58.42 TGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACTGTTGCCTACTTAGCGGGGTTTATTTTAAGAACGT:3 + chr3R 15943352 3' - jockey 4653 1 61.39 CTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAACTTGTTAAAAATCAAGTGGCATTAGAGCTAAGCACAAAGATGTGTATTTAAAAATACATATGAAAGTA:1 + chrX 14531586 3' - 412 6 2 74.26 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCG:1 + chr3R 28326732 3' + P-element 2825 1 20.79 TCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCACGGCAAGACCGTAAAAGTCAACTAAAGTACGGGCTGGTCTGACACAC:1 + chr2L 11065939 3' - P-element 28 1 51.49 TATTTCTAATCTATTTTTAAATAATAATAACATTAAGGCAATGCATATTTCATAACTCGGGATGATTCCTGCCTAATTACAGCCCCCATTTCCTTGGGGTT:1 - chr2R 19109612 3' - 1360 324 1 63.37 GTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGAC:1 + chr3R 16626834 3' + I-element 5326 1 68.97 GGCTGGTTCCCCAGAGGAAATTTATTCATATTGGAACAAGAGAAAAGCGAGGAAACGGAAAAGGAACCGCATGCATCTTACTTTATACTTTTCTACGTGAC:1 - chrX 12787518 3' + R2-element 206 1 69.31 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGATTCTTTCTGTCTGG:2 - chr2R 9862183 3' + roo 404 1 69.31 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGC:1 + chr2R 8378649 3' - pogo 51 1 80.20 GTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGCACTCAG:1 - chr3R 7993860 3' - Doc 31 1 49.50 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCT:1 + chr2L 108068 3' - P-element 26 1 54.46 AGAGGCGGCGCTCGTCTTGTTCACATTGTCGCTGAGAACGTATGTCGTTTTGATTCATTGTCTTAAATGTAAGGTGTCCTCGCCTCCACTTCCGTTTCCGC:1 + chrX 20764844 3' - Doc 249 1 56.44 ACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGTAGTTTAATTAATCATTAATATGTTTATGACAGTGAAAATATGTCTACCTTGTACACA:1 - chr3L 10175068 3' + 1360 3009 1 61.39 AGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAGAAATTACGAAGTTAAAGTTAAA:1 - chr3R 10734431 3' - G2 2998 1 47.52 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGACTGAGAATCTTTCGCTGGAGTAATTATTG:1 - chr3L 19215809 3' - roo 47 2 72.28 ATCTTCGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAAAACGAACACAAGCAAGCAAATTCTATTTTGTGGATTAGCAGGAACACCGAATC:1 + chrX 17203150 3' + 1360 3172 1 79.21 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGTATTCAAATTAACTACAGTTCAACTTCGAGCGCATTACAAG:1 + chr2L 7350780 3' + mdg1 366 2 75.25 CATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAAACAGAAAATAATAAGAAAAAACAAGGA:1 - chr2L 9020935 3' + opus 452 2 76.24 TAACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTACGCAATTTCCCTCCAACTATC:1 - chr2L 10291520 3' - jockey 4792 1 56.44 AAATANAACAACAATTTTACTATATTAGTTTCCAATTCGTTTAGTTTGCATATGTGTATGTTCCCCTATAATAACAGATGTAACTTGTATCATAGG:1 - chr3L 21625081 3' + 297 394 1 72.92 AGCAANCATCCTAGCTAATCCCATCTCCCTCCGAAGGCTGAAGAGGGTACACCCCACCGATCTCCCTACCCGGAGGATAGTATGGCCTCGCCCAGTATGCG:1 + chr2L 20659783 3' + G5 4602 1 81.19 CTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCCATTGCCAGCAGACCTTGTTGGTAAAA:1 + chr2L 7459610 3' + BS 5051 1 74.75 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCTGGCCCATCAATCTTGGTCTA:2 + chr2L 11686100 3' - hopper 8 2 68.32 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTAACTTAACTCAATTCCGGTTGTAATTGCATAGTTGCAGCAGCCTAAAAGTAGGCATCATTTTATCTTCGCC:1 - chr3L 19349920 3' - 1360 5 2 70.30 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTA:1 - chr3L 5716899 3' + copia 202 2 83.17 ATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTCTCCGCTCGACTATTGGACTAAGTTTGCTTAGGAAGCGCGCAGCGGGAACTC:1 + chr3R 19987299 3' - P-element 461 1 57.43 GCTGCAAAAAAAAAAGAAAAAAATCAGCAAGTGGAATCAGGACTCCGCGTGGAGTGATTATTTTCACATTAACACAACGGCATTTTCCTTTCGGCTTTTTA:1 + chr3R 26822364 3' + G2 3073 1 68.32 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATG:1 - chr3R 9981502 3' - jockey 4797 1 60.40 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGGGAAAAGTTTTTGATTTGTGTCATTGTCTTTTCCCCAGCCAGATG:1 + chrX 7809045 3' - roo 8694 2 56.44 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGGCGTGATTCAAACTTTTGGGCTTAGAGATTATCGCATTTGGG:2 - chr2L 1626537 3' + roo 9036 1 58.42 TACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTTCTTATGTTCGAACTGAATCTAA:1 + chr3L 20895040 3' + invader3 189 2 47.52 ACTTTATTTCTAAGAACTTTAACATTGTAACACAGCTAATCTAATTTCAAAATTTTATAGCTAATTTATTTTAATGAAAATTCTAGATACCACATTTATGC:1 + chr2R 15679136 3' + ZAM 242 2 76.24 GCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGAAACAATGTATTAGCGTTGACACCCACGAACGTGTTCAAACCGATTTAAATTTAGTCAAA:1 - chrX 1939982 3' - F-element 4486 1 63.37 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTG:1 + chr2L 13060313 3' + P-element 2836 1 28.71 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTT:1 - chr2L 6227662 3' + roo 9028 1 67.33 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCTTGATCCAGTAAC:1 + chrX 21668953 3' + pogo 2074 1 54.46 AATACCTAACTGAAACTAAAAGTGGATGGCACTTGAACCCAACGAGCCATAACAAAAGGCACACGAAGTAATTAACTTGTATTTATTGTATGCACACATAG:1 - chr2R 16707907 3' - Circe 336 1 79.21 TGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAA:1 + chr3L 24208196 3' - Quasimodo 28 2 62.38 TGGCAACAATTTTTATAAAAGCCACGGAGCCCATACAGGTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTACTCCCGTACTAGTCCCGTACTCGGTCCCGTAC:1 + chr3L 16047625 3' - Cr1a 457 1 58.42 AAAACAAAACAAAAATATGTGCATAAATCTGGTATCGTGTAAAATGCTAAATATATCGCCGGCCAAAAACTAGCACACACACACACACACATTCATTCATT:1 - chr2L 12970543 3' + Porto1 195 1 82.18 TCTTAGTTGGGATTTTACATATGTGTTCATATGATTTTGGCAATTATATGAGTAAATTAAATCATATACATATGAAAATAAATATTTATTATATGTATATG:1 + chr3R 31204192 3' + roo 411 1 76.24 AAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAGTGTAAGAAATCTAAAAATATAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTGTATTTTATGCAGGCTGCGAGAAAA:1 - chr3L 5044764 3' - 1360 3310 1 75.25 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATTGCAATTAAACAGGCACCACCCACTTCC:1 + chrX 12538532 3' - roo 21 2 58.42 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGGGAGTCCCAAGTTTTCATTAGCATATTT:1 - chr3R 27189279 3' - roo 49 2 76.24 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAATTTTACCGACTGGACCATAAATGGCATGCGTATCCATTTCAAACGCTTGCAAACGTTTCTAAACACAAGATA:1 - chrX 657981 3' + roo 9042 1 77.23 AATAAGAATAATAATAATTATACCAAAGAAATCAAGGCAAAATGAATCAGATATACTTTTTAACTTCTTGGGACTTCCAACAAAGTATTTTTATCTGAGCT:1 - chr2L 13465269 3' + mdg1 46 4 59.41 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCATGAAGTGTGTATGGGTGTAGTTGCTCTTAGCGACAAGATCCTTTTTGTGGCCATTTCGTGTT:1 + chr3R 10716171 3' - Transpac 4983 2 73.27 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATGCGTTTGCAACCTGCTAATCAA:1 - chr2R 22997940 3' + Transpac 5218 2 67.01 TTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCT:1 + chr2R 14457756 3' - mdg1 41 2 63.37 ATGTATATAAATAAGTAAATAATTTTTGTTTAAACATTTTGTTAGCATAATTTAAGCAAGAAGCAAAATACAAGCAATTTGAATATGGAAATATTCTTCGA:1 - chr3R 7410495 3' + 1731 4419 1 24.75 AACGCAGCGCCCAAGCTTAACGTAGGTAGAAACCAAAAACGGAACGATAGCAAGCGAAACGGCTGCAACTGCCGCTATGCGAAAATGCTTGCGATAAACGA:1 - chr2L 22218128 3' - diver2 4704 2 69.31 GTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCTGATCCAGACTGGTCCAGACAGATCCAGACTGGATTCGCAGGTCTCCTCGCCGGATGATTCG:1 + chr2L 19075175 3' - Transpac 315 1 68.32 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTCCCAACAAGGCACATCTCTTGCAGCTTTAAATCCGACTT:1 - chr2L 8472072 3' - roo 37 2 63.37 TGGTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGAACAGTTCCATGTTTATGACAGGCTGAAGTTTTGTGGCTT:1 - chr2R 13609395 3' - I-element 115 1 55.88 TTATAAATATTATTGTTATTATTACTAAGGTAAACATTATTTATAATGGAAATTAAAGGAAGTAGGATACCATAAACATACGAATCATTTATGGCAATATA:1 - chr2L 7588181 3' - mdg1 7067 5 80.20 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTATGATACCATTTAGCCGGAGGGTTGTTTTGACAAATTGTGCAAATTATTGTGTTAA:1 + chrX 7828964 3' - 412 20 2 59.41 GAGGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTATAAAGAAATAGAATC:1 - chr2R 18295615 3' - I-element 38 1 59.41 ATTTTCTCGACTATCAGATACCCGTTAGTAATAGTAAAAATAAACTAATCAATAATCAATAATCAATCAATAATAAAACTAATCAAAATGTTTATAAAGAA:1 - chr3L 15172630 3' - INE-1 557 1 32.67 TGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACA:1 + chr3L 19881819 3' - Idefix 38 2 75.25 CTGTTGTAGTTTTTAGAGCTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAA:1 + chr3L 9925276 3' - Doc 59 1 78.22 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGGTTAAGTTGCAAAAAGCTGGAAATCGG:1 + chr2L 19679759 3' - Doc 69 1 73.27 TTCGGNTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTAT:1 + chr2L 2197159 3' - P-element 19 1 59.00 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGGGCGCACTCCCCAAGTCACCTGCCACTCGCTGGCCCATCAATCTTGGTC:1 + chr2L 11686098 3' - hopper 10 2 66.34 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTT:1 + chr3L 12085233 3' - pogo 20 1 53.76 CTAAAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGC:1 + chr2R 10863943 3' + mdg3 193 2 81.19 GGGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGT:1 + chr3R 24281998 3' - Max-element 8288 2 73.27 TCTGAGTTCCTTACCTTTGGTAGGGGGAAACTGCAGAGTCGATTAAAGGCTCGATTGACCAAATGTAAAATCCCATATAAGTAAGTAGTTGGAAATGAACG:1 + chrX 13682187 3' - roo 471 1 80.20 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAATTTCGATGCAAGTATA:1 - chrX 20364235 3' + opus 468 2 61.39 TTAAGCATCTAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAACCATAACATACGGCCGCTCCTAAAAAATGTTTAAAAATCACTAAGGCAATT:1 - chr4 1131161 3' + 17.6 7182 2 58.42 CAGACNAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGC:1 + chr3R 4543235 3' - 3S18 5816 2 71.29 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTTC:1 + chr2R 5084067 3' - F-element 46 1 65.62 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGCAAAACAGTTGGCAGTTTTGTATGCAAAATGTAATCAATTGGCGGCATTTTAAATGCAAT:1 + chrX 2762213 3' - roo 8680 2 62.38 ATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATT:1 - chr2R 1320683 3' + diver2 4877 2 51.49 GCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCCGCGTTCACCCTTCGGCTCCGGTATTACCAATTCGATAATAAATATTGCAAGCT:1 + chr2L 15189193 3' + Doc 366 1 59.78 ATAAACAATTATAATAATATAATAATATAAATACAAGTAAACTTATGGAAAAAACTATAAACTATAACTATATGGAAAAACTATGTATACGTCCAATCGCC:1 + chr3L 22971600 3' + invader3 5042 1 73.27 TAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAGATGGACATATATATATAATCAAATATTTGCATTGAAAATTTAATAGGG:1 - chr2R 21848181 3' + Juan 4145 1 62.22 TTTTCGCTTGTTTTTTTGTTTTTTTTTTCCTTTCCTTTTATTT:1 + chr3R 29785103 3' - Porto1 170 1 65.12 TTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTTAACTGACAACAAATCGCAGCGTTTAATCGGAAAAATTGCACAGG:1 + chr3R 15525828 3' + P-element 161 1 54.46 ATTATTTATATAATGAAAAAAAAAAGGTTTTTAAAGTTGAAACTTAACAAATTGATTTTCATAACAAATTGATTTTCATAATCAATAAATAT:1 + chr2L 15635126 3' - P-element 2487 1 57.61 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAATTCAATATATAATATTCAGGGCAGCAAAGGTAAAGATTTAGTAGTGAAATTAACTGTAA:1 - chr2R 8245690 3' - mdg1 16 2 63.37 CTAGTACTCATTAAATTTATTTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATACCTAGCAAGTGAAGCCTTCATTTC:1 + chrX 12559876 3' + Ivk 5331 1 73.27 ATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTATTCTATGCGCTAGCAATTAATTGCTT:1 - chrX 4796917 3' + copia 255 1 78.22 TGATTAAAAACATGATCTCTGAAGGTAAAACCTACGCTGAAATTGGACGCATTGTCGGTTGTTCAAGCAAGAGGCGAAGCCCATCAAATGAGGCAAGGTGC:1 + chr3L 21442441 3' + Tc1 399 1 69.31 AATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAAATATATTTACCGAAAAATCACAATTAAAATTTATGTCAGTCTACATAAAGAATTATATATCAGTGAACTAAAATGGG:1 - chr2L 20928861 3' - INE-1 570 1 73.27 GCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATAACGTAAATGTATGTAAATGTAAATGTTGATTTACATGTACGTAACTTAGC:1 - chrX 17247270 3' - F-element 29 1 46.74 AATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGACTGATAGAACGGGCCAAATTAAATCAAGCTCAAACCAATGCTAGCAGTCACATTTGCACGATGGGAGCCGACTG:1 - chr3L 17969239 3' + rooA 263 2 75.25 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAA:1 - chr2R 2552116 3' - HMS-Beagle2 6918 2 64.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGTCAGACCCCCACG:1 - chr3L 9692649 3' + P-element 2881 2 73.00 AGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATTACACTTGATTCGCATCACGTCGGGG:1 - chrX 11282580 3' + I-element 5305 1 73.27 AAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTAGGCTTTTCATGTTTTTGAAGGCTGTAAAAGTGTT:1 + chrX 13134991 3' - jockey 4790 1 52.48 GGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATTTAAAACAACTCTTTTGCCATTAAGAATGTTATTCGAC:1 + chr3L 17125182 3' + diver 6 2 62.38 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGC:1 + chr2R 12779153 3' - roo 8703 2 66.34 AGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCAGAAAATACATATTTTTAGCGGGTTCTAGTGCTTTTGAGTGCAGAAAAAAACCCTTATAAAG:1 - chr3R 22718404 3' - opus 7386 2 65.66 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACATCTGCCTACTTCTAGACTCCGAAATTCA:1 + chr2R 1375139 3' + 297 6932 2 72.28 AGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACCGACGACAGTTACACCAAGGCGC:1 - chr3L 11828319 3' + INE-1 149 1 49.50 TTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTAGGTATTTCTTAGTTTCTCTGGTTTTTCTCCAATTTAAAGCATACTTTTCAGAGCGTGTATTCCCCAAGT:1 - chr2R 15004733 3' + Tc1-2 476 1 41.58 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGT:1 - chr2L 15333732 3' - P-element 30 1 40.70 CGTGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGGAAAATGGAAAATGCAGGCGAG:1 - chr3L 2800113 3' + blood 362 2 54.55 CTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCC:1 - chrX 18193738 3' + hopper 1370 1 72.28 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTAATG:1 + chr2R 14381340 3' - hobo 40 1 66.34 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTATCTTAATAAGTATGCTAGGCTTT:1 + chr3R 18881547 3' + roo 355 2 76.24 CACCCGTTGGAAGCTTGGCTTCCAACAGAGTCCTCAAGGGGAGAAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGTGCGTTGGTCGTGCTTATTAAGTGGTTCGA:1 + chr2R 18486795 3' - diver2 4506 1 64.36 ATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTAT:1 - chr3R 13423297 3' + 17.6 451 2 71.29 AGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAAACCTTAGCAGTGAAGGGAAGTGCCCTGGGCCAGCTTGC:1 + chr3L 1498401 3' - R1A1-element 262 1 61.54 CGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTAATGTAACGATGCATCATTTATGCCATTT:1 + chr2R 14381365 3' - hobo 15 1 63.37 CGCCGAGCTCTTGGAGGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCCTCGTCTGGATTTCCTATGCAAATTCATCGGATTCAAATGCAGCTACGGCGGTATCTCAACTG:1 + chrX 6137277 3' - R1A1-element 465 1 56.44 GGTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATAGAGGTATTTTACATTATATTCATTATGCCAGGGTTTACTTTGTATACCATTTATATGTG:1 + chr2R 13469868 3' + Cr1a 4282 1 61.86 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGACCGCCTTCATTACTTTGCCCAAGCCATCAGGATCCTTTGCCCTCGGACTCCTTTTC:1 - chr3R 27374783 3' - mdg1 19 2 60.40 GTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCTTGCGACCGACAGTTCCAGATTTCAAAGTGTTGCGCTCATCTTTCAGGCGGTGGCCCAGTTGGGTTGGCA:1 - chrX 21387703 3' - Doc 475 1 65.35 GTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTGCAGGGCCTGGTGTACGGGTGTATCTAGTATCTCGTATTT:1 + chr3R 20729567 3' - 1360 3240 1 60.40 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAA:1 - chr2R 10673408 3' + Tirant 345 2 79.21 TTCGGTACCATGGGTTGAGCAGCTATCCAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGAATCGTTTTTGTGGCTGCCCGGAAAAAG:1 - chr3R 21957558 3' + R1A1-element 4936 1 79.12 GACGGNTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATACCAATATTT:1 - chr2R 23495440 3' + 412 458 2 56.44 AATAAATATTGTTTAATTATATTTTATAAAAAAATTTCATTTAATTAAGCAAAAAATTGATGTTGAATCTTCGACCACTCCATTTGAGCAACTCCCCCTTG:1 + chr4 439997 3' + S-element 1609 2 52.48 TTTTTTCTGTGTTGATCCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTTTTAGCTGCCTTCTCTTCTTTTGTAGTGCGTCTGTGTGTGCCAAGGTATCTTAATCAAC:1 + chr3L 19896351 3' - Transpac 335 1 61.39 TAGAAGGTTGAGATTCAGCATACAGATTCTAGAGACATAGACGCAGCACAAGTTTGTTGACCTATGTTGCCAAGCCACACAAAACTGCCACGCCCACACAT:1 - chr4 479196 3' + INE-1 171 1 80.20 AAGATGTGGGACAATAACTTATAGGGCAATAACTTATACACAGTCTCCTTTCGTATCCCAAACATGCGCATCGCTTCCAAATTTCTCGAAAGAAAATAAAA:2 - chr3L 23235111 3' - HMS-Beagle2 13 2 60.40 TATGTCAATATATCGTCCTTTAGCAATTATTTTCTAAAGAAACAGTGATAAGACGGAGTACTCATACTAAGTTGAATTAATTAAAGTCCGGGGCTTTCGTA:1 - chr2R 25046153 3' + transib2 47 1 78.22 AAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATATTGCAAGGAGC:1 - chr2R 2552099 3' - HMS-Beagle2 6902 2 58.42 GTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATACATGCGGAACTTAACTAATTTATATTAACATACATGAACATGATGATATATTCGAAACGAAAA:1 + chr3L 19881852 3' - Idefix 5 2 74.26 TCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAGATAAAATAAATTTCCCAACTCACACGGTATCATTAAATG:1 - chr3L 15099564 3' + G4 3803 1 59.41 GCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGCTCGGGTGCGTTCCATCAGTGTGACTGATATGGGAATCGCCACT:1 + chrX 11688209 3' - F-element 123 1 61.39 AGTATCGTAAAATAAACAAACTTTCTTCGGCTATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGAGTTTCAACGTTTTGGCGACCGTGACAGAGCTAGTGTTG:1 - chr2L 22736928 3' + diver2 309 2 61.39 ATGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATACATATATTACTTAGTATATATATATATAATCGCATTTCA:1 + chrX 6608515 3' - opus 7148 4 75.00 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAAACACAAG:1 - chr3R 5505225 3' + mdg1 389 2 55.45 AGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGTAATGTGTTGGCCGTTTGTTTGTATGTTTTGTTTATTTCTTTGCCGTCAGTTGGTGAGATATGAATT:1 - chrX 6705127 3' + S-element 1512 1 69.31 GCTGGNGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAACATTTTCCATTTTTCGGAACTTTGTTTTAATCGTTACTGTGTTATCTTCAAAGTCATCTTCGG:1 - chr3R 2471363 3' + Cr1a 4434 1 87.13 CGTGCGTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCAAAAGTGTGCCACCAAATTGGATGCTCCCTGGTTGGCAGCTGTTGAGAAAGAAGAACTTCAATCC:1 + chr2R 12185067 3' + accord 347 2 69.31 AACACACACTCAACTCTCCCGCTCACAGCAGTTACGCTCTCAGCTCTCCCACTCTCAACTCGTCCGCTCTCTGTTCGCCGGACAGCGGTCCTTCGTTCCCT:1 + chr2R 8313796 3' + Porto1 466 1 70.30 TATATTAATTAATAAAAATAAATAATCATGCCAAATCTACTCCTTAACTTTATAAGCAGGTTGAATGTCTGGTTTGGAGCATAAATCTGGAGAGG:1 - chr3R 5221241 3' + transib3 2676 1 56.84 AAATAATTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTC:1 - chr3R 25823665 3' + hopper 1365 1 71.29 GTGTGTATATGTGTGTGAGTGTGTGTGGGTGTATTTGATGGTCTGCGTGCTTCGCTGTGGATGTGGATGTGGATGTGGATGTGTGTAAAAAAATCATAAAA:1 + chrX 14421606 3' - accord 7035 2 68.32 GATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTGTATAAGTTATGTATTTCTCTTCAGTGTCCAGAATTATGCAAGTTAGGTATTTCTCTCCAGTGTCCAGAATTAT:1 - chr2R 924415 3' - springer 7142 4 74.26 GTGCAAAACCAATGTATGACCGTTACGCATCTTGTTAGTGTCTTGTTAATTTTCGGTTTCCTTTCATTTATTTAATTAAATTTTATGTATGTATATTTAAA:1 + chr2R 16267110 3' + 1360 3359 1 52.48 ATCAAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACA:1 + chr3L 14603153 3' + jockey 4995 1 40.59 AAAAACGAAAACGAAAAAAAAAGGAAAATAATTTGTGAAAAAAGAAAGTTTTTGGCGACCATATCCAGGAGAGAGCAAGTTCTATAATCCTTTAAATTAC:1 + chr2R 22967700 3' + Doc2-element 238 1 66.00 CAACAAGATATTGTACTTAGGAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGCTACCATACATATTTCGAACCTATCGATTTCGATGTAGGAGAAACGGCCACAC:1 + chr2L 20927868 3' + Chimpo 152 1 55.45 GAGACGGGAACGGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCAGGGGGAGGGGGGGTTGGC:1 + chrX 14458540 3' - F-element 4501 1 81.19 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGAT:1 - chr2R 23305434 3' - I-element 50 1 72.28 GGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAAATATAAATACAAACTTTGGACATTTACCTACATAATAAATATTAAAAAATAGCGCATAAAGTCAAAC:1 - chrX 7387529 3' + mariner2 764 1 68.00 GCCACGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAGGGGGATGGCGGGGATTCCACCGCGTTTGAGCCAGG:1 + chr3L 6863760 3' + R1A1-element 5316 1 62.00 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGAAAATTGTTGTACACAGTCAAGATATTGATTTTTGCGAGCCGAGAGGAAAACGCGACCC:1 + chr3R 18906680 3' + P-element 2875 1 67.33 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTC:1 - chr3R 30272801 3' + P-element 2859 1 51.49 CTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAGGTATTATTTGGAAGTGTAAGTCTAGTGTGAGCACC:1 + chr2L 514914 3' + 3S18 304 2 62.77 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATG:1 - chr2L 13250362 3' - pogo 28 1 59.41 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTCTCCATCGCCTGTCAGACACACGAAAAACACAGAACAAACACACACACACACAAACACACACACACACACA:1 + chrX 7978947 3' - accord 7029 2 39.36 CACCTACATTTCCCGAGACAACAAAACTCCGTTCAACCGACTTCAACTGTGTATTTCCAATGTCACCATCCATATCTCGGAACCATCGGTATTGGGGTACA:1 + chr2L 3919139 3' + gypsy7 265 1 54.46 CCTGCTCACCGATGAAATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGAGAGCTCAATGTGATGTTGCAGGAGGCCAAGCTGGATGAG:1 + chr3L 14996960 3' + Rt1a 4897 1 65.35 AAACTCACTTTTTAGAAAATATTGATGATCTTTGGACTTTACGTTGGGCAAAACCAGGCACTCCTATTCTAGCAACAATACCTAAACACAGTAAAAG:1 + chr2R 1735241 3' - HB 265 1 70.10 TTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGAGCCGCGGATAGAAATTGCTTTGATTTCATGGATGATTGAAGTGCTCGGCTCTGGAATATGTTTGCAATT:1 - chr3R 5977721 3' - copia 8 2 71.29 TATGTGCATACATATGAAAAAGAATTCTTATGTGCTACGTGGCTATGTGCCTGCCAGTGGCTGGGCACGTTGTGAAAAACTGTTCTAAATGTAGAGG:1 - chr3R 2119742 3' - Tom1 176 1 67.01 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGTGCTACACAACTCGCGTTATCCTGGCGGTTGCAACA:1 - chr3R 29660242 3' + mdg1 381 2 66.34 AATATAAATTATAAATTACAACAAGATTTATTCGATTTTATTCAGAAAGCTGCTGCGTCAGTCTTTCACGTGCTCATCTCATGTTTAAATCCATATTCAAA:1 + chrX 2884924 3' + copia 254 1 67.33 GTATGTTTCATTTTTAATTTTATTTTTAACTTAATGCGCTCATTAGCTTTGCTG:1 + chr3R 11448703 3' - hobo 492 1 92.59 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCTGCAACCCTTAGCGAGTGCTC:1 - chr2R 20838576 3' - 1360 5 2 74.26 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGATGGACAACAAAG:1 - chr3R 25440159 3' + pogo 2065 1 66.34 ATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCT:1 + chr2R 8378650 3' - pogo 46 1 78.35 AGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTATTCTTTGGTCGCAAAT:1 + chr3R 4543264 3' - 3S18 22 2 57.43 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCA:1 - chr2L 1129089 3' - HMS-Beagle 50 2 76.24 TCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTTTTGGCCAAAAGTTGCCAA:1 + chr2L 16082699 3' - Stalker4 9 4 70.30 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTATACTCAAAAAAATTTCTTTGAATTACAGAATTCAGCTGACCTAAGAAATATTCCAACTTGCATGC:1 - chr3L 5015785 3' + I-element 5345 1 71.29 AAATATAGAAAAATGTATTGACTTTTATTTCATAATAATGGTTTTTGCATCTTGTGTCCTCACGCCAATCAACCCAAGACAATGTGTGCAT:1 + chr2L 13067510 3' + transib4 2283 1 72.53 GTGTGGCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGT:1 - chr2R 5485066 3' - 1360 31 1 60.40 GTGTAGTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCACCGCGATGTTGGCACACTGAAAGAAAATGGCCAGGCATTGCGATCGAATC:1 - chrX 6458163 3' - blood 7036 2 56.44 ACTGAATTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAGCGTGA:1 + chr2L 13837932 3' - 297 35 2 64.00 TGCAGGTGGAAAGTTGATTTACCAAAAAAAAATAATTAAATGTTTTATTTTTTTAAGTCAGATTGCATGAATAATTTAGCATCCGTTTTAGTTTAACATAA:1 - chr4 252189 3' + Tc1 30 1 72.28 ATTATTTTATTTATTTTATTTATTATTTTTACAACTCTCATACCAAATAAATATGTTAAATGAAATGATATAAAATGGTTTACTTCCCCATTTTGTGCAG:1 + chr3L 16258160 3' - HeT-A 5 1 69.00 TTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTGAACGCTTTAAGAGAGGCAGATAGGATAG:1 + chr3R 20845145 3' + 17.6 7414 2 74.26 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATG:1 + chr3L 21384037 3' + roo 9036 1 56.44 TATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTGCATGTGTAAGTAGCCGGCCATATTTGTATATGCACAGGGGAAAATTGTTCAG:1 + chr3L 7175160 3' + roo 105 2 60.00 GAGCCTCGCTCTTGGGTTCTTAAGATTAGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTCCGTTTTCATATGCGAGGCCACCAACTCCTTTTTTTCCTTG:1 + chr3L 1243924 3' - 297 195 2 59.41 TAGGGACTTATTGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTG:1 + chr2L 21007066 3' - Idefix 1 2 63.93 CTTAGGGATTGGCTGTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGCTTGTGGGGAGCACTTGGCAATGTAATCCTTCAGCCGCTCGGCTCCTC:1 + chr3L 2618393 3' - G2 2893 1 57.30 GCAACCAAATATTAAGATTCTGAGTAAAATGATGAAAGTCAAGAGTTAATAGCACAATAATTGCTATAGATGATTATATAGTTATATATATATATATAGG:1 + chrX 15218224 3' + Tc1 1340 1 62.00 CACACACACACACACATATTCACACATCCTGTCTAGCCTGAACGGATTGGTAGGCGGGGGAGGACAGGACAGGCAGAGGG:1 + chr3R 22838916 3' + accord 186 2 76.25 ATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATATGTATATGTATGTATACGTTCATGTAAATGGCTGTAA:1 + chr3R 14164165 3' + Quasimodo 7337 2 66.34 TTTTGGAGGGAAACATTAACGTAAGGGGAGTACGTCGAGTGTACTTGGGTAGGGGTTACGTTAACGTTTAACCCCACGCAACCCGGCAGGCGCCCATGCGG:2 - chr3R 13545728 3' - G2 3004 1 55.45 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCGTGGAGCTCTCTTGTCCGCTCCGCTC:1 - chr2L 13060241 3' - P-element 7 2 72.28 GGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGTCGCTTTGGTTGCCAAATCTTTTACCCACCACACACCCCACCAACCCTCACATTGTG:1 + chr2L 2911227 3' - hobo 2730 1 61.39 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTTAAGAGCAC:1 - chr2R 5485047 3' - 1360 12 1 67.33 AAACATTAACGTAAGGGGAGTACATCGAGTGTACTTGGGTAGTGACATTCTTGTTTCTGCTTTAAAGCCCTGGAGAAATTACGAAGTTAAAGTTAAACAGG:1 - chr3R 10734427 3' - G2 2994 1 49.50 GGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTC:1 - chr2R 10863895 3' - mdg3 31 2 57.43 GTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCAC:1 + chr2L 8959995 3' + Ivk 5360 1 56.44 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGTGCCGATTAAATCGTATCGAAATTGGAATGGGTTGCGTATGGGAGGGA:1 - chr3L 958726 3' + P-element 2877 2 67.33 CTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGAGCTGTTGTACTTGTACCGCTGTTATTGTTTGTTTTCCACCATTTCCCCCCCTTCGATTTCCCACATTTTCCAC:1 - chrX 3523207 3' + BS 5051 1 81.82 GGTAGACTAAACATCCGTCCCCTAATTTAAACAATTCCTTGATTAAAGTTACCTGCCCTAAATGGATTTCCCATCATCGGGAGAAACCAAATTCAGGCCAC:1 + chr3L 27413367 3' + Idefix 183 1 65.35 TTCACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTG:1 - chr3L 19951202 3' - Ivk 34 1 58.42 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGGGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACA:1 - chrX 5018649 3' - opus 162 4 79.21 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACTTATGATTTAATTTGCCTTTTGCTTACAGTATTTAATTATAATTAATT:1 - chr3R 9369927 3' - roo 8692 2 58.42 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACACTGCTACTAATCAAA:1 - chr3R 31884236 3' + hobo 2914 1 79.17 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGC:2 - chr2R 19192551 3' + roo 9020 2 79.21 TCTTGATCAGGTTCAATAGCCGAATCGAACTAGCCATGCCTATATGAACGCCTCGACCCAAAAATGTCCCGCCCACATTTGTAAAAACTTACATAGGCTG:1 - chr2R 5697249 3' + INE-1 88 1 60.00 ACACANACACACACACATACTCTGACAGGCAGACGGGTGGTCCACATACAAATACAAAAATGCGCTTCATTTAATTTTACGACAGATACATTTATGCTTAT:1 - chr2R 23654613 3' + accord 185 2 71.29 AGCGATCTTGCATTGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCATTTCGTATCTCGTCGGTCTGAGGCCTCGTAATACTTGTCTCGACCCCTTGTCTGGATGTGTG:1 - chr2L 14169790 3' - F-element 132 1 70.30 GAAGATATTACAAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGAAGCTGGGGTTAAGTCAATGAAATACCATTTAAAGC:1 + chr3R 19447597 3' + roo 356 2 65.35 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGAA:2 + chr3L 21384051 3' + roo 9050 2 57.43 TTTTATATATACATATATATTATATGTTATACTAGCCTTTAATTGTATTAACTATCTTTAGCTTTTAGTGGGCTCCGCTGCTCATCACTG:1 + chr2R 16732075 3' - Dm88 4378 2 66.67 GTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTTCGATTTTCCTCTATTTTTTTCACTTTTGTTTAAACGGTGTGTGTGTATTTTGTG:1 + chrX 15272374 3' + P-element 74 1 62.38 TGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAAATTGTCGTGTGCGTGGATTTAGTCTTTAAAGTTTGAAGACGAAGGCAAGATTTAAAATCTACTCTACTGTCAGAA:1 + chrX 10246241 3' + flea 464 1 58.42 GCAGAAAGTATGAGTATGTATATGGAATTGTATATAGTTACTAACGGAAAAATATCCCTGTTAACGTTTTGAATAGCCATAATCTAAATTTCATGATCATA:1 + chr2L 5460659 3' - ZAM 8172 2 72.28 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAA:1 + chr3R 14049400 3' + transib2 2776 1 73.27 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATGGTGGCTGTCCGCACGGCTGGCCGGCGATTATAAAT:1 + chr2R 19857425 3' - 297 5 2 63.37 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGAAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGCAGCATTTCCATA:1 + chrX 21668153 3' - Stalker2 7261 2 66.34 GCTCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTGCGACGAGCCGGGAACGGTGAGGTAGAATTCTTCGCCCGCTTCCTTTTCCGACGGCGTTCGTTCTGGTCGA:1 + chr3L 3075075 3' - Rt1b 4900 1 70.30 TCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGTTGGTTGGTCAGTCATTTTAACTTTGTTTAGATGCGCTAACGTCCGATATTATTGCCTTCCAAGTAGTT:1 + chr3R 25331178 3' + Doc 396 1 74.26 GAATCTAAACTTTCTAGCTTCTATTGATAAGAGTTTATAGGGCTGAATGTAAATAGTAATCCTGTCCGGAAACACCTAAACATTATTTAGTCGAAAATAT:1 + chr3L 18576729 3' - INE-1 165 1 88.00 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTTACGTTTATTTAGATTTCACTTAGTT:1 - chr3R 2301830 3' + pogo 2051 1 79.21 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCGTGAGCCAACAGGAGGTTAT:1 + chr2L 7548066 3' + blood 345 2 59.41 GTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGCAATTGTTGAGTGCTTGTGTTGCACGTTGTGCCGACGTTTTTCGTGTGACAGCCGCGCGTTTTGCC:1 - chr3R 21434064 3' + 1360 418 1 59.41 ATTATTAATTAATATTATTATTATTAAAATTACTATTGATATTTCAGTATAGATATCAAAATTAATGGAAAACATACATATATATTAATTAAGATAGTATA:1 + chr3R 14750634 3' + Tc3 272 1 60.40 AATATNGCATAGGCACATACTACAGTAGCATTGCGTACCAAAGCTTTCATCAATTAAAACCCATTCAAAGGATAAGAAATGTAAGCC:1 - chr2R 10912078 3' - 412 3 2 71.26 CAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCAACTTTGCCAGCGAGAAGCTTCGTGAGCCAACAGGAGGTTATAAATGGGTATTACTGACAGAAACGC:1 + chr2L 7548091 3' + blood 7382 2 71.29 GGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAAATGAGAAAAGGGGAAAGCTCCTTGCGAAGGCAGTGGACAACAGAACCGTTTGATGGCATCTA:1 - chr3R 8509453 3' - 297 6920 2 59.41 ATTGTATTATTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATAAGTAAAATAACATACTCAACAAAATCGAAGTCTGCATTGGGATTCCCCAAAAGTTGTGCTA:1 + chr2L 799088 3' - Stalker4 16 4 60.40 CAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACAATAGCTCGCTGCAGTGCAGCAGTGCAATCCAGTCAGTCACACGCACCAGGCGGTGCGGCCTTCTCCTGCCTGCC:1 - chr3R 9170193 3' + F-element 4425 1 78.22 GTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTATATTTAATATTTTTAATTTGTTTTTTGATATTCCTGTAACCTTACAATATGGATG:1 + chr3L 27396577 3' + S-element 1524 1 74.26 AAAATTTAAATTAAAAAAAAAAATTGTAACTTAACTT:1 - chr3R 25826332 3' + TART-C 11096 1 89.19 GGATTCAGCTGTGGAGCACTGCCAGCATCTCAAACCGTTTTCTAATGCACTACCAAGTACCTGTTCTTTGACAAGAAAAGCGCTTTTGGCCCAATCCAAAG:1 - chr2L 2356120 3' + G-element 3921 1 72.28 TAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGCCACACGACTCCCGATCTTGCCCCTACTTGTTGTGCACCCTCCTCGAAGTCCTCGAGTGCTCAC:1 + chr3L 4965883 3' + 1360 10 2 60.40 CGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTCTACACGTTTACATGCCTCAGACATGCACTGCAGGGCGGGATTGTGCACTGCGCGAAAA:1 - chr2L 3598728 3' - 17.6 7368 2 67.33 ATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAACTAATTGCAAGCTGCAATGGTTACAAGCTATAAATCAAAAGA:1 - chr3R 18937428 3' + F-element 4388 1 63.37 ATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTGTTAGTGAAC:1 + chrX 21667923 3' + flea 217 2 69.31 GCACTGGTAAATTACAACTACCTTAACACTAACAGTAGAAATACCGCGGGACCGCGGAGTGGGGAGCAACTGCAGTAGTCTACGCCGCCATCGACAACACC:1 + chr2R 24884918 3' - Max-element 8420 1 61.39 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAACGC:1 + chr2L 13060336 3' + P-element 2859 1 51.49 TACATGCATGTACATACTATATGTACATATGTATGTATATGCATGTATCTTCTCGCCCCCACTGCTTGGATATGCAGCGCTATTTGCCTGGAAGCTAATCT:1 + chrX 19711909 3' - INE-1 63 1 73.27 CAGATTTCCACCGCCTGGAGACCACCGGACGCATCCCAAAGGAGGAACACATTAATTTATATATATTGATGGCGGCTTTATGGCACCCATGAAGGACAAT:1 + chr3L 11470046 3' + gtwin 7355 2 54.00 GCTCGNAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGGATGGGGA:1 + chrX 15195315 3' + Transpac 5217 2 68.32 TCGGCATTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAAAAAGA:1 - chr3R 9254919 3' - F-element 224 1 53.47 TAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTCTAACAAGTAATCCGCTTGATGAAGTAA:1 + chr2R 23945291 3' - BS 5040 1 72.00 AACTACAAAATTATGATAAATTAATAAAAAATATAGCCTCCTGTTTGCTCCTCCTTTTGCCTCCACCGCTTCCTCTTCTTCTTCTCACCTGCCAAGGCA:1 + chrX 17077247 3' - Tc1-2 1377 1 64.65 TATTTNATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGTGCTTTTAGGCGTTAAATGCTATAAATTACTT:1 - chrX 868686 3' - jockey 4919 1 68.32 CTATCTATCGATATCCCAGAAAAATTTTCCGAATTTTATTCCCCAATATCATTTTTGCGTTTGCAATCACACTAGCTGAGTAACGGGAATCTGATA:1 + chr2L 16936423 3' + INE-1 498 1 77.08 ACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGC:2 - chr2L 20118694 3' - Max-element 36 2 60.40 CTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAAAAAGAAAACATTTTAGTTTTATGTTGTTGA:1 - chr3R 9254894 3' - F-element 197 1 63.64 GATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAACACATCGAATG:1 - chr3L 24131078 3' + HMS-Beagle2 7176 2 58.42 GTTTTNATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTTCGTTTGCATCCCTCGACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTCTGTTCCTCCTCAATTCCACTATT:1 - chr3L 2749400 3' - I-element 374 1 77.23 TGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTAGAGAGCACTGAAGTCGGCAATAAAAACT:1 + chr3R 15943318 3' - jockey 4687 1 71.29 TTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAGAAGACTCACACAGTTCGCAGGGCAGTATTTCGGGTGATGGTAAGATATTTCTATAGAT:1 + chr4 1095830 3' - flea 391 1 63.37 ACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATAAATTCTAGACTAAAAAAGTAAGGAGCTAT:1 - chr2R 12213908 3' - Transpac 19 2 61.39 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCAAAACGACAAAATCGCAGG:1 - chr2L 20939504 3' - hopper 14 1 65.35 GGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCTTGAAATATTTTGAAAAATGTTTTAATGTAAATAAAGTTTACGTATACACTGAAGAGAACTGCCCGCAGTAGG:1 + chr2L 17889425 3' - accord 2 2 77.23 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTG:1 - 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Transpac 4 2 75.25 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATATATAGTATTTATTTATGGTTAATATCCCTTAA:1 - chr3L 22231589 3' + 297 359 2 73.27 CGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAG:1 + chr3R 27080792 3' - HMS-Beagle 33 2 60.40 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTC:2 - chr3L 9692672 3' + P-element 2857 1 49.50 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGCCCCCATTGCAATTAAACAGGCACCACCCACTTCCACT:1 + chrX 12538535 3' - roo 18 2 61.39 TATCTATCGATATCCCAGAAAAATGAATAATTTCACATTCGCATTCACATCGACATTATTATGACCGAGAGCAACTCATAATGGTTTATATATCTCGGCGT:1 - chr3R 10986640 3' + INE-1 499 1 69.31 TCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACAGACAAAGGCTGGCCAAGAAAAATATGTGCAAAGGAAGTCTTGCCCATTTCAACAGAATTAAGTTGCTAC:1 - chr3R 18551103 3' - Max-element 8244 2 71.29 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCACATAATGTAGAATGTAT:1 + chrX 1235455 3' + P-element 2831 1 23.76 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCAGAGTTACTGTTGCTTGCCATT:1 - chr3R 19010022 3' - jockey 4718 1 71.29 TAAAANCTTTAGACATGTACCTACATTAAATAATATTTCATACGCCAATTTAAAAAACAAAATACTTGAGTACATAACCACTAACCACTTTAAGAATTTG:1 - chr3R 2646740 3' + mariner2 804 1 70.00 AGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTGTATTTATCCACTATCAGTATACATGCATGGAA:1 - chr2R 7540569 3' + Stalker4 365 2 70.30 TTTCGAACTTTTTCGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGCTCCGTGATGTTGGGCAAATAGGCTGGGGTCGAACTC:1 - chr2R 10716352 3' - FB 128 1 57.50 CCGCTGACGACCACTGATTCGCTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCTGACGCCCACTGCAGTCATTTACAATACGTCTAAAA:1 + chr2R 15654969 3' + HMS-Beagle2 7038 2 68.29 ACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTTAATAGGTGCTTAAATGAAATACATCAAATGAAATGAAACAAATGGAACTCCGTCATGCGAACCTTCTATTGAAAA:1 - chr3L 18249438 3' + Transpac 5098 2 79.21 TATAATAAATATTATTAATATTAAATTCATGCTTACCTTTTCAATTTCTAATATTTCATTATTAATTCAGACATTCACAAACATTAATTTCCTGACAAAAA:2 - chr2L 15807009 3' - mdg1 49 2 58.42 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTTTAAGTTGGC:1 + chr3L 17699389 3' - 412 31 2 53.47 AAATACCATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCTGCTCCGCCTCGTCCAGGCCCAGGCGGAGCAGCTCGTCCGAA:1 - 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297 350 2 73.27 ATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTAGGTATTTCTTAGTTTCTCTGGTTT:1 - chr2R 15005054 3' + BS 5045 1 80.20 CGTTGTACTTACAGAAGTTAAGTTAATCCTTTTTCGAGTGACTCGAAGTTAGTCAAGAGCGTGTTTTTTGTGTCATTTGCGTTTGAAATAGTTGGATAGCA:1 + chr3L 8016134 3' - gypsy7 385 1 64.36 AGCGCCTTCTTTCTAGGCGCTTTGGTCAGCTTGGTGGGTCGCGGGGGGGCTTGCCAGTCCATGTTGCTGATGTGCCATCGTGTTATAAAAAAAAAATACAC:1 + chr3L 10444649 3' - G-element 362 1 63.37 GTTCTTATACAAGAAGATTCAAGAAATAAAACCAACTCAAGCGAACCATCGCTACGAAAAAATGTACAAATCTAGCAGGGAGTGTAGAGAAAACAAATATT:1 - chr2L 14376782 3' + F-element 4648 1 76.24 CAAATTGGCTTCAGGATGGTCTTGTACAGGAGGAGTTTAAGGTTTTCCCTAAGTTTGGACCTTTTCCAAAATGTTCTATTTACTAGAACATATCCAGTTTG:1 - chrX 21284214 3' - G-element 3891 1 64.36 GAAAAAAAAAAATGAAAAAAAACATATTTCTCATTTCCATTGGTGGTTGGCATTGTAAAGCTGTTGTCGCATTTAAATGATGTTGATTTTGGCCTGTCCGC:1 - chr2R 10977809 3' + Doc2-element 250 5 93.07 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTTGTGGTTGCTTC:1 - chr3L 12452140 3' - 412 29 2 53.47 ATTATTATTATTATTATTGTGATTTCGGCCACCAATTGGAAAACTGAAAGTGCGGGAGAGGATGGAGCAGCAGGAGTGTAATGGATATTTATGCGCCGCAT:1 + chr2R 12499242 3' - mdg1 7059 4 62.38 ATGTCAGCATTCGGCCGGAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTTTCGCTGGCGGACTGCGCGTTCCATTGCTCTTGACGTTGTCGTCTTCA:1 - chr3R 13817660 3' - Tirant 104 2 52.48 CGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTTTTTTCTGTACCAGCCTCCCTCCCAGCAGGTGAAACGCTGCTGC:1 + chr3R 12717310 3' - Transpac 172 2 56.00 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGC:1 - chr3R 31644154 3' + roo 9024 2 75.00 CACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACACTGCTATTTCACAGTTTGTTAGCTGGTTAAAAAGTCAAAGG:1 + chr2L 18918539 3' + mdg1 305 2 58.42 TTTTTNTATTTTTTTGGTAAGTTGAGAGGTTGTGTTTGTCATCATCACGCTCGCTAACAAAGTAAATTGGAGTAGAAACCAAGTTAGTGGGTTGCCCACTG:1 + chr3L 14426078 3' + Tc1 1401 1 74.26 GAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAAAATAAAATAGGCGGAAAGGAAATTTGAAACACATTGGAAAATTGCTAAGCCA:1 - 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chrX 7862356 3' + Porto1 410 1 76.24 GATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGT:1 + chr3R 11165691 3' + Tabor 437 2 71.29 ATAGATATCAAATATCATTTTACCAGAGAACAAATTGAAAACAAACTAATTTGTGTTAAGTTGTGTCATATATCATTTGGCTTTCAAAGCGAACGGTCG:1 + chr2R 3341943 3' + Dm88 4130 1 61.62 TATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGACACGCGGCTCAAGACTTTTTATTTCGCGTTTACTCTTCCCAATAAAAATCAACTTGGGTCT:1 - chr2L 18380950 3' + 1731 4471 2 76.24 CCCTACCTGTAAAATCCATTCGGACTCCACCCTAATACAACCACTGCTTTACATACCCTTTGAGCAGCAACCTTCAGCCGCCACAGTGGCCACGTACTATA:1 - chr2L 2033906 3' - Circe 7184 1 61.39 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGAACTTGTTAAAAATCAAGTGGCATT:1 + chrX 14531541 3' - 412 51 2 80.20 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTTCTAGTGCCAGTGTTAGGCAGCATTTGAA:1 - chr3L 11070475 3' - P-element 9 2 70.30 CGATAAGCCTAGATATATAAGATATATAGCCAAATAGCCATAATTCGTGTGCTGTCTCTATTAACTATTGCCTCTTTTTTTTTTTGTAAAAGTTTAATTAA:1 + chr2L 8256049 3' + 412 7309 2 76.24 TTTAATAATTAAATTAAAATTTTTTGTAGAAATTGGTCGGTCTTAACTTCCAAAGTTTTTATAATTAATCTTAGTCTGCACGCGTTTGGTTTATGCTCGAA:1 - chr3L 4412051 3' + 1360 3044 1 51.49 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATAT:1 + chr3R 31644193 3' - roo 45 2 74.26 GATTANAAATAGCCAAATCTATGTACATACCATCACAAAATAAATCTGCGATAATCTCATTGCCTGGCAAGTGTATCCTTGTGAAGCGCCTAAGAGTAGGC:1 + chrX 12122758 3' + 1360 335 1 63.37 GAGCAAGACGATCGCCGGCTCTCATTGCAACGAAACAACGCGTACTTCTCTTACGTCTCCGCGACTTCCACATGGAGGGACTGACTGACTCACCGGCTTAC:1 + chr3R 21450941 3' + Doc2-element 318 1 67.33 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTGTTTGTTTTCTGTAATTTCGAATTAGCGAAATCATATTTAATATTTGCATATTTAA:1 - chrX 8352168 3' + blood 7369 2 58.42 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAG:1 - chr3L 7792182 3' - 412 7089 2 57.43 CCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTAAAGGCCCTCGTTGAGCTTTATTAAATAACCGGCGGTCTGGTTGAAGTCAGCAGCCGGAATGCACTTCTTTTCTA:1 + chr3R 21576115 3' - R1A1-element 273 1 78.22 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCTGTTTGTTTTCTGTAATTTCGAATTAGCGAAATCATATTTAATAT:1 - 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chr3L 21099666 3' - gypsy6 210 2 72.28 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGTTTTATGCAATCAATTTTGCAATGACCGAGATTAG:1 + chr3L 22790279 3' + blood 7335 1 69.31 CGCATCCTTCTGCCTGTTGCATACATAACAAACCTAACTAACACCTTTAAGCAAATTGACGATTGGGGCGACCACTCTGGCTCAGTCTTATCAAAAGACAA:1 - chr2R 5529291 3' - INE-1 30 1 27.72 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTCACCTCC:1 - chr3R 10457260 3' + roo 9052 2 59.41 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGCCCGTTTATATCT:1 - chr3R 9981468 3' - jockey 4760 1 75.51 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAAAGCACACAA:1 + chr2L 11551397 3' - Max-element 8275 2 65.35 TCTTGATCAGGATCAATAGCGGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATC:1 + chr2L 12286069 3' + INE-1 88 1 67.33 CTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAAAA:1 + chr2L 12074549 3' + Juan 4177 1 60.40 AATTAATAATAATTAATAATAATGACAATAGTAAATGATGGTTAATGCAAATGTTATAGATTATGAATTGAATTTACAGCGAAATCGCCAGGATTTCGATT:1 + chrX 9174282 3' + flea 4999 2 52.48 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCGCTTTTCAGGAATATTAAAAAGCTAC:1 - chr2L 13566949 3' - FB 53 1 74.26 GGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTTCTTATGTTCGAACT:1 + chr3L 20895032 3' + invader3 185 2 51.55 ATAAAAGCTAGAAGGTTAATATTTAGCATACATATTCTAGAGAGAAAGACGCAAGTTGGTTGACCCATGATGCAGGTACTAGCCATAACTCATGCGTACG:1 + chr2R 6608394 3' + INE-1 163 1 74.00 ATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCC:1 - chr3R 24729574 3' + Juan 4199 1 52.48 ATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATATTTATATTTATGGGACACAGAAAACATACAACATCCAAATCCTTATCAAATCGTAATCCAC:1 - chr2R 21140609 3' + Stalker4 7006 4 56.44 ATCTTGCATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGGATTTTTTATTTATTTGTTTATTATTTTGCAGATTTTGGCGCAAATTTTGGGAATCGTTGGGAATG:1 + chr3R 26056534 3' - F-element 128 1 61.39 GTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTCTTGATCATCATCCAGGCAGACAGTTGCGTGTTTTCCAGATTTCGGTCTCGTGTTGAAGTATATGGAAAGTGG:1 + chr3R 31490430 3' - Tirant 397 2 78.22 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAAAGGCTCAGTT:1 - chr3R 11165624 3' - Tabor 6857 2 65.35 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGGAAAGAAACTTAAAATGCCTTGAGTTCCTTTAAACCGA:1 - chr3L 13364515 3' + hopper 1402 1 60.40 AATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGTCAGTCGGAAAATTTGCATTGCAATGTTTAAATATATAATTTAACTTTTTCCCA:1 + chr3L 12866637 3' + R2-element 3425 1 56.44 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTACATATAAATTTATAAATTTCATAAATTT:1 - chrX 1454203 3' - roo 49 2 79.21 AGTGAGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATGTAATTCGGCAACTCGAAAATATTTATTTTTTTGTTTCATTATC:1 + chr2L 12074410 3' - Quasimodo 28 2 56.44 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGAATTAA:1 - chr3L 21735402 3' - Doc 48 1 68.32 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACCTATATGAGATGCC:1 + chr3R 26469509 3' - hobo 28 1 55.45 AATATCAACCACAAAGAGAAAATTTTGTTAGTTAACTTAAAAACGGCTGCAAAACCCCAAGTTGGCTGCCCAGGACCAACTTTAGTGAATACGATCTTGTA:1 - 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chr2R 5072171 3' + gypsy8 28 2 59.41 AACCANTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATAGATTATATACAAACCGAAAAGATCCCAGCTTGCGTCATGAACACAGGGAT:1 + chr2R 5485142 3' + 1360 3365 1 53.47 CTCCTAAGACCATGGATACGGTTGCAGGCTACCAATAAACGCAATAATGCGAAAGTGTGATTCCCAGAATATTATGATTAAACAGGGCCAAAGTGAAGTGA:1 - chr2L 552104 3' - GATE 8058 1 80.20 CCTCGNACTAAAGTCAAAAGAAGACTTAAGCGGCACCCTAATGACCTCCCCGACCGGGCTTTGACATACTACTTCTACAACATATACTACTATTGTCATAT:1 + chr2R 5924408 3' + jockey 4727 1 41.58 ACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTGGCGACGAGGATCAACCCAGAGAAATATAGATATTCAAATCAATTACAATTCCA:1 - chr2L 2426702 3' + Transpac 5203 2 68.32 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACTTGAATCACTAAAAAAAATATTATGTGTGATTGA:1 + chr3R 19076238 3' - roo 8670 2 66.34 TAAAAATTAAAATAATAATAAATTTTTAATTATGGTTTTTTAAGTACATTTATTAATGTTCAATGTAGTGTATTACTCTGATCGGGTTCAATTTATATTTG:1 + chr3L 14604186 3' + flea 231 2 86.14 TGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCCATTGCCAGCAGACCTTGTTGGTAA:2 + chr2L 7459608 3' + BS 5047 1 77.23 AAAATAGATTAGAAATAGCCAAAACTATGTACATAAGTATATATAGGGTTGTGTATATATAGGCTGGCAATTCAGTGATTATAAACTTTGGTTCTGATCAC:1 + chr2R 22248449 3' + 1360 329 1 74.26 CCTTTNACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACA:1 + chr2L 18694137 3' + P-element 2828 1 20.79 TAACCGGGCGACGGCTACGGCCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGCGTGCAAGTTAACAACTAAGAGCACACACTATTAAGTGT:1 + chrX 8229581 3' + gypsy6 7432 2 62.38 AATGATGTAAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAAAAACCA:1 + chrX 16798250 3' + diver 210 1 59.02 TGTGAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTTTCATAGGGTATATTAAGAGACAACAATTGGTATTTCAGCCTATTCAGCATTATACTCTG:1 + chrX 8031440 3' - roo 17 2 62.38 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATACCAATAT:1 - chr2R 23495442 3' + 412 7509 2 59.41 CACAACTTTATTCTTTGGATCTCAGCTTAAGACTAAAAATATTATACATCATTTTATATGATGTTTCCATAAAAATAATCCTCAGTGACTTGAAA:1 + chr2R 18552170 3' - 297 6875 2 55.79 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTTCAGGCTGCTCCAATTTGAGCTGAGTTTCCGACTCGTGAAGATTAAAATTGTTTTTCTCTT:1 - chr3R 25918875 3' - roo 8674 2 67.01 CCTTACTTTACTTTACTTTATTGATATAAAAGAATTAAAAAAAAAAATTGACTGTAATTATACAAAAGTCGTATAGGCTCTGAGAGCACTGCCAAAGGGAT:1 - chrX 17017555 3' - TART-A 13109 2 73.27 CGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGTCCAAATGACCGTGGGTGTCCCGCCGGA:1 - chr3R 8512154 3' + R1A1-element 5237 1 72.28 TGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTCCCATTGCGTTGGAGTGTTTATCGATGGTTTAATTATAAGTGCGGGAGTTAGTCCGACATAAGTTATCCCC:1 + chrX 1006028 3' - F-element 4443 1 73.27 TACACACACACACACATACACACAAGCTAGTCGCCTTCTATAAAATCAACTGTTTGCCTGTCATCCA:1 - chr2R 16059082 3' + Quasimodo 38 2 56.72 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAAGACTCTGGCTGGCAGATGAAAGTGAAA:1 + chr2R 21111193 3' - jockey 57 1 73.27 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCGGGCTATGTGTTTTAATGCATGGTGAGGTCTGTCGGATTTGTAAATTTGTTTCTTGATTCTGCAG:1 + chr2R 1089803 3' - 1360 12 1 56.44 AAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGT:1 + chr3L 14240882 3' + Tirant 8460 2 71.29 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTTATGTCCTCCGCCAA:1 + chr3R 11496902 3' - Doc 23 1 62.38 ACGATAACTTATAGGGCAATAACTTACATAATGGGTCCCGGGTAATCTTACGTTGGAAGTAGGAAAAATAAATATTCCAAGGAGCTAGTCTGCCAAGACAA:1 - chr2R 2552083 3' - HMS-Beagle2 6886 2 76.24 ACCCTCAAAGTGATAGAAGAGCGCGAATTCCACAACAATCTCGCATCCTGGAGGACAACGACATCTCTCGTGTGTGAGTGCAAGTGCTCTTGTGTGTATTT:1 - chr3L 7077282 3' + Porto1 329 1 79.21 CGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCACCACCTATAACCCACAGAACACGACTGAAAACCACAGAAATCCACTGAATCCACAGCTACCACAAGTTC:1 + chr3R 30574616 3' + G-element 4165 1 57.43 TGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATTGTATATAGGTGCCTAAAACCG:1 - chr2R 9454264 3' + opus 445 2 81.19 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGA:2 + chr3R 7101073 3' - pogo 22 1 57.43 CCGGGAACGCTGAGGAAGAATTCTTCACCCGCCGTCACCCAGGCCAAATGAATGGGGGGCAGAGACAGTTCCAGTCTCAGTCCCAGTCCCAGTCCCA:1 + chr3L 6340573 3' - Rt1b 4862 1 63.92 TGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTTGATTTCCAGT:2 + chr3L 25350823 3' + baggins 5416 1 41.58 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGGGCAAAATTAA:1 + chr2L 2920950 3' + hobo 2937 1 69.57 CACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATATCAGTGCTCTCGATAGTTGTAGTATTCAGCAGA:1 + chr2R 9454308 3' - opus 150 4 68.32 TTTTATACAATATTAAAATTGAAAACGAACGGCGGTATGTAAATATTAATGCCAAAGTAACGTATAGACCATCTGTGGAATTCGACTGCACTAATTATAAA:1 - chr3L 3981969 3' - hopper2 31 1 80.20 TAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGAGTGAAGCGGAGTGGAGTGTCAACGCATCGCCTCAACGCTTGGCTGGATTTGGTGCTGCTCCTGG:1 - chr3R 23906372 3' - ZAM 34 2 68.32 GACGCNTAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAATCAAAACAAAAACAAACAGAACTAGAAAAACCAAAAACTGAGAAAGAATTTTTTAACGGAATTAAG:1 - chr2R 4269967 3' + Porto1 223 1 62.38 ATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATAAGCAATTTATTGTTATTGCTTTCAACACCCAGCCACAACATTCCCAT:1 - chr2L 8620266 3' - Juan 4060 1 52.48 TTTTANTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTCCAGAATATATTTCAACTGATGGTTTTGGCAGATCCAGTGAGTTTTCGTG:1 - chr3R 30278669 3' - F-element 89 1 57.43 CACTAGCTGAGAAACGGGTATCTGATAGTCAGGGAACACGACATAATGGGTTTCCTCTGGTAATCAATTAACTATTAAAATTTGTATATTTACTACAAAAT:1 + chr2R 6948256 3' + INE-1 541 1 66.34 GCGCGTCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGGCGACATTTAATTGCAAACTGGTTGTCCAGTTAACCACCTGCGGGG:1 + chr3L 4345305 3' + mdg3 164 2 52.48 TATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAGTGACATATTCACATACATATCTTACATTTCCATTTCCGCGACCAAAACTGCCAATGAAATATATAAGCCC:1 - chr2L 17675258 3' - Stalker 261 4 59.41 ACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACATATGTACCTACTACTACTATATATTTAACTTTCAGGCAG:1 + chr2R 15005091 3' - BS 5033 1 65.35 CCACCCATACAAATTTTAGGCGCTGGTCAAAAAACCGACTGCGATCAGAAATTCAAGTTCCTGTGTGGCGATTACTTGATGGGACCAAATGTAACGGCACT:1 - chrX 4119744 3' + hobo 2677 1 81.19 TAACGGGTATCTGTTAGTCGAGGAACTCTTCTGCGCCGTGATCTGTTCTTATATCTAGAGATGTATTGTATTAAAAGCACCACATTATTGCATAGTGTAAA:1 - chr2L 14381362 3' + INE-1 552 1 53.47 TATTATAATTTTAAAATTTTAATTTTAATTTTAAATTTTTTTAATTTTAAAGCTTTTTAAATTCGTTTGTTTAATATTTTGGATTTTATTTGGGGAACACC:1 + chr3L 8765042 3' - 1360 3057 1 70.30 TTGCATGCACATAAACTGCACTCTGCACATATTCTCTCGTTCTCTGTTTGTTTCCAGTTTGGAAACCCTTTAGGCGCTCATTGTCAGCTCAGGTTCTTCGA:1 - chr3L 18192779 3' + Cr1a 265 1 66.34 AAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAGGATACATGGCACATCGTTAAAGGGGAAAAT:2 + chr3L 11910033 3' + Tabor 484 2 77.23 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATA:1 + chr2L 12074535 3' + Juan 4163 1 74.26 AACAANGAAATCAGCTGTTGCACGCACATAAAAAGGTTGTCTGCAACGACAAGCTTTTCCATCGATAAAGTTAATTTACGGTTGCCTTCCACATAGCTATT:1 - chrX 2076343 3' - Transib-N1_DM 353 1 59.41 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATAAAATTCAATCAGTTGACCGACCTTACAGAGTGGCCAACGGTTAAAT:1 - chr3R 20884885 3' - flea 25 2 55.45 TAATTGATTTATTAATTTAATTAATTTATCACAATTAATTTGATTTTACTACAATCCCATCCTAAATTAGTGCTAGAAATTAGGGTTTTCCGAGCACGAAG:1 + chr2R 13284202 3' - TAHRE 54 1 68.32 AAAAAATTGTTTGCACACTTCTCTTTTTTATGAGCTCGTCG:1 + chrX 1837062 3' + S2 217 1 65.85 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGGTAGTCAATCCATCGAACTGTGCTCCTTGCATATATACCAGGCTGGGGCTGGGTTCTATG:2 + chr3R 10321110 3' + roo 9055 2 62.38 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAGCACAATGGA:1 - chr3R 19114192 3' - 297 6611 2 65.35 GTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCTTGAAATATTTTGAAAAATGTTTTAATGTAAATAAAGTTTACGTATACACTGAAGAGA:1 + chr2L 17889410 3' - accord 17 2 62.38 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACGAGGTATTGGGTGACAATAAAGTTTGTT:1 - chr2R 7255812 3' + 297 6931 2 77.23 CCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGTCCTGTGTGTGTGTGTGTACGTTTGTGTATGGCGGCAAATACGTTTTTTACGACTTTATG:1 - chr2L 12567043 3' + opus 123 2 54.00 AGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGCACTCAGCTGTTTTTTGGTAAGAGAATCATGTAGAGG:1 - chr3R 7993830 3' - Doc 1 1 76.24 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCAGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTG:1 + chr3R 27080794 3' - HMS-Beagle 30 2 58.00 GAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAA:1 + chr2R 12185413 3' - accord 20 2 55.00 CAGAGAGTCAAAACTGCTTACACAGCTTTAAGGGTCGACGGGGACGCAGTCGTAGTCGTAAGCCTACAGGTAAAAGCGAGACAAGTGGCCAGGAGACAAAC:1 - chr3R 4638512 3' + Quasimodo 7068 2 66.34 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTAAGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGC:1 - chr2L 13060277 3' - P-element 43 1 36.63 AAAAAAAAAAGAAGGAAAATAAAAGCAGGAAACCCCAAGCTGCCCTTGCTCCTTATGTGTCCAAACCTATTTTATAGCTGGCTTCTCTTCTGCGTCTGCCA:1 + chrX 7939613 3' + Doc2-element 249 1 60.40 GAGAGCATACGTGTGCACACATTCTGTCGTCGACGCTCACTATATGCGTATAAGAGAACTGCTGATAAGGGAAATCAAGTTAAGGGTTGTCGAGATTCGAA:1 + chr3R 18723704 3' - 1360 178 1 61.39 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGTTAGT:1 - chr2L 14260743 3' - 297 6613 2 66.32 AGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAATTGGAGTCATGAGTGTGGCCCTGGTTTTTGTTGTGGAGCAGATGGGCTCCCATGTAATGCAGCT:1 + chr3R 25914149 3' - roo 9027 1 72.28 AAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTTGTTTTACCATTTAAATTTTAATGTTTTAATTAGCTGCAACCAGTATCTAATAATCA:1 + chr2L 8904490 3' + invader2 5057 2 62.38 TCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAAGCCGGTCGGACCGTTAATTCAAATGCAGCTCTATCAAAAACTCATTCGCTTAAAAATGA:1 + chr3R 3595217 3' + mdg3 5277 2 67.00 TAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAATGTACTATTGCAAGTTGCGATTTCAAAAGTGCTAA:1 + chr3R 30498627 3' - Tirant 8502 2 65.35 CGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTATTTTTGGGCTGGGGTTCACTGTGCAAGGACAACAAACAGTGATGGAAAAAAAGTCGAGAAAGACAATAAAGGCAAACA:1 - chr2R 24741939 3' + blood 7178 3 70.30 GCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACTATATAAGCTCATCATCCTCATCACTTGCTATTTTGAAACAGTTCG:1 + chr3L 25730319 3' + Quasimodo 6966 2 54.46 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTTAGTTTGGAGGGTCGGAG:1 + chrX 4180812 3' + I-element 5329 1 52.48 AAGTATTGGAATTCTAATTAACATTGTAAGTGTACTTACGAAATGACTGCAATCTCTGATCTGTTGAATGGTACAAATTAGAGTTGCCAGCTTGAACTTAG:1 - chrX 19125009 3' + mdg1 7455 2 80.20 TCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCCAAGAGGATTAGAGGACCACCGATTGCGACTGCTGAGCACTTGTTATTCCAATTTAATTAGGCCCGTGATAAGAGC:1 + chr3L 15210330 3' - roo 8905 2 57.43 CATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAATATGTACTCGTAAACTGCAATTAAAATCTCAACTCTATATTAAATGCTTGCAA:1 - chr3R 28728272 3' + jockey 4968 1 51.49 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATGCCGTAAAAACATTTACGGCCGGTAGACTGCCTTTT:2 + chrX 19306842 3' + P-element 2879 2 73.27 GGGTATCTGATAGTCGGTAAACTCGATTATATCGTCTCTTGCTTTAAATTATGTTGCTAGCAATAAAAAATTGAATTTTAATGAAAGGGAAACGGAAACTA:1 - chr3R 17733238 3' + INE-1 556 1 75.25 TTGCTTTTTGCTTTTTTTTTTCTTTTTTTGCTTTTGGCCCCCTTGGCGTGTGTTTTTTAGACAGCCACGCCCCCCTCCCCTCGTCAGCCAAAAACTCGCAC:1 - chrX 8968665 3' - Bari2 910 1 68.32 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGT:1 - chr2R 21379503 3' + P-element 2843 1 35.64 AGATAGGTTTTAAGACGGAGTTGTATAGAAGAGCTTTGAACTTCAGCCAGCGACTCTTGAACTTTCCTTCGAAATCAGCGAAAATCAATGCTCAACTAGCA:1 - chr3R 30630730 3' - Doc 4268 1 67.33 CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATTGTTGATTGTCGATCCTAAGAGGAGGATGTAGGCTAAGGTGTCAACAAGTAAAAAAATGCTG:1 - chr3R 5054350 3' + HMS-Beagle 241 2 74.26 TGAACGAGAATATACACAGAGACTTACAAATAAAACTTGCCAAATTTTCTTTCCGTGTCTGCTACAGTCAGATGTTATAATGATGCCCGGCATTATTTTCG:1 - chrX 5657879 3' + Doc3-element 4433 1 68.32 CAATGTATGGCCGTTTCGCATCTTGTTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chrX 20783463 3' + 1360 3368 1 61.90 TCCATACCTTTTAATTGCCGGTCTGCAGCTTTGCGGTTCAGTGACTCTCCAGGGCGTCGCAAATTGCGGCAAATTTCTCGCATTTATTTTCCATTTCGTGG:1 + chr3R 31104297 3' + GATE 351 1 79.21 ATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTCGCACCCAAGCAAATTGCTGAAATCGCAAGTGT:2 - chrX 868717 3' - jockey 4949 1 67.00 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAAATATGTGCCATTATCCGGCAATGCTCGCCCGTAATTATTCATTTTTGT:1 + chr3L 3671360 3' - roo 28 2 56.44 TCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACATAGGTTCTGTATGCTATATCTGGTTATATATATTTTTTGTATTTTTATGTCTTTATTTTTATTAATTTTAAAAC:1 - chrX 18019335 3' - Tirant 8326 2 69.31 CCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTATGCCAACAACAGCAACAACAAATACGACAG:1 - chr2L 7547967 3' - blood 7013 2 77.23 ATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTG:1 - chr2L 11047967 3' + Juan 4193 1 55.00 TATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGAAATATATGAAACATAT:1 - 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chrX 4890042 3' - 297 36 2 68.32 GACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTGAACGCTTTAGGAGAGG:1 + chr3R 20845133 3' + 17.6 475 2 60.40 AAGCTNCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTG:1 + chrX 12546484 3' - P-element 23 1 42.86 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAATTGAGTTCCCTTTAAGTATTTTTTAA:1 + chr2R 10863977 3' + mdg3 5479 2 57.43 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAATTGAGTTCCCTTTAAGTATTTTT:2 + chr2R 10863974 3' + mdg3 224 2 55.45 TAGCTGAGTAATGAGTATCTGATAGTCGAATAACTCAACTCTAAATGAATTACTCCATGTCTTCTCTAGCTTTAAAGCCAGTCACAAATCAAACTGCTACT:1 + chr2L 14345584 3' + INE-1 544 1 51.49 AATATTAAAATATTTTAATTTTTCCACTTTCAACTACGGTTTAGAAAATTAAGTTTATAAATAGCAATAATCACATGATTTGTTTTATAGGTATTAAGCAG:1 + chr3R 15126402 3' - 1360 3031 1 69.31 AGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACTGATTTGTTAATTTGGCATGTAATCCCTGAACAGATCGTCCAGTGTTCCATCAAAATCGAA:1 + chr3L 9698971 3' + transib2 2499 1 61.39 GTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCTTGAACTTG:2 - 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Max-element 8264 2 54.46 CATGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTG:1 - chr2L 17841010 3' - Juan 4030 1 61.39 CTCGCTCTTTCGCTCGCCCACTGACAGCATATGGTTAATTTTTTGTTGAGTCCGTGTGGACTAGCCCCTTTGCCAAGTAGTAGGATCGAGATGAGCTATTA:1 + chrX 21946710 3' + Cr1a 302 1 74.26 CAAATTAGTAATCGAAATAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATTAGCTGCTTAATAGCGTTATTTAACTTGAAT:1 + chrX 10975851 3' + Doc 4432 1 67.33 AACTATAAAATCTAGAAGGTTGAGATTCAACACACAGACTCTAGAGACTCTGAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAAC:1 + chr4 71479 3' + INE-1 159 1 84.00 ATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGTTCGTCTGGCAAAGGATATGGGTCGCTTTTTAAGAGGGTCCC:1 + chr3R 25702254 3' + Tirant 367 2 58.42 TGTCAATTACTTCCAAACCGCTTGTTTTTAATTCGCGAAACGGATCCCAGGAAAAGGATGTCCGACCCGGAGGCTCGGGTGGCCGGCAATCTTTTCACGTT:1 + chr3L 9606080 3' - R1A1-element 128 1 66.34 TCTTCNTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTCACCTCCTTGCATTTGATTCACTGAG:1 - chr3R 10457241 3' + roo 408 1 78.22 ATTATTTCATCAAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTTAAGATATTTATTTATCTGGCTAAACTTTTTGCAGAGTATGCAGACTTTGAGTTCGA:1 - 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Ivk 40 1 66.34 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTCCTGTCTTTTTGAATGGGTTAGTCGTTTTTGATCTAACTAGAGGGGATTCTTTGAAGTTTG:1 + chr2R 1398690 3' - 297 6594 2 62.38 TGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCAAAAGTGGTCCCTTAAAGCTTATAAACAATGCTAAAGAAAGTTTTACCTTTCCAGCGAATTTCCG:1 - chr3L 18126689 3' + BS 5014 1 70.30 ACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCATTTCTACGAGCTTTCAAGGTGAAGTCGCATACACACGCACAC:1 - chr3L 15035106 3' + pogo 2094 1 72.28 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGCAGCTTCGTGTAATGAGCCGAGCGCCGAGTGCAGGGG:1 + chr2L 15333811 3' - P-element 6 2 71.29 ATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTGCGTCACGGAT:1 - chr2R 9426431 3' + P-element 2866 1 60.40 AAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAAGCCAACGCGTGTCGCTGTCATTCTCCCCAATGCGTCTGCATTTATTGACTTTGTTGCTGGTGCTCT:1 + chr2R 16242896 3' + 297 6881 2 73.27 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATTTTTTTCTTTGAAGCGGTTTCATAAGTCCAATTGAATTTGTTTCAGTGCAA:1 + chrX 14713286 3' - flea 19 2 58.42 AGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCAATTGTACGGTATAATCAGATAGCGTCGCAAATGAGCAAACATACACATACACATGTGCGGTCATATACAGCTCTCTT:1 + chr2L 7994523 3' - jockey 4759 1 78.22 AGTCANCTGCCGCAAGGAACTTTGTGCCAAATTGTGTGATAAGCGGTTTAGGGCAAACAATTTGGAACTTTGGAGATCTAGTTAGCAATTGCAATTGTACC:1 - chrX 380430 3' - G5A 403 2 65.35 GCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTGTGGAAGGCC:1 + chr3R 22709046 3' + 412 45 2 55.00 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAAATAGATG:2 - chr2R 19192534 3' + roo 9037 1 62.38 TCTTCNAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGCGCTGTCCGTGTAACGTGGAATGTCTAGAGCCTGGACGCGAATGCACAATTGCATAATCGTTA:1 + chr3R 10171699 3' + Ivk 18 1 63.37 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTTCTTATCTCTGGCTCTCTAAACTCA:1 - chr3L 15035148 3' + pogo 2052 1 79.21 ATTTGTTGTATTATTTTTGTATCATTTGCCTTTTCTTTATGTGCACAACAGCAAAAGCTGCAGCAGTTGCCGAGTTGCAGGAACAGCAACAACTTTCAGAC:1 - chr2L 11400878 3' + Tc1 1388 1 76.24 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTG:1 + chr3R 9370010 3' + roo 9050 2 58.42 TTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAATTCATAGTTGGCTCGGTATAGTATCTTATAACAAATTTGGG:1 - chr2L 10604392 3' - jockey 4805 1 64.36 GACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAAGTTAGTTTTGCTAGACGAGTTAC:1 + chr2L 19075731 3' + Transpac 283 2 52.48 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTAT:2 - chrX 18193742 3' + hopper 1366 1 76.24 GTAACGGGTATCTGTTAGTCGAGGAACTCTTCTGCGCCGTGATCTGTTCTTATATCTAGAGATGTATTGTATTAAAAGCACCACATTATTGCATAGTGTAA:1 - chr2L 14381363 3' + INE-1 551 1 52.48 GGGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATATATGAATGATATTGAAGCATCTGGCTGAAGGCAA:1 - chr3R 14164086 3' - Quasimodo 27 2 65.35 ACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATTAAAAATCATCTTATA:1 - chr3R 10971894 3' + BS 5061 1 59.41 GTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAAAGCACACAAATTATAATTATTGAAAGACCCTAGACCAGATGCACTG:1 + chr2L 11551434 3' - Max-element 8238 2 76.24 CCGGAGAAACATCAGCCGAGTCAGTATTTAGGTTTTTAGTCTTCCATCACTTCAATTCGTTACACGTTACAAGTTATAGAAACTGGCGATGAAATAAACGA:1 + chr3R 3286137 3' - Gypsy12A_LTR 1884 3 66.34 GAGGGTTAGTGTTGTTAAATATGTCTTATTTGGTTTGCAGGAGGGATGGGCAATAAACTTCTTGGCGGTTAGTGCCGAATTGTACTGTATGTACCGAACTG:1 + chr3R 3187613 3' - I-element 5088 1 54.46 CTCTAGATCAGTCACAATAAATACTTGAAACGAATAGGTTATGGGCCCAGTAAACATTTAGTATTATTGGCCATTGGTTTCTGTAAGAATCGGAAAATTAA:1 + chr2L 3297564 3' + Dm88 163 2 81.19 CATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAATTCCAATTGTCCCTCCCAGCTCGTTTGTAAAAATTCATTGAAGCCAATTGATGGTACAAGTACACT:1 + chr3R 5289197 3' + Quasimodo 6995 2 71.29 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTGCATAAATCTACAGTTTTGTTAACAATTTCTACAAGAGCACGGATAGCAAAAAGGGCAGTC:1 - chr3L 21383955 3' - roo 16 2 63.37 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTTAAACGCTT:3 + chr3L 17699380 3' - 412 40 2 62.38 CAGGATCAATAGCGGAGTCGAATGAAGGATTCTAATTCGGTGTAAGTCCAGTTTTATGTATTATGTATTGATTGCTAAAATACTACATAAAATCTTAAACT:1 + chr2L 12286076 3' + INE-1 95 1 63.37 CTCTCTTCTACGCATACAGCGAACGGCGACTGCATTTGAAACATGTTTAAAATTTATGATTAACACACGTGCATTCAAATCTTTGCCTCATCGGTTTTTA:1 - chr2L 14699587 3' + 1360 142 1 74.00 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATCCGGACAGATCCCCGAGCGAGTTAAATCATTAT:1 + chr3L 13194823 3' + 297 6938 2 66.34 AAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGTTTAACAGTCGAAGTCTGCGTTATTGTTGAACATTTTGATTAAGTAGAGAGACAAATT:1 - chr3L 22920369 3' - 1360 21 1 58.42 TCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAACAAAAATATATATATATATAATAATCTGTACTATATGCTCTACAGGCTGGCACTACTGCGACATCGATGGA:1 - chr3R 18629874 3' + I-element 4904 1 68.00 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATTACGCAAATGCACTTTCGACGATCATTTAGCTAAGTT:1 + chr2R 5784389 3' + 297 359 2 64.36 TTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTAAGTGAGTACGGTTAGTAAGATATTTTATTCTACGAAACTCAT:1 + chr3R 19914409 3' - jockey 4794 1 56.44 AAAGAATCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGTGGGAGCTATCAAAGGAAAGATCAGGGGGCGCAAACACT:1 - chrX 9737827 3' + F-element 4336 1 59.41 AGAGAGCGCTACAGCGAACAGCTAGCAAATTCTATTTCTATATTTCTGAAATTGATTTTATACATTTTTATTCAGATTTATACATTTTGGCACGCTCCTTT:1 + chr3L 9939257 3' + 1360 121 1 66.34 ATGAATAAGATCAAGAATTGAGCGTGCTTACAACAAAAAAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCAACAGAACCAACCAGTACACCGCAGTAATAAATTGCA:1 - chr2L 485811 3' - Gypsy12A_LTR 2120 1 63.37 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAGGGGGCGTGGCAGCTGTAGAGTAAACACTTGAGAAC:1 - chrX 4041520 3' + hopper2 1567 2 64.36 CGGTGGGCAAACATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAATTTTTTTTTCTCAAACTCATCTTTTTTTAAGCTACGAATAAAATCGTAAAAGATA:1 + chrX 22490461 3' - FB 69 2 70.30 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTC:2 - chr2L 20118711 3' - Max-element 8288 2 75.25 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGCTTACCTACAACTGCTG:1 - chr3L 8974108 3' - P-element 51 1 26.32 TGGTCCTGATCCACACTCTGTACCACCCCACTCCATATCGTATCAGTTACAAAAAACGGACCACAAATCAGCAACAACACTAACCTAAACCAAAACGC:1 + chr2R 4580037 3' + Chouto 417 1 78.57 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTT:1 + chr3L 15035203 3' - pogo 32 1 63.37 TGATANGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATAGATTTTGTTTGTGACATTCATTCTCTGAAAGATTTCTCCACTCGAATTGC:1 + chrX 18997749 3' - jockey 161 1 63.37 AAAGTTTTCTTTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTGCTGGACTTAA:1 - chrX 4022897 3' - HMS-Beagle2 491 1 69.05 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGTAGAAGGCATTGGTATGGTACTCAGCATAGGGTTGAAGGCCCCTGGGGTC:1 + chr3L 10811238 3' + P-element 2883 2 77.23 TCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGCTTGACGCCAACGATCGTTAAAAAACATTTGTCTGTC:1 - chr2L 17447621 3' - FB 33 1 62.38 AAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAATTGAGTTCCCTTTA:1 + chr2R 10863965 3' + mdg3 5467 2 59.41 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAATTCGAGTTACATAT:1 + chr3L 12085250 3' - pogo 11 1 66.34 GCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCTTGTATGTAGCCTTTCTTTTTTGTATAAACGTGCTTCTTTT:1 + chr3L 27390865 3' + 1360 194 1 58.75 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTC:1 - chr3R 12877824 3' + mdg1 364 2 79.21 AGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATGAAAACTATTAAACTCGTATCAATATAAATTAAGACTATCATTTTCTGGTTATAC:1 + chr3L 6127152 3' + jockey 4797 1 62.38 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACACACACAAACAATATATATTAAAAATGTAGATGGGCCTGTTTGTACAGTGAGCTAGAAAAG:1 - chr2R 14381261 3' + hobo 2923 1 61.00 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTTGCCGAGCTCAGAACGCATTTCATATGCAATACCAATATTTACACAAGCTCGGTGCCAGCCAAAATAAAAGCCG:2 - chr2R 23495407 3' + 412 491 2 76.24 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCGTGGAGCTCTCTTGTCCGCTCCGCTCGGCT:1 - chr2L 13060237 3' + P-element 2884 2 76.24 GTAGCATATCGGACTAATCTACCCTACCAGAACAAACATACTACGAGCCCAACCCAGTAAGTAAGACGATGAAAACTTTCCTGTCGGCACGTGATAACTTG:1 - chr3L 1888739 3' + Stalker4 6958 4 71.29 GACGCTCTGAGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCAAG:1 - chrX 21668068 3' + Stalker2 7616 2 53.47 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATCTTAATATTTCAGATGTTCTGCGCCAGTGGAAGAATTTTCACAGAATTTCACTGAA:1 + chr3R 19610681 3' + Tabor 7294 2 59.41 CGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATTTGGAGTTTCCAATTAACTTTTGTTTTTGATTTTTAAGAATTAGTTGACAACAAAAACTCATA:1 - chr3L 875477 3' - P-element 2699 1 31.25 AGACGCGATATAAAAAAGAGAACAGGAACGAGGCGCTCGCTTGATGCTTAAAACTAAATAAAATTAATTTACAATTAGGTTTATCTTTTTTCATTTTCTTT:1 + chr3L 14175929 3' - Cr1a 4356 1 67.33 CCCTTTTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTC:1 - chr3L 23112571 3' - R1A1-element 4894 1 58.42 AATCAAGTCGGGACTCTCAACATCACCACGCTGTTATTTCAGCTCATCTGCGCCGGGAGATCGATCTACTCACATATAATATAAGTCTAAAATATAATAAG:1 + chr3L 25965821 3' - Cr1a 4069 1 75.25 ATTGATCCTGAACAAGAATATATACACTTTTTACAGAATCTACGAGTAATGGGTATAAAAATATACAGAGATAGATATTTAAACTGCATTTGTTATAAATA:1 - chrX 15408690 3' - INE-1 83 1 64.36 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTATTAAACAACGATATAGTGGACTGTATATTTTTATTTGTTATATTATTTTATTGTTTATT:1 - chr3R 19449925 3' + roo 344 2 64.36 TATGTTATACCCAATCATTTATGGTATTTTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACATGTGGAGGACCCAATCACAAGTCAATTAAAGTGCGACGAGCGCA:1 - chr3R 5766219 3' - Stalker 36 4 74.26 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCTCGGACAACGAGGCTATCTTGGACGTG:1 + chr3L 8974173 3' - P-element 5 2 73.47 AACTGTTCTATGATTAAACGGCCCTAATAATTTATTCGCTGGGTTGGTAGGTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAAATAAAAAAAA:1 - chr2L 13641813 3' - F-element 4563 1 53.47 ATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCTGGATTGCCCTGAATTATTCGAGTTGTTAAAGTTCTTGGATATTCTTGACTGTCCGCTGCCCTC:1 + chr3L 27413139 3' + invader4 2712 1 66.34 AATTAGCAATGGCATAAGTATTTGGACAAATTATTTAAATTTTATAAGGTATGTATTCCGACCATATTTAAAAACGCGTTGTTTGTCTTATTGAAATCTAA:1 - chr3R 4191382 3' - Tc1-2 1441 1 52.48 CTCCAGAACGGATTAAGATATTTAATTTATTTTATACAAACCACACAGAATAAAATTCATTTAACAAAAAACACTTGTACATAAGGCAGTCCTAAGTAACA:1 + chr2L 21105715 3' + Transib-N1_DM 44 1 61.39 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGATA:1 + chr2L 17957309 3' + opus 7481 2 58.59 GGCTTCTCCTCATTTTCACTTTCATTTGATTTTTAGTTTTTTTTGCTGCCCTTTTGGCCATTTGCATTCATTTGTTTGCCATTGAATGTGGAGCAAGTCTT:1 - chr3L 10488419 3' + 17.6 316 2 72.28 GTCCCAAAATTATCAATATTTTCTAAAAAGTGTGTTTGGTTAAGGTAATTCATATATTTAAAAGAGCAATAAATAAAAAAGAAACAAGGAAAAGTTGTTAT:1 - chr2L 21702606 3' + HB 250 1 79.21 TTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAATACCTAGCAAGTGAAGCCTTCATTTCTTGCACATTGCTGACTGACAAGGCAATTTCACGTTATTACCAACA:1 + chrX 12559921 3' + Ivk 5376 1 70.30 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTG:1 - chrX 6654737 3' - P-element 61 1 18.81 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCT:1 - chrX 14525278 3' - hobo 51 1 74.26 AAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGAAA:1 + chr3R 10741137 3' - 1360 3370 1 46.53 AATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGCATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTCTGTACTGCTACGATTTTAGGGTTTACGTTT:1 - chr3L 9121794 3' - Transpac 4934 2 65.35 CACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATAT:1 - chr2L 15333736 3' - P-element 49 1 30.69 GGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTGCGTGCACATTTCGAAGCACACTTTTTGGGGCCGTGAAAAAATGTG:1 - chr3R 29384321 3' - jockey 4758 1 80.20 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTAGAATTTAGTTTCTCCCAGCAAGTTAGTTTGTTTTTAATATTTAATGTAAGCGGTAACAGTCA:1 - chrX 8942073 3' + pogo 2089 1 68.32 ACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATATATATATGCGTGGGAAAATCTGAGTTTTTGGAGCTCGAAGGGCGTCGGGGGGTCGGAGCT:1 - chr3R 30325190 3' + 17.6 7410 2 71.29 AAAATATGCCCTTCACCCTAGAAGTTCTTTGACTTTAAATCTATATTATTGCGAAGTATAGTTGATTCTGCAAATGAATTAAAGTTAGTTGAGAATTTCAA:1 - chr3L 23148265 3' + 1360 216 1 50.50 ATGCTCACTGACACGGGCTAGTTGCTATGGTGGTAGAGGATGGGAAATATATTGCATTGTATGCCACAAAATGATCGTTAATTTGTAGTAACTAAAACAGT:1 - chr3L 15351754 3' - R1A1-element 314 1 72.28 ATAGGCAATGCCCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGC:1 - chrX 21474427 3' + 1731 9 4 59.41 CTTATCTTATAATCTGTTCGCTTGTGGACAAACATGAAAATCCAGGTGATCCGCCTCATTAAGCCCCAAATGCGATGGGATTGGCGATGGAGATGGAGATG:1 + chr2R 18070894 3' - GATE 320 1 49.50 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAGTGCATATAATAAACACAAAAATCAATGATAATTATGCCATTATATAATT:1 + chr2R 22194754 3' - roo 8691 2 61.39 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAAA:1 - chr2R 19192540 3' + roo 9032 1 68.00 AGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTCTGTACTGCTACGATTTTAGGGTTTACGTTTTTCGTGAAC:1 - chr3L 9121785 3' - Transpac 4925 2 74.26 TATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTG:1 + chr2L 18028724 3' + flea 4962 2 78.00 ATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGC:1 - chrX 21087579 3' - mdg3 24 2 53.47 AATCCGTGAGCAGTCTTCACTGTAACGACTCGGACCTTGTTGTCGATTCCTGCGTGCACTGCTGTGATGCTGGGCTGATGATACTTGAAGGAGCTGCGGC:1 - chr2L 19628943 3' - 3S18 5675 1 70.00 ATCGGATAGTCGGGGAACTCGACTATAACATTTTCTCTTGCTTTGAATTAAATGTATTTATTAATCTTTTTAATTTTACACCCCTGCTTTTT:1 + chr3R 31997572 3' + INE-1 560 1 64.13 ACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTC:1 - chr2L 12074495 3' - Juan 4031 1 61.04 TATCGAGAAACTTATCGACTAATCGACTCGCACACGTTTGGACCTTTGGTCGGCAGCCGCGGAACGGCCAAAACTGAC:1 + chr2L 2810747 3' + mdg3 120 2 65.38 GATTCGGGTGCGCACACAACGGGGTGTCTTGTCTGCATGTTCAGATTTATACTGTGTGTTTGTATTTTTATAGTTCAAAGGACATTTGAATGATTGAATGA:1 - chr3L 13652486 3' - hobo 136 1 63.37 CCCTCNATATATGCACATACTACAGAATATAGAGTTTTGGAATTTATTGTGGTCTAAAAAGAAGTCAAGACTTTAGGGCTTTAAGCCAATTTCAAACAAAG:1 + chrX 8948710 3' - blood 3 2 74.26 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGCGCTTTTGCGTGGGAGAGCCGCAGTGTTGGAAACCAACGGAATTG:1 - chr2R 9426441 3' + P-element 2856 1 50.50 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATCACCCGCCAATTCTCGCGCCTGCACTTCCGCATATGCAAAAGCGAGGCTTTCGCAGCTGTTTTCAG:1 + chr2R 22998049 3' - Transpac 4929 2 72.28 ACTTACGATAACCAAATTATCCCAAAACTTTCCGGGTGTAGCTGATAAAGAGTCTAGTATATTTCCGATGCATAAGACAGGCATGAGCAATAAGTTAGC:1 + chrX 18869740 3' - Gypsy12A_LTR 171 1 73.74 CGGTCAATGACCTAGCACCTGCAGAATGCAAACGATCGCGGTCGTTACACAACCCAGGGCTCCGGCCGACGTATAACCGATGACGCGGCTGCCCATCA:1 + chr3R 22983991 3' + Doc3-element 345 1 62.24 TGTTACATACTTTTCAACGAATTTAGCATATATAAATATATCAACTTTTATCAGTTAGTCAAGTTAAACGATTGCTTAGATTAATATTCGCTTGATTACTT:1 + chrX 19810299 3' - INE-1 16 1 70.30 GTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACA:1 + chr3L 25232856 3' - accord2 7458 2 53.47 ACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATA:1 + chr3R 9952247 3' - Ivk 31 1 57.43 AGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCG:1 + chr3R 31458533 3' + jockey 4960 1 55.45 AATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAACTACTTTATTTTTGCTCTTAAATGTAATGTTACTTTACACACTTTATAAGATACATTGAGACGTAAAAGATACACA:1 - chr3R 24281921 3' + Max-element 8533 2 77.23 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTATGCAAAACAATTTCATTGTTGTCTCAAGCA:1 - chr3R 20466613 3' + roo 401 1 70.30 AGACTTTTCGTAAATGCGCGGGCGCGACCGGGCGTATGTAGTATATATAAATTTCGATCTCCGCTTAGCTCCTCAAACATTTTGTGGCGACTTATGGACTA:1 - chr2R 14059209 3' - GATE 177 2 66.34 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTGTCTCGTCGTCGAGTG:2 + chr3R 9370025 3' + roo 402 1 73.27 TTATGCCAAAAAAAAGGAGTTCTGGGACGTGGAGAATATGCTAGCCTCCGTCAATGGCACACACACGACCTCCCAAGTAGTCATAAAGCTCTTTAAAAAAT:1 + chr3L 26008408 3' - transib2 13 1 76.24 ATATTTTCGAAACTATTAAAAAAATGAATGTGACACTTTTTCGTCGAATTTATCTAAGCAACACTTATATACATGGTTTCAATTTCGATTTT:1 + chr3L 16163857 3' + HB 1479 1 69.57 ATCACAAAAAAAAAGAAGAAAAATCAGAATAATCCTCTCAAATGCTTGACCAAATCTGACGCCGTGAGCAGTTGGGATTGTCTGTTAACAGACAGATATGG:2 + chr2R 5777593 3' + gypsy7 5002 1 78.22 TGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTGTGTTCGTTCTGCAGTCTCGCACTAAAAAAGTAAGTAACAGTGTTT:1 - chr3R 6147252 3' + copia 225 1 55.45 AATATATATATAATATGTATGTTCCGTTGCTAGCTATAGCACCATTTATAATGAGATCATCTATAACTAATTGAAATATTTTTGAACTCACCTGCTTGGTC:1 + chr2R 14793490 3' + Dm88 8 2 78.22 CAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGTAAATTGCTTGACGCCAACGATCGTTAAAAAACATTTGTCTGTCTGGAGTTCT:1 - chr2L 17447612 3' - FB 24 1 60.40 TTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATTATTCTGTGTCCCCGCTTCCTTCGTTAGGCGATAAGGCAGA:1 + chr2L 6193226 3' - Rt1b 4805 1 76.24 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGAATTAAAACCTAATGAATGTGGTACTCTTCAAATTTGTATATAAAGAAAGTTATTTACTTTTGCCTGCACAACC:1 + chr3L 10036473 3' - jockey 94 1 78.22 CCCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCAATCGATTTGTTTTATTACTGTGTAATCTGCGTAACTCTCAAATAAGCATATAAACTAATTACTAA:1 + chr3R 25139853 3' + 412 7364 2 68.32 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTCGCCTCTACTTCTTCTTCTTCAGCGTGTGCGTTCACAGCTGTTCAAGGTCCCCACAA:1 - chr2L 18694085 3' - P-element 16 1 63.27 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACATTCCATTCGTTTGCAAGTGGCACATTTAAAAGTAACTACGGTAGCTATAGCTGCCCAGTTTGCAACCCCAACCACCC:1 + chr3R 27412539 3' + 412 491 2 72.28 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAATAATTGTGAGCGGTC:1 + chrX 5443976 3' + mdg1 411 2 68.32 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAG:1 + chr3R 13376028 3' + 1360 3350 1 67.33 TCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTACCTTTTGGCCAAAAGTTGCCA:1 + chr2L 16082698 3' - Stalker 9 4 68.00 TACAATATCAGAAGTGGGCCGATCACGAGCCAAAGAGAAAACTAATTGAATTACAACGACTTGTTCGTAGCGTCTGATTGGATTTCCCCAAATCGTCCAC:1 - chr3R 6849551 3' + invader2 263 1 65.00 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCGTGAAGGCAAATGTTTGAGGTGGCGAAACTTTC:2 - chrX 19457121 3' + roo 401 1 72.28 AAAAATGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTTTGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCGTATCGACCGAAAATAAAATCCGTTG:1 + chrX 21388559 3' + 1360 3344 1 71.00 GTTTTGCGTCGCGGGTGCCGCTCACACACACATTCGGGATTCCGTTTGCCCCCCACTCACACAAATGTCATTATAAATTGTAATAACAGGAGCAGTGATGC:1 + chr3L 9465515 3' + hobo 166 1 80.20 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATTTTCCCTGTTATTTTTGAAGTGTACCCCTAGGTTCCT:1 - chr3L 2024320 3' - copia 38 2 64.36 TATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGTTGAGCTTGACTTTTCCCCCGCTGGCCATTACAT:1 - chr3R 9952165 3' + Ivk 5366 1 68.37 ATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCTGTTTATCTCTCTTTTGGACCGAC:1 + chr3L 20248382 3' - Transpac 4941 2 58.42 TAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATAGAGTATTGTAAAATGCCAGAGTTCATAAATTTTCATGAGGCCAAACGGAAAGTGAG:1 - chr3L 4949281 3' - Burdock 215 2 65.35 TTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCTATGCATAACATATTATGAAATAAAAGAACTAATACTTATTATGCCAGCCGAATAAAAAAAAAAATAATT:1 - chrX 23352851 3' - F-element 333 1 69.31 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAAATTGGCCACTA:2 - chr3R 19657438 3' + roo 388 2 58.42 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCACTCAGGATGCCTGTGAATAAATTCCATTTCCGTATATC:1 - chr2L 2437714 3' - roo 38 2 65.35 ATGGACGGAAAGAATAAACTCCAAACGGGGCCAACACGAAACGAACGACGGACCAAAGAGCGCAGCCCAAAGGCACATG:1 - chr2R 16902464 3' - Max-element 437 1 78.48 ATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAAAACCCAAGGCACCTTTTGTT:1 + chr3L 3279820 3' + Juan 4208 1 71.29 AAGAATGTTAATTATTAAGCTAAGAAGAAACGAATGTTTAAGGAATGCAACGCCTGCCGCATAATAACAACAACAATGCCAATGCAAGTATCCGATTCGAG:1 - chr3L 1367273 3' + HB 383 1 75.25 AATTAATATTAATATTAATATTACATTAGTAATATTTTTCTTTATGTTTATAGACAATTTGTTCGCATTGGGATTACCTACATAGTGGAAAATCCTCTTTA:1 - chr3L 17754837 3' - mdg1 7081 2 75.25 AGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATTCAATTT:1 + chr2R 9375234 3' - HMS-Beagle 39 2 70.30 CATTGTCTTTGACCCCTGTGACTTCGTATGGACCTAAATACCCGATCTACAAACAAGGGTGCTTATGAATGCAATTTGCATTTTAAGCACCCTTGTTTGTT:1 + chr3R 14090201 3' - flea 4588 1 43.56 CAATGTGTGCCTTAATTCCAAACCTGGATATAGATGAGCCGATATATGAATATAACGACGAGGACGACGATGTCGACAAAGCTGAAGGAGAATAAAAATGG:1 - chr3R 16393444 3' + Bica 4856 1 60.40 TTAGTTTCTTACAAAAATTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTTATTGTCATGGTCTTT:1 + chr3R 27189331 3' + roo 9040 1 53.47 GTGGGGTTTGAATTAACTCATAATATTAATTAGACGAAATTATTTTTAAAGTTTTATTTTTAATAATGGATGTTTCAATTTGCACCTTTAAGCAACTTGAA:1 + chr2R 13040238 3' - P-element 2733 1 42.57 CAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGAT:1 - chr3R 9657699 3' - BS 36 1 66.34 ATGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGCCCGTTTATATCTATA:1 - chr3R 9981465 3' - jockey 4760 1 76.24 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTGACCGTCCCTTCAGACGGGGGGGTGGCGTCTTAATT:1 + chr3L 17922679 3' + 1360 3353 1 87.63 AAGCCGACTCAGCATTCCTTGCGACGCAGCGCGATACTCCAAATGAGAAGCGTCGGACATACACCGCCGAACCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTT:1 + chr3R 4604452 3' - gypsy 7137 2 57.43 ACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATTTTTTTCTTTGAAGCGGTTTCATAAGTCCAATTGAATTTG:1 + chrX 14713275 3' - flea 4787 2 64.36 CCATTTAAAAAAAAAATAATTTTGAGTTTATAAGGTTTATTCTTTGTCAGAGATCCGGCTCATAGGACCAAAGATTATGTACCCTCTAACAATTCTGTTCC:1 - chr2R 16551028 3' - FB 181 1 80.20 TTTTGAGTCGCATCGTTGGTGGGGTGATTCGTGGTAGTTTGGGCACAGCATTAATGGTTTGTGCCCATCCCGCCGAGCGTGCAGAAGTCTTTCAGCAATA:1 + chr3R 17609385 3' - HMS-Beagle 6721 1 61.00 CCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAACACATCAAGCACACAACT:1 - chr2L 4189394 3' - 1360 56 1 79.21 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTCGCAGCTTTTAGGTAAAATCGGCGTTCTTTCGAACATTGGAGAATCCA:1 + chr2R 9426514 3' - P-element 26 1 53.47 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAATGAGCATGGTTGGGGGTAGGGGTCGGAAAAGCAATCGGAGTACTTGAA:1 + chr3R 11014717 3' + 297 6960 2 55.45 ACATTTAAAAGGAGGCGACTCAACGCAGATGCCGTACCTAGTAAAGTGATAGAGCCTGAACCAGAAAAGATAAAAGAAGGCTATACAAACTTATTTACTA:1 + chr3R 31811617 3' + P-element 336 1 24.00 TTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTTGTTTGGAAGCC:1 + chrX 14796929 3' + transib2 2801 1 56.44 GAAAATTGAAATTAAAAATCTATTGGAAATTATCCAG:1 - chr3R 28365322 3' + P-element 2640 1 89.19 GAAAGGGCTTGAGCGTTTCCGTTTCAATAGCCGAGTAGCATACAGATTCTAAACGCAGCGCAAGTCTGTTCACCCATATGGCCACGCCCACTTTTCCGCCC:1 + chrX 2774745 3' - Doc4-element 91 1 77.23 GCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCCTCTTGAGTGGATCGCACAATGTGTCACCGACCCATCCTCC:1 + chr3L 11439640 3' - Quasimodo 7031 2 67.95 TCAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATGTATGTATGTATGTACATATGTATGTGCCGATTGCAGCTGAACAAACCGATGTAAGATCGTCGC:1 + chr2R 17443163 3' + S-element 1707 2 64.36 CGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAGGTAGCTTTCTTTTCTGAAAAATACTCATATACAATTTGCAGCACAATATTGAATTTATATGATGAAA:1 - chr2L 7696901 3' - pogo 4 1 30.69 AACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGTAGAGCAAGCCCTTGCTGCCAAAAGTTTTGGCTTGAATTTAATTTGTTGTAAAGTTTCG:1 + chr2L 17053293 3' - F-element 4263 1 54.46 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTT:1 + chr2L 2437770 3' + roo 9033 1 64.36 CATGTGCAAGATTGTTTGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGGAGCATATTATGTTACTATATACATATATATGGGCCTACCAGAAACCAT:1 + chrX 20391094 3' - rover 48 2 77.23 GATTGACCTCTTTTGAATGCCAGATTTCGTCTTTAATGTAACCACTCCTCCGAATCGCGACGGCATTGAATGCCCGCATCCTTAGTGCCCGCATTCTCTGT:1 + chr3R 27918938 3' - diver 5766 1 60.40 CGATAACTGTAATTATTAACTTATATGGGCGTTACATAGGAGGTTCTATATGTCAATGGGGCGAGCATATACAGCGTTGTCATTA:1 - chr2L 13447090 3' + HMS-Beagle 246 1 75.29 GTACANCAGCGCCTTTTTACGACCATATCAGCATTACCTCACAACCCAGGCCGGAGGCTCCACGCATCCCGCTGCCAGTGCCAATTGCCACGGTTACGGGA:1 - chr2R 11218294 3' - Rt1a 4839 1 78.22 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCGTTTTTCTTTTTTTGGTTAGATTAGACAGATAATACATTTTCAAACGAACGAGT:1 + chr3L 7806247 3' - pogo 20 1 52.48 GCAAGGATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCGTACTATAAAAGCAACTGGCAATGCTTCCCTCTCTG:1 - chr2R 24965073 3' + P-element 2847 1 40.59 ACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATGCTAAAATC:1 - chr3L 12072530 3' - HB 9 1 63.74 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTCTCTCCGCTACGCAACTCAGTTGGCGAAGACGGGCG:3 - chrX 19457153 3' + roo 9032 1 67.33 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCG:1 + chrX 19306792 3' + P-element 2829 1 23.76 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCAAATTAAAAGAAAACAATTTTTTAAAGAAAATATAGCTTACGACTTGTTTTATGACAACAGTCAA:1 - chr2L 14793411 3' - roo 26 2 67.33 AGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTC:1 + chr2L 21007073 3' - Idefix 34 2 68.32 CAATTCAGAAAACTGTCGCCTCAAGATCGCGTACAGTTAAGGTTCTTCGCCTTGGCCGAAACTAGAAATTCTTGTCTGCGCAGCAATCATCATCGAACGAG:1 + chr3R 18136832 3' + G3 102 1 68.32 AATGATCCGCAACGCACTACTGTCGAAAAGAAGGAAACCCGTGGAAGAAAGCCCTCAATGTCCAACGAGCTGTGTGGCCCGAACCCAAAACATTCAATCCA:1 + chr3L 21912689 3' + Tc1 469 1 66.34 GTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAAAAAAGAGAGTCCAT:1 + chr2L 12074561 3' + Juan 4189 1 52.48 GGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACAGGTGAAAGATTTTCTCTTCCCTCACCGCATTTTCATACCTCAGTTAGTTAACTTAAATGAAGATACTTGAGTTTT:1 - chr2L 19156549 3' - Idefix 7075 2 79.21 ACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACGTCCAAAGAGATTTAAATATCCCTGAATTTCTGCAATCCCAATCATTTCAACGGTGGTTAACCTAAGT:1 - chr3R 12514604 3' + F-element 4355 1 53.47 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCACCACCATTTTTACTTTTATAGTTCTTATACTTTTTGTCGGCGAACAGAGCAG:1 - chr3L 833354 3' + P-element 2862 1 52.48 AACGANTAAAGTCTTTTCATTTGGGATTTTACAGCTTACGAAAAGCAAAAGTATATTCCTATATCGAATGGCATTCTTAATACGTACTTGTTTAAAAATGT:1 + chr3R 12136361 3' + roo 9060 1 67.33 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAATGAGCCGTT:1 + chr3L 17699372 3' - 412 7101 2 70.30 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTATGGTCACTCAGTCTTTGTTTTCATTTTATCTGCTCGCTTTTTCCATGTGACTCATTTGCACAGGCGA:1 + chrX 4155005 3' + blood 368 2 69.31 ATGATGCGCTGCAGGAATAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTCATCTGTAGTGCAAAATGTTTGGATAGTGCGGTCTAGTGGGGACACTATTAACCCATACA:1 + chr2R 13748705 3' - Chimpo 3889 1 64.36 GCAATTCAGTTCGTATGTCCGAGCTGTTGTAAAATCAATTAGTATATAGCCATATGTCTTTCCAAAACTGGCAGGGTAAGTATTACACTACAGGCAAACTA:1 - chr3R 19332895 3' - R2-element 3118 1 56.44 TTTTGTTTATTTTTGGATCTTAATGACATATTTTTTATTAATAGCTTCGCAAGTTTCTTATAGTCAGTCCGTAGGAATGAGCACGCACCGCAGACCGCAAA:1 - chr2L 5095654 3' - transib4 2532 1 58.42 TCTCCAACAAAAATTCGAGTGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAAAAAATCGTATGTCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTATCACAAAAATAATCCAAAA:1 - chr3L 25272574 3' - 1360 89 1 72.28 ATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTGTCGGTCGGCGGCTCAAAAAAGAAGAAAAAT:1 - chr3L 7821662 3' + R2-element 3400 1 69.31 ATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAGTATATTTTTTGAAAAGGCCCACGTATAACAAAACAATTCTTTTTTAATAACAAAG:2 + chrX 10251812 3' + flea 4992 2 56.44 TATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTTGTTTGGAAGCCCTCCCAGTAAC:2 + chrX 14796940 3' + transib2 2812 1 67.33 TCTAATAAGAGGGTCTGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACACAGCCCCAACTTGGAAAGGGTATT:1 + chr3R 31369376 3' - Transpac 4932 2 59.26 TGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTTTCTGTTTTCGGTTAGGGGGCTACAACTCCTCTTGTGAAAATCCACCGAGAG:1 - chr3L 10035596 3' - jockey 6 1 79.21 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAA:3 + chr3R 7101047 3' - pogo 48 1 80.20 AACGCGCGGGGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTGCCATGCAGGTCAGGAAGCGGGTCAGTGCTGTGCCCGTGCTGGGAATTGCCCT:1 - chr3L 8581792 3' - Max-element 225 2 59.41 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTAC:1 + chr2L 326214 3' - roo 8678 2 64.95 ATTTTTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATACAAAATTGAAGAAGTAATTAAATAAAGACGAAAACTGAATCGATCA:1 - chr2R 3502486 3' - 297 6957 2 61.39 AAGACACTAGAATATTATTATTATTATTATTATTATAGGGTCTTTGCTATGTCCTTGTTTGTCCTTAGTACTGTCATCCTTTAGTGCCATAGCCCGTTT:1 - chr3R 17615090 3' - Tc3 308 1 47.47 AAAATATAATTAAAAAAAAAAATATTTTAAAAAAGCCAAAAAACTGAGAAACGCCTCATAATTTCCTTAGGCAAAGTT:1 + chr3L 1450187 3' - hopper 160 1 82.05 AAAAAGGGAAATATCGGGATCCCTGCGGCCTCTAAAGGGTCAGCGCAAGCACGGATGAGGGTCATGGCGTCATCCGCGGTGGTGTTGGTGGCGGTGACTG:1 + chr3R 3382111 3' + gypsy8 314 1 65.00 GGTTCTTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGACCTTATAATTAAATAAACGTTCCGTTGGTCACCTAGCCAAGAGGACCACCAACTGTGTGTG:1 + chr3R 25578589 3' - 297 436 1 73.27 GTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATTGTATATAGGTGCCTAAAACCGAATAATATTTCCAAAG:1 - chr2R 9454248 3' + opus 7464 2 66.34 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGG:1 - chr3R 9657670 3' - BS 7 1 62.38 CGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATG:1 + chr3R 20119940 3' - S-element 72 1 82.18 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCAT:2 - chr3R 7522318 3' - blood 7060 2 71.29 GCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCT:2 - chr2L 15956034 3' - Max-element 8267 2 56.44 AAAATAATTCATCAAACGGATTATATCTTAAGAACTATGTTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGTTGGCATTAAATTTTCTTTATTGTAA:1 + chr4 776340 3' - Tc1 1383 1 80.20 ATTGTGTTTAGAAAGGAAAAATTTTTTTTGAAATTGATTTTTCTTATTAATTATGATCTGTTTTGTCTCTCAGCTGTTCGTGGAGCCCACTTAGGCCCCAC:1 + chr2R 8786689 3' - Stalker 6771 2 62.38 TTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAAAATATGCATATGTCAATTAATCTAAAATTCACTATAAAATCGAAACTAGTCGGGTATTTTTT:1 + chrX 20886053 3' + Ivk 5363 1 51.49 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGG:1 - chr3R 8198503 3' - Tirant 49 2 75.00 TATTTATTTAGAAGCGATGGTTTTAAATAAATGGATACGCAGGTACAGTGAGCAAAGGACATTAGAATACTGTACAGAAAACAAAAGTATTTAGAAAAAAT:2 - chr2L 7937220 3' - BS 5081 1 78.22 ATCTGATAGTCGGGGAACTCAACTATAGCTTTCTCTCCCGAATCGTGTCCTTTACATATGTGTATATATGGGGTATACTATGTGAGTGGGTATAAATTTAT:1 + chr2L 5450419 3' + INE-1 560 1 69.31 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTAGGGGTGGTTGACAGGGGC:1 - chr2L 22719612 3' - 1360 12 1 72.73 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACTACTATGCCAACAACA:1 - chr2L 7547986 3' - blood 7027 2 61.46 CCAAATATGCTGAAAAGAAACACTCGAATAAAAGCGACCACTGACTCCTCTCACCCTTACGAACATGCCAAGTTCTTGCCTTCCCTTCGGAACGTCCCTCT:1 + chr2R 4297383 3' - GATE 8454 2 64.36 CACACGATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACC:1 + chr3R 9952244 3' - Ivk 34 1 58.42 GCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGATCTCGGCTCACAGCTCACCTCACGACCTTGTTGGTTAGCATTGGGAAAAAGCAGCAGCTGAATCCAGAAGAAAATC:1 + chr2R 16741993 3' + opus 7136 2 78.22 ATTTCNAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCA:1 + chr3L 19215849 3' + roo 9026 1 69.31 TAGTGCGTGGTGGCGACGCTCTCGACGTTGAAATTAACATGAACCTACACACACACACGGATATGGTTGAAAAACCGCGCCAAATCAAAGACAACAAATC:1 - chr3R 27835273 3' + accord 7058 2 55.00 CCCAGAGATCAGTAGAGATTTTAGGTAGATCTCGCTCTTCAGCAAGGAGTGAGTCCTTTTGAGCTTTGTCGAGCTTTTCGCGTGTGAATAACAATATGAGT:1 + chr2L 9567206 3' + R1A1-element 5097 1 57.43 CTAATTAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATATGTATATGCATGGCTATATGTATGTACGTAGTTGCATAAATGAGGTCAGTTCCTCGTGCTC:1 - chrX 15195207 3' - Transpac 12 2 68.32 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCACAAATGTACGTGCACATCATAAATTTGGAGCAACTCGTAAAATAGTATACT:1 - chrX 17132450 3' - pogo 22 1 57.43 TTTATTTTCCTATTTTTTTTTTGTTGTTTACGGTTTTTGGCTGTCAGTTTTTGGGTTTTTGGTTTT:1 - chrX 3351474 3' - Doc2-element 250 2 62.12 AATCGTTGTCTGTCTAGCTTTCTTATCAGCAGAAGGAAAATTGAAAAGGTAAAAAGCAAAACATACAATCATATACACTAGCTGCAGCAGGCGTGAACTGG:1 + chr4 967513 3' - Tc1-2 176 1 65.35 GAAGAAGTAAATAAGCTCAGCCAAGGGTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTAGATTTTATTCTGTATATTTAGTGTCAGATCGAGTTTGGATG:1 + chr3R 23684029 3' + Quasimodo 7213 2 69.31 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTG:1 - chr3R 4986305 3' - roo 8715 2 77.23 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTATATACATACATATACATATATTGACCTGGGTGGGGGTGATGTGAGCGATATGCAGCGATTGGCTACGGCATA:1 - chr2L 19474459 3' + pogo 2098 1 65.35 TTCGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAGTGTTTGGTGGGTCTGCCATGATTGTAATTCTTCCAGCCATTATCTGTGAATT:1 + chr3R 15537066 3' - I-element 233 1 73.27 TCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTC:1 + chr3L 23678151 3' - Osvaldo 22 1 74.26 TTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTTTAGGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCAATAATTATTTGTACTGCTCAGTAACTAGGCTTTTGTTGGTT:1 - chr3R 30773750 3' - G4 3562 1 62.38 AAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAATAGATAAAAATAAGAAGTGATTTAT:1 + chr3R 10971970 3' - BS 5007 1 66.34 ATTCTGATTAGCATCTTAACAACACATATAAAAACAAATCTTAATGAACCAAACCTCGTCTTTCTTTTCGCTCCCTGCTTAGTAATTGCGTATTAAACCGA:1 + chr3R 4287712 3' - BS4 686 1 56.44 ATGGGTGATTGACCGCTCGCTGTATGCAGAATTTAATTGCATTTGTTGTCTCCGTGCCTTTTATTCATTTCCCCTTTGCATTTTTTGCGCATTTGCCTCG:1 + chr2L 4266050 3' - Doc2-element 392 1 48.00 GACCACACGGAGCCTATTGAGCTGGGATTTGGCGGCAGTTCCCCACATCTGGATGGCGTAGTCATCATGTAATAGTCATCGTTGTCTTTGTCTGGGGATCA:1 + chr2L 21403527 3' - G5 4428 1 72.28 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGCTAAGCAAAGATATGTAGTAAGACTAATAGTAAAAACTAATAAAATATTC:1 - chr3R 19967594 3' + pogo 2074 1 55.45 TGCCCTCTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGGAGCTTAATTGGAAAGTTAACTTGGAGGAGCAGATTTTTAATGTTGCTGTTTTACAGGCAATA:1 - chr2L 12896771 3' + 297 169 2 65.35 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAACAAAATAGAAACAACACAAACAACACAATGATCCGAAGCCAAACGACAAAAT:1 - chr2L 20939510 3' - hopper 20 1 57.43 AAAAAAAAAAATTTTAAAGTGTGGAAAACGGCAACGTATGTCAACGTACAGTGGCGATCAACTTTATACCAATGTAAGTGTTGAAATAAATGTTTGTTTTT:1 + chr4 1107797 3' - FB 876 3 79.21 TATGTACATAGTTTTGGCTATTTCAAATCTATTATCAAATAATAATAAGCTATTGATCCAAATCTAACGATATTTCCGGAGAGTCTTGCATTTGA:1 - chr2L 6942523 3' - 1360 342 1 58.95 ATTACAAAGTTGTAGATTGGTCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGTGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGACTAGAGACCGCGCTGGCCC:1 + chr2L 12978063 3' - G-element 4226 1 80.20 CTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGTAGTGGCAGCCAAACGAGCGTCCCTGACCACGTTTATTGTGCATTCCTGGTG:1 - chrX 8031308 3' + roo 409 1 46.53 AAATTATTTCATTAAGTAATACATATGTAAATAATAGGAGTAAGGGAATGGGGAAGTCAAGGAAAAAGCGGAAGTGGGCGGATTTTGCA:1 + chr3L 9124472 3' - Transpac 4868 1 57.30 GCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTGCATCGTTAATCTTCTGAAATTCGAATCCTCT:1 - chr2R 23305399 3' - I-element 15 1 61.39 CTGCATCGAGGCACTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCGGTTTTGGTTACCTTTTTGTGGGTTACGTTACCTTATTTGCCGA:1 + chr3L 21203068 3' + pogo 2070 1 53.47 GTTTTTTTCTTTGAGGTATAACAAAATATAATAAAGGAATGCAAAGTTGAGGGGCTGACTGACCTAAATTTGGTTTGCTAATGAGCGCGGAAAAAGGGAGC:1 + chr3R 6781977 3' - Ivk 4915 1 60.40 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAGCCA:1 + chrX 495215 3' - 412 53 2 75.25 AGTTTTTATATATATTATTCAACTTTGTAAAGAGAAACTTTTAGTTTATATAAAAATGTTCATTAGCACAGAGTTTTCTAAATGTTTTTTCAATTATCACC:1 - chr3L 9920611 3' + copia 4662 1 72.28 TGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATA:1 - chr3R 9657712 3' - BS 49 1 77.23 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGCGCTAAAATATGTCTTTATGCCCA:1 + chr2R 12446363 3' - jockey 4714 1 67.33 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACAT:1 + chr3L 13080994 3' - 412 40 2 65.35 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGTGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGACCCATTTCACCCCTTGATCGTATTTA:1 - chr2R 4502447 3' + roo 358 2 73.27 AAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTGATTTTATTT:1 + chr2L 18028760 3' + flea 250 2 75.28 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAGACTATATGGGTGCCTCGCAAAACGTATGGGCTGGAAAACTATTGATGGGTTTGCCCAAAA:1 + chrX 18353574 3' - jockey 16 1 65.26 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATATT:1 - chr3L 9772218 3' + 297 349 2 76.24 GTATTNTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTGTCCATTGGCTTGTACATACATATGCAC:1 + chr2L 8959995 3' + Ivk 5360 1 56.44 AGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGCACCGCGATGTTGGCACACTGAAAGAAAATGGCCAGGCATTGCGATCGAATCTGATTGATTTCAAAAG:1 - chrX 6458147 3' - blood 7020 2 72.28 TTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAA:1 + chr2R 22605976 3' - Juan 4066 1 63.37 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGA:1 - chrX 6654715 3' - P-element 39 1 40.59 CTCCCCATCACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTTGTCGACACTTTAATGTATAGTTATACCTACAATTACATAT:1 + chr3R 31848924 3' - Chouto 6311 1 67.33 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCG:1 + chr3L 8974128 3' + P-element 2834 1 26.73 TATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTCTTAAGGTTTTACCAAAAGGTCACCATAAGGTGATGCTTTAATTTCAGCC:1 + chr3L 19948900 3' - Ivk 393 1 54.46 GAGCCCCCATGGACTACACTGAAGGAAGGGAGTGCGACCTGGCCTCACATCCTGCTCGACAAGCATCATCTCCAGCTAGCAACCACCCTGCTGGCCACC:1 + chr3R 23548980 3' + Rt1b 4918 1 57.58 AAAAATAATTTTTTTTTTGTTTAACTATATATTATTATTTTTAAGGCCATACGATTTCTTCCAGTGCTTTG:1 - chr3L 7464420 3' - gypsy11 3941 2 85.92 AAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATA:1 - chr2R 12213937 3' - Transpac 48 2 74.26 GTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTGTATGCACATAAACTGCTCTGTGCACCCACTCCATCACACTACTCAGCACATCTCCATATCCTTTTTACGTAACAATCCC:1 + chr3L 18857617 3' + Cr1a 245 1 56.44 ATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCATAATATGCAGTTCACTCAAAATAGACGAATGCTCAATTCTTGTAAAATTGAAATA:1 - chr2L 9389039 3' + 1360 3370 1 60.40 GAATTTATGTCTTATATCCTAAGCCATTCTATGATGCGCTGCCTGCTTCTGTGAATGGCCACCTGCTCCTCCATGATGACCACCGCTGCTGGTATGATGAC:1 + chr3L 7717647 3' - Quasimodo 99 2 72.28 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCCGTGCGTGTGCGTATGCGTATAT:1 + chrX 2050893 3' + 412 469 2 54.46 AACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTCTAACAAGTAATCCGCTTGATGAAGTAAACTTTAAATATCGTCGCTT:1 + chr2R 23945310 3' - BS 5022 1 53.47 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAATATTTCTTAGAATGAAAATTCCCTTACTAT:1 + chr2L 4009502 3' - pogo 43 1 72.73 TGGTATGCAGAACTAAGCATTGGTCAATTATGAATGCATTTAATATTATCTTAATCGACCGCTTTTCAACTAATGACGACGAGCAGTAACAAAAACGTTTT:1 + chr3R 23040751 3' + Transib-N1_DM 398 1 59.41 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAATATTTTTTTCTTAAACAAGCCAAAAGCCAGACAGCAAAAACTTCTTTGTTTG:1 - chr3R 19622902 3' + pogo 2078 1 56.44 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCTTTGCCGC:1 - chr2L 15956020 3' - Max-element 8253 2 61.39 GTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTCTTCTCTGTCGCGCTCAGCATGGTGCAA:1 + chr2R 20348628 3' - 297 6938 2 75.00 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTA:2 - chr3R 7100995 3' + pogo 2065 1 65.35 GGTGTTGTTTTTTGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACCCATTCTCTCGCTCTCACTCCCTCGCAATTAGCATACGGCGGGG:1 - chr3L 10956730 3' + Cr1a 254 1 75.90 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTTCTCCTTGGATAATAAGCTG:1 + chr3R 8198536 3' + Tirant 374 2 75.34 GAAAATCGTTTTCTAGCACAAGCAAGCAATAATATGCTTTTATTTAAAGATTTATTACGATCTCAGTTTTACGAGTGTCGGTTGTTTCTCACCAAAAAAAA:1 - 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Tc3 87 1 67.33 CGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGCGAAGAATAATACGATATGTATATGACATATATCTCGCTCACCATA:1 + chr3R 9952247 3' - Ivk 12 1 52.44 ACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAGTGCATGAGGCA:1 + chr3R 9952273 3' - Ivk 5 1 73.27 CGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACTAGACCAACTAACGGTGGTGGCTAATGCTGATAAAATAAATCTTG:1 - chr3R 14324172 3' - 3S18 5774 2 73.27 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGCACTAAGCCACTGGAGCTGCGGGACTATCGATAATTCT:1 - chr3R 18906599 3' - P-element 36 1 43.00 TGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTATTACACAATCTTCGGTCTAGCTTAGAAAATGTTTGTGAACATT:1 - chr3R 8720955 3' + Doc 4381 1 57.43 ATGTATAAGCGTTAGATCGTATTTCATTGGCTGGAGTGTTTATGTAAGTGCATGTGGGGCAATCGTCACATATCTTCCACGGCCATCTGACCCCCATCGCT:1 - chrX 14199551 3' - Stalker2 7392 6 56.44 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACAATATTCTTGGGCTACTTTATTACTTT:1 + chr2R 12446399 3' - jockey 4678 1 68.32 CAAGCCCACACTTTTGAAAACTGTTTTGATAATACCATTTTTTTTTTAAATATAGAGATAAAAACATAAGACAAAGAACTCCAGTGAAAATGTGTCACATA:1 - chr3L 6763237 3' + INE-1 253 1 66.34 GTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGTAAATAAGTACAAAATTCATTTGTCGAGAAAAAG:1 + chr2L 8740948 3' + Burdock 6357 2 64.36 GTGGTGGTTTATGGTACCGATGGGTCGGATTCTAGCTAAGCTAACGTGAAAACATTCAATGAATGAATCAATGAATTCGAGCCCGTTGTTCTTTGATATAC:1 - chr2R 11329529 3' - ZAM 7974 2 78.22 CTGCCGACGCCTGCTGCGACGCTGCCGACGCCCACACTTGATTGCTAGGGTGAAGCTCGTAGGGGATGGGCAGGGGTTGATTTGAC:1 + chrX 595920 3' + HMS-Beagle2 176 2 58.14 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTATTTGTTAAATGGCTTTAAATGATTAGGTACAAATCAAAGGATATTTCGAAATGA:1 - chrX 21401844 3' + roo 390 2 59.41 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAAATGCGATTTAGAAATGCAAATTAGAAATGCAATATGCTGGAAAGTATGCTTGGGAAATTTTTGACATTTAA:1 - chr3R 19144386 3' - Juan 8 1 60.40 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCACTTTTACAAAATCGTATGTTATGTTTTG:1 + chr2L 18694188 3' + P-element 2879 2 71.29 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACTAATGCGAACCGAGAATGTGC:1 + chrX 12538498 3' - roo 8719 2 81.19 AACTATGAGTCGGAACGACACTCGCGCCCAGCGTCAGCGCATAGTCATGACATCTGCGACCACCAGAACTTTAAGATTTCGTCCTTTATGTACATTTAAT:1 - chr2R 2540676 3' + F-element 188 1 64.00 GTGTANACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTACGACGTTGACTTGCGCACATGTTTGTTTGTGTTTGTGTT:1 + chrX 12546494 3' - P-element 37 1 42.57 AAAAATAAATAAAAAAAGGAAAATGCGAATCCGAAGAAAAGGGAAGCA:1 + chrX 2566402 3' + Doc2-element 245 1 68.75 ACAGCAATATTGACATCATACAGCGAGCACAATGAAAGAAGTGGCAACCAAGCGCCTTTACAAATATGTAACAATTCAACTTGTCCATATGCTTTAGATTA:1 - chr2L 16334512 3' + F-element 4302 1 64.36 CCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAACATGAGTTGCACACAGAGACTTGTCTGCTAATTG:1 + chrX 17542089 3' + roo 259 2 66.34 AGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATACTTATTTTTAAAAA:1 - chr3R 9254921 3' - F-element 226 1 57.43 ATAACTAAATAAATAAATAACTAAATTCGCGATTTGCTGCCGCAATTACGTTTCTACGGGTACACGAGACATTGAAGACGCAGCCCATTAATTGGATTACA:1 - chr3R 10136677 3' + HeT-A 26 1 71.29 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCGTGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGT:1 + chr2L 13060316 3' + P-element 2840 1 32.00 TCCCAAAAACACTAACATATTCTTTAAGCAAGCACAGAGGCTTCTCCCCATCGAATTCGACCTTCGCCTTGAATAATATATAAATGCGTCAGTCTGCTTTT:1 + chr3R 30325317 3' + 17.6 278 2 59.41 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAG:2 - chrX 6654719 3' - P-element 43 1 36.63 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAGTAATAACTTT:2 + chr2R 8378681 3' - pogo 19 1 60.40 CCGAAGATATTTCCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAG:1 + chr3L 21384019 3' + roo 354 2 72.28 TTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATGGCAAAAGAGAAATAAAATTAATATTGCAAATATGATGT:1 - chr3R 16004022 3' + jockey 4957 1 59.41 ATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAAAGCTTAGCTAGCTTCCTTTTTTATTATGTTCTAGGCTTTCCTCTTT:1 - chr3L 6110029 3' - copia 178 2 55.45 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGA:1 + chr3L 9925293 3' - Doc 42 1 63.37 AACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTC:1 - chr2R 12185335 3' + accord 7349 2 61.39 AGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAATAATTGTGAGCGGTCAAATGAG:1 + chrX 5443983 3' + mdg1 418 2 75.25 GCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACATACAATATAACCTAGTGCATCCATGCTGCATAAT:1 - chr2R 23303717 3' + I-element 170 1 66.67 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATGTTGTTTCAGATGTTGCTGCCATTGCTGCGACCGTGTGGGTATTTTGATGTATTCTATGC:1 - chrX 4796935 3' + copia 237 1 60.40 ATCAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTACTTGGCTATAGCCTTTCACCCTCTTTTATATCTAACCTT:1 + chr3R 19657515 3' - roo 8699 2 60.40 TCTTCACACGTCGGCGATCGAATTATTATTATATTATTATAATAATTAGTTGTCATTAGAAATAAAGGGGTCATTTCTAAACAGCTCATAAGTGATTTTGC:1 + chr2R 13643916 3' - F-element 15 1 58.42 TATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGGCAGCGAAATTGGCACTCAAAAGGTGAAAAACCGAGGGAAAACATTACCAGGATGTGAATGGACATGGTGTCC:1 + chr2L 7641027 3' - HMS-Beagle2 7141 2 77.23 CTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAAGTCTATGGCGGGAAATGTATTTCTACGAATGCGGTTTTCCCCTCTCTCTGTGTCCCACTCCACATTTT:1 - chr3R 16708987 3' + 1360 426 1 80.85 AAAAAATAAAATAAAATAAAATAATAAATTCTATTAAAATTGCATACATTAATGTTGAAATTCTATTTATTATTAACTACCTTGTTTAAATATTTTTTAGT:1 - chr3R 16799763 3' - transib1 1900 1 77.23 GTTGCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGGTCGAAGGAAGTTGGGCAGGTGGAAAGGAAGCTGGGCGAGAGTTTTGGGTTTGGGGGACTAATGAG:1 - chr3R 18901325 3' - 1360 14 1 77.23 TCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCAATTTGGGATTTTACATTTGGCCAGATGTGTTTATTAACAGATTGCGGACATCGTGTCTT:1 - chr3L 17011670 3' + roo 9046 1 55.43 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTTAAGAATATTATTGCAACAAAAACATAGGTATATCATTAATCATAAAGAAGAAA:1 - chr3R 19224840 3' + hobo 2916 1 56.00 TAACCCACAACAATGAACCCCCGACCAATTTACAACTTTGTAATCCCTTAAGTTGACGCCGGCCGCATTGCCGCTCAAGCTGAAAACGTTTCCAACAACAA:1 + chrX 9433752 3' + G-element 4204 1 53.47 TCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCACCTATAATTACTGTTGTTTCCCAATT:1 + chrX 20437716 3' + roo 408 1 60.22 CTCCGCGGTCCCGCGGTATTTCTACTGTTGCTGATTCCGTTTTGTAAATAGTATGAATAAAGAGAGAGAAATGACAATTAGTTATGGTTTTATATGCAATA:1 - chr2L 20117314 3' + Max-element 8383 2 72.28 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGTAACATTATCGATAATATAGTAATTATTTTTCATTATGCAACTCAATGTGGTTTCAGATATGGTAAGA:1 + chr2L 13740010 3' - 412 7 2 71.29 CTGAACGTTAATCAATAAACAACACAATCGATATTCAATTTTAATTTCACATATCATCTGCCAATTGTGCATATGTAAATTCCCTTTTTATTTGTGGCGGA:1 - chr3L 712516 3' + 17.6 359 2 39.60 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGC:1 - chr2L 15333721 3' - P-element 34 1 45.54 TTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCA:1 + chr3R 29660297 3' - mdg1 7076 2 63.37 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCT:1 - chr3R 30272811 3' + P-element 2849 1 41.58 GCACCNCAACCACCTAGCGAGAAATCTAACCCAGCTCAGTGTCCAATTATTCTTAACTACCTTAGCCTTTTTTCCACGATTTCTGCACCGCCATTGCGTGA:1 + chr3L 5627493 3' + F-element 4468 1 72.28 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGCAAATAATTGACTCTTTGTTGCCAGAATTTATACGACCA:1 - chr3R 15998053 3' - pogo 15 1 66.34 ATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACTAAGCCTGCAATTAAATAAGGCCAAAATAATTG:1 + chr2R 10863954 3' + mdg3 5456 2 70.30 TAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCA:2 - chr3L 17122412 3' + roo 9041 1 57.43 TTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTTGTTTTTACAACATCTATTTTTGAGTCAGCCAAG:1 + chrX 19095841 3' + roo 410 1 78.22 CGAATAAATAAATAAAAAAAAAAACACGAGCAACACGCAAAGGATCCGGACCCGGCAACAGTCCCTCCTTGGGACTCCGTGTGGCGACGTCCTTCGTCACC:1 - chr2R 14278141 3' + Tc1-2 479 2 77.23 ACTTANTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATT:1 - chr2L 11065884 3' + P-element 2840 1 34.65 TTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAGGCGACGACCTCCTGGAGTTCC:1 + chr3R 15386716 3' - I-element 5177 1 78.22 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAGGGATACACATCAATAAATGAAGGAGCCAAGTTCCGA:1 + chrX 14041977 3' - roo 8697 2 72.04 GTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATCTAAACAAGCAACACACACCAACTACTTCTCTCTACTGGCTCGCCACGCAAAATCTCTGAACAGGATAA:1 + chr2L 4828205 3' - copia 5065 2 66.34 AGATANCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTTGTGTATAGGTGTGAGTGCTATTGTGCATGTGTTTGTGTTC:1 + chr3L 15035204 3' - pogo 31 1 61.39 ATGATTTATTGTTTAAGTTATTGGAAAAGGCATAAATTCTTTGTACATAGCACATACAGAGGTACATAAATTGCATGTTCATGCCTCAATAGTTGCATGCA:1 + chr3L 10668714 3' - copia 185 2 56.44 ACAATTACGTTTTTGTTTTATTCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAAGACTCTGGCTGGCAGATGAAAGTGAA:1 + chr2R 21111192 3' - jockey 58 1 72.28 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAATCCATACTTAATGGCGAAATAGTTG:1 + chr3L 3951111 3' + pogo 2055 1 74.26 ACTTCTCTAAGGGAGTTATTTACTGTAACATCGAAGAAGACACAATTCTACAAGAACTAAAACGGAGAAGGTCAATGTATACGAAAATGTGGAGCTCATGA:1 - chr3L 14512228 3' + I-element 482 1 62.38 ACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCCGAAATATATTTACCGAAAAATCACAATTAAAATTTATGTCAGTCTACATAAAGAATTATATATCAGTGAAC:1 - chr2L 20928870 3' - INE-1 579 1 64.36 ACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTAAGAATGCTATTCATTCTTTTTATTTT:1 - chr3R 4543196 3' + 3S18 308 2 61.54 AGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTAACCCGCACATACATAAAGATATAGCCGCGAGTGTGTGTGCTTGCCGTTGCATAGCTGTAAACCAGTTGCCAATTGC:1 - chr3L 13924725 3' - Stalker4 7266 4 66.34 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGCGTACCTATATGAGATGCCACAGCATCCAGCTGGGGCA:2 + chr3R 26469528 3' - hobo 9 1 70.30 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGGTGCGATCCACATTCGTAATTACCAATGTGTTGATGCGGCCAAAGCC:1 - chr2L 15344131 3' - transib2 28 1 51.49 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTC:1 - chr3R 10457266 3' + roo 9046 1 53.47 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGGAAAATTGAAAATGAGAACCTGGCTATGGGTAAAGTCACCTCGTT:1 + chr3R 11496888 3' - Doc 36 1 56.00 GCGTTTTTAATTTCGGGAAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCATCAGCTGCCGCTCGTGTACAT:1 - chr2L 11551356 3' + Max-element 242 2 78.22 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATTAACTTTATGGACCGAGTGCATTGACTGGA:1 + chr3L 18009641 3' + roo 9055 2 61.22 TTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCTGCATACGCAATAAGCTGCATGTCCAATAAATAATT:4 + chrX 5443966 3' + mdg1 7439 2 58.42 ACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGACGCCTCTTTTTGTTTGATTCTTTTGTTGTTTCCAGCTGCACGCTCATCAAAGTCAGAAACG:1 + chr2L 3908557 3' + invader1 23 2 53.00 CCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGG:1 - chr2R 12185345 3' + accord 7339 2 71.29 ATATTTGAAAGCTATCTAGATCGGATTGGGTATATTGCAACAGTTTGCGCGACAGTTTTATTGCATAAGTCAACACAAGTTTGTGCTACAAAATACGTACG:1 + chr3L 10572742 3' - Q-element 643 1 78.22 AATGTAAACCATGATCAGGGGATCAGAATTACCGCAACAAGTAGACAGAACCGATTGCAAGAACGCCCAAAAAAGTAGCAGCGAAAATTGC:1 - chr2L 2734732 3' + invader3 5142 1 82.42 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACACACACACTGCTACTAATCAAATATTTAGCATACTTTTTAGAAAGCATATTAAAATAACATTTCCGGTCAGCTT:1 - chr3R 31884184 3' + hobo 2937 1 78.22 TTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCAAGCTATTTATTTTGAGGGCGGGGCTCAAA:1 - chr3L 9192563 3' - I-element 50 1 69.31 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATAAAATATTGAGTTCGAATATCTTGTCAGTCGCTACG:1 + chr2R 13038967 3' + P-element 2873 1 63.54 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTC:2 + chr2R 19936666 3' + roo 358 2 72.28 CCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTAACTT:1 + chr2L 16082681 3' - Stalker 27 4 52.48 CGGTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGCCCATCTCGGCGTCGCTTTCTGAGGCTTAAGTATTAGTTGGAATGCCAAATCGGATCCGCG:1 - chr2L 8040524 3' + INE-1 91 1 63.54 TATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATACATGTAATTCGGCAACTCGAAAATATTTATTTTTTTGTTTCATTATCAGTTTGTTAAAAGGTC:1 + chr2L 12074426 3' - Quasimodo 12 2 71.29 TAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGCCAGGCCATCAAACATGCAGTGAGCTTGCGCCATCGTCTCCGTTC:1 - chr2L 6255762 3' + flea 226 2 54.46 AGAAGNTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGCGGGAGTAATAGCGGAAATCGAA:1 + chr3R 11742303 3' - I-element 5098 1 76.24 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTTATTTATATTATGTATATTTCACGTATT:1 + chr2R 9375228 3' - HMS-Beagle 6841 2 77.23 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGA:1 + chr2L 17957307 3' + opus 7477 2 55.45 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAGCGTTCAGCATTTTATACTGATTTTTATTTT:1 - chr3R 12136286 3' - roo 46 2 70.30 GGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCTTGAACTT:2 - chr3L 17869892 3' + 1360 3380 2 45.54 GCATTAAGTGCGAGTGAAAGGGGCCGGGGATCCAAATTGATTGGAGTAAATTGAAAAAAAACGCATAGTTAGAATACAGAAGTAGAGCAGTAGGTTACGCT:1 + chr2R 6107108 3' - P-element 2827 1 65.35 CATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTGGCGCATCCGTGACCCGTATCATCGTGATCGAATGTGGAGAAGGGCATTCCCTT:1 - chr2R 22115735 3' - roo 8784 2 60.40 GTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACCTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAAT:1 - chr3R 556454 3' + Tc1-2 1589 1 57.43 TTCCCCCGTTGACCCCTCACCCTGAGTGCCCCCAACCCCTACCCTCCATTACCCGCCGATGTGATGATTTATTGCGGATCCCTGGCTTCCCTGGCTACCCT:1 - chr3L 11033257 3' - opus 264 2 72.28 ATGGAGATAATACCGAACTTCCACTGTAGAGGGAAGTATTGCAGCCTCACAATAGCGGATAACCAAAATACAATATGCTGCTGCCCATAAGCGAACTCATT:1 + chr3R 26483499 3' - BS3 372 1 54.46 AGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACACACTGCACGCTGAAGCTGGTTGTTCTGTGCCCTGCCTAACACATGAGAAGGAACAGAATTTTTCTAATTTCT:1 - chr2R 1320671 3' + diver2 4889 2 63.37 TCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTTTCTCA:2 + chr2L 18112576 3' - transib2 2578 1 51.49 AATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTC:1 + chr3L 27415308 3' - transib2 23 1 56.44 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGTTGCTCGCACGGCAGCA:1 - chr3R 13715057 3' - P-element 6 2 73.00 TAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGG:1 - chr3R 19450165 3' - roo 8698 2 70.30 ATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGCTATGCATAACATATTATGAAATAAAAGAACTAATACTTATTATGCCAGCCGAATAAAAAAAAAAA:1 - chrX 23352856 3' - F-element 338 1 64.36 GGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTCGTAGCA:1 - chr2R 9014432 3' + blood 7387 2 59.26 CGAACACACACATACACACATACACACACACACTCACACACCACGCTGCCGTTGTCCTGCACTCAATTCGTTTTCTTTATTTTCCATCAGACGGAAGTCAT:1 + chr2L 16215624 3' + accord 7028 2 62.38 GGATGNGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGGCAAG:1 + chr3L 23821876 3' - HMS-Beagle2 12 2 67.33 GATGCAAGTGGAACCTGCGTTAACTTATATTGTATATAGGTGCCTAAAACCGAATAATATTTCCAAAGTGGAAGCACCAGCACATATATGTTATTTTCCGG:1 - chr2R 9454215 3' + opus 494 2 75.25 AAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGTTTCAAATAAAACTTCTTCGTGTTCGGTGGTTCCATCGGAGTTGTGCTTGAGCAGCCCCGCATGCGTCAC:1 + chr2R 22736790 3' + 1731 4452 1 57.43 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTATAGAACCGACAATTTGATGATAATTACGC:1 + chr3R 26469491 3' - hobo 46 1 73.27 CGGAATAGCAAAACAGTTGTACAATAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGTAGCAACAAAATGAGTGCTATTCA:1 + chr2L 8533742 3' + Bica 404 1 74.26 CAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGC:1 + chrX 21907809 3' - accord 128 2 56.44 TGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTGATACGCTTTGGTTATATAACAGTCGCCAGCTTTTCTTCTTGG:1 + chr3R 28877485 3' + HMS-Beagle 209 2 63.37 CTTACGCTCTCAGCGTAAGCGAATGGAATGAGGAAGATGAGAAAATGGAAATTTTAGAGGCTTTTCCAATACTAGCTAGGTAGAGCGGAGCGCGTGTCACT:1 + chr2L 12085146 3' + 1360 3291 1 77.23 TTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTTTTTATTTTGGAAATTCTAAGGCTTTTGTGAGCTGGACGAGAGTGTGGATGTTGTTGGTGCAGAGAAGCCGACGGGG:1 + chr3L 5829205 3' - F-element 4677 1 74.26 ATGAACTCCAATTAAGAACACGAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTTTCTGTTAAATTGTCTTGTTGAAAGA:1 - chr2L 13740812 3' - 412 486 2 75.25 CATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATGTATATATATTTAGATAATCTAGGATTCGCTCTTTGTGTGCATTTATGTTTAATATGAATTAAACGTT:1 - chr3R 20845024 3' - 17.6 8 2 72.28 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGGAGTGGCAAGCTCTTTTGTGGCGCACAATCTATATG:1 - chr3L 5964227 3' - BS 11 1 57.43 CAGTGCACGAAATATAATATCATAACGTTAAAGTGCAACATATTATTGGTTTCTATTCTACTATGGTTACAAACTCTATTAAACATAAG:1 - chr2L 22644430 3' + Gypsy6A_LTR 36 1 66.29 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATTTCAAACGGGCGAAATTGTGGCGCACCATGGCTCTGGATGTGGG:1 - chr2L 7366557 3' - roo 8755 2 57.89 GTTTGCTAAGCGTTCGCTTTGCAAATTAGATTTATATTTTATGCATTTTTCAAGAAAGACATTGTCATTAAAACTTTACTTTGAAGTGTGTGATTCTAGCA:1 - chr3R 12445326 3' + Quasimodo 7239 2 62.38 GTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATACTTATATGTGGGCTGGGCAAAAGTTATTAAAATCAACAGCAATAAATTAGCATATTTTATGCTTTCAATGC:1 - chrX 13350734 3' - jockey 4762 1 73.27 CAATCTGATGACGACCCGACCCTCCGTGGATATCTTCCCGGAGGACCAATATGAACCAGCATACCCACGGTGAAGATGCCGAAAGTGGAGCTAGCCGCAAT:1 + chr2L 2204272 3' + R2-element 279 1 57.43 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCTGGTGCGGCAGG:1 - chr3R 31644121 3' + roo 396 1 64.29 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTGTCTGAACT:1 - chr3R 7522289 3' - blood 7024 2 63.83 AATTGATCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCTAAGAACTTCTACGGTGCTTGGAAATTATTTGAAATTTATTGCCTCCGAGGATTGGATCCTCTTGCTCCA:1 - chr2L 14291435 3' - 1360 255 1 55.45 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATG:1 - chr3L 21735386 3' - Doc 32 1 52.48 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTG:1 - chr2L 11065860 3' + P-element 2864 1 58.42 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAA:1 - chr2L 7459565 3' - BS 5025 1 54.46 GTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAAAGTGCACATAGGGGAGGAAGTTACA:1 + chr3L 18000630 3' - BS 78 1 75.25 ACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACCTTTTGGGGCTCGCTGTGCAGAGCCACCTCTGTCTT:1 + chr2R 5084325 3' + F-element 291 1 64.36 ATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGT:1 + chr3L 24208213 3' - Quasimodo 11 2 65.35 CTTTCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACAAATATTGCTCAAATATTATTGTTGCTAATTCGGCTAAGGGTTTTTCA:1 + chr3R 27740642 3' + 297 6756 2 66.34 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTAAGTGAGTACGGTTAGTAAGATATTTTA:1 + chr3R 19914394 3' - jockey 4809 1 71.29 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCAAAGCTTTTGTTCTAGTGCCAGTGTT:1 - chr3L 11070489 3' + P-element 2864 1 56.44 GACTGGGCAAGCTCGCGGACAATTACAGCGGTGCGATGCTTACATTGATTCCGCTGATAAGCCCCAAGAAACCAAAGACAAAAAATAAAGAGGGAGCAAC:1 - chr3R 6432380 3' - 3S18 5891 2 61.00 AATTCAATACCAACTTGTCCGTTTTGCTAAGTTGATATTTCAATTAGCCATATATTTTTACATGCAGCCATGTTTTTGGGCGTCAAAAAGACTCCATAACT:1 + chr2L 14693600 3' + I-element 4995 1 55.45 ATATTTTTTTTTTAAGTTTCTTTGCCTTTTTATCCAAACTTTTGTTGTATCTTTTTTATTTTAAGTCGCGTCCATTTTCCTCTCACATCTGCCATTTTTAT:1 - chr3L 10379900 3' - gypsy2 426 1 72.28 GTGTACTGGATGCCACTCCTGATGAGCATGGCTGCTCCTCCGCGCGAACTCTTTGGAGGACACTCGTCTGTTGTACTGCACCACCGGGGTGCTGCTGAACA:1 + chr3R 15839900 3' - G2 475 1 59.41 AGCTTGAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAA:1 + chr2L 12074547 3' + Juan 4175 1 60.40 AGTGGNGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAGCGCGCATCATCATCAAACATGTGTTGTTGGAATGGGTCCAAAACGGGCTGTCCCCTCCTGGTTCCCTAG:1 - chr3L 14240803 3' - gypsy5 6963 4 70.30 CGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGAC:1 - chr3L 25232765 3' + accord2 175 2 51.49 AATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCCGCCGTGTTTTTAATGGCGTATAAAAGCCGCAAGCCGTTGTACTTTTGGCAATTAGTCTCGACGAAACCCAACGAC:1 - chr3R 18905641 3' + P-element 480 1 73.27 AATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATTGGCACCAAGAATTCACTTGATTGAGTCAGATCATACACACTCCTTCTAGG:1 + chr3L 15001794 3' + P-element 2724 1 58.42 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAA:1 - chr2R 19192541 3' + roo 9030 1 69.31 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGACTATTTCAATTTAAG:1 - chr3R 12767028 3' - 412 42 2 68.32 GAACTNAACCAATAAATGAAAAATAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATTACTTAAATTAATAATTTGTTGGGTAATCATACACAAATTTCG:1 - chr3R 6431027 3' + 3S18 306 2 54.46 AATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATAGTCTTTTACGAATGCTATTCATTC:1 - chr3R 4543206 3' + 3S18 6053 2 75.25 GAGAGCGACAGCAGCGTGAGTGCCTTGAGCGGAAGCAGTGCGCCAACCGCAAAGACCCTTGCCTACTTATAAAAATATTACGCTGCCTCCCCGAACCGGGA:1 - chr3R 22871875 3' + R1A1-element 388 1 68.32 ATGGGCACTCTTCATGCACAGGTACCAGTCTATCAATCCGAATTGCTACCTTTTTCCAGCACGATCCCGAGCAGTGGCGCATTGTGTTCTTCATTGCAGCC:1 - chr2R 18808735 3' + Ivk 4945 1 57.43 ATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTCCAAGGGCGTCGAAA:1 - chrX 2589674 3' + copia 255 1 64.89 CATTAATAATAATAATAATAATAACATAATAATTTGTTTAGTTAACAAACCCAGACTCTCTTGACCCATTGAAATGGTATAATTATATCTATCTATCAAAA:1 + chr3R 5925249 3' + mdg1 7074 4 73.27 TACTCTCTCAATATAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGCGTGCGAAACTAGGCGGTAGGAACTAATCGGAATAAGTTTCAAAACTAAC:1 + chr4 691132 3' + Tc1 142 1 59.41 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTCCCCATTTTCCATT:1 - chr3L 10736454 3' + 412 7512 2 59.41 TAAGTAAGTAAAATAAATTAAAATATCATTGAAAAATCCGCTTATAATATTAGCAGTGTATCTTGTAGATTCAACTCAGTTTTCCCTATACCATTATCGCA:1 + chr3L 12714317 3' + HeT-A 1 1 78.22 GCTGCTCAGGGTTTATAACCTGGCAACAATTTTTATAAAATCGGACACAAGGCAATGGAATGCCGAAAGAGAAGAGCAGAAGAGAGGAACGAGGC:1 + chr2R 3021989 3' - Cr1a 477 1 63.16 CCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACAATATTCTTGGGCTACTTTATTACTTTCTTT:1 + chr2R 12446403 3' - jockey 4672 1 73.74 CGCCCACACTTTTAAAAAATGTTTAGATTTTTCTTCTATTAATTATTTGGCCTGTTCTTTTACATTTCTTACATTCTTACTCGTGGCAAGACGCAGAGCGG:1 + chrX 10547842 3' + INE-1 255 1 63.37 ATACCTTGACTGGCAGTCCCGGTGAGCTTGACAAGGACAGGAGAGGGAGGCAGATGCATTAAGATTAAAGACACATTCTCCCTGAGCTATCGGCTTACCT:1 - chr3L 959969 3' + Rt1a 4913 2 61.00 TCTGCNTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCACACGCTGCTGGGCGATTTTAGCGTATTGGTGAGCT:1 + chr2R 9862562 3' + roo 303 2 64.36 GCGCAGATAACGCAGAAAATAGCTTTAAACTGCTCATTTGACTTAGCTAGATTTACGTTGAGCAGCCGGTAACCCCCATCTCTTCACCGCCCCACCCCCC:1 + chr2R 23015820 3' - McClintock 6093 2 75.00 GATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAATTTCGATGCAAGTATAATTCCTTTTGACGCAGTGTGCCAGTT:1 - chrX 20364209 3' + opus 494 2 75.25 TATATTGACATAAAAATTTAACGAGAAAAATGTACAGATATTCTGTATTCACTTTATTTATAACCTTAAACTTTTTCATGTGTAGTCAGTAATCAAAGATA:1 + chr3L 10429747 3' - transib2 37 1 53.47 CGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGG:1 - chrX 6654693 3' - P-element 17 1 60.40 GAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCGGCCTAGAGAGGGCTGCGTGAGTCGTGATCGCGGCAGTCGTGACACGAAGAAGTTTT:1 + chr2R 16366848 3' - hobo 19 1 59.41 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGTATGTACATACATATGTATCGTTTTGGAAACAATATATGGAAATTGAAACACTAATATCTCGA:1 + chrX 14043907 3' + opus 485 2 56.57 AGTGGTCATAAATAGTGTGTTAGAGAGGTTTGTGAATTAAATACGCTTTAAAGTTGGTAAAAAAAAAAA:1 - chr3R 20243917 3' + invader4 2900 2 56.52 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGAAAAAAAAATAAAGAAAGAAAACCAAAA:1 + chr3R 14024860 3' - pogo 40 1 77.17 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAACACAATAATAATAATAATAGTATTATTATTAATGATCTCACAACCGTGAGCAACCGAGCTAAG:1 + chr3R 6186000 3' - 412 15 2 64.00 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCGTGTACTCGATTGTACAAAATAATTAAAGCGGGCTAG:1 - chrX 6997144 3' - P-element 6 2 73.27 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAGTAAATTTCTTTTGTTGTTCGGCTAGACGCTTAGTCGCTGTGTGCGAGCGAGATGGCGAACGGGCTAAAGCAAT:1 + chr3R 9852196 3' - hobo 4 1 75.25 TAGTCTTAAGCTGAGATCGAAAGAATAAATATGAACAGGCAATAAACAAGCACAATTATCAATCCATCCATTTCGGGAACAATTAATGATGACATGCAAT:1 + chr3R 27550824 3' + 297 281 2 81.00 GTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTATATAAATCTACTGATATCTTGTAGATCCAAGTCTCATCAAACAAAATAAACTATGATGTCGAACT:1 + chr2L 2435501 3' - roo 9030 1 73.27 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATGCCGTAAAAACATTTACGGCCGGTAGAC:1 + chrX 19306834 3' + P-element 2871 1 65.35 TATTATGTTCGTATATACTACACTGTATTTATCAAATCTATTTTTCTTGTCCATATGCACCAAGGAATGCCTAGAATATAAAGAAATTTAAATTTTTTTAA:1 + chr3R 5505324 3' - mdg1 7039 2 78.22 GATATTTTTTATATTTAAAATTTATATTCTGTTCATAAGAAGTTTTAAGTGTGACGGAAGTTAAATGTAGTTTAAGGACGCTTACATAATTTCCATTTCAC:1 + chr2L 17104655 3' - transib4 2576 1 28.71 TGCAGTAGTTTAAACAAAGAAACTAACTCTCGCATATTTTGTCTATTTTCTTTTGATATATTAGATATTCGCTGGAGATCTTTTGGTTGTGTTGTTTTGTG:1 - chr2R 3931635 3' + Cr1a 160 1 65.35 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATTATAGACTACTCGAACCCGTAAAGGGTTTAAAACGGAATTGTAAACGGGTTTCGGGGAAAATTGTTGT:1 - chr3L 5716852 3' + copia 250 1 71.00 GAATAGATCTGGAATGTGCACTCGCTCAATAAAAACCATCTTAAAATATCGAAATATAGAAAAAGAATCAAAACAAACAGAAACTGTTCATACCCTCGATC:1 - chr2R 8242161 3' + mdg1 7366 2 71.29 GAAGAGGGTACACCCCACCGATCTCCCTAACCGGAGGATAGTATAAAATATGACACATTAAGTAATTAATTTTATCAATCGGTCAAGAACGTTTG:1 - chr3R 24572473 3' + G5 4641 1 74.74 GCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTTTATTTCCACAAACCCGACAAACGATTCATGGAC:1 + chr3R 3320510 3' - 1360 42 1 79.21 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACTTAGCTATACAATCTAGGACAAGTTGGTATTAAATTGAAAGCCACCCTCTGGATAAAAATGAA:1 - chr3L 11461324 3' + copia 240 1 64.36 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCGCTAAGAGCCAATTAGTTTTGAATATTTTGCAGTTACTACAACT:1 + chr3R 13203063 3' - roo 33 2 62.38 AATGAAAGCTGTTTTAAAGGGACTTGGGCTGGTGGCTCTTTGGGGTCACCATTGGCATTGGCAGCGTGGGTGTGGTCGTCGGTGGCATTGTGTCGGACAAG:1 + chrX 6754753 3' - transib4 2444 1 81.19 AGCTGAGTAATGGGTATCTGATAGTCGGGAAACTCGACTATTTCATTCTCTCTTGTTTTTTATTTTCTCAAAACAATTCAGTTTTATCAATAGGACACAGC:1 + chr2L 17974191 3' + INE-1 545 1 60.40 CAATGCTTCTATTTTTAGCCCATGAACAGTTGTTTATTTACACTATGGACTGTTCTTATTCTCTTAGTCAACCTGCCACCACTTCTATCGATCTGCTTCCC:1 - chr3R 4570571 3' - Bari2 34 1 72.28 TTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTATTTAAAGTGTTGCAAAAGTTGCTATACTTTTCT:1 - chrX 19372983 3' - Doc2-element 233 16 52.73 TGATGNAAGTGCAACTTGCGTTAACTTTTATAATTTATAATTCACAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGTGTTTGGATAATTCCAAGCCATTTAAA:1 + chr2L 17957326 3' + opus 493 2 74.26 AGTTGNTTTTGTTTTGTTTAGCTTGAAGCTCTCGCTTCTGATTTTGAGCGTCGGATGCGCTCATATTTGTGTTTTGTTTATGGGTATCCAGGTGCTGGTCT:1 - chr2R 12414417 3' - Porto1 253 1 75.25 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGC:1 + chr3R 28326772 3' + P-element 2865 1 58.42 AAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAACGGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCCCACACCATAATAGTGGCACGTTCTGTGAATTGGGATCCTCTAGTCACTTTT:1 + chr3L 27360985 3' + INE-1 141 1 54.46 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTAGCCTCGAGAAATTTGCATTTTAGAGCAGTTTCGGTCACGTGAGATGTTTTGATTAGGGCACACATGTG:1 + chr2R 17127753 3' - roo 8 2 71.29 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATG:1 + chr3L 21384037 3' + roo 387 2 50.57 GAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAAAGCACACAA:1 + chr2L 11551397 3' - Max-element 8275 2 66.34 ATTACGATTATTATTATTATTGTAAATAAATAGTCACACAATGCAGAATGATTTATTGAAGTGAGTGAAGCAAAACATACTCGCTTCTATACAGTTTTA:1 + chrX 11470226 3' - mdg1 36 2 63.64 CGTTTGTTGTTTTTTATTTTCTTTGTGTGTTTTTGCGTTGTTAAGTGAATTGCCTTTGCCTTGTGACTCGACTAATTTCGTTTGTTTTTACTTTTGGCCGT:1 + chr3R 30298752 3' - gypsy7 5015 1 71.29 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATGACCCCAGCTTATCGCCTCGTG:1 - chr3L 12085174 3' + pogo 2052 1 77.23 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAAATCCATACTTAATGGCGAAATAGTTGGTTACTATTTGATTATAA:1 + chr3L 3951129 3' + pogo 2073 1 56.44 GTTTTATCTATTAACTTACCTGTTAACAGTTAGTTTAAGTTCCAATTAAGCACTTAAACATAAATAAATGCATACTAGGATTGAGCAGACAGACAAAAAAA:1 - chr4 894453 3' - Bari2 214 1 53.47 TTTATTTTTTTTTTTAAATTTTTCTCAAATTTTACCAAAATTAGATAGAACTTGTTGTTAAACGTGCCTTTGTGGTGCTCTTGGAATTTAGTGAATTCTTA:1 - chrX 888708 3' - TART-C 11096 1 50.50 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTACCAGATGCTCGACGTTCTTGGGCAGTTAGTTT:1 - chr3R 11993305 3' + P-element 2841 1 33.66 GGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATGATGTATCCCATACCTGTTCGTGAGTTGCGGTTGTGTGTGTGTGTGTTTGTGTGTTTGTG:1 - chr3L 5132044 3' - F-element 32 1 50.00 TACTAACTATGTCCAACCCCCAAACTAATCCTGTACTCCTCCTACTCCGCCCCCATGCCGCATAGTCACCCACTCGGTGCGCATCACCAACCTGCGGGTGC:1 + chr2R 22871956 3' + TAHRE 10288 1 79.21 ACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATATAACTAAAACTCATAATCAGTTCATAAAACCTCTTTATGGTTTAATAAATGGTAGATTACTAG:1 + chr2R 8245793 3' + mdg1 7445 2 62.38 AACGGNCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATGTATCGGGTATCTGGATTCGATAAAAAACGTTAGTATTG:1 + chr3R 20845117 3' + 17.6 459 2 67.33 ACTCCAAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACACACAGAGCTAATATGAATACAA:1 + chr2R 14947604 3' + P-element 2681 1 24.75 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAATGGCTACGAAAATTTAACTCATGCGT:1 - chr2R 8378587 3' + pogo 2078 1 54.46 CCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCA:1 + chrX 16798281 3' + diver 6089 2 56.44 GGGTTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCG:1 + chr3L 5015870 3' - I-element 4953 1 57.43 TTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTTGTATAACTTCCGCTTAGTTGGCATCACTGAGTGTTCTAGAATGAAA:1 - chr3R 21123444 3' + Doc 181 1 55.45 TATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGAGAAACCAAATAAAATCAAATGAAATTTACCGCCAA:1 - chr2L 14260258 3' + 297 231 2 65.35 TAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCGAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAA:1 + chr2R 14457763 3' - mdg1 7072 2 56.44 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTA:1 - chr2L 107986 3' + P-element 2865 1 57.43 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACACGTTAAAAAACTCCAAGCACTATCATTTCGTTTTTTTCCCCCTT:1 - chr3R 7388341 3' - HMS-Beagle 6828 2 58.42 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTATCTTAATAGCTTATTATCTAGTTG:1 + chrX 21401909 3' - roo 8713 2 77.23 CTTTAAATCCTATTCCGTCCGTGGTCGCCATTTTCGTTTTCACTATTTGACGCTTGTTTACTCATTTCCGGTTGCCGCTTGCATTGTGTTTCGTCCGGAGG:1 - chr2L 15955510 3' + Max-element 390 1 65.35 AAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAACAACTAGACCAACTAACGGTGGTGGCTAATGC:1 - chr3R 14324189 3' - 3S18 24 2 57.58 TCTTGGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTGGGTTTT:1 - chr2R 22231068 3' - gypsy7 5011 2 77.14 GGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCACCTCAATTCAATTTAACTTTCAACTTTAGCTCTCGCTTTCTCTCCGCTT:1 - chr3L 10811138 3' - P-element 26 1 55.45 CCGTANCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTA:1 + chr3L 19951249 3' + Ivk 5325 1 71.29 CGGAATGGCAAGCGGTCAACAGCTTCGCCGCAGCGATAACAACCGAGCTCAGAAGATCTGAGAGAGCCAGGAGGGTGATTTACTTGTGCTTTGTGTTTGTA:1 + chr2R 12223382 3' + Rt1c 5222 1 75.25 GTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCATTGAGGCTTCGCT:1 + chr2L 21007076 3' - Idefix 31 2 65.35 TGGGAACAAAATAAACAAAAAACCTGCCACGTGCCTGGAATGGTGTGATATCATTGCTACCATTGGTAAACCAAAACTCACTTTCTTGTTAACCCGCTAAC:1 - chr2R 21137578 3' + Porto1 153 1 75.25 TTTCATTCTTTTTTTTTTTGTTTCCCGCAGGGGGAATTTTCATTAAAGCATTTT:1 - chr2R 18063879 3' - transib2 2642 2 85.19 GAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAACCATATGTCGCTTTTGTAAAACTTGTAAT:1 + chr3L 2024411 3' + copia 252 1 72.28 GTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAACCAAAGATGTTGCAGCATCCAAAATCTGCTGACGAACAAAG:1 + chrX 6458266 3' + blood 7388 2 76.29 ACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGCATAATATGCAGTTCACTAAAAATA:1 - chr2L 9389071 3' + 1360 3339 1 77.00 CTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGGCGTGGTCGGATGGG:1 + chrX 15195313 3' + Transpac 296 2 66.34 GATGCAAGTGCAACTTGCGTTAACTTATATATAGTCACACGTCAGCATATCAGCGTACTCACATTATTCTCATCGAAGACACGAAAGACCAGGGAGGCAAA:1 - chrX 18200706 3' + opus 7497 2 75.25 AATGAAAATAAATTGTACTTTTGAATTTCAATGCAAAAATATAAAGGCCTTTCAGTAATTGTCACAGGGAACAAAACCCATGACCTCTATTCGACAAACCG:1 + chr2R 2961860 3' - 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chr2L 17932612 3' + P-element 2789 1 18.81 GCTCCTCCGCGCGCTCTGCCAGATGGATGGTTGGCAGGGATGACATCGTAGCCGCTAATGCTAAAATGGGAGCCAGAATCAAAAGTAGTGTGACATCAATG:1 + chr2L 8169491 3' - G2 442 1 75.25 GACAANAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTTTTTACTTAAAGCAAAATTGGTTAATAATTTTTTTAATAATAAATTATGACAAATTAATAAA:1 - chr3R 24250461 3' - Tc1-2 1601 1 67.33 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCGATCCCCAAATGCACCCCAAAAAGTATGCAACGCC:1 - chr2R 16366778 3' + hobo 2898 1 62.38 GCGTATAAGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTCGGGTATTCTAGGGTCTTTGGTTAGATGACTTCGAGCAGAAATAAAAACCATTTTTGCTGTAT:1 + chr3L 19350009 3' - 1360 3215 1 43.00 ATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTCTATTTTCTATTTTCTGCTGTCTGCGCACCATAAAATTGTTTATATTACT:1 + chrX 8409013 3' - pogo 2062 1 66.34 GGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTCTCACTCGCAGGCTATAGCTGTCTC:1 - chr3L 10811395 3' + P-element 2755 1 25.74 TCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCGGGGACGCGGCTCTCAAAAGAACTGGTCACCCAAGGCGACTTTCGCATGGAATT:1 - 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roo 42 2 68.32 TAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGC:1 + chr3L 25232907 3' - GATE 8271 2 50.50 AATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTCCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCGGTCTCTTTCTCTTTTCCTGGCTGTGCCACA:1 - chrX 10089020 3' - FB 47 1 73.27 GTAAAAAAAAGAACAGGAACGAAGGAATGAATATAATGTGCGTAATCATTTCCACTTAAATAACATTCAATCTGGCTGTACTCGCAGTTTTATTGCTAGAA:1 + chr3L 21930340 3' - Cr1a 4347 1 69.31 AAGATCGCGTTCTTCCATCACTTTGAGTGTGTGAGTGGATCTCGAGTGGGTTTACAAAGGTTAACCAAAAGGGGAGGGGGGTTTTATTTCATATGGGGGT:1 - chr2L 18149833 3' - Porto1 337 1 73.00 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGC:2 - chr2L 18112526 3' + transib2 2774 1 75.25 AATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGC:1 - chrX 21087606 3' - mdg3 36 2 72.00 GCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAACCCCAATGCCGCAGACCCGAGAGACAGGCAGATTTTTCCCGAACCCAGCGGTTGGGTATAAA:1 + chr3R 21296575 3' + P-element 2875 1 68.32 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGGTCGGCGTTCCGCGGGAGCTGAGGTGATATCAAACCATCGATGGCGCTACTGAT:1 - 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pogo 6 1 75.25 GGAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCAC:1 + chr3R 7522376 3' + blood 7363 2 52.48 CCAGATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAG:1 + chr3L 21384031 3' + roo 9030 1 60.40 TTTGTTGAAATTTTTATTAATTACCAAGGCACACACAAAAAAACCCACTCAAAAACGTGCAACATTTACAACAAAATTTTATATTGTACAACGGATCACAC:1 - chr2L 14952760 3' - Transib5 2603 1 64.36 GTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTACTTACCTGATCTATTTACCATTTAGCCCAACTAATGACCTTTATTTTTGAACATAGCTTCAAGTGCCCTT:1 + chr3L 9928942 3' - blood 7334 1 69.31 CCGAAAATCTGCAACCACCCTGGAAAAGAACATGGCATACACCTCTGGCATACCTTCTGATTTAACTGAAGATCCGGTAAGTAATGCAACAAGGGCTTTGA:1 - chr2R 4901821 3' + G4 3365 1 78.22 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAATATGTGTCTTATAATCTATAATTTTAGG:1 - chr2R 12779110 3' + roo 9022 2 74.00 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATATATGCATGTGTATTTATGGTATATTTGTATATTTGCGTTACTGCGGAGGAACTTTAACATATGG:1 + chr2R 7255893 3' - 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Tc3 274 1 52.48 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATATATCCATGTTTGTTGCCCTGCCATGGCTGTCCCTTTATTAGTGGG:1 + chrX 15195299 3' + Transpac 282 2 58.42 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTGTCCAGTCATTCCAGATAGGGAATGGGACCCACACTCAAGGCGGA:1 - chr2R 19857327 3' + 297 369 2 56.44 GTCTGTAATGCCAATCTTGTGAAAATGGCTGTGAGACGGCAATGCCCCGTAAGAAGGTCTTAGACTCGGTAGTGGAGTGGGTAGAGCTCTACCGCCAGCCA:1 + chr2L 22298951 3' - baggins 5172 1 55.45 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAAT:1 + chr3L 23821838 3' - HMS-Beagle2 50 2 80.20 TTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATAGCTTAGGATCGAAAGCTAAAGTGATGTACATTTTAGACTGTTCAATTATTAAATAACCTTAACCTAAACA:1 - chr2R 6779744 3' + 17.6 487 2 73.27 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTCCTCCCCCCTCAAGATTTGTTTGTCTTTGGGCTTCTTTTTCTGCGGCT:1 - chr3L 8783453 3' - opus 7148 4 68.32 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAATCGTGTGTTCTGG:1 - chrX 6654736 3' - P-element 60 1 19.80 ACGAACATAATAACAAAAATAATAACAATAATAATAATAAATTAATAATTTGTTTGATTGTTGCGCTTCATTTAATATAAATAATAATAGCTTATTTGGGT:1 - chr2L 2499872 3' + mdg1 7049 2 55.45 ATATAATAATAAAAATAAAAAAACAAGTAAATTGTAATGAGAAGAAACTGAATAAGCTCTCCCGCCCATATATCAAAATGTACGTCAATTTTCATGCTTGG:1 - chrX 579746 3' + Rt1a 5071 1 57.43 GTCGAAGGACCCAATGTCACATCCACCAGCTGTGACAACATGAAGTTGTGGAAGTACATAGCCGAAAATCACCATGTTGTGCGCATCGAGGATCTGACCAA:1 + chrX 9167568 3' + flea 4639 1 68.32 GAAAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTTTCCTTCGCACTGCTATTTTTCTGCCCGCCGCTCACGCAGCTTGACCACATCCGCATCTATGTTGGCCGCTAG:1 + chr2R 18170815 3' - HB 56 1 56.44 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAATGGCTACGAAAATTTAACTCATGCGTGCGAGTGAGAC:1 - chr2R 8378576 3' + pogo 2089 1 65.35 CAGAGAAAGGCCAGCTCCTTTAAGCATCTTACAGCTAAAGGTAGCAAAAATAAATATACAAAACCAAACGGACAATGGCCAACTGCAGCTGCATTTTGAGC:1 - chr2R 11934324 3' + roo 489 1 52.48 ATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATAAGGGATCATTGACGGCCCTTGAATTGCTATTTGTAGACAAGGCACAGTCTTTTTTCGGC:1 + chr3L 23821873 3' - HMS-Beagle2 15 2 64.36 ATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCCTTGGCAACTTAGCTCTCTGTGCAGTTGCATGTGCAACATCAAGGG:1 - chr3L 11909931 3' - Tabor 6857 2 56.18 ATTATGACAAAGAATCTTTCAAAGGGAAAGCATAATGGGTTTATGAAAATGTTAAATTAAATTGTTCATTGACTTGAATAATTTTGTGCGTTGTCAATTTT:1 - chr2L 17108708 3' + 1731 4216 1 57.43 ACAGATGTGTTATCATCGAGCTCCGTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGC:1 - chr2L 11219887 3' + Doc3-element 16 1 45.54 AACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCAAGTAATAACATAAT:1 - chr3L 17122398 3' + roo 9055 2 63.37 TCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTT:1 - chr3R 7100985 3' + pogo 2075 1 55.45 AACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAATCCCTTCGGCCTGCCCGCCCTGGTAAGTTGGACCCGAAAAGCGGAAGTGGA:1 + chr2R 16423596 3' + Idefix 7029 2 51.49 ATATGATAATATGAAATAAAGTTAAATTTGTTTTTGTTGTGCAGTGTTGGCCCAGGTGGAGATCAATAAGCTGGAGAGCCAGAAACTCAACGAGATCGAGG:1 + chr2L 19301093 3' + Dm88 4392 2 78.22 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAACGAGTGAGCACATGTATGCGTTGTTCATCGGAA:1 + chr2L 2197175 3' + P-element 2883 2 74.26 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCTAAAGGACACAAGAAACTAATATGTTTATGAAATAAGAAACTTAACCG:1 + chr2L 8542913 3' + P-element 2859 1 51.49 GTCTTTATGGATACTTGTATTTGAAATAAAAATTGAGCACCAACCACTCCGCCCCTCCGCCCTTAAAAATTTAATTTTCAATTATTGCTGACTTTGCTTTT:1 - chr3R 14257916 3' - G4 3542 1 64.36 AACCAAATAAAGATAAAATGACCAAATTTTTTTTTCTTAACTTTCATTAACATTTTTATTTAACTTTACAAAGTTTTTGTTATAGAAATATAATATTTTC:1 - chr2L 7351072 3' + mdg1 361 2 80.00 CACTATGGCTTTCTTCGTTATCGCTGGTTTTTGCATCTTGAACTAAAGAGCGCACGATTTCATCATATAAATTCAATATTGTGCTGCAAATTGTATATGAG:1 - chr3R 19622974 3' - pogo 1682 1 65.35 AAAATAAAATTTTTGTTATTTTTCAGATGTATTTTTCAGCTTCTTTTTTGAGTTCGCAAAACGACCAAAACCAAAGCCAAAAACGGGGTGTAAGCCAAGTG:1 + chr2R 21546815 3' - HB 328 1 59.41 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAGTTAATCCTTGAATGCCAATTAGTAATCCAAAGGATCTTCAT:1 - chrX 21396668 3' - F-element 46 1 60.40 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGTTGAAATACATATGTACATAA:1 + chr3R 25285153 3' - roo 14 2 64.36 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTATGTGCATGTTACCACTTTTGATTGTGATTTAGAATACTAAATACGTTATAGCATCTT:1 - chr2R 5485055 3' - 1360 20 1 59.41 CCCATTACTATGATGCCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTAAACAGTGAGTCAGAGTGGGCCAAATGGAAAGTAATGTTAACTCAATTCCCCCCATGGCATT:1 - chr3L 2434539 3' + diver 6090 2 57.43 TTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGTCTATTTAAAAAAAATAAAACAAAAAACCTCTTTTTGTAATAACCCGGTAGTAACCCCGTGGTAACCCA:1 - 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chr3L 23716528 3' - flea 221 2 74.26 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCTCTTGAAGTCGCTGGCAGTTAGGCCCAACGTGGGTTCCAGCCGCCCGACAAGCGTTTAAAAAGGTT:1 + chr3L 14240917 3' + Tirant 8495 2 66.34 ATGCTGACCCTCGGACTAGAGCGAAATGGGGAGAAGAGAGCAGTAAAGTGAAACTTGAAATTGAATAAAGCCCACAGCATGGGTGGAAAAGGAGAAGGGGC:1 - chr2L 17209371 3' + jockey 4719 1 81.19 TAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATCTTATTATCTCTACAGTCAAAGTTTGCCTTGAACTTTCTAA:1 + chr2R 17006547 3' - I-element 5313 1 65.35 TATTATTATTATTATAATTATTATTATTATTTTATAATTAGATTATTATTACGAAGGTATTACCTAATCCAGAATCTAAGTTCTCAGCACTTTTCAACCAA:1 + chr3L 21482918 3' - mdg1 40 10 75.25 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCA:1 - chr3R 25823657 3' - hopper 42 1 65.35 GTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGGGAGATTCTAGCGTAGAAGCAGGGCAGGAATTAGAGTGAGAAGACCGATTACGGCGG:1 + chr3L 11710702 3' - P-element 268 1 65.66 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTACATTTT:2 + chr2R 16898305 3' - Max-element 39 2 63.37 GCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCATAAATTAGCGACAGCCGATAAGTAGGCAACATATTTGTGTGGATATCTGGCCTTTTTTT:1 - chr3R 29466271 3' + hobo 2935 1 67.42 TACAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTCATTCATAAAATTTTAAATGCAGTTTTTAATTTTTTATATTAATAAAGCACTAGTCCAG:1 + chr2R 25050029 3' - 17.6 7048 2 69.00 TATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCTGATCGCTAAGGCCTTTGGAAATGGTTGTGGTGAGAATCAAGTGTAGGCGA:1 + chrX 16803425 3' - diver 6050 2 58.42 TGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTGTGTGGCGCTCAGTGGGTGCCACTGCGTCTGTGTGGGTGGGTGTGTGTGCGTGTGTGTGTGGGG:1 - chr2L 8284837 3' - accord 180 2 56.47 GTTTATATGGATGATATAATAATCTTTTCTAATACAATTGAACAACAATGCATCTAAATCAACTTATAAGTGCAGCAGCAAAAATCAAAACATTAAAAAAC:1 + chr3R 1966455 3' + TLD2_LTR 40 1 53.47 AAACCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTATGGCTTTCTTGTTTTTTGGTTTTAAGCAGCCTATTTTCAAGAACATCAA:1 + chr2R 14507414 3' - pogo 1729 1 66.34 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATAATTCAATATATAATATTCAGGGCAGCAAAGGTAAAGATTTAGTAGTGAAA:1 - chr2R 8245700 3' - mdg1 7064 2 53.47 GATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTT:1 - chr3R 19450184 3' - roo 53 2 51.49 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGAGAACGTTGTCGAATTTCGAATAAAATATTGAGTTCGAATATCTTG:1 + chr2R 13038955 3' + P-element 2856 1 48.51 GCACAGTCACGTTATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTTTTTTCCCTCTATTTGAGTTTAGCCTCGTGCGAGCGTG:1 + chr3R 20603610 3' - P-element 474 1 39.00 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAGTGAGCTGATAATTATAAATTTGTCATGACATTCTGAGATATCAACAAAATTTATGCTAGAG:1 + chr3R 14095010 3' - Doc 20 1 65.35 CACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGCTTAAGTATAAATTAGTTTGTAAGCCAATATGGCATTATAGTTGCTTGTGAATGAAATTTTGGATG:1 + chr2R 13605634 3' - I-element 14 1 51.49 TTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCGATCACTGTTACTACTGGCCGTGTCAGCCATCCTTTTCTGTGCTGCAGT:1 + chr2R 13256717 3' - P-element 417 1 49.50 CTCCGCTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCGACTGCTCCAAACGCTGGTATCCTTGCAGCAGGTTGCTCGTGGGTCGCACGTCACTTGGGCCTTTGTTTGCTGC:1 + chrX 7214480 3' - TART-B 156 2 61.39 TTATTCATAGTTTTTTTTTTTCAAAAACTCAAA:1 - chr3L 3629412 3' - Doc 4595 1 96.97 ATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTGCATCGTTAATCTTCTGAAATTCGAATCCTCTTGCGAGTGC:1 - chr2R 23305390 3' - I-element 6 1 70.30 TTTCTACGCATACAGTGACAGCCAACAAAATATAAGAATGGCAAGAAATGGCAATTGAACATTGGGTGAATGGCCTCTCGGGTTAATGCTGATATACTGGA:1 + chr2R 13440036 3' + 1360 146 1 76.24 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCAC:1 - chr3R 14049358 3' - transib2 43 1 68.32 TTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAACAAAAAGAGACAGCAGCACTGTTGAAATAAAGAACCAAAGGCCCCCAAAGTACGCTAAGTAC:1 - chr3R 26899366 3' + jockey 4619 1 71.58 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAAAAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGGGGGTTCAGCAGCTGG:1 + chr2L 11686050 3' + hopper 1361 1 79.38 CTCTCCCACACAAAATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTGCTCTCGTGCGGTTCTCTTAATCGTCTCTATCCGAGGTATGTCCAACTTCAACTCTGCTGTG:1 + chr3R 1848669 3' + Cr1a 314 1 57.43 GCTAAGTTATTTTCATGTGTTCTTAGTCTGTCTAATTTTTTTATTCCTAAGACTTTATGGATACTTGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTG:1 + chr2L 22091196 3' - G4 3628 1 74.26 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACATATATGCATGAGCTTTTAGAAATCATGTAGACATTAGTT:2 + chrX 5515808 3' + 297 360 2 69.31 AATATTTTAAAAATAATTGGTAAAACAAAAAAACATTCAAATTTAGACAACAAAAAGTCTGACATTTACAAAACAAAACCAAGAAAGAACAGTCCAAACAG:1 - 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jockey 4679 1 65.35 CGCCCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCACATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCCTGA:1 + chr3L 22016760 3' - 1360 92 1 90.10 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCTCGGACAACGA:1 + chr3L 8974157 3' + P-element 2863 1 55.45 TCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTATGCCCCACGCCTGTTG:1 + chr3L 5015892 3' - I-element 4931 1 66.34 TCAAATAATAAAAAAAAAACATATACAAATGAAAAAAAACAAAA:1 - chr3L 9697898 3' + Rt1b 5146 1 95.45 ACCCGGATGACAATAGGTCTGCATTTTCGGCTATGTACTTCCAACGCCCACTCGACTAACATTGCTGGCAGGCAATTGAAATACACGCATTCGAACAACAA:1 + chr2L 3745078 3' - flea 4708 1 61.39 GACTTCTGTGAACACGACCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACGAGTACATGGCGAGCGGCAAGTAATTAAAAACTGTTTTTGCACTGCATATTT:1 + chr3R 28728346 3' - jockey 32 1 53.47 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGCGGATGCTCCTGCTCCCCTTCGCTTCTTCTTCGCTCTCTTAAGCG:1 - chr2L 13060266 3' - P-element 32 1 47.52 ATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTTAGTAATATTATACACAAATTCATTGGTTGC:1 + chr3R 11165694 3' + Tabor 440 2 68.32 TCTCAAGCAAACTCGATATGGCGACAAAAGGATGCTGCTGCAGCAGCAGCAGAAGCAGCAACTGCAGGAGCGAGAACCGAACGTATCTGGCGGATACAGCA:1 - chr2R 9649384 3' + G5A 2366 1 78.22 GAAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAA:1 - chr3R 14324221 3' - 3S18 58 2 79.21 GTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTTTATGCCCCACGCCTGTTGCGGTC:2 + chr3L 5015897 3' - I-element 4926 1 71.29 CGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATTTGCTATATATGGTAGGACCCGCTTCCTTTTGCCACGTTGTCCGCACTATTGCAGG:1 + chr3L 23240512 3' - INE-1 93 1 78.65 CGCTGATGCTAAAGTGGGATCTGGGTGAGAAGATTTTGATTTCGTTGTAGTTGTTCTGGTATCCATTCATGTTCGATTGTAGTAGTTTTAGGGTTAGTTAG:1 + chrX 20144405 3' - G2 390 1 56.44 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACATATTCTGTGTTTGGGGACCGTAACTTTTTCAAAAATAATTTAAGCAATTGAAATTAATCAACTAAGCAAT:1 - chr3R 10320998 3' - roo 4 2 75.25 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCG:1 - chr2L 15333730 3' - P-element 42 1 37.00 AATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCTGCAGGACTCTATCGAAGCGAGGACACCCGCGCCTGGACATTGGTCATCATTCATCAAAGTGAAATGTTGATT:1 + chrX 14126226 3' + R1A1-element 78 1 77.23 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGCATACTTAGCA:1 + chr3R 4986359 3' + roo 9044 1 56.44 GGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTCTTGTTCTTTTGATTTCTCAAAACCGAAGTCTTCCTAATTCACGGTGACTGTTTAGTTTGAT:1 - chr2R 21159086 3' + roo 283 2 61.39 AACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAATCATTCGATTAAAAT:2 - chr2L 7459562 3' - BS 5022 1 51.49 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTCAGCCGATTTGGGATGTT:1 + chrX 4488933 3' - 412 7084 2 56.25 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACGTACCCAGCCGAGCTG:1 - chr3R 25823622 3' + hopper 1408 2 68.32 TTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAGGGCG:1 - chr2L 21580875 3' - INE-1 499 1 66.34 GCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAA:1 - chr3R 25702166 3' - Tirant 8119 2 68.04 CCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACATCTGCAGCCGCTGCAGCAGCATCCTCAGCTCCTGCAAAGCGGCAACCAGCACAAAATGCAAAACGAGGCCG:1 - chr3R 8237698 3' + F-element 399 1 79.21 TCCGCTTCTCTGCCGACTTCACCAGGCAGCGAAGGCGCACTTCATAGCCTAAAAGGAATATTGTATTAGCTTTAAGAATCAGAAACAAATAAAACATTCAT:1 - chr2R 5039407 3' + gypsy11 284 2 80.20 ACGGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGCAGCCAGCGAAATATAAATGCAATAAAATATTTTTAATGGCTC:1 + chr3L 5313250 3' - Cr1a 4380 1 55.29 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGTGCAAAAAATGTGGCTTGACTTATCGATAGTGCGCGGCCGTCGATTTT:1 + chr3L 833432 3' - P-element 14 1 57.95 CGATAAAAACTAAAAATAATGGTTGGGCAAACGTTCTTTGTTGATAATATTTGGCGTCGACGATGGGCGAACTCAGATGTTGAACATCTCGGAGAATTATA:1 - chr2L 22212865 3' - FB 364 1 54.46 ATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATATTTTCTATAATTTTGTCTTTATATATACATATATTTCATTCTAAAATATCATTT:1 + chrX 23457221 3' - Stalker2 23 2 54.46 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCAAATATAATCGCTTCTTGCGAAGTTTTATTACTGTTGCCTACTTCC:1 + chr2R 5850020 3' + jockey 4951 1 60.40 CACTGGCGGTTGTATTTATAAACACTAATTTTCTTTTTTAATTTTAGTAACTATTTAATTATTTCTAACAAGAGTATTTAATAAGCGGCTCTAGTTAATAC:1 + chr3R 21695534 3' + 3S18 6103 2 76.24 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAACATCTTAAGGCGAAAAGGTGCGCAGAACTCAGGTAAATCACGGCATCTGCAACCCTTA:1 - chr2R 20838586 3' - 1360 15 1 64.36 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTGCACTATTTATTGATACTTTATATCCTATTC:1 - chr3R 22620205 3' - 297 6622 2 71.29 CAACTGAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAG:1 - chr3R 7522309 3' - blood 40 2 60.40 CATAGTTCTACGGTTAGCCAGGGAAGGAAAATTTCTTATCGTTTGGATTTTGCAGGCAAGTCAAGATGTTTATTAATAAATAACATATAGCATAGTCTAA:1 - chrX 20243022 3' - Cr1a 4009 1 74.00 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAACAACAGAAA:1 - chrX 10653545 3' + jockey 4967 1 59.60 AAAAAAAAATTTGGGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGAGGCCTGAGTAAACGTTGGAGGGCCGGCTGGTGGTCATT:1 - chr3R 25674269 3' - hopper 133 1 62.77 TTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTAATAGGTGTTTAACTTGCTGGGCAAACTCGTTTACCTGG:1 + chr3R 28478315 3' - 1360 3326 1 44.55 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGGAATGAAGCAGAAATGAGCTTAAAGCGGCGAGCAAAGACAAAGATCGTGATCGTGGGCAGTG:1 - chr3L 8063816 3' - P-element 14 1 65.35 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAGACAATACTGGATATATATAAAATCTCAATAGCTCATTCAGTATTTGGTGATAATG:1 - chr3L 15056300 3' - BS 5015 1 77.23 GTGAGTTAATAAAAAATTCGCGGTCGGCATTTATAAAAAAAAAAACAAAATAATACAAATAGAGGCATAGTGGGCCAGTAACTGATTGCAAACCATGCTGC:1 - chrX 15571978 3' + HMS-Beagle2 451 1 70.30 AAGGGCGAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTCCGATAGTCCTTCGTTTTGCA:1 + chr2R 22606013 3' - Juan 4029 1 74.26 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAATGCTTTGGTGAGATACAGACTCAAACCCGATCCATTGGGCAGCTACAAAATG:1 + chr3R 14639440 3' + roo 407 1 77.23 TGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTTCATAATGCCTTAATTGAAGCGCGACAACAAAAACCGAATAATGATTATGCATATCAATTA:1 - chrX 5018618 3' - opus 18 2 61.39 GGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCT:1 - chr3R 28755926 3' - 3S18 5786 2 58.42 AGTACGGTTTCCAGAAAGCTCCGTTCCCTTGGGTTGTATATCGTTATTTGTATTTTGTCATCCATTGCCCGCTTCTTTTGGCCAACACCGAATTTTCCATT:1 - chr2L 7128771 3' - Rt1c 5147 1 73.27 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATTAACAGCATGCAAATTAAAAGTACTCAACAACACATCAACTGACCAGCTACCAG:1 + chr2R 19936694 3' + roo 9050 2 60.40 TAATAATAACTTTAAGGCAATACAAAACAAGAATTTTTCGCATCACATGAATTAAGGAGCCACAGCAGCAGAATCAGCTAACTGCAAATGTTCAATACAAT:1 - chr3R 15590959 3' - 1360 303 1 57.43 TTATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGATCCTTTGACGTCAGATTGCTAAAAAGTTATTCGAGTTTTATTTTACT:1 - chr2L 808835 3' - I-element 4950 1 52.48 GTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTA:2 - chr3L 25889012 3' - gypsy8 307 1 77.23 GGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATGCATATGTATATGTATCCGTACGCAAAAACATAATATTGTAAA:1 - chr3R 14644537 3' + Stalker4 7144 4 73.27 GACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACATGGCCGTAAACCTCCCACTCACATGGCGCAAAAGTACAGTC:1 + chrX 4501384 3' + Quasimodo 25 2 59.00 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGTTGAAATACATAT:1 + chr3R 25285145 3' - roo 8684 2 57.58 ATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTATTCGTTATCAACACTTG:1 - chr3R 19467872 3' - Transpac 4949 2 59.41 GTAAAATCTTTTTATTTTAAGATTTTCAAAACAATGAACTTAAAGATAAATTGTTTATGATATTTTTTCTCTTGCAAGTCAGAAATATGCATCATACACTC:1 - chr2L 13248783 3' + P-element 2584 1 40.59 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCC:1 + chr2L 1626598 3' - roo 37 2 62.38 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATTTCCACATAATTAATAGTTATTATGGCTACGCATTTTGGC:1 - chr3R 22277141 3' - 297 6611 2 67.33 AGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCTTCTCCTTGGATAATAAGCTGAATAGGCGTATGACAATAAGCTATGTAATTATATGGCATATCAAA:1 + chr3R 8198581 3' + Tirant 391 2 71.29 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTTAG:1 - chr3L 18154128 3' - I-element 22 1 53.47 CAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATCTGT:1 + chrX 329085 3' + opus 474 2 55.45 AAAATTCACTCATCGTATTGATGGGCATTAGCAACAAAAATTTATTAGCATACTTTTGACAGACAAAGTGTGATGGTTTGAAACTTCAGAGTT:1 + chr2R 17816702 3' - transib2 2355 1 76.34 CAACTGCCGCGCTATGCTTTTCATAGTACAGTCAAATATATACGGGGCGACTACCCACACCGGGCTGCATCTCGTCTTCGGTTTCCGAATCCTCCAGCT:1 + chr3R 11675969 3' + Tc1-2 38 1 65.66 ACATACACATACACACACACACACAAAACCATTCTGCCGAAAAAGTAAGTGAAAGTTAATGTGAACGCGCTTGTTTACTCTGCGGCTTCTGAGGCAA:1 + chr3R 18831914 3' + Quasimodo 29 2 80.41 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTTCCATAGCTTCACATGGTGGTAGAAGTAAAAGCTGTTCTTCACCAAATAC:1 + chr2R 3188754 3' + 1360 3364 1 52.48 ATATGNACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTTTGATATGCACAGTGCT:1 + chr2L 21978158 3' - 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I-element 4997 1 61.39 GCTCCCCTCGCTGCTGCAGCTGATCTTGAGTGCTAACTAGAAACATTCTAGCTTAATTGCACCGGAAGTGCCGTCGTCCAAGAACATTATTTGCTGATGCT:1 - chr3R 18470631 3' - G6 399 1 72.28 CATAAAATCATGTATCCAATAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAAT:1 + chr2L 12074542 3' + Quasimodo 112 2 50.50 ATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCG:1 - chr2L 12074494 3' - Juan 4054 1 50.50 GCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAAACAAAAAATTAAGTTAACAATTTTTTCGATATATTTATTTTCAAATTTAATAAC:1 - chr2R 16744107 3' + opus 482 2 53.47 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAACCTCGCACGAAAACACA:1 + chr2L 1626617 3' - roo 8682 2 56.44 AAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATCATCATTCCCCTTATGCACCTTTTCCACCTTTCCTAAAGGCCATCTTGCAGGATGACA:1 - chr3R 19447972 3' - mdg1 104 2 62.38 CGTAGCTAATGCTATACTACCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATTTATACTCAAAAAAATTTCTTTGAA:1 - chr3L 5015828 3' + I-element 5302 1 81.19 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCGAATC:1 + chr3L 21384053 3' + roo 9059 1 63.83 AAACACTAACATATCCTTTAAGCACAGAGGCTTCTCCTCATTTTCACAGTATGCTTCGTTGCAGCGATCTCTTTCCCACCATAGAGTGCCATCTCTTTCCA:1 + chr3L 19083419 3' + 17.6 284 2 58.42 GTGTGGGTATGTGTGTGTGTGTGATGTGAGTGCAAGTAGTTTTGCTTAGCTTCGATTTCCACGTCCTTGTATTAATATGATAAAAATTTCAACAACTTCGT:1 + chr3L 7426237 3' - 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chr3R 9369951 3' - roo 52 2 82.18 ATTACNATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTATG:1 + chr2R 6984385 3' + HMS-Beagle2 271 2 68.32 AAAAAAAGTAAAAAAAAGACAAAAATGCAGCAAGGAGAGAACTATGCATTGTT:1 + chr3R 8142785 3' + gypsy7 5009 1 90.57 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTGTGCTACACAACTCGCGTTATCCTGGCGGTTGCAAC:1 - chr3R 29660243 3' + mdg1 7418 2 67.33 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTGTGTCCAGTCATTCCAGATAGGGAATGGGACCCACACT:2 - chr2R 19857336 3' + 297 6941 2 65.35 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTA:1 - chr2L 108015 3' + P-element 2847 1 32.22 GGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTC:2 - chr2L 7170399 3' - jockey 4655 1 75.25 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAACGAATCTCCCTGCCCCTCACCTCCTTGCATTTGATTCACTG:1 - chr3R 10457243 3' + roo 406 1 76.24 ATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTTTTTTCTTCTAGATTATCCTACTGCCGTGTG:1 + chr3L 4022818 3' + roo 8803 2 69.31 AAAAAAAATAAAATAAAATCGTGTCAAGAGAAAAACCCGAAAGTGCAAGGGGTGGACTAACTACAGTAGTCGGGCCACTTCAGCACAAACTGCTCGCTGCC:1 + chr2R 9766966 3' - transib1 1897 1 73.27 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAGCGTTCTCGG:1 - chr2L 107976 3' + P-element 2878 2 69.39 TATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGTAGATG:1 + chr2R 6779849 3' - 17.6 6951 1 57.43 GATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTGGATAGTTGGACAGTGAGTGTGACATCATCAGCGACTTAAGTCGAAAACGG:1 - chrX 6605045 3' - opus 436 2 55.45 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCTCCCTCTCTCGCGGCATCACAGCGAATTCGCCGCACTTTTAGCCGGTTGTTGTGTGTGTGAGATTTCGAAATC:1 - chr2R 13038859 3' - P-element 3 2 76.24 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCAGAATTATGACAAATCTT:1 - chrX 4890008 3' - 297 2 2 78.22 TACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAAAGCACACAAATTATAATTATTGAAAGACC:1 + chr2L 11551417 3' - Max-element 20 2 59.41 AGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTAAAAATCAAAAACAAAAGCCATGGCTGAAGCTGTTATGCTTATTATGCCAGGCATGTGAGTTAATTCTTCGA:1 - chr2L 18219150 3' + P-element 2565 1 60.40 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGGAAGATTTCCCAAGTGCCGAAGGCGACCAAAGAGA:1 - chr2R 17127646 3' + roo 391 2 61.39 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACCAGATGCCGAATACATTTATAGCTTATTTGCTCCCTATTCCAACATGAATCATTCATGCC:1 - chr3R 12894088 3' - blood 19 2 56.44 TTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGGACCAAGGCCAAGTA:1 - chr3L 17122408 3' + roo 9045 1 54.46 CTGCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCTCTAATGTCTATACACTTCTGGATGAAAAGACGTTTTCCAGCCACCTCTCTCTTTCTCACTTTATTCATTT:1 - chr2L 18021101 3' - invader4 217 2 55.45 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACATTTATACTAATATATTGGCATGTATTGAATTTTAGTGAACAAA:1 - chr3R 13202986 3' + roo 9049 2 57.43 ATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGACAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACA:1 - chr4 260885 3' - INE-1 253 1 44.55 GCTAAGTTTATTATATAAAGCAATTAACCCATAAGTCTCGAGTCGAAGGCCCCCGGAAAATAAATCTTATATCTTATATCTTTATACAATGCTATTAGCTA:1 - chr2L 8959596 3' + Ivk 5273 1 54.46 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTA:1 - 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chr3R 14169227 3' - blood 7022 2 64.36 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAATATAGAGTTTTGGAATTTATTGTGGTCTAAAAAGAAGTCAAGA:2 + chrX 8948679 3' - blood 34 2 58.42 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAATTCTTCGAAAAGATAGGTAGTATACTAGAGTCGGGATCAATTAA:1 + chr3L 13994297 3' + P-element 2883 2 73.27 GACGGCCAAAATTGCTCTCTCTCCCGTTTAATAAAATTAAAACAAATTTTCAATGAAATTTAATATATGCG:1 + chr2L 17011238 3' - 1360 3317 1 80.28 TAGGAGAAATAGTTTCACGACTTTATTCTTTTGATTTTTTTTTTAATGTTGGGATAAAAATAGCTAATTATATCCAATCCATAAAAAAAAAATCAAAAGT:1 - chr2L 7673289 3' - 297 6890 2 56.00 ATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGGTTTAGGATTATTATGGGGCAGGGTATATCGTCCTCGGGCGAGGCAACGCTCGTCCTGGGGCCACCTGT:1 + chr2R 4297314 3' - Quasimodo 84 2 75.00 TAGATCCGACTGGGTCGCATTACACATACAAGCCCACTTAATAATAATAATAATAATTTAAGGCAAAGGTATAATTCAGAGGGTAAGTCTGCAGGTTCTTT:1 + chr3L 25350813 3' + baggins 5406 1 52.48 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCACCTCAATTCAATTTAACTTTCAACTTTAGCTCTCGCTTTCTCTCCGCTTTCACCACCCCTTGAGCTG:1 - chr3L 10811120 3' + P-element 2879 2 73.27 CATTAGCGTCCAGGTTATGAGAGGCAGTCACGGTTGTTTGAATAAGAATGAAAAAAGCATTTTAGTAGAAAATTACATTTTCGGTGGAACAAACTACAAGG:1 - 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chr2R 4200539 3' - INE-1 542 1 74.26 CGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTCTCTCCAATCCATTAAGTACCATTCTTGAGGAGCGAGGCACACATGTGATTCCCCGTCTGGCA:1 - chr2R 20938829 3' - F-element 352 1 58.42 TTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTATATATATTATATTCTTCTCCTTCACATCCAAAAGTGTATTTGTTGAGCTTGACTTTTCCCCCGCTGGCCA:1 - chr3R 9952171 3' + Ivk 5357 1 60.40 GTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATAATAATAGAATCTAATATTTGCACCA:1 + chr3L 8924620 3' - Stalker2 46 2 67.33 ACGTGNTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 7373 2 64.52 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATAAGCATATAAGTAAATTTTTTTTAAATGCGCAAACTAAAGCCCCTTAATATAATCCAAAG:1 - chr3R 24729570 3' + Juan 4203 1 55.45 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGAAAC:1 + chr2L 2197143 3' - P-element 30 1 47.37 CTCGCGCATACACGCACACACACATGCGCGGTCGGGATAGTGTTGGATCACCGGAGCGAAGAGCGGGACATAGATTTGTGACCAGACAACCAAGAAAGG:1 - chr2R 19881662 3' - Stalker 447 1 67.68 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTGCCCTACTGCGTGCAAATGTCCTAAAAAGCATTTGTACTTC:1 + chr2L 4189435 3' + 1360 3356 1 60.00 ACGTTAATTAGGCGCTCTCTTCCCATCCCTAAATGTTTCCGGAGTCGAGGAGTCCCCTTGTTTTTATTTCAGTTTCTCGTTCAGTTCGTTAGTTGGCCAA:1 + chr2R 13477073 3' - Quasimodo 430 2 77.00 CCTCAGCTGAGGGTTATGAATCGTGCATGCCATCCAAGGACATTAGATGGTATCTTAGTTAAGTATATGGAATTAGTTAGCATATAAATTTGAAAAAAGAG:1 + chr3L 11280257 3' + Rt1a 4992 1 55.45 GTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGGTGAATAAACGATGAGTGGCT:2 - chrX 1427504 3' + Bari1 1703 1 75.25 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCACCTCATCTGCATCTGCAGCTGCATGGGCATCTAATGATATTG:1 + chr3L 17122479 3' - roo 8699 2 61.39 GACGCACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGAGTTATTGAATTAAATCTGTCGGACTTAACTCTTCGTAGTAAAAAGGTAGCTGTTGATACTCCC:1 + chr3L 13669826 3' - hobo 2748 1 69.31 ACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCACCATTTTTTGTTTTTAGTTTTTTTTTGCTGGCCCATTGGCCATTTGGGAT:1 + chr3R 24599141 3' + hopper 90 1 69.31 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAGGGTAGAACTTGCCCTAATCT:1 - chr3R 18960404 3' - hopper 11 2 64.36 ATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAATTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCA:1 - chr3R 6769710 3' - 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Quasimodo 25 2 59.41 CAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATATTTTTAAAACAATTACACTGTATTTATCCACTATCAGTATACATGCATGGA:1 - chr2R 7540570 3' + Stalker4 7320 2 71.29 AGTTACTCATCTTGTTATTCTAATGTATTTGACCCGACATTTCGACGTTTTTACGGGCGTGACCAGATTGACTCGACATTATAAGATTGGTTACAAATTCA:1 + chr2R 1442325 3' - 1360 10 2 55.45 ATCTGTCTTAAAAAAGTATGGCAATAAGTAAATCTTATAAATTAAGAGGTAAATTCAGTAAACAACGTAAACGTGTTTTGTTTAGAAATTTCTCATTTTTA:1 - chr3L 23590304 3' - G4 3823 1 67.33 AGATCTACCTAAAATCTCTACTGATCTCTGGGTCTCAGCACCCGAGTTTTGCGCAACCAGCACCGTAACTCAATGAATACACCCATTAGGAAAACTCTGTT:1 + chr3R 24703516 3' - R1A1-element 5107 1 72.28 CTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACTTATATTTGCGACTAAATAATGTTTAGGTGTTCC:1 - chr3L 18576719 3' - springer 41 2 69.31 TGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCG:1 + chrX 16798264 3' + diver 184 2 63.37 GTTTTTTGTATAACAATATTTATTTTTTTAGTTTTTATATTTATATTTTATAATAAATCCACTAGTTAGCCTATTTAAATCCTATTAACCTACGATCTATG:1 - chr3L 3279715 3' - Juan 4069 1 66.34 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATAATACAAGAATTCTCCTTTGACTATGTTAATATTGAATTTATA:1 - chr3R 18881502 3' - roo 8699 2 61.39 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAAAAATGAAATCAAGAAAAAAAAAAGAATTAGCTGAATCATCTAAATATATAGTAAACTGGTTCGTCTGCATG:1 - chr2R 17682401 3' + jockey 4964 1 73.00 ACAAACACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTACTTACAAATAAATATTTATTAATTTGCATGATGATCATAACCATCAAGAGT:1 - chr3R 21500914 3' + roo 387 2 55.45 AATTTAAAAACATTAATGATAAAAAAAATTTAATTTCACCGGGCAAAAACTTGGCTAACATCATTATGAAGATTATGACGTTAGTCACATTATGCATAAAT:1 + chr3L 16222477 3' + looper1 1818 1 61.39 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTGTGTTGCCGCCCCGTTTTATGTCGTGCATTAATGTAACGATGCATCATTTATGCCATTTAT:1 + chr2R 14381367 3' - hobo 13 1 65.35 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCACATAATGTAGAATGTATTTAGAAGAAACATGTC:1 + chrX 1235471 3' + P-element 2847 1 39.60 GTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATGTATATGCTATATTGTAGGATGACTTTTTCATTGAATTGTTGA:1 + chr3R 21848166 3' - rover 6982 2 64.36 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTAACGATAGATGATTTGGCCCCATTTTTACGTTTTCTGCCT:1 - chrX 12294665 3' + blood 7383 2 72.28 AGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACTCGGTTTGGACTTCAACTTGGTTGTCTGGTTTCTCCTCCTGCTCCTGCACCTCATTCTCAATCGGAACTTGATCT:1 - chrX 15187149 3' + Transpac 224 2 75.25 CTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAGCACCTCGTTATGATTCTCATTCATTGATGCTGCATCGTTAATCTTCTGAAATTCGA:2 - chr2R 23305406 3' - I-element 22 1 54.46 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATATATGCATGTGTATTTATGGTATATTTGTATATTTGCGTTACTGCGGAGGAACTTTAACAT:1 + chr2R 7255889 3' - 297 6590 2 67.33 TTAGGGACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCAGCACACAGATTCTACCCATCTTGTCACGCCCACTCTAACGCCTACAAACCGCACAAAACTGCCACGC:1 + chr3L 19271021 3' + INE-1 154 1 73.27 AGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGG:1 - chr2L 15956048 3' - Max-element 46 2 68.32 ACTCTGTACATTTAGTCTTAAGCCGACATTACTTTAATAAACAACCAGAAAAGTGGGCGTTTCCGGAACCCGCAATAACTGTCAAATATCAATGTGCCCAC:1 + chr2L 8748542 3' + rover 219 2 60.40 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAACGGCAGTCCAAGTGCTTG:1 - chr3R 7522297 3' - blood 7039 2 51.49 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAAGGCACACCACACTTCGTG:1 - chr3L 21841273 3' - P-element 9 2 70.30 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGA:1 - chrX 5443889 3' - mdg1 7074 2 62.38 AAGCATGAAGTGTACGTGGCCAAAAGAAATAAAATGAATAAATTCAAACAAAATTCAAATTCTTGGCGGGTCGATAGGGTCGCGATCTGTCCGCATAGGGC:1 - chr2L 17402521 3' + Stalker4 479 1 62.38 ATTGTTATAATTATTGTTATTTCACAAAATACTGCATTAGGACTAAGTTGTACTTGCAACAACTAAATTAACTTCGAAAATGCGAATTTCTGATTAGGTTT:1 - chrX 7711106 3' - mdg1 18 2 62.38 TAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTACAGACGGTAGTTCCACTCGGCTTGATCAATTGTTGATGGTTAATAGATTTTTTTAGTATTAACAATCGTAT:1 + chr2R 330540 3' - gtwin 7 2 72.28 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCACCTCAATTCAATTTAACTTT:1 - chr3L 10811167 3' - P-element 55 1 26.73 CTCTTCCAACGCTACCTAATCTTAAGAACCCAAGAGCGAGGCTCTCCCGAAATACATACCAAGCCATTAAAGATAAAGAAGAAATCTGGATTGGGTAAACC:1 - chr3R 14158981 3' + 297 173 2 53.47 TTTAATGCTCATAATTATATAATTATTTAACATTTTGCTTCTGTTTTATCTCCCTCTCTTTGCAGGTGAGATAACATTTTGCTTCTGTTTTATCTCCCTCT:1 - chr3R 8852143 3' + jockey2 3273 1 69.31 ATCGCTTCTAAATAAATAAATATATATAAAAAATTAAAGCTTGGAAGTTGAGACTTATAACGCAGAAAAGCATTGATTGCCACATTTTCGCAAAATTAACT:1 + chr2L 19364157 3' + BS 5085 1 55.45 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGTTCA:1 + chrX 20437690 3' + roo 9037 1 63.37 CTAGANTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGAGGGGGGAGGGGAAACCTTTTGGCTGGCATATCAAACTGCAAATCGCCGAG:1 - chr3L 471682 3' - 297 6628 2 53.00 ATTTCTATCGATTTGCCAAAAAACGTTATGCCAAGCCCACTCTAATGCCATAAAATCGAGCTAACAATAAATTTTAATTAAGAGCTAGCGAAGTAATCCTG:1 + chr3L 22639551 3' + INE-1 310 1 56.44 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACAAATTTACACTGACGTAGAACCCGCTCGAAATAGTAAC:1 + chr3L 5827940 3' + blood 7358 2 59.78 TGCATNCTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGTTTTGTTGCGTTTCGGGTTATATGTATAGCAAACATAGTT:1 + chr2L 20939588 3' + hopper 1379 1 58.42 TATTTATTTGATTATTCTGATAAATTTAAAATGCTGGAGGCTATTCTAACTTAGTCAACTTGGGTCTATCCACCGCTAAGCTAACGCAATCCCAAATGCTT:1 - chr2R 3920910 3' - jockey 4819 1 72.28 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTATAGTTTATT:1 + chr3L 18009612 3' + roo 360 2 76.24 AACAATTTTTCAAAAATGTGGGCGTAGCAGTTTCTGGATCGCTCGATAGTGGATTACGGTGCTTAAATTAAAGAATGCTTACTACTTCAACATGGGCTTGG:1 + chr2L 59774 3' - INE-1 374 1 74.26 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTG:1 + chr3R 13423355 3' - 17.6 6962 2 69.31 AAATAACTCCCTTAGAGAAGTTTAATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTCATCTGCAATTTTTGTTAGCTTTTGAGTTGGTTACAACCTCAACTAG:1 + chr2R 18294924 3' - I-element 481 1 79.21 AGTGGTAGCAGACAACTATATGTGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATCCGTGAGATGCCTGCAGCGAAC:2 - chr2R 19386727 3' + 1360 159 1 60.40 CTGGCATTTATTTTCCATATATTGATTGCTTTTTAATGGAAAATAAATGCCAGTCACCCAGCCCCATTCGTCCTCATCTCATTTCATCTAGTTAAGAGCCT:1 - chr3R 19717775 3' - transib2 267 1 65.35 GTGTGTGTGTGTGTGTGTAGGCGGCTGGAGGCCGTGGGTGGTGGCTGTTTCGTAATTATAATCTTTTTGCACAATTCATTAAACGCAAATTATGCCCCAGA:1 - chr2R 19050969 3' - accord 7100 2 51.49 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAAC:1 + chr2L 1626601 3' - roo 8698 2 59.41 TAAACCAATCACTGAAGAAGAAATTGCGTTGTGAAAATGAGGAACTGCCTTGGTTATCGGGTTGCGTAACAC:1 + chrX 14885239 3' - Bari1 264 1 66.67 AACATACACACACACACACACACACGAACACAGAAAGCGAATATCTCGGCAGAAAAATGGCTTAGAACTGTGATAACAACATTAGTTCATGTCACCATTG:1 + chr2R 10266235 3' + accord 253 2 56.00 TTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGAGTAGGTGTATTCCAGCAAAAACGGTCTTCAAATTTTGATATACGA:1 - chr3R 29331955 3' - F-element 337 1 54.46 ACTAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACACCTCTTTCCCGGAGAAAACGTCAAAAAGCTGATGCAATAACTCAACTTTATCTATAGAGAGAACATTCATGA:1 + chrX 16725937 3' - jockey2 3359 1 77.00 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTT:1 + chr3L 6024577 3' + roo 400 1 69.23 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTGTAGATGTCTCAATGGCTTTTGTTGTGCTATCTCAGATCTCAGAGTGATTTC:1 - chr3R 6185908 3' + 412 7522 2 53.47 AATCTTCGGGATGGTAACCTTCTCTTGCTGGTTAACTCCAGGGAAATTAGTGACAAATTTATCAAAGTGACTTCCTTACCAAGCCTTTCCTCTGTCCCCAT:1 + chrX 21464408 3' + Ivk 441 1 79.21 TAGCACTCACCAGTACATTCGGGCGCTGCTTCGTGCGGTGCAACATTGACGAATCCATGGACTCCACCAACTCCAGCTCCACCTGCCACAGCCCCATGATC:1 - chr3L 16522833 3' + BS 90 1 66.34 ATGTATATACAATATGTACAATATGTAAGAACACCATGTACGGGTAGCTGTACCCAAAGACAGCAACAGTGCCGTCTTAATGTCTTTCTAGTTTAAAATAG:1 - chr2R 18726455 3' + Stalker2 264 2 67.33 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAGTGGTAGTCAATCCATCGAACTGTGCTCCTTGCATATATACCAGGCTGGGGCTG:1 + chr3R 10321101 3' + roo 401 1 65.06 GTCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTATGTTATTTATTTCATGTATGTATGTTATTTCATCATGGTGACGACCTCGCCGCAGTAGATCGCT:1 - chr2L 2197102 3' - P-element 13 2 32.67 ATTTCAATAATGTATAATTCATAACCGTCTTCCCCTTCAAATGCAAATTCAAAGAACACACATCCTGTCCTCTATTTCTATTCATTAACAGCAAAAGATCC:1 - chr2R 13336246 3' + hopper 199 1 71.29 GCAGACCTAGTATCTTTCGAAGATTTCCATACCTCCGCGATCAAAAATGCGAGAGTTCGGGTCTTGAGATTAGAACAGAGTCTGGTTGCACTCAATTATAG:1 + chr2R 23111076 3' + R2-element 3544 1 59.41 AGCGAGAATGCTATAGCCGAGTTCCACGACTATCAGATACCTATTACTCAGCTAGTGGGAATGCGAACACGAAGTTTCCATGTTTTCTTGCATAAAAAACT:1 - chr2R 12849641 3' - INE-1 576 1 77.23 TAATAATATTCTAGTGTCTTTGGACATAGCAACTTCTTGCGACAGCAGCTGATATGATGTCGACGCTCCCCACCCTTAAGTGGACCATTTAACATAAGTGG:1 + chr3R 17615193 3' + Tc3 310 1 73.27 AGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATATATAAGTCAAAGTAGAAACATATTGTGCATATTG:1 + chr2L 8959968 3' + Ivk 5333 1 69.31 ATATAAAATAAATAAATAAATAAAAATAATCTTATATAGTTTTAGAACATGAACATTTCATCATAACGGTAAGTCCAGTTTATGTTAGAAAAGTTGTATCG:1 + chr3L 15211168 3' + Doc3-element 80 1 80.20 GTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGCCATGGGCACCTGATAGACAGGACTGTCAGTGGGCAATAGTGGACCCTTGTAATCTGTGGCTA:1 + chr3R 22409221 3' - X-element 4333 1 68.32 TTGCTCCGACAAGCAGGGTTAGAGGAATCCTATCGCTGTATTAGTCGTCTCTTAGATAGGGACAGTAGGAATCTCGTTAATCCATTCATGCGCGTCACTAA:1 - chr3L 23112566 3' - R1A1-element 4889 1 53.47 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGATCGGCCTAGAGAGGGCTGCGTGAGTCGTGATCGCGGCAGTCGTGACACGAAGAA:1 + chr2R 16366843 3' - hobo 24 1 54.46 AATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGC:2 - chr2R 6984310 3' - HMS-Beagle2 18 2 61.39 TAACAAGCAGAAGGAAGCGTTTCCGCCCATATAAAGAATATAGATGCCGCATTGGAGGAGCGTGGGCGTGGCTAATCGCCCGGCAATCAGAGGCAGCTAAT:1 - chr3R 6751526 3' + INE-1 33 1 66.34 TTGTTGTGCATCCATACGGTTCTTTTTTGTACACATATACTGATTAGACATTCCCTTTTTATCGCCGAATGCATTTTTTGCATATAAATTACAAAAAAAAA:1 - chr3L 11047242 3' + rover 121 2 52.48 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGCCCGTTTA:1 - chr3R 9981473 3' - jockey 4768 1 68.32 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGT:1 - chr3L 543443 3' + P-element 2826 1 18.81 TTTCGGCCCTAAAATCGTCTTCTAGCGTGTAAAACAGACATTCAGTCAGTTCTTAAATAAGTTCTAAGAACTTTTTAGCTCAGAATTGGGAAATCTTACTG:1 - chr3L 23592936 3' + 1360 3190 1 56.44 AAACAACACCAAAAAGCACTGCGCAAAATAATAAACAGGTTTCCATTCCAAAAGGGAGAACCTTAAAACAAAGAAGCTCTGCGTAATGCGGGGCACAG:1 + chr3L 14967613 3' - Cr1a 242 1 78.57 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATCTATGATTTCTTTCTCTGTAGGTCAAACGCTTGACAATGGGC:1 + chr3L 6024630 3' + roo 404 1 75.25 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCGAGGCTATGTTTCGCAATAAAT:1 + chr3L 17699364 3' - 412 7109 2 78.22 CAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGACTGGATGTGCGAGCCAAGGTGCAGGGGACTAAGTTATCCGCGCGGC:1 + chr3R 7178290 3' + F-element 4474 1 54.46 TGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGTGGGTTCTTAACTTATATATTATGTTTATATATATTATATTTATCCCACTATATAAATGGTAAAAATAGCGA:1 - chr3R 25510323 3' - opus 7024 2 68.32 CTAGACGACTAAGTATCGCAGCCCAGAGCCATCGGACAACTACGAGAAGAAGATTGAAACGCCACCACCCTCAAGACCTGACTGATTTCAATTAAGCTTCC:1 - chr3R 19051953 3' + jockey2 3121 1 80.20 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAAAAAT:1 + chr2R 14457769 3' - mdg1 7066 2 50.50 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGCTGAAATAAAAACGAATTTGATTCCTATATC:1 + chr3L 6024589 3' + roo 9026 1 72.28 ACTTGTTTGTAAACAAAACAAAAGTGTCGGCGACACAAAAAAAAAATTTATATATATGTGGATGAAAATTTCAAGAACTTCTGCCATATTAACAGCGATAC:1 - chr3R 17825025 3' + Penelope 731 1 62.38 AGAATATAAAATAAAATAATATTTCCTTAATTTTTTTGATTTTTTCCCAAAACTAAAGACACCAAATCTAATGTATTTCCTTGCGAGACATTTGAT:1 - chr3L 10295022 3' - transib1 1900 1 82.29 GCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATTTGTCAATTGCTGTACATCGGGCACAAGCCCGACACACATACGCCCTGTTGGC:1 - chr2L 8653801 3' + R1A1-element 19 1 58.42 AGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAA:2 + chr2L 12074547 3' + Juan 4175 1 62.38 CTTGAGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTT:1 + chr3L 20895014 3' + invader3 5349 2 71.29 TGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATG:1 + chr2R 6984381 3' + HMS-Beagle2 290 2 65.38 GCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACCTTTTAAAACCCCACTCCGCGTCTCATTAA:1 + chr2L 11551388 3' - Max-element 8261 2 66.67 TAATATAGATCTAAAGCCTAAGAACTTCTAAAGTGGCTGCTGCTGTATCTGTGCCAGAGACAAGATTTCACAAAATTTTTAATAGATGTCACGGAAATCGA:1 + chr2L 20115885 3' - 1360 242 1 70.30 GTTTAGTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTGATCGATGGCTGGAAAACAATCAAATGCGCAGATTCGGGAAGATAGCGAAGGCCTTGGGCAACAGA:1 - chr2L 6959744 3' - Idefix 287 2 43.56 