Identifier strand chr coord 5'/3' map gen strand TE coord num_maps_concensus_TE Blat_score ATTATAAATTAAAAATGAGCCAAGTTTAAAGCAAAAAAAAAAGTTTATATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chr2L 17957266 5' - flea 4947 1 68.28 ACAAATCCTAGCCCATAAGACACAGGCAACGGTAGTTAGATCTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAACTGAAATCTTCTCATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTAAATC:1 + chrX 21562854 5' + roo 431 1 72.60 ATGTTGACTTCATTTGTTTGCCTCGATGACGTCAAAAAGGATACAAACATATAGAAGATTGAGCAAATGAATTCTCCATTATATCAATTGTCTTTATACTTATGCCGTATAATGCAATTGATATTTACTAAACACGATAAGATTTA:1 - chr3L 7848445 5' - jockey 278 1 61.64 AAAATGAGGCTGTGTGTGGGTGTATCTATGTGTGTTAACATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAGGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGA:1 + chr2L 10143651 5' + jockey 4534 1 70.50 AAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAA:1 + chr2R 11246963 5' - 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chrX 21668394 5' - opus 7484 2 41.78 TTCAAAATTGACTTTACTGATTTTGCCTTTTGCATTTTATTATGTGTTTATTATGCTAACTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 22320559 5' + roo 29 2 54.55 AATTGGCGGGCATATGCAGACGTGTTTATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr3L 17268204 5' - hobo 2927 1 73.88 TAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAG:1 + chr2L 10536450 5' + flea 4791 2 57.34 CAGCTACAAAATTTCAGCTCAAATATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chrX 5841906 5' - roo 9011 2 60.00 TGAAAAGCCCAAAGCGCAAATTAACCCAAACACCCACTCGCACACACACACACACACACACACATATACA:1 - chr2L 7451342 5' + accord 186 2 78.57 GGACTTTTGCAAGTTGACCCAACAAGTACACAAACGCCGACTTTCTATATCACCCAGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTA:1 - chr3L 2528864 5' - blood 7067 2 61.64 ATTTTACCACCAATGAGTCNATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTA:1 + chr3L 2532414 5' + blood 36 2 58.22 AAATCATGGAAACCATAGGCCAAATTGTAGAGAAGCGCAAAAAAACGAATCCTTTAAGAGAACCCCAGAGACTTGTTGTCATTAATTGTTCTTAAGTTGACGAAGTTGTGTGACTTGGACTTGATTGGTGGATTAGGCACACGAGG:1 + chr3L 26010536 5' + invader4 2713 1 52.05 ATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACA:1 - chrX 15286971 5' + X-element 4404 1 50.40 GGAGACAACGCTTGCCGAGCAGATTGATCGGCGCACTATATGCTGGATGGTACCTTTTTGTGGCCAAAATGAATAATTTCAAAACGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 24059140 5' + roo 15 2 69.60 GACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 15148596 5' - roo 333 2 70.63 GGGGCATGGTTTTCTGCAGACATCTGGATCTGGAGCTTGAATGTGGCATATACATATATATTTCTATATGTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3R 28618344 5' - 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P-element 2857 1 47.00 GCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGC:1 - chr2L 15019943 5' + BS 4875 1 70.63 TCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTCAAGTGAACG:1 - chr2R 17350576 5' + F-element 65 1 64.29 TAATATCGGCGCCATTTCACGTGCAGAGCGTTGATATGCCATCTACATGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACACAACCACATAGGAACAGCCATACAC:1 + chr2R 15474466 5' + Quasimodo 61 2 63.01 AAATTATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGGACTTT:1 + chrX 666268 5' + 412 48 2 54.01 ACTTGGTATAATGTCAGGATGAGGAGCTAGAGCTGGTTTTGTCAGGCATACACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCC:1 + chr2R 17404813 5' - jockey 4622 1 65.07 CCTTTTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr2L 10536439 5' + flea 4773 2 68.38 TCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAA:1 - 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chr3L 19274916 5' - transib2 2790 1 60.00 CTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAA:1 + chr2L 8284376 5' + Doc 410 1 47.92 ACGTGATGTTATCAATTACTTTCGTATTCATTCGTTCTGTCTCAATGAAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAAT:1 - chr2R 17650643 5' + pogo 67 1 68.28 AGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr2R 18887066 5' + roo 8713 2 58.52 CATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAAT:2 + chr3R 556453 5' - Tc1-2 1545 1 70.55 ACCTCAACCTTTTTCCCCTGGGAATCATTCCATTCCCATTCCCATTTACAGTCCCATTCCCAGTGAATCTCTGTAAGTGACACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCG:1 - chr3R 12341212 5' - Tirant 403 1 81.90 ATCATTTAAATACCACTTTTAATATCCAAAACAAAGGATACTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAAT:1 + chr2R 22521890 5' + pogo 60 1 67.42 TATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3R 29627874 5' - roo 8994 2 77.04 CAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chr2L 9383722 5' + flea 4797 2 52.90 CAAAACGAACGAACCGAATACGTGGCGACATTGCTAGCTAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chrX 15191431 5' - hobo 2914 1 57.78 TTGTTTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chrX 13628862 5' - roo 9045 1 67.13 GGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3L 12873070 5' - hobo 2909 1 54.74 TGCCACGTAGTGAGGGGCCCAATGGGCACAGAATGCAAGCTTATCGATCCTTATCCACTGTTGTTTGTTGTTGTCCATGTGCCGACTCTGCAAGGGGAACACTTGGATCCTTAAAATAGCATTAAAGATTAGTGCTATAT:1 + chr3L 23213624 5' - Helena 68 1 66.43 ATTCAGACAGGAAATCTAAGGCAAATATTGAGAATCAATTTAGCAGAGGTCCCTTTCGGAGGAAGTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAA:1 + chr3R 31264432 5' - BS 5034 1 55.48 TTACCAACAGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3R 24084903 5' - roo 9028 1 54.79 GGAAACGGGCGTTTCGAGGGGCCAATATTTGCGACCCAGCGAGAAGCGTTGCATCTTATTTTTCTTTTTTTATTTTATTTTCCTTTTTTTTTTTG:1 - chr3L 11031076 5' - Doc2-element 250 1 77.89 TTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAA:1 + chr3R 16630294 5' + FB 70 1 76.00 GCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACG:1 - chrX 20330600 5' + P-element 53 1 39.34 TGCAGCTCGGTATCAAGGAGGATTTCTCGACTTAAACTTGGTGGCACGCTTTTGCTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAAGAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr2R 5963842 5' - roo 325 2 54.81 CATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGG:1 - chr3L 17748431 5' + Doc 463 1 67.42 AAAGCAAGAATTTGACTATCAGGGGCAAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGACTCGATGCAGGTAACTT:1 + chr4 880277 5' - pogo 2063 1 58.99 AAAAAGTAAGAAGTTTTTTTGGACCGATTCAATGCGGTCCGAGTGGACTGCGTATTGTGGAATCCAAGAGCAAAGACCCTAGAAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTTGCTCTAG:1 + chr2R 2007459 5' + 1360 53 1 48.92 GGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 5870798 5' - roo 347 2 58.22 GCAGCCTGTAAATTAAAGATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr3L 7024395 5' + 412 11 2 76.71 GGCATATGCAGACGTGTTTATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 + chr3L 17268212 5' - hobo 2908 1 62.76 GTTCCCACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTT:1 + chr2R 12492391 5' - hopper2 1567 2 54.79 TACATAAATACATATATTTATATACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2R 8189383 5' + roo 43 2 53.33 ATTTAAATTTTAATTTTTTAATTTAATATAATAATTTTCTTTTATTATCATACATACATGTACATATGTACATATATTGTAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGTTTCCCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGGAGTTGTTTTTG:1 + chr2L 8904464 5' + Cr1a 245 1 76.71 AATGATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTC:1 - chr2L 10536576 5' - flea 4954 1 60.96 AAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTG:1 - chr3R 10736142 5' + McClintock 5993 2 54.68 AAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACCCGCGGCCT:1 + chr2R 4730085 5' + gypsy8 323 1 78.99 GCCATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGC:1 - chrX 15198102 5' - Max-element 269 2 63.10 AATAGACGGAAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - 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chrX 1819117 5' + Osvaldo 1522 1 66.28 TCATCCTGCACACTCACCTCAGAACTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr2L 16884927 5' - pogo 2061 1 56.85 TACTGTCGATTGACAGCTTATTTGCTAGAATAATTGCTTCCATTTAAGAAAAAGTCGATTTAAATCAAGCGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTC:1 + chr2L 17269099 5' + gypsy6 20 2 65.83 GCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr2L 14056685 5' - pogo 2039 1 69.47 AATTTATTTAGCATTTTTATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 29627857 5' - roo 9011 2 64.44 AACATTATTACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGC:1 - chrX 23182957 5' + Idefix 11 2 65.07 GAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATG:1 - chr2R 23094973 5' + 412 57 2 56.85 GATATAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGAC:1 + chrX 13090995 5' - P-element 2868 1 71.23 TACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2R 9453361 5' + roo 45 2 66.09 TGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTCAGAGTCTCC:1 - chr3L 25232918 5' + GATE 8302 2 57.04 CAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGC:1 + chr2L 8284390 5' + Doc 441 1 76.42 AGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTT:1 - chrX 8839396 5' + Tabor 51 2 50.00 CAAATCGGAAATCCAAGCAAAGTTTCCCTCACCCATCAAATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCC:1 - chrX 684884 5' + jockey 4746 1 69.78 ATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 + chr2R 7314661 5' + blood 7102 2 77.40 AGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 9750271 5' + opus 152 4 57.24 AATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 - chr2L 544906 5' + Doc 80 1 73.29 TGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 17243230 5' - hopper 1370 1 52.74 ACGAGAAACAAGGTTTTAAAAGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTT:1 - chr3R 29288836 5' + BS 5001 1 77.24 TCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3R 25158672 5' + 1360 59 1 63.16 GATGAAATTCCCAACTCATTAAAAGGCAATTTCTCTCCATTATACGCAGGGCAGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 12873123 5' - hobo 2921 1 72.79 AATAATTCTAAACTCTCTTCTCTATAAATCTGTTATTGTTCAGCAAGTATTTTATTTTCCTGGAAAACTATTAAAATATACCTACAAAGCGAATATATCGTATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 + chr3R 17531737 5' + 297 15 2 52.41 AGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chrX 2300632 5' - P-element 2794 1 17.36 AATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr3L 414959 5' + 412 45 2 55.48 AATTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2R 14884083 5' - roo 9011 2 58.90 ACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAACAATTATATTTAGGATTTTGTTAG:1 - 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chrX 20999594 5' + BS 53 1 58.62 TTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAAAACATTAACCCTTACGTGGA:1 - chr3L 1463692 5' + P-element 121 1 13.70 AATTGATTATCGCTCTTTGGTTGGCTGAATAATTGTGTTTCGGTACTCAGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chr3R 12519566 5' + roo 8695 2 62.33 TATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 + chrX 6538650 5' + pogo 59 1 60.69 AAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGCTGCTAATTGAACTGAACT:1 + chr3R 23644876 5' + diver 5956 2 61.70 TAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATT:1 - chr2L 21683469 5' + pogo 80 1 77.24 AGCCCGTTTCTCTTAATTTTGGCCCGCAGACGTAACTCTTTTATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr2R 10977255 5' - roo 9059 1 74.48 GTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3L 2317258 5' + 412 35 2 60.27 CCTCAGAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chr2R 15392530 5' - mdg1 7399 2 62.96 TATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACCCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACG:1 + chr3R 21925133 5' + hobo 57 1 73.08 TAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr2R 16274554 5' - roo 9020 2 60.48 GAGGGGGGGGAGGGCGGCGGACGCATTTGCATGTGAAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTGCTGAAACTTAAAAA:1 + chr2L 2505717 5' + Tirant 336 2 63.28 TAGTATGCACACATATCAGTTTATCACTGTACCTGTATATATATATTCATAGCATACAAGCACATTGTAGCAAGTTTATACGTAATACAAAGCACCCACGTGCCTATATATAAATTATAAGGTTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTT:1 - chr3R 1296172 5' - gypsy 7435 2 75.34 CTACAATACAATAAATGTATTAATTATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 + chr3L 18074043 5' - 297 381 2 75.00 AACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACA:1 - chr3R 10148838 5' + 17.6 47 1 54.79 CTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2R 18886963 5' - roo 9018 2 58.70 CTCGCTGAAATTCATGCAACAGAATTTAACTTTTACATTTTTCTGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAG:1 - chr2R 9007118 5' - jockey 4907 1 78.08 AAAAAATAATTATAATTTTTTTAAAAATGACTACATATATTACGTCATTTCTTTAAAAAGGGAGGTGTCGTGTATCTACCCTCAATATGTAAGTAAGTAATATGTAAAGTAGAGTTAATATGTAAGTAAGCAA:1 + chr3L 2695345 5' + Stalker3T 65 1 70.68 GGCGAAGAATAAAAAAATCCCATATAAAACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCGTCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATAT:1 + chr3L 23496605 5' + blood 7149 2 41.43 AAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTT:1 - chr2R 6526611 5' - jockey2 3329 1 59.31 GTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 - chrX 8839362 5' + Tabor 79 2 72.14 GCTTGCGGCTGTTTTCTCATTATTTAATTTTACATATTTATGCACACTTGCGGCGACTTGTTTACGACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3R 11756844 5' + Tirant 15 2 67.62 TGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCC:1 - chr3L 13779417 5' + I-element 48 1 58.52 AGTAATGGAGAACAGATATCCCAGCATGCAGAGTTGCAGAGATGAAACACGAAGGTAGTGAGATTTTTCAGGGGCAGGAATAAAATGGAAATGATTCTGGGTGGGATAAAGGATCTCCAACGAGCAGCAGCTCTCTCTCTCTCTCT:1 - chr2R 11251309 5' + blood 7174 2 71.23 TCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3R 20905055 5' + roo 8731 2 66.21 CTTAAATGCGCACACATGCACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGT:1 - chr2R 10582527 5' + Juan 3808 1 76.03 CAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2R 7314615 5' + blood 45 2 50.68 TGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATT:1 + chr3R 25597849 5' + copia 76 2 72.60 TGCTTTCTTTTTGCTCTGGCTCAAAGCAAATTAATGATTTGCCATCAAGCAAATAAATCAAAAGCTTCAAAGCAGATCTCTGGCTTAGCGCGCTGCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 + chr3L 22330894 5' - hopper 1392 1 69.86 AACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3L 27391401 5' - 1360 3344 1 50.68 CGTGCTCCATCTTAAGTTACAATCTGAGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr3R 29680181 5' + 412 7093 2 57.24 AGAAACGGCTCAACGGAAGATCATGATCATTGCATCTACTCCGGTGTCTCCAAAAGTGAGTGGGTGGGTTAGTGGTACTTGGGTGATTGGGTGAGTCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 20753021 5' + 1360 23 1 66.90 GCGGTGGTTTATTTGATAGTTTTTTTTTTTAATGA:1 - chrX 5332408 5' - Doc 4591 1 71.43 CTGGATTATGAAGCACATTATAAGAAAATATTGGGAATATATTAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGCCACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr2L 12158911 5' + 1360 10 2 65.22 GTGTGGTTTTTGGCACTCANCATATTATTTCTTATTTCTTTGGACAGTGCTAATTATGTGAATTAAAGAAAACGAGTTAAATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGA:1 + chr3L 23607976 5' + Bica 272 1 62.33 GCCAACAAAGGCAACGACAGTAGGGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 - chr2L 18219446 5' + copia 4887 2 72.41 CGTTTATGGCGCACAACTTGTTTTTGTCTTCGCCCGTGTAATGTGACTAATTGGAACTGCAGTCGCCAGCATAATTAGTTCCCAATCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTA:1 - chr3L 416611 5' - 412 441 2 60.71 ATAAAAGTTTACTTTGATTAAAGTTCGATCTAAAGTCACAATATACACAAAGTAAGCTGAGATACCAAAATATTTGTAAACCAGGGGCGTGACAACTTAAAATGGAGGGGGGCTAGATATTCAGATAACAAAGTTAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 10548956 5' + gypsy2 424 1 55.48 CAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGGGAGCGTGATATA:1 - 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chr3R 25860617 5' - hobo 2921 1 73.29 AATAAAATTATGAGAAAATATCAACAATTTTTTTTTTAATTTTATATAAATATGCACTTTCTCTTACATCTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATCAGAAGGGGGATCGCCTTCGCCAC:1 + chrY 1803444 5' + invader4 350 1 52.82 AAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGA:1 + chr2L 8284378 5' + Doc 409 1 60.19 GGAAAAGACCATAAATTCTGAGAGCAATTTTAAGAATATCAGTAACCTTATAAAGTTTGTTCGACAACATAGTAAGTGGCGATGACCGACGCTTCTAATCTTCCAAAATCGACTAACTTAAGTATAGCAAGAGTTCTTATCTCTAA:1 + chr2R 15202336 5' - Burdock 105 2 52.74 CTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr3L 7751108 5' - 412 7468 2 70.34 CAAAAACGAGAGAGCTGAAGCTTCTCAGTCTCGCACATTTCGCCGCGAGCTTTTACCATGTTACACACTTCTCTGGCATTTTCTCGGTTTCTCCCATGATGAAATAACATAAGCTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chr2L 310186 5' + P-element 31 1 65.07 CCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTATCTCGAATTTTT:1 + chr3L 25272552 5' + 1360 81 1 74.29 CAACACGCCCCATAACCTTGCAGTCGACATTATTTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAATGAAGACTCAAGAGACA:1 + chr2L 14883359 5' + jockey 4740 1 70.99 GCCGTTCGCAGCGGGCAAAAACAATTGCGGTGCCGTTTTTTACGCCCTCACTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 2057758 5' + 412 16 2 74.48 ATTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAGTTTGTTATC:1 - chrX 17792593 5' + roo 8751 2 78.08 CATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAACGGTGCTCCAAGTGTGGA:1 - chr3R 15727979 5' - 1731 304 1 71.72 TTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGTG:1 - chr3R 3268041 5' + mariner2 137 1 73.28 GGCAGCTGGTGGCCAGGTGCTTTCAGGGCATTCCACGTGATTCCGGGTGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATCCTCTAACATCTTGTG:1 + chr3R 12613719 5' + HMS-Beagle 6812 2 74.48 TGATTGTGTCTGTGTGAGTGTGTGACTGACCTATCTCAATGCAATTTTGCTTGCCCGCTGCACCACAAACACACACGCACGCACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTA:1 + chr3L 17500695 5' - Tirant 364 2 61.38 TGATTCAGTAGTAATCGTACTTAACGTCAAAAAAATAAATAATAAGCATCGATAACAATAATTTTATAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 5193417 5' + roo 8696 2 57.60 AGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3L 13057426 5' + 412 7112 2 71.43 AATGTCAACAATAAAACAAAAACAAACGCGCAACACATATGGCACATGATTCGATTTTATTAAATGGTCAATTCATAAATTAAGAAACACTTTATTAAACGGAATGTATTGATTTCTTGATCACACTATATATTTTTAAAAATCAA:1 + chr3L 5921471 5' + TART-C 11032 1 81.51 CAACAAGTTGAGCTCACGACAACTCTGACCGTTCTCTCACACACACATAGGGAAACACGTTCGCATATCATATCTGTGTGTGTGTGTGCGCAAATCAGATACTTACAAAATCACATAAAACACCGTATTGATTCGGGTGCGCACAC:1 + chrX 978705 5' - hobo 141 1 78.77 TAGCCGAGATCGCGTAACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCGGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chr2L 14616166 5' + P-element 32 1 56.30 GTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 - chr2R 17350569 5' + F-element 99 1 77.70 CGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTTAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 18832358 5' - roo 355 2 58.14 CTCTCCACCATCGCTGATCTCCACTGCTTTTTCAATCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGG:1 + chrX 3811614 5' + P-element 84 1 28.08 ATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGCTACCACCCCCCCCCCTAAACCCCCACGCC:1 + chr3L 18183081 5' + Tirant 13 2 67.68 ATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTG:1 - chr3R 12376488 5' + HMS-Beagle 80 2 77.14 CTTACCTCTATTACGGCCAAAACGAACGAACCGAATACGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chrX 15191448 5' - hobo 2918 1 50.00 ATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATG:1 + chr3R 3617312 5' - micropia 5127 2 73.79 CAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCGAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2R 14415552 5' + 297 44 2 55.48 AAAAAATATCAACACATTTTCCAAAAGTGTGGGTGTGGTAGTTTTTGCAGCTTGTGGGCGTAGCAACATGGTTCAGCAAACTTGCGCTACGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAATCTTATAGCTTTTATAGTTCC:1 - chr2R 5466806 5' - INE-1 157 1 71.92 TAAATTAATTTTATTTTACAAATTAACAGTAATTGCATTTGTTAACAGAGTCTATTATTATTTAATTAATTTAGTTTATTATATAGATTAAATATGGTTAAATCATCTGTTGCAATTCAATTGTTTTATTTAACTAAATTATACA:1 + chr2L 16366869 5' - Bari2 370 1 53.79 CTTCACTTATTTTTATTAAAAAGTGGGTTTGTACAAAGACACTAGAATGAGAAGATACGGAACGACCATACATTGGTTTGGCTGCATAGTGCCAAACAAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTAG:1 - chr2R 527893 5' - 1360 1 2 57.55 AGGTGCATCAGAAGTTCAACGATTGGATTAGCCAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 10461098 5' - roo 389 2 71.53 TCAATTGGAAGAGGGCTCCGTTAGTTGTTGGTTTCCAGTTCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAAC:1 - chr2L 14616276 5' - P-element 2857 1 59.20 TGGCCCCGCTTTCAGTGAGCCAAATATGCAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chrX 18673682 5' + roo 64 2 76.67 CAATTTCACAGACAGAGGGCCATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGT:1 - chr3L 19944650 5' - accord 7039 2 71.62 TGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAA:1 - chr2R 14532052 5' - invader4 254 2 68.53 CATTTACTTGGATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGTATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr3R 24480420 5' + blood 7035 2 67.81 TATATATTATCAAGATTTTCAAATATTTTAATTATTACAATAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:2 + chr2R 9453292 5' - roo 330 2 72.60 GCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTT:1 + chr3R 12948602 5' + Stalker4 7015 4 56.64 GCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCAC:1 + chr2L 7633372 5' + Max-element 53 2 64.00 GATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 + chr3R 25798365 5' - hopper 1357 1 56.16 CTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr2L 20852518 5' + Tirant 62 2 73.55 AACTCAATTTGCTGGGCCAAATAAAGTACACTGGGCAAATGGCGTGGGGAAACGAAAGGTATAGAAAATTATTGCTCAACGGAAAACAATTATTTTGTGCCGACTCTCTCTCTTTTTTCTCTTGCCATTTTTTTTGTTTTGTTTTT:2 + chrX 8977823 5' + hopper 141 1 76.03 CAACAAGACACAACCATGGAAGTCACCTAAGCACTTATTTTGTTTCGATTAGAAGTAGGAGGATAATCGGGCTAGCAAGCCGACTGTCAAGTGGCCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 + chr2R 13852767 5' + 412 24 2 67.59 TGGTTGACTTTAATAGGGTTTTCCATTATTTCATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACACGTCCGT:1 + chr3L 13057314 5' - 412 7532 2 73.33 CACAAACTAACTAGTGTAAATGTGTAATTGTAAGACCAATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chr3R 4962898 5' + jockey 71 1 58.22 CAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 + chr2L 14262957 5' - P-element 2816 1 36.99 GAGCCAAATAAAAGTTGGTAGCCACAAATACTAATACCAAATAATACGAATTAAGTGAATCGAAAAGCCAGTACCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr3L 9397599 5' - 1360 3346 1 53.42 TTTTGTAGACAGGAATGTGATCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATTTTTATTAG:1 - chr3R 7049496 5' - Burdock 239 2 72.14 TGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chr3R 17243246 5' - hopper 1385 1 63.70 TGATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 23095014 5' + 412 15 2 73.10 GGGAACGAAACTCGTTCCATGTGGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 + chr2R 6236087 5' - P-element 2808 1 23.08 CATGGAAATCCTGCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3L 2966543 5' - roo 9007 2 60.96 ATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTTAGAGGGTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGT:1 - chr3R 20887533 5' - Doc 4649 1 64.14 GGATTTCATAGGTAAATTACCTAAAAATAGTGGAGAGATCTCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr2R 17269068 5' - roo 396 1 73.13 GGATAGGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chr3L 12890436 5' - hobo 2935 1 80.47 AAAAATCTTTGAAAAAATATGTTCTCCAAGCAGGCAACAGTAAATAGCAATTAGCTACAGAGTTTTCAGAGTCTCATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTC:1 - chr2R 19804856 5' - F-element 237 1 53.73 TTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 12519688 5' - roo 9003 2 67.59 GATCAGAGCGGAGCGAAAAGCGTTCTTTGTGGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAAC:1 - chr3R 19134460 5' + transib2 89 1 79.45 TTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2L 11617769 5' + 412 7125 2 71.01 AATTGGATTTAATTTAAGAATATGTTCAATGTATAACTTGGAAAGTTGTTAAGATCTTTAATTTGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTG:1 + chr2L 7924511 5' - F-element 4329 1 58.22 GTGCGCATGCGCGCACGCTGCAAAAGCTCAGGATTGGCTCTCTGCAAATGACACTTGTTGCATGTCCCAAAGTTAAAACGTATTTTAGTGAAAAGTATTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTA:1 + chrX 17048117 5' - jockey 4974 1 63.70 ATGAGCAGGGCTGCTTCGATGGAAATACATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr2L 5728828 5' - roo 9039 1 63.01 ACAAAACACAGAGAAATATGTATATGAATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGAC:1 - chr3R 26180555 5' - Transpac 5211 2 70.50 TGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:1 - chr3R 12613861 5' - HMS-Beagle 182 2 62.07 TGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATACGCAT:1 + chr3L 24272063 5' + gypsy11 4052 2 56.16 AAGCCGATATCTCCTTGCATTAATTTCATATTTCCGAAAACTGGGTTATAACAAAGACCCTAGAATAACTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGCGAATTTTAAAAAATTTTTTTATTTTATCATATTGCTAGGAAATTGGCAAAA:1 + chr2R 8436237 5' + 1360 3118 1 53.10 TTTTGCCAACGTGATATTTCAATAAGCCACGAGCTTATCGACCATATGTTCGGGTGATTTTTGGCCGGATAGTATGGTGGTAAAAGAGTTCGAAGCTAAGATAAATGTTGTAATCTATAATTTATATTTCCTTTC:1 + chr3L 23909056 5' - copia 247 1 77.78 AGGAAAATCAGCGAGAGCAGCACTTCGCAAAAGAGCAAGGTGAGTAGGGTTCGGGTGGAATGTGGTGGGAACGAAACTCGTTCCATGTGGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chr2R 6236021 5' - P-element 2858 1 65.75 GATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:2 - chr3R 10737077 5' + F-element 56 1 51.37 AGAAAGTCCCGCCCATTCCGGCCCCACTTTCCCCCATGCCACGTAAGGAGGAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCTGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr3R 6584742 5' - transib2 2807 1 68.66 AAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATT:1 - chr2R 19108559 5' + jockey 114 1 61.64 GCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr3L 6131917 5' + roo 74 2 70.55 ATTATGCTTGTAAAGCCTCGAGCATCAAACTTTGATAAAAAAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAG:1 + chr3R 23644836 5' + diver 27 2 65.22 CATACTTTTCGAAAAAGTTGAAAATATACATCAGCTTCATATATAATTAATATAACTGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGGAAATCGAAGTTATCGA:1 + chr3L 7787479 5' + flea 4825 1 68.49 GACTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 + chr3L 18846929 5' - 1360 3371 1 67.72 CTTTATATAGCGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACG:1 + chr3R 5164920 5' - invader4 266 2 57.53 TTTGCGACTTTTAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTG:1 + chr3R 17259510 5' - roo 9051 2 62.73 TGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 18886956 5' - roo 9017 2 56.16 TTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2L 3893057 5' + 1360 65 1 73.85 CTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 + chr2L 2544753 5' + blood 68 2 65.47 AAAGCCTTTAAACATCCATCTACCCTTTTGTTCGCCGCGCGGTGCAGGGGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chrX 609500 5' + 1360 9 2 76.74 TTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATC:1 - chr2L 11867397 5' + BS 29 1 50.00 TTAGGTTGGATAAATATTTCCCAATTGCAACATACTAGCTAGAGTACAATGGTATATAGTATTTAAGTGTACTGCTTATATTTTTTTTCAGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTT:1 + chrX 10179378 5' + roo 32 2 60.96 GCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAATCTC:1 - chr4 829127 5' - INE-1 148 1 67.12 TTGGGTATTTCCAATTGACGCTGCTTTTTGTTTATGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 + chr3R 26242480 5' + roo 8748 2 78.32 GATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr2R 9453373 5' + roo 39 2 57.85 AGCTCCGGTGGCAACAATTAAAATATTAGTTTGTTTATTCATCAAGCAATCTATAACGATAACTGACTGTTGCTATACTTTCGCATTAATCAGGGCAATTATATAAAGTATTCTTAATTTGTGACCGAACGACTGCTGCTGAGAAC:1 + chr2L 9384321 5' - flea 160 1 68.49 GGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAA:1 - chr2R 17350624 5' + F-element 38 1 66.17 TCTTGGCCTTCATTAGCCTCATCGTCACTCCAGATCTCCAGTCTTAACCCCATCAAGACCGTTCAAAAGTATCTCCACTGAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGAAACGTTAATTGTTATAAAATCCTACG:1 + chr3R 30573643 5' + mdg3 5199 1 62.76 TTAACAGGTACTTTAAATTGTGTTTTGATTTTAATCAGATACATTTCTGACCATCTGCAAGTTTATACTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAA:1 - chr2L 20016457 5' + I-element 203 1 54.01 TTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chr2L 10536443 5' + flea 30 2 60.96 CCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr2R 12462216 5' + roo 8736 2 68.49 TTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3L 19580006 5' + jockey 90 1 73.10 CGTAATCCATAATTTAGTAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCC:1 - chr3L 22257852 5' - mdg3 5450 2 54.07 CCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 + chr2L 15874847 5' - mdg1 7399 2 59.59 ATGCTAAGCTTCGTGCTTTCTTTTTGCTCTGGCTCAAAGCAAATTAATGATTTGCCATCAAGCAAATAAATCAAAAGCTTCAAAGCAGATCTCTGGCTTAGCGCGCTGCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3L 22330881 5' + hopper 10 2 78.77 TTATATTTTGTACAACGAGGAGAAGCTCATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 + chr3L 2907263 5' + 412 7088 2 60.96 AAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr3L 2907297 5' + 412 62 2 67.63 CTAAAACATAGCCCACTCGCATCAATAAATATGCAAGTAGTTAAAGTTAACTACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 12462279 5' + roo 9 2 76.71 CGTTTTTTTGTGGCGGTTATTTTTTTTAACGATTACTCACGGTTTTTTTTTTTGCCCAAAAAGGCCCAACGACAATTGTTTTCTTATTCTTTTTTTTTGT:1 + chr3L 6996591 5' - gypsy7 5005 1 55.00 CACTCACTTGGCTGGGCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:1 - chr3R 22647948 5' - transib2 2792 1 60.71 AAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTC:1 + chr3R 19514235 5' - blood 7324 1 61.64 AATTGGATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTG:1 - chrX 20149271 5' - pogo 2088 1 73.13 TTTGTAAAAATATTTATATTGATATGAAACTACATATATATTGAAAGTATAAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 14978555 5' - hobo 2909 1 53.77 CTTCATTTGGGTCGTGCGCAAATCAGACTCCCACTGCGGCTCCCTTATTCATGGTTATACATATATAGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 11153232 5' + roo 53 2 54.79 TTTATAAAAATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 - chr3L 17500820 5' + Tirant 8168 2 61.97 TTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chrX 21639404 5' + 412 70 2 65.75 GCAGCACTTAATTCATGGCAATGCTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chrX 16547438 5' - P-element 2856 1 62.68 ATAACCCGAAACGATTTAGAATCAGTTAGCCTAATTATTGCAAGCTTTAAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACA:1 - chr2R 15199240 5' - Burdock 6356 2 61.11 TATTAGCTTTACAATTTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCA:1 - chr2R 13256056 5' + 17.6 61 1 70.55 TCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chr2L 14262932 5' - P-element 2841 1 52.74 ACATGAATACAACTACTTGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3L 27349981 5' + 297 6602 2 62.88 CGGAAACAGTGGCCTTTAAGATACCCTCTTGTAAAAGAAAAGTAATAGTTTATAGGTTATTATAATGAAAGCTGATTCTTAAGAAATTCTTTTATTCTCAGGAGCAATAATACTTTGATTTAATTCATTGATTTTAAAAATCTGA:1 + chr3R 20900520 5' + gypsy12 9795 2 73.10 CACATCAAGTATTCGTTTATTTTTGTACATTGTTCCTAAGAAATTCTTAAGAATTTTTGTGTTCTGTTAAATAATATATATATTATACGTACTTCAACTCATACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTAT:1 + chr3R 7582934 5' - Stalker2 252 2 72.14 ATCGTGTCAAGTGGGTTGTCGCATATTGTTTGTTTAGTGGCGCACCTGAAGTCGGCCGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 + chrX 15197989 5' + Max-element 8251 2 73.97 GGATGGCCATTTTTATATAATTTATATTTTTGGACCCATCAAATTAACCATAACAAACAGCAAATAAAAGGGTATCTTTTTATTTATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATG:1 - chr3L 19951299 5' - Ivk 5339 1 56.16 AGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAA:1 - chr2L 15420126 5' + Burdock 6161 2 46.43 AAACTAATTAACCACTTGACTTCATATCACTTTTCACAGCCCACAAGAGTAGGCAACAAATTTTAGGTTCTTTATGTTAAACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCA:1 - chr2R 17207862 5' - jockey 4963 1 52.74 GTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGC:1 + chr2L 23295814 5' - micropia 5404 2 70.59 ATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr3L 27391416 5' - 1360 3376 1 68.22 AGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3L 2167694 5' + opus 7143 4 57.14 TGTACAATGTTTGAGTCTCTTAAAAAACGGATTCCCTTTTTCAATTCCTCGCTCTCGTGCACCCACATAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAACTTCTTCT:1 - chrX 547760 5' - jockey 4550 1 53.24 AATTTTTAAAAATTATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGACAAGAACTAGCGTAATATGTAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCG:1 - chr3L 14971176 5' + gypsy10 5679 2 53.23 ATGATTGTGCGTTTGCCATTGTCCACTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTATTCCGCATCCACAATTTAT:1 + chr2L 13899399 5' - TAHRE 10389 1 67.38 GTTATAAATGGAAAATATATATAAGCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3R 6685856 5' + 412 33 2 61.43 ATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 20061361 5' - roo 331 2 74.81 TATTGATAATTAAAAAGAATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3R 12519729 5' - roo 396 1 73.85 TATCCCTATTCGCTGAGAGACTTTTTCACTTATACTATTACAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAA:1 - chr2R 5303200 5' - FB 243 1 76.71 AGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGAAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTACCAACTGTTGTTCGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTAT:1 - chr3R 15727947 5' - 1731 4602 1 56.69 CACATTAATAAGTACTTACTGTAATTGTCGTACAAAAAATTTTAAAATGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr2L 388658 5' - roo 9049 2 68.49 AACGGTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 - chr2R 21713324 5' - P-element 2818 1 35.17 TAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCC:1 - chr2L 18219415 5' + copia 4919 2 52.74 AGATAAGGCGCACTGCGATCAGGAAACATTTGCGACGCCAGTATTTCAGAAGAACTGAATCTTAAAATAAAGCTAATCGTAAACTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATC:1 - chr2R 9744250 5' + opus 436 2 65.07 GGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACA:1 - chr2R 5621024 5' + ZAM 49 2 56.25 CTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATCTCTTCGGTTTAAATAGGGGACATGAGAATCGCA:1 - chr3L 10897521 5' - roo 8992 2 69.86 TTTGTGGTTATGCGCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 860748 5' + hobo 25 1 65.07 AATCTGGTTGATACGTCTAATTAATAATGTTTCCGGTTCGTTTAGTGTTGTTTTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAA:1 - chr3R 13339101 5' - BS 5027 1 62.07 TTCTCGTCGTTAGCTAAACACAGTGAGAAGCGCAAAGAGAGGCGTTGATATCTGATTGTTCAAGAAATTCTCGAATGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr3R 8197755 5' + pogo 38 1 57.04 CCAGAACGTGTGTTTAATGGCACTATATCAACTATATATAGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 10897396 5' + roo 17 2 73.79 ATATTCTAGTATAAGCGTAACATAAAAATAGTTTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGA:1 + chrX 3666475 5' - roo 9046 1 70.14 GGTTGCCCAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCGCTTCGTCAGTACTCA:1 + chr2L 15085607 5' + opus 18 2 65.83 AAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTC:1 + chr2L 8284316 5' + Doc 388 1 72.92 GATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:2 - chr2R 23095013 5' + 412 7070 2 71.92 AGGATCTTCAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGACTA:1 + chr3L 9635282 5' + Doc 36 1 47.14 GAGGGCTAGGAATAGAAAAATATTAAATGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 + chr3R 16475365 5' + mdg3 5329 2 76.92 ATGGGAATTCCTTGGTCATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGA:1 - chrX 2956309 5' + copia 4908 2 58.90 GATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACAGATCTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 5027164 5' - roo 358 2 49.66 ATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 + chrX 6538667 5' + pogo 77 1 71.23 AAGGATGCGGATTAAATTAATGTGGGGAAACAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGC:1 - chr3L 21764480 5' + hobo 40 1 58.90 ATGGCCATTTGTTGGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGT:1 + chr2L 5207424 5' + opus 7039 4 53.85 TCGCAAAAAGCTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chr3R 6419985 5' + Tabor 10 2 69.18 CGCTTTCCTCTGCTTGGCTGGACTTTGCTGCCGCTATAAATTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAA:1 - chr3R 15668244 5' - G2 3054 1 67.92 ATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTT:1 + chr3L 2907291 5' + 412 7104 2 61.94 GTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATA:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3373 1 67.81 GGGCGCATTTATCGTGTCAAGTGGGTTGTCGCATATTGTTTGTTTAGTGGCGCACCTGAAGTCGGCCGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGT:1 + chrX 15197979 5' + Max-element 6 2 80.82 TCTGAATCTCAAACGAAGTAACAATCCATTTTGATAGTACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAATAAATATTTTCAATATATTTGTTTGTAACTCATTGTTTACTTAAAGCAAAATTGTTTAATAATTTTAGTAAATAGGTAGA:1 - chr4 347744 5' - Tc1-2 1538 1 75.34 CATTGCAGTGTGGTTGTTCCAAAGGATCGCACAAGTGGCAATTTGGATCAGCCAGGCATTTGACTTGATCTGAAAGTGATTATGATGGTTAAGAGTGAAAAATAGCTGAATCAACCGAAAACTTAACCAAAAAAAAAAGGAAAATA:1 + chr2R 21832893 5' + Doc2-element 248 1 52.05 GTTAAGTTAACCAGCTATACAAAATTCAGCAAGAAGGCAAAGTAAACAAAACTGAATAATATGATTAATGAGTTTAAGATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chrX 8590816 5' + pogo 41 1 57.53 ACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGGCTCATCCATATTATTTAT:1 - chr2R 14532083 5' - invader4 311 2 70.09 AATGCCAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAACGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 5870904 5' + roo 56 2 58.90 GGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATT:1 + chr3L 25232768 5' - accord2 7554 2 67.12 TTTGCAGAATTGTCTACTTAAGTTTGACAATTTCAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGAC:1 - chr3L 18549780 5' + X-element 67 1 69.91 ATAGAATTCAGTTATGTTTAGCCACGTAATCTGCATACTTTTCACCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 - chrX 17048227 5' + jockey 90 1 71.72 CAATTGCAGTGCAGGGCGAGTGGGCCAAGGGAAGTCTGCTCACCGGGGAAATGTCTGAATGTCTGGCGCACCGCACGTAGTCTTTAAACAGGGTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 - chr2R 16372080 5' - 412 7522 2 64.83 GAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 13628809 5' - roo 350 2 67.77 CAGAAATGCTCCGCACACTNACACTCGCACAGCACAGCACAGCACACACACACACACACACTGATTCACTTTAAATCAATTTTTTTGGCGTTTTTCATTTCATTTTCCCTGTTGCGTATTGCACGCTCTCTCTCGCTCTCTCTT:1 + chr3R 30800202 5' + blood 7177 2 70.14 TTGTTATAAATGGAAAATATATATAAGCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3R 6685858 5' + 412 7090 2 60.27 TAACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2L 3893098 5' + 1360 38 1 56.25 GATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr3R 28438331 5' - mdg1 345 2 67.81 GAGGCCCCAGCGCGTCCAANAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chrX 8839375 5' + Tabor 72 2 64.38 TGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAAC:1 - chr3R 25796084 5' - BS 5025 1 59.31 TCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 - chr3R 25580824 5' - 1360 3322 1 82.61 ACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 17269128 5' - roo 323 2 76.03 TTATGGTGAATGAATTAATTGGACGTGAACTAATGTAAAGGCCACCACTGTATCAAATGTATATGATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAA:1 - chr3R 27547735 5' - 17.6 7358 2 57.53 AGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGT:1 + chr3R 24072014 5' + jockey 58 1 56.16 GTGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 - chr3R 20200476 5' + Transpac 73 2 68.97 GCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACCTTATTACA:1 - chr2R 10582438 5' + Juan 3897 1 79.45 TTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGTCGGCC:1 - chr3L 23456274 5' - 1360 3332 1 56.16 AATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr2R 8286813 5' + Burdock 24 2 61.19 ATTAGAGCATACTTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 + chr2R 14427116 5' + jockey 4802 1 56.85 CAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 + chr2R 20972671 5' + jockey 4745 1 66.44 GGTCCAGGTCAAAGGCAAGGGCGACATGGAGACCTACTGGCTGCTGGAGGGTCCCGAGGGCTAGGAATAGAAAAATATTAAATGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 + chr3R 16475310 5' + mdg3 5259 1 75.65 GGTAAATTACCTAAAAATAGTGGAGAGATCTCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2R 17269078 5' - roo 9037 1 61.64 GATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 26927388 5' - roo 337 2 67.81 TTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTG:1 - chr3R 23021007 5' + INE-1 578 1 43.15 ACTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTTGCAACGGCTAGCTCAGAGAGTGTGTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAG:1 + chr3L 27186406 5' + mdg1 66 2 62.07 CCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 22320480 5' - roo 8993 2 72.60 CTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3L 414843 5' - 412 7490 2 57.14 AAAGCCAAAAGGGGCTTGAAAAAATTAGCTTATTCTAATATGAGAGTATAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chrX 8469326 5' + hobo 34 1 62.33 ATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACACTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACCTGCATC:1 - chrX 21668400 5' - opus 494 2 52.52 CAGCTAGCGTGTGAGCGGGATGGCGACTGGCAGAAGAAGAAATTTAAACTGATAACAGCAAGCGAATGAGAGGGATGGCGAGTGGTGAAGCAGTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chr3L 5771017 5' + P-element 20 1 70.71 GTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chr3L 4547768 5' + mdg3 69 2 63.45 CTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chr2L 14262945 5' - P-element 2828 1 45.21 GATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr3R 12519684 5' - roo 334 2 70.55 GGAAACCAACCTTGCGCTTGTGTGGCTAAAAATGAACTGTACGGAAGAACGGAACGGTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGA:1 - chr2R 21713376 5' - P-element 2869 1 70.55 TGCGTAAAAATCACATTAGCGGCAGCCGTGCGACAATTTGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAGTTTT:1 + chr3R 25580727 5' + 1360 23 1 69.93 CATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTC:1 - chr2L 11475175 5' + jockey 143 1 53.23 TAACGCAGATTGTAAACCCGGCTTTTTCACTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATT:1 + chr2R 10582354 5' - Juan 4181 1 61.64 CTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAG:1 - chr2R 12185420 5' + accord 58 2 58.62 AACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCGTATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATT:1 - chr3R 10030794 5' + BS 5062 1 53.42 TCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr2R 12102026 5' - hopper 1406 2 61.70 TGCATAACCGNCAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGA:1 - chr3L 25206948 5' - HMS-Beagle 7017 2 67.81 ATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTA:1 + chr2R 12185304 5' - accord 7335 2 49.32 CCTTTCTGGTGGATGTGGAAACGGATCTTAGTAGTTTACTAGATGTTTGTTGACTTCAAAGTAATAAATATATCAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGA:1 - chr3R 29680321 5' - 412 451 2 54.79 TGCTAGTACTTACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTG:1 - chrX 20999642 5' + BS 5 1 75.86 ATTCTGGCAAAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAGAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGA:1 + chr2L 6618867 5' + 17.6 6955 1 61.64 TGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATATGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCATTGGTATATGAGAACAAGATACATCGAACGCGNCCTCAAGGTGCCCA:1 - chrX 20949715 5' + jockey 4595 1 49.32 GGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGC:1 + chr3R 3389429 5' + HMS-Beagle 83 2 75.34 TTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 + chr3R 23902200 5' + I-element 79 1 72.22 ATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAA:1 + chr3L 5027158 5' - roo 9027 1 53.42 AAAGTAATTCACTTTTATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 28438305 5' - mdg1 371 2 50.00 ATTTAGTTTACTTTATTTGGCGGTCACTTCACTCAAAACAATCGATTTTGTGCGGAGCTCGATAAAAAGGTCT:1 - chr3R 29359320 5' - F-element 34 1 89.04 GAAATGCTTTCTGGTCAGAGAGTATCACAAATGTAGACATGAAAGCTTATTTCAGTTTGAAAGCTTATTTAGTTTGAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAA:1 + chr2L 21876744 5' + X-element 58 1 47.95 CTCCGTATCTTAATCACTCAGGTCCTGGAACTTTAGTCCTTCTTTTGCAGGCGAAGATCGATTTTGTGGATCCCTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr2L 20227937 5' - 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jockey 4909 1 82.01 ACCAATTTCACCCACTAAACTCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3L 20680403 5' - 412 475 2 68.42 TATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr3L 14422819 5' - roo 9000 2 68.49 GGAAAAACTGTAGTTGCTTATAAATATTTGAATATTGTTAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTTGAAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAG:1 - chrX 19192473 5' + INE-1 17 1 79.86 ACAACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAAC:1 - chr3R 1446147 5' - 1360 3380 2 29.45 TGCCTCTGCTTCTGCACAACTGTTGAATTTTCCGCTGCCGCGACCAACAGCAGATGTTGGCGCTGTTAACTGTTATTTACTTTTGCGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAC:1 - chr2R 9376763 5' + hopper 13 2 71.65 CAGAGGAGCAGAGCTAAATTCTCTTTTATTGCAACAAATTAAGAGAGCCACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAAT:1 - chr3R 16475464 5' - mdg3 234 2 75.00 TCTCAGGCGGTGCGAAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTAT:1 + chr2R 9376620 5' - hopper2 1560 1 53.42 AGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGCATATTCGCGCCAC:1 - chr3R 10736139 5' + McClintock 33 2 57.03 AAAAATATAAACATAATATAATATTTTCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 8314542 5' - roo 349 2 60.96 CGAGCTGCTTAAGAATACAAGGGTGGTAATTGTTAAATGGTTTCATTTATTAGTAAAAATATAATTGTATTTGATTTGTATATTTAAGTATATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTA:1 + chr3L 22257718 5' + mdg3 19 2 71.11 TTCTCTTACATCTCGCGGAGACCGAACAAACGAAATGGATGAGACTCCTCTCTCGCCGACATCAGAAGTGGGATTGCCTTCGCCACAAGAGACCAGATCTGATCAGTATATGGCTGCGTTGGAGGCA:1 + chr2L 23299998 5' + invader4 391 1 81.89 TTTTTGGGAGTTTTCGGTTAGTTTCCGATAACGTTTAAAATGCCAATAGACCCAGCGATGAAAACGCCTCCTCCAGCACACCAGCGGGTTCTGGCACTCCATTCGAGGCCAGGGCAACCAGTTTCGCC:1 + chr3R 13474414 5' - R1A1-element 495 1 58.59 TGGACATATTTTGATTGCTTTTACAGTAGCAAATCTTTGAGATTATAAAATCCAACATGGTTAAGAACTAAAGATACTTCAGTCGTTTATCGTAACTCAATTATAACATTTACTTTGGGACCCCCTATTTATTTATATGTATTTTT:1 + chr3R 13061882 5' - S2 1605 1 62.33 ATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGA:1 - chr2L 4244964 5' - 412 7469 2 71.23 AAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATT:1 - chrX 18745406 5' + Juan 4105 1 69.86 CAGACATCTGGATCTGGAGCTTGAATGTGGCATATACATATATATTTCTATATGTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTT:1 + chr3R 28618360 5' - 412 7483 2 60.27 ACACGGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2R 21713271 5' + P-element 49 1 26.53 CTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTA:1 + chr2R 8966163 5' + BS 5073 1 69.18 TGTTATTTCAGATGTTTACATTCGGCGAGCACCGCTGGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 - chrX 2300659 5' - P-element 2828 1 36.50 TGCCACTGACTTCCGGGAGTTGAGCTACAGACGAGTAATTATGTTCCACCAGCCAGCTTAAGCGCACTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTCCACAATTATGCTAATTTGAAGTAT:1 - chr3R 27452090 5' - hopper 1367 1 52.05 TACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATAT:1 + chr3L 9324410 5' + HMS-Beagle2 17 2 72.03 ATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 - chr2L 4244976 5' - 412 7481 2 63.01 GATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTC:1 - chrX 14321911 5' + jockey 200 1 55.86 CTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGGCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chrX 20330533 5' - P-element 2812 1 35.17 GTTTTTATTTTCGGGGCTCGTTTCTATAAATACTACTCTTGGAATTACCAACCATACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 22750792 5' + 412 42 2 54.47 GATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCAC:1 - chr2R 12827083 5' + Burdock 23 2 63.33 ATTATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTACCAATAATAGCATCATA:1 + chrX 22641240 5' - Tc1 1637 1 22.60 AGCTTCTAAATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCT:1 - chr2R 5321235 5' - INE-1 515 1 70.59 TAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2R 6801717 5' + 297 6630 2 60.43 CAACCAAGCTTGTTTGCATACGCCGAAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGC:1 + chr2R 18933391 5' + blood 69 2 63.01 TTTTTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAG:1 - chrX 3555666 5' - transib2 2460 1 69.86 CCAGCTGTCCCACGGATTTCGAATTTTCAGGGTACTGTAATCGAGTGATATGCGTCATCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 + chr3R 31198550 5' - Transpac 5169 2 62.33 AATATATAATAAAATAAAACTGAACTTCAAGTGTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGTGCTCCTTGGTATATGAGAACAA:1 - chrX 2214353 5' + jockey 4565 1 77.14 AGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:2 + chr3L 13291946 5' + roo 39 2 53.42 TAATTATATATTCTGATATTACCTTTAATTCTGTGCGGTCCATTCAGTTAGTTGATGTCATAGCGGAGCGCTAGTGGTCCCATTCAAGAGGGACTACTGTAAAGTTTTGTCCCGACACAGTTCAGTCGCCATCATGCATTGGAATA:1 + chr2R 3933253 5' + mariner2 125 1 73.29 ATTTAAATGATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 - chr2R 12827091 5' + Burdock 6172 2 59.57 GTTTCAGCGCTCACGGCGCAGGAGTGGTAAAAGCGGGGAGTCCTCTCGCACACCGCAATTTATGCACAACCGACAGGCAAACACTGCGAAACAAACAAACAACCCACGCATACACACACACACACACATACGCAC:1 - chr2L 944325 5' + accord 187 2 77.04 GTATATATTCTTGTTCAGGATCAATCAATCGATCTGCCCGCTTCATTTTATTCCAAAATATCTATCGATATGCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCACTAGCTAAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 - chr4 559326 5' + INE-1 550 1 85.50 CAGCTGCCACTCGGCACTCACTTGGCTGGGCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGCGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr3R 22647962 5' - transib2 2816 1 76.15 TGCTGCACGAGTGTGGAAGTGAGACGGACTGCGAGAAAACGAGCAGGAAGGCAGATGTACAGCATGTGACACATAAACACAAAACACACTGTAAACGAGCTGTAGATGTGCAACAAAAAAAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 19205610 5' + G2 3077 4 63.70 GTTGTGGGCGAGGCAACATGTCTCTAGAATCTGTCTCGACTATTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCAC:1 - chr2R 6161775 5' - BS 5013 1 73.29 ACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 - chr2L 12236806 5' + jockey 78 1 76.00 GACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCA:1 - chr2R 14532050 5' - invader4 263 2 67.42 ATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 + chr2L 15085628 5' + opus 7023 2 57.43 ATCTCAAAAAATTCATCTATCTATTTCATGAATGCATTCTGCTGCATTCATTTTAAATCCGTTTTGAAAGTTTTTGACGGTTTTAAGGTGACAAGACGGTTTTTTTGTTAGTTTTGGCAGTCACAAACAAATAATACAAACCACAC:2 + chr3R 28349568 5' + Transib-N1_DM 225 1 47.26 CCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 17627572 5' + roo 8704 2 72.53 AACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr2L 14616181 5' + P-element 39 1 46.85 GCGGCGATGTAGCAGGAAGCACCCCCCAAATTAATATTTAAATTAACTATATTCTCAGTCCACACAAATTTCAACTCTCTCCATTCCATCCACACACACACACATATACACACGTACCGGCAGAAGCTCTCTCCCTCTCTCTCTC:1 - chrX 11982882 5' + blood 166 2 55.17 ATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACG:1 - chr3R 10144456 5' + Chimpo 56 1 60.00 GGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTCAGTCCTTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTCCCAATAAAGA:1 - chr3L 18183158 5' - Tirant 8417 2 76.71 ACACCCTGTACTGCAGACCTTTTCGATTTATTCATCCCCAATGTTTAAAGCTATATGTTAAATTAAATATGAGTTTATGCATGTAGTACATATGTACTTTATTAGTATCATAAGACTCAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTA:1 - chr2R 13939613 5' + G6 1974 1 76.71 ATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 + chr2R 15392543 5' - mdg1 337 2 74.66 TGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr2L 12236811 5' + jockey 93 1 75.86 GTAGTTAACATTACCAAAGTTGTCGTCCTTTAGAATTATTGGATTATATTTTCCTAGTCGTGTTTGAATTCATATGCCTTTAGTTTATTTTGTTGTTTCAGTTCAGACGCTTCAAATGATTATGTCGCCACCGATGCGTACGTTTT:1 - chr3L 26695593 5' - 3S18 6028 2 53.42 GTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 - chr3L 2317203 5' + 412 7113 2 74.14 CGAAAAAGAAAATCAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATA:1 - chrX 20949754 5' + jockey 4556 1 77.40 ACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 15148592 5' - roo 334 2 68.49 TCTGTTTAATAAGAAAAGGGAGGAAAGGAAATCCAACCATGCTTACATAATCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - 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chr2R 10565024 5' + Quasimodo 87 2 62.60 CTATTCCAGCTTTTAAATTTCAAAAAATTCGATTTTTCCGAACCCAGCTTCTTTGAGCTACTATGCGTCGATCCTCTATACCTGTTCATTTACGTATGGTTCTACGTTTTTCGGGCTTCCATTAATATTTAATGGCAGCGGATACC:1 + chr2R 1522958 5' - HB 464 1 79.45 TCCTTTTTCTCCTTTTGGCTAACGATGAAATGACTTAATAAAGAAGTTGTTTTGGACTTTTTGGTAATAGTAGGGTGGGAGTAAGATCAGCGGCAAAACGGAAATCGCACTGATTTTGAGAATAATCAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 855450 5' - blood 169 2 79.31 ATATGTTTATGCACTGCGGAAAAACATTGGAAAATCATACAATCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGATAAATAA:1 + chrX 7794377 5' - Circe 6980 1 60.27 CATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAA:1 - chr3L 20187419 5' - FB 473 1 52.41 AGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTG:1 - chr3R 10737068 5' + F-element 9 1 73.33 ACACTTCTCTGGCATTTTCTCGGTTTCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - 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P-element 2790 1 17.14 TACAATTATTGTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACACAGACACACAGATACCCAGTCCCTAATGGCTCACTCCAACACAATGCACTATGGGGCATTTGGCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTAGA:1 - chr2L 17574650 5' + hopper 35 1 40.00 GATGACGCCACCGATGGAAAAGCGAGGAAAACCAAATAGGAGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGT:1 - chr3L 2907372 5' - 412 7467 2 69.86 GTAGCCTGCAGCGCAGCGACGCTTATATACATACGTATCTTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGATAAACATATATGCCACGCAGGCTGGCCAGCACAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCG:1 - chr2R 2308825 5' + McClintock 46 2 71.23 ATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3L 13057439 5' + 412 7115 2 65.19 AAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGC:1 - chr3R 25597916 5' - copia 177 2 69.18 CAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2L 10461150 5' - roo 341 2 66.19 TTATTTTTCTAAGCAAACATAATAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCG:1 + chr2R 11574963 5' - INE-1 147 1 68.97 TAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTACGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGC:1 - chr2R 12185412 5' + accord 67 2 63.01 AAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGGTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr3R 24084879 5' - roo 9007 2 62.24 CGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAG:1 - chrX 21045274 5' + P-element 68 1 32.09 TAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTCTTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 22320469 5' - roo 351 2 60.74 GAGAAAAAATTTAACACAAATGTTTATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTT:1 + chrX 9846704 5' + transib2 26 1 67.81 TCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 26854740 5' + jockey 64 1 56.16 TTTTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACTACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGAGTGGGAGTGCTGTGCATGCACTTTGAAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTGTATGTATAAATG:1 - 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P-element 2802 1 29.79 GCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTT:1 - chr3R 30569104 5' - mdg3 5460 2 46.58 ATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chrX 666303 5' + 412 7139 2 81.43 TTTAAACAAAAATATTGCCNTTTTTCCGATCGTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGC:1 - chr3R 3268037 5' + mariner2 108 1 67.01 ATAAATACGTAATATATACATAATTTTTGTTGCTTTTTATTATGGTGAATGAATTAATTGGACGTGAACTAATGTAAAGGCCACCACTGTATCAAATGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGACTATTA:1 - chr3R 27547774 5' - 17.6 7397 2 71.23 TAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGCACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAACAACGTAATTGTGATCCACCACAAAC:1 + chr3R 19965253 5' + jockey 72 1 69.91 AAGAGTACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATC:1 - chr3R 10736185 5' + McClintock 4 2 79.45 TGTAGACAGGAATGTGATCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTT:1 - chr3R 7049493 5' - Burdock 230 2 67.12 AATGAGCAAAGTAACTTAAAATGTTAAACAGCAGATATACTGACAATAGGTGCGCAACAATTCTAAATTTAAATGTCATCGCTATGTTTTATTACTAAGTGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAGGCAGCGGACCAAGATGGC:1 + chrX 20981809 5' - Q-element 500 2 62.07 CAGGTATTTGGCATTCAGATCCGTAAGCCTGCCCCCTTAGACATAGCATCCCCAGTAGTTTGGGGGCGTAGTAGAAGTTCGTGCACGGATAAAAACATAATGCCTCAAAATTCCGGTCTATAAAAATATATATATATGTAT:1 - chrX 20008811 5' + G3 4501 1 71.63 ATAGCACCAATTAATGGGTAAGCCTGGCATCGGCAACTACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACT:1 - chr3L 17135456 5' - hopper2 1527 1 73.29 GTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr3L 18846942 5' - 1360 3351 1 54.48 TAACAAATACACAGCTACTNATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTG:1 + chr2L 20407775 5' + McClintock 52 2 68.46 ATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - 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chr3R 7049505 5' - Burdock 6378 2 75.34 TTTTTAAGAATAATCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 5027138 5' - roo 385 2 67.59 AACTTATTTGAAAGCCGCTGTTTGCAGTCTTGTTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATAGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 + chr3L 2167541 5' - opus 489 2 73.97 CATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAG:1 - chr2R 12185381 5' + accord 53 2 79.21 GAAGAGAAATGGCCTATGCGATAAATATCACGACAAATACTTCCGAGAGCGTTGAAGGCCTAGTTAGGGAAAGTGGCTACTCGAGTCCTCCGTTTTCATCTTATACATAAGTACCTAGGTTCTTAATTGTAAGCATA:1 - chr2L 2504388 5' - Tirant 192 2 54.01 GTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTCGGT:1 + chr3R 20200399 5' - Transpac 237 2 67.81 AGAAGAGCTACTGAAAATCCTAAAAATCTGTTCAATATTTGTTAGTATAATCTTATTAATTATTAAACAGGAAAAGTAAAGATGAAATATCATCATCATATCATGATAACGATAAGTCTGTTGGATTATTATAATTATTATTAATA:1 - chr2L 13271114 5' - mdg1 7089 2 56.85 ACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCAC:1 - chr2R 14532049 5' - invader4 248 2 71.23 CAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr3L 17268325 5' + hobo 75 1 68.49 CTTAAGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGC:1 - chr3L 22721172 5' + INE-1 29 1 67.86 GAAACTATCTCTACCGAACTAACGAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATCCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr3R 17077949 5' - 1360 3367 1 71.23 AGATTACCTGGCTAGTCGGCTATTGGTTTCAAAAACAAAAACAAAAAAAAAAGAACAAACGAAAAAAAAAAACGGTT:1 + chrX 16406783 5' - FB 883 1 80.52 ATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAA:1 - chr2L 15085717 5' - opus 7429 2 71.23 TGTGGTCACTGTTGTTGCCTCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 - chr2L 6637507 5' - 1731 306 1 73.60 ACATTTCTTGCGCTATAAATCGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAAC:1 + chr2L 15019853 5' - BS 5053 1 54.79 AATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCT:1 - chrX 20999593 5' + BS 55 1 59.59 GCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr3R 7049335 5' + Burdock 6155 2 67.74 TCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGAAATTAACATATAAA:1 + chr3R 10030715 5' - BS 5034 1 62.79 TTGAACTTGATTTGAAAAACGATACGATTCTCTTACCCTTTCCTAGTAAGGGCACTATAGAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTATCTTAATAAATAAATAAATA:1 - chr2R 6493376 5' - copia 229 1 55.48 TATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chrX 14978634 5' + hobo 67 1 62.68 AATAGTGCCCGAAGAACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCAGAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 + chr2R 19805423 5' + F-element 56 1 55.46 AACTAGAGGAAGAAGTTAAAGTAGCGGATATTGGTAGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 31159212 5' - hobo 2924 1 53.85 TCAAATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAA:1 + chrX 12979405 5' - transib2 2801 1 69.86 GAATATAGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 + chrX 21668541 5' + I-element 58 1 57.53 ATTCGCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 17012055 5' - 1360 3341 1 52.74 AAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 - chr2L 18311503 5' - opus 424 2 80.60 ACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGC:1 - chr3R 934265 5' - Rt1b 4719 1 44.68 AGCGTTGCCACGTTGCCCGAAAGTGCCGATAGAAAACTCAATTAGGCAACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTT:1 - chr3L 9324606 5' - HMS-Beagle2 305 2 79.31 CTCAAATCGACAGCTTCAACCTGTAACAAAATTGGAAAAATGGAAATATGTTACTACGAAATAGTATTTAAAATCGGTAATGAAGTTTGTTATAACACTCAAAAATAAAACATTTTCTTTAAAATATTATATTGTTCAAAATTTTC:1 - chr3L 6505081 5' - transib3 2599 1 76.03 TGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGCTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 + chr3L 13057355 5' - 412 7480 2 63.01 CGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chr2R 9376647 5' - hopper2 1533 1 67.12 ATTCATGGGGCTTGGGCATTGGCGTTGCCAATATATAACGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACACGACAC:1 + chr3R 21925100 5' + hobo 19 1 55.56 GCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTCGACACCGATGCGTACGTTTTCTCGCA:1 - chrX 3921705 5' - 3S18 257 2 71.92 TTCGATGTAAAATCAATGCTAAAAACATGGCATATACACTAAATAAGGACCAAGATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 23964767 5' + hobo 17 1 72.60 GTGCGACAATTTGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 25580754 5' + 1360 53 1 52.74 CATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr3R 13259817 5' + hobo 56 1 58.22 AACAAACAAGTTTGTAAGGTGGGTTACAAACACACTGGTACACACACTCACTCATAACACCCACATTCACACACACACACACACACACATACATA:1 + chr2R 8177678 5' + Quasimodo 38 2 52.63 CAAGCTAAGCAACAAAGTGTTCCTATACAGAGCGTTAGTGGTCCCTTCAATGACCTATTGCGTCCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAATATAACCCACCAACACTACCGAATTCCCAATTCAATACCAACTT:1 - chr3L 23854349 5' + I-element 4989 1 54.11 TTGTCGATTTAACATTTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 13285548 5' - roo 9051 2 69.78 CGATGGAAAACCTTCTAATATATGTACAAATATTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCTATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 11617813 5' + 412 7095 2 55.86 AAGATGGGGATTTCCTAATAATCAGGACCACAAAGAAGACATGGAGATTTCAGAAGGTATCTATAGGGCAGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTTGCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAAC:1 + chr2R 2046459 5' - Transpac 259 2 50.00 TTAAACATACATATTTGTATGTATGTACACGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr4 490367 5' - pogo 2079 1 70.34 AATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr2L 13033399 5' - hobo 2921 1 48.86 CTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACNCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGC:1 - 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chr3L 14568217 5' + Rt1b 125 1 60.27 CCCTCCGATATTAAAGATTGCGGGAAAATGTCCAACAATTGAAGTTGCTAGGGGCAGCGAGAAAAACAACAAAGGCAACATGGAAAGCGGGGATAGCCAAATATCTACGAGGCACGTGAATTAATTTTACTCCAGTCACAGCTCTG:1 - chr2R 6231825 5' - P-element 176 1 78.77 ACAATACAAATACAAATTAAATCATGTATTACAGCTAAAGTCGAAAACACGAAAAAAAAAATACAAAGGTGAATAGAAGCACAGCAGCACTACAAGAACGACATATACTAAGCACCGGGAAACAAAGAACACGCCGCCTAATCACC:1 + chr3L 18155050 5' - accord2 291 1 72.60 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCG:1 - chr3R 4571525 5' + gypsy 72 2 73.13 GCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 + chr2R 10417132 5' - 1360 3329 1 59.59 CGCCATTCCCGGCTAACAAAAATTACACGCACGAGTTATTCACATTAGGAATAATCGCAGAGGTCAACTCAGCCGAGGTGCAATGGCCAAGCCTCACTCCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGATAGCCGACGC:1 + chr3R 4947948 5' + P-element 21 1 69.86 ATAATGATAGATTGAAATAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCC:1 - chr3R 12376553 5' + HMS-Beagle 21 2 69.86 TAGATGATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGGAAGGTTGTG:1 + chr2L 14616186 5' + P-element 79 1 30.82 GTGCGCACTCCTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTG:1 + chr3R 19950440 5' + BS 5049 1 56.16 AGGGCAAACACAAAGCTATTACCTGCGGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2R 9341667 5' - roo 9019 2 56.16 GAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 2317221 5' + 412 72 2 67.12 GCATTCTATGAAATTTATTAATAATATTAAATAAGTTAGTTTTGATATTGGCAATACTAACAACAAAAATTTGTATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATA:1 + chr4 194415 5' + TART-B 10199 1 54.11 TTGATTAACCGCAAACGGGCAAATCGGGGCTGCTGGTCCCGTCCTCGTTCATAATTAAAATCAAATTAACACACACACACACACAAAAGAGGTACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 15191316 5' + hobo 26 1 65.75 ATTTCACTTAATCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 + chr2R 15199096 5' + Burdock 42 2 53.79 CATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chrX 3533843 5' + 17.6 6952 1 68.97 ATTAAAAGGGAGATTTCTAGTTCTTTTTAGATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGAT:1 + chr3L 25255412 5' + INE-1 300 1 68.49 GTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 - chr3L 1463754 5' - P-element 2843 1 56.16 TCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCCCTTTTTTAC:1 - chr2R 8315600 5' + hobo 9 1 76.85 GTATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTC:1 + chrY 104334 5' + INE-1 549 1 63.01 GAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 + chr3L 18846968 5' - 1360 3354 1 61.90 GCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTTCA:1 - chr3R 31264531 5' + BS 49 1 53.10 TAGGCTCTCAATTGTTTAATGAATGTCAAGATCGACTTGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr2R 11247093 5' + 1360 29 1 66.44 ATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 + chr3L 7024429 5' + 412 45 2 53.42 CGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr3L 23146454 5' + 1360 44 1 55.48 AAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGCATATATTTAAAGACGTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - 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chr2L 23175887 5' + INE-1 90 1 78.77 CATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 20904974 5' - roo 8998 2 71.23 GAAGTTTTTACAACGTGCTTTTTAAGTGTTTTGAAATTATTTGAGAAGCATTTTAATAAGAAAATTTTAGTTGAATACTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr2R 22522002 5' - pogo 2077 1 65.38 AGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGCTTTTATCTGGA:1 + chr3L 6015556 5' - roo 9029 1 50.68 ACTTTTTATACACAAACTAACTAGTGTAAATGTGTAATTGTAAGACCAATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:2 - chr3R 4962908 5' + jockey 61 1 51.37 ATTAACATTTTGCTGCCCCCTCGCCATCTCGCTCACACACACACACACACACACACATATACACA:1 + chr3R 8230100 5' + accord 7034 2 78.46 ATTACCCGGATTGTGAAGTGCCTTCCTTAAATATTTATTTATAATACTATGATACGAATTTAAAATCGGATGCAATAACTTATGTTTATTTTTGGACTTCGAAATTAGTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr2R 4597909 5' - 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chr3R 26188655 5' + jockey 9 1 68.07 AATGATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCNCAAGTGCTTTTCC:1 - chr2R 12827086 5' + Burdock 6171 2 58.52 TCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTTAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAA:1 + chr3L 27356089 5' - Tc3 1664 1 65.45 GGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2L 4244981 5' - 412 7507 2 52.80 ATTGACAGCTTATTTGCTAGAATAATTGCTTCCATTTAAGAAAAAGTCGATTTAAATCAAGCGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGCCAAATTGCTGACACAGC:1 + chr2L 17269107 5' + gypsy6 54 2 55.48 GTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chr2R 20052485 5' - transib2 2762 1 61.64 CATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAG:1 + chr2R 11246978 5' - 1360 88 1 59.59 CAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACT:1 - chr3L 829958 5' + G6 60 1 65.32 CCCAAAACAGCCAAGACGAAACGTGCGCCAAGTGAAATGATTAACACATTCTGAAAACCTGCGGGGCCCACAGTGAACGAAACTTGTCTGTGCTGCAGGATTTTCATTTGCAATAATGATAATATGATAATAATAATAATAATAAT:1 - chr3R 25767866 5' + mdg1 7068 8 75.34 CTATTAACAACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGC:1 - chr2R 17493215 5' + BS 4819 1 64.83 TTCGGATATAGAAAAACATTTTACTCTACTGATTTGCATTTTGTCAATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCTCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 17987601 5' + jockey 35 1 62.33 AGGATGTGTCGTCATGAAATTCGTCGTGGAATTTTAGATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 7751015 5' + 412 7083 2 56.00 TTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGAGGCGGGGAAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGT:1 - 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chr3L 6050252 5' + 412 7101 2 51.05 ATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr3R 26472894 5' + 1360 55 1 60.29 CGTTTTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTNAACTGT:1 - chr3R 17897191 5' - hopper 1332 1 70.55 GTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACC:1 + chr2L 20761876 5' + Doc 455 1 62.33 TAAGACTAAAATGAACAGCCCGATAATGTGATTGCAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTCCGGGCCCCGTCAGCAGG:1 - chr3R 13838570 5' + opus 7174 4 60.27 GTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 - chr3L 1463701 5' - P-element 2792 1 20.14 TGAATCTCATTCCGGAATAACTAACGAGGTTTTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:1 + chr3L 11904731 5' - copia 232 1 65.07 GCTACGAAAAATTATGTGGTCTAAGTAAAGATTTGGTATATCCAAAAGGTTGCCTCTATTCCTGATTAATTTGCATATTTAAATAGTTACTGCCTGGATATGATTTTGCGATAGAGTGGCGAATGGTTTATGAGAGATATTTGATT:1 - chr3L 18854953 5' - G5A 230 1 58.90 TAAGAATAATCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGCACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 5027142 5' - roo 401 1 73.60 AAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGCCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 - chr3R 12376522 5' + HMS-Beagle 6846 2 52.78 CTGAAAAAAATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAACTGTATGTGTGCACACG:1 - chr3R 12622396 5' + 1360 169 1 63.70 AATATCGAGAATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCA:1 + chr3R 10714149 5' - 297 350 2 58.27 TATGATTTCCCATATTCCATATCTTTTCCTGGTAATTGAGATCTTGAGAATTTTTAGTTCCCTGCCGGACATAGGGCAATTTTGATTGTCACCAAAAAAGTGGGGCTGCATAGTGCATAACCAATGTAGGGCCATTACGCATCTTG:1 - chr3L 11412426 5' + 1360 3371 1 45.21 AGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 - chr3L 15718157 5' - 1360 3318 1 67.81 TGGTCAAAACCCCCCTTTTCGGATGTGTATGTGTGTCCGTTTGTGACTGTGTGTGTGTGCTGGATGCCTTAATGTCGCTGCGTGTGGTTTTTTTTGTGTTTTTTTTTTGGCAGAAATTCGAAATG:1 - chr3R 25181956 5' - transib1 2123 1 64.80 GGAAACAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 21764455 5' + hobo 33 1 53.51 ACATAATACACTGCGTTATACACTGCGAGTCACCAGGTTAGCGCTCCTTCAGCAAAAATCTTTGATGTGAGATATTTAGAAAACTGTTTAAGAAATTCTTTTCCAATTCCAATACTTCTGATATAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr3R 4562670 5' - mdg1 7426 2 69.86 TTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3L 12227913 5' - opus 470 2 65.97 AAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCC:1 + chr2L 17957144 5' + flea 4772 2 68.99 TGTCGTTTCATTTTATGCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCAC:1 - chr3R 30569120 5' - mdg3 224 2 56.16 GAGGGACAGANAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAG:1 - chr3R 6419923 5' + Tabor 81 2 70.55 AAGTGTAGATGTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2L 512387 5' - roo 9046 1 62.33 GCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGCTGGCAGCGCTGT:1 + chr2L 9383712 5' + flea 4787 2 60.14 CCTTTGATGAATCGAACCTTCTCAATAAAAATAAAGAGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGC:1 - chr3L 15718193 5' - 1360 3354 1 61.64 CTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTACCGTACA:1 - chr3R 12613846 5' - HMS-Beagle 178 2 64.93 TGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 + chr3L 18074086 5' - 297 6905 2 69.86 AATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATA:2 - chrX 21668380 5' - opus 467 2 41.10 TTACGTACACTTGTATAGTTAATTACAGCAGAGTTCCTTTGTTTTGTAAATAGTATTGAATATTCCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAA:1 - chr3R 13613191 5' - copia 235 1 55.48 TTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAAAATTCTGTCGAGCGCTGCGGCAGAGG:1 - chr3R 5165001 5' + invader4 2842 2 77.40 TTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCACAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 - chr3L 12991452 5' - mdg1 361 2 56.85 CCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 12462216 5' + roo 8730 2 67.14 CAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr3R 10737092 5' + F-element 24 1 69.77 TCGGTTTTACACACCACCAATATGGTTTTCTTTGATCGTTTGTTGCTCACCATTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 9178725 5' + hopper 143 7 91.78 TGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chrX 14360841 5' + jockey 73 1 61.11 TGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTCTATATGTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATACAAAAGATAGAACCACACCTCTCACTAATCATGT:1 - chr3R 19950505 5' - BS 5004 1 71.23 ATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 + chr3L 18846934 5' - 1360 3347 1 55.48 GGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGTTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr3R 26472888 5' + 1360 59 1 66.42 ATTAGAGTTACAACAATATATGTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACTTAAGTGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCT:1 + chr2L 18181151 5' + blood 159 2 46.58 TGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTCAAT:1 - chr3L 10897534 5' - roo 347 2 60.71 AGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1 - chr3R 29288816 5' + BS 5022 1 63.01 TCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTATTGCGATTAAAAAAAAAAATTTGAAAAAATCGAAATTTTT:1 - chr2R 5303115 5' - FB 163 1 78.42 TACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2R 17269127 5' - roo 8988 2 73.97 GATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689437 5' - diver2 4466 1 62.39 ATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3R 17243232 5' - hopper 1372 1 54.11 TTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTAC:1 - chr3L 25232919 5' + GATE 8272 2 54.39 CAGAAAAGTTTTGATTTCAGTCGGGTATTAGGCACATTCCTCGTAATATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3R 31266069 5' + jockey 36 1 59.59 AGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 + chr3L 12227758 5' + opus 13 2 67.50 TTTATATTTTTATTTGAATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr2R 22957887 5' + hobo 31 1 58.40 AGTTCCGAAATGTGAGCACTAAGATGCACTCCAAGGAATTGCCATTTTTAAACCACTACTTTATTTTTCCTTCAAAGTAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chrX 666391 5' - 412 450 2 55.48 ACCAGGGGCCCAGCATGGGTCACCGGAAATGGCCCACACAAACACACACACAGACACTGGGATTTGAGACAACACCAATACAAATACTCAGAACACACACACACACACACACATGC:1 - chr3L 11672600 5' + accord 185 3 62.07 TGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr3L 23456269 5' - 1360 3327 1 62.33 TCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTGGGAAATATCTTC:1 + chr3R 30087688 5' - roo 356 2 50.69 TCATCAATAATAAAGTTTGGCAGCTGCCTAATATTTTCTTCATTTAGTAAAACATACCTTACCGGAACTTAAGGAAAAATACCATAGCAAGCTTTACACGCACCCCAAC:1 - chr3L 10142181 5' + F-element 4456 1 53.21 GATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGC:1 - chr2L 6637455 5' - 1731 4566 1 71.20 AAGCGTGCGAATTAATGAANATTAAACATTTACCATGTGTCTCGCATACTATTAATCTATTAGTGCACGATCCCCTGAAAATAGATTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr2R 6493251 5' + copia 37 2 58.90 GCAAAAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTGACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:1 + chr2L 17957127 5' + flea 14 2 73.10 GGGTGGTGGTGGCTAAGGGTTAAGCGGAAAGAGAGAGGTGAATTTTGGCAAATGATTTGGATTTGGCAGGAGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGA:1 + chrX 9121252 5' + P-element 18 1 65.22 ATGCGTTCCAAAAAATGATAGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 10909477 5' + 412 47 2 49.32 TGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGG:1 - chr2R 11247056 5' + 1360 66 1 63.01 GCCAACAATCGCTCGTCAATTGGAGTTGACTCTGTGCAGTGTTTCTAGCAATGCTGCATTATACTTGATCGAAGAAATCCATTTAACAATTAGTAAGACCAATTATTGACATTCGAATAAGTACTTCAATGTGAAATGTGTAAATA:1 + chr3L 17945042 5' - Bari2 112 1 80.14 AAAATTAAAGGAGACAAGTCCTGGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAA:1 + chr2L 1044962 5' + mdg3 59 2 56.85 TGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr2L 388611 5' - roo 349 2 61.48 TGACCCTGGGGTCGAAATTATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chrX 666254 5' + 412 7080 2 61.54 AGTAGGTGTGTAGAGTTGTGAGACGGCGATAGCTATCGATTTTTATTTTGTGTTTGTGAAACCAGCCAAGGTTTTTAAGAATTTTCTTTTATTATCATATATTGAAAACATAATTATTAAAAATCCGTTCGCTTCGCGAGTGACTC:1 - chr2R 4009048 5' + Cr1a 127 1 75.34 ATTGTATGTTTAGCATATATTGAGAACTCAAAACGACGAGTTAAAGAATTGAAATAACAAAAGTTTTCTGAATAATAAAACTAGTTAGTTTATAAGGTTATCTAACTTTTTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATAT:1 - chr3R 20841508 5' - Juan 4199 1 70.34 TTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr2R 21795213 5' - transib2 2809 1 72.31 CAGCTTAATTTCTACACATGTAGATTGGTTTATACAAAGAATAAAATGGACAGACGCACATTTATACACAATGTAAAAAATAAGTTAATTAGAGTTACAACAATATATGTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACT:1 + chr2L 18181064 5' + blood 7020 2 75.34 TTCGCTGCCTTAATAAGGTAGCAAAACTGATAACAGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr3L 13291912 5' + roo 5 2 76.71 AGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCATGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGT:1 + chr3R 23902161 5' + I-element 42 1 56.16 CAACACTCAATTGCTTACTGCATCTTTGAAAGTTGCGCCTAAAAGAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr2R 24427664 5' - 1360 3375 1 75.71 AACCTAAAAATAGGGCAAAGTCAGTTATACAAATGATTTTTAATACTATACATTTAGGTTACGATCGGTGGTCTAGTTCACAGTTTGTTTTTCATTCATATATGTATATTTATATATAT:1 - chr3L 20580156 5' - Stalker 6936 4 52.94 CCAATGGAGAACTAAAAGCGAGGCGCTAAAAGAACAATGTGTCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTA:1 + chr2L 15419983 5' - Burdock 235 2 66.90 TTATACGCAGCCAGCACTTTAATCACAAAAAATATGATAATAAATCAATATAAGGGTTATTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATGGTCTCCGCTG:1 + chr2R 13121770 5' + HMS-Beagle 36 2 52.42 AGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr2L 20132985 5' + 297 6631 2 63.57 AACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCC:1 + chr2L 8284350 5' + Doc 424 1 52.74 CCGGATTTATGCATTTACTTGGATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAC:2 + chr3R 24480409 5' + blood 13 2 75.34 CAACTGATGATTCGCGCAAAAACCGAGAACCACGTGCTTGTGCTCCCAACAAAAATATTTTCAAGACCAGAGAGACCAATGCTCCAAACTTGACGAAAAATTCATGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 - chr2L 21147739 5' - 1360 11 1 75.17 CAAGTTGTGTCGGTATGTATCGACATCATTAAAAAACTCGCAGAGGGTTTCATTTTTTTCATTCAAGGGAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr2R 9618222 5' - roo 9026 1 51.08 GAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 5870826 5' - roo 320 2 77.24 GTATTTAACAACTAACACTTACAAAGGTGTGACACATTTCGGCATTTAAGGCTCATTTTGTATAATTTATTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCT:1 + chrX 15286845 5' - X-element 4675 1 50.71 ATGCGACGCACTCGCTATGGAATGCTAAGTGCTCCAAATGGACTTGCCGGTGCAACCGATCACCCCCAGCGAGATTGCTGAGGTCATCGCCAA:1 + chr3R 1418287 5' + BS3 216 1 61.29 CCGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCAC:1 - chr2R 5621049 5' + ZAM 7991 2 59.40 TTTGATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 5193529 5' - roo 9014 2 60.27 GTAGGCAGAGAATTGGAGGAGCAAATTGAGTGAGGGTTTACTTACGCTCTCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTATGTATATATATTAGTA:1 + chr2L 6637389 5' + 1731 4414 1 66.44 TCATAGGTTGTTTTTTTGTACTATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3R 26854697 5' + jockey 20 1 74.66 GTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCCAA:1 - chr2L 12236810 5' + jockey 69 1 69.17 ATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3R 25580866 5' - 1360 3355 1 54.03 CGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr3L 27391399 5' - 1360 3342 1 52.05 CTTGGGGGCATATTTCACCTGAAAAAAATTACGACGCATATTAAATGGAGTGCAAACTCTTTAAATTTTTTGATTGTATATATGAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 + chrX 2956161 5' - copia 254 1 60.96 ATTGCCCCCACTTGACTGTCTGCCTGCGAGTGGAACCATGTTCACCCCAGGCCACCCATTTGCGCCCCAATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAAAATTCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAAC:1 - chr3L 17181130 5' + Cr1a 90 1 58.57 AGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAGAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTG:1 + chr2R 12185291 5' - accord 7348 2 56.85 CATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3L 13057456 5' + 412 48 2 53.62 TGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 + chr2L 7633347 5' + Max-element 28 2 61.60 GTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAG:1 - chr2L 11475171 5' + jockey 169 1 45.21 CGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACCAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3R 14608722 5' + jockey 81 1 73.85 GTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGG:1 - chr2L 21645251 5' + 1360 47 1 52.74 AGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 19506713 5' + mdg3 50 2 51.03 TCTGGGGATAAGCCGAGACCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCNAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAAC:1 + chr3R 12622140 5' + 1360 9 2 76.92 ATCAAGATTTTCAAATATTTTAATTATTACAATAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2R 9453300 5' - roo 8986 2 78.08 CGAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCT:1 + chr2L 20628507 5' + Stalker2 7256 2 40.85 CGGGAACTTTGGATAAAATAATAATTGGAATTCAAATAACAATCAACAAAACTAATAAAAAGAGCAGCAAAAAAAAAAATTGTTTACAATATATGATAATAAAAAAAAGTTAATGAATACTTCGGCTGGTTTGACAAACACAAAA:1 + chr2R 3515193 5' - Cr1a 48 1 73.79 ATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr2L 6149112 5' - hopper2 1551 1 56.55 AAAATGTGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTAT:1 - chr3R 20200481 5' + Transpac 69 2 65.75 GTGTGGGAAAACAAAAGAAAAGCACTTCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 + chr2R 18931775 5' - blood 359 2 71.03 GCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACTGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 7702831 5' + P-element 45 1 50.38 GCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTC:1 - chr3R 11284988 5' + blood 7072 2 63.04 CTACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTG:1 - chrX 21907829 5' + Stalker 7162 4 57.24 ATATTAATTTATTTGAAGTAATTTGTGTTTAGTTTTTATAAGAATAAAAAGCTTCTGCTCTGTTCGAGGTTCGTTATTTAAATGCTCAAAGTGTGCTGAAGTTGGATTCAGCTAACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATT:1 - chr3L 23398288 5' - Stalker4 275 4 82.88 CCTTACGTTGATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTA:1 - chr3R 20887543 5' - Doc 4660 1 74.31 GAAAGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTACATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGC:1 - chr2R 9750274 5' + opus 113 3 77.06 GGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACACTTGCGCA:1 + chr2R 22523181 5' + jockey 81 1 73.64 ATTAAATTTTAATCACTATCACAAAGTTTGCAAGCCCACTAATTTGAAGCTAAATGACAAATCCAAACGGATTCCATAAAATTGAACAGCTTAACTTAACAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAA:1 - chrX 3330440 5' + X-element 4261 1 65.75 ATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAAGAAGTAGATTTTATTCGGTTAGTATTTGTTACAAACTGATTTTATTTGGGAAT:1 + chr2L 5728856 5' - roo 362 2 49.62 TTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCCTAGTTTTAAAATT:1 - chr2R 19633326 5' + jockey 4797 1 59.57 GGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 - chr3R 26472887 5' + 1360 36 1 57.27 GTTGTTCGCCATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 25860555 5' - hobo 2902 1 58.25 CAACGAAGGCTACAACGACGCCCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 + chrX 19662924 5' - P-element 2867 1 68.38 CCACAGGGAGGTACACTGAAAAAAATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGCTAACAAC:1 - chr3R 12622411 5' + 1360 121 1 74.48 AACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 - chr2L 12236807 5' + jockey 97 1 78.62 ACGGCCAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATAGTGAATATATACACTTTATGTAATCGGAAACGCATCCTTCTGTCTGTTACAT:1 - chr3R 8005046 5' - INE-1 30 1 83.84 ATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:2 - chr3R 13423383 5' + 297 47 2 55.40 CCAGCCAGTGAAAAGCGAAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGT:1 - chr3R 23636446 5' + X-element 4288 1 52.74 AGAAAATTTTATAAAAATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr3L 5006635 5' + Tirant 15 2 65.05 TATTTGTCTGTCTGGTCAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2L 17019208 5' + 412 28 2 69.18 TACCTCATATATGTATAAGGGTCATGGTCAAATCGTCCGCAGGAATATATATTGTATTATCTTAGTGTTTGCCCATATTTTTGTGAATCACGTATTAGATAAAAAATATATATTTTTTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCT:1 - chr2R 5743753 5' + INE-1 97 1 77.40 AAATATTTATGTATGTATGTATGCACGGGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTTAC:1 - chr3L 18044636 5' - hopper2 1517 1 78.47 ATATTTTGTTTAGCACTCATTTAAAAGTTGAACGTAATTTGTGGTATTTCGTTCGGGTTGTTTAGACGAATGTTCAAGGCTATTGTATGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 - chr2L 18525736 5' - pogo 2069 1 63.70 TATTTATGTGCGCAGAAACTCTTTTTACTAGCTTTTCTTAAACAATATGAAGGTAGCATTAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGT:1 - chr2L 11523150 5' + HMS-Beagle 6853 2 61.64 ATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3R 26472789 5' - 1360 3338 1 57.53 AATCGTTCAGTCCTGGCTGATCTAATGATTGCCCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 18887109 5' + roo 8673 2 76.81 AAATTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCT:1 + chr2R 20972634 5' + jockey 4708 1 58.22 TGTTTTTTTAATAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCT:1 - chr2R 8286827 5' + Burdock 6158 2 65.75 AAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCCCGGCTCTCGTGTGTTCGTGCCCCGTC:1 + chr2L 15085615 5' + opus 7055 4 52.74 TATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chr3L 5770921 5' - P-element 2792 1 18.88 AGACGCCCCGAATCTGATGTCATGCCCAATGTTCATAAAGAGCAAGGCAAACGAAAATCTCCCCCATTTTCCACTTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACC:1 - chr3R 13335464 5' - F-element 64 1 54.74 TGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTC:1 - chrX 7702841 5' + P-element 45 1 53.85 TAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 - chr3L 7024559 5' - 412 7502 2 51.41 CGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chrX 8681451 5' + jockey 79 1 73.13 TCATCAACTACCAAAATACCGTACTACTTGTTGAATCACATGGCGACCGTGACAGGACTACTGAGGAAATGCTGCTAATATTGCCGATTTGATTTGGGAATTCTAAACAGCGACAACAAGTGT:1 - 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chr2L 2241304 5' + roo 8715 2 65.29 AGCTTTAATACTTTTGACATGAAACACAACATAATATTGTGATTAGGCTAAAAGCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACT:1 - chrX 22835298 5' - mdg3 5470 2 67.12 ACTTACGGCTGCTTCTGTCTATATGTATTTGTATTATATCGTATATACTTTACCACGGGCCCGAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr3R 17924386 5' + Burdock 10 2 74.82 TTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 14422816 5' - roo 9016 2 66.14 ATAGATTTGTAACGCTTTCAAATGTTCACACCTCGCCACTCAGTTGACTGCACTTCTGTAATGCGATACCCTTAAGGTAATAACTTACTTATATATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCC:1 + chr2R 10787998 5' + gypsy10 5668 2 67.12 AATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGT:1 + chr3R 25580784 5' + 1360 83 1 74.66 GTCAGCACTGACGAGCAGCAACTAAAAAAGGTGCGGGGAGTACGCAAACGCTCAGATATTTAGGCGAATTAGGCGAAAAATTAGCGGCAGCAAAAAGAAGACACAGATTACTGAGTCATAGCAATCTCCTTGCAAGACGTCTTATC:1 + chr3R 2847300 5' + Helena 1281 1 73.29 AATAAAGATCTAAAGTAAAAATACCTCGTGTTGATTCTTTCAAATCCGAAACTTCTTTAAAGGCGTTGATCTTAGTCAAACGACGGATCATTTGTTCGACTCGAAATATATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCAC:1 + chr3R 15784415 5' + McClintock 5958 2 73.61 CCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 16274565 5' - 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chr2L 2291557 5' + I-element 26 1 58.77 TAGTTATTTATGTGTATGGTTTTACAAAAATACGAATGATCATTACAATCCGTATGCTGGATCTTCCATCTTTTATATTTTTTATTGATCCATATCAAGGATATATCTACTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTAC:1 - chr2R 18487361 5' - INE-1 32 1 52.74 TTTATGCGGTATGTATCGGGGTATACGATTGGTGTTAATGGTAGTTTATCGATGTACAATTTCCCATCGGTAACAACTAGTAGTAACACCAATGTTACCTAGACCCCAACCCTGACTCAAGCTAGCTGTTC:1 + chr2R 3118351 5' + jockey2 288 1 66.41 CGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr3L 17268263 5' - hobo 2904 1 64.29 TATTATGCATACACTTGGGCTTGACTGTATATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCAC:1 - chr3R 3181148 5' - opus 461 2 59.29 TGTGACTCTTGCGTCTCCCAAGTCTATTTTTGCGATTTTGTCATACTCCTCCAGTGTTTGAATTTTTATAACTTGTGCACGAAAACACAAGATCAAAACTTTCAAGCGAGCTGTTAAAAGAACCGCACGAGAGCAGTCTGCACGCT:1 - chr3R 1828043 5' - Cr1a 341 1 53.42 ATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTTGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 6131822 5' - 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roo 335 2 67.12 TTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTT:1 - chrX 20999609 5' + BS 39 1 52.74 ACGCCACGCCCTCCGGCCAGCAAACTGCCAATCAGCCGTCAAGCAGTCAGTCAGTCAATCAATTTTCCATGTATACTTAAACAAAGGTAGCTTTTTGTATACATATATATATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCAT:1 - chr3R 17924583 5' - Burdock 6386 2 77.24 TCAAATGTGTCTGAGCCTCCAAACCCCATGAGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGCTAACACAATCACAAACCAC:1 - chr2L 15420156 5' + Burdock 1 2 65.07 AAAAGTATGCTACAAATTGCAATTTCCGCTGGTTAATTGCAGCATCAATATCTACTCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATT:1 - chr2R 22796849 5' + jockey 4845 1 61.38 TATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr3L 6050239 5' + 412 7101 2 56.15 TCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTGGTCTAATTTCAGATAAAGATGGAAACCGTAAATGTTGTCTGCTTTT:1 + chr3L 24796712 5' + Cr1a 441 1 49.31 TTTAATAGGATATTCTAACAAATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTT:1 + chrX 6216333 5' + Juan 4019 1 63.45 CATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr3L 13057345 5' - 412 7490 2 57.53 ATTCATCGTCCGCGACATGAAAGTTACCCTTTGCCACCACCGCCAGCCAAAAACTATAACTACTCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr2L 17019069 5' - 412 7490 2 58.22 CATGGGCGGTGGTGGGCGTGGCTATGGTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCC:1 + chr3R 9298429 5' + hopper 26 1 67.81 GTTCGGAAGCTGACTTCAAGCGTTAGCTTTCAGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2R 10417097 5' - 1360 3365 1 67.59 TTTTCTCTATTTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAACCTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2R 14884222 5' + roo 22 2 69.18 ATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 + chr2R 21795209 5' + transib2 21 2 70.00 CAAGTAAATTATCCATATTGCAAACGTCCGTGGGAAACGGACGTAAATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr2R 6767952 5' + pogo 19 1 70.55 GAGGTTCAAGCCGAAACATTCAGGTAAAATTGATAAATATTCAATATTCAATATTGTTCACAATCCATCCAACTATCTATCCAATTTAAAAGCGAAACAATTATATCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chrX 17884453 5' + pogo 12 1 71.92 TTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCA:1 - chrX 2214298 5' + jockey 4614 1 58.52 CTTGTTGCTATCGATTGAATTGCACTATCAACCCTAATGGAACTATCGAATAGTGGCATTGAATTATGAGATTTCTTCACTAGTTGGGTTTGGTGAAAAGACGCATGCTAGTATCTTATTGTTTTTTTTTATTTTTTTAATAATAG:1 - chr2R 18796921 5' + hopper 157 1 73.97 AAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGAGTCTTTGTTAGGTATAAGAATCATTTTAAGTTTCAGTTTGAATTTGTATTT:1 + chr3R 3269651 5' + Gypsy6A_LTR 161 1 60.96 GACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 + chr3R 12622171 5' - 1360 3355 1 55.65 CAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 + chr3L 9635290 5' + Doc 50 1 50.68 AATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACG:1 + chr3L 20189582 5' - FB 222 1 37.67 GATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGCGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr2R 6801703 5' + 297 58 2 67.91 AAGCGTCCCAAATTTCTTTCTATTTTTTCTGCCTGTCTCTTTCACTCATTTCGACAGATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGTTGGTACCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr3R 27707139 5' - P-element 2844 1 49.23 CGTTTTGATCCCATCCGAATCTCGGTGCGGCCCGGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 - chrX 683645 5' + jockey 20 1 68.75 CCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 + chr2R 16371975 5' + 412 89 2 80.14 CGGTCAATAGCCATCTGTCCGTATAAGCGAGATTCAGCGTACAGATTCTAGAGACATAGACGTAGCGCAAGTTTGTTTTGCCACGCCCATTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACGGCCACGCCCACATTTTTGAAAAA:1 + chr2R 5720595 5' + INE-1 252 1 64.29 GGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 + chr2R 7314594 5' + blood 24 2 65.07 AAGTTAACAGGCAAAAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr2L 17957117 5' + flea 4762 1 79.45 GTTTTCAGTTTAGGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAGGTAAATGAATCG:1 - chr2L 512531 5' + roo 8718 2 54.11 TTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGAT:1 + chr2L 11475142 5' - jockey 4897 1 79.45 TTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 - chr2L 12236812 5' + jockey 93 1 75.34 GCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGA:1 + chrX 16547488 5' - P-element 2803 1 28.08 TGGAATGTATAACTCGGAGTTAGCGTTTAGATACGCTATTCATAGACTTAATATGGACAAAAGCCTTTGCCGTTGAGGCCTACCTTTCAAGCCAGTGTTCGGTTATTAAAACACAGCGTGCAATTCGGAATCGCTTTAATTTAGCC:1 - chr4 646351 5' + mariner2 220 1 57.53 ATAACTGATACCGGAAATATATTTGAAAAACTTAAGAACCTTGAAAGGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGT:1 - chrX 13789613 5' + FB 75 1 67.81 GAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 - chr3R 6419923 5' + Tabor 80 2 70.34 ATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTCTAACT:1 + chr3L 23456282 5' - Gypsy6A_LTR 272 1 69.49 ACAATTAGTGACTAGAAGATGTCATTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATC:1 + chr2R 19574381 5' + I-element 5112 1 71.92 TAAATCCAAAGTCGTATACACCAAAGCACTCTGAAGCTTTTCGATAACAACGTCAACCTGCTAATAAAAACCAAGCAAAAAAAACTCCTAGAACTAACAAAAATTGCAGATGTGGATGTAAGAGCAAGTGAACATAACAC:1 - chr2L 22235919 5' + I-element 455 1 62.14 CGGTGTCATGCCCACAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 24059293 5' - roo 9047 1 65.69 CGCCGGCGACGATGATGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 + chr3R 11284899 5' - blood 353 2 57.14 ATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr3L 27415323 5' + transib2 52 1 53.10 GGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTA:1 - chr3R 31264498 5' + BS 83 1 77.40 TCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCGCAAGCACCG:1 + chrX 15198057 5' + Max-element 68 2 70.00 TTGAACATATGCAAACGTTTTTTCTTTTTTTTTTT:1 - chr2L 3754171 5' - HMS-Beagle2 491 2 65.71 ATGCATGAAGCCCGAGACAATTGCAGTGCAGGGCGAGTGGGCCAAGGGAAGTCTGCTCACCGGGGAAATGTCTGAATGTCTGGCGCACCGCACGTAGTCTTTAAACAGGGTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr2R 16372097 5' - 412 7538 2 76.03 AGAGATGATATAACTGGCTNAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 - chr3R 9298616 5' + hopper 10 2 76.71 AAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 + chr2L 6618876 5' + 17.6 37 2 55.48 CCACCAAATTATTTAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chrX 8346345 5' - roo 327 2 71.23 CCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTC:1 + chr2L 8284368 5' + Doc 439 1 64.34 CGTCTCCAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACA:1 + chr2L 9383716 5' + flea 42 2 52.74 ATACCCAAACGTAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr2L 18525581 5' + pogo 39 1 58.90 TTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCG:1 + chr3R 4160069 5' - invader2 5042 2 60.96 AACATTGAAATTAGGTTTTGACGACTAAGGGATACTTAGTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr2L 4244831 5' + 412 13 2 73.29 AAGCAAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTGTTGTTTTNGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 - chr2R 11844372 5' + I-element 11 1 74.82 AGCCGCGCTTTGACAGAGTTTTTATTTGCGTTTTATTAATGCTAAACGATTTCCACGAAAATGCCACCGAAAATGATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 5027335 5' + roo 8674 2 39.04 TTGGAATTTACACATCGACATATATTACGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCC:1 - chr2L 4141829 5' + accord 5 2 54.39 TAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 13423392 5' + 297 6619 2 55.40 AGTTCAGCTTTCTGTTACAGTGTGTCAACGTAAATACAAATAAATTCCGGCTGGAAATAACACGCGCTAAACTGTTCAATAAAATTAAATATTTAATTAAACAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAANGTTAAA:1 + chr2L 18510678 5' + copia 4888 2 73.29 TTCACCAATGTGGTGTGCAATTTCCTCAGGTGGAATTATTGGTCCCTGGTTTTTTTTTTAAAGGAAAATGGGGTTACAGTGACAGTGAATTCGGACCGGCCATTCCAAATCGCCTCTAATTGAGATAAGGCGCTCTGGAAAGTGTT:1 - chr3L 23571154 5' - mariner2 516 1 67.81 TGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 + chr3R 24666369 5' - hobo 2922 1 55.29 ATTTTCGGACATTAAAGTTTTTTGCTATAAATGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTANGCAGCC:1 + chr2R 5179552 5' - 1360 3350 1 57.53 TGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3L 7848485 5' + jockey 83 1 67.59 TAAATTAAGGGTGAATTGCACGGTATCAAATACAATTTAATAATATTCTAAATCTACGTTTTTGAAAAACGGGGAGGATGTTGGGTCAAAACTGTGCAGTAGACTAATCTCATACTTTTTAATATTGTAAGCCGAAGTAGTCAGTG:1 + chr3R 2398195 5' + diver2 58 2 52.05 CTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 24072039 5' + jockey 83 1 61.64 TCGGCGCCATTTCACGTGCAGAGCGTTGATATGCCATCTACATGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAA:1 + chr2R 15474471 5' + Quasimodo 65 2 67.59 CGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 20061341 5' - roo 9006 2 63.89 TGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCC:1 + chr3L 2167579 5' - opus 472 2 60.80 GTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTT:1 + chr3L 28063326 5' - Stalker 111 4 71.23 CATAAGTGATGAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 24072003 5' + jockey 25 1 74.40 TATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3R 10714259 5' + 297 38 2 54.14 CCCATTCCGGCCCCACTTTCCCCCATGCCACGTAAGGAGGAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCGGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTCGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 + chr3R 6584753 5' - transib2 2800 1 60.77 GGAGTTGGAATTGGAGTTGGAGGTGGAGGTGTAGCCGTTGGGCGTTGGAGACTATTCTCAAACATCTGTTTTGGAAT:1 - chr3R 26767469 5' - G2 2723 1 50.65 CCATTTCGTTACGTTCGTTGCGTATGTGGCGCTGCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3L 17181405 5' + jockey 10 1 75.83 TTTGCATAAAAATATTTTGCATAATAGCATAAAAATAATTTTAGAACATAGAACGAGTTATCGTTATTTTTGGCACGCTTTCAAAGCCAGCTGATTCAGAGGTGCTTTGAATTGTGAAAATTGGCGGAAAAAGTTTAACAA:1 - chrX 12767362 5' + transib4 197 1 68.09 TATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chrX 10693438 5' + hopper 13 1 73.44 TATATTTTTCACGATTTTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 - chr3R 19514347 5' + blood 7056 2 54.48 ACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2L 22592511 5' - mdg1 7421 2 58.90 AAGTGTCGCGCATGTGCACAAAAAAGCTTATCTATTTTGCTTTTACCGTTGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:1 + chr3L 27190320 5' + copia 67 2 68.57 AACATGGTCGCTTAGCTACTCCATTATCCGAGACCACAGAAATTTAAATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 - chr2R 19108608 5' + jockey 65 1 69.18 TTGGCACGTAAAGCAATATGGGTAAGCCGCAGACACACACACACACACACACACACACATATACA:1 + chr3L 9183575 5' + accord 186 2 80.00 GTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2L 512403 5' - roo 9051 2 64.00 CATACGTAACATATACGAGCGTGTATATATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 19965185 5' + jockey 14 1 77.42 TAAGAACTTAATCAATTCAAAAGCATTTACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAAT:1 - chr2L 544950 5' + Doc 35 1 54.48 TTTGTCTTTGTTATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACA:1 - chr2R 3146371 5' + rover 56 2 59.44 AGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chr2L 310100 5' - P-element 2790 1 16.43 GGGAAAATAATAATGTCTTTTTAATAGATTATGTTATAATATCTAAGAGAAGATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAAT:1 + chr2R 24215630 5' + I-element 5342 1 63.01 TTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCG:1 - 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chr3R 21537302 5' - Tc3 316 1 73.29 GAAAATAATCTTCGATATAAATTCCAAGCCGTGGCCTTACGGTTGAATTGCTTAACTCGTTACAAATCCTACTAACACTAATAATTATTAGAGTTATTTTACTTTATAAACATTTCCTCGTTTCTGTTCTCTTTTCTATATCGCGT:1 + chr2R 1982733 5' + Cr1a 4354 1 56.85 CCAATTGTTTATGGCTTATTGTTTCAGCTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGA:1 + chr2L 10133802 5' - jockey 4559 1 70.83 AATTGTGTCATTAGTTTGTATTTTTCTTATTAGTCGTTATGTATTTGTATTATTTCGCACTTGCCGCTTCGTTATCACTTCACTTGCAGCAACAACAATAATAACAACAATAACAATAACAATAACAACA:1 + chr3L 18797356 5' + mdg1 7057 3 74.62 AATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCT:1 - chr2L 11867363 5' + BS 63 1 61.64 GCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 + chr2L 14262960 5' - P-element 2835 1 41.13 GGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - 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roo 9051 2 52.08 AATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr4 490229 5' + pogo 65 1 63.70 TTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCG:1 - chr3L 17748414 5' + Doc 456 1 75.93 ATATATTAATAAAAATGTGTTGAAAAAACCCCTTTTCTCACCTCTGATTATATATTAGATACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 + chr2R 19389297 5' - 297 6920 2 64.38 ATAGAGGAATATTTAGGAATCTCAGTGAAGTGCTGCTAAAGAAATGTTTACGATATGAGACTATTTGTACCATCGTTCTAATATGTTATACAGATTTGGAATATGTTCGGAATAATAAAAAGTTATTAGGGTTGGATGGATTTGTT:1 - chr3R 18902404 5' - Quasimodo 156 2 63.01 TATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATAT:1 - chr3L 20988181 5' + blood 7191 2 75.71 TATTCCATTAGGCAAACTAATTAACCACTTGACTTCATATCACTTTTCACAGCCCACAAGAGTAGGCAACAAATTTTAGGTTCTTTATGTTAAACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGT:1 - 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Cr1a 4337 1 70.19 TTTTTGTTGCCTTTGTGTAATTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3L 22320103 5' + jockey 14 1 76.55 TAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGA:1 + chrX 6538665 5' + pogo 75 1 69.86 GAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGAGACATG:1 - chr3L 14422809 5' - roo 337 2 71.85 TCCAGCAGTCTGCTTAATTAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3L 20061312 5' - roo 397 1 70.59 CATTATACATAAACTTATAAGAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr2R 17269211 5' + roo 8712 2 56.12 GGGGATGTATTTAAAATTAAAATTGACTCTGAACCTTTCACAAGATAGACAATCATGGGATTTCGGGAACTTCAATTTACTATATACATACTTTAGCCTCCGTTTACAGAAGTTAATAGTCTAATACAATTNCACGTGACTCTTTT:1 - chr2L 1045093 5' - mdg3 213 2 57.53 CATTTAAGTTACAAAGGAATTAGGTCACAAAATCGTATGCGTTAAGTAAAAATATTATGAACCACCGAAGTGCTTTCACATTTGTACTTTTTTAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAA:1 + chrX 1288879 5' + jockey 4971 1 62.33 TAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAGT:1 - chr3R 20200470 5' + Transpac 80 2 73.29 AAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr2R 17350628 5' + F-element 47 1 63.01 AAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCG:1 - chr3R 23636429 5' + X-element 4305 1 64.38 ATTGTAAAGCCGTTTATGAGTCTGGGCCTAAAAATAATGCTAAAATTCTAACTTATTGTACATAATTCCTTTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTT:1 + chrX 13789520 5' + FB 51 1 53.42 TGTTGTTCTCGGGTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 13057470 5' + 412 7095 2 56.85 ACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACAT:1 + chrX 860785 5' + hobo 62 1 62.33 TTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 + chr3L 12227802 5' + opus 7060 4 74.17 CAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3R 10737059 5' + F-element 47 1 54.62 AGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 + chr3L 9635291 5' + Doc 51 1 51.37 ACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3L 18216447 5' + 297 6608 2 66.43 CCCCTCTAGAAAGTCCCGCCCATTCCGGCCCCACTTTCCCCCATGCCACGTAAGGAGGAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCTGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCAT:1 + chr3R 6584735 5' - transib2 2813 1 73.33 TTGCGCACAAGTTTGTCTGAACCGAGCAATTTGATGCGATTTAATTGCAGCTTCATCCGGCTGAAGAAGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr2L 4864363 5' + mdg3 38 2 53.44 TGGTGGCTAAGGGTTAAGCGGAAAGAGAGAGGTGAATTTTGGCAAATGATTTGGATTTGGCAGGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chrX 9121258 5' + P-element 40 1 54.20 GGAAAAATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTG:1 + chr3R 20841395 5' + Juan 66 1 60.27 ATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTAC:1 + chr3R 21925104 5' + hobo 49 1 57.60 CCCAGATAGTCGAGTATAACATAAGTTGGCTAATATTAAAATAGGATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGT:1 + chr3R 20200351 5' - Transpac 5205 2 60.00 TGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:2 + chr3R 13868937 5' - HMS-Beagle 6959 2 77.40 TGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGAGATAGACTAAGACGACAC:1 - chr2R 17493168 5' + BS 4854 1 58.65 TGAGGGATTGAAGAAGAAAATTAAAGAGTTAATCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chrX 22564433 5' + 412 7125 2 80.77 CAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr3R 24072016 5' + jockey 17 1 76.92 TTGAATATCTTGACCAGAAACTTTAATGATCGGATTATTACTTCAAATTAAAATAGCACTGCCAAAAAAAAAATGGCAAATAAACATTTACAAATACATATGGCGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 - chr2L 21941280 5' + flea 4768 2 76.71 ATCTGCCTGCATTAGCTTATCGCTATTTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTC:1 - chr3L 11684955 5' - Bari1 1680 1 64.38 GATTTGATTAAGATTTCTCTTAGTTCAGAAAAAATACAAACGCAGGAGTTGGCCTCTTTGGTTTATTTGATACTTCACGTGTTCAGCTTTAGCATTCGACTGACTCCCTCTCCGTTCGCGATCTGCCTCTATGCGTGTTGCTAC:1 + chr2R 4913747 5' - invader2 4977 2 75.69 ACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3R 24666367 5' - hobo 2909 1 55.00 ATGTTCACACCTCGCCACTCAGTTGACTGCACTTCTGTAATGCGATACCCTTAAGGTAATAACTTACTTATATATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAA:1 + chr2R 10788019 5' + gypsy10 5689 2 52.74 AATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCA:1 + chr3L 25482887 5' + accord 55 2 58.27 CGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 6801704 5' + 297 6613 2 59.63 TAGAATATATGCTTGGACCTGATAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTT:1 + chr3R 13254894 5' - roo 352 2 54.23 ATTAAGACGGATCATATTTAATAACATTCAACGGCAGAACCACAATAAATACAATAATATTTCATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAG:1 - chr2R 4270294 5' + gypsy9 5039 2 56.55 ATTGACTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGA:1 - chr3L 9318110 5' + P-element 2858 1 68.97 AGTTGAATGAATCGCGTTGATATGTCAGCTGCTTGGTTTGTTGGTATCGACTTAGGATCTACACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGT:1 - chr3R 14607930 5' + jockey 230 1 55.40 AAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAA:1 + chr3L 6557120 5' + Doc 48 1 53.73 TTGCAAATTCCTTTCTGACTTTCCGTTTGAGGCGAAGGAGAGATGAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGATTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 24973343 5' - roo 330 2 67.81 GCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chrX 9951321 5' + jockey 77 1 70.99 AGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCT:1 - chr2R 4261968 5' - invader4 223 2 56.16 AGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAACCTGGGCCGCTCT:1 + chr2L 20407757 5' + McClintock 6002 2 58.22 ATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 - chr2L 4244955 5' - 412 7460 2 77.40 GGGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3R 29680206 5' + 412 7095 2 62.30 CGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 5870787 5' - roo 358 2 50.68 GCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTG:1 + chr3R 12948602 5' + Stalker4 60 4 56.94 ATACCCATCATCAGGCTCCAGCAGTCTGCTTAATTAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 20061296 5' - roo 386 2 68.49 CCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 21668397 5' - opus 484 2 47.95 GGGTTCCGAAAATGAGTATGCGAAATTTTTAAGCTGTGCTGGTGGCTTAAGAACTTGACACCATTTGGAATGGGGAGAGCTTGAGAGAGACGCTCTCAGTGCTTTCGGGTTCATTTCATGGAGCCATAAGCATTGGTGACCAAGCC:1 + chrX 6936137 5' - Doc3-element 385 1 76.71 CCAAAAACGGATACAGTACTAAGAAAACTATAATAGAGCGCATCTTATATTAGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chrX 23102469 5' + Transpac 65 2 65.07 CGGCGCATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGCC:1 - chrX 15286977 5' + X-element 4416 1 52.45 TCTTTACTAGCTAGACCTGTTCTGTTTCCCAACATTGGGGATGGGATATTTTGGTATCCATAGAGTAAGTGACTAAATGGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGGACATTAAGCCTTTCCATATATT:1 + chr2R 11239577 5' - jockey 4650 1 62.77 ATTACGCATCGGGGGCCTGGTCCTGGTAAATAGACATAGTTTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 8469190 5' - hobo 2907 1 58.59 ATTTAATTGTATAGATGATTTATTTACGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAAATGGTACAAAAAACAATTATGTATGCTTCTATGGTTACACCAGAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGT:1 - chr3L 23456276 5' - 1360 3365 1 47.59 AAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - chr2R 17350638 5' + F-element 37 1 69.86 CTATCCGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGC:1 + chr3L 25482861 5' + accord 36 2 60.96 CCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTG:1 + chrX 22679659 5' + Doc 98 1 65.00 GTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAACCATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGG:1 - chr3R 25796054 5' - BS 5000 1 76.43 ACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGC:1 - chr3R 16475415 5' - mdg3 166 2 69.18 CAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTA:1 - chr2R 12827060 5' + Burdock 55 2 65.12 AAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCTATTTAT:1 + chr3R 24480488 5' + blood 7103 2 77.40 TCCCAGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr2R 16274547 5' - roo 9032 1 52.94 GTGTGCTCATTAAAAAGCGAGGCAGCTACGCAGAAAAGCGACATTTGCATAAAATGCCAGTGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTCCCGAAAGCTGGAAAAGCGTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGACTGTTTTTTTTACAA:1 + chr3R 27439788 5' - hopper 1403 2 75.86 GCTGGGTACATTTGAATGCAAACTTGAATATGTTTAAAACCAATCAAGCCATAAATAGCACCAATTAATGGGTAAGCCTGGCATCGGCAACTACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTT:1 - chr3L 17135510 5' - hopper 1394 1 67.14 GTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAG:1 + chrX 20330555 5' - P-element 2792 1 20.28 ATTTTCTTCAAAAAAACAAAGCACTACGTTTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chrX 17792507 5' - roo 358 2 54.79 AAGCCATGAGCTCTGCCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCACTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 - chrX 14360879 5' + jockey 34 1 63.89 CCGTTAGCCGTCATCAAGTNTACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTAT:1 - chr2R 19633283 5' + jockey 4844 1 73.97 GCAACTGCGCAACAAACATCAACTTATTATGCAAATTGTTATTCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATACATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACT:1 + chr3R 10736475 5' + F-element 4580 1 69.18 GGAATAAAAATACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr2L 6149094 5' - hopper 1376 1 46.21 ATATTGGGAAAGTTTAAATTTAGTACACTAGTACATTATACATAAACTTATAAGAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 17269244 5' + roo 8685 2 70.34 TTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTAGGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTTTCCATGTCCCCTTGGCTATTATGCGTG:1 - chr4 651045 5' + micropia 142 4 50.68 TGGCGAATTTCCCTCATTTTATTGGGCAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3R 27315055 5' + jockey 4694 1 61.29 GAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATATCTTCTGATATCGTCAGAC:1 - chr3R 10144440 5' + Chimpo 78 1 73.53 AGGAGAGAGAGCAAGAAAGCAGAAGAAGAGCACAAGGAGTGGGGCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chrX 9121348 5' - P-element 2812 1 33.56 AATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGCATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCCT:1 - chr2L 15019936 5' + BS 4884 1 74.48 CTTCCAAGAATTACTACGAAGTATATGTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 - chr3R 8197919 5' - pogo 2081 1 70.55 CATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chrX 20999605 5' + BS 43 1 51.37 ATATAACTTCACTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGG:1 + chr3R 19514217 5' - blood 7342 2 56.16 GGAACAATTAGTGACTAGAAGATGTCATTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCA:1 + chr2R 19574378 5' + I-element 5109 1 73.97 TTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2R 19389409 5' + 297 6630 2 63.56 ATTGATAGACCCTCAAATAATGAAAACTTAACCGATATAGAGCTGCGGTTAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTGATTTCCAAAAAAAAAATTTTTACTCTCTCAATGTAACGGTTCTTTTTGTTTTTGGGC:1 - chr3L 21442135 5' + Tc1 157 1 66.19 TGTGAATGCTGCCTTTTCATTTGGTTCGCAATTTATGCACTCACACTCATATTTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTT:1 + chrX 3921641 5' + G2 2673 1 57.60 TACTTTATGCCTTTCTTCGGTTTTGTTTGAAAAGTTCTGCTCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 + chr2L 14056631 5' - pogo 2080 1 65.97 AGCGACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAC:1 + chr3L 18183065 5' + Tirant 38 2 59.29 AAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chrX 19886988 5' - P-element 2786 1 14.89 TGTGATTACACGTTGGTAAACGCAAAGCCCACTCTTCCGGGCCATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTGTGGG:1 - chrX 15198142 5' - Max-element 284 2 65.14 ACGTTACTTTCTAATCGAAACAGCGAATTTAAATTAGACACCTTTGAAACAAAAAAAGAGAGAAACCTATAGTCCAGTTCCCCGACTATC:1 + chr2R 5217691 5' - INE-1 564 1 62.22 CCGTAAGTACGGCGGCTTTAATGGGAATAGGTTTTAGGGTTAAAAAATAAACCATTTAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 - chr2R 6768102 5' - pogo 2054 1 56.30 AGGGCCCTCAACACAATTTTGAAAGCAGACGCTGAGGTCTCAACTTTCTGACGACCCATAATATTGCTAAACATTCCTTTTCCGTTGCAGAGTAGTTTCTTTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTACTGGAG:1 + chr2R 4869795 5' - Osvaldo 12 2 72.66 CGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr2L 23310624 5' + 1360 48 1 56.06 TTGCAAATTGAAGAAACACAAACATGTAATTCCATCAAACAGCTTCAACTGTATTTAAGGCAATCAAATATACAAAATGTTTCGGTATTTAGCTGAGAACAAGATTAAAATAAAGGAGACCGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATC:1 + chr4 825516 5' - INE-1 564 1 56.16 TTTGTTGCAAAATGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCA:1 - chr3L 24766021 5' - 1360 3353 1 71.23 CTCCCAGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr2R 16274546 5' - roo 9035 1 54.70 TCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGCA:1 + chr2R 961121 5' - transib2 2684 1 68.89 AAAGCCGTCGCCAAACTAGCCGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACAC:1 - 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412 7506 2 65.98 AATAACCGTTAGTAAAACTATGGCAAAAGCTTGCGGCACAACCCCAGTTTTTATTTTTATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTT:1 + chrX 3382308 5' - pogo 2041 1 61.64 GCATAATATTTATCGCAACAGCGATTCGTTGTGCATTGATTTGTATCGGCATCTCCTGTGTACGGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAA:1 - chr3L 23372154 5' + Doc 49 1 51.85 TCCAATGACCCGCATGGGTTGCACACACCATCCCACTCGGTGCTGCCTCAAATCCCAATTCAATACCAACTTGCCCGTTTTGCCAAGGTGATATTTCTTTAAACCACATATTTAACTCATGCCCA:1 - chr2L 13956091 5' + I-element 5042 1 60.80 TATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCA:1 + chr2R 15392525 5' - mdg1 7432 2 53.27 TACTGGCTGTCTCATCATCGTCTTCATCCTCGTAGTCCTCATCTTCACCTTGGCCACTAGCCAAACGCGTGTTGTTGCCCCTTACGTCAAACTAATTGTTCCACGCCCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAA:1 + chr3L 2155039 5' + gypsy7 5006 2 57.81 AAATAGGCCGGACCGAAAAGGCAGCAGAGATCAGACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:2 + chr3R 27606573 5' + 412 7086 2 54.79 CGTGACTTTAAAATGGTGATATTTCTATAATTGGTGTAATTTGTTTGAAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAAC:1 - chr2R 10119090 5' + Juan 4069 1 55.48 ATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3L 13285583 5' - roo 345 2 63.01 AAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr3L 15718152 5' - 1360 3334 1 68.00 ACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTA:1 - chrX 21087699 5' - mdg3 5496 2 61.54 CATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 30569066 5' - mdg3 169 2 65.75 AGGGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 - chr3R 8050552 5' - hopper 1361 1 54.79 ATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - 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chr4 1022831 5' + Idefix 7147 2 71.92 ATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3R 26854719 5' + jockey 16 1 72.50 ATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATCTGATGTGT:1 + chr2L 2493977 5' - Tirant 8478 2 56.85 TGATATTTCGCAGTGCACAAAAGAAAAAGACGCTTTAGGAGAGCAGAAAGAGATGGATAGCTGCGGCAGGAAGTGGGTTTCCCTTGGCGTGCGAAAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGCTGTTG:1 + chrX 17484480 5' - blood 7174 2 85.27 TAGGGTGGCTCATTAGACTGAGCGAAATTGGGTACATACTTTTCGAAAAAGTTGAAAATATACATCAGCTTCATATATAATTAATATAACTGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCG:1 + chr3L 7787445 5' + flea 26 2 65.22 TGCCCCGACTTCACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGNAATCCGTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTNAACGCAGCGGAGAGGAACTACTCTGCA:1 - chr3L 23678168 5' + Osvaldo 33 1 64.34 CGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGCAGATAT:1 + chr3L 25232767 5' - accord2 128 2 65.07 GTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGC:1 - chr2R 5621047 5' + ZAM 31 2 57.89 CAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAT:1 - chr3L 7751139 5' - 412 448 2 53.15 ATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTG:1 - chr3R 10144456 5' + Chimpo 49 1 57.72 TGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAC:1 + chr3R 13868937 5' - HMS-Beagle 6989 2 71.55 CGACCAGAAATGGGAAACTTAGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 - chr2L 14056812 5' + pogo 16 1 63.57 CTCTATTTCTTGGTTCTCAAAAACTTTGGTTAGCTTAGAAACTAGTTCATCTTAATAAATATAGAAATAGGCATTAGATACATATTTATATGTTTTTAAGATTCATTTGGAAACCATTATATTGAGCCTAATTATTATTATTATTT:1 + chrX 14157563 5' - invader6 4390 1 55.48 ATGTATAATTGCGCATATTTCTTAAACTGTCCCGCAAAGAAAGTGTTGAGTACGAAATATTACGTTAGATAAACACTTTTTTAAATTGTGAAAAAATAAGGTAATAGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr2L 12158718 5' + 1360 10 2 70.55 GCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 + chr2R 12492368 5' + hopper 3 2 77.10 ACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr2L 17019174 5' + 412 62 2 60.96 AATCATTGTCGTATATTTACCATGAGAAACGTTGTTATTGTTTATTTTCTTGTTTTCTAAATGTATAAAAATCGATATAAATATATATATATATATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCTCGCC:1 + chr3L 3861389 5' - micropia 5432 2 72.00 AAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 22523159 5' + jockey 65 1 60.00 TTCCTATTCATAATAACATAAAAAAACCCTAAATATCTGAGACAATAATAAACATTTAATGCTGCGTTTCCCACTTTTAAAACCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3L 9695901 5' + 297 6617 2 60.96 TATTGTACATTTTGCACGAGGGTCCAACTGAGTGCCAAATCCCAAACGAGAATGGAAAGTTCTAAACAGTGAGTACTAGAGGGAGAAAGCCAAAGTGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATA:1 + chr2L 19248097 5' + mdg1 7063 2 68.49 TTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr3R 11284995 5' + blood 7061 2 56.72 CTCGACACAGTCAACCTCAATCACATTCCGATTTGTGGCAATTATTTTGGAAAATCTAAAATGATAAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCTTAAAGTCTAA:1 - chr3L 8824579 5' + transib2 20 1 71.23 CAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACGTCTTCTCCCTGTTCCCT:1 - chr2L 23295919 5' + micropia 40 4 71.13 CCGACGAGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAAC:1 + chr3L 24272053 5' + gypsy11 4036 2 65.00 TATATATATATGAAAATATTTTTAATATCACGGGTATGTATTTTGTCTTTTGAAGTTACTTGCTTTCTAGTCCATACTAGTGTAAATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 + chr3L 7849552 5' - copia 218 2 59.59 AAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 6015702 5' + roo 33 2 57.93 AAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 23964929 5' - hobo 2921 1 68.29 AAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3L 22320125 5' + jockey 21 1 68.46 ATATTTAAATCTGAATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATAT:1 - chr3R 31114374 5' - flea 204 2 55.24 TGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chrY 2720394 5' + 297 6617 2 61.64 TTCGCGGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCCACCGGG:1 + chr3R 12341119 5' + Tirant 43 2 69.89 GGACGCCCAGTGATGGGCACTATTTTGTCTGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr2R 21796125 5' + roo 51 2 53.10 ACAATTAAAAAATATACTCTATCAGTGCCATTTTTCTGTTTGCTACTAATGCTAATGCATATGCAGTATAGACTAGTGTTAGCATATATAGACTTCATTTAATTGCCGTTACGCGTCTGCTTTTATATTAATTTGCTTTATTTTAT:1 - chrX 2664312 5' - TAHRE 36 1 71.92 GATTTCAACTAAATTTTGCCAGCTTTCATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCA:1 - chr3R 30955460 5' + G-element 9 1 74.48 ATTTTATTACAAAAGTTTGTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chr3L 1459875 5' + 412 7121 2 65.07 ACTCAAATATGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTAT:1 - chr3R 10737105 5' + F-element 24 1 72.54 ACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCCACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCNCAAATAGTTTGNACACAA:1 + chr3L 27415238 5' - transib2 2739 1 73.97 GCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTT:1 - chr3R 11284984 5' + blood 35 2 56.48 AGAGTCAAATGAGCCGCCCGTTCTGAAATCAAATCACTTTATAGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGC:1 + chr2L 20407715 5' + McClintock 5960 2 80.82 GATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATTTTTATGCACGC:1 + chr2L 2057821 5' + 412 7133 2 70.55 GGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACGAACTAA:1 - chr3R 12146747 5' - gypsy10 283 2 56.16 ATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGAACTCTAG:1 - chr3R 10714263 5' + 297 47 2 52.74 TAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chr2R 7720041 5' + HMS-Beagle 6822 2 66.43 TTTCGGACATTAACACCCGATTTCGAAATCGTTTTTATTTTCGGGGCTCGTTTCTATAAATACTACTCTTGGAATTACCAACCATACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 + chr3L 22750762 5' + 412 34 2 60.69 AAGTGGCTTCAGTTGGTTAAATTTGTGCCGGCTGCTTGGTTCGTTGGTTGACTGGATTCGGTTTCGTTTGCGTTCGCTGAATAAGCTGTAAGTGGGATTTAC:1 - chr3R 28061954 5' - Porto1 4303 1 68.63 TAATATGTACTTACTGTAATTGTCGTACAAAAAATTTTAAAATGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2L 388653 5' - roo 9045 1 64.14 TTTCGGATGAGTTCTCTTTGACTATATCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCATTTGGGTGCAGCCGCCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr2L 9795444 5' - blood 7319 2 73.98 TTAAAGGTTCCCCTTTTCTATTTATGTTATCCACTTCCAATTGGGTGTAAACCCATGTCTGTGGTCTCCTTCAGCTGTGTGATGGATTCCCAGTGATGGATCTCGAACCCCATTGAAAATTTGTGGACCTACTTAAAGAAGAAG:1 + chr3R 5263209 5' + S-element 1258 1 76.39 TAAATCTAGTCCGGTAGCGATTAAGCTTCTCTAAGCCCATAGCCAAGCACACGTGGCGGTACCTCGGCGAGCTGTCGTCCACGAATGGGCAATGCGTTTGCCGATGACTATTTTCCTCTTCCGGAAAATCTGCTCTT:1 + chr2L 22699145 5' - HMS-Beagle 442 1 59.12 ACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 - chr3R 10737047 5' + F-element 86 1 71.23 GTTTATGAGGTGCTATAATTCTTGATGAACTAACTAAATGTTTTTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAA:1 - chr2R 19389483 5' + 297 6584 2 71.23 CAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr2R 7314610 5' + blood 7023 2 66.95 CGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATATACAAA:2 + chr3R 12948632 5' + Stalker4 92 4 78.08 CAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCGTGGCAACCAGCTTCGCCTGCGTTGGCGCCG:1 - chrX 23280901 5' - R1A1-element 482 1 58.82 AATCCAAGCAAAGTTTCCCTCACCCATCAAATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCA:1 - chrX 684875 5' + jockey 4743 1 74.02 GTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:2 - chr3R 18128543 5' + roo 8716 2 56.16 AATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATT:1 - chr3R 6014078 5' - hopper2 1559 1 68.79 GACCTGCAACCTGCCAACTGAAGGCGACCTGTGTGGCATGTGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCG:1 - chr2R 22957976 5' - hobo 2908 1 65.31 GAGGGACGTTGGAAAGGAGCAGGCAGCAGGCCAGTGGATGCTGTTTGGAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTAT:1 + chr2R 14072476 5' - mdg3 211 2 58.22 GATGTTGTGGCACACTTAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATACGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 13285616 5' - roo 9036 1 73.26 GTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 + chr3L 2532455 5' + blood 7073 2 70.54 CGATTTTGTTTGATAAACAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3L 13285726 5' + roo 17 2 73.97 GCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCA:1 - chr2L 22684602 5' + transib3 69 1 55.48 TTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCA:1 + chr3R 13406399 5' - pogo 2054 1 53.42 CTTTACAATTTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAA:1 - chr2R 13256050 5' + 17.6 67 2 74.66 TACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 + chr2L 6149104 5' - hopper2 1558 1 51.37 CGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTGAG:1 + chr3R 26180435 5' + Transpac 4998 2 71.92 GAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2R 21796033 5' - roo 8994 2 73.10 CAAACTATAAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAACTAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3L 14422851 5' - roo 398 1 71.79 TTACTGTCGATTGACAGCTTATTTGCTAGAATAATTGCTTCCATTTAAGAAAAAGTCGATTTAAATCAAGCGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCTGCCAAA:1 + chr2L 17269098 5' + gypsy6 41 2 56.34 CTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATT:1 + chr3R 19950450 5' + BS 5058 1 62.76 CACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr2R 1857480 5' - 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chr2R 9618234 5' - roo 9031 1 56.16 TCCTAATCTATGAATTGAATGAATAATAATTTATGGGAAGCTGAAGCTTGTTATACAATATTTATTATTATAAAAACTAAGTGTCATAAAAAGTCTATACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACC:1 - chr2L 10943912 5' + opus 20 2 71.92 ACACACTGGCAAACTTTAGAGGAAGTTTTCACTGCGGCTCAAAGTGAAAGGGCCAAAAAGAATCCGCTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chr3R 31159293 5' + hobo 56 1 53.42 TACGTGTTCACATATTTTTAGGTTTCCGAATTTATCCCCTTTACTAATTAGTTCCTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:1 - chr2L 21559355 5' - 1360 3325 1 60.96 CGGGTAAACTAGCGGGTGGGTGCGTCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCT:1 - chr2L 2544854 5' - blood 7365 2 62.60 AGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGGAAATTTTTATTTTAAAGAGG:1 - chr3L 20187415 5' - FB 468 1 55.48 CGTTTCTAAAATTGGTCGTATCGCTATAAGAAATGTTCATCGTTTGCATTTGCGTAAGGCACAACCTTTTACTCCTACCCGTGCAAAGGGTATTATTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr2R 5179711 5' + 1360 23 1 71.92 TTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGGTTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCACTTACAAGTAACCGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCT:1 + chr2L 8284345 5' + Doc 377 1 59.62 TGTCTAAGAAAAAGTTTGCCAAACTGCACAAACAAGTTTTTCGCTTCAACATTAACTATTTTTTATACCCTAATTTGCTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2R 6700023 5' - roo 9033 1 58.22 AATATTTATAAAAATAAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 - chr2L 18311518 5' - opus 427 2 72.60 TTTGAGATAACATGGACTTTCGTATAGTTGGCTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGAGCATTGCTCAACAACATGTAATTT:1 + chr2L 514981 5' + roo 8790 2 76.03 AAGTGTCCTTAGGCCGTGTATGCGTCTCGCCCAAGGATGTTTCGTCCTGAAATTCGTCGTGGAATTTTAAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGATTCGTGTATTGTAGTATGTGACTATGCAATATTNAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 7750982 5' + 412 7071 2 65.07 ACTTGTTGCATGTCCCAAAGTTAAAACGTATTTTAGTGAAAAGTATTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTG:1 + chrX 17048169 5' - jockey 4922 1 71.23 CTGTCTGGTCAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr2L 17019201 5' + 412 7088 2 64.38 CAGCGGGTCGGTAGCACAACGGGCGGAATGTTGCGTCGGTGGTGCTATATATTGCGGTGGATGGCAGTGTGTTCGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chrX 11983125 5' + 1360 27 1 53.60 AGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 - chr3R 6419922 5' + Tabor 82 2 71.23 GGGTGTCGTTTTTACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGAAATAACAGTAACATAA:1 - chr3R 19950554 5' - BS 5054 1 55.86 CACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 14884104 5' - roo 8990 2 73.29 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCT:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 4982 2 63.85 ATTAGTTATTTGGTTATATTTTGTTTTGAAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTNCGCTG:1 + chr2R 11246935 5' - 1360 132 1 62.76 AATCGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGC:1 - chr3L 2317268 5' + 412 25 2 67.12 AGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTAT:1 + chr3R 10736025 5' - McClintock 6372 2 60.27 CTCATGTTATAAATAATTTATTCAACGCCGGCCACTGCAGNTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCNCTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 24666334 5' - hobo 2911 1 61.83 TGTTTGTACATCAAACGTCGCGGATCCGAATAGTTTCCAATTAAAAAAAAAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 6700137 5' + roo 63 2 67.61 GATGGGCATTAAAAATAAAAAAAAAAAGAA:1 + chr2L 6105603 5' + TART-C 11101 5 76.67 GGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - 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1360 3386 2 80.62 GAAATTGGTGCAGTTAGATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTAGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTT:1 + chr3L 22518943 5' - hopper 1331 2 71.92 TTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2L 512447 5' - roo 8993 2 77.14 GAGGAGCAACAGAGATAGCTGCTGGGTGGAAGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 7929626 5' + roo 40 2 54.23 GTGTACCAAAGGCATATACTTCAAAAGTAAGTTAATTTTTTGTTTATCATTAATTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAAT:1 - chrX 21639457 5' + 412 7070 2 73.97 GGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3L 13285702 5' + roo 8699 2 60.00 AGACTGTGGCAAAATTTAATAAACTCTCACACCGCACTGTGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATT:1 - chr3R 12146787 5' - gypsy10 5983 2 80.00 CTATTATACAACATAACTATAGCTTGCCCTTCTCACTCATATTGTATACATACTCATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 - chr2L 5207533 5' - opus 435 2 68.49 TAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 3666535 5' - roo 320 2 80.14 CAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr3L 12227757 5' + opus 38 4 58.22 ACTGTATGGAAAAAGACCAACCCTTGTAGTCACTCCCTCGTTTCAGTGAGTCTGAGCATCTCGATGTAGCCATGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 24466148 5' + 412 7069 2 52.05 TTTCTTTCAAAGACGCCTTTATTAATTGTACCCGGTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCAATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chrX 21097331 5' + 297 14 2 71.23 TTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr3L 7024469 5' + 412 85 2 73.29 GCATTTTCATCGAGACTTATTAGAGTTTAGCTTGAAGCAGTCTCGGCGATTCGGCGTCGGCCCTCCTCCCCTCTAATTGGGCTCGAACCCTTCTGTGGTCTTGGTCACCACAGAGTACGGGGCTTACTCA:1 - chr3L 24704230 5' + baggins 4969 1 55.38 CTTGAGCTGGAATTATCACATAAATCACTGGCAGCAGTAGCAGAAACAGAAACAGAAACAGCACCAGAATCAGAGTCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATA:1 - chr3R 27815050 5' + I-element 451 1 54.07 TATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 - chr2L 19248225 5' - mdg1 352 2 62.33 TGTGAGTTTTCGCAAGTCTTTTATGATAACTAATTTAACACGGAGAAAAATGTGTACCAAGTTTTTACTCAAACTTAAATATGTTTAAATATTCAATATTAAAGATCCATTTTTTTATCGGCTCTATAAATTTTATTATATTTTAT:1 + chr3L 7619546 5' - transib4 2280 1 86.30 ACCACCCGCACCACCAGCAGCCACACCACTCAGGCTCAAGTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTG:1 + chr3L 7450162 5' - jockey 4678 1 63.64 GCTGCCGCTATAAATTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTACATCG:1 - chr3R 15668218 5' - G2 2989 1 72.41 TCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATT:1 + chr3R 20752906 5' - 1360 3326 1 72.44 GAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3L 22320131 5' + jockey 35 1 60.14 CGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGG:1 + chrX 13091035 5' - P-element 2828 1 43.84 CGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATAT:1 - chr2R 18887029 5' + roo 8668 2 64.15 GCAGCACACAAATGCAGCTAATGTGCAATCCGTTGCTATTGTGCAGAAAACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCTGTGTTAGAGCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCC:1 - chr3L 11535915 5' - roo 213 2 59.59 GAAATATAAATATATATAATATACATAATATACGTGTGGGAAAATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCT:1 + chr2L 11949505 5' + F-element 264 1 55.48 AATTGGATTACTTAATTTCAACTATGCCAGAAGCTAATTTGGGCTAGAAATAATTTAGTTGGGTTTAAAAGTGTAATTTAAAAGGAAATAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGC:1 - chr3L 14888897 5' + flea 27 2 67.12 TAGTCGACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACTCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTT:1 - chr3L 1437957 5' + Transpac 4991 2 66.67 GTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAACATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTCGTAATTT:1 + chr3L 27349999 5' + 297 53 2 55.48 CGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTG:1 + chr3R 9298461 5' + hopper 46 1 53.73 TTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3L 2167691 5' + opus 7055 4 64.18 TAATTACATTTAGCTTAAGTGTAACCATTTGCAATATTTATGGGATTTTGTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTT:1 - chr2L 18510807 5' - copia 215 2 65.75 CCCCTTTCACCACTTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 - 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Transpac 5204 2 68.53 GAGTATATATAATAATAATATATAATAAGCATAATTAGCAATGTCCGTATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATA:2 - chr3R 26954212 5' - Burdock 6320 2 67.12 GCAAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTT:1 - chr3R 26927457 5' + roo 84 2 74.66 TTAAATAATAAATAGTCATGAAATTAATGCCAGAATTTGCAAGTAGTGGGTATACTTGTTGAATTAATGTACTACACTATAAAGCATTATGGTTTGCCTTGTATTCTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAT:1 - chrX 18191440 5' - BS 5081 1 68.28 CAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr3L 21764450 5' + hobo 42 1 57.63 CTTTGCACGAATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTCTTTTGGCATAAAGTC:1 + chr2R 21795199 5' - transib2 2807 1 73.97 ATTGGTTGAGGTACTGTCACTTCATTACGCCGCATGTGTTCATCTGAGCTGCAAATAGTAATTAGACTTGCAATCGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTG:1 - 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Cr1a 474 1 53.42 CAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTCCCTGC:1 + chr2L 8284315 5' + Doc 385 1 74.65 ATATTGAAAAAAAAAAATTCAATTAATAATATCAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGC:1 + chr2L 17861775 5' + Doc 92 1 58.33 CGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 + chr3L 414869 5' - 412 407 2 76.39 AAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTT:1 - chr3R 20887490 5' - Doc 4605 1 63.01 AGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTTGCC:1 - chr3R 4604451 5' + gypsy 153 2 59.22 GCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 + chrX 21087579 5' + mdg3 5295 2 58.96 TCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCCGGAAGACGGCAACCGGAACACCGCATC:1 - 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blood 7332 1 65.60 AATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGC:1 - chr2R 4122895 5' - rover 369 1 78.77 TAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1 - chr2L 19248214 5' - mdg1 7379 2 69.86 TATTGGTTCCTCTAAAAAGAACTCCTGGTCTGACTCTGCGTAGTTAATCACCTTTAGCAGGCTTTGTTTTGACACTGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTT:1 - chr2R 2046582 5' + Transpac 48 2 52.74 ATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:2 - chr3L 414958 5' + 412 7099 2 54.79 AGCCAAATAGCCAAATGGCCAAATGGCCAAAGTGTCGCCAAAGTATTCTATGTAAAAGCCAAAGAATGCGTGTTTGCTTTGGAGTATATGTATTGTATTAATGGGTCGCTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr3L 1004788 5' + jockey 4689 1 69.44 TTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCC:1 + chr2L 8284345 5' + Doc 419 1 52.05 GTTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 + chr3L 2167572 5' - opus 7498 2 76.15 GAGTCGTAAAAGGAAAAAATAAAACACAAGCTGATAAATCAGTTTTATGGCACTTTTGCCAAACTTGCATATAGAGTATCTTAAAAATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTT:1 + chr2L 8536500 5' - Juan 4185 1 60.00 CCCAAAAAGTATGCTACAAATTGCAATTTCCGCTGGTTAATTGCAGCATCAATATCTACTCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACT:1 - chr2R 22796853 5' + jockey 4842 1 58.90 GGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTGGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATAT:1 - chrX 14770551 5' - INE-1 76 1 64.38 AAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTC:1 - chr2L 4864450 5' - mdg3 5414 2 73.29 ACCGCGTCACGTCTACAAGTTGCCACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2L 20718802 5' + jockey 4691 1 62.71 CACAGAATTCTTATTCACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTGTAAATAG:1 - chrX 20284528 5' - roo 345 2 56.34 GTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGG:1 + chr2L 5207441 5' + opus 180 4 65.28 GTGCTATTGAACCCAATGGACGTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 - chr3L 7751168 5' - 412 480 2 75.00 AACATTTGACTTGAAACCCTAAATGGAAACTATTACTCTGGCAAAATTGTATGTAGTTAACACAAAAATGTTAAGTAATGATGACACCAACGGCACCAACTTCGCCGCGAAGCCGTCAACTGCCTTCGACAGATGGTGCTCTTTGG:1 + chr2R 5343196 5' - Osvaldo 1319 2 57.53 GTTGTCTGCATGTGATTTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 + chr2L 15420667 5' + Burdock 6216 2 73.29 GATGTCAGCTACATTCTGGCAAAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chr2L 6618855 5' + 17.6 6943 1 69.86 GGGAAAGTTTAAATTTAGTACACTAGTACATTATACATAAACTTATAAGAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 - chr2R 17269239 5' + roo 27 2 66.44 TAGTCAATAACTTTCATCACTTTTTTTCTCAGGAATACGATTGGACTCTGACCCAGAAGTCGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGCGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACG:1 + chr2R 22833088 5' + HMS-Beagle 6841 2 51.52 TTTTCAGTTTAGGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:2 - chr2L 512530 5' + roo 55 2 56.16 ATAGTGGAGAGATCTCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr2R 17269094 5' - roo 357 2 52.74 AATAAGAGAACCCCCTCAAGTTGGTTTACCCATGGTTCTGGTCTGGTTAGTAGCCCCTTTACACCCAACCACCCGCCTCAGTAGTCCTCAGATCGCAGGCTCCTGCC:1 - chr3R 14276074 5' - blood 411 1 73.83 ACACGGAAAAAATAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCT:1 - chr2R 14072591 5' + mdg3 5314 2 62.22 CAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3R 30087690 5' - roo 359 2 53.24 AGGATTATACACATTCAAATAAAGAGATAAACATTTATTTTTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTG:1 + chr2R 10119005 5' - Juan 4128 1 76.03 GATTCTATTTTGGGGTATTATTTCTGAATATTAAGTGCCAACGGACTATGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGGTGCATTGCTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCA:1 + chr3L 20064534 5' + roo 147 2 64.75 GCAGTAGGGAATTGTGACCCTGGGGTCGAAATTATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chrX 666240 5' + 412 29 2 64.38 CGATTCTCCACCATTTCGTCTCTCCACCATCTCGTCTCTCCACCATCGCTGATCTCCACTGCTTTTTCAATCAGTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGT:1 + chrX 3811579 5' + P-element 48 1 51.03 CACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 + chr3L 6557126 5' + Doc 66 1 61.64 GTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2R 23095010 5' + 412 18 2 70.83 ATCTGAAGGAATATCAATTTCAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGATCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3L 6015723 5' + roo 8675 2 72.92 GAATACAGTAATGTTTAATAGGTCTAGGTAACGCATTCTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2R 16567284 5' + opus 157 4 64.60 AGTCACATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chrX 11232500 5' + roo 54 2 57.53 TAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCAT:2 - chr2R 4261958 5' - invader4 213 2 63.01 GAGGTGGTTATTTGGCTATTTGTCTGCTATCACTTTGTGCGTTGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAA:1 + chrX 12260587 5' - 1360 41 1 86.81 ATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCTGCTCACAAGTCGTG:1 + chr2L 8284329 5' + Doc 403 1 63.01 ATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 - chr2R 17350581 5' + F-element 88 1 69.29 CATTTAAAAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGACGAGATTATGCTATTTTACGTGT:1 + chr3L 11837695 5' - G5A 2713 1 47.95 ATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTT:1 - chr3R 10736131 5' + McClintock 6003 2 60.87 ATCAAAAAGGCACTTTAGAACCAACTCCACACACTGGCAAACTTTAGAGGAAGTTTTCACTGCGGCTCAAAGTGAAAGGGCCAAAAAGAATCCGCTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCCCTCGACTCACACCCTAC:1 - chr3R 31159321 5' + hobo 28 1 65.75 ATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 14422710 5' + roo 39 2 53.60 CACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAG:1 + chr2L 20718825 5' + jockey 4735 1 64.75 AAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTA:1 - 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INE-1 143 1 66.44 TTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATAC:1 - chr3L 4547746 5' + mdg3 5344 2 78.77 ATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTAT:1 - chr3R 31112284 5' - mdg1 367 2 56.16 GCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 - chr2L 15085739 5' - opus 7468 2 54.26 AGAAGGAATTGCATTCATGGAAGTCTTGAGAGGTGAATTAAATATATGCCTCATTTATTAGTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATTGTTCACACATGAACACG:1 - chr2L 13229280 5' + roo 8661 1 71.54 GATCGGGGACAACAAATCGTAATAGAATCTAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 - chr2R 9607390 5' + P-element 54 1 47.14 TTTCCCCCCTTTCTACAGAGAGAGAAAATGAGATTTGTTTGGATATAAGTTTGCATAATCCTAAAGTAGTCAATTTTTTTATTCAATAATCTACGATAACCAGAATTGAGTCCTTAAAATATATTAAATTTAAAAAATTTTATTTT:1 - chr3L 3394750 5' + HB 328 1 58.90 GTGAATCACTTTACATCACTTCCTGTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTG:1 - chr2R 20052509 5' - transib2 2786 1 58.22 ATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTTCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 20149252 5' - pogo 2057 1 54.11 CGCTTCAACATTAACTATTTTTTATACCCTAATTTGCTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 6700064 5' - roo 328 2 72.60 AAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:2 + chrX 21668563 5' + I-element 80 1 72.60 AGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCGATCTAGCCCTGTCCGTCTGTCCGTATGAACG:1 - chr2R 5213798 5' + INE-1 124 1 68.49 AATTTTATTTAAACTAACCACTAGTAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTCTCCTTGCAG:1 - chr3L 2532570 5' - blood 348 2 65.07 TAAAGTTTCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGC:1 - chrX 21575377 5' + INE-1 86 1 60.69 GCGCTCTGCGCAAACAACGTCTGGCAGTGAAAAGCTGACGCTTCTTATTCCGAGTGTTGCTGCACGCTGCAAGGAATGCTGAGTCGG:1 + chr3L 25804312 5' + gypsy 7134 2 83.91 AGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 + chr3R 28749114 5' - mdg1 345 2 66.90 ATTTAGAGAGCGGTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATAT:1 + chr3R 10144332 5' - Chimpo 159 1 67.12 CGAGAGCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCC:1 + chr3R 7049330 5' + Burdock 36 2 63.01 GTATATGTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAA:1 - chr3R 8197899 5' - pogo 2061 1 56.85 TCATTAATTTTTTGTTTTTGTTTTTCAGGTATATTAGCTTGGAGGTGAGTATTATATTTGTATTTATTTGATTTATTTATTGCATTGATTTTTTATCTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAATTCTGTTCCGCATCCACA:1 - chr3R 8130483 5' - TAHRE 10395 1 53.42 TGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 7848497 5' + jockey 92 1 75.35 GCAGTAGAAACTGAATAGTGGGGATACCAATCGCAGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTT:1 + chr3L 20189554 5' - FB 250 1 50.68 ACAAGCTATAATACATCAACATTAATACATACTAAAAATATTCTGCACTTTATTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 + chr2L 18219277 5' - copia 255 1 58.90 AATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 18183112 5' + Tirant 62 2 77.78 GCCCGGTGTTCTACTAATCTTGATGGCCTTCCACAACAGTCACATCGGGCTCCTCTACTTGCCGATAGTGTGCCTCAACAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 22709070 5' + roo 8704 2 58.22 CATATCTGTGTCCAAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chr3R 22647918 5' - transib2 2762 1 62.86 TCAGAGGAGCAGAGCTAAATTCTCTTTTATTGCAACAAATGAAGAGAGCCACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGATACTTTTAGCCGCCGTTTACATAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTC:1 - chr3R 16475465 5' - mdg3 5469 2 65.07 ATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr3R 26472789 5' - 1360 3344 1 55.71 GAAAACCTTCTAATATATGTACAAATATTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2L 11617808 5' + 412 48 2 52.05 TTTTTTTCATTTCACCTTCGGGTTCCTCAACTTAATTGCCAGAAAGAGACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2R 11558053 5' + 412 43 2 56.52 CTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCT:1 + chr2L 20407759 5' + McClintock 6002 2 60.42 CAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGTAATGGTT:1 + chr2R 23094901 5' - 412 400 2 82.19 AAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCT:1 - chr3L 4547754 5' + mdg3 84 2 73.29 ACAATTCGTGTTGTTTGTTTTGCACAAAGGAATGTCCTGCGTGGAAACTATTTTAGTCAACTCACAGTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGT:1 - chr2L 20029532 5' + I-element 13 1 75.86 CAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2L 13033299 5' + hobo 43 1 48.97 TATTTAAAGAATTGATGTTTTTACAATGCATATGCATAATTGCACTGCTGTATTTTTAGAAAAATTCAAACAAGCGACTATTATAACCGAATAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGA:1 - chr2L 8290480 5' + Doc 4458 1 68.49 CGAAATATTACGTTAGATAAACACTTTTTTAAATTGTGAAAAAATAAGGTAATAGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGATTGGCCCTATGCAGCCACTT:1 + chr2L 12158769 5' - 1360 3346 1 55.91 AAGTTTCGAGAGGCTCGAGGGGACCGCAGTCCCCGTTGATGTAGTGGAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTTTATTACTTTTATT:1 + chrX 8839303 5' - Tabor 7300 2 50.00 GCAGGCGACCAAAAGGGCGGCAAACTGCGTGAATCCAAAGGCTACGGGTTTCTCAGGCTGGCTTCAGTTAATTCGTTCGTATGCGTACAAAATGGCGAGATGTCAACAAAAACAAATGTTAATTACTTTGAAATATTCAA:1 - chr2R 23879877 5' - Copia1_DM 240 1 66.43 GAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGGTTGGCACTATGCTGCCACT:1 + chr2R 5179617 5' - 1360 3347 1 82.14 ATCAGACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chr3R 27606602 5' + 412 59 2 59.44 TAGAAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 + chrX 3533837 5' + 17.6 6943 1 74.65 AAGGTAAACGCAAAACGAAAATTGTCGGATGCCCAAGCTACATAGCTAAACGAAATGCTTTAAGTCTGAATTAAAACGCACCAAAAACGTATAAAATTTCGAATTCACACGATATTCACGGGTATCTGATAGTCGGGG:1 + chr3L 21141930 5' + INE-1 553 1 64.49 TTTTCCCTGTTTCTGTGATAATAGTAGTACGATTATTTTGTGTTGTTTATTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATAATGGGAAGATCCTAATCTTCACCCATACTCAGCGAATTGAGAGCAAAGGCTGAAAG:1 - chr3R 433129 5' - 1731 233 1 72.22 TGGCTTTAACTTTGCGAATAAGAGATGCGGAAACGACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3R 7074912 5' - P-element 2841 1 54.11 AATGCTGCCATTATCGGGGAGTTGGAGGCTATCCGAGAGGCTTCTACATCTCTGGTGTGTTTTCTTTCTTGTCCCCCCCAGTTTATGTAGGTTTTCTTCCTACATTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 19026780 5' + hopper 143 7 54.40 CAAATGTATAAAATGTGAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTA:1 - chr3L 1628719 5' - hopper 1363 1 54.11 ATTTGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr3R 21925081 5' + hobo 24 1 63.41 AAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATT:1 + chr3L 19951163 5' + Ivk 29 1 62.96 CTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTC:1 + chr3L 12227751 5' + opus 145 4 62.33 CATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTC:2 - chrX 21668376 5' - opus 463 2 45.89 TGAAGATATTCGTGTTTGCCGGCTGTTTGGAAGTTGGGGCTGAGGAACGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2R 9607302 5' - P-element 2851 1 48.18 TAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTA:1 + chrX 3533858 5' + 17.6 6940 1 72.03 CTATAGAAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGGT:1 - chr2L 11475190 5' + jockey 147 1 46.15 GGACGGGTAGCCTTGAGTGAAAGAGATAGCGGAATGGACAGCGGACAGGCTTTTAGCAACATGAAAATGCTTTATGGCAATTAAAAAGGTAATACATCAAATGCGAAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr3L 5051198 5' - flea 244 2 79.45 CTCTAACACAGGGAAGTAAATTCCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr3L 11535848 5' + roo 8683 2 71.23 CGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTCCAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr2L 23310599 5' + 1360 32 1 59.57 GCTTTCAGGGCATTCCACGAGATTCCGGGTGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 + chr3R 12613737 5' + HMS-Beagle 6829 2 61.11 AAGCATACGCAACGTAATCCATAATTTAGTAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTC:1 - 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chr2L 17574639 5' - hopper 1370 1 53.42 TAAATTCATGAATGAATACATGGATTTAGGACACATGATTGAAGTGAGTGATGAAGGCAAATATTTTTTACCGCACCAGGCAGTGATTAGAGATTCAAGCCTTACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGC:1 + chr3R 19445136 5' + Stalker4 7142 4 76.09 ATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3L 19579994 5' + jockey 79 1 65.07 ATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAG:1 + chr3R 19506722 5' + mdg3 60 2 56.16 GGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chrX 10725092 5' - pogo 2063 1 53.33 TAGAAAAAGGCGAAATGTCAACATATTTTTTGTATTTTCTAGCTAGCAGACAGCAAGGCGTCGAAATGGGAATTGGGATTGGAACATTCTCATAGCTAACATATTATTTATGATACTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 - chr3R 13155391 5' - hobo 2934 1 79.45 CTTTTTTAAATTGTGAAAAAATAAGGTAATAGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGGGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGCTCGCTCACG:1 + chr2L 12158793 5' - 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mdg1 364 2 54.11 AAAGGTTACATATAATATGTATAAGGGTGGAAGCAGATAAGAACCACAATATCAACGCACAGTTTACAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTG:1 - chr2L 901839 5' + jockey 4703 1 56.00 TTTGTCCAACTGATGGAATTAAATAATCATTAAAATGGTAATTTAATGAGGCGCTTTTGCAAAAAACAAAAGCAAGCCGCATGGCGATCGCACAATTACACACAACACACACACACACACACATACGCA:1 - chr2R 22560147 5' + accord 186 2 64.34 TATGACAGCAAACTGGGGTAATAATATCGAGAATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAAC:1 + chr3R 10714127 5' - 297 6935 2 51.03 AATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chr2R 21795208 5' - transib2 2798 1 67.81 TCCGCTTCCTTAATTTTGGCAATGTCCACTTCCAAAAGTTCCAGATTCTTGCGCTGCTCGTTACCCAGAGCATTGACCTGTTGCATAGCCTTTTCCATGCGATCCACTTAGTCTGGAGTTCAAAGCTCTTCTATACAACTCCGTCT:1 - chr3R 12011522 5' + Doc 4256 1 73.29 TTTTTATCATGCGATACACACTTCTAGAACGCTGAAACTACTTTTATCAATAGTTATTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 14821252 5' - roo 9054 2 60.96 AAATGAAGAAGATGAAAAGTTTTTCAACCTTCGGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 + chr2R 10977135 5' + roo 54 2 69.64 TATTTTATTACAAAGAAGCATTTAACTTGAATGTCTGCCTTATCATTTTAATTAGAATAGGTAATTATTTTTATATATATTACAAACTCAGTAATACAAAGCTTAAGATTTCAGTGTGTCCGTTTCAATAGGTTTATCATCATTAT:1 + chr3R 20841646 5' - Juan 279 1 73.97 AGTTTATAATTTAAAATTATCAATGTTCCATATGTCCCTAACATTTTAAAACTCTGAAATATCAAGGGTTTTTTTATTTTACTTTGCTTTTATTTATTGAATCTTCTTGTATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTAT:1 - chrX 8125357 5' - F-element 4620 1 54.79 GCGAGGCGCTAAAAGAACAATGTGTCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATT:1 + chr2L 15420000 5' - Burdock 6359 2 58.57 GCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr2L 17019146 5' + 412 7102 2 72.38 TTTAGTTAACTAATTGCACTCCTTTTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTG:1 + chr2L 10536419 5' + flea 4762 1 77.93 CCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAAC:1 + chrX 22679660 5' + Doc 104 1 66.90 ATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATA:1 + chr3R 7625303 5' - hopper2 1545 1 59.59 CGCGGGATCTCATCCATAATCCTGTGCCACTTACAGCCGGGCCACGTGCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 - chrX 20330647 5' + P-element 9 2 72.80 AAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 + chr2L 5207464 5' + opus 7040 4 70.33 TAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCC:1 + chr2R 7720041 5' + HMS-Beagle 6828 2 63.70 TGATCTTATCCATCAAATAAAGACAAATAGGATATTCGATAAAATAATATTCATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTAT:1 - chrX 20145626 5' - Bari1 1664 1 52.05 GCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 - chr3R 11284984 5' + blood 67 2 66.43 AAAAACATTTTACTCTACTGATTTGCATTTTGTCAATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGCGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 17987612 5' + jockey 23 1 66.67 TAGAATCCTTATGTATTTTTTATTGCCTTTTGAAAAAACATTTTAGAGTTAAAACACCAAAAATAAATGCATTTTTTTTTTTAAATATTTTTT:1 + chr3R 22184264 5' - TART-B 10505 5 87.10 CGAACAGAAGACAGATTTTCGGTTAATTCCAATACTCTGCTCCGGTCACTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chr3R 7074807 5' + P-element 69 1 43.15 TTCATTTTGTGTTTGTATAAAATTCCATAATATAAATGTTATGATGCGTTTCAAAAGCTCAAGTGTATGTAAGGCTGTTTTTGACGGAACCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTA:1 + chr3R 30568942 5' + mdg3 5265 1 65.62 TGATCTTACGAAGGGCAAAGCCAATTTTCTGCGTTCTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr2R 3492824 5' - 1360 3344 1 69.52 TGTTAGTTGAGGTTTTTTGAAAAGTTGATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAAC:1 - chr3R 11568698 5' - BS 5064 1 58.52 TAATATTAAATATCTTTTTTTTAAGAATAATCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3L 5027120 5' - roo 401 1 78.08 TCTACAAATGCTTATTAAAGCTGTTAAACTACATTTTTAGAAAAAACTTACGATACGACATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTG:1 + chrX 21092409 5' + 297 330 2 59.59 TAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCATGCTCTCTCGACTTTT:1 + chrX 609388 5' + 1360 80 1 72.03 ATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - 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P-element 2805 1 30.14 GAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTACATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chr3R 20841403 5' + Juan 73 1 64.14 TGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chrX 18673725 5' - roo 8982 2 76.03 ATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 18832333 5' - roo 9033 1 54.29 TGTGATGTATTCTATATGAATCCCTATGGTATAAAATTTAACATTATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTAACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCG:1 - chr3L 2167754 5' + opus 1 2 79.45 GGTTCAAGCCGAAACATTCAGGTAAAATTGATAAATATTCAATATTCAATATTGTTCACAATCCATCCAACTATCTATCCAATTTAAAAGCGAAACAATTATATCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCT:1 + chrX 17884455 5' + pogo 14 1 70.55 ATTAGCAATTATGCTTGTAAAGCCTCGAGCATCAAACTTTGATAAAAAAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGC:1 + chr3R 23644829 5' + diver 5916 2 66.44 ATATACTAAATGCCAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCATTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 5870912 5' + roo 8710 2 53.47 CAGTGGTATTGATTAGTTTATTTATAGATTAATTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 20904917 5' - roo 400 1 76.81 ACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chr3R 18832363 5' - roo 9008 2 65.19 GTGGCAGTTACCTACTGCTTTTGTTGCTGTTGTTATTGGGGTCTGGGTAACTGGCTCCGAAAATACAAAATACTTGCACAGCACACGGCTTTGTGCGATACTTGGCTAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3R 11937919 5' + hopper 8 2 79.86 AGTAAAACAATTTCAAGACCGGAAGGGCCACCTGTTAGTCGAATACAATATATCAGAAACACATTCGCTGTGATATTGAGTGCATGCCATCGAAGCCATTCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 - chr2R 21795385 5' + transib2 7 1 78.95 AGTCAACAAATGTTAATGAAATTTCCTGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAG:1 + chr3R 26180401 5' + Transpac 45 2 59.59 TTAGTATACCAAGAAAATTNACTTATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 10897562 5' - roo 9033 1 58.90 AAACTTCTTAGTTTTCAAACGTGACTGCACCGAATCAACACATACATAAACACTGGCCACAGACTGTACTGTTTGTATACCCTTTCCCGAGGGGAACCTGTGGGGGGAAATTAAACAAAATGTGTCGAAGAACTCCCCGACGTCTA:1 - chr2R 6984425 5' + HB 1195 1 69.86 ATCAATGAAATCATCATATTGTTGTCCGCGATTAAAAATTGCGCAGATAAATAAATCTTAATATACTAAATTATTTATATGAATAGTGTTTTAATAATTCATTTATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr2L 13229049 5' - roo 398 1 73.79 ACTGTGAACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chrX 21443061 5' + Transpac 4977 2 55.17 AATTACTTTCAAATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chrX 12979397 5' - transib2 2809 1 75.34 ATTAGGTTTTGACGACTAAGGGATACTTAGTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 + chr2L 4244840 5' + 412 7073 2 68.06 AAGTGCATGTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr2R 23094871 5' - 412 431 2 62.76 TATTTAATAATAATAATAATAATATGGACTGTGCCCACCAAACAGAGGGACTTGCCGACGCTGCAAGAGGCCTTACAAGAAAATCCAGCCGATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTT:1 + chrX 10693438 5' + hopper 2 2 80.34 TAAAGGAGACAAGTCCTGGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 + chr2L 1044967 5' + mdg3 5290 2 51.67 ACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGT:1 - chr2L 15019986 5' + BS 4799 1 77.27 ACCTGCATCAAAACTAGCAAAACGGATGTCACCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chrX 21233349 5' - roo 346 2 78.99 GTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATT:1 - chrX 3533976 5' - 17.6 7354 2 67.12 CAATTGAACTGACTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr3L 15393663 5' + pogo 39 1 54.79 ATTGCCGTGACATTGTACAAATTTATTCAACTGCGACCTGCAACCTACCAACTGAAGGCGACCTGTGTGGCATGTGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGACACTCGCACTCTACGTCCACTC:1 - chr2R 22958010 5' - hobo 2920 1 65.83 AAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 + chrX 11232511 5' + roo 62 2 64.34 AAAGGAAATTTGGATCGCGGAAAGAGAAATGCTGGGTTAGAGCACAATTTATTAAAAGCGGAGCATGGAAATTGCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 - chr3R 18294968 5' - copia 248 1 76.03 CCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTA:1 - chr2R 8286790 5' + Burdock 59 2 59.59 AAATAAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAA:1 - chrX 18745410 5' + Juan 4101 1 67.12 ATTTATTTTCAAATAATAATAACGTTAAGACAATGAAAAATAAGAATTTTTGACATGGTGCCAATTGTTCAAAAATCCTATAGATTTAAAGTCCAAGCACTTCCAAGGTAACGCGCATATTTTGTCAAATTAATAAT:1 + chr2R 4826124 5' - 1360 202 1 75.18 CTAGTGTTTTGGCTTTTCTTTGCTATCTCATCTCTCCCAAAAGAGAGGGAGAGAGTGCTCTTGGGTTCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGT:1 + chrX 19886928 5' + P-element 54 1 49.32 AGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACG:1 + chr2L 20407765 5' + McClintock 6010 2 65.07 GCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTT:1 - chrX 8839364 5' + Tabor 6922 2 71.92 CAAGTTCCTTTTCTGATGCTTCCCGATCAACGGTGCTACCTTTTAAATATAGCTTAGAAATAATAATAGCCTAATCTTCTATGTACATAATACCAGAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATTAGAATATTTGTCATTAGAGTA:1 + chr4 1195541 5' + 1360 399 1 71.92 TATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGTCATGAGAATCGCATCT:1 + chr3R 13254933 5' - roo 8989 2 78.46 AGAATTAAAGAGTGGCGAATCCCACGCAATGTACACAATCCACATGCGAGTACCAAGTGGTAGTCAGCACACATGACGGCACTGAAAGAAAAATACATGGCACACATCTGCCTTCATCGTTCACGCAGCGAGCACACGTCCGCAC:1 - chr3L 23603270 5' - Bica 53 1 75.86 AAGACTCGTTGTCGTCACGCACGACAACAAACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGCATGCGCATATTTCGAGGGTACACT:1 - chr3L 10033705 5' + blood 7020 2 75.00 TAATCAGGACCACAAAGAAGACATGGAGATTTCAGAAGGTATCTATAGGGCAGTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTT:1 + chr2R 2046477 5' - Transpac 5169 2 60.74 TTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGTGCCT:1 - chr3R 3268036 5' + mariner2 140 1 76.74 AGCAGGCCTTGAAAATGAGAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCG:1 + chr3R 7579352 5' - Stalker2 370 2 62.33 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTATGATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGG:1 + chr3L 27396714 5' - gypsy6 7775 4 49.57 ACGTCTCTTCACGTATTTGNAAAAAAGCTAGAAATGTATGATACGGCATGCTGATTCCCGATCACCAGTTTGGCTTCAGGCGG:1 + chr2R 4955346 5' + G7 365 1 68.67 ACCGATTGCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 + chr3R 25158581 5' - 1360 3364 1 56.64 AAAAAGCTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGCAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATC:1 - chr3R 6419981 5' + Tabor 6853 2 66.44 ATTTGCAAAGAAAGCAATTTGTCATGACATGATATTTTGTTTATCCAATCGATGGGCTGGGCGATAAACTTAATTACCGTTAATTAACTCTTTATAATACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:2 + chr3L 9317938 5' - P-element 2864 1 71.92 AATGTGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTC:1 + chr3L 25206786 5' + HMS-Beagle 6827 2 62.86 CTGGGCGGAACTGGTTAGTTAAGTGCATGTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 + chr2R 23094851 5' - 412 7510 2 58.27 ATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:2 - chr3R 13423388 5' + 297 49 2 54.11 TCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCAT:1 + chr3R 19506719 5' + mdg3 57 2 54.11 AAAAAAACGCATATTAAATTGCCTATTAAAACTGCGTCCATCCCACTAATATATGTATATATTTGGTAGTCCATCCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGTAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTC:1 + chr2R 8106991 5' - Tc1 1283 1 59.84 CAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAG:1 - chr2L 5728927 5' + roo 91 2 82.19 GATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3R 12519690 5' - roo 9015 2 63.70 TGCATCAGAAGTTCAACGATTGGATTAGCCAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 10461101 5' - roo 385 2 68.97 ATAAACATTTTGTTTAAATGTGATGTAGTTCTTAGATTTTCCCAGTATATATATATATATATATATATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTATGAT:1 + chr3R 5032929 5' + Transpac 20 2 52.21 TACGACGCAACACAACAGAAAAAAATGTTTTCTTGACAATTTAAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTT:1 - chr3R 25597960 5' - copia 5089 1 59.31 AACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 - chr3R 31112301 5' - mdg1 390 2 60.71 AGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 10897435 5' + roo 53 2 55.63 GATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGT:1 + chrX 19662981 5' - P-element 2813 1 28.57 TCGTAGATTTTCGAGTATAAGATAGAGATTTTGCTCATAATTAAGCATTTAGTATTGTTCCTTACAGGACAATAGGGTTTTTTGTAGAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - chr3L 9280494 5' - copia 257 1 66.44 AGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCC:1 + chr3R 20752898 5' - 1360 3315 1 69.18 TATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 31266115 5' + jockey 83 1 69.18 TTGCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTANTTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGNGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAG:1 + chr2L 7633342 5' + Max-element 8279 2 55.48 GTATATGTATGTATATGTATGTATACGTATGTATATGTATGTACATGTATGTTTCTTTTTTTTATTATATACGGCAGGAAAATGAAATCTTCTAAAGATACCATCTAACGTCCTTGGATGGCATGCACGATTCATAACCCTCAGC:1 + chr3R 29487012 5' - Rt1a 4997 1 63.45 AAATAGTTGAGCAGTTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2L 10909612 5' - 412 452 2 54.93 CGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCCG:1 - chr2R 9750243 5' + opus 57 4 65.19 TTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2R 14884167 5' + roo 8742 2 74.66 AGCCCCCACCACCGCCAGTACCCACTGTACCGCCCATTGTTGCCCAGGCTTTTTGAATTGCTTCAACTACGGTCTCAGTGTCACTAAATTGTCTTCCTCCTTCGTACACTCTCCT:1 + chr3R 4936658 5' - Tc3 1274 1 67.83 GAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCGAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 - chr3L 27415308 5' + transib2 36 1 49.12 CATACAGCACAGATACACAGACAAAAAATAAATTTCTAAGTATGTGCACAAAAAGAGCCGCATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATACAAAA:1 - chr3L 9696033 5' - 297 338 2 58.22 GTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 - chr3L 21764431 5' + hobo 67 1 75.00 TGTGGGCGTTAGAGTGGGAGTGGCAGCATGGTTCAACAAACTTGCGCTATCTCTATGTCGACAATGTCTCTAAAGTCTGTGTGGTTAATCGTAACCTCCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTT:1 - chr3L 22511715 5' - INE-1 142 1 66.15 AAGAAACGGCTCAACGGAAGATCATGATCATTGCATCTACTCCGGTGTCTCCAAAAGTGAGTGGGTGGGTTAGTGGTACTTGGGTGATTGGGTGAGTCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 20753022 5' + 1360 23 1 67.12 AAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr3L 21534255 5' + 1360 78 1 71.23 CTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTC:1 + chr2L 7633354 5' + Max-element 8285 2 55.00 TAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2L 18525592 5' + pogo 50 1 53.42 CCGTGTTCTTGCTCGCCGGCGCATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCAT:1 - chrX 15286993 5' + X-element 4400 1 55.94 TAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTTACACAAT:2 + chr2R 4673579 5' - Quasimodo 7291 2 74.66 AACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCA:1 + chr2L 15019899 5' - BS 5007 1 76.03 TTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 26927375 5' - roo 394 1 65.05 CAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chrX 19662962 5' - P-element 2844 1 45.45 AAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATC:1 - chr3R 31264533 5' + BS 29 1 55.12 TGTTGAAATATTTCATTGTTTTTTGTTGATCGAATTTTCTTTGACTGCACACACACCCACACACAAAACAGGTACGTATTTATCTACATACATGTATATACATACATTCAAGGCGACAGATCGGAAGAGC:1 + chr2R 17931688 5' - mariner2 570 1 48.46 ATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCAT:1 - chr3R 13406543 5' + pogo 35 1 57.53 AATAGATTGAAATAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 - chr3R 12376548 5' + HMS-Beagle 6822 2 67.81 AGAGTTTGAGGAAACTTTTTCAAAAATTCAATTCGCAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCC:1 + chr3R 12146609 5' + gypsy10 5657 2 73.13 TAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAA:1 - chr2L 544898 5' + Doc 88 1 78.77 GAAAAAATAGTAATTAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTCGTTACTTAGTTACTTAGTTCGAACTTGACCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGAAATTTTTGCTCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCC:1 - chr3L 14343594 5' - HB 1218 1 47.26 TAAGTGTTTGATTTACAGCATAATTTCTTTTGTTTACAGCATGTTTCCAATGTCATAAACGCTGATGGCAAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 26927527 5' + roo 17 2 72.60 TTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGGAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 20852541 5' + Tirant 28 2 55.45 AGCATGTAGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTA:1 + chr2R 7314586 5' + blood 16 2 70.55 TCTTTTAAACAAAATAATTAAACTTGTTGAAAATGACAACTTCTTCAAATTACCCCTTATCTTTAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGCACGACCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCT:1 - chr2L 725244 5' + Cr1a 4211 1 65.75 GCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 + chr3R 13259816 5' + hobo 39 1 53.85 TGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGAGGCGGGGAAACGATCTCAAGTGACTGACTC:1 - chr3R 19450163 5' - roo 163 2 78.77 AACTGTAACGTGTAACGAATTGAAGTGATGGAAGACTAAAGTAACTATACTTGCTTGTACAGATACCTCTTCGTTACATACAATAATGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAAGAAAATTAAGGAGCTAGTATACAAAATTGGAG:1 - chr3R 734946 5' - Gypsy12A_LTR 2074 1 65.52 AGGGAGGGCANGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3R 30087702 5' - roo 9004 2 63.70 GTTGCGTGACTCAGGCGCAAAATGCATTTTCCAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTT:1 - chr2R 14415583 5' + 297 6594 2 76.71 GAACCCAATGGACGTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:2 - chr3L 7751160 5' - 412 7519 2 66.44 AACTATCTCTACCGAACTAACGAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATGCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 - chr3R 17077947 5' + 1360 8 2 73.85 GCAAAAGAAACAAATAAGTTACATTTAATTAATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGAC:1 - chrX 8876916 5' + mdg1 7128 2 75.86 GACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTANTTAGTATAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTNAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCGTATCAGCAAAATCT:1 + chrX 21668553 5' + I-element 70 1 58.90 GGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3R 11516533 5' - roo 8984 2 77.93 ATGGGATCATACTCCTCGCCATCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTATTATTGTTAT:1 + chr3R 17783574 5' - mdg1 20 2 69.41 TATAAACAAATAAACTAATATAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGCGATACC:1 - chrX 19886799 5' + P-element 269 1 20.55 TTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCCTGCCGCGCTCTCTGCAG:1 + chr2R 14072532 5' - mdg3 155 2 75.86 GGATGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCACATCTTATGTAAATGAATCTAGAGCGATAAATTATAT:1 - chr2L 7929599 5' + roo 71 2 65.75 CACATAACCTACAAATCCGTGCCCAACTACAGGCACACCGACAAGGACAAGGATAAGCACCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 5953898 5' - roo 9022 2 58.65 ATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAA:1 + chr3L 15393701 5' + pogo 76 1 68.97 GCCCTTTGTCATGCTTCTCTACTTAGACTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chrX 22862401 5' + jockey 28 1 67.20 CAACAAATATAGCAACAAAATATAATATAATGAATATTATATTTGAGTCAAATGAAAATCGCCACATTAAATGCGCATAAGAACAGATGAAAAAGCTGAAATCATTTCCCATTTTTTTTTTGTTTTTNTTTT:1 - chrX 4336155 5' + hopper 143 8 66.67 GCAAAGAATTCACAAATTCCCAATTTACTATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGACCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGAACGCCGCGCTCTC:1 - chr3R 19506793 5' - mdg3 5412 2 74.82 GCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCC:1 + chr2L 20761907 5' + Doc 459 1 79.83 ACGTAACATATACGAGCGTGTATATATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTT:1 + chr3R 19965188 5' + jockey 22 1 72.09 GGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 18887050 5' + roo 8740 2 72.60 AAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr3L 12227909 5' - opus 7469 2 63.19 ACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3R 18832318 5' - roo 388 2 64.96 CATAGGGAGAAATTAGAGAATATAATGAGAAAAATGGGCGGATTTAGGGCGTTTGAGTGGCGTGGCAAAAAGTTTTTGGCAAATCTATAGAAATTTACAAGACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGG:1 + chr2R 5068255 5' - INE-1 135 1 73.10 TTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2R 7314597 5' + blood 7038 2 63.01 GTGTAACAAAGTTTTAATAGAAACAACAATTGAACTGACTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chr3L 15393637 5' + pogo 13 1 72.60 AATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAATCCCAAAAC:1 + chr3R 23902172 5' + I-element 53 1 52.05 ATTATTATTTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGGGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCCGTTTACTTCTT:1 + chrX 15148859 5' + micropia 114 1 58.33 CATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTC:1 - chr3R 25860546 5' - hobo 2902 1 63.83 AGGAAGGGCGTGGCCAAAGTGTTTATGGTATATCGAGAGAAATTTATAAGACAAACAATCAAAACATTTTTCAAGATTTTGTGCATGGCAGTTTTGGGCGATATGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTG:1 - chr2R 5296443 5' - INE-1 215 1 51.20 TAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACA:1 - chr2L 544909 5' + Doc 77 1 71.23 CAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 17259545 5' - roo 8999 2 77.95 TGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACGAACTA:1 - chr3R 12146748 5' - gypsy10 5926 2 55.48 TTAAGTGTCACAAAAAATGAATGAGGGTGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chrX 291984 5' + 412 56 2 55.48 TCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 19580007 5' + jockey 92 1 73.97 TGTAGCGAGACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 21796005 5' - roo 9047 1 60.00 ATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTTG:1 + chr3L 11364804 5' - Tirant 331 2 66.43 GCATAAATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATCTTATGTTGGGAGGCACTTTCCTCTTTTAAC:1 + chr3L 23456269 5' - Gypsy6A_LTR 273 1 59.23 CTTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3R 9298599 5' - hopper 1388 1 65.75 ATGTGACTTTCAATTACATATAAACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATA:1 - chr2L 4864520 5' - mdg3 5485 2 77.40 AACAATTATATGCTAGTATGCCAAATGCATCTGCTAGAACTTGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGGGGTCCAAACCAGC:1 + chrX 8038550 5' + 297 6589 2 80.82 GGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAG:1 - chr3R 10737074 5' + F-element 59 1 52.74 TAAACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTA:1 - chr4 829134 5' - INE-1 155 1 71.92 CCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 + chr3R 25580788 5' + 1360 54 1 70.80 ATAGACAGAGTGCATAGCGAGGGGGGGGGAGTGTCGGTTATTCAAGTTGCTATGGTGATAGCTCCACCTATTGGTAGAGTGCACTAAGCTGTCCCAAGACACAA:1 + chr3L 4630452 5' - R1A1-element 257 1 57.69 AGTTATGGCGAATTCCAAGAGGATTTTTCAATTGCTTCTCGTCGTTAGCTAAACACAGTGAGAAGCGCAAAGAGAGGCGTTGATATCTGATTGTTCAAGAAATTCTCGAATGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATA:1 + chr3R 8197720 5' + pogo 7 1 76.71 TTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTAATGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCAACGACC:1 + chr3L 9324484 5' + HMS-Beagle2 6977 2 80.14 ATGCAGGGCAGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3L 12873080 5' - hobo 2909 1 51.43 ATTCCAGGTTGGAAAACAATTTGAAAGCGTTATTGAAAAAAGTTGGCAATATTCAACTGTTCATCATTTAAATACCACTTTTAATATCCAAAACAAAGGATACTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chr2R 22521828 5' + pogo 12 1 74.66 TATTAGAACCCCAACTTCATGGTGACAATAACAAATTCGTCCGATGTAAACAATTTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTAAAGTTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGAGTTATCCACTCAAGANG:1 - chrX 22000010 5' + Quasimodo 6995 2 60.47 TAGACCGACTGTGTATAAACAACGCTACACTGACCTCCTTCCCAGGCATCGGGGAATTGCCGGGTCAAATATGCATTTGGCAACCCCGGCGAGGGAGACTGCTGTTTATGTATTTTAAATTTATTTGTTTAT:1 + chr3L 22520241 5' + S2 99 1 62.12 GGGTTAATTTTATGGAAAAATTAAAGGAGACAAGTCCTGGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACAT:1 + chr2L 1044946 5' + mdg3 42 2 55.17 CTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chrX 16547461 5' - P-element 2841 1 49.25 ATTTGTGTATGAGATTAAAAAAAAAAATTTAAAAA:1 - chr3R 26132017 5' + P-element 2691 1 71.43 TAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAACTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACC:1 - 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chr3R 27452048 5' - hopper 1325 1 76.71 GTGGGAGTAGAGCTGTTGGGCTTACCCAAAGGATGGGCAAACGAAATTATTTAGTTTTAAAAGGTGGGCAAACGTTAAAAATGAATTTTAAAGGATGGGCAAACGAAATTATT:1 - chr3R 27567887 5' - FB 644 3 69.91 GTAGTTGGAAAAGCCTTTAAACATCCATCTACCCTTTTGTTCGCCGCGCGGTGCAGGGGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chrX 609509 5' + 1360 1 2 83.08 TTTTGCAAATATCCCAAACGTGTTATACAGTGCCGCTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTATTAATTTAAGCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTTAAATAGCAAAGTTTATGATCTC:1 - chr2R 4723553 5' - Tc3 1601 1 76.03 TTGCTAGAAAAATATTATTTTCACTTATTCATTCTGATTGTTGAATAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTA:1 - chrX 12979586 5' + transib2 19 1 72.60 GACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 - chrX 2956286 5' + copia 41 2 53.60 CTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTG:1 - 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opus 7478 2 67.16 GTTCTAAACAGTGAGTACTAGAGGGAGAAAGCCAAAGTGAAGTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCGACTAATAAGTAAA:1 + chr2L 19248155 5' + mdg1 82 2 75.86 TTGCAAACAACTGCCACGCATACAGTCAGACTTGAAGCGGGTTCCCACACACGCACACATACACACACACACACACACACATAT:1 - chr3L 17102247 5' + Quasimodo 39 4 78.57 AACGCCCATAATTAAAAGCAACAAGATGTACAACGCCAAAAAAAGCACAATAAAACCATGACCAGCTCAAGGGAAACAGGAATGGTGTTTGGGTTATGGGGAAACCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGC:1 + chr2R 18932837 5' + blood 7332 1 77.40 TTTTATCGTCACTCAAAGGNTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAA:1 + chr3R 23020768 5' - INE-1 578 1 69.18 CAACAAAAAACAACAGCAACACAACTGCTCGTGTGTGTGCACACAACGGCGGTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAG:1 + chrX 2300574 5' + P-element 30 1 50.46 AGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3L 12873071 5' - hobo 2915 1 52.22 CTACATATATATTGAAAGTATAAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGCCACCCTACT:1 + chrX 14978584 5' - 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roo 9030 1 52.74 AAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 6015703 5' + roo 8690 2 60.43 TACGTTTTATTTAACTAATTCAAGATTGAACAGATTATATAGTTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 + chrX 20149084 5' + pogo 12 1 77.08 TATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chrX 609438 5' - 1360 3342 1 71.43 AATTTTTGCTATTTGCTCCGCTTTTCAGACGTGTGTGTGTATATGTCCCTGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTA:1 + chr3L 21764339 5' - hobo 2900 1 58.90 TACAGATTCAGCCGCGCTTTGACAGAGTTTTTATTTGCGTNTTATTAATGCTAAACGATTTCCACGAAAATGCCACCGAAAATGATTTCCCAAAGATTATTNCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACGCATGAACACGAATA:1 - chr3L 5027344 5' + roo 1 2 44.52 TATAATTATAATATCAAAATATTACTAAGATAAACACTTGTGCTAAACAATAAATATCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 + chr3L 10621691 5' - flea 4956 2 59.59 AAGAGAGAGAGAGAGTGAGAGCGAAAAGTGCATGCAAAAAACAACACCAAATAGCACTGCGAACAACGCACAAAGGGAAGAGTGACAAACACAAAATAAAAAATCGGGGCGCAAAAAAAAAATACGACCGTTCGCTTTAAAAGCTA:1 - chrX 9023558 5' - Cr1a 2 1 59.59 ATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 + chr3L 2907291 5' + 412 18 2 62.38 TTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 + chr3R 12519617 5' + roo 8746 2 76.03 GACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr3L 4547791 5' + mdg3 43 2 53.52 AGCTTTAAAGTAACAATTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGT:1 + chr3L 6557075 5' + Doc 15 1 73.97 GCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCTG:1 - 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pogo 2059 1 56.85 TTGCTTTGTTATTTTACTGCATTTTTGCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2L 9383694 5' + flea 4763 1 71.43 GAGGTAGGCGTGGCAGGCCATGAGCTCTGCCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCACTCGAGTGGACGTG:1 - chrX 14360893 5' + jockey 20 1 76.39 GAGATTTGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 25860437 5' + hobo 19 1 70.63 AGTTTTTACAACGTGCTTTTTAAGTGTTTTGAAATTATTTGAGAAGCATTTTAATAAGAAAATTTTAGTTGAATACTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 - chr2R 22522000 5' - pogo 2071 1 61.94 TTAACCTGCTGAATATTTCATTAATCAAACATTCCCACACTCACACACACACACACACACACACACACATATCT:1 - chrX 5258064 5' + accord 7031 2 54.05 ATGGTAAAAAAAAAAAGAAAATTACGACGCAACACAACAGAAAAAAATGTTTTCTTGACAATTTAAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCT:1 - 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chr3L 23219318 5' - 1360 3328 1 60.27 CAAAGGGTTGCGCTCCATTTCGTTACGTTCGTTGCGTATGTGGCGCTGCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 17181391 5' + jockey 20 1 72.92 GGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chr3R 21925113 5' + hobo 58 1 64.80 CAACAGCAACAGCAGAAAATTTTATAAAAATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGTCTCTAAACAAA:1 + chrX 11714354 5' + Tirant 23 2 64.52 GTGCGCAGATGTTGAGGGGACTCCGCAACTTCGAGTCATTTAGAGTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACA:1 + chr3L 23181923 5' + 1360 32 1 63.45 CGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 13628821 5' - roo 349 2 62.69 GATTTTCCAAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2R 22523151 5' + jockey 57 1 54.07 TGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 - chr2R 12133870 5' + jockey 10 1 77.39 AAAAAAAAGAAATAGTGCCCGAAGAACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAA:1 + chr2R 19805413 5' + F-element 73 1 58.22 ATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr3L 6131822 5' - roo 9018 2 52.05 TTTAAGGATCATAATATATAATATATTAATAAATAGTTCGATTCTGTTGTTATACTCATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCCGCCCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAAC:1 + chr2L 10908746 5' - 412 84 2 60.42 TAATTGAGTTTTTTTTTTATTTATTTATTTATTTAGAAGCGACGAAGCCATACAATGCCTCGCAATTTAATTGAGTATGTTTTGCAAACCATCCAATAAATGGGTTAATTTTTTTTTTTAGACTTTATTAAGGCATACGAGGTAGC:1 - chrX 7102793 5' - BS3 1752 1 39.04 TTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chrX 13628840 5' - roo 9036 1 56.92 AAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTAGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTT:1 - chr3R 26472875 5' + 1360 84 1 74.66 GTGGCGGAATGTCCTCGCGCGCTATCAATTTTAGTGCAGCTTCGACTTTTTGTTTTTCCTCCTTGCTATTTTGTCTTCTCGCAAGTTACGAACCCTCTTCTTGCGATCTTCGTCAGGACTCACCAGCG:1 + chr2L 15086375 5' + opus 7140 4 62.50 TGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTT:1 + chr3R 26180427 5' + Transpac 4968 2 62.10 CCCCCATTAATGTTTCAGCCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 - chr3R 25580889 5' - 1360 3356 1 61.64 AGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chrX 5751914 5' - roo 9017 2 72.97 ACACAAACATTCATACATTGCATATGTATGCAAATGTATATTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGA:1 - chr3L 9397133 5' - 1360 3241 1 72.60 CTCCTCTACTTGCCGATAGTGTGCCTCAACAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTGGTTATCTA:1 - chr3R 22709021 5' + roo 8753 2 78.77 AAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAG:1 - chr3L 2532512 5' - blood 297 2 77.14 TTGATATAATTTTATTTAAACTAACCACTAGTAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr3L 2532577 5' - blood 7378 2 75.56 GTTATATTTTGTTTTGAAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGC:1 + chr2R 11246947 5' - 1360 119 1 54.11 CAAAGCAAATTAATGATTTGCCATCAAGCAAATAAATCAAAAGCTTCAAAGCAGATCTCTGGCTTAGCGCGCTGCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 + chr3L 22330915 5' - hopper2 1566 2 56.25 TCTCTCAAGCACACTCAGTTGATCTCAGTCGCAAAACTAAAATTAAGAAAAAATCAAAATCAAAACACAGCACAACAAATAGAAATGGAAGACGTTCCATTACCCCTACTATATCCATCAATCTCAGCCCAAGTA:1 - chrX 3546540 5' + 297 6536 2 76.30 TAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 15148561 5' - roo 9029 1 55.48 TAAAAGTGGTATTAAATTTCCAATAAAGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 5751940 5' - roo 347 2 59.44 TCGCAGCTGGCCACGCTTGTAAATATTGTCTCGAAATACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAAT:1 + chr2L 9704755 5' - roo 9026 1 53.42 ATGCATAGTGTCGTATGAATCTCTCATACGGACGGACGGACGGACAGATGGACATACATAGTCAGATCCACTCGGCTATTGGTCCTAATCA:1 - chr2L 18791936 5' - INE-1 91 1 79.12 TAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTA:1 + chrX 9165340 5' + jockey 4834 1 65.75 AGACAGAGACAATGCCAAACAAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2R 11778097 5' - hopper 1376 1 58.90 GCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 23146486 5' + 1360 56 1 63.49 ATTTTCACTCGTTTGCCGTGCTTTTCTCGCATTTTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTNTTTGGAAATATNTTCGGT:1 + chr2R 11153129 5' - roo 353 2 54.79 GAGCGATTCGACTGAAACAGCCAGGTTTGGATGATCCTGGAGGCTAGCACGTAGTCCGAGTCACGGGGATCGCTGTCAAAGCAAAGATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 10074457 5' + pogo 23 1 68.57 CAGTCTTCGCAACAAGAGCGCGATATCCTTCGCAAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr3R 21794159 5' - hopper 1376 1 55.00 ATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chrX 16547498 5' - P-element 2794 1 21.38 TAAGGAGGAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCTGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAA:1 + chr3R 6584785 5' - transib2 2753 1 66.90 GATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGCCAC:1 - chr2R 4122892 5' - rover 366 1 79.45 TCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 + chrX 8681457 5' + jockey 59 1 72.22 ATGTATGTACACGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCC:1 - chr4 490349 5' - pogo 2100 1 79.25 TTTATTGCCGCTTACATGAATACAACTACTTGTGGGAACAATTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTANTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTT:1 + chr3L 27349968 5' + 297 22 2 64.38 ATGGTAGCTAACAGCAGCAGCATCCGATTTGTGCGAGCGGAATAACCGTTAGTAAAACTATGGCAAAAGCTTGCGGCACAACCCCAGTTTTTATTTTTATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 + chrX 3382268 5' - pogo 2092 1 65.19 TTGGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 + chr2L 5207435 5' + opus 59 4 60.56 ACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGACCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTG:1 - chr2L 11867353 5' + BS 57 1 63.08 AACTGACTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chr3L 15393669 5' + pogo 44 1 51.03 CTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 + chr3R 25597857 5' + copia 4953 2 76.71 AATTCTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAG:1 - chr3L 24208222 5' + Quasimodo 47 2 54.79 AATGTGTATGTGCTTGGTCGCTATTTACTTCTCCTATTATTCGTGATGAATGGATTATCTATACACGGGACTCTGCTAGAATGAGTGCGATAAATCTGTTGCTGAACGTTGCCCCTTGCG:1 + chr2R 4260436 5' + micropia 5202 1 40.83 AGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTC:1 - chr3R 10736127 5' + McClintock 63 2 65.75 TTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACGTTACCTATAATGACACAGATCGCCCTTCTATGCTTCAAGCTAAGGCAGCATC:1 - chr3L 10033671 5' + blood 113 2 42.47 TCGCAAAAAGCTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCA:1 - chr3R 6419985 5' + Tabor 7 2 70.63 AAAGAACAAGNTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 + chr3L 18216455 5' + 297 41 2 57.53 ATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGAAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 - chrX 13060272 5' + Tabor 78 2 70.34 AATACAATAATAGCAACAGCAGCGGCAGCACGAACGAAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chrX 1769804 5' - hopper 1373 2 56.25 TTTCGCCCCACGTGCATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTAATATTT:1 - chr3R 12764820 5' + copia 37 2 57.66 TTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACACCAGAATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3R 15003143 5' + Doc 84 1 76.43 TCAACATTTTCTTCAAAAAAACAAAGCACTACGTTTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chrX 17792502 5' - roo 9028 1 56.55 CCCCATTTCGGTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGTGTGTAGTATGGGCATATATCGAGGGTACATCGTACCTATA:1 - chr3R 11285016 5' + blood 18 2 66.67 TTTGTTTGATAAACAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:2 - 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chr2L 13033428 5' - hobo 2893 1 49.66 AAGGATTCATATGCAAATAGGCTCTCAATTGTTTAATGAATGTCAAGATCGACTTGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGC:1 - chr2R 11247110 5' + 1360 11 1 78.62 TGAATATTATTCGTATTCCTATGCGCATTATGGCCACCAAATACACACATTTATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATAT:1 - chrX 18582251 5' - I-element 5286 1 64.38 ATAATTGCATATATCTTGATAAACTTATCTAATGGGTTTTAAGTATTTAGGTTGGAGTTTAAGATCTAACTGAAGCATAAGTAATGAATCAACAACATTGGGTTTTAGCAAAGGGTTTTAAGGAATATGACCAGAGATTTCCTAT:1 - chr2R 21681315 5' - Tc1-2 1187 1 52.41 GATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr3R 24480430 5' + blood 7045 2 60.96 GAAGCTAATTTGGGCTAGAAATAATTTAGTTGGGTTTAAAAGTGTAATTTAAAAGGAAATAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 - chr3L 14888868 5' + flea 4807 2 59.29 TTAACTAATTGCACTCCTTTTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACA:1 + chr2L 10536424 5' + flea 11 2 73.97 TATATTTCACNCGAGGATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3R 18832298 5' - roo 9062 1 73.97 TCCCATATAGATTTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTG:2 + chr2R 7720023 5' + HMS-Beagle 14 2 76.03 ATTCCGCCGGATAAACTTAAATCCAAAATTCAAAGCGATCATTTTAAATATACATATGTAGTGATAGGTTTGTTATTGAAAGCATGAAAAAGTAAATTAAAAAAAAACAA:1 + chr2L 10294370 5' + F-element 4681 1 80.00 ACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 - chrX 21668351 5' - opus 438 2 60.96 TCCACTTGGCTATTACAAAAAAAGCGCGCCACTTTTGAAAAATATCTAAACTTACGATTAGCTTTATTTTAAGATTCCGTTGGCGATCTGCTAGCGGTTCCGTTATGGGTCCGTTCGAGACTGCGCCTCTTCTCCCGCCCCGCTG:1 + chr3R 13840163 5' - opus 7302 2 60.69 CCTACGAAAGTGAAGACTAGATCCACCACAACATCGAGCTTTACAACCCAATGAACAAAAACAAATAATAGCAATAATAATATTGCATTCTCGACAATTTCTCTGATTCTTCTCCGTTTGTAATTCACCGTCTTTCCCCT:1 + chr3R 17890157 5' - gypsy8 72 2 53.57 CTTCGAGTCATTTAGAGTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGATCTACCCTGAAACGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGCCATACGAATTTTGGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3L 23181951 5' + 1360 48 1 51.88 AAACTCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr3L 20680387 5' - 412 463 2 58.14 AATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 20972641 5' + jockey 4689 1 65.00 CGACTTTTAATGAAGCCAATGAGGTCTAAAATGAAGATAAATCATAAATATAATTATATATCAGTCATTAAAGCCGTTCTCCATAACTAAAGCCAGTACCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chr3L 9397753 5' - 1360 3377 1 63.57 CGCTATTTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACT:1 - chr3L 11684935 5' - Bari1 1676 1 56.92 TTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACCTACACACACA:1 + chrX 17770442 5' + hobo 82 1 72.86 AGAGTGAATCTCCATTCAGCAATCTGCTGGCTAGCCAATGGCCAACATCCAGACGCAATGTCTGATCCTTTGATTTAATGGAGTCCTCACACACATACAGAGCACCCTCGCACACACACGCACACACACGCACACACACA:1 + chrX 12837682 5' - Stalker 445 1 67.86 TAGTATACCAAGAAAATTGACTTATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr3L 10897561 5' - roo 9033 1 59.31 TAAGGCAACGGTGCGTTAACTACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAA:1 - chr3R 1844863 5' + Cr1a 156 1 50.34 AATTCGCGGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAA:1 + chr3R 12341117 5' + Tirant 8129 2 62.16 GAAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 - chrX 1769769 5' - hopper2 1531 1 70.83 TAGCTTTCTTTAGAATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 10714279 5' + 297 31 2 63.01 TCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chrX 19662954 5' - P-element 2827 1 43.15 TTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACG:1 + chr2L 15420044 5' - Burdock 175 2 79.31 GGGCCCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCT:1 + chrX 14735753 5' + diver 87 2 73.97 AGTGCTCAATTATTCCATCTCATTTGGAATATTGGCAAATTAAAAGAAGGTAATTGACCTTTTGGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATC:1 - chr3R 10733839 5' + mdg1 55 2 54.11 TTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 + chr3L 2167587 5' - opus 443 2 59.59 AGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chr2L 15085722 5' - opus 443 2 64.93 AGGCCATCTTGATACCAAATGCGCAGGTCAAACTAGGTAGCTCATTTGCCTTGGATTGTGTGGGATAAATTTATTTAAGATAAATTAACTTCACGTTCAACACAACCAGAATTTTAATAGAAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAAC:1 - chr2R 7723053 5' + HMS-Beagle 6608 1 79.45 ATTAATTTGAACGTAAAAAAAGTAGACAAGGGCAAACACAAAGCTATTACCTGCGGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - 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chr3R 11756803 5' + Tirant 8176 2 77.97 ACAAAGCGGACTGAACCCGTATCCATTTACTATACTATCTGTATATTTATACATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCAC:1 - chr2R 15474564 5' - Quasimodo 7303 2 70.34 CGGAGACCATCAAACTGGAGAGCGAAAACACGGGCGATAAATATTCCTTTGCGTAGGTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAATCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr3L 6131978 5' + roo 13 2 74.66 TGTATATGAATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGC:1 - chr3R 26180537 5' - Transpac 5188 2 55.56 ATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 + chr2L 2544764 5' + blood 70 2 71.54 GTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr2R 8315509 5' - hobo 2909 1 59.57 GCATTTATTAACACTTTGTTATAGCATATCTTGACGTGGAATATGCCCATGGGCATCTCTAGTACGCACACATACGCTGTGGGTTTTCCCCTTGTTTGCCGATGGTTGATTTGGGTTTTTTCCTTTCAGTTTCCGGAGA:1 - chr3L 18551181 5' - X-element 439 1 61.15 TACATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 6131817 5' - roo 9025 2 52.78 TCAAATCACTTTATAGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCA:1 + chr2L 20407743 5' + McClintock 36 2 61.64 CTGAAAACATTAGTAATCGAAGAAGCATTGATATTAAAAATCGATATGTTATCGCTGGGAAGTTTTATGATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAAGTAACTTAAAAATGCAGC:1 - chrX 17884618 5' - pogo 2052 1 50.68 GTTGGGTATTTCCAATTGACGCTGCTTTTTGTTTATGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chr3R 26242479 5' + roo 80 2 77.14 CTAATGAATGACATGAAAAAGGCAATTGAAATAAACCCACACATTTATAAACACAAAAATGGTTCACCGAATTGCAATACGACCCTTACAAACCAATTTTGTAGCGTTAAATAATTAAATCACCGGATGAATTAAGCTCCAGTGAG:1 + chrX 292385 5' - G3 4537 1 63.01 TGCTGACGCCTATCTGGCAACGCCGCCAGCAGCTGAAACAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 + chr3R 27707056 5' + P-element 40 1 43.52 GACTAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAA:1 + chr2L 20852454 5' - Tirant 325 2 72.41 TGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAACCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 19965228 5' + jockey 79 1 62.07 ATTTATCCCTACTACCTGTCACATATTTTCAAAGGAATATAGTAGCCCATATTACTAGAATTTATTATGGGCTAATTACTAGAACTACTAGTAATGGGTATAAAAAATAAGTCCACTAAAAAATTATGACAAATTAATAAACAATA:1 + chr2R 12317374 5' - Tc1-2 1366 1 60.27 AGTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGT:1 + chr2L 13033293 5' + hobo 36 1 52.08 CTTGGGTGTAGCTTTAATACGCACAGACAGAATGGACGACAATAACATGGAGAACTTAGATACATATGTACAGCTGTGTTCAGAAAAATAGCAGTGCGAAGGAAATTAAGTAATACAAAGGTATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGA:1 - chr3R 4187413 5' + HB 59 1 65.52 GGGAAAACCGGCTAAGCGAAATCGGTTTAATCGAATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 6050283 5' + 412 20 2 69.86 TTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCA:1 - chr3R 17243249 5' - hopper 1389 1 65.75 AAAATATTTGAAGGTAAAAAATCCCTGTTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCT:1 + chrX 16998245 5' + diver 5899 2 62.33 ACCTTAGTTTGATTGAGTAACTGTCACCCTCAGAACGAACAGATTCCATAATGAACGATAGACGAGTTTTAGAGAATTATAAAGATATATATATAGTGAAATGCTTGTGTTTATTGAGTGGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 + chr2R 4788759 5' - 297 362 2 46.90 ATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATCAAACCAGCTTA:1 - chr2R 3146359 5' + rover 71 2 65.75 GTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTC:1 + chr2L 20761861 5' + Doc 439 1 51.72 CTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3L 17181448 5' + jockey 33 1 49.00 TTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 6131854 5' - roo 8986 2 73.97 CCGTTTCTCTTAATTTTGGCCCGCAGACGTAACTCTTTTATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr2R 10977252 5' - roo 9055 2 71.92 AAATTGGATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATACCTC:1 - chrX 20149272 5' - pogo 2077 1 67.81 GAAAGCAAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTGTTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGA:1 - chr2R 11844374 5' + I-element 5 1 79.26 AAGCAATTTAACATAATTAATTGTTTTGTTTTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3L 19579948 5' + jockey 29 1 71.33 AATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chrX 12979408 5' - transib2 2798 1 67.81 TGTCGCGTTTGTTGCCATTTTCTGAAGGCCGCCCCGCACATACGAGTGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGG:1 + chr2R 14415440 5' - 297 327 2 66.90 CACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGATTATATTTACAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3L 13285692 5' + roo 8704 2 54.81 ACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCA:1 - chr2R 14532083 5' - invader4 283 2 56.55 AGAGCCATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGGCGGCGAAACAGGGGTCTCTTCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACG:1 - chr2R 14532063 5' - invader4 3050 2 51.28 GATTGGAAATGAAACTGAGTCCCTCCAGGGGGTGTGGTTAAAGCTGGGGTCCATCGGAAAATCCACCCCCCTTGTGGAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGG:2 - chr2L 9383856 5' - flea 213 2 54.79 GAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGGACTCGAA:1 + chrX 15198046 5' + Max-element 8278 2 55.17 TAAATCATCTNTACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTG:1 + chr3L 23456276 5' - 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jockey 4927 1 60.69 GTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAACCTACAAC:1 + chrX 22679617 5' + Doc 57 1 48.23 AACACAAATGTTTATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 + chrX 9846716 5' + transib2 38 1 59.59 ATGACATGATATTTTGTTTATCCAATCGATGGGCTGGGCGATAAACTTAATTACCGTTAATTAACTCTTTATAATACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 9317961 5' - P-element 2848 1 58.99 GCCTGAAATCGACTGATAACGTGCGAATAACAACGGAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAATTAATATTTTCAAAAGGAGGAAGTTCTAGAAGAGGAGGAAGAGCTTGAGAATTTGTTGCCTGCGCAACACAGG:1 - chrX 19590949 5' - Gypsy12A_LTR 1993 1 71.92 TTTTTTCTCCTCAGTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACAC:1 + chr2L 13033281 5' + hobo 23 1 60.84 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGCTAACTAACTGAATGGCGCGCATTTTAAAAAAGGAAGTTATGCTGCCGCACCCTG:1 + chr2R 8981355 5' - mariner2 1 1 63.89 GATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTATGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 4245011 5' - 412 7516 2 59.59 TGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACTGTATTATATATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chrX 20149234 5' + pogo 23 1 57.53 ATACCTAAACGCCCGTAACTTTTCTGGGGAAGTAGGGAAGCAAAAACTACGGAAGCAAATTCGTCGGGTGCGGTTCGGTCTTGCATGCGTCCCATCTGATTAATCCGTCCAGCAAAATAAAAAACAAAAAAAAAA:1 - chr2R 19138394 5' + F-element 4686 3 53.33 GATATGTTTTATTAAAATAAGTTTTTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTA:1 + chr2L 11475084 5' - jockey 4958 1 59.03 TCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2R 11153163 5' - roo 8984 2 79.31 AACTTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3L 12227916 5' - opus 473 2 68.06 GTGCTGCCTCGATCGTGTTTGAAGGTTAGAACCGAAACTGTCTGCAACTGCAATGCCAATACACTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAGAAAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGCGGCTTGTACTAACCA:1 + chr3R 545332 5' - gypsy2 303 2 72.92 CAATAATCATATACCAAAGGTATCAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTG:1 + chrX 23102371 5' - Transpac 5168 2 59.59 AGTCCGGCCTTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATGCAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 + chr3L 414812 5' - 412 473 2 69.63 AGCAAAACCATTTTGGCTAAATGAAATTGAGTAAACGCCGGTGCACAGACAAAAGAAATGCCAAACCGTTCAAGATCTGAGCACACAAAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr3L 2966418 5' + roo 8677 2 68.25 TGGCGTATGAGTAATGAGCGTTTTCTACATATTTGCCGGCCGTGGTTGAAGTTTCGATTCGATTCCATTACATTCCGCCTCCGAGGGTCGTCGATTAACCCAATTTAAGGTGTTTTTTTTTCTCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 10397433 5' - Doc2-element 252 5 56.30 CCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 16274565 5' - 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chr2R 5531677 5' + Doc4-element 2639 1 75.34 GAAAATGTGGGGTCCTATTAAATGCAAATGCAGTTACTCAAAACAGTTTGCAAAAGACTTTTGCATTATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTG:1 + chrX 5751811 5' + roo 25 2 58.62 AGTTACTCTGCTATTCATGTAAAATTGCTGGGCGGAGAGCAACAAAGTCAAAACATATATACATGCGGCAAACACAGCTGCAGTTTGAATTGCATTTGTCTGAAAAAAGAGCGGCAGCTTATCAACTCCGACTAAGCGTC:1 + chr2R 4187603 5' + Gypsy6A_LTR 204 1 50.71 CATACCCGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGC:1 - chrY 2720403 5' + 297 8 2 77.95 TATTGAAAATTAATATTACTATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAA:1 + chr3R 12764668 5' - copia 231 1 68.49 TAATGAACATTTTATTACAAAAGTTTGTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3L 1459883 5' + 412 49 2 56.30 GTGGAACTGATCCGCTGCGCTACGTTAGCAACCGAATTACTGATTAGTATCGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGG:1 + chrX 1515228 5' - 1360 3367 1 72.45 AAAAGCTCATTGCCTCAACATTTGGTGACCCTGACGTTCGGTAACATTTCTTTATCGTGAACTCAAAAAACAGTTTAACTAATTTCGGTGCACTTTTGTGTGTAAATTATTTAACGATTGATCGCAGCGTCTTGCGATACTGTCG:1 - chr3L 25996040 5' - Gypsy6A_LTR 380 1 79.31 AATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 18181236 5' - blood 335 2 54.79 GTTTCGGTTGTTGTTGTTGTCGATGAGATTGCAGTTGTGAGAGAGGCAACCCTGCTGGTAGTTACTGCAGCTAGGCTTAAGAATGTTGTGTGTAATTTGTTGTTGGTTGCGGCATTGGGGAAGCGCACTCTTCGCTCT:1 + chrX 7740687 5' - Doc4-element 170 1 47.10 GTTCCGTTCCCATGCGAAGATTTAAGTTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 + chr3L 7389705 5' + roo 8730 2 64.38 GACGTCATCGAGGCAAACAAATGAAGTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3L 7848434 5' + jockey 32 1 65.07 TTAAATGATTTTTGTTGTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACCAGTGTACAAGTTAAAACAATCACAAAACACCCGAAGTATAGTCGTACGCCTC:1 - chr2R 12827089 5' + Burdock 23 2 61.90 AACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCAC:1 - chr2R 5621018 5' + ZAM 7991 2 50.98 TGGGCGGTGGTGGGCGTGGCTATGGTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTCTTTTACAAAAATTAATACCTCCT:1 + chr3R 9298431 5' + hopper 27 1 66.90 TAAAGCGTTTACGCTGTACATGAAACCAGCTGCCCTCAACACAAAACAAATAATATAGATGCGGATTAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATCACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCT:1 + chr2R 25173857 5' + Doc 4485 1 52.74 GAATACTGAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 9453396 5' + roo 8687 2 66.41 GCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACT:1 - chr3L 18074197 5' + 297 43 2 56.85 GACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGC:1 + chr3R 12613790 5' + HMS-Beagle 6860 2 77.05 TGATACAAAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTNTTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTNAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 + chr4 868615 5' + roo 8704 2 57.53 GCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGC:1 + chr3R 25158588 5' - 1360 3324 1 59.59 TTAGAAAACTGTTTAAGAAATTCTTTTCCAATTCCAATACTTCTGATATAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAATAAGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTG:1 + chr3R 4562745 5' - mdg1 7352 2 77.24 CTCAAATCATATATGTTCACAAGACAGAAGATAAGCATTGATGTATATCTTTTGAAAGGAATACGGTATTACCAAATGCCCCATAGTGCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGAGAACAG:1 + chr4 306513 5' + 1360 120 1 52.05 CGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 - chr3L 2532523 5' - blood 7313 2 70.55 CTATATGTATTTGTATTATATCGTATATACTTTACCACGGGCCCGAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCC:2 + chr3R 17924404 5' + Burdock 6171 2 60.27 ACATATTTAAACTGATGACGCCACCGATGGAAAAGCGAGGAAAACCAAATAGGAGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGCTGAAGGCAGCC:1 - chr3L 2907385 5' - 412 7514 2 51.79 ATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTT:1 + chr3L 24213777 5' - invader2 173 2 68.49 AAAGGGTCGTTTTCAACCAGTCCGCAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGA:1 + chrX 3239281 5' + X-element 76 1 67.12 TTCCAAGAATTACTACGAAGTATATGTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGC:1 - chr3R 8197918 5' - pogo 2080 1 69.86 TGAAAAGTTCTGCTCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCT:1 + chr2L 14056658 5' - pogo 2051 1 54.11 TAAGAAACGTAGCTTGCCAAGTAAGATAAAAGCAAAATGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr3L 2317082 5' - 412 482 2 70.34 AAAGGAAATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCCAGATA:1 + chrX 6538618 5' + pogo 28 1 62.33 TATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3L 11535882 5' + roo 8717 2 54.79 GGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTCCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr3R 10737083 5' + F-element 43 1 56.83 TCAAGTGGGTCTCAAAGGAGCATTTTTAAAAATATGTACACACTAAACACTTTAAATAATGTATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCA:1 + chr2R 10969647 5' + Idefix 52 2 61.43 CAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCG:2 - chr3R 10737092 5' + F-element 33 1 65.22 CATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAAAT:1 - chr4 829130 5' - INE-1 151 1 34.93 CGTGAAAGTCTTACCCCCGAAAGTATGTTAGCAAAATGTTACATCTGCAGTTGGGTTGATTTTTGTAAACTGTTTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAAT:1 + chr2L 901730 5' - jockey 4956 1 53.68 TTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATT:1 - chr2L 23295900 5' + micropia 5019 4 56.16 GATAGACAGAGACAATGCCAAACAAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr2R 11778100 5' - hopper 1387 1 64.49 AATCCCTATGGTATAAAATTTAACATTATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr3L 2167736 5' + opus 7022 2 69.86 AGCTAAGCAAAGCATACTTACCTGGCGTAGAGGTTAACCGTGATCACGAAGGCGGTTCCTCCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3R 4948088 5' - P-element 2829 1 45.52 TGGGAATCGTCAAGGTGCCCTTGTACGCGTTTGACTCTGCTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 23182031 5' - 1360 3343 1 67.86 TAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGAC:1 - chr2R 14532064 5' - invader4 267 2 59.86 GTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAA:1 - chr3R 30955389 5' + G-element 79 1 70.14 ATAATGCAAGCCATAATGATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 - chr2L 10536590 5' - flea 4968 2 52.05 GCTTTCCGTACCGTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCACACA:1 + chr3L 23773884 5' - Transib5 2847 1 67.12 CACCTTTTCCACTACTTTGGCATCAAAGTTTTTTTTTCCGGATCTGTTGAGGGTAACTTATAACGATCCTTTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2R 7895476 5' - mdg1 382 2 63.01 CCCCTTTCACCCAGCACATCCTTGCCTCATCCTTTGTAGCATACTTTTTGGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 13033462 5' - hobo 2937 1 78.52 CTCCACAGTGGTTAATATTTTGGAATTGTTGGAAATCCATTTCCTTAAGTTGAATCCAACTTTCTGCAATTCATGGGGAATTAATGTTATTAATTTATTAGCTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTT:1 - chr3R 19445733 5' + roo 397 1 76.98 CAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAG:1 + chrX 4789101 5' - Quasimodo 7325 2 57.53 CAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 - chr3R 10714251 5' + 297 58 2 62.07 GGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTCCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTCAGAAACTGATTTTATTTTGAAATATTTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAA:1 - chr2R 9341641 5' - roo 8997 2 67.61 AATATCTTACGAACTACAATTAATCAAATTAATTTTGTCACAGCTGTTATCAACTAAATCAAAATTAATGAGTTAGGCACTGTTTGCACAGTGGTTCCGCTTGTATGGAGCAGAGGCCATAAATACTTCCAATATAGCTA:1 + chr2L 23020628 5' - Transib5 2948 1 52.14 GCCGGAAGTCCACGAAAGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGC:1 - chr2R 9750287 5' + opus 7026 2 68.28 TACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 22523177 5' + jockey 65 1 69.23 TTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTT:1 + chr3R 10148734 5' - 17.6 7347 2 67.81 TGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTCTGCTTAT:1 - chr2R 19108555 5' + jockey 95 1 56.10 TCATTAAAATATCATTAATTTCATAAATATTGTGCTGCAAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATCGTTTATTATTAATTTAATTATTGT:1 + chr3L 14888727 5' - flea 230 2 67.81 ATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTT:1 + chr2R 19574408 5' + I-element 5139 1 53.42 AGAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 - chr2R 17269192 5' + roo 8738 2 71.23 GCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGC:1 + chr2R 8315496 5' + hobo 2708 1 78.38 TGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGACAAAACAAAAACGCAATTGTGCTCCATCACA:1 + chr3R 24072037 5' + jockey 69 1 52.24 TTTATAAAGCAAAAAAATATTTATAAAAATAAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 - chr2L 18311533 5' - opus 442 2 63.01 TTAAATCTTTGCTACACAAGCTATTGGTTGTGAATAGGGTATCTGCTAGTTCCATAATCTCCTTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCCAGGCACCCCGTCTTTTTT:1 - chrX 860888 5' - hobo 2883 1 52.05 AAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAA:1 - chr3R 10737045 5' + F-element 88 1 72.60 ACGCTACAAACTGCATGTGCAGCGGCAGAAACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTC:1 - chr3R 31112330 5' - mdg1 416 2 79.72 GAAAGAGTTGGATTCGGCCTTGCTGGTTTTGGAACAATATATACTGAACTTGAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATAC:1 - chr3L 11826012 5' + X-element 80 1 64.38 GAAGCGCAAAGAGAGGCGTTGATATCTGATTGTTCAAGAAATTCTCGAATGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chr3R 8197781 5' + pogo 56 1 61.19 TTAGAAATTTAATAAAGCCGCTTGAGAAAACAAGCGTCCCAAATTTCTTTCTATTCTTTCTGCCTGTCTCTTTCACTCATTTCGACAGATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 - chr3R 27707170 5' - P-element 2859 1 66.44 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATG:1 + chr2L 19479165 5' + micropia 5007 4 60.55 TTTGCTAGAAAAATATTATTTTCACTTATTCATTCTGATTCTTGAAGAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGC:1 - chrX 12979587 5' + transib2 9 1 75.18 TCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 - chr3R 12613843 5' - HMS-Beagle 6959 2 74.66 TTACTGATTTTGCCTTTTGCATTTTATTATGTGTTTATTATGCTAACTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3R 22320546 5' + roo 56 2 69.35 TAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chrX 22862350 5' + jockey 22 1 60.29 AATGTTTTCACTTTTTTGTAAAAGTTTTTTCATTTTCCATTTTTCGTTTTATGTTTTTGGCTTTATGTTCATTTCGATTTTTTGGCACTCATTGACGTGTTCGGGTGGGCGCTAAGTCTGTTGGCATATCGGCTG:1 + chrX 2424969 5' - G5A 2604 1 67.41 GAATGCTGCACTTAAAGATTCTGTACCGCTTACAAAAAGCATTGAACTGCTGTTATTTTCTTTAGATATATTGGGTTGTAAGACATGTAAGAAACCTAAAATAATTTCACTAAAAAAATTCTAAAAGCAATTGTAAAAAAAAGATA:1 + chrX 15910330 5' + mdg3 5073 1 47.26 ACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATA:1 + chr3R 27547635 5' + 17.6 6951 1 53.27 TTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGA:1 + chrX 3533845 5' + 17.6 6955 1 67.12 TTCTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTC:1 + chr3L 12227749 5' + opus 17 2 69.92 CGTCTAAACTAATCAACAGGAGCAGCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATATTAATTATTTC:1 - chrX 3921729 5' - 3S18 6048 2 54.86 CAAAGAGATATAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 + chrX 13090989 5' - P-element 2874 1 75.34 TGCACTTTATTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr2L 18219320 5' - copia 213 2 68.28 TTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 20904949 5' - roo 9036 1 55.64 AATCATACTAAAATGTTTAACTAAAACTGTGTGCCTTGGCTTGGAAATTACACTTAGTGTTACATTGTTTATATGGTTGAATAAAAAAACTTTGAGAATGCAAGCAAGTTATTAAGATGTAACTTGGATTTTGGTTTTAAAATC:1 - chr3L 15062308 5' - mariner2 656 1 53.47 TGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATNAATGTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAANTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chrX 666288 5' + 412 7112 2 67.97 GACACACGCAAATCGGAAATCCAAGCAAAGTTTCCCTCACCCATCAAATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACC:1 - chrX 684892 5' + jockey 4745 1 65.75 AGCGCAGCGTAACTTCACTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chr3L 21534208 5' + 1360 25 1 67.14 GCTTTGCTCAATTTCTCATTTTCCAGCTGAAGATATTCGTGTTTGCCGGCTGTTTGGAAGTTGGGGCTGAGGAACGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGATATCCACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chr2R 9607275 5' - P-element 2843 1 55.17 ACAATCACATAATGGCCATAAGTGATGAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3R 24071987 5' + jockey 23 1 78.42 CGGGTGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:1 + chr3R 12613762 5' + HMS-Beagle 6840 2 56.92 CACTCCGGATAGGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chr3L 12890442 5' - hobo 2923 1 74.66 TTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAACTGAATCGAGAGCGATCAATTATAT:1 + chr3L 7389731 5' + roo 71 2 76.00 TGTGTTAATGTTCGCCCGAAACGCTTTTCGAATTCATGTCAGTTTCGGTTTCATGAGGTAACGAATTTCACAAATTCGCCGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 + chr3R 12341045 5' + Tirant 8 2 76.52 CATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAG:1 + chr2R 12492403 5' - hopper2 1555 1 52.05 CTTCAACTATTGGAGAAAACGTGGCATCAAGACGGCTCCCACATGGCCATTTGTTGGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr2L 5207382 5' + opus 10 2 76.71 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATA:1 - chrX 12649915 5' - blood 7017 2 68.61 TTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTA:1 - chr2R 12185453 5' + accord 26 2 65.07 CCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGATC:1 + chr3R 28749127 5' - mdg1 333 2 75.69 CCGGCGGGCAGTTAGTACAATCGAAAGATTCCAGATCAACAGAGCGACAGTTAAAGAGGGTTACACTTAACGTACATGGGCCATGTGTTGTGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGG:1 + chr3R 9548933 5' - F-element 4419 1 68.49 TTCATTTTGGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCG:1 + chr3L 25272570 5' + 1360 100 1 74.14 ATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 512408 5' - roo 9031 1 53.57 AGGGTCGCGGCGGGAAAGGATGCGGATTAAATTAATGTGGGGAAACAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGCGGCATTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 21764495 5' + hobo 25 1 69.18 TAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATGAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3L 19579979 5' + jockey 61 1 52.45 TATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATANTGCATTGTTTACGTTAAATCATACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTCGCGCTCTTCGTCAGGACTCCCCAGCGCTCGGCNCTCGTGTTTTCGG:1 - chr3L 2167710 5' + opus 7047 4 53.10 TTTAAAAAAATGTGTAAAGTACATGCGTTGTTTGCTATTACTTTCGGTTCGATTTGAGTTAATTCGAGTTTTTCTTCGCTACACTTCAAGTTGTCAAATGAAATGTTTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACT:2 + chr3L 22294345 5' - pogo 2091 1 78.77 GTTGGCATCTCGTCCGTTACGCCCCAGGCTCTCTCTTGTGGCTTCTGCTTTTTTTTTCCTTTTTTTTTTT:1 + chrX 20023752 5' - Doc2-element 232 4 78.57 AAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGC:1 - chr2R 17350572 5' + F-element 100 1 76.22 TTTTTATATATTGAAAGCAAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTGTTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAG:1 - chr2R 11844386 5' + I-element 4 1 80.14 TTTCTACCAATATAAGACCTCATGTTATATATGCAAATATCTCCTTATATTTTCAATATTTTTATTTATAAACATTTTTTATTAAACTGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGCGGACCTTATCTGTGGTCTC:1 - chr3L 23656059 5' - roo 214 2 60.27 AAAATCAATGCATCAATCGGATTGTCGATTCCGTTTAGCAAGAATAAATCAATGACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3R 11516461 5' - roo 9055 2 76.71 TACCTGGCCATAAGTTTTCTGGCCACGAGAGGTGTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATAACACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGG:1 + chr2L 1245541 5' - I-element 4992 1 75.34 ACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGA:1 - chr3R 8050545 5' - hopper 1372 1 53.91 TTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCTGC:1 - chr3L 17012020 5' - 1360 3313 1 71.94 TATCAGCTTTCGAAATTCACTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACATCCACCCGCTAAACACTCGG:1 - chrX 17770513 5' - hobo 2907 1 52.99 TTGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCA:1 - chr3R 23644936 5' - diver 6026 2 75.17 TAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCCCCGACTATCTCTCTTCGAGCGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAAT:1 + chr3L 19951221 5' + Ivk 54 1 69.61 GAAAAAGAAAATCAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATA:1 - chrX 20949753 5' + jockey 4556 1 77.24 GTTGTTAACAAGCGCTATTTGGCTAAGTGATTCATGCGGCCGGTCGCAGGCCTTCATGGCTAATTAAATTGCTCAAAGTGAATCAAGAGAAGGTTTCCTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTT:1 + chr3R 9914306 5' - F-element 300 1 69.40 GGAGACACTGCTGGCACGGACTTAGGGAAAATGGCGTACAGAAAACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAATACGAATACCTCACACACATGCGATTACCTCAAACAATCTCACCCAAATTGGACCAGACTCGACC:1 - chr2R 8418105 5' + I-element 4908 1 73.29 CTGAGCCAAAGAAGGAACAATTTTCAACTTTATAAAGCCCGTGAAATATTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTANATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGT:1 - chr3L 13779466 5' + I-element 10 1 76.03 AGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCG:1 + chr2R 7727082 5' + BS 4678 1 67.12 AAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCTAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 30087791 5' + roo 8730 2 63.01 TTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAACGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACG:1 + chrX 22633234 5' + INE-1 88 1 53.79 TATAGGCCATTCCATCTGATTGGCTCAGCGTATCAAGAACATCAGAATGCACACACAACGCATAAATAAAACCATTCGCACCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTT:1 + chr3L 20143229 5' - hopper 1391 1 65.65 TATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr3L 20061362 5' - roo 325 2 77.86 TTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGCGAAAGGAA:1 + chrX 19662993 5' - P-element 2826 1 24.07 TGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTG:1 - chr3L 10033655 5' + blood 129 2 34.93 TTAACATCGATTTACAGTAATCGGGTTCAGCTGTTGTTCGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACAAAAGGGGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGGGCGAG:1 - chrX 16547546 5' - P-element 2835 1 32.19 TTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3L 6131855 5' - roo 9002 2 71.32 TTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr2R 4816952 5' - blood 7314 2 76.03 CGCAACTTCGAGTCATTTAGAGTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGG:1 + chr3L 23181946 5' + 1360 56 1 56.85 GTCGCTGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGC:1 + chr2R 7314639 5' + blood 69 2 62.33 CGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTNAAACTA:1 - chr3L 9324557 5' - HMS-Beagle2 255 2 57.53 CATAATAAATATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGG:1 + chr2L 23069852 5' + Stalker4 173 7 71.23 TTTTACATATATATAGATTTAAAGTCTTAGAACTTCTAAGGTGAAAAGCATATTTTGTCGAATTTACAATGCATGAGTATACGTGTGCAAGTTAACACAAGCCAACGTCCTAGAACAGTTGGCTCAGTGCATGAAACATAATATAA:1 - chr3L 23334829 5' + Gypsy6A_LTR 36 1 47.95 GCGAAAGCATGACACGACTCAAGCTAAAGAAACGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTGCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 15148581 5' - roo 390 2 55.88 CCCATTTGGGCACACAAAGGTGTTTATTGTTATGTGTTTATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr3R 5704252 5' + 412 9 2 78.99 CGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGG:1 + chr3L 18183110 5' + Tirant 8164 2 75.44 TTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr3R 19514331 5' + blood 7073 2 59.59 GTTGGTGCTTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATT:1 + chr3R 7625289 5' - hopper2 1559 1 52.05 TAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTTTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCCTTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGT:1 - chr3L 8249462 5' - mdg1 347 2 67.12 CGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGTGTGCTTAAAATAGCACTCACC:1 - chr3R 31264499 5' + BS 79 1 74.83 TTGATTTTTTACAATGAATAATTAATAAGCTCATGGTATGTGAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATTTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 - chr3R 13406556 5' + pogo 22 1 66.44 AATGCTAGCAACTTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCAC:1 - chr3L 12227925 5' - opus 7483 2 73.29 GGAGCTGAGAGGTGTGTGCCCCATACATCGAAGCTCAGACAACGAACCGAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCGGTGAGTCGGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGG:1 + chr2R 5953769 5' + roo 8689 2 67.14 GAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATCCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 17077926 5' - 1360 3344 1 55.48 GTGCTTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTA:1 + chr3R 7625293 5' - hopper2 1556 1 52.41 ATCAGTTTGAAAATTACAGAATTGGTGGGATGGAGGAAGCCTTGTGCAAACCTCTACTGAAACTGTTTACCTTATCTCTGGAATCTTCACAGTTCCCTCATATATGGAAGGAGTCCTTTGTGATTCCTCTTCATAAAAAAGGTAGC:1 - chr3R 3751234 5' + Q-element 69 2 75.34 CTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 21683389 5' - pogo 2069 1 53.10 TCTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCT:1 + chr3R 20887377 5' + Doc 45 1 53.42 CTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3L 6557104 5' + Doc 32 1 58.96 TAAATTAAAGATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAA:1 + chr3L 7024403 5' + 412 19 2 71.23 CTGTTTCTACTATTCATTATTATTTTTTTTTAGGTAAGTTTTCCTTAACAACCTGTTTCTTATATCTTGTTTTTAGTTTATTTATTTTTCCATGTTTATTTTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGT:1 - chrX 23174332 5' + copia 15 2 73.91 GTTGATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 - chr2R 23095016 5' + 412 14 2 73.97 AAATAGGCCGGACCGAAAAGGCAGCAGAGATCAGACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr3R 27606573 5' + 412 7085 2 55.17 GCATACAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCGCACTATAACTCNACTCTA:1 - chrX 21668438 5' + Stalker2 7262 2 74.66 TGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAA:1 + chr3R 12046749 5' + Doc 69 1 65.71 CGAATGGTGGATACCGTGGAATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGC:1 - chrX 13060296 5' + Tabor 6894 2 55.48 GTGGTCACTGTTGTTGCCTCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGG:1 - chr2L 6637506 5' - 1731 4597 1 62.76 GTGAAAAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTCTTTAATTACTAAGTACAATATCT:1 + chr3L 20224103 5' - Chimpo 157 1 65.75 ATTTGGCCAATAAAATCTGCGAAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 - chr2R 19633355 5' + jockey 4770 1 78.47 GGAGGCGGGCCAAAGCCACTGGCAAACTTTAAAGACCCAAAAACAGAGAAGGGGAGCGAAAACACAAATTTAACGCAGTATGCGAGTGTAAAATATTTAAATTAAACTGCAAACGCAAATACACACACAACCACACACACACACAC:1 + chr2L 937617 5' + gypsy3 418 1 53.42 GCCTAAAGACCATCAAACTAATCGTTTCTATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTA:1 + chr2R 961100 5' - transib2 2694 1 78.08 TAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGGACATATTGTAGGATGCGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATAAAATAGCATATTAATTTATGGCAGCACT:1 + chr3L 20680273 5' + 412 7099 2 48.46 TAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCA:1 + chrX 3533858 5' + 17.6 41 2 58.22 CCAGCAGCTGAAACAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr3R 27707081 5' + P-element 97 1 15.71 ACAACGACGCCCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 19662935 5' - P-element 2848 1 56.94 ATGCTCGAATTTTATTGAGAGGATAATATGGTTTTATAAGGAAGATAAATATTTTTTTAATTAATTTAAAAATTTAAATTGCAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 - chr3L 15393831 5' - pogo 2065 1 58.22 GCTGGCAATCATCGACAGCGACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACA:1 + chr3L 18183049 5' + Tirant 21 2 71.22 AATCGGTGTGTAACAAAGTTTTAATAGAAACAACAATTGAACTGACTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:2 + chr3L 15393630 5' + pogo 6 1 77.40 CTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGA:1 + chr3R 12146648 5' + gypsy10 5681 2 51.26 GATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCCTAAAGTAA:1 - chrX 18673724 5' - roo 317 2 75.34 CTGCAGCAGTCGAGTGACTGCAGTGCGCACACCCCACCCACCCACACAAGACAAGATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGCCCCGTCGATAGCCGAAGCTT:1 + chr3L 1463640 5' + P-element 23 1 58.88 ATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 + chr2L 14056674 5' - pogo 2035 1 65.07 AATCAAAAAGTTTTCCAACTTCAAACTGATGACTCCCAGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2R 16274514 5' - roo 9038 1 65.75 GGCCGAAGAAACGAAAACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATAAAATCTAGAA:1 - chr3R 3586581 5' + INE-1 154 1 62.50 CCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTC:1 - chr3R 30955422 5' + G-element 48 1 48.63 GCAGCGCTGCAGCAGCGGGCATTTCAAACAAAGGACCCTGCTGGACACACACACACACACTCACTTGCACCCATGCACACACACACACACACACA:1 + chrX 19827899 5' + accord 7028 2 69.47 ACGTGGACAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATAT:1 - chr3R 25796097 5' - BS 5037 1 50.68 TTAATTCTTTAGCATCCATTCATAGCATCCATGCTGCCGCCTATCTGCCAACGCCGCCAGCAGCTGAAACAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr3R 27707025 5' + P-element 9 2 66.67 ATAGAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3R 26472928 5' + 1360 31 1 61.64 AACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCGTAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 + chr2R 21795219 5' - transib2 2787 1 60.27 CCTTGGACAGCTAAACGTCTGTCATCGTTGAAGCGAAATGAATTCAGTCCTTTTCATTGCAGGTAAAAAATCTTTACATAACGAATCTAACTATTTCCAATTAAGCACACAAATACTACACATGTGTGTGTGTGTGGTTGTGTGT:1 + chrX 9439368 5' - gypsy3 416 1 60.69 TAAATAAATCNTAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAA:1 + chrX 3533847 5' + 17.6 6957 1 65.07 AAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTAT:1 - chr2L 11867384 5' + BS 42 1 48.63 TTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:2 - chr3L 2317248 5' + 412 45 2 53.42 CTAATTGCACTCCTTTTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chr2L 10536428 5' + flea 4765 1 74.82 TGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chr3R 26854774 5' + jockey 98 1 78.08 CAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAAGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTA:1 + chr2R 22796795 5' - jockey 4909 1 76.71 TATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 + chr3L 18846957 5' - 1360 3340 1 59.23 CACTTAAGCTTAGTGTTGTCTAACAGTTTCATTGCTGGCTGTATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 - chr3L 22721174 5' + INE-1 30 1 67.83 ACACGATCTATCAAGCCAACTTAAGCTACAGCTACTATTTCAAAACCAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATG:1 + chr3R 10735978 5' - McClintock 6419 2 78.08 TTTATAAACATTTTTTATTAAACTGTCCCACGCTCCGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGCGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTTTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCATATAGTGTGCACTTAGAT:1 - chr3L 23655995 5' - roo 144 2 81.16 TCAGGAACGGCAATACGAGGTACATCACTGCAAGTGACGGAGCAGTGAAACGCGGATATTCACTCGGCAAGGATACGGGAGTGGACTTCAACCTTTCGTTCTTTATTCACGCACTGGTAAATTACAACTAACTTAACACTAACAG:1 + chr3L 25847270 5' - Max-element 8407 1 59.31 AACTAAATCTGAACAATTAAATGTGCAAATGCACTGGGCAACTATATACTACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGG:1 - chr2R 16567367 5' - opus 434 2 68.49 TAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 30087701 5' - roo 9010 2 61.70 GTGTAGAAAAATCACAAATGGATAACGAACTGGAATTAATCAACCGCAATTTAAACGATGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCG:1 - chr3L 11825681 5' - X-element 4391 1 57.81 TATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chr2L 10909582 5' - 412 425 2 68.35 ACCGTCAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCG:1 - chr3L 25206942 5' - HMS-Beagle 7018 2 67.63 ACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCA:1 - chr2R 6271496 5' - blood 142 2 57.53 TTAATAAGGTAGCAAAACTGATAACAGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr3L 13291921 5' + roo 8667 2 76.30 TCCAGAGTCAAACTATTTGCAACGAAGTCACTGAAAAGATGCTTTTCGGGCAAACGGCAAAATTTGCGGGAGTACATGAGTCCATAACATTGTTCACACTGTTGATCTGGCAACGC:1 + chr2L 22708459 5' - Rt1b 39 1 77.59 AATGTGGAAACCTGCTCGCAAACCCAATGGATTCTATTTTGGGAACAGTGACGTCTTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr2R 19230639 5' + I-element 16 1 73.79 GTGAGCAGTGCTGCAGATGCAAAGTGATTTTCGATACAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGACCAATGCTGACGCGCCAGAATCGGGTTCAGCGCTCCACGCGCAGA:1 + chrX 22754293 5' + gypsy 76 2 68.89 ACAATTTCACACATGCATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAAC:1 + chrX 20361974 5' - hopper2 1528 1 73.10 CAAATATAAGTAAAATAATAGAAAGCAATGTATTTTTAATAAATACCGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTCT:1 - chr2L 10074574 5' - pogo 2032 1 71.85 TATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGAGGGCAACTG:1 + chr3L 18183077 5' + Tirant 8163 2 56.85 TTTACTTTAACTACAGATTTTTAAGTCTCCTCCCGACACTTTTGAACAGCTTTTAAATTTTTTCTCATTTAATTCCCCAATATTTATCGCGTTCGAATTCACACCAGCTGAGTAACGGGTATCTGAAAG:1 - chr3L 25107614 5' + INE-1 547 1 75.19 AGTGGGAAAATTAGTGTCCTGCCGCCGCCTTTATGGGTCCTTAAAAGCCGCTAATGAAATCAATATAGCCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 29627955 5' + roo 8703 2 52.27 CAGCAGTATCTGAAAGGAGGCAGAGATGATGAAAGGGTATGTGAGTGCACTGTGGGAAAATAATAATGTCTTTTTAATAGATTATGTTATAATATCTAAGAGAAGATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCGGTAGCTAA:1 + chr2R 24215577 5' + I-element 5289 1 69.18 GGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 12890431 5' - hobo 2921 1 71.53 AATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 + chr3R 19514236 5' - blood 7323 1 62.33 CTGGCATCTTTTTTTATTTTTTTTAATTGGGTAGTGAAATTTAATTGAATCTTCTCTTGGTATGTAGAGCCTAACAATAAGTTAACAAATCTTAATCTACTCACTTATCGGGCGGGCAACGCGTCATGATCGAAAACCATGACATG:1 - chrX 4942280 5' + Osvaldo 492 1 69.18 GCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 + chr2L 15085641 5' + opus 7170 4 69.67 TTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTA:1 + chr2L 17550615 5' - Transib-N1_DM 442 1 79.02 AACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACG:1 - chr3R 1446145 5' + 1360 5 2 28.57 AAAAAGCCGTCGCCAAACTAGCCGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACAC:1 - chr2R 5621070 5' + ZAM 6 2 76.34 TTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCA:1 - chr2R 12185401 5' + accord 55 2 66.67 TTCACACAAGCGGAATTATTACATTGAGATAATGTCAGATAAATAAATATAGATATTAAAGCTTTAGAACGTTACAACTACGTTATATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr3L 21534361 5' - 1360 3352 1 60.96 GGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTT:1 - chr2R 17350625 5' + F-element 50 1 60.96 CATTCTTTTAGGGCGGCCTCCGCACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAA:1 - chr3R 7462986 5' + I-element 407 1 54.79 TTGCATGCCTATTTTTTCTGCATTTATCAATGTATAAAAATAATAATGAGGGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr3R 11756688 5' - Tirant 8492 2 76.03 TCATGAGTGTAATCAAAGTCCAGTGGGTCTGGAAGGCTGTGAAGTGAGCACACTGCTCAATAAGAGAAGTCAGATGTGCTGCGGACTTTCCCGGATTATAAGAATAGCAGTGCCTGGTTTTGACCAACGTAAAGTTCCGAAATGAT:1 - chr3R 4186884 5' + HB 241 1 69.86 GGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 18887050 5' + roo 8739 2 72.41 TTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATC:1 - chr3R 29288772 5' + BS 5066 1 63.01 TTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - chr2L 2291565 5' + I-element 39 1 55.56 ATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3L 8249511 5' - mdg1 402 2 69.29 TAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3L 18216472 5' + 297 58 2 60.96 TTATTTTCTTATTGCGACGCCAACACGCATATATGTACATAAATACATATATTTATATACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chrX 13628687 5' + roo 19 2 73.29 CCCTAAATGGAAACTATTACTCTGGCAAAATTGTATGTAGTTAACACAAAAATGTTAAGTAATGATGACACCAACGGCACCAACTTCGCCGCGAAGCCGTCAACTGCCTTCGACAGATGGTGCTCTTTGGCCCACAC:1 + chr2R 5343212 5' - Osvaldo 1312 1 49.64 TTATTGAGGAAAATATTTTAATATATTAAAGCTGAAGTGGCGGGATAACAGATTAGCTATAAATATATATATATATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTATTTTAATTCTAAATGCGG:1 - chr2L 21198285 5' - flea 213 2 59.59 CTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1 - chr3L 1628687 5' - hopper 1332 1 75.86 TTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAA:1 + chr2R 14427130 5' + jockey 4816 1 56.16 TTTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATTAGTCGTGCCTCT:1 - chr2L 2291575 5' + I-element 19 1 68.00 ACCGGCTGGCTTGAGACCGAACTGGAACAGATTACCCACGAAGGGGTATGGCGTGGGTCCTGGGATCATCTCCATGATGCCAGCCATGTGGTCTATGTAGTTGAATATCCTGTAATAAACCAATATATTCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr2R 8442585 5' - blood 7375 2 76.03 TACACACATATATTTTGTTTAGCACTCATTTAAAAGTTGAACGTAATTTGTGGTATTTCGTTCGGGTTGTTTAGACGAATGTTCAAGGCTATTGTATGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr2L 18525745 5' - pogo 2079 1 70.34 CTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATC:1 + chr3L 19951206 5' + Ivk 94 1 72.41 TATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr3L 11364900 5' + Tirant 38 2 55.47 ATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2R 9750254 5' + opus 147 4 54.47 GTTTGAATTTATTTATTTTATTTCTTTTGGCCACGGACACTTCATGCTTTTATTATAATCGTTAACTTCATGCACACGTGAATCCTGTCACGGTCGCATATACATATACATATGCATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAA:1 + chr2R 23352141 5' - Stalker4 215 4 62.33 TATTGTCTCGAAATACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2L 9704778 5' - roo 341 2 63.89 GATAGGCAAATACACTAGGAATGCTCGAATTTTATTGAGANGATAAGATGGTTTTATAAGGAAGATAAATATTTTTTTAATTAATTTAAAAATTTAAATTGNAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCGCGAGTACTTTGCAC:1 - chr3L 15393851 5' - pogo 2085 1 69.18 AGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTC:2 - chr3L 12227908 5' - opus 463 2 61.64 CTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:2 + chr3L 15393675 5' + pogo 51 1 53.42 TATTTTATTGTCTTTATGGCCGGCGATTCGGGCTATATTATGTATGTAGCATACATTACATTTATAAATATTATGATGTACATGCAATCTTAGTAAATAATTTAAATTTGAGTCGCGATAAACTGGAATGTCTAATCAGTATATG:1 + chrX 8876406 5' - rover 7116 2 73.79 AATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATT:1 - chr3L 27415317 5' + transib2 56 1 56.64 GAAGCGTACGCATGGGAATTCCTTGGTCATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTCGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTA:1 - chrX 2956320 5' + copia 4896 2 66.90 TAACTATAGCTTGCCCTTCTCACTCATATTGTATACATACTCATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGC:1 - chr2L 5207520 5' - opus 7442 2 74.42 GAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTT:1 - chr3R 15727946 5' - 1731 4582 2 50.00 CAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 20904967 5' - roo 9005 2 66.44 GTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 - chr3R 20200474 5' + Transpac 4992 2 69.93 AAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chrX 21668353 5' - opus 440 2 61.64 TCCTTTCGGGATCCCGTGCTGTCCGACTATCGGTTCGGTTTGAGAGCGGGCGCAATGCAGCAAAACTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 + chr3L 13993434 5' - P-element 2856 1 58.06 GAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr2R 10977177 5' - roo 316 2 76.03 AAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCNTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGTTGAAGGTT:1 + chrX 21442978 5' - Transpac 229 2 70.34 TTATAAAAAATAATTAATCTTTTGAATAATCTTTTAACTTACAGCCTTGTGGTCTGGCACAGTAAGTAATAAGAATATGTTTTACGACGCTTATTCGGAGTTGACGAGCTGCCGCTCTTTATTCTGATAAATGCAAATTCAAACTA:1 - chr3R 18245515 5' - Gypsy6A_LTR 165 1 72.60 ATGAACAAAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGCGT:1 + chr2R 961129 5' - transib2 2672 1 61.15 AATCGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr3L 2317268 5' + 412 7077 2 67.59 CTACGTAAATTGCGCAGCTGCTGCGAAGTTGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGCCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTGAGGACAA:1 + chrX 22578007 5' - 297 355 2 38.36 TAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2L 4244978 5' - 412 452 2 54.84 ACTAACTAAATGTTTTTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr2R 19389455 5' + 297 6612 2 52.05 TAACCCTATTAAGAATGACCTGGTTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGA:1 - chr2R 943921 5' + F-element 57 1 48.97 AACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGC:1 - chr3R 10736119 5' + McClintock 69 2 70.83 CCACCGAAAATGATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 - chr3L 5027264 5' + roo 8736 2 67.59 TCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTG:1 + chr3L 19580007 5' + jockey 88 1 73.24 GGAGAACTAAAAGCGAGGCGCTAAAAGAACAATGTGTCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGT:1 + chr2L 15419988 5' - Burdock 6372 2 66.19 TGCAGCAGTCGAGTGACTGCAGTGCGCACACCCCACCCACCCACACAAGACAAGATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 + chr3L 1463641 5' + P-element 46 1 48.06 CAACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACG:1 - chr3R 1446146 5' + 1360 10 2 29.45 AACAATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCA:1 - chr2L 20628695 5' - Stalker2 7623 2 64.03 TATATGTGTATATTTTCCATGCAGTCTTCGCAACAAGAGCGCGATATCCTTCGCAAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 - chr3R 21794180 5' - hopper 1390 1 67.12 ATGTAACGGTCACACTTGTGTTTGTTTAAGCGGTTTACTGTTATTTTAGTGTCTTTGGTACAAGCCTAAACATGTGTTTTGTACAAGTTAACTTAAGTTAACGCCGCTACGACGACCGTGTGGCAACAACGGCATTCTGCAACGTA:1 - chr2R 4134969 5' + gypsy2 6535 2 76.03 AATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chrX 23431556 5' - roo 322 2 77.40 TGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:2 + chrX 292011 5' + 412 7129 2 72.66 AAGTAGTTAAAGTTAACTACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:2 - chr2R 12462245 5' + roo 43 2 54.79 CACCTAAGTAAAAAATGCATTGCGATATGTTTCATATCCAAAGCGCACATTAAACTTTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTGGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTAT:1 + chrX 21096985 5' - INE-1 163 1 51.72 CTTGCATAATGGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr3L 414945 5' + 412 59 2 58.22 TGTAATTGCAGTTTGTGTGCTGAAGGGTTGATCGGGTTGCAATTGTGCCAAATGCCATTAATGAAAATCACAAACACAGTCCCTCCGTCTGTCCGACTGTCCGTCTGCCCGTATGATCGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCT:1 - chr2R 6593297 5' + INE-1 150 1 60.00 TCTTTCCTGCCCGCCCTGTTTACATTGTTTACACGTATGCCGCTGGCCACCATTCAACCGCTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTA:1 - chrX 9846839 5' - transib2 2762 1 60.96 AATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1 + chr2L 7633358 5' + Max-element 49 2 56.30 CAAACAAACTAGACGATAAGTTAGCAAAAATAATCAATTTTTGAGGGGGACAAAACAACACATAAAATCGGCAGATTGCGGTTAATGGTCGTTTAAGATCGCGTGAAAAGGGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTG:1 - chr3R 8050697 5' + jockey 4771 1 76.71 GTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 12133881 5' + jockey 30 1 68.49 TGCTTAATTTTTGGCGCACTCGGCAGAGTATTTTTTGTGGGTTCCTTGGGCTCTTTGTGGGTATGTGATGTGTTGTTGTGTGTTTCCTTAGTGGGGCGCCAATTATTAAATGTG:1 + chr3R 10462940 5' - gypsy3 385 1 64.91 GTGTCAACAAGGAATCAGTTTCCCAAAAGCTGCACATTTGTTTTTATTTTTAGTCAAATACCAAGAAATAAGTCGATCCAGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr3R 16187749 5' - mdg1 7418 2 54.11 CGGCAAATATTCCCTATTTTCGCCAACTTGATACTATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2L 5728992 5' + roo 11 2 76.34 TACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTTGGTGCTTAAAATAGC:1 - chr2L 11867354 5' + BS 72 1 66.44 TTCTAGTTCTTTTTAGATATATATTTCATTTCAATGCCGTTATCAAGGTTATCAATAAAGTGATTTCGATTTTTTTATTATACCTGGTACTCGTATAGTAAAAGGATCTTAGTCTTATAAATTTCTATCGATTCGCAAAAAAAAA:1 + chr3L 25255426 5' + INE-1 313 1 68.28 TTTTATTAATTTATATTTATGTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTT:1 - chr3R 18128563 5' + roo 8696 2 62.33 TAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 5027154 5' - roo 9037 1 58.57 TCGAATTAACAGAAGATTGGATTCGTGCAGAGCAACAGAATAAAATGTAAAATAACTATATTAAATATTACTGTTAGTAGGATCTAATTATGTAATAAAAAGGTTACAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAG:1 + chr2R 2675408 5' - Cr1a 4247 1 71.76 ATACATTTTTTATTTTATCAAATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTAAACATAACGCAAACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTCTATT:1 - chr2R 7635937 5' + 1360 3260 1 46.58 ACGCCCTCACTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAA:1 + chr2L 2057799 5' + 412 7085 2 55.83 TAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAA:1 + chr3R 13868923 5' - HMS-Beagle 6973 2 67.81 TGAAACAGCCAGGTTTGGATGATCCTGGAGGCTAGCACGTAGTCCGAGTCACGGGGATCGCTGTCAAAGCAAAGATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCG:1 + chr2L 10074469 5' + pogo 4 1 77.06 AGAGAAATCATTCCCCTTTTTATGATTTTTTGCTCGATTTTTCAGCGCTGAAATTGGTTTCGCTTCGTCAGCGTTATCCTTACATATAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAGG:1 + chrX 20915863 5' - accord 180 2 75.76 AATATTCTCTCACGAAATTAACAATTAAATGAAATATATATATGAAAATTTTGTAATTAGTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAACGCGGTAATTATATAAAGTATT:1 - chr3L 7787572 5' - flea 196 2 61.54 AATTTTATTACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2R 18886935 5' - roo 9038 1 62.33 TGTTATTGACTATCAATTAAAGGCAGGAGGCAACTCCAGATGCAACTCCCAACTCTACCACCCAACCACCCAGGTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 - chr3L 23496689 5' - blood 341 2 56.30 GGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTCCTCGCCACGCAC:1 - chr3L 21764442 5' + hobo 60 1 65.62 CATTTGTGGTCACTGTTGTTGCCTCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATA:1 - chr2L 6637511 5' - 1731 4601 1 65.75 TTCTAGATAGCTTAATTCCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr2R 16371958 5' + 412 56 2 64.62 CCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3L 27391424 5' - 1360 3368 1 66.21 ATTAATGTTTCAGCCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTTGTTTGGCACTATGCAGC:1 - chr3R 25580884 5' - 1360 3351 1 58.22 CGTCTGATTGTGTCTGTGTGAGTGTGTGACTGACCTATCTCAATGCAATTTTGCTTGCCCGCTGCACCACAAACACACACGCACGCACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 + chr3L 17500691 5' - Tirant 8479 2 65.96 CATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGCGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCG:1 + chr3L 1437885 5' - Transpac 246 2 65.91 AAGGATACCATTAGTAGAACATCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTA:2 - chr3L 18074221 5' + 297 6600 2 73.29 AAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGA:1 - chr2R 17493187 5' + BS 4848 1 50.68 GAAAAAATAAAAGCCAGTTGAATTGTCTGCCACCAATGTGGATGTGTATGTTGCAGTTTCAACAGCAAAAATATCCGATGGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chr3R 4666223 5' + FB 16 1 69.67 ATTGATAATTAAAAAGAATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - 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BS 5035 1 56.16 ATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGGGCACGTTTGCTCGTTG:1 - chrX 7702822 5' + P-element 64 1 40.56 GGAGGAAATTGGATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chrX 20149277 5' - pogo 2084 1 72.22 CGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAC:1 - chrX 12649915 5' - blood 7011 1 64.03 ATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATTCCTCACC:1 + chr3L 2167586 5' - opus 7463 2 53.08 TTATACACAAACTAACTAGTGTAAATGTGTAATTGTAAGACCAATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr3R 4962903 5' + jockey 66 1 54.79 ATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCAC:1 - 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roo 9036 1 54.62 CTTTGATAACAGCTAGCGTGTGAGCGGGATGGCGACTGGCAGAAGAAGAAATTTAAACTGATAACAGCAAGCGAATGAGAGGGATGGCGAGTGGTGAAGCAGTCCAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chr3L 5771026 5' + P-element 17 1 73.97 TTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chr3R 19514318 5' + blood 75 2 68.49 AAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 19965221 5' + jockey 70 1 58.04 TTTTTAGTATTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTT:1 - chr3R 17243258 5' - hopper 1412 2 79.55 CTTTACTTTTACGAATTCCGAAAGGCAATAATCCTTATTTGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr2L 20133114 5' - 297 381 2 74.62 ATTTTACTAATAATAACACCGAAAAATTAATAAAAACAAAAGATAATGCTATAGTCGTCTTCCGGGACTATCAAGTACCCGTTACGCAGGTAGTGGAAATACGAACGAAATATAATTTTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCT:1 - chrX 22958116 5' - INE-1 14 1 79.45 TCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:1 - chr3R 9298549 5' - hopper2 1531 1 69.18 AAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGCCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACA:1 - chr3R 8050537 5' - hopper 1352 1 62.14 GCAGCACACAAAGAGGTGAGGAGCCATAAAAAAAAATATGTAGAAAAATTCTGGGGCCTGTTTGGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 28014227 5' - roo 394 1 71.88 CTTTTATAATCCTCACATTGAAGTTCAAAGGAAACAATTGTTTTAGTTTTTAATTTTTGATTTTTAATTTTAATTTTTTAAAAATTTATCTCAAATACTTAAACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGAT:1 - chr2R 13121904 5' - HMS-Beagle 230 2 58.90 GTTTTTTGTAATTTTTCATTACCAAGATAGTTAGTTTATCTCATAAGACCTTTCCACCGATTGCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr3R 25158532 5' + 1360 3 2 74.66 TAATATTCCAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372610 5' - Doc2-element 232 1 83.81 GTTCGAATTGACACCTGAACGAGCTGCTTAAGAATACAAGGGTGGTAATTGTTAAATGGTTTCATTTATTAGTAAAAATATAATTGTATTTGATTTGTATATTTAAGTATATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTT:1 + chr3L 22257699 5' + mdg3 5263 1 78.77 CCAAGTTCTGCGCGGCCAGGCTACTTGGAATACCAGAAACCAGAATCCACAATCCAGAATCCTGATCCCAATGAAATGCTATAAAAAAAAAAGATGTGCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr3L 1459744 5' - 412 469 2 64.83 CAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:2 - chrX 21668396 5' - opus 7486 2 47.26 AGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCACTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGT:1 - chr3L 8249507 5' - mdg1 7436 2 65.00 CTAATCTCATATTACCAACGAATATCTGAGAATATCTTCTCTTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTT:1 - chr2R 24215694 5' - I-element 5280 1 68.06 TCTGGCAACCTAATCCACCAGGGGCCCAGCATGGGTCACCCGAAATGGCCCACACAAACACACACACAGACACTGGGATTTGAGACAACACCAATACAAATACTCAGAACACACACACACACACACA:1 - chr3L 11672616 5' + accord 182 3 67.72 TTCATTATTATTTTTGAGTTTTTGGTGTTTGGTGTGTGCGTTTGCCTTAATAAATTCGTTTCGTATTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 18128429 5' - roo 351 2 57.53 TAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chrX 13090999 5' - P-element 2864 1 68.49 ATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAA:2 + chr2R 7314628 5' + blood 7069 2 55.48 TTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:1 + chr3L 9324416 5' + HMS-Beagle2 6893 2 74.62 TTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCAC:1 + chr3R 19965248 5' + jockey 100 1 77.40 AAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3R 31266123 5' + jockey 90 1 74.48 TTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAG:1 - chr3R 6419974 5' + Tabor 6860 2 61.64 TTAGATTCTTTATTTTGACAATTTGACAATGCAGAAAATGTGAACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTANGTTATG:1 - chrX 21443097 5' + Transpac 23 2 67.81 AACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 - chr2R 6801724 5' + 297 6630 2 57.53 TCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 + chr2L 15420024 5' - Burdock 6330 2 65.75 AAGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2L 7929597 5' + roo 66 2 68.35 ATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGGACTTGGCCAGATCGACTCGTCTATTGATCCTGATCAAGAATATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTT:1 + chr4 829442 5' - 297 394 1 70.00 CATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chr2L 10909589 5' - 412 425 2 65.07 TGTAATTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:3 + chr3L 22320118 5' + jockey 30 1 65.75 TAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chr2R 5953909 5' + flea 30 2 58.54 CATCTGAGGAAATTGCACACCACTGTGACCTTTGGTGTCAGCCCAGTAGCGCATGTTTTGTTTGTTCCGAAATGCACTCTGTGTTTTAATAACCAATATCCGCTTGAAAAGTAGGCCTCAACGGCAATGGTACGCTCC:1 - chr2R 4802973 5' - mariner2 151 1 75.36 TTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGCAAGAAACTAATTGTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chrX 17792536 5' - roo 330 2 71.72 TAGCTGTTAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTG:1 + chr3L 11684809 5' + Bari1 46 1 52.17 GCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTA:1 - chr3R 12376515 5' + HMS-Beagle 6855 2 59.59 ATTCTGTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr3R 25597827 5' + copia 54 2 57.53 CAATTGCATTTATTAATATATTGATAATTAAAAAGAATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chr3R 12519747 5' - roo 398 1 78.08 GAATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGG:1 + chr2R 22957902 5' + hobo 67 1 63.01 AAACAATTGTTTTAGTTTTTAATTTTTGATTTTTAATTTTAATTTTTTAAAAATTTATCTCAAATACTTAAACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr2R 13121873 5' - HMS-Beagle 6995 2 52.05 TTTGGGAAAGGCGTTGAAAGTCGTTGGCGCGTAATTGACAGCCACAATGACAGCGGAGACACACGGACACCGAGGACGACCAGGAACGTACCAGAACGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGC:1 - chr2R 8842902 5' - F-element 211 1 73.85 TGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:2 - 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chr3R 18832475 5' + roo 36 2 58.22 AATCAAAACCAAAACTTTCGCTTTGCACTTTTCTTTCTTGCACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACACTT:1 + chr3L 17011917 5' + 1360 35 1 61.64 AACAAATTATAGAAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAAC:1 + chrX 3533828 5' + 17.6 10 2 79.31 CTTACGTTGATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACA:1 - chr3R 20887542 5' - Doc 4657 1 72.60 GAAATTTGGATCGCGGAAAGAGAAATGCTGGGTTAGAGCACAATTTATTAAAAGCGGAGCATGGAAATTGCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:2 - chr3R 18294964 5' - copia 244 1 73.29 CAAGTGGGGCAAAAAGAAAAGAAAAAGTTCGTGGGGGGTGGGGAGGGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTG:1 + chr2L 3661950 5' - blood 351 2 57.80 TGTTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 + chr3L 2167571 5' - opus 459 2 57.53 AATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr2L 7929527 5' - roo 330 2 69.66 AAATTGTAAAAAAAATGTAATTTAGTCGACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 - chr3L 4303994 5' + Transpac 52 2 53.42 CTGGCAACAATGCAACAATGCCATAGAGCCACCTAATTGGAATTTAAGCTTGTGCTGGTAATTAGTTTACAAGCAGCATGGCACAATTGAGTGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACACTGCCTCG:1 - chrX 6538791 5' - pogo 2076 1 68.49 CCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATG:1 - chr3R 15727901 5' - 1731 4545 1 76.09 ATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTT:1 + chr3R 4160066 5' - invader2 5045 2 58.90 AAAAGAAAATCAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGTGGCTCCTTGGGATATGA:1 - 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chr2R 17350619 5' + F-element 56 1 56.85 ACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCG:1 + chr2R 12185336 5' - accord 401 2 67.18 AAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAACAT:1 - chr3R 10737091 5' + F-element 41 1 61.38 CGGCACGTGGACAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATCACTGGTGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAA:1 - chr3R 25796101 5' - BS 5078 1 59.26 TACTCCTCGGTTTTTATCATGCGATACACACTTCTAGAACGCTGAAACTACTTTTATCAATAGTTATTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr2R 14821262 5' - roo 401 1 67.81 GTTTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCCCGGCCACACACACGGACAATGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAACGCCATACGATTTTTTGTCACACGATTTCTTCGCCGTGGCTC:1 + chr2R 16880919 5' + 1360 50 1 57.14 AAGACAAGTGCAAGCCAGAAAATTAACTTCAAGGAGGGTCTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 22708954 5' - roo 353 2 55.56 TTAAAGAAGTCTGAAATATTCCACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2L 8120135 5' + roo 57 2 62.32 AATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGAGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTG:1 + chrX 12979408 5' - transib2 2798 1 67.81 CCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGCAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3R 25580871 5' - 1360 3344 1 51.43 TGGATTAATAATTTAATATTTCCTGCCTTCGATTTCATCAAACTTGACGCCTTTCTTCTGTGAGTTCTTCCACTCGATAATTTGTACTGAATAATCTTAAAGAATCCTGATGGAAAGCGCCATGCAGTCACATATAATATGTGCAG:1 - chr3R 3886904 5' - baggins 5234 1 56.85 CGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACG:1 + chr3L 25232770 5' - accord2 160 2 58.56 ATCTTTTGACTGGAGCTTTGCTCAATTTCTCATTTTCCAGCTGAAGATATTCGTGTTTGCCGGCTGTTTGGAAGTTGGGGCTGAGGAACGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr2R 9607261 5' - P-element 2864 1 68.12 GGGAGCGGAGAGCGGAGAGCGAACAATATATATATAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCGGTGGGCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCGATCAGGGTTTATAGGATAATATCTTCTTATGAAGT:1 - chr3R 29682367 5' - gtwin 392 2 69.29 GTGGGTGTATGGGTTTTAGTCTAAATATTGACATGGCCCATCATCCCGGTTTTGCCTGGTGGCTCCGATCTGCCAATGCACCCGCCAACCTTGAACTTACAACACACACAGATATGCACACATACATACATATTACATACATATGC:1 + chr2R 11659966 5' - Dm88 7 2 49.32 AATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3R 17987646 5' + jockey 81 1 69.18 GGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr3L 7024432 5' + 412 7101 2 51.37 TTCAGCTCAAATATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 + chrX 5841918 5' - roo 8998 2 68.49 CCTTGTTAACATGTCGCATTTTATACGCATTATTAACGCTCATCGCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCAAAAATT:1 + chr3R 22647787 5' + transib3 24 1 69.18 ATATGGTATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 - chr2L 19248231 5' - mdg1 7396 2 58.22 GAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACA:1 + chr2R 4012515 5' + F-element 288 1 64.00 AAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTC:1 - chr2L 23295888 5' + micropia 5100 4 54.26 AAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCG:1 - chr3R 10736141 5' + McClintock 27 2 60.48 AAGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 - chr2R 9750272 5' + opus 39 4 57.53 AATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCANATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGNTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGATCGTGATATAAGATC:1 - chr2L 3662028 5' + blood 7093 2 70.55 TTTAAAAATGTTTAAAAATTCAAAATTCATGTTTATTTAAATATTTTTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 - chr4 868786 5' - roo 397 1 77.40 ATTTTTGCGACAATCTGTAGCACAAGTTTTTGCAATGTTTTTTAATCTGTCCTCATTATCATCAAATACTAAATAAAGACTGTTCCAAACATAGTTCTACGTTTAGCTAGGGGCGGTAAATTAATTAAAAGTAGTATACTAGAATA:1 - chr3L 18591628 5' - Cr1a 3974 1 52.05 GAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTA:1 + chr3L 24272066 5' + gypsy11 58 2 62.40 TACCATTCTTATAGCCTGCACTTATATAATTTTTCCTCAAGGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACCTGTTTAGTGAGAGGCTTGGTTTTATCTTT:1 + chr3R 25795962 5' + BS 5014 1 69.44 TTATCAATTTCGGCTATCATTACTATATACAAATTGCCTGGCGAGTTATATTTAGGGTACGACTATAGAACTAAGTTTATACATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCA:1 - chr3L 3861545 5' + micropia 32 2 60.27 CACAAATGTTTATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAAT:1 + chrX 9846718 5' + transib2 34 1 60.71 ATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:2 + chr2L 16884764 5' + pogo 23 1 62.33 ATTTTAATTAATTTTTTTCTAAGAAAAATAAATAAAAACGAAAAATTCAAATAAAAATTATAAAAAATAAACCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chrX 14046648 5' - roo 9021 2 56.85 TGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGA:1 - chr2L 20852510 5' + Tirant 44 2 74.74 GGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGCACAGTGTACCCGCGATATATGCACA:1 - chrX 12649914 5' - blood 7019 2 67.91 AGTTAATCGCTAGCAGAATCCAAACAATTGACCCAACTATAAAATGGGAAACTACCCTAGGAGTAGTTAAATCCTTACCAAAGACTCGCAGCGGCCAGGCAAATATGCTGTGTTTGCCCGCTG:1 - chr3L 25840571 5' - Gypsy6A_LTR 94 1 67.48 GGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3L 2317235 5' + 412 58 2 57.53 CATTCTGGCAAAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATT:1 + chr2L 6618866 5' + 17.6 6953 1 62.76 TGAAATCGAGTACGAGTCGTAAAAGGAAAAAATAAAACACAAGCTGATAAATCAGTTTTATGGCACTTTTGCCAAACTTGCATATAGAGTATCTTAAAAATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chr2L 8536487 5' - Juan 4197 1 68.49 GAGGATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTC:1 + chr3R 18832310 5' - roo 9063 1 72.93 ATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTA:1 - chr2R 17493146 5' + BS 4878 1 77.04 CATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGATAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGCGTGCTACTCGCCACGCACCACGCGGGTACTTANACACACACAGTATA:1 + chr3R 23964839 5' + hobo 89 1 72.60 TTTCATGAGGTAACGAATTTCACAAATTCGCGGCGGGTGANTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 + chr3R 12341093 5' + Tirant 8135 2 51.92 ATATCAACTATATATAGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 + chr3L 10897420 5' + roo 8706 2 56.85 GCATATCCAAAGGGTCGTTTTCAACCAGTCCGCAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACA:1 + chrX 3239273 5' + X-element 68 1 61.64 AAATATGAGGAACATTTACATAAATTACTCGTATTTTTTTTACGTGTTCACATATTTTTAGGTTTCCGAATTTATCCCCTTTACTAATTAGTTCCTTTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 - chr2L 21559395 5' - 1360 3376 1 73.33 CCTGTCTTCTGTCCGTCTCCAAGTCCGTGTCCTGCGACCACCTACACAATTTCAACTTAATGACACAACAATCACTCTGCGGTTTTTATTTCCTCGGTTGCTTTGAAGCCCTTGAGTCAGTCAAAAAAAATAAAATAAAATAAAAA:1 + chr2L 17038712 5' - transib1 1900 2 50.00 ATATTTTCTTATTTAATAAAATTTATGTTAAAATTATGAAAAGAAAGGAGAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chr3L 18600161 5' + F-element 87 1 69.18 GTCGCGATCCCGAGCTCAGTCGAAAACACGTTACGCGCCTGTGCAGAGCGTTTTTGCTCTATCCAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr2R 9836638 5' - P-element 2861 1 59.13 TTAGTGAGGTGCGTATGTCTAGGCACATTTTTAATTTAAGTATATATGTAAAAATCAGGCAATGCAATAATAAATTAAAGGCAAACTTATTTGAGTATTATTACTTGTGTGGTTGGTACCCATATCGCGGGTAGAGCCTTCATGCT:1 - chr4 598626 5' + R1A1-element 5028 1 79.45 AGATAGAGATNTTGCTCATAATTAAGCATTTAGTATTGTTCCTTACAGGACAATAGGGTTTTTTGTAGAATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAAT:1 - chr3L 9280475 5' - copia 238 1 52.74 AACACAGAGAAATATGTATATGAATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGATGTGTCCA:1 - chr3R 26180551 5' - Transpac 5200 2 64.38 TATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 - chr3L 2167710 5' + opus 7030 4 62.50 AATTAGGAAAATTACCAACAGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chr3R 24084914 5' - roo 9038 1 60.96 TTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTCAACACAAG:1 + chr3L 9324456 5' + HMS-Beagle2 45 2 54.40 GGAGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGC:1 - chr2R 2994309 5' + gypsy8 134 2 50.00 AACCTGGCTAAGCTGCTGATCTTTTAAGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAA:1 - chr2L 4245038 5' - 412 490 2 76.71 GACCGTTAGCCGCAAGTTGCTTGCGTTGGTTAGATTCCCGATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chrX 21045215 5' - P-element 2806 1 30.82 TAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 + chr2R 21795210 5' - transib2 2796 1 66.44 GTGGACGACAACGAAGGCTACAACGACGCCCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 + chrX 19662916 5' - P-element 2865 1 69.18 GAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chrX 20330598 5' + P-element 69 1 33.82 ACATTTAATAGGATATTCTAACAAATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTT:1 + chrX 6216330 5' + Juan 4017 1 61.64 AAGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTACAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGACTCGCATCTTAAAGT:1 - chrX 5751915 5' - roo 319 2 74.66 ACTTTTCTGGCCCGTTTCAGTGTAGAACTTTCCTTTTTGTCGTTGACTCATGATTGAGTGCCGTTTTTCCGAATCTCTCTTTGCTCTTGTACAACCGTTTTGCTATTCCGCGCCG:1 - 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roo 9047 1 66.20 ATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTT:1 - chr2L 16884901 5' - pogo 2035 1 64.38 TAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTC:2 + chr2R 11246971 5' - 1360 95 1 54.79 ATAATTAAGGATGATACGAGATATATTTTACCAGATAATTNTAGGGCTACACAAACTCATATCAGTTGCAATAGTGACTGTTAGTTAAGTACTTTTTAAGATTTGTAAACTTNTCATAATGAGAAGCTTTAATAAACAAACCAAC:1 + chr2R 3097181 5' + Fw2 3931 1 74.48 TTGGTACCAAGAGAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 18832436 5' + roo 75 2 71.92 CACACCGACTCACTTCCCGAAAGGCAAATAAAACCTGAACTGCAGCTGCAAATATGGTTAAAAGGGTGTGAGTTCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr2L 20228065 5' + 1360 38 1 56.93 GTGTGGGTGTATCTATGTGTGTTAACATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAGGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTG:1 + chr2L 10143664 5' + jockey 4551 1 80.42 CAAGTAAATTTGATTCCTTATTACGATTAGATGAGTTCTAGATAGCTTAATTCCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr2R 16371923 5' + 412 37 2 56.16 CGAGATTGGTCTGAGTGAACCTCTGGAATCGGAGGAGCCCTACAAGGCTATGACTGCTGGTAAGTGGCGACGATCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAACTT:1 - 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chr2R 9871054 5' + roo 72 2 72.14 GCCTCGTTGTCCTCTCGTGGCCGCTCGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGG:1 + chrX 20330505 5' - P-element 2885 2 77.00 TTAGAATATTCAAATACAGTGCTCAACTGAATAGGTTCAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTT:1 - chr3R 4577544 5' - Tc3 1701 1 80.00 GCCCAGTTAGTTTGATCTAGTTAGCTTTTCATGTCATGGATGATGGCACTTTTAACTTAAGAAATGCAGCAAAAGAAACAAATAAGTTACATTTAATTAATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAA:1 - chrX 8876984 5' + mdg1 23 2 69.86 TCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGT:1 - chr2L 20628678 5' - Stalker2 351 2 50.68 GTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2L 13229218 5' + roo 73 2 70.55 TTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTA:1 - 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Tabor 454 2 58.62 GGAATGTTGTTAACTTTATTCTCTGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATG:1 - chr3R 13349145 5' + BS 5037 1 53.52 ATTCACTATATTCAGCATGTAGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 + chr2R 7314573 5' + blood 3 2 79.45 AAAAATAAGTCAGGATTGTAAAGCCGTTTATGAGTCGGGGCCTAAAAATAATGCTAAAATTCTAACTTATTGTACATAATTCCTTTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTT:1 + chrX 13789506 5' + FB 16 1 68.80 TTTTGGCCACGGCGGCGGCATCTCAACAGTAGCATATATAAATCGATTTGATTAGACTTGGCAAGCAACTAAATTTCCAAAAAAAATTATGGGAAAATTGATGCAAATTCAAAAAAATAAATAATACAAAAAAAATATAAAAAAAA:1 - chrX 12572322 5' + G2 3075 2 63.01 TATGTCCATCGTTACGAACTAAAGGTTTGTTATCCCCTTTACTCGTAGAGTAATAGGGTATACTGGATTCGTTGAATAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTT:1 - chr3L 22721133 5' + INE-1 32 1 66.35 AGAGTTTATGACTATATGACACCGACTCGAAATTGAAATGCACAAAATAAATTTAAAAAAAAAACATGCATCTAAGAAATGGGAGAATTAGTTCGCTGAAAACTGCACGATTGCATTTAATTGCACACTTTTATTTAAAAAAATA:1 + chrX 3555548 5' + transib2 2628 1 51.03 TGGATTTCAACTAAATTTTGCCAGCTTTCATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 - 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BS 5057 1 60.96 AATCACAAATCGATGGTGCAACAGAGCAAATATATATCGAGCTGTGCGGTTGTGTGTTGGACGGAAAAAATGCTTCACTTTGCACTTTCGTTTCTTTGTCACAGCTTTGGGTGGTTAACGAACATTGTGAGTTCTATAAGAGTGC:1 - chr3L 7213400 5' - gypsy4 293 1 64.83 ACGCCCAATGGAGAACTAAAAGCGAGGCGCTAAAAGAACAATGTGTCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGAT:1 + chr2L 15419979 5' - Burdock 257 1 79.53 GTTCGTGCTCCATCTTAAGTTACAATCTGAGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 + chr3R 29680178 5' + 412 38 2 58.90 ATTGTTTTTGTCGCGTTTTCGACCGAATTATTTGCATCTGAAAACCCACTGGTGACAATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 7389802 5' - roo 351 2 57.34 AAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGAGGGCATAAGTATTTGGACAA:1 - chr3R 2520351 5' - Tc1-2 1618 1 64.44 AATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 6050250 5' + 412 7095 2 51.11 CTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 14360844 5' + jockey 35 1 55.45 GAATCTCGGTGCGGCCCGGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 - chrX 683629 5' + jockey 71 1 56.16 GACGATGATGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGCTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 + chr3R 11284906 5' - blood 7332 1 61.07 GCGTGTCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr2L 14263047 5' + P-element 40 1 53.54 AATTTGTTGAAATTGACTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGT:1 - chr3L 9318121 5' + P-element 2848 1 76.03 TTAATTTGCCGAAGAATTCATGCGGAAAATTCGCCAGAATCTATGTGACAACATTGTACTGTGATATATTTACTCGACTTCTATTCCATGTTCACTTGAATTTATTTGGGGCTATACTTTAAAATTTAACATTATATTTATTTCCT:1 + chr3L 4561162 5' + Cr1a 4326 1 60.96 TTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 - chr3R 13423367 5' + 297 48 2 62.90 TTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTCCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTT:1 - chr3L 9324549 5' - HMS-Beagle2 280 2 53.10 TTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 - chr2R 11247053 5' + 1360 69 1 65.07 ATTTTGCAAATAGCAGGTGCACCTTAAAAAAACTAGCTTTACGGAAACCAAGCTTCCTCTGTGGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACAAGATTCCTTGAAAAGTATGTAACAGGCATAAGGAAG:1 + chrX 10939795 5' + INE-1 28 1 48.15 TCCGTGGGAAACGGACGTAAATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCA:1 + chr2R 6767978 5' + pogo 45 1 52.74 CATATATGGCGATGGAAAACCTTCTAATATATGTACAAATCTTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTCGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACGATTAACTAACATAGCATATTAACT:1 - chr2L 11617822 5' + 412 34 2 58.90 CAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATAT:1 + chr3L 11904767 5' - copia 5065 2 57.53 ACGGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 20061465 5' + roo 8695 2 60.96 GATTTTGCAACTTCAGTTCGGGTAGCTTCAATAACATGATTAACTTGATGGTGAAACGAATCCCGGCAAATCGCCAGCGAAACTCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 - chrX 18150092 5' - hobo 2935 1 77.19 TAATATTCTTGAATGGATTTTGGCGTTCAAAAAGGTAGGTGTTACGTTTTCTTTAGTACTGTATTATGTGACGTAAGCATTACTTCCACGGGGACTATTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr2L 22629748 5' - 1360 3365 1 65.07 ATGTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr2R 23094877 5' - 412 424 2 67.12 TGTTCAAAGTAATTCCCTGTATTCTTTGAGTATCTGCAACTCACTCGACAGTATAGAAACAAAAAATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTG:1 + chrX 13060132 5' - Tabor 7322 2 78.77 GTAATTTAGTCGACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chr3L 1437963 5' + Transpac 4984 2 63.64 AACAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr3L 13285711 5' + roo 8690 2 66.43 AAAACTAATTTCGTAGTATACATATTATTCTGAAATGGCATATGAAAATGTATAAAAAATGCCGATGATTTTTTTTTTTATTTTTAATAA:1 - chrX 3361459 5' + hopper 154 1 81.11 GGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGCTTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTA:1 - chrX 8839373 5' + Tabor 66 2 63.77 ACCTCAACTATATCTGAACAATTAAATGTGCAAATGCACTGGGCAACTATATACTACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATG:1 - chr2R 16567372 5' - opus 7455 2 61.65 TTGCGAGCGAGAACAGTTGGGCGGCATCATGTTTCTAATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr2R 8442759 5' + blood 29 2 64.29 TTATGTTTTAACACCATAGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATA:1 + chr3R 27547591 5' + 17.6 8 2 74.81 AGTTAATAGACATATATACAAGAATATATAAAAATGAAATTTGAAGTTGTAAGTAGGGAAACTAAGTAATACAAATTTTTCCATGTCCCTTTTCGGAATCGTCTTTTTATTCCACTTATTAGTGTAAAATGGAATGTGTAGATTG:1 + chrX 21626900 5' + HB 107 1 55.86 ACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGC:2 - chrX 21668383 5' - opus 7473 2 41.10 CCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chrX 8681435 5' + jockey 75 1 64.38 ATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGGGAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCC:1 - chr3L 20224250 5' + Chimpo 47 1 53.10 GTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTT:1 + chrX 21087542 5' + mdg3 5259 1 73.55 ACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGGAAACACAAGTGC:1 + chr3L 9324438 5' + HMS-Beagle2 48 2 51.37 AAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTAT:1 - chr3R 19514301 5' + blood 92 2 80.14 ATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2L 512446 5' - roo 8988 2 77.40 GGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGACTGTC:1 + chr2R 5953919 5' + flea 50 2 57.14 TTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGATATTTGGGAGA:1 + chr3L 25232775 5' - accord2 7547 2 71.92 CAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 - chr2R 17350633 5' + F-element 42 1 66.44 TGTAAACTTAAACTTGAGTAGTATATTGGGCAGGTTGATCAGAGCGGAGCGAAAAGCGTTCTTTGTGGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAAT:1 - chr3R 19134496 5' + transib2 52 1 54.48 CGGTGGTGGTGCTTTCGATGTCTTGGCTGTGGGCTTGAACGGTGCCGAGAAATCGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 - chr2R 14009125 5' + 412 7083 2 59.26 TGATACAAAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr4 868615 5' + roo 8691 2 63.91 GAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGAT:1 - chr3R 26472925 5' + 1360 34 1 59.59 TGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3L 5027163 5' - roo 358 2 51.37 ACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGAGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chr3L 17268318 5' + hobo 78 1 71.13 ACAAGGACCTTTGATGAGCTATTAAATGACGGCAATATGAAGATGCCCGAAGATCATCCTTTCCTAAGAAGCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr2R 13847774 5' - 412 7497 2 50.00 CCGAAACGAACGGTAAATCCGAGCGCTGGCAATCCGAGGCGTCGATTGTGGGTCTGTGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACG:1 - chr2R 23444045 5' - P-element 2856 1 53.15 ATGATTTAATTTTGAAGTGATTGTACCGATTTACCGACGCGAGATATGGAAGTTGTAGTTGTAGTTGTAGTTCTTTAGCGGATGATACACAGAGAATTGAATATGTTTAATATCGCATCAATTAGTATCATCCTACCGACTGCGCC:2 - chr2R 4122894 5' - rover 368 1 78.77 CAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr3R 10737046 5' + F-element 72 1 68.70 GCATATTTCACCTGAAAAAAATTACGACGCATATTAAATGGAGTGCAAACTCTTTAAATTTTTTGATTGTATATATGAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chrX 2956168 5' - copia 248 1 55.17 CCTACCGTAGAAAAAGGAGTACAAAAGTTTGCTGGCTGGAGAGAGTGTGATAGGTTGGAGCGCCACAGAAATCGGCTGGCCAGCGCTCT:1 - chr2L 22343249 5' + X-element 4441 1 56.18 TAATCATTACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCGGTGTCCCAGCTCCCAAGCC:1 - chr3R 934293 5' - Rt1b 4742 1 62.33 GAATAATTCTAGTGTCTTTGATATTACTTTTGCAAGAAACAGTCATCATATTTAATTATTTAGTATATTTATTAAGTCATTTGACTTGGTAAATGTTGGTAGAGCCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGCAACGCCATACGATT:1 - chr2R 6085998 5' + 1360 20 1 56.85 GTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 - chr2L 20029466 5' + I-element 80 1 66.44 TACTCGCTCGAGTTAGCCCTCCACCCCCCACCCCCCTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 + chr2R 21411456 5' + hopper 141 2 67.27 CTGCATACATATGTATATGTATAAATAAAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTTAGCTGAACCCAACTTCAGTGTAATAGGTTCAAGGTTATACGGTATTTAGGTAGTTGATATAATAGACTTGGCTCTGCT:1 - chr3L 17307313 5' - Stalker3T 313 1 56.16 ATTCCCTTGACGGTAGAAATTTTAAAATATTATAGTACATATAGCAAAGAAGAGATTTACTTCTTTTAGGATGTTACAAAACTTTCAAAACTACGGAGCAAGAAAGAAAAAATATATCTTAAATTAAAAAAAAAAATAAAAACAAA:1 - chr3L 18233233 5' - hopper 150 12 65.75 GTTATTTAACTGCTTAAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTT:1 - chr2R 17350653 5' + F-element 22 1 80.14 TTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr3L 12227763 5' + opus 7047 4 55.48 TGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 - chr3R 22647922 5' - transib2 2760 1 61.64 TATAAGCAAACTGAGATCTAGGAGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAACCGAGTCG:1 - chr2R 5213820 5' + INE-1 93 1 50.36 TGTTTCTCTGTATGTATTTTATTTTTTTTTATCCGTTTCCCTACTGCTGCTCTCTATGTCAACGTTGCAAGTGCTGATGCGGTCCTTTTTATTTTGTGCCCCACTCAAATTTACAATGCATGAGCATACATGTGCACACATACAGT:1 - chr3R 25159370 5' - 1360 173 1 78.08 GATATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCCCGGGTTGGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTTCACC:1 + chr3L 17244979 5' - HB 1304 1 68.89 CATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTTATGCTGGACGCTGGAGGTGACTGTTGTTGGTGCTTGGATCCCGGATTTTAGTACACTTGCAAGGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATTAAGTCTAAAAATTGAGCTA:1 - chrX 14317416 5' - transib2 2793 1 45.89 TATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCCGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2L 12236834 5' + jockey 60 1 57.04 GTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 + chr2L 15085636 5' + opus 172 4 68.18 TACAAACTAGACTACGGTCTAAGTACTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTG:1 - chrX 12639623 5' - R2-element 3585 5 70.00 TCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr2L 18181204 5' - blood 7315 2 67.81 TTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACAC:1 - chr3R 18294891 5' - copia 172 2 74.48 GGAACTATAAAAGAACCCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCC:1 + chr2L 8284348 5' + Doc 373 1 73.20 GGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGCTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTT:1 + chr2R 21713275 5' + P-element 95 1 15.71 TACAGAAAGCGATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGA:1 + chrX 16998294 5' + diver 5948 2 57.53 CTGGACCAATGGTAGTGTGGATGATATGTTCCGTGTGCAGTGAGTGAGCTAAGTGGATTTTCCGTGCATCGATTGCAGTGGCAATCGCGTAATGAGTTTTTAATGTAAGTCGATAATTTATGTGACAAAGTGTCACAATGTATAT:1 + chr2R 7850588 5' - Stalker2 7302 6 77.24 CCTGGTCGTCCTCGCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chr3R 28014101 5' + roo 53 2 60.90 GCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGT:1 + chr2L 7633344 5' + Max-element 36 2 58.82 CTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 - chr2R 4816937 5' - blood 7309 2 85.29 TAACATGTCGCATTTTATACGCATTATTAACGCTCATCGCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCAAAAATTTTT:1 + chr3R 22647793 5' + transib3 27 1 66.43 TGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATATTA:1 + chr2L 17550612 5' - Transib-N1_DM 442 1 79.45 TAAGAAAAAATAAAAGCCAGTTGAATTGTCTGCCACCAATGTGGATGTGTATGTTGCAGTTTCAACAGCAAAAATATCCGATGGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAAT:1 + chr3R 4666220 5' + FB 35 1 61.11 ACAGCAGATGGATGAAGTTTTTACAACGTGCTTTTTAAGTGTTTTGAAATTATTTGAGAAGCATTTTAATAAGAAAATTTTAGTTGAATACTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chr2R 22522015 5' - pogo 2075 1 67.59 ACCGCTGCGTATGCTTAATACGATTTGGGCCCAGCCATCAGATAATCACTGGGTATTTCAGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGCC:1 + chr3L 6050141 5' - 412 458 2 50.83 GTGGGATGCATCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr2R 8436338 5' - 1360 3343 1 54.11 TTGTTGGAATTTTTTGAAAATGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGCACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 13827862 5' - pogo 2033 1 81.90 AATTTGGGATCGGCTGCTGTAATGATCACCTTGAAGAATGATATGTAGGAGGCTAGAGGTACACATACATAAGTTCAGTTCATAATAGCAACATAGTATATAAACATTAAGCACTTGTTCGCTTTCGGGTGGCATTCTCTCTGTTT:1 - chr3L 21881479 5' + invader2 4940 2 95.89 TTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGGTACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - chr3R 31112298 5' - mdg1 388 2 57.55 CAATAAATGTATTAATTATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGG:1 + chr3L 18074051 5' - 297 6940 2 62.33 CGTGTGCCTTTCAATAATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAT:1 - chr3L 8249527 5' - mdg1 412 2 77.40 ATAAAACCTGAACTGCAGCTGCAAATATGGTTAAAAGGGTGTGAGTTCAGGCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2L 20228038 5' + 1360 53 1 65.60 CTACAAAATTTCAGCTCAAATATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chrX 5841909 5' - roo 343 2 62.33 CGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGCTAGTTGTAGTGTGAAG:1 + chr3L 11364811 5' - Tirant 324 2 71.43 GTGGGAAACGGACGTAAATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:2 + chr2R 6767981 5' + pogo 48 1 53.42 AAATTATTTAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 8346350 5' - roo 8986 2 74.66 GAAATTGGGTACATACTTTTCGAAAAAGTTGAAAATATACATCAGCTTCATATATAATTAATATAACTGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGTCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATG:1 + chr3L 7787468 5' + flea 44 2 55.64 GAGTGACTATCTATACCTCCTGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr3L 13993604 5' - P-element 2814 1 20.34 AATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGT:1 + chr3L 19951177 5' + Ivk 33 1 56.80 TAGCCATTTTGGGTTTGGCTATTATAGCCATAGGTCTTCGCGGGTTGTGTGGAGTAATCATTGTGTAAACTGTGCTCATGTCTTTGCTCTTTGATGGACTCAATGGGTGCCTCCCATTTCAAACACATAAAGTAATTGCAATTAAA:1 - chrX 8475439 5' - hobo 2547 1 52.74 TAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTATCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACA:1 + chr3L 9635324 5' + Doc 55 1 67.52 CACGACAACAAACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTA:1 - chr3L 10033686 5' + blood 7109 2 52.74 TTTATTTAATTTTCCAATTGTTATTGTATCACAAATGTTATAGTGGTCTGAAATATTTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATC:1 + chr2L 11523045 5' - HMS-Beagle 187 2 60.96 TTCGCCCGAAACGCTTTTCGAATTCATGTCAGTTTCGGTTTCATGAGGTAACGAATTTCACAAATTCGCGGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr3R 12341055 5' + Tirant 15 2 72.09 ATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGCACATATACAAGTTAACGCAAGTTACACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATACGACAACCAACATGCTGTGGT:1 - chr2L 18311501 5' - opus 433 2 76.42 CGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCC:1 + chrX 15198045 5' + Max-element 48 2 58.20 AAGGCAAGCCATGTTTTTTTTTTTGTTTTT:1 + chrX 14187979 5' + hopper 141 1 76.67 AACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAA:1 - chrX 23280903 5' - R1A1-element 5301 1 39.04 TTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCA:1 - chr3R 11284968 5' + blood 7073 2 73.95 TACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr2L 11617763 5' + 412 7139 2 76.71 CCTCGCAGTTCCGTTCCCATGCGAAGATTTAAGTTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr3L 7389698 5' + roo 8716 2 57.55 CTGCTACTAAGGCACATGACTAGTACACACTTCGTAATTCACAGCCTTTCCATGTATCCTTCACTTGCCACAACGATCTTAAGTTTTAAAAAATATGTTTTACGACGCTTAGTCGGAGTTGACGAGCTGCCGATCTTCATTCTG:1 + chr2L 22748774 5' - Gypsy6A_LTR 185 1 63.19 AAAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGT:1 + chrX 21442977 5' - Transpac 5164 2 66.92 CCCATTAGAACATTGCCTATTTAATCCTTAATCAACTTCACATATGTATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGCCCCGTCAGTTGACTAA:1 - chr3L 18216570 5' - 297 6942 2 62.39 TTTAAGTTTCTCTGTTGCGATTGAACTTGATTTGAAAAACGATACGATTCTCTTACCCTTTCCTAGTAAGGGCACTATAGAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 6493396 5' - copia 255 1 59.29 ATTTTTAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3R 13423397 5' + 297 40 2 57.53 GGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCT:1 + chr2L 18311398 5' + opus 7142 4 66.19 TAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCT:1 - chr3L 2532546 5' - blood 7336 1 54.79 CATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr2R 21796017 5' - roo 347 2 61.81 GAAGCTACAACATAGAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGCAAAGATATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGCTT:1 - chr3R 26472939 5' + 1360 20 1 66.44 TGAGTTGCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGG:1 + chr2L 7633338 5' + Max-element 8248 2 70.59 TAGATTTATGTTAATTATATTTGAATATAAATTTAACAAGATTGATAAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 + chr2R 14821136 5' + roo 8715 2 64.00 ATGGGAGGGGCGGGGGGCGTGGCGCGCCAGCGATTACACGGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 17400780 5' + 412 42 2 60.38 TAATGTGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTG:1 + chr3L 25206785 5' + HMS-Beagle 6832 2 60.96 AATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr3L 15148571 5' - roo 9040 1 56.80 AGCCAGGTTTNGATGATCCTGGAGGCTAGCACGTAGTCCGAGTCACGGGGATCGCTGTCAAAGCAAAGATAATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:1 + chr2L 10074475 5' + pogo 47 1 53.42 TCGCGGTAATTTGAACCTTTTTCCGTTTGGGTGATTTCTGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATAT:1 - chr3R 6584857 5' + transib2 79 1 71.92 TTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTAC:2 + chr2R 21795214 5' - transib2 2792 1 63.70 AACATATGAATTAGATCTAATTAGTTCTATGTATAAAATAAACTTAAATTTGTATCTTAGCTATTATTATTTGACTTACGGTAGGAAAATTAAAATCTTCTAATGATACCACCTACTGTCCGTAGGTGGCATGCACGATTCATAA:1 - chr3R 7555748 5' - Rt1b 5075 1 55.17 GTAGGCAAGTAGTGATAAGAATATCATTGTCAAATTTTTTTTTTAGCTTGGACGAAAAGTATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 - chr2L 11475248 5' + jockey 16 1 68.28 CCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAACAGTGATCTATTTTGCTTTATTAT:1 - chr3R 31264535 5' + BS 45 1 50.34 AGTTTTGCTGGGGAACAGCTACAAATAGCTCAATTTCATACGCCAATAACTTAAATGCAATAACTTTAGTATGCAAATTTATTTAGGAAGCCAAATAAATTTTTTTATAAAGCGTGTAATATGTAATTTTGTGTAATATGTGTAAT:1 + chr3L 24241299 5' - 1360 2931 1 50.68 GTGGAAGGAGCATTGCTCCTTATCAACACACCCCAATTGCCTCCATGGGAGCGAGGGAGTTGGATAGATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTAC:1 - chr3R 8112817 5' - Burdock 221 2 55.81 CGTCTGCTGTACGAGGGCCCTGAAAACATTAGTAATCGAAGAAGCATTGATATTAAAAATCGATATGTTATCGCTGGGAGGTTTTATGATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chrX 17884637 5' - pogo 2077 1 65.71 ATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 26927451 5' + roo 8750 2 78.17 GAAGCAATAAAAATGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTA:1 + chr3R 12376405 5' - HMS-Beagle 191 2 56.85 ACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGCA:1 - chr3L 20061451 5' + roo 8709 2 52.05 TATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAAT:1 - chr3L 27415313 5' + transib2 63 1 60.27 CCCGGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 - chrX 683615 5' + jockey 85 1 65.75 TGTGAAAGTGTAGATGTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTNTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATNCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 512382 5' - roo 9052 2 67.59 GATTAGCACAACATGTCAGCGTTTTGATTTACCTGCATGCCCAGAGATTCGGCCCACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGT:1 + chr3R 28749051 5' - mdg1 7445 2 76.03 CTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGT:1 + chr3L 19951189 5' + Ivk 66 1 60.96 GGTCTAGCACTGGTTGACTTTAATAGGGTTTTCCATTATTTCATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3L 13057304 5' - 412 478 2 73.29 TAACGAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATCCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 - chr3R 17077930 5' - 1360 3365 1 65.89 GGTCGTCTAATTAACCCATTCGGGGTTAAGTCAACTTCAATTTAAACCCAGTAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGA:1 + chr2L 17237068 5' + X-element 76 1 65.07 ACAAGAGTGCATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTA:1 + chr3R 24084793 5' + roo 8732 2 65.07 AATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTT:1 - chr2L 10536570 5' - flea 4948 1 65.07 ATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 - chr2R 17350594 5' + F-element 74 1 59.71 ATTCGTAAAATCAAATGTTAAGTGTTTGATTTTTAATAATTAATCGTTTCAAGCAGCAAGAAATTTGATTTGTTGGAATTTTTTGAAAATGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr2L 13827931 5' - pogo 2072 1 64.38 TTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr2R 14821209 5' - roo 334 2 66.44 TGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTG:1 + chr3L 19951155 5' + Ivk 32 1 63.70 TCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAA:1 - chr2L 544915 5' + Doc 50 1 61.60 TCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 9750252 5' + opus 7040 4 56.45 ATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 23964888 5' - hobo 2909 1 58.51 ATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3L 19580012 5' + jockey 70 1 72.27 GTCGTTGTTGTTATTGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTAT:1 - chrX 7702855 5' + P-element 33 1 62.76 CTGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTNTTTTTT:1 + chr2L 14056674 5' - pogo 2035 1 64.38 TACATCATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 - chr3R 15727984 5' - 1731 308 2 74.66 GCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1 + chr2L 7633372 5' + Max-element 8278 2 60.87 GATTATTATGTCTAAACACTAAACACTCCTTTATAAATCTAATTTTTTTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGT:1 - chr2R 4029434 5' - 297 372 2 70.55 GAGCTGCTTAAGAATACAAGGGTGGTAATTGTTAAATGGTTTCATTTATTAGTAAAAATATAATTGTATTTGATTTGTATATTTAAGTATATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATA:1 + chr3L 22257719 5' + mdg3 5277 2 67.86 CAGTCGAAATTTATATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3R 26927355 5' - roo 9034 1 59.59 TGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCT:2 + chr2R 12185277 5' - accord 7363 2 68.28 ATCTCATCTCTCCCAAAAGAGAGGGAGAGAGTGCTCTTGGGTTCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTT:1 + chrX 19886952 5' + P-element 55 1 39.02 CACACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTG:1 - chr2L 22640240 5' - invader4 3054 2 51.88 ACTGTCAAGTCCACGTGAGCTTAACTTTGTTTTTTTTTTATTTTCACTTATTTCTTCTTTAAGTTTTCCTGGTTTCCTTTCTTCTTTTCGTCTTTATGGTTCTTTTTCTTTGTTAAATTTTCAGCGCCTAATTAACGCTGGCATTT:1 - chr3R 23083074 5' - TART-C 11071 1 71.23 GGCAGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGATCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCG:1 - chr3L 12873074 5' - hobo 2919 1 51.69 GATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr3L 6050222 5' + 412 7118 2 69.23 ATATTTGAATCTCATTCCGGAATAACTAACGAGGTTTTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 + chr3L 11904726 5' - copia 237 1 68.49 TTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 20904952 5' - roo 358 2 55.56 AATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3R 10714266 5' + 297 44 2 54.11 GCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGATTTTT:1 + chr3R 25580787 5' + 1360 80 1 75.00 AATGAGGGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTC:1 + chr3R 11756732 5' - Tirant 8453 2 54.61 ATTCCAAGCTGGGCAAAAACTTTTTCCGACACATGACAAGGGATTCAAAGTGCAGTAAATTTGTTCGGAATGGAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 2241171 5' - roo 395 1 76.03 TTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chrX 17792537 5' - roo 386 2 61.80 CGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCAC:1 - chr3R 10736145 5' + McClintock 33 2 57.46 GTACACGTTCTTAATGTTAATGTAAAATAACCAAATTTTAATAGAGCTGCGGTTCAAAACTTAAGTCCCTATAGAATTCAGTTATGTTTAGCCACGTAATCTGCATACTTTTCACCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 17048298 5' + jockey 18 1 69.44 GAGGAGATACAAATACTGACAATGATAGGGCAATTAATAGCAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGATGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTT:1 + chr4 294600 5' + 1360 80 1 71.92 ATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGCAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2R 12133809 5' + jockey 75 1 77.97 AAATTCAGGGGGTTTTTCGGATATGTCCATGGATTATTAAGTCAATGTTTTAGCATTTATAAAAAGTACAATAAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCA:1 - chr3R 18477909 5' - 1360 3375 1 74.66 CAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr3L 6015703 5' + roo 30 2 59.44 ATGCGCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chrX 860757 5' + hobo 34 1 58.90 GTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 24766004 5' - 1360 3343 1 82.01 GTCAAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCT:1 + chr2R 4887630 5' + jockey2 3016 1 71.92 ATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGC:1 + chrX 13091078 5' - P-element 2787 1 15.97 GCCAATTGCAGTTGAATATTTATTAATCTATTAGCAGCATTTCCTCAGTAGTCCTCAGGTCGCAGGCTCCTGCCTCACGGTCGCCATGTAATAA:1 - 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chr2L 13033422 5' - hobo 2932 1 66.00 TTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTG:1 - chr2R 14821209 5' - roo 9006 2 63.04 AGATTACCCACGAAGGGGTATGGCGTGGGTCCTGGGATCATCTCCATGATGCCAGCCATGTGGTCTATGTAGTTGAATATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr2R 8442613 5' - blood 7357 2 61.03 TAAAAATAAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAG:1 - chr2L 18311510 5' - opus 419 2 78.08 AAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chr3R 26472896 5' + 1360 57 1 60.00 AGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAA:1 - chr3R 10148841 5' + 17.6 44 1 54.79 CTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTACTACCTTGGAAATAC:1 + chr3R 29283198 5' - hopper 1342 1 66.20 AATCAATAAAATAAGCCAGAGTGCTAAAATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTAC:1 - chr3R 17421355 5' - pogo 2092 1 63.01 TGATCAAGAGTTTGGGATGAATGTGTTTGTTTTGTGGGCTGTGGGTTGTGTATGGCACATTGGGAGTTTTTGTTGTTGGTTTTATTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGGGTTTTGGG:1 - chrX 3489108 5' - I-element 67 1 55.17 GAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 15148583 5' - roo 351 2 60.14 TACAGATTCAGCCGCGCTTTGACAGAGTTTTTATTTGCGTTTTATTAATGCTAAACGATTTCCACGAAAATGCCACCGAAAATGATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr3L 5027344 5' + roo 8664 1 45.52 ATGGCCATTTGTTGGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTC:1 + chr2L 5207424 5' + opus 140 4 57.85 TTTTAATAAACTCTTATTAAACAAGCTATAATAAACTCTACATAAATATAATTATTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chrX 22564501 5' - 412 450 2 59.02 CAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATA:1 - chr3R 19514311 5' + blood 7088 2 72.34 AGGACTGCAGCAGTTGAGCACAGAGGGCAGTAGGCAGAGAATTGGAGGAGCAAATTGAGTGAGGGTTTACTTACGCTCTCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACA:1 + chr2L 6637360 5' + 1731 73 2 54.79 CACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGC:1 - chr3L 10033637 5' + blood 7151 2 44.60 ACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr3L 11535989 5' - roo 345 2 60.96 CGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATC:1 - chr2L 15420114 5' + Burdock 39 2 46.48 AAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3L 5027170 5' - roo 351 2 56.16 AGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTTTTTTTTTATATAATTTTATGCAGCTGTGCGCAGTCAACGAG:1 + chr2L 23295813 5' - micropia 5353 2 76.98 AATACGCACAACATACATTAGAAATGTTAAAATCTTTTTATGAGGTTGCCAAGCCCCATCTTCGTTTTATTTTGATTTTAACTTTTGATTCCATGGAATCATTTTGTTATATTTTTATTTTGGTAAATTGTTTTTATTTGTATAAT:5 - chrX 23439059 5' - P-element 2495 1 60.27 TTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chr3L 2317128 5' - 412 435 2 55.48 ATGTAGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGT:1 + chr2R 7314589 5' + blood 7022 2 72.46 AAGCGATAATAAATACGACCAGAAATGGGAAACTTAGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 - chr2L 14056827 5' + pogo 6 1 71.72 AATAATAGATTGAAATAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCAC:1 - chr3R 12376551 5' + HMS-Beagle 23 2 69.86 CTGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr2L 14056674 5' - pogo 2047 1 61.94 AAATGTTTTTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 - chr2R 19389448 5' + 297 6618 2 47.59 AAATGGAATCCCAAATGAATCAAGCTTTAAACCAACATTCAGCGGCGAAAAGACCGAGACGAGCGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATACATATTTCACCGTCGTGTCAGACGCCCGCGAGTGC:1 + chr3R 3004765 5' + Doc3-element 310 1 68.25 TATTTAATTTCATTCATTACTTGTAAATTAAGGTAAATAGAAGTACAATAAATTAATAACACACATTACACATAACCCATGTAGCGACCACAAGGTGGAGCTCGTGTGCCAGTTATTTAAGCTTAGTACCAGGTATCTGATAGTCG:1 + chr2R 8777903 5' + INE-1 550 1 49.32 ATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 - chr3R 10737036 5' + F-element 97 1 78.77 AGGCGCAAAAGCTCTTCCTACAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTGTGCAGCCACTTTT:1 + chr2R 10417128 5' - 1360 3344 1 53.33 AAAGTGGATTGGTTAAAATGTATTGGGAATACGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 5870756 5' - roo 9053 2 71.23 ATAAACTGCGATCTTTTCTGGTCACGAAAAGTGCCGACTGGCTGGACAACAACCAACAATAAACAAAAAAAAGGAAAAA:1 + chr3L 16173883 5' + Bica 337 2 82.28 GAAAATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGAC:1 + chr2R 4012509 5' + F-element 287 1 60.77 AACAAAATGCCACTCGAAATCACAAGGATAAAATCACAATTTTGTTGGAAATTTCGCATAATTTCGGATGAGTTCTCTTTGACTATATCGATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr2L 9795506 5' - blood 352 2 60.43 ACAGTAGGGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACT:1 - chr2L 18219430 5' + copia 4898 2 63.57 TGGCATTTCATTTGGCTGCATCAGCACAAAGCGAGTCGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGT:1 - chr3L 12991500 5' - mdg1 7448 2 77.93 CTCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAACGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGC:1 - chrY 311460 5' + 1360 4 2 52.05 CGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATA:1 - chr2R 12827071 5' + Burdock 61 2 61.64 AAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGCTTACTCCC:1 - chr2L 15019937 5' + BS 4883 1 75.17 ATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr2L 5728957 5' + roo 61 2 61.64 TTAATCGTTTCAAGCAGCAAGAAATTTGATTTGTTGGAATTTTTTGAAAATGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 13827892 5' - pogo 2033 1 66.44 TATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTA:1 - chr2R 5621027 5' + ZAM 42 2 52.42 AAAGTATGGTAAATAAATGAAACAGACAATGTATATGTATGGACATTTGTACAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAGCGCACTGTTACCCAAGCGGCA:1 + chr2R 22796744 5' - jockey 4963 1 56.64 TCTTTGTGCATCATCTGTATATTGATTGAGATGCTGCCTGAAAGTATGCAGCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGACAGCCTT:1 + chr2R 9007003 5' + jockey 4785 1 78.57 TAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3L 2167700 5' + opus 7058 4 60.96 TTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTG:1 - chr2R 19230584 5' + I-element 72 1 71.23 GCCGCAGTTGGTCCTATCGATATATCCCAACGAGTGCAGCTATAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chrX 13091116 5' + P-element 59 1 36.00 TATAATGTTAAATATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCA:1 + chr3R 4160055 5' - invader2 5077 2 58.40 CTTGTCAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTT:1 + chr2R 2666295 5' + Rt1a 11 1 68.29 CAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAA:1 - chr3R 29288755 5' + BS 5083 1 74.66 AATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr3R 17243235 5' - hopper 1375 1 56.16 AATAATTACTCAACCTCACCAGTTGTCAGATTCCGCTAGGCGTCAACGCCACGTCGCCGCTGTTCCGATGCTTGGTTGTTGGCAATGCCGGCTGACACAGGGGACATGTAACTCATAGTTAGATCTACAATAAATTAAGATAAGGG:1 + chr3L 25481707 5' - Cr1a 4140 1 69.18 CAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 20852501 5' + Tirant 8135 2 78.57 CGAGTCTTTTCTGACACTTTGAATAGATCCCACACACACACACACACGCACATACATACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCT:1 + chr2L 15516677 5' - Max-element 280 2 57.43 GGCAGAAACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3R 31112307 5' - mdg1 7443 2 69.47 AACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 24072017 5' + jockey 29 1 68.70 CAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTCGACATAT:1 + chr2R 2666300 5' + Rt1a 40 1 54.11 CGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTC:1 + chr2L 20761901 5' + Doc 458 1 75.81 CTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCTGCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 + chr3R 12078609 5' - hopper 1354 1 60.69 TATTTTTAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 - chr3R 13423398 5' + 297 6620 2 58.22 GTTATATGTGATTCACGTTTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1 - chr2R 954539 5' + Quasimodo 64 2 69.23 CCTTTCTATACATGCAAGCATTTATGTAAACAAAACTTGTCGCAGCTTACTTAAGCGCAACTTTTTAAGATACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAA:1 - chr2L 8536626 5' + Juan 4074 1 52.74 TATTTAGCATAAGTCAGCGACTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 + chr3L 18846911 5' - 1360 3370 1 71.23 ACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCCCTCCTACCC:1 + chr2L 8284386 5' + Doc 429 1 69.57 GCTGCAGCTGCAAATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGACACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 22320451 5' - roo 397 1 67.59 CTAATAACTTTCGACCCAACAGTTGCCAGTGGGCGATAAACTAATGAATGTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACAC:1 - chrX 14735814 5' - diver 175 2 51.92 TGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAAC:1 - chr2L 23295893 5' + micropia 5026 2 51.37 CAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 13057427 5' + 412 7119 2 72.44 TCACCTAAGCACTTATTTTGTTTCGATTAGAAGTAGGAGGATAATCGGGCTAGCAAGCCGACTGTCAAGTGGCCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2R 13852789 5' + 412 47 2 52.74 CGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCAATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 + chr2L 23310599 5' + 1360 37 1 58.90 ATGGAGGGCTATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGCTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGTTTTTGTTATCTA:1 + chr3R 24084814 5' + roo 8753 2 77.40 CTCGGCTCATTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGATATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGT:1 - chr3R 13868990 5' + HMS-Beagle 6824 2 62.79 ATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCA:1 - chr2R 14532057 5' - invader4 3015 2 65.75 AGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1 - chr2R 14532055 5' - invader4 280 2 60.00 TATTTAAATCTGAATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAG:1 - chr3R 31114373 5' - flea 4959 2 56.85 CAAAACATTCACATGCATTTCAATCAAGTTGTGTCGGTATGTATCGACATCATTAAAAAACTCGCAGAGGGTTTCATTTTTTTCATTCAAGGGAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr2R 9618246 5' - roo 9043 1 64.38 TATCGACTTCTGTTTTTAAGAGTTCTCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 - chr3R 13255004 5' + roo 16 2 66.06 ATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAGTTTTTGAAATTTGAAAGCT:1 + chr3R 17673777 5' + FB 30 1 67.47 GCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAA:1 - chr3R 18294895 5' - copia 5044 2 71.92 CAGTAGCCCTAACACATGTTTTAGGTGTGTTTCAAGAAAAATAAATTTGCACTTCTGCACGTGCGTTTGTTGTCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 - chr3R 26188635 5' + jockey 57 1 52.05 CCGGACGCCACACTGCGTATGATATTGCGCAAACCGTAAGTACGGCGGCTTTAATGGGAATAGGTTTTAGGGTTAAAAAATAAACCATTTAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr2R 6768135 5' - pogo 2090 1 75.00 CCAGGGAGATTTAATTTTGTTCCTCCCCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 14608658 5' + jockey 32 1 69.86 TGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTA:1 + chr3R 27547639 5' + 17.6 6993 2 67.59 TCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3L 19580004 5' + jockey 14 1 63.89 GTGATTCTTTCGTTCACTTTTGTTTGCTTATCTCACACAAAGCCCTTTATCTGGCCACCTTGTTTCGCTCTCTGAGCAAGAAATTTATGGTCTCTCAATGTAAAGGTTCTTTTTGTTTTTGGGCACTTGCTGCAAAAGTGCGCG:1 - chr2L 18115373 5' + Tc1 177 1 54.17 AGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3R 24084895 5' - roo 357 2 53.10 TTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAANGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGNTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGC:1 - chr3L 23456275 5' - 1360 3333 1 57.53 AGGAGACAAGTCCTGGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 + chr2L 1044970 5' + mdg3 67 2 62.33 GGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGG:1 + chr3R 12146652 5' + gypsy10 5680 2 52.63 GGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGC:1 - chr3L 10033631 5' + blood 7135 2 41.88 AGAAGGCAGAGATATAAGTACCGCTATTCCGGCAAATATCTAAAGTGAAAAACAAAGTTAGTTGATAACTTTGCTTAACTTTTGCACTTCACAGCCAATATAACTGATAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3R 10876139 5' - 1360 3378 1 76.71 TTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATNGCCAAT:1 + chrX 21087587 5' + mdg3 5301 2 55.48 TTGTGCAAATCAATTGATTGCTGCAGTTGTTAGCTTTTAATTATTGGGCTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTAC:1 - chr3L 11904902 5' + copia 4897 2 65.07 ATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chr2L 2493983 5' - Tirant 399 1 74.11 TTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAATA:1 + chr3R 12948629 5' + Stalker 78 4 74.07 AACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTTGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 + chr3L 7848462 5' + jockey 61 1 50.00 AATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 7024425 5' + 412 7094 2 56.16 TTTAATCTTTGTTATAATCTTAAGTTAATAGCTAATTTGGAGTAAACCGTAAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTA:1 + chr3R 8112661 5' + Burdock 6153 2 69.86 AAACGTAGCTTGCCAAGTAAGATAAAAGCAAAATGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTT:2 + chr3L 2317086 5' - 412 477 2 67.12 TATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCC:1 - chr3L 17748427 5' + Doc 460 1 68.80 GCCATTGTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTC:1 + chrX 22679611 5' + Doc 44 1 55.22 ATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 + chr2L 18311419 5' + opus 38 4 58.46 TGTGCTTGAGAGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 + chr3R 23964826 5' + hobo 76 1 71.23 CGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAGCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3L 5027194 5' - roo 8991 2 71.23 TTGAAATTGACTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCT:1 - chr3L 9318115 5' + P-element 2852 1 72.92 TATATGTTTGTATCCTTTTTGACGTCATCGAGGCAAACAAATGAAGTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGCGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 7848414 5' + jockey 12 1 76.71 ACAAAAGTATTAAATTTCAATAAACAAAATTATAAGAATCTATGAGCACTTGTATCCAAGAGTGAATGCACTTGAATCCAAGAGAAATGCAAAGACAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGC:2 - chr2L 3537662 5' + Max-element 26 2 68.49 ATTAGTTGGGCACATCTGTAAACTTAAACTTGAGTGGTATATTGGGCAGGTTGATCAGAGCGGAGCGAAAAGCGTTCTTTGTGGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATA:1 - chr3R 19134512 5' + transib2 37 1 60.27 TATGTTTACTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCTNCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTNTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGT:1 + chr3R 12078601 5' - hopper 1361 1 54.79 ATGGCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGGATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGTACTTTGTTGTTATGATTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 28618438 5' + 412 72 2 63.64 AGCGAGTCGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 - 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Tirant 8431 2 68.97 TAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 18832334 5' - roo 9026 1 51.37 AGTCAGTGCCAGATTGAGCTTCCCTGTATCCTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2L 12932196 5' + opus 7153 4 55.22 AGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTC:1 - chr2R 9750250 5' + opus 7037 4 56.30 AGCATACTTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTGACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chr2R 14427121 5' + jockey 4807 1 53.42 ACAGGACGAAAGTGCAGCAATGGCAAAAAAGTGCAACCGGATGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACC:1 - chr3R 7048531 5' + Burdock 2 2 58.22 TTTGCTATTTGCTCCGCTTTTCAGACGTGTGTGTGTGTATATGTCCCTGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTC:1 + chr3L 21764343 5' - 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roo 9026 1 55.48 CACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTAT:1 + chr3L 2532421 5' + blood 7028 2 63.33 AAAATTCCCCACTATCAATACAGAATTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chr3L 12890320 5' + hobo 72 1 69.85 TGACAGCCGATAAGGATACGCAATCACCAAGCACTTATTGTCAGAACCCACAATATCATGTACACCAACAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAAGCACGA:1 - chr4 953773 5' - 1360 483 1 58.54 ATCGTGATAATTTGAAAATGAACAATTTACCATAATTTGTCATTAGTATATGAGGCCTGCTAGTCCGCATGTCAGGTGGTAATCCATTAGTATAAACATGGTATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAG:1 - chr2R 13852945 5' - 412 473 2 68.49 GCTAGAACTTTTATTAATATTTTCAAATTATTACTTAGCTATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAG:1 - chrX 22460233 5' + HB 5 1 76.55 TAACGCAGTTAGAAGCGCATTTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCA:1 - chr2L 2291594 5' + I-element 21 1 71.23 ATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 5027153 5' - roo 9034 1 57.64 CAAACGTAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 18525586 5' + pogo 38 1 57.86 GATATCATCAGCCATCTTACCGCAAGGTTATAAATTTTGGTTAAGGTCTTAGACAATATTTATTTGTGTAAGTATAAATATTATAATAGCACTTAATGAGGCGAATTTGTATGTGTGTGCGTGGCGATGACCGACGCTTCTT:1 + chrX 22576276 5' - Burdock 154 2 59.15 GTCCTGCACTCGTCCTCTCCCTTTGAATCTCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr2L 15523145 5' + 412 43 2 56.94 GGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGTGACATGAG:1 - chr2R 9341641 5' - roo 8999 2 71.43 AAATATGTTTGTGGCCAGGGCCTAACAATCAATGGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTA:1 - chr3R 20332249 5' + jockey 4846 1 76.71 CAAGTTTATAGTTTATCACCCGGCAACGATTGACAACACTAAGCACTTCTTATTTCCTTTTTTTTTCCTTTTTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAA:1 - chr2L 22557692 5' - Doc 4628 1 58.33 AGCTGGTGGCCAGGTGCTTTCAGGGCATTCCACGTGATTCCGGGTGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGACTCTCTAACAT:1 + chr3R 12613722 5' + HMS-Beagle 10 2 77.21 CATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 24072035 5' + jockey 79 1 58.90 GTTGGCCCCGCTTTCAGTGAGCCAAATATGCAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 + chrX 18673680 5' + roo 8744 2 78.26 GATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTT:1 + chr2L 20628545 5' + Stalker2 7298 2 50.00 CCATCTGTTTGTATTTCCTCCCAATTTGCGACCCTTGTCGATGGGCGGTTTGTTGTCCGTTGTCTGTGCCATTTGTGTTATTATGTGTTTTGTCCATTAGCACTGTTTCTCGTAGTTTGCTAAAACTAACCAAAAAAAAAATAAAA:1 - chr3R 4833240 5' - Tc1 1401 1 68.49 TGCAGTTACGCTAATTTACTTTGTAACCTGATTTATAAATAACAAACAATAAAGAATAGAAAAATATATAAATATTAATTTAAAATAGAGATATCTTCTATTGTAGTGTATCGACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATA:1 - chr3R 7579518 5' + Stalker2 24 2 69.18 ATGACCTGGTTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr2R 943907 5' + F-element 72 1 58.22 ATTAAGAGACTGCATTTTAATTACTACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTA:1 + chr2L 388499 5' + roo 8705 2 58.22 AAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2R 9750264 5' + opus 40 4 54.68 CTGGACTGAGAACAGTGCTCAATTATTCCATCTCATTTGGAATATTGGCAAATTAAAAGAAGGTAATTGACCTTTTGGTATTTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAT:1 - chr3R 10733852 5' + mdg1 7080 2 56.85 GGTGGTACGGAGCTGAGAGGTGTGTGCCCCATACATCGAAGCTCAGACAACGAACCGAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCGGTGAGTCGGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr2R 5953761 5' + roo 23 2 68.49 GAGTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - 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Stalker2 366 2 56.30 ATATGTGGATATTGATACTGATACTGATATATGTGATATTCATCACCGCGATATTCGAACCAGAGGCTGGGTAGATCGCGACATTTAATGGAGATGTCTTTGTAAAAGAAAAATCAGTCATGAGATGAATTGTCAATTAAATAATT:1 - chr3L 27392382 5' + invader4 2627 1 64.38 TTACACAGTCTGTATGCGATAATCGTGACTTTAAAATGGTGATATTTCTATAATTGGTGTAATTTGTTTGAAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATA:1 - chr2R 10119113 5' + Juan 4046 1 67.81 ATTTGTGGTATAAATTTTTTACCCGTTGCTCGTAGAGTAAAAGGGTATATATATACTATAATAGATTCGTTGAAAAGGTTTTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAAGTATATATTCTTGATCAGGATCAATAGCCG:1 + chr2L 21582258 5' + INE-1 88 1 75.34 TATAAATCTAATTCATTGAAGCCAGTTGCCATACAAAGCAATATACTTTTCAAAATCGAATTCACTTAATATATGTATGTATGTACAGCTGTGTTCATAAAATTAGCAGTGCTTGGGCAATTTTTTTTATAATCTCATTAGGTATT:1 - chrX 22460188 5' - HB 1538 1 78.77 AGAGTATGTGGGTATTCAGGTGGCTTTACAAGCTATAATACATCAACATTAATACATACTAAAAATATTCTGCACTTTATTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTT:1 + chr2L 18219250 5' - copia 248 1 77.40 CTGGGCGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTG:1 - chr3R 10737086 5' + F-element 47 1 56.16 GCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:2 - chr3L 2317246 5' + 412 7100 2 52.05 TGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr2L 20132981 5' + 297 61 2 65.52 TAAAATATTTAATGCCTAAACGAAATCGAAACTGGCATATAACTCCTTGAATTTATTTATTAAACATACATGTTATACCGCATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACA:1 - chrX 4789253 5' + Quasimodo 26 2 65.75 GGGATAATTAACTGTGAATGGGGCAACACATTTGGGGGATGCTCCGAAAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 30087618 5' - roo 405 1 57.53 ATTCCCTGTATTCTTTGAGTATCTGCAACTCACTCGACAGTATAGAAACAAAAAATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATA:1 + chrX 13060143 5' - Tabor 472 2 71.23 AAAAAAAAAACAATATAGAGATAAGTAGCAAATTTTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:1 - chr3L 27350150 5' - 297 6955 2 72.60 AGTTCTCTGGCCCAGTGTGCGTGTGGCAATGCGTGCGGCCGAAGAAACGAAAACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATATCAGGAACTATA:1 - chr3R 3586617 5' + INE-1 144 1 76.03 AGTGCCGATAGAAAACTCAATTAGGCAACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGAT:1 - chr3L 9324585 5' - HMS-Beagle2 7177 2 69.63 CGGGCAAATCGTAACTGATTTCGGTTGCTGAAGTGTCCGCGGCAGGTGAGAGCCGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr2R 17394591 5' - jockey 4917 1 63.70 GGTTAAGTTGGATGGTTTGAATTTTAATTATTGAAGAATTCGCGTTTTAGGGAATTTCTCTTGGTTATTTAAGCTTTTTTTTTTTGTTTT:1 + chrX 13709273 5' + Tc1 1470 1 75.56 CCTATTAAGAATGACCTGGTTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGA:1 - chr2R 943917 5' + F-element 62 1 51.37 TCGGGGCGGGGAGCTTAACTTTGTTTTTAGAAGCTTCGTCAAGAATGTTCAGTTCAGATGTTGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGT:1 + chr3L 27380100 5' + gypsy 7044 2 54.47 GGGGGAGGTTGAAGGTGGAAGGTGGGAGATAGGAGCTATGTGTGCGATTTTGTATCACCTGGATACGTTTATAATTAGATTCGGCTGCAATTCCCCAAATCTGGATCCCGTATAACTACATCGGTACGATACAGTGCGCATACAC:1 - chrX 6707169 5' - Helena 1042 1 73.10 GGTTGCCCAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGG:1 + chr2L 15085607 5' + opus 157 4 54.11 GGTGCCCTTCGGGGAAGAGGAATAGGATACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGGACACAGCAACACTTAGCTG:1 - chr2L 3662070 5' + blood 7051 2 55.48 CAAGCTTTAAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 - chr2R 15199200 5' - Burdock 6315 2 77.40 TATAAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCNTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATANGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACA:1 + chr3R 15727842 5' + 1731 73 2 64.38 TGAGTGTCCTTGTGGTTTGGGCCAGAAATGTCGTAAATTTAAACGTTTTTTTAATTTTTAGTTCTACTAGGGATATGCGAGTCTATCTAGGAGTATCAGCATTCTTTTAAGGACATTGCATTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 10502497 5' - transib2 2645 1 62.69 AATTGAAATAAAATCAAAGAAATTTGTTAACATTTAATAGGATATTCTAACAAATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTT:1 + chrX 6216301 5' + Juan 3988 1 58.22 TCCTTCGTCTCAGGCGGTGCGAAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAA:1 + chr2R 9376613 5' + hopper 13 1 72.03 CCGGGCAGATGATCGAAGTGGAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - 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chr3L 12227902 5' - opus 7460 2 57.53 AGAGGAATAGGATACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 - chr2L 3662055 5' + blood 55 2 54.79 TGGCTGGCCGTTATGGCCGCTGCTGTCTGACAATAATAAAACAAGCTCCATGTTTTAAATGGAACGTAAACACACATGCCAGTGTATGGGTAATACCCACACACACAAACACTGACACACACACATATACACACAC:1 + chr2R 14443477 5' + accord 191 2 58.82 CTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGC:1 + chr3L 12227795 5' + opus 172 4 70.54 TTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCT:1 + chr3L 2167594 5' - opus 438 2 63.89 GTGCTACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACAAATTATATAAATTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTAAGACACTGTTTATGGAGAT:1 + chrX 21852439 5' - gypsy 7368 2 75.37 GTTGGGTTTTATAGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3L 7024434 5' + 412 7103 2 49.32 AAGTTCACGAGTTGCTTTTTAGCAAATGATTCTATTCTAGAAGGTGATTTAAGTAAAGATAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 - chr3R 25433907 5' + FB 64 1 63.70 TTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:2 + chr2L 20628595 5' + Stalker2 7336 2 76.03 TGTTGGCTTAAAAGCACGTGATGTTATCAATTACTTTCGTATTCATTCGTTCTGTCTCAATGAAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 - chr2R 17650658 5' + pogo 39 1 56.06 TGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 - chr3L 12890381 5' - hobo 2904 1 57.69 AATAAAAATGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCT:1 + chr3R 12376410 5' - HMS-Beagle 186 2 60.27 AGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:2 - chr2L 7929592 5' + roo 78 2 73.29 TCGTCTGCTGTACGAGGGCCCTGAAAACATTAGTAATCGAAGAAGCATTGATATTAAAAATCGATATGTTATCGCTGGGAAGTTTTATGATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chrX 17884638 5' - pogo 2076 1 64.08 TAAATTCCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chr3L 11535864 5' + roo 8676 2 71.54 ACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGATAGCAACGGCCGAATGAGTAAACGCGCAATA:1 - chr2L 6637440 5' - 1731 4530 1 81.51 CCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chr3L 21764437 5' + hobo 65 1 71.09 CATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr2R 22957926 5' + hobo 60 1 73.91 CGCATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGAC:1 - chrX 15286974 5' + X-element 4403 1 49.61 TTCCATATTCGTTTTGCTACAATCGGCCTCGGTAGTGGGGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr3R 26242590 5' - roo 9054 2 65.71 AATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGCGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 + chr3R 30087686 5' - roo 356 2 52.05 CACTCACACAGAGTTAAAGGAAATGAAAAATTCTTAGTAAAATTCCCATCATCCCTTATTGTGCTCTGCGTCATTTTCCCTAGAATCTCGTTGCTGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATA:1 + chrX 21497366 5' - INE-1 162 1 54.17 AAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chr3L 14422808 5' - roo 325 2 76.03 TCCTATTTTTATATTTTTATTTGAATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr2R 22957880 5' + hobo 32 1 60.15 GCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 30087692 5' - roo 350 2 56.85 CTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAA:1 - chr2R 14532042 5' - invader4 3038 2 67.59 AATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr2R 16274555 5' - roo 8997 2 67.12 TGGATTCTTGTTTTCAAGTTTCTACTAATGTTAGTTTTAAGCTAAAAAAGTTTTGATTCTTTAAAGCACTGACACTTAAAGTATTTAAAAATCCAAAATATTTAAATTCTAAATAAAGAAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTT:1 + chr2L 8776792 5' + G4 3686 1 65.75 AAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCACTTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr2L 10909561 5' - 412 7468 2 80.47 ATTATCCAATGGCCGACATTCAATTGCGCAGCGCGAAACGTCGATGTTGATAAACAAGTAAAATCTTTTTATTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTGAAATTAAAAATCAA:1 - chrX 19891117 5' + P-element 2640 1 25.93 GCCATGCGGACCCAGGCCGAAGGGCATGTAGGTGTAGGGCGTGTGTTCATGCCGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATATATAT:1 + chr2R 12188935 5' - accord 6938 2 71.22 GATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAAAGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - chr2R 23094963 5' + 412 59 2 61.59 CTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 9871057 5' + roo 8739 2 71.23 CATTAAAATACAGCGAAATTAATTATTATGTCGGTTCCTGGCTCTGGTCTAGAAGGTTGACGGCCAGGTGGTTGTGGTGGTTCTCCAGTCTGCTAGCATATCTCA:1 + chr3L 14607330 5' - G2 2839 1 61.90 CTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTAC:1 + chr3L 6557114 5' + Doc 54 1 53.42 TTAAGGAACGCGAATGAAAAANCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3L 18183100 5' + Tirant 8146 2 64.15 TATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCATAC:1 - chr4 373033 5' + pogo 85 1 77.40 AATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 - chr2L 3893093 5' + 1360 44 1 52.74 AAACCTTCTAATATATGTACAAATATTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2L 11617806 5' + 412 7103 2 52.05 AGTTTGGCATAAGGAACTGCTCTGCATTTATACACATGTATTTACACTGCTAACAAACATAAAGATGGTTTAACCAAAATACTTAATTCTATTACATATTTCTCTCGTTTGTCTGTCCCTCCGTATGAACGCCGAGATTTCAGGAA:1 - chrX 10328930 5' + INE-1 139 1 73.97 AAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGT:1 - chr3L 17748418 5' + Doc 464 1 75.00 TACACCAACAGCATTTCTTTCAAAGACGCCTTTATTAATTGTACCCGGTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCAATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCA:1 - chrX 21097344 5' + 297 1 2 80.14 TAACATTCTTTTAGGGCGGCCTCCGCACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCC:1 - chr3R 7462989 5' + I-element 403 1 57.24 GCTAACAAAAATTACACGCACGAGTTATTCACATTAGGAATAATCGCAGAGGTCAACTCAGCCGAGGTGCAATGGCCAAGCCTCACTCCGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGT:1 + chr3R 4947959 5' + P-element 3 2 77.78 TCGCTGTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3L 1463759 5' - P-element 2864 1 66.92 CCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2L 20852529 5' + Tirant 8 2 65.38 TATATGTAGGTTATATATATTTGCCACTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTTTGGTGTCAAGATCAAGAATGATGAAAGCTTTATTCTTAATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCAC:1 + chr3L 1149315 5' + springer 7158 2 72.46 GACCTGCGAGAGTCGAGCCGAGGCAGCAGCAGACACAACCATGTCGGCATTCAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATG:1 + chr2R 12826972 5' - Burdock 6329 2 62.76 AATCGATCTTAGAATGTAAGGTATATCAATAAACACAACAATAAAATATTTATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAA:1 - chr2R 7720164 5' - HMS-Beagle 6973 2 68.49 ACAATTAAACATAGAGCATAAAAATCACTAATTCATTTTGTGTTTGTATAAAATTCCATAATATAAATGTTATGATGCGTTTCAAAAGCTCAAGTGTATGTAAGGCTGTTTTTGACGGAACCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCT:1 + chr3R 30568911 5' + mdg3 5251 1 77.93 AACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATATTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATCTTTGATATGAATG:1 - chr2L 18219408 5' + copia 47 2 51.47 CCTGTGGCACTCTCAAGTGCATTTTAATGGATTTTTAGTTNTCGGTCGAGAAATTCGTACATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTNAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGTACTAAGACCAACGC:1 + chrX 9519461 5' - 17.6 435 2 56.16 ATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 - chr3R 6685813 5' + 412 82 2 73.29 TTTCTGTGGCCATGTTTTTTTTTCAATCATGCGTTCGCTTCCTCACTCATTCATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr2R 17345814 5' + jockey 74 1 64.34 TTAATTTAATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 + chr2R 15392499 5' - mdg1 383 2 57.64 CATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATAC:1 - chrX 21668367 5' - opus 466 2 45.52 ATACGGCAGGAAATAAAAAAGTGCTGTGGCGACTAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTTAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATG:1 + chr2L 20852424 5' - Tirant 362 2 57.97 AGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2R 23094985 5' + 412 7098 2 52.74 TGTTATTATTTTTAAAGCATTATTTATACTATATACTGGTCCATAAATATTGTATTTCTATGATAGATGTTATTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGGAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr4 880412 5' + pogo 46 1 54.79 TGATGATACCACCAGGATCAAGAAGATGACGGAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTT:1 + chr3R 19506681 5' + mdg3 5270 2 73.10 AACTATATCTGAACAATTAAATGTGCAAATGCACTGGGCAACTATATACTACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr2R 16567367 5' - opus 446 2 65.67 AATGGATTCTATTTTGGGAACAGTGACGTCTTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr2R 19230614 5' + I-element 41 1 56.55 ATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2R 10977213 5' - roo 352 2 54.79 AATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1 + chrX 15198047 5' + Max-element 8278 2 57.39 AATTCCAAACATAAATCGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:2 - chr3L 2317281 5' + 412 12 2 76.03 GCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTC:1 + chr2L 20761880 5' + Doc 393 1 67.50 TATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr2R 18887047 5' + roo 53 2 69.17 ATGAGTAATCGAAACTAATTGGATATGTTTTATTAAAATAAGTTTTTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTG:1 + chr2L 11475063 5' - jockey 4977 1 72.60 TTTCATTATTATTTTTGAGTTTTTGGTGTTTGGTGTGTGCGTTTGCCTTAATAAATTCGTTTCGTATTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 + chr3R 18128428 5' - roo 352 2 56.85 CTAAATAATTAATGCAAATACAAAGGAAATAATTATAACTGTTGTAACTTAAAACATAATTTTTCCAAAAAGAAGACATTACATTGAGAATTTTTCGCATGGTAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATCTTGTCAAAT:1 + chrX 8588678 5' - 1360 209 1 54.68 TTAAAAGGTTCCACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCACA:1 - chr2R 6493184 5' - transib2 2755 1 62.33 ACTTGTCGCAGCTTACTTAAGCGCAACTTTTTAAGATACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCA:1 - chr2L 8536592 5' + Juan 4108 1 76.03 CGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTTTGAA:1 - chr3R 19094237 5' + P-element 101 1 16.44 TATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAAC:1 + chr3L 11904783 5' - copia 5049 2 68.49 CAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3L 12991462 5' - mdg1 7440 2 65.22 GAAACGCCACGCCCTCCGGCCAGCAAACTGCCAATCAGCCGTCAAGCAGTCAGTCAGTCAATCAATTTTCCATGTATACTTAAACAAAGGTAGCTTTTTGTATACATATATATATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCC:1 - chr3R 17924586 5' - Burdock 252 2 78.77 CGTCAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 - chr3L 25206940 5' - HMS-Beagle 7016 2 66.19 CAGCCGATTCGCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 - chr3L 17012061 5' + 1360 36 1 59.29 TATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAACAACTCATACTTTTCCTCAAAA:1 + chr2R 19574428 5' + I-element 5148 1 57.78 TTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACC:2 - chrX 21668373 5' - opus 460 2 45.89 GTTGCGAGATTTGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr3R 25860432 5' + hobo 17 1 72.60 TTTTGTTCCTCCCCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 14608672 5' + jockey 30 1 67.69 TACGTCGCTACTCACATGCACATTTGGTCACACTGCTGTCGCTTGTTCGCAGTGTGCATTCTAATAAACAAATTCTTTGACAGCGGCACTTAGCCATTATTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCC:1 - chrX 3533329 5' + 17.6 7155 2 64.83 TGATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr2R 23095014 5' + 412 7069 2 72.60 TTCAATTATTTAAATTTTCGTTAGTTGAAACTAGTTTTGTGAACAAAGTCTTCAATAAGAATGCATTGTTAACTTTTATCATGGCAGTGGTATTCTAGTTGATTACGAGTATCAATCAATTTGAAAATAATTAATTTAATTTTGA:1 - chr2R 15443795 5' - NOF 3963 1 88.28 TTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGGGAAACAGGTACTAACGCCA:1 - chr3L 20224229 5' + Chimpo 37 1 53.51 GACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCG:1 + chr3L 23146455 5' + 1360 44 1 55.17 ATCAGGTCATTTTTGAAGACAATGAGGGTATTAAGGCTTTTTTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 - chr3L 7759400 5' - jockey 4931 1 71.43 TATAGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGC:1 + chr2L 20407754 5' + McClintock 47 2 57.53 ATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr2L 18181205 5' - blood 305 2 67.12 CCAAAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2L 310050 5' - P-element 2837 1 51.05 CATTTCAAATATATGTATGTATATATTCTTGATCTGAATCNATAGCCGAGTCGATATAGCCATGTCAGTCCGTCTGTCTTTCCGTCCGTTTCCGTAAACTATTGATGATAAANCAAAGAGTGCAATTACAGTTACACGCGAGAGG:1 - chr2R 10600058 5' + Tc1-2 111 1 60.69 AGTGGGGTTTCTTGCAACCGGAACCCGATTTTATAATGTTATACCCTTTACTCGTAGAGTAAATGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTATTACAGGTTTCTACAAAGTTTACATATTCTTGATCAGAATCAATAGCCGAGTT:1 + chrX 21130281 5' + INE-1 92 1 65.52 GAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr2R 10977180 5' - roo 320 2 73.79 CAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGAC:1 + chr2L 20761895 5' + Doc 454 1 71.43 TTTTTTTTGGCAATGGTAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCC:1 - chr3L 7024575 5' - 412 461 2 59.59 AGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGATCTCTTTCCGCTCGCTCACGCATTCTAAATTTGACAAAATATGCCCTTCACCGT:1 - chr3L 22016758 5' + 1360 213 1 75.00 AGCCCGATAATGTGATTGCAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 - chr3R 13838554 5' + opus 49 4 66.94 ATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACC:1 - chr3L 12227889 5' - opus 7449 2 54.86 CTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGC:1 + chr3L 6557109 5' + Doc 38 1 54.81 AAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 22320125 5' + jockey 36 1 61.38 TTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGGCATACATTCCT:1 + chrX 21087547 5' + mdg3 5284 2 59.57 GGGAACGAACTGGCTATGGGAAAGCAAAGGGGGCGTGGCATTTGTAAAATGGAAAATGAGGCAAAATAAAACGAGAGCTGCGTGTATGTGTCTCTAGAATCTGTATACTAAATCTTAACCTTCTAGCTTTTATAGATCCTGAGATC:1 - chrX 20892651 5' - INE-1 150 1 52.05 GTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAA:1 + chr3R 23964827 5' + hobo 77 1 71.92 CATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTAGAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATC:1 - chr4 373088 5' + pogo 30 1 63.70 TCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 24072026 5' + jockey 22 1 70.71 CACTCGTCCTCTCCCTTTGAATCTCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr2L 15523139 5' + 412 7103 2 52.41 TTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 + chr3L 2167573 5' - opus 7486 2 68.33 TAAAACAAATAATAGTGATNTCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCT:1 + chr2L 8284310 5' + Doc 383 1 75.86 CCTAATAATAGACGGAAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 23964944 5' - hobo 2921 1 71.74 CAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 25580769 5' + 1360 63 1 63.12 AAGAGTACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCANCTCATC:1 - chr3R 10736185 5' + McClintock 4 2 79.45 TCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACA:1 - chr3L 11364856 5' + Tirant 33 2 73.42 TATTAAGTAAGTACAGGGTGCAGCAGCATTCAGTTAGTTGATAGCGGAGCGCTAATGGTACCGTTCAAGAGGGGCTACTGCCTTAAATCAATTGTTATATAGGTCACTACATTCAGGCACCTGAGAACATTGAAGCAGTGAGAGCG:1 + chrX 21585275 5' + mariner2 358 1 53.42 CAACTCTAATAAATAAGAAAAAATAAAAGCCAGTTGAATTGTCTGCCACCAATGTGGATGTGTATGTTGCAGTTTCAACAGCAAAAATATCCGATGGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGCAAAATCG:1 + chr3R 4666207 5' + FB 9 1 77.10 GAAGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGCCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 + chr3R 23902159 5' + I-element 40 1 56.85 AATTTATTTTNCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3R 17987646 5' + jockey 81 1 67.81 AGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAG:1 + chr3R 5164947 5' - invader4 3002 2 75.35 ATTTGAAAACTTGATTGGATTTCTTTATTTTATTTTGGTCTTACTAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAAACGCCATACGTTTTTTTGGCGTTACGATTTTTTTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAAT:1 - chr2R 4598039 5' + 1360 77 1 51.09 ATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATT:1 + chr3R 11284916 5' - blood 371 2 61.43 ATGTGGAAACGGATCTTAGTAGTTTACTAGATGTTTGTTGACTTCAAAGTAATAAATATATCAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATA:1 - chr3R 29680309 5' - 412 445 2 54.29 TCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2R 16274611 5' + roo 8740 2 80.77 AAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCG:1 + chr2L 8284391 5' + Doc 417 1 71.43 AATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAA:1 - chr3L 25508749 5' + 1360 321 1 69.53 GATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGCAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTC:1 - chr2L 10536573 5' - flea 4952 1 60.69 GAGTGGGAAATTTAAATATTCTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAG:1 + chr3L 12227731 5' + opus 12 2 76.03 CGGATTAAATTAATGTGGGGAAACAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACANCCTACAATTTTGT:1 - chr3L 21764473 5' + hobo 36 1 58.52 GTAACCGCTGTCAACTCAAAAACTTATGAATTTAGGCGGATGGTCGTAGCTTCCCATTTGCATATACACACTCACACTTGCAGCCTGGCCAAAAGGCAAATGTGTGTGTGTGTGTGTTT:1 + chr2R 24323048 5' - accord 7029 2 56.30 TGGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 + chr2L 5207436 5' + opus 7067 4 62.33 CCATGGGTACGCTAGCACAGTAGGTCCAGGTTGCCATCAAGACACACCCAACACACCTAACAAACACACACACACACACACACATATAAAAACATATATTAA:1 + chrX 8440738 5' - BS4 664 1 76.47 GGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - 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chr2R 15199259 5' - Burdock 6374 2 73.79 TTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 22320123 5' + jockey 12 1 73.98 ACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAAC:2 + chr2R 7720053 5' + HMS-Beagle 44 2 55.48 AGGAAAATTACCAACAGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 24084910 5' - roo 9036 1 60.00 ATGTTCACACCTCGCCACTCAGTTGACTGCACTTCTGTAATGCGATACCCTTAAGGTAATAACTTACTTATATATATAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACC:1 + chr2R 10788019 5' + gypsy10 36 2 57.04 GCCGTTTTTTACGCCCTCACTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2L 2057789 5' + 412 7101 2 52.74 TTTTTTTTTTTAAATGAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCG:1 - 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roo 323 2 76.71 CCGAAAATTAATTTAATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGC:1 + chr2R 15392492 5' - mdg1 388 2 61.64 TTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 - chr3R 30087816 5' + roo 8683 2 70.16 GTCTGCGAAGTTTCCCTTATTCAATTTGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGCTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 9341498 5' + roo 7 2 57.78 TAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 - chr3R 13423385 5' + 297 52 2 56.16 TTAATGTTATTTCAGATGTTTACATTCGGCGAGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 - chrX 2300663 5' - P-element 2840 1 43.41 CATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAAATCCTGGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTCTGGCACACGATTTTT:1 + chrX 609394 5' + 1360 38 1 62.11 TCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCATTATGCCGAATGTCGATACGTAGCCGGCAGACAC:1 - 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chr2L 4864447 5' - mdg3 165 2 74.29 ATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTC:1 - chrX 13060272 5' + Tabor 79 2 71.92 ATAAAGTTGAGACCTTTGATGAATCGAACCTTCTCAATAAAAATAAAGAGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3L 15718205 5' - 1360 3366 1 69.86 TATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATCAATTATACTTAGGATT:1 + chr4 868654 5' + roo 79 2 71.92 CCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGGGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAC:1 - chr3L 25206916 5' - HMS-Beagle 193 2 57.75 ACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTT:1 + chr2L 6149105 5' - hopper2 1557 1 52.05 GGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTATTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTGACATATAAAAGATAAAACCTAACCTCTCACTANTCATGTGAGGACT:1 - chr3R 25796056 5' - BS 4997 1 72.41 TTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTG:1 - chr2R 2868554 5' - Rt1b 4700 1 58.27 GCGAACTTGTTTGCTCAATATGTTTCACACACAAGCGCACGCACACTCACACTACACTCACTCTCGTGCGCTGACAAAAAGCGGAGACAACGAGCCATGATGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACCTA:1 - chr3L 10740163 5' - P-element 2859 1 65.97 GGAACTGTACACGTTCTTAATGTTAATGTAAAATAACCAAATTTTAATAGAGCTGCGGTTCAAAACTTAAGTCCCTATAGAATTCAGTTATGTTTAGCCACGTAATCTGCATACTTTTCACCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 17048304 5' + jockey 14 1 72.60 TACTGATTTTGCCTTTTGCATTTTATTATGTGTTTATTATGCTAACTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr3R 22320545 5' + roo 8743 2 74.66 ACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 27391432 5' - 1360 3375 1 67.81 TGGGGGGGTTCGGATATAAAGATATTATGATATCAATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 18673784 5' - roo 9052 2 71.11 CTCGTTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGCGCTACTCGCCACGCACATCGCGTGT:1 - chr3L 21764424 5' + hobo 69 1 76.47 CCTCTTGGCCTTGTTAACATGTCGCATTTTATACGCATTATTAACGCTCATCGCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGT:1 + chr3R 22647779 5' + transib2 16 1 74.66 GAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr2L 10461230 5' + roo 8733 2 65.07 TAGGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 - chr3L 12890433 5' - hobo 2914 1 68.49 TGCTCGTTTGGTTTAGAGTTGCTTAAGCCTTTTACATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGC:1 - chr3L 17748465 5' + Doc 441 1 52.08 AAATCAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAA:1 - chrX 20949745 5' + jockey 4565 1 71.23 CCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGA:1 - chr3R 6419931 5' + Tabor 6912 2 65.07 GATTTTATGAGCAGGGCTGCTTCGATGGAAATACATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 5728822 5' - roo 9045 1 67.12 CTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 + chr3L 11535891 5' + roo 61 2 60.69 ATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:1 - chr3R 12764805 5' + copia 61 2 61.64 TAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAAACTAGTCATAAGCTTATACA:1 - chr3L 4547767 5' + mdg3 5320 2 62.24 ATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCA:1 - chr3R 23636420 5' + X-element 4302 1 67.91 ACTGATGCTATTCTAGTGTTTTGGCAGCACTATTTATACTTCCTATGGCGGGCTCAACAATGGTCTGAGCAAACTATGATCTGGAACAGGGTCGAGTAAATAAAAATTTGCAAAAAAAT:1 - chr3L 11564686 5' + HMS-Beagle2 395 1 67.23 CATATAAACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTC:1 - chr2L 4864504 5' - mdg3 5469 2 66.44 AGCCTGGGTTAACTGGACATGATAGTAAAGTTAATTTACTTAAACAAGAGGGAAAGCTTTAGTCGATTTCCTCGACTATCAGATACCCATTACTCAGCT:1 + chr3R 14576790 5' - INE-1 545 1 58.59 TTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chr2L 17019148 5' + 412 78 2 77.21 CGAAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTT:1 - chr2R 19633336 5' + jockey 4790 1 64.83 TATGGTTTGAAATGGTGACTAGGAATTTACTGGTGGCAGTAATGGAAATAGTTGGAAAATGGAATAGGTTTCTAGAATGTTAATGTGTAAATACTTGGTTTAAAACAGTAATTTTTATAGTTATAATAAGCAACAAATTTCAATTT:1 - chr2L 14202508 5' - S-element 1540 1 55.48 AGCAGCCAGCCTGCGACACATACCAGTAACATAATAGGGGGATTCCGCTTTAAATTGAAGAAAATTCCATTAGTTTTAAATTTTTAAAATTTAGAAACAACATTTTTTAACTTTTAATTTCTACTTAACTTAAATTTTTAATAAAT:1 + chr2L 2420564 5' - INE-1 428 1 69.86 GTGCGACAATTTGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3R 25580754 5' + 1360 53 1 54.11 ATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGG:1 - chr3R 19450183 5' - roo 8868 2 69.78 AGAATGTGAATATAATGTATGAAACTACTTATTTTACACACTCTTAAGTGAATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATT:1 + chr3R 13868857 5' - HMS-Beagle 7039 2 76.71 AACATTATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACCCACCAGCTCTCGGCTCT:1 - chr3L 2167715 5' + opus 7149 4 59.71 AAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr2L 310053 5' - P-element 2837 1 50.00 GTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAG:1 + chr3R 15003123 5' + Doc 64 1 65.00 TCTGAACCGAGCAATTTGATGCGATTTAATTGCAGCTTCATCCGGCTGAAGAAGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATAC:1 + chr2L 4864378 5' + mdg3 67 2 62.07 AAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTATAAATGTTCTTGATAAGGATCACCGGGCAAATGGATCTGGTCATGTCGGTATGTTTTTTTTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTTCCGCTCAACCGACC:1 - chr3R 4947765 5' - Cr1a 4424 1 50.00 TTTATTTAGTTAGTCTGCCTTGCCGCTTTGCGGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACA:1 - chrX 10725123 5' - pogo 2084 1 71.03 AGAAAGATTGTGTGGGAAATGATTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACTAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTA:1 - chrX 3534022 5' - 17.6 473 2 71.92 CTGGCCATGTCAAGTCAGCTGCCACTCGGCACTCACTTGGCTGGGCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGG:1 - chr3R 22647977 5' - transib2 2816 1 78.62 TTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2R 11153162 5' - roo 8984 2 78.77 TCTTTTATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTGTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr2R 10977219 5' - roo 358 2 50.68 AAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chrX 18149988 5' + hobo 52 1 64.41 TATGCAATTAATGTTAATAATTTATGAAAAAAACACATGCGACACACTCAGACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATAT:1 + chrX 12680652 5' + accord 7029 4 68.91 CCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTG:1 - chr3R 31264515 5' + BS 61 1 64.54 TATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTT:1 + chr3R 13868930 5' - HMS-Beagle 6966 2 72.60 AATAAATGAAATGCTTTTTAGAGTTCTCTACTACAATGCATTGAGATGAACTTTTGCATATGTTAAGGAAAATAATAAAATCGTCTTCTAGAACAACACGCACACTTATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCA:1 + chr2L 22708740 5' + 1360 3247 1 52.41 TCGCAAGTTTCCATTTCTTGGACTTTCATCATAATTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCCAGTGACACTGGGTCACTGCGTCTATGACTCTAGAATCTGTACGCCTAATATCAACCGTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCGAC:1 + chr2R 25240230 5' - INE-1 145 1 67.13 GCGGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr2R 9341643 5' - roo 8996 2 72.41 CGTTGTGTTCAGGGTCCGAAAATTAATTTAATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2R 15392477 5' - mdg1 403 2 71.92 AAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACNAAATCG:1 - chr2R 17350632 5' + F-element 43 1 65.75 AGTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATGATCATTACAATCCGTATGCTGGATCTTCCATCTTTTATATTTTTTATTGATCCATATCAAGGATATATCTACTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACA:1 - chr2R 18487360 5' - INE-1 31 1 52.05 GTTAATGCTAATTAGGACTTTCCGGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAG:1 - chr3L 20061486 5' + roo 10 2 76.03 TAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr3L 12991447 5' - mdg1 7394 2 61.64 ATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 + chr3L 7024459 5' + 412 7117 2 63.70 CACATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 - chr3R 27606720 5' - 412 450 2 54.79 CGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chr3R 19094214 5' - P-element 2814 1 21.95 TGGAACTAATTACGAAATTCCACATTACGTGATTTACTCGGTTGCCCAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2L 15085569 5' + opus 5 2 79.45 TCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chrX 21087591 5' + mdg3 50 2 59.44 ATACAATATATCAGAAACACATTCGCTGTGATATTGAGTGCATGCCATCGAAGCCATTCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCT:1 - 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chrX 21233401 5' + roo 8723 2 73.98 ATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 - chr3L 2167682 5' + opus 7164 4 67.77 CAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTA:1 + chr2L 10909515 5' + 412 85 2 73.97 AAAAGGCTTTCAGAACGGCTTAGAGTGGAGTTATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2R 24427482 5' + 1360 19 1 72.60 ACCCTGTACTGCAGACCTTTTCGATTTATTCATCCCCAATGTTTAAAGCTATATGTTAAATTAAATATGAGTTTATGCATGTAGTACATATGTACTTTATTAGTATCATAAGACTCAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATT:1 - chr2R 13939611 5' + G6 1976 1 75.34 GGTTTTTATCATGCGATACACACTTCTAGAACGCTGAAACTACTTTTATCAATAGTTATTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 - chr2R 14821254 5' - roo 393 1 62.33 TGATGCACACCGACAATGANATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr2L 3892985 5' - 1360 3321 1 65.75 TTTCTAAGCAAACATAATAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGTTT:1 + chr2R 11574968 5' - INE-1 141 1 65.07 CGCCACGCCCTCCGGCCAGCAAACTGCCAATCAGCCGTCAAGCAGTCAGTCAGTCAATCAATTTTCCATGTATACTTAAACAAAGGTAGCTTTTTGTATACATATATATATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATAT:1 - chr3R 17924582 5' - Burdock 6384 2 76.03 TTCTTATTGCGACGCCAACACGCATATATGTACATAAATACATATATTTATATACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTG:1 + chrX 13628692 5' + roo 8688 2 69.86 TGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2R 17269185 5' + roo 8745 2 76.03 GCTGGGTGAAAAATGTAGCGAGACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chr2R 21795992 5' - roo 9034 1 58.22 TATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3L 2167668 5' + opus 52 4 77.48 TATAAAAAAAAAACTGTTGAAAAAAAAGAAAAACAGTTTGAAAGAAAAACAAGATTTTTCGAAAGAGGAAAATATTCAACGGCAGAATATTGCCCATCATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGCGGAGACGTGTTTCTTT:1 - chr3R 15922543 5' + Doc 23 1 67.61 CTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGAGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAAC:1 + chr2R 7720070 5' + HMS-Beagle 6850 2 59.71 GTCTTGACCGCGTCACGTCTACAAGTTGCCACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2L 20718796 5' + jockey 4685 1 67.80 ATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr2R 21796027 5' - roo 338 2 68.53 ATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chr3R 17421320 5' - pogo 2057 1 54.11 TGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCAC:1 - chr3R 23644935 5' - diver 137 2 75.86 ACATAGCTTAAACTGGATATTTCCTTTGTTTATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCCCGGGTTGGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTT:1 + chr3L 17244964 5' - HB 1308 1 73.29 AAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAC:1 + chr2R 22523161 5' + jockey 74 1 62.68 TAACACCATAGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACA:1 + chr3R 27547599 5' + 17.6 6 2 74.40 GTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 + chr3L 2317120 5' - 412 443 2 50.00 TAAAAGGGTATATTCGATTCGTTCAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAGAGTGTATATATTCTTGATCAATAGCCAAGTTGAGATCTCAGAAAGTATAAAGGGTAGAAGGTTGAGATTCACCATAC:1 + chrX 14957087 5' + INE-1 172 1 86.11 AAAGTAAAGCCAATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3L 414970 5' + 412 7087 2 63.01 TTCTTTGTACATATGGTATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTT:1 - chr2L 19248241 5' - mdg1 7407 2 51.03 CACACTCACACTCACACTGAGCTTCAAGTAATCAGCAATAGTTGCCCCCTCTATAGGAACCGCCTTTAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACAATCCCACCCAAAT:1 + chr3L 1198868 5' + I-element 4892 1 54.79 GCTCGTTAGCCTTTGAACTGATGCTGATGGATAATGTATAAATTAAAAGGGACACTAGGTTAATCGTAGAGTAAAATCTGACCGTGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGTCGGTATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGA:1 + chr3R 31957317 5' + INE-1 153 1 53.24 CCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr3L 11535991 5' - roo 389 2 60.95 ATGTGGGTTAACACTTTGTACCTTCAGTTGATTCCAAAACTACTTTCTATTAACTATTGTTTCTATCAAACGATCTAATATATCAGATATTTGTTTTTTTAATAAGCTTTTTCTTAGATACACCCTAATACTAAATATGCGAATTC:1 - chr3L 8261308 5' + mdg1 7195 2 73.29 GAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr3R 20905053 5' + roo 60 2 65.44 ATTCCATTCCCATTCCCATTTCCAGTCCCATTCCCAGTGAATCTCTGTAAGTGACACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGT:1 - chr2L 18106287 5' - Tirant 336 2 60.96 TCCCACGGATTTCGAATTTTCAGGGTACTGTAATCGAGTGATATGCGTCATCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTC:1 + chr3R 31198557 5' - Transpac 266 2 60.98 AGTAATTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCT:1 + chr3L 18463347 5' - 1360 75 1 55.86 CGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTAT:1 + chr3L 19951185 5' + Ivk 46 1 54.62 CTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACATG:1 + chr2L 11475115 5' - jockey 4925 1 60.27 CACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATA:1 - chr2L 15019987 5' + BS 4834 1 58.90 CTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chr2L 2057808 5' + 412 65 2 62.50 AATATGTAACCTTAAACTTTTCTAGTCTGATTCTGACTTTTTTGATTAGCAGAAATATTAGTTGAAATATAACAGAGATTTTTGTTACCTGTCATAGACAAGCTAAGCTGCAGAATGATATGTGTATTAATTAATGCA:1 + chr3R 29085939 5' - diver2 419 1 84.06 TCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chr2L 11867318 5' - hobo 2915 1 60.49 GACAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATC:1 - chr2R 6526627 5' - jockey2 3345 1 70.34 ATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATA:1 - chr2R 23095012 5' + 412 18 2 71.23 ATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGGTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGCGACCGTTGTGTCCAACAGATCGTTG:1 - chr3R 26180528 5' - Transpac 270 2 52.99 TAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTA:1 - chr2L 11475162 5' + jockey 178 1 45.21 GTCACGTCTACAAGTTGCCACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGAC:1 + chr2L 20718807 5' + jockey 4713 1 51.11 CAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr2R 12827063 5' + Burdock 50 2 62.20 ACTTCCCTGATGGCGAATCAATTACTAAACATACTATTTAATGTTATTTCAGATGTTTACATTCGGCGAGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chrX 2300700 5' - P-element 2862 1 63.19 CGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATGATTA:1 - chr2R 4032636 5' - micropia 5123 2 68.89 TAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr2R 14884155 5' + roo 8737 2 80.62 AAAAGTCTGGTTAAGAGATTCTAAGCAGGACAAATGTAAATTTTTGATCTGTAACTCTAATCTCATATTACCAACGAATATCTGAGAATATCTTCTCTTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACT:1 - chr2R 24215750 5' - I-element 5334 1 54.11 AAACGCTTTTCCCAAAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr2L 310039 5' - P-element 2846 1 57.93 AATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chr3R 29680218 5' + 412 59 2 73.23 CACAGCTTTAAAGTAACAATTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGA:1 + chr3L 6557072 5' + Doc 12 1 76.03 TTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr3L 2532509 5' - blood 7315 2 77.69 TTGGTTTTCAGTTTAGGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCTCCGTGCATATCTTAT:1 - chr2L 512534 5' + roo 8706 2 52.55 GCTGGGGTAATGACAGGCAATCCGCGTAGTAGACGAATCCCACCGAGAGTGGGCTCTAAATAGGTGGCATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACG:1 - chr2R 14883287 5' - roo 8928 2 59.72 TCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 + chr3R 28438336 5' - mdg1 340 2 71.23 GCCCATTTGGGCACACAAAGGTGTTTATTGTTATGTGTTTATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATAGACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr3R 5704253 5' + 412 16 2 73.97 AATTTTACATATTTATGCACACTTGCGGCGACTTGTTTACGACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 - chr3R 11756819 5' + Tirant 60 2 66.40 GACATATGCTAGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 + chr3L 14422687 5' + roo 8701 2 44.52 TATTTAATTTAATTCTTTAGCATCCATTCATAGCATCCATGCTGACGCCTATCTGGCAACGCCGCCAGCAGCTGAAACAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTT:1 + chr3R 27707017 5' + P-element 39 1 57.53 TCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACATTTGCGCAGACCG:1 + chr3R 24072064 5' + jockey 86 1 71.77 AATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACAC:1 - chr3L 4547766 5' + mdg3 5321 2 64.34 TGATGGAGGGTTGGCTTCTGTTTAAGTCGGGGGGTTTTTAAATGGAGATACCACAGAAGTACCAAATAAGTGAGATCTAATTGAGTGCAATTGACTGCAGGCGTTGAGAATATGGTCAACGGTGAGCTCGT:1 - chr2L 16393167 5' - Ivk 5127 1 55.73 CAAATACACTAGGAATGCTCGAATTTTATTGAGAGGATAATATGGTTTTATAAGGAAGATAAATATTTTTTTAATTAATTTAAAAATTTAAATTGCAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3L 15393845 5' - pogo 2079 1 67.81 TTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGACATACAA:1 - chr3L 27350116 5' - 297 340 2 58.90 ATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTGTGCAACAATGTTTATG:1 - chr3R 6419935 5' + Tabor 6907 2 60.69 CGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACC:1 + chr2R 20972654 5' + jockey 4706 1 52.42 AAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCG:1 - chr3R 10736142 5' + McClintock 5998 2 54.86 AGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCGACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chr2L 310078 5' - P-element 2806 1 30.82 TTCAACTTTATAAAGCCCATGAAATATTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCT:1 - chr3L 13779444 5' + I-element 32 1 63.01 AAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCCTT:1 - chr3L 9324544 5' - HMS-Beagle2 263 2 60.00 TTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr2L 388596 5' - roo 329 2 73.57 ATTGAATTCCAATTACATTCAGCCACTTGTCGAGTGAAAAATACACGATAATAATAATATAATAACTAAATAATAATAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr3R 22477703 5' + Rt1a 5073 1 61.70 CTGCTTTCTCACTGTCTGTTTTCACTAACCATCACTTTGTCCGCACGTTCTCACTCCCGAACTCCTTCCTTCAACGGTCACTATCTTCTTCCTGGCTGACTGATCCCCGATCTGTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGGG:1 + chr2R 2315860 5' - gypsy8 334 1 73.79 GGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAGTTTGCACAACTAAC:1 + chrX 22679663 5' + Doc 108 1 69.18 CCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 6050227 5' + 412 7125 2 68.31 AAACAGTTCTTCAGTCATTCAGATTCACGGTTTTGCTTTCGCTGACTTAGTCAGACCGTGAGCGGGTGCGGCCGCTGACGAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGG:1 + chr3R 19446102 5' - F-element 417 1 75.40 CTTCCTGTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTATATTTTG:1 - chr2R 20052491 5' - transib2 2768 1 53.42 GACATCATTAAAAAACTCGCAGAGGGTTTCATTTTTTTCATTCAAGGGAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2R 9618201 5' - roo 9009 2 65.19 CTTTAGAATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3R 10714272 5' + 297 32 2 60.71 GTTCAGGTTCGTATCATTGATAAAGCAGCCTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAC:1 + chr2L 21683360 5' - pogo 2065 1 60.96 GCCAGTGGATGCTGTTTGGAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGC:1 + chr2R 14072505 5' - mdg3 192 2 55.56 AATACACAATAATAATGACTATGCGAGTATAGAATATAGTTGATGAAACATTTATAAATCGTCCTTTCGCCAAAATGCCCGATAAGAAAATGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 + chrX 8590658 5' - pogo 2074 1 67.12 AATAATAGGTAATATCTTTTTGTATAAAAGGTTAAGCTTAGTGAATACAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 17770375 5' + hobo 21 1 68.49 AGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 - chr3L 17500806 5' + Tirant 8145 2 61.90 TTTAGCCAGTCACATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 11232493 5' + roo 8711 2 52.74 TTTATAAGGAAGATAAATATTTTTTTAATTAATTTAAAAATTTAAATTGCAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 15393799 5' - pogo 2033 1 69.86 ACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGC:1 - chr2R 14532049 5' - invader4 261 2 68.42 CGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATATAT:1 - chr2R 18887060 5' + roo 8730 2 64.38 GAATCTCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr2L 15523121 5' + 412 66 2 62.94 GACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTCAG:1 - chr3L 1437952 5' + Transpac 79 2 71.92 ATACATACAAAAAATTTACCTTGAAGCTTCCTCGGTGTATAATAGCACCTCAATATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTC:1 - chr3R 5165067 5' + invader4 17 2 72.60 AGATTGAGAGTTGAAATTTGTTTATAAACTGTGGAAGGGTGATATGTTTATGGGTTGGATAACTTACATATATATTTAGAGTACATATATATATAGAGTACAATGTACTCAGAATACTTACATAAATCACTAACATAATTACATAC:1 + chr3L 24272059 5' + gypsy11 4048 2 58.22 CTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGGTTT:1 - chr3R 10737062 5' + F-element 51 1 53.17 TTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTTCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr2R 15392522 5' - mdg1 358 2 58.90 CACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 + chr2R 12492396 5' - hopper2 1562 1 51.37 ACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr2L 3662039 5' + blood 52 2 60.63 TATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2L 512410 5' - roo 9023 2 53.42 TGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGT:1 - chr3R 19950505 5' - BS 5004 1 76.71 GAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGAC:1 - chrX 21668363 5' - opus 450 2 52.74 TGAAATATTCCACTGCAATCAAAGCACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATCTAGG:1 + chr2L 8120146 5' + roo 8740 2 70.55 TGGGTATAGTTATTACTCAAATATGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAG:1 - chr3R 10737119 5' + F-element 14 1 78.77 AAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAAC:1 + chr3R 10030708 5' - BS 5025 1 63.45 ACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr3L 1463731 5' - P-element 2833 1 44.36 TCTTTTTATTAACAACTTGCCCTACATGATATTCTTTTTCCTTACGATCTTCATTATGTGTTTCTAACATTTTTTCTTGAGTGTTCCTTAGAATTTTTGAAATATTTTCACAGGATGGGTTACTTAAATAATTCGAAAGACTATGT:1 + chr3R 4148191 5' - Ivk 5200 1 74.66 ATTTTAACGTACTGACTTTTTATACACAAACTAACTAGTGTAAATGTGTAATTGTAAGACCGATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chr3R 4962922 5' + jockey 33 1 65.41 TGCCCCATTAGATGCGCTTCAATGGGTTAACCAACAATTAGTGTCCGCCCCAATAAAAACATCTTTTATTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTA:1 + chr3L 1186234 5' - I-element 5295 1 56.16 AAAGAAAAACAAGATTTTTCGAAAGAGGAAAATATTCAACGGCAGAATATTGCCCATCATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2L 21813768 5' + Doc 51 1 55.38 TTGATGCTCGGCTAGTGGTTACTAAAATAAGACTAGCCACTAGTGCTGGCTGGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAAATAAAAAAATAGTT:1 - chr2L 20133076 5' - Tc1 1396 1 61.27 AACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAG:1 - chr2L 22224600 5' - Rt1c 5395 1 50.34 GCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTT:1 + chr3R 7579380 5' - Stalker2 349 2 57.55 TTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATT:1 + chr3R 25796006 5' + BS 5058 1 59.03 ATTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCT:1 + chr3L 18463351 5' - 1360 73 1 58.04 CAAAGGGTTGCGCTCCATTTCGTTACGTTCGTTGCGTATGTGGCGCTGCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 17181391 5' + jockey 18 1 73.94 ACAGAAAAATTAGAGCATACTTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 + chr2R 14427108 5' + jockey 4794 1 62.33 ACTGGCAAACTTTAAAGACCCAAAAACAGAGAAGGGGAGCGAAAACACAAATTTAACGCAGTATGCGAGTGTAAAATATTTAAATTAAACTGCAAACGCAAATACACACACAACCACACACACACAC:1 + chr2L 937634 5' + gypsy3 416 1 48.03 TAGTAGACGCGGCGTAAGTTTCGGCCTTGTCAAGTTTACTATTCCTCTTTTCCCTTTTTTTTTGTCGACGTTTGCTATATCGTGCCGTTTTCCCGAATCTCTCTTTGTTCTTGTACA:1 + chr3L 23566522 5' - Bica 285 1 68.38 CCATGGAAAAAATAAATCAAAGAAAGGGAAAGGGAAAATCTCAACAACAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr3R 4527312 5' - mdg1 385 2 60.27 TGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3L 7848485 5' + jockey 84 1 66.44 GACAGTAGGGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr2L 18219431 5' + copia 33 2 62.07 CTTTCACAAAAAGTCAGAGGAGCAGAGCTAAATTCTCTTTTATTGCAACAAATTAAGAGAGCCACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGACACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 - chr3R 16475478 5' - mdg3 231 2 71.72 AGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 - chr3L 10897509 5' - roo 9032 1 70.21 CGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chr2R 5953901 5' + flea 45 2 54.79 TTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAA:1 + chr3R 27547620 5' + 17.6 48 1 54.79 ATAGCAGCCATGTGCAAGAGTCGACTCCTCCTGGCCAGCTCAAATCTGCTCCAATCCACTACACTCCACTCCACTCCACTCCACTCCACTCCACTTTGCTCAGCTCAGCTCCATTCGCTTTTCTTTTTTTTCCTTTATTATTTATT:1 + chr3L 13492498 5' - BS 5095 1 71.92 TTTGTACATATGGTATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr2L 19248238 5' - mdg1 7404 2 53.10 TCGCCCCCGATCCCAGCAANTTTACCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr3L 2532396 5' + blood 18 2 70.55 TATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATA:2 - chr2L 18219398 5' + copia 67 2 64.38 GGTGGAGCTGATTTGTTCAAAGACTAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATCTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGA:1 + chr3R 18294832 5' + copia 80 2 70.34 TTAAAATTTAAAATGTGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCT:1 - chr3R 20200490 5' + Transpac 4979 2 59.59 TTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGA:1 + chr2L 8284335 5' + Doc 409 1 58.90 ACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 12462141 5' - roo 332 2 69.18 GAATGGAACAAGAAATAATACATTATACAAAAATCTTGGAAAGCAGGAAGGTTTTTTAAATTGCATTGACAAAGGAGATACGCCACTTCAAACTTTACATATTTGTTCGAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chrX 22573929 5' + GATE 31 2 66.44 GGTTTATAAAAATAAATCCATTAATATCGGCGCCATTTCACGTGCAGAGCGTTGATATGCCATCTACATGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGACATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACAC:1 + chr2R 15474445 5' + Quasimodo 27 2 64.66 CGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGG:1 - chr2L 11867367 5' + BS 59 1 58.90 TTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 - chr2L 17019148 5' + 412 7134 2 77.70 ATAAATGAGCACAATAATACAATGCAAGCAAAAGCAGAAANAAGGCGGCGAAATTGTGCAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACANGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAACA:1 - chrX 4616183 5' + I-element 4879 1 59.59 TTTAGGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAT:1 - chr2L 512523 5' + roo 8726 2 60.96 GCACAGACAAAAGAAATGCCAAACCGTTCAAGATCTGAGCACACAAAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAG:1 + chr3L 2966460 5' + roo 75 2 69.18 GCCAGCTTGAAGCGTACGCATGGGAATTCCTTGGTCATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAAC:1 - chrX 2956328 5' + copia 4889 2 71.92 GGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 + chr3R 23902202 5' + I-element 80 1 73.43 GTTATTCTGCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTT:1 - chr2L 22224619 5' - Rt1c 5415 1 63.89 ACTCAGCAGGAAGACAAGTGCAAGCCAGAAAATTAACTTCAAGGAGGGTCTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 22708944 5' - roo 352 2 52.05 ACGAAGGACACGTTCTCAGTTGAAATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAG:1 - 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chr2L 14858468 5' - Ivk 5290 1 78.77 TCCGCTGGTCACACAGACAGAAAAGTTTTGATTTCAGTCGGGTATTAGGCACATTCCTCGTAATATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3R 31266052 5' + jockey 18 1 70.34 ACAAATAAATTCCGGCTGGAAATAACACGCGCTAAACTGTTCAATAAAATTAAATATTTAATTAAACAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 + chr2L 18510713 5' + copia 4923 2 56.85 GACGACAAATTGTTTTTGCGATAAAATAAGACAAGTGACACGCGGCCCTAATCGTTTGGGGGGGCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGG:1 - chr3R 24493975 5' - F-element 215 1 59.29 GACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 - chr3R 31112276 5' - mdg1 7397 2 61.64 ATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 - chr3R 13423381 5' + 297 6636 2 58.62 GAAAGTTGCGCCTAAAAGAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 - chr2R 24427637 5' - 1360 3342 1 54.11 TAGAAGATTTAAGAGTTAAAGTATTAAATAGTTTGTGATATCAGAATTACTTTTAAGTGGAAACGGCGTTTCATAAGCCGATATAAAAAACAACGTTAAGGCAATTCAAAACAAAAAAATTTGTACATGGTGCCAATTGATCAAAA:1 - chr4 1196947 5' - 1360 265 1 63.70 ATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 17259534 5' - roo 8991 2 73.29 GATTGTTGTTTTTATTGCCTTTTTTGGGGTATTTTATTCTCTGGTTGAGCCATTGACAACTCGTTGGCTGCTTAGGTGTTTACGTGTTAAAGTGTTATCCTGCTTACAGGATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTT:1 - chr3R 31198707 5' + Transpac 4926 2 76.71 GCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCTCGG:1 + chr3R 14608706 5' + jockey 36 1 52.94 ACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 20904973 5' - roo 335 2 70.55 CGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGGGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGGGGGCCAAAGCAGAGAACTGCACGGGTGGCACTTCTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chr3R 21925096 5' + hobo 28 1 52.68 TAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCC:1 - chr2L 15085713 5' - opus 428 2 72.86 ACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 + chr2L 14616204 5' + P-element 97 1 19.86 AATAATCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 + chr3L 5027146 5' - roo 9050 2 66.67 AATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGT:1 - chr2L 20628692 5' - Stalker2 365 2 58.90 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAG:1 - chrX 12649914 5' - blood 7010 1 65.52 TTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2L 12236814 5' + jockey 80 1 71.85 TTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAA:1 - chr2R 943892 5' + F-element 87 1 68.49 AAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACA:1 + chr3L 18183116 5' + Tirant 8168 2 80.36 GGTACCATACATTGCAGAACATGGAGCTTCCAAATGTGCTCGGAACTTGGCCAGCCTAGATAAGCTTTAAAATGGATCCTCCATATATTAATCTCGGTGATTACATTTTGTTCATTATTCACTTTTTATTTTGTGATTGCTATTTT:1 + chr3L 1692284 5' + transib4 41 1 70.55 GAGTCGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 - chr3L 12991468 5' - mdg1 377 2 55.48 CGCACACATGCACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGT:1 - chr2R 10582519 5' + Juan 3815 1 71.03 AAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGCGTTCACAGAAG:1 - chr2L 11475184 5' + jockey 30 1 50.00 AGTCAGGCAACCAATTTCACCCACTAAACTCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGCT:1 - 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chr2R 6801738 5' + 297 6615 2 62.76 CTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAACG:1 + chr3L 27350015 5' + 297 6643 2 66.19 TTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1 + chr3R 28438339 5' - mdg1 7376 2 73.10 ATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAAT:1 - chr3L 9324529 5' - HMS-Beagle2 238 2 75.56 CGGTTATTAGCTTGCTCAGTGGTTAGCACATTTTAAGATCTGGTTTGGTCATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr3R 13613060 5' + copia 4906 2 69.86 GAAATTGTCGATTTAACATTTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3L 13285544 5' - roo 393 1 73.19 CTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTGCGC:2 - chr3R 13868990 5' + HMS-Beagle 6884 2 79.45 GAAACGCTGGGTGAAAAATGTAGCGAGACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAGAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTGT:1 + chr2R 21795987 5' - roo 389 2 66.17 ATGTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGA:1 + chr2R 23094877 5' - 412 469 2 54.46 TTTTTAAAAGTATTATTATTAAATTGAAAACTAGGGAACCAATACATACATTTGTGCTCTGTAAAAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGA:1 + chr2L 7929457 5' - roo 395 1 68.49 ACGCATACGTTTATAAAAAGGGATTGCTTAAAGGGTTTATAAGAGGCCTATAAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCC:1 + chr3R 15727794 5' + 1731 4334 2 70.63 TCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 - chr3R 12764802 5' + copia 64 2 63.70 CAAAACGAACATCAAAGTCGTGCACAGACATAGACATTCCCATTTGCCTCCATTTAAAACTAAATTATTTCGTTTGCCCATCCTTTAAAATTCATTTTTAACGTTTGCCCACCCTTTAAAAATAAATTATTTCGTTTGCCCACCCT:1 - chr3R 22197048 5' + FB 859 2 67.81 TATGCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTAT:1 - chr3R 30569107 5' - mdg3 5463 2 48.63 AGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 10909496 5' + 412 7119 2 60.96 TTCTGAAGGTCCACAATAATGGAAATTAAATAAAAGAAAAGTGCACAGCCAGGGGGTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGACGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 - chr3L 2315950 5' - 412 7481 2 60.27 TTTCAACATATATCATATCATTTATACTGTGTATTTCAAAAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCC:1 - chr2R 25051921 5' + G5A 2662 1 74.48 AGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTG:1 - chr2R 12185407 5' + accord 6915 2 67.13 GTCTGGCCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGG:1 + chr3R 12046718 5' + Doc 9 1 68.91 CTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGT:1 + chr2R 10582387 5' - Juan 4148 1 62.33 AGTTTTTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAGT:1 + chr2L 11475103 5' - jockey 4937 1 52.05 CATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACACTTGCG:1 + chr2R 22523174 5' + jockey 79 1 69.40 ATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGC:1 - chr2L 19248224 5' - mdg1 351 2 63.01 TGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGGACTAACGCCAAGACCTTTCCTGG:1 - chr3R 10144478 5' + Chimpo 50 1 51.37 TCCTTCACAGTACAGAAAGGAAATCTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr4 868864 5' - roo 8990 2 74.66 TTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 20904949 5' - roo 360 2 53.79 AGGCAAGCTCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATAC:1 - chrX 16998383 5' - diver 146 2 69.18 AAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTT:1 - chr3L 6131911 5' + roo 8744 2 74.66 TTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAATGCCTTAGGATATA:1 - chr2R 954521 5' + Quasimodo 87 2 81.51 AATTTAATTCTTTAGCATCCATTCATAGCATCCATGCTGACGCCTATCTGGCAACGCCGCCAGCAGCTGAAACAGCTGACACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCG:1 + chr3R 27707022 5' + P-element 27 1 61.24 TTTCATATCCAAAGCGCACATTAAACTTTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTGGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGAC:1 + chrX 21097014 5' - INE-1 133 1 63.70 ATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 19965227 5' + jockey 35 1 52.43 AATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTGTATTTTTAGTGAGTAGATAAGA:1 + chr3R 26180444 5' + Transpac 88 2 75.34 CTATTACGGCCAAAACGAACGAACCGAATACGTGGCGACATTGCTAGCTAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 - chrX 15191441 5' - hobo 2923 1 60.44 TATTTCCATTTTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chr2L 12236871 5' + jockey 32 1 67.59 ATCAGCAAACGAAATCGAAGTTTGATGCACATAAAAGTGGTATTAAATTTCCAATAAAGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAAT:2 - chrX 5751971 5' - roo 9039 1 63.01 AGGAGAAGTCACAACAAAAACTTTTTGAGGTGGAAGGAGCATTGCTCCTTATCAACACACCCCAATTGCCTCCATGGGAGCGAGGGAGTTGGATAGATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAG:1 - chr3R 8112846 5' - Burdock 6369 2 69.18 TTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATT:1 + chr3L 11904762 5' - copia 201 2 54.11 AATGAATGGATACAAAACATAATTAGCTATTGCAATACATATTTACAGTATGTAACTAACCCAAAAACAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATAACACGAAATTTCGTAATTTTTCTGGGATATCTATAGAT:1 + chr2R 7925384 5' - INE-1 500 1 70.55 TGCCGGCCGTGGTTGAAGTTTCGATTCGATTCCATTACATTCCGCCTCCGAGGGTCGCCGATTAACCCAATTTAAGGTGTTTTTTTTATTCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10397400 5' - Doc2-element 232 4 75.73 AACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAG:1 - chr3L 20680358 5' - 412 417 2 67.81 CCAAAACATAGACGTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCCGCATCGATAG:1 - chr4 373108 5' + pogo 8 1 78.47 GAGTTCCACACGCTAAACTGGAAATCGATGAAGGCAGCATTAATGGGATGTCCCTTTGCATCGTACTCGAACATAATATTGGTGGTCCACAGATCTCCGTGATTGAGAATCACAAAATCGCCAGGATTATTA:1 - chr3R 25268080 5' + BS3 1373 1 43.94 TGCTCGTTTGGTTTAGAGTTGCTTAAGCCTTTTACATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTC:1 - chr3L 17748465 5' + Doc 437 1 53.57 AAACGTGTGCCTTTCAATAATTCAGTTTTATGGCACAAACNCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATNTGTGCTGTAGCTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3L 8249530 5' - mdg1 415 2 78.08 CACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3L 15148565 5' - roo 9031 1 55.00 GCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTA:1 + chr2L 20628531 5' + Stalker2 28 2 36.96 ATGCAGTCATTAAAATATCATTAATTTCATAAATATTGTGCTGCAAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAT:1 + chr3L 14888721 5' - flea 4996 2 72.41 CAACTTAATGNACTTCTCAAATGCAATTAGCGAAGAATAAAAAAATCCCATATAAAACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGT:1 + chr3L 23496577 5' + blood 106 2 44.12 GATCGGATTATTACTTCAAATTAAAATAGCACTGCCAAAAAAAAAATGGCAAATAAACATTTACAAATACATATGGCGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTCGGCAGCGCTGTTG:1 - chr2L 21941253 5' + flea 32 2 60.71 TATTACCCGAAATGCAAACAAATGAACAGAGTAAGTGCACACCATAATTGTAGATTACTTTTGTTATGACTTAGAAGTCGCGAAGAAACGATTTTGGAAATTCAAACCTTATATTTCAATAGATTATATCCACAGCTTGGTACAG:1 + chr3R 4199264 5' + Tc1-2 1297 1 53.79 AAACAATATAAGCAAAATCTAAACTGTTTATATGTTATTATAATGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 - chr2L 22164977 5' + 1360 51 1 69.11 AACGAATTTTGAATTTTAAATTTCAACTCAAAACTTGCATAAGTTGCAAATACATAAATGAACAAGTATATAAGAATGTTACACTCAAAAAGGGAAACTTTTGAAATGTTTAAAAGGCAGGGGTTTTTATTTTATTTTATTTTTTC:1 + chr3L 15206229 5' + transib1 1901 1 49.32 AGTAGGGAATTGTGACCCTGGGGTCGAAATTATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 + chrX 666242 5' + 412 31 2 63.01 CTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGTGATCTCGACGCTCATACGGACAGGTGGACATGGCTAGATCAAAGACACTAGAATAATTCTAGTGTCTTTGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTAATCAAGAATA:1 + chrX 392290 5' - INE-1 85 1 70.00 AAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTTACACCCTACTTGCGCC:1 - chr2L 13033386 5' - hobo 2866 1 72.31 CACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATG:1 - chrX 2214272 5' + jockey 4649 1 79.17 AAATAAGAATTTGCAGAGTGGCGAATCTTACGCAATGTACACAATTCACATCCGCTAGTTGTATATATATATTCAACAATATTCCCAGCGCGCTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATAT:1 + chr3L 25483022 5' + transib2 36 1 60.27 GATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 - 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INE-1 87 1 69.53 AAAAGTGATTTACATATAGTAGGTGAGCGAACCAAAACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCACATATATATA:1 - chr2L 21803009 5' + Quasimodo 18 2 72.60 TATAACGAACATCGATTTTATTCTATTAACAACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAG:1 - chr2R 17493237 5' + BS 4798 1 78.08 AAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGTGTGTTCCTAT:1 - chr2L 23295890 5' + micropia 149 4 53.33 CCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATNATTATGTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGNTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTGAGCTAAGGCTTTC:1 + chr2R 10582403 5' - Juan 4133 1 68.28 ATTATTATATTATATGTATACATATTATGTATGCCAAAAACACTGTGGCCACGCCACCAGCATTCTCTCTTGTTCAACTTGAATATTATCGACTTTTGTTGTGCCTTGTATATATGTACAGTTGCGGTAACAATAATAGCATCATA:1 + chrX 22641240 5' - Tc1 1637 1 23.97 AACAACGAACGGATTCCGGAATTGAGCTGTCGGGAATTTCAAGCGAAAACAATAAATTACAGCGAAGTGGGCGGGTGTATATTATTAATTCATTGCAGAACCCAATTACGCTGGTGGCGATAAAACAAAAATAAAAAAAATAAAAA:1 - 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chr2R 17394626 5' - jockey 4955 1 60.84 TTTGTCGCAGCTGGCCACGCTTGTAAATATTGTCTCGAAATACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr2L 9704751 5' - roo 385 2 64.06 TTCTTACATGTATGCTTCTATTTATTGAAAAATTTAATTTTTACGTATTTATTGGCTAGTAAAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTGTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3L 23646634 5' + 1360 48 1 56.15 GAAACGACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAA:1 - chr3R 7074883 5' - P-element 2842 1 43.10 TGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATT:1 - chr3R 29288776 5' + BS 5062 1 60.27 GCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr3R 25158604 5' - 1360 3313 1 69.50 TTTGGTTATTTCTCTGTGTGCAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAA:1 + chr2R 19574422 5' + I-element 5149 1 57.04 CTTGTGAGCATGCCCAGTTAGTTTGATCTAGTTAGCTTTTCATGTCATGGATGATGGCACTTTTAACTTAAGAAATGCAGCAAAAGAAACAAATAAGTTACATTTAATTAATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAAT:1 - 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chr2R 12185463 5' + accord 16 2 71.92 TTTCCTCTGCTTGGCTGGACTTTGCTGCCGCTATAAATTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTTGCCTTTTATTTATTATT:1 - chr3R 15668241 5' - G2 3058 1 69.70 TAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAAC:1 + chr2L 10536453 5' + flea 13 2 66.39 ATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCCCACATATCGAATAAGCACTTAATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTGATGTAAGACT:1 - chrX 13060276 5' + Tabor 6914 2 63.70 TTTCCTGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTATGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGCTATGTTAGAATACACATGGAG:1 + chr3R 26180422 5' + Transpac 4959 2 53.33 TGCTTAAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr2R 17350643 5' + F-element 31 1 73.79 AAATAAATTAAATTTTAATCACTATCACAAAGTTTGCAAGCCCACTAATTTGAAGCTAAATGACAAATCCAAACGGATTCCATAAAATTGAACAGCTTAACTTAACAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCA:1 - chrX 3330446 5' + X-element 4255 1 69.86 GCAAGCTCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAA:1 - chrX 16998381 5' - diver 144 2 70.55 AGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 - chr2L 12236828 5' + jockey 75 1 63.89 AAGACATGGATAATTCAATTCTTACTGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCAC:1 - chr3R 10144503 5' + Chimpo 14 1 74.07 TAATAGACGGAAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 - chr3R 23964939 5' - hobo 2924 1 72.31 CTATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr2L 8120237 5' - roo 9021 2 64.44 AGGCAGCAAGAGCGAAAAAACACACGCAGCAACTTTCACTAAAGTTGCCTGCGAAACTAGAGGAAGAAGTTAAAGTAGCGGATATTGGTAGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chr3R 31159158 5' - hobo 2933 1 76.42 CAAGCTTATTAATAAAAAATGCTCATAAGGAAACATTGCATGGAGCCTACCCAACCTAATAGAAAAATAACTCCAGATCGATATAGAACAATCCTACCCAAATTGGATCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACA:1 + chr3R 19446995 5' + I-element 4941 1 73.97 AAACGCCAGGCTGAAGTTGAAGCAGTCTTTCTGCGAATAAATTACGTTCGAAATCGCGTCATTTGCGAGAACATCTTCTCCATCATCCTTTCGACCATTCCTTCGAAGCGAGCAAACATTTGTTC:1 - chr2L 14436723 5' - G2 163 1 56.00 TGTTCCTCCCCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 + chr3R 14608675 5' + jockey 31 1 66.41 GACAGCGCTGGACGGAGACACTGAAAAAAAATGCACACATCTTTAGTATGTAGAAAAGCTTCAAAAACATGCGCCAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGC:1 + chr3L 18215750 5' - 297 352 2 50.00 GAAGCCACGAGTGATGTATNAAATAATTCTTATTCATATTTGCTACTCAATACTTTAACTTGAAATAAAAAGCAAGCAAGAGCAAAATAGACAAATTGTAAAGCATCTTCTCTTCATATATATGTACATATATACATATACATATG:1 - chrX 16110698 5' - Stalker 7096 4 71.23 GGTTGGGAAGGATTTTCCAAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr2R 22523141 5' + jockey 25 1 61.40 AAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 + chrX 18149966 5' + hobo 58 1 56.16 TGTATACAAAAAAATTCTGTTTTCAGTTTTCTTTTTTTGGTTGTTTTTTCTAGGTTTTTTTTTCGTTATGTTTTGTTGTTCATTGACAAGGTTTATGTGGAGGTCTCTATGGATGCTTTCGCTGCGTAGGTACCATGGTG:1 + chrX 20771236 5' - Doc2-element 4460 1 56.43 GAGCAATAAAACTCCTCCATCAGCAGCAATAGCAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAA:1 + chrX 20361905 5' + hopper 12 2 76.03 AAAAAGATTTACATTGATTTCATACTGCGGAACTAAAAAGGAGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTA:1 + chr3R 10733748 5' - mdg1 344 2 69.18 AATTTTAGTTACCGAAAGAATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:1 - chr3L 26709840 5' - opus 7467 2 82.93 ACGAGGAAGTCAAGGCTAAGTTGGAGGAGAAGAGGCGTGAGTATGCTGACTCTGCACTTCTGGTCTGAATAGCATTCTTGTGTGGTCAGATTGCTGAGCACTCAAGATATGCCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTG:1 + chr3L 21423070 5' - Tabor 6915 2 71.92 AAATTTAGTACACTAGTACATTATACATAAACTTATAAGAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTATAAATGAAAGCTTAGTGTTAACACATGCACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr2R 17269229 5' + roo 8679 2 68.55 TTTTAGACCACATTTTGCTTTGTTATTTTACTGCATTTTTGCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTG:1 + chr2L 9383680 5' + flea 4755 1 78.08 TTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chrX 13628844 5' - roo 360 2 53.42 GCAACGTAATCCATAATTTAGTAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCT:1 - chr3L 22257856 5' - mdg3 191 2 54.79 TTTATGAGTTTGCAGAGCATAACCAACAGCATCAGCCATTNACCTCGGAGCTCATCTAGACAGAAGATTTACTTGGCGTAAGCACATTGGAGCTAAGAAAANGCATTTGAAGCTGAAAGCCAGTAGGTTTCTCTGGCTTATCAACT:1 + chrX 10539638 5' + Doc4-element 2515 1 76.03 TTGCGGATTCAGTATTCCCTTAAAATATATTTTTCACGATTTTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3R 19514372 5' + blood 7031 2 71.72 ACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGGTTCGGCGGTGTATGTCCGACGCTTCTCATTTGGAGTATCGCGCTGCGTCGCAAGGAATGCTGAGTCGGCTTGCCGC:1 + chr4 158192 5' + gypsy 155 4 61.17 AGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAAT:1 - chr3R 25796058 5' - BS 5009 1 75.56 ACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAGGCAACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr3L 2532526 5' - blood 305 2 65.75 GAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - chr3L 2317264 5' + 412 23 2 67.14 AAAATAAAAGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTG:1 + chr2R 7727074 5' + BS 4670 1 72.60 AGTTATTTATTTTTTGCCCAAGATGAGAGATTAATCTAAATAAATTGAGTTGTCAAGTGGGGCAAAAAGAAAAGAAAAAGTTCGTGGGGGGTGGGGAGTGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 + chr2L 3661897 5' - blood 7379 2 78.08 AACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chrX 21668352 5' - opus 7443 2 62.07 AATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCAC:1 - chr3L 2317215 5' + 412 7131 2 71.23 TGGTATGTTCCGACGTCTTGTTGAAACTCTCACTCCTAGACCAAAGACATTAGAATAACAAGATGTGTAACGGACATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACA:1 - chr2R 3920252 5' + blood 7035 2 67.59 AAAAATTATAAAGATCTAGTCAATATATCTGGAGAATTTGCTCAGCACCATGTTTGAACAAAAAATCATTTCTCTATGATTTTTTTTATATAATACAAATATTCAATATTTTTATTCTGAATAAATAATTATTAATAATAATATCT:1 + chr2R 11534686 5' + gypsy9 5312 2 45.89 CGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTTT:1 - chr3L 12991464 5' - mdg1 7411 2 52.74 ATAATCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr3R 20905059 5' + roo 8728 2 63.70 AGCTGTTAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGTAAGTG:1 + chr3L 11684810 5' + Bari1 55 1 54.11 AGCAGTAAGCTAATTCACGAGCAACTAGCGCAAACGAAACGTGGCAAAAACGAGTGTGTTTTCGAATACTTTTATAGAATTTTTTTCATGTTTTGCTTATTTTTTGAATTTGCCCTTTTACTTAAGAGACTAACAATAAGTTTTCA:1 - chr2L 21400815 5' - Doc3-element 4674 1 43.15 GACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATTTTTATGTTT:1 + chr3R 27606606 5' + 412 7119 2 61.64 GCATATTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTA:1 + chr3L 19951211 5' + Ivk 45 1 67.96 CTTTTTCAAAAATTCAATTCGCAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATG:1 + chr3R 12146623 5' + gypsy10 5683 2 57.53 GCCAGTGTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTT:1 + chr3L 9324403 5' + HMS-Beagle2 6896 2 75.34 GCTGCAAACAATTCTAAAAAATTAAACTTAAAAATTATAAAACCTAACTGAAAAGTCACAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGC:1 + chr3L 1437821 5' - Transpac 5217 2 77.24 CAATATTCAAAATAAATCAGGATCTTGGATTCCTTGTCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTG:1 - chr2R 3760470 5' + accord 84 2 74.66 GGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTT:1 + chr3R 7579394 5' - Stalker2 7576 2 67.81 TTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAACGGAGCTATGCTTCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTCAATATAGCATGGCGACCGTGAC:1 + chr3R 19045995 5' + gypsy11 444 1 61.43 GATTCCGTTACCACCCATGACCCAGCCAACAAAACACCACCCCACTCAGCGCCCCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTGACCTTAATAAGATCCTGATCTTACAGGCGAAGACC:1 - chr3L 22497745 5' + jockey 4525 1 52.07 AAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 + chr2R 9376634 5' - hopper2 1546 1 58.22 AAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 9750264 5' + opus 138 4 61.29 TTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAANATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCANTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chrX 860768 5' + hobo 28 1 57.36 AATGACAGTCCGGCCTTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTGAAGTTG:1 + chr3L 414806 5' - 412 7523 2 69.44 CACTAACCCCTTTTTCCAACCCACCGTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAA:1 + chrX 3679531 5' - roo 8765 2 81.56 TTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2L 512430 5' - roo 341 2 66.21 AGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTCTTCAGTTCCCAG:1 - chr3R 6419914 5' + Tabor 88 2 75.00 CACGAGCTAAGTGGTATGTTCCGACGTCTTGTTGAAACTCTCACTCCTAGACCAAAGACATTAGAATAACAAGATGTGTAACGGACATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 - chr2R 3920263 5' + blood 7019 2 77.86 ATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 20904954 5' - roo 355 2 57.24 CTTGGTTAAAAAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACG:1 + chr3L 19951135 5' + Ivk 12 1 77.40 GTGATAAATATGTATAAGGAATAGATTAACGTTGTCCTCTTCAGTTTGGTAATATTCCCGAATAACGAGTCAGATTGTAAGATCAGGGAGCTAAAACTCACTCTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAAT:1 - chr2R 14820068 5' - roo 8790 2 72.60 ACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3L 11535913 5' + roo 8712 2 68.18 TTTCTGTGTCACTGAAAATCACACAACTCAGTCCAACTCAGCCAACTATAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3L 20680225 5' + 412 14 2 76.03 TTATAAATTAAGAACTGAAGAGTTAGTAGAATATTAACTTTTAAAGCTATTACTCGGAAAAAGCGCCTTTTCTACCCCATAAAGCGTCGATTTCGAAAAGGGACTTGGAAAAATACTTTTGTATTTCTTAGTTTCCATCGCACTG:1 + chr2L 21689013 5' - HB 27 1 57.93 AAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTGTTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAG:1 - chr2R 11844368 5' + I-element 22 1 69.18 TCCAAACATAGATCGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 2317278 5' + 412 15 2 72.60 GCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCT:1 - chrX 9951321 5' + jockey 92 1 72.60 AAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTG:1 + chr2R 12185294 5' - accord 499 2 56.16 TGTTTCGGTACTCAGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTACGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 12519601 5' + roo 60 2 62.14 AAAAAAAATATGTAGAAAAATTCTGGGGCCTGTTTGGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 28014198 5' - roo 347 2 59.59 CAGCGAGAGATTGAGATTAGGACTCTCTTTTAGGACCCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGGAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTTAAATTAAAGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAGTTTTTTTT:1 + chrX 15076779 5' + S-element 81 2 91.72 ATACAAGAAACGGCTCAACGGAAGATCATGATCATTGCATCTACTCCGGTGTCTCCAAAAGTGAGTGGGTGGGTTAGTGGTACTTGGGTGATTGGGTGAGTCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGNTGCGTAACGCCNTACGAT:1 - chr3R 20753026 5' + 1360 19 1 69.86 TTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 - chr2L 10909598 5' - 412 7487 2 58.90 TATATACATATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTTCCAACATACATAAATTTTGTATCCACACTTGTACAATTTTTGTTTAACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATT:1 - chrX 23431789 5' - roo 9038 1 60.27 AATGATTCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGGTTCACCTAAGACCCTATAATAACAAGATGCGTAACGCCATA:1 + chr3L 25406608 5' + 1360 15 1 67.12 GAAGCTACAACATAGAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 - chr3R 26472939 5' + 1360 20 1 69.18 GTTCTAGATAGCTTAATTCCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 + chr2R 16371957 5' + 412 40 2 59.13 AATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 + chr2L 17957151 5' + flea 4796 2 56.16 TTTTATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr3R 28438317 5' - mdg1 7397 2 58.22 TTCAATATTGTTCACAATCCATCCAACTATCTATCCAATTTAAAAGCGAAACAATTATATCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chrX 17884499 5' + pogo 51 1 61.87 CCGTAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 + chr3L 18183121 5' + Tirant 62 2 84.26 TTTATTTAGATTCTTTATTTTGACAATTTGACAATGCAGAAAATGTGAACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAG:1 - chrX 21443102 5' + Transpac 18 2 71.23 TTGAGCGTTTCGTGGCATTAGAACGCTTGCAAGCCGATCGCAATTCTTACCAAAAACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATAT:1 + chrX 576303 5' + accord 82 2 54.92 AGTCAAGACAGAAAATAAAGTGAGAAATTGTAATCTCCCTATTAAAAAATGTTTATCGGTCAATCATCTTTTTATTCCTTTTGTAGTTTCAACTATATAAATATGCAATCTACAATATACATGTAAGATGGTTTATTATTATTGTT:1 + chr2L 21941072 5' - flea 5010 2 76.71 TTTTGTTGGAAATTTCGCATAATTTCGGATGAGTTCTCTTTGACTATATCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2L 9795467 5' - blood 7341 2 59.35 TGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGC:1 + chr3L 23146458 5' + 1360 48 1 52.74 GGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2L 18311398 5' + opus 7025 2 68.15 CGAATTGTGTATACACTGTATGGTCGATTCGGCAACTCCTCCCCCCCCCCCTGGAATAAAGTGA:1 + chr2R 5400685 5' - gypsy5 6917 1 79.69 TTGGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr2R 8315470 5' - hobo 2921 1 69.42 CTCTGAGCTGCTGCAGCTGCAAATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr3R 22320442 5' - roo 9031 1 57.53 AGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 12519614 5' + roo 8743 2 73.97 CCGATTTGGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 - chr2L 15085777 5' - opus 486 2 73.97 ATGCGCACACATGCACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTG:1 - chr2R 10582522 5' + Juan 3807 1 75.71 TTTGCTTACTCTGAGGTTGGATTGGTGTGGACATCGCGGANTAAAGGTCAGTTAAATATAGAATATAGATATAGAATATAGATTAAGACTGCTCATTGAGGNAGGCCCCCTGGTGGGAGCATTGTGGTG:1 - chr3L 22702790 5' + R1A1-element 4987 1 45.74 GATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTG:1 - chr2R 17350578 5' + F-element 56 1 61.90 AATGCATCTGCTAGAACTTGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 + chrX 8038573 5' + 297 6612 2 65.07 ATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAAC:1 + chr2L 15019886 5' - BS 5020 1 67.12 ATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACA:1 - chr2L 15019963 5' + BS 4858 1 57.53 GTACTGTAATCGAGTGATATGCGTCATCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAA:1 + chr3R 31198581 5' - Transpac 5180 2 76.92 ATCTTATCCATCAAATAAAGACAAATAGGATATTCGATAAAATAATATTCATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATAT:1 - chrX 20145624 5' - Bari1 1662 1 50.68 AAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAA:1 - chr2R 19633332 5' + jockey 4794 1 62.07 TTACTTATATGCACTTGATAAATATTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAATTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 - chr3L 19274929 5' - transib2 2802 1 68.49 TAAGTCATAGCTGTGCTCACAGATGTCTGGCCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3R 12046694 5' + Doc 6 1 75.71 GTGAATGGAATGACAAGCTTAGGATTCATGTAAGACACCAAAATGGCAACCCCAGTGCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAG:1 + chr2R 13090831 5' + I-element 29 1 64.38 GCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTCAAGACTTACAACT:1 - chr2R 18887056 5' + roo 8684 2 57.29 GATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr2L 512495 5' + roo 8753 2 80.00 CTGCTCCTCCTAGACTTGGAGGTTCGTTCATTATTCTCCTCGTAGTCGCGATTTCTTGAGTTCCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 16274689 5' + roo 8678 2 76.03 GTTGGTAGTTCGAAACACTAATTGGGAATGGGAATCCTTGCAGATGCTTCCTCCGATTTTGTATACTAGCTCCTCTATTCCGTTGTTGAAAGCACGCTCAATTCTTGATTTTAATTATTAATGCCTGTAGGGAAAAGGTATTTGTA:1 + chrX 19595129 5' + Gypsy12A_LTR 2148 1 68.49 GTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTA:1 - chr3R 10736174 5' + McClintock 5967 2 73.29 AACTCAGCCAACTATAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 20680259 5' + 412 37 2 57.04 CGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chr2L 17019187 5' + 412 48 2 55.17 GCTGACCGTAACGGTATTGTCTCCATCCTGCGATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 25158719 5' + 1360 9 2 77.69 TAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chr3R 27606693 5' - 412 425 2 63.19 GAATAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGACAATATATCGTC:1 - chrX 12979544 5' + transib2 42 1 51.97 CCTGCCCGTGCTATTGTGGCCGGTGAAGTTTCGCCCCACGTGCATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 - chr3R 12764848 5' + copia 4887 2 73.29 CTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 - chr3R 23964912 5' - hobo 2910 1 57.26 CATATATTTAAAAGGGCAATAAATTAAAAAAAATAATATTTTAGTCGGTAGAGAACCGCACTGCTCCCAGGAGAAAAGAATGTTAATTCTTAAGCTATAAGGACATTCAAAAAACCTTTGAATGTTCTGTCAAAATGGTATCCAAT:1 - chrX 9724571 5' + HB 452 1 65.75 TGGTCAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr2L 17019196 5' + 412 7090 2 62.24 CAAAAAGCTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTAT:1 - chr3R 6419982 5' + Tabor 6852 2 67.12 ATTTAAATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAA:1 - chr2R 19108567 5' + jockey 106 1 56.16 TTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAA:1 - chr3R 19950535 5' - BS 5034 1 57.53 ATAAAAATAAAAAAAAAACTTAGCCCAGCTAAACAAAAATGTTCCGTCACAAAAAAATAAAAACAAAGTTCGCAAGCGAGCAGAAAAAACCCAAATATCGACGGGATGACGATATATATGTATGTATATATATAAGCC:1 - chr3L 9048787 5' + 1731 102 1 73.19 ATGAGAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGA:1 + chr3R 7579366 5' - Stalker2 7604 2 52.74 TACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATT:1 + chr3L 7024414 5' + 412 7083 2 63.70 CAGTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACACACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chr2L 13033292 5' + hobo 24 1 62.41 TGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3R 13254921 5' - roo 8987 2 75.00 AAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGA:2 + chr3R 15727845 5' + 1731 4388 2 67.12 GGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGAC:1 + chr2R 7720082 5' + HMS-Beagle 73 2 69.86 CTGGCCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3R 12046720 5' + Doc 33 1 56.74 CATGACCACTTTACTAAAGGTCCTTTCCTTTTTATAACTACGACAAAAACCTTTCGCAAAAACCTATAAGATTTCATCTTCAAAACAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTACATTATAAAAATAAATAAATATTTTCCGA:1 - chr4 651555 5' + mariner2 834 1 58.22 GTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCA:1 - chrX 2214320 5' + jockey 4586 1 59.69 AAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTTACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 - chr2L 13033386 5' - hobo 2861 1 74.81 CCACAATCGATGTCTTTGAAGTAAAAACTACAGAATGAAATAATACTATGATTTTTTTTTAAAACTATCTATAACCAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr3R 17531945 5' - 297 6937 2 51.37 ATATATTGATAATTAAAAAGAATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chr3R 12519732 5' - roo 9046 1 67.81 GAAGGGGGAAGACGATACGGAGTAGATTACCCCTGAAGTAGATTTGGCGGATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGT:1 - chr2R 558170 5' - copia 5085 2 65.75 TCGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGC:1 - chr3L 2167687 5' + opus 7058 4 66.92 GTGGTTTTCTATAGGCCTAAGTCAGATTAGTACAATAATCATATCGGGAATCGTTTTTACGTTCGTCAGGTCCAAAGTTCACCCAATACATTACTTGTTTATCAACATCGACGTTTCGCGCTGCTAATATTAATTTTTCCTTTAC:1 + chr3R 27705897 5' - P-element 2533 1 64.14 CAAATGAGCCGCCCGTTCTGAAATCAAATCACTTTATAGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGT:1 + chr2L 20407720 5' + McClintock 13 2 77.40 GAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGCCAGCAGGC:1 - chr3L 2167675 5' + opus 172 4 72.80 TAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGAAAGAGCATACATTAGGGACACCA:1 - chr2L 22684586 5' + transib3 85 1 66.44 CCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGGACCTTGGACTCGAGGGCACGGAGGTCGAATGGTAACGTTGCGGTCCTTTGACACGCACAAAGAGGACGCACCGTGAACTAAC:1 + chr3R 1202714 5' + gypsy8 4903 2 55.46 TTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCCCGGGTTGGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTTCACCTACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTG:1 + chr3L 17245013 5' - Tc1 1280 1 73.64 AAACACTCAGTCACGACGAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr2R 18931948 5' + blood 19 2 68.66 TACGGGACCGATTACGGGACCGAGTACGGGACTGAGTATGGGACCGAGTACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTC:1 + chr3R 16535295 5' + Gypsy6A_LTR 15 1 71.43 GTTAAGTGCATGTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr2R 23094868 5' - 412 449 2 56.15 CGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGACACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACACACA:1 - chr3R 23964873 5' - hobo 2858 1 79.23 AATATAAACATAATATAATATTTTCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 8314539 5' - roo 9016 2 60.00 AGAACAATACCAGAACACTCTTGAAAAAATCAACGCCACAGCAAAAACCAAACTAAAATCATATGACCCAATACTACCGTTTATCATGGAGGAAGTTAAGAAATCACAAACATAACCCACCAACACTGCCTAAATCCCAATCCA:1 - chr3L 27716861 5' + I-element 4979 1 75.69 TGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 13057445 5' + 412 66 2 63.45 TATCAATTACTTTCGTATTCATTCGTTCTGTCTCAATGAAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 - chr2R 17650634 5' + pogo 51 1 69.17 CATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr2L 10909503 5' + 412 7125 2 65.52 CGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCC:1 + chr3L 13057349 5' - 412 7534 2 65.31 TACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCTGTCT:1 - chr2L 12932162 5' + opus 7191 4 76.09 ATTACCTAGCTTTCTTTAGAATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATCGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr3R 10714285 5' + 297 25 2 67.12 GGGGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGTAGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGC:1 - chrX 609454 5' - 1360 3377 1 53.49 CGTTGGGGTTGTATGCGCCGGAAATACGCTTCACGTTTTACTGAATTTGAAAATTTGAAAATTATTCATGTGCATGTGGTCTTTGATGTGAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACT:1 + chr2L 20621153 5' - Stalker2 46 2 53.52 GTTATTAAAATAAATGTGAGTTGTGTGATTAACGACCGAATATGTGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGGAGCCTCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGCGTCGCTCAAATCTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTTTTATGCGTG:1 + chr3R 17660025 5' + micropia 55 4 47.95 CAAGCTCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAA:1 - chrX 16998380 5' - diver 6031 2 71.23 ATGTTTTAGGTGTGTTTCAAGAAAAATAAATTTGCACTTCTGCACGTGCGTTTGTTGTCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr3R 26188620 5' + jockey 66 1 60.71 GAAATTCGTCGTGGAATTTTAAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 7751030 5' + 412 7119 2 62.33 ACAACTCTCTCTCTTCGCTCTCCGGTTTTCTGGCATATCTGGCTCTCCAGATTCGACGAAATGTGTATATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCC:1 - chr2L 13419147 5' + ZAM 7986 2 62.50 GAAATAAAAAATAAAAATTACAGGAGCATGATTGACTATAAATTATCGCTGTGCATGCTTGGCATCTCAGACATTGCAGCACTTCTTGCCTGCGAACAGCTAGC:1 - chr4 1182251 5' - jockey2 299 1 65.38 GTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3L 8824512 5' - transib2 2739 1 79.17 CTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCACCCGGGCAGACGGCAAC:1 - chr3L 11364886 5' + Tirant 54 2 57.69 ATTTACTCCTCGGTTTTTATCATGCGATACACACTTCTAGAACGCTGAAACTACTTTTATCAATAGTTATTATGCTTGGAATGTACATATGTATATCCCTTTAGCTTTGGGAACACTTGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 - chr2R 14821265 5' - roo 404 1 69.86 CTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr3L 8249470 5' - mdg1 356 2 64.14 ATACTAACATCTCCTAGATTTCAAACATTACATGGCGACCGTGACAGTGTTCCCGTGTGCATGAAGTTAACGATTACATATGTATATGTCGGCTCGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTGGTC:1 - chr3R 1330079 5' + invader4 2885 2 68.15 GTCAATTATACGCACAAGTTTCGGTGACTGGCCACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chrX 609327 5' + 1360 22 1 67.81 CATTTTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTNTGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCNAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2L 12236865 5' + jockey 30 1 66.42 TGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3L 12890409 5' - hobo 2911 1 60.80 TGATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 5027254 5' + roo 8737 2 72.79 AAATAAAGTGAGAAATTGTAATCTCCCTATTAAAAAATGTTTATCGATCAATCATCTTTTTATTACTTTTGTAGTTTCAATTATATAAATATGCAATATACAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTT:1 + chr2L 21941084 5' - flea 239 2 72.60 TTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - chr3L 6050245 5' + 412 7097 2 52.27 CATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATACCATATTAACTTATGACAGCACTTTGTTGCTATGTTTATG:1 - chr2L 17019155 5' + 412 7116 2 67.19 TATTATGCTCCGCATATTCTAGCTGACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCGTCTTT:1 - chr3R 2533982 5' - gypsy8 250 2 63.85 AAATGTTTGTATCTTAATTGGTTATATTTTGATGAATATTTATACATATAAAGAATAGTAAATTTAAAAAATCAATCTTTGTATTATTTTCTCGAAGTGCATGTCCCTTTGTTAATTTGTTTTTCTTTTTCCTTTT:1 + chrX 13794025 5' - Doc2-element 239 1 59.56 CGCAGGGCAGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 - chr3L 12873079 5' - hobo 2894 1 56.30 CAACTATATATAGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 10897424 5' + roo 8710 2 54.11 TTCAATATATAATAAAATAAAACTGAACTTCAAGTGTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGA:1 - chrX 2214356 5' + jockey 4567 1 76.55 GCACGCGGTATTATAAACTGGGGCCCACCGGTCACCGAACTCCTGGAGGACGGAATGATCTCCGTGCAGCAGGCGAAGGCCACTGAGAGGTCTGGCCTGGTGTATATAATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - chr3R 13835393 5' - opus 496 2 67.86 AATAAAAGCGCTTTAAGAAATATTATGCCTACGTTTATAAACACAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 8630384 5' + HMS-Beagle2 480 1 85.45 TAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCA:1 - chrX 9023559 5' - blood 7021 2 69.17 CATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAA:1 - chr2R 19633318 5' + jockey 4808 1 52.41 AATAATAAATATTTTTGATGATGTGAATATATTACAATTAAAATTTAAAATGTGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATG:1 - chr3R 20200530 5' + Transpac 23 2 64.38 TTCCGAGTCTTATGCATATTTAACAACGAAATAATGCTATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACGAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGGGGGAGGTGAAA:1 + chrX 20145527 5' + Bari1 68 1 69.77 AAACAGGAAAACCTTCTTATGTCTGTGGCGAAATAATTGTTAACGAAAATAACTATATTAAATATTAGTGTTACTAACATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCTTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTACAG:1 - chr3R 1955290 5' - Cr1a 4231 1 72.22 CAACCGATATTTACACTATCACCTAAAATTAGCTTTTATATTGTTTATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATCCAGCTCAGCAGCCGTTCCCGTCTCCGGCGAAAGGACCTACCAACCCA:1 - chr2L 2206660 5' + F-element 4524 1 67.14 TTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTC:1 - chrX 13628840 5' - roo 356 2 52.05 ATCTGGATCTGGAGCTTGAATGTGGCATATACATATATATTTCTATATGTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr3R 28618365 5' - 412 7478 2 63.70 GGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr3L 20061463 5' + roo 6 2 73.95 ATGGGTTAAACAGCACTAGACGGCGACTCATTACTTGAGTGCTAAAATGGTTGCTGCTGGCACGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTG:1 - chr2R 20499789 5' - TART-B 152 2 53.00 AAAATTTCCAGATTTTATGAGCAGGGCTGCTTCGATGGAAATACATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr2L 5728812 5' - roo 9055 2 73.97 CTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATTTCTTGGGTGCTTA:1 - chr3R 31264508 5' + BS 65 1 68.84 CAACTCGTCAATAGTCCGTCAGGCCGTCGAGACGCGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGAAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGGGCAGTTTGCACAA:1 + chr2R 10315297 5' + Doc 103 1 72.36 CATTTTTTGCTGTTGTTCTCGGGTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTA:1 - 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chr3L 17739913 5' + jockey 35 1 62.96 TTACATCATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGT:2 - chr3R 15727985 5' - 1731 309 2 75.34 GCAACACTTTATGTTTAGTAATTGAATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAA:1 + chr3R 12948572 5' + Stalker 6864 4 71.32 TGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGCTAAAACAAAAACCAAATTGTGATACATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 19965231 5' + jockey 83 1 60.27 GATTTCTATTCCAAATTACCCAAGAAATAGGAGTATCATAACTATTATCATAAGTGACAAGTAATAACCTTAGCACTCTCGTAATAAATTTATTTACATTAAATTTAATTTGCACACCAACTAGCTGAGTAATGGGTATGTGATAG:1 + chr2R 16287421 5' + INE-1 547 1 80.14 TCGGGAGTTGAGCTACAGACGAGTAATTATGTTCCACCAGCCAGCTTAAGCGCACTGCACCGCTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTCCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGNATTAAT:1 - chr3R 27452078 5' - hopper 1355 1 55.48 GAAAAGTGTGGGAAAACAAAAGAAAAGCACTTCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 + chr2R 18931770 5' - blood 7375 2 72.60 CAGACGATCGTTGGCAGAGCTCATTGTGCCCCTGTTCCGTNCAATGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr3R 22825230 5' - accord 7035 2 73.13 AATTGTGCAAATCAATTGATTGCTGCAGTTGTTAGCTTTTAATTATTGGGCTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACAC:1 - chr3L 11904904 5' + copia 4894 2 66.90 TTATGCATAATTAAAAAGATATTTATTAAAAAAGGGATGACAATAATGCAATTCATATTGATTGGGTAAGCCATAACTTTACAACTTTAAAGACTAAATCTACGCACACGACAATTTCAACTTTATCAGTTCTCTCTAGCAGCTT:1 - chr3L 14888139 5' - flea 460 1 51.72 GCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTAC:1 + chr2L 20628529 5' + Stalker2 34 2 39.04 GAATTGCCATTTTTAAACCACTACTTTATTTTTCCTTCAAAGTAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACCTATATTTATTCAATTT:1 - chrX 666356 5' - 412 433 2 66.41 CTGCGCGGCCTTCAAAATGAGGCTGTGTGTGGGTGTATCTATGTGTGTTAACATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAGGATCCGGATCTTACAGGCGAAG:1 + chr2L 10143638 5' + jockey 4522 1 61.43 TAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chr4 868650 5' + roo 75 2 71.92 TAAATAAAAATAGATAATAGATAGATAGATAAATATCCAAATTTACAAGACTAATAAAAATGTGAAAAATATATTAACATGGGTCAACAACAATGCGCTGCGTCTCAACCTCCTAGCTTTATAGTTCCTCTGATCTCGACGTTCAT:2 - chr2L 15536019 5' - INE-1 139 1 63.70 AATTTCCTTTCTACAATACAATAAATGTATTAATTATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGT:1 + chr3L 18074033 5' - 297 377 2 74.66 ATAGTNAAATAGTTGGCTTAAAGAAGTTTCACTGTAGTTATCAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGTCCATGTTT:1 + chr2R 12706170 5' + FB 61 1 66.14 TTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTAGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTGAGCGGCCAATGCTTGGACTCGAAGC:1 + chr2L 7633355 5' + Max-element 45 2 50.75 TGTGGGCCATTTGCAAAGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTG:1 - chr3L 18183229 5' - Tirant 387 2 76.43 CAGGTACTTTCAGGGCATTCCACGTGATTCCGGGTGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 + chr3R 12613732 5' + HMS-Beagle 20 2 68.38 ATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAACTCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 - chr2R 17350590 5' + F-element 74 1 60.00 GCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3R 13259808 5' + hobo 34 1 57.14 TGAAGCTTAGNTTTTACCACCTTGCGCTACATTTTATTTTGAGAATCCCAGGCTGCTAATAGACTCTTGGGTCATGCAGCCGCCAAAACTGCGCAGTAGACTAATCTGATACTCTTTAATATT:1 - chr2L 22216590 5' + diver2 4570 2 90.24 CTATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTTAAT:1 - chr2L 8120237 5' - roo 9011 2 65.52 TATTTGCTATTATGTTTTTTTAATAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chr2R 8286839 5' + Burdock 6146 2 73.97 CAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr2R 9750268 5' + opus 7046 4 54.79 TCGGCTATCCCTTTATCGCTTTTGTCGTTTTAATGGGTCAGCAGTGTGTGCCTATACAGTTTGACAAAGACCACGAGCGAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGTAAGCTGGAATCGTTTGC:1 - chr2R 16519852 5' + FB 42 1 59.59 TTTAGTTAAGAAAAATAAAAGTACCAAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGA:1 + chr2R 7727063 5' + BS 4659 1 80.14 CTACGCTTTCCTCTGCTTGGCTGGACTTTGCTGCCGCTATAAATTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGG:1 - chr3R 15668247 5' - G2 3017 1 54.79 CGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 - chr3L 15718155 5' - 1360 3316 1 69.18 ATTAGATTTCTGATCATTAAACACAAAAAGCAATGGTCAGCGTCTCGTTCTCGAATACAGTAATGTTTAATAGGTCTAGGTAACGCATTCTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr2R 16567232 5' + opus 7028 4 67.12 AATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACAC:1 + chr3R 12948596 5' + Stalker4 7012 4 53.42 AGTGTTTGACTTAACGGTTGTTTAAGTAGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATG:1 - chr3L 18183213 5' - Tirant 374 2 66.42 TTATATTTTGTTTTGAAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCT:1 + chr2R 11246948 5' - 1360 118 1 53.42 GGAATTACCATTTGAATCGGTGCGGAAAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2L 10461267 5' + roo 8675 2 74.40 GTATATATCAGATTTTTACACAGACATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 14422665 5' + roo 15 2 60.96 TGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCTTCTTCATCATATTCT:1 - chr2R 4261953 5' - invader4 2967 2 66.44 GAATTCAAGTATAAATTAGTTGATACTGAGTGTTAAAATAGTTTCCTCGCAGTTCCGTTCCCATGCGAAGATTTAAGTTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATCTATTTAAAGACTTA:1 + chr3L 7389654 5' + roo 8679 2 73.29 TAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr2R 7314607 5' + blood 37 2 56.16 AAATTCATAAACAACGCTGAAATCAAGTTTCGAGAGGCTCGAGGGGACCGCAGTCCCAGTTGATGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAAT:1 + chrX 8839279 5' - Tabor 456 2 56.30 GCCGCTTACATGAATACAACTACTTGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr3L 27349974 5' + 297 6609 2 61.64 TTTCGAAAGGATTTCCGGAGTACCTCCACTTCAGACTGAGTCGCTAAAGCTAAGTTCAAACATACTACTTTTTACATTGTAAAAAAAACGAATTTTTAAAGCATTTGACTCTGTTAATCATTACCTTCTAGTAAGGAAACTTGATC:1 + chr4 291601 5' + Q-element 352 2 72.60 TTGTGATTCAACGAAGGACACGTTCTCAGTTGAAATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACA:1 - chr3R 10148879 5' + 17.6 6 2 80.82 ACACATTTACAATTATTGTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACCCATACATCCACGGCGTCCTCTGTGAGTGGGCTTACATACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr2L 17574657 5' - hopper 1388 1 65.75 GGATGCTTAAACAGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGATAATATTAATTAGAAATTTTATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 11516625 5' + roo 42 2 56.85 GTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGAACAAGAA:1 - chr3L 11826431 5' - INE-1 87 1 61.64 AATAAATAGTCCTAATTTATTTGCTATAGAAAAAAAGGATACTTGATATTCATGGCAAAACGGCAAGACTTGTAAAAGTGCAGAGTTCCTTCAAAAATTGCCCGAACAGATTTTTTTTCTTTAAAATACAATCTGTTTTTAAAAA:1 - chr3R 6821299 5' - Porto1 4651 1 23.45 TTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAAT:1 - chr2R 943898 5' + F-element 76 1 63.12 ATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGC:1 - chr3L 17748415 5' + Doc 478 1 79.39 CGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTCATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 18311406 5' + opus 7043 4 56.55 ACATGCATTATCAATTTAACGAATTTTGTTTAAACACCAAAGATTGCAACAAGAGGGAACGCTGTAGTCGAGTTTCCCGACTATCAGATACCCGTTATTTATCTGTATGCTTAACCTTAATTTTCTAGCTTTTATAGTTCCTAAA:1 - chr4 829131 5' - INE-1 153 1 70.34 CATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 - chr2R 5193515 5' - roo 336 2 69.86 TGAGCAGCCTGCGTACATAGCCGAGATCGCGTAACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr2L 14616149 5' + P-element 25 1 65.12 CCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCAAAATAAAACGA:1 + chr3R 10148749 5' - 17.6 7332 2 78.08 AATTTGGAGTAAACCGTAAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGAGCTTTT:1 + chr3R 8112694 5' + Burdock 6169 2 53.49 ATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 - chr2R 5193525 5' - roo 9033 1 54.47 ATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGA:1 + chr3R 12764688 5' - copia 5081 2 55.17 TTTTATATTTTATAGAAAGGGCTCTGATTTATATAGGCCATTCCATCTGATTGGCTCAGCGTATCAAGAACATCAGAATGCACACACAACGCATAAATAAAACCATTCGCACCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3L 20143198 5' + hopper 8 2 80.14 AGGGTATTCAATTAACTTCGTGTATAGAACAGAAGAGCAGAGCAGCGTTCGCCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTT:1 + chr3R 18291520 5' - copia 4895 2 52.73 ACAGACTGTTCTATTTAGCATAAGTCAGCGACTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3L 18846900 5' + 1360 8 2 78.77 ACGAGAGAGCTGAAGCTTCTCAGTCTCGCACATTTCGCCGCGAGCTTTTACCATGTTACACACTTCTCTGGCATTTTCTCGGTTTCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCG:1 - chr2L 310181 5' + P-element 27 1 65.69 GGCCATGAGCTCTGCCGATNATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chrX 14360878 5' + jockey 36 1 64.83 GAATGGTACAGTGTTATTGTACATTATAGAGTTTCCAAAGGTCACTGCAGAATCGTATTGGTTAATGCACCTATAGATAATGAGTACTCCCGTA:1 - chr3R 3396104 5' + Rt1a 4776 1 79.79 AAAACGTCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCC:1 + chr2L 23310584 5' + 1360 12 1 75.74 AGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGA:1 - chrX 21668364 5' - opus 7454 2 54.11 TCAGTTGTTGCCCTATTGTTACTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr2L 13033298 5' + hobo 34 1 49.64 CATGATAAAGTTGAGACCTTTGATGAATCGAACCTTCTCAATAAAAATAAAGAGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3L 15718209 5' - 1360 3370 1 72.60 TTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAACATATTAACTTATGGCAG:1 + chrX 666286 5' + 412 7095 2 60.18 CTCTCTTGGTGAAATCATCATATATTTAATTATTTGCATTTGCCAAGTGGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chrX 8314450 5' + roo 8736 2 67.81 ATGTCATAAACGCTGATGGCAAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 26927475 5' + roo 66 2 62.33 ATTTAACGTCCACTTCTTTGACCCGACCTTCATTTGTAGGACCTATTATGAGTGAGAACGCAGAAAGGCACATGTGCATCTGATTTCGTGATTTGTGTTTTCACTTTTTTTTTTGTGATTCTTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTT:1 + chrX 19720874 5' + hopper 146 109 64.58 AGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCAT:1 + chr3R 10030728 5' - BS 5006 1 77.08 TTTAATTTTAATTTTTTAAAAATTTATCTCAAATACTTAAACATGTAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCC:1 + chrX 16067295 5' - HMS-Beagle 6964 2 73.29 AGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCAGGC:1 - chrX 8839357 5' + Tabor 90 2 76.71 TTAGGACACCTTACGTTGATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGT:1 - chr3R 20887551 5' - Doc 4670 1 79.58 GGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 + chr2L 20761882 5' + Doc 451 1 63.97 AAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr3L 14422717 5' + roo 8731 2 65.07 TCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGC:1 - chr2R 5621045 5' + ZAM 23 2 60.98 AAATTTAAATACATATATTAAAATGTAAAAATTGAGGCATTTTCTAAAAGTGTGGGTGTGGTGGGCGGTGTAGAGAGAGGAAGCTATAGTCCTGGTCCTAGATACCTGCTACTCCGCCAGTGGGAAATCAATAATTAAATTAATAA:1 + chr3R 21535528 5' + flea 227 2 49.32 CGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTT:1 + chr3R 18832328 5' - roo 9032 1 54.11 AAGCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chrX 22835247 5' - mdg3 169 2 69.23 GATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 - chr3R 10737077 5' + F-element 27 1 64.10 TAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACNCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGNGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAATGTAATTGTGATCCA:1 - chr2L 12236841 5' + jockey 64 1 53.42 TCATTGCATAATGAGTGGAATCTTCTTCGGAGTAAGCCAATTTAACGAGTCCGTAGCTAGCCGTAGAAGTATGCTTGGAACAGTCTTTATTTGTAAGCTTATTCGTGGGGATGTTGAGAGTCCCGAATTGATTAGTCGGCTTAACT:1 - chr3L 23746229 5' + Cr1a 4082 1 69.18 GGCTTAACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr2R 6801729 5' + 297 6625 2 56.16 GCACTTTTCTTTCTTGCACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr3L 17011941 5' + 1360 51 1 56.52 GCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTGTCTTTCAAGCTATGAATAGCAAGTTCTAAAAATTACAACAGTATAGTGAAAGTTA:1 + chrX 22679635 5' + Doc 73 1 43.17 CCTTATTCAATTTGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 + chr2R 9341512 5' + roo 32 2 43.84 ATGGAAAGAGTTTGAGGAAACTTTTTCAAAAATTCAATTCGCAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGCGCGACGACCCGCCG:1 + chr3R 12146603 5' + gypsy10 5661 2 72.22 GTGAGAAGAGCTGAATTCTGGTTCTCACCCTCATCAGGTGTTGAGCCAGGAGAATTACGCTCCCAACTCCGCGCCAGCTGTGCAGTTGTTTCCCCTAACCTGGAAGGTATGCCAA:1 - chr2R 14384916 5' + jockey 474 1 70.43 CGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr3R 20752874 5' - 1360 3344 1 52.48 TTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGCAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGT:1 + chr3L 28063328 5' - Stalker4 109 4 69.86 ACGAGATTTTGAATCGATGTGATGTGTCCAAGATCACGAAAGTGAATGAAAATTAGAGAAAATTGGTTTGGCACATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCC:1 - chr4 909160 5' - 1360 3306 1 51.59 CATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3R 19965226 5' + jockey 78 1 62.33 TGAAGGGAGTATTTGATGCCCGTCAGGCGGCGGCGAAGCAATAAAAATGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAA:1 + chr3R 12376371 5' - HMS-Beagle 225 2 71.23 ATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3R 29627875 5' - roo 8982 2 79.45 AATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCG:1 + chrX 3533853 5' + 17.6 35 2 62.07 TTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3R 31266129 5' + jockey 79 1 74.42 TGTAGCTATCGGAGCGGTTTTATCACAGGATAATAAACCAATTACTTTCATATCTAAAACCTTAAGTAAAACTTAACAACTTTATGCCACGAATAAAAAAGAATTGCTAGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chrY 3572604 5' + 1360 46 1 74.66 GGAATGGACAGCGGACAGGCTTTTAGCAACATGAAAATGCTTTATGGCAATTAAAAAGGTAATACATCAAATGCGAAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCG:1 - chr3L 5051168 5' - flea 4973 2 58.90 GGCCAGTGTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTT:1 + chr3L 9324402 5' + HMS-Beagle2 6895 2 76.03 GCGAATCTTGTGTTATTCATTATAGCAGACTTGTTATGTGTAACGAAAAGAATTGATGGAATGTAAGGGAAACTTTACTGGCGGATGCACGCTTCAGAATCCGGCTCTAGCTCTTTGGCG:1 - chrX 19812528 5' - Gypsy12A_LTR 2192 1 69.17 GGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2L 10461135 5' - roo 349 2 57.53 AGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - chr2L 12236828 5' + jockey 77 1 64.38 CTTACTGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCG:1 - chr3R 10144483 5' + Chimpo 18 1 67.23 ACAAATAGGTTGTATTAATATATATGTATGCTAAACTTTATTAGCCGATGCAGATTGACTAAGCGAAAGCTTGGCCTCTACATACATATACATATATGTCGAAGAGTCATCAGGACACTCTTTTTCCTCTTCACTATTCTCGTTGT:1 + chr2R 5617464 5' - invader1 374 2 58.90 CTGAAATTGCATACTTTATGCCTTTCTTCGGTTTTGTTTGAAAAGTTCTGCTCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTT:1 + chr2L 14056620 5' - pogo 2089 1 72.60 AATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCT:1 - chrX 21668401 5' + Stalker2 13 2 68.52 AAAGTAACAATTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:2 + chr3L 6557081 5' + Doc 21 1 69.86 ATCTTTATATATAAATGCGGATGCACTGCAAAAAAATTATCAACAAGAAGTTTGAAATATATGTAATACATTACATTTAAGTCTATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chr2R 21958378 5' + 297 28 2 57.34 TCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 14422804 5' - roo 323 2 78.47 GTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTCACAAACACACA:1 - chr3L 21764434 5' + hobo 84 1 75.00 TTTATAAAAATAAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATA:1 - chr2L 18311514 5' - opus 7426 2 75.34 TATAGATGTCAGCTACATTCTGGCAAAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAAC:1 + chr2L 6618851 5' + 17.6 10 2 73.61 CTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 - 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chr3L 6050218 5' + 412 42 2 65.05 GAAAGTATACCATATTTGAAGAGGTTCGTTCCATTGTGTTGCTCAGAACAAAAAAGGCTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTAT:1 - chr3R 12948697 5' - Stalker4 344 4 51.37 GAGTTATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCGTACGATTTTCTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2R 24427509 5' + 1360 46 1 54.11 ATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCGGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTTGTTCAACAGCGACT:1 - chr3R 30569065 5' - mdg3 175 2 64.75 CCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3R 12046724 5' + Doc 42 1 52.05 AATAAATCAAAGAAAGGGAAAGGGAAAATCTCAACAACAATAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAGTACTTCTGATGTAGTTAATGAAGTCTCAAAACNCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3R 4527302 5' - mdg1 375 2 52.05 AAATGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 + chr2R 5179580 5' - 1360 3322 1 65.75 GTTTTGATAACAATGCAGTCAGAGAGAATTAGTTTGCCTTAATGTATGAGATGTAAATCTTAATGTAACCTCGTGTGCAGCTACGAAGTAAGGGGTATATAGTTTCTAATGAAACTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAAT:1 + chr3L 23270023 5' - Cr1a 4088 1 60.27 ACCAGCAAAAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTA:1 - chr2R 14532093 5' - invader4 3052 2 63.45 TTAATCACCTTTAGCAGGCTTTGTTTTGACACTGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATT:1 - chr2R 2046539 5' + Transpac 70 2 74.40 TACTAGCTTTTCTTAAACAATATGAAGGTAGCATTAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGC:1 - chr2L 11523125 5' + HMS-Beagle 6877 2 78.62 TTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAATACTATTTACAAGGCGTTAGATTGGGCGTAACAAACAAATTTGGTAAATTGATACAAATTTACAAGACTAATTAAAATATACAAAAATATCAACCGATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGG:1 + chr2R 5667269 5' - INE-1 252 1 40.69 TCTCTCTTTCATTCGCTTTTTTTTCGAATATTTCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 - 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chr2L 22640199 5' - invader4 3000 2 71.23 GTATGAACATATACATATGTATAGATAGCACAGAGAGTGCNTCGTGGGGAAAATTGCAAATGCGATTCAATTCCAAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTCCGCTGAGGGCAAAAGT:1 + chr3R 20885225 5' - Doc 353 1 69.57 ACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCAT:1 + chr3R 22320482 5' - roo 8991 2 72.60 AGAAAATTTCAGGCCAATTTAATTTTAAACTGTCGCTAATAACTTTCGACCCAACAGTTGCCAGTGGGCGATAAACTAATGAATGTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTA:1 - chrX 14735849 5' - diver 169 2 57.24 GGCCGTAAAACTAGCGCCCAATGGCCACAACGCCCACTCCATAACGGTTGAGCTTCAGCTGCAGCTCTGCGCTCCTCCTCGTGTGCCAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGGTTGATATTTGTTTAT:1 - chr2L 5222549 5' - I-element 94 1 69.05 ACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 - chr2L 18181233 5' - blood 352 2 61.11 CACTGCTCTTCATTACTCGGTTAGATAGAGAATTTTTAAAGAGGACTTCTTGCGTCCTGCCTTTCAGATAGCTTGAAATCCAATTTAAAAGATCAACAGGGAAACCTAAAAGCTCAACTTTCCTTAATAGAAGGTAATTATTAACA:1 + chrX 22992051 5' - Q-element 339 2 79.45 GAGCGCTGACGGCAAATTTGGGCTGTACCATAGTTACCACCTATTGATAGGGTATATTAGATTTGTTGAAAAGTATATAATAGGTAAATGGAAGCGTTTCCGACGATATAAAGTATATATATTTTTGATCAGGATCAATAGCCGAG:1 + chr2L 21666338 5' + INE-1 90 1 67.12 AAAATGTGGTAAGTATACAGTCAAGCCCAGTGAATCTGAGTTATTTAACTTGTTTGGCCGACATTTGTGTAGCTACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCC:1 - chr3R 31112502 5' + mdg1 332 2 51.37 CATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 - chr2L 18181232 5' - blood 7343 2 52.05 GACTTTTAATGAAGCCAATGAGGTCTAAAATGAAGATAAATCATAAATATAATTATATATCAGTCATTAAAGCCGTTCTCCATAACTAAAGCAGTTTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 - chr3L 9397752 5' + 1360 25 1 65.75 ACTAATTAACGCTGACATTAAGAGACTGCATTTTAATTACTACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 388483 5' + roo 8683 2 72.14 AAATTTCTATTGGCCAGATTGATTTTATTTACTTTCCAATGATAACCCTATTAAGAATGACCTGGTTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGAC:1 - chr2R 943963 5' + F-element 16 1 77.40 TTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACACAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAACCAGTTGCTTGTGC:1 + chr3L 11684828 5' + Bari1 47 1 57.50 TTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 - chr2L 12236861 5' + jockey 29 1 66.67 AAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAA:1 - chr3R 10737053 5' + F-element 75 1 65.96 GGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chr3R 26854732 5' + jockey 14 1 72.38 ATGCGAAAGCTTTTCTGCATACTAAAATAATATAGTCATATGATTTCTGCTTTATTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCTTTTCTGAACATATAAAGTACATATATTCTAGATCAGGATCAATAT:1 + chr3R 18084366 5' + INE-1 85 1 55.56 CCAAATTCAGCACAGCTTTAATACTTTTGACATGAAACACAACATAATATTGTGATTAGGCTAAAAGCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACA:1 - chrX 22835311 5' - mdg3 5483 2 76.03 ATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGG:1 - chrX 4339129 5' - G6 1958 1 58.22 TACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATA:1 + chr3R 27547622 5' + 17.6 50 1 56.16 ACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATCAGG:1 - chr3R 7462963 5' + I-element 430 1 61.64 GGCAATGACAGGAGCGCAGCGTAACTTCACTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 21534196 5' + 1360 19 1 72.60 GGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCCTATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3R 28014127 5' + roo 59 2 75.22 ATTTGTATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCA:1 - chr2L 21657045 5' + invader1 38 2 74.29 ATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAACAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGTTGTAAGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAA:1 + chrX 6216354 5' + Juan 4040 1 76.55 GGACGCCAAAATTTTCGGACATTAAAGTTTTTTGCTATAAATGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCA:1 + chr2R 5179542 5' - 1360 3360 1 64.38 TTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAGTGCAG:1 + chr3R 20887426 5' + Doc 94 1 77.40 TAAAAATACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCT:1 + chr2L 6149098 5' - hopper2 1564 1 47.26 CCTCTGAACGGCTTTTGCCTTTGTTTTGGATTTTGCAACTTCAGTTCGGGTAGCTTCAATAACATGATTAACTTGATGGTGAAACGAATCCCGGCAAATCGCCAGCGAAACTCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chrX 18150120 5' - hobo 2931 1 78.08 GTAATTTGTGGTATTTCGTTCGGGTTGTTTAGACGAATGTTCAAGGCTATTGTATGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chr2L 18525703 5' - pogo 2036 1 64.38 ATTGGGATGCTAAGAAATTCATTCAATTATAGCGTTCTACCGCACTGCTTTGCTGCTTAAATATCCCAATCCATCTAGCGCTTTACTATCGCTTTATTAATGGGTATCTTAGAGTCGCTACATTCGACTATAGCGTTGTCTCTTT:1 - chr2R 12391745 5' + INE-1 578 1 33.79 GATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 + chr3L 7024463 5' + 412 7130 2 68.75 AATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCG:1 - chr3L 17500812 5' + Tirant 8148 2 59.65 TATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGACTCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTG:1 + chr3L 6557100 5' + Doc 8 1 72.81 AGTTTTCACTGCGGCTCAAAGTGAAAGGGCCAAAAAGAATCCGCTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCTGGTACTTACAA:1 - chr3R 31159270 5' + hobo 77 1 67.36 TCAACAAAATCGTATTGTTGCGTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:2 - chrX 10319749 5' - mdg1 7440 2 71.92 TATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 + chr3R 24480476 5' + blood 7091 2 70.55 ATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCCAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chrX 9846729 5' + transib2 50 1 51.03 ATTTCGCCAGCTTTCAAATCTTAAAATGCAGTTCATTTAGCGTAGTTTTCCCATACATGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr3R 5704108 5' - 412 431 2 59.59 AAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr2R 17350632 5' + F-element 43 1 65.75 CTGTGATGTGCGCCCTCTTCTTCCGCAATGCGGGTTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGCACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTG:1 + chr3R 907898 5' + gypsy11 360 2 30.34 ATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTG:1 - chr3R 31114357 5' - flea 4944 1 67.59 CTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAG:1 - chr3R 15727915 5' - 1731 4560 1 65.69 AATTTAAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCA:1 - chr3R 25597921 5' - copia 5051 2 65.75 AACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAATA:1 + chr3L 23773899 5' - Transib5 2844 1 65.67 GCCGTGCACTACAATAACGATATCTTTTACCATGGTTTAATATATTTAAAATTTACAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTT:1 + chrX 20537603 5' + roo 8966 2 60.14 GAAATACAAAAGCTTTCAATTTTTGATTCACGTAATTTTATTGCAAGCACTTGTCTTCACAGATTTCCCTCGAATTAAATCTATTGTTATTGCCTCCGCAGCCTCGCGATTAATTCGGTTTTTGTGCCCTCCGTATTTTGGCCCAG:1 + chr2L 3695016 5' - mdg3 359 1 70.55 CATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAC:1 + chr3L 18846933 5' - 1360 3348 1 56.16 CACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chr2L 16884802 5' + pogo 61 1 62.33 GCTTGCCCTTCTCACTCATATTGTATACATACTCATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2L 5207512 5' - opus 468 2 72.83 TTTGCTGTTCCCATTTCAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 512434 5' - roo 9000 2 69.18 TCTAATAAATAAGAAAAAATAAAAGCCAGTTGAATTGTCTGCCACCAATGTGGATGTGTATGTTGCAGTTTCAACAGCAAAAATATCCGATGGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr3R 4666211 5' + FB 22 1 69.29 GTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAA:1 + chr2R 19574439 5' + I-element 5169 1 69.66 GGGCTGGGGTTATCCATCCGTCCCCCATTTCGGTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr3R 11285038 5' + blood 18 2 72.41 TCTTTCGCCGCACACAAAACTTCCAGTTTATTCAAAGTTANAGTACTCGCTGTCCCGGCAACCAGGACATATTCGCCATGGCAACATGGTCCCGTCGTGCTCGCTGCACTGTCAGCATAGTAATGATGAACNCCAATTAAGAACAC:1 + chr2L 15522973 5' - 412 487 2 76.03 AACAATTTGTATGGCAGCACAATTTGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 21925060 5' + hobo 12 1 75.00 AAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTAT:1 - chr3L 2532530 5' - blood 7320 1 65.75 TTTGGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTT:1 - chr2L 15085773 5' - opus 488 2 74.29 CGCGAATCTTCAGTCGTCTGCGAAGTTTCCCTTATTCAATTTGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATA:1 + chr2R 9341483 5' + roo 8667 2 63.01 TTCCTACGCAAACGACCGGCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 - chr2L 14263036 5' - P-element 2833 1 42.31 AACCGTTCCCTCTGGGCGTCCAGCTAGTTTCCTTTCCTTTCCATTTTTCTCTTTTACCTTCAGGACCAGGTGTTCTTCTAACCACTTTGAATAAACTTGTGAGGAGTTTTAAAACTCCCCATAAATCTC:1 + chr3L 26026703 5' + gypsy8 4660 2 55.04 TGTTTTTGTTGCCCGTCCGTCTGGCGCACCGCACGTAGTCTTTAAACAGGGTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr2R 16373623 5' - 412 426 2 65.07 AAAAATTTTCATTCAATCAAGTGTCAAATTAGTGGCGATTCTTAATTTAAGCAGCCATTCTACGTCGAGTCTCGAATCTTTTCACCCTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTC:1 - chr2R 9621796 5' + roo 8884 2 61.64 AGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 + chr2L 17957164 5' + flea 52 2 57.53 AAACATTCAGGTAAAATTGATAAATATTCAATATTCAATATTGTTCACAATCCATCCAACTATCTATCCAATTTAAAAGCGAAACAATTATATCGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATNG:1 + chrX 17884466 5' + pogo 8 1 71.32 TTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr3L 11364912 5' + Tirant 8114 2 76.15 CTTGCCTTCTGGTCCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCA:1 + chr2L 11867296 5' - hobo 2923 1 56.84 TTGAAAGCAAATCATTTTCATTAAAAAATTTTAATTATTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCGCCGAAGA:1 - chr2R 11844376 5' + I-element 3 1 79.26 AGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGTACACGTGG:1 - chr2L 23295887 5' + micropia 5032 2 47.26 TTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGT:1 + chrX 20149126 5' + pogo 56 1 59.59 ATCGCCTCCATGCGCCCTTTGTCATGCTTCTCTACTTAGACTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 - chrX 22862414 5' + jockey 25 1 70.37 CTTTTTAAGCAAATGGAAAAATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTT:1 + chr3R 20841381 5' + Juan 44 1 47.83 ATTATTCTCTGATATCATGTGTGGCATAAAGACCTCAAGCACTTTCGTAATAATAAACAAATATGTTCCGCTGATTTCAGCACATATGCTCGTACTCGTAGGCTACACCATATAAAAGTTGAAAAAAAAAATAAAATAAAAAACAA:1 + chrX 15292005 5' + gypsy7 5009 1 52.74 ATATTTTTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chr4 868746 5' - roo 9052 2 64.04 TGCACACATATATTTTGTTTAGCACTCATTTAAAAGTTGAACGTAATTTGTGGTATTTCGTTCGGGTTGTTTAGACGAATGTTCAAGGCTATTGTATGATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAG:1 - chr2L 18525745 5' - pogo 2095 1 77.52 ATCAGGGGATGTTCGGGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATT:1 + chr2R 1921398 5' - mdg1 377 2 54.79 TTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGTGCAAACAC:1 + chr3L 9324432 5' + HMS-Beagle2 6925 2 55.48 GAGTCTATGTTAAAGCATGCCGATGCTTTGAACAGAGTCTTGCTCTTTTTATAACAGATACTTTGATCAGAATTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACACGCACCCATATACGCGTTATCGTCTCTTGTTTTTACTC:1 + chr3L 25628021 5' + 1360 3238 1 57.53 TATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGC:1 - chrX 14978634 5' + hobo 65 1 62.14 ACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTC:1 + chr3L 9324411 5' + HMS-Beagle2 20 2 70.34 GTTGGAGCCGATCCTATAACTGGCCACGCTTAAAAGCGCGCGTTGTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAAAGAGACTCAAATATCCCATCAGTTTCCA:1 + chr3R 2689525 5' + F-element 4400 1 66.44 CCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAGCAGATACCATGACAGGCTGGAGCGC:1 - 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chr2R 16567391 5' - opus 459 2 58.62 TGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCT:1 + chr2L 8284325 5' + Doc 383 1 73.85 ATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAAAC:1 - chr2L 2544812 5' - blood 290 2 77.93 TGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAAC:1 + chr2R 4012527 5' + F-element 304 1 74.42 CGTTCAGACCTGGCTGATCTAATGATTGCCCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:2 - chr2R 18887106 5' + roo 8684 2 71.92 TTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATTTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 - chr2R 18931892 5' + blood 7098 2 73.97 AATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTGAGAACA:1 - 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chr2R 10582503 5' + Juan 3820 1 66.42 ATATCGATAGATATTGGGGAATTACATTTTTTAACTTTGCTTTTATTTATTAAATCTTCTTGAATAAGAACTAACAATAAGTTTAAAAATCTTAACTATTACACAGTTCTTCTAAACAGTTGTTTTATTTTTCCAACTGTTCTGAG:1 - chrX 23078693 5' - F-element 4573 1 67.81 TGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAAATAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 5870797 5' - roo 9014 2 61.11 TCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3L 5027160 5' - roo 9036 1 56.30 GTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGT:1 + chr3R 15003131 5' + Doc 17 1 61.18 GTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr4 373095 5' + pogo 23 1 68.49 AAAGTGAGGAAACCAATAGTCATATACCAAAGGTATCAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGA:1 + chrX 23102358 5' - Transpac 262 2 52.74 TTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chr3R 27606694 5' - 412 7477 2 63.01 TTTCGCCAACTTGATACTATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2L 5728975 5' + roo 8706 2 57.24 AAATGTTTATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTAATGTCAATATATCGTCC:1 + chrX 9846721 5' + transib2 43 1 56.16 GGAATATATTAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATGGTCAATCCTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGCTTATTATTAATTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 + chr2L 19800865 5' - flea 4953 1 55.86 CAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGC:1 - chr3R 11284983 5' + blood 7078 2 66.19 TAAACTGCAAAAAAGTAAAGCCAATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:1 - 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chr2R 17269191 5' + roo 8739 2 70.55 CCATTGAGCTCATAACTGACACCACCTCACACTCGACACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTATAAATCTGAACATGCAGACAAGACACCCCGTTGTGTGCGCACCCGAATCAATA:1 + chr2R 8316347 5' + hobo 140 1 73.98 AAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGCTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTCGATATGACAA:1 - chr2L 18311503 5' - opus 7451 2 74.55 AGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr2R 12462139 5' - roo 8998 2 67.81 GTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chrX 8681425 5' + jockey 64 1 57.24 ACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGCTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 + chr3R 28749106 5' - mdg1 7392 2 59.72 AAACTATTTGGTACCTAATGTCCGAGAGGTTAAAGACACAACAAACACAGGCAACACGACACAAAAACCAATTCATTGCCAACTTGTCCGGTTTTGCCAAGGTGATATTTCAATAAGCTACATATTAAACTCATGCCCATCCCTCC:1 - 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chr2R 17345831 5' + jockey 12 1 67.68 GGCTAAATGAAATTGAGTAAACGCCGGTGCACAGACAAAAGAAATGCCAAACCGTTCAAGATCTGAGCACACAAAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3L 2966432 5' + roo 46 2 51.03 CGTGTTTGCTTTGGAGTATATGTATTGTATTAATGGGTCGCTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATGACCTCC:1 + chr3L 1004848 5' + jockey 4757 1 70.83 CAATACTTTCGCCAGGAGAAAGCTTGTCTCGAAGGTATGTTTTGATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 5193569 5' - roo 391 2 74.66 TTGTTGCAGCCGAACTGAATTTATGGCCACGGTATATAGCAGTCAGTATCGCAGTCACACGGAAAAAATAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTCCTCT:1 - chr2R 14072647 5' + mdg3 5269 2 69.86 GTAACGGTATTGTCTCCATCCTGCGATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr3R 25158712 5' + 1360 13 1 74.02 TCTTAGAATGGATCTTTTCAGAAGGGTAACTGTTGTCCCACTGGGAGACCAATCAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAGACCACCCAAACACGTTGGCGAATGATCTTGTCGACCCTATTTCCCTTCGACGTC:1 + chr3R 22623010 5' + G5A 2662 1 76.03 GACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - 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chr2L 2544851 5' - blood 335 2 53.62 TCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAATAT:1 + chr2L 17550610 5' - Transib-N1_DM 444 1 79.45 CCTAAATTATTTTCTTATTGCGACGCCAACACGCATATATGTACATCAATACATATATTTATATACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTCACAGACT:1 + chrX 13628681 5' + roo 8677 2 74.66 TTTTATTTGAATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 + chr2R 22957894 5' + hobo 56 1 56.64 TAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAA:1 + chr2L 6618884 5' + 17.6 45 1 52.74 TTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATAC:1 + chr2R 19574405 5' + I-element 5136 1 55.48 GAGAGTCGAGCCGAGGCAGCAGCAGACACAACCATGTCGGCATTCAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAAT:1 + chr2R 12826979 5' - Burdock 185 2 67.81 TTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATT:1 + chr2L 11475108 5' - jockey 4932 1 56.85 GTTTGAATTAAACTTATCGTGTATGTGAATTGTGGCGTGATGTTGTTGAGCAAATGGGTTCTACATTAAAACAAGAGATTATGCTATAGTTGAGTAGCTAGTGTAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGT:1 + chr3R 24279323 5' + INE-1 579 1 68.46 TTATAAACTGCAAAAAAGTAAAGCCAATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 414984 5' + 412 20 2 72.60 GTAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGTGCTGACATAT:1 - chr3L 7024560 5' - 412 446 2 51.03 AGAGAATTATTTTGTGTGAACTAATTGCATTAGTGACATTCAATTTGATACCGGGGGGGTGCGAGATGCCAGGGAGTGCGGACGTGTGCTTGGTGAGTGAACGATGAAGGCAGA:1 + chr3R 21802193 5' + Bica 70 1 55.26 AGTGTATAAGTTAACTAAAATAAATACAAACAGCTAACTAATCAATAAATAATAAGGAAGAATTGCCTTAACAATAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATA:1 + chr3L 24208937 5' + invader2 5095 2 55.48 GTGGGAAAATAATAATGTCTTTTTAATAGATTATGTTATAATATCTAAGAGAAGATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATA:1 + chr2R 24215628 5' + I-element 5340 1 61.64 TCTGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr2R 7895518 5' - mdg1 362 2 56.85 GAACATTTCAGTTGCTTGCCTTTTTTTTTAGTGTTTGGATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 - chr3R 24666426 5' + hobo 66 1 71.65 CAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTA:1 - chr3R 10736115 5' + McClintock 6006 2 69.60 TGATTTGTTCAAAGACTAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGT:1 + chr3R 18294840 5' + copia 4947 2 75.56 GGTGTGGTCANGCGGGGCTTTAATTGCATTTGACCGGCAAGCGGGCTCATCAGTGCTCATCAGTAATTGCAGTTTTATTTTTTGTAGAATTGTGTCTTCGGCGATGTGTCTAAGGTGGTTACAGTAATTAACTCCCTTAG:1 + chrX 17722099 5' - I-element 488 1 60.00 ATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGCCTCGGGGC:1 + chr3L 12227788 5' + opus 7072 4 67.81 CCTGGGAGAACACGAAAGCTCAAAGTGAATTTTCCTTTCANTTGCTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGANAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGC:1 + chr2R 8966119 5' + BS 5028 1 59.31 AATATTCCACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr2L 8120149 5' + roo 8712 2 66.96 GTGGCTCTGATAGATTAATGCGTTCGCCATGAGCTGTTCTGTGCCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACT:1 - chr3L 11536034 5' - roo 9064 1 77.21 GTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 1459857 5' + 412 40 2 67.00 TAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr2L 16884766 5' + pogo 24 1 61.38 AAGGAAATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATAT:1 + chrX 6538619 5' + pogo 29 1 61.64 TTGAACGAACTGAATTTATTGGTCGTCTCGATACGAGATACGTGCGGCTGCTCAAAATCCCACCATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAA:1 + chr2R 5549791 5' - flea 4961 2 55.17 TTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTATTTTTTTTTAACTTTATTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGTTTTTATTTTTTTTTTTACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATAAGTTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTNTGCCTT:1 + chr4 1294992 5' - TAHRE 10381 1 67.12 TTTCTTCTTCCTCAACATTTGTTGTTCGCCATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3R 25860575 5' - hobo 2915 1 60.91 CTCTAATGAGGGCGTTTTGGGGTAATTAAAATTTCATTGCTTTATTACGAGCGTCTTGGATGTTGAGAGTCCCGACTTGATTCGTCGGCTTAACTTCTCGGTTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCT:1 - chr3R 30922426 5' + Cr1a 4127 1 58.57 ATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCATGCGTGGGAATAGTGAGGAGCGGGCCTTTGCCGTTGAGGCCT:1 - chr3R 3268038 5' + mariner2 155 1 75.34 AATTTTTCATATTTTTATGTTTTTCATATTTGCAACGCCCACTCTAACGCCCTAAAGCAGCCGAAGTGGCCACACTCCCACACTTGGGAAGAATTTTCGAACCTTTTCTCATTTTATTTCCCAAAATCTATCGATATCCCAGAAAA:1 + chr3R 26093186 5' + INE-1 499 1 78.08 TGTTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCA:1 - chr2R 11844341 5' + I-element 49 1 52.05 AATTGGGTACCGCTCGTCTGATTCGCAATTTCAACGTGGAGTTCAACCATTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATA:1 + chr3R 19134399 5' - transib2 2751 1 65.07 GCAATTTCCGCTGGTTAATTGCAGCATCAATATCTACTCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTT:1 - chr2R 22796831 5' + jockey 4864 1 73.97 AAGTGCAGTAAATTTGTTCGGAATGGAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATCTGGAAATATCTTC:1 + chr2L 2241218 5' - roo 356 2 56.20 TGGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGCTTTTCAATAACGCTTTCTCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACACGATGCGTAACGC:1 + chr2R 981622 5' + 1360 11 1 54.46 CACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1 + chr3R 28749117 5' - mdg1 7379 2 69.18 TATTTTGTATATTTGCCAGCGATTTTTTATCTACACTTCTCTAGGCGCTTCATTTGGGTCGTGCGCAAATCAGACTCCCACTGCGGCTCCCTTATTCATGGTTATACATATATAGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 - chr2R 11153279 5' + roo 8669 2 73.10 AAAACAGCAAATGCCGAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCA:1 + chr2L 20628493 5' + Stalker2 7246 1 49.32 TTTGGATGAACTTGCTTCCATTGCATTGCAATGTTTTTAAGACTAAAATGAACAGCCCGATAATGTGATTGCAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCA:1 - chr3R 13838607 5' + opus 21 2 65.75 GACAATCACATAATGGCCATAAGTGATGAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAA:1 + chr3R 24071986 5' + jockey 29 1 75.34 ATTTGTTTCTTAGTGTTGATATTACAACACAATGATTCAGTAGTAATCGTACTTAACGTCAAAAAAATAAATAATAAGCATCGATAACAATAATTTTATAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2R 5193385 5' + roo 8685 2 67.12 TAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCCTGCCGCGCTCTCTGCAGAG:1 + chr2R 14072534 5' - mdg3 5405 2 77.24 TCGCTTTCGCTGCGAAAACCTCTTCTTATACCCTTTACTCTTCCAGTGAAAAGGTATGCTGAATTTTTTAATTTCAATGCCAAAAAGATTGTTGAACTTTCTCGTTCGCACTGCTGCCAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chr3R 19113904 5' + INE-1 550 1 51.72 GGACAGGTTGTACAGAATTGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACT:1 + chr3L 18216426 5' + 297 12 2 78.08 CTAGCTCTATATATCTTGACGCATGTCCGTCAAAGCGAAACGCTCGAAAGGCACAAAGACGGCGACAACTGACGAAGCGTGACGGGTATAAGAAATGAAGGGTAAAAGGGAATACCCAAGAAAATTTTTGTGCTCATGTCT:1 - chr3R 24666032 5' - hobo 2610 1 57.45 TCTTAATGTATGCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAAAGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAG:1 - chr2L 15020001 5' + BS 4809 1 72.59 CCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTTCATGGGGGTTGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTCGAAG:1 + chr3L 11837740 5' - G5A 2674 1 66.44 AGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 - chrX 19887007 5' - P-element 2812 1 29.85 GAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:1 + chr2R 21795269 5' - transib2 2738 1 79.31 TTGCCTTTAGAAGGCAAACTAAAATGTAAATTGAAACGAATGAATGAAACAGAATGTTTTATTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chrX 8876856 5' - mdg1 360 2 58.90 TGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr3R 17243238 5' - hopper 1378 1 58.22 TTGGTGCGTATATGTAACTTCGCATATAAGGTAACTAACTCTCCGACTGGTAATTTCAACTGCAATTTTCTGCTCGATGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTGATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTT:1 + chr3L 4547657 5' - mdg3 215 2 60.74 AAAATTATATGACAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr2R 8286815 5' + Burdock 24 2 60.29 ACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCA:1 - chrX 21668394 5' - opus 493 2 50.00 CGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATTCGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTCTGGACAAGACCAGAATACCGGCACACATAGCANATAGTGACCCCCCA:1 - chr3L 3661123 5' + X-element 109 1 74.66 CGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCTCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATT:1 + chr3R 26854748 5' + jockey 56 1 56.92 GTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - 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chr2L 12236867 5' + jockey 30 1 67.63 TTCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chrX 8314517 5' - roo 324 2 78.08 GACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATNCAATACTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATNTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAGGACAGATGTAACATGA:1 - chr3L 6050202 5' + 412 7160 2 79.45 AACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATT:1 + chr3R 23644878 5' + diver 5946 2 61.24 TGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 14608708 5' + jockey 74 1 64.96 CTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr2R 10582383 5' - Juan 4153 1 59.31 TGTTGGCGCTGTTAACTGTTATTTACTTTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTA:1 - chr2R 9376709 5' - hopper 1330 2 73.97 CATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 15148567 5' - roo 361 2 52.08 TCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGCAAACCAGATTGGGAAGAGCCTAATCTTCACCCAA:1 - chr2L 6637479 5' - 1731 4575 2 51.43 CTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 + chr2R 7314653 5' + blood 7094 2 71.92 TACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGA:1 - chr2L 18219381 5' + copia 84 2 74.66 CCGAGGAACGACTGTGGATGTTGCCGAGGCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCC:1 - chr2L 20852574 5' + Tirant 7 2 78.69 CAGAGAGGCAAGACAAAAAGCAAGGCAACATAAGAAACCCAAACCAAAACCCGCTGAAAAACCATAAAAAGCTGTAAGAAGAAACAACAAAAAATACACCGAAAAAAAGGCCATGCGAAATTAAAAAAAAAAAGAACAAAATAA:1 - chr3L 3758995 5' + gypsy11 3933 1 64.58 TTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTT:1 + chr3R 12764690 5' - copia 5078 2 53.42 TTATACCCGGACCTCGCAGAGTAAAGGGATTTAGGAAATGTGAACAAAATCGATGACATTAAACAAAAGTTTTACGTGTAAAACAAAGAAAAAAATACAGTTGCAATTTTATTAATTTATTATGATAGACAGAATAGTTTACA:1 - chr3L 27670264 5' - I-element 5339 1 58.04 AAAATATTACTAAGATAAACACTTGTGCTAAACAATAAATATCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGAC:1 - chr2L 23349114 5' - flea 4942 1 69.66 AAACATTTTAACGCCCACAAACAACATTAGGGGAACGATTTCGAAATAAAGCGATCGAAATAAAGCGATCAGCATAGCAATATCTCTTTTAAGTTATTTAAAATGATTAAAATTGTTGAACTACAATGGGTATTGTAAAAATAATT:1 + chr2L 16141114 5' - Tc1 1495 1 66.44 TAAGAGCCATTTTGTTTGGATTTCATAAGCTCAACAAATTGAAAGTAGTCCAAAAATGAAGCAGAAGCTGGACTAATTGGAAACTGTGTTGTAACTCAAATGCTATACTTTTGAGAAAATCAGCATATTGATTTGCTTGGGTATTT:1 - chr2L 11784686 5' + invader5 3750 2 62.33 AGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr2R 7314593 5' + blood 20 2 67.13 TTTATGTTAATTATATTTGAATATAAATTTAACAAGATTGATAAGCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr2R 14821140 5' + roo 8740 2 71.92 TGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 14608708 5' + jockey 83 1 68.49 ATAAGTATGCAGCAAAAAAGTAACTTTATATTATGAAATAAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAA:1 - 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roo 9044 1 60.27 CGCCCAAAGCCACTGCATAATTTCATTTAATTGTCCATTTAAGCCTGGAAATTTAGACCTGATGCAGTTTAGATAATAAATCAAACATTTTGCACTTTTTACAGATACAAAAAAAGAAAAAAAAAAACAA:1 + chrX 19022685 5' + gypsy7 5009 1 73.08 AAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAACATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTT:1 + chr2R 21795259 5' - transib2 2769 1 66.13 GGTTCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATAGACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGCCATGT:1 - chrX 21575373 5' + INE-1 91 1 58.90 CACTGTTGTTGCCTCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTG:1 - chr2L 6637501 5' - 1731 4598 1 61.87 TGAATAGAAATTTACAAGACTAATCAAATTATAAAATGTGTGCGTGGCAGTTCTGGTCGGTTTTAGGACTTTAGAGTAGGCGGACAGACGGACATGACCAGTTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCANGA:1 + chr2L 23066893 5' - INE-1 88 1 66.92 AGTTTAAAACGGGGTGAAATTACATAAACTTCATATGTGAGATTATTTCTGGAAAGGATTTCAAATATTACAAAAAAACATGTGTCTGGATACGCCAGACAAGCGTCCCGGACTAGAAGCTATAGCTATGTACATAGCGACCACCC:1 - 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chr2L 14616256 5' - P-element 2816 1 36.99 TTGTTTGCTAAGAGAAATTTCGGGAGGCAAGCTCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATT:1 - chrX 16998407 5' - diver 6059 2 52.41 CAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2R 18887071 5' + roo 55 2 58.22 ATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAA:1 - chr2R 17350577 5' + F-element 98 1 73.29 TAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 13254916 5' - roo 9024 2 62.50 ACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTT:1 + chrX 20361968 5' - hopper2 1533 1 69.18 ATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGA:1 + chr3L 18846966 5' - 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HMS-Beagle 7032 2 68.37 CAGTACCACTTCAACCTTCGAAGAGATAAGTCGTGCCACCCAAAAACAACAATACCGCTAACCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATTACTTCAAAAATATACCAATCACAATTA:1 + chr2R 2146570 5' + I-element 222 1 71.23 CCTGCAGCCCTGTTTCCACATTGTTTGAACGAATGAGTTCAACTGGTTTAATTTTAGTTACCGAAAGAATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACA:1 - chr3L 26709889 5' - opus 7452 2 56.85 ATTTTCCAAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr2R 22523152 5' + jockey 69 1 58.22 CTGCGTGCAACATCGTTGACCTTGCGCCCCATGCAAATCAGCATAAAACTGAAAGCCAGTGAAAATTCCACACAATAACAGGACTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATT:1 + chr2L 17314735 5' + Stalker2 41 2 57.53 GCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTC:1 + chr3L 25232769 5' - accord2 140 2 64.39 GGTAAGGGGAGGCTGGCCTGAGGGTACTGAAAAGGCACGTGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGGT:1 - 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Transpac 301 2 78.77 TTTTAAAGTAATGTTTTACTTTTCTATTCGCATATCACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAAC:1 - chr2R 4816993 5' - blood 365 2 69.35 CCCTATTAAGAATGACCTGGTNATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCTGTTNTTTTGAGTGAAGT:1 - chr2R 943918 5' + F-element 60 1 48.28 AGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCA:1 + chrX 21668547 5' + I-element 64 1 61.64 TAAATCCTAGTTTGTTACAAAACACAGAGAAATATGTATATGAATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCG:1 - chr3R 26180571 5' - Transpac 301 2 78.08 TATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATA:1 + chrX 20149131 5' + pogo 61 1 62.33 TAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCT:1 + chr3L 9324422 5' + HMS-Beagle2 32 2 62.33 AGGTCCACCAACTCCTGTTCGACCTGACAGCCCTTCACTCTTCTCGCACTCCAGCCGTCTTCGCTGTCGCTGTCACAAACGTTATGTGAAAAAGTTCTATGTGAACGAACATGCAAAAAACAACACCAAACAGCACTGCAAACAAC:1 + chr3L 23933520 5' - 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412 418 2 80.00 TATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAAC:1 - chr3R 20887517 5' - Doc 4632 1 56.85 GCTGTGATATTGAGTGCATGCCATCGAAGCCATTCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAA:1 - chr2R 21795319 5' + transib2 86 1 76.71 TAAAGACATTAATGACAGTCCGGCCTTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTT:1 + chr3L 414796 5' - 412 478 2 75.34 CGGCTTAGAGTGGAGTTATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 + chr2R 24427497 5' + 1360 34 1 62.33 TTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3R 24480433 5' + blood 7048 2 58.90 TCTAATCGATGTTCATTCATCGTCCGCGACATGAAAGTTACCCTTTGTTTTCACCAGCTTTGGTCAATTCGTCCAGCGTTGGACGACTGTCACGGTCGCCATGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr2L 17019055 5' - 412 7535 2 69.40 TAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr3L 2167695 5' + opus 54 4 62.86 TAATAACAAGCCAAAAAAAAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGTGGACGCTGCGA:1 + chr3R 3269632 5' + Gypsy6A_LTR 110 1 65.22 TAAACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGAT:1 - chr2R 4206661 5' + 1360 316 1 75.17 AATACAGCGAAACGGAACTCAAAACTCTTTCACGATAATCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr2R 14385594 5' + jockey 90 1 71.92 CTCGAGTAAATCCACCAAAAACCACACAAACACACACACACACACACACACACACACAGTCACACA:1 + chr2L 2720250 5' + accord 190 2 74.24 CGTGCGATTGTCGAGCGATATCTCAAACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 - chr3L 21771020 5' + hobo 55 1 54.11 AATAAATACAGTCCACTACTGTTATGAATGCAACTAATATGATGTAATGACACTTGAAAAGGCCAAACAAATTTTACTCGATCACTTTATCCATAGAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 19450153 5' + roo 8680 2 48.18 GATGAGGATGAGGATGAGCGGCCGCCAAAGGTGGAAGTTGTTGTTGTTGTACGTGCAGATGAGCTTGGCGCGCATTCTGCGCTCCTGTGCTGAG:1 - chr2R 13367381 5' - Porto1 392 1 63.83 CTTGATGAACTAACTAAATGTTTTTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 - chr2R 19389463 5' + 297 23 2 57.53 GGGTGGGTGCGTCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 - chr2L 2544841 5' - blood 7329 1 58.22 AATCTTTGTTATAATCTTAAGTTAATAGCTAATTTGGAGTAAACCGTAAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGACATATAGTCGTAAGC:1 + chr3R 8112664 5' + Burdock 6156 2 67.81 TCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAAT:1 - chr3R 7049476 5' - Burdock 224 2 60.00 TTTCTATTGTTTTTATTTAATTTTCCAATTGTTATTGTATCACAAATGTTATAGTGGTCTGAAATATTTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAAT:1 + chr2L 11523034 5' - HMS-Beagle 207 2 54.74 GCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 9951321 5' + jockey 35 1 57.78 GAAAAAAATGTTGCTTTACGATTGATTAGTCACATTTAATTTGCATGTCGAAAATGGGTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGGATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3R 13406515 5' + pogo 46 1 55.04 AAGTGAATCTAAACTTGAAATTAGGAAAATTACCAACAGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chr3R 24084932 5' - roo 394 1 74.66 GCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACGTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 860761 5' + hobo 21 1 63.57 TCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr2R 1921416 5' - mdg1 7397 2 57.53 AAATTATAGAAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAG:1 + chrX 3533831 5' + 17.6 6941 1 76.71 TGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chrX 18673733 5' - roo 332 2 69.29 TTGAACTCAAGACAAGTTCATATACCCAAACGTAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCA:1 + chr2L 18525560 5' + pogo 17 1 73.79 TATGAATCCCTATGGTATAAAATTTAACATTATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGAC:1 - chr3L 2167740 5' + opus 15 2 72.60 ACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAAAATCGCATCT:1 + chr2L 9704792 5' - roo 8989 2 72.60 TAGCCTGCACTTATATAATTTTTCCTCAAGGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATG:1 + chr3R 25795973 5' + BS 5027 1 60.96 TGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGGGATC:1 + chr3L 17181466 5' + jockey 62 1 68.18 ATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3L 7024466 5' + 412 7124 2 68.89 ATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGGAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr2L 5728867 5' - roo 337 2 66.90 GTGGCAATTATTTTGGAAAATCTAAAATGATAAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTT:1 - chr3L 8824545 5' - transib2 2770 1 56.85 TAAACAGATTCATGTGCGTGGAGTGGGTCCTTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACC:1 + chr3R 10148703 5' - 17.6 462 2 62.96 AAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACA:1 - chr2R 20052460 5' - transib2 2740 1 78.32 CAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGAGCTCCGTTCGTATCTTATGT:1 + chr2L 388562 5' + roo 8708 2 77.91 CAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCC:1 - chr2L 20852536 5' + Tirant 8 2 68.24 AGTTTGAAATTGAACAACANAAATGCATTTAGAAAATATGAAAAGAAAGGAAGGGGTATATGGTTTCTAGTGAATCTACTTGGAACCGAGAAGTTAAGCCGACTAATCAAGTCAGGACTCTCAACATCCC:1 + chr3R 15658642 5' - Cr1a 4065 1 60.00 GTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGATCAGACACCAT:1 - 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chr2R 17350639 5' + F-element 34 1 71.53 TTCAATATATAATAAAATAAAACTGAACTTCAAGTGTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAG:1 - chrX 2214356 5' + jockey 4568 1 76.03 CCTCCTATTTTTATATTTTTATTTGAATTGAAGGGTATGCNTTTATGGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 + chr2R 22957878 5' + hobo 27 1 60.77 TCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3L 7024523 5' - 412 452 2 63.11 GTCTATCCCAATGATGATACCACCAGGATCAAGAAGATGACGGAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCC:1 + chr3R 19506670 5' + mdg3 5261 1 78.77 GAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATTGGTCGGCGGTCAGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chrX 19887055 5' - P-element 2865 1 68.22 AACTACTTGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATG:1 + chr3L 27349991 5' + 297 39 2 52.14 TCAAAAACACGAAAAGAACAATATGTTTGCATTACTCTCGCATACAGTCGCGATCGAACACTCGACGAGTGCAGACGTGCCTGCGGATCGACAGCAAATTGTTCACAGTTTTAAGTCCCGTTACTTGTGCCCAGCCACT:1 - chr3L 829959 5' + G6 74 1 68.35 GCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGAATACACTTAAAT:1 - chr2L 14263029 5' + P-element 43 1 44.64 GAAAATATTAGATCCATTTTGCAGCACTTAATTCATGGCAATGCTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 16547418 5' - P-element 2872 1 73.29 AGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGA:1 + chr2R 9341540 5' + roo 57 2 60.14 CGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAATAG:1 + chr2L 10461139 5' - roo 9009 2 58.90 ATGACTCGGATTCTTTTGCATTTCACCACTTTTACATACATACATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 + chr2R 9750158 5' - opus 7430 2 73.29 TTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTT:1 + chr3L 19951174 5' + Ivk 39 1 55.22 TTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTG:1 + chr3L 9324475 5' + HMS-Beagle2 85 2 75.34 GAGAAAGCGTTTCCGACTATATAAAGTGTATATTTTGTTGATCAGGCTCAATAGACGAGTCGATCTGGCCATGTCCAGCTGTCTGTCCAAATGTCCGTATGTCCGTGTGACCATCGAGTTCTCAGGAACTANAAAAGCTAGAAGGT:1 - chr3R 4947765 5' + INE-1 157 1 72.60 AAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTT:1 + chr2R 21795237 5' - transib2 2769 1 57.53 AGAAAGGGAAAGGGAAAATCTCAACAACAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGCAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTA:1 - chr3R 4527292 5' - mdg1 368 2 53.15 GCCGAGATCGCGTAACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAA:1 + chr2L 14616168 5' + P-element 41 1 51.59 TTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAGAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr3R 7625297 5' - hopper2 1551 1 54.11 TTGAAACAAAAACATCAATTTGCGACTTTTAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr3R 17259492 5' - roo 9033 1 59.59 ATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAG:1 - chr3L 12991443 5' - mdg1 352 2 64.38 TTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCAGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 11516521 5' - roo 335 2 67.61 AAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3L 7024540 5' - 412 7479 2 61.64 CAGAAACCGAGATGACTTCTGGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr2R 12462114 5' - roo 9023 2 52.05 CGGTTGAAGAGCAGGCCTTGAAAATGAGAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAG:1 + chr3R 7579343 5' - Stalker2 7627 2 68.49 TGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGTGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGC:1 - chrX 2214312 5' + jockey 4610 1 50.34 GACTTTTGTAAGAAGTCCGTTCTTTTTTTTTTCTTGATCAGCAGAAGCTTTCTGTCTTTGTCTCTGGAATCTGTCTGCTGGTTCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCT:1 + chr2R 2247487 5' - INE-1 156 1 53.64 CGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTAC:1 + chr2R 8315511 5' - hobo 2873 1 71.88 CACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATT:1 + chr3L 5770916 5' - P-element 2819 1 26.45 CGGATGATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACAGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTTTTCGCTCGCTC:1 + chr2L 23372627 5' - 1360 3307 1 71.72 CTTATTGACTACTTATTCAGATACATGAACGGACCCTAATAAGCCTAGATGACTTTCCTGGAAATCACAGAAATGAGTTTCACTTGTAAATTAGCATAGCAAGCTAAAAGTCAGGAAAGCTGCTAGAGAGAACTGATAAAGTTGAA:1 - chr2L 17956552 5' + flea 468 1 73.29 AGAAACCCGATATAGTCGAGTTCCTTGACTAGCTAGTTGGAGGCGAAAAAAATGGGGAAGAAAAAATATAGAAATACAAATCATTTAAACATTTTGGAAGATTGGGGGCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAA:1 - chr4 927145 5' - 1360 42 1 73.97 ATGTATAATTGCGCATATTTCTTAAACTGTCCCGCAAAGAAAGTGTTGAGTACGAAATATTACGTTAGATAAACACTTTTTTAAATTGTGAAAAAATAAGGTAATAGTGTATTATCAAAGACACTAGAATAACAAGATG:1 + chr2L 12158718 5' - 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chr3L 11364904 5' + Tirant 8127 2 65.79 ACTCAGTCACGACGAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr2R 18931944 5' + blood 7045 2 60.69 ATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTG:1 + chr2R 7727159 5' + BS 4713 1 82.69 CAGTTACTAAATATTTACATTTATAAAATGTACTCTTTATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCC:1 + chr3R 26472751 5' - 1360 3376 1 75.34 TGTTGAAGCTCATCGATTAGCTCTAACCTCACACGAAGAACGAACTCAGTGAACGAAATTAACGCAGAACTTGACAAAAAATCCGCTAATCGTTCCACTCGAGTACAATTGCTAAATTGTATTTTGAATTTATCTATATATTTTGA:1 - chr2L 22684609 5' + transib3 62 1 50.68 AAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 388608 5' - roo 8999 2 66.44 TTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACT:1 + chr3R 24480456 5' + blood 7071 2 56.85 TTGCATTTTGTCAATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3R 17987634 5' + jockey 69 1 60.96 ATAGAGTTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTC:1 + chr2R 7720029 5' + HMS-Beagle 20 2 70.55 GCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCC:1 + chr2R 12185298 5' - accord 7342 2 53.79 GACCACATTTTGCTTTGTTATTTTACTGCATTTTTGCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCT:1 + chr2L 9383685 5' + flea 4754 1 77.86 ATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chr3R 21925100 5' + hobo 66 1 60.96 CTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCAC:1 + chr2L 8284352 5' + Doc 395 1 60.00 TCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr2R 8436328 5' - 1360 3350 1 54.26 CTAGTAGGTAACATAATCAGCAAAGGTACACTTAAAATAGCCAAACAGTGTTTGCATAGTAATGGTGATTGAATTATGTTCCAGACAATCAGCATCATCAGCATTGTTTGTGCCACAAAGTTAGTAACCAAAAAACAGAAAAAAAA:1 - chr2L 17805160 5' + gypsy7 5003 1 73.97 GAGAACAGTTGGGCGGCATCATGTTTCTAATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2R 8442751 5' + blood 7054 2 56.16 CATTAATTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 - chrX 21639410 5' + 412 48 2 56.92 CGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGTGC:1 - chr2R 18887060 5' + roo 8723 2 62.59 CGATGCTCACTTAGGCAAATTGAGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCG:1 + chr3L 6015534 5' - roo 399 1 71.11 AAAAGAAACAGAATACAAATATTTAAAAACTATAGTATAACAAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGTTTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGGAAT:1 + chr3L 23890209 5' + 1360 323 1 51.37 AGACTTGTTGCATACTTACAGTATGAATTATTTAAGTGAAACTGCTGCGGCTGATGAATAATTGTTTCTACGGAGACTGAAAGGAAAAGATCCAAATGAAGTATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCTTCGTCTACAG:1 - chr3L 2008265 5' + X-element 487 1 47.06 TTTTGCCAGCTTTCATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGA:1 - 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chr3L 23150393 5' - Gypsy6A_LTR 356 1 74.66 TATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chr3L 17181444 5' + jockey 36 1 48.60 TATTTGCCCAGTTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCCCGGGTTGGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTTCACCTACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCC:1 + chr3L 17244994 5' - HB 1278 2 63.70 TAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACA:1 + chr3L 2167588 5' - opus 442 2 60.27 GCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAA:1 + chr3R 24072058 5' + jockey 102 1 74.66 CTAAGCCTCACTTTTAAAGTGTAACATTCTTTTAGGGCGGCCTCCGCACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGA:1 - chr3R 7463010 5' + I-element 383 1 71.23 AAGATCATGATCATTGCATCTACTCCGGTGTCTCCAAAAGTGAGTGGGTGGGTTAGTGGTACTTGGGTGATTGGGTGAGTCTGTCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr3R 20753005 5' + 1360 31 1 60.58 ATTCATTCTATTTGCTCGGTCAAATAACAGCCATAAACACTTTTTAAATTGAATTTTAACTATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chrX 14978694 5' + hobo 9 1 75.69 GACTCGATTATATTAACACTCCTAAAAAATTACACATATTTTGGGATCAGATTTTAAACATAATTATTAAAGATCCGCTCGCTTCGCGAGTTATTCCTTATGATTTGTGCAGTAGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTT:1 + chr2R 5446394 5' + Cr1a 177 1 65.75 ATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 20904970 5' - roo 338 2 68.49 TATCTGCTAGTTCCATAATCTCCTTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACT:1 - chrX 860849 5' - hobo 2903 1 68.97 GGGGTCTGGGTAACTGGCTCCGAAAATACAAAATACTTGCACAGCACACGGCTTTGTGCGATACTTGGCTAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTA:1 - chr3R 11937882 5' - hopper2 1561 1 53.42 CGAAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGATA:1 - chrX 19886990 5' - P-element 2783 1 15.75 ATAAATGCTAATCACCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 + chr3R 26472789 5' - 1360 3338 1 57.53 TGGCAACATGGTCCCGTCGTCCTCGCTGCACTGTCAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGG:1 + chr2L 15523051 5' - 412 411 2 73.61 GGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAAC:1 - chrX 2214304 5' + jockey 4618 1 57.24 CCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATGGTG:1 + chr3R 14608684 5' + jockey 59 1 52.05 CATCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 - chr3L 18074202 5' + 297 38 2 60.27 ATTTTAAAATGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - 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jockey 4952 1 56.35 ATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAAC:1 + chr2L 20132980 5' + 297 61 2 65.07 GCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAG:1 - chr2R 14532043 5' - invader4 3018 2 72.09 TACAATCTTTTGTAGACAGGAATGTGATCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGACTTTCCATATATTTATTA:1 - chr3R 7049503 5' - Burdock 6376 2 73.97 GAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCC:1 + chr2L 8284360 5' + Doc 429 1 58.16 CGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 - chr3L 18074196 5' + 297 44 2 56.16 TTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chrX 3666507 5' - roo 357 2 56.93 GATGTCATTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAA:1 + chr2R 19574398 5' + I-element 5129 1 60.27 ATCAGAAGTTCAACGATTGGATTAGCCAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr2L 10461104 5' - roo 9052 2 70.29 ATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 414958 5' + 412 40 2 57.14 TATATCAACATGTACGTGGACAACTTGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGTAACGACATTTCTAGTAATTGCGCGTTTCTGCTTGGCACGCGCCATGCAGGCGCCTTTTCTATTCTTTTGATGCGCGGCAGAGAACCGTTAG:1 - chr2L 21657040 5' + invader1 82 2 78.32 ATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAG:1 + chr2R 11246969 5' - 1360 129 1 50.00 TTTGCTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 + chr2R 8966159 5' + BS 5069 1 66.44 CGTCTGGCTACTTTTTCGGCAGCCAAAAGATTGAGGAAGAGTAATTTTTCGCCAGAGATGAGCGAAAACATCTGCGGATCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3L 17482053 5' - 297 6938 2 60.96 TTGAGAGGTGAATTAAATATATGCCTCATTTATTAGTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr2L 13229255 5' + roo 37 2 46.90 AGAAGGAATTGCATTCATGGAAGTCTTGAGAGGTGAATTAAATATATGCCTCATTTATTAGTTTAGGTAGTAAAACACGCCCTTAAAATATTTAAAGAGTTATATATCATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 - chr2L 13229280 5' + roo 8677 2 63.70 AGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3L 18216470 5' + 297 55 2 59.31 TCGTAGAGTANAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACATGCGTTTGCGACTATATAAAGTATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCAATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAG:1 + chrX 22651470 5' + INE-1 136 1 89.04 AAAAACGGAAGATCAAACACCGGATCCCAGGCGAGTCCTAGTGTTTTTGTAAAAGCGCCTCCATAGTCAAATTTCAAGAAGGATTCCCTTTCATCTCCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCCGGAGCCACCTCTA:1 + chr3L 23236277 5' - 1360 72 1 66.91 TTGCGACTTTTAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3R 17259511 5' - roo 9014 2 57.53 TGCGTGACTCAGGCGCAAAATGCATTTTCCAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCTAAACCAGCCAC:1 - chr2R 14415581 5' + 297 11 2 77.46 TGTCTTCTACACCTCAACCTTTTTCCCCTGGGAATCATTCCATTCCCATTCCCATTTCCAGTCCCATTCCCAGTGAATCTCTGTAAGTGACACGCGTGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTG:1 - chr3R 12341222 5' - Tirant 8479 2 67.12 ATTCAAATTTGATTTATGCAAATGGCACATGCAGCAGTAGCAACAGCAGCAGAAAGTGGCGCTCAGATCCCGGGAACCCATGTTTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTC:1 + chr3R 12044143 5' - Doc 53 1 62.33 CTAACGTACAAGCCCACAATTTTGCAAAATGTTTCTATCTTTTTACACCCGTTACTCGAAGATTAAACAGGTGGAGTAGATTCTGGTAGAAGGAGGAGTTTCCGATCGTACGCAGTATAGATATCAGGATCAATAGCCGAGTCGAT:1 + chr2R 5733409 5' + INE-1 95 1 69.86 TGAGTTGCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 + chr2L 7633338 5' + Max-element 8269 2 60.00 TAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 - chr2R 12133823 5' + jockey 68 1 69.60 CGTGGAGAATGGGCACAAGAAGTCGAATTAATTTGAAATGCTGTATAGTCTTAAAAATAAATTTCAAAAATGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGTCAATGATTG:1 - chr2L 23320517 5' + 1360 440 1 63.89 AAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGCGAGATGAGCAATC:1 + chr3L 22320128 5' + jockey 9 1 74.78 TTCAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTT:1 + chr3L 9635288 5' + Doc 22 1 50.00 CGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCATCCCCTAAACCCCCACGCCTCCAAAC:1 + chr3L 18183110 5' + Tirant 8127 2 54.55 AATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGG:1 - chr2R 17350631 5' + F-element 44 1 65.07 AATCATCTTTTTATTACTTTTGTAGTTTCAATTATATAAATATGCAATATACAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGT:1 + chr2L 21941133 5' - flea 4949 1 71.92 GTACAATACATGAGGTACTATTTTTGAGTAAAAGTGCTCAGAAAAGAAACCATAACCAAAACATAGGTTTAAGATGATGTTCAAAACTATTGTTTCTATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCT:1 - chr2L 6619045 5' - 17.6 474 2 72.60 AAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCT:1 - chr3L 27415330 5' + transib2 46 1 54.11 GGCCTTTATAAGTGCTCGCTGTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGACCCGTCGGCAAGAG:1 - chr3L 1463774 5' - P-element 2870 1 73.38 TGTGTACTACTTTATGTTTACTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCTGCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr3R 12078589 5' - hopper 1387 1 63.64 CAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2R 9453359 5' + roo 78 2 74.66 AAAAAAAACCCACTCAATTAATTCAAGAAAAATAATGTATGTATCTCCCAAATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGG:1 + chrY 253840 5' + accord2 175 2 72.50 AGATGCAAATTTTTTTGGCGGATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATTAATACCTCCTAAACTATTGG:1 + chr3R 25798345 5' + hopper 37 1 60.00 ACTGCGAAAAGCGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chrX 21045285 5' + P-element 47 1 43.55 ATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCACTCGAAGGTTCTTTTTTTCGGATACTTTTGTATCCTACCGACTGCGCCAGTAAAATTGTTGTTT:1 + chr2R 1355077 5' - 297 399 1 56.16 TGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTC:1 + chr3R 25580765 5' + 1360 62 1 61.11 ATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACT:1 - chr3R 15727968 5' - 1731 4604 2 63.70 TGGGGTTTGTCTGAAAGTTATCAGGTCGTGGCAGCATTTGTTAGCGGCATGTCCGCGATAAGAAGTGTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTT:1 - chr2R 13541620 5' - jockey 4945 1 54.11 ATCCGCATATTCTAGCTGACTACCACGAGTTGCGCTTCTGCTGTTCTTTTATAGACCGAGAGGACGCCCCGTTCGGGTACAAGGTGCAACTAATATCCCGTTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTGT:1 - chr3R 2533975 5' - gypsy8 4811 2 60.00 AATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3L 15148571 5' - roo 355 2 54.11 GGCCCACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr3R 28749101 5' - mdg1 7396 2 57.93 AGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAG:1 + chrX 21087582 5' + mdg3 5296 2 54.11 TGGTGTGTGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAA:1 - chr3R 12613868 5' - HMS-Beagle 195 2 55.40 TAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 - chr2R 17350610 5' + F-element 65 1 50.68 TAAACCTTGCAGAACTATATTTCCTTTTTGTCACGTTCAANAATCCTATGAAAACAAGTACATACGTTTGAATGAAAAAGGTAGCATAGCTAAATTCATAANTTTTACTTTTACCTTCACATTTTTGTTTTCTATATTTCATTCGC:1 + chr2L 2936445 5' - Penelope 614 1 67.12 ACTGTATTTTATTTATTATATTACTACCCGTTGCTCGAAGAGTAAAAGGGTATAATAGATTCGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTTCGACTATATAAGGCAAATATATTCTTGAACAGGAGATCAATAGCCGAATCGATCTA:1 + chr3L 23942445 5' + INE-1 98 1 66.44 CGGAAGTGTTGGTACCAAAAGAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 18832444 5' + roo 55 2 63.43 ATCCCACACACACACACACACACGCACATACATACTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGGTTGTGGTTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAATTAAAAACGCGCG:1 - chr3L 9494220 5' - Max-element 239 2 72.03 CAATCACATAATGGCCATAAGTGATGAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3R 24071988 5' + jockey 28 1 75.52 GATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 + chr3R 13868938 5' - HMS-Beagle 6959 2 77.93 TTTTAGACGCTGTCGTTGATGAGCTGCTGATGAGGCGTGCGCCCTGTCCAGTGAGAATATACATATACATATATCTATATATATATGTGTATATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGACTAAAGCC:1 + chr3R 27827148 5' + I-element 31 1 63.01 AGGTAGGAAGAATTCAATTTGTTTCTTAGTGTTGATATTACAACACAATGATTCAGTAGTAATCGTACTTAACGTCAAAAAAATAAATAATAAGCATCGATAACAATAATTTTATAAAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATT:1 + chr2R 5193369 5' + roo 5 2 78.08 CAATATGGAAATATTTTACACAATTTGAAAATTTAGCCAGTCACATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 11232462 5' + roo 16 2 71.23 ACTTTGTTGCAGCCGAACTGAATTTATGGCCACGGTATATAGCAGTCAGTATCGCAGTCACACGGAAAAAATAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTAC:1 - 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chr2R 10977185 5' - roo 324 2 70.55 GCATATAACTCCTTGAATTTATTTATTAAACATACATGTTATACCGCATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACA:1 - chrX 4789219 5' + Quasimodo 60 2 67.12 TCTGTGCATATCAACGAACGGGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAACGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chrY 311459 5' + 1360 5 2 57.53 AGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGA:1 + chr3R 30087706 5' - roo 9000 2 66.44 ATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 + chr3L 19951151 5' + Ivk 28 1 66.44 TGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCTGGTATGAACGTA:1 + chr3L 23797674 5' + Helena 1162 1 46.51 TTTCCGACTTGACCGCGCGTTCTCACTCCCAAACTTCCTTTTTCGACGCACTATCTCCTTCCACGCGCGATCTTGCTGTCTCACTGATTGCCTCGCATCCCTGCTTGCGCCGACCCTTTATAGGCCGCAGTGATTCCGT:1 + chrY 95063 5' - gypsy8 327 1 73.38 GGCCAAACAAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 8681393 5' + jockey 14 1 75.78 TAAGATTTTTCTTCGTTTTATTATTTGCCTTGCCAATTTTTTTTCATTTTTTTTTCATTGTATTCCCTAATATATTTGGATGTCCAAGAAAAATTATGAAATTTGCGCGTCCGCATTCACTCTAGCTGAGTTACGGGTATCT:1 - chr3L 24787906 5' + INE-1 542 1 51.41 GTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:2 + chr2R 7895521 5' - mdg1 7397 2 58.90 CCTACCCCCTTCATGCCAACGCCTCTGAGCTGCTGCAGCTGCAAATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3R 22320420 5' - roo 390 2 72.60 CCTTGATACTGTTGGCAATCTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 18149941 5' + hobo 33 1 61.64 GCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACC:1 - chr2L 15420124 5' + Burdock 6138 2 54.78 AAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chr3L 21534232 5' + 1360 55 1 56.16 TTAATGGGTCAGCAGTGTGTGCCTATACAGTTTGACAAAGACCACGAGCGAGTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAAT:1 - chr2R 16519823 5' + FB 71 1 66.44 TATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCG:1 - chr3L 2167710 5' + opus 7159 4 55.56 ACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGT:1 - chr2L 3662039 5' + blood 71 2 65.75 ACAAATTTATTCAACTGCGACCTGCAACCTGCCAACTGAAGGCGACCTGTGTGGCATGTGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2R 22957994 5' - hobo 2920 1 62.50 CGTGTTTATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCAC:1 + chr3L 17268224 5' - hobo 2895 1 54.11 CATACAAAAATGCATGGCTTACACTTAAGGTAATATGACCTTACAATTTGTGGGCGTTAGAGTGGGGGTGGCAATATCGGTCAATAAACTAGGATCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCAACGTTTTAGCTTTTATAGTTCCTGA:1 - chr4 965950 5' - INE-1 154 1 66.44 AAGGAACAACCAATGACGTTGGTGGTATAATTTCAACCACCAAAAGAAAGAACACGTGAAGACTAATAAGAATGGAGATAGATAGTGTGACCTGGAGCTTTTTTGGGGTTTTGTTTGGCGATGACGTCAGCAATCTCGCTGGG:1 - chr3L 23264103 5' - BS3 209 1 65.73 GTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr2R 24427530 5' + 1360 36 1 53.04 CCGAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCCGTGAGTCGGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 + chr2R 5953815 5' + roo 8720 2 64.00 TATCGCTTTTCAGAGACAAACAGTTCGTTGTTTTATTTCACTTAATCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTTTACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCC:1 + chr2R 15199062 5' + Burdock 3 2 75.71 GCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGGTTATGT:1 + chr3L 20680275 5' + 412 64 2 61.64 TATCAATCGATAAGAAAGTTAAAAAAATATTTTCTTTCGACATGAAAAAACCTGAGAATTGGTACTCTTTCAATGATGTTTGGCTATTTAATTTGTTTTGATTGGCTGCCGAACGTGACTTCTAAAAATAAAAACAACAAAAAAA:1 + chr3L 14549795 5' + gypsy11 3933 3 77.93 CAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAA:1 + chrX 8968616 5' - 1731 4555 1 65.52 CAATCTGGCTTGTTACTGTTGGCGGCTGACTAGGGATATCAGCTTGTAAAGCATTTTCATTTGAGTTAGCTTTTATGGCAAGGCCGCTCGTAGTATATATACGTAGTATATATTTTCGTGACCAGGATCAATAGCCG:1 + chr4 464099 5' + INE-1 88 1 68.61 AGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGGGGAATCCCCTGCCAACATCCATCTCTGCGACTTTTCTGGGGGAAATTGCTTTACACAATCGAAACGCACGAAATGACAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAATA:1 + chr3R 27376723 5' - I-element 5336 1 70.55 CATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATC:1 - chr2R 14532071 5' - invader4 3029 2 56.16 GGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATC:1 + chr3R 7049341 5' + Burdock 47 2 55.48 CCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chrX 19662945 5' - P-element 2853 1 55.81 AATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCT:1 - chr2R 19108562 5' + jockey 111 1 59.59 ATTATGAAAGATATTTAAAACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAA:1 + chr3L 27356064 5' - Tc3 1674 1 60.00 AAATTCCTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3L 23146464 5' + 1360 52 1 52.78 AACTGTATCGGGGGCGCTAATTTAATGATGCAATTTACATTGCCGCTAAACTGAATAGGTTTGACTATTTGTTTAGGTTTGAAACGTTATAACTTAGTCATATGCAATCCGATTTAAGCTAAACAAATTTTTATGTATGAATAGAT:1 + chr3L 27356082 5' - Tc3 1635 1 66.44 ATGTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 - chr2R 12133883 5' + jockey 28 1 69.86 GCCCACTCTTCCGGGCCATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAA:1 - chrX 15198116 5' - Max-element 8499 2 56.31 ATGTAGAAGCTTATGTTGTTATAAATGGAAAATATATATAAGCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3R 6685873 5' + 412 20 2 71.53 GTTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTG:1 - chrX 7702840 5' + P-element 49 1 50.68 GAAACTAAAAAAGTACCATATACTATATATACAATATTCCCCTAAACAATCTACGTTCGTTATTATTCATTATTTGATAATATTTTTTATTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTA:1 - chr2R 13090981 5' - I-element 5316 1 53.10 GCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr3L 7751109 5' - 412 7474 2 69.29 ATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAAT:1 + chr3L 19951157 5' + Ivk 28 1 65.00 ACCAAAGGTATCAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAGGT:1 + chrX 23102383 5' - Transpac 5156 2 67.81 ATTTTGTTCGCCTTATGTCAGCCTTATGCAATGCGACTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCCCTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chrX 6891436 5' - hobo 2911 1 60.16 CTAGTCTTGTAAATTTCTATAAATATGCCAAAAACCTTTTTGCCACGCTCACTCTAACGCCCTAAAGCCGCCCACATTCCCCAATATCTATCGAAATCCTAGAAAATTTATGATATTTCTCGTTTTCATTCACACTAGCTGAGTAA:1 - chr2L 23066894 5' + INE-1 533 1 39.73 AAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 - chr2R 14884174 5' + roo 8694 2 58.10 TGTTTACCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTCGCTTGGAT:1 - chrX 22835243 5' - mdg3 186 2 63.93 AGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCA:1 - chr2R 6271513 5' - blood 159 2 69.18 ATTATGTATATCCTGAAAAATTCAGCTTGCCTTCTGGTCCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATCAACAC:1 + chr2L 11867271 5' - hobo 2911 1 58.33 TTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTT:1 - chr2L 16884900 5' - pogo 2063 1 56.41 GATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr3L 7024412 5' + 412 28 2 65.07 CCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAATTTTGGGCTCTGTTCATATCTT:1 + chr3L 11535870 5' + roo 8704 2 56.55 ATGAGTACATTTCGTAATGCGTTTTTTTTTTTATACACTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTTTATTTTGGATTTTGT:1 - chrX 3666586 5' + roo 83 2 74.66 AAATGTGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATT:1 - chr3R 20200480 5' + Transpac 4989 2 66.44 ACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAA:1 - chr2R 8286769 5' + Burdock 80 2 73.97 CGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAACCATTTGCGCAGATCG:1 - chrX 14360830 5' + jockey 86 1 67.81 ATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr3R 18832314 5' - roo 9046 1 63.70 TTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGAC:1 - chrX 3533990 5' - 17.6 441 2 56.16 TTTATAGCTAGTAATGCTTTTTATGTATACTGCCTACTTANATCTTGAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACNTGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCAGGTTGGCAGCGCTG:1 + chr2L 10536442 5' + flea 4786 2 59.59 AAGTAGTGATAAGAATATCATTGTCAAATTTTTTTTTTAGCTTGGACGAAAAGTATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 - chr2L 11475242 5' + jockey 23 1 63.70 GTAATGAGCGTTTTCTACATATTTGCCGGCCGTGGTTGAAGTTTCGATTCGATTCCATTACATTCCGCCTCCGAGGGTCGTCGATTAACCCAATTTAAGGTGTTTTTTTTATTCCTTTTTTTTTT:1 - chrX 10397423 5' - Doc2-element 252 4 64.00 GGTTGGGGCTTTGCTTATGAGGACAGTAAAGGATTCGGGCCTGCTGCATCACAAAACAAAATTTTAACTTAAGCTTGTAAATAAAAGTGGAAGCGTCGGGCGGCAAGAAGCCCGAAGGACACGGAAGGA:1 - chr2L 22644365 5' + gypsy8 496 1 69.77 ATTACTTTTTCGCCGCGCCAAGGGACAGGACGCCGAAACACCCAAGAAGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGACA:1 - chr3R 28438403 5' + mdg1 69 2 65.00 CATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTANGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTCTNTTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr2R 21796024 5' - roo 353 2 61.07 AATCAAGTTAAATCCTGGTGCTGAGGTGGGTAATGAAAAGTAGTATAAATAGTTGAGCAGTTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTA:1 - chr2L 10909677 5' - 412 494 1 57.53 TAGTAATTAGACTTGCAATCGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACAT:1 - chr3L 3661142 5' + X-element 90 1 66.44 ACCAGTGTTTCTCATGTTATAAATAATTTATTCAACGCCGGCCACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3R 24666324 5' - hobo 2924 1 70.31 TTTAATTGCAGCTTCATCCGGCTGAAGAAGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTGAAC:1 + chr2L 4864402 5' + mdg3 88 2 76.76 GTCCGTTGTGCGGAACCAAATGTATTCACATATACTATATATCTTGTCACAATTGTAGTATAACTATGAGTTGCATGACCCTTACAGAGATTTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCT:1 + chr2R 23563998 5' + Cr1a 4227 1 66.67 AAATAATAATGAGGGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTT:1 + chr3R 11756725 5' - Tirant 8455 2 51.37 GTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 + chr3L 23146505 5' + 1360 73 1 78.23 ATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr2R 17350590 5' + F-element 79 1 62.86 ACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATAC:1 - chrX 21668368 5' - opus 7469 2 45.19 GCAGTGGCTAAGATAAGCGCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 13259790 5' + hobo 25 1 66.20 AAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACAT:1 + chrX 3533840 5' + 17.6 6950 1 70.55 TGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 21796096 5' + roo 75 2 72.14 CTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACT:1 + chrX 8968611 5' - 1731 260 2 58.65 TCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAG:1 - chr3R 934258 5' - Rt1b 4723 1 43.08 CAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTATGTTCTGTGCATGCAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGTTACTATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGC:1 - chr2R 6271514 5' - blood 160 2 69.86 TTTGCAAACACTCGGGAGAGCACGTTTGTTAGGACCGCTCCTGAAGTGATCAAGCTCGTACTGTCGTTCGTCGTGCTCAATAGCTGATTAACTTACTGGCCTCTGATAAGTACTTTTATTTAATTGCCTTTT:1 + chr3L 25254448 5' - GATE 452 1 79.55 TTAGGCGTTCTGGCTTCCCCGGGTTGAAAATATTCAACTGTTGTCCTCCTTTCAATTGACCAATATCTCTAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAG:1 - chr2L 21683538 5' + pogo 12 1 76.03 TTAATATTAATTAATATAATATTATTAATTTCAATTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAAAG:1 - chr3R 29397543 5' + Doc 89 1 88.28 GGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 + chr2L 1044984 5' + mdg3 45 2 62.73 ACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAACGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 + chr2R 12492406 5' - hopper2 1552 1 54.11 GTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 14422798 5' - roo 323 2 81.88 ATCTCATCCATAATCCTGTGCCACTTACAGCCGGGCCACGTGCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCG:1 - chrX 20330641 5' + P-element 17 1 67.72 TAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chrX 8469278 5' + hobo 25 1 53.93 AATAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATA:1 + chr2L 20628536 5' + Stalker2 37 2 42.25 AGAGATAATGCTATAGTCGAGTTTCCCGACTATCGGATACCCGTTACTCAGCTAATGTAAATGCGAACGCTAAATTTCATAATTTTTCTAGGATATCGTTAGATATTGGGGTGACCAATAGAATCTGTATGCTAAATCTCAACCTT:1 + chr3R 4562143 5' - INE-1 174 1 78.77 CTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTAC:1 - chrX 23182916 5' + Idefix 68 2 67.12 TTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCCATGAACTCCTTACACGTAAGATAGTAC:1 - chr2R 25051877 5' + G5A 2707 1 74.66 ATTATAATTTAGTTTGAATGATAAGAAATATTTTAACGCAGTATGTAAATGTGTGTTTAAAAATCTTTTTAGATGTAAACGTGCTATTGTCCAGACTAATTTTATGACCCAATTCGATATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATTC:1 - chrX 21088583 5' - INE-1 580 1 37.67 AATTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACTGTCTTCG:1 + chr3L 6557089 5' + Doc 4 1 77.69 CACAAGCTGATAAATCAGTTTTATGGCACTTTTGCCAAACTTGCATATAGAGTATCTTAAAAATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATG:1 + chr2L 8536524 5' - Juan 4171 1 54.81 ACTTACATATATGTTCATTATATATTCAACACTCCTTCTCAACGTTGTATGTTTACATATTCACTCAAAACATTCCCATTAGCTTAATACATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 6359451 5' - opus 468 2 63.01 TCATCATACTGCGATCTTATCTGGGATGCATCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2R 8436358 5' - 1360 3363 1 68.49 CATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATT:1 + chr2R 12492407 5' - hopper2 1551 1 54.79 GCAGCAGCAGACACAACCATGTCGGCATTCAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTCCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGCG:1 + chr2R 12826994 5' - Burdock 170 2 76.71 TTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGGGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGGACTTACAAACACAC:1 - chrX 14978622 5' + hobo 83 1 69.18 CTTAGAAAATGTACCCTGTGGACTTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTG:1 + chrX 8968551 5' - 1731 4620 2 71.72 AGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGTAAATGAAACGAGAGCGATAAAT:1 - chr3L 5027243 5' + roo 66 2 74.58 AAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr3R 26472889 5' + 1360 68 1 65.97 GATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chr3R 10714247 5' + 297 6632 2 61.94 ATATAATAAAATATATATAATTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 + chr3R 21594474 5' + Max-element 10 2 67.31 AGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGA:1 - chr3L 27415307 5' + transib2 66 1 63.64 AGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACTCACATTCAC:1 + chr3L 6015076 5' + accord 7033 2 72.50 TTCCAATGTCATAAACGCTGATGGCAAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCAGTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTACGTTCATAT:1 - chr3R 26927480 5' + roo 8701 2 51.64 ACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 - chrX 21668404 5' - opus 491 2 51.37 TAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGT:1 + chr3R 13423289 5' - 297 318 2 77.40 AATTGACGAACTTTTTGTTGGCTTAAAAGCACGTGATGTTATCAATTACTTTCGTATTCATTCGTTCTGTCTCAATGAAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2R 17650673 5' + pogo 38 1 60.96 CCAACAAATTCATAAACAACGCTGAAATCAAGTTTCGAGAGGCTCGAGGGGACCGCAGTCCCAGTTGATGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGT:1 + chrX 8839274 5' - Tabor 480 2 72.00 CGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGC:1 - chr4 490328 5' - pogo 2055 1 54.62 AAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chrX 17792541 5' - roo 8988 2 78.08 TGCAACTTCATTAAATTTTACTTTTATGAGCGCAAACAAATCGTTAAAAACAACTCAAAAGCTTTTACACAATGGAGGCCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTT:1 + chr3R 22649076 5' - transib2 2653 1 52.05 TGCATTTTTAAGTTTCTCTGTTGCGATTGAACTTGATTTGAAAAACGATACGATTCTCTTACCCTTTCCTAGTAAGGGCACTATAGAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 6493402 5' - copia 255 1 60.96 TTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGCTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAAC:1 + chr2R 7720071 5' + HMS-Beagle 6846 2 57.46 AATACTAACATCTCCTAGATTTCAAACATTACATGGCGACCGTGACAGTGTTCCCGTGTGCATGAAGTTAACGATTACATATGTATATGTCGGCTCGAACAGCCTCTGCAGCTGAGTGAGGTCCGATCGAGTG:1 - chr3R 1330080 5' + invader4 123 2 69.92 GTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTGAAGCTAAGTCAGCATC:1 - chr3L 10033654 5' + blood 7124 2 37.98 GCTAAGGAGGTAGTTGCGGTCCTCGCGACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 17627603 5' + roo 8704 2 54.10 CAAAATGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATNGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTANGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACA:1 + chr3L 2317114 5' - 412 449 2 48.63 CAATTCCCTTGACTTACAACTCAGTTGATAATAACTTGGGGCCCCCACATCAACAGAAAGCGTATACAGGCCAACATACGCCTTAAGCAACTCTACTGGCTCATCGGTAAAAAGTCCAAACTGCGAGAGAAACTAAAGATTCTCGT:1 + chr2L 23483989 5' + G2 2614 1 77.40 AAGTGCAGTAAATACTCTATTGTTGTGCATATAGTGCAAAGAAGTATTACTTGGCTTTTAAACAATAAGCACAAGTGCCTGTGAATAAAAAATAGTCATAACATAAATGACTTTGTTAACCCAAATAAGTAATTAATTAATTTTC:1 - chr3R 27534073 5' + looper1 347 1 73.10 CCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACC:1 - chr3R 30955421 5' + G-element 25 1 56.56 AAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACC:1 - chr3L 4547757 5' + mdg3 78 2 70.63 AGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGGATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2R 9750250 5' + opus 7022 2 59.62 CTTTCACAAAAGCGTCTAAACTAATCAACAGGAGCAGCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTAATAT:1 - chrX 3921741 5' - 3S18 293 2 54.79 GTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCC:1 - chrX 2214290 5' + jockey 4625 1 65.22 TAATAATGTACTCTGTGGTCAGGTTTTAGCAATGACTTTTGTTTTATTTTTCGGAATCATCATCATAATTTTTCTGGGATATGAATAGATATTAGGGAATAAAATGAGACAATATTTAACAATAGAGAATGCTATAGTCGATTTCC:1 - chr2R 4886042 5' - INE-1 573 1 50.00 AAAATATTTGCCTTCATCACTCACTTCAATCATGTGTCCTAAATCCATGTATTCATTCATGAATTTAGTGTAGTCAACCTTAAGTTTTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3R 19445181 5' + roo 89 2 65.07 TTTAATAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTG:1 - chr2R 8286821 5' + Burdock 6164 2 61.64 AGGGCACCGGAAACTCGTCCTACAAATAGGAATATAAAAGAAATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTA:1 + chr2R 16275918 5' + roo 460 1 69.06 AAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGC:1 + chr3L 7751050 5' + 412 80 2 75.00 TGGGCAAACGCATCGTGGAAATGGAACTGGAATTGGGTACCGCTCGTCTGATTCGCAATTTCAACGTGGAGTTCAACCATTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAC:1 + chr3R 19134369 5' - transib2 2781 1 58.22 CGCGTGTTACCCAGGTCGTTCGCATTTATGTATGTAGAACTCTGACAATTTCGTCTTTAGTTTTTCGTGCATTGTTTTGAGTATGTATGTCATTAATTTAAAACAAGAGAGAACGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCA:1 - chrX 22849131 5' - INE-1 563 1 57.14 TATGTGAAAGTGTAGATGTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 512380 5' - roo 9053 2 69.18 TCGTCTGATTGTGTCTGTGTGAGTGTGTGACTGACCTATCTCAATGCAATTTTGCTTGCCCGCTGCACCACAAACACACACGCACGCACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAG:1 + chr3L 17500690 5' - Tirant 8489 2 71.21 AGCCACAAATACTAATACCAAATAATACGAATTAAGTGAATCGAAAAGCCAGTACCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 + chr3L 9397618 5' - 1360 3327 1 60.96 ACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3L 8249492 5' - mdg1 384 2 56.12 CATTAGATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGT:1 + chr3R 17924455 5' + Burdock 77 2 80.29 CAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 15085614 5' + opus 7165 4 55.56 TAATTTGCCGAAGAATTCATGCGGAAAATTCGCCAGAATCTATGTGACAACATTGTACTGTGATATATTTACTCGACTTCTATTCCATGTTCACTTGAATTTATTTGGGGCTATACTTTAAAATTTAACATTATATTTATTTCCT:1 + chr3L 4561163 5' + Cr1a 4326 1 60.69 TTGTATGGCAGCACAATTTGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGGCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCCATTTTTTACCACTCGCCTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 21925066 5' + hobo 32 1 62.33 CATTTATCGTGTCAAGTGGGTTGTCGCATATTGTTTGTTTAGTGGCGCACCTGAAGTCGGCCGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAG:1 + chrX 15197984 5' + Max-element 8245 2 77.93 ATTCCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 + chr3L 11535867 5' + roo 35 2 59.44 TTAAAACCAATCAAGCCATAAATAGCACCAATTAATGGGTAAGCCTGGCATCGGCAACTACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGT:1 - chr3L 17135477 5' - hopper2 1548 1 58.90 ACCAGCGACGAAAAACCTTCGAACCGCTCGCCTCGAGCTGCAGCAGTCGAGTGACTGCAGTGCGCACACCCCACCCACCCACACAAGACAAGATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3L 1463603 5' + P-element 25 1 68.49 CTTGGCTTCATAAAAATAGTTGTAAATTCCCAAGCAGTCTGCATAAATTTCGGAAGAATTGGGCGCTGGTACAATAACAATAATACGAGAGCAGAAAACCACGAGAAAAGCATAAAAAGCATACAAAAACAACAAAAAAAAAAA:1 - chrX 3230432 5' + G2 3076 2 72.22 TTACATTCGGCGAGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTG:1 - chrX 2300644 5' - P-element 2804 1 25.34 TAGAAGCTTTTGCATAAATTGTTTTAATTACTTTTCCTGGAGGAAGTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTC:1 - chr2R 8966222 5' - BS 5015 1 66.44 CACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3R 30087726 5' - roo 8980 2 80.14 AATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGTAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAAT:1 + chr2R 14884099 5' - roo 8996 2 66.90 GCAAATCAATTGATTGCTGCAGTTGTTAGCTTTTAATTATTGGGCTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTT:1 - chr3L 11904898 5' + copia 30 2 63.19 TTATCAAGATTTTCAAATATTTTAATTATTACAATAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGATTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 9453298 5' - roo 8990 2 75.00 GTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAA:1 + chr3L 18216464 5' + 297 6631 2 55.48 ATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCNTAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATNGCGTCAATACATTGTGACACT:1 + chr3R 12948609 5' + Stalker 6906 4 58.21 GTAACTCAATTTGGAAGCTGAAAATTCGTGGCACATGTGCGACAGCTCAGGAAACAAGCTAATTTCAGAATCAGACTCTGAATCCTGCACACACACACACACACACACACACACACACACATTT:1 - chrX 20916028 5' + accord 185 2 78.23 AACAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGC:1 + chr2L 8284313 5' + Doc 385 1 75.00 GTACTGAATGGAGCAGCGCCACTCCGAGATTCAATGGGCCAAGTGGAGAGCGAGAGTGAGCTTTTTTGAGAGCCAGAGAAACAATTGCCACTAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr2R 13897697 5' - blood 7180 2 78.38 AAGTTTCGCCCCACGTGCATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGCACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3R 12764823 5' + copia 4902 2 58.82 ATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr3R 26472789 5' - 1360 3342 1 56.34 TAACTCTGGCGAAATAGGTGAGACGAGAAGTTTTTGTGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGTCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCA:1 - chrX 8839432 5' + Tabor 15 2 73.97 TGATTTGATTTTAAATAAATAATGCAAGCCATAATGATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTT:1 - chr2L 10536608 5' - flea 228 2 60.00 TTGACTTATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 10897545 5' - roo 9016 2 56.16 GTCAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTG:1 - chr3L 25206939 5' - HMS-Beagle 235 2 73.98 CTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGG:1 - chr2R 8315589 5' + hobo 42 1 56.92 AAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCCATGAACTCCTTACACGTAAGAT:1 - chr2R 25051882 5' + G5A 2702 1 74.66 GAGTTTGATATAAAATGTAAATGTATGCATTTTATATCTTATTCCACCAAATTATTTAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTAT:1 + chrX 8346302 5' - roo 9034 1 58.22 CGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCA:1 - chr2R 10582498 5' + Juan 3837 1 57.53 GTAGTCGCGATTTCTTGAGTTCCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2R 16274648 5' + roo 8708 2 54.07 ATTTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 - 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chr2R 8315593 5' + hobo 23 1 66.09 CACGCTTTCCATCCACTTTTCCGGACGTCATCCTGTCGCAGTTCATCAATTTATTTAGCATTTTTATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 29627810 5' - roo 396 1 72.39 TATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3R 17243221 5' - hopper 1362 1 53.79 CACGATATAGAGATATATATATTTGATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 - chr2R 5954017 5' - flea 4952 1 65.75 AGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCA:1 + chr2R 1105744 5' + HMS-Beagle 42 2 61.06 TTTTATGAAGCTACAACATAGAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGACAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAG:1 - chr3R 26472945 5' + 1360 14 1 71.92 AGTAAAAGTGCTCAGAAAAGAAACCATAACCAAAACATAGGTTTAAGATGATGTTCAAAACTATTGTTTCTATATATATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAA:1 - chr2L 6619019 5' - 17.6 7375 2 54.79 GACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTTGCGATTTTGTACGTCAGCG:1 - chr2R 14532050 5' - invader4 3044 2 59.09 TTTTTGAGGGGGACAAAACAACACATAAAATCGGCAGATTGCGGTTAATGGTCGTTTAAGATCGCGTGAAAAGGGCCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 - chr3R 8050660 5' + jockey 4807 1 51.72 TTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr4 373063 5' + pogo 53 1 56.94 CAATTCTTACTGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAG:1 - chr3R 10144488 5' + Chimpo 39 1 58.62 TAATGAGGGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTAGGAAGGTTTTTAAGTTTCAGC:1 + chr3R 11756731 5' - Tirant 343 2 53.79 CAGTGAGAAATATTCAAAAGTGAGGAAACCAATAGTCATATACCAAAGGTATCAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGCTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAA:1 + chrX 23102342 5' - Transpac 5197 2 63.70 TTTGATTTTTAATAATTAATCGTTTCAAGCAGCAAGAAATTTGATTTGTTGGAATTTTTTGAAAATGTTTTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTA:1 - chr2L 13827907 5' - pogo 2050 1 55.56 CTCGTCTAAAGCAGGAAGCTAAGCGCGCCTGTGGGGGAATCCTATGTAAACAGACGATGATTTCGCTGATCTTGATCGTGAAGAGAAAAAGCTTTCCGTTTCTGTTGGATTCAAGTGCATCTGCTCTTAG:1 + chr3R 4165033 5' - Idefix 338 2 53.08 CTTGCACTTTAGAAGACTCCGTCAATGAGTTCAATTTTGATTTCGGCAACCCCATTGGCCTGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGATCTATCGATATCCCAGCAAAATATTGAAATTACGCGTTCACATTTACACTAGCTGAGT:1 - chr4 519325 5' + INE-1 531 1 58.22 ATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 6131909 5' + roo 8745 2 75.86 ATTTCACTTAATCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:2 + chr2R 15199096 5' + Burdock 6179 2 53.42 TACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 26927395 5' - roo 346 2 69.23 TTAATTTTATTTAATAAAATTAAACGCGCTTCGTCGGCAAAAAACTCTCACGCGCAAATTTAATTAAATTCGCCTTTCAAGTTGAACAATTAAAAGTTAAAATTGTATTCCGGCC:1 + chr3L 22293796 5' + TAHRE 166 1 77.39 GGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAAC:1 - chrX 8839389 5' + Tabor 58 2 54.79 CATGGATAATTCAATTCTTACTGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGC:1 - chr3R 10144499 5' + Chimpo 9 1 76.19 GAAAGGTGTGTGAAAACTTTTAATCGAATCTTAATTGCATTAGGTCTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 8472134 5' - roo 352 2 66.67 ATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 + chrX 666280 5' + 412 7121 2 66.21 CGCACACAGTCACACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTG:1 - chr2L 22640250 5' - invader4 293 2 54.48 AGCAAATTGAGTGAGGGTTTACTTACGCTCTCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACTTGAACTGTCTGTATGTATATATATTAGTA:1 + chr2L 6637408 5' + 1731 4414 1 73.23 TTGATGTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2R 23095015 5' + 412 15 2 73.29 CGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATC:1 - chrX 21668407 5' - opus 7497 2 53.42 AAAAAAAAAGATTGTATCAAAATAATGATTGGGCCAAAGATTAATATTCTCTCACGAAATTAACAATTAAATGAAATATATATATGAAAATTTTGTAATTAGTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 - chr3L 7787614 5' - flea 4994 2 64.38 ATAAAAAAACGCATATTAAATTGCCTATTAAAACTGCGTCCATCCCACTAATATATGTATATATTTGGTAGTCCATCCCTTATTAGCAATAATAGGTGCGCAACGCTTTGGCATGGAGTCAACCAGGTCCTGGC:1 + chr2R 8106989 5' - Tc1 1278 1 61.94 CCTGGTAAAATCCGTCATTTCCATCATAATCATGCACATATGTTTGGCCAGAAAAAGGGTTGGCCGGCGATTAACGCGCGCGGCTTTTACTAACCAAGTGTCAGGCGGAGCCGTGACAATA:1 + chr3L 23325641 5' - gypsy2 6766 2 61.98 ATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTG:1 + chr3L 17181445 5' + jockey 77 1 63.01 CTTTTTTTAAAAGTATTATTATTAAATTGAAAACTAGGGAACCAATACATACATTTGTGCTCTGTAAAAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGGAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 - chrX 18019244 5' - roo 398 1 70.55 TTTGCGGGCACCCATTGGCCATAATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 - chr3L 17268354 5' + hobo 46 1 52.74 AAAAACAAATTTAAACACTCAAAATCTTGTTGAATACAATATATTTTTTTATTAGCTTTACAATTTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACA:1 - chr2R 13256105 5' + 17.6 6949 1 66.44 GCAAGGCCCAAAAAGTATGCTACAAATTGCAATTTCCGCTGGTTAATTGCAGCATCAATATCTACTCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATA:1 - chr2R 22796859 5' + jockey 4836 1 54.79 AGGCAAGTAGTGATAAGAATATCATTGTCAAATTTTTTTTTTAGCTTGGACGAAAAGTATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 - chr2L 11475246 5' + jockey 15 1 68.31 TATATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 + chr3R 26927366 5' - roo 9026 1 53.15 AATGATGGCCTTCCCATACCTTATAATCGCTATGGTCTCAGACAAATGGAAGTCCCCATCCACAATGGCGGGCACCTTCTGGAATCGATTGATCTTCCCTCAAGCTCTTATTTTCATTAAACAATGAACAGGACCTAACGCAC:1 - chr2R 9607636 5' - P-element 492 1 66.43 TATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAA:2 - chr2R 17350591 5' + F-element 84 1 63.70 CATTTATATTTTATTGTGTCGTCAACATAAAGCGGCGTTATGTATTTGAGTTCTAGCATTGTAAACACCATTGACTACGTCTCATCCCACTGCTACCTCGGAGTTCACCTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTA:1 - chr3R 2449043 5' - Tabor 7313 2 75.69 TTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 - chr2L 388591 5' - roo 8999 2 75.19 TGTGTTCCCGCAGCGTCCGTCCGATCACTATAATGTCGTCCTGATATGCGAACGCGTGAGTTACAATCCCGTGGCCGAGGGAGGAAAGCTTCCAAAAAAACG:1 - chr3L 25232856 5' + accord2 7459 2 52.94 TTATATTATATTATTATTACCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAATTGTGAT:1 + chr2L 11143116 5' + Juan 86 1 80.82 AGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAACCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 - chr3R 6419914 5' + Tabor 6921 2 73.91 AACAATTATAGAGAATACTGAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGNCT:1 - chr2R 9453408 5' + roo 8677 2 73.08 GTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAA:1 + chr3R 20887408 5' + Doc 74 1 66.67 ATCCATAATCCTGTGCCACTTACAGCCGGGCCACGTGCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 - chrX 20330636 5' + P-element 15 1 68.33 GGGGAGGGGGTGGAATGTAAAAGCTTCGTGTGGCCATCGTCGCTCGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATCCACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr3L 10740049 5' + P-element 59 1 37.98 TAAAAGTATAAAGCTTCTCGAAATAAAAAACTTTGAGGAACGTGGCGAAAATATTTTTGACATACGGCACTATTGTTCGACTTTTTTGCTAGGAAGTTTATCCAGACATATCCAAACATATTAGTACCAAAGACATTAGAATAATA:1 + chr2L 21745260 5' + Tc3 240 1 71.92 CATAAGTGATGAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGGGGACGTGTTCACAGAAG:1 + chr3R 24072003 5' + jockey 30 1 71.54 TTGTATTTTCTAGCTAGCAGACAGCAAGGCGTCGAAATGGGAATTGGGATTGGAACATTCTCATAGCTAACATATTATTTATGATACTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - 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chr3R 13423422 5' + 297 15 2 73.29 ATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 - chr3R 17243212 5' - hopper 1353 1 60.00 TTATATATAAATGCGGATGCACTGCAAAAAAATTATCAACNAGAAGTTTGAAATATATGTAATACATTACATTTAAGTCTATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCANACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2R 21958382 5' + 297 34 2 53.10 TATTAATGGTTGAAAACTAGTAAAATTATGCTTTCAACATGGTCAATCCTTATAAATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATGTTTATTATTAATTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTG:1 + chr2L 19800871 5' - flea 4946 1 61.64 AAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCACCTTG:1 - chrX 21668353 5' - opus 7460 2 54.26 AAGGGTTAAGCGGAAAGAGAGAGGTGAATTTTGGCAAATGATTTGGATTTGGCAGGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTA:1 + chrX 9121266 5' + P-element 32 1 54.78 TCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3L 23456282 5' - 1360 3340 1 54.79 CACGAAGACGTTCGTGTTGCAGACGGATGCAATCCTTACACAGCAGTCTGATCAATACGAGCGGCTGATCTCCTACTCAAGTAGATCGCTGAACGCAGCGGAGAGGAACTACTCTGC:1 - chr3L 23678157 5' + Osvaldo 32 1 72.65 CATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 - chr3L 11684916 5' - Bari1 1643 1 60.42 ACATATGTAAATATAAATTGATTTGAGTAAACATATATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAA:1 + chr3R 15283660 5' + BS 5082 1 74.66 AATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCAC:1 + chr2L 15019904 5' - BS 5013 1 77.78 AAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 20061429 5' + roo 55 2 61.94 ATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTTAT:1 - chrX 9951318 5' + jockey 95 1 74.66 GTACTGGATGTATAGCTAAATTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACCA:1 + chr2R 14884065 5' - roo 9041 1 59.70 TGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAA:1 + chr3L 9324440 5' + HMS-Beagle2 6927 2 52.14 ATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:2 + chr3L 14422690 5' + roo 40 2 46.58 TGGTGGGAACGAAACTCGTTCCATGTGGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTGTGCTTGCAATAAGTGCGAGTG:1 + chr2R 6236083 5' - P-element 2833 1 31.19 ACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTTATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 9871055 5' + roo 8739 2 70.83 GCTAGCAACTTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCG:1 - chr3L 12227922 5' - opus 7480 2 71.23 AATATCGACTTCTGTTTTTAAGAGTTCTCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 13255006 5' + roo 51 2 54.79 AGCCTTTTCTCTTTCTCTATAAAAACCTTAATGTTATATTCGTTCAGTGGTTTGATTTTAGATAAATATAGAAACAGTAAATTTTGCCTGCTGTTATAAAAATTGCTGCCAGGTTATATAACCTGAGCAG:1 + chr3R 1849009 5' + Cr1a 476 1 64.62 TGGTGGGCTTACCACCTCATTAGGGCCCTGGTGCCACAACCATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATT:1 + chrX 14735731 5' + diver 5921 2 50.00 GTAAAATAGTTGGCTTAAAGAAGTTTCACTGTAGTTATCAGCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAA:1 + chr2R 12706173 5' + FB 70 1 71.43 TCTCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2R 17269106 5' - roo 345 2 60.96 ACCACTTTTGGCACAATTTAATTAGACAAAACGTGATCCGTTGTAAAGGAATTTATTATACCCATTACTCTTAGAGTAAAAAGGGTATACTAGATTCGCTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCG:1 + chr2R 18487151 5' + INE-1 30 1 55.81 CCACACCAATCCAACCTCAGAGTAAGCAAAAAGAAGTATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACC:1 + chr3L 22702782 5' - R1A1-element 5281 1 69.03 GACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 - chr3L 22021741 5' - mdg1 354 2 66.21 CCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr2L 15085644 5' + opus 40 4 67.62 TAATTTATATAAGGACGAACAAGGTTATTAGTGAGTTTAATAAAAGCTCTCTCCAATTTAGTTCAATATTTTTCAACGATTAAATGTGCATTCCTTCATTATATTCGATCTCGATCTCGATCTCAGGAATTATAAAAGCTAGAAG:1 - chrX 14767107 5' + INE-1 155 1 50.34 CGTTTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr3R 30087819 5' + roo 38 2 61.64 CACACAGTCACACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCG:1 - chr2L 22640248 5' - invader4 291 2 53.10 ATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAATGAGTAAACG:1 - chr2L 6637447 5' - 1731 4537 1 80.82 CGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 9298584 5' - hopper2 1566 2 55.48 ATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGACAGG:1 + chr3R 29680232 5' + 412 92 2 84.93 TGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 - chr3R 16630342 5' + FB 67 1 69.17 GATTCCTTTCATTTCCTTCTCTCGCTTAAATATAATTTTGGAATTTCGTCGCATTCATATGGCATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTT:1 + chr2R 19230499 5' - I-element 5296 1 55.86 TATAAAATGGATATAAAAATACATCTTATATGTCTTATATTTCTTATATGTCAAATAAATAATAATTTTAGTAAATTATTTTTTGTTACACAAAGCACCTGTATTATTACCTCTTTTTTATTGGTTGGTTATTTTTTGATGTGACC:1 + chrX 18207632 5' - transib4 2530 1 56.16 TTGAGGGAGAGGAGTTATGAACCATCTCCATGTACCTTCCCCCTACCCACTACCAACCACGACCTACTCACAGCAAAAAAACGTACAAGAAGGAAAGAAGGAATAAAAAGAGTGGTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAA:1 + chr2L 22839554 5' - copia 78 2 62.33 TGATGCGTTTCAAAAGCTCAAGTGTATGTAAGGCTGTTTTTGACGGAACCTTATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTCATACA:1 + chr3R 30568983 5' + mdg3 5320 2 61.97 CCCATTTTGCGGTTGTCGCCGGCGACGATGATGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 + chr3R 11284883 5' - blood 345 2 58.91 ATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 19965234 5' + jockey 86 1 67.81 CTGGCAACACTTTATGTTTAGTAATTGAATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAA:1 + chr3R 12948569 5' + Stalker 6856 4 76.61 CCACTGACTTGCGCACCTTAAGTTTTAGCCTCCCCGCCTACCACACCCCGCAACTGCTAAAACTCCTCATCCGAAACATCCTCCACACATTATTATTGGATATATACGATAATCTCTTAATTACTTAACATTTCTCTTTATATCT:1 + chr2R 17365612 5' - invader5 3545 1 76.55 CATGGCATTGTCCTGCCTTTGAAACAATCAGAGTCGACGGCTTTTAATAACATTTTTCGCTGCGTTCCTACGCCCCATAGACAAAGGCCATGTGCAGCTGAAAACAATACAAAACAACAGAGAATGCTAAAGTCGAGTTCCCCGAC:1 - chr3R 24505364 5' - INE-1 568 1 50.68 ATTAACGGCACGTAGTCGTTCTGCTCTCGGTTGCCCATTCCCGAAAAACAAAAGTATCGATTTCAATAAACAAATTATAAGAATATAAGAGCACTTGTATCCAAGAGCAAATGCACTTGAATCGAAGAGAAACGCAAAGCTTTTT:1 + chr2L 6531083 5' + Idefix 361 2 73.79 CGGTTGTTGGCCAAAAAACCGCCCGAATCCCTTAACCCCTTCAAGTCTGTGGACAGCCTTCGTCTTAGAAGGGGAGGAGTTAACACAATCACAAAACACCCG:1 - chr2R 12816901 5' + Burdock 6140 2 58.82 AAATAGTAATTATTTCGAAATAGTGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTGAGGA:1 - chrX 22577209 5' - 297 6939 2 37.67 CGTGGGAAATGATTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGAC:1 - chrX 3534012 5' - 17.6 7390 2 64.38 ATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCAAATCTATGTACA:1 - chr3L 25508748 5' + 1360 340 1 60.96 GTGAAAAGGGTCACCTATACTGCAGTTTTATGTGGCATACTTTCGGGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTTTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 + chr3R 21735414 5' - hopper 1410 2 77.14 ATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATAT:1 - chr2L 10909583 5' - 412 7473 2 67.59 TGAAACTCAAAGCCAACTAAACCAGCAAAAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATACATATTATTTA:1 - chr2R 14532113 5' - invader4 3071 2 76.71 CCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGAT:1 + chr3R 28438345 5' - mdg1 7372 2 76.92 CCTCGTAATATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGACCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 + chr3R 31266107 5' + jockey 66 1 59.85 TTTAGTGAAAAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAAT:1 + chr3L 20224099 5' - Chimpo 161 1 68.49 CATGCAAACATTTGTGCTGAAATGCAACTTGTCTGCAGCTGTCAGTCAGTTAGACACACAGATACTACTACTACTACTACAACTACAGCTGCAGATGTAGTACATAAACACCCGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATC:1 + chr3R 22316418 5' + roo 160 2 76.92 TGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGT:1 - chrX 21045262 5' + P-element 75 1 24.03 CTGTGGGAAAATAATAATGTCTTTTTAATAGATTATGTTATAATATCTAAGAGAAGATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCA:2 + chr2R 24215626 5' + I-element 5338 1 60.27 CACGTTGAGTNCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGT:1 - chr3L 18183170 5' - Tirant 333 2 70.37 CACATAGAAATTCCCGTACTCGTAAAGTGGCCAAATAGAGGAAACCTTTCTATAAATGAAAACGTCGCGCGAACCATAACGAGAATAGTGAAGAGGAAGAAGG:1 + chr3R 1136368 5' + invader1 3989 2 58.25 TATACTTTTGATTTTCCGTACCATACAATTTATTTCTATTAACTTCAAAATGCTTTAAAAAGTGTCTTAATTAGCAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGATTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGA:1 - chrX 11232621 5' - roo 365 1 47.89 GCCATAATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 - chr3L 17268337 5' + hobo 63 1 60.27 CAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAG:1 - chrX 20999624 5' + BS 24 1 63.01 ACTCCGCTGTTTAGGTTACCATATCTGCCAATTAGGACAAGAATCGGTTAGCAAAGAATTCACAAATTCCCAATTTACTATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCT:1 - chr3R 19506843 5' - mdg3 216 2 59.70 AAAAGAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATTTTTAGGATTTTGT:1 - chr3R 18832428 5' + roo 8747 2 76.03 TATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTG:1 + chr3L 2167595 5' - opus 7438 2 65.07 CAAGAAAATGGAAAATTGTGACATATAACTTCACTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTT:1 + chr3R 19514195 5' - blood 352 2 71.23 GTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATGGC:1 + chr3R 30087729 5' - roo 8993 2 75.38 TTATTGGGCAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTACGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAG:1 + chr3R 27315073 5' + jockey 4718 1 54.62 GATTGACAAAGTTCAGCTGCTGAATTTACGAAGCCAAAAAGGAAAGTCATTCTTCCTTTGCAAAGAGAAAAAGTTCTTAAATTGGAGACAGAAAATCGTCTCTTTACACAAGTACGCACACATATACACGTTCTCGTCTCTTGTTT:1 - chr2R 949633 5' + 1360 3232 1 63.70 GGATCCCGTGCTGTCCGACTATCGGTTCGGTTTGAGAGCGGGCGCAATGCAGCAAAACTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chr3L 13993442 5' - P-element 2837 1 47.41 GCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGTTTGGTTCAACAGCGACTGAC:1 - chrX 22835245 5' - mdg3 172 2 68.12 ATCTGCAACTCACTCGACAGTATAGAAACAAAAAATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAG:1 + chrX 13060163 5' - Tabor 7291 2 57.53 CAAGTGCTATATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACC:1 + chr2L 20761841 5' + Doc 416 1 65.49 CGAGATATCAGGAAACACATTTCCTCTCTAGTTTCTCCCTCAAATGAACTATATTTGTGTACCTGTTACTCGTAGTGAAAATGGGTGTACTAGTTAGGTATAGTTCGTTGAATATATATATATTCTTGATCAGGATATATAGCCG:1 - chr2R 5191119 5' + INE-1 88 1 75.86 TATTTTTATTCTTGATCAGGATTAATAGCCGAGTCGAACTGGTCATGTCCGTCTGTACGTCCGTATGAACGTCGAGATTTTAGGAACTATAAAAGCTAGAAAATTAAGGTTAAGCATACAGATAAATAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chrY 104335 5' + INE-1 550 1 63.01 TGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTA:1 + chr2R 9341524 5' + roo 7 2 47.71 CATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGC:1 + chr2L 22132491 5' - pogo 2052 1 53.10 GGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTCAGCTACAGACTTGA:1 + chrX 12979440 5' - transib2 2784 1 52.34 TGTACATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3L 6131815 5' - roo 9025 2 53.42 TAGTTAGAAAGTAGCCAGANTGACAGTCCTTGCCGAACTGATAAGATCCAGACATTGCTCATCCGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 17627501 5' - roo 9016 2 59.59 AAGAGAGTACAAGAGAGAGCTTTCGTGAGAGGGAGCTTAGATAACGAAAGATATGCTGCACAGCTGTGGTACCGTAGAACCAAAGACACTAGACACTAGCTACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATGGCC:1 - chr4 909051 5' - 1360 3323 1 72.66 GTAAATTTTAAACTTCAATTCTTTATATAGCGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGAC:1 + chr3R 5164900 5' - invader4 3058 2 66.17 AGAAATTAATAAATTTCGTATTTAACAACTAACACTTACAAAGGTGTGACACATTTCGGCATTTAAGGCTCATTTTGTATAATTTATTGTTTTTTTTTTTAATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTT:1 + chrX 15286828 5' - X-element 4686 1 60.27 AATATCACTAAGATAAACACTTGTGCTAAACAATAAATATCATACATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGA:1 - chr2L 23349112 5' - flea 4939 1 71.23 TAAGCTCGAGGAAGTGCGCATGCGCGCACGCTGCAAAAGCTCAGGATTGGCTCTCTGCAAATGACACTTGTTGCATGTCCCAAAGTTAAAACGTATTTTAGTGAAAAGTATTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 + chrX 17048104 5' - jockey 4987 1 72.60 TAAAAGCCAGTTGAATTGTCTGCCACCAATGTGGATGTGTATGTTGCAGTTTCAACAGCAAAAATATCCGATGGAAAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATT:1 + chr3R 4666230 5' + FB 47 1 53.42 GACCTAAATATAGCGGCTATGACCAATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTCCCCTTCCCTT:1 - chrX 21093564 5' - 297 6571 1 78.26 AAAGCTTAGCCTCTGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATGGAATAAGCACTNTATCAA:1 - chr3R 6419979 5' + Tabor 6855 2 65.07 TCTCTAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAA:1 - chr2L 21683473 5' + pogo 77 1 74.66 ACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAAC:1 + chr2L 9383721 5' + flea 4798 2 52.86 TATAATAAACAATTGTAATAATACAACGTCGTCGCAGGAGTTTTTGTTATTAAACGGAACACTAGACTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCGAAAGCCGACTACACCGGAACGACCAAC:1 - chr2R 4938046 5' + Doc3-element 4573 1 55.71 AATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 22320463 5' - roo 347 2 60.69 TTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTA:1 + chr3L 414858 5' - 412 7471 2 68.75 ATTCGTTGAAAAGTATATAACAGACAGAAGGAAACTAGTCGGACCATGTAAAGCATACATATTCTTAATCAATAAACAAGTCAATCTGGTTATGTCCGTTTGTCTTTCTGCCCGTATAAACTTCGAGATCTCAGGA:1 + chrX 124082 5' + INE-1 138 1 52.21 CAAAATGGCTGGCGAGTCAACTTCCGCATGCTGTATGTGAGGTGTGTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGTG:1 + chr3R 24425215 5' - accord 7026 4 68.92 AAGGGAAAATCTCAACAACAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:2 - chr3R 4527283 5' - mdg1 356 2 61.64 TGAAACTGAACCGTTGGCTGACACAAATAGGCCGGACCGAAAAGGCAGCAGAGATCAGACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGA:1 + chr3R 27606549 5' + 412 7 2 72.22 GGAATAGGGAGGGAAATGGTATGAAGCTGAGAAAAATGAAGTTGAGGAATGGTAATAATGATAATAATAAAGATGTTCTAGCATTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAG:1 + chr3R 29288667 5' - BS 5051 1 52.74 ATGGTGGTTTCTATTGTGTCAACAAGGAATCAGTTTCCCAAAAGCTGCACATTTGTTTTTATTTTTAGTCAAATACCAAGAAATAAGTCGATCCAGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr3R 16187734 5' - mdg1 7440 2 67.63 ACGCATGGGAATTCCTTGGTCATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATAT:1 - chrX 2956313 5' + copia 4904 2 61.64 CAAGTAAGCAAGTCAACAAATGTTAATGAAATTTCCTGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACA:1 + chr3R 26180391 5' + Transpac 4954 2 66.44 TGGTTAAAATGTATTGGGAATACGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3R 5870765 5' - roo 9044 1 65.07 ATTGGAAGAGGGCTCCGTTAGTTGTTGGTTTCCAGTTCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2L 14616273 5' - P-element 2865 1 62.28 TCAAGGTTCGTAGGCTCACTAATTGCGTAGCATACTTTCCGGGGCTTTTAAAACGACTATTCGCAAGAAACAACACTAAAAGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTAT:1 + chr3R 13339003 5' + BS 5036 1 54.79 TTATAATTGTACGCAAATATTCAGACAGGAAATCTAAGGCAAATATTGAGAATCAATTTAGCAGAGGTCCCTTTCGGAGGAAGTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACA:1 + chr3R 31264414 5' - BS 5052 1 57.53 CTTGCTGAGTTACGTTAATTTTGAAATTAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATA:1 + chrX 9165313 5' + jockey 4807 1 53.42 CAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3R 10737054 5' + F-element 49 1 57.76 TCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATG:1 - chr3L 13057443 5' + 412 69 2 65.07 GTACATATGTGCACTGGATTATGAAGCACATTATAAGAAAATATTGGGAATATATTAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr2L 12158924 5' + 1360 5 2 70.55 ATGTATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGAT:1 + chr2L 2493973 5' - Tirant 375 2 58.90 ATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 + chr3R 24072042 5' + jockey 64 1 57.26 AATGCTCGGCCTGGGACCACCTTTGCCGACCACTGACTCCACTGACCCTTCCAAACACGCCAGGTCCTTGCTCCTTATGCCGGCCTCTTTCTGCCAGCAAGCGTTTCGTTAAGGAAACAGAAGAAGACTCTTGTAACGAGGAGTC:1 + chr2R 3068451 5' + invader5 3998 2 62.76 TTAAAAATTGTTCAAAAGTGTGGGCGGGACCGGCTTTAGGGTGTTAGAGTAGGCGTCGTAAAATTTTATTGACAAATCGATATAAATTTACAAAACTAATACAAATGTGAACAAATTTAAACCAATATTTTAAAAGTGTGGGCGTG:1 + chr2L 22211211 5' - INE-1 253 1 60.27 GAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr2L 13033403 5' - hobo 2922 1 51.65 CGAAAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3R 30087682 5' - roo 360 2 52.05 TCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGNTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTA:1 + chr2R 22957923 5' + hobo 87 1 76.55 ATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATT:1 + chr3L 19951178 5' + Ivk 55 1 54.79 ATCGTTACTACCTTATTTAAAAGGTTCCACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATT:1 - chr2R 6493200 5' - transib2 2771 1 53.42 TTTCAGCCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACAT:1 - chr3R 25580877 5' - 1360 3370 1 65.00 CCATTTCTTTTGTTTTAAAATATTGTCACTGTCCTAGTTTACCAAGTATTTGATCCATGTTTGGCAAGGGATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTACGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTC:1 - chrX 10609937 5' + opus 42 4 59.29 AATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCCTGATCAGTATCAATA:1 - chrX 21575363 5' + INE-1 84 1 58.91 ATTTGACTGCACCACGGTCGTCTAATTAACCCATTCGGGGTTAAGTCAACTTCAATTTAAACCCAGTAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTA:1 + chr2L 17237053 5' + X-element 41 1 52.38 GGGTGAAAAATGTAGCGAGACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr2R 21795995 5' - roo 9031 1 56.16 GAGCGGGCGCAATGCAGCAAAACTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTG:1 + chr3L 13993477 5' - P-element 2812 1 23.20 GAGCAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 24072013 5' + jockey 57 1 56.85 GGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAACGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCG:1 - chrY 311346 5' + 1360 44 1 59.56 AAAAAAAAGAGTCGAAAAAGGAAAAGCGCTCAGGAAAAGTAGCAAGTTGATGGAGATGTGTGGCAAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCGGCTCTCCCG:1 - chr2L 7921056 5' + F-element 366 1 69.63 TACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTT:1 + chr2R 19574409 5' + I-element 5140 1 52.74 AAAAACTAACAAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGCC:1 + chr2L 3892970 5' - 1360 3338 1 54.86 CAAAATAAAAGTAATGAAAAGAAAGCAAAAAATACTGAAAAAATTTCGCGAAAAAATGGGATTCATAGTAGATTCACTAGAAACTATATACCCCTTATCTTAAATCATTGTAGATCTAACTATGAGTTGTATGACCCTTACAGAGT:1 - chr2L 2024681 5' + Cr1a 4173 1 58.22 ATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2R 16274556 5' - roo 9053 2 60.67 TTAAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTT:1 + chr3L 7751048 5' + 412 7137 2 74.66 TATTGTGCTGCAAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATA:1 + chr3L 14888754 5' - flea 4962 2 58.22 ACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 - chr3R 6685818 5' + 412 77 2 69.86 GCGACTAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr2L 20852452 5' - Tirant 8433 2 71.23 AAAAGTAACAGCTTGCATGCGTTTTTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGT:1 + chr3L 20224106 5' - Chimpo 154 1 63.70 AATATATTAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 - chr2L 12158876 5' + 1360 53 1 54.79 AGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATAC:1 - chrX 2956260 5' + copia 4957 2 76.71 GATTTATATAGGCCATTCCATCTGATTGGCTCAGCGTATCAAGAACATCAGAATGCACACACAACGCATAAATAAAACCATTCGCACCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTAT:1 + chr3L 20143223 5' - hopper 1382 1 63.01 CAAATAACAGCCATAAACACTTTTTAAATTGAATTTTAACTATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTA:1 - chrX 14978674 5' + hobo 27 1 62.68 CGCTTATCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTG:1 - chr3R 16630385 5' + FB 17 1 69.84 CACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATC:1 - chr3R 10737048 5' + F-element 42 1 58.25 GGCAGCCGTGCGACAATTTGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:2 + chr3R 25580747 5' + 1360 46 1 54.79 CACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 13057419 5' + 412 66 2 77.31 TATAGGGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGC:1 + chr3R 5164925 5' - invader4 3020 2 60.96 TCTTCTAAGAAAACCAATCCCAGCTAAAGCACAAAAGTATTTTTCAAGATACAAGAGTTTAAATTTAGTTTTCAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTT:1 + chr2R 12134680 5' + jockey 4864 1 54.79 GTTGAGCAGTTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATT:1 - chr2L 10909607 5' - 412 443 2 52.74 TCACTCGAGGATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTAT:1 + chr3R 18832304 5' - roo 9067 1 76.30 GTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTT:1 + chr2L 23310600 5' + 1360 36 1 59.03 CGAAAACACGTCCGTCGTTAATCCATTCATGCGCGTAGATAGGGACAATTTAAAGCATTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATAACAACCACGGCACACTATACACCCACAAGTGAGCATATG:1 + chr3R 2412143 5' - R1A1-element 5256 1 53.17 TGTGAATATAATGTATGAAACTACTTATTTTACACACTCTTAAGTGAATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGAT:1 + chr3R 13868861 5' - HMS-Beagle 7035 2 73.97 TTTGGCTATTTGTTTTTGGGTTTTTGGAGGAGGCTTGGGGNTGGGCTCGGGCTTGGTTGGGATTGGTTTGCTGAGGCACTTGGGTAGACATGAGCGCATCTCTGTAGCTCATNTTGGAGAAACTTGGGAGCTTGATGGTGCAGG:1 - chr3R 28019267 5' - G2 29 1 63.89 TGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAG:1 - chr3R 25796058 5' - BS 5001 1 76.92 AACATTTAATACAAGCAATTCCTGAAATATTAAATTAGTTATTTAACTTTTAACTATAGTTATGAATTCTTTTTAATAACTATTTAAACACTTCAATGAATGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 + chr2L 11617645 5' - 412 7528 2 72.41 TAATGAATGGATACAAAACATAATTAGCTATTGCAATACATATTTACAGTATGTAACTAACCCAAAAACAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATAACACGAAATTTCGTAATTTTTCTGGGATATCTATAGA:1 + chr2R 7925383 5' - INE-1 501 1 71.23 CTTACATATATGTTCATTATATATTCAACACTCCTTCTCAACGTTGTATGTTTACATATTCACTCAAAACATTCCCATTAGCTTAATACATCTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 - chr2R 6359450 5' - opus 468 2 63.45 CGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chrX 8681424 5' + jockey 63 1 56.55 AATTTTCGGACATTAAAGTTTTTTGCTATAAATGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGC:1 + chr2R 5179551 5' - 1360 3351 1 58.22 ATTTCTTGAGTTCCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTAGACTAAGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACTATTTTGGGCTCCGTTCATTCCTTATGTAAATGNATCGAGAGCGATAA:1 - chr2R 16274639 5' + roo 64 2 58.90 TCAATTAGGCAACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGATATTGTT:1 - chr3L 9324569 5' - HMS-Beagle2 267 2 53.42 AGAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAA:1 - chr2R 24427621 5' - 1360 3330 1 60.56 CCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTCGAGTGCCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTT:1 - chr3L 6050227 5' + 412 7088 2 56.19 TTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:2 + chr3L 7024442 5' + 412 7111 2 54.79 GAGCCGGATTTATGCATTTACTTGGATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTG:1 + chr3R 24480406 5' + blood 7021 2 76.03 ATGATGATGTTGTTGTTTATATACTCGCCGCCTCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGC:1 - chr3L 6507173 5' + 412 300 2 70.64 AAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAA:1 - chr3L 8824514 5' - transib2 2739 1 78.08 TGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:2 - chr3R 29288759 5' + BS 5078 1 71.72 ACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 + chr3L 19274805 5' + transib2 77 1 70.55 CACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chrX 2300630 5' - P-element 2794 1 12.68 CATTAAAGTTTTTTGCTATAAATGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr2R 5179561 5' - 1360 3343 1 53.47 GCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTT:1 - chr3R 6419927 5' + Tabor 6916 2 67.81 CAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 + chrX 19662986 5' - P-element 2802 1 23.74 GTATTATTTATTTAGGTACTTATTTAATTTCGCAATTAGCTTTCAAAGCGAACGGTCGTGTTTTTTTTGCGCCCCGATTCTTATTTTGTGTTTGCCAAACCAGCCGTGGTTTTTAATAATCTTTTTTAATTATCATATATTTTAAA:1 + chr3R 3922955 5' + Cr1a 89 1 71.23 AATTTCTCGCCCTTTCGAGAGCAAACCTAGAATTATAAAAAGAAAATTAATATGAACGCAAATTTTACATTATTTATGCTTTCAATTATAAAATAATAAATATTTAAAAAAAATCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACA:1 + chr3R 25471594 5' + Bari1 6 1 75.34 TATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 + chr3L 15718059 5' + 1360 40 1 50.75 TTCTCCTCAGTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 + chr2L 13033285 5' + hobo 17 1 62.41 CTGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTT:1 - chr3R 9298576 5' - hopper2 1558 1 50.68 TCGAAAAATTATAAGAAATAATATTCAGAATAAGTGGTTCCTTTCGTCATAATGATAATTTTAAGCTAATCGAAAATATAGAATATTTCACGAAAGTCGTTCTTCCAAATTTTAGAATTTTGGTTTCCCGACTATCAGATACCAGT:1 + chrX 5711873 5' - INE-1 554 1 44.52 TTGGAGGAAATAAGGGGGAATAACAGTTTTTTCACAAATAGAAAAAAAACTAACAAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr2L 3892924 5' + 1360 9 2 77.40 TGGAAAATCTAAAATGATAAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 - chr3L 8824532 5' - transib2 2759 1 65.28 AAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTT:1 - chrX 1769768 5' - hopper2 1532 1 71.13 GGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTC:1 + chr3R 25158596 5' - 1360 3322 1 63.57 ATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chr3L 6050241 5' + 412 56 2 57.86 TGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATAT:1 + chr3R 7625304 5' - hopper2 1544 1 60.27 TGTTCGCCCGAAACGCTTTTCGAATTCATGTCAGTTTCGGTTTCATGAGGTAACGAATTTCACAAATTCGCGGCGGGGGATTGTGTGGAGGGGGACGAGTTACCACCCCACCCCC:1 + chr3R 12341053 5' + Tirant 8106 1 77.39 ATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAA:1 + chr3R 6419852 5' - Tabor 414 2 69.18 TTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGATAATATTAATTAGAAATTTTATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3R 11516595 5' + roo 8727 2 67.88 CTTCAAAGTCGTTGACATCGATTTGAGCCATCCACGTATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAG:1 - chr3R 26179332 5' + Transpac 223 2 74.66 CTTTGTTTTGTAAATAGTATTGAATATTCCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTT:1 - chr3R 13613155 5' - copia 5069 2 80.00 GAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr2R 18931931 5' + blood 43 2 53.19 TCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTNTTATCT:1 - chr2L 2544830 5' - blood 7318 2 65.07 TCTTCTACATGATATCTACATGAATTTTCCAGCATGCAGCAGCCAAGTATGCAACACATTCTATGTTATCATATTTCAAGCAGTTTCTAAATTCAAAGAATAGGAATTCATAATTTAATAATTTAAATAATTTAAAATGGGTGTT:1 - chr3L 3766914 5' + Transib5 260 1 70.34 GCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACAC:1 - chr2L 15019990 5' + BS 4823 1 64.49 ATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3R 17259543 5' - roo 8982 2 79.45 TTTTGCAAAGTTCTTTTATTTACTGTTATCTTCGCTTATTCATCATTCGGTTTTCCCCACACAATTACTCTTCTCTCACAAAAATCGGCTACCTACTTACTTAGACAACTTTTAAATAATTCACCTTCCCTAGGTAACCGTAGAAC:1 + chr3L 23016173 5' + Cr1a 4005 1 65.07 GGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAG:1 - chr3R 8050550 5' - hopper 1370 1 52.59 TATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGA:1 + chr3R 26472827 5' - 1360 3300 1 78.08 TGGGAAAATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATT:1 + chr3R 3617305 5' - micropia 5134 2 78.62 GCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAGTCGAGAG:1 - chr2R 9453367 5' + roo 8722 2 63.43 ATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATG:1 + chr2L 2493983 5' - Tirant 366 2 57.24 TAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 - chr2L 12158869 5' + 1360 59 1 59.31 TTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCT:1 + chr2R 23094891 5' - 412 7484 2 72.80 GCAGAATGATTGATGTACGTTAATATTAACTTTTACTAATGGTCTTGTAGCATTAAGCTACCGGCTGCATAGCCCAAAAGATGAGATTAGTCAGAGGTCCAGATAAGGTGGACCTACGACATTGTAATGCCGATCGCTGTCGTATT:1 - chr3L 26015184 5' + G3 199 1 72.60 TACAATAAATGTATTAATTATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTA:1 + chr3L 18074049 5' - 297 6943 2 64.14 TCAAGTAATACCAAGTGCTATATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGCCTCACAAGTCGTGGAGCGA:1 + chr2L 20761830 5' + Doc 409 1 71.23 AAAACTGGGCACAAATCGCATGTAGAAGAAAGAACCGTTTGAGAAGGCTAAAAGAATTAAAAAAATTTTTTTTGTTTTTCTTTTTTCGCACGGCCACACCTCCCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCCTGTATCGTA:1 - chr3L 21488856 5' - Cr1a 4401 1 82.01 TACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chrX 14360826 5' + jockey 79 1 69.63 ATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCATCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTGA:1 + chr3L 25482911 5' + accord 85 2 75.17 ACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTA:1 + chr3R 18832336 5' - roo 9035 1 54.07 TTTTTAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr3R 13423396 5' + 297 6622 2 56.85 GATAAGTAGCAAATTTTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr3L 27350131 5' - 297 356 2 60.00 AACTAGCCGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCC:1 - chr2R 5621055 5' + ZAM 7977 2 68.00 ACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGGGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTGCTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 10897513 5' - roo 320 2 75.34 CAATATCAAAAAGGTTTTTTGCGATCATACCATATGATAAAATTTGTAGGCTTTAGAGATTTCTGTAACACATCGGCACTTCTACAGCATTCACAAGCTACTTGAGGAAAGGAAATGTTTATTAAAAAAAGAAGAAAAAAAAACTT:1 + chrX 8050769 5' + HMS-Beagle2 490 1 78.77 TGGAGGGTCCCGAGGGCTAGGAATAGAAAAATATTAAATGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATC:1 + chr3R 16475354 5' + mdg3 5334 2 71.92 AAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATC:1 + chr2R 22957908 5' + hobo 63 1 64.71 ATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTAT:1 - chr2R 19633291 5' + jockey 4835 1 68.28 TTTTTGGAAAATGTATGTTTTAAATTAAAGTTGTTATAATAATTTCCGTATATATTTAGTATATTTCTCAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCAT:1 + chrX 14172935 5' - opus 7471 2 64.83 GCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGT:1 + chr3R 26854763 5' + jockey 87 1 70.55 TTATAAAAATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAACGGGCAGACGGCAAC:1 - chr3L 17500819 5' + Tirant 54 2 57.46 GTAAAGCCAATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 414967 5' + 412 37 2 60.96 TGAACATTTCTTTGACGGCTATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTAGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2L 8120255 5' - roo 9028 1 54.79 CAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCT:1 - chr2L 18219409 5' + copia 4925 2 56.85 GCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCT:1 + chr2L 23310614 5' + 1360 51 1 53.10 TGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCT:1 - chr2R 5321209 5' - INE-1 515 1 63.64 TATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACT:1 - chrX 20999573 5' + BS 75 1 73.29 ATAAAATGGACAGACGCACATTTATACACAATGTAAAAAATAAGTTAATTAGAGTTACAACAATATATGTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACTTAAGTGCTTTAAGCTAAGTCAGCAT:1 + chr2L 18181104 5' + blood 112 2 47.95 GTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCT:1 + chr3L 28063322 5' - Stalker4 7071 4 73.97 GTTGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 - chrX 18673720 5' - roo 8978 2 79.31 TTTTTTTATTTATTTATTTATTTAGAAGCGACGAAGCCATACAATGCCTCGCAATTTAATTGAGTATGTTTTGCAAACCATCCAATAAATGGGTTAATTTTTTTTTTTAGACTTTATTAAGGCATACGAGGTAGCTGAAAACCCCT:1 + chr3R 20793638 5' - BS3 1741 1 45.21 TGTAATGCGATACCCTTAAGGTAATAACTTACTTATATATATAAGTAAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCA:1 + chr2R 10788054 5' + gypsy10 31 2 60.00 ATAAGTTAATAAGTAACAAATATAACACATATAAAACAAAGCGAAAGAAACCCTTTTTTTAAATCTCAAACCTGTGACAAAGTGAGAAAATCTAAAACAAAAAAAAAA:1 - chrX 16197208 5' + TART-C 11096 1 70.37 ATGGTTTTCTGCAGACATCTGGATCTGGAGCTTGAATGTGGCATATACATATATATTTCTATATGTATATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3R 28618349 5' - 412 442 2 52.41 GAATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATT:1 + chr2R 21795207 5' - transib2 2799 1 68.49 AATTCAAAACTAAATTCAAACAATATAAGCAAAATCTAAACTGTTTATATGTTATTATAATGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGT:1 - chrX 9017703 5' + 1360 57 1 62.33 TATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAA:1 + chr3L 9324457 5' + HMS-Beagle2 65 2 62.50 GGAAAGAGAAATGCTGGGTTAGAGCACAATTTATTAAAAGCGGAGCATGGAAATTGCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAAT:1 - chr3R 18294950 5' - copia 230 1 65.07 TTTAAAGCAGTGCAGCGAACACAGAATTCTTATTCACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 - chrX 20284547 5' - roo 9031 1 56.83 TTTACATCATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAG:1 - chr3R 15727986 5' - 1731 310 2 76.03 GTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTC:1 - chr3L 9324535 5' - HMS-Beagle2 7116 2 73.29 ATAAAACTCACAAAACACTCAAAAAGAAATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACAC:1 - chr2L 18181263 5' - blood 7375 2 72.41 TAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chr3L 9635324 5' + Doc 84 1 73.97 TTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGTTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1 - chr2L 2544817 5' - blood 7311 2 72.14 AAATAGTTTCTTGTATATATTAATAAAAATGTGTTGAAAAAACCCCTTTTCTCAACTCTGATTATATATTAGATACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTATTGTCCCGTCAG:1 + chr2R 19389283 5' - 297 6950 2 59.23 AACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACAT:1 - chr2L 21802974 5' + Quasimodo 33 2 56.35 CTAGCTTTTATGAAAATATCACAATACTCTAATAATATCGACTTCTGTTTTTAAGAGTTCTCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGACCACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - chr3R 13255039 5' + roo 17 2 73.79 TTGGGTATTTCCAATTGACGCTGCTTTTTGTTTATGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATT:1 + chr3R 26242480 5' + roo 8751 2 78.08 ATCGGTTTAATCGAATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGGCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 6050263 5' + 412 40 2 58.22 ATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCG:1 + chr3L 17011968 5' + 1360 74 1 75.37 TTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCG:1 + chr3R 7049349 5' + Burdock 48 2 58.27 AAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAG:1 - chr2L 2544823 5' - blood 300 2 70.55 GAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr2R 14884175 5' + roo 8718 2 65.38 TAATGTGGCCGGGGGTCAAATGCACAGGCTACCTATTGCAGCTCGTATGCTCAAGTTGAAGTGGGACCAAGATTTGGCCCTTTTGGCTACAATCTTGGTAAAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 17875726 5' - 1360 3380 2 77.61 TATCGTCGAAATTAGGTTCAATATGTTACCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCTGGCCAGCCGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTC:1 + chr2L 12859379 5' - X-element 4422 1 75.65 CTTAATGTATGCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCAC:1 - chr2L 15020000 5' + BS 4821 1 67.81 AAAAGCACTTCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2R 18931792 5' - blood 360 2 67.72 AGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACAT:1 - chr3L 22021729 5' - mdg1 7379 2 74.66 TGCTAAAGACATTAATGACAGTCCGGCCTTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTC:1 + chr3L 414793 5' - 412 482 2 76.71 TGTGCCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCT:1 - chr3L 11535995 5' - roo 358 2 54.68 AAATGGAAAATTGTGACATATAACTTCACTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr3R 19514200 5' - 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Osvaldo 1074 1 68.57 GCTATACATTTTCTGCGAGAAGGCATGCAATAGAGACGCTGTGAAAACGACTTTGCGTTCGAGGTTTTGATTCTGTTGGAAAAGGATTACGATATCCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCG:1 - chr3R 8563670 5' - 297 6951 2 69.86 TCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 + chrX 20361959 5' - hopper2 1542 1 63.01 GGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chr3L 17268275 5' - hobo 2909 1 71.60 GCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGCAATT:1 - chr3R 31264516 5' + BS 52 1 61.65 CACACCGCACTGTGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATT:1 - chr3R 12146760 5' - gypsy10 5944 2 55.00 TCCCAAATCGACACGAATTATATAAGTTATAATTCCTATTTAGTATAACATTTAAACCAACTTTAACATAATTTAATGTATACAATTTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACCATGAATCAAAACGACATA:1 + chr2R 6219637 5' + Doc 209 1 60.27 AAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 26927455 5' + roo 8750 2 76.03 TTTACAGATTCAGCCGCGCTTTGACAGAGTTTTTATTTGCGTTTTATTAATGCTAAACGATTTCCACGAAAATGCCACCGAAAATGATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGA:1 - chr3L 5027346 5' + roo 8662 1 46.90 AGTTTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATATATCTTCGGTTT:1 + chrX 3666504 5' - roo 9015 2 57.53 GACTTTTCCGAGTGCACTGCATCAAAGTCAAAATGGCGGTCGAGTGTGTTTGTGGACGAAGTGAGACAAATACCGCCATAATTCCTGCCTAAAGTGGCATTAGACATTTAATATTTATGCATTTTTTTAAGTTAATTGTAATTCAA:1 + chr3R 19533145 5' + Juan 4008 1 76.71 CAACACGCGAGGATAGCCGAGGAGAGTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:1 + chr3L 23894739 5' + 1360 22 1 67.12 CCAGGTGTAAAGATAATCTTTAATTATTACAAATATTGAANTTTTATGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTNGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACGTGAAAATTTGTAC:1 - chr3L 19274900 5' - transib2 2774 1 48.97 TGTGAATATAATGTATGAAACTACTTATTTTACACACTCTNAAGTGGATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTNCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACGGTTATCGATTTGAT:1 + chr3R 13868861 5' - HMS-Beagle 7035 2 71.23 AAACCTAGAATTATAAAAAGAAAATTAATATGAACGCAAATTTTACATTATTTATGCTTTCAATTATAAAATAATAAATATTTAAAAAAAATCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGG:1 + chr3R 25471616 5' + Bari1 27 1 62.07 TGATTTTTTAGTAACAGTGTTACTCCTTTAATCGCAATCCATTGCGTTTTCTGTTTACACCCTGATTTTATACTGCGAATTATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAA:1 + chr3R 13559964 5' + jockey 4813 1 52.05 ATCTGAGGTTTTTAAGTGCCAATTATTATTTGTATACTTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTATG:1 + chr3R 30955341 5' - G6 1960 1 66.67 GGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGTTATGGTTATGCACGCAGGTAGGCCAGGGCG:1 - chr2R 14009071 5' + 412 95 2 79.45 CTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGA:1 - chr2R 8436295 5' - 1360 3300 1 79.45 AATGAAAATTTTACGCGTTATCCTGGTCGTCCTCGCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3R 28014080 5' + roo 8709 2 54.79 TATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTAA:1 + chr3R 20887424 5' + Doc 87 1 75.18 GTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTG:1 + chr3R 10144388 5' - Chimpo 130 1 66.10 CATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTT:1 - chr3R 6419926 5' + Tabor 6917 2 68.49 AGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr4 868648 5' + roo 72 2 70.34 GATTGGCATGGGCGGTGGTGGGCGTGGCTATGGTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTAGGGGGCATGTGGCCTGTTT:1 + chr3R 9298423 5' + hopper 3 2 81.40 TCTTCTCACAGAACGATCGGATTGTCAAAGGACAGAAATTGACGCTCTCACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCATTAGCGCTCCGCT:1 - chr2R 4802880 5' - mariner2 62 1 24.66 TTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCTCTACGCTCTCCCGCTCTTCACCTC:1 - chr3L 25232913 5' + GATE 8293 2 56.25 AACTCATCTCTACTCTGTGCATATCAACGAACGCGATCTCTACTTTGTGAGCATCGACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACAAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 23456043 5' + 1360 14 1 63.93 ATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTG:1 + chr3R 26854765 5' + jockey 88 1 71.72 GTTGCATGTCCCAAAGTTAAAACGTATTTTAGTGAAAAGTATTTTTTATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTT:1 + chrX 17048173 5' - jockey 4918 1 73.97 TTAGTTGATAACTTTGCTTAACTTTTGCACTTCACAGCCAATATAACTGATAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTAC:1 + chr3R 10876196 5' - 1360 3324 1 64.34 TATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 17243233 5' - hopper2 1566 2 54.79 AGCACTTCGCAAAAGAGCAAGGTGAGTAGGGTTCGGGTGGAATGTGGTGGGAACGAAACTCGTTCCATGTGGCCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr2R 6236039 5' - P-element 2848 1 56.52 GATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 + chr2R 15199125 5' + Burdock 71 2 70.34 GGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 14884107 5' - roo 323 2 75.34 TTATTCGACGTAATAGGATTTGATGGTTTCGGAGCTACGGGAACTGTGAGCCCCATTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGG:1 - chr3R 10736558 5' - F-element 4259 1 55.20 TCTTATTCACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACCTAATTTTATTTGGCAATATCTTCG:1 - chrX 20284520 5' - roo 355 2 58.87 CACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTC:1 + chr2L 8284366 5' + Doc 434 1 62.14 ACATCTATATTATTAAAATTATTATCACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAACGA:1 - chr3L 17748432 5' + Doc 453 1 64.23 ATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr3R 5870873 5' + roo 87 2 80.14 ATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATC:1 - chr3R 24084865 5' - roo 326 2 72.60 AAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAA:1 - chr3R 10737043 5' + F-element 90 1 73.97 GTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 + chr2R 14884109 5' - roo 8989 2 76.06 ATAATGATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTAT:1 - chr2L 10536578 5' - flea 4956 2 59.59 TTTTCAGTTTTGTGAGGGCGCGTGTGTGTCCGCTTTTTAATTCGCTTATTTAAGATTAACAGATTAACAATGTAACAGTAAGGATGGCAAATCCAGGACCCCCAGCGCATGGCTGCATTGCTTCTCGAGGACGATCAGG:1 + chrX 20231892 5' - Rt1c 5314 1 68.35 CCTGTAAATTAAAGATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3L 7024399 5' + 412 14 2 74.48 CAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGC:1 - chr3R 18294888 5' - copia 168 2 76.71 ATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCA:1 + chr3L 9324469 5' + HMS-Beagle2 6946 2 67.69 CAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCC:1 + chr3L 12227767 5' + opus 48 4 54.79 CACCTAAGGTGTCGAAAAGTATGCAGCAAAAAAGTAACTTTATATTATGAAATAAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAA:1 - chrX 18745459 5' + Juan 4050 1 67.36 AATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCA:1 + chr3L 9324463 5' + HMS-Beagle2 73 2 67.12 AGCAGGCGAAATATTCCCACGCCGGCATGGCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTCACTTATGGCA:1 - chr3R 28618464 5' + 412 7094 2 47.83 ACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr3L 14422833 5' - roo 9014 2 58.90 TTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3R 30087793 5' + roo 8717 2 60.00 TAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr3R 23902179 5' + I-element 60 1 58.22 TTTTTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr4 868743 5' - roo 9029 1 52.24 CTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAACTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGAGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr2R 14385563 5' + jockey 34 1 40.32 AAAAACTTTGATAACTTTATTCCCTTAAACTTCGCTCTTAAGCTAAGTTGGGGGTGGCAGTGGGGATCCCTCGCTGCAGTCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGGCAGAGTAAT:1 + chr2R 2144234 5' - Gypsy6A_LTR 245 1 69.86 CAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCG:1 + chrX 23102394 5' - Transpac 5171 2 70.00 TAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGACCAAGAGACATCGAACGCGAC:1 - chrX 20949728 5' + jockey 4582 1 59.59 AGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr4 868640 5' + roo 8728 2 64.83 ATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAA:1 - chr2R 12253309 5' + BS 4717 1 72.60 GTAAATAAAGNTTTCCACATTTTCGGAACTTCTTTTTCCGAATTCCGAAAACTGATGTACCATTAGAGTTTACACAATTACTAACCAGTACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACG:1 - chr2R 13132637 5' + BS 4657 1 59.31 CCGAATTTTATTACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTGTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTC:1 + chr2R 18886932 5' - roo 400 1 75.81 GAATCGTGGGGTTTATAAAAATAAATCCATTAATATCGGCGCCATTTCACGTGCAGAGCGTTGATATGCCATCTACACGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACA:1 + chr2R 15474436 5' + Quasimodo 30 2 64.14 GTGTAAGACAAAAGAGGAACGCGCAATTATTCAGGAAAGCTGGAATAACCAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTTAA:1 - chrX 22498750 5' - McClintock 6364 2 65.22 AGGGTCACCTATACTGCAGTTTTATGTGGCATACTTTCGGGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATG:1 + chr3R 21735420 5' - hopper 1398 1 71.23 TTTTACTCCTACCCGTGCAAAGGGTATTATTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCGCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGA:1 - 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roo 9001 2 68.09 CAAATCAATTGATTGCTGCAGTTGTTAGCTTTTAATTATTGGGCTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTAT:1 - chr3L 11904897 5' + copia 4902 2 61.64 GCCCCCCATTTTGCGGTTGTCGCCGGCGACGATGATGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGC:1 + chr3R 11284879 5' - blood 350 2 62.50 ACTTCAAAAGTAAGTTAATTTTTTGTTTATCATTAATTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chrX 21639440 5' + 412 7087 2 62.33 GCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCC:1 - chr3R 934270 5' - Rt1b 4730 1 49.63 GACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTT:1 + chr2R 12185335 5' - accord 7244 2 67.41 CACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCCCACCTTTT:1 - 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chr2R 9750284 5' + opus 27 4 65.75 GTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 4244869 5' + 412 7095 2 50.36 TGGAAACTATTACTCTGGCAAAATTGTATGTAGTTAACACAAAAATGTTAAGTAATGATGACACCAACGGCACCAACTTCGCCGCGAAGCCGTCAACTGCCTTCGACAGATGGTGCTCTTTGGCCCACACTGTGTCCCCCACCTTG:1 + chr2R 5343219 5' - Osvaldo 1296 1 54.11 TCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCA:1 - chr2L 14263042 5' + P-element 46 1 49.22 TCTGTATATTGATTGAGATGCTGCCTGAAAGTATGCAGCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGA:1 + chr2R 9007016 5' + jockey 4804 1 66.44 GCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 - chr3R 17243240 5' - hopper 1380 1 59.59 CAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGC:1 + chrX 20361937 5' - hopper2 1565 1 55.86 GTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCGACATCG:1 + chr2R 7720080 5' + HMS-Beagle 6867 2 68.49 CATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTA:1 + chrX 13060200 5' - Tabor 415 2 64.38 TTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 - chr2R 11844325 5' + I-element 65 1 59.59 GTGTGGGAAATGATTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAA:1 - chrX 3534013 5' - 17.6 468 2 67.61 GAAGGATTTTCCAAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr2R 22523147 5' + jockey 17 1 65.00 AAATGTGTCTGAGCCTCCAAACCCCATGAGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGGATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACC:1 - chr2L 15420154 5' + Burdock 2 2 64.14 TATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 + chrX 666272 5' + 412 7112 2 60.42 TACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3L 20061441 5' + roo 55 2 56.85 TTTTTAGAGTCGAACTTAGATTGACTGTAATTATTCGCACATCACTTTAAACACTGTCACGGTCGCATATACATACACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCTCA:1 - chr3R 4055326 5' - Stalker4 203 4 49.61 TTGACAGACATCCTTTTTATGTGACTTAAAGCAAGTGACTTATATGGCAAAGCATTTTGCAGAATTGTCTACTTAAGTTTGACAATTTCAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATGAAGTGAAATTAGTTT:1 - chr3L 18549823 5' + X-element 45 1 44.52 TGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 - chr3L 13285682 5' + roo 20 2 60.95 TCATGGGAAACAGTGGCAAAGCCAAAAGGGGCTTGAAAAAATTAGCTTATTCTAATATGAGAGTATAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGAC:1 - chrX 8469343 5' + hobo 17 1 73.97 CAAATATGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr3R 10737102 5' + F-element 31 1 68.49 ATTCTGATTTTTTTTACTGCATTGTGCTACTGGAAAATACCCCATTATTAAAAAAAGTTTTGTATAATGTATTAAAATGTGATCTGTCTTTGGGTACAGCTACCCGTACATGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACAT:1 - chr3R 7578794 5' - Stalker2 7512 2 61.64 GCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:2 + chr2R 12462136 5' - roo 9001 2 65.75 CGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCAC:1 - chr4 490338 5' - pogo 2085 1 66.36 CCTTGGGCATGGCCACAGCGAAACTGGTCACACTGGCACTGAATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTT:1 + chr3L 11364762 5' - Tirant 390 2 73.98 ACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr3L 2532526 5' - blood 305 2 68.49 ATCAACACGAATATAAAAACGCAGCATGCTTACAAAACGATTTTTATCGGCAATCAACAATTTTTATCGAATTGCGAACATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTA:1 - chr2L 6151317 5' - hopper 29 1 58.22 TTACGTTTTATTTAACTAATTCAAGATTGAACAGATTATATAGTTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 + chrX 20149083 5' + pogo 13 1 76.71 TTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATCTTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTA:1 + chr2L 4244879 5' + 412 7114 2 58.90 AGTATGCAGCAAAAAAGTAACTTTATATTATGAAATAAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAA:1 - chrX 18745442 5' + Juan 4068 1 55.17 TATCAAAACCCGGTCGGGGGTCGATTCGATTTCGATGTCCCTGGTTCTGATGTAACAAAGAGCCTCAGAAATCCTTCTTAGTGTCATATTCAGGTGACACATGTAGACCGTAGACTAGGCTGGGGGCTGAATTAATAGCNGCCAAG:1 + chr4 413913 5' + BS3 1712 1 58.22 TTTAAAGCGTCACATTTTTTCTCTATTTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAACCTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 - chr2R 14884238 5' + roo 6 2 80.14 AATCGCTGTGCCTTTTCATTTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCT:1 - chr3L 11364931 5' + Tirant 8121 2 75.56 CTGCGAAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 - chr2R 19633339 5' + jockey 4788 1 66.44 ATCATCATAAAATACCCAAATTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTG:1 + chr2R 20972617 5' + jockey 4691 1 69.86 CGTGGTTTGTTTGCGGATATAAATATATTTATACTACATTTATACTATATTTATACTATACATTTATACTAATTCTGGAAAAGATTTTCCCAACTGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTC:2 + chr2R 4918165 5' - S-element 411 1 71.92 CTACGCTTCTCTAGGTATATACAGTCCCATTGTAAAATGTTTATTTTTATCAATATTATTTTAAATACAAAAACCATTTAATATAAATTGAATGGTAAAGTTTAGCTCAAAGAAGCTGGGTTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATT:1 + chr4 560807 5' + FB 22 1 73.97 GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACAT:1 - chrX 12649914 5' - blood 7018 2 68.89 ATGTGCAACTAAATAAAGTTTATATATGTGTACATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr3L 6131787 5' - roo 9053 2 72.60 AATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 - chr3R 12376535 5' + HMS-Beagle 6835 2 58.90 TATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGTGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAG:1 - chr3R 2689450 5' - diver2 4475 1 69.42 CCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:1 + chr3R 24072044 5' + jockey 71 1 60.47 TTTGGCTGCATCAGCACAAAGCGAGTCGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3L 12991490 5' - mdg1 7453 2 79.23 CTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAA:1 - chr3R 10737086 5' + F-element 39 1 60.87 AAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr4 490228 5' + pogo 62 1 62.50 AGAGATTGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr2R 12102047 5' - hopper 1375 1 53.42 TTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAAC:1 - chr2L 15085715 5' - opus 443 2 68.50 ATCTACCGCTTTAATTCAANACACTTTTTTTTAAGCTGTCAAGTGTTTTATACGGCGATTTGGTCGCACTTGCAAAACTAAGCAACCTATATGTGTGGGCGTCTATGTCTTTAAAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTTCTGGCTT:1 - chrX 22593605 5' - INE-1 167 1 65.07 GGGGGATAACAGTTTTTTCACAAATAGAAAAAAAACTAACAAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 + chr2L 3892938 5' - 1360 3366 1 68.49 GCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTG:1 - chr3R 9298583 5' - hopper 1373 2 55.17 TAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 - chr2L 3893090 5' + 1360 45 1 53.15 ATATAGATTTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGT:1 + chr2R 7720027 5' + HMS-Beagle 18 2 73.29 GAAGAGTAATTTTTCGCCAGAGATGAGCGAAAACATCTGCGGATCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATA:1 + chr3L 17482088 5' - 297 6924 2 67.20 GTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGATGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAA:1 - chr2R 12827070 5' + Burdock 6198 2 62.33 CACCGTCGCTTAGTGTATTTCCATATTCGTTTTGCTACAATCGGCCTCGGTAGTGGGGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTA:1 - chr3R 26242608 5' - roo 403 1 75.34 ACATGATGATAAAGACATTTTTTTATTTTTAAATTAAGCAAGCGAGAAACTCTTATACTGACAGCCGCCCCAAAGTATGCAACGTTTTTCGTTCAAATTTATTAAACGAATTATTAAGTAGCCGCAATCTACGGTCTCCAGCTT:1 + chr3R 27027702 5' + jockey 496 1 60.42 CATTTTAAGATCTGGTTTGGTCATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 + chr3R 13613088 5' + copia 64 2 64.14 TAAAAGGGTATACTAGATTCAATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATAA:1 + chr2L 20491467 5' + 297 6641 2 65.75 ATTTCATTTCGGTTTTCATAAACATTTCAAAGTCTCAAATTGCAAATATAAGTAAAATAATAGAAAGCAATGTATTTTTAATAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAAGGC:1 - 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chr3R 17243224 5' - hopper 1365 1 51.72 CAAATATGATATTTAAATCTGAATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAAT:1 - chr3R 31114382 5' - flea 209 2 52.05 AAAAAATAGTAATTAAATTCAACTTGACTTAGAACGAACTTAGTTCGTTACTTAGTTACTTAGTTCGAACTTGACCACCAGGTCCTGGCAACGTTTGGGAGAAATTTTTGCTCATGCATCCTGCACAACTTGCCAAATCTGAGCCT:1 - chr3R 13444555 5' - HB 1217 1 47.95 CAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCTGTCGTGCGGACATATATTTATT:1 - chr2L 10909577 5' - 412 7492 2 62.50 GTGGACTTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCAT:1 + chrX 8968568 5' - 1731 4602 1 66.44 GTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chrX 3666527 5' - roo 328 2 74.66 TTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGGATTCTGAGTGTCGTATTGAG:1 - 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hopper 1410 2 82.14 ATTGACCATACCCAATACTCATACGACTTTTAATGAAGCCAATGAGGTCTAAAATGAAGATAAATCATAAATATAATTATATATCAGTCATTAAAGCCGTTCTCCATAACTAAAGCAGTTTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 - chr3L 9397776 5' + 1360 1 2 80.82 TTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chrX 683600 5' + jockey 91 1 74.45 AACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr3R 31112301 5' - mdg1 384 2 58.22 AGTCGAATCGGCGGAAGGCAATAAAATGTACAATGTACCAGTTGGTGGCCAGAAAAGGGTGAGTATTTGTTGATTTTTGGCAGGGACCTGTTGCAGGCGCTGGGTGCG:1 - chrX 21408485 5' - HeT-A 5652 1 57.41 AAAACTTGCGGCATACTTTAAGGCTGCGGCACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCTAGTGCGGGTGTGATGCTATGTATGATGGTGAGAGAAATCTGCGGTGCCACACACACACACACACACATTCACACAC:1 + chr3L 6015001 5' + accord 7037 2 73.28 AAGGTATGTTTTGATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - 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chr2R 14532038 5' - invader4 3021 2 74.38 AATGATTATTATGTCTAAACACTAAACACTCCTTTATAAATCTAATTTTTTTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAAC:1 - chr2R 4029437 5' - 297 383 2 76.81 ATTTAACGGTGCATGCCGCACCCGGACCAAAAGAACCATACTGACTTGGCCCAAAAACCAACACAACCCAATCCAATCCAATCCCCAAATGGCATCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chrX 6891581 5' + hobo 24 1 68.49 CGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATATTNAGGATTTTGTTNTCTAAG:1 - chr3L 6015645 5' + roo 8755 2 80.14 CAGTCTGTGCGGCATTGCGAGCGAGAACAGTTGGGCGGCATCATGTTTCTAATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr2R 8442773 5' + blood 7031 2 71.72 AGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTG:1 - chr3L 10033662 5' + blood 122 2 36.30 TCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTT:1 + chr2R 15199107 5' + Burdock 54 2 58.22 TGCATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 24084800 5' + roo 48 2 64.71 CCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3L 6131916 5' + roo 8739 2 71.23 TACAACGTGCTTTTTAAGTGTTTTGAAATTATTTGAGAAGCATTTTAATAAGAAAATTTTAGTTGAATACTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAA:1 - chr2R 22521994 5' - pogo 2060 1 55.40 TGTCTGGCCCGATGCTTAGTCAAATGAAGTTGTGTGATATGTGGTCAGAATTAAAATGTGAAATGAAAACAAAAAATCATTTCAGCTACACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAG:1 - chr3R 19951180 5' + BS 4998 1 65.75 TACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCGAATA:1 - chrX 21087700 5' - mdg3 233 2 57.04 GAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCG:1 + chr3R 7579370 5' - Stalker2 352 2 52.74 AAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCC:1 + chr2R 19805452 5' + F-element 32 1 66.67 TTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2L 4244874 5' + 412 7100 2 54.01 AATGGATATCTTATATTTAAAACGGGATCAATTAATCTTGATACTAATACTTGATACTAGGATACTATTGTATCCTAGAATATCCGCCTGAGGACAGGCTAAATTTAAAGGATGGGGAAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAG:1 - chr3R 11516199 5' + Quasimodo 4 2 61.54 TTAGTAAATACAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGGGCGGGTGC:1 + chrX 17770412 5' + hobo 46 1 50.75 ATTGTGTCGTCAACATAAAGCGGCGTTATGTATTTGAGTTCTAGCATTGTAAACACCATTGACTACGTCTCATCCCACTGCTACCTCGGAGTTCACCTTTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTT:1 - chr3R 2449031 5' - Tabor 7304 2 68.79 TGACTGTTTGCCTTGTCTATCCTCCGTTATGAGTGCCGAGTGTTATCGGCGCTCGAGACGCAGAGTACCGTATTGATCTGCATTTGCAGATTTATGCGGTGTGTTTGCAAGTACCCGCAATGAGCGTGGCG:1 + chrX 22413366 5' - hobo 72 1 57.25 ATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGC:1 - chr2R 18931922 5' + blood 7057 2 51.11 GCTTAAATGCGCACACATGCACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTG:1 - chr2R 10582528 5' + Juan 3807 1 76.71 TTGTATATATAAATATATATATACAGAGTGTGTGGGGTGGAGCTGATTTGTTCAAAGACTAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAAT:1 + chr3R 22171039 5' + copia 4915 2 53.42 TCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chrX 13091034 5' - P-element 2829 1 44.52 GAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 - chrX 14360840 5' + jockey 33 1 54.81 AAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 - chr3L 4547754 5' + mdg3 5323 2 70.68 ATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACATTCCCAAACGCAGACATC:1 + chr2R 4012513 5' + F-element 290 1 62.02 GTTAACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTC:1 + chr3L 23773896 5' - Transib5 2835 1 63.70 CTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chrX 14360844 5' + jockey 72 1 59.59 GGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGTCTGGCAACAACCCGGGT:1 + chr2R 5953896 5' + flea 19 2 68.00 TCCTTGATACTGTTGGCAATCTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chrX 18149940 5' + hobo 32 1 62.33 TCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 - 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chrX 21587763 5' + INE-1 126 1 51.94 CCAACATAAAATGCTTTGTTTTCGAGCATTAGAGATTCTTGTTATGTTGAGGGTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCT:1 + chr2L 402284 5' - roo 298 2 66.44 AAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCGCTCTCTGC:1 - chr2L 4864444 5' - mdg3 5409 2 77.24 TTGGTTGGCTGAATAATTGTGTTTCGGTACTCAGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chr3R 12519582 5' + roo 46 2 51.72 TTAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAACGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACGA:1 + chrX 22633234 5' + INE-1 89 1 54.11 TGGGATTAGAAATTTAATAAAGCCGCTTGAGAAAACAAGCGTCCCAAATTTCTTTCTATTCTTTCTGCCTGTCTCTTTCACTCATTTCGACAGATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 - chr3R 27707175 5' - P-element 2864 1 69.86 TACCAAGTGCTATATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGCGGAGCGAAGAGACCG:1 + chr2L 20761838 5' + Doc 417 1 65.75 AAAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGA:1 + chr2L 310052 5' - P-element 2832 1 48.63 TAAGAGAGCATATCATGCAAGTCCCTTGACCTATCATGCTTGACCTCATATATGCATATATGAGACACATATCAGCAAACTAATCCCAAAAAATTATGAAATTTCGCTTTCGTTCTACTGGCTGAGTAAAGGGTATCTGATAG:1 - chr3L 13007828 5' + INE-1 547 1 52.45 ACTGAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:2 - chr2R 9453392 5' + roo 8709 2 55.48 TTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGTGTCCACATA:1 + chr2R 7720035 5' + HMS-Beagle 6822 2 67.81 GAGCCACCTAATTGGAATTTAAGCTTGTGCTGGTAATTAGTTTACAAGCAGCATGGCACAATTGAGTGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAAT:1 - chrX 6538766 5' - pogo 2057 1 53.57 TAAGGTGTCGAAAAGTATGCAGCAAAAAAGTAACTTTATATTATGAAATAAATTCGTAAAGCTAGTTGATTAAAAATACATGGTTTTATGTTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 - chrX 18745455 5' + Juan 4055 1 64.14 GCTCGGTCAAATAACAGCCATAAACACTTTTTAAATTGAATTTTAACTATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCAC:1 - 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chr3R 6679419 5' - G4 3428 1 71.72 CCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTA:1 + chr3L 6557108 5' + Doc 46 1 52.08 TTGAAGCTTCCTCGGTGTATAATAGCACCTCAATATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATG:1 - chr3R 5165047 5' + invader4 2796 2 58.90 AATGAGCGTTTTCTACATATTTGCCGGCCGTGGTTGAAGTTTCGATTCGATTCCATTACATTCCGCCTCCGAGGGTCGTCGATTAACCCAATTTAAGGCGTTTTTTTTATTCCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 10397421 5' - Doc2-element 251 4 62.90 CAAGTCGATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACA:1 + chrX 21087539 5' + mdg3 27 2 63.19 GAAGGATGTGGTGCAGAATTCCTGCTGCTGAGGGTGAAATTTGAATTCGGTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr2L 2241312 5' + roo 68 2 65.75 CCAAAAGTGAATGGTACTGACCCCAAACCGTTGCACGTTTGTCTTAACACTTTGTTGCCTGGGCCTTGTTTGTTTTTGTTTGTTTTCCCCGCTCTTTCAGTTTTTTCCCCTATTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTTT:1 + chr3L 15250553 5' + hopper 144 111 63.70 TCAGATCCAGATTATGGAATATTTACAAAGTGAATTAAATGCGTCCACACATTTTCATTAATTACTTATTTATTGGCTGCATTTTTAAGTCAAATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACT:1 + chr2L 20029356 5' - I-element 5329 1 62.24 GGGTAAACTAGCGGGTGGGTGCGTCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTG:1 - chr2L 2544853 5' - blood 345 2 58.46 TAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr2R 12492389 5' - hopper 1376 1 56.16 ATGTGATTCACGTTTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGA:2 - chr2R 954534 5' + Quasimodo 72 2 73.29 CCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTT:1 - chr2L 20628677 5' - Stalker2 350 2 51.37 ATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGTGCAGATCGTGTGCTTATCTCACA:1 - chrX 14360815 5' + jockey 101 1 78.08 CGTGCGAACCACTCCGCTGGCGACCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chrX 20330603 5' + P-element 47 1 41.18 TTTAAATTCATCACTTGTCTCGCCGTATATTAAGCGTAAATTGTGCGCACTCCTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTC:1 + chr3R 19950398 5' + BS 5007 1 73.29 AAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAA:1 + chr3L 17667614 5' - P-element 198 1 16.31 AAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCCTGCCG:1 + chr2R 14072525 5' - mdg3 167 2 70.00 ATCTGGGATGCATCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr2R 8436340 5' - 1360 3355 1 60.29 TAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACCGGCTGCGAGTG:1 - chr3R 23636406 5' + X-element 4315 1 78.20 ACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr4 868731 5' - roo 347 2 62.86 CATACCTAAGTAAATCTGTGTGTGTGTTTCTATATAGCATATGAATATGCCCAAATAACGATAGCATTCTTATTTGGGATTTTACATTTGGTCAATCGAGCCTTTAATCGACTCTGCAGTTTCCCCCTACCAAAGGTAAGGAACTC:1 + chr2R 9459094 5' + roo 468 1 54.79 AAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTT:1 + chr3L 19951145 5' + Ivk 22 1 70.55 ATGCACGTGGGTGCTTTGTATTATGCATACACTTGGGCTTGACTGTATATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr3R 3181166 5' - opus 7486 2 73.72 AGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATAT:1 + chr3R 27547608 5' + 17.6 6952 1 62.22 ATTTACATTTATAAAATGTACTCTTTATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTT:1 + chr3R 26472763 5' - 1360 3365 1 67.59 CATAGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGNGTAAACATATTNAAAAGC:1 + chr3R 27547605 5' + 17.6 33 2 59.59 CCCCCATCCTTACCGCCCTTCTTCGCACCCACTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTGGCGCAGCCGGTAGGATGTC:1 - chr3L 15101341 5' + Tirant 418 1 78.08 ACATTTGTTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGT:1 - chr3R 934285 5' - Rt1b 4735 1 57.24 ATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 - chrX 13628811 5' - roo 9010 2 67.72 CGGATCTGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr2R 7895514 5' - mdg1 366 2 54.11 GCGGGCATATGCAGACGTGTTTATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCT:1 + chr3L 17268209 5' - hobo 2930 1 74.60 TGAAATCATCAACGTCATCATCAGTTGCTGTCTGCTTGACTTGGATAGGTTTGGTTTTTTTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 - chr3R 9298754 5' + hopper 32 1 50.81 AGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCA:1 - chr2R 14532077 5' - invader4 3039 2 53.52 CAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATA:1 + chr2R 7314626 5' + blood 53 2 54.55 TTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATA:1 - chrX 3534000 5' - 17.6 452 2 57.24 CCGGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:2 - chr3L 20061465 5' + roo 31 2 61.64 TTACGCATCGGGGGCCTGGTCCTGGTAAATAGACATAGTTTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGC:1 + chrX 8469191 5' - hobo 2935 1 74.75 TATAGCTTGCCCTTCTCACTCATATTGTATACATACTCATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAAT:1 - chr2L 5207516 5' - opus 7427 2 79.29 GTAAGGTAAAATTGTCCATATTTTACATATTTTTTTTTTAACTTCAATCTATTTGTTTTGGATCCAAAAGGAATCGTTCAGTCAATTCCTCTGAACTTGACCTAATGTGTGTATAAAGCTATATGAGACCANGTGGTTTCTTAATT:1 + chr3R 16004284 5' - G5 4742 1 80.14 AGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATT:1 + chr2R 9341553 5' + roo 72 2 69.66 GCGGCAATGACAGGAGCGCAGCGTAACTTCACTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 21534194 5' + 1360 17 1 73.97 GATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATAATATTATAATAAAACTCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACAGCCATA:1 - chr3L 24208211 5' + Quasimodo 58 2 62.33 AGTCCTTTGGTCCTCCGGTCGCTGTGCATTTTTTGTGCACTTTAGCACATTCTTGTCTGCGCTCCCTTGTCTTCTTGGGCACCAAAGGGTATGTAAAGCAGTGGTTGTATTAGGGGGGAGTCCGAATGGATTCCACAGG:1 - chr3L 13719152 5' + Circe 7179 1 56.12 ATCGACGTTTTGATATATTATCACCCCATAAATAAGGACACTTGCAAAATGTGGCCTCAAAAAAAAGTATTAAATATGCTCAAATTTATACAATTTCATCACTTAAACAGCGATAAGAAATACATTTTGTCAAGAAAGTGTTTACA:1 - chr3R 25495894 5' + S-element 3 2 52.05 TTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAA:1 + chr3R 12046762 5' + Doc 80 1 74.64 CAAAGCGAGTCGCAGCTCAGACTTAATTAAAATTTCATTGTGTGGCCCGGCTTTGACTGCTTCTGTTATTTCACGTTTCTGCGTATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 - chr3L 12991474 5' - mdg1 393 2 63.97 CCACTGACCCTTTAAGGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCACTCTTCACTTGTGGTGATCGTCCTTCGGTGTCCTTCGGGCCT:1 + chr4 145868 5' - gypsy8 496 1 81.05 AATACTCTAACGACTCTTTTCACTCATTTTATAATGTTAGCTGTTGAATTTATTCAAAGGAAAACGCATTAAAAACTTTTTACAAATTGTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAG:1 - chr3L 22294534 5' + pogo 25 1 68.06 GAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATC:1 + chr3L 15148578 5' - roo 359 2 55.56 AGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCA:1 - chr2L 15085728 5' - opus 445 2 61.59 ACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGA:1 + chr2R 7314650 5' + blood 7091 2 69.86 GCACCCTGACTCGCACGGTAAAATTACACATCGAATGGTGGATACCTTGGAATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATA:1 - chrX 13060327 5' + Tabor 3 2 72.00 TGGCTCATGGGAAACAGTGGCAAAGCCAAAAGGGGCTTGAAAAAATTAGCTTATTCTAATATGAGAGTATAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACT:1 - chrX 8469347 5' + hobo 13 1 76.71 CTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAACTCAAAACTCTTTCACGATAATCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr2R 14385563 5' + jockey 57 1 50.00 CTAACTGAAAAGTCACAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACT:1 + chr3L 1437863 5' - Transpac 5174 2 55.17 ACGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 15148579 5' - roo 348 2 59.31 GTGCCATTTTAATCTTTGTTATAATCTTAAGTTAATAGCTAATTTGGAGTAAACCGTAAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 + chr3R 8112654 5' + Burdock 10 2 74.66 TTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCG:1 + chr3R 10144365 5' - Chimpo 126 1 56.55 GCTGATCTTTTAAGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 - chr2L 4245024 5' - 412 7529 2 68.49 AGAAGCGCTCAAGTTTAAATCAGTTCAGATCGGAATCGTCCACGCGAACTGGCTTGCGTGACAGATATAGAACAATGATGGTGGTCAATGCGCTGACCAGGAATATTACGGGTAACATTGGTTGTGCACTAAGTTCCCATACTGCC:1 + chr2R 15199288 5' - Burdock 6028 1 75.34 AGAATGTTCTTACTTATAAATAGGTTATTCCACGTAACTAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATGTATTATTATTAAAAGGAAAGACAACGACTCTTTCAAAAGAACATCACCATTTATCATAAAAAAATCGGTGGACTGTGCCTGG:1 - chr3R 4144629 5' + I-element 318 1 73.29 AGAAATCCTATAAAGTGAGTATATCCTTGATTAGGATCACTAGCAAACTCGATCTGGTTAGTTTAAGTTCTCGATGTTTAAACATTAATATAATCGGATTATTTGATTATGATTTAAATATTAAAATATTTAAAATAAAAAAAAAA:1 + chr2R 11925505 5' + TART-B 10630 1 77.40 TAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCC:1 - chr2R 4261969 5' - invader4 2984 2 55.17 ACGGACGTAAATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTGTTTGTG:1 + chr2R 6767988 5' + pogo 55 1 56.85 GGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAAATTAAAAATGCAGC:1 - chrX 10725092 5' - pogo 2052 1 53.42 GAACCCACTGGCGGCTCAATTATAACTGACAAATAGAACTTATTGTTCCTTAATGATACCGTGTGAGTTGGGAAATTTATTTTATCTCTCTCTTTTTATTTACAATCTGTCTTTAAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAG:1 + chr3L 15099508 5' - G4 3804 1 71.92 TTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTG:1 - chr2R 9607358 5' + P-element 77 1 25.95 ATGTAAGGGCGGCAGCAGTAAAAACTGGGACACAAAGGGGCCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTTATGCGTTACACATGCC:1 - chr3R 7625384 5' + hopper 77 1 69.66 AAGGCAGCTAGAATATATGCTTGGACCTGATAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGG:1 + chr3R 13254886 5' - roo 9030 1 53.68 CAACAAGGAGAGTCGCAAGGAAACTCAAAAACCACTGTCGTGTTTCTATTATCTGAAGTGTAAAAGATATTTATGGAAAAGGCTTCTGAGCGCTTGAAATCCTTGGAAATATTTTAAATTAGCAAATAAAATATTTTTAAAAAACT:1 - chrX 4589741 5' - 1360 3090 1 45.89 TAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr2R 9607361 5' - P-element 2798 1 25.34 ATTGGTTTATGGTGATAAANCAATTCGCATGATACTAATTTAATTTGCAATCTATTTCTTCTACCATTGAGAATATGGAGTTACTGTTCTGGTAAAAATATTTTAATTCCAATTGAGATGGTTTTAATAAAGTAATCATCAGTTTT:1 + chr3R 20841000 5' - Juan 395 1 65.75 AGTCTTGTTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACC:1 + chr3L 2167566 5' - opus 465 2 61.38 AGGCAGCTTCTAAATACGCAGCGTTCTTCATGAAGACAGGACCGCTAGAATCGGGTCCCTTATTCGGTTTCCACATCTCCACCACCACGTACAGTTACGAAGTTATATTATTCAGTTATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGGATA:1 - chr2R 5321239 5' - INE-1 509 1 68.49 TGGCCATTATGCAACGACAGCGAAACGAAGGTGCTCACGAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATTGGTCGGCGGTCAGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCCATCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chrX 19887081 5' - P-element 2874 1 75.34 ATTAGATGTCTTTTGTATTAATTAAAATAATTATCAATTAGAATAAACGCTCAGACCACCCACACTTAGTGTTTTACTATCAAAGATGTGTCTTTGCATACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACC:3 + chr2L 21198118 5' + flea 14 2 76.71 CATTTTAAATTTTAATTGTAATATATTCACATCATCAAAAATATAAAGAAATAAGTAATTACACTCAATACGGTAACTACTTGATTAATAATAAAGACAATAAACGAAAAATCTATAAGGATCAGGTGAAACGGAAATATAAATA:1 + chr3R 20200497 5' + Transpac 4793 1 74.48 CTGCATGGAATTTTTGCTATTTGCTCCGCTTTTCAGACGTGTGTGTGTATATGTCCCTGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCC:1 + chr3L 21764331 5' - hobo 2924 1 72.31 TATATACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 - chr3L 2167710 5' + opus 10 2 72.07 CTCGATTTTGTTTGATAAACAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 - chr3L 13285728 5' + roo 15 2 75.34 CGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTT:1 + chrX 15198045 5' + Max-element 34 2 54.63 CTAAATAAGTTTAACCATAAGCCCTTAGCTATTATTTAACTATTTATAAAGCAAAAAAATATTTATAAAAATAAATATATAAGGCGACCAAGATATGTATGTACATATACAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chr2L 18311575 5' - opus 484 2 73.29 GTTTATCATTAATTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chrX 21639416 5' + 412 7111 2 57.53 GTTATAACTTGAATGCACACGGATCTCGCATTTGCTCGTTTGGTTTAGAGTTGCTTAAGCCTTTTACATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAG:1 - chr3L 17748497 5' + Doc 411 1 73.29 CTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCG:1 - chr3L 9318105 5' + P-element 2857 1 68.35 CGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGA:1 + chr3R 3617317 5' - micropia 5132 2 75.56 AGGTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTATTTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAATCATTGCCTTATTAATTGT:1 + chr3L 24996077 5' - 1360 440 1 58.90 TTAAGCTAATGGGAATGTTTTGAGTGAATATGTAAACATACAACGTTGAGAAGGAGTGTTGAATATATAATGAACATATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr3R 1519343 5' + opus 7043 4 57.93 ATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGGCATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chr2L 8120207 5' - roo 8981 2 80.69 ATTTAATGTCATAAGGGTATAACGTATTATTATTGAGATTGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr2R 12102080 5' + hopper 7 2 76.71 AAAATACATTTTTTTTGGCAATGGTAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3L 7024583 5' - 412 475 2 67.86 CGCAAAGTATCCACAATGCTGTTCAGCTGAAGGTGAGATGTTACTGTTGTGCACTGAGGGAAAATATTATGAATACTACTATATGAATGAATACACTATACTACACCATGAATAGATATTACTATCTATAATAATATTAA:1 - chr2L 3588641 5' - Tc3 280 1 78.57 TGTTTTGATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 5193532 5' - roo 353 2 58.22 CTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGG:1 + chr2L 8284341 5' + Doc 404 1 59.26 CAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:1 - chrX 21668433 5' + Stalker2 19 2 71.23 ACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCATTTTTGT:1 + chr3L 24291993 5' + 1360 83 1 75.34 CCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCT:1 - chrX 21668377 5' - opus 7467 2 45.21 CAATCTGAGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 29680200 5' + 412 7113 2 64.38 CCCATTTAACGCAGTTAGAAGCGCATTTTCCGCATTTTCANTTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACANTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGC:1 - chr2L 2291600 5' + I-element 15 1 74.66 ATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTG:2 + chrX 13060197 5' - Tabor 7257 2 62.33 CCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 16274627 5' + roo 8739 2 71.72 GCTGTGGCCAGCTTGCACTCACAGTCACCGCCGATAGCCCACCGAGATATAAAGGCAATCCAACCAAGTATTAGACCCTAATTAACACATTAAAAATAAAAACTATGTTAGTCACGTTGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCAC:1 + chr3R 4222144 5' + HB 1408 1 65.75 CTTTGTCTTTNTTATTGACGGATAATTTATTCGACTCACAAAAATTAATAACTACGTAAGTATATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCA:1 - chr2R 3146372 5' + rover 50 2 57.25 GATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAA:1 - chr2R 17350582 5' + F-element 91 1 69.44 TTTTTCGGAGATTTTCCGCCTGCATCCTGTGGCACTCTCAAGTGCATTTTAATGGATTTTTAGTTTTCGGTAGAGAAATTCGTACATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGT:1 + chrX 9519436 5' - 17.6 7387 2 63.01 TGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr3L 21764445 5' + hobo 72 1 68.53 TTTTTAAGTTTCTCTGTTGCGATTGAACTTGATTTGAAAAACGATACGATTCTCTTACCCTTTCCTAGTAAGGGCACTATAGAATCTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATAT:1 - chr2R 6493398 5' - copia 255 1 59.86 CACTTAATTATGTGCGAACATTTTGTGTAGCATACTTCAAGGCCATCGCCGAGACAGGGACAACGAGGATGGAGGATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTT:1 + chrX 14360742 5' - jockey 4954 1 55.00 GCTTTCTTTTTGCTCTGGCTCAAAGCAAATTAATGATTTGCCATCAAGCAAATAAATCAAAAGCTTCAAAGCAGATCTCTGGCTTAGCGCGCTGCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3L 22330895 5' + hopper 10 2 76.52 CTCATTTTATGCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGACGCCGTTTACAGATGTTAATATT:1 - chr3R 30569114 5' - mdg3 239 2 62.40 AAAGCTTATTATGACAGCAAACTGGGGTAATAATATCGAGAATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCTGTTGACTA:1 + chr3R 10714118 5' - 297 6943 2 56.85 GGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACT:1 - chr2L 15085770 5' - opus 7482 2 69.18 ATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATA:1 + chrX 13060213 5' - Tabor 402 2 73.29 CACAAATGCAGCTAATGTGCAATCCGTTGCTATTGTGCAGAAAACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCTGTGTTAGAGCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTA:1 - chr3L 11535909 5' - roo 208 2 55.86 CCGGAAGTCCACGAAAGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 - chr2R 9750286 5' + opus 7028 4 67.12 CAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTGACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGTATATTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAAATACAAATATT:1 - chrX 3663219 5' + 297 213 2 75.34 ATTGGTGCAGTTAGATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTAGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATG:1 + chr3L 22518946 5' - hopper 1328 2 73.97 AGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 + chr3L 20061333 5' - roo 9012 2 58.90 GCCTTATACTACTGAGTATTGGTGCTGTGGAATAGGGGATCTTATTGGGAATTCATGAATTCAGTTAAAAAACTCCAATCTCTGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAGAGAAATCAG:1 + chr3R 8563504 5' + 297 6615 2 58.90 ATACTTCATGTAATTACGCGTGCCCGAAAATGAACAAAATTAACAAAAATATAAATCGCGTGGTTGCACACAGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCATTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTA:1 + chr3R 17243069 5' + hopper 18 1 73.10 AGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTA:1 + chr3L 18216463 5' + 297 49 2 54.79 CATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chrX 14360809 5' + jockey 60 1 75.76 TCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 15523116 5' + 412 42 2 57.89 AACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAAC:1 - chr3L 9324559 5' - HMS-Beagle2 7140 2 56.85 TACGACCAGAAATGGGAAACTTAGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGT:1 - chr2L 14056814 5' + pogo 9 1 67.41 GGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAAAAAAAAGAGAATGCTATAATCGACTTTCAGACCCGACTAGCAGATACCCGTTACTCAG:1 - chrX 14770745 5' - INE-1 547 1 67.37 ATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTG:1 - chr2L 544920 5' + Doc 66 1 63.70 GCAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGC:1 + chrX 20361936 5' - hopper2 1565 1 56.16 GCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATT:1 - chr3R 17243240 5' + hopper 35 1 59.59 ATACCGCGGTATAATCACATTCTCCCGAAATTCTGTGTTTTGGTGAATACCTTATTTTAATACATTGTACAATTCTACTGTCAGCAAATACTTGAAATATATATATAATTACAACTTCGCGATTTGTTGGTTTATAAAAA:1 + chr2R 4673522 5' - Quasimodo 7354 2 73.57 CTAATTTCAAAAATAACTATATTTTTATTTGCAGGAGCTAGTGGATTTGTATGAACATCGCAATGATGAATGAATGATGTGAGTGATTGGGTAAGTACCATTTAAAACTGGTCAGCAACAGCAATTGGACACCCCTTATCCGG:1 + chrX 3450976 5' + gtwin 7036 2 75.52 TTGCTTTACACAATCGAAACGCACGAAATGACAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTTATTT:1 - chr2L 1243964 5' - I-element 5280 1 72.93 GGCAGCTGCGTGTCCAGATGGCTAAGGAGGTAGTTGCGGTCCTCGCGACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCCCACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3R 17627623 5' + roo 8686 2 62.10 TAGCTGGAGTTCCGAATTTCATAGGTAAATTACCTAAAAATAGTGGAGAGATCTCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2R 17269055 5' - roo 397 1 76.03 GGCTCGAAGGACCATGAAATGAGTGGGCGGGAAGATTTCTTTGG:1 - chr2R 4999696 5' - Max-element 8526 2 88.64 TTGTTTCGCACGGGTCCCACGGCCACACCTCCCGCCTAACCGACCGAGGGGCGCTGCCGTGCATCGTACGTAAATAACTATATTAAATAATACTGTTAGATGGATCTAATTATGTAATAAAAAAGTTAAAATCGATTGCAG:1 + chr3R 1135321 5' - Cr1a 4259 1 46.81 TACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATA:1 - chr2L 544923 5' + Doc 63 1 61.64 ATGTGACACACTGAAAGCGAGAACACAATAATTATACAAACAAATATTTATGTATGTATGTATGCACGGGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTATTTTA:1 - chr3L 18044677 5' - hopper2 1556 1 50.68 GAAGTCCATGAATCGTTTGTCGGGTTTGTGGAAATAAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTC:1 - chr3R 3320513 5' + 1360 73 1 73.33 GGAAGTTATATTTCAAGACAATGAGTTTGATATAAAATGTAAATGTATGCATTTTATATCTTATTCCACCAAATTATTGAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chrX 8346280 5' - roo 393 1 71.92 GCTCTGATTTATATAGGCCATTCCATCTGATTGGCTCAGCGTATCAAGAACATCAGAATGCACACACAACGCATAAATAAAACCATTCGCACCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACA:2 + chr3L 20143218 5' - hopper 1387 1 66.44 CATGCTTACATAATCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 20905068 5' + roo 8719 2 57.53 ATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATATATTGGAAATACATTAAACTGTTATGATA:1 - chr2R 11778046 5' - hopper 1325 1 72.60 AGGAAGAGTAATTTTTCGCCAGAGATGAGCGAAAACATCTGCGGATCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGA:1 + chr3L 17482086 5' - 297 6905 2 70.55 TCTAAGCAAACATAATAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTAATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCATGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACG:1 + chr2R 11574970 5' - INE-1 144 1 65.96 GTTATATTTGATTTAAAAAAATGTTGCATACTTCTACGGGGGAAGGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGCGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTT:1 - chr2R 15349810 5' + Transib5 2946 1 68.28 TTCGTCCTGCACTCGTCCTCTCCCTTTGAATCTCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr2L 15523148 5' + 412 7095 2 58.22 CACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTAC:1 + chr3R 24666366 5' - hobo 2904 1 56.60 CAAAAGAAAAGCACTTCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGT:1 + chr2R 18931786 5' - blood 7359 2 63.01 TCACAAGTCTATTTGTTACCTGCAGCCCTGTTTCCACATTGTTTGAACGAATGAGTTCAACTGGTTTAATTTTAGTTACCGAAAGAATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATA:1 - chr3L 26709907 5' - opus 467 2 64.38 CTTCGGTTTTGTTTGAAAAGTTCTGCTCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 + chr2L 14056645 5' - pogo 2064 1 55.48 AATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCG:1 - chr2L 4244985 5' - 412 7513 2 51.22 CCTAACTAAATATAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr3L 15148549 5' - roo 9041 1 63.70 GTTAGAAGCGCATTTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 - chr2L 2291587 5' + I-element 28 1 66.44 AACAATTATCAAACGCCCCGAAAAGTATGCAATAAATTACACAACAGGCACTCGCACATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAAC:1 - chr3R 27315187 5' - jockey 4961 1 60.27 AATAAAGGCCACTTGTTGAATGTGTGAAATGCTTACACACACGCACACACACTCACCCAGTAGAAGCTTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATT:1 - chr3R 12078716 5' + hopper 54 1 53.42 CCCTTTACCTCTGGCAGGTCGCTCTGGGGGATGTATTTAAAATTAAAATTGACTCTGAACCTTTCACAAGATTGACAATCATGGGATTTCGGGAACTTCAATTTACTATATACATACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATT:1 - chr2L 1045119 5' - mdg3 239 2 76.71 GAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 + chr3R 27547609 5' + 17.6 6964 2 56.85 AAGCTTTAAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTCCAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 - chr2R 15199199 5' - Burdock 6315 2 76.55 CATTTTGTTCTGATTTTTCTATTAAAGACCGAGAAATTTTATTTATNATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAATGGTACGGAAAATATTTATTTATTTATATAATGTAGGTNCATGTTTAAAGTTT:1 - chr2R 5185480 5' - mariner2 807 1 61.64 GAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 - chr2L 18219405 5' + copia 59 2 59.31 TCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCG:1 + chrX 9613964 5' - Cr1a 4410 1 86.49 ATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr2R 23094996 5' + 412 7087 2 60.27 ATAACCATTAAAGAAACCTGCTTTGAGGCATTGCTGGAATACCAGAGTTGTCACTTGGGGATTGGGGATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCC:1 - chr2R 17396032 5' + jockey 4613 1 54.11 AATGGTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGCTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAATAACTACA:1 + chr3R 15003119 5' + Doc 55 1 52.59 CAAAATTATGCACCCTGACNCGCACGGTAAAATTACACATCGAATGGTGGATACCGTGGAATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chrX 13060336 5' + Tabor 6855 2 68.49 AAGACTAATAAAAATGTGAAAAAATATGAAATGTTTGTGGGCCAACAAACTTGCGCTGCGTCTTTCTCTCTAGAATTTGTATGCTGAATCTCGATCGTCTAGCTCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGG:1 - chr2L 22063439 5' - INE-1 127 1 60.69 ATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTCGGTGGACCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGT:1 + chr2L 20132980 5' + 297 6629 2 58.65 TATGGCGTAAAATGTTTGTATCTTAATTGGTTATATTTTGATGAATATTTATACATATAAAGAATAGTAAATTTAAAAAATCAATCTTTGTATTATTTTCTCGAAGTGCATGTCCCTTTGTTAATTTGTTTTTCTTTTTCCTTTTT:1 + chrX 13794016 5' - Doc2-element 238 1 58.22 GGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTG:1 + chr3R 7049370 5' + Burdock 76 2 74.66 CCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 13091014 5' - P-element 2875 1 70.83 TCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr3L 2317137 5' - 412 426 2 61.64 AGGCAGCCGGAGCATTTGACACCCCGAACAAATGCGCCAGCTTGTAACCCGATCATCACCAGCTGGGTGGAGGAGCAAGTGCCCACCTCATCATGGGTAATTTTATTTATTTAACAAAATTAAATATA:1 + chr3R 11073480 5' - Ivk 5371 1 76.56 GCCTTGAGTGAAAGAGATAGCGGAATGGACAGCGGACAGGCTTTTAGCAACATGAAAATGCTTTATGGCAATTAAAAAGGTAATACATCAAATGCGAAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATT:1 - chr3L 5051189 5' - flea 4994 2 73.29 GTAGTTAAAGTTAACTACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACCGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTACAGACTTACAAT:1 - chr2R 12462243 5' + roo 8683 2 63.33 AGCGCGAACTGCGAAAAGCGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGC:1 - chrX 21045292 5' + P-element 50 1 45.52 CGGATACCCATTAAGCCAGCTAGAGAATTTTCAACATTTTTTGTATACCGATGGAAATTGGCCAGACGAAAAAATGCGAAACATTTTTGTTTCCGTCAATGTCTCTAGAATCTGTATGCTTAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATTG:1 - chr4 1187103 5' - INE-1 161 1 75.34 GAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 5728937 5' + roo 8745 2 75.34 TTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATC:1 + chr3R 26854761 5' + jockey 85 1 69.18 GGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGTGTAGCAGAA:1 + chr3R 11284920 5' - blood 7303 2 74.66 TTTGTCGCTGCTGCAGAGCAGATACCTATATATGTGTATATTTCTACATGGATACACGGATATATATGTACATGTTGCCACACTGGGTTCCTTTTCTTTATTGTTTTTTTTTTTCTTCTTGTT:1 - chrX 15357947 5' - gypsy7 5008 1 61.79 AGCCAAAAGGGGCTTGAAAAAATTAGCTTATTCTAATATGAGAGTATAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTG:1 - chrX 8469324 5' + hobo 35 1 61.38 AAGGATACAGGTGAGCGGGTTTTTTCCACATCCATTTGGAAATCAGGAGGAATGAGGAAGCTGGAAAAAATAGCTTTATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr2R 20972742 5' - jockey 4950 1 48.63 TTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3R 17987648 5' + jockey 70 1 67.67 TCCACTTTGTTCATTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chrX 17792605 5' + roo 8739 2 71.23 CGCTCCGCTTTTGGCGTCCTCAAATTAAATATTCCGGCACCATTAGTGCTAAAAGTGTTCGCATTAAAAACATTTTGCATTTTTTCTCGCCTCTTTTTATTCCTTCTTTTCCTTCTTGTACGTTTTTTGCTGTGAGTAGGTCGTAG:1 + chrX 17340076 5' + copia 145 2 67.12 TCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGGGAACGCCAA:1 - chr3R 10737064 5' + F-element 69 1 58.22 CTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 - chr2L 2544819 5' - blood 7315 2 71.74 TGGAACAGCGACGATCTGAGGTTGGCAAAACAAATAAAAACACTACTGGAGATGCTTCATTAACTCGGAGAATCGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTT:1 + chr2L 19341407 5' + FB 15 1 44.14 ATAAATCATCAATATCACGTGTGTGATTACACGTTGGTAAACGCAAAGCCCACTCTTCCGGGCCATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTT:1 - chrX 15198163 5' - Max-element 8529 2 75.00 TCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chr2R 12102029 5' - hopper 1357 1 58.90 AAAAGGATTTCTTTCTGCGGCAATTAAACTATCATAATAATAGTTTTTACTGAATAATTTTTGTTTTTAGAAGTAAACATACGACCCTTGTTTAAGGATTACTATAAAAACTCCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAAGAAT:1 - chr3R 14447067 5' + I-element 164 1 79.45 TATGGCCTTAAATGGCCAGCAGTCATAGCAACTGGAACTACTACAGTTGGCAAACAACTCGCATCGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGAAACTTTTGCCCTCAGCGAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCT:1 + chr3L 7286707 5' + Doc 383 1 57.24 CGAAAGTGATCCTCCTGCGAACTCCTTTCAAGCAGCACTACTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGC:1 - chr2R 10996379 5' - accord 7025 2 92.75 CACAGCTTTAACTGAGCTTTATTTGAATTTAAGATAGCTGCCCGTTCGTCCGTCTGTCATTAAAAGAACTCAAAACTCAGAACTCTTTTTTGGTTTTTGACCTTCTTTATTCATTTTCACTTGCTAAGGAACGGGTATCTGATA:1 - chr2R 8529667 5' + INE-1 546 1 50.69 TCCTATTCATAATAACATAAAAAAACCCTAAATATCTGAGACAATAATAAACATTTAATGCTGCGTTTCCCACTTTTAAAACCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAA:1 + chr3L 9695902 5' + 297 37 2 60.27 GGACGTGAACTAATGTAAAGGCCACCACTGTATCAAATGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATA:1 - chr3R 27547715 5' - 17.6 411 2 73.97 AAGTGCTATATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTC:1 + chr2L 20761842 5' + Doc 421 1 63.01 ATGGGTCCTTAAAAGCCGCTAATGAAATCAATATAGCCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3R 29627923 5' + roo 8733 2 74.62 AATTGCTGTTTTAGTACCCTGGAAACTATGAATTGTAGAAGGGTTTGATAGGGCCAGAAGAAAGTTGAGCACATTACTGAAATAGTAAGGTTACTAAGATTTAAAAAAAAATATGCCATTTATAAAATATTTTTTTTCTGAAAAA:1 - chr3L 6447819 5' + NOF 351 1 84.83 CCACTTGCTGCTGAGTAACGGGTACCTGATAAAACGTTCTCTTATGTCTGTCTAGGACTCTTGCGTTTTAAAAGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCC:1 + chr3L 21770879 5' - hobo 2920 1 43.86 GGGTAACGCTCGTCTGATTCGCAATTTCAACGTGGAGTTCAACCATTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTT:1 + chr3R 19134403 5' - transib2 2747 1 67.81 AAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - 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chr2R 9341651 5' - roo 9004 2 66.90 ATGGGTTTAGGATTATTATGGGGCAGGGTATATCGTCCTCGGGCGAGGCAACGCTCGTCCTGGGGCCACCTGTACCGACCACTGACTCCTCTCACCCTTACGAACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACG:1 + chr2R 4297263 5' + 1360 3275 1 73.57 GGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTT:1 + chr3R 11756738 5' - Tirant 8442 2 60.27 TATTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr2L 18219327 5' - copia 207 2 72.92 TTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAG:1 - chr3R 10736170 5' + McClintock 5964 2 74.10 CGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr2R 14415549 5' + 297 47 2 54.79 GAATTTCACAAATTCGCGGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAA:1 + chr3R 12341107 5' + Tirant 8145 2 62.00 CATTTAATATAGAAATATCTGTCCGTTACATATCTTTGAAGAATGGTATATAGTAACATAATATGCTTCTCATATTACGTTTACATACTTACACTAATTGTACATACAATCTTGCACATGCATAAACACATGAAACCAGTTTACAT:1 + chrX 5886156 5' + rover 7025 2 69.86 ACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689390 5' - diver2 4466 1 37.14 ACTGTAACGTGTAACGAATTGAAGTGATGGAAGACTAAAGTAACTATACTTGCTTGTACAGATACCTCTTCGTTACATACAATAATGAAATTGAGCGTGCTTACAACAACAAGAAAATTAAGGAGCTAGTATACAAAATTGGAGGA:1 - chr3R 734945 5' - Gypsy12A_LTR 2072 1 66.44 TTACTCGCATGCCCACGCCTTCAACTGGGCGCATCAGATCGCTCAGTTATGGAATGAATGGTGATGATGATAGTAGAAGCAAAGACACTAGAATAATGAAAAAGAAGAAATTCCTACATGGTGCCAATTGATCCAAAATAATATAA:1 - chr3R 22733432 5' - 1360 256 1 48.63 AAACTGTTGGTTATTATTGATTTTTTAGTAACAGTGTTACTCCTTTAATCGCAATCCATTGCGTTTTCTGTTTACACCCTGATTTTATACTGCGAATTATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAAT:1 + chr3R 13559947 5' + jockey 4796 1 62.33 AATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 7024477 5' + 412 72 2 75.20 TGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 18128506 5' + roo 86 2 81.12 CCCAAGTCACTGCCAGATTGAGCTTCCCTGTATCCTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 - chr2L 12932200 5' + opus 22 2 65.04 TGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 + chr2L 21683391 5' - pogo 2039 1 63.83 TTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGGGGCCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 + chr3L 18216467 5' + 297 21 2 64.04 GTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTTCTCCGCCCAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAA:1 - chr2R 17350605 5' + F-element 69 1 51.03 GTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2R 21713320 5' - P-element 2844 1 40.87 AAAAGAAACAAATAAGTTACATTTAATTAATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGACCAC:1 - chrX 8876914 5' + mdg1 7131 2 77.40 GTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3375 1 68.75 AAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 + chr3L 5027171 5' - roo 9037 1 52.85 TTTGGAACTTTGTTAATTTCAAAAACAGCCTTTTCGATTGACTCGAAGCTAACATCTGTACGATTTTTTTGGTCATATATGTATGTACATATAGATACTAAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCT:1 + chr2R 14531918 5' + invader4 2774 2 77.40 GCCGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGCGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCT:1 + chrX 15198043 5' + Max-element 8284 2 56.00 TATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr4 868635 5' + roo 8723 2 61.38 GACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTA:1 - chr3R 7074878 5' - P-element 2807 1 30.82 GCTCATTTTTTGCTGTTGTTCTCGGGTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr3L 13057483 5' + 412 29 2 65.75 GACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 + chrX 19662960 5' - P-element 2837 1 43.85 GGATTGTCGATTCCGTTTAGCAAGAATAAATCAATGACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGATT:1 + chr3R 11516479 5' - roo 9037 1 64.38 AAAACGCCGTCAAGTAAGCAAGTCAACAAATGTTAATGAAATTTCCTGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTT:1 + chr3R 26180381 5' + Transpac 25 2 73.29 CACAGAGGATGGGGATGCCATTTGCCATTCATATTGCACTATGTACTGGCACCAACGTTTATGTGCATTAGAAATACACGCAGAAAAGGTCATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTT:1 - chr3R 20984011 5' + hopper 5 2 78.08 AATGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTATTACAGGTTTCTACAAAGTTTACATATTCTTGATTAGAATCAATAGCCGAGTTAGTCCGTATGAACGTCGATATCTCA:1 - chr2R 2957713 5' + INE-1 135 1 55.05 AGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACAT:1 + chr3R 25597846 5' + copia 4942 2 70.55 GTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chrX 10319728 5' - mdg1 7421 2 58.33 CCATAAAAAAAAATATGTAGAAAAATTCTGGGGCCTGTTTGGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr2L 2730664 5' - roo 9016 2 56.16 TAGGTAATATCTTTTTGTATAAAAGGTTAAGCTTAGTAAATACAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chrX 17770380 5' + hobo 19 1 69.78 AAAACTTATTTGAAAGCCGCTGTTTGCAGTCTTGTTTTATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr3L 2167539 5' - opus 491 2 76.71 TGGTGTGTGCGTTTGCCTTAATAAATTCGTTTCGTATTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 18128458 5' - roo 335 2 75.19 AGAATACCGCATATTTCGGTTCATACTAAACTCCCCCTTTTTTTTTTTGTTTCGCACGGATCCCACGGCCACACCTACCGCCCAACCGACCGAGGGGCGCTGCCG:1 - chr2R 1949147 5' - Cr1a 4410 1 73.33 TCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGTCCCT:1 - chr2R 4261946 5' - invader4 223 2 66.13 TGTCGCTAATAACTTTCGACCCAACAGTTGCCAGTGGGCGATAAACTAATGAATGTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCA:1 - chrX 14735819 5' - diver 6026 2 62.33 GCAAAGCTCGCCAAACTATAAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 - chr3L 14422862 5' - roo 9044 1 65.52 TAATGGCTAACACCCACCCCAAAATGAAATTGAGCAACTACTATTTTCCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr4 372963 5' - pogo 2040 1 66.18 TTACTTATCCATTTCACTTATCCATTTTCACTCGTTTGCCGTGCTTTTCTCGCATTTTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 11153106 5' - roo 9051 2 68.15 ATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTGTGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTG:1 - chr3L 13057439 5' + 412 7105 2 60.80 GTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCC:1 + chr3L 27350023 5' + 297 6637 2 68.80 ACAATTGAGCAGCACTTCAGTTACTGCGAATATAAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTAT:1 + chr3R 6419796 5' - Tabor 473 2 74.83 AATAAAAAAAGCCGAAAAAACTAGTTGTGTTACTTATCTTACATTTTCTGAAAATGCTTCTTTTTATCGTCTAAAGTTTGTAGTGGACGAAAATAATTTGTAAATTGCTTGGAGCC:1 + chr3R 20840731 5' - Juan 227 1 62.07 AGCGGAATGGACAGCGGACAGGCTTTTAGCAACATGAAAATGCTTTATGGCAATTAAAAAGGTAATACATCAAATGCGAAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 - chr3L 5051171 5' - flea 4976 2 60.96 TAATCCCCACAGATTGCCATTGTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAG:1 + chrX 22679596 5' + Doc 41 1 60.96 AAGACAAATGTCACGTGGTCCGAAGTCCGAAGGCAGAAGTCAGAAATTAATGCCGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTA:1 + chr2R 20052387 5' + transib2 61 1 61.81 ATTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAAA:1 + chr3L 18463351 5' - 1360 70 1 57.53 AACAGCAATCGTTGGTGCTTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 + chr3R 7625279 5' - hopper 1376 1 58.90 GTTACAATCTGAATAAAAACAAATTATTTTAAAATATCGTTAAATTTTCAATACTTCACAGACTAAGTCAGAGAATTAAGGTGTTAGCTAGTTTTAATTGACAATATATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chr3L 3317414 5' - pogo 2090 1 76.71 CTGTTAGATAACACAACAACTATACAAGAGAGGGACTGTCGCTAAAATATTGAAATCTTAACAATGCCAAATTTTAGCGCTATTTTTTCTAGTTATAATCAAATTTAACAGTGCCAATAGCGTCTCTTTCGCTTTCGATTTATTT:1 + chr2R 5341096 5' - Doc3-element 93 2 73.10 TTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 - chr2L 4244971 5' - 412 425 2 65.97 TTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTCCGTGTTCAGCTTTA:1 + chr3L 24213781 5' - invader2 172 2 70.63 GGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGGCCACCCGATCAACAC:1 + chr2R 8315472 5' - hobo 2911 1 63.57 ATCTAATTGGCAGAGCAGCCAGCGAAGGATGCCGCTTCCTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGC:1 - chr3R 13869028 5' + HMS-Beagle 34 2 57.69 GTTGAAGAGTATGTAACAGGCAGATATAGTTTATAGTATATAGTTTCCGACTATATAAAGTATATATATTTTAAATCACATCAATAGCCGAGTAGATCCGGCCATGTCCGTCTGTCCTTATGAACGTTGAGATATCAGGAACTATA:1 + chr3L 19471447 5' + INE-1 144 1 67.81 GGTGGCAGCGGTGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACCTCCA:1 + chr3L 11115124 5' - R1A1-element 92 1 50.00 GTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATACCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTA:1 - chr3L 2532510 5' - blood 7331 1 72.17 AACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTTTTAAATGGTGGGCAAACGTTTTTTATTGG:1 - chr3L 20187432 5' - FB 488 1 58.04 TTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chrX 609398 5' + 1360 82 1 79.26 GCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 + chr3L 10897443 5' + roo 65 2 62.33 GTTTTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAACTACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATCTTGTGTG:1 + chr2L 13033294 5' + hobo 39 1 49.32 ATTCTGGTGGGATTAGGCTAACATCAAAGACCTTCTGTAANATCCCGAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAANATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGACGCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 20365460 5' - roo 318 2 74.66 CGTTATTGAAAAAAGTTGGCAATATTCAACTGTTCATCATTTAAATACCACTTTTAATATCCAAAACAAAGGATACTTTGAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATT:1 + chr2R 22521855 5' + pogo 39 1 56.16 GTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAA:1 - chr3R 19950511 5' - BS 5010 1 72.60 TGGGTGGAAGCAGATAAGAACCACAATATCAACGCACAGTTTACAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCG:1 - chr2L 901816 5' + jockey 4710 1 58.72 GACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr2R 21796013 5' - roo 349 2 59.59 GGAACGGAACGAGTCTTTCGTGAATATATGGCGTGTACTCAAGATTTCAAAGTTTCGTCTATTCTGTAATGTGTGAAAACTCTGTTGAGCTTAGGTGTTGCCTTACCATATTTCCCCAAATATTTTGTTTTTATTTTATTTTTATT:1 - chr3R 30488821 5' - Tc3 1573 1 77.40 TATGTGTATGTATGTGTATGTCCTGTACACCTATATATGTGTGTGTTTTGTGTATGTTTGTTTGACTGTGACACTTTAACTAAAATATTGATATCAATATCTATACGCACACAGTAACCATTCTCAATTTCTTCTTTTGATTTTGC:1 - chr3L 9734487 5' - 412 7470 2 67.81 TTGGAGCATTTGTTTGTACATCAAACGTCGCGGATCTGAATAGTTTCCAATTAAAAAAAAAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 6700147 5' + roo 56 2 61.38 ATATTAAATGGAGTGCAAACTCTTTAAATTTTTTGATTGTATATATGAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCT:1 + chrX 2956198 5' - copia 250 1 65.82 ATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3L 17268231 5' - hobo 2911 1 58.54 TGAATCAGGACAACGCTGAGCGGCGCTCGAAGGTAAAAGGATACAGGTGAGCGGGTTTTTTCCACATCCATTTGGAAATCAGGAGGAATGAGGAAGCTGGAAAAAATAGCTTTATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATC:1 - chr2R 20972778 5' - jockey 4986 1 64.38 GTTGCGTCTTGACCGCGTCACGTCTACAAGTTGCCACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTG:1 + chr2L 20718791 5' + jockey 4685 1 69.11 GTTGTCCTGTTTTGTTACTTCTGTGCGGTTGTTTTCATTTCATTTACAGTTGCACTTGGATAGACATGAGCGCATCTTTGTGGCTCATATTGGAGCTTGGTGGTGCAGGGCTT:1 + chr2L 20133398 5' - G2 25 1 54.87 CAGGAGCAGCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTTCAGACACTTATTATTAATTATTTCGACACCGATGTGTACGTT:1 - chrX 3921713 5' - 3S18 265 2 63.70 AAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAC:1 + chr3L 22320126 5' + jockey 17 1 70.40 AATGCATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCAACAACCACAGCAGATGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 12897034 5' - accord 187 2 71.25 AGGCTGTATATAAAAACTAACGTATTGAATGTTGCCACATAACCTACAAATCCGTGCCCAACTACAGGCACACCGACAAGGACAAGGATAAGCACCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - chr2R 5953933 5' - roo 9045 1 66.90 AGTACGTGCCATTCTGTTTGGTAAAGATCCTACCTGTGCGTATGTGTGGGTACACATACTTTTTGCAAACCATCTGTATCTTCATCCCTTCAGCCGGCTAATCTTGGCGAAAGCACGAGCACACCAAGGAGGCTCAATAGAAGGCA:1 + chrX 15287858 5' + X-element 4480 1 78.08 ATTAATTTCATAAATATTGTGCTGCAAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAAT:1 + chr3L 14888740 5' - flea 4976 2 58.90 CTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATGAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr3R 28749120 5' - mdg1 7393 2 65.89 ACTTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGC:1 - chr3L 12227915 5' - opus 7473 2 66.44 TCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCTACTCACACCCTACAATTTTGTGTG:1 - chr2R 8315594 5' + hobo 39 1 58.33 AACGACAGTAGGGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTT:1 - chr2L 18219434 5' + copia 31 2 63.70 TTAAAGAAGCTTTCTTTGGGATACGAAGTAAATAATATAATAATTTTTCATATTAATGCATTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACT:1 + chr3R 10420869 5' - Tabor 422 2 59.59 TATTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAG:1 - chrX 22824265 5' - Gypsy12A_LTR 2245 1 56.16 GTCGCTTAGTGTATTTCCATATTCGTTTTGCTACAATCGGCCTCGGTAGTGGGGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chr3R 26242604 5' - roo 399 1 72.60 CGATACTACGGGGCTGCCTCCTTCGTCTCAGGCGGTGCGAAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATAC:1 + chr2R 9376595 5' + hopper 22 1 71.03 GGGCACTATTTTGTCTGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr2R 21796111 5' + roo 8730 2 63.01 AAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGCATGCAAAAGTGATCTATTTTG:1 - chr3R 31264545 5' + BS 36 1 56.16 GAAATCGGTTTAATCGAATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 6050266 5' + 412 7090 2 58.22 ATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTCCCCATC:1 - chr2R 8286809 5' + Burdock 39 2 53.79 CGCAGCAGGCAACCTGCATCAAAACTAGCAAAACGGATGTCACCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chrX 21233338 5' - roo 330 2 75.34 ATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTG:1 + chr3R 20200396 5' - Transpac 5159 2 66.44 TCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chr2L 14616237 5' - P-element 2798 1 24.14 AAAAAAAAATTTTTTTATTTTTTAATATTTTTATTGGTGTTAAACTTTTCAACTTATCACTTTATTACAAGACACTTATTCTTATCTGTTAATACATTTATCAGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTC:2 + chr3L 22970744 5' + Ivk 24 1 67.81 AAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACA:1 + chrX 22679638 5' + Doc 79 1 55.63 TGCTCATAGCTTCTGGCTTCGCTTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACACCGCATC:1 - chr4 317827 5' + Tirant 68 2 78.23 TTTACACAATTTGAAAATTTAGCCAGTCACATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 + chrX 11232476 5' + roo 14 2 69.23 CACAGCGAGAGCGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGACCCAACTGGTTGGTCGAATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCA:1 + chr2L 18415766 5' + P-element 51 1 42.40 TGTAAGCGACAGCAGCGATCAACAATTAGAAACAATTTGCAGACGTTAAATGATGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCA:1 - chr3R 13349122 5' + BS 5064 1 63.70 TGATTGAATGGGGTTAACGTTGGGTTTATGTTCGAGTCCAGGGCACGTTTAGTGGCATTTGGTAGCCCGTTTTGAAGCAGTCAACGAAACTATTAAAACAAAAAGCAGCAAAAAACACACAAATCAATTACTTAGCCACCAAAACT:1 - chr3L 13251591 5' + Porto1 4462 1 53.42 CTTTAAATAAATTTTAGTTACTTAGACAATGTAATAATATAATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAA:1 - chr2R 12253342 5' + BS 4684 1 50.00 ATATTATTAATGTGCTTGTTAGCATTGGCTGCTGTAACTGCTCCGCTGTCCGAGTGGCATGAATTATGTGCTCTTTTTGCGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTT:1 + chrX 15235623 5' - jockey 4607 1 69.49 TGGTATTACATTAGGCTTTTGTTTTGATTTTAAATTTGCGCCTTCTTCATTTAAGCGCCTGAAAGTATGCAACAATATATATGATTGACTGGTTAGTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 + chr2R 13132483 5' - BS 5069 1 65.07 AACTCAGTCCAACTCAGCCAACTATAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3L 20680249 5' + 412 7079 2 64.93 CTTGAAATATAAAGCTTAATAGAACTTAAAAGGCTTATGTTAATCCTCTGATGGTTATCTGACACTCGTTTATTGTCGAACTGCATTTTCCTCGTGCCCCTCCGACCATATAAAAAATATATATTCTTGATCAGGATCAA:1 + chr2L 22674978 5' + INE-1 82 1 62.14 CAGGGCAGGACGCAAAGGACTCGCAGGACGACATGGTAGCAAGTTAGGAGCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3L 12873077 5' - hobo 2921 1 58.89 CTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCAGATCAGGATGTAACAG:1 - chr3R 7462954 5' + I-element 439 1 67.81 AAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3L 17500808 5' + Tirant 29 2 57.14 TTCCGGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 - 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chr2R 23094965 5' + 412 7093 2 54.55 TTTTTGTTGGGTATTTCCAATTGACGCTGCTTTTTGTTTATGTTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chr3R 26242474 5' + roo 81 2 74.66 CGACTTGGACCGAGATTGGTGGCCACCCACCGGGTGCAGTCATCATCCAGCTCAAGGACATGCAATGAACCGAACTTGATGCCCCTATCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACACTACCTAAATCCCAATTCAATA:1 - chrX 18586497 5' + I-element 4982 1 61.27 TCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3R 24072040 5' + jockey 84 1 62.33 TGCATTCAAAGATTTCTTAGCCTAGGTCGGGGAGCAGCGCTGTCGGCATAGCGATGCTTATCTATGTTATCTTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr3R 2411605 5' - HMS-Beagle 6995 2 53.42 GAAGTCGGACTTCGACTTTGGTTGACAGATGATAACGCTGGGTGGGGTTTATAATACAGATATACACATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTAC:1 - chr3R 27827277 5' - I-element 5303 1 52.05 TTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAA:1 + chr3R 25796040 5' + F-element 4686 3 79.45 TTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 + chr3R 23644883 5' + diver 68 2 66.42 TATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTT:1 + chr2R 24427513 5' + 1360 37 1 56.39 GAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGT:1 - 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Juan 4193 1 69.66 GTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTCAGTACGTG:1 - chr3R 7049435 5' - Burdock 6309 2 77.40 AAAGCACTTAATTATGTGCGAACATTTTGTGTAGCATACTTCAAGGACATCGCCGAGACAGGGACAACGAGGATGGAGGATATTATTACGATGATGTTATTATTATTTGATCAACGCAATGTTACCCATGCNGCAACTTAATTTG:1 + chrX 14360738 5' - jockey 4953 1 54.48 AGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCA:1 - chr3L 8249452 5' - mdg1 337 2 76.71 CCTTATTCAATTTGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACT:1 + chr2R 9341512 5' + roo 8677 2 50.39 ATGGGTTTCCAGTGGGCGGTGCTGGGATGCAGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGTATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAG:1 + chr3R 27452003 5' + hopper 82 1 72.86 TGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3R 21925084 5' + hobo 48 1 52.08 TTCTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3R 20887376 5' + Doc 25 1 62.20 ATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr2R 6768005 5' + pogo 51 1 64.80 CCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTA:1 + chr3R 25580790 5' + 1360 52 1 71.56 TTCAGCAAGTATTTTATTTTCCTGGAAAACTATTAAAATATACCTACAAAGCGAATATATCGTATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 + chr3R 17531775 5' + 297 47 2 58.99 AAGATCCACAGTGGTGTCCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCAT:1 + chr2L 15874830 5' - mdg1 378 2 56.16 AAATAATTAATCATAAATGACGTATTTTTGCTCAGTGGGGTTTGTCTGAAAGTTATCAGGTCGTGGCAGCATTTGTTAGCGGCATGTCCGCGATAAGAAGTGTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGAT:1 - chr2R 13541655 5' - jockey 4987 1 72.66 TTTTTTCTTCTTTTGTTTTGTATCTCAAATTACTATGTTATCTCTGTCTTCTATGGTTTCTACAGTATAAGGGCCTATATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATA:1 - chr3L 8168189 5' - Bari1 1663 1 52.74 GCTCGAAAAAATGTAAATTTAAATTTAAATTTAAATACAATAATAGCAACAGCAGCGGCAGCACGAACGAAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATA:1 - chrX 1769837 5' + hopper 11 2 78.08 CACTGACCCTTTAAGGCACGCCAGATCCTTCTCCTTCTCCTCTCCAGGATCACTCTTCACTTGTGGTGATCGTCCTTCGGTGTCCTTCGGGCCTCTTGCCGCC:1 + chr4 145869 5' - gypsy8 487 1 80.58 TCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAAT:1 - chr3R 10714252 5' + 297 6632 2 59.71 TCAGGCACAAAAATCCAATATCCTGCAATGAAATACAATTACACGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 + chr3L 8824454 5' + transib2 77 1 69.18 ATGAGCGACGCACCTTTTTTCCACAGCCACACACACAGTGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 2899140 5' - accord 259 2 68.52 ATTTATATTAAATTGTGCAAATCAATTGATTGCTGCAGTTGTTAGCTTTTAATTATTGGGCTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTT:1 - chr3L 11904914 5' + copia 4885 2 73.29 CAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3R 5870899 5' + roo 8716 2 59.85 TTTCCGTTTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 - chr3R 30087823 5' + roo 8698 2 64.38 CGAATTTCCCTCATTTTATTGGGCAACACCCAATTTCCCGCCATGTCCGTGCACTTTGACCATGATTTGTTGTACGTACACCCCAACAGCCGAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 + chr3R 27315058 5' + jockey 4692 1 61.34 CGGGACATTGACATGAGTACACAACATGGGATGCTTCAACTTTTGCTACTAGTATATACATACATATATAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 + chrX 17926578 5' + pogo 46 1 55.48 TTTATTTGGCCAATAAAATCTGCGAAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTT:1 - chr2R 19633358 5' + jockey 4769 1 79.45 TCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGC:1 + chr2L 8284375 5' + Doc 446 1 69.23 GTTTGTATCCTTTTTGACGTCATCGAGGCAAACAAATGAAGTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGA:1 + chr3L 7848419 5' + jockey 16 1 75.86 CAAGGATTCCAATCAGCCACCAGACGGTTGGCTCTTAGCATAAGAAGCGAGACGCGTTAAGAAATAAAGGGTGAAAGGGGACACCCAAGAAATAGGTCGTGCCACCGATTTCGAACACAAAAAGTATTTGAAATTAAAGACGGCAT:1 + chr3R 7641056 5' - hobo 2539 1 67.81 AATAGTTTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCT:1 + chr3L 19951146 5' + Ivk 21 1 69.44 CTCAAATGTGTCTGAGCCTCCAAACCCCATGAGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCA:1 - chr2L 15420157 5' + Burdock 6136 1 65.75 AACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGA:1 + chr2L 8284338 5' + Doc 412 1 56.85 AGAGATTTTGCTTGGATGATTTTTATTGCTCGTTTGTAGTAAATTTGGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGCGATACCCACTTTAATGCTTCGCAGTG:1 + chrX 20325900 5' + P-element 289 1 42.66 AACTGATATTCATTTCAAGGGTTTGCTTATTCATAGAATGTCTTAAAATCTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCC:1 - chr2L 13232003 5' - roo 8975 2 66.21 TACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2R 12462228 5' + roo 8724 2 60.27 TCGAGTGGTTCAAGTTTTGTTACATTATTGTTTACATAGATAGTTTGAGTATAGTCTAACATTGTGTTGGTAATTAATATTTCTTCTAATTGGGCAGAAGGAAGCGTTTCTGACTATATAAAGTTTCTATATTCTTGATCAGGATC:1 + chrY 2413356 5' + INE-1 80 1 67.81 TGGCCCCAAGTCACTGCCAGATTGAGCTTCCCTGTATCCTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 - chr2L 12932204 5' + opus 153 4 57.93 AGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - chr3R 12519667 5' - roo 331 2 78.79 TTTTGACTGGAGCTTTGCTCAATTTCTCATTTTCCAGCTGAAGATATTCGTGTTTGCCGGCTGTTTGGAAGTTGGGGCTGAGGAACGGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAT:1 + chr2R 9607264 5' - P-element 2853 1 62.33 TTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTGACATGA:1 + chr2L 512435 5' - roo 9000 2 68.28 CATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chr3R 13423292 5' - 297 6922 2 75.00 ATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 + chr2L 512411 5' - roo 9031 1 52.55 TTCCTGTTTTTTCCGTTGTCGTTCGCACAGTTTTCAACTATTTTCGTAATTGCGGCGCATTGTCGCTGCCATTAGTTTTCCCTTACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAA:1 - chr2L 20627770 5' + Stalker2 59 2 59.59 TGCCGAGGCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCAC:1 - chr2L 20852553 5' + Tirant 10 2 72.12 CTTCTCTATAAATCTGTTATTGTTCAGCAAGTATTTTATTTTCCTGGAAAACTATTAAAATATACCTACAAAGCGAATATATCGTATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGACA:1 + chr3R 17531753 5' + 297 6611 2 43.75 ATGCCCACAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 - 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chrX 15563292 5' + Quasimodo 18 2 53.10 AACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 - chr2L 12236807 5' + jockey 92 1 77.86 TAATAAAAATGTGTTGAAAAAACCCCTTTTCTCAACTCTGATTATATATTAGATACATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTT:1 + chr2R 19389303 5' - 297 6914 2 68.49 TTAATTTCAACTATGCCAGAAGCTAATTTGGGCTAGAAATAATTTAGTTGGGTTTAAAAGTGTAATTTAAAAGGAAATAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 - chr3L 14888886 5' + flea 4795 2 59.59 CCGCTTACATGAATACAACTACTTGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTC:1 + chr3L 27349975 5' + 297 23 2 63.57 AGGTTAGGTTCTCCTAAAGGAAAGAATATTCATGTCAAATGATTGCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTT:1 - chr3L 14603201 5' - jockey 4999 1 54.48 GGCTTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 - 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chr3L 23678152 5' + Osvaldo 23 1 73.79 CATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGAGATTTT:1 - chr2R 14532071 5' - invader4 296 2 58.33 TTATTTAGCATTTTTATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3R 29627860 5' - roo 8997 2 69.18 GAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGGAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGATTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGGCATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAG:1 - chr2L 2057867 5' - 412 7461 2 75.37 GTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 + chrX 20330560 5' - P-element 2786 1 16.67 TGCACAAAACAATGCCATTTCCATCGCAGCCATTTCAACACCCACAAAGCCAAGAAACCAGATCCCTGGTCAGGGCTATAGGATGAAAGGCATGGGGATTGTACTGAGTAAATACATAATACATAATACATACATACATA:1 + chr3R 13326384 5' + 412 219 2 82.86 TTAGCATAAGTCAGCGACTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTCTTCAAGACTTTTGGGAAATAACCCTCAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr3L 18846914 5' - 1360 3346 1 66.44 AGTTTGTATTTATTTATGTACTTATTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTC:1 - chr3L 26265111 5' + Gypsy12A_LTR 1879 1 76.71 ATAATCAGGGTCAATTCCCTAGAAACTCGTTTATGTTAACAATCATAAAACGTATGTTTAATCATATAAAATGGTTATTTTAAAAAGAATT:1 - chr3R 13353413 5' - Tc1 1495 1 58.24 AATTTTATTGAGAGGATAATATGGTTTTATAAGGAAGATAAATATTTTTTTAATTAATTTAAAAATTTAAATTGCAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr3L 15393824 5' - pogo 2064 1 55.71 GAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGA:1 + chr2L 15874859 5' - mdg1 349 2 67.81 TACAGAAGTAAGTCAGCGAACAGGATAAGGGATAAAATCTAAAAAATTCCCCACTATCAATACAGAATTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGC:1 + chr3L 12890278 5' + hobo 40 1 58.22 ATCCAATCTAGAAATTGAAAAAGTATTTCGGATATATATTTAAAGAATCTTAATATTTGGTTGCGTGACCTTTGGTGCCAATGACAGCCGCCCATCGTCTTGGCATGTAGTCCACCAAGTCCTGGCACCGTTATTGAGG:1 - chr3L 23620634 5' - Tc1 1265 1 75.54 ATGTACATATGTATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGCGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr2L 2493965 5' - Tirant 8492 2 62.50 TGTGGCAAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCC:1 - chr2L 7920998 5' + F-element 391 1 64.71 CATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCATA:1 - chr3R 13423378 5' + 297 6640 2 60.96 GACAGCAGATGGATGAAGTTTTTACAACGTGCTTTTTAAGTGTTTTGAAATTATTTGAGAAGCATTTTAATAAGAAAATTTTAGTTGAATACTCATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGA:1 - chr2R 22522016 5' - pogo 2075 1 67.81 ACGCATACGTTTATAAAAAGGGATTGCTTAAAGGGTTTATAAGAGGCCTATAAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATT:1 + chr3R 15727794 5' + 1731 4337 2 69.18 ACTTATTCATTTAAACAAAAATATTGCCTTTTTTCCGATCGTTTTTTAAAATACGCGCCATTCAAGAGGGGCTACTGCAAAGTTTTGTCCCGACACGGTGCAGTCGCCATCATGCGTTGGAATAGTGAGGAGCGTGCCTTTGCCGT:1 - chr3R 3268046 5' + mariner2 147 1 72.60 AATGCCGAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 + chr2L 20628502 5' + Stalker2 7255 2 43.15 AGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATCAGGAGACAAGCTC:1 - chrX 20949693 5' + jockey 4612 1 60.28 AAGTGGTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:1 - chr2L 18219404 5' + copia 4930 2 60.27 ATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATTT:1 - chr3L 5027252 5' + roo 80 2 70.92 TTGTTTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chrX 13628862 5' - roo 9043 1 66.21 TAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATT:1 + chr2R 18931852 5' - blood 7329 1 79.09 TCACTTACGGCTGCTTCTGTCTATATGGATTTGTATTATATCGTATATACTTTACCACGGGCCCGAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTTCATCCCGGGATATGAATAAGTTAACACAATCAAAAAACAACCGAAATATA:1 + chr3R 17924384 5' + Burdock 11 2 67.61 TACATAAGTAACCATTTGTACATAGTATGTGTTGAAGTTATAACTTTGCCTCAAGTCATCAAGGGCAAACACAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr2L 7596347 5' - roo 9033 1 51.11 ACGGAATAGGTGGACCAAAAATATTAATTTTTGCAAAAATGGAGTGCATTTTTATTCGTAGAAGATACATTATTTAGGATATATTTAAGTAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr2L 21559223 5' + 1360 19 1 71.43 ATTGCAGTGCATCGAATGGCTGGTTGGTGAGGGGGAGGGGGTGGAATGTAAAAGCTTCGTGTGGCCATCGTCGCTCGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTAC:1 + chr3L 10740018 5' + P-element 25 1 61.90 TTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGCGAAGATTTCCAATAAAGAATA:1 + chr3R 11756766 5' - Tirant 8414 2 78.08 CATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGA:1 + chr3R 24084802 5' + roo 8741 2 72.60 TCAAATCGACAGCTTCAACCTGTAACAAAATTGGAAAAATGGAAATATGTTACTACGAAATAGTATTTAAAATCGGTAATGAAGTTTGTTATAACACTCAAAAATAAAACATTTTCTTTAAAATATTATATTGTTCAAAATTTTCT:1 - 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hopper 1409 2 78.23 CATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGCCAGCCGTCGG:1 - chr3R 27606718 5' - 412 456 2 56.52 CGTCGGCGACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACGAAGA:1 + chr3L 25232764 5' - accord2 131 2 64.38 AAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAA:1 - chr3R 21794126 5' - hopper 1337 1 70.34 AGGCAACTTCCCAAGGCCGTTACTGGTTGCCCCCACACATATATACATACATATATACATAT:1 + chr3L 2574770 5' - G3 4507 1 85.48 TGGTCCCGTCCTCGTTCATAATTAAAATCAAATTAACACACACACACACACAAAAGAGGCACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTATTTTACCACTCGAC:1 + chrX 15191349 5' + hobo 17 1 58.65 TAAGCAAACATAATAAAACCCAGTGATTGACTGCATCATAAACAATTAGCAATTAAAATGCAATTCATTTGGGCAAATACATTACAAGCAGGACATACGTCCCGAATTTCTTGCTTTTGTAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 + chr2R 11574972 5' - INE-1 137 1 60.96 ATATGAGCGTAATTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTCTTCTTTTTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGATAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCG:1 - 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chr3L 11826484 5' - INE-1 141 1 74.48 TCCACAGTGGNCGGTGCCGATGGGAACGGCTTTCACTTTCTCCGGCGCTCAGCTGCTGGTCCACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGGAGCATACACTTAAATTCAGT:1 + chr2R 23443948 5' + P-element 48 1 49.64 AAAGAAAAGAAAAAGTTCGTGGGGGGTGGGGAGGGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAGGCCACCTTTGTATTTCT:1 + chr2L 3661962 5' - blood 7326 1 65.67 GGTAAGTGGCTGGTTATGCACAGCATGCCACATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTT:1 - chr3R 27606748 5' - 412 7531 2 73.97 TCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAAC:1 + chr2L 20761900 5' + Doc 451 1 73.73 GGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 2167685 5' + opus 163 4 66.67 GTTTTAAATTATTTTCTATTTTGCGGAAACGAAAAATTATATTGTTTATGTACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGAAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATAAAGGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAA:1 - 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chr2L 6619036 5' - 17.6 465 2 66.44 AGCGTCACATTTTTTCTCTATTTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAACCTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr2R 14884233 5' + roo 8675 2 76.71 CGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2L 15874853 5' - mdg1 7393 2 63.70 GGTTAGGTTCTCCTAAAGGAAAGAATATTCCTGTCAAATGATTGCGATGTGTTCGGCTCTACCAATTTACGTAAATGTAAAATTTATTAGTGTCCTGTTTTTAATAGCTGAATTATTTAACTTTATTTTATTTTTATGATGTTT:1 - chr3L 14603200 5' - jockey 4999 1 55.56 AATAAAAGAAACTTAACACCAAGAAGGAAGGAAGAGCTCAGCCAAAGACATTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATGTTTTCGCCGCGGCTCTGGAGGGGGCTCCAGGCTCTCTCGAGTTTTTGT:1 - chr2R 650977 5' + 1360 83 1 67.81 TAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr2L 23310618 5' + 1360 32 1 54.92 AGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCT:1 + chr3R 20841404 5' + Juan 75 1 66.44 AAATACCTGTATCAGCAACGCAAGGAATGTGTACTCGAATTCGAATCAAATTTCAATGAACAACGTGAAGGTGGAATTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1 - chr2R 12826697 5' - Burdock 6323 2 58.22 TGTACCTGTGATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACA:1 + chr3R 907893 5' + gypsy11 4332 2 36.30 AAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3R 5870867 5' + roo 82 2 82.96 ATACATATACTTGTTTAATATTTAAATGATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCT:1 - chr2R 12827110 5' + Burdock 22 2 70.55 TGCAGTGCATCGAATGGCTGGTTGGTGAAGGGGAGGGGGTGGAATGTAAAAGCTTCGTGTGGCCATCGTCGCTCGTTGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chr3L 10740020 5' + P-element 47 1 53.42 TACATAAGTCGCTGCACTTTTCGCCCTAGCTACTTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTCGGTTTCTTCTTTGCCTACCGCCAAATTCGTGTCGTTTTGTCTGTGCAAAAACAATTGACTTTATGCATAAACACACACACATCATTGCTA:1 + chr3L 25439408 5' + G3 48 1 74.66 AATCTGAGGCTTATTCAATGAGCCATGGGTCGCCGACTGGTCGTAAAGTGAAGGGAAATTATTGAATTATATAAAAGGCTGAGAACGAACTACGCCGAAAAGCTACGTTTTTCAGGTCACCAACAATAATTTGCATTTTTAAATAT:1 - chr3R 4965954 5' - TAHRE 10330 1 62.33 TTTTAAGCCCACTTAAGTTTCCCATTTGTATATTTGTACAGTGGAACTTCTTGAACTACAGCTCTATTGTTTCTTTTTAGTGCCTGCCACAACTGCTGCTATATGTTCTGATTTGTAATATAATAATAATAATATAATTGTAAT:1 - chr3L 12617904 5' + invader3 5049 6 69.44 GACAAAATTCGAAGCTCGTTTCTAGGAATACACAGGGGTATACGTGAGTACATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAGA:1 + chr2L 9795384 5' + blood 53 2 61.24 CAGGGAAAAACTGTAGTTGCTTATAAATATTTGAATATTGTTAATGAATTTGTGATCGTACTGGTTATACCGAGGGTTTTGTATTTTTTATACCCGTTACTTGAAGAGTAAAAGAGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACA:1 - chrX 19192476 5' + INE-1 16 1 78.77 CATAAATCGTATCAAGTTTATTGTCTCCAAATAACTTCCTNTTCCATGTGGTTTACAACCTTGATAGCTCATTTTCATATGTGATGATTTATATTTATTGAAATTCAGTAGCNAATCTGTGACATTTGTTATTTTCCTATTTTTTT:1 + chr2L 6823183 5' - Doc2-element 253 1 30.82 ATACATTTGTGCTCTGTAAAAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTAT:1 + chr2L 7929507 5' - roo 9034 1 49.60 TAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 15148574 5' - roo 9029 1 51.88 GCGGTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTT:1 + chr3R 10144341 5' - Chimpo 150 1 60.96 CATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTGTGGGTGCTGCGGCGGCTGCTGAAATTTTCCCCGAAAT:1 - chrX 15198100 5' - Max-element 8486 2 71.00 TAAGTTCGGCTCCCAGACCCAGGAATTGAACATTTCTTTGACGGCTATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTT:1 - chr2L 8120281 5' - roo 9054 2 73.97 TTTTTCGAATATAGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 + chrX 21668535 5' + I-element 50 1 52.78 TCGGTTCGATTTGAGTTAATTCGAGTTTTTCTTCGCTACACTTCAAGTTGTCAAATGAAATGTTTAGAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGC:1 + chr3L 22294388 5' - pogo 2055 1 54.68 ACGGTATTGTCTCCATCCTGCGATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAATAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATT:1 - chr3R 25158709 5' + 1360 35 1 62.33 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTGTGGAACACGCCACGTAAAAT:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 5306 1 57.27 CCTGAAAGTATGCAACAATATATATGATTGACTGGTTAGTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCAC:1 + chr2R 13132540 5' - BS 5013 1 76.55 TCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chrY 2720387 5' + 297 6617 2 59.71 ATGGACGTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 7751153 5' - 412 462 2 62.94 AAAAATTCAAGAATAATACATGTGCAAGGTAACACAAGCCAACGAACTAGAACAGTTGGCAGCCGGCAAACACAGCATGTTTGCGCGGACGCTGCGAGTCTTTGTTAGGTATATGTATCATTTTAAGTATCAGTTTGAATTTGTAT:1 + chr3R 3269649 5' + Gypsy6A_LTR 159 1 54.11 CACTGNGGCTCAAAGTGAAAGGGCCAAAAAGAATCCGCTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAG:1 - chr3R 31159264 5' + hobo 85 1 73.29 AGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAAATCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:1 - chr3L 8249507 5' - mdg1 7430 2 63.70 TAACGAATTTTGAATTTTAAATTTCAACTCAAAACTTGCATAAGTTGCAAATACATAAATGAACAAGTATATAAGAATGTTACACTCAAAAAGGGAAACTTTTGAAATGTTTAAAAGGCAGGGGTTTTTATTTTATTTTATTTTTT:1 + chr3L 15206228 5' + transib1 1900 2 50.00 CAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATA:1 - chr3R 10737059 5' + F-element 72 1 62.50 ATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:2 + chr3R 24084814 5' + roo 89 2 80.82 TTTTTGAGTTGAAACGCCCTCTTATAGATTCCCGGGTAGATTATTTAATTACGCCTAACGACAACAAATTGTTAAAATTTCCCTGTGATCTCCCACTAGTGTAGTATAGTCGGTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTAT:1 - chr3R 4541066 5' + INE-1 574 1 58.22 TGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 + chr2R 7895520 5' - mdg1 7398 2 58.22 TTCTATGAACAAAGAAAATNCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCA:1 + chr2R 961125 5' - transib2 2670 1 60.69 ATTTAGTCGACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCT:1 - chr3L 1437960 5' + Transpac 4974 2 62.31 ACTATAAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 - chr3L 14422848 5' - roo 9029 1 55.48 TAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAA:1 - chr2R 14532056 5' - invader4 255 2 66.44 GTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATTTTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1 + chr2R 23094879 5' - 412 7475 2 67.12 AATTTTAAACCAATCCATAGACCACGGGCGATCGGGGACAACAAATCGTAATAGAATCTAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTA:1 - chr2R 9607419 5' + P-element 12 1 74.80 CGATAAATTAGCAGCCGGACAATGGCACAGCAGCGTCGCGTCGCCCTCCCAACCACCCACACAGGACCTCAACTTCCTGCTTTATTTTCGGAAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGCAC:1 + chr2L 11494565 5' - roo 122 2 65.75 TTATCTCATAAGACCTTTCCACCGATTGCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 + chr3R 25158561 5' - 1360 3362 1 60.74 TTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGC:1 + chr3L 11535889 5' + roo 8723 2 59.31 GTCTATTTTGTGGTTATGCGCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chrX 860742 5' + hobo 19 1 69.18 AAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCG:1 - chr2R 14532085 5' - invader4 3044 2 57.93 TGGTTTAATGTAATTTAATCTTAATGACAACAAATACGTTGTACAAATATATCTATCTATCTATCTATATCTATATCTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATCTATCTATCTGTAGTACATATATACATATTGTAC:1 + chr3R 31953796 5' + gypsy11 27 2 43.06 CGGTTAAATCTTTGCTACACAAGCTATTGGTTGTGAATAGGGTATCTGCTAGTTCCATAATCTCCTTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chrX 860891 5' - hobo 2937 1 70.53 TCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr3R 30087775 5' + roo 75 2 74.10 AAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAACAGTATTCT:1 + chrX 19662964 5' - P-element 2817 1 36.30 TTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCCGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAA:1 - chr3L 17268314 5' + hobo 78 1 72.46 AAATCCAATAAATAAATGTTATTTCCGGTTTCTTTTCTATTGTTTTTATTTAATTTTCCAATTGTTATTGTATCACAAATGTTATAGTGGTCTGAAATATTTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAG:1 + chr2L 11523001 5' - HMS-Beagle 7028 2 74.48 GAAGTTTTTGTGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAA:1 - chrX 8839406 5' + Tabor 6874 2 60.00 GTGCGCACTCCTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTAC:1 + chr3R 19950440 5' + BS 5041 1 53.62 GGCATAGATTGCTTTGAATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2R 21796090 5' + roo 8747 2 76.71 GTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTAT:1 + chrX 22679617 5' + Doc 62 1 46.58 AAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAA:1 - chr2L 22224601 5' - Rt1c 5397 1 51.39 GTTGCCATTTTCTGAAGGCCGCCCCGCACATACGAGTGCATACATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTT:1 + chr2R 14415450 5' - 297 6897 2 73.97 CAAATTAGTTATTTGGTTATATTTTGTTTTGAAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGC:1 + chr2R 11246932 5' - 1360 134 1 64.38 GTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chrX 20330555 5' - P-element 2876 1 49.15 TTGCCCCTTTCGATTAACATCGATTTACAGTAATCGGGTTCAGCTGTTGTTCGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - 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chr3L 11672281 5' + Stalker4 7200 4 69.18 TGATGTTGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAA:1 - chr2R 5193527 5' - roo 348 2 60.27 TAGATATTGACAGACATCCTTTTTATGTGACTTAAAGCAAGTGACTTATATGGCAAAGCATTTTGCAGAATTGTCTACTTAAGTTTGACAATTTCAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGCGAAA:1 - chr3L 18549829 5' + X-element 38 1 48.97 CTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCAC:1 + chr3R 5164944 5' - invader4 3007 2 72.86 TTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCT:1 + chrX 6538632 5' + pogo 31 1 54.07 GGTCCCGTCCTCGTTCATAATTAAAATCAAATTAACACACACACACACACAAAAGAGGTACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 + chrX 15191350 5' + hobo 24 1 56.36 GTATTTATTGAAAATAATATAAGGGTTCTTTTGCAATGGCCGATCAACGCCTACTTCCTAAGATCTTGAAGTTTATACGGACGGACAGACGAACAGGGCCAAATCGACTCGGCTATTG:1 - 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Quasimodo 7316 2 57.53 AATGAAGAAATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGG:1 + chr2L 22132473 5' - pogo 2069 1 63.70 ATGGTCATAAAATGGGTGACACGCTCAAAGGAACCCTTAGACAAAATATCAACACTGGGCGCCGAAGAATTTTAAATGGCAAGCAGTGCTGCATAAGTTTTTTTTGAAGTCGAATAATTGCCAAATTTCGTTGTTTTTTTTTT:1 - chr3R 12877080 5' - transib2 2646 1 69.23 GCGGCAGTGGCTAAGATAAGCGCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chr3R 13259787 5' + hobo 25 1 66.90 TTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2R 23094981 5' + 412 38 2 54.07 TACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 11285005 5' + blood 52 2 53.42 TGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chrX 3666521 5' - roo 342 2 68.84 CACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGACAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATG:1 - chr2R 4261972 5' - invader4 2987 2 51.72 CCTTTGTTATTGCATTTCCTCGTGATTTGTGTGTTCTCGGGCCGGCGGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATTTCCAATAAAGAATACGACTGACTTTCTTGAAGTT:1 + chr3R 12345975 5' - Tirant 8394 2 67.81 CAGCACTTTAATCACAAAAAATATGATAATAAATCAATATAAGGGTTATTTGTACAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACG:1 + chr2R 13121781 5' + HMS-Beagle 51 2 61.72 GTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGNGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCANGGCGAAAACAGGTACTAACGCCA:1 - chr3R 10144470 5' + Chimpo 37 1 52.80 AGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 + chr2R 7314620 5' + blood 50 2 51.37 ATGGCCAAAAGTGGTTAGCTCGAGGAAATGGCTTTTAAAGCAGTGCAGCGAACACAGAATTCTTATTCACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - 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chr3L 20680412 5' - 412 7530 2 70.00 TTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCAT:1 + chrX 8968586 5' - 1731 4602 1 55.47 ACGACGCAACACAACAGAAAAAAATGTTTTCTTGACAATTTAAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTAT:1 - chr3R 25597959 5' - copia 5087 2 58.22 TGCTAGAAAATGTGACAGAGGAGAGCGGCATTCTTGGCGTTCGACATTAGCAATTAGAGCTCTTGGCGAGTGTACATTCCAGATCTATTCCTGATTTATAACTGAACTTAGTGTGGTCTACAGGCAGATCTCTTG:1 + chr3R 28750376 5' - mdg1 7321 2 50.37 CTGTTGTTCTCGTTGTTGTTGCCCATTATGCGCAAAATAAACGTTTTGTATCGTGACCAAAGTCAAATGAAAGTATGCCAGGGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTACGCAAATTTG:1 + chrX 870744 5' - hopper2 1566 2 56.85 TGCACGTGGGTGCTTTGTATTATGCATACACTTGGGCTTGACTGTATATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGC:1 - chr3R 3181165 5' - opus 473 2 68.49 AGCAATTTTATAATTTTGTTTTTCGAATATAGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCG:1 + chrX 21668517 5' + I-element 34 1 64.38 AAATTTTAAAATGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 - chr2L 388622 5' - roo 355 2 55.00 AGTCTGTGGACTGGCGCCTTTTTTTTTTCATTTCACCTTCGGGTTCCTCAACTTAATTGCCAGAAAGAGACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2R 11558072 5' + 412 7099 2 49.64 GAACCATACTGACTTGGCCCAAAAACCAACACAACCCAATCCAATCCAATCCCCAAATGGCATCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCAC:1 - chrX 6891549 5' + hobo 56 1 54.79 TTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr2R 17350574 5' + F-element 68 1 68.14 ACTTATCACTATCCTTGATACTGTTGGCAATCTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chrX 18149929 5' + hobo 21 1 69.86 GCAACGCCATTATGTACATATGTATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGCGATCGAGTGTGGAG:1 + chr2L 2493954 5' - Tirant 8501 2 73.97 TCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3L 12227752 5' + opus 25 4 65.22 TGTTCAAATTTCAAACTTTAAATATTTCATATTCTTATATGAAACCAATTTGAACGATTGATTATATTCATAATGGAACATTAAGTACTGAAGGTAAGGTATACAAGGTTAAAGATGTACACAATATTGCTTTTGTATGGCATA:1 + chr2R 8600058 5' + transib4 412 1 67.36 CTGAACCTTTCACAAGATTGACAATCATGGGATTTCGGGAACTTCAATTTACTATATACATACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTG:1 - chr2L 1045065 5' - mdg3 189 2 58.87 TTATTTTGCGCATATTCAAACAATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATAT:2 - chr2L 20628713 5' - Stalker2 386 2 73.29 GTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 + chr2R 8315502 5' - hobo 2927 1 62.65 TAAACATTTTTGGTTCCATAAATTTGTGAACATACATAAAACAATTACTTCTTCAGCATATTTCTCGAATGCATCTATTTTCGTCTTTACCAATTAAAAGACTAAACCTACTCGAGTTACTTAAAATTTATTCAAATTTGTTCAGC:1 - chr3R 19362516 5' - hopper 995 2 71.92 GTGTATGCATGCGTGTGCGTACTACACGTGTATGTGTTGGCGTGTCAGTGTGTTTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTC:1 - chrX 15432570 5' - F-element 4433 1 54.70 ACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACA:1 + chr2R 19574410 5' + I-element 5125 1 58.46 TATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACG:1 - chr3L 20988181 5' + blood 7194 2 76.22 TCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATC:1 - chr2R 9871044 5' + roo 8751 2 80.00 AGCGAACACAGAATTCTTATTCACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAAGCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTACTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chrX 20284534 5' - roo 350 2 54.55 AGCCTGTAAATTAAAGATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 + chr3L 7024397 5' + 412 13 2 75.34 GAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTTGCTGGCCCTTTGGCAGAATGTTTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3R 19450178 5' + roo 8724 2 50.00 CAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTC:1 - chrX 21668396 5' - opus 487 2 48.59 ATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr2R 7314661 5' + blood 7095 2 76.26 CAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGA:1 - chrX 20949741 5' + jockey 4569 1 68.49 GCTCCGCTTTTCAGACGTGTGTGTGTATATGTCCCTGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 + chr3L 21764353 5' - hobo 2886 1 54.11 GAAATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGC:1 - chr2L 18181238 5' - blood 7349 2 56.16 AGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATAC:1 + chr2L 6618880 5' + 17.6 40 2 53.10 AGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCC:1 + chrX 21772483 5' - gypsy3 6566 1 56.04 ATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCG:1 - chr3L 17500804 5' + Tirant 29 2 59.57 AACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGGAGTATCTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGTAGCACTTTGTTGCTATGTTGTTGTTTATGT:1 - chr2R 23094943 5' + 412 7123 2 64.34 AGCTTAACAATTGGAAAGCTTGTCCTGGACAGTAGAAGTTTCTCGGAGGAGTTACAAAATCATTCGAAGGAATGGAGTAACTAAAATTAAAGGGAAGCAAAACAAGGAAGAAAGCTATAGTCGAGTTCTCGACTATCAGATACCCG:1 - chr3L 20259649 5' - INE-1 555 1 63.70 CCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 - chrX 14360864 5' + jockey 21 1 69.83 AAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACTAACACACA:1 - chrX 14978619 5' + hobo 84 1 72.22 ATTTTGGCGCCACAAGACAGAAAAATTAGAGCATACTTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCT:1 + chr2R 14427092 5' + jockey 4775 1 74.83 TTTATTACGATAGTTCTAATTTTAACGAAGGAATGCGCATTGTGCTAAAAAATTTCCTTCTTCGGGTGAATTTGGTTTGAGTTTTTGGTCTCGTCATTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAA:1 - chr3L 22744759 5' + FB 26 1 79.31 AAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTT:1 - chrX 10319705 5' - mdg1 7398 2 59.72 GTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATATGCACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATA:1 + chr3L 8249360 5' + mdg1 7084 2 53.79 ATTTATGTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr3R 18128549 5' + roo 8682 2 65.25 AATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGG:1 + chr2R 22957903 5' + hobo 68 1 63.70 GCGTGGAAGGTGTGGTCATATGGTGGTTTCTATTGTGTCAACAAGGAATCAGTTTCCCAAAAGCTGCACATTTGTTTTTATTTTTAGTCAAATACCAAGAAATAAGTCGATCCAGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTG:1 + chr3R 16187715 5' - mdg1 414 2 77.40 GAATATTTTGTTGTTGGTTGTTTTCATCATATACATACATGTACATAGACATAACAAATAAATAATTTACGTTTTGATACAAGCAATTTCTTCTTGGATGTTGGTTTTCAAATCTTGTA:1 + chr4 1086152 5' - mariner2 651 1 72.27 ATGTGCTGCTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGA:1 + chr2L 2544745 5' + blood 7078 2 61.64 CATTATTCTCCTCGTAGTCGCGATTTCTTGAGTTCCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr2R 16274661 5' + roo 42 2 56.85 AAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTA:1 - chr3R 17673830 5' + FB 73 1 67.81 CTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTC:1 - chr3R 19950516 5' - BS 5015 1 69.18 GCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTGTCTTTCCGCTCGCTC:1 + chr2L 23372626 5' - 1360 3307 1 71.92 AACCACTGTTAGGTCGCGCCAAAAATTCAGTTGGCAACACTGCCGCCCCAACCCCCTACGCCAGAACGAGACCACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:1 + chr3L 5770844 5' - P-element 2876 1 76.47 AGTGCTAAAATAAACAATAAACTAAAGCGCATAAGCACATAAAGCATATGTGCTATACATATATACATACATATATATACATATGTAGGTTTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGAT:1 - chr3R 17421336 5' - pogo 2074 1 51.72 GAAAATTTTCAAATTTTAAATAAAAACCACGCAGTATGTGTGAATATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 + chr3R 1798084 5' - accord 7031 2 60.32 GTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3R 27606708 5' - 412 440 2 52.78 TTATTTCTATTAACTTCAAAATGCTTTAAAAAGTGTCTTAATTAGCAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAACACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 - chrX 11232592 5' - roo 9001 2 68.09 GCTGAAATCAAGTTTCGAGAGGCTCGAGGGGACCGCAGGCCCCGTTGATGTAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTT:1 + chrX 8839294 5' - Tabor 464 2 52.08 TGGAGTGCCGGGCAGATGATCGAAGTGGAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTG:1 - chr2L 2057894 5' - 412 424 2 62.76 AAGTTATTAAGTGCAAATTAATGAACATTAGCGGCTGCCATGGGCACTTAGCCATTCTTGTAAACAAATCTTAAAGTCTGCCTGCTCTCTCTGAGGCTTCTCCTCCACTTAAGAATCCAAGAGCAATGCTCTCCCAAAAACACTAA:1 + chr3L 19363367 5' + 17.6 271 2 71.23 GAGTTCACAGNAATCGCTCGCTGATGGCAGTCGAAATTTATATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 26927328 5' - roo 398 1 77.40 GGTATTGTCTCCATCCTGCGATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGG:1 - chr3R 25158707 5' + 1360 26 1 65.93 CTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCC:1 - chr3R 16630378 5' + FB 44 1 55.48 AAATTTGTGGATATTTTTGCATAGTTTTATTAGTCTTCTAAATTTCTGTCGATTTTTCGACTTCCCCCTTACTCTAAAGCCGTCAAGCTGGTCACGCACATGCTTTCTCATTTTAATCCCCAATATTAATCGATATCCCAGAAAA:1 - chr3R 24776703 5' + INE-1 499 1 33.79 TTAAAAATTATAAAACCTAACTGAAAAGTCACAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAG:1 + chr3L 1437847 5' - Transpac 5215 2 72.50 GGAAAGGATGCGGATTAAATTAATGTGGGGAAACAATGTGAGGGCGCCGGTTGTTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 - chr3L 21764483 5' + hobo 37 1 60.96 CTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCG:1 - 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chr3R 12341221 5' - Tirant 372 2 66.90 GATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr2R 21796084 5' + roo 8731 2 77.50 TATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACC:1 - chr2R 17493136 5' + BS 4855 1 79.41 AGTGTCCTTAGGCCGTGTATGCATCTCGCCCAAGGATGTGTCGTCATGAAATTCGTCGTGGAATTTTAAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 + chr3L 7750983 5' + 412 12 2 73.38 TTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCC:1 + chr3L 19579978 5' + jockey 63 1 54.11 CTGCGGACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr2R 9871536 5' + roo 29 2 41.78 TGGAATTTTAAATTAACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr3L 7751041 5' + 412 7103 2 63.03 AACAAAGGCAACGACAGTAGGGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 - 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chr2L 22098042 5' + INE-1 131 1 77.24 TAACGTATTATTATTGAGATTGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTTGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr2R 12102061 5' - hopper 1393 1 65.49 TCTGGCCAAGAGAGTGCCCTGCTGTTAAGTGGGGTCCTGGGGAATGGCTGTGGCATATGTCACAGTGTCACAGGTTGATATGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCC:1 - chr3R 16630379 5' + FB 43 1 56.16 AGTCGTCAATTATTTATATATCGCTAATTTTTTTATTTGTGATATAGAATGCTGAGCTTAGCTTGCTTTGAATTATTCTAGTGTCTTTGCTTTGGTCATATATTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCATTCAACAATCA:1 - chr2R 4402683 5' - 1360 456 1 47.86 TGTATTTGTCCCTGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACC:1 + chr3L 21764376 5' - hobo 2894 1 61.74 ATATGGTGGTTTCTATTGTGTCAACAAGGAATCAGTTTCCCAAAAGCTGCACATTTGTTTTTATTTTTAGTCAAATACCAAGAAATAAGTCGATCCAGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTC:2 + chr3R 16187732 5' - mdg1 7435 2 65.75 AGAGCGGTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTT:1 + chr3R 10144338 5' - Chimpo 153 1 63.01 CACAAACAAGTTTTTCGCTTCAACATTAACTATTTTTTATACCCTAATTTGCTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr2R 6700049 5' - roo 9014 2 60.43 ATATGTTTGTATCCTTTTTGACGTCATCGAGGCAAACAAATGAAGTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 7848415 5' + jockey 12 1 78.62 TTCAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chr3L 6015705 5' + roo 8695 2 59.59 ATGCAGTAATCTGTGCACATCAGTTACAAACTATCGTCCAGTACCTCAATGGTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTT:1 + chr3R 15003072 5' + Doc 18 1 73.79 CTTGGGGGAAATTAAACTTCTTATTCGACTTTTGGCCGGCAAGGAAATTCATTTGGTAATTTATTTATTTTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTAC:1 + chr2L 2291464 5' - I-element 5294 1 58.90 GCTCCCATTAGACAGCCGTTTGGTTACTTTAATGGTCTCCCAGTGGGACAACTTTTAGCTCCCTTTCGATGACTCGTTTGCTTACATACCAAATGTATGAGCTGAGTCTTAGAGGCAATTCCC:1 + chrX 22714230 5' - 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Doc 4639 1 70.34 TACACACATACATTGTATCAGCTTTCGAAATTCACTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCG:1 - chrX 17770528 5' + hobo 2707 1 80.21 CTGATGACTCCCAGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 16274539 5' - roo 394 1 69.61 TACGTGTATGGCTAAAAGCTAGCTGTCACACACACACACACACACACACACTGGG:1 + chrX 5107971 5' + accord 258 2 70.91 AAACAAGTTGTTAAACAGATTCATGTGCGTGGAGTGGGTCCTTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACC:1 + chr3R 10148692 5' - 17.6 462 2 65.75 AGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCG:1 - chr3L 2532523 5' - blood 302 2 70.55 GTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 27391430 5' - 1360 3374 1 68.28 ATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCT:1 + chr3R 19514237 5' - blood 7323 1 62.76 GTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACT:1 - chr2L 22640199 5' - invader4 3011 2 70.37 CGCATACATGCATAAATCCNTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACA:1 + chr2R 22957924 5' + hobo 76 1 75.94 TATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGGGAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTG:1 - chr3L 20224249 5' + Chimpo 49 1 52.05 AAAATATCAAAGGTGATTGAATGCATGCGAATAAGATTTTGAAAGGATTTAATTTGTTTGTGAAAAACGATTTCGATAACTCATTGTAATCTCTAATGGATATAAGCTAATTGAGTAGAAAACAAATTTTAATTTATTTGTAATTT:1 + chr2L 8329163 5' + Rt1b 124 1 76.71 GAACCAAAACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACATACATAACCACA:1 - chr2L 21802981 5' + Quasimodo 44 2 55.71 AATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATT:1 - chr3R 30955369 5' + G-element 39 1 73.81 TTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATGGT:1 - chr2R 3262651 5' - invader1 3980 2 64.38 ATATTAGGCAGTAAAGTAAAGTTAAACACAACCCAACCGAAAAGACTAGCCCAAAATTTACTCAGAAATCAACACAAGTGGAAAGCATTAATCGGAATGTCGAACCCTCTTAACTATCTTGACTATTATTTGGAGAACCACAGCAT:1 - chr2R 10233859 5' + opus 421 2 68.49 CTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAA:1 - chr3R 12764797 5' + copia 4938 2 67.12 AATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr2R 23094997 5' + 412 33 2 60.96 AGCGTAACATTTGTCTTCAAAATACATTTTTTTTGGCAATGGTAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3L 7024601 5' - 412 7540 2 77.40 TCGGAGCATGGTGCCTGTCAATTCCATGCTCCTGCATTAGTCACATGGATCTTCCTGTGCCCACAGTCCCACTATGCCACGATACCCATAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGCACGGAGCC:1 + chr3R 17260264 5' - roo 8709 2 64.49 CTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr2L 4244872 5' + 412 7094 2 51.13 GGCCTACCCAAAAGCACTTCAGACTTTGCCCAACCCCAATCCAAGTCCCAATTCCGAATCCAATCCAAGTCTAGCGTTCTCCGGTTGTTAAACTACGGGACTTTGGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chr3R 21925237 5' - hobo 2922 1 75.34 ACGTAGATATATATACTAAATGCCAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATAT:1 - chr3R 5870922 5' + roo 8701 2 60.00 TATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATACATATATATATACGCTG:1 - chr3L 20988181 5' + blood 186 2 76.71 TATAGATTAATTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3R 20904939 5' - roo 9033 1 57.53 CGGATAGGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACACCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3L 12890437 5' - hobo 2920 1 70.83 GAAGTGGCCAAGCTGCTCTCTGATTGGTCGGCGGTCAGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCG:1 - chrX 19887043 5' - P-element 2837 1 52.41 AAACATAGACGTAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGC:1 - chr4 373105 5' + pogo 13 1 75.34 ATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTCCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3L 6131842 5' - roo 334 2 64.38 ACGCCTCATCAGGGGATGTTCGGGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 + chr2R 1921391 5' - mdg1 389 2 61.70 TGCATGTGCAGCGGCAGAAACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATTTAGTTAATA:1 - chr3R 31112319 5' - mdg1 7440 2 70.55 TTCGTCGGCAAATATTCCCTATTTTCGCCAACTTGATACTATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCT:1 - chr2L 5728997 5' + roo 21 2 71.92 AAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCACTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAGGAAACTGATTT:1 - chrX 13628849 5' - roo 9037 1 58.70 TTCGGTTGGTGTGTGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTT:1 - chr3R 12613874 5' - HMS-Beagle 215 2 58.40 TCTATCGATATCCCAGAAAAATGATTAAAGTTCGCGTTCGCTTTTTTACTAGCTGTGTAAGGGGTACCTGATAACCATACAAGAGAGAGAACGCTATGGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGC:1 - chr4 652178 5' - INE-1 546 1 38.52 CCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAA:1 + chrX 12979468 5' - transib2 2738 1 76.71 TATTCTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAAACCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGG:1 + chr3L 12227747 5' + opus 13 2 72.52 TTTATTTATGTACTTATTTAATTTATTATGTACTTATTGTTATCAGTTATAAATATTGTTATTAATTACGAGTCAGCACCATGAATTAAAAAAAAATGAATTTCTAAAAACTTAAATATTGAACTCGTCTGATGTTTCTC:1 + chr3R 3922961 5' + Gypsy12A_LTR 1881 1 75.71 TTGAAATTAGGTTTTGACGACTAAGGGATACTTAGTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 + chr2L 4244835 5' + 412 7069 2 71.03 CACATTTCTTGCGCTATAAATCGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAA:1 + chr2L 15019852 5' - BS 5054 1 55.48 AAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTAC:1 + chr3L 11837702 5' - G5A 2717 1 65.19 CCCCTGAAACGCGGAAGTGTTGGTACCAAAAGAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 18832455 5' + roo 8693 2 54.62 TACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATT:1 - chr3L 7024548 5' - 412 434 2 56.85 TATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGT:1 - chr3R 30569084 5' - mdg3 187 2 53.42 TGGCCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCA:1 + chr3R 12046721 5' + Doc 39 1 54.11 GGGGAATAGGTTTTAGGGTTAAAAAATAAACCATTTAATGTATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTAAGGAAAAATAA:1 - 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chr3R 4962877 5' + jockey 92 1 72.60 GCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 15148603 5' - roo 323 2 76.03 ACATACATATTTGTATGTATGTACACGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCCAGTACTTTGCACAATGCCTCG:1 - chr4 490363 5' - pogo 2076 1 68.06 AGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTC:1 + chr2R 7314637 5' + blood 61 2 59.29 ATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTATTATAAT:1 + chrX 9165356 5' + jockey 4850 1 76.71 TAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 - chr3R 26242538 5' - roo 330 2 73.97 GCTAAAGACATTAATGACAGTCCGGCCTTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCG:1 + chr3L 414794 5' - 412 480 2 76.71 GATAGATTAATGCGTTCGCCATGAGCTGTTCTGTGCCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTAC:1 - chr3L 11536026 5' - roo 9065 1 76.38 TTGCGTTCGAGGTTTTGATTCTGTTGGAAAAGGATTACGATATCCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACGAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAACTAGT:1 - chr3R 8563618 5' - 297 318 2 69.18 TTTATAAGCAATTTAACATAATTAATTGTTTTGTTTTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTC:1 + chr3L 19579943 5' + jockey 23 1 75.35 ATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGCAATTTCTTGGGTGCTTAAAATAGCACTCACCAGTA:1 - chrX 20999565 5' + BS 83 1 77.40 TACATTTATAAAATGTACTCTTTATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chr3R 26472766 5' - 1360 3361 1 65.07 CGGATGAAGTGCGGATAAAATGGAATTAGAATTAGCCGCAAAACTGTTTGATTTTAGCTGCTTACATATGCGCCATTTCACACCGTTACCGTTAGGCACACTCGCACACACACCCTCTACACACACACACACACACACACATTTAC:1 + chrX 13701361 5' + accord 7031 4 59.59 TACAATAAGAAAAATTCAATTGTCACAGTCCCAGATATACAGCTGCGGTAAAAATAATAGCACTACTGCAGGTGGAAAGTTCATTTCATAATCATAAAATTATTAAATGTTTATATTTTTTAAAGTCAGATTGCATGAATAATAAG:1 - 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pogo 2094 1 76.03 ATTAATTATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAA:1 + chr3L 18074061 5' - 297 349 2 55.48 GCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 30087699 5' - roo 9007 2 61.64 CCCTGTTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTT:1 + chrX 16998267 5' + diver 22 2 51.11 CATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAA:1 - chrX 2956293 5' + copia 19 2 63.64 ACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGGTTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 11516515 5' - roo 9001 2 65.75 CATCCATTTGATACGGCAGGAAATAAAAAAGTGCTGTGGCGACTAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTG:1 + chr2L 20852414 5' - Tirant 385 2 72.00 GGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAGAGAATACC:1 - chr3R 12764777 5' + copia 4958 2 79.45 CCATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 - chr3R 25860547 5' - hobo 2917 1 56.25 TGGTATTAATATTATAGTTCATGTTATAATTAGTATTAATACCAATAGTAAGCAATTGTTAAGACAGAAAACAACGAACCATAAATTTGAAACTTCAAATATTAATATATTTTATAAATGAATAATAATAATAATAATAATAATA:1 - chr2R 17243909 5' + mdg1 37 10 72.41 TCTTTCAAAGACGCCTTTATTAATTGTACCCGGTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCAATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chrX 21097329 5' + 297 6596 2 70.34 AACTTTGTTTGCTAAGAGAAATTTCGGGAGGCAAGCTCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATAT:1 - chrX 16998411 5' - diver 6069 2 50.36 GAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTCTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAG:1 + chr3L 21534268 5' + 1360 53 1 72.22 TCTAGTGTTTTGGCTTTTCTTTGCTATCTCATCTCTCCCAAAAGAGAGGGAGAGAGTGCTCTTGGGTTCTCGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 19886927 5' + P-element 47 1 52.14 TGTATACTTAAACAAAGGTAGCTTTTTGTATACATATATATATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGA:1 - chr3R 17924514 5' - Burdock 6323 2 73.57 ATGCAAGCATTTATGTAAACAAAACTTGTCGCAGCTTACTTAAGCGCAACTTTTTAAGATACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAACAAACTAAA:1 - chr2L 8536615 5' + Juan 4073 1 55.22 GAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCA:1 + chr2L 20761885 5' + Doc 448 1 64.62 AAAAAGTAATGCCGGAATAAAAATACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr2L 6149081 5' - hopper 1405 2 62.02 AATTTGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3R 21925080 5' + hobo 14 1 69.30 ATGATGAAAAAGTGGATTGGTTAAAATGTATTGGGAATACGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3R 5870748 5' - roo 398 1 76.71 TGTCGGTGAGAGCGCCAAAGGCAAGAATTTCCGACTATATAAAGTATATATATTCTTGACCAGGACCATATTTATCGATTCAATAGAATCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCTGTATGAAAGTCGAG:1 - chr2R 5496350 5' + INE-1 129 1 59.84 AAATGCAAACCCAGACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 - chr3L 22021754 5' - mdg1 366 2 57.53 GCAGATTGCGGTTAATGGTCGTTTAAGATCGCGTGAAAAGCGACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCTTTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACT:1 - chr3R 8050627 5' + jockey 4828 1 70.68 TTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTAC:1 + chr2R 7314605 5' + blood 23 2 62.69 CTGTGGAATAGGGGATCTTATTGGGAATTCATGAATTCAGTTAAAAAACTCCAATCTCTGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCAT:1 + chr3R 8563528 5' + 297 6639 2 58.22 TTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACTATTTT:1 + chr3R 25860450 5' + hobo 34 1 62.07 TCAAAATGAGGCTGTGTGTGGGTGTATCTATGTGTGTTAACATTGGCCCCCTGCCTGTTCTACGGCCTGCAGGTATACGGCATTGCTGCGAAGAGTCACCTTAATAGGATCCGGATCTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTT:1 + chr2L 10143649 5' + jockey 4538 1 70.34 TCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCG:1 - chr2L 4864465 5' - mdg3 5430 2 62.76 CGGGGAAGAGGAATAGGATACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2L 3662061 5' + blood 7060 2 50.68 TTCCCCCCATCCAAATAGTAAGCAATAGAGTGCCACTCAGTTATCCACAAAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTC:1 + chrX 21442929 5' - Transpac 283 2 64.29 ACAAGGACCTTTGATGAGCTATTAAATGACGGCAATATGAAGATGCCCGAAGATCATCCTTTCCTAAGAAGCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 + chr2R 13847774 5' - 412 7539 2 70.19 AAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCT:1 + chr2R 19805440 5' + F-element 94 1 75.71 ACTAATTCAAGATTGAACAGATTATATAGTTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGAT:1 + chrX 20149097 5' + pogo 27 1 67.12 ACTGATCTTTACTCCGCGATGTCCACACCAATCCAACCTCAGAGTAAGCAAAAAGAAGTATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCA:1 + chr3L 22702760 5' - 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chrX 15286989 5' + X-element 4374 1 67.26 TGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chrX 860764 5' + hobo 41 1 54.11 ATTTGAAGGTAAAAAATCCCTGTTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGC:1 + chrX 16998250 5' + diver 5904 2 58.90 TCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 26854758 5' + jockey 25 1 55.56 CGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTC:1 + chr2L 7633345 5' + Max-element 8282 2 54.11 TCGCATCAACGTGTTGGGTGGCTGTGTGTGGGTGGTGTTTCGAACAAACCACTCGCAGCCGGTGATGAGCCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGAT:1 - chr3L 18549492 5' - X-element 4278 1 71.30 ACTTCATTCATTCATTTATAATTTAATATCGATCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCTAAGCTGTGTTGTTTTTGCCCCTCGCCCTGCGCGCTGCGCAAGCGGGAGGTTGTTACAATTTACCTTACAAGTAAACCG:1 + chr2L 11465301 5' + jockey 255 1 78.08 CAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAG:1 - chr3L 1463746 5' - P-element 2835 1 50.68 CTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTG:1 - chr3R 5870878 5' + roo 8746 2 76.71 AACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGGCATTTTTTCTTTATTTGGT:1 - chr3L 8249477 5' - mdg1 7400 2 56.85 TGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCG:1 - chr2R 12133877 5' + jockey 33 1 66.21 TTGTGTTCGTCTTAATGTATGCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAG:1 - chr2L 15020010 5' + BS 4809 1 75.69 AACTTCACTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGATATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTT:1 + chr3L 21534218 5' + 1360 36 1 59.57 CAGTCACCGATGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGC:1 + chr2R 10417148 5' - 1360 3313 1 70.55 AAAAGAAAACAAATTTCGCCCGCAGTTTCGGATTTCCATTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTT:1 + chr2R 9513400 5' + hopper 149 103 80.00 ATGATTTAATAGTTTTATAAATATTTTCGGCTTAATTGCCATACCATTTACGGTTTAAGTTGTCCATGACTTCAGTGTCTAGTATACAATTACACTATACACTATAAGGTATGTAAAAGAAAGTACAGTAACGGGTATCTGATAGT:1 - chr3R 32045671 5' + INE-1 548 1 73.29 ATTATAATTTTTAAAATGTATGTTTTAAATTAAAGTTGTTATAATAATTTCCGTATATATTTAGTATATTTCTCAAGTCATTTGACTTAATATGATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCT:1 + chr4 215095 5' - opus 475 2 63.64 TAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr3L 15148605 5' - roo 322 2 77.24 TAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATC:1 - chr3L 9318086 5' + P-element 2883 2 52.05 CACGACAACAAACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 - chr3L 10033686 5' + blood 7031 2 64.17 TGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACA:1 - 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chr2R 943923 5' + F-element 49 1 52.52 AAGAATGCGTTTAGTGGGATAGGCCGGTCGGTATGAGTTAAGTATGGTTTTGAGAGCCAAAAACGGATACAGTACTAAGAAAACTATAATAGAGCGCATCTTATATTAGTTCATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTAT:1 - chrX 23102525 5' + Transpac 4928 2 79.45 ATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGNATCGCA:1 - chr4 868718 5' - roo 328 2 72.60 AGGGGGAATAACAGTTTTTTCACAAATAGAAAAAAAACTAACAAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr2L 3892936 5' - 1360 3368 1 70.55 AGGGGCAAGTTTTCTATACGCTTTTAAGAAATCATGGAATATCATAGGATAAACGCAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 + chr4 880297 5' - pogo 2036 1 64.38 TAGAACAGGTTTTGCAACAGTATGTTTTGTTAGGAGAGTCACGTTAGAATGTTTCAACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCG:1 - chr3R 25471751 5' - Bari1 1643 1 59.59 TTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chrX 13091076 5' - P-element 2798 1 18.52 TCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTC:1 - chr3L 12227870 5' - opus 7432 2 67.61 TGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACT:1 - chr3R 30955385 5' + G-element 62 1 69.11 GAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCAC:1 + chr3R 25158618 5' - 1360 3309 1 77.10 TCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTA:1 + chr3L 10897452 5' + roo 74 2 68.49 TCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATAC:1 - chr3L 12227911 5' - opus 466 2 63.70 TATACTTAAACAAAGGTAGCTTTTTGTATACATATATATATGTGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAG:1 - chr3R 17924512 5' - Burdock 6315 2 74.66 CATTTCGGTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACA:1 - chr3R 11285013 5' + blood 26 2 63.28 ATTATAGTCCTTATAAATAACCATTATGCGACATTCTGTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAA:1 + chr3R 25597795 5' + copia 4891 2 69.18 TATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTATCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr2R 15392525 5' - mdg1 355 2 60.96 CGATAAATATTCCTTTGCGTAGGTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3L 6131944 5' + roo 8710 2 54.48 CTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 + chr2R 15392521 5' - mdg1 359 2 59.59 TGCGACACTATATTGGTTGAGGTACTGTCACTTCATTACGCCGCATGTGTTCATCTGAGCTGCAAATAGTAATTAGACTTGCAATCGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAG:1 - chr3L 3661208 5' + X-element 24 1 78.08 AAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 10897527 5' - roo 9025 2 49.32 AGCAGCGACTAGTTCGTGCTCCATCTTAAGTTACAATCTGAGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 + chr3R 29680167 5' + 412 7080 2 66.44 GGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 - chr3L 2167685 5' + opus 7067 4 70.00 ACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 5870806 5' - roo 339 2 63.70 AAAAAAACAATATAGAGATAAGTAGCAAATTTTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chr3L 27350147 5' - 297 6952 2 70.55 AATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTG:1 + chr2R 21795211 5' + transib2 7 1 77.42 TAGCATACTTTTTGGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chr2L 13033426 5' - hobo 2932 1 67.31 AAAGAATGAAGGCTAATGTATTGCCGTGTACTTTGAGATGAGAATGAATAGAACGAAATTAACGTCTAGCAAAAGAGGGCTGGTTAATCTAAATTAAGGCTATAGTAGATTGTAATAATTAACATTAATATTATTATTATATTATT:1 - chrX 7374284 5' - invader3 5054 1 71.92 TAGAACTTGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 + chrX 8038584 5' + 297 6616 2 60.43 TAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATT:1 + chr2R 558057 5' + copia 4905 2 60.96 TACCTGCATGCCCAGAGATTCGGCCCACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 28749080 5' - mdg1 406 2 69.49 TTCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGT:1 + chr2R 18931800 5' - blood 7346 2 55.17 ATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGAT:1 + chr3L 11364807 5' - Tirant 8429 2 71.23 GCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACC:1 - chr3R 23636424 5' + X-element 4304 1 66.43 GAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 + chr3L 15148575 5' - roo 9038 1 53.66 TTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCAC:1 + chr3L 17268250 5' - hobo 2904 1 54.95 GAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATG:1 - chr2L 2057867 5' - 412 403 2 80.58 AGGACACGTTCTCAGTTGAAATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAA:1 - chr3R 10148865 5' + 17.6 6947 1 71.23 CAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTC:1 - chr2L 2544829 5' - blood 306 2 66.44 ACTTTAATAGGGTTTTCCATTATTTCATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 + chr3L 13057320 5' - 412 7515 2 63.70 GGTGGAGCTGATTTGTTCAAAGACTAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTGAG:1 + chr3R 18294832 5' + copia 4950 2 71.92 TGTCCTATACGATGTACACGTGAATCCCGATATCAACAGACTGGGGACTGGCGAGGTTC:1 - chr2R 3469104 5' - BS3 121 1 74.58 CTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTATTGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 14884182 5' + roo 63 2 64.38 AAAAGTCAGAGGAGCAGAGCTAAATTCTCTTTTATTGCAACAAATTAAGAGAGCCACAGGTGCCGTACAATCAGAACATGGTGCTATAAATAAAGATACTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3R 16475470 5' - mdg3 5474 2 69.86 GTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:2 + chr3R 5870793 5' - roo 9016 2 54.79 TCTCATCATCCTGTCAGTTGCAATGCGAATATTCTATATATGTATGTGTATATGTGTGTATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCCAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAA:1 + chrX 18582168 5' + I-element 51 1 53.33 GATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3R 26242530 5' - roo 322 2 79.45 GTGTGTGACTGACCTATCTCAATGCAATTTTGCTTGCCCGCTGCACCACAAACACACACGCACGCACGCACGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTT:1 + chr3L 17500712 5' - Tirant 8461 2 52.17 GCCCTCATCTGCTTGCATAATTTCATTTTTGATTTCTTCTGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAG:1 - chr3L 8036764 5' - jockey 4804 1 72.41 GATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACG:1 + chr2R 7720064 5' + HMS-Beagle 6851 2 57.53 ACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGAAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCAT:1 - chr3L 4547790 5' + mdg3 5276 2 61.48 TTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCT:1 - chr3R 12613850 5' - HMS-Beagle 186 2 66.15 ATCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGG:1 - chr2R 8436329 5' - 1360 3334 1 56.85 CAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTG:1 - chr3L 24059279 5' - roo 9031 1 56.12 AACATTGGACTTAACCAAAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGG:1 - chr3R 1446145 5' - 1360 3378 1 29.45 TGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCT:1 + chr3L 9324465 5' + HMS-Beagle2 6953 2 67.38 AAAAAAAATTTTTAATCATTTTGTTTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCG:1 - chrX 13628882 5' - roo 399 1 79.45 GAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTC:1 + chrX 13091063 5' - P-element 2800 1 26.03 AACCAATTGAAAGCGGCATACAGCACAGATACACAGACAAAAAATAAATTTCTAAGTATGTGCACAAAAAGAGCCGCATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAAC:1 - chr3L 9696049 5' - 297 6935 2 59.59 GTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTTGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1 - chr3R 21907534 5' + Tabor 6909 2 67.59 ACACACTCTACTACTTCCAAGCGTACACCATCAGCACCAAGCAACAAAACAACCAACCGACTACTAACTACCCTAATTTAAACAATTCCTTGCTTAAGCCTCACCCCATCGTCACATTCCCACGTTCAAAGCTCGGAGCCGCAATC:1 + chr3R 27156427 5' + Idefix 7073 2 52.05 CAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3L 18216452 5' + 297 6619 2 60.27 GCGGCGAAATTGTCGGGTTCATTTTTGCCCTTTATTGTTGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGGGC:1 + chr3R 15762595 5' - F-element 369 1 62.50 CTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCAC:1 - chrX 17770494 5' - hobo 2922 1 51.81 ATAAACAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 13285714 5' + roo 8692 2 66.21 CAACGCCGGCCACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGCA:1 + chr3R 24666356 5' - hobo 2905 1 52.17 CCTTAGGTATATATAGGTACAACATTCAACCATTTTCCCTTTTGATCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTACAAGTCCTCTTTAAAAATTCTCTATCTTGTATTCTCCGAGTCACATCCGGTGTTAAACAAGGGAGTCATCTTGGTCC:1 + chr2L 22014453 5' + Q-element 491 2 77.40 CTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATTTATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATCTTTAG:1 - chr3R 20905042 5' + roo 75 2 70.00 CCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACT:1 + chr3L 18846974 5' - 1360 3323 1 70.77 ATAGCTATTAGGACTCCGCAGGTTAGCTCCTCCTCCTCCTCCAGATCCTCCTCCCCCTCCCCCCCCCCC:1 + chrX 7688056 5' + accord2 223 1 82.61 TTTTATAAAAATAAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr3L 17500821 5' + Tirant 8147 2 54.92 CCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAAC:1 - chr2L 20852529 5' + Tirant 20 2 56.67 TAGTGTAAATGTGTAATTGTAAGACCAATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 - chr3R 4962887 5' + jockey 79 1 65.03 ATGTGGCCGGGGGTCAAATGCACAGGCTACCTATTGCAGCTCGTATGCTCAAGTTGAAGTGGGACCAAGATTTGGCCCTTTTGGCTACAATCTTGGTAAAGCCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3L 17875728 5' + 1360 23 1 69.86 GAAGAACATCGAAAAAAGTCAATTATATTATTTTCGAACATTTTCGTCTTTAGCCTGGAAAACGAAACCGTTGGCTACGACATAATTATATTTATAATAAACATACGAATCGAGGTAGCCAGCCCAAAACTGCCACGCCCACACTT:1 + chr2L 22127476 5' + INE-1 244 1 78.77 GACTTTTAATGAAGCCAATGAGGTCTAAAATGAAGATAAATCATAAATATAATTATATATCAGTCATTAAAGCCGTTCTCCATAACTAAAGCAGTTTAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr3L 9397752 5' + 1360 19 1 68.57 GAAGGGGATCGAGGGGATCGAGTCTGTGGACTGGCGCCTTTTTTTTTTCATTTCACCTTCGGGTTCCTCAACTTAATTGCCAGAAAGAGACGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATT:1 - chr2R 11558092 5' + 412 3 2 75.00 TGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCA:1 - chr3R 6419924 5' + Tabor 6919 2 69.86 GGGCAGATGATCGAAGTGGAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr2L 2057885 5' - 412 7468 2 68.97 TTTTATTAAATAAAATTAATTGTTTTATTAAATAAATTTAATTTGCTTTATTTTATTATATTTTATTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTTTTTTTTAACTTTGCTGTTGGAGGTACG:1 - chrX 8976036 5' - HeT-A 6057 2 44.44 AATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 9324423 5' + HMS-Beagle2 6916 2 61.64 TTCTTATATACAATTTTTTTTAATTTTAACCGCGTTACTCGTAGTGTGAAAGGGTATACTATAAAATAAAACATAAGGTGTATATATATTCTTGATAGGTATCAATAGCTGAGACGAACTGGCCATGTCCGTTTGTCCGTATGAAC:1 + chr3L 14244575 5' + INE-1 123 1 48.63 TTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAG:1 + chr2R 7314618 5' + blood 27 2 56.80 ATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTT:1 + chr3R 10714159 5' - 297 331 2 66.18 AAGTGTACAAGCTGTCGGCACGTGGACAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACAT:1 - chr3R 25796116 5' - BS 5056 1 56.85 AGATTAATGCGTTCGCCATGAGCTGTTCTGTGCCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3L 11536023 5' - roo 9043 1 64.38 GAACTAATTACGAAATTCCACATTACGTGATTTACTCGGTTGCCCAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTC:2 + chr2L 15085571 5' + opus 7 2 78.08 TTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 - chr2R 23095002 5' + 412 28 2 64.38 TATCCAGACAAAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:1 - chr3R 31264555 5' + BS 10 1 70.77 TGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGAT:1 - chr2R 14532041 5' - invader4 271 2 70.43 ACTAAACCAGCAAAAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTC:1 - chr2R 14532098 5' - invader4 3063 2 69.78 AAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr3R 31266122 5' + jockey 85 1 73.05 TCCTTAAATAACTTTATGCCTATGACTAGGCATAATAACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGAGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCG:1 - chr2L 3893133 5' + 1360 5 2 77.40 GCCGATGAGAGTGTATGTGCCAGCTGGGCGGCATGATGCTGCTGTGCGTGCTGCTGTTGCTGCTGCTGGTGG:1 + chr3L 7830902 5' - TART-B 151 2 50.00 AAAGTCAAATGTAATAAAATGTCACAGTAAATTTAAACAATTATTAATTAGTGTATGCTTTCCTTTGAATAATTTAATTGTAGAACTACAAGGGAATTTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAA:1 + chr2R 7727088 5' + BS 4684 1 63.01 AAACCCATAAAAACCAACCAACCGAACCTAACAAAATGCCACTCGAAATCACAAGGATAAAATCACAATTTTGTTGGAAATTTCGCATAATTTCGGATGAGTTCTCTTTGACTATATCTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCA:1 - chr2L 9795535 5' - blood 374 2 79.45 CGTGTGTATCTCGCTTAAATTCGTCCGGCCATTGCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATATTTTCACTCCGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTG:1 + chr2R 19806887 5' - F-element 4329 1 74.10 CAAACAAAAATAACTCAATGTGTGACAATTTGGCAATGTCACAAACACTTATGGTGTGTCTGTGTGTTAGCACTAAAGGAAAATTAACTTACAAGTTAGTACACATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTCGGAGTGAAAACATCCAA:1 + chrX 4064339 5' + F-element 4372 1 65.07 GACTGATTAAAAGACTCCGCTCTTTTATATTGGCTTAAAGCCGACCTTGCGACAAAACAGAAAGAACACATAATAAACTGCAGTCCATGGTACCAATCTATTAACACGAACACCTCACACCCATGCGATTACCTTAAAC:1 + chr3L 5450113 5' + I-element 4878 1 76.26 AAAAAAAAACAAGAGTGCATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:2 + chr3R 24084785 5' + roo 60 2 60.96 GAATGACAGCCGCTTTAAAGGTGGCGTATGCGTGATGTTCTTTTTGATCCAACACAGTCAGCAATAGCAAGTATTGCAAACCCTAATTGATCCCATTGATTGAGCTTTCCCGACTTTTACCGACTTGTGTTCAAACA:1 + chr2L 21197784 5' - flea 430 1 70.07 TCATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGA:1 - chr3R 15727980 5' - 1731 304 1 71.92 ACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCACGC:1 + chr2L 8284386 5' + Doc 432 1 70.34 GGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACTTAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCCGTAGTTTAAAGAAATATAGTAAGTATTTTGCANTTTTCGTCTTTGTG:1 - chr3R 1844831 5' + Cr1a 189 1 65.75 TAGCTTTCTTTAGAATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 - chr3R 10714279 5' + 297 28 2 64.34 GGTTGTACAGAATTGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3L 18216431 5' + 297 6598 2 74.66 AAAGGAATTAACCTTTTCTCGCAGGCAACTTGAGTGTTTTTACACATTATTTGCGTATCTTCCATACACGTCACAGAATATGCGAGGCAACTCATATATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTGTCAGTCGAATAAATGATCCGT:1 + chrX 22381949 5' - Tom1 371 1 73.97 CCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTAGCTGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCA:1 - chrX 21907826 5' + Stalker 7166 4 59.59 TTCGCCGCAAACGCTTTTCCCAAAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr2L 310031 5' - P-element 2859 1 65.71 ATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTA:2 + chrX 21087561 5' + mdg3 37 2 50.00 GAGAGGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGCCGGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chrX 5083931 5' - P-element 2794 1 21.92 GATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr3R 25158688 5' + 1360 23 1 61.95 ATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGGGAAGTGAACGCCAAATAAAATA:1 - chr2R 17350590 5' + F-element 77 1 60.87 AGATCGTTTGCTTCTTAGCTAATCCATATACACACATACATTGTATCAGCTTTCGAAATTCACTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 17770556 5' - hobo 2921 1 70.55 AAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAAC:1 + chr3R 8112711 5' + Burdock 6203 2 65.07 TTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr3L 13779418 5' + I-element 58 1 60.96 TATTAAAAACTTGTGTTCTTTAACTAACTAACTTTAACTTTAACTAACAGACTTTAAAGAATACGAAAACTTTACAGCTCAAAGAAGCTGGGTTCGGAAAAAATATAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chr4 562997 5' + FB 49 1 59.59 TTGGCCAAACAAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 8681391 5' + jockey 14 1 76.15 CGGTATAAACCTTTTAAGACTTTGTAATTATTTTCAATATTAAATTACTTGGGCTTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATGCTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAAGCGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTAT:1 - chr2L 19248228 5' - mdg1 356 2 60.00 TCAGAAAAAAATAAAACCGTGTCTAGGGATCAAAATCGGGATTGGAAAAATTCTATTTTTAAATTCGTTAAACAGCTGACAGTCAGGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 - chr3L 13993687 5' - P-element 2851 1 60.27 AAACAATGCACAATGTTTGCCATTGTTTCGCTAGCCGTGTGTTTTCCTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTAC:1 - chr3R 9278160 5' + hobo 75 1 71.53 GCTGTGCCTTTTCATTTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACACATCATCG:1 - chr3L 11364927 5' + Tirant 29 2 67.12 GAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATG:1 - chrX 2214287 5' + jockey 4636 1 69.18 TGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGA:1 - chr3L 13285682 5' + roo 8725 2 60.27 AAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGC:1 - chr2R 17350609 5' + F-element 66 1 51.37 ATTCAAATTCCCATCGCACCTCGCACCAACAACAGCATTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAATGTGTCTTG:1 - chr3L 17181502 5' - jockey 4917 1 74.48 CTAAATGTTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 12133887 5' + jockey 18 1 75.71 GAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGC:1 - chr2R 14532062 5' - invader4 3020 2 62.33 TTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGAT:1 - chr2L 15019982 5' + BS 4839 1 55.48 CTGTGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTATCTTACG:1 - chr3R 12146751 5' - gypsy10 289 2 53.47 TTTTTGTCTTTTTTTTTTATTTATTAGTATTATTATGATTGTTATTATTATTATTATTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCG:1 + chrX 13812975 5' + micropia 4962 2 79.31 TGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTT:1 - chr2R 12827046 5' + Burdock 6221 2 78.62 GTGTATTAAGACTAATGGCCGAGAGCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAA:1 + chr3R 7049311 5' + Burdock 6 2 80.00 AGAGAAATGCTGGGTTAGAGCACAATTTATTAAAAGCGGAGCATGGAAATTGCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTC:1 - chr3R 18294946 5' - copia 226 1 62.33 CCAATCCATATAGCAAAGCGGGTGCTGCCAGCGGAAATTGAAAGCTTCCGTCGCGAACGGGCGGCGATAAGGAAGCCAACCACCACCCCCTTCTTCCCATAGGAAAACCATCCACACACACACACACCCACATTC:1 - chrX 13057910 5' + accord 7031 2 51.85 AAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCA:2 - chr3R 25597915 5' - copia 176 2 69.86 CCACCTCGCTGATCGAGAATTTCCACAAGAAGAACAGCTCACCGCAGCCACTTGGCAGTAGCAGCGCCATAAGCACCCTAACTCCAACAACCTTGAATGGAAGACGTTCCATTACCCCTACTATATCCATCAATCCCAGCCCAA:1 + chr3L 8093105 5' + 297 6533 2 70.14 TAATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 23431557 5' - roo 323 2 80.14 GTGGAGAGCGAGAGTGAGCTTTTTTGAGAGCCAGAGAAACAATTGCCACTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTT:1 + chr2R 13897739 5' - blood 7177 2 81.94 CTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCACTATGCAGC:1 + chr3R 12622159 5' - 1360 3351 1 57.86 TTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTCGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 + chr3L 18846943 5' - 1360 3344 1 52.14 ACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAG:1 - chr3R 15727957 5' - 1731 4593 1 56.16 TCCATTTTATCAAGTAATACCAAGTGCTATATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTC:1 + chr2L 20761821 5' + Doc 393 1 80.58 TACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATT:1 + chr2R 18886943 5' - roo 9033 1 58.04 TTTAGAAACATCTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGC:1 + chr2L 14262922 5' - P-element 2851 1 59.59 AGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTATGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 - chrX 5751910 5' - roo 326 2 79.10 AACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAATGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 + chr3L 7024451 5' + 412 66 2 60.69 TTCAATGTGACTTTCAATAACATATAAACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCT:1 - chr2L 4864524 5' - mdg3 237 2 78.77 CAACTAAATAAAGTTTATATATGTGTACATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chr3L 6131792 5' - roo 385 2 69.18 GCATAACCGTCAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGCTATCGATTTGATTTTTAAGATCGCAAGCGAC:1 - chr3L 25206947 5' - HMS-Beagle 7016 2 67.81 AACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCA:1 + chr3R 10030718 5' - BS 5014 1 70.55 CAATACCAACACGGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACG:1 + chr2R 21713263 5' + P-element 87 1 23.61 ACATCAATAATTGAAATAAAATCAAAGAAATTTGTTAACATTTAATAGGATATTCTAACAAATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAG:1 + chrX 6216293 5' + Juan 3979 1 62.76 GGGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACA:1 - chr3R 6419923 5' + Tabor 59 2 65.32 GTAAACCCAAAGTGCAAATCAAAGGTATAAAGCAGCGGGTAGCGGGTAGCGGGTAGCGAGGAGCTTGTTGAAAAGTCAGCAGCGTCATCCCCGCTCGCCAGGACTCTCGTATTTGGATTCAGATTCAGATTCTGATTCG:1 - chr2R 20496340 5' + transib2 2534 1 53.24 ATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCT:1 + chr2R 19574412 5' + I-element 5143 1 51.37 AGCTCATCAGCTTATCAGCAAACGAAATCGAAGTTTGATGCACATAAAAGTGGTATTAAATTTCCAATAAAGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 - chrX 5751984 5' - roo 389 2 71.92 TCTCTTTGTAGCAATTAACAACGCAGTGCGACACAAGCGGCGACGACAAGCCAACACTTGAGCCATAAACCAGCCCAACACGACCCCCGGAACGTACCACGGTGCCCCAGTGATGGTTCTCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAA:1 + chrX 2950482 5' - F-element 4320 1 60.96 ATTGCTTCTCGTCGTTAGCTAAACACAGTGAGAAGCGCAAAGAGAGGCGTTGATATCTGATTGTTCAAGAAATTCTCGAATGAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATT:1 + chr3R 8197750 5' + pogo 36 1 59.31 GCCAAATGGCCAAATGGCCAAAGTGTCGCCAAAGTATTCTATGTAAAAGCCAAAGAATGCGTGTTTGCTTTGGAGTATATGTATTGTATTAATGGGTCGCTCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr3L 1004789 5' + jockey 4694 1 70.00 TAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACG:1 - chr2R 12185400 5' + accord 66 2 69.92 TCGATCACCTCCAACATCTGGTTACTATACTATTTATTAAATGTAAAATGACCTACGCACTTGTAATCATCAGTTGTTCCTATCTTTGCGTTTGATGCAATTACAATTGAAAGGTTATAATTTTACACATATATTGAATATATTT:1 - chr2R 23885906 5' + Tc1-2 1595 1 77.93 GTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 + chr3R 25597832 5' + copia 59 2 60.96 AAAGTTCTGCTCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAAC:1 + chr2L 14056661 5' - pogo 2048 1 56.16 ATGCGCTGCGAAAAAATAGTCCATAATACTCCAAAACTTATATTTTTTTAGTGAATAAAAAAGCATATTCTAAAGATAGAATTTTAAAATACAAAATTCTAACATAGAAAAACTGATTAAATATAAATAAATATAAATATATAAAC:1 + chr3L 15446937 5' + 1360 2961 1 66.44 AAATGCGAAAGCTTCCATCACCAGTCTCAAAAATAATATAGATTTAAAGTCAAAGAACTTCTAAGGTGAAGGGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATAAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTCTGCTATCACTTTATGCGA:1 - chr4 48611 5' - 1360 151 1 80.82 CTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAAT:1 - chr2L 20029464 5' + I-element 82 1 67.81 TCCATTTTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2L 12236867 5' + jockey 36 1 64.83 AACCCTCTCTTTTTATTCTATTTTTTTTTTCCCTTTTTTTTTT:1 - chr3R 24606875 5' - Doc2-element 252 7 67.44 ATAAACAGTTTGGAATTGATAATATATTGTTGGTTATTGTAAGCTTATTCGTGGTGAAGTTGAGAGTCCCGACTTGATTAGTCGGCTTAACTTCTCTGTTCCAGGTATATTCACTAGAAATTATATACCCCATATCTTAAATCATT:1 - chr2R 3522370 5' + Cr1a 4136 1 75.34 TAAAACAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCT:1 + chr2L 8284310 5' + Doc 383 1 76.55 TTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTATTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1 - chr4 651045 5' + micropia 4997 4 53.03 GATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGA:1 - chr2R 12827083 5' + Burdock 6185 2 53.42 AGCCGTGCGACAATTTGGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 25580750 5' + 1360 7 2 74.04 ACCATTATGCNACATTCTGTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATA:1 + chr3R 25597814 5' + copia 4910 2 56.85 GCAAGTGACTATAATTCTCAAGTGCACTTTCTGCGGCAGGACGCTTAAATAGGCGCATTTATTTGCTTATTACTTTATGCTTTTAGTTCTGCTGGGTTTTTGAGTTTTGTGGCTATTCTGTTATAATTTTGTTTTTTTTCTTTT:1 + chr3R 14088249 5' + Tc3 86 1 62.50 TTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTT:1 + chr3L 13057361 5' - 412 7495 2 63.20 GACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGT:1 + chrX 20330548 5' - P-element 2808 1 26.87 GTTTTATTGCAGCTCCAATTATTTTCAAAATTTCCTTTATCCTTAGCGCTGTTTGTGCCACCAAGCTGATTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTAATTTT:1 + chr3L 12055238 5' - I-element 127 1 76.64 ATTTCGCAAGTTTAGAGTTCGCTGCGACGGCGAACACATGCGTGCACTGCGAGAACTTTATGAATTTTGAATATGATGACATAAGTGATGACACTTTAAGATATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAG:1 - chr3R 29758667 5' - I-element 5332 1 70.55 GTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACC:1 + chr3R 12146663 5' + gypsy10 5678 2 57.43 CTCTAGATGTAAGCTTTACATCTTGTTAACAGATTCAATTGACTGTCGTTTTCTTCGAGTGTAGTAGTAAATGACTTTGATTTGACTCAAATGGCACCACCAGCAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAACATCGAATTTTTGAA:1 - chr3R 23217783 5' + FB 19 1 57.53 GCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3L 17268253 5' - hobo 2892 1 62.50 AAATGCCCCACGTTGGGCGCCAATTATGAAAAGGGTTGGCCGGCGGTTAACGCGCGAATTAACGAGTGAAGCCTTCCAGTGTCTTCCTTCTGTGGTCCTTTGTGTTTCTTTTCCCTCTATTGTTTCT:1 + chr3L 17439100 5' - gypsy5 360 2 59.84 TGGCTGCTTTATTGGCGGCGCTTCAAAAACAACTCGTACCTCTCATTCACCACCATATCAAACTACACAAAAAA:1 - chrX 18141841 5' + Porto1 293 1 68.92 TAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATAA:1 + chr2L 17550607 5' - Transib-N1_DM 447 1 76.71 GTTGCGCTCCATTTCGTTACGTTCGTTGCGTATGTGGCGCTGCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGA:1 + chr3L 17181397 5' + jockey 28 1 67.81 AATTTAGTTTGAATGATAAGAAATATTTTAACGCAGTATGTAAATGTGTGTTTAAAAATCTTTTTAGATGTAAACGTGCTATTGTCCAGACTAATTTTATGACCCAATTCGATATTAAAAACAAGAGAGAATGCTATATTCCAGTT:1 - chrX 21088578 5' - INE-1 575 1 34.25 TCTGGTCTGTACAGTGAGAGTACAGTGAGATCGACAATCATAGGTTCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAAACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTGGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATTCTCGCGCTGACGCTG:1 + chr2L 22558551 5' - F-element 216 1 64.14 TCCGAATTCCGAAAACTGATGTACCATTAGAGTTTACACAATTACTAACCAGTACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAG:1 - chr2R 13132601 5' + BS 4681 1 60.15 AAACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 - chr3R 31112302 5' - mdg1 385 2 58.90 CAGATTATATAGTTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCC:1 + chrX 20149114 5' + pogo 44 1 55.48 CAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATATATAAGTAACGTACATACATTGTGACACTTTGTTGCAAACACAAATAAACATAATTCACATCAAAGAC:1 + chr2L 20628597 5' + Stalker2 7336 2 77.08 TTTAAGAATAATCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:2 + chr3L 5027140 5' - roo 9045 1 65.75 AGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr4 490221 5' + pogo 50 1 56.12 CCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTGT:1 + chrX 14735757 5' + diver 90 2 76.55 TGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGAT:1 + chr3R 19965249 5' + jockey 84 1 75.19 CAAACTATCGTCCAGTACCTCAATGGTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGAATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGG:1 + chr3R 15003098 5' + Doc 6 1 75.70 TTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3R 24084886 5' - roo 9042 1 54.78 AGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTA:1 - chr2L 6637471 5' - 1731 4587 1 56.67 AGGACTTTCCGGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:2 - chr3L 20061473 5' + roo 23 2 67.12 ATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTAT:1 + chrX 13091060 5' - P-element 2806 1 28.67 TTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGATACAAGTCTAACTATAAAATAAACGGAGCTATGCTTCAGAAAGAAACATTCAAAGGATTTTCAATATAGCATGGCGACCGTGACAGG:1 + chr3R 19045995 5' + gypsy11 447 1 60.14 GCAGCAGGCGAAATATTCCCACGCCGGCATGGCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTCAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 - chr3R 28618466 5' + 412 36 2 50.37 TCACTGAAAATCACACAACTCAGTCCAACTCAGCCAACTATAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGGACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTA:1 + chr3L 20680233 5' + 412 14 2 73.19 AGTATTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTT:1 - chr3R 17243253 5' - hopper 1393 1 68.49 TTCAGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCG:1 + chr2L 13033297 5' + hobo 41 1 48.97 TATCCAGACAAAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTG:1 - chr3R 31264555 5' + BS 26 1 63.01 TCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTT:1 - chr3R 20887481 5' - Doc 4604 1 67.39 TGCACATAACATAAGAATAGTATGAAGAAACGAAAGCGGAAATTTGGGCCAGAAGTGCGGATTGAGGATGTAACAGCAAGTGAACATAAAACATTAAACTTCTCTAAGAGAGTTAATTACTGTAACGACCTTAG:1 + chr2L 20039804 5' + I-element 497 1 51.49 TTAAAGATACAATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTAATTCAAATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTCAATTACTAAGTACAATATCATGTTGTTT:1 + chr3L 20224130 5' - Chimpo 149 1 51.18 TCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTNTATT:1 + chr2L 512414 5' - roo 9033 1 52.27 ATAGTGCCCGAAGAACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 + chr2R 19805424 5' + F-element 67 1 61.24 AAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr3L 13285675 5' + roo 8716 2 60.77 TATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3L 19580009 5' + jockey 80 1 72.73 TAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGC:1 + chr2L 8284322 5' + Doc 385 1 73.33 ACTACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr2R 12462230 5' + roo 58 2 58.90 TACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAG:1 - chr3R 19950542 5' - BS 5051 1 51.47 AAAGCAGCCTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTTCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTCAAA:1 + chr2L 21683381 5' - pogo 2059 1 51.91 TTCAAGCGAAATTTTCTGCCACATTTCTTGCGCTATAAATCGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAA:1 + chr2L 15019833 5' - BS 5073 1 67.12 AAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 11364854 5' + Tirant 15 2 67.80 GAAATCCATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGGAATATCTTCGG:1 + chr2L 5728849 5' - roo 354 2 54.79 AATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAAC:1 + chr3R 13868907 5' - HMS-Beagle 193 2 56.85 CCAAGCAAAGTTTCCCTCACCCATCAAATCTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGA:1 - chrX 684872 5' + jockey 4738 1 74.79 CGGTTCGGTTGGTGTGTGCGGGTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATCTTGAAGACCG:1 - chr3R 12613877 5' - HMS-Beagle 7024 2 64.35 TAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTG:1 + chr3L 7848491 5' + jockey 90 1 71.92 CGAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 - chr2R 18931932 5' + blood 7058 2 52.05 ACCTCTGAGTTCAGGTTCGTATCATTGATAAAGCAGCCTTGGAAACTCTACTCTACTGTACCCTATTCTCCACTTGCGATCCCGCTTATATCAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATG:1 + chr2L 21683352 5' - pogo 2073 1 66.44 CAGAAGGAAAAACATTGCAACATCCCGCGTTGATTGGAAATGAAACTGAGTCCCTCCAGGGGGTGTGGTTAAAGCTGGGGTCCATCGGAAAATCCACCCCCCTTGTGGAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATT:1 - chr2L 9383887 5' - flea 244 2 76.03 TTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTT:1 + chr3R 23644884 5' + diver 81 2 69.86 ATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGGGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 - chr3L 14422805 5' - roo 8986 2 75.34 AATTAGCGAAGAATAAAAAAATCCCATATAAAACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGC:1 + chr3L 23496601 5' + blood 140 2 42.47 TGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATG:1 + chr3R 17259524 5' - roo 9001 2 66.44 GCTATTTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTT:1 - chr3L 11684934 5' - Bari1 1660 1 50.34 ATGCTGCTAAAGGAATATCACGTAGAAGATAAAGTTTTCAGATAGCAGTGCGGGAAAATAACACCGTAAAACATGACGGTGCATCTAAAAGATTGATGACATCTTTCAACAAAGCCATTTTTTTTTATTTTGAGACGATTTTTTGT:1 - chr4 903393 5' - transib3 2435 1 55.48 CTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTT:1 + chr2R 18931828 5' - blood 7369 2 55.32 AACTAACTTAGAGTATAAANCTATAAGCAAACTGAGATCTAGGAGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr2R 5213841 5' + INE-1 81 1 54.11 CTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCA:1 + chr2L 20718847 5' + jockey 4733 1 76.52 GTGCGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCG:1 + chr3L 27328986 5' + HMS-Beagle 6861 2 63.45 TCGCTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 + chr2R 18931801 5' - blood 7345 2 54.48 ATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAG:1 + chr3R 24480464 5' + blood 7079 2 62.33 TTCTATAAAGTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTT:1 + chr2L 16884751 5' + pogo 10 1 71.23 CAGCTGCTTTTTGTTTACATCACGATTTCCCTTTTGTTGTCATTTTCCTGCGCCGGTGAAAAACGCACGTTTTTCCCATTTTCACCGACATAAACAAAAGCTAAAAAAAAGCAAAAGCAACAGAATTCT:1 + chr3R 14879436 5' + Copia1_DM 4243 1 79.84 ATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATG:1 - chr3R 19450134 5' - roo 160 2 67.91 AAACAGAGGGAGAAAAAATTTAACACAAATGTTTATTAAGTGCAGCGCTGTAATAAAGACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGT:1 + chrX 9846695 5' + transib2 16 1 74.48 GCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATT:1 - chr3R 22647933 5' - transib2 2771 1 54.11 TTGATTAGTAGATAGCGAAGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGANAAGTCGTGCCTNTCAGTC:1 + chr3R 23902143 5' + I-element 24 1 67.81 GTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 26854744 5' + jockey 57 1 55.56 AGGCTATGTGCATATTTCTCACCAAAGCAAAATTTCAGTTTTGAATGGCATTTGTTTAGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGAC:1 + chr2R 2832899 5' - 1360 3336 1 61.19 TGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAG:1 - chr2L 4245009 5' - 412 463 2 59.03 ATTTTCTTGCAAAGAACTTTATTATAGGGCGAGTAACTGAACATCTATAAATGTGCATAGTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAG:1 - chr3L 22491674 5' + Transpac 4977 2 59.59 AGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGGGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 5027176 5' - roo 352 2 62.59 CTCGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTC:1 + chr3L 7848499 5' + jockey 98 1 77.40 ATATCCAAAGGGTCGTTTTCAACCAGTCCGCAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCG:1 + chrX 3239275 5' + X-element 48 1 56.91 TCACTCGTTTGCCGTGCTTTTCTCGCATTTTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2R 11153133 5' - roo 355 2 57.14 ATTAGTAGGCAGATCAGAAACTGTGAATTAACGGTACCGCGCTGGACCTTGGACTCGAGTTGGCCAAGGGCGCAGAGGACGACCGGTAACGGTACATGCACAAAGAGGACGCACCTTG:1 - chr2R 5072608 5' + gypsy8 4896 2 66.10 TCATAATAACTGAAATGGTAAAATGATGAGTACATTTCGTAATGCGTTTTTTTTTTTATACACTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAANCGAGAG:1 - chrX 3666611 5' + roo 58 2 59.59 CTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTTGTCATAATAAATATAAA:1 + chr3R 12948618 5' + Stalker 6925 4 68.06 ATTTGTGCGAGCGGAATAACCGTTAGTAAAACTATGGCAAAAGCTTGCGGCACAACCCCAGTTTTTATTTTTATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCA:1 + chrX 3382294 5' - pogo 2071 1 47.69 TTTGCAATTGTTTCTATAAAGCAGCAAACGCAACAATAATGACATTCACAAATGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCC:1 + chr2R 12185269 5' - accord 7370 2 73.29 TGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGCGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCG:1 - chr2L 11867402 5' + BS 12 1 58.21 ACACCCGATTTCGAAATCGTTTTTATTTTCGGGGCTCGTTTCTATAAATACTACTCTTGGAATTACCAACCATACTAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 22750774 5' + 412 41 2 54.29 TATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTACAGTAA:1 + chrX 17792548 5' - roo 317 2 79.45 AACAACGTTCTTCTTCTTCCCATGGCCTAAATTAAATTCAAAACTGCATTTGGGGGCGCTAATCTGATGACGCGCAGTGTATATTCTGCACAATCGATGCTGAATGGTGCAGAAAATATACAGTTTGTCAAGAAATTGTTTGCACA:1 - chr2L 21396867 5' + S2 5 2 56.85 TACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3L 20061424 5' + roo 8718 2 64.06 TTTTGACGACTAAGGGATACTTAGTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATA:1 + chr2L 4244846 5' + 412 7081 2 63.01 ATCCAAATAGTAAGCAATAGAGTGCCACTCAGTTATCCACAAAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTCGC:1 + chrX 21442937 5' - Transpac 5188 2 56.16 GTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTCCA:1 + chr3L 18216471 5' + 297 6638 2 60.27 TATGAGGGCCGTCACAAGCCATAATATCCATTATTCCGACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCT:1 - chr3L 4547828 5' + mdg3 5262 1 77.40 ACATGAAAGTTACCCTTTGCCACCACCGCCAGCCAAAAACTATAACTACTCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTT:1 + chr2L 17019083 5' - 412 7478 2 67.36 TTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGT:1 + chr3L 28063328 5' - Stalker4 109 4 69.86 ACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTG:1 - chr2L 3893088 5' + 1360 40 1 52.94 ACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGAAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr2R 17269128 5' - roo 323 2 74.66 GACATTCTGTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGC:1 + chr3R 25597824 5' + copia 49 2 54.86 TCAATGAGTTGGAAGCATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACT:1 + chr2L 14056671 5' - pogo 2047 1 60.58 AAGAGAAAGTGTCGCAAACAATATCATTGCCTCAATTCAATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGACGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAA:1 + chr3R 16630236 5' + FB 27 1 64.08 CCCAGTGCTAAGGTAAGTCGATCCGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 + chr3R 20752851 5' - 1360 3375 1 70.68 AATGATCGGATTATTACTTCAAATTAAAATAGCACTGCCAAAAAAAAAATGGCAAATAAACATTTACAAATACATATGGCGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGC:1 - chr2L 21941256 5' + flea 35 2 60.27 AACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAG:1 - chr3L 1463725 5' - P-element 2814 1 36.30 TATAAGCGTAACATAAAAATAGTTTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chrX 3666484 5' - roo 9035 1 63.01 ATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr2L 2544812 5' - blood 308 2 74.80 CTATATATAGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 10897427 5' + roo 8713 2 52.05 GCGGGTGGGTGCGTCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr2L 2544843 5' - blood 7334 1 55.94 AATGATATGGCCTAAAAATATTTTATTTTAAAAGACGGTCGCGAAATTGTCTTACTACTCTCTTCGACTATTACAGTCATAAGCTGTTGTTGTGTTTTAGGTCCCTTTTTGCCACCTTCTTCTTTAAGTAGGTCCACAAATTTTCA:1 - chr3R 5245568 5' - S-element 1249 1 59.59 AAACTATTTTAGTCAACTCACAGTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTA:1 - chr2L 20029488 5' + I-element 58 1 51.37 TAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGAC:1 - chrX 20949728 5' + jockey 4582 1 59.59 CTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCA:1 - chr3L 12227869 5' - opus 427 2 68.53 CGATTTTCAACACATTTACAATTATTGTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACCCATACATCCACGGCGTCCTCTGTGAGTGGGCTTACATACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr2L 17574666 5' - hopper 1397 1 71.92 CCCCATTTCGGTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCA:1 - chr3R 11285016 5' + blood 7040 2 62.69 TTCCCACGCCGGCATGGCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3R 28618451 5' + 412 7115 2 60.96 TGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAA:1 + chr2R 12492428 5' - hopper2 1530 1 67.81 TTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGCTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCGGGGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAA:1 + chr2L 7633383 5' + Max-element 43 2 64.42 TAAAAAATAGATTTTGATTTGAAAATAGCTTTATTTAATCTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTG:1 + chr3L 19951141 5' + Ivk 18 1 73.29 TTAAACTAACCACTAGTAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTT:1 - chr3L 2532562 5' - blood 358 2 67.97 CAAGGCAAGGGTCGTGCTTTATCAGAAAAGATTCTTTGCATTCATTGGTATCCAGAAGATGACACTTTTCCTAATTAATTGTAGATGTAACTATAGGTTGCATGCCCCTTACAGAGTATTATGTTCTGACTATAATAGACTTTATC:1 - chr2R 1928166 5' + Cr1a 4202 1 54.79 GTTGACACTGAGTGTTAAAATATTTTCCTCGCAGTTCCGTTCCCATGCGAAGATTTAAGTTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 7389672 5' + roo 8681 2 68.46 AAAAGTCACAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTC:1 + chr3L 1437870 5' - Transpac 5166 2 60.27 CATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTT:1 - chr3R 31112285 5' - mdg1 7408 2 54.86 TGATAAGGCAAAGTATGGTAAATAAATGAAACAGACAATGTATATGTATGGACATTTGTACAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCA:1 + chr2R 22796735 5' - jockey 4970 1 62.07 ACTTAGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGTATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 - chr2L 14056796 5' + pogo 38 1 48.63 ACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGGGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGC:1 - chr2R 17493206 5' + BS 4827 1 59.03 CATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGACTAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCCCCAGGCTCTCTCGAATTTTTG:1 + chrX 609403 5' + 1360 82 1 80.77 CTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chrX 21639382 5' + 412 7119 2 76.67 AAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTT:1 - chr3R 6419940 5' + Tabor 6892 2 55.56 ACGTCTTCTGATTTGTTGATCTTGTTTTTCAATTTTGGATTTCTTTTTTTTTTTCATTATTATTTTTGAGTTTTTGGTGTTTGGTGTGTGCGTTTGCCTTAATAAATTCGTTTCGTATTATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTT:1 + chr3R 18128378 5' - roo 405 1 76.55 ATAAAAGTGAGGCAACCGATATTTACACTATCACCTAAAATTAGCTTTTATATTGTTTATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGAGGTCTAATC:1 - chr2L 2206672 5' + F-element 4477 1 58.10 AACAGGTAGAAGAAAGATTACATTTCAAATATATGTATGTATATATTCTTGATCTGAATCAATAGCCGAGTCGATATAGCCATGTCAGTCCGTCTGTCTTTCCGTCCGTTTCCGTAAACTATTGATGATAAAACAAAGAGTGCAAT:1 + chr3L 158528 5' + Tc1-2 92 1 74.66 GAGCGTAATTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTCTTCTTTTTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGATAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTT:1 - chr2R 14871503 5' - INE-1 553 1 79.17 AACGAATGAGTTCAACTGGTTTAATTTTAGTTACCGAAAGAATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGCGGTTCTC:1 - chr3L 26709862 5' - opus 429 2 72.66 ATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATAT:1 + chr3L 25482905 5' + accord 6926 2 72.60 ACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr3L 10897513 5' - roo 8985 2 77.93 AACTTTAAATGAAGTAATATTTCCATTTTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGG:1 - chr2L 12236888 5' + jockey 15 1 79.31 TTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGTAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTT:1 + chrX 16998276 5' + diver 5928 2 43.06 ATACCGTGGAATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTT:1 - chrX 13060286 5' + Tabor 65 2 62.33 CGTGGCTAATTAAGTTAAGAACTCATAGAACAATGTAATTATTTTTTATTTTCTAATAAGTGCATGATTGTGCACGAATGGTTCGTAAGGAACGCAACCCTGCACAAAGACCTCAAGCTAGCCACTGTCTTCGAGGCAATAAACAT:1 - chrX 23108341 5' + BS3 1452 1 50.00 TGGTGTGTTTCAAGAAAAATAAATTTGCACTTCTGCACGTNCGTTTGTTGTCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGCATAAAACANAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3R 26188613 5' + jockey 72 1 63.31 AGGCGACTAATTAACGCTGACATTAAGAGACTGCATTTTAATTACTACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 388478 5' + roo 8684 2 72.60 CCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTT:1 - chr3L 25206932 5' - HMS-Beagle 205 2 57.53 GTAAAAATATTATGAACCACCGAAGTGCTTTCACATTTGTACTTTTTTAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAAAAATAAAA:1 + chrX 1288924 5' + jockey 4997 1 62.20 TTCTACCAGGTGTAAAGATAATCTTTAATTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAATTT:1 - chr3L 19274905 5' - transib2 2778 1 52.05 GGTACTTTAAGGTGTGTTCCATTCTATCGTGAAGCTCCGTATTTGTCTTCCATAATCCTTGTCGAAATTGGAACCAGCTTCTGACAGATCAACCTTAATGCCCGTCAAGAATAATAACGTATAAATAATAATAATAATATCAGA:1 + chr3L 27382993 5' + invader3 5058 2 61.81 GCAGGGGCTTGCAGCACTAATGAACATTTTATTACAAAAGTTTGTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGC:1 - chr3L 1459900 5' + 412 43 2 54.79 AATTAATAATGTTTCCGGTTCGTTTAGTGTTGTTTTTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTA:1 - chr3R 13339083 5' - BS 5011 1 74.31 ATTGTATTTGATTTGTATATTTAAGTATATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACC:1 + chr3L 22257781 5' + mdg3 5345 2 79.45 TACAACTCGATTAATAAACTCTGTGCCACCTTTAGTTACTTTCAAATCCACGCTGTTTAAGATTGTTCTTCCTAAAATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTT:1 - chr3R 1327121 5' - Quasimodo 6946 2 54.55 GCTATAAGAAAGATACACCCCTTACCATCTTTTAATGGGATAATTCGAAGATTAGGTATATTTTGAGTCCGTTAATTAACATTGACTAATGAAATATACACCTCCTTCTATTATATTATTTTTATTTTTTATTTTACT:1 + chr2L 1303820 5' - F-element 4683 1 78.99 AACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGCTTCTAAAC:1 + chr3L 18183091 5' + Tirant 20 2 59.38 GTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr2L 10461133 5' - roo 9036 1 54.40 AGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATA:1 - chr3R 11284982 5' + blood 7086 2 69.18 TAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTGTTGC:1 - chrX 20999598 5' + BS 48 1 55.56 CATTTATTAGTAAAAATATAATTGTATTTGATTTGTATATTTAAGTATATTGTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTC:1 + chr3L 22257761 5' + mdg3 5323 2 65.97 AAATCTGAGGCTTATTCAATGAGCCATGGGTCGCCGACTGGTCGTAAAGTGAAGGGAAATTATTGAATTATATAAAAGGCTGAGAACGAACTACGCCGAAAAGCTACGTTTTTCAGGTCACCAACAATAATTTGCATTTTTAAATA:1 - chr3R 4965955 5' - TAHRE 10331 1 62.33 TTGGTTTAATGTAATTTAATCTTAATGACAACAAATACGTTGTACAAATATATCTATCTATCTATCTATATCTATATCTATCTATCTATATCTATATCTATCTATATCTATCTATCTATCTGTAGTACATATATACATATTGTAC:1 + chr3R 31953795 5' + gypsy11 27 2 42.76 AACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGACAAAGCAAAAACGTAATTGTGATCAATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGC:1 - chr2L 12236807 5' + jockey 91 1 73.38 CAGCTTTAAAGTAACAATTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 6557074 5' + Doc 14 1 74.66 ACGTTTATTTAGATTCTTTATTTTGACAATTTGACAATGCAGAAAATGTGAACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATT:1 - chrX 21443105 5' + Transpac 15 2 73.29 GCGGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chrX 10725094 5' - pogo 2079 1 61.16 CATGCCATTTATCGTATTCCGTTTTGCTCCCCGTCGCAGAGAGAGGGAGAGAACTCTCTTACTCTCTCACCAATACCAACACGGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCACGTCGTAAGCC:1 + chr2R 21713193 5' + P-element 16 1 71.33 CAGTATGTTTTGTTAGGAGAGTCACGTTAGAATGTTTCAACTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGT:1 - chr3R 25471734 5' - Bari1 1627 1 71.92 ATTCCTGCTGCTGAGGGTGAAATTTGAATTCGGTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2L 2241295 5' + roo 8747 2 77.08 AAGTGCGGTAAGTGGCTGGTTATGCACAGCATGCCACATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3R 27606754 5' - 412 484 2 75.34 TTTTATGAAGCTACAACATAGAAGCAAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 - chr3R 26472945 5' + 1360 14 1 73.29 GCTTAAAGGGTTTATAAGAGGCCTATAAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATA:1 + chr3R 15727819 5' + 1731 39 2 56.30 GAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAATACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAA:1 - chr3R 10148840 5' + 17.6 45 1 54.11 TAATCAGATAATCTCCAAGTTTCTCTACCACGGAAGCGGCCTGCTGGGGCTGAACGGGATCCTCGTAGATGGAAACGATATAATAGGCACAAAATGTGGTTTTTTGTTTTTTTTAACACAAACACAATACACGATA:1 + chr2L 5973591 5' - Stalker2 487 1 58.09 GTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 + chr3L 18846942 5' - 1360 3339 1 53.42 ATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCA:1 + chr3R 26854765 5' + jockey 81 1 66.67 AACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGGACGCCAAATAAAATAAACTAAATA:1 + chr2R 19805437 5' + F-element 86 1 71.11 TTTAATGCTTACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGA:1 - chrX 22824263 5' - Gypsy12A_LTR 2243 1 55.48 TGTTGCGTTACGATGCTCACTTAGGCAAATTGAGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chr3L 6015524 5' - roo 398 1 72.60 TGAGACGAGAAGTTTTTGTGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAA:1 - chrX 8839414 5' + Tabor 16 2 71.32 GATCGCGGAAAGAGAAATGCTGGGTTAGAGCACAATTTATTAAAAGCGGAGCATGGAAATTGCTCTTTCAAACGCAATCCAGTCCAATTAATACTACTCGATTACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATA:1 - chr3R 18294956 5' - copia 237 1 68.28 TGAATGAGGGTGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 + chrX 292001 5' + 412 7125 2 66.90 CGAGAAATCGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr2R 14009080 5' + blood 64 2 73.39 ATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCACCGGTACCATACACCACCCCTCCCTC:1 - chr2R 5621026 5' + ZAM 7980 2 58.59 AAACAATTCATTATTTGACCCTGTTCGGTTATTCAAACAAAATGATCCGCAACGCACTGCTGTTTGTCGAAAAGAACGAAACAACCTTAATGCGTGAGTTACCACATCTACATCTACTTCCCCACCCCCTAAACCTCCACGCCAGA:1 - chr3L 23912237 5' + gypsy5 6968 2 49.32 ATATACAATAACAATCGCCTGCAATTCTCTTAGCTAATTTTGCTTAATGTAGATGGTTGCAGGTTTTTTTTTTGGTTT:1 - chr3L 2944312 5' + Tc1 1469 1 85.90 TTACCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCACATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACAC:1 + chr3L 2532417 5' + blood 33 2 59.29 TGCTTAGGTGTTTACGTGTTAAAGTGTTATCCTGCTTACAGGATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTT:1 - chr3R 31198639 5' + Transpac 73 2 69.44 AAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 18128537 5' + roo 58 2 60.27 TAAGTATATTTGAATCTCATTCCGGAATAACTAACGAGGGTTTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 + chr3L 11904721 5' - copia 243 1 71.03 TACGTCGAAACGAATTCATAGTTAACAAGTGAGAACGCTATAGCCGAGTTCCCCGACTGTCATTTGTGTACGCAAATTGACTTATTGATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCC:1 + chr3L 22491536 5' - Transpac 282 2 67.12 ATTTCATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAACAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 + chr3L 13057341 5' - 412 7505 2 53.33 GTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3L 23146451 5' + 1360 38 1 58.74 AATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGCGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGA:1 + chr3L 19579990 5' + jockey 37 1 53.21 TGACATGATATTTTGTTTATCCAATCGATGGGCTGGGCGATAAACTTAATTACCGTTAATTAACTCTTTATAATACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCC:1 + chr3L 9317962 5' - P-element 2864 1 66.39 TGTCAACAGACTTTATTCCTTCCAAGGGACAAATTTTAGTAATGGGTCTAGTGATATATCCTTCCTGCATCTTTACTTTAGCCACTCGGACCTTATCATCAAATTCATGAATTTTAATAAAAGGCCTTTATATATTTGCATTTAAA:1 - chr3R 19448104 5' + S2 1664 1 69.18 GTTAACGATCTAGTTGCGATCAGACGTACTCAGTACTCATAAATTAAACCGACATGGAGAAGGATGAGATTTAGCATACAGATTTTACAGACAAAGACGCAGCGCATGTTGACCCATATTGCCATGCCCACTCTAACGCC:1 + chr2R 4975017 5' + INE-1 211 1 59.29 CAAATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 + chrX 12979406 5' - transib2 2800 1 69.18 AAAGTATCTACGCAAAGTGGTTGAAGTTTCAGCTTGGCCGACAAAGTTTAGCTCTACCAAAGACTTCTAGTGGCTACATTTAATTCAAAAAATCTATTAGTTATTATTTTAGTAGTCACTGTATATGTTTAGTATAGTATACTAT:1 + chr3L 11442774 5' + Ivk 5352 1 47.59 GCCCGAAACGCTTTTCGAATTCATGTCAGTTTCGGTTTCATGAGGTAACGAATTTCACAAATTCGCGGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr3R 12341058 5' + Tirant 8122 2 71.43 CCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1 + chrX 9165360 5' + jockey 4843 1 77.78 TTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 + chr3L 7024430 5' + 412 7094 2 54.61 ATAACAATGCTGCCAAGGCTTAGCCATTGAAATGTGTAATAAATGAGAAAAAGGAACCACTGCTACAATCCACAAGTTGCAAATCAAACTACAGAAACAATTATCAAAGCTTACACCTTCAAAG:1 + chr2L 17706903 5' + Porto1 317 1 70.97 TTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTAT:1 - chr2R 8286795 5' + Burdock 42 2 52.24 ATAAAGCCCATGAAATATTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr3L 13779435 5' + I-element 41 1 56.85 AACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chr3R 31112301 5' - mdg1 389 2 60.28 TCTAGAAATTATTAAGTTGTAGTTTAAGTTTAGGATTTCCTTAAAGATATATATTTGTTTTACAGGAAGGAAATGCTCCTAGTTAATCCAAATGGAATGTATTATTCTATTAAATTATTTGTATCTTTTCATATCTTAATCACTTG:1 - chr3L 13437600 5' - Stalker3T 194 1 44.52 ATACAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTAGTCTACA:1 - chrX 21668436 5' + Stalker2 7264 2 73.29 GTTGCCTTTGCGTAATTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGG:1 + chr3L 22320108 5' + jockey 20 1 71.23 CAGCCGCTATGAATCAAAACAAACCGCCAGCAAATCGGTACGTCCGTTCGGTTTCGAGAGCAAAGAACGACTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTG:1 - chrX 3811701 5' - P-element 2839 1 52.41 GAAAGGAGACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGCGTGCAC:1 - chr2R 2994313 5' + gypsy8 4791 2 50.77 AGCGAAAACTTTAGCGTCGTGAATCATTTCAAAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTT:1 - chrX 8461039 5' + hopper 143 11 72.73 AAATTTAAATTTAAATACAATAATAGCAACAGCAGCGGCAGCACGAACGAAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCACAAG:1 - chrX 1769817 5' - hopper 1385 1 64.83 ATGGAAATACATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGGAATATCTT:1 + chr2L 5728846 5' - roo 357 2 52.74 CTAGCGCTATCCGAAGAAATAAGAATATGCAGAATGGCAAAATACACACAATCCACATCCACTCATTGTATTGTATTGTAAATATCCCAAGCGCGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCC:1 + chr3L 25482855 5' + accord 24 2 67.86 GCTTAGTAAATACAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 + chrX 17770410 5' + hobo 33 1 56.10 CAGACTGCAAAACAACTGAATCTAATATGCATTTTAAATAATAAAAATGGATCATTTACATACATACATCATATTAAGTCAAATGACTTAATAAATAAAAATAACGTTAAGGCAATGCAAAACAAGAATTTTTCGCATGGTGCCA:1 + chr3L 27129534 5' - 1360 276 1 62.07 TTCCTAAAGAACTTGCACTTATCCGCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCC:1 - chr3R 3905860 5' + GATE 8266 2 61.67 AGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTA:1 - chrX 8839377 5' + Tabor 6909 2 63.01 AAAGATGTGCAACTTATCGATTATGTTGTTTTTAAATTTAGGTTTTGTAATTTTACGTTTCATAAATTAAGCCTGGATTTATAATTCATTGCCACCTGCCGCTGCTGCTGCTGCTGCTGG:1 - chr3R 30362493 5' - TART-B 154 2 56.67 GACTAACGGGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAACGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGCTTTTTTTGCCGTGG:1 + chr2R 981624 5' + 1360 47 1 60.96 AACGACAGCGAAGAGAAGGCCGGCTCCAAGTTCGTGGTCAAGTTCCCCAACAATGTGGAGGCGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAAGTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 - chr2R 16271398 5' - roo 9014 2 49.19 CGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGTATTTTTT:1 - chr2L 14263011 5' + P-element 95 1 21.92 ATATTATTTTCACTTATTCATTCTGATTGTTGAATAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGT:1 - chrX 12979575 5' + transib2 30 1 65.07 ATGGGATAAATTTCAAAAGCTCGTAGTTACTTCTCCCATTTGAATATTTTGTTTAGGCCAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTC:1 - chr2R 2832729 5' - 1360 3322 1 63.45 CACTCAAGATCTTTTGACTGGAGCTTTGCTCAATTTCTCATTTTCCAGCTGAAGATATTCGTGTTTGCCGGCTGTTTGGAAGTTGGGGCCGAGGAACGTGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCTGCAAGAGACA:1 + chr2R 9607253 5' - P-element 2867 1 68.53 TGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAA:1 + chr3L 18216444 5' + 297 6611 2 65.75 TGCGCAACAGAATTTCAATTAACAAAGCGTGCGTACTTCTCCACCTTCGATTTGCATAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTT:1 - chr3L 7319347 5' - 412 7486 2 57.53 GTCCAATGCCCTTGTCCGAATTTTATTACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr2R 18886917 5' - roo 393 1 74.66 AAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAAT:1 - chr3R 7049447 5' - Burdock 185 2 70.55 ACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr2L 3662042 5' + blood 68 2 63.70 TTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCC:1 - chrX 2214299 5' + jockey 4624 1 60.96 TTTTACCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAG:1 + chr3L 2532415 5' + blood 7031 2 65.89 TTGTCAGTTGTTGTTGCTGTTGGAGATCATTGATCCACCGTTGTTGTTGTGTGCGGATAGCGCACCACAGTGTGAATATTATGGAAAAAAGTGTTCGAGTTCCCGCGTATTTCGCACGTCTTTTTCTGCGCTGCGCGAATTTC:1 + chr2R 2666296 5' + Rt1a 33 1 58.04 ATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAATGAACTTACC:1 - chr2R 10582446 5' + Juan 3889 1 73.97 GAAAATATTATATCCATTTTGCAGCACTTAATTCATGGCAATGCTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 + chrX 16547418 5' - P-element 2872 1 74.66 TATCTATTGCAACTGCAGTAAATAATAATTTAATGTTCATTTAAAAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTA:1 + chr3L 11837658 5' - G5A 2743 1 73.29 CAATAACATGATTAACTTGATGGTGAAACGAATCCCGGCAAATCGCCAGCGAAACTCTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAAC:1 - chrX 18150064 5' - hobo 2913 1 55.56 GTTGCAAAATGATTGTTTTCCAAATACATTGTTTTGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTTGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3L 24766018 5' - 1360 3350 1 73.29 ATTATAGTTTCAATGCTCAGGCTTTGTTTTATGGCTTTTATGGCCAAATTGTTAAACAACAAATTGTTGTCCAATCAATTAAATTCATTTTCCAAGCAGAGGGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATA:1 + chr3R 4527144 5' + mdg1 19 2 72.60 GGTTGGGCATAGATCGGATTGTGTACTTTGAAAACTAGTTCTATATAACTCGCCATTAAAGCTCAATCTGCATTTGGTTGCTTGGGGAATTGGGTTTTTGTATATATATATATATTAT:1 + chrX 14741181 5' - Stalker4 84 4 62.71 TTGCAAATAAAAGGCGATGCAATTTTCATGGAAATCCTGCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr3L 2966569 5' - roo 9033 1 56.85 AGGTTGTACAGAATTGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCTCTTCCA:1 + chr3L 18216430 5' + 297 16 2 75.34 TGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTA:1 + chr2R 15199124 5' + Burdock 6207 2 69.86 CGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAA:1 - chr2R 10582494 5' + Juan 3841 1 54.79 GTGACTGGCCACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGT:1 + chrX 609350 5' + 1360 45 1 56.16 AAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACC:1 - chr2R 14072571 5' + mdg3 5345 2 78.77 TTATATTATATTATTATTACCAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTCTTTAAT:1 + chr2L 11143116 5' + Juan 80 1 80.00 TATGTTTATGCACTGCGGAAAAACATTGGAAAATCATACAATCCATACAATATTTCTTTTCTTTCATTCATCTTCTATATAAAGTCAGTGTAAGTGTAAGAGTGTAAGAGAGTATACATCAATTTTGCTTATCAACGAT:1 + chrX 7794378 5' - Circe 6986 1 62.59 TTATTTTTCGCAAGTTTCCATTTCTTGGACTTTCATCATAATTTTTGGGCGTTAGAGTGGGCCAGTGACACTGGGTCACTGCGTCTATGACTCTAGAATCTGTACGCCTAATATCAACCGTCTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCT:1 + chr2R 25240223 5' - INE-1 149 1 70.55 TTATTCCGTTTTTTCACCTTTTTCCCGTTCTTGGTGTTCTTACATATTGTACATATTGTATATACATATACATGTGTATGCAGAAGGCATACATATGTTATGTATGGCTTGACCACTTGAGCTGCTAAG:1 + chr2L 20629075 5' - Stalker2 7450 2 75.97 TGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr3L 25206790 5' + HMS-Beagle 38 2 58.74 GATACAAACAATAAAACAAATATTACAATTAACAATGTATCCATTTGAAATCATCTTCAACGCCTGGCTCTCGTCAAGACCGTATGATGAGGTCCTTCGGCTGCCTCCTGTGCAGCCTTCTTGGTGGGCGAGCTCTGGAT:1 + chr3R 28792777 5' - BS3 1534 1 77.86 AAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 - chr2L 2544828 5' - blood 305 2 67.12 TTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:2 + chr3L 19579995 5' + jockey 80 1 65.75 GACCAGTGTTTCTCATGTTATAAATAATTTATTCAACGCCGGCCACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCGA:1 + chr3R 24666323 5' - hobo 2929 1 73.39 CTGGTAATAGCTTTTATGTAAGTAATAATATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTT:1 + chr3L 15718031 5' + 1360 24 1 62.33 TTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 12133880 5' + jockey 22 1 72.26 TAGATCAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 2317257 5' + 412 15 2 68.00 AAAAGCCAGAGTTAAACCCGCGGAAAAAATAAAAAAAAAATGGG:1 - chr3L 7596748 5' - hopper 140 1 88.64 TGGCTAAGCTGCTGATCTTTTAAGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACA:1 - chr2L 4245034 5' - 412 486 2 75.34 TATAAGCAATTTAACATAATTAATTGTTTTGTTTTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTG:1 + chr3L 19579945 5' + jockey 20 1 76.64 ATTTAGTCGACAAGACAAAAAACACGTGTTGTATTGATTTTTAAGAAACTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTATCTTTATTT:1 - chr3L 1437960 5' + Transpac 4990 2 65.07 TCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTAT:1 - chr2R 23094961 5' + 412 7121 2 64.83 CTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 - chr2R 9750245 5' + opus 62 4 66.90 GGGAGGGATAAAGTGAATCTAAAAGTTGTCTCAGTGACAAATAGCGCCAAGTGAGAATATTTTATACCCTACAATTACTTCACGATGACACGATGAATACAGTTGCGGTAACAATAATAAGCGGATTTCGTGTTTGTCCCAGTGTT:1 + chrX 19695223 5' - Tc1 1610 1 76.71 CTCTTAAGAACTTAATCAATTCAAAAGCATTTACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 - chr2L 544954 5' + Doc 32 1 56.85 CTGGGCCCAGCGGAAACGAGTGTGCGCGACAGAATTTCAATTAACAAAGCGTGCGTACTTCTCCACCTTCGATTTGCATAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3L 7319369 5' - 412 484 2 73.50 TTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGT:1 + chr3L 6557102 5' + Doc 42 1 55.48 GTATAGTGTTCAAGATCAAGAATCGCACTTCCCATTCCAACATTATTTATTTGATTTATTTATTAGAGATAATAGTATTGTCTATAAAGCTATCACTAACATTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAAT:1 + chrX 22641676 5' - G6 2012 1 68.38 ATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3L 7024444 5' + 412 7113 2 56.16 AGAGTGGTGTTTTCGAAGGGGATCGAGGGGATCGAGTCTGTGGACTGGCGCCTTTTTTTTTTCATTTCACCTTCGGGTTCCTCAACTTAATTGCCAGAAAGAGACGTGTAGTATGGGCCTATGCAATATTGAGAACAATTAAATAA:1 - chr2R 11558106 5' + 412 19 2 69.18 CCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2L 512444 5' - roo 326 2 76.03 TGTACCCATTTCTTATATTTATACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACATAGGTG:1 - chr2R 5193521 5' - roo 9006 2 64.38 CGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chr2L 13033411 5' - hobo 2892 1 55.81 AAATATAAAAAAAAAAACAATATAGAGATAAGTAGCAAATTTTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTA:1 - chr3L 27350157 5' - 297 6962 2 77.40 TTTCAGAACGGCTTAGAGTGGAGTTATTCACGTTACTAACGGTACGGTGGATAATAAAAGAAGTTCGATAATGGTTGTGCGGCAGCTCATGGGTGAAGTCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr2R 24427489 5' + 1360 23 1 69.23 ATAAATTAAATTTTAATCACTATCACAAAGTTTGCAAGCCCACTAATTTGAAGCTAAATGACAAATCCAAACGGATTCCATAAAATTGAACAGCTTAACTTAACAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCA:1 - 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Circe 6981 1 60.42 TTTACTAATGAAGAAATGGAAAAACATTTTACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATG:1 + chr2L 22132467 5' - pogo 2081 1 70.71 CTGGGCAACTGGGAAATTGAGAAACTGGGGAAAGTTCGAATAGTTGTATAATCGAGTGGAAAAGAATGCAGCACGTTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAG:1 + chr2R 18931804 5' - blood 331 2 52.78 AATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3L 14422813 5' - roo 9016 2 67.74 ATGTAGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 + chr2R 7314589 5' + blood 7029 2 68.97 AGAAGGGAAAGCAGAGAAAGCGGGCAGCAGAAGACAGAGAGCATTTAAAGTCGCCGCAATGTCGGACAGAAAAGCAAAAGAAAATCTGTCCGTATGAATATCGAAATCTCAGGAACTATAAAATCTTGAAGGTTTAGATTAAGCAT:1 + chr2L 9320205 5' + INE-1 170 1 55.48 GGCTCAGCCAGCTAAGACAAATGTCACGTGGTCCGAAGTCCGAAGGCAGAAGTCAGAAATTAATGCCGACCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr2R 20052374 5' + transib2 50 1 53.42 AACATTTCTTTGACGGCTATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - 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pogo 2034 1 66.44 ATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTT:1 - chrX 9951318 5' + jockey 84 1 72.59 AGGTTGATCAGAGCGGAGCGAAAAGCGTTCTTTGTGGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 - chr3R 19134465 5' + transib2 84 1 76.03 GATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCTACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 - chr2R 14415548 5' + 297 6617 2 57.46 TCTGTGCCACAGCTGCTCAATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr3L 11535997 5' - roo 353 2 55.48 AAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGAAAAATTCAGCTTGCCTTCTGGTCCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAA:1 + chr2L 11867254 5' - hobo 2914 1 64.38 AAAATCTGCGAAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTC:1 - chr2R 19633344 5' + jockey 4783 1 69.86 TGCATCGAATGATACGCTCTCTGATTTCCCGATCAATGCAATTGCATGCGACTAACTAATTTCTCAAACAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCTCTATTCAAAGTTGAAAATTTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTA:1 + chrX 3452621 5' + hopper 1057 2 55.48 AAACTTCCAGTTTATTCAAAGTTACAGTACACGCTGTCCCGGCAACCAGGACATATTCGCCATGGCAACATGGTCCCGTCGTCCTCGCTGCACTGTCAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGCT:1 + chr2L 15522989 5' - 412 478 2 71.94 ATGCTGCCTGAAAGTATGCAGCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAAT:1 + chr2R 9007033 5' + jockey 4821 1 54.79 AGCCCAAATACTTTTGCTTATGCTAAAAATATAAACATAATATAATATTTTCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chrX 8314566 5' - roo 9037 1 60.27 GTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTT:1 - chr3L 2532537 5' - blood 7334 1 58.99 ATTTTCACTTATTCATTCTGATTGTTGAATAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAATTTTT:1 - chrX 12979570 5' + transib2 25 1 66.18 CCAGGATCAAGAAGATGACGGAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCT:1 + chr3R 19506692 5' + mdg3 17 2 71.43 GTTTTAAGCTAAAAAAGTTTTGATTCTTTAAAGCACTGACACTTAAAGTATTTAAAAATCCAAAATATTTAAATTCTAAATAAAGAAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTTATATTAGTATAAGTATTAAAACATGTTATGCAT:1 + chr3L 7897091 5' + G4 3728 1 34.93 AATTGCGCCATTCTGACTCGTGCATCAGTATTTTATTGTTNTTCGGCGGGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTNATAAACTTATGGACAAGACCAGAA:1 - chr3L 24008372 5' + X-element 77 1 62.77 TCTCCGGAATCCACCGCCGCCTCGCCTTCCGCCAAATCCGCCGAATCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTC:1 + chr3R 13608938 5' - copia 154 2 68.97 GAAGGAAAAACATTGCAACATCCCGCGTTGATTGGAAATGAAACTGAGTCCCTCCAGGGGGTGTGGTTAAAGCTGGGGTCCATCGGAAAATCCACCCCCCTTGTGGAATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTAT:1 - chr2L 9383885 5' - flea 248 2 77.86 TACACTATGTTACGTTATTTTTAAAAGGAGGGAGATGTGGTATGCGTACATATATATTTAGAGTTCATAAATCACTAACATAATTACATACGCATGGGCA:1 + chr3R 2169846 5' + gypsy11 4057 2 67.00 GCTCTTCGGGGAAGAGGAATAGGATACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 - chr2L 3662067 5' + blood 41 2 55.56 ATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chrX 18673739 5' - roo 332 2 66.44 GCATATACACTAAATAAGGACCAAGATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGC:1 + chr3R 23964796 5' + hobo 46 1 53.42 AGAGCAAGGTATCGCAATTATGATTATGTATATCCTGAAAAATTCAGCTTGCCTTCTGGTCCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 + chr2L 11867249 5' - hobo 2931 1 73.88 TCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr2L 17019158 5' + 412 72 2 70.71 GCCAGCTGGCAAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACA:1 - chr2L 22224611 5' - Rt1c 5418 1 63.16 CTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTT:1 - chr3L 20061422 5' + roo 73 2 69.66 TCACCACTTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACATTTTTGT:1 - chr2R 8315609 5' + hobo 36 1 63.89 CAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chr3R 11284983 5' + blood 70 2 67.61 ATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATNT:1 - chr2L 14056789 5' + pogo 40 1 48.23 GTATGAAACTACTTATTTTACACACTCTTAAGTGAATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGA:1 + chr3R 13868873 5' - HMS-Beagle 234 2 69.06 CCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGC:1 - chr3R 22647907 5' - transib2 2745 1 71.92 TTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAAC:1 + chr2R 7314605 5' + blood 7042 2 59.15 CTGGTGATTAGTGACCCAGGAGCGACTAACTAGCGCGAACTGCGAAAAGCGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGCTGAAATAACATAAGGAGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGT:1 - chrX 21045323 5' + P-element 31 1 63.01 GCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr3L 8249498 5' - mdg1 7421 2 57.53 CAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3L 20061430 5' + roo 58 2 62.32 GCACAGCTTTAATACTTTTGACATGAAACACAACATAATATTGTGATTAGGCTAAAAGCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCA:1 - chrX 22835302 5' - mdg3 225 2 71.33 TAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTA:1 + chr3R 19514250 5' - blood 7309 2 71.92 TATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAA:1 + chr2R 21795246 5' - transib2 2760 1 63.70 TGAATCTCTTCAAGCATTATTTCGATATTTTTAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 - chr3R 13423423 5' + 297 14 2 75.34 GGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCG:1 - chr3R 10737074 5' + F-element 43 1 55.38 GTGACTTTTTAAGCAAATGGAAAAATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGAGCGTTATCTTCTCTTCTCTCTGAGAACATTTT:1 + chr3R 20841377 5' + Juan 44 1 45.07 ATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 + chr2R 12492387 5' - hopper 1378 1 57.53 GGTTTGAGAGCGGGCGCAATGCAGCAAAACTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 + chr3L 13993470 5' - P-element 2798 1 24.66 ATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - chrX 18673723 5' - roo 317 2 77.24 TGCGAAAATAGAATAGCTTTTGGAACACTAATATCAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:2 + chr2R 10417158 5' - 1360 3303 1 77.40 AGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTA:1 - chr2R 17350567 5' + F-element 82 1 75.83 TGGCTACTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTTGCAACGGCTAGCTCAGAGAGTGTGTGCTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAAATATAATATGAATCATAATAA:1 + chr3L 27186401 5' + mdg1 62 2 57.53 ATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAA:1 - chr2R 11844297 5' + I-element 66 1 73.95 AAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGG:1 + chr3R 27547644 5' + 17.6 72 2 71.23 TGAATTTTTAATAATTATTTTATTTTATCAAATTGCTACGAAATTGGCAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCGTTTCTTAAACATAACGCAAACATATACGCGTTCTCGTCTCTTGTTTTTACTCACACAAGCAAG:1 + chr3L 12547995 5' + 1360 3249 1 56.55 AAAAAAAAACATCAACATTTTCTTCAAAAAAACAAAGCACTACGTTTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chrX 17792491 5' - roo 9038 1 63.70 AATTTTAAACCAATCCATANACCACGGGCGATCGGGGACAACAAATCGTAATAGAATCTAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAG:1 - chr2R 9607419 5' + P-element 20 1 69.63 ACAAAGAGATATAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAATTAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 13090988 5' - P-element 2875 1 76.03 TATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCAT:1 - chr3R 15727911 5' - 1731 4564 1 66.67 AGTGAATCACTTTACATCACTTCCTGTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAACGTCTAAAAATTGAGCTACAGACT:1 - chr2R 20052510 5' - transib2 2787 1 58.90 ACGCAAGCCTCGACTGTAAGATACCCCTTACTATGTGAAAGCGACTATAAAGGATAGTTATCTATGGTCGGAAACACCCTCAAGACCTGACTGAGCACTTGACATAAATCAAATCTTAATAATTCAAATCTTCTAAATATTACTGC:1 + chr2R 6526149 5' + jockey2 3235 1 67.12 CTTTAGTTACGGCTGCATTATAAATTTCAAATGCAAACCCAGACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 - chr3L 22021782 5' - mdg1 7443 2 72.59 CGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCCTCGGTACCATACACCAC:1 - chr2R 5621048 5' + ZAM 7971 2 69.64 ACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 + chrX 860795 5' + hobo 72 1 69.18 GTTGGGCGGCATCATGTTTCTAATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAA:1 - chr2R 8442744 5' + blood 50 2 51.37 AAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr2R 6801715 5' + 297 6613 2 56.67 CAAATTGTTGTTGAGCAATGCATTAAGTGCACAAATGAGTCTCTCTTATTTGTTCTGTCGTGGGCTATTGAGCCAAAAAGGATAGAAGAAATCTTTGAAATAATTAAATTACTGCCGAAACATAAAGCTCCAGGAATTGACAGGAT:1 - chr4 905658 5' + Helena 2 1 74.66 GAAAATGCTCCCCGTAAGTGGTGCAAAATCTAAAAAAAATCTGCAATCATGGTACCAGATAGTCGATGAAATCGACATACGAGTTCTCTCTCTTTTTTTCTTTTTTTCTTGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCTCCACGC:1 + chr2R 5070918 5' + gypsy5 6964 2 26.03 ACGCCAGCGGTGGGCGGTGAATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATAGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chrX 9846753 5' + transib2 74 1 63.45 AGCACTTTAAAACGATTGAAGGAACTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr2R 9870930 5' - roo 9051 2 71.23 AGCCCATCAGCAACCACAACAAACAAAAGAACGAGCTATAACAGCATTATAAGGATTTATGATGTTTAATTTAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGGTTGCCCATTTTTTGC:1 - chr3R 17673850 5' + FB 53 1 52.74 TTTAATTTTCGTTACTTATTTCAGAATTTGTTACATTTGGTTTGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGC:1 - chr3R 934278 5' - Rt1b 4727 1 52.05 AAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCATCCTTA:1 - chr2R 14072578 5' + mdg3 86 2 73.97 TGCATCAGGTTGGCAACATTTAATTACTTGTGGCTGCCTATGAACTTAACTTAAAATAATAACTAGTTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTG:1 - chr2R 8436332 5' - 1360 3338 1 54.48 CAATAATATAACATAATGTGCTGCTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 + chr2L 2544730 5' + blood 52 2 51.37 AAAATCCAAAATATTTAAATTCTAAATAAAGAAGAAGACTTAAAAGATTTCACGTGCTTATATTAGTATAAGTATTAAAACATGTTATGCATAGAGTATGAAATAGGGATTAAGGAATAACTACCGCCTCTGTTAAT:1 + chr3R 15395330 5' + G4 3773 1 43.07 AAGCCCTTTCACTTAAGTTTTAATGGAAAAAGCCTTAAACTCTTCCTCTCTCTCTTTCATTCGCTTTTTTTTCGAATATTTCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGTCTCCGTTCATATCTTA:1 - chr2L 9704890 5' + roo 41 2 57.24 CTATCCATTGAAAAACCCTTCTTGTAGTACCAAGAAGATTTTCCCATTGGGTAACAATTGACTAACACTTTAGGTCGACCATAAGACTCTTCAATAGCTTGATGATATTTTGTTTTCTTTTTTTTTAT:1 - chr2L 16769023 5' - gypsy11 3931 1 61.72 ATTGTGATTCCACTTTGTTCATTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chrX 17792613 5' + roo 8731 2 65.75 CTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 - chr2R 8315584 5' + hobo 31 1 58.77 TGGGGAGGAAAGAGTTGAAAGGGGGGGGTCTGCTTCGAGGGAATAGGGAGGGAAATGGTATGAAGCTGAGAAAAATGAAGTTGAGGAATGGTAATAATGATAATAATAAAGATGTTCTAGCATTTTTTATATTTATTTATTTAG:1 + chr3R 29288626 5' - Tc1-2 478 1 78.47 CCAGGTGCTTTCAGGGCATTCCACGTGATTCCGGGGGAGTCAGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGCTATTTCGCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTC:1 + chr3R 12613731 5' + HMS-Beagle 29 2 64.38 CAAGACAAGTTCATATACCCAAACGTAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 + chr2L 18525567 5' + pogo 23 1 69.44 CCCTGATGTCCAATAGCCGGGGTAAGTAGGCGGATCCTTTCGATCTTCTGCTCTCCTCTTCATTTCTCTGTACATTTGTTATTTTTATTATTTGACT:1 - chr2L 5518993 5' - Rt1b 5144 1 89.69 ATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCT:1 + chrX 13060197 5' - Tabor 7258 2 62.07 GAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chr2L 2241243 5' - roo 322 2 77.40 TGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr3L 2317119 5' - 412 7497 2 49.32 GATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 - chr2L 512495 5' + roo 8743 2 78.52 GTGGTTATGCGCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chrX 860751 5' + hobo 26 1 63.89 TACGACCAGAAATGGGAAACTTAGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:1 - chr2L 14056814 5' + pogo 3 1 70.54 GTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCCTTGCATAAATAAATGTCT:1 + chr3L 2532449 5' + blood 7071 2 65.41 GCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGCGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGC:1 - chr2L 15019946 5' + BS 4875 1 67.81 AAACTTGAATATGTTTAAAACCAATCAAGCCATAAATAGCACCAATTAATGGGTAAGCCTGGCATCGGCAACTACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGT:1 - chr3L 17135491 5' - hopper2 1562 1 52.74 TCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGTGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGG:1 + chr2L 15085629 5' + opus 179 4 65.07 ACAAACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAG:1 - chr3L 10033679 5' + blood 7116 2 47.95 CATGCAATGCAACTTGGAGCGTTAAAACGAACACAGGCGAGACAACCAAACAATCAGATAGAAAAAATGGAGGAACTAGTATACAAAATCAGAGGACGCAAATTAATATATTCGAAAGGAGACAGTTCTAGAAGAAGAG:1 - chr3R 4705911 5' - Gypsy12A_LTR 2029 1 54.68 TAAGTTGGTAATGCTAGCAACTTTCAAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGT:1 - chr3L 12227934 5' - opus 489 2 79.45 CGGTGCACAGACAAAAGAAATGCCAAACCGTTCAAGATCTGAGCACACAAAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGCTAAATTATAT:1 + chr3L 2966456 5' + roo 71 2 66.44 GCCGCTGACCGTAACGGTATTGTCTCCATCCTGCGATGCGAGTCCTGTTTTCTGGATGCCTCGCAATCGCTGAACAGGGCCCAGTATTTAATTACGCCGATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTT:2 - chr3R 25158722 5' + 1360 22 1 71.23 TTACACATGGCCAACAACAATAACACACTGATGGTGAAATCATTGAATTTGCCTATATAAAATCAAATTTTTAAGAAAACGAGCAAAAATGGGCAAAAGATATTACTTTACCGTGAAAGACAATAGTTAAAGGTACAAACTGACGT:1 + chr3R 22658170 5' - transib2 451 1 67.12 CTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 5193498 5' - roo 321 2 81.25 GAAGCTCAGACAACGAACCGAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCGGTGAGTCGGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2R 5953798 5' + roo 8724 2 57.53 CACCACAGCCAGGACTCGTTCGGGGCCGACTCTAAGGCGGCAAATCGAATCAAAGAAATAGCAAACAAAATAAAAATAAAAATAAAATAATTTGCATTTAATAATCAAAATAACTTCACTAGGTTACGTTATTTTTCAAAAGGAGG:1 + chr3L 13059826 5' + mdg1 7013 2 58.22 ACGAAGGTTCCTTCAATGCNAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTG:1 - chr3R 10737072 5' + F-element 61 1 54.11 ATAAAAGTTGGTAGCCACAAATACTAATACCAAATAATACGAATTAAGTGAATCGAAAAGCCAGTACCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTT:1 + chr3L 9397606 5' - 1360 3342 1 51.75 AAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2L 7929526 5' - roo 332 2 68.75 AAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAGAATCTGAA:1 - chr2R 943882 5' + F-element 97 1 73.97 GACATGGCCAAATCGATTCGGCTATTGATCCTGACCAAGAATAATACACTTTATATGGTCGGAAACGCTTCCTTTTACTCCACGAGTAACGGGTATAATAATTAATTAAAAAAAAAAA:1 + chr2L 21256472 5' + jockey2 3406 5 63.56 TACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTCTTCTTTCTTTCTCTCTTGTAATT:1 + chr3R 23644897 5' + diver 5982 2 76.71 ATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr2L 512411 5' - roo 358 2 54.11 TTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTG:1 - chr3L 23456283 5' - 1360 3341 1 54.11 TCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCAC:1 + chr2R 21795263 5' - transib2 2743 1 75.34 GAGGTTTTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTT:1 + chr3L 11904756 5' - copia 5076 2 50.00 TTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGT:1 + chr2L 17957153 5' + flea 30 2 59.26 ATTTTTAATCATTTTGTTTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 - chrX 13628875 5' - roo 394 1 75.69 AAATGAAGAAGATGAAAAGTTTTTCAACCTTCGGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCT:1 + chr2R 10977135 5' + roo 8752 2 78.08 AAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCT:1 + chr3R 25796018 5' + BS 5072 1 67.81 ATGCAAATTTTTTTGGCGGATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 + chr3R 25798347 5' - hopper 1375 1 58.22 CGTGTTTAGTTACCAATTCACCGGGCTTCCAGCTGATTGATTTCACCTCATATATTGCGCTTTTGACTGCAGTTTTATATCCGTTTGGGCGCCAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTAGT:1 + chr2R 15198246 5' - Burdock 227 2 53.52 TCGAGTACAACAATTATAGAGAATACTGAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 9453416 5' + roo 21 2 70.55 GACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTTGGCTCCGTTC:1 - chr3R 17627577 5' + roo 8697 2 64.04 AGATTGAGCCCGCGTTTATAGTAACAAAATTGTGATATAAGATGGGGCAATACAACCCCTGAGCCAAAATACCGTTGTGAGAAGCGCTGCCAAATGCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATACGCAAAA:1 + chr3R 13363454 5' + I-element 67 1 64.38 CACCTCATTAGGGCCCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 + chrX 14735743 5' + diver 5956 2 64.96 TACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3L 20061441 5' + roo 8693 2 55.00 CCTGTGGCACTCTCAAGTGCATTTTAATGGATTTTTAGTTTTCGGTAGAGAAATTCGTACATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGC:1 + chrX 9519461 5' - 17.6 435 2 58.22 GAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTT:1 + chr3L 23146501 5' + 1360 81 1 77.21 CGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:1 + chrX 3666539 5' - roo 8986 2 82.14 TGCAGCAAATTGTGGCAGCTGCAACATTTTGTGTTTTTTTTTTTCCTCGCTGCAGGTTCTCTTTTTCTTTTTTTTTCTCATTTTTTTTTT:1 - chr3L 2874301 5' + INE-1 477 3 67.78 AAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCA:1 - chr3R 10737044 5' + F-element 68 1 68.80 TTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCA:1 - chr2R 17493197 5' + BS 4825 1 57.14 ATTTTTCCTCAAGGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTACTGT:1 + chr3R 25795990 5' + BS 5044 1 49.32 GGCTTCCCCGGGTTGAAAATATTCAACTGTTGTCCTCCTTTCAATTGACCAATATCTCTAGTTCCTGGTTAGTTTTCCACGTTTTTTAGAAAAAATAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr2L 21683527 5' + pogo 23 1 68.49 GTAGAACATCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCC:1 - chr3L 18074208 5' + 297 6596 2 72.87 TAGCTGTGCTCACAGATGTCTGGCCCAAAATGTTTTATCGAAGTTGTTTGATTAGATGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTA:1 + chr3R 12046701 5' + Doc 18 1 68.28 TGATTGGGCCAAAGATTAATATTCTCTCACGAAATTAACAATTAAATGAAATATATATATGAAAATTTTGTAATTAGTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATG:1 - chr3L 7787589 5' - flea 4975 2 50.71 GGGGTAATAATATCGAGAATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 + chr3R 10714141 5' - 297 6920 2 58.22 TGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCC:1 + chr2L 23310616 5' + 1360 43 1 51.11 ATTTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACAACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 - chr3L 11364914 5' + Tirant 15 2 71.43 AAGAAACCGAGCCGATTTACCGATTTAAAGGAGACATATGCGATAATTTGTATTTTATTCCCCAATATCTATCGATATCCAAGAAAAATGATCTAATTTCGCGTTCGCATTCACACTAGCTGAGTAATGGGTATCTGTTAGTCGGG:1 - chrX 15939160 5' + INE-1 552 1 64.38 ATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGG:1 + chr3L 13285592 5' - roo 344 2 65.94 TTAACAACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTC:1 - chr2R 17493212 5' + BS 4814 1 66.42 GATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 - chr2R 9750249 5' + opus 7065 4 65.07 GAGAGGGAGAGAACTCTCTTACTCTCTCACCAATACCAACACGGCGTCGCTGCTTGTCGGCGTTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr2R 21713233 5' + P-element 59 1 43.84 TATCCAAAGGGTCGTTTTCAACCAGTCCGCAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGAGGATTAAGTGAAATTAG:1 + chrX 3239276 5' + X-element 42 1 53.45 TTATTAACGCCGATCCATTTAACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGC:1 + chr3L 27415182 5' - transib2 2795 1 65.75 TTTTACGCGTTATCCTGGTCGTCCTCGCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 + chr3R 28014088 5' + roo 48 2 51.06 GCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGTGTTCTCGGC:1 - chrX 21668387 5' - opus 482 2 43.48 TTAGTAGATAGCGAAGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAA:1 + chr3R 23902147 5' + I-element 28 1 65.07 GAGAGTTGAGCCTCTGACTGGCAGCTGAACTCGAATAAAACAAAGCTATACAAAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAA:1 - chr3R 27451870 5' + hopper 1402 1 66.44 AGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAA:2 - chr3R 7049442 5' - Burdock 180 2 73.97 ATGAACGCAAATTTTACATTATTTATGCTTTCAATTATAAAATAATAAATATTTAAAAAAAATCATATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGCAAGTGGG:1 + chr3R 25471645 5' + Bari1 57 1 56.16 CCAAGACAGGCCATAGAATAGTGTCGCCCCTGCCCCATTCAAATTCCCATCGCACCTCGCACCAACAACAGCATTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAT:1 - chr3L 17181538 5' - jockey 4969 1 52.34 TCTGTAGACAGCAATTAGATAGACAGAGACAATGCCAAACAAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTG:1 - chr2R 11778117 5' - hopper 1396 1 72.60 TCGTTATTGTTCGACTCAAGGCATGGCTATTGTTTTTGTCGCGTTTTCGACCGAATTATTTGCATCTGAAAACCCACTGGTGACAATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 7389830 5' - roo 9047 1 66.91 TTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTG:1 + chr3L 11684841 5' + Bari1 44 1 67.31 TTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr2L 4864455 5' - mdg3 5421 2 69.44 GTTATTACTCAAATATGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGA:1 - chr3R 10737111 5' + F-element 15 1 78.42 TCAATTAGAATAAACGCTCAGACCACCCACACTTAGTGTTTTACTATCAAAGATGTGTCTTTGCATACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATT:1 + chr2L 21198151 5' + flea 47 2 55.48 CGTTTTTACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCA:1 - chr3R 19950548 5' - BS 5047 1 52.05 GTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTA:1 + chr3R 10144344 5' - Chimpo 147 1 58.90 GTTTGCTTCTTAGCTAATCCATATACACACATACATTGTATCAGCTTTCGAAATTCACTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACT:1 - chrX 17770551 5' - hobo 2932 1 75.38 TTTATATATAAATGCGGATGCACTGCAAAAAAATTATCAACAAGAAGTTTGAAATATATGTAATACATTACATTTAAGTCTATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAG:1 + chr2R 21958381 5' + 297 6615 2 54.11 TGTATCAGCTTTCGAAATTCACTCGAGTAGGAGGTTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATA:1 - chrX 17770515 5' - hobo 2916 1 58.18 GGCTGGCTTGAGACCGAACTGGAACAGATTACCCACGAAGGGGTATGGCGTGGGTCCTGGGATCATCTCCATGATGCCAGCCATGTGGTCTATGTAGTTGAATATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 + chr2R 8442588 5' - blood 7372 2 73.97 GTCGGGATAATTAACTGTGAATGGGGCAACACATTTGGGGGATGCTCCGAAAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGGGTAAAATCCCAAATAAGAAGA:1 + chr3R 30087615 5' - roo 408 1 57.53 TATGTACTGTCGCCGAGCGATGGTGCTGAAGGAGGAGTACTATAGGCACACATATGGCCAGCGGCCAGCGTTGGAATGCTGACTTAGCTTGAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAAT:1 - chr2R 6460543 5' - blood 7074 2 65.07 TTACTTAACGTCTGTTCCCAAAAATAATTTGGGTGGTTATAGTTTATTAATTGGGTAACTTCAAAAGTTAATCTCTTTCCAGGCATTTTATTAAATTTAATAATTCGCTTTAAG:1 - chr3R 5256144 5' - S-element 376 1 77.19 AGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTAGCCGTGGCTC:1 - chr2R 11247046 5' + 1360 50 1 61.67 GTGGGGTCCTATTAAATGCAAATGCAGTTACTCAAAACAGTTTGCAAAAGACTTTTGCATTATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 + chrX 5751817 5' + roo 8695 2 54.48 ATGCTAAAAACATGGCATATACACTAAATAAGGACCAAGATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATT:1 + chr3R 23964782 5' + hobo 32 1 62.33 AAGTGTATCTTTCGTCCGCATAATGTAAACTAAATTTACGTGCCTGGCTCCCGATCTTTTTCTACTTCTTCTGGCCCGCGATGTTCCCCCCTTTTTTATACCCGTCACGCTT:1 + chr3R 23335160 5' + hobo 2655 1 80.36 GTGCGGACTTCTCCACCTTCGATTTGCATAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCTGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 - chr3L 7319319 5' - 412 426 2 71.20 GAGCTTTAGTTTGCTGTTTGAATTTTAAACTTTTCCCTCCCAATATTTTTTTTCAACTGGCATTTCTGCGGCTTAAATGCGACACGCCCACAGAAAAAGGAACTCAAGCATACATACGCACACACACACACAGATATTCG:1 + chr2R 15433740 5' + accord 7032 2 52.86 CAGCTCTAAGGCAGATAAAATAATATACATAAATATAAAAAATTAATTGATACGGCGTTTTAAGTGCCCTGAAATAATTTTATCTCATCAGATTTAAGAACGTCTCACTATGGGAAGTTGTACCACTTTTTCTGGTCGAAATTAAT:1 + chr2L 22107369 5' + Transib-N1_DM 20 1 55.48 CTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGC:1 + chr3R 16630289 5' + FB 84 1 75.69 AGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 + chr4 490226 5' + pogo 62 1 61.64 TAGCCGAGGAGAGTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 - chr2L 21645263 5' + 1360 19 1 68.46 CATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 14422689 5' + roo 39 2 45.89 CATAAAAAAGGAAACAAACTGGATGCAAGCAATTACTTCAAAAACTTTTTGAAAATGTTATCACTTCTCATTTGCAGCACCTTTCTAGATTAATTATATCACCGTGTCAGCACAGTTTTATGAAACGCAGATTAACAACCACTAAC:1 - chrX 12130936 5' + Q-element 225 2 71.92 CGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGTGGCATGTGGTCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 9298487 5' + hopper 62 1 66.94 CAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGGAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAANNNAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 - chr3L 10897532 5' - roo 339 2 61.64 AAGTGCGGTAAGTGGCTGGTTATGCACAGCATGCCACATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3R 27606754 5' - 412 484 2 78.08 GGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 20061334 5' - roo 9013 2 59.03 TGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATA:1 - chr3L 27415292 5' + transib2 84 1 74.66 TTTAGGTGTGTTTCAAGAAAAATAAATTTGCACTTCTGCACGTGCGTTTGTTGTCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 - chr3R 26188616 5' + jockey 74 1 64.58 ACAACTGAAATGATCAAGGTCTTTTGTACTGGATGTATAGCTAAATTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr2R 14884040 5' - roo 391 2 71.92 TTGTCGGTTAATTTATATATATTGGTGGCGGCTTTATCTTCTTCTGCTCCTGCTCCTGCACTTCGCAGTCATCCAATAGAGCTTAAGAGAGACGCTCTCAGTGCTTTCGGGTTCATTTCGTGCAGCCATAAGCATTCGTGAGCAAG:1 + chr3R 1153374 5' - Doc3-element 387 1 52.05 AAATGCCAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr3R 5870905 5' + roo 32 2 56.91 GTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGCAGATTTCCAATA:1 - chr3L 18183162 5' - Tirant 8421 2 76.71 TTAAAATCAAATTAACACACACACACACACAAAAGAGGTACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTG:1 + chrX 15191370 5' + hobo 37 1 59.22 ATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGATCGACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGA:1 + chr3R 29534665 5' + Stalker 7011 6 75.20 TCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCA:1 + chr3L 7024467 5' + 412 81 2 71.53 ATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 + chr4 868628 5' + roo 52 2 56.55 TAAAAAAACATCTAAAATATCTAAAATATCAACACATTTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTGTGTGCGGTTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTTTGTCTCTAGAATCTGTATGCGGAATCTCAACCTTCAAGCTTTTATAGTTC:1 - chr3L 12302057 5' - INE-1 158 1 66.44 AGTTGTTGCCCTATTGTTATTGTTGTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTG:1 + chr2L 13033300 5' + hobo 45 1 50.00 ACCAAGCAACAAATCGAGGAATCCCAAATTAGTAACCAAATAAACAAACCGAAAGCGAAAGAGACGCTCTATGCAATGCAAGATCGCTTAAATATATAGTCATTTGTTATCTTAAATAATAAAACTATGAGTCAGAACGATACTCG:1 - chr3R 12649754 5' + F-element 190 1 68.49 GCCTTTATAAGTGCTCGCTGTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 - chr3L 1463773 5' - P-element 2862 1 69.18 TTTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr3R 30087817 5' + roo 8704 2 60.27 GATTTGGGAAATTTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAAT:1 - chrX 3534002 5' - 17.6 7380 2 58.22 TCTCTATTTGTTAAAAATTAAAAAAAAAAACCTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 14884219 5' + roo 8687 2 68.06 AGTACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCA:1 - chr3R 10736182 5' + McClintock 5957 2 78.47 ACCGGCTAAGCGAAATCGGTTTAATCGAATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 6050277 5' + 412 7068 2 71.11 AAACTGGCTTTTCCGTTTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGCACACGAATATATTTAAAGACTTACAACTTTGTG:1 - chr3R 30087832 5' + roo 25 2 70.55 CATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:2 + chr3R 17259527 5' - roo 8998 2 68.49 GTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATTACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTTTA:1 + chr2R 15199139 5' + Burdock 6222 2 78.77 GTCCGAATTTTATTACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTTTNTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATANGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 + chr2R 18886930 5' - roo 9043 1 65.07 ATTTGATTGGCAGGTCGGCATTCATGGGGCTTGGGCATTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCT:1 + chr3R 21925081 5' + hobo 47 1 53.42 TCGTAAAGCGTGAAACAATAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAA:1 + chr2R 558039 5' + copia 18 2 73.29 CAGTCCCACGCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAA:1 - chr3L 25206937 5' - HMS-Beagle 7029 2 72.36 TACAAACTGCATGTGCAGCGGCAGAAACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 - chr3R 31112326 5' - mdg1 7453 2 78.57 TATGTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 18128546 5' + roo 8713 2 54.11 AATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2L 17019191 5' + 412 45 2 57.53 AAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTT:1 - chr3R 26472920 5' + 1360 37 1 56.94 TAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACACTGATTTTATTTGGAATTATCTTCGGTTTAAAT:1 + chr3R 13254916 5' - roo 9011 2 64.00 TAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACA:1 + chr2L 8284355 5' + Doc 396 1 58.41 TTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATATTTAGGATTT:1 - chr3L 6015656 5' + roo 8744 2 73.97 TTTTAATTACNACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 + chr2L 388513 5' + roo 8719 2 56.16 TTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGC:1 + chr2L 8284344 5' + Doc 418 1 52.74 AAGTGATTTACATATAGTAGGTGAGCGAACCAAAACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCAC:1 - chr2L 21803007 5' + Quasimodo 9 2 77.04 ATGCCATGTTAACGATTAGATTTCTGATCATTAAACACAAAAAGCAATGGTCAGCGTCTCGTTCTCGAATACAGTAATGTTTAATAGGTCTAGGTAACGCATTCTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCT:1 + chr2R 16567218 5' + opus 5 2 80.00 AGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTT:1 + chr3L 18846963 5' - 1360 3318 1 66.44 CCATGCAGGGTACATTTGAATGCAAACTTGAATATGTTTACAACCAATCAAGCCATAAATAGCACCAATTAATGGGTAAGCCTGGCATCGGCAACTACAATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTT:1 - chr3L 17135514 5' - hopper 1392 1 67.12 TGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACAC:1 - chr2L 15019960 5' + BS 4823 1 54.63 CCTATGACTAGGCATAATAACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 - chr2L 3893115 5' + 1360 23 1 66.44 AACTAACTTAGAGTATAAAACTATAAGCAAACTGAGATCTAGGAGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chr2R 5213841 5' + INE-1 81 1 54.79 CCTTTCCACCGATTGCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCAATTTT:1 + chr3R 25158574 5' - 1360 3344 1 50.71 CGGATGGAATTAAAGATCATCATGAAGGATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTTTAAGGGCAGATGCGTGTTTGCGCGCAAAACGCCGTGAAGATTGCAATATTGACGCTCTCACGGGCCGAGGGACTCCAGTTCTTCTTTTTG:1 - chr2R 4802910 5' - mariner2 315 1 78.77 GGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACC:1 + chr3L 25889021 5' + gypsy8 315 1 74.00 TTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCC:1 - chrX 2214298 5' + jockey 4625 1 61.64 AGGAACGACTGTGGATGTTGCCGAGGCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCC:1 - chr2L 20852571 5' + Tirant 8114 2 78.15 TTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr2R 17269124 5' - roo 328 2 73.10 CTGTTGTTTGTTGTTGTCCAATTGCCGACTCTGCAATTTAGAGTCCAAAGTTTAGAATGCGTGCTGTTTTGCACAGAAACGAATGCAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATT:1 - chr3L 27190434 5' - copia 254 1 60.96 TGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 26854723 5' + jockey 35 1 61.48 GCCTGATTAATTTCTGAGTCGCTTTTCGGATAGGAGTCGAGCTTGGCCAGGATACTTTCCCACGCATTCGCTTGGCTGGACAGACCCTCTAACCCCCAACCCCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATT:1 - chr3R 11861226 5' + 412 13 2 76.64 CGCAGGTTTCAAGTTTCGTTACGTTACATAACAAGTATGTTATGTAAGTGCGAGACTGTATGTTTGGCAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACGCTGCTCTTCTGCCG:1 - chr2R 6271516 5' + blood 7208 2 64.03 ACTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 2167705 5' + opus 50 4 57.53 TTCCCTTTGACTTCATTAACGCAGATTGTAAACCCGGCTTTTTCACTGCCTTTTCGCCACACTTTCCTTTGTCTTCTGAGCGGCATTATCCCGAAGTCAATTTATTATTATTTTTATTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATAT:1 + chr2R 10582338 5' - Juan 4197 1 72.60 TTTTGGCAATTTCTTTTTTAAGCTGATTTGGCCTGAGAATATTTGTATTTAGCCTACCGTGTGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCT:1 - chr3R 19448953 5' - roo 8974 2 57.53 ATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGC:1 - chr3L 17268331 5' + hobo 58 1 61.48 GGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAA:1 - chr2R 5620997 5' + ZAM 8016 2 72.64 TAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAAT:1 - chr3R 7049454 5' - Burdock 194 2 65.28 AAACTTTGGCAAGCTGTTTGCAACGGCTGCGTATGCAAAACATCTTCAAAATTGACTTTACTGATTTTGCCTTTTGCATTTTATTATGTGTTTATTATGCTAACTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 22320603 5' + roo 21 2 71.23 AAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTC:1 - chr3R 10736141 5' + McClintock 6001 2 56.16 GGATTTTCTGTTTTGGTGTCTTCTTCCAACTTAGCTGTTAAACTGTTAAGTTAAATACAGTTAAGAAGTAAGGCGTAAGTAGTTTGCTCTCACCTATTTATTTGGTCATTAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3R 23902312 5' - I-element 5343 1 68.75 TTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr2L 4864455 5' - mdg3 5419 2 69.86 TAAACTTAAATTGGTGATATACAAGACGACCATATCGGCCATTTGGTAGCTGTGTTATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGTTTCCAG:1 - chr3L 27390360 5' + 1360 65 1 71.23 CCAACAGTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTT:1 - chr3R 24084900 5' - roo 9037 1 57.46 GAGAGAAAAGGGGGGTATCTATGAAAGCTAAGTTCACCAAAAATGCGAAAATAACTATCAATAGAAAACCTTAAGCACCAAAGTCTTGTTTTAAGTTCCCTTTAAGGTTGTACGTATAAATTTAAATATAAGCCAAACAAATAAAT:1 - chr3R 14389590 5' + Doc2-element 85 1 21.23 CAGAGCAATAAAACTCCTCCATCAGCAGCAATAGCAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chrX 20361903 5' + hopper 10 2 77.40 ACCTATTGTATATCAATAAGAATCGCATTTCCAATTCTTGCTGAGTTACGTTAATTTTGAAATTAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTT:1 + chrX 9165277 5' + jockey 4770 1 78.08 GCGAAATGTCAACATATTTTTTGTATTTTCTAGCTAGCAGACAGCAAGGCGTCGAAATGGGAATTGGGATTGGAACATTCTCATAGCTAACATATTATTTATGATACTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACCTTACGTC:1 - chr3R 13155382 5' - hobo 2925 1 73.29 GCCTTAAACAAAAAAGGAATATTCACTGCATACTTTGCGGCAGTCAGCGATGCGAATTGAAAATAAAAATCTTAACAAAATAAGCTGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAAC:1 + chrX 22603121 5' + jockey 4683 1 71.07 TCACACACACGCACGCACACGTAAACATACACGCGCCCTTTGCATTGTTGTTTTTTTTTTTCTCT:1 - chr2L 9176640 5' - gypsy7 5013 1 72.31 GGTTGAGTTGCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGCAAGC:1 + chr2L 7633335 5' + Max-element 8258 2 65.91 GAGGATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGT:1 + chr3R 18832310 5' - roo 9056 1 69.29 AATATCTAATATTCCAATTGCCACAGAAATTGAGGTTTTCAAATGACATTGAACCTTGTTTACTTCTTTGGCTAGTTTATTAATACCATTTTGTTTTACCTTTTTTTTTTT:1 - chrX 7372616 5' - Doc2-element 232 1 84.68 CCGAGCTCAGTTCCCATTCAGATTTCGAGAGCACCCTCACCTTCAACTAACTCGCAACTTTTGCCCTCAGCGCACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTTCCTCTCTGCCTGCTTCT:1 + chr2L 545123 5' + Doc 389 1 69.30 AGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGC:1 + chr3R 27547608 5' + 17.6 36 2 57.53 AAAAACAATTGCGGTGCCGTTTTTTACGCCCTCACTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr2L 2057774 5' + 412 29 2 64.79 ACTATATCAACTATATATAGTATTCAGCGTTATCTTCATAGACGCGAATTTATAGCACAAATAACTAGACACTGGAAGAGAGCCACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTGTGGGCTCCGTTCATCTCT:1 + chr3L 10897417 5' + roo 8703 2 58.90 AATGTTATTCTTGATTTTCAATCTAAAAACGTAAATAAAAAAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCA:1 + chr3R 18299990 5' + copia 65 2 63.01 TAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCAT:1 + chr2L 6618879 5' + 17.6 6965 2 54.17 AACGAGAAGAGTACGAAAAAATAAACAAGTACTTTATTGAAAACGTTTTCTTTTAATGGCATGATTATTAAAAACACCCTTGATGAACTCTTGATTTAATACTTTTAAAAAAGCAAATTATCTTATCTTAACTTATCTTT:1 + chr3R 27199466 5' - Stalker3T 202 1 56.43 AATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAG:1 - chr2L 2544808 5' - blood 331 2 69.70 CTTCATCTGCAGATGCAAATTTTTTTGGCGGATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 + chr3R 25798335 5' - hopper 1388 1 66.90 GTGTAACGTATTTGCAAATGCGAATTTCAAGACAAGACCCTTTATCGAAACCTACCGCTCGAAGATACGATACGATTATCGATGCATATGCATTTTTAAATTCTCATCAATCAGCTAGTGGAAATGCGAAATTTCATAATTTTTC:1 - chrX 22517646 5' - INE-1 516 1 35.17 TCGTTATATGTGATTCACGTTTGTCAGTTGTCACTTGTTTTATATTCCAAAGATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATACACTTACGCACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAA:1 - chr2R 954541 5' + Quasimodo 64 2 66.90 AAATTCCAAAACATTGCAGCAGCAGACTTCAAAATTATAAAGAGATAAATAAAAATATAAAGAAAATGTTGCATAAACCCCTAAAAAAAAACGATAACCAAATA:1 + chr3R 11403681 5' - Circe 68 2 52.88 AACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTAT:1 + chr2L 3892981 5' - 1360 3356 1 54.78 GCAATCGGCATAATTAAATGTTTTGCACAGTCCCGAAGAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3L 14423521 5' - roo 8982 2 71.64 GATACCACCANGATCAAGAAGATGACGGAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCA:1 + chr3R 19506685 5' + mdg3 23 2 69.18 AATCCCAAGGCTGACTATTCCAAAAGATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCA:1 + chr3R 10030686 5' - BS 5047 1 51.03 TTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACAT:1 + chrX 16998272 5' + diver 38 2 43.84 AGCAAACAAAAAGACCACATACGTACGTATATGCGTATACCGGTGAAGGCTGGAATAATAAGAGAGAGAAGGTTTTCCCAGAGAAAAGGTGTGGAAATTAAGAAAAAAAAAAATTTGAAACA:1 + chrX 10435153 5' - FB 175 1 51.64 ATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTTGTCTTTTGATTTTAGAGTAG:1 - chr3L 7751094 5' - 412 7465 2 75.37 TTTATTGATACACGCGCCCCACACAACCAAAGAAACGTTCGTATAAATTGTTCTTTCTATATTCTTTCTCATTTTCATTTAGCCGGCAGCCGAAAACTTGGAAACCACTTCCAATCTGAAAATCCATTTTTCTTTTATTTTTTTT:1 - chrX 2638283 5' + hopper 141 1 54.48 TTCTATAATTGGTGTAATTTGTTTGTAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACAT:1 - chr2R 10119068 5' + Juan 4091 1 59.59 AAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGT:1 - chr3R 6419941 5' + Tabor 63 2 58.22 TAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3R 22320469 5' - roo 9006 2 64.58 TACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 + chrX 3666516 5' - roo 9008 2 65.96 GCCTGGCGAGTTATATTTGGGGTACGACTATAGAACTAAGTTTATACATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTAT:1 - chr3L 3861510 5' + micropia 153 4 67.59 CACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGAC:1 - chr3R 19094246 5' + P-element 86 1 23.57 ATAAGCTTGGCAGAAAAGTAATATATACTTTTCATCACAAGCGATCGTATCATCTATTCGTTTATTTGTATGAAATTTCATTTTCATAATTATAATCAATCATGGAATATATGTACATGATAAAAAATTATTATATTATTTAAATT:1 + chr3R 25184146 5' - HeT-A 338 1 76.03 GAGAGGGAGAGTGAGTGAGTGAGTGCCGGAGACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chrX 5083931 5' - P-element 2852 1 36.36 AAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAACCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCA:1 - chr3R 20887502 5' - Doc 4618 1 53.10 TTTTAAAATTAGAATATATTTTAGAATTAAGTACTTCAACAAAAAAATTTGAAATTAAAAATCAAAAACAAAAGTTAATTGGAAACTCCAAATAATTAAAATTAAAATTTAAAAA:1 + chr2R 11329664 5' + 1360 3049 2 26.09 ACACAGTCAACCTCAATCACATTCCGATTTGTGGCAATTATTTTGGAAAATCTAAAATGATAAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAAT:1 - chr3L 8824575 5' - transib2 2800 1 68.49 TAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTACCAGCGGATTACCATTTTATATA:1 + chrX 16998286 5' + diver 5934 2 47.14 CTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATAT:1 - chr2L 15085730 5' - opus 7456 2 58.33 GGTCACTGTTGTTGCCTCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGG:1 - chr2L 6637504 5' - 1731 4596 1 61.81 CATAATAGGGAATAATAAAAATACGCGTATTTGTAGGTGTAAGGAGGGGCGTGGCAAAAGTGTTTTTGGTATACCGACAGAAATTGGTAAAACAAACAATAAAACCAAGAAAAATCAAAACATTTTTCAAAAGTGTGGG:1 + chrX 23012249 5' - INE-1 257 1 79.14 TGATTTACATATAGTAGGTGAGCGAACCAAAACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCACAT:1 - chr2L 21803004 5' + Quasimodo 11 2 75.37 CGTCTTGACCGCGTCACGTCTACAAGTTGCCACTGCTGCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCC:1 + chr2L 20718795 5' + jockey 4707 1 57.45 CGTAAAGCGTGAAACAATAGTGATACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGACCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACACAAATAACGT:1 + chr2R 558040 5' + copia 15 2 74.65 GAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chr3R 18832424 5' + roo 86 2 80.00 CCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGAGGTAGTTAATAAAGCCTCAAAACGCAGTTGGTCATTT:1 - chr3R 31112293 5' - mdg1 376 2 52.74 TAGCATGGGGTATGTGTATACAAGTTTTCCAAGAACTACAACACTGATAGTATCTGATAACTCAATTGATTTCTGACGGCAGAGTGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGAT:1 - chr3R 24684671 5' - Tirant 8487 2 50.00 TTCGAACCGCTCGCCTCGAGCTGCAGCAGTCGAGTGACTGCAGTGCGCACACCCCACCCACCCACACAAGACAAGATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTG:1 + chr3L 1463620 5' + P-element 1 2 79.05 CATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 + chr2L 15085627 5' + opus 7053 4 61.36 GAACTCGTCGCAAGTTCATTTCCATTCAAATTTAAAACGCAACCCAATGTACATATATGTATATAGTGACGTATTTGTGTGCTCCAAACTGCTCTCTTTGTATATTTTCCTAATCTTAAGAATCCAAGAGCGAGGCTCAGCCGAA:1 - chrX 3663229 5' + 297 202 2 72.41 CCATTTGATACGGCAGGAAATAAAAAAGTGCTGTGGCGACTAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTACATGTATGA:1 + chr2L 20852417 5' - Tirant 8468 2 59.59 CATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCTGG:1 - chr3R 4571525 5' + gypsy 7071 2 73.97 TTCTGCAAACGTGAAAACTCACTTCAATACTGAAAGTTCGCCTCCGTCTTTAGTGAGGTTAACTTGACAGTTGCCCCAACACCAATACAAATGCCTACACGGATCCCTCCGAACTTGTTTTACGTGGCGTGTTCC:1 + chrX 7955917 5' - R1A1-element 5309 1 78.52 ATGTACCCTGTGGACTTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 + chrX 8968559 5' - 1731 306 1 74.82 GAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCA:1 + chrX 860804 5' + hobo 55 1 70.00 ATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 + chr3L 2167596 5' - opus 7443 2 64.29 AATTCGTTCAAATTAGACAGCATTTATATGTTTTTTTTTT:1 + chr3L 16502043 5' + Circe 422 1 72.50 CATTTTTGAAAAGTGTGAGGAGGGTAAAGTTGACAAAGGTCAATAAAAGTCGGGATTGTACTAACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACG:1 - chr3R 11076253 5' - I-element 5302 1 54.79 TTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:1 + chr3R 28438334 5' - mdg1 355 2 66.92 AGACATATGTTTGACTTCATTAAAAGGTCCATACAACTGATAATATAAGTTTATGCTCTTAAGTGAAGATAGAATCGCTGGATCGTCGTCTATCTATCTGAAAAGTAATGATGGCAATGTGACACACTCACACACACACACATATT:1 - chr2L 17421036 5' + accord 184 2 54.11 CAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCC:1 + chr2R 7720054 5' + HMS-Beagle 6834 2 57.55 ATATATTAATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGGT:1 - chr3L 2167709 5' + opus 152 4 55.40 GAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTCAGCGAGTGTACATT:1 - chr3L 22021728 5' - mdg1 7378 2 73.97 TAATCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATA:1 + chr2R 15199104 5' + Burdock 6179 2 53.62 TTTGGATTTTAAGCATCACTATGAGTATTGCCGACGTGGAGTACGAATATGTTGTGTTAAAAGTAAGTTCAATATAAAGTAGGACTAAGAACCGAGTTCTCGTTTTACCATAAATAGTAAGTAAAACAAAGGAAACAAACGAAA:1 + chr4 663681 5' - accord2 7255 1 81.94 TACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACTAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr3L 20061424 5' + roo 50 2 61.29 TTCATCAATTTATTTAGCATTTTTATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTT:1 + chr3R 29627851 5' - roo 9052 2 58.00 AGGTAGTGAAGTTGTGCAACATTTTTTCCCAGGAACTTCTGCCGCTGCCGTGGCTCCTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTACAAGACATCTGCGAAGCTACTAAT:1 + chr3R 29283897 5' + hopper 389 1 52.42 GGAAAAATTCTATTTTTAAATTCGTTAAACAGCTGACAGTCAGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - chr3L 13993644 5' + P-element 79 1 31.51 ACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTTGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 + chr3R 5870831 5' - roo 314 2 79.45 CGGCGGTCAGTGCCACGAGGCCAGCCGAAGTTCTCTCGCGAGAACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 - chrX 19887015 5' - P-element 2848 1 45.28 ACGTAGCTTGCCAAGTAAGATAAAAGCAAAATGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTT:1 + chr3L 2317088 5' - 412 7529 2 66.21 AATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTAT:1 - chr2L 11867391 5' + BS 32 1 46.85 AAATATCATGTTTGTGCTATCTGGAGTATTATTACTTTAGATTGCTACAGACGCAAGCCTCGACTGTAAGATACCCCTTACTATGTGAAAGCGACTATAAAGGATAGTTATCTATGGTCGGAAACACCCTCAAGACCTGACTGAGC:1 + chr2R 6526099 5' + jockey2 3186 1 64.38 ATACAGGGATACTTGGATACTTGGGTTTTCTGGTCTGAGCCGGGCACATGTTGGCCATGTTCACCAATATTACATGTTTTTGAGCAATGCACCCATGTCGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCAT:1 + chr3R 28007798 5' - roo 8732 2 55.48 GAAAGNTATTGTTGAATAAAATGAGAAAACTCTTGTTTCAAATTGTATTGGGCGTGGCAATAATTTTTTTGGCAAATCGATTGAAATTGAGGAGACTAATAAAAATATGAAAGAATATAAAAATATTTTGCAAAATTGTGGGCGTG:1 + chrX 8272425 5' - INE-1 253 1 67.12 TAATAAGTATAAATTGACATTAATAATGCGTTTTTCGCTTTCTTTCTATTTTATTTTTACCAATATTTAAGCTTACAATAATAATCAAAAACTAGAGAGAATGCTATAGTCTAGTTACCTGACTATCAGCTACCCGTTACTCAGCT:1 - chr3L 24075395 5' - INE-1 545 1 53.42 ATGTAAATTTTTGATCTGTAACTCTAATCTCATATTACCAACGAATATCTGAGAATATCTTCTCTTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr2R 24215717 5' - I-element 5301 1 54.11 CAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:2 + chr3L 18216469 5' + 297 6636 2 58.90 GCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCC:1 - chr3L 2532521 5' - blood 7340 1 64.96 ATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATA:1 - chr3L 27350109 5' - 297 336 2 67.83 AAACGCCCCGAAAAGTATGCAATAAATTACACAACAGGCACTCGCACATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAA:1 - chr3R 27315177 5' - jockey 4957 1 55.71 CTCGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATATACTTTATATAGTGCGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTAGTATAATGAGGCAATGATTGTTGAGTGCTTGTGTCCGCACTTCGTGCCTCAA:1 - 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chr3R 14593079 5' - Doc3-element 420 1 65.00 TGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAG:1 - chr3R 11284989 5' + blood 68 2 64.38 TGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3R 17243246 5' - hopper 1388 1 64.58 TTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATA:1 - chr2R 11844307 5' + I-element 83 1 71.92 TAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCGGCAATCCCAGTTATTATGTTGAGGGGAACTTTCCT:1 + chr3L 23456276 5' - Gypsy6A_LTR 281 1 60.00 CAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTCCCA:1 - chr3R 6419917 5' + Tabor 87 2 74.66 AAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chrX 8681418 5' + jockey 34 1 58.54 GGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGAT:1 + chr2R 8315491 5' - hobo 2917 1 60.58 GGAAGTTTTCCCAGCATTTTTACAAGAAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCG:1 + chr2L 5207437 5' + opus 65 4 63.01 CTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3R 24072029 5' + jockey 73 1 54.79 GACTTTTAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATA:1 + chr3R 17259515 5' - roo 9010 2 60.27 AAACCAAAACTTTCGCTTTGCACTTTTCTTTCTTGCACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr3L 17011922 5' + 1360 40 1 58.22 GTGGCAATGCGTGCGGCCGAAGAAACGAAAACAGGTCCTCAAACATCACGTGAAATCGAAACTAGCGGGAACGACAGCGGGACTGACATCTGTCCGTATGAACGTCGAGATATCA:1 - chr3R 3586595 5' + INE-1 135 1 77.39 TAAATGGATGCATTCAGCAGGTGAAACACATAAATATGGCCGCTGCAATCTCAGCAGCTCGAATAGATATTAGTTCCCATGGAAATGCAAATATATATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTT:1 + chrX 4789084 5' - Quasimodo 7345 2 70.63 TACCAAGCAGTTTTGTTTGATCACCGTAAAATTTTCCAAATAGTTATACCTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCT:1 - chrX 23182949 5' + Idefix 19 2 59.59 AACAAGCTGAATGGCTTAACACACGAATCCTTCATATTAAGATTTCCTTTGCTCGTAATCGTATGCACACCATTTAAGAATCATTAATATTTCCAGCTTTAAAGCTGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAACTCGAATTTTTGA:1 - chrX 10737642 5' + FB 18 1 71.92 AAACGATGTATGGAGAAAGCTGCATAGCAGCAACCAAGCCTCTCGGGCTGAGAGGTGACCCAGCGAGCGCCACGAGTTGCGCCCTCTCCTCGGCGAACCT:1 - chr3L 25615022 5' - Rt1a 4610 1 78.00 TGATATAAAATGTAAATGTATGCATTTTATATCTTATTCCCCCAAATTATTTAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGA:1 + chrX 8346307 5' - roo 9029 1 53.42 TGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTATATAGGTGACATG:1 + chr2L 512439 5' - roo 9001 2 70.00 TGTTATGTGTTTATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - 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chr3L 11364910 5' + Tirant 8146 2 58.27 TCATAAACGCTGATGGCAAACATAGTTTAATTACAATTTAATGGCGCACTCGGATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTCATGAAAATGAATCGAGAGCGATAAATTCT:1 - chr3R 26927472 5' + roo 8733 2 60.27 CAAGTTTTCCGCGATAGGCACATACATATGTATATATTAATAATCTTGAATGGATTTTGGCGTTCAAAAAGGTAGGTGTTACGTTTTCTTTTGTTCTTGTTACGGTTTACGCAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACG:1 + chr3L 19156612 5' + 1360 10 2 71.92 AACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGT:1 + chr2R 7314608 5' + blood 7049 2 55.48 AGAAACAAGGTTTTAAAAGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGT:1 - chr3R 29288833 5' + BS 5005 1 74.66 GAGCACTAAGATGCACTCCAAGGAATTGCCATTTTTAAACCACTACTTTATTTTTCCTTCAAAGTAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 - chrX 666378 5' - 412 7490 2 56.85 GGATAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAAAGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTTGC:1 - 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chr3R 19990973 5' + I-element 5000 1 63.64 ATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr3L 12227904 5' - opus 7462 2 58.90 ATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 - chr3L 10897538 5' - roo 9015 2 59.29 GACAAAATGCCACTCGTCTGCTGTACGAGGGCCCTGAAAACATTAGTAATCGAAGAAGCATTGATATTAAAAATCGATATGTTATCGCTGGGAAGTTTTATGATAGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCG:1 - chrX 17884651 5' - pogo 2097 1 77.61 CGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 + chr3L 18183108 5' + Tirant 39 2 69.39 TACGGGGCTGCCTCCTTCGTCTCAGGCGGTGCGAAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTT:1 + chr2R 9376601 5' - hopper 1393 1 69.78 AGGGAGGGCANGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr3R 30087702 5' - roo 345 2 62.41 CACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr3R 30087724 5' - roo 318 2 78.77 TTGAGCTAGAACTAGGAACTAGCTTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAGGGACAGACTGGCAAGGCCAGATCGGCTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAATATATAC:1 + chr2R 22307618 5' - INE-1 80 1 82.73 TTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 - chr2R 8286798 5' + Burdock 50 2 53.79 TGTATGGACATTTGTACAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACTCAAGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1 + chr2R 22796779 5' - jockey 4925 1 64.38 CGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGT:1 + chr3L 414869 5' - 412 7525 2 59.49 TAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGGATACACTTAAA:1 + chr2L 14616190 5' + P-element 42 1 40.95 TTAACTGCTTAAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTT:1 - chr2R 17350648 5' + F-element 20 1 80.58 ATTTAATTGCAGCTTCATCCGGCTGAAGAAGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACACCCAT:1 + chr2L 4864401 5' + mdg3 5333 2 76.47 ACTTTGTTTGCCCGATACCGTGGGCAAATAAAATTCCATTCCATTCCATTCTACCCCTCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCT:1 - chr3R 5036042 5' + Transpac 219 2 54.39 TGGAGCATTTGTTTGTACATCAAACGTCGCGGATCCGAATCGTTTCTAATTAAAAAAAAAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAAT:1 - chr2R 6700146 5' + roo 8664 1 67.05 GGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAG:1 - chr3R 6419920 5' + Tabor 6911 2 70.15 TTCTTTGCACAAAGTGTCAAATGCAAATAAATATAAAAGATAGATGTATAAGATTTGAAACAATCTTATATAGATAATGCTATAGTCAAGTTCCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGG:1 + chr4 949675 5' - INE-1 546 1 75.00 TATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 19965212 5' + jockey 32 1 60.00 CCTAACTGGCTGGGCCCAGCGGAAACGAGTGTGCGCGACAGAATTTCAATTAACAAAGCGTGCGTACTTCTCCACCTTCGATTTGCATAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTA:1 - chr3L 7319378 5' - 412 7528 2 70.37 TAAAAATCAATGCATCAATCGGATTGTCGATTCCGTTTAGCAAGAATAAATCAATGACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGCAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3R 11516459 5' - roo 394 1 78.08 GCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCA:1 + chrX 3533861 5' + 17.6 37 2 58.99 ATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGTGGCGAAAATAATGAATGCGGGTAGTCGCCGTT:1 - chr2L 23295850 5' + micropia 106 1 69.78 TTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 + chr3L 17181462 5' + jockey 93 1 74.48 ATTCGGCCAATAAGGCGCACTGCCAGAAAAAGTGATGACTGCATGTTAATTTGGTTTGATTTGTTAACAGTAAAAAGAATTTATAGATCTTATAATTTAATTAGAATTAATTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGAT:1 + chrX 20999454 5' - BS 5085 1 77.24 TACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGGAAGGAATAGTATTCTGAG:1 + chrX 19662967 5' - P-element 2814 1 34.25 ATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCATG:1 + chr2R 20972677 5' + jockey 4751 1 70.55 GAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTG:1 + chr4 490219 5' + pogo 55 1 56.85 TAATAATGTTTCCGGTTCGTTTAGTGTTGTTTTTTTTTTTATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTC:1 - chr3R 13339080 5' - BS 5017 1 74.81 AGAGTATAAAACTATAAGCAAACTGAGATCTAGGAGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATAACCGAG:1 - chr2R 5213832 5' + INE-1 90 1 45.21 TCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACACTTGCGCA:1 - chrX 14360819 5' + jockey 81 1 72.31 AAGGTAGAAATAAATGACCAGAAAAAACAGTATTAAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3R 17258229 5' - roo 9038 1 41.10 TACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCCCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3L 11364885 5' + Tirant 8113 2 66.67 AACGCCTCGTTAAAGACCCACCTCAACTATATCTGAACAATTAAATGTGCAAATGCACTGGGCAACTATATACTACATATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTG:1 - chr2R 16567391 5' - opus 474 2 65.38 TAAAAATATTCTGCACTTTNTTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr2L 18219309 5' - copia 223 1 60.96 GGCCCCAAGTCACTGCCAGATTGAGCTTCCCTGTATACTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 - chr2L 12932203 5' + opus 19 2 65.85 ACTCCGCGATGTCCACACCAATCCAACCTCAGAGTAAGCAAAAAGAAGTATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTATACACCCACAAG:1 + chr3L 22702770 5' - R1A1-element 5266 1 65.71 AGTGTGGGAAAATGAAAAAGTCATTTGTATATCTGTATTGTCATATTTCCATGACATGGTATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCCGAC:1 + chr2R 4012502 5' + F-element 287 1 54.74 AACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCTATACATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTCGG:1 + chr2R 5953922 5' + flea 52 2 60.61 AACGAGGAAATGATTCAAATGCTCTTCAGTGGACGTGAAAACGAACAGCTTGAGGCGACTCAAAAGTTCCGCAAACTGCTGTCCCGCGATCCCAATCCTCCCATTGAGGAAGCTATTTTGCCACCTTCTTCTTTCAGTAGGTCCAC:1 + chr3L 19808284 5' - S-element 1258 1 76.71 CACTATCAATACAGAATTTTGACTTAGTTGTGAGCAGAGANCTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGNACATCGCGGGGACTTACAAACACAC:1 + chr3L 12890329 5' + hobo 83 1 76.81 TTTGCTATTTTCAGTTATTTGCCTGTTATTTTTATAGCACACGACGTTTGCAATAGTTATAATTTACCTCGTTTTCTTTAATTCACATTTTCCACTTAGAAATGAATTTGTATCCCACTTCTGAATTGTCAGGTTGATCT:1 - chr2R 652299 5' - Bica 151 1 55.00 TTAAACTTAAAAATTATAAAACCTAACTGAAAAGTCACAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAG:1 + chr3L 1437841 5' - Transpac 277 2 64.14 AGAATAAATCAATGACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3R 11516501 5' - roo 352 2 58.62 AGTAGAGGAAACCAACCTTGCGCTTGTGTGGCTAAAAATGAACTGTACGGAAGAACGGAACGGTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGCGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2R 21713382 5' - P-element 2883 2 77.54 TATTTATTTCCCAGCCAGTGAAAAGCGAAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTC:1 - chr3R 23636456 5' + X-element 4278 1 48.63 CAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 + chr3L 11535871 5' + roo 8703 2 56.64 CAATCGCTGTGCCTTTTCATTTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCCCCCCCTAAACCCCCACGC:1 - chr3L 11364932 5' + Tirant 8119 2 76.87 GTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCT:1 + chr3L 23181967 5' + 1360 61 1 67.69 GCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCC:1 - chr2L 20852546 5' + Tirant 8 2 71.58 TTTACTATTTCCACAACCCTTTCGCCCATTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 - chrX 8501430 5' + hopper 142 2 79.17 AAGGGTATTTAATATTAAANATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr3L 6015702 5' + roo 33 2 57.24 CAACGTCCATTGCAGTTCAATACAAGTTAACTAACTGACTCTGCAACCTAAAATTCTGTCCTAAAGAACATAACGCTTTTGCTGAGCATCGCGACTATCAGATACTCGTTACT:1 + chr2L 10912456 5' - INE-1 550 1 85.84 CAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTC:1 + chr2L 8284337 5' + Doc 400 1 62.22 AGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 2317256 5' + 412 37 2 58.90 TGGCGGATGCTGCACAATCAAAACCAAAACTTTCGCTTTGCACTTTTCTTTCTTGCACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATT:1 + chr3L 17011902 5' + 1360 20 1 71.92 ATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAG:1 - chr2L 6637463 5' - 1731 4553 1 69.86 GTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr3L 13285658 5' + roo 8747 2 76.39 TAAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTACCGCTCGCTCAC:1 - 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chr3R 22709060 5' + roo 8714 2 53.42 TTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTT:1 + chr3R 10148733 5' - 17.6 7348 2 67.12 AAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAA:1 + chrX 22679630 5' + Doc 75 1 51.37 CCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chr3L 13285605 5' - roo 8987 2 78.08 TTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 13033397 5' - hobo 2937 1 58.57 CGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGA:1 + chr2R 23094894 5' - 412 407 2 78.77 ATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 11232506 5' + roo 8724 2 61.64 TATTTGTTAATGGGTTAGGTGAAGTTTGTTGGCATTGCGATAAAAATGTACAAGGAAAATAGTATAATAACAAAAAATTAACTTCCTCGTCTATTAGATACCCCTTACTCAGGTAGTGTGAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGG:1 + chr2R 5732801 5' - INE-1 513 1 69.18 TACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTT:1 + chr2L 11475109 5' - jockey 4931 1 57.53 ATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAA:1 + chrX 21087558 5' + mdg3 34 2 50.00 CCAACAGCATTTCTTTCAAAGACGCCTTTATTAATTGTACCCGGTACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCAATGAAAAGTATGTAACAGGCATTCAGACTATATAAAGTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chrX 21097340 5' + 297 4 2 77.93 CAGGCCATGAGCTCTGCCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATC:1 - chrX 14360880 5' + jockey 9 1 80.83 AATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCG:1 + chr3L 7848492 5' + jockey 79 1 70.15 AGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGATAATATTAATTAGAAATTTTATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCG:1 - chr3R 11516613 5' + roo 54 2 57.53 ATGTTTTCTTTTCATATTTCATTCATATTTTTTGAATTGAAATGTGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGTTATAGTTAAGATTTTTAAACTTATTGTTAG:1 + chrX 23282933 5' + F-element 4627 1 69.18 CAAATAGCACGCAACAGGGCATTTGTTGCAGTGTAGTGAAGTATTGTAGTTGTTTAGTGTTATCCTTGTTTCCGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACGACCTACTCACAGCAAAA:1 - chr3L 2305080 5' - copia 145 2 53.42 TCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGTTCATGGGGGTTGTTCATGGGGATGTATTCTCTTCAGACGTC:1 + chr3L 11837739 5' - G5A 2678 1 65.73 TATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 - chr2R 10977214 5' - roo 391 2 63.30 CCTAAGCGGGCGATCTCGCTCCCTAAATAATATAAAAAAATGGCCCCTGTTTTAAACGGCTACCTATGTGGAAAACCAGCTTTTAACATTGAGGGTTGTTCCGGAGGTTTGTTCTCGGTCACCAGAGCCTCTGCTTAGGC:1 + chr3L 25674205 5' - Rt1b 241 1 26.43 CACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATCGGTGACATGAGAATCGCA:1 + chr3R 22320481 5' - roo 8992 2 70.55 ACTGCACAAACAAGTTTTTCGCTTCAACATTAACTATTTTTTATACCCTAATTTGCTCAGTTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:2 + chr2R 6700045 5' - roo 347 2 59.59 CAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATGTACCCAGCCTTTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCCACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAAC:1 + chr3L 27415220 5' - transib2 2759 1 62.50 TAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTC:1 + chr3L 9324451 5' + HMS-Beagle2 6887 2 69.66 TCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTAT:1 + chrX 8681455 5' + jockey 95 1 78.08 AGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGATAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2R 10977178 5' - roo 8982 2 73.79 AAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAG:1 + chr3L 9635318 5' + Doc 70 1 68.12 CATTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCAT:1 + chr2R 19574403 5' + I-element 5134 1 56.85 GAAGGACACGTTCTCAGTTGAAATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGAGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTA:1 - 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chr3R 19094318 5' + P-element 20 1 70.55 ACGAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACAC:1 - chr2R 18931933 5' + blood 25 2 61.60 TAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGNTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGAGTACACTGTACCTATANGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATGAATAAATGTCTCA:1 - chr3R 11284994 5' + blood 7073 2 57.24 TTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTCGACACCC:1 - chr3L 12890395 5' - hobo 2876 1 58.90 CAGCCACTTTGAATTGCTTATCTCTGATTTGAAACTTTTCACGATCTTGTCCCGATGCAGACTGACTTCTAAGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTAGGCAAACGCTGTTATTG:1 - chr2R 5303159 5' - FB 203 1 50.68 CTTAAAGAAGTGATGTAATCTCCCCGGTCTAAATAGTATTTCAGAAAGTTCACATATTCTTCTCTATCTGGGTCGTCCTTTGTAATTTAAGTGCACACTACATGAGTCAGTCACTTGAGATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCC:1 - chr2R 9618359 5' + roo 184 2 53.42 TTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTG:1 + chr3L 28063329 5' - Stalker4 7075 4 74.81 CTGTGCCAGAAGTGGCAGCAACAGCAATTGCTGTTGCAGACCCCATTGAGAAATAGAATGTGAACACATCACAAGTGCGTGCGGGGCTAAACATATAGCACACACCCGGGGAAATATATATACATATGTATATAT:1 - chr2R 10594198 5' - G3 4507 1 58.52 TTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTTTGAATAGACAA:1 - chr2L 14056768 5' + pogo 66 1 62.33 GTTGTAAACGGTGCTAAAGTCGTGATGCTCTGTTTAAACTAATTTATTGTATTTAAACGACCTTTCCCGGCCACACACACGGACAATGTAAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr2R 2906098 5' + 1360 32 1 42.47 TATTCGTTTTGCTACAATCGGCCTCGGTAGTGGGGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAC:1 - chr3R 26242585 5' - roo 9043 1 59.59 ATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGCTGGTCATTTTAT:1 + chr2R 15392507 5' - mdg1 7411 2 51.37 AAACCAAAACTTTCGCTTTGCACTTTTCTTTCTTGCACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 + chr3L 17011922 5' + 1360 29 1 62.96 GCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCAAAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAA:1 + chr3R 22647831 5' + transib2 67 1 61.64 AAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGTTT:1 + chr3L 5027191 5' - roo 9038 1 55.88 TCACGCATCACAATGTGGCAAATCAGGCACAAAAATCCAATATCCTGCAATGAAATACAATTACACGGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTAT:2 + chr3L 8824432 5' + transib2 55 1 54.11 GCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTG:1 - chr3R 28618435 5' + 412 49 2 64.96 TTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCAC:1 + chr3L 19579995 5' + jockey 68 1 62.69 CAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAA:1 - chr3R 15727976 5' - 1731 303 1 70.63 ACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTT:1 + chrX 20361982 5' - hopper2 1519 1 78.77 TGCCCAACTTAATGCACTTCTCAAATGCAATTAGCGAAGAATAAAAAAATCCCATATAAAACCACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCAT:1 + chr3L 23496573 5' + blood 112 2 44.52 ATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTAAGAA:1 + chrX 15746321 5' + jockey2 3301 1 79.45 AACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTATGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr3R 28749123 5' - mdg1 335 2 71.92 AACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAAAAAAAACGTAATTGTGATCCATAAC:1 + chr2R 22523162 5' + jockey 68 1 59.26 TACATGAATACAACTACTTGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAG:1 + chr3L 27349980 5' + 297 6608 2 60.43 CGTGTATTAAGACTAATGGCCGAGAGCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCG:1 + chr3R 7049310 5' + Burdock 6151 2 75.17 GAATTACTACGAAGTATATGTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 - chr3R 8197912 5' - pogo 2077 1 67.13 AGACAGCAAGNCGTCGAAATGGGAATTGGGATTGGAACATTCTCATAGCTAACATATTATTTATGATACTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr3R 13155344 5' - hobo 2920 1 60.18 TTAATAAGAAAAGGGAGGAAAGGAAATCCAACCATGCTTACATAATCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3R 20905100 5' + roo 8687 2 69.18 ATGCATCGTTACTAGAAACTACAAATAAATAAAGAAAAGTGACCGAAAAGCACTTGAAAACTGTGATCTGCCATTTTTGAATGCCTACTTTTAGGATGTACGATTGGGCTCGAGAGAAACGCAGTATCCAACGATTCACCAGCCGC:1 - chr2R 17493759 5' - X-element 346 1 78.77 CAATTTTCATACAGTCATTTGGTAATGAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGC:1 + chr4 490193 5' + pogo 22 1 70.50 AAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCCTGCCGCGCTCT:1 + chr2R 14072525 5' - mdg3 161 2 71.23 GTCTGATATTGACAATTCCGCCCGGGGTGGTGGCAGCTTTCACAAAAGCGTCTAAACTAATCAACAGGAGCAGCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTA:1 - chrX 3921777 5' - 3S18 6094 2 78.08 TCCTTGTCATTTGCATGGCTTTCAGTGATTGGCATTGTTAATCAAGATTTAGCACTTCATTTATAAGTATGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAC:1 - chr3R 13611840 5' + copia 4923 2 56.85 ATTTGCAAGTTCCTTTTGCCGTTCCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGG:1 - chr2L 11867418 5' + BS 2 1 67.14 CACGTGGGTGCTTTGTATTATGCATACACTTGGGCTTGACTGTATATGTACACATTGTAACGGAATGCTACAATGTGCTTGTATGTTAGGAATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCG:1 - chr3R 3181163 5' - opus 7474 2 67.12 ACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAACAATATATGGA:1 - chrX 2214285 5' + jockey 4638 1 69.18 TCACCACTTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr2R 8315609 5' + hobo 25 1 69.17 CTGTCGCAGTTCATCAATTTATTTAGCATTTTTATGCTCTCCGCTCCAGCGGCATTGTTTAGAGCGGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 29627842 5' - roo 351 2 56.85 TCTTTGTGCATCATCTGTATATTGATTGAGATGCTGCCTGAAAGTATGCAGCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTT:1 + chr2R 9007003 5' + jockey 4790 1 75.86 TCATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 5027151 5' - roo 9034 1 58.22 ATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAA:1 - chr3R 10148845 5' + 17.6 6956 1 62.22 ATGATTGTTATTATTATTATTTTTTTTTCATGTAAATGGATAAGTGAAAACGATACCGGTGCCTTAACAGCGATTGTTGTACATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTT:1 - chr2R 23592060 5' + micropia 5084 4 56.85 AATTTTTATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGCT:1 + chr3R 26927362 5' - roo 397 1 69.03 GTTGTTGTTATTGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATAC:1 - chrX 7702852 5' + P-element 35 1 61.11 CCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGCTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCT:1 - chr3R 29288769 5' + BS 5069 1 63.70 TCTGTTTGACCAACAGGATTCCACTCAGCAGGAAGACAAGTGCAAGCCAGAAAATTAACTTCAAGGAGGGTCTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCGAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3R 22708922 5' - roo 9038 1 63.70 GTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 + chr3L 13285586 5' - roo 342 2 65.07 GTTAAACAGCTGACAGTCAGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTTTT:1 - chr3L 13993621 5' + P-element 96 1 16.43 CCTGTTAGTCGAATACAATATATCAGAAACACATTCGCTGTGATATTGAGTGCATGCCATCGAAGCCATTCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chr2R 21795355 5' + transib2 38 1 55.97 TCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGC:1 + chr2R 7314640 5' + blood 69 2 62.76 TATTTTGGCGTCGTTGTTGTTATTGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTAC:1 - chrX 7702864 5' + P-element 25 1 68.49 TTGGTCTACTAAAAAGTAAATTCAAACGCCTTCAACGGAATATTAGGGTAGTTTTTGCCAATTTTCTAGCAATATGATAAAATAAAATAATTTTTAAAAATTCGCGCCCTGACTATTATAATTTAAAAGCTTTTTAAATTCGTTTG:1 - chr4 175936 5' - 1360 3010 1 70.55 GGGCCGTCACAAGCCATAATATCCATTATTCCGACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACT:1 - chr3L 4547823 5' + mdg3 5267 2 73.97 AATTTTAAAGGTTCATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAA:2 - chrX 21575382 5' + INE-1 82 1 65.07 TGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACA:1 + chr3R 25860443 5' + hobo 22 1 69.29 AGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:1 - chr2L 12236839 5' + jockey 66 1 56.85 CTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAG:1 - chr3R 10737033 5' + F-element 99 1 80.69 ATCCGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 20752871 5' + 1360 8 2 69.16 AAAATCCAAAAATAGCCAAATACATATAATCCTTGAATTTAGACAGATTTGTCCGAAAGATAGCTAAACTTGCCACTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATC:1 + chr3R 6419829 5' - Tabor 437 2 53.42 CGGTGCAGGGGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTAC:1 - chrX 609461 5' - 1360 3324 1 62.33 ACTCCCGCTCTCGCTCTCTCGAGCACTTTGGTTTTCTATTTTTGATGCACTGCGAATTAGTTTTGGCGAAACCCTTCCTTTTTAATCTCCTTAGAGGCCTAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTG:1 + chr3R 11566844 5' - BS 4878 1 54.96 ACTTTGGTTGACAGATGATAACGCTGGGTGGGGTTTATAATACAGATATACACATATTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCT:1 - chr3R 27827263 5' - I-element 5290 1 61.38 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 82 1 58.62 CTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTC:1 + chr2L 20407792 5' + McClintock 6025 2 77.61 TTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3R 17243222 5' - hopper 1362 1 53.42 TCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGCT:1 - chr2L 17019165 5' + 412 7124 2 65.75 AAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACTGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTC:1 - chrX 609448 5' - 1360 3311 1 71.23 GCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAA:1 - chr3R 10737055 5' + F-element 78 1 65.75 TCATTAATTTCTCTTTAAAAACTGAGCCTCTGAAATCCCTTCCTGAGCGTGCATATTTATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 - chrX 21639411 5' + 412 56 2 58.99 TTGCTTACTCTGAGGTTGGATTGGTGTGGACATCGCGGAGTAAAGATCAGTTAAATATAGAATATAGATATAGAATATAGATTAAGACTGCTCATTGAGGTAGGCCCCCTGGTGGGAGCATTGTGGTGG:1 - chr3L 22702789 5' + R1A1-element 4988 1 47.29 AAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATCTGAA:1 + chr2R 4887633 5' + jockey2 3019 1 73.97 AACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACTCTAGGCACCCCGCTTTTTT:1 + chr3L 17268261 5' - hobo 2884 1 65.83 ATCATTGTCCCTCAACACTTAACGAACGCAACAATGCTGCGAGAGAGCGGAATAATGGAATTGTTCTGAAACATTCCTATGTGTTGTTATTAATATATTGTTTATTGTGGGCGCCTATTTCTAACAATTT:1 - chr3R 27438593 5' - hopper 1086 1 66.92 CCCAAATTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGAAAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 20972631 5' + jockey 4689 1 67.69 CGTTCCAAAAAATGATAGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 + chr2L 10909480 5' + 412 7103 2 50.00 GTTGATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCTNTTGTGTTAAGAGACTAAC:1 - chr3R 20887537 5' - Doc 4658 1 72.14 GCCTAATTATTGCAAGCTTTAAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAG:1 - chr2R 15199212 5' - Burdock 191 2 69.18 TCCATTTTGATGCAAAGTCAAATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGT:1 - chr2L 12236867 5' + jockey 31 1 67.14 CTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCT:1 + chrX 21087595 5' + mdg3 5303 2 61.43 TTCCAATAAGCAAGTTTTGTAATACAAGGTAAGGTATAAATTAACAACATCTACCTCGATCTGTACACATCATTGAATAAACCCTCAATTTGTTAAGCGAAACCTTTCGTTTTGTTTTAACCCCTCTTTA:1 + chr3L 1431068 5' + Transpac 5087 2 60.00 AATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGGGCTTA:1 + chr3L 17181464 5' + jockey 94 1 74.31 ATTGGCGATGGGATAAACCTCGGCGAACAAGAATAAGCGACTAAAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTT:1 - chr3R 395230 5' - accord 7367 2 72.22 CGTATGAAGCATACGCAACGTAATCCATAATTTAGTAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTG:1 - chr3L 22257870 5' - mdg3 206 2 57.24 ATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCAT:1 - chr3R 12376534 5' + HMS-Beagle 6836 2 58.22 AGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTA:1 + chr3L 15148576 5' - roo 350 2 57.53 CAGACCTTGCTGCTTGAACTTGCGACAAAGTGGAGCAATGACTCGGATTCTTTTGCATTTCACCACTTTTACATACATACATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGG:1 + chr2R 9750121 5' - opus 7494 2 76.47 CGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCTG:1 - chr3L 2966527 5' - roo 354 2 63.87 ACTCGCGGTAATTTGAACCTTTTTCCGTTTGGGTGATTTCTGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCAT:1 - chr3R 6584859 5' + transib2 77 1 71.23 TGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGCTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGCTT:1 + chr2L 15085640 5' + opus 7043 4 64.22 TATAAGGTAACTAACTCTCCGACTGGTAATTTCAACTGCAATTTTCTGCTCGATGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTGATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATGTGTCTTTTAGCTTGGTT:1 + chr3L 4547681 5' - mdg3 5438 2 54.68 CTTTCCACACACTTTCAATNGGTGCGTATATGTAACTTCGCATATAAGGTAACTAACTCTCCGACTGGTAATTTCAACTGCAATTTTCTGCTCGATGTTTTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTGATATTCTAATACAATTTCACGT:1 + chr3L 4547639 5' - mdg3 5474 2 67.81 ATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCCAGA:1 + chr3R 28438341 5' - mdg1 335 2 74.66 ACATACATATATAGAAGAGCTGCCAGCTGAATACCACTAAATATTTACGCTTTGGCTTTTATTGCTTCTGAGAGCCGGGAACTCTTTTTATCCCACTTATTTTTGTTAAATGGAATGTGTAGATAGGGAAAAA:1 + chr3R 31886630 5' + HB 114 1 68.42 GAACATCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGT:1 - chr3L 18074205 5' + 297 35 2 62.33 GTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGACAAATTATATTTA:1 - chr3L 13285656 5' + roo 74 2 74.44 ATTGGATATGCCCTGCAAGAGATTGGTCACAATGGGGTCACAGAAACCATTTGCAAAACATTAATTAATTAATTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTA:1 + chrX 18745340 5' - Juan 4154 1 60.27 CAAGAGCGCGATATCCTTCGCAAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chr3R 21794147 5' - hopper 1357 1 56.16 TAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr3R 20905041 5' + roo 8740 2 75.00 AAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGC:1 - chr3R 18477837 5' - 1360 3303 1 73.29 ATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chrX 14360815 5' + jockey 80 1 76.00 TTATGGCAAAAAAAAATGTAAAGCAATTAGAATCGTAGGATTTATAAAATAAAAAATTTATAAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chr3L 17273592 5' + pogo 19 1 63.70 CCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 + chr2L 2057819 5' + 412 62 2 66.92 CCATGATACAAAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCA:1 + chr4 868612 5' + roo 8698 2 61.54 GGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3L 20061457 5' + roo 8703 2 56.16 GTTTTAGAGTGTGTTTGCGGGCACCCATTGGCCATAATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGGGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTT:1 - chr3L 17268367 5' + hobo 33 1 61.64 TCAAGGCATGGCTATTGTTTTTGTCGCGTTTTCGACCGAATTATTTGCATCTGAAAACCCACTGGTGACAATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATA:1 - chr3L 7389815 5' - roo 9025 2 53.42 AAGATAAGCGCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 13259799 5' + hobo 19 1 66.93 CAGGCCAATTTAATTTTAAACTGTCGCTAATAACTTTCGACCCAACAGTTGCCAGTGGGCGATAAACTAATGAATGTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTA:1 - chrX 14735840 5' - diver 6047 2 50.68 ATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAACAC:1 - chr2L 20852511 5' + Tirant 62 2 78.07 ACTCGAGGATTTACTTGTAAATCGAGGATAACTCAGCGCTAAACACAGACAACGCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGGAGACTTTACTCGTT:1 + chr3R 18832306 5' - roo 9060 1 72.14 TACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGG:1 - chr3R 15727960 5' - 1731 4596 1 58.22 TTTTTCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 - chr3R 19094269 5' + P-element 69 1 38.36 AACTCAAAACTCTTTCACGATAATCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAT:1 + chr2R 14385609 5' + jockey 8 1 54.00 AGCAATAAAACTCCTCCATCAGCAGCAATAGCAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTCTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 + chrX 20361906 5' - hopper 1408 2 78.57 ATGGGCACTATTTTGTCTGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAAT:1 - chr2R 21796113 5' + roo 52 2 58.21 TTGCCTTTCTATACATGCAAGCATTTATGTAAACAAAACTTGTCGCAGCTTACTTAAGCGCAACTTTTTAAGATACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATT:1 - chr2L 8536629 5' + Juan 4055 1 59.23 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGGCTAACTAACTGAATGGCGCGCATTT:1 + chr2R 8981355 5' - mariner2 31 1 80.70 GAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTG:1 - chr2R 24427620 5' - 1360 3325 1 61.64 TTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACA:1 + chrX 12979415 5' - transib2 2791 1 63.01 CATTGTACAAATTTATTCAACTGCGACCTGCAACCTGCCAACTGAAGGCGACCTGTGTGGCATGTGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTA:1 - chr2R 22958000 5' - hobo 2905 1 56.80 TGCTAGGAGGAAATAAGGGGGAATAACAGTTTTTTCACAAATAGAAAAAAAACTAACAAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCG:1 + chr2L 3892921 5' + 1360 5 2 81.38 ATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 5704213 5' + 412 50 2 55.71 AAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTG:1 - 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chr3R 20887500 5' - Doc 4615 1 56.16 TCTCTCATCTCCGTTAAAGTTGCCCATAGTGCCGATAGTAAATGTTATACCGCCATCGCCTTTGCCCCAGGAGAGTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGGAAGATCCTAATCTTCACC:1 - chr2L 6637488 5' - 1731 4578 2 52.74 CACTGTGCACGCAATGCAGTTTGACTTAAACAAAATTTGACTTAAAACTAATATTGGTTAATGGTTTTTTTTTAATCGATCAAACTTATTACGGCGATTTATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTG:1 + chr3L 14231701 5' + diver2 367 1 64.58 GTCAGTCTACGAGCTTCTGTTGCCTACATAAAACCAAAGACACTAGAATAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCATTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGC:1 + chr2R 947050 5' - 1360 3309 1 76.15 GAAATACACGCAGAAAAGGTCATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGT:1 - chr3R 20983941 5' - hopper 1340 1 70.55 AGCCAAGCGTGGTCAAAGGACTGCAGCAGTTGAGCACAGAGGGCAGTAGGCAGAGAATTGGAGGAGCAAATTGAGTGAGGGTTTACTTACGCTCTCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAA:1 + chr2L 6637344 5' + 1731 57 2 65.75 ACAGACATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chr3L 14422684 5' + roo 8682 2 53.85 GGGTGAGGACGAACAAGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - 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chrX 17792647 5' + roo 33 2 61.64 GTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTAT:1 - chr3L 6131922 5' + roo 8733 2 67.12 TGAGATTACTGGTTTTGATTGAGGACAGCTGAGTGGCTAGCATTTAATTCATATTACTCGGTTTGCTCTTCTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr3R 25852681 5' - gypsy2 403 1 81.18 CGAAAGTGCCGATAGAAAACTCAATTAGGCAACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGC:1 - chr3L 9324589 5' - HMS-Beagle2 287 2 67.12 GTGTATTAAGACTAATGGCCGAGAGCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGACGTA:1 + chr3R 7049311 5' + Burdock 6153 2 73.97 ACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 - chr3L 2966528 5' - roo 8993 2 71.03 CATCAAAAACTGTACGGCATGACTATAATATTTAACTTAATTAAATTTGAATTATTTAATTAAAAGCCCGCTTTTATAAAACACAAATAATCCTTTGCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chrX 5842044 5' + roo 23 2 69.18 AATACGGCTCTACTCGAAGAAGTCTGGCTTTAACTTTGCGAATAAGAGATGCGGAAACGACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCA:1 - chr3R 7074936 5' - P-element 2874 1 75.18 TGAGGAAGAAGTTAAAGTAGCGGATATTGGTAGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTT:1 + chr3R 31159216 5' - hobo 2889 1 68.81 CACTGCTTCTGATCTATCTGATCTCTTCCTGTACACAAACACACACATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGA:1 + chr3L 17011957 5' + 1360 75 1 69.86 ATTTAAAAGGTTCCACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATATTAAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCA:1 - chr2R 6493186 5' - transib2 2757 1 59.59 CTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:1 - chr3R 31112278 5' - mdg1 361 2 60.27 AAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATA:1 - 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chr4 868760 5' - roo 9034 1 59.59 TTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr3L 14422823 5' - roo 9004 2 65.75 CCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTG:1 + chr2R 23094889 5' - 412 7477 2 73.13 ATTTGCCATCAAGCAAATAAATCAAAAGCTTCAAAGCAGATCTCTGGCTTAGCGCGCTGCGCTGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 + chr3L 22330930 5' - hopper2 1552 1 56.64 TCACACACAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGAT:1 + chr3L 19274803 5' + transib2 74 1 68.97 TGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTTGCCTGAAATAGTTCTTAT:1 - chr3L 11684896 5' - Bari1 1621 1 74.66 GTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chr2R 18887059 5' + roo 60 2 64.75 ACTGCAGTGAGCGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGGTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 + chr3L 7751056 5' + 412 71 2 75.20 ATTTATAAAACTCACAAAACACTCAAAAAGAAATACATACNCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTANTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAA:1 - chr2L 18181267 5' - blood 366 2 74.66 GGGAGGAAATGCCCCGCCACAGATGCGAATGGGTATGGCACCGCCACAGAGATTGGCCATGGGCGGTAAGAACACAACTAATTAAATGCGTCTAAATACATTTGCCATCGCCCAAATCGTTCTCTGTCTAGCTTTCTTAT:1 + chr3R 4486624 5' - Tc1-2 172 1 57.86 AATTCCAGATTCGGAGTGACTCAGTGAACTATAACTGGCATGGAGTACGTGATTAGAATGCCGGAGAAACAAACACTGTCCCAAACATGGCCTTATCCAACTTAAAGTTACGACAATATAATTAAGTATACTTCTGGGA:1 + chr2L 1239743 5' + Tc1-2 401 1 74.82 GATTTAAGTTTTCATGTTCATGGTTAAGGCCAAAACGCATCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATT:1 + chr3L 7389723 5' + roo 8731 2 72.09 TGTATGCTACGAAAACTTCACTCGCCCAACAGCAGTGTTTTCGTGTGGGTGTACATACGTGTGCATGCATATACTGCCTGTCAATACATATATGTGCTTACATGTGTGTGCGTGTGTGTTTAGGCACACA:1 - chrX 7154185 5' - G3 39 1 77.69 ATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCC:1 + chr3R 16630273 5' + FB 54 1 60.77 AGCCAACTAAACCAGCAAAAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAAGAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGC:1 - chr2R 14532103 5' - invader4 3061 2 69.86 AACGCAAGCGGTGCAAAATAAGTGCAAGAAATGTGCTAAAAATGCACGGAAGTGCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACCCAGCCACGGCAAAAACTAT:1 - chr3R 12079702 5' - hopper 409 1 65.00 GGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTC:1 - chr2L 13033413 5' - hobo 2937 1 66.28 TATCGGTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGTGTTAAATAG:1 - chr2L 8120236 5' - roo 9009 2 65.07 TGGCTTTTCCGTTTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:2 - 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Porto1 160 1 76.39 TTGTGAATAGGGTATCTGCTAGTTCCATAATCTCCTTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTT:1 - chrX 860861 5' - hobo 2886 1 66.38 AGAGCCACCTAATTGGAATTTAAGCTTGTGCTGGTAATTAGTTTACAAGCAGCATGGCACAATTGAGTGAATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chrX 6538767 5' - pogo 2056 1 53.52 AGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGT:1 - chr3R 21794121 5' - hopper 1332 1 73.79 CAGCAACAGCCTTTTCTATCTTTCTTTTAGCTGAGCGATTGTTTTGCTTGCAAACAAGCGCTTGTGCGCACGGCACTCTTAAAACTAAAGTCTAATCTTATTATACTAAGATTTGAATAATTATTGTTAGTCTCACAAA:1 + chr2R 4561328 5' + Doc2-element 4725 1 76.26 TAAGGGTTTCCCCAGAAGCAAGGCAACAACAACAGCTGCAGTGCGGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGCATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATT:1 + chr2L 20852457 5' - Tirant 321 2 73.29 CCGACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATAC:1 - chr3L 4547793 5' + mdg3 5292 2 55.32 GAGATTTTGAATCGATGTGATGTGTCCAAGATCACGAAAGTGAATGAAAATTAGAGAAAATTGGTTTGGCACATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGC:1 - chr4 909158 5' - 1360 3303 1 53.54 TGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr3R 10714256 5' + 297 6634 2 58.62 GCGGAAGAAACGCGAAGGGAAGATGCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chrX 8346392 5' + roo 78 2 79.84 CTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2R 14884085 5' - roo 345 2 60.27 TTTATCTCATAAGACCTTTCCACCGATTGCTCCCGTGGATTTTCGCCAATCCTAAGATGAGATCCAGCTGCGACACCGTGGGTATCGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAA:1 + chr3R 25158560 5' - 1360 3381 2 68.38 ATAAGCCGAGACCTTGGCATTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3R 12622147 5' - 1360 3368 1 68.89 ATCCTTCGCAAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAA:1 - chr3R 21794135 5' - hopper 1345 1 64.38 ACGATCTTGGTGAAAAGTGAATTACTACTATTACTTCTACTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCATCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCT:1 - chrX 20284512 5' - roo 8989 2 71.92 ACGTTTGGTTTTCCTTCCAGCAACAAAAAACAACAGCAACACAACTGCTCGTGTGTGTGCACACAACGGCGGTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 + chrX 2300554 5' + P-element 47 1 51.37 GAATCTTGTGAGCCAGACAGACCTTGCTGCTTGAACTTGCGACAAAGTGGAGCAATGACTCGGATTCTTTTGCATTTCACCACTTTTACATACATACATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 + chr2R 9750104 5' - opus 7485 2 74.48 GGTGCTAAATTTGAAAAGACCCCAGTAAATTCCAAAGACCCTAGTCGGTGTTATTCGTTGGAAAAATCGATCACCAGGATGCAGCATAAACACTAGGGAATGGTATAGTCGACTTCCCCGACTATCAGATATCCG:1 - chr4 919436 5' - INE-1 555 1 62.22 CAGCATTCGTTTATGCGGTTATGGCAGTGTTTTAACAATATTTGTATTTCGGAAGAGCATTGCTCATGGATTCTTAAGATTAGGAAAAGAGAGAGCAAAGAGAGCAGTCAGTCGGGCTTTAGGATGTTAACAAGAACGGCTAAGTG:1 + chrX 22578692 5' - 17.6 191 2 60.27 CCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCC:1 - chr2R 5621040 5' + ZAM 7977 2 63.64 ACTCAGGCGCAAAATGCATTTTCCAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 14415575 5' + 297 6602 2 71.23 AAAATAAAACCGTGTCTAGGGATCAAAATCGGGATTGGAAAAATTCTATTTTTAAATTCGTTAAACAGCTGACAGTCAGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTA:1 - chr3L 13993680 5' + P-element 24 1 64.57 AAGTTATATTTCAAGACAATGAGTTTGATATAAAATGTAAATGTATGCATTTTATATCTTATTCCACCAAATTATTTAAATTCTTTGCCTTGACTGCGAAGACACAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chrX 8346282 5' - roo 9054 2 71.92 TAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATG:1 - chr2L 15085729 5' - opus 7443 2 62.50 ATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 5027162 5' - roo 9024 2 51.03 CCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTAAG:1 - chr3R 12613837 5' - HMS-Beagle 6959 2 77.86 GCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACGCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATC:1 + chr2R 13090887 5' + I-element 85 1 73.97 AAGGGATAAAATCTAAAAAATTCCCCACTATCAATACAGACTTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCG:1 + chr3L 12890304 5' + hobo 15 1 60.00 TTAATCTGTTTGCTGTATACACGTTTATTAAATTGTTGATAATGCAACGAAATGAATTGGAGCTTGCATTTTATTTTCGCATATGTTTCTAGGAGACTACAGCTCTATTTGAAAACCCATTTTATGAAAGGCGGTCGATTAAGATA:2 + chr2L 17550606 5' - Transib-N1_DM 448 1 78.08 GAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATTGATTAAAACACTTTTTAA:1 + chr2L 18525621 5' - pogo 1902 1 60.27 GGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAATGTGGATCAA:1 - chr3R 10148808 5' + 17.6 7004 2 75.86 AGGGTTAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCAG:1 + chr3R 23020784 5' - INE-1 562 1 64.38 TTTTTGACAAATCAACAGAGACGTTGAATAGCCTTCATCTACAAGATGCATACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGTTGACATGA:1 - chr3L 13292058 5' - roo 9000 2 65.75 CTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGGGTA:1 - chr2L 544900 5' + Doc 86 1 76.03 CTGGAGGCACTCCATCCGCTGCCGACTGATTGCGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCAC:1 - chr3R 12619898 5' - 1360 3359 1 51.05 TCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAA:1 + chr2R 7314625 5' + blood 55 2 54.79 CAAAGTGCAAATCAAAGGTATAAAGCAGCGGGTAGCGGGTAGCGGGTAGCGAGGAGCTTGTTGAAAAGTCAGCAGCGTCATCCCCGCTCGCCAGGACTCTCGTATTTGGATTCAGATTCAGATTCTGATTCGGATTCAGATTCGGA:1 - 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17.6 7342 2 74.66 TATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAAT:1 + chr2L 20407760 5' + McClintock 22 2 63.48 ATATTTTCCATGCAGTCTTCGCAACAAGAGCGCGATATCCTTCGCAAGAGAGGAGCTGCTCAGTTAAGTTTTGCGGTCGATGTCGGCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACNAGTATG:1 - chr3R 21794171 5' - hopper 1381 1 60.96 ACAAAATACTTGCACAGCACACGGCTTTGTGCGATACTTGGCTAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTCCAAAAATGTGCTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 - chr3R 11937855 5' - hopper2 1542 1 60.14 CGCTCCTTCAGCAAAAATCTTTGATGTGAGATATTTAGAAAACTGTTTAAGAAATTCTTTTCCAATTCCAATACTTCTGATATAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGCTTTTAATAAGCG:1 + chr3R 4562711 5' - mdg1 7388 2 51.75 ACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTGAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGC:1 - chr2L 21645249 5' + 1360 27 1 60.48 TGAACTGACTTAAGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTNCAATTCACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTNCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTC:1 + chr3L 15393667 5' + pogo 43 1 50.00 AGCCGCTTGAGCAGTGGCAACAACATGAGGCACTGGCTTCCCACACCGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCAAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTCAATTTTTATGTCAATATA:1 + chr3L 19274765 5' + transib2 37 1 57.53 GGGCCGCGTTTAGCGTGTAAATTCACTCTACATTCCCGAGCCGTTACAATTTTTACTCCTTCAGCAATCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 - chr2L 6149203 5' - hopper2 1552 1 54.79 TCAGTGTAGCAACATAAGAATGTTAAAAAAGCCACTGATACTTCTTTAAAGTTTATTATAAAATAATATTATTTACTTTGTCCGATGGGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAG:1 - chr3R 4962656 5' - jockey 4710 1 58.90 CAGGTGGGGTCAACAAAATAACAGAGAGTTGCCCTTGGGGCAAACAAGAAAAATCCGAATGTTATGTTTGACAATTTCAAAAAAAACATACAATTAATATTTGCATAATTTGCATTGCAAAAAAAAGGTGTTTTAATCAATGCACC:1 - chrX 14153998 5' + pogo 1906 1 84.25 GTAAAGCAATTAGAATCGTAGGATTTATAAAATAAAAAATTTATAAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAA:1 + chr3R 17421193 5' + pogo 24 1 61.94 CGATTTTATTCTATTAACAACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAG:1 - chr2R 17493225 5' + BS 4809 1 71.03 TGTATATCCTGAAAAATTCAGCTTGCCTTCTGGTCCCTTGCCCTCAAAAAATCCTTGGTATTTGCATGGTGCAACAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCA:1 + chr2L 11867275 5' - hobo 2934 1 69.52 CAGGCGAAATAAAGAGCCATATCCCTGTAAAACATCATGCGCGATTCAATTCGATTCGATTCGATTCATTGTACACACCAACAGCCTAGC:1 - chrX 5509327 5' + jockey 4668 1 72.22 CTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 14884189 5' + roo 56 2 59.59 TTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAGGGAAACATTAACTTAAGGGGAGTA:1 - chr3R 15668204 5' - G2 2994 1 80.16 AACCAAATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGA:1 - chr2R 4206659 5' + 1360 315 1 75.35 CACCCAACCACCCAGGTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCCATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGGGCAGCCGTCAGGCCACATTTTTACTTCT:1 - chr3L 23496631 5' - blood 7326 1 76.92 CCCACAGATTGCCATTGTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 + chrX 22679601 5' + Doc 37 1 61.31 GATAAAGTTGAGACCTTTGATGAATCGAACCTTCTCAATAAAAATAAAGAGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATT:1 - chr3L 15718206 5' - 1360 3369 1 71.53 TTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAA:1 - chr2R 943895 5' + F-element 74 1 63.97 GAAAGTTAAGGTGCTGAAAGTTGTTGTTTTTCGCATGCACATAAACTGCACTGTGCACTATTCTCTCGCTCTCACTATCTCGGTCTTTCGCTCTCCCACACATCATCTAAATTTCTGAGCGTGCAGACTG:1 + chr2R 4613668 5' + Cr1a 332 1 73.08 AGAAGGGGATCGACCCACGGCTGCCACTTTTTAATCAAATTATTTATAACAAATGCCATTTAAATATCTATCTCTGTATATTTTTATAACCATTACTCGTAGATTCTGTATAAAGTGTATATATTCTTGTTCAGGATCA:1 + chrX 15408650 5' + INE-1 81 1 69.06 CCTGGCTAAGCTGCTGATCTTTTAAGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACA:1 - chr2L 4245036 5' - 412 7541 2 76.03 CTAAGATCCACAGTGGTGTCCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTC:1 + chr2L 15874828 5' - mdg1 380 2 57.53 GGGTGAGCGGGTTTTTTCCACATCCATTTGGAAATCAGGAGGAATGAGGAAGCTGGAAAAAATAGCTTTATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 - chr2R 20972734 5' - jockey 4948 1 52.14 CCATTTATAGACTTCTAGCGTGTGACGTTATAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATCAGTAAACTTAGGACCACCCTA:1 - chr2R 1921480 5' + mdg1 7135 2 78.08 TTTTGCTATCACGGAGTCCATTACTTGGCTCTAGATCTTTATCTGTCTTAGACTTTCCTGTGGTTTCCTTCTTGTCTCTTTTGGAATTCAATAAAGTCCTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAG:1 - chr2R 13847924 5' + 412 7077 2 65.07 TTTCAAAAACAGCCTTTTCGATTGACTCGAAGCTAACATCTGTACGATTTTTTTGGTCATATATGTATGTACATATAGATACTAAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATT:1 + chr2R 14531934 5' + invader4 2790 2 66.44 GCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chr3L 7848498 5' + jockey 81 1 73.85 CCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTGTACAGTGCAGTTTGCACAAC:1 + chrX 22679660 5' + Doc 104 1 65.52 GCAACCTGCCAACTGAAGGCGACCTGTGTGGCATGTGTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chr2R 22957971 5' - hobo 2893 1 73.15 CAAGTTTGAGGTCTACGAATGATATACATATGATCGCGAGATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGGGAA:1 - chr3L 20224277 5' + Chimpo 20 1 71.23 AATATAGAAAATAATTTAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 19075822 5' + TART-B 10627 2 85.71 GAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2R 16274625 5' + roo 8742 2 73.29 TATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGT:1 - chrX 13060268 5' + Tabor 6921 2 74.48 TTAGAATAAACGCTCAGACCACCCACACTTAGTGTTTTACTATCAAAGATGTGTCTTTGCATACATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGGTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAA:1 + chr2L 21198155 5' + flea 40 2 57.04 TTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAAC:1 - chrX 2214314 5' + jockey 4577 1 62.28 GCCCCGAAACGAACGGTAAATCCGAGCGCTGGCAATCCGAGGCGTCGATTGTGGGTCTGTGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr2R 23444048 5' - P-element 2829 1 43.97 AGCGCGGACCGGACGCCACACTGCGTATGATATTGCGCAAACCGTAAGTACGGCGGCTTTAATGGGAATAGGGTTTAGGGGTAAAAAATAAACCATTTAATGTATATACAGTATAATTCGCTTCGCTGCCTCG:1 - chr2R 6768143 5' - pogo 2097 1 77.44 TCAACAACAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGT:1 - chr3R 4527272 5' - mdg1 345 2 69.18 TCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTG:1 + chr3L 9324476 5' + HMS-Beagle2 6968 2 75.86 GAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGAAGATT:1 + chr3R 11756752 5' - Tirant 321 2 69.86 ACCTAACTAAATATAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3L 15148548 5' - roo 396 1 72.87 CTAGTGACGGTGTTGCCTTGACCCCGAGAACGCCAAGCCAACAACTTACACTGGCTCATCAACTCTGGTTCTCCGCTCAGCCTAGATCACAAGGTCTTGCTCTACAATTCTATATTGAAACCAATCTGGA:1 + chr3R 18456469 5' + F-element 4247 1 73.85 TCGTTTTTACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTACACTGCTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATGTAGAAGCGATGAATCAATATAATGCAATAACANTAACATAACAGCGC:1 - chr3R 19950549 5' - BS 5048 1 50.00 ACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGTAAG:1 + chr3L 11684853 5' + Bari1 53 1 76.24 TCTTTTAGAAGATCCCTTGGCCAAACAAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGTTGAGCAATCGAGTG:1 + chrX 8681375 5' + jockey 14 1 78.77 ACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2L 8120209 5' - roo 318 2 84.93 AATATTTAGATACATATACTCTGTACTTGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCT:1 - chr3R 23644962 5' - diver 6051 2 56.85 CCACGCCCACACTTTTCAAAAATCGGTTGATATTTTTGTATATTTTAATTAGTCTTGTAAATTTGCATCAATTTACCAAATTTGTTTGTTACGCCCAATCTAACGCCTTGTAAATAGTATTGTAAATTTCTATCGATTTGCAAAAA:1 + chr4 1221160 5' + INE-1 309 1 40.41 TAAAAAGCTCTAGCGTGTAACCATAAATAATTGTTTTTCAATAACGCTTTATCATTGTGGGTTGTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTTGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chrY 311342 5' + 1360 58 1 58.90 TGCTAACTCTGGCGAAATANGTGAGACGAGAAGTTTTTGTGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTCATGTGCACACTTATCGAATAAGCACTGTA:1 - chrX 8839435 5' + Tabor 12 2 76.71 GAATTACCATTTGAATCGGTGCGGAAAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 - chr2L 10461266 5' + roo 8697 2 63.01 TATCTCGCGACCGAACGCAACGAACTCCAAAACCGCACTGATCGCCAGCGATCTTGGCTGTCAGCAAAGAGTTGAAAAACTTTCGGAAGCGCTGGTTTTTTCTTGTCT:1 - chr3R 10686961 5' - rooA 439 1 80.56 GCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCACCGCCAAACGACCGTC:1 + chr2L 20761883 5' + Doc 458 1 64.79 CTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCGGCAACAC:1 + chrX 6891472 5' - hobo 2861 1 75.18 TGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 19965231 5' + jockey 83 1 65.75 CATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTT:1 - chrX 14360822 5' + jockey 76 1 71.09 TTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACCATATTGGG:1 + chrX 8968574 5' - 1731 4596 1 56.85 GATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGAGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTATTTTTTACAGTA:1 + chr3R 25798365 5' - hopper 1401 1 63.73 ATTTACGAACGGATCCTCCTTGGGCATGGCCACAGCGAAACTGGTCACACTGGCACTGAATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGAGGAGCCTTTTGTGA:1 + chr3L 11364745 5' - Tirant 384 2 73.97 TGGTTGTTGCCTTTGCTACAATTTTTGCACTTGCGTTAGCGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGCTGTTTCTGTGAGTGTGTTTGCACACAGATACAGGCTTATGTGCTCGTGTTTTTTCCCCATTTTTTTTTTCTTTTT:1 + chrX 3761387 5' + hopper 138 1 61.87 CTTCCAAATTTATATATAAATTTTATATTTCTTTCATATANTAATAGGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACNTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 - chrX 23431595 5' - roo 9041 1 57.69 CTATTGTGTCAACAAGGAATCAGTTTCCCAAAAGCTGCACATTTGTTTTTATTTTTAGTCAAATACCAAGAAATAAGTCGATCCAGACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGT:1 + chr3R 16187744 5' - mdg1 7423 2 57.53 AAGTAAAAACCTTGTTCTTATTTAACGTTTATCTGGAAAAAATTATCACATTGCAAAAACCTTGTTTATACCCTTGCATTTTCGTAAGATATTTCTTTTATTTTGGTCCATGCCGTTGGCATTGTTTTAATGTAATTTTTTTT:1 - chr3L 8026713 5' + transib4 27 1 55.24 AGGGGTATCCCTTGTGGTTGGGCATGTCGGAGATGTGGGTCTCATCGAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr3R 17077830 5' + 1360 58 1 68.55 AAAAATTCCCCACTATCAATACAGAATTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCCACTCGCCCCGCACATCGCTGGT:1 + chr3L 12890319 5' + hobo 69 1 64.18 ATTTATCTAAGACTTCTTTGCACAGCGAGTTTCCATCCTTGAGTTCCGCCCCGACACAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAAACATAGAACAGTTGGAAAAATAATACAACTGTTCAAAAAATACTTGATATA:1 + chr2R 8388721 5' + F-element 4601 1 57.04 GTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3L 18846960 5' - 1360 3343 1 61.29 TCTTAGTTTTAACAACCTTATTTACTTTTTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCC:1 - chr2R 12185455 5' + accord 24 2 66.44 AATAAATCAANGAAAGGGAAAGGGAAAATCTCAACAACAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTCATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 - chr3R 4527302 5' - mdg1 375 2 52.74 TTCTTATCAGCTGCACATATTTAAACTGATGACGCCACCGATGGAAAAGCGAGGAAAACCAAATAGGAGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACAC:1 - chr3L 2907399 5' - 412 487 2 72.00 GTTATGTATGTGTGTGTGTATGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATTGATCACGAGCTACCATGCCAGCATAGCCTCGTCCCCCGCTACCTGAAACTCTGTTGCACCCGATGATGAAATCGGCA:1 + chr3R 22496255 5' + accord 160 2 58.62 CGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 27606609 5' + 412 60 2 62.77 AACTGAAATGGTAAAATGATGAGTACATTTCGTAATGCGTTTTTTTTTTTATACACTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chrX 3666604 5' + roo 64 2 64.83 GACAGATTTTCGGTTAATTCCAATACTCTGCTCCGGTCACTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1 + chr3R 7074816 5' + P-element 78 1 36.99 CTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTAACGGAGTATTAAAAGAAGCCAATACTGTATTCGCTGGACCTTTTATTTTATTTCGCATAATACCAAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chr3R 19450171 5' + roo 16 2 54.07 ATTATTTTGTATATCTTGCTGCAGCTCACTCTGTCCATTATTTACAAATGTGGATTTATTCAATTGAGTGAACGCCATAGTGATTTGTTCTGTCGCTCTCCATCGGCATTGCTCCGATGGTGG:1 - chr2L 13500340 5' - R1A1-element 365 1 74.80 TAAATTCCGGCTGGAAATAACACGCGCTAAACTGTTCAATAAAATTAAATATTTAATTAAACAAAATGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 + chr2L 18510718 5' + copia 4928 2 60.27 GAACGTGTACCTATTTCCTTAATTAATAAAGGTTTAAGGCATAAATGCACAAGGAAAGTAATACATTTAAGAAGTCTGACATCGCCTAGGAAATTCAGAAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 - chr2R 15392661 5' + mdg1 7058 2 70.34 TGTACTATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 26854713 5' + jockey 25 1 68.89 TCATATTTTGTATATTTGCCAGCGATTTTTTATCTACACTTCTCTAGGCGCTTCATTTGGGTCGTGCGCAAATCAGACTCCCACTGCGGCTCCCTTATTCATGGTTATACATATATAGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATA:1 - chr2R 11153282 5' + roo 3 2 74.66 GCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chrX 683611 5' + jockey 82 1 66.91 CGGTTGTTGGTTTTCAGTTTAGGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 - chr2L 512540 5' + roo 45 2 53.42 TTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCT:1 + chr3L 18463352 5' - 1360 75 1 57.86 AACAAGGACAAGTTGAGCTAAATTAAGTGTCACAAAAAATGAATGAGGGTGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:2 + chrX 291962 5' + 412 7087 2 62.33 AACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr3R 20904965 5' - roo 343 2 65.07 ATTGTCATCGCTCATTTTTTGCTGTTGTTCTCGGGTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:1 - chr3L 13057492 5' + 412 7073 2 71.92 ATCCAAAGCGCACATTAAACTTTAAGAGAAAGACAAGACATTCATTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAATAAACTGGAATGCTGAATCTCAACTTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATATCGACTTTCATACGGACAGGCGG:1 + chrX 21097020 5' - INE-1 127 1 63.70 TGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAACCAATAAGCGACCACCATGCTTCTGTGGATCAAATAAC:1 - chr3R 10148804 5' + 17.6 82 2 73.29 GCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTG:2 - chr2R 17350623 5' + F-element 52 1 59.59 ATATTTATGAGTCTCTTCAAGCATTATTTCGATATTTTTAATATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAG:1 - chr3R 13423430 5' + 297 7 2 78.77 GACAACGAAGGCTACAACGACGCCCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chrX 19662922 5' - P-element 2859 1 65.07 GGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 - chr3R 26472887 5' + 1360 50 1 62.10 GCGTAGGTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr3L 6131928 5' + roo 8727 2 63.01 AACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 - chr2L 12236807 5' + jockey 82 1 76.15 GTTTGTTTAGTGGCGCACCTGAAGTCGGCCGAATGACGTTGTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTG:1 + chrX 15198016 5' + Max-element 8243 2 76.58 CCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCG:1 + chr3R 25580788 5' + 1360 44 1 67.96 ATTCTAGTATAAGCGTAACATAAAAATAGTTTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACGAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAA:1 + chrX 3666477 5' - roo 385 2 69.29 TGGCAGTCCTGTGAGTCCTCGGAGACCTGCGAGAGTCGAGCCGAGGCAGCAGCAGACACAACCATGTCGGCATTCAAATATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGG:1 + chr2R 12826949 5' - Burdock 214 2 56.16 CAGAAAGGGATTGGCAACACAAACCCCTGGGACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 13285709 5' + roo 8686 2 67.91 GAAAGTTGTTTATAGAAAGTATACCATATTTGAAGAGGTTCGTTCCATTGTGTTGCTCAGAACAAAAAAGGCTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGT:1 - chr3R 12948711 5' - Stalker4 7314 4 52.74 GTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCGTGTGCTTATCT:1 + chr3R 26854773 5' + jockey 97 1 77.40 GTTATGGGTTTTTAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGCCCAACCCAGCCACTTCCATTATTTCAA:1 - chr2R 10411411 5' + 297 6606 2 77.78 TATGCTATACAAATCTCAGCATGGTGAGTTCTTAGCGTTTACCATGAACATGAACGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGT:1 - chr2L 11475194 5' + jockey 146 1 45.21 AAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 - chr2R 21713295 5' - P-element 2794 1 17.14 TGTGCGCCACTTTTATGTGTGAGATGAGAGAGAGAAAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGG:1 - chr3R 6419966 5' + Tabor 6868 2 56.16 TACAAGGTTACGGGCTTCGTTTTCGGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTT:1 - chr3R 1844843 5' + Cr1a 177 1 63.70 GCGTATGCTTAATACGATTTGGGCCCAGCCATCAGATAATCACTGGGTATTTCAGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr3L 6050147 5' - 412 7479 2 63.01 TGTTGCATCAATGTGAAGGAATTTCTTAATTGAACAAATTAGGCAAACAATAAATTTACTCAGAGCCCGTCTCGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATATGCCAAAACAAGCTGTTAAAATTAATAA:1 + chr3R 20834929 5' + Juan 3879 1 54.79 CACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 + chr3R 26927410 5' - roo 8981 2 81.25 TATTATACATAGTATGTATGTAAGTGGTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGC:1 + chr2L 20761850 5' + Doc 418 1 62.22 CTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCA:1 + chr2R 7720057 5' + HMS-Beagle 48 2 52.74 CTGGGATCATCTCCATGATGCCAGCCATGTGGTCTATGTAGTTGAATATCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACC:1 + chr2R 8442644 5' - blood 7337 1 66.40 GCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 - chr2R 14532076 5' - invader4 3034 2 52.74 GATTATACGTATCATAAATGATCTTATCCATCAAATAAAGACAAATAGGATATTCGATAAAATAATATTCATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACT:1 - chrX 20145644 5' - Bari1 1682 1 64.38 AGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCT:1 + chr2L 20407757 5' + McClintock 50 2 59.59 GATATCCAACAACACATAGTTTCTTGACTAAACTAAGTTCNGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTANCAGAAACATACAAGCGCAATTAACATA:1 + chr3R 10030711 5' - BS 5038 1 55.81 GTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGGTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 18887049 5' + roo 75 2 71.53 ATAACTTCATTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 + chr3R 19514219 5' - blood 7341 2 53.79 ACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 - chr4 868731 5' - roo 9005 2 64.38 CCTCATCCTTTGTAGCATACTTTTTGGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 - chr2L 13033438 5' - hobo 2925 1 66.67 TTGTATCCTTGTTGACGTCATCGAGGCAAACAAATGAAGTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 + chr3L 7848421 5' + jockey 18 1 73.10 TGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 + chr3L 2532459 5' + blood 7094 2 76.71 GAAGAGTATTTAGAGTACAAGGATTATTAAAGTATTATTTTACAGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTC:1 + chr3R 13406376 5' - pogo 2077 1 69.18 TTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3L 7848475 5' + jockey 74 1 60.96 TAAATTGATTTGATTTTAAATAAATAATGCAAGCCATAATGATAATTATTGGTGATGAAGCCACTTATTTATTACCTATCATATAGTACGTGGATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATT:1 + chr3R 17605321 5' - flea 4991 2 62.33 AAATACCTGAAATATGCTTACAGGCTTGTAGACACACACACACCCATAAATACACACACACACACGCTTTTACGATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCA:1 + chr2L 6149101 5' - hopper 1389 1 48.00 TCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACAACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGC:1 + chrX 3533855 5' + 17.6 6960 2 62.41 AAAAATTGCAAAAACTACAGCGAGCGCATTGAGAATTAAAAAAGGCAAATAAATGTTTTAAGCAATTTAAATTATTATTAAATCTCATTCCTCACACTCTCACTTGCTGAGTAACGTGTATCTGATAG:1 + chr3R 7467010 5' + INE-1 547 1 80.47 CCCAGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATC:1 - chr2R 4261981 5' - invader4 238 2 48.61 AGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 + chr3L 22320147 5' + jockey 60 1 52.05 GTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 - chr3R 11285006 5' + blood 7045 2 57.36 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGATTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGA:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 159 2 55.86 CGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTT:1 - chrX 21443053 5' + Transpac 67 2 60.96 CCACTACTAAAAATCGCGATTCTGCGGTCTTAATCCCATAAAACACATACGCAGGGTTGTGTTTCTTACGTACCATTCACAGCCGGCAATCGTCCTGGCGATTTTGGTTTGGGCAGCCTGAATGCGACAAATTTGGCTG:1 + chr2R 5616849 5' - BS3 1342 1 61.87 CAATTCTCGATCCCAAATCCGTTTTCCTCCCTTTTCCGGGGCATGTCCTTTGTTGGCTCGTCCTTTTTTTTTTGTTTGTTTT:1 - chr3R 30922075 5' - Doc2-element 224 1 75.61 CGCTGAATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr3L 1459854 5' + 412 89 2 82.88 AAATATGGCCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGAGCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr3R 10737101 5' + F-element 31 1 68.28 TAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chr3L 27415325 5' + transib2 38 1 55.64 ATATCCAGACAAAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATG:1 - chr3R 31264556 5' + BS 18 1 66.91 AGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAACCGCATCTCAAAGTAAA:1 + chr3L 20061368 5' - roo 8980 2 79.72 GAAAGAGATGCCTGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATG:1 - chr3R 6419942 5' + Tabor 62 2 57.53 TTTTGCATACTGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGCTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAG:1 - chr2R 12133880 5' + jockey 30 1 66.90 ATTTCCCAAAGATTATTGCACCAAATTGTTGATTGACATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 - chr3L 5027252 5' + roo 8749 2 74.66 TCTGCACCGGATTCACAGTGAATCACTTTACATCACTTCCTGTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTGACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAA:1 - chr2R 20052526 5' + transib2 21 2 68.49 TCTAAAACTACCATTCTTATAGCCTGCACTTATATAATTTTTCCTCAAGGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTT:1 + chr3R 25795954 5' + BS 5008 1 73.97 TTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr2R 9870998 5' - roo 8984 2 79.31 GCGGTGGAAGGAAGTGCCGGTGGAAGACTGGCCGTTCCGAGTGGCCGCGGAAGACGGGTACACGCGAATGTTTTATTATTAAGGGGAGGTCGTTAATGAATAAGGTAAAAAGAAGCGGACCACG:1 - chr3R 2894731 5' - Q-element 505 2 53.23 CTCTTTTTAGTGCTTACTAAAATTCATATATTTTTAACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTCCTGTTT:1 + chr2R 3338793 5' + Juan 69 1 62.33 TTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGGGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 12227789 5' + opus 7042 4 60.00 CAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGC:1 - chrX 21668393 5' - opus 7485 2 45.83 TCGTAGAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGAATGTAACATGCGTTTGCGACTATATAAAGTATATATATTCTTAATCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGCCGAGATCTCAG:1 + chrX 22651470 5' + INE-1 136 1 91.10 AATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr3L 14422806 5' - roo 8987 2 77.40 TCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chrX 8314516 5' - roo 323 2 78.77 AGCCTATGATCCAGTCTGGAATGGAGCTAAAGATATGTTGCTTTCATTTATGTCTGCACTCGCGAAAAATCGTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 + chr3R 19094122 5' + P-element 4 2 80.14 AGGTTGTTTTTTTGTACTATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCTCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCA:1 + chr3R 26854701 5' + jockey 24 1 71.92 TTGATCGTTCCAAGTTCACTAACAATGTTATTGAACCGGGAAGATAAGATATATAAGTTAACTAAAGCTAACGTCGCTCCCACGGGCGCATGAAATACGACAACATCGGCATACTGCAACGTAAGCCTTATGCCGAATGTCGATAC:1 - chrX 21667936 5' + gypsy2 6558 2 67.12 TCGACATTCGGTGGGGATTACAAAAGTGAGGGGCGTTGGAAAGGAGCAGGCAGCAGGCCAGTGGATGCTGTTTGGAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 + chr2R 14072449 5' - mdg3 5490 2 78.08 TGTATATCTATGAGGCTTGAAATAATGCTTGATTAATAGAAAAGTAATATAATATTTTTATACCCGTATACTCGTAGAGTAAAAGGGTATACTACAATAGATACGTTGAATATATATTGTAGAATACATATTCTTGATCAGGATCA:1 - chrX 22511437 5' + INE-1 81 1 50.00 GTAATAATATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCAT:1 + chr3L 15718052 5' + 1360 14 1 60.87 TAAGTGTGTGTGTGTGTGTGGTGGGGAATCCCCTGCCAACATCCATCTCTGCGACTTTTCTGGGGGAAATTGCTTTACACAATCGAAACGCACGAAATGACAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAA:1 - chrX 12591908 5' - I-element 5336 1 72.60 ATATGCAGACGTGTTTATCCGCCAGTTTTAAGGACTTCGCCGCTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTC:1 + chr3L 17268215 5' - hobo 2925 1 70.40 AATAGGATATTCGATAAAATAATATTCATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCCGATTT:1 - chrX 20145601 5' - Bari1 1639 1 64.38 TAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCA:1 + chr2L 10536480 5' + flea 4796 2 62.71 TGTCTTAAAGTACACAGAGATGTGAACTATTATTTATACCGTACGTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTTTTTTT:1 - chr3R 20200475 5' + Transpac 73 2 64.58 TCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGGGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTA:1 - chr3R 19094265 5' + P-element 40 1 46.02 CATTTTCAATTCGCATATTTTTGCAAACTCTACTTTCAGTTATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr3L 11364915 5' + Tirant 8133 2 65.65 ATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAG:1 - chr3R 6685815 5' + 412 7139 2 71.23 TGTGTCTCGCATACTATTAATCTATTAGTGCACGATCCCCTGAAAATAGATTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCC:1 + chr2R 6493286 5' + copia 64 2 66.67 AAAAAGTACAATAAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCC:1 - chr3R 18477849 5' - 1360 3315 1 65.07 TTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCA:1 + chrX 9165345 5' + jockey 4839 1 69.18 ATATCCCTTTTGGACTGAAACCAATCAGCGAGTGAGTTCCTGAATCTCGATCGATGTGAAGCTGCTTAGCGATATAGAACTAGGACACCGCCGATTAATCAGTATGATAGCCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGTTCTCA:1 - chrX 21587771 5' + INE-1 135 1 52.05 TCGGGCAAAAAGTTTATAAAAACCATTTTTTTCTATATTATAGGATTATTTTGATTTATTTTTGATAAGCGGAGATTATCTTTGTTTTTTAAGTACTATGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 - chr3R 25700262 5' + hobo 12 1 68.42 TTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCA:1 - chr2L 22780909 5' + HMS-Beagle2 88 2 79.31 CCAAGTTTTATTATGGCTGCATAAATCCGTTAACAAAGCCCCAGCCACCTGATGCCCAGATTTCCGTATATATATATATATATATATACATATGTACATA:1 + chr2R 13403481 5' - G3 4508 1 67.00 AAACTTTCATATTTGTTACAGGTTTTTATACCCGTTAGTCGTAGAGTAAAAGGATATACTAGATTCATTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAACGAAGTATATATAAAGTATATATATTCTTGATCAAGATCAATAGCCGAGTCGATC:1 - chr2R 5810562 5' + INE-1 96 1 72.60 CTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chr3R 12519702 5' - roo 352 2 58.22 CTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCC:1 + chr3R 12146648 5' + gypsy10 5672 2 53.64 TGTCATATCCAGACAAAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGCAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGC:1 - chr3R 31264560 5' + BS 11 1 69.12 GAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:2 + chr2R 15392518 5' - mdg1 7400 2 57.53 AAAGAAAGCAATTTGTCATGACATGATATTTTGTTTATCCAATCGATGGGCTGGGCGATAAACTTAATTACCGTTAATTAACTCTTTATAATACCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTA:1 + chr3L 9317944 5' - P-element 2859 1 68.28 GCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 - chr3R 17243240 5' - hopper 1387 1 62.59 CCGATGTTACAAATGTTGTTTTTCAAAACGCTTCCACACCTTTCTGTTCCCCAAAAACACTGCCGTCACATGTTCATCAGCTCTTTAGAATTTGAACGATAAGCGTAGTGGGCATTGTTAATCCCTTGTCCGTA:1 - chr2R 5064353 5' + accord2 7402 1 63.43 TATATTAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:2 - chr2L 12158874 5' + 1360 55 1 56.16 GCAGGAGTGGGAGCGGGAGTGGTTGTCGTGGTAGTGTTACAGTTACCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCT:1 + chr3L 4460918 5' - Doc 433 1 67.01 CAGTGGGGATATGCGTTATTCAATAAAGTTTTCTACAAACCTTAAGGAAGGTTTTATAAATACTGATCCTTGATGGGTTGTTATAAAAACAAACCTTCATATAATATGCAATTCTAAATTTAAAAAATTAAAAAA:1 + chr3L 18038259 5' + HB 318 1 80.74 AAATATGCTACAGCAAAAACAAAAAATTTGAGCAATATGAAGGAAGGGGAATGCAAATGTAAGGGCGGCAGCAGTAAAAACTGGGACACAAAGGGGCCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACC:1 - chr3R 7625440 5' + hopper 23 1 68.49 TGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCG:1 + chr2L 2493978 5' - Tirant 403 1 73.45 GTAGCTTGCCAAGTAAGATAAAAGCAAAATGTGTTGAATTTAACCATTCTTGCAGCACTTCTATTGTTTTGAACGTTCAAAAAATGACTGCAATCAGGGGATATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTTA:1 + chr3L 2317090 5' - 412 7527 2 64.83 ATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACCGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGT:1 + chr2L 8284343 5' + Doc 404 1 58.65 ATTATGCAATTAAAAGGCAATTTTGCCGTTAGCCCACACTGTGCTAGCGATTACCAAACACACAGGAATATAACAAAAACAGCAAATAAAAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTT:1 - chr2R 15391618 5' - mdg1 384 2 67.81 ATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCA:1 - chr2R 8286812 5' + Burdock 37 2 55.48 ACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGA:1 + chr2L 10536470 5' + flea 45 2 57.46 TTGGAGATCTGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCT:1 - chr3R 23021007 5' + INE-1 574 1 44.37 ATTGTTTAATGAATGTCAAGATCGACTTGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTT:1 - chr2R 11247083 5' + 1360 38 1 60.00 CCAAACAATAGAACCCTGATGATGTACAAGGACAAGGAAGGTGATCATAGGTTGGGCGGAAAAATTCTATAAGTTCTTTCCTGTGTTTATCTATTATCTTGCTTCCGGTTTCGTAAACTTATTCTCTTTTGTCGCAAGCTCGCTAA:1 - chr2R 4688203 5' + Gypsy12A_LTR 2102 1 78.08 CCACCAGGATCAAGAAGATGACGGAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTC:1 + chr3R 19506689 5' + mdg3 5257 1 79.03 TGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCC:1 + chr2L 15085640 5' + opus 162 4 67.80 TTATGTTTACTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCNGCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGNTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 + chr3R 12078600 5' - hopper 1362 1 54.11 TGTTAGGGGAGGTGCAGTTGGCAATCAATTGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCTCTCACGCTG:1 + chr3L 28030026 5' - 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chr3L 20224193 5' + Chimpo 7 1 71.43 CTATTGAAAATTAATATTACTATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAA:2 + chr3R 12764667 5' - copia 232 1 69.18 GCTTCTCTACTTAGACTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chrX 22862389 5' + jockey 62 1 54.79 TTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGG:1 - chr2L 15085754 5' - opus 7486 2 67.46 TTAAAAAAATATTTAGATACATATACTCTGTACTTGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTT:1 - chr3R 23644969 5' - diver 6058 2 52.74 AAGGCTTACAAAGAGATATAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCC:1 + chrX 13090981 5' + P-element 5 2 80.82 ACACAGCACTTTGACACAGCACTTGCTACAATTCTTGAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCAAAAGGCAAAGAATCTCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAG:1 + chr2L 23325713 5' + Bica 498 1 70.16 TAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 - 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chr3R 19506811 5' - mdg3 172 2 67.59 GATTTAATTAGAGACAGTTGACATAATCAATTTAAGTTGGTTTGAATGAAAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGATGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr3R 31114273 5' + flea 4794 2 55.65 TCGTGTTCTGCTCAACAGTTGCCCAGACACACACGAAGCCCTATACATACATACATACATAGATATGTATATCGAATCACTATACATCCAAATACATATACAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGTGGGTCCAAACCA:1 + chrX 7851213 5' + 297 6587 2 77.62 AACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGG:1 + chr3R 25580772 5' + 1360 59 1 63.43 TGTTGTACTCACGACCTTAAAATATCCACTCCATGATGCCCATAAAGTTGGGCCCAAGCATACGTTGACATTGTCGAGTGATGCAAAATCGCGCACTACGACAAATAACCAACTGTCCCT:1 + chr3L 23797671 5' + Helena 1150 1 52.50 GGCATATTTTGTCAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCAAGTTAACAACTAACAATGTATTGCTTCGTAGCAACTAAGTAGCTTTGTATGAACAATGCTGACGCGCCAGAATTGGGTTCAACGCTCCACGCGAAGAATGCCT:1 - chr3R 4571527 5' + gypsy 7069 2 72.60 CACCCCTTTCACCACTTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGACACTTCCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTGTTTTACCACTCGACTC:1 - 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chr2L 9384978 5' + flea 4640 1 69.57 CTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATATATTGGAAATACATTAAACTGTTA:1 - chr2R 11778051 5' - hopper 1330 1 69.18 TTGCCGCTTTGCGGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCATGCAACT:1 - chrX 10725104 5' - pogo 2064 1 57.53 TGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGCTCATTCAC:1 - chr3R 2689438 5' - diver2 4466 1 62.71 TAAAAGTCATTTAGGGTGGCTCATTAGACTGAGCGAAATTGGGTACATACTTTTCGAAAAAGTTGAAAATATACATCAGCTTCATATATAATTAATATAACTGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCA:1 + chr3L 7787434 5' + flea 4780 2 69.18 GCTGCACACTCATCAGCTAGGCACACTTCAAAAATGCAGCCTGACCCAAATCCCTTTTGACTGTAGGCTTCATTTTGTTTTTGTCGTATTTTTGCGCTAGTTCTTTTAGTTGACTTATTTTTCTTTTCAATGTATAACATTTAAA:1 + chr3L 7175795 5' + Tc1-2 1408 1 72.41 ATTTATACATTGTATTCAAAACCAACAATTAACGGGGATACATGGCCTCGGCTGAAGTAATAATAGATACTTTTTAAGCCCACTATGTTTTTATTATTTAGATTGAGACATTAAAAAACGTAAAAATCAACAAATGCCGTCTTTA:1 + chr3L 21762990 5' + hobo 2529 1 58.62 GAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 - chr2L 10461230 5' + roo 68 2 64.83 GGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTGATCTGGCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTGACTGCCG:1 - chr3R 30569059 5' - mdg3 5419 2 68.79 GTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr3L 2966526 5' - roo 327 2 72.41 TAATATAAACCATAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATT:1 + chr3R 19450060 5' + roo 8684 2 63.70 GCGCACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTACAT:1 + chr3R 18832359 5' - roo 9011 2 61.03 CCCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTT:1 - chr2R 18887078 5' + roo 32 2 59.23 AAAAGATAAATGAGCACAACGGCCTGCTGTGTGTGTGTGTCTGAGTGCGTGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr3L 17500809 5' + Tirant 39 2 60.55 AAATGTGAACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTG:1 - chrX 21443062 5' + Transpac 52 2 52.86 CAAGGTAGAGAAACAGAAACCGAGATGACTTCTGGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2R 12462101 5' - roo 9036 1 60.96 TAAAAGCTGTCGTGGCATTTAGTAGTGATGGGATGTTTTTGAATCCAATAAGAATCACGCTATAAAGAGCGGCATTTGAAACGAATTGGGCAACAAGGATTCAGGGATAGTACCTGAAAAGAAACAAATTAAACTATATTAGTCC:1 - chr3L 22126106 5' + HeT-A 5770 1 72.41 GGTGTGTGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATC:1 - chr3R 12613867 5' - HMS-Beagle 187 2 58.22 TTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTA:1 - chr2R 19389440 5' + 297 6627 2 49.32 CCGCACTGTGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTG:1 - chr3R 12146756 5' - gypsy10 5941 2 52.52 TAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCAC:1 + chrX 3533886 5' + 17.6 59 1 69.86 GCCGTATCGCAGTCGTTTCAATTTGCATTGGAAATGGAGGGGCAGACATAAACTTGGCTAATGATACTGAAACTGAATCCGATAACGGCAACGATACTGATACTGATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATA:1 - chr3R 28749241 5' + mdg1 10 2 78.10 TGTTCAATATATAATAAAATAAAACTGAACTTCAAGTGTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAG:1 - chrX 2214358 5' + jockey 4566 1 77.40 ATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCA:1 - chr2L 3662027 5' + blood 83 2 73.97 AAAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCCATGAACTCCTTACACGTAAGA:1 - chr2R 25051883 5' + G5A 2701 1 74.66 TCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACC:1 - chr2R 5621041 5' + ZAM 7989 2 57.72 ACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATA:1 + chr3R 24480490 5' + blood 7088 2 77.52 AAGGACACGTTCTCAGTTGAAATCGAGAAACAGCACGTTGGATTGCACAAGTGCAGTGTGGATTGGTAACGAAAATTTACGCAAATGTACACACATACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAA:1 - chr3R 10148866 5' + 17.6 6946 1 71.92 GTTGGCTAATATTAAAATAGGATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGT:1 + chr3R 20200375 5' - Transpac 5191 2 48.89 AAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTA:1 - chr2R 11778077 5' - hopper 1357 1 53.79 TGTTTTACTTTTCTATTCGCATATCACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTC:1 - chr2R 4816982 5' - blood 333 2 55.17 GCAAATTGAAATTGTCGATTTAACATTTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATCGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 + chr3L 13285537 5' - roo 9055 2 71.92 CTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAANCAACAACATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGGAAGAAACTAATTTTATTTGNAAATATCTTCGGNTTAAATAGGTGACA:1 - chr3R 26242547 5' - roo 9003 2 65.07 GTGATATATGCCAGAGCCAGTTAAAATACTACCCAATTCAATGAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGATCTCCAAATAATAGTCA:1 - chr3R 13837261 5' - opus 7419 2 62.81 TGCCGTATCGCAGTCGTTTCAATTTGCATTGGAAATGGAGNGGCAGACATAAACTTGGCTAATGATACTGAAACTGAATCCGATAACGGCAACGATACTGANACTGATGTAGTATATACGAACATAATAACNATAATAATAACAA:1 - chr3R 28749242 5' + mdg1 17 2 73.10 TAAGGGTATAACGTATTATTATTGAGATTGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGT:1 - chr2R 12102069 5' - hopper 1397 1 69.18 CCACAGCACCTAACTAAATATAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 + chr3L 15148541 5' - roo 386 2 69.18 TTAGTAGATAGCGAAGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 + chr3R 23902147 5' + I-element 27 1 65.52 CAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCAT:1 - chr2L 20852536 5' + Tirant 8134 2 55.77 GACACATCCTGCAGCTGAGTGGACATTAGCTTGTCTTGGTTTTGATTAAAGAAGTCTGAAATATTCCACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTCAAAGACTTACAATT:1 + chr2L 8120090 5' + roo 20 2 71.92 ATAGATTTAAACTAAACCCAAGCTGAGGCGGGAAACCGCTGCTTGGAAAAACTAACAACAAAACTGTCAGGCTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGTGACGGCTACGACCGACCGTCCG:1 - chr2R 17373248 5' + gypsy6 7441 2 63.87 GGGAAAGGTCGACGACGACGCCATTCTTAAGTTTGACCGAAGACACTAGAATAACAAGACGTGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTCGGCGTGGCTCTAGGGGTGGCTCCAGGCTCTCTTGACTTTTT:1 + chr3L 26852645 5' + 1360 81 1 63.31 ATAAGGGTCAGTACTTTTTCTTAAAATGAAGAAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGGAATACAGATCTGGGGTATCGCAGCAAAATCCAACTACAACCGCATTCAGGTATTGCAAAATCGTGC:1 - chr2R 12253301 5' + BS 4724 1 77.93 TTCTGCGTTGCTTATCAATTTCGGCTATCATTACTATATACAAATTGCCTGGCGAGTTATATTTAGGGTACGACTATAGAACTAAGTTTATACATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTT:1 - chr3L 3861556 5' + micropia 19 2 68.75 CTGTATGTGCGTGCGAATCATGTTTTGATTTTGTTCGCCTTATGTCAGCCTTATGCAATGCGACTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCAC:1 + chrX 6891409 5' - hobo 2933 1 78.91 TTGGCTGACACAAATAGGCCGGACCGAAAAGGCAGCAGAGATCAGACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAA:1 + chr3R 27606562 5' + 412 7074 2 62.76 TCCCACGGATTTCGAATTTTCAGGGTACTGTAATCGAGTGATATGCGTCATCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACG:1 + chr3R 31198557 5' - Transpac 258 2 63.36 TTATTGTTCAGCAAGTATTTTATTTTCCTGGAAAACTATTAAAATATACCTACAAAGCGAATATATCGTATAAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCT:1 + chr3R 17531769 5' + 297 45 2 55.94 ACAGGTTGTACAGAATTGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACAAGCCACTTC:1 + chr3L 18216428 5' + 297 14 2 76.71 ACTAAATATTACATTTTTATTTCAAACCATAGACTCAATTATTTGTTGTATCTATAAAAGAGTGATTATTGTATATTTCGTCCGAAATAAAGTTATTATTTGTTATACCCGTTACTCGTAGAGTATGAACGTCGATATCTCAGGA:1 + chr3L 18072336 5' + INE-1 138 1 24.14 GTCAAGTGGGGCAAAAAGAAAAGAAAAAGTTCGTGGGGGGTGGGGAGGGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCA:1 + chr2L 3661948 5' - blood 332 2 56.92 TTTTGGAATATTTTTGGAAAATCACATAATTCAACACTCTAATAGGATAAAGTCTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAGGGTCATGCAACTCATAGTTAGATCTACAATGCTTCAAGATAAGGGATATATAGTTTCTGGTG:1 - chr3R 3752410 5' - Cr1a 4123 1 73.29 TCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 - chr3L 12890428 5' - hobo 2915 1 67.86 CAGACCAAAGCAAAACCCCACTCATGAGTGTTTGTCTTTTGCTTTCGTTTCGTTGCGTTTTGTTTCGATTCTCGCTTCTTGATGTCTTTGGTGGCTCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTC:1 + chr3L 12872955 5' + hobo 14 1 72.06 CCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTGATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3L 20061411 5' + roo 8745 2 75.35 AAATATACGCACAAGTTTCGGTGACTGGCCACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTG:1 + chrX 609330 5' + 1360 25 1 69.86 GCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCACGCTG:1 - chr3R 17077882 5' - 1360 3301 1 77.24 CCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chrX 10725077 5' - pogo 2037 1 65.07 CCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chrX 683605 5' + jockey 80 1 69.47 CCTTTGTGTAATTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTT:1 + chr3L 22320112 5' + jockey 22 1 70.83 AAACTGACTGTTTCCTTGCTTGACCTTTTTTTTTCTTTAAATATTTCAAGCACTAAATTTTAAGCCGGGCAATGGAAAATGCATACTGCGCACACAGTATTTTTTTTAATCGTTTATTAGACATTTAAGATTAAGATTAATTAAAG:1 - chr2L 22224601 5' - Rt1c 5395 1 50.68 AGTCAGATTAATAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACA:1 - chr2L 12236852 5' + jockey 26 1 64.17 TGAATTTATGGCCACGGTATATAGCAGTCAGTATCGCAGTCACACGGAAAAAATAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCAT:1 - chr2R 14072632 5' + mdg3 5276 2 63.04 CTCTGTGAAGAGTGGGGTTTCTTGCAACCGGAACCCGATTTTATAATGTTATACCCTTTACTCGTAGAGTAAATGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTGTATTACAGGTTTCTACAAAGTTTACATATTCTTGATCAGAATCAAT:1 + chrX 21130271 5' + INE-1 83 1 70.55 TATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTT:1 + chr2L 15874850 5' - mdg1 7396 2 61.64 ATTCGAGTTTAATTACAATTTAAAAAGAATCAGCTAACCCTACACAGTGCTTAAACTGTATAAATTTCGGGATAAACGCAGTATAAAGTCCTTTTTTTTTTTGTTTACAACGCAAATTTAAATAAAATAA:1 + chr3R 5194123 5' + HeT-A 332 1 58.46 AATACCCAAATTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCACGGAAGCTAG:1 + chr2R 20972627 5' + jockey 4679 1 74.19 TGGCAAAGCATTTTGCAGAATTGTCTACTTAAGTTTGACAATTTCAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATACACTTATGGACAAGACCAGAATACTGNCACACA:1 - chr3L 18549791 5' + X-element 89 1 67.12 CAGGCAACCAATTTCACCCACTAAACTCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTG:1 - chr3L 20680409 5' - 412 7523 2 67.36 TTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCGTTTGATT:1 + chr3L 414853 5' - 412 7474 2 64.38 TATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr3R 22320465 5' - roo 351 2 60.43 AATTACGTTCTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCA:1 + chr3R 20887369 5' + Doc 25 1 64.18 AGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCG:1 - chr3L 2167686 5' + opus 7166 4 66.14 CACAGCATGCCACATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3R 27606730 5' - 412 7515 2 62.50 GGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3L 15148577 5' - roo 9013 2 58.22 ACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:1 - chrX 21668394 5' - opus 484 2 46.85 TGTCATATCCAGACAAAAGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAA:1 - chr3R 31264560 5' + BS 21 1 66.44 AGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTTTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAATCTACAACAGTATAGTGAAACTTAAACACAAA:1 + chrX 22679652 5' + Doc 81 1 53.85 TTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCACTGGC:1 - chr3L 10033653 5' + blood 7142 2 34.93 TTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCG:1 + chr3L 12227776 5' + opus 141 4 58.12 GGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTT:1 - chr3R 10737084 5' + F-element 49 1 56.16 CCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTAACTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCA:1 + chr3L 2532420 5' + blood 7053 2 54.79 AAATGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCG:1 + chr3R 12376415 5' - HMS-Beagle 182 2 63.45 CAAGGGGGAATAACAGTTTTTTCACAAATAGAAAAAAAACTAACAACCTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr2L 3892934 5' + 1360 7 2 76.12 AAACAAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 + chrX 8681397 5' + jockey 36 1 63.70 CAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chr2R 8315485 5' - hobo 2907 1 57.50 AAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGAC:1 - chr2L 20852526 5' + Tirant 8139 2 59.60 GCAAATGCCGAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTAT:1 + chr2L 20628499 5' + Stalker2 2 2 45.83 AAGAAAATCAGGCACAAATACTAATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGA:1 - chrX 20949749 5' + jockey 4561 1 73.97 TTGCTGCGCCGCTGACTGTCCGTTGGCCCCGCTTTCAGTGAGCCAAATATGCAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chrX 18673659 5' + roo 8724 2 63.31 TAACTTAGAGTATAAAACTATAAGCAAACTGAGATCTAGGAGTATAAGTATTTTAGGCCTTCTGCTCGTGACAATGATTTGAGAGTCAGTAGGAAGCGTTTCCGACTACATAAAGTATATATATATATTCTTGATCAGGATCAATA:1 - chr2R 5213838 5' + INE-1 84 1 41.10 TGAGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 6015554 5' - roo 9047 1 58.46 TTGCTTTCATTTATGTCTGCACTCGCGAAAAATCGTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCAC:1 + chr3R 19094159 5' - P-element 2862 1 61.54 AAACCCAAGTGCACTTTTTAATTCATTTTGGATTATTTTCGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTGGAGAGCGAGAGAGCGGAGAGCGCT:1 + chr3L 25272549 5' + 1360 109 1 65.07 TATTACGGCCAAAACGAACGAACCGAATACGTGGCGACATTGCTAGCTAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 - chrX 15191440 5' - hobo 2893 1 60.83 CATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAG:1 + chr3L 2532444 5' + blood 37 2 57.39 GCAACCAGGCCGAGCTGACAATGAAAATTTTACGCGTTATCCTGGTCGTCCTCGCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 + chr3R 28014061 5' + roo 22 2 68.31 AATATTTGAAGGTAAAAAATCCCTGTTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACTCGGTGCTTC:1 + chrX 16998247 5' + diver 5901 2 60.96 GGATTATTTTTGTGATAACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGACATACGATTTTTTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATT:1 + chr3L 25272578 5' + 1360 78 1 76.74 CTACCGCATTTTAGTTAAGTAAGTATATTTTTAAATCTTTCATTTTTAAAGTTTTTTTTTTAAT:1 + chr2L 9646184 5' - P-element 2691 1 81.25 GCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTAT:1 - chr3R 6685832 5' + 412 7115 2 60.00 GTCTCATGGTAAGCTATGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr2L 8120231 5' - roo 340 2 71.23 TTACATATAAACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 - chr2L 4864507 5' - mdg3 5478 2 71.43 ATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCG:1 - chr2L 18181235 5' - blood 335 2 54.48 CCTCTTTGGATCCGGCGATTGTACCCGTATTGCGGTTGCAACCTGTCTTCGTCCGAATATATTAATTTGCTTCCTCCGATTTTGTTTACTATTCTTTTGTCGCAAGCACGCTCAATTTTCGATCTTATTCATTAATGTCTGTAGGG:1 + chr2L 21645588 5' + Gypsy12A_LTR 2134 1 69.86 CTTAAAAGCCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAACTAGGTT:1 + chr3R 13423275 5' - 297 6913 2 63.01 ATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGATTTCGGGCCCCGTCAGC:1 + chr3L 12227781 5' + opus 55 4 61.15 ATGCTTAAACAGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGATAATATTAATTAGAAATTTTATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3R 11516623 5' + roo 43 2 55.86 CATTTAAAAGACTTCAGACGTAAAAGTTGTTCTTCAGAGGCGCCTCCAGCTGATGGCGATAGGCTGCATCGGGTTCTGACCCGATTCTGTTCCTTAATTATAATGTGTAAAAATGTACAGTGAAGAGATTATGCTATCTTACGTGT:1 + chr3L 11837695 5' - G5A 2713 1 67.81 AGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chr3L 1463739 5' - P-element 2829 1 46.21 GATTTGGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCG:3 - chr2L 15085775 5' - opus 7487 2 72.60 AAAAGGAAATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGA:1 + chrX 6538617 5' + pogo 26 1 63.45 TATTGAGATTGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAA:1 - chr2R 12102050 5' - hopper 1378 1 56.16 TCCGGATAGGTTCCACATTGTTCTCCTTCTTGCTGATTTGGGTTTTCGCAGGGAACTCTGGATACAATGCATTTTTTACCAGATATACAGGCAATATCCTCACAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTC:1 - chr3L 12890439 5' - hobo 2931 1 78.52 AGCAAAACTGATAACAGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chr3L 13291931 5' + roo 8681 2 66.91 TTACCAGGGTAATCACAAATTCTGGTTCTCTGCTCTTAAACGGGGTTTATTCCATTTCTAAAAATATCAAATGTCTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAAT:1 - chr3R 16187882 5' + mdg1 48 2 53.10 AGTTGTTAAACAGATTCATGTGCGTGGAGTGGGTCCTTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTTTATTAAATGGACCGTTC:1 + chr3R 10148697 5' - 17.6 7385 2 62.76 GCCTACATAAACCCAAACATGCCCCAATACGTTAGTTCAGTTCTGAGTACGTTATCAATCGCCATAACCCTGCTTAAGATTGAACCACGCTCTCTCGATCTTGAACAAAAATTCGGGAGAGCCTGGAGCCACCT:1 + chr2R 4189432 5' - 1360 75 1 64.93 ATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGGTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTCAAGTAA:1 + chr3L 5027204 5' - roo 317 2 76.71 AATAAATAAAACTATGGCACACTGATCTAATCATTTTTCGAACTATTAGCGTGACTGATCTGATAAGATAAGAAGCTCTATTTTCAACTTATTACATCCTTTTCAACGAATTTGGTAAACACTTTTACTATATATACATACATATA:1 - chr3L 18416542 5' - Dm88 19 3 76.71 TCAGCGAGAGATTGAGATTAGGACTCTCTTTTAGGACCCCATATACAGTTTGTCAAGAAACTGTTTACACACTGTGGAATAAGTTGAATTTTTGACTTTAAAGCTTAAATTAAAGGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAGTTTTTTTT:1 + chrX 15076778 5' + S-element 81 2 91.78 AAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chr3R 30087791 5' + roo 66 2 64.38 TAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAA:3 + chr3L 19579986 5' + jockey 71 1 59.59 AACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATT:1 + chrX 20361965 5' - hopper2 1543 1 65.47 ACATGAGGTACTATTTTTGAGTAAAAGTGCTCAGAAAAGANACCATAACCAAAACATAGGTTTAAGATGATGTTCAAAACTATTGTTTCTATATATATATAATTGCAAATAANTGGTTGCAATAAATAGTTGTGAGTCTATTAAA:1 - chr2L 6619038 5' - 17.6 468 2 67.59 CCAGGCAAAGAGTAATTTGGGGGAAAAAAAACTTTTATACAGATATGTGGGATCTTTATAGGTCTTTCTTTCTTCGTTTCATTGGTTTCTCACACAATTTACTTACTTCCTGCAACAAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATA:1 + chrX 13598066 5' - blood 7198 2 81.38 GCAAATATTCCCTATTTTCGCCAACTTGATACTATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 5728990 5' + roo 8686 2 70.00 CTCCATTATCCGAGACCACAGAAATTTAAATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2R 19108590 5' + jockey 59 1 68.03 AAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr2R 7314611 5' + blood 7041 2 57.78 TTTCAGTTCACTTTTGCCATTTGACTGCACCACGGTCGTCTAATTAACCCATTCGGGGTTAAGTCAACTTCAATTTAAACCCAGTAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGT:1 + chr2L 17237035 5' + X-element 43 1 55.48 AATATTCCATTTGCATTTTGTTTGTGGGCACACGGCAGCAGGCGAAATATTCCCACGCCGGCATGGCTCAAGTTCACCCAGCTGCCAGCCGCAGATATGGTAGTATGTAGTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAAT:1 - chr3R 28618501 5' + 412 12 2 68.28 GTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGC:1 + chr2R 7314639 5' + blood 7080 2 62.33 TCGTGAGTCCCCCATTAATGTTTCAGCCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 25580897 5' + 1360 9 2 75.38 TGTAATTGTAAGACCAATTCATATTCTTTCAAGCAATTCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATGGTGATCCATCACAAAC:1 - chr3R 4962876 5' + jockey 72 1 67.20 CACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATG:1 - chr2L 17019173 5' + 412 7091 2 54.55 GGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCG:1 + chr3L 12227779 5' + opus 148 4 55.37 TCCCTGTGCAATATTATTCGTAAAACCCTTAATTTGAAAACTTGATTGGATTTCTTTATTTTATTTTGGTCTTACTAACAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTG:1 - chr2R 4598070 5' + 1360 46 1 50.34 GCGGAATGCGAAAATGATAGAAAATAAATGTAACCTGTTGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAAT:1 - chrX 16998375 5' - diver 6028 2 74.31 AGAACTTCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATT:1 - chr3L 18074206 5' + 297 18 2 69.23 GATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTT:1 + chr3R 26472810 5' - 1360 3317 1 71.92 TAAAGTCTGCCATAAAGTATTATTAACCTCGAGCATTTCGCCAGCTTTCAAATCTTAAAATGCAGTTCATTTAGCGTAGTTTTCCCATACATGTAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGATTTAAGTTGAAGGC:1 + chr3R 5704074 5' - 412 7518 2 67.81 CTCTTCCAGCGGCTGTGTGCGATAAAAACGCACCCAAAATTAGGCAAAGTGCAGTCGACTGAGAAACGATTAACGGCCTGCATTAGCCGCCTCTGATTGATGCCTGAGTCAATCGCTGACGCTCACCCATACCATGAAAACTCCGT:1 - chr2L 15445312 5' + G-element 4010 1 69.86 AAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTA:1 + chr3L 14888765 5' - flea 4951 1 65.75 AATAAACGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAAATCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACAT:1 - chrX 20949727 5' + jockey 4572 1 62.22 TTAATATTTGTATACATTTCATATCATTTCCGGTTTTTACTCACACAAGCAAGCAAATTATATTTTTAGGTTTCTTACGCTCTCAGCGGGAGTGAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAACAAGTGGCTGCATAGTGC:1 - chr2R 1591060 5' + 1360 3341 1 76.55 ACTGATTGGATTGCAAAGCTCGCCAAACTATAAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTT:1 - chr3L 14422874 5' - roo 9055 2 73.29 AATAAATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTGCAAATTAATGTGTTCCTCCTTCGGGATGTGTCCTGTGGTCTCCAGGCGGTGGAGATCTGGTGCTGGCTGCTACCAGGGATAATAGGATAATATCTTCTTATG:1 + chr3L 23456274 5' - gtwin 396 2 69.18 TGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 + chr3L 21764390 5' - hobo 2892 1 70.87 AAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGCTACAGACTTGAAACTTTGCACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATT:1 - chr2R 6493164 5' - transib2 2735 1 76.03 ATAATGAATGGATACAAAACATAATTAGCTATTGCAATACATATTTACAGTATGTAACTAACCCAAAAACAAGAGAGAATGCTATGGTCGAGTTCCTCGACTATCAGATAACACGAAATTTCGTAATTTTTCTGGGATATCTATAG:1 + chr2R 7925382 5' - INE-1 502 1 71.92 GCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAG:1 + chr3R 12613794 5' + HMS-Beagle 61 2 79.13 TCTAATAGATGGAGGGTTGAGAGTGTAGGAGTATAGCTTTTGGGGTGAGTACAAACAATAGATGAGAACTCGTATGTGTGTGCGTGTTTTGCTAGAAGACGATTTTTGTGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACAT:1 - chr4 425946 5' - 1360 3160 1 58.90 ATTCAAAACTAAATTCAAACAATATAAGCAAAATCTAAACTGTTTATATGTTATTATAATGTGTAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 - chrX 9017702 5' + 1360 58 1 63.01 TTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTA:1 - chr3R 10736173 5' + McClintock 5967 2 73.10 AAGATCGACTTGCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAAT:1 - chr2R 11247066 5' + 1360 34 1 56.45 AACTATTGAAAATTAATATTACTATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAAT:1 + chr3R 12764665 5' - copia 234 1 70.55 AGCTCTGCCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 - chrX 14360871 5' + jockey 12 1 77.19 ATTGTATCACAAATGTTATAGTGGTCTGAAATATTTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACAAAATGTTTCCCTA:1 + chr2L 11523067 5' - HMS-Beagle 6961 2 76.03 CATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAGAAGACTCAAGCGACACCACCCTCA:1 + chr2R 20972676 5' + jockey 4749 1 69.66 TTTTGATTTTAAATTTGCGCCTTCTTCATTTAAGCGCCTGAAAGTATGCAACAATATATATGATTGACTGGTTAGTATTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGC:1 + chr2R 13132504 5' - BS 5048 1 50.68 TTTATGAGGTGCTATAATTCTTGATGAACTAACTAAATGTTTTTATGGCACTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 - chr2R 19389482 5' + 297 4 2 70.55 GCGGCGCCAACGACTGTCTGCAAAATGTATGTATATGGCCAAAAGTCCTGCAGAAAAAAATCACAAAAAATGAGTCATGAGAAAAATGAGAACTGCAGCCCGCATACAAAAAATGACCTGCGGCC:1 - chr2L 11855532 5' + hobo 2730 1 52.00 AGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGTATTT:1 - chr2L 10461219 5' + roo 8744 2 69.18 GAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr3R 27606710 5' - 412 452 2 52.24 ACTCACTCTGCCATCTTCTTGCTTTGCTCATAGCTTCTGGCTTCGCTTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 - chr4 317851 5' + Tirant 34 2 55.26 TGTCCCGGCAACCAGGACATATTCGCCATGGCAACATGGTCCCGTCGTCCTCGCTGCACTGTCAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCCGCCGGGCTGACATATATTTATTCA:1 + chr2L 15523023 5' - 412 7490 2 53.42 CACCCTGTACTGCAGACCTTTTCGATTTATTCATCCCCAATGTTTAAAGCTATATGTTAAATTAAATATGAGTTTATGCATGTAGTACATATGTACTTTATTAGTATCATAAGACTCAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTAT:1 - chr2R 13939612 5' + G6 1975 1 76.03 CCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGT:1 - chr3L 1463733 5' - P-element 2822 1 41.78 ACAAATGATTCCACCTCTGAAAAATATGAAGTGTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGCAATCCAGCAAGGTGACGCTACCGAAGTTTAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCATTATGAAG:1 - chr3L 23219342 5' - 1360 3352 1 62.33 CATTATTCCGACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTATTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTAT:1 - chr3L 4547800 5' + mdg3 5290 2 58.22 AACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 2317227 5' + 412 7119 2 63.01 AGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGCGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 - chr2L 7929592 5' + roo 8742 2 71.92 GTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCT:1 - chr3R 18128543 5' + roo 39 2 53.38 CTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACTTT:1 + chr3R 12948603 5' + Stalker4 59 4 57.04 AAGGTGTCGTTTCTGGAGCACATTGAGTGTAAATGTCAAAAATAGTATTGAAAAATATTGAAAAATTAGGATAGAATAGAATGCTATAGTCGAGTGGGGAACTCGGGGAGTCTATCAGATACCCTTTACTCAGCTGGTG:1 + chrX 15946415 5' - INE-1 541 1 37.41 GTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAACTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGT:1 - chr3R 11284978 5' + blood 7069 2 65.60 TATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 14422819 5' - roo 342 2 67.14 CAGTCCAACTCAGCCAACTATAGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTA:1 + chr3L 20680253 5' + 412 36 2 59.29 CTATAATTGGTGTAATTTGTTTGAAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAACCAGGTCAACTAGACATA:1 - chr2R 10119066 5' + Juan 4092 1 59.31 ACAGACAAAAAATAAATTTCTAAGTATGTGCACAAAAAGAGCCGCATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATGGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAA:1 - chr3L 9696017 5' - 297 339 2 65.12 AATCGTAATATGATTATCGTGCCACATAAGCCCCCTCATCCACATCCTCTTCCTGTCCTGCTTTATGTCTCTCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTATATGTGTGTGTGTGTGTG:1 - chrX 20325166 5' - accord 7032 2 76.86 CAGTGGCACCTTAAAAAGGTCATGTGTTTGTTAAATGGATACCGCAATCGCTAGATTTCATCGTTTTAATATGTAAATATCCGATCTCGAAAATCAGTTTTTTTTTGCCTATTAATTAAAATGGCAATAAGGCAATAATATTTCTT:1 - chr2L 675138 5' - G7 771 1 73.97 AAATCCAACCATGCTTACATAATCGAGGACTATAACTAAACTTGCCTTTTGTACTTTCATGCTATTCATACATTCTGGATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 20905077 5' + roo 46 2 53.42 AATAGCACCTCAATATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGTAA:1 - chr3R 5165027 5' + invader4 2816 2 60.96 TGATTCCTTATTACGATTAGATGAGTTCTAGATAGCTTAATTCCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr2R 16371933 5' + 412 7100 2 51.37 GTTTATCGGTCAATCATCTTTTTATTACTTTTGTAGTTTCAATTATATAAATATGCAATATACAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTACTTCTAAATGCGGTAATTATATAA:1 + chr2L 21941122 5' - flea 202 2 62.76 ATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATT:4 + chr3R 28438321 5' - mdg1 355 2 60.96 AGTTGACGTATATATAATACCCATTTTTCGCATGAACACAGAAGTTCTCAACCGTCTTTGGAACCTCCTTGAAGAACAGCCTCATGTGGATATCGCCTTTCGTGGTGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCG:1 - chr2R 24573935 5' - accord 7074 2 74.66 CGGCCTCCGCACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAAT:1 - chr3R 7462973 5' + I-element 419 1 55.86 TATGCATGAGCTTCCGGCCAAATGCTTGGTCAGCAATTTGACCGGTGCTGGTGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATTAAGAATAAAGCTTTCATCATTCTTGATCTTGACACAAAACCGAGCAGTTGAT:1 - chrX 21772473 5' + accord 7237 2 62.33 TAGCGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAG:1 + chr3R 5164927 5' - invader4 259 2 62.33 GTATGCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGC:1 - chr2L 15019994 5' + BS 4827 1 63.70 GATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr3R 23964820 5' + hobo 64 1 65.71 TGGGGGAATCTTGTGAGCCAGACAGACCTTGCTGCTTGAACTTGCGACAAAGTGGAGCAATGACTCGGATTCTTTTGCATTTCACCACTTTTACATACATACATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCT:1 + chr2R 9750099 5' - opus 486 2 77.40 TCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAG:1 + chr3R 31266131 5' + jockey 82 1 77.52 ATTGCAGCTATTTATGTCTGATATTTCTCCACAGCCCGAAAAAAACCGTGTGCAAGAAAATCGTATGGCGTTACGGATCTTGTTATTAAATTCAACTTGATTTAGAACTAACTTAGTTTTTCATTTTAATGTGTTAATTAGGGCC:1 + chr4 123788 5' - HB 1350 1 78.62 ATTTATAAGCAATTTAACATAATTAATTGTTTTGTTTTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3L 19579942 5' + jockey 25 1 74.48 TATTTTATTTTATCATATTGCTACGAAATTGACAAGAACTAGCGTAATATGTAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCG:1 - chr2L 5307482 5' + gypsy10 37 2 56.76 AATACAATAATAGCAACAGCAGCGGCAGCACGAACGAAGAACGAGAGAGAGCAGGAAAAACCTCTCAAAAGCGTGCCAATGCACTATGGGGCATTTGGCCAGTTTTTTTTATAAAAATGTGTTTTTCAC:1 - chrX 1769804 5' - hopper 1388 1 62.79 TAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCA:1 - chr2R 12133823 5' + jockey 67 1 69.35 CAGAGGGCAGTAGGCAGAGAATTGGAGGAGCAAATTGAGTGAGGGTTTACTTACGCTCTCTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAACTGTATGTAT:1 + chr2L 6637380 5' + 1731 87 1 58.57 GGTATGAAAAACTAAAACGATTGCATGCCAAGACGCTGAAGAATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chrX 23102389 5' - Transpac 239 2 70.29 CTGCGTATGCAAAACATCTTCAAAATTGACTTTACTGATTTTGCCTTTTGCATTTTATTATGTGTTTATTATGCTAACTGTTCACACATGAAAACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr3R 22320577 5' + roo 8711 2 53.42 AATATGTGAATCCCATTAGAACATTGCCTATTTAATCCTTAATCAACTTCACATATGTATATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAAT:1 - chr3L 18216581 5' - 297 337 2 64.38 TTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3L 6050245 5' + 412 58 2 56.85 TTTTTGTTTTGTGCTATTGAACCCAATGGACGTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAG:1 - chr3L 7751178 5' - 412 7537 2 78.77 TTCTACTTCCCAAATTAAATTCCTTAAGTAGAGACAAAAATTCTTCACATCAACGTCAAGTGGTTGAAAATTCCCATCGCTTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr3R 30087816 5' + roo 8685 2 69.05 CAAGAAAATGAAGAAGATGAAAAGTTTTTCAACCTTCGGTTCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chr2R 10977130 5' + roo 83 2 74.66 GCTTAAGCCTTTTACATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCAAA:1 - chr3L 17748445 5' + Doc 450 1 57.14 CTGGGCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCTAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAG:1 - chr3R 22647937 5' - transib2 2796 1 60.80 ACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGCTTGAATCGTTTTAT:1 + chr3R 7579376 5' - Stalker2 7594 2 55.48 AAAACTTTGAGTTTATTCTTGCATATCCAAAGGGTCGTTTTCAACCAGTCCGCAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCG:1 + chrX 3239253 5' + X-element 48 1 51.37 TATATTGAAAGGGTATCTGATATATGTGGAAATTCTTTTGTATTAGCTGTTAAATACGCCTATTGTCAGAGAGAAATTTAGCTCACCTGGTATATATATCATATATAATTATTTATTTACTTATTATGATAGGTAGAATAGTTTAC:1 + chr2L 22121304 5' - I-element 5340 1 48.63 GCGGCCAGTGTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACAT:2 + chr3L 9324400 5' + HMS-Beagle2 10 2 77.40 TGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACAT:1 + chr3R 24072050 5' + jockey 74 1 64.29 ATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 14422826 5' - roo 9028 1 57.60 GATAAAAGAATTGTCAGCTAGAATTAAATCAAAATAAAATAGTACAATAATGGCTATTGAAAATGGTATATAAATATATATCTAATATGAATAGAATTAAGACAAGAGAGAATGCTATAGTCGAGTTCCCGACTATCAGATACCCT:1 - chrX 14770809 5' - INE-1 555 1 89.04 GTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGTTTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTTTATTTTTTA:1 + chr3R 10736034 5' - McClintock 414 2 65.73 GGGGGGGAGAGCAGAGTAAAGTAGACAAAATTCGAAGCTCGTTTCTAGGAATACACAGGGGTATACGTGAGTACATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCA:1 + chr2L 9795361 5' + blood 47 2 53.42 TGTATTTTCTAGCTAGCAGACAGCAAGGCGTCGAAATGGGAATTGGGATTGGAACATTCTCATAGCTAACATATTATTTATGATACTGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chr3R 13155361 5' - hobo 2921 1 66.67 TTAGTATTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAT:1 - chr3R 17243255 5' - hopper 1402 1 73.38 CAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 13285588 5' - roo 340 2 66.44 AACTTTGCACGAATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAG:1 + chr2R 21795197 5' - transib2 2809 1 75.34 ATAAAAAAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTG:1 + chr3R 23644870 5' + diver 5952 2 59.44 CAGCCTAGGTATTTTTGTGCGCTTGCGCGGCGGTCACATTGATTTAATTCAAATTTATTTCCGTTAAATTAATAATAAATAAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTAT:1 + chr2L 13827772 5' + pogo 38 1 59.59 TATGATATCAATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTT:1 - chrX 18673759 5' - roo 9068 1 75.53 AGATCATCATGAAGAATTCTTCTCACAGAACGATCGGATAGTTTAAGGGCAGATGCGTGTTTGCGCGCAAAACGCCGTGAAGATTGCAATATTGACGCTCTCACGGGCCGAGGGACTCCAGTTCTTCTTTTTGTCGCACTTGC:1 - chr2R 4802897 5' - mariner2 305 1 72.73 TGTGTGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTA:1 - chr3R 12613865 5' - HMS-Beagle 185 2 59.59 TCACTTTTATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGG:1 + chr3R 28438313 5' - mdg1 7401 2 55.48 CCATTAGGCAAACTAATTAACCACTTGACTTCATATCACTTTTCACAGCCCACAAGAGTAGGCAACAAATTTTAGGTTCTTTATGTTAAACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACC:1 - chr2R 17207871 5' - jockey 4972 1 57.53 CATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTAAGTTTTGCCAAAATAAAACGAA:1 - chrX 3533953 5' - 17.6 404 2 81.51 TATCTACAATTTTAAAAGTATCTGAGGTTTTTAAGTGCCAATTATTATTTGTATACTTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACCTTAGCTTA:1 + chr3R 30955322 5' - G6 1962 1 57.53 AGTGTGTGCGGGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGCTTAAGCGCGACA:1 + chr3R 12613772 5' + HMS-Beagle 68 2 66.67 ATTGTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGAAAGTTCTAAAAACTACAACA:1 + chrX 22679614 5' + Doc 58 1 48.97 AGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACG:1 - chr3R 30955380 5' + G-element 76 1 75.00 CTCTAATCTCATATTACCAACGAATATCTGAGAATATCTTCTCTTAGATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTT:1 - chr2R 24215696 5' - I-element 5280 1 67.12 AATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAATG:1 + chr3R 3617311 5' - micropia 172 2 73.97 GTTGCCACGTTGCATGCAAACAAGTGCAGCAAATACACACACACGTACATGCAGCGGCAAATAAACGCACGAGCGCTGACGTGCGGGCACCAGCGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTCACAATAATGTGTTT:1 + chr2R 16355764 5' - hopper 1393 1 43.48 TGCAAGCCAGAAAATTAACTTCAAGGAGGGTCTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 + chr3R 22708962 5' - roo 8998 2 64.38 AAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chrX 8681401 5' + jockey 73 1 63.38 TGCATGCCCAGAGATTCGGCCCACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTACACAATAAAGTCTCAAAACGCAG:1 + chr3R 28749084 5' - mdg1 386 2 58.21 CTCCGATTTGGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chr2L 15085779 5' - opus 7498 2 79.14 AACAGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTC:1 + chr3L 13291943 5' + roo 33 2 56.64 CGAGGGAGGAAATTGGATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTA:1 - chrX 20149281 5' - pogo 2093 1 77.70 TTCACAAATTGTGATTCCACTTTGTTCATTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 - chrX 17792620 5' + roo 8724 2 60.96 ATTAACGGGAAAAACAATGAAAACTTTTATTTGCCAACTTACCATGTTGCTTCTTGCCCTGAAAAGTCTTGGTCGCAACAACTCAGATATGAAGTTTGATGATATTCATTGAAATTGGCAAAAAAAACAGCTGATATGATGCACTT:1 + chr3L 15394763 5' - pogo 142 1 69.86 CTTGTCCGAATTTTATTACTTAATGTTATTGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 + chr2R 18886927 5' - roo 9046 1 67.81 ACATGCACACACTCATCGAACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGG:1 - chr2R 10582514 5' + Juan 3812 1 71.53 TTGTAGCATACTTTTTGGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGTAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGCCC:1 - chr2L 13033429 5' - hobo 2924 1 61.74 GTAATTGGTTTGCAATAAAAGCGAACAAAGAAAGTTGTTTATAGAAAGTATACCATATTTGAAGAGGTTCGTTCCATTGTGTTGCTCAGAACAAAAAAGGCTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAA:1 - chr3R 12948740 5' - Stalker4 392 1 75.18 GTGTGGGGTGGAGCTGATTTGTTCAAAGACTAGTGAGCGATATTGGTAATTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTT:1 + chr3R 18294826 5' + copia 4928 2 63.85 TGAAGATGGTGCTAATGGGCCAAAGTTTTGATCCTCTTTTGGGCGGTGAGTAAATATAAACTATATATATACATTCATGTATACATACATACATACATACATATATACATACATATATACATAC:1 + chrX 21226552 5' + ZAM 8159 2 54.03 TTGGAAGTACTACAAATAGTAATTATTTCGAAATAGTGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACTAATGTCCCGTC:1 - chrX 22577222 5' - 297 371 2 42.47 TTTACACAGACATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 + chr3L 14422679 5' + roo 23 2 53.57 TAGAATATATGCTTGGACCTGATAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chr3R 13254894 5' - roo 9013 2 56.55 AGTCTGCCTTGCCGCTTTGCGGTGACACCAATTTACCTGATGAGGCAATCAGCTGTCTCACCTGAATCTGGCCAACAGTGCCACATAACGTTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTT:1 - chrX 10725112 5' - pogo 2090 1 71.88 CGTTCTGTCCATCAATTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCC:1 - chr2R 5621048 5' + ZAM 7977 2 66.10 AACGATGTCATTATACCCACATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3L 5027192 5' - roo 333 2 73.29 TGTTCGACTCAAGGCATGGCTATTGTTTTTGTCGCGTTTTNGACCGAATTATTTGCATCTGAAAACCCACTGGTGACAATAGATGCTGTAAAATCCCATATAAGAAGACTTTACTCGTNGAGTGTTTGT:1 - chr3L 7389823 5' - roo 387 2 65.89 AACCCTTAATTTGAAAACTTGATTGGATTTCTTTATTTTATTTTGGTCTTACTAACAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 - chr2R 4598047 5' + 1360 55 1 62.60 AAATCGAGCTTCAAGCTCCTTTTGCATCACCCAAAAATCAAAAATCACCAAACAAAAAACAAAACACAAATATGAGCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTTCAAGCTAAACAAAACAAAAACAACTCCTACCTCTCA:1 + chr3R 18007598 5' + Porto1 264 1 62.33 AATTCGTGTTGTTTGTTTTGCACAAAGGAATGTCCTGCGTGGAAACTATTTTAGTCAACTCACAGTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCC:1 - chr2L 20029530 5' + I-element 16 1 73.97 AACGGTGACCCGCCGAAATTGGTGCAGTTAGATTTGAACGCTAGGCCGTGGACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTAGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 + chr3L 22518929 5' - hopper2 1542 1 61.27 GAGTCAGTGTGTGCGAGAAATGAGACAGCCGTCGGGCAACCTTATTGGCATCGACATGCAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCGCG:1 + chr3R 12613767 5' + HMS-Beagle 65 2 65.07 GAGGCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTCAACAAATCATCGGACACTCAAC:1 - chr2L 20852549 5' + Tirant 39 2 55.04 TTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr3L 6050235 5' + 412 40 2 55.08 ATTTCACACTAATAATTGTTTTATTTAACTCTTTTGTGCTCATGATTTCTAAAAATATATCATAACCCTTTGCAGACGTTCACAATTTTCCTGGCATCGTAACATTTTTTGATTGGTAGCGTTGTAGAATCTCAATATTTGAGTTG:1 + chr3R 1865123 5' - G4 3464 1 74.66 ATAGCGCCCATTTCACTGAATTTTCAGGTAACAATTTTTTATTTTTTTTTAACGCACGTGTCCCACGGCCACACCTCCCGTCCAACCGACCGACTTTCATAAAATGGATTTTGGCCAAAA:1 + chrX 22938834 5' + Transib-N1_DM 469 1 71.67 AACGCTGGGTGAAAAATGTAGCGAGACACATGTTTCATATCATGGAATTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chr2R 21795989 5' - roo 9037 1 58.90 AAACCTGCTCGCAAACCCAATGGATTCTATTTTGGGAACAGTGACGTCTTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTC:1 - chr2R 19230632 5' + I-element 24 1 68.49 TCGAGGACTGCTGCTCAGCAGGGGCTTGCAGCACTAATGAACATTTTATTACAAAAGTTTGTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr3L 1459917 5' + 412 26 2 67.81 GAAATGTCTGAATGTCTGGCGCACCGCACGTAGTCTTTAAACAGGGTGGAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCT:1 - chr2R 16372037 5' - 412 7481 2 66.91 ACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 + chrX 11232521 5' + roo 75 2 71.92 CTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCTT:1 - chrX 9951320 5' + jockey 93 1 73.29 TAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCG:1 + chr3R 23902179 5' + I-element 39 1 52.00 CAAGTGTTTTTGGAAACACCCATGTGCTTAACGGGAAACCAGTTAGTGTTTTGCCTATCATCCCTTTTTAGGCAAATGTCTTTTTCTGATTGTTTGTCTTCTCTATCCTCCGTTATGTATTGATTCGGGTGCGCGCA:1 + chrX 22771389 5' - hobo 142 1 68.61 GCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTT:1 + chr3R 17924454 5' + Burdock 84 2 79.31 TGTACTATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 26854713 5' + jockey 35 1 64.14 GGATTTCAACTAAATTTTGCCAGCTTTCATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGC:1 - chr3R 30955461 5' + G-element 8 1 75.17 ATCATTTATACTGTGTATTTCAAAAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCC:1 - chr2R 25051905 5' + G5A 2679 1 74.66 CATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCA:1 + chr3R 26854764 5' + jockey 81 1 66.19 GAGCTAAATTAAGTGTCACAAAAAATGAATGAGGGTGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chrX 291976 5' + 412 7101 2 52.74 TAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTTGTTAATATAAATAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGAAATATTTTCAAT:1 - chr3R 2520348 5' - Tc1-2 1604 1 59.59 CCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGGGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGTACAATTAAATAAAATAGCATATTAACT:1 - chr3L 414955 5' + 412 7087 2 57.25 ATTTCAATTTGTCGACCAGCCTGTTGACCTTCTTTAACTTTAACTTAACTTTGTTTGGCCACATTTTGCATATGTGCGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 9951382 5' + jockey 14 1 63.70 TAGTAATTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACC:1 + chr3L 18463346 5' - 1360 76 1 55.17 GTGTGTGAGCATTGGAATTCGCCCGTGTGTGTGGCGAGAGTGCGTCCATGTGTGTGTGACTGATTACAAATGTGAGTGAGAATTGAGGAGGGGCCTCTATGGGTTACAGAAATAAAGAATAGGAAAAAAAACGGAATATCTCC:1 + chr2L 20417292 5' - McClintock 195 2 60.14 GCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3L 2966531 5' - roo 349 2 64.84 GAGGTAGTTGCGGTCCTCGCGACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATTTCTTAT:1 - chr3R 17627597 5' + roo 8706 2 53.39 TGAGCTGCAAATAGTAATTAGACTTGCAATCGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATA:1 - chr3L 3661153 5' + X-element 79 1 58.90 AAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGA:1 - chrX 20949694 5' + jockey 4616 1 62.33 AAGGGGGCTTTACTTGGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATACACACGC:1 + chr2R 8315457 5' - hobo 2909 1 66.44 CGCGAAGAACGAGATTGGTCTGAGTGAACCTCTGGAATCGGAGGAGCCCTACAAGGCTATGACTGCTGGTAAGTGGCGACGATCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAACT:1 - chr3L 2040822 5' + HMS-Beagle2 489 1 73.83 CATCTGAGTCAAGTGCCATCCTCCGTCTCTGTTCGCCCAGTTATGGCCTTTTTGGCAATAACCAGGATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAT:1 + chrX 1138068 5' - blood 7178 2 75.28 TTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACAGATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTT:1 + chr2R 23094896 5' - 412 419 2 76.52 AAGCAAAAGTGAAACTTGCAGCAAAGAAAGGTGAGTGAATGGTCAGCAAGGCCCAAAAAGTATGCTACAAATTGCAATTTCCGCTGGTTAATTGCAGCATCAATATCTACTCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTT:1 - chr2R 22796904 5' + jockey 4791 1 75.34 CAGCGAAGGATGCCGCTTCCTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAGCG:1 - chr3R 13869009 5' + HMS-Beagle 63 2 65.00 CTTGACTAAACTAAGTTCAGTAGCACTTTTTTTTTTTATATTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTC:1 + chr3R 10030733 5' - BS 5003 1 78.17 TACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGC:1 - chr2R 23094990 5' + 412 7093 2 56.16 TGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGA:1 + chr3L 15393682 5' + pogo 58 1 58.22 ACTCATCCGATGGAAACCGGGATGGGACCAGTACGTGTGACCCATTTATCAGGCAGCTGAATCTCATCGGTATCAATTTAACGATTCTTAATATCTAACTTATTTACAAAGGTTATATGATTAAGAGTATTAAAGAAATGAAATGT:1 - chr3R 10441456 5' - jockey2 3261 1 60.96 GAAGGCAGCTAGAATATATGCTTGGACCTGATAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3R 13254885 5' - roo 9021 2 50.68 TACAATTTACAATCAATTACATTTGCCAAAAAGATTTACATTGATTTCATACTGCGGAACTAAAAAGGAGAAATTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCT:1 + chr3R 10733721 5' - mdg1 7409 2 50.68 AAGTATTCGGTAATTAAAAAGTGTGAGATTTATTTCATAGGCCGGGTTTATTATTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTCCC:1 + chr3L 20063292 5' - roo 267 2 65.75 TCTGCCTGCATTAGCTTATCGCTATTTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATCTTTGCAAACTTCA:1 - chr3L 11684954 5' - Bari1 1679 1 63.70 TCGCAGTTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTTTGTTTATGTT:1 - chr2L 17019165 5' + 412 71 2 65.75 AAGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGG:1 - chr2R 4939193 5' - 1360 3367 1 32.86 CTTTACAAAGTAATAACAAAATCATTTCAGCTATAATAAAATCTTAAAAGCCCATATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCC:2 + chr3R 13423233 5' - 297 374 2 71.23 ACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 - chrX 14360825 5' + jockey 86 1 71.63 GGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr3L 20061401 5' + roo 8686 2 68.49 ATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTT:1 - chr2L 16884893 5' - pogo 2033 1 68.57 AAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCAT:1 - chr3L 20224207 5' + Chimpo 11 1 58.21 TTGCAACGCCATTATGTACATATGTATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGG:1 + chr2L 2493952 5' - Tirant 8503 2 70.55 AAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 - chr3L 2317229 5' + 412 7095 2 54.84 CGGCTGTTTTGGGGCCGACTTGAGACACGTGACCATCTCTCGGTCACTACCCACTAAGGTTGGGGTTGATAAATTGACCGCCAGCCTTCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGG:1 - chrX 23155291 5' + blood 7014 2 76.99 CTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3R 20887378 5' + Doc 31 1 58.78 GTCAAAGGTTTCAGTATGGAATTATATGCAATTATTGGCAGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGG:1 + chrX 15198056 5' + Max-element 8290 2 66.10 ATTTTATGAGCAGGGCTGCTTCGATGGAAATACATCTAGGAAACATACATTTATCTTAGACTAGCATATATAGTATATCGCTTAGCTCTAGATATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGACA:1 + chr2L 5728823 5' - roo 9044 1 66.44 AATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTG:1 + chr2R 7314616 5' + blood 7056 2 50.34 ACCACTTGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 22320471 5' - roo 339 2 66.21 TCGCATTTTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 + chr2R 11153155 5' - roo 327 2 73.97 AAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCG:1 - chr3L 1463697 5' - P-element 2786 1 17.12 GCTACAAAATTTCAGCTCAAATATGTGATGCAATTTGCTANGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTNGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCATCGGTTTAAATAG:1 + chrX 5841908 5' - roo 345 2 59.31 TAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCTACTGTCCCTATCTACTTCTCGCTCCTCAGCAAGGGGGAGTGCTTGCCCGGCAAGCAAGTACTCGAATTGCT:1 + chr3L 23112567 5' + R1A1-element 5159 1 52.38 ACAAAAGTGTGAGCGTGACTTGCGTGGCTGGAATCTGTATGCTTGATCTCAACTCTATAGGCTTCCATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 + chr2L 22132497 5' - pogo 2072 1 57.98 TCTGGCAAAATAGAGTAGCTTCAACACTAACAAATTGTAAGACTAGCATAACTAAGCTAGTTTTGAATCAGTAAAATATGTTGATTATATTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTCA:1 + chr2L 6618869 5' + 17.6 6946 1 65.19 TATATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATA:1 + chr3R 26927366 5' - roo 361 2 52.78 TCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATC:1 - chr2L 20852540 5' + Tirant 28 2 56.88 TAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTA:1 - chr2R 19633325 5' + jockey 4802 1 56.85 GTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACAC:1 - chr2R 5621023 5' + ZAM 7999 2 52.17 AATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCA:1 + chrX 6538624 5' + pogo 34 1 58.22 AAAATATATATAAGCTATAAGTTCTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3R 6685845 5' + 412 7103 2 51.37 CCCACCCACCCACACAAGACAAGATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTGCGGACGAATTTTT:1 + chr3L 1463672 5' + P-element 94 1 21.23 GTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGC:1 - chrX 20949667 5' + jockey 4643 1 80.82 ATAGCGAAGGAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAANACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTNAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTACGTCTAAAGCCTCGC:1 + chr3R 23902154 5' + I-element 35 1 59.59 CTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAGACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATGAGAATCGCATCTTATAGTCAATG:1 + chr3R 22708993 5' - roo 8978 2 74.81 GATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 + chr3L 14422709 5' + roo 58 2 59.31 ATGAAGTATTCATGCGTAAAATGTTGTTATTGTATTTTACGTCGTAAATTGTTTAACTTTTAAACATTTATTGATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATCTGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCC:1 - chr3R 17243056 5' + hopper 399 1 57.64 TTCCAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCA:1 - chr2R 14415555 5' + 297 6622 2 57.53 GGGCGTGCCAAGCACCCTTAAAAAATATCCCTGCGAATTCCAGGTGCAAAATTATTCGACTGACGAAAAAGGCAAATACGGCCAACTGCACAAGCCAAAGGCAAAACATTAAAGCAAACAAACGAAACTCACACACACACACACAT:1 - chrX 2822035 5' + Quasimodo 33 2 54.79 CTAGAGCATATATAATGCAATGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGG:1 - chr3L 2167678 5' + opus 7071 4 74.45 TACCCATCATCAGGCTCCAGCAGTCTGCTTAATTAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTG:1 + chr3L 20061297 5' - roo 9051 2 69.23 CATGCGCCCTTTGTCATGCTTCTCTACTTAGACTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chrX 22862406 5' + jockey 18 1 72.50 GAGAACATACATACATACACATGAACGGTATGTATGTATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTG:1 - chr2R 20670580 5' + opus 7153 4 70.00 CGAGAAATCGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGTTATGTTTATGCACGCAG:1 - chr2R 14009080 5' + 412 82 2 75.35 GATTTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGG:1 + chr2R 7720032 5' + HMS-Beagle 17 2 72.86 GTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTTCAACAGCGACTG:1 - chr3R 30569070 5' - mdg3 5426 2 62.76 GCGAGAGCGAGAGAGAGAGGGAGAGAGGACCCAACTGGTTGGTCGAATACATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 - chrX 8080709 5' + P-element 59 1 37.98 CATTTCACTGCACAATCAACATAAAACCTTCGCGGATGTCGTGCACCTTAGATCGCGACACAGTTGCGTCATTGGCCCTAGAATAACAAGATTCGTAA:1 - chr2L 22631000 5' - 1360 3381 2 81.63 GTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTACACAAATCATCGGACACTCAACC:1 - chr2L 20852509 5' + Tirant 8147 2 72.22 ACACCTGCAAGCTAATAATCATTAGAGCCAAGGGCTCATAGTTAGGCTTGTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 + chr3R 18832363 5' - roo 333 2 67.81 CGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTATGTAAGACTTTTCAGTTC:1 - chrX 8839363 5' + Tabor 84 2 72.60 TTACAATCTTTTGTAGACAGGAATGTGATCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr3R 7049504 5' - Burdock 241 2 74.66 CACAGGGTATTGTGTCCGCCGTGACACGATTTGTTAATCTCAAGTGGGAATACGCATACAATATATGTATATAAGTGCCCATTATGCAAAAATGAATTTCTAAAAATATAAATACTAAACTGGGCTGATGTTTCTCAGGACATA:1 - chr3R 4719912 5' + Gypsy12A_LTR 1889 1 63.89 CGTGAATGTAAGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGG:1 - chrX 20949721 5' + jockey 4589 1 54.79 AGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTA:1 + chr3L 14422735 5' + roo 8749 2 77.40 CACACTTTCAAAAACGTTTACTTATATACGCATTAGAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCA:1 - chr2L 22640238 5' - invader4 3039 2 45.89 GAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAG:1 - chr3R 10737070 5' + F-element 54 1 52.55 TCCAAGTGCAACATTGGTACGTTCGATGTTTTCAAATTTCTGGCATCTTGTATCCAAAAGTCTTTCAGTGGAAGCAGCATCCTCCCATAATAGCTGGGTTTCACCTAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATAC:1 + chr3L 25406614 5' + 1360 16 1 73.05 TGTCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGC:1 - chr2L 22780915 5' + HMS-Beagle2 72 2 73.33 CGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGCACACAGCAACACTTAGTTGCAT:1 - chr3R 11285003 5' + blood 43 2 52.59 AAATGTATTGGGAATACGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3R 5870771 5' - roo 9038 1 60.96 GATCTGTTTCAATTGGAAGAGGGCTCCGTTAGTTGTTGGTTTCCAGTTCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chr2L 14616284 5' - P-element 2844 1 56.16 CAATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 + chr3R 17987645 5' + jockey 80 1 68.49 CGGCCTTTCATGTCTTATGTTATTACAGCCTGTGTGCACGGGAAGAAAAATGGGTGCAGCCAAAGACACTAGAATAACAAGA:1 + chr3R 12622180 5' + 1360 1 2 73.17 GCACGAATAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGACTTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCT:1 + chr2R 21795203 5' - transib2 2806 1 72.73 CCATTATGTACATATGTATGTACATGCATATGTCGCAGCGTTGACATTTTCTTGTGCCTGATCTCCCATGTTGGCAATTAAACTATTTGAGTGAAGCGAATTCCAACCGGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAG:1 + chr2L 2493960 5' - Tirant 401 1 71.43 AATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACG:1 - chr3L 9318068 5' + P-element 2860 1 55.24 AAAAAATAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTC:1 - chr2R 14072585 5' + mdg3 5274 2 50.56 ACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 + chr3L 14221072 5' + roo 76 2 71.72 AACGGAAATGGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCT:1 - chrX 21443055 5' + Transpac 65 2 59.59 ACAGTCCACTACTGTTATAGATGCAACTAATATACTAATGNACATCTCAGCTTGCTGGCCCTTTGGCAGGATGTT:1 + chr3R 19450160 5' + roo 8647 1 93.33 AAGCAATAATCTTTCTTTTTATTCAATTTTTCAAGGAGTTCTTTGATATTTAATAAAAGAAGTAGCATTCTATAGTTATTTAAAAAATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCT:2 - chr3L 12227909 5' - opus 7467 2 62.33 CCCAAGGTCAAATCCAGAACTTTAAAAAAAACCAACCTTCTGGGCGGCAGGGGTATCCCTTGTGGTTGGGCATGTCGGAGATGTGGGTCTCATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTT:1 + chr3R 17077782 5' + 1360 23 1 67.88 TCTTTATATATACATATATTTCATTCTAAAATATCATTTTATTTCCAACATACATAAATTTTGTATCCACACTTGTACAATTTTTGTTTAACCAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chrX 23431795 5' - roo 9047 1 65.73 CGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCNTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTNTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATGCTTCATTTG:1 - chr3L 9324557 5' - HMS-Beagle2 261 2 52.86 TACAATAATATAACATAATGTGCTGCTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCACCACTTAGTTGCATCGCATAA:1 + chr2L 2544728 5' + blood 50 2 48.63 AATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTC:1 - chr2R 14532058 5' - invader4 275 2 60.16 ATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTT:1 - chrX 20999592 5' + BS 34 1 53.23 AAAATAAAGAAAAATGTGAAAATCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCCTTGGTGAAAACTCCCAAATTTGTGA:1 + chrX 7708020 5' + P-element 265 1 19.18 ACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCC:1 - chrX 21668349 5' - opus 7475 2 50.00 CGCCATCTGTTGGCGAACAAACAAGTTGTTAAACAGATTCATGTGCGTGGAGTGGGTCCTTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTT:1 + chr3R 10148674 5' - 17.6 7408 2 78.62 AATTTCAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTC:1 - chr3L 6015708 5' + roo 8692 2 61.64 TGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTT:1 + chr3R 24666389 5' - hobo 2883 1 77.88 AATAATAGGTAATATCTTTTTGTATAAAAGGTTAAGCTTAGTAAATACAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 + chrX 17770375 5' + hobo 9 1 76.12 TAACGTATTTGCAAATGCGAATTTCAAGACAAGACCCTTTATCGAAACCTACCGCTCGAAGATACGATACGATTATCGATGCATATGCATTTTTAAATTCTCATCAATCAGCTAGTGGAAATGCGAAATTTCATAATTTTTCTGGG:1 - chrX 22517643 5' - INE-1 512 1 34.93 AAGTCAGCTGCCACTCGGCACTCACTTGGCTGGGCAAGAATGTATGGCCATATCTGTGTCCCAACATGGCCTACGATATTAGCACTTAAGTACTATTTTCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAA:1 - chr3R 22647966 5' - transib2 2804 1 70.55 TCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAACTA:1 - chr2R 19633284 5' + jockey 4843 1 73.29 AACCCCAGTGCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAA:1 + chr2R 13090878 5' + I-element 65 1 66.67 CAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAAC:1 + chr3R 12146644 5' + gypsy10 5690 2 53.03 GGATATACAGGAACACTTCAAGCTGTTCAGTGTCAAGGCAATGGACGGTAAGTCCGAAATGTCCAAGATTAAAAACAAAGTAACATAAAGCAATTCCGCTTTATTAATTCTATTAATATTAGTTTCGGAACGAAAACATACACAGA:1 - chr3L 171630 5' + Doc 4399 1 67.81 TTTACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGGTTCTTTCAAGCTACGAATAG:1 - chr2L 544925 5' + Doc 37 1 50.82 CTCAGTTATCCACAAAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTC:1 + chrX 21442964 5' - Transpac 5172 2 58.52 AAAACAAACCGTAAAACCGTATGAAGCATACGCAACGTAATCCATAATTTAGTAGATGAAATTTGCTGCAATATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGT:1 - chr3L 22257887 5' - mdg3 222 2 68.49 AGTCGAGTATAACATAAGTTGGCTAATATTAAAATAGGATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAA:1 + chr3R 20200358 5' - Transpac 279 2 55.17 TTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr2L 2291565 5' + I-element 50 1 52.05 CCTGGTAAATAGACATAGTTTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACT:1 + chrX 8469211 5' - hobo 2910 1 51.92 ACACACATTATAGAAACATAATACCAATTAAATAATTTGTACATTAGTTAATAAAATTATAGTGCCATCACTCGCGTTTATAATAATAATAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCATGGCTATCAAATACCCGTTACTCAGCT:1 - chr2L 22130779 5' - INE-1 545 1 60.27 TTGAATCGGTGCGGAAAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr2L 10461256 5' + roo 8707 2 56.16 GCAAGATTATTCGTAAAACCCTTAATTTGAAAACTTGATTGGATTTCTTTATTTTATTTTGGTCTTACTAACAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGA:1 - chr2R 4598063 5' + 1360 54 1 55.48 GCAGACATGTGTACTACTTTATGTTTACTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCTGCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGC:1 + chr3R 12078582 5' - hopper 1380 1 62.33 CTTCAGTTTTTTTTTTCCTTTTTTTTT:1 + chrX 3541962 5' - gypsy7 5007 3 96.30 ACTATCTCTACCGAACTAACGAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATCCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3R 17077946 5' + 1360 9 2 77.69 TCTTTCAGTGCAGCAACCTGAGCTGGTCCACTCCGAATCGGACTACCGTGCAAACCCATTTCGCAGTTAACAGCGCAACAAGTAAAAACAATAAACAAACAAAAATATGACCGCATCCGACGCTCAAAATCAGAAGCGAGAGCTT:1 - chr3L 11325794 5' + Porto1 228 1 57.93 ATAGATAGAGTAAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chr3R 27606717 5' - 412 7500 2 52.74 ATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAAC:1 - chr3L 27391416 5' + 1360 9 2 70.40 GCCGATTCGCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chr3L 17012059 5' - 1360 3364 1 63.78 CACGTAGATATATATACTAAATGCCAGCACTCCTTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 5870923 5' + roo 8693 2 63.77 GGAATCGTCAAGGTGCCCTTGTACGCGTTTGACTCTGCTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATG:1 - chr3L 23182029 5' - 1360 3355 1 66.33 AAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCGGTT:1 + chr2R 12185329 5' - accord 398 2 64.54 CTTTAAAATTTGTTTTTTTTTTCGTTTACCCACCCTTAAAAATAAATTTGATTGCCCACCCCTTAATAATGGTTTTTTTTGAAAATTCATATCTCAAAAACTGGACGTGGGCAAAAAAAACTAA:1 + chr2R 23000265 5' - FB 92 1 60.48 GAATTTTAACTATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACA:1 - chrX 14978644 5' + hobo 61 1 56.85 TTTGCGAATAAGAGATGCGGAAACGACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAG:1 - chr3R 7074902 5' - P-element 2872 1 65.71 GAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTC:1 + chr3L 18216458 5' + 297 6625 2 56.16 ATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCG:1 - chr2R 14532053 5' - invader4 3032 2 63.20 CCCTCTCATTTCTGAGCTCAGTCGTACTCCGTCGTACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACACGATTTTTTCGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCT:1 - chr2R 1512861 5' + 1360 70 1 68.22 AAAATTGGTCGTATCGCTATAAGAAATGTTCATCGTTTGCATTTGCGTAAGGCACAACCTTTTACTCCTACCCGTGCAAAGGGTATTATTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACA:1 - chr2R 5179704 5' + 1360 30 1 67.12 CATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGAGAAATTATATTTAG:1 + chr3R 24084802 5' + roo 8739 2 70.83 AAATACCCAAATTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGG:1 + chr2R 20972626 5' + jockey 4694 1 66.43 TCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAACGGACGCAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 - chr2R 10977200 5' - roo 9009 2 58.57 CAACCGCATCCATTGTCATACTCGTATTAACTACGTGCTGAGCGAACCATACCGCCCCCTTTTCGACAGTTCACCGACCATCCCGCTGTTCATGTGTTCTTACTCTGTCTATATATTTTTTACTATGTTTTGCTATTTCTTCTTTA:1 + chr3R 5444965 5' - G4 3581 1 58.90 AATCTTAATATACTAAATTATTTATATGAATAGTGTTTTAATAATTCATTTATATATATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 + chr2L 13229102 5' - roo 9007 2 65.07 TTGTCTTATTCTGTGTTTATTTGTTGAACGAACTGAATTTATTGGTCGTCTCGATACGAGATACGTGCGGCTGCTCAAAATCCCACCATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 + chr2R 5549768 5' - flea 224 2 65.07 ACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATA:1 + chr3R 29283211 5' - hopper 1325 1 78.08 CTGCGTGGAAACTATTTTAGTCAACTCACAGTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr2L 20029496 5' + I-element 50 1 52.05 GCTGCTCCCCTCTGTATCAAAAAGGCACTTTAGAACCAACTCCACACACTGGCAAACTTTAGAGGAAGTTTTCACTGCGGCTCAAAGTGAAAGGGCCAAAAAGAATCCGCTACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTT:1 - chr3R 31159336 5' + hobo 7 1 79.29 TTATTTGATTTTTCTTTAATATTTTGGTTCAACGTCTTTACAGTGTCTGAGTTGTGAGTTTTGAATATATTTCGTCTTAGGCTAAGCCGCGTAGCTGCGCTGCAGGATACGGCAGCGGCGGAGCGGCTTTCTTATGTATATCTTAT:1 + chrX 21948993 5' - 412 7325 2 73.29 TGTATTTCTGTCCATCTCTTTCTTTCATTCATCCATCTGTTTGTTCTTTTTTGGCGATTAAAATTAAAATTTAATTCCGTCATTCTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCAATACCCCAGATCTGTATTCC:1 - chr3R 23886128 5' - BS 4678 1 65.97 CGATATAGAGATATATATATTTGATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTT:1 - chr2R 5954015 5' - flea 4952 1 66.67 AGTTAAATCCTGGTGCTGAGGTGGGTAATGAAAAGTAGTATAAATAGTTGAGCAGTTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAAC:1 - chr2L 10909672 5' - 412 489 2 57.53 TTGGTGTTGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACA:1 + chr3R 21925118 5' + hobo 84 1 73.29 ACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTC:1 - chr3R 19950517 5' - BS 5017 1 68.28 AACGCCCCGAAAAGTATGCAATAAATTACACAACAGGCACTCGCACATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATC:1 - chr3R 27315176 5' - jockey 4950 1 52.74 TGTGCATGTATGTGGGTGTATGCGTGTCGGTGTGCAACAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACACCCTACTTGCG:1 + chr3L 21764388 5' - hobo 2868 1 75.19 CAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCAT:1 - chrX 21668382 5' - opus 495 2 45.83 CCCCGCTTTCAGTGAGCCAAATATGCAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 + chrX 18673685 5' + roo 8710 2 74.75 GCTAAGTTAATTAGTTTAGTATTTAGCTATGCAATTTGTTTAGTTTATGAATGTGTTAAGGATTTATGTATTTAAGTTTCAATTGAATAATAAAAGTAGTATTGAAAACGGTGAGTTTTGAAACTATTTTTGTTTTTTTTTTTCTT:1 - chrX 8668688 5' - Doc2-element 248 6 80.14 AAAGAAGTAGAAATTGCTTAAACCATATACATATATGTACTAAAAGCTACGGGTCAAAAAATAAGAATAAGCTTTTAAGGCTTGCGAATGTGCAAAAAAAACTAAAGTGAACAGTTTAATAGAATAGAATAAAAAAAAAACTATAA:1 + chr2R 11793020 5' - Circe 75 1 26.03 TTCTTTTGCATTTCACCACTTTTACATACATACATACATATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGAT:1 + chr2R 9750168 5' - opus 455 2 73.15 ATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTAAGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAAAACTTCAAATAT:1 - chr2R 10582479 5' + Juan 3852 1 48.59 AATATACCTTTTAGTATACCGTTTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGAGGCGTAATGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGCTGAGAGCGTAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGT:1 + chr2L 22113019 5' - 1360 3260 1 55.48 TAAAACAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTC:1 + chr2L 8284310 5' + Doc 378 1 79.29 TAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACA:1 - chr3L 27391428 5' - 1360 3371 1 67.81 TGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTAGGAGACAAGCTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCT:1 - chrX 2214279 5' + jockey 4644 1 74.66 AAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTTA:1 + chr3R 24480488 5' + blood 7102 2 78.62 CAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACC:1 + chr3R 24480481 5' + blood 7096 2 73.97 ATTTAAATGCTCGTAAAATGCAAAGCAAACAAGTGATAAAAGTTGTAAAGTTGTGGCTATATCTATTGCATTTAAAGTTGGAAAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAG:1 - chr3R 31113442 5' + flea 452 1 75.34 GTTCTTGGCTGTGTAAATACGCTTATACACACACACACACAGGAACAGACATACAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCG:1 + chr2L 13033324 5' + hobo 64 1 65.25 AATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTCTACT:1 - chrX 22824225 5' - Gypsy12A_LTR 2233 1 50.00 AAAATTGAAAAATAAGCCTCAGGGCAGACACACAACACACACAATACAGTAGCACTCGTTTAACCGAAAAGGCAATCAAATTACATATTAAGCTAGAGAGAAAGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTT:1 + chr3R 5678916 5' - INE-1 566 1 61.11 CTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - chr3R 11284987 5' + blood 7070 2 62.96 ATTTGTTAAAAAAATTTGTGTTCATTTAAATTTTTAAGTGAAAACGATCCCGGTGCCTTATCAGCGATTGATGTGCAAGTTAACTAAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACACCAGCACCGGTCAAATTGCTGACCAAGC:1 - chr3L 5171870 5' + springer 42 2 55.00 AGTTTTAGTAAGTTTTTTAAAAAGTAACAAAAATAGTATTTAATGCATATATTTAGGTTTAAGTGGATAAGCAATGTTTCATCAACATTAAATCTTTCTTACCACAATATACCTATATTTTCTTTTATATTCTTTTATATTCAGT:1 + chrX 16879369 5' + gtwin 231 2 83.45 TCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTA:1 + chr3L 18216451 5' + 297 36 2 61.38 TGGTTATATTTTGTTTTGAAAAGTATTAGACGCCATACGGTATATTTCGATGGGAACCAGTATGACAACTCAAGTTTAACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTC:1 + chr2R 11246945 5' - 1360 121 1 55.48 GAGGTTAATATGAGCGACGCACCTTTTTTCCACAGCCACACACACAGTGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chrX 2899149 5' - accord 258 2 70.31 CCTAATGAACGTGAGAATCGTGAGCTGACCCACGGGCCATTTTGGGGTGAAAGTTTCTTTGGTTTTTTTTTTTATTTTAACTCACGGAAATTTCTTTAGCACAATTTAACCTTTTTTTTTTTACCAAAATATTCGTTGGTTAAAT:1 - chr2L 6986412 5' + HMS-Beagle 346 1 44.83 AACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 - chr2L 3893097 5' + 1360 41 1 55.48 CTGAAAGTTATCAGGTCGTGGCAGCATTTGTTAGCGGCATGTCCGCGATAAGAAGTGTTTTTTTTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATT:1 - chr2R 13541610 5' - jockey 4937 1 60.42 TAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2R 8286816 5' + Burdock 6169 2 58.22 TCAGGGCAGCCGCTATGAATCAAAACAAACCGCCAGCAAATCGGTACGTCCGTTCGGTTTCGAGAGCAAAGAACGACTGATTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 - chrX 3811707 5' - P-element 2844 1 56.16 TGATCTAATGATTGCCCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2R 18887092 5' + roo 23 2 67.41 TATGCGATCTACGCTGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGATTC:1 - chr2R 9871065 5' + roo 8717 2 60.61 TTCGCTTATAACAAACGCAAAAATAAATAAATTCGCCAAAAAGTTGAAATTAATTAGTATTCTGGGGTGATATCACAAAACAAATGAGCAAATCTGTTTTTTGGCATAGTAATCATAAAGAGCGCACTTTAAAAGTTTTTTTCTTT:1 + chr3L 12951979 5' + FB 877 1 51.37 AATCAAATGTTAAGTGTTTGATTTTTAATAATTAATCGTTTCAAGCAGCAAGAAATTTGATTTGTTGGAATTTTTTGAAAATGTTTTACAGTATAGTTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACT:1 - chr2L 13827923 5' - pogo 2064 1 58.90 TAGTATAAATAGTTGAGCAGTTGGTAACTCATTTCATATTACAAAGATTTTCATAGTAAATATAGTTTGAAAATTCCAAACCAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr2L 10909618 5' - 412 454 2 57.53 AGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACAC:1 + chr3L 18183087 5' + Tirant 34 2 55.26 TTTAAATGTTTCCCAAAAATATGCTACAGCAAAAACAAAAAATTTGAGCAATATGAAGGAAGGGGAATGCAAATGTAAGGGCGGCAGCAGTAAAAACTGGGACACAAAGGGGCCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTT:1 - chr3R 7625456 5' + hopper 7 2 79.45 AATTATATATTAAAATGGTGTCGTTTTTACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAA:1 - chr3R 19950569 5' - BS 5068 1 66.44 GTGTTCTTGCTCGCCGGCGCATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTCCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCAACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCGAG:1 - chrX 15286991 5' + X-element 4390 1 59.54 CAGTTGGCAACACTGCCGCCCCAACCCCCTACGCCAGAACGAGACCACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chr3L 5770871 5' - P-element 2848 1 56.20 TTATGTTTAGTAATTGAATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGT:1 + chr3R 12948580 5' + Stalker 6889 4 57.53 TTAATTTAACTGTGTTTTTGCATTGGGTTTTCATTGTTTTTTTTTATTTTTACACTACAAGTGACAAAATATGAAATTGAATTACGGCAAAAGCAAAGGAAATTGTACGCATAAGAATTAGCAAAACAAAAAAAAAAACAATGAAA:1 + chr3R 23808735 5' + transib2 2642 1 73.97 AAAAAAAAAAACAAAAGAAAATTAATAACAGTAAATACAATTCCAGCTCAACTCCTGAAAATCAAGTGGGGTCCGATATAATATGTTTCGGACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAA:1 + chrX 13928357 5' + Quasimodo 460 2 61.64 AATATAGTGAAATTACGTTCTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTGTGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAG:1 + chr3R 20887359 5' + Doc 27 1 65.75 TCCTATCGATATATCCCAACGAGTGCAGCTATAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTG:1 - chrX 13091105 5' + P-element 79 1 25.37 GAATGGCCAAAGCTAAATCACGAAATTGAAAGTAAAAGAAAACAAACAAGAAGAAAAGAAAACCTAAAAAATGTTTAAGACCGTTCAAAAGTATCTCTACTAAGAAGAATAAAATAAGAAACAGGACCCTTAGCTTTAAGGAACGT:1 - chrX 11303195 5' + mdg3 5178 1 76.71 CAGCAACAGCAGCAGCCGCAGCAGCAGCAGCAACATCACCGTGCCCAACGATGCATGCAAAGCAGTCGCTGTTGTTGCTGCTGGTG:1 + chr3R 29098480 5' - TART-B 152 3 77.91 TCACTTCCTGTCCACCGTTCCTTCTCCGCCCCCCCAAAACGAGATTCCCATTTCGGCACGCTTATTAACAATGCATTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACATACTTGAA:1 - chr2R 20052494 5' - transib2 2783 1 51.11 AAAGGATTAAAGGGGTTACGAATTTATGATTGGGTAAGAGTTTTGTTTTTATTTGTATTAATATATTGTTTATTGTGTGCGCCTATTTCTAACAATTTGTACATTTAGCAAGTGGTGTCAACATGTAGTTGTTTGAAAAAATTTTC:1 + chr3L 23190779 5' - hopper 1038 1 67.12 CAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTCT:2 - chrX 10319692 5' - mdg1 345 2 67.81 TCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATT:1 + chrX 8681444 5' + jockey 75 1 68.61 TTAAAATGTGCTTGTATAAATCATAAGTTCAAAACATGGAACAAACATGAGATCACACCTCATCAAGGGTTTTTTTTATGACCCGCATTGAGTAGCAAGTATACACACTGATATTTTAAAGGGTGGGCAATCGAAATAATTTATTT:1 - chr3L 20187464 5' - FB 701 3 77.40 TTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr3L 11684929 5' - Bari1 1654 1 52.05 ATATGTGTACATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTG:1 + chr3L 6131810 5' - roo 9031 1 57.24 CTAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGGTGTGTGCGGACG:1 - chr2R 9607362 5' + P-element 87 1 26.21 GGTAAGTGCTGACCGGTCACGCCCACTATACGCCCACACACACACACACACACATACATACCC:1 - chr2L 10892370 5' + Quasimodo 41 2 53.97 GGCCAGAACCAAGGTCTCAATGCCCCAAAGTGTGCTATATGTTTTGCAGGAGCGTGTTACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCC:1 + chr3R 25580766 5' + 1360 63 1 61.81 ATCTAATTTCTTTAAGTATAAACTTGTAATTTACGACTGTAACGACTTCATTTCCACAAATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCTAAGAAATAAAAAATA:1 - chr2R 4029398 5' - 297 336 2 59.59 TAGTAAAACAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGATCTTGCTCTCCCTCTC:1 + chr2L 8284307 5' + Doc 378 1 79.02 CAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGAT:1 - chr3R 25796090 5' - BS 5030 1 55.48 TTGATAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAG:1 - chr3R 20887536 5' - Doc 4652 1 68.97 ATTTTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - chr3R 19514334 5' + blood 59 2 57.53 TATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 - chr3L 2167668 5' + opus 7067 4 79.67 ATATATGTACATACGTAACATATACGAGCGTGTATATATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTC:1 + chr3R 19965176 5' + jockey 23 1 73.94 TATAAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr3L 14422846 5' - roo 9028 1 54.48 CTACCCCCTTCATGCCAACGCCTCTGAGCTGCTGCAGCTGCAAATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 + chr3R 22320421 5' - roo 396 1 75.54 TCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGC:1 - chr2R 14532069 5' - invader4 3045 2 53.12 ACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 - chr2R 12133855 5' + jockey 22 1 66.07 GAATAATTGATAAGTGTTGTTACTGGTAACAGGGCGATAACGTTTAATATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTGTC:1 - chr2R 5549889 5' + flea 50 2 62.40 CTAAATTTTGCCAGCTTTCATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGC:1 - chr3R 30955452 5' + G-element 16 1 69.44 TAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 - chr2R 5193497 5' - roo 318 2 82.19 CGGCAAGTGGACGACAACGAAGGCTACAACGACGCCCTGACCGATCGAGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCG:1 + chrX 19662910 5' + P-element 10 2 76.43 AAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAA:1 + chr3L 6131848 5' - roo 9044 1 55.32 TTAAAGGTAACATTTAATACAAGCAATTCCTGAAATATTAAATTAGTTATTTAACTTTTAACTATAGTTATGAATTCTTTTTAATAACTATTTAAACACTTCAATGAATGCTCTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTC:1 + chr2L 11617637 5' - 412 7535 2 77.40 GAACAAGGACATTACGATGNCGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 - chr3L 20061453 5' + roo 43 2 52.74 ACACACACTCACACACTCTGCTGCATACTTTCCGGATTTTCGCTTTGCACACTTTTGGGCGCCCATTTGACGGGCGGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 + chrX 3476130 5' - jockey 4948 1 46.21 GTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGAGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCT:1 - chr3L 13057458 5' + 412 7107 2 54.79 TATGCAATGCGACTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAA:1 + chrX 6891460 5' - hobo 2915 1 52.63 AAAGACAGAAAGGCAGAGTATTCAGATACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr2R 9750273 5' + opus 7154 4 58.22 ATCTTTTGATATAATTTTATTTAAACTAACCACTAGTAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCGCTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTG:1 - chr3L 2532582 5' - blood 7372 2 71.92 CGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACATCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATC:1 + chr3L 19951185 5' + Ivk 61 1 59.31 AACAAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAACCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTCCCC:1 + chr3L 23773899 5' - Transib5 2832 1 67.12 ACTCTGATGTTCCATCTTCATCAGGCACTTTGGTCACTGGAATAATCTGTTAATTGGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTG:1 - chr2L 14876690 5' - jockey 4760 1 61.38 AAAGCATTATTTATACTATATACTGGTCCATAAATATTGTATTTCTATGATAGATGTTATTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGGAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAA:1 - chr4 880399 5' + pogo 59 1 61.64 TATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 + chr3L 15718059 5' + 1360 38 1 50.00 CATCAAGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAA:1 - chr3R 15727979 5' - 1731 303 1 71.23 CTTAGAATGGATCTTTTCAGAAGGGTAACTGTTGTCCCACTGGGAGACCAATCAAACTTCCACAGCAGCCGATATGCCCACAGACTTAGAGACCACCCAAACACGTTGGCGAATG:1 + chr3R 22623011 5' + G5A 2632 1 70.43 CATGAGCACAGCCCCTCAAAACAATTGGTGGTCGTTCGCAAACATTTCGAATCCAGTTGCATGCTCGTTTTGCGAATAACCGACCGCACCCCACCCAAATTGGACCAGACTCGAC:1 - chr3R 29763765 5' + I-element 4907 1 78.26 ATGCACACTTGCGGCGACTTGTTTACGACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCCGGAAGACGGCAACTGGAACAAC:1 - 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chr3L 13057464 5' + 412 7101 2 52.74 CTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCGACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCG:1 + chrX 18149960 5' + hobo 52 1 50.68 TCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATT:1 - chr2L 4244969 5' - 412 7474 2 67.81 AAGTGAATAATTTCGGAGAAATATCACTAACTACTATTGTTCTCATCACATATCTTTAAAGATAAAGATATCTTTAACACAACGACTACCAACAGATGGAGCGTGTTAGTTTTGAAACGGACATGGCCAGATCGACTCGGCTAGTG:1 - chrX 20996714 5' - INE-1 101 1 69.86 TCTCAACTTAACGTTGTTCTGCGAAAAATCAACTACATAACAAACTTTTTTTCTTCTTCCTCAACATTTGTTGTTCGCCATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr3R 25860624 5' - hobo 2928 1 78.08 ATAAATTTTTTTTTTATATTTAATGCACTTTCCAAAGGTCTCCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr3R 22075170 5' + roo 81 2 73.79 GATGGGCTTAAAATGATAATGTTTTAGCATTTTGAAAAATCTAGAAAAGAATGAGATATGAACTATTTGTGGAGTACGTAAAGCAAACATATTGATTTCCTTTATTAAAATAAGGAAACGAGCCATACT:1 + chr3R 14008073 5' + Transpac 354 1 53.49 TCCAGTTCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAA:1 - chr2L 14616243 5' - P-element 2830 1 34.45 ATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAA:1 - chr3R 30955387 5' + G-element 66 1 68.99 ATATAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTA:1 + chr3L 15148558 5' - roo 9035 1 58.74 GAGCATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr3R 30087714 5' - roo 329 2 71.72 TTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCA:1 - chr2R 17493138 5' + BS 4856 1 78.10 GAGTGATGTTTATGGTAAACCGATGGTATACTTTAGAAATGAAAGCTTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAG:1 - chr2R 17269191 5' + roo 75 2 71.92 TATTGATTTCATTAGTAGTTATTAGTAGCTATACCTGAGCTGTAATACCATAGCCTTAAAAAAATTGTTGAGATATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 + chr3L 2167576 5' - opus 7463 2 56.43 TGCTGCTAACGCATTTCTAACGAGCAAAGCCAGTCAACAGCACTTTAAATGGCAAATGCTCTCTTGGTGAAATCATCATATATTTAATTATTTGCATTTGCCAAGTGGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 + chrX 8314392 5' + roo 12 2 75.69 TGATTGCATTGCCTCAAACACTCAGTCACGACGAATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCT:1 - chr2R 18931963 5' + blood 15 2 73.79 AAATCAAAGAAATTTGTTAACATTTAATAGGATATTCTAACAAATTAAACATTGCTAAAAAGTGTTAATATTAAAGTGTACAAAAAGTTCAACAAAAAATACAATATTAACAATCTTTTGTTTCAAGTCTTAGTTTTTAAGTTAGT:1 + chrX 6216311 5' + Juan 3998 1 51.37 ATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCC:1 - chr2L 13033392 5' - hobo 2920 1 53.66 GGACTGGCACATTTAGCGGTCGCCCCGAGGCGAAAAACACACACTGCATTCTGTCTAATAAACTTTACAAAGCCAGCAGGCGTCGGCAGCGAATCGGTGGTCGGCAGCGGCTAC:1 + chr3L 9324089 5' - HMS-Beagle2 151 2 69.30 CCTCTATTACGGCCAAAACGAACGAACCGAATACGTGGCGACATTGCTAGCTAGTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGCTAAACCCTCGGTACTCTAGGCACCCC:1 - chrX 15191444 5' - hobo 2892 1 56.00 ATGACGCGGCAATGACAGGAGCGCAGCGTAACTTCACTCGAAAAAATTTATAAATGATACGTGGTCAAATTCTGTTAGTGAACAGATGGAGAGGATTTAACGGAGGAGATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAAC:1 + chr3L 21534189 5' - 1360 3380 2 77.62 AAGCACTCACTCTGCCATCTTCTTGCTTTGCTCATAGCTTCTGGCTTCGCTTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGC:1 - chr4 317855 5' + Tirant 51 2 59.26 TCTTATCAGCTGCACATATTTAAACTGATGACGCCACCGATGGAAAAGCGAGGAAAACCAAATAGGAGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTAT:1 - chr3L 2907398 5' - 412 7493 2 52.05 CAAGGATACAGAAGTAAGTCAGCGAACAGGATAAGGGATAAAATCTAAAAAATTCCCCACTATCAATACAGAATTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 + chr3L 12890272 5' + hobo 34 1 62.33 GCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGC:1 + chrX 609383 5' + 1360 67 1 69.63 TTAGTTGACAATTGAAGTTTTATTTAATTGACAATTGAAGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCAGCCCATTTGGGCTCGACGGCTAACTATAGTTAGCTTTTT:1 - chr3L 18546286 5' - X-element 4622 1 66.94 CGGGAGAGAGAGCAAGAAAGCAGAAGAAGAGCACAAGGAGTGGGGCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 - chrX 9121349 5' - P-element 2829 1 39.23 CTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGAC:2 - chr3L 9318105 5' + P-element 2864 1 65.07 CATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGC:1 - chr2R 17493155 5' + BS 4868 1 70.15 TTAGAAAATGTACCCTGTGGACTTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTG:1 + chrX 8968552 5' - 1731 306 1 70.55 CGGTTAACCATTCTTTTGGCCCAGTGCTAAGGTAAGTCGATCCGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTA:1 + chr3R 20752832 5' + 1360 7 2 76.55 TATCATCATTACGGAGCTCTTCATCATTTCATCAACTGGGGGGTGCAACCACGAGTGTCGACACGAATCCCCAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTTGGCGATGT:1 - chr2R 10858155 5' - jockey 4638 1 54.79 AAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr2L 15085615 5' + opus 52 4 56.85 TGCAAATATTTAACCACATGCCCACCCGCATCTCAGACTCCCGGGAAAACTTTCGGCACATTGTTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTGTATT:1 + chr3R 22320459 5' - roo 9033 1 52.76 AAAAATTATATTTTGTACAACGAGGAGAAGCTCATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 + chr3L 2907258 5' + 412 29 2 64.83 AAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGTCAGAAGCC:1 - chr2L 7920992 5' + F-element 389 1 65.96 CTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 14884182 5' + roo 8727 2 64.38 TTCCTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATANGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGNACGGTTAAGCGCGACATCGACACTTCTGCGCTG:1 - chr3R 13868993 5' + HMS-Beagle 6881 2 76.03 GTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 - chr2L 4864467 5' - mdg3 5438 2 59.71 AGTTGACTATTTAGTTCTCGCCCTTCCAAAAGCAATTATTTAAATGTACATATGTATGTACATATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chrX 20149124 5' + pogo 54 1 58.22 TAGGGAACCAATACATACATTTGTGCTCTGTAAAAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAA:1 + chr2L 7929493 5' - roo 9027 1 49.32 CTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTCTATATCGATGCTAACTGAACTGAACTGTATTCTTTCTT:1 + chrX 16998316 5' + diver 5968 2 69.44 TATCATTTATACTGTGTATTTCAAAAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTC:1 - chr2R 25051906 5' + G5A 2678 1 74.66 TAATTGATTATCGCTCTTTGGTTGGCTGAATAATTGTGTTTCGGTACTCAGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCG:1 + chr3R 12519565 5' + roo 8694 2 63.01 TATATTTAACTGATCTTTACTCCGCGATGTCCACACCAATCCAACCTCAGAGTAAGCAAAAAGAAGTATGTATGCTTTTCGGATCCCTCCGAACTTATTTTACGTGGCGTGTTCCACACTGAAGGGATTACAACCACGGCACCCTA:1 + chr3L 22702752 5' - R1A1-element 5278 1 55.48 CTTTGGTTGGCTGAATAATTGTGTTTCGGTACTCAGGTTGCCATTCACAGAAATCGATTTATTAACCTTTTAAAGATCATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATGT:1 + chr3R 12519580 5' + roo 21 2 63.11 CTAAAACGGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:2 + chr2L 18311391 5' + opus 7141 4 68.28 ACAGCTGCTGCTTAGCCAGCGTTTATTTATTTCCCAGCCAGTGAAAAGCGAAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGA:1 - chr3R 23636479 5' + X-element 4249 1 65.71 CAAAGATATTTCGGAAATGTGGTTACTCATTCTCACGGTCTGATTTTCATTTTTGGTCCTAAGAAGATGGTGTAATACCAAAGACACTAGAATAATTCTATAACTAGAATAATATTCTATAATTATTCTAGTGTCTTTGGTAATAC:1 + chr3L 14638584 5' + Tc3 317 2 54.79 GAATGAGCCAAGTTTAAAGCAAAAAAAAAAGTTTATATATATACATGTAAGATTGTTTATTTTTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr2L 17957254 5' - flea 4983 2 64.95 AATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATT:1 - chr3R 30955428 5' + G-element 39 1 53.15 ATCATCTATACAATTAAATATAAGAAGGATTCATATGTAAGTAATTAAAGTTGTGCGTGGCAGGGGGATCCCTCTCTGCAATCCCAGATATTATGTTGAGAGGAACTTTCCTCTTTTAACTGCCAGCCTT:1 + chr3L 23456279 5' - Gypsy6A_LTR 263 1 71.54 CGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTAC:1 + chr3R 26472804 5' - 1360 3324 1 67.59 GACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAG:1 - chr2L 14056761 5' + pogo 62 1 67.41 GAAGGGCCACCTGTTAGTCGAATACAATATATCAGAAACACATTCGCTGTGATATTGAGTGCATGCCATCGAAGCCATTCAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCG:1 - chr2R 21795364 5' + transib2 40 1 57.93 TATTGTCTCGAAATACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr2L 9704778 5' - roo 340 2 64.14 GTGCTGTGGAATAGGGGATCTTATTGGGAATTCATGAATTCAGTTCAAAAACTCCAATCTCTGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 8563525 5' + 297 6636 2 56.16 AGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCA:1 + chr3L 9324478 5' + HMS-Beagle2 88 2 77.40 TAGCACTGCCAAAAAAAAAATGGCAAATAAACATTTACAAATACATATGGCGTATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGATTG:1 - chr2L 21941227 5' + flea 48 2 64.62 CCGGGGGAAGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACT:1 - chr3L 15099669 5' + G4 3809 1 50.78 GAAAATATCTNGTATTTGTCTGTCTGGTCAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAA:1 - chr2L 17019220 5' + 412 7069 2 76.71 AAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCTTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGAC:1 + chr3R 12146655 5' + gypsy10 35 2 52.78 CTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 - chrX 14360834 5' + jockey 70 1 63.43 AGGCAAATTGAGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGAT:1 + chr3L 6015546 5' - roo 9039 1 57.53 CCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACAT:1 + chr3L 25206794 5' + HMS-Beagle 6821 2 63.49 GAGTGGATTTGAACTCAGTGCTTTTCGGTTTATATGCCAAAAAATACATATCAGCATTTATTGATACATAGTCCTCACAGCGCAGAAAAACTTATACGACGTACCAAGAAACTGAAATGCGTTAGAAATATATAAATATGTATAT:1 + chr3L 9517963 5' + G3 4503 1 71.03 GAAATATGTATATGAATTTGTAATCAGCAGGAAAATTAAAGAAAATGTTTTTGACTCTCTGTCATAAAACGTATATGTATGTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTGGTGTCCAAAAGATCG:1 - chr3R 26180543 5' - Transpac 5192 2 58.90 GGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAAAACATATTGTG:1 - chr3R 12764787 5' + copia 79 2 73.29 TTGTACAACGAGGAGAAGCTCATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr3L 2907270 5' + 412 7095 2 56.16 GAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAAT:1 + chr3R 7579370 5' - Stalker2 7602 2 52.08 CGAGGCTTCTTCGCCAGAGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAAACCCC:1 - chr2L 20852550 5' + Tirant 8115 2 72.73 GCGATCGCAAGCGTAAACTTTGTTTAGCTACACACTTTCGNAGCTCTATAGCCTGAAGAACTCGATAAAATCAAATGATGTTGATGCGCTTACTAAAGTCAATTGCAGCCCGNAAGCCTAATAAAATTCTGGCATTTATACAGTGC:1 - chrX 16487253 5' + baggins 5340 1 58.90 GCAATTTTACCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTA:1 + chr3L 2532411 5' + blood 22 2 65.93 TATTGGCCAGATTGATTTTATTTACTTTCCAATGATAACCCTATTAAGAATGACCTGGTTATTGTTGTTAGTTAAAGCTAAATTTATTTTTTCTTGAATTATTTGATTCGCCATTATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTCTTT:1 - chr2R 943956 5' + F-element 22 1 73.10 TTTCCACTCGCTCTAATGAAGCAACGCTTGCACACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 - chr3L 21764430 5' + hobo 43 1 69.70 CCAAATGCATCTGCTAGAACTTGGGCGATTCGATCAGATTGGACAAAATCAAATGCGTCTTGTTCTGTCGTCGGGTGATGTTAAAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGA:1 + chrX 8038570 5' + 297 6609 2 67.12 AAATTTAGAGAGCGGTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAAT:1 + chr3R 10144330 5' - Chimpo 161 1 68.49 CCCCTACGAACAGAAGACAGATTTTCGGTTAATTCCAATACTCTGCTCCGGTCACTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGC:1 + chr3R 7074801 5' + P-element 58 1 48.94 GCCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACCCGCGGCC:1 + chr2R 4730082 5' + gypsy8 322 1 78.57 TTACGTTAATTTTGAAATTAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAA:1 + chrX 9165322 5' + jockey 4816 1 53.42 TAAGAGTTTCGGTTTTAGTATACCAAGAAAATTGACTTATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr3L 10897576 5' - roo 9047 1 69.18 TTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCCGC:1 - chr2R 19230577 5' + I-element 63 1 71.54 GTGGTTATGCGCTTGGCTTGTCACGAACCATGAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTCACCACTCGACTCACACCCTAC:1 + chrX 860751 5' + hobo 28 1 63.01 GGTTTACAATTTCCGCGAAGGTTTGAAATACATTTTATATTTTCCGCAATTGTTACAGGTATTTTAAATTAAATTAAATTTACTTTATTTTCCAACTGATACCTTGTATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCAACAA:1 + chr3L 24996059 5' - 1360 459 1 71.72 CAAATAGTAATTATTTCGAAATAGTGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTGAGG:1 - chrX 22577210 5' - 297 359 2 36.99 CCATGGAAAAAATAAATCAAAGAAAGGGAAAGGGAAAATCTCAACAGCAAAAAACCAATTTTCCGCCTCCTTGACAAAAGTAATATTCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAACACGCAGT:1 - chr3R 4527312 5' - mdg1 385 2 58.90 AGAGGTTTAATCATTACAAAGCTAGGAACCTAAAAATAGGGCAAAGTCAGTTATACAAATGATTTTTAATACTATACATTTAGGTTACGATCGGTGGTCTAGTTCACAGTTTGTTTTTCATTCATATATGTATATTTATATATAT:1 - chr3L 20580182 5' - Stalker4 87 4 61.38 TGGGCGGCATCATGTTTCTAATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2R 8442742 5' + blood 7060 2 51.05 CTATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCCATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3R 6685822 5' + 412 7125 2 65.52 ACATCCCGAAACTAGTGAACAATGCTTGAAGCCCTTGAAACAAGAAAGGGATAAACTGTAGTTAACCAAGAAGCGAGAACCCTTTTTCCTGGTTCCCCCAGCTATGCCAGCCACATGCCGAGTCGGCCTGTTCATTATGC:1 - chr3L 18182608 5' + Tirant 175 2 77.86 TTTGCTTGCCCAAATTGGATTCCATCTCTTCATGACGGCACGCAGTAAATGAATTTTTCAAAATCTCCCGAAACAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTTTCTATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAG:1 - chr2L 15516825 5' + Max-element 16 2 75.17 TTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGG:1 + chrX 8469230 5' - hobo 2907 1 63.64 TGCGAGGAGCAACAGAGATAGCTGCTGGGTGGAAGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2L 7929629 5' + roo 8704 2 55.17 GAAATATATTACCACCCTTAAGACCTGACTGACCGGGACTTGACATAAATCATACTTAATTATAATCTTCTAAATATTACTGCCTAAACATTCCACTTCTTTAATACTCATAATCATATAATCTTTGTAAATAACTTAGATATTAA:1 + chrX 15746318 5' + jockey2 3298 1 77.40 TTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 - chrX 683600 5' + jockey 69 1 69.57 ATATTTGATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGTGACCGAACGAC:1 - chr2R 5953999 5' - flea 4934 1 72.60 AGCCGAGATCGCGTAACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAAT:1 + chr2L 14616167 5' + P-element 43 1 51.16 AACACATGTTCCGCTCCTTGCAACTTCCTAAAAGTATGCAACAGTTTGGCAAGCCAACAATACAGCGAAACGGAACTCAAAACTCTTTCACGATAATCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGCGGACGTGTTC:1 + chr2R 14385536 5' + jockey 23 1 71.74 TAGTGGCCGAAGAACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAA:1 + chr2R 19805425 5' + F-element 83 1 65.97 AGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGAAAGTTAAACACAAAGTG:1 + chrX 22679639 5' + Doc 84 1 57.53 AAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3L 17181440 5' + jockey 70 1 59.03 TCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATATAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAA:1 - chr3L 9324539 5' - HMS-Beagle2 248 2 68.15 CATGCCAGGCATCCGTATATAACTGTTTAAAAGGCCTGCGGTGGCGACTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCACTGTGTGAGCGGCACCCGCGACGCAAAACACCGTAT:1 + chrX 855303 5' - hobo 159 1 45.74 TAGTTTATTTATAGATTAATTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr3R 20904930 5' - roo 9042 1 63.70 CTGGTCACACAGACAGAAAAGTTTTGATTTCAGTCGGGTATTAGGCACATTCCTCGTAATATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCG:1 + chr3R 31266056 5' + jockey 10 1 71.43 AAAAGAACCATACTGACTTGGCCCAAAAACCAACACAACCCAATCCAATCCAATCCCCAAATGGCATCCTGACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 - chrX 6891553 5' + hobo 51 1 51.72 GACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGGGTGCGGACGAATTTTTTTT:1 - chr2R 9607350 5' + P-element 97 1 18.18 CAGAGACAAACAGTTCGTTGTTTTATTTCACTTAATCAAACAAATTTTACTTTGATTGTTGTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAG:1 + chr2R 15199072 5' + Burdock 6155 2 68.49 ACTTTTTGTTGGCTTAAAAGCACGTGATGTTATCAATTACTTTCGTATTCATTCGTTCTGTCTCAATGAAATTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTT:1 - chr2R 17650664 5' + pogo 41 1 57.14 AAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTAT:1 - chr2L 18219404 5' + copia 61 2 60.27 ATGGCATATACACTAAATAAGGACCAAGATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACACTTTTGTGTGCGGG:1 + chr3R 23964793 5' + hobo 43 1 54.79 AAAAGTATTATTATTAAATTGAAAACTAGGGAACCAATACATACATTTGTGCTCTGTAAAAATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 + chr2L 7929462 5' - roo 9053 2 66.44 AGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACT:1 - chr2R 12827062 5' + Burdock 68 2 67.36 CCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGTC:1 - chr3R 17077901 5' - 1360 3332 1 60.15 TGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGT:1 - chr2R 17350614 5' + F-element 60 1 53.79 CATGCCAGGCATCCGTATATAACTGTTTAAAAGGCCTGCGGTGGCGACTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGATT:1 + chrX 855303 5' + blood 169 2 61.05 TTTGAATGTTTCAGCTATTAATTTTAAAATATTTCGTTGATTTAAGATACTATGGAACTAACAACTGTATTTTACAATATGATCTATTTGTAATCTATTTAATTGAGCAATTAGTTATTATTTGTAAATGAAAATAGCTGTAA:1 - chrX 20559249 5' + I-element 5276 1 57.34 CATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTCCAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCG:1 - chr3R 27606676 5' - 412 7510 2 62.11 CCATCGAGTACAACAATTATAGAGAATACTGAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 - chr2R 9453419 5' + roo 8682 2 72.60 AGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAACTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTT:1 - chr3R 29288816 5' + BS 5022 1 63.01 GTGCTACGCCAGCGGCTATCCCACACCCACCATCACCTGGAGGCGCGAGAACAATGCCATTCTGCCAACTGGTGAGTTTCTTCATTTATTTGTGGGTGCGTTCTCCACTTCTCTCTCTCCCTCTTCGCTCTCTCTCTCTC:1 + chr2R 12453984 5' - 1360 107 1 70.00 TCGGTTGCCCAAAATATGCAGACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTT:1 + chr2L 15085605 5' + opus 7044 4 55.86 CATCAGTAATCTCCAAATTTCGGTGCTCAATCTCCAATTTTCCCTTCGGAACCCAACTTCCCACGAGCTATGATATCAAACATGCTTATTCAACAAAAGACAGGCAAAATCAAACAGATACAAAAAAAAATATATATAAAAAAACA:1 - chr3L 15179503 5' + Tc1-2 481 1 69.86 TCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTAAGCTT:1 + chr3R 7049379 5' + Burdock 84 2 80.69 GCACACGGCTTTGTGCGATACTTGGCTAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAACTGTTATGTT:1 - chr3R 11937839 5' - hopper2 1519 1 75.86 TTAATGTTGCACGAACTGTNAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGC:1 + chr3L 7848490 5' + jockey 78 1 68.89 AAAGTCAAAAAGTGTTTAAAAATGAGTTGAAAACTTTAATATTTAATTTAATTTAATTTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGC:1 - chrX 6216398 5' - Juan 4143 1 74.13 GTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTT:1 + chr3L 9324409 5' + HMS-Beagle2 6902 2 71.23 TAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGATTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCTGCAGTCAA:1 - chr2R 14532056 5' - invader4 3014 2 65.07 CGTGTATTAAGACTAATGGCCGAGAGCTGCCGGAAGTTCTTCATTGACAAAGACAGTAACGGAGGATATTCCATAGACAACATCTTTGGAATATTTATTTATGTATGTAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGT:1 + chr3R 7049310 5' + Burdock 6152 2 74.66 ATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGTT:1 - chr2L 15085717 5' - opus 7435 2 70.00 AAAAAAAAGAAAAACAGTTTGAAAGAAAAACAAGATTTTTCGAAAGAGGAAAATATTCAACGGCAGAATATTGCCCATCATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAA:1 - chr3L 15591495 5' + Doc 40 1 55.00 ATATAGAAAAACATTTTACTCTACTGATTTGCATTTTGTCAATTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTT:1 + chr3R 17987606 5' + jockey 22 1 68.75 AATCAAATCACTTTATAGCTATCGAGGAGCGGGCTAACAAATACACAGCTACTTATTGTAATTTCAGCCACACACATACATATTCATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCG:1 + chr2L 20407741 5' + McClintock 27 2 63.31 GCATCGAATGCCAGGCATGCTGTTCCTCTCACGTTCAGTGCTTGCACTTATGACGGTCCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTG:1 + chr3L 27654228 5' - Stalker4 7315 4 56.16 GATGCAGCAAAAGAAACAAATAAGTTACATTTAATTAATATGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAAGCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACT:1 - chrX 8876922 5' + mdg1 7122 2 71.72 CTGGTAGTTGCCATTACTTTTAAATCTATGTATGTCTCATTTTTGTATTCTTTGAATTGTATATATTTTGTCGGTGTTTTTTTTTTGTTAATTTTTTTTTTTCTTAGCTTTGGGGCTAACGCTGAGACTGGCAAAGCGATTATCCC:1 + chrX 7075269 5' - Ivk 217 1 67.12 GTAGCGGGTAGCGGGTAGCGAGGAGCTTGTTGAAAAGTCAGCAGCGTCATCCCCGCTCGCCAGGACTCTCGTATTTGGATTCAGATTCAGATTCTGATTCGGATTCAGATTCGG:1 - chr2R 20496309 5' + transib2 2547 1 76.32 GTGCATCGTTATACAGTAAGTTAGCTTAATGTGCATTAAATATATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 + chr2R 15199132 5' + Burdock 6215 2 75.34 ACTTTTCCCCAGCAGCATAAAGCTGACTTATGGAGAGGGGCCAGGACAGGATACATGTCCTGCAGCCTAAGTGGACTTCTTTGTCTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTG:1 - chr3R 31112300 5' - mdg1 383 2 57.53 TTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTT:1 - chr2R 8315602 5' + hobo 34 1 62.96 ACCCTGTTATTGCCCTAATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCACCTCATCACGCTC:1 - chr3R 10736179 5' + McClintock 10 2 76.71 ATACCATATTTGAAGAGGTTCGTTCCATTGTGTTGCTCAGAACAAAAAAGGCTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTGTTTGAATCTGTTTATTCGA:1 - chr3R 12948691 5' - Stalker 7189 4 54.86 CACCTTATGAAATAAAACGCCAATCTTAAAATATCTTAAGAGTATATACTGTTGAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAATTGGCACACGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCATTTTT:1 + chr3R 3282462 5' + 1360 81 1 72.79 TTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCT:1 + chr3L 17181461 5' + jockey 92 1 73.79 CTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCTG:1 - chr2L 20628676 5' - Stalker2 361 2 52.24 ATACGTAACATATACGAGCGTGTATATATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGT:1 + chr3R 19965186 5' + jockey 21 1 73.08 GTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 - chr2R 23094984 5' + 412 7099 2 52.05 GACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGTAACGGGGCGTGCACAA:1 - chr2R 2994306 5' + gypsy8 4793 2 54.40 ATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATAT:1 + chrX 9165343 5' + jockey 4837 1 67.81 CCGGTTCTCGAAATAAAAGACAGAAAGATCAAAAACAGTTTTTTCTTTCAGTTTTACAAACCTGGGAAAGACACAAAAATTCGGAATTACATTTAATTCCCTACCACTCTTATTTAATTGACCAAACATAAATATATATATGTATA:1 - chrX 14116458 5' + 1360 2960 1 75.34 CAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCAT:1 - chr2R 10977188 5' - roo 8991 2 68.49 AAATACAATAATATTTTATACACTAATTTAGAAAACAAAATACTTGAGTACAAGTTATCATAAGTAAGGGCAATGATACTGGACTTAATGCTAAGTCAGTATCCGGTCCGAATCTATTATGATAAATCAGCGAAATTTGCGGTTAC:1 - chr2R 16660292 5' + gypsy9 73 2 57.53 CTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGAACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATCA:1 + chr2R 7314624 5' + blood 54 2 51.37 AGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGTTGTCGTCTGTAG:1 + chrX 21442980 5' - Transpac 5158 2 69.92 ACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTTTTTTCTAATAGAAAATTGATCATAGAAAT:1 - chrX 12979522 5' + transib2 83 1 71.92 CATGATAATCAAATGCAATTTTGCGTAATGAAATATTTGTAGATAAACTAGATTCGTTGAAAAGTATATAACAGGAACAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAAAATATATACATATATTCCTGATCAGGATCAATAGC:1 - chrX 21575369 5' + INE-1 86 1 59.85 TGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGTTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTCTTAGTTAGTTGCTGCCCAGGTTTAAATAAATCAACTGCTCG:1 + chr2R 12185321 5' - accord 7247 2 60.27 GCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr3R 28014114 5' + roo 8743 2 73.29 AGTTAACCCTGGTTCGCAACCAGGCCGAGCTGACAATGAAAATTTTACGCGTTATCCTGGTCGTCCTCGCCGCTGTCTCCTGGCTGTCCTGCCGAAAAAGTGATGAAGGCAGCTTGTTCACACATGAACACGACTATATTTAAAG:1 + chr3R 28014046 5' + roo 8674 2 77.24 GAGGAGTGGCTGTCTGCATAAGATCGGTGGAAGAGCTCAACGTGCCTCTCGATCCGCTTGCCACATTGCTCACGTTGCCACCGATGCTGACAGACACTTTTGCGCTGATTGAGATCGCGTTCGAGAAATTCTTCTTAGGGTCTTCG:1 - chr4 714041 5' - jockey 4539 1 77.40 AAAAGCTCTAGTTCTTCCTTTATTGGAATTAATAAAAACGTTTAATAATACATAAAAAAGCTACTTGTGTTCTTTTTTTTATAAAACTTTCGGTCCGAATTCGTCAATATATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCC:1 - chr2R 4103363 5' - invader1 4002 2 65.28 CTACTCCATTATCCGAGACCACAGAAATTTAAATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGC:1 - chr2R 19108593 5' + jockey 80 1 58.90 AGTCTGGCTTTAACTTTGCGAATAAGAGATGCGGAAACGACGCGCACTTGCCAACGAACGTTGATTTCAAATATGGTGTAAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAA:1 - chr3R 7074916 5' - P-element 2845 1 56.85 ACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGC:1 - chr2R 23094942 5' + 412 88 2 78.08 GAGCGTTTGGCACACGGCGAGCGGTTGGAGCTTTCGGTGGTGGTGCTTTCGATGTCTTGGCTGTGGGCTTGAACGGTGCCGAGAAATCGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGAGCCTATGCAATNTTAAGA:1 - chr2R 14009157 5' + 412 7 2 76.03 TGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCG:1 - chr2R 5621021 5' + ZAM 8014 2 58.59 GCTTGCCCTTCTCACTCATATTGTATACATACTCATATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGATATGACAACCAACATGCTGTGGGT:1 - chr2L 5207512 5' - opus 7435 2 78.91 GAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATCTGGAAATATCTTCGGATTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATAT:1 + chr3R 5870826 5' - roo 8989 2 72.14 ATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCT:1 + chrX 21087546 5' + mdg3 32 2 59.86 GTAAATAAAGATTTCCACATTTTCGGAACTTCTTTTTCCGAATTCCGAAAACTGATGTACCATTAGAGTTTACACAATTACTAACCAGTACTGAGAGCCAAAAGAGCAGTCTACGTCCACTGCGTAGCCCCGATCTGGCTGTACGG:1 - chr2R 13132637 5' + BS 4658 1 59.59 TGTAGATCAGATAGGGTCGTAATTCATTGAATTGGGCACTTCAGAACTGGGACTCATCTAAACCACTCATGTGCAGATTAGATAGAGTCTAAATTCTTGTTGATAGTCTGGCTAATTTACGCTTTAAAATTTGTTTTTTT:1 + chr2R 23000123 5' + FB 723 2 70.71 ACGTGAATGGAATGACAAGCTTAGGATTCATGTAAGACACCAAAATGGCAACCCCAGTGCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTC:1 + chr2R 13090829 5' + I-element 11 1 73.85 TTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCATTAATATT:1 + chrX 13060215 5' - Tabor 400 2 74.66 ACAAGCTGATAAATCAGTTTTATGGCACTTTTGCCAAACTTGCATATAGAGTATCTTAAAAATTTAATTAATTTAATTTAATTTATTTGTGCTTTATCCCGTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGG:1 + chr2L 8536525 5' - Juan 4160 1 57.24 TATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTTTTTTAATTG:1 + chr3R 20841411 5' + Juan 82 1 69.86 TCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACCCTTAGTTGCAGTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATA:1 + chr2R 7314652 5' + blood 75 2 66.91 TGAAATTCCATCTGACTTTCTGCGTACCCCAGCCCAGAACCCACATTACCTTTTTCCGGGTCTCATCATCCTGTCAGTTGCAATGCGAATATTCTATATATGTATGTGTATATGTGTGTATTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAG:1 + chrX 18582108 5' + I-element 2 1 78.77 TACCAGTGACCCAGTGACTGCGGCGAGGGATCCCCTCTGCAGCACCCCACACTTATATTAATTTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATATAAGCAATGTATGTGCGGGTAGCTGAACCCAACTTCAGCACAC:1 - chrX 21907828 5' + Stalker 7158 4 56.43 GAAGTTCGGCACGCTGAAGTCGCCATGATACAAAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTA:1 + chr4 868590 5' + roo 8679 2 75.34 ATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCC:1 - chrX 14978627 5' + hobo 54 1 62.30 CGCACATATGTAAATATAAATTGATTTGAGTAAACATATATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAA:1 + chr3R 15283657 5' + BS 5078 1 72.41 ATTTCCCAGCCAGTGAAAAGCGAAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAG:1 - chr3R 23636451 5' + X-element 4264 1 51.97 AAGAAAATTCGAAAATTCAAACTCCTACAATAAGAAGGAGATACAGTGTTTGGAAAAGAAAATAGAAGAAACAAACTGTGCGACCACGCCCTCTCTTGCCTCCCATATTAACTACTGGTATGACTCAGGAGTCAACGAAATTTCAT:1 + chr2R 961136 5' - transib2 2658 1 53.42 AATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTACTTGTGATCCATCA:1 + chrX 8681453 5' + jockey 67 1 70.00 AATTACGACGCATATTAAATGGAGTGCAAACTCTTTAAATTTTTTGATTGTATATATGAGATTTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAG:1 + chrX 2956187 5' - copia 228 1 57.53 TGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTGAGCCAGG:1 - 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chr4 490316 5' - pogo 2053 1 62.50 GAAATATCATGTTTGTGCTATCTGGAGTATTATTACTTTAGATTGCTACAGACGCAAGCCTCGACTGTAAGATACCCCTTACTATGTGAAAGCGACTATAAAGGATAGTTATCTATGGTCGGAAACACCCTCAAGACCTGACTGAG:2 + chr2R 6526098 5' + jockey2 3185 1 65.07 AATGAATTTTTCAAAATCTCCCGAAACAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTTTCTATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTC:1 - chr2L 15516778 5' + Max-element 8282 2 53.49 TTTAAAAACAAATTTAAACACTCAAAATCTTGTTGAATACAATATATTTTTTTATTAGCTTTACAATTTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAA:1 - chr2R 13256108 5' + 17.6 6946 1 67.81 TGGTTTGTCAAAGCTGTTTAATTAAATTTAAAGCGAAATTACTTATTGATAATAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCT:1 + chr2R 5179583 5' - 1360 3319 1 67.81 AATTTAAATAAAATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACA:1 - chr2R 19108568 5' + jockey 105 1 55.48 CAGTCATTTGGTAATGAAGCTCAGAAATACGTTTTTAAAATCGTAATAATCACAATCACTGCAAATGTAAAAAGTATTTAAAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTT:1 + chr4 490204 5' + pogo 40 1 59.59 CGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGG:1 - 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chr2L 1045044 5' - mdg3 5415 2 74.66 AAAAACAGCAATCGTTGGTGCTTTCGAATGGCATGTTGAGTGTATTAAATTGCCATTTATTTGATTTTTGTTTTCGCCTTTCGCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3R 7625276 5' - hopper 1405 2 74.17 TTAATAAAGCCGCTTGAGAAAACAAGCGTCCCAAATTTCTTTCTATTCTTTCTGCCTGTCTCTTTCACTCATTTCGACAGATGTCAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATG:1 - chr3R 27707162 5' - P-element 2852 1 61.38 AAAGTGATTTATATATAGTAGGTGAGCAAACCAAAACGTTTCGAAAAGTCATCGGCTCCATACATTTGGGGTTGATTGCTCCTGGGGCAGCTATATATATATATATAGTAGCATATGTGTCATAGTATAAGACCACATATACTTAC:1 - chr2L 21803008 5' + Quasimodo 19 2 69.18 CTGTGAATGCCTGCCATAAGATGGTGCAAAAATAAAATGCTTTTTTGTTTAGCCTTATCTCAAATAAGTCTAGCTGTTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr2R 9870954 5' - roo 9028 1 55.17 TAAAGATTTGGATCGTATTAGCGAATATAATTTGAAGATAATACAAAAATATTAATTAATAAACACTTCCACATGATAAATACTTTTATTCTTCTGCCGAAAAACAAATAAAAAGAGAGAATACTATAGTCGAGTTCCCCGACTAA:1 + chr2R 5190092 5' - INE-1 565 1 75.34 TCGGAGATTTTCCGCCTGCATCCTGTGGCACTCTCAAGTGCATTTTAATGGATTTTTAGTTTTCGGTAGAGAAATTCGTACATATATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCC:1 + chrX 9519440 5' - 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chr3L 18549794 5' + X-element 82 1 66.20 ACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTCGAAGTATTTTAGTATTAATATATTGGAAATACATTAAA:1 - chr2R 11778056 5' - hopper2 1529 2 65.52 TAATTTTAAAACTTCTTTGGCAATGTAAAAATGATTTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGA:1 + chr2R 21795210 5' - transib2 2797 1 66.90 AGCTTTTGTGCTCGGCCACGTTGAGTGCGGTCAGTTTTTATTGTTTTTCTTTTTTTTGCGCGCGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 - chr3L 18183186 5' - Tirant 8446 2 61.38 ACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAG:1 + chrX 609360 5' + 1360 55 1 56.16 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATAGGAAAAAACTACTTCCGAAGGCAGTAATAAGTCTTTTGGAAATACAGTCTAGTCTTAAACCTGATCCATCAGACAAAATATTGGACTCACATTCTGATTCT:1 - chr3R 27036955 5' + transib2 2528 1 73.97 CTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chr3L 9635299 5' + Doc 33 1 47.50 GGGATTGAAGAAGAAAATTAAAGAGTTAATCAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCCAG:1 + chrX 22564436 5' + 412 91 2 84.93 TTTTACATATTTATGCACACTTGCGGCGACTTGTTTACGACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACCCAA:1 - chr3R 11756817 5' + Tirant 38 2 58.42 TCAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTT:1 + chr3L 9635289 5' + Doc 2 1 59.60 GGATTGTCGATTCCGTTTAGCAAGAATAAATCAATGACATACTTAATATCTTTTGGCAAAACAAAGTACATAAATGCCCGTAGGCCTAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3R 11516479 5' - roo 391 2 72.87 TTTAATACGTTGCCATTGGTGTTTTAGAGTGTGTTTGCGGGCACCCATTGGCCATAATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACT:1 - chr3L 17268387 5' + hobo 13 1 75.34 ATGACTAAGAAGTCTTTTCTTTTAGAAGCACTTTTTAAATACTTTCAGTTACGTTCATATGTACATATATTGTTGTCTCGTACCTTATAGAAAGATTTAGAAAGTACGACCGCAGAATACTTTATTTTTTTACATTATATTTATTT:1 + chr2R 13574561 5' + Cr1a 4323 1 57.53 AACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCA:1 - chr3L 10033676 5' + blood 108 2 45.89 GGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 6050231 5' + 412 7125 2 66.44 AAATATTTACATTTATAAAATGTACTCTTTATAAATGCTAATCATCGTAGTGATCTAATCATCATCATTATCTGCGTAATCACTACTCTTTTGGAATGTTTCGACAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 + chr3R 26472759 5' - 1360 3368 1 69.86 AGTCCGACTGGTACAAATTACTTAAGCTAGAATTAAGCCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACG:1 + chr3L 23146450 5' + 1360 17 1 69.11 GGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATT:2 + chrX 6538637 5' + pogo 47 1 52.05 AGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGTTAAATTATATTT:1 - chr2L 10461217 5' + roo 8737 2 70.80 TTATTGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATT:1 - chrX 7702845 5' + P-element 44 1 55.48 GGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGT:1 - chr2R 21713317 5' - P-element 2811 1 30.34 TCTTTCGAATATGTTATTGAGTCAGAGATTATCGCGCTTTGTTCGCCTGCTCTCTAATCCTCAATAATCGATGACAATATGCGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAAT:1 - chr3R 10714273 5' + 297 31 2 60.00 GTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTATATGCACGCAGT:1 - chr3R 6685810 5' + 412 83 2 73.61 TGTGTTCAGGGTCCGAAAATTAATTTAATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2R 15392480 5' - mdg1 403 2 71.33 CTTTCTGCATTCCCGTGTTCTTGCTCGCCGGCGCATTCGTTAAACATTCACTTTCTCTGCTGCAGGATTACACGGGCTAATCCCATCAGCCGCCGCGAGACCTGAAACTCGCCACGGTATTTGACGAAATAAACAAGCACTCG:1 - chrX 15287005 5' + X-element 4388 1 62.94 TTTTTTTGTGTACCCTGTAGGGTATTCGCTAGCCGCCTATTCTCGCGAAAATTGAAACAAAACTAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 + chrX 3666506 5' - roo 349 2 60.27 ATCTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGAGTGCTACT:1 + chrX 18149958 5' + hobo 50 1 50.00 AGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTT:2 - chr3L 17012032 5' - 1360 3318 1 65.75 ATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGATTGGGTATAACATAGCGTCAATACATTGTGACACT:1 + chr3R 12948597 5' + Stalker4 7013 4 54.11 TGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 - chr2R 9341629 5' - roo 353 2 76.36 ATCCATATGTACATACATTTAGCTGTTAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAAC:1 - chrX 15834520 5' + Bari1 35 1 62.33 ATACGATGGTAGCTAACAGCAGCAGCATCCGATTTGTGCGAGCGGAATAACCGTTAGTAAAACTATGGCAAAAGCTTGCGGCACAACCCCAGTTTTTATTTTTATTATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGT:1 + chrX 3382263 5' - pogo 2094 1 67.39 GCGACATGAAAGTTACCCTTTGCCACCACCGCCAGCCAAAAACTATAACTACTCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTT:1 + chr2L 17019080 5' - 412 426 2 65.75 TTTCCATATTCGTTTTGCTACAATCGGCCTCGGTAGTGGGGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - chr3R 26242591 5' - roo 9049 2 63.70 CCGCAATGAAACACAAAAATCTATTAAAATTATCACACGCCATGTTGACCTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCAAATAGTGACCCCCCAAGTCACTACCAGTGAA:1 + chr3L 3643208 5' + X-element 125 1 60.00 GTTTGTTGACTTCAAAGTAATAAATATATCAATAATAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTTGGCAGA:1 - chr3R 29680277 5' - 412 7460 2 76.71 ATGATATCAATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 - chrX 18673758 5' - roo 352 2 53.10 CACATTAGAAGTTATTTAAAAGCTGTTTGAGACTGTTAATTCGTTTGCTAGAAGCTTTTGCATAAATTGTTTTAATTACTTTTCCTGGAGGAAGTATATTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACA:1 - chr2R 8966270 5' - BS 5063 1 62.33 AATAACAGCCATAAACACTTTTTAAATTGAATTTTAACTATTCATATGACTTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACC:1 - chrX 14978672 5' + hobo 24 1 63.50 CCATAATGTGCCAGCGGGACAATTAACGGCAACAGTCCAGACAGTCGGCCTGTGTAAATACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGT:1 - chr3L 17268336 5' + hobo 38 1 52.50 TCATTCATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACA:1 + chr2R 19574402 5' + I-element 5121 1 62.69 GACTGTTCTATTTAGCATAAGTCAGCGACTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGG:1 + chr3L 18846903 5' - 1360 3378 1 76.71 TACTCTGCCTGCCCAGCGAGTAGAATCATCAGTTGCGTTTGTAATTTCCGAGCGTTTACTGTGACGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr2R 12462228 5' + roo 14 2 61.00 GGGCCACGAAGACTCGTTGTCGTCACGCACGACAACAAACTTTTCGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAA:1 - chr3L 10033713 5' + blood 7030 2 70.55 ATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCG:1 + chr3R 24072042 5' + jockey 86 1 63.70 ATGGCCATATGCCTGAATACCCATCATCAGGCTCCAGCAGTCTGCTTAATTAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3L 20061280 5' - roo 402 1 79.45 GCGTGTTGGCAAAGTATTTGGCAATGGGATCATACTCCTCGCCATCGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTAATATTGTTAT:1 + chr3R 17783551 5' - mdg1 7058 2 77.78 GCATTTACTTTCAGGTTCGCCGCCCGTAGCCTCTGGAACACCTCCTTCAAATCTGTTCAAGTTACGGGGTTTGGACTGTCACCCGCTCTCCGCTCCCT:1 - chr3L 25232907 5' + GATE 33 2 51.02 TATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTT:1 - chr2R 17350601 5' + F-element 22 1 69.15 CTTAAAAATTGGGAACCACCCACTTTAATTTCTTCATGTGTGTGAGCACAAAGGATACGTGAGATTAATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 - chr2R 19389432 5' + 297 53 2 54.48 AATGGCTGGTAATAGCTTTTATGTAAGTAATAATATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGAT:1 + chr3L 15718026 5' + 1360 19 1 65.75 ACAAAAACATCAATTTGCGACTTTTAATGGCATCATCATTGACTCAATCAGCAGTGAAACTTTCATTTGCCACACATCCAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 + chr3R 17259497 5' - roo 9028 1 56.16 AGGTAGTTGCGGTCCTCGCGACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chr3R 17627596 5' + roo 29 2 52.88 TTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTT:1 - chrX 20149231 5' - pogo 2036 1 65.75 TTGCTATTATGTTTTTTTAATAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATAT:1 - chr2R 8286836 5' + Burdock 6146 2 73.43 AAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr3L 15148585 5' - roo 9047 1 54.81 TCGGGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAG:1 - chr3R 8050553 5' - hopper 1362 1 54.11 AGTGTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTAT:1 + chr3L 9324406 5' + HMS-Beagle2 15 2 73.79 CCGTTACTCGTATAGTAAAATGGGATACTAGATTCGTTGAAAATTATACAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCAAACTCCATAAAGTATATGTCGCAGATCATTTAAATGAAACGAAATTTCGTGTTTCTGCTTGGCA:1 - chr3L 21858920 5' + invader1 27 2 65.44 GTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr2L 512397 5' - roo 9036 1 58.90 AATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTT:1 - chr3R 31114361 5' - flea 4947 1 65.07 AACACATTTACAATTATTGTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACCCATACATCCACGGCGTCCTCTGTGAGTGGGCTTACATACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTC:1 - chr2L 17574658 5' - hopper 1390 1 66.90 TGCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAG:1 + chr2L 9383711 5' + flea 4794 2 57.53 TAATAATGTCTTTTTAATAGATTATGTTATAATATCTAAGAGAAGATAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATA:1 + chr2R 24215637 5' + I-element 5349 1 67.81 TTAGTGTCCTGCCGCCGCCTTTATGGGTCCTTAAAAGCCGCTAATGAAATCAATATAGCCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAGTTTTGGGCTCCGTTCATATCTTAT:1 - chr3R 29627945 5' + roo 42 2 54.40 CGTGTCTTGCTTCCTACGCAAACGACCGTCAAACACGAACTGATCGCAAGCGCTGCACTTCAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chr2L 14263046 5' + P-element 47 1 50.38 CAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTTACACATGAACATGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAACTTAT:1 - chr2R 18887034 5' + roo 69 2 73.17 CTAACGTATTGAATGTTGCCACATAACCTACAAATCCGTGCCCAACTACAGGCACACCGACAAGGACAAGGATAAGCACCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 5953917 5' - roo 9028 1 55.48 TTTAAAATTATTAAAATTTGTTTTATATATTTATGTGCGCAGAAACTCTTTTTACTAGCTTTTCTTAAACAATATGAAGGTAGCATTAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCT:1 - chr2L 11523177 5' + HMS-Beagle 30 2 63.70 AGGACAAACAACAGCTGCTACTAGGATACCACACACACACACACAGACACTCGAACACCTTTCACACGGGGATACAAAAAGTGTGCACTTCATGTTAAAATTGAAATTAAAATGCTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTG:1 - chr3R 10421015 5' + Tabor 10 2 69.86 AATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCATCACTATAACTCTACTCTACATATA:1 + chr2L 20628533 5' + Stalker2 20 2 39.06 GGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGT:1 + chrX 19662980 5' - P-element 2801 1 26.71 GGCTATTGTGGCCCCAAGTCACTGCCAGATTGAGCTTCCCTGTATCCTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGC:1 - chr2L 12932212 5' + opus 7146 4 64.34 TTTTGAAAAGTGTGAGGAGGGTAAAGTTGACAAAGGTCAATAAAAGTCGGGATTGTACTAACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGG:1 - chr3R 11076250 5' - I-element 5299 1 56.85 CCTGTTACCATTCCGTCTGCATTCAGTCGGACTGTGGCATATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGT:1 - chr2L 12932167 5' + opus 38 4 64.15 TAAATATTGTCTCGAAATACAATTGTTTATATATTTCGTACATATATTTGCATTGTGAAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2L 9704774 5' - roo 9009 2 61.11 AAAAACAAAGCACTACGTTTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGCTTAAAT:1 + chrX 17792518 5' - roo 9011 2 57.53 AATAGAGTCAACATTCCAGCTTGATCGAAAAACATAAAAACGGGGTATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAACAGCCGCATACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTA:1 - chrX 22862606 5' + 17.6 66 2 67.15 TTTGTTCCCGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGG:1 + chr2R 21796036 5' - roo 9018 2 69.49 ATAATAATTAGCCCACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACG:1 - chr3R 30955433 5' + G-element 13 1 66.39 AACGCAAAGACACTAGAATAACTAGAATAAATAATGCGTAGAAAAGAGCGGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGG:1 - chr2R 2053923 5' - 1360 63 1 88.19 TGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGGATCTTCTTACATGCCCCTTCTTCATCATATTCTCTAA:1 - chr2R 4261949 5' - invader4 204 2 67.81 TATCGCTAAATTTTCAATACTTCACAGACTAAGTCAGAGAATTAAGGTGTTAGCTAGTTTTAATTGACAATATATTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATG:1 - chr3L 3317380 5' - pogo 2056 1 50.68 TTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATT:1 - chrX 13628858 5' - roo 9038 1 63.01 AAACGGAGGCAAAGAAGTGTGATGCCATATATGGCGATGGAAAACCTTCTAATATATGTACAAATATTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAAC:1 - chr2L 11617847 5' + 412 9 2 78.77 TTTGCATTATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 + chrX 5751866 5' + roo 8745 2 76.06 TTGGCACACCGCTGCGTATGCTTAATACGATTTGGGCCCAGCCATCAGATAATCACTGGGTATTTCAGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 6050134 5' - 412 450 2 50.37 AATCTAAAGTCTATGTTGCTAATCAGGAATTAAACTTATTTTATAAAAATTATGATTTCGACTCGGATTGTTATACCCGTTACTCGTAAATTAATAGGGTATACTATACATATAAACATATATACATTCTTGATCAGGATCAATAT:1 + chrX 15903126 5' + INE-1 85 1 72.60 CAAGATACATACACCAATGTGCCAATTCAGTTTTTCAGATATAAATTCAGATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGAC:1 + chr3L 1437878 5' - Transpac 5175 2 61.24 ACTAAGATGCACTCCAAGGAATTGCCATTTTTAAACCACTACTTTATTTTTCCTTCAAAGTAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATT:1 - chrX 666374 5' - 412 7492 2 57.86 TGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3L 5027180 5' - roo 9005 2 63.01 AATGTTGCTCGATTCTCGCAAAGCACTCACTCTGCCATCTTCTTGCTTTGCTCATAGCTTCTGGCTTCGCTTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 - chr4 317875 5' + Tirant 8133 2 65.38 GTCGTCTCATTTTATGCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACG:1 - chr3R 30569119 5' - mdg3 5475 2 56.85 ATCCTTGATACTGTTGGCAATCTGCAAAAACCTTTTAAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chrX 18149939 5' + hobo 31 1 63.01 CCGGTTGAGTTGCGTGTCCGCCTTTAATGGGATTTACGTGCAAAGCGTAATTACAGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTG:1 + chr2L 7633333 5' + Max-element 8253 2 68.99 TATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 5841929 5' - roo 323 2 76.03 TCTAGGGATCAAAATCGGGATTGGAAAAATTCTATTTTTAAATTCGTTAAACAGCTGACAGTCAGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chr3L 13993666 5' + P-element 57 1 46.58 GTTTGTACTTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGTTTTTATTTG:1 - chr3R 24084894 5' - roo 9031 1 52.99 TGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTT:1 + chr3R 11284914 5' - blood 7315 2 70.71 GCAATGCGACTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACA:1 + chrX 6891463 5' - hobo 2912 1 54.74 TAATGAGCCCACAGGGAGGTACACTGAAAAAAATCTTAAAGCGCTTTAAGGATTCATTAAACTGCAATGGCGTCATACGGCATTTTGAAACAATACTACGCTCACATATAGATATAAGAGCGCTAGAGCGCGAAGAGCGCTACAGC:1 - chr3R 12622419 5' + 1360 114 1 79.45 CGTGTTCTGCTCAACAGTTGCCCAGACACACACGAAGCCCTATACATACATACATACATAGATATGTATATCGAATCACTATACATCCAAATACATATACAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chrX 7851214 5' + 297 4 2 78.57 TAATGTGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGATCCACAT:1 + chr3L 25206785 5' + HMS-Beagle 6821 2 65.93 TTTTTTTTGGCAATGGTAGGACAAAACTACGTAATAAAATAAGCATAATCACTCACAATTCTTATCTATACAATTTTCGAAGGTAAATAGGTTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTT:1 - chr3L 7024575 5' - 412 471 2 63.97 TGAAGGTGTGTGTATACCAAATTCTCAATTTTCTCTTCGAGTCGTCGCAAACAAAAACCCTGTGAGATCATCGAAATGGTGGCGTACTACGACGAGTGCGACGCTCCGTTTGCCTCTATGCTTGTTGCTACT:1 + chr3L 224179 5' - invader2 118 2 78.79 AAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCG:1 + chr3R 28749108 5' - mdg1 7388 2 63.01 CATACATAAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTT:1 + chr2R 19574407 5' + I-element 5138 1 54.11 AATTATTGGCTGCCGCCGACATTTCCACTTGCACTGGGAAAAAAACACAGCCACAGACATTGAAAATCGGTAGCTAAATAAAATCTTAATCTAATTT:1 - chr3L 10380826 5' - Quasimodo 7261 2 75.26 GAAATGAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTA:1 + chrX 9165335 5' + jockey 4829 1 62.33 AATTATTTTCTTATTGCGACGCCAACACGCATATATGTACATAAATACATATATTTATATACATACGTATGTATTCATATATATGAGAGGTAGGAGATATAAGATACATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACA:1 + chrX 13628685 5' + roo 8681 2 74.66 CATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGC:1 - chr2R 17493147 5' + BS 4868 1 74.60 AATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATGGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGA:1 + chr3R 24480463 5' + blood 7078 2 60.27 TTGTTGACATAATATTTCTTAAAAAGTAGAACAATAATTAACCCATTAAAGCCGCCCACTCGGCGTAAAATTTTGATGTGTGAAGGATGTTCAAAACAAAAAAAAAA:1 + chr2R 19338687 5' - Tc3 93 1 65.42 GCAAGAAGGCTCCGCTTCTTTAGCTGCTGACGAAAGCGCCACATATTCCGCCTTCGCATGCTCTTCAGTCCTTGCACGCTCACGGGGACTACCAGTCAAGGTATGGTTTCGTTGCACAGAATGTGAGGCCAAGTCGCACT:1 - chr3L 23974072 5' - Rt1b 4948 1 62.86 TTTCTGCGTTGCTTATCAATTTCGGCTATCATTACTATATACAAATTGCCTGGCGAGTTATATTTAGGGTACGACTATAGAACTAAGTTTATACATATATATATATGTCGTGGCGAAAATAATGAGTATGCGTGTAGTCGCTGTTT:1 - chr3L 3861557 5' + micropia 4976 2 68.49 GCGTGGAAACTATTTTAGTCAACTCACAGTCTTAATCGTATAAAGTTTTGGGTGAAGCATGAAATATATTTGACTTAACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAA:1 - chr2L 20029494 5' + I-element 50 1 51.39 CCGAGCAATCTGGCAACCTAATCCACCAGGGGCCCAGCATGGGTCACCGGAAATGGCCCACACAAACACACACACAGACACTGGGATTTGAGACAACACCAATACCAACACTCAGAACACACACACACACACACAC:1 - chr3L 11672624 5' + accord 7029 2 66.18 TCCAAACGCTAATAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2R 17269108 5' - roo 9015 2 60.14 CCTGGTAAATAGACATAGTTTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGTTTTTTTTGACA:1 + chrX 8469211 5' - hobo 2879 1 62.22 GGCTCAAGGCATGGCTATTGTTTTTGTCGCGTTTTCGACCGAATTATTTGCATCTGAAAACCCACTGGTGACAATAGATGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 - chr3L 7389818 5' - roo 9038 1 58.09 CCTCCGCACTTTGGAGCTGGGGGTTTTAAAACACAATCAATTTTATTAGCCGAAATAAATTCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCTAAAACTAACAAAAATTGCA:1 - chr3R 7462970 5' + I-element 423 1 58.22 GCCTGTTGACCTTCTTTAACTTTAACTTAACTTTGTTTGGCCACATTTTGCATATGTGCGCTATCTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 - chrX 9951364 5' + jockey 32 1 52.74 CGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTCGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chrX 13628827 5' - roo 9008 2 59.31 CTGGTGAAGATTTGGTGGTATTGATCCCAAGAGAAACGTCCGTTGGAGTTGAGTTTGAAATTCTGAATGAATGTTTTATTTGTTTCTGATTCTTAAAGCTAATACAATTTTCCTTTTAGGCTATGAAGTGCGCCTTCGCTGC:1 + chr2R 5039341 5' - gypsy11 4285 2 59.15 TATGTGCGCAGAAACCCTTTTTACTAGCTTTTCTTAAACAATATGAAGGTAGCATTAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCAACGCCAACGAACGGTTAAG:1 - chr2L 11523146 5' + HMS-Beagle 61 2 64.38 AAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTAGGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGA:1 + chr2L 310057 5' - P-element 2827 1 45.21 GCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACG:1 + chr3L 20189592 5' - FB 212 1 44.52 AGCCAAAAGATTGAGGAAGAGTAATTTTTCGCCAGAGATGAGCGAAAACATCTGCGGATCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAA:1 + chr3L 17482073 5' - 297 338 2 61.38 ATGCGCCCTTTGTCATGCTTCTCTACTTAGACTCTACTCTACTGCCATTTCATTTTAATGACTCACGTGACTTTCACGTATCTCTTCATTCGCATGGGAGCTGAGCAATCGAGTG:1 - chrX 22862405 5' + jockey 14 1 74.78 CGCATCCGCATCCGGTACCCGGTACTGATGTCAACAAGCTACCACACGCAACTAATTCAAAAAATCCAACGACTGCGGACCACTGCTCCAGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGC:1 + chrX 20330340 5' + P-element 15 1 52.71 AGGGCCAGCTTGAAGCGTACGCATGGGAATTCCTTGGTCATCAAGGACATTGCACATAAATTGGTAGCACAAGAGGGCCTTTTGAATAGGAAACGGTTTAACCAATCTTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTA:1 - chrX 2956331 5' + copia 4886 2 73.97 AGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGCTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 + chr3L 15148586 5' - roo 9004 2 63.01 CACGTTGCCCGAAAGTGCCGATAGAAAACTCAATTAGGCAACGAAAATGTTCATAAAAATCAAGTGCCTATGTCCCGCCCCCTCCCTGCACACCGACTATGTACATGTAAGTAAATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTA:1 - chr3L 9324598 5' - HMS-Beagle2 7180 2 71.72 ACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTG:1 - chr3R 9298560 5' - hopper2 1542 1 61.64 TTACATTTCTTCTTGTCCGAAAACACAACATAATGCCACTCCAGCTTATATGCTCTCGAGCAAAACTCAGGTGTGCTTCTTTTTGCAACTTTTTCGTTTATTTGTCACAGCTTTGGCTGGTGTACAAATATTCTGAG:1 - chr3L 24109977 5' - gypsy4 407 1 67.15 AAAACCAAACGATTGCAGCTTAAATCTAGTAGATCATCCTCTAACCATGTCGGGCAAACTGATCATGAAGCGCAAGCGAGCCAGCCAGGAGGAGCAGCAGCAACATCAGCAGCAGGGAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGC:1 - chr2R 17475991 5' + 1360 3381 2 67.12 TTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTT:1 - chr3L 2532532 5' - blood 7322 1 64.38 TCAGAAGCTGCGAACTTGTTTGCTCAATATGTTTCACACACAAGCGCACGCACACTCACACTACACTCACTCTCGTGCGCTGACAAAAAGCGGAGACAACGAGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr3L 10740172 5' - P-element 2867 1 71.72 ACATGCTGTTTGTCTAAGATCCACAGTGGTGTCCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAA:1 + chr2L 15874815 5' - mdg1 7431 2 65.07 AAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAATAGAGATTCAGTATGATATCAGTAAAATTGTAACTTCTGTTAAGACTCAT:1 + chrX 13060209 5' - Tabor 7246 2 70.34 TCAAAAGCATTTACATATATCAGCATAAAATAAACTTAAAAATCCATTTCAGTTATTTTTGTCTTCGGCAATTGACATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAAC:1 - chr2L 544934 5' + Doc 51 1 53.79 CATAGTTTAGATAATGTCCTAACAAACAAATTGCTCTATATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTTTTTTTGACACCCTACT:1 + chrX 8469224 5' - hobo 2872 1 68.99 ATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTAATATTGCG:1 - chr3R 5165013 5' + invader4 53 2 66.41 AATTAAAATGTAGAATCTAGATATTTTGTTCATTCATATTCATTTTTATAGGTATATCTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTTGTTGTTTTATGCCGTAAGCTTGTTGCGCGCG:1 + chr3L 20224140 5' - Chimpo 124 1 63.12 CAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 5027190 5' - roo 8995 2 69.86 TGGACAGACGCACATTTATACACAATGTAAAAAATAAGTTAATTAGAGTTACAACAATATATGTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACTTAAGTGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCAC:1 + chr2L 18181110 5' + blood 118 2 43.84 ATAATTAACTGTGAATGGGGCAACACATTTGGGGGATGCTCCGAAAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTAC:1 + chr3R 30087621 5' - roo 402 1 57.53 AGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTT:1 + chr2R 16274551 5' - roo 351 2 60.61 TGTGATGTGTCCAAGATCACGAAAGTGAATGAAAATTAGAGAAAATTGGTTTGGCACATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTCCGCTCGCTCCCGCTGAGAGCATAAGAAATCTAAAAATAGAATTTGCT:1 - chr4 909143 5' - 1360 3269 1 69.86 CATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTT:1 - chr3L 14422840 5' - roo 357 2 54.11 TTGTTTCTTACACAGTCTGTATGCGATAATCGTGACTTTAAAATGGTGATATTTCTATAATTGGTGTAATTTGTTTGAAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTA:1 - chr2R 10119120 5' + Juan 4039 1 74.66 AGGACATTACGATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAAT:1 - chr3L 20061448 5' + roo 48 2 52.05 AGTGACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chrX 19662957 5' - P-element 2840 1 46.15 CTAACAAATACACAGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCA:1 + chr2L 20407774 5' + McClintock 6018 2 67.59 TTATTTAAACTAACCACTAGTAACCACTAGTTTCTTAAACACTCGGCAAAAGGAAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGCGTTTTCCTTGCAGTTGG:1 - chr3L 2532566 5' - blood 7356 2 62.33 GATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr2R 9453373 5' + roo 64 2 65.07 GGGTTTCCGCTTATTGATTTATGGAAACAACTTGAGTGCCATATGAAAGGGGATACTTGGGCCTGCTTTTCATTATGCTGACCGATTATGACACTTTTTAATGGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGG:1 + chr3L 7851482 5' - jockey 4777 1 75.34 ACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTAC:1 - chr3L 21770994 5' + hobo 75 1 69.29 AATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 18673750 5' - roo 9011 2 57.75 GACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGTGTG:1 - chrX 21045273 5' + P-element 81 1 28.77 ATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGA:1 + chr3L 5027156 5' - roo 9029 1 54.79 TCCCTATGGATGACGTAGATATAATAAATGCTTTTTGAATTATGCGATAGTTGGGGAATAGCGTATGTACATTTGACTAAACTCACATCAGGATTTAGTTTTTGGCACAAGTTGGCACAAATCATTTTTCACTCCACAATAGACGA:1 - chr4 904944 5' - transib3 398 1 63.70 TCACTCATTTTATAATGTTAGCTGTTGAATTTATTCAAAGGAAAACGCATTAAAAACTTTTTACAAATTGTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCAT:1 - chr3L 22294515 5' + pogo 46 1 54.11 AGTCAGCTGATTGATGCTAAGGGGATTATTAATATCTCGTGGGTTAGCACCAATAGGGTTTCGGGATGTTTGCTAGTTGATTCGGGTGGACCATAAGCCTGTCGGCATAACGGCTG:1 - chr4 108141 5' - G5 4560 1 59.48 AAACATTAAAATAAATTGGAATAAAATTTGTTCTTTTTGGAATTTAATATTTGGTACCATCTGGAGATTCGAGGATTACTGTTTCCCTCTCCCTTTTATATTATATATATACTTATTGCCATTCAAAAAAAAAAA:1 - chr3L 17219463 5' - FB 186 1 74.81 GAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATT:1 - chr3L 8249455 5' - mdg1 340 2 74.66 GGACAAGAATCGGTTAGCAAAGAATTCACAAATTCCCAATTTACTATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGC:1 - chr3R 19506809 5' - mdg3 5421 2 69.18 CAGGTCCTAATAATAGACGGAAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGA:1 - chr3R 23964949 5' - hobo 2918 1 71.23 AAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGC:1 + chr2L 8284358 5' + Doc 432 1 58.22 AATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAAT:1 + chr2R 21795260 5' - transib2 2752 1 72.14 ACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGCGATCCATCA:1 + chrX 8681448 5' + jockey 67 1 67.20 ACCTGCATCAAAACTAGCAAAACGGATGTCACCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chrX 21233349 5' - roo 320 2 82.76 AATTGTGATTCCACTTTGTTCATTGATCTCAAGGCTTAGCAATATATTTAATCAGTGTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATATAAATGAATCGAGAGCGATAAAT:1 - chrX 17792614 5' + roo 8730 2 63.70 TTTCCACCCACCATTTGCATGCAGACATTTTAATTTATATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCACCATGCTAA:1 - chrX 9519549 5' + 17.6 67 2 80.14 TTTGCTTTCGATTTGTTGATTTTAACTATTTTTATACCCGTTACTCGTAGAGTGAAAGGGTATGCTAGGTTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGTGTTTCGAACTATAAAAAGTACATATTTTCTTGATCAGGATCAA:1 + chrX 22794408 5' + INE-1 82 1 75.34 ATAGCAAACTACGTTATAGCTACCCGATGCATCGCACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGA:1 + chrX 8681413 5' + jockey 11 1 73.33 TTAAGCAAATGGAAAAATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATT:1 + chr3R 20841385 5' + Juan 54 1 52.78 ATGGTAAAATGATGAGTACATTTCGTAATGCGTTTTTTTTTTTATACACTAGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGATTTACAAT:1 - chrX 3666597 5' + roo 19 2 55.91 AAAGTGCAGTAAATTTGTTCGGAATGGAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTAAATATCTTCGGAT:1 + chr2L 2241217 5' - roo 9016 2 55.63 AACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACA:1 + chr2L 20628511 5' + Stalker2 7264 2 36.99 GAATCTAATTGGCTTGGACATGGTGGTCAATTGCTCCCGTTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTC:1 - chr2R 9607366 5' + P-element 4 2 63.64 CAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3L 22320157 5' + jockey 70 1 58.90 TAACTTTTTGGCTTTTAATATACTCGGCCAGACCCGAAATTTCCGCCTTCCGCCCCCAATCATCTGCCTTTTTTTTTTCTCATTTGTTTATTTTTATTTGTATTTGTACTTAAGTTTTATTTCATTTT:1 - chr2L 9401563 5' - Tc1-2 390 1 53.12 GATCCGGTCTACGTCTGTTATGCAAATATCTTTATATATAAATGCGGATGCACTGCAAAAAAATTATCAACAAGAAGTTTGAAATATATGTAATACATTACATTTAAGTCTATAGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAAC:1 + chr2R 21958351 5' + 297 6585 2 74.66 CGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTCCAAACA:1 + chrX 860803 5' + hobo 80 1 73.29 AGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGC:1 - chr3L 414928 5' + 412 76 2 69.86 AAGGTTCGTAGGCTCACTAATTGCGTAGCATACTTTCCGGGGCTTTTAAAACGACTATTCGCAAGAAACAACACTAAAAGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 + chr3R 13339005 5' + BS 5038 1 53.42 AACAACAAAAAAGATACAATAACGTATAAAATCTGCAGGATTTTCAAATGTCACGTATTAGCGCCGCAAAGCATGCAACAAAATTCGAAAAACTCAAAAACCTGTGTAAATTATTTACTTTTATCTATTTATTTATTTATTTAGAA:1 - chr3L 5622137 5' + copia 228 1 74.66 GATCTGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTG:1 + chr2R 7895516 5' - mdg1 364 2 55.48 CCCCATTTCGGTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTG:1 - chr3R 11285016 5' + blood 7051 2 57.93 ATATCGCTCAGTCAGACAAGCCCTTTCACTTAAGTTTTAATGGAAAAAGCCTTAAACTCTTCCTCTCTCTCTTTCATTCGCTTTTTTTTCGAATATTTCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr2L 9704907 5' + roo 8687 2 69.44 CCCAGGTTCTTATTTAATAGTTATTAGTTCATGTGTGGCGATTATACAACTGTGTTCATAAAAATAGCAGTGCCCGGGTTGGATTTCCTTTGTTAGCCAGCACTGCCTTTCACCTACGCGGCATGGAGTCCACCAGGTCCTGGCAA:1 + chr3L 17245000 5' - Tc1 1276 1 67.81 TACTCTTCATTACTCCATTACGAACCACCAGGCGTATGCCATTGCTGGCCATTCAACTCTAGGAACAAACGCTTTTCGTCCGCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTT:1 + chr2R 558063 5' + copia 4906 2 57.45 TATGGACGTTGCGCATCTTATTTGTCGTGCGATTGTCGAGCGATATCTCAAACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAA:1 - chr3L 21771045 5' + hobo 30 1 65.07 GATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACG:1 + chr3L 7024463 5' + 412 7132 2 69.18 TCTGGTTCTAATTTGGAAGTACTACAAATAGTAATTATTTCGAAATAGTGTTTGTGATGCAAATAAGACTTACCAACAAGAAAGAAAGATAGATTTGCCATGCCGAGGTTATATAGAAAAATAGTTGTTATATTTGTGAGTCGAAC:1 - chrX 22577234 5' - 297 383 2 50.68 TTTCACGTGCAGAGCGTTGNTATGCCATCTACATGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAACAGCCATACACAAAATCATAGAAT:1 + chr2R 15474480 5' + Quasimodo 74 2 73.79 CCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 - chr2R 18887077 5' + roo 8702 2 56.30 AAATAAGACTTTAAACTGAAAAAAAACAAATAAACTTGAATTATTAAAAACAAAAAAAGAGACATTATAATACATTTTGCTTAAATAAACTTGTTAATATAACTAATACACTAGTGGGCATAAGTATTTGGACAAGANAT:1 - chr3R 2520351 5' - Tc1-2 1613 1 59.29 GTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATC:1 + chr3L 6131845 5' - roo 331 2 67.81 AAACGTATTAGTTGGGCACATCTGTAAACTTAAACTTGAGTGGTATATTGGGCAGGTTGATCAGAGCGGAGCGAAAAGCGTTCTTTGTGGAATGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTC:1 - chr3R 19134518 5' + transib2 31 1 64.38 TACCGCAACGCTTGGCCACACAAGAAGCTTAATTTGTTGCAAGTTGTCCGCTGCCTCCGCTTGACTCCCCAGCAATCAGCCTTTAATCGACTCTGCACCTTCCCCCTAC:1 - chr2R 14812052 5' + roo 452 1 69.72 GCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACA:1 + chr3L 22320156 5' + jockey 69 1 58.22 ACTAACCTGCCTCAATCTCCACAGTGGCCGGTGCCGATGGGAACGGCTTTCACTTTCTCCGGCGCTCAGCTGCTGGTCCACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAA:1 + chr2R 23443931 5' + P-element 29 1 63.70 AAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCT:1 - chr2R 11247036 5' + 1360 68 1 73.44 AGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGG:1 - chr2L 4245012 5' - 412 7519 2 61.11 CTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGGCTGCGCA:1 + chrX 22398534 5' - Gypsy6A_LTR 90 1 41.10 AGCAGGCCAGTGGATGCTGTTTGGAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTT:1 + chr2R 14072500 5' - mdg3 186 2 55.48 GTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTC:1 + chr3R 19094193 5' - P-element 2818 1 34.29 TTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGCATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGTTATGTTTATGT:1 + chr3L 2907292 5' + 412 7117 2 63.70 TAAAAGCGAGGCGCTAAAAGAACAATGTGTCATAGCTATATTCGTGGTATTTTAAAGATCTTGACTGTTCTGCATATACATGTACGTATGTAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTA:1 + chr2L 15419995 5' - Burdock 6358 2 59.59 CAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGC:1 + chr2L 17957147 5' + flea 4753 1 80.37 TTATTGGTATCCATAATGATACGTTTTATATTTCATAACCATCCTAGCCATTACCCACCATATCGAAAATGGTTAAAAATATGGGCGTTTGGGCAGTTTTGGGGGGTTTTAGGG:1 + chr2R 4516661 5' - INE-1 348 1 55.26 GTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chr2L 388610 5' - roo 338 2 64.83 TTGTGCATCATCTGTATATTGATTGAGATGCTGCCTGAAAGTATGCAGCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAA:1 + chr2R 9007006 5' + jockey 4794 1 73.29 TGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 + chr3R 12376418 5' - HMS-Beagle 178 2 65.75 AACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCG:1 + chr3L 5027192 5' - roo 330 2 71.03 TTCTAACGATATGTTTTTATTGGTTTCAGAGAACGAGATTTTGAATCGATGTGATGTGTCCAAGATCACGAAAGTGAATGAAAATTAGAGAAAATTGGTTTGGCACATGCAGCCAATTTTTTAGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTT:1 - chr4 909192 5' - 1360 3318 1 62.33 CCCTGGTTCAAAAAGAATGTGGTCGATCTGTAGTCAGGTTGGCAGAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTC:1 + chr3L 23146487 5' + 1360 69 1 67.39 ACTCACAAAACACTCAAAAAGAAATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGT:1 - chr2L 18181258 5' - blood 359 2 69.44 GCATCTCGCCCAAGGATGTGTCGTCATGAAATTCGTCGTGGAATTTTAAATTAACTGCAGTGAACGCGGTGGGATGAGTCGTGTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 + chr3L 7751003 5' + 412 7092 2 56.16 TACTGGTTTTATTTTGGCGTCGTTGTTGTTATTGCTCCTCTTGCATATTTCATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGTTCCCG:1 - chrX 7702873 5' - P-element 2880 2 79.56 GAAAAATGATTCAAAAATGTGGGCGTGGCAGTTTCGTGTGGCTTGTGGGTGTTAGAGTGGGCGTGGCAATATGGGTCTAGAATCTTGTCTCTAGAATCTGTATGCTGAATCTCAACCTT:2 - chrX 23005433 5' - INE-1 174 1 73.95 CTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAACAATAACATCGGCGACGCT:1 + chr3R 12146648 5' + gypsy10 66 2 60.27 TTAAGTTAATAGCTAATTTGGAGTAAACCGTAAAAAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTANGCCTC:1 + chr3R 8112680 5' + Burdock 6159 2 62.41 TTATTTACGACCGGAATTCCATCTTGCTCTTATTGAATTAAAATTAAGCGATGATCTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGC:1 + chr3L 414821 5' - 412 454 2 58.62 ATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCT:1 + chr3R 20841401 5' + Juan 72 1 64.38 AAGTTTTCTGAATAATAAAACTAGTTAGTTTATAAGGTTATCTAACTTTTTTTTTATTTATTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGG:1 - chr3R 20841448 5' - Juan 4138 1 66.44 TATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGT:1 - chr3L 13057454 5' + 412 7103 2 55.07 GGGAAGGTAGGAAACTAATTGAAGAGGGTATTATACAGAAAACATGTAACTATTCAAACAATTTATAACAAAGATTGTAAGAAATAAGTTTATTTAGCAGCCAGTCGATTCTCTTATTGAAAATAAAAAATCTGTTATATTCAAAA:1 + chr2L 5439733 5' - accord2 339 2 69.86 CTCATGCCCATGTTGATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGAT:1 + chr3L 18846931 5' - 1360 3387 2 77.06 CTCCGCCAACCGAATGTCTCCTCCATGTAATTTAATAAGCTCCTCCATGTAACCAACTCGCGGGCCTGACTTCCCCTCCTCATCATTAATATGATGAAGCGTGTCCGATCAGAC:1 - chr3R 7550643 5' + Rt1b 4778 1 71.05 CGTGGCAAAAAGGATTTTTTTTTTAAATTATAAAAAAAAAACAGGAGAGAATGCTGTAGTCGAGTTTCCCG:1 - chr3L 14671919 5' - INE-1 570 1 56.34 AGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATTCCTAGTCATACATACCTAATTATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACATTCAT:1 + chrX 21087612 5' + mdg3 73 2 74.48 ACCAGTTGTGTTGCCTTTGTGCTGCCGCTTGTTTACGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCGCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATGGAGAGCGATAAATTATATTTAGGTTTTTG:1 - chrX 21233397 5' + roo 82 2 76.06 ATATAAGTATGTCAATTATTGCCCATTTGCGAGATCGCTCACTTGGGATATTGATTGTATACAAAAGTGGTTGGGGCACTGAGAATTGATTCCATTTAGTGTCAGGCATAGTGGGTAATGACCACTTCTGATGTTGTGGACGCCGA:1 - chr2R 1478327 5' - invader3 287 1 52.74 AATGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACATCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTAT:1 - chr2R 19633292 5' + jockey 4835 1 66.44 AGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 - chr3L 1463745 5' - P-element 2841 1 52.52 CTTTTACCATGTTACACACTTCTCTGGCATTTTCTCGGTTTCTCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGCGCACGTTTGCTTGTTGAGAGGAAAGGTTGT:1 - chr2L 310137 5' + P-element 78 1 31.94 TAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATAC:2 - chr3L 4547763 5' + mdg3 75 2 67.12 GCCAAGCTGGCAACACTTTATGTTTAGTAATTGAATTATGCTAACCATTTAATGGCTAGAAAATATTTTCGGCCTATTTCGGGTCCATAATGTAACTAGCCTTGTAGCATATTGGACTAATCTACCCTAAGAATACAATAGATGAT:1 + chr3R 12948563 5' + Stalker 6872 4 69.18 AGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACA:1 - chr3L 13779397 5' + I-element 79 1 75.34 CTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACC:1 + chr3L 19951189 5' + Ivk 58 1 60.14 TACAATCTTTTGTAGACAGGAATGTGATCTTAGAGGTTGTTTTTGTGGGTAGCCCAAAAATAGGCTACGTTGTCGCGAGTCTGCAGTACATTCCCACAACTGGATATACAAATTATCATTTTAGTAGATTTTCCATATATTTATT:1 - chr3R 7049503 5' - Burdock 6377 2 74.48 ATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTACATAAAATAGCATATTAACTTATGGNAGCACT:1 - chr2L 17019190 5' + 412 7099 2 56.85 CATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTNTAGGGTCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATANAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAACCATTTGC:1 + chr3R 19965233 5' + jockey 78 1 63.31 GGACACATCCTGCAGCTGAGTGGACATTAGCTTGTCTTGGTTTTGATTAAAGAAGTCTGAAATATTCCACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2L 8120089 5' + roo 19 2 72.60 ACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAA:1 + chr3L 9324442 5' + HMS-Beagle2 6935 2 52.74 ATTTATAAGCAATTTAACATAATTAATTGTTTTGTTTTAGCAAATAATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr3L 19579942 5' + jockey 26 1 73.97 CATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAA:1 + chr3L 15393694 5' + pogo 64 1 65.00 AAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAA:1 + chr3R 30087685 5' - roo 9027 1 52.86 AAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATAGAACTGCACTGTAT:1 + chr3R 23644876 5' + diver 72 2 61.38 TTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAACATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATC:1 + chrX 9165344 5' + jockey 4838 1 68.49 GATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTTGCTCC:1 - chr2R 11247051 5' + 1360 63 1 63.04 CATCGCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCAAAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATT:1 + chr3R 22647827 5' + transib2 53 1 55.88 AGGAAAAGTAGCAAGTTGATGGAGATGTGTGGCAAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGG:1 - chr2L 7921025 5' + F-element 375 1 55.75 CAACATTGTGGCTAAAACGGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCCGGAC:1 + chr2L 18311380 5' + opus 15 2 75.34 TTATTGTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACCCATACATCCACGGCGTCCTCTGTGAGTGGGCTTACATACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAAT:1 - chr2L 17574645 5' - hopper 1376 1 57.53 GGATTAGCCAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTT:1 + chr2L 10461122 5' - roo 397 1 70.54 ATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAAT:1 + chr3R 25860464 5' + hobo 31 1 59.38 TCCACCCACTTTGGTTTCTTGGGCGGACTGCAACAAAAACGAAGTTATTATTCGTCTTTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chr3R 11089670 5' + I-element 60 1 59.29 CCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTC:1 + chr2L 8284370 5' + Doc 437 1 64.75 GGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGT:1 - chr3L 6050232 5' + 412 58 2 62.41 CAACGTTTATGTGCATTAGAAATACACGCAGAAAAGGTCATTAGAGGATTTCCTCCTCTCTACCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATT:1 - chr3R 20983959 5' - hopper 1358 1 58.22 ATTCTACCAGCTGTAAAGATAATCTTTAATTATTACAAATATTGAAGTTTTAAGCCTAAAACAGGATTCTCGGCACACTGCAGTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGCCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAAATT:1 - chr3L 19274906 5' - transib2 2779 1 51.37 TACACAAGCAGATAAGTCTCGAATTTACATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCG:1 - chrX 20999632 5' + BS 10 1 71.43 TTGGGAACAAAACCGAATTTAATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAG:1 - chr2L 15085772 5' - opus 7495 2 76.30 AGAAATTGTAATCTCCCTATTAAAAAATGTTTATCGGTCAATCATCTTTTTATTACTTTTGTAGTTTCAATTATATAAATATGCAATATACAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGT:1 + chr2L 21941094 5' - flea 4988 2 67.12 GACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTT:1 - chr3L 22021741 5' - mdg1 7397 2 65.00 CCAGAAGTTTTCTATATAGCAGCGGCCTGCTTGCGGCTGTTTTCTCATTATTTAATTTTACATATTTATGCACACTTGCGGCGACTTGTTTACGACACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCC:1 - chr3R 11756872 5' + Tirant 8113 2 79.84 ATTATCTTTCATCAATCTGGCCAGTTAAATATACAAATGTATAAAATGTGAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 - chr3L 1628752 5' - hopper 1399 1 72.03 GAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTT:1 - chr3L 7751121 5' - 412 427 2 61.64 TAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAG:1 + chr3L 22320124 5' + jockey 12 1 73.77 CTAATGTGCAATCCGTTGCTATTGTGCAGAAAACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCTGTGTTAGAGCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCC:1 - chr3L 11535898 5' - roo 213 2 54.26 GAATCGAGCTGGCCAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGCCGTGCGCCAAAGGGGAAATAACGGGATACC:1 + chr2L 22601730 5' + gypsy8 315 1 77.08 TCTTTATATAGCGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGAC:1 + chr3R 5164919 5' - invader4 3026 2 56.85 AAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTGAGTTTTGCCACAATAAA:1 + chr3R 10148745 5' - 17.6 7336 2 73.97 TGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGATTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAA:1 - chrX 3533987 5' - 17.6 438 2 58.22 AGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTCATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGA:1 - chr2L 388607 5' - roo 334 2 67.12 CAGGAGCGACTAACTAGCGCGAACTGCGAAAAGCGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAG:1 - chrX 21045307 5' + P-element 14 1 67.26 CCTTTGAATCTCGCTGTGTTGGCCAGCCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGT:1 - chr2L 15523126 5' + 412 64 2 60.27 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATGCGCATATATTGCCAGCGGCCAG:1 - chrX 12649915 5' - blood 141 2 94.64 AATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAAT:1 - chr3R 11284993 5' + blood 52 2 58.21 GCGGTTCGCCCGACTTTAGTTACGGCTGCATTATAAATTTCAAATGCAAACCCAGACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGACGTAGT:1 - chr3L 22021795 5' - mdg1 7445 2 76.03 AATCAAATCAACTTACTACAATAATATAACATAATGTGCTGCTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACT:1 + chr2L 2544712 5' + blood 34 2 58.22 TGGCGGTGGTACGGAGCTGAGAGGTGTGTGCCCCATACATCGAAGCTCAGACAACGAACCGAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCGGTGAGTCGGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAAT:1 + chr2R 5953757 5' + roo 19 2 72.60 ATATCTCAAACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACT:1 - chr3L 21771003 5' + hobo 72 1 65.75 TGCACATAAAAGTGGTATTAAATTTCCAATAAAGGTAGACTGTTGATTTAAGTCAACCTTGAGCGGTGGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTCTTTGTATGAAATTAATTTTATTTGGAAATATATTCGGTTT:1 - chrX 5751946 5' - roo 9015 2 50.34 AGATCGTCTATATCTGATTATTGTCGAAAAAATTAGTCAGGTGATTAGGAATTTACAAAATACAATATTCTGTTAACTTTAAGATTTGTTTACAAGAATGGCTAAGTGCCGCTGTCAAAGAATTTGTTT:1 - chr2R 673152 5' - 17.6 170 2 67.44 AAAAGGTGGTTTTTTTTACCAATTCTAATTGCTCTTTTCAACTTTTTCAAGACCAAGAACGATATTTGTAGGGTATTTGTTTAACGGTGAATCGCACCGTCTTGCGACATTGTCATCCGTCAGGTTTCCTCCAGAGGTGAAGGGCT:1 - chr2R 3104479 5' - Gypsy6A_LTR 350 1 69.86 GCCCCTTTCACCCAGCACATCCTTGCCTCATCCTTTGTAGCATACTTTTTGGCGTCGCGTGAGAAATTAAAATTTCAAAGCAAAACGTGTTGCCGCATAAGCAGGTTGTATGTCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 - chr2L 13033463 5' - hobo 2928 1 73.79 TAGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:2 + chr2L 10909495 5' + 412 7118 2 60.27 CTCGATGAGTCTCAAATTTATGACCTACAATCTGAAAAGCAATATATCCATAGCAAACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATA:1 - chr2R 7895621 5' + mdg1 7102 2 59.59 TAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 + chr3R 20904971 5' - roo 338 2 68.97 TTTGTCAAGGGCGTCGCCAGGCCATCAGCCAGCAGGGGGCAGATAGTAGAATTCATATTCATAGTGTAAATAAACAACGGGAAGTTTCTGAAAGATGTTGGCATAAACACATTAGATTGGCCACCTCAAAGTCCAGACCTCAACA:1 + chr4 343352 5' + Tc1-2 1163 1 59.31 AAATTATTACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACT:1 + chrX 666268 5' + 412 7099 2 54.81 TTAAAAACTACTTAAAATAAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGATTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACT:1 - chr3R 25597918 5' - copia 5048 2 66.44 TGGCAGTGGTGGCAGCGATTTTAGCGGCAGTGGAAACAGCAGGGGCAACAGTGAGATCAAAATTTCCAATAATTTATTGTTAATAACTTCCAAACCGCTTGTTTTTGAATCGCGAAAATTTGCGCACCACTTCCACGGAACACTAA:1 + chr2L 19479165 5' - R1A1-element 81 1 58.90 TCTGTAATTATTTTGTTTATTATGTTATGTTTATTTATTATTATATTATATGGACGGGTGCGTATTTCCCGCTAGTTGAGCGCCAATTAATTAAATATATGGTGCAGATCCCTCGCCGCGGTCTCCGGCGTAGGTTGCAGGTAACA:1 + chr3L 27396714 5' - springer 343 2 41.78 TTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGT:1 - chr3L 9318091 5' + P-element 2848 1 69.83 AAAATCTTTGGAGCATTTGTTTGTACATCAAACGTCGCGGATCCGAATAGTTTCCAATTAAAAAAAAAAACCAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2R 6700154 5' + roo 50 2 56.85 AGGCAAATTGCAAAAGGCAGATGATGGGGTATGTGTGGCGTCATTATATAATCAAATCAAATAACAATTTGTACTTTGTTAAATTTCTTGTCGCCCTCGATGGCTGGCTGTCTTTGCCTCGAAAAAATATGCAAATTTCCAGTATT:1 - chr3R 6014083 5' - hopper2 1559 1 69.86 TTTTTAAGACTAAAATGAACAGCCCGATAATGTGATTGCAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGTCTCCGTCAG:1 - chr3R 13838574 5' + opus 7057 4 56.16 CCAGTTTATTCAAAGTTACAGTACACGCTGTCCCGGCAACCAGGACATATTCGCCATGGCAACATGGTCCCGTCGTCCTCGCTGCACTGTCAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCG:1 + chr2L 15522995 5' - 412 480 2 71.76 ACATTGAGTTCATTGCTTTAAATTACACCCATGGTTATTGATTAACAATACATATAATAGAAATCCATTCTAAGGCACTATTAGGCAGCTGAAGAACTTCTTATTTATTTTAAGCACTTTAGCATAAAATATAAAAATATTTAGT:1 - chr3L 1816123 5' + transib4 2280 1 63.45 ATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTC:1 + chrX 21772472 5' - springer 19 2 68.92 TACAATTTTAAAAGTATCTGAGGTTTTTAAGTGCCAATTATTATTTGTATACTTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGGGGAACATTAGCTTAAGGG:1 + chr3R 30955326 5' - G6 1958 1 61.64 CTAGGCATTATGATGTTTAATCAATTTAATCAATTTAATACAATTGAATTATTTAAAAAAATATTTAGATACATATACTCTGTACTTGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTG:1 - chr3R 23645013 5' - diver 223 1 75.17 AAAAGTCTTTAAATAACATAGTATTCCCAATTCGAACATCCTAACGCGATTCCGTTAGCCGTCATCAAGTATACTTTATGGAGCACCATTACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTATTAGTTTTAA:1 - chr2R 19633334 5' + jockey 4793 1 61.64 AATATAATCATTTAAATGAAACAGTAAAATCCAAAGGTTACATATAATATGTATAAGGGTGGAAGCAGATAAGAACCACAATATCAACGCACAGTTTACAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGT:1 - chr2L 901871 5' + jockey 4692 1 69.86 GCTATGAGCCCAAATACTTTTGCTTATGCTAAAAATATAAACATAATATAATATTTTCGTATTACTTGAAAGAGTTAGTAAATAGTTTTATTTACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 8314572 5' - roo 9046 1 65.73 GGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGGAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr3L 7848479 5' + jockey 70 1 60.14 TAATTTAAGTATTTAAGTATTATTGATTGACAACTTGTGGATTTCAATAGTCACCACTGCGTGCGTTTTATATAATTTATATCAAATATTGATCGTTAATAGATCTTGCTATTATTACCTTGAAGGCAACACACAAAAACACACAC:1 + chr2R 23095084 5' + gypsy3 412 1 88.36 TAGCATCAGCAACAACAACAACAGCGGCAGCAGTTGCAGGAAATGATCTCACAGCAAAATCCAATTGGCACACTCCGAAGTCCCGTACTCCTCTCCGGTCCCCTGGCCAGAAACAGGGGCCTGCGCG:1 + chr3R 13239625 5' + TART-A 223 2 80.31 AACGCTTTTCCCAAAACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCA:1 + chr2L 310040 5' - P-element 2846 1 57.64 TGCAGTTACTCAAAACAGTTTGCAAAAGACTTTTGCATTATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 + chrX 5751839 5' + roo 53 2 55.17 ATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCAATTGTGTGAGCTTTGCTTATCGCGTAATTACCATCGCCGTTACATTGATATTTATCATCTTATC:1 + chr3L 19951213 5' + Ivk 102 1 77.40 TGTTATACATATTAGATAAACTGTTGCATACATAGTATTATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTTGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 - chr2L 8120215 5' - roo 8988 2 82.19 TGCCGCGGTCTCTGCCGGCATCGCAGCCGACCGTTAGCCGCAAGTTGCTTGCGTTGGTTAGATTCCCGATTCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCAACTTAACGTATGCTTGCAATA:1 + chrX 21045187 5' - P-element 2843 1 51.82 TGTATGTATGTACACGCCACCAAACGATTCAGCCCGAAGGTATGCATACATATCTTGCGGTTACTGCATTGCGTTGGCTCGAATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGGACTTTGCACAATGCCTCGGTGCAGGGAACTT:1 - chr4 490352 5' - pogo 2063 1 59.59 GCGCATTTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACGTCCGAAGAGACAAGTCGTGCCTCTCATTCTAA:1 - chr2L 2291580 5' + I-element 27 1 65.22 TGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 18887063 5' + roo 63 2 63.70 AAAAATGTAACTTCATCTGCAGATGCAAATTTTTTTGGCGGATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCTTTTGGCCTGTTTTTTTTAC:1 + chr3R 25798325 5' + hopper 10 2 77.54 GAATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGGGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAG:1 + chr3L 11364802 5' - Tirant 8451 2 62.02 GGAATAGGGGTCGAAAAGTCAAACTAATCTAACAACTGCTAACAATAAGAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGGCAGCATTGACCACAGCTGCAG:1 + chrX 7780606 5' - jockey 4704 1 62.22 GTGGCGAAAACGGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAG:1 + chr2L 18311387 5' + opus 7025 2 65.75 CCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTCACTTATGGCAGCACT:1 - chr3L 414955 5' + 412 7099 2 53.85 CGACACGAGTTCGCTGTTAGCCCCGAAAGACCCACATCGGAATCAGTCAGATTCAGGTGCGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCC:1 - chr3L 10033669 5' + blood 115 2 41.10 AATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGG:1 - chrX 18673750 5' - roo 344 2 58.62 AAGCAAAACAAAATAAAACAAGAAAAATGGAAAGGAGATGGGCGAAAAGTTATATAGGAGAGAAAACCACATTCACAGCTCGAAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTT:1 - chr3R 26472920 5' + 1360 38 1 56.55 AGGGACGAGCTCCGGGTCACGATCAGCTTCAGGATCTTCAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCG:1 + chr3L 9635252 5' + Doc 4 1 69.57 TTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAACCTAGCGTACAAAATGTTT:1 - chr3R 12613850 5' - HMS-Beagle 6966 2 68.49 AATAATATATAATAAGCATAATTAGCAATGTCCGTATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGGC:1 + chr3L 15477462 5' - Burdock 6307 2 76.03 AAAAAATATATCACACCCATAAAATACATAAATTCATTCTTATAACTTTAAATATTTGTACAAATAAGGGATTCCTATCCTTTTTTGTGCTGCTCTTTTTTGTATCCGTGTCGGTGTGTTTTATATTTTGTTGTATTTTTTTTTTT:1 - chr3L 10049034 5' - gypsy11 3931 1 54.11 AGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAAG:1 + chr2R 20972656 5' + jockey 4725 1 54.61 ATCCACAATATCAAGAAATTAATACACCCCTGAAACGCGGAAGTGTTGGTACCAAAAGAATTGAAAGAAATTTCGGAGAAATGACATTGTCAAGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGA:1 - chr3R 18832481 5' + roo 11 2 71.65 TTAAAAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTAC:1 + chr3L 6557091 5' + Doc 31 1 63.01 ATGGTGATATTTCTATAATTGGTGTAATTTGTTTGAAAAGTAGAATATTAGATATTCATAAATGTTTATTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGT:1 - chr2R 10119078 5' + Juan 4080 1 52.41 CATATCATAATATACGAAAGGTGCGCGGTGTGGAAACAAGTGACTTGACTTGTAAATAAAGCGGAAGAAACGCGAAGGGAAGATGCTGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCC:1 - chrX 8346452 5' + roo 8693 2 65.00 TTCCTCTCGATCACCAAAGAAATTTACAAATGAGTCAACTTACCTAAATGAAGCTGCCAAACAGCTTAAAGTTTAATATGAAACGGACAGACAGAAGGGCGGACAGGGGCAGATCAAAGACACTAGAATAACACGATGC:1 + chr3L 23334860 5' - 1360 3385 2 54.68 CACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCC:1 + chr2L 8284366 5' + Doc 430 1 61.03 GTCATCGCTCATTTTTTGCTGTTGTTCTCGGGTCATATGAATAATGTCAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATA:2 - chr3L 13057489 5' + 412 7076 2 69.86 TCAGCAGCAATAGCAACTCCAACGAACGTTGCCAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chrX 20361924 5' - hopper 1384 1 64.38 TCCACCTCTGAAAAATATGAAGTGTTAGCATAGAGGGGCCTACGCGGGATTCTGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 - chr3L 23219333 5' - 1360 3343 1 52.74 AAAGGAGACAAGTCCTGGATAGGCTATGTTATGGTTTCAAGACACTATACTATACAGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTAT:1 + chr2L 1044968 5' + mdg3 5317 2 60.96 GCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTT:1 + chr3L 12227759 5' + opus 153 4 56.85 AATATTCTGCACTTTATTTCAAACATATATTAGTGATAAGTTTCTGTAACTAAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTT:1 + chr2L 18219313 5' - copia 221 1 63.19 ATTATAACGAACATCGATTTTATTCTATTAACAACACTTCTTTTTGACATACAAATGTTGAAATCATGAAATGAAAACCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATAC:1 - chr2R 17493239 5' + BS 4796 1 79.45 CTGGGGAAGGGTACTCCCAATGAAACCACTGTAATGATGAACTCCAATTCAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGACAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGCAGAAATGGTTCT:1 + chr3L 414876 5' - 412 7451 2 81.51 TTAAGTTATATATATCCGTGTATATACCAGTGTGTATGTATAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCCATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTG:1 - chr2R 15199194 5' - Burdock 173 2 81.51 CAGACAATACCAGTACATTTACAACTTAGTACATACATATGTACGCATACAAAAAAAAGAGTAAGATGGGGTAAACTGACTCGCTACTGCGAGGTTTCTTACATAGGTTCTTATCATCTAATTATATAATGCAGCGCATTTAAGAC:1 + chr2R 982346 5' - rooA 7475 2 43.15 ACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAA:1 + chrX 13091068 5' - P-element 2826 1 28.70 CTTCCTCTCTCTCTTTCATTCGCTTTTTTTTCGAATATTTCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 - chr2L 9704849 5' + roo 8747 2 76.03 GTTTGTGTTTGAAATGGGATAGTTCTCAGTAGTACTAATAGATGGTTGAAATGGAAATTTTGTAAGCGTCCTTAAACTAAATTTAACTTCCGTCACACTTAAAACTTCTTATGAACAGAATATAAATTTTAAATATAAAAAATATC:1 - chr2L 17104700 5' + transib4 2576 1 46.58 TCGTAGGATTTATAAAATAAAAAATTTATAAAAAAAAATGTATGATTAAAGAGTTATGCACGAAATAAGATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTT:1 + chr3R 17421208 5' + pogo 51 1 54.79 AATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGC:1 + chr2R 17269122 5' - roo 329 2 71.92 CAATTTGTACTCAATTAACTTATTTTAAACATTTTGCTTTTTCTATGTAGAAGTACATTTTCTATTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAG:1 - chr3R 19450026 5' - roo 8794 2 55.17 GTAAAGTGTCTCAGCTTGTTTCGCCGTTTGAAAATCTCGGTTTGGATCCATTTGTGACCTCTTGTCTATTCAGCATACCCGTTACTCGTACAGTAAAAGGGTATACTAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACAGGCAAAAGGGAGCGT:1 + chr2L 21936067 5' + INE-1 31 1 46.58 TTTGAATCTTTTTCAAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGCAGCTAGGAACTGCAGC:1 + chr2R 20972637 5' + jockey 4689 1 66.13 TTCAAATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chrX 12979404 5' - transib2 2802 1 70.55 AATGGCGGGGTATGAGTGGTTTTCTGGAGCGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAAATAAAAACCAAAA:1 + chrX 9846772 5' + transib2 94 1 78.08 AATTGTGACATATAACTTCACTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTG:1 + chr3R 19514208 5' - blood 341 2 63.19 AAATACTTGCACAGCACACGGCTTTGTGCGATACTTGGCTAACCAACTCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTA:2 - chr3R 11937852 5' - hopper2 1531 1 67.12 TTTCAAGTTTCCTTTAAATAAGCACATTCAAACGTTTTTTCTTTTTTTTTTTGAACATTTCAGTTGCTTGCCTTTTTTTTTAGTGTTTGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTT:1 - chr3R 24666478 5' + hobo 3 1 71.55 TCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 - chr3L 2167690 5' + opus 7055 4 64.66 AACTATGCCAGAAGCTAATTTGGGCTAGAAATAATTTAGTTGGGTTTAAAAGTGTAATTTAAAAGGAAATAATATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACATGAT:1 - chr3L 14888878 5' + flea 46 2 54.11 GAAAACTTGTTTAGCAACCGATTTTGGGTAGTGCGGTGAGTCGGTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 + chr2R 5953817 5' + roo 8731 2 67.91 AGGAGTAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCTGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAG:1 + chr3R 6584787 5' - transib2 2750 1 68.49 CGTTTTCTTCGAGTGTAGTAGTAAATGACTTTGATTTGACTCAAATGGCACCACCAGCAGAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCC:1 - chr3R 23217737 5' + FB 65 1 60.27 TATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAACCTCTACTTGCGAGTGCACACTTTAGAG:1 - chrX 22824232 5' - gypsy12 10151 2 54.48 ATATATATTTGATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGT:1 - chr2R 5954003 5' - flea 4945 1 68.35 TGTGATGGCGATGTCAACANGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATACATTATATTTAGGATTTTGTTATCTA:1 - chr3L 20061407 5' + roo 89 2 78.77 CATGATACAAAAAAGATAAATATATTAAGAATGGAAGTAGTTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATC:1 + chr4 868613 5' + roo 8702 2 59.59 TATTATCAAGATTTTCAAATATTTTAATTATTACAATAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr2R 9453296 5' - roo 8990 2 75.34 TGTGGCGGGCTGAAGAATAAAAAAAAAAATAAAAAAAAA:1 + chr3L 4001361 5' - hopper 150 10 69.23 GAAGGAAATATAGTGAAATTACGTTCTTAGCACAGAGTTAAACGTTGGGTAGAAAGTTGATTAAGGTCATTTATTAACAAAACTTTCTTATCAACTTTTATTAACACTATGCGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCT:1 + chr3R 20887353 5' + Doc 21 1 69.86 CGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAACTAGGTGACATGAGAATCGCATC:1 + chr3R 5870821 5' - roo 326 2 72.22 GTAAATGTGTGCAAAATTTCAGACCCTACACACCCATACATCCACGGCGTCCTCTGTGAGTGGGCTTACATACATACATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTT:1 - chr2L 17574640 5' - hopper 1392 1 63.20 ATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 + chr2R 6767998 5' + pogo 65 1 65.07 ATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATAT:1 - chr2R 23095000 5' + 412 29 2 63.45 AAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATT:1 - chr3L 13285674 5' + roo 67 2 65.28 TACACGTCATTAAACTCAAATTCAACAAACCATGGCAACATGTTTCAGCAAACTTTTGCTGCGTCTTTGTCTCTAGAATCTGTATTCTGAATCTCAACCTTCTCTTTTTTTTATATTTCCTGAGATCTCGACGTTCATAC:1 + chr3R 32036077 5' - INE-1 137 1 76.43 CTGGGTGGAAGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 - chr2L 7929605 5' + roo 64 2 64.14 GCTCCATCTTAAGTTACAATCTGAGCGGGTTTTTAATGATGTACAAAGATGGTTTTTAATAAAATAGTTAATAGAACCTATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 + chr3R 29680184 5' + 412 7097 2 54.79 TGCGTAGCATACTTTCCGGGGCTTTTAAAACGACTATTCGCAAGAAACAACACTAAAAGGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTG:1 + chr3R 13339026 5' + BS 5059 1 58.22 TAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGT:1 + chr3R 20904955 5' - roo 9017 2 58.22 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGGCTACCCAGTACTGCAACT:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 183 1 49.43 TAAAATGAACAGCCCGATAATGTGATTGCAAAGATACTAGAATATTATTACATTATATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCATCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGG:1 - chr3R 13838564 5' + opus 7048 4 59.06 ATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTA:1 + chr3L 18846956 5' - 1360 3325 1 62.33 GATTCATCGCTAAATGTTGTGACACTTTCAATGAATTGGTTAATTAATCGTCCACTTTCCTAATTTATTTATTTATGCACAAATTTTGGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACT:1 + chr3L 2527076 5' - blood 84 2 63.89 ATTCATAGAGCACTTGTAAGAATTCGGTCGGAAGAGTAATAATAATATATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCT:1 + chr3L 24291982 5' + 1360 72 1 69.18 ACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTAGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATT:1 - chr3L 25206924 5' - HMS-Beagle 6995 2 52.78 ATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAATCACGTCT:1 - chr3R 23644930 5' - diver 133 2 79.17 CATATTTATATACATCAGTTTCAATAGTCAAGCCGTTTCTACGCAAAATAGTAATAGTATCTCAGTTTAAGGTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTT:1 + chr3L 6131819 5' - roo 357 2 50.68 CGATTTCCCCAACTTTGCTCACGTTATGGAATGGCCTACGTTCAGTAGCGACACTGCTGCATCAAAAAATCTGGAGTTGAGAATTCAAAACTTTAAATTATTATGGCAACCTAAATAAGACATGGCGACCGTGAC:1 + chr2R 291274 5' + gypsy11 444 1 54.81 ACCAGAACAACGTTTAAAACATTCTCAAATTGATCAATCAAATGTAATAAAAAATTGTTTAAACCATTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTGATCCTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTATCTTAT:1 - chrY 1420697 5' - Stalker3T 201 1 51.72 AGGATAGCAGTGAAATGTTTTCTTTTTCCGAGACTTTAAGAATTATTTCAGCACCATATCGCAGCGCAATCCAAATATTAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTT:1 - chr2L 14056792 5' + pogo 42 1 48.63 TGGTTTTCTTTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGC:1 - chr2R 2868558 5' - Rt1b 4702 1 55.81 ACAGCGCCACAACGCTGTCGCCGAGCGTGGTTCGATGGTAGGCACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTG:1 - chr3L 26295007 5' - P-element 2816 1 12.41 TAGGTGTTTACGTGTTAAAGTGTTATCCTGCTTACAGGATTTATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTAGTTA:1 - chr3R 31198635 5' + Transpac 4997 2 71.72 GGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCC:1 + chr3L 17268275 5' - hobo 2893 1 76.29 AAATGAAACAGTAAAATCCAAAGGTTACATATAATATGTANAAGGGAGGAAGCAGATAAGAACCACAATATCAACGCACAGTTTACAAAGTACACCCCAACNGCCTAGCAAGGAAGCTAGGA:1 - chr2L 901858 5' + jockey 4681 1 70.49 TGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGAGGTGTTCACAGAAGTCGCGG:1 - chr2R 12133859 5' + jockey 36 1 60.00 CGCAGTAAATGAATTTTTCAAAATCTCCCGAAACAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTTTCTATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGC:1 - chr2L 15516785 5' + Max-element 8291 2 53.79 GATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACTCACTGCATAACGGTGACGGCTTCGGTTCGCGAAACTTATCAGCAACTAGCAATTTCT:1 - chrX 14321911 5' + jockey 177 1 52.46 AAAGTTTTCAACTGATATTTTTAAATGAATCACTGTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGTAGCAGAA:1 - chr3L 2532513 5' - blood 7303 2 77.40 CAATTCGCAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGAC:1 + chr3R 12146637 5' + gypsy10 35 2 55.56 CGAAAGCAACAAGACACAACCATGGAAGTCACCTAAGCACGTATTTGGTTTCGATTAGAAGTAGGAGGATAATCGGGCTAGCAAGCCGACTGTCAAGTGGCCATACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTANGAACAATTAAATAA:1 + chr2R 13852761 5' + 412 7072 2 68.49 GAATCGAGTTGCTAATGAGCTGCGATGTCCTGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCCCTCCATTTCATGGTCCTTCGAGCCGGATGAGCGCTGATCCTGCCAGAG:1 + chrX 19033190 5' + Max-element 338 1 68.91 TTCATTTGGTTCGCAATTTATGCACTCACACTCATATTTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGAAGATCCAGCGATTTCAAA:1 + chrX 3921656 5' + G2 2709 1 73.97 TTTATTTCTATTAACTTCAAAATGCTTTAAAAAGTGTCTTAATTAGCAATGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chrX 11232593 5' - roo 333 2 68.49 ACAGAAGTAAGTCAGCGAACAGGATAAGGGATAAAATCTAAAAAATTCCCCACTATCAATACAGAATTTGGACTTAGTTGTGAGCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCT:1 + chr3L 12890279 5' + hobo 26 1 64.12 AAAGAATACAATGTGTAGCTTTAAAAATAACTGATACCGGAAATATATTTGAAAAACTTAAGAACCTTGAAAGGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTT:1 - chrX 13789639 5' + FB 49 1 52.05 AATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAAT:1 - chr3R 12519712 5' - roo 9026 1 54.11 AGGGTTTTTAATCCCCACAGATTGCCATTGTTGTCGTACGTTAAGAAGCTAAGTCTTCGGCAACAGGTAACCCCAGGCGCCAACTTTTCTCATTTAACGTGTTTTAACGTGTTTCTTTCAGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGA:1 + chrX 22679588 5' + Doc 33 1 66.44 CCGCACCACCGACTTCTTATCAGCTGCACATATTTAAACTGATGACGCCACCGATGGAAAAGCGAGGAAAACCAAATAGGAGCAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 2907412 5' - 412 7515 2 61.59 AGTAACATAAAGCAATTCCGCTTTATTAATTCTATTAATATTAGTTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACA:1 - chr3L 171552 5' + Doc 4477 1 69.18 CAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr2L 10461130 5' - roo 9019 2 53.79 CTGACATCCGCACATTGAAATAGCAAAGTTATTTAATATAGATGGTTACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCTTTTATGCCATAACAGATATT:1 - chr3L 11904854 5' + copia 76 2 68.49 AGTTGAGTGGTAATGGTATAATTCTAGCAATTTTATAATTTTGTTTTTCGAATATAGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAG:1 + chrX 21668492 5' + I-element 9 1 80.82 GTCCTAAAACATCACTAAGAAAAGAGCTTCAAGTGCGTATGATACCGTCACAAATGACTTTATAGTGCTACTGAAATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGT:1 - chr3R 10030801 5' + BS 5055 1 50.00 AAGTAAGCAAGTCAACAAATGTTAATGAAATTTCCTGGAACTGCGACACAGAAATGAGTTTTCCCTCCTTGAAATTTTGGGTGTAATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACAT:1 + chr3R 26180392 5' + Transpac 36 2 65.75 GCTTACCAAAGTCCAGAGCGAGCGGACATTACATTCCTTCTGTACGCGCTGCTCAAGATCAGCATTACATGTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCA:1 - chr3L 25206928 5' - HMS-Beagle 209 2 57.97 CATCAAATTGCATCTGCATCTGCATCTGCTGGCCCCGGCAAAAGTGCATTCAATTGAGCGCTGCTCTCTCGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTT:1 - chrX 3382432 5' + pogo 48 1 51.37 TAATGAGTATGTTTATATTGCTTATTTTAAAAAACCAAGTCCAAATTTATATCGCCACTAAATGTGACTTGTTTTATGCATTGTAAGAGGTTGTTTCTTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTC:1 - chr3R 20887532 5' - Doc 4647 1 65.75 TTTCCGCATTTTCAATTCTCCGGCATTGCATGACAAATTGCATTTGAGGTTTTTCACATGGACATTGATTTAATTACCAAATGACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTC:1 - chr2L 2291574 5' + I-element 38 1 58.74 TGAAATAATATATTTTTGGAAGTAAAGCTTGGGTAAGGAAGACGTTTTTATAAATGTTTTGAAGGCCAAAACAAAATTGTAGTATATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCG:1 - chr3R 12376541 5' + HMS-Beagle 33 2 63.01 AAACTTGATGCACACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTC:1 + chr2L 3892980 5' + 1360 50 1 60.15 TAGGCATTATGATGTTTAATCAATTTAATCAATTTAATACAATTGAATTATTTAAAAAAATATTTAGATACATATACTCTGTACTTGTTAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCT:1 - 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pogo 2085 1 68.49 GCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 - chr3L 15718154 5' - 1360 3350 1 62.16 GAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTTGTTA:1 + chr3R 17924448 5' + Burdock 79 2 75.34 ACTCATCCAAAACATCATAAACGAATGTGAAATCTGTAACATCGCTAAAACTGAACATAGAAACACAAAATTAACCCTTGAAACAACCCCCTTCAGCCTTTGGAGGGATATGGAATTAGCTAGGACATTTGCTAGTCAGTTCGGG:1 + chrY 738923 5' - G5 4590 1 62.07 ACAATATATAAAAAACCACAACTGTGTTCTCTGTCCATATGATCGTCGAGGATCCATTCCGACCATATAGATCGAGTCGATCTAGCCATCTCCGTTTCTCCGTATGTATGAACGTTGAGATCTAAGGAACTATAAAAGC:1 - chrX 22905679 5' + INE-1 149 1 48.92 ATAATAATTTAAGATTTCTTCTATATACAAAGGTACCACCATCATGGCACAGTGCTCAGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:2 + chr3L 19579988 5' + jockey 73 1 60.96 ATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAG:1 + chr2L 2057833 5' + 412 82 2 78.68 GAAGCGGTGTCATGCCCACAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTA:1 - 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Juan 4136 1 72.60 GAGTCATTTTAGAAGGGGGAGAGTTATCCAACCCATAAACATAGCACCCTTCCACAGTTTATATGTTGTGCTAGAAGCCGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATTGTACATATTAGGGTAGTTTT:1 + chr3R 3485143 5' - 1360 3139 1 59.59 AATAAATCCATTAATATCGGCGCCATTTCACGTGCAGAGCGTTGATATGCCATCTACATGTGCATATATACATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACA:1 + chr2R 15474455 5' + Quasimodo 44 2 55.00 CCTCCTATTTTTATATTTTTATTTGAATTGAAGGGTATGCCTTTATCGCATACATGCATAAATCCCTTTTCGAGGTCACACACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGG:1 + chr2R 22957878 5' + hobo 43 1 56.16 CCGCAAATGGCAATGTTTATTAGCCATAATGATGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCACGCAGTTAGGCC:1 - chr2L 15523100 5' + 412 89 2 77.93 CCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGTCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAA:2 + chr2R 16274566 5' - roo 322 2 74.66 TTCTACACATGTAGATTGGTTTATACAAAGAATAAAATGGACAGACGCACATTTATACACAATGTAAAAAATAAGTTAATTAGAGTTACAACAATATATGTAGGTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:2 + chr2L 18181073 5' + blood 7029 2 69.18 CTGTAGACAGCAATTAGATAGACAGAGACAATGCCAAACAAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAAT:1 - 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Transib-N1_DM 444 1 78.57 CAAACTATGCTTTAATAAAATGAGATAACAAAAAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACATAGCA:1 + chrX 3239305 5' + X-element 94 1 81.43 TGATTCTGTTGGAAAAGGATTACGATATCCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAA:1 - chr3R 8563603 5' - 297 340 2 76.15 ATCCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAA:1 + chr3R 25798366 5' - hopper 1356 1 56.85 CATAAAAAAACCCTAAATATCTGAGACAATAATAAACATTTAATGCTGCGTTTCCCACTTTTAAAACCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 9695917 5' + 297 6633 2 59.59 TCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGC:1 - chr3L 18074200 5' + 297 6621 2 58.90 TTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACT:1 + chr3R 8112718 5' + Burdock 6210 2 69.86 ACTCCTTAAATAACTTTATGCCTATGACTAGGCATAATAACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATG:2 - 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chrX 14735808 5' - diver 127 2 69.86 GCCAAATCGGCATATTAAAATCATTCAACTGTCCCGTGTTCTGACCACAATGCAAAAAAAAACAAGTTATAAAAACGTAACCACAACAAGGCGGGGCTTACTGAAGTCAGTAGAGGAAGAAAAACGTCTGTCCTT:1 + chr3L 16522126 5' + baggins 5000 1 67.41 TAATGGACATGGGCATAGGGTATCCTGAAGGTATTCCAAATTGAATTATATTCTAAAATTACTGCACAGTACTCACCGCCTAATCCAAACTTCAACCAAAAAACAAGAGAGAATGCTATAGTCAAGTTACCCGACTATCA:1 + chr3R 23020789 5' - INE-1 563 1 60.00 AAAATATCTCGTATTTGTCTGTCTGGTCAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr2L 17019219 5' + 412 7068 2 77.78 AGGCTTTGTTTTATGGCTTTTATGGCCAAATTGTTAAACAACAAATTGTTGTCCAATCAATTAAATTCATTTTCCAAGCAGAGGGAATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATA:1 + chr3R 4527162 5' + mdg1 7075 2 60.27 GGCTTTAATAATTTAGAAACAGGTTGTTCAAGCTTTAATTATATTCAAATAGTGCATTTAAAGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAAATGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTG:1 + chr3R 25796002 5' + BS 5054 1 56.25 GTACGTGAACGTTAATCTGCTCGCAGACGTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 - chr3R 11285006 5' + blood 51 2 52.74 TCCTCTACTTGCCGATAGTGTGCCTCAACAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTGGTTATCTAA:1 - chr3R 22709020 5' + roo 90 2 79.45 ATGGAAAATTGTGACATATAACTTCACTGAAAGAAATACACTTTCAACTAGAGATATTTTCAAAAAGTTTTTAATTTAATGTTAGTTTTTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTNCAGTTG:1 + chr3R 19514202 5' - blood 345 2 66.44 TTTGCATTATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGT:1 + chrX 5751866 5' + roo 8747 2 76.39 TATGGCCGGGACATTGACATGAGTACACAACATGGGATGCTTCAACTTTTGCTACTAGTATATACATACATATATAATATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGCTAGCTGCATCGGC:1 + chrX 17926572 5' + pogo 22 1 66.41 GCCTCATCAGGGGATGTTCGGGATCCGGTCGATTGTTATCNCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATNCCAATACTTCTGATGTAGCTAATAAAGTCGCAAAACGCAGTTGG:1 + chr2R 1921393 5' - mdg1 7420 2 57.53 CCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTG:1 - chr2R 12133852 5' + jockey 59 1 53.79 GGAGACAAACAAGCATTAGAAGGGTAAAGAAAGGAGTGCTTAAAGTGAAAGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATGGCGCTAAGCTTTTTGTCTGAGCTTAGCTTTATTTTTA:1 - chrX 21443046 5' + Transpac 74 2 65.75 ATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTT:1 - chr2L 20628691 5' - Stalker2 7612 2 58.22 CCAAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACACTATACTTGCTAGAC:1 - chr2R 17493162 5' + BS 4873 1 66.44 TTCACTTATTCATTCTGATTGTTGAATAGTCATGGGTTGCTAAAAACATTATTAATAAAGTTTCCAGGAACTTGTTTGCATACACTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATAT:1 - chrX 12979567 5' + transib2 38 1 59.59 ACGGGACCGAGTACGGGACCTAGTACGGGAACGAGTACGGGACCTGTAAGTTAACACGGGCCAACGAGCTAGACCAGTTGGCTCAGTGCACG:1 - chr3R 13421968 5' + Gypsy6A_LTR 23 1 56.52 CGTGAAAAGGGTCACCTATACTGCAGTTTTATGTGGCATACTTTCGGGGGGACGGCCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTTTGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 + chr3R 21735413 5' + hopper 8 2 77.08 GGTTTCTTAGACGTTAACTCTAGTATTAATAAACATAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGCGAGTGATTCTGTTGTGATTTGTGCAGTAGTTTAAAGAAATATACGAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGT:1 - chr3R 1844819 5' + Cr1a 190 1 78.52 CAGTTGGTAATTTGCTCCATTTGTCCGAAATCAATGATCCAATCAAGCAGTCCAAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 + chrX 17770422 5' + hobo 25 1 55.34 AACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAA:1 - chr3R 25580844 5' - 1360 3329 1 68.75 TAGAGAGCGGTTTTTTTTTGAAAGTATATATTAAAATCTAATAAGCGTAAAGGGTATTTTTTATTGTTTTTTATGCCAACCTGTTAGATGCACTTATAGTAACTTATGTAGTTACCGCTTTATTTAATTACTAAGTACAATATCTT:1 + chr3R 10144335 5' - Chimpo 156 1 65.07 CATAATAAAGAGCATCTACCACCTCATAAAAATGCTGGAGTGCGGACGATCAGTCCGGTTAACTCAGTTAACTACTCCCCCCCCCAAGATTGAGGCCGTCCTCGGCCGACCCTATTTGGGTGAGGACTTCCTTC:1 + chrX 21772491 5' - springer 7078 1 73.88 GCATTAGCTTATCGCTATTTAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGTGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTT:1 - chr3L 11684947 5' - Bari1 1672 1 58.90 AATAAACCCCTTTCATCATTTGTATAAACACCTCGGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chr2L 10613763 5' + hopper 147 105 67.24 AACCACTTGACTTCATATCACTTTTCACAGCCCACAAGAGTAGGCAACAAATTTTAGGTTCTTTATGTTAAACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGC:1 - chr2R 17207853 5' - jockey 4967 1 51.13 GTGAATGCTGCCTTTTCATTTGGTTCGCAATTTATGCACTCACACTCATATTTAAAGATTCTCGTCTACAAGACTATTCTCAAGCCAATCTGGACGTACGGAATTCAGCTGTGGGGCACTGCTTGCACATCACATAGAAGGA:1 + chrX 3921642 5' + G2 2691 1 63.38 ATTTAACTAAAGCATTTACGATTTTTTAATTATGGTCCTCTATTTTTATACCCGTTACTCTTAGAGTAAAAGGGTATGCTACAGGCAGAATGAATCGTTTCCGACCATATAAAGTGTATATATGCTTGATCAGGATCTATAGCCG:1 + chrX 22484662 5' + INE-1 88 1 53.10 CGTGCCGGCTAAATGAATTATGTAACATGTCTAGCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTA:1 + chr2R 21796044 5' - roo 318 2 80.82 ATAAGATAGCTTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr3L 2167701 5' + opus 167 4 60.27 AATCATAGGTTGTTTTTTTGTACTATTTTGCGGTCCTGGGTGAAATCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3R 26854695 5' + jockey 15 1 76.39 AATCCCCTGCCAACATCCATCTCTGCGACTTTTCTGGGGGAAATTGCTTTACACAATCGAAACGCACGAAATGACAATATTTTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCAT:2 - chr2L 1244007 5' - I-element 5310 1 54.79 TCATGGCAATGCTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAA:1 + chrX 16547450 5' - P-element 2858 1 60.16 ATGTATAAGGGTGGAAGCAGATAAGAACCACAATATCAACGCACAGTTTACAAAGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAG:1 - chr2L 901823 5' + jockey 4716 1 57.38 TGAAATAAAAATTATATTTTTTTCACTTCTAAATATTGCAAGCATTTAATTATATAATTACAACTTCGCGGTTTGTTGGTTTATAAAAAAAAGTATTTTTATTGATCAAAAACTTAAGCGAATGTCGGAGACAAATTCACGTCTT:1 - chr3R 8963755 5' - Quasimodo 7298 2 68.97 CAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGCTTATGTTT:1 + chr2L 4244899 5' + 412 7125 2 70.80 AAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCC:1 - chr2R 17350608 5' + F-element 67 1 52.05 AAATACCGGACGCCGGGCCGAGCCGAAGGATGGCAGTGACTGAAGGGAAGACGAGGGGACTTACCAAAGGGCGCGAACGATTGTAGGATGTTGCCGATGGCAAACAGCTTACCTGCGGTGATTACAAAAACATTTAAGTGGCAACA:1 - chr3R 31091347 5' + transib3 117 1 63.70 ACACCGCACTGTGGGGCTTCCATCGATGAGTTTTTCGATTCTTTGCAGATATGTGGGCCAATTTTGCATGTGCATGTAAATTAAACCAAATACGTTTGTATTGAATGGTTCTTTTTATTAGAGCCAACTGCTCTGAATTCTGGTAT:1 - chr3R 12146759 5' - gypsy10 295 2 52.05 TGCGGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGT:1 - chr3R 12613861 5' - HMS-Beagle 6977 2 62.33 AAGAGATGCCCGAGCATGAGGGACAGAGAAGGACGCACCGAGCGAATGAATGAATGTGTGGTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTAGCACTTTTGCAACAATGTT:1 - chr3R 6419940 5' + Tabor 64 2 58.90 GAAGTTTCGCCCCACGTGCATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr3R 12764824 5' + copia 42 2 56.85 TTACCCAGATAGTCGAGTATAACATAAGTTGGCTAATATTAAAATAGGATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCG:1 + chr3R 20200348 5' - Transpac 290 2 62.50 CATGAGGTTGCATATAAAATTAATTATATACCTCCTTCCAGTTCTGCATTTTTCATTATTTCGTTTAATTTGTTTACGTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTGTAATTTT:1 + chrX 11947677 5' - Doc 4698 1 66.36 ACCAACAGCAGATGTTGGCGCTGTTAACTGTTATTTACTTTTGCGGCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACAT:1 - chr2R 9376721 5' + hopper 74 1 66.44 CGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGT:1 - chr3L 27391423 5' - 1360 3366 1 65.07 CGTGGACAAACTTGAGTTGAAGTGGAATCGATGATAACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATA:1 - chr3R 25796096 5' - BS 5036 1 51.37 TGGCTCTGATAGATTAATGCGTTCGCCATGAGCTGTTCTGTGCCACAGCTGCTCCATTGTCCGCCATCAGCACATCCATCCACATGCAAAATCAATAAAACCCCAATGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 11536033 5' - roo 9053 2 71.23 AGTATGAGTATGCAATGAATCTAGAAAGGTCAGCGTTGGGTTTTATCGTTTTTTTTTGTTATTTTTTTTTT:1 + chrX 3276736 5' + hopper 146 111 77.46 AACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAACGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACGAGTCGATC:1 + chrX 22633244 5' + INE-1 96 1 60.14 CCTGCATTTTATTGCAACGCTCGGTGGGCTTACCACCTCATTAGGGCCCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAA:1 + chrX 14735710 5' + diver 35 2 59.12 CTTATGCTATCCATTGAAAAACCCTTCTTGTAGTACCAAGAAGATTTTCCCATTGGGTAACAATTGACTAACACTTTAGGTCGACCATAAGACTCTTCGATAGCTTGATGATATTTTGTTTTCTTTTTTTTTA:1 - chr2L 16769029 5' - gypsy11 3932 1 57.89 GGCGGGTGATTGTGTGGAGGGGCACGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTC:1 + chr3R 12341124 5' + Tirant 15 2 65.00 AGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATGGTGATCCATCACAAACAC:1 + chr2R 22523168 5' + jockey 74 1 64.44 AAATAAAACAAAACTCCATCGCCAGTAAAATAAATTATACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGACAGCGGCAGAAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 + chr2R 18945176 5' - blood 7180 2 69.42 GTCATTTTTGCAAGACATCAAAGCGACAATCTTCAACGTCCGACCAAACTGTTCCAATAATTTTAGAGAATACGCTTCAGACGAATTGCTGCCAGTGATTTGTATTTCTGATCGTAAAGAGAAAAAGCTTTGGGTTTCTCTTGGAT:1 + chr2R 3290409 5' - Idefix 7175 2 75.34 ATAAAGAGGGATAAGTACCGAAAAAGAAGACGATGTAGTTGAGCAACTCAACTATCCGATACCCATTACAAGCTTTATGAGAAGAATATTATATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCG:1 - chr3R 10736162 5' + McClintock 27 2 65.07 CACGGCACGGGCCACCGTATACATGGCACGGGCCACCATTTTAGCCAGGACCAGTGTCAAGTCAATCCTTAGTCCTCTCGCAGCGCCAAACGACCGTCACGGGTAACTGTAACACTGCAATAACGAGTG:1 - chr2L 20815859 5' + Doc 489 1 58.14 AATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3L 11535897 5' + roo 60 2 63.04 AAGGACCTTTGATGAGCTATTAAATGACGGCAATATGAAGATGCCCGAAGATCATCCTTTCCTAAGAAGCAGGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATAT:1 + chr2R 13847776 5' - 412 444 2 50.00 ACATCAAATCGTGCTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTC:1 + chr2L 15085626 5' + opus 7168 4 61.48 TAAGTGGTATGTTCCGACGTCTTGTTGAAACTCTCACTCCTAGACCAAAGACATTAGAATAACAAGATGTGTAACGGACATACATTGGTTTGGCCAAAGACACTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATA:1 - chr2R 3920256 5' + blood 7029 2 71.33 AGCCCTAACACATGTTTTAGGTGTGTTTCAAGAAAAATAAATTTGCACTTCTGCACGTGCGTTTGTTGTCACATTCGCTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGAT:1 - chr3R 26188631 5' + jockey 61 1 54.79 TTCCGATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCG:1 - chr2R 5621033 5' + ZAM 52 2 53.57 GAATCTATGGACGTTGCGCATCTTATTTGTCGTGCGATTGTCGAGCGATATCTCAAACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCC:1 - chr3L 21771050 5' + hobo 25 1 68.49 AGTACATGTGTATGTATCATTAGGAAGGAAATTTTTTTAGAAAGGAAATTTTACAAAAATACTTTAGATTGCCAATTTTTACATTTGTATGTATTAAATATTTAACTTTGAATATTACCTTTTGAAAAAGAAAACTTTAAAAAAAA:1 - chrX 7706619 5' + P-element 2694 1 65.75 TTACTACGAAGTATATGTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCC:1 - chr3R 8197909 5' - pogo 2079 1 67.39 AATGGAGCTAAAGATATGTTGCTTTCATTTATGTCTGCACTCGCGAAAAATCGTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAG:1 + chr3R 19094141 5' - P-element 2870 1 70.00 AAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTCTTTTTTACAAT:1 - chr2R 11778072 5' - hopper 1402 1 64.21 CAGAGGGTTTCATTTTTTTCATTCAAGGGAGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 - chr2R 9618182 5' - roo 8980 2 80.69 ATTTACGACATCGACGAAAAAGCTGCAGTTATGGTGAACAAAATCGGTAAAATTGCAGTCGCTACATTCAGTTGGCAATTATTGTTTTATTATGACATGCAAGCCTATTTTGATGTCATCTATTCATCCTCACACATTGACAAT:1 + chr3R 3617312 5' - micropia 5128 2 74.31 AAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATTATTGC:2 - chr3R 31264533 5' + BS 48 1 53.42 CTGCTTAAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTC:1 - chr2R 17350644 5' + F-element 31 1 73.97 ACTAGGCATAATAACAAATTAACAAACGTAATTTTTTCTCTGTGCAACCCTTTTTCTTTGTCGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCAC:1 - chr2L 3893109 5' + 1360 29 1 62.33 CGGCAGTGGCTAAGATAAGCGCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCAC:1 + chr3R 13259788 5' + hobo 21 1 68.57 GTATAATGATAATAATAATAATAATAATTAATGAAGTAAATAGTTAATATCATAAAATAAATAAATAAATTGAAAGCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTTTACTACAAAGCACTACTCTGTGTGTGGAATAATAA:1 - chr2R 1247765 5' + Doc3-element 151 1 75.86 GCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTA:1 - chr3L 1459853 5' + 412 7126 2 77.52 CGTAACTCTTTTATTTCCATGCAAGTCCATGCGAGTCCAGATCCTGAAGAGACCCAAAGGCCGAAAGGACGAAACGAACCTGTAAAATCCCCAATTGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAA:1 - chr2R 10977225 5' - roo 9028 1 54.79 TGTGTTTCAAAATAAGATTAACTTAATGGCTTTTTCTACCCGTTACTCGTAGAGTAGATTCGTTGAAAAGTAAGTTCACACTAGCAAAGTAACAAGTATCTGATAGTCGGGCAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGT:1 - chr3R 23020998 5' + INE-1 579 1 43.48 TTGTCGATTTAACATTTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTT:1 + chr3L 13285548 5' - roo 391 2 71.32 GAATGNGTTGGACAGGATATGGGCAGCTTTGAGATACGAAGGCAGCTAGAATATATGCTTGGACCTGATAATATGATTTCTATAATATTACCTAAATAATTTTAAGACAATTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTCACTCGTTG:1 + chr3R 13254848 5' - roo 9059 1 75.86 CAAACAATAGAACCCTGATGATGTACAAGGACAAGGAAGGTGATCATAGGTTGGGCGGAAAAATTCTATAAGTTCTTTCCTGTGTTTATCTATTATCTTGCTTCCGGTTTCGTAAACTTATTCTCTTTTGTCGCAAGCTCGCTAA:1 - chr2R 4688202 5' + Gypsy12A_LTR 2102 1 78.62 TGTGTCTGAGCCTCCAAACCCCATGAGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCAC:1 - chr2L 15420151 5' + Burdock 1 2 63.83 ATACCAAATAATACGAATTAAGTGAATCGAAAAGCCAGTACCATTAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTGCTCTCTTTC:1 + chr3L 9397632 5' - 1360 3316 1 69.93 CACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACAT:1 + chr3R 29283204 5' - hopper 1351 1 69.29 CGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATAATAT:1 - chr3L 6015654 5' + roo 71 2 73.33 AGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCAC:1 - chr2R 23094972 5' + 412 45 2 53.38 GTTAACATGTCGCATTTTATACGCATTATTAACGCTCATCGCTCCGCCTTGCCGTGCTTTGTTTTAACGGTCTTTGTTGGCCCGGCTATTTACACTGCACTATGGTCCAGACTTCGTTTTTT:1 + chr3R 22647791 5' + transib2 4 1 79.51 CATGTGTGAGTTGCGATCGTGTGATTTGTTGCTCTCCTCTTCTTCCCTGTCTCTCCGGCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTG:1 - chrX 7702823 5' + P-element 57 1 43.07 AAGTGTTTATTTTGTGGACTGGTTGTTTTGTTACGTTGAACTTAATGTGACCCACTTGACTTCCTTTCGTTAAGGGTTTACTTTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCA:1 - chrX 2214324 5' + jockey 4595 1 57.04 TTTTGCGCATATTCAAACAATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGA:1 - chr2L 20628710 5' - Stalker2 383 2 71.23 AAACATAATTTGGTTATTTCTCTGTGTGTAAAATCCCCATTTCGCTCAGGAGCACACAAATAAACCTTGATTTAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAGCAAACCCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCA:2 + chr2R 19574414 5' + I-element 5145 1 52.74 TTTTTGACAAATCAACAGAGACGTTGAATAGCCTTCATCTACAAGATGCATACTGTAAAATCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTG:1 - chr3L 13292058 5' - roo 342 2 65.71 TCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTCCGTTTGAATCGTTTTATTTGAATGAATTCTATGTTGCTGT:1 + chr3R 7579399 5' - Stalker2 7571 2 71.23 AATTAGATAGACAGAGACAATGCCAAACAAATCAAGTCAAATACAATAAACGCCCTGGCATTTTATCAGCTCCAAATCAGACATAACATCAGCCCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 - chr2R 11778105 5' - hopper 1384 1 64.38 TTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGACTGCCGCC:1 - chrX 22835239 5' - mdg3 5417 2 73.38 GCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 2966531 5' - roo 8996 2 68.97 GTCCAACTCAGCCAACTATNGCCAGCTTGTAATTGGCGGCCCCCAGACGGGGGAGGCTCAAGATCGGCGATATGTACATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 + chr3L 20680255 5' + 412 37 2 57.55 ACATAAGTTGGCTAATATTAAAATAGGATTGTTTTTAATTTAACTGTCAATTTCTTTTAGTAATATAATTGCTATTATATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCT:1 + chr3R 20200369 5' - Transpac 268 2 47.59 AACGCCGGCCACTGCAGTTTCGCTTGGATCGATGAAAGTGCTCGGAAGTTAATCCAAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 + chr3R 24666357 5' - hobo 2921 1 60.20 TTAGTGTTCATTTTTGCTGCATGTGCATGCCATATTTGATAACAAAGCCATGCTATGTGGCAGCAACTTTGAATTTATACACTCATACACCCATCCTTAACATACCAATATTAGTCGATAAGTTTCTCGATAATATTGGTATGTTA:1 + chr2L 4865017 5' - mdg3 5358 2 50.68 CTCTCGTGGCCGCTCGGCTCAGGCAATCGTTTGACGTCGGTGGCGTTCGGCTGGAACCGGCTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTG:1 + chrX 20330516 5' - P-element 2848 1 52.38 GTAAAACAAATAATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCC:1 + chr2L 8284309 5' + Doc 382 1 77.24 AGCTTTTATGTAAGTAATAATATCAATAAACATATTTCCTAATCCACATTTTCCACCAGAGAGGATGCAAGGACAACTTTCACGTCGTTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chr3L 15718039 5' + 1360 32 1 56.85 AGTAAGCAATAGAGTGCCACTCAGTTATCCACAAAAGGAACACCGATTAACTCTAATTAGCTAAATAAAGGTCTTTAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAG:1 + chrX 21442945 5' - Transpac 5182 2 51.39 GTGGGAAAATTAGTGTCCTGCCGCCGCCTTTATGGGTCCTTAAAAGCCGCTAATGAAATCAATATAGCCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAA:1 - chr3R 29627954 5' + roo 8710 2 53.62 TTTATTAGCTTTACAATTTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCAC:1 - chr2R 13256058 5' + 17.6 59 1 69.18 ATGTTTATTTAAATATTTTTAACACCTACACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 - chr4 868758 5' - roo 9033 1 58.62 CCATGGTGTTGGATTTAATTCTGAATCCCCATTGGGATGGCCAACAGTGGAGTGAGTGCCAGTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATA:1 + chr3R 25798368 5' - hopper 1354 1 58.22 TAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGTAAGTGGGGGG:1 + chr3L 11684816 5' + Bari1 60 1 57.93 CGAGGTTATGAAACTCGGTCTCTTCGCTGGCCCCTTTTATAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCACCAATTAGTTTTTTTTGCC:1 + chrX 19393204 5' + FB 85 1 75.34 AAATTGGATTCCATCTCTTCATGACGGCACGCAGTAAATGAATTTTTCAAAATCTCCCGAAACAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTTTCTATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCA:1 - chr2L 15516814 5' + Max-element 8263 2 67.12 AGATATGTAGAGCCCGCTTTTAAGACATGGTGTTAATTTAATATATTTAAGATTGAATTCCTTGTATTCTTCACCTCGAATATGTTTTCTAATGCAACTAACAACCGACTATTAGATAGCCGTTACTCAGCTAGTGTGAATGC:1 - chr2L 21614233 5' - INE-1 534 1 73.43 TTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTAT:1 + chr3L 7024441 5' + 412 56 2 53.79 AAATTATTAAAATTTGTTTTATATATTTATGTGCGCAGAAACTCTTTTTACTAGCTTTTCTTAAACAATATGAAGGTAGCATTAATATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGTTTC:1 - chr2L 11523173 5' + HMS-Beagle 20 2 67.42 CTTCAGGGAGGGTCTAAAGAAGGCTCTACGATTGTAAAGTCCCAAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAA:1 + chr3R 22708980 5' - roo 8980 2 76.71 TTTTTCCGGATCTGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTATGTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr2R 7895508 5' - mdg1 7413 2 49.65 TGATATCTAATTCAACCTATTTGGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCAC:1 + chr2L 8284325 5' + Doc 395 1 66.20 AATATTCGCTGTCAGCTAGGGAGGTTTTATGGAGATGTGGCAAGCAGCTCGAGCAGCCGATGTCTGGTGTTGGGATTGCTGGGGGTGTTGTTTTTTACGTTTTTTTTTT:1 - chrX 15569217 5' - Bari2 910 1 83.49 ATTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACC:1 - chr2L 15085751 5' - opus 460 2 56.16 GGATGAAAAATCAAATTTCGTAGTCGTACCCATACAACTATAATATTGTCCGCATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTAATCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTC:1 + chr3R 1342053 5' - invader4 3023 2 62.59 TCCAAGATTATATTATCTTTCATCAATCTGGCCAGTTAAATATACAAATGTATAAAATGTGAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTT:1 - chr3L 1628763 5' + hopper 8 2 78.08 GATGGCCGCTCTATGGTCTGAAACAGCTGTTTACTGTTTTGGTACTATTGGTACGCGTAGAAAAGAGCTGCTGGCTGTAGAGATTTCCGCTCTCTCGCTCTTGAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAAAGCCACGC:1 + chr4 1197927 5' - 1360 63 1 73.97 CATGATGATAAAGACATTTTTTTATTTTTAAATTAAGCAAGCGAGAAACTCTTATACTGACAGCCGCCCCAAAGTATGCAACGTTTTTCGTTCAAATTTATTAAACGAATTATTAAGTAGCCGCAATCTACGGTCTCCAGCTTAAT:1 + chr3R 27027703 5' + jockey 499 1 59.59 CAGTCGATTAACACTCACACAATTTCACACATACATACGTACGTTCAGTCCAACATACCATGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTAT:1 + chrX 20361956 5' - hopper2 1546 1 60.69 CAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3L 2317245 5' + 412 41 2 53.96 TGGGCGCTAGAGTGGGCGTGGCAACATGGGTCAACGATCTTGCGCTGCGTCTTTGTTTCTACAATCTTTATGCTGAATCTCAAACTTCTTCAGGAAACTGAGTAATACAAAGGTATTCTTCCATGTCCCTTTTCGGACTCGACTCT:1 - chrX 7332396 5' + HB 68 1 59.59 ACTCGCATTCTATATGTCTTTGCATGCCAGGTATTGTATATTCATTCATACATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAG:1 - chr2R 9750246 5' + opus 7170 4 64.44 GACTATGCTTGGCGTTTGGGTTGCGTTTAACCACAAATTAAATTATCTGACAATTTACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTC:1 + chr3R 19958591 5' - jockey 4625 1 60.00 CCATAAAAAATATATGCCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATT:1 - chr3R 8050541 5' - hopper 1350 1 62.33 CCACATTTCTTGCGCTATAAATCGCAGTATCCATTATAGCATATCAACAACCAAATTAAGACGAAAGTACAATAAAATGCAACTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAG:1 + chr2L 15019851 5' - BS 5062 1 58.99 ATTGTTGCGTAAACTTGCAATTTCCCCAGTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACG:1 - chrX 10319736 5' - mdg1 7427 2 63.01 ACATACATACATACATAGATATGTATATCGAATCACTATACATCCAAATACATATACAATATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3L 17780727 5' + 297 47 2 65.00 TGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATC:2 + chr3L 25206790 5' + HMS-Beagle 41 2 57.53 AGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr3R 30087706 5' - roo 341 2 65.25 ACAATTATCCAGAACCAATTGAAAGCGGCATACAGCACAGATACACAGACAAAAAATAAATTTCTAAGTATGTGCACAAAAAGAGCCGCATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTG:1 - chr3L 9696061 5' - 297 6947 2 67.81 CTGCTCCTGCGGTTTGTTCATGTCGCTTATAATTAGTTTTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGAC:1 + chr2L 15085639 5' + opus 7178 4 70.45 GTTTTGGGTGCCACATGATGTTTGTCTAAGATCCACAGTGGTGTCCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTA:1 + chr2L 15874803 5' - mdg1 405 2 74.66 CTTTAACGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGGACT:1 + chr3L 17268257 5' - hobo 2903 1 59.05 ACTATGGCACGCCTCATCAGGGGATGTTCGGGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAA:2 + chr2R 1921383 5' - mdg1 392 2 65.07 TCAATAATTCAGTTTTATGGCACAAACTCCGCAACTTCGCAACCAGCCTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTAACGGCGATATATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 - chr3L 8249517 5' - mdg1 402 2 70.55 AGCCGCCGAATAAACACCATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCA:1 + chr3L 20189588 5' - FB 216 1 41.78 GATATGGTTGGAACCCTACCTTTTCGAGCGTGGGAAGTATGTTCGAAGCAGAAGCCATGCGCGAGTTACCGACCCATCGGTACCATACACCACCCCTCCCTCTAAGCCACCACGCCTACACAAGTAGAAGACATCGAACC:1 - chr2R 5621029 5' + ZAM 8018 2 56.43 CAATGCGATGCATTTGCCACACGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCA:1 - 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Stalker2 7605 2 52.94 AGAAAGTTGTTTATAGAAAGTATACCATATTTGAAGAGGTTCGTTCCATTGTGTTGCTCAGAACAAAAAAGGCTGTAGTTAATTTTTAAATTATAACAGGTATAGATGTAAAAGATTTGGTTTCCGAGCTCAGAACCTCTGCTCTG:1 - chr3R 12948712 5' - Stalker 359 4 53.42 GCATACTTTGTGTGATTTGCCAACGAGCTTGTCAACACCAAAGCCCCGTTTTTTACGATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAATTTAT:1 + chrX 683554 5' - jockey 4938 1 61.76 AGTCCATAAATGTAAATTAGAACCGTTTAGGCAAAAAAAAAACCTTGTTATTATAACGAGTTCATAATTCATAACTGCGTACAAATTCAATATATAAATTAACTAAAGATAGATCGCACCGTCTTGCGATACTGTTGTCGTCAGG:1 - chr2L 17269248 5' - Gypsy6A_LTR 372 1 66.21 CTATGTCAAGTCGATTTCCTTTTTTTGCCGGTTTCGATTTATTTTAATTTAGCTTGAAAGTTGCAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCCTG:1 + chrX 16547461 5' - P-element 2848 1 51.97 TAAGCTTGTTTCTATAAAAAAAAAAATTTTTTAA:1 - chrX 8962558 5' + Stalker2 7180 1 64.71 TTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCT:2 - chr2R 12827078 5' + Burdock 6188 2 56.25 ATGGAGGAGGCGGAAAAAAGCAGCGGGCAGGCTGCCCAAAAGAAAGGCAACTGGAACACCGCATCCGGCCGAATGCCGACATTCCGGCCGAATGCTGACATTACACAAAAGGCGCACTGCAA:1 + chr3L 11365379 5' + Tirant 8232 2 59.84 CGGTGCCGAGCTGGAATTTAATTGACTGTTGGCCGTATTTACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTAGGCACCCCGGTT:1 + chr3L 17268263 5' - hobo 2888 1 67.54 TATGTTTTCCCAATCTGTTTATTTATTTACCGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTCCAATTTTTGCCTCCGTTCTTATCTTATGTAAATGAA:1 + chrX 5751873 5' + roo 51 2 66.67 GTTCAGGGTCCGAAAATTAATTTAATCACGTTCACGAGCTTATATGCCCTCAAAGTGGGTATGACAAATATTCCAATGCTTGGCCAAATTGCAAAGATACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAAT:1 + chr2R 15392483 5' - mdg1 7441 2 70.71 TACCGAACTAACGAAGCTGTGAAGGATCCCTATCGATCCGAGATTAGTGCCAAAATGCAAACCCAAATGCACTCGCCCATGCAATATGAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTG:1 - chr3R 17077938 5' - 1360 3368 1 69.40 TACACCACCTTATTTTCACGGATTCCGATAATGAATTCGGTTAAGAACATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 - chr3R 12519710 5' - roo 9036 1 55.97 TGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 - chr2L 12236811 5' + jockey 73 1 72.00 CGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTT:1 - 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INE-1 550 1 67.81 ACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTAAGCGAGTGTACATTCC:1 - chr3L 22021726 5' - mdg1 338 2 76.71 GGCTCTGGTTAAGGATACCATTAGTAGAACATCAGCGCAGCAGAACCCTGGAGTTTCTTTTGGGAATTTACGTGCGTTACAATGCTGACATAGGACATATAAGTATGTACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCC:1 - chr3L 18074231 5' + 297 6590 2 80.14 AAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAA:1 - chr2R 9341633 5' - roo 8985 2 79.45 CCCGAGTCAGCCAGCTGGCGTAGCTTTTGGTTATTCATTATTTTCAATACGAAACCAATCGGCCTAATGACACGAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTT:1 - chr2R 18887078 5' + roo 8704 2 55.80 CAGGTCAAAGGCAAGGGCGACATGGAGACCTACTGGCTGCTGGAGGGTCCCGAGGGCTAGGAATAGAAAAATATTAAATGTATTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACA:1 + chr3R 16475314 5' + mdg3 5293 2 57.24 ACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTGGACAACTTAATCTAATCGGTATCAATTTTAAC:1 - chr2R 6526607 5' - jockey2 3325 1 56.55 TTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTAAAAATTTACAATGCATGAGCATACGTGTGCACACATAAAGTTTTCTGCTATCACTGTATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGCTGTAGCGCTCTTCGCTCTCTCGCTCTCTAACAAAAATTC:1 + chr3L 20431712 5' - 1360 95 1 80.82 ACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGCTATAGCTCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTCACATGAG:1 + chr3R 20904973 5' - roo 8999 2 67.12 GTGAAAAAATAACAAGCCAGTTGAAGGATTATACACATTCAAATAAAGAGATAAACATTTATTTTTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTAC:1 + chr2R 10118981 5' - Juan 4153 1 59.31 TGAGGGAATATAAAATAAGAAATACTCGTACTTTTGCACTAACTGCGTAGAAAGCAAATCGCGTGAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGAT:1 + chr3R 11756734 5' - Tirant 339 2 57.53 GGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr2R 12462134 5' - roo 339 2 64.38 AACTTTCATTTATGTTGTCGTAGGTCGCGAGCACACGTAAATACCATATTGCAAGCCAAAAAGTGACAACACATCCAACCACACACACACACACATATAC:1 + chr2L 16671145 5' + accord 185 2 59.00 AGAGAACGATAAGAAACCTGAAAACAGTTGTTAAATTCAAAATATCGTCGGAGTTCGTGGCATATACCAACAACACGCCGCCTAATCACCTTGCT:1 + chr2R 3290267 5' - accord2 286 1 74.74 TGGGATATTTATTCACTCATGTTTAAAAGGAAATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATC:2 + chrX 6538593 5' + pogo 3 1 78.08 ACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAACTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAAAGCGA:1 + chr2R 19805444 5' + F-element 102 1 77.78 TTGAACAACTATGAAAAGTTACTTACCAATGACCTTTCGTCATTTTTGAAAAGTGTGAGGAGGGTAAAGTTGACAAAGGTCAATAAAAGTCGGGATTGTACTAACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTTT:1 - chr3R 11076293 5' - I-element 5342 1 73.29 CTTTCAGCCCGCCCCCAAAAAAGTGTTGCATGCAAATGCATCGACGACAACGAAAAACGAGTGCAACAACCACAGCAGATGTGTGTGTGTATGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGT:1 - chr2L 12897068 5' - accord 7033 2 79.82 GAACGTTTCTGGGCCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAG:1 - chr2L 22640203 5' - invader4 287 2 57.69 TCTATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTCTTTCCGCT:1 - chr2L 22780913 5' + HMS-Beagle2 84 2 76.55 AGGTCTTTTGTACTGGATGTATAGCTAAATTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr2R 14884056 5' - roo 9038 1 60.96 CATTAATAAGTACTTACTGTAATTGTCGTACAAAAAATTTTAAAATGTAAGCTTAAGTAATTATTTTAAAACATGGCGACAACAAATTTCCCATAGCAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 - chr2L 388656 5' - roo 9047 1 67.12 TGAGGGTGAACAACATTAGACAAAATAATAACGAAATTGAAGAACTGATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTATGCA:1 + chrX 292005 5' + 412 7130 2 69.86 AGCTCAAGCCAAGCGAATTCTTCCTCTGCCACCCACTTCCTCACCGGATGTTTCGCTTCGAGCAGGCACTTCCTCCGAAATAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTAGTTTGCT:1 - chr3R 31264543 5' + BS 38 1 54.79 CATAATCTTTGTTGGGTTATTTGGAGAATAAAACACCCGTGCAATGTTGAAGAGAGTAAGTAATAAAAATGTGTGCTGGAAAATGCAAATTCAAACTGAAACTTAAAATGATTCTTAGAGCTAACAAATATGCTGTGTTTGCCGGC:1 + chrX 22398528 5' - Gypsy6A_LTR 96 1 45.21 AAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAA:1 - 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chr2R 23094959 5' + 412 7124 2 66.44 AGACCTTTTCGATTTATTCATCCCCAATGTTTAAAGCTATATGTTAAATTAAATATGAGTTTATGCATGTAGTACATATGTACTTTATTAGTATCATAAGACTCAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCAGTAGGAC:1 - chr2R 13939599 5' + G6 1988 2 67.12 AATGTGCTGCTTACTTATAAATGCATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTG:1 + chr2L 2544744 5' + blood 7077 2 60.96 ATTGAGAACTTGTAAATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 6015552 5' - roo 9033 1 53.42 CAAACTTAAGCTGGTTCCAGTTTTGGAGCAGTTCTTCGGTACAGATCGAGTGCTTTTCCTAGTCAGAAAACTATCGAAGGTGCAATCCAGCCAAGCGTTAAATTTTTTAGGCCACACAGCTCGAATCATTTCATAAAATGATATTT:1 + chr2L 3051617 5' + Doc3-element 4632 1 63.01 CGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTG:1 - chr4 373065 5' + pogo 53 1 58.22 GGTATTTCTAGCATACTAAAATAAGATGGAAAATAAAAAATCCCAAACCAACAGCATGAACATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 - chr3R 26242554 5' - roo 401 1 66.30 CCGTTTGTCTGATGATTTTGATGCGTCATAGTTCTTGGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGA:1 + chr3L 21024992 5' - jockey 4524 1 74.48 TGTTTAATATTTAAATGATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTT:1 - chr2R 12827099 5' + Burdock 33 2 63.01 CAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCT:1 + chrX 13091050 5' - P-element 2817 1 35.92 AAAGCCAGCTTTATTTCAAACAAAAAATATAAGGCATTCGTAGTAGTGCTGAAACGATTTAAATAAGCTAAGGAAAAATGATTGTTGAGTTCTTGTGTCTTTGGTCCAGTGTCTCGGCTGTTAATTGCCCCTTTTTTGTTTTTTAC:1 - chr3L 12872412 5' + hobo 378 1 55.48 TCGTTTGCCGTGCTTTTCTCGCATTTTCCCAGTTTTAAGCACACAAAGCTAATATGGCAACCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAG:1 + chr2R 11153137 5' - roo 9009 2 61.64 CAGAAGACAGATTTTCGGTTAATTCCAATACTCTGCTCCGGTCACTTTACACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGCAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCT:1 + chr3R 7074811 5' + P-element 59 1 44.70 CCGTTCCCTTTTCAGATTTTTTTTCCAGCATTAGTTTTAACTTTTTGGGCTTACTCCTTGGCCTTTCGCATGTGTGCGTGTGTGTGTGCTGCTTATTAAGCACGCAGTGCGTGAGTGTATGTGTGTGTGTGGGTTC:1 - chrX 5284747 5' - accord 252 2 56.62 ATGTATTGGGAATACGAAGGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATACCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTT:1 + chr3R 5870773 5' - roo 9036 1 59.59 TATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTGACAACTATATTGGCAAGATCCTAATCTTCACCCAAACTCAGCGCATTGAGAGCAAAGGCCGAAT:1 - chr3R 15727897 5' - 1731 4546 1 76.69 TTATGAGTGCCGAGTGTTATCGGCGCTCGAGACGCAGAGTACCGTATTGATCTGCATTTGCAGATTTATGCGGTGTGTTTGTAAGTACCCGCAATGTGCGTGGCGGGTAGCACCTGAACACAAAATTGTTGGGTGTGAGTCGAGTG:1 - chr3R 1465943 5' - hobo 31 1 60.27 ACCGTGGAATCCATTTTATTTTTCTTCTCTTCATTTTTTTTTTTGTAGAAGCTTCTTATGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACCTTGTAGCACTTTTGCAACAATGTTTAT:1 - chrX 13060284 5' + Tabor 6906 2 62.33 CAAATTATAGAAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACTTACAAAACCACATAACGTA:1 + chrX 3533830 5' + 17.6 6940 1 77.40 CCAGTCGTTCTATTTGATTATGTAATTATGCTTGGTTTCTTATTGGATATTGAACGGTACGTGTGTCCTAGGGCTATGTATGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACAATTTTTTGGCACACGATTTTTTGG:1 - chr2R 14277268 5' + 1360 41 1 58.22 CTTTTGTCTAAACGCGAAAGTTGAGGCGGCAGTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTTTTTATTA:1 - chr3L 8249470 5' - mdg1 7392 2 61.64 ATGGTGGTGGGGGGGTTCGGATATAAAGATATTATGATATCAATATACAAAGATACAATGGTATAGTGATAGTAGTGACACCACTCACAGAGGTTCCTGGTTGTAAAGTCCCAAATGAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGT:1 - chrX 18673791 5' - roo 387 2 71.53 AATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATACACATGAA:1 + chr3R 15727846 5' + 1731 4389 2 67.81 TCTGTCGTCTCATTTTATGCAATTTCAAAGCTAGTGCTTATCATGACATATGGTTGCATGAAAGGCTTTATTTAATGGAAGGCAGTTGGCTGTCAGTTATTAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTC:1 - chr3R 30569122 5' - mdg3 226 2 58.90 CAAAAGTTAAGCCTCTTAAGCATTCTGTTTTTCAATTTATATGAAAAAAAAGCATGATATATATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTGATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCT:1 + chr3L 14888764 5' - flea 4953 1 63.45 ATTCACTTTTATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATT:1 + chr3R 28438311 5' - mdg1 7404 2 53.79 ACGCAGATATGTGTACTACTTTATGTTTACTTTACAGCCTTATGCTCGATTGAGCAAATCTGCAGTAAGCAAGTCGCTCTGGCGTCACAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGT:1 + chr3R 12078580 5' - hopper 1384 1 63.19 AACTGCGAAAAGCGACCGCTACGATGCTGCCAACGAAGGCGATTGAACGGAATCGGGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAG:1 - chrX 21045286 5' + P-element 47 1 44.00 CTTTTTTTCTCACGGGTCCCACGGCTCGTTTCGCAAGAAGATAGACGCGTTATAGAAAAGAGAACAGACAAAAGATCATAACTTTACGCTTGGAGCCATTTAAGTCAAATAATAATCATAATAATTTGAAATCGTTCTAGATCGGT:1 + chr3R 1135319 5' - Q-element 640 2 52.74 GCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3L 22320160 5' + jockey 73 1 60.96 TAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATT:1 + chr3L 18216472 5' + 297 52 2 59.29 ATAACATTGAAATTAGGTTTTGACGACTAAGGGATACTTAGTGCTTTAGATTTATTAATATTATATAAATCAGCCTGAGAAATGTAACAATATATTTATGTATGAATGTACTTGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAA:1 + chr2L 4244829 5' + 412 11 2 74.66 CTGGCAGGTCGCTCTGGGGGATGTATTTAAAATTAAAATTGACTCTGAACCTTTCACAAGATTGACAATCATGGGATTTCGGGAACTTCAATTTACTATATACATACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAAT:1 - chr2L 1045109 5' - mdg3 5481 2 69.86 CTCTTTCATTTCGTACGCTGACATAATAAAATTTTAATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGTTCGTGTGCT:1 - chrX 9951316 5' + jockey 92 1 75.18 TAAATTGGAATTTACTTCCCTGTGTTAGAGCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAG:1 - chr3L 11535856 5' - roo 194 2 71.70 TAACTGGACTTTCATTGCTCTATGGTCTCTATTGCGGGGGTTTGCCTTATCTTCGAACATGGTGCTCTATACAGAGGTGGTCAAAAATATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTT:1 - chr3L 11684928 5' - Bari1 1654 1 52.41 CTTTTTACTATTTTGAAATATATTTTGCAAAGCTTCATAAGAGCTCGGATATATATAGTGACATATCCATAAGTCCCTAAGACTTAAGCATATGCCTACATACTAATACACTTACAACATATACACCCCAATACAACATACACTA:1 - chrX 23182916 5' + Idefix 67 2 66.90 CACAAGACAGAAAAATTAGAGCATACTTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTAGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGT:1 + chr2R 14427102 5' + jockey 4788 1 65.07 AAGATACCTTTTACAAATAATTGGGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 + chr3L 7024410 5' + 412 26 2 66.44 TACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr2L 388523 5' + roo 8724 2 61.70 GCCCGAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTATAAGAAACTGTAACTT:1 + chr3R 17924444 5' + Burdock 6211 2 72.60 GCTTGATCTAGAATCTAAAAAGTAAACAACTGGGGATTTACGAGTGCAAGCCGTTAAACAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAG:1 - chr2R 11247055 5' + 1360 65 1 63.19 AGTTGGAAAAGCCTTTAAACATCCATCTACCCTTTTGTTCGCCGCGCGGTGCAGGGGAGAAGCAAATAGTATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGTGTAACGGCCATACAT:1 - chrX 609507 5' - 1360 3370 1 72.60 TTATGCAATGCGACTTTAATTCTAATACCGACCCAGTTGTTGGGTCAGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 + chrX 6891459 5' - hobo 2909 1 53.92 ACTTTCAATTACATATAAACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATT:1 - chr2L 4864515 5' - mdg3 5480 2 73.97 ATTCAATTCGCAACCTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATC:1 + chr3R 12146634 5' + gypsy10 29 2 59.35 TGCATCAAAAGTTTGACGAGAAAGCCGGGTGTGTTTAATTATTTATAGATTATAGCGTGAGTTACGGGTGCCCCCGTTGGATCGG:1 + chr2R 12185321 5' - accord 7379 2 64.71 TTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAAC:1 + chr2R 7314629 5' + blood 7070 2 55.48 GAATAGAAAAATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTC:1 + chr3R 23902163 5' + I-element 33 1 60.00 AGACAAACAGGATCAAACAGATACAGACGCCTTTGCATTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTT:1 + chr3R 17243140 5' + hopper 90 1 75.34 CAATATCACGTGTGTGATTACACGTTGGTAAACGCAAAGCCCACTCTTCCGGGCCATTTACGAGTCTAAAAGCGGACAACTGCTGAAATGGAGTGGGCGGAAAGATTCCTTTGTTTG:1 - chrX 15198154 5' - Max-element 8523 2 70.94 GTGTTTTATTCAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACATATAGTACCCCTACACAAAATACTTGAGTATGTCGGGTTAAGAATATCAGAGGCCCCGCCGTCCGTCCGTCCGTCCATATCAGC:1 + chrY 2346859 5' - micropia 424 2 54.47 ACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:2 - chr3L 14422841 5' - roo 358 2 53.42 TTTTTATATAAAATATAAATAACGGGCAATAACGTAATTTCTGATAGGTGACATCCCCCATTCTCCATATATTGCGTAAACCGATTTCTGGCGTTTTGTCGTGACTCTTGTTGGTTAGCATAGCAGGTGTTAAGTTGTCAATTTCT:1 + chrX 14992201 5' - mariner2 679 1 70.55 TTATTTAATTTAGCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGAT:1 + chr4 868653 5' + roo 78 2 73.97 ACTTTTTAAGCAAATGGAANAATGAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTAC:1 + chr3R 20841380 5' + Juan 51 1 50.00 CTGAATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAG:1 - chr3R 31114364 5' - flea 4950 1 63.01 ACGCCCCACACGCACACACACAAGCAGTCGCGTCGAGGGGTTGCACACACCCACGCCTACTTTGGACCAGCGTCCCTTTCGAATGAGTCACAACTACAAACACACACACACACACACAT:1 + chr3R 28989536 5' + accord 183 2 53.78 ATCGAAATAAATAAATAAATAAATAATAAATAAATCGAAATCGAAAGAGACGCTATTGGCAATGTTAAATTGCTATACTGCAAAATTTTCTGTGTGTGGAATAATAAAGTAAAACTAAAAAAAAA:1 - chrX 17501198 5' + Doc3-element 169 1 78.40 CATGCCAAAACGCCCAAAACTGTAACGCCCACAAATTATTTCATTTTAATTTGTGTAATGTGTATTTTGGATTATTTGTATCACATGCAAAGTTTTCAGGTCCCAAGCACTGCTATTCTTATGAACA:1 + chrX 22689468 5' - HB 209 2 76.38 AGTTGACTATTTTAACATTCTTATGGTTTCAATTTACAAAACTTTGACTGCGGTGAATCCAATATTGGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGT:1 + chr3L 15393679 5' + pogo 54 1 55.86 ATGTTTTAACACCATAGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAAC:1 + chr3R 27547593 5' + 17.6 6948 1 67.81 CAGTATTCCCTTAAAATATATTTTTCACGATTTTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 - chr3R 19514363 5' + blood 30 2 65.07 ACTAAAAACAGAAATACCTAATAAATTAAACTTTTGAAATAGATATTATCATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTT:1 + chr2R 17650555 5' - pogo 2040 1 66.42 GCTTTATTGTGCTATAATATTAGATCATGGACTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAA:1 + chr4 868665 5' + roo 8754 2 82.19 TGGCGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGT:1 - chr2R 12102041 5' - hopper 1369 1 50.68 TTATTGATTTTTTAGTAACAGTGTTACTCCTTTAATCGCAATCCATTGCGTTTTCTGTTTACACCCTGATTTTATACTGCGAATTATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAAT:1 + chr3R 13559960 5' + jockey 4809 1 54.79 TCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGCCGGGCTGACATATATTT:1 - chr3L 20680383 5' - 412 442 2 49.32 GTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 - chr3L 14422802 5' - roo 8984 2 80.00 AATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGC:1 + chr2R 7314627 5' + blood 41 2 50.77 TAATTAACGCTGACATTAAGAGACTGCATTTTAATTACTACCAGGTTGGATATGCTATTAGCTTAGTTTTTTGGTGCCAGCATTTATTTAACGATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCT:1 + chr2L 388485 5' + roo 27 2 67.81 TAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTT:1 + chr3L 20061330 5' - roo 404 1 70.21 GTCTTAATGTATGCGCACATTTCTAAAGAAAATAACCAAATTTGAAACGAAAATAAGCCGCCAGCAAATCCATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGC:1 - chr2L 15020002 5' + BS 4819 1 69.18 GGTGCGAAAATAAATCATCCGAGGACATAAAACGAAGCCAGGCAAAAATTATAACTGTTGCTGCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTGTTTTTTACAAAAATGGGGTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTAT:1 + chr2R 9376628 5' - hopper2 1552 1 50.00 AGGATAGCTAAACAAAATGTTGTTTATTATATGTAAATATACGTGTAAAAATATGGAACAGGCAGAAGGAAGCATTTCCAACCACATAAATTATATATATTCTTGAATAGGATCTGGCCATGTCCGTCTATCCGTATGA:1 + chr2R 5780172 5' + INE-1 121 1 66.91 GCTGCAAGGTAGAGAAACAGAAACCGAGATGACTTCTGGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 + chr2R 12462097 5' - roo 9040 1 63.70 CCTAATTGTCGAGGTTTTCTCGAGGGGAGAGAGATATAGATGGACAACGAAAATTACCAAAAATACAAATCGAATGTACTAAACAATGAGCTATACGTTTCCACTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTG:1 - chrX 10069096 5' - gypsy7 5006 1 77.95 CAAGTTTCGGTGACTGGCCACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGC:1 + chrX 609341 5' - 1360 3361 1 65.94 GCAGTGGACACAGTTTCGATACTGTCCGTTTTAAATGACCCTGTTGGGTTTTAAGTGTCACTATTCGGACTAACGTATCCGTCCCTGTGTGTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATCTAGTTAATAAAGTCTCAAAAC:1 + chr2L 22592504 5' - mdg1 7428 2 63.70 CACTTAATTATGTGCGAACATTTTGTGTAGCATACTTCAAGGCCATCGCCGAGACAGGGACAACGAGGATGGAGGATATTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTG:1 + chrX 14360742 5' - jockey 4948 1 52.74 TTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr2L 20132975 5' + 297 6636 2 61.38 TTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGT:1 + chr3L 17181455 5' + jockey 87 1 69.86 CCTAACTAAATATAAACACATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr3L 15148549 5' - roo 394 1 71.54 CGCAATTCGCAATTCGCATAAATTTGCGCAAGTTTTTGGACCGGAATAAAACGAATATAGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGCTTATGTT:1 - chr2L 17019171 5' + 412 65 2 61.64 AATTACTGTCGATTGACAGCTTATTTGCTAGAATAATTGCTTCCATTTAAGAAAAAGTCGATTTAAATCAAGCGTATGTATAAGTTAACTAAGTTAACCGGGCGACGGCTACGACCGATCGTCCGAAGACTCGCTCCGGC:1 + chr2L 17269096 5' + gypsy6 7456 2 58.57 GGTGGGTGCGTCAAATAAAAACTTTATGATTTAATCCGGCAGTGCAAACGCGTGCTGCACTAGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTT:1 - chr2L 2544840 5' - blood 7332 1 57.75 GTTTGGAAATTGACTTGTCGCTGCCCCAAAAAGTATGCTACGCGTTTGTCACTGCAAAACCTGTGAAATTCCCAGTAAACTTGATTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTAT:1 - chr3L 9907384 5' + BS 5017 1 62.12 TTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATATGAACTAAGACCAACGCTGAAAATTA:1 - chrX 3533975 5' - 17.6 426 2 67.12 CAACAATTTGAGGCACAACGTCATCTAATTGGCAGAGCAGCCAGCGAAGGATGCCGCTTCCTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATC:1 - chr3R 13869050 5' + HMS-Beagle 11 2 75.19 GCAATACAATACTCTAACGACTCTTTTCACTCATTTTATAATGTTAGCTGTTGAATTTATTCAAAGGAAAACGCATTAAAAACTTTTTACAAATTGTGATATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCG:1 - chr3L 22294541 5' + pogo 20 1 71.92 GGTGCGGAAAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGT:1 - chr2L 10461249 5' + roo 8708 2 53.57 TGTACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATT:1 + chr3L 9324408 5' + HMS-Beagle2 6901 2 71.92 GCCCAGTGATGGGCACTATTTTGTCTGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr2R 21796121 5' + roo 56 2 56.16 TTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCT:1 - chr3R 30955386 5' + G-element 73 1 71.11 TGAAAACTATTGTAACTCAAATTACTGTTGTCCTTTTTTTTAATTTACATTTCATAAAATCCTACGAATGTAATAGTTACCTCAACCTAACAAAAACTGCCAACTTACCGACTTTTAAATTAAATTAAATTATTTTTTTTTTCAAT:1 + chr3R 20245295 5' - jockey 4925 1 62.33 GCATATACACCCCCTCTCCCCCTTGACTGACTGACTCGCATTTTCGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGGCAA:1 + chr2L 20718832 5' + jockey 4722 1 63.03 TTGGATTTCTTTATTTTATTTTGGTCTTACTAACAAAGACTCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGCA:1 - chr2R 4598025 5' + 1360 76 1 77.69 TGTGCCTGTGATTGTTTACAAAAGTGTGTGTGGTTGGGGAGTTGTGGGTGTAGAATGGATATGTTACTATATATTACTTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATA:1 + chr3L 25206790 5' + HMS-Beagle 6822 2 64.12 GATGAGAGAGAACAAGCAAAAATCAGCTCGGGATTCTTGGGAAGTAATATTATATTAGCCTAGCGAAAGAAGATATAGTGTAATAAGTAATAAGTAATAGCTCAGTGTAATAGATATTGAATAGCTCAGAGCGTCTGTTC:1 + chr3R 7579365 5' - Stalker2 7611 2 55.00 CGAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATA:1 + chr2L 20628507 5' + Stalker2 7251 2 42.34 TATAACACGCATACTTGTACTATTACGTACACTTGTATAGTTAATTACAGCAGAGTTCCTTTGTTTTGTAAATAGTATTGAATATTCCATACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTAT:1 - chr3R 13613213 5' - copia 257 1 60.96 CTGATGGCCAACAAATTCATAAACAACGCTGAAATCAAGTTTCGAGAGGCTCGAGGGGGCCGCAGTCCCCGTTGATGTAGTGGAATAATTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTTT:1 + chrX 8839267 5' - Tabor 473 2 65.79 TAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCC:1 + chr2L 7633398 5' + Max-element 8286 2 80.41 TCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAG:1 - chr2L 4244963 5' - 412 415 2 71.92 AAATGTACCCTGTGGACTTGTGAATTTTCTTTCGCTTATTTCCGCTCATTCAGCCTAGCCAAATACCCATTGCCATTAACATATTTGACTTAAATATGCAAAGTTGTTGTTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACA:1 + chrX 8968557 5' - 1731 301 1 69.86 CATAATATTCATGATGTTAAAATTAGACTGGCGAACTACAAACGATGTCATTATACCCACATTATAAGTGCGATATCCTTCTTATGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATT:1 + chr3L 5027152 5' - roo 9033 1 57.53 AACCTCTTCTCCGGTCCGCAATCTGTTTGTAGTTTCACGATATCTCCATTAAATATCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCA:1 + chr3L 27415202 5' + transib2 50 1 51.37 TTTTATACCCGTTACTCGTTCAGTAAAAGGGGATACTACATTCGTCGGAATGTATGTAACCCGAAGAAGGAAGCGTTTCCGACCATATAAGGAAGACATATTCTTGATCAGGACCAATAGCCG:1 + chr3L 16164931 5' + INE-1 88 1 71.54 TGGCTGGGCCCAGCGGAAACGAGTGTGCGCGACAGAATTTCAATTAACAAAGCGTGCGTACTTCTCCACCTTCGATTTGCATAACCCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTACGTTGAAGGCA:1 - chr3L 7319372 5' - 412 7517 2 63.57 TTTAATCGAATTATTTGATTATTTTCGGGAGCCATCGATCAGAAATTGTTTACGGCGACACTCACCGCAGTGGAGTGTCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAA:1 - chr3L 6050258 5' + 412 7068 2 66.38 CATTCGTCTGGCTACTTTTTCGGCAGCCAAAAGATTGAGGAAGAGTAATTTTTCGCCAGAGATGAGCGAAAACATCTGCGGATCAAATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAA:1 + chr3L 17482049 5' - 297 6942 2 63.70 ATATCTAAAGTGAAAAACAAAGTTAGTTGATAACTTTGCTTAACTTTTGCACTTCACAGCCAATATAACTGATAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCGCTTTTT:1 + chr3R 10876174 5' - 1360 3343 1 52.74 TATACCATATAGTATATATTTTTTTTTCTTCTCTCTTTTTATTTACAATCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTT:1 - chr3R 6685821 5' + 412 7124 2 67.13 TGAAATTTAGCGGGAGAGAGAGCAAGAAAGCAGAAGAAGAGCACAAGGAGTGGGGCCCACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAG:1 - chrX 9121359 5' - P-element 2823 1 41.78 TTTCGTTTCGTTGCGTTTTGTTTCGATTCTCGCTTCTTGATGTCTTTGGTGGCTCCTAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCG:1 + chrX 8343607 5' + hobo 66 1 61.64 AACCACCCAACCCATCTCAGCTATCCAAGTCATCCAAACCACCCGACCTTCAGCCAACTTTTTCCGCCAAGCTGAAACTTGACTCGGCGACCGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCC:1 + chr2L 550330 5' + Doc 382 1 70.16 AGCAATGGAGGATAGGTGGTGTAACTCAGTAGAAGAATTAATCGATACTAAAAACTGTTAAGTAATACAACCTCTATCCTTAGCCAAGTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTGATCG:1 + chr3L 2040636 5' - R2-element 3581 1 72.81 AAACATATTCTTGCCTGTCCTCTAAAAAGGACACTGAATACTTGCAGCAGAATCCTTATATAGTACTCGTTTTTGTTGTCACCATTCTAGTTCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCACGCTACGAAT:1 + chr3L 6557095 5' + Doc 35 1 60.27 GTACGCGGCGAATGCGTGACAAAGTCGAGCGGCAAAAAATGAAAATGCAAAGACATTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTG:1 + chr2L 20761876 5' + Doc 403 1 61.70 AAAATATGGTTTACTTTGTGGTTGGTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATTTCAACTGCAACACCAGCACCACG:1 - chr3R 25597900 5' - copia 5031 2 80.00 ATATTGATAATTAAAAAGAATACACCACCTTATTTTCACGGATTCCCATAATGAATTCGGTTAAGAGCATTTATCCTTCATTTAAATGCAACATGATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGCGTTTT:1 - chr3R 12519730 5' - roo 390 2 69.34 CGGTGGTGGGCGTGGCTATGGTCTCTCGAGCACGTCGGTCCAAAATGCAGCTCGGCATGTTATTTGGTTGTTAGGGCAAAAGTTGGGCCAACGCACTATGGGGCATGTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACT:1 + chr3R 9298435 5' + hopper 32 1 63.70 CAGTATCTACAATTTTAAAAGTATCTGAGGTTTTTAAGTGCCAATTATTATTTGTATACTTTTTTTTTTTGTTGTAGCGTGCGTTTATTTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATGGTTTTGCGGG:1 + chr3R 30955319 5' - G6 1976 1 53.33 TATAGGTATGACAATTTCAAAAATTATTTTATTTTGTGTATTATATGTATTTAGTTTAATTAATTTGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATC:1 + chrX 21668544 5' + I-element 60 1 59.31 CAAACCCAATGGATTCTATTTTGGGAACAGTGACGTCTTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAA:1 - chr2R 19230621 5' + I-element 27 1 64.49 ACTTCATATCACTTTTCACAGCCCACAAGAGTAGGCAACAAATTTTAGGTTCTTTATGTTAAACTTTTTTTTTTACGATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGAT:1 - chr2R 17207844 5' - jockey 4951 1 54.29 GCACGAAAGCTCAGCTATTTATTAGTGAAATGTCAAAGGTCAAATGTCTTTCTCATATGTGTGTGTATATATTTAATTCTCATTTTATCGTAAATTAAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGA:1 + chr3R 17673709 5' + FB 25 1 69.18 TACTAAAAATGCCGCGCACAGCAATAAAAAAATCCTTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 - chr2R 5193500 5' - roo 8987 2 79.86 TGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAA:1 - chr3R 19950534 5' - BS 5033 1 58.22 GCCCGAGCACGCATTAAATATTTATGAAATTACAGCCCGGGATATGTATAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTAT:1 + chr3R 17924444 5' + Burdock 6196 2 69.47 GAGAAACCAAACTATAGATTATGCAACTTACAGCAAATTTATTTAGCTTTAAGCTGATACGGGTCTATGTTTGTAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2R 9453389 5' + roo 8690 2 62.90 TGACAGTCCTTGCCGAACTGATAAGATCCAGACATTGCTCATCCGCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAG:1 + chr3R 17627521 5' - roo 8999 2 72.73 CCCGCTTTTATAAAACACANATAATCCTTTGCTTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTAT:1 - chrX 5841978 5' + roo 86 2 79.72 ATTTTAAAGTACCAGCTGTTCATACTTTTTTCTAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACCGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATTT:1 + chr2L 2544768 5' + blood 7101 2 76.03 CACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACC:1 + chr2L 8284366 5' + Doc 428 1 60.45 ACACCTTCCAATCACGCCTTGCATTCTTGGACTTTTGGATTTTTACAAACTGCTTCCAAAAGCTTAAATACAAAAGAATTCCATGTTTTGCGAAAATATCAAACATATCAAAAATTTTAAGATTTTATTTATTATATTTTTAAGTT:1 - chr3L 7065057 5' + INE-1 426 1 79.45 ACAACAACTGGCACACGATCCGCTTCTCGCGCAGAGCCTCCAATCTGCGGCTGCAAGTCGACGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTT:1 + chr3R 22473669 5' - roo 135 2 56.90 GCAACAAACATCTGACCTTGACTGGTTTCATTTCAGTTCACTTTTGCCATTTGACTGCACCACGGTCGTCTAATTAACCCATTCGGGGTTAAGTCAACTTCAATTTAAACCCAGTAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGC:1 + chr2L 17237005 5' + X-element 13 1 74.66 CACACGAATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCA:1 + chrX 8681447 5' + jockey 81 1 71.43 ACTAAAAGAAGAAAAGGCGATCGCATTCTATTTATGCGATCTACGCGGTCTTCTCGTTTGTTTAGAAGTACGTTTAAGAATCAGAATAACTGTTCACACATGAACACGAATATTTTTAAAGACTTACAATTT:1 - chr2R 9871530 5' + roo 8685 2 44.70 CAGCGAAACTGGTCACACTGGCACTGAATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGG:1 + chr3L 11364777 5' - Tirant 399 1 76.77 GCCGGATTTATGCATTTACTTGGATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTA:1 + chr3R 24480408 5' + blood 12 2 76.03 CGCACAAGTTTCGGTGACTGGCCACTGGTCAGCAAAAGATGCGTCAGCGTTTAATTTCATTTTCGACATGTGCCGGGAAAAGGACAGTTTCACCAAAGATCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACG:1 + chrX 609337 5' + 1360 32 1 65.07 ATGTAAGACACCAAAATGGCAACCCCAGTGCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 + chr2R 13090858 5' + I-element 56 1 55.48 CTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATCCAGATCATAACGTAAACAATAAGTGACCA:1 + chrX 3533885 5' + 17.6 58 1 69.18 ATTTGCATATGCCTCGTCCATATCGCCAGTCCATCATCAGCACCATCCGAAACCGAAATCGAAAACACACCACAACAAACAGAAATAGAAGAAACTCCATTTCCCACACTATATCCATCAATC:1 - chrX 7867911 5' + 297 6524 1 55.28 TTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTT:1 - chrX 21668409 5' - opus 499 1 55.94 TCCAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTTTTGTGCGTTGTTCGCAGTGCTATTTGGAGTTGTTTTTTGCATGCATTTGATTTTGTGTTTCCGTGCACAGTG:1 + chr2R 23238458 5' + Cr1a 395 1 76.30 GAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGNTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGNAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGA:1 - chr3L 1628703 5' - hopper 1347 1 64.38 ATGTGCGTCCTCTTCTTCCGCAATGCGGATTTTAGTTTTTTTTGACAAGCGTCGTTTTTCAAGTACCAAATTCTCTATGTCACTGTTTGTTGTAGTGTATTTTAAACGTACTGTTAAGAATCAGTCGAGTTTTACAACTGAT:1 + chr3R 907903 5' + gypsy11 4338 2 30.28 GAGAAATCGGTGGTGCCGAGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGGATATGTTTATGCACGCAGTTAGG:1 - chr2R 14009079 5' + 412 87 2 75.34 TGCATGCCCAGAGATTCGGCCCACAAACTCAGCCACCTGAACTCCGGGAACTAACAGGCTCAGGTTCATCGAATCAGTGTAGTTAATTATGATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTT:1 + chr3R 28749084 5' - mdg1 375 2 53.79 TAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 + chr2R 14884098 5' - roo 8996 2 69.18 ACTACACTCCGTTCAGCGCAACAGTCGATTTTGGCTGGTCTTAAGAAGCCTTTGTTGTTTGTTTTAAGCATCATCATGCCAGACCAGCCAGACATTTGGAGGAAGCAACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 - chrX 21087702 5' - mdg3 238 2 58.99 GATGACGACAAAAATACTCGTAAGATGCCGATGTGATGGCGATGTCAACAAGGACAGGAAGGCAAACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTT:1 - chr3L 20061438 5' + roo 8678 2 61.76 CAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTTTGCTATTATGCGTGTTCCTATTTATGAACACGGGGCGAAAATAA:1 - chr2L 23295846 5' + micropia 85 2 66.67 TATAAATATACAAATATACAAAAAGACCACTAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAAC:1 + chr3R 29534664 5' + HMS-Beagle2 40 2 80.00 ATTAATATTACTATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTTTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAG:1 + chr3R 12764676 5' - copia 223 1 63.01 ACCGAAAAGAGTGGAAAATTGATATGATATTGACGGCTTAACCAGCACATCTTACTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr3R 27606607 5' + 412 60 2 61.87 CTTATCGACCTAACTAGCTCATCAAACTAACGCATACTCATTAAAACACATCATCAAATTAAAAAGATACGTCACCGACTATCTCTCTTCGAGTGCGGACGTCTGTGTCTTTCCA:1 + chr3L 19951180 5' + Ivk 26 1 59.13 TAAAACTTATGACTTTCCTCGGAATTACCATTTGAATCGGTGCGGAAAATGCCATCCGAAGCGATGTCAGAGTTGAAGCGAGTAATCACCTCCTTGCCAATGCCATCATCAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGAC:1 - chr2L 10461287 5' + roo 12 2 77.40 ATAACAGTGTGACAGAACACCCATTCCTGGTTTCTAATTATTCCCGGTACACTTAGAGAAAAAACGTATACTGTATTCGTTGAAAAGTATGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATCTTGGGCTCC:1 + chr3L 13291941 5' + roo 29 2 58.87 ATCGCTTTCGCTGCGAAAACCTCTTCTTATACCCTTTACTCTTCCAGTGAAAAGGTATGCTGAATTTTTTAATTTCAATGCCAAAAAGATTGTTGAACTTTCTCGTTCGCACTGCTGCCAGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCG:1 + chr3R 19113903 5' + INE-1 550 1 51.37 GCTTGTTTTTATTTACCCAAGACGCGAACCACGTCAAATGGAAATTGCAATGTAAAAGTTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGCCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATAATAATTACTATGTTATATCAA:1 + chr2R 9007053 5' + jockey 4840 1 57.93 TTTCGGTCATATAAAGCTGCCTTTGTTTGGGCCAGAGAACGGCAGTCCGCCACTTGCACTCTACGTCCACCCGATATACACTC:1 - chrX 17770481 5' - hobo 2909 1 55.42 ATATCAATTTCAAGGGTATTTAATATTAAAAATGCCATTTAGACTCAAGTCCATTATTTCGTAATTTCCGAAATTCGGTTCTTGACTAACTGGAATTAACAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTG:1 - chr3L 6015713 5' + roo 23 2 65.07 AGAAAACATATTTACTGGGAATTTATTCCCAGTTCAGTAATAGACTTGTCAGGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGGAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTT:1 + chr3R 13406419 5' - pogo 2034 1 65.75 TGTGATGCCATATATGGCGATGGAAAACCTTCTAATATATGTACAAATATTCTTTTCATATACGGAGGATTTGCTTGAAAAGTTAATTACCATAGGAGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCA:1 - chr2L 11617830 5' + 412 26 2 67.12 CAGTTAAATATACAAATGTATAAAATGTGAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATT:1 - chr3L 1628731 5' - hopper 1375 1 57.53 GTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCAC:1 + chr3L 2532460 5' + blood 7095 2 77.40 TCTTGTTGTTTTCCCTTCGCATTTGCAAAGATCACTAGCAAAAACCCAAAAAGTGCATTTTATTAAAATTCATGGATTTTTTTTATTAATATCTATTTATTCATATGTTTTTCATCAATATGTAAAAAATAATAACAAAACTATTA:1 + chr2R 2963687 5' + S2 142 2 60.96 TGTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr3L 1463755 5' - P-element 2849 1 58.87 ATTCTATTTTGGGAACAGTGACGTCTTGATGCTTGGGGAATTTAGCCGCCATATGAAACTATTATATATGCCATATGTCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGC:1 - chr2R 19230609 5' + I-element 40 1 55.40 GGTATAATAAAAAGATATAGTTCTGATTCAGAATTGGACTCTAGTTCAGCAAATCCACTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr2L 512519 5' + roo 55 2 60.74 ATATACACTAAATAAGGACCAAGATCCTTGTGCTTGAGGGCCATTATGCCGACCTTAACTTTGCGTATACACACAATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTA:1 + chr3R 23964798 5' + hobo 48 1 52.74 AAAAATTTTTAATCATTTTGTTTTGAACGAAAAGTTTATTTGAATGATGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chrX 13628879 5' - roo 396 1 77.40 TTCTAGATAGCTTAATTCCATGTTTCCGCCAGTGTATTGGGAGTCTAGTGTTCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTT:1 + chr2R 16371958 5' + 412 48 2 62.30 AATGTTATTTATTATTAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 2770040 5' - hopper 160 1 85.19 CTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGTTTAT:1 + chrX 666285 5' + 412 74 2 69.86 ACGGAATACTAATACGATTCACACACACACACAAGCTAAAAGGCAGCGCATTAGGGTGCCTCACCTTATGGCAAATAAATTGACTTCTCCAATATTAATGTATGGGTCACCTGTTTGGGGTAGATGTGCTCAAACTCATATCAAAA:1 - chr2R 10582495 5' + Juan 3840 1 55.48 TTGCATTTTCTTGCAAAGAACTTTATTATAGGGCGAGTAACTGAACATCTATAAATGTGCATAGTATATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATG:1 - chr3L 22491678 5' + Transpac 4956 2 55.81 CAAAGCATATTGCAGCAGTTTTTGAAAGGGTATTCAGAGCTACACTTTATTTCTTATAAAAAACTTTTTTCAAAGTCTGTATGCTGAATCTCCACCTTCTAGCTTTTATAGTTCATGAGATATCGACGTTCTTACGGACAGACGGA:1 - chr4 1113319 5' - INE-1 126 1 54.11 CAGCGTCTCGTTCTCGAATACAGTAATGTTTAATAGGTCTCGGTAACGCATTCTATACATACAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCG:1 + chr2R 16567269 5' + opus 7063 4 61.81 CAGTACCTCAATGGTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAAC:1 + chr3R 15003110 5' + Doc 57 1 52.74 GACGTTTCAACGGGCATTGGACCAAGTCCGAAATGATGCCGCACGAGTTAACATACCCCCTCTCTCGGTCTACCCAGTACTGCAACTGAGAGCCGAGCAAAAGTTCAACGAAGATCGCCAATACGAACTCTGACG:1 + chr3L 25232771 5' - accord2 7562 2 66.67 AGAGCAAAAGAAGTACGAGGTAACTGGAAGGTTAAATTATAAATGTATTGTTTTTTTTTTGTTTTTATTTTAATT:1 - chr2L 12729186 5' - F-element 4682 2 62.67 ACTAAACTAAACTTAAATAATAATCAACAACGTTGCTCCAACAGACTTAAAATGGAATTAGAACAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAA:1 - chrX 18572046 5' + I-element 377 1 56.16 GGGAAACGGACGTAAATTACTCATTGAATTATAGTATATTGCACGATTTTTATTACTTTTATAGGAATGTTAGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTT:1 + chr2R 6767983 5' + pogo 50 1 54.79 GTATGTAGTTAACACAAAAATGTTAAGTAATGATGACACCAACGGCACCAACTTCGCCGCGAAGCCGTCAACTGCCTTCGACAGATGGTGCTCTTTGGCCCACACTGTGTCCCCCACC:1 + chr2R 5343244 5' - Osvaldo 1299 2 64.41 CTGAAAGAAGTGCTGCAAAAGGAACAAGCCGCCGAATGCGATCCACAAGGTCCACACTCTCACGGATCTGGTCTGAAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGC:1 + chr2L 14262933 5' - P-element 2847 1 54.68 ATCAAGGTCTTTTGTACTGGATGTATAGCTAAATTTGGAGAACTTTTAATTACACGGGTAAAAGGAAGCAGATCAAACTTGGAGAGCTTTATATATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 + chr2R 14884052 5' - roo 9042 1 63.70 TCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCA:1 + chr3L 18183075 5' + Tirant 8133 2 61.86 CCAATTTCACCCACTAAACTCAGGCACACGACCAAGAGGCCAAAAACTTGACAATCTTTGACAATTGCCAGAGACACCAGCGCCGTATATATTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGC:1 - chr3L 20680402 5' - 412 7515 2 62.07 TGACCTTGACTGGTTTCATTTCAGTTCACTTTTGCCATTTGACTGCACCACGGTCGTCTAATTAACCCATTCGGGGTTAAGTCAACTTCAATTTAAACCCAGTAATACAAAAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTG:1 + chr2L 17237017 5' + X-element 18 1 71.22 TAAGTGGCTGGTTATGCACAGCATGCCACATAGATAGAGTCAGATCTCCATATTAGGTCACATAATTGACCATAGATGAGCTACCCCAAAGATCAGCTACAGTCCAGTGTAATGATGAACTCCAATTCAGACCACAAGTCCGTTT:1 - chr3R 27606746 5' - 412 477 2 70.34 CACTCACTCTGCCATCTTCTTGCTTTGCTCATAGCTTCTGGCTTCGCTTTGCTTCTCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTA:1 - chr4 317852 5' + Tirant 17 2 63.27 GGAAATTAATTGGCAATGCCTCGCGGCCAACTGAAATGGAAGAAGGATGTGGTGCAGAATTCCTGCTGCTGAGGGTGAAATTTGAATTCGGTTCCTGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGC:1 - chr2L 2241353 5' + roo 26 2 63.45 AGGGATGCTGCAGAGAAAAGAAAACTCGCGCTCACCACTAATGTGTTTTAATTTTTGGTCATAGTGTGAAATTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGC:1 - chrX 20949711 5' + jockey 4592 1 51.80 TTGGCTAAATGAAATTGAGTAAACGCCGGTGCACAGACAAAAGAAATGCCAAACCGTTCAAGATCTGAGCACACAAAGGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTA:1 + chr3L 2966430 5' + roo 45 2 52.05 CAAAAAGTATTGTTTTAAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCG:1 + chr2L 17957128 5' + flea 16 2 71.92 TTTTCCATTATTTCATGCGCTTGTGCATATTTGGCAGTCAATTAATGTCAAACTAGTTACAGCTCTCGCCCGGCAATCGATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGAC:1 + chr3L 13057332 5' - 412 7503 2 55.48 TCATGTTTAAAAGGAAATCTTTCTTTTGGGACTTTTTCACTTATGTATGTATGTTCTAATGAGTTCTTTCTTTTGGGACTTTTCTCTTTATGCCTCTTATGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATC:1 + chrX 6538609 5' + pogo 19 1 63.70 ACTTGAGAACAAATTTCTGGAGTCGCTTTGAGCTACTTCAAATTGCAAGTTGCTGTTGCCACTGATACTCGTACGTTTCCCAAAGTTTAGCTATCCGAACTTTATCCACACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGG:1 - chrX 7750071 5' - jockey 4677 1 80.82 ATGGTGTTGCGCAGGCAACGCAGCTCCCTGGTGAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCAT:1 - chr2R 14383015 5' + jockey 128 1 72.50 CTTGATGGCCTTCCACAACAGTCACATCGGGCTCCTCTACTTGCCGATAGTGTGCCTCAACAATCGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAG:1 - chr3R 22709052 5' + roo 58 2 58.90 GGGTATATATCAGATTTTTACACAGACATATGCTTGCTCACGAGCAGATGTGGAAAACAACTTATGCACAACAGGCTTAGAGAAAATAATGGAAAGCTCTATTTATGATTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTT:1 + chr3L 14422663 5' + roo 6 2 65.47 CGCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTGTTTTGGTG:1 - chr3L 17012052 5' - 1360 3338 1 51.37 CTGCATCTTTGAAAGTTGCGCCTAAAAGAATGCACTCAACTTTGGAATTCGATGAAATTTGCTTTGTACTAGCTAAGTACCACTTCACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAG:1 - chr2R 24427647 5' - 1360 3352 1 60.96 CGGTAAAGAACCTGTGTCGCTTCCGCAGCCGATTCGCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCAT:1 - chr3L 17012086 5' - 1360 3374 1 75.00 TTTACTTTTCTATTCGCATATCACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGC:1 - chr2R 4816979 5' - blood 329 2 57.53 AAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACG:1 - chr2R 17350608 5' + F-element 65 1 51.39 ATCGGCGCACTATATGCTGGATGGTACCTTTTTGTGGCCAAAATGAATAATTTCAAAACGGATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCG:1 + chr3L 24059166 5' + roo 8724 2 63.89 CATATACATTGCATGCATTACATCTCCACGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAGCTGCGTAAGCGGTTTTGACCCTTTGGTGGGAATAACTGATTCGGAAGCGGATGTTAATGTTTACATTAGGGTAGG:1 - chrY 2720346 5' - Quasimodo 167 2 78.62 ATTATTAAAACTGAAATTAGTTGCATTTTATTCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGAC:1 - chr2L 15019931 5' + BS 4873 1 76.74 ACAGAATGACATAAAAGACCACAAAAGTTTGTTCTAGTTCTTTTTTGAAGAATAAATCTGAATAACAACCATAGTTTGTGGATGCATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATT:1 - chr2L 4864497 5' - mdg3 5462 2 61.64 CACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCAACAGGATTGTCGGAAATCGA:1 + chr2L 9383748 5' + flea 4816 1 67.94 GTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAATGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGAT:1 + chrX 19662997 5' - P-element 2784 1 15.07 TTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAG:1 + chr3R 23902178 5' + I-element 45 1 53.03 CAGAGAGTATCACAAATGTAGACATGAAAGCTTATTTCAGTTTGAAAGCTTATTTAGTTTGAATTGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACC:1 + chr2L 21876759 5' + X-element 73 1 58.22 TTGGGTGCCACATGATGTTTGTCTAAGATCCACAGTGGTGTCCTTATCGTCAGGAGCGTAGTGAAAAATATTTGCAGCGGGGGCAATATTAATATTTATTCAAACTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATA:1 + chr2L 15874806 5' - mdg1 402 2 72.60 TATCTGTCAATTAGGCGGCTCCTTGTTGTGGTGAAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGGAACGGCCATACATTGGTTT:1 - chrX 609438 5' - 1360 3364 1 61.45 TCGAAACTGGCATATAACTCCTTGAATTTATTTATTAAACATACATGTTATACCGCATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAACCACATAGGAAC:1 - chrX 4789228 5' + Quasimodo 51 2 60.96 TAAGAACTCATTTAATTTGAGCATATTTTAGCCCAATTTACTCTGTGTGTACACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAA:1 - chr3L 11903775 5' - copia 243 1 40.41 TGCAAGCGTTACACTTTTTATGCGGTTTATTTAAACATTTTTCAAAATGTTTAATGTTACCATTGTCACATTGGCTTGGAAACATACTAATGCAAAAGAGAGTGCTATAGTCGAGTTACCCGATTATCA:1 + chr3L 27565 5' - INE-1 563 1 67.44 CGTTATTTATATAGTTGACTACCCCTGTGTATAACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCA:1 - chr2L 3893048 5' + 1360 64 1 79.17 CCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGC:1 + chr2L 8284370 5' + Doc 444 1 66.44 TTGTCGCAGCTTACTTAAGCGCAACTTTTTAAGATACTTGTCAATTAAGGTTTTTCTTCTCCCTTGTTTTCCTTAATAAATAATAAATATTGTTATACAAAAAACTAAAAACAGGTCAACTAGACATAATTAATAAATATTTCAG:1 - chr2L 8536590 5' + Juan 4109 1 77.24 TTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAAATTTGTACGAAAATTCA:1 - chr4 373036 5' + pogo 82 1 75.34 CCAGTGCATTATACTTCATTCAACGGGCATCAATTTTTATATTATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAA:1 + chr2R 13090882 5' + I-element 80 1 71.92 TGAAGTTATGGCAGCCGGGGGAGCCACCCGGGTCACACAAATACATATACATACATATA:1 + chr3L 10084790 5' - 1731 4412 1 86.44 GATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTCGC:1 - chrX 20149266 5' - pogo 2087 1 71.54 ACAAGAGTGCATGATAAATGTATGGAGGGATATACATGAATGGAAGGTATAATGGCATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTA:1 + chr3R 24084793 5' + roo 68 2 66.44 CGTCATCTAATTGGCAGAGCAGCCAGCGAAGGATGCCGCTTCCTCGGCTCCTTAGATGGGGTATATACATATGTATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCA:1 - chr3R 13869032 5' + HMS-Beagle 39 2 56.83 TGACCCTCGACACAGTCAACCTCAATCACATTCCGATTTGTGGCAATTATTTTGGAAAATCTAAAATGATAAGTAACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAG:1 - chr3L 8824584 5' + transib3 15 2 74.66 TAGCCGAGGAGAGTACCGGTCGAAACGGAGTCTGAAGGCGGAGGAGTAGTGATCAGTCAGCCAACCGCGCGTGGAAGAAGATAGTTAGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCA:1 - chr2L 21645263 5' + 1360 13 1 70.16 ATTTTAGATTCCTTCCAAAAGAATGCTTTAAACAACGCAATCTTGATAAAAGTGAGGCAACCGATATTTACACTATCACCTAAAATTAGCTTTTATATTGTTTATAGCAAGCTTCACACGCACCCCAACCACCTAGCGCGCGGTCT:1 - chr2L 2206717 5' + F-element 4473 1 71.92 AAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAACACGTAATTGTGATCCATCACAAACA:1 + chr3R 14608701 5' + jockey 73 1 61.54 TGCTCTTCTATTCCTTCAATTTTTCTGCTCACTTCACCCAATTGTACATTTATTTATCGGTAAATTAATTCCATTGTCAGGGTTGGCGCTGAACCTTCTGATGAAATTGTAATATTGCGGGAAAATTCTGTCGAGCG:1 - chr2R 3550158 5' + invader4 71 2 71.53 GAGTATCTGCAACTCACTCGACAGTATAGAAACAAAAAATACATTTTTGGAAATATTTATTTAAATAGAAATGCTGTGCTACATGTGTTGGTAAGTGTAATACTTGTAATGCATTTTTGTGTTCTTTATATTACTTTTATTGAAA:1 + chrX 13060159 5' - Tabor 457 2 60.69 GCTGCGGCTTTTTAGTATTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTA:1 - chr3R 17243266 5' + hopper 9 2 76.03 AAGCGAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTAGCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGGACTAGAGTCAAAA:1 + chr2R 20972651 5' + jockey 4724 1 52.41 CAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 - chr2R 23094965 5' + 412 65 2 62.33 TCTTCCTCAACATTTGTTGTTCGCCATGGACATGAAAATCTACAAGAACAATATACCGACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 - chr3R 25860570 5' - hobo 2911 1 56.88 AAAGAACTTTTTCAAATGATTTTAATTCAGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTC:1 + chrX 18149975 5' + hobo 51 1 57.69 TTGGGCCAAAGATTAATATTCTCTCACGAAATTAACAATTAAATGAAATATATATATGAAAATTTTGTAATTAGTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATT:1 - chr3L 7787586 5' - flea 4967 2 53.79 AATTGCAAAATGGCAGAAAACCCAGGTTAGTACCATTCGTTTTAATGGCCGTCCAAAATTTTCAACCACATACTTGAAACTTACGCTGGGGGAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACA:1 - chr3R 26181002 5' + Transpac 4952 2 59.59 CACGGGGGCTGCAGAATAGTAAAACTTTGCTGCCAGAGTTGCCAACCCCACCATTGAGTTGCCCCAGGTGATGACCACTCAGCGTGGCCACGATTCGTGTATTGATCATAATTATGTTGAAATCGGAAGT:1 + chr3R 23645673 5' - diver 5802 1 78.46 ATTCCATAGACAATAGGACGTGCTAATTGCATATCAAGTATATTTTGTATTATCTTCTACAATTAATTATAATTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTCGCGCGTATGCAAAAGTGATCTATTTTGCTTTATT:1 - chrX 20999604 5' + BS 43 1 51.72 TCTTTGTATTAGAAACGTAATCAATGTGAGTTATTTTTATCATTTTTATTTATTAAAAATTTTAAAATTATTATTATTAAAATATATGTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATC:1 - chr3L 17482208 5' + 297 6613 2 64.38 AAGGATTGCTTGAATGTGACAGCCTCATTAGTTCCCACACAGCATACATGCGAATGTCAAAAATATTTGTACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACA:1 + chr2R 12492361 5' + hopper 11 2 73.97 AAAATGTACAACAATTGAAATTTTAATTCATTTTAATGAGAATTTTTGATTTGAAGATTTGTATGTTTAAGTAACTGAATGGACCACATACATATATGTATGTATATGTACATACATATATGTACATGTATACATATGTACATACA:1 + chr2L 6644053 5' - invader3 5087 1 65.75 CAAATAATTTTGTTGCAGTAACCCACGGAGGTGGTTGCATTTAAATTTTTGATCGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTATGT:1 - chr3L 13057442 5' + 412 7123 2 65.75 CGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCTTGA:1 - chr2L 15085740 5' - opus 456 2 53.24 GCCGGATTTATGCATTTACTTGGATTTCTGTCAATTTGTATAAATTTTTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCAGATATCGAGGGTACACTGTC:1 + chr3R 24480408 5' + blood 7023 2 76.03 AAACTTCATTACAAATGCCATATATACATAAATATACACAGAAACTTAGTCCTGTAAATAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACC:1 + chr2R 25171798 5' + Doc 4529 1 59.59 CTGTGTGTTTTGTGTGTTTTTGTGCGTTTGGTGCTTGCTGATCGTTTTGCTGTCTGCTCATCAGTTGCTACACGTGGCATGCCACACAATCTGGTTTGGTGCACAGTTATGCACAGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTATTGGTG:1 + chr3L 28063320 5' - Stalker4 7075 4 76.39 CCTTTATAAGTGCTCGCTGTGCGGTGCAGTATAAGAGAGCCACTTCGAACATGTTGTGTTTTGGTTCGGCCGTATAAGTGTTGCATGGCACATCCGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACT:1 - chr3L 1463772 5' - P-element 2861 1 68.49 ATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTT:1 + chr3L 20061339 5' - roo 9016 2 60.29 AAGTAGCAAATTTTATTTGATGATTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACA:1 - chr3L 27350128 5' - 297 356 2 59.15 ATCTTTTTATTACTTTTGTAGTTTCAATTATATAAATATGCAATATACAATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAAATGCGGTAATTATATAAAGTATTCTTAGTTTGT:1 + chr2L 21941137 5' - flea 4945 1 74.66 GAAAACGTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTC:1 + chr2L 20628508 5' + Stalker2 7 2 40.71 CCACTTTTTTCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTG:1 - chr3R 19094274 5' + P-element 64 1 41.78 AAAATAAGTCAGGATTGTAAAGCCGTTTATGAGTCTGGGCCTAAAAATAACTGATACCGGAAATATATTTGAAAAACTTAAGAACCTTGAAAGGAAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGC:1 + chrX 13789507 5' + FB 29 1 37.67 ATATGCATTTATTTGCTCTTGAATTCGGTACATAAACACACTTCACAGCTGCGCAAATGGTTTAATGAAGACATCTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCT:1 + chr3R 26927367 5' - roo 9022 2 53.42 TGCATCGACATCGGGCAAATGATGAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chrX 13628832 5' - roo 9013 2 57.24 TACATTTATAGCAAGCTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATAC:1 + chr3R 29283183 5' - hopper 1353 1 58.90 TTTGCGCATATTCAAACAATGCATATTAGCATCCTAGCCATATTTATGCAGTCCCGAAACCTCGGGCCAGCAACAAAAACACCATCAACTGTGGAAAAACCAGTGTAATAAGTAATAAGTAATCGCTCAGTGTAATAGATATTGAA:1 - chr2L 20628709 5' - Stalker2 7630 2 70.55 TTGTGTGCTATGGTTTAGTTAGATTTTTAAAAGCGTTTACGCAATACATATGCGATATGAAAAGTATTGCACGAGTTACCATGCCCAGCATTAACCCCCCTCAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCA:1 - chr2R 12185427 5' + accord 52 2 54.11 TACAAAAAATTTACCTTGAAGCTTCCTCGGTGTATAATAGCACCTCAATATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGT:1 - chr3R 5165062 5' + invader4 20 2 70.14 GCGCCATTCTGACTCGTGCATCAGTATTTTATTGTTTTTCGGCGGGAAGGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAATAAACTTATGGACAAGACCAGAATACTGGCACACAT:1 - chr3L 24008368 5' + X-element 90 1 68.49 ATAAATTAAGGAAGCGAAAGCAGGACACGACTCAAGCTAAAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATATATCT:1 + chr3L 15148568 5' - roo 9022 2 50.68 TAATTATACAAACAAATATTTATGTATGTATGTATGCACGGGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATTCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAAC:1 - chr3L 18044649 5' - hopper2 1528 1 69.86 TTTCACTAAAGTTGCCTGCGAAACTAGAGGAAGAAGTTAAAGTAGCGGATATTGGTAGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr3R 31159191 5' - hobo 2911 1 54.46 ATGTCTTTGAAGTAAAAACTACAGAATGAAATAATACTATGATTTTTTTTTAAAACTATCTATAACCAGCATATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGA:1 - chr3R 17531912 5' - 297 347 2 52.74 TCGCCCCACGTGCATTTCGCCCTGGACAAAAGGACTACACTGGAAAAATATTATATGTGTACGAAAGAAACGATCACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATA:1 - chr3R 12764818 5' + copia 4880 2 70.64 GATATTAGATTGATACAGCACACCTTTTGAAAAACATATAGATATGCTTTAAAACCTTTAAAGATATGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGGGAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCTGGAGGACGATAT:1 - chr3L 20224238 5' + Chimpo 60 1 57.53 GCATTGGCCCTCCACTTTTTTCCACCATCCCACAACGGTCACTCTAATCGAGTCGGAAAACAAAGTCGGACGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGTAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTCAATTCAGTGCACG:1 - chr3R 19094285 5' + P-element 53 1 45.89 TATGAAGGAAGGGGAATGCAAATGTAAGGGCGGCAGCAGTAAAAACTGGGACACAAAGGGGCCAACGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATTAATACCTCCTAAACTATTGGAGATATTTGGATGAATTTTTT:1 - chr3R 7625405 5' + hopper 58 1 57.53 AGTACAGAGTGAGTAAAACGGATCAGTGAGAAAGTGCAAGAGAGTACAATCGATTTCGTATGCAATTTAAAATCATATTCTCATTTCCCAACTCTTATAAAATTTACTTATTGTCGTACTTTTTTAAAGACAGATTGTAAATAAAA:1 - chr3L 15099661 5' + G4 3834 1 47.26 TCCGTGTGCATAAGAAGGCAAAGACCCTGGCTGCGCCGTCGAGCGTCCGAAAGACGAATATTATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGG:1 - chr3R 11089756 5' - I-element 5301 1 59.85 ATGACAAGGGATTCAAAGTGCAGTAAATTTGTTCGGAATGGAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGGGTTTTTG:1 + chr2L 2241203 5' - roo 9051 2 65.29 CAAATATCTAAAGTGAAAAACAAAGTTAGTTGATAACTTTGCTTAACTTTTGCACTTCACAGCCAATATAACTGATAATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTT:1 + chr3R 10876171 5' - 1360 3346 1 54.79 TATTTTGTGCAGCTGAAATATTGCGTTAATTATCGCGAAATGCCACAGAAAATATATTTTGAAACACACACACATACATACGTACACATTTTGGCCCAAAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTT:1 - chr3R 17243251 5' - hopper 1391 1 67.12 AAAATAATAATAATTATGTTTTAACACCATAGAGAAATGTCTTTTACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACA:2 + chr3R 27547578 5' + 17.6 6 2 78.08 AAAACCAACCNAAACCATTTCCAAAAAAAAAACATCAACATTTTCTTCAAAAAAACAAAGCACTACGTTTTGTAAGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGT:1 + chrX 17792467 5' - roo 398 1 78.08 AAAAAAACCTTAGATCTCATGGGAAAGCTTTTGGATGAAGTGTAATGCTTGTTGCATTGCAATTATATGTAGTATATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 - chr2R 14884197 5' + roo 8711 2 53.79 TCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTT:1 + chr3L 12227770 5' + opus 39 4 55.22 ATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAG:1 + chr3L 12227783 5' + opus 7060 4 64.03 CTAACGAGGTTTTGACCAATCACTGTTTGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATATATAGTCAAGTTTATGTTTG:1 + chr3L 11904751 5' - copia 5082 2 53.10 CATGAGCTCTNCCGATTATAAATGACTCTGACTGTGAAGGGCTACCGCATACCCATTCGCATCCCTCATCCCTCATTCATCCTCCATCCTCGATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 - chrX 14360875 5' + jockey 35 1 64.54 ATTCCCCACTATCCTTCGCTTTTGCTGGTGCATATAAACCAAATATGTATGTAATTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATATCTTGCT:1 - chr3L 1186068 5' - I-element 5080 1 63.01 CACTAGTAATTAAAATTGATTGGTTCCAAAACATCTTTAAGTTGAGAATCCCTTTAATCCGTCACTTTAAAGTTACATTTTCTCGGCTCACCACACTGAATGTTCATTCTATCGATGTTGTTGTTTTTTTTATCCTTTT:1 + chr2L 9284565 5' - gypsy7 5012 1 58.27 CTCCAAACCCCATGAGGCAAACAATCCGAACCCAACCTGACCGCGCTCCACGCAAAGCTTCAACTTGTCAGCGCGCTAAGTGCTCAAAAAAAAAGGTATATATGTACAAGTTAACACAATCACAAACCACCCGAAATAT:1 - chr2L 15420140 5' + Burdock 6146 2 56.83 TATTTCCTTGAACACAGTGTGATAAGTTTATTTTTTCACGAATAGTAAAAAACTGTCATGATGTATATTTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGAC:1 + chr3L 18074067 5' - 297 6938 2 56.82 CACGGCGCTTTGCGAAAATACCAGCTACAAAATTTCAGCTCAAATATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTT:1 + chrX 5841885 5' - roo 9037 1 58.57 TTTTCGATTGACTCGAAGCTAACATCTGTACGATTTTTTTGGTCATATATGTATGTACATATAGATACTAAATATATATATGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAATTGTA:1 + chr2R 14531948 5' + invader4 45 2 56.85 CACCACTTTCTCCATCTGCCTGTCCTTCTCGGTCGAACTCTCTTCACACTCCCAGGATTCCTTGTGTCTGTCTGTGTGGAAACTTCCAGAGAACTGCAAGGGCGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTAC:1 - chr2R 8315608 5' + hobo 28 1 67.41 AAAAACATATTTACATACGATTTTTATTATTGTAGTTTTGTATCTACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGACGACACCACAGTATACTTGCTAGACGC:1 - chr2R 17493160 5' + BS 4875 1 69.18 AAATGGTAAGTTGTGTGCTCTTCGTAAATAGTTTTATATCAAGTGAATTAAAGTGCTTAAATGGAAGAGTGTTATGCCTCAAATGATGAAACAGATGACGAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACA:1 - chr2L 9894963 5' - P-element 2867 1 71.72 TACAATATTTTAAGTTGTAACCTATCGATAATCATAGTATCCCGCTTACAGATGTAGTTTAAAATAAAGAGAATATCCCCAACGATTTAATACTTGTTTTGTAACGTGTAACGAAATAAATTGATGGAAGGCAAGGAAAC:1 - chrX 22824254 5' - Gypsy12A_LTR 2240 1 52.14 TTTTGGTGGGTTTAGTTGGTGGCACACAGGAGAATCACATCCGCAAGTGACCCCTATACATACATATTGTATATAATTACAAATCAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGACCGTTCCGAATAAGAACTAAGAC:1 - chrX 3533990 5' - 17.6 441 2 54.79 TGGCAACATGGTCCCGTCGTCCTCGCTGCACTGTCAGCATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTGAGTTGAAGGCAGCAGTCGGGCTGACATATATTTATTCAAT:1 + chr2L 15523051 5' - 412 7488 2 67.50 AACTGAGTATTTCCAGTGAGGCAAAGGATTCAAAGTGATGATGATGTACGGGGAGTTCTATGCATTCCAACCAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAGGGAAAAG:1 + chrX 5443375 5' + Doc2-element 229 2 50.50 TGACTTTTCCGAGTGCACTGCATCAAAGTCAAAATGGCGGTCGAGTGTGTTTGTGGACGAAGTGAGACAAATACCGCCATAATTCCTGCCTAAAGTGGCATTAGACATTTAATATTTATGCATTTTTTTAAGTTAATTGTAATTCA:1 + chr3R 19533144 5' + Juan 4007 1 77.40 GTGTATATATCAGCCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCAC:1 + chr3R 19965205 5' + jockey 25 1 66.09 ATGTATACTGCCTACTTAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGC:1 + chr2L 10536464 5' + flea 4795 2 54.89 ATTTATACTGTGTATTTCAAAAAACTTACCCCTTGAAATCATGCGAGACCTAGACTTGTTTACATTTTGAAAATTGAAAATAGCCATTTGAAGGCTTTTAATTGAACCCTATTTCCCTCCGACGCCTGAAGAGAATACATTCCCAT:1 - chr2R 25051902 5' + G5A 2682 1 74.66 CAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAA:1 + chr2L 8120161 5' + roo 8728 2 78.15 GACAAGGAGCAAAAAGAAAAACTGCACTAGAGACGGTTCCTGCCTACTAACAGGGTATACGGTATTCTTTGGAAAGTACGCAACAGGTAGCAAGAAACGTTTTTTATTTAATAGCGTACTATTATCCTTCTTTGACAACTTAATC:1 - chr2R 6526627 5' - jockey2 3345 1 70.34 GAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAG:1 + chr3R 19094217 5' - P-element 2788 1 16.44 TTAGGGTGCACGCCAAGAGCCTAGAGCAAGCAAATTTTAGATAAATGTATATTTAGAACGTTTATATAAGTATGTCGATACATGTAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCACTCGCTGCCGCATACCTCACCT:1 - chr2L 15085750 5' - opus 7462 2 55.48 TTGAGTAAATACACAAACAGGACTCACACATTCTGGCAATGTCAGAGGAACCCAGACCATCTAACTAATGAGCAGGCAAGCACTCATTCACCAAGCCGCACACACACACACACACACACATATAC:1 + chr3R 28061281 5' + accord 185 2 74.40 TGTTAAAAAGAAACTTTCCTTTGAAAACTTCAGGTGTTGCTTGTACTGTCCAGTAGAATTAGAATACAATTACATAATTACACATTTATTATGCTTACAACAACAACAAAATGAAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCAAA:1 + chr3R 14620132 5' - Gypsy12A_LTR 2066 1 67.12 AACAAGGATTCTCGAAAGGGGTTGTGTGTGGTTGGTTGGTGCTTTGGAATTGAAAAGCGAAAAGCATTTCAATTAACGCAACGCCATATAGGTGCATATATGCACTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAA:1 + chr3L 8249333 5' + mdg1 20 2 71.92 GAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAA:1 - chr2L 7920989 5' + F-element 408 1 75.45 TAGTATACCAAGAAAATTGACTTATATTGCAGCTAAGTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTG:1 - chr3L 10897561 5' - roo 396 1 72.27 GTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGC:1 - chr3L 7751147 5' - 412 454 2 57.93 AGTTCTTGCTTACAACATACTGGTCAGAGTCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chrX 18150003 5' + hobo 60 1 75.68 TTTATATAAAGTAAGTATAAGATTCTTGTACTTTTTTTTTCCATTGAATGCCAACTAAATGCCATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chr3R 24084886 5' - roo 9011 2 59.59 CTGCTAACGCATTTCTAACGAGCAAAGCCAGTCAACAGCACTTTAAATGGCAAATGCTCTCTTGGTGAAATCATCATATATTTAATTATTTGCATTTGCCAAGTGGTAATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTAC:1 + chrX 8314394 5' + roo 8680 2 73.29 GAACCCAATGGACGTGATGGCCAAACAACGCCAAACACCGAAATGGAAAGTGCTGGATTGACATATATACACACAATATAACTTTTACAGGGTATACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAA:1 - chr3L 7751160 5' - 412 468 2 67.36 TTGCGCTTGTGTGGCTAAAAATGAACTGTACGGAAGAACGGAATGGTTGGCACAACGAAGAAAACGAGAGAAGATGAGAGAGTGCAAAGGAACGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTT:1 - chr2R 21713365 5' - P-element 2860 1 62.50 TAACTTTGCTGGTTTTAACTTTTTTATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACTGGGATTTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATGAATTCTGTTCCGCATCCACAATTTATTTTGCCTT:1 + chr2R 25286858 5' - TAHRE 10381 1 75.19 TGGGCTTACCACCTCATTAGGGCCCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACT:1 + chrX 14735734 5' + diver 5956 2 60.96 ATAGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGCTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCAC:1 + chr2L 8284321 5' + Doc 395 1 68.49 GAGGCCTAAAAGTATGCAACACATTCGAAACACTTTCCCAGATTTATCGCGTCCTCATTCCTCCATTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGCAC:1 + chr2R 20972655 5' + jockey 4713 1 48.46 GGAAAACATAAAAGCAACGAAGTGTTATGATGTGGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATAT:1 - chr2L 18219423 5' + copia 42 2 56.16 TTTACATTGTTTACACGTATGCCGCTGGCCACCATTCAACCGCTCCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCA:1 - chrX 9846821 5' - transib2 2744 1 73.29 AAACAGACAATGTATATGTATGGACATTTGTACAATGTACCTTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr2R 22796763 5' - jockey 4979 1 55.56 CACACACACACACACAAAAGAGGTACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGCACTTACAAACACAC:1 + chrX 9971182 5' + hobo 83 1 79.85 TGCGGATGGTGGTAAGTCGAGGAGGCCCCAGCGCGTCCAAGAATTTTCCTAGCCAACATCTTGATTGTGCCTACTGTAATGTGCACACATATCGAATAAGCACTGTATCAAATCAGAACATTGGGAACAATCACATTGTA:1 - chrX 8839396 5' + Tabor 6884 2 52.86 CTTTCTATAAAGTACATTAAGTGCTTAATTTCGATTAATTACTTGTCTAATCACACTAGATTACTGTGTCAGAACACTTTGAATTAACTAAATCTATTAGAATTTAATTACAATATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGAT:1 + chr2L 16884749 5' + pogo 6 1 73.61 CAACGAGGAGAAGCTCATTTTCAAATTTATCACATCGGCACACAGCAACTAGATGGCAATTGCAACGGTTTGTCCTGCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 2907275 5' + 412 47 2 54.11 CCGGCCCCACTTTCCCCCATGCCACGTAAGGAGGAAAAGTTTTCGCTTTGATATTTGATTTCTCTGCTGGCCTGCAATGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTT:1 + chr3R 6584759 5' - transib2 2779 1 51.72 TATATCTATGTTATTATTTTTAAAGCATTATTTATACTATATACTGGTCCATAAATATTGTATTTCTATGATAGATGTTATTATGTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGGAAGATATCTGCATTAT:1 - chr4 880420 5' + pogo 38 1 60.27 GGTTGTATTTGGCTTTCGCCCCCGTATGTACTTCGCATTTGCGGCCCAGCTAATGCAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAGCGTACA:1 - chr3R 12613858 5' - HMS-Beagle 6974 2 64.38 CTTCCTCCCACTGACACCCCCACCCACTGACTAATTTGTCACTTTTGTTCTCGCCTCGCAGGGACTTTTGGAATATCTTGTTTGCTGTTTTTTGTTTGTACATTATACCAGTTGCCATTTTTGGCACTTTTTTTGTTTTTTTTTTT:1 + chrX 12071592 5' + hopper 142 3 59.59 GTTTATTTGCTTGCCCAAATTGGATTCCATCTCTTCATGACGGCACGCAGTAAATGAATTTTTCAAAATCTCCCGAAACAACCGCAGTGTGCCTGTGTGTGTTTCTATGTATGTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCG:1 - chr2L 15516830 5' + Max-element 12 2 78.08 CGCTAGTAAATTTTACTTTTGGCATGGGCTAAGACATTTTCAATGATTACTAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTGGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGGGACA:1 + chr2R 17269114 5' - roo 339 2 61.81 AAGGTGTTTATTGTTATGTGTTTATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAAC:1 - chr3R 5704236 5' + 412 7086 2 63.70 GGTGTNGCCAATATATAATGGAGGAGGAGTGGGCCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCAC:1 + chr3R 21925120 5' + hobo 60 1 69.17 TTTATTGCTTATAATTGCCTGCCGTAGTTTGTTGTTGGCCCTTTTGAGAGCAAACAAACATACAGTTTGTCAAGAAATAAATTGAATTTTTGACTTTAAAGCTAAAAATTAAGAGTTTTTTGCTTAATTAAACGCAATTTTATTAT:1 - chr3L 25610067 5' - S-element 1634 2 65.75 AATTTCAAATGCAAACCCAGACACCTCGTGCAGAACCTGTCCAGGAACCGAGTCCCATTTGTCAGGGTTATGTGCTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTGGGTCATTTTA:1 - chr3L 22021760 5' - mdg1 7412 2 52.78 ATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 12133867 5' + jockey 18 1 71.67 CGCCAGAACGAGACCACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAAT:1 + chr3L 5770902 5' - P-element 2844 1 41.82 TAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr2L 20132976 5' + 297 6636 2 61.81 AATGAATTAAGAAAATAATAAAAACCTTTTGGGGACTTTTGAAACAATCGAACAAAACTTAATGACCAAATACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAAC:1 + chr3R 23902172 5' + I-element 53 1 53.42 TAAAAATGTAAATAACTATATTTATTTTAATGTATGTAATTAGAAGGGTTTTAATAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATCTAG:1 + chr3R 12376412 5' - HMS-Beagle 184 2 61.64 TAAATCTTAAAAATATGGATTCTAAATGCTCAATGTAGCAAATTGTATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTGAGCAGCCACATGATTGTCG:1 + chr2L 10536480 5' + flea 51 2 62.31 TATTTAATATGCATTTAATGCCTTTAATTCAATGCACATGTTTGGTTCTACAGGGCGTATGCGTGATCAATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAG:1 - chr3R 13423389 5' + 297 47 2 53.10 CAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAACGGGAACGGGG:1 - chr2R 2994303 5' + gypsy8 4784 2 50.44 TGATTGATATACATTTTATGAAATTTCAAGCCCATGTAGATTGCTCCTTTGGCATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAG:1 + chr3R 12046749 5' + Doc 59 1 63.08 TAATGTTATTGCATTTCTCCTTTTTCTCTCCAAACGATACCACCACTCATTCGATTTGCATAAGTCTTTAATTGATTCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2R 18886947 5' - roo 9047 1 63.20 TAATACTAAAACAACATATTCACTGTGGTCCCATATAATAATTTCTGTGAATATTATATCGTTGAAAAGTATGTAAACGGTAGAAGGAGGGGATTCCGACCAAATAAAGTATACATAGATATTCTTGATCAGGATTAATAGACGAG:1 + chrX 22633235 5' + INE-1 90 1 54.79 TGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATC:1 - chr2L 12236809 5' + jockey 96 1 77.40 AAAAAAAAAATTTTAAAATTATATTTTATTGAGTATTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAATAATATTAATAATAATTATAATATGAATCATAATAATAAGTCAACTAATAAGTAAACTTAGGA:1 + chr2R 10496798 5' + mdg1 89 2 80.14 GATTTTTTTCTTAAATCGCACATCTTGCAGGGTGATTTATAATCTGATTACATTGCGCAAGGGAAGTGAAGTGAATCAGAGCCATATTTGTTATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chrX 20149266 5' - pogo 2072 1 64.14 TGTCCCCTTGCTGCTGCTCCTTGGTCCTTTTTTGTCCTTTTTTTTTACCAGTTTTACCAGTTGTGTTGCCTTTGTGCTGCCGCTTGTTTACGGGGGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGT:1 - chrX 21233457 5' + roo 8695 2 63.70 CTTTCTATTTGCAAATTGGGCAGTGTGACCATGCCAGGCATCCGTATATAACTGTTTAAAAGGCCTGCGGTGGCGACTTCAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAT:1 + chrX 855274 5' + blood 168 2 70.73 AGACAAATAGGATATTCGATAAAATAATATTCATATTAATACTTTTAATATTTATTCGTATACAGAGGTGGTCAAAAGTATTTTCACAACGCACAATATTTGCAAACTTCAACTTCTTTTTGTTATATTTCTTCTTGTTGTTGTCC:1 - chrX 20145606 5' - Bari1 1644 1 60.96 AAGGAATTGCCATTTTTAAACCACTACTTTATTTTTCCTTCAAAGTAACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCCTCTTTTGATTTTA:1 - chrX 666359 5' - 412 7471 2 68.49 TTATTGAAGCGTTCAAATTCGATGGAACTTCCTGGCAAGCTGACGACATTTTATTTCCATTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAA:1 + chr2R 21795245 5' - transib2 2761 1 63.01 GAACTTGCTCCACCTGCTCCCACCCATTCCTATAGATATGTATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGTAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACAT:1 - chrX 13628809 5' - roo 9002 2 69.17 AAATAATATAGAAGTCTTGCCTAAAAAGCAAAACATTTCTAGATATATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTT:1 - chr3L 2317216 5' + 412 66 2 68.15 TAAAGTAATGTTTTACTTTTCTATTCGCATATCACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGC:1 - chr2R 4816990 5' - blood 7352 2 56.85 CCACTGTTAGGTCGCGCCAAAAATTCAGTTGGCAACACTGCCGCCCCAACCCCCTACGCCAGAACGAGACCACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCC:1 + chr3L 5770846 5' + P-element 6 2 79.07 TTTGGCAAATGATTTGGATTTGGCAGGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGTATACACTTAAATTCAGTGCACGTTTGCTTGTTGAGAGG:1 + chrX 9121295 5' + P-element 69 1 27.64 TCAGCAAACTGGCCATGATGCGTTCCAAAAAATGATAGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAANAACAATTAAATAAAATA:1 + chr2L 10909460 5' + 412 7076 2 64.03 TGATGAGGCCTGTCCTGCCCAGCCAGGACCTTCTCCCCGTCTCCTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCT:1 + chr3R 11284914 5' - blood 7316 2 70.50 GTTTGAACATATGCAAACGTTTTTTCTTTTTTTTT:1 - chr2L 3754173 5' - HMS-Beagle2 493 1 71.43 ATTAAAAAGGAGCCAGGGCAACCGTAGACCGAAAGCAGGCAAATCAAATCGACGACAGCAACGAGGGCAAGGACGACAAGGGCTGCAAGGAAACAATCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGC:1 + chr3L 22320122 5' + jockey 34 1 63.01 AATTGATTGAATTGAAGTTCCAGTTTCAGCGGCTAACACGCACTCAGCGGCTAACACAAACACATGCACTCTCGCACACACACACAAGTACAGAGACACACACACACACGCACACATAGTC:1 + chrX 14348139 5' + accord 7031 2 73.55 AACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTCGGCATTCGCTGCCGCATACCTCAACTTGATATGACAACCAACATGC:1 - chrX 21668352 5' - opus 439 2 58.90 GATTTCTTGAGTTCCGAGCTACTCCTTCTTCTCGGTGTTTTGGACTAGGACATTTTAAATGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATA:1 - chr2R 16274640 5' + roo 8727 2 63.01 TGCATGGCCCTTGACACGCCGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACG:1 - chr2R 12133870 5' + jockey 18 1 72.36 TTGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTC:1 + chr3R 25860442 5' + hobo 19 1 71.01 GGATTAGCCAGGTGGTGCGTGTTTACAACAAGGATTCATACGCCGAATTCGAATGGCTGGTTGGACCCATTCCCATTGATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAG:1 + chr2L 10461122 5' - 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P-element 2839 1 51.43 TACTGGGGTAGTCACGAATTTTAAATGCGCTTTTTTTTATTTGTTTTTATTTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAG:1 - chr3R 25796061 5' - BS 5001 1 75.34 ATTTAATGCCTAAACGAAATCGAAACTGGCATATAACTCCTTGAATTTATTTATTAAACATACATGTTATACCGCATATATATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACA:1 - chrX 4789247 5' + Quasimodo 32 2 61.64 AGAACACGAAAGCTCAAAGTGAATTTTCCTTTCATTTGCTAAATGTTGTTAATTGTATTCAGTTTCGTGATGACTTCCTCCAGCTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTT:1 + chr2R 8966125 5' + BS 5034 1 55.86 GAAATTGCATATTTGCTTTTATTATAATAAATGCCAATTTGGCCGACGGTGGGTGGAAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCAAAATAAGGTAGCAAGACTCATCACC:1 - chr3R 23636430 5' + X-element 4304 1 63.70 AGCTTCCTCGGTGTATAATAGCACCTCAATATTCCAAAGATGTTTCAGTTAAAAAAGTTAAGATCCCTAAATGATATACATATATGTCGGAGCGCGACTCATCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTGATTTCATATTCTGATGAAAT:1 - chr3R 5165043 5' + invader4 2800 2 56.16 AATAGCCATTGCCATTATTTTGGCCACCATTTTGGTGTTCAAGGGAGTGAGGATTGCAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - 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chr4 962572 5' + INE-1 534 1 74.13 CACTTGAATACGCATTGAAATTGTAGTTCAAGTATTGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGCGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTAT:1 - chr3R 30955420 5' + G-element 38 1 50.75 GCATTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr2L 20132972 5' + 297 53 2 59.59 GGGTCTCGATCAGCTTCAGGATCTTCAGCGAGTCCTTCCAGTAAGCCGTCTAAAAGTATTAAAAGAATTCAGTATTTCATTTTCGGCATTCTTTCGGCATTTCTTTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACG:1 + chr3L 9635265 5' + Doc 14 1 60.00 TACAATGTGCTTGTGTATTATGAATACAAATTATATAAATTCCAATAGGTCCAGAGTTATGTTATTTCCAGTAGGTCCAGAGATCCTCCTTCTTTCGCTGAGGTTCGTCTAAGACACTGTTTATGG:1 + chrX 21852443 5' - gypsy 385 2 76.98 ATTGTTGTTTTTGAGTTGTTCAACAGTTTTCTTTGTTTGACGTTGAATAGTTGAAAATGTTCAAAACTTTCGCGCCCACAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCG:1 - chr2R 11844343 5' + I-element 41 1 55.71 TACAAATAGGGATGAATTTATAGCTTAATGTCGTTTATTGGAAATAAAAGCTTGCAACTAAATAATTTCCATGCAAGATATTTTAGATTGATTTGAAAGTTTTAATATGTGTTTAGACATGATAAGTATGCAAACTATAAATATGT:1 + chr2R 330203 5' + rooA 28 2 73.97 GCAAGTTTGGCACACCGCTGCGTATGCTTAATACGATTTGGGCCCAGCCATCAGATAATCACTGGGTATTTCAGACTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATAT:1 + chr3L 6050128 5' - 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chrX 10319731 5' - mdg1 7424 2 60.42 GCTGGTGCTTTTTATTTGGGTCTTAATTTTTAAAAATTCTATATTATTACTAAGGGTATGCCATTTCTCTCATGTCACACGAATGGTTACAAATTTATAAATATTTTAAGTTTTTTTAAATAGTAAAAACAAAGACACTAGAATAT:1 - chr3L 11314567 5' - Tc3 315 1 43.84 TTTTCTTTTTGCCCCAGGAGCTCTGATCTGCATGTGGCTCCTGAGCAGGTGTGTGCCTCCTGCGTGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCAAG:1 - chr3R 16563257 5' - accord 180 4 76.53 TTACGTGCAAAGCGTAATTACAGTGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAA:1 + chr2L 7633366 5' + Max-element 8236 2 70.89 AATTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACATCTCCCTCCTTTTGAAAAATAACGTAATAATATGAAGTTATTTTCAAGTATATGTCGAAGAGTCATCAGAATGCCCTTCTTCCTCTTCACTACTCTCGTTATG:1 - chr3L 4469445 5' - invader1 373 2 65.75 CAATTATGGGTATAAAATATTAATGATGTAAAAGTAAGTTCTAAGTTGTTGTATTTTGAATAATCTGATATTTCAGATTCTTAAAGTGGTTAGCGGATATGTACTTGTCGTAGTCGCTGTTTACTTCTTCTCCATGTTCCCTT:1 - chr2L 23295919 5' + micropia 128 4 70.63 AAAGCGAAATATTGCCTACGATATTGATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTCGGGGCCGGTC:1 + chr2L 5207463 5' + opus 7077 4 76.74 ACTCCCAGTTAATGGCATGTCCCGCGTATGATCGTCGTGATCCTAAGGAATGGCCCCATTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAG:1 + chr2R 16274545 5' - roo 394 1 65.62 AATAAATTGAGTTGTCAAGTGGGGCAAAAAGAAAAGAAAAAGTTCGTGGGGGGTGGGGAGGGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAG:1 + chr2L 3661935 5' - blood 338 2 56.93 CTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGCCACACGACCGTCCCGGGTAACTGTAACACTGCAA:1 - chr3L 17748428 5' + Doc 480 1 72.60 GGTGCCGAGAAATCGGTGGTGCCGTGTGCGCCGAGTGGAGCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGG:1 - chr2R 14009085 5' + 412 7092 2 63.46 AAAAGTAAAGCCAATCCCTTGAGTGCCTTGCATAATTGCACGGAGTGTGTAAATAATAATTTAATTTTGTGACTAACTCTACAAATTAGTGGTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCAT:1 - chr3L 414971 5' + 412 27 2 66.43 GCCAAACATTTAGCAGGCTCTTGTAGTGAAAGTGGGTGGCACTTCAGCCCTGAGCCAAAACTTGCCACTCACACTCACACACGAGTGCACACACACACACACACACA:1 - chr3R 28449140 5' + accord 7028 2 39.25 TTTATGATAATGAAGCGCAAATATTTCAAGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATA:1 + chr3R 24480455 5' + blood 57 2 57.64 ATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCATT:1 - chr2R 18931890 5' + blood 89 2 76.71 AACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCCGCCTTATCGAGGTCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGAC:1 - chr3L 11535867 5' - roo 202 2 76.11 AGGGTATTTCCATGTTCCGGTAGATGTTAACTCCCAAAAGTATACTAAATTTGTGACACAGAAAGGACAATACGATTTTTTGTATGTGCCCTTGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATACGTAACGGCCATACATTGGTTTG:1 - chr2R 4939192 5' - 1360 3363 1 34.97 CTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGAGGACGTGTTCACAGAAGCCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 24072039 5' + jockey 57 1 50.00 TACGCTTTCCTCTGCTTGGCTGGACTTTGCTGCCGCTATAAATTTACAAGCGTATAACAAATATTTTCCTTTGTTTTTTTTTGTGTAGCCTTTTATTTATTATTTAAAATCTGTCCTAGTGGACAATAATTAAATTTTTTGGAG:1 - chr3R 15668246 5' - G2 3018 1 54.86 TTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTT:1 - chr2R 12827078 5' + Burdock 6189 2 56.55 AAAATCCCTGTTCTTTATTTAGAGTAATTATCTACAGAAAGCTATGAAAAATGTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCG:1 + chrX 16998262 5' + diver 29 2 50.68 AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGC:1 - chrX 9023557 5' - blood 7008 1 62.86 AGCAAATATTATTTTTATATATTTTAGTTTTATCTTACACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 17792542 5' - roo 323 2 78.77 CACAGCTTTAACTGAGCTTTATTTGAATTTAAGATAGCTGCCCGTTCGTCCGTCTGTCATTAAAAGAACTCAAAACTCAGAACTCTTTTTTGGTTTTTGACCTTCTTTATTCATTTTCACTTGCTAAGGAACGGGTATCTGATAG:1 - chr2R 8529667 5' + INE-1 547 1 51.03 TTTTTACATTTACTTTAGACTTTTGACTTTTGACTTTTGACTTTAGACTAATGATAATGCTGTGTCCCAGCTCCCAAGCCCCGCTGTTCGCCAGCATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAAC:1 - chr2R 2868549 5' - Rt1b 4697 1 61.60 CTTGAATTTTAATTGGATTGCGTTCAAATGGCTTTTCCAATGAATCCGATTGTTTTGCTTCTTTTCTTTCTCATTTTTGTTTTCTTTTGTTTTGCTTTACGTTTAGGTTTGCCGTGATTCTTTTTTTATTTTATTTTTTTTTTAA:1 + chrX 15852567 5' - TART-C 11101 4 57.93 TGTTATAGCGAAGAAAGCAGGATCCGGTTAAATCTTTGCTACACAAGCTATTGGTTGTGAATAGGGTATCTGCTAGTTCCATAATCTCCTTTGAACCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACC:1 - chrX 860915 5' - hobo 2921 1 65.93 GACGAAAGACCAGAAAGGAGAGTGTGGGGCCAACACAAAGTAATTGATTGTTTATGGTCGTTGTTTACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAG:1 - chr3L 13285679 5' + roo 8720 2 58.70 ATTTTCGGTTCTGTGCGGGTTTTTTTTTTTCGGAGGGGGGCCTCATAAATTCTTTTGGGGTGCGGGGCCTTCAGCCCTTTTTTATATTTTTTTTCAGTTTGGCTGCTTCCCGAGTTTTTGCCTTGTTTTTTATGTATTTTTTTTTT:1 + chr3R 14398755 5' + transib1 8 2 38.36 ATGCTGTTTGGAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGC:1 + chr2R 14072513 5' - mdg3 173 2 63.70 GGTTCTTGGGAGGACACACTCGGAAATCGCTGCTAAAAGTAATTCACTTTTATATTAAAAAGATTTTCGTTATGCCCGGGTAGCTCGCTCATTTGCATGGTGTCCTCTTTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTT:1 + chr3R 28438270 5' - mdg1 406 2 73.29 CGTACCACCTAGTGATCAACCATCAATACAACCGCCGGCAGCTGCTCTACATAGATCTGAGCGTAGTAGACAACGTCCGGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTTAACAAACCAAATTATACCACAA:1 - chr3L 23848767 5' + I-element 5167 1 61.83 TATTCGCCGATAATTGATGTCAAAGGACGCAGTTGTGCTCCGCCGGAGTTACCACCCCACCCCCTAAACCCCCACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAGACGGCAACTGGAAC:1 - chr3L 11364875 5' + Tirant 60 2 68.00 AGTGTAGATGTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAA:1 + chr2L 512388 5' - roo 9045 1 63.70 GTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATTC:1 + chr3L 9324466 5' + HMS-Beagle2 76 2 69.18 CAGTGCGTCCTTATTCGGAAGTACCGGGTCCATACTTTATTATTTATTGAATCTTCCCTTTGTGTTAAGAGACTAACAATAAGTGTTCAAATCTTAATCTAACTTAATTAACTTTCACTTAGTGATAGTTTTTTTTTTT:1 - chr2R 10455582 5' - Doc 4596 1 74.82 TTTGAACAACTATGAAAAGTTACTTACCAATGACCTTTCGTCATTTTTGAAAAGTGTGAGGAGGGTAAAGTTGACAAAGGTCAATAAAAGTCGGGATTGTACTAACATTTTTTATTTATTTATTTATTATGATAGATAGAATAGTT:1 - chr3R 11076294 5' - I-element 5343 1 73.97 GGCCTACAACAACCACTGTTAGGTCGCGCCAAAAATTCAGTTGGCAACACTGCCGCCCCAACCCCCTACGCCAGAACGAGACCACTGTATTCGTCGGCAGCAGACACTTGGACTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGG:2 + chr3L 5770834 5' - P-element 2876 1 78.08 AAAAAAAAAAAGAAAAACTAATCAGTTAACTAAGTTAAGAAAAATTCAAATGGCCTTTTTATTGTTTTTTTTTTGCGTATTTTCATGTTTACTTA:1 - chrX 9702322 5' + Transib5 389 1 74.74 TATTTATAAAACTCACAAAACACTCAAAAAGAAATACATACTCATGTATGTATATGATTTCGCATCATGATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGA:1 - chr2L 18181268 5' - blood 7379 2 75.34 CAACAAGGTTGGGGCCAGAGTGGGGGTTAAGGGTGGTGGTGGCTAAGGGTTAAGCGGAAAGAGAGAGGTGAATTTTGGCAAATGATTTGGATTTGGCAGGTGGGCCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAG:1 + chrX 9121222 5' + P-element 14 1 75.89 GGCTAAGCTGCTGATCTTTTAAGATGTTTGAAGGATAAAGTGTATACTAATAGGTTAATTCGTTTCGAAATCATCTAAATCTGACTACAAATTTGATACAAATAATATCTTACAAGTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAA:1 - chr2L 4245033 5' - 412 485 2 74.66 GACGTCATGACAACGTTGCCCGCGCTTGTGTCCGTGTGCGCTTGTGTGTGGGCCAACAGGCAACAAAAAAAAACAGAAAAAAACACA:1 - chrX 18371696 5' + Porto1 4435 1 79.31 AAAGAAAAACAAGATTTTTCGAAAGAGGAAAATATTCAACGGCAGAATATTGCCCATCATCATTCGGCATTTCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACGAATAGCAAGTTCTAAAAACTACAACAGTATAGTGA:1 - chr2L 21813768 5' + Doc 67 1 60.27 ATATTTAATGTGAAGGGCGGGGGAGGATAAACAGTAGCAACAGGATGCAATTCACGCTTTAATAAACTGTTTGTAAAATCCCAGATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 + chr3L 6015567 5' - roo 360 2 54.29 CGTGTCCAGATGGCTAAGGAGGTAGTTGCGGTCCTCGCGACGTCCCAGCTGCCGGTACAGCGGCAACTCTGCGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 - chr3R 17627615 5' + roo 8713 2 52.45 TTCGTGGGGGGTGGGGAGGGGTAAAAAATGATATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTCGAGT:1 + chr2L 3661977 5' - blood 7310 2 80.00 TTTATAGATTAATTTTTATAGTTTTTCAAACAAATAACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGATTTTTTGTAAGAAACTGATTTT:1 + chr3R 20904937 5' - roo 9036 1 59.31 AAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCT:1 + chr3L 18846971 5' - 1360 3321 1 69.63 GTTAAATCAGCAAATTCAATCCACTTTCAGTTAATTGCATGTGTGCCGTAATAATTAGACCCCATGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTAATAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGTT:2 - chrX 10319708 5' - mdg1 361 2 58.22 ACGTTGCAAATAAAAGGCGATGCAATTTTCATGGAAATCCNGCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCANATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTT:1 - chr3L 2966572 5' - roo 9053 2 65.89 TAAACAGATTCATGTGCGTGGAGTGGGTCCTTTAAGCCCTTTAAGACCCTGCATTTTGGGCCAAATTGCAAAGAGAAGGTATATAATTGCAAATAAATGGTTGCAATAAATAGTTTTGAGTCTATTAAATGGAC:1 + chr3R 10148703 5' - 17.6 7390 2 63.43 AAAGGGGGCTTTACTTGGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTCCGTCCACCCGATAAACACA:1 + chr2R 8315456 5' - hobo 2910 1 67.12 TTTTTGGCGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAAT:1 + chr2R 14427128 5' + jockey 4814 1 54.79 TTAATGTTTTTACATTTATTTTTAGAAAAATTTAGCAAAATTTTAGTATGCCACGCCCATTAGTTTGGGCGGTAGCGAAAGTTTTCATTGTTTTTTTTTATAAATCACAGAATATGAAATATTTTTCTTTATAATGACAATTTAA:1 - chr3R 7404186 5' - looper1 1653 1 58.62 TGATCGAAGTGGAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTTTTCAATTTCTTCTTTTGATTTTAGAGTAGGTAGA:1 - chr2L 2057878 5' - 412 407 2 72.60 GGAACCTATTACTACCTTACTAAAAATAATTTAATATCCCTAAATTTTAGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACCCTTTATGCCATAAAACATAT:1 - chr2L 18219390 5' + copia 4944 2 68.49 AAAAATTATAGAAGGTCCCAACATATGCCAGCAGAAAAAAATGAAATACACGATATAGAGATATATATATTTGATGCCGGGAATAAATAATGAGGGCTGATTTCACATGTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAAT:1 - 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hopper2 1525 1 73.29 TACCTATTGTATATCAATAAGAATCGCATTTCCAATTCTTNCTGAGTTACGTTAATTTTGAAATTAGATTTATCTGAAAAATGGCCAATATACTTTGCTAANATCCGGAAAGTATCACCACCCTCATGACCGCCCTAACCTGGTTT:1 + chrX 9165276 5' + jockey 4769 1 77.40 ATTATCAAACGCCCCGAAAAGTATGCAATAAATTACACAACAGGCACTCGCACATACACACACACACACACGCAACAACAAATCATTTTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCC:1 - chr3R 27315183 5' - jockey 4971 1 63.64 AAAACTCCATTTGTAAATCTATTGTACCCGCCAAATAAATAATCGTGAACCACAATCCTTATATTCAAAATAAGCAAACCACAAAAAAAGAAGTTTTGGAAAGGCAAAAATAAAACAAAAAATATAAAAAAATAA:1 - chrX 9503099 5' - Tc1 1398 3 75.56 CTATTTACTGATAGGCATTGGAAATGTTAATGAATTGGCTATATTTAATGACTGGCAATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTT:1 - chr2L 16884903 5' - pogo 2037 1 63.01 CCATGATGCGTTCCAAAAANTGATAGTTATACATACTAAGTATCAAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAG:1 + chr2L 10909472 5' + 412 42 2 52.05 TTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCA:1 - 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G5A 2805 1 82.14 CTTCGGGGAAGAGGAATAGGATACTACAGCAGTAACAATAAGAAAACGATTACTCACCGTTGGTATTTATTTGGCATATTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGC:1 - chr2L 3662064 5' + blood 28 2 60.16 TACTTGTCAATTGAATTGAATTATTGGTGTTTTATAGAGATGAATAGTTGTGATGCCTCACTGCTTTGACATCATTGTAATGGGGTTCGCAAATAAGAATCATATATACACTATTTAACTTCATTTATTTCTTCATATACAAAAAT:1 - chr3R 23644939 5' - diver 140 2 73.29 ATTGACTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGAC:1 - chr3L 9318110 5' + P-element 2859 1 68.49 GGTTGGGTTTTATGGGTAAACTAACAATTTGATATCTTATTATAAATTTGAAATTAACGTAATACAATCTTAACCTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTT:1 + chr3L 7024433 5' + 412 47 2 51.39 GAGCACCTTATTGCATTTCAAGTTAGATAACACAGTCTTCGACTAGCTCTTGTCGAACGCGGTTGTAAAAATTGAACGCTGCGATCGTTATCTTCTATTCTCTCTGAGAACATTTTGGTGTACATTAAATATTTTCTGTTTTCTT:1 + chr3R 20841403 5' + Juan 73 1 65.52 GACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAGT:1 - chrX 21668429 5' + Stalker2 7271 2 68.49 GTCTAATAAATAATAAGGCTGTTTGATTAATAAAAAAAAAACAGGTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTT:1 + chrX 16998314 5' + diver 5968 2 71.23 CGTTGGGGAAATACGCGTTCTTTAAAAATCCATTTAGTTAATCACTTCCTAGTGTGTACAAGTTAACACGAGCAAGTCAGAGGGGTGCGACGACCCGCCGAAATGCCATCCAAGACCGGATGGACCAACAATAACATCGGCGACGC:1 + chr3R 12146647 5' + gypsy10 65 2 59.59 TTGAAATTGACTTTAGGCGTTCGCTTGATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGATGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTT:1 - chr3L 9318115 5' + P-element 2853 1 72.41 ATTTGTTAATTAAAATTATACAAACAATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGTCTCTTTTATTTTTGATCTGTCCTTTAGCTTCGTCTAACCGCGACTGACTCCGCGCTCTCTGCAGAGTGGC:1 - chr3L 22257815 5' - mdg3 5401 2 76.71 TTTAAATGTTGAACTGGTTAAGCATGTTACTAGGTTGTTAGTAATTTGTAGCTACATGTTTAAGAACCCCTGACTGACTTTAGCATATATTTTTTTTTTCATTGGGTT:1 + chrX 10539288 5' + Transib-N1_DM 69 1 58.33 CGTATTGATTCTTCGATTTGTCCTTAGTTATACCCCCATTTCTGCAAGTGTATGTTTTTTTGTATGCCTGGCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGCATGCAAATTTGAAGTATT:1 - 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Tirant 8504 2 79.67 AGTAGCGCTCTAATCGATGTTCATTCATCGTCCGCGACATGAAAGTTACCCTTTGCCACCACCGCCAGCCAAAAACTATAACTACTCTATTGTAATGATGAACTCCAATTAAGAACACAAGTCCGCTTTAAGTTGAAG:1 + chr2L 17019047 5' - 412 467 2 65.22 TTAAGTGAAAGTAGCGCACAGGCAGTGAAGGAACTTTTACCCGACTGTCTCAAGATTATTGCTTTGCTCTACGTTTTTCGTGTTTTCCTTTCCGTTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTT:1 - chr3R 9298598 5' - hopper 1409 2 76.61 TTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGG:1 - chr2L 5728941 5' + roo 8740 2 72.41 AGTTGCATATATATTATAGAATGCTCCTCTTCATTTTTATTCATGAATTTGAATACTATGTTGAGAAAGATCGTATATTTTTTGTTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTG:1 - chr2R 952662 5' + copia 4907 2 48.63 GAAGTTTCCCTTATTCAATTTGGTAGTTTGTGCTGAAGTTCCCTCTTTCAGAACTTCTGACGCAACTCTTGCAGTACGTTCGATTTTCGTTCGTTTATTTATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGG:1 + chr2R 9341504 5' + roo 8688 2 49.32 ATCCACATTTGTCTTTATACATTTAACGTTATACGTTAAATATAACATAACAGGTATTAGGTAATAGGCCTTATATTTTCTAAAGTATAAATTTTTTCAAAATTCTAAAGGGTGGGCAAACGTGGGCAAACGATGTTATTGCGATT:1 + chr3L 20189606 5' - 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chr2R 4915973 5' + G7 841 1 75.76 GTTATTTCCGGTTTCTTTTCTATTGTTTTTATTTAATTTTCCAATTGTTATTGTATCACAAATGTTATAGTGGTCTGAAATATTTAATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGAC:1 + chr2L 11523018 5' - HMS-Beagle 7016 2 65.00 AGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTT:1 + chr3L 18216473 5' + 297 6634 2 60.00 AGTGCCAAAGTCTTGCTACTGAATGTTGCTGGCAGCGCAGTCGCGTCGCTGCCCGAGTTACCACCCCACCCCCCAAACCCCCAC:1 - chr2L 20852533 5' + Tirant 10 2 65.48 GACAAAGTACGACTAATATCGGATCTCAGGAACTTCGGTTCTGCCGGCAGCTATTCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAG:1 + chrX 19662960 5' - P-element 2841 1 45.24 CCAAAAACTGGGTGGCGATGGACGAAGGTTCCTTCAATGCAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTA:1 - chr3R 10737093 5' + F-element 23 1 70.54 ATTGTTATGTGTTTATCATCGACTAACCAAACATCCCCAAAAGCGATGTGTATCTTGTGCTAATTCGTACTATATACATCTACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCA:1 - chr3R 5704227 5' + 412 7094 2 57.93 TAATTTCATTTTATCTAAAATATGCAAACCGTTGGAGATTAGGAGAAAAATATAAATATTATATTAATGGATGGCTAAAGAATATGATATTCCATATGATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCA:1 - chr4 373094 5' + pogo 23 1 68.28 ACTGCTTATGGTCACACCAAAAAGATAACAGAAATGTTACGAGAGATTAGAGTTCAGTGATGGCTAACGTACAAGTGTGTGGCGCCCAGACTGAAGCCCGGTCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGAC:1 - chr3R 10144480 5' + Chimpo 41 1 55.40 GAAAAGTAATTTAGAAGTTGTGCGCACTTTTTGGCTTTAAAGTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAGCTTGGTTCAACAGCGACTGCCTG:1 + chr2R 14072523 5' - mdg3 170 2 68.35 GAAACAAGGTTTTAAAAGCGGATTGCAAAAAGTGTTGCATACTTTCAAGGGTTCTCTGATTTTCCGACTTATTTGTGCAGGGAACTGATTTATAAATCTATCAATGCTAGAACAAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTT:1 - chr3R 29288832 5' + BS 5006 1 73.97 ACTTTTGGGCGCCCATTTGACGGGCGGCTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATAAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACGTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTAT:1 - chr3L 965473 5' - jockey 4933 1 70.91 ACTAAAGTTTCGCCTGTGTTAGTGCCAGTTGCTCTTATTGGTGTGAATGGAGTTCGTTTTTTACAGCACAATTTTATAGTTGTTCCTTTTTTTTTTTGTGTCTTTTTTTATTTTTTTTTT:1 - chrX 9299981 5' - Doc2-element 258 4 77.50 ACGATTTTTTATTCCCTTTTTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATGGCATAAATAA:1 - chr3R 19514337 5' + blood 54 2 53.47 TCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTG:1 + chr2L 23310608 5' + 1360 46 1 52.74 TGATATATGAGCCGGCTGTGCTGAGTATCTGGAGTGCCGGGCAGATGATCGAAGTGGAAACGGAAACAGAAACATAAACATTTTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTG:1 - chr2L 2057923 5' - 412 452 2 56.85 ACAATATGATGTACAGTGTCCAAAAATTGGCACATGTAATGTAGAGATAATGTAGAAATACAGTATGTATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGAAAAGCCGCATACGTAAACAATAA:1 + chr3R 27547623 5' + 17.6 51 1 56.85 CAGCATAATCGTCTATTCGAATCAGCTATGATTTGGGTGCATAATTTTGTATAGTTTTCATATATATAGTTAAATAGATTTTAATTGAGCCGAACAAATGATCCGTATTTAAACTAAGATCAACGCTGAAAGTTAAATAGTTTT:1 + chr3R 10736024 5' - McClintock 423 2 57.64 TCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGA:1 - chr3R 13254979 5' + roo 55 2 68.29 TGATCAGCACCGTAAAAATTAATTGCTCAGTATACAAATTGGAGTCGCGATCGAACACTCAACGAGTGCAGACGTGCCTACGGACCGACGGCAAGTTATTTTCGTGCTCAAAGTCCCGCTACTCTAAAACCGCTACGTAA:1 - chr3R 30955385 5' + G-element 79 1 72.14 AAATTACTTATCGTTTTAGAAAGTTTGTATCAAAACTTTTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTTTCTGTTTATGCACGCAGTTAG:1 + chr2L 10909516 5' + 412 86 2 73.29 AGAGGCAGAAATAAAGGGGGGATTTAAAAACAATGTTGTTCACGCCAGAAGGGCGCAAACAGTTGAGCGGCAGTGTAAGCGGCCAATGCTTGTACTCGAAGCTCCTCCACGGCTCG:1 + chr2L 7633387 5' + Max-element 59 2 74.14 CGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTT:1 + chr3R 20752874 5' - 1360 3343 1 52.82 ATTAGAAATTAGAAAAATTCTGTTCCTTCTCATGTGTTAGGCAGGGCACAGAACAACCAGCTTCAGCGTGCAGTGTGTTTAGCTATTGAGCTTTTTCAATAGCTGTTGCGAATAATAAATAGCCGAAGAAAGTTTGTTTATTTTAC:1 + chr2R 1320668 5' - diver2 315 2 48.63 CTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGC:1 + chr3L 12227751 5' + opus 138 4 65.47 GAAAAGAAACTCAGCATTAATATTTGCCAGAAACAATTTTTTTTTATAAAAAATCATATCGAAAAGCAAAATTTTGTATTAAAGACTTTTTGACGATTTTTTTTTTACTTTTTTTTTTAA:1 - chr2L 5466925 5' + hopper 151 4 84.17 CGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACGGCCA:1 - chr3L 27391431 5' - 1360 3375 1 68.28 AATCCCACTAGTATAAAACAGCTGATCCCCAGACAAAGACAACGATGACTATTACATGATGACTACGCCATCCAGATGTGGGGAACTGCCGCCAA:1 - chr2L 21403549 5' + G5 4400 1 52.63 ACAGGTTGTACAGAATTGTACGATCAGAAAGAACAAGTTTTCAGTAGCTAAGCTTTATAAATTATTTAGAACACCATTTTGCACTACTTGCTAATAAGATACACACTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTC:1 + chr3L 18216428 5' + 297 14 2 76.71 CACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTC:1 - chr3R 19950518 5' - BS 5017 1 67.81 TTTGGATACAGCCTTGCATTAATAAAAGTATCTTTTGAATCTTAAGCATTCCTACTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATA:2 - chr3R 