CTTGTCTTCTTAATTTCTCCTGGTTTACTTTCTCCTCTTCGTCTTTTGGCTTCTTTTGTTGAGTATTTTCATCTCTTAGCCCCCATCCCGCATTATTCGTA:1 + chrX 12544158 3' - TAHRE 324 1 52.48 CTCCCCTCTTAATCGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGCTGCTTTTTCCCTTCCGGCTCACATAAAATGGT:1 + chr2L 16139821 3' - HMS-Beagle2 6861 1 67.33 CAGTGAAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATAGAGTGTTAGACATGTCTGTGCATACAGACGAAACCAGTGGAGAGACTACGAAGCACTACCTGGT:1 - chr2L 236294 3' + BS 4817 1 67.33 GGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATTTCTAACTTATAATTTATATAAATTTCATGACTTTAGTTTCCTCT:1 - chrX 20974849 3' + opus 7475 2 63.37 AAGGTTAAGATTCAGCATACATATTCTGGAGGCATAGACGCAGCGCAAGATTGTTGACCCATGTTGGCACGCTCTAAAACTACCACAAAATGAACAATATA:1 + chr3L 19683591 3' + INE-1 174 1 79.21 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTAACATTGCGAAATTGATTTTTCATCTGCTAGCGGTAC:2 - chrX 12546439 3' + P-element 2849 1 41.58 ATTTTTGTATATTTATACTTATTTAGCATAAAGTTTTGGATAAAACTAAATGAATGATTTTCAAGAATTTAATGTTCTTGCTGCTCTTCTCGTGCGTTGAG:1 - chr2R 18320057 3' - Stalker 87 4 86.14 ATTGCNAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATG:1 + chrX 19306807 3' + P-element 2844 1 38.61 TGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATAATAAAAAGTAAAAAAAAAGTGCATTGAAATCAGAGTC:1 + chr3L 17921196 3' - Quasimodo 36 2 66.34 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTTCTTGGGGATTTAAAGTTGTGGTTTGAGTTCAGAAACTCACACTCCCTTGGTTTTTT:1 - chr3L 18154130 3' - I-element 24 1 51.49 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTG:1 + chr3L 9925287 3' - Doc 48 1 69.31 GACCGAGGGGCGCTGCCGTACAGCTCGATTCGCGAGAAGATATAGACGCGATATAAAAAAGAGAACGATGACGATCTTGGTCGTATTGCCCAAATTTATCC:1 + chr2L 22131660 3' - Cr1a 4406 1 65.35 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGCATACTTAGCAACATATCTTTAACTC:1 + chr3R 4986374 3' + roo 396 1 71.29 GGAGGATAAATTACAAATTAAAAGCCAGGGTATTTATACCTTACAAGTATCGACTTAATATAATATAAACAAAAATAACATGCAATCCCCAGCTCCCAAGA:1 + chr2L 2196131 3' + TAHRE 379 1 51.49 TTTTTTTTTTCGTTTTTTTCGTTTAGCGATCCAA:1 + chr2L 12026395 3' - gypsy7 5005 1 67.65 TAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTAACTTATCTAGAATTGGAGTTGGCAGAGTTGGCAGTTGGCAGTTGGTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 12098270 3' - Idefix 185 1 54.95 GCTGCAATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAG:1 - chr3L 7792189 3' - 412 7096 2 62.38 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCAATAAAAGAATCGTGTTCCGATATACGTACTCC:1 - chr3R 4578409 3' + 1360 3350 1 68.32 GCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATTGTGAATGGCAAAAGAGAAATAAAATTAATATTGCAAATATGATGTTAAAAAATATACCAGACTAAAACT:1 - chr3R 16003998 3' + jockey 4981 1 57.43 ATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAA:1 + chr3R 846555 3' - accord 150 2 78.22 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGTTCCACTCGCAAGT:1 + chr2R 6779844 3' - 17.6 6948 1 56.99 CGGCTATGGATTCTGATCAAGAATATATTTACTTTATATAGTCGGAACCGCTTCCTCCTGCCTGCTACATACTTCTCAACGAATCTAGTATACCCTATTAC:1 - chr2R 4618504 3' - INE-1 88 1 82.18 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTAGAGACCGAGACCGACGAAGAGAGAGAGAGCGAGAAAGAGA:1 + chr2R 18288823 3' + P-element 2850 1 41.58 AATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGCAGTAGTGAACA:1 + chr2R 24493746 3' + flea 232 2 59.41 TTTACTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCAGAATGAATAGTGAAGTTTATGGTTTAGTCTTAAAATTAGTTAACTATGAAA:1 - chrX 6671059 3' - Tc1-2 64 1 57.43 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCAT:2 + chr3R 9370001 3' + roo 9041 1 56.44 ACGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAACCCCAAACGCAGACATCGAGCGGACAATGTGTAAGGGACAAATAATAAGAAGGAGTACACTGA:1 + chr3R 29564050 3' + F-element 257 1 63.37 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAAACCATAGTTCATAGTACTTTGCTTTCTCTGTACTGCTACGATTTTAGGGTTTACGTTTTTCGTG:1 - chr3L 9121788 3' - Transpac 4928 2 71.29 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCTCGGACAACG:1 + chr3L 8974156 3' + P-element 2862 1 54.46 GGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGTTTTTTATGCTCCAAG:1 + chr3L 13364612 3' - hopper 23 1 53.47 AATACACCGTTGCCCGTGGAATTTTGTATAAATCAATGATATTTTGTATTTTTATTAATCGATACTAACTACCTATTTGTTTACGGCTAATCTGGGGTATG:1 + chr4 800985 3' - Tc1-2 455 1 62.38 TGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGGTGCTGCGGATTCTGTTGATGCTGATGCGCCCTTTAATTACGATTAGTGTAAAGCTACAATTTACAAGTTAAA:1 - chr3R 7183505 3' - F-element 4309 1 80.20 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAG:1 + chr3L 19215841 3' + roo 9018 2 78.22 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTTATT:2 + chr3R 27189319 3' + roo 9028 1 67.33 GTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACCTTACTTTATGATTTTGTTGTTGTGTTGCTGTGAGT:1 - chr3R 7100968 3' + pogo 2092 1 66.34 TAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACACTGCTTGTTTATTGCACTCGAAATTGACACCAATTATGTGAACGGCTCGTCGATCGCTTGAAAT:1 - chr2L 12074479 3' - Juan 4039 1 62.38 GCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGTATGTTTTGCGCAGAAAAACTATATATATAAGTCCCAATATAAGGGTTCAT:1 - chr2L 18028666 3' - flea 22 2 59.41 GAACTCGACTGACTGCAACGCTGACTTCCACTCGACTCCACTGCTGACAAGGCAACCTGTAGTTGACATATGACATTTTTATGTGCCCCGAAGCCTTCGC:1 + chr2L 18028274 3' - flea 142 1 59.00 GCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTAAATACTAATGCAGGAAGGAAATGGTGCCCTTCCACCATCGCTATCAAATAAGACAATAAAAACGGGGTGGAAAG:1 - chrX 7410141 3' - jockey 4668 1 74.26 AACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGGGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACC:1 - chrX 21668086 3' + Stalker2 350 2 69.31 GGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAA:1 - chr3L 2800155 3' + blood 7337 1 78.22 AATCGATTTTAACTTTTTTATTTATACGGGACCGAGTATGGGACCAGTACGGGACCAGTACGGGACCAGTGTGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGTGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4263 1 69.31 TTTTGGTGTCCCCAATCTATGCTCTTCCATAATGATTTTGTGTGTTATGGGTTCAGAGACACCGTGGTAATCGGATTAACTGATAACCGAGTGTGGCAGTC:1 - chr3R 24989376 3' - transib3 88 1 64.36 TAGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAG:1 + chr2R 4677360 3' - invader3 5197 2 69.31 AAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTAAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAACAAGATTTAT:1 - chr3R 20466642 3' + roo 372 1 55.45 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATATGTATCGGCGCCCAATGTACATAAGGC:1 + chr3R 31644219 3' - roo 8683 2 60.40 AAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATACCCAGATAGATAGGGGGATATAGTTGTGGGGCAACCCGAACGTT:1 - chrX 4500191 3' + Quasimodo 7344 2 57.43 ATATGTTGTAAGTGTATTAGTATGTAGGCATATGCTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATATATAACAAAAGGCGCCGTCCAGGGCA:1 + chr2L 21007063 3' - Idefix 44 2 78.22 TTTTATTTTCTTTTCTTTTTCTCCTCCTCTCAAATATTGCATTTGCACTTTTGCTTTTCGCGGTGAAGCAATTTATGTTTGATTTCGGTATGGTTTTAATT:1 + chr3R 15867565 3' - Doc2-element 221 1 55.45 ATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCAGCACGCTTTGAAAAAAGCATTGCCTACTTTTAAGGGCACAAACAGCTCAGTG:1 - chr3R 22864551 3' + jockey 4969 1 54.46 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGATTAAAACGACTATAGACTCTGTCCCACGGGTCACTTTT:1 + chr2R 5084066 3' - F-element 52 1 68.32 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGTTATAAGCTTACGTTCTGCTGAATTGTTTAA:1 - chr3L 11654541 3' - pogo 43 1 71.29 GGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTA:1 - chr2R 18295630 3' - I-element 48 1 75.00 AAATTTTGCTAAAAAATATTCGTTGGTTAAATTGCTACATTTAAGGATTACAAAACAAGTAGGCCAGGAAAAGTAATTTGCTATGCCTATAACTTTCAATT:1 + chr2L 3470168 3' + HMS-Beagle 336 1 74.26 CGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTT:1 - chr3R 25702199 3' - Tirant 8156 2 75.25 GTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATGTATATGAAATCGGGCCTATACAATCTTACCAACGCGTTTCTTAAAAGCATGTACA:1 - chrX 14043879 3' - opus 7022 2 50.50 GAGGCTGAGGATGAATTCTTCGCCCGCCGTCACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGTTTCCTGAAGATTCTATTTCGTCACCTGAATCAGGTGTTTATTGC:1 + chr2L 3112401 3' - Rt1b 4857 1 53.47 TTTTTTGTTTTTTTTTGTTGTTTCTAATCTCAGCCAAATCGAACCACTGTGCACTGAACCTGCGCACAGTGGTGCTCGCGCTCTTGTCCAGTTCG:1 + chr3L 737783 3' - gypsy7 5001 2 74.74 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAACCGAAATGTGCTAATAGGCGGTCCAAGGGCGTCGAAAGTGAGGGGGGTGGCTAGCCAAGGG:1 - chrX 2589650 3' + copia 240 1 63.64 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTG:1 - chr3R 25633343 3' - Tirant 43 2 68.00 CGACTNCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCA:1 - chr2R 5849961 3' - jockey 33 1 53.47 CATAAAAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTGGCAATGGATTAAGTTTCTCTATTGGGCATGTGAA:1 - chr2L 7459577 3' - BS 5037 1 64.36 CTTAGAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTTAATATCTAATTTCCCGGAACAGCTGATAAACAACACAGTGCAAGTGGAAAGTATT:1 + chr2R 9091838 3' - I-element 5277 1 59.41 ACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACTTTACTCCCATTTAGCCAATAGAAATATCTAATTATGGCTAAAATCATAATTCAGGTCTAGA:1 + chr3R 29399467 3' + accord 152 2 66.34 GATTCGTTGAAAAGGATGTAACAGGTAAAATGAAGCGTATAATGTATACATATATTCTTGATCATGATAAATGCGCCGCAGTCAATTTGATGAATTTTTCA:1 + chrX 22654276 3' + INE-1 15 1 63.37 ATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAATGCAGCACGCTTTGAAAAAAGCATAGCCTACTTTTAAG:1 - chr3R 22864569 3' + jockey 4951 1 69.31 AGCTCAACGTCTACAGAGTCTCTCTCTGATTTTTTCAGTTTTTTTTTACCAGCCCGCCAAAGGATTATCCTTTTTGTGCCTCAGCTTAGGACCAACTTAGG:1 - chr3R 7821176 3' - 412 373 2 67.33 AATCGCTATTATCATATTGTAACCTGTTCTCCCCCCTGCAGATCATCTGCCTGCGTAATGCTAATGCATCACATGTAGATTATACCAGAAGGATGTGGGTA:1 - chr3R 26355931 3' + Burdock 458 1 71.29 GCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAAGCAAGTAAAATTAAAAAAAAGACATCATAAATGTGGGGCATGAAAAATCATAATC:1 - chr2R 8413082 3' + roo 124 2 63.37 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTGAGCCACCCTAAA:1 - chr2L 7350726 3' - mdg1 24 2 51.49 TCTTGNCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACGAGGTATTGGGTGACAATAAAGTTT:1 - chr2R 7255815 3' + 297 347 2 79.21 ATTTAACGCTGAGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTCCGGTGGCATTGTCGCCTAATACTAGTACAGATTTGTTTGATGGAAGTTTTGTGCTGC:1 - chrX 11161093 3' - Doc3-element 4589 1 64.36 AAAGGAAGGAGCACGTGTATTCATTTTTCGGCGTCCACAATAATTATTTTTATGTTATATATA:1 - chr3R 11081919 3' + invader3 5446 2 71.43 ATATGTATATATGTATACATATAATTGTAAAGCTTTAAAAATGTAGTGATCACATAAAAATGGGCGAGTGTCTGGCCTCATGTCCACTATCAGCAGCCAAA:1 - chr3R 21161685 3' + G3 4507 1 54.46 CCGCGAGAAGTGGTGCCGACGAACGGAGCCCATCCACCAGGGTGATGTAGTCTTCGTCTGCGATCCTGGGTCTTCCTCACATTGCTGATCTCGAATTTGAT:1 + chr3R 22427360 3' + aurora-element 3797 1 67.33 GCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACAGCAAAGCAGTTGTAGTCGGATATGGTTTTCTAGCTATATGATTTAAGTTTTTCTTAAATCCCATAACTTTCAT:1 + chr2L 7761421 3' - Ivk 398 1 57.43 TACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATTAAAAATCATCTTAT:1 - chr3R 10971895 3' + BS 5060 1 60.40 CTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCAAGGAGAAAAACTGCTGTAATAAATAGAGATACTGCAAATGTTTGAATTAA:1 + chr3L 10036405 3' - jockey 4568 1 57.43 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATACATTCATACACATACATTCTTTGTCAAATCAAAACACAACCAAAGAAAATTCG:1 - chr2R 5784308 3' - 297 6598 2 62.00 ATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACG:1 + chr3L 27391399 3' - 1360 2 2 77.23 CCTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTACAAAACTAGACAAACTAGCATTAATACGGGGCTACATGTTGCATTGTGAAAGGATTTTGACCACTGTACGT:1 - chr2R 2230397 3' - Doc3-element 4684 1 73.27 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAAGGCACACCACACTTC:1 - chr3L 21841276 3' - P-element 9 2 69.39 AAAAAAAAAAACAAGGGGGCGGTGGCCCGGGTCTAATCCGATTTTGACTTTATTA:1 + chrX 6637041 3' - hopper 136 1 89.09 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATACAAGAGACCTTTTGGTTTTATACAACTAATTGCATACTTATGGGGGCTGCACTAATGAAATCTGCA:1 + chr3R 9657768 3' + BS 5084 1 60.40 GTTGAATAGTATATTCCAACAGTAATGACCCTACCACATCATTCACTTGACCACAATCTAAATTAATCC:1 + chr2L 18953103 3' - copia 4869 1 71.01 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCCCCAAGTGCCCAAGTGAAATCACAGCCCCAAAAACTTGCCAACCTCGCACGAAAACACATAAAACTGTCGT:1 + chr2L 1626629 3' - roo 8670 2 68.32 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTCTTTGATTTTCCTAAACTTTTAATATAACTCTAATAAAGTTGACATTGAACTACACTGTTAAATATCATTT:1 + chrX 17132561 3' + pogo 2098 1 76.24 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATTTTCCCTGTTATTTTTGAAGTGTACCCCTAGGTTCCTTTTTTCGTGGACAGAACGAA:1 - chr3L 2024300 3' - copia 18 2 59.41 AATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAACAGTATTTTCACATCAAACGGCACAATTT:1 - chr2L 16933609 3' + 3S18 6057 2 72.00 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTC:1 + chr2R 9014493 3' - blood 18 2 59.38 AGCGGCAGAGAGTCAAGATAACAGATAATTCTTGCTTGCTAAGTAGATTTTTTGTCCTAAAGATTATAAACACCACGTCGCCAACTTCTGCGACAGAGAGC:1 - chr3R 1848249 3' - Cr1a 4233 1 70.30 AAACTGTCTTTCTCAATAAGGACCATTATTTGTTTACGAGGGCGCTGGAACTTTTTCTGCATTTCATATTCTTTTATTTAAGAAACTTTATACTTTAACAC:1 - chr3R 4502201 3' - Fw2 267 1 55.45 TTTTTTTTTTTAATTCATTTAGCCAGTTTTTTGGGCC:1 - chr3L 3027959 3' - jockey2 3406 1 62.16 AACATATTTGTGTATGTGTGCATTCGGAACAAGTGCCGTTGGTCGCACTCAGGTTGGTTATTCGGACAAATGGCTACAGATTTTTCCTTAATCTTAATG:1 - chr3R 26127116 3' + opus 213 2 51.52 TATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAAGTGGTGGTTTCTCATAATCTTCATAAATAAATATACATAGGTCGTATGCTATAAG:1 + chr3L 1343683 3' + mdg1 402 2 64.36 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTAT:1 - chr3R 7993884 3' - Doc 55 1 73.27 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTATGAACTCCCACAAGGACCTTCGTTGGAAAATGGCAGAAAAAAAATGTTGTATGATGCTTG:1 + chr3R 29466368 3' - hobo 17 1 52.48 TTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAAT:1 + chr3L 19951280 3' + Ivk 5356 1 62.38 AGAATNACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCTTATTTTGGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTACACCCATGCCTAACTACATCTATTGGCTACATC:1 - chr3R 4973102 3' + 1360 11 1 41.58 TCCCCNTGAAGTCCAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGGTTCATGGGCATGCACACAGTCGTTATTTGCTTCTTATTGCGGTTGTGGCAAAA:1 - chr2L 22706853 3' - baggins 5357 1 56.44 AGTTGCTTTTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAAAGCAAGAAAAGCAGCAAGTAGCAGATCAGGGTCAGGAGTGGTAGTGTAGCAGTAGATCTCGGTTAGAA:1 - chr3L 2507972 3' + Bari1 57 1 71.29 TTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGAGTTTGAATATGGTTTAAACATATCGGTAGATTGGAATAACAAATAACAAACTATGGTCCAG:1 + chr3L 23491602 3' - Juan 19 1 61.39 CGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAGTTAGTTGCGTTTTGTATC:1 + chrX 329082 3' + opus 7474 2 55.45 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGTCTCACCAAC:1 - chr3R 10457283 3' + roo 9029 1 68.32 CTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCGCTTGCGCAATGTG:1 - chr3R 27080686 3' + HMS-Beagle 232 2 82.18 CACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCGTGTTATTGCATCAATGTCATTTTTGTTATCTAGCATTCTATT:1 - chr2L 17432021 3' - 1360 3340 1 54.46 CNTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACCCAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGCATGCATGTACATATCTTATTGTCATCGCT:1 + chr3L 20248359 3' - Transpac 45 2 65.35 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAAAAACAAAACAAAAACAGTAACAAAAGAAGCCAAATAGGCTGAAGAAAAGGGA:1 + chr3R 10818445 3' - 412 17 2 54.26 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACCTTTTCATACGACC:1 - chr3L 14910570 3' - roo 8695 2 58.42 TAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAGTTTTACTAGAAGTGCGTTACGTTTTTCTTCTTACCGCAAAATTCAATT:1 + chr3L 11461414 3' - copia 27 2 52.48 GCAGCAACNACAACCAAAGGAATCTTTCCGCNNACTCCATTTCAAGTTCATGCANNNNNTATTGCATTATGCTGTGGTTANTACTAAGCT:1 - chr2L 15893698 3' + Max-element 278 2 46.67 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTTCTTTGCCGCTTCC:1 - chr2L 15956016 3' - Max-element 8249 2 65.35 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTCATAGGTGCACAATGGTGTTGCCTGCCTCCGTTTCCGCCCGCAAA:1 - chr3R 28095149 3' - hobo 32 1 55.45 AAATCCCTATGTAAGTTATCACTTCGAACGTACTACGCCGCAACGGGTCCGGTTCTCGCCTGTCGTTGTTCTTTCTCTGTCCTTGGAAAGTCTCGCTGGTG:1 + chr2R 1027580 3' - Fw2 3663 1 66.34 AAATGAAAAAAAAAAATGAAAAAATAAATGTAAAAACATTGTGTTTAATGCTGGGTCTTAGTGAAGGAAATGCTGGAGGTGCTGGCGAGATGAGCCGATGG:1 - chr3L 3390471 3' + Doc2-element 246 2 76.24 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTGATTTTATTTGCCTCGCAGG:1 + chr2L 18028770 3' + flea 5007 2 76.24 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCT:1 - chr3R 30272806 3' + P-element 2855 1 47.00 GCAATNAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGTATGAGGATAACCTCAGAGAACTTCCACTGCATCCAAGCATT:1 + chr3L 26644796 3' + HMS-Beagle 7006 2 61.39 ATTATGTTCGTATATACTACACAATGTTCTCCGTTGTTGTTGTTGTTGCGGCAATTGCAACAGCTACCATGGTGCACAAAAGGAGGAGGATGGCAAAAAAC:1 - chr3R 17121598 3' - mdg1 7038 1 78.22 TGATATGGACGGACGGACGGACGGCGAGGCTCCTGATATTCTTAACCCGACATACACATATTCGGTCGTTAATCACACAACTCACATTTATTTTAATAACC:1 - chr3R 17660024 3' + micropia 426 2 52.48 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAGGGAAATTCTTAGTATCTAAGAGGTCACCAGAGATGGCTCATACCGCTATTTTACTTTCTAAACTGTA:1 + chr3R 31458555 3' + jockey 4982 1 67.33 CCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAACTACTTTATTTTTGCTCTTAAATGTAATGTTACTTTACACACTTTATAAGATAC:1 - chr3R 24281943 3' + Max-element 8511 2 55.45 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACAGTGTAGATGTCTCAATGGCTTTTGTTGTGCTAT:1 - chr3R 6185929 3' + 412 448 2 70.30 GCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAAAGTGTTTTAATTATCCTAATGTCATTAAGGAATAATCATAAAAACACAAACTAATTTCACAGTTT:1 - chr3L 2292061 3' - Max-element 14 2 55.45 CATCGNGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAATATTGTTCGATTTTGTTGTTCTTGGCCTAATGAAAAATTATTG:1 - chr2L 2909537 3' + pogo 2073 1 59.41 AGAGAGCATAAGAAAAGAGGAATACGCGAGACGCGGCATTCGGTGGCGTGAGCTTGAAGGGAGAAGTCTGAAGTCTATACAATCTGAAAACACATTTATTT:1 + chr3L 20895018 3' + invader3 167 2 67.33 ATGCGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCCCATTCCGTGTTTGGTTACTTTTTCTGAGTTTG:1 - chr2R 18479962 3' + Stalker 7146 4 65.35 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATGCAACCCTTATAGTACTTATACATATGCCATAATCTGAGAATCTGCTTTCATAACAAGAAATAT:1 + chr2L 9389137 3' - 1360 14 1 63.37 GAGGTTAGTGGTTGTTGATCTGCGCGCGTGGCAGTTTTGGTCGTTTGTAGACGTTAGAGTTTGCGTGCCAAAAAGTTTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAAT:1 + chr2R 5667267 3' - Q-element 228 2 52.48 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAG:1 + chr2R 8378671 3' - pogo 26 1 57.14 AGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAATTATATGTAAGGCTGAATCCAGAGTTCATCCGTGCGAACTTGCGTAGTGACTTGGCTT:1 + chr3R 28755637 3' + 3S18 333 2 51.76 TTCGAAAATACAACTTCCGCATAATACCCCAAAAAAAGGACAGCATCCACGAAACCTTGGAGTAAACAAGCCATGGAGCCATTGAGAAATAACTGGGTAAC:1 - chr2L 4262445 3' + Fw3 45 1 54.46 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCTCGTTGGAGGTATAAA:1 + chr2L 108087 3' + P-element 2880 2 73.27 TGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATGTGTTCTTTGGCATTTTGGCCAGGCACCTGGAAGTATGCAATCACATAA:1 + chr3L 22324360 3' - jockey 4669 1 79.21 TTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGC:1 + chr3L 9925285 3' - Doc 49 1 71.00 ACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAATATCCCGGAAGCTGCGCTTAATTGATGCCCCTTTGCCTGCACAAAAAATA:1 + chr2L 4323852 3' + Doc 4379 1 55.45 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTATTTATGTGGGTCCTCGATTTGGCCAGATGGACAA:1 - chr3R 25440164 3' + pogo 2060 1 71.29 TAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACANTAAGCCTTTCCATATATTTTTGNNNNNTGTTAGAGAGCACTGAAGTCNGCAATAAAAACTGT:1 + chr3R 15943320 3' - jockey 4678 1 56.38 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAAAAGAC:1 - chr3L 21735366 3' - Doc 12 1 70.30 CGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAAGTTAATCCTTGAATGCCAATTAG:2 - chrX 21396687 3' - F-element 65 1 79.21 CGCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGAC:1 + chr3L 15638271 3' + roo 352 2 82.18 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACTAATTGATAGGCGAACCCTTCCTTACAGGGCTGATAAAACTATGGGATCGCCGTGGTTTTCC:1 - chr2L 1156718 3' - 412 14 2 65.35 GTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTT:1 - chr3R 7993880 3' - Doc 51 1 69.31 CGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCGGCTTTTATACGCCATTAAAAACACGGCGGG:1 + chr3R 18905697 3' - P-element 2857 1 55.56 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGGAAGATTTCCCAAGTGCCGAAGGCGACCAAAGAGAAAATT:1 - chr2R 17127641 3' + roo 397 1 67.00 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATTACGCAAATGCACTTTCGACGATCATTTAGCTAAGTTATTTCAAACAGA:1 + chr2R 5784401 3' + 297 371 2 55.45 TTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGAATACA:1 + chr4 1152079 3' + transib2 2783 1 64.36 ATGCCAACAAAATCGAATTCTGGACCACAGGTAAAAGCACGCAAATGGCAATAACTAAGGGAAAAAAAATAAAAACCAAGCTGTATTGTTGGCAAATAAAG:1 + chrX 11070348 3' + transib2 2813 1 77.23 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACTGGCGTTAT:1 - chr2L 5974418 3' - roo 8705 2 68.32 CGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAAGGAGGATGAAGGGGATTCTCCCTCTAAGTACTGTGAGAACACTAAAACTAGAGGTGAATTGCGTCGC:1 + chr3L 18347279 3' + roo 8714 2 65.35 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCCAGG:1 - chr3L 2800141 3' + blood 7351 2 64.36 ATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGAACAAAAGAATAAATAATTAGAGGTAATAAG:1 + chr3R 29380106 3' - jockey 4972 1 69.31 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCTCTACCAACATTTACCGGTACACCATTGATGGCCGGAAGGTCAAGGTGACGCGGAAGGATGGCCAGCCGTAT:1 - chr3L 20239392 3' + 1360 3384 2 54.00 GACTTTAAAGTTAAAAATTAAGGGTTCTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTTTTATCAAGTATCAAGTTTATTATAGGATTGACAAATAATCACAAAACATC:1 + chr3L 22987117 3' - S-element 1667 1 53.47 CGAAGAACTTAGTTTTCCGTATTTGGAAGTAAACAAATAGGTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCGCAAATTTTCGCGGAGGGGAAAAAGCCGGGCTA:1 + chr3L 13771742 3' + R1A1-element 35 1 80.20 TTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 170 2 54.46 TCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATCCGAAAGTGTGCTAAAATATGTCTTTATGCCCATTATTATACAATATTCTTGGGCTACTTTATTAC:1 + chr2R 12446396 3' - jockey 4681 1 65.35 ATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTATAATGTTTCATTTTGTTGGTTCTCCACTTTTTGGGAGTCACACACAGATGGGCATTAAATGCTTCACCTTTT:1 - chr2R 20699605 3' - Doc 4422 1 78.22 CCTTGTTTTGTTTTTTTTTTAATTTTTGAGCATTTTCCAGTCGATTTATATTAGCTTAGAACTTTATACATTTTTTTTATAATTATATATAAGCACGAATG:1 - chr3L 15012527 3' - transib2 2639 1 90.10 ATCTCAGGAACTATTAAAGCTGGAAGGTAGAGATAAAAGCTAGAAGGGTATCTGATAGTCGGAGAACTCGACTCTCTTGTTTTTTTTTTTATCATTTT:1 + chrX 18006046 3' + INE-1 151 1 44.90 TACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGTTGCATTGCCAAAGGTTCGGATGGGATTTCGAGGGTCGTCTGCAGCTATGGCTCGTTGCGGGCCACCACTTC:1 + chr2R 9014511 3' - blood 5 2 74.26 GCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAA:1 + chr2R 12185402 3' - accord 32 2 58.42 CGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGCAACTGCGAGTTT:1 + chr2L 18112571 3' - transib2 2583 1 56.44 AGACGAGGACGTCGCGATTACGCAGTGTGTATGTGTGTGTGTGGCTAGTCTAGCCGAAATCGCGATGACAGCGAATCAGTTGTGCAGCAACAGGTCGGGGT:1 + chr2L 20255758 3' - accord 278 2 70.30 CTTTTGTTTATATTTAGAATTGGCACGGTTATAAACTCCTACATTTCAAAAAATCATAATACCTATGAATGTATTTTTGTTTTTAGTGGAAGAACTATTTT:1 + chrX 15259921 3' - transib3 2420 1 41.58 AAGTGGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATAAGGCACACGAGGACGTGTGTATGGTCATGAAGACGAAATGTATTATTATAAGAAAAAATTTAATTTTAT:1 - chr3L 27395492 3' + invader4 2691 1 61.39 ACAAGTTTATAGTGTGAACACCCACTATAACCCCCACATACCGCACATGACACTTTGTTGATCGACGTCAGCCAAATCAATTTAACTACATTAAATATGGG:1 - chr3L 23934886 3' + rooA 367 1 58.42 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAAAGTATGTACA:1 + chr2L 487151 3' + P-element 2868 1 59.00 ACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCTTTTAAGATTTTATTAT:1 - chr3R 13423265 3' + 17.6 7410 2 71.29 TGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGTAGGCTGGGTATGGCTGG:1 + chr3R 22715614 3' - INE-1 568 1 80.33 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAATTTTGT:1 + chrX 14796920 3' + transib2 2792 1 57.43 GTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAG:1 + chr2R 12185420 3' - accord 14 2 61.39 TCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAAAGGCTC:1 - chr3R 11165628 3' - Tabor 22 2 61.39 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACCGGTAAGAAGGGGTACTTTTTTAGAGGGGAG:1 - chr3L 5964260 3' - BS 43 1 69.00 AAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACATATGTATGTACATATATCTTTTGACGGATGTATGACAGATGCCCACCGATGATACGATAA:1 + chr3R 23665349 3' - 297 13 2 65.35 AGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAATAGTATACTCTCTTAATAT:1 + chr2L 15957516 3' + Max-element 268 2 54.46 TGGGGAGTTTTAAAACTCCTCACAAGTTTATTCAAAGTGGTTAGAAGAACACCTGGTCCTGAAGGTAAAAGAGAAAAATGAAAAGGAAAGGAAACTAGCTG:1 - chrX 2550483 3' - gypsy8 1 2 69.31 GTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTATCTAGTAACAGCCCGTCGAGCTTTGGCATATTT:1 - chr2R 23764726 3' + opus 7074 4 55.36 CTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAGCAACAG:1 - chr2R 20411848 3' + 297 389 2 73.27 AATAATAATAATAATAATAATAATAATACTATTTAATTACAACGTATTTATAACTGCATTCCAAGCAACCAAACCATAGAAAAGTTTATCAAATCCCCCAA:1 - chr3R 17908902 3' + mdg1 31 10 47.52 TAAGCCGACTAATCAAATCCGGACTCTCAACATCTCCAGCCTCATCCGCCTCCTCGACGGCCTCCATCTCATCTGCATCCTGCTCGAGTGGACCCTCCACT:1 + chr3L 13495794 3' - Cr1a 4079 1 70.30 TGCAAGGGGGACGGAATGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTTACGCTTCAGCTGATTGATGGGATGCGTACGGATGGTG:1 - chr3R 9999991 3' + GATE 8220 1 68.32 ATTGTTTATTGATATTGTTTATTGTATTAAAAGGAAGTAGGTTTCAACCAGTTTACATGCTCCAATGGTTTTGTTTGAACTTCCCGCGCAATGGCAACGTT:1 + chr2R 16607546 3' - flea 248 2 78.22 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTAGCCCCGAGTGAAAAATAATACCGTTCTTTCT:1 - chr2R 10673395 3' + Tirant 358 2 66.34 CTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACACTGGATCCTCTACGTAGTGGCAGCCAAACGAGCGTCCCTGACCACGTTTATTGTGCATTCCTGGTG:1 - chrX 8031308 3' + roo 409 1 44.55 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTACCTTTTGCAACACACAAAAACAATTTGAAGCCGACTTGAAAATTAACAGCAAATGTTATATAAAATG:1 + chr3R 20466728 3' - roo 8674 2 71.29 CACAAAAATGCATTACAATTATTACAGCACACTTTTGGGCAGACAAAATCACTGATTGTATTCTATTTCTTCCACATATTTGCTGCTCATTTATTGAGTTG:1 - chrX 17204055 3' + Tabor 481 2 78.22 CTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAAGACCTCTGGAC:1 + chr2R 1243237 3' + mdg1 386 2 59.41 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTC:1 - chr3L 21841308 3' - P-element 22 1 45.57 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATATATATATAAGCTGCTTTCAGCGGTAGCGAAAATATAACTCGGGATTTTTGCGAC:1 + chr3R 29432831 3' + 297 6958 2 61.39 GGTAAATTAATTAAAAGTAGTCTACTGGAATAAGGAGGTAATATACGGTTTGCATCCCAATTTAGGCGCCTTATTGACAGATGGTTTTGAATAAGTGACAC:1 + chr2R 675026 3' - Cr1a 3984 1 74.26 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCAAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAA:1 - chr2R 8378616 3' + pogo 2049 1 79.21 TCTTCNAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCGCTTGCGCAATGT:1 - chr3R 27080687 3' + HMS-Beagle 7027 2 81.19 CGCTTAGCCAGTCTCAGCGTTAGCCCCAAAGCTAAGAAAAAAAGACCCTTTCAAAAGTGGGGGCAAACAAGTGGGTGGCGACTGTTGCTTCTTTGTGCCCG:1 + chrX 6493831 3' + Ivk 225 1 53.47 CAAACTAGCCACTGTCTTCGAGACAATAAACATGCACTCTAGCCGTTCATGTAAGTCCGATAGGTAAACAAATATCATGTACAGATGCAGAACAGATTTTA:1 - chr2R 19840579 3' + BS3 1441 1 57.43 AACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAGAATACCATGTAGGTCAAGTTGTTTATGAAAAGAAACAACTTCACCTACATGATATATAGTGAGCTCTTAAGAATT:1 - chr2R 616132 3' + Doc 4576 1 43.56 CATGGGAAATGGATCATCGTGATCCGAATCCGAGTCGCTATCATCGCTTCCCAAAAAATGTTCAATATTAATGAAAAAACTGGCTAAATGTAACCGTACAA:1 - chr2L 1577672 3' - transib3 2565 1 72.28 TATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCATCTCCCCTGCGACACTCCTATTTTGGCCTATTTTTAT:1 - chr2R 18073182 3' + roo 105 2 63.37 ATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGTAGAAGGAAGCTTAAATTACATATGTATGTATTACTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCG:1 - chr2L 21256470 3' + INE-1 16 1 97.03 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGCTTAGGGATAAAAATTATATTT:1 + chr3R 25918942 3' + roo 355 2 81.19 CAGTTTTGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGTATATCTGTGTGTTTAATTGATTTGTTTGTTTTGCTCTATAAGATACGACGAGTTATGC:1 + chrX 10206927 3' - Quasimodo 7062 2 69.00 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCGATTACTCAGCTCGGGGCAATCGATGTAAACAT:1 + chr2R 24965159 3' - P-element 4 2 75.25 CATAAGCACACACACACACACACACGCACGCACGCACTCGCACACGCACACACACACCTAGACAGTACCCTGTTTTCCCAAAATGGTCAAAACGGGCCATT:1 - chrX 13301038 3' + accord 180 2 50.50 ATTCATTCGAATAAACCGCTTCAAGCAGAGCAGAGCCAAGTCTATTATATCAACTACAAAAATGGAATCCAAGCTTTAATTAAAGTGCATAGCCTTGAAGT:1 - chr2R 20044055 3' + Stalker3T 285 1 62.38 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAATATTTATGTAAATAAATGAGAGCTATAGACATTTAAAGTAGCCAAGTTGCTCGAATT:1 - chr3R 25285056 3' + roo 387 2 57.43 TAATTTATTTATTAATTTAATTAATTTATCACAATTAATTTGATTTTACTACAATCCCATCCTAAATTAGTGCTAGAAATTAGGGTTTTCCGAGCACGAAG:1 + chr2R 13284202 3' - flea 4982 2 68.32 GGGATTAATAATCCAAAATGGACGATAAAATCATCCTGAACGACTTTTCGTTGACAATTTGGACAACCTTTTTGATATTGCACATGCAAATGCAATGGATG:1 + chr2R 4192010 3' + mdg3 279 1 55.45 AGCCAAAGGAAAAGGTCACAATAATGGCAGAAGCGAGAACCGCAAAAGCACTTCACTTGATAATATCACACAAAAAAAACGACAACAAAAAAACGAAAGCG:1 + chr3R 31883635 3' + hobo 440 1 73.27 GTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGTGAATCGGCTTGGAGGGGGTCATATCCATAAACAATGGGTTGTTTT:1 - chr3L 22646559 3' + R1A1-element 4971 1 61.11 TCCTGAGATCTCGACGCTCATACGGACAGACAGACATGGCTATTGATCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACCAAAGACACTAGA:1 + chr2R 1621921 3' - INE-1 138 1 49.50 AGATANGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACT:1 + chr3R 19076205 3' - roo 39 2 64.36 GGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGAATCATCAATTTAATGCTTAAAATGTAGTTAGTAACCATTATTTGTAGCTTGCTTACATACTTACT:1 - chr2L 14260710 3' - 297 6586 2 71.29 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAACAACAGAAA:1 - chrX 10653545 3' + jockey 4965 1 60.40 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAACCACATATTCTGTGTTTGGGGACCGTAACTTTTTCAAAAATAATTTAAGCAATTGAAATTAATCAACTAAGCAATATA:1 - chr3R 10320995 3' - roo 8665 2 78.22 TATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAAGCCCGGC:1 + chr3R 29660306 3' - mdg1 7066 2 54.00 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGGTGCTCAGTGCAACGTGGCGCATGAGTAA:1 + chr2R 8378674 3' - pogo 26 1 55.45 GCACTNAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGC:1 + chr3L 9692722 3' - P-element 50 1 27.72 AACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATGTATATTGTTGATTGTCGATCCTAAGAGGAGGATGTAGGCTAA:1 - chr3R 5054375 3' + HMS-Beagle 7012 2 59.41 CGCCACGAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCACAAAACGGTAACCTCATGGAAATAATAAGATTCCCATCCTGCCCTTCAAGCACT:1 - chr3L 8357932 3' + invader4 366 1 74.26 AGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCGAGAATAGGCCTTCAGGCGGC:1 + chr2R 24493735 3' + flea 221 2 62.38 GGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGTTCACATGTCTTTATGTACAATGAATCGATTAATGTTCG:1 - chr3R 27080699 3' + HMS-Beagle 219 2 69.31 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATACTACATATACTGAGCAAAAGTC:1 - chr3R 4986272 3' - roo 8682 2 61.39 AAGCTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGTTGCAGTGCTTCTCGGTGATGGTGCCATTAATTGGATTGACGTGCCGGAATATGAAGTGC:1 + chr3R 29317883 3' + R1A1-element 499 1 61.00 AGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCAAGATGTTTATCACACGAGTGAGAC:2 + chr3R 29350797 3' + opus 7489 2 65.35 GGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTAATCGCTTTCTGTAGTGCCACACTCAATTGTG:1 + chr3L 1809555 3' - diver 6070 2 72.28 ATGCTTCTTCGTATGCTTCCTCGTATGCTTCGTGGGCCTTTTGGGTGTTGTACATGGCTATAAGCCTAATTGATGCGCTCTTTCCAGCATTGCCTGATTTT:1 + chr2L 13122049 3' - invader3 40 2 50.50 TTTTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTTTGCGTTATCAGTTTGAATATTTAGACAAGTGCTAACGAGAATGACAACAACAATGCTCGATAGGGCACAAACAG:1 + chrX 5915771 3' + hopper 149 110 78.00 TTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTCATTAATGCCCTAATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCGTGCAAACTTTGGGCCAAAGTT:1 - chr3R 19197814 3' - Doc 4600 1 78.22 AATAATGATAATAATAATAATAATAACCAAAATTCTATTCAAAAATGGTCACAAAAGGCAACTTAACCCGTTAACGCGTTAAAGAGCAAGCCGAGTGGCTA:1 + chr3L 19416209 3' + mdg1 37 10 60.40 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTTACGTGTATCTGAGAAGAAACTTCGCTTTCAGCACAATGGAAAGTTTCTCAAGCTGGCCC:1 - chr3R 19114173 3' - 297 11 2 69.31 TAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTAACATAATAATAATAATAATAATGCAATGATAAAATCAATTTTTTATTATGCCTGACTTGGCTTTGGCGAAGT:1 + chr3R 16626850 3' + I-element 5328 1 57.43 AGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGACACATTTCGTAATCGCTCAAAATTGTTTGGCAAACACTTTAAATATTTTCTATT:1 + chrX 8364657 3' - jockey 4784 1 51.49 CTGTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTGTAGACTGATGGGCAGGCGGCCTACATGAC:1 - chr2L 17210103 3' - jockey 4718 1 68.32 ATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGGGTAAGATGTTATTGACATATGTCACATA:1 + chr2R 8192597 3' - Quasimodo 7114 2 72.28 GTGAGTGTGTGTGTTGTTGTGTGCACCTAATTGAGCTTAGACTGCCGGAATGCCAAGCAGACAAATCTACGAAATAGTTAACAATGACTATATTTTATCTG:1 + chrX 10729099 3' - gypsy3 418 1 50.50 AAGCTTTTCCTCCTGTTCTAGAACTGTCCCCTGCGATTTAGTTGAAACATTTTTGCAGATCCGATTGCAGTTGCGTGCTTCTCTTTTCTATTTTGATGGTC:1 + chr2L 17871288 3' + Gypsy12A_LTR 2020 1 70.30 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATGCAAAGAAATTTCTTAAATTTGGATTATTTAACAAATCTTGAGAGTAATTATG:1 - chr2R 8560101 3' - 297 6600 2 61.39 ATTCATTTACATAAGATATAAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAAACATTCTGCCAAAGGGCCAGCAAAGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTG:1 - chr3R 19450183 3' - roo 52 2 52.48 TAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAGATAAAATCAGCTAGCAACAAAAAAATAGTGAATGTTGTAT:1 + chr2L 16497282 3' + roo 309 2 73.27 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGAGAGTATGCATGTTCATTCAGGTATATGCGTCGACCAATCGCGACACTCGGCTAAACAGGTTTCGC:1 - chr2L 15333697 3' + P-element 2877 2 67.33 CAAAANAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGATAGCCTGCATATTGATTGG:1 + chr2R 8378646 3' - pogo 53 1 82.00 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACACAGCCCCAACTTGGAAAGGGTATTTCCACAA:1 + chr3R 31369383 3' - Transpac 4945 2 54.46 AGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGA:2 - chr3L 21735383 3' - Doc 29 1 53.47 TATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCAAATCTTGGATTTTTAAAACACTTTTAGGCTT:1 + chrX 13134962 3' - jockey 4819 1 69.31 GTGGCGCCCGAACAGGGACCAGCTAGACATAGAAGGATAAAAGTATGACTTCTTGGCTTCTGTATGGAAATTGGAAGCTGGAATTTAAGTTTCCGACAAAC:1 - chr3L 1984883 3' + HMS-Beagle2 331 2 76.24 ACTTTACTTTACTTTACTTTTACTTTACTTAACAAGGTATCATTTATTTACTGAACTCCTTACAAGAATATTCTCTACTTCCTGTACCACATCTGCAGGGT:1 - chr3R 29516457 3' - TART-A 13150 1 79.21 CTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATAAAAATTCCCAAATCAAATTAAACAATCGATTTTCTTGTAAGA:1 - chr3R 14688243 3' + pogo 2070 1 59.41 TTTTTNAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGGTTTTTTGTATGTATAAAAGTGGAATCGAGC:1 - chr3R 14024815 3' + pogo 2058 1 75.25 AACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACACTTTTCGCCGCTTTGTCAGACTCATCATATTTTTATTGCATACTTTTGTGCGCACTCAC:1 + chr3L 14603353 3' + jockey 4975 1 61.39 GTTAGGTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATTATTCGAATAAACCGTTTCAAGCAGAGCAGAAGCTCTGAAGCGAAGACGTGAGCATGATCACGAATCCC:1 - chr2L 11439352 3' + Stalker4 7261 4 68.32 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAATG:1 - chrX 13347307 3' + roo 355 2 79.21 CATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTCTAAGCCAGCTTTTTGGCATTTACTGAAACATT:1 - chr2L 19689801 3' - Doc 4509 1 67.33 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCACCAGATAGCTAAGTAATTAAAA:1 + chr2R 18601867 3' - Transpac 4969 2 76.24 GTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTACAAATTTAAGTTTGTCCCCTA:1 - chr2L 22967003 3' + 1360 3324 1 75.25 AATTTCATTTTATTTTGAAACAGGCCCATGGACGTTTGTCGGAATCGTCGCGAGACCCACCAACCACCATAGGTGAGCTACCGGTTAGAGAAGATCCAGAT:1 + chr2R 9259269 3' - NOF 3954 1 50.50 ATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACCTCTGATGAACGAAATTAGCATTCCTCAATTCATTAAACATTTCTAAGTTAAACAAATC:1 + chr3L 1809892 3' + diver 205 1 59.41 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATACTTATATGTGGGCTGGGCAAAAGTTATTAAAAT:1 - chrX 13350772 3' - jockey 4800 1 63.37 AAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGCAAATAATTGA:1 - chr3R 15998081 3' - pogo 41 1 73.74 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACAGATTCCGCCCTCAGGCGTATTTCAAGGAAAAT:2 - chr3R 9479451 3' + mdg1 7419 2 64.36 AAGCTGCAGACAAATAAGAATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACATGTACAGACATTACAATTGGAAC:1 - chr3R 14324220 3' - 3S18 57 2 78.22 TCTGCNCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCACCCAAGGAACCTAGTATGTGTACGTATTTCAA:1 + chr2R 12214008 3' + Transpac 295 2 65.35 AGTAAAAACAAGAGACGATAACGCGTATATGTGTGAGTACGGCTTGTATAAGGAAAAATGTTCATATTATAATTAAAATAGTACTTGCTGGGAATCAGG:1 + chr2L 10194118 3' - 1360 3237 1 67.68 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGATATAGTAGTAGATATATCTTTTCACAACC:1 - chr3R 7101003 3' + pogo 2057 1 73.27 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAATGCTTTGGTGAGATACAGACTCAAACCCGATCCATTGGGCAGCTACA:1 + chr3R 14639435 3' + roo 402 1 72.28 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGGGCC:2 - chr3L 2800144 3' + blood 7348 2 67.33 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAATATAATATTTTTAACTTCAATCTTTTGAAGGGAAACGCTCCTTTTTCTCCGTGTACCAGT:1 + chr3R 12877883 3' - mdg1 17 2 62.38 CAGAANAAGTGGTCAAATTTCCCATAGTGTGGTGGTTGCGTGTGCATAGACTTTTGGGGAGCGATGGTTTTCTGGCCCCTTTGTCCCTCTGCGGCACTAGA:1 - chr3L 21785041 3' - Transib-N1_DM 8 1 75.25 GTTCAATTAACTGAGCATGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAAAGTATAAATATTATTGATCAGGATCAATAGCCGAT:1 - chr2L 21737998 3' - McClintock 5974 2 59.09 ATGGAGTTTCTTCTATTTCTGTTTGTTGTGGTGTGTTTTGATTTTGATTTTTTCTTATTTTAAGTTTTGCTGCCTGCCACAAAGAGGAAGAGGGCATCAAA:1 - chr2L 13837555 3' - 297 6501 1 69.31 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAG:1 - chr3R 19657475 3' + roo 350 2 81.19 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGTACATATCACACGTTTGTATTTATGTGAATATGATTG:1 - chr2L 19075662 3' - Transpac 4956 2 64.00 CGAGCTGCCTCTCTTTATTCTGGTAACTGCAAATTTAAGCTGAAACTTAAAATGATTCCAAAGCATCATGAAAGATATCGCCTCCAACGACTTCCTCGGTG:1 + chr2L 18687430 3' - 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Chimpo 151 1 67.33 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACTTGAATCACTAAAAAAAATATTATGTGTGATTGAAAGAA:1 + chr3R 19076243 3' - roo 8664 1 72.00 ACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGATTTGAATTTGTATGTGGAATGTTGTTTGCAACTGAAAGGCGGTGCAAGTGGTTGGAGA:1 + chr2L 11604789 3' + invader4 2659 1 57.43 AGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTAGCTCTCTGCTGTTTGACTGAAAGCCACTTGACTGCACACAGACATGA:1 - chr3R 31877856 3' - FB 30 1 52.48 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGTATATAGTTATTTATATATAGGTGCAGAGGATG:1 + chr2R 19857390 3' - 297 6619 2 75.76 GAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCACACATACTGCGTGGTGGCCATTCAATTTGATTATTCAATTGC:1 + chr3L 10126345 3' + accord 149 2 76.24 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAAGTATGGTTTGAAGGGTTGCTATAACTTCAACCCCTGAACCGTTTTTCTTTTA:1 + chr3R 24152940 3' - P-element 21 1 59.41 CGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTA:1 - chr3R 9657677 3' - BS 14 1 55.45 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCC:1 + chr3R 28326769 3' + P-element 2862 1 55.45 AGCAGNCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTACATATAGTTATATAGTATATA:1 + chrX 15731363 3' + F-element 4505 1 77.23 ACTCAAAGATCCCCCTGAAGTCTAATGCACTGTATAAATGCCAGAATTTTATTGGGTCTCAGGGCTGCAATTGTTTCCCGGCTTGCATTGTGTTGTCTGTG:1 - chr3L 4855819 3' - baggins 5366 1 73.27 TTGGTTCAAAACATTTGCTTGCTGTCTTGGCATAACATCAATAAAGGCATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAACCAAAATGCAATTGCACAATT:1 - chr2L 2502970 3' + R2-element 3364 1 79.21 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTACTGAAAGTGTGTTTCTGTCCACTGGCACTTTCTCTCTGCGGTCATTTCCCCCTATTT:1 - chrX 21599650 3' + 1360 3367 1 64.00 AATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAAAAAAGTTACAAGCTGTTTTTATTGCGTGGAAAGAACCCGAATAATGAGCTTCTCAAGCAATGAAAACA:1 - chrX 12466695 3' + S-element 33 2 74.26 AACAATGAAAATAGTTTGCTGACAATTTTGGAGTCGCAAAATCGCCATTTTTCCGAACTTTTGATGCGAAATAAACTTTGAATAGAACGAACAAATATA:1 - chrX 10218020 3' + invader1 454 1 64.65 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACACCCGTTTTTATGGTTTCATATTTCAGTGAATTTATTGTCA:1 + chr3R 27189323 3' + roo 9032 1 63.37 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAATATGTTTCCCTTATTTTGTTTATTCCATTATTTTGTTTTCCGGTT:1 + chr3R 25285134 3' - roo 8697 2 66.34 GTACCCTCTTCAGCCTTCGGACAGCTCATGGGTAATAGATAGTTTCGTTTGGCTGCAATTAACACCTTGCGAGCTGCACACAAATATTTGCCAGACTTATC:1 - chr3R 28751880 3' - G5 4630 1 81.19 AAAAAAATAATAAAAAAAAATGGCAATAAACTCGTGGTAGCGACGGCAATGAGCTCACATCATATGGACGGCGAGGGGGATCGGATTCGGAATCGGGATTG:1 - chr3L 702468 3' - hopper 142 3 81.19 AGGTCAAGCGGGTGCGTTCTCTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTGTCCAGAAGGTTGATGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTCATATAGAACATTGACATC:1 - chr3L 12887344 3' - G2 2923 1 81.19 ACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACGTATACTTGGATTACAATAACAGAATATTTTGTGAAGAACCTTGACTGGGTAAAAGTTTTATCGGGAT:1 - chr3L 9772179 3' + 297 388 2 74.26 TATAGNAAAATATGGAAAATAAATGTCAAGGTATGATGTTTTTCTATAATGAATATTATATATTTGTCCGAAAGTCCTTATAGTATAAGACAAGCTTGTGT:1 + chr2L 17684682 3' + transib2 260 1 62.38 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATGGACAGATTCCGCCCTCAGGCGTATTTCAAGGAAAATGTTAAAGTAATGTAATATAAAACTTTGCAAA:1 - chr3R 9479420 3' + mdg1 412 2 63.37 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAGGATACATG:1 + chr3L 11910011 3' + Tabor 7301 2 55.45 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCACCTTGTCTCCGTTAGA:1 + chr3L 15638302 3' + roo 9047 1 55.45 TCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAGTGTACTAATGCGTTTGCAACCTGCTAATC:1 - chr2R 22997942 3' + Transpac 293 2 62.38 GGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACGAGGTATTGGGTGACAATAAAGTTTGTTGCTAGGCCAAAAAGTTCTAGGCAG:1 - chr2R 7255788 3' + 297 374 2 53.47 AGAATTTGTTGCCAGCGAAACACCGGTGTCATTGTGTTCGCGGTTTGCCCTACCCTTCCAGCCCCCACTCGAATGGGCTCTGTGCCCCAAAATATTCCTTA:1 + chr2L 20973258 3' - Gypsy12A_LTR 1997 1 62.38 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGCATAAGCCTGTAGTATCAGCGTTCCCACAGTCGCATTCTCCGGAATGCGAACAGTGGTGT:1 - chr3R 14639325 3' - roo 8680 2 63.37 AAAAGCCGAATGGTACATTATAAACGAAGATATACATAATGACTTGGCGCACGTCGTCAAGAAGAGCCAATAGTTAATAACCACTTCCTAATCACGTTGTT:1 - chrX 2442334 3' + Porto1 4361 1 60.40 AACAAAAAATACGAAAAAAAAAGGAACGACTTACAGACTGTCAGAGCCATCAACATGTGTGGCTCATTAAATATGCTGCGAACACACAGCAAGTACATGAA:1 - chr2L 12120469 3' + gypsy7 5004 1 76.24 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAGCGTTCTCGGTACTC:2 - chr2L 107971 3' + P-element 2880 2 72.28 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTT:1 - chr3L 12452151 3' - 412 7093 2 64.36 CATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTACAGCATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTTTTTTGTTGAGATAATTAAGCCACTAA:1 - chr2L 16082589 3' + Stalker4 397 1 65.35 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTGTACAGATAGT:1 + chr3R 27080809 3' - HMS-Beagle 6812 2 63.37 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTTGATTTGAATTCGAGTTA:1 + chr3L 12085245 3' - pogo 16 1 61.39 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGCAAAACAGTTGGCAGTTTTGTATGCAAAATGTAATCAATTGGCGGCATTTTAAATGCAATTTGTAAATG:1 + chrX 2762222 3' - roo 8670 2 72.00 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGGAAAAATA:1 - chr3R 25702164 3' - Tirant 14 2 67.33 GCGATNAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCA:1 + chr3R 9952229 3' - Ivk 49 1 74.26 CTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAAGCGCATTTAAAATTCGTGACTACCCCAGTTATCATCGATTCCACTTCAACTCA:1 + chr3R 25796084 3' + BS 5068 1 50.50 ATCGCATAGAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTGGAATGTGAATTATTGTAAAATGTTCCTCTATTAGTGTGATCTTAAAGAATTTGGTTTCCGTTCTT:1 + chr3L 16255506 3' - F-element 121 1 77.23 GTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAGTTTTACTAGAAGTGCGTTACGTTTTTCTTCTTACCGCAAAATTCAATTAT:1 + chr3L 11461416 3' - copia 25 2 52.48 ATAAACATCGCAAAATAATGGTTATAATTAAATGGCTATGAGGATTACAAGATGAGGAGTTCAAGAAATGGATTAGCAGGGACTACATACTGTACTAATCA:1 + chr3R 4631043 3' + R2-element 3412 1 64.36 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTG:1 + chr2L 326210 3' - roo 8686 2 58.42 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAAAGTAAGTAACTTGATGT:2 - chr2L 13250361 3' - pogo 27 1 58.42 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAACACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAGCTTTATTGAGTTAAGATGGCACTA:1 - chr2L 10291541 3' - jockey 4813 1 77.23 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAA:2 + chr3R 7101063 3' - pogo 32 1 64.36 CAGTATGGGGGTGTCAAAATGCAGAGTGGATATTTTTGTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTGATAGGTTCGCCCGCTTATCATAGATTTTTTT:1 - chr2R 6779256 3' - 17.6 7046 2 68.32 GTTATAGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTATCACTGCTCCGCTTGG:1 + chr3L 13996588 3' - P-element 464 1 26.73 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTACTTACAAATAAATAT:1 - chr3R 21500950 3' + roo 350 2 82.18 TGTGTNGGAGAGCGAAAGAGCGAGAGAGTGAGAGCGAAAGGTGCAGTTTATGTGCATGCAAAATGGATAAAAAAAACACCAAAACCCTAATAAAAATAAAC:1 + chr3R 16948883 3' - Cr1a 304 1 70.30 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCGATA:1 - chr3R 8198487 3' - Tirant 8141 2 59.41 ACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAAGCTGACAATAGCTCGTTGTACATGTTAGCATTTTCATTGCCCAAC:1 + chr3R 25582229 3' + jockey 4861 1 57.43 AGGTAGATCTCGCTCCTCAGCAAGGATCCCCCCAGACGCCTACGAAATCCAAGCCGAAGATACGGCATGATGGCACACCCTGCCTCACTCCCGACTGGGAT:1 - chrX 613727 3' + R1A1-element 5119 1 49.50 AATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTATACACTTGGGTAAATAAGTACAAAATTCATTTGTCGAGAAAAAGTTACATTGGCACCATTGTATAACA:1 + chr2L 8740972 3' + Burdock 6381 2 69.31 TTTTATTTATTATAATTTTAAGGTTTCAAATGTGTAATATTTACACGTCGTTTAAAGAAAAGTTAAATGTAAATCCAGAAATATGCGCATCACATGGGTGT:1 - chr3R 13135827 3' + INE-1 424 1 45.54 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCATACGGAAGTTCGCAACTATACATC:1 + chr3L 10698739 3' + roo 404 1 75.25 AGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTATAC:1 - chr3R 4160054 3' + invader2 5102 2 73.27 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCGGACTATTGAGCCGGCAGAACAGTTTAAT:1 + chr3L 13994254 3' + P-element 2840 1 30.69 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATACCCTTTTACTTTAATAGTAAGAGGTATAAAAACAGGTACTTGCACTTAAATG:1 + chr3L 25126290 3' - blood 25 2 54.46 ATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTTATAACTGCTGATAAAACTCTTTTAAATTAATCATATCAAATCGATATGATTTTACTAG:1 - chr2R 3090138 3' - Doc 4617 1 57.43 GGAATNGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCAAATTGCGCTGGATGCTGGTTTGGGTGGAGCAGTGAAGCGTATGCGTTTGCACGAGGA:1 + chrX 6658047 3' - P-element 2808 1 61.39 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTACCTTTGACGAGTGCATCTCCATCGCCAT:1 - chr3R 16404463 3' + roo 359 2 75.25 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCCCGCTCTCTCGTTGGAGGT:1 + chr2L 108082 3' - P-element 12 1 68.32 CGTCAATACATTGTGACACTTTGTCACAATATTTATATTTATGGGACACAGAAAACATACAACATCCAAATCCTTATCAAATCGTAATCCACAAAAGGGAC:1 - chr2R 21140600 3' + Stalker4 7015 4 65.35 AATATATATACATACATATATAGTATGTATGTATGTATGAATTCATATATCGGCAAACAAATCGCAATGTTGTTTGCAGTCTCAGTTTTTTTTTATTTTGT:1 + chrX 11541563 3' - 1731 4410 1 75.25 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCACTCTAACTAACATCGCATGAAGATTATTCAACCCATAAAGTTTCGTGACAGC:1 + chr3L 19215871 3' + roo 9048 2 57.43 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGAACAAAGTCCCATGTCGTGAAGTGCATCTTT:1 - chr3L 13080948 3' + 412 446 2 72.28 AGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAA:1 - chrX 21087587 3' - mdg3 32 2 56.44 TCATTGAGTTCTCAATATTAATATTGGGTTTATTTTGGGTGGTGTCACCAGAACTCGGGAGAGATTTCAATGGAAACCAGAAAATTTAACATTTTAAACTC:1 + chr2R 10602661 3' - Stalker4 6900 2 78.22 TGGTATGTTTTTGAAGTGATTTGAAGTGAAATTAATGACAATTAAACTCGTTAATACTTTATATTAATACATACCATTTTATATTAGATAAAAAAGATATT:1 - chr2R 21712726 3' - I-element 212 1 72.28 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTAGCCGATACACCAACTTATTCCTACAACGAGCGAAACAGTAAGAAAGCCAA:1 + chr2L 22719660 3' + 1360 3364 1 51.49 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTGT:1 + chr2L 18028752 3' + flea 230 2 57.43 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGGGATTGGTTCCACTA:1 - chr3R 25633323 3' - Tirant 24 2 55.45 GAATTCGAAGAGTCGCGCTCCGACACGGCCTTCCTGACCTTTCACATGTCCTCGTGTGTCTTATCCGCCAATCCCCAATACAATTAAACTTGACGAACGCT:1 + chr3R 30780462 3' - invader4 4 2 72.28 AACCACCAGTTGGGAAAATCTTTTCCAGAATTAGTATAAATGTATCCTGTATCCCGTAAGACCTCAGCTGAAATGATTACATGCCTGTTTAGATTTGTCAG:1 + chr3R 23543902 3' + S-element 452 1 62.38 CGAAGNCTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAATGGGAAGCCTTTCACAAAAGACCATACAAA:1 - chr3L 21735358 3' - Doc 4 1 78.22 CAAACACGAAATGTGCTTATGGTGCTATTGTTACCGCAACTGTACATATATACACATCATAAAATTAATATACGGAATGTTTTTACAATTATCATAAAATA:1 + chr2L 14377988 3' + Tc1 1620 1 51.49 ATGATGAAGCGTGTCCGTAAGGACGAGATGGCCAATCGGAACTATAGATAAGGAGTACTCCCGGTAGAATCCAAGTAACCTCAAACGAATGAGTAATGAAA:1 - chr3R 14682067 3' + Rt1a 4734 1 62.38 GAACANGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGGATGGCATGCAGTTATCCTGTCGTTTTCTGTTTTCGGTTAGGGGGCTACAACTCCTCTTG:1 - chr3L 10035613 3' - jockey 23 1 62.38 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAGTTAATACAAAGTAACGTTGAGTTTGTTTTGT:1 + chr2L 6252557 3' - P-element 42 1 37.62 TCTCTTTTTCCTTTTTTTTTTAATATTTTCTCGTCCCCTCCCCTTCTGATCCCCTTTTTTGATCCCCCCTTTGAACCCCAACCCATCGACGCTGCGTTTT:1 + chrX 17779842 3' - Doc2-element 232 1 64.00 TCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCCCCTCCCCCTCTCCAATCATTTGGAGAAGAAACACGGAATAATAGGTGACAACTGGAGATATTCCCCATTTGGCAGCT:1 - chrX 16671751 3' + roo 8830 2 80.20 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTGTACCATCTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCATAAATAAATCATCTATACA:1 + chr3L 23456269 3' + 1360 3372 1 58.42 AACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTAGAAGGAAGCGCAAAGAGGGGCCAGCGATCAGATGTCTAGGTGAGAGATACAAAAAGCG:1 + chr3R 29257640 3' - 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chr3L 14910573 3' - roo 8698 2 61.39 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGTAATTCTAATTAACTACAATTAGTAAGGTTAAACCAATTCG:1 - chr3R 12877823 3' + mdg1 365 2 78.22 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAAAAATGGCTACGAAAATTTAA:1 - chr2R 8378596 3' + pogo 2069 1 62.38 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAACATTATCATCTAAGAAAGTAGAAAATTCTAAACGTAGTCCAACTAAAGCTTAAATATTATGTTCTT:1 + chr2R 17384111 3' + mdg1 7447 2 58.42 CGGTGCTAACTGTACTGCAAGTGATGTTCGCGCTGCCTGCTGCATTTTGTCTAACAATTATATACATGAGGAAATCTTGGAGAGCTAAAACAAAATCTTTA:1 + chr2L 14078322 3' + Stalker 479 1 60.40 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCAGCCGAAGAGAACCGCCTCCTCCGTTTGCGACGATAAGCAAAAGCC:1 + chr2L 108064 3' - P-element 25 1 53.12 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAGAAACACGTCAGGTGCCGATGACATGCAATCCACGAATGACCAAATTTCTAAAAAAAAAA:1 + chr3L 9867752 3' - Doc 45 1 75.00 GCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATGAATATATATTTTTATATTTATAATAACACAACAAGAG:1 - chr2R 6493955 3' - 17.6 33 2 76.53 CCTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCCCATTCGGATAATAGCATACTATGTATCTCCATATTTGGAGCCCAATTATG:1 + chr3R 19223358 3' + FB 458 1 58.42 CTGAATTCCGTACGTCCAGTTGTCATTCCTAAATGTGTACTTTACAACACTACTGCCTGAAATCGCTTAACTCAGAGAGAGGGATCTCTTTAAACAAGGGG:1 + chr2R 11403985 3' - G2 2657 1 79.21 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAAC:1 + chr3R 13715144 3' + P-element 2851 1 43.56 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTATATTATTTTCAT:1 - chr2L 1129068 3' - HMS-Beagle 6825 2 55.45 GTGAGCTTGAAGTGAGAGGTCGAATAAAAAGGGACAGCATCAGCGAGAAGGAGAGAGAGCGCCCTACTGCTAGCGAAAGAGACAGAGAGCAGTGAAAAAAA:1 - chrX 12269515 3' + invader3 214 2 78.22 AAAAAAAAAACAAAAAACTAAAAACTATCAAAATGAATTTTTCGGTTGTTTTCGATGAGATTAAATTCTTATACTTTCAAAATGGTACTCAATCTGCTTGC:1 - chr3R 26510479 3' + gypsy7 5018 4 74.26 CTTTTTATTATTGTTATTATTATTATTATTATTTCAAGGCTTAAGTTTTTGGTTGTAAGTTTGGCTATAGGCATATAAATCGTTCCTATACCAATAGAAGG:1 + chr3L 15076869 3' - mdg1 7065 3 79.21 AACTCNACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCGAA:1 - chr2L 19642956 3' + roo 392 2 61.39 TATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGTTTGGTTATTTATCGGGTGGCG:1 + chr2L 22921309 3' + copia 237 1 74.26 AAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGGTATGTAAGTAATTTTATTGTGTTGGTATTTACAA:1 - chrX 7787217 3' + roo 389 2 59.41 CAAATATTTTAATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTGTGATATTATATTATTATATATATTATATTACATATTATTATATACTTACGTAGTTATTAAT:1 + chr2R 3146331 3' - 1360 388 1 53.47 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATACCCGGAGAAGGGAAAATCCAT:1 - chr3R 29432768 3' - 297 26 2 72.60 TCATATAATTTTTGTAAACAACTCATAGATCATTAAAATAAAATTTATTAATTCAATTAAGCTTCTAACTTAAACAAGTTGGCTCTTCGAAAAACAAGGG:1 + chr2R 9050366 3' + jockey2 3287 1 68.00 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCTACGCTCAGGTTGACCCTAGATTTTTAATTTTGGAGCGCAATCTAGATCGTCAGCATCGCCTCAGAGAAC:1 + chr2R 5262676 3' + 1360 3383 2 73.27 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGGCTTGATTTAGTTGGCCACATTATTCGTTAATTACTCATAAGTCAAAATTTAG:1 + chr3R 21501002 3' - roo 23 2 57.43 CACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTGCCGACTTTTCGTTTCGTTTATTTTTCACACGCTATCAGTTTTCAATGA:1 + chr2L 5567042 3' - 412 7521 2 57.58 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTT:4 - chrX 21087564 3' - mdg3 5261 1 66.34 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATGGCAATCAAGAATAGCATGAAAATACGATGATTTCTAACAATAATTTCTAATCAAATAACACTTTGCTCTTTACTT:1 + chr3L 4345064 3' - 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chr2L 16664020 3' + Cr1a 4030 1 59.41 GTTAAGTTCAGAGGAATTGACCGAACGATTCCTTTTGGAACCAAAATAAATATAATATAGTTTAAAAAAAAACGCTTAACTATGTTAGAGACGGCAAATAA:1 + chr3R 5826310 3' + G5 4787 1 65.35 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAATAAAATAAAATAAAATAGCTTTGATGGGTTAATTTACAGAGTGCCACTTTCTCGTAC:1 + chr3L 9192607 3' + I-element 5324 1 54.46 CACACTAGCTGAGTAACGGGTATCTGATTGTCGGGGAACTCGACTATAGCATACTCTCTTGTTTTTAATCTGATGGGTAAGTAGCTTAAGTATAGCTAAAG:1 + chr2L 20928629 3' + INE-1 539 1 65.35 GAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGGGGCTTTATGTGGAAAAAGAATGGGGATTCCTGGCGAAAAGCAGGATACATGGCACATCGTTAAAGGG:1 + chr3L 11910027 3' + Tabor 7317 2 71.29 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCG:1 - chr3R 7993872 3' - Doc 42 1 61.00 ATTAGNTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAA:1 + chr2L 12074544 3' + Juan 4172 1 64.36 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCAT:1 + chr2L 3694171 3' + roo 396 1 59.78 AGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTAAGAGTCTTTTATGATTAAACTATGCACTTTAAATCCGC:1 + chr3L 6129860 3' - jockey 4714 1 61.39 AACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCCTCGGTCTCTTGTATAATATCATAGTCTTGGATAGATCATAGTCGATCATAGTCGACTATAACTGGCTT:1 - chr3R 9657667 3' - BS 4 1 65.35 CTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATCCGTTTTATTATAGAAATAATACAAAATAGCAAAACTATTTAAATTAAATAAAGTTTTC:1 - chr2R 9375153 3' + HMS-Beagle 7028 2 68.32 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGA:1 + chr2L 14490455 3' + P-element 2857 1 49.00 GGAACGAGACACCCTGTATACGCGAACAAGTCACCCTTTATCTTTATTTACATTCTGTCTTGTTAATTTACTTTTAAATTTTTCTAACACTTGGCACGTGT:1 + chr3R 4545362 3' + 3S18 5772 2 55.45 CAGACGCTCTGAGCTATTCAACATTTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGAACGTCCAGAGATAATTATCCCACCTACAAGAGGAATTTCA:1 - chrX 21668070 3' + Stalker2 7614 2 55.45 ATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGTTGCAGAGCCATAGAAGTCATTTCTGGAGGATAATATATAATAAAATGTAATTATTTCATGGTCGTAGAAT:1 + chr3R 19967701 3' - pogo 2 1 77.23 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTCTGTGTCCATGTG:1 - chrX 14525258 3' - 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chr3R 25702178 3' - Tirant 28 2 54.46 AAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCTGAGAAATTAGGTGTAATATGATTATTAAGACAAGCTACAATACTTTAAGAAGAAATATTCTGAGGAGCTG:1 - chr2R 7344066 3' - Cr1a 350 1 64.36 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACAACAT:1 - chr3L 3944706 3' - jockey 4778 1 45.92 CTTTTGTTTTTGATTTTTAATTTCAATTTTTGATGGTTCTCTTTCATAAATTTAATTTCATTATTCAATCGTTCAAATTCCTCAGTATGATTTAATATTGA:1 - chr3R 19449682 3' - P-element 2649 1 80.20 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCATATTAAACGTAAACTAAAAGTACAAAAGCAACTTAGATCACGAGTCAC:1 + chrX 4009350 3' - 412 27 2 54.46 TCAGGTCCTTACAAATGAAAACAGGTGGTTTAGCATGATGCTCTGCAGGAGTAGGTCGGGCTGCCCTGATATGTTGACGAGCGACTTTCATTTTCATTGTA:1 - chr3R 25557788 3' - Chimpo 3923 1 78.22 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCCAGCTACCGAAGTCGCCGGGCACTACACAAAAAATTATTTTAGACTCATTAGAG:1 - chr3L 3090870 3' + P-element 2864 1 54.46 GGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTCGTGTCTTTCTTTTTGCCATTTTGCACTCTG:1 + chr2L 17051974 3' - F-element 4451 1 70.30 TGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTAGTCGAAAGGGGGGGGCAAATAGTACGAG:2 - chr2R 22997971 3' + Transpac 5183 2 75.25 AAACTCGCAACGGCATTTGACGAGTTAAACCAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGTTGAGGAAGCCATGCCCATCTTATCCGCCACCTGGTTGGAGTAG:1 - chr2R 14371698 3' + X-element 4371 1 57.43 ATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCGGCATCTTTGGAAACTGTTT:1 + chr3L 12085228 3' + pogo 22 1 44.55 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATGATTAAAGAGTAACATTTATTTTAAGTAAAACACACACATGCAT:1 - chr2R 22993701 3' - opus 28 4 59.41 AAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCA:1 - chr2R 20411866 3' + 297 394 1 71.79 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATTCATTAACCGGGCAACCGAACAGCTGCTGGCATTTGGCA:1 + chr3L 16533757 3' + 412 446 2 65.35 CTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGTAAGAGTATCTTTAATATCAGTAGTTCTGCACTGAAACTCCCCAATGAGGTTAAAGCATT:1 - chr3R 14049330 3' - transib2 15 1 64.36 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTCTTAAATGATATGTAATTAAAAATAAGCTATACAATACAAGCTTAGCAACACAAAAGTAGAAATCG:1 + chr3R 19224934 3' - 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chr3R 18717919 3' + diver2 4892 2 67.33 CTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGGAAACAATCAGGTACCGAAAATGTGAACTCTTACAATATATTTTACCTCTTTTTCATCTTAA:1 - chr2L 8740860 3' - Burdock 12 2 67.33 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTACTTACAAATAAATATTTATTAATTTGCATGATGATCATAACCATCAAGAGTAAACGAT:1 - chr3R 21500907 3' + roo 399 1 64.58 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACCTTTTCATACGACCTGATTGGCAAACAAATTTAA:1 - chr3L 14910550 3' - roo 10 2 69.00 AGTGGGCGCACAGGCAACGATCGGCCGCAAGTAATTTTCTGTACGCCTAAAATTTGTACACACGTCGCAAGCTGAATAACAAAAACCGCCGACAACGAATG:1 - chr2R 20348704 3' - hobo 2752 1 75.25 GGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATA:2 + chr2R 16898296 3' - Max-element 48 2 72.28 AAAATTAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATG:1 + chrX 8958636 3' + Doc 4698 1 78.22 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTT:1 - chr3R 23665274 3' + 297 6929 2 79.21 ATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTAGTTGTTCCATTAAATAATTTCATAAATTCTAGACTAAAAAAGTAAGGAGCTATTATGTTATAT:1 - chr2R 12213898 3' - Transpac 4928 2 71.29 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGTGGAATACATTATATATGCGTACCATTTCTGGGGTCTGGGGCTAAATTGGTATCACTTCAATTAAGACCCAGA:1 - chr3R 17367970 3' + roo 404 1 70.30 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATAGTGAGCTGATAATTATAAATTTGTCATGACATTCTGAGATATCA:1 + chr3R 14094992 3' - Doc 38 1 63.37 CATATTGGTCCTCCGGGAAGATATCCACGGAGGGTCGGGTCGTCATCAGATTGTGTAAAGGTATAGAATCTGCTAGGATATTTATAAGTATTCCGGTATTT:1 + chr2L 84936 3' - R2-element 310 1 63.37 CTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAGTTTCTCTCGCAGCTTTGACTTTTTACAGGATCAGCGATTGGCAGCCGGTGAGTGTCTGTTGTTTTTAG:1 - chr2L 17531988 3' - G2 2633 1 59.41 AATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGGCGATTACACTCCACCCGGAGCCACACAAAACTATTCAGGGTATTATTT:1 - chr3R 18368620 3' - R1A1-element 145 1 51.49 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAATTTGTTTTTGGATTCCTAGGATTACAAT:1 + chr3L 9925320 3' - Doc 13 1 65.35 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAACTTACGATTTCTAATCGGTCGT:1 + chr2R 9272923 3' - FB 53 1 83.17 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATATGGGCTAGGACTTTTTTAAACAGACATAGTGTTTAAAAATTGATGGGCAGCGACATGAAAATTGGACGACAGCA:1 - chr3R 29355944 3' + opus 432 2 77.00 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTGGTCTTAGAGAAATAACAAATTAGACACAACTCTGGTACATTGTGCTCTGTACAAGCGAAG:1 - chr2L 19642955 3' + roo 397 1 64.95 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGTGACAACACCGAGTTATCTTTACTATTTGGAAAGTTTCCAGGAATGATCGGTAATGAAACTATGA:1 + chr2L 1156827 3' + 412 491 2 75.27 ATCATTGCGACTTACGCCGATGATATTGCGGTTCTTTACAGATCCTTGATCCTTAGATTGCTCTGTATCAATTTTATTTTCTTCGGTTTGATAGTGATTTA:1 - chr3R 17661134 3' + BS4 175 1 58.42 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTTTAGAAGGAACAAGCTTAAAGAGAAATTTTAAAATG:1 - chr2L 8542854 3' - P-element 43 1 34.65 CTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGAAAGAACTTATAGAAGACGAAATAGAAATTCCTCTTCCTCATGAGAAT:1 + chr2L 5169959 3' + copia 4983 2 53.47 CGTCTACAGAGTCTCTCCGATTTTGCTTTTTTTTTTCTTTGCTTGTCGCTAATTATTGTACCAATACATAATAGATATATCCTTATATGGATACGCCCTTT:1 + chrX 2055364 3' - 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chr2R 4756643 3' - HB 402 1 61.39 GAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTATACGATTATTATTGGCAGCTC:1 + chr3L 26008057 3' + micropia 5311 2 79.21 CTGGCTAGCTGGGGACAATGTTGCAGTGCGACTTTTGTGGTGTGCATTTAACAGCATTTAAAGAGGTTCTGTTATCTAGTTATGAGTTGATGGCGGGGGAT:1 + chr3R 16287824 3' - Tirant 8252 2 68.32 AGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTTAACTTGGCTAATGAATGACTTTCGGCCAGAACCTCAAAACGAACAAGTAACTGTAATTAACTGC:1 - chrX 11519770 3' - accord 123 2 70.30 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTTATAGCATATAGGAAATAATAATAGCAACGGCAAAC:1 + chr3L 21319299 3' - jockey 4711 1 62.89 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTGGATTTAAATGAATTTTCATTGCCTTGACATCCTCCGTAGATAAAAATAACGCATTTGTTCTTTTTGGAATCAT:1 + chr2L 3694190 3' + roo 406 1 73.27 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTGCAGCACCTTTATCTTCCAGGTGTCGCCGACGAAGTAACTATGACTAGGTGAGTGGTTGGCATTGTTCGGATTCGCA:2 + chr2R 23737310 3' + blood 346 2 81.19 CATCTACAGATAAGTACGATTGCAGCGGCCTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATATGACCACGCGGGAGCAGCAGCCGTGCGACGTTTTTCGGCAAAACGAG:1 - chr3R 7185479 3' + rooA 96 2 67.00 ATATTAACTCTACTCTACATATTGAGGGTAGCTTTACAAATTTTATTTTGAGATGTTTCTTAAAATCGACTTATCATAGCTTGCTCTTGGTTAATACTTTT:2 + chrX 21668895 3' - Stalker3T 53 1 67.33 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTTATGATACCATTTAGCCGGAGGGTTGTTTTGACAAATTGTGCAAATTATT:1 + chrX 7828957 3' - 412 7080 2 52.48 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGC:1 + chr3R 19076190 3' - roo 54 2 80.20 GGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGGACCAAAAAATTTTAAAAACAACAAATATATG:2 - chrX 14796862 3' - transib2 43 1 74.26 AACAANGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGT:1 - chr3L 7792197 3' - 412 51 2 71.29 AATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCCAGTTTCTTTAAGGTGCTCAAAATGGAAAGAGCTTTCTGCGGGATA:1 + chr2R 8011939 3' + Tabor 400 2 54.46 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTATTTTCCCTGTTATTTTTGAAGTGTACCCCTAGGTTCCTTTT:1 - chr3L 2024317 3' - copia 4904 2 61.39 TCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTCGGGCGCCCCAAAGCTGGCAATGAAATATGCGACTGCA:1 - chr2L 7170360 3' - jockey 4616 1 63.37 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTATGA:1 + chr2R 12779175 3' - roo 17 2 65.35 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGTACTCCACACGCTGGATCCTCTACGTAGTGGCAGC:1 - chrX 8031365 3' + roo 9030 1 66.34 AGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTTAACAATCTTATTCTTTCTGGTATCTGTTGGGTACATCCGGAGTCGAGGAGTTGCACAGAAAGGATTCA:1 - chr3R 6889812 3' - Idefix 161 2 75.25 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAAAGTATGGTTTGAAGGGTTGCT:1 + chr3R 24152908 3' - P-element 53 1 27.72 AAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAATACCTAACAAAGCACCCCTAACATCAAATTAAGGGATAGGAATAT:1 - chr2L 514859 3' - 3S18 5799 2 57.43 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCGGGGTGTCAACTCTGGAGT:1 - chr3L 958773 3' + P-element 2830 1 17.82 AAAAAAGAAATCGAAAGCGAAAGAAATCTATTTGGAGGATTAGACCCAATACTTCGGCCATCCATGGTTTTGTCTTTAAGATAGCATACATTTTTAATTGT:1 + chr2R 14498591 3' + Doc2-element 96 2 61.39 GAGTGCCGAGAACCCTGATGAAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATGCTAACTGGCCAAGGACAGGCAGCTAG:1 + chrX 329064 3' + opus 478 2 61.84 GGGGGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTTTTTTACGTTTTTTAACATTTGTTTGGTTTTATTTGGGTTTGTAGTTA:1 + chr2R 1918684 3' - F-element 4457 1 52.48 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTGAGCCACCCTAAAATA:1 - chr2L 7350723 3' - mdg1 7059 2 53.47 TATTAGTAGCTTTGCAGATATCTTTTACAGAGCTCACCAACAAAAAAAAAAATATGTGAAAAAAAAGGGGACAGAAAAAATGAAGGAAAAGCGGA:1 + chr3L 9240003 3' - hopper 390 1 68.42 TTCTTATTTATTTTATTTATTATGTAACAGTCTTGTGCGCCAGTATACACAAGGATTAAGCTTATCCTGGATCCTGGGCTGGAAGCTTATATATTTTTAT:1 - chr3R 29640476 3' - X-element 4715 1 70.00 CAATCAGTCATCGAAGGAACGATCGCAAGGCAGCAGTTGCAGCTTTATAGCTTTATGGCTGTGGCCGGAAAAGTGCAATATGCTCTTGCGCCTCCATAAAA:1 + chrX 14707045 3' + flea 4847 1 71.29 GCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCG:1 - chr2R 12185337 3' + accord 7347 2 63.37 CAGCCNAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAACTATCACTAAGAGAATGAAAGAAATCCGAAAAAAAGGCGATATAACGAACAGTTGAGC:1 - chr2R 20425009 3' + Doc 4563 1 57.43 AAGAGACGAGAACGCGTATAAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACAATTTTCGGGCCGAAATGAAGGAAGCAAAGTCCGAAAGGATCCAAAATTCTAGCTCA:1 - chrX 6420410 3' - 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Doc 43 1 64.36 AAAAAAAAAAGTAAAATAAAAAAATATACAAAAAAAAAAGAGGAGAAGGAACAATGGATGGGGCAGACAA:1 - chr3L 12558571 3' + Doc2-element 252 1 60.00 TAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTACTCATTGGATTTATTTATAGGATTATAA:1 - chr2R 18295627 3' - I-element 26 1 64.94 AAGAGGATAACACAATAGGAGAAAAAAAGCTTTTGGTTACCGCGACCAAAAGAGGGAGACACAGTGCATTGTCAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTAT:1 - chr2L 22211546 3' - Dm88 102 2 68.32 ATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTTAATTGACTCTCAAAAGAACTCGACTAATTACGTAAAGCCAACTATTATTCAACCTATTAAC:1 - chr3R 7890057 3' + F-element 309 1 70.30 TTACACGCGAGAGGTATGTTTTGCTTTTGTTTTAGGTAGACTTGTGAATTCTTCAATTTTTGTACCCCCATTTTCTTTCAGTGCTTGGTATTTTTTTGGAC:1 - chr2L 5455326 3' + Tc1-2 119 1 80.20 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATTGAAATGCCATATGATCTAATCCTTCATTAGATACACACCATATGTATGTA:2 + chr3L 9121894 3' + Transpac 291 2 61.39 TAACAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTAGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCTCTTACGAGAAATATTCGATTTTTTA:1 + chr2R 5424268 3' - 1360 3362 1 81.82 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTGGATATCCTTTCCTTTTTAAAATGTTCATATAGTGCGAAATTAACC:1 + chr3R 12894171 3' + blood 346 2 55.45 GCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTGGGGAAAAATGGCATTTTTCCTAGCTCTAGCTGAAGAAGAGAGAAAGCAAACCGGAAATCGTAG:1 + chr2L 1861049 3' - 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chr3L 18009580 3' - roo 25 2 70.27 TTCTAGCAAATATAAAATGTACGTTACAATTGGAAATTAAAAAGGAATACACGACATATATATATTATTATTATTATATTAAATTATAATATAATATTATA:1 + chr3L 23392815 3' - invader5 35 2 55.45 GTTTACTTACAGGTAGGTAATTATTAATAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCTTTTGTCTTTGCCCTGCCATTGTGCTCGAAATGTTGT:1 + chr3R 25633033 3' - Tirant 452 1 63.37 GTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAATCCATTGCCAGCAGACCTTGTTGGTAAAAGAGT:1 + chr2L 7459614 3' + BS 5053 1 71.29 ACTTANCCTAATGTGTAGCTTAAAGGATAATATTATCGATACTCTTAATTGAAGATCTTTATAGAAGTTAGATCTTTGTCTATATTATATTATATTATATT:1 - chr3L 20525228 3' - G5A 2782 1 76.24 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCCCTTCTTTCTAACCCATAAACCTTCTCGGGCGCCCCAAAGCTGGCAATGAAATATGCGA:1 - chr2L 7170365 3' - jockey 4621 1 58.42 ATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGAAATATATGAAACATATTCAAAAG:1 - chr3R 16626757 3' - I-element 5262 1 72.28 CCTGGAAAGAGATTAACTTTTGAAGTTACCCAATAATTCCCATAATGATAGCAGGTTCGCGGCTTTGGATCTGCTGCAAGAATGGCAAAATCTCGTCTAG:1 - 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Ivk 51 1 77.23 TTACCAAAGACACTAGAATAGTGTCTTATTCTTGCTTTTACTCTACGAGCAACGGGTATAATCATATATAATAAAATATGTCATCAAAGTTAGGCTTTAAG:1 - chr2R 5249844 3' + Tc3 239 1 69.31 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATAGTTATTATGTTCGTATATACTACAACACTTTTGCGGGCCGCTCGTTCGTGAAACCAATTCGGCCCAAA:1 + chr3R 29660299 3' - mdg1 36 2 59.41 CTGAGCTATTACTTATTACTTATTACAGTATGTAGAGCGAATGCGAAAAAAAAAATACAGGACAACTTCATATATCTGCAACTCCCAACTTGGATGTGTGT:1 - chr2R 9387298 3' + Stalker2 398 2 73.27 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTAAGTTATTAGGACCCCAAAAATGACTGCCCCGAAAAGTAGGCAATCCAAAATGCAG:1 + chrX 10653610 3' - jockey 29 1 57.43 ATAATAATAATATAAATAATAATAACAACAACGACAAATTACACATACGCCACGTTGCCGGCAATCACTTATGCAGAGAAGTCTGCAGGCCAATACACTCG:1 - chr2L 20505705 3' + mdg1 41 2 70.30 TCTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTATTATCAGTATAAATATAGGGGACA:1 + chr3L 4403536 3' + roo 8985 2 53.70 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATTCACATAACTTAATGAAAGGGATAATTAATTTATGTGTATGTGTGTATAAGAGGAGTAGCT:1 + chr3L 21927943 3' - blood 25 2 54.46 CAGATAAGCACGATTGCAGCGGCTTATTGCCGAAGTGTCAAGAGATTTGACCACGCGGGAGGGACAACATGTTGGCAAGTAGTAATAATGGAAGTTACAGA:1 + chr3L 23455007 3' + rooA 7337 2 61.39 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAAT:1 - 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chr2R 23843661 3' - Stalker3T 325 1 59.41 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAG:2 + chr3L 15638276 3' + roo 9021 2 81.19 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTATTCAGGTGGGGTATCATGGGTTAAGTGTTATGTACACCCGTTTGCATATTGAAATTGC:1 + chr3R 25818902 3' - mdg1 7057 2 60.40 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGTCACCTTGGCATTGAAATATGCCTACGCACACAAGGA:1 + chr2L 2197140 3' - P-element 39 1 41.58 CTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTAATGTTGTCAAAAGTAATTTCTGAGTTGTTGGAT:1 + chr3R 1206442 3' + I-element 5313 1 70.30 ATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATACAAACCCTGGACATTCCTACTTAAAATTATAAATAAAACGCCACTTTGTTTTCATGGTTTACGTACTTTAAC:1 - chr2R 4030292 3' - Doc2-element 4444 1 79.21 CTTTCCGTCCATCCGTATTAAGTGAAAAGTGAAAATATATAAGTACATGCGCCCAGCCACCGTGATTACTTTCTTTTTCTTTGCCAATATTTACGCGGCG:1 + chr2L 5930977 3' + Max-element 447 1 74.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGGGCGATTCCAATTGGTGAATTACTTTCAAGGATGATTTTAGTTGTTCTTCTAAAA:1 + chr2L 2437787 3' + roo 9050 2 56.44 GATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTTCCACT:1 - 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F-element 323 1 69.31 TACTCAGCTAGTGTGAGTGCGAACGCGAAATTTCATAATTTTTCTGTGGGCCTGTTATCTCGTTTACGCATTTTGAGCCTGGTCCTTGTCCCAACTACCT:1 - chr2R 12054112 3' - INE-1 532 1 58.00 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCTCAAGTGCGTGTACTCGATTGTACAAAATAATTAAAGCGGGCTAGA:1 - chrX 6997143 3' + P-element 2882 2 74.26 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAGACTATATGGGTGCCTCGCAAAACGTA:1 + chrX 18353540 3' - jockey 57 1 73.27 GTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTCTGTGTCCATGTGTGTGCATTTATAACAGACA:1 - chrX 14525239 3' - hobo 12 1 69.31 CTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGA:1 + chr3L 19951261 3' + Ivk 5337 1 60.40 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAA:1 + chr3L 7989804 3' + mdg3 211 2 61.39 CGTGTATCGTACGGCTCGAGTCGCGAAAAGATAAAGACGCGATATGAAAAAGAGAACAGGAACGAGGAAAAAATACCAATTTTTTTGTTGCAC:1 + chr3L 25730474 3' - Cr1a 4390 1 70.97 ATATGCGGGTTAGCTGAACCCAATTTCAGCACACTTTGAGCAGTCAAATAATGAACCTGGAACAGAGCAAAAGCGCTTATATTCTTATAAAAATTAAACAC:1 + chr3L 23398264 3' + Stalker4 297 4 75.25 TTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGCGCATGGAGCAGGGTTTCAACTATGCCAATCATCGGGCACTCGGCTTTTATGAGGTTTCCGC:1 - 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chr3R 2210587 3' - 1360 94 1 57.00 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACATCCGTTTTATTATAGAAATAATACAA:1 - chr2R 9375187 3' + HMS-Beagle 6994 2 78.22 GTTAANTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGCGGTTGCTGCTGCTGGTGCTGTTGTGTTGAAGAATGTTGAAGAAC:1 + chr2L 13060334 3' + P-element 2857 1 49.50 TACAACGCAACAATGCATACTTTTCTTTCGTCTCACCGCAAATCGGTGATCGAGCACCATCACCTTCAACTAACTCAGTTGAATACGTATCTGTCGGTGGG:1 + chr3L 13823399 3' + Doc 274 1 75.25 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGGATTGTTAAAAGTTAATTTCT:1 + chrX 5443931 3' + mdg1 7404 2 78.22 ACATTTTTGTTTGTTTATTTTCGATCACTCCCCCTGCAGGGAAGTGCAACTGGAATATGGCTTGGATATGACAGCATTTCAGGGCCATATAAAGATATTTT:1 + chr3L 15763764 3' - Fw3 3057 1 76.24 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCCTGTCCTCCTTCTTTGTCGTGGTGTGCGTGTGCCAACGCGTGTGTGTGTGTGCCAGTGGACA:1 - chr3L 16667694 3' - hobo 14 1 65.35 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCTATCGACATTTTTGCAGGCCCA:1 - chr2R 10863866 3' - mdg3 5254 1 74.26 GCAAGTGGGGGGAGGTGAAATGCAAAAAAACTTTTGCTTTTGCAAGCAGAAGAGACTAAGATGGAAGAGCACACACCAATAGGGCTATAGAATATGTCTTC:1 + chr2R 18757626 3' + Bari1 70 1 59.41 TTCTAAGAAAAAGAACAAAACAAAATTAGAAGACGCATTCGTGTCAAAGGAAGTTTCAACAATGCCGGAAATGTTGTTTAATAAAATAAATAC:1 + chr3R 24119529 3' - S-element 252 1 74.19 GCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGATGCGGAATTGCCTTTGTGTCCCTGCCGTTTATGACATTGTATTCGAATC:1 + chr3L 17710249 3' - Stalker4 147 4 50.50 CACGAGTGCGTTGGTAGTGGTAGCGATAAGGATGAAGGCAACGAGAACGCCGATCTCCTGCAGAAGGGCAATCAACTGGGGATTCCTGAATCGCGCTTCTC:1 + chr2L 18388738 3' - G-element 160 1 79.21 CCTCGTCGCCAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCAAAGCTCGATTACTGTCATTAATCCAACCCAACCTCCCTCTTT:2 + chrX 2574438 3' - Transpac 319 1 57.43 AGTTAAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATT:1 - chrX 1427531 3' + Bari1 1676 1 53.47 GCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTTCTTTGCGCTCATCTTCCCGCTAGATCCGATTTTCGAGTC:1 + chr2R 4676444 3' + Max-element 52 2 63.64 TGACCCTCTGGTGGGAGTCGCGAATGCGGCTGCGGATGTTTATGTCTGTTGGATTGGGTGCCTTCTTGAGAGTCTTTAAAGATAAGGCAAAACGTATTGTT:1 + chr2L 14292398 3' - Quasimodo 7056 2 69.31 TGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACTCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGCACAACACATCAAGCACACAACTATAACTACTCTATCTATATATAACTACA:1 - chr2L 4189366 3' - 1360 28 1 52.48 TTTGGAAATCAACTTTCCACATGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCTTCAAATTTAGGCGGTAACAAAAATAGCACTGTTTCTCATAGTTTCCGGCTCGAAT:1 - chrX 20541930 3' - Tc1 33 1 46.53 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCAGCTTTCGCCA:1 - chr3L 11070514 3' + P-element 2841 1 32.32 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCAGAGAGACACAGAGAGGGAGAGTGAGCGTGACATATGTGCCAAGATAAAA:1 + chr2L 14490460 3' + P-element 2861 1 53.47 AACAATATTAATAACAATAACAACAACAACAACAACAACAACGATGGCGAGGAGTATGATCCCATTTCCACGACTCCATTGCCTTGTTGCTCTTTCATTTT:1 + chrX 7715388 3' + mdg1 22 2 60.40 ATCAGGATAAATAGCCGATTCGATTTGGCCCTGTCCGTCTCCAACACGGTCTTCCATCGCAAGAACGTAATCACCGATTCGAATACAGCCAATGGCAGCCT:1 + chr2R 14197568 3' + INE-1 93 1 61.39 GTCTTCTTATTTGGGACTTTACACTTACTCTTCGTCGTCTCCTTCATCCTTCTCCTAGCTCCTTTCCGTTTCGTTTTGGCTGCTTTCTGCAACTAATTG:1 - chrX 7808946 3' + roo 407 1 76.77 AATAAATATAAATATACAAATATAACATAAATTGAATTTCTTCACTTTTTGTATGAATTTTAAAATATTGCCTTGGTTCAATGGGCAGATCGGGCAGGGGG:1 - chr3L 6641158 3' + Stalker4 86 4 56.44 TGAGAAATTTAAATTTTGTGTGGTACAATATAATCGTAATTACAGAGTCGAGACCAAACAAAAGGCACTCTTGGAAACGGGCGGCGCTAACAGTCGCGAAG:1 + chr2L 12011814 3' - Cr1a 320 1 76.24 GAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAAAATCCCAATAAATTTAAATTTTTAACAAACAAAAATTG:1 - chr3L 7855451 3' + Tirant 8402 2 62.38 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGAGCCTGTCTCAAACTTTTCCAGCTCCTGTGTCTGTGTCCATGTGTGTGCATTTATAACAGACATTTCATTGC:1 - chrX 14525230 3' - hobo 3 1 78.22 CAGAAACGCGTGGCGATTCACCGCCAAATAACGGATCAGCAGCCGAAGAGTGGGGAATGGATAGGATAGCATCGTGGAC:1 + chrX 4497275 3' + invader3 445 1 62.03 GAGGANCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCT:1 + chr3R 24282001 3' - Max-element 50 2 71.29 AACATAATACTCTGTAACGGTCATGTAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTTAAAAAGGGGGTATTATCAAATTGCAATTGCTGCGGAAAGCAGAAGATT:1 + chr2R 4877395 3' - Cr1a 4181 1 58.42 CTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGA:1 + chr3L 8974135 3' + P-element 2841 1 33.66 TATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATGTAATAAAGAATACATAGATATAAGCACCCAACAGAACAAACTTTGAACAGTTGAATAAAGAACCTC:1 + chrY 3648910 3' + 17.6 7412 2 71.29 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACTTGAATTTACTTTCCGGAGCAGTGCTTCTAAATAAATAGATGCAGAAAGTG:1 - chr2R 19192525 3' + roo 9046 1 57.43 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGAGACTATATGGGTGCCTCGCAAAACGTATGGGCTGGAAAACTATTGATGGGTTTGCCCAAAAGTATG:2 + chrX 18353579 3' - jockey 17 1 66.34 GACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTTATCCATATAAAGAGCATCGAGTTGCGATGCAGCCCCCTTTTCTGTCTTTC:1 - chr3L 11548350 3' + mdg1 300 2 57.43 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATAGACACCACCCATCGCCCACTTTCCACCCCATATGCCAT:1 - chr2L 2920893 3' - hobo 39 1 62.38 GAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCAACCACGATACTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCACTGGGGCCCCCTACTTGCGGGTCGG:1 + chr3R 11771124 3' - R1A1-element 5023 1 73.27 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATTG:1 - chr3R 31812712 3' - P-element 85 1 20.79 GTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGTTGTTAGTTTACTAGTTTCAAATTCAACATGAAGCAGTTCGCA:1 - chr2R 9362875 3' + Doc 192 1 57.43 GTTGGACCTAATATGGATTTTTTTAAAAGAGCCTTAGTTGACATATACATACATATACATATGTACTTAATTTGATCGCGAATTACTTCGTTACTACATTC:1 - 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chr3R 16004013 3' + jockey 4966 1 50.50 TTTTTTGGTGACGGCCAAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACCGTGTTATTGCATCAATGTCATTTTTGTTATCTAGCATTCTATTAAAGGATGGAATTT:1 - chr2L 17432007 3' - 1360 3326 1 66.34 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTGCCATGTTTTCTCGCCTCCTGTTGTATTTCCCCATTTTCC:1 - chr3L 10736457 3' + 412 456 2 62.38 TTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAACGG:1 - chr3R 25702171 3' - Tirant 19 2 61.62 TTTTTTTTTATTTTTAAATTTGGGTTCTATACAATTCAGTTAAAGTTGAAGCTTTAAGGGAAAACCCCCTGTAGCTT:1 - chr3L 715551 3' - TAHRE 10440 2 72.73 ATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAATACTTATATGTGGGCTGGGCA:1 - chrX 13350786 3' - jockey 4814 1 77.23 GCTAAAAGTGCGATCATCTGCACTTCTCCGCCGCGTAGCCGCTGACGACCACTGATTCGCCGCCCGAGAGTCCAACATTGCCGCAGCGACGCTTCAAATAA:1 + chr3R 26976524 3' + HMS-Beagle2 117 2 59.41 GGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCATCATCGGCATTAGAGAGAGTTTTCCTCCAGTTTCCCCT:1 + chr2L 17617917 3' + blood 143 2 55.32 ACTTGTTGCGTCCTGGCATTCAGATAGCTTTAAAAACAAAAAACAAAAACAATTTTAATAAGTATTTAAACATACAAATCAGAAAGCAAAACGCAAAACTA:1 + chr3R 27745631 3' - Q-element 419 2 47.52 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAATCTATCCGCAGAATGGAGCAATTATTTCGGACC:1 - chr3L 14910583 3' - roo 8708 2 71.29 ATGCTTTTTCGTCCTTCGCGTCGAACGAAGCCTTTAGCTCAGCACTATCACTTTCGTTTTTAACCACACATGTTTTTTTTACAGCATCCTTAAATTCTTGA:1 + chr2R 2955039 3' - Dm88 479 1 68.32 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACACATCTCATTAGTTTACGGCTC:1 - chr2R 9014438 3' + blood 7361 2 71.62 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTATATATAGAAATACGAAATACTGGCGGCAATAGGCCA:1 + chr3R 29350773 3' + opus 498 1 64.62 TTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGG:1 + chr3R 1977611 3' + micropia 415 2 63.37 TTTGGAGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAATATAGCGTAAATAGTAAAAAACGTAATTATAAAAAAAACAATAAA:1 + chr2L 13551033 3' - 1360 3323 1 53.47 ATAAATATAAATACACACATATTCACACATGGGCTTCATAATATAGCTTGAACGATTCATATAGTTTGCGAAGAAAACTATTTGCATGGAAACTCGGGGCC:1 + chr3L 6675511 3' + Stalker4 7043 4 66.34 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACGTTTATACTAATATATTGGCATGTATTGAATTTTAGTGAACAAA:1 - chr3R 13202986 3' + roo 386 2 55.45 GCTGCGGTCAAAATAATAGCACCGGAAGTGCAGAGATTTAGGATATACATAAATAAAAATAGTTCTTATTCAAAATAAAGAAATTGTGATTTATGTACAGT:1 + chr3R 24574246 3' + Tc1 5 1 83.17 ATTTATAGTTCCTTAGATCTCGACGTCCATACGAATGGACGGACAGGGCCAGATCGACTAGGCTATTGATCCTGATCAAGAATTTATATACTTTATATGAC:1 + chrX 10233970 3' - INE-1 147 1 78.22 GCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGCTCTTCGTACTTTTGTACTATTGAAAGTTCGTA:1 - chr2L 13071872 3' - Doc 4523 1 72.28 ACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAAT:1 - chr3L 19951219 3' - Ivk 51 1 75.25 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACATTTATATATAGCTGGTAATGCCTCCTTTGGCAGCATCAATATGTGC:1 - chr2L 6464840 3' - 297 25 2 62.38 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATGCTGGAAAAAAAAAGTCACTGGGGG:1 - chrX 7787251 3' + roo 355 2 77.00 AAATTATAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTGGTAAATGTAACTAAATATTTAATAAAGAAAATAGTATGAAATATATAAAAAAAAA:1 - chrX 13682546 3' - roo 8685 2 60.40 GCTGTCCCAAGACACAATCCTTAGCGGTGACTACCACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCCGGGTATCCTAACCACTAGACAATATGGGAGT:1 + chr3L 22847777 3' - R1A1-element 252 1 68.32 TTTTTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACAACGTTATTCCACTGATTGAGGCGAATCGGCAGATCCCTGTAGGATTGTACCCAT:1 + chr3R 23953482 3' - INE-1 313 1 65.17 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTAGTGGGCTACTTTGAGTTCATCGTTTTCAATTCATTTTCGAGAGTTTCTCTTCTCTCTTAGCTCTGCTTCCTC:1 - chr3L 543387 3' - P-element 5 2 74.26 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGACTA:1 - chr3R 12767040 3' - 412 54 2 80.20 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTTCGATGGCATGGTAATTGACGGAAGAACTCCATGACATCCATCAGAAGGAATGAGCATTGAAT:2 + chr3L 13081019 3' - 412 7068 2 64.36 ATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACGTATCCCAGCTGCGTAGGAAGTTGTCACCGGCCTCGAGGAGTAGGTTCTGCGGGTCGTAAATCCACTTTCGTAAAC:1 + chr3R 10777227 3' + 297 6639 2 66.34 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGA:1 - chr2L 18112522 3' + transib2 2778 1 71.29 CAAAGCTCGGACTCGCAATCCCGAAAAACAAAAAAATCGAATCGAAGGGAAGGAAAAAAAATCTCCACACAAAAGAGACAGACCAGAAAAAAGGGCCACAG:1 + chrX 18347907 3' + Idefix 258 2 70.30 AATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGATGCTACCTGCTCAAAGGAAGTGTGTCCTGCACTTCAATTTAAACCGTAAGCCAGCTCTCAGCT:1 + chr3L 13371220 3' + gypsy3 6773 2 70.30 GTTGTTCGATGAATATCAAATTTTTGACTTTTTTAGATCATTTGAGCGATATATGGAAACCATCACTCTGTAACTTCCTTTCCTCTCTTTTAAGACTGGAG:1 - 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chr2L 9946884 3' + roo 402 1 37.62 ACGTCNTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACAAAGGATTTCAGAGACTGGTTGCTGCA:1 - chrX 13398642 3' - F-element 18 1 45.54 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCATTTGATCAATCATAGTTAATGCTTTTGGCCAGCATTTAATTGCAT:1 - chr3R 23665255 3' + 297 367 2 60.40 AAAAATGCGGTGTGCATAAGTATTGGTGTATGCGGACTAACAACTGTCATAATTGTGGCACAGAACTCAGCAACTGCATGGTTTCAAATTAAATAATGATT:1 + chr3L 9662302 3' + invader1 3793 2 55.45 AATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGTAATCATAAAATAAGAAGAATTCTTGTCTTAGCCATTACATTATAA:1 + chr3R 6431092 3' - 3S18 33 2 56.44 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCCTTATGCTTAACTGATCGATTTCGGTGATCGGTGCGCGATAATCTAAGCGGGGGAGAACGGCAGAGCTCCAG:1 - chr3R 8198456 3' - Tirant 3 2 76.24 TATGTTTGTGTGTCCTAGTCGAAGTCGTATTATTTTTATTTGGTCGAGTCTGGTATAAATATATTTCGTGCATGGTTTCACTAAGGGATTGAAGTCGTGTT:1 + chr3L 5015874 3' - I-element 4949 1 53.47 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGAATTGCTTCCCTCGCTCTTCTTCTTCTGC:1 - chr3R 30272798 3' + P-element 2862 1 54.46 TACGCATCTTGTTATTGTAGGGTCTTTGGAACAACGGAAAATTTAATTTAAAGGGAAAGGCAAC:1 + chr3L 22919844 3' + 1360 3382 2 60.94 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAATAAAAATGTTACTCATATGCGTGGAAGATTTCCCAAGT:1 - chr2R 17127666 3' + roo 9034 1 65.35 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACTTGAATCACTAAAAAA:1 + chr3R 19076220 3' - roo 24 2 50.50 CATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAG:1 - chr3R 19609663 3' + Tabor 7281 2 65.35 TTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAATCTGAACTCGAATCAGCGCGCTGAAGGAACTAAAAATGCCACAGAGGC:1 + chr2L 18112559 3' - transib2 2595 1 68.32 GTGGTCTGACTTACTTGAAATTATTTTAAATGTCAGACCACGCCGGAAGCCTTCATGAGTGACTTGTTCAAGAACAATATTGCGGACAGGATGGACATGGC:1 + chr2R 5471170 3' + transib3 2756 1 61.39 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATT:1 - chr2R 5849959 3' - jockey 31 1 55.45 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACCTTATGAATAATCACTGCATTAATATTTATATACAATAATTGACTACGTTGCTTCTCGCGATTATCAAGGCCATT:1 + chrX 5441057 3' - mdg1 7042 2 55.45 ACAGGATCAATAGCAGAGTCGATGTTGTAATATCCGTCCGTTCGTATGAACGTCGAGGTCAAAGAGTCCGATCCTTATGACTGGGAAAAAGTGGATTCCAC:1 - chr4 480153 3' + INE-1 94 1 59.41 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAATACCGTAATATTCAAGTGATAGTAGTAAGTTTTGATTACGCCATTATGTTAGTACAAGATTATAGCTAACAAGA:1 - chr3R 13375938 3' - 1360 2 2 75.25 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAAGG:1 - chr3L 21841289 3' + P-element 2862 1 54.46 AATGAGCACACACACACACACACACACACACACACATTGCAGAACGTTCAACTGCTAGTTCGGCGAAACTCGGGAAATCGGAAGGTTCAACTTTTGGGGCG:1 - chr2R 13942066 3' + accord 7026 2 53.47 TATTATTATTATTACTGTTGTTGTTGTTATTCGTTGTGAATAATGCAGCAGGCAATGAAGTGACTTCCAAATGGCCCCGAGGTGCAGAGGCTGTGGCTACC:1 - chrX 19975233 3' - mdg1 7069 2 61.39 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGGCAAACATAAAAACCCAACGAAACGTAACCTAACGATAGAT:1 - chrX 12294695 3' + blood 7353 2 59.41 GCCAGGGCAGATGTAACATGATCACCCACACCGTTAAACGAGAGAAGGCGATCCCGATCCCGATCCCGATGCCGATGCCATTATTTCTCATGCATACGCTC:1 + chr3R 10819339 3' + 412 7161 2 73.27 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTTCTGCAGTGGCAGAATCGCGAGAGA:1 + chr3R 30272854 3' + P-element 2838 1 31.68 GGGCGGGGGTTCATTGTTGTGGGTTATAGGTGGGGGAGATCAAGCGGGTGTTTCCTCTGGAGGCGTCTGATGGTTTTTGGATGTGGGGCGAGGTTTTGCTG:1 - chr3R 28997062 3' - G-element 4208 1 73.27 GAGAAGTACGCGATTTGGAAATTTAGAATTAGGGCTCTTTTAGCCGAGGGAGTCCGGTTCTTGGTCAACGCACCCGAGCAGTTCATCTGCAAGGAGCCGTG:1 + chr3R 22687106 3' + copia 471 1 56.44 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACGGGATGCCTCATATACAAATAATAGACAGGA:1 + chr4 1152074 3' + transib2 2778 1 69.31 GAAATTTCCAACTTATAACTATTACATTGTTCTTAGCCGCTATTTGTTACACTTTTTTTTTATAGTAGAGGCTGCCTCTATTAAGAAATTAGAAACTTTTA:1 + chr3L 21882126 3' - invader2 4798 1 61.39 CTGAGGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTCATTTGTATAACAGCTCGCGAGCGGGTGTACCCTCTGCCTATTGCAACAAACCCTCGTTTGCTTTA:1 - chr2L 21632801 3' + blood 437 1 78.22 TACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACATTTCCAATTAACTCGGGGGAGCTACCACTTTGCCCAACTTCCGGTGGCGGGGCATGCCGTT:1 - chr3R 25818801 3' + mdg1 7447 2 65.00 CGCTGTAGCGCTCTCCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCATTGTGGCGGAAGTGAAGCAGACGCCTGATCAGCGGGTTTGTGCTGTTGGC:1 - chr2L 22975387 3' - 1360 115 1 49.50 GAGTTNCCGGACTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACA:1 + chr3L 23871826 3' - INE-1 558 1 57.43 GGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTGGCCATTCCGCAGCGTTTGCTTTGGCATTAGATCTGTTATTAGCCCAGAATTATGACAAATCTTGA:1 - chrX 4890006 3' - 297 6581 1 80.20 CATAATAATAATAATAATAATAGTACTCAAAAACAATACGGATACGAATTACATCAATAACTACAAGCAGGATAATCCCAGCAACAATAAATG:1 + chr2L 5306146 3' + mdg1 7069 11 75.27 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATA:1 + chr3L 8974125 3' + P-element 2831 1 23.76 GACGGNACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTACACTTTTGTGTGCGAAGAGCAAACGACTATTTGGAAGGGAGATGGAGAGAGCGCGAAGCGGGCAGT:1 - chr2L 8031228 3' + P-element 2878 2 71.29 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGCACATTGTTTGAATGGAGAAATCTAAGATGGACTTAATACACCAAGCAGACAAGATCTGATTTATTAAC:1 - chr2L 10118861 3' + hobo 2933 1 69.31 TACATACTTTTCAACGAATCTATTTTACGCTTTTACTCTACGCGTAACGGGCATAAGAACATAAAACGGATAATAGAAAAATAGAAGCCAATTTGAAATTA:1 - chrX 21002380 3' - INE-1 13 1 90.10 TAGTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAATACCCTATATTGAGAGGAACCCTCGATTCGGGTCCAATCG:1 + chr3R 10741158 3' + 1360 3388 3 63.64 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGGCATACTTAGCAACAT:1 + chr3R 4986363 3' + roo 385 2 60.40 CACACACACACACACATATATATATATAGGGTCGGAAAATGGGAAATGGTAATGTGGGCAAGGGTGTGACA:1 - chr2R 10979655 3' + accord 186 4 57.75 GTAAATTTGTATAATTAAAGATAATGATGCTTTTCGGAGACAGATATTCCTCCAAAAAATTTGTCAGTATCTACATAATTTGAGGATACTTACAGATTGAC:2 - chr3L 11651869 3' + invader2 4730 1 77.23 TAACANACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTCATGAGAGTGCCATGATTGCTGGGAGATTGTTTTGGGGTTGTTCTCGACGGGTTGGGGG:1 - chr2R 11477960 3' + I-element 5138 1 67.33 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACATTTATACTAATATATTGGCATGTATTGAATTTTAGTGAACAAAATAACCG:2 - chr3R 13202979 3' + roo 393 1 64.36 GAGATAAGAACTCTTGCTATACTTAAGTCAGTCGATTTTGGGAGCTTCATCGCATCGGCCACGGGAATACTCTACACTGCCGTTTATGTGAAGTTGGTAAC:1 + chr2L 11645836 3' + Burdock 108 2 56.44 GTGAAAAGATCCCGTTTGAATATGACCTGCAAAAACTTGTCCAGGTTGATGAAGCCAGTCTTCATGTACTCCTTGATGTCGCGGTTCAGGGGAGACGATCC:1 - chr2R 24175231 3' + S-element 1338 1 61.39 GAAGAAATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTATCTTTTTGCTCTGCGTGTGTTTGT:1 - chr3R 10457292 3' + roo 9020 2 75.25 TATTTATGCAATGCAACCAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATAGCACTCAATCAGTAGAAAAATGCC:1 - chrX 4154934 3' - blood 53 2 74.26 GAAGAAAAACCTTAATTGACTGTTTCTATTCTTTGTTGCAAGTTAATTAATACTTAAAACTTAAACAGACTTTTCCGATAGTCCTTCGTTTTGCAGCACTG:1 + chr2R 22606019 3' - Juan 4023 1 80.20 TTATTAAATATCGGTTTAAGACTTATTGAACTTTACTTGATTATTTTATTTATACGTGAATCGGATATAGTATGCAAATTGTATCAATTCATATAGTGTTA:1 - chr3R 29827361 3' - McClintock 313 2 72.28 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATCGCCTGGCATCCAGGATCCCCCAACTGCCGTCGTCTTCGTGCGCGGCCGACGTTTATATTGTTTTAAATGCCA:1 - chr3R 10957637 3' + hopper 1411 2 75.25 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATGGCGGTCTATTACAATCATAAG:1 + chrX 495212 3' - 412 56 2 78.22 TCTTACGGGGCATTGCCGACTTCACAGCCAATTTTAAACTCCGCAAATGGTGTTTTGGAGAGCGTTGCTGAAGGGGACAAGGTGCAGTTTTATGACGAGAG:1 + chr3L 24150318 3' + baggins 5139 1 72.28 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTTTGATA:1 + chr2L 21978147 3' - roo 8712 2 77.23 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGACTTTAATCAAGAAAGTTCAATTTT:1 + chrX 19457192 3' - roo 8718 2 81.19 GCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCGCTGCTAGCTGAGCTCTCTGGCTACGATCTTATCGGTCGTCTCATATCAATTTATGTATATAAACTTCTTAAA:1 + chr3R 8813809 3' + Max-element 65 2 75.26 GGGAAACTCGACTATTTCATTCTCTCTTGTTTTTTATTTTCTCAAAACAATTCAGTTTTATCAATAGGACACAGCAAATCTTCCCTACTTTTTGTTCGAAT:1 + chr2L 17974217 3' + INE-1 571 1 64.36 GTATGGCGGTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCTAGATTAAAGAAGTGATATCGAACGCTGAGATCGAACTATCCTGAATGTATCCTCCTTCGCCT:2 - chr3L 17869899 3' - 1360 16 1 41.58 GGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTGTGTATCAGGTTTTTGTGTCAGGTGCAAAAGGAATCGTTGTACTCTGTTTT:2 - chr2L 15956029 3' - Max-element 27 2 52.48 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCTCCTTTCCCACTGATTTTTCGGTTTTTTTTTGTTTTCGATTCTCGACGAAGGTCAAAGGGACTTTGGT:1 + chrX 17064843 3' - Tirant 9 2 64.36 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATTATGATTAAAGAGTAACATTTATTTTAAGTAAA:1 - chr2R 22993715 3' - opus 7158 4 73.27 GCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATATTTATCCAGCTTTTTTGGTAAGTA:1 - chr3R 28755913 3' - 3S18 5773 2 69.31 TCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCAAGTAACCATTATCTTGGTGGCAAATTCACTTCCTCGCCTTGCTGGCAAGTAAATACATATATATGCCACTGCCAG:1 + chrX 11517347 3' - FB 2 1 75.25 ACATCGCGGGTACTTACAAACACACAATTACAACGAACTTGCGGATCGGATGAGAACTTCATTCTTGTGAAATACAATACATAGAAGTTATCAACTG:1 - chr2R 24366298 3' + hobo 80 1 77.32 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACAACCATAATTATCATAAACTCAGCTAAAAGGAAGCTGCTCTTTTCCTAA:1 - chr3R 19657449 3' + roo 9040 1 55.45 GCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAGTTGGCTGGTTGGTGGCAATGATTC:1 + chrX 4488916 3' - 412 7106 2 75.25 GTAAAATTCCCCTTCCGCACATCATATGATATGACTTACGAATTACAGAAGAATATTCCCCCTCTGCGCTCAAATTCCCCGAAGTGGAACCCCTTAATC:1 + chr3L 19588172 3' - R2-element 70 1 80.81 GATGGGAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTA:1 - chr2L 1129080 3' - HMS-Beagle 41 2 65.35 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTCGAGAGGGTGTAATTATTTTCCTGTTTGCAGTGGATCAGCAACTGGAGGGGATCGGGAAGTG:1 + chr3L 1078997 3' - I-element 19 1 60.40 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTTAGGGAAGCATGCGG:3 - chr3L 17122422 3' + roo 9031 1 66.34 ATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATCTAAGCTTAATACGGATAACAACTATATATATCTGCATAT:1 - chr3R 28319153 3' + jockey 4897 1 63.37 CCTGCACAGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAGATAAACCAGCACTCGAGCACTTCCTTGGAGTTCAACTTTAGGCCAAAGAGCTCCACTGCGC:1 + chr3R 7473574 3' + X-element 4355 1 58.42 GTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGTAAGTGAGTACGGTTAGTAAGATATTTTATTCTACGAAACTCATATAAAACACACTAAGTATAAT:1 + chr3R 19914430 3' - jockey 4773 1 56.44 TAGGGGTATTATATATCCTCTTAGTTAATTAAAACACACAAACGCTTGTCGTGTTGGAATTTAAAGCATAAAATTAGGTAAATTGTGATTTATTATCGGAA:1 - chr3R 14308500 3' - invader2 243 2 65.35 TACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATGGAAACAATCAGGTACCGAAAATGTGAACTCTTACAATATATTTTACCTCTTTTTCAT:1 - chr2L 8740865 3' - Burdock 17 2 62.38 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATACATATATATGTAAAATACAGATATAGATATATGTACTATCGTATGCCCGATAATGCT:1 + chr2R 9862291 3' - roo 20 2 57.43 TTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTAGTTAGCTCTTCGACTGTAGCCTTGCACTACGCACATGACAGTGCATTCGCTGGG:1 - chrX 1427524 3' + Bari1 1684 1 56.00 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGCATTAGGAGCGGGGAGAACCGAAAAACCAGG:1 - chr3L 2800147 3' + blood 7345 2 70.30 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTTAAACAAAGAATGTGTTGC:2 + chr2R 4502527 3' - roo 3 2 76.24 TAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGTTATTTCATTTGCTTCTCGATGGTTGAACGATTAATGGGTGAGTGGATTGAATGAGTTTGAATGACTGGAATG:1 - chrX 5395290 3' - F-element 4397 1 77.23 CAAATCGGCAATATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCCCCACTGAAATTATAAAATATATTTCCCATGAACGGTTTTCTTTT:1 - chr3L 14197727 3' - blood 446 1 56.44 TAGTATGGGCAGTCTGTAATTGCACGCATGGCACGATTTTTCAACCCGAAAATCCAATACTTTCTTTGGATATAGTTTCGCATTAGGTTTATCCCTCCATG:1 - chr3R 19447033 3' - BS 4754 1 65.35 CTGATGTTTTAATGCTGCTTTCATTTTTGCATTGGGGACCTTCGTGCTCATTGGCAAATAATGTCATTGAGAAACTCGAGAAGGCTCTTAAGGTTGATTTC:1 + chr3L 14569049 3' + transib4 53 1 75.25 TGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCAATTATCAAACAAACGGCTTGCAAATAATTGACTCT:1 - chr3R 15998077 3' - pogo 17 1 62.03 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATACATATATAGTATTTATTTATGGTTAATATCC:1 - chr3L 22231594 3' + 297 354 2 78.22 TATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTTATTGGAAAG:1 + chr2L 326231 3' - roo 8665 2 77.23 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTA:1 - chr3R 5505244 3' + mdg1 7408 2 74.26 AGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAGCCCAGTGAACCTCAGTTGGTCACGTGTCGTTCACAGGATATTACTTTTATCG:1 - chr3L 13194738 3' - 297 12 2 67.33 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATCGAATGTATTTGTCATTATCATTAATTATGATTAAGTGATTACGTT:1 + chrX 12857900 3' - 297 6607 2 57.58 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAAGTGTGTATAACAAAGAAAAACAAT:1 + chr2R 19192578 3' - roo 8718 2 84.16 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACA:2 + chr3R 31369352 3' - Transpac 4976 2 78.22 AATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACATAAGAATATTTAATGAGCAGAAGCAGTTGTTCTGCCTTATCAGTAGGTGTCACTCGGTTATCTCAGGCCATG:1 + chr3R 7522395 3' + blood 7383 2 72.00 TACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAAATAAATAAACTTTCAATTGAAACAAAATACG:1 + chr2L 20120148 3' + Juan 4168 1 70.30 AATAAAAAAAAAAATAAAAAATCTGCACCTGAAGATGCAGTGTTTCCCTATTTTCCAGAATAATTCTCGATGCCACACGCATTGGCAAAATAAAAATAAA:1 - chrX 2888559 3' - hopper 143 11 63.00 ACCCATGAGTGATCCACTCAAGAAGGCACCCAATCCAACAGACATAAACATCCGGTACGGAGCAATAGACTCCGGGATATTTCTCACGGGCACAGCCCGTT:1 - chr2R 11337561 3' + Quasimodo 264 2 54.46 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAGCTCTGCGCCTACATTTGGCGGTATTG:1 + chrX 1523695 3' - jockey 63 1 76.24 AAATATATTATTGAAATTATATTATAAATTTAAAAAAAATTCTTGGCTAAAAGCGGTACTCTTGGTAACTGTGTGCAAATTCAATTAAGACCCGCTTAAAA:1 + chr3L 4576886 3' - transib1 1924 1 82.18 ATAACGTACATTTTGTATTTGCTGAAGGCTGGACATATTGATTTGGATACTTTACGGGTACTTTATCGTCGCGATAATCGCGCTTTAGAAGAAAAAGTGGG:1 + chr2L 23033404 3' + invader5 30 2 58.42 GTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGT:1 + chr3R 24281998 3' - Max-element 53 2 75.25 ATTTTTTATTTTTTTTTTAATATATTTTCGGGAAAAGTTTGG:1 + chr2L 9304997 3' + hopper 153 2 90.48 TTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATCCTAGGTGAATGTGCGGCATACTTTCAGGCGCGGGC:1 - chr3R 14135112 3' - Tabor 7283 2 64.36 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCGCCAAGAAGTGAGGTAGCAAACTGGCAAAGTAGCAACTGGTAGCA:1 - chr3L 3671259 3' + roo 405 1 76.24 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCT:1 + chr2L 16686601 3' - pogo 40 1 73.27 CCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATTAATAAAATTTATGGTTTATTGGGAATTCTTGTTC:1 - chr2L 3536351 3' + 1360 281 1 66.00 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCTGCACATAATGTAGAATGTATTTAG:1 + chrX 1235459 3' + P-element 2835 1 27.72 TATTATTTATATAATGAAAAAAAAAAGGTTTTTAAAGTTGAAACTTAACAAATTGATTTTCATAACAAATTGATTTTCATAATCAATAAATATGACTACTA:1 + chr2L 15635134 3' - P-element 2488 1 60.40 TTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCTCGGCGGAACGCCCGAGAGAGCGTTCTCTTTTGGC:1 + chr2L 15333775 3' + P-element 2845 1 37.62 CTCGGAAACCAAATCTATTACATCTATACCTGTTACATTTTTTTAAAACAATTACAGCATGATTCAACTCCAGCTGATTTCGTGATAGGTTTTTTTTT:1 - chr2L 16082612 3' + Stalker4 7333 4 57.14 ATATCATTTTATGGAGTGATTCGTGCTGTGTATCCTGACTTTTCTTTCCAATCGGTTCGCTTGACACGGCGGTTGAGGTTTAGTTACAGT:1 - chr2L 2191321 3' - Doc3-element 4630 1 71.11 CAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATATATAAGCACGCATTTGCGTAAGTCAAATAAATGGCCGTCGTTCTTTTATACCGTTCAG:1 + chr2R 21433233 3' + flea 253 2 75.27 TTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACCTCACCCCGGCGCACTTGCTCTTCTTTACCATTTCAGATTCACCTGTCATCCAACATGT:1 - chrX 5657659 3' - flea 389 1 63.37 AGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGACTTACGTAAAACACTCGAATATAGCAAGCTTGTATTAACGATTTATATGGTTTG:1 + chr2R 16131306 3' - accord2 7574 2 61.39 ATGTAAATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAACTATTATAGTTAGATTGATTGCATCAGCGGTAAGCTGATTA:1 + chr3R 4543248 3' - 3S18 38 2 59.41 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTATGAAAATATGGCA:1 + chr2R 12779185 3' - roo 7 2 75.25 CCACGGCACCCTATACACCCACAAGTGAGCATATGGTGCATGTGTCCGTAACTCAAACGTCGAGCCAATAAAGTATGCACGGAAAGAAATATTATTTAAGC:1 - chr2R 21377461 3' - R1A1-element 5269 1 62.38 AGATCCACTCGGCTAATGATCCTGTTCAAGAATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCGAACGAATCTAGAATACCATTCCTGGTGCGCATGGCTAATG:1 + chr3R 21413971 3' - INE-1 97 1 80.20 CGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAA:1 + chr3L 9925277 3' - Doc 58 1 78.22 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGATGATTAAAGAAGAGTGCTTACAATAGCAATGATTGAAACCAAACCATTTGTGGGCTGCCATGCACTA:1 - chrX 21433781 3' - Tabor 11 2 68.32 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTA:1 - chr3R 25823648 3' + hopper 1382 1 60.40 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGATGGATATTTTTGTGAAAATGAAAAAACATGCTGTCATGAATTTGTTTTTGGATTCCTAGGATTACAATTACAATTTTC:3 + chr3L 9925330 3' - Doc 3 1 75.25 CGCAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAA:1 + chr2L 16082656 3' - Stalker4 7008 4 72.28 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCCGTTGGAACTTGTTGTACACAGTCAAGATATTGATTTTTGCGAGCCG:1 + chr3R 18906663 3' + P-element 2876 1 56.63 TTAAATGGCTATGAGGATGGTTTTAGTACGTAGGCGTTGCGGCAAGACCATGTTGGGCAAGGCGGTGGCCCATCATACGACGGCGTCGTTCATACGCGTCG:1 + chrX 11126099 3' + R2-element 3439 1 63.37 AACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAAAAGTCATTATTATTATCGTTCATTG:1 - chr2R 15652576 3' - Stalker2 7302 2 75.25 TTTAAAATTTTAAAAAACTTTGGAGAAGACTTGAATTGATGGCTAATAGTCCATTGCTAGCTGGAACTCATTGTTATTTTCAAAATATAATCTTTGTTCCT:1 + chr3L 12678168 3' - TAHRE 8 1 70.30 TCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCATACGGAAGTTCGCAACTATACATCAGCG:1 + chr3L 10698743 3' + roo 408 1 79.21 GCAGTTCCCCAGAGTTCTGTTCCATTCGTCCATATTGCTATTTTATTATGTAATTATAGTTGTTTCTGAAGTCACGGTCAACAGTTCAGCATCGCCAGTCG:1 + chr3R 20401149 3' - Porto1 4279 1 60.40 CACGCCCACACTTTTCCAAAATGTTTTAATAGTTGGGGAATCTTCCTCTTTGCCATTTTTAGTAGCTATTTTTGTTATAATTTTACTGAGGAAATCTACAA:1 + chr2R 25195456 3' + INE-1 253 1 78.22 TCTCCTCAAGGGGGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTGTCTTCTGAGATGCCGAGACGTGTGCCCATGGATACCACTGAGTTGT:1 + chr3L 15339796 3' - BS3 1588 1 50.59 CTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTTACAATGTTATTATATCTTAATTTAGTCATTGCATTAAGGTATCCGACCATGAGAAGAAATTAAGGCATCACAGA:1 - chr3R 16626780 3' - I-element 5285 1 52.48 TTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGAGTTTGGCTTCAGTCGTTTGGTATCATTAGCCTCTGGGGATGATTTGTTGTTGTT:1 + chr3L 7955125 3' - I-element 5126 1 56.44 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGTCGGTAGGATGTCCTACTTACACATAAATACCCTGTAGAAATAC:1 - chr2L 10200351 3' + Tirant 8484 2 69.15 GTGTTTTTTTGCAAATCGATAGAAAATTGCAAGACAAATTAAATTATGGAAAAATTATTCAACATAATATTTGGCTGTGCTATTTGTTTACTATAAACTAG:1 - chr2R 6254415 3' - INE-1 314 1 58.42 AACATATTAATAATGAAAATTTTTGGGAAGCGATGATGATGGCCCCGCTCCGATCACCCTGCTCGCCGTAGAGCCAGGAATCAATATTCTAAATTCTTTAA:1 + chr2R 24375096 3' + transib3 2510 1 68.32 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGTCTCTAAATCGATTCAATTGGAATTTTTCAGTAGACATCCGCTTTTGGTGAACATTT:2 + chr2L 10126596 3' - mdg1 7057 2 60.40 AAGCAAGCAAATTCTATTTTTAGATTTCTTATGTTCTCATCGAGGATTTGCGACCGGTAGACGGGAATTCCAAGCTAGAGTACTCCTACAGGCCGATGGAC:1 - chr2L 20059429 3' + 1360 3264 1 64.36 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCAATTTGAGTTCAACCGATGGCG:1 + chr3L 12085209 3' - pogo 52 1 79.21 CGAAGTGAGTCGCGAGAAACGGGAATGTCTAATCAAATTAGCGAATGTGTTGAAAATTAAAAACAAATTCACGGATAAATTGCATCTGCCAGATACGCAAT:1 - chr3R 13939050 3' - rover 7136 2 70.30 TGTAATATGTGTAATAGTCGGTACCCAGGGATACAACCACGGGCCAGGTGGTGAATCTCATATCCAACGATCTGGGCCGCTTCGATCGCGCTCTGATACA:1 - chr2L 20933007 3' - 1360 2924 1 73.00 TAAATAATTAAAATAAATAAAAATAAAAAGTTAATTAGGATTAAAGTATTTTGTTTGCGACAGTTGACAATTCACTAAATCTGGATTATTTTTCACTTCAT:1 - chrX 2815431 3' + HeT-A 1 3 83.17 CAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATACAAACAGTACAGTCTGTGGCCAGTGTTTATGTA:1 + chr2R 6984383 3' + HMS-Beagle2 7152 2 71.29 TATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTTGGCTAACGGCCGGGAACTATCGGCAGACCGATACAATTTT:1 + chr3L 21841359 3' - P-element 34 1 47.00 ATACAGATACAAATATATTATTGGCTAAACATTCAGGTTATTACTTCATCAAAGTTTTTTGGTCGTGAAAAGAGTGATACTTTGCGATGTAGATTTTCCGC:1 - chr3L 6458012 3' + transib1 1952 1 51.49 AAGAAAAACAAAAAAAAAAACTGCAATTGTCACTACTTACATGTGGTTTACAAAATCAAATGACGAATGATTCGATTCCAGTCATATTTCCGCTGAGTGGT:1 - chrX 7067310 3' + HMS-Beagle2 489 1 79.21 GACCGNGACTCGGTCTCGAGTCTGTCTCTGTGTTGTGTGTGTCCATGTAGGTGCGAGTGACTTTAAACGGTGCTAAATGGCAAGTGGATGCCACAACCACC:1 + chr3R 27981375 3' + Stalker 412 1 83.17 ACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATTCCCATATATGCGCTCGTATCTGTCTGCTTTAGTTTGGAGGGTCGGAGGCACCTCGATTCCCG:1 + chrX 4180827 3' + I-element 5344 1 66.34 TACACTTTGTGACACAGTTGTGTGCTCCCTTGTGTTGTTGTTTATGACCGGGCAGGCGATTACCGATCCAACTTCAGTTTTGTATCCGTTTCGCCAACTCC:1 + chr2R 5726603 3' - G5 82 1 80.20 GGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATCATGATAAATAGGAATGCCCCTGCTGACATTTCCTCCCCCCAC:1 + chr2L 13447176 3' - HMS-Beagle 32 2 57.43 AACTCAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGTAGGTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATTAAAGGTGGGCTAACTGCA:1 - chr3R 31973097 3' + Stalker4 6912 2 79.21 ACAAATTTTAGGCGTACAAACATCAACCGCCTGCTGCATTTGCAGCATACTTTATGCCCCATATGTTCAGCGCACATGCGTTATCGGACCCAAATTGGATT:1 + chrX 7295312 3' + hobo 2685 1 73.27 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGAGCCAAAAACAATAACAAACTTCACCAGCTTGCTATCTCA:1 + chr2L 18694160 3' + P-element 2852 1 44.00 AAATATAAATTATAAATTACAACAGCGGGCGTGGCAACATGGGTAAACAATTATGCCCTGCGTCTTTGTCTATATCAATAGCTATTAATAAAATGTTAAAT:1 + chr3L 23263704 3' + copia 253 1 76.24 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGGTTATTCAGTGGGATCTAAGCAAACTATCTATATTATTTTCATATTACAGGTATCA:1 - chr2L 1129055 3' - HMS-Beagle 6812 2 61.39 CAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCGCTAAATAAAATGACATTAAACAAACCCCTCTAAGTTCTATACTCTATAC:1 + chrX 17204156 3' - Tabor 6867 2 50.50 CTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAA:1 + chr3L 23678147 3' - Osvaldo 18 1 76.34 ATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGAGGTAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTGACCTCATTATGCTCGCTTTCCTCGGCTGAT:1 + chr3L 25268191 3' - Cr1a 4262 1 69.31 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATAATATTGTATATTTGTTTGACATATGTCAAA:1 - chr2L 13250378 3' - pogo 44 1 73.27 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAAGGAAGAGTGTATAACTAAGTCCGTGGAGTAATATCTTTTCTAAAATATCTGTAGAATAAAGATTGTATG:1 - chr2L 3694067 3' - roo 6 2 69.00 AAAAAAAAAACAAAAAAAAAATATATGAAAAGAAACCACAAACGAACAATAAACAATATTTAAAACGCATTTACCTATTAATC:1 + chr3R 10396441 3' - hopper 143 7 75.90 AGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAATTAATTTAGTGTTCCGTGGAAGTGGTGCAAAAAGAAAGGAACTGCTTGGGGCCCACA:1 + chr3R 19716933 3' + R1A1-element 31 1 71.29 CTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATATGTATGAGCAGTATTATGTTGTATTTATATTACATTTTTTATTCAGTCTACACAA:1 + chr2R 16898322 3' - Max-element 22 2 57.43 ATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAA:1 + chr2R 14457765 3' - mdg1 7070 2 54.46 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAA:2 - chr2R 8378616 3' + pogo 2049 1 81.19 CATTTTTTTTTTTATTTTTTATTTTTGTAAATTTTTTTTATTTCAAACTTCCCAGATTTTACTGTGCAAAGCTATCTATATAGTTAACCCGATTTTTGGGC:1 - chr3L 10289802 3' + hopper 142 2 68.32 ATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACACACATA:1 - chr2R 24033709 3' - accord 7031 2 80.49 CATTCGCCAACGAGTTCGGGCGGGCGCAAGTGCCACTCAGAAACAAGTTGTTTCGCTGTTTTGAGTATTGCGTGTC:1 - chr2R 17107949 3' - G5A 2632 1 76.32 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTACAATTTTTTAAATATTAGATCTCAAAAAATTGCTTGG:1 + chr3R 4986348 3' + roo 9033 1 67.33 CTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTGGATAGCTACTTCAAATGTGTATATAATGCAAGCATTTGTTAAATCCGAATCATATGACGACAAGCC:1 + chr3R 14688341 3' - pogo 8 1 61.39 GCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCCGCACACTAATTGCAGCAACACCCTCGTGGGGCATTAAGGGCTTACCTGATAACAG:1 + chr3L 958825 3' - P-element 21 1 54.46 TCTGCNGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTCATCACCACCGATGTGTGGGCTCGGGGTATCGATCCCACGGCCAATTGCAACGATTGTGTGGCCCAATGA:1 - chr2R 18459853 3' + invader4 2875 2 39.60 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGTCCTGGGTGTGCATAAAAAGCCGCCCCGAACCGCAGCACTTCCCCTGTT:1 - chrX 9746652 3' - hopper 22 1 49.48 CTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGTTAAATACTAATGCAGGAAGGAAATGGTGCCCTTCCACCATCGCTATCAAAAAAGACAATGAAAACGGGGTGGA:1 - chrX 7410144 3' - jockey 4671 1 75.25 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTAAGCATGGGCGCATGGAACTAGTTCCAATGAAATCCAAGCATTTTGTAAATTAAATGTATTCTTATTATTATAGTTGTTA:1 + chrX 2790002 3' - blood 165 2 72.28 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCAGTGATGGGGATATGGGGCAGAATGCTTTGGTGAGATACAGACT:1 + chr3R 14639409 3' + roo 9039 1 58.42 TTGGATGTTACACAACACAAAAATATAGTACAACTACACATATATTAACTACATACGTTAAAAACAACATACCTTGGCGACTACCGCGGCAATTAACAATC:1 - chrX 3813298 3' - transib2 338 1 77.23 CAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTATGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGATCGGTCAATAACCCTTACCGATCCCATTTTCATAACG:1 - chrX 4079941 3' + F-element 250 1 73.27 GGGTGAGGGTGCTCGATCACCGATTTGCACTGAGAGAAAGTCTTGTTATTAGGAAATTGCTAGGATATATATCGCCCAAAAGGTGACCCAGAACATTACTG:1 - chrX 7177344 3' - Doc 317 1 76.24 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTACACACATAGTTGAGATGTCGGTGCACCTTAAGCCCGGATTTAGTATATTGTTTGAGCGAC:1 + chrX 13347372 3' - roo 16 2 60.40 AACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTATATGCAAACATTCAATGACCTAAAGAATTTCGATGCAAGTATAATTCCTTTTGACGCAGTGTG:1 - chrX 20364215 3' + opus 7491 2 69.31 TATCTGATAGCCGGGAAACTCGACTACAGTATTCTCTCTTGTTTTGAATTGGCTTTCTTAAAAATAGAAATTCAAAATGTAACAACAAGACAAACCTTGC:1 + chrX 1820999 3' + INE-1 559 1 62.00 GAGAGGCAACCGTGCTGGTGGTTACAGCAGCTAAGCTTGAAAGTGTAGGTTTGGTAGCCGTGATTAGTGGGGTGTATGTGGACCCCCTGACCAAGGGTGCA:1 + chr2L 23008130 3' - Doc4-element 274 1 80.20 ACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATACATGGGAGCAACGAATATGGAGGTTAGATGCGT:1 + chr2R 6779831 3' - 17.6 42 2 68.32 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCACCGATTTCTCGGGTGTCTT:1 - chr3L 12828170 3' - pogo 52 1 78.00 CTTGAGGCACGAAGAGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTTCCTTATTAATTTTTCAATAATTTATGTATGACGATGGGTGGTTGGGTGTTTGGGCGGCT:1 - chr2L 20430710 3' - 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Porto1 169 1 86.14 TTCAGTTCGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGTGTCCGTTCGAGACTGGGGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTGCTTTTCTAACCGCCTAGATTGACAATCGA:1 - chr3R 31690650 3' - opus 7352 2 76.24 AACGCGTATAGGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGTTTTTCAATATTATAGAAAGTCCCTTCAATATATAGATTCAAGTTGAATTGAAATCAAGTGATGGC:1 - chr2L 18570530 3' - 1360 3218 1 62.38 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCAACGCTATGAAGTCGTA:1 - chr3R 19609645 3' + Tabor 460 2 51.49 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAA:1 - chr2R 5849965 3' - jockey 37 1 54.46 ATATGTGTGCGTATTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCTAAATCAATTCTAATCCAAGAAACGCATTTACATACTATGGGAGTTTTGGCCAATTTCGTAG:1 - chrX 3703809 3' - 1360 3211 1 84.16 CGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATTAGCAAGTTCAATGAGTGAATTTTAAGCAAACATCAA:1 + chr3R 19467939 3' + Transpac 5192 2 63.37 AATATTTGTCATTAGAGTATTCAGCTTGCGACGTGTGAAAAATTAATAAGGCATTGTAATCAAAGATTGTTGAAACCCAATTACAGGTAACCTCAGCCTTC:1 - chr3R 27061544 3' + 1360 402 1 60.40 TGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAAAATTCCTCATATATTTAAAACATAAATTGCTGGGCCCCCCAA:1 - 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chr3L 2024291 3' - copia 4878 2 68.32 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGTATTCAAATTAACTACAGTTCAACTTCGAGCGCATTACAAGCGTATGCAAATTAAAATC:1 + chr2L 7350798 3' + mdg1 384 2 57.43 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATGTACTTCTCCCCGAGTGGATTGATTGACTCTTCTGTGTTATTCAGCTTG:1 + chr2L 18028751 3' + flea 4989 2 58.00 GGCCAGATGGCCTCTACGCCTGCATCGTCTTGATTTCCTTGAGGCACTGCTTCCGCTCAAGGCACTCACGCTACTGTCGCTCGAAACGAAAACGAAAGTGA:1 - chrX 9989514 3' - R1A1-element 450 1 77.23 ATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGAACTGCTGGTTCTTTTTTGCACCGCGACAGGTGATATGTCTTG:1 - chr2L 7350738 3' - mdg1 36 2 57.43 ATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCGTGGGCCTTATGAGTGTTCATCCTACCACAGAAGTGAGCACTAAGTCACTGTTTTGGCTAGCTTACTTAGTTTG:2 - chr3R 15157602 3' - invader3 48 2 56.44 ATGCATTACAATTATTACATTAAGCTAAAACGTGTGGTCTGACTTGTTTTTATAGCAACGCTATGAAGTCGTAAAATTTAAGTAAATCCACCAAACATATT:1 - chr3R 19609617 3' + Tabor 488 1 79.21 TATATATACATATTTATATATATTTATGTGTCGTACAAAACGTCTACTGTTTGCCGAAGTTAAATGCATTATCGTGCTGCATTAGACATTGCTGTTGAAC:1 - chrX 19740110 3' - G3 4506 1 74.00 GCGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTATACACATTATGGTTTAAATATATCAGGTCCTACATACAGTATACTTTTTAACATATAATGTCTTCTACTTT:1 - chr3R 26469413 3' + hobo 2933 1 73.27 CACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGACCGCGCATCATTAGAGTCGCACAATTAATGCGAATATTGTTGC:1 - chrX 21474415 3' - 1731 4347 2 71.29 GATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGACGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGAGAGTGAGAGCAAACATCAACATTATTTTTATATTCA:1 + chrX 12294794 3' - blood 7009 1 79.21 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCATTGGCCTAACAAAGATGTCGGGAATGGAGATGATGCCGTAAAAACATTTACGGCCGGTAGACTGCCTTTTGGT:1 + chrX 19306845 3' + P-element 2882 2 76.24 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATTTGGCCAACGAGTAACATAAACGCGGTAAAGATCGAAATCTGTTGGAGAAAAACTG:1 - chr3R 9837564 3' + 412 7525 2 58.42 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAACGCTTGTCTAACAAAGTTGTACAGAGG:1 - chr3L 13364552 3' + hopper 1365 1 71.29 AATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATATAACAATATAACTTAAATTTATTTTCTAATTT:1 + chr2L 1129133 3' + HMS-Beagle 206 2 72.28 AATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAAT:1 + chr2L 15957498 3' + Max-element 250 2 71.29 GCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGAAACTCATAGAAATGACTTCGTCACAATAC:1 - chr3R 9254934 3' - F-element 239 1 70.30 AATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATAATAAGATTGAAATTTGTAAATTTTATGCGCTCTCCTGGCAGCAAGTTATGTATTTTGCATAGA:1 - chr3L 7926320 3' + flea 5003 2 69.31 CTTATGAGTGTTCATCCTACCACATTATTAACATAAATATAAATATGTAAACTGCACCTAATTGATACGAAATTGGCCACATCTGAACTGAAGATGTTGTG:1 + chr2R 4677368 3' - invader3 5189 2 75.25 GGGGCTGCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTT:1 - chr2L 10450247 3' - 1731 4427 1 64.36 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATAATATCCTTTACCCCAAGGAGCGGACAAAAAGCGCTGACT:1 - chr2L 7548001 3' - blood 36 2 61.39 GGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTAATGTCAAGTAACCTGGACGCACAACG:1 + chr3R 25440214 3' - pogo 44 1 73.00 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGAGAGCATTAAACAACTCGATGAGCTTTGTGAGAGCTTCGA:2 + chr2R 18503547 3' + roo 9033 1 64.36 TTCGTCCACTACAAACTTTAGCCGATAACAATACGTCAATAAACGCGTCATGTAAACATGCCAACACTGGAGACAAAGTTAAACCAAAGACACTAGAATAA:1 + chr3R 4148502 3' + Juan 252 1 79.21 GCCCGCGCCCCTGAAAGGGCTGAATTGATAGCGACCAAGGTGACAAAGGGGTGTCAAAGAGGTATGTCTATAAAAAAAAGTATGATTGTGCCCCCGCAC:1 - chr3L 23436147 3' + BS3 1695 1 77.78 ACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAACAGTTTTAATATAGTTTTAAAAATGTAT:1 + chr2R 7540607 3' - Stalker 6900 4 77.23 TAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGAACTGCAGCAGCGACGCCGGCAATTGACCCAGTTTAAGTATGCTGGCTCACTGTATATATATGCCCGTTTATATCTATA:1 - chr3R 9981465 3' - jockey 4760 1 76.24 TTTTTTTTTTTAAATAAATATGATCAACATTATGAATAAAGAAAAATAAGCAACGTGAGCGCATAATATATGCAGGGAGATATTCAAATAATATACTGGA:1 - chr3R 4973369 3' - transib2 2630 1 45.00 ATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTAAATGATCGGATTACATTGCCCCGAGGATCGTCGGGGATCGATTCCTTTCCATTCCTCTCTC:1 - chr3R 10602527 3' - R1A1-element 5220 1 65.00 AAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGC:1 + chr3R 9952239 3' - Ivk 39 1 65.35 GCGTATGCGACTTCGCGAGAGGATTTTCGTGCTCTGTCTATTCATATAATCTGTCAAATGACTTTATTGACTGTATTTTTGTGCGGAAAGCGAACAATAAA:1 - chr3R 20042122 3' - Doc2-element 4576 1 73.27 ACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCACCCAAGGAACCTAGTATGTGTAC:1 + chr2R 12213999 3' + Transpac 5205 2 56.44 GTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACAATGTGTTAATCACTTCCCATGAATTATTCAATAAATTTCGC:1 - chr3L 4048457 3' + 3S18 6067 2 63.37 CGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCCAGAGATACGATTATTCTTTGCCCACTGACCCAACCAATCCCTAACCCTAGCCCTCATCGATGTGGACAAGACAC:1 + chr3L 19064329 3' - Cr1a 292 1 77.23 CTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCCCCCCCTCTCGTTTCCATACTCCCCACAGCTGAGTACTAATTGAGCACGTTCCA:1 + chr3R 30283020 3' - roo 305 2 62.38 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAACACCCACTCAGTCACATATTCAACGCAAATG:1 + chr2R 23495495 3' - 412 7096 2 69.31 GGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTCCTCCTCTTCCTCTTCGCCAGATGGCT:1 - chr2L 20118685 3' - Max-element 27 2 52.48 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAG:1 + chr3L 9692718 3' - P-element 54 1 23.76 TATAAGAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTATTATCAATAGATAAAAATAAG:1 + chr3R 10971959 3' - BS 5018 1 55.45 ACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTCCCATGACTTTGTTAGGGAAGAAACGCAGCCACAAAGGCCAACAACATTCCTTAAATTGGATTGAAAGTAACAA:1 + chr3L 4386556 3' - jockey 13 1 75.25 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACCGGCGCATCGGCTGTTTTCTGTTTTGTTTTTGTTTTGGATCTGAAGCCACA:1 - chr3R 28326690 3' - P-element 22 1 59.79 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAACCAAAGACACTAGAATATTCTAATGTCT:1 - chr3L 24531543 3' + roo 9054 2 62.38 AGATCAGCCGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGTTTTGACCCTTAAAGCTGTGTTAGCAGTTTTGACCCTCTGGTGGTAGTCTGCATCTGCATCTTCTATGGTT:1 - chr2L 1699244 3' - Quasimodo 7116 2 78.22 AGAAGATTTGAAAGCCAACATCCAAGATGAAATTGGAATACAAATGAGAATGGGAATGACCGCAGATGGTAGAACTAGCCGACAACGAATTCTAAGAGATA:1 + chr2L 11186631 3' + mariner2 652 1 73.27 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATGGATTCGATAACGCTGATGTATGGATACCATATGGCTTGGCTCAGGACAATGCGGACCACGCTTTTATTGA:1 - chr3L 1820143 3' - 1360 62 1 76.24 ATAAAGATAAAGGGTGACTTGTTCGCGTATACAGGGTGTCTCGTTCCCAAACAGGTTGGCTCAATCCATTAAATATTATAACAATTTTACACAAAAGTATA:1 - chr3R 28755937 3' - 3S18 32 2 53.47 ACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCAGTTCCTTACATTCATTTTCTCCCTTTTGACTAGGCTCAA:1 - chr3L 6032316 3' - hobo 253 1 71.29 ACAAAGCTTAAAGCAAAAGAAAATATGCATGCAAGTTGTCAATAGTATTTTCTTTTCTCGTATATTTTATTTTTGGTTACTTTTCAGCATATGCAACACGG:1 + chr2R 18245190 3' - Bari1 1537 1 53.47 GCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAACAATAACCAACTTGTTAATAA:1 + chr2L 5974455 3' + roo 353 2 82.18 ACGTGTTTTCGTTGCGCTCGTGGACATAGTGCGAAGAACTTTGTTTTCCGTATTTGGAAGTATACGAATAAATAATTTCGTGTCTGTGTGCTTTCAGCTAC:1 - chr3R 7865758 3' + R1A1-element 4 1 80.20 CCGCGGCTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGGATTTTAATGACAGCATTGCGTATACAATGATGTAATTTTAATGCCAC:1 - chrX 8977385 3' - jockey 36 1 52.48 GATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTAGTCGCTTTTTCGCCAAGTCTCTTCACAGATTACATATTAATAATAAGCT:1 - chr2L 20363291 3' + accord 6951 2 53.00 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCA:1 - chr3L 9692699 3' + P-element 2830 1 22.77 TTTCTNACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAAGTGGCTCGTACAAAAATGTGCGCCATTTGCGGCTGCTGCCTAAGCTGATTT:1 - chrX 12538448 3' + roo 9044 1 51.49 GCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGTACTACCTTATACTGCTATAGCTCT:1 - chrX 6997188 3' - P-element 50 1 29.70 GATCGGTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTCTGTATCTTTGACTGAAATCGATTTCATTCACTTTTCGCTGGTCATCAACGT:1 + chr3L 12877400 3' - Porto1 4485 1 55.45 CTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGGCAGCTCTTGATGACGAGCGAACTGCGCTCATTTG:1 - chr3R 29384366 3' - jockey 4803 1 65.35 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGCAGGGTATCCAGA:1 + chr3R 12554354 3' + P-element 2823 1 21.78 CTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATGAAAATAAATATTTATTATATGTATATGGAAAAAT:1 + chr3L 7774230 3' - flea 37 2 75.25 GGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTACTGCAGAGGGGATCCCTCGCC:1 + chrX 21907807 3' - accord 126 2 56.70 TAGAGTGGGTTTCAGCTGATCGTGATTTCCGCCGATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTTCACCATAACGAGAATGTTGCATCAGCC:1 + chr2R 964177 3' + Gypsy12A_LTR 192 1 42.57 GAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTG:1 - chr2L 21089161 3' + flea 4981 2 63.37 GGCAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGGCTGGATTTGTTATTGTCACCAGAATTTGGGTTCTTATTGCATTGTCTAGCTTCAAACCTCTAGTGTGC:1 - chr3R 10761066 3' - Quasimodo 178 2 71.29 GGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATACGTAAAGGACGGTAAACCATTTAAGAATGTGCACAAATCATCTAAAC:1 - chr3L 24131088 3' + HMS-Beagle2 7166 2 52.48 AAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTTAAATAAATAAACAAGCAGTAGTAGTCATGATAACATAATAATAAAAAAGAGAG:1 + chr2L 12074556 3' + Juan 4185 1 53.00 GTATCTGATAGTCGGTAAACTCGACTGCCGCCCGTCCTCTTGTTTTCGCTTCCATTTTCGTTTTTGGA:1 - chrX 18146988 3' + INE-1 558 1 85.29 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGTTTT:1 + chr3L 13364600 3' - hopper 35 1 64.36 AGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTTTTGGCAAATCTGTGGCAACAACCTGCGTTAGATGGAAAATAA:1 + chrX 1954548 3' - Tirant 8107 1 79.21 ACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATATCATAAGATATGATAAATTATTGAAACATGT:1 - chr3R 27080737 3' + HMS-Beagle 6977 2 69.31 CTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGCGAAGGGTAGTGCCATGTGCTACACATTAAAAACGCATAAAAATCGGCCAAATAAAACACTACAACC:1 - chr3L 18127108 3' - BS 4809 1 50.50 CTGCAGGCGTCTTAGGGATTGGCTATTATCCAGAATGTTGATGGCCAGGTGGTTTCGCTGGTACTTTAAGGCTTCCTACAATAAGGCGGCAAAACTGAACC:1 - chr2L 12480950 3' - G2 2903 1 53.47 AACTCTCAAGTCCAAAGCACTGATATTTTTCTGAACACAGCTGTATATTATGTTTAGTGCTCAGCCTTCGCCCACAATAGTTTTGCATGAGGTTTAGAATG:1 - chr3L 12072538 3' + HB 1606 1 49.50 AGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGTTTGTTGACCAACGGAAACCAGAAGGAGACGAGCTTGAAACAAGAAAAGAA:1 - chr2L 18914457 3' + mdg1 262 2 59.41 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGGTGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACAAAGGATTATAAAAGATTAAATCTGTTAAATATAATACTCAAATA:1 + chr3L 12298632 3' - pogo 29 1 57.14 CTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGA:1 - chrX 21087594 3' - mdg3 34 2 60.42 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGTCTCTAAATCGATTCAATTGGAATTTTTCAGTAGACATCCGCT:1 + chr2L 10126582 3' - mdg1 33 2 54.46 TCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGCGAACCCACACAGGAGAACGACCCTTCCAGTGCTCGCATTGCCCAAGGTCCTTTACAGCTGGGCACCACCT:1 - chr3L 21489433 3' + Cr1a 4359 1 71.29 CGGCTCGAAGGACCAAAATGTTGGGATGTAGGGGGGATGCTGGGGTGAGCATTGTCGCCAATTGTACGATCGGGAAAATGCGGGAAGAAGCGGGAATAGCG:1 + chr2L 5631222 3' - GATE 269 1 66.34 ACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCGTCTCCCGATCCCCGGCACCCTTTTCCTTTTCCATCCGCAGGTGTACGCCGTAGTCGTTTCGCATGAGCAAACC:1 - chr3R 5514616 3' + F-element 301 1 76.24 GAGCTCTGATCCTGCCAGCGCTCCTAGCGGAAAAGGAGAAAAGGAGGGAGGATGGATGGCCAAGACGCTCTATTAACTAACTGCCGTTGAATAATTAGACA:1 - chr3R 23540981 3' + Max-element 340 1 71.29 AGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCCCAACATTTCGCCGAGTGTTCTGCCAAAGGTTAACTGCCACTGA:1 + chrX 12294758 3' - blood 34 2 60.40 GGGTTTTTATTGGATACATGATTTTATGACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTTGCTAATCAGATGCGAATAGTTCTATATGTGAACAGATTTCCAG:1 + chr2L 6301040 3' - Quasimodo 118 2 54.46 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATT:1 - chr3L 21735393 3' - Doc 39 1 59.41 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATTCGATTATTGAAAAATTACATTACTACTT:1 + chr3L 14910624 3' + roo 9024 2 75.25 AAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTTATCTGGCTTCTCGTAAGTGATCTTCGGGCC:3 - chr2L 11047956 3' + Juan 4203 1 65.35 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCTGTAGACTATTTGTTTTCATACTCACTT:1 + chr3L 9858318 3' + pogo 2057 1 71.29 TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAACTTGTTAGAATTAAAAGTTGCATACTTTCGATCCAACGCATTGAATTTCTGCACTTCAAAGTGAAA:1 - chr2R 23945227 3' + BS 5082 1 66.33 TGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTGTCCGCTCGCTTACGATGAGAGCGTAAGCAATCTGAAAATAGAATTTGCTTGTCGCCATGTTAATAAGAGGCTGATA:1 - chr2R 5319735 3' - 1360 3321 1 76.24 ACAAACGCTAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGAAGAATGGGGTAGTTTCCTGTTTTCATTACCTTCTCATTCCAAAAATTTATTTTCATTAATTAGGCTC:1 - chrX 23047615 3' + mariner2 722 1 70.30 GATCTTCGTTTTTGTTATATTTGTTTCCGGTTTTGTGGGCAAAGTTATTTTTTAATTGTAATTGAATATTCCACTTGACCAGAGGCCAAAGACCGACTATT:1 - chr2L 7364195 3' - G4 101 1 64.36 GTGGGTAGAGGACAGCACTGCTCCGAGGAGAAAAAGGAAGTCGCTGAAGACGAAGAAGAGAGCAGCAATAATGCCAAACCCATTGACCTTCACCAGCCAAT:1 + chrX 8427643 3' + HB 351 1 77.23 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCTCGCTGCCACTTGAAATGTTGCCAAGAAGCCGGCCAGCAACATTAGCAGCATTTCGAAAACTTGTTTTCA:1 + chr3R 13715173 3' + P-element 2881 2 73.00 GCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCACCTCAAGGTTTTAGCCTAGTAATAGCT:1 - chrX 16563615 3' + Stalker4 7102 4 78.22 GGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTT:1 - chr3L 23773904 3' + Transib5 2872 1 77.23 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAAGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCAGTAAGTCAGTTCACATTCTCTATCATCCAA:1 + chr2R 12213981 3' + Transpac 5199 2 61.80 ATAAAAGTGAAAAGACGCTAACACATATTTGTATGTGTTAAAAACCTTATGTCTCTCGAGTGCACAATAAGAGAGGCTTAACCATTCAGAAGAAAACCAAT:1 - chrX 6016539 3' + Porto1 96 1 56.44 CATAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCAAAAGTGGTCCCTTAAAGCTTATAAACAATGCTAAAGA:1 - chr3L 18126716 3' + BS 4987 1 60.40 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGTTTGGATCTGGCATATTGCCAGCCATTGGC:2 + chr2L 15344191 3' + transib2 2779 1 66.34 TTAGCNTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAAATTGTAGGCTGTGCCGTCTAAGTTCACATTCCACTT:1 - chr2L 11047986 3' + Juan 4173 1 66.34 TAGTCAGGATGGCCGAGTTGTGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGAGGAAGCATAAACAACACAACATTCTACGTCTCAACGATCAGC:1 - chrX 17593188 3' + invader3 5169 1 67.33 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTTAAGATTAGTGCCACATTTTGATGTTCATTAAC:1 - chr3R 7522314 3' - blood 7056 2 67.33 GATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAAATTCATTATTATGCCAAGTGCTCGCAGGGGAGGTGCCATGCAATGCGGTAGGA:1 + chr3R 25407559 3' - jockey 4968 1 57.43 AAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTCTTGCAGCTTTAACAAGCAAATAGGGCTTGACGAAA:3 + chrX 14796914 3' + transib2 2786 1 63.37 TGTTGTTGCAGATAGCGGGGCTTGTGTCGGAGCTAGAATTGCGCTCTTTCTTGATTTGCATATGAAGTTGAAACTACGGTGGGGGCTGCTTCGGCGATAG:1 + chr2R 4576734 3' - F-element 407 1 54.00 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACTTGAATCACTAAAAAAAATATTATGTG:1 + chr3R 19076231 3' - roo 8675 2 60.61 TCGAGATCTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGCACACAGATCAAAAGGGTATTCCGGACGAATTGATTGGTAGCTGTCGACAAATTAACGAACCCT:1 - chr2L 22044735 3' + INE-1 146 1 61.39 CAAGACATCCGATTAGTTCATTTTCGACCACCAACTTAAATTAAAGTTGGCGTAACTATTTGATTTATTTGCAATAAAAAAAAAATAATAATTTC:1 + chr2R 6487358 3' - Circe 7114 1 73.68 TACCCCGTTCAGCCCTAGTGGCTTGTTCGCGGCTATACTGGCGAACAGCGGGGGATTGGGGGTATCCGGGGATATCGGGGG:1 - chr3L 14464229 3' + Rt1b 4691 1 69.14 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGCACTGCGTTCATTCGATTCATTTTGAGTGTAA:1 + chrX 6458225 3' + blood 7343 2 70.30 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAAACTGCAAGCATAAAAGGAAAACATCAGCGCACAC:1 + chrX 6404993 3' - jockey 4802 1 71.29 AAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAATATACATACG:1 - chr3R 25823637 3' + hopper 1393 1 55.45 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACAGGTGTGGAGTGATTGGTT:1 - chr3R 25633329 3' - Tirant 30 2 56.44 TTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGCTAAGGGTGTGGGGGCGCCTCAAAGTATGCTTATAAATTGCTTAAAATAGCA:1 - chr3L 13652601 3' + hobo 2914 1 54.46 AGTTATTTTACATTATATTAATTTCATCGTTTCTGTTCTAAATCAAACCAAGTTTTCTTTTTATTTAAATGGGGTGGTGAATTTTATTGAATCTTCTCTTG:1 + chr2R 5284492 3' + Cr1a 4321 1 59.41 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATGTACGAAGTGTATATATATGGAATTTATTGCAA:1 - chrX 14713212 3' + flea 4974 2 76.24 ACGGCACGAGGCGCCGACTAAGCGAGGAGATTGTTGTTGCGCCGCTGCCTGCGTCGGCGTTCTCTGCCGGCGTCGCTGCTGCTGCGCCGCCAACGTCGCTG:1 + chrX 12464248 3' + gypsy10 5840 2 81.19 TTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGCTGGCACACGTTGGCGTCTCGCCATTCAGATAGGCCAGGAGCTCTTTACGATCCGGCCGATTCACAGC:1 - chr3R 9040289 3' - F-element 319 1 73.27 GGGAATGTCTAGTCAGTATATGTGTACAAAAAGAACGATCAAGGGAACACATAAGAAAGAAAATTGGGGAAAGAGTATACATCAAAACATATATTTAGGTG:1 + chr2L 9722110 3' - rover 165 2 67.33 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACAC:1 - chr2R 9862225 3' + roo 361 2 75.25 GGCAAACGGTGTTATTGCAATTAAAAAAAAATTAAGTTTCGCCCAAGAACAGTCCCAAAGATTTTCTTTAAATCTCGAACTTTGACGAAAACTTTACTTT:1 - chrX 22489694 3' - FB 198 1 65.00 CAAGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAGTCGAGGAACTGGACATTCAGTAGCATTCTCTCTTGTTTTCTTTGTATATACCCATATACATATATGAAAAAAGAT:1 - chr3L 4323643 3' + INE-1 543 1 74.26 AGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAAAATATAAATAAAAACAAAGAAAATCGAAGCTTCTTTGTTGGGGATAAGCTTAAAACCCAAGGCACCTTT:1 + chr3L 3279816 3' + Juan 4204 1 67.33 AACGTTACTTTTGTAGGTTGAATAGCATATTCCAACAACAGCTGATTGTAACGGAAGCAGATTAAAACTTATGCACACACTCAGCGCTAGTTG:1 + chr3R 6147330 3' - copia 4885 2 60.22 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCAAGTCCAAATTCGACCGACCGACCAATAGTCTCGCAAAACACAAAACAAA:1 - chr3L 21841291 3' + P-element 2860 1 52.48 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTGTTCTTCACACAATCCGCAGCAAACAACAAACAATGAGAGTGCGCACAAATCCCTACGTCTTCAGTTCGA:1 - chrX 2050791 3' - 412 7 2 72.28 TCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCAACTAAGGGGCCCTGCAAAAACTCCTGCGACGACGTTGTATTATTACAATTGTTTATTATATTATAAACATTTAG:1 + chr2R 4938060 3' - Cr1a 4431 1 60.00 GACTCTTTGATTTATTTGTCAGAGTGTCCAGTGCGAATTATACGAGTTATGAATCACCAAGACCCAACTAACGAGTGCTAACGAATAGAGTTTCCTGAAGC:1 + chr3L 9555791 3' - invader2 190 2 78.22 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCGGACAGCAGCAGTGTTGCC:1 + chrX 8243303 3' - P-element 57 1 16.83 GTAGAGCCTTCATGCTCGACGTTTGAGTTACGGGTCAGCTCGCTCTGGTACTGAAAAAGTAGATAGCCCACGCTCGGACGAGCTCCGCGTCGGTGGTTGGC:1 + chr3L 4694697 3' + R1A1-element 5034 1 70.30 AAAAATTAAAAAAAAAAGTTAAAATAAAATGCACGG:1 + chr2L 448685 3' + P-element 2653 1 83.33 ATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAG:1 - chr3L 27356084 3' + Tc3 1678 1 59.41 TCGGTNAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGGCCGAGTCAGGGCTGCGGAGGCTCCGATAGAACTATCGATTACTCA:1 + chr2R 24965135 3' - P-element 28 1 51.49 GCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGATTCTTGGCCATAATGGGCGTGTAATTTATTTTTGGTC:1 + chr2L 14056203 3' + flea 395 1 62.38 AGTCGGTTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTGCTGTGAAAATTAATCTTGGCCCTAACCAGGTTGACCCAAACCAGTGCCAATAGTCGTAA:1 + chr2L 20000010 3' - G5 4580 1 57.43 GGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCCCTACGACATGTTTTCCGCTCCAAAAGTGAACTTTTTGGCAAATCTGTGGCAACAACCTGCGTTAG:1 + chrX 1954537 3' - Tirant 8118 2 68.32 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTCGTCAATGCCAGGTGGGCGTGGCTGGCTG:1 + chr3R 18507855 3' - jockey 22 1 54.55 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTAATTGGAATTCTAATTAACTACAACAGCATACCCTGTTAACCTACGAGTAACGGATGTAAAAACACAAGACTAATAGC:2 - chr3R 5505216 3' + mdg1 398 2 54.46 GTCTCGTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCGTGGACATTTTCCAAAGTATTATTTGCCATTTTGTCGCGTTCATTAATTGGCCTGCC:1 - chr2L 11065858 3' + P-element 2868 1 61.62 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAAT:1 - chr3L 21735387 3' - Doc 5 1 68.49 CGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGTACATGAACATGGGTGTGCAAAAAAGTTAGTTTTGCTAGACGAGTTACCGTTATGTGACTCTTATT:1 + chr2L 19075749 3' + Transpac 5220 2 70.30 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAGGAACACCCACTCAGTCACATATTCAACGCAAATGGACTTCCAAC:1 + chr2R 23495505 3' - 412 7086 2 59.41 TTAGTTTGTGGCAAGTACAATTTTTGGATATTTTGCATGCTCAATATGTTTTTAAATATACCAAAAGGGCCATTAAAGAAAAAACATGTTGGTACATTTTC:1 - chrX 14983743 3' - TART-B 10263 1 75.25 GTACCAGGGGAGCCCAGATGCGTGACGTGCTGCTCTCTTTTTGATTCCTGCTGTTGCTGGTTTGATTAGTGCTTTGATTATTCTCGTTACTGTTGCTGGTT:1 - chr3R 4707400 3' - G5 4470 1 74.26 TATTCATATTGAAACTACAAGCAACTAAAGGATTCGATAACATTATAATCTGCTTCACGCTCTTGAGCTTATCAATAACCAATTACAGTTGTAAGTTAGT:1 - chrX 11959167 3' + R2-element 228 1 81.00 TACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCAAAAAGGCAGTAGCTGAAGAGAGAAGCAATCTCCATAGGACAATCACCATAGGACAATAGACCAGGCTAACACT:1 - chr3R 7363094 3' - jockey 4893 1 78.22 GCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCCAAATGCCCACCATGCGGGGGAGTCGCTGCCGCAGTCGACGTCGCAACGTATGCCGACTCTT:2 + chr3L 9692757 3' - P-element 15 1 60.40 TGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTATCCCCTCCCTCGTTGACTTCTCCCGCCT:1 - chr2R 10863887 3' - mdg3 5275 2 53.47 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAATAAACAGTAAAAAAAAAATAACTTACGGCTCAGTGGTAAAAGGCAACAACAGAA:1 - chrX 10653546 3' + jockey 4964 1 61.39 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACATTAATTTAACCTTCTTGAAAATTCT:1 + chr3R 12571524 3' + roo 9031 1 75.27 TTTAAAGTCGAAAATTCCACTTGTTGCAGTTATTGCAAGGTTAGTTATTGAATGCACTGCCTATTTATCGGATTTATCCGCTTTTTGGCAGCACCCGTATA:2 + chr2R 12869255 3' + S-element 1680 2 78.22 ATCGTTGATCAGGATCAATAGCCAAATCGATGTGGGCAAATTTATTTCTAAGCTGCATAAAAGCTCGGTCAGCACGCGAGATGAAAAAGTTGGACCAAATA:1 - chr2L 9382664 3' + INE-1 86 1 57.43 AGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACTGGGGAGAAGAATAATACGATATGTATATGCCATATATCTCGCTCACCATAAATCACGACTGCGAG:1 + chr3R 9952262 3' - Ivk 15 1 63.00 AAAGGGAGATGGATGGGTGGCATTGGCAGCGTGGGTGTGGTCGTCGGTGGCATTGTGTCGGACAAGATTGTCGCCAAGATGGGCATTCGATCACG:1 + chrX 6754782 3' - transib4 2429 1 82.11 TCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGATTGAACTGCTGCCTCTGTAGCTGCTGCTGTTGTTGCAGAGGACTGACAG:1 - chrX 396820 3' - accord 493 2 55.45 AACCANCAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATACCCAGATAGATAGGGGGATATAGTTGTGGGGCAACCCGAACGTTATGCCTCGCTGGCGCTGC:1 - chrX 4500173 3' + Quasimodo 7362 2 75.25 CAAATNTCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACA:1 + chr3R 25823703 3' - hopper 46 1 67.33 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCC:1 - chr3L 9692700 3' + P-element 2829 1 21.78 AATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCTTCATGTTTATTCTTTTCTTTTATTAATGTTTCAAGTGCGATGATGATACCCATTTGCTAAA:1 + chr2L 22234904 3' - Bica 169 1 68.32 ATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATGATTAGTACATATATGTTTATATGTACAGATAATAGGTTGGCCTTTGTCGGCAAATTTTATGTAAT:1 - chr2L 21089135 3' + flea 248 2 73.27 AACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAATTCTAACAAGTAATCCGCTTGATGAAGTAAACTTTAA:1 + chr2R 23945298 3' - BS 5034 1 65.35 GTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCTCACGTAGCTAATAGTGTCCTAAATAACA:1 - chr3R 25633347 3' - Tirant 8155 2 74.26 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATTGTAATACCATTTTCGGAAAATTGAAAATTGAATA:1 - chr3R 4986294 3' - roo 8704 2 66.34 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTACATACCCAGTATATGTAAGTACAGGGCTGTGGGTTTATGTGCTGGTGCTGGTGCGGC:1 - chr3R 31644124 3' + roo 391 2 60.00 CACGGCTATTGATCCGGATCAAGAATGTATATACAAATTAAAAGTAAAGCTAGAATTTAAAAAAGTAAAATGTAGATGATACAATTGGAGGCCTAAGTTGT:1 + chr3L 8309856 3' - INE-1 90 1 77.23 CTATCAGATACCCTTTACTCAATTAGTGTGAATGGACCTAATAGCTTTTATAGTTCGTGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTGGAT:1 + chr3R 21568086 3' - INE-1 547 1 56.57 TTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAGTTCTAATATACTTTCTTTAGTGTTATCATAGTCCAGTCCATTTACTTCTATTGC:1 + chrX 21668141 3' - Stalker2 25 2 54.46 ACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATATATATTAAATTAGTTATTTCAATTTTTATAC:2 - chrX 5651614 3' + flea 212 2 79.21 TTTGATCTGTTTTGTGGTCAGTTAAGCAAGCTCTTTTGTGGCGCACAATCTATATGAAACAGAAAATCAGTTGGCACTCGGCCAAGTGCATATTAGAAGCA:1 - chr3L 5964182 3' + BS 276 1 71.29 AAAAAATTTAACAATTTATCACTTGTTGCTTCATCTTTAAATGAAATCAACTAGGCTCTCTCCAAAAAAAAGAAAATACATACTGCAATGTGTGTAAAAAT:1 + chr3L 16988282 3' + NOF 4124 2 57.43 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAATCATTTGAAATATAAACCATTTATTTTCGCTTTCAAGACAT:2 + chr3R 22277218 3' + 297 6948 2 63.37 GCATTNTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAATATTGTTCGATTTTGTTGTTCTTGGCCTAATGAAAAATTATTGTTGGCAT:1 - chr2L 2909530 3' + pogo 2080 1 56.44 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGGTGTTGCTTCATATTAGGCCATGGTCAGTCGAAAGCAATTCTGCCGGGATGGCACCCAGAAAAATTATATAAA:1 - chr2R 19936586 3' - roo 8668 2 76.24 AGCTGAGTAACGGGTATCTAATAGTCGAGGAACTGACTATAGCGTTTACCATTATTTTTTACGGTACAAAACGTAAATCTTG:1 - chr2R 9237015 3' + INE-1 545 1 73.17 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGCATCAACAAAACTTGTACATCTTGCTCGATGA:1 - chr2L 18112519 3' + transib2 2781 1 68.32 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAAAGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAGGTGGCATGTACATAATAGAGATTT:1 - chr3L 17122436 3' + roo 9017 2 79.21 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGCTCGCAGCTTTTAGGTAAAATCGGCGTTCTTTCGAACATTGGAGAATCCAGAGCCACC:1 + chr2R 9426522 3' + P-element 2869 1 61.39 GATAACTTATAGGGCAATAACTTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGCAGAACGACAACAAACAGCACTTGAACGCGCCGGCAATCCCGGCCTCGAAAC:1 - chr2R 6984293 3' - HMS-Beagle2 1 2 78.22 ATTATNGTTATTATGTTCGTATATACTACATAACCCAAAAAAGCTAATTCCTTCATCAAAGTCAAATCTCGCCAAAAAAAATGAACAACAAAAACCACAAA:1 + chr2R 14457789 3' - mdg1 9 2 67.33 CGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAA:1 - chr3L 19951170 3' - Ivk 2 1 77.23 GTGGTGAATACCTTGCGGGAAGGGAGGAGAGCGAGAGAAGAGAAGGAGAGCGCGAGCAGCAAGCTGGGGATCAAGACGGATCTCTCGAAAATCTAACAAAT:1 + chrX 6530653 3' - Max-element 8362 1 59.41 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAGTCCAGCCACTATAACTAGAATAAAACAAAGCATTAAAAATGCATTGGAAA:1 - chr3L 21735388 3' - Doc 33 1 54.00 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCATCCTTTACTAACGCACTCGACTCCAGTACCGAACCAC:1 + chr3L 15638287 3' + roo 9032 1 70.30 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTCATAGGCCGACTACCAATAATAAGAAGGAA:1 + chr2R 1243226 3' + mdg1 7413 2 70.30 CTGTGAGAGAATACCACTCTTTTTATTCCTTCTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTGGTCGCTGCAGTGGTCGCCCCCGTGGACGTGG:1 - chr3L 16070442 3' + copia 4965 2 73.27 GAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAGCGATGATACTACATTTATACTAATATATTGGCATGTATTGAATTTTAGTGAACAAAATAACCGATTACAG:1 - chr3R 13202972 3' + roo 400 1 71.29 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGTATGTTTATGTTTCTGCCGACGCTCATACACAACATCATTCTTGTTGGCCCCTTTTTGAT:2 - chr2R 9862196 3' + roo 9054 2 56.44 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACGGTCTTTTGCAAAATGGCTTCTTAGCCACAAAAG:1 + chr3R 13376028 3' + 1360 3356 1 65.26 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTCTAGCTGCAATTGGTTTGTGGGTGTGCGTGTCAATCGTTTTTTATGCT:1 + chr3L 13364607 3' - hopper 28 1 57.43 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCTGGCGTTTATTCGCTTACACCTTTTTACTTCTGCTCT:1 - chr3R 19321944 3' - P-element 40 1 39.60 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAAGTATATACAGCTTGTTACACATTGCATATATGTATCGGCGCCCAATGTACATAAGGCAAAGTGTAAGTAA:1 + chr3R 31644232 3' - roo 6 2 73.27 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTGGAGCGAGTACACTATATACA:1 - chr3R 21296512 3' + P-element 2832 1 25.74 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTAAGATTAATAAGTACGTCATGACTT:1 - chr3R 10445214 3' + roo 355 2 77.23 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATTTTTATCAGTGGCGCCAAGTGACCTTAT:1 - chr3R 19467888 3' - Transpac 46 2 75.25 ATTTCATCGGTGAGCAGGATGTGGTGCCAAGTTGCACACCATCTTCTTTTGCGGTGCACAGCAGCGCCTTTTTACCTTTCCCGGCAGCTGCTGACACTCAG:1 + chr3R 12816892 3' - Rt1a 4893 1 74.26 CTTGCNGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCTGGCCACTTG:1 + chr2L 16686615 3' - pogo 25 1 58.00 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCTGAAAATCAAGTGGGTAAAGTCGGGCGAAAGCCGAAAGGTAAAGGTAGAACTTGCCCTAATCT:1 - chr3R 18960404 3' + hopper 1404 2 66.34 ATGAGTTGCACGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTAGACCCATCTTCAGGCAAAGAATGCAGATATATTCAATATTCGACCAAATTCAACAAACAAG:1 + chr2L 22725503 3' + Cr1a 4170 1 65.35 ACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATGATTTCCAGCGAAAAACGCAACTACAACCGAGCACCGATCGAGG:1 - chr3R 19077149 3' + I-element 5076 1 56.44 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACCGACCGACCACCATTCACTACAGCTGACCACCGACCACCATTCTTGGCGTTTACCTTACTCGCCCACTACT:1 - chr3R 19836995 3' - P-element 4 2 76.00 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGACAATCGGAAAAAGAGAGCGCCGTAAAGTACGCACTTGAATCACTAAAAAAAATATTATGTGT:1 + chr3R 19076232 3' - roo 8676 2 60.40 GGGCGGAGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAATTTATTATCAAGATTTAATTCATAGCCGTATCAGATTTTTAAATTTTTGCTAGTATCTCAACCTTGAATT:1 - chr3L 13364984 3' - hopper 120 1 31.68 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATATCGAATACCGATTCTAATTCGCTGTCAGCGTGATGAACG:1 + chr2L 13837938 3' - 297 19 2 56.67 TATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCT:1 - chr2L 17841041 3' - Juan 4061 1 64.36 GCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGATTGGGGTGCGTGTAAAGCTGTGTACTATATTTACCTCGGTATTTAGCCTAATTATTCCAGCTATTTCGAAACTGT:1 + chr3L 3569135 3' - F-element 4481 1 60.40 ATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACACATAATTGCTATCAGCAGGTTTTTCTTTTCTATTTGTATAAGCTTTTTGGAAAGTAA:1 + chr2L 20473336 3' - 1360 201 1 63.37 ATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAATCTTAAATGTCAGGATGGTCGAATTGTAGTAGGCTAGAGGTACACAT:1 + chr2R 1234688 3' - 1731 32 2 53.47 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATATATTGTTCTAGTTGACCAAATGCACGTTTGCCATTGCAAAACTCCTTGCAAGGGTATGAAAATATGGCAAA:1 + chr2R 12779187 3' - roo 5 2 77.23 TGCTGTGTGGCCTTACAAATTTAACTCTGGGCTGGTTGGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCCGACTTTGCATCGTTCTGCGAGTCTTCTTCGAAA:1 - chr3R 17064837 3' - Doc3-element 4607 1 66.34 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTCGGTGTGGGTGAAAAAGTCTATCTGCTACCTGTTACATACTTTGGTCGCC:1 - chr2L 6227646 3' + roo 9044 1 51.49 AAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCTGAAGGGGGCGGTAAGCGAGTCTAAAGTCGGGTGTTAAAT:1 - chr2L 9274332 3' + jockey 4585 1 60.40 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTAAACTAAAACTACAAAATAACAACAATGG:1 - chr2R 8378610 3' + pogo 2055 1 75.25 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGGACGGACACCTGCAGGCTTTTGCTCCTGCTGCACCGGAATTAA:1 - chr3R 25823647 3' + hopper 1384 1 59.00 ATATATTTATATTTATATTTATATTTTGTAATATTTTACTTTCAGTTTTATTGGAAAATATATAAAGATATTGCAAAATCATGTAGAGCATTCAGAGTCGA:1 - chr3R 22273981 3' - Stalker4 87 4 55.45 ACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATACAAGCAAGATCAGTAAAGCCATTTCAAGTATGTGGGCGCACTTATATCACACAAAG:1 + chr3R 22620281 3' + 297 377 2 61.39 GTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTTAATAACCAAATTTAAGTGAAATTCTTTTTCAGCTGACTCAGCAGACAAAGGATACTTGCCGGTGTCGTCCTGTTG:1 + chr3L 20903899 3' - F-element 16 1 67.33 ATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACCAAAATACCCAAGGTAATAAGGTACTCAATACTTTCTAGACCTTCTCCAAAAAGAACAAACACCGAAACAA:1 + chr2L 20836585 3' - 1360 2 2 75.25 GCAATTGGCCTAGGGACTCAGATTGCTATGATCAAATATAAAATTGATACCTTTTAGCCAACGATTAACCAATCGTTCATATTCCCTTTGCCATTTATGCC:1 + chr2R 13751636 3' - gypsy3 6796 2 62.38 AGCGAATTGTTTACAGCAGCTAGGGCCGACAAAGAGCTACATAAACCTCAAAATGTAAACATACAGAAATAAAAGCCGCCAGAGGAGCTCGTTTAATTCGA:1 + chrX 13193181 3' - diver2 279 2 71.29 AATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCT:1 + chr3L 27415307 3' - transib2 23 1 56.00 TTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTAGTGTATATTAATCTTTTGGGCAATATTAATCTTTTGGGTAAATGCTTCTCACTGCTACCTGGCCTTATTGGAAAGC:1 + chr2L 326232 3' - roo 8663 1 79.00 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGC:1 + chr2L 16686600 3' - pogo 40 1 74.00 ACTTCCGGTCAGAGATGAAATAGCCAAACAAATGGAAAAATATCGCAACAAACTACGTGCCGGATACGTTCAACCAGATGGGCTTGGAGTATTTTATAGTA:1 - chrX 23346561 3' + Fw2 3691 1 60.40 TTTTTATAGGATATCGATAGATATTGGAGAATAAAATAAGAAAAAATTTAAAAAAATTTCAAAAGTGTGGGCGTGATTGGCTGATTTCTCAAAATTCGAGA:1 - chr2R 15760039 3' - INE-1 500 1 79.21 ATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAATAGTAGTTGAAGTAGTAAGGTGTGCAAAACAATGGTTATAAATTTAGAAATATATACGTAGATG:1 + chr3L 7989826 3' + mdg3 234 2 67.00 CGCTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAAT:1 - chr3L 27356101 3' + Tc3 1661 1 76.24 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCACTCAATCAAAAACTTGATTATTTTGATATGCACAGTGCTTGAGGCCCTGCAG:1 + chr2L 21978171 3' - roo 8688 2 55.45 CGTAAAATAAGTTCGGAGGGATCCGAAAAAGCATACATTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGGGCTATTATCTAAGCCATACAATCA:1 - chr2L 11210416 3' + R1A1-element 5320 1 71.29 CTTCTTACGGGGCATTGCCGGCTTCACAGCGGATGGTTAAAGTGTCCGAAACGATTTAGTGGCTGCTCCCTGCTTCGGGGGTTATGTGTTTCCTGCGTGAA:1 - chr2L 14831895 3' + baggins 5137 1 72.28 GCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTGCCAGACAGACGGCGGGC:1 + chr2L 2920942 3' + hobo 2897 1 66.34 TATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAATAAAAAAATGAAAATGGGAAAATCAGTACTGCAGTTGGGCAAATGTGTCCGCCAGATG:1 - chr2R 14971648 3' + F-element 4653 1 60.40 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTTGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATACAACCCAGTGAACCTCAGTTGG:1 - chr3L 13194771 3' - 297 6621 2 71.88 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGCAAACCACATATGGCCAACTAGTTTTGG:1 + chr2L 10118935 3' - hobo 44 1 76.04 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGAGAGTT:2 - chr3L 7792173 3' - 412 7080 2 52.48 TGAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACATGATCAAGAATATATATACTTTGTATGGTCGGAAACGCTTCCTTC:1 - chr4 836650 3' - INE-1 166 1 89.11 TATTATTATTGTTATTAATTATTCTAGTGTCTTTAGTATATCAAGTATAACAACTCACACAACTCTTTGAGCGACCTCCTTAATAGCCGATTGCCCGCCAA:1 - chr3L 18284561 3' + Gypsy12A_LTR 1813 3 69.31 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAAGGGAAATAAAAGCTTAAGAGGCTTAAAAAAGTGTAAATAAATACAGCTTGCATTCATTTTAGATTAATT:1 + chr3R 25921029 3' - roo 50 2 69.31 TTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTCACCTTGTTGACTATATCTTGTATT:1 - chr3R 10971909 3' + BS 5046 1 74.26 CGGGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGGACACGCCACGTAAAATAAGTTCTTTTGCTCCCCAGATCC:1 - chr3R 5513219 3' + R1A1-element 5286 1 67.69 TCACGCCCACACTTTTGAAAAAAAAAAATGAATTGCAATTATAATTTTAGCGACTTCTGAATTTTAAAGCACAGAACTCGTTATACATGCATAAGTGTATG:1 + chr2R 1594473 3' + INE-1 252 1 74.26 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCGCGCCTTTTATT:1 - chr3R 31812713 3' + P-element 2823 1 19.80 ATAGACGGGGAACTCGACTATAGCAATCTCTCTTGTTAATATTGATTTATTAATAAACTATACAATGCTATACAAACTATATTTAATTTGCACCAAACTGA:1 - chr2R 11570610 3' + INE-1 565 1 57.43 GGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTAGATTATATTTATTAACCACATTAAAGGTT:1 + chr2R 16744175 3' - opus 49 4 81.19 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAACAGACCTTGAAAGCAGATTCTCGA:1 - chr3R 30272826 3' + P-element 2834 1 26.73 ATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGACTCTTGTGCTTAACTTTGTGCGCTTTTTTCTGCTGTTGAACAAATTCTAAA:1 - chr3R 25702174 3' - Tirant 24 2 57.43 TTTGTCTCTGTATGCTGAATCTAAACCTTCTAGCTTTTATAGTCCACTGGGACTTCAGACAGATCGCTGACCGGCTATCGAGCATCATCATCATCATCATC:1 - chr3R 9132793 3' - INE-1 181 1 57.43 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCATGGAGCCGTGAGTATGCCATTCAGATGGGACACTGGTACACGTGGACGGACTGGCTTGGCCC:1 + chr3R 25823733 3' - hopper 15 1 64.36 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGAATGGAGAAAAGAAAGGCGGCAAAAAGTATTGCCTACTTATGGGGGCACT:1 - 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chr2L 20118695 3' - Max-element 8259 2 55.68 CACATTAAAAATGGGCGTCCTCGTCCATGTCTATGTTATCAAGGATTTGCGTCGTCGACATCGAGGCTCCACTTTGCATAAAAGTCCATGATGAAAGGTCC:1 - chr3R 12380024 3' - Chouto 6303 1 77.23 CCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTCTATAATAAACAAAAAATTAAGTTAACAATTTTTTCGATATATTTATTTTCAAATTTAATAA:1 - chr2R 16744108 3' + opus 483 2 53.54 GTGGANGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAATCTTCTTCAACGAGTTCTTCGAACTC:1 - chr2L 20118711 3' - Max-element 8288 2 74.26 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTCAAACTATATATGTTAAGATACATTGGGAAAGCAAAATAACATTCGTTTAAAGACTGAGCTAAACTGTA:1 + chr2R 20838693 3' - 1360 9 2 70.30 GCTCGGCTAAAAGAGCCCTAATTCTAAATTTCCAAATCGCGTACTTCTCGCCATCAAACGGTTTTAATAGTTCCCACTTAGCCTGAGTTCGTTTCAAAGAT:1 + chrX 15498796 3' - copia 498 1 69.31 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGCTACGAAAGTTGGACCAGACCTGGCCTTAACCCATTAAGCCCTTGTTTTTACAACATCTATTTT:1 + chrX 19095828 3' + roo 397 1 65.35 AAAATTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAATTCTTGTTGTGTGTATCTCGCATTTATAGCAAAGAATTAACTAGAGAGCCCCAA:1 + chr3R 30116244 3' + P-element 2641 1 55.45 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATAAACATATAGCCTTACGATCATTCCTAATTTATGGGATTTTTAAACCATATGTCGCTTTTGTAAAACTT:1 + chr3L 2024406 3' + copia 247 1 67.33 TAAGCCCCGTACTCTGTGGTGACCAACACACCAGAAGGGTTCGGGCCCAATTAGTTAGTTGTTGCTTTCTGCCTTGTGTCAAAGCTTGTTCGAAG:1 - chr2L 1115069 3' - baggins 4965 1 56.84 CATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTAATGCAGTTCCCTTTGCAACACACAGCCCCAACTTGGAAAGGG:1 + chr3R 31369372 3' - Transpac 37 2 58.42 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTGACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCCAGTACTTACAAATAAATATTTATTAATTTG:1 - chr3R 21500939 3' + roo 9025 2 71.29 ATAAAATTTTAATTTAATTTTTAAGCACTCGCAACGATTACGCGTAATTCAATCGAAATGAATGGGCAGGAACGAAGGGAAGTCGGTAGTCATGGACTGGC:1 + chr3R 18833108 3' - 1360 3047 1 69.31 AAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTAGAAGACATAAATGATAAAGAAAAACTCCTGAAGATTATCGAAAACGAACACATAAAGA:1 + chr2L 1154174 3' + 1360 3 2 65.35 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCTGGCCACTTGTCCGTCTGTCTGCC:1 + chr2L 16686629 3' - pogo 11 1 68.00 CTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTGTGCGTTTGGGGTTGTTTTATTTACGTTATTAATTACTTG:1 + chr3L 2872283 3' - F-element 346 1 76.24 TGGGTGGGATTGTTTGAGCTAATCGCATGTGTGTGAGGTATTCGCATTAATTGATTGGTACCATGGACTGCACTTTATTGTTTGCAGAAATATCATGAAAA:1 - chr3L 14960148 3' - I-element 4889 1 78.22 AATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTGACTGCTTTCTAGCGCCAACTCTTGTAAAAGCTGCGCTTGATT:1 + chr3R 1868215 3' - G-element 39 1 58.42 GCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCACACACCTTTTACGATACTTTTTAAGGAATAGTATACTCTCTTAATATACGAGAAACG:1 + chr2L 15957526 3' + Max-element 278 2 57.43 TAGATGGTGTTCTTACATATTAAGAAATAAGACTTAAATTAATCTTCAATTAAATGACGCTTTCTCGGTTTTGCCATCAATTTTTCATAATCAGCTTATTG:1 + chr2L 12419808 3' - Stalker2 282 2 73.27 AGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGTGTGCAGTTTTTTATTTAATTTATAGGAATATATTTATGC:1 + chr3R 14049411 3' + transib2 2787 1 62.38 CATCCAAAGAGACTTAAATATCCCATCAGTTACCAACGCAATCACGGAACTTAAGGAAAAATACCGATATGTGGAACTAGTACACTGCTTGTGCCACATTT:1 - chr2R 18005816 3' + F-element 4387 1 64.36 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTGAATATAACTCCAGCAATTGTCAATTGTTACACTATGAAAAAAAATCTTAATTCAATGCCTTTTGAAA:1 + chrX 5018723 3' + opus 487 2 68.32 ATGGANAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCTAATGTCAAGTAACCTGGACGCACAAC:1 + chr3R 25440213 3' - pogo 46 1 73.27 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATAAACAATTAGTTTATTGGACTATTTCAA:1 - chr3R 12767034 3' - 412 7101 2 74.26 CCTTCGACAGGTGGTGCTCTTAGACCCATACAGTGTCCCCCAACCTTGTGTTCCCCTCCGTATCTGTATCTGAAACACCGCCCGTCACTTCCTCTTCGGGG:1 - chr3R 16652814 3' - Osvaldo 1321 2 74.26 TCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGACTTGGCAACCAGCTGGCTTTTTTCCACAGAATTTGTCAAGCTG:1 - chr3L 5829788 3' + F-element 4492 1 57.43 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACAC:1 - chr3R 13715103 3' - P-element 53 1 26.73 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACCCACCTTGACGCAAATACCGCAACCGATGCACAGCTCCTCGGACAA:1 + chr3L 8974154 3' + P-element 2860 1 52.48 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAAACAAGGTGAATACTTTTCATAACTTTTAGTATTA:1 + chr3R 10971938 3' - BS 5039 1 69.31 CCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGATTTGTGCGGAGTGTAAGAATGCCTGGGATGTGTTCTTTGGCATTTTGGCCAGG:1 + chr3L 22324335 3' - jockey 4694 1 54.46 TAATTATAATATAATAATAATAATGATAATAATGATTTTGAGCCTTTAAGTATTCAAAAGATTTAATTTCATGTTTGAGCAACCAAACACTTTCGAAGCAG:1 + chr2R 21437871 3' + invader3 5050 5 71.29 GTGTCTGGAGTAGTCAAAATATTAAATACCTAGTACACAGCATATGTACTAGGTATTTAATATTTAAAAATATACATACACACATTTTTATGAGCGGAAAC:1 - chr3L 15585714 3' + invader2 4684 1 67.33 CTAGCTTAGTAACGGGTATCTAATAAGGCGCATTTAGCGTCTGTCAGTCTAGAGTGTGGAACAGAGAAGACCAAGACAAAGGCAAATAGGAATCAGTTATG:1 - chr2R 25133762 3' + INE-1 543 1 79.21 CAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCTAGCGACACGAGGACGTAGTAGGTCGGGCAGTTCCTGGTCAAGCAATGGAAGTA:1 + chr3R 21358468 3' + jockey 4707 1 53.47 AGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGGCATTTTTTCTATTTTTTTAAATGGAGTGGGTAAGTGGGTGGTGCCTTTGGAGAGTTG:1 + chr3R 13577881 3' - Doc 4632 1 60.40 AGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACAACAAACCAGCAAACAAAGTGAAAACAAGAATAAAAATACCACGATTTAGTGAGGTATGAATTTGTATAGAA:1 + chr3L 12315819 3' + gypsy4 461 1 67.33 AGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGTGGAAGTGCGAAGGAAAAATGCTGTCATATCGATATTAATTGCGGAAAAATTAATAATAATGCAA:2 - chr3L 17715405 3' - INE-1 557 1 48.51 CTAACTGTAACTTGTTTACGTCTTATGCTAGACTAATCGTACGGCGTGCTGGAATCTGATTAAAGTGCCAGTTCCTTTTCGACATGCGACTCCTATTCAC:1 - chr3R 28758218 3' + 3S18 5937 2 69.00 TCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTATGTGATATACGTTCATTTATTTTGCA:1 - chr3R 19450129 3' - F-element 416 1 73.27 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATAATGGCGACGACAGCGACAGACACAATTACCCAGATTTTTAAATAGTGCCTCAA:1 - chr3L 16838179 3' + P-element 2809 1 61.00 TGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTATTTACATCTCTTTATTCCTGCTTTCTGTTACCAAAATAAGTATTGCTTAATTTAA:1 + chr2R 11711232 3' + pogo 1944 1 59.41 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGACTGCAAGAAGCGATAGGAAACGGACCCCGGCAGTGGGGCTTTCAGTTAGAAATCCATTTCT:1 - chr2R 5849956 3' - jockey 20 1 63.44 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCATTCTTATGCTCGTTTCGTCTCTCTGGCGCTTGAAACACCTTTGGGCTGCT:1 + chr3L 2800211 3' - blood 25 2 54.46 CACCCNAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCTCCCAACTTAACTTTAGAAATTACCGCTTTTTGTATCAATTGTAACCAAATAATTCAACTATATGCACTTCC:1 - chr2R 9364100 3' - Doc 8 1 66.34 TATTCTAATTAGTTAGGCTATCCCAAGCGCAGCGGATACGCTGTGGCAATTTATCTGCTTTAATAAATTGGGAGTTTTCGAGTCGATACTTCAATGGCGTG:1 + chr3R 12042874 3' - GATE 8343 2 57.43 AAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGCAGTTCAACTACAGATACATTTGTTTAAAATGTGCTATTTTAGTCATAAGGACA:1 - chr3L 3944710 3' - jockey 4785 1 51.49 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTATTGTTGACTGCCGCTCGGC:1 - chr3R 7993866 3' - Doc 37 1 55.45 GACGTGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGGTGGGCCAAATGTGGCCTGAAGGGCAGAAGGCATTGGTATGG:1 + chr3L 10811206 3' + P-element 2878 2 59.46 TTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATGTATTTTAAATATCTTTATTAAATTTTATGAGCTGTTGA:1 - chr2L 20928078 3' - Chimpo 38 1 64.36 AATAATAATAATAATAATAAATCCCCAAGCCTGTGTTTCCCATTTATTAACTCGTTGCATATGGTTTGCATACAAACGGCGG:1 + chr3L 18154217 3' + mdg1 43 3 79.27 GGAAGAGGGTAGAAGGAGAAGCCTACTACATATTTACGTTCAGAAACTTATTTTGACTCCTCTTGCCCCCAACCAAAGCTAAATTACATAAATGCATAAAT:1 - chr3L 7989715 3' - mdg3 5261 1 74.26 AATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGAGACCGCCTTCATTACTTTGCCCAAGCCATCAGGATCCTTTGCCC:1 - chr3R 27374797 3' - mdg1 33 2 58.42 TCCAANTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAA:1 - chr3L 24213785 3' + invader2 5068 2 61.39 GCCGCTCTCCGTCAAGCGGACGCCACTTGCCCGGACTCTCCGTTAGCGACTGGGCCAGCCTGGCAGACCCAAGACCGGTTTGCCATGATGAATGCTTTCGA:1 + chr3R 11169012 3' - baggins 473 1 67.33 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATCAGAAGACGGACAAAAGACTCAAGTTGGCCTTCGTCATCGCCACAGAGAATGGGAGCGGGGAAGGAATCGAG:1 + chr3R 19989895 3' + pogo 2098 1 76.24 ATATTACACATCAATATTTATGAGCGAAATTTCCATATTTTTGGTTACACTTTATCAACGATCCCGACGAAACATTTTCAATCTTTCGCCGGGTCTCGGAT:1 - chr3R 31731627 3' + 1360 2938 1 57.43 AAAATAACTTAGCCGTAAGTTTGGTAAATAATAATAACAACGTCAGAGGACTTAAAAAATTTCACGCTGAGATGGCATAGAGAGGCCCTGAAGAAGTACTC:1 - chr3L 20315178 3' + G4 3637 1 65.35 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTGTCTATCTCATTGCTTTTTCCAGACA:1 + chr2L 2920932 3' + hobo 2899 1 73.03 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATTTGGACTCTCTTTGGAGCCCATTCTCCCGCTCTCTCTCTCTTGCTCTCAGACTAAGTGT:1 - chr3L 9692661 3' + P-element 2869 1 61.00 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGACTCGATTATTATTTTGAGACTTATTTGGGCGCTCTTTAGGGAAACTTTCCTAGCGTTCTCGGTAC:1 - chr2L 107973 3' - P-element 9 2 70.30 TATGTTGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATCCGTTACTATCATATACGTTAACTACCAGTAGCACTTAAGTGAGTTG:1 + chr3R 27080799 3' - HMS-Beagle 6822 2 53.47 ATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATCTCCCTCCTTTTGGAAAATAACGTAATCAGGTATTTAATGGAGATGGCATTAA:1 + chr2L 12203350 3' - Tabor 26 2 74.26 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATACAAATGTACATATACATACATATGTCATCTAGA:1 - chr3L 20248312 3' + Transpac 5191 2 74.23 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCATACGGAAGTTCGCAAC:1 + chr3L 10698731 3' + roo 396 1 67.33 ACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGTAAAAATATTAAGAATGCGAATAAAAGGTTAAAATAAAAAAATTATGCAGCTAAGGTATTAAATATAAGAT:1 + chr3L 20904980 3' - P-element 2837 1 75.25 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAAGGACAAAACATTTCGGACGATGAGTCAGTAGCAACTGCACCAATTATGACAAACGAAAAAAATAGGTCATGGTTT:1 + chr2R 3595837 3' - roo 2 2 77.23 ATATTTTTAAAGTTTATTTTTAATTTCAATATCTAGCACTCAACATCTATTATTTATGAAAAGTATTTGAAATATGACGTACAACTTGGTCGTGAAATTTT:1 - chr2R 2313517 3' + hopper 177 1 76.24 CACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGTTAGCCGCATGGCCACTTAGCAACAATGGGAAAAG:1 + chr3R 14169307 3' + blood 7372 2 60.53 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCTACGTATGTAATATTATCTCGCACGCTGAAGATCCGTTGAAACGTTGTTA:1 - chr2R 17394622 3' - jockey 35 1 50.00 AACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATGCAATACAAGTTTGTTTCCAGATGTTGCCCACAATTTAAGAAAATGATTTGATATTTTTTTATTTTTTTTTTTAG:1 + chr2R 23173573 3' + INE-1 159 1 53.47 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGGTTTTTTGATAGTAATTTAAGGTTCAAGCTTAAACCCTTTTAATAGTCCAATTTAGCTGGAAACCAAGTATGA:1 - chr3R 18692902 3' + roo 405 1 61.39 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTAGTCGTTTCGGTTAATATGGTAATTGAATGTGCATACGGAAGTTCGCAACTAT:1 + chr3L 10698734 3' + roo 399 1 70.30 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAACGTAAGAGGTTTTTATTCTGCGGTCAACATGTGACTTGTGGTTGCTTCATGAGGCACA:1 - chr3L 12452130 3' - 412 7072 2 56.44 TTATTGTTAGTTCTTATACAAGAAGATTCAATAAATAAAAGCAAAGTAAAATAAAAAAAAGGATTAACTAAAGATAAAAAAATCACTATTGAGC:1 + chrX 21396713 3' + F-element 4639 1 75.53 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGCCAAAATTCTGGGCATTGAGGGGAGGTTGGGCAAGAAAGTAGGAGA:1 - chr3L 7792178 3' - 412 7074 2 53.33 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTTGGAATCTTATTTGTATCTCATTGTTAAATGCTTCT:2 + chrX 21668941 3' + pogo 2062 1 66.34 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATCGATA:1 + chr3R 7101075 3' - pogo 20 1 59.41 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTCAACTAGTATAGTATAGCGGTAGTTCCGATCGTCAATCGGTGCTAAAAGTATGTACATGCGTGAGGCGAAT:1 + chr2L 487165 3' + P-element 2881 2 72.28 CCGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTTTATGTTCTGCTGAACGGGACCATTCGCGGTACTGAAAAAGAGTGACTGCCACTGTGAC:1 + chr3R 15209134 3' + BS 5011 1 59.41 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACACGATAGTTTATGGCTATCTAAACATGGGCCC:1 + chrX 2050871 3' + 412 7500 2 66.34 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATATGGACGAGCTGCCAGCGCA:1 - chr3L 11070524 3' + P-element 2829 1 21.78 GCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATGACTTTGTTCTGCAAACGCACTCACCTTCTACTCGTACTGTATTCATGG:1 - chr2L 5777927 3' - FB 29 1 55.45 TGACTGAACGATTACATTTGGAACTAAAATAAATAGAATGAGATATAAAAAAAAATTGATAAATATACAATATGCAGCATTTGCTATTAATTCTTATTCCT:1 - chr3R 17212285 3' + G5 4804 1 58.42 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAATCTAATCAAATTTGTTTAGATTTTCCCTTTTTTATC:1 - chrX 2884835 3' - copia 4911 2 69.31 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAAAAGATGTATTTAATAACGACGGAGTGCGACGAGAGATACTCAGGCCGGGAAAGGCTCAGTTTGATCTGATT:1 - chr3R 11165614 3' - Tabor 6847 2 75.25 AGAGAGTCAAGAATACAGATTACAGTGTTTTATATTAAAACCGAAATGATAAAAAAACGAAGAATATTATAAAGTGATCCGATCCGACTAGTCCGAC:1 - chr2L 21643419 3' - Cr1a 4227 1 65.98 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAAAAAATAATAAAACGAAAAAAAGTAATAGTTTTGGTAGGTTTGTGGGTGCAGAAAGCAGTTTTT:1 - chr2R 5788291 3' + I-element 5329 1 51.49 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACAAAGTAACGATAATTTATATGGAAATTATACTAAAATGTAATTTGTTAAC:1 - chrX 16798201 3' - diver 5916 2 51.00 CTGATAATTATTATGATTTGGAAACACGGTGATTTGTGTGCAACTAATAGCACTTCGGCGGTGTGCCAAGTCACATTGAACACGCTTTTTAACTGAAAA:1 + chr2L 14365777 3' - Idefix 453 2 84.85 GTATGTATGTATAATAATATGTAATGAGCCGTGCTTTTAGTATAATTAGGGCACACTAGCTTTACGGTCACACTGGTCGTCATTTTGCCGCCAAAATGAAA:2 - chrX 13329478 3' + Dm88 24 2 80.20 CTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAATCCCCAAGCCTGTGTTTCCCATTTAT:1 + chr3L 18154182 3' + I-element 5307 1 76.24 TAAAGNAATTGGCCCCTGCTATACAATGCTTACATGGCAGAACTGACTGTGCTGCAGAGCCGTGGGAGACGAATTGCAGCAGGTCACGAAGCCCGACATCC:1 - chr2R 4932788 3' + G7 490 1 69.31 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAATGCTGCATTTCGAAGTTTTTCTATCAAATATTTGTAG:1 - chrX 13347272 3' + roo 9054 2 61.39 ATAAANTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTCTAAATGCCTAATTTTTATGGAAAATAAATTAGAAATGT:1 + chrX 20437687 3' + roo 9034 1 65.35 ACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACCAAATTATACCAAAAAAAGAAAACGGTAGCAAAAAAAAAGGAATGTGTGTTTGAAAGGGATACAGCTATGC:1 - chr2R 15621238 3' + I-element 5144 1 60.40 ACAGATTCCTCGGCATGTATGTAGTCCCACGGGAAACAATTACCCCAATAAAATTCTGGCATTTATACATCTCATCCTCATAATGAGGCAAATGTTTATGC:1 + chr3R 11649796 3' + baggins 5279 1 68.32 GACCCCAAGTTTTGACTGGGGCAATTACAGCTGAAATTGAAGGCAGAAGGGTCAGCTTTTACTTATCCGGATCATTGTCGTGACCCCACGATTCGACGGG:1 + chr3R 509528 3' + Gypsy12A_LTR 418 1 67.00 GCGTTTCATAAAACCGTGTTGACACGGTAATAGTAGAATTTCTCTACTGCCCAGACAAGTGCTAAACTCTCTTTCTCCGTTTGAGAGTAGCGCCTAAGAAC:1 + chr3L 25727119 3' - Q-element 207 2 75.25 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAACGACGTCAGACGCATTGACGTCGCTTTA:1 - chr3R 7993885 3' - Doc 48 1 72.04 TGGTCGAGTCTGGTCCAATTTGGGTGAGATTGTTTGAGGTAATCTCATGTGTGTTTGGGTGTGCATAAATAGGTTTCTTATAATCGTTTAATGTTTTTTTT:1 - chrX 19906694 3' - I-element 4909 1 53.47 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGTATATAATTGCATGTGGAAAATGCTGCATTTCGAAGTTTTTCTATCAAATATT:1 - chrX 13347277 3' + roo 386 2 56.44 GGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATGTGGAAAGCTTGGTGCGGTAAGACTATACAGATTTCGATCTGGTTAATGCTTTCAAATGTTTTGGGAGAACA:1 + chrX 764117 3' + blood 441 1 71.29 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAGTAGTTTACTATCTCTTTATTTGCTGTGCTATATTTAAATTGGGCTTGAATCTCCTTAAATT:1 + chr3R 24282033 3' - Max-element 18 2 62.38 GACCGTGACTTGGTCTCGAGTCTGCCGCTGTGGAAACCTGTGTGTGTGTGTGTGAATTCAAGATGGAGCGCCTTGCGCAAGATGGCCAAGAATCGCCTGCC:1 - chr3L 6986241 3' + Stalker2 429 1 72.28 TCAAGAAAGTCAGTCGTATTCTTTATTGGAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTTCATCGATTCTGTGGGCGATGGCGAGTATAAGCAGCTTC:1 - chr3R 8204507 3' + Tirant 8398 2 61.39 CGACTNATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATTGCCAAAGATCCAACAACAATGGATATAGCAACAATCGCTGTACCCACAGACACAACAGCAA:1 - chr2R 20411851 3' + 297 6967 2 70.30 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCTTTGAAACCAGCTTATGCTGCTCGGCACACGCAGCCCTGGCGACGTCAGCGAAGTTAAA:1 + chr2R 4502512 3' - roo 18 2 61.39 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAGTACGTATATATCGTTACTACACAAAGGTGGAAAATATGGATCTGCATTCAAGGTTGTCTC:1 + chr3R 9370014 3' + roo 391 2 62.38 TTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAGTGACCATTCTGTTGAGTTGTTGTGGCAAC:1 - chr3R 20466651 3' + roo 363 1 70.30 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAAGTGACTGCAAATTTAAAAAAAAAACATGCTC:1 - chrX 13985538 3' + roo 9028 1 73.00 TTTTTGATTTTCAGCCAAAAAATATCAGTTTTTTATCCATTTCGGCCATATAGTATAGTATGCCCTTATAGAAGGACATGCCTCGCCTAATAAGAAATCAA:1 - chrX 7790015 3' - transib1 23 1 65.35 GCATGACGAACGCCGGCTCTCAATTCAACGACAACATCATCTGCAGCCGGAGTCCACTGACTCACCGCCATACAGCACGGATTGCATAAGACTGTGGCCAG:1 - chr3R 15071653 3' + F-element 230 1 73.27 TCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTTAGCAATTGACACGGCGGTATGGCGACCCCGGCATTTGGTATTTGGGTTGCTCCGGCGGCACCTTGAAATT:1 - chrX 7575931 3' - mdg1 377 2 80.20 ATAAGACTAATAATGATGCGACACATACATATGTATATGGCTATTTTTGCTGCTTTTTTGGTTCAGTTTCAATTCCGATTTTTATGTAACCTCTTAAGCGG:1 + chrX 11534014 3' - invader6 2 2 77.23 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACGGTCATAATTGGCATGTAAATAGACT:2 - chr2L 5974426 3' - roo 8713 2 76.24 CACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAAAAGTGCAGCTCGTCTAACTACTAATCACTTAT:1 + chr3L 9142074 3' + F-element 286 1 68.32 TATTTNTGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAACCAATCACTCGAGTATCCTGTTCCC:1 - chr3R 14169269 3' - blood 7064 2 77.23 CAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGATCACGCACACATAACAATAACCGAGATAACTAATAGCAAATTGCTGGCATCGTTCACTTCACGGCCCCC:1 + chrX 5443098 3' + accord 75 2 67.33 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGCCGGTTCATGGATGCGTGAGAGAGGAGGAAGCGGAGAACAGGAGAGTTTTGCCGGCGAGAGCGTGAGCGCAGGG:1 + chr3R 28326790 3' + P-element 2883 2 76.24 CCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCACTTTGACTTATACAATTAACAACCAGGCTAAATAGTTCGCTACAGATCCCCGCCCAC:1 + chrX 16798282 3' + diver 202 2 57.43 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGACCGACACGAAGGCCAGCCCGAACGCAGACGAGCGTTTTCTCAGTG:1 - chr2R 21379493 3' + P-element 2853 1 45.54 AATCAATCAATAAAAACGCACAGCGGATTCAATCGGAGTTTTTACTTAATTCGGCGTTGATCTTAGTTCATCGACGCTCTTGCGGTTTTCCGGTTGGAGG:1 - chr3R 31405383 3' + Tom1 298 1 70.00 TTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGTATGACCCTTACAGAGTATTCTGTGACTCCCTGGTTTTGTGTTT:1 + chrX 732052 3' + Cr1a 4121 1 76.24 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTTTCTTTCTCACAAAGGACTGACCTAT:1 - chr2R 10863914 3' - mdg3 5302 2 76.24 AGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACCAAAAGGACATTAACTTAAATTAGTACTTTATAAGAATGTCCTTTGCTTATTTGCCGTATAAAGTATTGCTTTGAA:2 - chr2L 17841008 3' - Juan 4028 1 63.37 CATGGTGCCCCAGTGATAGTTCGCAGAATCGTGGACTGAGCTCGCTGTATGATTTCAATGTTGGTGTATCCAGGACCCTAAAGAACGTGTTATTTATGGTC:1 + chrX 8012590 3' - Doc2-element 4445 1 64.36 GATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTAACGCTCCTTTCCCACTGATTTTTCGGTTTTTTTTTGTTTTCGATTCTCGACGA:1 + chrX 17064824 3' - Tirant 8135 2 50.50 TAGGGTCGACTAGATTATTCGCCGACGTGTTCGGGTGGGCGAAGCCGAGGGGGAACCACTGCCGTAGCTATAGCTTGTTTGATACGGCGAGGGAGTCTTCC:1 + chrX 2428422 3' - G5A 2647 1 67.33 ATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAAAAATAAATCGCATTTAAACTGGCAAAGCTTT:2 + chr3R 19144442 3' + Juan 4164 1 76.24 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATTTATATTCAAGCTGGTCTTGGCTCG:1 + chr2R 24493715 3' + flea 216 2 79.07 TTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGATCCTTAGGAGGTACTTACAATGGTAGCTTGCGGATGACATACCA:1 + chrX 9360937 3' - mdg1 7183 2 58.00 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGCTCTCAATCAGCAATGCAAGCGCATCCGCGAAACTCGTGAC:1 + chr3R 5977808 3' + copia 5087 2 61.39 GAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGAGTGTGATGCCAAGTGGAACCAG:1 - chrX 11282013 3' - I-element 5048 1 78.22 ACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAATGCTCTTATTCAGGCGAAGTACGAAAATCGTTTACCATTTCGAGCGTA:1 + chr2L 16082677 3' - Stalker 28 4 52.04 CGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGATACGAGGCGAAGTGCAAATTTAGAATTCTTATTACAAGTTCATGGGAAAGTGGCGAA:1 + chr3R 9052915 3' - 1360 92 1 61.39 GGCAATGATTGTTGAGTCCTTGTGCCTCAAGATGTGACTTTTCCAACAAACATTTTTAATATTTTAATTGATCGAAATTGATGTTGTGTGTGGGAGATAG:1 + chr2L 22254851 3' + 1360 451 1 63.00 AAGCTGCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCGAGATAAACAACACGCACACACACCGACACACGCGAGTGCAAACATTGCAATGT:1 - chr3R 13715073 3' - P-element 23 1 56.44 AAAATAAAAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACATCATGTCCCAGCGGATGCACTACTATACTCCGTACA:1 + chrX 4123225 3' + I-element 119 1 68.32 CGCATTTAGAATTAGACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAACCAATCTTACATATATATCTTATCTTCCCGGTTCACTAACATTGTTAG:1 + chrX 21667918 3' + flea 4973 2 69.70 CGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACAGCTTAGCGCACAATCAATTAAACTGGTTTATTGACACTTTTCCTCCGACACAGACACACACACACACAC:1 + chr3L 19692543 3' + I-element 4950 1 73.27 TTAGTCGCCTTTTACGACGAGCCGAAGAGCACCAAAGCGATTCCCCGAAGAAGGCGATTCTTCTTCCCGTATCGCCCATTTCTTCCCGCAT:1 + chr2L 3662128 3' - Rt1b 4883 1 76.92 TGTAANTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTATTGTTTTAAAGTATTCAACATACATATGTTGGTATAAATGGTACTTGCTGTCAGGTATGA:1 - chr3L 21708594 3' - roo 17 2 62.38 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACTAAAAGAACTATCAAGTACTAGCAAAAGCACTAGCAACAAATTCCAATC:1 + chr3R 7101071 3' - pogo 24 1 56.44 ATATATATACATACATACAGTTGCAACGGTGCGTATAGTGTGGTCTCATTCCAGTTAAAACCCATATCCCAACCCCACCCACCTGACCCCTCCTCGCTCTC:1 - chrX 4792978 3' - 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S-element 95 2 65.35 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTATGGTCCCAACGATGGAGTTGTCTCCTCGCCAAGAA:1 - chr3L 3671296 3' + roo 9031 1 65.35 TCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGAATTAGAACAGTATAAACAAAAAGAGACATAAGACAGTTATACAGAAACCGACGCACCGTG:1 - chr2R 13269145 3' + hobo 295 1 64.00 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGAAACTTATTTAAACTTTCTCACCCAACTTTGTAAAAATTAGA:1 - chr3L 11435583 3' + roo 9037 1 61.39 GGACACGCTTCATCATGGTGACGATGATGACGTGAGCCCCATCCCAAACGATTTTGTCCTTACGATGAAACGCGCATTCGCAACCTTTGGA:1 - chr2R 20621180 3' - Rt1a 4728 1 64.84 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAGCCATCAGCTAATTTGGTGACCTTAGAAT:1 - chr3R 22079742 3' + pogo 2057 1 74.75 AACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGATATGGCTGTAACCCCGGCGGCGGTTGTCTGCCGATGCTGATCCTGATGCTAAACGT:1 + chrX 15691441 3' - flea 321 1 58.42 GTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGTACCCTTTCCTTTCCTATGTGCGGGAAAATGTGTGGCACATATGGCCAGGACGA:1 + chr3R 31884291 3' - hobo 21 1 58.42 TATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAAAAAAAATTAAATTAAAAATTTACACAACGATATGATAGTGTTATATGTTTTATAAG:1 - chr2R 3905553 3' + Juan 4194 1 51.49 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCTATCACCTATGCCAGTCAAACATTTCGCTAAGCCTGTCAACTTA:1 - chr2L 22235199 3' - 1360 35 1 59.41 AATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTGTATTTATAAACACTAATTTTCTTTTTTAATTTTAGTAACTATTTAATTATTTCTAACAAGAGTATTT:1 + chr3R 21695512 3' + 3S18 316 2 54.46 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACACAACTTTAGTTAATTTGCGTTGCGGATTACGCTTTCATTTATAAGCTGCATT:1 - chr3L 10698574 3' + roo 9047 1 57.00 ATTCAAAATGCGCACGGTGTTTTTCCCGTGTGTCATTAAGATCTTGAATCTTTTATGGTAAGTGCCGGAAATTGTCCGCCGTGACGCCAGAAAGCCCGTGT:1 - chrX 14899544 3' - baggins 5112 1 54.46 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACATTACACAGTAGATTAGCTCGTCAACGGCAAGTGAAGGCCGAAGGATATGCTCAGTCCCCCG:2 + chr3L 21384049 3' + roo 385 2 55.45 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCATATTCATCAAATCGTTTAATAATTGCGTAGAATAAGTGCCAAGACTTAAC:1 - chrX 2762114 3' + roo 9046 1 53.47 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAAAATAAAAAACGCCAGAAAAAACTGGCAGCGCTGGTCTGGCCACTTGTCCGTCTGTCTG:1 + chr2L 16686627 3' - 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