5870890 5' + roo 8734 2 68.49 TTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTC:1 - chr2R 18931913 5' + blood 59 2 58.99 AATTTTTGCTTTTTGGTTTTAAATTTTGTTTTTCCTTCGCTTTGCTTTGCTTCCGTTTTTATATATATTTTTCAAATTTAAATTCCTGTAAACATATTTTGTTACAATGATCTGATCGGGTTTTTCTGGGTTTTCCCCGTATCCTC:1 - chr3R 25601097 5' + copia 4733 1 62.33 TTAGCTGCTCACGAAGCTTATCTGTATAGATAAATCTGATGCGTAATTGTGCAATTTAGGTGCTGCTGGCGGCTGCGAGACCCGACATACTCCTAACGTTGGAAGCGTTACATTCAACCCCATCCTCACGGCGAAGCAGACACAGC:1 - chr3R 2689474 5' - diver2 4474 1 75.34 TGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACGTCAGCAGTCAAACTTCACTG:1 + chr3R 5164950 5' - invader4 246 2 76.47 GCGAAAATAACACAAAAATAGCCATATATTATTTTTGCTCAATCAAATAAATTCCACTGCAAGTGCGTATGTGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - chr3L 17012051 5' - 1360 3340 1 52.45 GCGTGTGTATGTGTTGGCTTATTTATCTTTCGTTTCTTTTTTTTCAATTGGCGCGAAATCCATATCAAGGTGTTTGGAGTAGTCAAAATAATAAACATTGGCTAGGGAGTAGAAAGTAAATTTGTATAATTAACGATAAG:1 + chr3R 2239379 5' + invader2 4733 1 71.43 TTCTGTTTATATGTGTTTAGTTGTTAATGCTTCTTAATTTTATTTCGCATACCGAATCATTTAAATTAACTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACACC:1 + chr3R 25597828 5' + copia 55 2 58.22 AATGAATAAGCAAATATGATATTTAAATCTGAATTATTATATTGTGTCATTTGAATCTAAATTATAGCTATTACGCAATTAAATATTTATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAATTCTAA:1 - chr3R 31114392 5' - flea 4978 2 58.90 ATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAG:1 + chr3R 8112716 5' + Burdock 6186 2 62.90 GTCTGGGCCTAAAAATAATGCTAAAATTCTAACTTATTGTACATAATTCCTTTCAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCCCAC:1 + chrX 13789539 5' + FB 67 1 65.73 GTCAAAAATTGTTTAAATTTGACTATTTTGGTTATTAAAGTAAGTTTAAAAACATAATGATTTAAAACATTCAAAAAGAACTGGACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTATGCCAGAGATATCGAACGCGATC:1 + chr2R 4887630 5' + jockey2 3015 1 71.72 AAAAGTCACTATTCACCACATCTAGCCAGTGCACATAAATACTTCCAATATAGCTAGAAGCCTAAGATTTCGTTTTAGGCAAAGATTTTTGAGATTGGGGCCCTCCAGCCCCATTTTTTCGGCAAACAATATATTCCTTCCCCC:1 + chr3L 23773902 5' - Transib5 2831 1 67.36 AATGAAACTCAAAGCCAACTAAACCAGCAAAAACCAGAAGCCAACATCCCTTAGAGCAATAGATGGACATGTGCTGCGAATTCCAAATGTCAGAAGCCCTGTACGTACATATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATT:1 - chr2R 14532115 5' - invader4 314 2 78.08 ATGAATTTTAATATGTAAGTATGAAAAGCCTTTTCCAAAGACTCAAAACGGAACACTCAGCTGGCAAAGGGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCC:1 + chr3L 18846946 5' - 1360 3350 1 52.67 AGTCTTAGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGACCAAGA:1 - chr3L 11826432 5' - INE-1 88 1 66.44 TATGTATGGACATTTGTACAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAAGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACA:1 + chr2R 22796777 5' - jockey 4927 1 64.38 TTGCGCATCTTATTTGTCGTGCGATTGTCGAGCGATATCTCAAACATCGATTAGATATCGATAAGGAAAACCCTAATCGCTTTTAAACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTAC:1 - chr3L 21771037 5' + hobo 9 1 74.36 TCTTATTCGGGTGTCACTCGTTTTAATCTCACTGTTCGGTTCCTGATTCTGATATCCTGGCAACAGGATGATCATTGCTCTGAGTCGCGCTAATCGCCTAATGAAGCCAAAGCACTTTTATTTATTTATTCATTTTTTTTTTCGCT:1 + chrX 2377821 5' - invader2 296 1 60.27 AGAGAATGTGAATATAATGTATGAAACTACTTATTTTACACACTCTTAAGTGAATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATTG:1 + chr3R 13868855 5' - HMS-Beagle 246 1 78.62 GATAAAAAAAACAGTTTGGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTTACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAA:1 + chr3R 23644869 5' + diver 66 2 58.22 AATTTTCAGGGTACTGTAATCGAGTGATATGCGTCATCGCATATAGTTATGTGGAAGGTTGATAGGGCCTTCCGAGCAGAGACCGTTGTGTCCAAAAGATCGTTGCCTCCAGAAACGACTTCGT:1 + chr3R 31198571 5' - Transpac 251 2 72.58 GAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATA:1 - chr3L 27415296 5' + transib2 80 1 71.92 GAGAAGGACGAAAATGTTGGCGACTGAAAACGGCTAAAAACTCGCGGTAATTTGAACCTTTTTCCGTTTGGGTGATTTCTGCCATTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCA:1 - chr3R 6584898 5' + transib2 32 1 63.57 TTCCGACTCATTACAAGGCAAAATGCGGTAATTAGCGAAAAAAAAAGTATTAAAAAATGCTTTAAAATATTGCAAAACAAACTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATA:1 - chr3L 4547795 5' + mdg3 43 2 54.79 CTGGTAAAAAAGGAAAAACTGTGAATTATAAATTAAAAATGAGCCAAGTTTAAAGCAAAAAAAAAAGTTTATATATATACATGTAAGATTGTTTATTATTATTGTTTATTATTAATTTAATTATTAGTTTAAT:1 - chr2L 17957290 5' - flea 224 2 58.65 GTGGTATGGGAAATTATTGCAATATTAAAACATTTCCATGTGTATCTACACATCTTTCGAAGATGCCTTACGCTTCCTTGTAAATATTATCTAATAGCAGGTTACCTTTTTTTCCTATGTATCTACATATACATATGTAT:1 - chr3L 19462740 5' - Stalker2 252 2 60.71 ATCAAAGCCACAGCATCATTATCTCTGCATTAGCTGTAGAGGCAGAAAAAAAAAGAAATAGTGCCCGAAGAACAAAGACGCGCAAAAAAAGAACTTTAAAAGCAGGCTTCAATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGT:1 + chr2R 19805366 5' + F-element 27 1 73.29 ATCTTAGTATTTGAAATATTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCAGTGGAAACGGATACAGTCTCATTAAGTTAAGACTTGAGGATTAATTTCCCATCCCAACTCACACTAATAACGTTATTATTATTTGAAAATAGATT:1 - chr2R 4206653 5' + 1360 317 1 73.19 TAATTAACTGTGAATGGGGCAACACATTTGGGGGATGCTCCGAAAATCCAGCTGGTGGCAAGGGAGGGCAAGGAACATTTCACACACGTGTAAACTCAACAAAATTGGAACGTAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACT:1 + chr3R 30087622 5' - roo 401 1 57.53 TTGTGGCTAAAACGGCTTCATCGAAGTATTGTATATACTGCTTGTATTGGGGCTTTTCAATGTATGTAATATCATACAAATCAATTAATAAATATGCAATATGTAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCAC:1 + chr2L 18311385 5' + opus 7022 2 72.41 CCCATGAAATATTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTACGCC:1 - chr3L 13779429 5' + I-element 47 1 52.74 TGACGAAACGTAAAAATAAGCCTCAATCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACT:1 - chr3L 23219281 5' - 1360 3347 1 81.11 ATGACAAGGGATTCAAAGTGCAGTAAATTTGTTCGGAATGGAAAACTGTGACCAAGTCTCTGAATTTTCCTTTTCCAGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTGGTAAGAAACTGATTTTATTTGGATAT:1 + chr2L 2241203 5' - roo 9026 1 54.11 GAAAATATTGGGAATATATTAGGGATATTATATTGTCGAGATTCGGAATATACTTCGGCAATTTGAAATCCAATTTGATAATACCAAAGACACTAGAATAACACGATGCGTATCGCCATACGATTTTTTGGCACAC:1 - chr2L 12158888 5' + 1360 31 1 50.74 GATACAGTAATCTACTTAGGACATGGTTAATACAGACCAAGATGTATAAGTTGTATGGGTTCCAAAACCCATTAGCAGCTTCCTTTACGCCTGCACTTCTTTATAAAAATAATAAAAAAAAAAA:1 + chr2R 18392169 5' + BS 5094 11 87.90 AACATTTTGAATTATCGTTTAGCAAATGGTCAATATTTTCCACTACTCCTTCTGCCTCGATGTTGTGGCACACATAAATTGTACGACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTACGAAACTGATTTTAT:1 + chr3L 13285558 5' - roo 9034 1 59.59 AGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGATACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAAC:1 - chr2L 12236828 5' + jockey 72 1 63.12 GGGTACTGGGAGAAAACATCAGTGCTTACTCGGAGGAAGAACTAGGTTTTATAGGACTAATCTATTGTAGGTGTAACATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCG:1 + chr3R 5870791 5' - roo 9019 2 53.10 AGGCAACTCCAGATGCAACTCCCAACTCTACCACCCAACCACCCAGGTGGTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCCCCTTTTTAT:1 - chr3L 23496662 5' - blood 7330 1 62.60 GCTGTTAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTCACAAACAGTTGCTTGTGCAGT:1 + chr3L 11684811 5' + Bari1 50 1 53.57 TCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTT:1 - chr3R 8197877 5' - pogo 2039 1 63.01 GTTATTTATGTGTATGGTTTTACGAAAATACGAATGATCATTACAATCCGTATGCTGGATCTTCCATCTTTTATATTTTTTATTGATCCATATCAAGGATATATCTACTATATATAGTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACAT:1 - chr2R 18487359 5' - INE-1 30 1 51.37 GGCCCTCCCACATTATTTGAGCCACAGCCCCACGGGGCTTTGGTCATTCGTTTGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATC:1 - chrX 683612 5' + jockey 62 1 60.83 CAACCCACCTTCTCTGCCACATGCTCATCCTTCCTGCCTCCTGCACATTCTGCTGAATTCTCGGTCTCCATTGCCGTTAATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCG:1 + chr3R 24072016 5' + jockey 33 1 66.67 ATAAGACTGTCAATATATTTTCCTATTCATAATAACATAAAAAAACCCTAAATATCTGAGACAATAATAAACATTTAATGCTGCGTTTCCCACTTTTAAAACCTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCAT:1 + chr3L 9695882 5' + 297 6598 2 73.97 CCTTAAAGTCGGCTTCGTTCGCTCGCGAACTCACCACGCCCCGAAACGAACGGTAAATCCGAGCGCTGGCAATCCGAGGCGTCGATTGTGGGTCTGTGGCATGATGCAATAACATAAGGCGGTCCCGTCGGCAAGAGACATC:1 - chr2R 23444085 5' - P-element 2865 1 69.72 GCAGGGGCTTGCAGCACTAATGAACATTTTATTACAAAAGTTTGTTCGCTGGATGAGGAGCGAAAACTTGTGCAAGTTGCACTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTAT:1 - chr3L 1459900 5' + 412 37 2 58.57 TTTTGCTTTTTATTTCTTTTTTTGTTTTTGGCCCCCTTGGCGTGTGTTTTTTAGACAGCCACGCCCCCCTCAGCCAAAAACTCGCACAACTGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTG:1 - chrX 7061941 5' + 1731 4347 2 50.00 CGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGGACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATG:1 + chr3L 2532464 5' + blood 57 2 74.78 ATATGGAAATATTTTACACAATTTGAAAATTTAGCCAGTCACATACCAAGCGTATTAACAAATGTGTACCTCAACTTTAAGGTATATCACTGCTGTTAAACTATTGCTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAA:1 + chrX 11232464 5' + roo 8682 2 69.86 AAACATTTCTACAAAGTATATTTTTATTTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATAT:1 - chr3L 14422843 5' - roo 9024 2 52.05 TACAAAAGTGTAGCATACATTGCAGCGTTTTTGTTGCCAGCACACCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAAAAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGCTGTATTTTAGTATTAGTATATTGGAAATACTTTAAAC:1 + chr2R 12492430 5' - hopper2 1528 1 69.18 TTGATGGAGATGTGTGGCAAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTGGCTCCGACAGAAGCCCCGCTAC:1 - chr2L 7921010 5' + F-element 396 1 59.66 AGTGATATCTAATTCAACCTATTTAGGAACTATAAAAGAAACCCACCCCCCTTCTAAGATTCTACTCCAAATTACACTTTCTTCCAATTAAAAGTAAACGACAGACCGCGTTCTTGCTCTCCCTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAA:1 + chr2L 8284323 5' + Doc 397 1 67.12 TCATACAATAATAATTAATAATTTTAATAAACTCTTATTAAACAAGCTATAATAAACTCTACATAAATATAATTATTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATA:1 - chrX 22564522 5' - 412 7500 2 52.05 AAAACTCTATAGTATTCCCTGTATCTTGCTATTATTTTATTAATTCTTTTAAAGACTTAATATTATTTTCTGCTCACGATATTTTCCTTCCGTTTAGTTGTCCTTTAATTTTATTAAAGAAATTATTTTATTTAATTGACTAGCG:1 - chr3R 904671 5' - jockey2 3374 1 42.76 AGGTGGAACCAAAGAGCGCAGCTGGCAATCATCGACAGCGACAAAATCTATTATGCAAAGGCAACACAAAATTAAGGAACGCGAATGAAAAACCGCAAAGCAAACATGAAAAGCGCGCGAGTTACCACCCCACCCCCTCAACCCCC:1 + chr3L 18183029 5' + Tirant 8115 2 80.82 ACCAATGAAGTAAAATTGAAAACAAAAACATTGATTTACAACACACAACAAACAAATCTCTCGTTATCTCGAAAGAGAGCGCCCTAAACGGCCCTCCTTCAACTTATTTATTCTGTTTATAAATTTATATATATATTTATCAA:1 + chrX 11923050 5' + copia 4662 1 72.03 CTTAAATACAAATAAAGGGCTTAAATCTGATTAAAAGTATTATTTATATCTATTAGATGGATAGATCTTAAAGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGCAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGC:1 - 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chr4 868726 5' - roo 336 2 67.81 CCTGCTTCAGTTGGCCATATTTTAATGGGTCTTTTCGGCCATTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACNTTGGAAATACGNTAAACT:1 - chr3R 8050525 5' - hopper 1334 1 71.92 AATCGTCAAGGTGCCCTTGTACGCGTTTGACTCTGCTATACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTT:1 - chr3L 23182027 5' - 1360 3344 1 71.03 ATAAATTTTATATTTCTTTCATATAATAATATGAATCCATTTTGTATTATACCGTAACGATATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAAT:1 - chrX 23431580 5' - roo 9011 2 61.38 TGCTATTGTGCAGAAAACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCTGTGTTAGAGCCCACGCTCGGGCACATCTGCCTATCTTGAGCGGCGAGGACCTTATCTGTGGTCTCCCACTAAGGGACTATTTTAGGAGGCGGGGAACGA:1 - chr3L 11535882 5' - roo 8844 2 61.64 ATCGGCGCTCGTCATTGAGGCAGTCAGTGCGGTCTACATTTATAGCAAGCTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACA:1 + chr3R 29283149 5' - hopper 1387 1 67.12 CAATTCACATCCGCTAGTTGTATATATATATTCAACAATATTCCCAGCGCGCTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAG:1 + chr3L 25483063 5' + transib2 65 1 61.19 AAAGGGTTGCGCTCCATTTCGTTACGTTCGTTGCGTATGTGGCGCTGCAAAGTATGCTACACTTTAAGTTTTAATGGGCAATTGCCCCTCTATGTCGCTGTTGTTGGTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGG:1 + chr3L 17181392 5' + jockey 15 1 75.36 CAGTTACAAACTATCGTCCAGTACCTCAATGGTCTTACAGTTTAGGTACGTTTGGAATAGAATATTAAAAAAGTATTTAAGGAAATAGGATTCGGCATTCCACAGTCTTCGGGTGGAGACGTGTTTCTTTCAAGCTACG:1 + chr3R 15003092 5' + Doc 32 1 64.03 CTGCCAGCACTCCGATCTGTATGGGATGCCATGCGATGCGTTGATTATGATAATAAATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTT:1 + chr2L 2057808 5' + 412 60 2 61.15 GATTAATTACCATTGTATTTAAATTCAGCCATGAAGGCATAGCATGTGTGGGTGTGTGCGGTGATTTTATGGGGTATTACATGATGAAATAACAAGCATACGTTAAGAGGATGTCGCTTGCCGAC:1 - 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hopper2 1566 2 45.83 AGTAGTCAAGTAAAAGAACTGACGTAATGTGTTATTCGATCGCCGACGCGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAACTAAATAAAAAATCTGAA:1 - chr2R 17350570 5' + F-element 97 1 76.81 GTATCTTTGCAAACTTAGGCACAGATGGATAATTTGAAGTAAATGTGGCTGTAAAATCCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAAT:1 - chr3L 10897525 5' - roo 8996 2 69.86 TAAACAAAGCTAATGAAAAATGTATAAGAGGCGGAATGCGAGATGAAGGATGCAGGATTCATCACCGCGATATTCGAACCAAAGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTATTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATC:1 - chr3L 27415335 5' + transib2 39 1 58.33 CCGGGAAACCGAATGCGGCAGTGGCTAAGATAAGCGCTAAAAGGCATAAACGGAATGGCCAAACATTTGACTGATAAGTTCCGCTGATAAGGGCATTCACAATGTGTACGAACCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCAC:1 + chr3R 13259773 5' + hobo 12 1 76.03 ATGTACATCCATATGTACATACATTTAGCTGTTAATTGCGAACTTTTGATCTGTAGCTTCGATTTCGTCACAGGGCACTTATGCATTAATGAACATACAGTCATGGTCAAAATTATTTTCACAAAGTGCATTTTTGTGCATGGGTC:1 - chr3L 10224603 5' + Bari1 29 1 65.07 TCCGTTTCTAAAATTGGTCGTATCGCTATAAGAAATGTTCATCGTTTGCATTTGCGTAAGGCACAACCTTTTACTCCTACCCGTGCAAAGGGTATTATTATTATCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 - chr2R 5179713 5' + 1360 21 1 73.29 ATATTCCTTTGCGTAGGTATTGCCCAGAAATGATTTGGACATAATGCATTTAATTGTAAAATTTTTTAACCTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATC:1 - chr3L 6131938 5' + roo 53 2 56.16 TGTATGGACATTTGTACAATGTACATTGTACATACGAGTAGATATTTTTTTCAGCGTATTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCAAGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTATTTTATTTTACAAT:1 + chr2R 22796779 5' - jockey 4925 1 65.75 TGATGGAGATGTGTGGCAAGGAAAAACTTTTGCCTCACAGGCGTCTCTCTCCCAACAAATCAAGAAAGAGCGCGCTCCTGCTCTCCCGCTCTATTAGATCCAACAGAAGCCCCGCTACCTCCAACAACAACAGCT:1 - chr2L 7921009 5' + F-element 413 1 60.74 GTGATATATTATTAATAATTTACACAGTATTGTTTGGGAGTGACCCAGATCAATTCGTCTATATACCAACGCGCTGAGCACAATGTAGAACAATGGGGAAACACCTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAA:2 - chr2R 23095010 5' + 412 20 2 69.86 TCTGTTTCAATTGGAAGAGGGCTCCGTTAGTTGTTGGTTTCCAGTTCGTGTCGGCCCCGTATTTATAGGAAGATCCGTACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTT:1 - chr2L 14616282 5' - P-element 2849 1 57.55 TAAAAGGGTATATTCGATTCGTTCAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATAGAGTGTATATATTCTTGATCAATAGCCAAGTTGAGATCTCAGAAAGTATAAAGGGTAGAAGGTTGAGATTCACCATACAG:2 + chrX 14957087 5' + INE-1 174 1 84.93 AAAAAATAAATTTCTAAGTATGTGCACAAAAAGAGCCGCATGCATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAATTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTTAGGAGAAATAGTTT:1 - chr3L 9696011 5' - 297 6897 2 74.66 TTGAACTCAAGACAAGTTCATATACCCAAACGTAGCTATCTCGAAACATTATAATCGTCTGGAATCTGTTTAGATAGACACCACAAGCGGTCACTTAAAAGTTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGC:1 + chr2L 18525560 5' + pogo 16 1 74.31 AGCTACTTATTGCAATTTCAGCCACACACATACATATACATATATAGTGACGTATTCACGCCAACTCATCACGCTCAGTTAATTGAATATTCGCGCCACCCAAACTGGGCCGCTCTTGTAAACGGATTCCCAAGCTCTCCTCAACG:1 + chr2L 20407787 5' + McClintock 6032 2 76.03 AAAAATACATTTCCACAGGTGCAGAATTTTCATCCTCCTCTCACTGGCATTGGTGTCAGCGCGAGTTACGGGTGCCTCCGTTGGATCGGGGGTCCTCCTTTCTCTACTC:1 - chr2L 23084411 5' - accord 7359 2 57.80 CATCTGCACTTTACTGATAAGAATGCAATTCCAAGATAAAGCGCACATATGTAAATATAAATTGATTTGAGTAAACATATATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGT:1 + chr3R 15283616 5' + BS 5038 1 54.79 AAATATTCCCTATTTTCGCCAACTTGATACTATGAAGCTTCTGCAGCTTGAGAAATAGTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTT:1 - chr2L 5728988 5' + roo 22 2 69.57 AATAAATAGAGCCAAAAAAAAACAGTAAAAAATTGTGGTATCCTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGACTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGCGACATG:1 + chr2L 7929527 5' - roo 9001 2 66.67 CTATATTCAGCATGTAGGGTTCTTTTCTTTAACAAAACAATTAGCGCTCAATTAAGCTAAGGTCGCAGCCCAACTCTATATCAATCTAATTGACATTCAATTTTGAGACCATTGTGCTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACAC:1 + chr2R 7314578 5' + blood 8 2 76.03 TTTGTCACAGCCTCCGGCATGTGCGTACATATATAAATGAATACATGTACATAAGTATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCAGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAA:1 - chr3L 27350105 5' - 297 346 2 65.89 CCACTAATTTGAAGCTAAATGACAAATCCAAACGGATTCCATAAAATTGAACAGCTTAACTTAACAGTATGGGTGCCAAATCTGGGGCTTAGCCTGCGACAGCCACATCAAAAGGATCCAGGCTATTCA:1 - chrX 3330405 5' + X-element 4279 1 49.61 AATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATG:1 + chr3L 11535872 5' + roo 43 2 54.79 CTCCCCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTC:1 + chr3R 14608680 5' + jockey 32 1 64.52 TAATTTTAATAAACTCTTATTAAACAAGCTATAATAAACTCTACATAAATATAATTATTGTGTAATGATGAACTCCCATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTC:1 - chrX 22564504 5' - 412 429 2 63.70 TGAAAAGTTGATATTACGATTTTGTGCTGCATACTTTCGGGCTTTAAAGTTTCCGAATGACTTTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAA:1 - chr3R 11568681 5' - BS 5035 1 58.22 AAAAACCGTAGCATACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAA:1 + chr2R 22523159 5' + jockey 70 1 61.43 TGTGGTGGCTACTGTAACGAACTGATTTTCTATGTCTGCTTGCAACGGCTAGCTCAGAGAGTGTGTGCTGTAGGATATACGAACATAATAACAATAATAATAACAATAATAATAA:1 + chr3L 27186396 5' + mdg1 26 2 59.13 ACAACGACTATAAAATTGTACACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATA:2 - chrX 21668434 5' + Stalker2 18 2 71.92 CTTCCAATTAAAAAATGACCTGGTGTTAAAACTTCTAGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAGATGAATCGAGA:1 - chr3R 19447748 5' + roo 57 2 58.99 GTTGAAACTATTGTTTACATTTAGACAACTAATTCATTTATGATATTATGGGATCCGAAGTATCCATTGCTCTGTAAAAGACATATGCGAAGCTACTAATAGTTTTTGCCGTGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCT:1 + chr3R 25802032 5' + hopper 435 1 71.92 CCTTTCTTCCAGCAATTCAATGAAAATGTAGGGACAGCAAAACTTTTTATAATAATGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCG:1 - chr3R 19514323 5' + blood 7081 2 65.07 CGGGGTGGTGGCAGCTTTCACAAAAGCGTCTAAACTAATCAACAGGAGCAGCTTGTTTGTTGCCCTGCCTGCCAACTGAATTAAATATGAGTGTTTATAAATAAAACCGCCAGTGTTACTGTTAATTTTCATTTATTGGTTAAGTT:1 - chrX 3921755 5' - 3S18 307 2 64.38 TTCATAGGAATATCTAGAGCATATATAATGCATTGTTTACGTTAAATCGTACAAACATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTCAGGACTCACCAGCGCTCGGCTCTCGTGTTTTCGGGCCCCGTCAGCAGGCGACTC:1 - chr3L 2167691 5' + opus 64 4 67.12 AACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGAC:1 + chr2L 310095 5' - P-element 2790 1 19.31 GGATGAGTAATCGAAACTAATTGGATATGTTTTATTAAAATAAGTTTTTACACCCTGCACGTTATGCAAAGATACAAGACCTTGGTTAGCCCAAAAATATGTTCATGTTCATTAATGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCAC:1 + chr2L 11475061 5' - jockey 4979 1 73.97 GGCAAAGTAAACAAAACTGAATAATATGATTAATGAGTTTAAGATATTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCATCGATAGTTAGCTGCATCGGCAAGATATCTGCATTATTTTTCCATTTTTTTGTGTGAATAGAAA:1 - chrX 8590781 5' + pogo 65 1 71.85 GTGAGCGGGCACTAACCTGCCTCAATCTCCACAGTGGCCGGTGCCGATGGGAACGGCTTTCACTTTCTCCGGCGCTCAGCTGCTGGTCCACAGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTC:1 + chr2R 23443921 5' + P-element 9 2 75.20 TGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGCATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAA:1 + chr3L 2532459 5' + blood 30 2 65.59 CAGGACAACGTGACAAATAAAATCAAGCTGGCTTTGAGCAGTGCACTATGGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGATCATATAA:1 + chr3L 19274810 5' + transib2 81 1 72.41 AAAAAATAACAAGCCAGTTGAAGGATTATACACATTCAAATAAAGAGATAAACATTTATTTTTTTATTTATTTTATTTGTGCTTTATCCCTTATATATATATGTACATTTCATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAG:1 + chr2R 10118984 5' - Juan 4151 1 61.11 AGATTTATAATAGTAGGTCATAACAACTAATGTGATTAGCTTTAGAGTTGTGGTGCTAATTCTGTAAGATGTTTAAAATAACCTGTGTACGTATGTACATATAAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCA:1 + chr2R 7720031 5' + HMS-Beagle 22 2 70.55 TGCCCACAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGA:1 - chr3L 24059285 5' - roo 9040 1 61.76 TAAGATCGGTAATTGTAAACTGGCTTACAAATTTTAATTAGACAGCTTAAGCTTAGTTTAGTTAAGCCAATTTAGTCAAAGCACTGTCGAATGTAAAAATAGAGTTGTTGAAGACTAAATGGTTTTAATGTAATTTTTTT:1 + chr3L 17206678 5' + transib4 26 1 72.86 TTTCAGATGTTTACATTCGGCGAGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTAT:1 - chrX 2300654 5' - P-element 2820 1 33.57 AAGCGGTGTCATGCCCACAATTTTTGGTGTTATATATGTAAGATATGGCCTAGTGTAACCCAATACAAAAACTGAAACAATATATCATTATCCGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACT:1 - chr3L 24059296 5' - roo 9042 1 62.07 TTGTACCGTTTGGCATTTCGAATTCGCCTGCAGGTTTTACTAGGCTTGTAATGTCTGTTTTTCAAGAGTTGGTCGCCAGAGGCATTGTAATACCAAAGACACTAGAATAACATGATACGTAACGCCATA:1 + chr2R 4193295 5' + 1360 15 1 70.54 ATGAAAATATCACAATACTCTAATAATATCGACTTCTGTTTTTAAGAGTTCTCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGTGCT:1 - chr3R 13255030 5' + roo 27 2 67.12 GAAACCAGAGCCAACTACATGCGAAACATGCAAAAAACTTGGCAACAAAAAAAAGCGGGTTCAAAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCA:1 + chrX 860782 5' + hobo 59 1 60.27 TGTTTGGTAATTGCTAAGAATATTTCTCCACCCTGTGATGTTAAGATACAATATTATGATGTACGGATTCTTCACTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTA:1 + chr2L 20165282 5' - copia 244 1 60.96 CATTAATGTTTCAGCCTGCATGCTGGCATTATAAATTCAAAAACTTGCCTTAGCCGGCAAGTCAAGGCTTAAATGGCCAAGGTAACACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGG:1 - chr3R 25580885 5' - 1360 3362 1 63.24 ACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGACCGATAAATTATATTTAGGATT:1 + chr2L 8120157 5' + roo 79 2 76.81 CCGAAAAGCATGCTGCATAACTTCCAAAAGTTGTGTAGTTAAAGGCATCGCCAGTATAGGGGCATTCGCATGTGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCG:1 + chr3R 19965218 5' + jockey 35 1 56.25 GTTCCACGCGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAGTGAGCGTGATATAAG:1 - chr3R 11284978 5' + blood 7090 2 71.92 GAGAGCGGGCGCAATGCAGCAAAACTTGGAGCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTG:1 + chr3L 13993475 5' - P-element 2794 1 21.38 GCGTAATTAAAAGTATGATAAGAATTTTGCATTTCTTATCTGTTATTTTTTTTCTTCTTTTTTTATCTGATCCAATAGCAGACTTATTATATAGTTTTCCGATAACGATAATTTTGAATTTCTCGACTATCAGATACCCGTTACTT:1 - chr2R 14871501 5' - INE-1 549 1 79.45 GGATCCGGTCGATTGTTATCTCTCTCTTGAAAAGTGTTTGGGAAACTAACTGATTGGTAATACGTTGTAGTTAATTGGAATTCCAATACTTCTGATGTAGTTATTAAAGTCTCAAAACGCAGTTGGTCATTTTATCTTTATTTGGT:1 + chr2R 1921413 5' - mdg1 7400 2 54.11 GCCTATAAATTAATGTAGGTTTTCAATCAGTTTTCTTTTCTTCTTTTCTTGTTGATGTTGAATATAGGCAATGCCCACATGTGTGTTGAATATAGGCCATTTGCACATGTGCATATGTAATTCTGTATGAGAACATACATACATAC:1 + chr3R 15727839 5' + 1731 70 2 63.01 AACTTCAATTCTTTATATAGCGCTCGAAAAAATACTCAGCTGGTGGAATAAGAGTTTTCGACTTAATTAAGTATATGTCGGCGAAACAGGAGTCTCATCCATATTATTTATTCACTTCGCGACTTTGTACGTCAGCGC:1 + chr3R 5164910 5' - invader4 3043 2 56.52 ATCAGTTCCAGGAGCATGTCCGTGGGCGACATCATCATTATCGCAGCAGGCAACCTGCATCAAAACTAGCAAAACGGATGTCACCCGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGA:1 - chrX 21223171 5' - roo 9046 1 42.96 TAATTATATATTAAAATGGTGTCGTTTTTACTGAATTGAGACATTTTTCCGTCACTGCAGTGCACTGTTATCAAGCTGCACCCTTCTTGCATTTGGCTTTTTTTTATATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCA:1 - chr3R 19950570 5' - BS 5069 1 67.12 TAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTGCTGCGAATTGTGGAGCTTGGGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGNCTCCGTTCATATCTTATGTAAATG:1 + chr3L 11535899 5' + roo 49 2 60.00 CCTTTACCTCTGGCAGGTCGCTCTGGGGGATGTATTTAAAATTAAAATTGACTCTGAACCTTTCACAAGATTGACAATCATGGGATTTCGGGAACTTCAATTTACTATATACATACTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTC:1 - chr2L 1045118 5' - mdg3 238 2 76.03 AAATTTCAAAGCAAAGCTCAAATCAAAGTATTTTCCAACGTGGAATGCATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTACCTA:1 + chr3R 8112714 5' + Burdock 6195 2 64.44 AGAGCAAACGACAAAAGCCGAGTCGCATAAGATAATGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATAACTCAAGTGAGCGTGATATAAGATCACCCA:1 + chr3R 24480483 5' + blood 87 2 75.34 TGCAATATATACAAATTACGAGTAATATTGATCAGTAAATTTATTAACCGTAACTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATAAATAGTCAAGTTTATGTTTGAGTTTTATGATTTATATTTTAAGTTATT:1 + chr3L 11904778 5' - copia 5054 2 65.07 TTATTAAGCCAAAGGAGAAGGAAATATACGAGGCAGATTTTTGAAAGGCTCTCGATGAGTCTCAAATTTATGACCTACAATCTGAAAAGCAATATATCCATAGCAAACAGTTGTAGTATATACGAACATAATAACAATAATAATAA:1 - chr2R 7895671 5' + mdg1 7052 2 76.03 TATATCTTTGTTAAATACCATTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGC:1 - chr3R 8197898 5' - pogo 2072 1 59.70 CGCCTTTTAGCCCGCTCTCGCCCAGATATAAATACGTAATGCATGTCAGTTTGGTTTTGCGCTTTGATTTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGA:1 - chr2R 12133851 5' + jockey 60 1 54.48 TTAATTTTTGTATTTACTTTGCCAACAACAATTTGACCACAACAACGATTTGCCAACAATTAGCAAAATGAGATGTCGGAAGATGTGAGGAACTATAAAAGCTAGAG:1 + chr4 555510 5' + INE-1 154 1 60.75 TAGAAACATTTAAATAAATCATAAGCGACAAGTTTTCCTAAGCAATCCCTAACTCACTGATAAATTCGTGACAATAAGCCCTCTCAACTAGGCCAACATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAA:1 + chrX 3533837 5' + 17.6 6947 1 72.60 TTTTTTTAATAAAATTATATGTCAACTTTCTTGATCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCA:1 - chr2R 8286825 5' + Burdock 24 2 64.38 ATGGAGTGCATTTTTATTCGTAGAAGATACATTATTTAGGATATATTTAAGTAGAGTTAAAGCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACGATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTG:1 + chr2L 21559261 5' + 1360 58 1 62.41 GGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCAACATCATTTCTG:1 + chr3L 9324426 5' + HMS-Beagle2 6916 2 60.84 TGTGGGAACATTTTTCTCTAATTCTGTGAAAAAAAAATCAGTCAAAATATTTTTTTTCAAAGCACTTATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAAT:1 + chr3L 27349998 5' + 297 38 2 51.52 TATAGCATCTATAGCTGCATATTGTATTCTTTACATTGCACATACATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTTGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAAAAATAGTTTTT:1 + chr3R 13423287 5' - 297 6911 2 74.26 ACTATTGAAAATTAATATTACTATTTATAAGAGCGTTGTTTATTTAAATAATCGTCTAAGCCATAAAAAAAGTTAAAACAGATATATTAATTTAATTGTGATTGTTGTAATTTATAATTTATATTTCCTTTCTTAATAAATAAATA:1 + chr3R 12764666 5' - copia 233 1 68.49 AGCAACTTTCACTAAAGTTGCCTGCGAAACTAGAGGAAGAAGTTAAAGTAGCGGATATTGGTAGCGGATCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTCGGTACTCTATGC:1 + chr3R 31159185 5' - hobo 2897 1 50.76 CACCGACAATGACATCCAGAATTACAACAACAAATAAAGTTGGGTTATACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTC:1 + chr2L 3892992 5' - 1360 3316 1 70.14 CGTACGGAAAAAGGTAGCCTCACATTTTGCGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGCATCCCTCAACTTCTCCTCCACAGGCAAAGTCCACCGATTTTTTTATGATGAATGGTGAAGTTCTTTCGAAAGAGTTGTTGTCATTTCTTT:1 - chr3L 5448903 5' - I-element 269 1 79.17 ACAACATAATATTGTGATTAGGCTAAAAGCTGTTTTCCATCGGGCGACTTACTATTTGGCTCCCAATCTATTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACTCTTTTATTTTGATCTGTCCTTTAG:1 - chrX 22835273 5' - mdg3 193 2 51.72 AACAGAAAGCTAGTTATTGAGTTTATTAACTATGCTCAAAGAAGCTTGATAATATTAATTAGAAATTTTATTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAA:1 - chr3R 11516616 5' + roo 8715 2 55.48 ACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATC:1 - chr2R 4816957 5' - blood 308 2 72.60 TAAAATCAAATTAACACACACACACACACAAAAGAGGTACTAGCCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGTTACTCGCCACGCACATCGCGGTTACTTACAAACAC:1 + chrX 15191371 5' + hobo 81 1 70.55 ACATTCCTCGTAATATGAACAAAAGCATTTCTATCGTCTTAAATATTTTTAATATTTCATCTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGGGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3R 31266102 5' + jockey 57 1 54.89 CACTTTCAGGACACCTTTTCCACTACTTTGGCATCAAAGTTTTTTTTTCCGGATCTGTTGAGGGTAACTTATTGGCTTTGCTTCGGTTAATAAAGTTGATTTTAAGTGGTTGGTACTGTGTAGTTAATTAGAATTCCAATACTTCT:1 + chr2R 7895465 5' - mdg1 7453 2 78.08 TCATATTTTAGGTAGGTAATAACTCACTGATAGTTTCAACAACAAGCAGTTACTCGACGACTAAGCTGCTTTGTAAAGTTCTAGTATAGAGCTATTGGTTTATTGCTTCTTAAATTATACATTCGATTTCGTACAGAGTTTCTTAA:1 + chr2L 1055459 5' - mdg3 5035 1 69.86 TCTGGTTGCGAGCAAATTTCATTGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGCTCCA:1 + chr3R 26854740 5' + jockey 64 1 52.74 TATGTGATGCAATTTGCTATGAACAAATTATGTGACAAAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAATTAGGTGCCATGAGAATCGCATCTTA:1 + chrX 5841929 5' - roo 323 2 73.29 ATATAGATATAATCGATACCTAACTTAATTATCTAAATTCGTTGCAGGTGTAAGCAAATTTATTATCGAGGCACTTCGATTTATTTGTATGACGATACTATAGCTCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGC:1 + chrX 13090996 5' - P-element 2875 1 74.64 TTAAGGGCTTAACAATATAAAAGTACAGATCGATACCCTGCCTATCAGCACCGAATTAATTAGCTAAGAACACAATATATATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTACATTAT:1 - chr2R 6801734 5' + 297 6601 2 68.50 TTTGTTTTATAGATAACTTCCTTAATTAAATATATATATAGTGACATATTCACATACAAAACCACATAACGTAGAGTAAACATATTGACAAGCCGCATC:1 - chr2R 13256041 5' + 17.6 6966 2 71.72 TCAGGCGCAAAATGCATTTTCCAGCGATCAATCTGCATATGCAGCCGCAGAGAATGAAAAACGTATCTCTATTCAGATAGCTAAATATTCGTAAATACATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATT:1 - chr2R 14415573 5' + 297 6602 2 70.83 TCCTATAGTTTGCTAGATATTCACGCTCTTACTTACGAAGACATGAACAAAATTACGGACATGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTCAAGTGCTTTTCCCATCTATAGATCGAGCTTTAC:1 - chr2R 8286791 5' + Burdock 56 2 58.33 CCCATAACTTGTTGATTATTTACCATTTATATGTCGGCGAGGCAGGAGTCTAATCCATTTCGTTTATTCACTTCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACTTCAGCAGTCAAACTTCACTGAAGGG:1 - chr2L 22640190 5' - invader4 3000 2 77.37 TATTTAAAAGGTTCCACTCATTCAAAACGGCGCTGAGTGAGTTCGCAATATTACCAGCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTAAGCTACAGACTTGAAACTT:1 - chr2R 6493187 5' - transib2 2779 1 55.20 CAGGATATTAAATAATTTTATAGAGATTTTAGATAGTGCAAATGTTTTTGTGTTTTCAGACGTTATTTGATGCAACATTTTGTGGTTATTAAATTTGTTCTATGTTTTTAAATTTACAAGAACATGATGTTTTTTTTTTCCTTTTT:1 - chr3R 22076849 5' - gypsy7 5011 1 67.81 CAAATTCACAAAAAGCGAATCCTTTCAAATATTCTCAAATCATATCATCTTCGTATTCAATTCGATCGCCGACGTGTGAAGACGTTTTTATCGTGCTCCGCACAAAATCGGTTGTTTTGAGTGAAGTGAACGCCAAATAAAATAAA:1 - chr3R 10737054 5' + F-element 79 1 66.44 CTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAG:1 + chrX 12979418 5' - transib2 2790 1 61.81 GAGCTGAAAATAAATTGTGATGCCTGTCAGTAAACTTGAGCTGCGGCACAATCGTATCTCATAGGTGCAGCCGGCTTTGACTGCATACTCGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACT:1 + chr2L 20762320 5' - Doc 4470 1 56.25 CACCACATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTCTAGTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGAC:1 - chr4 868730 5' - roo 9004 2 65.07 TATTTAAATGATTTTTGTTTTCGTTCGAGCAGCAATGTGCATATTTTGGAGAAAGCACTTTTCGTGGAGGGCTCACAAGTGTACAAGTTAACACAATCACAAAACACCCGAAATATAGTCGTAAGCCTC:1 - chr2R 12827092 5' + Burdock 6159 2 65.89 CGGCGAGCACCGCTAGGAGAGCTATTCGTCTGACCCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAGGTGCGAGTGAAAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTG:1 - chrX 2300637 5' - P-element 2798 1 20.69 TAATAATATATAATAAGCATAATTAGCAATGTCCGTATGTAAATTATCATTTTAGTGGATTTTCTATATATTTATTAGCGTAAGTTTATTAATTACAATAGGGCTTGCGCGGTCTGCACTTAATGAGACGAATAGTAAGTACGTGG:1 + chr3L 15477461 5' - 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chr3R 9298597 5' - hopper 1386 1 64.38 AATGAACTCGGCTTGATTGACAAGCCATTTACAATTTGTTTTTGTTTTTTTTTTGTTTTTTTAAA:1 - chr2R 21248678 5' - TART-C 11100 1 60.00 TGCATACTTTTGTGGGCTTAAGTATTTAGGCACCAAAAACCCCACACATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATCTGCGCAGATCG:1 + chr3R 26854762 5' + jockey 86 1 69.86 AGTAGGGTATACTAGATTCGTTGAAATGTGTGTAGCAGGTAGAAGGAAGCGTTTCCAACTATAAAAAGTATATACATTCTTCACCATTCTTCACCATGTCCGTCTGTCCGACTGTCCGTCTATCCGTATGAACG:1 + chr3R 14437792 5' + INE-1 124 1 62.69 AAACATTAAACAAATTAAAGGTTTAGTAAGTAAGTGAAGCACAAGAAGAATTCATTCGTAAAGTACATAAACTTTGGAAAGGAGCTACCTTTAGAGGGTATTTAGAGTGCCGTTTTGCCATTTTTTGTTTGTTTTTAAAAAATATA:1 - chrX 5717094 5' + transib4 454 1 67.81 TTTTAATAAGCTTAAAGGTCCCACGGTAGGGCAAGCTAAGGAATAAAAGGAAAAAAAAAGAATTTTTCTAGTTATTAATTACTTAATGTGTAATATTTTATACTATCCTCCGGGTAGGGAGATCGGTGGGGTGTACCCTCTTCAGC:1 - chr4 116107 5' - G5 4638 1 69.86 CAGTTGGGAATTATTGCAGTGAAAGTGCGTGAAAGTCTTACCCCCGAAAGTATGTTAGCAAAATGTTACATCTGCAGTTGGGTTGATTTTTGTAAACTGTTTTATTTTACGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTAC:1 + chr2L 901703 5' - jockey 4973 1 68.49 CGTTGGAGTGACAACTCTTCAATCCAACTTAACTTTCTTGATTCCACTGTGGACGGAAGTACTGACGAAGCCCACCAGAACAATGCCGAATCGACTATACAATAACATCGTTTGCCCACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAA:1 + chr4 556122 5' + FB 228 1 66.44 TACCTGCGGAGGGGAAAATTGAGAGGATTGTGCAGCAAATGGCATAAATAAATTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGT:1 - chr2R 9341648 5' - roo 9007 2 67.63 TTCTAGAGAAAGAGGTAAACATTAAACCATAGAATGCTTAGTTTATTTAATGAGCAATCTACTACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAACATGCAGCTAACTTAATTTT:1 - chr3R 8197878 5' - pogo 2040 1 60.96 ATCTCGAACTGCAACTAGTTCGTGATTTTTGCACCCATCANTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGANCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTT:1 + chrX 8681454 5' + jockey 93 1 75.86 AACTCTGGCCGGGCCAAATCGAATTGTGTGCACCGCACTGTGGTCCAGAATTCGATTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAAATTGAGCTACAGACTTGAAACTTTGTACATTTTGTTTTTAAACCACAAATAGTTTGCACACAAAATT:1 - chr3L 8824510 5' - transib2 2735 1 80.82 TTCAAATTAGTTTCCTCAGGTGCGACGAAACGAGTTGGAGTGATGAACAACTCAAAAGAGAATCCCTCATTCGTGAGTAAAAACAGTTGACATTTCGCCAGTGCACTGTGGTGCAGAATTCGATTTTTTTGGCATAAAGTCTAAAA:1 + chrX 12979404 5' - transib2 2802 1 70.55 ATAAGAATGCAATTCCAAGATAAAGCGCACATATGTAAATATAAATTGATTTGAGTAAACATATATAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTG:1 + chr3R 15283632 5' + BS 5054 1 55.48 AATAGTAAATATGTTTATTTGCCCAATCAATTTGTTATTTATGCTCAGACAGATTTGTCAGTTGATTTGGACACGTTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATA:1 - chr2R 18931930 5' + blood 7060 2 50.68 AGTTGCTTAAGCCTTTTACATCTATATTATTAAAATTATTATTACCATATACGTCATTACGTCTCTGCCTGCTTCGGCTCACAAGTCGTGGAGCGAAGAGACCGCCTCTCCTACCCCGCTCCTCTCGCAGCGC:1 - chr3L 17748449 5' + Doc 446 1 54.14 ATTAATTTATATTTATGTGTGCAAAGACCAAAAGTATATATGAAACTCTTGGCTGGAGGCCGCTTTAAATGCCTCATAACTTAATAATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCAT:1 - chr3R 18128559 5' + roo 35 2 60.00 GTTATGTTTAAATTCATCACTTGTCTCGCCGTATATTAAGCGTAAATTGTGCGCACTCCTAAAAGTGTGCTAAGCTTTTCGACATCACACATACGCCATGTTAGCCAAATGCAAGTTGTAAGTCCTCACATGATTAGTGAGAGG:1 + chr3R 19950392 5' + BS 4999 1 78.47 CAACAGAGATAGCTGCTGGGTGGAAGGGAGATGGAGCAGTTTGTGCATTCATTTTGCCACTGCATATTTCGTAGGTGTTCACACATGAACACGAATA:1 - chr2L 7929620 5' + roo 1 2 73.20 ACTAATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCNAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTCGATTTAGGTATATAAGTTATTGNCCTATAAGTTATCGTCCCACATTTTATATTTCA:1 + chr3L 9324411 5' + HMS-Beagle2 6904 2 69.18 AAATGCCACTCGTCTGCTGTACGAGGGCCCTGAAAACATTAGTAATCGAAGAAGCATTGATATTAAAAATCGATATGTTATCGCTGGGAAGTTTTATGATAGATACAGTACAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAA:1 - chrX 17884647 5' - pogo 2083 1 65.97 GTCCACAAATTAACAGTTCTTCGGGAGCGACGCGCAGCTAGGCGTCCGACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGT:1 + chr3R 19094193 5' - P-element 2840 1 40.68 GTTTGTGGATCCTTGCGTTCTGCAGCTGTGTTTAACTTTACCTACGAAGGTGTGTAATGATGAACTCCCAATTAAGAACACAAGTCCGTTTTAAGTTGAAGGCAGCCGTCGGGCTGACATATATTTATTCAATTTCTTCTTTTGAT:1 + chr2R 23094879 5' - 412 422 2 68.49 TTATCAAGATTTTCAAATATTTTAATTATTACAATAGTTACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTAGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTT:1 + chr2R 9453298 5' - roo 8988 2 76.71 TGTAGATGGTAAGCCAAAAATCCTTTAATGGCTAGAGATTTTAATTAAGTATTTGTTTTAGTTCAAAGATGCAGGCAGGAATACCAAATCAACCAGATGCATGCAGGAATACCAAATCAATGACTTAAAATATTTGATAATTAAAA:1 + chr3R 28025726 5' - Cr1a 88 1 73.97 TGAAAGTTCGTAGCTCTGCAGGGAGCTGGAAGACAGAATTCGTAAATATATAGCTACTTAGTTGCTATGAATTATTATGTTATGAGTTGTTAACTTATACACTAGTGGGCAAGTATTTAGACACCATTAG:1 + chr3R 4221590 5' + Tc1-2 12 1 63.08 GCTGCGGTTCAAAACTTAAGTCCCTATAGAATTCAGTTATGTTTAGCCACGTAATCTGCATACTTTTCACCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATC:2 - chrX 17048252 5' + jockey 66 1 54.79 TTTAATCGAAAATCGTAAGTCGTATGTTTTATGTGTTGTATTTAACGTAATGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAA:1 - chr3L 14422816 5' - roo 8997 2 70.55 ATATGGTTTCGAGAATGTGCTTTCCTAGGCTTATCATTTGGGAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTT:1 + chr2L 14056687 5' - pogo 2038 1 70.77 CTCAAAAAAAGGGGGCTTTACTTGGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTAC:1 + chr2R 8315449 5' - hobo 2928 1 77.78 TTGGCCGGGTTAAAAACTTTGGCGAGCAGCTGTGTAAAATCCCAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATTTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATG:1 - chr3R 28014165 5' - roo 8978 2 80.82 GCCCTGGTGCCACAACAATACATCATTTAAGCCTTCTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCTCTCTTG:1 + chrX 14735755 5' + diver 5977 2 75.34 CTAAGACGATCTAAAATTTTGTTTTAATGTACGAATAAAGTTAATACTATTATAATAAAACCCAAAATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACACACATAACCAC:1 - chr3L 24208218 5' + Quasimodo 43 2 57.25 AATAATAGACGGAAACAAAGGTAACGACACTTGAAGTTTTCAACTTGATGACAATAAACGATAGCTAACGGAAGGCGCACAAATCCGCATTGTGTGCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACG:1 - chr3R 23964941 5' - hobo 2927 1 74.42 CCAGGCACGTCGCACTCCAACTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAG:1 - chr2R 12828673 5' + roo 8895 2 76.67 CAAAGTCGGCAATTTATGCTATAAAAATTAAACCAATTAAGAACCACCTACAAAAACCATTTAATTTGATGTTTAATGCATAAAACAATCCAAAATGACTTTCCATCAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGA:1 - chr3R 4666384 5' + FB 18 1 73.29 TTATTGCTGCGCCGCTGACTGTCCGTTGGCCCCGCTTTCAGTGAGCCAAATATGCAACCAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAA:1 + chrX 18673656 5' + roo 47 2 58.14 CCCAGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTTTCGTCCAGTTTCTTATTTTGCGCGCGATTTTGTGCGTCAGCGCAGCAAGTTCCGATCGACT:1 - chr2R 4261981 5' - invader4 266 2 60.34 CCCGGTGATGGGCACTATTTTGTCTGGGCTGGCATAGATTGCTTTGAATTATGGCACTAAATGGCTAGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGA:1 - chr2R 21796120 5' + roo 8714 2 54.68 GCGTACATAGCCGAGATCGCGTAACGGTAGATAATGAAAAGCTCTACGTAACCGAAGCTTCTGCTGTACGGATCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGAAAGCCGAAGCTTACCGAAGCATACACTTAAATTCAGTG:1 + chr2L 14616159 5' + P-element 49 1 51.75 TCATCAATCTGGCCAGTTAAATATACAAATGTATAAAATGTGAAAAAAACATATAACCTTAAAATCACTGGTGTAACGGTGTTTTAATCCTTCCACTGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCAC:1 - chr3L 1628744 5' - hopper 1388 1 66.44 CGTTGCGTGTCTCCTGCTTGAGGAAGCGTGGAAAGGAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAATAAATGTCTCAAG:1 - chr3R 11284970 5' + blood 7075 2 73.17 CAGGCTCCAGCAGTCTGCTTAATTAAAGGAGCATCGGATTGCAGGCGGTAGTGAATATTTGAGACCCAGACTCCGCTCTCGATATTGTTTGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACGTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTAATT:1 + chr3L 20061307 5' - roo 9038 1 60.96 ATTTTCCTCTATTTTCGCATTTATGCATTCGAAACACAAACCTACTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCCGTCAGGCCACCTTTTTATTTCTTCTTATCTCTTC:1 - chr2L 18181199 5' - blood 303 2 70.42 CGCCGTGAAGAAAACAAGTTGGCAGCCCCAATTTAGTAACGAGAAAAAGTGCATACTTTTCAACACCACCCTCATGACCTCCCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAATAAATA:1 + chr2R 14427135 5' + jockey 4819 1 59.03 GTCAACATTATTTCATTTATGGATTTTGTTATTAATGTTGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCGTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTG:1 + chr3L 7848459 5' + jockey 57 1 49.66 AAACAGTAATTATAAGGTTCAGTTGATTTGATAAAGAATATTTTAAAAGTGGTACATACAAAACAATGCCTATCGATTAACATATATATGTATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCAACAACCCGGTTGGCAGCGCTGTTG:1 + chr2L 17957144 5' + flea 4789 2 60.96 CGAAATCGGAGTGAAAGGGATTCGGCGTATTACAGTTGCACTACACAACACTGCATTTGGCGGTGTTCAACACTCCTGCTTCGCATACTAGAGAGCATGATGAAATAACATAAGTTGGTCCCGTC:1 + chr3L 22094425 5' - P-element 2878 2 75.20 TTATCTACACTTCTCTAGGCGCTTCATTTGGGTCGTGCGCAAATCAGACTCCCACTGCGGCTCCCTTATTCATGGTTATACATATATAGGTTGTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAA:1 - chr2R 11153253 5' + roo 8673 2 65.04 AAAATAAAGAGCGCAAAGATCAAGATGGCCAAAGCAAAAGTCGCAAGGCAGATATAGTATAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAAT:1 - chr3L 15718166 5' - 1360 3327 1 63.01 AGGAGTAAGTAGTTTGCTGTCACCTATTTATTTGGTCATTAATTATTATTATTATTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTT:1 - chr3R 23902250 5' - I-element 5272 1 75.17 AACATTAAAAATATATTGTTTACCAAATCGCTCTGACAATTATGGATAACATTAAGCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATAT:1 - chr2R 10863230 5' - jockey 4575 1 66.90 GACCAGAAGGATGCGGGACAACGAGCGGAGAAGTTTGGGTGGAACGAGGGGGATGGCACCGCACTGGACCTTGGACTCCAACGGGCCAAGGGCGAAGAGGTCGAA:1 - chr2R 2994306 5' + gypsy8 4773 2 45.71 TAAAAGAGATTCAGCCTCAGGCAAAATCACCAATGACTGTCGTGGCAGCACTTTTTTCTGATTTAATTAGAGACAGTTGACATAATCAATTTAAGTTGGTTTGAATGAAAATAAATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGGCA:1 + chr3R 31114212 5' + flea 4765 1 76.55 GATTGTTTTTCTGATTATGAAAGGTGCACTGTTTGCTAGCGATTCTTCATCTGTTCTAGTCGCTACTAGAAACACAACGTCCGGAGGTTGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATT:1 + chrX 21087545 5' + mdg3 29 2 61.43 GCTGGAATCGCCTGTGCTCCCGTTGAAATTACTATCTGCGGCTGATGCTGTACGGCATCTGCGTTGAGTCGCCTCCTTTTAAATGTCTGACCTTTTGCAGGTGCAGCCTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTG:1 - chr3L 14013482 5' - P-element 276 1 41.10 GATGTTGAGGGGACTCCGCAACTTCGAGTCATTTAGAGTATGTGTCAACGACCAAAAAGAAAGTTCTACCCTGAAACGGTATAGCCAAAGACACTAGAATGACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTG:1 + chr3L 23181930 5' + 1360 40 1 58.22 ATTGCGCGACCAAGGAAAAGACAGAGTTTCAGATTAAGGACTGACTTCTCGGGTGATCTGTATCCATGCGCATTCCACTCAAGAGAGCGCCTAATTAACGTAAACATAAATGAGAGCCTATGTACGCTCAATATGAAGAAGTAAA:1 + chr2R 3068291 5' + Quasimodo 474 2 66.21 ACTACACTAAGGTACCCATTGCAATCCAAAAACATTAAAACATAACAAATTTAACGCTGAGCTGGTTTGTCGTTCCGGTGCAGTCGGCTTTGGCTGCATACTCGAATAAGTTTTCTTGCAAGAGGATTTGGATGTGAGGCTAGTTT:1 - chr2L 6727716 5' - Doc3-element 4513 1 69.86 ATAAAACTTCTCTGTACTCTATTGGCCATTATACCTGAACGTATCCCATATCAACAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTTGCCCATTTTTTGCCCATGTTTGCC:1 + chr3R 16630273 5' + FB 64 1 63.57 CGAATTAGTAGATAAAATTGCAAGTGGGTCGGGGAGAAAACGTAGAAAAAAATAATATAGAAGCCTTGCCTAAAAAGCAAACCATTTCTAGATACATTGTAGTATGTGCCTATGCAATATTACGAACAATTAAAT:1 - chr3L 2317265 5' + 412 17 2 65.19 GAGGTCATCAATCAACGGTGAGTGAAGTGAAATAGTGGGCAAGAAATGGTTAGATTTCTACGGGTAAAAAGGATATGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATC:1 + chr3R 19506712 5' + mdg3 5302 2 51.37 TTCGGGAATTCATTGCTCATATATCGCTCCCAAAACATTTCAAGGCATCTGATTTCGTATGATTCCAAACAACTCAACCCTATATGCATGCCATATTTGCATTTCACTTGATGTTTTTTTTTT:1 + chrX 13230844 5' - Porto1 169 1 73.98 TTAAAACATATCGCAGCCCACTCTGAAACCAGCCCTTTTATACAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACCTCGCGGGTACTTACACACACAC:1 - chrX 14978622 5' + hobo 83 1 69.18 CTAGCGTTCTCCGGTTGTTAAACTACGGGACTTTGGCCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACACTC:1 - chr3R 21925167 5' - hobo 2909 1 58.43 TAAGGTTTATAAAAGTATGCAACACTTTTTTGTGAACTACGCTGGAGACCAATGCACGATTCTCAATTCATTCGCATGGGAGATGAGCAAGCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCA:1 - chr2L 12236841 5' + jockey 64 1 55.48 TGACTCCGCTGTTTAGGTTACCATATCTGCCAATTAGGACAAGAATCGGTTAGCAAAGAATTCACAAATTCCCAATTTACTATCTTTAGCCGCCGTTTACAGAAGTTAATATTCTAATACAATTTCACGTGACT:1 - chr3R 19506845 5' - mdg3 218 2 61.19 ATTAGTATGCGAGCGAATATTAAAACCCAACTTGAAGATTACCATATTTTATGCTGATGCATACATATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr2L 20132974 5' + 297 6636 2 60.96 TTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAACGGACCTGCTTGAAGCGGTTTATTCGAATGAATTCACATTGCTGTTCTTGGGTACAGCCACCCGCACATGACGTGCTTAAGACTACGTGTTTGTTATCTTATCTTATCTTATCT:1 - chr3R 19449905 5' - Stalker3T 204 1 74.83 TTCTATTCGCATATCACTAGTTATGATCGAAACAACTTCAGCATTTTCTTATCTTCGTGTATATAGTATTGTAATAAACCAATATATGCCACCAATTGAGAACACGTGTTTTCCTTGCAGTTGGGTGCAGCC:1 - chr2R 4816972 5' - blood 336 2 58.33 CACATTTTGCTTTGTTATTTTACTGCATTTTTGCTTCGTCTACAGCTTATCTATATAAAATCTTTGCACACAAAGTGTCTGCAGCATTTGGTACGTGCATAATTTGATTATACATATATGTAACATGGAGTAAGGCTGAAGGCTGG:1 + chr2L 9383688 5' + flea 4763 1 72.60 TTAATGAAAATTAAACATTTACCATGTGTCTCGCATACTATTAATCTATTAGTGCACGATCCCCTGAAAATAGATTCTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAA:1 + chr2R 6493262 5' + copia 45 2 53.15 GCCCCCGATCCCAGCAATTTTACCACCAATGAGTCCATGCCCCCCATTCATGTGTGCTCGTCATGTCTCGAGTCTGACACTCGTTAAGGGTATGGCCAAAGGTACTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACC:1 + chr3L 2532398 5' + blood 14 2 72.86 TTTATTTTGCACTCGGTTTTTTTCTCGTATTTTCGATATTGACTCGCTGCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGA:1 + chr3R 17987648 5' + jockey 83 1 70.55 TTTAAAAATTCAAAATTCATGTTTATTTAAATATTTTTAANACCTANACCATATGCATATCATTCGATTTCTGGAGGCATACTAGTAATCTTATAATTNTAGTTGTAAAATCCCAAATNAGAAGACTTTACNCGTTGAGTTTTTGT:1 - chr4 868776 5' - roo 387 2 68.49 GTCTAGAAGTCGTGAAGAATCGAGGGCTGTAAGATCGAACGGAAATTAATGGACCTTGGACCGCGGCAAAGCGGAGACCGTGACGTACAACGCTGGACCAAAGACCCTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTT:1 + chr2L 23310589 5' + 1360 21 1 68.57 ATTAAAAGGGAGATTTTTCGTTCTTTTCCTAAAGATTTTGAGTGGGAATTTACCATTTCAATGATGTAGGGGTATTATATATCCTCTTAATTAACTAAAACACACAAAGGCAGGAGTTGGACTCTTTGATTTATTTGTTACTTTC:1 + chr3R 4160068 5' - invader2 186 2 60.00 AAGAAAAGTGCGTCATGGGTTTTCCGTGAAAGGCAATGTAAAGTCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAG:1 + chr3L 15148607 5' - roo 8984 2 78.62 AATTTCACGATCGATAGGATATCGCCAAGCTGCATGGTGAAGTCGGCAGAGAAGCGGATATTATATATTTATGTTAGGAGAGTTGAGAGAAAATGCTATGTGCGCACATTATGTACATAGCGGAATTTGGTTAGCGTGGGATT:1 - chr2R 5029584 5' - gypsy11 187 2 77.62 ATGCTGCATAAATCTAGGCGCTGCCAACAGATACAAACACACACACACAAGCGACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACACAATCT:1 - chr2R 19108556 5' + jockey 111 1 57.86 TAGAGTGGGAAATTTAAATATTCTCCCACAGCCCTTTTCAGTCCCATTTTGGATATGGTATTAAAGCTGTTTCTTTTGAGGTTACAGGCTATTACATTTATAGACAAATGATATAAGTTAAGAACCCTCTTCTTGCGCTCTTCGTC:1 + chr3L 12227729 5' + opus 10 2 77.40 GGGCGAGGCAACATGTCTCTAGAATCTGTCTCGACTATTTTTTTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATC:1 - chr2R 6161770 5' - BS 5008 1 76.71 ATATCGAGAATGCCCAAATTTCCTGATGCCGACATTTGTGTAAGCACGGTCTTAGATATATAGTAAAATTGTTGTTTTATTTATGAGTCGAACTAATGTCCCGTCAGTCGACTAAGGACAACGCCAAGAAATAAA:1 + chr3R 10714150 5' - 297 341 2 60.00 GTATCTGGCAAAATGGCGCAATAACAACAATGATAATAATGTAAGCAGAAATGGCTTATGTTTTGCATGTTCAACATGCGACCGACCTGTCCCCTGTTTTTGCTGGTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATAT:1 + chr2L 20628514 5' + Stalker2 19 2 34.93 ACATTACAGGGCAATTCGTGATTGAGCCACCCAACCGCCGTTCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCAT:1 + chr2R 22523173 5' + jockey 65 1 66.94 TTTTTAAGAGTTCTCTAAAGTATTTGGAAACATGACCATCTTACAATGCTATAATATTGTTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAA:1 - chr3R 13254992 5' + roo 8729 2 64.38 AATTACCTTAATGGTTATTTCAACACTGACCTCGGGCTAAGGTTATTTAAATGTCATAATTTTCAGGAAATTTGTGCCGATTTTTTTGATTTAGGGATATAAGTTATTGCCCTATAAGTCATCGTCCCACATTTTATAT:1 + chr3L 9324414 5' + HMS-Beagle2 6900 2 64.75 GATTTCAATGGGCCTAGTTTTTCTGGCTTTTAATTTTATTGGATTACAATTATGGTTTATATTATTTTTAATTCAACAATTTGTACTCAATTAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTAAGTAAATAGTCCCCGCCTTATCGAGGTC:1 - 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invader4 3045 2 60.27 TATTAATATTCTTAATTGTTTTTGTGTTTTTCTGTATAAGTTATTGCCCTATAAGTTATCGTCCCACATCTTATATTTCAACATCATTTCTGGGTAAACACAAGTGCCCAAAATGCTGACCAAAGGTCTGCATT:1 - chr2L 22780911 5' + HMS-Beagle2 6958 2 76.12 TGCACGAACTGTGAATGTTTTAGTGCCTCTTGACGCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACAGAAGTCGCGGATAAAACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATC:1 + chr3L 7848497 5' + jockey 85 1 74.07 TAGCCTTACCTGACACCTTTTTTGTTTTCACCCAAAAACTCTCTTTATTTAATAAACTAAGATTGAGGTCAAAAATATGCCGATAAAGTGCGATAACACGTAAGCTAAACGCCTCTAAACAAATCATCGGACACTCAACCGGGAAG:1 + chr3L 18187406 5' + Tirant 46 2 74.66 AATGAAGTACTTAGGTTAACTTATATAAATTGATTTACCATCGAATATATTGATTTCATAAAACATTGTATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAA:1 + chr3R 13868907 5' - HMS-Beagle 194 2 56.55 CACCTTTCGAACAAATGCCAACAAACTGCCAACAAATCCATTTCCGACATAGAAAGCATTAAAACACTACCAACAAACGAATTATGTTGTAGTGTATCTACCCTCACTATAACTCTACTCTACATATAAG:1 - chrX 21668414 5' + Stalker2 7270 2 65.38 CTTATATTTAATTGTATAGATGATTTATTTATGCGGATAATTTAAACGATCGACTGTTCAAGTAGATGGTACAACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGG:1 - 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chr3L 6015646 5' + roo 8752 2 80.56 CCTTTAACTCTACCAGTAACGGGTATGAAAATGAGAGTAAACAAAACATAAAGACAGAAAAGTAAAAGATTTTCTTAAAGTATTTAAGAAAATAATAATTATGTATAATTCGGAGGAAATGAAAGGAACGACCGTTCGCTTTGAAA:1 - chr2R 1949366 5' - Cr1a 6 1 62.33 CTGCAGACCTTTTCGATTTATTCATCCCCAATGTTTAAAGCTATATGTTAAATTAAATATGAGTTTATGCATGTAGTACATATGTACTTTATTAGTATCATAAGACTCAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTA:1 - chr2R 13939603 5' + G6 1984 1 69.86 CTGTGGAATAGGGGATCTTATTGGGAATTCATGAATTCAGTTAAAAAACTCCAATCTCTGGTTATATAGTGACGTATTTGGGTGGTCCAAACCAGCCACTTCCATTATTTCAAAGAAATCAGTAATGCACTCTAGTAATTTTC:1 + chr3R 8563528 5' + 297 55 2 57.34 AGTGGTCATTATTATTATTAGAACATGCGTCTTTGTCTAAAGAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTTCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGTTAGATCAACTCGGCTATTGATCATGACCAAG:1 - chr3L 11826426 5' - INE-1 89 1 66.91 ATGATACCGTACCGCGGCAATGATTCCAAAGGTGATGTGAAACTGCGCCGGAGTTAAGTCCGTGATCGAGGGTGGAGCCTTTTGTGAAGATATGATGTGTAAATGTATGAAGGTTTTTAAGTTTCAGCAGATAGTTGTAGTGTGA:1 + chr3L 11364804 5' - Tirant 8433 2 68.97 TTAAGTCAATGTTTTAGCATTTATAAAAAGTACAATAAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGT:1 - chr3R 18477873 5' - 1360 3339 1 50.68 TTACCTGCAGCCCTGTTTCCACATTGTTTGAACGAATGAGTTCAACTGGTTTAATTTTAGTTACCGAAAGAATTATATAAGTTAACGCAAGTTCCACTTGCATCAGGGTTCTC:1 - chr3L 26709892 5' - opus 7488 2 69.91 ATTGCCGACACCGACTACAAAGAGAATATTTTATGCATGCGCATGTGTAAAAATATATTTTATTAGATCAGTACCACTTCAACCTCCGAAGAGATAAGTCGTGCCTCTCAGTCTAAAGCCTCGCTTCGCGTAAGCCCAAAACTCT:1 - chr3L 13779419 5' + I-element 56 1 60.00 TTCATTACGCCGCATGTGTTCATCTGAGCTGCAAATAGTAATTAGACTTGCAATCGTTATATATCAATTAGAATAAAAATATATGTTCGTGTCTAACAATACGCACCTGACAAAGTGGATTAAGTGAAATTAGTTTTCGCGGTAAT:1 - chr3L 3661177 5' + X-element 55 1 56.85 AACATCTGATTATTTCCATTAGTATTCCAAGCTTCAAATTGTTATAGATCCAGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACA:1 + chr3R 20904972 5' - roo 339 2 69.23 AATAGATTCGTTGAAAAGTATGTAACACCCAGAAGGAAGCGTTTCCGATCGTATAAAGTATATATAAGTTAATAATTACAGTTATCGATTTGATTTTGAAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGCAATTTATCATTTGAAACTAAATC:1 + chrX 16116152 5' - HMS-Beagle 6983 2 60.27 GCTCCAAATTGCGCACAAGTTTGTCTGAACCGAGCAATTTGATGCGATTTAATTGCAGCTTCATCCGGCTGAAGAAGATGTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGC:1 + chr2L 4864355 5' + mdg3 5297 2 53.42 TAGTAATTCAGAGTGCTTAAAATTCTTCATGTTGTCATTGGGTAAAATGGTCTGCTGTCACTGAATGCGTAGAAAAGAGCTGTTCGATATATAGCTCTCCGATCTCTCGCTCTCGAACATAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCT:1 + chr3L 18463346 5' - 1360 75 1 55.48 TCCATATACATACATATACATATACATTGCATGCATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATATACATACATATACATTACATCTCCATGAGTGGATCACTCATGGGTACTGATCAGCCGAGAACTTGAG:1 - chrX 6106827 5' - Quasimodo 6970 2 71.13 ATCCTAAAGGTGTCGTTTCTGGAGCACATTGAGTGTAAATGTCAAAAATAGTATTGAAAAATATTGAAAAATTAGGATAGAATAGAATGCTATAGTCGAGTGGGGAACTCGGGGAGTCTATCAGATACCCTTTACTCAGCTGG:1 + chrX 15946409 5' - INE-1 543 1 40.56 ACACATCCTGCAGCTGAGTGGACATTAGCTTGTCTTGGTTTTGATTAAAGAAGTCTGAAATATTCCACTGCAATCAAAGTACAAAATTAAAGTAACTCAATAATTGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTT:1 + chr2L 8120091 5' + roo 21 2 71.23 TTGACGTTAAACCGTCCAGATTCCGCTGAATGCCAACGTCATCAAGGGCCGCAACAACAACAACTCAGTAGTCCACATACATGAATAAACACATATTATAAAATAAGCTCATACCAAAGACACTAGTATAACAAGATGCGTAACG:1 - chr3L 27391435 5' + 1360 10 2 67.59 TAAAATGAAATGAAAAGTATAATCTATGTTAAAGCATATAGAGCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTCGTGTGCGGGTGCGACTCG:1 - chrX 8469278 5' + hobo 52 1 61.21 ACGGATTTACTTTGAGAATTGCAACGCATCCAACAATACAATGGATAAAGATGAATGTTATGTAGTATGTGCCTATGCAATATTAAGAACAATTAAATAAAATAGCATATTAACTTATGGCAGCACTTTGTTGCTATGTTTATGTT:1 + chrX 666276 5' + 412 65 2 63.70 TAAAACCGAAAATGAGCAAAAACAGTTTGAAAAGTGCTTTTGTAGTAGGCTGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCATACAC:1 - 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chr2R 8747030 5' + mdg1 230 2 57.24 GGCAATAATTGTACTTTTAATTGCTTCGTATTATGTCTCTTGTACGGATTATGAGCGGAGTCACCCGGTGCTTCAGCTGTCTTAACAGCGGATTAACATTTTATATATATCGATGCTAATTGAACTGAACTGTATTCTTTCTTTCT:1 + chr3R 23644886 5' + diver 83 2 72.60 CCAATACCAGGGAGATTTAATTTTGTTCCTCCCCCAAAAGCATGCCACAAAAATGCTGAAAAGCGAAATGCGGAAACCTCATAGGAGTACTCAGTACCCAGCATCCATTCGCATGGGAGATGAGCAATCGAGTGGACGTGTTCACA:1 + chr3R 14608652 5' + jockey 26 1 73.97 ATTGAGGCAGTCAGTGCGGTCTACATTTATAGCAAGCTTTCGCACACACACAAACAGCAAATCAGCCGGGAAGGCGGCCCACAGCACTATGGGGCATTTGGCCTGTTTTTTTTACAATAATGTGTTTTTCACAAATATGCAAATTT:1 + chr3R 29283162 5' - hopper2 1567 2 58.22 TGAATGTTTCTTTTTATTGCCATTGCCATTGTTTTTGTTGCTCTTGTGGCCCGTTGTTCTTGTTTTTGGCAACATTTTTATATTATTTGGTCGGTATCAGAGAACTGCAAGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACT:1 + chr3R 25860443 5' + hobo 18 1 71.32 GTTGCAAAACCTAAACTTAGCCGATAGATATGAATATATGTTCACACATGAACACGAATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTT:1 - chr2L 5728931 5' + roo 81 2 78.57 AGGCAAAGGCAGAGCAAGCCACCAAATCCAGACCGGCCACCTCTATCAGCAAGCCCTGCACCACCCAGCTTCCAACAAATGTTTGCTCGCTTTGAAGGCATGGTCGAAAGAATGATGGAGAAGATGTTCTCGCAATTGACGCATCT:1 + chr2R 5893690 5' + G2 215 1 43.15 CCACAATCTCGAAAGCCAAAAAGCTGTGCGAAAATGTTGCATACTTTCCTCGGCTTAGCAAAAGTTTGTTGCAGAGAACTGCAAGGTGAGTCGCAAATCTGCATTCATAGAGATCGGTTGTGTC:1 - chr2L 11867395 5' + BS 9 1 57.26 AGATGTTTGCGTTAAATGATATCCATTGTTTTTCAATTTTTTTGCTGTTCCCATTTGAGGACAACTTTAATAAATTAGACGCTTTTATAGTGGTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTG:1 + chr2L 512393 5' - roo 9041 1 62.07 CGCAGAGTAAAGTAGACAAAATTCGAAGCTCGTTTCTAGGAATACACAGGGGTATACGTGAGTACATAGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGCAACACTTAGTTGCATTGCATAAA:1 + chr2L 9795370 5' + blood 7062 2 56.03 ACAAAAACAAAACCTGGCAACGCAGAGAGAAAGCTTCTCAAACAGAGAGAGGTTCTCAGGGAGAAACCATGATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAAAG:1 + chr2L 310055 5' - P-element 2829 1 46.58 AGTGCTAAGGTAAGTCGATCCGAGAGTCTGCATTGCCCATTGCCAGCCAAAGTCACCTCACATAAAGTGCATCGATGGGATGCCGAATGACAGACCAAAGTCACTAGAATAACAAGATGCGTAACGGCCATAC:1 + chr3R 20752854 5' - 1360 3372 1 68.42 AGGGTCATTTCCACTACACTTGGGAGCAGAAAATGAATTAATATGGACAGAAAGTAGTGCTGTTATGGCATATCCTTTATGACTCTTCAGCATAATTATCTATCAACTGTTGTTTGTTGAAAAGGTGCTCCAAGTGTGGAACACTG:1 - chr3R 15727974 5' - 1731 298 1 67.81 TTTTCATGGAAATCCTGCTACGTCTGCGGGCCAAAAGTTGGTGCAACCATCCTATCTTGGCCTTTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAA:1 - chr3L 2966547 5' - roo 349 2 57.64 TTTTAGCATTTATAAAAAGTACAATAAATATTTAATAAGAAGATTAAAATTTAAAGCGTTACACCAAAGACCCTAGAATAACAACATACGTAACGGCCATACATTGGTTTGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAA:1 - chr3R 18477862 5' - 1360 3328 1 58.22 TCGAAACAGTGAAGTTTTTTTTTCTTTAAATTAGTATTTGTAGAACTACTGCATATATAAATTGAAAAAGAAATTAACAAATTAATGTGGCATATCAAGAGAAAAACTTTTTTTTTATTAACGAAATTATTTTATTTAATTGACTA:1 - chrX 16727225 5' - jockey2 3377 1 54.11 TGGGCTAGACTTATACAGAAAGAACCTGTTTTGGGCCCGGTCTCTCGGGGCAGTCACTGTAAAATCCCAAATAAGAAGACTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGA:1 + chr2R 12462133 5' - roo 341 2 63.45 GTACTTCTGGCTGGATTTCCGATAAACTAACCTTTCTTGATTTGTTGGTAGAAGAAGGTTTCTTGGGCTATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTTGGTGAGATGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGT:1 - chr2R 6752192 5' - F-element 257 1 78.17 AAAAGGGGGCTTTACTTGGGGTGGACATGGCAAAACGGGCTGCAAACGTCTCTAGTCGGACCCAAAAATATATTGCATACTTCGCAGTTGAAGTTTCCAGAGAACTGCAGCCCGCCACTCGCACTCTACGTCCACCCGATAAACAC:1 + chr2R 8315455 5' - hobo 2911 1 67.81 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGGCGTTCTCTGATATAGAGCAATTTGTTTGTTAGGACATTATCTAAACTATGTCTATTTACCAGGACCAGGCCCCCGATGCGTAATATTGGCGCAC:1 - chrX 8469180 3' + hobo 2917 1 66.41 AATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACNTGTATATATATAAACTTTTTTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTTTAATTTATAATTCANAGTTTTTCCTTTTTTACCAGCTTAAAATGAGTTTGGATAATTC:1 + chr2L 17957313 3' + flea 235 2 66.90 TAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTAAAACCCTTCTAATTACATACATTAAAATAAATATAGTTATTTACAGTTTTAT:1 - chr3R 12376411 3' + HMS-Beagle 6981 2 60.96 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCAC:1 - chr3L 14422712 3' - roo 46 2 56.92 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGATATATAACTCTTTAAATATTTTAAGGGCGTGTTTTACTACCTAAACTAAT:1 + chr2L 13229222 3' - roo 63 2 66.43 CCCGACGGCTGCCTTCAACNTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGATTGCCGGGCGAGAGCTGTAACTAGTTTGACATTAATTGACTGCCAAATATGCACAAGCGCATGAAATAATGGAAAACCCTA:1 - chr3L 13057327 3' + 412 455 2 58.90 ATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTG:1 + chr3R 11284983 3' - blood 7085 2 68.49 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATAAAATTTCTAATTAATATTATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTATTAAGTAGTTCACGAAACAGAACGT:1 + chr3R 11516652 3' - roo 8677 2 76.39 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTG:1 - chr3R 12341115 3' - Tirant 70 2 75.81 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAG:1 + chr3L 10897529 3' + roo 9001 2 66.90 CCTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCAT:1 + chr2L 7921007 3' - F-element 420 1 67.86 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGGATGCCATTTGGGGATTGGATTGGATTGGGTTGTGTTGGTTTTTGGGCCAAGTCAGTATGGTTCTT:1 + chrX 6891551 3' - hobo 51 1 52.45 AGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAAAACTCCAATCTCAGCAGCAGATAAATAAC:1 + chr2L 21657078 3' - invader1 3654 2 76.55 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTATTCCTTTGA:1 + chr2R 17650684 3' - pogo 27 1 68.49 AAACTGCGAACAACGCACAAAAAGGAGGGTAAACAAAACAAAAAGACGAAAAATTCAAAATACTTTGAATATTTCTTTAAACTATTGCACAAATCACAAGAATCACTCGCGAAACGAACGTATTTTTAATAATTATATTTACAATT:1 - chr3R 18717467 3' - Cr1a 227 1 78.77 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACTTTTCAACGAATACAGTATACGTTTTTTCTCTAAGTGTACCGGGAATAATTAGAAACCAGGAATGGGTGTT:1 - chr3L 13291956 3' - roo 8713 2 52.74 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCCAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTC:1 + chr3L 10897543 3' + roo 9035 1 53.23 ATGCTGAATCTCAAGCTTCTAGCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGATCGAGATCGAATATAATGAAGGAATGCACATTTAATCGTTGAAAAATATTGAACTAAATTGGAGAGAGCTTTTATTAAACTCACTAATAACCTTGTTCG:1 + chrX 14767092 3' - INE-1 170 1 41.38 TCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGG:1 + chr3R 11284975 3' - blood 7084 2 72.26 GATGGGTCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATGGCAGTAGAGTAGAGTCTAAGTAGA:1 + chrX 22862384 3' - jockey 66 1 56.55 TATTTTCTGAGTCACATCCGGTGTCCCAAAAGGGAGCTACCTTTGTCCGCTTAAGAATACTCGCCAACTCTTCCAATTAGATTTTCCTTCAGACTCTTCAAGCTTAAAAATCTTTTGCCCCTGGTTGTCTTCAACCAAGATCTGCT:1 + chr2L 22323558 3' + Q-element 465 2 66.44 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAAGGTGGTGTATTCTATTTAATTATCAAT:1 + chr3R 12519728 3' + roo 9042 1 63.70 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAAT:1 - chr3L 23146481 3' - 1360 71 1 65.07 CCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAAATGCGTTACCTCATGAA:1 - chr3R 12341094 3' - Tirant 71 2 65.07 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGACTTGATTAAG:1 + chr2L 544944 3' - Doc 36 1 50.71 AATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTGTTTTTTTTTTATTAATCAAACAGCCTTATTATTTATTAGACATTTTTCATAGCTTTCTGTAGATAATTACTCTAAATAAAGA:1 - chrX 16998273 3' - diver 39 2 43.15 AACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCAATCAATATACAGATGATGCACAAAGAA:1 - chr2R 9007002 3' - jockey 4789 1 76.55 AGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGGAAAGCGTAGGAAAAGCGAAAGCGCACAGAAA:1 + chr3R 15668269 3' + G2 3045 1 69.29 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTC:1 + chr3L 2317230 3' - 412 62 2 60.69 CAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATT:1 + chrX 3533958 3' + 17.6 433 2 75.41 ATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTTGGACGCGCTGGGGCCTCCTCGACTTAC:1 + chrX 8839385 3' - Tabor 61 2 57.24 AAGCATACGGTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACC:1 - chrX 20330554 3' + P-element 2849 1 32.18 GATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAAATGCTGTTGTTGGTGCGAGGTGCGATGGGAATTTGAATGGGGCAGGGGCGACCCTATTCTATGGC:1 + chr3L 17181529 3' + jockey 4950 1 53.96 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTGTCCGCTGTCCATTCCGCTATCTCTTTCACTC:1 + chr3L 5051184 3' + flea 230 2 69.86 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACGC:1 - chr2R 21795253 3' + transib2 2753 1 68.49 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCACGCAGACGTAGCAGGATTTCCATGAAAATTGCCTCGCCTTTTATTT:1 + chr3L 2966565 3' + roo 9030 1 51.72 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTAAAATGTCCTAGTCCAAAACACCGAGAAGAAGGAGTAGCTCGGAACTCAAGAAATCGCGACTACGAGGAGAATAATGAACGAACCTCCAAGTCTAGGATGAGCAG:1 + chr2R 16274689 3' - roo 14 2 74.66 TGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTGGCGCCCGAACAGGGACCGGCAATGTCCGGCCGATAAAAGTGATACGAAAAAATTGTGGAAATTGAGCGCCACAAGCGCACACAGGTGCTGGCGAAGGGGG:1 + chrX 8971047 3' + opus 7499 2 70.16 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCGGGCAC:1 - chr2R 19805427 3' - F-element 33 1 52.17 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAGGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAA:1 + chrX 666346 3' + 412 7458 2 77.40 AAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTCCAGAAAACCACTCATACCCCGCCATTCACCGCCCACCGCTGGCGTCTTTATTACAG:1 - chrX 9846742 3' - transib2 58 1 56.43 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTT:1 + chr2R 14072571 3' - mdg3 72 2 75.20 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTTTTTAATTACACACAGGCAACA:1 - 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chr2R 5179581 3' + 1360 3322 1 63.45 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGT:1 - chr2L 10909506 3' - 412 7128 2 67.59 GATATAATAACATTGTAAANAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAAAGATGTTTTTATTGGGGCGGACACTAATTGTTG:1 - chr3L 1186265 3' + I-element 5264 1 76.71 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTGGTTATAGATAGTTTTAAAAAAAAATGATAGTATT:1 + chr3R 17531885 3' + 297 6896 2 74.66 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATACGATATATTCGCTTTGTAGGTATATTTTAATAGTTTTCCAGGAAAATAAAATACTTGCTGAACAATAACAGATTTATAGAGAAG:1 - chr3R 17531753 3' - 297 6601 2 44.78 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGG:1 + chrX 10319711 3' + mdg1 364 2 56.16 GGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTAGCTAGCAATGTCGCCACGTATTCGG:1 + chrX 15191418 3' + hobo 2893 1 74.49 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATA:1 - chr3R 29627861 3' + roo 9013 2 65.89 CCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTC:1 + chr2R 9750274 3' - opus 7032 4 62.32 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAATGTAATAATATTCTAGTATCTTTGCAATCACATTATCGGGCTGTTCATTTTA:1 + chr3R 13838564 3' - opus 160 4 61.24 ATAGCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTGGGAGGCAACTTG:1 + chr3R 8049042 3' - Q-element 116 2 67.81 TTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGTTACTAAAAAATCAATAATAACCAACAGTTTTGTATTAATTTCAAATA:1 - chr3R 13559930 3' - jockey 4779 1 73.97 AAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACATATATTTTTATTCTAATTGATATATAACGATTGCAAGTCTAACTACTATTTGCAGCTCAGATGAACACATG:1 + chr3L 3661165 3' - X-element 61 1 50.71 CTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAGAAGATATCTCTATTTTAAATTAATATTTATATATTTTTCTATTCTTTATTGTTTGTTATTTATAAATCAGGTTACAAAGTAAATTAGCGTAACT:1 + chr3R 7579515 3' - Stalker2 7274 2 67.59 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGAC:1 - chrX 20361958 3' + hopper2 1543 1 62.33 ATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGATTCTTCACGACTTCTAGACGTTTTCCCGTCCG:1 - chr2L 23310576 3' - 1360 14 1 76.03 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTCAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTGCTG:1 - chrX 20361928 3' + hopper 1382 1 61.11 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCCTGAAAGCACCT:1 - chr3R 12613733 3' - HMS-Beagle 6819 2 68.12 GAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGA:1 - chr2R 7727109 3' - BS 4705 1 53.42 AGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGCTGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACT:1 + chr3L 10033662 3' - blood 7132 2 35.17 TATTAACACACACACACACACACACACACACACACACACACTCCATGCACTCATGTGTGTCGGCAAGCACAATCATAAATAAAC:1 + chr3R 25165221 3' + accord 7026 2 75.00 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTTGAATGTGGGTGTGTGTCTGTGTGTCTCGGA:1 + chr3L 5159333 3' - hopper 39 1 56.16 AATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTAGTACACTGGCCG:1 - chr3L 9324401 3' - HMS-Beagle2 11 2 76.71 GTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTT:1 + chr2L 15019958 3' - BS 4854 1 58.39 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACG:1 - chr2L 15874862 3' + mdg1 346 2 69.86 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAAATCA:1 + chr2L 16884948 3' + pogo 2082 1 71.23 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGATTATCGTGAAAGAGTTTTGAGTTCCGTTTCGCTGTA:1 - chr2R 14385596 3' - jockey 75 1 69.77 CAGATCGCGTTCGATATCTCTGGCATAATATGATGTTTTTATGCTATGCTATGATGCTTAGGTCCAGTTCTTTTTGAATGTTTTAAATCATTATGTTTTTAAACTTACTTTAATAACCAAAATAGTCAAATTTAAACAATTTTTG:1 - chr2R 4887632 3' - jockey2 3017 1 73.10 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCGTGTGACTG:1 + chr2R 14072596 3' - mdg3 5320 2 61.64 ACAAAATCCTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTAC:1 + chr3L 6015653 3' - roo 8747 2 76.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTA:1 - chr3L 11535917 3' - roo 8740 2 76.87 GCCGACAATTTAGAGATTCCCCAATTTGGTCAAAAAGACCAAATATGATTTTGCGTTTGGTTTAATTGCTGTTCGGTCTTGTTAGCTGATTTATTTTGGCCAACCTTCGTCCCACGAACCAATGGAGGGTG:1 + chr3R 8049030 3' - Q-element 113 2 67.94 AAAACAAATGCTTTTTTTTTTTGGGTTACTTACAAACGTACATTTTTATAATCTGTACCTAATAAAAAGGGTTAGGTGGTGATATGTTTTAAAA:1 - chrX 18811929 3' - HMS-Beagle2 497 1 86.17 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCGCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAGTGTGCAAAGCGAAAATCCGGAAAGTATGCAGCAGAGTGTGTGAGTGTGTGTGTGCTG:2 + chr2R 22053338 3' + jockey 4953 1 42.47 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCACTGTGGATCTTAGACAAACA:1 - chr2L 15874821 3' + mdg1 388 2 62.76 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAA:1 + chr2R 4816973 3' + blood 7336 1 61.38 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTT:1 + chr2R 24427610 3' + 1360 3315 1 68.49 GAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAAGCCTGCTTGCATGTGCAAAGCTGCATTTGTTTGCACAACTTAGATCCCTT:1 + chr2R 2980288 3' - 1360 69 1 72.60 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTCAACAATTTTTTTAAGGCTATGGTATTACAGCTCAGGTATAGCTACTAATAACTACTAATGA:1 - chr3L 2167584 3' + opus 7449 2 57.53 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTAAGAGAGGTCTC:1 - chr2R 21713241 3' - P-element 51 1 41.54 CGATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTATGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCAC:1 - chr3R 26854773 3' - jockey 86 1 74.07 TGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAAT:1 + chr2R 19633305 3' - jockey 4799 1 51.22 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACGTAAAA:1 - chr3L 15718042 3' - 1360 34 1 53.79 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACCACTTGGCAAATGCAAATAATTAAATATATGATGATTTCACCAAGAGAGCATTTGCCATTT:1 - chrX 8314438 3' - roo 8724 2 59.59 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACA:1 - chr2L 15874844 3' + mdg1 373 2 54.74 AGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATATTATAGCATTGTAAGATGGTCATGTTTCCAAATACTTTAGAGAACTCTTAAAAACAGAAGTCGATATTATTAG:1 + chr3R 13255011 3' - roo 8703 2 56.83 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCATAAACATCACTCT:1 + chr2R 17269192 3' - roo 73 2 71.03 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCA:1 + chrX 7702841 3' - P-element 48 1 52.74 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTTAATT:1 + chr3L 17268316 3' - hobo 84 1 74.66 CTAACTGTAGTTAGCTTTTTCAAATTTACAGTAATTTAACTACAATTACATAACAAGTACGGAGTTTGTAAAATACTTAATATTAGCTAAGTCCGTGCGAGCGTAGCCAAACAAGGCAACTAATTCC:1 - chr3L 11833416 3' - X-element 4620 1 58.27 CACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCAGCGGGCAAGCAAAATTGCATTGAG:1 - chr3L 17500729 3' + Tirant 8436 2 66.44 ACAAATAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTT:1 - chr2R 6767987 3' - pogo 54 1 56.16 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGTTAAATTCAACACATTTT:1 - chr3L 2317115 3' + 412 449 2 48.97 TTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGCAACGGTAAAAGCAAAATAGATAAGCTTTTTTGTGCAC:1 - chr3L 27190333 3' - copia 4954 2 77.24 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACCAAAAAACTAAGCTAATAGCATATCCAACCTGGTAGTAATTAAAATGCACTCTCTTAATGTCA:1 - chr2L 388495 3' - roo 8680 2 69.60 TTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTATTAAATGTTAACAAATTTCTTTGATTTTATTTC:1 - chrX 6216305 3' - Juan 3992 1 55.48 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGACTCGGGCA:1 + chr2R 18887080 3' - roo 40 2 56.43 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTGGCAGTGAGGGCGTAAAAAACGGCACCGCAATTGTTTTTGCCCGCTGCGAACGGCGCAAT:1 - chr2L 2057753 3' - 412 12 2 77.40 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGCCGCCGTACTTACGGTTTGCGCAATATCATACGCAGTGTG:1 + chr2R 6768127 3' + pogo 2069 1 62.76 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACT:1 - chr3L 15393679 3' - pogo 55 1 56.16 CGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGCACTTGGTA:1 - chr2L 20761838 3' - Doc 417 1 65.75 AAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTGTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGACAAGCTA:1 + chr3L 11684943 3' + Bari1 1689 1 64.00 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGAGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCGAAGATACTTAGCTGCAATAGAAGTCAATTTTCNTGGTATACTAAAAC:1 + chr3L 10897565 3' + roo 9036 1 58.22 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATAATTTTTGAA:1 - chrX 21668559 3' - I-element 76 1 73.29 AAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGCAGCGCGCTAAGCCAGAGATCTGCTTTGAAGCTTTTGATTTATTTGCTTGATGGCAAATCATTAATT:1 - chr3L 22330922 3' + hopper2 1557 1 52.05 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACA:1 - chrX 22679619 3' - Doc 64 1 45.21 GTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTGTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATTAGTGGTGAGCGCGAGTTTTCTTTTCTCTGC:1 + chrX 20949702 3' - jockey 4563 1 62.38 AGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGCTGCA:1 + chr3R 31112313 3' + mdg1 7434 2 66.44 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTCATTATCATAAAAAATTTATACAAAT:1 - chr3R 24480441 3' - blood 7050 2 57.14 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGT:1 - 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P-element 2853 1 72.60 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTT:1 + chr2L 20133052 3' + 297 321 2 75.38 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGTTGCGTCAGAAGTTCTGAAAGAGGGAACTTCAGCACAAACTACCAAATTGAATAAGGGAAACTTCG:1 - chr2R 9341503 3' - roo 23 2 50.00 GGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTTGAGAAAAATGTTCCCACAAGTAGTTGTATTCATGTAAGCGG:1 - chr3L 27349975 3' - 297 15 2 65.91 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATATTGACCATTTGCTAAACGATAATTC:1 - chr3L 13285566 3' + roo 9037 1 58.52 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCC:1 + chr3R 5870887 3' - roo 8737 2 70.55 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGGCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGC:1 - 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297 39 2 46.58 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTA:1 + chr3R 24084880 3' + roo 341 2 63.70 ACAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAA:1 - chr3L 9317956 3' + P-element 2847 1 60.00 TAAGTTAACAGAATGTAACTTTAACATCTTACGAAAGTTTTGTTGTTAGGTTCTTTTAGACCAAAAGAAAAGTTCGTAACTCTCAGCGAAAGCTTATATTTTTAATTTCCGGTCAGAGCTTTAAGTTCAGGAACCAAAACTTC:1 - chr2R 21417215 3' - accord2 425 1 53.15 CTTATTAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTATATCAGAGGTATTGGAATTGGAAAAGAATTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCACATCAAAGATTTTTGCTGAAGGAGCGCTAAC:1 - chr3R 4562706 3' + mdg1 7390 2 49.32 CTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTC:1 - chr3R 20983875 3' - hopper 82 1 70.55 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCGTGAACGTGATTAAATTAATTTTCGGACCCT:2 - chr2R 15392487 3' + mdg1 7431 2 65.07 TGTTTTTCTTTAATTTTTTTTTTCTTTTCCAATGCCAGTACCCAGTGCGAAGTAAACCCCCTCCTCGGCGTTCCTTCTGCTAGGTTTTCTGGG:1 + chr3R 29273933 3' + Tc3 77 1 89.25 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGG:1 - chr2R 23094889 3' + 412 412 2 75.34 CTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAATATAGCTA:1 - chr2L 15420027 3' + Burdock 6327 2 67.81 CCAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAACAGCCGGCAAACACGAATATCTTCAGCTGGAA:1 - chr2R 9607295 3' + P-element 2858 1 54.55 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATCTAAAGCACTAAGTATCCCTTAGTCGTCAAAACCTA:1 - chr2L 4244842 3' - 412 24 2 65.75 TTTTTTGTTTTTTTTTTTAAATATGCATTGTTGAAGGATATGGCGGGGGGAAA:1 + chr2L 6893690 3' - TART-B 10633 2 66.04 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTC:1 - chr3R 20841379 3' - Juan 50 1 49.32 AGAGCAGCGTATATATATATGTGTATATGAGAGAGAGAGGGCTTATGCGCACATATGAGCGATCAGCGCTTGGCCAGCGTGAGAACTGCTGACCATGCAATTATGTACGTTAGCCCTCAAGTGGGTGCTCGTATTACGTATACACT:1 - chr2R 4794622 3' - blood 190 2 65.07 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCATT:1 - chr3L 23146434 3' - 1360 24 1 69.18 TGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGCCATA:1 + chr3L 18549793 3' - X-element 87 1 67.81 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATGTCAATCAACAATTTGGTGCAATAATCTTTGGGAAATCATTTT:1 + chr3L 5027258 3' - roo 8732 2 69.63 AGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTGATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATACAGCCCGCAAAAGTTAATTTTACAATGCACCGGATTCTTAAATTTGTTATATAAAAAAAAAGCAATTTTCTAATCGTTTTAGAA:1 - chr2R 5308507 3' - hopper 1365 1 63.01 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGT:1 + chr3L 9907334 3' - BS 5081 1 76.03 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCTTCT:1 - chr3R 7074812 3' - P-element 74 1 39.73 TGTGTTTTTCACAAGTATGCAAATTTGAAGTATTTTAGTATTAATACATTGGAAATACGTTAAACTGTTATGATACAGCCCGCAAAAGTTACAATAAGGTGATGGTTGCGCTATGTCACGTTCTACACGTTGTTTGACCTTATTAC:1 - chr2R 5295509 3' - hopper 1378 1 62.33 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGG:1 - chr3R 27606608 3' - 412 67 2 64.14 TATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCCT:1 + chr2R 5321239 3' + INE-1 509 1 68.49 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAGGTGGGTCTTTAACGAGGCGTTGCACTTCGCAAGAAGCTCTCTTTGAT:1 + chr2R 16567417 3' + opus 484 2 76.03 CTTAGCTAAAGACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAAAATAAATGTTTATCTCTTTATTTGAATGTGTATAATCCTTCAACTGGCT:1 - chr2R 10118995 3' + Juan 4139 1 67.59 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCCAC:1 - chr3R 9298440 3' - hopper 36 1 60.69 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAA:1 - chr2R 18886952 3' + roo 358 2 53.10 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTC:2 - chrX 292006 3' - 412 78 2 70.55 CGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTGGCAGTTTGTTG:1 + chrX 21668396 3' + opus 7487 2 47.59 AAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCGCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAGTGTGCAAAGCGAAAATCCGGAAAGTATGCAGCAG:1 + chrX 9165376 3' + jockey 4931 1 57.93 CTAAGTCAGCGAAAGCAAANCCGCTAGCAATAAACGGTACTGCTGCACTGCCAGCAAAACAAAACGAAAACGTAAACAAAAAAGCTGACTAGTTAGTGGAAAAATTTGCTAAACATTTCGCTTGAATTTTCTTGCAGGGC:1 + chr2R 17351075 3' + F-element 493 1 61.43 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCT:1 - chr3L 20061336 3' + roo 349 2 59.86 AGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGTCAAACCCTCGTATCTTTTTTTTTTCGCCATGTTGCCAGCCAAATATAACTCCACTCTCTAACTCTGTGGCG:1 - chrX 18252966 3' + G2 101 1 63.92 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTAGCCTTCGTATTC:1 - chr3R 5870782 3' + roo 9027 1 52.05 GCTGAACAAATTTGAATAAATTTTAAGTAACTCGAGTAGGTTTAGTCTTTTAATTGGTAAAGACGAAAATAGATGCATTCGAGAAATATGCTGAAGAAGTAATTGTTTTATGTATGTTCACAAATTTATGGAACCAAAAATGTTTA:1 + chr3R 19362516 3' + hopper 995 2 71.92 TATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGAT:1 - chr2L 18219291 3' + copia 241 1 49.32 AATATAAATTTTAAAATTTCTTTAGTTTGTCATATTCCATGCCGTTTCGTGTAAATACATTTCATTTCTTTAAAAGTAAATGTACTAATTAAAGTATATCACCCCCGAGACGGAAAACCGAAAAGTATAATTTAGTTGTTTAATG:1 + chr3R 15961788 3' - 1360 3037 1 58.62 CCAACGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTG:1 - chr3R 12078614 3' + hopper 1348 1 63.01 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTT:2 - chr3R 15283653 3' - BS 5074 1 69.66 TTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAA:1 - chr3R 12948610 3' - Stalker 6919 4 63.01 GGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAA:1 + chr3R 11568661 3' + BS 5019 1 71.13 CGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGAAAAATCAAATAAAAACCTAAGTCAGCCTAACGGCTG:1 - chrX 21948969 3' + 412 307 2 79.26 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTGTCTCTACTTAAGGAATTTAATTTGGGAAGTAGAAACGGAAAAGCCAG:1 + chr3R 30087829 3' - roo 21 2 71.94 ATATANGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAG:1 - chr3L 414843 3' + 412 444 2 54.14 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAGCATTTATAAAGAGTACATT:1 - chr3R 26472777 3' + 1360 3356 1 60.00 ATTGTTTTTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATTAATTAAATGTAACTTATTTGTTTCTTTTGCTGCATTTCTTAAGTTAAAAGTGCCATCATCCATGACATGAAAAGCTAACTAGATCAAACTA:1 + chrX 8876977 3' - mdg1 7056 2 70.90 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGAACTCACACCCTTTTAACCATATTTGCAGCTGCAGTTCAGGGTTTATT:1 + chr2L 20228039 3' - 1360 73 1 69.86 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCC:1 + chr3R 4527286 3' + mdg1 7397 2 59.59 GAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTA:1 + chr2L 20628675 3' + Stalker2 400 2 73.40 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTA:1 - chr3R 15003096 3' - Doc 43 1 58.22 AACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGCCAGTACATGTAGCAAGTTTTCCTTATTTCTTTTTCTAGCTAGAGAAAAGGAATATAGATGGATTGATAGGAAAAAACGAGAAAGAGCGATTGAACAAA:1 - chr3L 5050995 3' - flea 19 2 69.18 TCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAAGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGGAGAGTT:1 - chr3L 4547693 3' + mdg3 173 2 65.00 ACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATA:1 - chr2R 961128 3' + transib2 2672 1 61.43 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAATAGCAATTATATTACTAAAAGAAATTGACAGTTAAATTAAAAACAATCCTATTTTAATATTAGCCAACTT:1 - chr3R 20200373 3' + Transpac 5182 2 51.37 CCTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAG:1 + chr3L 2317201 3' - 412 7145 2 80.82 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAGATTTTAG:1 + chr4 549214 3' + flea 236 2 73.10 TTGCGGAGATTCAGGTGGGGTTTGACGGGTTTGGTTGGTCTTCTTGCTTTGAGCCTGGTTCTGGTACTATGAAAATCGCGTGCACTTAAATGATTGACCAGCCAGCAACGGCAATGGCGAGGAACCCTTGGTGTTCGGCCGCAG:1 + chr2L 149943 3' - G2 129 1 77.08 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTATACTCGTAGTCTTGTCGATACAGCAAAGACGGGAGTTCTACGGTCTGGCACAGGTCACAACAAACGCGCAGCTGACTGAAATGCGCACGCAGACGCGTGCC:1 + chrX 22834789 3' + mdg3 227 2 77.14 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAAGTTGCGGAGTTTG:1 + chr3L 8249495 3' + mdg1 7418 2 55.48 AGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATTATAAATCTATATGGGATT:1 - chr2R 7720021 3' - HMS-Beagle 12 2 77.40 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTC:1 - chrX 14317418 3' - 1360 63 1 63.20 AGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAAAGACCTTTATTTAGCTAATTAGAGTTAATCGGTGTTCCTTTTG:1 - chrX 21442976 3' + Transpac 5162 2 66.92 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTTAAATAAATTATCTA:1 + chr3L 10897589 3' + roo 397 1 78.08 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACNGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCANAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGT:1 - chr2R 5953807 3' - roo 69 2 63.01 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATGCGTGCTCGGGCCCGTGGTAAAGTATATACGATATAATACAA:1 - chr3R 17924414 3' - Burdock 36 2 56.93 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGCTCGG:1 + chr2L 6149168 3' - hopper 73 1 75.78 GGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATG:1 - chr2L 15019882 3' + BS 5024 1 64.38 AATTTGAATTTGAATTTGAAATATATTTACAATAAATTTAAATGAGGTCTGGATATTCAACTGTTATTACTAAGTCAATAAAACCGTAAAAAATATAAAACAAATTTTTACCGACATGTGAAAAATAGTTAGATGATTTGGTATCA:1 - chr3L 14920325 3' - Rt1a 310 2 54.79 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGACATTCATTAGTTTATCGCCCACTGGCAACTGTTGGGTCGAAAGTTATTAGCGACAGTTTAAAATTAAATTGGCCTGAAATTTTCTTTTATTTC:1 + chrX 14735857 3' + diver 6064 2 62.33 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATG:1 - chr3R 19965194 3' - jockey 33 1 64.93 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCTTGGTCGTGTGCCTGAGTTTAGTGGGTGAAATTGGTTGCCTGACTT:1 + chr3L 20680413 3' + 412 7527 2 70.14 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTGCATATTTGGCTCACTGAAAGCGGGGCCACCG:1 - chrX 18673679 3' - roo 56 2 73.04 TAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCAGAACGGGCGG:1 - chr2L 20407728 3' - McClintock 5967 2 75.00 GCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAACATTACTGTATTCGAGAACGAGACGCTGACCATTGCTTTTTGTGTTTAATGATCAGAAATCTAATCG:1 - chr2R 16567230 3' - opus 23 2 68.49 TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCA:1 - chr3R 19506739 3' - mdg3 5328 2 67.59 TGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTGGCTCTCTTATACTGCACCGCACAGCGAGCACTTATAAAGGC:1 + chr3L 1463773 3' + P-element 2863 1 69.66 CTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCGTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCGTAAACAAGCGGCAGCACAAAGGCAACACA:1 + chrX 21233391 3' - roo 8755 2 83.45 CCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTATGTATATGTCTTAAAAGTTAGTTCTAGGAGATTTTAATATACAA:1 + chr4 1266625 3' - HMS-Beagle 17 2 72.66 AAGTTAAGTTAATCCTTTTTTTCCTTAATTAATATTATTCTTTGCACATTGGGTAGATATGTGACCCTGTTCACCGCACTTGTAGCAAGTTACACTTGATTTTCCGCGT:1 + chr3L 26057557 3' - gypsy7 371 1 66.06 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAACGGAGCCCTCTTC:1 + chr2L 14616269 3' + P-element 2860 1 58.26 GACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATACATATACGTTTTATGACAGAGAGTCAAAAACATTTTCTCTAATTTTCCTGC:1 + chr3R 26180517 3' + Transpac 247 2 67.12 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTAAGTCAAATATATTTCATGCTTCACCCAAAACTTTATACGATTAAGACTGTGAGTTGACTAAAATAGTTTCCACGCAGGACATTCCTT:1 + chr2L 20029506 3' - I-element 40 1 58.90 CACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCAATCCACACTGCACTTGTGCAATCCAACG:2 + chr3R 10148831 3' - 17.6 54 1 59.59 CGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGCAGTATTGTTTCTAAATGCCGTATGACGCCATTGCAGTTTAATGAATCCTTAAAGCGCTTTAAGATTTT:1 + chr3R 12622390 3' - 1360 169 1 59.29 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTNTTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAANTTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACC:1 - chr3L 7024447 3' - 412 62 2 57.24 ATAAGATAAGATAAGATAAGAAATATAAATAACTATATAAGTATCCAAACATTAAACCTGCTATGTTATTAAAGCGGAAATCTTAATGTATTTCCTTTTTAAACAAAATTCTTAAATTTACAAATATCTATCAGTGAAAGGCTTGA:1 - chr3R 15768155 3' + Stalker3T 206 1 78.08 CGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAACGTCAAC:1 + chr3L 27391436 3' - 1360 10 2 67.81 ATAAATAAAAGGATAAAAAAAACAACAACATCGATAGAACGAACCAGAATTTGTGGAGCGAAGTGTCTTAAAAGAGATTGTGTGGTTAAGGATATTCTGCGGAAGTGGCGTGTGCTAAGCCTCGAATAACAAACTTGGTTTTC:1 + chr2L 9283040 3' + G2 3062 1 74.83 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGGTGAAAAGTATGCAGATTACGTGGCTAAACATAACTGAATTCTATAGGGACTTAAGTTTTGAACCGCAGCTCTATTAAAATTTGGTTATTTTACATTAACATTAAGAACGTGTACAGTTCCGTT:1 + chrX 17048307 3' - jockey 11 1 74.66 AAAAAAAAAATTAAGTTAACTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCACAAGCTTAAA:1 + chrX 6538749 3' + pogo 2034 1 63.70 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAATTAAAAGTTCTCCAAATTTAGCTATACATCCAGTACAAAAGACCTTGATCATTTC:1 - chr2R 14884046 3' + roo 386 2 68.28 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGAGTATGTATACAATATGAGTGAGAAGGGCAAGCTATAGTTATGTTGT:1 + chr2L 5207526 3' + opus 7431 2 73.29 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTGTTGCATACTTTTAGGCCTCGCTTGAAAAAGATTCAAATTTGGG:1 - chr2R 20972631 3' - jockey 4705 1 60.27 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAA:1 - chr2R 7895545 3' + mdg1 7377 2 71.92 ATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACAACAACTTAGAACTTACTTTTACATCAT:1 + chr2L 23295897 3' - micropia 5022 4 54.11 AGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGTCCGTTACACATCTTGTTATTCTAATGTCTT:1 + chr2R 4618430 3' - blood 119 2 37.93 TCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTGATCCGCAGATGTTTTCGCTCATCTCTGGCGAAAAATTACTCTTCCT:1 - chr3L 17482086 3' + 297 324 2 70.55 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGT:1 - chr3L 15148597 3' + roo 8993 2 71.92 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAAGCGAAGCCAGAAGCTATGAGCAAAGCAAGAAGATGGCAGAGTGAG:1 + chr4 317850 3' - Tirant 8133 2 57.14 TAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAATAAAAAATATTATCAAATAATGAATAATAACGAACGTAGATTGTTTAGGGGAATATTGTATATATAGTATATGGTACTTTTTTAGTTTCGTACTGAAGAGTATGTA:1 + chr2R 13090998 3' + I-element 5333 1 64.83 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTACATGCTG:1 + chr2L 19800970 3' - flea 28 2 55.46 ATACCCCTTATCTTAATTCATTGTAGATCTAACTATGAGATGCATGACCCTTACAGAGTATTATTCTGACTATAATATTATACTGCCTTTCAATATAATAATATTATTTAATAACACTGACGGGGACCAACAAAACAGATAAATTG:1 + chr3L 24366219 3' + Cr1a 4136 1 52.74 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAGAAAAGCACGGCAAACGAGTGAAAATGGATAAGTGAAATGGATAAGTTAACGAGCAGCAGCACCCA:1 - chr2R 11153089 3' + roo 400 1 76.43 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACA:1 - chr3R 19965206 3' - jockey 58 1 51.37 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATATATGTACATACATATGTACATTTAAATAATTGCTTTTGGAAGGGCGAGAACTAAATAGTCAACTATATAATCTGTTCAATCT:1 - chrX 20149106 3' - pogo 35 1 61.38 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATGTATATAGTACGAATTAGCACAAGATACACATCGCTTTTGGGGATGTTTGGTTAGTCGATGATAAACACATAACAATAAACACCTTT:1 + chr3R 5704237 3' - 412 7085 2 64.38 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGACTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTCGACCGCACTGACTGCCTCAATG:1 - chr3R 29283161 3' + hopper 1400 1 67.77 CCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAATATGCAATTTCGCTTTTCACTGGCTG:1 + chr3R 23636445 3' - X-element 4272 1 47.29 GTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTTGAATATATAGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACTAGGTACGGCATCTGCTTATGACATCTCCCATCAGAGCTATATTTCGGATGGAAATA:1 + chr2R 9749979 3' - P-element 2756 1 31.03 CATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATC:1 + chr3L 11364867 3' - Tirant 78 2 73.33 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATT:1 + chr2R 9607365 3' - P-element 84 1 28.28 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGTTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACAAGAAGCGAAAAAGGGTTTGCCTGCG:1 - chr2R 11777944 3' - hopper 25 1 67.14 GCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACGAATGGTGATGGTGATGGTGATGGGTGACGGGTAAATGGCATATGGATGGGTATGAAAAGAGAAGCTAAGGCCAATATTGAAG:1 + chr2L 14892673 3' + jockey 4643 1 54.48 GGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAATATGCACATTGCTGCTCGAACGAAAA:1 + chr2R 12827075 3' - Burdock 6193 2 58.90 TTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAAC:1 + chr2R 6493383 3' + copia 236 1 52.05 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTCAGACACACACACACAGCAGGCCGTTGTGCTCATTTATCTTTTATTTTTATAAAATTTTC:1 + chr3L 17500826 3' - Tirant 54 2 57.45 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGATGTATTATAG:1 - chr2L 18219282 3' + copia 250 1 55.48 CGTACTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCAGAGGGAAATACTATGAATCGGTGAGGGCACTTTGAATTTTGTGTGAGCAGTTAACGAACAAACACAAACTAAG:1 - chr2R 25056160 3' - G5A 2708 1 59.52 AAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTTAATTGCATAATAGCTATAATTTAGATTCAAATGACACAATATAATAATTCAGATTTAAATATCATATTTGCTTATTCATTTGCTAATTAGTGCAAAAAAC:1 + chr3R 31114412 3' + flea 239 2 71.23 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCACCGAG:1 + chrX 683625 3' - jockey 62 1 54.89 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATGTATATAGTACGAATTAGCACAAGATACACATCGCTTTTGGGGATGTTTGGTTA:1 + chr3R 5704204 3' - 412 7118 2 63.70 TTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTA:1 - chr2R 23094866 3' + 412 7489 2 59.31 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTAA:1 - chr3R 15003095 3' - Doc 42 1 58.90 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTTTTTACCCCTCCCCACCCCCCACGAACTTTTTCTTTTCTTTTTGCCCCACTTGACAACTCAATTTATTTAGATTAATCTCTCATCTT:1 - chr2L 3661916 3' + blood 7377 2 75.19 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAGTATTCTCTATAATTGT:1 + chr2R 9453407 3' - roo 8694 2 64.38 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGAGGACGACCAG:1 - chr3R 28014102 3' - roo 17 2 60.42 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACAAATTTACTGCACTTTGAATCCCTTGACATGTGTCGGAAAAAGTTTTTGCCCAGCTTGG:1 - chr2L 2241174 3' + roo 392 2 72.60 TAGCGTTGGGTGTGGTGGTCTTGTTTGTACAGATATCTTTTCGTTACATACAATAATGAATAAGACCAAGAAATTGAACGTGCTTACAGTTCCCAAAGTTAAGTAATTTCAAAAGATAACGGGCGATCAATGAGTTATGAGCC:1 - chr2R 23874442 3' - Gypsy12A_LTR 2175 1 61.54 ATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCTTGGAATTGCATTCTTATCAGTAAAGTGCAGATGCTGTAGCTACCA:1 - chr3R 15283604 3' - BS 5025 1 63.45 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCC:1 - chr3R 8563550 3' - 297 6620 2 62.86 CGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACCATAAGCAGTAAGAATTGAATTAT:1 + chr3R 10144494 3' - Chimpo 34 1 62.33 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTAATGTCTAAGTAC:1 - chr3L 25206773 3' - HMS-Beagle 18 2 72.14 TTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCGCTGGGAATATTGTTGAATATATATATACAACTAGCGGA:1 - chr3L 25483072 3' - transib2 86 1 70.55 GGGTGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACTGTATAGTATAGTGTCTTGAAACCATAACATAGCCT:1 - chr2L 1044988 3' - mdg3 83 2 72.92 AGGATCAATAGCCGAGTCGAGACAAGTCGTCCGTCTGTCTGTCCGTATAAACGTCGGGCTCACAGGAAGTATAAAAGATAGGAAGTTAGTTGTAAGAAAGTGTGCAGATTCGCAGCACATGTTAACTTAACCTATATATGTATGT:1 - chrX 22872348 3' + INE-1 96 1 75.17 ATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTACTTTAAGACACATTTTAAATTTTAATTGTAATATATTCACATCATCAAAAATATTTATTATTA:1 + chr3R 20200531 3' - Transpac 22 2 65.07 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCAC:1 - chr3R 31114255 3' - flea 49 2 53.79 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGGAAATCGACTTGACATAGCATTGCCATGAATTAAGTGC:1 - chrX 16547441 3' + P-element 2850 1 59.31 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGGACAAACCGTTGCAATTGCCTTCTAGTTGCTGTGTGCCGATGTGATAAATTTGAAAATGAGCTTCTCCTCGTTGTACAAAATATAATTTTTTTTCTGAAACGTT:1 - chr3L 2907245 3' - 412 16 2 72.41 ATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCAATCCAGCACTTTCCATTTCGGTGTTTGGCG:1 + chr3L 7751132 3' + 412 7493 2 53.47 AGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCTG:1 - chr2R 12185290 3' + accord 7363 2 65.15 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCGGGTCACCGTTGACAGGACTGCCTACACCGCCGGTCC:1 - chr3L 22518903 3' - hopper 13 1 70.43 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGCGAAAGGCGAAAACAAAAATCAAATAAATGGCAATTTAATACACTCAACATGCCATTCGAAAGCACCAACGATTGCTGTTTTTGTGTTGAAATTGTTATTG:1 - chr3R 7625258 3' - hopper 16 1 74.31 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTA:1 + chr2L 12236844 3' - jockey 61 1 53.42 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGCTAAATTCC:1 + chr2R 19230573 3' - I-element 75 1 77.54 TTATTGAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGA:1 - chr2L 18219292 3' + copia 240 1 48.63 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTAACCAGTTCCGCCCAGCCTTCCG:1 - chr2R 23094844 3' + 412 7512 2 61.11 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCAATGATGTATTGCCGCCTGTGGTGG:1 + chr3L 23796359 3' + 1360 3354 1 52.80 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCC:1 + chr3R 7625378 3' - hopper 24 1 56.47 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATGTGTGGGTGAACTGGTGTAGGTATATTCGA:1 - chr3R 21794001 3' + hopper 1412 2 82.31 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTAA:1 - chr3R 20904929 3' + roo 9043 1 64.38 TCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTATTTCCTTTTAAATTACACTTTTAAACCCAACTAAATTATTTCTAGCC:1 + chr3L 14888856 3' - flea 4825 1 69.18 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCG:1 - chr2L 4864385 3' - mdg3 5320 2 65.47 TTGTTCAAAAGTGTGGGCGGGACCGGCTTTAGGGTGTTAGAGTAGGCGTCGTAAAATTTTATTGACAAATCGATATAAATTTACAAAACTAATACAAATGTGAACAAATTTAAACCAATATTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTT:1 + chr3R 4322609 3' - INE-1 252 1 68.49 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGG:1 + chr2L 12932175 3' - opus 7061 4 65.67 ATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATT:1 + chr2R 18931923 3' - blood 56 2 54.11 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGTGCCTGTTGTGTAATTTATTGCATACTTTTCGG:1 + chr3R 27315170 3' + jockey 4948 1 50.00 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGT:1 - chr2R 21796016 3' + roo 9010 2 61.64 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCT:1 + chr2R 12133828 3' - jockey 84 1 70.55 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAATATTTATCGCCCGTGTTTTCGCTCTCCAGTTTGATGG:1 + chr3L 6131972 3' - roo 18 2 73.79 CACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTAATTTGACTTTGCATCAAAATGGAAATATTACTTCATTTAA:1 + chr2L 12236884 3' - jockey 20 1 76.03 CAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAGATACTCAAAGAATACAGGGAATTACTCTGAACA:1 - chrX 13060132 3' + Tabor 483 2 77.40 CTCGGAGTCAGAGCCTAGGGAAGTCAAGCGCAAAGCAGCGAGCAGAGACGCAAACAGGGGATCACGATGTCAGCAAATGGCAAAACTGTCATTTTCTAAAGAATTTAAT:1 + chr3R 30959059 3' + G-element 435 1 53.21 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGTTCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTT:1 - chr2L 14262950 3' + P-element 2842 1 46.46 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTG:1 + chr2R 10411447 3' - 297 47 2 63.08 TACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGG:1 + chr2R 5621049 3' - ZAM 42 2 54.11 CGTATGGCGTTACGCATCTNGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGACTCACCCAATCACCCAAGTACCACTAACCCACCCACTCACTTTTGGAGACACCGGAGTAGATGCAATGATCATGATCTTCCGTTGAGCCGTTTCTTGTATG:1 + chr3R 20753027 3' - 1360 17 1 71.03 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGT:1 - chr3R 10030699 3' + BS 5039 1 55.71 ATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTCAAACTAAATAAGCTTTCAAACTGAAATAAGCTTTCATGTCTAC:1 - chr2L 21876776 3' - X-element 78 1 67.16 TACTTGGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGAC:1 + chr2L 14263050 3' - P-element 32 1 58.20 CGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCTAGCTTCTTTGAGCTTTAAAGCTGCTGTGGTTTCTTGTGGTGCATTAGATGGGTTGGTCTGGATT:1 - chrX 10737516 3' - FB 69 1 63.57 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAAC:1 + chr2L 4244972 3' + 412 7477 2 65.75 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTT:1 + chr3R 21794146 3' + hopper 1356 1 56.85 GCTGCCTGCGGGATCTTGCAGCCATACTTAAAATTCTTTTGTTGAACTAAGATCAGTCGACTGTGATTATTAGCACATTTTAAACACTGTGAACATTGTCAAGGTCGCCATGTAATGAGTGCTAGTTGATTAAAAGTATTTAGTTG:1 + chr3L 27411761 3' - hopper 454 1 72.60 TAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTC:1 + chr2L 18219405 3' - copia 4929 2 59.59 CGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCTTCGTATCTCAAAGCTGCCCATATCCTGTCCAACGCATTCGGAC:1 - chr3R 13254844 3' + roo 9062 1 78.77 GTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCG:1 + chr3R 10736133 3' - McClintock 57 2 61.64 GTTAACTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCCTACT:1 - chr2R 6236063 3' + P-element 2857 1 51.43 TGTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGGGCTCCTGAGCGAAATGGGG:1 - chr2R 19574448 3' - I-element 5179 1 76.03 CCGGCAGCGCAGCTACGCGGATTAGCCTAAGTCCCAATATATAAAAAAATGTGGGAGATACGCGAGACGGGGTAACC:1 + chr2R 22161134 3' + 412 312 2 59.74 TGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTAT:1 + chr2R 12185463 3' - accord 16 2 71.92 TGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTT:1 + chr2L 6637449 3' + 1731 4565 1 75.00 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTTAATTGTCCCGCTGGCACATTATGGCCAATGGGTGCCCGCAAACACACTCTAAAACACCAATGGCA:1 + chr3L 17268377 3' - hobo 2 1 80.00 TGTACATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGATCCTGGGCGAACTGCATGTTAACGTAGATTTTAACGAATGTTGACAATTACGAAAAATTTGGTTTCGGGTTAA:1 + chr3R 24484878 3' - accord 186 2 77.88 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCATTCAAATAAACTTTTCGTTCAAAACAA:2 + chrX 13628862 3' + roo 9042 1 65.75 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGC:1 - chr3L 14422694 3' - roo 8701 2 46.76 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAG:1 - chr2R 7895490 3' + mdg1 390 2 60.96 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAGGTGCGCCACTAAAC:1 - chrX 15198020 3' - Max-element 31 2 62.31 TTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACACTAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAGTCAGAAGATTAGC:1 + chr3L 24008429 3' - X-element 22 1 64.03 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAGTTGGACCCTCGTGCAAAATGTACAATAT:1 - chr2L 19248096 3' - mdg1 24 2 69.18 CGCATTCATTATTTTCGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACGACAAGTACATATCCGCTAACCACTTTAAGAATCTGAAATATCAGATTATTCAAAATACA:1 + chr2L 23295870 3' - micropia 5049 1 58.90 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGGATGAGCAATGTCTGGCTCTTATC:1 - chr3R 17627540 3' + roo 8993 2 79.23 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTG:1 + chr2R 558202 3' + copia 248 1 56.85 ATGATTAGTGAGAGGTTTGGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGT:1 + chr3R 19950507 3' + BS 5006 1 75.34 TAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCGCTGGGAATATTGTTGAATATATATATACAACTAGCGGATGTGAATTGTGTACATTGCGTAAGATTCGCCACTCTGCAAATTCTTATTTCTTC:1 - 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chr3R 6437410 3' - I-element 430 1 69.66 GCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGATCGAGATCGAATATAATGAAGGAATGCACATTTAATCGTTGAAAAATATTGAACTAAATTGGAGAGAGCTTTTATTAAACTCACTAATAACCTTGTTCGTCCTTATATAAATTATTAATTC:1 + chrX 14767114 3' - INE-1 149 1 54.79 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGC:1 - chr2L 4864398 3' - mdg3 88 2 76.03 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCGCAACCAGATTTCACCCAGGACCGCAAAATAGTACAAAAAAACAACCTAT:1 - chr3R 26854699 3' - jockey 21 1 73.79 TTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAA:1 - chr3R 29283188 3' + hopper 1400 1 62.77 TGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAGTTACCAACTGCTCAACTATTTATACTACTTTTCATTACCCACCTCAGCACCAGGATTTA:1 + chr2L 10909669 3' + 412 7539 2 57.53 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGGCAATTCCTTGGAGTGCATCTTAGTG:1 + chrX 666375 3' + 412 445 2 55.56 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTTTCTTAGACAAAACACAGATAAGATTCAGAAAATAAGAA:1 - chr2R 6699994 3' + roo 399 1 78.08 ACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTTGTGCCTCAAA:1 + chr3R 13869044 3' - HMS-Beagle 18 2 70.00 TATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTTATAAATGAAGTGCTAAATCTTGATTAACAATGACCAAACCAGATCTTAAAA:1 - chr3R 13613090 3' - copia 4936 2 65.75 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACATGTATGGGAAAACTACGCTAAATGAACTGCATTTTAAGATTTGAAAGCTGGCGAAATGCTCGAGGTTAAT:1 - chr3R 5704095 3' + 412 444 2 53.42 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACCTCATG:1 - chr2L 10461094 3' + roo 397 1 76.43 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCGAAGGGTAACTTTCATGTCGCGGACGATGAATGAACATCGATTAGAGCGCTACTA:1 - chr2L 17019046 3' + 412 7537 2 72.95 GTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAA:1 - chr3R 7074824 3' - P-element 86 1 31.51 TGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCCTGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGT:1 - chr3L 18183107 3' - Tirant 84 2 78.47 TATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACATATATATATGTATACAAAAAGCTACCTTTGTTTAAGTATACATGGAAAATTGATTGACTGACTGACTGCTTGACGGCTGATTGGCAGTTTGCTGGCCGGAGGGCGTG:1 + chr3R 17924579 3' + Burdock 249 2 76.06 GGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGATATATAACTCTTTAAATATTTTAAGGGCGTGTTTTACTACCTAAACTAATAAATGAGGCATATATTTAATTCACCTCTCAAGACTTCCAT:1 + chr2L 13229264 3' - roo 29 2 52.74 AAAACTGTAAATCAAAGGATTTTTTCTTAAACTCACAGGACCCAAGCACTGATATTTTTATGAACTCAGCTATATATACTCGTACTTCATAGGCTAATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTGAATCATTTTTATCTAATCAAGCATAC:1 + chr2R 5740030 3' + HB 1574 1 80.14 ACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCNTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGNATTCCACGGTATCCACCATTCGATGTGTAATTT:1 + chrX 13060307 3' - Tabor 44 2 50.00 TTATTATTGTGATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAATTTGTTGTTTAACAATTTGGCCATAAAAGCCATAAAACAAAGCCTGAGCATTGAAACTATAATGAAGTCCC:1 - chr3R 4527136 3' - mdg1 11 2 78.08 TACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTGGTAAAATTGCTGGGATC:1 - chr3L 2532404 3' - blood 12 2 72.73 CTCAAAAACATGTAATTTAAGTACACACTACATGAGTCAGTCACTTAGAGAGGAGGGACTTGTTTAAGTGTGTGAGTTCGTGAGTTCGTAGGGAGCTAACGCCCATAAGTGTGCTTTAATTTATGATGTGCTTTAATTATGATGAA:1 + chr2L 7931798 3' + roo 8794 2 62.33 TGTGTACTTATAGGTACAGNGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTC:1 + chr2R 18931934 3' - blood 7037 2 61.42 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCA:1 + chr3L 6131929 3' - roo 51 2 59.26 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATTAATTAAATGTAACTTATTTGTTTCTTTTGCTGCATTTCTTAAGTTAAAAGTGCCATCATCCATGACATGAAAAGCTAACTAGATCAAACTAACTGGGCATGCTCACAAGCCA:1 + chrX 8876998 3' - mdg1 7047 2 79.45 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGAGTTACTTTAATTTTGTACTTTGATTGCAGTGGAATATTTCAGACTTCTTTAATCAAAACCAAGACAAGCTAATGTCCACTCAGCTGCAGGATGTGT:1 - chr2L 8120091 3' - roo 21 2 71.23 TTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCAATCC:1 + chr3R 10148808 3' - 17.6 7004 2 75.86 TCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGCAGCATACTTTGCAGCGCCACATAC:1 - chr3L 17181426 3' - jockey 16 1 64.76 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCCCG:1 - chr3L 20680302 3' - 412 7144 2 81.51 AAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCC:1 - chr3R 11937786 3' - hopper 61 1 67.72 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCGCTACCAATATCCGCTACTTTAACTTCTTCCTCTAGTTTCGCAGGCAACTTTAGTGAAAGTT:1 - chr3R 31159188 3' + hobo 2922 1 61.54 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTT:1 + chr3R 17421329 3' + pogo 2066 1 47.95 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGCTCAGACAAACTTGTGCGCAATTTGGAGC:1 - chr2L 4864355 3' - mdg3 5296 2 52.41 TTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCA:2 - chr3R 25798377 3' + hopper 1345 1 64.38 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAAGGTGGTGTATTCTTTTTAATTATC:1 + chr3R 12519725 3' + roo 9039 1 63.01 TAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAA:1 + chrX 22824255 3' + Gypsy12A_LTR 2235 1 50.68 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGC:1 - chr3L 14422694 3' - roo 44 2 49.32 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTATGTAAGCCCACTCACAGAGGACGCCGTGGATGTATGGGTGTGTAGGGTCTGAAATTTTGCACACATTTACAATAATT:1 + chr2L 17574647 3' + hopper 1379 1 59.31 AATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTCGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACG:1 + chr2R 12102038 3' + hopper 1366 1 52.74 AAGAGGGTATGTAAGGGCATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGTCAATGGCTCAACCAGAGAATAAAATACCCCAAAAAAGGCAATAAAAACA:1 + chr3R 31198701 3' - Transpac 4926 2 75.71 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTT:1 - chr3R 17897120 3' - hopper 55 1 59.85 TCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAGCACTCTGGCTTATTTTATTGATTCAA:1 + chr3R 17421358 3' + pogo 2096 1 65.52 GAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCATTTTGCCAGATACGTTTTCGGCATTTGCTGTTTTT:1 - chr2L 20628492 3' - Stalker2 7245 1 50.00 TCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTTCTTAAAAATCAATACAACACGTGTTTTTTGTCT:1 + chr3L 1437948 3' - Transpac 83 2 74.66 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTTTCTGGAAACTTCAACTGCGAAGTATGCAATATATTTTTTGGGCCGACTAGAGACGTTTGCAGCCCGTTT:1 - chr2R 8315487 3' + hobo 2933 1 68.48 GGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTT:1 + chr2R 17350608 3' - F-element 67 1 52.05 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACACAATGCGGATTTGTGCGCCTTCCGTTAGCTATCGTT:1 + chr3R 23964885 3' + hobo 2885 1 68.70 GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAATCCCATAAATATTGCAAATGGTTACACTTAAGCTAAATGTAATTAAATTACGAAACGTTAAATCCAATTAAACCTTATT:1 + chr2L 18510841 3' + copia 252 1 59.44 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAGCGGTACCC:1 - chr3R 19134403 3' + transib2 2747 1 67.81 TTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACGGCAAGTGAAAAAGGCATGCAGGTCATTAAATTGTTGTTGTAAATT:1 - chr3R 20841327 3' - Juan 18 1 71.23 ATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAACGAAAGGTTTCGCTTAACAAATTGAGGGTTTATTCAATGATGTGTACAGATCGAGGTCTTCTTATCTACTGACATTTTTTAATTTAGGCCAAAAAAATGTTATACATAACTCACAATAGTATA:1 + chrX 23101442 3' - Transpac 5089 2 65.75 TGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCT:1 + chr2R 22796856 3' - jockey 4839 1 56.85 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAG:1 + chr3L 13057463 3' - 412 7100 2 52.78 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTATATGGGTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGTC:1 + chr2R 6768089 3' + pogo 2048 1 66.41 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGTTCGAAAACGCGAC:1 + chr3L 7389793 3' + roo 339 2 64.38 GACTTGGTCTCGAGTCTGCCTCTGTGTTGTGCCTCTGTGTATTGTGATTATGTATCGTGTATTGTGTTTGTGTTAAAAAAAACAAAAAACCACATTTTGTGCCTATTATATCGTTTCCATCTACGAGGATCCCGTTCAGCCCCAGC:1 - chr2L 5973633 3' + Stalker2 435 1 73.29 ATTAGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTGTGCATCCGATCATCTTCTTGTCCTTGGTGAAACCAGCTTCCACGAGGTACTGCGGCAC:1 + chr2L 19125929 3' - Idefix 187 1 59.31 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATG:1 + chrX 22862360 3' - jockey 79 1 72.39 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTC:1 - chr3R 27606606 3' - 412 66 2 63.01 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGATTTGCG:1 + chrX 684886 3' - jockey 4748 1 69.23 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATA:1 - chr2R 21796026 3' + roo 9006 2 67.14 ATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTTTCCTGCTCTCTCTCGTTCTTCGTTCGTGC:1 + chrX 1769777 3' + hopper2 1537 1 65.75 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAGCGGAAAATTCAA:1 + chr2R 9376741 3' - hopper 38 1 54.62 GGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGTCATTCGGCATCCCATCGATGCACTTTATGTGAGGTGACTTTGGCTGGCAATG:1 - chr3R 20752891 3' + 1360 3350 1 57.63 GGAGTTACGTTCATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTC:1 - chr3L 23797683 3' - Helena 1167 1 46.40 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATG:1 - chr3R 10733759 3' + mdg1 7371 2 76.71 ATTTAAACCGAAGATATTCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGAT:1 - chr2L 5728856 3' + roo 347 2 59.59 GAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAG:1 + chrX 22824256 3' + Gypsy12A_LTR 2237 1 51.72 TCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGG:1 - chr2R 20972692 3' - jockey 4717 1 71.13 CTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGAAGAACTTCCGGCAGCTCTCGGCCAT:1 - chr3R 7049325 3' - Burdock 6162 2 66.67 TACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCG:1 - chr3R 6419822 3' + Tabor 444 2 55.48 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATGTG:1 - chr3R 21794028 3' - hopper 46 1 54.79 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGT:1 + chr2L 2544820 3' + blood 7308 2 72.60 GGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGG:1 + chr3L 9318080 3' - P-element 2865 1 57.38 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAA:1 - chr3L 17181461 3' - jockey 93 1 73.97 CGGCTGTCTGTCCCGCCAATTGCCACTTCTTCGTCTGTCGGAAGAGACTAAAATTGTGCATTCGATATAGCTCTTTAGGCCTTGTCCTTATGTAGGTTTCGGATATATGTAGATATAAATTTCGCTGA:1 + chr2L 22215904 3' + diver2 195 2 59.38 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGACAACAAACGCACGTGCAGAAGTGCAAATTTATTTTTCTTGAAACACACCTAAAACATGTGTTAGGGCTACTGCCTTTAAGTCTAGCCGCTGATTCGG:1 + chr3R 26188660 3' - jockey 31 1 58.90 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTAAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGTTTATTATTGTCTCAGATATTTAGGGTTTTTTTATGTTATTATGAATAG:1 - chr3L 9695904 3' - 297 39 2 58.90 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATCCTCCATCCTCGTTGTCCCTGTCTCGGCGATGGCCTTGAAGTATGCTACACAAAATGTTCGCACATAATTAAG:1 - chrX 14360744 3' + jockey 4949 1 52.45 CTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAGGCTAGACAGAGATCTCCTAGGCTGCATATAAAAACTAACGCATTGAATGTTGCCACATAACCTACAAATC:1 - chr2R 5953903 3' - flea 4758 1 74.00 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGAAGAACTTCC:1 - chr3R 7049341 3' - Burdock 6183 2 55.48 ATAATAAAAACATCATCATAAAAAAAAAAGGTGGGTATATGTGCGATGGGTTTTGCTTGTTTCCCGACCAAAAGGAGCGGAAAATCACGCCTAATCGGGCACAGAGCAG:1 - chrX 550369 3' + jockey 4992 1 71.56 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCG:1 - chr2R 15392517 3' + mdg1 7401 2 56.85 GTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGG:1 + chr2R 20052462 3' + transib2 2743 1 76.76 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGGTGATAAGAAAGTTTTGGTAATAA:1 - chr3R 20887423 3' - Doc 79 1 73.13 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAA:1 - chr2R 18886946 3' + roo 9027 1 54.79 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTT:1 - chr2L 14056662 3' + pogo 2049 1 56.25 GCTATTTTATTCAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTTCTGATTGTT:1 - chrX 291953 3' - 412 7078 2 68.49 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGCGTTTATTGTATTTGACTTGATTTGTTTGGCATTGTCTCTGTCTATCTAATTGCTGTCTACAGAACTAGAATT:1 + chr2R 11778126 3' + hopper 1405 2 78.77 TGTAACATGATCACCCACTCGAAAGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACTCGAAGGCAAATCGAATCAAAGAAATAGCAAACAAACAAATAAGAAAGGAAAAGGAGACTCCTCTATGGTATTGTTGACAGGCCGCCGAAATG:1 + chr3L 13059930 3' + 412 7172 2 59.72 CTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAGCGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGT:1 - chr2R 12706164 3' - FB 74 1 66.44 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTAAT:1 - chr3L 11535915 3' - roo 42 2 67.65 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTGAGACAGCTGATTGCCTCATCAGGTAAATTGG:1 + chrX 10725085 3' + pogo 2047 1 59.03 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATG:1 + chr2L 12932159 3' - opus 7061 4 74.58 TTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTA:1 - chr3L 9324413 3' - HMS-Beagle2 6905 2 68.97 TATTTATGCAATGCAACTANGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGC:1 - chr2R 7314623 3' - blood 53 2 52.74 ACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGTAGGTGTGGCCGTGGGATCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAAGGGG:1 - chr3R 26759755 3' + Cr1a 4402 1 90.00 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCCGTACCACCGCCAT:1 - chr2R 5953756 3' - roo 8682 2 73.29 GAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGCATTAATATGAAAAATTATTATATTATTTACTTCGTATCCCAAAGAAAGCTTCTTTAATTTTTGAAAACCTTTTTCTTGATG:1 - chr3R 10420845 3' + Tabor 7287 2 55.56 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATAATTTTCGAAATTGTCATACCTATATTCGAAAAACAAAATTATAAAATTGCTAGAATTATACCATTACCACTCAACA:1 - chrX 21668492 3' - I-element 9 1 80.14 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACGCAAACAGTCGAGTGCGTGTGTGTGTGTGGGTGTG:1 - chr3R 27499993 3' - hopper 80 1 74.31 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACC:1 - chr2L 388557 3' - roo 10 2 64.91 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACATAAAAGCTATTACCAGCCAT:1 - chr3L 15718027 3' + 1360 3380 2 70.37 AATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTGAATGCCGACATGGTTGTGTCTGCTGCTGCCTCGGCTCGACTCTCGCAGGTCTCCGAGGACTCACAGGAC:1 - chr2R 12826954 3' + Burdock 241 2 67.54 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGACTGCTTCACCACTCGCCATCCCTCTCATTCGCTTGCTGTTATCAGTTTAAATTTCTTCTTCTGCCAGTCGCCATCCCG:1 + chr3L 5771002 3' - P-element 24 1 65.12 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGT:1 + chr3R 8197882 3' + pogo 2044 1 59.59 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCGT:1 + chr2L 18219433 3' - copia 4897 2 64.79 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTTGTCGTGCGTGACGACAACGAGTCTTCGTGGCCA:1 + chr3L 10033713 3' - blood 11 2 75.36 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTCCGGCACTCACTCACTCACTCTCCCTCTCTCTCTCTCGCTCTGTTCCTC:1 + chr3R 7851080 3' + P-element 2821 1 37.41 ACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTTTAATAAAAGCAAATATGCAATTTCGCTTTTCACT:1 + chr3R 23636440 3' - X-element 4288 1 55.00 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTTGTGCCTCAAATTGTTGATT:1 + chr3R 13869053 3' - HMS-Beagle 25 2 68.49 CTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATTAGTGGTGAGCGCGAGTTTTCTTT:1 + chrX 20949695 3' - jockey 4615 1 61.64 TCTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAACCATCTATATTAAATAACTTTGCTATTTCAATGTGCGGATGTCAGCCCA:1 + chr3L 11904858 3' - copia 72 2 69.86 GCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTTTAATTAAGTCTGAGCTGCGACTCGCTT:1 + chr3L 12991472 3' + mdg1 7426 2 61.15 CACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTTAT:1 + chr3R 9298607 3' + hopper 1396 1 71.23 TATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGTTTGCTCTGCATATGCGCAATCCATTCTAGCTATTATAGCATCAAAATTTAGTACTGTATTATGTGACGTAAGCATTACTTCCACGGGGA:1 + chr3L 23526495 3' + Tabor 7294 2 64.38 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCG:1 - chrX 20330563 3' + P-element 2783 1 14.58 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGTTTACC:1 + chr2L 2544852 3' + blood 7348 2 54.35 TAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTCACAATGCAAATATATGTACGAAATATATAAACAATTGTATTTCGAGACAATATTTACAAGCGTGGCCAGCTGCGACAAAAAAA:1 - chr2L 9704747 3' + roo 9035 1 59.31 CGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATTGTATCTTTGTATATTGATATCATAATATCTTTATATCCGAACCCCCCCACCAC:1 + chrX 18673788 3' + roo 9062 1 77.52 GAACAAAACAAAAAAAAAGAAGAAGACGAAGAGAAACCAGCGGTGATGTCCCCGAATACGTCTTTCCGAACATCAGAACTGTCTTGTAGTCGAGCAGCAAAACGGATGGTGTTACATTGGTCACTAAAATATGCA:1 + chrX 7450554 3' + gypsy2 399 1 70.37 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCTGGCGGTTT:1 + chrX 3811681 3' + P-element 2870 1 59.57 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTATCAGCGATACCCTGTCACCTCTTCCCCTTTGTCAACCGACCACCAATATGTTAATTTGA:1 + chr2R 12706247 3' - FB 62 1 58.90 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCCCATCGGCATCTTACGAGTATTT:1 + chr3L 20061427 3' - roo 8721 2 63.43 CCCGAAAATAGTCTTCTAGCACCACACACACACACACTACGCACCGGCACATTCAGACACAGAGCGAAGTGGCTGACATTGGCGGCGTTG:1 + chrX 18554967 3' + 1360 3196 1 80.00 ATCACATACCCCTTACTCAGCTAGTGGAAGCGTGAATGACAAATTTCAACTTTTTTCTATAATTTCGATAGAAATTGGGGGGAAAAATATAATAATAGCATTTATTTTTGAAAAAAGCATTCATGCTATGAGATCTTGACGTTTAT:1 - chr2L 7488825 3' - INE-1 545 1 78.77 TATTATTATTCAATTATTATTATTTTAATTTGTCCGCAATGTCAGCAAACCACATTCCAAATCGTATCTTTAGATGACTTTATTCTCCTATTTACTTCTTCAATTTACTGTCCAGTTGCTGCATTGTTTCAATGTACAGCCAGAAA:1 + chr3L 1805973 3' - invader3 5050 7 78.77 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATCCACTACCGC:1 - chr3L 20061351 3' + roo 8994 2 76.03 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACATTTTAAAATTTTTTGTACGACAATTACAGTAAGTACTTATT:1 + chr2L 388652 3' + roo 9043 1 64.38 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTG:1 + chrX 23439053 3' + P-element 2495 1 62.86 TTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAGACGTTAAATGAGAGTTCCGAGTCCGTAGTTCAGCTGTAGTTGTTA:1 - chr3R 13349057 3' + BS 5021 1 69.66 TGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAACTTTAAGCACTCTGAATTACTAC:1 - chr3L 18463345 3' + 1360 78 1 55.56 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAA:1 + chr3R 17243248 3' + hopper 1389 1 65.52 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTT:1 + chr3L 20061427 3' - roo 8714 2 61.42 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTGAGCAGCAGTCCTCGAAAGGGCCAT:1 + chr3L 1459926 3' - 412 7070 2 73.97 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATAGTTTAACAGCAGTGATATACCTTAAAGTTGAGGTACACATTTGTTAATACGCTTGGTAT:1 - chrX 11232506 3' - roo 8716 2 59.42 AAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAAATTATATAATTTACACGCAATGCCCAAGTGATGCAAGACGGAGAATGCATCGTGAAAGCCAA:1 - 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TART-B 10158 1 83.81 GCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTC:1 - chr2L 23310610 3' - 1360 48 1 51.37 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATACAATTTGCTACATTGAGCATTTAGAATCCATATTTTTAAGATTTAAGTAGGCAGTATACATAAAAA:1 - chr2L 10536459 3' - flea 4803 2 53.42 GAAAGGAAATATAAATTAGAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAGAAACTTA:1 + chr2R 6493394 3' + copia 247 1 55.48 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATG:2 + chr2R 9618196 3' + roo 8993 2 71.23 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCCCGTCTGGGGGCCGCCAATTACAAGCTGGCTATAGTTGGCTGAGTTGGA:1 - chr3L 20680256 3' - 412 7087 2 59.26 GTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGTTATTCAGATTTATTCTTCAAAAAAGAACTAGAACAAACTTTTGTGGTCTTTTATGTCATTCTGTTTATATGT:1 + chr2L 4864505 3' + mdg3 5471 2 67.59 ATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCATGCTTTTTTTTCATATAAATTGAAAAACAGAATGCTTAAGAGGCTTAACTTTTGCAGCACAATATTTA:1 - 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chr3R 12613745 3' - HMS-Beagle 6832 2 58.99 AAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCAT:1 + chr3R 18294904 3' + copia 5053 2 65.75 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTA:1 + chr3R 11285005 3' - blood 41 2 54.07 TTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAGGCGTGCCATAGTATCAGATA:1 - chr2R 1921375 3' + mdg1 400 2 70.55 GAATAAATATTAATAAATAACATATATATAATGCTCTTTATAATCTTAAAATTATCGTGGTCTAAGCATTGCATTTGCAAATAGGGTCATAATCTTTATATGATATGTTTACGTAAACTCGTGACACAAAAGAGAGAACAATTTT:1 + chr2L 16709867 3' + Burdock 310 1 86.90 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACGCAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGACCTCGAAAAGGGATTTATGCATGTATGCGATAAAGGCATACCCTTCAATTCA:1 - chr2R 22957901 3' - hobo 66 1 60.96 ACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTCATTATCATAAAAAATTTATACAAATTGACAGAAATCCAAGTAAATGCATAAATCCGGCA:1 - 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roo 68 2 67.12 TATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCA:1 - chr2R 9007049 3' - jockey 4836 1 55.17 AATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTT:1 - chr3R 19950453 3' - BS 5062 1 65.07 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCTTCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATC:1 - chrX 13091073 3' + P-element 2790 1 19.18 TATGTGGTTANGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGCACATGTAGATGGCATATCAACGCTCTGCACGTGAAATGGCGCCGATATTAATGGATTTATTTTTA:1 - chr2R 15474451 3' - Quasimodo 46 2 54.79 TTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGTACATGCAATTTGT:1 + chr3L 24916728 3' - Porto1 145 1 39.73 CACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATT:1 - 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roo 26 2 69.86 CAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGGGGCTTCTCTATGGCATCGGCATCAACGGCAGCAAAACAGTTTCCGTATC:1 - chr3L 17135380 3' - hopper 28 1 54.63 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAAACAGTTTATTAAAGCGTGAATTGCATCCTGTTGCTACTGTTTATCCTCCCCCGCCCTTCACATTAAATATT:1 - chr3L 6015566 3' + roo 356 2 55.17 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACGCCTTGGGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAACAACCTA:1 - chr3L 22021620 3' - mdg1 4 2 73.28 GTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTCTGAATTACTACT:1 - chr3L 18463344 3' + 1360 77 1 54.79 TGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGG:1 + chr2R 6801694 3' - 297 6638 2 74.19 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGC:1 + chr3R 17243229 3' + hopper 1380 1 56.30 TAACACAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAAT:1 - 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mdg3 33 2 57.53 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTC:1 + chr2L 18219431 3' - copia 4897 2 64.29 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAATACTTTTCACTAAAATACGTTTTAACTTTGGGACATGCAACAAGTGTCATTTGCAGAGAGCCAATCCTGAGCTTTTGCAGCGTGCGCG:1 - chrX 17048126 3' + jockey 4965 1 57.53 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAAC:1 - chr2R 9607334 3' + P-element 2814 1 20.00 TCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGCC:1 - chr2L 20360644 3' + R1A1-element 119 1 56.80 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTATT:7 + chrX 23439059 3' + P-element 2495 1 60.27 CCAAATAAATATTTATAAAAAATAAAGAATAACAATGTTAATGATTCTTAACCTGCTGATAAACCTTATTTTATAATTTTATTCATTCAGCGATCAGAGCCTCGCAAATTTTATGAATGAATCGAAAAGCACCGACGACTGTCTCC:1 + chr2R 14433041 3' + Tc1-2 478 1 53.42 AAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATT:1 - chr3R 4160065 3' + invader2 5046 2 58.22 TTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACTGCGATTTATAGCGCAAGAAATGTGGCAGAAAATTT:1 - chr2L 15019841 3' + BS 5065 1 61.64 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGAT:1 - chr2L 4244897 3' - 412 7132 2 72.60 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAANAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAANCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTAT:1 + chr3L 27415312 3' - transib2 64 1 60.27 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGCACTGTGCCATGATGGTGGTACCTTTGTATATAGAAGAAATCTTAAATTATTATTAT:1 - chr3L 19579985 3' - jockey 70 1 58.90 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCC:1 + chrX 20330608 3' - P-element 41 1 40.68 TTGATTTCGGCCCGAAAATCGTCTTCTAGCACAACAAGCCGATGATTGATGTACTCGAGGCTAATGAAAAGAGGCAGGCAAAGCTGGCAAGGATAAGGACAGGCCCATCGCTATTGTTCAACGAACATGGTTTTT:1 - 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chrX 19695268 3' + Tc1 1565 1 65.07 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTAGTTTCGATT:1 - chr2L 11475069 3' + jockey 4982 1 74.07 CGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGCGGAAAAATTATATAAGTGCAG:1 - chr3R 25795977 3' - BS 5029 1 57.64 GCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGATGATTTA:1 - chr3L 23456276 3' + Gypsy6A_LTR 253 1 72.03 TGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTATGGTGGCTAAAGATTACCTATGACAAACTCTCAAACACCTGGGCTCACTCTAAGCATATGCGTTTTTTTCG:1 - chrX 20332875 3' + P-element 450 1 56.83 CCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTC:1 - chr2R 18931822 3' + blood 330 2 58.27 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGATGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTT:1 + chr3L 10897575 3' + roo 9046 1 67.12 TGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTGTAAAAAATCA:1 + chr3R 13406555 3' - pogo 23 1 65.75 TGGTGTTTTTTTTTTTCGTTTTTAATAAATTATGGCTTTTTAACTAAATCAATTTAATTACTACTGTACGTTAC:1 + chrX 4443295 3' - gypsy7 5011 1 82.43 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTTGCCACCAGCTGGATTTTCGGAG:2 - chr3R 30087679 3' + roo 9027 1 53.42 TGTTATTTATTTATTTATTTATTTACAATCTGGTTTCTTTTGTGAGCTCTTCTTTGTCTTCTCGCATCTGGACAAAGTGGCATTGGTACTCGGATTGTGGCTGCTCCGGAGCATTTGAAGTCTCGTGCCGCTGCC:1 - chr3L 1209481 3' - Juan 4215 1 85.19 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATG:2 + chrX 21668358 3' + opus 7449 2 55.86 CTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAA:1 + chr3R 12948683 3' + Stalker4 7286 4 60.96 AGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTTTCGCTAATTACCGCATTTTGCCTTGTAATGAGTCGGAATAATGGATATT:1 + chr3L 4547806 3' - mdg3 32 2 62.33 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTAACTGATGTG:1 - chr3R 15003087 3' - Doc 34 1 64.38 AGCTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTCACCTTTCTTTGCTGCAAGTTTCACTTTTGCTTTC:1 + chr2R 22796906 3' - jockey 4789 1 76.71 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCTGAAATACCCAGTGATTATCTGATGGCTGGGCCCAAATCGTATTAAGCATACGCA:1 - chr3L 6050146 3' + 412 7484 2 61.27 TCGGCTATTCATTATTCGCAACAGCTATTGAAAAAGCTCAATAGTTCAGAGAAACGATAACCAAATACCCCGCAAAAATGAAGCAACAACTGGAACAACAATTTCGATGCTCGACAACGCTAAGCTAGCAACGTCCAGCAGC:1 + chr3R 9358724 3' + diver2 4867 2 70.42 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGATAATGATATATTGTTTCAGTTTTTGTATTGGGTTACACTAGGCCATATCTTACATATATAACACCAAAAATTGTGGGCATG:1 + chr3L 24059287 3' + roo 9037 1 60.99 CTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCCCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCG:1 + chr2R 5621030 3' - ZAM 43 2 51.56 GCACACGATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAACCCCA:1 - chr3R 26854774 3' - jockey 91 1 76.98 CCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAATTATATATTAGTATTGCAATTTTTTAATTGGCGCAGTCGGTAGGATCTGATAACCGTCCTCTTAGTACGGTACTGACAAAGACACTAGAATAACATGATGCGT:1 - chr2R 1982173 3' - Doc 6 1 77.69 TACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTT:1 - chr2R 24215609 3' - I-element 5321 1 48.63 TAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTACATGTAATGCTGATCTTGAGCAGCGCGTACAGAAGGAATGTAATGTCCGCTCGCTCTGGAC:1 + chr3L 25206918 3' + HMS-Beagle 6987 2 58.90 ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGCCGTGGTTCGCGT:1 - chr2R 9007074 3' - jockey 4862 1 72.60 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACA:1 + chrX 22835261 3' + mdg3 180 2 60.27 ACATGCATACTCATTATTTTCGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCG:1 - chr3L 11115123 3' - micropia 9 2 68.35 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTGGACT:1 - chr2R 18886916 3' + roo 395 1 75.86 AAAAAAAAAAATGAAAACGAAACCCTTTCAAACGCATTAACATATGTGTGTGTGTGTAATGTTGGT:1 - chr2L 12256271 3' + Doc2-element 232 1 89.39 GACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCGGTCGTAAATAAGGCCGGACTGTCATTAATGTCTTTAGCA:1 - chr3L 414793 3' + 412 482 2 77.93 CGAGACCACTCGAGTATTTTTGGAAACACCCGAGTATTTTTGGAAACACCCATGTGTTTAACGGTATACCCACAAGTGTTTTTCTCACTCATCCCTTTTTAGGCGCAATAAGCACAAGAAAGTAGGCAATGGTTTTTGAA:1 + chr3R 23962618 3' - hobo 278 1 74.29 CGTAGTTCTTGGTAGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGAAAAAGTGTCACAATGTATTGTATTGTAATGCCGGCTGAAAGGACGGAGAGCGAGGAGGCGAACAGAGCAGCGCGAAAGCTCGCTCGCAAAATGCC:1 - chr3L 23397879 3' - Stalker4 111 4 51.37 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACAAATTTACTGCACT:1 - chr2L 2241219 3' + roo 352 2 59.29 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACACATTTACTGCACTT:1 - chr2L 2241218 3' + roo 9012 2 60.00 ATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAAAGTCATTCGGAAACTTTAAAGCCCGAAAGTATGCAGCACAAAATCGTAATATCAACTTTTCAA:1 + chr3R 11568682 3' + BS 5037 1 57.53 ACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAGTCAATTTTGAAGATGTTTTGCATACGCAGCCGTTGCAA:1 + chr3R 22320586 3' - roo 31 2 62.59 CTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGAC:1 - chr3L 2532455 3' - blood 7090 2 73.97 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCCAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGTTTATTGTTTATTTTAGCACTCTGGCTTAT:1 + chr3R 17421345 3' + pogo 2082 1 57.53 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATCCATAAATGAAATAATGTTGACTTCATTTG:1 - chr3L 7848451 3' - jockey 29 1 61.90 ACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTCTGTACATATAGGCACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCGTGAACACCA:1 + chr2R 8442691 3' - blood 7076 2 76.85 GAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATCATGACAGTTTTTTACTATTCGTGAAAAAATA:1 - chr3L 18074095 3' + 297 6896 2 76.03 TGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTG:1 + chr2R 20052461 3' + transib2 2744 1 77.14 CTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGACGAATAATAACTTCGTTTTTGTTGCAGTCCGCCCAAGAAACCAAAGTGGGTG:1 - chr3R 11089672 3' - I-element 62 1 60.71 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGG:1 + chrX 683606 3' - jockey 57 1 62.39 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATACACATATATATATAGATATATGTATATGTATATTCTCACTGGACAGGGCGCACGCCTCATCAGCAGCTCATCAACGACAGCG:1 - chr3R 27827155 3' - I-element 38 1 58.22 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTATCAGGATTTCCATGAAAATT:1 + chr3L 2966549 3' + roo 349 2 56.85 TTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTT:1 + chr3R 9298547 3' + hopper2 1529 1 70.55 AATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAATGTAAACAGGGCGGGCAGG:1 + chrX 9846834 3' + transib2 2771 1 60.61 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATACATATAAG:1 + chr2R 5193510 3' + roo 8995 2 73.29 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGG:1 - chr3R 11284932 3' + blood 332 2 75.27 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCAAACACTAAAAAAAAAGGCAAGCAACTGAAATGTTCAAAAAAAAAAAGAAAAAACGTTTGAATGTGCTTATTTAAAGGAAACTTGAAACCACTTCTAAAT:1 + chr3R 24666490 3' - hobo 14 1 70.50 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCG:1 + chr3R 21794141 3' + hopper 1372 1 53.60 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCCCGTCTGGGGGCCGCCAATTACAAGCTGGCTATAGTTGGCTGAGTTGG:1 - chr3L 20680257 3' - 412 7097 2 54.86 GCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGC:1 + chr2R 19230565 3' - I-element 40 1 75.79 AAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTG:1 - chr3R 16630235 3' - FB 23 1 66.19 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTCACCTTTCT:1 + chr2R 22796880 3' - jockey 4812 1 60.14 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTG:1 - chr2R 16274535 3' + roo 353 2 53.42 ATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCCTGCAAGATGTGCGATTTAAGAAAAAAATCCAA:1 + chrX 20149269 3' + pogo 2074 1 65.75 TATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCTAGATCATCGCTTAATTTTAATTC:1 - chr3L 414855 3' + 412 445 2 60.00 ATTATAATTATTATTACTTTTAATCCGATGTGTTGAAGTGATGTTAACATTTTTATCAAAGTGACTTCCTATTTTTCTCAGTGCTCAATCTGTAGATGGCAGCAAACACAGATACCAGCTCACACAGAAGCCGAGAGCGAGAAATG:1 - chr2R 16822779 3' - mdg1 7086 2 56.85 ACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGAACCCGCTTTTTTTTGTTGCCAAGTTTTTTGCATGTTTCGCATGTAGTTGGCTCTGGTTTCATGGTTCGTGACAAGAC:1 - chrX 860765 3' - hobo 38 1 53.52 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCCCGTCTGGGGGCCGCCAATTACAAGCTGGCTATAGTTGGCTGAGTTGGACTGAGGTGTGTGATTTTCAGTGA:1 - chr3L 20680233 3' - 412 7075 2 69.18 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAACCTATTAGTATACACTTTATCCTTCAAACATCTTAAAA:1 + chr2L 4245017 3' + 412 469 2 63.70 TCCCCGACTATCAAATACCCGTTACTCAAAATCGATGGAAATTTACTAGACTAATCAAAATGCGAAAAATATCAACACATTTTTGAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTGTGCTGTTTGTGGGCATTAGAGTGGGCG:1 + chrX 21581823 3' - INE-1 554 1 59.56 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAACACTTCTTATCGCGGACATGCCGCTAACAA:1 + chr2R 13541583 3' + jockey 4929 1 76.00 AGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACACCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTA:1 + chrX 22824254 3' + Gypsy12A_LTR 2236 1 49.31 AGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGGCT:1 + chr2R 5621051 3' - ZAM 17 2 65.85 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGAGTTACTTTAATTTTGTACTTTGATTGCAGTGGAATATTTCAGACTTCTTTAAT:1 - chr2L 8120134 3' - roo 8728 2 63.70 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTTAAATAAATTATC:1 + chr3L 10897587 3' + roo 395 1 76.71 ACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCACTGCAGCTGTTGTTGTTGCCTTGCTTCTGGGGAAACCCTTAGTCGCCACAGCACTTTT:1 - chr2L 20852440 3' + Tirant 349 2 60.00 GTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCAT:1 + chr3L 24008376 3' - X-element 59 1 56.10 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAAAGGAGC:1 + chr2L 14616262 3' + P-element 2834 1 39.55 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCTG:1 + chr2L 14616231 3' + P-element 2791 1 18.49 CGTATATGTGTGCGTGTCGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAAGGATATGATGAAAATGGTAGAATAACGACTCAGAAGCAGTCAAACGACCGATTGACCTCATGACGCCATCGGAATCCAGAACCGGATTAAGGATA:1 + chr2R 3173124 3' - 1360 3214 1 72.34 ACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGT:1 + chr3R 1977621 3' + micropia 5367 2 63.70 TGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAATGTA:1 + chrX 9846819 3' + transib2 2742 1 74.66 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGGGGGGTGTGCGCACTGCAGTCACTCGACTGCTGCAGCTCGCGGCGAGCGG:1 - chr3L 1463626 3' + P-element 2882 2 70.87 TTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCGTTTCAGGGTAGAACTTTCTTTTTGGTCGTTGACACATACTCTAAATGACTCGAAGTTGCGGAGTCCCCTCAACATCTGCGCAC:1 - chr3L 23181923 3' - 1360 33 1 63.01 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATTTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGG:1 - chr3R 24072055 3' - jockey 95 1 70.42 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAA:1 - chr2R 23094881 3' + 412 421 2 69.66 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCANTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTTTTTTTNCGTTCAAATTAATTTGAGCTGCACGAAAAGAG:1 + chr2R 9341714 3' + roo 404 1 79.31 ATAAATAAAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAAATATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTACTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAAC:1 + chr2L 12553466 3' + HeT-A 4 2 71.23 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAAATATGCACGCTCAGGAAGGGATTTCAGAGGCTCAGTTTTTAAAGAGAAATTAATGATAAACAAAAAATTAACTTACTTTTGAAGTATA:1 + chrX 21639443 3' - 412 7084 2 64.38 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCA:1 - chr3R 24072037 3' - jockey 81 1 60.27 GGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAAATGCATATTAAATATTAAAAATATCGAAATAATGCTTGAAGAGATTCAT:1 + chr3R 13423424 3' - 297 9 2 78.17 TTGGATTTAGTTTTCTTTCTCGTTCATTGTTAATAGTTTTTTTATTTTTTTGAAGTGGGGCTCCACATACAACTCTTTCTGTCTGTCTGTATCTCAATCGGTTTTCTGCGGGCTCTTGCGGCCTTCGCTTCGTGTTGTCATTAAAA:1 + chrX 4473783 3' + S2 1541 2 71.23 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTG:1 - chr3L 2532421 3' - blood 7039 2 60.31 GGAGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTAAGTGTCCAACCAGATGGCCGGAAAAAGTGCATTGCTGGATGGACTTTCCCAAACAACATCATATCAGATGTCACGATGTCATTTGGAGTATTTCTATAGAATATCCTTTCTG:1 + chrX 12870571 3' - accord 257 2 72.86 GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTATTCACCAAAACACAGAATTTCGG:1 - chr2R 4673546 3' + Quasimodo 7324 2 54.11 TTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGCTGGTTTTGAAATAGTAGCTGTAGCTTAAGTTGGCTG:1 - chr3R 10735990 3' + McClintock 455 4 69.18 CAAAACTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTCA:1 - chr3L 1458106 3' - HMS-Beagle2 493 2 80.00 GGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCCGCGACAACCGCAA:1 - chr3R 11284889 3' + blood 378 1 75.56 CACACACACACACACAGATACATCCCTCCGCAGCTCCTTTTCCGGCGGTTTTGGTCTCTTTGTTGTCTTTTTTTCGGAATATCGC:1 + chr2L 510849 3' + accord 7032 2 88.24 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAAGGTTCCGTCAAAAACAGCCTTACATACACTTGAGCTTTTGAAACGCATCATAACATTTATATTATGGAATTTTATACAAACACAAAATGAATTAGTGATTTTTATGCTCTA:1 - chr3R 30568922 3' - mdg3 5261 1 70.83 CAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTAACCTAAGTACTTCATTCACTTAAGAGTGTGTAAAATAAGTAGTTTCATACATTATATTCACAT:1 - chr3R 13868860 3' + HMS-Beagle 241 2 75.17 TATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAAT:1 + chr2R 19633312 3' - jockey 4815 1 54.11 ACTATCAGATACCCCTTACTCGGCTAGTGTGAATGCGAAAGCGAAATTTCGTCAAGAATATACATATATACTTTATATAGTCGGAAACACTTCCTTCTGTCTTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTAC:2 + chr3R 2473817 3' - INE-1 548 1 67.81 AGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGCTCCTCGGCCGAG:1 + chr2L 20852579 3' - Tirant 8121 2 73.88 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACTGTATAGTATAGTGTCTTGAAACCATAACATAGCCTATCCAGGACTTGTCTCCTTTAATTTTTCCATAAAATTAACC:1 - chr2L 1044947 3' - mdg3 5296 2 54.11 AATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTTTCCCACG:1 - chr2R 6767980 3' - pogo 47 1 52.74 TCAATTAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATA:1 + chr2L 20628669 3' + Stalker2 342 2 55.48 TGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAGTTGGACCCTCG:1 - chr2L 19248113 3' - mdg1 4 2 77.06 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTATTATTTTCT:1 - chr3R 23902181 3' - I-element 49 1 55.64 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCCTTCACCAACCAGCCATTCGATGCACTGCAATTATAAGTTGTTAGATTCATTTGGAAAATC:1 - chr3L 10739989 3' - P-element 9 2 78.42 TTAGGGTCACCCTAGTAGATCTTTAGATACACCCTAATACTAAATACGCGAATTCAGACTGATTTTTGTCCTCTTGTCCGTTCTCCAAATCCCAGTCGTATGGACTGCACAGCAACGATCGAACAATTAG:1 + chr2L 22592274 3' + mdg1 7162 2 64.62 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGATTCTAGATCAAGCAAGTCGATCTTGACATTCATTAAACAAT:1 + chr2R 11247083 3' - 1360 39 1 59.59 GGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAGTGCACCTTTCATAATCAGAAAAACAATCGACTT:1 - chrX 21087540 3' - mdg3 5261 1 72.80 TTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATT:1 - chrX 9165355 3' - jockey 4849 1 76.03 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTAAATAGTATGTTTAGTAATTGATTCGCCATCAGGGAAGGGGAAGCGAATGGCAGCACTCCCT:1 + chrX 2300723 3' + P-element 2883 2 76.71 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGA:1 - chr3R 29680190 3' - 412 7102 2 57.24 GAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAA:1 - chr3L 9324421 3' - HMS-Beagle2 6914 2 63.01 GTTTTTTAAAAATATTTTATTTGCTAATTTAAAATATTTCCAAGGATTTCAAGCGCTCAGAAGCCTTTTCCATAAATATCTTTTACACTTCAGATAATAGAAACACGACAGTGGTTTTTGAGTTTCCTTGCGACTCTGCTTGTTGA:1 + chrX 4589742 3' + 1360 3091 1 45.21 TGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCNAT:1 - chr2L 20407755 3' - McClintock 5984 2 59.23 TGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATG:1 + chr2R 14532048 3' + invader4 3019 2 69.17 CGATCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCA:1 - chr3R 26854762 3' - jockey 86 1 69.86 AGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATCCTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCATGTGCGCCAC:1 - chrX 15198025 3' - Max-element 8284 2 50.35 GTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTTCAAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTAACAATATTCAAATATTTATAAGCAACTACAGTTTTTCCCTGC:1 + chrX 19192477 3' - INE-1 15 1 78.77 AAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTCCACAAGGGGGGTGGATTTTCCGATGGACCCCAGCTTTAACCACACCCCCTGGAGGGACTCAGTTTCATTTCCAATCAACGCGGGATGTTG:1 + chr2L 9383870 3' + flea 4986 2 64.38 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTCCAGCA:1 - chr3R 16475351 3' - mdg3 5330 2 69.66 AAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTAAGTTTTTTGAAATACA:1 + chr2R 25051892 3' - G5A 2691 1 74.48 AAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACGAGAATGTGTATATGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAGGAAGGACGAGTAATACAAAGTGGAGATCGAACCT:1 + chr3R 2452326 3' - 1360 3261 1 74.66 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACAAGCATAATTGCTAATTAATGG:1 - chr3R 23644823 3' - diver 5908 2 71.53 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATAGACTTAAATGTAATGTATTACATATATTTCAAACTTCTTGTTGATAATTTTTTTGCAGTGCATCCGCATTTATATATAAAGATATTTGCATAACAGAC:1 - chr2R 21958363 3' - 297 6592 2 68.79 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCTAAGTTGCTCTCTTATACTGCACCGCACAGC:1 + chr3L 1463757 3' + P-element 2857 1 60.00 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATATCCTCCGTTAAATCCTCTCCAACAATTACAATTATACTGAATTATAGGTATGCAACAGTAATACTTTAACACAAAGGCTCATAACAATAACAAAAATATTATT:1 + chr3L 21530865 3' - 1360 15 1 54.48 AATAGTAAACGATTGGATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACAGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGAAATACTTGTATTTTTTCCTGGGGTGTGTCACTGTCCGGTGCCTTGACCCG:1 + chr3L 24039787 3' + Bica 227 2 64.29 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGACAACAAACGCACGTGCAGAAGTGCAAATTTATTTTTCTTGAAACACACCTAAAACATGTGTTAGGGCTACTGCCTTTAAGTCTAGCCGCTGATTC:1 + chr3R 26188658 3' - jockey 33 1 57.53 GTCAAAAAAATCGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAACTTCAACTGCGAAGTATGCAATATA:1 - chr2R 8315523 3' + hobo 2880 1 76.15 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGAGCAAATTACCAACTGTATTTACTAAGCT:1 - chrX 17770409 3' - hobo 40 1 53.44 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACTGACCGCCGACCAATCAGAGAGCAGCTTGGCC:1 + chrX 19887038 3' + P-element 2865 1 63.39 ACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGA:1 - chr3R 19506716 3' - mdg3 54 2 52.05 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTGATGTTCTACTAAT:1 + chr3L 18074212 3' - 297 20 2 71.01 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATCAAATTGGATTTCAAATTGCCGAAGTATATTCCGAATCTCGACAATATAATATCCCTAATATATTCCCAATATTTTCTTATAATGTGCTTCATAATCCAGTGCACATATGTAC:1 + chr2L 12158924 3' + 1360 3384 2 70.55 ATAAACAAACTTTGTTCGGCTTTTTATTATTCGCAAACGCTATTGAAAAAGCTCAATAGCTAAACATTGATGACCCCGAAGCGATCGTGTTAATTTGCATGCAT:1 - chr2L 1336903 3' + diver2 4852 2 84.62 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGGGGCTTCTCTATGGCATCGGCATCAACGGCAGCAAAACAGTTTCCGTATCCGCCAGCC:1 - chr3L 17135372 3' - hopper 17 1 63.81 CAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAA:1 + chr3L 10033660 3' - blood 7133 2 35.42 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAA:2 - chr3L 17181462 3' - jockey 94 1 74.66 CATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACATAAAGTGTTGCCAGCTTGGCAG:1 - chr3R 12948561 3' - Stalker 21 4 70.55 TTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAAT:2 + chr3L 5910557 3' - BS 5083 1 73.97 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCGCTCTCAAACCGAACCG:1 - chr3L 13993464 3' + P-element 2804 1 28.77 TAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGAT:1 - chr3R 10736031 3' + McClintock 6366 2 64.38 GCGATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGT:1 - chr3L 19951187 3' - Ivk 63 1 60.69 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAGAAACTTAAAAATGCACAAACTTCTGAAAGATG:1 + chr2R 6493419 3' + copia 245 1 76.26 CGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTT:1 + chr3R 25580847 3' + 1360 3314 1 70.55 TGTAATACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATAATTAAATGCTTGCAATATTTAGAAGTGAAAAAAATATAATTTTTATTT:1 + chrX 22905334 3' + Quasimodo 7295 2 69.18 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCCAACAT:1 + chr3R 6584885 3' - transib2 36 1 58.02 TCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTCGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGCATTATTTCGTTGTTAAATATGCATAAGACTCAGAAATTCTTGAAAAAACCGATGGTTGA:1 - chrX 20145503 3' - Bari1 61 1 56.85 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGACTCGG:1 + chr2R 18887077 3' - roo 49 2 54.11 AAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGTCGTTTTCAC:1 + chr3R 8563630 3' + 297 6911 2 63.70 CGCCCACGGCACTCTTATAGAACTCAGAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACACAAGAACACGCTACAACATAATCAACCAGACACAAAA:1 + chrX 12455920 3' + gypsy4 285 1 73.88 ATAAGAAGCGTCGGTCATCGCCACGCACACACATACAAATTCGCCTCATTAAGTGCTATTATAATATTTATACTTACACAAATAAATATTGTCTAAGACCTTAACCAAAATTTATAACCTTGCGGTAAGATGGCTGATGATATCA:1 - chrX 22576275 3' + Burdock 152 2 58.62 AAGAAGAAATTGCCATCATAACACCTGCCATGCTAACAAGACTCACGACAAACGCCAGAAATCGGTTTACGCAATGTATGGAGAATGGGGGGCAAATAAACCACATCACAGAATAAAAATATGGGTATTTCAGTTATCAACTTCAA:1 - chr4 1078590 3' + mariner2 675 1 62.33 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTGATTATGCTT:1 + chr3L 7024535 3' + 412 421 2 65.07 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAACATTCATCTTTATCCATTGTATTGTTGGATGCGTTGCA:1 - chrX 666295 3' - 412 84 2 76.71 AATCGGCTATTGTTCCTGATCAAGAATATATGTATATACTTATTTGTAGATTCAAAACCATGTATTGGACTATTAAATCCAGATCAGGAGGATCAAATGAAAGTATGCGGTTATCGACGTTCTCTTATGCGAACTGGTTTTTGTTG:1 + chr4 136954 3' - INE-1 91 1 75.34 ATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTTTCGCTAATTACCGCATTTTGCCTTGTAATGAGTCGGAATAATGGATATTATG:1 + chr3L 4547809 3' - mdg3 5280 2 64.83 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGC:1 - chr2L 10909471 3' - 412 7094 2 53.42 GTGGAAACGCAAGGTGGGGGACACAGTGTGGGCCAAAGAGCACCATCTGTCGAAGGCAGTTGACGGCTTCGCGGCGAAGTTGGTGCCGTTGGTGGCATTATTACTTAACATTTTTGTGTT:1 - chr2R 5343254 3' + Osvaldo 1287 1 73.33 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAAT:1 - chr2L 11475080 3' + jockey 4963 1 62.24 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATT:1 - chr2L 14056673 3' + pogo 2052 1 60.00 CAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATCTCAACAATTTTTTTAAGGCTATGGTATTACAGCTCAG:1 - chr3L 2167610 3' + opus 7440 2 70.54 TACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAGAAGATATCTCTATTTTAAATTAATATTTATATATTTTTCTATTCTTTATTGTTTGTTATTTATAAATCAGGTTACAAAGTAAATTAGCGTAAC:1 + chr3R 7579514 3' - Stalker2 28 2 66.44 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATGTAAATCTTTTTGGCAAAT:1 - chr3R 10733741 3' + mdg1 351 2 64.38 CGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTATGTATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGATCTATTCAAAGTGTCAGAAAAGACTCGCTGCCCCAGAGATTTACTACAAATTACGGAGTCTATC:1 - chr2L 15516640 3' + Max-element 8509 2 66.44 TAAAATAAATAAAATAAACTATATATGTAAATTAACTATAAAGCCTAATTTACTCTGAAACTCGGAAATGGTTCAATAAAAGTTATTAGCTTCCCACGATGCTGATTAGTGTCCTGTAGTCCAGTGGTAACTCATCTACTTAAATA:1 - chr3L 6375281 3' + G7 1147 1 90.41 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCCGCATCTCTTATTCGCAAAGTTAAAGCCAGACTTCTTCGAGTAGAGCCGTATTCCGGAGTCCTT:1 + chr3R 7074947 3' + P-element 2878 2 79.17 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATGCCATATGAATGCGACGAAATTCCAAAATTATA:1 - chr2R 19230529 3' + I-element 5268 1 76.22 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGNTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTNACTAACCAGTTCCGCCCAGCCTTCCGAT:1 - chr2R 23094842 3' + 412 7517 2 63.12 AGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCACAATATGCACAT:1 + chr2R 12827058 3' - Burdock 6210 2 70.55 CTTCGTTGAACTTTTACTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 157 2 57.89 TTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTG:1 - chr2L 20407744 3' - McClintock 5989 2 60.96 CAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTAGTATCTATATGTACATACATATATGACCAAAAAAATCGTACAGATGTTAGCTTCGAGTCAATCGAAAAGGCTGGTTTT:1 - chr2R 14531938 3' - invader4 2778 2 67.69 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATA:1 + chr3L 14422846 3' + roo 9027 1 54.11 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACT:1 - chr2L 14262941 3' + P-element 2854 1 56.45 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACTGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTGAGTTTATCGGATGAGTAGATCGTCTTTTGACTCATGACCATACAGA:1 + chr3L 23090552 3' - 1360 73 1 95.86 AATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCT:1 + chr3R 1844839 3' - Cr1a 169 1 63.43 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAACAGCCGGCAAACACGAATATCTTCAGCTGGAAAATGAGAAATTGAGCAAAGCTCCAGTCAAAAGATCTTGAGTGTCAC:1 - chr2R 9607249 3' + P-element 2869 1 73.10 CGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAGCATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCA:1 - chr2R 6768007 3' - pogo 74 1 70.55 ACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGG:1 + chr3R 31264552 3' - BS 25 1 62.68 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGAAGGAG:1 + chr3L 12890417 3' + hobo 2919 1 67.20 TTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAA:2 - chr3R 30087720 3' + roo 322 2 76.03 TTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTAGATTTCCTGTCTGAATATTTGCGTACAATTATAAAAATCGTGTGTGTCTTACTGATTGAA:1 - chr3R 31264388 3' + BS 5078 1 75.34 AATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTTCTTAAAAATCAATACAACACGTGTTTTTTGTCTTGTCGACTAAAT:1 + chr3L 1437960 3' - Transpac 70 2 66.21 ATGTATATGTATAAATGTAAGTAAGAATACATAGATGGTTGCGCGATCCACATCGCCCTTGGGTCGTTGATGGTAGCGAGCCTCAATCTGGACATCTTCGGGTTCATCGGGCACATCCTTGTTGCGAGCCGTGTCGATCTG:1 - chr2L 5189089 3' + Stalker 250 4 68.79 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTCGAAAAG:1 - chr3L 7787483 3' - flea 4804 2 65.29 CACCCATTTTAAATTATTTAAATTATTAAATTATGAATTCCTATTCTTTGAATTTAGAAACTGCTTGAAATATGATAACATAGAATGTGTTGCATACTTGGCTGCTGCATGCTGGAAAATTCATGTAGATATCATGTAGAAGACGT:1 + chr3L 3766917 3' - Transib5 258 1 71.92 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATCTATGTGGCATGCTGTGCATA:1 + chr3R 27606734 3' + 412 7517 2 64.38 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAAC:1 + chr3R 11284969 3' - blood 7099 2 78.08 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAA:1 - chrX 21087590 3' - mdg3 52 2 59.59 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCA:1 - chr2R 23094874 3' + 412 7499 2 59.84 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAAGCTTTCCCATGAGATCTAAGGTTTTTTTTTTTATTT:1 + chr2R 14884205 3' - roo 8704 2 54.79 ATTAAGTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCCACCACCGCCCATGCCAATC:1 - chr3R 9298423 3' - hopper 20 1 71.92 TTATATATACATATATATTATATGTTATACTAGCCTTTAATTGTATTAACTATCTTTAGCTTTTAGTGGGCTCCGCTGCTCATCACTGTTGCAACATAGAACAAGCTCGTTCGCGACTCTTAAG:1 + chr2R 16732111 3' - Dm88 4376 2 75.81 AAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTTTTTACCCCTCCCCACCCCCCACGAACT:1 - chr2L 3661975 3' + blood 7322 1 76.80 GAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATCCGAGTCATTGCTCCACTTTGTCGCAAGTTCAAGCAGCAAGGTCTGCCTGGCTCAC:1 - chr2R 9750111 3' + opus 7481 2 69.72 GGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGTCGTTTTCACAGCGTCTCTATTGCATGCCT:1 + chr3R 8563650 3' + 297 351 2 56.55 TTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATGGAGCCGATGACTTTTCGAAACGTTTTGTTTCGCTCACCTACT:1 + chr2L 21802992 3' - Quasimodo 39 4 59.59 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAAAGTAAAACATTACTTTAAAATAT:1 + chr2R 4816996 3' + blood 348 2 61.81 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTTTGGCGAGCTTTG:1 + chr3L 14422861 3' + roo 9042 1 64.38 ATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGG:1 + chrX 15286944 3' - X-element 4400 1 62.77 CAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAG:1 - chr3R 19950450 3' - BS 5059 1 63.01 TGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTACGCAATTAGTGAGCCTACGAACCTTGAGTGGTCAGCATCACAGCGACATCT:1 - chr3R 13338979 3' - BS 5012 1 71.23 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTCTAGATATTCCTATGAAGCTATCTTATTA:1 + chr3L 2167703 3' - opus 7168 4 58.90 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTT:1 - chrX 291962 3' - 412 7087 2 62.33 CACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATTAGTGGTGAGCGCGAGTTTTCTTTTCTCTGCAGCATCCCTTACATTCA:1 + chrX 20949719 3' - jockey 4591 1 53.42 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAGTATTCAACTAAAATTTTCTTATTAAAATGCTTCTCAAATAATTTCAAAACACTTAAAAAGCACGTT:1 + chr2R 22521991 3' + pogo 2050 1 57.53 ATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAATGTTAGTGATAGCTTTATAGACAATACTATTATCTCTAATAAATAAATCAAATAAATAATGTTGGAATGGGAAGTGCGATTCTTGATCTTG:1 - chrX 22641686 3' + G6 1995 2 58.74 TGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTGTTTGTGTGTGCAGAGGCAAATTTACAGCTGCTGGCCGGTTATTTGCAGCAGACGCTGAGCGCCGATCCCAATGTCCGCCGGCCGGGGG:1 - chr2L 16824979 3' - Quasimodo 32 2 69.09 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTT:1 - chr3R 11516500 3' + roo 353 2 55.17 AATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAAGTTAGATAACCTTATAAACTAACTAGTTTTATTATTCAGAAAACTTTTGTTATTTCAATTCTTTAACTCGTCGTTTTGAGTTCTCAAT:1 + chr3R 20841490 3' + Juan 4181 1 59.31 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTAATAAATA:1 - chr3R 20904923 3' + roo 9049 2 65.07 CGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGCGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGG:1 + chr2L 14616226 3' + P-element 2786 1 16.44 TTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTT:2 - chr3R 12948623 3' - Stalker4 7039 4 71.92 ATTGTTATGTNTTTAATTATAGACGTTATTTTTGAGGGGGCGTGTTGGAATATACTATTCAACCTACAAAAATAACGTTAAACAACACTACTTTATATTTGATATGAATGGCCACAGGCAAACACACTGGCAGCGTAAAATAAAAA:1 + chr2L 18216325 3' + copia 4828 1 78.77 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAACCGAAGGTTGAAAAACTTTTCATCTTCTTCATTTTCTTGATTTTGTTGTGCTGCTGCTGATGCTGCTGCAGCGA:1 + chr3R 14666423 3' - roo 48 2 52.05 TTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTCTACAAAAAACCCTATTGTCCTGTAAGGAACAATACTAAATGCTTAATTATGAGCAAAATC:1 + chr3L 9280468 3' + copia 231 1 57.53 CTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTGTTGCATACTTTTAGGCCTCGCTTG:1 - chr2R 20972650 3' - jockey 4716 1 50.00 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGC:1 + chr3R 17243243 3' + hopper 1383 1 61.64 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGCATCTTCCCTTCGCGTTTCTTCCGCTTTATTTACAAGTCAAGTCACTTGTTTCCACACCGCGCACCTTTCGT:1 + chrX 8346439 3' - roo 36 2 58.21 TTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTTATGAACATTTT:1 + chr3L 9324555 3' + HMS-Beagle2 253 2 59.59 CCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGTCGTTTTCACAGCGTCTCTATTGCATGCCTTCTCGCAGA:1 + chr3R 8563659 3' + 297 6940 2 62.33 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAAGGTGGTGTATTCTTTTTAACTATCAAT:1 + chr3R 12519728 3' + roo 9042 1 63.70 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATGTGAAGTTGATTAAGGATTATATAGGCAATGTTCTAATGGGATTCACATATTTCATGAATTCTACGGCCACCTGCTG:1 + chr3L 18216606 3' + 297 365 2 64.34 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACTTTGTAAACTGTGCGTTGATATTGTGGTTCTTATCTGCTTCCAC:1 + chr2L 901813 3' - jockey 4750 1 71.23 CTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATCTTAAAGTGTCATCACTTATGTCATCATATTCAAAATTCATAAAGTTCTCGCAGTGCACGCATGTGTTCGCCG:1 + chr3R 29758640 3' + I-element 5322 1 58.91 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTGGAAATTTAATACCA:1 + chrX 5751934 3' + roo 9002 2 64.38 CCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTTTAGTGTCTTTGCTTTAACTCTACTTAAATATATCCTA:1 - chr2L 21559297 3' - 1360 66 1 82.30 TGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGGTAACGGTACGGAAAGCGCTT:1 - chr3L 23773880 3' + Transib5 2851 1 68.49 TAAGAAGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAA:1 + chr3R 24084861 3' + roo 323 2 75.17 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTCAGACACACACACAGCAGGCCGTTGTGCTCATTTATCTTTTATTTTTATAAAATTTTCTGCTGTTGCTGTTGT:1 - chrX 11714353 3' - Tirant 8117 2 70.91 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTCAATTTCCCAGCTGCCCAGCGA:1 - chr2R 18931801 3' + blood 332 2 52.74 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTTTGGCGAGCTTTGCAA:1 + chr3L 14422864 3' + roo 9045 1 66.44 AGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAATTAGACGACCGTGGTGCAGTCAAATG:1 - 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BS 5072 1 69.18 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTA:1 - chrX 20361934 3' + hopper 1390 1 63.08 GTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAAAGCTGG:1 + chr3R 30955442 3' - G-element 28 1 61.64 CTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATACACACTGGTATATACACGGATATATATAACTTAAAGCTTGCAATAATTAGGCTAACTGATTCTAAATCGTT:1 + chr2R 15199231 3' + Burdock 234 2 65.29 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGCCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGTCGTAAACAAGTCGCCGTAAGTGTGC:1 + chr3R 11756803 3' - Tirant 70 2 76.47 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAAATGCTGTTGTTGGTGCGAGGTGCGATGGGAATTTGAATGGGGCAGGGGCGACACTATTCTATGGCCTGACTTGGCCATTAGTTGAAG:1 + chr3L 17181551 3' + jockey 4972 1 58.99 TTCCATTTTACAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAGTAAAAA:1 - 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chr2L 15874851 3' + mdg1 7395 2 62.33 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTG:1 + chrX 5751920 3' + roo 324 2 73.97 TTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGCCGTTTTCACAGCG:1 + chr3R 8563634 3' + 297 340 2 59.29 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCTGTAGCTCAACTCCCGGAAGTCAGTGGCAGCC:1 + chr3R 27452093 3' + hopper 1408 2 73.15 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAGACCGTGCTTACACAAATGTCGGCATCAGGAAATTCGGGCATTCTCGATATTATTACCCCAGTTTGCTGTCA:1 - chr3R 10714129 3' + 297 357 2 50.00 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAGAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTTTCTT:1 - chr2R 6700028 3' + roo 9028 1 53.42 TTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATCTGAATTTATATCTGAAAAACTGAATTGGCACATTGG:1 - 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roo 21 2 66.15 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCAGAATGTATGAATAGCATGAAAGTACAAAAGGCA:1 + chr3R 20905035 3' - roo 81 2 79.14 ACCACCAGCAGCAGCAACAGCAGCACGCACAGCAGCATCATGCCGCCCAGCTGGCACATACACTCTCATCGGCCG:1 - chr3L 7830900 3' + TART-B 150 2 61.33 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTT:1 - chrX 291997 3' - 412 7122 2 64.38 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATG:1 - chr2R 21796029 3' + roo 8999 2 70.14 TCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTATAGGCCTCTTATAAACCCTTT:1 - chr3R 15727823 3' - 1731 4366 2 52.05 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATAATAATACGTTAT:1 + chr2R 12102062 3' + hopper 1390 1 64.38 ACGATATTGCAATACCTGAATGCGGTTGTAGTTGGATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCCTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTAT:1 + chr2R 12253304 3' - 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F-element 54 1 52.74 TACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGGGCGTCCTTCTCTGTCC:1 + chr3R 6419920 3' - Tabor 70 2 69.70 CCCATTTCTTTTCTTTTTTTTTTGGCATTCCCTTTCTGTTATCCCCTGTGTCTGGATCCCTAATTAAATGCCTGGGCATAATATTAATTTATGGTAATTTAATACTTATTTGTCGTCTATTTTCGCTCACAATTGTTCG:1 - chrX 8948085 3' + hopper 140 1 70.50 CAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCT:1 + chr3R 10144458 3' - Chimpo 66 1 61.97 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCTGTTAGTTCCCGGAGTTCAGGTGGCTGAGTTTGTGGGCCGAATCTCTGGGCAT:1 - chr3R 28749087 3' + mdg1 7409 2 51.37 CAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAATCATTTTTACATTGCCAAAGAAGTTTTAAAATTATT:1 - chr2R 21795208 3' + transib2 2798 1 67.81 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCA:1 + chr3L 7389807 3' + roo 9017 2 54.79 GCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAAGTGCTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTTGCG:1 - 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copia 51 2 53.42 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACTAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAATTAAACGTTCTCCAAATTTAGCTA:1 - chr2R 14884077 3' + roo 9017 2 53.42 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACT:1 + chr3L 2317243 3' - 412 44 2 52.14 GTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGG:1 - chr2L 20718842 3' - jockey 4753 1 77.14 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTTCTGATTG:1 - chrX 291955 3' - 412 7080 2 67.12 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTCGAGCTGTGAATGTGGTTTTCTCTCCTATATAACTT:1 + chr3R 26472874 3' - 1360 85 1 76.71 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATCCTGGGAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAGAAGGACAGGCAGATGGAGAAAGTGGCGAAAGGGGTG:1 + chr2R 8315617 3' - hobo 8 1 79.03 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAAT:1 - chr3R 30087718 3' + roo 8988 2 74.66 GGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTA:1 + chr3L 8249462 3' + mdg1 7388 2 68.53 GAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTNATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATACTTCCTCCAGGANAAGTAATTAAAACAATTTATGCAAAAGCTTCTA:1 + chr2R 8966222 3' + BS 5015 1 65.75 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATGAGACCGATAGCCGTCAAAGA:1 + chr2L 8120247 3' + roo 9020 2 60.27 TTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCACAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATAGAAACAATAGTTTTGAACATCATCTTAAACCTATGTT:1 + chr2L 6618986 3' + 17.6 430 2 70.23 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCACTTGAGTCTTCTTTTGACTCAAATGAGCAATGTGCGTGTTCCACTTGGAGTCACTACACAGACGAAGTGGGCGAAATTTAATCAAGTTTC:1 - chr3R 17991905 3' - jockey 4787 1 49.30 CTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAA:1 - chr2R 7314597 3' - blood 7031 2 66.19 ATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATAAACAACTTTCTTTGTTCGCTTTTATTGCAAACCAATTACAA:1 + chr3R 12948742 3' + Stalker4 389 1 73.97 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAATTGCATCACATATTTGAGCTGAAATTTTGTAGCTGGTATTTTCGCAAA:1 - chrX 5841893 3' + roo 359 2 51.37 AATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGACACCGAAAACG:1 + chr3R 1844826 3' - Cr1a 176 1 71.88 GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTCGACATTTGTTTGGGCTGATGATGATGATTTCCTAAATGGGGGAGGTGTGGGGCTCACA:1 + chr3R 11906012 3' - accord 183 2 76.25 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAAGTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTC:1 + chrX 12979544 3' - transib2 34 1 52.10 TGGCGGCCTGAATAAATTTGATTTGCATTCAGTTCGTAAGATACGAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTATACATAAGTGTATAGAACGTTACGTCTTAATTTATT:1 + chr2R 10788115 3' + gypsy10 5897 2 74.66 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTTTGTGTGCTCAGATCTTGAACGGTTTGGCATTTCT:1 - chr3L 2966471 3' - roo 8750 2 78.08 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTGTCTCTACTTAAGGAATTTAATTTGGGAAGTAGAAACGGAAAAG:1 + chr3R 30087825 3' - roo 32 2 65.75 ACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAAATGAGACGACAGAGGGCTTCAGGCAA:1 + chr3R 30569135 3' + mdg3 246 2 71.22 GTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTAAGTCAAATATATTTCATGCTTCACCCAAAACTTTATACGATTAAGACTGTGAGTTGACTAAAATAGTTTCCACG:1 + chr2L 20029493 3' - I-element 53 1 50.00 CTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAA:1 - chr2L 15420035 3' + Burdock 6319 2 73.29 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTTGATTCAACTGCAGCACTCGTACATATGTATATATGTATGTGTATGGAAAGTCGAGGCGTGACAACAACAAAAGAAGCGGCTAACACGC:1 + chr3R 21735596 3' - hopper 21 1 67.88 TAACAAAATCCTAAATATANTTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTTATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACAT:1 - chr3R 24084810 3' - roo 85 2 76.03 AATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGATTCTAGATCAAGCAAGTCGATCTTGACATTCATTAAACAATT:1 + chr2R 11247084 3' - 1360 35 1 61.54 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAAT:1 - chr3L 13285592 3' + roo 9007 2 67.63 TGTACAAATACCTTTTCCCTACAGGCATTAATAATTAAAATCAAGAATTGAGCGTGCTTTCAACAACGGAATAGAGGAGCTAGTATACAAAATCGGAGGAAGCATCTGCAAGGATTCCCATTCCCAATTAGTGTTTCGAACTACCA:1 - chrX 19595131 3' - Gypsy12A_LTR 2150 1 69.86 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATAC:1 + chr3L 6131922 3' - roo 8730 2 66.43 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTGGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTG:1 - chr2R 20972685 3' - jockey 4737 1 70.16 CAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATT:1 - chr3R 6419839 3' + Tabor 427 2 60.27 GTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATACACACTGGTATATACACGGATATATATAACTTAAAGC:1 + chr2R 15199197 3' + Burdock 176 2 79.45 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTCATTATCATAAAAAATTTATACAAATTGACAGAAATCCAAGTAAATGCATAAAT:1 - chr3R 24480413 3' - blood 17 2 72.60 CTGTTGAACCAAGCTAAAAGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGGAGAGTTAGTTACCTTATA:1 - chr3L 4547681 3' + mdg3 180 2 57.93 TTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTAGTTAACTTATACATACGCTTGATTTAAATCGACTTTTTCTTAAATGGAAGCAATTATTCTAGCAAATAAGCTGTCAATCGACAGTAATTA:1 - chr2L 17269095 3' - gypsy6 7459 2 57.64 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTT:1 + chr2R 17650649 3' - pogo 62 1 64.38 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAAATTCGTTACCTCATGAAACCGAAACT:1 - chr3R 12341085 3' - Tirant 8118 2 66.32 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAAT:1 - chr2L 16884776 3' - pogo 34 1 54.48 GGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGTTATTATCCATCAGTAATTTCGCTTTAAATTTAAT:1 - chr2R 5179603 3' + 1360 3315 1 75.38 AAATTATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACGGACACGGACACGGACA:1 - chr2L 12844165 3' + P-element 2686 1 15.75 GTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGATATCAAATATGGCATTTTCTTCGCAAATTATAATGGTTTAACATT:1 - chrX 12732965 3' - S-element 69 1 66.44 CTGTAAGCCCCGTAGCTAANGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAAAGATGTTTTTATTGGGGCGGACACTAATTGTTGGTTAACCCATTGAAGCGCATCTAATGGG:1 - chr3L 1186237 3' + I-element 5292 1 57.53 ACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGGATATGACAGATTTACTACGCCA:1 + chr3R 31264574 3' - BS 6 1 76.55 ACGTATTTCCAACGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTCCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGC:1 - chr3R 12078623 3' + hopper 1340 1 68.97 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCCTGCAAGATGTGCGATTTAAGAAAAAAATCCAATTTCCTC:2 + chrX 20149276 3' + pogo 2081 1 70.55 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCAT:1 + chr3L 7389808 3' + roo 9018 2 54.11 ATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTATAGGCCT:2 - chr3R 15727837 3' - 1731 68 2 61.64 GAGTCCTGACGAAGAGCGTAAGAAGAGGGTTCTTAACTCCTCCCCCCTCAAGATCTGCGTCCCAAAGCTCATTGCTGCTGAGAATCGGTTAAATTTGGGCATGGTGGTAAATAAGGAAATGAGACAGCATCAGCTGTTGTGTGACA:1 + chr3L 11540643 3' - opus 17 2 53.42 AGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGAAGGAGAACAATGTGGAA:1 + chr3L 12890429 3' + hobo 2910 1 65.75 AGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAGCGGCCGATCTCGCTTCCGTTGTTTACGGGCAGTATAAGAAAGATTTTTGTCACTTAAATTAAGTCTTAAGCTGAGATC:1 + chr2L 22076766 3' - transib2 44 1 55.48 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTAATCAATACCACTGATGTGAT:1 - chr3R 20904910 3' + roo 400 1 77.93 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTATATAGTCTGAATTCCTGGTACATACTTTTCATTGAATCTAGTATACCCTTTT:1 - chr2L 20491468 3' - 297 60 2 66.21 AGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTAGCAG:1 - chr2L 2057808 3' - 412 7107 2 59.40 CGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTC:1 - chr2R 5070918 3' - gypsy5 6963 2 26.21 TCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGGCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTGGTCGTGCGTGACGACAACGAGTC:1 + chr3L 10033703 3' - blood 7039 2 62.07 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATG:1 + chr2R 5953896 3' + roo 9024 2 58.91 AAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAATATTGTCATTTCGTGCGTTTCGATTGTGTAAAGCAATTTCCCCCAGAAAAGTCGCAGAGATGGATGCTGGCAGG:1 + chr2L 1244002 3' + I-element 5324 1 57.48 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTCTTCAAATGAACGGATCGTCTCCAAGCTTTGAGATGCCGTAATCTCAGCTATTGACTCCCAGGGGGGTGGCGG:1 + chr2L 306593 3' + P-element 2830 1 64.96 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGCAATGGCTATTAGAAACATGATGCCGCCCAACTGTTCTCGC:1 + chr2R 8442753 3' - blood 7051 2 57.93 GTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAATGGTACTGGCTTTTCGATTCACTTAATTCGTATTATTTGGTATTAGTATTTGTGGCTACCAACTTTTATTTGG:1 - chr3L 9397602 3' + 1360 3380 2 69.72 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCC:1 - chr3R 19506748 3' - mdg3 5335 2 73.43 TCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTTATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAAAATAAATGTTTATCCCTTTATTTGAATGTGTA:1 - chr2R 10119012 3' + Juan 4127 1 78.57 CACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAAC:1 - chr3R 11284894 3' + blood 341 2 53.28 AAAATTAAAAAAAATTAATTTTTGTTAAAATGTTTGATTACTTTTTCGGTCCTAAAGCAAAATGGTTTAGTTTCAGGAAAAAAAGAAAATTCCTTTTGTCCAACTAAAATGAAACTGTGTTAGATTTTTCTGAGTGCAAATTTGTG:1 + chr3R 30978553 3' + HB 328 1 80.82 GTGGAATAAAAAGACGATTCCGAAAAGGGACATGGAAAAATTTGTATTACTTAGTTTCCCTACTTACAACTTCAAATTTCATTTTTATATATTCTTGTATATATGTCTATTAACTCTATCGTAGAACGCACT:1 - chrX 21626883 3' - HB 77 1 53.79 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGT:1 - chr3R 18832357 3' + roo 9015 2 60.45 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGC:1 + chr3R 13869014 3' - HMS-Beagle 6840 2 57.14 CACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTAAAGGCGGACACGCAACTCAA:1 - chr2L 7633337 3' - Max-element 8253 2 68.00 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATA:1 + chr2R 14821248 3' + roo 9050 2 58.22 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATA:1 - chr3R 16187793 3' + mdg1 7374 2 76.03 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTGCATATTTGGCTCACTGAAAGCGGGGCCAACGGACAGTCAGCGGCGCAGCAATAAACTTCA:1 - 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chr3L 8249363 3' - mdg1 7088 2 51.37 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACAA:1 + chr2L 12932207 3' - opus 7140 4 65.91 TAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGCCTTTGAAAAATGCTGACCCGCCCATGATGACGACGAGATTGAGCGCGGGTTAACAG:1 + chr3L 5910617 3' - BS 5023 1 63.70 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGGGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTTAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAA:1 + chrX 14978646 3' - hobo 48 1 50.37 ACGAGTTGCAGAGAAATAAACGGTCCAAGTGGACGTTTTTTTGTTTCGGTTTTTGGCTTGCTCAAAGGTTGTTGACCAAAACGCAAACGCGATCACGAACGAAAAAGATTTAATTATATTTCTCGTTATA:1 - chr2R 13543236 3' - baggins 369 1 80.00 TATAGAACTCACAATATTTGTTCACCAGCCAAAGCTGTGACAAATAAACGAAAAAGTGCGAAATAATAGACCTCCTTAGCATTAAGGTAGGCCATATAATTAGGTACAATCAAAAACTTGGACTCATTGATGGGTAGTGGAAT:1 - chr3R 775732 3' + gypsy4 300 1 60.14 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAATACCCTACAGGGTACACAAAAAAACTATTTTT:1 - 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blood 7057 2 54.11 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACCGTGTGAGTT:1 - chr3L 22021607 3' - mdg1 7059 2 71.23 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAGCGAGATTCAAAGGGAGAGG:1 + chr2L 15523132 3' - 412 42 2 53.08 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATNTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCANAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAA:1 - chr3L 15393689 3' - pogo 65 1 62.33 GGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATGGGGATGGGGATACAAACAAACAAATGTATGAGTATTATGCAAATGGTATAAACGCTAAAATCAACTTGGAGCTTTTCAATG:1 - chr2L 1307272 3' + P-element 2880 2 58.90 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGGGGGAGTGCGTGCGATTGTTTGCGCGCCTAAGCTGAGGCTTTTGTTTTGCCCTGTCTTTGTAGACTTTGAATG:1 + chr3L 17739903 3' - jockey 34 1 62.10 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAGTTGGACCCTCGTGCAAAATGTACAATATTTTAC:1 - chr2L 19248091 3' - mdg1 7057 2 72.60 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAGTATTCTCTATAATTGTTGTACTCGATG:1 + chr2R 9453418 3' - roo 8682 2 72.41 ATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAACGACTGCGATAC:1 + chr3R 28749238 3' - mdg1 6 2 80.00 GAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTTTCCTGCTCTCTCTCGTTCTTCGTTCGTGCTGCCGCTGCTGTTGCTATTAT:1 + chrX 1769798 3' + hopper 1390 1 61.98 TATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGCCTTTGAAAAATGCTGACCCGCCCATGATGACGACGAGATTGAGCGCGGGTTAACAGGTTT:1 + chr3L 5910621 3' - BS 5018 1 66.90 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCATGCCTTGAGTCGAACAATAACGAAAGCCAA:1 + chr3L 7389837 3' + roo 386 2 69.44 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGTTTACCCGCCGCAAAATCT:1 + chr2L 2544865 3' + blood 354 2 66.17 AATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGACTTAGATTTATA:1 + chrX 22460188 3' + HB 1538 1 77.40 TTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCTTTTTTAAGGTTTTTG:1 - chr3R 6665904 3' - Juan 3876 1 60.00 TTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAACCGTGTGCTGTGCAAGTATT:1 + chr3R 11937851 3' + hopper2 1530 1 67.81 GCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGAT:1 + chr3R 2689455 3' + diver2 4474 1 71.65 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTC:1 - chr2L 10074457 3' - pogo 24 1 68.09 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCCTACATG:1 - chr2R 7314588 3' - blood 18 2 69.18 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTATATCTGCCTTGCGACTTTTGCTTTGGCCATCTTGATCTTTGCGCTCTTTATTTTTATTGAGAAGGTTCGATTCATCAAAGGTCTCAACTTTATCATGTC:1 + chr3L 15718211 3' + 1360 3373 1 74.48 GGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTCCTAACTTGCTACCATGTCGTCCTGCGAGTCCTTTGCGTCCTGCCCTG:1 + chr3L 12873077 3' + hobo 2921 1 58.89 TTTTCTTTTTTTTTTTGATCGTCGCCACTTACCAGCAGTCATAGCCTTGTAGGGCTCCTCCGATTCCCGAGGTTCACT:1 + chr3L 2040800 3' - 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chr3L 17500732 3' + Tirant 326 2 68.49 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGA:1 - chr3L 6131839 3' + roo 343 2 62.14 AACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAATATG:1 + chr2R 12827053 3' - Burdock 6214 2 73.79 ATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGTTACTAAAAAATCAATAATAA:1 - chr3R 13559957 3' - jockey 4800 1 59.29 CGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAAAGCGCATTTAAAATTCGTGACTACCCCAGTTATCATCGATTCCACTTCAACTCAAGTTTGTCCACG:1 + chr3R 25796096 3' + BS 5049 1 48.12 AAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGGGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTCCTAACTTGCTACCATGTCG:1 + chr3L 12873049 3' + hobo 2884 1 75.76 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGG:1 + chr2L 2544805 3' + blood 7325 1 78.07 TGTATAAACGTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTATTATGTTTGCTT:1 - chr2R 11574973 3' + INE-1 136 1 61.64 AAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCCCGCACGTCAGCGCTCGTG:1 + chr2R 16355852 3' + hopper 1364 1 75.00 CAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGCTCACCTGTATC:1 + chr2R 20972739 3' + jockey 4948 1 50.34 AGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAGGCTTAAATGATGTATTGTTGTGGCACCAGGGCCCTAATGAGGTGGTAAGCCCACCGAGCGTTGCAATAAAATGCAGGCTAATTAAAAAAAAAATAAATA:1 - chr3R 7821793 3' - diver 17 2 72.34 GATGAAATCGGCATGAACACACACACACACACATATTCGGTGTGCGTGTGTGTGTCTACCGCGCGTGCAAACAAAATAACAATTTGATAAAGCCAATGTAATCTC:1 - chrX 10255359 3' + accord 169 2 63.81 ACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTT:1 + chr3L 2532519 3' + blood 299 2 73.10 CTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATC:1 + chr3L 11826017 3' - X-element 75 1 60.96 TACTGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCAAACACTAAAAAAAAAGGCAAGCAACTGAAATGT:2 + chr3R 24666424 3' - hobo 87 1 76.71 ACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACATATATATATGTATACAAAAAGCTACCTTTGTTTAAGNATACAT:1 + chr3R 17924515 3' + Burdock 6318 2 72.60 TGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACA:1 + chr2R 10119049 3' - Juan 4108 1 72.22 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATA:1 - chr3R 29627874 3' + roo 8983 2 78.77 TTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGT:1 - chr2L 6618892 3' - 17.6 51 1 57.64 TTTAATATTATTATATATATTATATATTTGCAGCTATAATTTTCACAATAATTCTAAATTTTCAGCCAGGTTTGTTTCTTAAATATAGTGATTATGTACGATTTCAGAGAGAACGCACAATATCATCTTTGACCAAAATTATAATT:1 + chr3L 15667752 3' + Tc3 279 1 36.99 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACCTTGCAGCGAGCTGTGA:1 - chr2R 12462088 3' + roo 387 2 70.34 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGATTTATTTT:1 + chr3R 4527304 3' + mdg1 377 2 54.79 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATG:1 - chr2R 1921397 3' + mdg1 7428 2 60.45 GCCCCGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTT:1 + chr2R 2994312 3' - gypsy8 4785 2 48.78 CAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTAAAGGCGGACACGCAACTCAACCGGAGCCA:1 + chrX 6649670 3' - Max-element 8243 2 75.81 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTCGCTTGTGTGTGTGTGTTTGTATCTGTTGGCAGCGCCTAGATTTATGCAGCATTTTATTTAAATTTCTGTGGTCTCGGAT:1 + chr2R 19108583 3' - jockey 84 1 54.29 CTTTGCAGCAAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCGGTTTCGCGTTGGCCTGTTACCCTTACATGCGCACACAAATCTACACACG:1 - 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chr3R 15727819 3' - 1731 4359 2 51.75 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTTGACAATGTCATTTCTCCGAAATTTCTTTCAATTCTTT:1 + chr3R 18832427 3' - roo 8747 2 77.93 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCT:1 + chr3L 6131924 3' - roo 8728 2 65.03 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATT:1 - chr2R 7720059 3' - HMS-Beagle 50 2 54.11 TGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTCTAGATATTCCTATGAAGCTATCTTATTAGTATATAATGTTAAATTTTATACCATAGGGATTCATATAGA:1 + chr3L 2167744 3' - opus 11 2 73.97 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTGAGCTTCATTACCAAATGACTGTATGAAAAT:1 - chr4 490195 3' - pogo 31 1 65.75 GTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTTTCGCTAATTACCGCATTTTGCCTTGTAATGAGTCGGAATAATGGATATTATGGCTT:1 + chr3L 4547813 3' - 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chr2R 13090858 3' - I-element 46 1 52.21 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTCAA:1 + chr3L 18183192 3' + Tirant 345 2 57.24 AATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAGTCCTTTGACCACGCTTGGCTTGCATCTGATA:1 - chr2L 6637333 3' - 1731 4358 2 73.29 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTAAGAGAGTTCTCTCCCTCTCTCTGCGAC:1 - chr2R 21713225 3' - P-element 24 1 60.50 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAGTATTCTCTATAATT:1 + chr2R 9453405 3' - roo 32 2 63.01 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATGGAGCACGAACTAGTCGCTGCTGCTGGAAC:1 - chr3R 29680159 3' - 412 12 2 75.54 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATATATTTT:1 + chr3R 19514351 3' - 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chr3L 2532449 3' - blood 37 2 60.00 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCATTCAAATAAACTTTTCGTTCAAAACACAATGATTAAA:1 + chrX 13628872 3' + roo 9052 2 71.23 TTTTTTTTTTTCAAATAAAAGCACAGGTTTCTCTATTTTTTATTATAACCAAAAAATTAATCGGGCAACTATTAAGATTTTAAATTCGTTTGAATCCCTCCA:1 - chrX 14661541 3' - transib2 2631 1 71.57 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGCTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAG:1 - chr3L 414876 3' + 412 7472 2 76.80 TTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTG:1 - chr3R 12613752 3' - HMS-Beagle 6845 2 54.48 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCATAAACATCACTCTTATAAGTTTATGTATAATGTACTAGTGTACTAAATTTAAACTTTCC:1 + chr2R 17269238 3' - roo 22 2 68.57 AAATACATATTACATACGTACATACATATCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATACGCGTGGATGGAAACGGGTCTGTGTGTATTTAACGTGCCTTAAATCACATTTGGTCTGTAATCAAG:1 + chr2L 17017436 3' + 412 7270 2 58.87 TGTGTGTGTGTGTGTGTTCGTGTGCGTGTGTATCTGTATGTGCGATTTTCTGAGGTAGTTGCCCGATAGGGTGCTAAGACGAGTAAACGCCTACATGGCCAGAAGTCATGTTGGCCCAGAAAGGATTTGCTTTTCC:1 - chr2R 25069577 3' - accord 180 2 59.56 CTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTGGGTGAGAGAGAGNGAGAGAGACACAGGAACACACGGATATGGAGGCACACACACACATACACATATACATATGCATGGAACTGGNTGATACGGGCTCCCTTTTAACCCATCACT:1 + chrX 15403960 3' - blood 100 2 78.17 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGTGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACG:1 + chr2R 12102038 3' + hopper 1399 1 63.72 ATAGATTTTTATATATTTTATTTATTTGTGCGAAGATAATGATTTCATAAAGCTAAGCACCCCAATATGGTCAAATCGAAAGGTACATTGTTTTCACAGCCTGTTTGGTTGTTCCTAAAACATCTGATCGACTTAAAGCTCCGATT:1 + chrX 4515338 3' - transib4 2279 1 54.11 TTTATCATAAAATTTACTTATTCCGATTGAAAATACTATTCTTAAAATCATTTTCCATGTTCTTCATATTTCAAAACGAAAGATCCAAAATCGTATTAGCTGACCCATTTTCTTGCCCGCGGTTGTCTGAAGCAGATTGCAAGGCC:1 - chr3R 16533536 3' + G4 3801 1 70.55 TCAAAAGAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCA:1 + chr2L 2057878 3' + 412 7476 2 70.77 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCACATACGCAACGAACGTAACGAAATG:1 - chr3L 17181406 3' - jockey 36 1 62.07 AATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAG:1 + chr3R 6584865 3' - transib2 71 1 67.12 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTCGAGCTGTGAATGTGGTTTTCTCTCCTATATAACTTTTCGCCCATCTCCTTTCCATTTTTCTTGTTTTATTTTGTTTTGCTTGCTTCTATGTTGTAGCTTCATAAAAATAC:1 + chr3R 26472949 3' + 1360 3379 2 76.03 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCACAACAAGGAGCCGCCTAATTGACAGATACTATTTGCTTCTCCCCTGCACCGCGCGGCGA:1 + chrX 609469 3' + 1360 3344 1 54.48 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAACTTAAACGCTG:1 - chrX 609381 3' - 1360 63 1 67.67 TCAAGATTACAGATAATAGGATAAAGTCTATTATAGCCAGAGATAATGCTAAATTCAAGTTCCCCGACTATCAGACACCCCTTAGCTAGTGAAAGTGCGAATGTAAAAAAAATTAAAAAAAAAATTTATTGAATGTGTGGGAATGA:1 - chr3R 1192317 3' - Cr1a 4221 1 75.34 GATCGGGAGATCTAGTTGTCAGGACGGCCGAGTTGTAGTAGGCTGCTCCTCCTACCCTCTTCCTTTACTCTTAGTCATACATACCTAATGAGTAAAAAAAGACGGGGGAGGCAAAACAGGACCGGGAGCCGACA:1 + chr3L 22254256 3' + mdg3 5220 1 64.93 AAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAG:1 + chr2R 4261959 3' + invader4 233 2 56.69 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTGTCTCTACTTAAGGAATTTAATTTGGGAAGTAGAAACGGAAAAGCCAGTTTTTGGATGAGTTTT:1 + chr3R 30087845 3' - roo 11 2 78.62 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATAT:1 + chr3L 6015691 3' - roo 8679 2 62.93 AACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAAT:1 - chr2R 12185312 3' + accord 7353 2 55.00 CTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTGCCCGGCACTCCAGATACTCAGCACAGCCGGCTCATATATCACGC:1 + chr2L 2057926 3' + 412 7537 2 73.50 CGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGATTATCGTGAAAGAGTTTTGAGTTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCC:1 - chr2R 14385583 3' - jockey 79 1 64.38 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTAT:1 - chr3R 5870784 3' + roo 9025 2 52.05 TGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCA:1 + chrX 21907810 3' - Stalker 308 4 64.46 TATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATTTAAATGTT:1 - chrX 3533841 3' - 17.6 6951 1 69.86 CACGATCAGAACCCTAAAGTCTAAAGTCCATATCAGAAAAGCTCGATACCTAGGCTTGAACGTCAATCAAATTAGAATAATTATCAGAGTTCATTTTCTCAAATAAAAATTTTGTAATCATTTTGTGAAATAAAAATTATATTTTT:1 - chr3L 19590776 3' + Idefix 7205 2 58.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACACAGCTGCTCGCCAAAGTTTTTAACCCGGCCAAACAGGCCCCAGAATTTTTCTACATATTTTTTTTTATGG:1 + chr2L 2730664 3' + roo 396 1 66.99 GACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACATA:1 - chr3R 12948581 3' - Stalker4 41 4 56.85 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCCATTAAAAGTCGCAA:1 - chr3R 17259511 3' + roo 9015 2 57.24 TATCATGTCCTGGAGCTTTTTTTTGGGGGGGTTTTGTTTGGCGATGACCTCAGCAATCTCGCTGGGGGTGATCGGTTGCACCGGCAAGTCCATTTGGAGCACTTAGCATTCCATAGCGAGTGCGTCGCAT:1 - chr3R 1418287 3' - BS3 248 1 63.85 ATAAAAAAAAAAACAGGAAAATCGAATGGGTGGGAGGTGGAAAAGGGAAAAGGGGCGAAAGCAGGGGAGAAAGCGAGAGAGCGCAACAACACTTGTTGTAATTACTCGAGCAAGTCTCGGTTCAATGGCTGCGG:1 + chr2L 12677508 3' + gypsy11 3931 1 71.64 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGTGAATAAGAATTCTGTGTTCGCTGCACTGCTTTA:1 + chrX 20284545 3' + roo 9022 2 52.74 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGCGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAA:1 + chr3R 29283263 3' - hopper 64 1 67.44 ATATGTATATATGTATATGTATATATGTGTATATCCGTGTGTAATGCGTACTTGGATTTATGTACATCCAATTGACAGCTGCGAAAAGAACGTCATTGTTTCTGAAGTTTATGTTGATTAAATTTAAATATTAAGTCGACATTTT:1 - chr3L 18206638 3' + G3 4507 1 75.17 TTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTGAATGCCGACATGGTTGTGTCTGCTGCTGCCTCGGCTCGA:1 - chr2R 12826984 3' + Burdock 6361 2 58.00 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTA:1 - chr3L 18216472 3' - 297 36 2 54.84 AAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCACTGCAGCTGTTGTTGTTGCCTTGCTTCTGGGGAAACCCTTA:1 - chr2L 20852457 3' + Tirant 8454 2 69.17 AACTTGCTGCGCTGACGTACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTATTTTTTCGAGCGCTATATAAA:1 - chr3R 5164921 3' + invader4 3035 2 54.81 ATAATTTTGAAAGGACAAATAAAAGTGTGCCAAATTTTAAAAGTTTTCCCATTGCCAAGTCGCATTGTCCCGTCCTTTTCTCTTTGAGCTATATTTCCCTCTCACATGTTTGGGGAACTACAGACCTTTGTGGCAGTTCAATC:1 + chr3L 15406156 3' + P-element 2510 1 53.15 GCGGGTATCTGATAGTCGAGAACTCGACTATAGCTTTCTTCCTTGTTTTGCTTCCCTTTAATTTTAGTTACTCCATTCCTTCGAATGATTTTGTAACTCCTCCGAGAAACTTCTACTGTCCAGGACAAGCTTTCCAATTGTTAAGC:1 + chr3L 20259648 3' + INE-1 554 1 63.01 TTAATAAATTCTAAAAAAAAAAATCATTTCTGGGAAGTGATTGGTGTAAGAAGTTCACTACTAGGTCTACAATAACTTTTTTAAATTTAATTAAAGGCATTACTATTGGTTTGGGAATCCTTAGCAATGACTTGATGCTGCTTGT:1 - chr2R 14444621 3' + BS3 1767 1 35.17 AGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACAAATGGTAACCAAAGTATTGAAGAG:1 - chr3R 460053 3' - F-element 114 1 65.07 ATAGCAAAAGGCAAAGAATCGCAAACGGTTGATCGAAAGGAAAAAGCAAGAAATTCACGAAAAGGTGCCTAATTTTGTTACACACTTTAACATTCAGCCCAGCGGCTAGAAACCCACAAAAAAAAAGATCAAGGCGAAAAAAATA:1 + chr3R 16128940 3' + Bica 470 1 71.03 TTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTT:1 + chr2L 18219420 3' - copia 45 2 54.11 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATTCTTTCGGTAACTAAAATTAAACCAGTTGAACTCATTCGTTCAAACA:1 + chr3L 26709868 3' + opus 7431 2 71.23 AAAATGAGTTTCTTACAAANACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGTGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCACAGAACAGCTCATGGCG:1 + chr3L 11536010 3' + roo 9036 1 55.71 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGGATGGTGGAAAAAAGTGGAGGGCC:1 + chr3R 19094280 3' - P-element 23 1 60.36 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTGTGTGTTTGTGTACAGGAAGAGATCAGATAGATCAGAAGCAGTGCAAGAAAGAAAAGTGCAAAGCGAAAGTTTTGGTTTTGATTGTGCAGCATCCGCCA:1 - chr3L 17011902 3' - 1360 19 1 72.41 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGGGTGTATATGCAGCAGTGGCAACTTGTAGACGTGACGCGGTCAAGACGCAACGGA:2 - chr2L 20718788 3' - jockey 4705 1 60.27 GTGGGAGACCACAGATAAGGTCCGCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACAGTTTAATAAAAAATGTTTATAAATAAAAATATTGAAAATATAAGGAGATATTTGCATATATAACATGAGGTC:1 + chr3L 23656044 3' + roo 8874 2 54.07 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGCTCAC:1 + chr3R 11285002 3' - blood 53 2 54.86 TGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATA:1 - chr2L 15019892 3' + BS 5014 1 71.23 TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAAT:1 + chr3R 18294898 3' + copia 5051 2 69.01 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGAAAAGACCCATTAAAATATGGCCAACTGAAGCAGGCATATATTTTTTATGGCCGTCCCCCCGA:1 + chr3R 8050553 3' + hopper 1362 1 54.11 CGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAAACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAAAACGTCTTCCTTACCCACGCTTTACTTC:1 + chr3R 12376523 3' - HMS-Beagle 6847 2 52.74 GAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGGGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCACCAAACAACAACAACAACTTGGCATATTTAAGTCAAATATGTTATTGGCAA:1 - chrX 8968626 3' + 1731 269 2 59.63 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGAAGGAGAACAATGTGGAACCT:1 + chr3L 12890432 3' + hobo 2919 1 70.71 AACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGCAATAAGTGCGAGTGAGAGGAATAGTATTCTGAGTGTCGTATTGAGTCTGAGTGAGACAGCGCACTGATTGTTGATTAACCCTTAGC:1 + chrX 9909334 3' - P-element 2875 1 15.44 CACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAGTATCCTTTGTTTTGGATATTAAAAGTGGTATTTAAATGATGAACAGTTGAATATTGCC:1 - chr2R 22521872 3' - pogo 55 1 57.93 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGACGAATTGATCTGGGTCACTCCCAAAC:1 + chr2R 23094979 3' - 412 7104 2 52.74 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTG:1 + chr3R 22709037 3' - 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chr3L 17011946 3' - 1360 63 1 62.07 ATAAGGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCC:1 + chr2R 10582442 3' - Juan 3893 1 76.71 CAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAA:1 - chr3R 12948586 3' - Stalker 6874 4 62.40 GCACCAGCAAGTACAGGTACTCTCGTCTTCCATCCCTTTATTTTGTTACACGTTACAAGGCTCTACTTATCCTATTGGATCGGCTGCTTTGCTAGAGGATTTCTACGTAG:1 - chr2R 1530582 3' + gypsy12 10162 2 49.09 ATGCCACCCTTCCAGTTCTCTGCTGGACAATATGGACGCTGAAGTGGAAGAAAAGTCGCGCTCGGGGCTTCTCCGAAATACACAAAAAAGGAAAAAAACAACTTCAACCATGTTCTTACCAAATTTAAGACTCGTTAAGACAAAAA:1 + chr2R 2495337 3' - hobo 1 1 57.53 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGCTATATTGATTTCATTAGCGGCTTTTAAGGACCCATAAAGGCGGCGGCAGGACACTAATTTTCCCACT:1 + chr3R 29627955 3' - roo 28 2 57.02 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTA:1 - 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INE-1 82 1 36.99 TATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTGTTTTTAATCTTGGACATTTCGGACTTACCGTCCATTGCCTTG:1 + chr3L 171597 3' - Doc 4432 1 45.21 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCACAGTAAACGCTCGGAAATTACAAACGCAACTGATGATTCTACTCGCTGGGCAG:1 + chr2R 12462220 3' - roo 66 2 65.28 ATAATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAATCAAAACGACACAAGATAGATCCTAATATATTTTATTGTACAAATGGATCGCACATATGGTTTATAAGTGTATTCATGTTGATGTT:1 + chr3L 6556027 3' + Doc 164 1 55.00 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTA:1 - chr3L 27415231 3' + transib2 2753 1 69.06 TCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTCCTGAGATCCGATATTAGTCGTACTTTGTCACTCGATCG:1 - chrX 19662951 3' + P-element 2871 1 62.86 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGC:1 - chr3R 26854777 3' - 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chr3R 25597855 3' - copia 4951 2 75.34 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTATTCCTTT:1 + chr2R 17650682 3' - pogo 28 1 67.59 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCACCCTGTTTAAAGACTACGCGCGGTGCGCCAGACATTCAGACATTTC:1 + chr2R 16372037 3' + 412 444 2 63.41 ACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCACG:1 - chr3R 31114254 3' - flea 4806 2 53.42 AAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCC:1 + chr3L 2317233 3' - 412 7113 2 58.90 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAACACTTGTCGCTTATGATT:1 - chrX 3533853 3' - 17.6 35 2 60.69 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGTGAATAA:1 + chrX 20284518 3' + roo 331 2 69.18 TCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGG:1 - 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297 6618 2 59.29 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAATATAAGAA:1 + chr2R 5193512 3' + roo 8997 2 71.92 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCCGTACCACCGCCATTCC:1 - chr2R 5953753 3' - roo 8 2 79.14 ATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTCAACAATCAGAATGAATAAGTGAAAATA:1 + chrX 12979571 3' - transib2 34 1 62.33 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCT:1 - chr3R 11516501 3' + roo 9016 2 55.86 AGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTTTCATCATCTCTGCCTCCTTTCAG:1 - chr2R 24215586 3' - I-element 5298 1 63.01 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATG:1 - chrX 3811606 3' - P-element 54 1 39.52 CATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAACCATCTATATTAAATAACTTTGCTATTTCAATGTGCGGATGTCAGCCCAATAATTAAAAGCTAACAACTGCA:1 + chr3L 11904881 3' - copia 4916 2 54.86 CCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCACACATGCCACACAGGTCGCCTTCAGTTGGCAGGGTGCAGGTCGCCGTCGAATAAATTTGTACAATGTCACGGC:1 + chr2R 22958007 3' + hobo 2898 1 53.24 TAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTGGCAATTGTTTCTCTGGCTCTCAAAAAAGCTCACTCTCGCTCTCCACTTGGCCCATTGAATCTCGGAGTGGCGCTGCTCCATTCAGTACCGAAAGCGACGTGG:1 - chr2R 13897683 3' + blood 7176 2 82.17 CAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAANAAAAAGAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAATGGTTGTGATAGCGCCAGTAAAGNGCATAATTTATAAGCAGCGAGTCATAGGGACTCAATGTTGTTGT:1 + chr3R 25798476 3' - hopper 46 1 50.00 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTGGAAAAGGCTTTTCATACTTACATATTAAAATTCATCAACATGTGCATGAGTCGCTGACTTATG:1 - chr3L 18846918 3' + 1360 3364 1 65.52 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAA:1 - chr2R 7895504 3' + mdg1 7414 2 51.37 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTGATTATGCTTATTTTATTACGTAGTTTTGTCCTACCATTGCCAAAAAAAATGTATTTTGAAGACAAATG:1 + chr3L 7024594 3' + 412 7533 2 72.60 ACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTTCAGACAAACTTGTGCGCAATTTGGAGCC:1 - chr2L 4864354 3' - mdg3 21 2 64.23 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTTTTTCATTCTCTTCGGCTG:1 + chr2R 14415532 3' - 297 6592 2 63.44 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCT:1 + chr2L 16884907 3' + pogo 2055 1 56.06 TGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTTGGCGTGCACCCTAATTAAATTCGGTTTTGTTCCCAAATCG:1 + chr2L 15085776 3' + opus 493 2 77.54 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACTTTTCAACGAATACAGTATACGTTTTTTCTCTAAGTGTACCGGGAATAATTAGAAACCAGGAATGGGTGTTCTGT:1 - chr3L 13291952 3' - roo 45 2 50.00 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTACATTTGCATTCCCCTTCCTTCATATTGCTCAAATTTTTTGTTTTTGCTGTATCATATTTT:1 + chr3R 7625441 3' - hopper 14 1 71.74 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTGG:1 + chr3L 10033678 3' - blood 22 2 58.77 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGGCATT:1 - chr3R 17259522 3' + roo 351 2 61.94 ATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAACATAAAACCATGTATTTTTAATCAACTAGCTTTACGAATTTATTTCATAATATAAAGTTACTTTTTTGCTGCATACTTTTCGACACCTTAGG:1 + chrX 18745457 3' - Juan 4048 1 67.86 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTTGAAAGTGTATTTCTT:1 - chr3R 19514232 3' + blood 7327 1 59.59 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCACATTATGTTATATTATTGTAGT:1 - chr2L 2544726 3' - blood 7059 2 50.00 CACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCCAACTTTATTTGTTGTTGTAATTCTGGATGTCATTGTCGGTGTGCATCAAG:1 - chr2L 3892983 3' - 1360 58 1 52.05 TGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTANCTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTG:1 + chr3R 31112254 3' + mdg1 7375 2 73.97 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCATGCTTTTGGGGGAGGAACAAAATTAAATCTCCCTGGTATTGGTGCAGTA:2 - chr3R 14608645 3' - jockey 19 1 78.77 ACTCTGGAGTGCTTACGTAGTTCTTGGTAGTCTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTATGAAAAAGTGTCACAATGTATTGTATTGTAATGCCGGCTGAAAGGACGGAGAGCGAGGAGGCGAACAGAGCAGCGCGAAAGC:1 - chr3L 23397895 3' - Stalker4 7082 4 54.48 CTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCGCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAGTGTGCAAAGCG:1 + chr3L 965483 3' + jockey 4907 1 73.97 TAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAAATTTCATTAACATTTGTTGACTTGCTTACTTGAC:1 - chr3R 26180389 3' - Transpac 4945 2 71.22 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAAAGATGATTGACCGATAAACATTTTTTACTAGGGAGATTACAATTTCTCACTTTATTTTCTG:1 - chr2L 21941080 3' + flea 243 2 75.34 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTTTGCTATGGATATATTGCTTTTCAGATTGTAGGTCATAAATTTGAGACTCATCGAGAGCCTTTCAAAAATCTGCCTCGTATATTTCCTTCTCCTTTGGCTT:1 + chr2R 7895666 3' - mdg1 7057 2 72.60 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCAT:1 - chr4 868643 3' - roo 68 2 67.12 CATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTC:1 - chr3R 20983864 3' - hopper 64 1 61.15 ACAAGCATACNTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAA:1 - chr3L 9317956 3' + P-element 2847 1 60.00 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTG:1 - chrX 20361983 3' + hopper2 1528 1 77.94 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAA:1 + chr3R 29288761 3' - BS 5076 1 70.34 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAG:1 - chr2L 16884804 3' - pogo 63 1 63.70 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAGTATTCAACTAAAATTTTCTTATTAAAATGCTTCTCAAATAATTTCAAAACACTT:2 + chr2R 22521979 3' + pogo 2038 1 65.75 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCCCTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGCGTGCGCACAATTTACGCT:1 - chr3R 19950430 3' - BS 5039 1 50.00 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTAACGGTTATTC:1 - chrX 3382307 3' + pogo 2042 1 60.96 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTTT:1 - chr2R 21796001 3' + roo 9037 1 56.72 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTGGGCCCCACTCCTTGTGCTCTTCTTCTGCTTTCTTGCTCTCTCTCCCGCT:1 + chrX 9121351 3' + P-element 2853 1 49.07 GCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACTCGCATCGCAGGATGGAGACAATACCGTTACGGTCA:1 + chr3R 25158717 3' - 1360 11 1 76.15 ATAATTTTGAAAGGACAAATAAAAGTGTGCCAAATTTTAAAAGTTTTCCCATTGCCAAGTCGCATTGTCCCGTCCTTTTCTCTTTGAGCTATATTTCCCTCTCACATGTTTGGGGAACTACAGACCTTTGTGGCAGTTCAATCGTA:1 + chr3L 15406159 3' + P-element 2510 1 54.11 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTGTCACTTACAGAGATTCACTGGGAATGGGACTGGAAATGGGAATGGGAATGGAATGATTCCCAGGGGAAAAAGGTTGAGGTGTAGAAGACAGCTTCTCCCGCGCAAATGGCATC:1 + chr3R 12341245 3' + Tirant 395 2 81.51 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAA:1 - chr3R 26472826 3' - 1360 86 1 78.47 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCACGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAG:1 + chr2R 9871548 3' - roo 17 2 41.78 TTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGTTTAACA:1 - chr3R 10148700 3' + 17.6 7381 2 60.27 GGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTAAAACCCTTCTAATTACATACATTAAAATAAATAT:1 - chr3R 12376429 3' + HMS-Beagle 6963 2 73.29 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCTTAAACTCATTAATCATATTATTCAGTTTTGTTTACTTTGCCTTCTTGCTGAATTT:1 + chrX 8590795 3' - pogo 61 1 64.14 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATTAATGACCAAATAAATAGGTGACAGCAAACTACTTACTCCTTACTTCTTAACTGTATTTAACTTAACAGTTTAACAGCTAAGTTGGAAGAAGACAC:1 + chr3R 23902297 3' + I-element 5327 1 60.69 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAATCCCATAAATATTGCAAATGGTTACACTTAAGCTAAATGTAATTAAATTACGAAACGTTAAATCCAATTAAACCTTATTT:1 + chr2L 18510842 3' + copia 250 1 58.90 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAATTTAAATTATTATTTACACAC:1 + chr3L 414927 3' - 412 76 2 70.34 GAACGGTCCATTTAATAGACTCACAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATAGAAACAATAGTTTTGAACATCATCTTAAACCTATGTTTTGGTTATGGTTTCTTTTCTGAGCACTTTTACTCAAAAAT:1 + chr2L 6619026 3' + 17.6 7385 2 60.84 TAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCACTAAAAATAAAGG:1 - chr3L 20224091 3' + Chimpo 169 1 73.97 GTATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTAATTTAAATGATTCGGTATGCGAAATAAAATTAA:1 - chr3R 25597861 3' - copia 4957 2 79.45 TTGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGG:1 + chr3L 9324532 3' + HMS-Beagle2 7124 2 73.33 GTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATG:1 - chr2L 15019882 3' + BS 5025 1 64.14 CCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGCGACCAGTT:1 - chr3L 11364783 3' + Tirant 8465 2 50.75 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAACTTCAACTGCGAAGTATGCAATATATTTTT:1 - chr2R 8315518 3' + hobo 2920 1 60.81 AAATGTACAAATTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGT:1 - chr3L 19274784 3' + transib2 2770 1 52.08 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCA:1 + chrX 20149222 3' + pogo 2034 1 70.50 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGCTTACTGGAAGGACTCGCTGAAGATCCT:1 - chr3L 9635282 3' - Doc 30 1 49.25 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGGGTGTATATGCAGCAGTGGCAACTTGTAGACGTGACGCGGTCAAGACGCAACGGAAGCAGACCATAAAATCAAT:1 - chr2L 20718769 3' - jockey 4686 1 73.29 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCACAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGGCAAATGCATCGCATTGACCAGACAGACA:1 + chr2L 17019204 3' - 412 7085 2 65.07 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATG:1 + chr2L 544927 3' - Doc 59 1 58.90 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAG:1 + chr2L 12932191 3' - opus 151 4 54.62 CGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTC:1 - chr3R 24480466 3' - blood 7081 2 63.70 AACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCTGGTTAAGAGCGATTTACATACAAATCGCTGCCTTTTGCTGGCTCTTT:1 - chr2R 12101932 3' - hopper 68 1 65.07 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTG:1 + chrX 20330614 3' - P-element 16 1 60.61 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGGAACGGAACTGCGAGGAAAATATTTTAACACTCAGTATCA:1 - chr3L 7389674 3' - roo 8699 2 60.96 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATCCTGGGAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAGAAGGACAGGCAGATG:1 + chr2R 8315596 3' - hobo 37 1 59.85 ATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATATAAACTTTTTTTTTTGCTTTAAACTTGGCTCATTTTTAATTTATAATTCACAGTTTT:1 + chr2L 17957276 3' + flea 197 2 61.64 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCGGTTGGAATTCGCTTCACTCAAATAGTTTAATTGCCAACATGGGAGATCAGGCACAAGAAAATGTCAACGCTGCGACATATGCATGTACATACATATGTACATAATGGCGTTG:1 - chr2L 2493955 3' + Tirant 396 2 69.93 ATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAATAACCCTTATATTGATTTATTATCATATTTTTTGTGATTAAAGTGCTGGCTGCGTATAACTTTATACTAATACAATATCAAAGTCCATGTTCAGTTTCC:1 - chr2R 13121730 3' - HMS-Beagle 10 2 76.09 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGC:1 - chr3L 17181438 3' - jockey 24 1 57.43 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACA:1 - chr2R 16274562 3' + roo 8991 2 71.72 GTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTTGCAGCGGCCAGCTCTGAAGATTTTGTTTGTCCTAACAAGTTTATGTTAACTTCATCATCATCCGGTTACCAGTAATAACACTTTGGTGATCTTGTCTC:1 - chrX 21184460 3' + S-element 1712 2 77.40 CATATGTGTGTGTGTGTGTGGTTGGTGGGTTAGTGGGTGGTGGTTGGGGAATTGCGGCCATTCGCGCTTTTACGACCCACCTGAATGAATGGATTTTTAG:1 - chr2R 18500839 3' - accord 184 2 74.00 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTTCCATTT:1 + chr3R 6685851 3' - 412 7097 2 55.48 TGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGCACTTGGTATTACTTGATAAAATGGACAAGCA:1 - chr2L 20761815 3' - Doc 394 1 80.14 TATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTA:1 + chr3R 20200465 3' - Transpac 85 2 75.34 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTGGACCAGCAGCTGAGCGCCGGAGAAAGTGAAAG:1 - chr2R 23443977 3' - P-element 84 1 27.78 TATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTCCAGAAAACCACTCATACCCCGCCATTCACCGCCCACCGCTGGCGTCTTTATTACAGCGCTGCACTTAA:1 - chrX 9846730 3' - transib2 35 1 56.59 TTGTATCAGTTGTAAAACTCGACTGATTCTTAACAGTACGTTTAAAATACACTACAACAAACAGTGACATAGAGAATTTGGTACTTGAAAAACGACGCTTGTCAAAAAAAAACTAAAATCCGCATTGCGGAAGAAGAGGACGCACA:1 - chr3R 907904 3' - gypsy11 366 2 28.77 TAGATCTAACTATGACTTGCATGAACTTACAGAGTAATATGTTGTGACTATAATAGACTTTATCCTATTATCTGAAATCTTGACTCTCCTCCGAGGGACCACCTACCGGCTGGAATGGGTTTATAATGTTATGGGGCAGGGTGTAC:1 - chr2R 5634080 3' + Cr1a 4159 1 60.27 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGAC:1 - chr2L 15874845 3' + mdg1 7401 2 58.22 CACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCCATAT:1 + chr3R 10737099 3' - F-element 28 1 69.29 TTAACGTATTTCCAATGTGTTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGGTGCCCGCACGTCAGCGCTCGTGCG:1 + chr2R 16355854 3' + hopper 1337 1 77.52 CGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGT:1 - chr3L 18183063 3' - Tirant 8148 2 58.62 TAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCCACTAAACCCACCAAAAATT:1 + chrX 3533993 3' + 17.6 445 2 55.17 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAA:1 - chr3L 27415227 3' + transib2 2767 1 63.57 CTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCTGTTAGTTCCCGGAGTTC:1 - chr3R 28749122 3' + mdg1 7374 2 72.60 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTC:2 - chr3R 16475356 3' - mdg3 75 2 71.53 CTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAGTGACAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCCTACATGCTGAATATAGTGAATG:1 - chr2R 7314572 3' - blood 7012 2 77.93 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCAACACCATGGATCCG:1 - chr3R 25798363 3' + hopper 1359 1 54.79 TGCTATAGTCTAGTTTCCCGAATATCAGATACCCAGTTACTGAGCTAGTGTGAATGCGAATATAATAATATAAATATAAATATCATATAATAATAATATTTATCCTTCTTATCATTTTACCTGCTTTCCAACATCATTGATAATTT:1 - chrX 21285029 3' - INE-1 568 1 54.79 TATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAG:1 - chr3R 12078609 3' + hopper 1354 1 60.69 CAACGGGGGAAGCGGATATAAAAGCAGCGGGGCGGGAGAAGAGGCCCAGTCTCGAACGGACACATAACGGAACCGCTAGCAGATCGCGAACTGAAAGGAGGTGACTGCATATCCAGCCAGGCA:1 - chr3R 11358773 3' + opus 275 2 77.24 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCCAAATAAATACCAACGGTGAGTAATCGTTTTCTTATTGTTACTGCTGTA:1 + chr2L 3662040 3' - blood 7065 2 60.77 CCGTATAAACGTCGAGATCTCACGAACTATGAAAGCTAGAAGGTTGAGATTAAGCATACAGATTCTAGAGACAAAGACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGACACGACCACTCTAAAGCCCACACAAAACTGCCACGCCCAC:1 + chr3L 19271025 3' + INE-1 135 1 80.14 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGA:1 + chr2L 11617768 3' - 412 81 2 73.29 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGACGAATTGATCTGGGTCACTC:1 + chr2R 23094973 3' - 412 7110 2 56.85 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAAAGGCACAGCGATTGAGGAAAATAGAGA:1 + chr3L 11364945 3' - Tirant 11 2 79.45 TGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCAAGTGTCTGCTGCCGACGAATACAGTGGTCTCGTTCTGGCGTAGGGG:1 - chr3L 5770896 3' + P-element 2867 1 55.91 TTCTAGCTGTTATAGTTCCTCAGATCTCAACGTTCATACGGACGAACATGTCCAGGTTGGCTCGGCTATAAAACTTTTGATACACATCCTTATCCTCGATATATTTAAATATGGTTATGTTGTTAGTAAGCTTT:1 - chr2L 21661053 3' - INE-1 154 1 54.48 TTACTAAATAATTTTAATTTATAGGTACTACTAATATGCTTACAATTTCTAGTCAATTTTTAAAGCCTTTATTATAATGTAATTTGCATGCGTTCTTACCAACTCTGTCACATTTGTACACTGTGGTTTCGGTTAATTACCTACT:1 - chr3R 13927192 3' - HeT-A 353 1 38.62 CTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTTCAGACAAACTTGTGCGCAATTTG:1 - chr2L 4864359 3' - mdg3 20 2 63.25 TTCCTATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGA:1 + chr3L 24208219 3' - Quasimodo 50 2 56.85 GGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGC:1 + chr3L 18074192 3' - 297 15 2 69.03 ATAAGTTTATTGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTAATGTCAAAAAATGAAGATCTTAGTATAAGTATTTAAGTAGTTTAATGCAATTATAGGCGGTTCTATTGGAAAA:1 - chr3L 9630672 3' - Doc 4561 1 38.33 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAATGTTGATGTTTTTTTTTTGGAAATGGTTNTGGTTG:1 - chrX 17792472 3' + roo 393 1 74.66 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAGCATTTATAAAGAGTACATTTTATAA:1 - chr3R 26472771 3' + 1360 3356 1 61.64 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAG:1 - chr2R 16274539 3' + roo 9019 2 54.29 GTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACACTCGAG:1 + chr2L 21400825 3' + Doc3-element 4686 1 35.42 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGATGTATTTCCATCGAAGCAGCCCTGCTCATAAAATCTGGAAATTTTCTTT:1 - chr2L 5728808 3' + roo 396 1 76.71 CATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCACTCGTATGTGCGGGGCGGCCTTCAGAAAATGGCAACAAACGCGACATTAAATTATGCGCCTAGGCCTATTATTTTATGCAATTGATAAATTGACAACG:1 - chr2R 14415388 3' + 297 378 2 74.66 TCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATAATCAAATTATGCACGTACCAAATGCTGCAGACACTTTGTGTGCAAAGATTTTATATAGATA:1 - chr2L 9383727 3' - flea 53 2 58.22 TAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATCAAATTGGATTTCAAATTGCCGAAGTATATTCCGAATCTCGACAATATAATATCCCTAATATATTC:1 + chr2L 12158877 3' - 1360 52 1 54.11 ACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATCGGGAAACGAATTCCATCGATTACTCACCCAGCTGTCTAGTCAGCATGAAGCAGCTC:1 - chr3L 2186340 3' - opus 430 2 56.49 AGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGACCTGCTCTTCCTTAATGCGGTTGTGGTTGGATTTTGCAGAAATACCCCAGATCTGTATTCCGAAGACTCAATCTTTACTGACTCATAGTTTATGGTTAAGGTTTACTAAACG:1 + chr2R 4004220 3' - BS 4844 1 68.49 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGCTACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCT:1 + chr3R 29283286 3' - hopper 58 1 57.53 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATCCCTACAA:1 - chr3R 11937781 3' - hopper 75 1 68.49 ATGTAATTGTAGTAAAATTACTGTAAACTTGAAAAAGCTAACTATAGTTAGCCGGCGCGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGAAAGTAACACACTGAGTCGGTAAGTGATAGTGAATTAAAGCCTCCTTAAATTAGCCAATTCCCTA:1 + chr2R 2743795 3' + X-element 4591 1 58.90 CACTGGAGCGCCGTGGTACCTTCGGAACGAAAACATACACAGAGACCTAAAAATCAAATTAGTAATCGAAGTAATAGCTGAGAAATATAATTGTATAATTGGTTAGCATTATATTTTCGCCATATTTCAGAAACAATAGAGGGGTT:1 - chr3L 6554043 3' + Doc 4378 1 58.22 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGTTGATTACTCGCTTCAACTCTGACATCGCTT:1 + chr2L 10461229 3' - roo 58 2 62.69 ATAAAATTAGTTTCTTACANAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAG:1 + chr2R 14821232 3' + roo 9034 1 47.26 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTGGGACTTTACAATCGTAGAGCCTTCTTTAGACCCTCCTTGAAGTTAATTT:1 - chr3R 22708973 3' + roo 8987 2 71.92 GACGTCTGCTTGTTTGGCTATTGTCTAACAGGTTGTGGGTATGCGGTAGTAAGGGATTATGTTATCGGGGGCGACTCGTACGGGGGAATAATTAGATTGGACCCATCAGCGGGCATTCAAAGCACGGCA:1 - chr3R 30952886 3' - G6 1855 1 72.09 CAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATACTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTA:1 + chrX 22835255 3' + mdg3 174 2 64.38 AATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCATTTCCGTTCACATTTTCTGCATTGTCAAATTGTCAAAATAAAGAATCTAAATAAACGTA:1 + chrX 21443106 3' - Transpac 4929 2 76.06 TGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCATATTTACACAGCCAAGAACAACAATAACAATAG:1 - chr2L 13033310 3' - hobo 55 1 56.85 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACCATGTAAACAGGGCG:1 + chrX 9846828 3' + transib2 2754 1 67.83 AAAAAATTGTAAAATTTAAACTTCAAATTAAAGTTGCTATAGAAAGGATAATTACTTTAATGCTAGTACTAATAAAACAAAATCTTTAATAAAGTTGGATCAGTGTGCCACTGCAGGCTTTCGGCATAATTCCCAAGAAAAAATG:1 - chr2L 4728716 3' + 1360 3037 1 83.45 GAGGAGTCGGTAACCCGACCCATGGTGCAGGGGGCGCCGGCGGTTGAGAGAGGGGAGCAAACGGCCCCCAAACGACGTCGGCAATACCCAATAA:1 - chr3R 3902168 3' + Rt1b 465 1 75.53 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGTTTTCTGGCTAAGTATGTGTATTTGTGT:1 - chr3R 21794049 3' - hopper 67 1 65.07 TAGGGAAACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATNAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACNTGCATTAGCTGGGCCGCAAATGCGAAGTACATACGGGGGCGAA:1 + chr3R 12613844 3' + HMS-Beagle 6961 2 72.41 AGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCC:2 + chr3R 1977623 3' + micropia 5369 2 62.33 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTCACAGTTCCTTCAAT:1 - chr2R 9870944 3' + roo 9037 1 61.64 TTCTTGATCAGGGTCAAAAGCCGAGTCGATCTGGCCATATCCGTCCTTCCGTATGAACTTCAAGATCTCAGTAACTATATAAGTTAGAAGGTTGTTATATAAGTCTTACAAATTTATGCTACCCTGTG:1 + chr4 823782 3' + INE-1 87 1 73.44 AGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCG:1 - chr3R 11284905 3' + blood 307 2 65.75 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAAT:1 + chr2L 15085717 3' + opus 453 2 64.71 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGACTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCC:1 - chr2L 10461153 3' + roo 352 2 61.60 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTG:1 + chr3R 19094255 3' - P-element 76 1 30.22 CTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAATGTAAACAGGGCGGGCAGGAAAGAGAGGGAGAG:1 + chrX 9846848 3' + transib2 2790 1 58.27 TTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAGCCACGTGGTATATGCTCGCAACAGCCGACTTTAACAGCTGTTATTATAACGGTGCATTGTAAAATTAACTAAGCTATGATGGCCCAAGAAGAGATTTGTGCGG:1 - chr3R 4949215 3' + hopper 1209 1 74.64 TTGGGAAATCAAAAAAAAAAACATGTAGAAGACATCGAATTACAGATAAAAGATCTTTTTAGCGTATATTATTATTAAACAAGAGACTTCACTGACATTTTTCTCTTCAATTAAATGACTGCAATAAAAACCGTTTTTGATATTTT:1 - chr2L 13043764 3' - Tc1 1475 1 50.68 AACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTATTTCCTTTTAAATTACACTTTTAAACCCAACTACATTATTTCTAG:1 + chr3L 14888854 3' - flea 4820 1 69.06 GAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAGGTGGGTCTTTAACGAGGCGTTGCACTTCGCAAGAAGCTCTCTTTGATTTT:1 + chr2R 16567420 3' + opus 487 2 78.08 GAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGACGGTTGATATTAGGCGTACAGATTCTAGAGTCATAGACGCAGTGACCCAGTGTCACTGGCCCACTCTAACGCCCAAAAATTATGATGAAAGTCCAAGAAATGGAAACTTGCGAAAAATA:2 - chr2R 25240224 3' + INE-1 148 1 69.86 ATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAAC:1 - chr3R 7074828 3' - P-element 90 1 28.77 GTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACGGTATCCACCATTCGATGTGTAATTTTACCGTGCG:1 + chrX 13060316 3' - Tabor 6863 2 60.00 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATAC:1 - chr3R 24084812 3' - roo 86 2 79.31 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTGCCCGGCACTCCAGATACTCAGCACAGCCGGCTCATAT:1 + chr2L 2057919 3' + 412 448 2 54.11 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAATGAAGCGCCTAGAGAAGTGTAGATAA:1 + chr2R 11153253 3' - roo 8696 2 54.79 ACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCG:1 - chr2R 7314641 3' - blood 71 2 63.70 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTAGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATG:1 - chr2R 21796024 3' + roo 9024 2 59.68 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTG:1 - chr3L 13285598 3' + roo 330 2 73.29 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGTAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATG:1 + chr3R 13869029 3' - HMS-Beagle 42 2 54.68 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATA:1 - chr4 868654 3' - roo 75 2 73.94 CCCGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCAC:1 - chr2L 20761891 3' - Doc 463 1 71.22 TAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGT:1 + chr3L 20680342 3' + 412 7471 2 75.97 GCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCAATATCGTAGGCAATATTTCGCTTTCTTGTAAAAATGCTGGGAAAACTTCCAACAAATGGCCATGTGGGAGCCGTCTTGA:1 - chr2L 5207408 3' - opus 7033 4 61.43 TGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTGCCTCCCGAAATTTCTCTTAGCAAACAAAGTTGT:1 + chrX 16998413 3' + diver 6064 2 49.32 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGC:1 - chr3R 21925090 3' - hobo 44 1 51.49 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATAGTATTTTCTTATA:1 - chr3R 20983842 3' - hopper 38 1 56.30 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGA:1 + chr2L 12932168 3' - opus 7173 4 69.05 GGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAGTTTAACATAAAGAACCTAAAATTTGTTGCCTACTCTTGTGGGCTGTGAAAAGTGATATGAAGTCAAGTGGTTAATTAGTTTGCCTAATGG:1 + chr2R 17207871 3' + jockey 4972 1 57.53 TAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGA:1 + chr2R 17350593 3' - F-element 82 1 62.33 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTCTGAGATTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATACACCTGACAAATGGGACTCGGGTCCTGGACAGGTNCTGCACGAGGTGT:1 + chr3L 22021740 3' + mdg1 7391 2 63.45 ACATTTTTTTGGTTTTCTTTTCTTCTTGTTTGTTGAAAATTATAAGCGCTTTAAAATGCAAAAATCGCTACCGCATTGTTTCCGAATCGGTGGGGTGGGGCTATTTTTGGAGCTCTCTCACTTCATAACGATAAAATATGATAA:1 + chr3R 26552106 3' - mdg3 5106 1 40.97 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTATTTTCGCACCGCCTGAGACGAAGGAGGCAGCCCCGT:1 - chr2R 9376602 3' + hopper 1385 1 65.75 TAGTTCCTGAGATACCGACGTTTATACGGACAGACAGACGGACACGGTCAGATTTTACTCTACGATTAACCTAGTGTCCCTTTTAATTTATACATTATCCATCAGCATCAGTTCAAAGGCTAACGAGCAGCCCAT:1 - chr3R 31957310 3' - INE-1 142 1 58.52 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTGTCAGCGTCCGTGTCTTTGTGTTGCCGCTGCATGTACGTGTGT:1 - chr2R 16355802 3' + hopper 1411 2 66.22 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGGATCGATCTGTACTTTTATAT:1 + chr2R 6801720 3' - 297 6612 2 57.26 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGCGAAAGGCGAAAACAAAAATCAAATAAATGGCAATTTAATACACTCAACATGCCATTCGAAAGCACCAACG:1 - chr3R 7625288 3' + hopper 1388 1 61.60 TCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTAAAGCCAAAAAGTGCGCACAACTTCTAAATTACTTTTCCAAACAGCATCCACTGGCCTGCTGCCTGCTCCTTTCCAACGCCCCTCCCTTTTGTA:1 - chr2R 14072467 3' + mdg3 220 2 64.38 ACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGCTCACCTGTATCCTT:1 + chr2R 20972742 3' + jockey 4976 1 48.33 CGAAATTGGCAAAAAAACTACCCTAATATGTACAATGTAAATTCATTTCCTCGTGTAAATTCGTCTTCTAGCACAACACGCACACATATACGCTGGCCATTCCAAGGAAAATATTAATTAAATATTTTCCCGCCATTTACCCATAT:1 - chrY 2720363 3' + 1360 3126 1 63.01 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGGCAATTCCTTGGAGTGCATCTTAG:1 + chrX 666373 3' + 412 7486 2 60.00 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATACACACATATACACATACATATATAGAATATTCGCATTGCAACTGACAGGATGATGAGACCCGGAAAAATG:1 - chrX 18582156 3' - I-element 43 1 47.48 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTA:2 - chr3R 20904955 3' + roo 9017 2 58.22 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGATAATGATATATTGTTTCAGTTTTTGTATTGGGTTACACTAGGCCATATCTTACATATATAACACCAAAAATTGTGGGCATGACACCGCTTCT:1 + chr3L 24059298 3' + roo 9043 1 61.64 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTCAACAATTTTTTTAAGGCTATGGTATTCCAGCTCAG:1 - chr3L 2167610 3' + opus 7444 2 71.20 TAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGACTTAAAAATGCAGCCAATAAATAAGTAATTAATGAAAATGTGTGGACGCATTTAATTCACTTTGTAAATAT:1 - chr2L 20029374 3' + I-element 5308 1 50.68 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTCCACAAGGGGGGTGGATTTTCCGATGGACCCCAGCTTTAACCACACCCCCTGGAGGGACTCAGTTTCATTTCCAATCAACGCGGGATG:1 + chr2L 9383867 3' + flea 4995 2 67.91 AATAAAGTAATTGTTGAAATTTATGGGAATATTGCTAAGTTATAATTACATACATCTAATATCATGGTATAATAAATTAGATTTAATTAAAACTTTTGGCCATGCTATACACTCACATGCTCCTTTAGGCGATCCAACATTTTCT:1 - chr2L 6122382 3' - 1360 376 1 60.00 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCACTGACTGCCTCAATGACGAGCGCCGATAAG:1 - chr3R 29283146 3' + hopper 1390 1 69.18 ATGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAATAACATTCAGACTGTCCTGCCAGGCAAACGGCAACTTAATTACGGA:1 - chr3R 9898631 3' + jockey 4899 1 70.55 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTG:1 - chr3L 14422701 3' - roo 8715 2 54.11 GCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTCCATCGGATATTTTTGCTGTTGAAACTGCAACATACACATCCACATTGGTGGCAGACAATTCAACTGG:1 - chr3R 4666236 3' - FB 53 1 53.42 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACTCGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATT:1 + chrX 18673735 3' + roo 331 2 68.53 AAGTGCAAAGTGAAGTATTTTTTCCGACCAAGAACACGTACAGTGTTGGCTAATGCGCCATTTAGCTAATTGATATTCCAATTGGTTTCAAATTTGATCGTTAATTTGAAGAATAATTATAAACAGAACAGAGCTTTAACTTCAAT:1 + chrX 6701367 3' + gypsy4 453 1 82.19 AAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGTATGTACCTTTAATATTTAGCAACGCTTTTGCGCTTACTAC:1 + chr2L 22150636 3' - S-element 76 1 83.56 CTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTA:1 - chr2R 7314635 3' - blood 7075 2 59.31 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATTTAAAT:1 - chrX 3533844 3' - 17.6 6954 1 67.81 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCGAGTCAATATCGAAAATACGAGAAAAAAACCGAGTGCAAAATAAATTGACAAAATGCAAATCAGTAGAGTAAAATGTTTTTCTATATCCGA:1 - chr3R 17987602 3' - jockey 35 1 63.45 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTGCGCCTCTTATACATTTTT:1 + chr3L 27415320 3' - transib2 51 1 53.90 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTT:1 + chr4 880398 3' - pogo 60 1 62.33 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGCGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCG:1 + chr2R 23094939 3' - 412 7144 2 78.77 GGAAAAGTGGGCGTGCCCCAACTCCGCCCCATTTTTTTTTTTGGAGTGTGTGGCAGAAATGATAGAGAAAGACAGATGGGAGGGAAAATTGGGAGGTGGCAAGGTGAAAGCGATGACAATATGTTTCGCCCACGGGAAG:1 - chr3R 21798903 3' + hopper 113 1 75.54 TGCCCATCCCTTCTACAAACCAAACAAGACATATTCAACAACACCAACCCTCTAGACCTTCTTAAGATCTTTTGTAGTAGCCCCACACACTTCGCTTACCCTAGATGAATGACAATCCCGTTTGCCATGTATCTCACACAAGTCGA:1 + chr2R 14282086 3' + I-element 5058 1 63.01 GTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGCTTATTTTGTTAAGATTTTTATTTTCAATTCGCATCGCTGACTGCCGCAAAGTATGCAGTGA:1 - chrX 22603143 3' - jockey 4730 1 58.22 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGAGGA:1 - chr3R 25795995 3' - BS 5049 1 52.05 CGTTTGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGTTCGTCTTCCCGGTTCGGTGTCCGACAGAGTTAGAGGCGTGGAGGTTTAGGGGGTGGGGGGGTAACTCGGGCTTCTTCCTCGCTTTTTAATAATAATTTTAATTGATTT:1 + chr2L 12297218 3' - Tirant 78 2 71.53 GAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTT:1 + chr3R 8197870 3' + pogo 2033 1 66.90 TGAGAGGTTTNGTTCTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGC:1 + chr3R 19950514 3' + BS 5014 1 69.66 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGATGTATTTCCATCGAAGCAGCCCTGCTCAT:1 - chr2L 5728828 3' + roo 9039 1 63.01 CTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCGGGTCACCGTTGACAGGACTGCCTACACCGCC:1 - chr3L 22518908 3' + hopper2 1566 2 54.68 AATCTCGTGTAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCCACGATGCAAGGCGGCCAGGGCAAAGCGGAGAGACCGTGAATTAACGGTAGCCCGGTAGGCCGTGCGTCCTCTTTGCGTCCTCCACGGCC:1 - chr2R 1119184 3' + gypsy8 25 2 79.51 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCAT:1 + chrX 21443048 3' - Transpac 4991 2 64.38 GTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTC:1 + chr2R 12827044 3' - Burdock 67 2 76.80 AACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAACTGTAATTATTTACTTATATTCTGGTTATATGAGGCATTTGTTCTCATTTCTTTCTGGGGTGGTTGACTTACGTTTCCAGTTGCTTTCCTTTTTA:1 - chr2L 22780819 3' + HMS-Beagle2 7150 2 54.79 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTCGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTTACCTATGAAATTCGGAA:1 - chr2R 17269064 3' + roo 388 2 68.49 TCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTAAGTTTTTTGAAATACACAGTATAAATGATATGATATAT:2 + chr2R 25051914 3' - G5A 2670 1 74.66 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTT:1 + chr2R 14415514 3' - 297 6622 2 68.57 TATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACATAAAG:1 - chr3R 12948578 3' - Stalker 6885 4 59.72 ATTGGCCGCTCACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTAAAGGCGGACACGCAACTCAACCGGAGC:1 - chr2L 7633330 3' - Max-element 8265 2 63.89 ATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCCAACATTTTCGTCCTTCTCG:1 + chr3R 6584899 3' - transib2 36 1 62.07 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAGGTGGGTCTTTAAC:1 + chr2R 16567383 3' + opus 7454 2 57.24 TCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAAAACACACGCCAAGGGGGCCAAAAACAAAAAAAGAAATAAAAAGCAAAAAGCAAAAAACTAAGGGTTCTTG:1 + chrX 8968748 3' - 1731 13 2 67.81 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACATTTATCATGCACTCTTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 24084783 3' - roo 8682 2 62.26 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTGAGACAGCTGATTGCCTCATCAGGTAAATTGGTGTCACCGCA:2 + chrX 10725095 3' + pogo 2055 1 52.74 AATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTA:1 - chr3R 20841386 3' - Juan 54 1 53.15 AACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTATGTATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGATCTATTCAAAGTGTCAGAAAAGACTCGCTGCCCCAG:1 - chr2L 15516668 3' + Max-element 283 2 63.30 GCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTT:1 + chr3L 1459863 3' - 412 7133 2 73.29 CCCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAGTGTATAATGGCCTTGAATTTAAGCATGCTTCTATTTGACATAAAAGAGTTGACATTTCTTCGTAAG:1 - chr3R 19447643 3' + roo 9017 2 56.85 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAAC:1 - chr3R 20887396 3' - Doc 61 1 55.94 AGTTTAATGTATTTCCAATATATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGC:1 + chr2R 11778054 3' + hopper2 1527 2 66.90 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGCAGCGCGCTAAGCCAGAGATCTGCTTTGAAGCTTTTGATTTATTTGCTTGATGGCAAATCAT:1 - chr3L 22330927 3' + hopper2 1552 1 55.48 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTCAGTTCAATTGT:1 - chr3L 15393662 3' - pogo 37 1 55.86 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAA:1 - chr3R 19950467 3' - BS 5076 1 74.66 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCC:1 - chr3L 10740049 3' - P-element 75 1 33.79 CTTCCACTGCGAATCATTAAAGTGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCCTCCTTGGGAATACGCACAAAGATCGACAGCTTTCTCCTTGCTCGTGCAACAAGCTCCCG:1 - chr2R 6238055 3' - P-element 293 1 43.15 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTTTGC:1 - chr2L 6618873 3' - 17.6 6954 1 60.43 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCC:1 - chr3R 23902204 3' - I-element 58 1 69.75 GCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATTGTTGTATATTTATATTTAT:1 - chr3L 1072346 3' - Stalker 7020 6 71.43 GATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTCATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAACAAAGACAA:1 + chr2R 3146370 3' - rover 60 2 60.27 TGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCGACCAAATAATATAAAAATGTTGCCAAAAACAAGAACA:1 - chr3R 25860497 3' - hobo 76 1 71.43 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATATTGACCATTTGCTAAACGATAATTCAAAATGT:1 - chr3L 13285559 3' + roo 9033 1 58.90 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAAATGAGACG:1 + chr3R 30569117 3' + mdg3 5473 2 55.48 ATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTTAATGCACATTAAGCTAACTTACTGTATAACGATGCACAACAATCAAAGTAAAATTTGTTTGATTAAGTGAAATAAAACAACGAACTGTTTGTCTCTGAAAAGCGATAT:1 - chr2R 15199061 3' - Burdock 8 2 74.66 CTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAG:1 - chrX 13060165 3' + Tabor 452 2 56.94 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCCTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTT:1 - chr3L 22320141 3' - jockey 30 1 57.72 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACCCATAAAACCCAACCCAATTATTTGTAAAAGGTATCTTTAATTTACAGGCTGCG:1 - chr3L 7024394 3' - 412 10 2 77.40 GGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGT:1 - chrX 292017 3' - 412 89 2 78.08 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCTGAAATACCCAGTGATTATCTGATGGCTGGGCCCAAATCGTATTAAGC:1 - chr3L 6050153 3' + 412 7479 2 65.71 AATCTAAAACCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAAAACTTTGTAAGTAAGGGACATGATTCAATTTTTGGTACAGTGTCGAGGCAAATTCGGAATTTG:1 + chr3L 23024535 3' - Tc3 320 1 57.26 ATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAG:1 - chr3R 12948603 3' - Stalker 6897 4 53.44 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAGTACCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTGATTTTAATTATGAACGAGGACGGG:1 - chrX 15191353 3' - hobo 51 1 57.46 GCGTATGAATTTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAG:1 + chr2L 21683463 3' - pogo 87 1 80.82 TTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTCGTCTTTCGGACGCTCGACGGCGCAGCCAGGGTCTTTGCCTTCTTATGCACACGGAATTTTTATGAGTTAATTTAATTTATAGTTTTATTATTATGTTCGG:1 + chr3R 11089801 3' + I-element 5337 1 71.92 ATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTAGGATGCTAATATGCATTGTTTGAATATGCGCAAA:1 + chr2L 20628709 3' + Stalker2 388 2 73.57 GTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACGCTCCTGCAAAACATATAGCACACTTTGGGGCATTGAGACCTTGGTTCTGGCCAAATTGTCGCACGGCTGCCGCTAATGTGAT:1 - chr3R 25580736 3' - 1360 29 1 65.00 TAAATTTAAAAAATTAAAAAACGTTGAATTCATTTTTAAAACAAAAACAACCAGTTTGCATTGTCACGCCAAGTCACAAAATTACTTCTAGAACATAAATATTCTGTTGACAACTCGTCCGGAACTAGTTTTTCCATTTTCACT:1 - chr2L 21318006 3' + HB 319 1 65.97 AATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTA:1 - chr2R 23094870 3' + 412 7487 2 61.54 GAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTCTAGAT:1 + chr3L 2167680 3' - opus 7180 4 72.59 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACGCACTTGCAGTGGAATTTATTTGATTGAGCAAAAATAATATATGG:1 + chr3L 17012030 3' + 1360 3342 1 60.83 TCTCGGTCACCAGAGCCTCTGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAATTAC:1 - chr2L 7570112 3' - Rt1b 247 1 30.22 TGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGAC:1 + chr3L 2317203 3' - 412 90 2 79.45 ATTAATCCTGATCAAGAATATCTATGTATACTTTATTTGGTCGGAATCCCCTCCTTCTACCGTTTACATACTTTTCAACGATATAATATTCACAGAAATTATTATATGGGACCACAGTGAATATGTTGTTTTAGTATTACGC:1 - chrX 22633232 3' - INE-1 83 1 51.41 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATANTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATANTATCAAGTTGGCGAAAATAGGGAATATATGCCGACGAAAAATGT:1 + chr2L 5729003 3' - roo 15 2 73.29 CAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTGGCAGTTTGTTGGCATTTGTT:1 + chrX 21668405 3' + opus 498 1 54.29 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGA:1 + chr3R 12078735 3' - hopper 35 1 60.27 TTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTAGAGTAGAAGATG:1 - chr4 372933 3' + pogo 2060 1 57.53 GTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGA:1 - chr3R 13423294 3' + 297 313 2 80.82 AATAATATTCTAGTGTCTTTGGTCTAAAAAACAGTACACTTGTGTCATTAAAATAATGCATGGATCACTATGTGGTACGCGACTGTGACTGTTAACATATCTAGCTGTTAAGAATATAGCTTTTTGTGTTGATCGCTGAG:1 - chr3R 7541412 3' + Tc3 311 1 75.71 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACACCTGCAACGAATTTAGATAAT:1 - chrX 13091023 3' + P-element 2851 1 56.30 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCAT:1 + chr2R 19633291 3' - jockey 4826 1 66.18 AAAATCCTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGA:1 + chr3L 6015655 3' - roo 81 2 74.66 AGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATCTTTATTTATAGCACCATGTTCTGATTGTACGGCACCTGTGGCTCTCTTAATTTGTTGCAATAAAAGAGAATTTAGCTCTGCTCCTCTG:1 + chr3R 16475464 3' + mdg3 5468 2 65.75 GATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATNAACCTTCCACATAACTACTGCCCTATAGATACCTTCTGAAATCTCCATGTCTTCTTTGTGGTCCTGATTATNAGGAAATCCCCATCTTTTAGCTGCAC:1 - chr2R 2046449 3' + Transpac 274 2 58.27 AGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTACTTTTCCTGAGCGCTTTTCCTTTTTCGACTCTTTTTTTTTCGCCGCTCAGATGC:1 + chr2L 7921072 3' - F-element 362 1 73.97 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACATTTCACTGCTATCCTAAGTTTCCCATTTCTGGTCGTATTTATTATC:1 + chr2L 14056823 3' - pogo 11 1 68.49 TATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCT:1 - chrX 21087582 3' - mdg3 5295 2 54.48 ACGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACCCTTTAAATTTAGGATCGAGTTTAATTTGATGACGTTCTTCGTTTTTGAGCAAAACA:1 - chr2L 18297462 3' - copia 4935 2 62.07 CCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTCAATTTCCCAGTTGCCCAGCGAAGTGCTTTTCT:1 - chr2R 18931790 3' + blood 7355 2 60.27 GAATAGTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCGTTC:1 + chr2R 21713325 3' + P-element 2818 1 35.62 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAA:1 + chr3R 28749220 3' - mdg1 7078 2 58.90 CAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATG:1 + chrX 15286961 3' - X-element 4409 1 56.67 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTGTTTTTTTTTTATTAATCAAACAGCCTTATTATTTATTAGACATTTTTCATAGCTTTCTGTAGATAATTACTCTAAATAAAGAACAGGGATTTTTTAC:1 - chrX 16998258 3' - diver 5912 2 53.42 TTTTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACCACTTGGCAAATGCAAATAATTAAATATATGATGATTTCACCAAGAGAGCATTTGCCATTTA:1 - chrX 8314437 3' - roo 8682 2 60.95 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATAGTAAATTGGGAATTTGTGAATTCTTTGCTAACCGATTCTTGTCCTAATTGGCAGATATGGTAACCTAAACAGCGGAGTC:1 + chr3R 19506844 3' + mdg3 231 2 67.50 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAAATATCAAAGAACTCCTTGAAAAATTGAATAAAAAGAAAGATTATT:1 + chr3L 12227905 3' + opus 468 2 63.04 AGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTGGACCAGCAGCTGAGCGCCGGAGAAAGTGAAAGCCGTTCCCATCGGCACCGGCCACTGTGGAGATTGAG:1 - chr2R 23443941 3' - P-element 22 1 64.41 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCACCCTGTTTAAAGACTACGTGCGGTGCGCCAGACATTCAGACATTTCCCCGGTGAG:1 + chr2R 16372046 3' + 412 7486 2 62.24 GGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGA:1 + chr2R 5621041 3' - ZAM 27 2 57.72 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCGACCAAATAATATAAAAATGTTGCCAAAAAC:1 - 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chr3L 15148570 3' + roo 357 2 53.10 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGG:1 - chr2R 12492394 3' + hopper 1377 1 55.00 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTT:1 - chr3L 18183071 3' - Tirant 8144 2 57.89 CTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACT:1 + chr3L 25232865 3' - accord2 7465 2 52.99 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATA:1 + chr3L 13993634 3' - P-element 89 1 24.66 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGTTCCTCGGCCGAGCAACCG:1 + chr2L 20852585 3' - Tirant 13 2 76.98 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACACTAAAGCTAA:1 - 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Chimpo 68 1 66.67 TGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAG:1 + chr3R 31264504 3' - BS 77 1 73.29 GCGGCGTCTTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTT:1 + chr2L 23390133 3' + rooA 235 2 52.00 GTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGA:1 - chrX 17770437 3' - hobo 83 1 73.29 TAATAAAAATAATAATAATTATTATAATAAACATTTGGCTGGCCATATAAATTCAACCATCGGAATTTTTAGAGTGCAATTTTTGCTTTGTCTGATGTTAGCGACGGTTTGAAAATACATTTTTTTTATAGCCGTTACTCGTACAG:1 + chr2R 1439238 3' + mdg1 7068 4 76.03 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCAGAATGTATGAATAGCATGAAAGTACAAAAGGCAAGTTTAGTTATAGTCCTCGATTATGTAAGCATGGTTGGATTTCCTTTCCTCCCTTTTCTTATTAAA:1 + chr3R 20905101 3' - roo 8686 2 69.86 AACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTTGTTATCTCATTTTATTAAAGCATAGGTTGCGGACTGGTTGAAAACGGCCCTTT:1 - 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chrX 22679660 3' - Doc 105 1 67.12 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATTGTA:1 + chrX 18673738 3' + roo 337 2 65.71 AAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTATAAAAGGGGCCAGCGAAGAGACCGAGTTTCATAACCTCGCATTCCCGCAGATATCCAAATAATGGAGTCCCGCACTTTTGTCCACTCGCAATTTTCTAGCTGCGTCCTG:1 - chrX 19393134 3' - FB 15 1 75.34 CAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGGTTTTC:1 + chr2R 17493167 3' - BS 4867 1 64.14 CAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCATAACGGTGAAATGTTGAAATGCTAAAATACTGAAATTGGCGGAAGATATACTATGTAGGTAGATTTTCCGATAAATGCTCGGCACA:1 + chr2R 12134155 3' + jockey 89 1 56.16 TTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGGCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCAT:1 + chr2R 5621026 3' - ZAM 7983 2 56.86 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAACATACATA:1 - 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jockey 4817 1 56.25 GAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCAATCAATATACAGATGATGC:1 - chr2R 9007010 3' - jockey 4798 1 70.55 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGATGAAATATTAAAAATATTTAAGACTATAGAAATGCTTTTGTTCATATTACGAGGA:1 - chr3R 31266106 3' - jockey 59 1 58.78 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCATGCTCCGCTTTTAATAAATTGTGC:1 + chr3R 18294927 3' + copia 208 2 49.66 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTT:1 + chr3R 24084907 3' + roo 9032 1 57.53 CTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATGTAAATCTTTTTGGCAAATGTAATTGATTGTAATTTGTAATTGATTAATTAATTTTTTTTTTAAATGGTGTACCTT:1 - chr3R 10733685 3' + mdg1 7446 2 74.66 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTATTCCCAATA:1 - chr3R 5870776 3' + roo 9033 1 57.53 TCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGCTCTCTGCACACAATGCGGATTTGTGCGCCTTCCGTTAGCTATCGTTTATT:1 + chr3R 23964889 3' + hobo 2881 1 66.67 GGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTGTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTACTTTTCCTGCGCGCTT:1 + chr2L 7921033 3' - F-element 400 1 51.37 GGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCTGTTAGTTCCCGGAGTTCAG:1 - chr3R 28749120 3' + mdg1 338 2 71.23 GTTATTGATGCCAAAGGTGGTGTTACAAAATATTAGTATTGCCAAGTCAATATTTGCCGGCTGATTGCGTTTAATCCGCAATGCTACCGTTGCGAATAAGTGGGGCAGGAGAAACCAGAGCAAATTCAATTGGCCAACACAAACGC:1 - chr2L 8231771 3' + Bari1 1363 1 71.92 CTCTGGTCCTCATATACCAAGGAGCGCCTGTAATCTTCCTCAGAGTTTTGATCCGTGAAGCAGCTTTCACCCTTCTAGTGGGAATAACGAATAAGACTGCGGATGTTTATGTTAAATTGTTTACATCGGACGAATTTGTTATTGTC:1 + chrX 21999987 3' - jockey2 3000 1 69.86 GGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTA:1 + chr2R 4261969 3' + invader4 224 2 55.48 ACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCAATGATGTATTGCCGCCTGTGGTGGTTGATTCATGATTTCCTGGCATGATATACAATTCTTGTAGTTTACTCGAT:1 + chr3L 23182102 3' + 1360 3383 2 79.45 AAATAAACTTAAAAAAAAGAAAGAAGTGCCTCAGAAAATAAATAAAAATAAGAAAGCAAGGTATTTTGCACATGCAACTACTATATTCGCACTCACTGGCACACCGAAATCTTTATTTTCACCGTTTTCTTTTCTTTCAGTAGCTG:1 + chr2R 12588933 3' + gypsy2 425 1 58.90 TTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGCATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCGATGCCTATCAGTAAATAGTGCTGAGGTGAGTGNGCAGGATGACAC:1 + chr2L 16884930 3' + pogo 2066 1 56.25 GTTACTGGGCTGGCTCAGCGTCGCCGATGTTATTGTTGGTCCATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTGTACACACTAGGAAGTGATTAACTAAATGGATTTTT:1 - 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chrX 2300571 3' - P-element 58 1 41.43 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGCAATGGCTATTAGAAACATGATGCCGCCCAACTGTTCTCGC:1 + chr2R 8442753 3' - blood 41 2 57.53 CAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTT:1 + chr3L 14422849 3' + roo 9031 1 56.55 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTAATGTCTA:2 - chr3L 25206778 3' - HMS-Beagle 29 2 65.75 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACCTCGCAGCGAGCTGTGAGTTC:1 - chr2R 12462084 3' + roo 394 1 73.24 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAA:1 - chrX 609397 3' - 1360 70 1 78.23 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTAAATAGTATGTTTAGTAAT:1 + chrX 2300680 3' + P-element 2846 1 50.71 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATAAAAACCGAGGAG:1 + chr2R 14821260 3' + roo 400 1 66.90 TAGGTAGGACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTAAGTCCGCGATCGAGGGTGGAGGCTTTTGGCCACATCGATGATGATGATGAGTGGAGCAGGTCTAGGAGGGAATATCAGCCGCAGTGTGAGACGCTGGGCGAGGAGCG:1 - chr3R 11754635 3' - Tirant 425 1 62.59 ATATAAATCGTAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTACGGTTAATAAATTTACTGATCAATATTACTCGTAATTTGTATATATTGCAAACAGTGAT:1 - chr3L 11904769 3' + copia 196 2 56.94 GAGCGAAAAGAATGTGGCGTCAGCTTTTTGGGCGGATGTCGGCGGCTGACTCGTCGTTGATGTTTATGTTGCAACTTTGTTGTTGTCAATAATGTTGCTCATAATTATGTTGTTGTTGCCATTTTGCCGCTTTGGCCAAATCGAAA:1 - chrX 16634946 3' - ZAM 151 2 54.79 GTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTT:1 + chr3R 10737045 3' - F-element 80 1 71.01 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGC:1 + chr3L 22021731 3' + mdg1 7398 2 69.77 TCCAAAAAATATAATATTAATTGGTTGGTAACATTAAAAATTTGATAATTTAACAAATATAGCAATCGATATATAGTGTATCAAGCCAATTGAAGAGAATGTTTAAAAATCATTACATTTTAAAATTATATTACAAATTGATAGCT:1 - chr3L 10485259 3' + Burdock 405 1 80.82 CAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATACAATTTGCTACATTGAGCATTTAGAATCCATATTTTTAAGATTTAAGTAGGCAGTATACATAAAAAGCATTACTAGCTATAAAAGGAGTGCA:1 - chr2L 10536433 3' - flea 20 2 67.81 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATACATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCTGATCGAATCGCCC:1 - chrX 8038592 3' - 297 21 2 63.25 TAAAAAAAAAGAAAACAAAATATCATCAAGCTATTGAAGAGTCTTATGGTCGACCTAAAGTGTTAGTCAATTGTTACCCAATGGGAAAATCTTCTTGGTACTACAAGAAGGGTTTTTCAATGGATAGCA:1 + chr2L 16769025 3' + gypsy11 3932 1 61.24 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAAATTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTATGCAAATCGAAGGTGGAGAAGTACGCACGCTTTGTTAATTGAAATTCT:1 + chr3L 7319339 3' + 412 7486 2 59.42 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATTGTATCT:1 + chrX 18673741 3' + roo 8999 2 64.83 CTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGCCATATAAGTCACTTGCTTTAAGTCACATAAAAAGGATGTCTGTCAATAT:1 + chr3L 18549826 3' - X-element 42 1 46.58 TGTATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTT:1 + chr3L 9324544 3' + HMS-Beagle2 7125 2 67.12 GAATAACAATAATAATAATATTAAGTGATTTGTATCCATAACTGTTATCCTTAAGGATAATATCCATCACCTATATATATTTCTCAAACCCTTTCGGCTGCAAATCCCACAAGCTGCTGTTCACCAAGTGTATCGTTAAACAG:1 - chrX 4284375 3' + mdg1 7068 2 67.83 TTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCTAATAAAATATATTTTTACACATGCGCATGCATAAAATATTCTCTT:1 + chr3L 13779400 3' - I-element 76 1 73.29 AGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATACCTTTTTTTTTGAGCACTTAGCGCGCTGACAAGTTGAAGCTTTGCG:1 + chr2L 15420090 3' - Burdock 6176 2 56.30 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCTGGTTAAGAGCGATTTACATACAAATCGCTGCCTTTTGCTGGCTCTTTTTTGTCTGTCGACGTCGACACATACAA:1 - chr2R 12101905 3' - hopper 13 1 70.34 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTT:1 - chr2L 18525588 3' - pogo 39 1 56.83 ATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAA:1 + chr3L 9907339 3' - BS 5076 1 72.60 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTAAAAATACATTGCTTTCTATTATTTTACTTATATTTGCAATT:1 + chr2L 10074579 3' + pogo 2035 1 71.53 AGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTTGAAACATTCTAACGTGACTCTCCTAACAAAACATACTGTTGCAAAACCTGTTCTAAGCTAAACTACTT:1 + chr3R 25471764 3' + Bari1 1658 1 51.72 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGCCCGCTGGTTCTCTTTGTTAAATACTATAAAGTAAAGGAATAAAACAAATCCCTGTAAAGTGGCTGTCAGGCAGAACAAATAAGCGAAGATCCTTCCGAAATCGAAGGATGT:1 + chr3R 31128233 3' - flea 4803 2 75.34 TTAAAAAAACAAAAAACAAAAAGGACCTGGAATTGGTAGAATAAACATTGGAAAATATAACTTGTGTTATCCCGTCTATGGCTTTAGATAAAATAAATTATTCTTGTCCGAGGATCTTTAGTTTATTATATCAAAGACATCACAAT:1 - chr2L 21642866 3' + TART-C 11101 4 60.96 GATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGAAGAACTTCCGGCAGCTC:1 - chr3R 7049333 3' - Burdock 6175 2 58.90 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAACTTCAACTGCGAAGTATGCAATATATTTTTGGGTCCGACTAGAGACGGTTG:1 - chr2R 8315497 3' + hobo 2920 1 57.89 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATATTTGCAGCTGCAGCAGCTCAGAGGCGGTGGCATG:1 - chr3R 22320431 3' + roo 9042 1 63.70 ATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAAC:1 + chrX 20949667 3' - jockey 4631 1 79.10 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTCCAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAA:1 - chr2L 512441 3' + roo 340 2 70.37 TCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTG:1 + chr2R 4206656 3' - 1360 315 1 74.82 GACAACAGACAAGGATCAGTTCAATGCTTCTATTTTTAGCCAATAAACAGTTATTTTTTCACCTTGCTAACTTGCACCGTCACATATGGATCACTGGTACCGCTTTTATCCTTCGCTATCAGGCCTTGAGCACAAATCACTGCATC:1 + chr4 878978 3' + Bari2 989 2 63.70 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTCAATATTT:1 - chr3R 22320462 3' + roo 9016 2 58.87 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGATGTATATAAATATGTACACATATATAAACTATATTTAGTTGCAC:1 - chr3L 6131789 3' + roo 388 2 69.86 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACAAAACCGA:1 - chr2L 14056647 3' + pogo 2062 1 54.11 TTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCA:1 - chr3R 12948615 3' - Stalker 6924 4 66.44 GCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTAAGAGAAC:1 + chr2L 544957 3' - Doc 28 1 59.31 TCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAATTGCTTTCTTTGCAAATTTTCA:1 - chr3L 9317933 3' + P-element 2869 1 73.97 AGGTAGCGTTGAAAGAGGGCAGTCAAATCTGCTTAGGTCAGGCTTTAGGATGTTTACAAGAACGGCTGCGCTGCCAAAGATAAACGAATGCTGCGCAGCTGGGATATGGTATGTTAAAGCGTTGAAATTTGATTTAAATCTCATTT:1 - chrX 5461804 3' - 297 6749 2 72.60 ATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCC:1 + chrX 2300636 3' + P-element 2844 1 29.59 TATTACCAAAGACACTAGAATAATAGAATATAGTAATAGAAAATAGTAACAGCGTAATTAATAGGAGCTGGTCACACAACCTGCCTTGTTTGAACTGCACGTGTTTATCAATTCGTTTGGTGTATCAAACTAAGTTGAAAAATATA:1 + chr2R 10875809 3' - Tc3 316 2 69.18 GAATATAGCATTCTCTCTTGTTTTTAATATCGAATTGGGTCATAAAATTAGTCTGGACAATAGCACGTTTACATCTAAAAAGATTTTTAAACACACATTTACATACTGCGTTAAAATATTTCTTATCATTCAAACTAAATTATAAT:2 + chrX 21088583 3' + INE-1 580 1 37.67 GTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCG:1 + chr3L 10033658 3' - blood 7129 2 35.51 CGGCTATTGATCCTGATCAAGATATATATACTTTACATGGTCGAAGCGCTTTCTTCTTCCTTACAACGAATTTAGAATACCCATTTCCTATACGAGTAACGGGTATAAGCACTCCAACACTCTGATCATTAAGACCAAACAGGGGA:1 + chr4 1088458 3' - INE-1 88 1 43.84 TTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTGATAAATGAAGTGCTAAATCTTGATTAACAATGACCAAACCAGATCTTAAAAGGTGCTAACCGCTGAGCAAGCTAATAACCGAAANGAGTCAGTGCGTTG:1 - chr3R 13613042 3' - copia 19 2 77.40 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATACGTGTTCATGTGTGAACACACAGCATCTTCCCTTCGCGTTTCTTCCGCTTTATTTACAAGTCAAGTCACTTGTTTCCACACCGCGCACCTATC:1 + chrX 8346437 3' - roo 34 2 56.92 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTG:1 + chr3R 5870882 3' - roo 8739 2 73.43 CAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGG:1 + chr2R 5621011 3' - ZAM 8042 2 70.55 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTGCTG:1 - chrX 20361928 3' + hopper 1411 2 78.26 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTTAGTATATATATCTAC:1 + chr3R 5870920 3' - roo 27 2 63.91 CTAGCTTTTATAGTTCCTTAGATCTCAACGTTCATACATACGGAGAAACGGAGATGGCTAGATCGACTCGATCTATATGGTCGGAATGGATCCTCGACGATCATATGGACAGAGAACACAGTTGTGGTTTTTTATATAT:1 + chrX 22905676 3' - INE-1 152 1 50.36 TCTTTAATCGACAAAGAAGTCGATGGGTGCTTAACTGAGGAGTTCAACCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGACATTTTTCTTCTTATAGCCAATCAAACTTTTCACAATACTTTTTATAGGGTCCA:1 + chrX 23100428 3' + Transpac 5103 2 63.01 GAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACAGGG:1 + chr3R 10736178 3' - McClintock 10 2 76.55 ATATTTTAACAAAAAGTTTAAACATTCATACCTAATAGCACATAATGAAATGGTTAAAATATGTTGAATAATTTTCCACTCAACTCTTACAACAAAATTACATAGATTTTACAATAAATTTTCCCTTTTCTCGCAGATTTTGGGAA:1 + chr2L 10120708 3' - Penelope 336 1 38.36 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGAC:1 - chrX 20330551 3' + P-element 2799 1 23.57 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTCATTATCATAAAAAATTTATACAAAT:1 - chr3R 24480441 3' - blood 7055 2 55.17 TACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATAAACAACTTTCTTTGTTCGCTTTTATTGCAAACCAATTACAACGACTG:2 + chr3R 12948748 3' + Stalker4 395 1 78.08 CGTACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTATTTTTTCGAGCGCTATATAAAGAATT:1 - chr3R 5164916 3' + invader4 291 2 57.60 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAG:1 - chrX 20330533 3' + P-element 2817 1 36.43 CATACCAGGGACAGTTGGTTATTTGTCGTAGTGCGCGATTTTGCATCACTCGACAATGTCAACGTATGCTTGGGCCCAACTTTATGGGCATCATGGAGTGGATATTTTAAGGTCGTGAGTACAACAAAACAACAACAAAA:1 - chr3L 23797657 3' - Helena 1156 1 55.00 TCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGCCAGTACATGTAGCAAGTTTTCCTTATTTCT:1 - 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Max-element 8259 2 69.86 AGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAACTTTCGCGCCCAAATAAGCTTGCTTATCGGTATTATTGATAAGGCGACCATCGATAAGTTCTGCAATCGGTTGCGATTAGCTTTTAGTATTT:1 - chr2R 11844207 3' + I-element 5329 1 60.27 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACG:1 - chrX 20330543 3' + P-element 2801 1 28.08 CGTAGGAGAAGTACGCGTGGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGACGCTGGGCGCGAGTGTCATTCTGACTCATAGTTATATTATCATTTTTACAGTCGAACTTAGATCGACTGTAATTTTTC:1 + chr3L 25605480 3' - F-element 261 1 70.00 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCTCTCTTCCAGTGTCTAGTTATTTGTGCTATAAATTCGCGTCTATGAAGATAACGCTGAATACTTTATATAGTTGATATAGTGCCATTAAACACACGT:1 - chr3L 10897401 3' - roo 8687 2 68.49 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACACATTTACACTAGTTAGTTTGT:1 + chr3R 4962897 3' - jockey 71 1 58.62 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAATGAAGCGCCTAGAGAAGTGTAGATAAAAAATCGCTGGCAA:1 + chr2R 11153267 3' - roo 8676 2 67.14 TTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGTAAAAGACATTTCTCTATGGTG:1 - chr3R 27547602 3' - 17.6 6957 1 61.64 ACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCATGCTTTTGGGGG:1 - chr3R 14608682 3' - jockey 21 1 70.27 CGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTCGGCTATCCTCGCGTGTTGACACTGACTGCCTCGGG:1 + chr2L 21645311 3' + 1360 3384 2 62.33 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCT:1 - chr3R 17897121 3' - hopper 49 1 58.40 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTTTCCCACGCACGTTTG:1 - chr2R 6767972 3' - pogo 39 1 55.48 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATATTTGCTTCGACAGCGATCCCCG:1 - 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jockey 63 1 55.48 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCA:1 - chr3R 11516532 3' + roo 8984 2 77.40 ACATTTTTTATAAATTTGTCATTTAATATTTAGTTACACATTTTGTTTAATACTAAGAACAACTAACATGTATGTTATATAGCAGCTAGCATAACAGCATAAGATAACATTACAGTCACCATTAGGCATTTGAATTTCTTCACTT:1 + chr2L 9266840 3' + Tc1-2 1365 1 70.34 ACCTCCGCAAGACTCCCCGGAGGTAACTCGCGCATAGGTGTACCACTGTACCTGCAGCGCTCTTCGAGCTTCTCTTTTCTCCCTTTTT:1 - chr2R 5620932 3' + ZAM 8408 2 65.91 GGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTC:1 - chr3R 10148723 3' + 17.6 7361 2 58.74 TCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCT:1 + chrX 3811673 3' + P-element 2836 1 40.00 CCAAAGATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACG:1 - chr3L 25232773 3' + accord2 7551 2 68.75 TTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATATAAAAATTGATGCCCGTTGAATGAAGTATAATGCACTGGGGTTGCCATTTTGGTGTCTTACATGAATCCTAAGCTTGTCATTCCATTCACG:1 - chr2R 13090830 3' - I-element 28 1 65.07 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCTGGCG:1 + chrX 3811677 3' + P-element 2840 1 43.33 GGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATAGACTTAAATGTAATGTATTACATATATTTCAAACTTCTTGTTGATAATTTTTTTGCAGTGCATCCGCATTTATATATAAAGATATTTGCATAACAGACGTAGACCGGA:1 - chr2R 21958353 3' - 297 5 2 73.79 TTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTG:1 + chr3R 10737048 3' - F-element 78 1 69.06 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAA:1 - chr3L 7751047 3' - 412 83 2 73.97 TTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAG:1 - chr3R 19134411 3' + transib2 2739 1 73.29 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATCTAAAGCACTAAGTATC:1 - chr2L 4244861 3' - 412 43 2 52.74 AATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTGTCAGCGTCCGTGTCTTTGTGTTGCCGCTG:1 - chr2R 16355815 3' - hopper 89 1 76.03 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCGTGTACATACATACAAATATGTAT:1 + chr4 490361 3' + pogo 2073 1 66.21 ATAGTATACTATACTAAACATATACAGTGACTACTAAAATAATAACTAATAGATTTTTTGAATTAAATGTAGCCACTAGAAGTCTTTGGTAGAGCTAAACTTTGTCGGCCAAGCTGAAACTTCAACCACTTTGCGTAGATACTTTT:1 - chr3L 11442773 3' - Ivk 5352 1 47.26 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTAATGTCCTTGTTCG:1 + chr3L 20061454 3' - roo 8706 2 54.11 CTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTACCCAGACCCCAATAACAACA:1 + chr3R 11937892 3' + hopper 1385 1 63.31 TTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGG:1 + chr2R 6801699 3' - 297 37 2 66.06 CATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCTATTCCCTCGAAGCAGACCCCCCCCT:1 - chr3R 29288647 3' + BS 5071 1 64.38 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTC:1 - chr3L 19274813 3' - transib2 20 1 58.02 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTT:1 - chr2L 11475097 3' + jockey 4943 1 49.32 TTTTATATTTATTTATTTAGAAGCGATGAAACCGGGTTTTTAGTATTTTAAAGTTACAAATAGAAATTCACACTTTAATAGCTCAAAGTCTCATGAGGCCGGTTCCTAGAACTCACTCATAATATTTAATGGAATATCTTTTATA:1 + chr2R 12343562 3' - Tc1-2 476 1 77.24 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCATTCGTTTCTGTGCAAAACAGCACGCATTCTAAACTTTGGACTCTAAATTGCAGAGTCGGCAATTGGACAACAAC:1 + chr3L 27190425 3' + copia 245 1 54.79 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCT:1 - chr3R 18832352 3' + roo 9044 1 51.82 TAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGC:1 - chr2L 2057814 3' - 412 73 2 67.12 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGTACACATTGTGAATGCCCTTATCAGCGGAACTTATCAGTCAAATGTTTG:1 - chr3R 13259832 3' - hobo 62 1 66.42 TAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGATTGTGTTTTAAAACCCCCAGCTCCAAAGTGCG:1 + chr3R 7462966 3' - I-element 405 1 54.03 GTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCAAAGGGTAACTTTCATGTCGCGGACGATGAATGAACATCGATTAGAGCGCTACTAAAATGGT:1 - chr2L 17019039 3' + 412 487 2 76.19 GAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTGATCAGGCTCAATAGCCGATTCGATCTAGCCATATCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCGG:1 - chr3R 4487813 3' + HMS-Beagle 6994 2 52.74 ATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTATTCTCC:1 + chr2L 21645256 3' - 1360 34 1 55.07 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGG:1 - chr2L 14262964 3' + P-element 2846 1 43.12 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGGATATCATTTAACGCAAACATCTACACTT:1 - chr2L 512387 3' + roo 389 2 65.00 GAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAGGTGCGCCACTA:1 - chrX 15198023 3' - Max-element 50 2 53.42 ATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTAAAACCCTTCTAATTACATACATTAAAATAAATATAGTTATTTACATTTTTATTGCTTCGCCGCCGCCT:1 - chr3R 12376395 3' + HMS-Beagle 207 2 57.14 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAAGCAAACACGCATTCTTTGGCTTTTACATAGAA:1 - chr3L 1004825 3' - jockey 4736 1 55.48 TGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTNCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCAATATCGTAGGCAATATTTCGCTTTCTTGNAAAAATGCTGGGAAAACTTCCAACAAATGGCC:1 - chr2L 5207426 3' - opus 7056 4 54.48 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCAT:1 + chrX 13628836 3' + roo 360 2 52.17 TACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAACAACAACTTTGCATATTTAAGTCAAATATGTTAATGG:1 - chrX 8968629 3' + 1731 4541 1 74.66 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCACAATTAAATTAATATATCTGTTTTAACTTTTTTTATGGCTTAAACGATTATTTAAATAAACAACGCTCTTATAAATAGTAAT:1 - chr3R 12764682 3' + copia 5086 2 58.90 GTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTTTTATACTTTCAATATATATGTAGTTTCATATCAATATAAATATTTTTACAAAGGGCTTTAATTCGTAAAGCAAAACAGCTGGGCTTC:1 - chrX 14978521 3' + hobo 2933 1 70.09 TACGAGTAAAAAAAACACCCGGTGCCTGCTGCTCAATAACCATTTGTGTGAGTGGACGCACAGGCAACGATCGGCCGCAAGTAATTTTCTGTACGCCTACATTGTTTATTGAGCCTGATTGTATTGTCCGTTATGTTGGACCAAAG:1 - chr3L 25847462 3' - hobo 2802 1 67.81 CTCACCGCAGTGTGTCCTCCAACTCTTACACGACAATGAAAAGCTAAATTTTCCCGGCAACACAGTAGAGACAAAGAAAATCTTGGAAAAACTGCGACTATATCGCACGCGTTTGGGTAAAGCAAGACCAGCCAAAACTTGACAAA:1 + chr3R 24086072 3' - aurora-element 4201 1 61.64 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTTCTCGGCACCGTTCAAGCCCACAGCCAAGACATCGAAAGCACCACCACCG:1 + chr2R 14009125 3' - 412 21 2 63.49 CCACTTGCTGCACAAGTAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGATTTTTTTTAAATATTTATTATTTTATAATTGAAAGCATAAATAATGTAAAATTTGCGTTCATA:1 - chr3R 25471644 3' - Bari1 56 1 54.11 CGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATGGCAGTAGAGTAGAGTCTAAGTAGAGAAGCATGACAAAGGGCGCATG:1 + chrX 22862406 3' - jockey 33 1 64.44 TGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAAT:2 - chr3L 9324415 3' - HMS-Beagle2 6907 2 67.59 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGNGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAATGGGTATGCGGTAGCCCTTCACAGTCAGAGTCANTTATAATCGGCAGAGCTCATGGCCTGCCATGCCTACCTCAAACC:1 + chrX 14360898 3' - jockey 17 1 76.03 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCACCCTGTTTAAAGACTACGTGCGGTGCGCCAGACATTCAGACATTTCCCC:1 + chr2R 16372040 3' + 412 7498 2 61.60 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCT:1 - chr3R 7049360 3' - Burdock 6197 2 66.67 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGCATATGTCTGTGTAAAAATCTGATATATACCC:1 - chr3L 14422663 3' - roo 3 2 66.91 AGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTAAATAGTATGTTTAGTAATTGATTCGCCATCAGGGAAGTGGAAGCG:1 + chrX 2300707 3' + P-element 2867 1 67.12 TACAAGCAAAGACACTAGAATAATTATTCTAGTGTCTTTGATACAAGGTTGTGCTGGCGGAAGTTCTCACGACATTCTATGTAATCCTGCACACCTAATCCCATCAGAGGTGAGTAGAAAATGCAGTTATCGCCTCAGTCACGGCC:1 - chr2R 8638641 3' - Tc3 316 1 71.23 CAAAAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGTACGAGTATTTCTTATTTTATATTCCCTCATTATTATTTTTGTACATTGATAAATGCAGAACAAATAGGCATGCAAA:1 - chr3R 11756687 3' + Tirant 8494 2 74.48 CGTCTTTTGATCCTGATCAAGAATATATATACTTTATGTGGCCCCAGGGTTCCGTTTAATAACAAAAACTGCTGTGACGAGAAAAAGTGTGGTTCATGTGTTACATGGTCATGTTTTTCATCTCTATTCT:1 + chr3R 1443509 3' - INE-1 88 1 78.46 CGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCAT:1 - chr2L 20628526 3' - Stalker2 7279 2 36.99 TTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACGCACTTGCAGTGGAATTTATTTGATTGAGCAAAAATAATATATGGCTATTTTT:1 + chr3L 17012038 3' + 1360 3330 1 60.71 AAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTCTACAAAAAACCCTATTGTCCTGTAAGGAACAATACTAAATGCT:3 + chr3L 9280451 3' + copia 5083 2 69.18 TGAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCACTGCTGATATAGGCCCTAGTATCCCTTTCGCCCGCTAAGTACTCCTGTATGTCGGAAGCGGCGTAC:1 + chr3R 4205022 3' + HB 1401 1 70.21 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGC:1 + chr2L 15523105 3' - 412 7138 2 74.66 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTC:1 + chr2L 21645258 3' - 1360 31 1 61.31 GTGCGAGTGGCGGGCTGCTGTTCTCTGGTCCAAAAAAAGGCAGCTTTATATGACCGAAACCTCCTACTCGAGTG:1 + chrX 17770496 3' + hobo 2933 1 58.11 GCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTC:1 - chr3R 12613783 3' - HMS-Beagle 6877 2 76.03 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATC:1 - chr2L 2057832 3' - 412 7121 2 75.61 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAATTGCATCACATATTTGAGCTGAAATTTTGTAGCTGGTATTTT:1 - chrX 5841899 3' + roo 353 2 55.48 TCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTCATGTCAAAAGTATTAA:1 + chrX 22835294 3' + mdg3 5472 2 67.14 GGAAAACACGTGTTCTCAANTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAAAGTAAAACATTACTTTAAAATATAGACCTCA:1 + chr2R 4817004 3' + blood 354 2 66.44 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTA:2 - chr2L 10909501 3' - 412 71 2 64.38 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACCAAAAAACTAAGCTAATAGCATATC:1 - chr2L 388533 3' - roo 8739 2 69.86 AGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCAATCAAATTGTGCTGCCATACAAATTGTTTACTGCATTTTTG:1 - chr3R 21925047 3' - hobo 13 1 76.71 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCACGACAGTCATTGGTGATTTTGCCTGAGGCTGAATCTCTTT:1 - chr3R 31114214 3' - flea 11 2 74.66 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCTATTCCCTCGA:1 - chr3R 29288662 3' + BS 5056 1 54.79 TGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACCAATATCGCTCACTAGTCTTTGAACAAATCAGCTCCACCCCACACACTCTGTATATATATATTTATATATACAATATATATGTACATATATGCCTGAGATCGATGTGTTTGTCAC:1 - chr3R 18294760 3' - copia 5 2 78.08 GTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAATAAAAAATATTATCAAATAATGAATAATAACGAACGTAGATTGTTTAGGGGA:1 + chr2R 13090944 3' + I-element 5278 1 67.81 GTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGAC:1 + chr2R 10977201 3' + roo 9043 1 52.34 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATA:1 - chr3L 7848488 3' - jockey 74 1 66.92 AGGCGCCTGCATGGCGCGTGCCAAGCAGAAACGCGCAATTACTAGAAATGTCGTTACATTTAAATGATCTGCGACATATACAAGTTGTCCACGTACATGTTGATATACAAATTCAAAACTCCAATCTCAGCAGCAGATAAATAACC:1 + chr2L 21657079 3' - invader1 45 2 76.71 CTACTAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACAC:1 + chr3R 31198632 3' - Transpac 5001 2 73.97 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAAT:1 - chr4 868636 3' - roo 61 2 62.33 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATG:1 - chr3R 20904988 3' + roo 8995 2 79.26 TTTGGCGGCAGTTCCCCACACCTGGATGGCATAACTCCACGTTGGAGCAAGTATGGCTTTGATTTAAAGGGCATAAAGTTTTCTATCTCCATCTCCAATGAGATGGGAAATTAATTGAAATTATTATTGACATCCGAAAGGAAATG:1 + chr3R 896210 3' - G5 4401 1 51.37 TACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTGTGTATACGCAAAGTTAAGGTCGGCATAATGGCCCT:1 - chr3R 23964834 3' - hobo 70 1 74.24 AAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATAT:1 + chr4 490303 3' + pogo 2046 1 71.93 ATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTTTTATATGGGATTTTTTTATTCTTCGCTAATTGCAT:1 - chr3L 23496597 3' - blood 136 2 39.73 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCC:1 + chr2R 9871532 3' - roo 8697 2 42.47 TGTGTTTTATTTAAATAAGAGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGCTGTTGCATTCTGGCGACTTCGATGATGTAT:1 - chr3R 3758995 3' + invader2 227 2 63.70 TGTGGCTCAAGTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGATCGGCGTTA:1 - chr3L 27415186 3' + transib2 2791 1 63.01 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACC:1 + chr3R 29288825 3' - BS 5011 1 70.14 TTACTAAAATAATATTTTTAATGTTGTTTATAAGTAAAAA:1 + chrX 18920434 3' - blood 6914 1 87.50 GCTTTGGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAATACACACATATACACATACATATATAGAATATTCGCATTGCAACTGACAGGATGATGAGACCCGGAAAAAGGTAATGTGGGTTCTGGGCTGG:1 - chrX 18582136 3' - I-element 30 1 59.59 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGA:1 - chr3R 24072026 3' - jockey 70 1 52.74 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCACACCGACACGCATACACCCACACACATGCACAGGGACATATACACACAC:1 - chr3L 21764371 3' + hobo 2886 1 65.62 CATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAAT:1 + chr2L 21802945 3' - Quasimodo 75 2 77.04 TGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGGGAAGAGGTTAAATGGA:1 - chr3L 27415195 3' + transib2 2793 1 60.00 GCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTTTGGTATATGACTATTGGTTTCC:1 - chrX 23102365 3' + Transpac 269 2 53.03 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTACGCAACAATACGA:1 + chrX 10319740 3' + mdg1 393 2 65.75 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACA:1 + chr2R 558197 3' + copia 244 1 53.79 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGANATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTATATAGTCTGAATGCCTGTNACATACTTTTCATTGAATCTAGTATACCCTTTT:1 - chr2L 20491468 3' - 297 6642 2 65.75 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATATGGCC:1 + chr3R 22647921 3' + transib2 2759 1 62.33 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGAGGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCCGTACCACCGCC:1 - chr2R 5953758 3' - roo 17 2 72.03 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTG:1 + chr3L 7024526 3' + 412 412 2 71.23 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAGTATTCAACTAAAATTTTCTTATTAAAATGCTTCTCAAATAATTTCAAAACACTTAAAAAGCACGTTGTAAAAACTTC:1 + chr2R 22522002 3' + pogo 2067 1 60.71 ATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTATATACTGTATTTACTTACACTTGTATTGAATATCCCTGCAAATTCCTTTGTGAACTTACACAGCTTTTCTTTCTGTGCACATATTTATTAGCTTTTACTCCAGA:1 - chrX 15563076 3' + Quasimodo 7359 2 64.38 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAGGTG:1 + chr2R 16567373 3' + opus 7443 2 64.38 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTGGCAGTGAGGGCGTAACAAACGGCAC:1 - chr2L 2057787 3' - 412 45 2 53.10 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGA:1 + chrX 13628828 3' + roo 9009 2 60.00 TAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTCATGTCAAAAGTA:1 + chrX 22835290 3' + mdg3 212 2 62.50 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATACACATGTAGATGGCATATCAACGCTCTGCACGTGAAATGGCGCCGATATTAATGGATTTATTTTTATAAACCCCACGATTCTCATACGA:1 - chr2R 15474428 3' - Quasimodo 23 2 69.18 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGC:1 - chr3L 22021630 3' - mdg1 7073 2 59.12 TAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAAGAAGGATATCGCACTTATAATGTGGGTATAATGACATCGTTTGTAGTTCGCCAGTCTAATTTTAACATCATGAATATTATGAT:1 - chr3L 5027150 3' + roo 9035 1 58.90 CTAACTCAATGAGCAGTCTTGGATAGCTGCTCAACCCGTGGTACCGAAAAGAGGCTCGGTGGGCCTCCCCCTTTTGCTCCAGGACTGCGGTAGTATTCTCGCCC:1 - chr2R 9103948 3' - R1A1-element 4962 1 75.00 TAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGTTCATCACTCCAACTCGTT:1 - chrX 12979432 3' + transib2 2805 1 65.22 TATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCAATCCACACTGCACTTGTGCAATCCAACGTGCTGTTTCTCGATT:1 + chr3R 10148846 3' - 17.6 39 2 58.22 ATATCGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAG:1 + chr2R 5321230 3' + INE-1 502 1 63.19 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTA:1 - chr3L 18183062 3' - Tirant 35 2 60.71 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGG:1 + chr2L 13033443 3' + hobo 2916 1 63.50 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATCCATAAATGAAATAATGTTGACTTCATTTGT:1 - chr3L 7848450 3' - jockey 32 1 60.77 GCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTATAGTGTAGCATCCCTCCCACAATATAATATAATGAAAAATATAATACTCTATAATAAAAAGTAT:1 - chrX 4461006 3' - blood 110 2 43.84 AGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCATATCCATACA:1 + chr2L 18181224 3' + blood 7336 1 53.79 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAAATTAAACATCATAAATCCTTATAATGCTGTTATAGCTCGTTCTTTTGTTTGT:1 + chr3R 17673832 3' - FB 19 1 58.51 ATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCCTGTC:1 - chr3L 23773873 3' + Transib5 2861 1 76.22 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATATTTGCAGCTGCAGCAGCTCAGAGGCGTTGGCATGAAGGGGGTAGGAATA:1 - chr3R 22320416 3' + roo 394 1 75.34 AACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGG:1 - chr3R 11284922 3' + blood 7358 2 62.92 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAATGTTGATGTTTTTTTTTTGGAAATG:1 - chr2R 7250525 3' + roo 9046 1 68.49 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGG:1 + chr2R 5953936 3' + roo 400 1 76.92 ATTTATTGCAATTTTTATTAATATTTCTTCTAACACAAATTTTGTAACTTACTGGCTATAAAGTAAATATGTATTTTGAGTAGTTAACTATTTTAAATATTAACCAACAATTTTTTTGAACTCCAATCATTGATTTTATTACTGAC:1 + chr3L 12576619 3' - Transib5 2604 1 69.18 CTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTAT:1 + chr3R 30955433 3' - G-element 34 1 56.64 CATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGG:1 + chr2L 15085731 3' + opus 440 2 61.64 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATAGTTTAACAGCAGTGATATACCTTAAAGTTGAGGTACACATTTGTTAATACGCTTGGTATGTGACTGGCTAAATTTTCAA:1 - chrX 11232486 3' - roo 8704 2 54.79 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTTTGGCGAGCTTTGCAATCCA:1 + chr3L 14422868 3' + roo 9050 2 69.66 AATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGCGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGAGGAACATAATTA:1 + chr3R 27452055 3' + hopper 1375 1 60.19 GAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAA:1 - chr3R 20887376 3' - Doc 44 1 54.11 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACT:1 - chr2R 6700035 3' + roo 357 2 52.74 GGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCT:1 + chr3R 6419911 3' - Tabor 6924 2 77.54 AAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCAC:1 + chr2L 11867370 3' - BS 56 1 56.85 CAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAA:1 - chr2R 5179570 3' + 1360 3363 1 59.13 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGC:1 - chr3R 24072058 3' - jockey 75 1 68.91 TTTTATTTCTATGATCAATTTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATA:1 + chrX 12979518 3' - transib2 87 1 74.66 GAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGAACTCACACCCTTTTAACCATATTTGCAGCTGC:1 + chr2L 20228024 3' - 1360 71 1 77.52 ACGTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGGGAAAATATT:1 + chrY 2720367 3' - 297 6644 2 69.86 ATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCACAAGGTTTTTATTATTTTCTTA:1 - chr3R 23902179 3' - I-element 59 1 57.93 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACGAACAACAGCTGAACCCGATTACTGTAAATCGATGTTAATCGAAAGGGGCAACGCTGTCTACACGAGGTTCTTGTACTCGCTAAACTGTAAGGCTAGGCGTA:1 + chrX 16547609 3' + P-element 2884 2 79.10 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGGGGACGGATGGATAACCCCAGCCC:1 + chr3R 11285038 3' - blood 19 2 71.92 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAGGTGGGTCTTTAACGAGGCGT:1 + chr2R 16567390 3' + opus 458 2 57.93 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTT:1 - chr3L 414866 3' + 412 7467 2 73.57 TTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGGTTTTCATTTCATGATTTCAACATTTGT:1 + chr2R 17493189 3' - BS 4846 1 49.32 TTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCG:1 + chr2L 20852566 3' - Tirant 3 2 80.00 GTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTA:1 - chrX 20361934 3' + hopper 1388 1 63.64 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAATACCCTTGAAATT:1 + chr3L 6015708 3' - roo 8692 2 61.64 TTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCT:1 + chrX 16998378 3' + diver 6029 2 72.60 TTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATGCGGTATAACATGTATGTTTAATAAATAAATTCAAGGAGTTAT:2 + chrX 4789215 3' - 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pogo 30 1 55.48 TCTTTTTTTTTTTATAAATTTTCATAAAAACGAAACCGATTATGCGCTGAAGGCAGGCAGACAAAGGCG:1 - chr3R 27139906 3' - TART-C 11096 1 73.91 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCA:1 - chr3L 17181446 3' - jockey 78 1 63.70 TTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCGGTCGTAAATAAGGCCGGACTGTCATTAATGT:1 - chr3L 414801 3' + 412 474 2 72.41 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAGACCCACAATCGACGCCTCGGATTGCCAGCGCTCGGATTTACCGTTCGGTTCGG:1 + chr2R 23444045 3' + P-element 2883 2 67.86 GAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATAATTTTTGAAATTGTCATACCTATATTCGAAAAACAAAATTATAAAATTGCTA:1 - chrX 21668516 3' - I-element 33 1 65.07 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACCGTGTGAGTTAT:1 - chr3L 22021605 3' - mdg1 19 2 72.60 TTATACGGAGATCGATGAAAACACGTTCACAGTTCACTCTTAATGCACAGTTACCAGATTATTAAGCCAAATTGGATCATGTTCAAGCCACTACCGAACGTACAAGTTATTGCCCTACAGTTTGAGCAAAGACACTAGAATAACAA:1 + chrY 917822 3' - 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P-element 48 1 47.73 TCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGC:1 + chr3L 18183172 3' + Tirant 323 2 71.92 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAG:1 + chr3L 2966524 3' + roo 9022 2 66.07 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTG:2 - chrX 22679603 3' - Doc 48 1 56.16 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGGATGGTGG:1 + chr3R 19094264 3' - P-element 48 1 42.50 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAG:1 + chr2R 12102028 3' + hopper 1356 1 59.59 AGTGCATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCACAATCATGCACTTATTAGTAAATAAAAAATAATT:1 + chrX 23108305 3' - 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INE-1 150 1 48.06 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTGGAAATTTAATACCACTTTTATGT:2 + chrX 5751943 3' + roo 347 2 58.22 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTTTTTTTAC:1 + chr2R 9341683 3' + roo 9046 1 63.70 TGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCA:1 + chr3L 7751102 3' + 412 7462 2 74.48 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGAGG:1 - chr3R 24072041 3' - jockey 85 1 63.01 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGAC:1 - chr3L 20061319 3' + roo 9033 1 55.40 TAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTGTTAAGTTAAGCTGTTCAATTTTATGGAATCCGTTTGGATTTGTCATTTAGCTTCAAATTAGTGGGCTTGCAAACTTTGTGATAGTGATTAAAATTTAATTTATTTACATCAATCTTTC:1 + chrX 3330459 3' - X-element 4241 1 79.31 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGT:1 - chr2L 10909467 3' - 412 37 2 56.16 TATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTAT:1 - chr2L 6618878 3' - 17.6 39 2 54.11 GTGGACGTTAGAGTGGTCATGGCTACAATGTTCTTGCCATATCGATAGCAGTTGACAAGGCAACAGAAAAAATGAGAATAAGTTCAAAGATTTTTCAACAACTAATAACACATTGTGGCCGTGGGAGAGTAAACTGCAAAATGTTT:1 - chr2R 8548194 3' - INE-1 214 1 69.18 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGTTCTTTCTGATCGTACAATTCTGTAC:1 - chr3L 18216435 3' - 297 21 2 71.92 TTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTTTCGTTGTCTTTGTCTCCAGAATCTGTCAGCACAGTGGTACTTATAAAGAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCG:1 + chr3R 4562396 3' - mdg1 8 2 78.99 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACCAAAAAACTAAGCTAATAGCATATCCAACCTGGTAGTA:1 - chr2L 388520 3' - roo 62 2 60.96 AACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCTTCGTATCTCAAAGCTGCCCATATCCTGTCCAACGCATTCGG:1 - chr3R 13254846 3' + roo 9060 1 77.40 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAAT:1 + chr2R 9341631 3' + roo 8983 2 80.82 TACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCTCGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTT:1 + chr2L 2544821 3' + blood 298 2 71.92 TGCAAAAAATACTATCTTAATAAAGGTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTTACAACTTTTACCGATTGAAGAATGGATATTCCCACCATCACACCTCAGGACTTCGATTTAATAGCCGACGGGCAAATGAGCAATAAATTATGTACGC:1 - chr2L 14285723 3' - Transib-N1_DM 62 1 48.63 GTTATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGTTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCA:1 + chr3R 10148804 3' - 17.6 82 2 77.40 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAG:1 - chr3R 20983829 3' - hopper 36 1 60.96 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTT:2 - chr3R 25796019 3' - BS 5073 1 68.49 ACTTATTGCAAGCATACGTNAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCGTTCCGTTCTTCCGTACAGTTCATTT:1 + chr2R 21713347 3' + P-element 2840 1 50.68 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTGCATCCCAGCACCGCCCACTGGAAACCCATCCCAGATATATCCCAGATACACCCAGCTCCAACGCACACACCCACACATTCCGT:1 - chr3R 27451949 3' + hopper 1412 2 72.17 TGTCAGAAATGTTTTCTGCATCGCGGGGAACAATTTATAACGTAATTAATCGCACAAAAACGAGGGCAGATTGGGACTATGAAAATTATGTGGTTGATTGGGGCAATCAAGACGATTATCAGTTGGTCCGTAAATTAGGC:1 + chr3L 23102362 3' + S2 482 1 52.86 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCAT:1 + chrX 18673734 3' + roo 327 2 69.86 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATT:1 - chr2L 512428 3' + roo 342 2 65.07 TTAGGAGGCGGGGAACGATCTCAAGTGACTGACTCATGTAGTGTGCACTTAAATTACATGTTTTTGAGCAATGTAGTCTAGTCTTAGATAATATGCAAAGTCAGTTATCGGAACTTGAAGAAAACAATAAATTGTTTATGATAC:1 + chr3R 19448497 3' - roo 176 2 54.86 CGGAGCCCAAGATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTGTGGAAGGCCATCAAGATTAGTAGAACACCGGGCATAACGATTC:1 + chr3R 22709080 3' - roo 30 2 65.07 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGTTGCTCATCACTTATGGCCATTAT:1 - chr3R 24071995 3' - jockey 25 1 75.94 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTCTTCATTAAACCATTTGCGCAGCTGTGAAGTGTGTTTATGTACCGAATTCAAGAGCAAATAAATGCATATAAATCTCGACTGCCATCAGCG:1 - chr3R 26927346 3' + roo 9055 2 70.15 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTG:1 + chr2R 9607378 3' - P-element 43 1 46.15 ATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATATACTTCCTCCAGGAAAAGTAATTAAAACAATTTATGCAAAAGCTTCTAGCAAACGAATTAACAGTCTCAAACAGCTTTTAAATAACTTCTAATGTGGGTTACGTTATGCGTACT:1 + chr2R 8966288 3' + BS 5081 1 74.66 CTCCAGAACATCGCCCAAAAATATATGGAAAGGCTTAATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGCTGTGGTCAATGCTGACCCTCGTGGTTGCACCCCCCAGTTGATGAAATGATG:1 + chr2R 10858134 3' + jockey 4631 1 77.10 AATGCTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAGATACCCCTTACTCGGCTAGTGTGTGGGTATGTATGGTGTGCGGGTGTCTGTGAGTGGGCTTTGCATTAAAGTCATCACAAGGCAATCTAATTTGA:1 + chrX 21263848 3' - INE-1 570 1 61.60 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACATGTATGGGAAAACTACGCTAAATGAACTGCATTTTAAGATTTGAAAGCTGGCGAAATGCTCGAGGTTAATAA:1 - chr3R 5704093 3' + 412 7505 2 57.14 TGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATGTCTCAATTCAGTAAAAACGACACCATTT:1 + chr3R 19950557 3' + BS 5057 1 58.62 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTCAGTTCAATTGTTGTTTCTATTAAAACTTTGTTACA:1 - chr3L 15393638 3' - pogo 14 1 71.92 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATAC:1 - chr3R 19965207 3' - jockey 37 1 59.20 CTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTCCAGCAGCCAGTAGGTCTCCATGTCGCCCTTGCCTTTGACC:1 - chr3R 16475316 3' - mdg3 5296 2 55.48 TACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGCCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAATATGCAATTTCGCTTTTCACTGGCTG:1 + chr3R 23636445 3' - X-element 4289 1 53.42 CTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGTATGAATGACATCTTCTAGTCACTAAT:2 - chr2R 19574384 3' - I-element 5115 1 69.86 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAACATTCATCTTTATCCATTGTATTGTTGGATGCGTTGCAATTCTCAAAGTAAATCCG:1 - chrX 666277 3' - 412 65 2 64.14 AAAGCAAAACATACCTCTCGCGTGTAACTGTAATTGCACTCTTTGTTTTATCATCAATAGTTTACGGAAACGGACGGAAAGACAGACGGACTGACATGGCTATATCGACTCGGCTATTGATTCAGATCAAGAATATATACATACAT:1 + chr4 559332 3' - Tc1-2 124 1 52.74 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTC:1 - chr2R 12462122 3' + roo 9023 2 53.62 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTCACGTACGACAAC:1 - chrX 22679617 3' - Doc 62 1 45.21 CACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAAT:1 + chr2L 15019984 3' - BS 4837 1 56.85 TTCTAGTGTCTTTGTTTTTACTATTTAAAAAAACTTAAAATATTTATAAATTTGTAACCATTCGTGTGACATGAGAGAAATGGCATACCCTTAGTAATAATATAGAATTTTTAAAAATTAAGACCCAAATAAAAAGCACCAGCA:1 + chr3L 11314568 3' + Tc3 318 1 45.14 GGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATGGAGCCGTTGACTTTTCG:1 + chr2L 21802967 3' - Quasimodo 7 2 68.13 AATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTGTGTTTGGATAAACAGAAAATTCTTGTTTTGACTTAGCTGATGTCGTTGTTGTTGCTGGTTCTGCTGGTGG:1 + chr2L 18780075 3' - 297 18 2 93.97 TATTTCTTTATATTTATTTATTTTGGAAATTTTAAATCTACAACCAAAGAAAGAATCCATGTAATCGTCAAAAAGTAGCTTTCTACATTTTCTATAAACAAGACAATAAGATACGAGGTATTCTCGCAGTCGCAACGAGTTTGTG:1 + chr2L 12205173 3' - Tc1-2 481 1 62.07 AAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCG:1 + chr2L 11867386 3' - BS 39 1 46.90 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTAAATAAATAAACAGATTGGGAAAACATAATGCAAAAGTCTTTTGCAAACTGTTTTGAGTAACTGCATTTGCATTTAATAGGACACCACATTTTCCCACAAAGTTATAAACAATAT:1 - chrX 5751790 3' - roo 3 2 70.83 TGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTTTTTAGA:1 - chr3L 6557115 3' - Doc 55 1 54.11 ACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAGATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATACAGAAAAACACAAAAACAATTAAGAATATTAATAGACACAGGAGCCACATCTCGCTATATCAAAAAGGGGATCT:1 + chr2L 22780951 3' - HMS-Beagle2 6929 2 53.79 GGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGGCGAATATGTCCTGGTTGCCGGGACAGCGTG:1 - chr2L 15523018 3' + 412 7514 2 57.48 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCTGG:1 + chrX 3811675 3' + P-element 2813 1 34.48 ATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATTAGCTGGGCCGCAAATGCGAAGTACATACGGGGGCGAAAGCCAAATAT:1 + chr3R 12613854 3' + HMS-Beagle 174 2 67.12 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTTTAAAAATAATA:1 + chr4 880409 3' - pogo 49 1 54.79 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACT:1 - chr3R 20904956 3' + roo 9016 2 58.90 CCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCC:1 + chr3R 31112269 3' + mdg1 7390 2 65.07 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGTCGTAAACAAGTCGCCGCAAGTGTGCATAAATATGTAAAATTAAATAATGAGAAAACAGCCGCAAGCAGGCCGCTGCTATATAGAAAACT:1 + chr3R 11756867 3' - Tirant 10 2 76.42 GAGTCAACGAAATTTAATTTTTTTTTTAAATAAAAGTGAGCTCCAAGCCGTACTTCCTAATCAACTGGAA:1 - chr3R 6580710 3' - transib2 2654 1 58.57 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCG:1 + chrX 684879 3' - jockey 4748 1 72.79 CATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTATCTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATAACAATCGACCGGATCCCGAACATCCCCTGATGAGGCGTGCCATAGTATCAGATATCTCGTTGGGA:1 - chr2R 1921364 3' + mdg1 411 2 78.08 GTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCAATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTC:1 - chr3R 12613767 3' - HMS-Beagle 8 2 65.17 CCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTTTGTTGCCTTTGCATAAT:1 - chr3L 18183078 3' - Tirant 8137 2 57.14 AGTGATAGCAGACAACTGTATGTGTACACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGTATGTTGGTAAAAGGGACGGGGACGAGGAATAGGGAAAGAACAATACAAGAAAGAAATTGATTAACAGATTCCGTGTCTAA:1 - chr4 853343 3' + 1360 159 1 63.01 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTACACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATG:1 - chr2L 10461103 3' + roo 9051 2 68.57 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGC:1 - chr3R 11284891 3' + blood 342 2 54.84 CAAATTAAGTTGCCGCTTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACGCTGAAAAAAATATCTACTCGTATGTACAATGTACATTGTACAAATGTCCATACATATACATTGTCTGTTTCATTTATTTAC:1 - chr2R 22796752 3' + jockey 4953 1 50.34 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACGCTCCTGCAAAACATATAGCACACTTTGGGGCAT:1 - chr3R 25580785 3' - 1360 62 1 70.97 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTGTCTGCATTGCGCCCGCTCTCAA:1 - chr3L 13993473 3' + P-element 2795 1 20.55 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAG:1 + chrX 20330592 3' - P-element 39 1 40.00 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATGATGTCGATACATACCGACACAACT:1 + chr2R 9618220 3' + roo 353 2 54.79 TTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAAAGTGGCTGTAATAGTATAAGTGAAAAAGTCTCTCAGCGAATAGGGATA:1 + chr2R 5303200 3' + FB 243 1 76.71 CGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTT:1 + chr3R 10737088 3' - F-element 33 1 64.18 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACT:1 + chr3L 14422829 3' + roo 346 2 61.64 GAGGGGGATCTGGAGTGGTCAATCCGTTAAAAGATTGATAGCAAAGTGTCTCCTCAGAAAATATGATAGTCATATCATTAAATAAATAAATAAAAATAAATAGCCAAATGCCTCTTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGAT:1 + chr3L 23112566 3' + R2-element 3195 1 53.79 TGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAA:1 + chr2L 23390220 3' + rooA 7505 2 46.85 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCG:1 - chr3L 14422703 3' - roo 27 2 45.83 AAAACAAAAGGAAAACAAAAAAAACGGAAAAACAAAAAGAACAAACTTGGCGCTAGCTGAGTCAGTGGGCAATGAATACACAGGCGAGATCTTTGCAGCCACTTAGTGACCACTTAATTAGTCGTACACTGGCGGAAATAAATTGG:1 - chr3R 10689091 3' + Doc2-element 253 1 80.14 AGCGAGAGGTATGTTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTTATAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGGTGGCAAAAAACTTATGCAATCGAAATTGAAACATCTTAAGCCAATGAACATACATAAGCTGGTAT:1 + chr4 348940 3' + Tc1-2 124 1 60.27 TGTCTGAAATTAACCAATAAATCAAACTAAACAGTAACACTGGCGGGTTTATTTATGAACAGATACCAATAGGGGAATATTCGACAAATGTATTATTGGAATCATCAAACAAGAGCAAACTCAATGCAAATATATTAAAACACATA:1 - chr3R 10628522 3' + 3S18 6066 2 60.96 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAGTAG:1 - chr2R 7895487 3' + mdg1 394 2 63.45 ATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTATTCACTTTTTGGTCCCATAAGGTACATG:1 - chrX 22835193 3' - mdg3 90 2 77.40 ATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAA:1 + chr3L 20187437 3' + FB 491 1 57.24 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTAAAACGCAAGAGGCCTAGACAGACATAAGAGAACGGTTTATCAGGTACCCGTTACTCAGC:1 - chr3L 21770888 3' + hobo 2909 1 48.28 CGAAAATACTGGAAATTTGCATATTTTTTCGAGGCAAAGACAGCCAGCCATCGAGGGCGACAAGAAATTTAACAAAGTACAAATTGTTATTTGATTTGATTATATAATGACGCCACACATACCCCATCATCTGCCTTTTGCAATTT:1 + chr3R 6014079 3' + hopper2 1555 1 69.86 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCAC:1 - chrX 20330521 3' + P-element 2824 1 42.07 TGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACATATAACGACGCGAAATAGTTCATTGTGGAATAGGTCACTGAAGCTAGTCAAACTATGCGTTGACG:1 + chr2R 954598 3' - Quasimodo 8 2 80.82 AACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAATAGCAATTATATTACTAAAAGAAATTGACAGTTAAATTAAAAA:1 - chr3R 20200400 3' + Transpac 236 2 69.86 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCATATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCTTGT:1 - chr3L 8249334 3' - mdg1 20 2 71.72 TTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTTGTTGACACAATAGAAACCACC:1 - chr3R 16187736 3' + mdg1 7431 2 63.01 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCCATTAAAAGTCGCAAATTGATGTTTTT:1 - chr3R 17259499 3' + roo 9026 1 54.79 ACATAAACATCGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTC:1 + chr3L 1459879 3' - 412 64 2 60.96 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGCATTGTTGATTCAACTGCAGCACTCGTACATATGTATATATGTATGTGTATGGAAAGTCGAGGCGTGACAACAACAAAAGAAGCGGCTAACA:1 + chr3R 21735593 3' + hopper 1412 2 77.59 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAA:1 + chr2R 11153227 3' - roo 58 2 58.22 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAAT:1 - chr3L 7024459 3' - 412 75 2 66.44 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGC:1 - chr3L 22021640 3' - mdg1 54 2 53.42 GAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGCAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCT:1 + chr2L 12932186 3' - opus 7030 4 56.14 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAAGTTAGATAACCTTATAAACTAACTAGTTTTATTATTC:1 + chr3R 20841439 3' + Juan 4129 1 72.60 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGTACACATTGTGAATGCCCTTATCAGCGGAACTTATCAGTCAAATGTTTGGCCATTCCGTTTATGCCTTTTAGCG:1 - chr3R 13259807 3' - hobo 46 1 52.74 AATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACT:1 - chr2L 11475103 3' + jockey 4937 1 53.42 GGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAAATTCGTTACCTCATGAAACCGAAACTGACATGAATTCGAAAAGC:1 - chr3R 12341067 3' - Tirant 8115 2 73.64 TTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTTAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGC:1 + chr3R 10737055 3' - F-element 70 1 63.77 TTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTTATCTCACAAACAAAATCTATTTTTAGTCACTGCAATGGAACAGCTTTGTGCGTTCAGTT:1 + chrX 682381 3' + jockey 76 1 74.49 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAC:1 - chrX 22679643 3' - Doc 88 1 55.48 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTATATATGTATGTATATACTAGTAGCAAAAGTTGAAGCATCCCATGTTGTGTACTCATG:1 - chrX 17926589 3' - pogo 56 1 62.76 AATATTGACATCATTCAGCGAGCACAATCAAAGATTCTGAGAACCATCACTGGGGCACCGTGGTACGTTAAGCGACTATTTGTAGGGATGTCGGCTTTTTTAAAACTTGTATTTCATTTTCTGCCTTTCAACAATAGGTTTACTTA:1 + chr3R 4592059 3' + F-element 4307 1 47.26 ATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTAAAGCTGCTGTGGTTTCTTGTGGTGCATTTGATGGGTTGGTCTGGATTTTAGTGGGTGGATGGGTG:1 - chrX 10737498 3' - FB 57 1 55.48 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATTTAAATGTTTCTATA:1 - chrX 3533835 3' - 17.6 6944 1 74.48 CTATTACTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCAC:1 - chrX 20330521 3' + P-element 2823 1 41.78 TGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATATTCAACTACATAGACCACATGGCTGGCATCATGGAGATGATCCCAGGACCCACGCCATACCCCTTCGTGGGTAATCTGTT:1 - chr2R 8442610 3' + blood 7351 2 59.31 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAGGATTTCCATGAAAATTGCATCGCCTTTTATT:1 + chr3L 2966564 3' + roo 406 1 74.29 AATCTACATCAGAGAAAAAAGTTCCAGCGCCCTCGTAAACAAATAAGGAGGCTTTATTATTTGACCGTGTACGGTGTACCATTTGTCAGAATGGTATACCCACATATGCCTGAAAAATCGCATTCAGTAGTTGCTTTCAGTGTTAT:1 + chr3R 4502058 3' + Fw2 217 1 73.29 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATT:1 - chr2L 512428 3' + roo 9018 2 61.94 GAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGC:1 - chr3L 19274781 3' - transib2 45 1 52.17 GCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACCAGGTCATCATCTTAGTCCAGAAAGTGGGGTGCACGATATAGAAGGCCTTCAGGTTCTTCTTGTATCTAACCGAACATAAGCAGAATTTAGTAAAA:1 + chr2R 7719583 3' - HMS-Beagle 62 2 71.03 ATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGTGTCT:1 + chr2R 10977176 3' + roo 8979 2 76.71 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAATTATCCTCGATTTACAAGTAAATCCTCGAGTGA:1 - chr3R 18832304 3' + roo 9056 1 69.18 TGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCATGACTTTGGCAC:1 + chr2L 20852532 3' - Tirant 8168 2 65.67 TAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGCTTATTTTGTTAAGATTTTTATTTTCAATTCGCATCGCTGACTGCCGCAA:1 - chrX 22603155 3' - jockey 4715 1 58.82 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATG:1 - chr3L 2532444 3' - blood 66 2 65.97 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGG:1 + chr3R 28618443 3' - 412 58 2 63.43 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGC:1 + chr3R 31112309 3' + mdg1 7430 2 63.70 CCTTTCACTCGCAATTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGCGACAGGCAGAAAGAATAGAAAGAAATTTGGGACGCTT:1 + chr3R 27707139 3' + P-element 2828 1 43.84 ATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAACCAACCACAAAGTAAACCATATTTTATTTTAAGTAGTTTTTAAATTGTCAAGAAAACATTTTTTTCTGTTGTGTTGCGTCGT:1 + chr3R 25597959 3' + copia 218 2 58.22 TGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGCGAAACT:1 - 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chr2L 23286585 3' - Tirant 420 1 61.54 TGATATCTCAACGTTCATACGGACAGACGGACATCCTGATCAAGAATATATATAATTTCTATAGTCGGAAACGCTTCCTTATGCCTGTTACATACTTTTCAAGGAATCTTGTATACCCTTTTACTCTACGAGTA:1 + chr3L 25245596 3' - INE-1 135 1 72.39 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTG:1 + chrX 10725054 3' + pogo 2035 1 77.60 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTTTCGTTGTCTTTGTCTCCAGAATCTGTCAGCACAGTGGTACTTATAAAGAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATT:2 + chr3R 4562392 3' - mdg1 7058 2 71.92 TTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATAT:1 + chr2R 21795338 3' - transib2 67 1 65.07 TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACTTATAACGA:1 + chr2R 954541 3' - Quasimodo 62 2 67.83 CACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTATGTATATAGTAAATTGAAGTTCCCGAAATCCCATGATTGTCAATCTTGTGAAAGGTTCAGAGTCAATTTTAATTTTAAATACATCCCCCAGAGCGA:1 + chr2L 1045101 3' + mdg3 221 2 64.38 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTT:1 + chr3L 1459864 3' - 412 7121 2 70.37 CTATTTTTAAGTTAGTTTTAAAAAGTGTTTTAATCAATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGT:1 - chr2L 18525639 3' + pogo 1885 1 60.69 GCCATGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACAAAACTGACACGCCCACACATTTGGAAAATGTGTGGAAATTTTTTCTCATTTTTTTTTT:1 - chr3R 28630797 3' + INE-1 213 1 73.63 TACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTTTTTCTTTTT:1 + chr2R 6526617 3' + jockey2 3336 1 63.89 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATGGCGAATCAAATAATTCAAGAAAAAATAAATTTAGCTTTAACTAACAA:1 + chr2R 943892 3' - F-element 87 1 68.49 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATTTATGTGTTTATATTTAGTTAGGT:1 - chr3L 15148548 3' + roo 9042 1 64.38 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGG:1 - chr3R 12613751 3' - HMS-Beagle 6823 2 61.29 GATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTC:1 - chr3R 12613788 3' - HMS-Beagle 6866 2 76.92 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGGGGCTTCTCTATGGCATCGGCATCAACGGCAGCAAAACAGGTTCCGTATCCGCCAGCCGCCATTGTGCCAGGATGCCAA:1 - chr3L 17135351 3' - hopper 19 1 67.19 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGAC:1 - chr3R 21925094 3' - hobo 51 1 54.01 ATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTGCGCACAATTTAC:1 - chr3R 19950433 3' - BS 5036 1 51.43 CTTACAAACACACCGCATAAATCTGCAAATGCAGATCAATACGGTACTCTGCGTCTCGAGCGCCGATAACACTCGGCACTCAT:1 + chr3R 1465941 3' + hobo 92 1 56.63 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTTCTGAT:1 - chrX 291957 3' - 412 7082 2 65.75 GGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTCGTGGACTTCCGGCGCG:1 + chr2R 9750290 3' - opus 7023 2 68.97 TAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGT:1 - chrX 20361982 3' + hopper 1330 2 78.17 AAACATCATAAAAATAAATAAACAGAGAAACCACAAGCTCACAGACGGTCTCCTTGTGTACTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTTATTGCCACTCCCCTGCTTTCCTCGTCCCTTTTT:1 - chr3L 8458927 3' + jockey 4999 1 72.44 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTT:1 + chr2R 5193496 3' + roo 321 2 82.39 ATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGNTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGTTGGTTTGTCGGGGTTTCTAGGCGGCGNGGAGGGTGTTGTGTGCCTGG:1 - chr3L 18044581 3' - hopper 62 1 66.17 GCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTGATGTTCTACTAATGGTATCCTTCACCAGAGCCA:1 + chr3L 18074232 3' - 297 6589 2 79.45 GGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGAT:1 + chr2R 16567361 3' + opus 428 2 72.60 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCCTGCAAGATGTGCG:1 + chrX 20149250 3' + pogo 2057 1 53.47 CAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTACTTTAAGACACATTTTAAATTTTAATTGTAATA:1 + chr3R 20200498 3' - Transpac 4971 2 54.11 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAATCTAT:1 + chr2R 6768076 3' + pogo 2055 1 69.44 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGTGACATCCGTTTTGCTAGTTTTGATGCAGGTTGCCTGCTGCGATAA:1 - chrX 21233334 3' + roo 399 1 62.20 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAATAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTAATTTGACTTTGCATCAAAATGGAAATATT:1 + chr2L 12236873 3' - jockey 30 1 67.59 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATATTATAGCATTGTAAGATGGTCATGTTTCCAAATACTTTAGAGAACTCTTAAA:1 + chr3R 13254990 3' - roo 58 2 63.50 CATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTATACATTTTTCATTAGCTTTGTTTACAATCTTATCGT:1 + chr3L 27415347 3' - transib2 29 1 65.75 TTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGGAGGAACCGCCTTCGTGATCACGGTTAACCTCTACGCCAGGTAAGTATGCTTTGCTTAGCTCGGCATAGGAATTTCCATG:1 + chr3R 4948107 3' + P-element 2858 1 62.96 CTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATG:1 + chr2L 21802950 3' - Quasimodo 81 2 75.69 ATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCATTTTGCAAGATACGT:1 - chr2L 20628512 3' - Stalker2 7265 2 34.93 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCTGAAATACCCAGTGATTATCTGATGGCTGGGCCCAAATCGTATTAAGCATACGCAGCGGTGTGCCAAACTTGCCAACTCA:1 - chr3L 6050121 3' + 412 452 2 55.48 TAAGTAAAATAAATATTGTTTTATTATATTTTATAAAAAAAAATTGCGTATAATTAAGCAAAAAACTCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCAACAGTTTCTTAACAAACTGTATAGAGGTGTATGTATGT:1 + chr3R 20119941 3' + S-element 1602 2 84.25 CACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGATTCTAGATCAAGCAAGTCGATCT:1 + chr2R 11247065 3' - 1360 46 1 53.33 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCCGCATCTCTTATTCGCAAAGTTAAAGCCAGACTTCTTCGAGTAG:1 + chr3R 7074927 3' + P-element 2860 1 66.20 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAACGGAGCCC:1 + chr2L 14616264 3' + P-element 2860 1 56.36 ACAGATAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGCTCTAACACAGGGAAGTAAATTCCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTG:1 + chr3L 11535907 3' + roo 8884 2 60.31 AGCCACAAAGTATAAGTGCATTGCCCACTCGAAGGCAAAAAGTATAAGTGCATGTAGAAGAAAAGAAAATAAGAGCTATACCTAGAGCTAAACTTATCCAGCCATAGAATACGATTCTGTGCTTAGCCATTAAGATAATAAATA:1 + chr3L 6056811 3' + 412 142 2 65.97 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTT:2 + chr3L 2532518 3' + blood 297 2 73.97 TCATAGCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGACATTCATTAGTTTATCGCCCACTGGCAACTGTTGGGTCG:1 + chrX 14735803 3' + diver 6010 2 73.29 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATAAAATTTCTAATTAATATTATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCC:1 + chr3R 11516625 3' - roo 42 2 56.85 CCAATCCAGATAACATACAAAAACTCATACTTTTCCTCAAAAAAACTAAATTATACCACAAAAACAGTGTATTATAAGACAAGAAATCAACACAACACAAGAACAACAACAGCCACATCAAGCAACCGAAAATAAGAATTAAGAGC:1 - chr2R 19568383 3' + I-element 5128 1 61.64 CAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTGGTTAGTTTAAATAAA:1 + chr3L 2532567 3' + blood 7357 2 63.01 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTAAGAGAGTTCTCTCCCTCTCTCTGCGACGGGGAGCAAAACGGAATACGATAAATG:1 - chr2R 21713198 3' - P-element 24 1 66.44 GATAAAATGACCAACTGCGATTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAACTCAA:1 - chr2R 7895563 3' + mdg1 372 2 75.53 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATCTAAAGCACTAAGTATCCCTTAGT:1 - chr2L 4244854 3' - 412 7089 2 57.53 TGGGCTTACGGGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCTAATAAAATATATTTTTACACATGCGCATGCATAAAATATTCTCTTTGTAGTCGGTGTCGGCAATATTTCATG:1 + chr3L 13779427 3' - I-element 49 1 53.42 ATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGGGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGTTCATCACTCCAAC:1 - chrX 12979437 3' + transib2 2800 1 60.87 TATATTTATTTACAATTTAATTTTCAGTATTAACTTATATTTGGTAACATTGCAACCAACGACTGAATGTTTAGCTTATTCCAGCTTATATAGGAATCCATTTAAATTTTTTTGTTTGCACATAAATGTGCAGTATTACTTAAGAC:1 - chr2L 9554479 3' - I-element 5269 1 81.51 CACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATGTATAAACTTAGTTCTATAGTCGTACCCTAAATATAAC:1 + chr3L 3861501 3' - micropia 5031 2 73.79 GATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCAC:1 - chr2R 24215628 3' - I-element 5337 1 60.84 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGG:1 - chr3R 10030690 3' + BS 5042 1 51.37 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTTATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAANTTTATG:1 + chr2L 17019155 3' - 412 7134 2 72.60 ACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTG:1 + chr3R 15727976 3' + 1731 4619 2 72.66 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATCCTCCATCCTCGTTGTCCCTGTCTCGGCGATGGCCTTGAAGTATGCTACACAAAATGTTCGCACATAATTAAGTGCTTTCA:1 - chrX 14360736 3' + jockey 4954 1 56.85 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAGAAACTTAAAAATGCACAAACTTCTGAAAGATGCTGTGC:1 + chr2R 6493425 3' + copia 244 1 75.34 ATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGTGTAATTGTATTTCATTGCAGGATATTGGATTTTTGTGCCTGATTTGCCACATTGTGATGCGTGAGCCAACCCCCTGCCGCCATCCACCACC:1 - chr3L 8824403 3' - transib2 28 1 67.81 AAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCAATAACAACAACGA:1 + chrX 7702854 3' - P-element 23 1 67.16 GAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTA:1 + chr2R 12185452 3' - accord 20 2 67.63 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAATATTTATCGCCCGTGTTTT:1 + chr3L 6131954 3' - roo 37 2 60.96 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGCGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAA:1 + chr3L 7389787 3' + roo 8997 2 68.49 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTC:1 + chr3L 1463726 3' + P-element 2835 1 42.86 AAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGTCCTTTTTGATATTACTCTTGTGAACAATTTTCCCTGTTTCTGTGATAAT:1 - chr3R 433129 3' + 1731 4435 1 64.38 CCACACTTGGAGCACCATTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTT:1 + chr3R 15727975 3' + 1731 305 1 71.43 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCGTGAACGTGATTAAATTAATTTTCGGACCCTGAACACAACGAAAGTAAA:1 - chr2R 15392469 3' + mdg1 7449 2 77.40 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCC:1 - chr3R 12613744 3' - HMS-Beagle 6838 2 56.85 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCAC:1 - chr3R 12613765 3' - HMS-Beagle 7 2 68.89 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCATTTTCTTATCGGGCATTTTGGCGAAAGGACGATTTATAAATGTTTCATCAACTATATTCTATACTCGCATAGTCATTAT:1 - chrX 8590669 3' + pogo 2063 1 59.59 AAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAGTACCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTGATTTTAATTATGAACGAGGACGGGACCAGCAGCCCCGATTTGCCCGTTTGCGGTTAATCAACTGTCCATGGCATAAATAT:1 - chrX 15191297 3' - hobo 7 1 78.77 TTTTTGCATTCACACTAGCTGAGTAACGGCTATCTAATAGNCGGTTGTTAGTTGCATTAGAAAACATATTCGAGGTGAAGAATACAAGGAATTCAATCTTAAATATATTAAANTAACACCATGTCTTAAAAGCGGGCTCTACATAT:1 + chr2L 21614231 3' + INE-1 529 1 69.86 CTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACATCTTTTTTTTTTATAGCATTTCATTGGGATCAGGATTCTGGATTGTGGATTCTGGTTTCTGGTATTCCAAGTAGCCTGGCCGCGCAGAACTTGGCCCAATTTGAGATAT:1 - chr3L 1459729 3' + 412 484 2 75.17 TAATTGCGCTGTTATGCTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGAT:1 - chr2L 15019879 3' + BS 5043 1 56.15 AAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTGCCACCGCTGC:1 - chr2L 20360645 3' + R1A1-element 121 1 57.38 GTAACTCAAACGTCGAGCATGAAGGCTCTACCCGCGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACAATGCTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTAATCTATATTCTATATCTATATTCTATATTTAACTGATCTTTAC:1 + chr3L 22702750 3' - R1A1-element 5043 1 66.90 TGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGGGTGTGCGTGTGGGT:1 + chr3L 6895713 3' - hopper 77 1 74.07 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTTTCATATATACTTTTGGTCTTTGCACACATAAATATAAATTAATAA:1 + chr3R 18128561 3' - roo 8698 2 60.96 CAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAGTGTTTGAGGCAATGCAATCA:1 + chr2R 18931963 3' - blood 10 2 76.43 CAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTACTTTA:1 - chr2L 16884756 3' - pogo 15 1 67.81 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCTACCTGCC:1 - chr3R 21925089 3' - hobo 39 1 52.31 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATTGCAAGTTTAC:1 + chrX 10319728 3' + mdg1 381 2 57.53 ATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATGGCAGTAGAGTAGAG:1 + chrX 22862374 3' - jockey 61 1 60.77 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAA:1 - chr3R 28438334 3' + mdg1 343 2 69.66 GATTGAGGAGAAGCCTCAGTATTTGAACAATATTTGTATTTCGGGAGAGCAACTTCTTGATCTTCCCGCCATCGCTGAAATCGGACACGAAATCTGACATTTCCTTGAAGAACTT:1 - 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chr3L 17011918 3' - 1360 36 1 58.22 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGGAAATCGACTTGACATAGCATTGCCATGAATTAAGTGCTGCAAAATGGATATAATATTTTCTCAGG:1 - chrX 16547413 3' + P-element 2877 2 78.08 GCTCAATCGCGACCTAGCAATGGGTGCGATAAATTTGAGAAAATGAGGAAAGTAGCAGTTGGAAAAGTGCATAGCCTAATTGTACATTCTTTTAGAAGATCCCTTGGCCAAACAAATTCGTTTCAATAGCAAACTACGTTATAGC:1 + chrX 8681411 3' + jockey 360 1 62.76 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAGACCCACAATCGACGCCTCGGATTGCCAGCGCTCGGATTTACCGTTCGTTTCGGGGCGTGGTGAGTTCGCGAGCGAACGAAG:1 + chr2R 23444073 3' + P-element 2870 1 69.60 AACTCCCTAAAACCGCCCAAAACAGCCTAGCTGAGTAAGGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGTATTCTCTCTTGTTTATATTTAATATTTCCATGATATACATATAAACTTACGCCATCGCATAA:1 + chr2L 117007 3' + INE-1 344 1 78.36 GTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGA:1 - chr3L 15393697 3' - pogo 73 1 66.44 GCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAG:1 + chr3R 29283257 3' - hopper 76 1 74.07 CGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTGCCCAAACTACCACGAATCACCCACCAGCGAAACCAGCAACAACTACAACCCATCCGAAACTCAGTAAACTATGA:1 - chr2R 7722146 3' + HMS-Beagle 6635 1 64.75 ATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACATTTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGT:1 + chr3L 9696013 3' + 297 321 2 71.33 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAATACCCTACAGGGTACACAAAAAA:1 - chrX 3666507 3' + roo 9012 2 60.96 CCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTGTGGAACGGCAAAAGGAACTTG:1 + chr2L 11867413 3' - BS 2 1 65.93 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAA:1 - chrX 3666530 3' + roo 332 2 75.54 AGATCAATAGCTGAGTCGATCTAGCCATCTGATCCGCCTGTCCGTATAAACTTCGAGATCTCAGGATCTATACAAGTGAGACTCAGCATACAGATTCTAGCGCAAGTTTGTTATAACATATTGCCACGCCCATTCTAACGCCTACA:1 + chr2R 6172795 3' + INE-1 97 1 49.32 TTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTNAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAAACAACACTAAACGAACCGGAAACATTATTAAT:1 + chr3R 13339082 3' + BS 5054 1 65.00 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGAGGACGACCAGGATAACGCGCAA:1 - chr3R 28014090 3' - roo 8719 2 56.85 AAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAAT:1 + chr3R 30569101 3' + mdg3 214 2 47.45 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCCAA:1 + chr3R 6584882 3' - transib2 54 1 55.48 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAATATAAGAAATGGGTACAACATCAAAACATACC:1 + chr2R 5193536 3' + roo 9021 2 55.48 GGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGAC:1 - chr2R 7720047 3' - HMS-Beagle 6834 2 59.59 CACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTTGTGGCTCAAATTGTTGATTATGAAT:1 + chr3R 13869059 3' - HMS-Beagle 6812 2 72.73 CATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTG:1 + chr2R 20972716 3' + jockey 4924 1 66.44 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGCTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGT:1 + chr3R 9298604 3' + hopper 1393 1 67.81 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGC:1 + chr2L 15085725 3' + opus 7438 2 65.52 GTTGACAGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTC:1 - chr3L 9324480 3' - HMS-Beagle2 90 2 78.77 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACC:1 - chr3L 22021616 3' - mdg1 26 2 66.90 TGGTAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACCTAATATATTGGACAGCAGCGATTGGCAGGTCTCAGCCAATCCCTTGCAAATAAATACAGCACTACAACAGCTGTAAAAGCAATGACACAAAATTGCTCCATTGATAAGGTAAAA:1 + chr2R 3293744 3' + Gypsy6A_LTR 268 1 58.90 CACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAGCCAAGAAAAAAAATGGGTCGCCGCAAAGTATGCAACAAAGCTGGTTGGC:1 + chr3L 1004895 3' + jockey 4922 1 71.92 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATACGAAACGAATTTATTAAGGCAAACGCACACACCAAACACCAAAAACTCAAAAATAATAATGAAAAAAAAAAGAAATCCAAAAATGAAAA:1 - chr3R 18128403 3' + roo 9052 2 62.96 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCT:2 + chr2R 5953948 3' + roo 396 1 75.34 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACCCATAAAACCCAACCCAATTATTTGTAAAAGGTATCTTTAATTTA:1 - chr3L 7024403 3' - 412 14 2 73.76 ATTAATTTATTTATTAAGGCATACGGGGAAGTCTTGAATCCCCTTTGTGTCCTTCTTATCTATTAATTCCACACATTGGTGCTTCGTCTCTAGACTTCCCTTCAAATTTATTTACTGAAGTAAAAACGAATATTATTTCCATATTT:1 + chr2L 12854146 3' - X-element 4709 1 53.42 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACATTTATCATGCACTCTT:1 - chr3R 24084795 3' - roo 8734 2 67.81 TAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGTATATTGTTCTTGTAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTTGAGGAAG:1 + chr3R 25860569 3' + hobo 2874 1 60.69 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACA:1 + chrX 2300647 3' + P-element 2807 1 27.40 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGGTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATG:1 + chr2L 12932159 3' - opus 77 4 76.64 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTCTGATCTCTGCTGCCTTTTCGGTCCGGCCTATTTGTGTCAGCCAACG:1 - chr3R 27606560 3' - 412 7072 2 64.14 TACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAGGC:2 - chr2R 12492382 3' + hopper 1383 1 59.59 AATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCCAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATAAATGGGTGTACCGAAGAAGACATGTTCAATTAACCGAAATGTGAGCA:1 + chr2L 3241272 3' + I-element 5281 1 65.75 GGATCTTTAATAATTATGTTTAAAATATATGATAATTAAAGAAGAATATTAAAAACTACATAAAATAAAAAATTGTTGCTAGCCCACAACCTACCGACCTAAGCGAAGCCAGCTTGCTTTTCTGTGATGCTTGCCCAAGCTAAGAA:1 + chr2R 5580648 3' - Cr1a 107 1 52.05 TGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGT:1 + chr3R 29288766 3' - BS 5072 1 66.44 ACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGA:1 - chr3L 15718090 3' - 1360 83 1 76.03 TACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAAAGATGATTGACCGATA:1 - 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BS 19 1 66.44 AAATGTGTGGGCGTGACAGTTTTAAAAGGTTTGAGGGCATTAGAGTGGGAGAGGCATTCTTTTACAAGAAACTTGTACAAAATTTGTGTTGATTACATATTTTCTTGAAGTAACTAAAATTATAAACCATCATCCAGATGATCG:1 + chrX 22664002 3' - INE-1 246 1 54.86 AGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTA:1 - chr2L 18181153 3' - blood 161 2 47.95 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTTGTCTATAAATGTAATAGCCTGTAACCTCAAAAGAAACAGCTTTAATACCATATCCAAAATGGG:1 - chr3L 12227771 3' - opus 52 4 57.53 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGCTTCCGCATTTCGCTTTTTAGCATT:1 - chr3R 14608703 3' - jockey 26 1 50.53 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATAAAATTTCTAATTAATATTATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATANCTA:1 + chr3R 11516606 3' - roo 8710 2 58.02 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAGACCCACAATCGACGCCTCGGATTGCCAGCGC:1 + chr2R 23444023 3' + P-element 2824 1 30.58 TCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAGTCCACAAAATAAAC:1 + chrX 2214320 3' - jockey 4603 1 52.74 CATCGATTTCAATAAACAATTTCAATGGTCTGGGCGGAGAGACGCACAATACCTCGTCTATTGTGTGGGGTGTGGGGATTACTCGCACTCGCCTCGAACTCGAAAGAGCTTTCA:1 - chr3R 21678298 3' + Idefix 292 2 80.70 CGAAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAACTCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGCAAACGAAGCCCGTAACCT:1 + chr3R 1844839 3' - Cr1a 181 1 65.07 AATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGCAAATGGTTTCTGTGACCCCATTGTGACCAATCTCTTGCAGGGCATATCCAATTCGAATACT:1 - chrX 18745331 3' + Juan 4163 1 54.11 TAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCCATTTTT:1 + chr3R 10737101 3' - F-element 23 1 70.80 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATTGTATCTTTGTATATTGATATCATAATATCT:1 + chrX 18673765 3' + roo 9022 2 52.74 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATCCTCCATCCTCGTTGTCCCTGTCTCGGCGATGGCC:1 - chrX 14360782 3' + jockey 4908 1 74.66 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCACTCAAGGGATTGGCTTTACTTTTTTGCAGTTTATAATTTTTGATAC:1 + chr3L 414994 3' - 412 10 2 79.45 CAAACTATTTGTGGCTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATT:1 - chr2R 21795260 3' + transib2 2746 1 71.92 TGTTTGCCCACGTCCAGTTTTCGAGATCTGAATTTTCAAAAAGTTCGAAAATTGAAAATGAAAATTTTTTTAAGTCGCAATTAGAAGCTCAAAGAAGCTGGGGTCGGAAAAATCGAATTTTTGAAATTTGAAAGCTGGAATCGTTT:1 - chr2R 1522955 3' + FB 99 1 56.85 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTCGCTTGTGTGTGTGTGTTTGTATCTGTTGGCAGCGCCTAGATTTATGCAGCATTTTATTTAAATTTCTGTGGTCTCG:1 + chr2R 19108580 3' - jockey 93 1 50.00 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTGGCTCTCTTATACTGCACCGCACAGCGAGC:1 + chr3L 1463761 3' + P-element 2854 1 62.68 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATNATAAAGAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTNATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTA:1 + chr3L 5051145 3' + flea 4966 2 56.92 TTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGATCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAA:1 + chr2R 17350599 3' - F-element 75 1 56.55 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATAAAATTTCTAATTAATATTATCAAGCTTCTTTG:1 + chr3R 11516580 3' - roo 87 2 80.14 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTACCCAGACCCCAATAACAACAGCAACAAAAGCAGTAGGTAACTGCCACAGC:1 + chr3R 11937922 3' + hopper 1408 2 80.82 GACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGATTGCCGGGCGAGAGCTGTAACTAGTTTGACATTAATTGACTGCCAAATATGCACAAGCGCATGAAATAATGGAAAACCCTATTA:1 - chr3L 13057324 3' + 412 7511 2 60.96 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCAATAACAACAACGACGCCAAAATAAAACCAGCAACG:1 + chrX 7702876 3' + P-element 2874 1 75.34 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATTTCTAATGCACATAAACGTTGGTGCCAGTACATAGTGCAATATGAATGGCAAATGGCATCCCCATCCTCTGT:1 + chr3R 20984010 3' + hopper 1411 2 78.47 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCACACTTCTTTGC:1 + chr2L 11617839 3' - 412 7070 2 73.29 AAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAGATACTCAAAG:1 - chrX 13060155 3' + Tabor 466 2 65.71 GCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACGGCAAGTGAAAAAGGCATGCAGGTCATTAAATTGTTGTTGTAAATTGATGAGCTGT:1 - chr3R 20841317 3' - Juan 8 1 77.40 CATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGCTCGGGAATG:1 + chr2L 6149173 3' - hopper 75 1 73.33 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAGTCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTAGGATACCACAATTTTTTACTGTTTTTTTTTTGCTCTATTTATTTTTACAGA:1 - chr2L 7929519 3' + roo 9001 2 67.81 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGGAAATCGACTTGACATAGCATTGCCAT:1 - chrX 16547452 3' + P-element 2838 1 51.37 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATA:1 + chr2L 8120212 3' + roo 321 2 84.25 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTAACCATAGAAGCATACATAATTGTTTTTTGTACCATTTACTTGAACAGTCGATCGTTTAAATTATCCGCGTAAATAAATCATCTATACAATTAAA:1 + chr3L 23456275 3' + 1360 3366 1 50.35 TAAGCAGATCNAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATCAGTTACGATTTGCCCGCGAAAG:1 + chr2R 17394597 3' + jockey 4944 1 52.00 CTCTGTGGTGACCAACACCACAGAACTGTTCGGGCCCAGTTAGAGGGTTCTCTGCCCCTTTCTTGGCTCGGTATGGCTTGTCCTCCTTTA:1 - chr2R 5114497 3' - baggins 4954 1 74.44 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCTTTAAAGC:1 + chr2R 6768088 3' + pogo 2065 1 59.09 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTCTTTGTGAATTTGCATTGAAG:1 + chr3R 10737062 3' - F-element 71 1 60.96 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTTTAT:1 + chr3R 17897196 3' + hopper 1351 1 64.39 TAATTAAATAACAAAATTTAATAGGTAAGCTGTGTTAGAAGACCAGTTTCGGGTTACCAAAGCCAATTTGTCAGTCGAAGACCATCTTTAACATATCATAACTCGGTCAAAAAATGTCGTATCCTGGAATGTTATACCTTTCG:1 - chrX 7572501 3' + HeT-A 35 1 58.74 AAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCGTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTAT:1 + chrY 311343 3' - 1360 40 1 53.49 TGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAACAAAGACA:1 + chr2R 3146369 3' - rover 61 2 60.27 CTATTTAAACCGAAGATATTCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAG:1 - chr2L 5728858 3' + roo 9009 2 60.96 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGG:1 - chr2R 18886926 3' + roo 9050 2 69.93 TAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCC:1 + chr2L 22224604 3' + Rt1c 5398 1 52.74 GGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAGACATAAATGACAGCAACATATCTTTAGCTCCATTCCAG:1 - chr3R 19094137 3' + P-element 2882 2 75.76 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGAAGGCTGGCGGTCAATTTATCAACCCCAACCTTAGTGGGTAGTGACCGAGAGATGGTCACGTGTCTCAAGTCGGCCCCAAAATAGCCGCAA:1 + chrX 23155294 3' - blood 15 2 71.88 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGA:1 + chr3R 11284991 3' - blood 26 2 55.66 AGCTTAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAA:1 + chr2R 12827049 3' - Burdock 83 2 76.71 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTGTGGAAGGCCATC:1 + chr3R 22709049 3' - roo 40 2 54.40 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGATTCTAGATCAAGCAAGTCGATCTTGACATTCAT:1 + chr2R 11247075 3' - 1360 31 1 60.77 GGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGGTTGCTGCTTTATAGAAACAATTGCAAA:1 - chr2R 12185269 3' + accord 7370 2 71.92 GAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAACCTTACATACCCATTTACTTTACGAGTAACGAGTAGCAAGAGGAATGCTTGGTCAATTAAATTTATCACAAATAAATAATGCATTTCTGCTCTCCCTCTTGACAGTA:1 - chrX 21125438 3' - INE-1 34 1 90.41 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCT:1 - chr3R 19950464 3' - BS 5073 1 72.60 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTTTTTTTACGTTCAAATTAATTTGAGCTGC:1 + chr2R 9341704 3' + roo 393 1 73.29 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTG:1 + chr2R 21795340 3' - transib2 48 1 58.91 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATCATAAAACTTCCCAGCGATAACATATCGATTTTTAATATCAATGCTTCTTCGATTACTAATGTTTTCAGGGCCCTCGTACAGCAGACGAGTGG:1 + chrX 17884642 3' + pogo 2076 1 65.07 TGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAACCAACCACAAAGTAATCCATATTTTATTTTAAGTAGTTTTTAAATT:1 + chr3R 25597921 3' + copia 5051 2 65.75 TAATATCTTTATTTTACATTATTGTAAGGTAGACAATATAGACACACAACAATTTGAAAAGTATTAAGATAATGTAGAATATTAGAAAATCAAATCAAATAGAATTAGCTATTACCAAATCAAATATCTGGCGTTTTCGTTGTTTC:1 + chr3L 18092229 3' + Cr1a 4315 1 50.00 ATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTCATGTCAAAAGTAT:1 + chrX 22835291 3' + mdg3 5463 2 62.33 CTGACGCTTATCTTAAATCCTATTTGTTATATGTGATTGTTATGTAATTGTAGTCAAAACGTAAATCTACCTGCATGTTTTACTAAGTACACGTATTTTATTGATTACGAAATTATGAGTATGATGAGTATTTTGGAATGGCAAAG:1 + chr3L 11820379 3' + X-element 4550 1 60.96 CGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTAGCTGCACGTGTTCAACGTCATCAGCATTAGCGGGTCTGTTGTATTAGGCGAGAACAGAAAAGCCAAGGAAAAAGATCAGACTTCTCTGCTGGTTG:1 + chr3L 18267474 3' - F-element 282 1 73.91 TATTAATCCTGATCAAAAATATATATTTATATATTTGATTATATGGTCGGAAACGCTTCCGTCTGCCTGTTGCATACTTTTCAACGACTTCACCTCTCTTTTTCCTATCAACGTTTGGTATGCGATCCTATTGGATTTTGGATTAC:1 - chr2R 5705565 3' - INE-1 84 1 63.01 TTTAAGCACCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTA:1 + chrX 20999581 3' - BS 67 1 67.81 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTT:1 - chr3L 22320128 3' - jockey 9 1 74.78 TGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTGATGATGTAAAAG:1 + chr3R 15727988 3' + 1731 312 1 77.40 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACAC:1 + chr2L 15523111 3' - 412 7120 2 67.91 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAA:1 + chr2R 12102048 3' + hopper 1376 1 54.79 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTATTTTATGTGTTTATATTT:1 - chr3L 15148556 3' + roo 393 1 67.74 AATAATATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAA:1 - chr2L 11475108 3' + jockey 4932 1 52.74 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTC:1 + chr3L 2317221 3' - 412 72 2 67.12 ATTATTAATAAGATTATTATTAAGTTGTCAAAGGGTATCGTACAGTCGAGCAATTTATATAAGTTTCTACTTCACACATTTTTCACAGTTGCAACCCAAAGTGGCTTTTAGTTTTCCCGTATGCTTAAGTATAATTTACTGTTGA:1 + chr2L 9660773 3' - mdg1 39 4 60.00 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTTT:1 - chr2R 6700031 3' + roo 9025 2 52.74 CGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGCAAAATGGGGGGCAAGGACTCGTGTCACGTAGAC:1 - chr3R 11284858 3' + blood 362 2 73.72 TTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACC:1 + chr3R 10737083 3' - F-element 39 1 60.00 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCAC:1 - chr2L 10461136 3' + roo 9012 2 58.22 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCC:1 + chr3L 20680365 3' + 412 424 2 63.01 ACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTATCAAATTGGATTTCAAATTGCCGAAGTATATTCCGAATCTCGACAATATAATATCCCTAATATATTCCCAATATTTTCTTATAATGTGCTTCATAATCCAGTGCACATATGTA:1 + chr2L 12158923 3' + 1360 3383 2 69.86 AACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACTTATGTACATGTATTCATTTATATATGTACGCACATGCCGGAGGCTGTGACAAATCATCAAAT:1 + chr3L 27350114 3' + 297 6948 2 59.83 CAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCC:1 + chr2R 5620997 3' - ZAM 67 2 75.63 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTGGTTAAACCGTTTCCTATTCAAAAGGCCCTCTTGTGCTACCAATTTATGTGCAATGTCCTTGA:1 + chrX 2956291 3' - copia 31 2 56.67 GTTCTAGTGTTCTGTGGAATATTACTTTTGTATGGCACAACGAATCACCAAAGTTAAAGTTGTATGTTTTTAACAAATATATGTGGGCGTTAGAGTGGGCGTGGTAACATTCAGAAAAAAACTCTGAAATCTTTATGTCTAATCTC:1 + chrX 22511254 3' + transib4 395 1 58.90 ATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACACTATTACCTTATTCTTTCACAATTT:1 - chr2L 12158800 3' - 1360 77 1 61.87 GTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACAAATT:1 - chr2L 2241228 3' + roo 407 1 70.13 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTC:1 - chr3L 22320131 3' - jockey 31 1 61.94 ATATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATATTAAATATACAAGAAAATAAACAACAAATTCCTAGTTTACACACTTAGGAAGAAGTAAATCAATAGAAGTTAGTCACAAGAATGAGAGCAACTGAAAAGGAAATGGAGC:1 - chr3L 16973356 3' + S-element 124 2 55.48 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACCTGCTTCTTAGGAAAGGATGATCTTCGGGCATCTTCATATTGCCGTCATTTAATAGCTCAT:1 - chr2R 13847787 3' + 412 7495 2 54.81 ATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGATATATAACTCTTTAAATATTTTAAGGGCGTGTTTTACTACCTAAACTAATAAATGAGGCATATATTTAATTCACCTCTCAAGACTTCCATGAATGCAATTCCTTCTCCGTAAACT:1 + chr2L 13229289 3' - roo 8664 1 71.83 ATTAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGG:1 + chr2L 20628672 3' + Stalker2 345 2 53.42 TGGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAACGTCAT:1 - chr3R 20887370 3' - Doc 33 1 58.87 TGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTC:1 + chr3R 6419923 3' - Tabor 6919 2 70.34 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTT:1 - chr2R 6700032 3' + roo 360 2 52.05 AGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACAATAGCCATTCGGTTATCCAGTCGG:1 + chr2L 12932230 3' - opus 3 2 82.09 TTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCCCTTTTCACGCGATCTTAAACGACCATTAACCGCAATCTGCCGATTTTATGTGTTGTTTTGTCCCCCTCAAAAATTGATTATT:1 + chr3R 8050669 3' - jockey 4793 1 60.00 GAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTAATG:1 - chr3L 25206782 3' - HMS-Beagle 6827 2 63.89 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTATTCACTTTTTGGTCCCATAAGGTACATGGGTGTAT:1 - chrX 22835186 3' - mdg3 5335 2 72.60 ATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTAGG:1 + chr2L 20628677 3' + Stalker2 381 2 61.74 TTATGTATCTATTTAATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAG:1 + chr2L 22684601 3' - transib3 2632 1 45.89 GGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGATAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTT:1 - 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chrX 22679591 3' - Doc 36 1 64.38 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGGTGTATCTTATTAGCAAGTAGGGCAAAATGTGGTTCTAAAAAATTTATAAAACTTAGCTACTGAAAACTTGTT:1 - chr3L 18216459 3' - 297 6600 2 57.50 CGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTT:1 - chr2L 20761909 3' - Doc 456 1 80.70 CTAACAAAAACCAAAAATGAAACTGTTTTCATTTGTGGACGGAAATGTCTTATTTTCATTGTTAGTAGACATAACAGAGCCATGTGCTAAAGCCAAGAAATATGTAAAATGAAAATAAAGTGCTGCGTGTACATTTGAACTAAG:1 + chr3L 5799807 3' + I-element 385 1 75.69 ATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCGTTAATGAAGTCAAAGGGAA:1 - chr2R 10582338 3' + Juan 4197 1 72.60 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGTCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTT:1 + chr3L 17268312 3' - hobo 43 1 67.33 TATGTGGAACCACAAGATGNTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGT:1 + chr3R 13869033 3' - HMS-Beagle 6822 2 62.99 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCG:1 - chr2R 19805432 3' - F-element 90 1 70.83 ATTGCAAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCCAACA:1 + chr3R 6584884 3' - transib2 52 1 51.37 AACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTTGCCGATGCCAGGCTTACCCATTAATTGGTGCTATTTATGGCTTGATTTGTTTTAAACATATTTAAGTTTGCATTTAAATGTACCCTGCATGGCAATATTTGCCATTT:1 + chr3L 17135529 3' + hopper 1413 2 63.57 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAACCGAAGGTTGAAAAACTTTTCATCTTCTTCATTTTCTTGATTT:1 - chr2R 10977126 3' - roo 8712 2 64.35 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGATAATAATAATACCCTTTGCACGGGTAGGAGTAAAAGGTTGTGC:1 + chr2R 5179653 3' - 1360 80 1 73.10 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAATACCCTACAGGGTACACAAAAAAACTAATTTTATGTTACGCTT:1 - 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blood 7015 2 80.71 AATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTG:1 + chr2R 21795332 3' - transib2 71 1 68.75 AAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTATTAAATGTTAACAAATTTCTTTGATTTTATTTCAATTATTGATGTTGGGG:1 - chrX 6216288 3' - Juan 3975 1 65.75 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCACTCAAGGGATTGGCTTTACTTTTTT:1 + chr3L 414973 3' - 412 31 2 65.07 TAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTGTCCGCTGTCCATTCCGCTATCTCTTTCACTCAAGGCTACCCGTC:1 + chr3L 5051197 3' + flea 243 2 78.77 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAA:1 + chr3R 10737065 3' - F-element 68 1 58.90 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTATT:1 + chr2R 17650677 3' - pogo 34 1 63.70 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAATTTGTTGTTTAACAATTTGGCCATAAAAGCCATAAAACAAAGCCTGAGCATTGAAACTATAATGAAGTCC:1 - chr3R 4527137 3' - mdg1 7048 2 78.47 GAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTCGAACACCTAGCCTAAGAGAAGTTAAATTTTTCCACTTTTATATTATCGGCTTTTGTTTTGTCTTGTATAAATTAGGACAAATAATAATCATTATACATTATTA:1 - chr2R 22247324 3' - GATE 34 2 68.06 AAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGAAACAACCTCTTACAATGCATAAAACAAGTCACATTTAGTGGCGATATAAATTTGGACTTGGTTTTTTAAAATAAGCAATATAAACATA:1 + chr3R 20887525 3' + Doc 4640 1 62.33 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAAATAAAACTATTTACTAACTCTTTCAAGTAATACGAAAATATTATATTATGTTTATATTTTTAGCATAAGCAA:1 + chrX 8314553 3' + roo 9024 2 53.42 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTGCTAATTAAGACACTTTTTAAAGCATTTTGAAGTTAATAGAAATAAATTGTATGGTACGGAAAA:1 + chrX 11232610 3' + roo 352 2 56.25 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAACGACTGC:1 + chr3R 28749233 3' - mdg1 21 2 70.71 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTGATCCGCAGATGTTTTCGCTCATCTCTGGCGAAAAATTACTCTTCCTCAATCTTTTGGCTGCCGAAAAAGTAGCCAGACGAATGTC:1 - chr3L 17482047 3' + 297 6952 2 68.84 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCAT:1 + chr3R 29283290 3' - hopper 47 1 52.52 GAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCC:1 - chr2L 23310612 3' - 1360 50 1 52.05 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGGAGGAACCGCCTTCGTGATCACGGTTAACCTCTACGCCAGGTAAGTATGCTTTGCTTAGCTCGGCATAGGAATTTCCATGAGGGCGCAACTAGAACTAG:1 + chr3R 4948126 3' + P-element 2868 1 72.22 CATAGATGGCGCAGCTAACTTTGATGATATTCATTGAAATTAATGTCAATGCAACCGACCACAAAAGAAACTCCGTCACGTGAGCCGAGACGGCTGGCCGAAATCAATAGAATAGCATAATGACA:1 + chr2L 18526109 3' - pogo 191 1 72.00 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGC:1 + chr2R 20972728 3' + jockey 4936 1 58.22 GGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCGTGTGACTGCGATACTGACTGCTATATACCGTGGCCATAAATTCAGTTCGGCTGCAACAAAGTGGAGCAGTCGG:1 + chr2R 14072661 3' - mdg3 5254 1 80.00 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGGG:1 + chr3R 11285016 3' - blood 7030 2 67.74 GGTTGTTGTTTTTTTTTTCCTTTTGGCTTTGCGGCGTTCTTGGGCTCGCCGCAACGTATTTGACGTTGCCCGGTTGACCTGCCAACTAAA:1 - chrX 9714063 3' - gypsy7 5014 1 86.67 TACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGCGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAA:1 - chr3L 28063329 3' + Stalker4 108 4 67.81 TTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTTTCACGTTGTCCTGTGT:1 - chr3L 19274807 3' + transib2 2803 2 54.55 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTCACAATGCAAATATATGTACGAAATATATAAACAATTGTATTTCGAGACAATATTTACAAGC:1 - chr2L 9704769 3' + roo 9017 2 56.74 ATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATACATATAGAAATATATATGTATCTGCCACATTCAAGCTCCAGATCCAGATGTCTGCAGAAAACCATGCC:1 - chr3R 28618346 3' + 412 448 2 51.41 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTA:1 + chr2L 17019153 3' - 412 83 2 75.34 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCATTCAAATAAACTTTTCGTTCAAAACAAAATGA:2 + chrX 13628867 3' + roo 9047 1 69.18 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGCCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCAC:1 + chrX 683621 3' - jockey 68 1 58.52 TTTTTTTTTTTATTTTGTTTTGTCTCTCTACCCGGGCCCATCCGGATGTTTGGGGTTTGGGCGGGGCAGGGGGTTCAACTTAGT:1 + chrX 15366004 3' - G2 3077 8 88.10 TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAAGGTTCCGTCAAAAACAGCCTTACATACACTTGAGCTTTTGAAACG:1 - chr3R 30568988 3' - mdg3 5328 2 66.90 TAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCACTCG:1 - chr3R 12078626 3' + hopper 1357 1 68.00 TCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTCTGAATTACTACTAAAAATTCATTGGCTTCATTCATTCTTTGAACACATTCAGTTAGTTCATTTCGATTGTACGCCTAA:1 - chr3R 4512228 3' + 1360 143 1 68.49 CTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATGGAGCCGATGACTTTTCGAAACGTTT:1 + chr2L 21802975 3' - Quasimodo 53 2 57.34 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTT:1 - chr2R 21796002 3' + roo 9024 2 52.05 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGGGTTCTAAA:1 - chr3L 18216492 3' - 297 6640 2 70.87 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGC:1 + chr3R 10030810 3' - BS 5046 1 56.16 ATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTGGC:1 - chr2R 4730082 3' - gypsy8 304 1 78.69 CTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTTCATTGA:1 + chr3R 10737060 3' - F-element 59 1 58.33 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCT:1 + chr3R 27606692 3' + 412 7475 2 64.38 GCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAA:2 + chr2R 12185456 3' - accord 23 2 67.12 AGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTG:1 + chr2R 21795326 3' - transib2 60 1 69.29 AGCGGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAA:1 - chr3L 9324474 3' - HMS-Beagle2 6967 2 74.66 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTAACCAGTTCCGCCTAGCCTTC:1 - chr2R 23094846 3' + 412 7509 2 57.93 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTT:1 - chrX 20361965 3' + hopper 1382 1 55.14 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGCATTCAGTGTCCTTTTTAGAGGACAGGCAAGAATATGTTTTTAATTGTTACT:1 - chr3L 6557083 3' - Doc 23 1 67.12 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAATACCCTTGAAATTGATATTCCTTCAGATT:1 + chr3L 6015724 3' - roo 8674 2 73.61 GTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAAAGGAGATTATGGAACTAGCAGATACCCTATTCACAA:1 + chrX 860861 3' + hobo 2878 1 68.55 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACA:1 + chr2R 21795353 3' - transib2 49 1 53.85 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCACCCTGTTTAAAGACTACGTGCGGTGCGTCAGACATTCAGA:1 + chr2R 16372031 3' + 412 7480 2 70.15 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTAAAT:1 + chr4 868752 3' + roo 9026 1 54.11 AAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGTTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAA:1 - chr2R 23094891 3' + 412 426 2 73.85 ATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTATACATAAGTGTATAGAACGTTACGTCTTAATTTATTTATAAGTCAGTGGGGTTTTTTATTCAAACCAAAAATAATGTGGCTACA:1 + chr2R 10788163 3' + gypsy10 303 2 57.53 CTTATTTATTTGACTGTACTATGAAAAGCATAGCCCGGCAGTTGCCAAGAAGTGATAATTGGGATTACAAAAACGAAAAGACCGTAGAAGCCAGCATTGAGAATGAAAAGGAAACATCTCCAAATGGATCTGGAAGTACAAGCAGT:1 - chr4 957145 3' - Tc1-2 60 1 69.18 TCATTATTATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGC:1 + chr3L 25232861 3' - accord2 66 2 59.31 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACATAAAA:1 - chr3L 15718042 3' + 1360 3355 1 53.79 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAGCATTTATAAAGAGTACATTTTATAAATGTAAATATTTAGTA:1 - chr3R 26472755 3' + 1360 3372 1 72.60 TTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTAC:1 + chr3R 6584852 3' - transib2 82 1 75.00 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGTGCCTGTTGTGTACTTTATTGCTTACTTTTCGGGGCGTTTGATAAT:1 + chr3R 27315183 3' + jockey 4978 1 64.00 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTAAAGGCGGACACGCAACTCAACCG:1 - chr2L 7633334 3' - Max-element 8266 2 62.41 GAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTATTGTCTTTGGTGAAGCGGGATCTAGCTAGTACAACGCAAATTTCA:1 + chr2R 24427595 3' + 1360 3311 1 77.78 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCAC:1 - chr2R 6236082 3' + P-element 2798 1 24.14 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTATTCCCAATACATTTTAACCAATCCACTTTTTC:1 - chr3R 5870753 3' + roo 394 1 73.79 GATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATTATAAATCTATATGGGATTA:1 - chr2R 7720020 3' - HMS-Beagle 6807 2 78.08 ATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCATTTTAATTTCAATTTTAACATGAAGTGCACACTTTTTGTATCCCCGTGTGAAAGGTGTTCGAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTATCCTAGTAGCAGCTGTTGT:1 + chr3R 10421008 3' - Tabor 13 2 68.06 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGAAACTTCAACTGCGAAGTATGCAATATATTTTTTGG:1 - chr2R 8315515 3' + hobo 2882 1 72.17 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCGCTCTCTAAC:1 - chr3L 13993471 3' + P-element 2813 1 25.38 GTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGGGTGTATATGCAGCAGTGGCAACTTGTAGACGTGACGCGGTCAAG:1 - chr2L 20718798 3' - jockey 4713 1 54.17 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTGTCTCTACTTAAGGAATTTAATTTGGGAAGTAGA:1 + chr3R 30087815 3' - roo 8706 2 58.90 TAGCTAGTACTCATTAAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGCAATGACAGGTGAAAAAATCCCGTTCGAGATGTAGTTTTATAATACTATTTTTCGATTATTTAACT:1 + chr2L 14858498 3' + Ivk 5328 1 52.74 GAAAGCCAAACCAACTAAGACCATTGAATCCGAGGGAAAAGCGACGATTAAATCGTGCTGAATGAAGGCGAGTATAGGTAGCTCGCAGTGGATTGCATTGACGACATCTATTTTTACTAAATCTTTTAGTGAGCGAAGCAATG:1 - chr2R 1954084 3' + gypsy10 5583 1 79.02 CATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTAT:1 + chr3L 11826016 3' - X-element 64 1 58.21 TCTGGCATCACGGCGAAAACAGGTACTAACGCCAAGACCTTTCCAACGGGCGCGTTAAGTGTACTCGCAAACGGACTACCGTTGGTGCTAAAAGAACGCCATAAAATCAGGCCAAGCAAAGTGAGTTACCCGAATTACTACCCGTA:1 + chr2R 10272085 3' + Chimpo 25 1 74.66 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAAGGTGGTGTATTCTTTTTAATTATCAATATATTAATAA:1 + chr3R 12519738 3' + roo 391 2 72.92 AGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGA:1 + chr2R 954527 3' - Quasimodo 78 2 77.93 AGAAAAAAACGAAGTATAACGAAAAGCTGACCACCCATACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAGCCGGCTGCACCGCAACGACCTCCCAGCCCAGCCTAGGCACCCGGTTTGAGACACTCAAGAGCGG:1 + chr3L 172362 3' + Doc 4458 1 78.08 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACCGTGTAATCGCTGGCGCGCCACGCCCCCCGCCCCTCCCACTGTCCCGCGCTC:1 - chr3L 17400768 3' - 412 7116 2 61.15 TATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCACGATTATCGCATACAGACTGTG:1 + chr2R 10119110 3' - Juan 4049 1 67.81 CATAAACACACACGCACACACACACACACACACTGAGATTCTAGATGGGCTCCGCGGGGCTGGCTGTTATAACCTTCTCAATGACCTTTTATTGACCTTCTGTGCGGAGGACAGGAAATGCTATAGCACTGAGCTTGAA:1 - chr3L 5318330 3' + accord 7026 2 58.27 GCATTATTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAAACATTTCATTTGACAACTTGAAGTGTAGCGAAGAAAAACTCGAATTAACTCAAATCGAACCGAAAGTAAT:1 - chr3L 22294381 3' + pogo 2055 1 54.11 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCGCTGCCAGGTTTTGTTTTTGTTTTGGG:1 - chr2L 310049 3' + P-element 2852 1 55.81 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATACAAGCAGTATATACAATACTTCGATGAAGCCGTTTTAGCCAC:1 - chr2L 18311387 3' - opus 7025 2 70.55 TTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTTTCCTGCTCTCTCTCGTTCTTC:1 + chrX 1769769 3' + hopper2 1529 1 71.23 TGCAGTGTCTGCCGGCTACGTATCGACATTCGGCATAATGCTTACGTTGCAGTATGCCGATGTTGTCGTATTTCATGCGCCCGTGGGAGCGACGTTAGCTTTAGTTAACTTATATATCTTATCTTCCCGGTTCAATAACATTG:1 + chrX 21667914 3' - gypsy2 6577 2 76.22 AAAGTAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGC:1 + chr3L 23678129 3' - Osvaldo 30 1 72.22 AGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTTTGGCTTGTTATTAACAATTAAGGACCTATCTATTTCAATTATATTCTG:1 - chr3R 3269597 3' - Gypsy6A_LTR 106 1 73.97 TAAAATAAGGAAACGAGCCATAATCATTTAAATAACTCCTTTCTCTCACTTGAAGCTGTAATATTGGTGAACTTATTTGTTTCTCTGTTTAATATTTATTCAGAGTTTTAGAGCCACTGTTCGGCTTTCGGTGTTACACGCACACA:1 + chr3R 14008251 3' + Transpac 352 1 21.23 AAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGGGCTGCCAACTTGTTTTCTTCACGGCGCCAAAAAGTATGCTCTAATTTTTCTGTCTTGTGGCGCCAAAATCAAAATGT:1 - chr2R 14427084 3' - jockey 4770 1 78.77 ATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAATTTGAAAGGTAGGACAACATATTTTT:1 - chr3L 27356039 3' + Tc3 1678 1 67.12 ATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCACTTTCCATTTGAC:1 - chr2R 9007085 3' - jockey 4862 1 78.52 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCTGAAATACCCAGTGATTATCTGATGGCTGGGCCCAAATCGTATTAAGCATACGCAGCGGTGTGCCAAACTTGCCAACTCATTCGAGTGGGCGGGCGGTCA:1 - chr3L 6050101 3' + 412 7527 2 70.14 CCTTTGTGCACGCCCCGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTTC:1 + chr2R 2994313 3' - gypsy8 145 2 52.59 TCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAG:1 - chrX 3811632 3' - P-element 85 1 17.83 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGGACAAACCGTTGCAATTGCCATCTAGTTGCTGTGTGCCGATGTGATAAATTT:1 - chr3L 2907297 3' - 412 7122 2 69.18 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTT:1 - chr3R 19514247 3' + blood 7312 2 69.86 AAAAAAGTACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGC:1 + chr3L 15099670 3' - G4 3814 1 49.25 TCTTATTCCTAACGGGGATATGATCGTATGCTTCTTCGTATGCTTCTTTCCTCAGTGGCAATACTTCTACTGCAATACCGCCAGTGCCACATAGCTCGCGACAT:1 - chr3L 27264789 3' - invader3 67 2 58.65 TGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTCGAGAATTGTTTGTAGAGGAGGCTGCGTCGCTATCAGGAGTTCGCATCTTAACGATCTCACCTCCGAAGGTTACTCGCTTTAATCCCCGAGAGGGAGTACCCGGCGCGG:1 + chr2L 151815 3' - G2 2667 1 76.71 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAATGCAGCGCCACACAATGAAATTTTAA:1 + chr3L 12991448 3' + mdg1 7406 2 57.78 CATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATGTTAATA:1 - chr2L 4244881 3' - 412 63 2 61.64 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACGTCCGG:1 - chr3R 29627830 3' + roo 9040 1 59.40 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCGCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGT:1 + chr2R 10977221 3' + roo 9024 2 50.68 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTG:1 - chr2R 18886920 3' + roo 390 2 72.60 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATACTTTTCAACGAATACAGTATACGTTTTTTCTCTAAGTGTACCGGGAATAATTAGAAACCAGGAATGGGTGTTCTGTCACACTGTTATCAGTTTTGCTA:1 - chr3L 13291930 3' - roo 8687 2 64.38 CTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATGTATATATATATATATTTATAGCTAATCTGTTATCCCGCCACTTCAGCTTTAATATATTAAAATATTTTCCTCAATAAACTGCAATTACTTGAAG:1 + chr2L 21198302 3' + flea 230 2 71.23 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACATACAGTTG:1 - chrX 6891406 3' + hobo 2923 1 73.76 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTGTCTCTACTTAAG:1 + chr3R 30087794 3' - roo 52 2 59.26 TACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATCGAAAATCACTTTGCATCTGCAGCACTGCTCACTGACATGAAATTTCCTGTCATCTTCGGTACAAACAGCACATCTTTGAGCGTGAGCGTGCACAAGTCT:1 - chrX 22754226 3' - gypsy 20 2 69.18 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCC:1 + chr2L 20852559 3' - 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G5A 2691 1 74.66 CAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGGCAAATGCA:1 + chr2L 17019184 3' - 412 52 2 54.11 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTGCACTCGTAAATCCCCAGTTGTTTACTTTTTAGATTCTAGATCAAGCAAGTCGATCTTGACATTCATTAAACAATTGAGAGCCTATTTG:1 + chr2R 11247097 3' - 1360 25 1 69.18 AAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATTTGATCCGCAGATGTTTTCGCTCATCTCTGGCGAAAAATTACTCTTCCTCAATCTT:1 - chr3L 17482079 3' + 297 6912 2 65.75 TAGCCGAGTCGATCTAGCCAAAGACACTAGAATTATTCTAGTGTCTTTGATCTAGCCATGTCCACCTGTCCGTATGAGCGTCGAGATCACAGGAACTATAAAAGCTAGAAGGTTG:1 - chr2R 1751259 3' + INE-1 104 1 52.17 TATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATCATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATGATTCAATTACTAAACATAAGGTGTTGCCAGCTNGGCAGGTGGTATT:1 - chr3R 12948553 3' - Stalker4 6968 4 71.72 TTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCAAAAAAACTTATGCTTCCAAATTGGAGAATAGAAAGAGCCGCGGTAGCAATTTTTAATAGAATGTTATATCG:1 - chr3L 27422181 3' - transib2 2596 1 65.04 GCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGNCTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTNAATCGCATCAAATTG:1 - chr2L 4864389 3' - mdg3 61 2 67.19 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACACATTTACACTAGTTAGTTTGT:1 + chr3R 4962897 3' - jockey 70 1 58.33 TTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCATATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCTTGTTCCT:1 - chr3L 8249330 3' - mdg1 7055 2 73.97 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGGG:1 + chr3R 11285016 3' - blood 7052 2 57.53 CGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAAAGCTG:1 + chr3R 30955441 3' - G-element 29 1 60.96 TGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGG:1 - chr2L 23295817 3' + micropia 377 2 77.78 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATCTGGGATTTTACAAACAGTTTATTAAAGCGTGAATTGCATCCTGTTGCTACTGTTTATCCTCCCCCGCCCTTCACATTAAATATTTACAAGTTCTCAATTTGCCTA:1 - chr3L 6015545 3' + roo 9048 2 61.59 CGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGGGCGCG:1 + chr3R 7074876 3' + P-element 2809 1 28.87 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGACGAATAATAACTTCGCTTTTGTCGCAGTCCGCCCAAGAAACCAAAGTGGGGGGCCATTGGGGGCG:1 - chr3R 11089659 3' - I-element 24 1 56.52 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTT:1 + chr2R 9453365 3' - roo 8736 2 70.55 GATGACTGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATTAAACGTTATCACCCTGTTACCAGTAACAACACTTAT:1 + chr2R 5549880 3' - flea 80 2 73.97 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTAGCTAGCAATGTCGCCACGTATTCGGTTCGTTCGTTTTGGCCGTAATAGAGGTAAGGGTTTAGTTAGATTTTGGG:1 + chrX 15191467 3' + hobo 2919 1 66.94 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCATAAAC:1 + chr2R 17269184 3' - roo 8744 2 76.39 CAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAATCGAAAAACTCATCGATGGAAGCCCCACAGTGCGGTGTGAG:1 + chr3R 12146762 3' + gypsy10 5941 2 54.48 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAGGATTTCCATGAAAATTGC:1 + chr3L 2966551 3' + roo 9015 2 55.48 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACCGTGTAATCGCTGGCGCGCCACGCCCCCCGCCCCTCCCAC:1 - chr3L 17400780 3' - 412 75 2 69.78 CGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTAGTTT:1 - chr2L 11475074 3' + jockey 4966 1 65.07 TTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTAAATGGA:1 - chr3L 27415195 3' + transib2 2783 1 57.64 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGA:1 - chr3L 6131839 3' + roo 338 2 63.45 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGGGCTGCCAACTTGTTTTCTTCACGGC:1 - chr2R 14427136 3' - jockey 4822 1 60.27 ATAAAATTAGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTGGAAATTTAATACCACTTTTATGTGCATCAAACTTCGATTTCGTTT:1 + chrX 5751965 3' + roo 9034 1 59.31 TAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGCCTTTGAAAAATGCTGACCCGCCCACGATGACGAC:1 + chr3L 5910595 3' - BS 5023 1 55.65 ACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGATTTATTTTTTCCATGGAATTTATTCACAG:1 + chr3R 4527325 3' + mdg1 398 2 69.18 CGTTTTTTTTTTTAATTTTTATATATATTTTTTTTGTCTTTATTTCCCTGCTTTCGAGCTTAATTATATTTGTACTTATTAATAACACTTGTAGAGTATTTATTGTACGATTATCGCCCTTTTGTTTATATTCCCCGTT:1 - chrX 9309253 3' - Doc 4695 1 42.45 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGTAAAAGCGTGTGTGTGTGTGTATTTATGGGTGTGTGTGTGTCTACAAGCCTGTAAGCA:1 - chr2L 6149115 3' + hopper2 1548 1 58.62 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCG:1 - chr3R 19965219 3' - jockey 71 1 57.53 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATCATGACAGTTTTTTACTATTCGTGAAAAAATAAACTTATCACACT:2 - chr3L 18074082 3' + 297 328 2 67.12 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTAGTAACGTGAATAACTCCACTCT:1 - chr2R 24427503 3' - 1360 39 1 58.62 TGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCT:1 + chr3L 2532516 3' + blood 7306 2 75.34 CTATTTTTAGATTTCTTATGCTCTCAGCGGGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCA:1 + chr4 909151 3' + 1360 3277 1 64.38 ATGTTTACAGGAATTTAAATTTGAAAAATATATATAAAAATTTCATTCAGCATTCGATTGGTCGTCTTGCAACAAACCCAATTTGTCTCGTAACTCCACAAAAGAACAAAAAAAAAGTGAAAACGATGCATATTTGATGAGCAAAA:1 + chr3R 25599127 3' - copia 4682 1 68.49 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATG:1 - chr3R 5870807 3' + roo 9002 2 64.38 GTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGCTTCACACAACAAACTACATCAGGCTCAGGACTGTGCTGGCTATTTGGGAATCCTCTTT:1 + chr3L 13630259 3' + hobo 2895 1 53.23 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGCTGACGCATCTCTTGCTGACCAGTGGCCAGTCACCGAAACTTGTGCGT:1 - chrX 609336 3' - 1360 31 1 64.38 ATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTAATGTGCAATCCGTTGCTATTGTGCAGAAAACAATATAATNAAATTG:1 - chr3L 11535871 3' - roo 8706 2 54.79 GCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATAGTCATGTATACCCTTACATACCCTCTTATTAGATTAAGTTATGTTAGAATACACATTGGTTGTAGAGTAAAGGGGTTTACTATATTCTTTAGAAAGCAT:1 - chr2R 542927 3' + Stalker4 7162 4 43.84 GTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGT:1 + chr3R 10144465 3' - Chimpo 55 1 55.80 TTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGACATAACCAAATTATGTTTATGTATGAATGACATCTTCTAGTCACTAATTGTTC:1 - chr2R 19574379 3' - I-element 5110 1 71.92 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCTGATCGAATCGCCCAAGTTCTAGCAGATGCATGTGGCATACTAGCAT:1 - chrX 8038559 3' - 297 17 2 73.29 AATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATATCATTTAGGGATCTTAACTTTTTTAACTGAAACATCTTTGGAATATTGAGGTGCTATTATACACCGAGGAAGCTTCAAGGTAAATTTTTTGTATGTATTTATG:1 + chr3R 5165072 3' - invader4 12 2 76.03 AAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGTGGTGAATAGTGACTTTTGTTAACGGTACGGAAAGCGCTTCCCTGTCA:1 - chr3L 23773872 3' + Transib5 2859 1 75.34 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACAATAACAAT:1 - chr2L 13033312 3' - hobo 43 1 53.79 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCC:1 - chr3R 17077823 3' - 1360 73 1 69.86 TATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCG:1 + chrX 19886990 3' + P-element 2783 1 15.75 AACTATATATATGTATATATACTTTTTTTTGCAATTTTGCTCTGTCTGATTGAAGTGGATTACCTTGAGGAGAGCTCCACCACGTTAACTGGATGCATTTGCTGCGTGTCGCATATCTTGAAAA:1 + chr2L 10035836 3' + 1731 4409 1 89.52 ATAATTAATAATTAATATTATTCCATTGTCGTGTGCAAAGTTTTGAAAGCTATTCTAGCATAATTGAAGTGAGTTTGAAATCGCGTAAAATATTAAAAAAAAATTTAATTTAAGCTCCAAAAAAATCAGTTTCGACCCACTGTGCA:1 + chrX 14744067 3' + Tc3 269 2 78.08 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAA:2 + chr3R 12519701 3' + roo 351 2 58.90 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCT:1 + chr3R 4527292 3' + mdg1 7403 2 55.48 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAATATGCA:1 + chr2R 12827055 3' - Burdock 77 2 72.60 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATGCGTGCTCGGGCCCGTGGTAAAGTATATACG:1 - chr3R 17924425 3' - Burdock 6191 2 59.31 TTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTAG:1 - chr3L 9324412 3' - HMS-Beagle2 22 2 69.18 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTGA:1 + chr3L 18074200 3' - 297 6621 2 58.90 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAATATTTCGCCTGCTGCCGTGTGCCC:1 + chr3R 28618475 3' - 412 30 2 54.35 TAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCAATCAATATACAGATGATGCACAAAG:1 - chr2R 9007004 3' - jockey 4786 1 77.86 GTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAATTAACTTATTTTTTACATTGTGTATAAATGTGCGTCTGTCC:1 - 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chr2L 9744436 3' + hopper 165 1 38.89 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGCGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAG:1 + chr2L 10909591 3' + 412 427 2 62.33 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAGCGGTACCCAATTCCAGTTCCATTTCCACGATGCGT:1 - chr3R 19134376 3' + transib2 2774 1 53.42 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAA:1 + chr2L 5728941 3' - roo 8741 2 72.60 TTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGGACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGACACTTAAAACCCAACAGGGTCATTTAAAACGGACAGTATCGAAACTGTGTCCACCGCCA:1 - chr2L 22592502 3' + mdg1 392 2 63.70 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAA:1 + chr3R 24084892 3' + roo 9017 2 55.48 TTAAGATGCGATTTTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTCACAATGCAAATATATGTACGAAATATATAAACAAT:1 - chr2L 9704795 3' + roo 8986 2 73.97 GGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTCCAGC:1 - chr3R 16475352 3' - mdg3 5331 2 70.34 AGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAAC:2 - chrX 16547492 3' + P-element 2799 1 25.34 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGC:1 + chrX 22835252 3' + mdg3 5423 2 66.44 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTAAAATGTCCTAGTCCAAAACACCGAGAAGAAGGAGTAGCTCGGAACTCAAGAAATCGCGACTACGAGGAGAATAATGAA:1 + chr2R 16274663 3' - roo 40 2 58.22 TATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACATAAAGTGGTGCC:1 - chr3R 12948571 3' - Stalker 6880 4 62.33 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATAGTATCAAGTTGGCGAA:1 + chr2L 5728974 3' - roo 8697 2 60.74 TCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAGTCAGAAGATTAGAACAACGACAG:1 + chr3L 24008439 3' - X-element 19 1 70.55 CCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCCAGAAGGTTGGTTTTTTTTAAAGTTCTGGAT:1 - chr3R 17077793 3' - 1360 41 1 56.94 GCTGCCATAAGTTAATAGGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGACACAAAATTATATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATG:1 + chr3L 414941 3' - 412 43 2 53.17 CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG:1 - chrX 12649915 3' - blood 168 2 68.54 ATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGGACCAGAAGGCAAGCTGAATTTTTCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACCTTGCT:1 - chr2L 11867251 3' + hobo 2917 1 66.44 GTTGAGAGGAACTTTCCTATTTTAACTGCCAGCCTTGTGATCTGGCAGAGGAAGTAATCGTTAAGACCCAAGAAAGGAACCTGTGTATAGTTTGGCTAAGCTTAACCACCACGCATACGCCCCGGCAAGACCCCGCTCATCCCACG:1 + chr3L 24058988 3' - Gypsy6A_LTR 277 1 64.38 AATTTAAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGCTGAACAGGATGAAAATAAACCGCG:1 + chrX 8958661 3' + TART-C 11098 1 77.61 TGTAACAGGTAGAAGGAAGCGTTTCATACTATCCCGTCTGTATGTCCGTCGGTATGAACGTCGATATCTTAGGAACTATAAAAACTAGAGGGTTAAACTGCTGAAAAATAATTCGCCTGTTCTTCAATTTATTGTTCGTCCTGCCA:1 - chr3L 24756909 3' + INE-1 31 1 77.40 TTATAATTACAATTTAAGTGTTAATTAAAACTAATGTTGTTCCCTTCTTCTTTTTTTTTTTGCCGCACAACAGCAACGATGTGGGCGAAGTTTTCCAGGACGGGAAGAACATGGCCGCGATCT:1 - chr2R 23779054 3' - looper1 1648 1 52.03 TGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTGGCAGTTTGTTGGCATTTGTTCGAAAGGTGTACAATTTTATAGTCGTTGTA:1 + chrX 21668435 3' - Stalker2 16 2 73.10 AAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACG:1 - chr3R 20841372 3' - Juan 43 1 44.52 ATTTTATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATAAACTAAAACCTTACGTAAACATAAAAAA:1 + chr2L 22187554 3' + S-element 1629 2 78.77 GATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATACTTTATACGATCGGAAACGCTTCCTTCTGGGTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATT:1 - chrX 16116152 3' + HMS-Beagle 6983 2 60.27 TGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATACGATATATTCGCTTTGTAGGTATATTTTAATAGTTTTCCAGGAAAATAAAATACTTGCTGAACAA:1 - chr3R 17531772 3' - 297 24 2 49.58 ATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAAAGATGTTTTTATTGGGGCGGACACTAATTGTTGGTTAACCCATTGAAGCGCATCTAATGGGGCAAATACGAAGCACTTTAAGCGCAGCCGGCATCTCAAG:1 - chr3L 1186198 3' + I-element 5347 1 74.62 TATGTGAGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGC:1 + chr3L 18549789 3' - X-element 91 1 69.18 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCC:1 + chr3L 13285654 3' - roo 8741 2 77.61 ATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGNGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATNGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTC:1 - chr2R 961131 3' + transib2 2663 1 56.16 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACNTGTCCT:1 - 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gypsy8 142 2 52.71 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGGTGCTCATCACTT:1 - chr3R 24072006 3' - jockey 30 1 69.29 CATATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCCACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAA:1 + chr3L 1463692 3' + P-element 2781 1 13.70 TCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCTCTCTTCCAGTGTCTAGTTATTTGTGCTATAAATTCGCGTCTATGAAGATAACGCTGAATACTAT:1 - chr3L 10897433 3' - roo 8719 2 55.48 TCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAGTCAATTTTGAAGATGTTTTGCATACGCAGC:1 + chr3R 22320578 3' - roo 8675 2 71.17 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATATTGACCATTTGCTAAACGATAAT:1 - chr3L 13285568 3' + roo 9024 2 52.74 AAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAA:1 - chr2R 10582401 3' + Juan 4135 1 71.72 TTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGTTCATCACTCCAACTCGTTTCGTCGCACCTGAGGAAACTAATTTGAAAG:1 - chrX 12979402 3' + transib2 2804 1 71.92 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATG:1 - chr3R 24072041 3' - jockey 75 1 60.29 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGTCGTAAACAAGTCGCCGCAAGTGTGCATAAATATGTAAAATTAAATAATGAGAAAACAGCCCCAAGCAGGCCGCTGCTATATAGAAA:1 + chr3R 11756864 3' - Tirant 10 2 74.17 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTA:1 + chr2L 16884892 3' + pogo 2034 1 68.84 TGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAACA:1 + chr2R 3146363 3' - rover 7012 2 62.86 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATGTAAATCTTTTTGGCAAATGTAATTGATTGTAATTTGTAATTG:1 - chr3R 10733717 3' + mdg1 376 2 53.79 GAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTGAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTG:1 + chr2L 2057882 3' + 412 438 2 63.03 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTAT:1 + chr3L 14422845 3' + roo 9028 1 54.17 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATC:1 - chr2R 23094886 3' + 412 415 2 73.29 GAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGT:1 - chr2R 19574410 3' - I-element 5141 1 52.05 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGTTTGCTGACACAGGTGAA:1 - chr2L 10909450 3' - 412 20 2 67.81 TGGGTAAACACAAGTGCCCAAAGTCTGCATTCTTTCCGCTGTCATCGAGAGGGGGTGGCAAAAAAAAAAA:1 - chr2L 4085333 3' + HMS-Beagle2 6936 2 62.86 GTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGAATTTAACCGAATATTGTTGGGCTGTATCTTTGAGGTTAGGTCGAGTTGGTTATCGGTCGCGTTC:1 + chrX 1349355 3' - I-element 5052 1 58.22 TATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTTATAAATGAAGTGCTAAATCTTGATTAACAATGACCAAACCAGATCTTAAAATGTGCTAACCACTGAGCAAGCTAATAACCGAAA:1 - chr3R 13613057 3' - copia 34 2 71.92 TTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACGGCAAGTGAAAAAGGCATGCAGGTCATTAAATTGTTG:1 - chr3R 20841336 3' - Juan 19 1 68.84 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGAACTCACACCCTTTTAACCATATTTGCAGCTGCAGTTCAGGTTTTATTTGCCTTTC:1 + chr2L 20228047 3' - 1360 65 1 64.38 GAATACCTTTGTATTACTCAGTTTCCTGAAGAAGTTTGAGATTCAGCATAAAGATTGTAGAAACAAAGACGCAGCGCAAGATCGTTGACCCATGTTGCCACGCCCACTC:1 + chrX 14770555 3' - HB 40 1 71.56 TACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGGATATGA:1 + chr3R 31264558 3' - BS 16 1 68.35 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATGTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAACGCTTTAAATTTTAATCTTCTTATTAAATATTTATTGTACTTTTTATAAATGCTAAAACATTGACTTAATAATCCATG:1 + chr3R 18477882 3' + 1360 3348 1 56.16 CATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGG:1 + chr3R 28618443 3' - 412 57 2 63.16 TCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGGTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGTGTCGTAAACAAGTCGCCGCAAGTGTG:1 + chr3R 11756802 3' - Tirant 8189 2 77.69 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATT:1 - chrX 3533853 3' - 17.6 6963 2 61.64 TCTTATCTTATCTTAATCACTTGAGCTACAAAGTGCATGCTCAGCATTCCCACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATTGAATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGTTTTTTTTGGGTATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' - Stalker3T 195 1 58.62 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTAAAGCCAAAAAGTGCGCACAACTTCTAAATTACTTTTCCAAACAGCATCCACTGGCCTGCTGCCTGCTCCTTTCCAACGCCCC:1 - 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chr2R 6767994 3' - pogo 59 1 61.81 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATCTTCGTTTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCACGATGTGACTGTTGTGGAAGG:1 + chr3R 22709044 3' - roo 8704 2 53.33 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCATCTCATTGAGCAG:1 - chr2L 14056667 3' + pogo 2042 1 56.85 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTTTCCTGCTCTCTCTCGTTCT:1 + chrX 1769767 3' + hopper2 1528 1 72.41 CGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCCTGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGT:1 - chr3L 18183092 3' - Tirant 64 2 66.91 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGG:1 + chr3R 31264500 3' - BS 43 1 67.59 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCATTAACGAGTGTCAGACTC:1 - 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chr2L 18181115 3' - blood 7134 2 37.67 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGG:1 - chrX 20330506 3' + P-element 2877 2 71.03 CTCCAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTGTTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCG:1 + chr3R 25158655 3' - 1360 88 1 75.17 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAACGTAATTTCACTATATTTCCTTCAAA:1 - chr3R 20887350 3' - Doc 18 1 71.92 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTAC:1 - chr3L 7024448 3' - 412 7117 2 58.90 AATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAACACTTTTTGCAATC:1 + chr3R 29288812 3' - BS 5026 1 60.27 ATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCATATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCCCTTTCGAGAATCCT:1 - chr3L 8249337 3' - mdg1 7059 2 70.63 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTCACCTTTCTTTGCTGCAAGTTTC:1 + chr2R 22796894 3' - jockey 4801 1 68.49 ATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAG:1 + chr3R 10030775 3' - BS 5080 1 64.83 TTGAGAGAACAAGTCGGAAAAACTTGTCATGCTTATATGGATGTAAATAGTAAAGAGTAAATAATGGAAAAAGTTCTAGGAGAATGTCTACAAAAATTAAAATACAGTTAGATGACCCAGCTGTTGAAGCTTTTAACGAACTTA:1 + chrY 382983 3' + TLD2_LTR 8 1 59.72 TGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATT:1 + chr3L 24008372 3' - X-element 74 1 62.69 CTTCTGTCGGAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTACTTT:1 + chr2L 7921021 3' - F-element 387 1 51.24 TGACGTACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGANACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTATTTTTTCGAGNGCTATATAAAGAATTGAAGTTTAAAATTTACTA:1 - chr3R 5164898 3' + invader4 3047 2 60.96 CGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAAAACGTCTTCCTTACCCAAGCTTTACTTCCAAAAA:1 + chr3R 12376529 3' - HMS-Beagle 6841 2 54.79 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCCAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAG:1 - chr2R 12492384 3' + hopper 1381 1 59.59 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACA:1 + chr3R 17243246 3' + hopper 1394 1 67.39 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGG:1 + chr3R 19094257 3' - P-element 77 1 30.99 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTATGCAAATCGAAGGTGGAGAAGTACGCACGCTTTGTTAATTGAAATTCTGTCGCGCACACTCGTTTCCGCTGGGCCCAGCCAGTTAGGAGCA:1 + chr3L 7319382 3' + 412 468 2 67.81 CTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGAT:1 - chr3L 7024466 3' - 412 7135 2 71.23 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGGGGGAGTGCGTGCGATTGTTTGCGCGCCTAAGCTGAGGCTTTTGTTTTGCCCTGTCTTTGTAGACTTTGAATGGGTTTTTTAAAAAGAAGTCGAGCACAACAGCTTTTG:1 + chr3L 17739939 3' - jockey 20 1 74.66 ACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTATAGGCCTCTTATAAACCCTTTAAGC:1 - chr3R 15727819 3' - 1731 50 2 52.05 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTAGTAACGTGAATAACTCCACTCTAAGCCGTTCT:1 - chr2R 24427493 3' - 1360 16 1 71.97 GTTGTAGTTGTATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTGGCTCTCAGTACTGGTTAGTAATTGTGTAAACTCTAATGGTACATCAGTTTTCGGAATT:1 + chr2R 13132597 3' - BS 4698 1 65.07 TATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCC:1 - chr3L 19274812 3' - transib2 84 1 73.97 TTTCTATTAGAAAAAAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATG:1 + chrX 12979537 3' - transib2 68 1 63.01 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTC:1 + chr2L 5728955 3' - roo 63 2 63.01 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGAGTTACTTTAATTTTGTACTTTGATTGCAGTGGAATATTTCAGACTTCTT:1 - chr2L 8120138 3' - roo 8728 2 65.49 CGTCTTTAATTTCAAATACTTTTTGTGTTCGAAATCGGTGGCACGACCTATTTCTTGGGTGTCCCCTTTCACCCTTTATTTCTTAACGCGTCTCGCTTCTTATGCTAAGAGCCAACCGTCTGGTGGCTGATTGG:1 - chr3R 7641064 3' + hobo 2543 1 70.90 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTAATCAA:1 - chr3R 20904925 3' + roo 9047 1 67.12 TATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCC:1 + chr2L 18219424 3' - copia 4910 2 56.85 ATTACAATGANGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTGCCTCCCGAAATTTCTCTTAGCAAACAAAGTTGTTACTTTGCCACGTAATAATTATCCCTCCC:1 + chrX 16998442 3' + diver 205 1 69.18 AACGATGGGCCGCAGGTCATTTTCTGTATGCATAAAATTTGTATGGGTGAAAGAATTTTTGTACTCAACATTATTCAATTTAGATTGTTTTTTTTTTTGCTTTGTTTTTTTTTTATTTAAATTAAATGTATTATTTTAGGCACT:1 + chr3R 19128820 3' - hobo 2737 1 38.19 ACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTTATTTGCCTGCTTTCGGT:1 - chr3L 22320149 3' - jockey 58 1 52.11 GTATCATGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATTACAATGCCACTAGCGACCAACTCTTGAAAAACAGACATTACAAGCCTAGTAAAACCTGCAGGCGAATTCGAAATGCCAAACGGTACAAACAAAAATTCGTACTGCCCACTTTGAAT:1 - chr2R 4193266 3' + 1360 3385 2 74.66 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCGGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGTTTACCCGCCGC:1 + chr2L 2544858 3' + blood 7368 2 63.71 GTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 10582474 3' - Juan 3860 1 54.48 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTTC:1 + chr3L 13285676 3' - roo 66 2 64.14 ATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAA:1 - chr2R 8966155 3' - BS 5065 1 63.70 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGGGTTATGCAAATCGAAGGTGGAGAAGTACGCACGCTTTGTTAATTGAAATTCTGTCGCGCACACTCGTTTCCG:1 + chr3L 7319359 3' + 412 447 2 52.78 TTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGT:1 - chr3R 15003101 3' - Doc 48 1 54.79 ATGTCCGTCTGTCTGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATTAAAGCTAGAAGGTTCAGATTCATCATACAGATTCTAGAGACAAAGACTCATCCAAATTTTTTCTTCTTTTCTCATCAAACCCATACACCAAATGCACGCGCAT:1 - chr3R 4737835 3' + INE-1 123 1 69.86 TTTTTTTTTTATTTAAGTAAAAAACAAAAATAAAAGCGGTCTCAATAGAAAAAATATAATTTCGCATTGCAAACAAATCCTTGAAAATTAAACAAGGGTATAAAAACATTAACATTAACCACATTTAACTTTTGGGCACGAAAAGT:1 + chr3R 9221655 3' - transib2 2633 1 69.86 TACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATACGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGT:1 - chr2L 14262956 3' + P-element 2821 1 37.32 TTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAAACAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCAGTTGTCCGCTTTTAGACTCGTAAATGGCCCGGAAGAGTGGGCTTTGCGTTT:1 + chrX 15198125 3' + Max-element 8500 2 51.35 AAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGAAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTCCAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTT:1 + chr2R 14072584 3' - mdg3 5315 2 62.79 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACGAACAACAGCTGAACC:1 + chrX 16547523 3' + P-element 2832 1 19.05 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTATAG:1 + chrX 22460189 3' + HB 1539 1 78.77 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCGTGTGACTGCGATACTGACTGCTATATACCGTGGCCATAAATTCAGTTCGGCTGCAACAAAGTGGAGCAG:1 + chr2R 14072657 3' - mdg3 5258 1 77.24 CCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACGCAAACAGTCGATTGCGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTTAACACACTGCCAGCAATGCGGTGGG:1 - chrX 1769672 3' - hopper 47 1 53.42 TGCAAAAACTCATCATTATTGTTTCGCATAAAAATGGACTTTAAAGCCTTAATTGCTGCAAATCCATCCTTAAAAGTAGGACGCTCAGTATCGTCCACATCTTCATCACTAAGGCCACTTAACTCATGATTTGCACAGACAATT:1 + chr2L 18523985 3' - pogo 1788 1 75.69 AAATGATTAAATTTAATTTTGAATTATGCTTTATTATCACAGCTCATTTATTTTTCTAAACTAATTCAAACTGAATTCTATTGTCGGTGAAGCATGGTTACTGAAATTTGGCTTTTCGTATAGTAAAAGTTTAGCACTCCTGCCCC:1 - chr2L 7570019 3' - Bari1 334 1 48.63 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACCGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTTTCCCACGGACGTTTGCAATATGGATAATTTAC:1 - chr2R 6767955 3' - pogo 22 1 68.49 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTA:1 + chr2L 8120222 3' + roo 331 2 77.40 TTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTA:1 - chr3L 22021633 3' - mdg1 14 2 69.03 CTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATACCTTTTTTTTTGAGCACTTAGCGCGCTGACAAGTTGAAGCTTTGCGTGG:1 + chr2L 15420093 3' - Burdock 63 2 62.07 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACATCTTTTTTTTTTATAGCATTTCATTGGGATCAGGATTCTGGATTGTGG:1 + chrX 6032117 3' + 412 455 2 54.87 TTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGG:1 - chr2L 23295819 3' + micropia 5357 2 79.84 GTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTGGTTAGTTTAAATAAAATTATAT:1 + chr3L 2532574 3' + blood 365 2 74.44 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTC:1 - chr2L 10074457 3' - pogo 29 1 65.75 AAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTACATGTTTAAGTATTTGAGATAAATTTTTAAAAAATTAAAATTAAAAATCAAAAATTAAAAACTAAAACAATTGTTTCCTTTGAACTTCAATG:1 + chr2R 13121889 3' + HMS-Beagle 7011 2 48.63 TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGAGTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATA:1 + chr3R 22647916 3' + transib2 2755 1 64.14 GCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTGGGGATTAAAA:2 - chrX 22679593 3' - Doc 38 1 63.01 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAG:1 - chr3L 15393675 3' - pogo 51 1 53.42 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCTGACCAGTATGTTGTAAGCAAGAACTGAATTAAAATCATTTGAAAAAGTTCTTTAAAAGGTTTTTGCAGATTGCCAACAGTATCA:1 - chrX 18149944 3' - hobo 36 1 59.59 CTCGGCTATTGATCCTAAACAAGAATATATATACTTTACATGGTCGAAAACGCTTTCATGTACCTGTTAAATGCCTTTCAATAAATCTAGTATAGTCTTTTACTCTACGAATAACGGGTATAAAAGGTGAAAACTACGTGATTCGC:1 + chr2L 23175887 3' - INE-1 90 1 78.77 TGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAATAACCCTTATATTGATTTATTATCATATTTTTTGTGATTAAAGTGCTGGCTGCGTATAACTT:1 - chr2R 13121767 3' - HMS-Beagle 48 2 54.68 AAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCG:1 + chr2R 20972727 3' + jockey 4935 1 58.90 TTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATAATCAAATTATGCACGTACCAAATGCTGCAGACACTTTGTGTGCAAAGATTTTATATAGATAAGCTGTAGACGAAGCAAAAATGCAGTAAAATAACAAAGCAAAAT:1 - chr2L 9383691 3' - flea 9 2 70.55 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTCATATATACAATCAAAAAATTTAAAGAGTTTGCACTCCATTTAATATGCGTCGTAATTTTTT:1 - chrX 2956183 3' + copia 232 1 54.79 GCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTGTTAAGTTAAGCTGTTCAATTTTATGGAATCCGTTTGGATTTGTCATTTAGCTTCAAATTAGTGGGCTTGCAAACTTTGTGATAGTGATTAAAATTTAATTTATT:1 + chrX 3330445 3' - X-element 4253 1 70.63 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCAATATTAGCGCAGCTGCTCCATTTCAATCTCTCTCTCTCGCTTTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCTCGCCTGCACTCGAAGACTATTATTTTTGCCT:1 - chrX 10724937 3' - pogo 26 1 65.75 CCACCCAAATTGGACCAGACTCGACCAAATAAAAATAATACGACTTCGACTAGGACACACAAACATAACCCACCAACATACTCCAAAGAAAAACTGGAGCAAACCCAAAAAGGCAAATAAGCAGCAACAAGAATGCGCAGCTTCCA:1 + chrX 12643054 3' + I-element 4904 1 53.42 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATG:2 + chr2L 8120227 3' + roo 336 2 73.97 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTC:1 - chr3L 7787489 3' - flea 4823 1 73.13 TTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTA:1 + chr2R 10582486 3' - Juan 3827 1 58.06 TTTTTAGTTGACTTTTCTGTTTTTAGTTTATGACATTTAAATAATTTTTCTATATACCTATGCCACTGTTCTTGTTTAAATACTTATGCCCACTTGTGTAGGTTGTACAAAGCACATATAGGAGTTTTTAGAGCAATATATTAAAA:1 - chr3R 4484801 3' + Tc1-2 1390 1 78.08 TAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATGTACGAATTTCTCTACCGAAAACTAAAAATCCATTAAAATGCACTTGAGAGTGCCACAGGATGCAGGCG:1 - chrX 9519452 3' + 17.6 7372 2 52.41 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAA:1 + chr2R 11153227 3' - roo 8721 2 57.93 AGGCGTCGAACGGTAACGGTGCGTACGTCGGACAGGCACAAAGAAGACTCACCGTAAACTAACGGTACCGCG:1 - chr2R 2527698 3' + gypsy8 4785 2 87.50 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCA:1 - chr3R 21925088 3' - hobo 51 1 51.75 GGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTTGTCTATAAATGTAATAGCCTGTAACCTCAAAAGAAACAGCTTTAA:1 - chr3L 12227789 3' - opus 183 4 69.86 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTAGCGGATTCTTTTTGGCCCTTTCACTTTGAGCCGCAGTGAAAACTTCCTCTAAAGTTTGCCAGTGTGTGGAGTTGGTTCTAAAGTGCCT:1 + chr3R 31159314 3' - hobo 18 1 68.99 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACACATTTACACTAGTTAGTTTGTGTATAAAAAGTCAGT:1 + chr3R 4962912 3' - jockey 57 1 54.11 TATTTATTTATATTTATTTATTTTGGAAATTTTAAATCTACAACCAAAGAAAGAATCCATGTAATCGTCAAAAAGTAGCTTTCTACATTTTCTATAAACAAGACAATAAGATACGAGGTATCCTCGCAGTCGCAACGAGTTTGCG:1 + chr2L 12205173 3' - diver2 446 2 59.31 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCGCAACCAGATTTCACCCAGGACCGCAAAATAGTACAA:1 - chr3R 26854712 3' - jockey 35 1 64.38 GGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTT:1 + chr3L 4547755 3' - mdg3 83 2 72.60 ACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATATAATGCCAGGGCGTTTAT:1 + chr2R 11778060 3' + hopper 1361 1 59.68 ATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAATGTGCGCATACATTAAGACGAACACAA:1 + chr2L 15020010 3' - BS 4811 1 74.66 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAG:1 - chr2L 19248124 3' - mdg1 7058 2 64.04 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAAT:1 + chr2R 18887046 3' - roo 8744 2 75.34 CAGATACCCCTTACTCGGCTAGTGTGAATGCGAAAGCGAAATTTCGTCAAGAATATACATATATACTTTATATAGTCGGAAACACTTCCTTCTGTCTTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATATCCTTTTACTCTACGAGT:1 + chr3L 25245595 3' - INE-1 543 1 77.24 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATGTGTGGGTGAACTGGGGTAGGTATATTC:1 - chr3R 21794003 3' + hopper 1410 2 79.23 CAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAG:2 + chr3R 10737086 3' - F-element 47 1 57.53 AAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTTTATTTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTAT:1 + chr2L 20133050 3' + 297 6888 2 79.58 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCAGAAAAATGTAAAAGTTAAATTCTGTTGCATGAATTTCAGCGAGT:1 + chr2R 9007119 3' + jockey 4908 1 77.40 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTCCAAC:1 - chr2L 10074453 3' - pogo 25 1 68.49 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCACACCTGGCTGTTTC:1 - chr2L 10074470 3' - pogo 31 1 60.00 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATGATATATAACTCTTTAAATATTTTAAGGGCGTGTTTTACTACCTAAACTAATAAATGAGGCATATATTTAATTCACCTCTCAAGACTTCCATGAATGCAATTCCTTCTCCGTA:1 + chr2L 13229285 3' - roo 8 2 67.12 TATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATATATAAACTAAAACCTTACGTAAACATAAAAAAGATG:1 + chr2L 22187558 3' - S-element 83 2 76.03 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACAAACATATACTTCGTAGTACTT:1 + chr3R 8197911 3' + pogo 2073 1 63.70 TGATTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTCTACCCCCCCTTCCCACTTGCAAA:1 - chrX 18060072 3' - gypsy11 3936 1 83.33 TTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATT:1 - chrX 3533849 3' - 17.6 6957 1 65.28 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGAAATATTCGAAAAAAAAGCGAATGAAAGAGAGAGAGGAAGAGTTTAAGGCTTTTTCCATTAAAACTTAAGTGAAAGGGCTTGTCTGACTGAGCGATATTGATAC:1 + chr2L 9704913 3' - roo 19 2 72.60 CCCAAAAACAAAAAGAACCGTTACATTGAGAGAGTAAAAATTTTTTTTTTGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCAGCTCTATATCGGTTAAGTTTTCATTATTTGAGGGTCTATCAATTGACA:1 + chr3L 21442140 3' - Tc1 156 1 67.83 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTAACCAGTTCCGCCCAGCCTTCCGATTTCCA:1 - chr2R 23094837 3' + 412 7517 2 65.07 TCATAACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTG:1 - chrX 9205541 3' + hopper 1327 1 77.40 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAA:1 + chr3R 29288764 3' - BS 5074 1 68.49 GAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATG:1 + chr3L 25232906 3' - GATE 8293 2 59.50 GAACCGATCTTTTCTACGCATACAGTGATAGCAGACAACTTTATGTGGGCACATGTATGCTCATGCATTGTATATTTTGTGTCAATTTCATAACTTTGTCTGTTCTTGTTAAGTTTTTTAATTATATTTAGATTTATCACCTGTGA:1 + chrX 16617280 3' + 1360 136 1 54.11 GCTTTTATCGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATACCTAGATCGACTCGGCCATTGATCCTGATCGAGAAGTACATTAGGACTGTTTGTTGTAGATAGAGAATTAGTCAAT:1 + chr2L 21268618 3' - INE-1 149 1 65.60 AATTAATATTATTAATATTATTACTTCTTGGTAAATATAAAATATATCTTGTATTATGAGATGCCAATGTAAGTAAATAAGCCTTTGCTTCGCACTCGCCTATGGGGATATACCCTACCCTATACCCTATAAGTGAAGCAATCATA:1 - chr3R 21725611 3' - mdg1 37 2 60.96 ACTTGNCTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGACGATAA:1 - chr3R 23020770 3' + INE-1 576 1 69.18 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAA:1 + chr4 868714 3' + roo 8988 2 76.03 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGACCGCCGTTGTGTGCACACACACGAGCAGTTGTGTTGCTGTTGTTTTTTGTTGCTGGAAGGAAAACCAAAC:1 - chrX 2300556 3' + P-element 2873 1 65.77 TAAAAAAAAAAATATTTGAAAAAATGAAAGCATAATATGAAAGGGTAGCAACTTTTTGCATTTGTCGTTATCTTTAGTTCATAACTCACAGCAAAGTGATTTGCTATTTAAT:1 + chrX 8672851 3' - FB 176 1 73.21 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTTAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGGTTATTATTGTCTTAGATATTTAGGGTTTTTTTATGTT:1 - chr3L 9695915 3' - 297 6620 2 54.81 AACATGCAGAAGGAAGCGTTTTGGGCCACATTGCGCCAGGCACGGCTGAGGTAGTTCTGTCCACGATTGGCTAGGCAGTTTTTGC:1 + chr3R 4345400 3' + INE-1 34 1 69.41 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGGCTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAAATCTTTTTAATATAAAAGTGA:1 - chr3R 28438313 3' + mdg1 364 2 53.79 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAAC:1 + chr2L 5728931 3' - roo 8751 2 79.45 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGC:1 - chr3L 6131850 3' + roo 8990 2 71.23 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTT:1 + chr3R 4527277 3' + mdg1 350 2 65.75 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATACTTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACA:1 + chr2L 14056777 3' - pogo 57 1 58.90 CATTATACATATTTGTAATAAAGAATTCATTATTATTCTCATTTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTCCTGGCGGCTTCAGCTGCGCTATTGCCGCTACCTTCTCAGGATCCGTTCTAATTCCTTGATTCGTCACGCGGTGACC:1 - chr3R 3905898 3' - accord2 7523 1 56.85 ACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCACCGAGATTCG:1 + chrX 683630 3' - jockey 13 1 68.89 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAATTTGTTGTTTAACAATTTGGCCATAAAAGCCATAAAACAAAGCCTGAGCATTGAAACTATAATG:1 - chr3R 4527143 3' - mdg1 7053 2 74.83 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTATGTAAGCCCACTCACAGAGGACGCCGTGGATGTATGGGTGTGTAGGGTCTGAAATTTTGCACACATTTACAATAATTGTAAATG:1 + chr2L 17574654 3' - hopper 30 1 63.70 ATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGA:1 + chrX 22862356 3' - jockey 95 1 77.40 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATGTCAATCAACAATTTGGTGCAATAATCTTTGGGAAATCATTTTCGGTGGCATTTTCGTGGAAATCGTTTAGCATTAATAAAACGCAAATAAAAA:1 + chr3L 5027317 3' - roo 28 2 36.99 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATATTTGCAGCTGCAGCAGCTCAGAGGCG:1 - chr3R 22320439 3' + roo 394 1 70.73 ACTCAACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCTTCGTATCTCACAGCTGCCCATATCCTGTCCAACGCAT:1 - chr3R 13254850 3' + roo 9056 1 73.29 CATAAGTACACAATAAAGTCATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCCATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAA:1 + chr2R 4181291 3' + accord 450 2 78.08 TATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAAT:1 - chr3L 9324415 3' - HMS-Beagle2 6899 2 71.53 AGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTC:1 - chr2R 8966145 3' - BS 5042 1 52.63 TCCTCCTTCCACCCTTTAGTCGCCTTTTACGACTAGCCGAGAACGCTGAGTTTATACAGCCTGTCCCCTTATAGTCGATACTTCAGTTCGCTCGTCTTATTTTCCATGTCTCTTCTCTTTCCATCGTTTCCTCCGTTCCACCGCGC:1 - chr2R 5205429 3' - Rt1b 4898 1 69.86 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCACCAATACTCAGTAGTATAAGGCTGGCCAACTG:1 - chr3R 8563494 3' - 297 6598 2 69.06 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTTTGTGTGCTCAGATCTTGAACGGTTTGGCATTTCTTTTGTCTGTGCACCGGCGTTTACTCAATTTCATT:1 - chr3L 2966437 3' - roo 8716 2 54.79 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACCACTTGGCAAATGCAAATAATTAAATATATGATGATTTCACC:1 - chrX 8314457 3' - roo 36 2 61.17 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTT:1 + chr3L 20061427 3' - roo 8733 2 66.44 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTCCCGAAGACTTAGCTTCTTA:1 - chrX 22679629 3' - Doc 58 1 45.38 AAGAGCAGCGTATATATATATGTATAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCATGGATAAAAGCTACTAACCGGCGTGGCGG:1 - chrX 8479394 3' - blood 191 2 69.70 AGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACA:1 + chr2L 12932206 3' - opus 7147 4 62.32 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGAAATGCCGAATGATGATGGGCAATATTCTGCCGTTGAATATTTTCCTCTTTCGAAAAATCTTGTTTTTCTTTCAAACTGTTTTTCTTTTTTT:1 + chr3L 15591494 3' - Doc 47 1 52.05 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGC:2 - chr2R 12492410 3' + hopper2 1549 1 55.86 AGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATG:1 - chr2L 15019890 3' + BS 5016 1 69.86 ACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTG:1 + chr3R 22647905 3' + transib2 2767 1 68.03 AAATTAAAAAAAAAAAGAAAACAGCGTTTTAGGGCCAGCTCTACTTTCATGGGCCTCATAAAAAGATTATAGATAGAAAACAGTCAGTGTGACAAACCTTCATTTGAAGTAGGCAGTGTGACCATGCAAATGCTAGAATGCA:1 - chr3L 8012551 3' + Doc 4699 3 83.80 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTAAAATGTCCTAGTCCAAAACACCGAGAAGAAGGAGTAGC:1 + chr2R 16274623 3' - roo 8743 2 74.48 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATCCGATTGATGCATTG:1 - chr3R 11516466 3' + roo 9051 2 73.79 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGC:1 + chr3L 2532521 3' + blood 7311 2 71.92 TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAGTTGAG:1 + chr2R 16567370 3' + opus 444 2 64.75 TTGTGAATTAAAGATTGTGAAAATAAATTGGAAATAACCTTTTTTCACCTTCTTTGGGAATTGTTTTTTTTTTT:1 - chr3R 13824100 3' + copia 314 1 79.73 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGAAACCGAGAAAATGCCAGAGAAGTGTGTAACATGGTAAAAGCTCGCGGCGAAATGTGCGAGACTGAGAAGGCTCAGCTCTCTCGTTTTTGCAT:1 + chr2L 310189 3' - P-element 6 2 75.81 TTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACTGTGCAGCGGCCGATCTCGCTTCCGTTGTTTACGGGCAGTATAAGAAAGATTTTTGTCACTTAAATTAAGTCTTAAGCTGAGATCAA:1 + chr2L 22076768 3' + transib2 2782 1 56.85 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTTTGGCGAGCTTTGCAATCCAATCA:1 + chr3L 14422872 3' + roo 9053 2 71.92 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACCGTGTAATCGCTGGCGCGCCACGCCCCCCGCCCCTCCCACTGTCACGCGC:1 - chr3L 17400770 3' - 412 59 2 60.90 ATAGTCTTTAATATTTGTAATTTAAAAGGTGAAAATGAATTGTAACTTCTTTAAGAGATCGCATCTTATACATGTTCCAAGAACAATGTCTGAATGAATCCATTCACCAGGTCATTCTCTACTCTTCCAAGTGACACATCTGCCCA:1 - chr3L 1320686 3' + gypsy7 5093 1 86.30 AAAAGAGACACGTGAAATTNTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGGAGAGTTAGTTACCTTATATGCGAAGTTACATATACGCACCAATTGAAAGTG:1 - chr3L 4547648 3' + mdg3 213 2 62.33 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTT:1 - chr2R 5179592 3' + 1360 3316 1 70.00 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTGTCCGCTGTCCATTCCGCTATCTCTTTCACTCA:1 + chr3L 5051185 3' + flea 242 2 76.30 GTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTGGCAGTTTGTTGGCATTTGTTCGAAAGGTGTACAATTTTATAGTCGT:1 + chrX 21668431 3' - Stalker2 7263 2 72.86 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCATGCTCCGCTTTTAATAAATTGTGCTCTAACCCAGCATTTCTCTTTCCGCGATCCAAATTT:2 + chr3R 18294963 3' + copia 243 1 72.60 CGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAACCTATTAGTATACACTTTATCCTTCAAACATCTTAAAAGATCAGCAGCT:1 + chr2L 4245028 3' + 412 480 2 71.23 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAATATTTATCGCCCGTGTTTTCGCTCTCCAGTTTGATG:1 + chr3L 6131971 3' - roo 8684 2 72.60 TAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTAATCGG:1 - chrX 15746258 3' - jockey2 3238 1 58.90 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGG:1 - chr2L 14262975 3' + P-element 2842 1 35.29 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAAAGGAGATTATGGAACTAGCAGATACCCTATTCACAACCAATAGCTTGTGTAGCAAAGATTTAACCGGATCC:1 + chrX 860896 3' + hobo 2892 1 48.97 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTATTC:1 + chr2R 17650678 3' - pogo 32 1 64.83 TATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTT:1 - chr3R 8112705 3' - Burdock 6197 2 60.96 ACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATCCAGTTGTGGGAATGTACTGCAGACTCGCGACAACG:1 + chr3R 7049436 3' + Burdock 182 2 76.81 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGAATGGCGTGACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTCAATAATATGGCATGATGTCAGATC:1 - chr3L 23219255 3' - 1360 60 1 75.23 GTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTACTGCTTACA:1 + chr2L 21400819 3' + Doc3-element 4690 1 35.07 AAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTCAATAATATGGCATGATGACAGATCCATTTCGTTCTGCTTCA:1 - chr3L 23219238 3' - 1360 80 1 72.60 TCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAGTTTTCTTTGTTCATA:1 - chr2R 961128 3' + transib2 2666 1 57.53 ATCGCTCATTAACCAACAACTCCGGCATTCTGTCGTTAATTTTATATTTGATCATAGCAATCTGAGTCCCTAGGCCAATCGCATTAAGGAAGACAGTCATCTTCATTTTTGCTTCAACTAAAAATGATTCCGGTCTTATAGCTAAA:1 + chr2R 5581268 3' + gypsy3 161 2 69.86 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTC:1 - chr3R 19506731 3' - mdg3 58 2 59.26 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAAAACGTCTTCCTTACCCAAGCTTTACTTCCAAAAATATATTATTTCAAT:1 + chr3R 12376543 3' - HMS-Beagle 6826 2 64.83 TTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTCGGCTATCCTCGCGTGTTGACACTGACTGCCTC:1 + chr2L 21645308 3' - 1360 8 2 62.33 TTTCGTTTTTGTGTTTTGTTTACTCTCCCTCTTGTGCGTTGTTTGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCATGTTCGTTCACATAGAACTTTTTCACATAACGTTTGTGACAGCGACAGCGAAGACGGCTGGAGTGCGAGAAGAG:1 - chr3L 23933557 3' + Cr1a 198 1 76.03 CGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCT:1 - chr3R 20887386 3' - Doc 32 1 55.65 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCC:1 - chr2R 9376668 3' - hopper 19 1 68.12 ATAAAAAAAAACAACTAAAAATCCTTTAAATTTCAAGTGCAAAACCATTCAAAAACGTTGCCAAGAAACGCATAATTTTTAGCCACCTTTGCTAGTGATTTCAAATCACTTCGATGAATATTT:1 - chrX 11650990 3' + Transib5 27 1 52.85 AAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTT:1 - chr3L 19951163 3' - Ivk 40 1 58.22 AATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCA:1 + chr3R 16630342 3' - FB 72 1 70.29 AAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTTGAAACATTCTAACGTGACTCTCCTAACAAAACATACTGTTGCAAAACCTGTTCTAAGCTAAACT:1 + chr3R 25471760 3' + Bari1 1654 1 53.79 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGTTCTTTCTGATCGTACAATTCTGT:1 - chr3L 18216437 3' - 297 6604 2 70.55 TCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCCAGAAGGTTGGTTTTTTTTAAAGTTCTGGATTTGACCTTGGGTCTACAGTTCAATT:1 - chr3R 17077768 3' - 1360 18 1 73.29 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACATACAGTTGATGAATAGA:1 - chrX 6891397 3' + hobo 2927 1 77.40 TGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATCC:1 + chr3L 11826018 3' - X-element 74 1 60.27 TCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTAACTGATGTGC:1 - chr3R 15003086 3' - Doc 33 1 65.07 ACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAGAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAAGAGAGAGAGTCGCCACAAATCTAATATATCCACCACCCAGTGCACCAGTATCCTCA:1 - chr2L 18686149 3' + Gypsy6A_LTR 248 1 42.47 ATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCATAAGAGTTGGTGGCAGACTGAAGCACTCATCGTTGGACTATGACGCCCATAATCCATTAATATTGCCACGTCAGCACCTAGTCA:1 + chr3L 25441658 3' + 412 7497 2 74.36 CGGGGAGTAGTTAACTGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGATGCTCTTTATTATGTATG:1 - chrX 21772487 3' + gypsy3 6568 1 56.47 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATTTCTAATGCACATAAACGTTGGTGCCAGTACATAGTGCAATATGAATG:1 + chr3R 20983986 3' - hopper 24 1 65.00 TATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAGTCAATTTTGAAGATGTTTTGCATACGCAGCCGTTGCAAC:1 + chr3R 22320587 3' - roo 8700 2 60.00 AGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACA:1 + chr2R 18931919 3' - blood 60 2 56.85 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAGCGGAAAATTCAACAGTTGTGCAGAAGC:1 + chr2R 9376756 3' - hopper 38 1 59.31 CAGACAACTTTATGTGTGCACACGTATGCTCATGCATTAATACAAGTCTGTCACGGTAACATTCTCTCTGAAATGTTGTGGGCAAGTTTCCTTTAAAATTACTAAGGAACTTATCATTTGTATGTTTCTTTACACATTTAAGTA:1 - chr2R 3066634 3' + 1360 167 1 73.61 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTCAAAAAGTATGTACCCAATTTCGCTCAGTCTAATGAGCCACCCTAAATGACTTT:1 - chr3L 7787436 3' - flea 4782 2 66.44 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAAT:1 - chr3L 15148572 3' + roo 9029 1 51.85 CTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTATCAGAGATACAAAACATACATTTCTTTGTTGCATTTATATATAATATATA:1 + chr2R 21958509 3' + 297 328 2 65.75 AATAAAATTANTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAAT:1 - chr3R 29627858 3' + roo 9033 1 57.14 TCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGCACATGTAGATGGCATATCAACGCTCTGCACGTGAAATGGCGCCGATATTAATGGATTTATTT:1 - chr2R 15474454 3' - Quasimodo 49 2 56.16 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATCAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTCTGCG:1 - chr3R 12078581 3' + hopper 1389 1 65.22 CTATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGA:1 + chr3L 11825999 3' - X-element 92 1 72.41 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCTAAGTAAACTGCAACTTTCGCCCCATTCGCCCTTTTAAATCAAATCATGAAATCGATGTAGGCATCTATTTGATATCCTTATAAGTGATCTCCTTGTATAATTT:1 + chr3R 28377097 3' + jockey 4967 1 69.86 GTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCAATCAAATTGTGCTGCCATACAAATTGTTTACTGCATTTT:1 - chr3R 21925049 3' - hobo 9 1 76.43 CATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATAGAAACACACACAGGCACACTGCGGTTGTTTCGGGAGATTTTGAAAAATTCATTTACTGCGTGCCGTCATGAAGAGATG:1 + chr2L 15516803 3' - 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P-element 14 1 75.86 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAATTTTACCTGAATGTTTCGGCTTGAA:1 - chrX 17884457 3' - pogo 16 1 69.18 TAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGG:1 + chr3R 31112260 3' + mdg1 7443 2 52.38 ATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTG:1 + chr3L 171555 3' - Doc 4474 1 67.12 TACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGCCTTTGAAAAATGCTGACCCGCCC:1 + chr3L 5910584 3' - BS 5056 1 55.48 CAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATAAACAACTTTCTTTGTTCGCTTTTATTGCAAACCAATTA:2 + chr3R 12948739 3' + Stalker4 386 1 71.92 AAATTTGCATATTTGCGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGCCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCAGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCTCTGACTGCCTCA:1 - chr3R 29283164 3' + hopper 1374 2 54.86 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCAAGGCTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGT:1 - chr2L 310096 3' + P-element 2830 1 23.08 AATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAGTAAAAAAACTAGGCAGAAC:1 - chr2L 21795713 3' - HB 82 1 58.62 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTAAGAGAACTGACTCTCG:1 + chr2L 544966 3' - Doc 4 1 73.08 CGTTAGATGGTATCTTTAGAAGATTTCATTTTCCTGCCGTATATAATAAAACCTCCTCATACCCGTTACTGGTAGAGCAAGAGGAAAACTATGATTGATTTGAACTTAACTAATACAATTGGTGGTGTTTAATACTGTCGGATGCG:1 + chr2L 23181422 3' + Rt1a 5032 1 54.79 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGATTTTACACAGCTGCTCGCCAAAGTTTTTAACCCGGCCAAACAGGCCCCAGAATTTTTCTACATATTT:1 + chr3R 28014193 3' + roo 9013 2 61.15 TGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCT:2 - 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hopper 9 2 28.08 GGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGGACCAGAAGGCAAGCTGAATTTTTCAGGATATACATAATCATAATTGCGATACCTTGCTCT:1 - chr2L 11867249 3' + hobo 2920 1 68.28 GTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGCGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTAAAAAGCCGC:1 + chr3R 17243263 3' + hopper 1403 2 72.60 GAGAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCC:2 + chr2R 4261952 3' + invader4 2966 2 67.12 CAAAACCGCTTACGCAGCTCAAGTTCTCGGCTGATCAGTACCCATGTGTGATCCACTCAGGAGAGAAAATGAAAGGCTGTATGCATGACCGACGTGTCAACGATATTAAAATAAATAACACTTAATCGCA:1 + chr3L 26640361 3' + Quasimodo 225 2 52.31 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGAGACAGGCAGAAAGAATAGAAAGAAATTTGGGACGCTTG:1 + chr3R 27707140 3' + P-element 2838 1 48.91 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAATGGTTGTGATAGCGCCAGTAAAGAGCATAATTTATAAGCAGCGAGTCAT:1 + chr3R 25798457 3' - 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chr2L 15019867 3' + BS 5040 1 53.79 AGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAAT:1 - chr2L 8284381 3' - Doc 433 1 69.35 GCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTTCAGTTCTCTGGTCGTGAGGATATTGACTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCA:1 + chr3L 12890381 3' + hobo 2869 1 65.47 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACACAGGGGTAGTCAACTATATAAATAACGACAAAGAAAAAGGGTTGCACAGAGAAAAAATTACGTTTGTTAATTTGTTATTAT:1 + chr2L 3893102 3' - 1360 30 1 60.00 AAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGGGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCCA:1 - chr3R 8112698 3' - Burdock 6190 2 56.16 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTACATTTGCATTCCCCTTCCTTCATATTGCTCAAATTTTTTGTTTTTGCT:1 + chr3R 7625429 3' - hopper 18 1 68.46 GTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTATAAAATTATTGTTATCGATGCTTATTATTTATTTTTTTGACGTTAAGTACGATTACTACTGAATCATTGTGTTGTAATATCAACACTAAGAAACAAATTGAATTCT:1 - 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BS 81 1 73.97 TTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTCTGATCTCTGCTGCCTTTTCGGTCCGGCCTATTTGTGTCAGCCAACGGTTC:1 - chr3R 27606556 3' - 412 8 2 70.29 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGACGAATAATAACTTCGT:1 - chr3R 11089708 3' - I-element 18 1 73.33 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGCTTACTGGAAGGACTCGCTGAAGATCCTGAAGCTGATCGTGACCC:1 - chr3L 9635265 3' - Doc 14 1 61.48 TGCAAAAAATACTATCTTAATAAAGGTTTTTTTTATTGTTTTTTTTTTACAGCTTTTACCGATTGAAGAATGGATATTCCCACCATCACACCTCAGGACTTCGATTTAATAGCCGATGGGCAAATGAGCAATAAATTATGTACGC:1 - chr2L 14285723 3' - Transib-N1_DM 62 1 48.28 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAGTTAT:1 - chr3R 18832333 3' + roo 9040 1 57.14 ATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATGTGTGGGGGAACTGGTG:1 - chr3R 21794014 3' - 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chr2R 5953775 3' - roo 8684 2 68.22 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACTTGCAATTTT:1 + chr3L 2317252 3' - 412 7085 2 59.85 GCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACG:1 - chr3R 28438337 3' + mdg1 351 2 69.40 GTATATTTGTATATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATAAGCTACAATGTACTGGTCCCGTACTCAGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Stalker4 89 4 97.14 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATCCGATTGATGCATTGATTTTTATGT:1 - chr3R 11516456 3' + roo 397 1 78.77 AAATATCATTGATTTATACAAAATTCCACGGGCAACGTTTGGGGTTTGCTGCAGTAAAGCGAACTGCCCCGTACTGGCTGCTCAGATGATTGTGCAATTCCTGAAGGCAGCTTTCGTGCTGCAGTCTCTTCACGTTCTGAAGTTGT:1 + chr4 803256 3' + Tc1-2 433 1 71.23 CCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCGATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAGGTGCGC:1 - chrX 15198028 3' - Max-element 55 2 53.42 ATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCTGTAGCTCAACTCCCGGAAGTCAGTGGCAGCCG:1 + chr3R 27452094 3' + hopper 1382 1 59.26 AACTCAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCACAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATATATATAGAAACAATAGTTTTGAACATCATCTTAAACCTATGTTTTGGT:1 + chr2L 6618991 3' + 17.6 7349 2 69.44 GATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAACAA:1 + chr2L 22684610 3' - transib3 50 1 54.07 TATATTATTATTGATCAATTGACACCATGCAAAAAATAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTATTATTTGAAAATATATTAGAAA:1 + chr3R 18066415 3' + 1360 257 1 73.29 AAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGGTAAA:1 - chr3L 27415199 3' + transib2 2778 1 52.74 TGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACACCTGCAACGAATTTAGATAATTAAGTT:1 - chrX 13091017 3' + P-element 2846 1 56.16 GCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCTCTTGTTTTTTATATGTATATCCCACAAAGGCGGCTGCCAGAAACATTCCAGCAATAATTGAATCTCTCGATTGCCAGTTTGCTT:1 - chrX 10445516 3' + INE-1 534 1 76.71 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTGGTAAAATTGCTGGGATCGGGGG:1 - chr3L 2532399 3' - blood 7028 2 71.13 GCATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGT:1 - chr3R 24480490 3' - blood 7105 2 80.14 TTTTATTGTTTATTATTAATTTCTATTTCATAACTATAATTTCATGTATGTAAGTAAATTTGACCTTAAGAGTCTTAATTTTTTTTATTTTCCTCTGAAATCTTTCTAACAATTTACTAATTCAATTTGGTAAGTAAATTAGTAG:1 - chr3R 17129040 3' - flea 239 2 51.72 ATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATTCAAATACAGGAATAAGAATACAGGAAACGGACAAAATGACAGACTCTGCCGCAA:1 - chr3L 25691431 3' + mdg1 7266 2 68.49 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAA:1 + chrX 14360820 3' - jockey 96 1 76.03 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTAACGGTTATTC:1 - chrX 3382307 3' + pogo 2044 1 60.42 AGTGTTTTGTGTAAAGAGTTTCTTGACAGTCTCAAAAGTGTGTAAACTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGATTATATAATATCTTTTTAGAGGTATATAAGACTCAGTTGCTTCCTTATATTTCCTATATGTGTCATGGCTTT:1 - chr3R 4496157 3' + S-element 1496 1 57.24 TTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAAAAATGTTAGTACAATCCCGACTTTTATTGACCTTTGTCAACTTTACCCTCCTCACACTTTTCAAAAATGACGAAAGGTCATTGGTAAGTAACTT:1 + chr3R 11076278 3' + I-element 5327 1 63.01 ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAGTCCACAAAATAAACACTTGAAGCTCAGTTTTATTTTATTATATAT:1 + chrX 2214352 3' - jockey 4572 1 71.92 TGGGTATCACAAATTTGGGAGTTTTCTCAGGGCTGCCCCTGGACCCGGAACGTGCCCCTCTATGTTTGTCTATTGGTTGGATGGCTCCGTTGCTGGGCGCTAGCTCGGCC:1 - chr2L 14965270 3' - P-element 271 1 80.00 TTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGATACTTCTTTTATTAAATATCAA:1 + chr3L 12227867 3' + opus 7425 2 70.55 CCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTGTTCGATGTTG:1 + chr3R 2520365 3' + Tc1-2 1622 1 73.10 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGG:1 - chr3L 1463675 3' - P-element 97 1 18.49 AAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCT:1 - chr3R 15283649 3' - BS 5070 1 66.90 TTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGCAAAGAGCATGGTGATAAAGGGGAGGAGGGGAGGGGTAGATGGTTTGGATAACGATTGCACGTATTTGTGGTGCGT:1 - chrX 7319837 3' - jockey 4820 1 52.78 AGATACTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGG:1 + chr2R 10977172 3' + roo 358 2 67.68 CGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCCAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAAAGTTTAATGTGCGCTTTGGATATGAAACAT:1 - chrX 21097011 3' + INE-1 136 1 62.33 TGACACCAAACCGAGCAGTTGATTTATTTAAACCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAA:1 - chr2R 12185332 3' + accord 7236 2 67.81 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTTTTTCATTCTCTGCGGCTGCATATGCAGATTGATCGCTGGGAAA:1 + chr2R 14415557 3' - 297 6620 2 57.53 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCAAAGGGCAACTTTCATGTC:1 - chr2L 17019082 3' + 412 7495 2 62.50 TTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCATTTTGCC:1 - chr2L 20628520 3' - Stalker2 7273 2 34.25 GGGAAATCGACTATAGCATTCTCTATTGTTAAATATTGTCTCATTTTATTCCCTAATATCTATTCATATCCCAGAAAAATTATGATGATGATTCCGAAAAATAAAACAAAAGTCATTGCTAAAACCTGACCACAGAGTACATTAT:1 + chr2R 4886040 3' + INE-1 572 1 49.66 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTG:1 + chr3R 7074865 3' + P-element 2807 1 24.06 GAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATT:1 + chr3R 10736163 3' - McClintock 5962 2 73.85 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCTG:1 + chrX 3811674 3' + P-element 2812 1 33.79 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCCATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACC:1 - chr3R 5870792 3' + roo 353 2 54.11 ATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGT:1 - chr3R 20887394 3' - Doc 62 1 55.48 TGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCCATGTCATGGAAATATGACAATACAGATATACAAATGACTTTTTCATTTTCCCAC:1 - chr2R 4012505 3' - F-element 299 1 62.33 AGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTAG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 7568 2 64.62 CGATATATTGACATAAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAACAACGACTTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGGCAAGGCGGAGCGATGAGCGTTAATAATGCGTATAAA:1 - chr3R 22647806 3' - transib2 40 1 56.94 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATATTATATATGTATGTATATACTAGTAGCAAAAGTTGAAGCATCCCATGTTGTGTACTCATGTCAATGTCCCGGCCATATCC:1 - chrX 17926569 3' - pogo 37 1 60.27 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTGGGG:2 - chrX 22679600 3' - Doc 45 1 58.22 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAGATACTCAAAGAATACAGGGAATTACTTT:1 - chrX 13060137 3' + Tabor 479 2 75.86 AGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCA:2 + chr3L 9318090 3' - P-element 2869 1 58.82 GAATGCTAAAGTCGAGTTTCCCGACTGTCAGATATCAGCTACTCAGCTAGTGTGAATGTGAACGCAAAATTTCATTATTTTTCTGGGATATCGATAGATATAGGGGGGGGGGAGGGTTAAGAAAGAATGGTCGAG:1 + chr3L 23974830 3' - INE-1 571 1 71.85 TGATAGTGCTGAGCTAAAGGCTTTGTTCGACGCGATATGAAACAATAACAAGACCGAGTTGTAGACTCCGATAAAAACTGCGGTAACGTCGGGATCACCAAATGTTTATGGGAAGACAACCTATATGCCAGCCTTAGAGTTATAAA:1 - chr2R 529320 3' + Dm88 451 1 41.78 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTTCTGATTGTTTG:1 - chrX 291951 3' - 412 7076 2 69.86 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGGGAAATTCGTTACCTCATGAAACCGAAAC:1 - chr3R 12341086 3' - Tirant 10 2 64.52 TCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCT:1 + chr2R 21713297 3' + P-element 2791 1 13.10 GGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATACAAGCA:1 - chr2L 18311423 3' - opus 7164 4 63.24 ATGTGTGTGTGTAGGTTCATGTTAATTTCAACGTCGAGAGCGTCGCCACCACGCAGTATGTGTATGTATGTGTATGTGTATGTGTATGAGTGTGGGTAAAGAAAGGATGTTTTTGCTTGTGTCTGCTTGTTTGCATGCGCTTTTCT:1 + chr2L 1661613 3' - accord 7094 2 60.27 ACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTCGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATAGCATTATTTCGTTGTTAAATATGCATAAGACTCAGAAATTCTTGAAAAAACAGATGGT:1 - chrX 20145506 3' - Bari1 64 1 58.90 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGGCAAATGCATCGCA:1 + chr2L 17019189 3' - 412 45 2 56.94 ATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGATTAGTGAGCTGCAATGCAATGGTGGTGCCGGGTAACATGAAGTGGGTGAAGGCCTCTGTA:1 - chr2R 13356741 3' - jockey 4847 1 60.27 CCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATATCATTTAGGGATCTTAACTTTTTTAACTGAAA:1 + chr3R 5165001 3' - invader4 2842 2 77.40 AGGAAACCAGTTTGGGATTAGACAGTCATTCGGTGAAGAGCAGCACATTTGCAGATGATTCACAACATTTGTATGAATTCGAATGCTAATGCACCTCTTTGGAGTTATATCTGCAAAGTGTGTCATGTATGGACCCCGCTTCAAC:1 + chr2R 25002039 3' - Rt1b 4822 1 75.17 GTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGTACATATATGAAGAAGTAT:1 - chr3R 19965166 3' - jockey 17 1 78.77 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAAGTGGA:1 + chrX 17792605 3' - roo 75 2 71.23 GATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGA:2 - chrX 3533902 3' - 17.6 7002 2 80.82 TGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCC:1 - chr3R 12613744 3' - HMS-Beagle 6820 2 64.84 TCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTAACCTAAGTACTTCATTCACTTAAGAGTGTGTAAAATAAGTAGTTTCATACATTATAT:1 - chr3R 13868866 3' + HMS-Beagle 234 2 70.55 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAAATATGCACGCTCAGGAAGGGATTTCAGAGGC:1 + chrX 21639386 3' - 412 88 2 78.08 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTGTTTAATTAAATATTTAATTTTATTGAACAGTTTAGCGCGTGTTATTTCCAGCCGGAATTTATTTGTATTTACGTTGACACACTGTAACAGAAAGCTGAACTG:1 - chr2L 18510677 3' - copia 18 2 73.97 AGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAATCGAAAAACTCATCGATGGAAGCC:1 + chr3R 12146745 3' + gypsy10 300 2 52.76 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCAGCGGGCAAGCAAAATTGCATTGAGATAGGTCAGTCACACACTCACACAGACACAATCAGACGAGTGCAGCG:1 - chr3L 17500682 3' + Tirant 8484 2 70.34 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCATCCGGCACCACCGATTTCTCGGCACCGTTCAAGCCCACA:1 + chr2R 14009098 3' - 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412 7085 2 62.76 TTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTCGCTTGTGTGTGTGTGTTTGTATCTGTTGGCAGCGCCTAGATTTATGCAGCATTTTATTTAAATTT:1 + chr2R 19108569 3' - jockey 102 1 54.17 TGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGACTATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACATATAACGACGCGAAATAGTTCA:1 + chr2R 954555 3' - Quasimodo 52 2 56.55 CGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAGTACCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTCTTTTGATTTT:1 + chr2R 22739645 3' - hobo 64 1 70.31 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAGTATTCTCTATAATTGTTGTACTCG:1 + chr2R 9453415 3' - roo 21 2 70.34 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGATACCCACGGTGTCGCAGCTGGATCTCATCTTAGGATTGGCGAAAATCTGCTGGGCTCCAATGCGTATGGTA:1 + chr3R 25158874 3' + 1360 3358 1 45.67 TAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTTCAGACAAACTTGTGCGCAATTTGGAGCCA:1 - chr2L 4864353 3' - mdg3 37 2 57.14 ATTTAATATTATCTTAATCGACCGCCTTTCATAAAATGGGTTTTCAAATAGAGCTGTAGTCTCCTAGAAACATATGCGAAAATAAAATGCAAGCTCCAATTCATTTCGTTGCATTATCAACAATTTAATAAACGTGTATACAGCAA:1 - chr2L 17550615 3' + Transib-N1_DM 439 1 79.45 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGTGGGGTGTGCGCACTGCAGTCACTCGACTGCTGCAGCT:1 - chr3L 1463638 3' - P-element 31 1 55.56 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTG:1 - chr2L 10461106 3' + roo 387 2 68.84 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTNAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATAAATGAATTATTAAAACANTATTCATATAAATAATTTAGTATATTAAGCTTTATTTATCTGCG:1 - chr2L 13229090 3' + roo 9019 2 56.16 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTTTGGGTATATGAACTTGTCTTG:1 - chr2L 18525567 3' - pogo 25 1 68.49 CATAGTTAGATCTACAATGATTTAAGATAAGGGGTATATAGTTTCTATGATATCGAATGCATTCTGCGCATCCTCCAGACAGGACTTGCATATGGTGTTGGACAGTGGATCGTGCTTCTCAACTTGCCAGCCCGTGCACTTGTATA:1 + chr3L 21489925 3' - Cr1a 4151 1 71.23 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAA:1 - chrX 9165344 3' - jockey 4835 1 67.83 CTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGTTACTAAAAAATCAATAATAACCAACAGTTTTGTATTAATTTCAAATAT:1 - chr3R 13559929 3' - jockey 4777 1 75.17 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATTGCCAGCTGCGCTCTTTGGTTCCAC:1 - chr3L 18183031 3' - Tirant 8117 2 80.14 TGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCACGACAGTCATTGGTGATTTTGCCTGAGG:1 - chr3R 31114226 3' - flea 4780 2 66.44 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGC:1 + chr2L 11617814 3' - 412 7095 2 56.16 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGC:1 + chr3L 8249472 3' + mdg1 383 2 55.00 CGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACAT:1 - chrX 6891413 3' + hobo 2920 1 70.80 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCTTGGTCG:1 + chr3L 20680374 3' + 412 7486 2 56.85 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCAT:1 + chrX 13628836 3' + roo 352 2 54.79 CATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGCAAATGGTTTCTGTGACCCCATTGTGACCAATCTCTTGCAGGGCATATCCAATTCGAATACTTTCTATGA:1 - chrX 18745323 3' + Juan 4171 1 48.63 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGC:1 + chr3L 8249457 3' + mdg1 375 2 65.49 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACGGCGGTTGGGTGGCTCAATCACGAATTGCCCTGTAATGTATGCTACGGTTTT:1 - chr2R 22523160 3' - jockey 64 1 60.15 ATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTG:1 + chr3R 17243208 3' + hopper 1351 1 62.24 AAATAGAAAAAAAAACTGAATAAAACGCCGATGATAATGGCGCTGGTCTCGCACACTTTTTGTTTTAGCACTCTTCGCTCAGATATTACACATACGCACTGTGATAGCACCAGAAAATAA:1 + chrX 12868410 3' + invader2 294 1 76.67 TAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATATAAAAATTGATGCCCGTTGAATGAAGTATAATGCACAGGGGTTGCCATTTTGGTG:1 - chr2R 13090866 3' - I-element 58 1 59.29 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGGGGCTTCTCTATGGCATCGGCATCAACGGCAGCAAAACAGTTTCCGTATCCGCCAGCCGCCATT:1 - chr3L 17135366 3' + hopper 1406 2 70.87 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAGAATCGGCCTGGTCAAACCGCAATCAGCCAGGCAGGTAATCGAAGTAAAGGGCACAAATCCCCCACACACATGGGTTACTTTGT:1 - chr2L 19341456 3' - FB 12 1 72.50 CATTAAAGCTAATGGTATAATTAGGTATTTACAGTGTTTAGCTAAGGCTTTCATCTGAAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAAAAAAAAAGAGTCATTATAATACATTTTGTTTAAATAAACTCGGTAATATAA:1 + chr3R 556471 3' - Juan 4163 1 64.38 ATAGATCCGACTGGGTCGCAGTACACATACAAACCCACTTAATAATAATAAAGAAGAAGATGGCAAAAAGGGCTCTAAAACACGACAACAGCTTATGACTGCAAAATCGTAATCTTAATACCTATGTATGTGACAGAACGGTGTAG:1 + chr2R 3123038 3' + baggins 5405 1 71.23 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTA:1 + chr2R 18887058 3' - roo 63 2 67.38 AAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTGGACCAGCAGCTGAGCGCCGGAGA:1 - chr2R 23443986 3' - P-element 95 1 21.23 TTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATAACAAAGA:1 + chr2R 3146367 3' - rover 63 2 61.64 GAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATGTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAACGCTTTAAATTTTAATCTT:1 + chr3R 18477823 3' + 1360 3322 1 78.76 TTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTACGGTTAATAAATTTACTGATCAATATTACTCGTAATTTGTATATATTGCAAACAGTGATTGGTCAAAACCTCGTTAGTTATTCCGGAATGAGATTCAAATATACTTA:1 - chr3L 11904721 3' + copia 243 1 72.41 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTT:1 + chr2L 11867383 3' - BS 43 1 49.32 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTG:1 - chr2R 18886920 3' + roo 397 1 76.26 TTTAAGCTACACATTAGGTGAAGTTCAGAAGAAACTGAACGATTGCTAATGAATAATAAATAATTATAATTAAAAGGCTTATTTGTCACATTTTCTCCATTTATTAGAACCCATCGATCCACCCTCGTTTTTCTAGCTTTTTGAGT:1 - chr2L 15203998 3' + G5A 2780 1 80.14 CTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATATGTGTATATCTGTATTATAAACCCCACCCAGCGTTATCATCTGTCAACCAAAGTCGAAGTCCGACTTCGCCAGTTCTTCAGAAGCTTCAGCAGCCTGCGTGGCCGAAAA:1 + chr3R 27827318 3' + I-element 5345 1 74.48 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAAC:1 + chrX 7702814 3' - P-element 61 1 37.88 TAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTATAACGTCACACGCTAGAAGTCTATAAATGGAAGGCTTCTTAAACACAGCCGCAGGCAGCATAGAATCAAAGACATTAGAATAA:1 - chr3R 4164276 3' - mdg1 7082 2 55.48 AGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGC:1 + chr2L 11867368 3' - BS 55 1 57.34 TCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCCAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAAAGTTTAATGTGCGCTTTGGATATGAAACATATCGCAATACATTTTTT:1 - chrX 21096994 3' + INE-1 154 1 50.34 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCA:1 - chr3L 14422697 3' - roo 8711 2 51.37 GCCTTGAGCGGAAGCAGTGCCTCAAGGAAATCAAGACGATGCAGGCGTAGAGGCCATCTGGCCTCCTTTTCGGTTTGAAGCAACAAATTGATAAGAGAAAACTTTATGTTTTTCTCGCTCTCCGTCGAATTGACTCTACATTTT:1 + chr2L 20310974 3' + R1A1-element 409 1 44.44 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGTATATTGTTCTTGTAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTTGAGGAAGAAGAAAAAAAGTTTGTTATGTAGTTGATTTTT:1 + chr3R 25860601 3' + hobo 2913 1 65.94 GCTTAAGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATACACATATATATATAGATATATGTATATGTATATTCTCACTGGACAGGGCGCACGCCTCATCATCAGCTCATC:1 - chr3R 27827165 3' - I-element 46 1 50.69 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTT:1 + chr3L 8824528 3' + transib2 2753 1 68.49 TCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCTATGACTTA:1 - chr3R 12046694 3' - Doc 12 1 72.60 TTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACT:1 - chr3R 10148724 3' + 17.6 430 2 60.96 GTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAACCAACCACAAAGTAAACCATATTTTATTTTAAGTAGTT:1 + chr3R 25597913 3' + copia 174 2 71.23 AAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTTTGTATAATTTTAATTAACAAATATTGCAGCAAATTTCATCTACTAAATTATGGATTACGTTGCGTATGCTTCATACGGTTTTACGGTTTGTTTTGTTTA:1 + chr3L 22257892 3' + mdg3 227 2 71.92 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAATGTAATAATATTCTAGTATCTTTGCAATCACATTATCGGGCTGTTCATTTTAGTCTTAAAAACATTGCAATGCAATGGAAG:1 + chr3R 13838593 3' - opus 7151 4 56.16 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATAGAAACACACACAGGCACACTGCGGTTGTTTCGGGAGATTTTGAAAAATTCATTTACTGCGTGCC:1 + chr2L 15516789 3' - Max-element 39 2 55.30 AAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCACTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACA:1 - chr3R 23644844 3' - diver 5928 2 57.34 AACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCT:2 + chr2R 14532077 3' + invader4 3035 2 52.05 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACCGTGTGAGT:1 - chr3L 22021608 3' - mdg1 7060 2 70.55 AAGCTGGTTTGATGTGTTTATGCATGTGCAAGATTGTATGTACAATTAGTGTAAGTATGTAAACGTAATATGAGAAGCATATTATGTTACTATATATACTTACGTAGTTATTAATTTTTGTGAGTCGAATAAATTATCCGTCAATA:2 + chr2R 3146360 3' - rover 70 2 65.07 TCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTA:1 - chr2L 14616180 3' - P-element 18 1 58.24 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATATTATTTCCTTTTAAATTACACTTTTAAACCCAACTAAATTATTTCTAGCCCAAATTAGCTTCTGGCATAGTTGAAATTAAGTAATC:1 + chr3L 14888892 3' - flea 31 2 64.14 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGGATGAGCAATGTCTGGATCTTATCAGTTCGGCAAGGACTGTCAGTCTGGCTACTTTCTAA:1 - chr3R 17627504 3' + roo 350 2 61.38 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTT:1 - chr2R 11153173 3' + roo 9032 1 74.71 TTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGATAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACC:1 - chr3R 20887400 3' - Doc 68 1 58.22 ACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACGCTCCTGCAAAACATATAGCACACTTTGGGGCATTGAGACCTTGGTTCTGGCCAAATTGT:1 - chr3R 25580759 3' - 1360 57 1 57.24 TTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCACAATTAAATTAATATATCTGTTTTAACTTTTTTTATGGCTTAAACGATTATTTAAATAAACAACGCTCTTATAAATAGTAATATTA:1 - chr3R 12764678 3' + copia 232 1 66.67 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCC:1 - chr3L 15148590 3' + roo 344 2 65.22 GGAGTTTTCACCAAGGCTGCACCCAAGGCTCTGCTCCCACAATTTTCTCTTAATAGCACACTTCGGCACGTGAATTAATTTTACTCCTGCAAGCCGAGTCAAAACTAAACTGACCAACACACACACACCCACACAAACACACACAC:1 + chr3R 27499994 3' - P-element 254 1 30.82 TGATCAGGATCAATAGCCGTGTCGATCTGGCCATGTCCGTCTGTCCGTCTGCTGTTTATCCAACCAATCGACAAATCAAATCACTAGCCATGGCTGTCCTGAAATTCATTTACTGTGCAAACGCCCCGTG:1 + chrX 152103 3' + INE-1 91 1 62.31 GTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTG:1 - chr3R 10148707 3' + 17.6 447 2 55.48 AGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAGGCTTAAATGATGTATGGTTGTGGCACCAGGGCCCTA:1 - chrX 14735751 3' - diver 5951 2 67.74 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCCTGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGA:1 + chr2R 18887035 3' - roo 8754 2 81.38 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTTGAAAGTGTATTTCT:1 - chr3R 19514233 3' + blood 7326 1 60.27 ATAGTCCAGTGCTCGAAACNTCTCCCAAAATAAGTTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCACCAATACTCAGTAGTATAAGGCTGGCCAACTGTAATAATGGAGCTTAGATAGCT:1 - chr3R 8563472 3' + 297 484 1 55.48 AGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGTGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGT:1 - chr3R 23020795 3' + INE-1 567 1 60.00 TTTAATTATTATTTGATTTTTTAGTTTTTTCTTCATAATTATGAAAGCTGTATAATTCTAGCTTAATATACTTTATTATTCCATAGGATTTTCCAACAATTAGGAGTCCGTTTTTTTGCCAAGTTGTAAGGGATTTTCTCTCAGTG:1 + chr3L 16169125 3' - Tc1-2 388 1 65.75 TAAGACTAAAAATCAAATGTAAATTGGTTTGAGAAGAAGACACAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATA:1 + chr3R 2472940 3' - 297 6848 2 72.60 GTGTGTGTTTTTGTGTGTTGCCTTCAAGGTAATAATAGCAAGATCTATTAACGATCAATATTTGATATAAATTATATAAAACGCACGCAGTGGTGACTATTGAAATCCACAAGTTGTCAATCAATAATACTTAAATACTTAAATTA:1 - chr2R 23095084 3' - gypsy3 412 1 88.36 CAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCNTTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGATTGTNTTTTAAAACCCCCAGCTCCAAAGTGCGGAGGC:1 + chr3R 7462971 3' - I-element 421 1 56.55 CCTTAGATAACAAAATCCTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTT:1 + chr3L 6015643 3' - roo 92 2 82.76 GCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATG:1 - chr3L 19274788 3' - transib2 49 1 55.56 ATTTTTTTTTGCGAAATTTGATGGTTTTATCATGCTAATTGCATGCCCACTTGATTTTCGATTTGCATATGACGACCCAAGGGGCGCTCCCCCC:1 - chr2R 8991411 3' - HMS-Beagle2 397 1 73.40 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTAGAAAAACCGCCTGTCGAGACACATTTTAGCAATAAAAGCAAACTGCGAAGAAGTTGAGGAATATAAATGAAAAATAAACAACAATAACTACAGCAACA:1 - chr3L 10737491 3' - FB 20 1 67.86 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGCGGGTGGGGTGTGCGCACTGCAGTCACTCGACTGCTGCAGCTCGAGGCGAGCGGTTCGAAGGTTTTTCGTCGCTGGTTATTCACCGGTTTCCC:1 - chr3L 1463587 3' - P-element 9 2 76.71 AAAAGAGAATGCTTTAGTCGAGTTCCGACTATCAGATACCCTTCACTTCGCTAGTGGGAATGCAAACGGAATGCAAATATATATGCGGGAATAAAATGAGAAAATCTAATAACCCTTTAATCTATGAGTAACGAGTATACAAATT:1 - chr4 705937 3' - INE-1 577 1 72.41 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATACCGACCAAATAATATAAAAATGTTGCCAAAAACAAGAACAACGGGCCACAAGAGCAACAAAAACAATGGCAATGGCAATAAAAAGAAA:1 - chr3R 25860449 3' - hobo 34 1 62.33 TTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATA:1 + chr3R 15727904 3' + 1731 4540 1 75.34 ACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTATATAGTCTGAATGCCTGTTACATACTTTTCATTGAATCTAGTATACCCTTTT:1 - chr2L 20491468 3' - 297 48 2 63.16 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAG:1 + chr2R 10977218 3' + roo 357 2 50.00 TGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTT:1 + chr3R 6419941 3' - Tabor 59 2 57.04 TTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCCACAAAGAACGCTTTTCGCTCCGCTCTGATCAACCTGCCCAATATACCAC:1 + chr3R 19134479 3' - transib2 69 1 66.21 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATT:2 - chr3L 15148571 3' + roo 9019 2 54.11 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTGCTGGAGCCTGATGATGGG:1 - chr3L 20061299 3' + roo 9048 2 67.36 TGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATA:1 + chrX 22824225 3' + Gypsy12A_LTR 2247 1 45.19 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCACACTTCTTTGCCTCCGTTTTG:2 + chr2L 11617849 3' - 412 7 2 80.14 CACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGGATATGACAGATTT:1 + chr3R 31264565 3' - BS 7 1 74.45 TTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAG:1 - chr3R 29627880 3' + roo 8981 2 82.39 GTAGTACATCCTACCGGCTGCGCCAGTTATCAGCGTGTCCAAGGGGGAAGCTTGTGATCAGATGATGATTCCGCTGTTGAGAAAGTATGTATCTGTTTAGTTATAAGTTGAGTTTCAGAATTTAA:1 - chr2L 23286566 3' - Tirant 422 1 52.80 AAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGGGGGCGG:1 + chr2R 20052469 3' + transib2 2747 1 72.41 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTA:1 - chr3L 15393677 3' - pogo 52 1 54.48 TTCTTTGTTTTTTAATTTTTATCTGCCCATTGTTACAATATAAAAACAATATTAAGATATTTCTTTGTCCCATTACCTATTTATTTAACCATTTTTCCAGGCCGAGCTGCTTTCCGTTCTTAGTGTCTTTAAGCCGCAAAAACTGT:1 - chr3L 3532008 3' - Doc 4695 2 69.18 AACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTCACTTTGAGCTTTCGTGTTCTC:1 - chr2R 8966124 3' - BS 5034 1 56.16 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATAGAATTTTTCCAATCCCGATTTTGATCCCTAGACACGGTTTTATTTTTTTCTGACAAATTTTTCTATTTTAATCT:1 + chr3L 13993708 3' + P-element 2878 2 78.57 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTGGTTA:1 + chr3L 2532556 3' + blood 7354 2 58.70 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGC:1 - chr3R 24072038 3' - jockey 36 1 57.43 AAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGCTGACGCATCTTTTGCTGACCAGTGGCCAGTCACCGAAACTTGTGCGTATATTTGA:1 - chrX 609328 3' - 1360 23 1 71.23 AAAATCACTTCAAAAACATACCAATCCCAATTAGGCGAACCTAAATTTATAATTATTAAAAGAAATAACAATAACAACAAATCCAAACCAACAACAGGTACAACAAAAGGTACAGTCACAAATGACGTCGACGCTTAACGCTGGCA:1 + chr2L 18314290 3' + I-element 211 1 58.22 AAGAGCCTTCAACATGTCCTAATTGAATATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACCTAATCTCTACTGCTTCGAAGATTTTGCCAAATTTCAGTAAGAAATTTAGTTACAGCTTCACTCGCCT:1 + chr3R 6427150 3' + Tabor 7214 2 55.71 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGTATCTTATATCTCCTACCTCTCATATATATGAATACATACGTATGT:1 - chr3L 14221072 3' - roo 77 2 71.92 ATCGTTCCCCGCCTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAAATAAGGTCCTTTCATTGATCATTGATTGAGTTTCGATTCGTTTCGATTCGATTCGATTCGTTGGGTTGTGTTAGGACTCCACAGTCCAGGTTTGTCCGCAT:1 + chr2R 18891361 3' + roo 179 2 67.12 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCATCGTAGCGGTCGCTT:1 + chrX 21045277 3' - P-element 39 1 42.59 AACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGTTGGCTGC:1 + chr3R 13869014 3' - HMS-Beagle 58 2 61.43 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGCTGC:1 + chr3R 31112312 3' + mdg1 395 2 65.75 TTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCAATCAATATACAGATGATGCACAAA:1 - chr2R 9007005 3' - jockey 4793 1 73.97 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAGAATTTTTG:1 + chr3R 30087782 3' - roo 73 2 70.14 AGAAAAAAAAAAATTATACAAAGGGTTTTAGGATGTTTGATGATACATATGCCAGAAATTCATCAAAAATT:1 - chr3R 14590370 3' - Tc3 81 1 90.14 CGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGACGTAATGACGTATATGGTAATAATAATTTTAATAATATAGATGTAAAAGGCTTAAGCAACTCTAAACCAAACGAGCAAATGCGAGATCC:1 + chr3L 17748477 3' - Doc 431 1 59.59 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCG:1 - chr3R 26854748 3' - jockey 66 1 60.00 ATTGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTGGAAAAGGCTCTTCATACTTACTTATTAAAATTCATCAACATGGGCATGAGTCGCTGACTTATGCTAAA:1 - chr3L 18846913 3' + 1360 3369 1 67.59 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAACCTATTAGTATACACTTTATCCTTCAAACATCTTA:1 + chr2L 4245014 3' + 412 7520 2 62.07 ATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTT:1 - chr3R 19506736 3' - mdg3 5325 2 65.52 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCC:1 - chr3R 5870822 3' + roo 323 2 74.66 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTCACAGTTCCTTCAATCGTTTTAAAGTGCTT:1 - chr2R 9870929 3' + roo 395 1 75.00 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAGGAAGCAAGACACGCGTCGGGTCTCG:1 + chr2L 14263058 3' - P-element 18 1 66.38 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACGACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAA:1 + chr3R 26242590 3' + roo 385 2 60.96 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACNGGTGGC:1 + chr2R 21795359 3' - transib2 46 1 53.42 GGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGTTTACCCGCCGCAAAATCTGTGTGCCA:1 + chr2L 2544873 3' + blood 354 2 68.09 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAATTGCTTT:1 - 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chr3L 23146476 3' - 1360 65 1 61.38 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAG:1 - chr2R 5953822 3' - roo 84 2 73.97 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCNAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCNAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCCTA:1 - chr2R 7314592 3' - blood 6 2 73.08 TAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACG:1 + chr3R 31198646 3' - Transpac 68 2 65.07 AGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTATATTATTACATTGTCTAAGTAACTAAAATTTATTTAAAGATAATTTGGGTAGGATGTGCTGAGACTCCACTGTAC:1 + chr2R 12253378 3' - BS 4648 1 65.07 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTCGGCTATCC:1 + chr2L 21645266 3' - 1360 31 1 63.45 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATTTATACAAACGAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGTGAATTTTTAATAATTATTG:1 - chr4 1267798 3' + copia 220 1 67.81 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGT:1 - chr2L 10461161 3' + roo 8987 2 75.34 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGGGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAAAATGTTCCCACAAGGAGTT:1 - chr3L 27349991 3' - 297 6621 2 48.94 ATAGCCGCGAACAAGCCACTAGGGCTGAACGGGGTACCTGACAGCGTCTTAAGCTGCTCTCTCTCCCCCGTGAACCTGGAGCATGACAAGAAAATGCAAGGTATCGATCAGTTGAAATTCAAACTAAAATCACCAGCCTTTGTG:1 + chr3R 958984 3' - Rt1b 4705 1 57.64 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTATGTAAGCCCACTCACAGAGGACGCCGTGGATGTATGGGTGTGTAGGGTCTGAAATTTTGCACACATTTACAATAATTGTAAATGTGTTGAAAAT:1 + chr2L 17574664 3' + hopper 1395 1 70.55 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCGCAACCAGATTTCACCCAGGACCGCAAAATAGTACAAAAAAACAACCTATG:1 - chr3R 26854698 3' - jockey 20 1 74.48 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCCACACAGCGAGATTCAAAGGGAGAGGACGAGTGCAGGACGGA:1 + chr2L 15523148 3' - 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chr3L 17181464 3' - jockey 91 1 75.18 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTTTC:1 + chr3R 18128518 3' - roo 8740 2 73.10 CTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTCATATTTAATTCAGTTGGCAGGCAGGGCAA:1 + chrX 3921696 3' + 3S18 309 2 62.35 CCTATTTCCCTTCGACGTCTGAAGAGAATACATCCCCATGAACAACCCCCATGAACACGTAAGATAGCATAATCTCTTCACTGTACATTTTTACACATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCC:1 + chr3L 11816252 3' + G5A 2665 1 66.44 TAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTGTGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAA:1 - chrX 21087590 3' - mdg3 52 2 58.90 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTTTTCACCCAGC:1 - chr2R 21795992 3' + roo 9034 1 58.22 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGG:1 + chrX 21668371 3' + opus 7461 2 47.26 CGGATTAGTTTTCTTGCGAGGGGATTTGTATGGGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGGCACTGTGCTCCGCTGTCCCACGACTTCTACTTCGCCT:1 - chr3L 17749039 3' - Doc 4503 1 73.97 GACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAGCCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTAATGTCTA:1 - chr3L 25206778 3' - HMS-Beagle 29 2 64.38 AGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGCCGGCTAAAAGTATCTTTATTTATAGCACCATGTTCTGATTGTACGGCACCTGTGGCTCT:1 + chr3R 16475421 3' + mdg3 175 2 62.94 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTG:1 - chr3R 8197775 3' - pogo 45 1 55.04 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGACTGCTTCACCACTCGCCATCCCTCTCATTCGCTTGCTGTTATCAGTTTAAATTTCTTCTTCTGCCAGTCGCCATCCCGCTC:1 + chr3L 5771005 3' - P-element 9 2 74.36 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTACGCGATCTCGGC:1 - chr2L 14616168 3' - P-element 61 1 44.52 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGATGTATATAGTACGAATTAGCACAAGATACACATCGCTTTTGGGGATGTTTGGTTAGTCGATGATAAACACATAACAAT:1 + chr3R 5704227 3' - 412 42 2 57.53 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCTTGACAATGTCATTTCTCCGAAATTTCTTTCAATTCTTTTGGTACCAACACTTCCGCGTTTCAGGGGTGTATTAATTTCTTGATATTGTGGATGCACGAAG:1 + chr3R 18832489 3' - roo 8684 2 68.75 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGTTAAATTCAAC:1 - chr3L 2317122 3' + 412 7496 2 50.69 ACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCATATACATACATGAGTATGTATTTCTTTTTGAGTGTTTTGTGAGTTT:1 + chr2L 18181260 3' + blood 7371 2 69.86 ACTTTAGAAAATATAAGGCCTATTACCTAATACCTGTTATGTTATATTTAACGTATAACGTTAAATGTATAAAGACAAATGTGGATGGTGTTTATTCGGCGGCTGCGATTGGTATCCCCACTATTCAGTTTCTACTGCGTGTAGT:1 - chr3L 20189547 3' + FB 258 1 55.86 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTTGAATTTATAATGCCAGCATGCAGGCTGAAACATTAATGGGGGACTCACGAGA:1 + chr3R 25580899 3' + 1360 3366 1 68.49 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTC:1 - 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F-element 70 1 55.63 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGTTCTGTTTGTTTGTGTTT:1 - chrX 291946 3' - 412 7071 2 71.92 GCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATATAAAAATTGATGCCCGTTGAATGAAGTATAATGCACTGGGGTTGCCATTTTGGTGTCTTACATGAATCCTAAGCTTGTCATTC:1 - chr2R 13090838 3' - I-element 35 1 60.00 TATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATTAAAGTTTACTGTAAAATTTGATTAGTGATTATCTAACATATTTAGTTGTGGGGATATATTATTCTTTAAAATACA:1 - chr3R 20456550 3' + jockey 4866 1 59.59 ATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTAAAGCCAAAAAGTGCGCACAACTTCTAAATTACTTTTCCAAACAGCATCCACTGGCCTGCTGCCTGCTCCTTTCCAACGCCCCTCACT:1 - chr2R 14072473 3' + mdg3 5492 2 75.00 AACCGTGTCGGGAAAAAACTTAGCACTAGCCCCTCTTAAACAGGACCACTAGCGCTCCGCTATGACATCAACTAACTGAAATGGCGCTCAATTTAAAAAAGGAAGTTATTCTGCCGCACCCTGTAGATTTTCACGCTCTCAATTT:1 + chr3L 27364874 3' - mariner2 101 1 80.00 CCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAATAATTATATTTATGTAGAGTTTATTATAGCTTGTTTAATAAGAGTTTATTAAAATTATTAATTATTATTGTATGATATTAAAGA:1 + chrX 22564531 3' + 412 456 2 58.22 CAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAGCGGTACCCAATTC:1 - 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chr3R 28438319 3' + mdg1 376 2 53.54 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAG:1 - chr3R 12046720 3' - Doc 36 1 55.56 AGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGT:1 - chr3L 2317132 3' + 412 431 2 58.22 CATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGTTATAAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACAACTGATAACATTTTAGAGGAAATAGTTTGTAC:1 - chr3R 16190151 3' + mdg1 7274 2 77.40 TATGTACATAGCTATAGCTTCTAGACCCGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGCACCATATGCTCACTTGTGGGTGTATAGGGTGCCGTGGTTGTAATCCCTTCAGTTGCATATACTCGTAGATATT:1 - chrX 10775351 3' + R1A1-element 5195 1 82.58 GCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGAGAATTCCAAATCTCTTTGTCATAAAAAATCACTCCGGATCTTG:1 + chrX 22659845 3' - 412 7129 2 73.10 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGT:1 + chr2L 2544847 3' + blood 7335 1 54.11 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACATGAAGTATT:1 - chr3R 17243068 3' - hopper 18 1 73.29 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACTAGACTCCCAATACACTGGCGGAAACATGGA:1 - chr2R 16371974 3' - 412 88 2 79.45 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAATGGGTATGCGGTAGCCCTTCACAGTCAGAGTC:1 + chrX 14360852 3' - jockey 64 1 54.11 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCCTACTCACCTTGCTCTTTTGCGAAGGGCTGCTCTCGC:1 - chr2R 6236031 3' + P-element 2851 1 58.74 TGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAG:1 - chr2R 11153154 3' + roo 8992 2 73.29 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTGGAAAGCAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGGTAAGGTGATATTGGAACTG:1 + chr3L 22519017 3' - hopper 65 1 62.33 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTATTCCCAATACATTTTAACCA:1 - chr3R 5870765 3' + roo 396 1 72.52 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTTGTCGTGCGTGACGACAACGAGTCTTCGTG:1 + chr3L 10033709 3' - blood 19 2 70.42 AGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCAAGCG:1 + chr3L 9318094 3' - P-element 2869 1 60.00 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGTATATTGTTCTTGTAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTTGAGGAAGAAGAAAAAAAGTTTGTTATGTAGTTGATTTTTCGCAGAACAACG:1 + chr3R 25860613 3' + hobo 2919 1 71.53 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCTAATTTCAAGTTTAGATTCACTTATCTCAG:1 + chr3R 24084939 3' + roo 401 1 79.45 AATGTATACTTTGTTAAATAGTTTAAGTGGTCAAATCGGATGGCCTATAACTAAGTTACAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTAAATCCTATTCAGTTGAACGGCACTGTATAACTATTTAAAAGTATAACTATACTTTGGATT:1 - chr2L 22748971 3' + Tc3 1514 1 76.55 TCTGATAGTCGTGAAACTCGACTATAGCCTTATCTCTTGATTTTTCTACATTATCAAAATGTTCGCCGTTTACATTTGTGTTATTATAAATAGGTGTGTGTTTTTTCAAACGATTATCACTAATTGAGGATATCCGTAAATCGACT:1 - chr3R 3626467 3' + INE-1 561 1 51.37 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCG:1 + chr2R 9607387 3' - P-element 46 1 48.84 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATAACTAGTTATTATTTTAAGTTAAGTTCATAGGCAGCCACAAGTAATT:1 + chr2R 8436311 3' + 1360 3347 1 60.87 TGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACT:1 - chr3R 19506732 3' - mdg3 5320 2 62.50 CTCTCCGCTGCGTTCAGCGTTCTTCTGGAGTGCGAGATCACCCGTTCGCCTTGATCGGACTGCAGTGTGAGGAACGCGGCCAGCCCATAGTCGCTGGCATCCGTC:1 + chr3L 23678136 3' - Osvaldo 20 1 73.33 AAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCAAACAAAGGCAGCTTTATATGACCGAAACCTC:1 + chrX 17770485 3' + hobo 2886 1 70.00 GTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAGTCCTTTGACCACGCTTGGC:1 - 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chr3R 26854771 3' - jockey 95 1 76.03 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATAATAATACCCTTTGCACGGGTAGGAGTAAAAGGTTGTGCCTTACGCAAATGCAAACG:1 + chr2R 5179671 3' + 1360 3337 1 57.04 ATCTTGAATTTGTTTTTCAATTGCACATTACTAATATACAAATGAGTTGAGCAAAGTACTTTCCATGTGAGCCCGTATGTGAATTTTTGTCAATTATTCACATTTATTTAACAAAATTTTTGAAGAACGTTTAAGATGATATATC:1 + chr2R 23658962 3' + S-element 1578 2 67.59 CGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTATTATTTTCTTAATTCATTTTTCTATTCCTTCGCTATCTACTAATCAAACTTGATATGCA:1 - chr3R 23902131 3' - I-element 12 1 74.66 TGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATCCACCGTGCTCTGCAAGAAGCGAAAAGTCGCCCTCAGGCATTCCTGGAACAACGTAGCG:1 + chr3L 11826075 3' - X-element 14 1 72.03 AACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAATCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTAATGTCAAAAGTATTAA:1 + chrX 22835294 3' + mdg3 245 2 78.26 TGATAGTCGGGTAACTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTCGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGTCCAT:1 - chr3R 23020791 3' + INE-1 563 1 59.42 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGC:1 - chr3R 5870814 3' + roo 331 2 69.18 TAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTTATATCATCTCTT:1 + chr3R 9298617 3' - hopper 9 2 78.08 TGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATTTGAATGCCGACATGGTTGTGTCTGCTGCTGCCTCGGCTCGACTCTCGCAGGTCTCCGAGGACTCACAGGACT:1 - chr2R 12826953 3' + Burdock 6387 2 74.29 TCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTT:2 + chr2L 15019973 3' - BS 4848 1 50.68 GTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAACATAAAACCATGTATTTTTAATCAACTAACTTTACGAATTTATTTCATAATATAAAGTTACT:1 + chrX 18745427 3' - Juan 4084 1 55.48 GAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTT:1 - chr2L 8284391 3' - Doc 439 1 76.67 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATTTTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCG:1 - chr2R 10417160 3' + 1360 3328 1 74.79 AAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAAC:1 + chr2R 4816953 3' + blood 7315 2 75.34 TTAAATATACATACAAATTACACATTTTTTCATATTTTTTAGAAGTGTTCTTCTTAATTTAAAGTAAAGTATTCGAAAGTAAACAAAAATGTTAATGCTTTACAGCGGAAATCCTTCGCTTCGCTGTTAAGTGTTAACATTAACTT:1 + chr2R 10564164 3' - Dm88 4376 2 51.37 ATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTT:1 - chrX 292440 3' + G3 4507 1 72.18 ACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTGCGCACAATTTACGCTTAATATACGGCGAGACAAGTGATGAATTTAAACA:1 - chr3R 19950396 3' - BS 5005 1 74.66 CTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAAT:1 + chr3L 12991443 3' + mdg1 352 2 64.38 GTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGA:1 - 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chr3L 11535847 3' - roo 16 2 72.92 ACGGCTGGAGTGCATGTTTATTGCCTCGAAGACAGTGGCTAGCTTGAGGTCTTTGTGCAGGGTTGCGTTCCTTACGAACCATTCGTGCTCAATCATGCACTTATTAGAAAATAAAAA:1 + chrX 23108299 3' - BS3 1465 1 70.94 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGAC:1 - chr3L 9317958 3' + P-element 2850 1 60.71 CTTTACTCGTTGAGTTTTTGTAAGAAACTGATTTTATTTGTATGAAAGTTAAGTTGAAAACGTATAAGGCACTAGTGGTATTTCAACTCTATAAAACTTAATAGAAAAATTTATAAAATCTATTAAATTGTATTATATGTACAC:1 - chr3R 20903765 3' - roo 9049 2 74.31 CAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTT:1 + chr3R 10736137 3' - McClintock 52 2 58.62 TATTCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGATGTATTTCCATCGA:1 - chr2L 5728843 3' + roo 361 2 53.10 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTATGGCCACTTGACAGTCGGCTTGCTAGCCCGATTATCCTCCTACTTCTAATCGAAACAAAATAAGTGCTTAGGTGACTTCCATGGTTGTGTCTTGTTGCTT:1 - 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F-element 69 1 53.42 AATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGG:1 + chr2R 4206657 3' - 1360 317 1 73.94 ACCGCCTCATTTCGCGCGCTTTTGCAGCAAGTGCCCAAAAACAAAAGGCACTTGCCTCTCTCATGGAGAGAGTAAAAATTTCTTGATTAGACAGACAAATACAAATTTTCATATTCAAGGAAGTGCGCTCAGGAAGCA:1 - chr4 787481 3' - Tc1 189 1 71.74 GCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGCTTGCTGGCTTTTAATTGTAATCCAATAAAATTAAAAGCCAGAAAAACTAGGCCCATTGA:1 + chr3R 19450098 3' - roo 8622 1 41.78 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTTGAATTTATAATGCCAGCATGCAGGCTGAAACATTAATGTGGGACTCACGAGAAGTTTTTC:1 + chr3R 25580907 3' - 1360 4 2 78.52 TCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGA:1 + chr2L 22224614 3' + Rt1c 5411 1 60.42 TTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTTTGTTAGAGAGCGAGAGAGCGAAGAGCGCTACAGCGAACCGCTCTTTTCTACGCATTATTTATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTT:1 + chr2R 2053923 3' + 1360 44 1 86.99 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGACGAGATACAAAGATAGTTTGCTAGCTCTAATTCCACTAATTTTTGCGTATTTGTTTTAAGCTGAAGTAA:1 + chr2R 12492524 3' - 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P-element 23 1 68.57 TGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATACACATATATATATAGATATATGTATATGTATATTCTCACTGGACAGGGCGCACGCCTCATCAGCAGCTCAT:1 - chr3R 27827166 3' - I-element 49 1 53.42 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGGACAAACCGTTGCAATTGCCATCTAGTTGCTGTGTGCCGATGTGATAAATTTGAA:1 - chr3L 2907294 3' - 412 7119 2 67.12 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCATTTCCGTTCACATTTTCTGCATTG:1 + chrX 21443071 3' - Transpac 49 2 50.00 TCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTAGGCGTG:1 + chr2L 15085742 3' + opus 451 2 54.11 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACCTAAGGCGAACAAAATCAAAA:1 - chrX 6891431 3' + hobo 2928 1 69.37 GAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGATATTCAACTACATAGACCACATGGCTGGCATCATGGAGATGATCCCAGGACCCACGCCA:1 - 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chr2L 2241245 3' + roo 8985 2 78.62 GACGTGGGCAAAAAAAACTAATCGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTCCATCGGATATTTTTGCTGTTGAAACTGCA:1 - chr3R 4666274 3' - FB 91 1 78.08 GTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATCAGTTACGATTT:1 + chr2R 17394586 3' + jockey 4912 1 67.12 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACATTTCACTGCTATCCTAAGTTTCCCATTTCTGGTCGTATTTATTATC:1 + chr2L 14056823 3' - pogo 10 1 68.97 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGT:1 + chr3R 7074877 3' + P-element 2806 1 30.14 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAG:1 + chr3L 2966533 3' + roo 8997 2 67.81 CGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTACATACTCACCCTAATGCGAACAATAAAAAAGGAAAATGTTATTTAATTGAATTTATTTAA:1 - chr3R 5243141 3' - HMS-Beagle 6859 2 61.64 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCTTTTAAGATTTTA:1 - chr3R 13423269 3' + 297 346 2 61.59 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATCAGGCTGA:1 - chrX 6891453 3' + hobo 2871 1 63.70 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGACTGCTTCACCACTCGCCATCCCTCTCATTCGCTTGCTGTTATCAGTTTAAATTTCTTCTTCTGCCAGTCGCC:1 + chr3L 5770996 3' - P-element 31 1 60.00 GTATTTGTCTCAAGTTTGAGTTTTGGTGGCTAAGTAATTGATTTGTGTGTTTTTTGCTGCTTTTTGTTTTAATAGTTTCGTTGACTGCTTCAAAACGGGCTACCAAATGCCACTAAACGTGCCCTGGACTCGAACATAAACCCAAC:1 + chr3L 13251573 3' - Porto1 4480 1 59.59 CTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAATTGTAGATACTGTTGTGGCT:1 - chr3R 30955311 3' + G6 2003 1 55.17 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCTTAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATCTAAAGCA:1 - chr2L 4244870 3' - 412 7104 2 52.41 GCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTGCTTTATCAATGATACGAACCTGAACTCAGAGG:1 - chr2L 21683353 3' + pogo 2072 1 65.75 AATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAG:1 - chr3R 6419860 3' + Tabor 406 2 74.66 TGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGTCCGTTACACATCTTGTTATTCTAATG:1 + chr2R 4618426 3' - blood 108 2 39.23 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGGTTGCGTAGGAAG:1 + chr2L 14263037 3' - P-element 29 1 52.83 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACGAAATATGCAGTGGCAAAATGAATGCACAAACTGCTCCATCTCCCTTCCACCCAGCAGCTATCTCTGTTGCTCCTCGCACTTTAAGGATAAACA:1 + chr2L 7929644 3' - roo 8674 2 73.08 TCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTG:1 - chr3L 11364790 3' + Tirant 8488 2 60.58 GTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATAAACAACTTTCTTTGTTCGCTT:1 + chr3R 12948722 3' + Stalker4 369 2 60.27 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCGAGTCAATATCGAAAATACGAGAAAAAAACCGAGTGCAAAATAAATTGACAA:1 - chr3R 17987641 3' - jockey 76 1 65.75 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTA:1 - chr3R 18832378 3' + roo 9013 2 72.17 GATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACCATTACTTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTACCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGG:1 - chr3R 24072052 3' - jockey 96 1 66.44 ATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTTTCATCATCTCTGCCTCCTTTC:1 - chr2R 24215588 3' - I-element 5300 1 61.64 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCACAACAAGGAGCCGCCTAATTGACAGATACTATTTGCTTCTCCCCTGCACCGCGCGGCGAACAAAAGGGTAGATGGATGTT:1 + chrX 609490 3' + 1360 3364 1 65.93 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACT:1 - chr3L 2532466 3' - blood 7101 2 81.51 GACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAA:1 - chr2R 4673573 3' + Quasimodo 7300 2 69.93 CAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGACCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTA:1 + chrX 20999581 3' - BS 44 1 60.16 AGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCAATAAAATGAGGGAAATTCGCCAGAAGGAAAACCTCGAAGTGC:1 - chr3R 27315035 3' - jockey 4684 1 70.15 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAACGAC:1 + chr3R 28749230 3' - mdg1 23 2 69.06 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTT:1 + chr2R 6801715 3' - 297 6612 2 57.14 GCCCGCAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGG:1 + chr2L 12932175 3' - opus 7162 4 60.66 TTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCG:1 - chr3R 19965219 3' - jockey 70 1 57.24 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATC:1 - chr2R 9750166 3' + opus 7422 2 77.40 CACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGTAAATTCGAGACTTATC:1 + chrX 20999622 3' - BS 26 1 61.64 AATAAATAATTAAAATTAAAAACTTTGTATAAATAATTTTTAGCTATATGCATTACGTTGTAGTTATTAGAATTTTGGATATTTAGTTATTGAAGAACTTCAACACAAAAGGACACGATCTACAAATGGAAAATCAAATACCTAG:1 + chr2L 16588587 3' + Doc 4687 1 78.62 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATT:1 - chr2R 7314627 3' - blood 7063 2 54.61 TGGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTTGTATACCTTGTATACTTTTACTCTACGATTAACGGGTATAAGAAAACATACCCTAACAGCAAGAAATAGCATTTACCTGTCTTTTGGTAATCGATTGATTGCAGTG:1 - chrX 22875438 3' - INE-1 31 1 77.40 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTC:2 + chrX 7702816 3' - P-element 73 1 35.62 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAAATTCCACGACGAATTTCATGACGACACATCCTTGGGCGAGATGCATACACGGC:1 - chr3L 7750994 3' - 412 7071 2 67.91 CGCAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTGTTAAGTTAAGCTGTTCAATTTTATGGAATCCGTTTGGATT:1 + chrX 3330381 3' - X-element 4311 1 70.07 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAA:1 - chr3L 18216465 3' - 297 50 2 55.86 TCTAAAACCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAAAACTTTGTAAGTAAGGGACATGATTCAATTTTTGGTACAGTGTCGAGGCAAATTCGGAATTTGTTTGGAATGTGTTCAATATAACTACGATTAT:1 + chr3L 23024566 3' - Tc3 318 1 65.75 CATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATACTATGCACATTTATAGATGTTCAGTTACTCGCCCTATAATAAAGTTCTTTGCAAGAAAATGCAAATCTTTCCGTTGGCCGATATATTTTTGTAG:1 + chr3L 22491708 3' - Transpac 23 2 70.34 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTGTCAGCGTCCGTGTCTTTGTGTTGCCGCTGCATGTACGTGTG:1 - chr2R 16355803 3' - hopper 77 1 69.18 TATTTTAAATGTTTTAAACTTTGGAGCAGACCAATTCAACGAACTTACAAAAGTGGAGTGACACGGAGAAATGGAAAGCGGGGGAAAGGCAGAGTGAAAATCTTTTTGCCAACAGTTGAGATGAGCGAAAAATGCGAGTGAATCGG:1 - chr2R 21457294 3' - gypsy3 490 1 69.18 TTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGATTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCAGGCTGTAATTTCATAAATATTTA:1 - chr3R 17924458 3' - Burdock 6201 2 77.05 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGAGAGAGCAGCGCTCAATTGAATGCACTTTTGCCGGGGCCAGCAGATGCAGATGCAGATGCAATTTGATGATAGTAAAC:1 + chrX 3382441 3' - pogo 24 1 64.12 AAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGAC:1 + chr2R 21795348 3' - transib2 57 1 58.22 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGT:1 - chr3L 14422702 3' - roo 41 2 51.11 TGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCCGCCGGTCTCTGGTCGGGACATTGGTCTTGGAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTT:1 + chr3R 25860562 3' + hobo 2923 1 51.69 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTTTAATTAAGTCT:1 + chr3L 12991456 3' + mdg1 394 2 58.97 GCAATTTTTTTATAAAATAGAATTAAACAAAACTTATTTTACTTATAAATCAAAAAACAAATTAAAAATAGTTCAAAAGTGTGGGCATGACCGTTTTAGGTGTGTTGTACTCGTGGAGTAAAACGGTAGGCAAGGGAGACCGCTTA:1 - chr3L 22973390 3' - S-element 1625 2 52.05 CTATTATTATTATTATTGTTGTTATATCATTCTTCATCAGCTTGATTCGCCCATTCATTGTTGTGTTTATAAGGCGCTCAGAAATGGGAAAATATCTTTCATTACTTGTTTTGAATCATCATAGAATAGCTTTGAAATGCGAATAT:1 - chr3R 16543980 3' - mdg1 7070 2 73.29 TAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATATGTCTTGTTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTTAATATGTGAAGAAAGCAAGAATTGAATTAATTTCTGGCGAGAGAGTACACGCAGTTGATCTGCATAAAGCTGATGT:1 + chr3L 23855716 3' - I-element 5090 1 54.74 GAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTTAATTGTCCCGCTGGCACATTATGGCCAATGGGTGCCCGCAAACACACTCTACAACACCAATGGCAACGTATTAA:1 + chr3L 17268386 3' - hobo 14 1 73.29 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATATTGACCATTTGCTAAACGATAATTCAAAATG:1 - chr3L 13285560 3' + roo 9032 1 58.22 TGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCAGAACGGGCGGCTCATTTGACTC:1 - chr2L 20407716 3' - McClintock 9 2 80.14 GAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAG:1 + chr3R 27606701 3' + 412 438 2 56.12 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAAC:1 + chr3R 28749227 3' - mdg1 7064 2 66.91 CCGAGTCGGCATGTTCATTATGCTTACAATTAAGAACCTATGTACTTATGTATAAGATAAAAACGGAGGACTCGAGTAGCCACTTACAGAAAAATATGTGGTAATTATGCTGCCAGTTACAGCAGACAAACA:1 + chr3L 11379610 3' + Tirant 174 2 61.36 GAGCCCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAATAAATTATACAAAATGAGCCTTAAATGCCGAAATGTGTCACACCTTT:1 - chrX 15286867 3' + X-element 4647 1 65.07 ACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACAGGTGGCCCTTCCGGTCTTGAAATTGTTTTACTTGT:1 + chr2R 21795388 3' + transib3 2847 2 73.97 GTTTTTTTTTTATTATTATTATTTTGGAGGAACCGCCTTTGGTATTCCTCAACCCCTTGATGGAAGAAAGAAAGAAAAAAAAACAGTCGATGGCACACCCGCAAAACAAATTAGCTTCATTTCCTGCCCA:1 - chr3L 4353117 3' - Rt1a 5073 1 80.00 AACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCT:1 + chr3R 27452062 3' + hopper 1339 1 67.12 GAGGTAGAGCGGGCTGTCGGTCCTTCTCCAGCTGTTGTTGTTGGAGGTAGCGGGGCTTCTGTCGGAACTATATTCCCATGGCCGGTCCTCTTCGATTTCC:1 + chr2L 20294971 3' - F-element 442 1 66.00 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCATGCC:1 + chr3L 7389811 3' + roo 357 2 52.05 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACACGACGAGATACAAAGATAGTTTGCTAGCTCTAATTCCACTAATTTTTGCGTATT:1 + chr2R 12492506 3' - hopper 67 1 61.64 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACACACTACCCGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAGAACACCAGCAAAAAATGAGCGA:1 + chr3L 13057485 3' - 412 26 2 66.21 TCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGAACCCAAGAGCACTCTCTCCC:1 - chrX 19886974 3' - P-element 100 1 17.81 TTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTTTGCCAGA:1 - chr2L 6618869 3' - 17.6 6956 1 60.69 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAG:1 - chr2R 5953773 3' - roo 18 2 69.77 CTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGTAAATTACGAAATAA:1 + chr3L 6015660 3' - roo 8739 2 71.03 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTACGAGAGTTCTCTCCCTCTC:1 - 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chr3R 18832344 3' + roo 9018 2 54.17 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGTGCGAATGGTTTTATTTATGCGTTGTGTGTGCATTCTGATGTTCTTGATACGCTGAGCC:1 - chr3L 20143250 3' + hopper2 1548 1 57.53 GTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGA:1 + chr3R 29283272 3' - hopper 72 1 66.44 ACGGAGCAGCCACCGAAGGAAGCCCTTCACCTCTGGAGGAATCCTGACGACAACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTATATATTGAATTTGTACGCAGTTATGAATTATGAACTCGTTATAATAACAAGGT:1 + chr2L 17269207 3' + Gypsy6A_LTR 330 1 63.70 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCTAACGCCACCGACGTCAAACGA:1 - chrX 20330542 3' + P-element 2834 1 35.09 TGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGTGAAATCTAAATGATGATG:1 - chr2R 12706146 3' - FB 56 1 55.48 TGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGTGTGCATGAGTGGGCAAAACGTTTAGTTCAATTGTTTGCGGACCGCACAAAAAATCATAGCATACTTTCAGAGGCCGAATGAATTTTTAATGCGAAGAAAGGAATGCGAGCGTATTTGCGAGTG:1 - 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roo 25 2 66.43 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTACATTTGCATTCCCCTTCCTT:1 + chr3R 7625401 3' - hopper 21 1 58.10 CGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAGGTG:1 - chrX 15198031 3' - Max-element 8259 2 62.50 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTCAGGGATCCACAAAATCGATCTTCGCCTGCAAAAGAAGGACTAAAGTTCCAGGACCTGAGTGATTAAGATACGGAGAATGCTA:1 - chr2L 20227930 3' + 1360 3356 1 59.29 GACTATCAGATACCCGTTGCTCAGCTGGTGTGAATGCGAACGCAAAACTTTTTCTGGAATATCGGTAGATATTAAGAAATAAAATGAGAAAAAATTTAAAAATTGAGTAAAATTGTGGACGTGGCCGTTTTGTAGGTGAAAGGAAG:1 - chr2L 21580879 3' - INE-1 549 1 54.79 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACAA:1 - chr2L 2241231 3' + roo 9029 1 60.87 GCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCG:1 + chr2R 18931932 3' - 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Doc 430 1 60.27 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATC:1 - chrX 21087585 3' - mdg3 47 2 54.11 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACATGTATGGGAAAACTACGCTAAATGAACTGCATTTTAAGATT:1 - chr3R 5704124 3' + 412 7468 2 70.55 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTT:1 + chr2R 19633320 3' - jockey 4806 1 53.79 TGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACATATATTTTTATTCTAATTGATATATAACGATTGCAAGTCTAATTACTATTTGCAGCTCAGATGA:1 + chr3L 3661158 3' - X-element 74 1 55.48 CTAATAAGAAAACTTGATCTTTTAGGTTTCCCTGTTGATCTTCTAAATTTGATTTCAAGCTATCTGATTGGCAGGACCCAACAAGTCCTTTTTTAAAAATTCTTTATCTTATTGGTAATTTAAGCCTAAAATATTGTAACACAATG:1 + chr3L 8042408 3' + Q-element 355 2 69.18 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTATAAAATTATTGTTATCGATGCTTATTATTTATTTTTTTGACGTTAAGTACGATTACTACTGA:1 - 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roo 52 2 58.57 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGATACCCACGGTGTCGCAGCTGGATCTCATCTTAGGATTGGCGAAAATCCACGGGAGCAATCGGTCGAAAGG:1 - chr3R 25158574 3' + 1360 3349 1 51.11 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTAT:1 - chr3R 21794061 3' - hopper 58 1 68.80 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACTTTGTTTTCCGACTCGAT:1 + chr3R 19094239 3' + P-element 2787 1 14.38 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTT:1 - chr3R 12046728 3' - Doc 39 1 51.80 ACAATGACTTAATGTTTATATACTTAATGTTTATATACTANGTTGCGATACTGAACTTATGTCTGTGTACCTCTAGCTTACTACATTTGTTTTGTAAATTGNTGTATACATGTAAGATTGTTTATTATTATAGTTTATTATTAATT:1 + chrX 1268706 3' - invader2 4912 2 78.08 AATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCAATGATGTATTGCCG:1 + chr3L 23796349 3' + 1360 3369 1 59.00 GTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGC:1 - chr3R 19506750 3' - mdg3 88 2 75.34 GTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTG:1 - chr3R 15003129 3' - Doc 76 1 65.75 ACCGCTGCTCGCGCTCTCCTTCTCTCCTCTCGCTCTCCTCCCTTCCCGCAAGGTCTTCACCACTCCGCGGTCTGGAGGAATTAGCCGCAACAACAAACAATTCCGCCCACTCCAC:1 - chr2L 23506306 3' + Max-element 8321 2 62.61 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTGGAAATTTAATACCACTTTTATGTGCATCA:1 + chrX 5751949 3' + roo 9020 2 53.15 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAATTGCATCACATATTTGAGCTGAAATTTTGTAGCTGGTATTT:1 - chrX 5841900 3' + roo 9016 2 56.16 GCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGT:1 - chrX 20361945 3' + hopper 1380 1 56.59 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGGACCAGAAGGCAAGCTG:1 - 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P-element 20 1 72.41 AAACAAGAGAGAATGCTATAGTCGACTTCCCCTACCATGAGATACACGTTACTTAGCTAGTGGAAAGGCGATCGCAAAATTTCATCAGTTTTCTGGGGGAAAAAATTTTAAATTTATTTAAAGGAGGGGTGTGGCCAGAGTGTTTT:1 - chr3L 22848528 3' - INE-1 581 1 79.45 ATTATTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCCGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTGG:1 + chr2R 4181305 3' + accord 7316 2 67.14 AGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCAC:1 - chr3R 10148720 3' + 17.6 7361 2 58.22 GAAAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAGGCTTAAATGATGTATTGTTGTGGCACCAGGGCCCTAATG:1 - chrX 14735748 3' - diver 5970 2 70.55 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTTAGCTAACGACGAGAAGCAATTGAAAAATCCTCTTGGAATTCGCCATAAC:1 - chr3R 8197721 3' - pogo 7 1 76.55 TCAGAGCAGTAGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAATCGAAAAACTCATCGATGGAAGCC:1 + chr3R 12146745 3' + gypsy10 5947 2 52.46 TTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTCGAAAAGTATGTACCCAATTTCGCTCAGTCTAATGAGCCACCCTAAATGACTTTTAAGTGGATTATT:1 - chr3L 7787423 3' - flea 12 2 76.71 AGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTAT:1 - chrX 6216337 3' - Juan 4024 1 66.44 GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTTGAAAG:1 - chr3R 19514242 3' + blood 7317 2 66.44 GATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAATGTGCGCATACATTAAGACGAACACA:1 + chr2L 15020009 3' - BS 4812 1 73.97 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTG:1 + chrX 20330614 3' - P-element 42 1 48.00 CTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTTTGGTATATGACTATTGGT:1 - chrX 23102369 3' + Transpac 263 2 54.48 GTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTATGTATATAGTAAATTGAAGTTCCCGAAATCCCATGATTGTCAATCTTGTGAAAGGTTCAGAGTCAATTTTAATTTTAAATACATCCCCCAGAGCGACAT:1 + chr2L 1045104 3' + mdg3 224 2 65.07 TTGTTTTATCATTAATGTTTTTACATTTATTTTTAGAAAAATTTAGCAAAATTTTAGTATGCCACGCCCATTAGTTTGGGCGGTAGCGAAAGTTTTCATTGTTTTTTTTTATAAATCACAGAATATGAAATATTTTTCTTTATAAT:1 + chr3R 30619993 3' - 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chr3R 5870779 3' + roo 9030 1 52.05 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATGAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTGCAGAAACTTATCACTAATAGATGTTTGAAATANAGTGCAGAATATTT:1 - chr2L 18219312 3' + copia 220 1 61.64 TCTGCGCAGATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGCTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATG:1 - chr3R 26854759 3' - jockey 83 1 67.81 TATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATT:1 + chrX 20949672 3' - jockey 4632 1 76.43 TACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTA:1 - chr2L 7633357 3' - Max-element 37 2 54.03 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGCTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTT:1 - chr3R 20887392 3' - Doc 34 1 50.83 TATGTTGCTATTATGAACTGAACTTATGTATGTGTATCTCTAGCCTACTACATAAATTAGGTCTTCTAATAGATTGTTGGTGCAACGTTGAAATGTCATCAATAGTAATTTCGTTTAGTTTGCGATAGTCGATTACTATCCTA:1 - 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P-element 26 1 67.81 CACGCCCACACTTTTAAAAAAATGTGTTGATATTTTAGATATTTTAGATGTTTTTTTAAACAGTTTTGGAAATGGCCCAATACTGCCAGTTTGTAACCGTATTTTTAGTTAACATAAAATTAAATTGGACTTTCAATATTTC:1 - chr3R 20125777 3' + INE-1 253 1 69.01 GGCTATTGATCCAGATCTAGAATATATGTATATCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTTCAAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGGTATAACCAGTACGATCACAAATTCATTA:1 + chrX 19192435 3' - INE-1 87 1 80.14 CAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTA:1 + chr2L 7921017 3' - F-element 374 1 52.88 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGTCAATGGCTCAA:1 + chr3R 31198663 3' - Transpac 51 2 53.42 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAATATAAGAAATGGGTACAACATCAAAACATACCTTCGAGACAAGCTTTCTCCTGGCGAAAGTATTGGG:1 + chr2R 5193571 3' + roo 393 1 76.03 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGCGGAAGTG:1 + chr3R 31264510 3' - BS 34 1 58.72 AATAAACCAAAGAGGCCAACTCCTGCGTTTGTGTTTTATTTAAATAAGTGGACTTATAGTACCCCTACACTAGTAGTGCGTTATTAAAGTGGCCATTCGTCTATCGGTCATCTCACCTACTTCTTTATCCAGTTCGCCGATGAGCT:1 + chr3L 24368824 3' + invader2 5054 2 62.33 TCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAGGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAAT:1 + chrX 666348 3' + 412 7460 2 76.03 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTGAAGTTGGAAAACTTTTTG:1 - chr2R 16274517 3' + roo 9035 1 63.70 TAAGAACCCAAATTCTGGTGACAATAACAAATCCAGCCTACCCTAATGTAAACATTAACATCCGCTGCCGAATCAGTTATTCCCACCAATCGCACGGCTCTTGCCGTACGTGTCTATTATTGGTATTTGCTGAATGAAT:1 - chrX 4793515 3' + Quasimodo 131 2 64.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAA:1 + chr2R 9871040 3' - roo 76 2 80.77 AATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGATTATTGAGGATTAGAGAGCAGGCGAACAAAGCGCGATAATCTCTGACTCAA:1 + chr3R 10714257 3' - 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INE-1 557 1 57.53 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTGCTGGAGC:1 - chr3L 20061310 3' + roo 393 1 68.80 TGATACAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCG:1 + chr2R 19633288 3' - jockey 4839 1 69.18 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACTTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGCATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCG:1 - chrX 8681445 3' - jockey 85 1 68.49 GTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTGTGTGACCTCGAAAAGGGATTTATGCATGTATGCGATAAAGGCATACCCTTCAATTCAAATAAAAATATAAAAATAGGAGGCAGAAGGAGCTTAAGAATGTAGGAGC:1 - chr2R 22957852 3' - hobo 17 1 72.60 ATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCG:1 - chr3L 2532464 3' - blood 7099 2 80.14 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGTATATTGTTCTTGTAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTTGAGGAAGAAGAAAAAAAGTTTGTTATGTAGTTGATTTTTCGCAGAACAACGGTAAGTT:1 + chr3R 25860620 3' + hobo 2924 1 73.97 AAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTT:1 + chr3R 9298547 3' + hopper2 1567 2 60.19 AACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAACACTTCTTATCGCGGACATGCCGCTAACAAATGCTG:1 + chr2R 13541589 3' + jockey 4914 1 75.34 TTAGTTCACGGTGCGTCTTCTTTGAATGTCATGTCATTACTAGTGCATCAATCAAAATGGCTTAACAGTTTCCAATTGTTAATTGAAATAGAATGAGGCTGGAATTGTAATCATAATCCTGCAGACAATTANAGTCATTTGGGATT:1 + chrX 696902 3' - 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mdg1 7052 2 76.03 AAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACTAATATAAGATGCGCTCTATTATAGTTTTCTTAGTACTGTATCCGTTTTTGGCTCTCAAAACCATA:1 + chrX 23102483 3' - Transpac 51 2 55.48 ATGTAGACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAAGTGG:1 + chrX 10319688 3' + mdg1 341 2 70.55 TTTGTTTTGTTTTTTTTTTAATTTTTTTTATTTTATGTGTTGCGTTTCTTTCTGGCTTCATTTGGTGGAGTTGATGTCCGGCGCTTTT:1 + chr2L 16113811 3' + hopper 152 2 85.23 CGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATAATATAAAAATTGATGCCCGTTGAATGAAGTATAATGCACTGGGGTTGCCATTTTGGTGTCTTACATGAATCCTAAGCTTGTCA:1 - chr2R 13090841 3' - I-element 39 1 57.53 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTG:1 - chr2L 15874856 3' + mdg1 7397 2 64.03 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGGGAATAAGAATTCTGTGTTCGCTGCACTGCTTTAACAGCCATTTC:1 + chrX 20284556 3' + roo 9045 1 62.69 AGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATAT:1 - 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Juan 3853 1 52.17 AGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATAACTAGTTATTATTTTAAGTTAAGTTCATAGGCAGCCACAAGTAATTAAATGTTGCCAACCTGATGCATCCCAGATA:1 + chr2R 8436341 3' + 1360 3358 1 61.94 CCAAAAAAAAACGAAAACCAAAAAGATAAAAACTCACTGAGGCTGTGACTTTCGCTTGGAATGCATTTGAATGCTTAGCATTGCGAATCCCACTGTCGCGTTTATTGGGCACAAGAGAGAACAAACCAAAGAGAGAATTTGGCCAG:1 + chr2R 16129617 3' - Circe 7280 1 54.11 GAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGAC:1 - chr3L 9324466 3' - HMS-Beagle2 76 2 69.18 TTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATAAATAGCTGAGCTTTCGTGCTTAATT:1 - chr3R 17673703 3' - FB 19 1 73.29 GGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCATTTCCGTTCACATTTTCTGCATTGTCAAATT:1 + chrX 21443078 3' - Transpac 4922 2 74.77 CTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGCAAAATGGGGG:1 - chr3R 11284881 3' + blood 368 2 72.22 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCACGAGAGG:1 - chrX 20330515 3' + P-element 2829 1 45.89 TCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATGTGAAGTTGATTAAGGATTAAATAGGCAATGTTCTAATGGGATTCACATATTTGATGAATTCTACGGCCACC:1 + chr3L 18216601 3' + 297 6939 2 62.76 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTCTG:1 - chr3L 17181439 3' - jockey 71 1 58.90 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGAC:1 + chr2R 18887073 3' - roo 53 2 56.85 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCG:1 + chr2L 17019171 3' - 412 7118 2 63.01 CGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACAG:1 + chr3R 10736176 3' - McClintock 5959 2 77.86 AAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTTAGCTAA:1 - chr3R 8197764 3' - pogo 51 1 52.74 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAACGGAGCCCTCTTCCAATTGACACAGATCGAA:1 + chr2L 14616287 3' + P-element 2848 1 57.24 GGTCCAGAATTCGTTTTTTTTGGCATAAAGTCTAAATTTTTATGTCAATATATCGTCCTCTAGCAATTATTTTCTAATAGAAAATTGTATTTCATTGCAGGATATTGGATTTTTGTGCCTGATTTGCCACATTGTGATGCGTGAGC:1 - chr3L 8824430 3' + transib2 7 1 59.59 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGGAGAGACGAAATGGTGGAGAATCGCGATGG:1 - chrX 3811573 3' - P-element 18 1 66.12 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGGCGAATATGTCCTGGGTGC:1 - chr2L 15523030 3' + 412 430 2 59.59 TTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAGCGAGATTCAAAGGGAGAGGACGAGTGCAGGACGAAA:1 + chr2L 15523149 3' - 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ZAM 7966 2 61.43 TAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAATAAATTACCAAATGAATTTCCTTGCCGGCCAAAAGTCGAATAAGAAGTTTAATTTCCC:1 - chr2L 2291469 3' + I-element 5289 1 62.33 TGTAAACAGTTTTTTGACAAACTGTACATTGTTTGTTCTCAAAAGGGCCAACAACAAACTACGGCAGGCAATTATAAGCAATAAAAGAATATAAGCGACCTAGGCTCTTTTTGTAAACCATTTCGTCTGAATAGCACACAGTATAT:1 - chr3L 25608350 3' - S-element 3 2 65.75 TATGTGGTTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATTTTGGGTTTTATTATAATATTATTAACTTTATTCGTACATTAAAACAAAATTTTAGATCGTCTTAGAATTA:1 + chr3L 24208223 3' - Quasimodo 46 2 54.11 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACATGTATGGGAAAACTACGCTAAATGAACTGCATTTTAAGATTTGAAAGCTGGCGAAATGCTCGAGGTTAATAATACTTTATGGCAGACTTTAGCATTCAGCTC:1 - chr3R 5704063 3' + 412 7529 2 75.34 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATCCGATTGATG:1 - chr3R 11516471 3' + roo 9045 1 69.86 TATTTGATCCACATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCAAT:1 + chr3R 10148806 3' - 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chr3R 9298421 3' + hopper 1409 2 79.85 TTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATA:1 + chr3R 15727911 3' + 1731 4547 1 70.55 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACGAAATATGCAGTGGCAAAATGAATGCACAAACTGCTCCATCTCCCTTCCACCCAGCAGCTATCTCTGTTGCTCCTCGCACTTTAAGGATAAACA:1 + chr2L 7929644 3' - roo 8679 2 70.37 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAAGTGTTTATGGCTGTT:1 + chrX 14978669 3' - hobo 24 1 62.69 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGGAAGAGAGTTCTCTCCCTCTCTCTGC:1 - chr2R 21713228 3' - P-element 54 1 45.89 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTC:1 - chrX 20361947 3' + hopper 1387 1 59.17 TCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCC:1 + chr3R 10737080 3' - F-element 53 1 53.42 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCGCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAGTGTGCAAAGCGAAAATCCGGAAAGTATGCAGCAGAGTGTGTGAGTGTGTG:1 - chrX 3476131 3' + jockey 4963 1 40.31 ACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCCTATCAATT:1 - chr3R 27606623 3' - 412 83 2 74.66 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATCAGTTACGATTTGCCCGCGAAAGCATTAACAACG:1 + chr2R 17394608 3' + jockey 4961 1 57.98 TTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGAATCTATTTTCAGGGGATCGTGCACTAATAGATTAATAG:1 - chr2R 6493299 3' - copia 4954 2 76.03 AAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAAATTTCATTAACATTTGTT:1 - chr3R 26180405 3' - Transpac 49 2 56.85 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACTGACCTCCGACCAATCAGAGAGCAGCGTGGCCA:1 + chrX 19887039 3' + P-element 2874 1 65.38 AACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCGGGCACTATTTCTTTTTTTTTCTGCCTCTACAGCTAATGCAGAG:1 - 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flea 26 2 67.81 AAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAGCAATCACCAAACACTATAAAAA:1 - chr2L 20165273 3' + copia 253 1 64.38 ATTGTAACACCCTCCCGCTTGCGCAGCGCGCCGGGCGAGGGGTAAACACAACACAGCTCAGAAATTGCTAGTTGCTG:1 + chr2L 17002636 3' - jockey 236 1 87.01 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTA:1 - chrX 22679624 3' - Doc 64 1 45.39 ATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAG:2 - chrX 3533889 3' - 17.6 62 1 71.92 GTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAA:1 - chr3R 19506761 3' - mdg3 5319 2 78.07 CAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTCCGGCACTCACTCACTCACTCTCCCTC:1 + chr2R 18905166 3' + P-element 2804 1 22.39 TATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGGCAAATGCATCGCATTGACAAGACAGACAAATACGAG:1 + chr2L 17019212 3' - 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transib2 76 1 68.28 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCACCTGCCAAATCCAAATCATTTGCCAAAATTCACCTCTCTCTTTCCGCTTAACCCTTAGCCACCACCACCCTTAACCCCCACTCTGGCCCC:1 - chrX 9121232 3' + P-element 2879 2 77.60 AATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATATCCTCCGTTAAATCCTCTCCATCTGTTCACTAACAGAATTTGACCACGTATCATTTATAAATTTTTTCGAGTGAAGTTACGCTGCGCTCCTGTCATTGC:1 - chr3L 21534197 3' - 1360 20 1 71.92 ACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACA:1 + chr3R 16630357 3' - FB 59 1 60.00 TCCTATTAGCCAGTTAAGTTGTCGAAATTTGTTTTTTATTTCATTTCGTTTATTTAGAATGGTAAACTAGAAACAAAGATATACATAATGACTTAAAAATAGAAACAGTCAACGAAACTATTAAAAAAAAAACAGCAA:1 + chr3L 8684284 3' - Porto1 4184 1 53.62 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTAAAAATACATTGCTTTCTATTATTTTACTTATATTTGCAATTTGAGACTTTGAAATGTTTATGAAAACCGAAATGAAAT:1 + chr2L 10074616 3' + pogo 2063 1 52.74 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTCCACCCTGTTTAAAGACTACGTGCGGTGCGCCAGACATTCAGACATTTCCCCGGTGAGC:1 + chr2R 16372047 3' + 412 433 2 61.81 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATGGAGCACGAACTAGTCGC:1 - chr3R 29680171 3' - 412 7084 2 63.70 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTATATGCTTTAACATAGATTATACTTTTCATTTCATTTTATACTCTCATATTAGAATAAGCTAATTTTT:1 + chrX 8469307 3' - hobo 51 1 51.39 TCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAA:1 + chr3L 25232863 3' - accord2 7473 2 52.03 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTCTTCATTAAACCATTTGCGCAGCTGTGAAGTGTGTTTATGTACCGAATTCAAGAGCAA:1 - chr3R 26927379 3' + roo 9010 2 61.64 CTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTAAATAGTATGTTT:1 + chrX 2300674 3' + P-element 2835 1 46.21 ACCGGACTCGTATATGTCGAAATTCGCGCAGCGCAGAAAAAGACGTGCGAAATACGCGGGAACTCGAACACTTTTTTCCATAATATTCACACTGTGGTGCGCTATCCGCACACAACAACAACGGTGGATCAATGATCTCCAACAGC:1 - chr2R 2666311 3' - Rt1a 51 1 47.95 GCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATATCCTCCATCCTCGTTGTCCCTGTCTCGGCGATGGCCTTGAAGTATGCTACACAAAATGTTCGCACATAATTAAGTGCTTTCAACTA:1 - 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chr3L 11535875 3' - roo 8710 2 51.37 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCA:1 - chrX 3811628 3' - P-element 57 1 25.71 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTACAACA:1 - chr2R 3338773 3' - Juan 48 1 49.66 CACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGTCATTCGGCATCCCATCGATGCACTTTATGTGAGGTGACTTTGGCTGGCAATG:1 - chr3R 20752891 3' + 1360 3338 1 61.54 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGGTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAA:1 - chr3L 1004857 3' - jockey 4766 1 74.31 CATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTACCCAGACCCCAATAACAACAGCA:1 + chr3R 11937895 3' + hopper 1381 1 62.33 TACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATATATTGTCAATTAAAACTAGCTAACACCTTAATTCTCTGACTTAGTCTGTGAAGTATTGAAAATTTAACGATATTTTAAAATAA:1 + chr3L 3317391 3' + pogo 2067 1 60.96 CTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCA:1 + chr2R 5953908 3' + roo 9019 2 54.11 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGAGACTGAAGGAACAAATTCTCGACTTGGCGCTG:1 - chr2L 9894852 3' - P-element 82 1 26.43 ATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTG:1 + chr2L 11867379 3' - BS 28 1 44.88 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGNGATCGTTTCTTTCGTACACATATAATATTTTTCCAGTGTAGTCCTTTTGTCCAGGGCGAAATGCACGTGGGNCGAAACTTCACCGGCCACAA:1 + chr3R 12764835 3' - copia 4887 2 69.17 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCGTTCCGTTCTTC:1 + chr2R 21713333 3' + P-element 2827 1 41.38 TTATTAATATTGTTACTATTATACGTCGTCACAAAGTGTCCCGACTAATTTATTCCATTTTGTGCCAGTATTATCAAAATACAATAAATGTGAATATACATATTTCATTTGAAACGAATACACTGCTTTCAAAAGCCATTTTTAA:1 - chr2R 6579779 3' - mdg1 38 4 69.66 TTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCGGCGATAATTCAAGTTTCTATTAATATGTACGTAGTGCTAGGATATGCGATTCGAAAGCCTATAAATTTAATGTGCT:1 - chr2R 21954330 3' + 297 482 1 56.85 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATATATTTTAAG:1 + chr3R 19514354 3' - blood 7050 2 58.90 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCGTAATTTTAATTCAA:1 - chr3L 414853 3' + 412 7474 2 65.75 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTGGACTGCTTCACCACTCGCCATCCCTCTCATTCGCTTGCTGTTATCAGTTTAAATTTCTTCTTCTGCCAGTCGCCATCCCGCTCACACGCCA:1 + chr3L 5771013 3' - P-element 19 1 68.89 ACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTT:1 + chr3R 6685845 3' - 412 7103 2 51.37 GCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAGTGTTTGAG:1 + chr2R 18931951 3' - blood 28 2 65.07 TACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAAAGTTTTTGTTGTGACTTCTCCTAC:1 + chr3R 8112848 3' + Burdock 235 2 70.55 TTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATAAGTCACCATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTTTTTCATTCTCTGCGGCTGCATATGCAGATTGATCGCTGGAAAA:1 + chr2R 14415557 3' - 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chr3L 11535879 3' - roo 8712 2 52.08 CTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCT:1 + chr3R 8112809 3' + Burdock 239 2 62.14 TTTGTTTGTTAAAATCGCCGCTCGAATTAGCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTGTAAATATATATTTTTTTTTGAAACACTTTTAATGTTAATGTTACATCATATTAAGTCAAATGATTTAATAAATATACTAAAT:1 - chr3R 25504189 3' - 1360 2996 1 96.58 GAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTGCTTTATCAATGATACGAACCTGAACTCAGAGGTGAC:1 - chr2L 21683349 3' + pogo 2077 1 68.97 AGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAATCATTTTTACAT:1 - chr2R 21795232 3' + transib2 2780 1 53.57 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCGTTGCCAGGTTTTGTTTT:1 - chr2L 310058 3' + P-element 2857 1 56.52 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCT:1 + chr3R 9298586 3' + hopper 1375 1 56.85 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTCGTACACATTGTGAATGCCCTTATCAGCGGAACTTATCAGTCAA:1 - 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chr3R 19113900 3' - INE-1 547 1 49.32 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCG:1 + chr3L 2907361 3' + 412 419 2 74.62 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAAC:1 - chrX 22679627 3' - Doc 65 1 46.76 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCAATATCGTAGGCAATATTTCGCTTTCTTGTAAAAATGCTGGGAAAACTTCCAACAAATGGCCATGTGGGAGCC:1 - chr2L 5207415 3' - opus 149 4 56.83 CTTTCTTGTGTGAGTAAAAACAAGAGACATATAATACAGTATAATTCGCTTAGCTGCCTCGAGTACTTTGCACAATGCCTCGATGCAGGTAACTTAAAAATGCAGCTAACTTAATTTTTTTTTTTAGGAA:1 + chrX 15958950 3' - 1360 3249 1 77.69 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGTTCATGTTCATGGTAAACGCTAAGAACTCACCATGCTGAGATTTGTATAGCATACTTTTCGTCCAAGCTAAAAAAAAAATTTGACAATGATATTCTTATCACTACTTGCCT:1 + chr2L 11475246 3' - jockey 19 1 66.44 AAAAGTGTTTTAATCAATTCACCATCACTTAAATTTATATGTCGATCTTACTTATCATTAAGAATGAAATTATCAGTTCCTTTTAAAGAATTCTTTAATTTGGGCTTTAGTTATTTTACCATTTATGAGCATACTTC:1 + chr2L 21668062 3' + pogo 1905 1 62.04 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTGAGCAGCAGT:1 + chr3L 1459911 3' - 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jockey 29 1 69.18 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTT:1 + chrX 8839358 3' - Tabor 87 2 75.69 GGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCACACCGACACGCATACACCCACATACATGCACAGGGACATATACACACA:1 - chr3L 21764372 3' + hobo 2894 1 59.66 AGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGTTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCGAGTGTCGTTGCCTTTGTTGGCATTTAT:1 + chr2L 18219452 3' - copia 2 2 77.78 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAAAATAAACATGGAAAAATAAATAAACTAAAAACAAGATATAAGAAACAGGTTGTTAAGGAAAACTTACCTAAAAAAAAATAATAATGAATAGTAGAAACAGAATTA:1 + chrX 23174337 3' - copia 4887 2 73.29 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGCGCAACTTTCAA:1 + chr2R 24427639 3' + 1360 3344 1 55.48 TTTGTTGGTTTTTTTTTTGTTTTAAATAGGTTTTTGCTTTCTTTTTGGAATCGGAAATTTACAATATTAAATATTGATTTAGTAGGGTGAATTTAGAACTTGATAGTTCACTAGGGGAAACCATT:1 - chrX 12479163 3' - gypsy7 5013 3 63.20 TGTTGTCCTCAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCACAAATATAACAACTATTTTTCTATATAACCTCGGCATGGCAAATCTATCTTTCTTTCTTGTTGGTAAGTCTTATTTGCATCACAAACACTATTTCGAAATAATTAC:1 + chrX 22577204 3' + 297 6934 2 41.10 TTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTG:1 + chr2R 10582476 3' - Juan 3857 1 52.78 GCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAATT:1 - chr2L 17237076 3' - X-element 84 1 74.66 ACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTATTCGACCAACCAGTTGGGTCCTCTCTCCCTCTCTCTCTCGCTCTC:1 + chrX 8080707 3' - P-element 78 1 32.19 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTT:1 + chr3R 18128516 3' - roo 8742 2 74.48 CCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATATATATTTTTCATTTTTAAAATTAATCTTAGCTGTGTAGTAGCGGTTGCTACTTCTGTAAATGAAATTTAATAAATTGTGCACGTAATCAAGATCCCCGGTTAATTG:1 + chr3R 13560772 3' - jockey 4952 1 74.29 AAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTTGTTGCGAAGACTGCATGGAAAATATACAC:1 + chr3R 21794175 3' + hopper 1392 1 66.91 AAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATTAGCTGGGCCGCAAATGCGAAGTACATACGGGGGCGAAAGCCA:1 + chr3R 12613849 3' + HMS-Beagle 6994 2 63.25 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACAATCGCCATTCGGTTA:1 + chr2L 12932221 3' - opus 7140 4 67.81 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCATTTCCGTTCACATTTTCTGCATTGTCAAATTGTCAAAATAAAGA:1 + chrX 21443091 3' - Transpac 27 2 64.58 AAAACCCACTTCCATTTTCCCTGAACATGCTGGTCAAAATAAGTCGGGATATACGGGCACACCACACCTCGCCTAACCGCTATATAAGGCGGATTGCAGCCCTCCGTCGATCTTCAACGGTGGAACTAGCAAGACAAACGGAGA:1 + chr2R 5086037 3' + Circe 150 2 76.39 CCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGG:1 - chrX 3811605 3' - P-element 74 1 34.48 AGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAAAGATGATTGACC:1 - chr2L 21941129 3' + flea 4953 1 69.18 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGCGTAA:1 + chr2R 9836608 3' + P-element 2806 1 27.14 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGGCGCGAAAGTTTTGAACATTTTCAACTATTCAACGTCAAACAAA:1 + chr2R 11844312 3' - I-element 72 1 67.14 TTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAAAGGGATATGACCAAATTAACG:1 + chrX 21587784 3' - INE-1 122 1 44.52 CTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGTTGCTCAGCACTTATGGCCATTATGTGATTGTCGC:1 - chr3R 24071984 3' - jockey 27 1 75.34 CTTCTATGTGATGTGCAAGCAGTGCCCCACAGCTGAATTCCGTACGTCCAGATTGGCTTGAGAATAGTCTTGTAGACGAGAATCTTTAAATATGAGTGTGAGTGCATAAATTGCGAACCAAATGAAAAGGCAGCATTCACATTAT:1 - 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transib2 45 1 54.79 ACCACGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAATTAGACGACCGTGGTGCAGTCAAATGG:1 - chr2L 17237051 3' - X-element 52 1 49.64 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAG:1 + chr2R 17650652 3' - pogo 59 1 62.33 GCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGCCGCCGTACTTACGGTT:1 + chr2R 6768104 3' + pogo 2052 1 56.12 CCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCA:1 - chr3L 9324425 3' - HMS-Beagle2 6918 2 60.27 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGCTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACAAGAAGCGAAAA:1 - chr2R 11777958 3' - hopper 39 1 55.71 TTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTT:1 + chr3L 8824521 3' + transib2 2754 1 71.74 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGCGTTTATTGTATTTGACTTGATTTGTTTGGCATTGTCTCTGTCTATCTAATTGCTGTCTACAGAACTAGAAT:1 + chr2R 11778125 3' + hopper 1404 2 78.08 TTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCC:1 + chr3R 10737095 3' - F-element 38 1 63.70 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTGGAAAAGGCTTTTCATACTTACATATTAAAA:1 - chr3L 18846951 3' + 1360 3347 1 55.81 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGACTTCGGACCACGTGACATTTGTCTTAGCTGGCTGAGCTGGCAGCGGGCATTTAGCCAC:1 - chr2R 20052354 3' - transib2 13 1 70.54 TGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTTGTTATCTCATTTTATTAAAGCATAGTTTGCGGACTGGTTGAAAACGACCCTTTGGATATGCAAGAATAAACTCAAAGTTTTTGCAGCCATTGTAACAAAACTGAGACA:1 - chrX 3239226 3' - X-element 21 1 69.86 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTG:1 - chrX 20361971 3' + hopper2 1547 1 67.44 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAG:1 - chr3R 19094175 3' + P-element 2830 1 43.84 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAG:1 - chr2R 11153154 3' + roo 9011 2 69.29 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTGGGACTTTGCAATCGTAGAGCCTTCTTTAGACCCTCCTTGAAGTTAATTTTCTGGCTTGCACTTGTCTTCCTGCTGAGTGGAATCCGGTTGGTCAAACAGAGCGCGAGCCTGCACCTCATCAC:1 - chr3R 22708900 3' + roo 398 1 75.86 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGGAACGGAACTGCGAGGAAAAT:1 - chr3L 7389693 3' - roo 54 2 56.16 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCTTTGGTTCGAATATCGCGGTGATGAATCCTGCATCCTTCATCTCGCATTCCGCCTCTTA:1 + chr3L 27415311 3' - transib2 65 1 61.64 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTGTGG:1 + chr3R 22709040 3' - roo 8699 2 56.76 GCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGC:1 - chrX 609383 3' - 1360 60 1 67.97 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCCAAATTAGCTATTAACTTAAGATTATAACAAAGA:1 - 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Doc 4699 1 54.79 GCATATTTAGTATTAGGGTGTATCTAAAGATCTACTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTAGAATCGAAAATCTGCTGCGACAGTCCGATTGATTTGATTTCTTTTTGACCCTATCCTAATCTGGAGAGTCGTTCATAAAAAATCA:1 - chr3R 4559086 3' - mdg1 151 2 61.64 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTC:1 + chr3L 10897550 3' + roo 357 2 52.74 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCAT:1 - chr3R 15003120 3' - Doc 67 1 59.59 AATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGTTACTAAAAAATCAATAATAACCAAC:1 - chr3R 13559952 3' - jockey 4801 1 60.27 CGGCTATTAATCATGATCAAGAATATATATTCTTTATATATTCGGAAACGCTTCCTTCAGCATGTTACATCTTTTTTAACGAATCTCCACGAGTAACGGGTATAATTTGCTAGATCAGCTTGCAAACAGCATCTTCCAATCATAG:1 - chr2L 21711592 3' - INE-1 88 1 73.10 TTCACACCTCAAACTACTCAGTCGTTTTTTTGGAAGCTTTCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGA:1 + chr3L 25232868 3' - 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chr2L 13033286 3' - hobo 31 1 56.16 ATCAGTTTCTTACAAAACCTCAACGAGTAAAGGCTTCTAATTGGGATTTTACAAAGCTGTTCGCCAAAGCTTTTAACCCGGCCAAACAGGCCC:1 + chr3R 28014173 3' + roo 9039 1 53.76 TTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTATAACGTCACACGCTAGAAGTCTATAAATGGAAGGCTTCTTAAACACAGCCGCAGGCAGCATAGAATCAAAGACATTAGAATAACAAGATGC:1 - chr2R 4618429 3' - mdg1 7073 2 61.38 CGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCTGGACAGGCCTCATCATCATTGTCGCCGGCGACAACC:1 - chr3R 11284893 3' + blood 335 2 51.94 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAGCGGAAAATTCAACAGTTGT:1 + chr2R 9376748 3' + hopper 1410 2 75.00 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAGACATAAATGAAAGCAACATATCTTTAGCTCCATTCCAGACTGGATCATAG:1 - chr3R 19094125 3' + P-element 2880 2 78.08 AACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATAGCGTTACGCATCTTGTTATTCTTGTACAAATTGAAGTTTGTCCCCTAGAAAGCTG:1 - 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chr2L 15419981 3' + Burdock 6378 2 70.71 CTGTCCATCTAATAGTCGGAGGGCAGTATAGTTACATTAGAAGCAGTAGCGGCAGGACAGCTAATTCTCGGAGCACACAGCCCTTGTTGACCAACTAACCGCCGGA:1 - chr2L 16992144 3' - G5A 343 1 50.94 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGTAATGGCTATTAGAAACATGATGCCGCCCAAC:1 + chr2R 8442744 3' - blood 7055 2 52.14 CATTATATTCATTTCCTCGTTTCTGTTCTCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGAGCCTCTCAGTCGGTTGGGCGGGAGGCATGGCGGTGGGACCCGTGCGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 23244251 3' + Cr1a 4331 1 76.52 AGGTCTTCGCCTGTAAGATCCGGATCCTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATGTTAACACACATAGATACACCCACACACAGCCTCATTTTGAA:1 - chr2L 10143648 3' - jockey 4526 1 67.16 ACTGAGTATGTTCCATTGTTAATTTTATTTTTAACGAAATCAGCCGCTTCTGCCATTATTGTGGCCACATGGCGGAAAAGGGAGAGCGGTGGGAACGGCGATGAATTGGCTTAAATGACGTTAAACA:1 - chr3L 21765075 3' - hobo 497 1 53.54 TGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAGGCTTAAATGATGTATTGTTGTGGCACCAGGGCCCTAATGAGGTGGTAAGCCCACCGAGCGTTGCAATAAAATGCAGGC:1 - 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roo 50 2 54.48 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGCTGCCCTGGCTCCTTTTTAAT:1 - chr3L 22320122 3' - jockey 23 1 66.67 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGG:1 + chr3R 12078708 3' - hopper 56 1 57.14 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCC:1 - chr3L 13993482 3' + P-element 2802 1 18.46 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTACTTTATGTGTTTATATTTAGTTAGG:1 - chr3L 15148549 3' + roo 9041 1 62.33 AGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTACTTTTCCTGA:1 + chr2L 7921027 3' - F-element 354 1 69.15 GCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATCATAAAACTTCCCAGCGATAACATATCGATTTTTAATATCAATGCTTCTTCGATTACTAATGTTTTCAGGGCCCTCGTACAGCAGACGAGTGGCATT:1 + chrX 17884646 3' + pogo 2080 1 67.81 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGATGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGT:1 + chrX 21668368 3' + opus 7459 2 48.97 ATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTTATGAACATTTTCGTTGCCTAATTGAGTTTTCTATCGGCACTTTCGGGCAACG:1 + chr3L 9324596 3' + HMS-Beagle2 7177 2 71.92 AACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACT:1 + chr2L 512501 3' - roo 84 2 76.03 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTCCATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGTA:1 + chr3L 14422837 3' + roo 354 2 52.74 AGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAGCGATTTTCTGAT:1 - chr3R 19113895 3' - INE-1 542 1 45.89 TGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCATTTTATGCTCCACTTCCTTCCAGTTCACCGACCACCACATATTCCAATTGCCTTTTGTCATCGTAT:1 - chr2L 11870900 3' + hobo 477 1 59.59 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTAGATTTCCTGTCT:1 - chr3R 31264436 3' + BS 5030 1 58.22 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGTATCATAAATAATATGTTAGCTATGAGAATGTTCCAATCCCAATTCCCATTTCGACGCCTTGCTGTCTGCTA:2 + chr3R 13155348 3' + hobo 2908 1 56.59 TAAGGTCCTCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCCGAGCGTGGGCTCTAACACAGGGAAGTAAATTCCAATTTAATTATATTGTTTTCTGCACAATAGCAACGGATTGCACATTAGCTGCATTTGTGTG:1 + chr3L 11535911 3' + roo 225 2 63.85 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCCATG:1 - chr3L 11364769 3' + Tirant 378 2 65.62 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGACATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGA:1 - chrX 12979470 3' + transib2 2736 1 78.08 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATGATGTCGATACATACCGACACAACTTGATTNAAATGC:1 + chr2R 9618232 3' + roo 9029 1 54.11 TATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCG:1 + chr3R 6584856 3' - transib2 80 1 72.60 AAGCACTCAACAATCATTGTCGCATGCTGAACACTCTATTGACAAAAAACAAAAGACGAGCGACTGTCAAAAATTGAAATCCAACGCCGAAAAGAAAAAAAAAAAGAGAGGAGTAGGAGGCCTTCAATGACTTTTGCCGCTTTTCC:1 - chrX 4150762 3' - 1360 450 1 69.18 AAATATATATTCTTGATCAGGATCAATGGCCGAGTCGATCAGGTCATGTCCGTCTGTCCGTCCGTCCGTATGAACGTCGACATGTCAGTAACTTTAAAAATGGAAACAATGTTTTTTTGCGTGCGATTTG:1 - chr2L 22930093 3' + INE-1 78 1 59.23 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTCACTTTGAGCTTTCGTGTTCTCCCAGGCAGGCTCAACTTTCACAT:1 - chr2R 8966101 3' - BS 5011 1 71.92 GCGTGCATAAACATAACCATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTTCTCGGCAC:1 + chr2R 14009084 3' - 412 7133 2 72.92 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCCTACAAACATGGTTAACAGAC:1 - chr3R 11937766 3' - hopper 34 1 52.50 GCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCTGACAAGTCTATTACTGAACTGGGAATAAATTCCCAGTAAATATGTTTTCTGTAAAATAATACTTTAATAATCCTTGTACTCTAAATACTCTTCACCTTATTT:1 - chr3R 13406367 3' + pogo 2087 1 75.86 AGAGAATACATCCCCATGAACAACCCCCATGAACACGTAAGATAGCATAATCTCTTCACTGTACATTTTTACACATTATAATTAAGGAACAGAATCGGGTCAGAACCCGATGCAGCCTATCGCCA:1 + chr3L 11816253 3' + G5A 2687 1 60.80 GGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTC:1 + chr3L 10033663 3' - blood 7127 2 38.30 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATA:1 + chr2L 5728958 3' - roo 59 2 60.69 GACTTATATCCTAAGGCATTCTATGATTTTGTGTATCGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCC:1 + chr2L 21802940 3' - Quasimodo 91 2 80.82 ACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGG:1 + chrX 20330590 3' - P-element 75 1 28.36 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTT:1 - chr3R 30087701 3' + roo 9042 1 53.21 CATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAAAGATGATTGACCGATAAACATTTTTTAATAGGGA:1 - chr2L 21941107 3' + flea 216 2 59.59 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAATATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATAT:1 + chr4 868720 3' + roo 330 2 71.92 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAATGATCCACA:1 - chr2R 23094882 3' + 412 419 2 70.55 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCTCCGTCTAAGTGGTTTTTCATTAGAAGCACTCGCTCTCTGGTCGCTCAAACTTTTATACATCGCAAAGTTTTCACTCGAT:1 - chr3R 31112157 3' - mdg1 15 2 66.39 GTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCG:1 + chr3R 11285008 3' - blood 6 2 73.79 AAATAAATGAATCTAAAAAAACACCTCAATAATTTGAGGAAATAAAAAGTGCACAGAGTTTGAAAGCATCTTTACTGAACTAAGTTGTAAGCTGATATA:1 + chrX 5002965 3' + Tc1-2 480 1 84.85 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGG:1 - chr2L 15523048 3' + 412 419 2 70.50 ACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAATGCGGCAAAAAGGTGTAACGGCAGCACAAAAAGCGAAGGAAAATGGCCAATCGAAGTTTGGGGAATCGAACATTGGAAAA:1 - chr3R 19962094 3' + jockey 4674 1 74.55 TGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTTTTTACCCCTCCCCACCCCCCACGAACTTTTTCTTTTCTTTTTGCCCCACTTGACAACTCAATTTATTTAGATTAATCTCTCATCTTG:1 - chr2L 3661915 3' + blood 7361 2 67.12 ATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTCTGAATTTCCTAGGCGATGTCAGACTTCTTAAATGTATTACTTTCCTTGTGCATTTATGCCTTAAACCTTTATTAATTAAGGAAATAGGTACACGTTCTTAACAAAG:1 + chr2R 15392670 3' - mdg1 7050 2 76.03 GTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATATGGCCATACATTCTTGCCCA:1 + chr3R 22647936 3' + transib2 2774 1 52.05 ATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTAT:1 + chrX 21668366 3' + opus 7456 2 52.74 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAACAAATGTGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTTCCTTTCAAGGTTCTTCAGTTTTTCAAATATATTT:1 + chrX 13789599 3' - FB 89 1 74.66 CAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGGGGGCGGAGAAGGAACGGTGGACAGGAAG:1 + chr2R 20052491 3' + transib2 2768 1 57.53 ATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGGCAAATGCATCGCATTGACCAGAC:1 + chr2L 17019199 3' - 412 37 2 63.01 AAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAA:1 - chr2L 11475081 3' + jockey 4959 1 60.27 TAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAATATAGCTATGACACATTGTTCTTTTAGCGCCT:1 - chr2L 15420003 3' + Burdock 226 2 58.96 TTATTTAATTAATTGTTTAATTTATTTAATTTATTTATTTAATTTGTTTAATATTTATTTAACTTTGCTTTATTTTATTAATTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTTTATTTTTTTTTAACTTTATTTACTTTGCTGGTGGAGGTAC:1 + chr4 1294994 3' - HeT-A 16 1 68.97 AACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTCGAAAAGTATGTACCCAATTTCGCTCAGTCTAATG:1 - chr3L 7787455 3' - flea 31 2 57.89 ACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAGGCTGTCACATTCAA:1 - chr2R 12492370 3' + hopper 1395 1 67.81 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATT:1 - chr3L 27350017 3' - 297 39 2 60.53 GAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATGCGATGACGCATATCACTCGATTACAGTACCCTGAAAATTCGAAATCCGTGGGACAGCTGGCATTTGCCAGTTAGACCGACCCCAAGT:1 - 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chr2R 12492362 3' - hopper 12 2 73.29 TAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGACATTCATTAGTTTATCGCCCACTGGCAACTGTTGGGTCGAAAGTTATTAGCGACAG:1 + chrX 14735820 3' + diver 6061 2 50.00 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGTCCGTTACACATCTTGTTATTCTAATGTCTTTGGTCTAGGAGTGAGAGTTTCAACAAGACGTCG:1 + chr2R 3920242 3' - blood 7030 2 67.69 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGGAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATCTATGT:1 + chr3R 27606719 3' + 412 475 2 64.17 TTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAACCTAATTACCAGCA:1 + chrX 6538739 3' + pogo 2025 1 70.34 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATTATCGGTTATATTGGCTGTGAAGTGCAAA:1 - chr3R 10876219 3' + 1360 3326 1 80.51 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGCACTGTGCCATGATGGTGGTACCTTTGTATATAGAAGAAATCTTAAATTATTATTATTTGCTAAAACA:1 - 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chr2R 15474433 3' - Quasimodo 12 2 73.85 GAGCATATTTCGTCAAATTTACAATGCAAGAACATACTTGTGAACACATAAAGTGGAAGTACGAACACACCAACTCTCTGAGCAAGCCGGTGCAACTCATAGCGAGCAGAAGAAAAGAGTTCGTTACACTTAATGGTATGACAGCG:1 - chr2R 4520003 3' - 1360 205 1 58.90 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACGCTCCTGCAAAACATATAGCACACTTTGGGGCATTGAGACCTTGGTTCTGGCCAAATTGTCGCACGGCTGCCGCTAATGTGATTTTTACGCATCATTTGAGTGAGCAG:1 - chr3R 25580711 3' - 1360 10 2 79.45 TTAATAAATAAGTATAATTTATTTATAATGAAGGAGTAACGTATTTAAAGATACTCGACATGAAATACGTATACGGTTCAGGTTAAAGAACTATACCCCTTTCACGCGAAAGGGGTTCATCAGAAAATTCAGGTTATACTAGCAGA:1 - chr3L 8796809 3' - HeT-A 353 1 75.34 TTGAAATATTTTTTAATTTTTTCTTATTTTATTCCCCAATATCTATAGATATCCCAGAAAAATTACGAAATTTCGTGTTATCTGATAGTCGAGGAACTCGACCATAGCATTCTCTCTTGTTTTTGGGTTAGTTACATACTGTAAA:1 - chr2R 7925425 3' + Tc1 1393 1 54.48 AAAGGTCACAATAATGGCANAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATATACATATGTTTGCTGGCTAAAACTGTAATCAAATAGTAATTTATGGCCGGGAAATTTCTGCCAAATGCGCAAAATTTGCGAATATT:1 + chr2R 22952294 3' + hobo 450 1 64.62 AAAAAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCCAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTGGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGTAAAGTTCCACCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTATATA:1 - 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chr2R 25240215 3' + INE-1 158 1 76.55 AACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAANGATGAT:1 - chr2L 21941134 3' + flea 4948 1 72.60 TGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTG:1 - chr3R 20887383 3' - Doc 39 1 53.73 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTG:1 + chr3L 1463732 3' + P-element 2851 1 51.72 AAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTG:1 - chr2R 21713272 3' - P-element 39 1 28.74 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGGATATCAT:1 - chr2L 512408 3' + roo 361 2 52.05 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGC:1 - chr3R 19965203 3' - jockey 37 1 60.47 GATGATCAGGAGGGCCGAATGTAACATGGAGTAGAGGAGAAGGATCAGGCATGTCTGACAGGGTCAGCGGAGAGGTGGCCAGCAAAGGCAAAAGC:1 + chr2R 5534638 3' + flea 4738 1 63.16 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGGATGAGCAATGTCTGGATCTTATCAGTTCGGCAAGGACTGTCAGTCTGGCTACTT:1 - chr3R 17627509 3' + roo 344 2 65.07 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTATAAAATTATTGTTATCGATGCTTATTATTTATTTTTTTGACGTTAA:1 - chr2R 5193437 3' - roo 63 2 70.59 ATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATC:1 - chrX 9165342 3' - jockey 4835 1 66.90 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTCACAATGCAAATATATGTACGAAATATATAAACAATTGTATTTCGAGACAATATTTACA:1 - chr2L 9704772 3' + roo 392 2 61.00 TTTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGCACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGACACTTAAAACCCAACAGGGTCATTTAAAACGGACAGTATC:1 - chr2L 22592521 3' + mdg1 7429 2 57.81 AAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAATATAGCTATGACACATTGTTCTTTTAGCGCCTCGCTTTTAGTTCTCCATTGGGCGTTCAACTCGCACATTCG:1 - chr2L 15419963 3' + Burdock 254 2 78.77 AAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCATGATCATCGCTTAATTTTAATTC:1 - chr3L 414855 3' + 412 430 2 64.44 TAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAATACTTTTCACTAAAATACGTTTTAACTTTGGGACATGCAACAAGTGTCATTT:1 - chrX 17048162 3' + jockey 4929 1 66.44 CACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTGATGATGTA:1 + chr3R 15727984 3' + 1731 4620 2 74.66 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGTCAATG:1 + chr3R 31198657 3' - Transpac 4975 2 57.24 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGCATATGTCTGTGTAAAAATCTGATATATACCCAACTATCA:1 - chr3L 14422655 3' - roo 3 2 68.75 TTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTTTAATTAAGTCTGAGCTGCGACTCGCTTTGTGCTGATGCAGCCAAATGAAA:1 + chr3L 12991495 3' + mdg1 7442 2 73.97 GCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAA:1 + chr2L 14616245 3' + P-element 2851 1 43.00 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAGACATAAATGAAAGCAACATATCTTT:1 - chr3R 19094150 3' + P-element 2870 1 67.94 TGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATGGGCAACTTTAACGGAGATGAGAGAGGCAACAAC:1 + chr2L 6637497 3' + 1731 301 1 68.33 ATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATC:1 - chr3L 414870 3' + 412 7457 2 77.40 CCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAGACATAAATGAAAGCAACATATCTTTAGCTCCATTCCAGACT:1 - chr3R 19094134 3' + P-element 2885 2 79.55 CGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTT:1 - chr2R 20972682 3' - jockey 4737 1 70.08 CACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAG:1 + chrX 21668348 3' + opus 7438 2 63.01 GAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATATACACATATATATATAGATATATGTATATGTATATTCTCACTGGACAGGGCGCACGCCTCATCAGCAGCTCATCAACGACAGCGTCTAAAATATCGCATATTTC:1 - chr3R 27827135 3' - I-element 18 1 71.92 GTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAAATTCGTTACCTCATGAAACC:1 - chr3R 12341091 3' - Tirant 8141 2 51.79 TTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATA:1 - chr3L 15393700 3' - pogo 76 1 68.49 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCACATACGCAACGAACGTAACG:1 - chr3L 17181411 3' - jockey 36 1 60.71 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGC:1 - chr2R 10417159 3' + 1360 3315 1 75.94 TGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGATACCAAATTAAATTTAAAGATATTAGAAGCACAACATTTTCATGAACCATGTAACTGTGAACCCTAGCATTTTATTGGCTCATCATCATGTTGATGCTCTTAACCCCTTT:1 + chrX 21097866 3' + 297 464 1 74.66 AGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATCCG:1 - chr2R 9750164 3' + opus 430 2 75.91 ATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAAAACACACGCCAAGGGGGCCAAAA:1 + chrX 8968708 3' - 1731 4372 2 57.53 CTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAATGTGCG:1 + chr2L 15019989 3' - BS 4826 1 62.86 CGGCTCATTGCCGTTAAACACAATTGTTCTTATTTACAATCAAATCGCTATCGCCACAAGGCTAGTGATAAGTAGGTTCTTTGGAAGTTGCGGAGGGTCGTCGAGTTTGGATTTTGTTTAGGGAAATTAAACGTCTGCTCGTTTTG:1 + chr3L 27391776 3' + gypsy 276 2 56.16 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTGGTTAAACCGTTTCCTATTCAAAAGGCCCTATTGTGCTACCAATTTATGTGCAATGTCCTTGATGACCAAGGA:1 + chrX 2956301 3' - copia 4909 2 54.68 AAAATTGTGTGCAAAAAAATCGAATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTGAACTCTGCGGTACCCCAGCCGTGCAGCAAATTCTTCGATATCTTAGCTCCTCTTTACCTCGTAGTCTCGCTTTTGCAC:1 + chr2R 3487941 3' - 1360 37 1 72.14 TTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATAATCTTGAACCTTTAATGGTAGGGCCTAAGTGCTGGTAGGTGTTCCCAGTAGGACAGACGTTTTTCTTCCTCCAGTG:1 - chr3R 1940458 3' + flea 219 2 60.28 ACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGTGTGTGCATG:1 + chr2R 10582513 3' - Juan 3821 1 66.90 TTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGTGAAATCTAAATGATGATGGTTTTAGGTTACGAAAACGGGTGCTTTATTATTGTA:1 - chr2R 12706110 3' - FB 20 1 69.18 GATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGATTATTGAGGATTAGAGAGCAGGCGAACAAAGCGCGATAATCTCTGACTCAATAACATATTCTAA:1 + chr3R 10714270 3' - 297 6613 2 60.14 TTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTACGCGATCTCGGCTAT:1 - chr2L 14616165 3' - P-element 42 1 52.31 AAGCTTCAGGGCTTGCATTGGCCTCTCTTTGCGGCTGGTTAAATGTGTTAACTTACACATATGGGTACATTTGAACTAGTGTACATAAATATCTTTTATGATAGCAAAAATTGTCAGCGTGGCACCGCCTGTTAT:1 + chrX 22913218 3' - gypsy7 32 2 58.52 CTCGATTCATCTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACCACTTGGCAAATGCAAATAATTAAATATATGATGATTTCACCAAGAGAGCATTTGCCATTTAAAG:1 - chrX 8314434 3' - roo 56 2 55.48 AGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATACCTTTTTTTTTGAGCACTTAGCGCGCTGACAAGTTGAAGCTTTGCGTGGAGCGCGGTCAGGTTGGGTTCGGATTGTTTGCCTCATGGGGT:1 + chr2L 15420134 3' - Burdock 22 2 50.34 ATAAAAAGTCGATTCCGATAAGGGACATGAAGAGGGTCCATTAGGAATGAATGTGAAATTGATTGAAATGCAAAAAATATCCTTTAGAAATTCAGTACCC:1 - chrX 22883581 3' - HB 72 1 73.00 GTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGT:1 - chr2L 11475112 3' + jockey 4928 1 59.59 GGTGGTCAGCTTTTCGTTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTGTTT:1 + chr3L 171558 3' - Doc 4471 1 65.07 GAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCG:1 + chr2L 18181208 3' + blood 7324 1 63.83 TTGTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGG:1 - chr2L 11867309 3' + hobo 2859 1 71.92 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGA:1 - chrX 17792514 3' + roo 351 2 59.59 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAGGATTTCCATGAAAATTGCATCGCCTTTTATTTGCAAC:1 + chr3L 2966570 3' + roo 9042 1 60.87 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAACATACATACATAAGTGAAAAAGTCCCAAAAGAAAGATTT:1 - chrX 6538623 3' - pogo 33 1 58.90 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTG:1 - chr3R 17259541 3' + roo 8985 2 77.93 TCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAG:1 + chrX 2214306 3' - jockey 4616 1 55.86 ATATGTCAGCCCGACGGCTTCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGATTGCCGGGCGAGAGCTGTAACTAGTTTGACATTAATTGACTGCCAAATATGCACAAGCGCATGAAATAATG:1 - chr3L 13057337 3' + 412 7499 2 52.41 TGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCAC:1 - chr2L 19248128 3' - mdg1 7094 2 57.53 AGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAA:1 - chr3L 9324460 3' - HMS-Beagle2 58 2 61.94 TCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTA:1 + chr2L 20628675 3' + Stalker2 7637 2 65.71 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTCTACAAAAAACCCTATTGTCCTGTAAGGAACAATACTAAATGCTTAATTATGAGCAAAATCTCTATCTTATA:1 + chr3L 9280479 3' + copia 242 1 56.16 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGAGTTGCCGCTGTACCGGCAG:1 + chr3R 17627567 3' - roo 8736 2 83.05 TAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTGCGCACAATTTACGCTTAATATACGGCGAGAC:1 - chr3R 19950414 3' - BS 5023 1 62.33 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATCTATGTGGCATGCTGTGCATAACCAGCCA:1 + chr3R 27606742 3' + 412 7525 2 69.86 ATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGC:1 + chr3R 15727949 3' + 1731 4585 1 52.05 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATT:1 - chr2R 17269122 3' + roo 8993 2 71.92 CCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTGAATGTCATTATTGTTGCGTTTGCT:1 - chr2R 12185291 3' + accord 7378 2 73.28 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCACATTATGTTATATTATTG:1 - chr2L 2544730 3' - blood 7054 2 50.36 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATA:1 - chr3R 19965196 3' - jockey 19 1 72.03 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGNTTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTNATATATATTTTCCATTTATAACAACATAAGCTTCTACATAACGA:1 + chr3R 6685878 3' - 412 7070 2 72.60 CGCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCCA:1 - chr3R 27315076 3' - jockey 4737 1 60.96 GCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATATATAAATTAAAATGTCTGCATGCAAATGGTGGGTGGAAAAATTCAACCTCTTGAAATGCTAAATGCTTCTCTCTCAAGAT:1 + chrX 9519587 3' - 17.6 6963 2 54.11 CGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAAATGAGACGAC:1 + chr3R 30569119 3' + mdg3 223 2 56.85 TAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAAC:1 - chr3R 13560009 3' - jockey 4826 1 68.42 AAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTAGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGTTTAACAACTTGTTTGTTCGC:1 - chr3R 10148686 3' + 17.6 480 2 74.63 TCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTG:1 + chr3R 10144468 3' - Chimpo 57 1 55.24 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACCAAAGTAATTGATAACATCACG:1 + chr2R 17650642 3' - pogo 66 1 68.53 AAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGTGTGTGCATGTGTGCGCATTTA:1 + chr2R 10582525 3' - Juan 3810 1 74.66 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTTGTTGCGAAGACTGCATGGAAAATATAC:1 + chr3R 21794173 3' + hopper 1384 1 62.76 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGATTATCGTGAAAGAGTTTTGAGTTCCGTTTCGCTG:1 - chr2R 14385598 3' - jockey 94 1 74.66 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTG:1 + chr2L 15523103 3' - 412 69 2 72.66 TTTATTGTTTTATTTTTTATATGTTATAACAATAAATGAATGCAATCTTCGAATCAGTTTCATCCTTTTCTATATATTTATTATGTAGAAAAAATACCACTGGAATTACCAATTTTGATGACAATTTTTCCCGC:1 + chr3L 2411147 3' - gypsy11 3929 1 64.93 CAAATTTGTTTTTTTTTTTATTAACATTTTT:1 - chr2L 14410887 3' - Copia1_DM 293 1 93.55 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTATAGCTGCACTCGTTGGGATATATCGATAGGACCAACTGCGGCTGGCCAGCGCTAG:1 + chrX 13091129 3' - P-element 46 1 46.40 TCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAA:1 - chr2L 18219329 3' + copia 5072 2 74.66 ACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCACATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAACTATGGTATACTTTCTATA:1 + chr3R 12948701 3' + Stalker 348 4 47.26 CCTGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCT:1 + chrX 8839357 3' - Tabor 6928 2 76.55 CAACAGTATCGCAAGACGGTGCGATCTATCTTTAGTTAATTTATATATTGAATTTGTACGCAGTTATGAATTATGAACTCGTTATAATAACAAGGTTTTTTTTTGCCTAAACGGTTCTAATTTACATTTATGGACTGAACGACCCA:1 + chr2L 17269258 3' + Gypsy6A_LTR 380 1 71.23 CGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCAAACAAAGGCAGCTTTATATGACCGAAACCTCCTACTCGAGTGAATTTCGAAAGCTGATACAATGTATGTGTGTATATGGATTAGCTAAGAA:1 + chrX 17770545 3' + hobo 2919 1 67.15 TATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAA:1 + chr3R 934273 3' + Rt1b 4724 1 49.31 AAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCATCGGGCAAGCAAAATTGCATTGAGATAGGTCAGTCACACAC:1 - chr3L 17500712 3' + Tirant 354 2 52.17 AGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTGCACCCATTTTTCTTCCCGTGCACACAGGCTG:1 - chr3R 12622205 3' + 1360 3319 1 80.95 ATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATTCTTTCGGTAACTAAAATTAAACCAGTTGAACTCATTCGT:1 + chr3L 26709861 3' + opus 421 2 76.03 TTTTTCAGGATCTTCGGCTTCCTCTTCATCTTTCTCCGAAGAAGCCTTGCCATCTTCATCCTTTTTCTCAGAATCATTCCACAATCACCTACTTGAAATCGATCTGACGCAGGCT:1 - chr2R 18642024 3' - G7 724 1 60.00 GGAAAGAATGCAGACCTTTGGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGGAAATT:1 - chr3L 9324471 3' - HMS-Beagle2 6964 2 72.60 TTAACGCTAGCTGAGTAACGGGTAGCTGATAGTCAGGTAACTAGACTATAGCATTCTCTCTAGTTTTTGATTATTATTGTAAGCTTAAATATTGGTAAAAATAAAATAGAAAGAAAGCGAAAAACGCATTATTAATGTCAATTTAT:1 + chr3L 24075387 3' + INE-1 537 1 57.53 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCACCAATACTCAGTAGTATAAGGCTGGCCAACTGTAATA:1 - chr3R 8563489 3' - 297 19 2 69.18 TATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATCTTAAAGTGTCATCACTTATGTCATCATATTCAAAATTCATAAAGTTCTCGCAGTGCACGCATGTGTTCGCCGTCGCAGCGAACTCTAAACTTGCGAAATAATAAATTCAATT:1 + chr3R 29758680 3' + I-element 5346 1 80.00 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAACACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCACTCTGTGGGGATTAAAAAC:1 - chrX 22679591 3' - Doc 36 1 63.01 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAGACCCACAATCGACGCCTCGGATTGCCAGCGCTCGGATTTACCGTTCGTTTCGGGGCGTGGTGAGTTCGCGAGCGAAC:1 + chr2R 23444069 3' + P-element 2857 1 61.94 TTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCAC:1 - chr3R 29283175 3' + hopper 1377 1 55.38 CGATATCCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTG:1 + chr2R 5321236 3' + INE-1 506 1 66.44 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGACATGGGGG:1 + chr3R 11285017 3' - blood 7051 2 56.85 CTGAATCTCAAGCTTCTAGCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGATCGAGATCGAATATAATGAAGGAATGCACATTTAATCGTTGAAAAATATTGAACTAAATTGGAGAGAGCTTTTATTAAACTCACTAATAACCTTGTTCGTCCT:1 + chrX 14767096 3' - INE-1 167 1 43.84 TTTCGTGTGCGGCGAGCTTTGCTTGATGTTTACTTTTTTTACTCAAACTGTGCTTTAAGTCTGCTATAATTTAAATATAACTAAATATAATTCAATGCCTAATTTTGCAAGAATCCCCAGCAACAAAGTGGCTT:1 - chr3L 25824970 3' - Doc2-element 4552 1 74.63 GTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTAAAAATACATTGCTTTCTATTATTTTACTTATATTTGCAATTTGAGACTTTGAAATGTTTATGAAAACCGAAATGAAA:1 + chr2L 10074615 3' + pogo 2065 1 53.15 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGG:1 - chr2R 7895513 3' + mdg1 367 2 53.42 GTATGAACTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATTCAAATACAGGAATAAGAATACAGGAAACGGACAAAATGACAGACTCTGCCG:1 - chr3L 25691434 3' + mdg1 7264 2 70.34 TTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTTTGTCAAAATAAAGACTTTGGTAGTTGAATATACATCAGAATTCAATCGAAAACTGCACGCATTAGAAAATGATACTGAAAACGTGCACGCATCGGAATTGGATA:1 + chrX 9162802 3' - jockey 4817 1 76.71 CTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTG:1 - chr3L 19274795 3' - transib2 65 1 63.19 GGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCAAACAAAGGCAGCTTTATATGACCGGAACCTCCTAC:1 + chrX 17770489 3' + hobo 2876 1 68.55 AAAAACTAGCCTCACATCCAAATCCTCTTGCAAGAAAACTTATTCGAGTATGCAGCCAAAGCCGACTGCACCGGAACGACAAACCAGCTCAGCGTTAAATTTGTTATGTTTTAATGTTTTTGGATTGCAATGGGTACCTTAGTGT:1 + chr2L 6727713 3' + Doc3-element 4511 1 71.72 CTTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAAGCAAACACG:1 - chr3L 1004848 3' - jockey 4751 1 68.12 GTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAA:2 + chr2R 17350611 3' - F-element 64 1 51.37 GTGGGTGTAAGGCTGTGCTGGCTAACAAAGGCTATCCAACCAAATATTACGCCCTAATTAACATATTAAAAACAAAAACAGGGAAGGGAAATATATGTTTGTATG:1 + chr4 511331 3' + HB 1301 1 71.43 ATTAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTAGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGG:1 + chr2L 20628672 3' + Stalker2 345 2 53.42 CAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATGGCGAATCAAATAATTCAAGAAAAAATAAATTTAGCTTTAACTAACAACAATAACCAGGTCATTCTTAATAGGGTTATCATTG:1 + chr2R 943927 3' - F-element 52 1 52.74 CCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGCGTAACGTGTTTTCGACTGAGCTCGGGATCGC:1 + chr2R 9836635 3' + P-element 2828 1 44.83 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCGAGTCAATATCGAAAATACGAGAAAAAAACCGAGTGCAAAATAAATTGACAAAATGC:1 - chr3R 17987636 3' - jockey 71 1 62.33 TAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGATAAG:1 + chr3L 11684940 3' + Bari1 1665 1 54.11 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTAAGTCAAATATATTTCATGCTTCACCCAAAACTTTATACGATTAAGACTGTGAGTTGACTAAAATAGTTTCCACGCAGGACATTCCTTTGTGCAAAACAAACAA:1 + chr2L 20029522 3' - I-element 24 1 69.86 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTTTCCCACGGACGTTTGCAATATGGATAATTTACTTGTGACGCAT:1 - chr2R 6767944 3' - pogo 11 1 76.03 AAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCG:1 - chr3R 7049369 3' - Burdock 75 2 73.97 ACGTGTTCTCAATTGGGGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGCGGTTAGTTTAAATAAAATTATATCAAAAGATG:1 + chr3L 2532583 3' + blood 361 2 72.60 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCACAGGAATATTTA:1 + chr3L 6131941 3' - roo 50 2 54.11 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCATTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAGCATATATAAAGAGTA:1 - chr3R 26472781 3' + 1360 3348 1 54.17 CACTAGCCGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAGATATCTTTATCTTTAAAGATATGTGATGAGAACAATAGTAGTTAGTGATATTTCTCCGAAATTATTCACT:1 + chrX 20996713 3' + INE-1 101 1 69.66 AATGGAAAAANAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCGAGAGAGCAGCGCTCAATTGAATGCACTTTTGCCGGGGCCAGCAGATGCAGATGCAGATGCAATTTGATG:1 + chrX 3382432 3' - pogo 47 1 51.72 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGG:1 + chr4 490336 3' + pogo 2073 1 59.17 TCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTATGTACTCACGTATACCCCTGTGTATTCCTAGAAACGAGCTTCGAATTTT:1 - chr2L 9795387 3' - blood 7084 2 69.18 GATGTACGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCACAACTAAGTCCAAATTCTGTATTGATAGTGGGGAATTTTTTAGATTTTATCCCTTATC:1 - chr3L 12890301 3' - hobo 63 1 57.53 TAAAATCAGTNTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCT:1 + chr3R 24084910 3' + roo 9035 1 59.59 CGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAACGAA:1 + chrX 15286970 3' - X-element 4426 1 58.22 AGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGT:1 + chr2L 20852564 3' - Tirant 8142 2 61.43 TCTTCATATTGAGCGTACATTTATGTTTACGTTAATTAGGCGCTCTCTTGAGTGGATTGCGCATGGATATAGATCAGACGAGTTTGAGCTACGTGGAAAGCAATGGGTTCTTATTATAGTATTTTATTCTACAGCCTTAT:1 + chr2R 4297009 3' - Quasimodo 7196 2 71.43 TTTCTTAAATCAAAATTGATTTTGGCCCATTTGGAAGAGGAATTTTTGCGAAAGGCGTTCTGGAATAATTATTTTTCGAGTGAAAGTGCTTCCACAATTACGAAAGTTATCATACCTTTTTTGACGGACATGGAGACTCTAATCTA:1 + chr3R 3847681 3' + 1360 3171 1 25.34 CGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGCTTCTTCACGACTTCTAG:1 - chr2L 23310591 3' - 1360 17 1 70.15 CAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTACATAGTATGTTTAGTAATTGATTCGC:1 + chrX 2300688 3' + P-element 2848 1 52.74 GGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGT:1 - chr3L 9324442 3' - HMS-Beagle2 6933 2 52.08 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGG:1 - chr3R 24072032 3' - jockey 74 1 56.25 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGC:1 - chr3L 22320156 3' - jockey 26 1 55.77 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAACGTAATTTCA:1 - chr3R 20887366 3' - Doc 34 1 60.96 TGAAAAAATAATAACAAAAATTCAAACGTTTGGGGGGCCTAGTTTTTGGGGTCCTAGTTTGGTTTGCGGGCGTTTGAAGGGGAGCGACAAAGTATTCTTTGCAAAACATATAAAACACCGAAAATATAT:1 + chr2L 17178169 3' - HB 1402 1 84.50 ACACACACACGCACACAGATTCTGGGCTAACCCAAACTTAGGGTTCAATTGAGATGAATTACACCCGAGATCAAATTTGCTGGCTCGTTCCAGCGTGTCAGAGTTTCAATGT:1 - chr2R 20296359 3' + accord 185 2 74.11 AAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGGTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACG:1 + chr2L 13033411 3' + hobo 2885 1 58.09 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTAATCTCACGTATCCTTTGTGCTCACACACATGAAGAAATTAAAGTGGGTGGTTCCCAATTTTTAAGTGCCATAAAAACATTTAGTTAGTTCATCAAGA:1 + chr2R 19389464 3' - 297 22 2 58.22 TATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAA:1 - chr3R 13339048 3' - BS 5081 1 73.29 ATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTAGATTTCCTGTCTGAATATTTGCGTACAATTATAAAAAT:1 - chr3R 31264410 3' + BS 5056 1 60.27 AGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCATTTTGCCGAGTGTTTAAG:1 + chr3L 2532533 3' + blood 7323 1 63.70 AAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAATGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGAACCCACCCGCTAGTTTACCCGCCGC:1 + chr2L 2544858 3' + blood 357 2 60.98 ATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTTAATTAGGAAGCCTGATGAATGTTAACTAACTCATAA:1 + chr3R 8188701 3' - pogo 38 1 43.84 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTGTTTAATTAAATATTTAATTTTATTGAACAGTTTAGCGCGTGTTATTTCCAGCCGGAATTTATTTGTATTTACGTTGACACACTGTAACAGAAAGCTGAACTGA:1 - chr2L 18510676 3' - copia 17 2 74.66 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAAC:1 + chrX 7702814 3' - P-element 63 1 37.31 ATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATG:1 + chr2L 21802946 3' - Quasimodo 69 2 75.38 ATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAACTATCA:1 + chr3L 12227866 3' + opus 441 2 66.67 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGCTGCACATGCAGTTTGTAGC:1 + chr3R 31112328 3' + mdg1 7449 2 76.71 GTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAGACCGTGCTTACACAAATGTCGGCATCAGGAGATTTGGGCATTCTCGATATTATTACCCCAGTTTGCTGTCATAATAAGCTTTGGCATTAAAAATCCTACAAAT:1 - chr3R 10714097 3' + 297 383 2 69.86 GGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAAGTGTTTATGGCTG:1 + chrX 14978667 3' - hobo 24 1 62.12 CCAGATTTTATAGTTCCTGAGATCGAGACGTTCATACGGACAGACGAACATGGCCACATCGACTCGGTTAGATCAAAAATATATATACTTTATATAGTAGAAAACGATTCCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAAAGAATCTAGTA:1 + chr2L 22211546 3' - INE-1 152 1 76.03 CCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGCACTTGGTATTACTTGATAAA:1 - chr2L 20761826 3' - Doc 404 1 74.48 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATATATTTTAAGGGAATACTGAATCCGCAAATAT:1 + chr3R 19514376 3' - blood 7028 2 73.97 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAATATTTCGCCTGCTGCCGTGTGCCCACAAACAAAATGCAAATGGA:1 + chr3R 28618496 3' - 412 7071 2 64.38 ATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTAATTTAAATGATTCGGTATGCGAAATAAAATTAAGAAGCATTAACAAC:1 - 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chr3L 16679400 3' + blood 153 2 71.05 AAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAGCGACGACAACTGTCCGACAAAACAGCTTAATTATATTTCAAGTTTTTTTTTTTACCAATTCTGTTTGCCAAAGGAAGGGCGAAGA:1 - chrX 6156708 3' + Doc2-element 245 7 56.88 TAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCAAGCGAACG:2 + chr3L 9318098 3' - P-element 2871 1 60.27 GCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAG:1 - chr3R 19950461 3' - BS 5068 1 70.14 TGATGATGTTTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAAAAAAGTACAAATGTGAAAGCACTTCGGTGGTTCATAATATTTTTACTTAACGCATACGATTTTGTGACCTAAT:1 - chrX 1288897 3' - jockey 4988 1 50.34 ATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGGTTTAT:1 + chr2R 4206662 3' - 1360 316 1 75.34 CTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAACCTATTAGTATACACTTTATCCTTCAAACATCTTAA:1 + chr2L 4245015 3' + 412 7520 2 62.33 AGTTACTCGACTATCAGATACCGACTAAGTTACGCTTGTGAGATCGCAAGCAAGCAAGTAAAAGGTTATTTTGGCATATTAACAGAAATTCTCACAAATAAACTTACATAATTGTGGAACTATTTCCATTCATTATTATTTCACT:1 + chr2L 9086025 3' - INE-1 557 1 57.93 ATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTAT:1 - chrX 3533896 3' - 17.6 62 1 75.54 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTTATAAAATGCCAGGGCGTT:1 + chr2R 11778057 3' + hopper 1383 1 54.55 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATGGTTTTGTTAA:1 - chr2R 7314606 3' - blood 36 2 55.48 GTCGAGATCTCAGAAACTACAAAAGCAAGAAATTCGGGACGTATGTCCTGCTTGTAATGTATTTGCCCAAATTAATTGCATTTTAATTGCTAATTGTTTATGATGCAGTCAATCACTGGGTTTTATTATGTTTGCTTAGAAAAATA:1 - chr2R 11574964 3' + INE-1 145 1 67.81 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGTACGAGTATTTCTTATTTTATATT:1 - chr3R 11756740 3' + Tirant 333 2 61.64 AACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTTGTTGACACAATA:1 - chr3R 16187745 3' + mdg1 7422 2 56.85 TACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCG:1 - chrX 22679645 3' - Doc 86 1 55.63 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAACACATTTC:1 + chr2L 14056781 3' - pogo 53 1 56.16 TGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTTGGACGCGCTGGGGCCTCCTCGACTTACCACCA:1 + chrX 8839390 3' - Tabor 6895 2 53.79 AATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTGCTCAAGCGGCTCTGTGTGT:1 - chr3L 19274757 3' - transib2 23 1 68.57 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTACGTGTGGCAAATGCATCGCATTGACCAG:1 + chr2L 17019197 3' - 412 7081 2 65.19 CTCTGGCGCTCTTAAAGCGATCGATTTTAACTTTTTATTTATTCGAAACAGATGCTTACAGGAGCGGCTAAACTGCGTAGGGAGGCGAATATTCGTAGTTGGACTGATTTAAAGGCTAAGATG:1 - chr3R 1227625 3' + Cr1a 4245 1 70.73 AAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGCGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAA:1 + chr3R 31264526 3' - BS 34 1 51.20 TTTGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTCAATAAATTGCAAAGAATAAAATGCTTGGCTCTTCCCCTCAAATGTATGCAATGAAATTCATTTATTTACGCCCACAAAGCC:1 + chr3L 6686391 3' - jockey 103 1 55.48 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTTTCGCTAATTACCGCATTTT:1 + chr3L 4547776 3' - mdg3 62 2 58.22 CATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCA:1 + chr3L 13057429 3' - 412 69 2 71.97 TAGAAATATATATTGACAATTTTTCATTGGACAATTTTAAAATAATACAAAGAACTGGCATAACATTTTGTTTTTACATTTTATTCAAGCAAAAGCACACTGTGCCTACTTTCAGCTAATTCATTTTCCTGTTCCCTTCCGCTTTC:1 + chr2L 7401133 3' - TART-A 13337 1 73.29 GATTATTTTTTGTCTTTCTGGTTGGCTTCTGCCTAATTTCCAACTGTCACCCGAGATGGCTTTTGGACCCCGGGTCTCACACACGCACACACACCCATACAAGCGAGGATACGAGGATAGCTGGGGTAAAAAAAAACCAAGAATCG:1 + chr3R 19700169 3' - Gypsy12A_LTR 1843 1 72.60 AATAAGTTAATTAAAAAAAAAATAAATAGCAATTACACCATTACAACCTTAAAACTATAAAGAAATATTAGTGATATAAACATATAAGAATTTGATAAAATATTATTGAATTTACCATTTAAAAGATTGTAAGCTTTAAAGGCTCA:1 - chrX 18256415 3' + jockey2 3405 1 56.85 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTC:1 + chr2R 9341635 3' + roo 323 2 78.08 TTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACA:1 + chrX 2214296 3' - jockey 4627 1 63.01 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCC:2 - chr3L 15148577 3' + roo 9013 2 58.22 ATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGCAACATCCGGTGAGGCAGTGGGTGGCAGAGGAAG:1 + chr3R 31264524 3' - BS 45 1 55.97 ATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCACTTTAT:1 + chr2R 17650676 3' - pogo 35 1 61.64 TACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTAAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGTTTATTATTGT:1 - chr3L 9695942 3' - 297 6630 2 71.19 GTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATCATGACAGTTTTTTACTATTCGTGAAAAAATAAACTTATCACACTGTGTTCAAGGAAATAATTAATACATT:1 - chr3L 18074056 3' + 297 354 2 58.90 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTG:1 + chr3R 5870899 3' - roo 61 2 62.33 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATTTATGTGTTTATATTTAGTTAGGTGCTGTG:1 - chr3L 15148542 3' + roo 385 2 68.49 AAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTCGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGAT:1 + chr3R 4527297 3' + mdg1 7408 2 52.05 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCC:1 + chr3L 2317235 3' - 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chr2R 20972617 3' - jockey 4691 1 69.86 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCATTTTGCAACAAAAT:1 + chr3L 24766023 3' + 1360 3357 1 69.44 TTTAAGTTCAGTGAGTAAAATGATAAAAAGCGTCAGAAAATGAGGAAACGCTGGGACAAACACGAAATATGCTTATGTAAGTATATACGTGCACGCACGTCGTGTCTCAAAAAGCCAATT:1 + chr4 952807 3' + Tc1 1563 1 62.50 TATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGATGTATTATAGCTTGTA:1 - chr2L 18219276 3' + copia 256 1 59.59 TCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTCAAAAAGACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTGGGTCGCGGCAG:1 + chr2R 9376729 3' - hopper 48 1 55.47 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATGATGTCGATACATACCGACACAACTTGAT:1 + chr2R 9618224 3' + roo 9021 2 52.05 GTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACTTGTGGCGCAGG:1 + chr3L 11826451 3' + INE-1 129 1 62.90 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGTACGTCTGCGAGCAGATTA:1 + chr3R 11284994 3' - blood 45 2 55.47 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATG:1 - chr3L 2532440 3' - blood 7046 2 54.70 TCGCGAATCGAGCCGTACGATACACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGACCGAG:1 - chr3L 16047622 3' + Cr1a 4386 1 46.83 ATAAGATATACATAAGAAAGCCGCTCCGCCGCTGCCGTATCCTGCAGCGCAGCTACGCGGCTTAGCCTAAGACGAAATATATTCAAAACTCACAACTCAGACACTGTAAAGACGTTGAACCAAAATATTAAAGAAAAATCAAATAA:1 - chrX 21948993 3' + 412 7325 2 73.29 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGAACCCGCTTTTTTTTGTTGCCAAGTTTTTTGCATGTTTCGCATGTAGTTGGCTCTGGTTTCATGGTTCGTGACGAGCCAAGCGCATAACCACAAA:1 - chrX 860748 3' - hobo 22 1 65.03 TTTTTTATTTTTTTTTGTTCGCCTATTTAATTTTTTGGCTGCTTTTTTGGGCAAAATTAAATTGTTTCGCCCAAAAACTTGCCGAAGCTGGGAAAATTTAATTTGTTTCTATATAAATATTGCGAAAGGGAATTTTAATCGTACT:1 - chr2L 15526723 3' - R2-element 3580 1 63.45 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTGGCTCTCTTATACTGCACCGCACAGCGAGCACTTCTA:1 + chr3L 1463768 3' + P-element 2857 1 64.38 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCA:1 + chr2R 17269179 3' - roo 8750 2 80.00 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACGAAATATGCAGTGGCAAAATGAATGCACAAACTGCTCCATC:1 + chr2L 7929591 3' - roo 78 2 73.79 AAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGCGTTTATTGTATTTGACTTGATTTGTTTGGCAT:1 + chr2R 11778086 3' + hopper 1365 1 51.72 AGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGCCA:1 + chr3L 18549791 3' - X-element 81 1 67.39 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACT:1 + chr3L 2317243 3' - 412 28 2 58.87 AAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTTTCATAAACCACTTGCCCTACATGATATTCATTTTCCATACGACCTTTATTAAGTGCTTCTAACATTTTTTCT:1 - chrX 23174181 3' + copia 5076 2 52.05 TGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTA:1 - chr2L 11475078 3' + jockey 4963 1 62.76 AATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTG:1 + chr2R 10977229 3' + roo 9033 1 57.93 TCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTA:1 + chr2R 17350610 3' - F-element 62 1 51.75 AGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCACGGGTCCAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCG:1 - chr3L 25889009 3' - gypsy8 323 1 65.83 ATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGCAGCGCGCTAAGCCAGAGATCTGCTTTGAAGCTTTTGATTTATTTGCTTGATGGCAAATCATTAATTTGCTTTGAGCCAGAGCAA:1 - chr3L 22330904 3' + hopper 1382 1 63.01 GATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGATTCAATAAATAAGAAACAACCTCTTACAATGCATAAAACAAGTCACATTTAGTGGCGATATAAATTTGGACTTGGTTTTTTAAAATAAGCAATATAA:1 + chr3R 20887520 3' + Doc 4636 1 59.31 GCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGANGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGNAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCT:1 + chr3R 1977624 3' + micropia 385 2 60.96 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCC:1 - chr2R 6236067 3' + P-element 2834 1 40.32 TTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCT:2 - chr2R 7314620 3' - blood 50 2 51.37 AAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATTCTGGTAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAGAAGGACAGGCAGATGGAGAAAGTGGTGAAAGG:1 + chr2R 8315613 3' - hobo 4 1 79.31 TGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGG:1 - chr3R 16475362 3' - mdg3 89 2 77.24 CTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAG:1 + chr2R 12102028 3' + hopper 1362 1 57.86 CATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATNAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCNATCTTGAGCCTCCCCCGTCTGGGGGCCGCCACT:1 - chr3L 20680286 3' - 412 75 2 69.86 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCCTACTCACCTTGCTCTTTTGCGAAGTGCTGCTCTCGCTGAGTTTCCTCTTCCTCCCACCGCCAC:1 - chr2R 6236004 3' + P-element 2876 1 76.55 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGGCAAGGGCCATGCAG:1 + chr2R 12133871 3' - jockey 24 1 67.69 CGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAATTAACTTATTTTTTACATTGTGTATAAATGTGCG:2 - chr2L 18181118 3' - blood 7137 2 37.67 GTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTAAAAAACGGGGCTTTGGTGTTGACAAGCTCG:1 - chrX 683577 3' + jockey 4905 1 80.82 TTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCTAATAAAATATATTTTTACACATGCGCATGCATAAAATATTCTCTTTGTAGTCGGTGTCGGCAATATTTC:1 + chr3L 13779424 3' - I-element 52 1 56.85 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCAATGATGTATTGCCGCCTGTGGCGGTTGATTCATGATTTC:1 + chr3L 23182067 3' + 1360 3355 1 56.83 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGAAATATTCGAAAAAAAAGCGAATGAAAGAGAGAGAGGAAGAGTTTAAGGCTTTTTCCATTAAAACTT:1 + chr2L 9704876 3' - roo 8718 2 56.94 CACGAACACATACACACACACACTCACACTCACAGAGAGGCGATGGCGATGGCGACGACGTTGACGGGGCCAAAAACTTTAATGTGGCATCAGCAAATGCGAGGCGAAGCGGAGCGTGGCAAACCGATGGC:1 + chrX 14979338 3' + accord 7026 2 46.56 TTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCACGACAGTCATTGGTGATTTTGCCTGAGGCTGAATCTCTTTTACGTAAATA:1 - chr3R 31114204 3' - flea 4757 1 82.07 TTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAATCGGAAAGAACATAGCAAAAGAGTAATCCTTCTGTTTGGTATTACACATCTATTCATTAAAAAATGTTTCAGATTATGAAATATAAAAGATTTTAAGCT:1 - chr2L 12993291 3' - mdg1 7058 2 72.60 ATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTAACCTAAGTACT:1 - chr3R 13868912 3' + HMS-Beagle 6984 2 60.27 TAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGGAAAGCGTAGGAAAAGCGAAAGCGCACAGAAAAGCC:1 + chr3R 15668273 3' + G2 3056 1 75.94 CAATAATGGCAGAAGCGGCTGATTTCGTTAAAAATAAAATTAACAATGGAACATACTCAGTTGCCAATAAACATAAAGGAAAAAGTGTTATTTGGAGCTAAAGGATCTGCAAAATGGAGGACAAAACTGGCACGGGCAGCTGGC:1 + chrX 14981159 3' + hobo 458 1 68.06 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAAT:1 - chr2R 14884100 3' + roo 330 2 70.55 AACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGACG:1 + chr2R 23094955 3' - 412 71 2 68.31 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAAT:1 + chr3R 28618452 3' - 412 7114 2 60.27 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACTGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGGAAAGTTAAACA:1 - chr2R 23094907 3' + 412 7474 2 77.31 TTATAATTTGTTTATTGAAATCGATACTTTTGTTTTTCGGGATTTCGGGTCCGAGCATTGAGCGTGGGAACGTGACGATGGGGTGAGGGTTAAGCAAGGAATTGCTTAAATTAGGGCGACCGTAAAATAATGAACAGTGAGAAACT:1 + chr2R 22182906 3' - Idefix 7113 2 78.08 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCGTTGCCAGGTTTTGTTTTTGTTTTGGGAAAAGCGTTTGCGGCGAAATGTTCATGTTTTGATA:1 - chr2L 310014 3' + P-element 2870 1 74.66 ATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGGTTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAATTA:1 - chr2R 14884098 3' + roo 332 2 67.81 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAG:1 - chr3R 29627842 3' + roo 9015 2 56.85 GCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATATCATTTTTTACCCCTCCCCACCCCCCACGAACTTTTTCTTTTCTTTTTGCCCCACTTGACAACTCAATTTATTTAGATTAATCTCTCATCTTGG:1 - chr2L 3661914 3' + blood 350 2 67.81 GATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTATTCACTTTTTGGTCCCATAAGGTACATGGGTGTAT:1 - chrX 22835186 3' - mdg3 82 2 72.41 TCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGCACGTC:1 + chr3R 11284981 3' - blood 73 2 69.23 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTCTGCGTATATTTGTAGTCGACTG:1 - chr3R 12078563 3' + hopper 1399 1 75.34 TTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTCGTAATTATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCACCTGCTGAATGCATCCATTTATGC:1 - chrX 4789081 3' + Quasimodo 7353 2 75.36 AAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGAAACCGAGAAAATGCCAGAGAAGTGTGTAACATGGTAAAAGCTCGCGGCG:1 + chr2L 310146 3' - P-element 60 1 40.74 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGGAACGGAACTGCGAGGAAAATATTTTAACACTCAGTATCA:1 - chr3L 7389674 3' - roo 34 2 61.38 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTT:1 - chr2L 310085 3' + P-element 2800 1 26.21 ATATATGATAATTAAAAAAGATTATTAAAAACCACGGCTGGTTTGGCAAACACAAAATAAGAATCGGGGCGCAAAAAAAACACGACCGTTCGCTTTGAAAGCTAATTGCGAAATTAAATAAGTACCTAAATAAATAATAC:1 - chr3R 3922955 3' - Cr1a 83 1 72.14 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCCCTCAAAATCCGTACAGGAGACATAATACGAACCAATTAAAAGAACAGTGCACCCGTGCTCGTGTTACCTATCAGCCCGAA:1 + chr3R 23641690 3' - diver 24 2 40.91 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGTACA:1 - chr3R 19965181 3' - jockey 32 1 68.49 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCAATCCAGCACTTTCCATTTCGGTGTTTGGCGTTGTTTGG:1 + chr3L 7751140 3' + 412 7500 2 53.10 AAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATCATAAAACTTCCCAGCGATAACATATCGATTTTTAATATCAATGCTTCTTCGATTACTAATGTTTTCAGGGCCCTCGCACAGCAGACGAGTGGCATTTTG:1 + chrX 17884649 3' + pogo 2089 1 71.43 TATAAAATTTACTTATTGTCATACTTTTTTAAGACAGATTGTAAATAAAAAAAGAGGGAAAAAAAATAATAATGAAAAAAAATTGATACGTAAGCGTTACTATGATATATGTAAGAATGTATGTAAAATATACCTTTGC:1 - chr2L 19817804 3' + G4 3806 1 56.83 ATAAATAATAAAAATTAGAATAAATATATAAAATAATATATTCGATAGCGATTTAAGTAAACATTTATAAAACTACACTTTTGCCGTCCAGAAATATTGACGATGCCGCCGGCGCCAAGGAGGTTC:1 + chr3L 12116256 3' + Doc 4688 1 62.70 TTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGTCTGTGTATCTGTGCTGTATGCCGCTTTC:1 + chr3L 9696041 3' + 297 346 2 54.11 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGCATCTTCCCTTCGCGTTTCTTCCGCTTTATTTACAAGTCAAGTCACTTGTTTCCACACCGCGCAC:1 + chrX 8346432 3' - roo 49 2 54.29 TCAGAATTTGAGTGAAAAATGGACAAGGCTAAACGTAATATTAAGCCGTTTGATGGCGAGCTGATAAATCGCATGTGGAAATAATTTTGTCATCACAGCCCGTATTTCGCATTGCATTTTACTGTTATACTTAAAAGCGAAATTCT:1 - chr2L 18510548 3' + copia 414 1 65.07 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTGGACT:1 - chr2R 18886916 3' + roo 394 1 75.34 CGAACCGCTCTTTTCTACGCATTATTTATTCTAGTTATTCTAGTGTCTTTGCGTTAAACTTGAGTTGTCATACTGGTTCCCATCGAAATATACCGTATGGCGTCTAATACTTTTCAAAACAAAATATAACCAAATAACTAATTT:1 - chr2R 11246933 3' + 1360 135 1 64.58 TAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAACTAATTACAAAATTTTCATATATATATTTCATTTAATTGTTAATTTCGTGAGAGAATATTAATCTTTGGCCC:1 + chr3L 7787584 3' + flea 207 2 54.86 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGTTGCGTCAGAAGTTCTGAAAGAGGGAACTTCAGCACAAACTAC:1 - chr2R 9341526 3' - roo 45 2 51.03 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTG:1 - chrX 17792515 3' + roo 351 2 60.00 CTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGAGGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAACATTACT:1 - chr2R 16567290 3' - opus 77 4 74.29 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCT:1 + chr3R 8112809 3' + Burdock 223 2 53.78 CGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCACAGCTTTTTGGCTTTCGAGATTG:1 + chr2L 11867392 3' - BS 12 1 54.84 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACC:1 - chr2R 12462104 3' + roo 9033 1 58.90 TACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGAATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGC:1 + chr3R 11937866 3' + hopper2 1547 1 56.94 CCTGGGTGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGT:1 - chr3R 20983876 3' - hopper 83 1 71.23 GACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGTTGAGGGATGCAAACGTACAAGAGACGGCAACCTGCTAATAAAAACCAAAAATGAATTACAAGCCAGAAAACTCCAAAAACCATCCACAATCCCAGATGCAATGAAGACAATTCATTAACAAAA:1 - chr3R 5088530 3' + I-element 328 1 69.18 TCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTGGAAAGCAATGGCCTTGGAATGGCTTGGATTCTGG:1 + chr3L 22518998 3' - hopper 84 1 74.66 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCAC:1 - chr2R 6236082 3' + P-element 2829 1 30.70 ATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGCCAGATAAGCGAAAACATTT:1 + chr3R 16630394 3' - FB 12 1 74.62 ATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGAGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGAGCTTTCTCCAAAATATGCACATTGCTGCTCGAACGAAA:1 + chr2R 12827074 3' - Burdock 38 2 51.59 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAA:1 - chr2R 5953827 3' - roo 89 2 77.40 CACACGATCTGCGCAGATGNTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAGAAGTA:1 - chr3R 26854766 3' - jockey 90 1 71.92 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATGAGACCGATAGCCGTCAAAGAAATGTTCAATTCCTGG:1 + chr2L 8120263 3' + roo 9036 1 61.64 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTGCTAATTAAGACACTTTTTAAAGCATTTTGAAGTTAATAGAAATAAATTGTATGGTACGGAAAATCAAAAGTATACTAACTTACCTCGAAGCTAACAATGCCGCT:2 + chrX 11232651 3' + roo 9054 2 67.12 AAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTTAAATTTTATTCTTTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTCTTAAGTACGAAAACAAGTTGCGTAAGGATCCTATCAATC:1 + chr2R 12487582 3' + hopper2 1317 1 71.23 AGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCATTT:1 - chr2L 20628524 3' - Stalker2 13 2 38.46 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCGTTTCAGGGTAGAACTTTCTTTTTGGTCGTTGACACATACTCTAAATGACTCGAAGTTGCGGAGTC:1 - chr3L 23181941 3' - 1360 51 1 53.42 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGCATCTTCCCTTCGCGTTTCTTCCGCTTTATT:1 + chrX 8346398 3' - roo 8753 2 79.45 AAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGACTTCGGACCACGTGACATTTGTCTTAGCTG:1 - chr2R 20052382 3' - transib2 58 1 58.90 AATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTGATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGAT:1 + chr3R 7462935 3' - I-element 458 1 80.82 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTC:1 - chr3L 414855 3' + 412 419 2 67.12 ATTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCATG:1 - chr3R 20983814 3' + hopper 1402 1 75.36 TAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCAC:2 - chr2L 15874840 3' + mdg1 368 2 54.79 CGATTTCATCATCGGGTGCAACAGAGTTTCAGGTAGCGGGGGACGAGGCTATGCTGGCATGGTAGCTCGTGATCAATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACAC:1 + chrX 21292604 3' - accord 7003 2 61.65 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTTGCCGATGCCAGGCTTAC:1 + chr3L 17135439 3' + hopper 1378 1 74.12 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACATACAGTTGA:1 - chrX 6891405 3' + hobo 2930 1 77.78 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTCCTGAGATCCGATATTAGTCGTACT:1 - chrX 19662965 3' + P-element 2824 1 37.68 GAATATGATGAAGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGCACATCCAA:1 + chr2R 4261954 3' + invader4 2968 2 65.75 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCC:1 - chr2L 10074485 3' - pogo 54 1 59.44 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTCATTCGGCTGGA:1 + chr3R 29283299 3' - hopper 29 1 59.23 TTTAATTCAATTAATTTAAATTTAATTAATTGCTAGAGCACTGAGCTGTAACAACCAATGTGCAGGCGAAATAAACACAAAGCTGTCTTCTTAGTCGGCAGCAAGAGGCCCTTATAATGGGCCAAGGCG:1 + chr2R 13381108 3' - HeT-A 382 1 76.74 CATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTAAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGTTTATTATTGTCTCAGATATTTAGGGTTTTTTTATGTTATTATGAATA:1 - chr3L 9695905 3' - 297 39 2 58.62 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTNTTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAANTGAAAAACAATGGATATCATTTAACGCAAACA:1 - chr2L 512396 3' + roo 9038 1 58.62 GCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATAGAATTTTTCCAATCCCGATTTTGATCCCTAG:1 + chr3L 13993665 3' - P-element 58 1 45.89 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGC:1 + chrX 20330612 3' - P-element 37 1 49.15 CTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGGTT:1 + chr2R 17493164 3' - BS 4871 1 66.44 TTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATAGAAACACACACAGGCACACTGCGGTTGTTTCGGGAGATTTTGAAAAATTCATTTACTGCGTGC:1 + chr2L 15516788 3' - Max-element 43 2 53.33 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCACCAA:1 - chr3R 8563522 3' - 297 19 2 60.18 CTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGCACTTGGTATTACTTGATAA:1 - chr2L 20761827 3' - Doc 406 1 73.29 AGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACT:1 - chr3L 19274777 3' - transib2 46 1 53.15 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCG:1 - chrX 20330563 3' + P-element 2800 1 16.54 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAA:2 + chrX 22835240 3' + mdg3 159 2 74.66 ACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAATTAGACGACCGTGGTGCAGTCAAATGG:1 - chr2L 17237051 3' - X-element 52 1 51.08 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGCC:1 - chrX 15198039 3' - Max-element 54 2 57.46 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTGAGCAGCAGTCCTCGAAAGGGCCATCCAA:1 + chr3L 1459930 3' - 412 7 2 80.00 AACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTGATATATTTATTACTTTGAAGTCAACAAACATCTAG:1 + chr3R 29680283 3' + 412 7466 2 73.29 GTGTACCGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCCTACAAAC:1 - chr3R 11937779 3' - hopper 72 1 65.52 ATGTAAACGGTAGCTAATTCGAGCGGCGATCTTAACAAACGAATTTAAAAAACTTTAAAATTATAATAGTCAGGGCGTGAATTTTTAATTGTTATTTTTTTTTCTTATTATTGCTTTTATTTCAAATATTTATTCACTTATGTT:1 + chr2R 3914019 3' + 1360 2975 1 74.31 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTCCTGAGATCCGATATTAGTCGTACTTTGTCACAGTGGAACATCATGGCCAAAATGGTAGCTTTTT:1 + chrX 19663192 3' + P-element 2856 1 40.41 CCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCGACACTTTTTGCAATCCGCTTTTAAAACCTTGTTTCTCGTTAG:1 + chr3R 29288839 3' - BS 4999 1 77.40 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCCTACAAACATGGTTAACAGACACATATAAAACAGCGCGCATATTTGTC:1 - chr3R 11937739 3' - hopper 31 1 62.50 TCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTGCTGGAGCCTGAT:1 - chr3L 20061305 3' + roo 9046 1 65.00 ACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTATGTGTGTACATTTGCGTAAATTTTCGTTACCAATCCACACTGCACTTGTGCAATCCAACGTGCTGTTTCTCGATTTCAACTGAGAACGTGTCCTTC:1 + chr3R 10148867 3' - 17.6 6944 1 73.10 CGGGGGAAGGAATATATTGTTTGCCGAAAAAATGGGGTTGGAGGGCCCCAATCTCAAAAATCTTTGCCTAAAACGAAATCTTAGGCTTCTAGCTATATTGGAAGTATTTATGTGCACTGGCTAGATGGGGTGAATAGTGACTTTTG:1 - chr3L 23773901 3' + Transib5 2830 1 67.81 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCAAAGTCCCGTAGTTTAACAACCGGAGAACGCTAGA:1 + chr3R 21925168 3' + hobo 2899 1 62.00 CGCGGCTAAGAACAATGTAATAGTTATAAGTTGGAATTTTCAACAGATAGAATATGAAGATAGAAGTGTAAAAGTATTTGGTGCAACTTTTCTAAGAATCTGGAATATTTGCAAATATTCTTCAGTTAATAAAAGAATAAATATAT:1 + chr3L 16459236 3' + invader2 4779 1 67.12 ATAAAAAAAAAGAAAACAAAATATCATCAAGCTATTGAAGAGTCTTATGGTCGACCTAAAGTGTTAGTCAATTGTTACCCAATGGGAAAATCTTCTTGGTACTACAAGAAGGGTTTTTCAATGGATAGCATAAGATTGGGACTT:1 + chr2L 16769039 3' + gypsy11 3931 1 54.86 AGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGG:1 - chr3L 23146488 3' - 1360 72 1 68.57 TTTAGAACAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAAAAAAAAAATAAATTCTAGCGTTATCTAGGCTTTCCATTTAAATTTTCATATATTTATGACGTAATGTAGTACTGTCAGGGCTTTCCATTTTAATCTTTTTATATTTATGACGTA:1 + chr2L 8777168 3' + G4 3833 1 91.78 TTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATTTAAATGTTTCTAT:1 - chrX 3533836 3' - 17.6 6946 1 73.29 TAAATTACTGCCGAAGAAACTCCCGTGAGTTAATGAAAAATTTACATATATACAATATATATATATCCGAGATTTCTTTACATCATTTAATATAACACTAAACTNNNTTTTATGCAACAGGAAAAATGTCAAGCTAAAGGTCACAT:1 + chr3L 25121048 3' + HMS-Beagle2 427 1 50.68 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGACGAATAATAACTTCGTTTTTGTTGCAGTCCGCCCAAGAAACCAAAGTG:1 - chr3R 11089676 3' - I-element 72 1 65.07 AAAATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTT:1 - chr2R 961140 3' + transib2 2655 1 51.03 CAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAATTTGACTGGAAATGAAC:1 + chrX 3663216 3' - 297 6795 2 73.61 CTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCAGCGGGCAAGCAAAATTGCATTGAGATAG:1 - chr3L 17500725 3' + Tirant 350 2 58.91 TATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACAATATACTTAAATATACAAATCAAATACAATTATATTTTTACTAATAAAT:1 - chr3L 22257762 3' - mdg3 74 2 67.12 ACTAAAAATCAAATGTAAATTGGTTTGAGAAGAAGACACAATATTTGTATTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATA:1 + chr3R 2472940 3' - 297 6844 2 71.83 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGG:1 + chr2R 5953936 3' + roo 394 1 73.53 AGACGGTCTTACGGGATACAGAAAACATTTATACTCATAGATGGAAGTACATAAATAGTTATTGAGCGAAGTATGAAAAGTTTAGAAAAAAAACCTATAATGTCTGGACACAAATGCGGGTACTAAACTTTACGTTAATTTTTTT:1 + chr3R 4708559 3' - S-element 497 1 79.31 AATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGCTCGGGAATGTAGAGTGAATTTACACGCTAAACCCGGCCCAAA:1 + chr2L 6149206 3' - hopper 17 1 63.64 TACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGATGTTGAAGTGGTACTGATAATATAAAAATTGATGCCCGTTGAATGAAGTATAATGCACTGGGGTTGCCATTTTG:1 - chr2R 13090869 3' - I-element 43 1 54.10 TATTTAGTTTGTTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCGGGCACT:1 - chr2R 19805426 3' - F-element 86 1 65.75 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAAATTTCATTAACATT:1 - chr3R 26180409 3' - Transpac 4972 2 55.48 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATAAATATACATCATGACAGTTTTTTACTATTCGTGAAAAAATAAACTTATCACACTGTGTTCAAGG:1 - chr3L 18074072 3' + 297 345 2 58.27 TTTATAAAAAAAAAATTAAAAAACGTATTGCTAAACACCAGTTTTAAACAGCTTAATATTTTCGAGCTAAAAAATAGTTATAAAAAACAGAATAATTCCTTGCCAGCAATCCGATTGCTGTATATTTGTGGTGCGGCTTCTGATG:1 + chr3L 13935860 3' + HMS-Beagle2 480 1 71.03 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCCAAATAAATACCAACGGTGAGTAATCGTTTTCTTATTGTTACTGCTGTAGTATCCTATTCCTCTTCCCCGAAGAGCACCC:1 + chr2L 3662071 3' - blood 7030 2 65.87 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTAT:1 - chr2R 9376654 3' + hopper2 1527 1 71.72 TAGACGTTGAGCTGACAGAACCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTATTGATTGGGAAACGCTCGGATAAAGTTTCACTTCACGGCA:1 - chr3R 28619311 3' + 412 382 2 71.92 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGAGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAAT:1 - chr3L 2532441 3' - blood 7060 2 60.00 ATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTATTGTCTATGGAATGT:2 + chrX 20999606 3' - BS 42 1 50.68 ACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCATGCTCCGCTTTTAATAAATTGTGCTCTAACCCAGCATTT:1 + chr3R 18294942 3' + copia 222 1 59.59 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATAGTATCAAGTTGGCGA:1 + chr2L 5728973 3' - roo 45 2 55.48 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGAT:1 - chr3R 16187762 3' + mdg1 7405 2 54.79 ATATTAATTAATTTGTTATATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAG:1 - chr2L 23372503 3' - gtwin 37 2 55.88 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAATACGGCCAACAGTCAATTAAATTCCAGCTCGGCACCGTTAAAGCGGCGAAGTCCTTAAAACTGGCGG:1 - chr3L 17268233 3' + hobo 2926 1 66.04 TAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTAACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATCGATGAGCTTCAA:1 + chr2L 22684607 3' - transib3 48 1 52.31 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACATTTATCATGCACTCT:1 - chr3R 24084796 3' - roo 8735 2 68.49 ACAGTCAACGATCGGCCGCAGGTCATTTTTTGTATGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCATTTTTTGTACGCCTAAAATTTGTATGGGTGTGTGTGTGTTTGTCATCACCTGTTAGCATTTGCGAGTCCTTGAAATTC:1 + chr3R 13155900 3' - hobo 2743 1 64.44 GGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCTGGACCCTCCAGCA:1 - chr3R 16475351 3' - mdg3 5330 2 69.66 CTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTCAAACTTTTGATGCATTTGTG:1 - chr2R 12185315 3' + accord 7340 2 54.62 AAATCAAAAGAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTGCCC:1 + chr2L 2057885 3' + 412 7473 2 67.86 AAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTAT:1 - chr3R 5164941 3' + invader4 251 2 70.71 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCCCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGCAAAGGATTATTTGTGTTTTATAAAAGCGGGCTT:1 + chrX 5841981 3' - roo 85 2 76.55 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAATAT:1 + chr3L 6131938 3' - roo 8717 2 56.16 TAAATTTAAAAAATTAAAAAACGTTGAATTCATTTTTAAAACAAAAACAACCAGTTTGCATTGTCACGCCAAGTCACAAAATTACTTCTAGAACATAAATATTCTGTTGACAACTCGTCCGGAACTAGCTTTTCCATTTTCACT:1 - chr2L 21318006 3' + HB 319 1 67.36 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGACTCG:1 + chr2R 18887076 3' - roo 8714 2 56.16 CTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAACATACATACA:1 - chrX 6538652 3' - pogo 62 1 62.33 AACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGCTCAATTGTCATTAATTT:1 - chr3R 6419787 3' + Tabor 479 2 79.45 TTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAATCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTCAAGTATTTGCTGACAGTAGAATTGTACAATGTATTAAAATAAGGTATTCACCAAAACACAGAATTTCGGGAGAAT:1 - chr2R 4673540 3' + Quasimodo 7332 2 59.03 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAAATCTTT:1 - chr3R 28438328 3' + mdg1 348 2 65.75 AGCCGCTGGTTTTGTCTCCGGATCCTCCTTTTGTTTGGTAAGCGATCTAACTTCAGACGCATTTTTAGCAGCACTCAGAAGATTTATTGCTAGACGGGGAAAATGTTCCAATATCTATTCAGACAACGGAACAA:1 + chr3R 19447417 3' - Burdock 341 1 73.88 AACTGATTTTTCCAACTTTAAATGCAATAGATATAGCCACAACTTTACAACTTTTAAAGACTATACCCACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACTACTAAAACGATTTCGACGCTTTCGATCTACTACCACAC:1 - chr2L 21941835 3' - flea 398 1 73.29 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGAATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGC:1 + chr3R 31112309 3' + mdg1 392 2 62.33 ATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGC:1 - chrX 21087583 3' - mdg3 35 2 58.20 ATGAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATG:1 + chr3L 9318079 3' + P-element 5 2 50.00 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATA:1 + chr2R 17350601 3' - F-element 71 1 55.94 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGGTGATTACTCGCTTCAACTCTGA:1 + chr2L 10461221 3' - roo 77 2 71.03 CACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGATTTTTTTTAAATATTTATTATTTTATAATTGAAAGCATAAATAATGTAAAATTT:1 - chr3R 25471653 3' - Bari1 65 1 61.64 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACTAGAATTATAAGATTACTAGTATGCCTCCAGAAATCGAATGATATGCATATGGTGTAGGTGTTAAAAATATTTAAATAAACATGAATTTTGAATTT:1 + chr4 868771 3' + roo 9045 1 67.12 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCG:1 + chr4 490338 3' + pogo 2053 1 52.82 TTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGCGGTACAGAAATACACACATATACACATACATATATAGAATATTCGCATTGCAACTGACAGGATGATGAGACCCGGAAAAAGGTA:1 - chrX 18582154 3' - I-element 27 1 55.20 CAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAATACGGCCAACAGTCAATTAAACTCCAGCTCGG:1 - chr3L 17268268 3' + hobo 2882 1 73.91 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7554 2 67.12 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTC:1 - chrX 19662989 3' + P-element 2811 1 23.62 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTAAATAAATAAACAGATTGGGAAAACATAATGCAAAAGTCTTTTGCAAACTGTTTTGAGTAACTGCATT:1 - chrX 5751837 3' - roo 8714 2 53.47 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGATTATCGTGAAAGAGTTTTGAGTTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTTGCAAGG:1 - chr2R 14385551 3' - jockey 29 1 65.12 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTAT:1 + chr3L 20061425 3' - roo 8735 2 67.81 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAATACCCTTGAAATTGATA:1 + chr3L 6015712 3' - roo 24 2 64.38 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAAACATTTCATTTGACAACTTGAAGTGTAGCGAAGAAAAACTCGAATTAACTCAAATCGAACCGAAAGTAATAG:1 - chr3L 22294379 3' + pogo 2058 1 55.86 AAAATTAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTATGTATATAGTAAATTGAAGTTCCCGAAATCCCATGATTGTCAATCTTGTGAAAGGTTCAGAG:1 + chr2L 1045067 3' + mdg3 208 2 51.20 ATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCTTCTGTTCGTAGGGGAAGCTTTTCTAGTCTGGTCC:1 - chr3R 7074781 3' - P-element 43 1 60.96 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTAAAAATACATTGCTTTCTATTATTTTACTTATATTTGCAATTTGAGACTTTGAAATGTTTATGAAAACCGAAATGAAATGCATACAATCTCAGCTAATCAAATCCAGCATTTTT:1 + chr2L 10074651 3' + pogo 2098 1 76.71 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGTTTTTTGAGGATTAGAGAGCAGGCGAACAAAGCGCGCT:1 + chr3R 10714243 3' - 297 45 2 62.10 TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTCTGAAATACCCAGTGATTATCTGATGGCTGGGCCC:1 - chr3L 6050167 3' + 412 406 2 76.71 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATGTCTGTGTCGCAGTTCC:1 - chr3R 26180428 3' - Transpac 46 2 61.67 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACT:1 - chr4 868648 3' - roo 73 2 70.55 GGGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAGAATCGGCCTGGTCAAACCGCAATCAGCCAGGCAGGTAATCGAAGTAAAGGGCACAAATCCCCCACACACATGGGT:1 - chr2L 19341464 3' - FB 46 1 54.11 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATCTTCACT:1 - chr3L 20061356 3' + roo 8995 2 72.14 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATG:1 - chr3R 29627853 3' + roo 361 2 58.40 CTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGTACGAGTATTTCTTATTTTATATTCCCTCATTATTATTTTTATACATTGATAAATGCAGAAAAAATAGGCATG:1 - chr3R 11756691 3' + Tirant 382 2 73.97 ATTGGATACCATTTTGACAGAACATTCAAAGGTTTTTTGAATGTCCTTATAGCTTAAGAATTAACATTCTTTTCTCCTGGGAGCAGTGCGGTTCTCTACCGACTAAAATATTATTTTTTTTAATTTATTGCCCTTTTAAATATATG:1 + chrX 9724571 3' - HB 452 1 65.75 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTTAGCTTCGATGTATGGGGC:1 - chr2R 5953786 3' - roo 8712 2 51.37 GGAGCGCTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATCGAAAATCACTTTGCATCTGCAGCACTGCTCACTGACATGAAATTTCCTGTCA:1 + chrX 22559052 3' - gypsy 67 2 61.64 AGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAGCAGAGTCAAACGCGTACAAGGGCACCTTGACGATTCCCAATG:1 + chr3L 23182034 3' + 1360 3312 1 72.60 AAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGTTCTACATAAGTAAATATAAGCAATATATATGGTATATGTTGTGGCTATGTTCCATTATTAAACAAAATTAAGCAAAGAAACAAAGTAAATTAAAAGTAAATTTAAACGGTTAAAAGA:1 - chr3L 577728 3' - transib2 2592 1 75.34 GGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGAAAATAACAGTTAACAGCGCCAACAT:1 + chr2R 9376710 3' - hopper 77 1 72.46 TGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCACTGTGGATCTTAGACAAACA:1 - chr2L 15874821 3' + mdg1 7425 2 62.33 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAAGTGGAATC:1 + chrX 17792608 3' - roo 64 2 67.39 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATGTCAATCAACAATTTGGTGCAATAATCTTTGGGAAATCATTTTCGATCCGCGTTAATGAGTT:1 - chr2R 14540473 3' - roo 32 2 49.15 GTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGCTGGATGCGAAGTTGC:1 + chr3L 8249487 3' + mdg1 7428 2 55.47 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTT:1 - chr3R 15003100 3' - Doc 47 1 55.48 TTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGGACATCGCGATATTTAATGGAGATAT:1 - chr3L 27415241 3' + transib2 2737 1 77.93 TAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGCAAATGGTTTCTGTGACCCCATTGTGACCAATCTCTTGCAGGGCATATCCAATTCGAATACTTTCTATGAGGC:2 - chrX 18745320 3' + Juan 4174 1 46.58 TTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACTTATGTACATGTATTCATTTATATATGTACGCACATGCCGGAGGCTG:1 + chr3L 27350098 3' + 297 323 2 75.86 AGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGCTAAATTCCCCAAGCATCAAGACGTCACTGTTCCCAAAATAGAATCCATTGGGTTTG:1 + chr2R 19230621 3' - I-element 32 1 62.24 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAG:1 + chr2R 9453391 3' - roo 46 2 54.79 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATAACGTAGTTGTAACGTTCTAAAGCTTTAATATCTATATTTATTTATCTGACATTATCTCAATGTAATAATTCCGCTTGTGT:1 + chr3L 21534358 3' + 1360 3349 1 58.90 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTA:1 - chrX 17792531 3' + roo 8998 2 71.23 TCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATGTGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATATCATTTAGGGATCGTAACTTTTTTAACTGAAACATCTTTGTAATATT:1 + chr3R 5165016 3' - invader4 2827 2 67.12 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGCTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTT:1 - chrX 22679630 3' - Doc 63 1 47.01 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTCCGCAGAGAAACGTCGAG:1 + chr2R 9871548 3' - roo 15 2 42.36 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAAATGAAAAAAAAAAGGCGCCAGGCCACAGA:1 + chr2R 11558070 3' - 412 14 2 61.90 CACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCCTCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGGGCATTGGTATCCAGCGTAGGTC:1 + chr2L 12236808 3' - jockey 88 1 75.18 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGNTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATTGCGAGCTG:1 - chr3L 18183047 3' - Tirant 9 2 73.64 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTT:1 - chr3L 15148584 3' + roo 9007 2 62.76 GAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCT:1 - chr3R 12046702 3' - Doc 20 1 67.12 CAGGCCTTCAAGAGCTCGGCGCCAACGCAGGCGAAACTGGTTGCCCTGGCCTCGAATGGAGTGCCAGAACCCGCTGGTGTGCTGGAGGAGGCGTTTTCATCGCTGGGTCTATTGGCATTTTAAACGTTATCGGAAACTAACCGAAA:1 - chr3R 13474425 3' + R1A1-element 466 1 68.49 AGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCATGCTTTTTTTTCATATAAATTGAAAAACAGAATGCTTAAGAGGCTTAACTTTTGC:1 - chr3L 14888763 3' + flea 4953 1 64.38 ATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCTGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCAACTAAACCCACCAAAAATTTCCCACATCATTTCCCACACAATCTTTC:1 + chrX 3534021 3' + 17.6 472 2 68.49 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATCTTAATT:1 + chr2L 13033399 3' + hobo 2863 1 69.18 GCGGCAGAGAGTCAAGATTACAGATAATAGACTTTATCCTATTATCTGTAATCTTGACTCTCTGCCGCTTTTAACTTTTAACTATATTTAATAAA:1 - chr2L 10450460 3' - Cr1a 4232 1 66.32 AAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAATATAGCTATGACACATTGTTCTTTTAGCGCCTCGCTTTTAGTTCTCCATTGGGCGTTCAACC:1 - chr2L 15419973 3' + Burdock 244 2 73.29 GGTCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCT:1 - chr3L 9324453 3' - HMS-Beagle2 6945 2 60.00 ATTAGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGT:1 - chr2L 15019897 3' + BS 5009 1 74.66 TATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGTCTGTGTATCTGTGCTGTA:1 + chr3L 9696031 3' + 297 336 2 60.96 TTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTG:1 - chr2R 7314626 3' - blood 7066 2 55.17 CCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAAATGCTGTTGTTGGTGCGAGGTGCGATGGGAATTTGAATGGGGCAGGGGCGACACTATTCTATGGCCTGACTTGGCC:1 + chr3L 17181540 3' + jockey 4965 1 52.59 ATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGAGCGAGTGCGAAGCTCTTAAAGCTGTTGCATTTGGCCAGAAATCAGACAACGCAGAAGCCATTAATCCCAAGCTTCATCCACC:1 - chr2R 16519716 3' - FB 35 1 58.57 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGGTGATTACTCGCTTCAACTCTGACATCGCTTCGGATGGCATTTTCCGCACCGATTCAAATGGTAATTCCGAGGAA:1 + chr2L 10461273 3' - roo 8690 2 67.81 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACA:1 - chr3R 12046717 3' - Doc 35 1 56.85 GAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAATCGAAAAACTCATCG:1 + chr3R 12146736 3' + gypsy10 301 2 56.41 CAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGAT:1 - chr3L 22320164 3' - jockey 77 1 63.70 ATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACA:1 - chr3R 23644844 3' - diver 43 2 56.16 CCCAAGAAATTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTC:1 + chrX 20999588 3' - BS 59 1 62.76 ATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATTTTTAAGATACTCTATATGCAAGTTTGGCAAAAGTGCCATAAAACTGATTTATCAGCTTGTGTTTTATTTTTTCCTTTTACGACTCGTACTCGATTTCAAAT:1 - chr2L 8536484 3' + Juan 4201 1 71.03 TGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTG:1 + chr3R 15727976 3' + 1731 301 1 69.66 ACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGCGAAAGGCGAAAACAAAAATCAAATAAATGGCAATTTAATACACTCAACATGCCATTCG:1 - chr3R 7625300 3' + hopper2 1548 1 57.53 TATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTCTATAAAACACCAATAATTCAATTCAATTGACAAGTACAGAGTATATGTATCTAAATATTTTTTTAAATAATTCAAT:1 + chr3R 23644979 3' + diver 180 2 54.79 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTCTCCCTCATGCTCGGGCATCT:1 + chr3R 6419937 3' - Tabor 63 2 59.86 CAGAATCTGAATCTGAATCCAAATACGAGAGTCCTGGCGAGCGGGGATGACGCTGCTGACTTTTCAACAAGCTCCTCGCTACCCGCTACCCGCTACCCGCTGCTTTATACCTT:1 + chr2R 20496319 3' - transib2 2529 1 61.06 AAAATAAAAGCAAATAAAAATATTTGGCATTTAATGTATTATGTTTTTTAAATATATACCTTTAAGTTTATGTTATGAGCTGAATTACCGATATTAAATTAAAGAAGTCGTTAATACATTTATACTACAAATTGTTTTTTAAGTA:1 - chrX 20991099 3' + HeT-A 326 1 67.59 TTTGCTTAATAAAACGCAATTTTTTTAAATATAATTAAACAATTAATCAAAAAACAAATTAAAAATATACTCCTATCATTTGATGACAGTAGCTACGCTAAATAAGTACTACGCTAATAAGTATCAAAAATGGAATCATTAGCTT:2 + chr2R 1647626 3' + S-element 76 1 57.93 TTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTAT:1 + chr3R 27606675 3' + 412 405 2 76.03 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTT:1 - chr2R 12462118 3' + roo 9019 2 53.42 GAATAACAATAATAATAATATTAAGTGATTTGTATCCATAACTGTTATCCTTAAGGATAATATCCATCACCTATATATATTTCTCAAACCCTTTCGGCTGCAAATCCCACAAGCTGCTGTTCACCAAGTGTATCGTTAAACAGAT:1 - chrX 4284373 3' + mdg1 30 2 68.28 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTT:1 - chr2R 12462111 3' + roo 9026 1 54.11 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCTGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGT:1 + chr2L 17019174 3' - 412 62 2 60.96 CAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGT:1 + chr3L 10033636 3' - blood 122 2 40.83 TTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAGTTGGACCCTCGTGCAAAAT:1 - chr2L 19248105 3' - mdg1 26 2 66.19 CCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGCAGTTTTTCTTTTTGCTC:1 + chr2R 6526621 3' + jockey2 3338 1 65.75 ATTGTACTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTCTGATCTCTGCTGCCTTTTCGGTCCGGCCTATTTGTGTCAGCCAACGGTTCAGTT:1 - chr3R 27606552 3' - 412 12 2 69.18 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTAATGCTACCTTCATATTGTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGTTTCTGCGCACATAAATATATAAAACAAATT:1 + chr2L 11523163 3' - HMS-Beagle 6840 2 54.11 TTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATCATGCTTTTTTTTCATATAAATTGAAAAACAGAATGCTTAAGAGGCTTAACTTTTGCAGCACAATATTTATGAAATTAATG:1 - chr3L 14888739 3' + flea 4977 2 59.59 ATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAACAACACTAAACGAACCGGAAACATTATTAATTAGACGTATCAACCAGATTTCTGGCTATAAGC:1 + chr3R 13339114 3' + BS 5039 1 54.79 CGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGCGCTTGGGATATTTACAATACAATACAATGAGTGGATGTGGATTGTGTGAATTTTGCCATTC:1 - chr3L 25482886 3' - accord 35 2 51.67 TGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTTTGGGTATATG:1 - chr2L 18525578 3' - pogo 34 1 61.81 GGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCAATAGTCCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTGGGTCTGGGGGCTTAGATGTGTG:1 - chr3R 21794026 3' - hopper 26 1 61.72 TTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTG:1 - chr3L 17181439 3' - jockey 71 1 58.90 ATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAA:1 + chr2R 6493349 3' + copia 202 2 75.34 AAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCACAAGCTTAAATT:1 + chrX 6538751 3' + pogo 2036 1 63.70 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAAT:1 - chr3L 9317954 3' + P-element 2849 1 61.38 TTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTTTCATATATACTTTTGGTCTTTGCACACATAAA:1 + chr3R 18128548 3' - roo 47 2 52.74 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAATTATTCATTG:1 + chr3R 13406545 3' - pogo 7 1 71.67 CTTGAAAAAAATATATATAAAAAATATAAATACCTTTTAGGCATGAATGTATATCATTAATCGTAATCATAATTTTTTCTCAGTGCATAACCGTAGTAAACTACTAAATCAAGTAGCCAAGCAGCTCCAAAGGTAACAA:1 + chr3L 7002164 3' + mariner2 787 1 54.68 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCC:1 + chr2L 13033413 3' + hobo 2899 1 52.42 GCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATC:1 - chr2L 7633363 3' - Max-element 8299 2 62.76 GGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGATT:1 + chrX 684882 3' - jockey 4754 1 72.41 ACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCG:1 + chr3R 13406497 3' - pogo 56 1 68.60 AGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATAAATATGTATATATATATATCAAATAAGTGCAGTGGATGTCCAATCATCTGATTCTCAAGAACATTAATCAATGCGTTTACATG:1 - chr2R 6801580 3' + 297 363 2 65.07 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTTTGGTTTCTCAGTATTCTCTATAATTGTTGTACTCGA:1 + chr2R 9453416 3' - roo 8684 2 71.03 GAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTCCAGCAGACAGTAG:1 - chr3R 16475343 3' - mdg3 5323 2 64.38 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAAC:1 + chr2R 14821213 3' + roo 338 2 63.70 TGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGTTCATCACTCCAACTCGTTTCGTCGCACCTGAGGAAACTAATTTGAAAGTAATTTGTTT:1 - chrX 12979392 3' + transib2 2814 1 78.77 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGTAAAAGACATTTCTCTATGGTGTT:2 - chr3R 27547600 3' - 17.6 6955 1 63.01 AAACCAAAGAAAAAAAAAAACATT:1 + chrX 8525588 3' + gypsy7 5008 1 83.33 TGCTTATCTTGTTCACAGAGATATACAAGGTCTTTAACACATATAACACGTATAAGTGTTACCGTCTTTTCTGTTGAATCAAATGGGGAAGTTGGTCAGTCAATTATCAATCAAATTATCAAATCAACGTGATGGAACATGCAATT:1 + chr3L 24916725 3' - Porto1 148 1 38.36 TACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAAATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAA:1 - chrX 6538662 3' - pogo 72 1 67.81 TTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTAAGAGAG:1 - chr2R 21713246 3' - P-element 72 1 34.93 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTGATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAG:1 - chr3R 28014134 3' - roo 51 2 78.57 CTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTTTCATCATCTCT:1 - chr2R 24215598 3' - I-element 5309 1 55.17 TTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCAACTA:1 + chrX 3533978 3' + 17.6 429 2 64.38 AATCTATATTATTTTTTATCAATTCTATCAATTTTATTCTAGTGTCTTTGGTTAAACCCAAGTTGATTGCCTTCACTGGCAATTTAAAGGAAGTGCCAATCCAAAAACTAAAGAACAAGATTTACAACTTCAATTGCAATGCCTTA:1 + chr3L 16047750 3' + 1360 253 1 31.51 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAAGCTTTCCCATGAGATCTAAGGTTTTTTTTT:1 + chr2R 14884199 3' - roo 8710 2 54.11 AAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAAACTTTAATGTCCG:1 - chr2R 5179557 3' + 1360 3346 1 54.48 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTTTTTTTACGTTCAAATTAATT:1 + chr2R 9341696 3' + roo 9048 2 67.81 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACAAAACCGA:1 - 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chr3L 10778547 3' + Tc1 1466 1 90.32 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTAC:1 - chr2R 24427530 3' - 1360 65 1 62.50 TTTACCAACGTAGACTGCGGCGTCTTACAAGCGCTGCATTATATAATTGGTTGATAAGAACCTATGTAAGAATGAATAAAAGGCGTGTAAATAACGGAGTAAAAGAACGCGAGCGAGGAACCGTAATGCGAGTAG:1 + chr2R 9875396 3' + rooA 219 2 62.96 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTT:1 + chr2R 10977222 3' + roo 9031 1 55.00 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTG:1 - chrX 20361981 3' + hopper2 1526 1 77.14 ATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATATAATCGGAAAGAACATAGCAAAAGAGTAATCCTTCTGTTTGGTATTACACATCTATTCATTAAAAAATGTTTCAGATTAT:1 - chr2L 12993313 3' - mdg1 7080 2 57.53 CTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTCAGC:1 - chrX 22679635 3' - Doc 59 1 47.20 ATACCGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAA:1 + chrX 8968685 3' - 1731 83 1 71.92 GCACCCGCTTGACCTTACTCAACATACTTAATCATACTTAACCCCTACCCAAGGACACGCCGACGATACTGGCAAGGATATTCTGGAAAGCCCCGTAGACGGAC:1 + chrX 20323742 3' + G2 2930 1 57.69 AAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATAT:1 - chrX 6216342 3' - Juan 4029 1 69.86 AGGCCAAGCAGGGAGTAAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATC:1 + chr2R 17493142 3' - BS 4893 1 80.14 AGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTGCATCCCAGCACCGCCCAC:1 - chr3R 27452014 3' - hopper 78 1 78.40 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCCCGACGATCATACGCGG:1 - chr2R 16274566 3' + roo 8998 2 71.11 CCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCC:1 + chrX 15286941 3' - X-element 4406 1 67.01 CACAGCTGCANTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTG:1 - chr3R 27315084 3' - jockey 4693 1 50.00 CAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAACCATCTATATTAAATAACTTTGCTATTTCAATGTGCGGATGTCAGCCCAATAATTAAAAGCTAACAACTGCAGCAATCAATTG:1 + chr3L 11904892 3' - copia 4907 2 58.22 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAGGCTAGACAGAGATCTCCTAGGCTGTATATAAAAACTA:1 - chr2R 5953936 3' - flea 4808 2 67.52 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTC:1 - chr3L 12802126 3' - 412 7123 2 65.75 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAAATCTTTTTAATATAAAAGTGAATTACTTTTAGCAGCGATTTCCGAGTGT:1 - chr3R 28438285 3' + mdg1 7429 2 63.01 TTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGAT:1 + chr2R 9607389 3' + P-element 2873 1 65.66 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAAAGTAAAA:1 + chr2R 4816980 3' + blood 7343 2 56.55 TCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAA:1 + chr3R 30569109 3' + mdg3 220 2 52.52 AAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTGCAATTTAAATTTTTAAATTAATTAAAAAAATATTTATCTTCCTTATAAAACCATAT:3 + chr3L 15393806 3' + pogo 2040 1 65.07 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAA:1 + chr2R 9376707 3' - hopper 88 1 76.03 TTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATG:1 + chr2L 6637464 3' + 1731 4554 1 69.18 ATATATATGTATGTATATATATATGGAGTAATAATAATAACTTTGCTAACTTTTAATCGATTGTATTCGTCGCACATCATTGTTTGTATCGCCATTAATAATACAATTAATCTAAAAATAGTAAAGGATACCTTCTATGAAATTGT:1 - chr3L 14957556 3' + 1731 4409 1 70.55 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGCTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGTCTAGCCT:1 + chr2R 5953953 3' + roo 401 1 77.40 ACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATCTTTATTTATAGCACCATGTTCTGATTGTACGGCACCTGTGGCTCTCTTAATTTGTTGCAA:1 + chr3R 16475436 3' + mdg3 187 2 54.79 CCTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCAC:1 - chr3R 31045726 3' - INE-1 137 1 67.72 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTAC:1 - chr3R 5870793 3' + roo 352 2 54.79 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATGATGTCGATACATACCGACACAACTTGATTGAAATGCATG:1 + chr2R 9618235 3' + roo 9032 1 56.85 AAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTTACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAATATATTTTTTTCCGAGGCAAAAACTTGTGGCGATCGACTTCTTCAACATTCAC:1 + chr2R 5674730 3' - S-element 76 1 67.12 AGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGGTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATATATACCTTTTTTTTTGAGCACTTAGCGCGCTGACAAGTTGAAGCTTTG:1 + chr2L 15420088 3' - Burdock 68 2 65.52 AAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACACTATTACCTTATTTTTTCACAATTTAAAAAAGTGTTTATCTAACGTAATATTTCGTACTCAACA:1 - chr2L 12158760 3' + 1360 3342 1 56.43 AAGATCATCGTTATTATTGGGTTTGGCTTCAGAGACCTTTTGGCACGCGTAGTTCTGCCCACGTCAGGGCTCCATCAAACTGTTTCACTTCCGGAGCCGCTAAAACTAAAGCGAGCCAATGCAG:1 - chr3R 4833368 3' - Tc1 1210 1 66.94 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAA:1 + chr3R 26242549 3' + roo 341 2 66.44 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCAT:1 + chr3R 28618438 3' - 412 7121 2 68.35 AAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACT:1 - 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P-element 76 1 28.68 ATCTAAAAATAGAATTTGCTTGCTTGTGTGAGTGGAAACAAGAGACGAGAACGCGTATATGATTTTCGGGCCGAAATAAATTTCCCAAACGTTTCTATGGCAGCTGAAGAATGTTAGTCATCAGCTTCGGATCAAAGTAAACATT:1 - chr4 612232 3' - 1360 3267 1 56.55 GCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGCCTGAACTCACACCCTTTTAACCATATTTGCAGCTGCAG:1 + chr2L 20228026 3' - 1360 67 1 75.59 TTCAATTAGCATCGATATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGT:1 - chr3R 23644864 3' - diver 5949 2 56.16 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGTTTGC:1 - chr2L 10909463 3' - 412 33 2 58.90 TGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCG:1 - chr3L 414832 3' + 412 7502 2 53.24 ATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAGTCCACAAAATAAACACTTGAAGTTCAGTTTTATTTTATTATATAT:1 + chrX 2214352 3' - jockey 4572 1 73.29 ATCTGCTGAANCTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTC:1 - chr3L 11364802 3' + Tirant 339 2 64.18 TTTATTTACATTCTTGAGCATAATCACAACTTTTAGACTGTTCCGTTTCCATTTCATCTTCGCTGAGAATCTCTTCCTTGATTCTGACTTCTTCAAAAGGTGCATTATCCACTGGCTTGGGTTGGGGAGCCGGC:1 - chr3R 31675147 3' + HB 171 1 73.13 TCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCA:1 - chr3R 12948594 3' - Stalker4 7009 4 51.72 GCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCTAATTTATAA:1 - chr3L 7024472 3' - 412 7141 2 75.34 TAAAATCAAAAGAGGAAATTGAATAAATATATGTTAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGTCAATTCCT:1 + chrX 666358 3' + 412 7471 2 67.59 TTATCGCTCTNGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTT:1 - chr2R 5953818 3' - roo 64 2 66.92 ATAAAATATAAATAAAAACTTTAGACATGTACCTAACATTATAAAAATCAATAAAAATGTTTACTGCATAAACTTTGTATTTATATGTTTTATAACAATTAATAGCGAAGTTTTCATGATGTTTTGTTCTTTTAAGTACCGTATAT:1 - chrX 13691938 3' + mariner2 792 1 69.18 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATCCATAAATGAAATAATGTTGACTTCATTTGTTTGCCTTCATGACGTCAAAAAGGATACAA:1 - chr3L 7848421 3' - jockey 19 1 71.23 CTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTTGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCG:1 - chr3R 11284905 3' + blood 7350 2 54.39 CCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCAATTTCCAAACAATGAGCAACTTTGTGCTGACCACATC:1 + chr3L 9907411 3' - BS 5004 1 71.92 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTG:1 + chr3R 21794127 3' + hopper 1337 1 69.86 TACCCGTAACTCAGCTAGAGTGAATGCGGACGCGCAAATTTCATAATTTTTCTTGGACATCCATATATATTAGGGAATACAATGAAAAAAAAATGAAAAAAAATTGGCAAGGCAAATAATAAAACGAAGAAAAATCTTAA:1 + chr3L 24787907 3' - INE-1 539 1 47.14 TCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGGGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCACAGAACAGCTCATGG:1 + chr3L 11536008 3' + roo 9029 1 53.10 CGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATGCCAGTACATGTAGCAAGTTTTCCTTATTTCTTTTTCTAGCTAGAGAAAAGGAATATAGATGGATT:1 - chr3L 5051029 3' - flea 4808 2 54.17 ATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTATGTAAGCCCACTCACAGAGGACGCCGTGGATGTATGGGTGTGTAGGGTCTGAAATTTTGCACACATTTACAATAATTGTAA:1 + chr2L 17574651 3' + hopper 1382 1 61.64 ATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTAGTACACTG:2 - chr3L 9324405 3' - HMS-Beagle2 6898 2 73.97 TGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTATGTATATAGTAAATTGAAGTTCCCGAAATCCCATGATTGTCAATCTTGTGAAAGGTTCAGAGTCAATTTTAATTTTAAATACATCCCCCAGAGCGACCTGCCAGAG:1 + chr2L 1045111 3' + mdg3 231 2 71.23 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAGGCT:1 - chr2R 12492381 3' - hopper 15 1 67.69 AGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAA:1 - chr3R 13339039 3' - BS 5072 1 67.12 AAAAGGAAAGACAACAACTCTTTCGAAAGGACATCACCATTTATCCTAAAAAAAATCGGTGGACTTTGCCTGTGGAGGAGAAGGTGAGGGATGCAAGCGAACAAGAGACGGCGAATTCTACAAGAACTAAAACCACAAAAAGTAAC:1 - chr3L 17956674 3' + I-element 268 1 71.92 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAA:1 + chr2R 11558043 3' - 412 84 2 72.60 TCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATT:1 - chr3L 11364803 3' + Tirant 8433 2 68.49 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTGAAACTTCAACTGCGAAGCATGCAATATATTTTTGGGTCCG:1 - chr2R 8315511 3' + hobo 2904 1 56.70 TCTGATTTTTATTCACTAATTTGTAGTTTCCAATATAAAAGAACCCACATAAAGTTGCCAATGTGCAATACGTAAGGTAAGCCCGTGTTTGTTTATATTATTTAAATTATATACAACTTACTTTTTAAATAATCGTTACGGAACTA:1 - chr2L 3145779 3' - Bari1 323 1 73.29 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATACATATACGTTTTATGACAGAGAGTCAAAAACATTTTCTTTAATTTTCCTGCTGATTA:1 + chr3R 26180523 3' + Transpac 5172 2 63.01 TTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGGGAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTC:1 + chr3R 27452058 3' + hopper 1356 1 63.20 TTATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTGTTTTTAATCTTGGACATTT:1 + chr3L 171574 3' - Doc 4455 1 54.11 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACACATTTACACTAGTTAGTTTGTGTATAA:1 + chr3R 4962903 3' - jockey 66 1 54.79 GGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCGGCTTGTTCCTTTTGCAGCACTTCTTTCAGATGTTTCTAAAGTTGAAAAGCTATTCCTTTTCTAT:1 - chr2L 14262898 3' + P-element 2881 2 76.43 TAGAAGAGCGCGATCTTGCTCTCCAGCATTGGAGAGACCCAACAATAACAACCACATCCACATTTCCTCCAACGACAACAACAAAACTTGCAAGGTATTTTACCTATTCATTGGAATCGCTACCTGAAAAAACATCTGAACAAAAG:1 - chr2L 33793 3' + Porto1 342 1 73.29 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCAT:1 + chrX 9846803 3' + transib2 2764 1 80.56 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACAATAACAATAGGGCAACAACTGAAAACTGAGGAGAAAAAAAAAA:1 - chr2L 13033277 3' - hobo 22 1 60.96 ATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTTG:1 + chr3L 18183216 3' + Tirant 8482 2 67.63 TTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTC:1 - chr3R 12078585 3' + hopper 1377 1 60.27 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTTTAATTAAGTCTGAGCTGCGACTCGCTTTGTGCTGATGC:1 + chr3L 12991483 3' + mdg1 392 2 65.75 TCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAATTTTACCTGAATGTT:1 - chrX 17884467 3' - pogo 26 1 62.33 TGCTCCTTCTACCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTAATTATACATAGCCAATCTAGTCATAAGCTTATACACTCAATCTCATTCACAAAGAAATTCCATTTTCCTAATATATTGTGAAAAAGATGTGAGATTAAGTA:1 + chr2L 1042589 3' + mdg3 5263 1 57.24 CTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAATGCATTAATATGAAAAATTATTATATTATTTACTTCGTATCCCAAAGAAAGCTTCTTTAATTTTTGACAACCT:1 - chr3R 10420856 3' + Tabor 435 2 50.68 ATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCCATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGTGCTTATTGTCACNAATTTATCAGTGA:1 - chrX 3533890 3' - 17.6 62 1 71.03 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATACCCGTTACTTGTAGAGTAAAAGTATGTAACAGGCAGAAGAAAACGGTTCTGACTATAGTCAAAATTATATATATTCTT:1 + chr3L 9220097 3' - 297 6612 2 58.27 AATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTATGCAAAGACACATCTTTGATAGTAAAACACTAAGTGTGGGTGGTCTGAGCGTTTATTCTAATTG:1 - chr2L 21198152 3' - flea 4804 2 55.17 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATAGAATTTTTCCAATCCCGATTTTGATTCCTAGACACGGTTTTATTTTTTT:1 + chr3L 13993683 3' - P-element 40 1 56.85 GACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAA:1 + chr3R 31112297 3' + mdg1 7418 2 55.48 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTACTATTCTATTCCAAACGT:1 - chr3R 15003139 3' - Doc 70 1 69.23 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACATTTTAAAATTTTTTGTACGACAATTACAGTAAGTACTTATTA:1 + chr2L 388653 3' + roo 9045 1 65.52 GTGCATAAACATAACCATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTTCTCGGCACCG:1 + chr2R 14009086 3' - 412 78 2 71.53 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAATACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGAGCACGACGATCATACGCGGGGCATGCCATTAACNGGGAGTCATCAGTT:1 - chr2R 16274537 3' + roo 351 2 53.42 CTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTTTCATCATCTCTGCCTCCTTTCAGATACTGCTGTATCCCGCGGAGG:1 - chr2R 24215564 3' - I-element 5270 1 76.43 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAGAAAAGCACGGCAAACGAGTGAAAATGGATAAGTGAAATGGATAAGTAAACGAGCAGCAGCAC:1 - chr2R 11153092 3' + roo 9054 2 72.60 ACCTATTTAAACCTAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATG:1 + chr2R 5953896 3' + roo 343 2 62.33 TAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTAT:1 + chrX 20149228 3' + pogo 2045 1 64.93 ACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATNATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATNCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATCACCCTTGATGATGT:1 + chr3R 15727983 3' + 1731 307 2 71.23 GACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAAAACTATTTTCAAAAACAGCGCAGTGTGATCATACTGC:1 - chr3R 18346556 3' + INE-1 580 1 79.17 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGAGGTGTCTGGGTTTGCATTTGAAATTTATA:1 + chr3L 22021764 3' + mdg1 7414 2 54.79 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTG:1 - 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chr3R 31906756 3' - HB 1568 1 65.75 TATTATTATTGTTATTATTAATTGAGATCTTTTTTTTTTTGTTTCGTGCTGTGTACCAAGGCTGTGAATGCAAATTGGAGAAACGTTTAAAGGAGAAGGGATGGCGATCATTAGTCAAATGTG:1 - chr3R 18124294 3' - mdg1 7063 2 56.10 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGG:1 - chr3L 7389713 3' - roo 72 2 69.44 AAAAGAAACAAAAAAAAAAAGAATTCATGTTAATAACATTTACTGCCCACAATTTTTTCGTTTTGGTAGACTCGTTTGTCGTTTAACCGCTTTGATCGGTG:1 + chr2R 17368966 3' + Doc2-element 224 2 55.45 CATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCAATAAAATGAGGGAAATTCGCCAGAAGGAAAACCTCG:1 - chr3R 27315041 3' - jockey 4700 1 62.50 AAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTACATGTAATGCTGATCTTGAGCAGCGCGTACAGAAGGAATGTAATGTCCGCTCGCTCTGGACTTTGGTAAGCGTGGGACTGACGGTTATGCAGTT:1 + chr3L 25206951 3' + HMS-Beagle 236 2 76.87 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCTTTCACTTTAAGCACTCCTTTCTTTACCCTTCTAATGCTTGTTTGTCTCCATTTCCGTTCACATTTTCTGC:1 + chrX 21443067 3' - Transpac 4972 2 51.37 GTGTTTCTTTTCAGCATATTTGGAAAATTCCAGGACAGCATCCCCCTACAACGCAACATTTTGGTCCTTTCTAAGTCCAAATTTCCGAATATATTTAAATATTAATCCAG:1 - chr3R 20005368 3' + GATE 8453 2 61.82 TATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAATGTGCG:1 + chr2L 15019989 3' - BS 4832 1 60.27 GCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATAAATATACAGATAGTATAGTAAATGGATACGGGTTCAGTCCGCTTTGTACTCTCAGGTTCAATAACTGCG:1 + chr2R 15474586 3' + Quasimodo 7324 2 56.16 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAATGTTGATGTT:1 - chrX 17792498 3' + roo 9031 1 58.90 CGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGATCGCCCGTGG:1 + chr2R 9607398 3' - P-element 27 1 61.16 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGAACATTCGTCTAAACAACCCGAACGAAATACCACAAATTACGTTCAACTTTTAAATGAGTGCTAAACAAAAT:1 + chr2L 18525734 3' + pogo 2078 1 67.41 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTTTTCACCCAGCGTTTCTCTGGCGAACAATGGAGCTGTGGAT:2 - chr2R 21795962 3' + roo 401 1 76.03 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGC:1 + chr2R 9836591 3' + P-element 2784 1 14.48 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCGCTACCAATATCCGCTACTTTAACTTCTT:1 - chr3R 31159221 3' + hobo 2890 1 71.84 TCCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTA:1 - chr3R 20904955 3' + roo 9017 2 57.53 CGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCAATCCAGCACTTTCCATTTCGGTGTTTGGCGTTGTTTGGCCATCACGTC:1 + chr3L 7751150 3' + 412 7510 2 60.00 ATAAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTT:1 - chr3R 24480489 3' - blood 92 2 79.31 CAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCT:1 + chr3L 20187399 3' + FB 452 1 65.75 AGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACATTTTAAAATTTTTTGTACG:1 + chr2L 388630 3' + roo 358 2 51.03 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAACATACATACATAAGTGAAAAAGTCCCAAAAGAAAGATTTCCTTTTAAACATGA:1 - chrX 6538609 3' - pogo 19 1 63.70 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTTATATTGTTAAGC:2 + chr2R 6801728 3' - 297 6626 2 55.48 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGTGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCACAG:1 + chr3L 11535996 3' + roo 9016 2 56.16 TAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGTTAATTAATCAAGC:1 + chr3L 9318093 3' - P-element 2876 1 55.48 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCATTTAAAATGTCCTAGTCCAAAACACCGAGAAGAAGGAGTAGCTCGGAACTCAAGAAATAGCGACTACGAGGA:1 + chr2R 16274653 3' - roo 8681 2 64.60 AAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAAATGCTGTTGTTGGTGCGAGGTGCGATGGGAATTTGAATGGGGCAGGGGCGACACTATT:1 + chr3L 17181522 3' + jockey 4936 1 60.96 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATATT:1 - chr3R 22320463 3' + roo 9010 2 60.96 TCAGAATCTTTGATTGTGCTCGCTGAATGATGTCAATATTGCTGTTGCTGGCATTGCCCCATAACTGTGAGCCATAGGTCCAGATTGGTTTCAATATAGAATTGCACTGCCAAGACCAGTTGGATAGCCAATCTATTCGTGCAT:1 + chr3R 21371627 3' - F-element 4325 1 75.69 TCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTGGGTTTCTTTTATAGTTCCTAAATAGGTTGAATTA:1 - chr2L 8284332 3' - Doc 405 1 61.38 CACCCAGGACACCAGTTTGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGATGTGGCGTGTTAGAAAGTATGTACATGCATATACTCCTGCATAGCAGAGAGTATATGTAGAG:1 - chr3R 1944511 3' - Rt1b 4827 1 58.90 CTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGCTTATTTTGTTAAGATTTTTATTTTCAATTCGCATCGCTGACTGCCGCAAAGTATGCAGTGAATATTCCTTTTT:1 - chrX 22603131 3' - jockey 4718 1 52.05 TTATTTTTAACTTTTTATTTTTTTCGCATTTTACGGACAAACTTGGGCGGGCAAGTTGGCTCATGCTAGA:1 + chr3R 24428117 3' - P-element 2694 1 80.00 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACCCATAAAACCCAACCCAATTATTTGTAAAAGGTATCTTTAATT:1 - chr3L 7024405 3' - 412 7073 2 70.34 TGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCAC:1 + chr3L 414949 3' - 412 44 2 52.59 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGCAATGGCTATTAGAAAC:1 + chr2R 8442729 3' - blood 54 2 57.78 TTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTT:2 + chr2R 9341676 3' + roo 9028 1 54.11 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCACATTATGTTATATTATTGTAGTAAGTTGATTTGATTCATTTCAATTGCTTAGCATT:1 - chr2L 2544692 3' - blood 7025 2 71.92 GAAATCTTCACACTACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAAC:1 + chr3L 18183167 3' + Tirant 8426 2 74.66 TGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGGATCCAGCGTAGTTCACAAAAA:1 + chr2L 12236815 3' - jockey 69 1 68.80 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTTCCATTTATAACA:1 + chr3R 6685857 3' - 412 7091 2 59.59 CTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAA:1 - chrX 609391 3' - 1360 86 1 77.40 AAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATCAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGA:1 + chr2L 15019934 3' - BS 4866 1 73.60 CCCTAACCATCTGGCTATAAACCTCCTGGACAACAGTGAAACCATCAGACGCCTCCAGAGGAAACACCCGCTTGATCTCCACCACCCAACACCCATCCACTTCGCTAACC:1 + chr2L 6821607 3' + G-element 4116 1 76.36 GCCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTGTACGAGTAACGGGTATGCTGAATAGACAAGAGGTCACAAATGGATCCAAACCGAGATTTTCAAACGGCGAAACAAGCTGAGACACTTTACGCTTGGATG:1 - chr2L 21936058 3' - INE-1 19 1 40.56 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGA:1 - chr2R 12492393 3' - hopper 43 1 53.42 GATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTTCAGACAAACTTGTGCGCAATTT:1 - chr2L 4864360 3' - mdg3 5302 2 52.05 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATCCGAGTCATTGCTCCACTTTGTCGCAA:1 - chr2R 9750140 3' + opus 456 2 56.30 TATAATGTTCTTTATTTTAACATAAGAAAGACTGGTTTGCTTTTCAGGGTCTTCGCTGGAAATACTTCTATTTGAGCATTTTTCCGGCTTCATAAAAAGTCAAACCACACAAGGTAAAGACCGAATGAG:1 + chr3R 9176967 3' - Circe 473 1 76.74 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGGATGAGCAATGTCTGGATCTTATCAGTTCGGCAAGGACTGTCAGTCTGGCTACTTTCTAACTA:1 - chr3R 17627501 3' + roo 9016 2 59.59 AACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCAAAGTCCCGTAGTTTAACAACCGGAGAACGCTA:1 + chr3R 21925166 3' + hobo 2889 1 66.67 AATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGNGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTNATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTNCCTCCCGAAATTT:1 + chrX 16998393 3' + diver 6045 2 61.38 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGCTAAATTCCCCAAGCATCAAGACGTCACTGTTCCCAAAA:1 + chr2R 19230603 3' - I-element 38 1 54.20 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTAAATACGGCCAACAGTCAATTAAATTCCAGCTCGGCACC:1 - chr3L 17268264 3' + hobo 2891 1 69.09 TAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTAACCTAAGTACTTCA:1 - chr3R 13868909 3' + HMS-Beagle 6987 2 58.22 ATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTGCG:1 - chr3R 19950443 3' - BS 5052 1 58.22 AGTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGA:1 - chr2L 15019894 3' + BS 5012 1 72.60 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAATATATTGTCAATTAAAACTAGCTAACACCTTAATTCTCTGACTTAGTCTGTGAAGTATTGAAAATTTAACGA:1 + chr3L 3317378 3' + pogo 2069 1 58.02 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCC:1 - chr3R 17077823 3' - 1360 51 1 64.52 GCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAG:1 + chr3R 15727915 3' + 1731 4551 1 67.81 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCACTCAAGG:1 + chr3L 414955 3' - 412 7102 2 52.74 GTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTG:1 - chr2L 21683385 3' + pogo 2048 1 58.70 AAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTACGGTTAATAAATTTACTGATCAATATTACTCGTAATTTGTATATATTGCAAACAGTGATTGGTCAAAACCTCG:1 - chr3L 11904755 3' + copia 208 2 49.32 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATC:1 - chr2L 4244877 3' - 412 59 2 58.90 GCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGC:1 - chr2L 7633377 3' - Max-element 64 2 69.47 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGTTGCTCATCACTTATGGCCATTATGTG:1 - chr3R 24071992 3' - jockey 24 1 77.04 GGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGATCT:1 + chr2R 4261968 3' + invader4 274 2 57.89 TAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATAAATAAATGTGTGTATTTGGTGGCCATAATGCGCATAG:1 + chrX 18582233 3' + I-element 5268 1 76.71 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAG:1 + chr2L 14263033 3' - P-element 40 1 47.79 TCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTG:1 + chr3R 8112794 3' + Burdock 6326 2 69.57 AATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTTAGTTTGTGTATGGAGTTTTGGGATTTTGTTTAACAGCCGTCAGACTGCAAAACTTGTGTTTGGTCGGCGCTGCCGCAGTCCAGACGTCAGTCGTTGCCG:1 - chr2R 1070815 3' + FB 335 1 68.75 GATAACTGTAATTATTAACTTATATATACTTTATACGATCGGAAACGCTTCCTTCTGGGTGTTACATACTTTTCAACGAATCTATTGTAGTATACCTTTACTCTACGAGTAGCGGGTATAAAAAATCAATAAAGAGCACACGAATT:1 + chr3L 20108220 3' + HMS-Beagle 247 1 80.14 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGACGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACT:1 + chrX 19887007 3' + P-element 2800 1 27.40 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGT:1 - chr3R 19965184 3' - jockey 34 1 66.90 CTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGATAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAACGCACCGTTGCCTTAAGCT:1 + chr3R 1844867 3' - Cr1a 153 1 51.37 ATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATGATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAA:1 + chr3R 22320546 3' - roo 8742 2 76.71 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTG:2 + chr3R 17243208 3' + hopper 1348 1 63.01 AAATACAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAGAAAAGCACGGCAAACGAGTG:1 - chr2R 11153134 3' + roo 9032 1 50.79 ACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTA:1 - chr2R 7314635 3' - blood 65 2 59.59 AGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGAAAAGTTGGGCAAATAAATAGAATTCGAATGGGAATGCTAATGAAGCCATTATTATTTTATGCGCTATTTAAACAAGACCAGCTTGCAACGCAACGCAGCGCCACCCT:1 + chr2R 18373844 3' + jockey 4949 1 71.23 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGAT:1 - chr3R 11516526 3' + roo 8990 2 73.29 GGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTAT:1 - chrX 3533857 3' - 17.6 40 2 58.90 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATACATATACGTTTTATGACAGAGAGTCAAAAACATTTTCTTTAATTTTCCTGCTGATTACAAATT:1 + chr3R 26180529 3' + Transpac 5178 2 58.90 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAATTGCATCACATATTTGAGCTGAAATTTTGTAGC:1 - chrX 5841908 3' + roo 9009 2 61.38 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAATCA:1 + chr2R 17350614 3' - F-element 61 1 53.42 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCGATGCATCGGGTAGCTATAACGTAGTTTGCTATTGAAACGAATTTGTTTGGCCAAGGGATCTTCTAAA:1 - chrX 8681378 3' - jockey 17 1 76.71 TTACAAAAACNCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTCTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTAATCAAT:1 - chr3R 20904924 3' + roo 385 2 66.44 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAGAAACTTAAAAA:1 + chr2R 6493398 3' + copia 251 1 58.22 CGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACATCTTTTATTAT:1 - chr2R 24427539 3' - 1360 74 1 68.75 CATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGG:1 - chrX 20361942 3' + hopper 1398 2 66.67 AGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAGCGGAAAATTCAACAGTTGTGCAGAAGCAGAGGCAA:1 + chr2R 9376764 3' - hopper 24 1 66.19 ATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTATTTTCGCACCGCCTGAG:1 - chr2R 9376621 3' - hopper 49 1 52.74 ATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATAGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGT:1 - chrX 20361945 3' - hopper 16 1 62.73 CGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAAGTGTCTTTGGCCAAACCAATGTATGTCCGTTACACATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' - blood 126 2 34.03 GCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAGCTTATTTTGTTAAGATTTTTATTTTCAATTCGCATCGCTGACTGCCGCAAAGTATGCAGTGAATATTCCTTTTTTGTTTAAGGCCGCCGCGGCAATTAGTTTTGTC:1 - chrX 22603099 3' - jockey 4686 1 73.97 ATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCC:1 + chr2L 18219423 3' - copia 4911 2 56.16 GGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGCGTCATCAGTTTAAATATGTGCAGCTGATAAGAAGTCGGTGGTGCGGAAAATGT:1 + chr3L 2907419 3' + 412 461 2 63.01 TTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTAAAAAACGGGGCTTTGGTGTTGACAAGCGCGTTG:1 - chrX 683574 3' + jockey 4908 1 78.77 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACCTC:1 - chr2L 10461097 3' + roo 9051 2 71.23 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATA:1 - chr3R 19965208 3' - jockey 37 1 58.87 CAGGAGTCAACGAAATTTCATTTTTTTTTTGTTTTAAATAAAAGTGTGTACATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTGTGACATTTAGCTTTTCACTTAAATAGGCCAGAAGTTACACTTGTTTATGGCCAATAT:1 + chr3R 22646958 3' - transib2 2657 1 59.59 GGTGTTGCAGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAACCAACCACAAAGTAAACCATATTT:1 + chr3R 25597899 3' + copia 5040 2 79.26 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCAATCAAATTGTGCTGCCATACAAATTNTTTACT:1 - chr3R 21925056 3' - hobo 22 1 69.86 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCAT:1 - chr3R 14608693 3' - jockey 68 1 58.22 AATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGAAAAGACCCATTAAAATATGGCCAACTGAAGCAGGCATATATTTTTTATG:1 + chr3R 8050540 3' + hopper 1350 1 62.76 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATA:1 - chr2R 15392523 3' + mdg1 7396 2 60.69 TTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGGATATCATT:1 - chr2L 512407 3' + roo 9027 1 52.41 CCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCG:1 - chr3R 9298461 3' - hopper 37 1 53.60 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCTTGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTCCTGAGATCCGATATT:1 - chrX 19662974 3' + P-element 2852 1 39.60 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATGGCGAATCAAATAATTCAAGAAAAAATAAATTTAGCTTTAACTAACAACAATAACCAGGTCATTCTTAATAGGGTTATC:1 + chr2R 943923 3' - F-element 55 1 50.34 AATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATAAACATGCATATATGTGTTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAACTAGCAGGTCAGGCGAGGACATATTGGGGCCATCGGGCCG:1 - chr2R 22063066 3' + G3 4506 1 68.49 CTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACGTCCGGAAAAGTGGATGGAAAG:1 - chr3R 29627814 3' + roo 409 1 80.34 CGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGGAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGAGCTCATGTACCGCGTGCTCATGCTGCAG:1 - chr2R 24422042 3' - Doc 452 1 75.20 GCGATCAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGACATTCATTAGTTTATCGCCCACTGGCAACTGTTGGGTCGAAAGT:1 + chrX 14735808 3' + diver 127 2 69.86 TGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTAATGCTACCTTCATATTGTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGT:1 + chr2L 11523133 3' - HMS-Beagle 6870 2 73.29 TGACTATGTGTGCGTGTGTGTGTGTGTCTCTGTACTTGTGTGTGTGTGCGAGAGTGCATGTGTTTGTGTTAGCCGCTGAGTGCGTGTTAGCCGCTGAAACTGGAACTTCAAT:1 - chrX 14348149 3' - accord 186 2 78.57 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCT:1 - chr3L 15148602 3' + roo 324 2 75.34 TTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTA:1 + chr2R 17350580 3' - F-element 87 1 69.57 GCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGCTCACCTGTATC:1 + chr2R 20972739 3' + jockey 4947 1 50.68 GATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCT:1 - chr2R 12462115 3' + roo 9023 2 51.72 TTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCAACACCATGGATCCGCCAAAAAAATTTGCATCTGCAGATGA:1 - chr3R 25798337 3' - hopper 30 1 65.07 TGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGGCGAATATGTCCTGGTTGCCGGGAC:1 - chr2L 15523024 3' + 412 7490 2 55.17 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGACAGAACAAGACGCATTTGATTTTGTCCAATCTGATCGAATCGCCCAAGTTCT:1 - chrX 8038585 3' - 297 18 2 68.60 GAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATGTGCTGG:1 + chr2L 13033452 3' + hobo 2931 1 73.28 TTAACTACATCAGAAGCATTGGAATTCTAATTAACTACAGAAGCCCAAGTAATTTAATATTGAAAATAATTACAAAGTCTTAAAAGGTTTATACCATATGTACAAAGAACAAATAAATAATAATATAATAAATGTAACCATTTACA:1 + chr2L 19248278 3' + mdg1 7442 2 71.92 GACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACAATAGCCATTCGG:1 + chr2L 12932218 3' - opus 10 2 75.97 TTATTATTATTATTGTTATTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCCTGCTTCTATTTTGTCACCGC:1 + chrX 21947766 3' - mdg1 7067 2 68.38 GTTTTTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGG:1 - chr2R 19574450 3' - I-element 5178 1 76.92 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATA:1 - chr3R 22320465 3' + roo 9008 2 62.33 TTATCCTTTAAGCTACACATTAGGTGAAGTTCAGAAGAAACTGAACGATTGCTAATGAATAATAAATAATTATAATTAAAAGGCTTATTTGTCACATTTTCTCCATTTATTAGAACCCATCGATCCACCCTCGTTTTTCTAGCTTT:1 - chr2L 15204004 3' + G5A 2774 1 76.03 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAG:1 + chr3R 22320548 3' - roo 8740 2 72.60 AGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAAATTAAATGACCACAAGCAGCCTGGTTCGCCAAAAGGA:1 + chr2R 1515964 3' + Juan 4129 1 76.03 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTT:1 - chr2L 4244895 3' - 412 77 2 71.23 CGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCTTCTGGTCGTAGGGGAAGCTTTTCT:1 - chr3R 7074791 3' - P-element 53 1 52.74 CAATATTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAATGGTTGTGATAGCGCCAGTAAAGAGCATAATTTATAAGCAGCGAGTCATAGGGACTCAATGTTGTTGTCATG:1 + chr3R 25798480 3' - hopper 36 1 55.00 TGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATA:1 + chr2L 16884943 3' + pogo 2086 1 70.80 GATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAGTCCACAAAATAAACACTTGAAGTTCAGTTTTATTTTATTATAT:1 + chrX 2214350 3' - jockey 4573 1 72.41 CTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATACAATTTGCTACATTGAGCATTTAGAATCCATATTTTTAAGATTTAAGTA:1 - chr2L 10536476 3' - flea 4818 1 66.67 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATA:1 - chrX 6891460 3' + hobo 2875 1 65.93 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAA:1 + chr2R 14884169 3' - roo 76 2 73.29 CGCTCTCTAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGACGCATCTTGTTATTCTAGTGTTCTTGGTTCACCGGTGACGGTGAGATTTTATACT:1 - chr2R 4830331 3' - 1360 92 1 92.41 AATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGATCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTATATATATGAAAACTATACAAAATTATGCACCCAAATCATAGCTGATTCGAATAGACGATTATGC:1 - chr3R 10736026 3' + McClintock 419 2 60.96 TACAAATCCCCTCGCAAGAAAACTAATCCGAGTATGCAGTCAAAACCATATATGTAGGACCTTGGCGATTGGTCAAAACCAAAGTCCGTCTAAATTAGCCAACATATAGTGCATCGATATCAGACTAACCAAATTACGTGTGTGTG:1 - chr3R 12551700 3' + Doc 4495 1 73.29 TATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATGTCTCAATTCAGTAAAAACGACACCATT:1 + chr3R 19950556 3' + BS 5055 1 57.53 ATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGAC:1 - chr3R 11937793 3' - hopper 74 1 74.44 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGA:1 - chr3R 29627840 3' + roo 9031 1 52.27 GACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCATATACATACATGAGTATGTA:1 + chr2L 18181234 3' + blood 333 2 53.42 AAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGNATTGTTCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGANCATTCGTCTAAACAACCCGAACGAAATACTACAAATTACGTTCA:1 + chr2L 18525708 3' + pogo 2041 1 58.90 AGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAAATTCCACGACGAATTTCATGACGACACATCCTTGGGCGAGATGCATACA:1 - chr3L 7750998 3' - 412 34 2 59.59 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAATTGCATCACATATTTGAGCTGAAATTTTGTAGCTGGTATTTTCGC:1 - chrX 5841896 3' + roo 356 2 53.42 GTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTGGTTAAACCGTTTCCTATTCAAAAGGCCCTCTTGTGCTACCAATTTATGTGCAATGTCCTTGATGACCAAGGAATTCCCATGCGTACGC:1 + chrX 2956317 3' - copia 4897 2 65.73 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTTTTTAGAGGACAGGC:1 - chr3L 6557107 3' - Doc 41 1 54.29 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAGTTATCC:1 - chr3R 18832331 3' + roo 9050 2 62.40 ATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGCTAAATTCCC:1 + chr2R 19230574 3' - I-element 82 1 78.08 GAAGGTACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTG:1 + chr2R 4261964 3' + invader4 221 2 56.94 GTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCAC:1 + chr2R 14532045 3' + invader4 3026 2 69.11 AAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCC:1 + chr3R 6584880 3' - transib2 24 1 62.28 CTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTGC:1 + chr2L 2057883 3' + 412 7468 2 69.93 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCCACCACCGCCCATGCCAATCTTTT:1 - chr3R 9298419 3' - hopper 14 1 75.69 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCTTCGTATCTCAAAGCTGCCC:1 - chr3R 13254868 3' + roo 9038 1 62.33 TGGCTGGGTTCAACAAAAGAATTTTAAGTATGGCTGCAAGTGTGTGNAACAATAAATAAGTGCCATGCGGTTAATCTAAGCCATTAAAAATAGAATTCGTGATACAGATAACAGAGTTTTCGTGTCCTCCGCGCATAAAATATTA:1 - chrX 17996893 3' + hopper 422 1 74.48 CAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATACGTGCTCGG:1 - chr3R 17924446 3' - Burdock 76 2 73.79 GTAAGCCGAATTAGTCAGTAGTAGCAATTGCGATGCCCACNGTGCAGACCGCTGTTCTCGCACGCATTTATCTGTACAGCGCTCATTCCTTGTTCTTTTTGNTATCTACCTACGCTAAGAGGCGTTGAATGTGATCCATACCTTAT:1 - chr2R 5064735 3' + diver2 4592 2 74.66 TTGAGGCTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATGTCCGTGGGGTTGGTCGACTCGCATCTATGGAAAAACCATGACAAAGCCGTGGGAGCAAAACGAATTCTTTAGCAAAAAATTGAATCTTTTCAAGAGC:1 - chr3L 14765924 3' - P-element 2785 1 62.33 TTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTTAAATTTTATTCTTAGATTTATTTTCTTACACTTAGCTGTATTTTCTAATGGAATCGCATTTGGTGTTCT:1 - chr3R 11938380 3' + hopper2 1296 1 60.27 CAATCTACACACACACATACACAGGGATTTCCGCCCACTAGCCCGTGGCTCCGGCAGCGTTAGTTGTTTTGCATAATTAATGCCATCATAGGCAGAGGTAATTGC:1 + chrX 10695880 3' + accord 252 2 68.57 TATCTATAGATATCGCAGAAAAATGGTGAAATTTCGGGGAGCTCGACTATAGCAATATCTCTTGTTTTATTTGAAGAACTAAAATATTTTCCTTTTAATTACCTTTTCCCAATTTAATTACATACCTCAATTTTGTGAATTAGTCT:1 - chrX 20880042 3' + INE-1 499 1 73.97 CAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTT:1 - chr3R 16187757 3' + mdg1 7421 2 52.59 TCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTGTCAGCGTCCGTGTCTTTGTGTTGCCGCTGC:1 - chr2R 16355814 3' - hopper 83 1 75.89 TTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCAC:1 - chr3L 2532449 3' - blood 7062 2 64.52 TTAATTAATTGTTTAATGTATTTTATTTATTTATTTAATGTTAACTTTTTTTTTAAACTTTGCTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAGGTACGGAGACAGAATTTTTTATCTTTGCTTTTTTTTTAACTTTGCTGGTGGAG:1 + chr4 1294990 3' - HeT-A 12 1 77.70 TATTTTTCAATAGCAATAAAAATAGCAAAAAAAAACCTATTTCTCCATCCCCCTGTGTTTAAATATGGAAGATCCAAGAGGTTTCCCTTTTTTGCAGTTCAACAAAAAAAAAGAAAAAGCAAAAACAAGAAAATGTTTCTGTGTTA:1 + chrX 12338527 3' + gypsy7 4993 1 48.63 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTCTGAATTTCCTAGGCGATGTCAGACTTCTTAAATGTATTACTTTCCTTGTGCATTTATGCCTTAAACCTTTATTAATTAAGGAAATAGGTACACGTTCTTA:2 + chr2R 15392664 3' - mdg1 7056 2 71.92 TGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATAGTAAATTGGGAATTTGTGAATTCTTTGCTAA:1 + chr3R 19506796 3' + mdg3 156 2 78.08 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAGTT:1 + chr2R 9453380 3' - roo 8721 2 60.27 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACAAGCATAAT:1 - chr3R 23644836 3' - diver 5921 2 62.50 TCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTTTTTTTTTAATTGGAAACTATTCGGATCCGCGACGTTTGATGTACAAACAAATGCTCCAAAGATTTTATTGTACGTTTTAGATTGATTGAAAATGGTCACTTGTTATTGCATAC:1 + chr2R 6700201 3' - roo 8662 1 80.85 AGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGT:1 + chr2R 10411446 3' - 297 6624 2 60.80 AATTTCACAGACAAAGTGAAAACCCCAAATAAAAGTGCGGAAAACAGCAAAAACAAAAAAAATTATGTTCGATATCAATTTCGCGTGGACACATGCCAAGAGACACGCAACGCCACCAAACACGCGCACCACATTTTTCCGCAGTC:1 - chrX 5015148 3' - S-element 338 1 65.75 CTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTGCTTTATCAATGATACGAACCTGA:1 - chr2L 21683362 3' + pogo 2095 1 76.32 GCAGATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTTTAAAAATAATAACATAGATATACTGCA:1 + chr4 880425 3' - pogo 33 1 63.70 TGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATGGAGCCGATGACTTTTCGAAACGTTTTGGTTCGCTCACCTACT:1 + chr2L 21802992 3' - Quasimodo 22 2 66.92 ATGTGCGCTCTTAATAGTGTGTGCTCTTAGTTGTTAACTTGCATAGATAAGTGTATGGACGCACATCGTAGCCTCACACCGTGTCGACCTAAGGCACTTTGGTAACTCGCGCGTCAGGGCCAACGTCTGCTACGAAACTNGCCGGG:1 - chr2L 23372474 3' - gtwin 18 2 71.23 GCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTTTT:1 - chr3L 22320126 3' - jockey 34 1 61.97 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTT:1 + chr3L 1459864 3' - 412 7132 2 72.60 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTTAAATAAATTAT:1 + chr3L 10897586 3' + roo 394 1 76.03 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCGTTGCCA:1 - chr2L 310069 3' + P-element 2831 1 41.54 GCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTAGTAACGTGAATAACTCCAC:1 - chr2R 24427506 3' - 1360 42 1 56.55 GCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTTTTGTTATCTCATTTTATTAAAGCATAGTTTGCGGACTGGTTGAAAACGACCCTTTGGATATGCAAGAATAAACTCAAAGTTTTTGCAGCCATTGTAACAAAAC:1 - chrX 3239233 3' - X-element 13 1 72.52 AAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCACTCCAGCACTTTC:1 + chr3L 7751115 3' + 412 7486 2 63.43 TTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTGAGTG:1 + chr2R 24427615 3' + 1360 3328 1 63.77 GAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACAGGGT:1 + chr3R 10736179 3' - McClintock 10 2 76.71 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGA:1 - chr3L 6131833 3' + roo 9019 2 55.97 CTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAAAGTAAAACATTACTTTAAAATATA:1 + chr2R 4816997 3' + blood 7360 2 62.07 CCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGCACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAATTAAATTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTT:1 - chr3R 556391 3' + Juan 4138 1 69.86 TAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTCAGTTCAATTGTTGTTTCTATTAAAACTTTGTTACACAC:1 - chr3L 15393635 3' - pogo 11 1 73.97 GTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGAAACCGAGAAAATGCCAGAGAAGTGTGTAACATGGTAAAAGCTCGCGGCGAAATGTGCGAGACTGAGAAGCTTC:1 + chr2L 310170 3' - P-element 25 1 63.71 ACAAGAAAATAAACAACAAATTCCAAGTTTACACACTTTTGAGACTGTCAAGAAACTACACATTTTGTTTTCCTACTTTGTTTTGACTTTGAAAATTTACAATTATGTAGATGACAGAAAATCGTTACGGGAGCAAACATAATGTA:1 + chr2R 4929354 3' + S-element 169 2 58.22 ATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTTTTATATGGGATTTTTTTATTCTTCGCT:1 - chr3L 23496605 3' - blood 144 2 45.21 ATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCC:1 + chr3L 18074182 3' - 297 6639 2 65.75 AATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCGTTGTCTCCGCTTTTTGT:1 + chr3L 10740090 3' + P-element 2819 1 19.82 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAA:1 + chrX 17792600 3' - roo 8744 2 74.66 ATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATNTAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTANCTACTGAAAACTTGTTCTTTCTGATCG:1 - chr3L 18216448 3' - 297 6598 2 69.77 ATTCGGAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAACGTAATTTC:1 - chr3R 20887367 3' - Doc 35 1 60.27 ATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTCTGAATTTCCTAGGCGATGTCAGACTTCTTAAATGTATTACTTTCCTTGTGCATTTATGCCTTAA:1 + chr2R 15392628 3' - mdg1 7092 2 54.79 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTCATTTACTTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTCTATAATATTAAT:1 - chr2L 4244882 3' - 412 58 2 57.86 GTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGAAAAAACGGCACGATATAGCAAACGTCGAATAAAAAATAAAAATCCAAAGTGAATAAAAGACATTGGCGAGAGCGTGACAAAACTGCTAAGAAATCAATTGAATAACACTTACCAGGTGTTCG:1 + chr2R 13917106 3' + Bica 286 1 62.33 AAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAAT:1 - chr3L 19951173 3' - Ivk 44 1 53.57 TTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCA:1 - chr2L 14056658 3' + pogo 2059 1 51.45 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGTCTGTGTATCTGTGCTG:1 + chr3L 9696029 3' + 297 345 2 59.26 ACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAGTCCTTTGACCACGCTTTGCTTGCATCTGACAACATTGCTAACA:1 - chr2L 6637321 3' - 1731 34 2 78.77 AAAAGCTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGTACTACTTGTACTACCGTGTACTACCGTACTACTTGTTGAACCTATC:1 - chr3L 24104299 3' + Stalker 123 4 60.00 TTTTTTTCCTTTATTATTTATTTGTTTTTCTTTCCCTTCCAGTTTATGATTACTTTTGCAGCCCAGCGAACGAGCGCAAGACGAAGACTGGCAAAGAAACCGAAGACGGAAGACAGAAGACTCGGCCGCGGCTTCGGAGCTTCGCA:1 + chr3L 13494649 3' - BS 5095 1 63.70 ATATTGCATANGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTCTGATCTCTGCTGCCTTTTCGGTCCGGCCTATTTGTGTCAGCCAACGGTTCAGTTTCATCTGGT:1 - chr3R 27606543 3' - 412 2 2 75.86 AATACTAAAATACAGCTAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCG:1 - chr3L 22518939 3' + hopper2 1551 1 63.41 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCATAAACATCACTCTTATANG:1 + chr2R 17269198 3' - roo 51 2 62.79 GAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGATCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATNCAGGGGAGCTCAATCTGGCAGTGACTTG:1 + chr2L 12932198 3' - opus 7158 4 53.19 ATTCTCTCACAATATGTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAG:1 + chr2L 18219379 3' - copia 86 2 76.03 ATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCAC:1 - chr3L 14422712 3' - roo 8726 2 61.64 AACCTTAATTGACTTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTATTAAATGTT:2 - chrX 6216329 3' - Juan 4016 1 60.96 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTG:1 - chrX 6891454 3' + hobo 2928 1 63.64 TAATTATTAAAGATCCGTTCGCTTCGTGAGTGATTCTTTTGTGCTTTGTGCAGCAGTTTAAACAAATAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTTTGTTTTGTTTGTGCGTTTGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTTGTCTTTT:1 - chr3R 30486951 3' + Cr1a 113 1 75.34 CCCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCCTTAC:1 + chr2R 5321242 3' + INE-1 512 1 70.55 ATAATTATTCTAGTGTCTTTGGCACTGTGATCGTTGTAGCTAGCAGTCTTGACCACCCACAGTCCGTCCAGTCCGCCCGACTCTACCAGCGATTTCCGCAAGGAC:1 - chr3L 21730987 3' + Tc3 311 2 77.14 AACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAATGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTATAGCTGCACTCGTTGGGATATATCGATAGGAC:1 + chrX 13091106 3' - P-element 76 1 26.52 CAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATCATA:1 + chr3L 20224249 3' - Chimpo 49 1 52.05 TATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATA:1 + chr2R 17350601 3' - F-element 72 1 56.25 TAGTCTTGTAAATTTCTATCGATTTGCCAAACAACTTTTTGCCACGCCCACTTAACGCCCTAAAACCGCAGAACCGGTCACGACCACACTTTGGAAGAATTTTAAAATTTTTAATCATTTTATTCCACAATATCTATCGATATCCC:1 + chrX 23078696 3' + INE-1 299 1 78.08 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCC:1 + chr3R 7074884 3' + P-element 2813 1 34.93 GCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATCCACCGTGCTCTGCAAGAAGCGAAAAG:1 + chr3L 11826043 3' - X-element 49 1 50.00 TGTATGGAGAATGGGGGACGTCACCTATCAGATTTCATCTTCAAAAAATATGACATGTACGTACAATATAAAAAAAAATAAATTTTTTCCGATGCCTACAATAGTTTACTCACTGAATATTTTCGTTTTATAAAGATTGGTTA:1 - chr4 1089033 3' + mariner2 749 1 74.83 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACTGACCGCCGACCAATCAGAGAGCAGCTTGGCCACTTCGTGAGCACCTTCGTTTCGCTGTCG:1 + chrX 19887067 3' + P-element 2864 1 70.42 TTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCACTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAA:1 - chr2L 17957166 3' - flea 4811 2 58.90 CATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCTTGGAATTGCATTCTTATCAGTAAAGTGCAGATGCTGTAGCTAC:1 - chr3R 15283606 3' - BS 5020 1 65.22 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGCCTTTGA:1 + chr3L 5910567 3' - BS 5073 1 67.12 ATTATTCCATATTGTTCTGGTAATTGTTATATGTGGACTTAGAACAATGAAACAAAACGACATACGTTCTCAGCGACAATGTGAACAAGACGAGGAAACGGTGATCCATTCCACTGTTCCCCATTTGGAGATTAACATATCAAACC:1 + chr2R 17431256 3' + Doc 167 1 64.38 GGAGCCCAAANTTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACTATATCTTTTTATTATACCTAAACTGAAAACCAACAACCGCGGCTTTTGCTTGCTC:1 + chr2L 512556 3' - roo 29 2 64.38 CACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAGTCAGAAGATTAGAACA:1 + chr3L 24008432 3' - X-element 26 1 65.75 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCG:1 + chr3L 20061439 3' - roo 51 2 56.43 CAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCTAGAAGGTTGGTTT:1 - chr3R 17077810 3' - 1360 25 1 56.76 CCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGCTTACTGGAAGGACTCGCTGAAGATCCTGAAGCTGATCGTGACCCGGAGCTCG:1 - chr3L 9635257 3' - Doc 5 1 67.91 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAG:1 + chr2R 18887064 3' - roo 8707 2 57.48 TCCGAAGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGTTCCTCGG:1 + chr2L 20852574 3' - Tirant 31 2 65.75 AAGATGTTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAAT:1 + chr2R 5953910 3' + roo 9021 2 50.68 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTA:1 + chr3L 20061441 3' - roo 8718 2 56.55 CACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCGTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTTAGTCG:1 - chr2R 981623 3' - 1360 46 1 62.33 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCTTGTTTGTCTGTGT:1 - chr3R 17243136 3' - hopper 83 1 71.33 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGTTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACAAGAAGCGAAAAAGGGGTTG:1 - chr2R 11777950 3' - hopper 27 1 63.24 CACTTCTTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCTGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACGAACAACAGCTGAACCCGATTACTGTAAATCGATGTTAATCGA:1 + chrX 16547550 3' + P-element 2839 1 34.93 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACGAAATATGCAGTGGCAAAATGAATGCACAAACTGCTCCATCTCCCTTCCACCCAGCAGCTATCTCTGTTGCTCCTCGCACTT:1 + chr2L 7929632 3' - roo 8702 2 56.85 TTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAAACTTTAATGTCCGAAAATTTTGGCGTCCGTTTCTATGAAAAATCTCAGT:1 - chr2R 5179521 3' + 1360 3381 2 78.77 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTA:1 - chr3R 20887391 3' - Doc 58 1 53.10 TATTAAAAATAAAACTTTAAAAATAATTTCGTCTAATTAATATTATGAGTTAATTCAAACCCCACGGACATGCTAAGGGTTAATCAACAATCATATCGCTGTCTCACTCAACTAATTTTGTTTCGCAGATAATACTTGATGAG:1 - chr3R 27710658 3' + P-element 2690 1 23.08 TCAACAGCCTTCCTCAATGCCAACATGTTTACAAAAATTAAAACGTAAAGTAAAGTTTAAAAGATTTAAACGCAAACCCACTGTTAATTGCACTTCTCGGTGGCGGAGCACAAAGGAAGGGTCTCGCAC:1 + chr3R 15728081 3' - 1731 4297 1 68.99 TTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAAACAATATAATTTTTCGTTTCCGCAAAATAGAAAATAATTTAAAACAATAAG:1 + chr4 194528 3' - S-element 67 1 66.44 TTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTAATTTCAAAATTAACGTAACTC:1 - chrX 9165319 3' - jockey 4813 1 51.37 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTAAATAAATAAACAGATTGGGAAAACATAATGCAAAAGTCTTTTGCAAACTGTTTTGAGTAACTGCATTTGCATTTAATAGGACCCCACATTTTCCCACA:1 - chrX 5751806 3' - roo 10 2 66.67 GTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAGCATTTATAAAGAGTA:1 - chr3R 26472781 3' + 1360 3348 1 55.56 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCC:1 - chrX 20330531 3' + P-element 2872 1 60.92 ATCATATACCCGTTACTCAACTAGAGGGAGGTGCCAGGAAGATGTCTCTAAAAATTTGTTGGCATAGCAACGAATATTGTATAATAGTAATAGTAAAATGACTGCTTTTTGCGGTTAAAGTAACAATGTTTTAAAACAACTAAGCG:1 - chr2R 16193766 3' - INE-1 545 1 45.89 CTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATATATATAAGTAAGTTATTACCTTAAGGGTATCGCATTACAGAAGTGCAGTCAACTGAGTGGCGAGGTGTGAACATTTGAAAGCGTTACA:1 - chr2R 10788005 3' - gypsy10 33 2 62.33 AGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGGTTTGGTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGTC:1 - 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chr2R 6236058 3' + P-element 2826 1 41.84 TACGGTTTTGTGCCTCCAACGCAGCCATATACTGATCAGATCTGGTCTCTCGTGGCGAAGGCGATCCCACTTCTGATGTAACACTCCATAGCCCAGAATGCACTAGAACACTTCTAATTTGGATGTTCCATGATTCATAATTCTTT:1 - chr2R 4261948 3' - invader4 401 1 54.11 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATTTCTAATGCACATAAACGTTGGTGCCAGTACATAGTGCAATATGAATG:1 + chr3R 20983986 3' + hopper 1385 1 62.33 TGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAGCGTTGCTTCATTAGAGCGAGTGGAAACAACCGGCGCCCTCACATTGTTTCCCCACATTAATTTAATCCGCATCCTTTCCCGCCGCGCCCCTGCA:1 + chr3L 21764498 3' - hobo 22 1 69.86 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACA:1 - chrX 13091044 3' + P-element 2830 1 40.74 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGC:1 + chr2L 15523105 3' - 412 91 2 73.97 TTTATTCAAATTTGTTTTTTCGGCCAACAAAAGGGTGAAACTTAAGTGAAGGCTCTCTCAGCTCTCGACTTCCTGCATTAAGAATCGGCTAAAACCAAAGCCAGATGACTAACATTCGAATGAAACTGCATCAACTCACCATAA:1 + chr3L 7090728 3' - Tc1 385 1 61.81 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAATTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGTCTGTGTATCTGTGCTGTATGCCGCTTTCAAT:2 + chr3L 9696044 3' + 297 6930 2 56.16 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCCCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAGTGTGCAAAGCGAAAATCCGGAAAGTATGCAGCAGAGTGTGTGAGTGTGTGTGTGCTG:1 + chr2R 22053338 3' + jockey 4954 1 42.07 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTG:1 + chr3L 1459902 3' - 412 41 2 57.53 CAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTGGGTTTCTTTTATAGTTCCTAAATAGGTTGAATTAGATATCACTATTATTTGTTTTACTAA:1 - chr2L 8284306 3' - Doc 380 1 77.40 CCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAGAAAAAAGTGCTGCCACGACAGTCATTGGTGATTTTGCCTGAGGCTGAAT:1 - chr3R 31114220 3' - flea 4774 2 70.55 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCG:1 - 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P-element 187 1 80.00 TACCAGAATTCAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAATCGAACAACTCATCGATGGAAGCC:1 + chr3R 12146745 3' + gypsy10 5938 2 54.20 ACGGCAGTTGCAAGCTAATGGTGTCTAAATACTTACGCCCACTAGTGTATTAGTATAAACGTAACCTTAATAAATTTGAAAAAGTTTACGTTAAACACAAAAAAGGAAGAAACTATTACGTTTAAAATTCAAATTTATCTAAAAG:1 - chr2L 23373390 3' - Tc1-2 26 1 59.31 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTATTCCCAATACATTTTA:1 - chr3R 5870769 3' + roo 9040 1 62.33 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGGTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTA:1 + chr2L 13033421 3' + hobo 2909 1 51.64 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCACTGTGGATCTTAGACAAACATCATG:1 - chr2L 15874816 3' + mdg1 7430 2 65.75 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATAATTTTTGAAATT:1 - 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chr2R 1921395 3' + mdg1 380 2 56.85 AAGTGTGCGTGTTGTGCTAGAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCAAAGAAACGAATTTACATATTTGGAGAGTTTTGGCCAATTTCGTAGCAATATGATGAAACTGGAATATAAAAAAAAAATGAATATGAAAAACA:1 + chr3R 29978111 3' - 1360 3209 1 80.14 CCGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTATTATTTTCTTAATTCATTTTTCTATTCCTTCGCTATCTACTAATCAAAC:1 - chr3R 23902141 3' - I-element 22 1 69.18 TACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTT:1 - chr3L 6557121 3' - Doc 61 1 58.22 TAAATATTTCAGATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAAATAAATAAAAAAATAAATGTTTATCTCTTTATTTGAATGTG:1 - chr2R 10119014 3' + Juan 4119 1 82.19 TTTCTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACTTATGTACATGTATTCATTTATATATGTACGCACATGCCGGAGGCTG:2 + chr3L 27350098 3' + 297 322 2 76.03 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAAGTGTTTA:1 + chrX 14978661 3' - hobo 43 1 53.79 TTCGCCTGTAAGATCCGGATCCTATTAAGGTGACTCTTCGCAGCAATGCCGTATACCTGCAGGCCGTAGAACAGGCAGGGGGCCAATGTTAACACACATAGATACACCCACACACAGCCTCATTTTGAAGGCCGC:1 - chr2L 10143642 3' - jockey 4521 1 62.96 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGCGTCATCAGTTTAAATATGTGCAGCTGATAAGAAGTCGG:1 + chr3L 2907404 3' + 412 7499 2 52.74 AGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCTTGGAATTGCATTCTTATCAGTAAAGTGCAGATGCTGTAGC:1 - chr3R 15283609 3' - BS 5031 1 59.59 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAA:1 - chr3R 26180423 3' - Transpac 63 2 64.08 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACATAAACAAAAAGCAGCGTCAATTGGAAATACCCAACAAAAAAAAA:1 - chr3R 26242470 3' - roo 8717 2 66.39 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATG:1 + chr2R 10977198 3' + roo 342 2 60.28 TACCTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTATTCAAAACCCCCGACTTTTTGCCGCATGCTCGTCCATTGAGTTCTGTAATTTCACCAGTGACCAGTGGGCG:1 - chr3R 17991156 3' - Doc2-element 244 1 73.96 GAAAATTAATTAATTACTTATTTGGGTTAACAAAGTCATTTATGTTATGACTATTTTTTATTCACAGGCACTTGTGCTTATTGTTTAAAAGCCAAGTAATACTTCTTTGCACTATATGCACAACAATAGAGTATTTACTGCACTT:1 + chr3R 27534073 3' - looper1 347 1 73.10 GAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTATTAAAAATACATTGCTTTCTATTATTTTACTTATATTTGCAATTTGAGACTTTGAAATGTTTATGAAAACCGAAATGAAATGCATACAATCTCAGCTAATCAAATCCAGCATTTT:1 + chr2L 10074650 3' + pogo 2098 1 76.55 CTGGCCACTCTGCAGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTGACGTGAAATTGTATTAGAATATTTATACTCGATTCGCTTGGCGCACTAAAAATAGCATCCCCA:1 - chr2L 4867489 3' + mdg3 5398 2 68.12 TTGATACAGTGCTTATTCGNTATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACGGTATCCACCATTCGATGTGTAATTTTACCGTGCGAGTCAGTGTGCATAATTT:1 + chrX 13060334 3' - Tabor 6855 2 66.90 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATGTCAATCAACAATTTGGTGCAATAATCTTTGGGAAATCATTTTCGGTGGCATTTTCGTGGAAATCGTTTAGCATTAATAAAACGCAAATA:1 + chr3L 5027313 3' - roo 18 2 40.15 ACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAAGGAATTATGTACAATAAGTTAGAATTTTAGCATTATTTTTAGGCCCAGACTCATAAACGGCTTTACAATCCTGACTTATTTT:1 - 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P-element 20 1 56.57 TTCATCTTAGAAGTTCTTAGACTTTAAATCTACATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGTACAAATTTTTTTGTTTTGAATTGCCTTAACGTTGTTAAGTTATCAGGGCTATTGCGTACAACACTTTTAAACTACATTTACCTTCA:1 + chr4 1193543 3' + 1360 227 1 64.38 AATAACTCGCGGGAGTTTCTTCGGCACAATTTAACCAACGAATATTTTGGTAAAAAAAAAAAGGTTAAATTGTGCTAAAGAAATTTCCGTGAGTTAAAATAAAAAAAAAAACCAAAGAAACTTTCACCC:1 + chr3R 26294968 3' - HMS-Beagle 374 1 50.39 TTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTT:1 - chr2R 19574415 3' - I-element 5146 1 53.42 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCCAATTAACTACAACGTATTACCAATCAGTTAGTTTCCCAAACACTTTTCAAGAGAGAGATA:1 - chr2R 1921429 3' + mdg1 348 2 65.97 AATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGACTTCGGACCACGCGACATTTGTC:1 - chr2R 20052389 3' - transib2 56 1 61.31 TCGGGATTGCGGCTCCGAGCTTTGAACGTGGGAATGTGACGATGGGGTGAGGCTTAAGCAAGGAATTGTTTAAATTAGGGGCGGATGAAGTGACACTAAAACTCAAAAGAGAGTTATATTTCCCAAACATTAATGAAAAAATAAAA:1 - 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roo 8749 2 78.77 TTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGACTTCGGACCACGTGACATTTGTCTTA:1 - chr2R 20052386 3' - transib2 62 1 61.64 CTAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGATTCGGGACTGCATAAAT:1 + chr2L 20628668 3' + Stalker2 7605 2 50.77 GATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATTTTCATTCAAACCAACTTAAATTGATTATGTCAACTGTCTCTAATTAAATCAG:1 - chr3R 31114271 3' - flea 4823 1 65.07 ATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAGGCACGTGGGTGCTTTGTATTTCGCATACACTT:1 - chr3R 2411514 3' - HMS-Beagle 40 2 67.00 ACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTT:1 - chr3R 19965236 3' - jockey 31 1 50.00 TCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTCCAAAATAATTGCCACAAATCGGAATGTGATTGAG:1 + chr3L 8824564 3' + transib2 2789 1 60.96 CAAAATTGTAGCGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTT:1 + chr3L 17268312 3' - hobo 35 1 62.37 GGCCTACTTTTCAAGCGGATATTGGTTATTAAAACACAGAGTGCATTTCGGAACAAACAAAACATGCGCTACTGGGCTGACACCAAAGGTCACAGTGGTGTGCAATTTCCTCAGATGGAATTATTGGTCCTTGGTTTTTTGAGGAA:1 - chr3L 23649871 3' + mariner2 172 1 56.85 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTG:1 - chr3R 20904967 3' + roo 341 2 66.44 TTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGAGGTGTC:1 + chr3L 22021741 3' + mdg1 7391 2 66.44 AGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGGTCTTAAGAGAACTGACTCT:1 + chr2L 544964 3' - Doc 21 1 62.76 TATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTAGTATCTATATGTACATACATATATGACCAAAAAAATCGTACAGATGTTAGCTTCGAGTCAAT:1 - chr2R 14531954 3' - invader4 2788 2 62.10 TGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTA:1 - chr3R 13868923 3' + HMS-Beagle 6974 2 67.59 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCGAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTTATAGGCAGG:1 + chr2R 6801698 3' - 297 18 2 57.30 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTAATTTAAATGATTCGGTATGCGAAATAAAATTAAGAAGCATTAACAACTAAACACA:1 - chr3R 25597839 3' - copia 66 2 65.75 CTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATACATATACGTTTTATGACAGAGAGTCAAAAACATTTTCTTTAATTTTCCTGCTGATTACAAATTCATATACATATTTCTCTGTGTTTTGTAACAAACTAGGATT:1 + chr3R 26180569 3' + Transpac 5218 2 76.71 AAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTGTTAGTTTTTATATTAATAACATGCCCACAATTCATCCCCGTTTAAATAACTAAGCTAT:1 - chr2R 5674637 3' - S-element 61 1 62.33 TTGACTCCCATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTGGAAATGTATTT:1 + chr2L 23084409 3' + accord 474 2 61.64 ACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTTCAGTTCGAGATTCGTG:1 - chrX 8681449 3' - jockey 89 1 73.97 TCAGTAACGGGTATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTCTAGCATTTTCTCTTGTTTTCTAATACTTTTTCTCTGTTGTAGGCCATGTCGGGGGCACTTAATGGCCATTGAGTCG:1 + chrX 22742795 3' + INE-1 548 1 67.26 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGGTGAAAAGTATGCAGATTACGTGGCTAAACATAACTGAATTCTATAGGGACTTAAGTTTTGAACCGCAGCTCTATTAAA:1 + chrX 17048261 3' - jockey 57 1 48.63 AATGTATGCTATTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAATC:1 + chr2L 22684595 3' - transib3 75 1 58.62 TGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGT:1 - chr2L 23295816 3' + micropia 364 2 79.29 GTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTAAT:1 + chr2L 22684594 3' - transib3 72 1 59.57 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAG:1 - 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chr2L 5207427 3' - opus 7171 4 56.16 CATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACG:1 + chr3R 11284997 3' - blood 7068 2 58.04 TTCGAGGGTTTTTTTTTTTGTTTTGCCAAGTGGCTTTAAGT:1 + chrX 7635298 3' + Tc1 1468 1 95.12 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGCACATCTTTTTTTTTTATAGCATTTCATTGGGATCAGGATTCTGGATTGTGGATTCTGGTTTCTGGTATTCCAAGTAGCCTGGCCGCGCAGAACTTGGCCCAAT:1 - chr3L 1459738 3' + 412 7527 2 68.49 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTACGCGATCTCG:1 - chr2L 14616170 3' - P-element 63 1 43.15 CGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTG:1 - chr2L 15085623 3' - opus 7176 4 62.33 TTTGTTTTATTTTTTTTATTTTGTTCTTTTTTTGTTATTTTTTTCTATCTCCCAGAAAACATGCGAAATGCGCATTAGTCGCTAGGTGGTAGTTAGGATCTCCCTTCCTTTGTTTGTTGATTTTTTTGGGGCTTTTT:1 + chr2L 5408991 3' - F-element 4686 3 80.29 TAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCACCTTACGTTAATGTTTACCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAATG:1 - chr2R 12833022 3' + G2 2849 1 63.89 ATACTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTATCAACGAATCTAGTATACGCGTCTTTTGTTTTTCTTGTTTTTTTTTTTATTCTATTCAAACTAGTTTAAACAACGTGGGCTTTAAATGCCCATTAAGAAAGAAGCAA:1 + chrX 1819108 3' - INE-1 31 1 60.74 TATTTNACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAAACAATATAATTTTTCGTTTCCGCAAAATAGAAAATAATTTAAAACAATAAGTGCTGTAAGGAACAAAAGAAGATTTTAGACAAATAA:1 + chr4 194564 3' + S-element 1701 1 72.31 CAAAAAAATGGAAAAATAANGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGTCAATTGAAAGGAGGACA:1 + chr2L 21683497 3' - pogo 53 1 57.53 CCAAATGGGCTGAATTAATAGATAAGAAGGACACAAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAATAAATTATACAAAATGAGCCTTAAATGCCGAAATGTGTCACACCTTTGTA:1 - chrX 15286864 3' + X-element 4651 1 62.76 GTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGT:1 - chr2R 7720053 3' - HMS-Beagle 44 2 55.48 TAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGATACCCACGGTGTCGCAGCTGGATCTCATCTTAGGATTGGCGAAAATCCACGGGAGCAATCGGGGGAAAGGTCT:1 - chr3R 25158571 3' + 1360 3341 1 49.32 ATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTAATTTAAATGATTCGGTATGCGAAATAAAATTAAGAAGCATTAACAACTAAACAC:1 - chr3R 25597840 3' - copia 66 2 66.21 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATT:1 + chr2R 18931930 3' - blood 7060 2 50.68 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATGAGACCGATAGCCGTCAAAGAA:1 + chr2L 8120248 3' + roo 357 2 59.59 TTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTGAGCAGCAGTCCTCGAAAGGGC:1 + chr3L 1459923 3' - 412 20 2 71.92 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCGTGTACATACATACAA:1 + chr4 490353 3' + pogo 2071 1 63.31 TAGTTAAATATTTTTTATTTTTTTTATATTAAGTCCTTCTAAAACTATTTTAAGCATAAGCTTTCGCTATTATTTTGACCGCGAGTGTACACACAGATGCGCCCAATGCCCTGGGGCCATTGCATTATTC:1 - 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chr3L 22885745 3' - INE-1 136 1 73.29 CAAATCTCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGC:1 - chr3R 9298449 3' - hopper 46 1 54.11 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACCTC:1 - chr2L 10461097 3' + roo 391 2 72.73 GAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAATGGGTATGCGGTAGCCCTTCACAGTCAGAGTCATTTATAATCGGCAGAGCTCATGGCCTGCCACGCCTAC:1 + chrX 14360890 3' - jockey 23 1 74.31 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTGAAGTTGGAAAAC:1 - chr2R 16274523 3' + roo 9029 1 59.59 ATACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGCGATTTGTGGGCGTTAGAGTGGGCATGAAAACATGGGTAGAATCTTATGCTAAATCTCAACCTTCTAGCTTTTATAGTTCCTGAACAGACGGACATGGCCAGATCGACT:1 + chr2R 6241630 3' - INE-1 257 1 64.14 CTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAGTGTTTGAGG:2 + chr2R 18931952 3' - 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chr2R 12101945 3' - hopper 81 1 73.97 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTC:1 - chrX 15198046 3' - Max-element 8302 2 64.29 AGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAAT:1 - chr3R 12948597 3' - Stalker4 7013 4 54.11 TGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAA:1 + chrX 2214297 3' - jockey 4626 1 62.33 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAG:1 + chr2R 5953935 3' + roo 395 1 73.88 TGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGGGTTGCCTTTGCATAATAGAGTTTGTCGCTG:1 - chr3L 18183064 3' - Tirant 8128 2 64.52 TGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGA:1 + chr3R 11285009 3' - 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roo 62 2 63.57 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGT:1 + chr2R 14415513 3' - 297 60 2 75.61 AGAGAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGTTATTCAGATTTATT:1 + chr2L 4864447 3' + mdg3 5411 2 75.34 TACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAGTGTTTGAGGCAATGCAATCAGTATGTAAAT:1 + chr2R 18931973 3' - blood 7016 2 80.69 AATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACA:1 - chr2R 12492415 3' + hopper2 1543 1 58.90 TGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAA:1 + chr3R 11285011 3' - blood 7037 2 62.70 AGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACTGTATAGTATAGTGTCTTGAAACCATAACATAGCCTATCCAGGACTTGTCTCCTTTAAT:1 - 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BS 24 1 63.01 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATG:1 + chr2L 17019155 3' - 412 81 2 73.97 ACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACG:1 + chrX 13060282 3' - Tabor 69 2 65.07 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAATGGTACTGGCTTTTCGATTCACTTAATTCGTATTATTTGGTATTAGTATTTGTGGCTACCAACTTTTATTTGGCTCACAGATATTGTATCTTTATCTTTAGTTAT:1 - chr3L 9397570 3' + 1360 3386 2 76.30 CCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCG:1 - chr3L 25340833 3' - gypsy8 309 1 77.27 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTAC:1 - chr3L 20061354 3' + roo 8991 2 73.29 GTCGTCAGGATTCCTCCAGAGGTGCTTCCTTCGCTGGCTACTCTGGGGAGCACAGGTTATTAGTTACGTTGAGAGGAACAATCCTCTTTAAACTGCCAGCCTTGTGGTCTGATAGAGTAAGTAAAAATAAAAATATGTTT:1 + chr3L 18438817 3' - Gypsy6A_LTR 359 1 73.57 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCGGGTTACCGTTGACAGGACTGCCTACACCGCCGGTCC:1 - chr3L 22518903 3' + hopper 1405 2 70.54 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAA:1 - chr3R 25798386 3' + hopper 1336 1 70.55 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCAAATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCA:1 - chr2L 14056658 3' + pogo 2061 1 50.74 TTAAAGAAGTGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAA:1 - chrX 15746276 3' - jockey2 3256 1 52.05 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAA:1 - chr2R 12462130 3' + roo 9008 2 60.27 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACCCATAAAACCCAACCCAATTATTTGTAAAAGGTATCTTTAATTTACAGGCTG:1 - 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chr2L 20762343 3' + Doc 4445 1 71.23 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGGAAGCCTATAGAGTTGAGATCAAGCATACAGATTCCAGCCACGCAAGTCACGCTCACACTTTT:1 - chr2L 22132499 3' + pogo 2053 1 55.88 AAACGCAGACATCGAGCGGTCAATAACCCATAGCCCAGGAAACCTTCTTCTACCAACAAATCAACAGCAGCAACTAAAGCAATGCAAACAAGAGAACTCGGCGCATGGAGAATCTTGTAG:1 - chr4 546324 3' + F-element 299 1 55.00 TGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTAATGCTACCTTCATATTGTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGTTTCTGCGCACATAAATATATAAAACA:1 + chr2L 11523159 3' - HMS-Beagle 48 2 55.48 CATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATA:1 + chr2L 16884939 3' + pogo 2073 1 65.07 ATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAAC:1 - chr3R 12948584 3' - Stalker4 44 4 54.79 GCGCTAGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGCTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTCGTGGACTTCCGG:1 + chr2R 9750286 3' - opus 138 4 67.12 TTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATATGTACGAATTTCTCTACCGAAAACTAAAAATCCATTAAAATGCACTTGAGAGTGCC:2 - chrX 9519466 3' + 17.6 430 2 61.64 TGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGGCTAGTTTGG:1 + chr2R 5621058 3' - ZAM 17 2 67.69 GGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTTAATTTACGATAAAATGAGAATTAAATATATACACACACATATGAGAAAGACATTTGACCTTTGACATTTCACTAATA:1 - chr3R 17673728 3' - FB 44 1 56.16 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTG:1 - chr2R 20972693 3' - jockey 4756 1 80.00 AATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGAACCCAAGAGCACTCTCTCCCTCTCTTTTG:1 - chrX 19886965 3' - P-element 91 1 23.97 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCAT:1 - chr3R 24084814 3' - roo 8752 2 80.69 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACCGTGTGAGTT:1 - chr3L 22021607 3' - mdg1 10 2 77.04 TAATTACTCTGCCAGACCACAAGGCTGGCAGTTAAAAGAGGAAAGTTCCTCTCAACATAATATCTGGGATTGCAGAGAGGGATCCCCCTGCCACGCACAACTTTAATTACTTACATATGAATCCTTCTTATATTTAATTGTATAGA:1 - chr3L 23456283 3' + Gypsy6A_LTR 243 1 77.40 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAA:1 + chr2L 16884944 3' + pogo 2047 1 56.85 TAACGGGTATTTGATAGTCGGGGAACTCGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTTTTTATATAGATTCGTGAAAAGTTTGGCGTGTAATGAAAAGCTCTCTGCGAGACTATTTCATTTTGGCATTTCTGTCGGCGATTTTAATAAA:1 + chr2L 9305062 3' + INE-1 552 1 63.01 TGGCACTATGCAGCCACTTTTTTGGTGACGGCCAAAATTACTCTCTTTCCGCTCACTCCCGCTGGAGAGATAAGAAAACCCGGTTAAAAGAGCAGGCCGAGTGTCGTCAAGAGGGTATTGGAGGAAAACGAGAATACTAGTGATCA:1 + chr3R 3880209 3' - 1360 3343 1 58.90 AACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTATGTATGTAAGCCCACTCACAGAGGACGCCGTG:1 + chr2L 17574598 3' + hopper 1331 1 79.17 AAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGGGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTC:1 + chr2R 5621004 3' - ZAM 8028 2 69.60 AATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGATAT:1 + chr2R 19633322 3' - jockey 4797 1 56.52 TCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCACTCAAT:1 - chr2R 9007023 3' - jockey 4804 1 60.43 TGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGG:1 + chr3R 31264521 3' - BS 20 1 54.72 CACGGCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTACAACCCACAATGATAAAGCGTTATTGAAAAACAATTATTTATGGTTACACGCTAGAGCTTTTTATCCCGTCAGTCG:1 - chr2R 981623 3' - 1360 46 1 60.96 TATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTTCGTCC:1 + chr3L 13285680 3' - roo 8727 2 61.64 CGAATTGCTACCGGGGTGGTCGCTATGTACATAGCTATAGCTTCTAGTCCGGGACGCTTGTCTGGCGTATCCAGACACATGTTTTTTTGTAATATTTGAAATCCTTTCCAGAAATAATCTCACATATGAAGTTTATGTAATTTCAC:1 + chr2R 14142188 3' + R1A1-element 5172 1 55.48 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGCATTGAAAATGAAAAGGCACA:1 + chr3L 11364925 3' - Tirant 16 2 71.76 GATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTGAAGCAGGAGACACGCAACGCG:1 + chr3R 11284972 3' - blood 82 2 75.52 CTTACAGGCGAAGACCTTAAGAAGAATTTCGGGGGCTCCTTGGTATATGAGAACAAGAGACATCGAACGCGACCTCAAGGTGCCCAAATTATGTGGGTGCACGCGAGCGAGGAATTGAAAAAGGGAATCCGTTTT:1 + chrX 547737 3' + jockey 4531 1 67.41 GTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGATTAGCTTTATTTTTGTTGTTGCTGTTGGTCTCTGTGTGCGCTTCATTGTTTACTTGTAACAATCGACAAATAATGATTTATGCATAGTCAGCACTT:1 - chrX 8960813 3' - opus 7419 2 63.70 CAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGTGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCACAGAACAGCTCATGGCGAACGCATTAATCTATCAGAGCCACGCTCC:1 + chr3L 11536039 3' + roo 9059 1 75.34 AGTTGGGGCACGCCCACTTTTCCAAAATATTCCTGGGTGCATGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATC:1 - chr3R 25798379 3' - hopper 114 1 37.06 AGTTTCATACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACCGCTCAAGGTTGACTTAAATCAACAGTCTACCTTTATTGGAAATTTAATACCACTTTTATGTGCATCAAACTTCGATTTCGTTTGCTGGTAAG:1 + chrX 5751974 3' + roo 9042 1 63.70 TTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTTAATTTAAATGATTCGGTATGCGAAATAAAATTAAGAAGCATTAACAACTAAACACATATAAACAGAATGTCGCATAATGGTTATTTATAAGGACTATAATTTAC:1 - chr3R 25597791 3' - copia 4887 2 71.92 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTGTCACATAATTTGTTCATAGCAAAT:1 - chrX 5841940 3' + roo 9013 2 74.31 AAAGCGAAAAAAAAAATGAATAAATAAATAAAAGTGCTTTGGCTATTATTTGCTGTTTTGGTCAGCAGCCTCCCGTTCTCGCCCTGATCTATAATTCATCTTCGCCG:1 - chrX 2394929 3' + invader2 294 1 62.62 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGGTTTTCATTCTCTGCGGCTGCATATGCAGATTGATCGCTGGAAAATGCATTT:1 + chr2R 14415564 3' - 297 6606 2 65.47 CATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGCGCCAG:1 - chr3L 11364794 3' + Tirant 377 2 50.96 AACAAGAAAAAAAAAAACAAAAATAGTTTCAAAACTCACCGTTTTCAATACTACTTTTATTATTCAATTGAAACTTAAATACATAAATCCTTAACACATTCATAAACTAAACAAATTGCATAGCTAAATACTAAACTAATTAAATT:1 + chrX 8668685 3' + gypsy7 5011 2 81.51 ATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCAACACCATGGATCCGCCAAAAAAATTTGCATCTGCAGATGAAGTTACATTTTT:1 - chr3R 25798325 3' + hopper 1402 1 75.89 TTATATTTATTTATTTATATGTGTGCTCTCCCACTTTTCCACTGTGTACTTAGGCACCCGTATTAGCTGGCACCGGCATTTCACCGGCTAACAGTTGACCTTCCGCAGG:1 + chr2L 4783427 3' - Juan 4215 2 54.13 ACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTT:1 + chr3R 31112302 3' + mdg1 385 2 58.90 AATAATAAAGTAAAATTTAAAATACTATCGAAGTATACACAGTAACCATATAACTTAATACTATATATAGTTTTATTCATTTCTTTGAATTCCGTTTTTAGTTAGTTAGTTATTCTAGGGAAATCTCTGACTAAAATAGTATCTAC:1 + chr3L 7236810 3' + Doc3-element 165 1 45.21 GTGAAGAAGATAAACACAAAAAGGCTCAAGAGACACGCTTTTGGGTCTGAAGATTGGGATACTCTCACAGGACCATTTTATCGTCAACCAATTGATATGAAACAATGGAATTGAATATATTTCGACATTATATGGCATTGTATATA:1 - chr3R 30289165 3' + Porto1 154 1 82.19 ACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAATCTGGCAGTGACTTGGGGCCACAATA:1 + chr2L 12932209 3' - opus 7039 4 60.96 GGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAACATTACTGTATTCG:1 - chr2R 16567283 3' - opus 183 4 70.71 AAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACGCAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGT:1 - chr2R 19574410 3' - I-element 5139 1 51.39 AATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATGTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGTTGGTTTGTCGGGGCTTCTAGGCGGCGGGG:1 - chr3L 18044599 3' - hopper 54 1 73.83 TTAAAATAAAAAAAAAACCATGTCACCATCTATCATCGTGTCGTGCATTTGTCATAATCTTCAGATCGTAAGGAA:1 + chr3L 15176487 3' + transib2 2639 1 64.00 ATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAGGCTAGACAGAGATCTCCTAGGCTGTATATAAAAACTAACGTATTGAATGTTGCCACATAACCTACAAA:1 - chr2R 5953905 3' - flea 46 2 53.15 CATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTAGATTTCCTGTCTGAATATTTGCGTACAATTATAAAAATCGTGTGTGTCTTACTGATTGAATAATTA:1 - chr3R 31264382 3' + BS 5084 1 79.45 GTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATT:1 - 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roo 8675 2 78.08 TGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAAAGCGCATTTAAAATTCGTGACTACCCCAGTTATCATCGATTCCACTTCAACTCAAGTTTGTCCACGTGCCGACAGCT:1 + chr3R 25796107 3' + BS 5063 1 56.92 CTGTCCATATGAACGCCGAGATTTCAGATTCTAGGGACATAGAAGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGTTGTCACGCCCACAAACTGCCCAAAACTGCAACGCCCCCACTTTTGAAAAATTGTTTGATATTTTTTCATATTTT:1 + chr2L 21377754 3' + INE-1 131 1 78.32 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATGGAATATTCAATACTATTTACAAAACAAAGGAACTCTGCTGTAATTAACTATACAAGTGTACGTAATAGTACAAGTATGCGTGTTATAAATAAAAACCTAGATGTAA:1 + chr3R 13613232 3' + copia 242 1 72.60 AACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTGCGCACAATTTACGCTTAATATACGGCGAGACA:1 - chr3R 19950413 3' - BS 5022 1 63.01 AAGGTTGAGATTCCGCATACAGATTCTAGAGACAAACGCCCACTCTAACGCCCACAAACCGCACACAACTGCCACGCCCACACTTTTAAAAAAATGTGTTGATATTTTAGATATTTTAGATGTTTTTTTAAACAGTTTTGGAAATG:1 - chr3R 20125845 3' + INE-1 174 1 63.01 ACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGG:1 + chr3R 28618443 3' - 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P-element 35 1 56.39 ATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGTTAAA:1 - chr3L 2317128 3' + 412 7488 2 55.48 CCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAATTACCAATATCGCTCACTAGTCTTTGAACAAATCAGCTCCACCCCACACACTCTGTATATATATATTTATATATAC:1 + chr3L 19003778 3' - copia 4917 2 52.05 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAA:1 + chr3L 18074174 3' - 297 6602 2 59.41 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGC:1 - chr2R 17269115 3' + roo 344 2 65.22 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAAGAAGGATATCGCACTTATAATGTGGGTATAATGACATCGTTTGTAGTTCGCCAGTCTAATTTTAACATCATGAATATTAT:1 - chr3L 5027153 3' + roo 9032 1 56.85 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGGTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGGAAGGGACCAGAAGGCAAGCTGAATTT:1 - 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chr3R 24071984 3' - jockey 27 1 76.71 TCATGTGTATATATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAA:1 + chrX 8968685 3' - 1731 76 2 70.50 AGTTAATTAAGAGGATATANAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATC:1 - chr3L 24213776 3' + invader2 235 2 57.65 GAGCATGACGAACGCCGACTCTCAATTCAGCGCAACAACGCGTACTTCTCCTACGTCTCACCGACAATCCCAAACGCAGACAGCGTGGGTAGATGGAAGAGCATAATCCTGCCAACAGGAGGAA:1 + chr2R 17355705 3' + F-element 228 1 66.94 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTCAAT:1 - chr2R 18931819 3' + blood 7326 1 61.64 ATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAGTAGTGGAAAAGGAGTCCTGAAA:1 - chr2R 7895468 3' + mdg1 412 2 74.66 CGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCCAAATTAGCTATTAACTTAAGATTATAACAAAGATTAAAATGGCACAT:1 - chr3R 8112652 3' - Burdock 4 2 78.17 GTCCGCGCCGCTCAAGATAGGCAGATGTGCCGGAGCGTGGGACAGTTTAATAAAAAATGTTTATAAATAAAAATATTGAAAATATAAGGAGATATTTGCATATATAACATGAGGTCTTATATTGGTAGAAATATAGGTATAAA:1 + chr3L 23656071 3' + roo 8893 2 69.93 TATGCTGGCGAACAGCGGGGCTTGGGAGCTGGGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAAT:2 + chr3R 934274 3' + Rt1b 4724 1 49.66 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTGCATATTTGGCTCACTGAAAGCGGGGCCAACGGACAGTCAG:1 - chrX 18673670 3' - roo 8716 2 66.67 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGTTTGCTGACACAG:1 - chr2L 10909455 3' - 412 7078 2 64.38 AAATAATAAAATTTAAAAAAATTTTAATAATATTTCAAGATATCTTCGCAAATAAAGATACTAATTTTTGAAGAGAAGCTGATCGAATGGGTTGATCGGTTTTTTTTATCAGTGCAAGGGCAGGGCANGCAGGCAGCCG:1 + chr3R 23149314 3' + Doc 4690 1 91.37 GTGCGAGAACAGCGGTTTGCACTATGGGCATCGCAACTGCTACCAAGTCTATAACTTCACAATCTATATTTAACGTTGATTTTGCAATTTCTGCTACCTATTAAAATAGTATAGTATCACTGAAGTCTATTTAAATATGGGGACTT:1 - chr2R 1595987 3' - diver2 4633 2 71.92 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAGAGCAATTTGTTTGTTAGGACATTATCTAAACTATGTCTATTTACCAGGACCAGGCCCCCG:1 - chrX 8469199 3' + hobo 2913 1 58.41 CCCCGTTACCGTTCGACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCC:1 + chr2R 2994309 3' - gypsy8 4784 2 49.58 TTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGCTGGTTGCG:1 + chr3L 8249480 3' + mdg1 391 2 55.00 TCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACAATGAATCGAATCGAATCGAATTGAATCGCGCATG:1 + chr3L 8688991 3' - jockey 4738 1 73.60 AACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAAAACGTCTTCCTTACCCAAGCT:1 + chr3R 12376516 3' - HMS-Beagle 58 2 58.90 GTACAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTAGCCGTGTCAGTCTATCCGTTTGAACGTCGAATCTAGAAGGTTGAGAATCAGCATACAGATTCTAGAGACAAAAACGCAGCGCAAGTTTGTTGACCCATGT:1 + chr2R 5296380 3' + INE-1 92 1 46.88 AGTTTTCTGGCATGTAATTAATGGTTATGTATACCGTACAGGATATTCCTTATTTTTTGTGCTTAGGGGCTTTTGGGGTTATTATATACAGACTTGTATATGCATTTGGATGTATATATTTAAATATATATATATATGTATATGCT:1 + chr2R 7719197 3' - I-element 401 1 68.49 AATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTGCTTGAAATATTTAAAGAAAAAAAAAGGTCAAGCAAGGAAACAGTCAGTTTGCCAGCTGGCAGAATAACATT:1 + chr2L 22224622 3' + Rt1c 5416 1 65.07 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGGGCAGTGGCAGAATGGTTGTGATAGCGCCAGTAAAGAGCATAATTTATAAGCAGCGAGTCATAGGGACTCAATGTTGTTGTCATGTTGCAGGC:1 + chr3R 25798488 3' - hopper 13 1 64.00 AAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTATTTTTTCGAGCGCTATATAAAGAATTGAAGTTTAAAATTTACTAAAATACAT:2 - chr3R 5164890 3' + invader4 3055 2 67.12 GATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTTTTTAATTACACAAAGGCAACAAAAA:1 - chr3L 22320103 3' - jockey 9 1 79.29 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAGACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTT:1 + chr3R 9298567 3' + hopper2 1551 1 61.11 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCNCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATGTGCTGGGTGAAAGGG:1 + chr2L 13033461 3' + hobo 2937 1 78.36 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACT:1 - chr3R 5870811 3' + roo 9015 2 62.79 CGATTTGCGGTGAGACGAAAGAAAAGTATGCATTGTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGCACTTGGTATTACTTGATAAAATGGACAAGCA:1 - chr2L 20761815 3' - Doc 297 1 74.66 CTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAA:1 + chr3R 30955436 3' - G-element 34 1 57.53 ATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGTAAAAGCGTGTGTGTGTGTGTATTTATGGGTGTGTGGGTGTCTACAAGCCTG:1 - chr2L 6149121 3' + hopper2 1546 1 61.70 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCCAAATAAATACCAACGGTGAGTAATCGTTTTCTTATTGTTACTGCTGTAG:1 + chr2L 3662041 3' - blood 69 2 64.38 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCATGCTTT:1 - chr3R 14608688 3' - jockey 36 1 60.00 AAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTAACTGATGTGCACAGAT:1 - chr3R 15003080 3' - Doc 23 1 71.13 TATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGT:1 - chr3R 13559977 3' - jockey 4822 1 52.11 CACGCTCCGCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTCGATCGATCGGCTTATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTGTATATTTATATTTATTAT:1 - chr2L 23069853 3' - Stalker4 174 7 76.03 TGGCCGTCACCAAACAAGTAGCTGCTTAGTGAAAAACCAATGTAAGGCCCTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATCTGACCCTGTCCGCCCTTCTGTCTGTCCGTTTCATATTAAACTTTAAGCTGTTTGGCAGCTTCAT:1 - chr3L 23334907 3' + 1360 3331 1 75.34 ACAAAAACGTAATTGTGATCCATCACAAACATTTGCGCAGATCGTGTGCTCTTGGTTGGAATTATGTAGCAATGGAGTAACAATCGTGGCAGTGCTAGAGTAAAACAACTAAACACAGAGCCATAAATATTGTATAAATCAAAGAA:1 - chr3L 19576999 3' + jockey 64 1 71.92 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGAGTTACTTTAATTTTGTACTTTGATTGCAGTGGAATATTTCAGACTTCTTTA:1 - chr2L 8120136 3' - roo 8709 2 59.20 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACCTTGCAGCGAGCTGTGAG:1 - chr2R 12462087 3' + roo 393 1 73.57 TATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTTGGTAATTAAATCAATGTCCATGTGAAAAACCTCAAA:1 + chr2L 2291532 3' - I-element 83 1 74.66 CGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTGCAATTTAAATTTTTAAATTAATTAAAAAAATATTTATCTTCCTTATAAAACCATATTATCCTCTCAATAAAATT:1 + chr3L 15393824 3' + pogo 2076 1 60.94 TGTATCAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACAATATACTTAAATATACAAATCAAATACAATTATATTTTTACTAATAA:1 - chr3L 22257764 3' - mdg3 76 2 67.12 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGGGGGAGTGCGTGCGATTGTTTGCGCGCCTAAG:1 + chr3L 17739862 3' - jockey 76 1 73.39 AAAGGGACATGGAAAAATACCTTTGTATTACCTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTTTATGATCACAGCTGTATGTTCTTGATATTCAGGATCAATAGCCGAGTCGATCTTGCTATGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGGAACTA:1 - chr2L 22036461 3' - HB 54 1 69.18 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTA:1 - chr3R 20887414 3' - Doc 82 1 69.18 TAAAAACAAAATGTACAAANTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTCCAAAA:1 + chr3L 8824535 3' + transib2 2762 1 62.07 AGAGTTGTTGTCATTTCTTTTAATAATTATAAATTTAGGTTCGCCTAATTGGGATTGGTATGTTTTTGAAGTGATTTTGTAAATGTTTGGTGGGTCTGTCATGATTAGCAGTCCTTTCTAAGGAGAGAAGAGTTGAGATGG:1 + chr3R 11094919 3' - I-element 267 1 75.18 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCAAGTGTCTGCTGCCGACGAATACAGTGGTCTCGCTCTGGCGTAGGGGG:1 - chr3L 5770895 3' + P-element 2816 1 35.17 TTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACAAAACCGAAGAAAGGCATAAAGTATGCAA:1 - chr2L 14056626 3' + pogo 2083 1 68.49 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAG:1 + chr2R 12133871 3' - jockey 17 1 73.17 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATA:1 - 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chr2L 18525614 3' - pogo 72 1 67.81 TAACATTGTAAATGAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATAAAACTTTCGCGCCCAAATAAGCTTGCTTATCGGTAT:1 - chr2R 11844266 3' + I-element 5271 1 75.17 CAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCACAACTAAGTCCAAATTCTGTATTGATAGTGGGGAATTTTTTAGATTTTATCCCTTATCCTGTTCGCTGACTTACTTATGTATCCT:1 - chr3L 12890274 3' - hobo 35 1 60.00 CGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGTGGACCAGCAGCTGAGCGCCGGAGAAAGTGAAAGCCGTTCCCATCGGCACCGGCCACTGTG:1 - chr2R 23443950 3' + P-element 2856 1 56.78 TTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCAAGTGTCTGCTGCCGACGAATACAGTGGTCTCGTTCTGGTGT:1 - chr3L 5770901 3' + P-element 2830 1 36.00 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATG:1 + chr2L 13033446 3' + hobo 2911 1 62.07 GACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCAGTGTCAAAACAAAGCCTGCTAAAGGTGATTAACTACGCAGAGTCAGACCAGGAGTTCTTTTTAGAG:1 + chr2R 2046573 3' - 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Quasimodo 41 2 67.59 AATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATAATACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGCCGAATTGATCTGGGTCACTCCCAAACAATACTNTGTAAATTATTAAT:1 + chr2R 23095000 3' - 412 7083 2 60.96 CGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAATATGCAATT:1 + chr3R 23636428 3' - X-element 4305 1 64.83 GGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGGT:1 + chr2L 20852568 3' - Tirant 5 2 77.19 AGAAGGTTGAGATTTAGCATACAGATTCTATTGGTCACCCCAATATCTAACGATATCCTAGAAAAATTATGAAATTTAGCGTTCGCATTTACATTAGCTGAGTAACGGGTATCCGATAGTCGGGAAACTCGACTATAGCATTATCT:1 + chr2L 3964500 3' + INE-1 172 1 78.77 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCTA:1 - chr4 372945 3' + pogo 2051 1 55.24 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTGAGACAGCTGATTGCCTCATCAGGTAAATTGGTGTC:1 + chrX 10725089 3' + pogo 2050 1 56.55 AGGCACGTCTGCACTCGTCGAGTGTTCGATCGCGACTGTATGCGAGAGTAATGCAAACATATTGTTCTTTTCGTGTTTTTGACAAACAAAATGGCGACGGACGAACGAGATGATAATATATTCAAATTGCTGCTAATCAGAAAAAA:1 + chrX 22383293 3' - 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Doc 4476 1 68.49 AAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCG:1 - chr3L 23146454 3' - 1360 38 1 57.86 TGTACTGGTGAGTGCTATTTTAAGCACCCAAGAAATTGCAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATCCGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAA:1 + chr3R 31264492 3' - BS 85 1 79.58 TTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTTATTTAAATGTTTCT:1 - chrX 3533838 3' - 17.6 6947 1 72.41 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCCAACTTTATTTGTTGTTGTAATTCTGGATGTCATTGTCGGTGTGCATCAAGTTTGTTAGTTTTTTTTCTATTTGTGAAAAAACTGTTATTCCCCCTTAT:1 - chr2L 3892933 3' + 1360 3377 1 75.71 TCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAAATGGAGTTCATCATTACAATGGGTTATGCAAATCGAAGGTGGAGAAGTACGCACGCTTTGTTAATTGAAATTCTGTCGCGCACACTCGTTTCCGCTGGGCCCAGCCAGTTAGGAGCAC:1 + chr3L 7319383 3' + 412 7522 2 68.49 CGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGT:1 - 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chr3R 11516483 3' + roo 9033 1 61.64 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTTTTTTTTTAATTGGAAACTATTCGGATCCGCGACGTTTGATGTACAA:1 + chr2R 6700134 3' - roo 8732 2 70.14 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGAGGTGTCTGGGTTTGCATTTGAAATTTATAATGCAGCCGTAAC:1 + chr3L 22021777 3' + mdg1 7427 2 63.70 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAA:1 + chr2R 12102048 3' - hopper 39 1 54.79 GAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAAGGAAATTAAACGC:1 - chrX 609383 3' - 1360 73 1 70.92 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCTGAGCACTGTGCCATGATGGTGGTACCTTTGTATATAGAAGAAATCTTAAATTATTATTATTTGCTAAAACAAAACAATTAATTATGTTAAAT:1 - chr3L 19579953 3' - jockey 37 1 66.44 TGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATGTATATATGCACATGTAGATGGCATATCAACGCTCTGCACGTGAAATGGCGCCGATATTAATGGATTTATTTTTATAAACCCCACGATTCT:1 - chr2R 15474435 3' - Quasimodo 30 2 65.75 CAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAAATGAAAAAAAAAAGGCGCCAGTCCACAG:1 + chr2R 11558069 3' - 412 49 2 51.08 GAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAAGCAAACACGCAT:1 - chr3L 1004845 3' - jockey 4756 1 69.18 TATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTCCGTCATC:1 - chr3R 19506705 3' - mdg3 5295 2 56.16 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCGTGAACG:1 - chr2R 15392511 3' + mdg1 369 2 52.74 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTATGCAAAGACACATCTTTGATAGTAAAACACTAAGTGTG:1 - chr2L 21198178 3' - flea 4831 1 72.60 ATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACACTATTACCTTATTTTTTCACAATTTAAAAAAGTGTTTATCTAACGTAATATTTCGTACTCAACACTTTCTTTGC:1 - chr2L 12158750 3' + 1360 3356 1 54.41 TTTAACAAACAAATTTAAAAAGCTTTAAAATTATAATAGTAAGGGCGCGAATTTTTAAAAATTTGTTTATTTTATAATATTGCTAGGAAATTGGCAAAAACTACTCCTATACNATACTGCTCGCACAGTAAAATTTTAATAGAAGT:1 + chr3L 23637011 3' + 1360 3005 1 71.92 AAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGTTCTTTCT:1 - chr3L 18216453 3' - 297 6603 2 67.44 GGTGCTTGCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATAGAAACACACACAGGCACACTG:1 + chr2L 15516746 3' - Max-element 8302 2 76.07 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTT:1 - chrX 17884487 3' - pogo 45 1 55.17 CTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGAT:1 - chr2L 15085633 3' - opus 7060 4 66.17 TGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCTGTTAGTTCCCGGAGTTCA:1 - chr3R 28749121 3' + mdg1 7375 2 71.92 CAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCCCTTTTCACGCGATCTTAAACGACCATTAACCGCAATCTGCCGATTTTATGTGTTGTTTTGTCCCCCTCAAAAATTGATTATTTTTGCTAACTTATCGTCTAGTTTGTTT:1 + chr3R 8050696 3' - jockey 4771 1 76.55 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGTGTAATTGTATTTCATTGCAGGATATTGGATTTTTGTGCCTGATTTGCCACATT:1 - chr3L 8824443 3' - transib2 51 1 57.58 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCC:1 + chr2R 9341637 3' + roo 8991 2 76.39 TCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAACCATCTATATTAAATAACTTTGCTATTTCAATGTGCGGATGTCAGCCCAATAATTAAAAGCTAACAACTGCAGCAA:1 + chr3L 11904885 3' - copia 4913 2 53.79 AATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTTGAAAGGAATTATGTACAATAAGTTAGAATTTTAGCATTATTTTTAGGCCCAGACTCATAAACGGCTTTACAATCCTGACTTATTTTTCCAGAGTGTGAAAAGATAGTAAGA:1 - chrX 13789482 3' - FB 13 1 76.71 CCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGGGGTGCCCAATAAAATGAGGGAAATTCGCC:1 - chr3R 27315056 3' - jockey 4711 1 50.71 TGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCCTACAAAC:1 - chr3R 11937779 3' - hopper 73 1 67.12 TTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGGAGGGTATCGA:1 + chr2R 6801705 3' - 297 6641 2 68.84 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAAT:1 + chr3R 24084904 3' + roo 9029 1 55.48 TGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTGTATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATCTTTGGAATATAAAACAAGTGACAACTGACAAACGTGAATCACATATAA:1 + chr2R 954538 3' - Quasimodo 62 2 69.29 CTGAGTGAGACAGCGATATGATTGTTGATTAACCCTTAGCATTCTCATAAGACTTTATTTGGAACGTGGTCGCGTGCCAGACAGGAACAACATAAATCAGAGCGAGAGCCCAGAACTAACCCCC:1 + chr3L 1466441 3' - P-element 2779 1 70.97 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTTATTTAAAGACTTTTCG:1 + chr2R 19633336 3' - jockey 4791 1 64.38 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAATATAAG:1 + chr2R 5193510 3' + roo 8995 2 73.29 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACGCACTTGCAGTGGAGTTTATTTGATTGAGCAAA:1 + chr3L 17012018 3' + 1360 3345 1 66.67 TGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATGGGCAACTTTAACGGAGATGAGAGAGG:2 + chr2L 6637490 3' + 1731 268 2 52.74 AAATAAAATAAATAAAATAATTTGTTTTAAAACTCTTTAANTATTTCGAAAATCATCTCCAGGTAAATTTTCATTTCATTTTCATTTGAGTCAGTTAGTTTCCCACAGTTTANTTCTTGAAATAAACCCATTAAGTAACTCCAAC:1 + chr2L 12553472 3' + HeT-A 6 1 73.10 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTCATAAAATTCGGACAAGGGCATT:1 - chr2R 18886921 3' + roo 400 1 76.30 ATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTCCAAAATAATTGCCACAAATCGGAATGTGATTGAGGTTGACTGTGT:1 + chr3L 8824575 3' + transib2 2800 1 68.49 GCTATTGATCCAGATCAAGAATAAATATACTTTATATGTTCGGAAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTATTCAACGAATCCAGTATACCCTATTACTCTACGAGTAAAGGGGATAACAAACCTTTAGTTCGTAACGATGGACA:1 + chr3L 22721131 3' - INE-1 86 1 74.66 AATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTTGCCGATGCCAGGCTTACCCATTAATTGGTGCTATTTATGGCT:1 + chr3L 17135464 3' + hopper2 1551 1 63.85 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTACCTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATGGAGCACGAACTAGT:1 - chr3R 29680174 3' - 412 28 2 62.86 ATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATCCACGTACTATATGATAGGTAATAAATAAGTGGCTTCATCACCAATAATTATCATTATGGCTTGCATTATTTATTTAAAATTAAATCAATT:1 - chr3R 17605323 3' + flea 4995 2 62.86 GTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATCACCATTAAGGTAATTAGTAC:1 - chr3L 9324409 3' - HMS-Beagle2 6891 2 75.56 TGCGACAAAAAGAAGAACTGGAGTCCCTCGGCCCGTGAGAGCGTCAATATTGCAATCTTCACGGCGTTTTGCGCGCAAACACGCATCTGCCCTTAAACTATCCGATCGTTCTGTGAGAAGAATTCTTCATGATGATCTTTAATT:1 + chr2R 4802903 3' + mariner2 310 1 76.39 TGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTCTG:1 - chr3R 12078583 3' + hopper 1379 1 61.64 TTTGTTTTATTTTTTTTTTAATGTATTCCAATACAGAAGAATTAGTTCATTACCACCCCAAATTCCAATAAAATGTGTGAGAATTTTACCGTTGGGTGAGGTAAAACCATTTATTTTATGTAAAA:1 - chr2L 16354508 3' + hopper 152 3 76.80 TTTGAATTAAATAAAATAAAATTATTTTATTAAATAACGTTGCCAAATACTTGCATTGACAATATACAAGTAGGCCAACCTATAATTCGTCAAACATTTTTTAGCTAACATTCAGAAAGAAGAATCTTCACATTGAAGATAATTTC:1 + chr3L 18074312 3' + G7 1145 1 58.22 CTATAGTCGAGTTCCCCGACTATCAAATGCCGGATACTTGTCGACAACAAGTTTTCATAGAATTCCATAGCCAACTGGTGGGCGCAGCTCGCAAATGGTATTT:1 - chr3L 25353897 3' - INE-1 566 1 62.14 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGTTGCGTCAGAAGTTCTGAAAGAGGGAACTTCAGCACAAACTACC:1 - chr2R 9341525 3' - roo 45 2 50.68 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGTTGCTCATCACTTATGGCCATTAT:1 - chr3R 24071995 3' - jockey 26 1 75.37 GTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAAATAAAAACAAATAAAAAAAAGCGCATTTAAAATTCGTGACTACCCCAGTTATCATCGATTCCACTTCAACTCAAGTTTGTCCACGTGCCGACAG:1 + chr3R 25796105 3' + BS 5053 1 52.17 AGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATGCCATATGAATGCGACGAAATTCCAAAATTATATTTAAGCGAGAGAAGGAAATGAAAGGAATCGGTTTCATAAAGTGCGCAGTTCTAGGAATT:1 - chr2R 19230469 3' + I-element 5325 1 66.44 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAAATTCGTTACCTCATGAAACCG:1 - chr3R 12341090 3' - Tirant 8144 2 52.59 TCCGTATAAAATCACTTGGTTTTAGTGAAGCAAATAGTTAATCACATAAAATAAATAAATAAATCGAAAGCGTAAGAGAAGCTATGGGCAATGTGGAATAACCAACCCAAGCTTAGACCGCACCGATATAAATATATATAAAGCCA:1 - chr3R 851703 3' + Doc3-element 37 1 69.86 ACATACATTTCAAAGAATCTAGTATACCCCTTTACTCCAGGAGTAACGGGTATAAAAAACCATTTGGTTCAGACTAAATTATTTTTCTCTCTGCGAACGTGAAAAAAAATTTGTTGTCAAGTACTTATTTTCTGACCCTTGCAATT:1 + chr2L 11154363 3' - INE-1 12 1 78.77 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCAC:1 - chrX 6891419 3' + hobo 2928 1 73.98 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCAC:1 - chr2R 6236075 3' + P-element 2811 1 30.22 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCG:1 + chrX 683618 3' - jockey 64 1 58.59 TCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGT:1 + chrX 21045254 3' - P-element 100 1 15.75 TGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAATGTGCGCATACATTAA:1 + chr2L 15019999 3' - BS 4816 1 70.00 ACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATACTTTATATAGTCTGAATGCCTGTTACATACTTTTCATTGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTACC:1 + chr3L 25245598 3' - 297 35 2 54.48 GTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACACTATTACCTTATTTTTTCACAATTTAAAAAAGTGTTTATCTAACGTAATATTTCGTACTCAACA:1 - chr2L 12158760 3' + 1360 3336 1 56.85 TCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATTAAACGTTATCACCCTGTTACCATTAACAACACTTATCAATTATTCTTTCCTTGAT:1 + chr2R 5549899 3' - flea 53 2 58.70 TGTGGGGAGTTTTAAGACTCCTCATATAACTTTCTTTCAGAATTCGTGTAAAATGTACTATTCTCGTATTCATACTTCTAAAATTTGAATTTACTTCATTCTATGATCTTTATAGGATATTTAGTATGT:1 + chr2R 18971784 3' - gypsy8 3 2 58.91 CAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCCTTCACCAACCAGCCATTCG:1 - chr3L 10740030 3' - P-element 57 1 46.58 CCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTGGCAGTTTGTTGGCATTTGT:1 + chrX 21668404 3' + opus 491 2 51.37 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCT:1 - chr3L 414867 3' + 412 413 2 74.29 GCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGTCATTCGGCATCCCATCGATGCACTTTATGTGAGGTGACTTTGGCTGGCAATGGGCAATGCAGACTCTCGGATCGACTTACCTTAGCACTGG:1 - chr3R 20752852 3' + 1360 3377 1 71.54 CGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACTGGCCACGCTGCACACACTTACACGCACACAGACTCATTCCTACAAACATGGTTA:1 - chr3R 11937772 3' - hopper 66 1 62.33 GGGTGGTGTCNCTTGAGTCTTCTTTTGGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACGACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGG:1 - chr3R 27315086 3' - jockey 4746 1 69.66 TATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGCAATGGCTATTAGAAACATGATGCCGCC:1 + chr2R 8442740 3' - blood 7064 2 53.10 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGATAATGATATATTGTTTCAGTTTTTGTATTGGGTTACACTAGGCCATATCTTACATATATAACACCAAAAATTGTGGGCATGACACCGCTTC:1 + chr3L 24059297 3' + roo 9042 1 61.64 CCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAAAATTACT:1 - chr2R 16567290 3' - opus 7061 4 71.90 GGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATACATACATATACGTTTTATGACAGAGAGTCAAAAACATTTTCTTTAATTTTCCTGCTGATTACAAATTCATATACATATTTCTCTGTGTTT:1 + chr3R 26180552 3' + Transpac 282 2 65.07 TAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTTAATTGTCCCGCTGGCACATTATGGCCAATGG:1 + chr3L 17268343 3' - hobo 8 1 68.04 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCNATGCGGATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAANCCATAAATGAAATAATGTTGACTTCATTTATTTGCCTCGATG:1 - chr3L 7848439 3' - jockey 35 1 60.42 ATTGGGAAATCAAAAAAAAAAACATGTAGAAGACATCGAATTACAGATAAAAGATCTTTTTAGCGTATATTATTATTAAACAAGAGACTTCACTGACATTTTTCTCTTCAATTAAATGACGGCAATAAAACCCGTTTTTGATATTT:1 - chr2L 13043765 3' - Tc1 1476 1 47.26 GAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCA:1 + chr3R 18294903 3' + copia 183 2 66.44 TAAAGTAGAGTTAATTTGTATGTTAAATTAGTAATGAGTTGTGCTATTATACACAATTTTAGACCAATACCAAGACCATGTTCGATACTAACTGAAACATCACTCTTTTTCCAAAGGTTCGCATCGCGATGAACAGCGTGGGTGCC:1 + chr2R 19172720 3' + Stalker3T 58 1 60.27 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACGCAAACAGTCGATTGCGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTTAACACACTGCCCGCAATGCGGTG:1 - chrX 1769674 3' - hopper 27 1 59.68 GGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCAATATCGTAGGCAATATTTCGCTTTCTTGTAAAAATGCTGGGAAAACTTCCAACAAATGGCCATGTGGGAGCCGTCTTGATGCCACGTTTTCTCC:1 - chr2L 5207393 3' - opus 21 2 69.18 CTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTG:1 + chr3L 2532552 3' + blood 7343 2 53.10 GATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACATAAGAGGCATAAAGAGAAAAGTCCCAAAAGAAAGAACTCATTAGAACATACATACATAAGTGAAAAAGTCCCAAAAGAAAGATTTCCTTTTAAACA:1 - chrX 6538612 3' - pogo 19 1 66.43 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTGAGGCTTATTTTTACGTTTCGTCAGAATCCCGCGTAGGCCCCTCTATGCTAACACTTCATATTTTTCAGAGGTGGAATCATTTGT:1 + chr3L 23219342 3' + 1360 3355 1 45.45 TTTTTAGAACNTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGCTTACTGGAAGGACTCGCTG:1 - chr3L 9635290 3' - Doc 50 1 50.00 TTTGTATTTTTTTTTTTAATTTCCTTAAACATTCTCATATGCTGCAAACAAACTTTCCTAAACGTTAGCCACCCCATATATCACACAATATTCGAATGGTTTCTAATTTACAGATGGTATAT:1 + chrX 12456407 3' - Doc 4699 1 73.77 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGTGA:1 + chrX 20284514 3' + roo 327 2 71.92 GATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGATTCGGAAAAACGGGTCCGATTCTAAAAAAATGAGATTGTAAAGGGTCCAAAACCGAGCGTTGCGCACAATCAGCAACGCGCCC:1 + chr3L 23611171 3' + Bica 378 2 52.05 CATGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGAGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCGTTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGCTCACCT:1 + chr2R 20972734 3' + jockey 4944 1 50.00 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTAC:1 + chr3R 11285006 3' - blood 29 2 59.68 AAGTTTCGCGAACCGAAGCCGTCACCGTTATGCAGTGACTAAAAATGGCAGCGAAATGCGAGGAAGGAGTGGCCATCCAATGGCCATGGCAATAATAAATTATTCCCCAGCCGAAAAAGGTGCAA:1 + chr3R 17988135 3' - jockey 157 1 60.80 ACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGTGTGTGCATGTG:1 + chr2R 10582515 3' - Juan 3801 1 77.95 CAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTTGTGTTCGATGTTGAT:1 + chr3R 2520367 3' + Tc1-2 1623 1 59.59 CAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAAAAAAGTACAAATGTGAAAGCACTTCGGTGGTTCATAATATTTTTACTTAACGCATACGATTTTGTGACCTAATTCCTT:1 - chrX 1288892 3' - jockey 4965 1 61.42 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGTGAATAAGAATTCTGTGTTCGCTGCACTGCTTTAAAAGCCATTTCCTCGAGCTAACCACTT:1 + chrX 20284572 3' + roo 9049 2 69.86 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATA:1 + chr3L 1459871 3' - 412 7118 2 66.19 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTATCACTATACCATTGTATCTTTGTATATTGATATCATAATATCTTTATATC:1 + chrX 18673772 3' + roo 9045 1 64.62 TAGATTTGCAAATCGATAAAAAAGAAATACCGTCTGAAGTAATAATGTCTTCTTATTTTCCCGACTTCAAAAGACTTTTATTCAAGTGTAAAAATGCATGATTACACCTAACACCAAATTTCTAATTGTAGCCCCAAGGCATTGG:1 + chr3L 15881350 3' + G3 4486 1 77.24 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTG:1 - chr3L 18216461 3' - 297 47 2 54.11 GGACACAGCATTATCATTAGTCTAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCAAAAGTCTAAAGTAAATGTAAAAAAGAAAACCAAACCAAATGTAACAAATTCTGAAATAAGTAACGAAAATTAAACAAATGTAATGATTACAAGAAGTAGAG:1 + chr3R 934305 3' + Rt1b 4755 1 71.03 CAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCC:1 - chr3L 25232768 3' + accord2 7565 2 64.44 CTCAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCACAAATATAACAACTATTTTTCTATATAACCTCGGCATGGCAAATCTATCTTTCTTTCTTGTTGGTAAGTCTTATTTGCATCACAAACACTATTTCGAAATAATTACTATTTGT:1 + chrX 22577211 3' + 297 6941 2 36.30 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCG:1 - chr3L 2532464 3' - blood 87 2 80.00 CATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAATCCCATAAATATTGCAAATGGTTACACTTAAGCTAAATGTAATTAAA:1 + chr2L 18510809 3' + copia 5086 2 64.38 ACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATAATGTAATAATATTCTAGTATCTTTGCAATCACATTATCGGGCTGTTCATTTT:1 + chr3R 13838563 3' - opus 7154 4 58.82 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCT:1 - chr3L 20061336 3' + roo 9020 2 57.78 ACGAAAATAACTTGCCGTCGGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTA:1 + chr3R 30955425 3' - G-element 44 1 50.34 GTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATACATGTGAAATCAGCCCTCATTATTTATTCCCGGCATCAAATATATA:1 + chr2R 5954002 3' + flea 4937 1 70.55 GATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTATTAAATGTTAACAAATTTCTTTGATTTTATTTCAATTATTGATGTTGGGGCTGAGTA:1 - 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roo 8747 2 76.43 CTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGATCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTCTGAA:1 - chr3L 18463352 3' + 1360 90 1 52.80 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATAT:1 + chr3R 19514346 3' - blood 7058 2 53.42 GTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTCAGGATGCCATTTGGGGATTGGATTGGATTGGGTTGTGTTGGTTTTTGGGCCAAGTCAGTATGGTTCTTTTGG:1 + chrX 6891555 3' - hobo 23 1 63.87 GTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTGGTAAAATTG:1 - chr3L 2532412 3' - blood 7024 2 70.40 TATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGATTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGCTGAATTGAGAGTCGGCGTTCGTCATGCCATGTCATGGAAATATGACAATACAGATATACAAATGACTTTTTCATTTTCC:1 - chr2R 4012508 3' - F-element 302 1 64.38 GGTATCAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTACATTTGCATTCCCCTTCCTTCATATTGCTCAAATTTTTTGTTTTTGCTGTAGCATATTT:1 + chr3R 7625440 3' - 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BS 4886 1 75.34 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGGGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTATTTTGACTTTGCATCAAAATGGAA:1 + chr2L 12236868 3' - jockey 36 1 62.33 TATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTTTCGCTAATTACCGCATTTTGCCT:1 + chr3L 4547780 3' - mdg3 58 2 55.48 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAGAAAAGCACGGCAAACGAGTGCAAATGGATAAGTGAAATG:1 - chr2R 11153115 3' + roo 9031 1 55.48 CTAGGGTGACCCTAAGGAATTAGGGTGGTCCTAAGTTTACTTATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTGTTCCCAAAGCAGAGGAATTAACAACCAATCACTTGCATAACCGTAAATGTTATTATATTT:1 - chr2L 15876745 3' - mdg1 7155 2 58.62 TTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAA:1 - chr3R 20887379 3' - Doc 47 1 52.05 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTTGTT:1 - 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chrX 17792493 3' + roo 9036 1 62.33 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTTCTTGGGTGTTTCGGCGTCCTGTCCCTTGGCGCGGCGAAAAAGTAATAAAATAAACAAGTGTCCTGGAAAAAAAGGACGGCCTGCTGTAAAAACCGGGTCTACACCA:1 + chr3R 28438463 3' - mdg1 7053 2 75.34 CTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTGGATCGCATTCGGCTGC:1 - chr2L 14262960 3' + P-element 2823 1 36.03 TTAGAAAATANTTGCTAGAGGACGATGTATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTC:1 - chr3L 19274791 3' - transib2 62 1 58.62 ATTATATGATTATGAGTATTAAAGAAGCGGAATGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGGCAGTGTGCGCACTTAAATGGCGGAATGTCGTCGTCCATGAA:1 + chrX 15744087 3' - jockey2 3274 1 57.58 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCCGTACCACCGCCATTC:1 - chr2R 5953754 3' - roo 8677 2 76.22 CGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTATATGCTTTAACATAGATTATACTTTTCATTTCATTTTATACTCTCATATTAGAATAAGCTAATTTTTTCAAGCCCCTTT:1 + chrX 8469319 3' - hobo 41 1 57.53 ATTTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTA:1 - chr3R 13339051 3' - BS 5084 1 75.34 ACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTGGCAGCAGTGCGAACGAGAAAGTTCAACAATCTTTTTGGCATTGAAATTAAAAAATTCAGCATACCTTTTCACTGGAAGAGTAAAGGGTATAAGAAGAGGTTTTCGCAGCGAAAGCGATTT:1 - chr3R 19113901 3' - INE-1 548 1 50.00 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCTTCTTGGGTGTTTCGGCGTCCTGTCCCTTGGCGCGGCGAAAAAGTAATAAAATAAACAAGTGTCCTGGAAAAAAAGGACGGCCTGCTGTAAAAACCGGGTCTAC:1 + chr3R 28438459 3' - mdg1 18 2 73.10 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAA:1 + chr3L 414936 3' - 412 68 2 64.38 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTA:1 - chr2R 7720051 3' - HMS-Beagle 42 2 56.85 GTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTNCACAAA:1 + chr3R 17243248 3' + hopper 1388 1 64.38 AAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGA:1 + chr3R 27606689 3' + 412 419 2 66.44 GACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCATATTTT:1 - chr2L 15085615 3' - opus 165 4 56.85 TAAAAAAAACAGTCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCACGCTTTTCCAGCTTTCGGGACACATACACATACACACACACACACTGGCATTTTATGCAAATGTCGCTTTTCTGCGTAGCTGCCTCGCTTTTTAATGTGCACACACAC:1 - chr3R 27439784 3' - hopper 9 2 76.71 GGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGAAACCGAGAAAATGCCAGAGAAGTGTGTAACATGGTAAAAGCTCGCGGCGAAATGTGCGAGACTGAGAAGCTTCAGCTCTCTCGTTTTTGCATTTC:1 + chr2L 310192 3' - P-element 16 1 73.72 ATCGATAGAAATTTATAAGACTAAGATCCTTTTACTATACGAGTACCAGGTATAATAAAAAAATCGAAATCACTTTATTGATAACCTTGATAACGGCATTGAAATGAAATATATATCTAAAAAGAACTAGAAATCTCCCTTTTAAT:1 - chr3L 25255412 3' - INE-1 300 1 68.49 CACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCTATG:1 - chr3R 12046699 3' - Doc 16 1 69.66 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAGGATTTCCCTGAAAATTGCATCGCCCTTTATTTGC:1 + chr3L 2966567 3' + roo 9037 1 55.00 AAAAGTTTTATTGTTAATAATTGTTGTCTAAGCAGGAAGGTTAAGATTATAAATCTTAAGTGTATATAGGGTATCTGATGGTCTCACTACTTCAGAACTTCTTATTTTAATTATTTCGCTCCCAATAGTTTTTTGCAGAGTGTACA:1 - chr3L 11597594 3' - P-element 2687 1 48.63 ATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAG:1 + chr3R 31264520 3' - BS 45 1 57.69 TGTGAAAATTTGTCATAATAAATATAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCA:1 + chr2R 2879457 3' + Stalker 6919 4 62.76 TGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTC:1 - chr3R 19965220 3' - jockey 64 1 55.80 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCCCATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATATAATATTAATAAATCTAAAGCACTAAGTATCCCTTAGTCGTCAAA:1 - chr2L 4244847 3' - 412 29 2 62.33 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAAAATTTTATTATGTCAGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCGCACATATGCGAAATGTGGCCAAACAAAGTTAAGTTAAAGTTAAAGAAGGTCAACAGGC:1 + chrX 9951364 3' - jockey 32 1 51.37 TGATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATGTATAGGCTAGACAGAGATCTCCCAGGCTGTATATAAAAACTAACGTAT:1 - chr2R 5953930 3' - flea 4831 1 69.86 TTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGGAAAGCG:1 + chr3R 15668244 3' + G2 3014 1 56.85 AATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATGATTTGTTGTTGCGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGCGAGTGCCTGTTGTGTAATTTATTGCATATTTTTCGGGGCGTTTGATA:1 + chr3R 27315181 3' + jockey 4955 1 54.79 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTTG:1 + chr3R 21794147 3' + hopper 1378 1 53.60 TTTCCAACGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGG:1 - chr3R 12078617 3' + hopper 1345 1 65.07 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTTTAACATCACCCGACGGCAGAAAAAGACGCATTTGATTT:1 - chrX 8038615 3' - 297 6622 2 64.91 AAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAAGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGA:1 + chr3R 10030826 3' - BS 5015 1 71.76 AGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGTTTAACAACTTGTTTGTTCGC:1 - chr3R 10148686 3' + 17.6 474 2 72.86 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGC:1 + chr3R 11284988 3' - blood 21 2 57.14 TTAGATTTTGTGGTATAATTTAGTTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTTAGAGTACTCTTGTTGCTCTTACAATTTTTTTTTTAACATAAATAACTATTATGATATTTTGTATACACCTTACTCGTTAAGTAAATGGGTCTACC:1 + chr2L 172539 3' - I-element 5174 1 76.71 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCCTAC:1 - chr2R 6236064 3' + P-element 2849 1 45.54 CTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACGAACAACAGCTGAACCCGATTACTGTAAATCG:1 + chrX 16547539 3' + P-element 2829 1 27.59 TTATATGTATGTATATATAGTAAAAGTGTTTACCAAATTCGTTGAAAAGGATGTAATAAGTTGAAAATAGAGCTTCTTATCTTATCAGATCAGTCACGCTAATAGTTCGAAAAATGATTAGATCAGTGTGCCATAGTTTTATTTAT:1 + chr3L 18416541 3' + Dm88 4378 3 76.03 TAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGT:1 + chr3R 31198652 3' - 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Doc 4693 1 64.18 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGGAACGGAACTGCGAGGAAAATATTTT:1 - chr3L 7389688 3' - roo 8690 2 60.98 GCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAATTTTACCTGAATGTTTCG:1 - chrX 17884464 3' - pogo 22 1 64.83 AGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGACTCGGGCAATCATTAGATCAGCCAGGT:1 + chr2R 18887099 3' - roo 8691 2 67.12 GAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAA:1 + chr3L 24008411 3' - X-element 47 1 51.37 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTCACAGTAAACGCTCGGAAATTACAAACGCAACTGATGATTCTACTCGCTGGGCAGGCAGAGTAGTTAACTTTAACTACTTGCATATTTAT:1 + chr2R 12462255 3' - roo 8684 2 63.16 GAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGAATCTTTTGGACACAACGNGCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATCCATCAATAAGTCAATTTGCGTACACANA:1 - 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chrX 20361930 3' + hopper 1410 2 77.19 CGGCGCAGCGCAGAAGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGGTTTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCAGGTCGAGGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTG:1 - chr3R 12613792 3' - HMS-Beagle 6886 2 76.03 CGTGTAACGAAATAAATTGATGAAGGGCAAGGGATCCTTTTTCGCTAAAGACATTAATGAATAAGATCAAGAATTGAGCGTGCCAAGAGCCAAGTGGCTGGTGGCTGTTTGAAATCCTTGACCAGTTTCAGGTTATCGGC:1 - chr2R 4687329 3' - Gypsy12A_LTR 2254 1 57.86 CGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATC:1 + chr2R 12185458 3' - accord 21 2 68.49 CTGGAATGTACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCT:1 + chr3R 31112253 3' + mdg1 336 2 75.34 TCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGTTTAACAACTTGTTTGTTCGCCAACAGATG:1 - chr3R 10148677 3' + 17.6 478 2 76.55 TTTATGCTGCAACTTTGTATCGCAAAGCTTCCCGGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGC:2 + chr2R 5621002 3' - ZAM 89 2 76.71 ATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATAGTAAATTGGGAATTTGTGAATTCTTTGCTAACCGATTCTTGTCCTAATTGGCAGATATGGTAACCTAAACAGCGGAGTCATCA:1 + chr3R 19506848 3' + mdg3 211 2 59.03 TTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGAAGTTGCAGCA:1 + chr3R 12078745 3' - hopper 14 1 69.63 TGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCAAAGTCCCGTAGTTTAACCACCGGAGAACGC:1 + chr3R 21925164 3' + hobo 2865 1 73.85 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGG:1 + chrX 19886995 3' + P-element 2806 1 21.88 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTTGAATTTATAATGCCAGCATGCAGGCTGAAACATTAATG:1 + chr3R 25580885 3' + 1360 3355 1 60.14 TGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTATTCACTTTTTGGTCCCATAAGGTACATGGGTGTATATCGGTG:1 - chrX 22835179 3' - mdg3 76 2 67.81 TTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTC:1 + chr3L 2167675 3' - opus 80 2 76.71 ACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTTGCAGCGGCCAGCTCTGAAGATTTTGTTTGTCCTAACAAGTTTATGTTAACTTCATCATCATCCGGTTACCAGTAATAACACTTTGGAGATCTT:1 - chrX 21184465 3' + S-element 1707 1 75.34 ATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTAATTTCAAAATTAACGTAACTCAGCA:1 - chrX 9165315 3' - jockey 4809 1 52.05 TAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAAAGTTTTTGTT:1 + chr3R 8112834 3' + Burdock 6358 2 61.38 TAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTCTACAAAAAACCCTATTGTCCTGTAAGGAACAATACTAAATG:1 + chr3L 9280449 3' + copia 219 2 69.06 ATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTATAGGCCTCTTATAAACCCTTTAAGCAATCCCTTTT:1 - chr3R 15727809 3' - 1731 4350 2 59.72 TTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTT:1 + chrX 21668354 3' + opus 444 2 58.04 ATAAAAATACATATAAATAAATAGGGGGTCCCAAAGTAAATGTTATAATTGAGTTACGATAAACGACTGAAGTATCTTTAGTTCTTAACCATGTTGGATTTTATAATCTCAAAGATTTGCTACTGTAAAAGCAATCAAAATATGTC:1 - chr3R 13061884 3' + S2 1603 1 60.96 GTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTCCGTCATCTTC:1 - chr3R 19506702 3' - mdg3 40 2 58.22 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAAT:1 - chrX 17884505 3' - pogo 48 1 63.85 CTCTAAAGCTTAACAAGTTACTGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTA:1 - chr3R 7049383 3' - Burdock 89 2 82.19 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTG:2 - chr3R 15003129 3' - Doc 75 1 65.52 AGAAAAAGAAAAAAAAAACCAAAGTGGAAATACCCAGACGATTCCGCGTTATCTTAACCTCTCTGCTGCCGCCTTACTTTATG:1 + chrX 20548336 3' + gypsy7 5009 3 87.95 CACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAAC:1 + chr2L 14616239 3' + P-element 2812 1 27.82 AGCGAACAATAAATCAGTGAATTATTTGTGCAAGCTGCCGCCATAACCAAAAGGAGAAGAAGCCAAAAGCGGAAGAGCGAAAGAGAGGGTCCGATGCCGGAAGCGAAAGAGAGAGGGCGAATGGCCAAAGGAGGGAGAG:1 - chrX 11644695 3' + TAHRE 235 1 53.24 CTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTC:1 - chr3L 9324441 3' - HMS-Beagle2 45 2 51.43 TTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTTGTCGTGCGTGACGACAACGAGTC:1 + chr3L 10033703 3' - blood 19 2 69.12 TTATAGTTCCTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTAT:1 - 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1360 1 2 71.74 ACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAATAACCCTTATATTGATTTATTATCATATTTTTTGTGATTAAAGTGCTGGCTGCGTATAACTTTATACTAATACAATATCAAAGTCCATGTTCAGTTTCCTAG:1 - chr2R 13121727 3' - HMS-Beagle 6811 2 73.97 TAATTTAGCAAAAAACCCTTAATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAAAAGTTTCTTGACAAACTGTATGTAGTTCATACTGTTCTAACTTAAAGTATGTTCCAATCGGTTAATCCAAGAATTT:1 + chr3L 16973458 3' - S-element 66 1 60.69 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGCCAAAGTCCCGTAGTTTAACAACCGG:1 + chr3R 21925157 3' + hobo 2871 1 76.92 TTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATGTGAAGTTGATTAAGGATTAAATAGGCAATGTTCTAATGGGATTCACATATTTGATGAATTCTACGGCCACCT:1 + chr3L 18216602 3' + 297 361 2 64.34 GGCATACTGTAACGTAAGCATTTGTCTGAATCGCCGGCAAACACAAACCAAACGCAAACCAACAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAGAAAATACAAAACTCGAACTGAAACTGCTAATTAAAATAATGTCAATAAAATTGTT:1 + chrX 7599777 3' + gypsy2 6541 2 75.52 GTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATCGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAA:1 - chr2R 7314618 3' - blood 6 2 66.35 GTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCGCAGCGCGCTAAGCCAGAGATCTGCTTTGAAGCTTTTGATTTAT:1 - chr3L 22330946 3' + hopper2 1535 1 68.06 TTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAAATATCAA:1 + chr3L 12227867 3' + opus 7425 2 70.55 CTATCTATATTCCAGAAAAATTATGAAATTTCGGGTTCGCATTCTTACAAGCTGAGGAACGGTAGGGTCGAGGAACTCGACTACAACGTTCTGCCTTGTTTATTTCTTAACAAAAACTTAGTAGCCG:1 + chr3L 64958 3' + INE-1 502 1 63.78 TTTGCGATCTTCTTTTTAAGTTCTAACACTTTGAAAGTTAAGCTAAATTTTGCGCGCAAAGCAACCAAAAAAAAATAGAATAAGCGGAAATTTGTCGGGGAAAAAAAAATGTAACTTCATCTGCAGATGCAAATTTTTTTGGCGGA:1 + chr3R 25798345 3' + hopper2 1385 1 51.37 AGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCAATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACCATAAGCAGTAAGAATTGAATT:1 + chr3R 10144492 3' - Chimpo 30 1 62.14 CTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTCAATGAGAAAAGTTGGCGCC:1 - chrX 22679663 3' - Doc 70 1 58.33 GCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGATGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGGATATGACAGATTTACTA:1 + chr3R 31264569 3' - BS 11 1 71.72 TTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAG:2 - chrX 22679642 3' - Doc 87 1 54.79 TGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGG:1 + chr2R 5621049 3' - ZAM 8 2 70.54 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGATTCATCGTTTTTTGCTTGACTACAAATTGTTTTGTTAATTCATTTTGTAACCCC:1 + chr3R 29686370 3' + roo 342 2 62.07 TGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACTATTTATTCACTTTTTGGTCCCATAAGGTACATGGGTGTATATCGGTGAGG:1 - chrX 22835176 3' - mdg3 5324 2 65.52 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGTCGAAACATTCCAAAAGAGTAGTGATTACGCAGATAATGATGATGATTAGATCACTACGATGATTAG:1 - chr3R 26472796 3' + 1360 3337 1 60.71 GTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACATTTTGTTTAATTAAATATTTAATTTTATTGAACAGTTTAGCGCGTGTTATTTCCAGCCGGAATTTATTTGTATTTACGTTGACACACTGTAACAGAAAGCTGAA:1 - chr2L 18510680 3' - copia 4889 2 72.41 GAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTTGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGCTGC:1 + chr3R 31112312 3' + mdg1 395 2 65.75 TCGACTTCTTTGTCGATTAAAGAGGGGTTAAAACAAAATGTGAATAGGTAGCCAAAGCAGTTATACAGTCTAAATTGTTTTATTAATCATTGTGCAATACCCTTTTTGATCAAAAATTGGCTAAGGTACAGACTTTATTCTCAGAA:1 - chr3L 13672850 3' - Transpac 185 2 68.49 TCTCGCTCTCCCGATAAGCCTAGATATATAAGATATACATAAGAACGCCGCTCCGCTGCTGGCGTACCCGGCAGCGCCAGGAGAAAGGAACCCTGCTGATCGGGAAAACAGAGACCTGATTGTTTCCTGCATC:1 + chr3L 416385 3' + 412 7298 2 57.89 TGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTCAACAATCAGAATGAATAAGTGAAAATAATATTTTTCTAGCAAATGCAGCTG:1 + chrX 12979595 3' - transib2 10 1 78.77 GGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGACTACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGGT:1 + chr3R 10736114 3' - McClintock 6017 2 71.11 GGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACAATATACTTAAATATACAAATCAAATACAATTATATTTTTACTAATAAATGAAACCATTTAACAATTACCACCCTTGTATTCTTAAGCAGCTCGTTCAGGTGTCAATTCGAACTG:1 - chr3L 22257697 3' - mdg3 5261 1 80.14 GTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCACATATGCTACTATATATATATATATATATGCGGTATAACATGTATGTTTAATAAATAAATTCAAGGAGTTATATGCCAGTTTCGATTTCGTTTAGGCATTAAATAT:1 + chrX 4789249 3' - Quasimodo 23 2 66.19 TAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTA:1 + chr2R 21795350 3' - transib2 54 1 56.55 TGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGGTTTTCATTTCATGATTTCAACATTTGTATGTCAAAAAGAAGTGTTGTTAATAG:1 + chr2R 17493215 3' - BS 4820 1 64.38 ACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTAC:2 - chr2L 15874863 3' + mdg1 345 2 70.55 ATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCATATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCAAAGCACCAACCAACCACACACAACCGCTTTCGAG:1 - chr3L 8249343 3' - mdg1 30 2 63.70 TTTTCNATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTTTGCCAG:1 - chr2L 6618870 3' - 17.6 6958 1 59.59 GATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTTAATGCACATTAAGCTAACTTACTGTATAACGATGCACAACAATCAAAGTAAAATTTGTTTGATTAAGTG:1 - chr2R 15199100 3' - Burdock 47 2 53.42 GAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGTATGTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAACGCTTTAAATTTTAATCTTCTTATTAAATATTTATTGTACTTTTT:1 + chr3R 18477849 3' + 1360 3316 1 64.83 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATTGCCAGCTG:1 - chr3L 18183047 3' - Tirant 10 2 77.69 TGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAA:1 + chr3L 10033671 3' - blood 111 2 43.06 GATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTTAGTATTTTTTCGAGCGCTATATA:1 - chr3R 5164923 3' + invader4 270 2 57.55 TGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTC:1 - chrX 13060208 3' + Tabor 408 2 69.66 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCTTAAACTCATTAATCATATTATTCAGTTTTGTTTACTTTGCCTTCTTGCTGAATTTTGTATAGCTGGTTAACTTAACAC:1 + chrX 8590818 3' - pogo 37 1 59.72 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAG:1 - chr2R 7314651 3' - blood 81 2 70.55 CTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATACTATGCACATTTATAGATGTTCAGTTACTCGCCCTATAATAAAGTTCTTTGCAAGAAAATGCAAATCTTTCCGTTGGCCGATATATTTTTG:1 + chr3L 22491705 3' - Transpac 27 2 67.81 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGCTGCTCCTTTAATTA:1 - chr3L 20061326 3' + roo 9019 2 54.11 AACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAACAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATA:1 + chrX 13060268 3' - Tabor 83 2 74.66 AATTGTTATAAAATCCTACGATCGGAAGAGGTACTTGAAACTAGAACAAAAACGAAGACGCCCAAGAAGCCGATTGTGAAAGCACCAGAAAATGTTATCCTTATTGAAGAAATGGCTCCTGAAACCGTCATAGAAAATA:1 - chr3L 2056687 3' + mdg3 5201 1 70.50 CGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGGTGAAAAGTATGCAGATTACGTGGCTAAACATAACTGAATTCTATAGGGACTTAAGTTTTGAACCGCAGCTCTATTAAAATTTGGTTATTTTACATTAACATTAAGAACGTGTACAG:1 + chrX 17048300 3' - jockey 18 1 69.86 AAACAGAAAATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAG:1 - chr2R 3338793 3' - Juan 69 1 63.70 GGCTTATGGTCCACCCGAACCAACTAGCAAATATTGTCAATGCCATTAAAACAGGAAATTGGCCACGTATACCATGTTTTGCACATAGCTTGAACCTAATTGTGCAAAAAGGATTCCGCAAAATCAGCGTTGTACAAAC:1 + chr2R 4781592 3' + G5 4577 1 79.14 ACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGCGTA:1 + chr2R 9836607 3' + P-element 2813 1 28.03 AGAAAAATTATGAAATTTCGCATAACTGAATAATATAACTTCGTAACTGTACGTGGTGGTGGAGATGTGGAAACCGAATAAGGGACCCGATTCTAGCGGTCCTGTCTTCATGAAGAACGCTGCGTATTTAGAAGCTGCCTTACATG:1 + chr2R 5321245 3' + INE-1 515 1 72.60 AGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTCCAAAATAATTGCCACAAATCGGAATGTGATT:1 + chr3L 8824561 3' + transib2 2794 1 62.32 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAACCGAAGTTCCTGAGATCCGATATTAGTCGTACTTTGTCACTCGATCGGTCAGGGCGTCGTTGTAGCCTTCGTTGCCGTCCACTTGCCGCC:1 - chrX 19662908 3' + P-element 2879 2 76.43 GAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAA:1 + chrX 14978654 3' - hobo 51 1 50.00 CTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGGGGGCGGAGAAGGAACGGTGGACAGGAAGTGATGTAAAGTGATTCACTGTGAATCCGGTG:1 + chr2R 20052522 3' + transib2 2809 1 72.06 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGC:1 + chr3R 11284971 3' - blood 7074 2 72.36 GAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGACCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAGTTATCCTCGATTTACAAGTAAATCCTCGAGTGC:1 - chr3R 18832304 3' + roo 9063 1 71.94 TAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCTATTCCCTCGAAGCAGACCCCCCCCTTTCAACTCTTTCCTCCCCATTC:1 - chr3R 29288623 3' + Tc1-2 479 1 79.45 AAGGCATTCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTAT:1 + chr2L 21802949 3' - Quasimodo 79 2 75.52 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAA:1 + chr3L 18074177 3' - 297 40 2 61.79 TTATAGTTCCCGAGATGTCGACATTCATAATCACCGGAAACGTTTTACAGATTTTGCTATATAAACTAGAATCGAGATAAATGTGCTATCATTTGTTCAACTATTATCTCAGAAGCTTTGATACCAAATTCTGCGCAATGTCTCGC:1 - chr2R 25172630 3' - INE-1 145 1 73.29 ACTCAAAAACATCTCATCCTTTTTTCTGGGGAAATAATTGGAACACGATCCACATTCTCATCAATACGATATTTCTTATGATAAGAAATATGAAAAGAAAATCGTACTTATTTTTAAAAATACATATTAATTGTT:1 - chr3R 28043823 3' + HMS-Beagle 6735 1 57.78 CCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAGAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGTGGTATGAGTAATTGGAA:1 + chr2L 18689251 3' + Gypsy6A_LTR 254 1 71.03 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTACTTTAAGACACATTTTAAATTTTAAT:1 + chr3R 20200491 3' - Transpac 4976 2 58.33 CGACTTAAAAAAATAAAAACTATTTAACTTTCAGCGTTGACCTTAGTTTAAATACGGATCATTTGTTCGGCTCAATTAAAAACTATTTAACTGGTTATTCCAGCTTTCCTGAATAATTGCGCGTTCCTCTTTTG:1 + chrX 22498742 3' + McClintock 6360 2 68.66 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAAAGCAAAGGATTATTTGTGTTTTATAAAAGCGGGCTTTTAATTAAATAATTCAAATTTAATTAAGTTAAATATTATAGTCATGCCGTACAGTTTTTGATGCTTTT:1 + chrX 5842049 3' - roo 8682 2 72.60 TTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCGGGCACTATTTCTTTTTTT:2 - chr2R 19805414 3' - F-element 74 1 58.90 TGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACG:1 - chr3R 20887395 3' - Doc 25 1 57.41 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGCTATATTGATTTCATTAGCGGCTTTTAAGGACCCATAAAGGCGGCGGCAGGACACTAATTTTCCCACTGCATATTCAAGAGGACTTTACCCCCTGCCGCTC:1 + chr3R 29627988 3' - roo 3 2 77.52 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAAAGGCACAGCGATTGAGGAAA:1 + chr3L 11364938 3' - Tirant 17 2 75.17 GCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCCGTACC:1 - chr2R 5953764 3' - roo 8690 2 67.81 TATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATTCTTTCGGTAACTAAAATTAAACCAGTTGAACTCATTCG:1 + chr3L 26709860 3' + opus 7423 2 76.71 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTATTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCATATACATACA:1 + chr2L 18181224 3' + blood 7335 1 52.74 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAG:3 - chr3R 19950461 3' - BS 5070 1 70.55 TGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGGGTTTACAATCTGCG:1 - chr2R 10582357 3' + Juan 4188 1 63.97 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTC:1 - chr3R 12078585 3' + hopper 1385 1 63.77 TCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATACCAGCCAGCACTAGTGGCTAGTCTTATTTTAGTAACCACTAGCCGAG:1 + chr2L 20133070 3' + 297 6946 2 54.90 AAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTTGTTG:1 - chr3R 16187753 3' + mdg1 376 2 51.37 ATAGCAACAAGCATAGAGGCAGATCGTAAACGGAGAGGGAGTCAGTTAAATGATTCTGCATTATTTGTCGATTCCAGTCCATGTGCTTTGTTTTCGTCTGTTGCCTGCCATAAAAAGTCAATGCATGCGAAATGTTTGCGTGACG:1 - chr2L 22073769 3' + invader2 4977 2 68.28 AATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGCCATATAAGTCACTTGCTTTAAGTCACATAAAAAGGATGTCTGTCAATATCT:1 + chr3L 18549828 3' - X-element 40 1 47.95 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGAGTTGCCGCTGTACCGGCAGCTGGGAC:1 + chr3R 17627574 3' - roo 57 2 75.45 AGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACCTTATAATTTATATATAGGCACGTGGGTGCTTTGTATTACGTATAAACTTGCTACAATGTGCTTGTATGCTATG:1 + chr3R 1296125 3' + gypsy 7388 2 57.53 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATT:1 - chr3L 15148571 3' + roo 356 2 53.79 AAATAAATATAATGTAAAAAAATAAAGTATTCTGCGGTCGTACTTTCTAAATCTTTCTATAAGGTACGAGACAACAATATATGTACATATGAACGTAACTGAAAGTATTTAAAAAGTGCTTCTAAAAGAAAAGACTTCTTAGTCAT:1 - chr2R 13574561 3' - Cr1a 4323 1 57.53 TTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGC:2 - chr3L 414868 3' + 412 7459 2 76.03 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTTTT:1 - chr3L 22320126 3' - jockey 30 1 63.77 GAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTCGTGGACTTCCGGCGA:1 + chr2R 9750289 3' - opus 17 2 71.63 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTGTCACTTACAGAGATTCACTGGGAATGGGACTGGAAATGGGAATGGGAATGGAATGATTCCCAGGGGAAAAAGGTTGAGGTGTAGAAGACAGCTTCTCCTG:1 + chr3R 12341232 3' + Tirant 8492 2 75.52 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCCGAGTGCGCAGCTGTGAAGTGCGTTTATGTACCGAATTCATGAGCAAATAACTACATATAAATTTCGACTGCCA:1 - chr3R 26927352 3' - roo 8 2 57.94 GATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGG:1 + chr2L 20852537 3' - Tirant 68 2 65.07 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATAC:1 + chr2R 14884165 3' - roo 8728 2 73.08 TTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGTACGAGTATTTCTTATTTTATATTCCCTCATTATTATTTTTATACATTGAT:1 - chr3R 11756713 3' + Tirant 360 2 58.90 GATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCACAAATTAAAAC:1 + chrX 20949667 3' - jockey 4621 1 77.42 TTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCAAAGGGTAACTTTCATGTCGCGGAC:1 - chr2L 17019076 3' + 412 468 2 56.48 TTTCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTC:1 + chr3R 19094236 3' - P-element 102 1 15.75 AGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAAGTTG:1 + chr2R 24427611 3' + 1360 3323 1 66.19 ATCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGAATCGGGAATCTAACCAAC:1 - chrX 21045239 3' + P-element 2784 1 14.58 CAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTCTATAAAACACCAATAATTCAATTCAAT:1 + chr3R 23644930 3' + diver 6020 2 79.31 AACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCA:1 + chr3R 11937845 3' + hopper 1331 2 71.92 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATCCATAAATGAAATAATGTTGACTT:1 - chr3L 7848457 3' - jockey 56 1 49.32 ATAGGCGCACACAATAAACAATATATAAATAACAACACATAATAAGAACCTAAAGATTGATTATCCATTTCAAATTATACTTTTAGAAGCTTTCAAAAGAATATGAAAAAAAATCATTAATCGAAAAGAGCTTATTCTTTTTATAA:1 + chr3R 21730882 3' + hopper 1098 1 55.48 ACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGAGACAGGCAGAAAGAATAGAAAGAAATTTGGGACGCTTGTTTTCTCAAGCGGCTTTATTAACTTT:1 + chr3R 27707166 3' + P-element 2855 1 62.33 CCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGC:1 + chr2L 20852519 3' - Tirant 43 2 67.96 AGATATCCGTTACTCATCTAGTGAATGTGCGAACGCGATTGGGGAATAAAATAAGCTTACCCCAGAAAGGTTTGACACACTTGTTGAGGAGATTATAAAATTGAAAATTGATACACCCGACAAAGTGGACGAAGCAATTGTGTTGG:1 - chr4 919910 3' - INE-1 542 1 65.75 TCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATACACAACTTTCTTTGTTCGCTTTTATTGCAA:1 + chr3R 12948731 3' + Stalker4 378 2 65.07 GATTGGTGGATTAGGCACACGAGGACGTGTGAAAGGTCAGGAAGGCCGTGTCGGAGCGCGACTCTTCGCATTCCAGAAATTCCTTCTGTAGACAAACTTGTGCAGAGCGTGAAGAAAAACGTATCTAATGGGGTTATTGG:1 - chr3L 24860471 3' + invader4 2711 1 63.57 AACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTT:1 + chr3R 10737069 3' - F-element 46 1 52.34 AATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGAT:1 + chr3R 30569083 3' + mdg3 5480 2 44.76 TTTCAGGCAAATCGGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCA:1 + chr3L 11684896 3' + Bari1 1631 1 72.79 AAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGGCAAGGCGGAGCGATGAGCGTTAATAATGCGTATAAAATGCGACATGTTAACA:1 - chr3R 22647790 3' - transib3 27 1 67.12 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATG:1 + chr2R 21795324 3' - transib2 81 1 73.29 GTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGTTTAACAACTTGTTTG:1 - chr3R 10148691 3' + 17.6 463 2 66.44 ACCACGAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCTGTGCATAACTGTGCACCAAACCAGATTGTGTGGCATGCCACGTGTAGCAACTGATGAGCAGACAGCAAAACGATCAGCAAGCACCAAACGCACAAAAACACACAAAACACA:1 - chr3L 28063323 3' + Stalker4 7073 4 74.83 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAATTTGTTGTTTAACAATTTGGCCATAAAAGCCATAAAACAAAGCCTGAGCATTGAAACTA:1 - chr3R 4527148 3' - mdg1 23 2 69.86 AAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGACATTCATTAGTTTATCGCCCACTGGCAACTGTTGGGTCGAAAGTTATTAGCGACAGTTTA:1 + chrX 14735824 3' + diver 6044 2 54.89 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAAT:1 + chr3L 6015696 3' - roo 8698 2 55.71 TCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACA:1 - chr3L 15718047 3' - 1360 33 1 53.96 AAATATTTAAAAAAATAAAAAGAACTTTATGCGTGAGATAGTAATGTTCTTAAAAAAACGTTTGGGAATATTATAAATTATTGAAAATAATCTATTTAAATCTTGTTAAATTAACTTTACAAAATAAGTATAATCGGCTCTTTATA:1 - chr2L 15368600 3' + TART-B 10629 2 73.97 CGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTCCGTCATCTTCTTGATCCTGGTGGTATCATCATTGGGATAG:1 - chr3R 19506672 3' - mdg3 5262 1 78.77 AAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACAATAACAATAGGGCAACAACTGAAAACTGAG:1 - chr2L 13033290 3' - hobo 34 1 53.79 ATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCACACTTCTTTGCCTCCGTTTTGTCTCC:1 + chr2L 11617854 3' - 412 2 2 83.56 TTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTTAGTA:1 + chr3R 5870909 3' - roo 8715 2 55.48 GTTCTGACTATGATAGACTTTATTCTGTTATCTGTAATCTTGACTTTTTTAGTACATATTCAGATCCTTCTAACACTAATATTTAATACAGTTATTTTCCATTTTTTAACCTGACTTTAATAAAGCTTTAGAATATTAATAACTTA:1 - chr2R 3346167 3' + Cr1a 4200 1 70.55 GTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATT:1 - chr2L 4244896 3' - 412 78 2 71.92 CTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAA:1 + chr3L 18074173 3' - 297 6615 2 63.72 TATTTGCGTGGCCGCTACGAATATAAGACCAGAACAATGTGTTACGCTTTCATTCTAGCTCTTAAATTGAATTCTTCAATTTGTGTATTCTTTTCCTTTCTACCCTCATAAGCAGGAGCAATTGCTCTGCTTAATATAGAGTTCTT:1 - chr3L 25960406 3' + gypsy2 6599 2 78.08 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGAAGCTG:1 + chr3R 12078740 3' - hopper 13 1 72.09 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTT:1 + chr3L 12991445 3' + mdg1 355 2 62.76 GCGAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACG:1 - chr2L 7633369 3' - Max-element 8295 2 64.44 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGTTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACA:1 - chr2R 11777969 3' - hopper 56 1 54.11 AAAAATAATCGCCCTCTTCNTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGGTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2592 1 69.18 TTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCG:1 - chrX 17770447 3' - hobo 77 1 77.69 ACCCATGTAACAATTGATTTGCGGTCTGGGATGGGAGCCAACTGGGCTAAATAAAAGCGATTCCAAAATGCACGCTGTGTAGAGGGATATGACTGAATCGTCTGAGCCGTTAGTGAAGATTATGAGGCTAAAAATATCCTTTTCAC:1 - chr3L 23174854 3' - mariner2 264 1 54.79 TGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTG:1 - chr3L 11364798 3' + Tirant 342 2 62.22 CGTGAACACTCAGAATAATGTCTTACTTGTCAGATAGATAGATAGTTGCCTTAATTGAGTTAAAAGAAACATATGTCATTGTTATGGTAAAAATCTCGCCATGATTTGTTCTCGAAATGCACACCGCATAAAC:1 + chr2L 3437268 3' - frogger 309 1 53.38 TTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGGCAAGGCGGAGCGATGAGCGTTAATAA:1 - chr3R 22647816 3' - transib2 51 1 51.03 TAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCC:1 + chr3R 16630340 3' - FB 73 1 71.53 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCAGAATGTATGAATAGCATGAAAGTACAAAAGGCAAGTTTAGTTATAGTCCTCGATTATGTAAGCATGGTTGGATTTCCTTTCCTCCCTTTTCTTATTAAAC:1 + chr3R 20905102 3' - roo 8685 2 70.55 GGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGC:1 - chrX 6891456 3' + hobo 2892 1 59.02 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGATT:1 + chrX 684882 3' - jockey 4749 1 71.43 GCGTTTACTCATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAG:1 + chr3R 15727900 3' + 1731 4536 1 78.08 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTTTTTAGAGGACAGGCAAGAATATGTT:1 - chr3L 6557096 3' - Doc 36 1 59.59 CAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTTATGAACATTTTCGTTGCCTAATTGAGTTTTCTATCGGCACTTTCGGGCAACGGGGCA:1 + chr3L 9324601 3' + HMS-Beagle2 299 2 73.97 GAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTCTGCGGATATTTGT:1 - chr3R 12078572 3' + hopper 1390 1 67.81 TGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGGGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCG:1 + chr2R 10582498 3' - Juan 3837 1 56.16 AAGCTAAAAGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGGAGAGTTAGTTACCTTATATGC:1 - chr3L 4547678 3' + mdg3 5442 2 53.62 AAAATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGTTGGTTTGTCGGGGTTTCTAGGCGGCGGGGGGG:1 - chr3L 18044596 3' - hopper 91 1 78.77 TTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGACT:1 - chr2R 20052410 3' - transib2 86 1 76.71 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCATCGTAGTGGTCGCTTTTCGCAGTTCGCGCTAGTTAGT:1 + chrX 21045299 3' - P-element 24 1 57.39 GTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCG:1 + chr3L 12890393 3' + hobo 2904 1 51.72 TATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAACGGTTTTAAAGCATATCTATACGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATC:1 + chr3L 20224227 3' - Chimpo 59 1 61.94 TCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCGGTTGGAATTCGCTTCACTCAAATAGTTTAATTGCCAACATGGGAGATCAGGCACAAGAAAATGTCAACGCTGCGACATATGCATGTACATACATATGTACATAATGG:1 - chr2L 2493960 3' + Tirant 8502 2 68.35 CGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATGTCTCAATTCAGTAAAAACGAC:1 + chr3R 19950550 3' + BS 5049 1 53.42 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACG:1 - chr2R 21713277 3' - P-element 87 1 15.38 AACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGT:1 - chr2L 18219323 3' + copia 5078 2 70.55 TCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTACGCGATCTCGGCTATGTACGCAGGCTGCTCAGCCGGCGAC:1 - chr2L 14616140 3' - P-element 11 1 75.00 TCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACA:1 + chr2R 5953929 3' + roo 9040 1 63.70 ATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTGCCTCCCGAAATTTCTCTTAGCAAACAAAGTTGTTACTTTGCCACGTAAT:1 + chrX 16998429 3' + diver 192 2 60.27 GCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTAGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAACG:1 + chr2L 14616258 3' + P-element 2838 1 44.44 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTCGCTTGTGTGTGTGTGTTTGTATCTGTTGGCAGCGCCTAGATTTATGCAGCATTTTATTTAAATTTCTGTGGTCTCGGATAATGGAGTAGCTAAGCGA:1 + chr2R 19108601 3' - jockey 63 1 68.61 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTG:1 + chrX 20330614 3' + P-element 2883 2 68.97 AAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTG:1 + chr3R 12519694 3' + roo 9021 2 60.15 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAA:1 + chr2R 18887045 3' - roo 81 2 76.03 AGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTTCACAATGCAAATATATGTACGAAATATATAAACAATTGTATTTCGAGACAATATTTACAAGCGTGGCCAGCT:1 - chr2L 9704759 3' + roo 9022 2 51.37 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCAACGGTA:1 + chrX 13060285 3' - Tabor 67 2 63.70 TTACAACTAACTTAAAAACTAAGACTTGAAACAAAAGATTGTTAATATTGTATTTTTTGTTGAACTTTTTGTACACTTTAATATTAACACTTTTTAGCAATGTTTAATTTGTTAGAATATCCTATTAGATGTTAACAAATTTCTTT:1 - 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X-element 4301 1 67.72 ATCACATCAGCCTGGGCAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCTGACACCAATGCCAGTGAGAGGAGGATGAAAATTCTGCACCTGTG:1 + chr2R 4181304 3' + accord 7329 2 64.29 TTAAATATATCTTGCTTGGTTTGTAGGAGGGATGGGCATGAGTTAAATATGTGGTTTAAAGAAATATCACCTTGGCAAAACGGGCAAGTTGGTATTGAATTGGGATTTGAGGCAGCACCGAGTGGGATGGTGTGTGCAACCCA:1 + chr2L 13956077 3' - I-element 5074 1 75.52 GATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTATTGAGTTACTTTAATTTTGTACTTTGATTGCAGTGGAATATTTCAGACTTCTTTAATTCAAACCAAGACAAGCTAATGTCCAC:1 - chr2L 8120108 3' - roo 38 2 56.85 GATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCC:1 - chr2L 10461153 3' + roo 331 2 69.86 AAACAAAACAAAAAAAAAACTTGATTTGGGAAAATCCATTAGAAACTTTTATTTGCCTTTAA:1 - chrX 18397771 3' + HMS-Beagle2 490 2 83.87 ATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTATTCTACAAAAAACCCTATTGTCCTGTAAGGAACAATACTAAATGCTTAATTATTAGCAAAATCTCTATCTTATACGCG:1 + chr3L 9280483 3' + copia 257 1 60.74 GCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAACGAATGCGCCGGCGAGCAAGAACACGGGAATGCAG:1 + chrX 15287001 3' - X-element 4383 1 65.67 TTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACTAGTGTATAAAAAAAAAAACGCATTACGAAATGTACTCATCATTTTA:1 + chrX 3666593 3' - roo 65 2 70.37 TCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATACTATGCACATTTATAGATGTTCAGTTACTCGCCCTATAATAAAGTTCTTTGCAAGAAAATG:1 + chr3L 22491675 3' - Transpac 57 2 58.90 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCC:1 - chr3L 20061342 3' + roo 357 2 60.16 TATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATCT:1 + chr3R 27606715 3' + 412 7498 2 51.37 TATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACATATATTTTTATTCTAATTGATATATAACGATTGCAAGTCTAATTACT:1 + chr3L 3661141 3' - X-element 91 1 67.12 GAATTATGTTTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACA:1 - 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TAHRE 46 1 39.73 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTTTTTCATTCTCTGC:1 + chr2R 14415527 3' - 297 38 2 61.74 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGATTT:1 + chr3R 4527299 3' + mdg1 373 2 51.72 TTATTATGTTCGTATATACTACAAGGTGCCGTGTCAGCGAATTTGTGTCCGTTTGACGACGGTCACTAATTGTCGGCGAGTTCGTCCCGGCGGCCTCC:1 + chrX 21947746 3' - mdg1 2 2 74.49 CAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTGCTGGTGGTGCCATTTGAGTCAAATCAAAGTCATTTACTACTACACTCGAAGAAAACGACAGTCAATTGAATCTGTTAACAAGA:1 + chr3R 23217763 3' - FB 31 1 46.38 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATTTATGTGTTTATATTT:1 - chr3L 15148556 3' + roo 9037 1 60.14 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATATTATAGCATTGTAAGATGGTCATGTTTCCAAATACTTTAGAGAACTCTTAAAAACAGAAGTCGATATTATTAGAGTATTGTGATATTTTCATAAAAGCTAGA:1 + chr3R 13255040 3' - roo 17 2 73.97 GTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAA:1 - chr2R 9607327 3' + P-element 2790 1 20.55 TGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAG:1 + chr2L 15523113 3' - 412 7130 2 69.18 TATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTT:1 + chr2L 13033400 3' + hobo 2916 1 51.06 TTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAG:1 - chr3R 22647847 3' - transib2 82 1 72.41 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAACATTCATCTTTATCCATTGTATTGTTGGATGCGTTGCAATTCTCAAAGTAAATCCGTAATAATTTCGACCCCAGGGTCACAATTCCCTACAGCATCT:1 - chrX 666236 3' - 412 7078 2 65.75 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCG:1 - chrX 22679645 3' - Doc 75 1 51.91 TCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACATAAAGTGTTGCCAGCTTGGCAGGTGGTATTATA:1 - chr3R 12948550 3' - Stalker 6858 4 78.62 AAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGGCAAGGCGGAGCGATGAGCGTTAATAATGCGTATAAAATGCGACATGTTA:1 - chr3R 22647793 3' - transib3 27 1 66.43 CACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAA:1 - chr3R 20841382 3' - Juan 48 1 49.65 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATAATAATACGTTATACCCTTATG:1 + chr2R 12102071 3' + hopper 1399 1 70.55 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGAAGAACTTCCGGCAGCTCTCGGCCATTGGTCTT:1 - chr3R 7049318 3' - Burdock 14 2 75.00 ACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCC:1 + chr3L 2966519 3' + roo 319 2 77.40 AAAAATAAGTGGAATTAAAAGTCGATGCCGAAAAGGAATACCTTTGTATTGTACCTTAGTTTCCCTCGCACTGCTATTTCATTGAACACAGCTGTACATACTCGTACTTCATAGGCTAATAAACGCGTTCTTCTGCCTGTTGAATC:1 + chr2R 5740008 3' - HB 85 1 69.18 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGTCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCACGCTTTTCCAGCTTTCGGGACACATACACATACACACACACACACTGGCATTTTATGCAAATGTCGCTTTTCTGCGTAGCTGCCTCGCTTTTT:1 - chr3R 27439799 3' + hopper 1391 1 67.81 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGTAAATAAATAAACAGATTGGGAAAACATAATGCAAAAGTCTTTTGCAAACTGTTTTGAGTAACTGCATTTGCATTTAATAGGACCCCACATTTTCCCACA:1 - chrX 5751806 3' - roo 8685 2 61.64 CCTAAATATAATTTATCGCTCCCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATG:1 - chr3L 7389715 3' - roo 8740 2 69.86 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGGATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTTCCCAGACCCCAATAACA:1 + chr3R 11937889 3' + hopper 1378 1 56.64 CACTGCTTCAATGTTCTCAGGTGCCTGAATGTAGTGACCTATATAACAATTGATTTAAGGCAGTAGCCCCTCTTGAACGGTACCATTAGCGCTCCGCTATCAACTAACTGAATGCTGCTGCACCCTGTACTTACTTAATAGCGATG:1 - chrX 21585269 3' - mariner2 352 1 57.53 CAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATCCGATT:2 - 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Cr1a 151 1 54.33 AAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATATTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCCACAGTGCACTCACATACCCTTTCAT:3 - chr2R 24215605 3' - I-element 5317 1 50.00 TTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACCCATGATTCTATCAAAAAGTTGTTTCTATTCAGTGCTGCAAAGTACAAAAATCGTTTGAGTTATTCAAACAATGTTTGGGTTCTTAGCATCCAAGTGATGTGATATTGAAAACATTGCTT:1 - chr2R 10865552 3' - jockey 4812 1 77.40 GCTTTTGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCCTTCACCAACCAGCCATTCGATGCACTGCAATTATAAGTTGTTAGATTCATTTG:1 - chr3L 10739996 3' - P-element 15 1 73.91 CAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGGCGCGAAAGTTTTGAACATTTTCAACTATTCAACGTCAAACA:1 + chr2R 11844310 3' - I-element 72 1 68.12 TTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATGTGAAGTTGATTAAGGATTAAATAGGCAATGTTCTAATGGGATTCACATATTTGAT:1 + chr3L 18216585 3' + 297 341 2 61.64 CAGCTTTCAAGTTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGTGAAATCTAAATGATGATGGTTTTAGGTTACGAAAACGGGTGCT:1 - chr2R 12706121 3' - FB 31 1 61.64 TGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTGGCTCTCTTATACTGCACCGCACAGCGAGCACTTATAAAGGCC:1 + chr3L 1463774 3' + P-element 2874 1 75.56 GTCTTTGCTGATATACTTAAGGGCTCTATGGACGGCAAAGCAGATATAGTCGGATATGGTTTCGAGAACTCATCATCTACCCGTGCAGATCGGGTGCTATGGTTTTGGTCTAATGGCTC:1 + chr3R 5680626 3' - Ivk 404 1 54.62 GACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGAGACAGGCAG:1 + chr3R 27707111 3' + P-element 2800 1 26.03 TACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGATTATTGAGGATTAGAGAGCAGGCGAACAAAGCGCGATAATCTCTGACTCAATAACACATTCTAAAGAA:1 + chr3R 10714274 3' - 297 36 2 58.22 CAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCT:1 - chr3R 7074815 3' - P-element 77 1 37.67 TCAAAACAAACAAAAAAAAATCGTCATGCAACTGTGGTACTTCAGGCCGGAGCTTTCCTTATAGAAGCTGAAAAACTATAAACTAACTATAATTTATTTAACTAACTTATAACTTATTTTTTTCCGTGCATCCGATTCT:1 + chr2L 8601676 3' - Tc3 88 2 78.42 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCAAACGTTTCCGATCCCATCCGATCCAATCCGATACGATACGATCCGATCCGATTCCATACGATACAAAGCCAGCGGATTCGAAAG:1 - chr2R 9836511 3' + P-element 2879 2 73.73 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGT:1 + chr3R 30087764 3' - roo 85 2 81.88 CCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATCATATGTATATCATTCGTAGACCTCAAACTTG:1 + chr3L 20224277 3' - Chimpo 18 1 72.22 CCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATC:1 + chr3R 21794138 3' + hopper 1348 1 62.33 GGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACG:1 + chrX 2214291 3' - jockey 4625 1 64.75 CTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTATACGGCCGAACCAAAACACAACATGTTCGAAGTGGCTCTCTTAT:1 + chr3L 1463742 3' + P-element 2872 1 66.67 CGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAA:1 + chr3R 11285011 3' - blood 7010 1 79.80 GCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCGAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTCC:1 - chr2L 10074456 3' - pogo 16 1 70.90 TTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCG:1 - chr2L 310075 3' + P-element 2831 1 38.71 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGGTGATTACTCGCTTCAACTCTG:1 + chr2L 10461220 3' - roo 8741 2 71.53 CCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAG:1 - chr3R 20841375 3' - Juan 46 1 46.58 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCGGTTGGAATTCGCTTCACTCAAATAGTTTAATTGCCAACATGGGAGATCAGGCACAAGAAAATGTCAACGCTGCGACATATGCATGTACATACATATGTACATAATGGCGTTGCAA:1 - chr2L 2493952 3' + Tirant 8503 2 70.55 AAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATAGTTGAAACATTCTAACGTGACTCTCCTAACAAAACATACTGTTGCAAAACCTGTTCTAAGCTAAACTACTTTAAAACCTTTTAAAACTTGTAG:1 + chr3R 25471786 3' + Bari1 1681 1 65.97 ACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCTT:1 + chr2R 14532078 3' + invader4 290 2 57.89 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACGTCCG:1 - chr3R 29627831 3' + roo 9026 1 53.42 GTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCGAT:1 - chrX 8681443 3' - jockey 72 1 67.41 CGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCA:1 + chr3L 20061436 3' - roo 8724 2 60.27 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCC:1 + chr3R 26242555 3' + roo 9011 2 62.33 CCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTGTTCGGCAGGACAGCCAGG:1 - chr3R 28014124 3' - roo 8740 2 78.20 TTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATC:1 + chr3R 27606714 3' + 412 474 2 63.79 CAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATC:1 + chr2R 17394575 3' + jockey 4917 1 71.54 TAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCAC:1 - chr3R 12613777 3' - HMS-Beagle 6855 2 68.46 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTATGCACTCGTATGTGCGGGGCGGCCTTCAGAAAATGGCAACACACGCGACATTAAA:1 - chr2R 14415435 3' + 297 6914 2 63.19 GTTCATACGGTCAGACGGACATGGCCAGTTCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGAACATATGTTTATACATGTATACTTTATAGGGCGGAAACGGCAACGGAAACAATCGCAACCCGCGAGGCGGCAACCACCGAAACCGCAAC:1 + chrX 643314 3' - INE-1 123 1 64.38 TTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAACACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGA:1 + chr3R 10737064 3' - F-element 69 1 58.22 TGGCACTTTGCTGATGTCGCCTACCGGGCGGGCTTCATAGGCGGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAA:1 + chr2R 12185413 3' - accord 6909 2 62.94 CAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAACATTACTGTAGT:1 - chr2R 16567285 3' - opus 72 4 72.14 GAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGTTAATTATAATGTATGTATGTAGGTCGTAAATGCAAAAGTAGGCTAACGGACAAAAATCCGTCAAAAT:1 + chr3R 27053187 3' - jockey 4732 1 53.42 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGCAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATATTTTTTTAATATTCTATTCCAA:1 - chr3R 15003143 3' - Doc 82 1 76.81 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGGAAAGTCATTTTGGATTGTTTTATGCATTAAACATCAAATTAAATGGTTTTTGT:1 + chr3R 4666335 3' - FB 61 1 63.57 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGC:1 - chr3R 15283658 3' - BS 5080 1 73.29 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAA:1 - chr2L 16884773 3' - pogo 25 1 58.99 ATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGCGTTTATTGTATTTGACTTG:1 + chr2R 11778073 3' + hopper 1355 1 55.94 TGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCACTGTGGATCTTAGACAAACATCATGTG:1 - chr2L 15874814 3' + mdg1 394 2 67.12 TGTCAATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGATTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTC:1 - chr3R 3617308 3' + micropia 175 2 74.66 TGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGTACATATATG:2 - chr3R 19965175 3' - jockey 26 1 72.60 AAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTGTGTATACGCAAAGTTAAGGTCGGCATAATGGCCCTCAAGCAC:1 - chr3R 23964827 3' - hobo 33 1 59.80 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTAATGTGCAATCCGTTGCTATTCTGCAGAAAACAATATAATTAAATTGGAATTTACTTCCCTG:1 - chr3L 11535856 3' - roo 8678 2 70.68 TTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAGCATTAAATA:1 + chrX 22824265 3' + Gypsy12A_LTR 2246 1 56.55 TCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATCCGCCGCGTACCACTTACATACAT:1 - chr2L 20761863 3' - Doc 409 1 61.06 AATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAGCTATTTTCAAATCAAAA:1 - chr3L 19951152 3' - Ivk 29 1 65.75 GACCTCACTTAGCTGCAGAGGCTGTTCGTGCCTCTGCCGCAGCGCTCGACAGAATTTTACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAATGCCCTTTTAGAACACCAACCGTGGGTGAAAATTTGAAGCAATTT:1 + chr3L 23746670 3' - invader4 2872 2 67.36 AAATCAGGAATAGATCTGGAATGTACACTCGCTTATTAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTATATCAGAAGTATTGGAATTGGAAAAGAATTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCA:1 - chr3R 4562737 3' + mdg1 7359 2 71.92 ATTGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGGGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGTCA:1 - chr3R 27547621 3' - 17.6 49 1 54.11 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCATCGTAGCGGTCGCTTTTCGCAGTTCGCGCTAGTTAGTCGCTCCTGGGTCACTAATCACCAGCACTGGTAAGTA:1 + chrX 21045335 3' - P-element 19 1 71.23 TAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGTTTACCC:1 - chr3L 7024446 3' - 412 61 2 57.24 TAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGGCAAGGCGGAGCGATGAGCGTTAAT:1 - chr3R 22647818 3' - transib2 47 1 50.36 TAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGCGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTC:1 + chr3R 27452061 3' + hopper 1338 1 67.81 TTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAAATATGCACGCTCAGGAAGGGATTTCAGAGGCTCAGTTTTTAAAGAGAAATTAATGATAAACAAAAAATTAACTTACTTTTGAAGTATATGCCTTTGGT:1 + chrX 21639453 3' - 412 21 2 71.23 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGACGAATTGATCTGGGTCACTCCCAAACAATACTGTGTAAATTATTAATAATATA:1 + chr2R 23095006 3' - 412 7077 2 67.12 AAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTC:1 + chr3L 8824530 3' + transib2 2769 1 63.64 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATGGCAG:1 + chrX 22862364 3' - jockey 76 1 69.63 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCCGGTTGGAATTCGCTTCACTCAAATAGTTTAATTGCCAACATGGGAGATCAGGCACAAGAAAATGTCAACGCTGCGACATATGCATGTACATACATATGTAC:1 - chr2L 2493967 3' + Tirant 8495 2 63.31 CTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAA:1 - chrX 20361952 3' + hopper2 1549 1 58.22 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGGTAAATATTTGCAGCTGCAGCAGCTC:1 - chr3R 22320446 3' + roo 9030 1 54.55 CAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGCCGCTGCACATGCAG:1 + chr3R 31112320 3' + mdg1 414 2 77.04 ATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGGAGGAGCAGCCTACTACACAATATACTTAAATATACAAATCAAATACAATTATATTTTTACTAATAAATGAAACCATTTAACAATTACCACCCTTGTATTCTTAAGCA:1 - chr3L 22257723 3' - mdg3 35 2 62.33 TCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCGAATTACCGCGAGTTTTT:1 + chr3R 6584863 3' - transib2 66 1 66.91 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTG:1 + chr2R 10977229 3' + roo 9032 1 57.53 TCAAAACAAAAAAAACAAAAATTAAAAAACATAACAAAAGTTTCTGTTGCAGAATAATGAAATACGCATCTCACTGTGTCGACTGTGACCACTATCAAACCCTTTTG:1 - chr2R 10559082 3' - Tc3 88 2 64.49 AAATGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGAT:1 - chr2R 7314661 3' - blood 7101 2 77.24 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAA:1 - chr2R 7895522 3' + mdg1 7396 2 59.59 TTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTACATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTNGAAATA:1 - chr3L 9324429 3' - HMS-Beagle2 6922 2 55.48 GTGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGT:1 - chr2R 14884103 3' + roo 327 2 71.92 ACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAAATGCTGTTGTTGGTGCGAGGTGCGATGGGAATTTGA:1 + chr3L 17181500 3' + jockey 4915 1 75.86 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTAAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGTTAAATTCAACACATTTTGCTT:2 - chr3L 2317111 3' + 412 452 2 51.37 TGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGACGACTTAGCT:1 - chrX 22679634 3' - Doc 79 1 49.32 AATATATTAATACTAAAATACTTCGAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGGCTGATGTTATGTCTGATTTGGAGCTGATAAAATGCCAGGGCGTTTATTGTATTTGACT:1 + chr2R 11778071 3' + hopper2 1543 1 56.85 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAATGAAGCGCCTAGAGAAGTG:1 + chr2R 11153246 3' - roo 8701 2 50.69 AAAAAATTAATTTTTGTTAAAATGTTTGATTACTTTTTCGGTCCTAAAGCAAAATGGTTTAGTTTCAGGAAAAAAAGAAAATTCCTTTTGTCCAACTAAAATGAAACTGTGTTAGATTTTTCTGAGTGCAAATTTGTGGTGGCT:1 + chr3R 30978559 3' + Tc1-2 1466 1 81.94 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATC:1 - chr2R 24427538 3' - 1360 49 1 61.67 GTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGAGTTTCGCTGGCGATTTGCCGGGATTCGTTTCACCATCAAGTTAATCATGTTATTGAAGCTACCCGAACTGAAGGTGCAAAATCC:1 + chrX 18150093 3' + hobo 2911 1 62.59 GAAAGGACCTACCAACCCAGCGAATAAATTATTAGGGCCGTTTAATCTTAGAACAGTTGGAAAAATAAAACAACTGTTCAAAAAATACTTATAGCTAGTACGACTAAAGCTTGAAAAGAGTGCAACTCAATAAATAACAATAAGT:1 + chr3L 19255164 3' + F-element 4527 1 60.00 ACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTGGT:1 + chr3L 2532554 3' + blood 334 2 54.86 GTATGTAACAGGCAGAAGGAAGCGTTTCCGACTATATATAGTAGATATATCCTTGATATGGATCAATAAAAAATATAAAAGATGGAAGATCCAGCATACGGATTGTAATGATCATTCGTATTTTCGTAAAACCATACACATAAATA:1 + chr2R 18487357 3' + INE-1 28 1 50.00 TCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGT:1 + chr2R 5953918 3' + roo 9029 1 56.16 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTAT:1 + chr3R 10736162 3' - McClintock 5978 2 65.52 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACG:1 + chr3R 11284965 3' - blood 72 2 77.78 GGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACTCGCATCGCAGGATGGAGACAATACCGTTACGGTCAGCGGC:1 + chr3R 25158722 3' - 1360 12 1 76.47 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAA:1 + chr2L 14056774 3' - pogo 60 1 60.96 GATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTTTGGGTATATGAACTTG:1 - chr2L 18525572 3' - pogo 30 1 65.07 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTT:1 - chr2R 9870971 3' + roo 9012 2 60.42 AAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTT:1 - chr3L 22518944 3' - hopper 3 2 62.50 CCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAAC:1 - chr2R 24427551 3' - 1360 47 1 68.57 AAAGAATGCAGACCTTTGGNCAGCATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTAT:1 - chr3L 9324469 3' - HMS-Beagle2 79 2 70.55 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTT:2 - chr2L 11475102 3' + jockey 4938 1 52.74 GTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAAT:1 - chr3R 30955330 3' + G6 1954 1 64.38 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTCCAACGACAACTTTCG:1 - chr2L 10074442 3' - pogo 12 1 77.08 AAAGTTAAAAAAATTTTATTATATCAATATTTCTATCAATCGAGCCACTACCTACAAAGCGTGTTTGTATATTTTTTTTTTTGTGAATAGGGAGCCCCCGAGTACACTGAGCAGAGCCAAATGCAGCAG:1 + chr2L 2407488 3' + HB 328 1 76.74 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTCTCTCAAT:1 - chr2R 18931819 3' + blood 7326 1 61.64 AGGAGTGACGTATTTGGGAGGTCGAAACCGGCACCTTCAATTATTTCTAAGAAAACAGTAATGCACTTTAGTGATTTTCCATAATGTAAGCCTGATTTTGGTTAAGAGCAAGACAATGCATCTCTTAAATTTGAACCTCATAGGTA:1 + chr2R 3504280 3' + 297 6579 1 60.27 GTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAAAGGCACAGCGATTGAGG:1 + chr3L 11364935 3' - Tirant 8117 2 78.52 ACAAAATTAAATATAGTATACAATACTAAACCTAATTAAATTTAATGAGTACTAGCTTTGAGCTCCACCTTGCCGGCCGGGTTCTTGCCCAGGATGAGCACGCTGGGGTCCACTTCGAGGACGCG:1 - chrX 21048807 3' - Ivk 5364 1 57.60 ATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 7018 2 69.12 TACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCC:1 - chr2L 20628528 3' - Stalker2 33 2 38.36 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTG:1 - chr4 490225 3' - pogo 61 1 60.96 TTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGC:1 - chr3L 6557141 3' - Doc 81 1 71.92 AATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGTTATTCAGATTTATTCTTCAAAAAAGAACTAGAACAAACTTTTGTGGTCTTTTATGTCATTCTGT:1 + chr2L 4864497 3' + mdg3 5462 2 61.64 ACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACA:1 - chr3R 12046731 3' - Doc 42 1 49.64 TTTTATTTTTTGTTATTATTTAAAACAACAGTTCTTTATAATTTCAACAACGGAGTCAAAACAGCCATGTGTGAAGATCTGAACTTTCTGATCTGAAATCTTCATGGAGAGTTGAAAGTTGGATAGTAGTAGTACTACTTGATCAG:1 + chr2R 9493899 3' - BS 5097 1 80.82 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGATCGCCCGTGGTCTATGGATTGGTT:1 + chr2R 9607412 3' - P-element 30 1 63.77 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGG:1 - chr2R 16274548 3' + roo 9004 2 62.33 GGCAGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTCACCACAACAAGGAGCCGCCTAATTGACAGATACTATTTGCTTCTCCCCTGCACCGCGCGGCG:1 + chrX 609468 3' + 1360 3332 1 57.24 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATCCTGGGAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAG:1 + chr2R 8315581 3' - hobo 66 1 67.12 TAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGCG:1 + chr2R 10977231 3' + roo 9041 1 61.87 ATCAAAACATCATAAAAATAAAATAAAGTTAAATAATTCAGCTATTAAAAACAGGACACTAATAAATTTTACATTTACGTAAATTGGTAGAGCCGAACACATCGCAATCATTTGACAGGAATATTCTTTCCTTTAGGAGAACCTA:2 + chr3L 14603197 3' + jockey 4995 1 53.10 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTCAACAGATATGAAATTTTCATTGCGTTTTAAAAATATTATTCTGTCAGCTGACACAGTCAGTTGTGTCCTTGTTTGACATCCTTTTTTTTATTA:1 + chr2R 3784974 3' - jockey 35 1 60.69 CGCGGGCGCCGGCGCGCCAGGAGTCTTTAAAGAATAAACGGACACAAAAAAAAAGAAGAAACACAAACAGGTTGGGTGAGGAAGGGGGAAAGACGATACAAGGGATCGATCCGGAACAGAAGTCACCAACACAAACACAC:1 - chr3R 15072361 3' + Osvaldo 1491 1 60.00 TGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGATTATTGAGGATTAGAGAGCAGGCGAACAAAGCGCGATAATCTCTGACTCAATAACATATTCTAAAGAAAGCTAGGTAATAAGACACCACTTGGT:1 + chr3R 10714300 3' - 297 6591 2 77.40 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAAATATCAAAGAACTCCTTGAAAAATTGAATAAAAAGAAAGATTATTGCTNGAAAGT:1 + chr3L 12227915 3' + opus 7473 2 65.75 ATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCATTCGTTTCTGTGCAAAACAGCACGCATTCTAAACTTTGGACTCTAAA:1 + chr3L 27190398 3' + copia 218 2 64.38 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTAAAAACCCATAAAGATTATCGCAGTCATTT:1 + chr2R 10411428 3' - 297 6621 2 72.12 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCAAAGGGTAACTTTCATGTCGCGGACGATGAATGAACATCGATTAGAGCGCTACTAAAATGTTTCGCAAATTAACGACCACCGA:1 - chr2L 17019018 3' + 412 7541 2 81.51 AAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATCAGCTACGATTTGCCCGCGAAAGCATTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGT:1 + chr2R 17394628 3' + jockey 4954 1 59.59 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACATTTTAAAAT:1 + chr2L 388620 3' + roo 9011 2 58.22 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAA:2 - chr2R 7314606 3' - blood 36 2 56.85 TGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCCTTCCCCAACCAGCCATTC:1 - chr3L 10740031 3' - P-element 51 1 46.76 AATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAATATTTCGCCTGCTGCCGTGTGCCCACAAACAAAATGCAAATGG:1 + chr3R 28618495 3' - 412 3 2 71.54 TGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTGTTACTTTTCACTAAAAA:1 - chr3L 20224097 3' + Chimpo 163 1 69.86 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAAGAAGGTTATCGCACTTATAATGTGGGTATAATGACATCGTTTGTAGTTCGCCAGTCTAATTTTAACATCATGAATATTATGATTATTCTTAAAA:1 - chr3L 5027139 3' + roo 394 1 71.85 ATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCGTGTACATACATACAAATATGTATGTTTAATTG:1 + chr4 490370 3' + pogo 2082 1 72.41 TAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTG:1 + chr3L 18074199 3' - 297 6600 2 68.55 TACTTACACACACACACACACACATAACCACATAGGAACATAAGATGGATCGGAGGCATACAGGTGGCGCTAATCTGATGACGCGCAGTGTATAAGTTAACTAAAATAAATACAAACAGCTAACTAATCA:1 + chr3L 24208959 3' + Quasimodo 34 2 73.08 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACACCTGCAACGAATTTAGATAATTAAGTTAGGTATCGATTA:1 - chrX 13091005 3' + P-element 2864 1 67.14 AGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATCTTAAAGTGTCATCACTTATGTCATCATATTCAAAATTCATAAAGTTCTCGCAGTGCACGCATGT:1 + chr3R 29758632 3' + I-element 5297 1 54.79 CTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGCTGACGCATCTT:1 - chrX 609372 3' - 1360 65 1 63.89 GCCCCTCGGTCGGTTGGGCGGGAGGTACGGTGCCGAGTACCGGACCAGTACAGGACCGAGTAGGGGACCAGTACGGGACCGAGTACGGGAC:1 - chr3L 16047626 3' + Cr1a 4417 1 61.54 TTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTA:1 + chr2R 18931925 3' - blood 7065 2 52.74 AAAAACTCAANGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACTACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAAATAC:1 + chr3R 26242594 3' + roo 389 2 65.75 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACG:1 + chr3L 22021734 3' + mdg1 358 2 68.66 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCACAAGCTTAAATTC:1 + chrX 6538752 3' + pogo 2038 1 62.76 TTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACA:1 + chr3R 29288759 3' - BS 5079 1 71.92 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTTCGTCCCAGGGGTTTGTGTTGCCAATCCCTTTCTGTTTATCAAACAAAA:1 + chr3L 13285723 3' - roo 8683 2 72.41 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGC:1 + chr2L 6149164 3' - hopper 43 1 71.28 TGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCCCGTCTG:1 - chr3L 20680298 3' - 412 7134 2 77.86 CGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTCCATCGGATATTTTTGCTGTTGAAACTGCAACATACACATCCACATTGGTGGCAGACAATTCAACTGGCTTTTATTTTTTCT:1 - chr3R 4666222 3' - FB 37 1 59.72 TTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACAGGTGGCCCTTCCG:1 + chr2R 21795366 3' - transib2 33 1 61.43 TTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTAGATTTCCTGTCTGAATATTTGCG:1 - chr3R 31264425 3' + BS 5042 1 50.34 TATATGAAGAAATAAATGAAGTTAAATAGTGTATATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTGCCTC:1 + chrX 16998384 3' + diver 147 2 68.49 AACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGCTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACG:1 - 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chr3R 17243064 3' + hopper 1403 2 77.08 TGAAGATTAGGATCTTCCCAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTT:1 + chr3R 15727944 3' + 1731 268 2 49.32 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACTACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAAATACACT:1 + chr3R 26242597 3' + roo 9055 2 67.81 ATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTGATG:1 + chr3L 18074202 3' - 297 38 2 60.27 GCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATA:1 + chr2R 12102050 3' + hopper 1380 1 56.94 TACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTAATGTCCTTGT:1 + chr3L 20061451 3' - roo 45 2 52.05 CAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAGGCAGAAATTTAAGGACGTCAGCAGCGCTTGTAAACTTATTAGCGAAATGCACG:1 + chrX 22866230 3' + jockey 4953 1 54.62 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGATCGCCCGT:1 + chr2R 9607396 3' - P-element 48 1 51.43 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTAACACGCTCCTGCAAAACATATAGCACACTTTGGGGCATTGAGACCTTGGTTCTGGC:1 - chr3R 25580767 3' - 1360 63 1 62.24 AACACACAACCACACACACACACCGTATAAAAATAAAACCAAAACATATTAACAGTTCCCCGATTCCCCCACCGAAATGTTATTCCCCCCCTA:1 - chr3R 8837673 3' + gypsy3 415 1 74.19 AAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTGAAATTGTCAAACTTAAGTAGACAATTCTGCAAAATGCTTTGCCATATAAGTCACTTGCTTTAAGTCACATAAAAAGGATGTCTGTCA:1 + chr3L 18549822 3' - X-element 46 1 43.84 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATA:1 + chr2R 23094949 3' - 412 7123 2 71.11 TATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATACACACTGGTATATACACGGATATATATAACTTAAAGCTTGCAATAATCAGGCTAACTGATTCTAAATCGTTTCGGG:1 + chr2R 15199236 3' + Burdock 217 2 57.34 TGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCT:1 + chr3R 13869015 3' - HMS-Beagle 42 2 56.00 AGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTTATTGCGCCATTTTGCCAGATACGTTTTCGGCAT:1 - chr2L 20628503 3' - Stalker2 7256 2 42.47 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTGAAAAGAGCACGTCCT:1 - chr2R 3338785 3' - Juan 61 1 58.22 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGTGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTT:1 + chr3R 4527290 3' + mdg1 363 2 56.85 TTTTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAAAAAAGTACAAATGTGAAAGCACTTCGGTGGTTCATAATATTTTTACTTAACGCATACGATTTTGTGACCTAATTCCTTTGTA:1 - chrX 1288888 3' - jockey 4979 1 56.55 TAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAGTTATCCTCGATT:1 - chr3R 18832325 3' + roo 9035 1 53.42 CGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAGTATTTTTTCGAGCGCTATATAAAGAATTGAAGTTTAAAATTTACTAAAATACATTTACTAA:1 - chr3R 5164883 3' + invader4 3062 2 71.92 CCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTCTAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATC:1 - chrX 17884484 3' - pogo 21 1 59.68 GGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTTAAAACTAAGAATCATTATAGTAAATGTAATC:1 + chr2R 12185476 3' - accord 3 2 79.45 CAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGTAAAAGACATTTCTCTATGGTGTTA:1 - chr3R 27547599 3' - 17.6 6954 1 63.70 TGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTCGGCTATCCTCGCGTGTTGACACTGAC:1 + chr2L 21645302 3' - 1360 13 1 62.76 TAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGGGCTGCCAACTTGTTTTCTTCACGGCGCCAAAAAGTATGCTCTAATTTTTCTGTCT:1 - chr2R 14427106 3' - jockey 4792 1 63.70 AACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCCATATTTGAGTAATA:1 + chr3R 10737109 3' - F-element 19 1 75.89 CGCCACGTGTTCATAAATAGGAACACGCATAATAGCAAAGGGAACATGGAGAAGAAGTAAACAGCCATTGTCACATACATACATTGCAAATCCCTGGAAATCGAGACG:1 - chrX 3986675 3' - micropia 5034 2 60.19 TATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATGGAGCACGAACTCGT:1 - chr3R 29680174 3' - 412 7071 2 67.69 ATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAGTTTGTTTTGCAATATTTTAAAGCATTTTTTAATACTTTTTTTT:1 + chr3L 4547757 3' - mdg3 81 2 71.23 AGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATT:2 - chr3R 6419847 3' + Tabor 419 2 65.75 ACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTAAAA:1 + chr3R 17243257 3' + hopper 1397 1 71.23 TAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATCGCCAAATCATATTCATGTTTTTACCACATTTAAAAAATATTTTTTTT:1 + chr3R 6343787 3' - Transpac 16 2 60.44 ACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAGTAACCATCTATATTAAATAACTTTGCTATTTCAATGTGCGGATGTCAGCCCAATAATTAAAAGCTAACAACTGCAGCAATCAATTGATTTGCACAATTTAATATAAAT:1 + chr3L 11904914 3' - copia 15 2 73.79 GAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAAATGAGACGACAGA:1 + chr3R 30569122 3' + mdg3 5478 2 58.90 TAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCGACGGAGGAGCGGGAAAATGGAGAGAGGAAAGCCGTATAAATTAATAAAACATCAACGG:1 + chr2L 12234147 3' - jockey 4786 1 54.62 TATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAATGTCTCTTTTTTTGTTTTTAATAATTCAAGTTTATTTGTTTTTTTTCAGTTTAAAGTCTTATTTCGTG:1 + chr3R 2520355 3' + Tc1-2 1612 1 64.83 ATATGATTCTTATTTGCGAACCCCATTACAATGATGTCAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCAACAGGTTACATTTATTTTCTATCATTTTCGCATTCCGAGCTTGCCTCCCGAAATTTCTCT:1 + chrX 16998397 3' + diver 181 2 52.80 TCGTGTTCATGTGTGAACAGCCTTTGTGTGCTCAGATCTTGAACGGTTTGGCATTTCTTTTGTCTGTGCACCGGCGTTTACTCAATTTCATTTAGCTAAAATGG:1 - chr3L 2966425 3' - roo 8662 1 75.96 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTTGCCACCAGCTGGATTTTCGGAGCAT:1 - chr3R 30087676 3' + roo 9051 2 64.80 ATGTGTGCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATC:1 + chr3L 11826002 3' - X-element 90 1 71.23 AATGTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTTTCCCA:1 - chr3R 3617305 3' + micropia 5134 2 78.62 GATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACAC:1 + chr2R 14884158 3' - roo 87 2 80.82 CGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCTATGACTTAA:1 - chr3R 12046693 3' - Doc 4 1 76.98 AAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCAACACCATGGATCCGCCAAAA:1 - chr3R 25798357 3' + hopper 1391 1 62.50 ATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGACATATGGCATATATAATAGTTTCATATGGCGGCTAAATTCCCCAA:1 + chr2R 19230577 3' - I-element 68 1 74.07 GCCGTTACGTATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCAAGGGCACATACAAAAAATCGTATTGTCCTTTCTGTGTCACAAATTTAGTATACTTTTGGGAGTTAACATCTACCGGAACATGGAAATACCCTTTGGTTAAGTCCAATGT:1 + chr3R 1446144 3' + 1360 3377 1 27.40 ATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGC:1 - chr3R 21925109 3' - hobo 62 1 63.91 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAA:1 - chr2R 18886960 3' + roo 9013 2 58.90 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTT:1 + chrX 21668361 3' + opus 7451 2 56.16 ACCGCAATATTACAATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTAGTATCTATATGTACATACATATATGACCAAAAAAATCGTACAGATGTTAGCTTCGAGC:1 - chr2R 14531958 3' - invader4 55 2 58.22 GTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGT:1 - chrX 12979450 3' + transib2 2756 1 64.38 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAGTATGCAAAACATTTAGATATTTATA:1 - chr2L 18599032 3' - jockey 14 1 79.31 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCTACCCG:1 + chr2L 2544842 3' + blood 7339 1 54.74 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAA:1 + chr2L 12236815 3' - jockey 78 1 70.90 GCGGAAAGAGAGCAATTTTGGACGTCCCCAAAAAACTGACTGTATAGTGCCAAACCAATGTAGAATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTATCGTCTTTGGTACTGTATATGTGAGTTTTAAACGTTTCATTATTTTGCTAATTTC:1 + chr4 315193 3' + 1360 3313 1 78.77 ATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATACTTCTGAATTTCCTAGGCGATGTCAGACTTCTTAAATGTATTACTTTCCTTGTGCATTTATGCCTTAAACCTTTATTAATTAAGGAAATAGGTANACGTTCTTA:1 + chr2R 15392664 3' - mdg1 9 2 75.91 GTGCGGAGCACGATAAAGACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATAATGGCGAATCAAATAATTCAAGAAAAAATAAATTTAGCTTTAACTAACAACAATAACCAGGTCATTCTTAATAGGGTTATCATTGGAAAGTAAATAAAA:1 + chr2R 943941 3' - F-element 36 1 63.19 CAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATCGGTGACTGTAGGAAGAGCTT:1 - chr2R 10417136 3' + 1360 3341 1 57.69 TTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGGAAATCGACTTGACATAGCATTGCCATGAAT:1 - chrX 16547448 3' + P-element 2842 1 54.11 TTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAA:1 - chr2L 17237078 3' - X-element 77 1 70.07 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTGAGACAGCTGATTGCCTCATCAGGTAAATTGGTGTCACCGC:1 + chrX 10725094 3' + pogo 2063 1 54.01 CAGCCAGATCGGGGCTACGCAGTGGACGTAGACTGCTCTTTTTCTTCATTTTAAGAAAAAGTACTGACCCTTATTATATTATTACATTGTCTAAGTAACTAAAATTTATTTAAAGATAATTTGGGTAGGATGTGCTGAGACTCCAC:1 + chr2R 12253373 3' - BS 4653 1 61.64 AAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGAATGGTTGTGATAGCGCCAGTAAAGAGCATAATTTATAAGCAGCGAGTCATAGGGACTCAATGTTGTTGTC:1 + chr3R 25798477 3' - hopper 45 1 51.37 GATCTTTAATAATTATGTTTACAATATATGTACATATGTACATGTATGTATGATACTTTTTAGAATTTTCACGTTACTATGTGGGTTAATGGTTTCTCTAAAAAGTCTTTATCGTTTTCCAGGTAAATAGCACTGTTATTATT:1 + chr3L 25335914 3' - Cr1a 106 1 66.43 GTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAA:1 + chr3L 27391429 3' + 1360 3372 1 67.81 ATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAAGCAAACACGCATTCTTTGGCTTTTACATAGAATACTTTGGCGACACTTTGGCCATGTGGCCATTTGGCT:1 - chr3L 1004788 3' - jockey 4699 1 66.44 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGGGGGAGTGCGTGCGATTGTTTGCGCGCCTAAGCTGAG:2 + chr3L 17739867 3' - jockey 93 1 73.97 GATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCTGACCAGTATGTTGTAAGCAAGAACTGAATTAAAATCATTTGAAAAAGTTCTTTAAA:1 - 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mdg3 5274 2 67.61 TTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACCAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCAC:1 - chr2L 10461136 3' + roo 348 2 56.85 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGTAAAAAAAGGCAATCGACTTGACATA:1 - chrX 16547462 3' + P-element 2859 1 53.04 AGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCATCGTAGCGGTCGCTTTTCGCAGTTCGCGCTAGT:1 + chrX 21045295 3' - P-element 59 1 43.84 TGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGAACATTCGTCTAAACAACCCGAACGAAATACCACAAATTACGTTCAACTTTTAAATGAGTGCTAAACAAAATATATGTGTGTAT:1 + chr2L 18525746 3' + pogo 2084 1 73.05 TTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCAACTAAA:1 + chrX 3533980 3' + 17.6 431 2 64.38 TACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACGTTGGCATTCAGCGGAATCTGG:1 + chr3L 27391420 3' + 1360 3382 2 77.95 CCAAGGAGGCTCAATAGAAGACAAGCGAGGGCAGTTTCATGACTTCTTATAAAGAATAAAATAAAAATACTTGAAGTTCTGTTAAAATTTAAATGAAAATAGTTTAATGCCAAGAGGCGAAAGAATCTGAACATTTTAGAGAATTG:1 + chrX 17264756 3' + X-element 4479 1 39.73 AAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTC:1 - 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chr3L 22320125 3' - jockey 32 1 63.12 ATACGCTAAGAGTAATACAATCGCGAGCGGCACGACGTGCAACTGGCAACCCTTATAATCTAGTGTGTGTGTAGTCAAGAAGACGGGCATAGATTAAGAGGAATACAAGAAAAAAAGGATGGGAGGATTCTTAAAACTCCACAAAC:1 + chr3R 2446806 3' + G5A 2477 1 64.38 AATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTG:1 - chr2L 17019106 3' + 412 421 2 80.80 TTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACCTGACAAGTCTATTACTGAACTGGGAATAAATTCCCAGTAAATATGTTTTCTGTAAAATAATACTTTAATAATCCTTGT:1 - chr3R 13406392 3' + pogo 2061 1 58.22 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCATGCCTTGAGTCGAACAATAAC:1 + chr3L 7389828 3' + roo 396 1 72.80 CTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGTTTGCTCTGCATATGCGCAATCCATTCTAGCTATTATAGCATCAAAATTTAGTACTGTATTATGTGACGTAAGCATTACTTCCACGGGG:1 + chr3L 23526494 3' + Tabor 7293 2 63.70 CAATTTTGGCCATCACCAAAAAAGTGGCTGCATAATGCAAAACCAATCTATGGCCGGTACGCATCTTGTCATTCTAGTCTTTGGTCCTACATATAATCTAGCATTAAACAATAAGAAAAGAAAGCGCCAGAAGCG:1 - chr3L 25980827 3' + 1360 3325 1 58.52 TGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCT:1 + chr2R 14532061 3' + invader4 260 2 63.01 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCATTCAAATAAACTTTTCGTTCA:1 + chrX 13628856 3' + roo 9036 1 61.64 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGA:1 + chrX 14360814 3' - jockey 85 1 77.52 TAACCGCATTTTCTGCTGATTTTAAAATTCCTTCTTTGGATAATGCCAAAATAGGTTATAAATCAAAATTGGTATGTAATCGATACAGTGCATAGAGACCCGTTTAATCAACCTTTGAACTCTCATCCTCCCATT:1 - chr2L 4252185 3' - gypsy9 72 2 86.67 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTT:1 + chr2L 20852526 3' - Tirant 62 2 68.99 CGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGAT:1 + chr3L 10897523 3' + roo 8994 2 71.23 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAA:2 - 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chr2L 14262965 3' + P-element 2849 1 43.81 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTAAGAAACGTGGCTTTGGTGTTGACAAGCTCGTTGGCAAATCACACAAAGTATGCAACAAATACGAACGAATGCCCCACCGTCAGCAAAAA:1 - chrX 683518 3' + jockey 4982 1 60.16 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAATT:1 - chr3L 9317953 3' + P-element 2862 1 67.67 ACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTAACCAGTTCCGCCCAGCCTTCCGAT:1 - chr2R 23094842 3' + 412 459 2 61.64 AATCGTTAAAATTGATACCGATTAGATTAAGTTGTCCAAGAAGGATAATAGTACGCTATTAAATAAAAAACGTTTCTTGCTACCTGTTGCGTACTTTCCAAAGAATACCGTATACCCTGTTAGTAGGCAGGAACCGTCTCTAGTGC:1 + chr2R 6526604 3' + jockey2 3321 1 54.11 CGCTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTAATTTGACTTTGCATCAAAATGGAAATATTACTTCATTTAAAGTTCC:1 + chr2L 12236890 3' - jockey 14 1 80.14 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGGTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACTATAGACTTAAATGTAATGTATTACATATATTTCAAACTTCTTGTTGATAATTTTTTTGCAGTGCATCCGCATT:1 - 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chr2R 18886966 3' + roo 9007 2 63.01 AAATAAGAAAAAAAAATAAAATAAAAAGCAATTACCATTAAAGTGACTGTAAGTATGCAATGAAAAAGGAGCCGCATTTTAAAGCTTAAATATGTAGAACATTAGCTTGTTTTTTAATGCTGTCCTACGCGTTTCGATTTGGCCAA:1 - chrX 14767964 3' - INE-1 470 1 65.07 TAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCAC:1 + chr3R 10030808 3' - BS 5046 1 55.56 TTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTACAACAGCTGACTTTACAGCTGTTTTTTTTCAACACTATACGGTTAATTTT:1 - chr2R 3338728 3' - Juan 17 1 72.66 GACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCC:1 - chr3L 414833 3' + 412 7511 2 56.59 CGCCTTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTAGATTCGTTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCATTTTCATGTGTGAACAGTTCGCATAATAAACANATAATAAAATGCAA:1 + chr3R 22320530 3' - roo 8758 2 80.82 AAATCGTGTGCCAAAAAATNGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTTAACTTTGTCTCCAGTGCAACTGTTAATGTCGTCGGCCCTCTGCAAATTTCTGTCTGTGACGTCTAGCACGTTCATGC:1 + chr3L 23485782 3' - 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chr3R 8197751 3' - pogo 38 1 58.22 TACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGA:1 + chr3L 24008405 3' - X-element 53 1 47.26 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCACAAGCTTAAATTCCAATTAGGTGGCTC:1 + chrX 6538766 3' + pogo 2051 1 53.42 ATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGA:1 - chr3R 11516490 3' + roo 9026 1 56.85 TACGGAGGGCACAAAAACCGAATTAATCGCGAGGCTGCAGAGAAGGTAGGAGCGGAGCTGGAAGAGGAGGAGGGAGAGGAGGAGGTGACCGCTACGGACATATTACCAAGTGAGGAAGACGAGTATAC:1 - chrX 22828086 3' + mdg3 370 1 72.66 TTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGTCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCACGCTTTTCCAGCTTTCGGGACACATACACATACACACACACACACCG:1 - chr3L 15792588 3' + hopper 1345 1 63.70 TTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTG:1 + chr3L 24008404 3' - X-element 54 1 46.58 GAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCTCC:1 - chr2R 5953769 3' - roo 8692 2 65.73 AAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTC:1 - chr2R 9007078 3' - jockey 4866 1 75.34 CACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAAGCCTGCTTTTAAAGTTCTTTTTTTGCGCGTCTTTGTTCTTCGGGCACTATTTCTTTTTTTT:1 - chr2R 19805413 3' - F-element 61 1 54.48 TCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTTTGGTATATGACTATTGGTTTCCT:1 - chrX 23102364 3' + Transpac 5181 2 52.86 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATAT:1 + chr3L 10897538 3' + roo 9009 2 60.96 TTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATAAATATTTAATTGCGTAATAGCTATAATTTAGATTCAAATGACACAATATAATAATTCAGATTTAAATATCATATTTGCTTATTCATTTGCTAATTAGTGCAAAAA:1 + chr3R 31114410 3' + flea 237 2 71.23 AACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGG:1 - chrX 3811602 3' - P-element 55 1 41.09 ATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACGG:1 + chrX 13060283 3' - Tabor 67 2 64.14 AGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTGTTAAGTTAAGCTGTTCAATTTTATGGAATCCGTTTGGATT:1 + chrX 3330381 3' - X-element 4308 1 69.40 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAGCGAGATTCAAAGGGAGAGGACGAGTGCAGGACGAAAGGG:1 + chr2L 15523152 3' - 412 25 2 66.92 CTAATCTTACCTAAATACTGCGACTGCGCCGCCGTCGTTAGCGTCTGAAGAGCCGTGTATAGTTTTATGTATTAGCGAGTGAGAGAGTGAGAGAGAGAGAGAGA:1 - chrX 12649914 3' - blood 7249 2 35.58 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGTGTGCTGGCAACAAAAACGCTGCAATGTATGCTACACTTTTGTACAAATATTTTTGACATTCGCATGTATGCTGTGTGGGAACTAATGAGGCT:1 - chr2R 12492381 3' + hopper 1387 1 61.54 TTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATTTACGAATATTTAGCTATCTGAATAGAGATACGTTTTTCATTCTCTGCGGCTGCATATGCAGATTGATCGCTGGAAAATGCATTTT:1 + chr2R 14415565 3' - 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Doc 428 1 54.69 TAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTG:1 + chr3R 30087766 3' - roo 85 2 80.71 GTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAAAACACACGCCA:1 + chrX 8968696 3' - 1731 4384 2 65.75 CTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATAGTAAATTGGGAATTTGTGAATTCTTTGCTAACCGATTCTTGTCCTAATTGGCAGA:1 + chr3R 19506820 3' + mdg3 180 2 61.64 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCAC:1 - chrX 20330521 3' + P-element 2865 1 58.65 TTGTAGGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTAATGTGCAATCC:1 - chr3L 11535906 3' - roo 18 2 52.87 AAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGA:1 - chr3R 17897128 3' - hopper 55 1 63.71 TTCGTCGAAAAGAACGAAACATGGAAGAAGGAGCTTCAGATAGCTAAAAGAGGCTACCGTTCGTAAAAGTAATGTCCTCTGCAAAAATGCATTTCTTATTTTGAGTTGGAATAGTCACGTATTGTAACACTGTCTAGTATGCAGG:1 + chr3L 24036714 3' + Tc1 491 1 69.66 CGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGT:1 + chrX 21668383 3' + opus 7474 2 38.62 ACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGACGTGGGACTTTGCCTTTCCTTGGCCGTGCGTGTTGCTCACTCGT:1 - 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F-element 97 1 78.77 TTATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAG:1 + chr3L 9907333 3' - BS 5082 1 76.71 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACTCGCATCGCAGGATGGAGACAATACC:1 + chr3R 25158707 3' - 1360 37 1 60.96 TACACTCGCTTATTAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTATATCAGAAGTATTGGAATTGGAAAAGAATTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCACATCAAAGATTTTTGCTGAAGGA:1 - chr3R 4562714 3' + mdg1 7382 2 56.16 ACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATTAGTAAATAAGCAGCCGCATGAAGCTGGCATTTTTATGTGTATCAGTTTCAGT:1 - chr3R 20627938 3' + opus 433 2 65.07 AGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACC:1 - chr3R 21925093 3' - hobo 47 1 52.24 AACTATGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTTATTTAAAGACTTTTCGC:1 + chr2R 19633337 3' - jockey 4789 1 65.52 TGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACAGTTATATTAATTATATATGAAGCTGATGTATATTTTCAACTTTTTCGAAAAGTATGTACCCAATTTCGCTCAGTCTAATGAGCCACCCTAAATGACTTTTA:1 - chr3L 7787434 3' - flea 11 2 75.37 ATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAAC:1 - chr3R 29680196 3' - 412 7109 2 61.64 CACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCGCTCTCAAACCGAACCGATAGTCGGACAGCACGGGATCC:1 - chr3L 13993442 3' + P-element 2833 1 46.04 GACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTGGGTTTCTTTTATAGTTCCTAAATAGGTTGAATTAG:1 - chr2L 8284331 3' - Doc 400 1 63.83 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACCTTGCAGCGAG:1 - chr2R 12462094 3' + roo 9044 1 66.21 TAATTGAATGGTTTTGCGGGGGAACATTGAGTCTTATGATACTAATAAAGTACATATGTACTACATGCATAAACTCATATTTAATTTAACATATAGCTTTAAACATTGGGGATGAATAAATCGAAAAGGTCTGCAGTACAGGGTGT:1 + chr2R 13939613 3' - G6 1974 1 76.71 AAAGGGGATTCAAGACTTCCCCGTATGCCTTAATAAATAAATTAATTAAAAAAAAAAACAATAAATTATACAAAATGAGCCTTAAATGCCGAAATGTGTCACACCTTTGTAAGTGTTAGTTGTTAAATACGAAATTTATTAATTT:1 - chrX 15286830 3' + X-element 4685 1 59.31 CAATATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAG:1 + chr3R 15727961 3' + 1731 4598 1 59.31 AGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGTGGCTAGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCT:1 + chr2L 21071991 3' - INE-1 141 1 83.70 AACACACACAAACACACCGATAGAGAATCGAGTTAATAATAAATGGCAACAACAACTCGGTGAAAATTATTTGTACTTAATAACACACAATTTTAATTTATATAGTACATATATGTATATAGGAGTAAGTAAGTGAGTAAGTACTA:1 - chr3R 13851197 3' + gypsy3 425 1 54.11 AGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGACCAGTGGTCCGTCTTTATTTGG:1 + chr2R 2879476 3' + Stalker 6964 4 52.10 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTGAAGTTGGAAAACTTTTTGATTTT:1 - chr2R 16274512 3' + roo 387 2 72.06 ATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTTCAGACAA:1 - chr2L 4864375 3' - mdg3 5317 2 62.33 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGT:2 - chr2R 7314609 3' - blood 39 2 54.79 AATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGA:1 + chr3L 11684936 3' + Bari1 1661 1 51.37 GGAGGTGGTTGTTGAGGGGGGTTAATGCTGGGCATGGTAACTCGTGCAATACTTTTCATATCGCATATGTATTGCGTAAACGCTTTTAAAAATCTAACTAAACCATAGCACACAAAAAGTAAATAAGGTTGTT:1 + chr2R 12185445 3' - accord 21 2 65.41 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGA:1 - chr2R 23094888 3' + 412 7469 2 74.13 ATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGCATGCGGCTCTTTTTGTGCACATACTTAGAAATTTATTTTTTGTCTGTGTATCTGTGCTGTATGCCGCTTTCAATTGGTTCTGGATAATTGTTGCTCTGCAAATA:1 + chr3L 9696074 3' + 297 379 2 76.71 TATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAA:1 + chr2R 17650623 3' - pogo 61 1 78.15 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACA:1 + chr2L 388611 3' + roo 9002 2 64.38 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTTCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAG:1 + chr3R 9298599 3' + hopper 1410 2 75.81 CAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTG:1 + chrX 3533966 3' + 17.6 7346 2 72.22 AATATAAAATAAATAAGTAAATATATTTAATCAGCCCTATTCCCCGAAACTAACAATTTTCGAGGTAAAACTTCAATATAAAAAAAAAAGTTCAATCTAATAAATTTAAGTGAGCTACAACGTTCCACAGTAATACCCAAGCCAAA:1 + chr3L 14605037 3' + Doc3-element 79 1 83.56 ATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTTTGTATAATTTTAATTAACAAATATTGCAGCAAATTTCATCTACTAAATTATGGATTACGTTGCGTATGCTTCATACGGTTTT:1 + chr3L 22257875 3' + mdg3 5463 2 60.69 AATATATTTAAAGACTTACAATTTTGGGCTCCGTTCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTTGTTATCTAAGGCGACATGGTGTTAAAACTTCTTGTTGGTCCTTCTCACTAACTATAGTGTAT:1 - chr3R 19447704 3' + roo 19 2 70.55 TATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGG:2 - chr2R 14427162 3' - jockey 4848 1 76.03 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAGAAACCGAGAAAATGCCAGAGAAGTGTGTAACATGGTAAAAGCTCGCGGCG:1 + chr2L 310146 3' - P-element 63 1 39.86 CAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTC:1 + chr3L 11684922 3' + Bari1 1647 1 56.85 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAG:1 - chr3R 19094175 3' - P-element 7 2 66.67 GAGAGAGAGAGAGAGAGCGTCTTCTATTTCGGTTTCTATTCCTACTTGTGTGTCTGCCGCCTTTGTTTTGCTTCCTTTCAATTGCTTTAGGAACTATAAAGATCATTAGTACTAGTACATTCATCCA:1 + chrX 8669666 3' - blood 164 2 69.29 ATATATGTATATATAATAATACATATATGTATGTATATCCTGTATGGCAGCGCATCAACAAACACTTCACGCCTGACATTTGACAAGACGTTGTGTGCCTTGGGTGGTTCCTGGCAGGAACCCTTTTTTGTGAAA:1 + chrX 12536317 3' + Dm88 4382 2 78.52 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAAT:1 - chr3R 20904948 3' + roo 9024 2 53.42 GTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTCGCTGAGGGCAAAAGTTTCAAGTTTGATTTCGTGAACTTAGCTGCGTGTTTAAGTCAGCCTGTTTA:1 + chr3R 14999740 3' - Doc 395 1 61.40 TGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAATGAATGCGCCGGCGAGCAAGAACACGGGAATGCAG:1 + chrX 15287001 3' - X-element 4384 1 63.70 ACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACGCGCATCGCAG:1 + chr3R 25158692 3' - 1360 45 1 51.80 ATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACATACTTATAAATGAAGTGCTAAATCTTGATTAACAATGACCAAACCAGATCTTAAAATGTGCTAACCACTGAGCAAGCTAATA:1 - chr3R 13613064 3' - copia 40 2 67.59 TATTAATGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAAT:1 - chr3R 6419865 3' + Tabor 402 2 77.93 CAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTATATCTTCTTTCGCTAGGCTAATATAATATTACTTCCCAAGAATCCCGAGCTGATTTTTGCTTGTTCTCTCTCATTTT:1 - chr3R 7579363 3' + Stalker2 7614 2 57.55 ACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCA:1 + chr3R 17243244 3' + hopper 1384 1 62.33 TCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGAACATTCGTCTAAACAACCCGAACGAA:1 + chr2L 18525689 3' + pogo 2028 1 70.71 AGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTGCGTTGCCAGGTTTTGTTTTTGTTTTGGGAAAAGCGTTTG:1 - chr2L 310038 3' + P-element 2850 1 59.86 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAA:1 + chr3R 12519688 3' + roo 9002 2 67.81 CCCATTTTAAATTATTTAAATTATTAAATTATGAATTCCTATTCTTTGAATTTAGAAACTGCTTGAAATATGATAACATAGAATGTGTTGCATACTTGGCTGCTGCATGCTGGAAAATTCATGTAGATATCATGTAGAAGACGTGT:1 + chr3L 3766919 3' - Transib5 256 1 73.29 GTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACACAGGGGTAGTCAACTATATAAATAACGCCAACGCAAAAGGGTTGCACAGAGAAAAAATTACGTTTGTTAATTTGTTCTTATG:1 + chr2L 3893103 3' - 1360 31 1 55.63 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAGTAGAAGTAATAGTAGTAATTCACTTTTCACCAAGATCGTGAATAAGAATTCTGTGTTCGCTGCACTGCTTTAAAAGCCATTTCCTCGAGCTAACCACTTTTGGCCATCCCAC:1 + chrX 20284585 3' + roo 399 1 78.77 GAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCGGTATATTGTTCTTGTAGATTTTCATGTCCATGGCGAACAACAAATGTTGAGGAAGAAGAAAAAAAGTTTGTTATGTAGTTGATTTTTCGCA:1 + chr3R 25860605 3' + hobo 2909 1 65.07 TCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTGATATGGGATACGTTCAGGTATAATGGCCAATAGAGTACAGAGAAGTTTTATTGAATTGAGGCAATGATATTGTTTGCGACACTTTCTCTTGGCCGCC:1 - chr3R 16630229 3' - FB 18 1 70.00 GGCTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGG:1 - chr3R 27315086 3' - jockey 4720 1 60.50 CCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACCATAAGCAGTAAGAATTGAATTATCCATGTCTTGACGCTTG:1 + chr3R 10144511 3' - Chimpo 16 1 74.48 CATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCCGTG:1 - chr3L 11364769 3' + Tirant 362 2 56.94 AATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 7554 2 68.06 AAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATTTGACTTAAAAATGCAGCCAATAAATAAGTAATTAATGAAAATGTGTGGACGCATTTAATTCACTTTGTAAATATTCCATAATCTGGATCAGATTCATTAATTCGCACG:1 - chr2L 20029340 3' + I-element 5342 1 71.92 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGC:1 + chr2R 9836604 3' + P-element 2802 1 24.29 GGTTTAGGCAGTAATATTTAGAAGATTATAATTAAGTATGATTTATGTCAAGTCCCGGTCAGTCAGGTCTTAAGGGTGGTAATATATTTCCCGCTAGTAATGGCTATTTCCCGCTAAATCACTGCAAAATAAGCCGCACAATTTA:1 - chrX 15746263 3' - jockey2 3242 1 55.86 GTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCACTCAAGGGATTGGCTTTACTTTT:1 + chr3L 414971 3' - 412 33 2 63.70 CTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGGAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATATTTTTAGACG:1 - chr3L 9635311 3' - Doc 37 1 54.46 AGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAG:1 - chr2R 10582399 3' + Juan 4136 1 70.55 ACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGACGGGAATAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTGATATATTTAATGCACATTATGCTAACTTACTGNATAACGATGCACAA:1 - chr2R 15199130 3' - Burdock 77 2 67.81 ACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCGCTGGGAATATTGTTGAATATATATATACAACTAGCGGATGTGAATTGTGTACATTGCGTAAGATTCGCCACTCTGCAAATTCT:1 - chr3L 25483027 3' - transib2 41 1 56.85 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTTAA:1 + chr3L 10897577 3' + roo 9048 2 69.86 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCACTCAAGGGATTGGCTTTACTTTTTTGCAGTTTAT:1 + chr3L 414982 3' - 412 22 2 71.23 CTTGTAGACGAGAATCTTTAAATATGAGTGTGAGTGCATAAATTGCGAACCAAATGAAAAGGCAGCATTCACATTATCTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTTGCGGCTAAGCTCTCTTCACTTGG:1 - chrX 3921584 3' - G2 2621 1 82.03 ATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTGAGATCCAAAGAATAAAGTCGTGAAACTATTTCTCCTAAAAACTATTTTTATATGTTGGTTTTAAAACTTAGTTGCCTTTGGACTTAATATTTT:1 + chr2L 7340953 3' + 297 241 2 69.86 ATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCGCAATCAGCAGGCGGGAAGTTCACATAATGCTGCCAGACTTACGCT:1 + chr3R 29678941 3' - 412 27 2 48.80 CCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATACAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCTGCATCCCAGCACCGCCCACTGGAAACCCATCCC:1 - chr3R 27452000 3' - hopper 83 1 71.53 ATGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGAGTGTGTGAGTGCCAAAAAACTTTTGCGTGGCGGGTGTTT:1 + chr3L 7300255 3' - accord 187 2 71.43 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAATGTAAACAGGGCGGGCAGGAAAGAGAGGGAGAGAG:1 + chrX 9846850 3' + transib2 2779 1 54.29 TTTATTTAGTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGA:1 + chr3R 10030773 3' - BS 5083 1 66.44 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAG:2 - chr3R 15003116 3' - Doc 63 1 61.64 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCCCTGGCTCCTTT:1 - chr3L 22320127 3' - jockey 29 1 63.97 ACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTGTAAGT:1 + chrX 20330619 3' + P-element 2884 2 71.43 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGCGTCATCAGTTTAAATATGTG:1 + chr3L 2907386 3' + 412 7482 2 60.00 GTTTTTTTTTTTGTTTTGAACATCCTTCACACATCAAAATTTTACGCCGAGTGGGCGGCTTTAATGGGTTAATTATTGTTCTACTTTTTAAGAAATATTATGTCAACAAGTTATGGGAAATACATAAGCCATGCACGGGATTTTT:1 - chr2R 19338651 3' + Tc3 91 2 71.72 TTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTA:1 + chr2L 544898 3' - Doc 80 1 77.54 GCGGCTTTAAAGGGAGATGGATGGTGGGCGAAGGAGATGTGGGTGTTAATATGTATGTGGTTCAACCGGTGTTAAGTTAAAACATTGACTGCCTACGCCCACCAACGACAATTGCCGTAAATCGAATTCTGCCGTTATTCGCA:1 + chr3R 15973405 3' - transib4 2437 1 52.45 TTATTTATATTTATTTATTTTGGAAATTTTAAATCTACAACCAAAGAAAGAATCCATGTAATCGTCAAAAAGTAGCTTTCTACATTTTCTATAAACAAGACAATAAGATACGAGGTATTCTCGCAGTCGCAACGAGTTTGTGTAT:1 + chr2L 12205176 3' - Tc1-2 478 1 64.14 CACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCACATT:1 - chr2L 2544744 3' - blood 66 2 60.96 TGCTGGGCTGGGAGGTCGTTGCGGTGCAGCCGGCTTTGACTGGGATTCCGAATCATCAACCGCGGGCGGGAAAATGCCTCCCATGCCATTCGTACATTCTGCAGCCGTTCCATCTCTTTCTTGCTATCTGCGTAACGCTG:1 - chr2L 14470263 3' - Doc 4551 1 72.86 ATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAGAAA:1 + chr3R 10030828 3' - BS 5025 1 68.53 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTC:1 - chr3L 6557130 3' - Doc 69 1 64.14 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCT:1 + chr3R 26242545 3' + roo 9001 2 69.18 ACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGAACCCAAGAGCACTCTCTCCCTCTCTTTTGGGAGAGATGAGATAGCAAAGAAAAGCCAAAACACTAGAACAATCCAGAAGCCAAGTTTTC:1 - chrX 19886905 3' - P-element 31 1 65.07 ATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTC:1 - chr3L 22021662 3' - mdg1 75 2 67.59 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTGGTTTTATATGGGATTTTTTTATTCTTCGCTAATTGCATTTGAGAAGTGCATTAAGTTGGGCATCGAACTGGAAACTTGCAAATATACATATGTATGTAGAGGAG:1 - chr3L 23496531 3' - blood 7029 2 73.29 GCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAA:1 - chr2R 8966154 3' - BS 5030 1 51.79 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCGCTCTCAAACCGAACCGATAGTCGGACAGCACGGGATCCCGAAAGGACCCCGAGCAG:1 - chr3L 13993424 3' + P-element 2870 1 68.33 TTTGCTATTTCTTCTTTAACATAAGGGATTCCTAAGTCTATATGGATACGAAGCATTTGAAATATAAAATGGAGCATTAACAATTTGTCTTTTTTTTTCCATTTCCTGAATCATAATTCTGCATCCTATAATTCT:1 + chr2R 4899121 3' - G4 3577 1 68.89 TTATTATTATTATTATTATTATTATATCTCGAATCATATTGTAAGTTAGTAAGTGCTACAACTACTGGCTTTCAAAAGATTTTCCCTGGGTTTTTTCTCGCACATACCATCTGGCTGCTTCATGCCGGGCTTCATGCTTGTTAGA:1 - chr2L 7183628 3' - mdg1 38 8 70.34 GAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATACCCATTTTCGAAATGCAAATTAAATGTGACTAATCAATCGTAAAGCAACATTTTTTTCACATACCATGAGCTTATTAA:1 + chr3R 13406535 3' - pogo 43 1 52.05 TTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAAATTTCATTAACATTTGTTGACTTGCTTACTTGACGGC:1 - chr3R 26180386 3' - Transpac 29 2 70.34 ATCGCCCTCTTCTTCTTCTAGCTCAACATTATAATTTTCCGAGTCTGATGGATCAGGTTTAAGACTAGACTGTATTTCCAAAAGACTTATTACTGCCTTCGGAAGTGTTTTTTTCCTATTTTTTCTCTCTCTTTCTTTT:1 + chr2L 14147250 3' - transib2 2585 1 68.35 CGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAGTACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCT:1 - chr2L 20407765 3' - McClintock 5998 2 60.45 AGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATT:1 - chr3L 18183112 3' - Tirant 8162 2 76.36 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTC:1 - chr3R 8197781 3' - pogo 60 1 62.32 ACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAAATTCCACGACGAATTTCATGACGAC:1 - chr3L 7751022 3' - 412 58 2 56.85 AGCTGAGATGTACATTAGTATATTAGTTGCATTTATAACAGTAGTGGACTGTATTTATTTGATATATGTTCATTTATTTTGCAACTAAGATTTCAATGGGACTAGTTTTTGTTCTTTATGCACTCCATGCTGCAAAAAAGCTAGGA:1 + chr3L 14437786 3' - roo 8623 1 73.97 TAATACCTCCTAAACTATTGAAGATATTTGGATGAATTTTTTTTTATGCGTTACACATGCCTCCAGGAATATTTTGGAACTAGTGGGTTCAGAGTTGAACCGATGATTTTAATTATTTATATTTTTATATGTTTGTTTATATGTT:1 - chr3R 17239066 3' + hopper 38 1 55.86 GGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCGTGTGACTGCGATACTGACTGCTATATACCGTGGCCATAAATTCAGTTC:1 + chr2R 14072636 3' - mdg3 5255 1 75.21 GGAAATGCTGCTAATACTGCCGATTTGATTTAAGAATTCGAAACAACAACAAGTGTGAGAGGCAGACAGCAACTACTAACTGAGATTTGGCAACGGAATGTTTGCTTGAACTCGAACTTTTTGCGGCAGTTACCTAATCG:1 - chr2R 7314293 3' + blood 441 1 59.29 ATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGGCGAATATGTCCTGGTTGCCGGGACAGCGTGTAC:1 - chr2L 15523015 3' + 412 446 2 51.03 AAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCCAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAAAAATAAATGGGTGTACCGAAGAAGACATGTTCAATTAACCGAAATGTGAGCAATT:1 + chr2L 3241275 3' + I-element 5284 1 63.70 AACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGCAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAAT:1 - chr3R 4160068 3' + invader2 5050 2 58.27 GTGGGAGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTAAGGGAACGGAAACCGGAAACTAAAATAACGAACGGAAGGTATAATTGAATGAAATCAAAAGGTACAAGCAGCATTTTGTTCGGCATTTTTGCGTAAT:1 + chrX 15614400 3' - Cr1a 301 1 72.39 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGCTCCTAACTTGCTACCATGTCGTCCTGCGAGTCCTTTGCGTCCTGCCCTGCGTATAATGGAGAGAAATTGCCTTTTAATGAGTTGGGAATTTCATCTGCGCCTTG:1 + chr3L 12873132 3' + hobo 2928 1 78.26 CCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCTCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGT:1 - chr2R 12462141 3' + roo 354 2 63.71 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCCCAGTACCCTTCGTATTCCCAATACATTTTAAC:1 - chr3R 5870767 3' + roo 9048 2 66.43 CTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATCAAGAAGAGCCAGAAGATACACGAGCTGAACGCAATGAAG:1 + chr3L 24008416 3' - X-element 42 1 54.79 AAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTG:1 - chr2R 7314615 3' - blood 35 2 54.41 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATG:1 - chr3L 15393694 3' - pogo 59 1 63.70 AAAGAAAAAAAAAAGTAAGGAATCACCATGCCAAAGGGCCTGATAAAGACATTAGGACCCGGGGAACGTGAAACAATCAAGGCCGAGCCCAATCGACTGCTAAACGCTGTCGGCACACATCTGAAAGA:1 + chr2L 12090203 3' + Doc2-element 225 1 62.50 AGCTTGGGAATCCGTTTACAAGAGCGGCCCAGTTTGGGTGGCGCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTACCGGA:1 + chr3R 10736109 3' - McClintock 6022 2 75.56 TTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTA:1 + chr2R 17350573 3' - F-element 90 1 73.88 ATTTTGGGCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTA:1 - chr3L 9324451 3' - HMS-Beagle2 55 2 57.14 ATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCTAGTTTT:1 - chr2R 11777991 3' - hopper 34 1 55.88 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAATATATTTATCTTTTTTGTATCATGGCGACTTCAGCGTGCCGAACTT:1 - chr4 868591 3' - roo 8680 2 74.66 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATATAT:1 + chr3R 19514348 3' - blood 7056 2 54.79 TGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAATAAAATTTCTAATTAATATTATCAAGCTTCTTTGAGCATAGTTAATAAACTCAATAACTAGCTTTCTGTTTAAGCATCCTATTAAGTAGTTCACGAAACAGAAC:1 + chr3R 11516650 3' - roo 17 2 73.97 ACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAGTTTCTTAAAAATCAATACAACACGTGTTTTTTGTCTTGTCGACTAAATTACATTTTTTTTACAATT:1 - chr3R 15297501 3' - Transpac 4972 2 54.11 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTGGCAGTGAGG:1 - chr2L 2057803 3' - 412 7115 2 59.59 TGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAGTTACCAACTGCTCAACTATTTATACTACTTTTCATTACCCACCTCAGCACCAGGATTTAAC:1 + chr2L 10909671 3' + 412 7541 2 57.53 ATTAAAAACAATATGTAAGTAAGTAAGTAGCAGGTAAGGTAAGTAGCAAGTAGTTTAACCATTTAATTTACTTTCTGATCATGAAAGAAACGTGTTTACCATAAATGCTATGAATATTTCCTGTTCCCTTAGCGGATGTTCACTGT:1 + chr3R 14549001 3' + blood 6914 1 68.49 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCNCCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATT:1 - chr2R 7720039 3' - HMS-Beagle 30 2 64.38 GGGCTTCAGTCTGGGCGCCACAAATACTTGGGATGGGGTACTTATCATCAGTTGTTTTTTGGTTAAGTTTACGAAAATCGATGACCATACGCTTTAGCTTTTGGCCCGATTGGTCTACCCTAAGAATATAATAAATGATTGGGTAT:1 + chr2R 545172 3' - Chimpo 1 1 79.45 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCAATAACAACAACGACGCCAAAATAAAACCAGTAACGTGTAT:1 + chrX 7702881 3' + P-element 2879 2 80.14 GGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTATTTACACAGGCCGACTGTCTGGACTGTTGCCGTTAATTGTCCCGCTGGCACATTATGGCCAATGGGTGCCCGCAAACACACTCTAAAACACCAA:1 + chr3L 17268372 3' - hobo 10 1 74.22 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTT:1 - chr2L 6618876 3' - 17.6 35 2 56.25 ATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACTCGCATCGCAGGATGGAGACAATA:1 + chr3R 25158705 3' - 1360 2 2 79.82 ATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAGTGTTTGAGGCAATGCAATC:1 + chr2R 18931962 3' - blood 7028 2 72.60 GCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTATTTGTTT:1 - chr2R 7314612 3' - blood 41 2 51.72 GGTAAGTTCATTATTAATTTTAACAGCTTGTTTTGGCATATTTGAAGTTTTTTGATATGAGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAAT:1 + chr2R 10582446 3' - Juan 3889 1 73.97 GGTCCGTAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAAAGCTGGCAA:1 + chr3R 30955445 3' - G-element 25 1 63.70 CTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTTTGGGTATATGAACTTGTCTTGAGTTCAAGATCCA:1 - chr2L 18525554 3' - pogo 12 1 77.40 TTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATCCACCGTGCTCTGCAAGAAGCGAAAA:1 + chr3L 11826042 3' - X-element 37 1 54.14 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCTTCTTATCTCAAAGCTGC:1 - chr3R 13254870 3' + roo 9036 1 59.59 AAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCGTTCCGTCCTTCCGTAC:1 + chr2R 21713338 3' + P-element 2860 1 53.85 AAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGTTACTAGTGGTTAGGTTAAATAAAATTATATCAAA:1 + chr3L 2532578 3' + blood 356 2 69.18 AAATGTACAAAGATTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTA:1 + chr3L 8824523 3' + transib2 2770 1 65.32 TTTAGGGGGGGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGCGTTGCCTTTGCATAAT:1 - chr3L 18183078 3' - Tirant 3 2 73.91 CCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGTATCATAAATAATATGTTAGCTATGAGAATGTTCCAATCCC:1 + chr3R 13155317 3' + hobo 2867 1 68.35 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAGATGAAATATTAAAAATATTTAAGACGATAGAAATGCTTTTGTTCATATTACGAGGAATGTGCCTAATACCCGACTGAAATCAAAACTTTTCTGTCTGTG:1 - chr3R 31266063 3' - jockey 30 1 63.70 TTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGTATGAATGACATCTTC:2 - chr2R 19574395 3' - I-element 5126 1 62.33 AAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTAAATACTTTTTACATTTGCAGTGATTGTGATTATTACGATTTTAAAAACGTATTTCTGAGCTTCATTACCA:1 - chr4 490212 3' - pogo 48 1 54.11 AGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAGTTTGATGGTCTTT:1 - chr2R 961104 3' + transib2 2691 1 75.86 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTATATCTGCCTTGCGACTTTTGCTTTGGCCATCTTGATCTTTGCGCTCTTTATTTTTATTGAGAAGGTTCGATTCATCAAAGG:1 + chr3L 15718193 3' + 1360 3354 1 61.64 GGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATGCGTGCTCGGGCCCGTGGTAAAGTATATACGATATAATACAAATACATATAGACAGAAGCAGCCG:1 - 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chrX 5751826 3' - roo 8705 2 49.32 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGGGGCAAAGGGTAACTTTCATGTCGCGGACGATGAATG:1 - chr2L 17019068 3' + 412 464 2 55.83 CTCCTAAAATAGTCCCTTAGTGGGAGACCACAGATAAGGTCCTCGCCGCCATTGAAATCTTAGTTGCAAAATAAATGAACATATATCAAATAAATACAGTCCACTACTGTTATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCAGC:1 + chr3R 19450189 3' + roo 191 2 67.12 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGCTCTTTCTGATCGTACAATTCTGTACA:1 - chr3L 18216434 3' - 297 20 2 71.23 CATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTCCAGAAAACCACTCATACCCCGCCATTCACCGCCCACCGCTGGCGTCTTTATTACAGCGCTGCACTTAATAAACATTTGTGTTAAATTTTT:1 - chrX 9846708 3' - transib2 29 1 65.52 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTCCATTTGC:1 + chr3R 7625388 3' - hopper 6 2 59.74 GTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGGTC:1 + chrX 20330598 3' - 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chr2R 4730079 3' - gypsy8 309 1 79.23 ACTCGGCTATTGATCCAGATCTAGAATATATGTATATCTTCTGTCTGTTACATACTTTTCAACGAATCTAGTATACTCTTTTACTCTTCAAGTAACGGGTATAAAAAATACAAAACCCTCGATATAACCAGTACGATCACAAA:1 + chrX 19192428 3' - INE-1 91 1 78.32 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACAC:1 - chr2R 23094893 3' + 412 413 2 77.30 CTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGNGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATACATATGTGAAGTTGATTAAGGNTTAAATAGGCAATGTTCTAATGGGATTCACATA:1 + chr3L 18216579 3' + 297 6916 2 65.07 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTACCCAGACCCCAATAACAACAGCAACAA:1 + chr3R 11937899 3' + hopper 1397 1 70.90 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACATTTCACTGCTAT:1 + chr2L 14056789 3' - pogo 45 1 50.68 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTTTATTTTTTATAATTTTTATTTGAATTTTTCGTTTTTATTTATTTTTCTTAGAAAAAAATTAATTAAAATTAAAGAAAACTGAATTTTTATTTTCG:1 - chrX 13999712 3' + roo 9047 1 68.49 ACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGC:1 + chr3R 31198638 3' - Transpac 76 2 70.55 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGCAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTCC:1 - chr3R 5870799 3' + roo 9026 1 52.31 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAATGTTGATGTTTTTTTTTTGGAAATGGGTTTGGTTGGT:1 - chrX 17792470 3' + roo 395 1 75.34 GCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACATATATATATGTATACAAAAAGCTACCTTTGTT:1 + chr3R 17924504 3' + Burdock 6307 2 81.51 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGCGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCT:1 - chr3R 20887403 3' - Doc 67 1 59.15 ACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTGTCAGCTGTTTCAGCTGCTGGCGGCGTTG:1 - chr3R 27707073 3' - P-element 54 1 28.57 TCATGCGGCTGCTTATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCC:1 - chr2L 6637406 3' - 1731 4431 1 78.08 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTATTTTCGCACCGCCTGAGACGAA:1 - chr2R 9376616 3' + hopper 1378 1 58.99 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAAGTGGAATCACATTTTG:1 + chrX 17792616 3' - roo 64 2 63.70 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACTTGCAATTTTATCTACTAA:1 + chr3L 2317261 3' - 412 7085 2 62.33 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGG:1 - chr3R 24072020 3' - jockey 25 1 70.37 GCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGGCTTGAGCTTTTGTCTGGAT:1 + chr3R 31264554 3' - BS 19 1 65.94 TCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGCGAAATGTCAACTGTTTTTACTCACGAATGAGGGATTCTCTTTTGAGTTGTTCATCACTCCAACTCGTTTCGTCGCACCTGAGGAAACTAAT:1 - chrX 12979409 3' + transib2 2797 1 67.12 GTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTT:1 - chrX 22679656 3' - Doc 101 1 64.38 AATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCTATATGCTTTAACATAGATTATACTTTTCATTTCATTTTATACTCTCATATTAGAATAAGCTAATTTTTTCAAGCCCCT:1 + chrX 8469317 3' - hobo 32 1 60.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCAATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAAACTATAAAAATTAATCTATAAATAAACTA:1 - chr3R 20904930 3' + roo 9042 1 62.33 ACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTG:1 - chrX 8681449 3' - jockey 87 1 73.61 ATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCTTCTGGTTTTTGCTGGTTTAGTTG:1 + chr2R 14532100 3' + invader4 3058 2 67.81 CCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAAATCTCCCTTTTAATATTTAACATTATA:1 - chr3R 4160055 3' + invader2 211 2 54.89 TTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCA:1 - chr3R 12046749 3' - Doc 75 1 67.12 AAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAACGGTTTT:1 - chr3R 23902192 3' - I-element 71 1 66.67 TTTTTTTGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAAT:1 - chr2R 19574421 3' - I-element 5151 1 57.24 TGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAAATTAATATAAGTGCGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTC:1 + chrX 21907813 3' - Stalker4 308 4 75.81 TAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATT:1 + chr2L 15019936 3' - BS 4870 1 73.28 AGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTCTA:1 + chr3L 2167677 3' - opus 7187 4 75.54 CGCCACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACACATATATATATGTATACAAAAAGCTACCTTTGT:1 + chr3R 17924503 3' + Burdock 170 2 80.82 TACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCC:1 - chr2R 7314594 3' - blood 7033 2 65.97 AATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCCTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCC:1 + chrX 20149237 3' + pogo 2042 1 61.64 GCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTACATGTAATGCTGATCTTGAGCAGCGCGTACAGAAGGAATGTAATGTCCGCTCGCTCTGGACTTTGGTAAGCGTGGGACTGACGGTTATGCAGTTATA:1 + chr3L 25206954 3' + HMS-Beagle 227 2 72.60 AAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTTAAAGCCAAAAAGTGCGCACAACTTCTAAATTACTTTTCCAAACAGCATCCACTGGCCTGCTGCCT:1 - chr2R 14072496 3' + mdg3 5460 2 51.94 TAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTA:1 - chrX 9165340 3' - jockey 4834 1 65.75 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATGCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACA:1 - chr2L 14056654 3' + pogo 2055 1 51.37 AGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGG:1 - chr2R 9007069 3' - jockey 4857 1 69.18 TATTGTTTACATAAATGATTTTTTTTACTATTCAAACTTACTCTGTTTGTGTACTCCCACTGGTATAGCCTTCTTTTATCTTTTCTGGTTCAGGCTCTATCACTTTACAGATCGCTATTTAAACTGTTTTTTCCCATGTACCCATG:1 + chr3L 1460607 3' - P-element 462 1 32.88 TTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACACATACATAGAAACACACACAGGCACACTGCGGTTGTTTCGGGAGATTTTGAAAAATTCATTTACTGCGTGCCGTCATGAAGAGATGGAATCCAATTTGGGCAAG:1 + chr2L 15516821 3' - Max-element 8256 2 71.92 GACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAGTAGTGGA:1 - chr2R 7895483 3' + mdg1 397 2 65.75 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGATGTATTATAGCTTGTAAAGCCACCTGAATACCCACA:1 - chr2L 18219256 3' + copia 244 1 74.31 TCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTG:1 - chr2L 8284366 3' - Doc 409 1 53.91 CACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCACTGCAGCTGTTGTTGTTGCCTTGCTTCTGGGGAAACCCTTAGTCGCCACAGCACTTTTTTATTTCCTGCCGTATCAAATG:1 - chr2L 20852418 3' + Tirant 372 2 64.18 CCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGGTCAAATTACCAACTGTATTTACTAAGTTTAACCT:1 - chrX 17770403 3' - hobo 43 1 50.00 AAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAACAACAACTTTGCATATTTAAGTCAAATATGTTAATGGCAATGGGTATTTGGCTAGGCTGAATGAGCGGAAATAAGCGA:2 - chrX 8968588 3' + 1731 270 2 52.74 AAAGTGTGCTGAAGTTGGGTTCAGCTACCCGCACATACATTGCTTATATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGATCCCTCGCCGCAGTCACTGGGTCACTG:1 + chrX 21907825 3' - Stalker4 312 4 70.00 TTTGGTCACTTGTGTTTACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGG:1 - chr3L 9324443 3' - HMS-Beagle2 6936 2 49.32 AATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACACAATAAACAATATATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATGGGGGAAATCTAATTTCCTTAATAGTCTCAACAATTACACGATTTCTGACCAGGTCAAATTCAATCGGTG:1 - chrX 1765686 3' + hopper2 1283 1 52.05 ATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAATAGGTTCAAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCAGTCGCCAACATTTTCGTCCTTCT:1 + chr3R 6584897 3' - transib2 22 1 66.67 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCCAACTTTATTTGTTGTTGTAATTCTGGATGTCATTGTCGGTGTGCATCAAGTTTGTTAGTTTTTTTTCTATTTGCGAAAAA:1 - chr2L 3892951 3' + 1360 3353 1 58.90 AGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTGTGTGTTTGTGTACAGGAAGAGATCAGATAGATCAGAAGCAGTGCAAGAAAGAAAAGTGCAAAGCGAA:1 - chr3L 17011933 3' - 1360 51 1 53.42 CGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATACAAGCAGTATATACAATACTTCGATGAAGCCGTTTT:1 - chr2L 18311393 3' - opus 28 4 66.44 AAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCACACCGACACGCATACACCCACATACATGCACAGGGACATATACACACACAC:1 - 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412 75 2 52.05 ACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTCATTGTAGTGTCTTTGGTATGACCGTCCCTCCAGACGGGGAGGTGGAGTCTTAATTGCGGTTAGAGTAGGCGTGTCAACGCGTGGTTGAAAATACGAAGGAAACTATTCCTTTCTTGT:1 + chr4 249457 3' + 1360 3366 1 63.70 CTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGGACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGACACTTAAAACCCAACAGGGTCATTTAAAACGGACAGTATCGAAACTGTGTCCACTGCCAATCCGTT:1 - chr2L 22592495 3' + mdg1 7437 2 69.86 CGAGTCGATCTGGCCATGTCCGTTTCAAAACTAACACGCTCCATCTGTTGGTAGTCGTTGTGTTAAAGATATCTTTATCTTTAAAGATATGTGATGAGAACAATAGTAGTTAGTGATATTTCTCCGAAATTATTCACTTACTCAC:1 + chrX 20996720 3' + INE-1 108 1 74.48 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATCCAGTTGTGGGAATGTACTGCAGACTCGCGACAACGTAGCCTATTTTTGGGCTACCCACAAAAACAACCTCTAAGATCACATTCCTGTCTACAA:1 + chr3R 7049494 3' + Burdock 6374 2 71.22 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAACTGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGA:1 + chr3R 12519687 3' + roo 338 2 70.34 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAATTAAAAGTTCTCCAAATTTAGCTATACATCCAGTACAA:1 - chr2R 14884063 3' + roo 9034 1 57.34 TCTTAGGGTAGATAAGTCCAATATGCTACACCTCCCTTTTTAAAGAAATGACGTAATATATGTAGTCATTGAGTTCTCAATATAAATATGATTTAGAAGACTATACAGAATATAGACAACAGTATAGAATACCATTTTTTACTAAG:1 - chr3R 1048293 3' - Stalker4 6965 4 63.01 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCAT:1 + chr3R 5870903 3' - roo 57 2 59.59 TCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAATATAT:1 - chr4 868632 3' - roo 57 2 59.59 ATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTTGTTGCGAAGACTGCATG:1 + chr3R 21794163 3' + hopper 1376 1 56.64 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGAATAGCTGCCGGCAGAAC:1 - chrX 19662997 3' + P-element 2820 1 20.00 AACAGATAGTATTTTAAAGAAATATTTCATTATTTGCTCATTAAATAATCCCTATACTCACTACTCACATTTTTTTGTAATACATATTATCTATTCCACGTGAAGCATATTTCATTGCTAAACTAGAGTAATACATATATTAAAAT:1 - 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chr3R 12046691 3' - Doc 9 1 67.12 TATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATTTTTAAGATACTCTATATGCAAGTTTGGCAAAAGTGCCATAAAACTGATTTATCAGCTTGTGTTTTATTTTTTCCTTTTACGACTCGTACTCGATTTCAA:1 - chr2L 8536486 3' + Juan 4198 1 69.18 TTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAATATGCAATTTCGCTTTTCACTGGC:1 + chr3R 23636443 3' - X-element 4261 1 50.00 CAAAAATAAGTGAAATAAAAAGTCGATTCCAAAAAGGGAAAATACCTTTGTATGACCTGTGTATGAGACACAACTGCGAAACATATTCTACACCTTAAAATATTTAAATAAGAAGTAAAAAAGAGTTGAGTAAAAAAACTAGGCAG:1 - chr2L 21795716 3' - HB 86 1 56.16 AAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCG:1 + chr3L 11684935 3' + Bari1 1660 1 50.68 GAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTTTCCTGCTCTCTCTCGTTCTTCGTTCGTGCTGCCGCTGCTGTTGCTATTATTGTATTTAAATTTAAATTTAAATTT:1 + chrX 1769823 3' + hopper 1390 1 68.49 AGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAG:1 - 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chr3L 21440854 3' - Tc1 442 1 54.11 TAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGCAAATGGATTCTGTGACCCCATTGTGACCAATCTCTTGCAGGGCAT:1 - chrX 18745347 3' + Juan 4154 1 63.31 TAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCATGCTCCGCTTTTAATAAATTGTGCTCTAACCCAGCATTTCTCTTTCCGCGATCCAAATTTC:1 + chr3R 18294964 3' + copia 244 1 73.29 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTACGAAATATGCAGTGGCAAAATGAATGCACAAACTGCTCCATCTCCCTTCCAC:1 + chr2L 7929601 3' - roo 67 2 66.67 GAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTGGAAAAGGCTTTTCATACTTACA:1 - chr3L 18846959 3' + 1360 3322 1 63.70 GCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAA:1 + chr2R 20972720 3' + jockey 4967 1 50.47 GCTATATATCCTGATCAAGAATATATATATATTCAACGAACTATACCTAACTAGTACACCCATTTTCACTACGAGTAACAGGTACACAAATATAGTTCATTTGAGGGAGAAACTAGAGAGGAAATGTGTTTCCTGATATCTCGGCC:1 + chr2R 5191122 3' - INE-1 86 1 77.40 GAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCG:1 + chr2R 21795346 3' - transib2 59 1 59.59 TGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAA:1 + chr3L 11364881 3' - Tirant 8144 2 57.41 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCAGTGTCAAAACAAAGCCTGCTAAAGGTGATTAACTACGCAGAGTCAGACCAGGAGTTCTTTTTAGAGG:1 + chr2R 2046574 3' - Transpac 56 2 54.11 GTCCGAGTAATACGATCTAACGCTCATACATAAGCCGATCGCGGAGCGTGGGAATGCTGAGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTGTATGTATATGCGACCGTGACAGTGTTTATAGTGATGT:1 + chr3R 4055288 3' + Stalker 146 4 73.97 TGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGTATGGAGCCGATGACTTTTCGAAACGTTTTGGTTCGCTCAC:1 + chr2L 21802987 3' - Quasimodo 42 2 58.33 TATGGGTTATTGACCGCTCGATGTCTGCGTTTGGGGTTGTCGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTGCGTTGAATTGAGAGCCGGCGTTCGTCATGCTCGCGCTGCAACACCCAAAATAACAAATAATACAATTAATTCAAA:1 - 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roo 8679 2 72.66 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAATACTTTTCACTAAAATACGTTTTAACTTTGGGACATGCAACAAGTGTCAT:1 - chrX 17048164 3' + jockey 4927 1 67.81 TCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGTGACATCCGTTTTGCTAGTTTTGATGCAGGTTGCCTGCTGCGAT:1 - chrX 21233336 3' + roo 8998 2 73.61 TTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGGGGGTTGCTCATCACTTATGGCCATTATG:1 - chr3R 24071994 3' - jockey 29 1 72.46 ACAACTATCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCCGCACTGCAGCTGGTGTTGTTGCCTTGCTTCTGGGGAAACCCTTAG:1 - chr2L 20852456 3' + Tirant 8440 2 71.85 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTC:1 - chr3L 15393673 3' - pogo 49 1 52.05 TTTCGTACAAATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAAC:1 - chr2L 18525627 3' - pogo 77 1 75.36 TTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGAGCAAATTACCAACTGTATTTACTAAGCTTAACCTTTTATACAAAAAGATATT:1 - chrX 17770385 3' - hobo 30 1 63.45 TGAGTCTTAACAGAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCC:1 - chrX 13060207 3' + Tabor 408 2 69.18 ATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAA:1 - chrX 16547485 3' + P-element 2806 1 30.14 ACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTT:1 + chr3R 6419941 3' - Tabor 6902 2 58.22 TCAAATTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCTGTAGCTCAACTCC:1 + chr3R 27452075 3' + hopper 1372 1 51.59 GGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAACTTCCTCCGAAAGGGACCTCTGCTAAATTGATTCTCAATATTTGCCTTA:1 - chr3R 31264448 3' + BS 5019 1 66.21 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGT:2 + chr3R 17421316 3' + pogo 2053 1 56.85 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATG:1 - chr3R 29680188 3' - 412 48 2 56.16 AGTAAACAGCGACTACACGCATACTCATTATTTTCGCCACGACATATATATATATGTATAAACTTAGTTCTATAGTCGTACCCTAAATATAACTCGCCAGGCAATTTGTATATAGTAATGATAGCCGAAATTGATAAGCAACGCA:1 + chr3L 3861553 3' - micropia 23 2 66.21 CACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACC:1 - chr3L 20061353 3' + roo 342 2 69.70 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCCAACTTTATTTGTTGTTGTAATTCTGGATGTCATTGTCGGTGTGCATCAAGTTTGTTAGTTTTTTTTT:1 - chr2L 3892966 3' + 1360 3347 1 54.68 GGGGGAGGTGTAGTATGTGCATATATCGAGGGTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT:1 + chrX 12649915 3' + blood 7004 1 61.64 AAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTAAGAGAACTGACTCT:1 + chr2L 544964 3' - Doc 22 1 63.70 CCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACC:1 - chr3R 12613764 3' - HMS-Beagle 56 2 61.43 ATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATGGGCAACTTTAACGGAGATGAGAGAGGCAACAACAGTG:1 + chr2L 6637501 3' + 1731 4591 1 58.90 AGAAGGGACATGTAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGT:2 + chr2R 4261965 3' + invader4 220 2 58.22 ATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACG:1 - chr2R 21795254 3' + transib2 2752 1 69.18 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTG:1 - chr2R 5953808 3' - roo 8734 2 64.38 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAGTTACCAACTGCTCAACTATT:1 + chr2L 10909611 3' + 412 7500 2 52.74 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTC:1 - chr3L 14422704 3' - roo 8717 2 55.86 TAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGG:1 + chr2R 5621015 3' - ZAM 7982 2 52.22 GCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGT:1 + chrX 22835273 3' + mdg3 192 2 52.05 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAAC:1 - chr3R 29627850 3' + roo 9008 2 62.07 GGAACTCGACTTTAGCATTCTCTTTTGTTTAATCTTTGGTTTGTAAAATAAGTTCTAAGCTTTCTTAGTTTAAGTTATTTTCACTGATTGATGTAGGATTTATTAAGATCATTCGATAATATAGTTTTTCTTAACTCATTCAGT:1 + chrX 22672494 3' + INE-1 573 1 49.31 CTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTAT:1 - chr2L 20761854 3' - Doc 411 1 64.52 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAA:1 - chr3R 7074823 3' - P-element 84 1 32.41 TCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCTTTTAAGATTTTATTATAGCTGAAATGATTTTGTTATTACTTTGTAAAGTAGCTATACCC:1 - chr3R 13423222 3' + 297 6966 2 78.77 TTAAGCGATCTTGCATCGCATAGAGCGACTCTTTCGCTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCAAGCAATCGCAAGACATATTATCCAAACTTGAAAATACAGATCATGTTGAAGACTCTTGTTGTTTGGACACA:1 - chr3R 460077 3' - F-element 135 1 51.05 AACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGAATTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCGCCGA:1 - chr3L 25232766 3' + accord2 165 2 54.55 TCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGTATGAATGACATCTT:1 - chr2R 19574396 3' - I-element 5116 1 66.67 TAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTGGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATTGCTCGGTT:1 - chr2L 4864382 3' - mdg3 5285 2 50.47 AACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCAC:1 - chr3L 2532449 3' - blood 39 2 60.71 CCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAGTCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATACTTAATTAAGTCGAAAACTCTTATTCCACCAGCTGAG:1 - chr3R 5164944 3' + invader4 242 2 73.97 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGNAGCTCGATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACNCAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTA:1 + chr3L 8824511 3' + transib2 2753 1 71.32 CACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCT:1 - chr2L 23310620 3' - 1360 46 1 53.73 ATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAACCGAATTCAAATTTCACCCTCAGCAGCAGGAA:1 + chr2L 2241294 3' - roo 8750 2 78.08 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCGCAACCAGATTTCACCCAGGACCGCAAAATA:1 - chr3R 26854718 3' - jockey 35 1 62.86 TCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGTGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCACAGAACAGCTCATGGCGAACGCATTAATCTATCAGAGCCACGCTC:1 + chr3L 11536038 3' + roo 9058 1 74.66 GAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTATTTTCGCACCGCCCGAGAC:1 - 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chr3R 12613731 3' - HMS-Beagle 29 2 65.75 GTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGCAAGTTCTTTAG:1 + chr3R 3905857 3' - GATE 8272 2 57.72 CTAGCTGAGTAACGGGTATTTGGTAGTCGAGGATATCGACNATATCATTCTCTATCTTTTATTAACTCGGCAGAAGTTGTTTTGGCTCGGATTATTGGATGNTGATTTGTTTCTAGTCTCTTAG:1 + chr4 625115 3' + INE-1 543 1 66.13 AAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGA:1 + chr3L 10033659 3' - blood 7108 2 42.37 AAAATCAGTTGTACAGATTTTGTTTGAACACAAGTCGGTAAAAGTCGGGAAAGCTGCTAGAGAGAACAGAATAGAACAGAGCTTGTGGTAGCTGAAAATGAAAGCACACAAAATGGCACGCAACTAGGACCACTAAGTGAATAGA:1 - chr3L 5029107 3' + flea 410 1 49.66 TTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTCAGTTCAATTGTTGTTTCTATTAAA:1 - chr3L 15393649 3' - pogo 24 1 64.83 CCGCTTGCGCAGCGCGCAGGGCGAGGGGCAAAAACAACACAGCTTAAGTAGATTTGGATTTACAAGTTAGTTTCTCCTAATGATGTATTACCCTTAAATTTGTAACTCAACTAAGGACATCCAGTAATCGATTAATTTAAAGGCGC:1 - chr2R 19109226 3' - jockey 222 1 71.92 CCACGGGATTGTAACTCACGCATTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACT:1 + chr3L 25232865 3' - accord2 7431 1 74.70 TGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATG:1 - chr2R 20972676 3' - jockey 4749 1 69.66 CGTGTGTCCGCATGAACGTCGATATCCCCTATAAAAGCAATAGATTAGGAGTGCAGCTTCTAGTGACGCCGACGTTGTGAGAGTTTCTTCTCATTTTATTATTTTTCGTAATATTGTTTATTTTATCCAAAGCCTACACATCTCAA:1 - chr2L 20840106 3' + INE-1 128 1 77.40 TCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCT:1 + chrX 15286942 3' - X-element 4411 1 67.96 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCCGCATCTCTT:1 + chr3R 7074893 3' + P-element 2853 1 52.17 ACATGCCGACTCGGCATGTGGCTGGCTAGCTGGCATCCAGTGTTTTGTGGATTTGTGTAAATTTCTGGCTGAGGGCCAAGGGCGGAACACGCGTAATTCCAATCACGTGC:1 - chr3L 11361725 3' - Tirant 166 2 77.27 CACCCCACCAACGATGCGACTCAAAAACATCCCATCCTTATGATGACCGCTCGAGGCACAACGTCATCTAATTGGCAGAGCAGCCAGC:1 - chr3R 13869027 3' + HMS-Beagle 6717 1 71.59 TATAACAAAATCCTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTT:1 + chr3L 6015643 3' - roo 87 2 81.43 ACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATATAACTCGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACGGAAAGTGAAAAAGGCATGCAGATCATTAAATTGTNGTTGTAAATTGATG:1 - chr3R 20841323 3' - Juan 14 1 67.81 AATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAGAACAACAGCAAAAAATGAGCGATGACAATGAGGTA:1 + chr3L 13057498 3' - 412 13 2 76.55 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGCGAAAGGCGAAAACAAAAATCAAATAAATGGCAATTTAATACACTCAACA:1 - chr3R 7625309 3' + hopper2 1564 1 56.20 TTAAATGCGCTGCATTATATAATTAGATGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGT:1 - chr2R 982349 3' + rooA 243 2 42.14 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCG:1 - chr2L 18525601 3' - pogo 58 1 59.31 TGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTC:1 - chr3R 19506712 3' - mdg3 5299 2 52.45 ACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCGCGCGATCTCGCTCCGAAATAATATACATAAACAAATTAGCAATAAGTGATATTTTCACATAATCAGTACTTTCCGAAGAAATAAGAATT:1 + chr3L 25483011 3' + accord 7350 2 58.90 GTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTATAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGGCACGCTTTTGAGAGGTTTCTCCTGCTCTCTCTCGTTCTT:1 + chrX 1769768 3' + hopper2 1528 1 71.92 CACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTGCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGTAACGTCTGCG:1 + chr3R 11284985 3' - blood 7083 2 67.81 ATCCGATTTAAGCGAAATAAATTTGTATGTATGAATAGATCAGTCATTTGTGTTGATTTCGTGTTGCAGCTGCAGGCATCATTTGCGCTTTGAGGCAGGACAAGAAAATTGTAATAGAATGTGATAAACTAACCTGTTGCCAGTCC:1 + chr2L 18105420 3' - Tc3 1653 1 67.81 CAATGTTTTAGCATTATTTGGTATTTGGTATGGCCACCCTTTTTTTTTATTACTTCAAACATACGGTTTGGTAAGGAATCATAATATTTTTTAATTTCCTCACCAAAAATATTTGCAGTGTAACAGCATATAATGTCTGTTGGG:1 + chrX 21741710 3' - Tc3 1440 1 66.67 ACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCAATCGCAACAGAGAAACTTAAAAATGCACAAACTTCTGAAA:1 + chr2R 6493415 3' + copia 240 1 72.86 CTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTG:1 - chr3R 8563565 3' - 297 27 2 69.23 GAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAAC:1 + chr2L 4244980 3' + 412 432 2 60.27 AGGTGAGATAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGGTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGTATG:1 + chrX 14360809 3' - jockey 102 1 80.14 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCC:1 - chr3L 19274793 3' - transib2 39 1 54.17 TAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAATAAATATCTTAAAGTGTCATCACTTATGTCATCATATTCAAAATTCATAAAGTTCTC:1 + chr3R 29758617 3' + I-element 5283 1 64.83 GACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAGGAGTGTTTAGTGTTTAGACATAATAAT:1 + chr2R 4029433 3' + 297 6952 2 69.86 CCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACC:1 + chr3R 10144471 3' - Chimpo 53 1 52.82 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTGGACTTG:1 - chr2R 18886914 3' + roo 396 1 76.71 AACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATATGTAGTATATAGTTGCCCAGTGCATTTGCACATTTAATTGTTCAGATATAG:1 + chr2R 16567365 3' + opus 7435 2 69.86 TTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGTTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACAAGAAGCGAAAAAGGGTTTGCCTGCCTGAACATTCTTTGATC:1 - chr2R 11777928 3' - hopper 15 1 73.97 TGTTTACGTATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGT:1 - chr3R 27547623 3' - 17.6 47 1 55.63 ATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTT:1 - chr2R 3338784 3' - Juan 60 1 57.53 CTTCTCATTTGGGATTTTACGTTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGATGTGCTGATGGCGGACAATGGAGCAGCTGTGGCA:1 + chr3L 11535993 3' + roo 409 1 75.86 ATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTAT:1 - chr2R 9376637 3' + hopper2 1552 1 57.66 CATACCGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTAC:1 - chr3R 15727853 3' - 1731 84 1 71.23 TGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGT:1 - chr3L 11364784 3' + Tirant 345 2 55.48 GGACAACAACAAGAAGAAATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAA:1 + chr3L 11684919 3' + Bari1 1644 1 58.90 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTAGTGTGATTAGACAAGTAATTAATCGAAATTAAGCACTTAATGTACTT:1 - chr2L 16884758 3' - pogo 14 1 67.83 CATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTAAACTGCTTTAGTTATGGAGAACGGCTTTAATGACTGATATATAATTATATTTATGATTTATCTTCATTTTAGACCTCATTGGCTTCATTAAAAGTCGTATGAGTATTGGGTATGGTCA:1 + chr3L 9397774 3' + 1360 3386 2 79.45 GTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGGAAAGCGTAGGAAAAGCGAAAGCGCACAGAA:1 + chr3R 15668268 3' + G6 1998 2 65.75 TATTTTTCATTATCATTAATTAACTAATTGTGCGCATTCATTTAAGAAAAAAGAAAAACGATTAAGTCAGGCGAAAAATCTCTTGTGCCAACAGCTAAATTCTAGCTAAATTACAGTTTAAGTTATTTAATCAAAACGGTATGCCA:1 + chrX 12857976 3' + Transib5 2580 1 48.63 GTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAATATGCACAT:1 + chr2R 12827058 3' - Burdock 6209 2 70.34 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACTACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAAATACACTA:1 + chr3R 26242598 3' + roo 393 1 68.49 TTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGATTGTGTTTTAAAACCCCCAGCTCCAAAGTGCGGAGGCCGCCCTAAAA:1 + chr3R 7462981 3' - I-element 412 1 51.37 GCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGA:1 + chr3R 31198647 3' - Transpac 64 2 63.64 AATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCGTGAACGTGATTAA:1 - chr2R 15392504 3' + mdg1 7415 2 53.79 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACATCAACTGGGACTGCGGTCCCCTCGAGCCTCTCGAAACTTGATTTCAGCGTTGTTTATGAATTTGTTGGCC:1 - chrX 8839272 3' + Tabor 7297 2 59.68 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTGGGGTGCTCATCACT:1 - chr3R 24072007 3' - jockey 35 1 66.41 AGATGAATACTCTAATGACAAATATTCTTATATAAAGTCATTTTTGAAATTTATTTTTGTGATAATATGTATATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTTTGTAAGCTCTTACGCGCCGGCTACCAAGAGCACCTCAAATCACC:1 - chrX 7490924 3' - 1360 406 1 68.97 GCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTAGG:1 + chr2L 20628677 3' + Stalker2 7619 2 56.80 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTT:1 + chr3R 10737090 3' - F-element 42 1 60.69 AATAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAAATGAAAAAAAAAAGGCGCCAGTCCACAGACTCG:1 + chr2R 11558074 3' - 412 7104 2 48.63 CTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAAGTTGACTTAACCCCGAATGGGTTAATTAGACGACCG:1 - chr2L 17237067 3' - X-element 75 1 64.38 AAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTCCCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACATATCTTTAAAGGTTTTAAAGCATATCTATATGTTTTTCAAAAGGTGTGCTGTATCAATCTAATATCTCGCGATCAT:1 + chr3L 20224248 3' - Chimpo 44 1 53.57 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACATG:1 - chr3R 17243075 3' - hopper 19 1 71.43 TTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTG:1 - chrX 20361975 3' + hopper2 1529 1 73.43 ATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTGCATTCGTTTCTGTGCAAAACAGCACGCATTCTAAACTTTGGACTCTAAATTGCAGAGTCGGCAATTGGA:1 + chr3L 27190418 3' + copia 238 1 50.68 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATTTCCATGCTCCGCTTTTAATAAATTGTGCTCTAACCCAGCATTTCTCTTTCCGCGATCCAAATTTCCTT:1 + chr3R 18294967 3' + copia 247 1 75.34 AAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCTTCTGGTTTTTGCTGGTTTAGTTGTCTTT:1 + chr2R 14532105 3' + invader4 3072 2 74.45 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGG:1 + chr2R 10977199 3' + roo 360 2 54.03 GGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATCTTCCAAAGATGTTGTCTATG:1 - chr3R 7049381 3' - Burdock 36 2 69.47 GATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGA:1 - chr2R 8966156 3' - BS 5066 1 64.38 CTAAAATTATTAAACAATTTTGCTTTAAGTAAACAATGAGTTACAAACAAATATATTGAAAATATTTCTTGTCCAAATACTTATGCCCACTAGTGTATTATTTATATTAACAAGTTTATTTAAACAAAATGTATTATAAT:1 - chr3R 556454 3' + Tc1-2 1550 1 70.00 GCCGAATAGTTCCTCTCCGCTGCGTTCAGTGTTCTACTGGAGTAATAGATTACTCGCTCGCATCGCTCGGAATGCTGCGTAAGGATTGCACCCAGCCCATGGTCGCTGGCATCCGTCTGCAACACAAACGTCTTCGTG:1 + chr3L 23678157 3' - Osvaldo 32 1 86.96 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATA:1 + chr3R 31112272 3' + mdg1 355 2 64.38 TTATTTGTGTTTGCAACAAAGTGTCACAATGTATGTACGTTACTTATATATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAGAAGATATCTCTATTTTAAATTAATATTTATATATTTTTCTATTCTTTATTGTT:1 + chr3L 14286934 3' - Stalker2 68 2 63.01 TTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCAAAT:1 + chr3R 6584849 3' - transib2 86 1 77.24 GACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTCCGTCATCTTCTTGATCCTGGTGGTATCA:1 - chr3R 19506684 3' - mdg3 5274 2 70.55 ATATATGTATATTTATATATATATATATAGGAAGAAAACCAGTTACGTAGGTTTCCACGTAGATAAGACATTAAAAAGTGGCAGCCACCGCAGAAGGAACTTAACAAACAAGAGCCGAGATAAGTAGGGAAAATGAGAACACCGA:1 + chr2L 14902937 3' - Stalker 6936 4 62.07 GAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGG:1 + chr3R 25580838 3' + 1360 3316 1 74.81 CAAGGGCACAGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGG:1 - chr3L 25497423 3' + gypsy8 125 4 76.00 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTATCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAGGGAATAAAAAATCGTGAAAAATA:1 + chr3R 19514345 3' - blood 48 2 52.74 CAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTTTCTTAG:1 - chr2R 6700026 3' + roo 9031 1 56.55 GATATGACAACCAACATGCTGTGGTTCTCCAAATAATAGTCAAGATAGTTAAGAGGGTTCGAGTTTACGGAGGAGGTCAAGTGAGTGTTGGTTTTTGTTGTTTTTCCACTTCCTACGTGGGCGTACGAGCCTATGGAAACTTTCGT:1 - chr3R 13837737 3' - opus 7439 2 54.11 GGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGGGGTACTTAGCTAGTACAACCATTATCGAACCTCTTTTATTATCC:1 - chr2R 24427537 3' + 1360 3315 1 68.49 GTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACTGACCGCCGACCAATCAGAGA:1 + chrX 19887027 3' + P-element 2868 1 61.22 CCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAATATTTCGCCTGCTGCCGTGTGCC:1 + chr3R 28618474 3' - 412 39 2 50.68 AAGAAAGAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAA:1 - chr3R 23644884 3' - diver 5968 2 69.66 TTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAA:1 + chr2R 20972723 3' + jockey 4942 1 58.52 TATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCATATATGCACCTATATGGCGTTGCGTTAATTGAAATGCTTTTCGCTTTTCAATTCCA:1 - chr3L 8249377 3' - mdg1 7102 2 60.96 GTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGGCTCTCACCTGCCGCGGACACTTCAGCAACCGAAATCAGTTACGATTTGCCCGCGAAAGCATTAACAACGTTTCAACGGATCTTCAGCGTGCGAGATAATAT:1 + chr2R 17394640 3' + jockey 4983 1 76.74 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTGTGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACC:1 - chr2R 24427534 3' - 1360 50 1 58.40 TATATTATTGATCAGTATCAATAGCCGAGTCAATATGAACATGTTCGTCTGTTCGTCCGTCTATCCATATGAACGCCGCGATCTCAGGAACTAATAAAGCATAAAATAATAATAATGGGTGTAAT:1 + chr4 699080 3' + INE-1 83 1 78.40 TAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCAGAATGTATGAATAGCATGAAAGTACAAAAGGCAAGTTTAGTTATAGTCCTCG:1 + chr3R 20905054 3' - roo 8732 2 66.90 TATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTATATACTGTATTTACTTACACTTGTATTGAATATCCCTGCAAATTCCTTTGTGAACTTACACAGCTTTTCTTTCTGTGCACATATTTATTAGCTTTTA:1 - chrX 15563083 3' + Quasimodo 7358 2 62.14 GATATCTTCCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATAATAACATCTATCATAGAAATACAATATTTATGGACCAGTATATAGTATAAATAATGCTTTAAAAATAATAACATAGATATACTGCAGCT:1 + chr4 880428 3' - pogo 30 1 65.75 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGGTAAATATTTGCAGCTGCAGCAGCTCAG:1 - chr3R 22320444 3' + roo 9047 1 62.50 AAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTAAAAAGCCGCAGCAATA:1 + chr3R 17243270 3' - hopper 4 2 79.31 GTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCTATGACT:1 - chr3R 12046696 3' - Doc 13 1 71.72 GAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCT:1 + chr3R 29288754 3' - BS 5063 1 71.20 CATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGGGCACGGAACTGCGAGGAAAATATTTT:1 - chr3L 7389688 3' - roo 49 2 52.74 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAGGCTGCTTTATCAATGAT:1 - chr2L 21683372 3' + pogo 2053 1 52.74 GCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCACCACATTCCACCCGAACCCTACTCACCTTGCTCT:1 - chr2R 6236052 3' + P-element 2847 1 51.59 ATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTTATGTATGAATG:1 - chr2R 19574403 3' - I-element 5134 1 56.85 TTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATACAATTTGCTACATTGAGCATTTAGAATCCATATTTTTAAGATTTAAGTAGGC:1 - chr2L 10536473 3' - flea 4817 1 63.01 TGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGCACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACCATAAGCAGTAAGCAT:1 + chr3R 10144486 3' - Chimpo 13 1 67.52 TCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAACA:1 - chr2R 9607325 3' + P-element 2803 1 23.70 AAATTTAAAAATATATTATGAATTCTGAAAAATTATGAAAAAAAAATTATGAATTCTAGAAGTATCCTAAAAAAATCTATTAGGTGAGGCTTTTGAAATCCTTCAAAATCAGTGGCTGCATCCTTATTTAGACAGTCTCTTTCTCG:1 + chr3R 25637367 3' - hopper 169 1 78.77 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCTACCTTG:1 - chr2R 12462101 3' + roo 9042 1 63.57 TGTGCATATGTGTGTGTGTGTGGCAGTTGAGGCCAAGTTAACGCAGCTGCATTTAAAGTTTGTTTGCCAAAAGTCAGGCAAGAGCGGAGCCGAAAAAGGGTTTTTATTTCTGTTATAAATGAAGTTGAATACTTTTGGATGGCCA:1 + chr3L 13625185 3' - accord 7034 2 47.59 CAATAGCTGAGTAACGAGTATCTGATAGTCGGGAAAATCGATTAAGGCATTCTCTCTGGTTTTCGTTACCATTAAATACATCCAAAGTATACGTTAGATGTGTGCTTACTGTAACTGTTGTTGGCGATCTACGCGTTCTTTCT:1 + chr3R 4357489 3' + INE-1 541 1 60.14 TCTAGTGTCTTTGCTTTGTTCATATCTTGAGGCACGAAGTGCGGACACAAGCACTCCACAATCATTGCCTTATTAATTTTTAGGATTATGAATATAGTTTTTCAATGTATGGTAGATAAAGTAGTTTCAGATCTTAAAAGCTTAGC:1 - chr2L 7024543 3' - 1360 498 1 54.11 TATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGG:2 - chr3L 2532437 3' - blood 49 2 58.21 TTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTTCTCGGCACCGATCAAG:1 + chr2R 14009092 3' - 412 7085 2 56.73 TAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTCACCTTTCTTTGCTGCAAGTTT:1 + chr2R 22796893 3' - jockey 4802 1 67.81 CACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTCAT:1 + chr2L 12236846 3' - jockey 59 1 52.05 CTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAGACCGTGCTTACACAAATGTCGGCATCAGGAAATTTGGGCATTCTCGATATTATTACCCCAGTTTGCTGTCATAATAAGCT:1 - chr3R 10714120 3' + 297 360 2 55.48 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTTACCTATGAAATTCGGAACTCCA:1 - chr2R 17269059 3' + roo 400 1 76.98 TAACTCTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTT:1 - chr3R 20887405 3' - Doc 73 1 61.64 CAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTATTATTGATATATTTATTACTTTGAAGTCAACAAACATCTAGTAAACTACTAAGATCCGTTTCCACATCCACCAGAAA:1 + chr3R 29680319 3' + 412 452 2 54.55 AGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAAT:1 + chr3R 23636420 3' - X-element 4297 1 66.67 AGGGGACGGATGTTTAGTCTACCAGTGGGTGACTTATCTAGAATTGGGGTTTTTTCCATTCTCGAGGATCATATAACAATCTTATTCTTATCAGGACAAGTACGTGGCATGGATACAATCTCCCACCTATGCCTTTTAATTGTTC:1 - chr3L 27552518 3' - Idefix 184 1 63.45 CAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAACGAATGCGCCGGCGAGCAAGA:1 + chrX 15286987 3' - X-element 4409 1 50.68 AGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAAGGTTCCGTCAAAAACAGCCTTACATACACTTGAGCTTTTGAAACGCATCATAACATTTATATTATGGAATTTTATACAAACACAAAATGAATTAGTGATT:1 - chr3R 30568933 3' - mdg3 5258 1 71.54 TAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTC:1 - chr2R 9376651 3' + hopper2 1531 1 69.44 TCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCTTAAACTCATTAATCATATTATTCAGTTTTGTTTACTTTGCCTTCTTGCTGAATT:1 + chrX 8590794 3' - pogo 63 1 65.07 TTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGATGTATATAAATATGTACACATATATAAACTTTATTT:1 - chr3L 6131797 3' + roo 9045 1 66.67 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGGTGATTACTCGCTTCAACTCTGACATCGCTTCGGATGGCATTTTCCGCACCGATTCAAATGGTAAT:1 + chr2L 10461264 3' - roo 8699 2 61.64 TGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCCTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCTATTCCCTCGAAGCAGAC:1 - chr3R 29288655 3' + BS 5063 1 59.59 CCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTT:1 - chr3L 10740068 3' - P-element 84 1 22.22 GGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGAGACAGGCAGAAAGAATAGAAAGAAATTTGGGACGCTTGGTTTCTCACGCGGCTTTATTAAATTTCT:1 + chr3R 27707168 3' + P-element 2864 1 65.47 GTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGA:1 - chr3R 7049350 3' - Burdock 6192 2 60.96 TTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTTATGAACATTTTC:1 + chr3L 9324556 3' + HMS-Beagle2 254 2 58.90 TTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCATTTTAATTTCAATTTTAACATGAAGTGCACACTTTTTGTATCCCCGTGTGAAAGGTGTTCGAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTATCCTAGTAGCAGCTGTTGTTTGTCCTTTGC:1 + chr3R 10421019 3' - Tabor 4 2 74.66 TTTTATAAAAAAAATGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATGTATATGATATCAAATATGGCATTTTCTTCGCAAAT:1 - chrX 12732982 3' + S-element 1630 2 77.40 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTATTATTTTCTTAATTCATTTTTCTATTCCTTCG:1 - chr3R 23902158 3' - I-element 38 1 57.93 TTATTATTTGATCAACGCACTGTTACCCATGCGGCAACTTAATTTGATCTGCTTAAATTAAAAAAGTACAAATGTGAAAGCACTTCGGTGGTTCATAATATTTTTACTTAACGCATACGATTTTGTGACCTAATTCCTTTGTAACT:1 - chrX 1288885 3' - jockey 4977 1 58.22 ACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAG:1 - chr3L 6557128 3' - Doc 65 1 62.24 TGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAAGCGAAGCCAGAAGCTATGAGCAAAG:1 + chr4 317830 3' - Tirant 8133 2 64.71 TAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGACATATGCAAGAGGAGCA:1 + chrX 7702841 3' - P-element 40 1 54.35 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAACCAGGAACCTCTGTGAGTGGTGTCACTACTAT:1 + chrX 18673723 3' + roo 8987 2 76.26 GTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTT:1 - chrX 23102387 3' + Transpac 5178 2 64.17 ACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAGTATCTTTATTTATAGCACCATGTTCTGATTGTACGGCACCTGTGGCTCTCTTAATTTGTTGCAATAAAAGAGAATTTAGCTCTGCTCCTCTGACTTTT:1 + chr3R 16475470 3' + mdg3 5474 2 69.86 AAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACA:1 + chr3R 4962876 3' - jockey 93 1 73.29 GAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAATGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTAT:1 + chr2L 2544826 3' + blood 7314 2 68.49 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAATCAG:1 + chr2R 17350615 3' - F-element 60 1 54.11 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACC:1 - chr3R 12613764 3' - HMS-Beagle 6826 2 55.26 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAACG:1 + chr2L 2544819 3' + blood 7328 1 68.80 TCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTCATGTCAAAAGTATTAAAGCTG:1 + chrX 22835299 3' + mdg3 220 2 68.28 AGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCTTTTAAGATTTTATTATAGCTGAAATGATTTTGTTATTACTTTGTAAAGTAGCTATA:1 - chr3R 13423225 3' + 297 6963 2 76.71 ATACAACGACAGACTAGAATCGCATCCTAATAGTCCAGCTAGACGACTAAGTATCGCATACCAAAGCAATCGGACAAGTACTCGAGAATATAATAAAAGAAAGTTCATTGAATCCCATAATATTTTGCCATGTGAACAATTTGGTT:1 - chrX 22928035 3' + jockey2 3083 1 52.74 TTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAAT:1 + chr2R 9871068 3' - roo 8710 2 58.59 ATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAACAGCCGGCAAACACGAATATCTTCAGCTG:1 - chr2R 9607298 3' + P-element 2820 1 39.31 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTTGCCACCAG:1 - chr3R 30087693 3' + roo 9027 1 53.03 AAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACTTCACCCATGAGCTGCCGCACAACCATTATCGAACTTCTTTTATTATCCACCGTACCGTTAGTAACGTGAATA:1 - chr2R 24427513 3' - 1360 39 1 55.56 TTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAATTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAA:1 - chr3L 15393690 3' - pogo 66 1 63.70 GAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGC:1 + chr3R 11284955 3' - blood 61 2 82.86 CACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACAATAACAATAGGGCAACAACTGAAAAC:1 - chr2L 13033294 3' - hobo 37 1 51.39 TCACCTCCCCCCACTTACTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATGTTCATTAATGCATAAGTGCCCTGTGACGAAATCGAAGCTACAGATCAAAAGTT:1 - chr3L 11684824 3' - Bari1 66 1 62.94 AAACCAAGTCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAATGGAACGAACCTCTTCAAATATGGTATACTTTCTATAAACAACTTTCTTTGTTCGCTTTTATTGCAAACCA:1 + chr3R 12948735 3' + Stalker4 7338 2 69.18 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTTACCTAT:1 - chr2R 17269075 3' + roo 9040 1 63.70 TATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAAGAAGGATATCGCACTTATAATGTGGGTATAATGACATCGTTTGTAGTTCGCCAGTCTAATTTTAACATCATG:1 - chr3L 5027161 3' + roo 361 2 51.72 CCTAACTATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACG:1 + chr3L 20061420 3' - roo 8740 2 69.86 ACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGTAAAAGCGTGTGTGTGTGTATTTATGGGTGTGTGTGTGTCTACAAGCCTGTAAGCATATTTCAGGTATTTTTATTCCGTCATTACTTTTTATGCACTCACG:1 - chr2L 6149070 3' + hopper 1397 1 60.96 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCA:1 + chr2L 11617828 3' - 412 7081 2 65.75 GTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGGGGACGGATGGAT:1 + chr3R 11285027 3' - blood 6 2 77.87 TATAGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGA:1 + chr3R 15727965 3' + 1731 4601 1 61.64 TTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACATCTTCTTCAGCCGGATGAAGCTGCAATTAAATCGCATCAAATAGCTCGGTTCAGACAAA:1 - chr2L 4864374 3' - mdg3 59 2 58.16 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTG:1 + chrX 20330605 3' + P-element 2877 2 60.71 TCTCGACGTTCATACGGACAGATGTCAGTCCCGCTGTCGTTCCCGCTAGTTTCGATTTCACGTGATGTTTGAGGACCTGTTTTCGTTTC:1 + chr3R 3586574 3' - INE-1 130 1 76.40 GAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTAAGTCAAATATATTTCATGCTTCACCCAAAACTTTATACGATTAAGACTGTGAGTTGACTAAAATAGTTTCCACGCAGGACATTCCTTTG:1 + chr2L 20029508 3' - I-element 38 1 60.27 TAAGTATGGCTGCAAGATCCCGCAGGCAGCACTTCCGTGCAGCTTGAACCAAAAGCCGTTCGTTGTGAATGTAAATTTGCTCCTTGCTCTCAATTTGGTTCGCCTTCTT:1 + chr3R 12079369 3' + hopper 446 1 60.55 AAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAACACTTCTTATCGCGGACATGCCGCTAACAAATGCTGCCACGACCTGATAACTTTCAGACAAACCC:1 + chr2R 13541618 3' + jockey 4945 1 54.86 TTTTGGCAAAACTTAATTTTCAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTG:1 + chrX 3533955 3' + 17.6 7340 2 79.14 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATTGATCACGCATACGCCCTGTAGAACCAAACATGTGCATTGAATTAAAGGCATTAAATGCATATTAAATATTAAAAATATCGAAATAACGCTTGAAGAGAT:1 + chr3R 13423420 3' - 297 6592 2 75.00 ACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATG:1 + chr2R 18887043 3' - roo 83 2 77.40 AAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATCACAATTAAATTAATATATCTGTTTTAACTTTTTTTATGGCTTAAACGATTATTTAAATAAACAACGCTCTTATAAATAGTAATATT:1 - chr3R 12764679 3' + copia 220 1 60.96 CCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAATAAAAAATATTATCAAATAATGAATAATAACGAACGTAGATTGTTTAGGGGAATATTGTATATATAGTATATG:1 + chr2R 13090965 3' + I-element 5300 1 53.10 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCATGCTTTTGGGGGAGGAACAAAATTAAATCTCCCTGGTATTGGTGC:1 - chr3R 14608649 3' - jockey 22 1 76.55 CGACGCTTGTCCTCAAGCGGTCATCAAAAAAACGGGATGTTGTTGAAACGCATTGTTGGTGGGGTGGGGGGGGGCAGCTTGTGAACGGAGATCCATTG:1 + chr3L 9324866 3' - HMS-Beagle2 6848 1 67.35 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAA:1 - chrX 291974 3' - 412 45 2 54.48 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGC:1 + chr3L 7389805 3' + roo 351 2 56.16 GGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTNTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGGCAATTCCTTGGAGTGCATCTTAGTGCTCACATTTCGGAACTTCTAGATGTTCTCGAATTTTCACTTGGCAAT:1 + chrX 666422 3' + 412 7534 2 76.03 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTATTCTTT:1 - chr3L 18216455 3' - 297 41 2 56.85 GTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGTTATTCAGATTTATTCTTCAAAAAAGAACTAGAACAAACTTTTGTGGTCTTTTATGTCATTCTGTTTATATGTAATT:1 + chr2L 4864509 3' + mdg3 5484 2 75.00 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATT:1 - chr2R 9376640 3' + hopper 1390 1 56.31 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCCCTCCCCGCCATCCCTACACATACCCCTTTCCGCCGCCCTGACCACCCGC:1 + chr3R 21923852 3' - hobo 57 1 58.39 TACATTTCTATCGATTTTCTAAATAAGTTTACTCCGCCCAAAAAAAAGTATAAATTTTGTTATATATTAATTGTTGAGCCCCAAATTATGTGAGACTGAGTTCTTTTTTTTTTGTGATGTGTTTACTGATCCTTG:1 - chr2R 4745678 3' + INE-1 307 1 60.00 CGGTGAGACGTAGGAGAAGTACGCGTTGTTATATGTTTCTTTTTTTTTTCCTTTTGCGATTCATCGCATCCCTCATGTAGAGGTCACCCCAACC:1 + chr3L 8540901 3' - F-element 269 1 72.34 CAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTCTCGAGATAG:1 - chr2L 18525595 3' - pogo 53 1 55.48 ATTACCTTCTAATAAGAAAACTTGATCTTATGGGTTTCCCTGTTGGTCTTCTAAATTGGATTTCAAGCTATCTGAATGACAGGACACAACAAGTTCTCTTTGTAGAGGTAATAAATCAAAAGTTTTTCAAAAGTCTATTC:1 + chr3L 25264298 3' + Q-element 347 2 72.14 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTGGG:1 - chrX 22679601 3' - Doc 46 1 57.53 TGAGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTTT:1 - chr2R 19574414 3' - I-element 5145 1 52.74 TTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACT:2 - chr3L 20061318 3' + roo 9027 1 53.42 GCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAATCATTTTTACATTGCCAAAGAAGTTTTAAAAT:1 - chr2R 21795212 3' + transib2 2795 1 65.52 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAGCCGCCCGTCAAATGGGCGCCCAAAAG:1 + chr3L 965472 3' + jockey 4927 1 76.52 TTCCTCTCCGCTGCGTTCAGCGATCTACTTGAGTAGGAGATCAGCCGCTCGTATTGATCAGACTGCTGTGTAAGGATTGCATCCGTCTGCAACACGAACGTCTTCGTGAAGTCGGGGCAAGC:1 - chr3R 1433809 3' - Osvaldo 23 1 62.30 AAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTATAGCTGCACTCGTTGGGATATAT:1 + chrX 13091097 3' - P-element 93 1 18.57 TATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAGATACTCAAAGAATACAGGTAAT:1 - chrX 13060143 3' + Tabor 472 2 69.86 GAGGCAGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAAGTGCTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTTG:1 - chr2R 6526152 3' - jockey2 3238 1 69.18 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCG:1 - chr3L 14422703 3' - roo 8714 2 54.55 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTT:1 + chr3L 14422843 3' + roo 360 2 52.05 AGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGG:1 - chr3R 11284922 3' + blood 7326 1 72.73 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTT:1 - chr2R 17269090 3' + roo 361 2 53.42 TGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATAATAATACGT:1 + chr2R 12102059 3' + hopper 1387 1 62.33 AATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACATAAACAAAAAGCAGCGTCAATTGGAAATACCCAACAAAAAAA:1 - chr3R 26242472 3' - roo 79 2 73.29 ATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAATAAAGCTATTTTTTCCAGCTTCCTCATTCCTCCTGATTTCCAAATGGATGTGGAAAAAACCCGCTC:1 + chr2R 20972730 3' + jockey 4938 1 56.85 TCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCTGGTTAAGAGCGATTTACATACAAATCGCTGCCTTTTGCTGTCTCTTTTTTG:1 - chr2R 12101928 3' - hopper 38 1 54.17 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAGAACAACAGCAAAAAATGA:1 + chr3L 13057481 3' - 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roo 76 2 70.34 ACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTAAGAGAACTGACTCTCGAAC:1 + chr2L 544969 3' - Doc 17 1 67.12 TGACTTGCTCGTGTTAACTTATATATATAAGTAAGTTATTNCCTTANGGGTATCGCATTACAGAAGTGCAGTCAACTGAGTGGCGAGGTGTGAACATTTGAAAGCGTTACAAATCTATTAATGATCGCCT:1 - chr2R 10787986 3' - gypsy10 5640 1 80.00 ATATTACCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTG:1 + chr3R 24084899 3' + roo 9024 2 52.05 AAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCGTTG:1 + chr2L 18219435 3' - copia 30 2 64.38 TATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTGTTTTTAATCTTGGACATTTC:1 + chr3L 171575 3' - Doc 4454 1 53.42 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTAACGGTTATTCCGCTCGCAC:1 - 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chr3R 12622151 3' + 1360 3375 1 71.77 TGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACTAGTGATATGCGAATAGAAAAGTAAAA:1 + chr2R 4816980 3' + blood 7344 2 56.25 TTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATAAATATACAGATAGTATAGTAAATGGATACGGGTTCAGTCCGCTTTGTACTCTCAGGTTCAATAACTGCGAC:1 + chr2R 15474588 3' + Quasimodo 7326 2 57.53 AGAGAAACGCAAAGCTTTTTCTCTTCCCGATCAGAATTCTAAAGTCTAAAGTCCATAATAGAAAAGCTCGATACCGAGGCAAAGGTTTTCCATAAATCAGACGTTAGAAGGTAACGAGGAGTAGCTTACAGATTCTGCTCTTTAAT:1 - chr2R 1688187 3' + Idefix 363 2 53.42 GTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAGCGGTACCCAATTCCAGTTCCATTTCCACGATGAGTTTGCCC:1 - chr3R 19134370 3' + transib2 2781 1 56.55 TGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAG:1 + chrX 7702839 3' - P-element 46 1 52.82 TAAAATTCTTCTTTTGATTTTATTTTGGTAAGGCAACTGAAGCACCCAATGTGGCATCCTTCTGAATCCTCCTAAGCCATTGCTTATTAAAACATACCACGACAACCTCGTACTTTAACTGTATTTGCACTCAGAAAAACATTT:1 + chr3R 20530453 3' - 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jockey 21 1 74.64 GAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCTTCTGGTTTTTG:1 + chr2R 14532088 3' + invader4 3068 2 70.16 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATCGGTGACTGTAGGAAGAGCTTTT:1 - chr2R 10417134 3' + 1360 3353 1 53.33 TTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTCT:1 + chr2R 4261978 3' + invader4 254 2 53.60 TTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTG:1 - chr3L 20061317 3' + roo 9028 1 54.11 CAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTAAATATTTCAGACCACTATAACATTTGTGATACAATAACAATTGGAAAATTAAATAAAAACAATAGAA:1 - chr2L 11523035 3' + HMS-Beagle 6993 2 54.11 CCAAAGACACTAGAATAATTATAATTATTCTAGGGTCTTTGCTAAAACTTTGTAAGTAAGGGACATGATTCAATTTTTGGTACAGTGTCGAGGCAAATTCGGAATTTGTTTGGAATGTGTTCAATATAACTACGATTATTGTCCA:1 + chr3L 23024572 3' - 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chr3R 3580889 3' - gypsy9 81 2 65.75 AGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAA:1 + chr3R 15727967 3' + 1731 4604 2 63.45 TTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTT:1 + chr2L 2057865 3' + 412 436 2 75.96 TATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGTTGCGTCAGAAGTTCTGAAAGAGGGAACTTCAGCACAAACTACCAAATTGAATAAGGGAAACTTCGCAGACGACTGAAGAT:1 - chr2R 9341488 3' - roo 3 2 62.41 ATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAGGCCAAGATAGGATGGTTGCACCAACTTTTGGCCCGCAGACGTAGCAGGATTTCCATGAAAAT:1 + chr3L 2966548 3' + roo 9039 1 52.10 GGAGAGGGAGAGCAAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTGGGTTTCTTTTATAGTTCCTAAATAGGTTGAATTAGATATCACTATTATTTGTTTT:1 - chr2L 8284311 3' - Doc 379 1 78.57 TAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATCCTGGGAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAGAAGGACAGGCAG:1 + chr2R 8315593 3' - 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BS 4828 1 61.64 AAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTTCGTCCCAGGGGTTTGTGTTGCCAATC:1 + chr3L 13285701 3' - roo 40 2 57.64 GTTATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATACGCATATTGTCATCGATTATTGAGGATTAGAGAGCAGG:1 + chr3R 10714228 3' - 297 6642 2 74.40 ACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATTTGCTTAAAAAGTCACAGACGGCAAGTGAAAAAGGCATGCAGGTCATTAAATTGTTGTTGTAAATTGATGAG:1 - chr3R 20841321 3' - Juan 11 1 75.86 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGG:1 - chr3R 22320480 3' + roo 360 2 65.22 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACC:1 - chr2L 10461099 3' + roo 386 2 69.86 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGACAGACTCACCCAATCACCCAAGTACCACTAACCCACCCACTCACTTTTGGAGACACCGGAGTAGATGCAATGATCATGATCTTCCGTTGAGCCGTTT:1 + chr3R 20753019 3' - 1360 4 2 74.19 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATCGTTAAATAAATGCTGGCACCAAAAAACTAAGCTAATAGCATATCCAACCTGGTAGTAATTAAAATGCAGTCTCTTA:1 - chr2L 388501 3' - roo 35 2 60.14 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACAAAACCGAAGAAAGGCA:1 - chr2L 14056638 3' + pogo 2071 1 60.27 TTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTC:1 + chr3R 8112820 3' + Burdock 6370 2 63.03 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTGATGATGGCATTGGCAAGGAGGTGATTACTCGCTTCAACTCTGACATCGCTTCG:1 + chr2L 10461231 3' - roo 66 2 63.89 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGATCTCTGT:1 + chr2R 5953946 3' + roo 394 1 73.97 AGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATGGGCAACTTTAACGGAGATGAGAGAGGCAACAACAGTGACCACAAATGTAAA:1 + chr2L 6637515 3' + 1731 299 1 71.43 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATGTGTGTGTTTGTGTACAGGAAGAGATCAGATAGATCAGAAGCAGTGCAAGAAAGAAAAGTGCAAAGCGAAAGTTTTGGTTTTGATTGTGCAGCAT:1 - chr3L 17011908 3' - 1360 26 1 67.81 CGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTTTATGCTGCTGGGGAAAAGTTTCTGC:1 + chr3R 31112306 3' + mdg1 389 2 61.64 CTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGAGGTGTCTGGGTTTGCATTTGAAATTTATAATGCAGCCGTAACTAAAGTCGGG:1 + chr3L 22021787 3' + mdg1 7437 2 70.55 AGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCGGTCG:1 - chr3L 414828 3' + 412 453 2 56.12 GAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTT:1 - chr2L 15874869 3' + mdg1 7377 2 74.66 TCGCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTACGGATCTTCCTATAAATACG:1 + chr2L 14616225 3' + P-element 2785 1 15.07 GCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTACATGCTGGTCCAGAAGTCTGGAAAAGAGTGAGTCACG:1 + chr2L 19801000 3' - flea 25 2 65.75 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAATATAAGAAATGGGTACAACATCAAA:1 + chr2R 5193529 3' + roo 9014 2 60.27 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATCTTTAAAAGGTTAATAAATCGATTTCTGTGAATGGCAACCTGAGTACCGAAACACAATTATTCAGCCAAC:1 - chr3R 12519585 3' - roo 50 2 54.11 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTGTATATTGCATATTTATATAATTGAAACTACAAAAGTAATAAAAAGATGATTG:1 - chr2L 21941132 3' + flea 4950 1 71.23 CTGATAGTCGGGAAAGTGGACTATAGCATTCTTTATTATTTATTATGGGGCAGTGAAACACTCTGGGTGCACATTAGAGGATTGCTAAACCAAAGTTTCGTTGTTTTTGATCGGAAAGAGTTTTCAGAAACATGTAATTTCTGAAT:1 - chr3L 22901526 3' + INE-1 562 1 67.12 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATTAATTAAATGTAACTTATTTGTTTCTTTTGCTGCATTTCTTAAGTTAAAAGTGCCATCATCCATGACATGAAAAGCTAACTAGATCAAACTAACTGGGCATGCTCA:1 + chrX 8876991 3' - mdg1 16 2 74.66 TTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGAAGTTTGCTCTGCATATGCGCAATCCATTCTAGCTATTATAGCATCAAAATTTAGTACTGTATTATGTGACGTAAGCATTACTTCCACGGGGACTA:1 + chr3L 23526498 3' + Tabor 458 2 66.44 AACTTTCCGATTTCTTTCGATTTCGCCAGGCCAAATCGCATCGCATCACCCAACGAAAACAAACGCGAGCCGCACAATTAGTTTCTGGTTCACCAAAGATCGGGCTTTATATTTAGAGCGCTGCGCGGAT:1 + chr3R 9637476 3' - G5 4506 1 75.38 CATTCGGCCTTTGCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTAT:1 + chr2L 6637454 3' + 1731 4545 1 75.86 CGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTAAATATTTCAGACCACTATAACATTTGTGATACAATAACAATTGGACAATTAA:1 - chr2L 11523050 3' + HMS-Beagle 182 2 63.70 TCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTCGTTGTGCCAACCGTTCCGTTCTT:1 + chr2R 21713332 3' + P-element 2832 1 42.45 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAACCAATACGCCAATCTCAATAA:1 + chr2R 12102051 3' - hopper 36 1 55.48 ACGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAA:1 - chr3R 12078611 3' + hopper 1351 1 60.96 TTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTGTCCGCTGTCCATTCCGCTATCTCTCTCACTCAAGGCTAC:1 + chr3L 5051192 3' + flea 242 2 76.06 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCTA:1 + chr3R 24084911 3' + roo 9036 1 60.27 ATCAGAAGATATCGTCCTCCAGGAAAGGTCTTGGCGTTAGTACCTGTTTTCGCCGTGATGCCAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTG:1 + chr3R 10144452 3' - Chimpo 68 1 65.22 GCTGTGTCTGCTTCGCCGTGAGGATGGGGTTGAATGTAACGCTTCCAACGTTAGGAGTATGTCGGGTCTCGCAGCCGCCAGCAGCACCTAAATTGCACAATTACGCATCAGATTTATCTATACAGATAAGCTTCGTGAGCAGCTAA:1 + chr3R 2689474 3' + diver2 4474 1 75.34 AGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGGCTTTGGACAAGCCTGCTTGCATGGGCAAAGCTGCATTTGTTTG:1 + chr2R 2980271 3' - 1360 70 1 69.77 TATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTTAAGTCAAATATATTTCATGCTTCACCCAAAACTTTATACGATTAAGACTGTG:1 + chr2L 20029470 3' - I-element 75 1 63.45 TGAGTTAACCGGACTGATCGTCCGCACTCCAGCATTTTTATGAGGTGGTAGATGCTCTTTATTATGTATGAGCTTCCGGCCAAATGTTTGGTCAGCAATTTGGCCGGAAGCTCATACATAATAAAGAGCACCTACCACCTCATAAA:1 + chrX 21772499 3' + gypsy3 8 4 42.47 ACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGNCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGNAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAGTCATTTTTACATT:1 - chr2R 21795231 3' + transib2 2776 1 52.41 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCGCTACCAATATCCGCTACTTTAACTTCTTCCTCTAGTTT:1 - chr3R 31159211 3' + hobo 2900 1 62.14 TTTCGCGATTCAAAAACAAGCGGTTTGGAAGTTATTAACAATAAATTATTGGAAATTTTGATCTCACTGTTGCCCCTGCTGTTTCCACTGCCGCTAAAATCGCTGCCACCACTGCCACCGCTTCCACCGCTGCCGC:1 - chr3L 19782216 3' + R1A1-element 110 1 52.21 GACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATGCGTGCTCGGGCCCGTGGTAAAGTATATACGATATAATACAAATACATATAGACAGAAGCAGCCGTA:1 - chr3R 17924389 3' - Burdock 6150 2 72.14 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTTATATTGTTAAGCCCTTAAAGACGCTCAACCA:1 + chr2R 6801747 3' - 297 6599 2 71.01 AACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTT:1 - chrX 291996 3' - 412 65 2 62.94 ATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTTGGCGTGCACCCTAATTAAATTCG:1 + chr2L 15085759 3' + opus 7471 2 61.64 ACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGA:1 + chr2L 17019165 3' - 412 7123 2 66.90 GATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATT:1 + chr2R 22796835 3' - jockey 4860 1 71.23 ATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCG:1 + chrX 684879 3' - jockey 4750 1 73.19 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTG:2 + chr2L 17019162 3' - 412 74 2 69.18 AGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACATTGTTTTTAAATCCCCCCTTTATTTCTGCCTCTGTAATTACGCTTTGCACGTAAATCCCATTAAAGGCGGACACGC:1 - chr2L 7633344 3' - Max-element 8274 2 57.55 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATACACAGGGGTAGTCAACTATATAAATAACGACAAAGAAAAAGGGTTGCACAGAGAAAAAATTACGTTTGTTAATTTGTTATTATGCCTAG:1 + chr2L 3893108 3' - 1360 30 1 61.64 GTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTAAAAGGCGGCGTGTCAAGGGCCATGCAGTATGCAAAACATT:1 + chr2R 12133884 3' - jockey 17 1 75.74 TAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGCATATTGGCCATTTTTCAG:1 - chrX 9165349 3' - jockey 4843 1 75.34 AAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTGATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCAAGCGAACGC:1 + chr3L 9318099 3' - P-element 2870 1 59.59 TCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGGTGCTTATCCTTGTCCTTGTCGGTGTGCCTGTAGTTGGGCACGGATTTGTAGGTTATGTGGCAACATTCAATACGTTAGTTTTTATATACAGCCTAGGAGAT:1 + chr2R 5953940 3' + roo 395 1 74.82 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAAGCTTTCATTTCTAAAGTATACCATCGGTTTACCATAAACATCACTCTTATAAGTTTATGT:1 + chr2R 17269205 3' - roo 8725 2 62.33 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGCGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAAATCTTCGCATGTGAACGGAACTGCGAGGAAAATATTTTAACACTCA:1 - chr3L 7389680 3' - roo 34 2 58.27 ATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACAGTGGCAAGTTTAGCTATCTTTCGGACAAATCTGTCTAAATTCAAGGATTATATGTATTTGGCTATTTTTGGATTTTATATTCGCAGTAACTGAAGTGCTGC:1 - chr3R 6419804 3' + Tabor 462 2 67.81 CAAATTTGAACAAATTGTTGTAGCGCTATTCAAAGTTGAAAAATTTTTCAAACAACTACATGTTGACACCACTTGCTAAATGTACAAATTGTTAGTAGTAGACGCACGCAATTATCAGTGCTCCGGAAAGATTTTTTAGACGTTAC:1 - chr3R 20987893 3' + hopper 1001 2 72.60 CGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCAAACAAAGGCAGCTTTATATGACCGAAACCTCCTACTCGAGTGAATTT:1 + chrX 17770501 3' + hobo 2891 1 59.50 AAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTACTATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGC:1 + chr3R 28618444 3' - 412 48 2 58.40 GTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGGTAAATGGATCGGCG:1 - chr3L 27415189 3' + transib2 2788 1 59.59 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTTCCATTTA:1 + chr3R 6685852 3' - 412 7096 2 56.16 AAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCGTTTCAGGGTAGAACTTTCTTTTTGGTCGTTGACACATACTCTAAATGACTCGAAGTTGCGGTGT:1 - chr3L 23181942 3' - 1360 36 1 54.62 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAAGCTTTCCCATGAGATCTAAGGTTTTTTTTTTTA:1 + chr2R 14884202 3' - roo 43 2 54.79 TTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTTGGAGTGAGCCATTAGGGACTGGGTATCTGTGTGTCTGTGTGCAAAGTGAACATTCGATTTTACCG:1 - chr2L 17574512 3' - hopper 52 1 53.42 ACCGCGGTGGGTTCAGGATTTGCACTCCATTACTGTTACATTGTTATTTACTTTAATTAATCTTAATCTTAAATGTCTAATAAACGATTAAAAAAAATACTGTGTGCGCAGTATGCATTTTCCATTGCCCGGCTTAAAATTTAGTG:1 + chr2L 22224553 3' + Rt1c 5350 1 76.71 ATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCTCTCTTCCAGTGTCTAGTTATTTGTGCTATAAATTCGCGTCTATGCAGATA:1 - chr3L 10897447 3' - roo 8733 2 65.07 TTGCAACAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCAATTATAATTAATTGTAGAAGATAATACAAAATATACTTGATATGCAATTAGCACGTCCTAT:1 + chrX 20999592 3' - BS 50 1 58.57 AAAACTTAACAACAAAAACAACAATACCGCTAATCCGGGCTCAAGCCCTTAACCAACAATCATGACAGACCCACCAAACATTTACAAAATCACTTCAAAAACCAAACCCAACTCACTCAACAGCACCTCGGCGATGAGTCTCCTTT:1 - chrX 13730622 3' + I-element 126 1 69.86 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGGTTGCATATTTGGCTCACTGAAAGCGGGGCCAACGGACAGTCAGCGGCGCAGCAATAAACTTCAAAAACTTTGCCGGTCAACGAACCCGCATCTGTAT:1 - chrX 18673616 3' - roo 8688 2 69.18 CAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAATAGCAATTATATTACTAAAAGAAATTGACAGTTAAATTAAAA:1 - chr3R 20200401 3' + Transpac 235 2 70.55 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTGTAATTAAATTCTAATAGATTTAGTTAATTCAAAGTGTTCTGACACAGTAATCTA:1 - chr2L 16884805 3' - pogo 64 1 64.38 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTTGTGCCTCAAATT:1 + chr3R 13869046 3' - HMS-Beagle 6817 2 68.89 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAGAATGCGTTACCTAGACCTATTAAACATTACTGTATTCGAGAACGAGACG:1 - chr2R 16567272 3' - opus 7181 4 64.38 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCGCAAATTTATGCGAATTGCGAATTGCGTGTGG:1 + chr2L 17019176 3' - 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chr2R 2046425 3' + Transpac 292 2 73.10 AACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTA:1 + chr3R 17243254 3' + hopper 1394 1 69.18 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGATGTATATA:1 - chr3L 6131825 3' + roo 351 2 54.79 ATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGC:1 + chr3R 11284988 3' - blood 7054 2 57.50 CATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTTATTTGCAATTATATACCTTCTCTTTGCAATTTGGCCCAAAATGCAGGGTCTTAAAGGGCTTAAAGGACCCACTCCACGCACATGAATCTGT:1 - chr3R 10148706 3' + 17.6 450 2 56.94 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTAAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGTTTATTATTGT:1 - chr3L 9695942 3' - 297 6635 2 72.36 GAGCGCGGCAGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGTATGTATATAGTAAATTGAAGTTCCCGAAATCCCATGATT:1 + chr2L 1045043 3' + mdg3 162 2 75.34 GAATGTACACACGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTAGATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAACACACAGGGACGGATACGTTAGTCCGAATAGTGACACTTA:1 - 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chr2R 14427101 3' - jockey 4787 1 67.12 GCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCCTCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATTAGTTCGTGTTTGACGGT:1 + chr2L 14263022 3' - P-element 82 1 28.47 TGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTAAATGGTTAGCATAATTCAATTACTAAACA:1 - chr3R 12948583 3' - Stalker 42 4 55.86 AAATTTAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATTACCCATGATGAGGTGGGCACTTGCTCCTCCACCCAGCTGGTGATGATCGGGTTACAAGCTGGC:1 - chr3R 11073515 3' + Ivk 5343 1 53.72 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATGTGCTGGGTGAAAGGGGCTG:1 + chr2L 13033465 3' + hobo 2929 1 74.66 TTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTGATGATGTAAAA:1 + chr3R 15727987 3' + 1731 4623 2 76.71 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATAT:1 - chr2L 14056687 3' + pogo 2058 1 65.45 CTGACTTTCTTGAAGTTCAAAATCAGTATGAAGTTTATTGTAGAATATGGTATAAGTTCCACAGTTGGTTGCTGCTATATGCGTTGTTAAAATGTTAATAAGGCTCATCTCTAGCGATTGAGTTGGCAAAAACATG:1 - chr4 313891 3' - Tirant 282 2 78.68 ATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTAT:1 - chr3R 15727843 3' - 1731 74 2 65.75 ATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATA:1 + chr2L 11617820 3' - 412 7082 2 63.31 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTCTCTG:1 - chr2L 310077 3' + P-element 2816 1 33.58 CCATCCCTCCTACAAACCAAGCAAGATATATTTAACAACACCAACCCAAAAAAGCATAAGGAAAAACTTATGGCTCCCCCGGGAGACACTTGAGTGACTACAAAAACAACAGGGAGTGGAAA:1 + chr3R 7457346 3' + I-element 5061 1 65.57 GGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGGGAAACTAC:1 - 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chr3R 6584785 3' + transib2 2778 1 61.67 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACAAATTAATTAAACTAAATACATATAATACACAAAATAAAATAATTTTTGAAATTG:1 - chrX 21668555 3' - I-element 70 1 66.67 GAAAGTTAATTAAGTTAGATTAAGATTTGAACACTTATTGTTAGTCTCTTAACACAAAGGGAAGACTCGAATTATAATAAAAGTCAGTCCGGAATCAAAAGAACATTTTTATTTCATTTTGAACTCGTTTGAACCCGATTCCGATC:1 + chrX 17162641 3' + Doc 4619 1 57.53 TATTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTT:1 + chr2R 13259721 3' + INE-1 85 1 65.22 TTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAAT:1 + chr2R 17350590 3' - F-element 79 1 62.86 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATGAAATTTTAATTAAGTCTGAGCTGCGACTCGCTTTGTGCTGATGCAGCCAAATGAAATGCCAC:1 + chr3L 12991501 3' + mdg1 410 2 78.08 GTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCATTTTAATTTCAATTTTAACATGAAGTGCACACTTTTTGTATCCCCGTGTGAAAGGTGTTCGAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGGTATCCTAGTAGCAGCTGTTGTTTGTCCT:1 + chr3R 10421015 3' - Tabor 6847 2 71.92 TATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAAACTTTAATGTCCGAAAATTTTGGCGTCCGTTTCTATGAAAA:1 - chr2R 5179529 3' + 1360 3373 1 73.29 ACCCAATTTCGTTAGCCCACCTCTTTAAAATAAAAATTTCCAATAAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAAC:1 + chr3L 20187396 3' + FB 449 1 67.81 CTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTTTGGTATATGACTATTGGTTTCCTCACTTTTGAATATTTCTCACTGTGCATAAAGTAGTCGC:1 - chrX 23102326 3' + Transpac 294 2 74.66 ATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGA:1 - chr3R 28014112 3' - roo 48 2 64.96 CAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACTGTCGAGTGAGTTGCAGATACTCAAAG:1 - chrX 13060155 3' + Tabor 460 2 63.01 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGGACAAACCGTTGCAATTGCCATCTAGTTGCTGTGTGCCGATGTGATAAATTTGAAAATGAGCTTCTCCTCGTTGTACAA:2 - chr3L 2907270 3' - 412 7095 2 56.16 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGC:1 - chr3R 17243086 3' - hopper 13 1 72.36 AATTATGCGTAGTTTTTGACTTTACATGCAATACCAACACAATTATGACAGTTGTTCTAGTCCGCATACACCAATACTTATGCACACCGCATTTTTCTGTATGCTTCTCGTTTTTAAATCCAAATTAAAAAAGAGAGTGAACAGAG:1 + chr4 909909 3' - invader1 3867 2 78.08 GAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGATTTGCGTG:2 + chrX 684888 3' - jockey 4748 1 68.28 ATAATCTTAATAATATTAATAATGATCAATGAATCAAACAGTAAGCATTTACATAACATAACACACATACATTTTTTACAGTGCACAAAGCGCAGAATCTGGAGCGGGCGACATTGCGACATATAAATGACAAGGACACTCCCATA:1 + chr2L 3845209 3' + mdg1 7076 2 72.60 AAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTACTCTCCTCGGCTATCCTCGCG:1 + chr2L 21645271 3' - 1360 22 1 68.79 GTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGTCGTTTTCACAGCGTCTCTATTGCATGCCTTCT:1 + chr3R 8563653 3' + 297 357 2 59.86 ATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCACGATTATCGCATACAGACT:1 + chr2R 10119107 3' - Juan 4052 1 67.12 ATGATCAATAGCCGAGTTGATCTAACCATGTCCGTCTGTCCGTATGAACGTCGAGATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAGGTTGAGATTCTTTAGACAAAGACGCATGTTCTAATAATAATAATGACCACTAAGACTCCCTTACT:1 + chr3L 11826440 3' + INE-1 96 1 67.81 AGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTCCCAAATGATAAGCCTAGGAAAGCACATTCTCGAAACCATATGCTTCCAACTCATTGAGCAGAACTTTTCAAACAAAACCGAAGAAAGGCATAAAGTATGCAATTTCAGC:1 - chr2L 14056619 3' + pogo 2091 1 73.79 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTCATATATACAATCAAAAAATTTAAAGAGTTTGCACTCCATTTAATATGCGTCGTAATTTTTTTCAGGTGAAATATGCCCC:1 - chrX 2956165 3' + copia 250 1 58.22 ATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGCCATAGGCACTTGATTTTTATGAACATTTTCGT:1 + chr3L 9324558 3' + HMS-Beagle2 277 2 52.00 TTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAAACAACACTAAACGAACCGGAAACATTATTAATTAGACGTATCAACCAGAT:1 + chr3R 13339100 3' + BS 5026 1 63.01 TCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTATTAATGTGTGATCTTTGAATAATTTCAAAATCTACATCGCTCTCAATATAAATGGTAATGTTTCTATGGATAAAGAGACCAGTAAAATTTTTTTGGCCTTTTCAAGTGT:1 + chr3R 9975402 3' - 1731 13 2 75.34 CAGCAACTAACTAAGAGTAGAGAAAGGAGGACCCCCGATCCAACGGAGGCACCCGTAACTCACGCTATAATCTATAAATAATTAAACACAACCGGCTTTCTCGTC:1 - chr2R 12185335 3' + accord 7345 2 62.86 AATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTG:1 + chr3R 31264502 3' - BS 43 1 66.36 AAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAATAATTATATTTATGTAGAGTTTATTATAGCTTGTTTAATAAGAGTTTATTAAAATTATTAATTATTATTGTATGATATTAAAGAANA:1 + chrX 22564534 3' + 412 476 2 67.44 GTGTGAGGATGAATAGATGACATCAAAATAGGCTTGCATGTCATAATAAAACAATAATTGCCAACTGAATGTAGCGACTGCAATTTTACCGATTTTGTTCACCATAACTGCAGCTTTTTCGTCGATGTCGTAAATTT:1 - chr3R 3617310 3' + micropia 182 2 79.56 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTGTATATCCAGTTGTGGGAATGTACTGCAGACTCGCGACAACGTAGCCTATTTTTGGGCTACCCACAAAAACAACCTCTAAGATCACATTCCTGTC:1 + chr3R 7049489 3' + Burdock 236 2 69.12 TATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCTCGTTGTCTCCGCTTTTTGTCAGCGCA:1 + chr3L 10740097 3' + P-element 2824 1 25.66 ATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCTATGTCTCGACTATTGATCAAGAATATATTTTATATATATTTATGCATATATATATTACATTATATGTTCGGAAACGCTTCTTTCTACCTGTTGCATACTT:1 - chr2L 167986 3' - BS 17 1 67.81 TGAACGTCGAGATCTCAGGAACTATAAAAGCTAGAAGATTGAGATTACTATAAAATCTGGATTTTGAACTTAAATAGACTTTAAGATAATTAAGATGTTGGATAATTGAAATATGTATATTCTTAACCAAATGTT:1 - chr4 179631 3' + INE-1 140 1 65.19 AAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATATCTTAAACTCATTAATCATATTATTCAGTTTTGTTTACTTTGCCTTCTTGCTGAATTTTGTATAGCTG:1 + chrX 8590805 3' - pogo 52 1 57.53 TGGCAGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATATAATGTAGTTGTAACGTTCTAAAGCTTTAATATCTATATTTATTTATCTGACATTATCTCAA:1 + chr3L 21534338 3' + 1360 3331 1 60.42 CCAGCAAAGTTAAAAAAAAAAATCCCAGTACCTCCACCAGCAAAGTTAAAAATAAAAAAGTTAAAACCAGCAAAGTTAAATTAAAAATAAACAAATTAAATAAATAAATAAAATAAATTAAACAATTAATTAAATAATTAAATA:1 - chr2L 10673199 3' + TAHRE 10436 1 75.00 TATGTGCCATAGTATAAGACCACATATACTTACACACACACACACATACATAATTTTGTCTTTGAATGTTCCGTTTCTTACGATGCCTATGCGCTCGGCGACTGAGAGAAGAATCGGCAAGAAATAAAATAGAAATATATTTGTTG:1 - chr3R 3298218 3' + Quasimodo 8 2 63.01 GAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGCAAAATGGGGG:1 - chr3R 11284881 3' + blood 355 2 64.46 GCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACAGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATC:1 - chr3L 7848480 3' - jockey 78 1 64.14 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCC:1 - chr3R 9298442 3' - hopper 28 1 63.70 AAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAAACTTTAATGTCCG:1 - chr2R 5179557 3' + 1360 3345 1 54.11 CTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTTGGACGCGCTGGGGCCTCCTCGACTTACCACCATCCGCACAAAAACTTCTCGTCTCACCTATTTCGCC:1 + chrX 8839425 3' - Tabor 6860 2 71.03 GGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCCGTTCTCTGACATATAACCTGCCTATGCGGCAAGACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTC:1 + chr2L 13033403 3' + hobo 2924 1 43.82 TTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAG:1 - 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roo 85 2 78.62 GCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCA:1 - chr2L 2544748 3' - blood 69 2 63.45 AACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTAC:1 + chr3L 13057425 3' - 412 7137 2 76.92 CGTGGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAGAATCGGCCTGGTCAAACCGCAATCAGCCAGGC:1 - chr2L 19341507 3' - FB 89 1 77.40 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCCTGCAAG:1 + chrX 20149243 3' + pogo 2050 1 56.94 CACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCC:1 - chr3L 22320138 3' - jockey 14 1 69.09 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAG:1 - 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jockey 88 1 79.26 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAATTTTACCTGAAT:1 - chrX 17884470 3' - pogo 28 1 60.69 ATATCACACTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGCATTGCTGGAA:1 + chr3R 19514317 3' - blood 76 2 67.81 CAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAAGCCCGTAACCTTGTAGTTAA:1 + chr3R 1844848 3' - Cr1a 172 1 60.27 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCAC:1 + chr2L 11617829 3' - 412 7079 2 66.90 TCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGT:1 + chrX 21668368 3' + opus 7459 2 48.97 CAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATGATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTTAGCTAACGACGAG:1 - chr3R 8197757 3' - pogo 32 1 58.96 AAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATGATAATATCTATTTCAAAAGTTTAATTTATTAGGTATTTCTGTTTTTAGT:1 - chr2R 17650555 3' + pogo 2038 1 66.91 TGAGCGATACATGAGTAAACTACACAACCATGATAATGTCCTAGCACTAGGCCTACTAGATAACAAAAGCAACCTAAGGCGACTAAAAGATTTCATGTACTGGACCTGCCATATAGATACACAAATAGATAAAAATATGTAAATA:1 + chr3L 26170623 3' + G3 4372 1 83.45 CACAAAAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGCACGAGTATTTCTTATTTT:1 - chr3R 11756745 3' + Tirant 8492 2 58.43 AATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACATATCGGAGT:1 - chr2L 2057816 3' - 412 3 2 64.86 GTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTCCCGCCGAAAAACAATAAAATACTGATGCACGAGTCAGAATGGCGCAATTGCATC:1 + chr3L 24008377 3' - X-element 59 1 55.65 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGCGAGTCAATATCGAAAATACGAGAAAAAAACCGAGTGCAAAATAAATTGACAAAATGCAAAT:1 - chr3R 17987632 3' - jockey 67 1 59.59 ATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGTCAATTGAAAGGAGGACAACAGTTGAATATTTTCAACCCGGGGA:1 + chr2L 21683523 3' - pogo 27 1 67.12 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACACATTTACACTAGTTAGTTTGTGTATAAAAAGTCAG:1 + chr3R 4962911 3' - jockey 56 1 54.17 GAAATAACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAAT:1 + chr3L 9318088 3' - P-element 2880 2 53.79 ATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATTTCTAATGCACATAAACGTTGGTGCCAGTACATAGTGCAATATGAATGGCAAATGGCATCCC:1 + chr3R 20984000 3' + hopper 1399 1 71.23 GCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTAAAACCCTTCTAATTACATACATTAAAATAAATATAGTTATTTACATTTT:1 - chr3R 12376414 3' + HMS-Beagle 6979 2 62.76 ATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGTATCGAAAATCACTTTGCATCTGCAGCACTGCTCACTGACATGAAATTTCCTGTCATCTTCGGTACAAACAGCACATCTTTGAGCG:1 + chrX 22559082 3' - gypsy 36 2 57.93 GCTGAGAGTAATTGTTGGGTCCCTCCAATGCTGGAGAGCAAGATGCGCTCTTCCATCACTTTGAGGGTGTAAGCTTTGATAATTTTTTGTGTAGTTTGATATGGTGGAGAAGGAGGACGTGGTTGAAAAACAAAATTAGC:1 - chr3L 23665641 3' - Porto1 376 1 75.00 TTTGAAAATAGATTAGAAATAGCCATAACTATGTACATATTATCACAAAAATAAATTTCAAAAATTACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCAATTTTTCGCTGTTTCCTCACGGCGCCTGTTCGCTC:1 - chr3R 2211719 3' + 1360 325 1 75.34 GAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTTGGCGTGCACCCTAATTAAATTCGGTTTTGTTCCCAACTCG:1 + chr2L 15085776 3' + opus 485 2 71.92 TCCCAGCCCAGCAATAAACTTATTAGGGCATTAATGAAAAAAAAAAAGAGGTGGGAGAAGGGGGTCTGTAGAATATGTTATGTAAGCTGGTGACAAATGAGCGGGCTGAGAACGGAAGCCAAACTTGTCGCCACAACTCGAGAACA:1 + chr3R 30157910 3' + Doc 4560 1 76.71 CCAGTGGGAGTACACAAACAGAGTAAGTTTGAATAGTAAAAAAAATCATTTATGTAAACAATAACGTGACTGTGCGTTAGGTCCTGTTCATTGTTTATGGTGGCGAAAGATTACCTATGACAAACTCTC:1 - chrX 20332914 3' + P-element 421 1 29.46 TAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCACGATTATCGC:1 + chr2R 10119098 3' - Juan 4059 1 61.81 AAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATT:1 - chr3L 22320163 3' - jockey 76 1 63.01 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCATGCTCGGGCATCTCTTTCTCTCTCTCATCTCACACATAAAAGTGGCGCACAGAGGCT:1 + chr3R 6419972 3' - Tabor 20 2 61.54 ATCAGGACAACCGTTATGTGCTTCTAGACCGACCGAGCAAATAAACATGAAAATCATCGGGCGGGCTGAAAACGAGCGCGAAATGTGTTGAAAATTGCACTAGCAATGCGATCATAAAGCATTCGCCATTAATGACACCAGCCGGA:1 + chr2L 21931221 3' - Copia1_DM 162 1 70.55 CATTATTGTTTTAAAAATAATCGCCCTCTTCTTCTTCTTGCTCAACATTTATAATTAATTTTATAACAAGAAAAGTTATTTTCGTTAAAAACTTCACTTATTACGCCATGCTGACATCAACGATCGACTTATATTACTGACACCCG:1 + chr3L 8823648 3' - transib2 2604 1 73.29 GTGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTCTGAATT:1 - chr3L 18463350 3' + 1360 77 1 57.14 CGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCC:1 - chr3L 22320187 3' - jockey 86 1 77.27 TTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCACTGCT:1 - chr3L 19274774 3' - transib2 13 1 69.91 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCCAT:1 - chr3R 17259523 3' + roo 9002 2 65.75 CTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTATCTAATATATAATCAGAGTTGAGAAAAGGGGTTTTTTCAACACATTTTTATTAATATATACAAGAAAC:1 - chr2R 19389288 3' + 297 348 2 58.22 TGGGCTTAGACATCCACTCTGTTGGCCATCTCGTCTGATCGGACACGCTTCATCATATTAATGATGTGGCGTGTTAGAAAGTATGTACATGCATATACTCCTGCTT:1 - chr3R 1944531 3' - Rt1b 4810 1 62.26 AATAAAACATTAAAAGTAACTCCTAATCTTTTATTGTCACGGCTCCGCCTGACACTTGGTTAGTAAAAGCCGCGCGCGTTAATCGCCGGCCAACCCTTTTTCTGGCCAAACATATGTGCATGATTATGATGGAAATGACGGATTTT:1 - chr3L 23325647 3' + gypsy2 6735 2 70.55 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAATATTTATCGCCCGTGATTTCGCTC:1 + chr3L 6131959 3' - roo 8696 2 63.01 TTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGCTGAGATTGCAGCGGCCATATTTATGTGTTTCAC:1 - chrX 4789104 3' + Quasimodo 7326 2 57.04 GAGCGGAAAGAGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTATAACTAGTTATTATTTTAAGTTAAGTTCATAGGCAGCCAC:1 + chr2R 8436303 3' + 1360 3311 1 73.43 TACGACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACAA:1 + chr3L 15099689 3' - G4 3807 1 58.22 AACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCTTCTGTTCGTAGGG:1 - chr3R 7074802 3' - P-element 63 1 46.90 ACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTGACATCTGTCGAAATGAGTGAAAGAGACAGGCAGAAAGAATAGAAAGAAATTTGGGACGCTTGTTTTC:1 + chr3R 27707145 3' + P-element 2834 1 49.32 ATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCTCCTATGGTAATTAACTTTTCAAGCAAATCCTCCGTATATGAAAAGAATATTTGTACATATATTAGAAGGTTTTCCATCGCCATATATGGCATCACACTTCTTTGCCTCCG:1 + chr2L 11617844 3' - 412 12 2 76.71 CTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTTTTCACCCAGCGTTTCT:1 - chr2R 21795986 3' + roo 9047 1 64.03 GATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAATTAACTTATTTTTTACATTGTGTATAAATGTGCGTCTGTCCATTTT:1 - chr2L 18181106 3' - blood 7124 2 46.90 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGTTGCC:1 - chr3L 22320138 3' - jockey 25 1 62.81 TTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGGCGCATATGCTACTATATACATATATTTATTTATATTAAGATATTTTGTAGTACTTTGGCTTACAAAACATAATTATTTTAATATTTTT:1 + chrX 15563261 3' - Quasimodo 50 2 58.90 AAAAAAAATTACATTAAAACCATTTAGTCTTCAACAACTCTATTTTTACATTCGACAGTGCTTTGACTAAATTGGCTTAACTAAACTAAGCTTAAGCTGTCTAATTAAAATTTGTAAGCCAGTTTACAATTACCGATCTTAATAAT:1 - chr3L 17206673 3' - transib4 27 1 73.29 TGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACAAACATATACTTCGTAGTAA:1 + chr3R 8197909 3' + pogo 2071 1 63.70 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTGCTGGAGCCTGATGATGGG:1 - chr3L 20061299 3' + roo 9049 2 67.83 GTGAAATTGTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGGAGAGTTAGTTACCTTATATGCGAAGTTACATATACGCACCAATTGAAAGTGTGTG:1 - chr3L 4547644 3' + mdg3 224 2 68.35 AAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGT:1 + chr3R 10737087 3' - F-element 20 1 70.83 TCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAG:1 - chr3R 28014118 3' - roo 77 2 75.00 AGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCACGCAAAAAGTGGACACAG:1 + chr3R 10030825 3' - BS 5031 1 65.07 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGTTTGCTGACACAGGTGAACAATTGTGC:1 - chr2L 10909441 3' - 412 11 2 73.97 ATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAAC:1 - chr3R 8563567 3' - 297 6601 2 68.12 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAG:1 + chrX 20330592 3' - P-element 79 1 28.57 AAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTCCATCGGATATTTTTGCTGTTGAAACTGCAACATACACATCCACATTGGTGGCAGACAATTCAACTGGCTTTTATTTTTTCTTATTTATTAGAGTTGCTCGACTC:1 - chr3R 4666199 3' - FB 16 1 74.66 GTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACATTATCTTATGCGACTCGGCTTTTGTCGTTTGCTCTTGAAATATTTGCGCTTCATTATCATAAA:1 - chr3R 24480455 3' - blood 7070 2 56.85 TAAAAACAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTACATGTATGGGAAAACTACGCTAAATGAACTGCATTTTAAGATTTGA:1 - chr3R 5704121 3' + 412 7471 2 65.07 CAGCCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCAAATATGCA:1 + chr3R 23636425 3' - X-element 4309 1 67.12 TCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAGTCAATTTTGAAGATG:1 + chr3R 22320563 3' - roo 8725 2 62.33 ATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCCGCATCTCTTATTCGCAAAGTTAAAGCCAGACTTCTTC:1 + chr3R 7074921 3' + P-element 2853 1 61.54 TGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTCGAGCTGTGAATGTGGTTTTCTCTCCTATATAACTTTTCGCCCATCTCCTTTCCATTTTTCTTGTTTTATTTTGTTTTGCTTGCTTCTAT:1 + chr3R 26472928 3' - 1360 30 1 62.07 GAGAGAGAGAGCTTATGCGCATATATGGCCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAAT:1 - chr2L 18181151 3' - blood 158 2 46.21 TCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAATTAACCTATTAGTATACACTTTATCCTTCAAACATCTTAAAAGATCAGCAGCTTAGCCAGGTTT:1 + chr2L 4245039 3' + 412 7544 2 77.40 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACNTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATANGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACAACTAAC:1 + chr2L 14616257 3' + P-element 2817 1 36.99 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCCGTTCCTCAGCCCCAACTTCCAAACAGCCGGCAAACACGAATATCTTCAGCTGGAAAATGAGAAATTGAGCAAAGCTCC:1 - chr2R 9607272 3' + P-element 2859 1 62.88 TATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGCTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTT:1 + chr4 146068 3' - 1360 15 1 64.42 ACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCAACAGCAATATTGACATCATTCAGCGAATGGGGCTCACAGTTCCCGTAGCTCCGAAACCATCAAATCCTATTACGTCGAATAAAG:1 + chr3R 10736560 3' + F-element 4258 1 54.69 TCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATC:1 + chr2R 12102044 3' + hopper 1372 1 52.05 CAGACCGGGCTTCAGTCTGGGCGCCACACACTTGTACGTTAGCCATCACTGAACTCTAATCTCTCGTAACATTTCTGTTATCTTTTTGGTGTGACCATAAGCAG:1 + chr3R 10144479 3' - Chimpo 7 1 73.08 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGT:1 + chr2R 10977226 3' + roo 9029 1 55.48 ACCCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAAT:1 - chr3L 9324430 3' - HMS-Beagle2 36 2 58.45 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAA:1 + chr3R 11285010 3' - blood 7036 2 62.90 AAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTATACTTTCAATATATATGTAGTTTCATATCAATATAAATATTTTT:1 - chrX 14978560 3' + hobo 2871 1 68.35 TCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTT:1 - chrX 22679630 3' - Doc 67 1 48.55 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGG:1 - chr2R 14427161 3' - jockey 4846 1 77.24 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCGGGGGAGGGCGTGCGATTGTTTGCGCGCCTACGCTGAGGCTTTTGTT:1 + chr3L 17739876 3' - jockey 84 1 67.81 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAAGACAGATCAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATCAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAAAACATCGAGCAGAAAATTGCAGTTGAAATTACCAGTCGG:1 - chr3L 4547699 3' + mdg3 171 2 68.38 TAATTAGGTTTAGTATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAATTATATAAAAATGGCCATCCCATACTACT:1 + chr3L 19951308 3' + Ivk 5348 1 60.96 TATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAAT:1 + chr3R 10736099 3' - McClintock 5975 2 71.79 TAAAAACAAAAAGAACCGTTAAATTGAGAGTGTAAAAATGTATTGCTCATAACATTTAATAATTATTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTTTAACCGCATCTGTACGTATAATACGTTTATCTGCTTT:1 + chrX 16361578 3' - Tc1 154 1 48.28 ATATAATCTAAATATAATTCGTAGGCCATAGCCACTACATCCATAAAAACTCACACCTATTAACTTACAATGTTTTAAGTCGCTCGGAAAAAGAGAGCACGCTTGAACCTAAGCATCATAGCATAGCATAAAAACATCATATTAT:1 + chr2R 4887874 3' + gypsy7 5422 2 70.34 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAAT:1 + chrX 683598 3' - jockey 81 1 73.60 GATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGACAACAAACGCACGTGCAGAAGTGCAAATTTATTTTTCTTGAAACACACCTAAAACATGTGTTAGGGCTACTGCCTTTAAGTCTAGCCGCTGATTCGGTTGCATGAATTGAAC:1 + chr3R 26188675 3' - jockey 9 1 72.66 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGG:1 + chrY 2720355 3' - 297 6635 2 74.40 TATTAACAGAAACACATAATACAAACCTGTAGATTGATTATCCATTTCAAGTTGGCCGGGTAAAGTGCACTCCAAACATTGAGACTCCGAGGCGAGAGTCAGTCAAAGCAAAATAAGGCACAG:1 - chr3L 17142726 3' + hopper2 1325 1 66.67 CCAAACATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGCGGTGCGATGGGATCCTGGGGCTGGCTGCGATTTAAGTCCCTTTCATCTCGGCCTGCTCCACTT:1 + chr3L 22331041 3' - hopper 47 1 52.14 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTTGCAATTTAAATTTTTAAATTAATTAAAAAAATATTTATCTTCCTTATAAAACCATATTATCC:1 + chr3L 15393811 3' + pogo 2047 1 61.11 ATAATTACAATTTATTGATTTTTATTTTGTAGATCGCAAGCGACCGTTTATTGTAATTGTTCATTTGAAACTAAAGCTAAGATACAAAATATTTCCCTAAGTCCCAAGCAATCAAGGTGTGAGTTCGCCAATGCAGAACACATCC:1 - chr2R 142815 3' - HMS-Beagle2 306 2 79.31 TCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCT:1 + chr2L 15019940 3' - BS 4848 1 65.49 TTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACGGTATC:1 + chrX 13060287 3' - Tabor 6899 2 60.56 CTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTCTGCGTATA:1 - chr3R 12078577 3' + hopper 1385 1 65.75 AAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTCTTGCTAAGCCGAGGAAAGTATGCAACATTTTCGCAC:1 + chr2L 11867370 3' - BS 40 1 53.08 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATAAAAAATACTTATCACTAAAATACGTTTTAACTTTGGGACATGCAACAAGTGTCATTTGCAGAGAGCCAATCCTGAGCTTTTG:1 - chrX 17048137 3' + jockey 4961 1 47.48 GATTTTGCTGCGATACCCCAGATCTGTATTCCGTACAGCCAGATCGGGGCTAAATTCCCTTGTAGTTCTACAATTAAATTATTCAAAGGAAAGCATACACTAATTAATAATTGTTTAAATTTACTGTGACATTTTATTACATTTG:1 - chr2R 7727093 3' - BS 4688 1 60.00 TAATAATAATAATATTAATAAATTAAAATGAAATTTCTATGTTTTTCATATCTAGCTATGTTTTCATTTAAACAGTAATGGTTTTCGTTGTGTTTGTGTTCAGACGTCTTTTTTTCAGTGTAGGAACGAGCCCTCTAGAGTTGCA:1 - chr3L 5447701 3' + mdg1 39 2 22.76 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGTCCATGATCTAATATTATAGCACAATAAAGCTAAATTAAATAACTACTTCCATTCTTAATAT:1 - chr4 868634 3' - roo 8722 2 60.69 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGGTCTTTGCTCTCG:1 + chrX 3811647 3' + P-element 2787 1 12.59 CGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTT:1 + chr3R 5870905 3' - roo 8718 2 57.93 GGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTATATATATAAGTAAGTTATTACCTTAAGGGTATCGCATTACAGAAGTGCAGTCAACTGAGTGGCGAGGTGTGAACATTTGAAAGCGTTACAAATCTATGAATG:1 - chr2R 10787993 3' - gypsy10 18 2 72.03 GTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCA:1 + chr3L 12890401 3' + hobo 2913 1 59.13 GAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCAGAACG:1 - chr2L 20407733 3' - McClintock 26 2 68.49 CTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCCACTAAAATGATAATTTATACATACACACTGGTATATACACGGATATATATAACTTAAAGCTTGCAATAATTAGGCTAACTGATTCTAAATCGTTTCGGGTTATCCTAAAATGAGAGGC:1 + chr2R 15199255 3' + Burdock 233 2 70.55 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTTTCGTTGTCTTTGTCTCCAGAATCTGTCAGCACAGTGGTACTTATAAAGAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATTACCG:1 + chr3R 4562396 3' - mdg1 16 2 74.66 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCGATATTAGCGCAGCTGCTCCATTTCAATCTCTCTCTCTCGCTTTCTCTCTCCCTTTCTCTCTCTCGCCTGCACTCGAAGACTATTATTTTTGCCTATTTAATAA:1 - chrX 10724928 3' - pogo 10 1 74.10 ACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGCATTTTAATTTCAATTTTAACATGAAGTGCACACTTTTTGTATCCCCGTGTGAAAGGTGTTCGAGTGTCTGTGTGTGTGTGTGTGGTATCCTAGTAGCAGCTGTTGTT:1 + chr3R 10421009 3' - Tabor 11 2 68.09 ATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTTCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGT:1 - chr3R 17243138 3' - hopper 86 1 73.61 ATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCAATCAA:1 - chr3R 21925083 3' - hobo 31 1 59.38 TATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTA:1 + chr2L 544950 3' - Doc 36 1 54.11 CACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGGAGAGACGAAATGGTGGAGAATCGCGATGGTGGAGAATCGCAATGAGCATTCGGTACAGACATCAACCAGCG:1 - chrX 3811515 3' + P-element 2886 2 59.59 TTTTTAATTCTTACTCTGCCAGACCACAACGCTAGCAGTTAAAAGAGGAAAAGACCACAAGGCTAGCAGTTAAGAGAGGAAAGTTTCTCTCAACGTAAATAATAATCTTCCGTTGCTCCGCGAATAATTATTTTCAATTTTTATGT:1 + chr2L 18689234 3' + Gypsy6A_LTR 236 1 69.86 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATTCTAGCTTAAGTAATTTGTACCAGTCGGACTGACCGACTAACGCA:1 - chr3L 23146436 3' - 1360 26 1 67.81 TTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATTTATACGATATATTCGCTTTGTAGGTATATTTTAATAGTTTTCCAGGAAAATAAAATACTTGCTGAACAA:1 - chr3R 17531772 3' - 297 50 2 58.62 ACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGGACTGGAGCTGATCTTTGGGGTAGCTCATCTATGGTCAATTATGTGACCTAATATGGAGATCTTACTCTATCTATGT:1 + chr3R 27606719 3' + 412 472 2 64.23 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAAGTGTTTATGGCTGTTATTTTACCGAGCAAATAGAATGA:1 + chrX 14978692 3' - hobo 11 1 72.92 TTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCATCTTAGTTGTTATGACCTACTATTATAAATCTATATGGGATTAACCG:1 - chr2R 7720016 3' - HMS-Beagle 7 2 78.08 ACACTCGCCTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTC:1 + chr3R 31112256 3' + mdg1 345 2 72.14 GATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATGTACTTATTCATATATATTTTTAATGAATAAGAATAGAAGAAAACATTATAGACCTTTTAGAGTAGGTCATTTTAAGTAACAATCCTTATCCGTCCTTGGTACGTACATTTAA:1 - chr3L 3317201 3' - pogo 3 1 31.43 GTTTTTATTTTTTTTTTTAATTTAAGATATATTTTTTCTTTCTTGCTCCGTAGTTTTGAAAGTTTTGTAACATCCTAAAAGAAGTAAATCTCTTCTTTGCTATATGTACTATAATATTTTAAAATTTCTACCGTCAAGGGAATTA:1 + chr3L 18233235 3' - Doc 4700 1 64.14 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTCTAAACATTTCATTTGACAACTTGAAGTGTAGCGAAGAAAAACTCGAATTAACTC:1 - chr3L 22294400 3' + pogo 2047 1 62.22 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAGATTATCGTGAAAGAGTTTTGAGTTCCGTTTCGCTGTATTGTTGGCTTGCCAAACTGTTGCATACTTTTAGGAAGTTGCAAGGAGCGGAACATGTGTTTGCCATGTCAA:1 - chr2R 14385525 3' - jockey 20 1 75.34 CTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATGTATGTGCAATGTAAAGAATACAATATGCAGCTATAGATGCTATATGGGCTTTTAAGATTTTATTATAGCTGAAATGATTTTGTTATTACTT:1 - chr3R 13423240 3' + 297 6950 2 67.36 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAACCGTGTGAG:1 - chr3L 22021609 3' - mdg1 23 2 69.86 TGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTC:1 + chrX 14978625 3' - hobo 80 1 69.86 TTTTTAAGTTACTTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTATCATAAAACTTCCCAGCGATAACATATCGATTTTTAATATCAATGCTTCTTCGATTACTAATGTTTTCAG:1 + chrX 17884618 3' + pogo 2058 1 50.71 GTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTGATTATGCTTATTTTATTACGTAGTTTTGTCCTACCATT:1 + chr3L 7024564 3' + 412 450 2 53.42 TATCTCCAATATGAGCTACAAAGATGCGCTCATGTCTACCCAAGTGCCTCAGCAAACCAATCCCAACCAAACCCGAGCAACAGCAAGTAGTTAGTGTAAACAGAAAAAAAAAGGAAGGAAACCAC:1 - chr3L 13339291 3' + G2 51 1 60.00 ATGATGAAATGTCCAGGGAATTTCCAAAAGAATGTTCCCATTTGCCTAATGTTCACAACTATTCTGATTCAAGTGAAGGAATCAAGTCGCAAATAAAGCGATTAAAGCATGTTTTTTTGGGCTGGGTCTTAGGTACAAGTGTCCAT:1 - chr2R 15909074 3' - G4 20 1 79.45 TTACAGACTGCCCATACTATGTACGTGGCACTACCCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACCAGCAGATATAGTGATAGACTAAGAGAAGCATTAATAATTCGACTAAATATTTTTTA:1 - chr2R 1073221 3' + BS 4757 1 77.93 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATGTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAG:1 - chr3L 27415224 3' + transib2 2753 1 64.38 AAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCT:1 + chr3L 20680368 3' + 412 7480 2 60.96 TTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGAAGCACGAGGGTAAAATGGACTTTTAAAACGTAATTAGC:1 + chr3L 5910561 3' - BS 5078 1 71.03 TTTAATTAAGCAAAAAACCTTTAATTTAAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTCCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATATGGGGTCCTAAAAGAGAGTCCTAATCTCAATCTCTCGCTGATACTGTTTTGGCG:1 - chrX 15076765 3' - S-element 68 1 91.78 TTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGCGGGTTGGTTTGTCGGGGTTTCTA:1 - chr3L 18044609 3' - hopper 19 1 70.97 TATAGAATATAAATTACTTAAATCCAAACCCAAATTCGAGCTACGAACTCTCGAACTTTGCTCGGTCAGTGGCAGTCG:1 - chr2L 3235004 3' - blood 6927 1 67.95 TATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATATGCTACAAGGCTAGTTACATTATGGACCCGAAATAGGCCGAAAATATTTTCTAGCCATTA:1 - chr3R 12948612 3' - Stalker4 7028 4 64.38 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATGCCTCTATGCAGGCATGCGTGAATGTTGCAGGACACGTAGTCCTTGTAGTCCTGCAAAGGC:1 + chrX 7851380 3' + 297 349 2 59.31 ATTTTGTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTT:1 + chr2R 20052459 3' + transib2 2736 1 79.45 CTTAAGTCTTAGGGACTTATGGATATGTCACTATATATATCCGAGCTCTTATGAAGCTTTGCAAAATATATTTCAAAATAGTAAAAAGGTATAACTATTTGGAAAATTTTACGGTGATCAAACAAAACTGCTTGGTAATAATGTTG:1 + chrX 23182958 3' - Idefix 10 2 65.75 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTG:2 + chr3L 10897516 3' + roo 323 2 76.03 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAAATTCCACGACGAATTTCATGACGACACATCCTTGGGCGAGATGCATACACGGC:1 - chr3L 7750994 3' - 412 28 2 63.19 AGCTGAGTAACGGGTATCTGATAGTCGGGGAACTAGACTATAGCATTCTGTCTTGTTTTATTTATTTTATAAATAATAACTTTAAAGAATGTGTGCTTGTAATGTTTTTATTAGATCGTCACATAAGAATTTAATTTGTCGAAATT:1 - chr4 99855 3' + INE-1 545 1 69.18 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTCGTTCACAAAAAAGTGATGCATACTTTTATAAACCTTATTAATTTG:1 + chr2L 12236849 3' - jockey 56 1 50.00 ATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGCAAGCCCCTGCTGAGCAGCAGTCCTCGAA:1 + chr3L 1459918 3' - 412 22 2 69.93 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTGTATATGTACATACATATGTACATTTAAATAATTGCTTTTGGAAGGGCGAGAACTAAATAGTCAACTACATAATCTGTTCA:1 - chrX 20149110 3' - pogo 39 1 55.86 TAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACCAATATTGGATTCACCGCAGTCAAAGTTTTGTAAATTGAAACCATAAGAATGTTAAAATAGTCAACTTAAGTCAGTTCAATTGTT:1 - chr3L 15393661 3' - pogo 37 1 56.16 CATCCGGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTGTACACACTAGGAAGTGATTAACTAAATGGATTTTTAAAGAACGCGTATTTCCCCAAGGTTGCGAATTGAATTTTTG:1 - chr3R 12146629 3' - gypsy10 5683 2 55.71 TAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCCTACCTTCGGGCTGAATCGTTTG:1 + chr4 490332 3' + pogo 2050 1 56.12 AACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTATTTGACGCACCCACCCGCTAGTTTACCCGCCGCAAAATCTGTGTGCCAACAGCAGCG:1 + chr2L 2544882 3' + blood 7370 2 71.92 CCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCTCTCTTCCAGTGTCTAGTTATTTGTGCTATAAATTCGCGTCTATGAAGATAACGCTGAATACTATATATAGTTGATATAGTGCCATTAA:1 - chr3L 10897409 3' - roo 24 2 67.63 TTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGG:1 - chrX 22679660 3' - Doc 88 1 62.79 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATTGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTGTTGTGGAAGGCCATCAAGATTAGTAGAACACCGGGCATAACGATTCCAACCAGGGGAAGG:1 + chr3R 22709094 3' - roo 2 2 81.06 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACC:1 + chr3R 26242554 3' + roo 9010 2 63.01 AATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTGGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCTTAGCACACTTTTAGGAGTG:1 - chr3R 19950445 3' - BS 5053 1 59.31 TGTATTAATAATAATTATAATAATCCAACAGACTTATCGTTATCATGATATGATGATGATATTTCATCTTTACTTTTCCTGTTTAATAATTAATAAGATTATACTAACAAATATTGAACAGATTTTTAGGATTTTCAGTAGCTCTT:1 + chr2L 13271112 3' + mdg1 7087 2 55.48 GCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGG:1 + chrX 21668371 3' + opus 7473 2 44.78 GAAGAGGAAGAAGAGCGTCCTGATGACTCTTCGACATATACATATACATCTGTCGTGAAATGTTAAGTATGCAGTCCATTTATTTTCTTTGTCAACATTCCTTTCATAAAGAATGCCTCAATTACAAATCGACCAAACG:1 - chr3L 23148094 3' + invader1 3997 2 66.19 CGTAGCTTGATAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTGGTAACTGATGTGCA:1 - chr3R 15003085 3' - Doc 32 1 64.38 AAACGCTTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTACAACGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAACGGGTATAAATATAAATTCTCTGAAGTCAACTTGCCACCAGTGTTTGTTCATTTTTTTTTTCCGCATCAATTCTCAGTG:1 + chrX 19300938 3' - INE-1 33 1 94.52 AAAAATGCAAAATACTTCGTATATTTCTTTAAACTACTGCACAAATCACAACAGAATCACTCGCGAAGCGAACGGATCTTTAATAATTATGTTTATTAATACTAGAGTTAACGTCTAAGAAACCGAAAACGAA:1 + chr3R 1844828 3' - Cr1a 179 1 71.43 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACTACATACTACCATATCTGCGGCTGGCAGCTGGGTGAACTTGAGCCATGCCGGCGTGGGAATATTTCGCCTGCTGCCGTGTGC:1 + chr3R 28618473 3' - 412 40 2 50.00 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAATACCCTACAG:1 - chrX 3666520 3' + roo 335 2 69.86 TTATTAAAGATCCGTTCGTTTCGCGGGTGATTCGCAGTGCTGTTTGACACTGCTTAAATATTCGTAAAAGAATAAAAACCTCGATTAATATATAAATATATAGCAAATATATATGCAAAATATGATAAACTGACCTATTAATCCCA:1 - chrX 21631040 3' + Cr1a 116 1 70.55 CGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGAAGGAGAACAATGTGGAACCTATCCGGAG:1 + chr3L 12890440 3' + hobo 2927 1 76.43 AAAAATATTTAAAAAAATAAAAAGAACTTTATGCGTGAGATAGTAATGTTCTTAAAAAAACGTTTGGGAATATTATAAATTATTGAAAATAATCTATTTAAATCTTGTTAAATTAACTTTACAAAATAAGTATAATCGGCTCTTT:1 - chr2L 15368603 3' + TART-B 10627 2 77.93 TCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATA:1 - chr2L 18311429 3' - opus 7177 4 69.23 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTACGTTAAATACAACACATAAAACATACGACTTACGATTTTCGATTAAAATAAAAATATACTTTGTAGAAATGTTTATAGTTTGGCGAGCTTTGCAATCCA:1 + chr3L 14422868 3' + roo 9051 2 70.14 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGT:1 - chrX 20361939 3' + hopper 1391 1 63.71 AAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTTGGCGTGCACCCTA:1 + chr2L 15085749 3' + opus 7461 2 54.79 TACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATGACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATAATAAT:1 + chr2R 12102055 3' + hopper 1383 1 58.22 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCTTTATAAAATTATTGTTATCGATGCTTATTATTTATTTTTTTGACGTTAAGTACGATTACTACTGAATCATTGTGTTGTAATATCAACACTAAGAAACAAATTGAATTCTTC:1 - chr2R 5193375 3' - roo 10 2 74.48 TACTATCTTACGTGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTAAG:1 + chr2R 25051878 3' - G5A 2706 1 74.66 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTT:1 + chr3L 18183201 3' + Tirant 8476 2 60.77 CAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAATTGTAGATACTGTTGTGGCTCCTTGAAAGCGTATACCCGTTGGACATTT:1 - chr3R 30955282 3' + G6 2009 1 66.91 TAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATGTGTG:1 - chr3R 21794026 3' - hopper 28 1 63.08 GATGAAAGCCTTAGCTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAA:1 - chr2R 10582406 3' + Juan 4130 1 75.17 TATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGG:1 - chr3R 21794041 3' - hopper 42 1 54.26 TGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAGTCCTTT:1 - chr2L 6637358 3' - 1731 71 2 56.16 CAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGTGAAATCTAAATG:1 - chr2R 12706152 3' - FB 62 1 59.59 TAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTTTCCGCTGTCCATT:1 + chr3L 5051166 3' + flea 4993 2 66.13 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACTATATCTTTTTATTATACC:1 + chr2L 512519 3' - roo 8730 2 63.70 TACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAG:1 - chr3L 27415205 3' + transib2 2775 1 51.75 TTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTAATGTCCTTGTTCGTCCTCACCCGGAAAGTC:1 + chr3L 20061471 3' - roo 8 2 74.42 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTCAATTTCCCAGT:1 - chr2R 18931811 3' + blood 7334 1 56.16 TTAAAAAAAAAAATAATAAAAATTCTAACACTGTTGAAAGGGGACATTCACAAAACGATAATTAAGGCTGTAAATAATATATATATCAAGAATTGATTTCGCATCTTAAAATGAAAAAATGT:1 + chr4 336461 3' + TART-C 11101 5 54.92 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGGCAATTCCTTGGAGTGCATCTTAGTGCTCACATTTCGGA:1 + chrX 666388 3' + 412 7500 2 53.42 AAAGATGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGCGTCATCAGTTTAAATATG:1 + chr3L 2907384 3' + 412 426 2 60.27 TGTAAGGAGTTCATGGGAATGTATTCTCTTCAGGCGTCGGAGGGAAATAGGGTTCAATTAAAAGCCTTCAAATGGCTATTTTCAATTTTCAAAATGTAAACAAGTCTAGGTCTCGCATGATTTCAAGGGGTAAGTTTTTTGAAATA:1 + chr2R 25051890 3' - G5A 2694 1 74.66 TTTTAGATTTCTTACGCTCTCAGCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGAATGGCCATTACGCCTCTTGTTATTCTAGAGTCTTTGGTAAAACGGTATACTAAAAGGTAT:1 - 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chr3L 414856 3' + 412 441 2 61.79 AATTGAAATTAAAAATTTAAAAACGCTTTCCATCGTCATCTGATAAGCCAAGATAGGCTGACCCACCTAATCTGTCTGCTCTTCGCTCTTGTTTATGAATAACGACAATATAGCAGCGAAATTATTGCCCCAACGGTC:1 - chr3R 31461336 3' + 1360 3049 2 78.26 ACATTTTGTACGCTAGATTTAGTTTCAAATGATAAATTGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTGCATTAGCTGGGCCGCAAATGCGAAGTACATACGGG:1 + chr3R 12613838 3' + HMS-Beagle 172 2 75.76 TCTACCAGTGGGTGACTTTTTTAGAATTGGGGTTTTTTCCGACCAAGAACACAGCAAACCAGCAAACAAAGCGAAAACAAGAATAAAAATAAAAAAGCTAAACAAACGGTTTAAGCAACATACAAATTAAAAAGAAAAAAACG:1 + chr3R 3347128 3' - Idefix 167 2 76.22 CCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAACACAATGGTAATTAATCAAGCGAACG:1 + chr3L 9318098 3' - P-element 2844 1 72.27 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATATATATAAATGAATTATTAAAACACTATTCATATAAATAATTTAGTATATTAAGATTTATTTATCTGCGCA:1 - chr2L 13229088 3' + roo 358 2 55.17 CTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTGGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTCTC:1 - chr3R 5870800 3' + roo 9009 2 59.59 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATGAGACCGAT:1 + chr2L 8120235 3' + roo 9008 2 68.49 CGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAAAGGCACAGCGATTGAGGAA:1 + chr3L 11364937 3' - Tirant 8118 2 78.26 ATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATACCAAAAGGTCAATTACCTTCTTTTAATTTGCCAATATTCCAAATGAGATGGAATAATTGAGCACTGTTCTCAGTCCAGACATTCTTCTTCAGTATT:1 + chr3R 10733870 3' - mdg1 24 2 69.18 AAGCTCCTTGTGGATAACGGAGTTTTCATGGTATGGGTGAGCGTCAGCGATTGACTCAGGCATCAATCAGAGGCGGCTAATGCAGGCCGTTAATCGTTTCTCAGTCGACTGCACTTTGCC:1 + chr2L 15445270 3' - G-element 4026 1 51.67 AAGGCTCCACCCTCGATCGCGGACTTAACTCACGCGATTTGCTTTCTACGCAGTTAGTGCAAAAGTACGAGTATTTCTTATTTTATATTCCCTCATTATTATTTTTATACATTGATAAATGCAGAAAAAATAGGCATGCAAATAAA:1 - chr3R 11756683 3' + Tirant 390 2 79.45 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTGGTTTTTTTTTTTAATTGGAAACTATTCGGATCCGCGACGTTTGATGTACAAACAAATGCTCCAAAGATTTTATTGTAAGTTTTAGATTGATTGAA:1 + chr2R 6700178 3' - roo 16 2 68.38 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGG:1 + chr2L 13033443 3' + hobo 2928 1 69.60 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATGTATA:1 - chr3R 12046756 3' - Doc 82 1 71.92 AGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAAAGGATTTTTTTATTGCTGTGCGCGGCATTTTTAGTATAAA:1 + chr2R 5193504 3' + roo 8989 2 77.40 TTGAGGAAAANTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGATCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTT:1 - chr2R 19574415 3' - I-element 5146 1 52.74 GTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTAT:1 + chr3L 11364866 3' - Tirant 54 2 71.82 TAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGAACATTCGTCTAAACAACCCGAACGAAATACCACAAATTACGTTCAACTTTTAAATGAGTGCTAAA:1 + chr2L 18525728 3' + pogo 2062 1 58.62 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGTTGCGTCAGAAGTTCTGA:1 - chr2R 9341551 3' - roo 71 2 68.49 TGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAAAGTGTTGCATACTTTTATAAACCTTATTAAT:1 + chr2L 12236846 3' - jockey 26 1 64.04 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACC:1 - chr2L 10461132 3' + roo 9019 2 54.55 TCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGCATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCCATATTTGAGTA:1 + chr3R 10737106 3' - F-element 12 1 77.86 TTAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCAC:1 + chr3L 20061406 3' - roo 90 2 80.82 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATTTAGTGCCATAATTCAAAGCAATCTATGCCAGCCCAGCCAAAAT:1 + chr2R 21796104 3' - roo 71 2 67.36 AAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGAGGACGACCAGGATAACGCGTAAAATTTTCATTGTCAGCTCGGCCTGG:1 - chr3R 28014065 3' - roo 14 2 71.54 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATA:1 - chr3L 9317970 3' + P-element 2854 1 58.87 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTTGTCGTGCGTGACGACAACGAGTC:1 + chr3L 10033703 3' - blood 7032 2 68.12 AAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCTCCCTTGAATGAAAAAAATGAAACCCTCTGCGAGTTTTTTAATGATGTCGATACATACCGACACAACTTGATTGA:1 + chr2R 9618227 3' + roo 9036 1 55.97 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTTGCCACCAGCTG:1 - chr3R 30087690 3' + roo 9016 2 55.48 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGTGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGTTCTT:1 - chr3L 18216456 3' - 297 6612 2 62.22 TAGAACTTGCTATTCGTAGATTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTA:1 - chr3R 20887380 3' - Doc 46 1 52.08 CGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATG:1 - chr3R 29627838 3' + roo 355 2 54.11 TGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTGATTATGCTTATTTTATTACGTAGTTTTGTCCTACCATTGCCAAAAAAAATGT:1 + chr3L 7024578 3' + 412 7517 2 61.64 TTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTACATCATTAAAAACCCGCTCAGATTGTAACTTAAGATGGAGCACGAACTAGTCGCTGCTGCTG:1 - chr3R 29680163 3' - 412 7069 2 72.66 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAAC:1 + chr2R 19633281 3' - jockey 4846 1 75.34 AGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGTCAATGGCTCAACCTGAGAATCAAATACCCCAAAAAAGGCAATAAAAACAACAATCG:1 + chr3R 31198708 3' - Transpac 4 2 75.69 GTAGATAACAAAAAGAACAAGGAATGAGCGCCGTACAGATAAATGCGTGAGAGAATGGCGAAAAAGAGAGACTCGAGGGCCGCTGCAGGTACAGTGCTCACCACTTCCCCTTTGGCAGGTTACGGTTCCAACTATAC:1 - chr3L 24790440 3' - diver2 147 2 62.77 AAGCGTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCG:2 + chr2L 15019944 3' - BS 4877 1 70.55 CAATTGTGTAAGACGTGAATTTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATATTTGCATTTCCATGGGAACTAATATCTATTCGAGCTGC:3 - chrX 4789137 3' + Quasimodo 7289 2 76.03 TCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGCTTTGCCAAACGATATTAAGTATG:1 - chr3R 11516516 3' + roo 9005 2 65.25 TAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAG:1 + chr3R 24084862 3' + roo 323 2 76.03 AGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACA:1 - chr3R 17243077 3' - hopper 27 1 67.12 ACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGAGCAAATTACCAACTGTATTTACTAAGCTTAACCTT:1 - chrX 17770402 3' - hobo 44 1 54.23 TGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGTTGCCCACCGACACGCATACACCCACATACATGCCCAGGGACATATACACACACACGGCTGAAAAGCGGTGCAAATAGCAAA:1 - chr3L 21764343 3' + hobo 2896 1 50.68 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAACTGTTTGCTATGGATATATTGCTTTTCAGATTGTAGGTCATAAATTTGAGACTCATCGAGAGCCTTTCAAAAATCTGCCTCGTATATTTCCTTCTCCTTTGGCTTAA:1 + chr2R 7895668 3' - mdg1 7054 2 74.48 CGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATCGGTGACTGTAGGAAGAGCTTTTGCGCCTGA:1 - chr2R 10417126 3' + 1360 3335 1 55.48 AAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTGCGTTTATCCTATGATATTCCATGATTTCTTAAAAGCGTATAG:1 - chr4 880310 3' + pogo 2035 1 70.90 GTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGAT:1 + chr2L 12932169 3' - opus 7178 4 69.70 TAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGGTTACGCCTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATACATATCCCGGGCTGTAATTTCATAAATATTTAATGCGT:1 - chr3R 17924452 3' - Burdock 6195 2 70.49 ATATAACAAAAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAAT:1 + chr3L 11684931 3' + Bari1 1662 1 50.00 ATAAATGCAACTAATATACTAATGTACATCTCCTAGGCTGTATATAAAAACTAACGTATTGAATGTTGCCACATAACCTACAAATCCGTGCCC:1 - chr2R 5953896 3' + roo 8609 1 70.97 ATAAAACGATTCAAACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCTATTACTTATTACTTATTACACTATATCTTCTTTCGCTAGGCTAATATAATATTACTTCCCAAGAATCCCGAGCTG:1 - chr3R 7579388 3' + Stalker2 346 2 61.94 ATTAGGTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAGGAATGTATGACTAAGAGTAAAGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACACAACCTCCGGACGTTGTGTTTCTAGTAGCGACTAGAACAGATGAAGAATCGCTAGCAAACAG:1 - chrX 21087573 3' - mdg3 5301 2 54.11 ACTTGGCTATTGATCCTGATGAAGAATATATATACTTAATATAGTCGGAAACGCAATCTTCTACTATACAATGAATATACAATAGTATAACCTTATACTCCATGAGTAATGGGTATAAAAACATTCGATTATCGACAACCAAGTAT:1 + chr3L 100628 3' - INE-1 91 1 60.27 AACCGAAGATATTCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGA:1 - chr2L 5728857 3' + roo 352 2 58.57 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCTGTTAGTTCCCGGAGTTCAGGTGGC:1 - chr3R 28749115 3' + mdg1 350 2 66.19 GTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTAAAAATATATGAATTTTAGTAAGCACTAAAAAGAGCACGTCCTTTTTTTA:1 - chr2R 3338778 3' - Juan 51 1 52.45 CAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTAGTTTCGATTACTCA:1 - chr2L 11475064 3' + jockey 4977 1 72.41 AAATTGTAAGTCTTTAAATNTATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTTAGTATATATATCTACGTGGCACCTGTAGGGTAGA:1 + chr3R 5870939 3' - roo 21 2 71.23 CGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAGCGAATGTGACAACAAACGCACGTGCAGAAGTGCAAATTTATTTTTCTTGAAACACACCTAAAACATGTGTTAGGGCTACTGCCTT:1 + chr3R 26188639 3' - jockey 35 1 51.94 TGTATTGATTCATCGCTTCTAACTAAATAAATATAAAAAAAAAAAGTGCTACTGAACTTAGTTTAGTCAAGAAACTATGTGTTGTTGGATATCTTTTGGAATAGTCAGCCTTGGGATTGATAAATTTTTAAGAACGGCAATAA:1 - chr3R 10030661 3' + BS 5074 1 67.83 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAAT:1 + chrX 14360821 3' - jockey 81 1 72.73 TAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTTACGGTTAATAAATTTACTGATCAATATTACTCGTAATTTGTATATATTGCAAACAGTGATTGGTCAAAACCT:1 - chr3L 11904757 3' + copia 5075 2 50.68 TATGGTAATTACGCGATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTT:1 - chr3L 19951191 3' - Ivk 61 1 61.15 GATTGTCGATAACTTCGATTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATATATGTATGTATGCAAAGACACCTCTTTGATAGTAAAACACTAAGTGTGG:1 - chr2L 21198177 3' - flea 4830 1 71.92 TAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGGATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGA:1 + chr3L 12890412 3' + hobo 2900 1 55.40 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACATACCGTTGATGAATAGAATA:1 - chrX 6891394 3' + hobo 2930 1 78.08 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAGTTACCAACTGCTCA:1 + chr2L 10909605 3' + 412 7494 2 54.11 TAAGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATGAGTGAGGAAGCGAACGCATGATTGAAAAAA:1 + chr2R 17345798 3' - jockey 94 1 76.71 AGTAATATTTAGAAGATTTGAATTATTAAGATTTGATTTATGTCAAGTGCTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTTTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTTGCGTCT:1 - chr2R 6526147 3' - jockey2 3233 1 65.75 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATCTTTAAAAGGTTAATAAATCGATTTCTGTGAATGGCAACCTGAGTACCGAAACACAATTATTCAGCCAACCAAAGAGCGATAATCAATTAGTAAGC:1 - chr3R 12519559 3' - roo 8686 2 68.06 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGTCCGACTTTGTTTTCCGACTCGATTAGAGTGACCGTTGTGGGATGGTGGAAAAAAGAGGAGGGCCAATGCTGAAACCGATAACAAAAATACCAGATGTGCGATAT:1 + chr3R 19094320 3' - P-element 10 2 74.64 CTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGTGGGGTGTGCGCACTGCAGTCACTCGACTGCTGCAGCTCGAGGCGAGCGGTTCGAAGGTTTTTCGTCGCTGGTTATTCACCG:1 - chr3L 1463594 3' - P-element 14 1 74.31 AAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCCATGCCCAAGGAGGATCCG:1 - chr3L 11364754 3' + Tirant 388 2 74.44 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGC:1 - chr3R 18832341 3' + roo 9029 1 50.00 AGAGCGGGAGAGCGTAAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGCCCAAACCCCGTAACTGGAACAAACAATAATAAATTTTCTTTATATTTTTCCCAATAATTTTTATCTTCTATGGATAATTC:1 - chr3R 19446010 3' - GATE 8286 3 95.08 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAACCGAAGGCTGAAAAACTTTTCATCTTCTTCATTTTCTTGATTTTGTTGTGCTGCTGCT:1 - chr2R 10716642 3' - roo 18 2 59.00 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGT:1 - chr3L 7024456 3' - 412 72 2 64.38 TTGATATTTGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGAAAGACGAATAATAACTTCGTTTTTGTTGCAGTCCGCC:1 - chr3R 11089691 3' - I-element 87 1 75.34 TTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTC:1 + chrX 14978625 3' - hobo 78 1 69.44 TATGTACATATGTATGTATATGTGTGTACATATTGTATGTATATTATAGCACATAAGACTCCATTCAATTTTGCTTGTGTAAATACATATAAGCTATACATATATTTCGCTTTGTTCCTAGGCACCCAACATTTTTCAATGGAATC:1 + chrX 6856240 3' + G3 4508 1 56.85 AAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATAAAAACCGAGGAGTAAA:1 + chr2R 14821264 3' + roo 404 1 69.66 TTAATTAATTAATATCATAAATATGCGACGGCGCTTAATTGCCGATGCAGAGCAGAGGGGGGGCAGCTCTAGCAGCGATAGCGACGACAGTAGCAGCACCTCGAGCGGATCCAAA:1 + chr3R 11953456 3' - transib3 2670 1 55.65 ATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACGAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCNACGCGTGGAACGTC:1 + chr3R 11284981 3' - blood 76 2 68.49 TAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTT:1 - chrX 9165354 3' - jockey 4846 1 75.00 CTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTATTCCTTTGAAT:1 + chr2R 17650686 3' - pogo 25 1 69.86 CAAATATTAAGATTCTTTAAACATAGTTCTTAAGATATTATCCATTTGTTGAATTATTTTTTTATTTTATTATTTAAGTTTGACCGCTGACTTGTTGTCGCATCGGTTATTCGCCCTGAACAAGCAATGTCGGTTTAATCAGTTTC:1 - chr3L 26570404 3' + Tc1 1345 1 54.79 GTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCAATCGAATTTGAACGCTTCA:1 - chr2R 21795249 3' + transib2 2759 1 65.28 TTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACGTCCGGAA:1 - chr3R 29627828 3' + roo 9040 1 60.00 AGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGGAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTTGGGGTGGGTGTTAGCCATTATTACAACCGTTATTTCT:1 - chr4 372946 3' + pogo 2047 1 56.85 CTCTCGATTCATTTACATANGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCAT:1 + chr3L 20061437 3' - roo 8722 2 58.62 TAAATATACAAATACCCAAAAAGACCACCAAGAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCTAGTAATACGATCTAACGCAAGTTAAAGTAAAACGTTTGTTTTTACGATAAGATATTCAGGAC:1 + chr2R 2879455 3' + Stalker4 7050 4 60.50 AACGGTGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGAC:1 + chr2R 18887073 3' - roo 32 2 57.60 TTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGAGGACGACCAGGATAACGCGTAAAATTTTCATTGTCAGCTCGGCCTGGTT:1 - chr3R 28014063 3' - roo 9 2 74.80 TAGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTC:1 + chr3R 18128504 3' - roo 8753 2 82.64 TTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTCTGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAACGACTGCGATA:1 + chr3R 28749237 3' - mdg1 23 2 70.55 ATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTG:1 + chr2R 10977188 3' + roo 9002 2 67.41 AACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACACTCATATTTAATTCAGTTGGCAGGCCGGGCAACAAACAAGCGGCTCCTGTTGATTAGTTT:1 + chrX 3921724 3' + 3S18 6077 2 53.64 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGCATATGTCTGTG:1 - chr3L 14422683 3' - roo 33 2 48.63 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTA:1 - chrX 291985 3' - 412 7099 2 52.59 TGCTTAGGCACCAGCACGGAGACAAGAGACAGGTCTGTCCGCGACCTTTTTGCCCTTTTCCGAAGGAACCAGTATCAAATTAAATCTAACGATTTAAAATTAAATTTAATTTTGAATTAC:1 - chr2L 7570112 3' - Rt1b 228 1 35.00 TATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAAATAAAAAAAAAGTTAGATAACCTTATAAACTAACTAGTTTTATTATTCAGAAAACTTTTGTTATTTCAATTCTTTAACTCGTCGT:1 + chr3R 20841476 3' + Juan 4166 1 49.32 TATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATTATAA:1 - chr2R 7720035 3' - HMS-Beagle 26 2 67.81 GCTGTCTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATGTGCCATGCAACACTTA:1 + chr3L 1463698 3' + P-element 2787 1 17.81 TTTAACTTTTTTATTACATAATTAGATCCTACTAACACTAATATTTAATATAGTTATTTTACATTATATTCATTTCCTCGTTCCTTACCAGATGCTATCGTTGATGGAGCAAAGGGAATTGATGTGTTTCAGATTTTAACTGACA:1 - chr3L 25730945 3' + Cr1a 4270 1 58.62 CTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACCACCTGGGTGGTTGGGTGGTAGAGTTGGGAGTTGCATCTG:1 + chr3L 23496653 3' + blood 300 2 73.05 GAACAATTCTGATGACACCCAGCTTTTAAATAAGCAGAGTAACCATAGAACAATGTTCTCAATAGCTGGCAATTCTAGGTAATGGTTTTAAATTGTTTTATATTTATTATAGCAGGATCGCAAGATCTTGTGTTATCATCGGGAAT:1 - chr3L 24300891 3' + BS 349 1 56.85 TCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAAGAGATACGTGAAAGTCACGTGAGTCATTAAAATGAAATGGCAGTAGAGTAGAGTCTAAGTAGAGAAGCATGACAAAGGGCGCATGGAGGCGATGATGCTGCTCTTGCACTG:1 + chrX 22862432 3' - jockey 11 1 79.86 CTGGAGCACCGCATCCGGCCAAGTGCTGACTTTGCTTACAAAGTTGCACAGCAACATTGTCCGCAAGCAACCCGACCAGCCAAAAACTTGAGTAACCAAGAGCTAGAGGAGACTTCTCCGACACAATAAAGAC:1 + chr2R 5071047 3' + Tirant 75 2 44.36 ACACACATACATACATACATAAGTACATATATTATACTTAATGAGCCAAGTTATCCAAGAATATAAATTCCGGACATATGCATGTGGAAAATATTTATAATTTGCGTACAAACTATCATCTAACAAGGCGACTGT:1 - chrX 4400978 3' + Quasimodo 39 2 71.85 CTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAAATATGCACGCTCAGGAAGGGATTTCAGAGGCTCAGTTTTTAAAGAGAAATTAATGATAAACAAAAAATTAACTTACT:1 + chrX 21639432 3' - 412 42 2 56.85 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCG:1 - chr3L 18183108 3' - Tirant 70 2 76.74 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATATATAAAGCTCTCCAAGTTTGATCTGCTTCCTTTTACCCGTGTAATTAAAAGTTCTCCAAATTTAGCTATACATCCAG:1 - chr2R 14884068 3' + roo 9026 1 52.74 AAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGATTGCCGGGCGAGAGCTGTAACTAGTTTGACATTAATTGACTGCCAAATATGCACAAGCGCATGAAA:1 - chr3L 13057342 3' + 412 7495 2 54.86 AAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTA:1 + chr3R 17243225 3' + hopper 1365 1 51.37 TTATAGTTCCTGAGATCTCGACGTTCATACGGACGTGGCTAGATCGACATGGCTATTGATCCTGATCAGGAATATATGTATATATTTTATATAGTCGGAAACGCTTCCTTGTTCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTTTA:1 - chrX 16116149 3' - INE-1 145 1 81.38 CTGCAGTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAAAACCTACATATGTATATATATGTATGTATATATGTATAGCACATATGCTTTATGTGCTTATGCGCTTTAGT:1 + chr3R 17421316 3' + pogo 2053 1 55.48 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATCCGATTG:1 - chr3R 11516474 3' + roo 389 2 72.79 GAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATCGATTGCCGGGCGAGAGCTGTAACTAGTTTGACATTAATTGACTGCCACATATGCACA:1 - chr3L 13057353 3' + 412 429 2 63.01 GCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCCCTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTTAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCC:1 - chr3R 8563538 3' - 297 6621 2 55.08 TAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTTAGTATATATATCTA:2 + chr3R 5870919 3' - roo 41 2 57.53 AACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTA:2 - chrX 9165340 3' - jockey 4833 1 65.52 TTAAAACTCCCCACAAATCTGGATGCAGGGGAGTGGCCTAGCAACAGCGAAGAAGGCTGCGATGCAAGAAGAGTCAAGAGTGCTCAAAAGGGAAAATATCGATCCCTGATATTATGTGGCATGTGTGTGTGAGGGCGTG:1 - chrX 6049745 3' + gypsy8 4661 2 56.12 TTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTC:1 - 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chr3R 31198534 3' + Transpac 287 2 65.60 TCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTT:1 - chr3L 22320162 3' - jockey 28 1 52.00 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCAATAGTTTAACAGCAGTGATATACCTTAAAGTTGAG:1 - chrX 11232533 3' - roo 81 2 79.29 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTTAGCTAACGACGAGAAGCAATTGAAAAATCCTCTTGGA:1 - chr3R 8197733 3' - pogo 20 1 69.18 TTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTATAAAGGAGTGTTTAG:1 + chr2R 4029416 3' + 297 355 2 58.62 AAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACATTTCACTGCTATCCTAA:1 + chr2L 14056794 3' - pogo 40 1 50.00 ATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAG:1 + chr3L 2532540 3' + blood 7330 1 58.90 GTCTAGCAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTT:1 + chr2L 15019948 3' - 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Tabor 6888 2 60.17 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTTCTTTAATTAAGC:1 - chr3L 20061323 3' + roo 9049 2 59.66 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAAT:1 + chr3L 414937 3' - 412 67 2 63.70 GAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGT:1 - chr3R 25796020 3' - BS 5071 1 68.53 TGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGGGCAACAAGTCGGGCGGTGCACTGGGCACCGTGCATTTGCAT:1 - chr2L 12896952 3' - accord 188 2 79.71 AGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAA:1 + chr3R 12376495 3' - HMS-Beagle 76 2 72.73 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACGCTGAAAAAAATATCTACTCGTATGTACAATGTACATTGTACAAATGTCCATACATATACATTGTCTGTTTCATTTATTTACCATACTTTGCCTTATCAGTTTTCTCATTAA:1 - 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blood 65 2 72.80 TACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCAATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTGTTATCTAACTTGAAATGCAATAAGGTGCTCATTTTTCCATT:1 - chr3R 20841392 3' - Juan 50 1 54.14 ATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAGTTTTGTTTCAATTTTCGCGAGAATAGGCGGCTAGCGAATACCCTACA:1 - chrX 3666521 3' + roo 9026 1 63.56 GATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACAATATTATAGCATTGTAAGATGGTCATGTTTCCAAATACTTTAGAGAACTCTTAAAAACAGAAGTCGATA:1 + chr3R 13255004 3' - roo 8717 2 56.16 AAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACGCAAACAGTCGATTGCGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTTAACACACTGCCAGCAATGCGGTGGGTGTTGCTGCCCC:1 - chrX 1769660 3' + hopper 1408 2 76.27 CAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCNCTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGANTTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAACATTTGAAAGGATTC:1 + chr3R 10737038 3' - F-element 95 1 76.03 TGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGCTGATAACTACAGTGAAACTTCTTTAAGCCAACTATTTTACTATCACAGTGAAATCTAAATGATGATGGTTTTAGGTTA:1 - 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roo 63 2 78.76 ATATAATATTTAAATAAATACATTAATATTTTACCTACTTTCTGTAAGTATACGTGTAAAAATACATTATTAAATTAGTGAGTATTTATACAAAAAAAATAGGTAACAGCCCTCTTTTCCACCTTGGCCATCGGCAACAAAGAAAA:1 + chr2L 14245057 3' + transib1 1935 1 47.26 TACACACACACACGCACACATAACAATAACCGAGATAACTAATAGCAAATTGCTGGCATCGTTCACCAATCACTTTCCCATCCACACTTCAATTTCGGTG:1 - chrX 5443708 3' + Quasimodo 38 2 64.00 CGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTTGTCTATAAATGTAATAGCCTGTAACCTCAAAAGAAACAGCTTTAATACCATATCCAAAATGGGACTGAAAAGGGCTGTGGGAGAATATTTA:2 - chr3L 12227743 3' - opus 137 4 67.81 ACTGCCAGTAAATCCCACTTACAGCTTATTCAGCGAACGCAAACGAAACCGAATCCAGTCAACCAACGAACCAAGCAGCCGGCACAAATTTAACCAACTGAAGCCACT:1 + chr3R 28061953 3' + Porto1 4296 1 63.89 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAACGTGCTGCATTCTTTTCCACTCGATTATACAACTATTCGAACTTTCCCCAGTTTCTCAATTTCCCAGTTGCCCAGCGAAGTG:1 - chr2R 18931797 3' + blood 7348 2 56.85 ATTTAATTTTGTTATACAAAATAAGTAGACGTGGCATTTTCTCGCAGTGCAGATATGAACTCACCTTGACAACCTCACTGGCGGCGAAGG:1 + chr3L 11183638 3' + Ivk 5374 1 68.89 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAAT:1 + chr2R 10977213 3' + roo 9044 1 57.63 CCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAGCTCAGTCTGGCAGTGACTTGGG:1 + chr2L 12932200 3' - opus 45 4 53.42 TTCCGGCCAGACGCTGTGTCAGCAATTTGGCCGGAGCGAGTCTTCGGACGATCGGTCGTAGCCGTCGCCCGGTTAACTTATATTTTTTTGTTATATAATTTTATTTTTTATTTACTATTGATATTTATAGTACTGGCAAC:1 - chr3R 19449897 3' - gypsy6 7485 2 99.29 TGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTCGCTTGTGTGTGTGTGTTTGTATCTGTTGGCAGCGCCTAGATTTATGCAGCATTTTATTTAAATTTCTGTGGTCTCGGATAATGGAGTAGCTAAGAGACCATG:1 + chr2R 19108606 3' - jockey 67 1 66.44 AATTTGAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCGTGTTGGTATTGGTGAGAGAGTAAGAGAGTTCTCTCCCTCTCTCTGCGACGGGGAG:1 - chr2R 21713219 3' - P-element 44 1 53.79 TGTATAATTTAGTTAAATAAAACAATTGAATTGCAACAGATGATTTAACCATATTTAATCTATATAATAAACTAAATTAATTAAATAATAATAGACTCTGTTAACAAATGCAATTACTGTTAATTTGTAAAATAAAATTAATTTAT:1 - chr2L 16366868 3' + Bari2 370 1 53.42 AACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAAATCAAGTTTACTGGGAATTTCACAGGTTTTGCAGTGACAAACGCGTAGCATACTTTTTGGGGCAGCGACAAGTCA:1 + chr3L 9907374 3' - BS 5039 1 51.39 CGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTAT:1 + chr3L 2317214 3' - 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chrX 2352659 3' + F-element 4687 3 59.66 AGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAGGTTACAACTTAAAATATTGTAAG:1 + chrX 22824256 3' + Gypsy12A_LTR 2236 1 51.37 TGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAATGGGTATGCGGTAGC:1 + chrX 14360835 3' - jockey 81 1 65.75 GCGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCAG:1 - chr2L 20407737 3' - McClintock 28 2 66.67 ATTATACAAATAAAAACAATTTACCAAAATAAAAATATAACAAAATGATTCCATGGAATCAAAAGTTAAAATCAAAATAAAACGAAGATGGGGCTTGGCAACCTCATAAAAAGATTTTAACATTTCTAATGTATGTTGTGCGTAT:1 + chrX 23439058 3' + P-element 2495 1 60.69 TCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTCAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAAATGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCCTACATGCTGNATATAGTGAATGT:1 - chr2R 7314571 3' - blood 7011 1 77.93 CAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATTCTTCAGCGTCTTGGCATGCAATCGTTTTAGTTTTTGATACCTTTGGTATATGACTATTGGTTTCCTCACTTTTGAATATTTCTCAC:1 - chrX 23102344 3' + Transpac 5206 2 67.41 CAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCC:1 - chr2L 23310613 3' - 1360 40 1 53.33 CTTAAAAAAANAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATCATACAATAGCCTTGAACATTCGTCTAAACAACCCGAACGAAATACCACA:1 + chr2L 18525697 3' + pogo 2030 1 65.75 TTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTAACGGTTATGCCGC:1 - chrX 3382304 3' + pogo 2049 1 57.75 AACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGGGCTGCCAACTTGTTTTCTTCACGGCGCCAAAAAGTATGCTCTAATTTTTCTGTCTTGTGGCGCCAAAATCAAAATGT:1 - chr2R 14427084 3' - jockey 4768 1 79.86 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCTTGGTCGTGTGCCTGAG:1 + chr3L 20680384 3' + 412 7496 2 50.00 AAAAATATGAATATATGTATATATATATAGATTTATAAACATGCATATATGTGTTGGTGGTACTCGAATATACATATACACACACTGTATGTTTCATGTGCAAATTGAACTAGCAGGTCAGGCGAGGACATATTGGGGCCATCGGG:1 - chr2R 22063069 3' + G3 4503 1 66.44 AGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATAGNATCAAGTTGGCGAAAATAGGGAATATTTGCCGACGAAAAATGTG:1 + chr2L 5729004 3' - roo 13 2 76.55 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACATTTATCATGCACT:1 - chr3R 24084798 3' - roo 8731 2 68.57 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTCGTG:1 + chr2R 9750277 3' - opus 7035 4 60.42 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATCATGTTGCATTTAAATGAAGGATAAATGCTCTTAACCGAATTCATTATCGGAATCCGTGAAAATAAGGTGGTGTATTCTTTTTAATTATCAATATATTAATAAATGCA:1 + chr3R 12519743 3' + roo 394 1 75.34 AGGGTGGCACTTTTTTACCACTCGACTCACACCCTACAATTTTGTGTGCGGGTGCTACTCGCCACGCACATCGCGGGTACTTACAAACACACAGTAAAGCTACTATTAAAATCGAACTTAAACTGATATG:1 + chrX 15189628 3' + hobo 13 1 73.85 GACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTCATTTGGTAATTAAATCAATGTCCATGTGAAAAACCTCAAATGCAATTTGTCATGCAATGCCGGAGAATTGAAAATGCGGAAAATGCGCTTCTAACTG:1 + chr2L 2291589 3' - I-element 24 1 68.75 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGTTTTC:1 - chr3R 5870802 3' + roo 9014 2 58.99 TAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGNATAAATGCGACAATAGAGGAAAATCATGATGCG:1 + chr2L 18181208 3' + blood 7331 1 61.94 GTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTCTTACT:1 - chr3L 20224109 3' + Chimpo 164 1 66.17 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCGATGCATCGGGTAGCTATAACGTAGTTTGCTATTGAAACGAATTTGT:2 - chrX 8681399 3' - jockey 36 1 63.19 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCCATGCCCAAGGAG:1 - chr3L 11364760 3' + Tirant 396 2 78.15 CTTTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGA:1 + chr2R 17350576 3' - F-element 99 1 73.97 CCGCGAAAACTAATTTCACNTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGAATCCAACTCTTTCTTATCCACCGTGCTCTGCAAGTAGCGAAA:1 + chr3L 11826041 3' - X-element 51 1 47.26 AAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATGTTGCCATGGCGAATATGTCCTG:1 - chr2L 15523035 3' + 412 425 2 63.01 TTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACTACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAA:1 + chr3R 26242590 3' + roo 385 2 63.01 ATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTAATGTCCTTGTTCGTCCTCAC:1 + chr3L 20061461 3' - roo 2 2 76.11 AAAATTTGCAATATTTCATTTTTTTTTATTCCACGTAAGGGTTAATGTTTTCAAAAAATGGAGCAGCTGCTTTAATTTTTTGTCCACAGGCCACATATCCAAATATTGTTTCAAAAACAATTTCATGTTT:1 - chr3L 7837926 3' - P-element 150 1 55.38 ATAGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACC:1 - 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chr2R 11777983 3' - hopper 43 1 55.46 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCG:1 - chrX 8681451 3' - jockey 32 1 59.09 TTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACTGCGATTTATAGCGCAAGAAAT:1 - chr2L 15019855 3' + BS 5059 1 56.52 ATTCTTTATTTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGGATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGNAAAATAGTAGTTGCTCAATTTCATTTT:1 - chr4 372983 3' + pogo 2016 1 76.43 TGTATGTACATATGTATACATGTACATATATGTATGTACATATACATACATATATGTATGTGGTCCATTCAGTTACTTAAACATACAAATCTTCAAATCAAAAATTCTCATTAAAATGAATTAAAATTTCAATTGTTGTACATTTT:1 - chr2L 6644053 3' + invader3 5087 1 65.75 TGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTTGGACGCGCTGGGGCCTCCTCG:1 + chrX 8839379 3' - Tabor 6898 2 59.12 ATATTCCTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATGTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGTGTCAGCGTCCGTGTCTTTGTGTTGCCGCTGC:1 - chr2R 16355814 3' - hopper 88 1 75.34 TTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTGAGCTTCTTAACGTACGA:1 - chrX 22679621 3' - Doc 50 1 47.69 ATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCACGATTATCGCATACAGACTGTGTAA:1 + chr2R 10119113 3' - Juan 4045 1 68.28 ATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACTATGGGC:1 + chr2L 6637467 3' + 1731 4585 1 59.32 GAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCAGGTCACCGTTGACAGGAC:1 - chr3L 22518921 3' + hopper 1380 1 51.26 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGCGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGAACCCGCTTTTTTTTGTTGCCAAGTTTTTTGCATGTTTCGCATG:1 - chrX 860799 3' - hobo 40 1 60.91 CTAAGAATACTTTATATAATTACCGCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATCCACGTACTATATGATAGGTAATAAATAAGTGGCTTCATCACCAATAATTA:1 + chr2L 10536571 3' + flea 4950 1 64.14 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCAGGACAAACCGTTGCAATTGCCATCTAGTTGCTGTG:1 - chr3L 2907315 3' - 412 7140 2 81.51 CTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTT:2 + chr2L 15019974 3' - BS 4847 1 50.00 AATTTTGGCCGTCACTAAAAAATTGGCTGCATGTGCCAAACCAATTTTCTCTAATTTTCATTCACTTTCGTGATCTTGGACACATCACATCGATTCAAAATCTCGTTCTCTGAAACCAATAAAAACATATCGTTAGAAATCGCTAA:1 + chr4 909200 3' + 1360 3326 1 67.81 TGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAATTTTACTTGAATGTTTCGGCTTGAACCCCCGCTGCTTTGA:1 - chrX 17884442 3' - pogo 1 1 76.71 TTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAAGTGCATCTAACAGGTTGGCATAAAAAACAATAAAAAATACCCTTTACGCTTATTAGATTTTAATATATACTTTCAAAAAAAAACCGCTCTCTAAATTTT:1 - chr3R 10144329 3' + Chimpo 162 1 69.18 CCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTTATTTAAAGACTTTTCGCAGATTTTATTGGCCAAATAAATGT:1 + chr2R 19633361 3' - jockey 4766 1 81.51 AGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTTTGGCCCACTCCTCCTCCATTATATATTGGCAACACCAATGCCCAAGCCCCATGAATGCCGACCTGCCAATCAAATTGTGCTGCCATACAAATTGTT:1 - 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chr3L 14422728 3' - roo 71 2 68.35 AAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTACGGATCTTCCTATAAATACGGGGCCGACACGAACTGGAAACCAACA:1 + chr2L 14616251 3' + P-element 2849 1 45.37 CACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACGAGACTGAAGGAACAAATTCTCGACTTGGCGCTG:1 - chr2L 9894852 3' - P-element 79 1 27.01 CGAAGCCTTCGCAGCAGCGAGTCAGTTTTGGGATTCTATTCCATTCTATTCTTCTGTTGACTCTATTCCATTCTATTTCTTTATGAATTATGTATTTACGTTACTCCTGTGTTTGTTGTCCCTTTCGAAG:1 + chr3L 24352567 3' + rooA 7537 2 70.77 AATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGTAAAATAATTTTTACTTAAGATAATGTTTTCG:1 + chr3R 2425650 3' + 1360 3326 1 73.10 CCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTGGGACTTTACAATCGTAGAGCCTTCTTTAGACCCTCCTTGAAGTTAATTTTCTGGCTTGCACTTGTCTTCCTGCTGAGTGGAATCCTGTT:1 - chr3R 22708933 3' + roo 9030 1 57.34 CAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTCACCTTGCAGTTCTCTGCAACAAACTTTTGCTAAGCCGAGGCAAGTATGCAACATTTTCGCACAGC:1 + chr2L 11867373 3' - 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hopper 37 1 55.65 CGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAAT:1 + chr3L 11364874 3' - Tirant 70 2 70.90 ACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCATCTATTGTCACCAGTGGGTTTTCAGATGCAAATAATTCGGTCGAAAACGCGACAAAAACAATAGCCATGCCTTGAGTCGAACAATAACGAAAGCCAAATAGATACC:1 + chr3L 7389846 3' + roo 393 1 73.29 ACAACAAAAACAAGAACACCGCCATTTCAACAGGTAACTGACTTTTTCGACAGTCCCCGTTGACGCTCAAAGGTTCGAGAGGTTGTAGGTTCACAGAAACTGTATCGCGGACTATTACTCTTGTCATCCTCAAACGATTGATTTAT:1 + chr3L 2580675 3' + I-element 134 1 61.64 AACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGTTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTGC:1 - chrX 20361930 3' + hopper 1394 1 66.15 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACA:1 - chr2R 16274562 3' + roo 8990 2 71.92 TTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAATTAACTTATTTTTTACATTGTGTATAAATGTGCG:1 - 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hobo 13 1 72.93 AGTAAAAACAAAGACACTAGAATATTCTAGTGCCTGTGGTAAAAACCTTAGGCAACCTAGTGAGTTATAAGCAGAAAGTGAAGCAAATTTAGCAATTAAAAAGAGTATTTAATGGTCGTATTACTTCCACTTATTGTTTGACTGAC:1 - chr3L 11314355 3' - Tc3 318 1 60.27 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTAAATAAAACTATTTACTAACTCTTTCAAGTAATAC:1 + chrX 8314514 3' + roo 8985 2 80.14 TTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCT:1 - chr2R 9007052 3' - jockey 4840 1 57.53 TCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACTTGCAATTTTATCTACTAATTCGATTTATGTTTGGAATTTTTAT:1 + chr3L 2317286 3' - 412 7 2 79.45 CAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGTGGGGTGTGCG:1 - chr3L 1463665 3' - P-element 61 1 31.67 AACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTGTGGAAC:1 - chr2L 10909481 3' - 412 7104 2 50.68 AAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACGCAGAGTTGCCGCTGTACCGGCAGC:1 + chr3R 17627568 3' - roo 8670 2 60.38 CAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGTTATTCAGATTTATTCTTCAAAAAAGAACTAGAACAAACTTTTGTGGTCTTTTATGTCATTC:1 + chr2L 4864494 3' + mdg3 207 2 59.59 AGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTGGGCGCGAAAGTTTTGAACATTTTCAACTATTCAACGTCAAACAAAGAAAACTGTTGAACAACTCAAAAACAACAATTAAAATTTTTTAATGAAAATGATTTGCT:1 + chr2R 11844371 3' - I-element 19 1 71.23 AAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTT:1 - chr3L 14422717 3' - roo 21 2 49.00 TTTCTTTTTGCAAATCGATAGAAATTTACAAGACTGTGCAAATATATTAATACATTTTGCAAAAGTGTGGGCGTGGCAGTTTTTGGGCGTTAAGCATATTATTACTCTAATGTCGGCATTTACTGTACAACTAACGCGTG:1 + chr4 1097139 3' - INE-1 313 1 65.71 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCTGGTTAAGAGCGATTTACATACAAATCGCTGCCTTTTGCTGGCTCTTTTTTGTCGGTCGACGTCGCCACATACAAA:1 - chr2R 12101904 3' - hopper 35 1 59.57 TTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAGTATCCTTTGTTTTGGATATTAAAAGTGGTATTTAAATGATGAACAGTT:1 - chr2R 22521882 3' - pogo 65 1 64.83 TTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGTCGGCATTAATTTCTGACTTCTGCCTTCGGAC:1 - chr2R 20052411 3' - transib2 87 1 77.40 ACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCAAGTGTCTGCTGCCGACGAATAC:1 - chr3L 5770920 3' + P-element 2811 1 22.40 GTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGGATATCATTTAACGCAAACATCTACACTTTCACATATATGAATCTCTA:1 - chr2L 512368 3' + roo 402 1 76.03 ATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAA:1 + chr3R 12078727 3' - hopper 43 1 54.79 GGCTGCTGAGCTGGATTAGACCTCGCGCTAGGTGGTTGGGGTGCGTGTGAAGCTTGCTATAAACAATATAAAAGCTAATTTTAGGTGATAGTGTAAATATCGGTTGCCTCACTTTTATCAAGATTGCGTTGTTTAAAGCATTCTTT:1 + chr2L 2206700 3' - F-element 4490 1 60.96 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCCGATACCGACCAAATAATATAAAAATGTTGCCAAAAACAAGAACAA:1 - 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X-element 4276 1 51.59 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTTTCCTAGATGTATTTCCATCGAAGCAGCCC:1 - chr2L 5728835 3' + roo 9032 1 58.22 ATTAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCATGTAGACAAGGACGATTGCGGGCGGGTGAA:1 + chrX 3533195 3' - 17.6 6995 2 77.24 AACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGCGGGCCAAAATTAAGAGAAACGGGCTCA:1 + chr2R 10977257 3' + roo 9060 1 75.34 GCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAACCCAACTTTATTTGTTGTTGTAATTCTGGATGTCATTGTCGGTGTGCATCAAGTTTGTTAGTTTTTTTTCTATTTGTGAAAAAACTGTTATTCCCCCTTATTTCCTCCTAGCATT:1 - chr2L 3892919 3' + 1360 3385 2 82.19 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAAACATTTCACTGCTATCCTAAGTTTCCCATTT:1 + chr2L 14056805 3' - pogo 29 1 56.16 TTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGACACTCCACTGCGGTGAGTGTCGCCGTAAACAATTTCTGATCGATGGCTCCCGAAAATAATCAAATAATTCGATTAAACCGATTTCGCTTAGCCGGTTT:1 + chr3L 6050279 3' - 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HMS-Beagle 9 2 77.30 ATTTATTTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGCGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGC:1 - chr3R 15283658 3' - BS 5080 1 71.92 CTAAATATTATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAAT:1 + chr3L 6015661 3' - roo 75 2 70.55 ACCAAATATTATCAACAAAAAACGTTTGCCCAACCATTATTATTAGTTGAGTTTATTAAGTCTTTACTTAATTTAGCTGTTATTATTATGGTTCAATTAGTTGTAATTAAGTTCATTTAGTTTTCACTT:1 + chrY 3649205 3' + FB 331 1 65.12 TAAATAATTTATTAAACGAAATTATTTAACGGACTAGCGTACTATTGCCCTTTTTAGACAACCTAATCTAATCGGTATCAATTTAAACGATTCATTCCTCAGATAATTGTCCTCTGATATTTTTTTAGGAGTAGTTAACTAAAACT:1 - chrX 21636123 3' - jockey2 3396 1 63.70 CCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTCAAACTAAATAAGCTTTCAAACTGAAATAAGCTTTCATGTCTACATTTGTGATACTCTCTGACCAGAAA:1 - chr2L 21876751 3' - X-element 65 1 52.74 AACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGCGCTAAGAACGTAATTTCACTATATTTCATTCAA:1 - chr3R 20887351 3' - Doc 18 1 68.97 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGCATGGCCCATACGCATTTTGTTCTTCTAGGGGCTTTGGTTATAACTAGTTATTATTTT:1 + chr2R 8436280 3' + 1360 3321 1 75.45 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGNGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTGTAAGTGG:1 + chrX 20330621 3' - P-element 19 1 60.55 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTGGC:1 - chr2L 2057810 3' - 412 68 2 64.14 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGATTTATTTTTTCCATGGAATT:1 + chr3R 4527316 3' + mdg1 406 2 71.32 GTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAATAGAAGATATCTCTATTTTAAATTAATATTTATATATTTTTCTATTCTTTATTGTTTGTTATTTATAAATCAGGTTACAAAGTAAATTAGCGTAACTGCAACGTTAAATGAATT:1 + chr3R 7579532 3' - Stalker2 7258 2 77.40 GATCTGGAATGTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGC:1 - 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chr2L 11867244 3' + hobo 2924 1 71.23 ACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTACTAGCTAGCAATGTCGCCACGTATTCGGTTCGTTCGTTTTTG:1 + chrX 15191432 3' + hobo 2906 1 60.61 TTAGTTGTGCAAACTGCACTTTACACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCC:1 - chrX 22679663 3' - Doc 107 1 68.97 ACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGACCGCCACC:1 - chrX 20330554 3' + P-element 2801 1 20.74 CAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCC:1 - chrX 13091065 3' + P-element 2798 1 24.66 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGG:1 + chrX 14360806 3' - jockey 63 1 78.79 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACAAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAATACTATGTATGCAACAGTTTATCTAATATGTATAACATAGCTTACCATGAGACCGATAGCCGTCACAGAAAT:1 + chr2L 8120250 3' + roo 9033 1 55.15 ACCTCTTCGCCCTTGGCCCGTTGGAGTCCAAGGTCCAGTGCGGTGCCATCCCCCTCGTTCCACCCAAACTTCTCCGCTCGTTGTCCCGCATCCTTCTGGTCTCCTTTC:1 + chr2R 2994313 3' - gypsy8 118 2 42.59 TTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTG:1 + chr3R 20983935 3' + hopper 1336 1 74.31 CTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAGAACAACAGCAAAAAATGAGCGATGA:1 + chr3L 13057488 3' - 412 24 2 69.18 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATACAAG:1 - chr2L 18311425 3' - opus 51 4 64.96 TTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGT:1 - chr3R 15003097 3' - Doc 34 1 61.76 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCT:1 - chr3R 19965202 3' - jockey 37 1 60.77 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCACACAAAGCGGATTTGTGCGCCTTCCGTTAGCTATCGTTTATTGTCATCAAGTTGAAAACTTC:1 + chr3R 23964909 3' + hobo 2930 1 65.96 CTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATT:1 + chr2R 9607365 3' - P-element 73 1 30.60 CTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGGTTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGTGAATGTTTAACGAAT:1 + chrX 15286971 3' - X-element 4382 1 56.31 ATAAACACACACACACACACACACACACACACATCCGTGA:1 - chr3R 16591784 3' + accord 7027 2 85.00 AAATAAAATCGGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTC:1 + chrX 13628826 3' + roo 9032 1 51.67 CGGGAGAGCGAGATATGTATGTACGTATGTAATATGTATTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTTTCAGTACCCTCAGGCCAGCCTCCCCTTACCCACCACCAACAATTATCCAACACAACCCCA:1 + chrX 22563498 3' - 412 236 2 58.22 TATATCACGCTCACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGG:2 - chr2R 7314647 3' - blood 7088 2 67.81 AGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTG:1 - chr3R 20887385 3' - Doc 52 1 48.97 AAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAGATATACCTATAAAAATGAATATGAATGAACAAAATATCTAGATTCTACATTTTAATTGTATCTTTAAAAACGCATGCAAGCTG:1 - chr3L 20224114 3' + Chimpo 148 1 59.03 CGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCAGAAC:1 - chr2L 20407734 3' - McClintock 5979 2 67.81 ACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTGGTAAAATTGCTGG:1 - chr3L 2532408 3' - blood 7032 2 67.15 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTAGAAAAAAGTATGAACAGCTGGTACTTTAAAATGCATTTATAAGTAAGCAGCACATTATGTTATATTATTGTAGTAAGTTGATTTGATTCATTTCAATTGCTTAGCAT:1 - chr2L 2544693 3' - blood 7026 2 71.23 GGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGGGGACGGATGGATAACCCCAGCCCGG:1 + chr3R 11285040 3' - blood 14 2 74.13 GTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGCAAAATGGGGGGCAA:1 - chr3R 11284877 3' + blood 363 2 70.09 TAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCG:1 + chr2L 18219432 3' - copia 17 2 70.00 CTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCCAGAACGCGGTCTGTCGTTTACTTTTAATTGGAAGAAAGTGTAATTTGGAGTAGAATCTTAGAAGGGGGGTGGGTTTCTTTTATAGTTCCTAAA:1 - chr2L 8284344 3' - Doc 411 1 55.40 AACAGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCA:1 + chr3R 21794115 3' + hopper 1331 1 77.14 TAAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAGTGGCAATTGTTTCTCTGGCTCTCAAAAAAGCTCACTCTCGCTCTCCACTTGGCCCATTGAATCTCGGAGTGGCGCTGCTCCATTCAGTACCGAAAGCGACGTGGTTGTGT:1 - chr2R 13897677 3' + blood 165 2 82.96 CTTCATACATACATATTGCAGAATTTGCTAGTGTCAGCACTTGGCTGTCACAAGAGATCTGCCTGTAGACCACACTAAGATCAGATTCAAATACAGGAATAAGAATACAGGAAACGGACAAAATGACAGACTCTGCCGCA:1 - chr3L 25691432 3' + mdg1 7271 2 67.86 ACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCCGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAA:1 + chr3L 12890403 3' + hobo 2890 1 52.86 TTCCAGTATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATT:1 + chr3R 11937858 3' + hopper2 1539 1 61.11 AGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGAATGGGGGGCATGGACTCATTGGTGG:1 - chr3L 2532420 3' - blood 15 2 67.23 GTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGAAGCTGCAGCAAACTGAAGTTCGCTC:1 + chr3R 12078760 3' + hopper 1405 2 76.03 ATTAGAGACGTACAACAAAACGGCACGGAATAGCAAAACGGTTGTACAAGAGCAAAGAGAGAAACCAAGGAAGATCGACAAACGGCGAGGAATAGCGCTCTATGCGTTGCTCACTATGTTCGGGATAAAAATGCCAAGGAACACAA:1 - chr2R 4626545 3' + Bica 243 2 65.75 AGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCACCAATACTCAG:1 - chr3R 8563515 3' - 297 45 2 51.37 ACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAGCTTGCTATAAATGTAGACCGCACTG:1 - chr3R 29283173 3' + hopper 1395 1 64.91 AGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTACATACATAAATAAATATTCCAAAGATGTTGTCTATGGAATATCCTCCGTTACTGTCTTTGTCAATGAAGAA:1 - chr3R 7049346 3' - Burdock 6188 2 58.22 AATATGTTTAAAAGAAAGAGAGAGAAAAGTCACGCATGACCCTCGACACAGTCAACCTCAATCACATTCCGATTTGTGGCAATTATTTTGGAAAATCTAAAATGATAAG:1 - chr3L 8824533 3' + transib2 2417 1 80.73 GTGAGAGGTTTGGTTTTATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGAT:1 - chr2L 15019893 3' + BS 5013 1 71.92 AAAAAAAAAAGAAAAGGGAAAATTAATCCTCATATCTAAGTAGTAAGCAAACATTTTATTATTATTAATTTGCTGCTTAAAACCGCTATTTTATTTAAATGTCTTATTCAAGTGCAGTTCATTTGTTCATTCATTAAAGCGCGACA:1 - chr3R 22555267 3' + Bica 337 1 80.82 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATATCCACGTACTATATGATAGGTAATAAATAAGTGGCTTCATCACCAATAATTATCATTATGGCTTGCATTATTTATTTAAAATCA:1 + chr2L 10536603 3' + flea 4997 2 63.08 GTGTGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGA:1 - chr3L 27415236 3' + transib2 2741 1 73.97 TCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCGGTCG:1 - chr3L 414828 3' + 412 7504 2 55.32 TGACTTTATATAAGAATATTTGTCATTAGAGTATTCATCTTGCGGCGTGTGAAAAATTAATAAGGGTGTAAAGTGCTTTGGTGCTTCTACATTTGGTGCAATTCGTAACGATTCCACCTGAGGCTGACTAATCCGAGTCCATTTGT:1 + chr2L 12162704 3' + 1360 388 1 58.22 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAAT:1 - chrX 17792507 3' + roo 9022 2 54.79 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTT:1 - chr2R 5953818 3' - roo 8744 2 71.23 ATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTTTGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTAAATAGCCGGGCCAACAAAGACCGTTAAAACAAAGCACGG:1 - chr3R 22647842 3' - transib2 77 1 68.97 ATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATG:1 - chr3L 2532457 3' - blood 7092 2 75.34 TCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACACCTGCAAC:1 - chrX 13091036 3' + P-element 2827 1 43.15 ATAAATTTAAAAAATTAAAAAACGTTGAATTCATTTTTAAAACAAAAACAACCAGTTTGCATTGTCACGCCAAGTCACAAAATTACTTCTAGAACATAAATATTCTGTTGACAACTCGTCCGGAACTAGTTTTTCCATTTTCACTT:1 - chr2L 21318005 3' + HB 318 1 66.44 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCTAATTTCAAGTTTAGATTCACTTATCTCAG:1 + chr3R 24084939 3' + roo 400 1 78.08 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTT:1 - chr3R 21794048 3' - hopper 60 1 62.86 AGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGTCTGAACGTACGTATGTATGTG:1 - chrX 20361983 3' + hopper2 1527 1 78.10 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTTTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGT:1 - chr3L 18183063 3' - Tirant 40 2 57.64 TGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCCACAAAGAACGCTTTTCGCTCCGCTCTGATCAACCTG:1 + chr3R 19134466 3' - transib2 76 1 74.10 AATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAAGAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAATTGTAGATACTGTTGTGGCTCCTTGAAAGCGTATACCCGTTGGACATTTT:1 - chr3R 30955281 3' + G6 2018 1 70.23 TGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAGTCCTTTGACCACGC:1 - chr2L 6637350 3' - 1731 4375 2 61.64 ATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCGAGCACAAAAGCTACTTAAACAACCGTTAAGTCAAACACTTT:1 + chr3L 18183215 3' + Tirant 8485 2 68.89 GGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTG:1 + chr3L 10033666 3' - blood 115 2 39.86 ATATGTACATATGTATATACATACTCTTAAATACATAAAATAACTTATGTGCTCAATGTGAGTTATAATTATGGTATTTTAAAATAATTCCACATCCCCGGCGCCCAAAATCCCGCAAAGTCCAAATAGGCGCTGACACGGAAAAC:1 - chr2R 7030664 3' + G3 4507 1 37.67 TGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTGTTTTTTTTTTATTAATCAAACAGCCTTATTATTTATTAGACATTTTTCATAGCTTTCTGTAGATAATTACTCTAAATAAAGAACAGGGATTTTTTACCTTCAAATATTTTAATCTAAAG:1 - chrX 16998236 3' - diver 5890 2 68.49 ATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCA:1 - chr2L 15874841 3' + mdg1 367 2 55.48 TCTATGATTTTGTGTATGGCTGTTCCTATGTGGTTATGTATGTGTGTGTGTAAGTATATGTGGTCTTATACTATGACACATATGCTACTATATATATATATATAGCTGCCCCAGGAGCAATCAACCCCAAATGT:1 + chr2L 21802947 3' - Quasimodo 72 2 75.37 ACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCACGATTATCGCATAC:1 + chr2R 10119102 3' - Juan 4057 1 63.70 CAATAATAAAGCAAAATAGATCACTTTTGCATACGCGCGACACAACCGATCTCTATGAATGCAGATTTGCGACTATTTCGGAGGAAGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCC:1 + chr3R 31264498 3' - BS 47 1 70.00 GTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCACGAGAGGAC:1 - chrX 20330513 3' + P-element 2862 1 60.00 TGAGGGCATTAATCGTGGAGAAGCCAAAGCAGACGCAAGTGGACTCGTTGACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAGTAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGAGGCAAATTACACACTGGGAGAAAAGGGTTGAACGG:1 + chrX 5076061 3' + micropia 5310 2 75.86 TTCCTCGTTCCTGTTCTCTTTTTTATATCGCGTCTATATCTTCTCGGCGAACTGGCGCCACTTGAGCTTCGCCGTGGCGGATTTGAGAATATCATCGGTAAGCC:1 - chr3L 21493520 3' + Cr1a 4343 1 62.50 ATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACAGGTGGCCCTTCCGG:1 + chr2R 21795367 3' - transib2 38 1 59.59 AAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTTCC:1 + chr3R 6685847 3' - 412 7100 2 53.10 TAAGTAAGTAAAATAAATTAAAATAATAATAATATTAGCATTATATATATTAGCAGTGTATCTTGTAGATTCAACTCAGTTTTTCCTATACCATTATCGCACTTCGAATTGCAAACGGCGACTGATGCGTTTATACTTAAAGTTA:1 + chr3L 12714361 3' + HeT-A 1 1 64.14 TTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATATTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGGCCGCCTTCCCGGCTGATTTGCTGTTTGTGTGTGTGCGAAAG:1 - chr3R 29283198 3' + hopper 1337 1 68.49 CTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCATATTTTGTGCAACCGAGTAAATCAC:1 - chr2L 15085596 3' - opus 7025 2 65.19 GGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATATATAGTAGCATATGTGCCATAGTATAACACTTGACTACATATACTTATGTATATGTCTTAAAAGTTAGTTCTAGGAGATTTTAATATACAAAA:1 + chr4 1266627 3' - HMS-Beagle 6817 2 71.03 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGG:1 - chr2L 512415 3' + roo 9024 2 55.00 TCAGCGTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTCATATTGCATGGGCGAGTGCATTTGGGTTTGC:1 + chr3R 17077882 3' + 1360 3300 1 77.40 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGCAGGATATCGCGC:1 + chr3R 21794142 3' + hopper 1352 1 59.59 TGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAAC:1 + chr2L 15523109 3' - 412 10 2 61.33 GGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAAT:1 + chr3L 11364899 3' - Tirant 40 2 54.26 CAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACATTAAGTAATAAAATTCGGAAAAGGGCATTG:1 - chr2R 18886920 3' + roo 396 1 74.29 ACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTATATATAATAGCAATTATATTACTAAAAGAAATTGACAGTTAAATTAAAAACAATCCTATTTTAATATTAGCCAACTTATGTTATAC:1 - chr3R 20200364 3' + Transpac 272 2 50.68 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATAAAAACCG:1 + chr2R 14821255 3' + roo 400 1 65.71 CAAAGGAGATCGGGTAATGAGATCCCTCGGTTGCCTTCTATTGAGCCTCCTTGGTGGGCGAGATCTGTTTAAAGCGCGTTGTGTGTTAATGTGTGACTTATTATTGTGCCGTCAGATGCAACGTCATCGTATCGCATCCATCACCA:1 - chr3R 23635714 3' - X-element 4511 1 53.42 TAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTATA:1 - chr3L 9635313 3' - Doc 46 1 58.82 TTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAACATAAAACCATGTATTTTTAATCAACTAGCTTTACGAATTTATTTCATAATATAAAGTTACTTTTTTGCTGCATACTTTTCGACACCTTAGGTGCTGGCATA:1 + chrX 18745467 3' - Juan 4044 1 71.92 GATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAATCAGATTTAAGCCCTTTATTT:1 + chr2R 17350632 3' - F-element 42 1 66.21 GAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACCGACTCACCGCACTACCCAAAATCGGTTGCTAAACAAGTTTTCGGTTCGTTGTCTGAGCTTCGATGTATGGGGCACACACCTCTCAGCT:1 - chr2R 5953771 3' - roo 8697 2 63.01 CGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATAATAGATTTTGTCGCTGTCGATGATTGCCAG:1 - chr3L 18183050 3' - Tirant 29 2 67.12 TGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAAAATGTTCCCACAAGTAGTTGTATTCATGTAA:1 - chr3L 27349979 3' - 297 6614 2 58.22 TATTTTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGA:2 + chr2L 14056766 3' - pogo 68 1 66.44 ATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTTTTAAGCCAACAAAAAGTTCGTCAATTTAT:1 + chr2R 17650676 3' - pogo 29 1 65.71 CTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAA:1 - chr3L 24213779 3' + invader2 5029 2 69.86 CAGCGTTGGTCTTAGTTCATATTCGGAACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATATAATATATATGTTAACTCATCTAATCTTTTAATGCTTTTCAGTGAAATCCATATTTGTTTT:1 - chr2R 13255964 3' + 17.6 7360 2 63.70 AAAGTCCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAAATGAAAAAAAAAAAGGCGCCAGTCCACAGACTCGAT:1 + chr2R 11558076 3' - 412 48 2 50.00 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACCATCTTTGTA:1 - chr3R 29680225 3' - 412 85 2 81.51 GATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGA:1 - chr3R 24072040 3' - jockey 66 1 57.03 AATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAGGAATGCTTAAGATTCAAAAGATACTTTTATTAATGCAAGGCTGTATCCAAAGGAGTGCTGGCATTTAGTATATATATCTACGTGGCACCTGTAGGTTAGAC:1 + chr3R 5870940 3' - roo 8684 2 70.55 AAGGACAGATCAAAAATAAAAGAGACACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATTGTTTGTATAATTTTAATTAACAAATATTGCAGCAAATTTCATCTACTAAATTATGGATTACGTTG:1 + chr3L 22257855 3' + mdg3 196 2 53.57 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGATGTTATTTGTTTGAAAA:1 - chr3R 20904959 3' + roo 9013 2 60.96 TATTAATTTTTGTAAAAAAAACAAGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCCGCCGGGGCTCTCGAGTGTCGGGCCCTCAGATCGCCAAGGTTTGGTTTACAACGCAAAAGCGACAAGAAGCGAAAAAGGG:1 - chr2R 11777954 3' - hopper 21 1 65.08 ATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTCACCTTTCTTTGCTGCAA:1 + chr2R 22796889 3' - jockey 4806 1 65.07 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGACCGCCGTTGTGTGCACACACACGAGCAGTTGTGTTGCTGTTGTTTTTTGTTGCTGGAAGGAAAACCAA:1 - chrX 2300558 3' - P-element 24 1 59.66 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGAATGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAATGTAAACAGGG:1 + chrX 9846826 3' + transib2 2764 1 66.41 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATCGTAAAAAAAAAAGTTTAACATAAAGAACCTAAAATTTGTTGCCTACTCTTGTGGGCTGTGAAAAGTGATATGAAGTCAAGTGGTTAATTAGTTTGCCTAATGGAATATTTTAG:1 + chr2R 17207881 3' + jockey 4982 1 64.38 ATCGCAAGAAGAGGGTTCGTAACTTACACGAACATGTTACTAGACAGGCCCCGAGTCGCCGACGCCGCCGAGGCCGTCAAGTCGCCGTCGCTGTGACAGTCAAA:1 + chr3L 12224987 3' - opus 116 2 57.69 ATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTGGTTAAACCGTTTCCTATTCAAAAGGCCCTCTTGTGCTACCAATTTATGTGCAATGTCCTTGATGACCAAGGAATTCCCATGCGT:1 + chrX 2956313 3' - copia 4904 2 61.64 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTTTCATATATACTTTTGGTCTTTGCACACATAAATATAAATTAATAAAA:1 + chr3R 18128563 3' - roo 8696 2 62.33 TGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATACCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAAGATACATACATTTTTATTAACCTTTGCTTTGTTTTAAAATGTTAATTATCT:1 - chr3R 25433821 3' - FB 69 1 64.38 CCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTACCTAAACTGTAAGACCATTGAGGTACTGGACGATAGTTTGTAACTGATGTGCACAGATTACTGCATCTTTTTGAGG:1 - chr3R 15003062 3' - Doc 9 1 80.14 TTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCA:1 - chr2R 9007029 3' - jockey 4817 1 57.53 GAAACTCGAATATAGCATTCTCTCTTGTTTATTATTTCAAGAATTAGCGCAGATGTAATGGTAACGTACTTAGCGGTGAGAATATCGTTTATTTGCCGATTAAGAACAGAGGGGTAGGGGGACTGACGGAAAACGTAAAGCTGAG:1 + chr3L 24242080 3' + INE-1 573 1 68.97 CAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCCCCCAGCAATTATTGTTTGATAGTTGTTAAGTATTCGCTTAAAAATCACATAATTGCTTGATGAATTC:1 - chr3R 26184857 3' - Transpac 56 2 58.22 TCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTG:1 - chr3R 16187781 3' + mdg1 7387 2 67.59 ATGCTAGCAGACTGGAGAACCACCACAACCACCTGGCCGTCAACCTTCTAGACCACAGCCAAGACCTGCGAGGCAGAGATCGATCAAAAGCTTACTAACAACATAACCATATTTAAATATATCGAGGATAAGGATGTGTATCAAAA:1 + chr2L 21661091 3' + G2 2845 1 58.90 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCGTAAACAAGCGGCAGCACAAAGGCAACACAACTGGTAAAACTGGTAAAAAAAAAGGACAAAAAAGGACCAAGGAGCAGCAGCAAGGGGACACACGGAGATAATG:1 + chrX 21233470 3' - roo 7 2 78.52 CTTAAAATGATTCTTATACCTAACAAAGACTCGCAGCGTCCACGCAAACATGCTGTGTTTGCCGGCTGCCAACTGTTCTAGTTCGTTGGCTTGTGTTACCTTGCACATGTATTATTCTTGAATTTTTTTTTTGTCTTGT:1 - chr3R 3269637 3' - Gypsy6A_LTR 140 1 49.64 TTACATACGAACATACATACCTTTGGGGAGCGCATAGGAAAAGTACTAGTTTTTTTCACGTGAATATAAAAAAATGTGGCTAGGTACATTGCATCAAACGGCTTTTTATAGTGTATTCGTATGTTTTGAAAATATAAGGA:1 - chr4 622796 3' + 412 226 2 66.43 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGCGTCATCAGTTTAAATA:3 + chr3L 2907382 3' + 412 424 2 63.01 ACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCACAACTAAGTCCAAATTCTGTATTGATAGTGGGGAATTTTTTAGATTTTATCCCTTATCCTGTTCGCTGACTTACTTCTGTATCCT:1 - chr3L 12890274 3' - hobo 36 1 60.96 GAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTGTCCCTCA:1 + chr3R 6419924 3' - Tabor 6918 2 69.66 GTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCGTGTCGAAAAGTTTGTTGTCGTGCGTGACGACAACGAGTCTTCG:1 + chr3L 10033707 3' - blood 25 2 67.12 CGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAATCAGATTTAAGCCCTTTAT:1 + chr2R 17350630 3' - F-element 43 1 65.28 AAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTAAAGATACATACATTTTTATTAACCTTTGCTTTGTTTTAA:1 - chr3R 25433835 3' - FB 81 1 75.00 ACCAAAGACACTAGAATAACAAGATGCGTAACGCCATACGATTTTTTGGCACACAATTTTTTGGCCGTGGCTCTAGAGGTGGCTCCAGGCTCTGAAAAAGAATGAGATTCCCACTGTGTTGGCCTTCCGAGACTCTCACTTTGTGC:1 - chr3L 16997532 3' - Tc3 312 1 63.70 GAAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACATCAACTGGGACTGCGGTCCCCTCGAGCCTCTCGAAACTTGATTT:1 - chrX 8839298 3' + Tabor 7259 2 69.12 TTTTCGCATAGTGCCAATTGATCAAAAATAATACAAATAAAATAATAACAAGAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCGAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGT:1 + chr2R 1982173 3' - 1360 270 1 67.81 CATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTA:1 - chr3L 11364808 3' + Tirant 374 2 55.91 AATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAG:1 - chr3R 24072029 3' - jockey 56 1 51.94 GCGCAGAACGCCGCGGAGATCACAATATTGACCCTGTCACTGCTTCAATGTTCTCATGTGATCTCACCTTGTTTAGTCGATCGTTGAGCTCGAGAGTGTCGTTCAGGCTGAAAAGGCCACAGTAAACACCGGATACAATGGCCATG:1 + chr2R 7392429 3' - mariner2 389 1 60.96 TACAATATAAAAAAAAATAAATTTTTTCCGATGCCTACAATAGTTTTCATTGAGTTCTGAAAAAGGAAATTATGCTGCCGCACCCTGTATATACTTTACATGGTCGAAAACGCTTTCTTCTAACTGTTACATACTTATCAACGAAT:1 - chrX 124082 3' + mariner2 825 1 66.44 TGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATAGAGTAGTTATAGTTTTTGGCTGGCGGTGGTGGCAAAGGGTAACTTTCATGT:1 - chr2L 17019083 3' + 412 7502 2 60.83 ATTTCATCAGAATATGAAATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATGTATATCATTTAGGGATCTTAACTTTTTTAACTGAAACATCTTTGGAATATTGAGGTGCTATTATACACCGAGGAAGCT:1 + chr3R 5165043 3' - invader4 2800 2 56.16 AAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGACACTGATTC:1 - chr3R 16187760 3' + mdg1 369 2 53.42 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCA:1 - chr2R 16274557 3' + roo 9014 2 63.78 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAATGAAGCGCCTAGAGAAGTGTAGATAAAAAATCGCTGGCAAATA:1 + chr2R 11153270 3' - roo 8679 2 66.44 TCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTATAGCTGCACTCGTTGGGATATATCGATAGGACCAACTGCGGCTGGCC:1 + chrX 13091121 3' - P-element 18 1 56.18 GATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTAATTTCAAAATTAACGTAACTCAG:1 - chrX 9165317 3' - jockey 4810 1 51.03 ACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCAT:1 - chr2L 15085620 3' - opus 7167 4 58.57 AAACTCAACGAGTAAAGGCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCAGCTCGGTTTCTGTTTCTCTATCTTGCAGCGAG:1 - chr2R 12462094 3' + roo 391 2 68.15 CAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCG:1 + chr3R 21794139 3' + hopper 1349 1 61.64 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCACGCACTCAGACACACACACACAGCAGGCCGTTGTGCTCATTTATCTTTTATTTTTATAAAATTTTCTGCTGTTGCTGTTGTTGTTGTTGTCGCCGAGGCGTCAGCAGCTATT:1 + chr3L 17500872 3' - Tirant 8118 2 76.39 CATGTCACCTNTTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATA:1 - chr3L 13285591 3' + roo 9001 2 67.81 TCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGTGTCCTAGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCACATCGATCGAGATTCAGGAACTCACTCGCTGATTGGTTTCAGTCCAAA:1 + chrX 21587763 3' - INE-1 121 1 51.61 ATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTAT:1 + chr2R 18931929 3' - blood 48 2 50.69 TACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAAGTGCATCTAACAGGTTGGCATAAAAAACAATAAAAAATACCCTTTACGCTTATTAGATTTTAATATATACTTTCAAAAAAAAACCGCTCTCTAAATTTTATA:1 - chr3R 10144326 3' + Chimpo 165 1 71.23 CATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTT:1 - chr3R 19506752 3' - mdg3 5334 2 74.64 ATTAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTCTTTCGTTCTGCCCGTCTCGAAACCAATCCGAAAGATCATGTGCAGCCAAATCTAATGAGTCAGAGTTATTTGAACTCGAATTTAAATG:1 - chr3R 8837269 3' + blood 164 2 65.00 ATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTGGCTCTCTTCCAGTGTCTAGTTATTTGTGCTATAAATTCGCGTCTATGAAGATAACGCTGAATACTATATATAGTTGATATAGTG:1 - chr3L 10897416 3' - roo 8699 2 60.84 GTACACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAA:1 + chr3L 12991423 3' + mdg1 7381 2 74.81 AAAAACAAAAATCAAGTGAAAAAACCAAGACGAAACGGCCCATGAATGATGGCCAACTAATAGTTAAAGTATTTCAATTTGGTGGTTTAGCTAAAGTTCCAAGTAAAGTTCCACCAAGAACTATTTATTTTCTTTAATTTTGTAT:1 - chr3L 16184095 3' + Porto1 170 1 55.17 AATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAGCACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGT:1 - chr2R 961133 3' + transib2 2662 1 54.48 TGGGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATT:1 + chr3R 19514305 3' - blood 7098 2 77.24 TCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAAAAAAAAAACACTTCTTATCGCGGACATGCCGCTAACAAATGCTGCCACGACCTGATAACTTTCAGACAAACCCCACTGAGCAAAAATACGTCATTTATGATTAATTATTTATAATTTT:1 + chr2R 13541663 3' + jockey 4988 1 74.66 CAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTG:1 - chrX 20361975 3' + hopper2 1526 1 73.97 AAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAAGCCAGTT:1 + chr3R 9298605 3' + hopper 1407 2 76.69 AAAGAAACAAAAACACAAAAAAAAACACAATACATCAATAAAAATATCCAATCAATGTGTAAAATTTAAATGATTCTTTTTCTTGCGGCTCATACATTAGATCTTTAAAAAGATGTCAAGAAGATGAATTAATCGAGTGGATTGCC:1 - chrX 21061801 3' - pogo 300 3 74.66 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGCTAGTACCTCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTGATTTTAATT:1 - 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chr2L 15419976 3' + Burdock 242 2 71.72 AGTTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGTAATCGAGTAGTATTAATTGGACTGGATTGCGTTTGAAAGAGCAATT:1 + chr3R 18294899 3' + copia 179 2 69.18 GTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATAAGGTTCCGTCAAAAACAGCCTTACATACACTTGAGCTTTTGAAACGCATCATAACATTTATATTATGGAATTTTATACAAACACAAAATGAAT:1 - chr3R 30568941 3' - mdg3 30 2 58.22 GTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGAT:1 + chrX 21668379 3' + opus 7469 2 41.78 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATNTGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGAGTGTACAGCGGTAAATAAATAAACAGATTGGGAA:1 - chrX 5751879 3' - roo 8745 2 76.74 AATCACAGAAGGAATTTCTGGAATGCGAAGAGTCGCGCTCCGACATATATATATTTAGTATCTATATGTACATACATATATGACCAAAAAAATCGTACAGATGTTAGCTTCGAGTCAATCGAAAAGGCTGTCTTTGAAATTAACAA:1 - chr2R 14531927 3' - invader4 24 2 69.86 AAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAG:1 - 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chrX 8590678 3' + pogo 2054 1 54.11 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTTACGTTCCAATTTTGTTGAGTTTACACGTGTGTGAAATGTTCCTTGCCCTCCCTTGCCACCAGC:1 - chr3R 30087692 3' + roo 9014 2 56.85 TGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGGTCTCTGATATAGAGCAATTTTTTTGTTTGGACATTATCTAAACTATGT:1 - chrX 8469223 3' + hobo 2862 1 70.71 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCACAGACCCACAATCGACGCCTCGGATTGCCAGCGCTCGGATTTACCGTT:1 + chr2R 23444037 3' + P-element 2857 1 50.00 TAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGCTGGTTGCGAA:1 + chr3L 8249482 3' + mdg1 7412 2 53.96 TAAGGTAATCGCATGGGTGGGAGGTGGTAAACGGGGTGGTGGTGGTCTCGGTCTTGGAATTTTGTAGGTATAGTGTTACCTCTAGCACATTGTTGTGTACTTAAGGAATAATAAATGTGAATATTGTAATC:1 + chr2L 1242188 3' - I-element 4875 1 79.39 CGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTCAAACTAAATAAGCTTTCAAACTGAAATAAGCTTTCATGTCTACATTTGTGATACTCTCTGACCAGAAAGCATTTCCATGCATTTT:1 - chr2L 21876734 3' - X-element 48 1 44.52 AAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAAGCGATGGGAATTTTCAACCACTTGACGTTGATGTGAAG:1 + chr3R 30087774 3' - roo 81 2 75.69 AATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTGTATATAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCTAAT:1 + chr3R 24084913 3' + roo 9038 1 58.90 GCTGTAACATAACAGTTTAAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATACTGCAACCCGTGCATACATACATACATAAATATT:1 + chr3L 18044635 3' + hopper2 1514 1 78.08 TATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGTGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATAACAT:1 - chr2R 18886949 3' + roo 9025 2 51.72 CACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTGTGTATACGCAAAGTTAAGGTCGGCATAATGGCCCTCAAGCACAAGGATCTTGGTCCTTATTTAGTGTATATG:1 - chr3R 23964797 3' - hobo 45 1 54.17 AGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTATGAAAATCTTTGTAATATGAAATGAGTTACCAACTGCTCAACTAT:1 + chr2L 10909610 3' + 412 7506 2 54.68 AGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCTATACCGTTTCAGGGTAGAACTTTCTTTTTGGTCGTTGACACATACTCTAAATGACTCGAAGTTGCGGAGTCCC:1 - 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chr2R 9607258 3' + P-element 2860 1 66.90 GGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTG:1 + chr2L 20852536 3' - Tirant 8176 2 65.75 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGG:1 + chr2R 6801699 3' - 297 6604 2 61.05 CTGGCCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACTATATTCGTTTTATTCCGGTCCAAAAACTTGCG:1 + chr2L 17019145 3' - 412 7144 2 80.82 CTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATG:1 - chr3R 19965194 3' - jockey 12 1 76.99 ATAAAAAAAAATGAAATATTGCAAATTTTGCTGCAAAGCTGTGACTGGAGTAAAATTAATTCACGTGCCGAAGTGTGCTATTAAGAGAAAATTGTGGGAGCAGAGCCTTGGGTGCAGCTCACAAGAAAACGAGACGGGGCAAGAGG:1 + chr2R 6238204 3' + P-element 143 1 22.60 TGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCAT:1 - chr2L 20761887 3' - Doc 442 1 63.93 TTTATACATATACATATGTATGCAGAAGGCATTGACCACTTGAGCTGCAAAGTGCATGCATATATGTATAAGCGTTAGATCGTATTACTGGGGCGCTGGAGTGCTTACGTAGTTTTTGGTGGTCTTTTTGTATATTTATATTTATT:1 - chr2L 18093451 3' - Stalker 7092 4 57.53 TTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACACTTGTGAGCCCTCCACGAAAAGTGCTTTCTCCAAAATATGCACATTGCTGCTCGAACGAAAACAAAAATCATTTAAATATTAAACAAGTATATGTATAT:1 + chr2R 12827112 3' - Burdock 18 2 72.92 TTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTGTTGCATACTTTTAGGCCTCGCTTGAA:1 - chr2R 20972648 3' - jockey 4722 1 50.68 GCTCTCAATGCGCTGAGTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACACTCTCCTGGGGCAAAGGCGATGGCGGTATAACATTTACTATCGGCACT:1 + chr2L 6637461 3' + 1731 4557 1 70.00 CACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTT:1 - chr3R 8197770 3' - pogo 57 1 56.85 AAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATGTTACACCTACAATAGATTAGTCCTATAAAACCTAGTTCTTCCTCCGAGTAAGCACTGATGT:1 - chr3R 5870806 3' + roo 351 2 60.45 GAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACTCTGCCTTTCTGTCTTTCGTGGACTTCCGGCGAGACTTGTTTACGTCT:1 + chr2R 9750304 3' - opus 7 2 79.45 CCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCAACCACAACCAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGTATGTATGTGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGATCTATTCAAAGTGTCAGAAAAGACTCG:1 - chr2L 15516677 3' + Max-element 237 2 59.59 ATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTT:1 - chr2R 17269081 3' + roo 9034 1 59.59 CTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGA:1 + chr3R 11284991 3' - blood 7075 2 62.50 GCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACATAAAAGCTATTACCAGCCATTGGGCCAGAGCTAAAA:1 - chr3L 15718011 3' + 1360 3385 2 76.03 GTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCG:1 + chr2L 20852566 3' - Tirant 8146 2 60.27 CCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGCTGACGCATCTTTTGCTGACCAGTGGCCAGTC:1 - chrX 609352 3' - 1360 47 1 54.79 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTGAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACAATTGTCTTAAAATTATTTAGGTAATATTATAGAAATCATATTATCAGGTCCAAGCATATATTCTAGCTGCCT:1 - chr3R 13254887 3' + roo 9019 2 52.05 TGATGGGAAAAGCACTTGANGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCCAAATTAGCTATTAA:1 - chr3R 8112685 3' - Burdock 6176 2 53.79 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCTGGAAAAGGAAAATTCAGAGACTTGGTCACAGTTTTCCATTCCGAACAAATTTACTGCACTTTGAATCCCTTGTCATGTGTCGGAAAAAGTTT:1 - chr2L 2241187 3' + roo 397 1 74.22 TCTGCTGAAACTTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCAGCGGGCAAGCAAAATTGCAT:1 - chr3L 17500733 3' + Tirant 340 2 65.65 GTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGATCAAAAATTTAAATGCAACCACCTCCGTGGGTTACTGCAACAAAATTATTTGACATTATTCATATGACCCGAGAACA:1 + chr3L 13057467 3' - 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chr3R 18628623 3' - frogger 239 1 60.27 CTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTGAATTGATTAAGTTCTTAAG:1 + chr2L 544952 3' - Doc 27 1 58.27 ACTGGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGACTGTGGAAAGCAATGGCCTTGGAATGGCTTGGAT:1 + chr3L 22518993 3' - hopper 83 1 76.43 AGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTTTTTAGAGGACAGGCAA:1 - chr3L 6557105 3' - Doc 45 1 53.42 GTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGAGAAGCAAAGCGAAGCCAGACGCTATGAGAAAAGCAAGAAGATGGCAGAG:1 + chr4 317846 3' - Tirant 8169 2 66.42 AAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAAATCTCATATATACAATCAAAAAATTTAAAGAGTTTGCACTCCATTTAATATGCGTCGTAATTTTTTTCAGGTGAAATATGCC:1 - chrX 2956167 3' + copia 248 1 55.48 AAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCTTGGAATTGCATTCTTATCAGTAAAGTGCAGATGCTGTAGCTACCATC:1 - chr3R 15283602 3' - BS 5008 1 72.31 ATTTAAAAATAAAATAAAATTATACCTTATATTTCTCTCTCTGTACCCCTTCGTCTCTGGGCATGGTGTCAAATGCAAAAACCGGATGCGGAAATGCA:1 + chr3L 13159416 3' + NOF 3955 1 71.43 AGTGTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTT:1 - chr3R 12613784 3' - HMS-Beagle 76 2 75.71 TCATATCTTATGTAAATGAATCGAGAGCGATAAATTATATTTAGGATTTCTTGAGGAACACAACAAAAATGAAATGAAAACAAATCAATTCTTTTGGGCGTAAAGTTTTCAAGACTTTCAACGATGCCAATTTGAACCAATTGAAA:1 + chr2R 9450905 3' + roo 53 2 68.49 TATTTTATTTTACAATGTGTCTTGGTTACTTAAGACTAACAGATTTTTAATCCTAAAAATGATAGGGAGAATTATAATAGTTGATATAACATAGTAATTATTATCTGTCTTAATTGCTTGACTCAGAGAAATAGATATTAGTTATT:1 - chr2R 17211408 3' - jockey 4919 1 71.23 CAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCAAGCGAACGCCTAAAGTCAATTTCAA:1 + chr3L 9318115 3' - P-element 2854 1 71.92 TAATATTTTACAAAAAGCACATATGAAAATTTCTGCTTTTGCCCACTGTATGGCCTGATTAAGATTAAGAATTTCTTCTTTAAGCATTTGAATTTGAAACAATGATGTAGTGCTTTGAGCGTCTCCTTCATAATTTAG:1 + chr2R 2875239 3' + TLD2_LTR 113 1 71.01 TCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACACAATAATTATATTTATGTAGAGTTTATTATAGCTTGTTTAAT:1 + chrX 22564486 3' + 412 416 2 75.18 ACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTAAAACGCAAGAGTCCTAGACAGACATAAGAGAACGTTTTATCAGGTACCCGTTACTCAGCAGCAAGGGGGGTTGCAAGGGAGAAATTAAAAATATTT:1 - chr3L 21770851 3' + hobo 2926 1 54.41 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAAATTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGGAAATC:1 + chr2L 18924635 3' + P-element 2817 1 36.99 CACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCACCGAGATTCGGATGGGATCAAAACGGTGGTCC:1 + chrX 683652 3' - jockey 20 1 70.59 AAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAAC:1 + chrX 6538727 3' + pogo 2033 1 76.80 TGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACTTCAATCGAGCTAACGCAGCAGCAAATGGTTACTATGCGTCAGGGAGAACTTCCTTTAATGACTTTTTATAATGACTTTTTTTTTAATGACTTATTAT:1 + chr3L 15916570 3' - Tabor 20 2 71.43 CTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTACTTTAAGACACATTTTAAATTTTAAT:1 + chr3R 20200491 3' - Transpac 4977 2 58.62 CTCACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGTCTCCGGCACTCACTCACTCACTCTCCCTC:1 + chr2R 18905166 3' + P-element 2792 1 20.55 AGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGTCAATTGAAAGGAGGACAACAGTTGAATATTTTCAACCCGGGGAAGCCAGAACGCC:1 + chr2L 21683535 3' - pogo 14 1 74.48 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTCATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCCAAATAAATACCAACGGTGAGTAATCGTTTTCTT:1 + chr2L 3662025 3' - blood 85 2 73.97 AAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGATGGACCCCGCCCACTCACAATAACTGAGACCGGGCAAGAAAGGAGAAAAAGGCACATAAAAA:1 - chr2L 2638418 3' - hopper 58 1 55.86 TCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAAAGCTGGCAAAATTTAGTTGAAATCCAGCT:1 + chr3R 30955465 3' - G-element 4 1 77.93 TCCTTGGAGACTCTGAGGTGAAGAGCGGGAGAGCGTAGAGGGAGCGGAGAGCGGGTGACAGTCCAAACCCCGTAACTTGAACAGATTTGAAGGAGGTGTTCCAGAGGCTACGGGCGGCGAACCTGAAAGTAAATGCGGATAAGTGC:1 + chr3L 25232917 3' - GATE 8307 2 58.90 CAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCG:1 - chr3R 19094220 3' + P-element 2816 1 14.78 TCAAAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGAACGCCGACAAGCAGCGACGCCG:1 - chr2R 21713274 3' - P-element 100 1 15.75 TACATAAAATAAATTAAACAAGAAGCATTGTGTATTGTATATTCGTAATTTTTCAGTAATCCTTAGTTACGTTTACCTTGAGTTGTATAAATCTAAGCAGCTTCTTTGGGGGGCATCCTCTGGGGGCATCTCCTCGTTTCTCCT:1 - chr2L 1696862 3' + HeT-A 5 1 63.89 AATATTTAATGTACACCAAAATGTTCTCAGAGAGAATAGAAGATAACGATCGCAGCGTTCGATTTTTACAACCGCGTTCGACAAGAGCTAGTCGAAGACTGTTCGATTGATTTTGGGATGATTACCTGCCTTATTGTTTT:1 - chr3R 7598810 3' - Juan 61 1 61.43 AGGAAAAGTATGAGTTTTTGTATGTTATCTGGATTGGGTTTGCTAAGAAGGTCTAGAGGGTTGGTGTTGTTAAATCAAGGTTTATTTGTGTGCTCCTGAGCGAAATGGGGATTTTACACACAGAGAAATAACCAAATTATGTCTAT:1 - chr2R 19574412 3' - I-element 5143 1 51.37 GAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGTCCAAGTGTCTGCTGCCGACGAATACAGTGGTCTCGT:1 - chr3L 5770909 3' + P-element 2818 1 30.23 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACGGCGGTTGGGTGGCTCAATCACGAATTGCCCTGTAATGTATGCTACGGTTT:1 - chr2R 22523161 3' - jockey 68 1 61.76 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTGTGGTGCGGTGCGATGGGATCCTGGGGCTGGCTGCGATTTAAGTCCCTTTCATCTCGGCCTGCTCCACTTTAAAGCCAGTCCTGAATGCATAGTTTTATTTCGCAGCTA:1 + chr3L 22331080 3' + hopper 1409 2 79.71 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTATATCTGCCTTGCGACTTTTGCTTTGGCCATCTTGATCTTTGCGCTCTTTATTTTTATTGAGAAGGTTCGATTCATCAAAGGTCTCAACTTT:1 + chr3L 15718203 3' + 1360 3364 1 68.49 TTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAATAAAACAGTTTACAAAAATCAACCCAACTGCAGATGTAACATTTTGCTAACATACTTTCGGGGGTAAGACTTTC:1 - chr2L 901733 3' + jockey 4943 1 52.74 ATAGAGGCCCCTACTCAATTCTCACTCACATTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACAGGGTACTCTTTAACCCACGTGTATATGC:1 + chr3R 10736203 3' + McClintock 237 2 72.73 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCGCTCTCAAACCGAACCGATAGTCGGACAGCACGGGATCCCGAAAGGACCCCGAGCAGATGTCAAGCTACCACCGAAGGAGCAGCATC:1 - chr3L 13993394 3' + P-element 2876 1 77.78 CTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCAACGAGCGACGATGGCCACACGAAGCTTTTACATTCCACCCCCTCCCCTTCAC:1 - chr3L 10740044 3' - P-element 30 1 51.43 TGAAAGGCAGTGCTGGCTAACAAAGGAAATCCAACCCGGGCACTGCTATTTTTATGAACACAGTTGTATAATCGCCACACATGAACTAATAACTATTAAATAAGAAACTGGGCAAATAAACAAAGGAAATATCCAG:1 - chr3L 17244976 3' + HB 1306 1 69.85 TCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAGTGGTACTTAGCTAGTACAAAGCAAATTTCATCGAATTCCAAACTTGAGTGCATTCTTTTA:1 + chr2R 24427625 3' + 1360 3337 1 56.83 TAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTGGG:1 - chrX 22679601 3' - Doc 30 1 64.62 TCTAAAGTGTGCACTCGCAAGTAGAGGTTTCCTTGCCTTCCATCAATTTATTTCGTTACACGTTACAAAACAAGTATTAAATCGTTGGGGATATTCTCTTTATTTTAAACTACATCTGTAAGCGGGATACTATGATTATCGATAG:1 + chrX 22824233 3' + gypsy12 10152 2 53.79 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACG:1 - chr3R 29627835 3' + roo 9029 1 53.24 AAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGATGTATATAAATAT:1 - chr3L 6131820 3' + roo 9021 2 50.34 CCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCTACGGGTGCCCTGGCTCCTTTT:1 - chr3L 22320126 3' - jockey 36 1 59.72 TATTGTATACTATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAATAAATAAAAGCAATGACAGGTGAAAAAATCCCGTTCGAGATGTAGTTTTATAATACTATTTTTCGATTATTTAACTTTAAATTGGTTTTTTTGAACACCAAACTATTT:1 + chr2L 14858530 3' + Ivk 5361 1 64.14 TACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGGGTGTATATGCAGCAGTGGCAACTTGTAGACGTGACGCG:1 - chr2L 20718804 3' - jockey 4696 1 59.50 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCATTTCTGGGCAATACCTACGCAAAGGAA:1 + chr3L 6131935 3' - roo 8720 2 58.22 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATGTG:1 + chr2L 13033448 3' + hobo 2928 1 70.77 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCAATAACAACAACGACGCCAA:1 + chrX 7702860 3' - P-element 29 1 65.75 TCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATAATCGTAAAAAACGGGGCTTTGGTGTTGACAAGCTCGT:1 - chrX 683576 3' + jockey 4906 1 80.14 ATAAAATAAAATAAAAATATATAAAATATTTCATAAAACTATGGTAATTTTCATACAAAAATGCGTTGACTGTCATTTCACTTGCTTCTTCATAATTTATGAATGCAATTTTTATGCCCATTAATATCGACATTTGGGTTTTTTCT:1 - chr3L 14334745 3' - transib1 1895 1 80.82 GCCAGTATTCTGGTCTTGTCCATAAGTTTATTACCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCTTTTTTCAAGTTCAGTATATATTGTTCCAAAACCAGCAAGGCCGACTCCAACTC:1 + chr3L 11826008 3' - X-element 84 1 67.12 GTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCTAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAA:1 - chrX 6891473 3' + hobo 2863 1 73.88 TTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGTTGGTCTGGGGGCTTAGATG:1 - chr3R 21794030 3' - hopper 29 1 61.42 GGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGTCGTAAACAAGTCGCCGCAAGTGTGCATAAATATGTAAAATTAAATAATGAGAAAACAGCCGCAAGCAGGCCGCTGCTATATAGAAAACTTCTGGTTGGAATCGTCCAGA:1 + chr3R 11756887 3' - Tirant 13 2 76.71 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTA:1 - chr3L 25206785 3' - HMS-Beagle 6831 2 61.38 TACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGCCGGAGAGACAGGGAAGAAGAGGAGAGCAACAAATCACACGATCGCAACTCACACATGAAATATGCAAGAGGAGCAATAACAACAACGACGCCAAAA:1 + chrX 7702862 3' - P-element 12 1 74.81 TAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTGCAACTTGCACAAGTTTTCGCTCCTCATCCAGCGAACAAACTTTTGTAATAAAATGTTCATTAGTGCTGC:1 + chr3L 1459890 3' - 412 7089 2 55.81 AAATTAAGTTGCCGCTTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACGCTGAAAAAAATATCTACTCGTATGTACAATGTACATTGTACAAATGTCCATACATATACATTGTCTGTTTCATTTATTTACC:1 - chr2R 22796751 3' + jockey 4954 1 51.03 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGAACCGAAGGTTGAAAAACTTTTCATCTTCNTCATTT:1 - chr2R 10977135 3' - roo 8752 2 78.08 TTCTATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAAATTTCATTGAGACAGAACGAATGAATACGAAAGTAATTGATAACATCACGTGCTT:1 + chr2R 17650647 3' - pogo 64 1 65.75 AAAGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGATAAGCTAATG:1 + chr3L 11684946 3' + Bari1 1671 1 58.22 ATTAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACATTGCTAATTAAGACACTTTTTAAAGCATTTTGAAGTTAATAGAAATAAATTGTATGGTACGGAAAATCAAAAGTATACTAACTTACCTCGA:1 + chrX 11232635 3' + roo 375 1 56.16 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTACGCAATTAGTGAGCCTACGAACCTTGAGTGGTCAGCATCACAGCG:1 - chr3R 13338985 3' - BS 5011 1 70.50 TCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGTGTGTATCTTATTAGCAAGTAGGGCAAAATGGTGTTCTAAATAATTTATAAAGCTTAGCTACTGAAAACTTGTTCTTTCTGATCGTACAAT:1 - chr3L 18216442 3' - 297 6609 2 65.75 TGTGTGTTTGTAAGTACCCGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTATCTGGAAGTTTCCACACTGACAGACACAAGGAATCCTG:1 + chr2R 8315556 3' - hobo 84 1 77.70 CATAATAATAATAATAATAATAAAACTTTCGCGCCCAAATAAGCTTGCTTATCGGTATTATTGATAAGGCGACCATCGATAAGTTCTGCAATCGGTTGCGATTAGCTTTTAGTATTTCGATTTTTTACGCAGGTTAATT:1 - chr2R 11844185 3' + mdg1 7069 11 79.14 GTATGTTAAGGATGGGTGTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCG:2 - chr3R 16475364 3' - mdg3 92 2 78.77 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGTACAAATAACCCTTATATTGATTTATTATCATATTTTTTGTGATTAAAGTGCTGGCTGCGTATAACTTTATACTAATACAATATCAAA:1 - chr2R 13121747 3' - HMS-Beagle 6831 2 60.27 GTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATCCGTTTTGAAATTATTCATTTTGGCCACAAAAAGGTACCATCCAGCATATAGTGCGCCGATCAATCTGCTCGGCAAGCGTTGTCTC:1 - chr3L 24059141 3' - roo 16 2 68.80 GGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGG:1 + chr2R 5621049 3' - ZAM 7973 2 68.70 CATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAGATAAATCTAATT:1 - chrX 9165337 3' - jockey 4831 1 63.70 CGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGGCTGTTTCAGTCGAATCGCTCC:1 - chr2L 10074456 3' - pogo 20 1 70.29 TTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAGACCGTGCTTACACAAATGTCGGCATCAGGAAATTTGGGCATTCTCGATATTATTACCCCAGTTTGCTGT:1 - chr3R 10714131 3' + 297 6930 2 51.37 TATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTATTTTTTCTAAAAAACGTGGAAAACTAACCAGGAACTAGAGATATTGGTCAATTGAAAGGAGGACAACAGTTGAATATTT:1 + chr2L 21683511 3' - pogo 28 1 63.70 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAGTTTCATATATACTTTTGGTCTT:1 + chr3R 18128536 3' - roo 52 2 58.99 TGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATACTATATCTGCCTTGCGACTTTTGCTTTGGCCATCTTGATCTTTGCGCT:1 + chr3L 15718157 3' + 1360 3349 1 60.87 TGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATCTAAGACCGTGCTTACACAAATGTCGGCATCAGGAAATTTGGGCATTCTCGATATTATTACCCCAGTTTGCTGTC:1 - chr3R 10714130 3' + 297 350 2 50.68 AATTATTTATTTATTTTTAGAAGCAATTGTTATCAACGCTCCCAAAATGTTTAGACTATATAGTTACTATGATTGTTTATTTTATGAATTTTTATGGGTGTATTTTATGAATTTTTATGTGATGGTAAGTGTCAAGCTGGTAATTC:1 - chr3L 8809276 3' - mariner2 829 1 73.29 AAATACTCGAGTGGTCTCGTAGGTAGTCGAGTCAAATGGCGCCATACATAATGATTGTTGAATAAAATTAAATCATTGTGAGATTGGATATTATAAAATTGAGCCTAGTTTTCTTATTAATAAATGTTGCCTAAATATGCTGAAAT:1 + chrX 14979649 3' + hobo 281 1 65.75 TTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCAT:1 + chrX 21045263 3' - P-element 89 1 22.22 CGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGACCGCCGTTGTGTGCACACACACGAGCAGTTGTGTTGCTGTTGTTTTTTGTTGCTGGAAG:1 - chrX 2300567 3' + P-element 2877 2 64.58 ATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCCCTTTTCACGCGATCTTAAACGACCATTAACCGCAATCTGCCGATTT:1 + chr3R 8050633 3' - jockey 4830 1 66.67 CATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATTGCCAGTCATTAAATATAGCCAATTCATTAACATTTCCAATGCCTATCAGTAAATAGTTCTGAGGTGAGTGTGCAGGATGACACCTGCTCATAGATAAATC:2 + chr2L 16884947 3' + pogo 2081 1 70.55 TACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATA:1 - chrX 13091056 3' + P-element 2807 1 30.82 TTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGC:1 - chr3L 9635309 3' - Doc 69 1 63.70 TATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAA:1 - chrX 22679618 3' - Doc 63 1 45.89 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGC:1 - chr3R 17259526 3' + roo 8999 2 67.81 TCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCG:1 + chr3L 18183159 3' + Tirant 402 1 67.27 GGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTCAACAATCAGAATGAATA:1 + chrX 12979561 3' - transib2 44 1 55.48 ACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTTAATGCACATTAAGCTAACTTACTGTATAACGATGCACAACAATCAAAGTAAAATTTGTTTGATTAAGTGAAATAAAACAACGAACTGTT:1 - chr2R 15199080 3' - Burdock 27 2 63.01 AACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACCTCATGA:1 - chr2L 10461093 3' + roo 392 2 73.97 AAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTGGAAAAGGCTTTTCATACTTACATATTAAAATTC:1 - chr3L 18846948 3' + 1360 3344 1 55.56 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGTGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCG:1 - chr3R 11284899 3' + blood 7348 2 54.10 GAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATTATAAATCTAT:1 - chr2R 7720029 3' - HMS-Beagle 20 2 71.92 GCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATATCTCAACAATTTTTTTAAGGCTATGGTATTACAGCTCAGGTATAGCTACTAATAACTACTAATGAAATCAATAAAACAAGAC:1 - chr3L 2167567 3' + opus 473 2 64.71 CTCGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTATCATACTGATTAATCGGCGGGGTCCTGGTTCTATATCGCTAAGCAGCTTCA:1 + chrX 21587703 3' - INE-1 129 1 75.00 AAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATACTATGCACATTTATAGATGTTCAGTTACTCGCCCTATAATAAAGTT:1 + chr3L 22491660 3' - Transpac 4991 2 69.18 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGGATGAGGCAAGGATGTGCTG:1 + chr2L 13033451 3' + hobo 2928 1 71.43 AATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGATCCACAAACATGCACTTAACTAACCAGTTC:1 - chr2R 23094858 3' + 412 7496 2 54.11 AATGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGANAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATNTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGGA:1 + chr3R 15668239 3' + G2 3009 1 59.59 AAAGGTTGAAGTCCACCCCGCGCGTTTTTAATTTCGGGGAAAATTTCAGCAGCCGCCGCAGCACCCACAAACAAAGGAATCTTTCCGCCCACTCCATTTCAGCAGTTGTCCGCTTTTAGACTCGTAAATGGCCCG:1 + chrX 15198105 3' + Max-element 221 2 74.81 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTTCTCGCGAGAGAACTTCGGCTGGCCTCGTGGCACTGACCGCCGACCA:1 + chrX 19887019 3' + P-element 2825 1 39.10 TATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATATGAGTATGTATACAATATGAGTGAGAAGGGCAAGCTATAGGTATGTTGTATAATAGTGGAGTCGAAG:1 + chr2L 5207544 3' + opus 7470 2 54.40 TGATCTTATATCACGCTCACTTGATTGCAGCAAAATTGGCATCACTCGCTGGATAATGCAAGTTGCACGGTTCTGAAGTCCAAGTAAATACAATTTATGAAATGTTCTCATGGAATTTATTTTCGATACTAGATATATTCTAGATG:1 - chr2L 5939863 3' - blood 7094 2 76.71 CACTCCCCTACACGAGATTTATGGGGAGTTTTAAAACTCCTCACAAGTTTATTCAAAGTGGTTAGAAGAACACCTGGTCCTGAAGGTAAAAGAGAAAAATGGAAAGGAAAGGAAACTAGCTGGACGCCCAGAGGGAACG:1 - chr3L 26026706 3' - gypsy8 4673 2 51.08 TAACAAGTTACAGTTTCTTATAGGTAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTATATATTTAATGCACATTAAGCTAACTTACTGTATAACGATGC:1 - chr2R 15199134 3' - Burdock 6215 2 76.39 AAATAAAAGCAAAATTATATAAAAATAAATAAGAAACAAAAAATTAATTGCAGGACTTGATATAAATATTCTGGGCTGAAAAAATTGTTTGCACTACATTTTTTTGAAAATTAATGAGGTAAAAGTAATGAAAGTAATAACATGAT:1 - chr2R 14923987 3' + HeT-A 327 1 63.70 ACAATAATAATAAACAATCTTACATATATTCCACAAGGGGGGTGGATTTTCCGATGGACCCCAGCTTTAACCACACCCCCTGGAGGGACTCAGTTTCATTTCCAATCAACGCGGG:1 + chr2L 9383864 3' + flea 252 2 76.52 CCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCTTTACGAATGTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTGTAACGCTTTAAATTTTAATCTTCTTGTTAAATATTTATTGTACTTGTTATAAATGCTANAACATTGACTTAA:1 + chr3R 18477873 3' + 1360 3340 1 48.97 AAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGGCCCTTTTCACGCGATCTTAAACGACCATTAACCGCAATCTGCCGATTTTATGTGTTGTTTTGTCCCCCTCAAAAATTGATTATTTTTGCTA:1 + chr3R 8050676 3' - jockey 4791 1 62.76 CTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAATACCCTTGAAATTGATATTCCTTCAGATTTG:1 + chr3L 6015726 3' - roo 8674 2 73.97 AATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGGGCCTCATGTTGTTGC:1 - chr3L 19274781 3' - transib2 53 1 54.11 ATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAAACGTTATGTGGCACTGTTGGCCAGATTCAGGTGAGACAGCTGATTGCCTCATCAGGTAAATTGGTGTCACCGCAA:1 + chrX 10725096 3' + pogo 2057 1 52.41 TGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGGCCAGCCAAGCAGAGGAAAGCGTAGGCAAAGCGAAAGCGCACAGA:1 + chr3R 15668267 3' + G6 1997 2 62.33 ATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAATAGATTGGGAGCCAAATAGTAAGTCGCCCGATGGAAAACAGCTTTTAGCCTAATCACAATATTATGTTGTGTTTCATGTCAAAAGTATTAAAGCTGTGCT:1 + chrX 22835303 3' + mdg3 229 2 73.57 CCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGATTCTTC:1 - chr2L 23310602 3' - 1360 26 1 62.88 TATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGCGTACGTATGTATGTGTGCGCGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTAAAAAGC:1 + chr3R 17243260 3' + hopper 1401 1 69.66 ATCTGCGCAGNTGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAAT:1 - chr3R 26854760 3' - jockey 84 1 67.81 AATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTGCACGTACCGAAATG:1 + chr3R 11285013 3' - blood 44 2 54.11 CTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACATCCGAGTGCGCCATTAAATTGTAATTAAACTATGTTTGCCATCAGCGTTTATGACATTGGAAACA:1 + chr3R 26927483 3' - roo 58 2 56.85 TTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATATTGTATATGTATTTGGATGTATAGTGATTCGATATACATATCTATGTATGTATGTATGTATAGGGCTTCGTGTGTGTCTGGGCAACTGTTGAGCAGAAC:1 - chrX 7851217 3' - 297 2 2 79.26 CGAATATTCAATTAACTGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCT:1 + chr3R 10736139 3' - McClintock 5979 2 59.84 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGAGGTGTCTGGGTTTGCATTTGAAATTTATAATGCAGCCGTAACTAAAGTCGGGCGAACC:1 + chr3L 22021793 3' + mdg1 406 2 75.17 AAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGCCGTGTGCTGTGCAAGTATTTTGTATTTTCGGAGCCAGTTACCCAGACCCCAATAACAACAGCAACAAAAGCAGT:1 + chr3R 11937906 3' + hopper 1406 2 77.27 AGGCATTCTTCGCGTGGAGCGTTGAACCCAATTCTGGCGCGTCAGCATTGTTCATACAAAGCTACTTAGTTGCTACGAAGCAATACATTGTTAGTTGTTAACTTGCACACGTATGCTCATGCATTGTAAATTTGACAAAATATGCC:1 + chr3R 4571527 3' - gypsy 7069 2 72.60 AGGCCGCGGGTATCCCGTTATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATTGCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCT:1 - chr2R 4730086 3' - gypsy8 323 1 78.83 CCACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCCATGCCCAAGGAGGATC:1 - chr3L 11364756 3' + Tirant 8503 2 78.86 CGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATTTGTCTATAAATGTAATAGCCTGTAACCTCAAAAGAAACAGCTTTAATACCATATCCAAAATGGGACTGAAAAGGGCTGTGG:2 - chr3L 12227754 3' - opus 35 4 60.27 TAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATANCAGCGCAATTAACATATAAAAGATAGAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACAACTTGCATTTNGCTAACATGGCGTATGTGTGATGTCGAAAAGCT:1 - chr3R 19950464 3' - BS 5073 1 71.92 GGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATGTTTGTACGATTTAACGTAAACAATGCATTATATATGCTCTAGATATTCCTATGAAGCTATCTTATTAGTATA:1 + chr3L 2167708 3' - opus 7050 4 55.48 ACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTCAAACTAAATAAGCTTTCAAACTGAAATAAGCTTTCATGTCTACATTTGTGATACTCTCTGACCAGAAAGCATTTCCATGCATTTTCAG:1 - chr2L 21876731 3' - X-element 34 1 50.37 CAAAGCAGTGAGGCATCACAACTATTCATCTCTATAAAACACCAATAATTCAATTCAATTGACAAGTACAGAGTATATGTATCTAAATATTTTTTTAAATAATTCAATTGTATTAAATTGATTAAATTGATTAAACATCATAATGC:1 + chr3R 23645009 3' + diver 218 1 71.92 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATCAGTATCAGTATCGTTGCCGTTATCGGATTCAGTTTCAGTATCATTAGCCAAGTTTATGTATGCCCCTCCATTTCCAATGCAAATTGAAACGACTGCGATACGGC:1 + chr3R 28749241 3' - mdg1 18 2 72.41 TGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAGAGAAAGGGAATGTTTAACGAATGCGCCGGCGAGCAAGAACACGGGAATGCAGAA:1 + chrX 15287003 3' - X-element 4392 1 60.69 TCTGCTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTC:1 + chr3L 2532514 3' + blood 7304 2 76.71 AAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACNGTCGTTCAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCAGAAGGAGTAGTGGAAAATATTGACCNTTTGCTAAACGATAATTCAAAATGTTAAAGCGACAATTTCAATT:1 - chr3L 13285540 3' + roo 9052 2 70.55 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATT:1 - chr3R 29627857 3' + roo 9003 2 66.43 GAATACAGTTCAGTTCAATTAGCATCGATATATATAAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTT:1 - chr3R 23644877 3' - diver 74 2 65.07 ACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGC:1 - chr2R 21796009 3' + roo 353 2 56.85 GAATTTTGTTACTATTTTTTCATAGCATTTCATTGAACACCAGAATTTCTGTTTTCGACGGTTCCCTTTAATAAATCTGAGTGTACCTCAATTTTGCTACTACGGATTGGTTCCGGATCACTGACTTTGACTTGGTTTAGTATGA:1 + chr3R 4511531 3' + HB 1402 1 70.34 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGCTTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATTGAGAATCGTGCATTGGTATCCAGCGTAGTTCACAAAAA:1 + chr2L 12236815 3' - jockey 90 1 73.29 CACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGCTGTAAGTGGCACAGGATTATGGATGAGATCCCGCGTCCTGGCG:1 + chrX 20330655 3' - P-element 1 2 79.20 GAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATGAGACCCACATCTCCGACATGCCCAACCACAAGGGATACCCCTGCCGCCCAGAAGGTTGGGTTTTTTTAAAGT:1 - chr3R 17077800 3' - 1360 50 1 54.11 TTCCTGAGATATCAACGTTCATACGGACGGACGGACGGAGTCAGATCGACTCAGCTATTTTTCCTGATCAGGAATTTCTATTATTTATATGGTCGGAAACGCTCCCTCCTGCCAGTGAAACACTTTCACTCTATG:1 - chr3R 31045720 3' - INE-1 139 1 69.63 CTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTGCTCCTATTTGGTTTTCCTCGCTTTTCCATCGGTGGC:1 + chr3L 2907366 3' + 412 408 2 73.97 AAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTTCGTCCCAGGGGTTTGTGTTGCCAATCCCTTTCTGTTTATCAAACA:1 + chr3L 13285720 3' - roo 8686 2 70.34 GTTGGAGTGGCCGCTATGAGTTTCATAAATCACACAAGGCGAAAATCCGAGCGGTAAGCAGCAGCAGTTCCGAGGACGAG:1 + chrX 2236010 3' + gypsy6 7535 2 68.75 TCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACTATATCTTTTTATTATACCTAAACTGAAAACCAAC:1 + chr2L 512535 3' - roo 8714 2 52.74 AATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAGGTTTTAAAAGTGGGAAACGCAGCATTAAATGTTTATTATTGTCTCAGATATTTAGGGTTTTTTTATGTTATTATGAATAGGAAAATATATTGACA:1 - chr3L 9695889 3' - 297 6602 2 70.63 AAAGTATTTCCAATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGAGTTGGTTAGCCAAGTATCGCACAAAGC:1 + chr3R 11937832 3' + hopper2 1532 1 77.60 TTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGAACTCG:1 + chr3L 10033664 3' - blood 7110 2 44.00 AAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGCTCGGGAATGTAGAGTGAATTTACACGCTAAACGCGGCCCAAA:1 + chr2L 6149206 3' + hopper 1410 2 73.47 GTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAAGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCGTTGCCTTTGT:1 + chr2L 18219442 3' - copia 4892 2 67.81 TTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGNTGTCTTTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACTTTCAAGCTAANTTAAAATAAATCGAAACCGGCAAAAAAAGTAAATCGACTTGACA:1 - chrX 16547464 3' + P-element 2826 1 41.10 CGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGCGGGCCAAAATTAAGAGAAACGGGCTCAAA:1 + chr2R 10977259 3' + roo 9062 1 76.71 ACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAAT:1 - chr3R 29627858 3' + roo 9007 2 65.94 ACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTT:1 + chr3R 10737045 3' - F-element 48 1 62.26 ACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACTATATCTTTTTATTATACCTAAACTGAAAACCAACAACCG:1 + chr2L 512540 3' - roo 8708 2 53.79 AATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCAT:1 - chr2R 15392526 3' + mdg1 355 2 62.76 TGTAAAATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGG:1 - chr2L 11475113 3' + jockey 4927 1 60.27 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGTCAATTGCCGAAGACAAAAATAACTGAAATGGATTTTTAAGTTTATTTTATGCTGATATATGTAAATGCTTTTNA:1 + chr2L 544934 3' - Doc 35 1 48.06 AAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTGCTAAACGGAATCGACAATC:2 - 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chr3R 29680187 3' - 412 47 2 55.48 GGAGGCATGTGTAACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTCGCTGGTTAAGAGCGATTTACATACAAATCGCTGCCTTT:1 - chr2R 12101944 3' - hopper 80 1 73.29 TAATAATAATAATAATAATAATAGTATTAGCATTAACATTAATAAATGAATGAAATAAATGAGCGAAGAGCGAGCATATGGAATGCAGCAGTAATTTCTTAATTTGGTGTTTTGCGGTTGCAGCTATTGCCGCTAATTGA:1 + chrX 13901807 3' + mdg1 39 8 62.14 TGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTG:1 + chr3L 18074199 3' - 297 41 2 58.22 CTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCT:1 + chr2L 15019976 3' - BS 4829 1 57.69 ATTTAGAATTAAACTGATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATATTGACCCAAACGAATTGAGCGTCTAATTGAATTTTCATGAACCAAAAATATCCGATAAATAATAGTACTTTCGTTTT:1 + chr3L 16284610 3' + flea 4976 2 56.16 CAGCGCAATTAACATATAAATGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCGGAAAGTATGCTACGCAATTAGTGAGCCTACGAACC:1 - chr3R 13339007 3' - BS 5032 1 55.07 ATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATATACATATAGAAATATATATGTATATGCCACATTCAAGCTCCAGATCCA:1 - chr3R 28618368 3' + 412 422 2 65.75 TTAATCGCAATAACAGCGTTTGCCTACGTTTGCCCACCCTTTAGAATTTTGAAAAAATTTATACTTTAGAAAATATAAGGCTTAGAAGTCAGTCTGCATCGGGACAAGATCGTGAAAAGTTTCAAATCAGAGATAAGCAATTCAA:1 + chr2R 5303151 3' + FB 196 1 55.86 TGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACTTAA:2 + chr3R 9298598 3' + hopper 1387 1 65.07 CGAGATCTAAGGAACTATAAAAGCTAGACGGTTGATATTAGGCGTATAGATTCTAGAGTCATAGACGCAGTGACCCAGTGTCACTGGCCCACTCTAACGCCCAAAAATTATGATGAAAGTCCAAGAAATGGAAACTTGC:1 - chr2R 25240232 3' + INE-1 147 1 66.19 AGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTTGAATTTATAATGCCAGCATGCAGGCTGAAACAT:1 + chr3R 25580880 3' + 1360 3347 1 55.48 CGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAGCTATAGTATCGTCATACAAATAAATCGAAGTGCCTCGATAATAAATTTGCTTACACCTGCAACGAATTTAGATAATTAAGTTAGGTATCGATTATATCTATATCTCTTTGTAAGCC:1 - chrX 13090983 3' - P-element 7 2 79.45 TGTTTATCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCTAATAAAATATATTTTTACACATGCGCATGCATAAAATATTCT:2 + chr3L 13779397 3' - I-element 79 1 75.34 TGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTA:1 + chrX 21668355 3' + opus 442 2 60.27 ATCTTTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACT:1 - chr2L 15019876 3' + BS 5030 1 60.27 CAGCCTAGACCACAAGATCTTGCTCTACAATTCTATATTAAAACCAATCTGGACCTATGGCTCACAGTTATGGGGCAATGCCAGCATATAGCAAAAACAAAACGTTGAGAATTTGTTTATTCGTGTGTGTTGAG:1 + chr2L 1697561 3' + F-element 4216 1 64.18 TTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCC:1 + chrX 20330608 3' - P-element 13 1 53.33 CTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAACATTCATCTTTATCCATTGTATTGTTGGATGCGTT:1 - chrX 666298 3' - 412 7139 2 78.62 TAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATATATATATACTTTATATAGTCGGAAACGCTTTCTTTCGCCTGTTATAATTAGGAAAAAAGCATATCTTACAAATTATTTGTCGGTTTCGCGCTATACAGATTTTAGG:1 + chr4 549215 3' + flea 4997 2 74.66 AACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTTTGAATAAATATTAATATTGCCCCCGCTGCAAATATTTTTCACTACGCTCCTGACGATAAGGACACCACTGTGGATCTTAGACAAACATCATGTGGCACCCAACACG:1 - chr2L 15874802 3' + mdg1 406 2 73.97 CATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGTTACCTTGGCCATTTAAGCCTTGACTTGCCGGCTAAGGCAAGTTTTTGAATTTATAATGCCAGCATGCAGGCTGAAACATTAATGGGG:1 + chr3R 25580888 3' + 1360 3355 1 60.96 AGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTAT:1 - chr3R 23902189 3' - I-element 70 1 65.07 ATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGACCCATGTTGCCACTCCCACACTTTTGAAAAATGTGTTGATATTTGTTTTGCCACGCCCACTCTAACGCCCTAA:1 + chr2L 2545707 3' + mdg1 373 2 51.72 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATAGAATTTTTCCAATCCCGATTTTGATCCCTAGACACGGTTTTATTTTTTTCTGACAAATTTTTCTATTTT:1 + chr3L 13993703 3' - P-element 19 1 72.41 AGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGCGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGGGCAAAGTCCCGTAGTTTAACAACCGGAG:1 + chr3R 21925159 3' + hobo 2903 1 64.37 TGTTACCTGCAACCTACGCCGGAGACCGCGGCGAGGGATCTGCACCATATATTTAATTAATTGGCGCTCAACTAGCGGGAAATACGCACCCGTCCATATCATACATAATAAACAAAATAATTACAGA:2 - chr3L 27396714 3' + springer 7480 2 48.03 CTTGACTATAGCATTCTCTCTTGTTTTTTGGTTGAAGTTTGGATTAGGCGGTGAGTACTGTGCAGTAATTTTAGAATATAATTCAATTTGGAATACCTTCAGGATACCCTATGCCCATGTCCATTAACCCTTTGAGTGACGATA:1 - chr3R 23020771 3' + INE-1 577 1 69.44 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTC:1 - chr3R 24084817 3' - roo 8752 2 82.39 CGCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGCATCCTGGGAG:1 + chr2R 8315560 3' - hobo 66 1 78.40 ACGGTCCATTTAATAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCAACTAAACCCACCAAAAATTTCCCAAATCATTTCC:1 + chrX 3534008 3' + 17.6 7387 2 62.76 GTGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTAGTACACTGGCCGC:1 - chr3L 9324400 3' - HMS-Beagle2 6893 2 77.40 GAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTGCTGCTGATGGAG:1 - chrX 20361919 3' + hopper 1390 1 68.28 TTTTGTAAAAGAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCGTAATTACATGAAGTATTCATG:1 - chr3R 17243064 3' - hopper 14 1 76.03 TTTTCTTTTTTTTTGTTTGTAGCCATCGCCATAGCCATCTTCATCTCAGCCCGCGGTATCGAAGTTTCAGTAT:1 - chr3R 4478840 3' - G2 3074 1 75.34 AAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGC:1 + chr2R 10977230 3' + roo 9036 1 59.44 ATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTTGAAAAGTATGCACTTTTTCTCGTTACTAAATTGGGGCTGCCAACTTGTTTTCTTCACGGCGCCA:1 - chr2R 14427132 3' - jockey 4818 1 57.53 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATATAGAGCAATTTGTTTGTTAGGACATTATCTAAACTAT:1 - chrX 8469225 3' + hobo 2922 1 52.56 ATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTTTTCTCCCCGACCCACTTGCAATTTTATCTACTAATTCGATTTATGTTTG:2 + chr3L 2317276 3' - 412 17 2 72.60 CAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATACAATTTGCTACATTGAGCATTTAGAATCCATATTTTTAAGATTTAAGTAGGCAGTATACATAAAAAGCATTACTAGCTAT:1 - chr2L 10536445 3' - flea 4789 2 59.59 TGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCTCCGTCTAAGTGGTTTTTCATTAGAAGCACTCGCTCTCTGGTCGCTCAAACTTTTATACATCGCAAAGTTTTCACTCGATGCGGATGTAGCAAACAACTCGGCCAA:1 - chr3R 31112131 3' - mdg1 7054 2 71.92 TTTGGTCGGCGTGTGAATGCTGACCATGCACTTATACTTTTTGCCTTCGAGTGGGTGATCATGTTACATCTGCCCTGGCCTAACTGCGTAAGCCCAACCAATTTAAGGTTTTTAAAGTCGTGAATTAGTCGAAATTTTAGTTGGAC:1 + chr3R 27608727 3' - 412 7251 2 60.96 TAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGCTGGTTATAGATAGTTTTAAAAAAAAATCATAGTATTATTTCATTCTGTAGTTTTTACTTCAAAGACATCGATTGTGGTAACCATAATTCACTGTAACCAACGAACTTGGTCCGC:1 + chr3R 17531982 3' + 297 393 2 40.41 ACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAA:1 + chr3L 20680355 3' + 412 7467 2 69.86 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAAATGTTG:1 - chrX 17792503 3' + roo 9026 1 55.48 ACTCCGCTCATAATCCGTACACCTGTTTTTTTTTTATTAATCAAACAGCCTTATTATTTATTAGACATTTTTCATAGCTTTCTGTAGATAATTACTCTAAATAAAGAACAGGGATTTTTTACCTTCAAATATTTT:1 - chrX 16998245 3' - diver 5888 1 67.41 AGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGTCTTGCAGCTCTAGAAACATCGTGCTCCTAGGTCTCCAAAC:1 + chr2R 558219 3' + copia 250 1 78.74 ACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTTTCTTC:1 + chr2R 21713309 3' + P-element 2808 1 25.71 CCTAACCTGGTTTTGACCTAGAAAGTCTTAGTTTTAAAATTCATTAGAATAATCAAGAGTGTGGAGTATATTTGAATCGGATATCAAAGATCATACGTGTTCGTTTTCGGCTAATTAACTGCCAGCCCAAGAATTG:1 + chrX 689203 3' + jockey 4778 1 63.97 GGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGTCTCTTG:1 + chr2L 15085737 3' + opus 7449 2 57.53 GTGTGAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCGTTGGTAACTGATGGGATATTTAAGTCTCTTTGGATGTTTTCACTCCGCTTTCTGGCTTCTTGATTGCATTACATTCTCAGCCCTCGACTCGACTC:1 + chr2R 14635428 3' - F-element 4446 1 65.71 ATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACATAAGAAGGATATCGCACTTATAATGTGGGTATAATGACATCGTTTGTAGTTCGCCAGTCTAATTTTAAC:1 - chr3L 5027167 3' + roo 9024 2 52.14 GTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTGCTCTAAGGGATGTTGGCTTCTGGTTTTTGCTGGTGT:1 + chr2R 14532095 3' + invader4 3066 2 69.17 CAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGG:1 + chr2R 17493162 3' - BS 4867 1 66.43 TTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGGATCTATAACAATTTGAAGCTTGGAATACTAATGGAAATAATCAGAT:1 - chr3R 20904975 3' + roo 8997 2 71.92 TAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGC:1 - chr3R 9298444 3' - hopper 18 1 68.29 TTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATCCGAGTCATTGCTCCACTTTGTCGC:1 - chr2R 9750142 3' + opus 448 2 60.99 CGATTTCTCATCTCCCATGCGAATGAGATGAAATATTAAAAATATTTAAGACGATAGAAATGCTTTTGTTCATATTACGAGGAATGTGCCTGCTCGAAGCGAAACATCCGGTGAGGAAGTGGGTGGCAGAGGAAGAATTCGCTTGG:1 + chr3R 31264535 3' - jockey 10 1 45.21 AAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATATCTAGAAATGTTTTGCTTTTTAGGCAAGACTTCTATATTATTTTTTTCTACGTT:1 + chr3L 2317227 3' - 412 7119 2 63.01 AACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATATACTATGCACATTTATAGATGTTCAGTTACTCGCCCTATAATA:1 + chr3L 22491655 3' - Transpac 4996 2 72.60 AGAGGTCGAACGGTAACGGTGCGGACTTTGGACATACACAAAGACGACGCACCGTGAACTTACGGTACAACTGTTGGACCTTGTACCCGGGC:1 - chr3L 25497422 3' + gypsy8 134 2 78.26 AAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCA:1 + chr2L 18181214 3' + blood 7325 1 60.96 AAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTATCTTTGCAATTTGGCCAAGCATTGGAATATTTGTCATACCCACTTTGAGGGCATATAAGCTCGTGAACGTGATTA:1 - chr2R 15392505 3' + mdg1 7413 2 52.74 AGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTAGTTTCGATTACTCATC:1 - chr2L 11475062 3' + jockey 4978 1 73.29 AATATATTTTTCCGTTCTGGAGTTATAAGCCACAAAAAATAAACCCCATTGCGAAAATTATCTTAATATCTCTCTATTTGTAAAATTAGTTATACATTCTCAGCTACGATCACGATCATACTATTCATTCTTGATGGAT:1 + chr2L 22108209 3' - Transib-N1_DM 44 1 48.20 TGGTAGGATGAACACTCATAAGGCCCACGAAGCATACGATCATATCCCTGTTAGGAATAAGTATATCATTGCTATCTCGCTCTTACTTATAAGCTAGCATTAAGAGATAAGTAAATGAAATTTTCCCACATAAGTGTTTAAGTTTT:1 + chr2R 2077685 3' + invader3 5189 2 76.03 GATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTA:1 - chr3L 9324417 3' - HMS-Beagle2 26 2 66.21 TTGAAATAACTTAAAATATAAATCATAAAACTCAAACATAAACTTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAATTTTCATAAACCACTTGCCCTACATGATATTCATTTTCCATACGACCTT:1 - chrX 23174207 3' + copia 5050 2 67.81 ACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACATTATTATAAAAAGTTTTGCTGTCCCTACATTTTCATTGAATTGCTGGAAAAAAG:1 + chr3R 19514322 3' - blood 7082 2 65.75 AAAATGTTAATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACAAG:1 - chr3R 23644842 3' - diver 5929 2 57.53 AAAAGTTTTTTTGCATTTCACCTCCCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGATTTTTTTTAAATATTTATTATTTTATAATTGAAAG:1 - chr3R 25471672 3' - Bari1 83 1 74.48 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCACAAGCTTAAATTCCAATTAG:1 + chrX 6538759 3' + pogo 2044 1 58.22 CCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCTGTTTCTCT:1 - chr2R 12462107 3' + roo 9030 1 56.85 GGTTCGATGTCTTCTACTTGTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGAAGGGTTCCAACCA:1 + chr2R 5621025 3' - ZAM 8018 2 58.09 TGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGCTCCTCGGCCGAGCAACCGTCTGCATCG:1 + chr2L 20852594 3' - Tirant 8118 2 78.08 CCAGCGGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCACTTAAGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTACCTACATATATTGTTGTAACTCTAATTAACTTATTTTTTACATTGTGTATAAATG:1 - chr2L 18181122 3' - blood 7141 2 37.67 TAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTG:1 + chr2R 18931937 3' - blood 7047 2 57.86 GACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCGGACGCCTAGCTGCGCGTCGCTCCCGAAGAACTGTTAATTTGTGGACGATTTTTCGCGAGTGCAGACATAAATGAAAGCAACATATCTTTAGCTCCATTCCAGACTGGATCATAGGCT:1 - chr3R 19094122 3' + P-element 2883 2 80.14 AAGCAATCAAGTTGTCAATGCAGAACACATCCGAGTTGCACAAACCTCGAACGCACGCAACAATAAACACCTGGCATTCAAACCATTAATGCTGTACCCCAAGGATATTCAGAAGCAGGCGGTGATCAATCAACGCCTTTACTTCG:1 + chr3R 12373358 3' + HMS-Beagle 6604 1 67.12 AACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCGATGCATCGGGTAGCTATAACGTAGTTTGCTATTGAAACGAATTTGTTTGGCCAAGGGATCTT:1 - chrX 8681383 3' - jockey 22 1 73.29 AGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACAAATATGGCTCTGATTCACTTCACTTCCCTTGCGCAATGTAATCAGATTATAAATCACCCTGCAAGATGTGCGATTTAA:1 + chrX 20149256 3' + pogo 2078 1 64.34 AATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAATTGTAGATACTGTTGTGGCTCCTTGAAAGCGTATACCCGTTGGACATTTTTCAGAACA:1 - chr3R 30955273 3' + G6 2018 1 73.38 TTTTTTTGGCATAAAATGAAAACAGTTTTTCAACGCATAAGTTATACAAATATTGAGTGAAGGAAACATTGAGAATTTATAAAAATGCAATATAATTGAAATGCGAGTGGGGATTAGGCTAAACCCTCGTCCACGGGGCGAATGTG:1 - chr3L 5659224 3' + transib3 21 1 66.44 AACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCTGAAAGAAACACGTTAAAACACGTTAAATGAGAAAAGTTGGCGCCTGGGGTTACCTGTTGCCGAAGACTTAGCTTCTTAACGTACGACAACAATGGCAATCTGTGGGGAT:2 - chrX 22679598 3' - Doc 43 1 59.59 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGTAGAGAGGAGGAAATCCTCTAATGACCTTTTCTGCGTGTATTTCTAATGCACATAAACGTTGGTGCCAGTACATAGTGCAATATGAATGGCA:1 + chr3R 20983989 3' + hopper 1389 1 64.83 GGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCACAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAAACAGGGCTTAATTCTAGCTT:1 - chr3L 23146473 3' - 1360 63 1 58.22 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATTTATGTGTTTATATTT:1 - chr3L 15148556 3' + roo 9054 2 68.25 TAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAATCATGGAACATCCAAATTAGAAGTGTTCTAGTGCATTC:1 + chr2R 4261977 3' + invader4 232 2 50.00 CGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAGGTGCGCC:1 - chrX 15198027 3' - Max-element 54 2 52.74 TAGTATCCCTTAAGCTAATGTTCCCCCGCAAAACCATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAA:1 - chr3R 30955332 3' + G6 1952 1 65.75 TGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTTTCATTCGAGAATTTCTTGAACAATCAGATATCAACGCCTCTCTTTGCGCTTCTCACTGTGTTTAGCTAACGACGA:1 - chr3R 8197758 3' - pogo 45 1 53.42 AACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATGTATCTAATATATAATCAGAGTTGAGAAAAGGGGTTTTTTCAACACATTTTTATTA:2 - chr2R 19389303 3' + 297 333 2 68.49 TTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATTTCAAATACTAAGATTTGG:1 + chr2R 4206657 3' - 1360 310 1 77.78 GTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTCTGAGGGCAAG:1 - chr2L 11867311 3' + hobo 2873 1 70.00 CCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGAAGTGAATAAACGAAATGGATTAGACTCCTGCCTCGCCGACATATAAATGGTAAATAATCAACAAGTTATGTGCCCAGAAACG:1 + chr2L 22640200 3' + invader4 3001 2 71.92 CCCCCACTTGCTGCACAAGCAACTGTTTGTGACCCATGCACAAAAATGCACTTTGTGAAAATAATTTTGACCATGACTGTATATGATTTTTTTTAAATATTTATTATTTTATAATTGAAAGCATAAATAATGTAAAATTTGCGTT:1 - chr3R 25471648 3' - Bari1 59 1 57.93 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAACCACGC:1 - chr2L 10461138 3' + roo 9010 2 59.59 TGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGACTGAG:1 + chr2R 18931943 3' - blood 7040 2 62.59 AACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCATATGGAATATCATATTCTTTAGCCATCCATTAATATAATATTTATATTTTTCTCCTAATCTCCAACGGTTTGCATATTTTAGATANAATGAAATTACGTCTATGTTT:1 + chr4 373105 3' - pogo 10 1 76.22 CAATAATAATNAACAATCTTACATGTATATATCCACGTACTATATGATAGGTAATAAATAAGTGGCTTCATCACCAATAATTATCATTATGGCT:1 + chr2L 10536582 3' + flea 5012 2 67.02 GAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATACTATATACACGAAGATAAGAAAATGCTGAAGTTGTTTCGATCATAACT:1 + chr2R 4816954 3' + blood 7317 2 74.48 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACACAAGCCTAACTATGAGCCCTTGGCTCTAATGATTATTAGCTTGCAGGTGTGCGCGTTGTCTGTGTTTAGCGCTGAGTTA:1 - chr3R 18832334 3' + roo 9026 1 51.37 AAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAGTATCTTAAAAAGTTGCGCTTAAGTAAGCTGCGACAAGTTTTGTTTACATAAATGCTTGCATGTATAGAAAGGCAAAATAGTTTTATTATTTTATATAAAAAAATGAATAATA:1 + chr2L 8536666 3' - Juan 4034 1 78.08 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATGATTT:1 - chrX 3533852 3' - 17.6 35 2 62.33 TGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTCAACAATCAGAATGAATAAGTGAAAATAAT:1 + chrX 12979573 3' - transib2 32 1 63.70 ACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATGCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACC:1 + chr3R 10737067 3' - F-element 55 1 54.07 CACCAAAAGGTTAAAACCGCTTACGCAGCTCAAATCCTTGGCTTATCCATATATTTACAGAGTGAGAAAAGTTGTGATACCTATGTACGTATACCTACAAAACCAAAGAATTATCAGTAGAGACATTGGTTAAAAAGAATACTC:1 + chr2L 8750230 3' + Quasimodo 214 2 59.03 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTGTTGGAGTGAGCCATTAGGGACTGGGTATCTGTGTGTCTGTGTGCAAAGTGAACATT:1 - chr2L 17574523 3' - hopper 63 1 60.27 CGTAGGCAAAAAAAACTAATTGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGTTATCAGCGATACCCTGTCACCTCTTCCCCTTTG:1 + chr2R 12706219 3' - FB 89 1 76.55 AGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAACGATATAATTGTTTCGCTTTTAAATTGGATAGATAGTTGGATGGATTGTGAACAATATTGAATATTGAATATTTATCAA:1 - chrX 17884482 3' - pogo 4 1 71.56 TAAATATAAATATACAAAAAGACCACCAAAAACTACGTAAGCACTCCAGCGCCCCAGTAATACGATCTAACGCTTATACATATATGCATGCACTTTGCAGCTCAAGTGGTCAATGCCTTCTGCATACATATGTATATGTATAAATG:1 - chr3L 9218281 3' + Stalker4 7044 4 56.16 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTCGTGCCTCAA:1 + chr3R 13869043 3' - HMS-Beagle 35 2 60.27 TATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACTATCCCTTTTTGTGCGTTACGTTTCTTTGCCGTTTGTAAATAAATCTGCGGGAAATGTTATAATTATGCAACCGACAGTCGAGATGCGGATGGAAGAGC:1 - chr2R 3526008 3' + Cr1a 187 1 40.60 AAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGGAGAATCGGCCTGGTCAAACCGCAATCAGCCAGGCAGGTAATCGAAGTAAAGGGCACAAATCC:1 - chr2L 19341479 3' - FB 61 1 58.22 AAGCCCAGTACTCTGTGTTGACCAATCGGGCCCGATTAGAGGGATCTCTGCCCCTTTGCGGCTCTAATAATTATTTCTGAATAGTCAATGAGATTAAATTCTTCCTTTATGCAACGAGCTATTTCTGTTAATGTTGAATGTCCCCT:1 + chr3L 25827658 3' - baggins 4964 1 63.01 AAAAAAAAGTGAAAATAAAAAACTGAATTGTTTAC:1 - chr2L 11891419 3' + Doc2-element 253 1 91.43 CTTCGAGTGGAAAATAAGTTAAATTTTATAGTCCAGTGCTCGAAACATCTCCCAAAATAAATTCGTGAAAACTCTTCAACTTGGATTATAATTCCAATTCGGTATTCAAGATCAGAGACGCAATGGAAAATAACCTTTGACGTGT:1 + chr3L 9697687 3' + 297 457 1 71.03 CTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGTCAAACGATTGCCTGAGCCGAGCGGCCACGAGAGGACAACGAGGCTACTT:1 - chrX 20330500 3' + P-element 2870 1 68.33 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCG:1 - chr3L 20061341 3' + roo 397 1 61.11 TAAAGTAAAATAATGGAAAGTAATGGCAAAATAATCGCAAGCCAAGACCGAGTTTTCCTTCTCGAATTTCGTTTTTTCCTTTCAGCGTTATTGCCTCAATTCTCTGTATTTCTGTATTTTCGTTATTCAGTTATAATAGAAATACC:1 - chrX 5216661 3' + TART-A 13116 1 71.23 TTTAAGAGCGGCAGAGAGTCAAGATTATAGATAATAGGATAAAGATTATTATAGTCAGAACATAATACTCTGTAAATGTCATTCATCTCATGGCAGGCCGTTACATTCCCAGATTGCTATATTTAAGTTGGATATTGTTCGG:1 + chr2R 5134164 3' - Cr1a 4239 1 62.68 GTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTTTGCCAGAATGTAGCTG:1 - chr2L 6618860 3' - 17.6 6948 1 66.44 TTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTCCGGTCGTAAATAAGGCCGGACTGTCATT:1 - chr3L 414806 3' + 412 7527 2 71.43 AAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCACTATTTCACTTCACTCACCGTTGATTGATGACCTCCGTCATCTTCTTGATCCTGGTGGTATCATCATTGGG:1 - chr3R 19506676 3' - mdg3 5259 1 79.86 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATATACTACAATTTTGTTTTGGCCTTCAAAACATTTATAAAAACGTCTTCCTTACCCAAGCTTTACTTCCAAAAATATATTATTTCAATCTAT:1 + chr3R 12376547 3' - HMS-Beagle 25 2 68.06 CTTAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAGGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAACCTTATAATTTATATATAGGCACGTGGGTGCTTTGTATTACGTATAAACTTGCTACAATGTGCTTG:1 + chr3R 1296116 3' + gypsy 398 2 60.71 GTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATAATTAACGCAATATTTCAGCTGCACAAAATACTAAA:1 + chr3R 17243256 3' - hopper 31 1 38.57 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTAGTTCATCATGGTCTGGCCACATGGAACGAGTTTCGTTCCCAC:1 - chr2R 6236085 3' + P-element 2817 1 26.02 TGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAATGAATCAGTGAGGAAGCGAACGCATGATTGAAAAAAAAACATAGCCACAGAAAGTCGAGGCCCGTTCATTGTTTTCCCCTACTCACACACACTTACACGCTCGCA:1 - chr3R 6070133 3' - jockey 24 1 69.18 TGATAAGAACCTATGTAAGAAACCTCGCAGTAGCGAGTCAGTTTACCCCATCTTACTCTTTTTTTTGTATGCGTACATATGTATGTACTAAGTTGTAAATGTACTGGTATTGTCTGATGGTTAGTTTCGGTTCTAACCTTTAAACA:1 + chr2L 23390223 3' + rooA 7505 2 45.89 TAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATAAATATGCACGCTCAGGAAGGGATTTCAGAGGCT:1 + chrX 21639387 3' - 412 85 2 77.08 TAGGCACGTCTGCACTCGTTGAGTGTTCGATCGCGACTCCAATTTGTATACTGAGCAATTAATTTTTACGGTGCTGATCAATACTTGAACTACAATTTCAATGCGTATTCAAGTGGGCTAATTATTATGAAAGCTGGCAAAATTT:1 + chr3R 30955450 3' - G-element 19 1 67.59 CTTAAATCGGATTGCATATGACTAAGTTATAACGTTTCAAACCTAAACAAATAGTCAAACCTATTCAGTTTAGCGGCAATGTAAATTGCATCATTAAATTAGCGCCCCCGATACAGTTTTAAATATCTTTCATAA:1 - chr3L 27356065 3' + Tc3 1663 1 55.56 TCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTCATTTTTATGAACATTTTC:1 + chr3L 9324556 3' + HMS-Beagle2 7143 2 57.14 GGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGC:1 - chr3R 11284891 3' + blood 336 2 52.31 CCGTACGATATACGGTAGCGCCCCTCGGCGATGAATGCATGCATTTAATATTCTAATGATCGAACGACTTTCAGAAAATGTGTTTTGGTTAGAAAAAGTGGGTAAATTTGTAGATCTCTCCCCCTATTTGATTTTGACAT:1 + chr3L 23940549 3' + Cr1a 4398 1 69.29 GCGACGTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTC:1 - chr3R 19965201 3' - jockey 34 1 62.50 AGCTGAGTAAAGGGTATCTGATATCTGATATCTGAACTTGACTATAGCATTCTCTTCTTTTTTTTATTTATAAATGATGCTGATAACCTAGTAGTTCTCTAACTCTCTCTACTATCTTAAATTGCACCAAATAGACGACTTTCAAA:1 - chr3R 18346603 3' + INE-1 545 1 53.42 GCCTTTCCATATATTTTTGGGCGATGTTCTGGAGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGG:1 + chrX 2214274 3' - jockey 4643 1 77.14 CATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAAACGAAGCTATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTAT:1 + chr3R 26242522 3' + roo 314 2 78.08 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATACCGTGTAATCGCTGGCGCGCCACGCCCCCCGCCCCTCCCACTGTCACGCGCTCGCCACGCTCCC:1 - chr3L 17400757 3' - 412 43 2 50.00 TTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCTTTCCATCGGATATTTTTGTTGTTGAAACTGCAACATACACATCCACATTGGTGGCAGACAATTCAACTGGCTTTTATTTTTT:1 - chr3R 4666224 3' - FB 34 1 58.99 AATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCAAGCTCCACAATTCGCAGCACACAAATGCAGCTAATGTGCAATCCGTTGC:1 - chr3L 11535901 3' - roo 72 2 67.81 CGGCGGTGACAAAAGTATTTAGACATCACATTTAATTAGTTCGCATTGATCTGTTCTCTAACTGTGTGGATGTTGAGGAGTTAGGTTATTACCTATTTTTTTTCCAAAAATACATATGCACTTTAATAAGTGTTTGTGTATTTTTT:1 - chr4 808530 3' + Tc1-2 199 1 69.86 AGAAGTTGAAGTTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATGGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGATAAGCTAATGC:1 + chr3L 11684947 3' + Bari1 1673 1 56.55 TAAGTGGCGCAGTCGGTAGGATGATACTAATTGATGCGATATTAAACATATTCAATTCTCTGTGTATCATCCGCTAAAGAACTACAACTACAACTACAACTTCCATATCTCGCGTCGGTAAATCGGTACACTCACTTCAAAATTAA:1 + chr2R 4122889 3' + rover 363 1 80.14 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCATTTCTTTCTGCTGGCTGGTGAAAAAGTGTAGTTGGTTCTAGTAGAGGTACTCATTTTCCGTATACTTAACCCTTCTATTGTGCTATAAATCTGTATAGAAAAGTGGTAAGTACTGCCAACACAA:1 - chr3R 27618451 3' - accord 182 2 77.40 TTTATTTTATTTAAAAAAATTGTGGGACCAAAAGTAGGCAACCTTCTATATCAAAAAATATTGATTTTATTATATAGATTCTGGAAAAAAGCATATCGTATATCAAATTGCCTTTAGTTTGAGTTTAAATTGTGGGACGCCTTTCC:1 + chr4 97363 3' - Ivk 5377 1 70.55 CAACAACCACCTCCGCCTATGAAGCCCGCCCGGTAGGCGACATCAGCAAAGTGCCAACGCTGTATATATATATATTTTCTCTGTGAGCCGAATGCATTCAATTTGCTTTCACTCTGCGGTGACCGTTCATTACATTGATACGCAGC:1 + chrX 14365734 3' + accord 29 2 52.05 TACATAGATTTGGCTATTTCTAATCTATTTTCAAATAATAATAACGTTATTAGTGTGAGTTGGGATGGGAAATTAATCCTCAAGTCTTAACTTAATGAGACTGTATCCGTTTCCACTGGTCCCTGTTCGGGCGCCAGTTAATATT:1 + chr3L 25508749 3' - 1360 338 1 61.38 AAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTTTATA:1 - chrX 292430 3' + G3 4504 1 67.81 GATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAGTGTATGCAAACAAGTTCCTGGAAACTTTATTAATAATGTTTTTAGCAACCCATGACTATTCAACAATCAGAATGAA:1 + chrX 12979559 3' - transib2 39 1 56.83 AACTTATTGTTAGTCTCTTAAGTAAAAGGGCAAATTCAAAAAATAAGCAAAACATGAAAAAAATTCTATAAAAGTATTCGAAAACACACTCGTTTTTGCCACGTTTCGTTTGCGCTAGTTGCTCGTGAATTAGCTTAC:1 + chr2L 21400811 3' + Doc3-element 4678 1 42.75 CTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAGCGGTTGACTGGTGGCCAGCGGCATACGTGTAAACAAGGTAAACAGGG:1 + chrX 9846826 3' + transib2 2750 1 69.66 CAATTAAAGTTACACGCGAGAGGTATATTTTGCCGTTTACCTTTTCAATTATCCTTCTGCTGATAAGAAAGCTAGACAGACAACGATTTGGGCGTTTAATTTGGTATACATTTTTTACTACATTTTTTTAATTTTGAACAATCTTT:1 - chr3R 4480410 3' + Tc1-2 110 1 64.38 ATAAGCAAAGCTCACACAATTGGAAAGACACAGACGTCCGCACTCGAAGAGAGATAGTCGGTGACGTATCTTTTTAATTTGATGATGTGTTTTAATGAGTATGCGTTAGTTTGATGAGCTAGTTAGGTCGATAAGATTAAATAAAG:1 - chr3L 19951169 3' - Ivk 46 1 54.11 ACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATTTTTCACCCAGCGTTTCTCTGGCGAACAATGGAGCTGTG:1 - chr2R 21795965 3' + roo 398 1 73.97 AAGCAAAGTAAAATAAAAAAACCCTTGATATTTCAGAGTTTTAAAATGTTAGGGACATATGGAACATTGATAATTTTAAATTATAAACTTACCTATCAATGACCAATACAGCCACGAGTCCAGTTCGGTTTACCCAAAGTCGAGGG:1 - chr3R 14505222 3' + F-element 4677 1 78.08 GGGCAAAAAAAACTAATCGGTGGGCAAACATGGGCAAAAAATGGGCAAACGATTCCAGCTTTCAAATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTGATGGAAAGTCATTTTGGATTGTTTTATGCATTAAACAT:1 + chr3R 4666316 3' - FB 86 1 76.71 CCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGTAGGAGTTTGAATTTTCGAATTTTCTTTGTTCATAGAAACGATTAGTTTGATGGT:1 - chr2R 961108 3' + transib2 2686 1 72.60 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGAACGGCGGTTGGGTGGCTCAATCACGAATTGCCCTGTAATGTATGCTACGGTTTTTGGAAAATCCTTCCCAACCA:1 - chr2R 22523140 3' - jockey 57 1 50.00 AAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAAGTGGAAT:1 + chrX 17792607 3' - roo 8737 2 69.86 AAAAATTGCGTTTAATTAAGCAAAAAACCCTTTATTTTTAGCTTTAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTATCTGTCTGATCGCTACTAGTTGCAGCGGCCAGCTCTGAAGATTTT:1 - chrX 21184535 3' - S-element 78 1 71.92 GTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAAAGATGTTTTTATTGGGGCGGACACTAATTGTTGGTTAACCCATTGAAGCGCATCTAATGGGG:1 - chr3L 1186236 3' + I-element 5294 1 57.24 TGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAATACTTTTAGACGGCTTACTGGAAGG:1 - chr3L 9635298 3' - Doc 58 1 56.16 AAGCAAATTAAAGTTACTTAATACGATATTTTAGAGAATAAATTCGTTGCCTGTCAGAATTTAGTGTCTCTTTATATTTCTGTTACTTATATTTAAGTCTATAAATATCATTTTTTTTCAGCTGTTCAAACATATTTATTTATTCT:1 - chr2R 16500782 3' + TAHRE 44 1 37.67 ATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCTCACTATCTTCTTCCACGCGCGGTTGGCTGACTGATCACTACTCCTCCGCCTTCAGACTCCGTTTCGACCGGTAC:1 + chr2L 21645251 3' - 1360 19 1 65.25 CGTGAGCGAGCAGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACGCACTTGCAGTGGAATTTATTTGATTGAGCAAA:1 + chr3L 17012018 3' + 1360 3304 1 74.66 TATGTTAGTGATTTATGTAAGTATTCTGAGTACATTGTACTCTATATATATATGTACTCTAAATATATATGTAAGTTATCCAACCCATAAACATATCACCCTTCCACAGTTTATAAACAAATTTCAACTCTCAATCTCGTC:1 - chr3L 24272055 3' - gypsy11 63 2 63.12 GGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGAACCCAAGAGCACTCTCTCCCTCTCTTTTGGGAGAGATGAGATAGCAAAGAAAAGCCAAAACACTAGAACAATCCAGAAGCCAAGTTTTCCGGCTTGCACATACG:1 - chrX 19886890 3' - P-element 16 1 75.34 AACAGCGCATTTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGAGGAAAAATTATATAAGTG:1 - chr3R 25795980 3' - BS 5034 1 56.16 TTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTTATATTGTTAAGCCCTTAAAGACGCTCA:1 + chr2R 6801743 3' - 297 30 2 65.75 AAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACAAACATATACTT:1 + chr3R 8197901 3' + pogo 2063 1 58.22 TGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAAT:1 - chr2R 7314617 3' - blood 7058 2 49.32 GTTGCCGCATGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAAAAAAAGCCAAGAAAAAAAATGGGTCGCCGCAAAGTATGCAACAAAGCTGGTTGGCAAATTTGCAGTTTCCGCCTCC:1 + chr3L 1004916 3' + jockey 4961 1 51.56 TGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTT:1 + chr2R 17350607 3' - F-element 68 1 52.74 GAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGAGTTTCGCTGGCGATTTGCCGGGATTCGTTTCACCATCAAGTTAATCATGTTATTGAAGCTACCCGAACTGAAGTTGCAAAATCCAAAA:1 + chrX 18150097 3' + hobo 2937 1 79.49 GCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCTTGGTCGTGTGCCTGAGTTTAGTG:1 + chr3L 20680391 3' + 412 7518 2 60.31 CTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATAC:1 - chr2L 20761861 3' - Doc 413 1 61.34 CTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATGAACTAATATAAGATGCGCTCTATTATAGTTTTCTTAGT:1 + chrX 23102452 3' - Transpac 5001 2 76.71 GCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGA:1 - chr3R 12341120 3' - Tirant 8172 2 78.07 AAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATAACCCTGACAAATGGGACTCGGTTCCTGGACAGGTTCTGCACGA:1 + chr3L 22021735 3' + mdg1 7396 2 68.15 AGGAACTATAAAAGCTAGACGGTTGATATTAGGCGTACAGATTCTAGAGTCATAGACGCAGTGACCCAGTGTCACTGGCCCACTCTAACGCCCAAAAATTATGATGAAAGTCCAAGAAATGGAAACTTGCGAAAAATAAAATTAAA:1 - chr2R 25240216 3' + INE-1 156 1 75.34 AAATGAAATTTCGTTGACTCCTGAGTCATACCAGTAGTTAATATGGGAGGCAAGAGAGGGCGTGGTCGCACAGTTTGTTTCTTCTATTTTCTTTTCCAAACACTGTATCTCCTTCTTATTGCAGGAGTTCGAATTTTCGAATTTT:1 - chr2R 961139 3' + transib2 2656 1 50.34 GATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTNTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCT:1 + chr3R 16630371 3' - FB 8 1 70.87 CCTTCAACCTACAGACGACAACGAAGTCGTTTCTGGAGGCAACGATCTTTTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAAGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAAAGACCTTTATTTAGCTAATTAGAGTTAATCGGTGTTCCTTTTG:1 - chrX 21442976 3' + Transpac 5150 2 68.28 AAAAAATATAAACAAAATTTAAAAAAAATTTACATTTCTTATTAATATCATAACTTATTATCGAGCTAATAAAAGTTTCTTATTTGCCTGTGAATTGTGATAGCTTTAAAGTTTGGACAGCTTCGAAAAGCAAACACAATAAGTGA:1 + chr2L 5710258 3' - HB 1400 1 73.97 AAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATAACGACGTGAAAGTTGTCCTTGCATCCTCTCTGGTGGAAAATGTGGATTAGGAAATATGTTTATTGATATTATTACTTACATAAA:1 - chr3L 15718043 3' - 1360 24 1 58.96 AGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGACTGCCCCGAGAGACCGGGCCCAAAACAGGTTCTTTCTGTATAAGTCTAGCCCAGAAGTCATCTCGGTTTCT:1 - chr2R 12462115 3' + roo 358 2 51.37 AGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAA:1 + chr3L 11364918 3' - Tirant 8123 2 71.77 AAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTATCTTAGCTTCGAACTCTTTTACCACCATACTATCCGGCCAAAAATCACCCGAACATATGGTCGATAAGCTCGTGGCTTATTGAAATATCACGTTGGCAAAAC:1 - chr3L 23909055 3' + copia 245 1 76.81 AAGATTTTTTCTTTTTTTTTTTGAACTCATTTGTCTATTAGGGAATATGTTTCTTTCCCTTGTCATTCGAAAAAGAACCAAATGATAATTTTTTATTACCACACAATCTCTGTCAGGGATTCGAGATTCTGTGGGACTGGTTTAA:1 + chr3R 12928641 3' - HMS-Beagle2 490 2 80.69 ATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCCTACTGCCCTCTGTGCTCAACTGCTGCAG:1 - chr2L 6637364 3' - 1731 74 2 53.15 TAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGACAAAACAATGTATTTGGAAAACAATCATTTTGCAACAAAATT:1 + chr3L 24766024 3' + 1360 3357 1 68.97 CGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATGTATGAATGAATATACAATACCTGGCATGCAAAGACATATAGAATGCGAGTATCTGAATACT:1 + chr2R 9750257 3' - opus 156 4 56.30 CACAAGACGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATGTACATACGTACACAGGTTATTTTAAACATCTTACAGAATTAGCACCACAACTCTAAAGCTAATCACATTAGTTGTTATGACCTACTATTATAAATCTATATGG:1 - chr2R 7720025 3' - HMS-Beagle 16 2 74.66 AAATATTGTTCAAATACTGAGGCTTCTCCTCAATCCAATTTGCATTTGATTTTTAGTCTTAAGCTCTTCCCCGAAAATCTCCTTATATCCATTAGCAAATGTACTTATGGAGGAACCACCCACATGTCGTATTCCCAGCGCGTAAC:1 + chr3L 18090845 3' + 297 228 2 58.22 CACACACACACACATATATACACAGGCATATGGACTTGCAAAGATATCTAATAGCTT:1 + chrX 10513527 3' + accord 7032 4 85.96 AGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTG:1 - chr2R 20972674 3' - jockey 4747 1 68.28 CGGCCTGAATAAATTTGATTTGCATTGAGTTAGTAAGATACCAGAATTTAGAGCAGTTGGCTCTAATAAAAAGAACCATTCAATACAAACGTATTTGGTTTAATTTACATGCACATGCAAAATTGGCCCACATATCTGCAAAGAAT:1 + chr3R 12146722 3' + gypsy10 258 2 71.23 GTGAGCGAGCGGAAAGAGAGCAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGCAAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCT:1 + chr3R 1202714 3' + 1360 3305 1 94.44 TATAGTTCCTGAGATTTTGACGTTCATACGGACAGACGGATATGGCCGACCTCCCGCTCATCCTGTTATTCACCCAGCTGCCCGCGTGCCTTGCCCACCCAATTCCATAATTCCGCCGGCGGCGAATTTAGAACG:1 + chrX 22487378 3' - INE-1 144 1 68.89 GTGTTGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGTATCATAAATAATATGTTAGCTATGAGAATGTTCCAATCCC:1 + chr3R 13155317 3' + hobo 2861 1 69.66 CGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCAT:1 - chr2L 15085620 3' - opus 50 4 58.27 TTTTCCTTAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTATTCACTCAATTGTGCCATGCTGCTTGTAAACTAATTACCAGCA:1 + chrX 6538739 3' + pogo 2025 1 70.34 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGAGCAAATTACCAACTGTATTTACTAAG:1 - chrX 17770411 3' - hobo 56 1 55.17 TATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAACGGGTGACATCCGTTTTGCTAGTTTTGATGCAGGTTGCCTGCTGCGAT:1 - chrX 21233336 3' + roo 9010 2 71.21 TAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATAGTATCAAGTTGGCGAAAATAGGGAATATTTGCCGACGAAAAATGT:1 + chr2L 5729003 3' - roo 8679 2 76.03 GACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATTAAAATTTTATTATGTCAGCGTACGAAATGAAAGAGATAGCGCACATATGCAAAATGTGGCCAAACAAAGTTAAGTTAAAGTTAAAGAAGGTCAACAGGC:1 + chrX 9951364 3' - jockey 32 1 52.74 GCTCAGTCAGGTCTTGAGGGTGTTTCCGACCATAGATAACTATCCTGTATAGTCGCTTTCACATAGTAAGGGGTATCTTACAGTCGAGGCTTGCGTCTGTAGCAATCTAAAGTAATAATACTCCAGATAGCACAAAC:1 - chr2R 6526108 3' - jockey2 3186 1 62.04 CAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAATCAGTAAAGTCAATTTTGAAGATGTTTTGCATACGCAGCCGTTGCAAACAGCTTGCCAAAGT:1 + chr3R 22320601 3' - roo 23 2 69.86 TGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATAATAAAAATAATAATAAATTGACTTCGGGATAATGCCGCTCAGAAGACAAAGGAAAGTGTGGCGAAAAGGCAGTGAAAAAGCCGG:1 - 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chr3R 31114266 3' - flea 4811 2 59.71 AGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTGGGACTTTACAATCGTAGAGCCTTCTTTAGACCCTCCTTGAAGTTAATTTTCTGGCTTGCACTTGTCTTCCTGCTGAGTGGAATC:2 - chr3R 22708938 3' + roo 9022 2 52.74 GTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCGGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGC:1 + chr2L 15019943 3' - BS 4852 1 63.33 CCGGTGATGAGTCTTGCTACCTTATTTTGAATAGCCTGGATCCTTTTGATGTGGCTGTCGCAGGCTAAGCCCCAGATTTGGCACCCATACTTCCACCCACCGTCGGCCAAATTGGCATTTATTATAATAAAAGCA:1 + chr3R 23636417 3' - X-element 4306 1 70.37 ACGCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGGGGCTTCTCTATGGCATCGGCATCAACGGCCGCA:1 - chr3L 17135396 3' - hopper 67 1 70.99 TAGTTGATATAACATAGTAATTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGATACTTTCCGGATGTTAGCAAAGTATATTGGCCATTTTTCAG:1 - chrX 9165349 3' - jockey 4843 1 71.92 TTGAATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTCCACGGCCTAGCGTTCAAATCTAACTGCACCAATTTCGGCGGGTCACCGTTGACAGGACTGCCTACACCGCC:1 - chr3L 22518908 3' + hopper 1378 1 56.72 GAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCGT:1 + chr2R 558179 3' + copia 247 1 52.42 TATGGAAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATGTATGTATATGGAGATGTAATGCATGCAATGTATATGGGTAAATGGCGG:1 + chrY 2720358 3' - 297 6640 2 73.68 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCGAGAACCCAAGAGCACTCTCTCCCTCTCTTT:1 - chrX 19886967 3' - P-element 87 1 23.57 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGACCATAAACAATCAATTACTTTGTGTTGGCCCCACACTCTCCTTTCTGGTCTTT:1 + chr3L 13285675 3' - roo 67 2 64.83 CTAAAAAATTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCGATACCCACGGTGTCGCAGCTGGATCTCATCTTAGGATTGGCGAAAATCCAC:1 - chr3R 25158594 3' + 1360 3340 1 58.06 AAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAAATACCACGAATATAGCTATGACACATTGTTCTTTTAGCGCCTCGCTTTTAGTTCTCCA:1 - chr2L 15419987 3' + Burdock 230 2 63.70 ATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATACACTGATTAAATATATTGCTAAGCCTTGAGATCAATGAACAAAGTGGAATCACAATTTGTGA:1 + chrX 17792619 3' - roo 8716 2 59.12 CATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTTAGTCAATGATGATGCCA:1 - chr3R 17259524 3' + roo 9001 2 66.44 ATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACGTTGTGCCTCAAATTGTTGA:1 + chr3R 13869051 3' - HMS-Beagle 6821 2 68.06 CTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAAAGTAAACCCTTAACGAAAGGAAGTCAAGTGGGTCACATTAAGTTCAACGTAACAAAACAACCAGTCCACAAAATAAACACTTGAAGTTCAGTTTTATTTTATTATATATTGAA:1 + chrX 2214356 3' - jockey 4568 1 76.03 TATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAATTTGTTGTTTAACAATTTGGCCATAAAAGCCATAAAACAAAGCCT:1 - chr3R 4527162 3' - mdg1 7075 2 60.27 TATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACACCAGCAAAAACAGGGGACAGGTCGGTCGCATGTTGAACATGCAAAACATAAGCCATTTCTGCTTACATTATTATCATTGTTGTT:1 - chr2L 20628536 3' - Stalker2 7268 2 40.00 CTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACTGCTCAAAGCCAGCTTGATTTTATTTGTCACGTTGTCCTGTGTGTGAAGCCAGTGCCTCATGTTGTTGCCAC:1 - chr3L 19274778 3' - transib2 48 1 52.08 CTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACACAAAATCCCATAAATATTGCAAATGGTTACACTTAAGCTAAATGTAATTAAATTACGAAACGT:2 + chr2L 18510820 3' + copia 228 1 56.85 TTTGGGCTTATGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGTATTTGGTCATTAAGTTTTGTTCGATTGTTTCAAAAGTCCCCAAAAGGTTTTTATTATTTTCTTAATTCATTTT:1 - chr3R 23902170 3' - I-element 51 1 50.68 AACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATCCAGAATGTATGAATAGCATGAAAGTACAAAAGGCAAGTTTAGTTATAGTCCTCGATTATGTAAGCATGGTTGGATTTCCTTTCCTCCCTTT:1 + chr3R 20905091 3' - roo 32 2 63.01 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTACAAACATAGACCCGTATCAGCTTAAAGCTAAATAAATTTGCTGTAAGTTGCATAATCTATAG:2 + chr2R 9453378 3' - roo 59 2 61.64 CTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTCAGTGTCAAAACAAAGCCTGCTAAAGGTGATTAACTACGCAGAGTCAGAC:1 + chr2R 2046555 3' - Transpac 4994 2 67.12 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCG:1 + chr2R 14072588 3' - mdg3 75 2 66.90 CAATTATTTTTACAATACCCATTGTAGTTCAACAATTTTAATCATTTTAAATAACTTAAAAGAGATATTGCTATGCTGATCGCTTTATTTCGATCGCTTTATTTCGAAATCGTTCCCCTAATGTTGTTTGGGGGCGTTAAAATGTT:1 - chr2L 16141115 3' + Tc1 1494 1 64.38 TGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAGATTTGATGGGTGAGGGAAACTTTGCTTGGATTTCCGATTTGCGTGTGTCCT:1 + chrX 684894 3' - jockey 4743 1 64.38 GTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATAAGTAATATATAGTAACATATCCATTCTACACCCACAACTCCCCAACCACACACACTTTTGTAAACAATCACAGGCACACATTAATGTCTAAGTAC:1 - chr3L 25206773 3' - HMS-Beagle 23 2 69.66 AAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGGCCGAAAAGACCCATTAAAATATGGCCAACTGAAGCAGGCATATATTTTTTATGGCCGTCCCCCCGAAAGTATGCCACACAAAACTGC:1 - chr3R 21735435 3' - hopper 6 2 74.17 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTT:1 - chrX 292016 3' - 412 7140 2 77.24 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGTGGATTTGCTGAACTAGAGTCCAATTCTGAATCAGAACTATATCTTTTTATTATACCTAAACT:1 + chr2L 512525 3' - roo 8723 2 59.31 AAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCGTT:1 + chr2L 18219434 3' - copia 4900 2 63.70 AAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACGAATCAATTAAAGACTTATGCAAATCGAATGAGTGGTGGTATCGTTTGGAGAGAAAAAGGAGAAATGCAATGACATTAAGTAATAAAATTCGGACAAGGGCATTG:1 - chr2R 18886920 3' + roo 9053 2 71.23 TAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGTCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTGAATTGGAGTTCATCATTACAGTGGTTTCATTGGGAGTACCCTTCCCCAGATCATCGCTTAATTTTAATTCAATAAGAGCAAGATGGAATTC:1 - chr3L 414834 3' + 412 441 2 52.41 TGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCCTTTGTGTCCCAGTTTTTACTGCTGCCGCCCTTACATTTGCATTCCCCTTCCTTCATATTGCTCAAATTTTTTGTTTT:1 + chr3R 7625425 3' + hopper 1404 2 71.43 GCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGTTGGCGTGT:1 + chr4 490341 3' + pogo 2055 1 51.75 AGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAATTGCTTTCTTTGCA:1 - chr3L 9317941 3' + P-element 2861 1 69.86 AGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGACATACAACCTGCTTATGCGGCAACACGTTTTGCTTTGAAATTTTAATTTCTCACGCGACGCCAAAAAGTATGCTACAAAGG:1 + chr2L 13033432 3' + hobo 2932 1 69.09 AAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCTGACCAGTATGTNGTAAGCAAGAACTGAATTAAAATCATTTGAAAAAGTTCTTTAAAAGGTTTTTGCAGATTGCCAACAGTATCNAGGATAGTGATAAGTATCTTTTTTTATTA:1 - chrX 18149908 3' - hobo 3 1 79.58 TTTAGAAAGTACCGTTAGGCTTGAAGCAAAAACTGGTTTTGGCTGGAAGTATTTAAACTATTTGGAGACAAGTTGGTTACTTTATGGCTCGAGAGAGGAGTTGCCAGCCCTGGCTCAAGAGAGGAGTTGCCAGCC:1 - chrX 22575246 3' - Transib5 120 1 73.33 GTCGAGTTCCTCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCTAGGAAGCAGGGACGAAGAAGAAATTTTTTTGGAATATCTATAAAGCTTGAGTAAAAAATAATAAAACTTATCAAAGAGCACCATTACGACAGCAAATCCGAAATAAAT:1 + chr3L 13427965 3' - INE-1 561 1 68.49 AAACGATTCCTTCTGCCTGTTACATACTTTTCAGCGAATCAAGTATACTCCTTTACTCTACAAGTTACGGGTATAATAATAAAATCGTTTCTTAAAAGTGTGTCCGCGGCAGTTTTGCGTGAAATCGCTAATAGAAGTCTTTATTT:1 + chr2R 5797047 3' - INE-1 33 1 57.53 TATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTACTTTGAAGGAAAAATAAAGTAGTGGTTTAAAAATGGCAATTCCTTGGAGTGCATCTTAGTGCTCACATTTC:1 + chrX 666385 3' + 412 7500 2 52.45 TGGCTCCAGGCTCTCTCGAATTTATGTTCGAGAGCGAGAGATCGGAGAGCTATATATCGAACAGCTCTTTTCTACGCATTCAGTGACAGCAGACCATTTTACCCAATGACAACATGAAGAATTTTAAGCACTC:1 - chr3L 18463356 3' + 1360 78 1 60.15 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCT:2 - chr3L 22320155 3' - jockey 62 1 55.71 GAAATTTCATAATTTTTCTGGGATATCGATAGATATGGGAGAATAAAATGAGAAAAAATTTTAAAATTGTTCCAAAGTGTGGCATAATTCCAGGCGTTATAAACTGTTTTTGACAGCCGAGTTGGGTTGGCGTATGTGGCTGGG:1 - chr2R 6608458 3' - INE-1 512 1 55.56 ATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAATAAATGACCTTAATCAACTTTCTACCCAACGTTTAACTCTGTGCTAAGAA:1 - chr3R 20887376 3' - Doc 35 1 57.66 AATATAATAACAACAAAAATAAACCTTACAAATGAAGTCGTTGGGGAAGCCTTTCAGTGCAATACGAATCCCATTTCCAGTAACGAAGATGATGGCGAAGAAGCCAATGGGTCCAATCA:1 + chrX 10849808 3' + mdg1 7052 2 72.27 ATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCCATTAAAAGTCGCAAATTGAT:1 - chr3R 17259505 3' + roo 9026 1 52.86 ACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGG:1 - chr3R 11284901 3' + blood 342 2 52.63 GAATCTCAAGCTTCTAGCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGATCGAGATCGAATATAATGAAGGAATGCACATTTAATCGTTGAAAAATATTGAACTAAATTGGAGAGAGCTTTTATTAAACTCACTAATAACCTTGTTCGTCCTC:1 + chrX 14767097 3' - INE-1 165 1 44.14 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTGAAGTTGGAAAACTTTTTGATTTTTCGCTTCAT:1 - chr2R 16274503 3' + roo 9049 2 73.29 TTCAGATTTTTTATTTAGTTTATTTTATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATC:1 + chr2R 17350578 3' - F-element 97 1 72.60 GGATATTGATCCTGATCAAGAGGATGTATACTTGTAAACGCTTCTTACCTGTTACATACATTTTAAGAAATTTAGTAAGCCGTTTTACTCTATGAGTAACGAGCATAAAAGATAAAGATAGATATTATGCACAGGAATGTTAAA:1 - chr2L 22196889 3' - INE-1 87 1 36.11 CCTTCACCGTGATCTGAATCTTCATACAGTGGAAGAGCAGATCTCCAGGCACACTAGCAGATATAGTGATAGACTTAGACGACAGGACTAAGGACAAACAACGGCATAGCAACTTCTTACGACAGCAGCTGTAATGCTGTCTACGC:1 - chr3L 27422763 3' + BS 4791 1 57.53 ACTCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCACGGTACGGATCTTCCTATACATACGGGGCCGACA:1 + chr2L 14616234 3' + P-element 2795 1 20.69 TAAATAAAATAATTTTGAAAAAAGATGCTTTCCCTGTTTTTTTTTTTATAGAAAAATATGCAAAATAGGCAGGAAAAGTTGCATATCATATGC:1 - 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297 20 2 71.23 GCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAATGAAATTAAACGCTGACGCATCTTTTGCTGACCAGTGGCCAG:1 - chrX 609354 3' + 1360 3354 1 59.09 TTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCAT:1 + chr2L 18219397 3' - copia 4937 2 65.07 CTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCGCACAGTGTTAATAAAAGTTGATAAGAAAGTTTTGTTAA:1 - chr3R 20887426 3' - Doc 64 1 71.55 CATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATGTAAATCTTTTTGGCAAATGTAATTGATTGTAATTTGTAATTGATTAATTAATTTTTTTTATAAATGGTGTACCTTTT:1 - chr3R 10733683 3' + mdg1 7449 2 76.55 TCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATTGTTTCCTTGCAGCCCTTGTCGTCCTTGCCCTCGTTGCTGTCGTCGATTTGATTTGCCTGCTTTCGGTCT:1 - chr3L 22320147 3' - jockey 37 1 54.03 AAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCG:1 + chr2L 15019944 3' - BS 4866 1 68.15 CTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAAAAGCACTTTTCAAACTGTTTTTGCTCATTTTCGGTTTTATTTTTTCCGTG:1 + chr2R 14072590 3' - mdg3 53 2 60.00 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGGGGGCGGAGAAG:1 + chr2R 20052474 3' + transib2 2753 1 68.75 CTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCGAGCGAGAGCGAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGCGAGAGAGAGAGAGAGACAGA:1 + chrX 13874136 3' - blood 168 2 57.27 AATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCTATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATTAATATTTGGATTGCGCTGCGATATGGTGCTGAAATAATTCTTAAAGTCTCGGAAAAAGAAA:1 + chr2L 14056774 3' - pogo 39 1 52.80 ATTTACTAATATATATACATACATACAGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACAGAGAGCGTAAGTAAACCCTCACTCAATTTGCTCCTCCAATTCTCTGCC:1 - chr2L 6637392 3' - 1731 4417 1 68.49 GAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCCACCCAGTTTTTGGCCATATTTG:1 + chr3R 10737102 3' - F-element 31 1 68.49 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACCCACTTATAAGGTAGTTCAACTGTGCGAAAATAAATAAAATTATCCCACGAATCACAAGTTTACGCAAGTCAATAAAGCGACAGGTTTTTCAACT:1 - chrX 10319574 3' - mdg1 7067 2 63.01 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTT:1 + chr3R 10030781 3' - BS 5074 1 62.07 GTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATATCCCCTGATTGCAGTCATTTTTTGAACGTTCAAAACAATAGAAGTGCTGCAAGAATGGTTAAATTCAACACATTTTGCTTTTATCTTACTTGGCAAGCTACGTTTCTTAACTTTGTA:1 - chr3L 2317074 3' + 412 489 2 75.34 CACTTGAGTTATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTT:1 - chr2R 7314636 3' - blood 66 2 60.27 CAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAGACAAAGAAGTCCACTTAGGCTGCAGGACATGTATCCTGTCCTGGCCCCTCTCCATAAGTCAGCTT:1 + chr3R 31112281 3' + mdg1 364 2 58.22 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCG:1 + chr4 490318 3' + pogo 2069 1 55.66 TGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCAT:2 + chr3R 17243212 3' + hopper 1352 1 60.27 GTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAAGAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAAT:1 - chr3L 9324415 3' - HMS-Beagle2 23 2 66.67 TTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACC:1 - chr3L 25889010 3' - gypsy8 303 1 76.77 TTACGCATCTTGTTATACTAGTGTCTTTGGTATGAGCTTATTTTATAATATGTGTTTATTCATGTATGTGGACTACTGAGTTGTTGTTGTTGCGGCCCTTGATGACCTTGGCATTCAGCGGAATCTGGACGGTTTAACGTCAACTA:1 + chr3L 27391438 3' + 1360 3381 2 66.44 CCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTATATCAGAAGTATTGGAATTGGAAAAGAATTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCACATCAAAGATTTTTGCTGAAGGAGCGCTAACCTGGTGACTCG:1 - chr3R 4562695 3' + mdg1 363 2 52.74 TTATGATAGATAGAATAGTTTACAAAACTAGACTAACTTAGATAGTATAGCATTAGCTACGGGGCTTACAGCTATACTCATTTACAATGTTATCTTCTCTTAGATATTATAACATAATCTATTAAAAAGACATTATTATTTTCCC:1 - chr2R 24215630 3' - I-element 5341 1 61.38 AACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCAGTAAGATGTGCTGGTTAAGCCGTCAATATCATATCAATTTTCCACTCTTTTCGGTCTGATCTC:1 - chr3R 27606599 3' - 412 7112 2 58.22 TAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTATATATGTTTACTCAAATCAATTTATATTTACATATGTGCGCTTTATCTTGGAATTGCATTCTTATCAGTAAAGTGCAGATGCTGTAGCTACCATCCTCGAATTAAAAACC:1 - chr3R 15283587 3' - BS 5009 1 74.66 TGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATGTCTCAATTCAGTAAAAACGACACCATTTTAATATA:1 + chr3R 19950564 3' + BS 5063 1 63.01 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAA:1 - chr3L 7751047 3' - 412 7127 2 72.26 CAAGTATACTGTGGTGTCGTCTTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGGTAGATACAAAACTACAATAATAAAAATCGTATGTAAATATGTTTTTGGTTTTCA:1 + chr2R 17493168 3' - BS 4867 1 63.70 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTC:1 - chr3L 15148583 3' + roo 344 2 62.07 ATATACTAATACTAAAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAAACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGT:1 + chr3R 9298555 3' + hopper2 1544 1 63.31 AAAAAAGTGGGTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTATAAGGGTGTTAAGTCTATTTCCGAGGGAAAATAATTTTTACTTAAGATAATGTTTTCG:1 + chr3R 2425650 3' + 1360 3342 1 68.22 AAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCC:1 + chr3R 12078710 3' - hopper 60 1 57.53 ATAAACATAACCATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTT:1 + chr2R 14009076 3' - 412 74 2 76.15 TATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCG:1 + chr2R 9871061 3' - roo 8734 2 68.28 TTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGG:1 + chr3R 21794133 3' + hopper 1345 1 65.28 TGAGATCGGCGCGACCAACATGCCAACTATGCGGGGACGAGCTCACCGTTGACCATATTCTCCCTGACATTTAATGGGGCATCAAAAACCAACATGTTGGTATTGATGACAAATAAATTGATGCTTCAATCAATCAAAA:1 - chr3L 19956482 3' + Ivk 5091 1 54.68 ACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGGTATTATAAAGAGTTAATTAACGGTAATTAAGTTTATCGCCCAGCCCATCGATTGGATAAACAAAATATCATGTCATGACAAATTGCTTTCTTTGCAAATTTTCA:1 - chr3L 9317933 3' + P-element 2879 2 79.41 GTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCACTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATA:1 - chr2L 17957154 3' - flea 41 2 54.48 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAAAATGTTCCCACAAGTAGGTGTATTCATGTAAGCGGCAATAAA:1 - chr3L 27349968 3' - 297 6592 2 69.63 CTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGTGTACTTTAAGACACATTTTAAATTT:1 + chr3R 20200487 3' - Transpac 63 2 61.64 CCCGCAGCGCTTTCAAAAAATAAAGCGAAAGTCTCGTGCTTCTCCGGAAACTGAAAGGAAAAAACCCAAATCAACCATCGGCAAACAAGGGGAAAACCCACAGCGTATGTGTGCGTACTAGAGATGCCCATGGGCATATTCCACG:1 + chr3L 18551147 3' + X-element 399 1 66.90 TATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTTATTCTTG:1 - chr3R 11516499 3' + roo 361 2 53.62 CCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGAT:2 - chr3R 11516508 3' + roo 344 2 60.96 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTGTAAGATAAAACTAAAATATATAAAAATAATATTTGCTTACAAAACGTAGTGCTTTGTTTTTTTGAAGAAA:2 - chrX 17792509 3' + roo 356 2 56.16 AAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTACAGTGATTCATTTAAAAATATCAGTTGAAAACTTTCCTTTTGCCGAGTGTTTAAGAAACTAGTGGT:1 + chr3L 2532544 3' + blood 7334 1 56.16 TGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCCTGAAAGCACCTGGCCACCAGCTGCCG:1 - chr3R 12613718 3' - HMS-Beagle 9 2 78.42 TCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATAATATAATCAACATATTTTACTGATTCAAAACTAGCTTAGTTATGCTAGTCTTACAATTTGTTAGTGTTGAAGCTACTCTATTTTGTCAG:1 - chr2L 6618870 3' - 17.6 6955 1 59.44 TTAGTCTATCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATT:1 + chr2L 15019972 3' - BS 4846 1 50.35 AACCATATTTATTATTTATTTATTGTATGTATTAGAATTTAAACCATTTTTCACCTTCGAATATTCGTTGACATTTGACAGAGATTCGTATGCATCTCTGCATTTGTCAGTTTCTCCAAGAGAATTCCATTTCGTATTTTTCCTCT:1 + chr3L 10723562 3' - Juan 4058 1 84.93 CTAATGCTCCTGATCAAGAATATCTATACTTTAAAAGTTACGAAACGCTTCCTTCCATTGATACCTTCGAATCAAGCATACTCTATACTTCACGCGTATCGTTGCTTAGTGGGCTGGTGCTCATCGGTGCCNT:1 - chr3R 23592714 3' - INE-1 85 1 70.68 AAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACAAGATTGGTTAAACCGTTTCCTATTCAAAAGGCCCTCTTGTGCTACCAATTTATGTGCAATGTCCTTG:1 + chrX 2956290 3' - copia 57 2 57.24 CGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATTCAGTGTCCTTTTTAGAGGACAGGCAAGAATATGTTTTTAATTGTTACTTTAAAGCTG:1 - chr3L 6557074 3' - Doc 14 1 74.66 TAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAACGATAGTTGAGGCACACTATCGGCAAGTAGAGGAGCCCGATGTGACTG:1 + chr3R 22709034 3' - roo 8738 2 70.83 ATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCCTCGGATGATTTAT:1 - chr2R 9376637 3' + hopper2 1560 1 55.04 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAAC:1 - chr2L 10909497 3' - 412 67 2 61.64 TTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAAATTTTTACCTATCGATTGTCTGGTTTAAAATAA:1 + chr2L 15874920 3' - mdg1 74 2 75.38 TTTCGGCTGAGCCTCGCTCTTGGATTCTTAAGATTAGGAAAATATACAAAGAGAGCAGTTTGGAGCACACAAATACGTCACTATATACATATATGTACATTGGGTTGCGTTTTAAATTTGAATGGAAATGAACTTGCGACGAGTTC:1 + chrX 3663229 3' - 297 203 2 71.92 ATTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATAGCAAAAAGTATTAACCAAGAGCAAGCTATGATAAG:1 - chrX 21668885 3' - pogo 60 1 73.33 TTGCAGTCAGTCGAGTTCTCAGCAGCAGTCGTTCGGTCACAAACTAAGAATACTTTGTCAAGTTTCTAGCGCATTACCTAAAGATATAGCACCAAGATATTCTATAGACAAAATAAATAAAACCTCAGCAATATATCTAGACCCG:1 + chr3R 19448277 3' + flea 146 1 62.76 GAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTACATATTGCATATTTATTAATTGATTTGTATGATATTACATACATTGAAAAGCCCCAATACAAGCAGTATATACA:1 - chr2L 18311414 3' - opus 34 4 58.02 GACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGGAGAGACGAAATGGTGGAGAATCGCGATGGGGGAGAATCGCAATGAGCATTCGGTACAGACATC:1 - chrX 3811523 3' + P-element 2878 2 54.79 TATTAGTTGACTTATTATTATGATTCATATTATAATTATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAATTCCCTCTGCTTGGAAAATGAATTTAATTGATTGGACAACAA:1 - chr3R 4527207 3' - mdg1 76 2 72.14 TGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTCCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATATATCTAGAGCTAAGCGATATACTATATATGCTAGTCTAAGATAAATGTATGTT:1 - chr2L 5728864 3' + roo 339 2 65.07 TTTCCGACAATCATGTTGCTGCTCAACAGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATTTATATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATCTATTGTATT:1 - chr2R 545172 3' - flea 55 2 60.00 TAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTGTGTATACGCAAAGTTAAGGTCGGCATAATGGCCCTCAAGCACAAGGATCTTGGTCCTTAATTAGTG:1 - chr3R 23964803 3' - hobo 48 1 53.90 TAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCAATCCAGCACTTTCCATTTCGGTGTTTGGCGTTGTTTGGCCATCACGTCCATTGGGTTCAATAGCACA:1 + chr3L 7751169 3' + 412 475 2 72.60 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCACCTGCCAAATCCAAATCATTTGCCAAAATTCACCTCTCTCTTTCCGCTTAACCCTTAGCCACCACCAC:1 - chrX 9121254 3' + P-element 2876 1 70.75 CAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATATGCCAAATAAATACCAACGGTGAGTAATCGTTTTCTTATTGTTACTGCTGTAGTATCCTATTCCTCTTCCCC:1 + chr2L 3662060 3' - blood 45 2 51.77 ACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTTACCAACACATGTAGCACAGCATTTCTATTTAAATAAATATTTCCAAAAATGTATTTTTTGTTTCTATACT:1 - chrX 13060181 3' + Tabor 7273 2 51.37 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAAGTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCA:1 - chr2L 10909492 3' - 412 62 2 58.22 AAAAACAAAATGTACAAATTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACACTGCAGTGTGCCGAGAATCCTGTTTTAGGCTTAAAACTTCAATATTTGTAATAATTAAAGATTATCT:1 + chr3L 19274890 3' + transib2 2763 1 58.90 AGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATCTGATATAAGCGGGATCGCAAGTGGAGAATAGGGTACAGTAGAGTAGAGTTTCCAAG:1 - chr2L 21683389 3' + pogo 2051 1 59.54 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTGTAAAGTGACCGGAGCAGAGTATTGGAATTAACCGAAAATCTGTCTTCTGTTCGTAGGGGAAGCTTTTCTAGTCTGGTCCCATTTGATATAAC:1 - chr3R 7074768 3' - P-element 24 1 72.86 GTATGAGTGTATAAGCTTATGACTAGATTGGCTATGTATAATTAGGTATGTATGACTAAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACATATCCTTTTTACCCGTAGAAATCTAACCATTTCTTGCCCGCTATTTCACT:1 - 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Quasimodo 29 2 65.07 GTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATGTATCGACATACTTATATAAACGTTCTAAATATACATTTATCTAAAATTTGCTTGCTCTAGGCTCTTGGCGT:1 + chr2L 15085741 3' + opus 450 2 54.79 TTTAAAATTTTGATTTAAAATTAAAAATAAACATATATGTATAAAACTTTAGTTCTGTAGTACTTAGTAGATGGTCAGGTATGAGTTAATATATTACACATATATCGAATTTCACATAAATCAAGCCTCAATCCTAAATTTCATTA:1 - chrX 17052928 3' - 1360 3048 1 57.53 CCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAGCCGGTTCCAGCCGAACGCCACCGACGT:1 - chrX 20330549 3' + P-element 2876 1 53.85 ATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATTAACGGCAATGGAGACCGAGAATTCAGCAGAATGTGCAGGAGGCAGGAAGGATGAGCATGTGGCAGAGAAGGTG:1 - chr3R 24072021 3' - jockey 65 1 51.37 TGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGATCGCCCGTGG:1 + chr2R 9607398 3' - P-element 36 1 56.92 CTCCTAAAAACTATTTTTTATTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATATATATATATGCCTCTATGCAGGCATGCGTGAATGTTGCAGGACACG:1 + chrX 7851356 3' + 297 6906 2 75.86 ATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGCTGCCTTCATCACTTTTTCGGCAGGACAGCCAGGAGACAGCGGCGAGGACGACCAGGATAACGCGTAAAATTTTCATTGTCAGCTCGGCCTGGTTGCGAAC:1 - 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roo 8692 2 61.11 CTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGGAATACACACATATACACATACATATATAGAATATTCGCATTGCAACTGACAGGATGATGAGACCCGGAAAAAGGTAATGTGGGTTCTGGGCTGGGGTACGCAGAAAGTCAGATGG:1 - chrX 18582115 3' - I-element 9 1 73.29 GTGCGTTGTGAAAATATTTTTGACCACCTCTGTATAGAGCACCATGTTCGAAGATAAGGCAAACACCCGCAATAGAGACCATAGAGCAATGAAAGTCCAGTTAAATAGCGATAAGCTAATGCAGGCAGATTCGGGTTACGATTCG:1 + chr3L 11684970 3' + Bari1 1696 1 75.17 GTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTAGGCATACTGAGATACAGATACCGACATACAGACACACCAGCAGACATGCACACGAATACAAGTTAACGCACTGATTTAACGTAACTATTT:1 - chrX 6700652 3' + P-element 2857 1 65.07 TGTAATGTCAGCATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGGAACTCGCGCGAGAAGCAAAGCGAAGCCAGAAGCTATGAGCAA:1 + chr4 317828 3' - Tirant 8215 2 77.40 GAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTAGAAATTTCATAAAATGTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGCCAGACATCTGTGAGCACAGCTATGACT:1 - chr3R 12046696 3' - Doc 3 1 75.56 TCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCGCTTTTCATGTTTGCTTTGCGGTTTTTCATTCGCGTTCCTTAATTTTGTGTTGCCTTTGCATATTAGATTTTG:1 - chr3L 18183070 3' - Tirant 8154 2 52.78 ACATAAGGTGGTCCCGTCGGCAAGAGACATCCACTTAACGTATGCTTGTTATTTCATCATGTAATACCCCATAAAATCATCGCACACACCCACACATGCTATGCCTTCATGGCTGAATTTAAATACAATGGTAATTAATCAAGCGA:3 + chr3L 9318095 3' - P-element 2874 1 58.22 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTTTTCATGTGTGAACAGTTAGCATAATAAACACATAATAAAATGCAAAAGGCAAAA:1 + chr3R 22320539 3' - roo 8735 2 76.52 TTATTATTTATTTGATTATTCTAATGAATTTTAAAACTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGAGTAGATATTGATGCTGCAATTAACCAGCGGAAATTGCAATTTGTAGCATACTTTTTGGGCCTTGCTGACCATTCACTC:1 + chr2R 22796872 3' - jockey 4823 1 54.11 CAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTTATATCCTCCGTTAAATCCTCTCCATCTGTTCACTAACAGA:1 - chr3L 21534259 3' - 1360 82 1 73.97 ATATAATATGTATGTATATATCTTATAACTTCCTTAGAAACGACCGGATAGCAGTTGGATTTTTTTTTTTGGATGCTCCTACGTGATATTCTACACAATGCATTTAGCTACATCATTTAAAATGAATGGTATAGCATAGGAATTAA:1 + chr2R 6144452 3' + Dm88 4375 2 51.37 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATTTAGTGCCATAATTCAAAGCAATCTATGCCAGCCCAGACAAAATAGTGCCCATCACTGGGCGTCCGTACTCCAATAAAAA:1 + chr2R 21796140 3' - roo 37 2 60.27 AGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTANATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACATGGGGTCTAATTATTACGGCACACATGCAATTAACTGAAANTGGATTGAATTTGCTGATTTAACTGGGGAAATT:1 + chrX 10319718 3' + mdg1 7409 2 50.68 TGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTCTCCGTCTAAGTGGTTTTTCATTAGAAGCACTCGCTCTCTGGTCGCTCAAACTTTTATACATCGCAAAGTTTTCACTCGATGCGGATGTAGCAAACAACTCGGCCAACG:1 - chr3R 31112129 3' - mdg1 7042 2 78.68 AGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATGGACAGAACGGCTA:1 + chr2R 5621052 3' - ZAM 17 2 66.13 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACACTAGTGCAGCACGCGTTTGCACTGCCGGATTAAATCATAAAGTTTTTA:1 + chr2L 2544825 3' + blood 7328 1 65.65 ATCACGCTCACTTGAGACANTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGCCAAAATAATGGCAATGGCT:1 + chr2R 8442720 3' - blood 7085 2 66.44 CTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATTCTGCCAACCTGACTACAGATCGACCACATTCTTTTTGAACCAGGGCTTAATT:1 - 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chr2L 15874844 3' + mdg1 364 2 57.53 AAATAAACGCACGCTACAACAAAAAAAAAAAGTATACAAATAATAATTGGCACTTAAAAACCTCAGATACTTTTAAAATTGTAGATACTGTTGTGGCTCCTTGAAAGCGTATACCCGTTGGACATTTTTCAGAACATCC:1 - chr3R 30955270 3' + G6 2021 1 75.54 GGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCAAACGAATGACCAAAGCCCCGTGGGGCTGTGGCTCAAATAATGTGGGAGGGCCGGGCCGCACCGAG:1 + chrX 683625 3' - jockey 63 1 55.22 AGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGCATGCCCTGAAAGC:1 - chr3R 12613737 3' - HMS-Beagle 6831 2 60.27 TAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAAAGTTTTGATACAAACTTTCTAAAACGATAATTAATTTGATACTTAGTATGTATAACTATCATTTTTTGGAACGCATCATGGCCAGTTTGCTG:1 - chr2L 10909461 3' - 412 7084 2 58.90 AAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGAAGATGATATGATTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTGTGAATTTGCATTGAAGGAACCTTCGTCCATCGCC:1 + chr3R 10737080 3' - F-element 21 1 68.42 CAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTGTTGCATACTTTTAGGCCTCGCTTGAAAAAGATTCAAATT:1 - 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chrX 5841896 3' + roo 9028 1 51.45 AAATATTTATTAATTATGTCTAGTTGACCTGTTTTTAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGACAAACATAAAACCATGTATTTTTAATCAACTAGCTTTACGAATT:1 + chrX 18745405 3' - Juan 4106 1 70.55 ACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTTACCTATGAAATTCGGA:1 - chr2R 17269065 3' + roo 9050 2 69.18 GTGGGATTGTTTAAGGTAATCGCATGGGTGTGAGGTGTTCGTGTTAATAGATTGGTACCATGGACTGCAGTTTATTATGTGTTCTTTCTGTTTTGTCGCTCTTTTGTGTTTGCTTTTCTTGTGTGTGAAAAGTCATTTTTCCTGTA:1 - chr3R 31691266 3' - I-element 4886 1 67.81 CAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACTATTCGTCGTGAC:1 + chr2R 18931939 3' - blood 7051 2 56.85 CATGAGCATACGTGTGCACACATACAGTTGTTAGCTGTAGCGCTCTTCGCGCTCTAGCGCTCTTATATCTATATGTGAGCGTAGTATTGTTTCAAAATGCCGTATGACGCCATTGCAGTTTAATGAATCCTTAAAGCGCTTTAAG:1 + chr3R 12622385 3' - 1360 179 1 56.55 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGCCGCCGTACTTACGGTTTGCGCAATATC:1 + chr2R 6768115 3' + pogo 2058 1 54.86 AAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTGCTATTGCTGCTGATGGAG:1 - 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chr3R 16475352 3' - mdg3 5332 2 69.18 TATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAGTATCCTTTGTTTTGGATATTAAAAGTGGTATTTAAATGATGAACAGTTGAATATTGCCAACTTTTTTCAATAACGCTTTCAAATTGTTTTCCAACCTGGAATTTTC:1 - chr2R 22521824 3' - pogo 7 1 77.93 ATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAAAGTTTTTGTTGTGACTT:1 + chr3R 8112841 3' + Burdock 228 2 65.75 TAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAACGGGAGCAATTGACCACCATGTCCAAGCCAATTAGATTCTATTACGATTTGTTGTCCCCGATCGCCCGTGGTCTATGGATTGGTTTAAAATTCAGCAAC:1 + chr2R 9607426 3' - P-element 24 1 69.86 ACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTATACCCTGTAAAAGTTATATTGTGTGTATATATGTCAATCCAGCACTTTCCATTTCGGTGTTTGGCGTTGTTTGGCCATCACGTCCATTGGGTTCAATAGCACAAAACACAA:1 + chr3L 7751177 3' + 412 7536 2 76.71 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCTTATATATATTTTCCATTTATAACAACATAAGCTTCTA:1 + chr3R 6685870 3' - 412 7078 2 68.49 TTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAAAAATAGTCGAGACAGATTCTAGAGACATGTTGCCTCGCCCACAACAAAAA:1 + chr2R 6161780 3' + BS 5022 1 69.01 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATGCCATTATACCTTCCATTCATGTATATCCCTCCATACATTTATCATGCACTCTT:1 - chr3R 24084795 3' - roo 64 2 66.43 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGTGTGGGGTTTTTGGTGCCTAAATACTTAAGCCCACAAAAGTATGCAATGAAATTTGCTCGCAACCAGATTTCACC:1 - chr3R 26854733 3' - jockey 57 1 51.37 GCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGAACACTAGACTCCCAATACACTGGCGGAAACATGGAATTAAGCTATCTAGAACTCATCTAATCGTAATAAGGAATCAAATTTAC:2 - chr2R 16371926 3' - 412 7093 2 54.11 GCCCGGATTAGCGGTATTGTTGTTTTTGTTGTTAAGTTTTTTATTTTCTCTTTGTGATGTAGAAACCTGGGCTTGTGCCTCAAACTGGCTGCCAACAATTGACCCCTCAGCGTGGCACGGGCGTTCTCCTCATCCGAGCTGTCGGA:1 + chr3R 22638471 3' - I-element 144 1 63.70 TCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCACACATGCCACACAGGTCGCCTTCAGTTGGCAGGGTGCAGGTCGCAGTTGAATAAATTTGTACAATGTCACGGCAATTATGTAAAACAGCGCC:1 + chr2R 22958026 3' + hobo 2918 1 68.84 AATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATGTACATACTTATATGTCCTATGTCAGCATTGTAACGCACGTAAATTCCCAAAAGAAACTCCAGGGTTCTGCTGCGCTGATGTTCTACTA:1 + chr3L 18074210 3' - 297 18 2 71.64 AAAATGAAAAAAAAAAACAACATTATTTTAGTTTATGATAGACAGATAAGAAACAATAGAACTCAGTTCCCACTTTACTTAAAGTTTCTTCAAATTCACCCTTCACTGTACGCCCTTC:1 - chr2L 3938938 3' + gypsy7 5011 1 79.66 GTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTAATGCTACCTTCATATTGTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGTTTCTG:1 + chr2L 11523138 3' - HMS-Beagle 6863 2 69.44 AATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGGATTGCTGAAGGAGTAAAAATTGTAACGGCTCGGGAATGTAGAGTGAATTTACACGCTAAACGCGGCCCAAAA:1 + chr2L 6149207 3' - hopper 35 1 56.59 GGCCAGCGTGGGGATGCTGACTTAGCTTAAAGCATAAATGGGTGATCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCGCACCTGAATCTGACTGATTCCGATGTGGGTCTTTCGGGGCTAACAGCGA:1 + chr3L 10033659 3' - blood 125 2 34.25 CTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGGAAAA:1 + chr3L 12890366 3' + hobo 2899 1 69.15 GATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGTTAGGGATTGCTTAGGAAAACTTGTCGCTTATG:1 - chrX 3533856 3' - 17.6 39 2 59.59 GGCAAAAAATGGACAAACGATTCCAGATTTAAAATTTCAAAAATTCTATTTTTCCGAACCTTCTCGGCACCTCCAATGACTTGTAGTTCGATGGCTCCAAAAAATTACTGATTTCTGTCGAATATCGCTTTT:1 - chr2R 4135133 3' - FB 54 1 55.30 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAGTTGGACCCTCGTGCAAAATGTACAATATTT:1 - chr2L 19248094 3' - mdg1 22 2 70.55 TAAGAAGATCCCTTCAGTGAAGTTTGACTGCTGAAGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGCACAAAATCGCGCGCAAAATAAGAAACTGGACGAAAAGAATTATGAA:1 + chr2R 4261939 3' + invader4 232 2 67.59 CGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGATC:1 + chr2L 14263005 3' - P-element 87 1 19.70 TAAAGTCAAAAATTCAACTTATTTCACAGTGTGTAAACAGTTTCTTGACAAACTGTACATAAACAATATAATTTTTCGTTTCCGCAAAATAGAAAATAATTTAAAACAATAAGTGCTGTAAGGAACAAAAGAAGATTTTAGACAAA:1 + chr4 194561 3' + S-element 1682 2 62.33 ACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGAACTAGAATGGTGACAACAAAAACGAGTACTATATAAGGATTCTGCTGCAAGTATT:1 - chr3L 6557131 3' - Doc 71 1 65.07 AAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATACGAAACGAATTTATTAAGGCAAACGCACACACCAAACACCAAAAACTCAAAAATAATAATGAAAAAAAAAAAGAAATCCAAAAT:1 - chr3R 18128409 3' + roo 9037 1 55.17 CTAAATATAANTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCCGTAAACAAGCGGCAGCACAAAGGCAACACAACT:1 + chrX 21233394 3' - roo 8739 2 80.30 AAGCGATGAATCAATACAATGCAATAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCG:1 + chr3R 29288768 3' - BS 5070 1 65.75 GTCAAAAAAAACGGGGTGCNTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCCAAACAAAGGCAGCTTTATATGACCGAAACC:1 + chrX 17770483 3' + hobo 2880 1 71.93 ACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCTGACTGTCAGCTGTTTAACGAATTTAAAAATAGAATTTTTCCAATCCCGATTTTGATCCCTAGACACGGTTTT:1 + chr3L 13993675 3' - P-element 48 1 52.74 CACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCTGACCAGTATGTTGTAAGCAAGAACTGAATTAAAATCATTTGAAAAAGTTCTTTAAAAGGTTTTTGCAGATTGCCAACAGTA:1 - chrX 18149947 3' - hobo 39 1 57.53 TGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATGTATATGTATGTGTGTGGCTGAAATTGCAATAAGTAGCTGTGTATTTGTTAGCCCGCTCCTCGATAGCTATAAAGTGATTTGATTTCA:1 - 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chr2L 8284306 3' - Doc 380 1 77.40 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAATGGGGACATTCCTTAGGATCACGACGATCATACGCGGGACATGCCATTAACTGGGAGTCATCAGTTTGAAGTTGGAAAACTTTTTGATTTTTCGCTTC:1 - chr2R 16274505 3' + roo 9049 2 72.92 GATCGAGACGTTCATACGGACAGACGGACATGGCTAGATCGACTCGGCTATTGATCCTGATCAAGCCTTCTGCCTGTTATATACTTTTCAACGAATCTAGTATACCCTTTTAC:1 - chr2R 4618504 3' - INE-1 132 1 80.53 TAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCAGTATCATAAATAATATGTTAGCTATGAGAATGTTCCAATCCCAATTCCCATTTCGACGCCTTGCTGTCTGCTAGCTAGAAAATACAAAAAATATGTTGACATTTCGCCTTT:1 + chr3R 13155386 3' + hobo 2929 1 76.03 CAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAACCTATTTACCTTCGAAAATTGTATAGATAAGAATTGTGAGTGATTATGCTTATT:1 + chr3L 7024538 3' + 412 424 2 63.01 TTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGAT:1 - chr3R 22320488 3' + roo 321 2 78.08 TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAAAAATGCTAGAACATCTTTATTATTATCATTATTACCATTCCTCAACTTCATTTTTCTCAGCTTCATACCATTTCCCTCCCTATTCCCTCGAAGCAGACCCCC:1 - 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F-element 78 1 59.59 ACCCTCGATCACGGACTTAACTCCGGCGCAGTTTCACATCACCTTTGGAATCATTGCCGCGGTACGGTATCATTCAGTGCCAGTGTGACCAGTTTCGCTGTGGCC:1 - chr3L 11364772 3' + Tirant 398 2 77.14 GTCTGTCGTTCTCTGAGGGCAAAAGTTTCGAGTTAGTTGAAGGATTACAAAGAATTTCAAGTTGCTCGATTGTGTTCCTGACTTCAGCTGGTGCCCAACTCCAATTATTGCAAAGCGAAGACTCCCGTCTG:1 + chr3L 4182817 3' - Doc 357 1 75.57 TTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACACTTCACTTTGGCTTTCTCCCTCTAGTACTCACTGTTTAGAACTTTCCATTCTCGTTTGGGATTTGGCACTCAG:1 - chr2L 19248124 3' - mdg1 29 2 59.35 CTGTCCGTATGAAAGTCGATATCTCAGAAACTATAAAAGCTAGAAAGTTGAGATTCAGCATTCCAGTTTATTGACCCATGTTGCCACGCCCACTCTAATGAATGTCTTGTCTTTCTCTTAAAGTTTAATGTGCGCTTTGGATATGA:1 - chrX 21097016 3' + INE-1 131 1 63.70 AACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGTAAAAGAACGAAAAATCTCCCTT:1 - chr3L 24213770 3' + invader2 5038 2 63.70 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATTGGATGTGTGGCAAATGAAAGTTTCACTGCTGATTGAGTCAATGATGATGCCATTAAAAGTCGCAAAT:1 - chr3R 17259509 3' + roo 9016 2 56.16 ATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGTATTCGACTAACAGGTGGCCCTTCCGGTCTTGAAA:1 + chr2R 21795375 3' - transib2 11 1 74.80 GATAAAAATATGTAAATATGTATATATATGGACCTCATATGGATATGACCTCACTGGAGCTTAATTCATCCGGTGATTTAATTATTTAACGCTACAAAATTGGTTTGTAAGGGTCGTATTGCAATTCGGTGAACCATTTTTGTGTT:1 - chrX 292434 3' + G3 4500 1 70.55 GATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGT:1 + chr3R 10736113 3' - McClintock 4 2 67.12 AGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTGTGCAAGCGTTGCTTCATTAGAGCGAGTGGAAACAACCGGCGCCCTCACATTGTTTCCCCACATTAATTTAATCCGCATCCTTTCCCGCCGCGACCCTGCAT:1 + chr3L 21764499 3' - hobo 18 1 73.43 GATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGC:1 - chr3L 17181433 3' - jockey 62 1 53.85 TTCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATTCAAAGTATCCTTTGTTTTGGATATTAAAAGTGGTATTTAAATGATGAACAGTTGAATATT:1 - chr2R 22521875 3' - pogo 59 1 60.27 TCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATACAATGTTTTATGAAATCAATATATTCGATGGTAAATCAATTTATATAAGTTAACCTAAGTACTTCATTCACTTAAGAGTGTGTAAAATAAGTAGTTTCATACATTA:1 - chr3R 13868869 3' + HMS-Beagle 7027 2 68.49 CACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGGTTCCGCATTTCG:1 - chr3R 14608715 3' - jockey 90 1 73.29 ACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTGGGAAACTGATTCCTTGTTGACACA:2 - chr3R 16187748 3' + mdg1 381 2 54.79 ATACCTAATGAGATTATAAAAAAAATTGCCCAAGCACTGCTAATTTTATGAACACAGCTGTACATACATACATATATTAAGTGAATTCGATTTTGAAAAGTATATTGCTTTGTATGGCAACTGGCTTCAATGAATTAGATTTATA:1 + chrX 22460188 3' + HB 1539 1 78.62 TGAGCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACAGGG:1 + chr3R 10736178 3' - McClintock 11 2 76.03 CGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTG:1 - chr3R 16187781 3' + mdg1 350 2 67.36 AGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACGTCTCTTTCTGGCAATTAAGTTGAGGAACCCGAAGGTGAAATGAAAAAAAAAAGGCGCCAGTCCACAGACTCGACCCC:1 + chr2R 11558079 3' - 412 7099 2 50.68 TAACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAA:1 + chr3R 31198636 3' - Transpac 78 2 71.23 ATATTTCGGGTGGTTTGTGNTTGTGTTAACTTGTACATATATACCTTTTTTTTTGAGCACTTAGCGCGCTGACAAGTTGAAGCTTTGCGTGGAGCGCGGCCAGGTTGGGTTCGGATTGTTTGCCT:1 + chr2L 15420126 3' - Burdock 6146 2 50.40 ACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAAATCTTTTTAATATAAAAGTGAATTACTTTTAGCAGCGATTTCCGAGT:1 - chr3R 28438287 3' + mdg1 410 2 72.00 CACCAAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGACTCACCCAATCACCCAAGTACCACTAACCCACCCACTCACTTTTGGAGACACCGGAGTAGATGCAATGATCATGA:1 + chr3R 20753001 3' - 1360 44 1 54.11 CCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTATTATCAATAAGTAATTTCGCTTTAAATTTAATTAAACAGCTTTGACAAACCATTTATAGCAAAAAACTTTAATGTCCGAACATTTTGGCGTCCGTTTCT:1 - 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Tirant 12 2 76.87 GAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGATGTATTATAGCT:1 - chr2L 18219280 3' + copia 252 1 56.85 TTTCTTGGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGGATATCGTAATCCTTTTCCAACAGAATCAAAACCTCGAACGCAAAGTCGTTTTCACAGCGTCTCT:1 + chr3R 8563639 3' + 297 345 2 55.71 GAGCCGTGGAGGAGCTTCGAGTACAAGCATTGGCCGCTTACACTGCCGCTCAACTGTTTGCGCCCTTCTGGCGTGAACAACTGCCAATAATTGCATATAATTCCATACTGAAACCTTTGACAACGTCATTCGGCCGACTTCAG:1 - chrX 15198034 3' - Max-element 58 2 56.64 AAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAGGTTAAAAAATTTTACAATTAAATGCATTATGTCCAAATCAT:1 + chr3L 6131909 3' - roo 8744 2 75.69 GCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGTAGCTCCACTCGGCGCACTCGGCACCACCGATTTCTCGGCACCGTTCAAGCCCACAGCCAAGACATCGAAAGCACCACCAC:1 + chr2R 14009123 3' - 412 7096 2 53.42 CCCTCTTCCGTTACTCTTAGTCATACATACCTGATGAACCTCGTTCCAGCCCTGGCTGTCCTGGATTCCCAACGTGGCATGGTCATGCAGCAGACTCTCTGTGATCTTCGCCTCACACTTCCTG:1 + chr2R 14069787 3' + mdg3 22 2 77.42 TGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAGTGAGT:1 - 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roo 47 2 54.11 AAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGTCTGGATCGACTTATTTCTTGGTATTTGACTAAAAATAAAAACAAATGTGCAGCTTTTG:1 - chr3R 16187772 3' + mdg1 359 2 61.11 TATTTATTATGACAAAGTGTCACAATGTATTGACGCTATGTTATACCCAATCATTTATTGTATTCTTAGGGTAGATTAGTCCAATAAGCTACAATGTACTGGTCCCGTACTCAGTCCCGTACT:1 + chr3L 16047626 3' - Stalker4 72 4 96.75 ATTATTATAATTATATTATAATTATTATAATTCCTAATTATAATTTCGACTGTCTGGAATTCCCGAGATCTTATCTGATTCAGCATTCTGTCCAAAAGTGCCTAGTTGTTCCTGTGACTCACAGAATATCCATATCAAT:1 + chr2R 9794606 3' - invader3 5052 6 76.98 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATAAAAACCG:1 + chr2R 14821255 3' + roo 394 1 63.01 TTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGTACGCAAACAGTCGATTGCGTGTGTGTGTGTGGGTGTGGGTGTGTGTTAACACACTGCCAGCAATGCGGTGGGTGTTGCTGCCC:1 - chrX 1769661 3' - hopper 15 1 71.20 TTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATTGTAGTTGCCGATGCCAGGCTTACCCATTAATTGGTGCTATTTATGGCTTGATTGGTTTTAAA:1 + chr3L 17135478 3' + hopper 1386 1 55.17 AATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAATATATACGGCGCTGGTGTCTCTGGCAATTGTCAAAGATTGTCAAGTTTTTGGCCTCTTGGTCGTGTGCC:1 + chr3L 20680380 3' + 412 7492 2 52.74 AAGTTACAATTTTACTGATATCATACTGAATCTCTATTTCAATAAAAGTAATATAAAGAACACAAAAATGCATTACAATTATTACACTACATCAACTGGGACTGCGGTCCCCTCGAGCCTCTCGAAACTTGATTTCAGCG:1 - 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chr3R 11516479 3' + roo 9037 1 60.96 TGCAAACTATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGGAATGGTTGAACTCCACGTTGAAATTGCGAATCAGACGAGCGGTA:1 - chr3R 19134406 3' + transib2 2744 1 69.86 AATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACAACCTATATATGTATAACCATGAATAAGGGAGCCGCAGTGGGAGTCTGATTTGCGCACGACCCAAATGAAGCGCCTAGAGAAGTGTAGATAAAAAATCGCTGGCAAATATACAAAAT:1 + chr2R 11153278 3' - roo 5 2 72.92 AAGAGTAACGGAAGAGGGTAGAAGGAGCAGCCTACTACAATACATTTAATATTTTTCTATTCCTAGCCCTCGGGACCCTCCAGCAGCCAGTAGGTCTCCATGTCGCCCTTGCCTTTGACCTGGACCGTACCACGCGACCC:1 - chr3R 16475296 3' - mdg3 5270 2 70.71 TTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGGATCTTGTCTTGTGTGGGTGGGTGGGGTGTGCGCACTGCAGTCACTCGACTGCTGCAGCTCG:1 - chr3L 1463636 3' - P-element 12 1 67.00 ATATTTAATTATTATTTGATTTTTTAGTTTTTTCTTCATAATTATGAAAGCTGTATAATTCTAGCTTAATATACTTTATTATTCCATAGGATTTTCCAACAATTAGGAGTCCGTTTTTTTGCCAAGTTGTAAGGGATTTTCTCTC:1 + chr3L 16169121 3' - Tc1-2 391 1 65.52 TCCTCCCTCGGCCACGGGATTGTAACTCACGCGTTCGCATATCAGGACGACATTATAGTGATCGGACGGACGCTGCGGGAACACATGCGCAACTTGAAGGAG:1 + chr3L 25232873 3' - accord2 11 2 67.65 TCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATATTCATATCTATCGGCTAAGTTTAGGTTTTGCAACTATTTCTCAAGCTGCAGAAGCTTCATAGTATCAAGTTGGCGAAAATAGGGAATATTTGCCGACGAAACATGTGTCT:1 + chr2L 5729007 3' - roo 11 2 77.40 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTTGGGACTTTACAATCGTAGAGCCTTCTTTAGACCCTCCTTGAAGTTAATTTTCTGGCTTGCACTTGTCTTCCTGCTGAGTGGCATCCTGTTGGTCA:1 - chr3R 22708928 3' + roo 9032 1 58.22 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTT:1 - chr3L 14422717 3' - roo 8730 2 64.83 ATTAAGAGGGGAGGAGTTATTGCCCTGCAATTGATTCTCTAACATCTTGTGGTTCCACATAGTCTCCGCTGCCATCGCCGCCCTCCTGCTGCATCCGCTTGTGCTTGGTGCGTCGGTTCTGGAACCAAACCTT:1 + chr3R 13868010 3' + HMS-Beagle2 6870 2 57.14 TATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCAAATACTCCATCAGTTCTTCAATTTCGTTATTATTTTGTCTAATGTTGTTCACCCTCATTCATTTTTTGTGACACTTAATTTAGCTCAACTTGTCCTTGCTCTGATT:1 - chrX 291956 3' - 412 7081 2 63.70 TATTTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTTGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGAC:1 - chr3L 25340831 3' - gypsy8 305 1 75.00 AGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTA:2 - chr3L 9324422 3' - HMS-Beagle2 6915 2 62.33 GTTTGGGTGAAGATTAGGATCTTCCCAATATGGTTGTCAGTGTTCCACACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAACAACAACTTTGCATATTTAAGTCAAATATGTTAATGGCAATGGGTATTTGGCTAGGCTGAATGAGCGGA:1 - chrX 8968597 3' + 1731 4573 2 52.74 AGCTTCTGCTACAACTTATAACGATCCTCTGTCACGGTCGCCATGTAGTTAAATAGGAGTCAAAACGCAATCGGTCATATTTTCCTTTTTTTGGTTTT:1 + chr2L 10035400 3' - mdg1 464 1 65.31 GTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATTAGTGGTGAGCGCGAGTTTTCTTTTCTCTGCAGCATCCCTTACATTCACGTTTATTAGTATT:1 + chrX 20949733 3' - jockey 4570 1 66.19 ACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAA:1 - chr2L 10074483 3' - pogo 54 1 58.62 TAGCATGGTGGTCACTTATTGTTTACGTTATGATCTGGATGCGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATATGTTGGCCTAGTTGAGAGGGCTTATTGTCACGAATTTATCAG:1 - chrX 3533893 3' - 17.6 6993 2 74.66 GCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATAAATCCTGTAAGCAGGATAACACTTTAACACGTAAACACCTAAGCAGCCAACGAGTTGTCAATGGCTCAACCAGA:1 + chr3R 31198668 3' - Transpac 4965 2 53.42 AGTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAA:1 - chrX 7677507 3' + hopper 1334 1 72.60 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGCGGCTATATTGATTTCATTAGCGGCTTTTAAGGACCCATAAAGGCGGCGGCAGGACACTAATTTTCCCACTGCATATTCAAGAGGACTTTACCCACTGCCGCTCGC:1 + chr3R 29627990 3' - roo 8682 2 71.23 TGTGTGTGTGTGTGTGTTCAGGGGGGCAATTACAGACGGAGCATAGAGAGAATC:1 - chrX 6139046 3' - accord 7026 2 59.26 ATCGACTCGGATATTGATCCTGATCAAGAATATATACCTCATATGGACGGAAACGATTCCTTCTACCTGTTATATACAACGTAGAAGGATATGTATATGTAGAAGGATGTATATACTTTACAACGAATCTATAAAAGACAAAAAAA:1 - chrY 28439 3' - INE-1 95 1 71.92 GCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGACTCACCCAATCACCCAAGTACCACTAACCCACCCACTCACTTTTGGAGACACCGGAGTAGATGCAATGATCATGATCTTCCG:1 + chr3R 20753008 3' - 1360 27 1 63.24 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTGCTATGGGAAATTTGTTGTCGCCATGTTTTAAAATAATTACTTAAGCTTACATTTTAAAATTTTTTGTACGACAATTACAGTAAGTACTTATTAATGTGTCTATGCACGG:2 + chr2L 388669 3' + roo 397 1 76.03 GAGCCAATAGAGCGGGAGAGCAGGAGCGCGCTCTTTCTTGATTTGTTGGGAGAGAGACGCCTGTGAGGCAAAAGTTTTTCCTTGCCACACATCTCCATCAACTTGCTACTTTTCCTGAGCGCTTTTCCTTTTTCGACTCTTTTTTT:1 + chr2L 7921055 3' - F-element 378 1 63.70 ATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCTTGGAGCAGAGAAAGGGAATGTTTAACGAATGCG:1 + chrX 15286974 3' - X-element 4400 1 47.58 GTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACAATA:1 - chr2L 13033317 3' - hobo 56 1 60.00 TGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGAATGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGTTTCGAATGTGTTGCATACTTTTAGGCCTCGCTTGAAA:1 - chr2R 20972647 3' - jockey 4721 1 50.00 GTACACTGTACCTATAAGTACACAGATCACCCATTTATGCTTTAAGCTAAGTCAGCATCCCCACGCTGGCCGCTGGCCATATATGCGCATAAGCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTA:1 + chrX 9023559 3' + blood 7035 2 77.60 AACATTTTTTAAAAGTGTGGGCGCGGACGTTTAAGGCGGTTTGTGGAAGTTTTTTGGCATATCGATAGAAATTTACAAGACTAATACAAAAATCAAAAATTAGCAAAAACTTTTTAAGAAACGAAAACACTTCTTTCAAAAAAAGA:1 - chr3L 40933 3' - INE-1 256 1 78.08 AAAAAAAATTCGTCCGCACACAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGG:1 - chr2L 14616210 3' - P-element 97 1 16.43 AGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAAATATCAAAGAACTCCTTGAAAAATTGAATAAAAAGAAAGATTATTGCTTGAAAGTTGCTA:2 + chr3L 12227920 3' + opus 475 2 69.86 TCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTC:1 - chr2R 9870958 3' + roo 9029 1 54.29 AAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGTAGGTTTGTGTTTCGAATGCATAAATGCGAAAATAGAGGAAAATCATGATGCGAAATCATATACATAC:1 + chr2L 18181223 3' + blood 7335 1 54.48 AATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGTCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCACGCTTTTCCAGCTTTCGGGACACATACACATACACACACACACACTGGCATTTTATGCAAATGTCGCTTTTCTGCGT:1 - chr3R 27439815 3' + hopper 1375 1 56.85 CAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATTTCAGTAGCACTATAAAGTCATTTGTGACGGTATCATACGCACTTGAAGCTCTTTTCTTAGTGATGTTTTAGGACCACTCA:1 + chr3R 10030807 3' - BS 5049 1 54.11 CGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATCCAAACACTAAAAAAAAAGGCAAGCAACTGAAATGTTCAAAAAAAAAAAGAAA:1 - chr3L 21364056 3' - hobo 57 1 61.65 AATATCATTTTGTTATTTGCACAGAACGTATGACTTTAACTTTAGAGTCCTGTTTGAAATCTAACATATTCTATAGGAATCTAAAAATATATTAAACAAATTTTTTTTATAATTTCATTTTCAGTGTCTTTTGCTTTTGGTG:1 - chrX 13226503 3' + gtwin 7223 2 91.55 GTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTG:1 + chrX 21668350 3' + opus 443 2 62.14 TATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTGAATGGCTTCGATGGCATGCACTCAATATCACAGCGAATGTGTTTCTGATATATTGT:1 + chr2R 21795341 3' - transib2 64 1 63.01 ACTTAATCCACTTTGTCAGGCGCGTATTGTTAGGCACGAACCTTTTTGTATTACTGGGTTTAAATTGAGGTTGACTTAACGCCGAATGGGTTAATTAGACGACCGCGGTGAAGTCAAATGGCAACAGTGAACTGA:1 - chr2L 17237037 3' - X-element 34 1 51.11 AAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTTGAAAGTGTAT:1 - chr3R 19514237 3' + blood 7328 1 61.43 AGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCAAGTGTTCCCAAAGCTAAAGGGATATACATATGTACATTCCAAGCATAATAACTATTGATAAAAGTAGTTTCAGCGTTCTAGAAGTGTGTATCGCATGATAAAAACCGAGGAGTAAATAA:1 + chr2R 14821267 3' + roo 406 1 71.23 TTTTTAAGGGATATCGATAGATTTGCGGAAACATTTAAGTTGTTCAAAAAGTGGCAAAAGTGTTTTTTGTATACCAATAGAAATTGGCTAGACAAACAATAAAACGAAGGATGAATGCTTCCATTTTATTTCAGAGCAAATTTCGG:1 - chrX 778473 3' - INE-1 500 1 64.38 ACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGTACATATATGAAG:1 - chr3R 19965172 3' - jockey 19 1 76.76 TGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGTTTGGACTGCTTGATTGGATCATTGATTTCGGACAAATGGAGCAAATTACCAACTGTATTTACTAAGCTTAACCTTTTATACAAAAAGATATTACCTATTATTGGGTAAGCTA:1 - chrX 17770365 3' - hobo 11 1 76.71 ACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAAAGTTTTTGTTGTGACTTC:1 + chr3R 8112842 3' + Burdock 6372 2 69.78 CGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAGGGAAG:1 + chr2L 12932178 3' - opus 7068 4 65.97 AGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCGTTCCTTTGCACTCTCTCATCTTCTCTCGTTT:1 + chr2R 21713304 3' + P-element 2817 1 26.19 TCAACCTTTCCTCTCAACAAGCAAACGTGCACTGAATTTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCCCGATTCCGTTCAATCGCCTTCGTTGGCAGCATCGTAGCGGTCGCT:1 + chrX 21045276 3' - P-element 78 1 30.82 TATTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTGGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAAC:1 - chr3L 27415226 3' + transib2 2751 1 67.12 CTCCATAAACAGTGTCTAAGACGAACCTCAGCGAAAGAAGGAAGATCTCTGGACCTACTGGAAATAACATAACTCTGGACCTATTGGAAATTATATAATTTACACGCAATGCCCAAGTGATGCAAGACGGAGAATGCATCGTGAAA:1 - chrX 22559004 3' + gypsy 7370 2 70.55 CATTTACACANCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTGTCACTTACAGAGATTCACTGGGAATGGGACTGGAAATGGGAATGGGAATGGAATGATTCCCAGGGGAAAAAGGTTGAGGTGTAG:1 + chr3R 12341216 3' + Tirant 366 2 63.01 TTAAAATATTTATTATTTATTAGGTAATTTTGTTGTTTTATAATATATTAAGATATCATATTGTATGTTATTTTTGGATATTCTTTTATGATTTTTACCACATTGCTATGATATGATTTAGACATGCTTTTCGCCGACAGGATG:1 - chr3L 11480086 3' - Juan 4059 1 38.19 GCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACAAGCATAATTGCTAAT:1 - chr3R 23644829 3' - diver 28 2 66.44 TTTAATGTAATTATATTTATGTTGTTTCTTATTCGTTTAATTTTATAAAAATATTAGCTATCAAAAATATATATTCGGGAATAAATATTTACATCAACAATATATATTTAAATTGAATTATGTGATTTAACAAATCGCATTGGTCA:1 + chr3L 10471926 3' - diver2 449 1 88.36 TTTTTTTTAGGAAATCAACTTTCCACCTGCAGTAGTGCTATTATTGTTACCGCAACTGTACATATATCTCTCTCAGTAACATTTTGATACAAACATTGTAATGAGATTTTTTCCATAGCTGCGGGCCATTGGGTTTGTTTAGACAC:1 - chr4 784071 3' - Tc1 39 1 69.18 GTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTC:1 + chr3R 13869016 3' - HMS-Beagle 6846 2 58.21 TGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGGAAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAATCATTTTT:1 - chr2R 21795236 3' + transib2 2773 1 55.94 ATTTGGCGTTCACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATA:1 + chr2R 17350604 3' - F-element 71 1 54.79 AAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTA:1 + chr3L 10897561 3' + roo 9032 1 58.90 ACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTT:1 + chr2L 15019965 3' - BS 4836 1 50.79 TCTATATTATTTTTGATCAATTGGCACCATGCGAAAAATTCTTGTTTTGCATTGCCTTAACGTTATTTTTATTTATTAAGTCATTTGACTTAGTGAAGAGCGAACTGTGAAAGTGTCGGGAACTTAGAAAGGCGCAGGACACAGA:1 - chr3L 27130726 3' + 1360 255 1 51.03 TATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGGTCAACAAACTTGCGCTGCGTTTCGTTGTCTTTGTCTCCAGAATCTGTCAGCACAGTGGTACTTATAAAGAAGCCAAACGGTAGTGATTGAATGTGTGTAGATAACC:1 + chr3R 4562395 3' - mdg1 10 2 76.26 TTCTTGATCAGGATCACTAGCCATTCCGGACATGTCGGGATCTTTAAAAGCTTGAATTTTCAAATTGGTATTTGAGTAGTGATTTTATAAATAAATTTATAAGGTAACATCTGTTACTTTCATCTCCAGTTCCTTTTCTTGATTG:1 + chr2R 13259730 3' + INE-1 87 1 68.28 AGCTTGTCTCCTAATTTGGGCACCTTGAGGTCGCGTTCGATGTCTCTTGTTCTCATATACCAAGGAGCCCCCGAAATTCTTCTTAAATTTCACACTATGACCAAAAATTAAAACACATTAGTGGTGAGCGCG:1 + chrX 20949685 3' - 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Juan 3872 1 65.00 GTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGGATCGATCTGTACTTTTATATTGTTAAGCCCTTAAA:1 + chr2R 6801735 3' - 297 11 2 72.27 AAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGTATTAATGTTGATGTATTATA:1 - chr2L 18219283 3' + copia 249 1 54.79 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAAAATGTTCCCACAAGTAG:1 - chr3L 27349993 3' - 297 47 2 52.74 ATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTATGCACATCCACCCTCCATCTTGACTCCTTGTGCGACAATCGTCTGGGCTGCATTACGCTAATAACCTAAAC:1 - chr3L 22021617 3' - mdg1 7056 2 70.68 AGAGTAATTTTGGCCGTCACCAAAAAAGTGGCTGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCCCTTTGCCAGCTGAGTGTTCCGTTTTGAGTCTTTG:1 - chr3L 18846981 3' + 1360 3321 1 75.20 TCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAA:1 + chr2R 18931912 3' - 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X-element 55 1 48.59 TGGGAACTGAAAAGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACACCACACATTCATTCATTCGCTCGGTGCGTCCTTCTCTG:1 + chr3R 6419917 3' - Tabor 6926 2 74.66 AAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATTACACCCAAAATTTCAAGGAGGGAAAACTCATTTCTGTGTCGCAGTTCCAGGAAATTTCATTAACATTTGT:1 - chr3R 26180406 3' - Transpac 50 2 56.16 GGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTCGGAAATGGATTTGTTG:1 + chrX 21668385 3' + opus 472 2 39.73 TAACAAAAATTCGAGAGAGCCTGGAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATTGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGTTTAACGGCTTTCGCTCGGAAATCCCCAGTTGTTTACTTT:1 + chr2R 11247037 3' - 1360 85 1 76.03 TCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCCGGACCACAGTGCAAAGGCTGGGTACATCGCGATATTTAATGGAGATATCGTGAAACTACAAACAGATTGCGGACCGGAGAAGAGGTTA:1 - chr3L 27415201 3' + transib2 2797 1 61.60 TGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACATAACATTCATCTTTATCCATTGTATTGTTGGATGCGTTGCAATTCTCAAAGTAAATCCGTAATAATTTCGACCCCAGGGTCACA:1 - chrX 666252 3' - 412 7094 2 56.16 GAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGGCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAA:1 - chr3L 27350010 3' - 297 6595 2 56.25 GCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGATTGTGTGTATACGCAAAGTTAAGGTCGGCATAATGGCCCTCAAGCACAAGGATCTTGGTCCTTATTTAGTGTATATGCCATGTT:1 - chr3R 23964790 3' - hobo 40 1 56.85 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGGAGAGACGAAATGGTGGAGAATCGCGATGGTGGAGAAT:1 + chr3L 20045980 3' - P-element 19 1 66.92 GCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGACTCTGACCAGTATGTTGAAAGCAAGAACTGAATTAAAATCATTTGAAAAAGTTCTTTAAAAGGTTTTTGCAGATTGC:1 - chrX 18149955 3' - hobo 46 1 51.03 TGCATAGTGCCAAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGTCTGATATTAGTGTTCCAAAAGCTATTCTATTTTCGCATCGGTGACTGTAGGAAGAGCTTTTGCGCCTGAAAGCTAACGCTTGAAGTC:1 - chr2R 10417108 3' + 1360 3353 1 59.59 AGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATCGTAAAAGCGTGTGTGTGTGTGTATTTATGGGTGTGTGTGTGTCTACAAGCCTGTAAGCATATTTCAGGTATTT:1 - 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chrX 21668538 3' - I-element 55 1 58.90 CATAATATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTTCCACATCTGCTCGTGAGCAAGCA:1 - chr3L 14422693 3' - roo 8707 2 47.26 ATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACATCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAGCGG:1 + chr2R 9376732 3' - hopper 63 1 60.27 GATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAG:1 - chr3L 17181453 3' - jockey 85 1 68.49 GCGATGTGCGTGGCGAGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTTGTATGTCTGTTCCTGTGTGTGTGTGTGTATAAGCGTATTTACACAGCCAAGAACAACA:1 - chr2L 13033320 3' - hobo 65 1 63.70 CTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTCAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAATGCTGACAGTGCAGCGAGGACGACGGGACCATG:1 - chr2L 15523057 3' + 412 412 2 76.64 CACTCCCCTTCCCTTAAAGAGAAGCCTATACTTGGGCTGGGATTGATGGATATAGTGTGGGAAATGGAGTTTCTGTTTATGGAGTTGTTTGGTGCGAGAGAGCAAGAGATAACGCAGAGGAGAGTTGATTTAATCAAGCTGAAGCA:1 + chr3L 9696793 3' - 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blood 26 2 75.36 CTACTTGGAACCGAAAAGTTAAGCCGACTAATAAAGTCGGGACTCTCAACATCCCCACGAATAAGCTTACAAGGTAAGTTTAAGGTAAGGATTGCCATTGTGGGTCAATTCGTGCCGAGTTAGCAAAGTCATAAATAAACCAAGA:1 - chr3L 21490408 3' - Cr1a 4098 1 51.72 AATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTA:1 - chr3L 9324417 3' - HMS-Beagle2 6894 2 73.85 GGTCTTGGATGGCATTTCGGCGGGTCGTCGCACCCCTCTGACTTGCTCGTGTTAACTTGTACACACTAGGAAGTGATTAACTAAATGGATTTTTAAAGAACGCGTATTTCCCCAAGGTTGCGAATTGAATTTTTGAAAA:1 - chr3R 12146625 3' - gypsy10 5678 2 58.99 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACACAGCATCTTCCCTTCGCGTTTCTTCCGCTTTATTTACAAGTCAAGTCACTTGCTTCCAC:1 + chrX 8346423 3' - roo 8728 2 62.33 AGCGCTGCCAACCGGGTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATAAATGTACATATTATATTACATGTTATATTCTATATTGAGTGGCTGATTTTTGAAAGTGTACATGCTGGTCCAGAAGTTTGGAAAAGAGTGAGTC:1 + chr2L 19800997 3' - flea 28 2 62.33 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATG:1 + chr2R 10977198 3' + roo 350 2 57.89 AAATGCTTTAAAATTAAATAATTTTTTAAGTTAAAAATGTAAATCCATAAGCTATAGTTTACTTAACCCTTCTGCCACGTTAACAATATTCTGTTTTATTAAATATCGAAATCATCGATACCATCGAAATTTATGGTCTCTGCAGT:1 - chr2R 15070141 3' + 1360 3022 1 78.08 CTACTCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCT:1 - chr3R 19514251 3' + blood 7308 2 72.60 TTGTCTCCGACATTCGCTTAAGTTTTTGATCAATAAAAATACTTTTTTTTATAAACCAACAAACCGCGAAGTTGTAATTATATATATGTATAAATATACAGATAGTATAGTAAATGGATACGGGTTCAGTCCGCTTTGTACTCTC:1 + chr2R 15474570 3' + Quasimodo 7309 2 66.21 AGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAACTTTTAAGTGACCGCTTGTGGTGTCTATCTAAACAGATTCCAGACGATTATAATGTTTCGAGATAGCTACGTTTGGGTATATGAACTT:1 - chr2L 18525573 3' - pogo 31 1 64.38 GTTTAACGTATTTCCAATGTATTAATACTAAAATACTTCAAATTTGCGTACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCCCTGGCATACTTTCATTTGACTTTGGTCACGATACAAAACGTCT:1 + chr3R 17897194 3' + hopper 1335 1 69.18 CTCATCGTCAGAAAATAGGTTGTCGGACATGGACATGTTGGTTTTTATTATGTTAAAACGAAAACAAACCGTGCAATATGATTATGTTACCAGACCATGTTACTGTCTAAAAGCTAAGTTTACAAAAAAAAATACTAATTTACAA:1 + chr2R 16383091 3' - TAHRE 467 2 62.07 GTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAAATTAATTCTAATTAAATTATAAGATCTATAAATTCTTTTTACTGTTAACAAATCAAACCAAATTAACATGCAGTCATCACTTTTTCTGGCAGTGCGCCTTAT:1 - chrX 20999463 3' + BS 5075 1 69.18 TGTAGCGAAANGGAATCTGTACAAGCAAGGCCACCACACCCAATGCCATCGAGCTAGAGCCGGATTCTAAAGCATGCACCCGCCAGTACAGGTGTATGAAGATGCGCAAGGGTAGGGTGCTGTTCTCCTTTATCCTTGCCAGCGTC:1 + chr3L 23768075 3' + Gypsy12A_LTR 2149 1 62.33 TGCAATAAACGGTCGCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTACATGTAATGCTGATCTTGAGCAGCGCGTACAGAAGGAATGTAATGTCCGCTCGCTCTGGACTTTGGTAAGCGTGGGACT:1 + chr3L 25206936 3' + HMS-Beagle 7005 2 60.27 CCATTTCTGCCTACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACAGTTGGTTTGGAATTTTCAAACTATATTTACTAT:1 + chr2L 10909566 3' + 412 402 2 80.82 AGTAGCACCCGCACACAAAATTGTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGCTCACAACTAAGTCCAAATTCTGTATTGATAGTGGGGAATTTTTTAGATTTTATCCCTTATCCTGTTCGCTGACT:1 - chr3L 12890288 3' - hobo 50 1 51.37 GTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTNGGCTGTTGGGGTGTACGTACAACAAATCATGGTCAAAGTGCACGGACATGGCGGGAAATTGGGTGTTGCCCNATAAAATGAGGGAAATTCGCCAGAAGG:1 - chr3R 27315050 3' - jockey 4705 1 57.14 CAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAG:1 + chr3R 12078733 3' - hopper 36 1 59.31 GTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGATGTCTGTGGCGGAAATGAAACGTGCTTTCTGTCTAAGTATGTGTATTTGTGT:1 - chr3R 21794049 3' - hopper 29 1 54.63 AAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCAATGGAAATAAAATGTCGTCAGCTTGCCAGTAAGTTCCATCGAATTTGAACGCTTCAATAAATCATTTTTACATTGCCA:1 - chr2R 21795227 3' + transib2 2779 1 53.42 TTAGACTTTATGCCAAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCGGTGCACACAATTCGATTTGGCCCGGCCAGAGTTACTTATCATTTTAGATTTTCCAAAATAATTGCCACAAATCGGAATGTGATTGAGGTTGACTGTGTCGAG:1 + chr3L 8824579 3' - transib2 20 1 71.23 TTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGTGCGTGCGTGCGTGTGTGTTTGTGGTGCAGCGGGCAAGCAAAATTGCATTGAGATAGGTCAGTCACACACTCACACAGACACA:1 - chr3L 17500699 3' + Tirant 368 2 62.04 ACTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAAAGAAATGCCGAAAGAATGCCGAAAATGAAATACTGAATTCTTTTAA:1 - chr3L 9635323 3' - Doc 83 1 73.29 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTATTCTGATTCTTAAACGTACTTCTAAACAAACGAGAAGACAGCGTAGATCGCATAAATAGAATGCGATCGCCTTTTCTTCTTTTAGTC:1 + chr2R 9871531 3' - 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Bari1 1420 1 77.40 ACCAATAAGCTTCTCTCAGCTGTTCGAAAAGCTCACCCGCTACCTGCCCATCTTTTCGCCGGATCTAAATCTGCGGCACCACATCGAGACCGCTGGCCACCAGA:1 + chrX 17134603 3' - R1A1-element 217 1 71.15 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATGAGTATTCAACTAAAATTTTCTTATTAAAATGCTTCTCAAATAATTTCAAAACACTTAAACAGCACGTTGTA:1 + chr2R 22521994 3' + pogo 2053 1 55.48 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGATGTCTTCATTAAACCATTTGCGCAGCTGTGAAGTGTGTT:1 - chr3R 26927401 3' + roo 8988 2 76.71 GATCAGGATCAATAGCCGAGTCTATATGTCCCTGTCTGTCTGCCCGAATGTCTATGCGTCCATATGAACGCCGAGATCTCAAAAACTATTACGAGTATATTCAAAATACATTAATTTAAACAAATTTTGCATTAAAAAACTGTTAA:1 - chr2L 21347275 3' + INE-1 92 1 59.59 TTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACACAGTACCAACCACTTAAAATCAACTTTATTAACCGAAGCAAAGCCAATAAGTTACCCTCAACAGATCCGGAAAAAAAAACTTTGATGCCAAAGTA:1 - chr2R 7895488 3' + mdg1 392 2 62.33 TTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATATAATAATCCAACTTTACAGGCAGGTAATAAACTAATATTTGCCTGCCACCAAAAA:1 - chrX 23431485 3' - roo 64 2 63.89 GTGTAGGCGTGGTGGCTTAGAGGGAGGGGTGGTGTATGGTACCGATGGGTCGGTAACTCGCGCATGGCTTCTGCTTCGAACATACTTCCCACGCTCGAAAAGGTAGGGTTCCAACCATATCGGAATTGATG:1 + chr2R 5621039 3' - ZAM 37 2 50.38 GACTGCGCACAGCTGCATAAAATTATATAAAAAAAAAAGAGATTTGAGCGACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGCCATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTAT:1 - chr2L 23295811 3' + micropia 5359 2 73.33 ATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACTTTAAATGCACTATTTGAATATAATTAAAGCTTGAACAACCTGTTTCTAAATTATTAAAGCCTTGAGGAAAAATTATATAAGTGCAGGCTATAAGAATG:1 - chr3R 25795965 3' - BS 5019 1 66.44 ATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGGTTAAGATTGTATTACGTTAATTTCAAATTTATAATAAGATATCAAATTGTTAGT:2 - chr3L 7024452 3' - 412 7121 2 61.64 GCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGACCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATT:1 - chr3L 17181464 3' - jockey 80 1 73.08 GGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAAAGACCTTTATTTAGCTAATTAGAGTTAATCGGTGTTCCTTTTGTGGATAACTGAGTGGCACTCTATTGCTTACTATTTGGATGGGGGGAAAAGGGAAATTAAAT:1 - chrX 21442915 3' + Transpac 291 2 71.23 GGTTGGGGTGCGTGTAAAGCTTGCTATGGTATTTTTCCTTAAGTTCCGTGATTGCATTGGCAGGACAAAAGGATTCGGTGCAAGGATTGTTTGCTCACTTCGTTGTCAGCGATTTGCATATCGTTGTTTTGTTATTGCGCTTTTT:1 - chrX 2765954 3' - F-element 4457 1 65.52 CCCTAATGTATGCTCTTTCAAAATATATAGATAAATTCAAAATACAATTTAGCAATTGTACTCGAGTGGAACGATTAGCGGATTTTTTGTCAAGTTCTGCGTTAATTTCGTTCACTGAGTTCGTTCTTCGTGTGAGGTTAGAGCTA:1 + chr2L 22684592 3' - transib3 79 1 62.33 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATTATCTTTGCTTTGACAGCGATCCCCGTGACTCGGACTACGTGCTAGCCTCCAGGATCATCCAAACCTGG:1 - chr2L 10074477 3' - pogo 49 1 54.79 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGAAGCTGCAGCA:1 + chr3R 12078745 3' - hopper 22 1 68.53 AGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCCTGAAAGCACCTG:1 - chr3R 12613732 3' - HMS-Beagle 30 2 65.07 GAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATTTATATATATTAAAAACCCATAACGATTATCGCAGTCATTTCGTTATAGCGCTGAATGTGTAGAATAGCGATATGGTTTTCAGTTTTT:1 + chr2R 10411475 3' - 297 23 2 64.93 TTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACGTAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTC:1 - chr2R 21796013 3' + roo 9013 2 59.59 TTTGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGGGG:1 + chr2R 20052465 3' + transib2 2753 1 73.33 ACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACAAACATATACGTCGTAG:1 + chr3R 8197906 3' + pogo 2068 1 60.27 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGCCGCCGTACTTACGGTTTGCGCAATATCATAC:1 + chr2R 6768119 3' + pogo 2088 1 70.34 AAAATTGTAAGTCTTTAAATGTATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATCTTTAAAAGGTTAATAAATCGATTTCTGTGAATGGCAACCTGAGTACCGAAACACAATTATTCAGCCAACCAAAGAGCGATAATCAATTAGTAAGCCA:1 - chr3R 12519557 3' - roo 22 2 68.49 CTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATT:1 + chr2R 9341632 3' + roo 320 2 80.14 GTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGGACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAAAACCAAACTGACATGCATTACGTATTTATATCTGGGCGAGAGCGGGCTA:1 + chr2R 12133844 3' - jockey 68 1 58.22 GTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACATATTAATTAAATGTAACTTATTTGTTTCTTTTGCTGCATTTCTTAAGTTAAAAGTGCCATCATCCATGACATGAAAAGCTAACTAGATCAAACTAACTGGACATGCTCAC:1 + chrX 8876992 3' - mdg1 15 2 73.97 CCAGAAATGATGTTGAAATATAAAATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGNCAGTG:1 - chr3L 9324437 3' - HMS-Beagle2 34 2 56.39 GCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACTAACATTCCTATAAAAGTAATAAAAATCGTGCAATATACTATAATTCAATGAGTAATTTACGTCCGTTTCCCACGGACGTATGCAATAT:1 - chr2R 6767966 3' - pogo 33 1 59.59 TTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAAAGCTTCTACTGGGTGAGTGTGTGTGCGTGTGTGTAAGCATTTCACACATTCAACAAGTGGCCTTTATTTGGGCAACAAAGAAAAGGAAGCTGCAGCAAACTGAAGTTCG:1 + chr3R 12078757 3' - hopper 13 1 73.97 ATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGCAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAGTTCCATCGCAACAGAGAA:1 + chr2R 6493389 3' + copia 242 1 50.68 GACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACACCTGTTTTTTTTTTATTAATCAAACAGCCTTATTATTTATTAGACATTTTTCATAGCTTTCTGTAGATAATTACTCTAAATAAAGAACAGGGATTTTT:1 - chrX 16998261 3' - diver 5908 2 53.96 TGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGAGACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAATGGG:1 + chr3R 11285015 3' - blood 42 2 55.48 TGTGGTTTAAAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATA:1 + chr3R 22647916 3' + transib2 2755 1 65.52 ATACTTCGTTTTTTTCTCAGCTATTACTTCGATTACTAATTTGATTTTTAGGTCTCTGTGTATGTTTTCGTTCCGAAACTAATATTAATAGAATTAATAAAGCGGAATTGCTTTATGTTACTTTGTTTTTAATCTTGGAC:1 + chr3L 171570 3' - Doc 4453 1 55.00 TAAAGCTCGATCTATAGATGGGAAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCC:1 - chr3R 8112699 3' - Burdock 6191 2 56.85 TGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCA:1 - chr3R 11284917 3' + blood 7339 1 66.37 TCACTATATCTGCTGGTGTGCCTGGAGATCTGCTCTTCCACTGTATGAAGATTCAGATCACGAATAAAATGCAACTAATTTCAGTTTTAATAATGGATTTGCTGGCGGCTTATTTTCGTTTCAAATTTGGTTATTTTCTTTAGAAA:1 + chr2L 15019983 3' - BS 4838 1 56.16 GAGGTTTGGTTTTATCATTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTACTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATAAATAAAAAAAAAAACAACACTAAACGAACCGGAAACATTATTAATTA:1 + chr3R 13339084 3' + BS 5017 1 72.66 CTAAGACTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATGAGGGTGGTGTAATGGTGCTCCATAAAGTATACTTGATGACGGCTAACGGAATCGCATTAGGATGTTCGAATTGGGAATACTATGTTATTTAAAGACTTT:1 + chr2R 19633333 3' - jockey 4787 1 65.47 CCCATAATATCATCAATAAATTTAAAGAGGCGGCGACATATGCCAAATGATTGTGTGCAAAAATGTGTAATGAGCATGACTGCAACCATTCAGGGAAAAGAGTATAATGGATTTGAAAGATTAAATGTGAAGGAAGTTATGAATAA:1 - chr3R 29281832 3' - hopper 341 1 80.14 GTAGGGTGTGAGTCGAGTGGTAAAAAAGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGTATAAAAGGGCTGGTTTCAGAGTGGGCTGCGATATGTTTTAAGTCATATGAATAGTTAAAATTCAATTTAAAAAGTGTTTATGGC:1 + chrX 14978665 3' - hobo 28 1 60.45 GAGCCACCTCTAGAGCCACGGCCAAAAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGATCTTTGGTGAAACTGTCCTTTTCCCGGCACATGTCGAAAAT:1 - chrX 609395 3' - 1360 62 1 75.42 TTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGC:1 + chrX 20330612 3' - P-element 19 1 58.00 GTTTTAAAACATATTGAAAGAATTCGCGAAACACACTTCCGTTGTTTCTCTATTATTTTAATAAATAGAAACCAAAGACACTAGAATTATTCTAGGGTCTTTGTAGAAACTGTCTTTCGCAGTGATAAATACATATTTGT:1 + chr3L 22940339 3' - transib1 1828 1 72.14 TGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGGGCAGCGACGCGACTGCGCTGCCAGCAACATTCAGTAGCAAGACTTTGGCACTCTGGCGAAGAAGCCTCGGCAACATCCACAGTCGTTCCTCGGCCGAGCAAC:1 + chr2L 20852583 3' - Tirant 8116 2 78.95 TTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGATTCCACGGTA:1 + chrX 13060285 3' - Tabor 6899 2 61.43 TGTGTGAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGGCACCGCAGATTTCTCTCACCATCATACATAGCATCACACCCGCACTAGCACACACACACACACACACATGTGCCGCAGCCTTAAAGTATGCCGCAAGTTTTGCCGCTCTTTGTTAAT:1 - chr3L 6014985 3' - accord 190 2 76.71 AGTTTGAGCACATCTACCCCAAACAGGTGACCCATACATTAATATTGGAGAAGTCAATTTATTTGCCATAAGGTGAGGCACCCTAATGCGCTGCCTTTTAGCTTGTGTGTGTGTGTGAATCGTATTAGTATTCCGTTCGATGAGG:1 + chr2R 10582504 3' - Juan 3830 1 61.38 GAAAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTA:1 - chrX 3382317 3' + pogo 2032 1 67.81 TATTTNTTAGCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATATATTTGTGGAAATGAAGTCGTTACAGTCGTAAATTACAAGTTTATACTTAAAAAAATTAGATTTAT:1 + chr2R 4029402 3' + 297 6924 2 51.75 GCGTTAATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATACATATGTATATACCCCATCTAAGGAGCCGAGGAAGCGGCATCCTTCGCTGGCTGCTCTGCCAATTAGATGACG:1 + chr3R 13869032 3' - HMS-Beagle 6842 2 54.11 GCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATAAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAAT:1 - chr2L 512446 3' + roo 8993 2 76.60 TGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTCAAAGGAGATTATGGAACTAGCAGATACC:1 + chrX 860851 3' + hobo 2879 1 74.34 ACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGGGCCAAAATGTGTACGTATGTATGTGTGTGTGTTTCAAAATATATTTTCTGTGGCATTTCGCGATA:1 + chr3R 17243221 3' + hopper 1361 1 54.11 AAATACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGTGGCAGCAACAGTTATAATTTTTGCCTGGCTTCGTTTTATGTCC:1 - 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chr2R 1921408 3' + mdg1 7405 2 52.05 TCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAGGTCATAATTCGCAGTATAAAATCAGGGTGTAAACAGAAAACGCAATGGATTGCGATTAAAGGAGTAACACTGTTACTAAAAAATCAATAATAACCAACAGTTTTGTATTAATTTCAAATAT:1 - chr3R 13559929 3' - jockey 4778 1 74.66 CGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGATAATACACTATTACCTTATTTTTTCACAATTTAAAAAAGTGTTTATCTAACGTAATATTTCGTACTCAACACTTTCTTTGCGGGACAGTTTAAGAAATATGCGCAATTATACATTTTTC:1 - chr2L 12158713 3' + 1360 3384 2 73.97 AATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATTTTTAAGATACTCTATATGCAAGTTTGGCAAAAGTGCCATAAAACTGATTTATCAGCTTGTGTTTTATTTTTTCCTTTTACGACTCGT:1 - chr2L 8536498 3' + Juan 4186 1 60.96 ATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGTTGGCAAGTGCGCGTCGTTTCCGCATCTCTTATT:1 + chr3R 7074896 3' + P-element 2825 1 43.15 AAGATCTTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTA:1 - chr3L 20061326 3' + roo 9021 2 52.08 TGAACCCAACTTCAGCACACTTTGATCATTCGAATAAACAGATTCAAACAGAGCAGAGGTTCTGAGCTCGGAAACCAAATCTTTTACATCTATACCTGTTATAATTTAAAAATTAACTACAGCCTTTTTTGTTCTGAGCAACACAA:1 + chr3R 12948664 3' + Stalker4 7267 4 73.97 AGTGAAGTTTGACTGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGTGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACAGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATG:1 + chr2R 14532048 3' + invader4 247 2 71.92 CTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGGCCACACAATG:1 + chr3L 12991439 3' + mdg1 7386 2 67.12 GTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCC:1 - 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chr3R 21575930 3' - Doc 82 1 56.92 CATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATACACGACTCATCCCACCGCGCTCACTGCAGTTAATTTAAAATTCCACGACGAATTTCATGACGACACATCCTTGGGCGAGATGC:1 - chr3L 7751003 3' - 412 38 2 57.93 CGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTACGAGTATTTTTGTCGTCATCGTAATGTCCT:1 + chr3L 20061448 3' - roo 8694 2 57.03 TTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCTCTAGAATGGTATTTAACAAACAT:1 + chr3R 8197895 3' + pogo 2058 1 54.48 AGTGCCACCCTTGCAGTTCTCTGGAAGTTTCCACACAGACAGACACAAGGAATCCTGGGAGTGTGAAGAGAGTTCGACCGAGAAGGACAGGCAGATGGAGAAAGTGGTGTCAGTTATGAGCTCAATGGCCAAATAGCAAGCCAAAG:1 - chr2R 8316329 3' - hobo 2 1 62.33 CGATATGGGTACCAACCACAGCCACCACAATGCTCCCACCAGGGGGCCTACCTCAATGAGCAGTCTTAATCTATATTCTATATCTATATTCTATATTTAACTGATCTTTACTCCGCGATGTCCACACCAATCCAACCTCAGAGTAA:1 + chr3L 22702785 3' - R1A1-element 5009 1 43.15 CAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGATGCTGGGTACTGAGTACTCCTATGAGGTTTCCGCATTTCGCTTTTCAGCATTTTTGTGGCATGCTTTTGGGGG:1 - 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INE-1 499 1 64.38 GTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTACATATGTATGTATGTATGTAAAAGTGGTGAAATGCAAAAGAATCCGAGTCATTGCTCCACTTTGTCGCAAGT:1 - chr2R 9750138 3' + opus 447 2 59.59 TACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTGGGGATTTTACAGCCACATTTACTTCAAATTATCCATCTGTGCCTAAGTTTGCAAAGATACTTAGCTGCAATATAAGTCAATTTTCTTGGTATACTAAAACCGAAACTCTTAAA:1 + chr3L 10897578 3' + roo 9049 2 70.55 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAACTGTTGGTAATTTTCCTAATTTCAAGTTTAGATTCACTT:1 + chr3R 24084932 3' + roo 394 1 73.79 TTTATATGTTAATTGCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGCCAAATGCAAGAAGGGTGCAGCTTGATAACAGTGCACTGCAGTGACGGAAAAATGTCTCA:1 + chr3R 19950534 3' + BS 5034 1 57.93 AATGTGGGACGATAACTTATAGGGCAATAACTTATATACCTAAATCGAAAAAATCGGCACAAATTTCCTGAAAATTATGACATTTAAATAACCTTAGCCCGAGGTCAGTGTTGAAATAACCATTAAGGTAATTAG:1 - chr3L 9324412 3' - HMS-Beagle2 6894 2 74.81 AATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATCGAGGATGGAGGATGAATGAGGGATGAGGGATGCGAAGGGGTATGCGGTAGC:1 + chrX 14360835 3' - jockey 75 1 64.29 GCTTGCGATCTTCAAAATCAAATCGATAACTGTAATTATTAACTTATATATTATTAAAACCCTTCTAATTACATACATTAAAATAAATATAGTTATTTACATTTTTATTGCTTCGCCGCCGCCTGACGGGCATCAAATACTCCCT:1 - chr3R 12376374 3' + HMS-Beagle 7019 2 69.66 TAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACCAGGAACCGAATTCAAATTTCACCCTCAGCAGCAGGAATTCTGCACCACATCCTTCTTACATTTCAGTTGGCCGCGAGGCATGGCCAATTAATTTCCAACATCTAATTGG:1 + chr2L 2241366 3' - roo 8671 2 72.66 CTAATTTTATTTGGAAATATCTTCGGTTTAAATAGGTGACATGAGAATCGCATCTTAAAGTAAATGGCCTACGCAGAGGCCTTTATCCTGCTAAAGATATTCATTCCATCAATCATTGTCATGTCGAGCATATACGCATTGGTATC:1 - chr3R 22708192 3' - roo 9022 2 56.16 AGTCAGTCGCTGTTGAACCAAGCTAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATGCATCCACAAACTATGGTTGGTATTCAGATTTATTCTTCAAAAAAGA:1 + chr2L 4864459 3' + mdg3 171 2 67.12 TTTATTGTTTTATTTTTTATATGTTATAACAATAAATGAATGCAATCTTCGAATCAGTTTCATCCTTTTCTATATATTTATTATGTAGAAAAAATACCACTGGAATTACCAATTTTGATGACAATTTTTCCCGCAGTGCTTGAAC:1 + chr3L 2411158 3' - gypsy11 3929 1 66.90 TAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGCGCAAGAAAAAAAGAAAAAAAGAGAGAGAACTCGTATGTCGATTTCATCGACTATCTGGTACCATGATTGCAGATTTTTTTTAGATTTTGCACCACTTACGGGGAGCATTTTCGAAATGTATTC:1 - chr2R 5070907 3' - Tirant 8108 2 33.56 AACGTACGCATCGGTGTCGAAATAATTAATATTAAGTGTCTGAACTTAACCAATAAATGAAAATTAACAGTAACACTGGCGGTTTTATTTATAAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACATATAACA:1 + chr4 96892 3' + 3S18 6030 2 67.81 ATAGACAACGAACAAATCGATCGTTCTAAAAAAGACCAAGGAGTGACGACTCTCTTCGCAGCGGAACAATGCATACTCTAGAAAGACTCTAGAAAGCGGTAGCGGACAAGAACCAAAACAAAACAAAAAACTT:1 - chr2L 2895949 3' + Doc3-element 191 1 69.92 CTTTGTGTTTAACTTTCACTATACTGTTGTAGTTTTTAGAACTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATCCTATTTCCTTAAATACTTTTTTAATATTCTATTCCAAACGTAC:1 - chr3R 15003137 3' - Doc 82 1 75.69 ATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAACCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTAGGCCTACGGGCATTTATGTACTTTGTTTTGCCAAAAGATATTAAGTATGTCATTGATTT:1 - chr3R 11516506 3' + roo 9011 2 59.31 GAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGGTTGCCATATTAGCTTTGTGTGCTTAAAACTGGGAAAATGCGAGAAAAGCACGGCAAACGAGTGAAAATGGATAAGTGAAATGGATAAGTAAACGAGCAGCAGCACCCATCCCCC:2 - chr2R 11153083 3' + roo 400 1 78.77 TAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATAGGTTCTATTAACTATTTTATTAAAAACAATCTTTGTACATCATTAAAAACCC:1 - chr3R 29680210 3' - 412 7120 2 70.63 TTGGACACAACGGTCTCTGCTCGGAAGGCCCTATCAACCTTCCACATAACTAAAGACCTTTATTTAGCTAATTAGAGTTAATCGGTGTTCCTTTTGTGGATAACTGAGTGGCACTCTATTGCTTACTATTTGGAT:1 - chrX 21442937 3' + Transpac 5199 2 60.74 AAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTG:1 - chrX 20361943 3' + hopper 1391 1 62.50 AAAAAACGTTTGCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTT:1 + chr3L 20187440 3' + FB 493 1 60.96 AATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGAAAAGACTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCA:1 - chr2L 10461137 3' + roo 9038 1 53.78 TATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACACTCCTTTCCACGCTTCCTCAAGCAGGAGACACGCAACGCGTGGAACGTCTGCGAGCAGATTAACGTTCACGTACCGAAACGGGGGACGGATGGAT:1 + chr3R 11285027 3' - blood 18 2 69.40 ATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACAAGTACATTCATACATAAATATATTGTTACATTTCTCAGGCTGATTTATA:1 - chr2L 4244892 3' - 412 74 2 69.18 GAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAA:1 - chr3L 20061325 3' + roo 9020 2 53.42 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTGCAACGAACAACAGCTGAACCCGATTCCTGTAAATCGATGTT:1 + chrX 16547544 3' + P-element 2865 1 37.72 ATATATACACATACATACCGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTG:1 - chr3R 15727866 3' - 1731 97 1 78.77 CTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGG:1 + chrX 20330611 3' - P-element 14 1 60.64 ATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTT:1 - chr2R 17269091 3' + roo 360 2 52.74 TGCTGACGTCGATCGGAACTTGCTGCGCTGACGTACAAAATCGCGAAGGGAATAAATAATATGGATGAGACTCCTGTTTCGCCGACATATATGTACGTACTGGGCTTCTGACATTTGGAATTCGCAGCACATGTCCATCTATTG:1 + chr2R 14532059 3' + invader4 3019 2 62.50 GCCCACCATTTAAAAATAAATTATTTCGATTGCCCACCCTTTAAAATATCAGTGTGTATACTTGCTACTCAATGCGGGTCATAAAAAAAACCCTTGATGAGGTGTGATCTCATGTTTGTTCCATGTTTTGAACTTATGATTTATA:1 + chr3L 20187450 3' + FB 688 2 68.28 AAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCACAATTTGTAAAAAGTTTTTAATGCGTTTTCCTTTGAATAAATTCAACAGCTAACATTATAAAATGAG:1 + chr3L 22294512 3' - pogo 49 1 52.74 AGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTG:1 - chr2L 10461106 3' + roo 9042 1 65.07 CTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACAGCCTCGGATACTTGTGCGTTTGAATTGCGAGAAGGGTAAACCAGAATGAACTACCGATACCCTTC:1 + chr3R 29283288 3' - hopper 39 1 51.94 GCGTTGTCCTTAGTCAACTGACGGGACATTAGTTCGACTCATAAATAAAACAACAATTTTACTATATGTACGCACTCGTATGTGCGGGGCGGCCTTCAGAAA:1 - chr2R 14415458 3' + 297 6933 2 68.63 TGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAATGCCAGGCATACAAAAAAACATACACTTGCAGAAATGGGGGTATAACTAAGGACAAATCGAAGAATCAATACGCCAATCTCAATAATAATACGTT:1 + chr2R 12102060 3' + hopper 1389 1 63.45 TACTTTAAGATGCGATTTTCATGTCACAACAAAAATGCTGCCTCAGTGCAGATGAAATCTCAAATAGACTCTTAAAAAGTCCCGCTGACAGTTTAGTTCAACGTTTTATCCCCGCTGACTCAGCAGAAGGCAAAGCAGATACAAA:1 - chr2L 9705607 3' + roo 318 2 78.62 GATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCTAGACATGTTACATAATTCATTTAGCCGGCACGGGAACAAATTCCATGATATGAAACATGTGTCTCGCTACATT:1 - chr2R 21796003 3' + roo 359 2 52.74 CGGGACGGTCGTTTGGCGCTGCGAGAGGAGCGGGGTAGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCA:1 - chr2L 20761892 3' - Doc 461 1 71.32 AATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATCATAATTAACTACACTGATTCGATGAACCTGAGCCGGTTAGTTCCCGGAGTTCAGGTGGCTGAGTTTGT:1 - chr3R 28749106 3' + mdg1 366 2 57.58 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATATTATTAAGTTATGAGGCATTTAAAGCGGCCTCCAGCCAAGAG:1 + chr3R 18128514 3' - roo 75 2 75.00 AAAACAAAATGTACAAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTCTAGACTTTATGCCAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATATGGC:1 + chr3R 22647920 3' + transib2 2764 1 58.99 TTAAAAACCTTCATACATTTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCGCGCGCAAAAAAAAGAAAAACAATAAAAACTGACCGCACTCAACGTGGCCG:1 + chr3L 18183174 3' + Tirant 351 2 63.64 AGCACACGATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGAATTGCTTGAAAGAATATGAATTGGTCTTACAATTACAC:1 + chr3R 4962877 3' - jockey 92 1 72.60 ACAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGAAAA:1 + chrX 12439158 3' + gypsy7 5005 1 76.92 CGATTTCTGTGGCGCTCCAGCCTGTCATGGTATCTGCTCGAGTGCTTGTTTATTTCGTCAAATACCGTTGCGAGTTTCAGGTCTCGCGGCGGCTGATGGGATTAGCCCGTGTAATCCTGGAGCAG:1 + chrX 15286949 3' - X-element 4426 1 68.00 TTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACAAACAATATCGAGAGCGGAGTCTGGGTCTCAAATATTCACTACCGCCTGCAATCCGATGCTCCTTTAATTAAGCAGACTGCTGGAGCCCGATGATG:1 - chr3L 20061301 3' + roo 9044 1 63.70 CTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCTGTAGCTCAACTCCCGGAAGTCAG:1 + chr3R 27452085 3' + hopper 1385 1 57.72 TTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATATAAATAATACTTTTAATCAGATTTAAGCCCTTTATTTGTATT:1 + chr2R 17350637 3' - F-element 38 1 69.18 TAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGACTTTACAGCAACTGAATGTTTTAGTCTCCGAAAATCCACCTGCCACCAATCTTTGAATCGGACTACTAGGGCAG:1 - chr3R 5769006 3' + roo 350 2 56.16 CATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAGCTACGCCAGCTGGCTGACTCG:1 + chr2R 18887076 3' - roo 8707 2 53.96 GCATTTAGAATTAAACTAATAATTAAATTAATAATAAACAATAATAATAAACAATCTTACATGTATATTTCGCATTTGATGTATTACCTTTTTAATTGCCATAAAGCATTTTCATGTTGCTAAAAGCCTGTCCGCTGTCCATTCCG:1 + chr3L 5051169 3' + flea 4974 2 59.59 AGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAGCCGCTCTAAACAATGCCGCTGGAGCGGAGAGCATAAAAATGCTAAATAAATTGATGAACTGCGACAGGATGACGT:1 - chr3R 29627834 3' + roo 401 1 71.43 AATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATTGCCTTTCACGGAAAACCCATGACGCACTTTTCTTTAGCTTGAGTCGTGTCCTGCTTTCGCTTCCTTAATTTATGTGTTTATATT:1 - chr3L 15148557 3' + roo 9033 1 58.22 TAATTATTTTTAATATTATTATTATTATATTGTGTTATCTATTGGCAAATAAGTTTCTGATTAAAAGTCTGATTCCTGATTAAAGAGTTGTTCAAATTTATCAAGTTCATATCAGCTAGCAACTAACCAACTGCATGCCCTCGATT:1 - chr3R 6769667 3' - mdg1 44 2 68.49 AAAGTGTGTAATCTTGGAATTTGTTGTTTATTTTCTTGTACTTGGCATTTTCTACGACTCCCAGAGGATAATCTTCGTTGGCCTTGATGGCTGTCCCTGGACTTGGTAATTTATTGGAATTTGCCAAAAG:1 + chrX 15212201 3' + S-element 1530 1 62.31 ATCTTAGCTTTAGTTTCAAATGAACAATTACAATAAACGGTCGCTTGCGATCTACAAAATAAAAATCAATAAATTGTAATTATTTACTTATATGTACATAGTCGGTGTGCAGGGAGGGGGCGGGACATAGGCACTTGATTTTTATG:1 + chr3L 9324547 3' + HMS-Beagle2 7128 2 65.07 TTACACATCATATCTTCACAAAAGGCTCCACCCTCGATCACGGACTTAACTCACGCGTGTCACTTACAGAGATTCACTGGGAATGGGACTGGAAATGGGAATGGGAATGGAATGATTCCCAGGGGAAAAAGGTTGAGG:1 + chr3R 12341211 3' + Tirant 8476 2 63.04 TACTTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGACTGATTGAAAAAGCAGTGGAGATCAGCGATGGTGGAGAGACGAGATGGTGGAGAGACGAAATGGTGGAGAATCGCGATGGTGGAGAATCG:1 - chrX 3811563 3' - P-element 32 1 60.69 CCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAATAATAAAAATAAAAACTGGGGTTGTGCCGCAAGCTTTTGCCATAGTTTTACTAACGGTTATTCCGCTCGCACAAATCGGATGCTGCTGCT:1 - chrX 3382280 3' + pogo 2069 1 60.96 GCGTGATGAGTTGGCGTGAATACGTCACTATATATATAATATTCTTCTCATAAAGCTTGTAATGGGTATCGGATAGTTGAGTTGCTCAACTACATCGTCTTCTTTTTCGGTACTTATCCCTCTTTATTAGGGCAATAACA:1 + chr3R 10736175 3' - McClintock 8 2 77.14 ATATTTAATTTTGTTAAATAAATAAAATAAATAAAAAGATACCCTTTTATTTGCTGTTTGTTATGGTTAATTTGATGGGTCCAAAAATATAAATTATATAAAAATGGCCATCCCATACTACTGTGCAATTATAGATTATCCTAGTA:2 + chr3L 19951332 3' + Ivk 5372 1 77.40 TATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACAGTTGTGCGAGTTTTTGGCTGAGGGGGGCGTGGCTGTCTAAAAAACACACGCCAAGGGGGCCAAA:1 + chrX 8968707 3' - 1731 61 2 58.22 TAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGCACAATGGTCTCAAAATTGAATGTCAATTAGATTGATATAGAGTTGGGCTGCGACCTTAGCTTAATTGAGCGCTAATTGTTTTGTTAAAGAAAAGAACCCTACATGC:1 - chr2R 7314587 3' - blood 7027 2 70.34 TCAGACTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTCAGACCAGATCCGTGAGAGTGTGGACCTTGTG:1 - 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chr3L 18216478 3' - 297 6643 2 64.58 GTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGNCCAACAACAGCGACATAGAGGGGCAATTGCCCATTAAAACTTAAAGTGTAGCATACTTTGCAGCGCCACATNCGCAACGAACGTAACGAAATGGAGCGCAACCCT:1 - chr3L 17181394 3' - jockey 25 1 68.49 AAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTG:1 + chr3R 30569103 3' + mdg3 213 2 47.86 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATCCGCCAAATCTACTTCAGGGGTAATCTACTCCGTATCGTCTTCCCCCTTCAGTAGTCG:1 + chr2R 558178 3' + copia 224 1 60.27 TTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCACCGTGTAATTGTATTTCATTGCAGGATATTGGATTTTTGTGC:1 - chr3L 8824458 3' - transib2 81 1 71.23 TGTTTCCCTCCAAAAAATTTAATTATTGTCCACTAGGACAGATTTTAAATAATAAATAAAAGGCTACACAAAAAAAAACAAAGGAAAATATTTGTTATACGCTTGTAAATTTATAGCGGCAGCAAAGTCCAGCCAAGCAGAGG:1 + chr3R 15668238 3' + G2 3011 1 60.14 AAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGCGGGCCAAAATTA:1 + chr2R 10977242 3' + roo 391 2 69.34 AAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAAACCTTAAACTGAGATACTATTACTATTTTGCGTAGAAACGGCTTGACTATTGAAACTGATGCATATAAATATGTACACATATATAAACT:1 - chr3L 6131803 3' + roo 9037 1 60.27 GTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACAGTAGGCACAATCAAGATGTTGGCTAGGAAAATTCTTGGACGCGCTGGGGCCTCCTCGACTTACCACCATCCGCACAAAAACTTCTCGTCT:1 + chrX 8839412 3' - Tabor 6872 2 62.50 CTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATAACCAGAGATTGGAGTTTTTTAACTGAATTCATGAATTCCCAATAAGATCCCCTATTCCACAGCAACAATACTC:1 - chr3R 8563517 3' - 297 47 2 50.68 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGCGTAACGTGTTTTCGACTGAGCTCGGGATCGCGACTGCGCCAACAGCAGTT:1 + chr2R 9836654 3' + P-element 2854 1 60.87 TACTCTAAAATCAAAAGAAGAAATTGAATAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGGAGTTCATCATTACACACCTTCGTAGGTAAAGTTAAACACAGCTGCAGAACGCAAGGA:1 - chr2R 23094888 3' + 412 413 2 74.66 TTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAAGCTTTCCCATGAGATCTAAGGTTTTTTTTTTTAATTTCTAACAAATAGAGAAAAAATG:1 + chr2R 14884226 3' - roo 8682 2 70.55 TAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTAGGAAAAGAACGAAAA:1 - 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roo 8668 2 74.77 TATCGACTCGGCTATTGATCCTGATTACTTATAGATTACTAATATATATATAACATACTTTGCAATGAATCTAGTATACCCTTTTACTCTACGAGTAAGGCGTATAAAAACTATTAACATGAGAAGAATTACTGCATAGGATGTCT:1 + chrX 14815848 3' - INE-1 96 1 77.40 GAAGACGATTTTCGGGCCGAAATCAATTCTGATCGAAGAAACGAATTTACATGGTACATATTAGGGTAGTTTTTGCTAATTTCCTAGCAATATGATAAAATAATTATCTACCGTTTACACATTTATATTTATGTTTAATTCTCATT:1 - chr2R 23418855 3' - 1360 3190 1 69.18 ATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATGAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCATTTGGGATTTTACATTGGGGTTTTATTGATTTTGCATGTGGATGGTTGTGCTGATGGC:1 + chr3L 11535971 3' + roo 327 2 73.29 ATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTAATCATAAATAGAGCTTTCCATTATTTTCTCTAAGCCTGTTGTGCATAAGTTGTTTT:1 - chr3L 14422716 3' - roo 8730 2 64.38 TCACACAAAAAAATGGAAAAATAATGCAGATATCTTGCCGATGCAGCTAACTATCGATGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATATCACAATTTGTAAAAAGTTTTTAATGCGTTTTCCTTTGAATAAATTCAA:1 + chr3L 22294491 3' - pogo 58 1 64.18 AATAAAATAATTTAAGCAGATCAAATTAAGTTGCCGCTTGGGTAACAGTGCGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCGTAATACGCTGAAAAAAATATCTACTCGTATGTACTATGTACATTGGACAAATGTCCATACATA:1 - chr2R 22796777 3' + jockey 4932 1 63.12 ATCTCAAGCTTCTAGCTTTTATAATTCCTGAGATCGAGATCGAGATCGAATATAATGAAGGAATGCACATTTAATCGTTGAAAAATATTGAACTAAATTGGAGAGAGCTTTTATTAAACTCACTAATAACCTTGTTCGTCCTTATA:1 + chrX 14767100 3' - INE-1 163 1 46.58 ACGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATAAATATGGCTA:1 + chr2L 20628675 3' + Stalker2 360 2 51.49 CACGCACACAACAATGTCTTTTTTCTTTAAACAACTGCACCTTCATATAACCGAACCGGCAGGTAAAAGACCAAAAGACCACGTACTTAGCCTGATTTACACGTCGCCATGGCGAGGAGCAGGCAGCGTATTT:1 + chr3L 5044571 3' - flea 330 1 60.15 ATGTTTTATGTTCACTTGCTGTTACATCCTGATCTGCAATTTTTGTTAGTTTTAGGAGTTTTCTGGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGAT:1 + chr3R 7462935 3' - I-element 457 1 80.69 TCAACNAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATGTTCATGCTGTTGGTTTGGGATTTTTTATTTTCCATCTTATTTTAGTATGCTAGAAATACCCCACTACCGAGGCCGATTGTAGCAAAACGAATATGGAAATACACTAAG:1 + chr3R 26242600 3' + roo 395 1 69.86 CGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTCCAGCGTTGTACGTCACGGTCTCCGCTTTGCCGCGGTCCAAGGTCCATTAATTTCCGTTCGATCTTACAGCCCTCGATTCTTCACGACTTCTAGACGTTTTCCCGTC:1 - 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chr3R 22708911 3' + roo 392 2 74.29 TTTGCAAATATTGTGCGTTGTGAAAATACTTTTGACCACCTCTGTATACGAATAAATATTAAAAGTATTAATATGAATATTATTTTATCGAATATCCTATTTGTCTTTATTTGATGGATAAAATCATTTATGATACGTATAATCGA:1 + chrX 20145646 3' + Bari1 1684 1 64.38 GTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAATGCATTGTTAATAAGCGTGCCGAAATGGGAATCTCGTTTTGGAGGGCGGAGAAGGAACGGTGGACAGGAAGTGATGTAAAGTGATTCACTGTGAA:1 + chr2R 20052515 3' + transib2 2792 1 60.96 GATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTAGCTGGAGGAAGTCATCACGAAACTGAATACAATTAACAACATTTAGCAAATGAAAGGAAAATTCACTTTGAGCTTTCGTGTTCTCCCAGGCAGGCTCCACTTTCACAT:1 - chr2R 8966101 3' - BS 5011 1 70.55 CTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTGCATGTCGATGCCAATAAGGTTGCCCGACGGCTGTCTCATTTCCCGCACACACTGACTCACCCGGAATCACGTGGAATGCCCTGAAAGCACCTGGCC:1 - chr3R 12613729 3' - HMS-Beagle 27 2 67.12 AATCCGCTGTTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAGAAGGCTTAAATGATGTATTGTTGTGGCACCAGGGCCCTAATGAGGTGGTAAGCCCACCGA:1 - chrX 14735730 3' - diver 33 2 53.04 GCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAGCGAGATTCAAAGGGAGAGGAC:1 + chr2L 15523134 3' - 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chr3R 12613738 3' - HMS-Beagle 6832 2 60.96 AGAAGAAATTGAAAAAATATATGTCAGCCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATGGGAGTTCATCATTACAAAATGTTTATGTTTCTGTTTCCGTTTCCACTTCGATCATCTGCCCGGCACTCCAGATAC:1 + chr2L 2057899 3' + 412 7481 2 59.59 TAAGATATAATAACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAAATAAAAATAAAAGATGTTTTTATTGGGGCGGACACTAATTG:1 - chr3L 1186268 3' + I-element 5261 1 79.45 TGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCATCGTCGCCGGCGACAACCGCAAA:1 - chr3R 11284888 3' + blood 364 2 67.62 GTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTCACACATGCCACACAGGTCGCCTTCAGTTGGCAGGTTGCAGGTCGCAGTTGAATAAATTTGTACAATGTCACGGCAATTATGTAAAA:1 + chr2R 22958019 3' + hobo 2922 1 70.87 TGAATCGTTTGACTTAAAGAGAAATTAAATGTTAAAGACTATGCTTGTCTGCAGAATAGCCTTACTCTTACCTTGTTTGCTGCATTTGGACTTTCGCTTATCTCCTCGTCGGATGATTCCTCCTCAGTGGAGGGCTGCTTTTCCGG:1 - chr2R 13136783 3' - Doc4-element 338 1 68.49 CTCAATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCAAGTTTTGCTGCATTGCGCCCG:1 - 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X-element 4361 1 72.15 CCAGAAAAATTATGAAATTTCGCATTCGCATTCAGACTAGCTGAGTAACTGGCTTCATTCGATTTCAGCTGCCAATAAACAATATAAATTGCATGCGTTCACATTCCACAGACAAAACATCAAAGCACTGTTCCACTTTATGGCAC:1 - chrX 721081 3' + INE-1 513 1 71.92 GTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTATCGGCGTAATTAAATACTGGGCCCTGTTCAGCGATTGCGAGGCATCCAGAAAACAGGACTCGCATCGCAGGATGGAG:1 + chr3R 25158699 3' - 1360 16 1 69.23 CGGCTTTTCAATATGTTTACTCTACGTTATGTGGTTTTGTATGTGAATATGTCACTATATATACATACTGTATTTCTACATTATCTCTACATTACATGTGCCAATTTTTGGACACTGTACATCATATTGTAAAAGACATTTCTCT:1 - chr3R 27547608 3' - 17.6 6962 2 57.93 GTTTTTATTTATATGATCAATTTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCGCTCCAGAAAACCACTCATACCCCGCCATTCAC:1 - chrX 9846769 3' - transib2 89 1 75.69 TAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACACCACTAATTTGTAGAGTTAGTCACAAAATTAAATTATTATTTACACACTCCGTGCAATTATGCAAGGCAC:1 + chr3L 414949 3' - 412 7108 2 55.48 CCTAACTGCGTGCATAAACATAAACATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATATGTACATATCGCCGATCTTGAGCCTCCCC:1 - 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Doc2-element 246 1 88.54 AAATTTAAAAAATTAAAAAAAAAATAAAAAAAGAAACCGAAACGAAAAAAAGAAGATACATCGAGAGTAAAAAACATAATTATCATGGTAAAAATTGAATCGAGGGCATGATGAACAGGATGAAAATAAACCGAGGAGTAACGAA:1 + chrX 8958671 3' + HB 320 2 82.07 TTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAAAACATTTTCAAAAAATTCCAACAAATCAAATTTCTTGCTGCTTGAAACGATTAATTATTAAAAAT:1 + chr2L 13827903 3' + pogo 2044 1 58.90 CACTCGCTTAATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAAAGAGGACACCATGCAAATGAGCGAGCTACCCGGGCATAACGAAAATCT:1 - chr3R 28438330 3' + mdg1 346 2 67.12 TTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAGCAATTACCA:1 - chr2L 20165286 3' + copia 240 1 58.22 TACACATACATACCGTTCATGTGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGA:1 - chr3R 15727861 3' - 1731 92 1 75.34 ATCTATGTATTCTTACTTACATTTATACATATAAATTAATATAAGTGTGGGGTGCTGCAGAGGGGAGCCCTCGCCGCAGTCACGGGGTCACTGGTAGT:1 + chrX 21907830 3' - Stalker4 7220 4 65.31 TGTGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTAATGGAGGACTGAGGACGCGCTAAATCTGGGAAAGTGCT:1 - chr2R 20972683 3' - jockey 4751 1 72.14 CCGCGAAAACTAATTTCACTTAATCCACTTTGTCAGGTGCGTATTGTTAGACACGAACCAATTCAAACTAAATAAGCTTTCAAACTGAAATAAGCTTTCATGTCTACATTTGTGATACTCTCTGACCAGAAAGCATTTCCATGCAT:1 - chr2L 21876737 3' - X-element 51 1 43.15 AAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGATTTTACAACGGGTGACCTCCGTTTTGCCAGTTTTGATGCAGGTTGCCT:1 - chrX 21233344 3' + roo 8988 2 73.79 TATTTATAGTTTGCATACTTATCATGTCTAAACACATATTTAGACAAGTGTTAACAAATATTATATTTCTTTTAAAATTACAAAAAATAGACTAGGAAAATGCAGGCTAAGGTTAGCATGTGGGCCAGTTGTATATGGCGTGTGTT:1 - chr3R 23504135 3' - rooA 25 2 60.27 ACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGAAAGGAAGACACGAAAAACGTAGAGCAAAGCAATAATCTTGAGACAGTCGGGTAAAAGTTCCTTCACTGCCTGTGCGCTACTTTCACT:1 + chr3R 9298595 3' + hopper 1384 1 61.64 ATAAAAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATACGCAGAAACGTGAAATAACAGAAGCAGTCAAAGCCGGG:1 + chr3L 12991429 3' + mdg1 356 2 70.31 ACTTGGAGCACCTTTTCAACAAACAACAGTTGATAGATAATTATGCTGAAGAGTCATAAAGGATATGCCATAACAGCACTACTTTCTGTCCATATTAATTCATTTTCTGCTCCCAAGTGTAGTGGAAATGACCCTTGATGATGTAA:1 + chr3R 15727985 3' + 1731 4621 2 75.34 GTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGTCAAATGCCCCATAGTGCACTGGAGAAAACAACTCGAGGACGTTGGTACACACATTAGTCACGTCTTGCTCTGAGTAATAGTATTTTCTTATAGGGCTTCCATGAGTCCGGAACAACCA:1 - 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jockey 171 1 45.21 TTCCCCTTTGGCGCACGGCCCGGGTACAAGGTCCAACAGTTGTACCGTAAGTTCACGGTGCGTCGTCTTTGTGTATGTCCAAAGTCCGCACCGTTACCGTTCGACCTCTGTGCCCTTG:1 - chr2R 4730084 3' - gypsy8 302 1 78.81 TATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTCTCCCTGAGAACCTCTCTCTGTTTGAGAAGCTTTCTGTCTGCGTTGCCAGG:1 - chr2L 310067 3' + P-element 2843 1 45.00 AAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCACTATTAAAGCGTCTAATTTATTAAAGTTGTCCTCAAATGGGAACAGCAAAAAAATTGAAAAACAATGGATATCATTTAACGCAAACATCTACACTCTCACATATATGAATCTCTAACT:1 - chr2L 512365 3' + roo 405 1 75.34 GGCTTGTAATTCATTTTTGGTTTTTATTAGCAGGTTGCCGTCTCTTGTACGTTTGAATTTATTTCGGCTAATAAAATTGATTGTGTTTTAAAACCCCCAGCTCCAAAGTGCGGAGGCCGCCCTAA:1 + chr3R 7462979 3' - I-element 393 1 58.40 TGGAAGTGGCTGGTTTGGGCCACCCAAATACGTCACTATATTTATACGATATATTCGCTTTGTAGGGATATTTTAATAGTTTTCTAGGAAAATAAAATACTTGCTGTACAATAACAGATTTATAG:1 - chr3R 17531758 3' - 297 16 2 40.80 TTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACTGCGATTTATATCGCAAGAAATGTGGCAGAAAATTTCGCTTG:1 - 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roo 8688 2 67.81 AAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGGGGTATGGCCCACAAAACTATAACTGTATGGGTGAGCGACTACGACTACGCTT:1 - chr3R 17897120 3' - hopper 56 1 60.15 TAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCCGGCGGAGCACAACTGCGTCCTTTGACATCAATTATCGGCGAATAACTGAAAGTAGAGTTTGCAAAAATATGCGAATTGAAAATGAAAAGGCACAGCGATTGAG:1 + chr3L 11364934 3' - Tirant 17 2 74.47 CGACACGGCCATCCTGACCATTACACGACCTCGTGCAATACTTCCAAAATATACTTTGCTTGTGGCTGTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTTT:1 - chr3R 18126081 3' - invader4 2743 1 46.67 CTAAACACTGTAAATACCTAATTATACCATTAGCTTTAATGAAATGTACATATATATATAAGGGATAAAGCACAAATAAATTAAATTAAATTAATTAAATTTTTAAGATACTCTATATGCAAGTTTGGCAAAAGTGCCATAAAACT:1 - chr2L 8536540 3' + Juan 4144 1 69.18 CGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATGAATCCTTGTTGTAAACACGCACCACCTGGCTAATCCAATCGTTGAACTTCTGATGCACC:1 - chr2L 10461099 3' + roo 399 1 76.69 TGTATGTATGTATGTTCTCATACAGAATTACATATGCACATGTGCAAATGGCCTATATTCAACACACATGTGGGCATTGCCTATATTCAACATCAACAAGAAAAGAAGAAAAGAAAACTGATTGAAAACCTACATTAATTTATAG:1 - 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F-element 73 1 56.55 GTCGAATGCTAAAGCTGAACACGGAAAGTAACAAATAAATCAAAGAGTCCAACTCCTGCCTTTGTGTGTTTTAGTTAATTAAGAGGATATATAATACCCCTACATCATTGAAATGGTAAATTCCCACTCAAAATCTTTA:1 - chr3L 24213794 3' + invader2 5021 2 79.14 TATTATTAATATTATTATTATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAGTGCTCGCATACGTCGCGGTTTAGGCACATCCACCCTCCATCTTGACTC:1 - chr3L 22021662 3' - mdg1 40 2 58.18 GCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGGGTGTACGAAAATGCGAGTCAGTCAGTCAAGGGGGAGAGGGGGTGTATATGCAGCAGTGGCAACT:1 - chr2L 20718819 3' - jockey 4736 1 62.33 CGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACATCATAACACTTCGTTGCTTTTATGTTTTCCCTACTGTCGTTGCCTTTGTTGGCATTT:1 + chr2L 18219450 3' - copia 4883 2 75.17 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATATTTACT:1 + chr2R 18931927 3' - blood 7063 2 51.37 CGTAAGCCCAAAACTCTTATCAGCAAAATCTTGATAAACAAATATCAACCACAAAGAGAAAATAAAAAACTTAACAACAAAAATCTGGAGAGTGAGAGAGTTTTGGAGGGCTAACGACTTGGCAGCACGCGAATGAACATGGCTAA:1 + chr2R 19231296 3' + I-element 61 1 56.85 ATACTAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGGCACTCACTCCACTGTTGGCCATCCCAATGGGGATTCAGAATTAAATCCAACACCATGGATC:1 - 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chr3R 12046729 3' - Doc 42 1 50.35 GCATAAAAAAAAATTCATCCAAATATCTCCAATAGTTTAGGAGGTATTAATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCACTGCCGCAAAAGTAAATAACAGTTAACAGCGCCAACATCTGCTGTTGGTCGCGGCAG:1 + chr2R 9376729 3' - hopper 65 1 62.07 AAAGTTTCAAGTCTGTAGCTCAATTTTTAGACTTTATGCCAAAAAAATCGAATTCTGGACCACAGTGCACTGGAAAATAGTACTTAAGTGCTAATATCGTAGGCCATGTTGGGACACAGATATGGCCATACATTCTTGCCCAGCCA:1 + chr3R 22647940 3' + transib2 2778 1 54.11 CTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCACATGCGAATGCCCCTATACTGGCGATGCCTTTAACTACACAACTTTTGGAAGTTATGCAGCATGCTTTTCGGCTGATATATACACGCTCGTATATGTTACGTATGTACATA:1 - chr3R 19965179 3' - jockey 30 1 69.86 TCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAACTTAATAACTGACAGCCAACTGCCTTCCATTAAATAAAGCCTTTCATGCAACCATATGTCATGATAAGCACTAGCTTTGAAATTGCATAAAATGAG:1 + chr3R 30569114 3' + mdg3 5472 2 54.17 TCGTGTTCATGTGTGAACAATATACTACATATAATTGCAATGCAACAAGCATTACACTTCATCCAAAAGCTTTCCCATGAGATCTAAGGTTTTTTTTTTTCATTTTTAACAAATAGAGAAA:1 + chr2R 14884221 3' - roo 8662 1 80.99 CACGTACTTACTATTCGTCTCATTAAGTGCAGACCGCGCAAGCCCTATTGTAATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATACGTACATGTATATGCAGAACAGTCAAGATCTTTAAA:1 - chr2L 15420045 3' + Burdock 6309 2 80.14 TAAAATACTTCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCGCTGCCGACATCGACCGCAAAACTTAACTGAGCAGCTCCTCTCTTGCGAAGGATATCGCGCTCTTGTTGCGA:1 + chr3R 21794153 3' + hopper 1363 1 52.05 TTCGGTAAGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTCTGAAGTGCAGCGCTTGCGCTCAGTTCGTGTTTGACGGTCGTTTGCGTAG:1 + chr2L 14263033 3' - P-element 29 1 50.98 AGTCTTACATAAACATTGTTGCAAAAGTGCTACAATGTGATTGTTCCCAATGTTCTGATTTGATACAGTGCTTATTCGATATGTGTGCACATTACATAAGAAGCTTCTACAAAAAAAAAAATGAAGAGAAGAAAAATAAAATGGAT:1 + chrX 13060276 3' - Tabor 6914 2 69.18 GTTGTTGGCCAAATTAAACAAGGTCCTGATTATTTAACTTTACAAAAAACCCTTCTTGGTTAAGTTGGTTGGCGAAGGTATAAGTCTGCGGTCCCTAAACAAGGTCAGGTCCATTAGGTCGGTTTAAAATAGTATGCCGT:1 + chr2R 3393428 3' + G3 419 1 60.71 TTTCTTATCTACCGTTTGAAAGCCAAACGTCAACAACCATCTAAGACTATTAAATCCGGGGACGAATTCATCTTAAGACAAGGAGGAGTTAACACGAGCAAGTTAGAGGGGTGCACATATTTTTTATTCACATATGTATGAATCCC:1 - chr3L 23515303 3' + gypsy10 5566 1 72.60 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTCAATTGGGGATTTTACAGGTTCGTTTCGTCCTTTCGGCCTTTGGGTCTCTTCAGGATCTGGACTCGCATGGACTTGCATGGAAATAAAAGAGTTACGTCTGCGGGCCAAAATTAAGAGAA:1 + chr2R 10977248 3' + roo 9051 2 69.18 TGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGGCGTCAAGAGGCACTAAAACATTCACTGTTCGTGCAACATTAATAACAAAATACATAA:1 - chr3L 7848475 3' - jockey 73 1 60.69 TATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTTAGTTACAGAAACTTATCACTAATATATGTTTGAAATAAAGTGCAGAATATTTTTAGTATGT:1 - chr2L 18219303 3' + copia 229 1 56.85 TGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTTGTTGCACCATGCAAATACCAAGGATTTTTTGAGGGCAAGGGACCAGAAGGCAAGCTGAATTTTTCAGGATATACATAATTCTAATTGCGATACCTTGCTCTAC:1 - chr2L 11867247 3' + hobo 2934 1 72.93 AAAAGCACTTGAGGCTTACGACTATATTTCGGGTGTTTTGTGATTGTGTTAACTTGTACATGCATTCCACGTTGGAAAATACTTTGATTTGAGCTTTGCTTTGAAATTTTTTACGGTTTACTCCAAATTAGCTATTAACTTAAGAT:1 - chr3R 8112677 3' - Burdock 6169 2 58.90 CTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTATATACATTAAATGGTTTATTTTTTAACCCTAAAACCTATTCCCATTAAAGCCGC:1 + chr2R 6768091 3' + pogo 2053 1 61.60 CGTTGATCAAATAATAAAAACATCATCATTAATGAACATGAACATATTTTTGGGCTAACCAAGGTCTTGTATCTTTGCATAACGTGCAGGGTGTAAAAACTTATTTTAATAAAACATATCCAATTAGTTTCGATTACTCATCCGAA:1 - chr2L 11475058 3' + jockey 4982 1 76.03 AGGAGAGGCGGTCTCTTCGCTCCACGACTTGTGAGCCGAAGCAGGCAGAGAGGGAGAGCAATGTCTTTGCATTTTCATTTTTTGCCGCTCGACTTTGTCACGCATTCGCCGCGTACCACTTACATACATACTATGTATAATATAGC:1 - chr2L 20761846 3' - Doc 425 1 60.27 TCAAGATTTTGCTGATAAGAGTTTTGGGCTTACGCGAAGCGAGGCTTTAGACTGAGAGGCACGACTTATCTCTTCGGAGGTTGAAGTGGTACTGATCTAATAAAATATATTTTTACACATGCGCATGCATAAAATATTCTCTTTGT:1 + chr3L 13779403 3' - I-element 73 1 71.23 TTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCAATGGCAGAAATCACCCAAACGGAAAAAGGTTCCAATTACCGCGAGTTTTTAGCCGTTTTCA:1 + chr3R 6584874 3' - transib2 62 1 60.96 AGCGTGGGACCTCGATAAGGCGGGGACTATTTACTTAGGCCTCTGCGTAGGCCATTTACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTCCACCCTGCCACTGACCTTTTGACGC:1 + chr2L 5725779 3' + roo 8926 2 81.40 GCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATGATCTTTAAAAGGTTAATAAATCGATTTCTGTGAATGGCAACCTGAGTACCGAAACACAATTAT:1 - chr3R 12519594 3' - roo 8723 2 60.27 ATTTCAAAAATTCGATTTTTCCGACCCCAGCTTCTTTGAGCTCATATCAACCTGTGACACTGTGACATATGCCACAGCCATTCCCCAGGACCCCACTTAACAGCAGGGCACTCTCTTGGC:1 + chr3R 16630375 3' - FB 21 1 65.00 TGCCGCAAGTAGGGTGTCAAAAAAAACGGGGTGCCTAGAGTACCGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTTGTTCAAAGGAGATTATGGAACTAGCAGATACCC:1 + chrX 860852 3' + hobo 2865 1 73.44 GACAATAAGTAAATTTTATAAGAGTTGGGAAATGAGAATATGATTTTAAATTGCATACGAAATCGATTGTACTCTCTTGCACTTTCTCACTGATCCGTTTTACTCACTCTGTACTTCCCCCGGCAAGTTGATGATAGCTACAATAA:1 + chr3L 15099692 3' - G4 3804 1 60.27 ACACACACACACACACAGATTATACAATGCGAATCGGATGAAACTGTAACTCCACTCCAACCCACTTTTGTCGTAAACTCAGTGTTGTGTGCTGTAGGTTATGATTGTTTATATCTTTATTACTTGATCATACCGTTGTATT:1 - chr3R 24684781 3' + gypsy3 426 1 63.38 ACAGCAAATTTGCATACTTGTGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAACGGCGAAAGGCGAAAACAAAAATCAAATAAATGGCAATTTAATACACTCAACATGCCATTCGAAAGCACCAACGAT:1 - chr3R 7625286 3' + hopper2 1562 1 54.11 AATGAATTTTAAAACTAAGGCTTTCTAGGTCAAAACCAGGTTAGGGAACTTTTACATTGCAATTTCCATTTGACGTGGTTCGCGTCTTGGGTAAATAAAAACAAGCTGCATACTTTCAGGCAGCATCTCAATCAATATACAGATGA:1 - chr2R 9007013 3' - jockey 4801 1 68.49 CTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGCGGATGAGCAATGTCTGGATCTTATCAGTTCGGCAAGGACTGTCAGTC:1 - chr3R 17627518 3' + roo 8999 2 71.23 CTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCCACTATTTTTAGGTAATTTACCTATGAAATTCGGAACTC:1 - chr2R 17269061 3' + roo 394 1 73.43 ATGGAACAGACGCTCTGAGCTATTCAATATCTATTACACTGAGCGATTACTTATTACTTATTACACTGGTTTTTCCACAGTTGATGGTGTTTTTGTTGCTGGCCCGAGGTTTCGGGACTGCATCA:1 + chr2L 20628666 3' + Stalker2 360 2 50.40 TTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGCATCATTATGGCTAATAAACATTGCCATTTGCGGCTGGCCAACACAGCGAGATTCAAAGGGAGGGGACGAGTGCAGGACGAAAGGGTCTTTCGTCACC:1 + chr2L 15523164 3' - 412 11 2 75.57 TAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAATTTATTATCATAATCAACGCATCGCATGGCATCCCATACAGATCGGAGTGCTGGCAGTGAGGGCGTAAAAAACGGCACCGCAATTGTTTTTGCCCGCTGCGAACGGCGCA:1 - chr2L 2057755 3' - 412 14 2 76.03 CAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTACATTCGAGCCAACGCAATGCAGTAACCGCAAGATATGTATGCATACCTTCGGGCTGAATCGTTTGGTGGCGTGTACAT:1 + chr4 490345 3' + pogo 2088 1 70.18 AATGTACACCCCAACAGCCTAGCAAGGAAGCTAGGAACTGCAGGAGAAAGCAATGCTAAATCAATTAGAGAGGGCTGGGAATTGAAGGGAAGTGACCAGATGCAGTTGGCGATAAAAGCGCAAAATTTTAAATTGAAAACGCCATT:1 + chrX 547961 3' + jockey 4667 1 74.66 AAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATAATACGAAACGAATTTATTAAGGCAAACGCACACACCAAACACCAAAAACTCAAAAATAATAATGAAAAAAAAAA:1 - chr3R 18128421 3' + roo 9032 1 50.36 GGTGATCTTATATCACGCTCACTTGAGACATTTATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAATCCTCACTCCCTTGAACACCAAAATGGTGGACAAAATAA:1 + chr2R 8442709 3' - blood 7096 2 74.66 AAACCAATGTATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGCACATACGCACTTGCAGTGGAATTTATTTGATTGAGCAAAAATAATATATGGCTATTTTTGTGCTATTTTCGCGAATCG:1 + chr3L 17012057 3' + 1360 3364 1 61.60 AATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTAGCCATTTAGTGCCATAATTCAAAGCAATCTATGCCAGCCCAGACAAAATAGTGCC:1 + chr2R 21796110 3' - roo 67 2 63.70 TATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGACATTTGATATTTTTAGAAATGGAATAAACCCCGTTTAAGAGCAGAGAACCAGAATTTGTGATTACCCTGGTAAAATATCCCACTTGAATTAACCCCCTGCTAA:1 + chr3R 16187934 3' - mdg1 19 2 46.58 TAGACTCAAAACTATTTATTGCAACCATTGATTTGTAATTATATACAATATGTATGTATAGGGGTCACTTGCGGATGTGATTCTCCTGTGTGCCACCAACTAAACCCACCAAAAATTTCCCAAATCATTCCCCACACAATCTTTC:1 + chrX 3534021 3' + 17.6 473 2 70.34 TACTTTAAGATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGCCTTCTTATTTGGGATTTTACAGTCGTACAATTTATGTGTGCCACAACATCGAGGCA:1 - chr3L 13285610 3' + roo 318 2 80.14 AACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACCAACTGAGCAAATTAGGGTATAAAAAATAGTTAATGTTGAAGCGAAAAACTTGTTTGTGCAGTTTGGCAAACTTTTTCTTAGACAAAACACAGATAAGATTCAGAAAATAAG:1 - chr2R 6699996 3' + roo 397 1 76.71 TTAAGACAGCTGAAGCACCGGGTGACTCCGCTCATAATCCGTACAAGAGACATAATACGAAGCAATTAAAAGTACAATTATTGCCAAACTGTTTTTTTTATCAAAGTTTGATGCTCGAGGCTTTACAAGCATAAT:1 - chr3R 23644836 3' - diver 24 2 66.67 TGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATATATGCCACAGTCCGACTGAATGCAGACGGAATGGTAACAGGATACAG:1 + chr2L 12932173 3' - opus 7172 4 66.15 AGCTTCGGCTTACGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCTGGAGCAGTGGTCCGCAGTCGTTGGTCGCCAGCGGAGTGGTTCGCACGTGGCCCGGC:1 + chrX 20330612 3' - P-element 22 1 56.31 AATTATTATTAATAAGATTATTATTAAGTTGTCAAAGGGTATCGTACAGTCGAGCAATTTATATAAGTTTCTACTTCACACATTTTTCACAGTTGCAACCCAAAGTGGCTTTTAGTTTTCCCGTATGCTTAAGTATAATTTACTGT:1 + chr2L 9660770 3' - mdg1 43 2 57.53 TCGAAGAGATAAGAAGAAATAAAAAGGTGGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAGGAGACGGGGAGAAGGTCCTGGCTGGGCAGGACAGGCCTCATCATCA:1 - chr3R 11284911 3' + blood 7312 2 69.86 AGATAACAAAATCCTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATAAATAAACGAACGAAAATCGAACGTACTGCAAGAGT:1 - chr2R 9341585 3' - roo 8752 2 80.14 ATATCTTCGTCAGAGTTCGTATTGGCGATCTTCGTTGAACTTTTGCTCGGCTCTCAGTTGCAGTACTGGGTAGACCGAGAGAGGGGGTATGTTAACTCGTGCGGCATCATTTCGGACTTGGTCCAATGCCCGTTGAAACGTCG:1 - chr3L 25232770 3' + accord2 128 2 67.83 ATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCCATCATGATAAATAAATAAAAATATTGTCATTTCGTGCGATTCGATTGTGTAAAGCAATTTCCCCCAGAAAAGACGCAGAGATGGATGTTGGCAGGG:1 + chr2L 1244003 3' + I-element 5315 1 52.55 TTTTGAGACTTTATTAACTATATCAGAAGTATTGGAATTGGAAAAGAATTTCTTAAACAGTTTTCTAAATATCTCACATCAAAGATTTTTGCTGAAGGAGCGCTAACCTGGTGACTCGCAGTGTATAACGCAGTGTAT:1 - chr3R 4562675 3' + mdg1 7429 2 70.29 TTGCATACTTGTGAAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCTTTGTGACGCCAGAGCGACTTGCTTACTGCAGATTTGCTCAATCGAGCATAAGGCTGTAAAGTAAACATAAAGTAGTACACATGTC:1 - chr3R 12078585 3' + hopper 1378 1 60.69 GGCCTGACGGCTGCACCCAACTGCAAGGAAAACACGTGTTCTCAATTGGTGGCATATATTGGTTTATTACAATAAAAACTAACATTAAATTAAAAACTTTTTGAAAATATCTCTAGTTGAAAGTGTATTTCTTTCAGTGAAGTTAT:1 - chr3R 19514219 3' + blood 7340 1 54.79 GCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATTTTTTAAATAACTATAGAATGCTACTTCTTTTATTAAATATCAAAGAACTCCTTGAAAAATTGAATAAAAAGAAAGATTATTGCTTGAAAGT:1 + chr3L 12227915 3' + opus 7473 2 66.44 CAATTAAATAAAATAATTTCGTTAATAAAAAAAAAGTTTTTCTCTTGATATGCCACATTAATTTGTTAATTTCTTTTTCAATTTATATATGCAGTAGTTCTACAAATACTAATTTAAAGAAAAAAAAACTTCACTGTTTCGAAAGG:1 + chrX 16727229 3' + jockey2 3381 1 56.85 GTCGATGTCGCGCTTAACCGTTCGTTGGCGTTGATGGCAGCGGAGACTATGTGGAACCACAAGATGTTAGAGAATCAATTGCAGGGCAATAACTTATATATTAATGCTACCTTCATATTGTTTAAGAAAAGCTAGTAAAAAGAGTT:1 + chr2L 11523134 3' - HMS-Beagle 6869 2 72.60 ATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGATGGGTTTTGGCCTTAACCATGAACATGAAAACTTAGATCTTCGCATGGGAACGGAACTGCGAGGAAAATATTTTAACACTCAGTATCAACTAATTTATACTTGA:1 - chr3L 7389658 3' - roo 19 2 69.18 TTAGAAGCGATGAATCAATACAATGCAGTAACAGTAACATAACAGCGCAATTAACATATAAATGGTAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTACCTTTTAGTGTTGTTTCTTGCGAATAGTCGTTTTAAAAGCCCCG:1 - chr3R 13339042 3' - BS 5074 1 67.59 AAAAAAAAAATTAAGTTAGCTGCATTTTTAAGTTACCTGCATCGAGGCATTGTGCAAAGTACTCGAGGCAGCTAAGCGAATTATACTGTAGTAGATTGCTCATTAAATAAACTAAGCATTCTATGGTTTAATGTTTACCTCTTTCT:1 + chr3R 8197872 3' + pogo 2034 1 66.44 CGAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTAACAATGTGCCGAAAGTTTTCCCGGGAGTCTGAGATGCGGGTGGGCATGTGGTTAAATATTTGCAGCT:1 - chr3R 22320456 3' + roo 355 2 55.56 GGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGTGAAGAATCCGTACATCATAATATTGTATCTTAACATCACAGGGTGGAGAAATATTCTTAGCAATTACCAAACACTATAAA:1 - chr2L 20165275 3' + copia 251 1 65.07 AGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGCTTTTAAAACGCAAGAGTCCTAGACAGACATAAGAGAACGTTTTATCAGGTACCC:1 - chr3L 21770898 3' + hobo 2930 1 41.18 GTTGTTGCCAGCCTTCAGCCTTACTCCATGTTACATACATATATATGTTAATCGATAGGCATTGTTTTGTATGTACCACTTTTAAAATATTCTTTATCAAATCAACTGAACCTTATAATTACTGTTTAAAACAATACTTTTTGCCT:1 - chr2L 17957125 3' - flea 13 2 73.97 ATTCGGCCGGATGCGGTGTTCCAGTTGCCGTCTTCCCGGTTGAGTGTCCGATGATTTGTTTAGAGGCGTGGGGGTTTAGGGGGTGGGGTGGTAACTCGTGCCCCTCCACACAATCACCCGCCGCGAATTTGTGAA:1 - chr3R 12341111 3' - Tirant 8184 2 74.81 GCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAAAGTTTTTGTTGTGACTTCTCCTACGCT:1 + chr3R 8112851 3' + Burdock 6374 2 72.60 ATAAAAAAAAACAACTAAAAATCCTTTAAATTTCAAGTGCAAAACCATTCAAAAACGTTGCCAAGAAACGCATAATTTTTAGCCACCTTTGCTAGTGATTTCAAATCACTTCGATGAATATTTTTGATAAAAGCCCATTAAATTT:1 - chrX 11650968 3' + Transib5 27 1 58.62 CAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGACTTTACATACATATCTATAGGAATGGGTGGGAGCAGGTGGAGCAAGTTCATCATTTGCCCGATGTCGATGCATCATTCAAATAAACTTTTCGTTCAAAACAAAATGATTAA:1 + chrX 13628871 3' + roo 9051 2 71.92 TTTGCATACTTGTGGAAAACACATTATTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCAGCGGTGCAGTGCGCTTAAGCTGGCTGGTGGAACATAATTACTCGTCTGTAGCTCAACTCCCGGAAGTCAGTCGCAG:1 + chr3R 27452091 3' + hopper 1377 1 55.47 TCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTGTGTCTTCGCAGTCAAGGCAAAGAATTTAAATAATTTGGTGGAATAAGATA:1 - chrX 8346336 3' + roo 336 2 65.07 ATTTTGCGGTCATAGCGATNAGACGTGATTTTTGTATATGAAGAAATATAATACATTTGCTATCATATAGCAACTAGTTCTACATGGTTGAATAAATAGGCCAACATATGTTTTTACAACATTTTCAAGAAGTTTGAACCCATGCA:1 - chr3R 23642991 3' + diver 113 2 72.60 GAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTGTATGTATAAAACTAATTATAAGCGACATGAACAAACCGCAGGAGCAGCACGATTTGATGTCTGCATATTTTGGGCAACCGAGTAAATCAC:1 - chr2L 15085596 3' - opus 7035 4 62.07 CCCGACTATCAGATACCCGTTACTCAGCAGGTGAGAATGCGAACGCGAACTTTAAAATTCTAAAAGATATTGAAATAGTTTCATTATCGATGCAATTGCTGTAATTAGTGTAATTTGCCTTGTGATTTTCTGCTAACTATTTTAAT:1 + chrX 14314240 3' - INE-1 552 1 53.42 AGTTTAAACAAATATACAAAGTATTTTGCATTTTTCGTCTTTGTGTTTTGTTTACCTTATGTGCGTTGTTCGCAGTGCTGTTTGGTGTTGTTTTTTGCTATACTATAAAATTTTTGGTGTGTGAAATAATAAAGTAAAACTAAAAA:1 + chr3R 836740 3' + Cr1a 166 1 67.12 ATAATAATAATAATAATAATAATAAATAAATTTGAAGCTTCTAAATGGCTTTGTCTATTCAATTCAATTTGTAATTTTAAAATTGGTAAGCTTAAACCATTTTTTCGCCATTAGTTATTTTGTTTTTAATTAATTTGGTAAGCTCC:1 - chr2R 17243684 3' + mdg1 7067 8 56.16 ATGGCCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGGGTCTTTGGTTTCGAGCTGTGAATGTGGTTTTCTCTCCTATATAACTTTTCGCCCATCTCCTTTCCATTTTTCTTGTTTTATTTTGTTTTGCTTGCTTCTATGTTGTAGCTT:1 + chr3R 26472938 3' + 1360 3374 1 71.43 GATGCGATTCTCATGTCACCTATTTAAACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATCAATGGGAATGGGTCCAACCAGCCATTCGAATTCGGCGTATG:1 - chr2L 10461158 3' + roo 8990 2 73.29 ACTTGAGACATTTATTTATNCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAGTACCTTTGGCCATACCCTTAACGAGTGTCAGACTCGAGACATGACGAGCACACATGA:1 - chr3L 2532443 3' - blood 65 2 64.58 TATTATTGTTATTATTATTGTTATTATGTTCGTATATACTACAAGACATTTGATATTTTTAGAAATGGAATAAACCCCGTTTAAGAGCAGAGAACCAGAATTTGTGATTACCCTGGTAAAATATCCCACTTGAATTAACCCCCTG:1 + chr3R 16187930 3' - mdg1 7060 2 46.90 GTTTTATGGCATAAAAGGTGTGGCCATTCATATCAAATATAAAGTAGTGTTGTTTAACGTTATTTTTGTAGGTTGAATAGTATATTCCAACACTAAAATTTAGGGATATTAAATTATTTTTAGTAAGGTAGTAATAGGTTCCACAT:1 + chr2L 18219394 3' - copia 4940 2 67.12 TTAAGTGTATACTTCGGTAAGCTTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGCCCACCTGCCAAATCCAAATCATTTGCCAAAATTCACCTCTCTCTTTCCGCTTAACCCTTAGCCACCACCACCCTTAACCCC:1 - chrX 9121244 3' - P-element 41 1 58.22 ATTTTTGTAAAAAAAACAGNCCAAATGCCCCATAATGCAAAGGCGTCTGTATCTGTTTGATCCTGTTTGTCTGTGTGCAACCACGCGATTTATATTTTTGTTAATTTTGTTCATTTTCGGGCACGCG:1 - chr3R 17243085 3' - hopper 16 1 70.87 ACTTCACTCAAAACAACCGATTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACGCGTCGGCGATCGAATAACACATTACGTCAGTTCTTTTACTTGACTACTTTAAGATCTATCCATCTAATAGATAT:1 + chr2R 17350596 3' - F-element 60 1 54.33 TGAAAAACACATTTTTGTAAAAAAAACAGGCCAAATGCCCCATAGTGCATGGTATGTTGGACTGAACGTACGTATGTATGTGTGAAATTGTGTGAGTGTTAATCGACTGGCAACGTTCGTTGGAGTTG:1 - chrX 20361937 3' + hopper 1389 1 63.28 AACCGAAGATATTTCCAAATAAAATTAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACACTTAGTAATCATTGAAAATGTCTTAGCCCATGCCAAAAGTAAAATTTATTAGCGTTTGGAGATCTCTCC:1 - chr2R 17269099 3' + roo 352 2 56.16 AAAATTACTAGAGTGCATTACTGATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATATATATTGTGTTCTTAGCTAATTAATTCGGTGCTGATAGGCAGGGTATCGATCTGTACTTTT:1 + chr2R 6801716 3' - 297 6635 2 62.24 TTTATGCCAATAAAAACGAATTCTGGACCATAGTGCATTCCACAAAGAACGCTTTTCGCTCCGCTCTGATCAACCTGCCCAATATACCACTCAAGTTTAAGTTTACAGATGTGCCCAACTAATACGTTTTACAATATATTAGATAT:1 + chr3R 19134535 3' - transib2 14 1 76.03 CATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGAATCAGTCGTTCTTTGCTCTCGAAACCGAACGGACGTACCGATTTGCTG:1 + chrX 3811674 3' + P-element 2852 1 46.67 GATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGGAGGAACCGCCTTCGTGATCACGGTTAACCTCTACGCCAGGTAAGTATGCTTTGCTTAGCTCGGCATAGGAATTTCCATGAGGGCGC:1 + chr3R 4948114 3' + P-element 2865 1 68.15 CTATTATTTGGAGAACCACAGCATGTTGGTTGTCATATCAAGGTGAGGTATGCGGCAGCGAGTGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATAATTCTTTCGGTAACTAAAATTAAACCAGTTGAACTCATTC:1 + chr3L 26709859 3' + opus 419 2 77.40 AAACCAAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAATTTCTCCTTTTTAGTTCCGCAGTATGAAATCAATGTAAATCTTTTTGGCAAATGTAATTGAT:1 - chr3R 10733732 3' + mdg1 360 2 58.22 CCCGACGGCTGCCTTCAACTTAAAACGGACTTGTGTTCTTAATTGGAGTTCATCATTACACTTGTAAGATATTATTTGTATCAAATTTGTAGTCAGATTTAGATGATTTCGAAACGAAT:1 + chr2L 4244976 3' + 412 7508 2 54.62 TGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACACTGTTAATTCCAGTTAGTCAAGAACCGAATTTCGGAAATTACGAAATAATGGACTTGAGTCTAAATGGCATTTTTAATATTAAATACCC:1 + chr3L 6015700 3' - roo 8698 2 56.94 CGAGTGTTTATCGGGTGGACGTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGGTTGTGAGGATATTGCCTGTATATCTGGTAAAAAATGCATTGTATCCAGAGTTCCCTGCGAAAACCCAAATCAGCAAGAAGGAGAACA:1 + chr3L 12890421 3' + hobo 2908 1 62.86 ATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATTTATTTATGCCATTTGCTGCACAATCCTCTCAATTTTCCCCTCCGCAGGTAATAGCTTTGTGTTTGCCCTTGTCTACTTTTTTTA:1 + chr2R 9341682 3' + roo 9034 1 58.22 TATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGAATATTACTTTTGTCAAGGAGGCGGAAAATTGGTTTTTTGTTGTTGAGATTTTCCCTTTCCCTTTCTTTGATTTATTTTTTCCATGGAATTTATTCACAGGTGA:2 + chr3R 4527329 3' + mdg1 402 2 71.92 AAAAACAGGCCACATGCCCCATAGTGCGTTGGCCCAACTTTTGCCCTAACAACCAAATAACATGCCGAGCTGCATTTTGGACCGACGTGCTCGAGAGACCATAGCCACGCCCACCACCGCCCATGCCAATC:1 - chr3R 9298423 3' - hopper 5 2 80.15 CTAAATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAGTTTGCCTTCCTGTCCTTGTTGACATCGCCATCACATCGGCATCTTAC:1 + chr3L 20061419 3' - roo 75 2 71.53 TACTAACAGTATTATTTAATATAGTTATTTACGTACGATGCACGGCAGCGCCCCTCGGTCGGTTAGGCGGGAGGTGTGGCCGTGGGACCCGTGCGAAACAAAAAAAAAAATAAGAATAATAATTACGCATAAATATTTGA:1 + chr3R 21728388 3' + Cr1a 4299 1 72.86 CTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAAACATAAACAAAAAGCAGCGTCAATTGGAAATACCCAACAAAAAAAAA:1 - chr3R 26242470 3' - roo 8720 2 67.20 GTAGAGTGCGAGTGGCGGGCTGCAGTTCTCTGATCCTGACCCAACAACTGGGTCGGTATTAGAATTAAAGTCGCATTGCATAAGGCTGACATAAGGCGAACAAAATCAAAACATGATTCGCACGCACATA:1 - chrX 6891412 3' + hobo 2928 1 75.38 AATTAATAAACTTACGCTAATAAATATATGGAAAATCTACTAAAATGATAATTTACATATCTATCCAACTCCCTCGCTCCCATGGAGGCAATTGGGGTGTGTTGATAAGGAGCAATGCTCCTTCCACCTCAAAA:1 + chr3R 8112824 3' + Burdock 223 2 58.96 CTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGATAGAGCAAAAACGCTCTGCACAGGCGCGTAACGTGTGTTCGACTG:1 + chr2R 9836622 3' + P-element 2814 1 34.25 ATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACATTACCACTTGGCAAATGCAAATAATTAAATATATGATGATTTCACCAAGAGAGCATTTGCC:1 - chrX 8314442 3' - roo 37 2 53.78 CCAAATAAATATTTATAAAAAATAAGGAATAACAATGTTAATGATTCTTAACCTGCTGATAAACCTTATTTTATAATTTTATTCATTCAGCGATCAGAGCCTCGCAAATTTTATGAATGAATCGA:1 + chr2R 14433020 3' + Tc1-2 478 1 64.00 TAGTTTTTTGTATAACAATATTTATTATTTATTAAGGAAAACAAGGGAGAAGAAAAACCTTAATTGAATAAACATTTATGAATATCTAATATTCTACTTTTCAAACAAATTACACCAATTATAGAAATATCACCATTTTAAAGTCA:1 + chr2R 10119088 3' - Juan 4071 1 54.11 AAAATNAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACAATAACAGCTAGACTTATTTGAGATAAGGCTAAACAAAAAAGCATTTTATTTTTGCACCATCTTATGGCAGGCATTCACAGTTCCTTCAA:1 - chr2R 9870945 3' + roo 9036 1 60.96 ACATAACAGCGCAATTAACATATAAAAGATAAAACCAAACCTCTCACTAATCATGTGAGGACTTTGTTCTAGCATTGATAGATTTATAAATCAGTTCCCTGCACAAATAAGTCGGAAAATCAGAGAACCCTTGAAAGTATGCAAC:1 + chr3R 29288799 3' - BS 5038 1 51.72 GACGCTGATATGGACGGACGGACGGACGGCGGGGCCTCTGATATTCTTAACCCGACATACTCAAGTATTTTGTGTAGGGGTACTATATGTAGGGGTACTATAAGTCCTCTTATGT:1 - chrY 2346870 3' + micropia 5406 2 50.43 AAATAAAGATAAAATGACCAACTGCGTTTTGAGACTTTATTAACTACATCAGAAGTATTGGAATTCTAATTAACTACAGCACATATATCGCCGTTAATGAGCGACTGCCGCCTCAACTTTCGCGTTTAGACAAAAGGCTGGTTGCG:1 + chr3L 8249480 3' + mdg1 7403 2 57.53 ATAAACATAGCAACAAAGTGCTGCCATAAGTTAATATGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAAGATTGTAAATAAAAAGAGAGAAGAAAAAAAAATATATACTATATGGTATAGAACTTATAGCT:1 + chr3R 6685833 3' - 412 62 2 59.59 TCTTATCTACTGACTAAAAATAAAGCTAAGCTCAGACAAAAAGCTTAGCGCCATGTGTATTCTAACATAACTTAATCTAATAAGAGGGTATGTAAGGGTATACATGACTATATACGTACGGTATAAATAATAGTTCACATCTCTGT:1 + chr3R 20200462 3' - Transpac 88 2 77.40 TAAAGGACAGATCAAAATAAAAGAGTCACGTGAAATTGTATTAGAATATTAACTTCTGTAAACGGCGGCTAAAGATAGTAAATTGGGAATTTGTGAATTCTTTGCTAACCGATTCTTGTCCTAATTGGCA:1 + chr3R 19506818 3' + mdg3 5446 2 58.46 AAAATCGTGTGCCAAAAAATCGTATGGCGTTACGCATCTTGTTATTCTAGTGTCTTTGGACAGACTCACCCAATCACCCAAGTACCACTAACCCACCCACTCACTTTTGGAGACACCGGAGTAGATGCAATGATCATGATCTTCCG:1 + chr3R 20753008 3' - 1360 37 1 58.90 ATATAATTTATCGCTCTCGATTCATTTACATAAGATATGAACGGAGCCCAAAATTGTAAGTCTTTAAATATATTCGTGTTCATGTGTGAACAATTCGTGTCATTAGGCCGATTGGTTTCGTATTGAAAATAATGAATAACCAAAAG:1 + chr2R 18887055 3' - roo 71 2 69.18 GGTGAAGTTCTTTCGAAAGNGTTGTTGTCTTTCCTTTTAATAATTATAAATGTATGTTCACCTAATTGTGATTGGTATGTTTTTGAAGTAATTTTGTAAATGTTTGGTGCACTATTAATTCTTTGTTGGAAATTTAAAGGATTTTG:1 - chr3R 3005286 3' - I-element 284 1 73.97 TAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTCCGGAGGAACCGCCTTCGTGATCACGGTTAACCTCTACGCCAGGTAAGTATGCTTTGCTTAGCTCGGCATAGGAATTTCCATG:1 + chr3R 4948107 3' + P-element 2859 1 63.43 ATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGCAAATCAAAGCGCAACACCAAACTGACATG:1 + chr2R 12133810 3' - jockey 74 1 78.81 ATCTGCGCAAATGTTTGTGATGGATCACAATTACGTTTTTGTTTTATCCGCGACTTCTGTGAACACGTCCACTCGATTGCTCATCTCCCATGCGAATGATGGGTGCAAAAATCACGAACTAGTTGCAGTTCGAGATTCGTGTGCG:1 - chrX 8681445 3' - jockey 84 1 71.03 TAGACAGGCCCCGAGTCGCCTGCTGACGGGGCCCGAAAACACGAGAGCCGAGCGCTGGTGAGTCCTGACGAAGAGCGCAAGAAGAGGGTTCTTAACTTATATCATCAATATCGTAGGCAATATTTCGCTTTCTTGTAAAAATGCTG:1 - chr2L 5207448 3' - opus 189 4 70.55 TACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGTTTGGCCCGTACGAAGTCGGGTCCTTTCACCGCACGAAGCTCTAAGGACTCGGCTCCGAGTTCTCTGGGC:1 + chr3R 20449737 3' + P-element 2854 1 56.80 AGGTATGCGGCAGCGAATGCCGAGAACCCTGATGCAAGTGGAACTTGCGTTAACTTATATGTAGAGTAGAGTTATAGTGAGGGTAGATACACTACAACATAATTCGTTTGTTGGTAGTGTTTTAATGCTTTCTATGTC:1 + chrX 21668369 3' + opus 7467 2 47.83 CTTGCTATTCGTAGCTTGAAAGAAACACGTCTCCACCCGAAGACTGTGGAATGCCGAATGCCAAAGGAGCAATCTACATGGGCTTGAAATTTCATAAAATCTATATCAATCATCTAATCAAACAACTTCGATAAAACATTTTGGGC:1 - chr3R 12046723 3' - Doc 41 1 51.37 TGCTATTTTATTTAATTGTTCTTAATATTGCATAGGCACATACTACAGGTGTTTCCCCATTGTTCTACATTGTGCTCAGCGCGTTGGTATATAGACGAATTGATCTGGGTCACTCCCAAACAATACTGTGTAAATTATTAATAATA:1 + chr2R 23095004 3' - 412 26 2 65.75 GCAACAAGCTTACGGCATAAAACAACAAGATATTGTACTTAGTAATTAAATAAAGCGGTAACTACATAAGTTACTATAAGTGCATCTAACAGGTTGGCATAAAAAACAATAAAAAATACCCTTTACGCTTATTAGATTTTAATAT:1 - chr3R 10144362 3' + Chimpo 129 1 54.48 CATGAGGGTGGTGTCGCTTGAGTCTTCTTTTGACTCTAGTCCGAGGGTCAGCATTGACCACAGCTGCAGTTCCTAGCTTCCTTGCTAGGCTGTTGGAGCGACCCATTAATACAATACATATACTCCAAAGCAAAC:1 - chr3L 1004851 3' - jockey 4751 1 71.11 ACATTGTAAATAAATATAGCTGTAAGCCCCGTAGCTAATGCTATACTATCTAAGTTAGTCTAGTTTTGTAAACTATTCTATCTATCATAATAATAATAATAATAATATTCGTCTTTCGGACGCTCGACGGCGCAGCCAGG:1 + chr3R 11089731 3' + I-element 5273 1 78.57 TTTCTATTAGAAAATAATTGCTAGAGGACGATATATTGACATAAAAATTTAGACTTTATGCCAAAAAAACGAATTCTGGACCATAGCGCGCTGGGAATATTGTTGAATATATATATACAACTAGCGGATGTGAATTGTGCACATTG:1 - chr3L 25483054 3' - transib2 68 1 58.22 ATTTATGCAATGCAACTAAGTGTTGCTGTGTACTTATAGGTACAGTGTACCCTCGATATATGCACATACTACAACGTGTCCAAATCAACTGACAAATCTGTCTGAGCATAAATAACAAATTGATTGGGCAAATAAACATA:1 + chr2R 18931921 3' - blood 52 2 53.57 TTGACTATTTATTTATTTATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACATTAAGAAAGGAAATATAAATTATAAATTACAACAGATTCTATAGTGCCCTTACTAGGAAAGGGTAAGAGAATCGTATCGTTTTTCAAATCAAG:1 + chr2R 6493371 3' + copia 224 1 60.27 TACTATGTTATATCAACTATTATAATTCTCCCTATCATTTTTAGGATTAAAAATCTGTTAGTCTTAAGTAACCAAGACACATTGTAAAATAAAATAATTTAAGCGCGAATTCAATTAACTTTTTGTTTGCGTGTCTTCGCCAATGT:1 - chr3R 26854402 3' + jockey 4846 1 71.23 TTCGGCTTTCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGATCCGTACAGCAGAAGCTTCGGTTACGTAGAGCTTTTCATTATCTACCGTTACGCGATCTCGGCTATGTACGCAGGCTGCTCAGCCGGCGAC:1 - chr2L 14616140 3' - P-element 19 1 70.45 GCGCTGTTATGTTACTGTTATTGCATTGTATTGATTCATCGCTTCTAAATAAATAAATATATAAAAAAAAGTTGCATTTTATTGTACTTTCGTCTTAATTTGGTTGTTGATATGCTATAATGGATACTGCGATTTATAGCGCAAGA:1 - chr2L 15019858 3' + BS 5048 1 51.37 ATTTCTTTGAAATAATGGAAGTGGCTGGTTTGGACCACCCAAATACGTCACTATATATAAGTGCTTTGAAAAAAAATATTTTGACTGATTTTTTTTTCACAGAATTAGAGAAAAATGTTCCCACAAGTAGTTGTATTCAT:1 - chr3L 27349983 3' - 297 31 2 57.86 GAAGATATTTCCAAATAAAATCAGTTTCTTACAAAAACTCAACGAGTAAAGTCTTCTTATTTGGGATTTTACATGGCATTTAGTTGGCATTCAATGGAAAAAAAAAGTACAAGAATCTTATACTTACTTTATATAAAGTACAAAC:2 + chr3R 24084894 3' + roo 9020 2 53.79 AATACGACACTCAGAATACTATTCCTTTCACTCGCACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGCTTTACACCATATTTGAAATCAACGTTCGCTGGCAAGTGCGCG:1 + chr3R 7074876 3' + P-element 2805 1 28.08 ACTTATTGCAAGCATACGTTAAGTGGATGTCTCTTGCCGACGGGACCACCTTATGTTATTTCATCATGGGTCAGACGAATAGCTCTCCTAGCGGTGCTCGCCGAATGTAAACATCTGAAATAACATTAAATAGTATGTTTAGTAAT:1 + chrX 2300680 3' + P-element 2840 1 48.63 TTTTGTGCGGAGCACGATAAAAACGTCTTCACACGTCGGCGATCGAATTGAATACGACGATGTTTTGGTTTGAGAATATTTGAAAGGATTCGCTTTTTG:1 + chr3R 10737046 3' - 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